JP2022510913A - 構造を識別する方法 - Google Patents
構造を識別する方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2022510913A JP2022510913A JP2021530111A JP2021530111A JP2022510913A JP 2022510913 A JP2022510913 A JP 2022510913A JP 2021530111 A JP2021530111 A JP 2021530111A JP 2021530111 A JP2021530111 A JP 2021530111A JP 2022510913 A JP2022510913 A JP 2022510913A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- sample
- interest
- subsequent analysis
- subsequent
- region
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 112
- 230000000737 periodic effect Effects 0.000 claims abstract description 12
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims description 252
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 claims description 85
- 230000008569 process Effects 0.000 claims description 49
- 239000000538 analytical sample Substances 0.000 claims description 15
- 230000003993 interaction Effects 0.000 claims description 6
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 claims description 6
- 238000005520 cutting process Methods 0.000 claims description 5
- 238000000399 optical microscopy Methods 0.000 claims description 5
- 238000004621 scanning probe microscopy Methods 0.000 claims description 5
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims description 5
- 238000001493 electron microscopy Methods 0.000 claims description 3
- 238000003963 x-ray microscopy Methods 0.000 claims description 3
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 claims description 2
- 238000002372 labelling Methods 0.000 claims description 2
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 claims 1
- 238000005286 illumination Methods 0.000 claims 1
- 239000010410 layer Substances 0.000 description 24
- 238000000386 microscopy Methods 0.000 description 19
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 19
- 238000004627 transmission electron microscopy Methods 0.000 description 18
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 11
- 230000010287 polarization Effects 0.000 description 8
- 229920003209 poly(hydridosilsesquioxane) Polymers 0.000 description 7
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 7
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 6
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 5
- 239000003086 colorant Substances 0.000 description 5
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 5
- 238000003491 array Methods 0.000 description 4
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 4
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 4
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 3
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 3
- 239000000463 material Substances 0.000 description 3
- 238000001878 scanning electron micrograph Methods 0.000 description 3
- 230000003595 spectral effect Effects 0.000 description 3
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 2
- WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N Formaldehyde Chemical compound O=C WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 2
- 230000008859 change Effects 0.000 description 2
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 2
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 230000031700 light absorption Effects 0.000 description 2
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 2
- 210000001328 optic nerve Anatomy 0.000 description 2
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 2
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 2
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 2
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 2
- 238000000411 transmission spectrum Methods 0.000 description 2
- 230000000007 visual effect Effects 0.000 description 2
- 108700024394 Exon Proteins 0.000 description 1
- SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N Glutaraldehyde Chemical compound O=CCCCC=O SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HTTJABKRGRZYRN-UHFFFAOYSA-N Heparin Chemical compound OC1C(NC(=O)C)C(O)OC(COS(O)(=O)=O)C1OC1C(OS(O)(=O)=O)C(O)C(OC2C(C(OS(O)(=O)=O)C(OC3C(C(O)C(O)C(O3)C(O)=O)OS(O)(=O)=O)C(CO)O2)NS(O)(=O)=O)C(C(O)=O)O1 HTTJABKRGRZYRN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101710135898 Myc proto-oncogene protein Proteins 0.000 description 1
- 102100038895 Myc proto-oncogene protein Human genes 0.000 description 1
- 229930040373 Paraformaldehyde Natural products 0.000 description 1
- 229910004298 SiO 2 Inorganic materials 0.000 description 1
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010064127 Solar lentigo Diseases 0.000 description 1
- 101710150448 Transcriptional regulator Myc Proteins 0.000 description 1
- 206010044565 Tremor Diseases 0.000 description 1
- 229910021417 amorphous silicon Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000000740 bleeding effect Effects 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 1
- 238000004040 coloring Methods 0.000 description 1
- 210000004292 cytoskeleton Anatomy 0.000 description 1
- 238000013500 data storage Methods 0.000 description 1
- 230000007850 degeneration Effects 0.000 description 1
- 230000001066 destructive effect Effects 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 1
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 1
- 238000011143 downstream manufacturing Methods 0.000 description 1
- 230000009977 dual effect Effects 0.000 description 1
- 230000005611 electricity Effects 0.000 description 1
- 230000005672 electromagnetic field Effects 0.000 description 1
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 1
- 239000003574 free electron Substances 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 229960002897 heparin Drugs 0.000 description 1
- 229920000669 heparin Polymers 0.000 description 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 1
- 238000010884 ion-beam technique Methods 0.000 description 1
- 210000005240 left ventricle Anatomy 0.000 description 1
- 238000001459 lithography Methods 0.000 description 1
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 1
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 1
- 229910044991 metal oxide Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000004706 metal oxides Chemical class 0.000 description 1
- 238000000520 microinjection Methods 0.000 description 1
- 210000003007 myelin sheath Anatomy 0.000 description 1
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 1
- 239000012188 paraffin wax Substances 0.000 description 1
- 229920002866 paraformaldehyde Polymers 0.000 description 1
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 1
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 1
- 238000000206 photolithography Methods 0.000 description 1
- 230000000704 physical effect Effects 0.000 description 1
- 238000004321 preservation Methods 0.000 description 1
- 239000011241 protective layer Substances 0.000 description 1
- 230000002787 reinforcement Effects 0.000 description 1
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 1
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 1
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 1
- 229910052709 silver Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000004332 silver Substances 0.000 description 1
- -1 silver halide Chemical class 0.000 description 1
- 230000003068 static effect Effects 0.000 description 1
- 210000004895 subcellular structure Anatomy 0.000 description 1
- 238000012800 visualization Methods 0.000 description 1
- 238000009736 wetting Methods 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G02—OPTICS
- G02B—OPTICAL ELEMENTS, SYSTEMS OR APPARATUS
- G02B5/00—Optical elements other than lenses
- G02B5/008—Surface plasmon devices
-
- G—PHYSICS
- G02—OPTICS
- G02B—OPTICAL ELEMENTS, SYSTEMS OR APPARATUS
- G02B21/00—Microscopes
- G02B21/34—Microscope slides, e.g. mounting specimens on microscope slides
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
- G01N21/17—Systems in which incident light is modified in accordance with the properties of the material investigated
- G01N21/25—Colour; Spectral properties, i.e. comparison of effect of material on the light at two or more different wavelengths or wavelength bands
- G01N21/255—Details, e.g. use of specially adapted sources, lighting or optical systems
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
- G01N21/17—Systems in which incident light is modified in accordance with the properties of the material investigated
- G01N21/55—Specular reflectivity
- G01N21/552—Attenuated total reflection
- G01N21/553—Attenuated total reflection and using surface plasmons
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
- G01N21/17—Systems in which incident light is modified in accordance with the properties of the material investigated
- G01N21/55—Specular reflectivity
- G01N21/552—Attenuated total reflection
- G01N21/553—Attenuated total reflection and using surface plasmons
- G01N21/554—Attenuated total reflection and using surface plasmons detecting the surface plasmon resonance of nanostructured metals, e.g. localised surface plasmon resonance
-
- G—PHYSICS
- G02—OPTICS
- G02B—OPTICAL ELEMENTS, SYSTEMS OR APPARATUS
- G02B21/00—Microscopes
- G02B21/06—Means for illuminating specimens
-
- G—PHYSICS
- G02—OPTICS
- G02B—OPTICAL ELEMENTS, SYSTEMS OR APPARATUS
- G02B21/00—Microscopes
- G02B21/36—Microscopes arranged for photographic purposes or projection purposes or digital imaging or video purposes including associated control and data processing arrangements
- G02B21/365—Control or image processing arrangements for digital or video microscopes
-
- G—PHYSICS
- G02—OPTICS
- G02B—OPTICAL ELEMENTS, SYSTEMS OR APPARATUS
- G02B21/00—Microscopes
- G02B21/36—Microscopes arranged for photographic purposes or projection purposes or digital imaging or video purposes including associated control and data processing arrangements
- G02B21/365—Control or image processing arrangements for digital or video microscopes
- G02B21/367—Control or image processing arrangements for digital or video microscopes providing an output produced by processing a plurality of individual source images, e.g. image tiling, montage, composite images, depth sectioning, image comparison
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
- G06T7/00—Image analysis
- G06T7/0002—Inspection of images, e.g. flaw detection
- G06T7/0012—Biomedical image inspection
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B82—NANOTECHNOLOGY
- B82Y—SPECIFIC USES OR APPLICATIONS OF NANOSTRUCTURES; MEASUREMENT OR ANALYSIS OF NANOSTRUCTURES; MANUFACTURE OR TREATMENT OF NANOSTRUCTURES
- B82Y20/00—Nanooptics, e.g. quantum optics or photonic crystals
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
- G06T2207/00—Indexing scheme for image analysis or image enhancement
- G06T2207/10—Image acquisition modality
- G06T2207/10056—Microscopic image
- G06T2207/10061—Microscopic image from scanning electron microscope
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
- G06T2207/00—Indexing scheme for image analysis or image enhancement
- G06T2207/30—Subject of image; Context of image processing
- G06T2207/30004—Biomedical image processing
- G06T2207/30024—Cell structures in vitro; Tissue sections in vitro
Landscapes
- Physics & Mathematics (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Optics & Photonics (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Multimedia (AREA)
- Computer Vision & Pattern Recognition (AREA)
- Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
- Medical Informatics (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Radiology & Medical Imaging (AREA)
- Quality & Reliability (AREA)
- Theoretical Computer Science (AREA)
- Nanotechnology (AREA)
- Sampling And Sample Adjustment (AREA)
- Investigating Or Analysing Materials By Optical Means (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Microscoopes, Condenser (AREA)
- Analysing Materials By The Use Of Radiation (AREA)
Abstract
Description
本開示は、顕微鏡検査、組織学及び病理学の分野に関する。1つの形式では、本開示は、光学顕微鏡及び増強型試料保持器を使用して組織学を行うシステム及び方法を提供する。
La Trobe Universityの名義におけるPCT/オーストラリア特許出願公開第2018/050496号(その内容全体が参照により本明細書に援用される)は、サブミクロン構造の周期的アレイを含むプラズモニック層を有する試料保持器の使用を通して増強型画像コントラストを提供する光学顕微鏡検査のシステム及び方法を開示している。この開示では、ナノスライドへの参照は、その両方の内容がすべての目的のために参照により本明細書に援用されるPCT/オーストラリア特許出願公開第2018/050496号又は2018年11月29日出願の本出願人の同時係争中の「Microscopy method and system」という名称のオーストラリア特許出願公開第2018904553号及び本出願と同じ日に出願されたオーストラリア特許出願公開第2018904553号に対する優先権を主張する国際特許出願の教示による試料保持器への参照である。このような試料保持器を使用する顕微鏡検査は、本明細書において組織学的プラズモニックス又は色コントラスト顕微鏡検査(CCMと略称される)と呼ばれる。試料は、プラズモニック層に隣接して試料保持器上に置かれる。使用中、試料及び試料保持器が光、通常、広帯域の白色光で照明され、試料の画像が生成される。本発明者らは、試料及びプラズモニック層と光との相互作用を介して色コントラストが生成対象画像内に呈示され得ることを観測した。特に、異なる誘電定数を有する試料の領域は、異なる色で画像内に出現する。強度コントラストも実現される。これとは対照的に、染色試料を使用する従来の光学顕微鏡検査から取得される画像は、通常、使用される染色に対応する単一色の強度コントラストを呈示するのみである。
本発明者らは、ナノスライドの使用が、これらの独特の利点の1つ又は両方を活用する顕微鏡検査技術に対する有用な改善を可能にすることを理解した。
上側表面及び下側表面を有する試料保持器を提供することであって、上側表面は、それに関連するプラズモニック層を有し、プラズモニック層は、サブミクロン構造の周期的アレイを含む、提供することと、
関心領域が判断される試料を試料保持器の上側表面に貼り付けることと、
光が試料及び試料保持器と相互作用するように、前記光で試料を照明することと、
前記試料及び試料保持器との相互作用後の前記光を使用して画像を形成することであって、試料の少なくとも1つの局所化構造特性は、受け取られた光の色に基づいて画像内で可視である、形成することと、
試料の少なくとも一部分の色に少なくとも部分的に基づいて、試料保持器に貼り付けられた前記試料の関心領域を選択することと
を含む。
上側表面及び下側表面を有する試料保持器を提供することであって、上側表面は、それに関連するプラズモニック層を有し、プラズモニック層は、サブミクロン構造の周期的アレイを含む、提供することと、
試料を試料保持器の上側表面に貼り付けることと、
光が試料及び試料保持器と相互作用するように、前記光で試料を照明することと、
前記試料及び試料保持器との相互作用後の前記光を使用して画像を形成することであって、試料の少なくとも1つの局所化構造特性は、受け取られた光の色に基づいて画像内で可視である、形成することと、
後続の分析処理を制御するために、形成された画像を使用することと
を含む。
後続の分析において使用される1つ又は複数のデータ点及び/又は座標系を定義すること、
さらなる分析のために試料の領域を選択すること、及び
前記後続の分析の順序又はスケジュールを判断すること
の任意の1つ又は複数を含み得る。
各出願の内容をすべての目的のために参照により本明細書に援用する、
2018年11月29日出願の本出願人の同時係争中の「Method of identifying a structure」という名称のオーストラリア特許出願公開第2018904550号及び本出願と同じ日に出願されたオーストラリア特許出願公開第2018904550号に対する優先権を主張する国際特許出願、
2018年11月29日出願の本出願人の同時係争中の「Automated method of identifying a structure」という名称のオーストラリア特許出願公開第2018904551号及び本出願と同じ日に出願されたオーストラリア特許出願公開第2018904551号に対する優先権を主張する国際特許出願。
本発明の例示的実施形態は、添付図面を参照して非限定的例として説明されことになる。本国際出願と共に出願された添付図面は、本発明の実施形態において使用されるカラー画像であって、その使用から生じるカラー画像を含む。色情報は、実施形態の本開示の一部を形成する。画像の白黒再生又は階調再生が発生すれば、色開示は、元々申請された文書から取得され得る。
本発明者らは、ナノスライドの使用が、ナノスライドの独特の利点の1つ又は複数を活用する分析技術に対する有用な改善を可能にすることを理解した。
Δλ≒(λθ SPP,s-λθ SPP,a)(1-exp(-2t/ld)) (1)
ここで、ld≒λ/2√εdは、SPP電磁場の固有減衰長であり、それ自体、試料の誘電定数εdの関数である。試料が、図2bの例に示される試料の固有減衰長より厚い場合である。この例では、固有減衰長ldは、参照番号110により指示される。分かるように、試料保持器100上の試料108は、減衰長110より厚い。膜厚が増加すると、透過SPP共鳴ピークは、λθ SPPに等しくなるまで一層赤方偏移され、その後、これ以上の色変化は、発生しない。要するに、標準的透過明視野顕微鏡を使用する際、試料内の局所的誘電定数の変化に直接関係する色の空間分解分布が結果として生じることになる。光学スペクトルにおいて符号化された局所的誘電定数により、顕著な色コントラスト効果が生成される。これは、光学的に透明な試料内のいかなる構造(コントラストの欠如に起因して検出することが以前に困難であった)も画像内の捕捉された色コントラストのために可視光透過画像内で検出可能であることを意味する。さらに且つ照明されると、試料内の強度コントラストを誘起又は強化するために染色液又は染料を使用する従来の光学顕微鏡検査とは対照的に、好ましい実施形態では、試料内の狭い(約200nm未満の)層を表す識別可能な色コントラストを生成する。従来の顕微鏡検査は、試料の全厚さにわたる強度コントラストを示す。これは、試料の画像が実際には試料の全厚さ(200nmより著しく厚いことができる)にわたる全光吸収の2次元投影であるという欠点(従来の顕微鏡検査において)を有する。これは、見る人にとって試料内の詳細を曖昧にする影響があり得る。視覚的に、これは、画像内で可視である構造を不鮮明又は曖昧にし得る。対照的に、ナノスライドによる組織学は、試料保持器に最も近い試料の一部分における色コントラストのみを誘起し、したがって染色のみに依存する従来の顕微鏡検査より小さい寸法を有する構造を有用に示し得る。従来の光学顕微鏡検査の技術分野の当業者によって理解されるように、より薄いスライスは、にじみ又はぼやけの問題をいくぶん改善し得るが、薄いスライスは、薄いスライスで感知可能強度コントラストを示さないことがあり得るという付随する欠点を引き起こす。
後続の分析が行われる試料は、処理403から判断される1つ又は複数のデータ点及び/又は座標系に基づいて配向又はマッピングされ得るか、
試料の一部分の物理的選択は、ROIが例えば元の試料の残りを分析することなくより効果的又は効率的に分析され得るように、例えば後続分析試料を生成するために、関心領域を含む試料の一部分を切断することにより行われ得るか、又は
前記後続の分析の順序付け又はスケジューリングは、ROIを優先的に処理する(例えば、ROIを最初に又はより詳細に分析するなど)ために行われ得る。
Claims (30)
- 試料の分析の方法であって、
上側表面及び下側表面を有する試料保持器を提供することであって、前記上側表面は、それに関連するプラズモニック層を有し、前記プラズモニック層は、サブミクロン構造の周期的アレイを含む、提供することと、
前記試料を前記試料保持器の前記上側表面に貼り付けることと、
光が前記試料及び試料保持器と相互作用するように、前記光で前記試料を照明することと、
前記試料及び試料保持器との相互作用後の前記光を使用して画像を形成することであって、前記試料の少なくとも1つの局所化構造特性は、前記受け取られた光の色に基づいて前記画像内で可視である、形成することと、
後続の分析処理を制御するために、形成された前記画像を使用することと
を含む方法。 - 後続の分析処理を制御するために、形成された前記画像を使用することは、
後続の分析において使用される1つ又は複数のデータ点及び/又は座標系を定義すること、
さらなる分析のために試料の領域を選択すること、及び
前記後続の分析の順序又はスケジュールを判断すること
の任意の1つ又は複数を含む、請求項1に記載の方法。 - 後続の分析処理において使用される試料の関心領域を選択する方法であって、
上側表面及び下側表面を有する試料保持器を提供することであって、前記上側表面は、それに関連するプラズモニック層を有し、前記プラズモニック層は、サブミクロン構造の周期的アレイを含む、提供することと、
前記関心領域が判断される試料を前記試料保持器の前記上側表面に貼り付けることと、
光が前記試料及び試料保持器と相互作用するように、前記光で前記試料を照明することと、
前記試料及び試料保持器との相互作用後の前記光を使用して画像を形成することであって、前記試料の少なくとも1つの局所化構造特性は、受け取られた光の色に基づいて前記画像内で可視である、形成することと、
前記試料の少なくとも一部分の色に少なくとも部分的に基づいて、前記試料保持器に貼り付けられた前記試料の関心領域を選択することと
を含む方法。 - 前記選択された関心領域に対応する後続分析試料に対して後続の分析を行うことをさらに含む、請求項3に記載の方法。
- 前記試料保持器に張り付けられた前記試料の関心領域を選択し、且つ前記選択された関心領域に対応する後続分析試料に対して後続の分析を行うことを含む、請求項1~4のいずれか一項に記載の方法。
- 前記試料の前記関心領域を選択することは、選択された関心領域に対応する前記後続分析試料を生成するために、前記選択された関心領域を含む前記試料の一部分を切断することを含む、請求項3~5のいずれか一項に記載の方法。
- 前記選択された関心領域に対応する前記後続分析試料は、同じ組織試料から取得される、前記選択された関心領域に空間的に対応する異なる試料であり得る、請求項1~6のいずれか一項に記載の方法。
- 前記後続分析試料は、その隣接部分における又はその隣接部分の近くの同じ組織試料から導出される、前記選択された関心領域に平面視でほぼ空間的に対応する試料である、請求項7に記載の方法。
- 前記試料は、前記後続分析試料として使用される、請求項1~6のいずれか一項に記載の方法。
- 前記後続の分析処理は、後続の画像処理である、請求項1~9のいずれか一項に記載の方法。
- 前記後続の分析処理は、後続の顕微鏡検査処理である、請求項1~10のいずれか一項に記載の方法。
- 前記後続の顕微鏡検査処理は、
光学顕微鏡検査処理、
電子顕微鏡検査処理、
走査プローブ顕微鏡検査処理、
X線顕微鏡検査処理、
TEM処理
の少なくとも1つを含む、請求項11に記載の方法。 - 前記後続の分析のための順序又はスケジュールを判断することを含む、請求項1~12のいずれか一項に記載の方法。
- 関心領域に対して前記後続の分析を行うことを含む、請求項1~13のいずれか一項に記載の方法。
- 関心領域のみに対して前記後続の分析を行うことを含む、請求項1~14のいずれか一項に記載の方法。
- 関心領域でない他の領域の前に関心領域に対して前記後続の分析を行うことを含む、請求項1~15のいずれか一項に記載の方法。
- 前記後続の分析における使用のために前記試料から1つ又は複数のデータ点及び/又は座標系を転送することを含む、請求項1~16のいずれか一項に記載の方法。
- 1つ又は複数のデータ点を物理的に標識付けすることを含む、請求項17に記載の方法。
- 前記画像が前記光を使用して形成されたときに使用された基準座標系と、前記後続の分析を行う際に使用された基準座標系との間で既存のデータ点又は座標系を整合させることを含む、請求項1~18のいずれか一項に記載の方法。
- 試料を分析する方法であって、関心領域を含む試料を提供することであって、前記関心領域は、請求項3若しくは4又は請求項3若しくは4に従属する場合の請求項5~19のいずれか一項に従って選択される、提供することと、前記関心領域に基づいて後続の分析を行うこととを含む方法。
- 前記後続の分析処理は、後続の画像処理である、請求項20に記載の方法。
- 前記後続の分析処理は、後続の顕微鏡検査処理である、請求項20に記載の方法。
- 前記後続の顕微鏡検査処理は、
光学顕微鏡検査処理、
電子顕微鏡検査処理、
走査プローブ顕微鏡検査処理、
X線顕微鏡検査処理、
TEM処理
の少なくとも1つを含む、請求項22に記載の方法。 - 前記試料は、生体試料である、請求項1~23のいずれか一項に記載の方法。
- 前記局所化構造特性は、ある位置における前記試料の誘電定数である、請求項1~24のいずれか一項に記載の方法。
- 請求項1~25のいずれか一項に記載の方法を使用して画像を形成するためのシステム。
- 画像形成システムを有する顕微鏡と、照明システムと、上側表面及び下側表面を有する試料保持器であって、前記上側表面は、それに関連するプラズモニック層を有し、前記プラズモニック層は、サブミクロン構造の周期的アレイを含む、試料保持器とを含む、請求項26に記載のシステム。
- 前記試料のデジタル画像を生成するための画像捕捉システムを含む、請求項27に記載のシステム。
- 後続の分析のためのシステムを含む、請求項26~28のいずれか一項に記載のシステム。
- 前記後続の分析のためのシステムは、以下のシステム:
光学顕微鏡、
電子顕微鏡、
走査プローブ顕微鏡、
X線顕微鏡、
TEM顕微鏡
の任意の1つ又は複数を含む、請求項29に記載のシステム。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
AU2018904552A AU2018904552A0 (en) | 2018-11-29 | Method of identifying a structure | |
AU2018904552 | 2018-11-29 | ||
PCT/IB2019/060307 WO2020110070A1 (en) | 2018-11-29 | 2019-11-29 | Method of identifying a structure |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2022510913A true JP2022510913A (ja) | 2022-01-28 |
JP7426999B2 JP7426999B2 (ja) | 2024-02-02 |
Family
ID=70853876
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2021530111A Active JP7426999B2 (ja) | 2018-11-29 | 2019-11-29 | 構造を識別する方法 |
Country Status (8)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20220091407A1 (ja) |
EP (1) | EP3966554A4 (ja) |
JP (1) | JP7426999B2 (ja) |
CN (1) | CN113544492A (ja) |
AU (1) | AU2019389908A1 (ja) |
CA (1) | CA3121423A1 (ja) |
SG (1) | SG11202105311VA (ja) |
WO (1) | WO2020110070A1 (ja) |
Families Citing this family (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CA3121425A1 (en) * | 2018-11-29 | 2020-06-04 | La Trobe University | Automated method of identifying a structure |
US20230394852A1 (en) * | 2022-06-03 | 2023-12-07 | Fei Company | Automatic selection of structures-of-interest for lamella sample preparation |
Citations (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2009222401A (ja) * | 2008-03-13 | 2009-10-01 | Tokyo Metropolitan Industrial Technology Research Institute | 局所表面プラズモン共鳴イメージング装置 |
EP2653903A1 (en) * | 2012-04-20 | 2013-10-23 | FOM Institute for Atomic and Molecular Physics | Plasmonic microscopy |
JP2015514225A (ja) * | 2012-04-10 | 2015-05-18 | ザ トラスティーズ オブ プリンストン ユニバーシティThe Trustees Of Princeton University | 超高感度センサ |
US20160334398A1 (en) * | 2013-12-02 | 2016-11-17 | The General Hospital Corporation | Nano-plasmonic sensor for exosome detection |
JP2018528405A (ja) * | 2015-07-16 | 2018-09-27 | コーニンクレッカ フィリップス エヌ ヴェKoninklijke Philips N.V. | デジタル病理学における情報変換 |
JP2018532132A (ja) * | 2015-07-16 | 2018-11-01 | コーニンクレッカ フィリップス エヌ ヴェKoninklijke Philips N.V. | デジタル病理学システム |
JP2019505824A (ja) * | 2015-12-23 | 2019-02-28 | コーニンクレッカ フィリップス エヌ ヴェKoninklijke Philips N.V. | 蛍光較正スライド |
Family Cites Families (14)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20080099667A1 (en) * | 2001-08-14 | 2008-05-01 | President And Fellows Of Harvard College | Methods and apparatus for sensing a physical substance |
AU2005246415B8 (en) * | 2004-05-19 | 2011-09-01 | Vp Holding, Llc | Optical sensor with layered plasmon structure for enhanced detection of chemical groups by SERS |
FR2872910B1 (fr) * | 2004-07-07 | 2006-10-13 | Nanoraptor Sa | Composant optique pour l'observation d'un echantillon nanometrique, systeme comprenant un tel composant, procede d'analyse mettant en oeuvre ce composant, et leurs applications |
US8027039B2 (en) * | 2007-04-16 | 2011-09-27 | University Of Maryland, Baltimore | Subwavelength resolution optical microscopy |
US9304234B2 (en) * | 2011-03-10 | 2016-04-05 | The Regents Of The University Of California | Plasmonic dark field and fluorescence microscopy |
DE102012214932B4 (de) * | 2012-08-22 | 2023-08-24 | Carl Zeiss Microscopy Gmbh | Testprobenvorrichtung und Testverfahren für ein optisches, im Sub-Wellenlängenbereich auflösendes Mikroskop |
EP2904373B1 (en) * | 2012-10-03 | 2022-12-14 | Koninklijke Philips N.V. | Combined sample examinations |
JP2015012128A (ja) * | 2013-06-28 | 2015-01-19 | ソニー株式会社 | 撮像装置及び電子機器 |
WO2015199976A1 (en) * | 2014-06-24 | 2015-12-30 | The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health & Human Services | Target activated microdissection |
US10908090B2 (en) * | 2015-03-13 | 2021-02-02 | Chris Geddes | Microarray slides that enhance fluorescent signals via plasmonic interaction |
US9835870B2 (en) * | 2015-06-05 | 2017-12-05 | Vasily N. Astratov | Super-resolution microscopy methods and systems enhanced by dielectric microspheres or microcylinders used in combination with metallic nanostructures |
JP7057279B6 (ja) * | 2015-12-23 | 2022-06-02 | コーニンクレッカ フィリップス エヌ ヴェ | デジタル病理学に関する較正スライド |
CA3044862A1 (en) * | 2016-12-08 | 2018-06-14 | Drinksavvy, Inc. | Surface plasmon resonance sensor comprising metal coated nanostructures and a molecularly imprinted polymer layer |
AU2018273795B2 (en) | 2017-05-22 | 2023-08-31 | La Trobe University | Image contrast enhancement for optical microscopy |
-
2019
- 2019-11-29 CN CN201980090290.4A patent/CN113544492A/zh active Pending
- 2019-11-29 SG SG11202105311VA patent/SG11202105311VA/en unknown
- 2019-11-29 WO PCT/IB2019/060307 patent/WO2020110070A1/en unknown
- 2019-11-29 JP JP2021530111A patent/JP7426999B2/ja active Active
- 2019-11-29 EP EP19889218.4A patent/EP3966554A4/en active Pending
- 2019-11-29 CA CA3121423A patent/CA3121423A1/en active Pending
- 2019-11-29 US US17/297,977 patent/US20220091407A1/en active Pending
- 2019-11-29 AU AU2019389908A patent/AU2019389908A1/en active Pending
Patent Citations (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2009222401A (ja) * | 2008-03-13 | 2009-10-01 | Tokyo Metropolitan Industrial Technology Research Institute | 局所表面プラズモン共鳴イメージング装置 |
JP2015514225A (ja) * | 2012-04-10 | 2015-05-18 | ザ トラスティーズ オブ プリンストン ユニバーシティThe Trustees Of Princeton University | 超高感度センサ |
EP2653903A1 (en) * | 2012-04-20 | 2013-10-23 | FOM Institute for Atomic and Molecular Physics | Plasmonic microscopy |
US20160334398A1 (en) * | 2013-12-02 | 2016-11-17 | The General Hospital Corporation | Nano-plasmonic sensor for exosome detection |
JP2018528405A (ja) * | 2015-07-16 | 2018-09-27 | コーニンクレッカ フィリップス エヌ ヴェKoninklijke Philips N.V. | デジタル病理学における情報変換 |
JP2018532132A (ja) * | 2015-07-16 | 2018-11-01 | コーニンクレッカ フィリップス エヌ ヴェKoninklijke Philips N.V. | デジタル病理学システム |
JP2019505824A (ja) * | 2015-12-23 | 2019-02-28 | コーニンクレッカ フィリップス エヌ ヴェKoninklijke Philips N.V. | 蛍光較正スライド |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
TETSUO KAN ET AL: "Sub-micron aperture plate for intracellular calcium transient measurement", TRANSDUCERS'05: THE 13TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON SOLID-STATE SENSORS, ACTUATORS AND MICROSYSTEMS, JPN6023022673, 6 June 2005 (2005-06-06), ISSN: 0005074574 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CA3121423A1 (en) | 2020-06-04 |
WO2020110070A1 (en) | 2020-06-04 |
US20220091407A1 (en) | 2022-03-24 |
JP7426999B2 (ja) | 2024-02-02 |
CN113544492A (zh) | 2021-10-22 |
EP3966554A1 (en) | 2022-03-16 |
SG11202105311VA (en) | 2021-06-29 |
EP3966554A4 (en) | 2022-09-07 |
AU2019389908A1 (en) | 2021-06-10 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Rigort et al. | Focused ion beam micromachining of eukaryotic cells for cryoelectron tomography | |
US6900426B2 (en) | Reverse focusing methods and systems | |
Liu et al. | High-resolution confocal imaging and three-dimensional rendering | |
Sivaguru et al. | Capturing the surface texture and shape of pollen: a comparison of microscopy techniques | |
EP2562245A1 (en) | Cell observation device and cell observation method | |
JP7426999B2 (ja) | 構造を識別する方法 | |
JP7466540B2 (ja) | 構造を識別する方法 | |
Borovkova et al. | Screening of Alzheimer’s disease with multiwavelength Stokes polarimetry in a mouse model | |
Bushby et al. | Correlative light and volume electron microscopy: using focused ion beam scanning electron microscopy to image transient events in model organisms | |
Appleton et al. | Preparation of wholemount mouse intestine for high‐resolution three‐dimensional imaging using two‐photon microscopy | |
Tsunoda et al. | Real‐time three‐dimensional imaging of cell division by differential interference contrast microscopy | |
Dauphin et al. | Structure and composition of the boundary zone between aragonitic crossed lamellar and calcitic prism layers in the shell of C oncholepas concholepas (M ollusca, G astropoda) | |
US20190113456A1 (en) | Multi-surface image acquisition system, observation device, observation method, screening method, and stereoscopic reconstruction method of subject | |
JP2008505319A (ja) | 結晶の像を形成するためのシステムおよび方法 | |
JPH06258578A (ja) | 試料断面からの立体情報画像化装置及びその試料断面画像の観察方法 | |
US20240077712A1 (en) | Microscope Slide and Method for Selecting the Same | |
Battistella et al. | Application of light-sheet mesoscopy to image host-pathogen interactions in intact organs | |
Schoeppler et al. | Soft x-ray linear dichroic ptychography: the study of crystal orientation in biominerals | |
Klaus et al. | Confocal imaging and three-dimensional visualization of thick autofluorescent specimens | |
JP7483707B2 (ja) | 顕微鏡検査方法及びシステム | |
Borovkova et al. | The use of Stokes-Mueller polarimetry for assessment of amyloid-β progression in a mouse model of Alzheimer’s disease | |
Ribeiro et al. | Comparative assessment between objective and subjective methods in slides stained by immunohistochemistry | |
Hibbs | What is Confocal Microscopy? | |
WO2023167877A1 (en) | Apparatuses systems and methods for three dimensional microdissection of samples | |
Haase | OMX-a novel high speed and high resolution microscope and its application to nuclear and chromosomal structure analysis |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20220929 |
|
A977 | Report on retrieval |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 Effective date: 20230524 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20230602 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20230831 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20231003 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20231227 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20240123 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 7426999 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |