JP2022097744A - 緩衝剤溶液を提供するための方法及びシステム - Google Patents

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Abstract

【課題】バイオ製品を処理するための溶液を製造するためのより費用有効性の高い方法を提供すること。【解決手段】処理溶液を送達するための方法は、バイオプロセス容器の中に濃縮処理溶液を提供するステップを含み、濃縮処理溶液は第1のサイトで製造される。また、方法は、濃縮処理溶液と、第1のサイトとは異なる第2のサイトのバイオリアクタ内で製造された生体高分子含有溶液とを結合するステップを同じく含む。いくつかの実施例では、処理溶液は、バイオリアクタ内で培養された細胞の産物を処理するための緩衝剤である。方法を実施するためのシステム及び薬剤製造施設が同じく提供される。【選択図】図2

Description

本出願は、2016年8月2日に出願した米国仮特許出願第62/370,041号の優先権の利益を主張するものであり、この米国仮特許出願は、あらゆる目的のために、参照によりその全体が本明細書に組み込まれている。
本開示は、バイオリアクタ内で培養された細胞の産物を処理するための溶液、例えば、緩衝剤に関する。
バイオリアクタは、大量の所望のバイオ製品を製造するために使用されている。バイオ製品を製造するためにバイオリアクタ内で細胞を増殖させた後、バイオ製品を単離し、濃縮するための後続するステップが実施される。これらの処理ステップには、無菌状態を維持し、バイオ製品がその活性を保持していることを保証するために、高価な処理溶液を大量に必要とし得る。バイオ製品を処理するための溶液を製造するためのより費用有効性の高い方法が必要である。
米国特許出願公開第2011-0312087A1号明細書 米国特許第6,703,199号 米国特許第5,272,071号 WO01/96584 WO01/29058 米国特許第6,326,193号 米国特許第5,633,162号 米国公開第2013/0280797号 米国公開第2012/0077429号 米国公開第2009/0305626号 米国特許第8,298,054号 米国特許第7,629,167号 米国特許第5,656,491号 米国特許出願公開第2016/0097074号明細書
Batzerら、Nucleic Acid Res. 19:5081 (1991) Ohtsukaら、J. Biol. Chem. 260:2605~2608ページ(1985) Rossoliniら、Mol. Cell. Probes 8:91~98ページ(1994) Process Scale Purification of Antibodies、Uwe Gottschalk 2011 John Wiley & Sons ISBN: 1118210743 Antibodies Vol 1 Production and Purification、G. Subramanian 2013 Springer Science & Business Media Basic Methods in Antibody Production and Characterization、Gary C. Howard 2000 CRC Press Hodgesらの「The Use of Fourier Transform Raman Spectroscopy in the Forensic Identification of Illicit Drugs and Explosives,」、Molecular Spectroscopy 46:303~307頁(1990) Rodgerらの「The In-Situ Analysis of Lipsticks by Surface Enhanced Resonance Raman Scattering,」、Analyst 1823~1826頁(1998) Thomasらの「Raman Spectroscopy and the Forensic Analysis of Black/Grey and Blue Cotton Fibres Part 1: Investigation of the Effects of Varying Laser Wavelength,」、Forensic Sci. Int. 152:189~197頁(2005) Suzukiらの「In Situ Identification and Analysis of Automotive Paint Pigments Using Line Segment Excitation Raman Spectroscopy: I. Inorganic Topcoat Pigments,」、J. Forensic Sci. 46:1053~1069頁(2001) Mazzellaらの「Raman Spectroscopy of Blue Gel Pen Inks,」、Forensic Sci. Int. 152:241~247頁(2005) Grasselliらの「Chemical Applications of Raman Spectroscopy,」、New York: John Wiley & Sons (1981) Yanらの「Surface-Enhanced Raman Scattering Detection of Chemical and Biological Agents Using a Portable Raman Integrated Tunable Sensor,」、Sensors and Actuators B. 6 (2007) Eckenrodeらの「Portable Raman Spectroscopy Systems for Field Analysis,」、Forensic Science Communications 3:(2001) Protein Mass Spectrometry、Julian Whitelegge、2008年、Elsevier Protein Sequencing and Identification Using Tandem Mass Spectrometry、Michael Kinter、2005年、John Wiley & Sons Characterization of Protein Therapeutics using Mass Spectrometry、Guodong Chen、2014年、Springer Science & Business Media Antibody Expression and Production (2011) Ed. Mohamed Al-Rubeai; Springer Publishing Hollinger and Hudson、Nature Biotechnology 23:1126~1136ページ、2005 Leaderら、「Protein therapeutics: a summary and pharmacological classification」、Nature Reviews Drug Discovery、2008、7:21~39ページ Fanら、Pharm. Bioprocess. (2013); 1(5):487~502ページ
本開示の一態様は、処理溶液を送達するためのシステムに関し、システムは、第1のサイトで製造された濃縮処理溶液を含むバイオプロセス容器と、第1のサイトとは異なる第2のサイトに少なくとも1つの処理ユニットを有する処理エリアと、バイオプロセス容器を少なくとも1つの処理ユニットに接続するパイプであって、バイオプロセス容器から少なくとも1つの処理ユニットへの濃縮処理溶液の流れを許容し、それにより濃縮処理溶液と、少なくとも1つの処理ユニット内で製造された生体高分子含有溶液とを結合させるバルブを有するパイプとを備え、処理溶液は、緩衝剤及び培地のうちの少なくとも1つである。
いくつかの実施例では、システムは、少なくとも1つの処理ユニットに接続されたコントローラを更に含み、濃縮処理溶液は、処理溶液が必要であることがコントローラによって決定され、その決定が第2のサイトから第1のサイトへ通信されると、それに基づいて提供される。
いくつかの実施例では、システムは、生体高分子含有溶液との結合に先立って濃縮処理溶液を希釈するように構成される。
いくつかの実施例では、処理溶液は、トリス、トリス塩基、トリシン、HEPES、MOPS、PIPES、TAPS、ビシン、BES、TES、カコジラート、MES、アセテート、MKP、ADA、ACES、グリシンアミド、アセトアミドグリシン、酢酸、クエン酸、グリシン、グリシングリシナート、リン酸ナトリウム、エタノール、塩酸、水酸化ナトリウム、塩化グアニジニウム、塩酸グアニジン、塩化ナトリウム及び/又はこれらの任意の組合せである。
いくつかの実施例では、バイオプロセス容器は、処理溶液を接触させるための内部層、及び内部層を支持するように構成された外部層を含む。
いくつかの実施例では、内部層はポリエチレンであり、また、外部層は、ポリエチレン、EVOH、ナイロン及びPVDCのブレンドである。
いくつかの実施例では、システムは、処理溶液のバイオバーデンを決定するように構成されたコントローラを含む。
いくつかの実施例では、システムは希釈液サプライを含み、バイオプロセス容器からの濃縮処理溶液及び希釈液サプライからの水及び/又は緩衝剤がインライン処理溶液希釈システムの入口に加えられ、それにより希釈された処理溶液が得られる。
いくつかの実施例では、少なくとも1つの処理ユニットは、複数のバイオリアクタを更に含む。
いくつかの実施例では、システムは複数のバイオプロセス容器を含む。
いくつかの実施例では、処理溶液は緩衝剤である。
本開示の別の態様は、処理溶液を送達するための方法に関し、方法は、バイオプロセス容器の中に濃縮処理溶液を提供するステップであって、第1のサイトで濃縮処理溶液が製造されるステップと、濃縮処理溶液と、第1のサイトとは異なる第2のサイトのバイオリアクタ内で製造された生体高分子含有溶液とを結合するステップとを含み、処理溶液は、緩衝剤及び培地のうちの少なくとも1つである。
いくつかの実施例では、濃縮処理溶液は、濃縮処理溶液が必要であることが決定され、且つ、その決定が第2のサイトから第1のサイトへ通信されることに基づいて提供される。
いくつかの実施例では、方法は、生体高分子含有溶液との結合に先立って濃縮処理溶液を希釈するステップを含む。
いくつかの実施例では、処理溶液は、トリス、トリス塩基、トリシン、HEPES、MOPS、PIPES、TAPS、ビシン、BES、TES、カコジラート、MES、アセテート、MKP、ADA、ACES、グリシンアミド、アセトアミドグリシン、酢酸、クエン酸、グリシン、グリシングリシナート、リン酸ナトリウム、エタノール、塩酸、水酸化ナトリウム、塩化グアニジニウム、塩酸グアニジン、塩化ナトリウム及び/又はこれらの任意の組合せである。
いくつかの実施例では、バイオプロセス容器は、産物接触のための内部層、及び内部層を支持するように構成された外部層を備える。
いくつかの実施例では、内部層はポリエチレンであり、また、外部層は、ポリエチレン、EVOH、ナイロン及びPVDCのブレンドである。
いくつかの実施例では、方法は、処理溶液のバイオバーデンを決定するステップを含む。いくつかの実施例では、バイオバーデンは、高速検出アッセイで決定される。
いくつかの実施例では、方法は、バイオプロセス容器からの濃縮処理溶液及び希釈液サプライからの水及び/又は緩衝剤をインライン処理溶液希釈システムの入口に加え、それにより希釈された処理溶液を得るステップを含む。
いくつかの実施例では、方法は、処理溶液を含むバイオプロセス容器を第1のサイトから第2のサイトへ輸送するステップを含む。
いくつかの実施例では、方法は、バイオ処理溶液をバイオプロセス容器の出口を介して供給し、それにより生体高分子の精製を容易にするステップを含む。
本開示の別の態様は、濃縮処理溶液を含むように構成された少なくとも1つのバイオプロセス容器を受け取ることができる緩衝剤貯蔵エリアと、少なくとも1つの処理ユニットを有する処理エリアと、緩衝剤貯蔵エリアを処理エリアから分離する壁と、緩衝剤貯蔵エリア内に第1の端部を有し、また、処理エリア内に第2の端部を有する少なくとも1つのパイプであって、第1の端部は、少なくとも1つのバイオプロセス容器のうちの少なくとも1つのバイオプロセス容器に接続するように構成され、また、第2の端部は、少なくとも1つの処理ユニットのうちの少なくとも1つの処理ユニットに接続するように構成されるパイプとを備える薬剤製造施設に関している。
いくつかの実施例では、少なくとも1つのパイプはバルブを有する。
いくつかの実施例では、少なくとも1つのバイオプロセス容器は、処理溶液を接触させるための内部層、及び内部層を支持するように構成された外部層を含む。
いくつかの実施例では、特許請求の薬剤製造施設は、緩衝剤貯蔵エリア内のプラットホームを更に含み、プラットホームは、少なくとも1つのバイオプロセス容器を支持するように構成され、少なくとも1つのバイオプロセス容器は複数のバイオプロセス容器を含み、プラットホームは、複数のバイオプロセス容器のうちの少なくとも1つのバイオプロセス容器を支持するように構成された第1のレベル、及び複数のバイオプロセス容器のうちの少なくとも1つのバイオプロセス容器を支持するように構成された第2のレベルを有し、プラットホームは、ユーザによる、フォークリフトを使用したプラットホーム上への複数のバイオプロセス容器のうちの1つのバイオプロセス容器の据付けを許容するように構成され、また、プラットホームは、ユーザによる、フォークリフトを使用したプラットホームからのそれぞれのバイオプロセス容器の除去を許容するように構成される。
いくつかの実施例では、薬剤製造施設は、プラットホームに沿って間隔を隔てた複数の入口を更に含み、個々の入口は少なくとも1つのパイプに接続され、また、個々の入口は、複数のバイオプロセス容器のうちの1つのバイオプロセス容器の出口に接続されるように構成される。
いくつかの実施例では、処理エリアは、クリーンルーム環境として構成される。
一態様では、本発明は、方法、例えばバイオリアクタ処理溶液を送達する方法、又は生体高分子含有溶液を形成する方法を提供する。方法は、濃縮処理溶液を提供するステップ(例えば受け取るステップ)と、濃縮処理溶液と、例えばバイオリアクタ内で製造された生体高分子含有溶液とを結合し、それにより生体高分子含有溶液を形成するステップとを含む。
実施例では、濃縮処理溶液は、少なくとも20リットルの単位、約20リットルから2000リットルの単位、例えば75リットル、100リットル、125リットル、250リットル、500リットル、1000リットル、1250リットル、1500リットル、1750リットル、1825リットル、1900リットル又は2000リットルの単位で提供される。
実施例では、生体高分子含有溶液は、以下の「治療製品及び例示的な産物、例えば二重特異性分子」という名称の表からの生体高分子を含む。
実施例では、生体高分子は、チャイニーズハムスター卵巣(CHO:Chinese hamster ovary)細胞でできている。一実施例では、細胞は、CHO-K1細胞、CHO-K1 SV細胞、DG44 CHO細胞、DUXB11 CHO細胞、CHOS、CHO GSノックアウト細胞、CHO FUT8 GSノックアウト細胞、CHOZN又はCHO誘導細胞である。CHO GSノックアウト細胞(例えばGSKO細胞)は、例えばCHO-K1SV GSである。
実施例では、処理溶液は、1つ又は複数のバイオプロセス容器の中に提供される。
実施例では、処理溶液は、1つ又は複数のバイオプロセス容器の中に提供され、且つ、単一の希釈のために使用される。
実施例では、方法は、パラメータのための値を提供するステップと、任意選択でその値を基準に対して比較するステップとを含む。
実施例では、評価は第1のサイトで実施され、また、バイオリアクタは第2のサイトに配置される。
実施例では、評価はバイオリアクタのサイトで実施される。
実施例では、方法は、生体高分子含有溶液との結合に先立って濃縮処理溶液を希釈するステップを含む。
実施例では、処理溶液は、第1のサイトで出荷又は製造され、また、バイオリアクタは第2のサイトに配置される。
実施例では、処理溶液は、緩衝剤、例えばトリス、トリシン、HEPES、MOPS、PIPES、TAPS、ビシン、BES、TES、カコジラート、MES、アセテート、MKP、ADA、ACES、グリシンアミド及びアセトアミドグリシン又は酢酸或いは類似を含む。
実施例では、バイオプロセス容器は、産物接触のための内部層及び外部層を備える。
実施例では、内部層はポリエチレンである。
実施例では、外部層は、ポリエチレン、EVOH、ナイロン及び/又はPVDCのブレンドである。
いくつかの実施例では、方法は、処理溶液のバイオバーデンを決定するステップを含む。
実施例では、方法は、処理溶液サプライからの濃縮バイオ処理溶液(濃縮処理溶液)及び水/緩衝剤サプライからの水又は緩衝剤をインラインバイオ処理溶液希釈システムの入口に加え、それにより希釈されたバイオ処理溶液を得るステップを含む。
実施例では、方法は、バイオ処理溶液をバイオプロセス容器の出口を介して供給し、それにより生体高分子の精製を容易にするステップを含む。
また、本発明によれば、バイオ処理溶液を送達するためのシステムが同じく提供される。システムは、第1のサイトで製造された濃縮処理溶液を提供することと、濃縮生体高分子含有溶液と、第2のサイトのバイオリアクタ内で製造された生体高分子含有溶液とを結合することとを含む。
実施例では、濃縮バイオ処理溶液は、濃縮バイオ処理溶液が必要であることが決定され、且つ、その決定が第2のサイトから第1のサイトへ通信されることに基づいて提供される。
本発明の利点は、とりわけ、下流側処理溶液の製造をバイオリアクタ内の生物学の生産から切り離す能力である。これは、バイオプロセス容器(「BPC:bioprocess containers」aka緩衝剤バッグ又はトート)に貯蔵された緩衝剤濃縮物の使用と相俟って、生物学製造とは離れた場所でのプロセス中間物の製造の準備を許容する。これは生産コストを低減する。延長された安定時間は、GMPペーパワークの精査及びリリースを許容する。したがってGMPエラー又は品質試験の失敗の影響を受けた製造過程の中間物を拒絶することができ、したがって生物学製造に対する危険を取り除くことができる。
バイオリアクタ準備エリアの従来技術による配置を示す略図である。 本開示による緩衝剤準備配置の一実施例を示す略図である。 本開示による方法の一実施例を示すブロック図である。 バイオプロセス容器の外部層の一実施例を示す斜視図である。 その側面図である。 その背面図である。 その側面図である。 その正面図である。 その上面図である。 バイオプロセス容器の外部層の別の実施例を示す側面図である。 プラットホームの一実施例を示す正面図である。 その側面図である。 薬剤製造施設における緩衝剤貯蔵エリアの一実施例を示す側面図である。 その正面図である。 その上面図である。
本発明は、バイオリアクタを含む大規模発現ベッセルの生物学的産物を濃縮し、精製するための費用有効性の高い処理溶液を提供する。
生物学的生産は、典型的には2つの主生産ステージを含む。第1のステージは生物学的産物製造ステージであり、生物学的産物、典型的にはポリペプチド又はタンパク質などの生体高分子が製造される。生体高分子は、典型的には、微生物発酵作用、生体内変化又は哺乳動物細胞培養を使用して合成される。バイオリアクタ発現システムは、例えば米国特許出願公開第2011-0312087 A1号明細書に記載されている。
第2のステップは、生物学的産物を精製するステップを含み、製品が不純物、例えば細胞残骸、不要な生体高分子、DNA培地成分及び異化代謝産物から分離される。第2のステップには、可能な範囲まで生物学的産物の望ましい活性を維持する大量の生物学的適合性溶液が必要である場合があり、生物学的産物と生物学的適合性がない場合、不純物を選択的に除去するために多くの下流側処理ステージ(ユニット操作)が実行される。これらのユニット操作の間、サイズ排除濾過、クロマトグラフィー、pH不活性化、再折り畳み、接線流濾過、等々を含む多くの技術が使用される。これらのユニット操作を容易にするために、標的分子の物理化学的環境(例えばpH、導電率)を変える多くの異なる水溶液(緩衝剤)が使用される。
図1は、バイオリアクタ準備エリア10の従来技術による配置を示したものである。緩衝剤準備ベッセル12を有する緩衝剤準備エリアは、緩衝剤保持タンク14及び携帯型トート16を有する緩衝剤貯蔵エリアの物理的に近傍に位置している。また、緩衝剤準備エリアの緩衝剤準備ベッセル12も、クロマトグラフィーコラム18などの下流側処理ユニットを有する下流側処理エリアの物理的に近傍に位置している。パイプ20は、緩衝剤準備ベッセル12を緩衝剤保持タンク14及び携帯型トート16に接続している。別のパイプ22は、緩衝剤保持タンク14を下流側処理エリア内の下流側処理ユニット18に接続している。更に別のパイプ24は、携帯型トート16を下流側処理エリア内の下流側処理ユニット18に接続している。この配置は、高価で、且つ、時間を消費する配置であり、長いリード試験及び/又はGMP記録(バッチ記録)の精査及びリリースが完了する前に、製造過程材料が使用されることになる。緩衝剤の備蓄は、大量のGMP処理空間を占有する。
一方、図2は、本開示による、処理溶液を送達するためのシステム100の一実施例を示したものである。図に示されているように、システム100は、第2のサイト108における下流側処理エリア106とは全く異なる緩衝剤準備エリア102を第1のサイト104に含む。いくつかの実施例では、第1のサイト104はキャンパス又は建物であり、また、第2のサイト108は、第1のサイト104のキャンパス又は建物とは全く異なるキャンパス又は建物である。緩衝剤準備エリア102及び下流側処理エリア106は、1つのより大きいエリア、例えば工場又は製造サイト内であってもよく、溶液の安定性又は活性に悪影響を及ぼすことなく濃縮溶液を下流側処理エリアに送達することができる限り、近接している必要はない。溶液のスケジューリング、調合及び引渡しを実施して、それらの意図された使用時に、又はその直前に溶液を準備することができる。更に、本開示による配置によれば、バイオリアクタを含む高い値の位置で準備することが好ましいと思われる下流側処理溶液を低い値の位置で実施することができる。また、この配置は、バイオリアクタのサイトにおける貯蔵空間を小さくする。
図2では、緩衝剤準備エリア102は、少なくとも2つの緩衝剤準備ベッセルを含み、それぞれ110で示されている。緩衝剤準備ベッセル110は、少なくとも1つのパイプ(又は少なくとも1つのマニホルド)112によって、緩衝剤貯蔵エリア116内のそれぞれ114で示されているいくつかの貯蔵タンク(又はトート)に接続されている。また、緩衝剤貯蔵エリア116は、既に充填済みで、且つ、マニホルドから切り離された少なくとも1つのトート114を同じく含み、したがって第2のサイト108への輸送の準備が整っている。
緩衝剤準備ベッセル110は処理溶液を製造するのに有用である。いくつかの実施例では、処理溶液は、トリス、トリシン、HEPES、MOPS、PIPES、TAPS、ビシン、BES、TES、カコジラート、MES、アセテート、MKP、ADA、ACES、グリシンアミド及びアセトアミドグリシン又は酢酸、或いは表6~9に示されている緩衝剤などの緩衝剤である。
個々のトート114は、濃縮処理溶液を接触させるための内部層即ちライナー118、及び内部層を支持する外部層即ちボディ120を含む。いくつかの実施例では、内部層118はポリエチレンでできている。いくつかの実施例では、外部層120は、ポリエチレン、エチレンビニルアルコール(EVOH)、ナイロン及びポリ塩化ビニリデン(PVDC)のブレンドである。いくつかの実施例では、個々のトート114はプラスチックでできている。いくつかの実施例では、個々のトート114は、ガンマ放射によって殺菌することができる。
いくつかの実施例では、個々のトート114は、トート内に含まれている処理溶液の一カ月間の保存可能期間を保証するように構成される。いくつかの実施例では、個々のトート114は、トート内に含まれている処理溶液の三カ月間の保存可能期間を保証するように構成される。いくつかの実施例では、個々のトート114は、トート内に含まれている処理溶液の六カ月間の保存可能期間を保証するように構成される。いくつかの実施例では、個々のトート114は、トート内に含まれている処理溶液の一年間の保存可能期間を保証するように構成される。
いくつかの実施例では、個々のトート114は、1,000リットル(L)の体積を有する。いくつかの実施例では、個々のトート114は、画定された形状をトート114の側壁に外部支持を必要とすることなく保持することができる剛直な外部層120を有する。
緩衝剤貯蔵エリア116では、ユーザは、パレットなどの出荷構造の上に1つ又は複数のトート114を置く。一実施例では、パレット上に支持されたパッケージ済みトートは、122cm(4フィート)×122cm(4フィート)×122cm(4フィート)の立方体の出荷ユニット122を形成する。ユーザは、1つ又は複数の出荷ユニット122をトラックなどの車両124に積み込む。ユーザは、第1の施設(第1のサイト)104の緩衝剤貯蔵エリア116から、矢印Aに沿って、下流側処理エリア106を収容している第2の施設(第2のサイト)108まで車両124を運転する。
第2の施設108では、ユーザは、車両124から矢印Bに沿って出荷ユニット122を下ろす。次に、ユーザは、第2のサイト108内の第2の緩衝剤貯蔵エリア126にトート114を置く。
第2の施設108は、下流側処理エリア130内に配置された少なくとも1つのバイオリアクタ128を含む。いくつかの実施例では、下流側処理エリア130はクリーンルームである。図に示されている実施例では、それぞれ132で示されている2つのパイプは、第2の緩衝剤貯蔵エリア126内に配置されたトート(バイオプロセス容器)114を下流側処理エリア130内に配置されたバイオリアクタ128に接続している。図に示されているように、個々のパイプ132は、第2の緩衝剤貯蔵エリア126を下流側処理エリア130から分離している下流側処理エリア130の壁136の中、又は壁136に隣接して位置決めされたバルブ134を含む。壁136の中、又は壁136に隣接するパイプ132及びバルブ134により、濃縮処理溶液をバイオプロセス容器114からバイオリアクタ128へ流すことができ、それにより濃縮処理溶液と、バイオリアクタ128内で製造された生体高分子含有溶液とを結合することができる。
上で言及したように、壁136は、クリーンルームとして形成される下流側処理エリア130を、必ずしもクリーンルームである必要はない第2の貯蔵エリア126から分離している。バルブ134は、バルブへの1つ又は複数のトート114のクリーンルーム迎合接続を許容し、バイオリアクタ128を汚染する危険を最小化する。
いくつかの実施例では、個々のバルブ134は、第2のサイト108の天井から垂れ下がっている。
下流側処理エリア106に処理溶液が必要である場合、パイプ132を介して下流側処理エリア106内の下流側処理ユニット128へ処理溶液がポンプ供給されるか、さもなければトート114から移動される。
いくつかの実施例では、第2のサイト108は、1つ又は複数のトート114への接続が可能な複数のバイオリアクタ128(又は他の下流側処理ユニット)を含む。いくつかの実施例では、1つのトート114のみが使用される。
いくつかの実施例では、第2のサイト108は、1つ又は複数のバイオリアクタ128に現在接続されている少なくとも1つのトート114、並びに1つ又は複数のバイオリアクタ128に未だ接続されていない少なくとも1つのトート114を含む。これは、第2のサイト104のユーザがトート114内に含まれている処理溶液のバックアップサプライを有することを保証する。
バイオリアクタ128はコントローラ140に接続されている。いくつかの実施例では、コントローラ140は、第2のサイト108の1つ又は複数のバイオリアクタ128が1つ又は複数のトート114内に含まれている処理溶液を必要としていることを決定するように構成される。コントローラ140は、次に、この決定を第1のサイト104内のコントローラ142に通信する。この決定のこの通信により、第2のサイト108における処理溶液の不足が防止される。
いくつかの実施例では、コントローラ140は、処理溶液のバイオバーデンを決定するように構成される。例えばバイオバーデンは、高速検出アッセイで決定することができる。いくつかの実施例では、バイオバーデンは、Raman分光写真術高速検出アッセイで決定される。
システム100は、生体高分子含有溶液との結合に先立って濃縮処理溶液を希釈するように構成される。これは、システム100による、バイオリアクタ128に提供される溶液のpHなどのパラメータの調整を許容する。システム100は、トート114の形態の処理溶液サプライを含む。また、システム100は希釈液サプライ144を同じく含む。いくつかの実施例では、希釈液は水及び/又は緩衝剤であってもよい。トート114からの濃縮処理溶液及び希釈液サプライ144からの水又は緩衝剤は、パイプ132に沿ったインライン処理溶液希釈システム146の入口に加えられ、それにより、バイオリアクタ128の入口に提供される希釈された処理溶液が得られる。
図2には1つのバイオリアクタ128しか示されていない。本開示の範囲を逸脱することなく、もっと多くのバイオリアクタを第2のサイト108に含むことも可能である。いくつかの実施例では、第2のサイト108内のバイオリアクタ128は精製のために有用である。いくつかの実施例では、第2のサイト108内のバイオリアクタ128は、少なくとも1つのクロマトグラフィーコラムを含む。
次に図3を参照すると、本開示は、処理溶液を送達するための方法300を提供する。図3では、処理溶液を送達するための方法300の例示的な一実施例は、302で、第1のサイトで濃縮処理溶液を製造するステップを含む。いくつかの実施例では、処理溶液は緩衝剤である。
いくつかの実施例では、緩衝剤は、トリス、トリシン、HEPES、MOPS、PIPES、TAPS、ビシン、BES、TES、カコジラート、MES、アセテート、MKP、ADA、ACES、グリシンアミド及びアセトアミドグリシン又は酢酸、或いは表6~9に示されている緩衝剤である。
いくつかの実施例では、304で方法300は、処理溶液のバイオバーデンを決定する。ステップ304は、図2のコントローラ140などのコントローラによってその全体又は一部を実施することができる。ステップ304で方法300は、処理溶液が品質規格に合致していることを決定する。これは、ユーザによる、バイオリアクタ(又は他の下流側処理ユニット)からの製品が汚染される危険の低減を許容する。任意のバイオバーデン試験方法を実現することができる。いくつかの実施例では、バイオバーデンは、高速検出アッセイで決定することができる。いくつかの実施例では、バイオバーデンは、Raman分光写真術高速検出アッセイで決定される。いくつかの実施例では、バイオバーデン試験は、処理溶液製造サイト又は処理溶液が使用される第2のサイトのいずれかで実施されるインライン試験又はアットライン試験であってもよい。
306で方法300は、濃縮処理溶液が第2のサイトで必要であることを決定する。308で方法は、この決定を第2のサイトから第1のサイトへ通信する。ステップ306におけるこの決定は、第2のサイトのバイオリアクタに接続されている、図2に示されているコントローラ140などのコントローラによって実施することができる。次に、この決定に基づいて濃縮処理溶液が第2のサイト108に提供される。
310で方法300は、第1のサイトで製造された濃縮処理溶液をバイオプロセス容器の中に提供する。いくつかの実施例では、ステップ310は、処理溶液を含む1つ又は複数のバイオプロセス容器を第1のサイトから第2のサイトへ輸送するステップを含む。
いくつかの実施例では、バイオプロセス容器は、プロセス溶液を接触させるための内部層及び外部層を含む。いくつかの実施例では、内部層はポリエチレンである。いくつかの実施例では、外部層は、ポリエチレン、EVOH、ナイロン及びPVDCのブレンドである。
312で方法300は、生体高分子含有溶液との結合に先立って濃縮処理溶液を希釈するステップを含む。例えばいくつかの実施例では、方法300のステップ312は、処理溶液サプライからの濃縮処理溶液及び水/緩衝剤サプライからの水又は緩衝剤をインライン処理溶液希釈システムの入口に加え、それにより希釈された処理溶液を得るステップを含む。
314で方法300は、濃縮処理溶液と、第1のサイトとは異なる第2のサイトのバイオリアクタ内で製造された生体高分子含有溶液とを結合する。
本開示の構成、システム及び方法は、拡張された安定データを提供し、且つ、プロセス中間物の長期間にわたる貯蔵を許容する。これは、オペレータによる、生物学的産物を処理するために使用される中間物の製造からの生物学的産物の製造の切り離しを許容する。本開示の他の利点は、本開示によれば、生物学製造のサイトから離れたサイトで濃縮緩衝剤溶液を製造することができることである。低い値の製造施設で濃縮緩衝剤を製造することができ、したがってバイオリアクタによって占有される高い値の製造施設における空間を解放する。生産コストの低減に加えて、延長された安定時間は、GMPペーパワークの精査及びリリースを許容する。GMPエラー又は品質試験の失敗、等々の影響を受けたプロセス中間物を拒絶することができ、したがって生物学製造に対する危険を取り除くことができる。
遠隔準備エリアからBPC中に供給される濃縮緩衝剤、インライン希釈及び緩衝剤溶液のための長期満了時間が相俟った使用により、危険を負った緩衝剤サプライ戦略がより安価になり、且つ、危険がより少なくなる。
本開示のシステム及び方法は、様々なバイオプロセス容器を使用することができる。図4A~4Fは、バイオプロセス容器の一実施例の400で一括して示されている外部層を示したものである。外部層400は、内部層内に緩衝剤を含むためのバッグなどの内部層を支持するために使用することができる。バイオプロセス容器の外部層400の下部端は、フォークリフトによって持ち上げることができる部分を含む。図4Aは、バイオプロセス容器の斜視図を示したものである。
図4Bでは、バイオプロセス容器は1264ミリメートルの全体高さCを有している。図4Cは、バイオプロセス容器の外部層400に蓋が固着されると1287ミリメートルの高さDを有するバイオプロセス容器の別の面を示したものである。
バイオプロセス容器の下部端はフォークリフトによる係合が可能であり、凹所408、410を画定するベース部分402、404、406を含む。凹所408、410の各々は135ミリメートルの高さEを有している。第1の凹所408は310ミリメートルの幅Fを有している。第2の凹所410は310ミリメートルの幅Hを有している。第1のベース部分402は160ミリメートルの幅Gを有している。第2のベース部分404は180ミリメートルの幅Iを有している。
図4Fでは、バイオプロセス容器の外部層400の上面図は、1140ミリメートルの長さJ及び1140ミリメートルの幅Kを有している。バイオプロセス容器の外部層400の内部体積は、内部長さL及び内部幅Mによって画定される。内部長さLは1056ミリメートルであり、また、内部幅Mは1038ミリメートルである。
ポート412は、プロセス溶液をバイオプロセス容器から分配するためにバイオプロセス容器の外部層400の中に画定されている。ポート412は97ミリメートルの直径Rを有している。ポート412は、バイオプロセス容器の外部層400の第1の内部表面414から、171ミリメートルである寸法Qだけオフセットしている。ポート412は、バイオプロセス容器の外部層400の第2の内部表面416から、181ミリメートルである寸法Sだけオフセットしている。ポート412は、第1の外部表面418から、222ミリメートルである寸法Pだけオフセットしている。ポート412は、第2の外部表面420から、222ミリメートルである寸法Oだけオフセットしている。
いくつかの実施例では、バイオプロセス容器の内部層(バッグ)は、外部層400のポート412を貫通してねじ止めされる出口配管を含む。
図5は、バイオプロセス容器の500で一括して示されている外部層の別の実施例を示したものである。図5では、バイオ処理ユニットの外部層500は、593ミリメートルの高さU及び1140ミリメートルの幅Vを有している。バイオ処理ユニットの外部層500及び外部層500に固着される蓋の高さTは617ミリメートルである。
いくつかの実施例では、バイオプロセス容器は追跡システムを含む。例えばいくつかの実施例では、バイオプロセス容器は、出荷受取りの間、バイオプロセス容器の追跡及び管理を容易にするためにバイオプロセス容器の外部層400に貼り付けられたRFIDタグ422(図4A)を含む。複数のバイオプロセス容器の上にそれぞれのRFIDタグ422を含むことにより、ユーザは、バイオプロセス容器の在庫管理をより容易に管理することができ、また、バイオプロセス容器に含まれている処理溶液の品質をより容易に監視することができる。
図6Aは、バイオプロセス容器602を支持して緩衝剤貯蔵エリア604を編成するための、600で一括して示されているプラットホームの一実施例の正面図を示したものである。プラットホーム600は、少なくとも1つのバイオプロセス容器602を支持するように構成されている。このプラットホーム600を使用して、図2の緩衝剤貯蔵エリア126などの緩衝剤貯蔵エリアの他の実施例におけるバイオプロセス容器を支持することができる。
プラットホーム600は、少なくとも1つのバイオプロセス容器602を支持するように構成された第1のレベル606、及び少なくとも1つのバイオプロセス容器602を支持するように構成された第2のレベル608を有している。プラットホーム600は、ユーザによる、フォークリフトを使用したプラットホーム600上へのバイオプロセス容器602の据付けを許容するように構成されている。また、プラットホーム600は、ユーザによる、フォークリフトを使用したプラットホーム600からのそれぞれのバイオプロセス容器602の除去を許容するように構成されている。
第1のレベル606は、61cm(2フィート)である高さAAだけ地面からオフセットしている。プラットホームは、それぞれ610で示されている、5.1cm(2インチ)の高さABを有する脚によって支持されている。それぞれ612で示されている支柱は、脚610から上に向かって伸びており、また、第1のレベル606及び第2のレベル608を支持している。
図6Aでは、バイオプロセス容器602の下部部分は、2つの凹所620、622を画定している3つのベース部分614、616、618を含む。凹所620、622は、プラットホーム600の正面からそれぞれのバイオプロセス容器602にアクセスすることにより、ユーザによる、個々のバイオプロセス容器602を持ち上げるためのフォークリフトの操作を許容する。
凹所620、622は、13.5cm(5・5/16インチ)の高さACを有している。第1のベース部分614は、18.1cm(7・1/8インチ)の幅ADを有している。第2のベース部分616は、49.1cm(1フィート7・5/16インチ)の距離AEだけバイオプロセス容器602の側面からオフセットしている。第2のベース部分616は、15.9cm(6・1/4インチ)の幅AFを有している。第3のベース部分618は、95.9cm(3フィート1・3/4インチ)の距離AGだけバイオプロセス容器602の側面からオフセットしている。第3のベース部分618は、18.1cm(7・1/8インチ)の幅AHを有している。
個々のバイオプロセス容器602は、129.5cm(4フィート3インチ)の高さAI及び114cm(3フィート8・7/8インチ)の幅AJを有している。プラットホーム600の第2のレベル608上のバイオプロセス容器602と緩衝剤貯蔵エリア604の天井との間のクリアランスAKは16.5cm(6.5インチ)である。プラットホーム600の第2のレベル608上のバイオプロセス容器602の上部縁626の全体の高さALは、地面628から348cm(11フィート5インチ)である。天井624の高さAMは、地面628から364.5cm(11フィート11.5インチ)である。
第1のレベル606上のバイオプロセス容器602は、支柱612と支柱612の間に位置決めされており、したがってバイオプロセス容器602と、これらの支柱612のうちの少なくとも1つとの間には7.6cm(3インチ)のクリアランスANが存在している。第2のレベル608の下部表面630と、第1のレベル606上に位置決めされているバイオプロセス容器602の上部表面632の間には、16.2cm(6・3/8インチ)のクリアランスAOが存在している。
図6Bは、図6Aのプラットホーム600の側面図を示したものである。図6Bは、バイオプロセス容器が114cm(3フィート8・7/8インチ)の奥行きAPを有していることを示している。
本開示の一態様は、濃縮処理溶液を含むように構成された少なくとも1つのバイオプロセス容器を受け取ることができる緩衝剤貯蔵エリアと、少なくとも1つの処理ユニットを受け取ることができる処理エリアと、緩衝剤貯蔵エリアを処理エリアから分離する壁とを有する薬剤製造施設に関している。施設は、緩衝剤貯蔵エリア内に第1の端部を有し、また、処理エリア内に第2の端部を有する少なくとも1つのパイプを同じく含む。第1の端部は、少なくとも1つのバイオプロセス容器に接続するように構成され、また、第2の端部は、少なくとも1つの処理ユニットに接続するように構成される。いくつかの実施例では、処理エリアはクリーンルーム環境として構成される。
図7Aは、薬剤製造施設に含めることができる、一括して700で示されている緩衝剤貯蔵エリアを示したものである。緩衝剤貯蔵エリア700は、複数のバイオプロセス容器704を支持するためのプラットホーム702を含む。
個々のバイオプロセス容器704は、処理溶液を接触させるための内部層、及び内部層を支持するように構成された外部層を含む。個々のバイオプロセス容器704は、本明細書において示され、且つ、説明されている実施例のうちの任意の実施例のバイオプロセス容器であってもよい。
図7Aは、プラットホームに隣接するユーザ歩道708からユーザ706がバイオプロセス容器704にアクセスすることができる様子を示している。
薬剤施設は、緩衝剤貯蔵エリア700内に第1の端部を有し、また、本明細書における様々な実施例に関連して説明されている処理エリアなどの処理エリア内に第2の端部を有する少なくとも1つのパイプを含む。個々のパイプの第1の端部は、少なくとも1つのバイオプロセス容器704に接続するように構成され、また、第2の端部は、処理エリア内の少なくとも1つの処理ユニットに接続するように構成される。図2に関連して説明したように、個々のパイプはバルブを含むことができる。
図7Bは、緩衝剤貯蔵エリア700が、プラットホーム702の長さに沿って間隔を隔てた、それぞれ710で示されている複数の入口を含むことを示している。個々の入口710はパイプに接続されている。個々の入口710は、バイオプロセス容器の出口に接続されるように構成されている。入口710及びパイプは、バイオプロセス容器704のうちの1つ又は複数から処理エリア内の処理ユニットへの緩衝剤の流れを許容する。
もう一度補足的に図7Aを参照すると、プラットホーム702は、緩衝剤貯蔵エリア700の床716と天井718の間のプラットホーム702の第1のレベル712上、及びプラットホームの第2のレベル714上でバイオプロセス容器704を支持している。プラットホーム702は、ユーザ706による、緩衝剤貯蔵エリア700の空間を有効に使用する方法、及びユーザによる、フォークリフトを使用したプラットホーム702上へのバイオプロセス容器704の据付け、及びプラットホーム702からのバイオプロセス容器704の除去を許容する方法でのバイオプロセス容器704の編成を許容する。
バイオプロセス容器704が、個々のバイオプロセス容器704に貼り付けられたバーコード又はRFIDタグなどの追跡システムを含む実施例では、ユーザ歩道708は、ユーザによる、バイオプロセス容器704の在庫管理を実施するため、或いはバイオプロセス容器704の経年などの情報収集のためのバイオ処理ユニットへの容易なアクセスを許容する。
また、ユーザ歩道708は、ユーザ706による、入口710へのバイオプロセス容器704のうちの1つのポートの接続を同じく許容し、したがってそのバイオプロセス容器704からのプロセス溶液は、バイオプロセス容器704から入口710及びパイプを通って処理エリア内の1つ又は複数の処理ユニットへ流れることができる。
図7Cの上面図は、歩道708が91.4cm(3フィート)の幅BAを有していることを示している。
歩道708は、2つの階段720、722に接続されている。歩道708及び第1の階段720は、それぞれ91.4cm(3フィート)の幅BAを有している。第2の階段722は、76.2cm(2.5フィート)の幅BBを有している。歩道708は、後方の壁724から15.2cm(6インチ)の距離BC1、及び個々のプラットホーム702から15.2cm(6インチ)の距離BC2で位置決めされている。歩道708は、側壁726から53.3cm(1フィート9インチ)の距離BDで位置決めされている。
プラットホーム702は、それぞれ728で示されている脚を含む。側壁726に最も近い脚728は、側壁726から64.1cm(2フィート1.25インチ)の距離BEにその中心を有している。
入口710は間隔を隔てており、第1の入口710は、側壁726から327.7cm(10.75フィート)の距離BFであり、第2の入口710は、第1の入口710から320cm(10.5フィート)の距離BGであり、第3の入口は、第2の入口710から287cm(9フィート5インチ)の距離BHであり、第4の入口710は、第3の入口710から304.8cm(10フィート)の距離BIであり、また、第5の入口710は、第4の入口710から309.9cm(10フィート2インチ)の距離BJである。
2つのプラットホーム702は緩衝剤貯蔵エリア700内に含まれている。個々のプラットホーム702は、幅7.6cm(3インチ)及び高さ5.1cm(2インチ)の断面を有するフレーム部材730を含む。プラットホーム702は、184.5cm(6フィート5/8インチ)の距離BKだけ間隔を隔てている。
建屋支持支柱732、734、736は、床716と天井718の間を延在している。第1の支持支柱732と第2の支持支柱734の間の距離BLは、829.3cm(27フィート2.5インチ)である。第2の支持支柱734と第3の支持支柱736の間の距離BMは、829.3cm(27フィート2.5インチ)である。第2の支持支柱734の幅BNは、116.8cm(3フィート10インチ)である。第2の支持支柱の面738は、プラットホーム702の前縁から200.7cm(6フィート7インチ)の距離BOである。
図4A~7Cに関連して考察されている寸法は例示的なものであり、特定の施設に適合させるために変更することができる。
定義
別途規定しない限り、本明細書で使用される全ての技術用語及び科学用語は、本開示が属する技術分野の当業者によって一般に理解されるのと同じ意味を有する。本明細書に記載される方法及び材料と類似又は均等な任意の方法及び材料が、本開示の実施又は試験において使用され得るが、好ましい材料及び方法は、本明細書に記載される。本開示の記載及び請求項において、以下の用語は、ある規定が提供される場合、どのように用語が規定されるかに応じて使用される。
本明細書に使用される用語は特定の実施態様を記載する目的のためだけに使用され、限定されることを意図するものではないことも理解される。
文字「1つ(a)」及び「1つ(an)」は、文字の1つ又は1つを超える(即ち、少なくとも1つ)の文法上の対象を指すため、本明細書に使用される。例示として、「1つの細胞」は、1つの細胞又は1つを超える細胞を意味し得る。
本明細書で使用するように、「処理溶液」は、上流側処理及び下流側処理に使用される溶液を含む、生物学生産プロセスに使用される緩衝剤又は培地を意味している。
本明細書で使用するように、下流側処理薬品(DPA:downstream processing agent)は、バイオリアクタの産物又は関連する成分、例えば標的分子に対して実施される下流側処理操作のためにバイオリアクタ内で培養された細胞に対して作用する1つ又は複数の合成分を含有する生物学的適合性溶液である。適切なDPAの実例は、例えばHBSS、PBS、トリス、酢酸又は類似などの緩衝食塩水溶液を含む。したがって本明細書において使用されているDPAは、細胞の増殖及び分裂を実際にサポートする培地とは全く異なっている。本開示のDPAは、細胞増殖及び/又は分裂をサポートすることなく生理学的に等価な物理化学的環境を提供する。
DPAは、生物学生産のための下流側処理に広く使用されており、これまでのところ、製造バッチに一時的に緊密に結合されるGMP方式で製造されている。時間及びコストの追加に加えて、これは、長いリード試験及び/又はGMP記録(バッチ記録)の精査及びリリースが完了する前に、製造過程材料が使用されることになり、製造過程材料は、そういうものとして「危険を代償にして」使用されている。リリースされていない材料の使用は、製品品質を危うくし得るプロセス中間物を使用した後にGMPエラーが明らかになり得る可能性を危うくし、これらは、計器較正エラー、等々を含み得る。この方法が使用されているのは、緩衝剤は、日々の日付による割り当てられた使用を有し得ること、また、緩衝剤の備蓄は大量のGMP処理空間を占有することによるものである。
本明細書で使用するように、「バイオバーデン」という用語は、組成物(例えば固体又は液体)の中及び/又は物品の表面(例えば外部表面及び/又は内部表面)に存在する生物学的汚染物質の自己複製の水準を意味している。例えばバイオバーデンは、クロマットを含有している組成物中に存在する生物学的汚染物質の自己複製を意味することができ、「バイオバーデン」という用語は当分野で知られており、また、組成物(例えば固体又は液体)の中及び/又は物品の表面(例えば外部表面及び/又は内部表面)に存在する生物学的汚染物質の自己複製の水準を意味している。他の実例では、バイオバーデンは、クロマトグラフィーコラムの内部表面及び/又はクロマトグラフィーコラム内のクロマトグラフィー樹脂内の生物学的汚染物質(例えばクロマトグラフィーコラムの内部表面の生物学的汚染物質、及びクロマトグラフィーコラム内のパックされたクロマトグラフィー樹脂中の生物学的汚染物質)の自己複製を意味することができる。また、バイオバーデンは、液体(例えば本明細書において説明されている任意の方法又はプロセスに使用される緩衝剤)内に存在する生物学的汚染物質の自己複製を意味することも可能である。生物学的汚染物質の自己複製の非制限の実例は、細菌(例えばグラム陽性又はグラム陰性細菌、或いは細菌胞子)、マイコバクテリア、ウイルス(例えばベシウイルス、カシェ渓谷ウイルス、パルボウイルス、ヘルペスウイルス及びブンヤウイルス)、寄生虫、菌類、酵母菌及び原生動物門であってもよい。
本明細書で使用するように、用語「内因性」は、生物、細胞、組織若しくは系からの又は内部で天然で産生される任意の物質を指す。
本明細書で使用するように、用語「外来性」は、生物、細胞、組織若しくは系に導入される又は外部で産生される任意の物質を指す。したがって「外来性核酸」は、生物、細胞、組織若しくは系に導入される又は外部で産生される核酸を指す。一実施例では、外来性核酸の配列は、外来性核酸が導入される、生物、細胞、組織若しくは系の内部で、天然で産生されない、又は天然で見出すことができない。一実施例では、外来性核酸の配列は、非天然で生じる配列である、又は非天然で生じる産物をコードする。
本明細書で使用するように、用語「異種性」は、異なる種からの生物、細胞、組織若しくは系に導入される場合、1つの種からの任意の物質を指す。
本明細書で使用するように、用語「核酸」、「ポリヌクレオチド」又は「核酸分子」は、交換可能に使用され、デオキシリボ核酸(DNA)若しくはリボ核酸(RNA)、又はDNA若しくはそのRNA、及びそのポリマーの単一若しくは二本鎖形態のいずれかの組合せを指す。用語「核酸」には、遺伝子、cDNA、又はmRNAが含まれるが、限定されない。一実施例では、核酸分子は、合成(例えば、化学的な合成又は人工)又は組換えである。特に限定されない限り、用語は、参照核酸として類似の結合特性を有する及び天然で又は非天然で生じるヌクレオチドと類似する様式で代謝される、天然ヌクレオチドの類似体又は誘導体を含有する分子を包含する。別途示されない限り、特定の核酸配列はまた、保存的に修飾されたそのバリアント(例えば、縮重コドン置換)、対立遺伝子、オルソログ、SNP、及び相補的な配列並びに明示的に示される配列を暗示的に包含する。特に、縮重コドン置換は、第三の位置の1つ又は複数の選択された(又は全ての)コドンが、混合された塩基及び/又はデオキシイノシン残基で置換された、配列を生成させることによって達成され得る(Batzerら、Nucleic Acid Res. 19:5081 (1991);Ohtsukaら、J. Biol. Chem. 260:2605~2608ページ(1985);及びRossoliniら、Mol. Cell. Probes 8:91~98ページ(1994))。
本明細書で使用するように、用語「ペプチド」、「ポリペプチド」及び「タンパク質」は、ペプチド結合によって又はペプチド結合以外の手段によって共有結合的に連結されるアミノ酸残基を含む化合物を指すように使用される。タンパク質又はペプチドは、少なくとも2つのアミノ酸を含有しなければならない、タンパク質の又はペプチドの配列に含まれ得るアミノの最大数に限界は設定されない。一実施例では、タンパク質は、1つを超える、例えば、2つ、3つ、4つ、5つ、又はそれを超える、ポリペプチドを含み得、各ポリペプチドは、共有結合性の又は非共有結合性の結合/相互作用のいずれかによって他と関連する。ポリペプチドには、ペプチド結合によって又はペプチド結合以外の手段によって互いに結合される2つ又はそれを超えるアミノ酸を含む任意のペプチド又はタンパク質が含まれる。本明細書で使用するように、用語は、短鎖(これは、ペプチド、オリゴペプチド及びオリゴマーなどとも当技術分野において一般に呼ばれる)及び長鎖(これは、多くのタイプが存在するタンパク質と当技術分野において一般に呼ばれる)の両方を指す。「ポリペプチド」には、例えば、生物学的に活性な断片、実質的に相同的なポリペプチド、オリゴペプチド、ホモ二量体、ヘテロ二量体、ポリペプチドのバリアント、修飾されたポリペプチド、誘導体、類似体、融合タンパク質がとりわけ含まれる。
本明細書で使用するように、「産物」は、産物を産生させるため修飾又は操作されている細胞によって産生される(例えば、発現される)、分子、例えば、タンパク質、核酸、ポリペプチド、又は任意のそのハイブリッドを指す。一実施例では、産物は、天然で生じる産物又は非天然で生じる産物、例えば、合成製品である。一実施例では、産物の一部は、天然で生じるが、産物の別の部分は、非天然で生じる。一実施例では、産物は、ポリペプチド、例えば、組換えポリペプチドである。一実施例では、産物は、診断上の又は前臨床使用のため適切である。別の実施例では、産物は、治療使用のため、例えば、疾患の処置のため適切である。一実施例では、産物は、表1又は表2から選択される。一実施例では、修飾された又は操作された細胞は、発現を制御する又は産物をコードする外来性核酸を含む。他の実施例では、修飾された又は操作された細胞は、例えば、核酸ではなく、細胞における産物の発現又は構築を制御する、他の分子を含む。
一実施例では、細胞の修飾は、内因性核酸配列、例えば、内因性遺伝子の発現を制御する又は変更する、例えば、増加させる、核酸配列を含む外来性核酸の導入を含む。そのような実施例では、修飾された細胞は、細胞によって天然で又は内因性に発現される内因性ポリペプチド産物を産生するが、修飾は、未修飾細胞と比較して、例えば、内因性産物又はポリペプチドの質と比較して、産物の産生及び/又は産物の質を増加させる。
別の実施例では、細胞の修飾は、本明細書に記載されるような、組換えポリペプチドをコードする外来性核酸の導入を含む。そのような実施例では、修飾された細胞は、天然で生じ得る又は非天然で生じ得る組換えポリペプチド産物を産生する。そのような実施例では、修飾された細胞は、細胞によって内因性にも発現され得る又はされ得ない、組換えポリペプチド産物を産生する。組換えポリペプチド産物が細胞によって内因性にも発現される実施例では、修飾は、未修飾細胞と比較して、例えば、内因性産物又はポリペプチドの質と比較して、産物の産生及び/又は産物の質を増加させる。
本明細書で使用するように、「組換えポリペプチド」又は「組換えタンパク質」は、本明細書に記載される細胞によって産生され得るポリペプチドを指す。組換えポリペプチドは、ポリペプチドをコードする配列の少なくとも1つのヌクレオチド又はポリペプチドの発現を制御する配列の少なくとも1つのヌクレオチドが、(細胞の又は前駆細胞の)遺伝的な操作によって形成されたものである。例えば、少なくとも1つのヌクレオチドは、変更され、例えば、それは細胞に導入され又はそれは遺伝的に操作された再構成の産物である。一実施例では、組換えポリペプチドの配列は、ポリペプチド又はタンパク質の天然で生じるアイソフォームと異なっていない。一実施例では、組換えポリペプチドのアミノ酸配列は、ポリペプチド又はタンパク質の天然で生じるアイソフォームの配列と異なる。一実施例では、組換えポリペプチド及び細胞は、同じ種からのものである。一実施例では、組換えポリペプチドは、細胞に対して内因性であり、換言すれば、細胞は、第一の種からのものであり、組換えポリペプチドは、その第一の種に対してネイティブである。一実施例では、組換えポリペプチドのアミノ酸配列は、細胞の内因性ゲノムによってコードされるポリペプチドと同じ又は実質的に同じ、又は1%、2%、3%、4%、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、又は99%以下で異なる。一実施例では、組換えポリペプチド及び細胞は、異なる種からのものであり、例えば、組換えポリペプチドは、ヒトポリペプチドであり、細胞は、非ヒト、例えば、げっ歯類、例えば、CHO、又は昆虫細胞である。一実施例では、組換えポリペプチドは、細胞に対して外来性であり、換言すれば、細胞は、第一の種からのものであり、組換えポリペプチドは、第二の種からのものである。一実施例では、ポリペプチドは、合成ポリペプチドである。一実施例では、ポリペプチドは、非天然で生じる供給源から由来する。一実施例では、組換えポリペプチドは、ヒトポリペプチド又はタンパク質の天然で生じるアイソフォームとアミノ酸配列において異ならない、ヒトポリペプチド又はタンパク質である。一実施例では、組換えポリペプチドは、ヒトポリペプチド又はタンパク質の天然で生じるアイソフォームと、1、2、3、4、5、10、15又は20アミノ酸残基以下で異なる。一実施例では、組換えポリペプチドは、ヒトポリペプチドの天然で生じるアイソフォームと、そのアミノ酸残基の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、又は15%以下まで異なる。
用語として「獲得」又は「獲得すること」が、本明細書に使用され、物理的な実体又は値を「直接的に獲得すること」又は「間接的に獲得すること」とは、物理的な実体、又は値、例えば、数的な値の保持を得ることを指す。「直接的に獲得すること」は、物理的な実体又は値を取得するため、プロセスを実施すること(例えば、合成又は分析方法を実施すること)を意味する。「間接的に獲得すること」は、別のパーティー又は供給源(例えば、物理的な実体又は値を直接的に獲得した第三者の研究室)から物理的な実体又は値を受けいれることを指す。物理的な実体を直接的に獲得することには、身体物質、例えば、出発原料における物理的な変化を含むプロセスを実施することが含まれる。例示的な変化には、物理的な実体を2つ又はそれを超える出発原料から作製すること、物質を剪断すること又は断片化すること、物質を分離すること又は精製すること、2つ又はそれを超える分離した実体を混合物に組み合わせること、共有結合又は非共有結合を破壊すること又は形成することを含む化学反応を実施することが含まれる。値を直接的に獲得することには、サンプル又は別の物質における物理的な変化を含むプロセスを実施すること、例えば、物質、例えば、サンプル、分析物、又は試薬における物理的な変化を含む分析用プロセスを実施すること(時々、本明細書で「物理的な分析」と呼ばれる)、分析方法、例えば、物質、例えば、分析物、又は断片又は他のその誘導体を別の物質から分離するステップ又は精製するステップ;分析物、又は断片又は他のその誘導体を、別の物質、例えば、緩衝剤、溶媒、又は反応物と組み合わせるステップ;又は分析物、又は断片又は他のその誘導体の構造を、例えば、分析物の第一と第二の原子の間で、共有又は非共有結合を破壊又は形成することによって、変化させるステップ;又は試薬、又は断片又は他のその誘導体の構造を、例えば、試薬の第一と第二の原子の間で、共有又は非共有結合を破壊又は形成することによって、変化させるステップの1つ又は複数を含む方法を実施することが含まれる。
用語として「サンプルを獲得すること」が、本明細書に使用され、サンプルを「直接的に獲得すること」又は「間接的に獲得すること」とは、サンプル、例えば、組織サンプル又は核酸サンプルの保持を得ることを指す。「サンプルを直接的に獲得すること」は、サンプルを取得するため、プロセスを実施すること(例えば、物理的な方法、例えば、手術又は抽出を実施すること)を意味する。「サンプルを間接的に獲得すること」は、別のパーティー又は供給源(例えば、サンプルを直接的に獲得した第三者の研究室)からサンプルを受けいれることを指す。サンプルを直接的に獲得することには、身体物質、例えば、出発原料、例えば、組織、例えば、ヒト患者における組織又は患者から以前に単離されていた組織における物理的な変化を含むプロセスを実施することが含まれる。例示的な変化には、物理的な実体を出発原料から作製すること、組織から摘出すること又は擦過すること;物質(例えば、サンプル組織又は核酸サンプル)を分離すること又は精製すること;2つ又はそれを超える実体を混合物に組み合わせること;共有結合又は非共有結合を破壊すること又は形成することを含む化学反応を実施することが含まれる。サンプルを直接的に獲得することには、例えば、上記のような、サンプル又は別の物質における物理的な変化を含むプロセスを実施することが含まれる。
各及び全ての特許、特許出願、及び本明細書に引用された文献の開示は、参照することによってその全体が本明細書に組み込まれる。本発明は特定の態様を参照して開示されているが、本発明の他の態様及びバリエーションが、真の本発明の精神及び範囲を逸脱することなく、他の当業者によって考案され得ることは明らかである。添付の特許請求の範囲は、全てのそのような態様及び均等物バリエーションを含むと解釈されることを意図している。
クロマトグラフィー及び分光学技法
処理溶液は、更に精製し、或いは溶液の純度を評価するために、クロマトグラフ及び/又は分光学的方法と共に使用することができる。ここで説明される方法に使用するのに適した1次元(1D:1-dimensional)クロマトグラフィーの方法は当業者に知られており、例えばアフィニティクロマトグラフィー、ゲル濾過クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、逆位相クロマトグラフィー、疎水性相互作用クロマトグラフィーを含む。いくつかの実施例では、1次元クロマトグラフィー方法はHPLC逆位相クロマトグラフィーである。クロマトグラフィーは、高性能液体クロマトグラフィー(HPLC:high performance liquid chromatography)、ガスクロマトグラフィー(GC:gas chromatography)、キャピラリー電気泳動、イオン移動度を含むことができる。同じく、例えばProcess Scale Purification of Antibodies、Uwe Gottschalk 2011 John Wiley & Sons ISBN: 1118210743、Antibodies Vol 1 Production and Purification、G. Subramanian 2013 Springer Science & Business Media、Basic Methods in Antibody Production and Characterization、Gary C. Howard 2000 CRC Pressを参照されたい。
追加の例示的なクロマトグラフ方法は、それらに限定されないが、Strong Anion Exchangeクロマトグラフィー(SAX)、液体クロマトグラフィー(LC:liquid chromatography)、高性能液体クロマトグラフィー(HPLC)、超高性能液体クロマトグラフィー(UPLC:ultra high performance liquid chromatography)、薄層クロマトグラフィー(TLC:thin layer chromatography)、アミドコラムクロマトグラフィー及びそれらの組合せを含む。例示的な質量分析法(MS:mass spectrometry)は、それらに限定されないが、タンデムMS、LC-MS、LC-MS/MS、マトリックス支援レーザ脱着電離質量分析法(MALDI-MS:matrix assisted laser desorption ionisation mass spectrometry)、フーリエ変換質量分析法(FTMS:Fourier transform mass spectrometry)、質量分析法を使用したイオン移動度分離(IMS-MS:ion mobility separation with mass spectrometry)、電子移動解離(ETD-MS:electron transfer dissociation-MS)及びそれらの組合せを含む。例示的な電気泳動方法は、それらに限定されないが、キャピラリー電気泳動(CE:capillary electrophoresis)、CE-MS、ゲル電気泳動、アガロースゲル電気泳動、アクリルアミドゲル電気泳動、特定のグリカン構造を認識する抗体を使用したウェスタンブロッティングが後続するSDS-ポリアクリルアミドゲル電気泳動(SDS-PAGE:SDS-polyacrylamide gel electrophoresis)、及びそれらの組合せを含む。例示的な核磁気共鳴(NMR:nuclear magnetic resonance)は、それらに限定されないが、1次元NMR(1D-NMR)、2次元NMR(2D-NMR)、相関分光学磁気-角度回転NMR(COSY-NMR:correlation spectroscopy magnetic-angle spinning NMR)、総相関分光学NMR(TOCSY-NMR:total correlated spectroscopy NMR)、ヘテロ核単量子コヒーレンスNMR(HSQC-NMR:heteronuclear single-quantum coherence NMR)、ヘテロ核多量子コヒーレンス(HMQC-NMR:heteronuclear multiple quantum coherence)、回転核オーバーハウザー効果分光学NMR(ROESY-NMR:rotational nuclear overhauser effect spectroscopy NMR)、核オーバーハウザー効果分光学(NOESY-NMR:nuclear overhauser effect spectroscopy)及びそれらの組合せを含む。
適切な分光学的技法は、例えばRaman分光学を含む。Raman分光学は、法科学の異なる分野の間で人気が高まっている技法である。今日のその使用のいくつかの実例は、医薬品(Hodgesらの「The Use of Fourier Transform Raman Spectroscopy in the Forensic Identification of Illicit Drugs and Explosives,」、Molecular Spectroscopy 46:303~307頁(1990))、棒口紅(Rodgerらの「The In-Situ Analysis of Lipsticks by Surface Enhanced Resonance Raman Scattering,」、Analyst 1823~1826頁(1998))、及び繊維(Thomasらの「Raman Spectroscopy and the Forensic Analysis of Black/Grey and Blue Cotton Fibres Part 1: Investigation of the Effects of Varying Laser Wavelength,」、Forensic Sci. Int. 152:189~197頁(2005))、並びに塗料(Suzukiらの「In Situ Identification and Analysis of Automotive Paint Pigments Using Line Segment Excitation Raman Spectroscopy: I. Inorganic Topcoat Pigments,」、J. Forensic Sci. 46:1053~1069頁(2001))及びインク(Mazzellaらの「Raman Spectroscopy of Blue Gel Pen Inks,」、Forensic Sci. Int. 152:241~247頁(2005))分析の識別を含む。Raman分光学の基礎をなしている理論は、固体サンプル、液体サンプル又はガスサンプルによる低強度非破壊レーザ光の非弾性散乱に基づいている。サンプルを準備する必要はほとんどないか、或いは全くなく、また、試験済み材料の必要な量は、数ピコグラム又はフェムトリットル(それぞれ10-12グラム又は10-15リットル)程度であり得る。典型的なRamanスペクトルはいくつかの狭帯域からなり、材料の固有振動シグネチャを提供する(Grasselliらの「Chemical Applications of Raman Spectroscopy,」、New York: John Wiley & Sons (1981))。別のタイプの振動分光学である赤外線(IR)吸収分光学とは異なり、Raman分光学は、水による干渉をほとんど示さず(Grasselliらの「Chemical Applications of Raman Spectroscopy,」、New York: John Wiley & Sons(1981))、それは、Raman分光学を体液及びそれらの痕跡を分析するための重要な技法にしている。固有Raman分光学的測定はサンプルを損傷しない。ステイン及びスワブを現場で試験することができ、またDNA分析のために研究室で更に使用するために依然として利用することができ、それは、法アプリケーションにとって極めて重要である。携帯型Raman分光計の設計は今や現実的であり(Yanらの「Surface-Enhanced Raman Scattering Detection of Chemical and Biological Agents Using a Portable Raman Integrated Tunable Sensor,」、Sensors and Actuators B. 6 (2007)、Eckenrodeらの「Portable Raman Spectroscopy Systems for Field Analysis,」、Forensic Science Communications 3:(2001))、犯罪現場で識別する能力をもたらすことになる。
本開示と共に使用するために適したタイプのRaman分光学は、それらに限定されないが、従来のRaman分光学、Ramanマイクロ分光学、それらに限定されないが、チップ強化Raman分光学、表面強化Raman分光学(SERS:surface enhanced Raman Spectroscopy)及び表面強化共鳴Raman分光学(SERRS:surface enhanced resonance Raman Spectroscopy)を含む近距離場Raman分光学、コヒーレント反ストークスRaman分光学(CARS:coherent anti-Stokes Raman Spectroscopy)、等々を含む。ストークスRaman分光学及び反ストークスRaman分光学の両方を使用することができる。
いくつかの実施例では、本明細書において説明されているクロマトグラフ方法又は分光学的方法を使用して、1つ又は複数のバイオ処理中間物に対して高速非侵略的試験が実施される。いくつかの実施例では、Ramon分光学を使用して高速試験が実施される。
質量分析法
本明細書において説明されている方法に使用するために適した質量分析法方法は当業者に知られており、例えばエレクトロスプレー電離MS、マトリックス支援レーザ脱着/電離MS、飛行時間MS、フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴MS、四重極飛行時間MS、線形四重極、四重極イオントラップMS、オービトラップ、円筒状イオントラップ、3次元イオントラップ、四重極質量フィルタ、タンデム質量分析法を含む。いくつかの実施例では、質量分析法はタンデム質量分析法である。同じく、例えばProtein Mass Spectrometry、Julian Whitelegge、2008年、Elsevier、Protein Sequencing and Identification Using Tandem Mass Spectrometry、Michael Kinter、2005年、John Wiley & Sons、Characterization of Protein Therapeutics using Mass Spectrometry、Guodong Chen、2014年、Springer Science & Business Mediaを参照されたい。
製造パラメータ
本明細書において説明されている方法は、糖タンパク質調製物を製造する際に、予め選択済み1つ又は複数のグリカン特性を得ることができるよう、糖タンパク質調製物のための1つ又は複数の製造パラメータを決定するステップ及び/又は選択するステップを含む。グリコシル化に対する様々な製造パラメータの効果に関する情報を使用することにより、所望のグリカン特性と積極的に相関する糖タンパク質調製物の製造に先立って製造パラメータを選択することができる。本明細書において使用されているように、製造パラメータは、製造プロセスにおけるパラメータ又は要素である。選択することができる製造パラメータは、例えば、糖タンパク質調製物を製造するために使用される細胞又は細胞系、培養培地、培養プロセス又はバイオリアクタ変数(例えばバッチ、フェッド-バッチ又は灌流)、精製プロセス及び糖タンパク質調製物の調合を含む。
一次製造パラメータは、1)宿主のタイプ、2)宿主の遺伝学、3)培地タイプ、4)発酵プラットホーム、5)精製ステップ、6)調合を含む。本明細書において使用されている二次製造パラメータは、一次製造パラメータの各々内で調整可能又は変更可能な製造パラメータである。実例は、所望のグリカン特性に基づく宿主サブクローンの選択、構成的又は誘導可能な宿主遺伝子レベルの調整、新規な遺伝子又はプロモーターエレメントの導入、培地添加剤(例えば表IVの部分リスト)、生理化学的増殖特性、増殖ベッセルタイプ(例えばバイオリアクタタイプ、Tフラスコ)、細胞密度、細胞周期、所望のグリカンタイプを使用した製品の濃縮(例えばレクチン又は抗体介在濃縮、イオン交換クロマトグラフィー、CE又は同様の方法による)、又は当業者には明らかである同様の二次製造パラメータを含む。
培地及び緩衝剤
本明細書において説明されている方法は、所望の1つ又は複数のグリカン特性に対する積極的な相関を有する培地成分を決定するステップ及び/又は選択するステップ、及び/又はその濃度を決定するステップ及び/又は選択するステップを含むことができる。培地成分は、培地の変化が存在すると、培養状態に応じて糖タンパク質製造の進行中に加えることができ、或いは糖タンパク質の製造が進行している間、管理することができる。培地成分は、培養のために直接加えられる成分、並びに細胞培養の副産物である成分を含む。
培地成分は、例えば緩衝剤、アミノ酸含有成分、ビタミン含有成分、塩含有成分、ミネラル含有成分、血清含有成分、炭素源含有成分、脂質含有成分、核酸含有成分、ホルモン含有成分、微量元素含有成分、アンモニア含有成分、共同因子含有成分、インジケータ含有成分、微小分子含有成分、加水分解物含有成分及び酵素モジュレータ含有成分を含む。
以下の表1は、選択することができる様々な培地成分の実例を提供したものである。
Figure 2022097744000002
例示的な緩衝剤は、トリス、トリシン、HEPES、MOPS、PIPES、TAPS、ビシン、BES、TES、カコジラート、MES、アセテート、MKP、ADA、ACES、グリシンアミド及びアセトアミドグリシンを含む。
任意選択で存在するミネラルは、ビスマス、ホウ素、カルシウム、塩素、クロム、コバルト、銅、フッ素、ヨウ素、鉄、マグネシウム、マンガン、モリブデン、ニッケル、リン、カリウム、ルビジウム、セレン、ケイ素、ナトリウム、ストロンチウム、硫黄、テルル、チタン、タングステン、バナジウム及び亜鉛を含む。例示的な塩及びミネラルは、CaCl2(無水)、CuSO4 5H2O、Fe(NO3).9H2O、KCl、KNO3、KH2PO4、MgSO4(無水)、NaCl、NaH2PO4H2O、NaHCO3、Na2SE3(無水)、ZnSO4.7H2O;リノール酸、リポ酸、D-グルコース、ヒポキサンチン2Na、フェノールレッド、プトレシン2HCl、ピルビン酸ナトリウム、チミジン、ピルビン酸、コハク酸ナトリウム、コハク酸、コハク酸.Na六水和物、グルタチオン(還元)、パラ-アミノ安息香酸(PABA)、リノレン酸メチル、バクトペプトンG、アデノシン、シチジン、グアノシン、2’-デオキシアデノシンHCl、2’-デオキシシチジンHCl、2’-デオキシグアノシン及びウリジンを含む。所望のグリカン特性が減少したフコシル化である場合、製造パラメータは、マンガン、例えば約0.1μMから50μMの濃度で存在するマンガンの存在下で、細胞、例えばCHO細胞、例えばdhfr不足CHO細胞を培養することを含むことができる。減少したフコシル化は、例えば細胞(例えばCHO細胞、例えばdhfr不足CHO細胞)を約350mOsmから500mOsmの浸透圧重量モル濃度で培養することによって得ることも可能である。浸透圧重量モル濃度は、培地に塩を加えるか、或いは製造中に蒸発が生じる際の副産物として塩を生成させることによって調整することができる。
また、製造パラメータは生理化学的パラメータを含むことも可能である。このような条件は、温度、pH、浸透圧重量モル濃度、剪断力又は撹拌速度、酸化、スパージレート(spurge rate)、増殖ベッセル、接線流、DO、CO、窒素、フェッドバッチ、酸化還元、細胞密度及び供給戦略を含むことができる。選択することができる生理化学的パラメータの実例は、以下の表2に提供されている。
Figure 2022097744000003
システムは、所望の1つ又は複数のグリカン特性とのその相関に少なくとも部分的に基づいて選択することができる。細胞は、例えばバッチ、フェッド-バッチ、灌流又は連続培養として増殖させることができる。選択することができる製造パラメータは、例えば、培地が採取される時期(培養時間中の初期、中間又は後期)及び頻度を含む培地の追加又は除去、細胞培養が撹拌される速度の増減、細胞が培養される温度の増減、培養密度が調整されるように培地の追加又は除去、細胞培養が開始され、或いは停止される時間の選択、及び細胞培養パラメータが変更される時間の選択を含む。このようなパラメータは、バッチ、フェッド-バッチ、灌流及び連続培養条件のうちの任意の条件に対して選択することができる。広範囲にわたるフラスコ、ビン、リアクタ及びコントローラは、製造を許容し、また、細胞培養システムのスケールアップを許容する。
追加の製造パラメータは当業者に知られており、例えばAntibody Expression and Production (2011) Ed. Mohamed Al-Rubeai; Springer Publishingを参照されたい。
製品及びそれらをコード化する核酸
本明細書においては、製品を製造することができる細胞又は細胞系を識別し、選択し、或いは作るための方法が提供される。本開示によって包含される製品は、それらに限定されないが、例えば細胞中で発現されることによって製造することができる、分子、核酸、ポリペプチド(例えば組換えポリペプチド、例えば抗体、二重特異性抗体、多重特異性抗体)又はそれらの混成を含む。いくつかの実施例では、細胞は、製品を製造するために工作又は修正される。そのような修飾には、産物の産生を制御する又はもたらす分子を導入することが含まれる。例えば、細胞は、ポリペプチド、例えば、組換えポリペプチドをコードする外来性核酸を導入することによって修飾され、細胞は、ポリペプチド、例えば、組換えポリペプチドの産生、例えば、発現及び分泌に適切な条件下で培養される。
実施例では、本明細書に記載される方法によって同定される、選択される、又は生成される細胞又は細胞系は、医学的な状態、障害又は疾患の処置に有用な、産物、例えば、組換えポリペプチドを産生する。医学的な状態、障害又は疾患の例には、代謝病又は障害(例えば、代謝酵素欠損)、内分泌障害(例えば、ホルモン欠損)、止血(haemostasis)、血栓症、造血障害、肺障害、胃腸障害、免疫調節(例えば、免疫不全)、不妊症、移植、がん、及び感染性疾患が含まれるが、限定されない。
いくつかの実施例では、産物は、外来性タンパク質、例えば、細胞によって天然で発現されないタンパク質である。産物は、例えば、薬物スクリーニングのため有用な治療タンパク質又は診断上のタンパク質であり得る。治療又は診断上のタンパク質は、抗体分子、例えば、抗体又は抗体断片、融合タンパク質、ホルモン、サイトカイン、成長因子、酵素、糖タンパク質、リポタンパク質、レポータータンパク質、治療ペプチド、又はこれらの任意の構造上の及び/又は機能的な断片又はハイブリッドであり得る。
一実施例では、産物、例えば、組換えポリペプチドは、抗体分子である。本明細書に包含される産物は、診断及び治療抗体分子を含む。診断抗体分子には、イメージング技術のため有用な、抗体、例えば、モノクローナル抗体又はその抗体断片が含まれる。治療抗体分子は、例えば、疾患又は障害の処置又は予防のため、対象への投与に適切である。
抗体分子は、タンパク質、又は抗原と特異的に結合する免疫グロブリン分子から由来するポリペプチド配列である。一実施例では、抗体分子は、完全長抗体又は抗体断片である。抗体及びマルチフォーマットタンパク質は、ポリクローナル又はモノクローナル、複数又は単一鎖、又はインタクトな免疫グロブリンであり得、天然供給源から又は組換え供給源から由来し得る。抗体は、免疫グロブリン分子の四量体であり得る。一実施例では、抗体は、モノクローナル抗体である。抗体は、ヒト又はヒト化抗体であり得る。一実施例では、抗体は、IgA、IgG、IgD、又はIgE抗体である。一実施例では、抗体は、IgG1、IgG2、IgG3、又はIgG4抗体である。
「抗体断片」は、インタクトな抗体の少なくとも一部、又はその組換えバリアントを指す、並びに抗原結合ドメイン、例えば、抗原などの標的に対する抗体断片の認識及び特異的な結合を付与するため十分であるインタクトな抗体の抗原性決定可変領域を指す。抗体断片の例には、Fab、Fab’、F(ab’)、及びFv断片、scFv抗体断片、直鎖状抗体、単一ドメイン抗体、例えば、sdAb(VL又はVHのいずれか)、ラクダ科(camelid)VHHドメイン、及び抗体断片から形成される多重特異的抗体、例えば、ヒンジ領域でのジスルフィド架橋によって連結される2つのFab断片を含む二価断片、及び抗体の単離されたCDR又は他のエピトープ結合断片が含まれるが、限定されない。抗原結合断片はまた、単一ドメイン抗体、マキシボディ(maxibody)、ミニボディ、ナノボディ、イントラボディ(intrabody)、ダイアボディ、トリアボディ、テトラボディ、v-NAR及びbis-scFvに組み込むことができる(例えば、Hollinger and Hudson、Nature Biotechnology 23:1126~1136ページ、2005を参照されたい)。抗原結合断片はまた、ポリペプチド、例えば、フィブロネクチンタイプIII(Fn3)に基づく足場にグラフトされ得る(フィブロネクチンポリペプチドミニボディを記載する、米国特許第6,703,199号を参照されたい)。
本明細書に記載される方法又は細胞において産生される、例示的な産物、例えば、ポリペプチド、例えば、組換えポリペプチドは、以下の表3及び4に提供される。
Figure 2022097744000004

Figure 2022097744000005

Figure 2022097744000006
別の実施例では、産物は、二重特異性分子、例えば、二重特異性抗体である。本明細書に記載の二重特異性分子は、2つ又はそれを超える別個の抗原又は標的に結合することができる分子を含む。一実施例では、二重特異性分子は、抗体断片を含む。一実施例では、二重特異性分子は、二重特異性抗体、二重特異性抗体融合タンパク質、又は二重特異性抗体コンジュゲート、Bi-specific T cell Engager(BiTE)分子、Dual Affinity Re-Targeting(DART)分子、Dual Action Fab(DAF)分子、ナノボディ、又は2つの別個の抗原を認識する又は結合する能力を有する分子をもたらす抗体断片の他の配置を含む。
Figure 2022097744000007

Figure 2022097744000008

Figure 2022097744000009

Figure 2022097744000010
他の例示的な又は診断上のタンパク質には、Leaderら、「Protein therapeutics: a summary and pharmacological classification」、Nature Reviews Drug Discovery、2008、7:21~39ページ(本明細書に参照によって組み込まれる)の表1~10に記載される任意のタンパク質;又は本明細書に記載される組換えポリペプチドの任意のコンジュゲート、バリアント、類似体、又は機能的な断片が含まれるが、限定されない。
他の組換え産物には、非抗体足場又は代替タンパク質足場、例えば、DARPin、アフィボディ及びアドネクチンが含まれるが、限定されない。そのような非抗体足場又は代替タンパク質足場は、1つ又は2つ、又はそれを超える、例えば、1、2、3、4、又は5又はそれを超える、異なる標的又は抗原を認識する又は結合するため操作され得る。
本明細書に記載される、産物、例えば、ポリペプチド、例えば、組換えポリペプチドをコードする核酸、例えば、外来性核酸も本明細書において提供される。所望の組換えポリペプチドをコードする核酸配列は、例えば、標準技術を使用して、所望の核酸配列、例えば、遺伝子を発現する細胞のライブラリーをスクリーニングすることによる、同じものを含むことが公知のベクターから核酸配列を誘導することによる、又は同じものを含有している細胞及び組織から直接的に単離することによる、当技術分野において公知である組換え方法を使用して取得することができる。或いは、組換えポリペプチドをコードする核酸は、クローン化というよりも合成的に産生することができる。組換えDNA技術及びテクノロジーは、当技術分野において高度に進歩しており、確立している。したがって、本明細書に記載される組換えポリペプチドのアミノ酸配列の知識を有する当業者は、組換えポリペプチドをコードするであろう核酸配列を容易に想定又は生成させることができる。
いくつかの実施例では、外来性核酸は、宿主細胞によって内因性に発現される産物の発現を制御する。そのような実施例では、外来性核酸は、内因性産物(本明細書で「内因性産物トランス活性化配列」とも呼ばれる)の発現を増加させる、1つ又は複数の核酸配列を含む。例えば、内因性産物の発現を増加させる核酸配列は、構成的に活性なプロモーター又は、例えば、所望の部位での転写を増加させる、例えば、所望の内因性遺伝子産物の発現を増加させる、より強力なプロモーターを含む。内因性産物トランス活性化配列を含む外来性核酸の導入後、前記外来性核酸は、内因性産物トランス活性化配列が、所望の内因性産物のトランス活性化又は発現を増加するように、例えば、内因性産物をコードするゲノム配列に対して近位である事前に選択した位置で、細胞の染色体ゲノムに組み込まれる。内因性産物の発現を増加させるため、細胞を修飾する、例えば、外来性核酸を導入する、他の方法は、例えば、参照することによってその全体が本明細書に組み込まれる米国特許第5,272,071号に記載されている。
本明細書に記載される産物の発現は、組換えポリペプチド又はその部分をコードする核酸をプロモーターに作動可能に連結すること、及び構築物を発現ベクターに組み込むことによって典型的に達成される。ベクターは、真核生物又は原核生物に複製及び組み込むため適切であり得る。典型的なクローニングベクターは、所望の核酸配列の発現の制御のため有用な、他の制御エレメント、例えば、転写及び翻訳ターミネーター、開始配列、及びプロモーターを含有する。
産物、例えば、組換えポリペプチドをコードする又は内因性産物の発現を制御することができる核酸配列を含む、本明細書に記載される核酸配列は、いくつかのタイプのベクターにクローン化することができる。例えば、核酸は、プラスミド、ファージミド、ファージ誘導体、動物ウイルス、及びコスミドを含むが、限定されないベクターにクローン化することができる。特に対象とするベクターには、発現ベクター、複製ベクター、プローブ生成ベクター(probe generation vector)、及びシークエンシングベクターが含まれる。実施例では、発現ベクターは、ウイルスベクターの形態で細胞に提供され得る。ウイルスベクターテクノロジーは、当技術分野において周知であり、例えば、Sambrookら、2012、Molecular Cloning: A Laboratory Manual、volumes 1~4、 Cold Spring Harbor Press、NY)、及び他のウイルス学及び分子生物学マニュアルに記載されている。ベクターとして有用であるウイルスは、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ関連ウイルス、ヘルペスウイルス、及びレンチウイルスを含むが、限定されない。一般に、適切なベクターは、少なくとも1つの生物において機能的な複製起点、プロモーター配列、簡便な制限酵素部位、及び1つ又は複数の選択可能なマーカーを含有する(例えば、WO01/96584;WO01/29058;及び米国特許第6,326,193号)。ウイルスから由来するベクターは、長期の遺伝子移動を達成させるための適切なツールである、というのも、それらは、導入遺伝子の長期の安定な組込み及び娘細胞におけるその伝播を可能にするからである。
ベクターはまた、例えば、分泌を促進させるためのシグナル配列、ポリアデニル化シグナル及び転写ターミネーター(例えば、ウシ成長ホルモン(BGH)遺伝子由来)、エピソーム複製及び原核生物における複製を可能にするエレメント(例えば、SV40起源及びColE1又は当技術分野において公知である他のもの)及び/又は選択を可能にするエレメント、例えば、選択マーカー又はレポーター遺伝子を含み得る。
一実施例では、ポリペプチド、例えば、組換えポリペプチドをコードする核酸配列を含むベクターは、ポリペプチド、例えば、組換えポリペプチドの発現のため転写開始を可能にするポリメラーゼの動員に関わるプロモーター配列を更に含む。一実施例では、本明細書に記載される方法のため適切なプロモーター配列は、多量の転写を駆動し、それ故、標的外来性mRNAの大量のコピーを送達する、エンハンサーと通例では関連する。一実施例では、プロモーターは、両方とも、それらの同名のウイルス又はそれから由来するプロモーターから由来する、サイトメガロウイルス(CMV)主要初期プロモーター(Xia、Bringmannら 2006)及びSV40プロモーター(Chernajovsky、Moryら 1984)を含む。いくつかの他の頻度の低いウイルスプロモーターは、ラウス肉腫ウイルス末端反復配列 (RSV-LTR)及びモロニーマウス白血病ウイルス(MoMLV)LTR(Papadakis、Nicklinら 2004)を含む発現ベクターに含める際に転写を駆動するため首尾よく利用されている。別の実施例では、特異的な内因性哺乳動物プロモーターを、対象とする遺伝子の構成的な転写を駆動するため利用することができる(Pontiller、Grossら 2008)。CHO特異的チャイニーズハムスター伸長因子1-アルファ(CHEF1α)プロモーターは、ウイルスベース配列を代替する高い収量を提供する(Deer、Allison 2004)。プロモーターに加えて、本明細書に記載されるベクターは、上記のようなエンハンサー領域(転写の割合を上方制御する転写因子を動員することができる、コアプロモーターに対して近位である、特異的なヌクレオチドモチーフ領域)を更に含む(Riethoven 2010)。これらの領域は、プロモーター配列と類似して、ウイルスから由来することが多く、プロモーター配列内に包含され、例えば、hCMV及びSV40エンハンサー配列である又はアデノウイルス由来配列などに追加的に含まれ得る(Gaillet、Gilbertら 2007)。
一実施例では、本明細書に記載される、産物、例えば、ポリペプチド、例えば、組換えポリペプチドを含むベクターは、選択マーカーをコードする核酸配列を更に含む。一実施例では、選択可能なマーカーは、グルタミン合成酵素(GS);ジヒドロ葉酸レダクターゼ(DHFR)、例えば、メトトレキセート(MTX)に対する耐性を付与する酵素;又は抗生物質マーカー、例えば、抗生物質、例えば、ハイグロマイシン、ネオマイシン(G418)、ゼオシン、ピューロマイシン、又はブラストサイジンに対する耐性を付与する酵素を含む。別の実施例では、選択マーカーは、Selexis選択系(例えば、SUREテクノロジープラットホーム(商標)及びSelexis Genetic Elements(商標)、Selexis SAから市販される)又はCatalant選択系を含む又はそれに適合する。
一実施例では、本明細書に記載される組換え産物をコードする核酸配列を含むベクターは、細胞を同定することに有用である選択マーカーを含む又は細胞は、本明細書に記載される組換え産物をコードする核酸を含む。別の実施例では、選択マーカーは、本明細書に記載されるように、組換え産物をコードする核酸配列のゲノムへの組込みを含む細胞(単数又は複数)を同定することに有用である。組換えタンパク質をコードする核酸配列が組み込まれている細胞(単数又は複数)の同定は、産物を安定的に発現する細胞又は細胞系の選択及び操作のため有用であり得る。
使用のため適切なベクターは、市販されており、Lonza Biologics,Incから利用可能である、GS発現系(商標)、GS Xceed(商標)遺伝子発現系、又はPotelligent(登録商標)CHOK1SVテクノロジーに関連するベクター、例えば、参照することによってその全体が本明細書に組み込まれる、Fanら、Pharm. Bioprocess. (2013); 1(5):487~502ページに記載されるようなベクターを含む。GS発現ベクターは、GS遺伝子、又はその機能的な断片(例えば、GSミニ遺伝子)、及び1つ又は複数、例えば、1、2、若しくは3、又はそれを超える、対象とする遺伝子、例えば、本明細書に記載される組換えポリペプチドをコードする核酸の発現のための効率の高い転写カセットを含む。GSミニ遺伝子は、ゲノムCHO GS遺伝子のイントロン6を含む、例えば、からなる。一実施例では、GSベクターは、SV40Lプロモーター及び1つ又は2つのpolyAシグナルと作動可能に連結しているGS遺伝子を含む。別の実施例では、GSベクターは、SV40Eプロモーター、SV40スプライシング及びポリアデニル化シグナルと作動可能に連結しているGS遺伝子を含む。そのような実施例では、例えば、対象とする遺伝子の発現のための転写カセット又は本明細書に記載される組換えポリペプチドには、第一のイントロンを含む、hCMV-MIE遺伝子からのhCMV-MIEプロモーター及び5’非翻訳配列が含まれる。他のベクターは、例えば、他の選択マーカーが、本明細書に記載される発現ベクターにおけるGS遺伝子に関して置換された、GS発現ベクターに基づいて構築することができる。
本明細書に記載される方法における使用のため適切なベクターには、他の市販のベクター、例えば、pcDNA3.1/Zeo、pcDNA3.1/CAT、pcDNA3.3TOPO(Thermo Fisher、以前はInvitrogen);pTarget、HaloTag(Promega);pUC57(GenScript);pFLAG-CMV(Sigma-Aldrich);pCMV6(Origene);pEE12又はpEE14(Lonza Biologics)、又はpBK-CMV/pCMV-3Tag-7/pCMV-Tag2B(Stratagene)が含まれるが、限定されない。
細胞及び細胞培養
実施例では、細胞は、哺乳動物細胞である。他の実施例では、細胞は、哺乳動物細胞以外の細胞である。一実施例では、細胞は、マウス、ラット、チャイニーズハムスター、シリアンハムスター、サル、類人猿(ape)、イヌ、ウマ、フェレット、又はネコである。実施例では、細胞は、哺乳動物細胞、例えば、ヒト細胞又はげっ歯類細胞、例えば、ハムスター細胞、マウス細胞、又はラット細胞である。別の実施例では、細胞は、カモ、オウム、魚、昆虫、植物、真菌、又は酵母からの細胞である。一実施例では、細胞は、古細菌である。一実施例では、細胞は、アクチノバクテリア、例えば、結核菌の種である。
一実施例では、細胞は、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞である。一実施例では、細胞は、CHO-K1細胞、CHO-K1 SV細胞、DG44 CHO細胞、DUXB11 CHO細胞、CHOS、CHO GSノックアウト細胞、CHO FUT8 GSノックアウト細胞、CHOZN、又はCHO-由来細胞である。CHO GSノックアウト細胞(例えば、GSKO細胞)は、例えば、CHO-K1SV GSノックアウト細胞(Lonza Biologics,Inc.)である。CHO FUT8ノックアウト細胞は、例えば、Potelligent(登録商標)CHOK1 SV(Lonza Biologics,Inc.)である。
別の実施例では、細胞は、HeIa、HEK293、HT1080、H9、HepG2、MCF7、Jurkat、NIH3T3、PC12、PER.C6、BHK(ベビーハムスター腎臓細胞)、VERO、SP2/0、NS0、YB2/0、Y0、EB66、C127、L cell、COS、例えば、COS1及びCOS7、QC1-3、CHOK1、CHOK1SV、Potelligent CHOK1SV、CHO GSノックアウト、CHOK1SV GS-KO、CHOS、CHO DG44、CHO DXB11、及びCHOZN、又はそれから由来する任意の細胞である。一実施例では、細胞は、幹細胞である。一実施例では、細胞は、本明細書に記載される任意の細胞の分化型である。一実施例では、細胞は、培養における任意の初代細胞から由来する細胞である。
一実施例では、細胞は、組換えポリペプチドをコードする、例えば、組換えポリペプチド、例えば、表5又は3から選択される組換えポリペプチドを発現する外来性核酸を含む、本明細書に記載される、いずれか1つの細胞である。
一実施例では、細胞培養は、バッチ培養、フェッド-バッチ培養、ドロー及び充填培養(draw and fill culture)、又は連続培養として実施される。一実施例では、細胞培養は、浮遊培養である。一実施例では、細胞又は細胞培養は、組換えポリペプチドの発現のためインビボに配置され、例えば、モデル生物又はヒト対象に配置される。
一実施例では、培養培地は、血清非含有である。無血清及び無タンパク質培地は、市販されている、例えば、Lonza Biologics。
哺乳動物細胞系のため適切な培地及び培養方法は、一例を挙げると、米国特許第5,633,162号に記載されるように、当分野において周知である。研究室でのフラスコ又は低密度細胞培養のための及び特定の細胞タイプの必要性に適合される標準的な細胞培養培地の例は、一例を挙げると:Roswell Park Memorial研究所(RPMI)1640培地(Morre、G.、The Journal of the American Medical Association、199、p. 519 f. 1967)、L-15培地(Leibovitz、A.ら、Amer. J. of Hygiene、78、1p. 173 ff、1963)、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、イーグル最小必須培地(MEM)、ハムF12培地(Ham、R.ら、Proc. Natl. Acad. Sc.53、p288 ff. 1965)又はアルブミン、トランスフェリン及びレシチンを欠くIscovesの改変DMEM(Iscovesら、J. Exp. med. 1、p. 923 ff.、1978)である。一例を挙げると、ハムのF10又はF12培地は、特にCHO細胞培養のため設計された。特にCHO細胞培養に適合させた他の培地は、EP-481791に記載される。そのような培養培地がウシ胎児血清(FBS、ウシ胎児血清FCSとも称される)を添加されてもよいことが公知であり、後者は多量のホルモン及び成長因子の天然の供給源を提供する。哺乳動物細胞の細胞培養は、現在では日常的な操作であり、科学のテキストブック及びマニュアル中によりよく記載され、例えば、R. Ian Fresney、Culture of Animal cells、a manual、4th edition、Wiley-Liss/N.Y.、2000に詳細に論じられている。
他の適切な培養方法は、当業者に公知であり、利用される組換えポリペプチド産物及び宿主細胞に依存し得る。細胞によって発現される組換えポリペプチドの発現及び産生のため適切な条件を決定又は至適化することは、当業者の能力の範囲内である。
一態様では、細胞又は細胞系は、産物、例えば、組換えポリペプチドをコードする、外来性核酸を含む。一実施例では、細胞又は細胞系は、産物、例えば、治療又は診断上の産物を発現する。所望の ポリペプチド又はタンパク質を発現させるため細胞を遺伝的に修飾する又は操作するための方法は、当技術分野において周知であり、例えば、トランスフェクション、トランスダクション(例えば、ウイルストランスダクション)、又はエレクトロポレーションを含む。
本明細書に記載される外来性核酸又はベクターなどの核酸を宿主細胞に導入するための物理的方法には、リン酸カルシウム沈殿、リポフェクション、微粒子銃、マイクロインジェクション、エレクトロポレーションなどが含まれる。ベクター及び/又は外来性核酸を含む細胞を産生するための方法は、当技術分野において周知であり、例えば、Sambrookら、2012、Molecular Cloning: A Laboratory Manual、volumes 1~4、Cold Spring Harbor Press、NY)を参照されたい。
本明細書に記載される外来性核酸又はベクターなどの核酸を宿主細胞に導入するための化学的方法には、コロイド性分散系、例えば、高分子複合体(macromolecule complex)、ナノカプセル、ミクロスフェア、ビーズ、及び水中油型エマルジョン、ミセル、混合ミセル、及びリポソームを含む、脂質ベース系が含まれる。インビトロ及びインビボで送達ビヒクルとして使用するための例示的なコロイド系は、リポソーム(例えば、人工膜ベシクル)である。核酸の最新の標的化された送達の他の方法が、利用可能であり、例えば、標的化されたナノ粒子又は他の適切なサブミクロンサイズの送達系でのポリヌクレオチドの送達である。
実施例では、外来性核酸の宿主細胞の核酸、例えば、宿主細胞のゲノム又は染色体核酸への組込みが、所望される。外来性核酸の宿主細胞のゲノムへの組込みが起こっているかどうかを決定するための方法には、GS/MSX選択方法が含まれ得る。GS/MSX選択方法は、細胞からのタンパク質の高レベル発現に関して選択するため、組換えGS遺伝子によるグルタミン栄養要求性の補完性を使用する。簡潔に述べると、GS/MSX選択方法は、組換えポリペプチド産物をコードする外来性核酸を含むベクターにおけるグルタミン合成酵素をコードする核酸を含めることを含む。メチオニンスルホキシイミン(MSX)の投与により、組換えポリペプチド及びGSの両方をコードする外来性核酸がゲノムに安定的に組み込まれた細胞が選択される。GSはいくつかの宿主細胞、例えば、CHO細胞によって内因性に発現され得るので、MSXでの選択の濃度及び持続時間は、組換えポリペプチド産物の宿主ゲノムへの安定的な組込みを有する高産生細胞を同定するため、最適化され得る。GS選択及びその系は、参照することによってその全体が本明細書に組み込まれる、Fanら、Pharm. Bioprocess. (2013); 1(5):487~502ページに更に記載されるようなベクターを含む。
外来性核酸が宿主細胞ゲノムに安定的に組み込まれている細胞を同定する及び選択するための他の方法には、外来性核酸にレポーター遺伝子を含めること及び細胞におけるレポーター遺伝子の存在の評価、及び外来性核酸のPCR分析及び検出が含まれるが、限定されない。
一実施例では、本明細書に記載される方法を使用して選択される、同定される、又は生成される細胞は、安定的な発現、例えば、組換えポリペプチドをコードする外来性核酸の組込みのための選択方法のみを使用して選択される細胞よりも高い収量のタンパク質産物を産生することが可能である。一実施例では、本明細書に記載される方法を使用して選択される、同定される、又は生成される細胞は、タンパク質分解の阻害剤と接触されていなかった細胞、又は安定的な発現、例えば、組換えポリペプチドをコードする外来性核酸の組込みのための選択のみされた細胞と比較して、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、又は10倍又はそれを超える産物、例えば、組換えポリペプチドを産生する。
細胞系及び組換えポリペプチド産生のための方法
哺乳動物及び微生物選択系の両方における当技術分野における現在の最新技術は、RNAへのDNAの転写のレベルで選択圧を適用することである。対象とする遺伝子は、対象とする遺伝子の高発現をもたらす可能性が高い、選択マーカーを高レベルで発現させる選択マーカーに厳密に連結される。高レベルで選択マーカーを発現する細胞は、生存及び増殖することができ、発現しないものは、生存及び増殖する可能性が低く、例えば、アポトーシス(apoptose)及び/又は死亡する。このような方法で、細胞の集団は、選択マーカーを発現する細胞に関して富化され得ることから、対象とする遺伝子が高レベルであることが含意され得る。この方法は、直接的なタンパク質の発現について非常に成功することが証明されている。実施例では、本明細書に記載されるプロセスは、実質的に純粋なタンパク質産物を提供する。本明細書で使用するように、「実質的に純粋」は、実質的に発熱性物質非含有、実質的に核酸非含有、及び/又は実質的にポリメラーゼ、リボソームタンパク質、及びシャペロンタンパク質などの宿主細胞からの内因性細胞タンパク質酵素及び成分非含有であることを意味する。実質的に純粋なタンパク質産物は、例えば、25%、20%、15%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、又は1%未満の夾雑内因性タンパク質、核酸、又は宿主細胞からの他の高分子を含有する。
方法及びシステムは、当分野で確立されている、製品を回収し、且つ、精製するための方法と共に使用することができる。組換えポリペプチド産物を回収するために、物理的又は化学的或いは物理化学的方法が使用される。組換えポリペプチド産物を回収するため、物理的な又は化学的な又は物理化学的な方法が使用される。物理的な又は化学的な又は物理化学的な方法は、濾過方法、遠心分離方法、超遠心方法、抽出方法、凍結乾燥方法、沈殿方法、結晶化方法、クロマトグラフィー方法又はその2つ若しくはそれを超える方法の組合せであり得る。一実施例では、クロマトグラフィー方法は、1つ又は複数のサイズ排除クロマトグラフィー(又はゲル濾過)、イオン交換クロマトグラフィー、例えば、陰イオン若しくは陽イオン交換クロマトグラフィー、親和性クロマトグラフィー、疎水的相互作用クロマトグラフィー、及び/又は多モードのクロマトグラフィーを含む。
本明細書において説明されているデバイス、施設及び方法は、原核細胞系及び/又は真核細胞系を含む任意の所望の細胞系を培養するのに適している。更に、実施例では、デバイス、施設及び方法は、懸濁細胞又は付着依存性(粘着)細胞を培養するのに適しており、また、ポリペプチド産物、核酸産物(例えばDNA又はRNA)などの薬剤及びバイオ薬剤製品、或いは細胞治療及び/又はウイルス治療に使用されるような細胞及び/又はウイルスの製造のために構成された製造操作のために適している。実施例では、細胞は、組換え治療製品又は診断製品などの製品を発現し、或いは製造する。以下でより詳細に説明されるように、細胞によって製造される製品の実例は、それらに限定されないが、抗体分子(例えばモノクローナル抗体、二重特異性抗体)、抗体模倣体(とりわけ抗原に結合するが、例えばDARPin、アフィボディ(affibody)、アドネクチン(adnectin)又はIgNARなどの抗体に構造的に関連していないポリペプチド分子)、融合タンパク質(例えばFc融合タンパク質、キメラサイトカイン)、他の組換えタンパク質(例えばグリコシル化タンパク質、酵素、ホルモン)、ウイルス治療薬(例えば抗がん腫瘍退縮性ウイルス、遺伝子治療のためのウイルスベクター、及びウイルス免疫治療薬)、細胞治療薬(例えば多能性幹細胞、間葉系幹細胞及び成体幹細胞)、ワクチン又は脂質カプセル封入粒子(例えばエキソソーム、ウイルス様粒子)、RNA(例えばsiRNAなど)又はDNA(例えばプラスミドDNAなど)、抗生物質又はアミノ酸を含む。実施例では、デバイス、施設及び方法を使用してバイオシミラーを製造することができる。
言及したように、実施例では、デバイス、施設及び方法によれば、真核細胞、例えば哺乳動物細胞、或いは例えば酵母菌細胞又は糸状菌類細胞などの下等(lower)真核細胞、或いはグラム陽性細胞又はグラム陰性細胞及び/又は真核細胞又は原核細胞の産物、例えば大量方式で真核細胞によって合成されたタンパク質、ペプチド、抗生物質、アミノ酸、核酸(DNA又はRNAなど)などの原核細胞を製造することができる。本明細書において別途言及されていない限り、デバイス、施設及び方法は、それらに限定されないが、ベンチスケール容量、パイロットスケール容量及び全製造スケール容量を含む任意の所望の体積即ち製造容量を含むことができる。
更に、本明細書において別途言及されていない限り、デバイス、施設及び方法は、それらに限定されないが、かき混ぜタンク、エアリフト、繊維、超極細繊維、中空繊維、セラミックマトリックス、流動床バイオリアクタ、固定床バイオリアクタ及び/又は噴出床バイオリアクタを含む任意の適切なリアクタを含むことができる。本明細書において使用されているように、「リアクタ」は、発酵槽ユニット又は発酵ユニット、或いは任意の他のリアクタベッセルを含むことができ、また、「リアクタ」という用語は、「発酵槽」と交換可能に使用されている。例えばいくつかの態様では、一実例バイオリアクタユニットは、栄養物及び/又は炭素源の供給、適切なガス(例えば酸素)の注入、発酵培地又は細胞培養培地の入口流及び出口流、気体相及び液体相の分離、温度の維持、酸素レベル及びCO2レベルの維持、pHレベルの維持、撹拌(例えばかき混ぜ)及び/又は洗浄/殺菌のうちの1つ又は複数、或いは全てを実施することができる。発酵ユニットなどの実例リアクタユニットは、ユニット内に複数のリアクタを含むことができ、例えばユニットは、1個、2個、3個、4個、5個、10個、15個、20個、25個、30個、35個、40個、45個、50個、60個、70個、80個、90個又は100個、或いはそれ以上のバイオリアクタを個々のユニット中に有することができ、及び/又は施設は、単一のリアクタ又は複数のリアクタを施設内に有する複数のユニットを含むことができる。様々な実施例では、バイオリアクタは、バッチ、セミフェッドバッチ、フェッドバッチ、灌流及び/又は連続発酵プロセスのために適切であり得る。任意の適切なリアクタ径を使用することができる。実施例では、バイオリアクタは、約100mLと約50,000Lの間の体積を有することができる。非制限の実例は、100mL、250mL、500mL、750mL、1リットル、2リットル、3リットル、4リットル、5リットル、6リットル、7リットル、8リットル、9リットル、10リットル、15リットル、20リットル、25リットル、30リットル、40リットル、50リットル、60リットル、70リットル、80リットル、90リットル、100リットル、150リットル、200リットル、250リットル、300リットル、350リットル、400リットル、450リットル、500リットル、550リットル、600リットル、650リットル、700リットル、750リットル、800リットル、850リットル、900リットル、950リットル、1000リットル、1500リットル、2000リットル、2500リットル、3000リットル、3500リットル、4000リットル、4500リットル、5000リットル、6000リットル、7000リットル、8000リットル、9000リットル、10,000リットル、15,000リットル、20,000リットル及び/又は50,000リットルの体積を含む。更に、適切なリアクタは、マルチユース、シングルユース、使い捨て又は非使い捨てであってもよく、また、ステンレス鋼(例えば316L又は任意の他の適切なステンレス鋼)及びインコネル、プラスチック及び/又はガラスなどの金属合金を含む任意の適切な材料で形成することができる。
実施例では、本明細書において別途言及されていない限り、本明細書において説明されているデバイス、施設及び方法は、このような産物の分離、精製及び単離のための操作及び/又は機器などの言及されていない任意の適切なユニット操作及び/又は機器を含むことも可能である。従来の現場組立て施設、モジュラー施設、移動施設及び仮施設、又は任意の他の適切な建造物、施設及び/又はレイアウトなどの任意の適切な施設及び環境を使用することができる。例えばいくつかの実施例では、モジュラークリーンルームを使用することができる。更に、別途言及されていない限り、本明細書において説明されているデバイス、システム及び方法は、単一の場所又は施設に収容することができ、及び/又は単一の場所又は施設で実施することができ、或いは別法として、個別の、即ち複数の場所及び/又は施設に収容することができ、及び/又は複数の場所又は施設で実施することも可能である。
非制限の実例として、また、非制限で、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれている、米国公開第2013/0280797号、米国公開第2012/0077429号、米国公開第2009/0305626号、及び米国特許第8,298,054号、米国特許第7,629,167号及び米国特許第5,656,491号は、適切であり得る実例施設、機器及び/又はシステムを記述している。
実施例では、細胞は、真核細胞、例えば、哺乳動物細胞である。哺乳動物細胞は、例えば、ヒト又はげっ歯類又はウシの細胞系又は細胞株であってもよい。そのような細胞、細胞系又は細胞株の例は、例えば、マウス骨髄腫(NSO)細胞系、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞系、HT1080、H9、HepG2、MCF7、MDBK Jurkat、NIH3T3、PC12、BHK(ベビーハムスター腎臓細胞)、VERO、SP2/0、YB2/0、Y0、C127、L細胞、COS、例えば、COS1及びCOS7、QC1-3、HEK-293、VERO、PER.C6、HeLA、EB1、EB2、EB3、腫瘍溶解細胞系又はハイブリドーマ細胞系である。好ましくは、哺乳動物細胞は、CHO細胞系である。一実施例では、細胞はCHO細胞である。一実施例では、細胞は、CHO-K1細胞、CHO-K1 SV細胞、DG44 CHO細胞、DUXB11 CHO細胞、CHOS、CHO GSノックアウト細胞、CHO FUT8 GSノックアウト細胞、CHOZN、又はCHO由来細胞である。CHO GSノックアウト細胞(例えば、GSKO細胞)は、例えば、CHO-K1 SV GSノックアウト細胞である。CHO FUT8ノックアウト細胞は、例えば、Potelligent(登録商標)CHOK1 SV(Lonza Biologics,Inc.)である。真核細胞は、例えば、EBx(登録商標)細胞、EB14、EB24、EB26、EB66、又はEBvl3などの、鳥類の細胞、細胞系又は細胞株であってもよい。
一実施例では、真核細胞は、幹細胞である。幹細胞は、例えば、胚性幹細胞(ESC)、成体幹細胞、誘導多能性幹細胞(iPSC)、組織特異的幹細胞(例えば、造血幹細胞)及び間葉系幹細胞(MSC)などの多能性幹細胞であってもよい。
一実施例では、細胞は、本明細書に記載の細胞のいずれかの分化した形態である。一実施例では、細胞は、培養物中の任意の一次細胞に由来する細胞である。
実施例では、細胞は、ヒト肝細胞、動物肝細胞、又は非実質細胞などの肝細胞である。例えば、細胞は、播種可能な代謝条件付きヒト肝細胞、播種可能な誘導条件付きヒト肝細胞、播種可能なQualyst Transporter Certified(商標)ヒト肝細胞、懸濁条件付きヒト肝細胞(10ドナー及び20ドナーのプールされた肝細胞を含む)、ヒト肝臓クッパー細胞、ヒト肝臓星細胞、イヌ肝細胞(単一の、及びプールされたビーグル犬肝細胞を含む)、マウス肝細胞(CD-1及びC57BI/6肝細胞を含む)、ラット肝細胞(Spraque-Dawley、Wistar Han、及びWistar肝細胞を含む)、サル肝細胞(カニクイザル及びアカゲザル肝細胞を含む)、ネコ肝細胞(家庭用短毛種の肝細胞を含む)、並びにウサギ肝細胞(New Zealand Whiteの肝細胞を含む)であってもよい。例示的な肝細胞は、Triangle Research Labs、LLC、6 Davis Drive Research Triangle Park、North Carolina、USA 27709から市販されている。
一実施例では、真核細胞は、例えば、酵母細胞(例えば、Pichia属(例えば、Pichia pastoris、Pichia methanolica、Pichia kluyveri、及びPichia angusta)、Komagataella属(例えば、Komagataella pastoris、Komagataella pseudopastoris若しくはKomagataella phaffii)、Saccharomyces属(例えば、Saccharomyces cerevisae、cerevisiae、Saccharomyces kluyveri、Saccharomyces uvarum)、Kluyveromyces属(例えば、Kluyveromyces lactis、Kluyveromyces marxianus)、Candida属(例えば、Candida utilis、Candida cacaoi、Candida boidinii)、Geotrichum属(例えば、Geotrichum fermentans)、Hansenula polymorpha、Yarrowia lipolytica、又はSchizosaccharomyces pombeなどの下等真核細胞である。好ましいのは、Pichia pastorisである。Pichia pastoris株の例は、X33、GS115、KM71、KM71H、及びCBS7435である。
一実施例では、真核細胞は、真菌細胞(例えば、Aspergillus(A.niger、A.fumigatus、A.oryzae、A.nidulaなど)、Acremonium(A.thermophilumなど)、Chaetomium(C.thermophilumなど)、Chrysosporium(C.thermophileなど)、Cordyceps(C.militarisなど)、Corynascus、Ctenomyces、Fusarium(F.oxysporumなど)、Glomerella(G.graminicolaなど)、Hypocrea(H.jecorinaなど)、Magnaporthe(M.orzyaeなど)、Myceliophthora(M.thermophileなど)、Nectria(N.heamatococcaなど)、Neurospora(N.crassaなど)、Penicillium、Sporotrichum(S.thermophileなど)、Thielavia(T.terrestris、T.heterothallicaなど)、Trichoderma(T.reeseiなど)、又はVerticillium(V.dahliaなど))である。
一実施例では、真核細胞は、昆虫細胞(例えば、Sf9、Mimic(商標)Sf9、Sf21、High Five(商標)(BT1-TN-5B1-4)、若しくはBT1-Ea88細胞)、藻類細胞(例えば、Amphora、Bacillariophyceae、Dunaliella、Chlorella、Chlamydomonas、Cyanophyta(シアノバクテリア)、Nannochloropsis、Spirulina、若しくはOchromonas属のもの)、又は植物細胞(例えば、単子葉植物(例えば、トウモロコシ、コメ、コムギ、若しくはセタリア属)、又は双子葉植物(例えば、キャッサバ、ジャガイモ、ダイズ、トマト、タバコ、アルファルファ、Physcomitrella patens若しくはArabidopsis)に由来する細胞)である。
一実施例では、細胞は、細菌又は原核細胞である。
実施例では、原核細胞は、Bacillus、Streptomyces、Streptococcus、Staphylococcus又はLactobacillusなどのグラム陽性細胞である。使用することができるBacillusは、例えば、B.subtilis、B.amyloliquefaciens、B.licheniformis、B.natto、又はB.megateriumである。実施例では、細胞は、B.subtilis 3NA及びB.subtilis 168などのB.subtilisである。Bacillusは、例えば、Bacillus Genetic Stock Center、Biological Sciences 556、484 West 12th Avenue、Columbus OH 43210-1214から取得可能である。
一実施例では、原核細胞は、Salmonella spp.又は例えば、TG1、TG2、W3110、DH1、DHB4、DH5a、HMS174、HMS174(DE3)、NM533、C600、HB101、JM109、MC4100、XL1-Blue及びOrigamiなどのEscherichia coli、並びに例えば、BL-21若しくはBL-21(DE3)などの大腸菌B株に由来するものなどのグラム陰性細胞であり、これらは全て市販されている。
好適な宿主細胞は、例えば、DSMZ(Deutsche Sammlung von Mikroorganismen and Zellkulturen GmbH、Braunschweig、Germany)又はAmerican Type Culture Collection(ATCC)などの菌株保存機関から市販されている。
実施例では、培養細胞を使用して、治療的使用のためのタンパク質、例えば、抗体、例えば、モノクローナル抗体、及び/又は組換えタンパク質を産生させる。実施例では、培養細胞は、ペプチド、アミノ酸、脂肪酸又は他の有用な生化学的中間体若しくは代謝物を産生する。例えば、実施例では、約4000ダルトン~約140,000ダルトンを超える分子量を有する分子を産生させることができる。実施例では、これらの分子は、一定範囲の複雑性を有し、グリコシル化などの翻訳後改変を含んでもよい。
実施例では、タンパク質は、例えば、BOTOX、Myobloc、Neurobloc、Dysport(又は他の血清型のボツリヌス神経毒)、アルグルコシダーゼアルファ、ダプトマイシン、YH-16、絨毛性性腺刺激ホルモンアルファ、フィルグラスチム、セトロレリックス、インターロイキン-2、アルデスロイキン、テセロイキン(teceleulin)、デニロイキンジフィトックス、インターフェロンアルファ-n3(注射剤)、インターフェロンアルファ-nl、DL-8234、インターフェロン、Suntory(ガンマ-1a)、インターフェロンガンマ、サイモシンアルファ1、タソネルミン、DigiFab、VeperaTAb、EchiTAb、CroFab、ネシリチド、アバタセプト、アレファセプト、Rebif、エプトテルミナルファ、テリパラチド(骨粗鬆症)、カルシトニン注射(骨疾患)、カルシトニン(経鼻、骨粗鬆症)、エタネルセプト、ヘモグロビングルタマー250(ウシ)、ドロトレコギンアルファ、コラゲナーゼ、カルペリチド、組換えヒト上皮増殖因子(局所用ゲル、創傷治癒)、DWP401、ダルベポエチンアルファ、エポエチンオメガ、エポエチンベータ、エポエチンアルファ、デシルジン、レピルジン、ビバリルジン、ノナコグアルファ、Mononine、エプタコグアルファ(活性化)、組換え第VIII因子+VWF、レコンビナート、組換え第VIII因子、第VIII因子(組換え体)、Alphnmate、オクトコグアルファ、第VIII因子、パリフェルミン、Indikinase、テネクテプラーゼ、アルテプラーゼ、パミテプラーゼ、レテプラーゼ、ナテプラーゼ、モンテプラーゼ、フォリトロピンアルファ、rFSH、hpFSH、ミカファンギン、ペグフィルグラスチム、レノグラスチム、ナルトグラスチム、セルモレリン、グルカゴン、エキセナチド、プラムリンチド、イニグルセラーゼ、ガルスルファーゼ、Leucotropin、モルグラモスチム、トリプトレリンアセテート、ヒストレリン(皮下埋込み体、Hydron)、デスロレリン、ヒストレリン、ナファレリン、ロイプロリド徐放型デポー剤(ATRIGEL)、ロイプロリド埋込み型(DUROS)、ゴセレリン、Eutropin、KP-102プログラム、ソマトロピン、メセカルミン(成長不全)、エンフュービルタイド(enlfavirtide)、Org-33408、インスリングラルギン、インスリングルリジン、インスリン(吸入薬)、インスリンリスプロ、インスリンデテミル、インスリン(口腔、RapidMist)、メカセルミンリンファバート、アナキンラ、セルモロイキン、99mTc-アプシタイド注射剤、ミエロイド、Betaseron、酢酸グラチラマー、Gepon、サルグラモスチム、オプレルベキン、ヒト白血球由来アルファインターフェロン、Bilive、インスリン(組換え体)、組換えヒトインスリン、インスリンアスパルト、メカセルミン(mecasenin)、Roferon-A、インターフェロン-アルファ2、Alfaferone、インターフェロンアルファコン-1、インターフェロンアルファ、Avonexの組換えヒト黄体形成ホルモン、ドルナーゼアルファ、トラフェルミン、ジコノタイド、タルチレリン、ジボテルミンアルファ、アトシバン、ベカプレルミン、エプチフィバチド、Zemaira、CTC-111、Shanvac-B、HPVワクチン(四価)、オクトレオチド、ランレオチド、アンセスチム、アガルシダーゼベータ、アガルシダーゼアルファ、ラロニダーゼ、プレザチド銅酢酸(局所用ゲル)、ラスブリカーゼ、ラニビズマブ、Actimmune、PEG-イントロン、Tricomin、組換えハウスダストダニアレルギー脱感作注射剤、組換えヒト副甲状腺ホルモン(PTH)1~84(sc、骨粗鬆症)、エポエチンデルタ、トランスジェニックアンチトロンビンIII、Granditropin、Vitrase、組換えインスリン、インターフェロン-アルファ(経口トローチ剤)、GEM-21S、バプレオチド、イズルスルファーゼ、オマパトリラト(omnapatrilat)、組換え血清アルブミン、セルトリズマブペゴール、グルカルピダーゼ、ヒト組換えC1エステラーゼ阻害剤(血管浮腫)、ラノテプラーゼ、組換えヒト成長ホルモン、エンフュービルタイド(針を用いない注射剤、Biojector 2000)、VGV-1、インターフェロン(アルファ)、ルシナクタント、アビプタジル(吸入薬、肺疾患)、イカチバント、エカランチド、オミガナン、Aurograb、酢酸ペキシガナン、ADI-PEG-20、LDI-200、デガレリクス、シントレデキンベスドトクス、Favld、MDX-1379、ISAtx-247、リラグルチド、テリパラチド(骨粗鬆症)、チファコギン、AA4500、T4N5リポソームローション、カツマキソマブ、DWP413、ART-123、Chrysalin、デスモテプラーゼ、アメジプラーゼ、コリフォリトロピンアルファ、TH-9507、テズグルチド、Diamyd、DWP-412、成長ホルモン(徐放型注射剤)、組換えG-CSF、インスリン(吸入薬、AIR)、インスリン(吸入薬、Technosphere)、インスリン(吸入薬、AERx)、RGN-303、DiaPep277、インターフェロンベータ(C型肝炎ウイルス感染(HCV))、インターフェロンアルファ-n3(経口薬)、ベラタセプト、経皮インスリンパッチ、AMG-531、MBP-8298、Xerecept、オペバカン、AIDSVAX、GV-1001、LymphoScan、ランピルナーゼ、Lipoxysan、ラスプルチド、MP52(ベータ型リン酸三カルシウム担体、骨再生)、メラノーマワクチン、シプリューセル-T、CTP-37、Insegia、ビテスペン、ヒトトロンビン(凍結型、手術による出血)、トロンビン、TransMID、アルフィメプラーゼ、Puricase、テルリプレシン(静脈内、肝腎症候群)、EUR-1008M、組換えFGF-I(注入型、血管疾患)、BDM-E、ロチガプチド、ETC-216、P-113、MBI-594AN、デュラマイシン(吸入型、嚢胞性線維症)、SCV-07、OPI-45、Endostatin、Angiostatin、ABT-510、ボーマン-バーク型阻害物質濃縮剤、XMP-629、99mTc-Hynic-Annexin V、カハラリドF、CTCE-9908、テベレリクス(徐放型)、オザレリクス、ロミデプシン、BAY-504798、インターロイキン4、PRX-321、Pepscan、イボクタデキン、rhラクトフェリン、TRU-015、IL-21、ATN-161、シレンジタイド、Albuferon、Biphasix、IRX-2、オメガインターフェロン、PCK-3145、CAP-232、パシレオチド、huN901-DMI、卵巣がんの免疫治療用ワクチン、SB-249553、Oncovax-CL、OncoVax-P、BLP-25、CerVax-16、マルチエピトープペプチドメラノーマワクチン(MART-1、gp100、チロシナーゼ)、ネミフィチド、rAAT(吸入型)、rAAT(皮膚科薬)、CGRP(吸入型、喘息)、ペグスネルセプト、サイモシンベータ4、プリチデプシン、GTP-200、ラモプラニン、GRASPA、OBI-1、AC-100、サケカルシトニン(経口薬、エリゲン)、カルシトニン(経口薬、骨粗鬆症)、エキサモレリン、カプロモレリン、Cardeva、ベラフェルミン、131I-TM-601、KK-220、T-10、ウラリチド、デペレスタット、ヘマタイド、Chrysalin(局所用)、rNAPc2、組換え第VIII因子(PEG化リポソーム)、bFGF、PEG化組換えスタフィロキナーゼ変異体、V-10153、SonoLysis Prolyse、NeuroVax、CZEN-002、膵島新生治療、rGLP-1、BIM-51077、LY-548806、エキセナチド(制御放出型、Medisorb)、AVE-0010、GA-GCB、アボレリン、ACM-9604、酢酸リナクロチド、CETi-1、Hemospan、VAL(注射剤)、速効型インスリン(注射剤、Viadel)、鼻内型インスリン、インスリン(吸入型)、インスリン(経口薬、エリゲン)、組換えメチオニルヒトレプチン、ピトラキンラ(皮下注射剤、湿疹)、ピトラキンラ(吸入型乾燥粉末、喘息)、Multikine、RG-1068、MM-093、NBI-6024、AT-001、PI-0824、Org-39141、Cpn10(自己免疫疾患/炎症)、タラクトフェリン(局所型)、rEV-131(眼科用)、rEV-131(呼吸器疾患)、経口型組換えヒトインスリン(糖尿病)、RPI-78M、オプレルベキン(経口薬)、CYT-99007 CTLA4-Ig、DTY-001、バラテグラスト、インターフェロンアルファ-n3(局所用)、IRX-3、RDP-58、Tauferon、胆汁酸塩刺激リパーゼ、Merispase、アルカリホスファターゼ、EP-2104R、Melanotan-II、ブレメラノチド、ATL-104、組換えヒトマイクロプラスミン、AX-200、SEMAX、ACV-1、Xen-2174、CJC-1008、ダイノルフィンA、SI-6603、LAB GHRH、AER-002、BGC-728、マラリアワクチン(ビロソーム、PeviPRO)、ALTU-135、パルボウイルスB19ワクチン、インフルエンザワクチン(組換えノイラミインダーゼ)、マラリア/HBVワクチン、炭疽病ワクチン、Vacc-5q、Vacc-4x、HIVワクチン(経口薬)、HPVワクチン、
Tat Toxoid、YSPSL、CHS-13340、PTH(1-34)リポソームクリーム(Novasome)、Ostabolin-C、PTHアナログ(局所型、乾癬)、MBRI-93.02、MTB72Fワクチン(結核)、MVA-Ag85Aワクチン(結核)、FARA04、BA-210、組換え疫病FIVワクチン、AG-702、OxSODrol、rBetV1、Der-p1/Der-p2/Der-p7アレルゲン標的化ワクチン(イエダニアレルギー)、PR1ペプチド抗原(白血病)、突然変異体rasワクチン、HPV-16 E7リポペプチドワクチン、ラビリンチンワクチン(腺癌)、CMLワクチン、WT1ペプチドワクチン(がん)、IDD-5、CDX-110、Pentrys、Norelin、CytoFab、P-9808、VT-111、イクロカプチド、テルベルミン(皮膚科用、糖尿病性足部潰瘍)、ルピントリビル、レティキュロース、rGRF、HA、アルファ-ガラクトシダーゼA、ACE-011、ALTU-140、CGX-1160、アンジオテンシン治療用ワクチン、D-4F、ETC-642、APP-018、rhMBL、SCV-07(経口薬、結核)、DRF-7295、ABT-828、ErbB2特異的免疫毒素(抗がん剤)、DT3SSIL-3、TST-10088、PRO-1762、Combotox、コレシストキニン-B/ガストリン受容体結合ペプチド、111In-hEGF、AE-37、トラスニズマブ-DM1、アンタゴニストG、IL-12(組換え)、PM-02734、IMP-321、rhIGF-BP3、BLX-883、CUV-1647(局所型)、L-19をベースとする放射線免疫治療薬(がん)、Re-188-P-2045、AMG-386、DC/1540/KLHワクチン(がん)、VX-001、AVE-9633、AC-9301、NY-ESO-1ワクチン(ペプチド)、NA17.A2ペプチド、メラノーマワクチン(パルス抗原治療薬)、前立腺がんワクチン、CBP-501、組換えヒトラクトフェリン(ドライアイ)、FX-06、AP-214、WAP-8294A(注射剤)、ACP-HIP、SUN-11031、ペプチドYY[3-36](肥満、鼻内型)、FGLL、アタシセプト、BR3-Fc、BN-003、BA-058、ヒト副甲状腺ホルモン1-34(経鼻型、骨粗鬆症)、F-18-CCR1、AT-1001(セリアック病/糖尿病)、JPD-003、PTH(7-34)リポソームクリーム(Novasome)、デュラマイシン(眼科用、ドライアイ)、CAB-2、CTCE-0214、グリコペグ化(GlycoPEGylated)エリスロポエチン、EPO-Fc、CNTO-528、AMG-114、JR-013、第XIII因子、アミノカンディン、PN-951、716155、SUN-E7001、TH-0318、BAY-73-7977、テベレリクス(即放型)、EP-51216、hGH(制御放出型、Biosphere)、OGP-I、シフュービルタイド、TV-4710、ALG-889、Org-41259、rhCC10、F-991、チモペンチン(肺疾患)、r(m)CRP、肝臓選択性インスリン、スバリン、L19-IL-2融合タンパク質、elafin、NMK-150、ALTU-139、EN-122004、rhTPO、トロンボポエチン受容体アゴニスト(血小板減少症)、AL-108、AL-208、神経成長因子アンタゴニスト(疼痛)、SLV-317、CGX-1007、INNO-105、経口型テリパラチド(エリゲン)、GEM-OS1、AC-162352、PRX-302、LFn-p24融合ワクチン(Therapore)、EP-1043、肺炎連鎖球菌小児ワクチン、マラリアワクチン、B群髄膜炎菌ワクチン、新生児B群連鎖球菌ワクチン、炭疽病ワクチン、HCVワクチン(gpE1+gpE2+MF-59)、中耳炎治療薬、HCVワクチン(コア抗原+ISCOMATRIX)、hPTH(1-34)(経皮型、ViaDerm)、768974、SYN-101、PGN-0052、アビスクミン、BIM-23190、結核ワクチン、マルチエピトープチロシナーゼペプチド、がんワクチン、エンカスチム、APC-8024、GI-5005、ACC-001、TTS-CD3、血管標的化TNF(固形腫瘍)、デスモプレシン(口腔制御放出型)、オネルセプト、及びTP-9201である。
いくつかの実施例では、ポリペプチドは、アダリムマブ(HUMIRA)、インフリキシマブ(REMICADE(商標))、リツキシマブ(RITUXAN(商標)/MAB THERA(商標))、エタネルセプト(ENBREL(商標))、ベバシズマブ(AVASTIN(商標))、トラスツズマブ(HERCEPTIN(商標))、ペグリルグラスチム(NEULASTA(商標))、又はバイオシミラー及びバイオベターを含む任意の他の好適なポリペプチドである。
他の好適なポリペプチドは、以下の表5、及び米国特許出願公開第2016/0097074号の表1に列挙されるものである。
Figure 2022097744000011

Figure 2022097744000012

Figure 2022097744000013

Figure 2022097744000014

Figure 2022097744000015

Figure 2022097744000016
実施例では、ポリペプチドは、ホルモン、血液凝固/凝集因子、サイトカイン/増殖因子、抗体分子、融合タンパク質、タンパク質ワクチン、又は表3に示されたペプチドである。
実施例では、タンパク質は、多特異的タンパク質、例えば、表4に示された二重特異性抗体である。
本開示のシステム及び方法を、以下の実験例を参照することにより更に詳細に説明する。これらの例は、単に例示目的のために提供され、別途特定しない限り、限定されることを意図していない。したがって、本開示は、以下の例に限定されるものとして決して解釈されるべきではなく、むしろ、本明細書において提供される教示の結果として明らかとなる、あらゆるバリエーションを包含すると解釈されるべきである。
更に記載されなくとも、当業者は、先行する記載及び以下の例示的な例を使用して、本開示の化合物を作製し、利用し、請求項に記載される方法を実施することができると考えられる。以下の例は、本開示の様々な態様を具体的に示しており、残りの開示をいかなる点においても限定するものとして解釈されない。
(例1)
本開示による生物製剤を処理するための処理溶液成分
表6~9は、バイオリアクタ中で調製される1つの生物製剤のための本開示による処理溶液の成分、成分濃度及び緩衝剤要件を列挙する。表7~9における緩衝剤A~Lは、表6において同定される緩衝剤A~Lに対応する。
バイオプロセス容器を使用して、以下の緩衝剤を含有させることができる:トリス、トリス塩基、Tricine、HEPES、MOPS、PIPES、TAPS、ビシン、BES、TES、カコジレート、MES、アセテート、MKP、ADA、ACES、グリシンアミド、アセトアミドグリシン、酢酸、クエン酸、グリシン、グリシングリシネート、リン酸ナトリウム、エタノール、塩酸、水酸化ナトリウム、塩化グアニジニウム、塩酸グアニジン、塩化ナトリウム、又はこれらの緩衝剤のいずれか若しくは他の緩衝剤の組合せ。
トリスは、トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタンとしても公知である。HEPESは、4-(2-ヒドロキシエチル)-1-ピペラジンエタンスルホン酸としても公知である。トリス塩基は、2-アミノ-2-(ヒドロキシメチル)-1,3-プロパンジオール、THAM、トリス塩基、及びトリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン、Trometamolとしても公知である。MOPSは、3-(N-モルホリノ)プロパンスルホン酸としても公知である。PIPESは、ピペラジン-N,N’-ビス(2-エタンスルホン酸)としても公知である。TAPSは、[トリス(ヒドロキシメチル)メチルアミノ]プロパンスルホン酸としても公知である。BESは、N,N-ビス(2-ヒドロキシエチル)-2-アミノエタンスルホン酸、N,N-ビス(2-ヒドロキシエチル)タウリンとしても公知である。TESは、2-[(2-ヒドロキシ-1,1-ビス(ヒドロキシメチル)エチル)アミノ]エタンスルホン酸、N-[トリス(ヒドロキシメチル)メチル]-2-アミノエタンスルホン酸、及びTES遊離酸としても公知である。MESは、2-(N-モルホリノ)エタンスルホン酸としても公知である。MKPは、リン酸一カリウムとしても公知である。ADAは、N-(2-アセトアミド)イミノ二酢酸、N-(カルバモイルメチル)イミノ二酢酸としても公知である。ACESは、N-(2-アセトアミド)-2-アミノエタンスルホン酸としても公知である。
Figure 2022097744000017
Figure 2022097744000018
Figure 2022097744000019
Figure 2022097744000020
本開示は、以下の特許請求の範囲で更に説明される。

Claims (20)

  1. 処理溶液を送達するためのシステムであって、
    第1のサイトで製造された濃縮処理溶液を含むバイオプロセス容器と、
    前記第1のサイトとは異なる第2のサイトに少なくとも1つの処理ユニットを有する処理エリアと、
    前記バイオプロセス容器を前記少なくとも1つの処理ユニットに接続するパイプであって、前記バイオプロセス容器から前記少なくとも1つの処理ユニットへの前記濃縮処理溶液の流れを許容し、それにより前記濃縮処理溶液と、前記少なくとも1つの処理ユニット内で製造された生体高分子含有溶液とを結合するバルブを有するパイプと
    を備え、前記処理溶液が緩衝剤及び培地のうちの少なくとも1つである、システム。
  2. 前記少なくとも1つの処理ユニットに接続されたコントローラを更に備え、
    前記濃縮処理溶液が、前記処理溶液が必要であることが前記コントローラによって決定され、前記決定が前記第2のサイトから前記第1のサイトへ通信されると、前記決定に基づいて提供される、請求項1に記載のシステム。
  3. 前記システムが、前記生体高分子含有溶液との結合に先立って前記濃縮処理溶液を希釈するように構成される、請求項1又は請求項2に記載のシステム。
  4. 前記処理溶液が、トリス、トリス塩基、トリシン、HEPES、MOPS、PIPES、TAPS、ビシン、BES、TES、カコジラート、MES、アセテート、MKP、ADA、ACES、グリシンアミド、アセトアミドグリシン、酢酸、クエン酸、グリシン、グリシングリシナート、リン酸ナトリウム、エタノール、塩酸、水酸化ナトリウム、塩化グアニジニウム、塩酸グアニジン、塩化ナトリウム及びこれらの任意の組合せのうちの1つである、請求項1から3までのいずれかに記載のシステム。
  5. 前記バイオプロセス容器が、前記処理溶液を接触させるための内部層、及び前記内部層を支持するように構成された外部層を含む、請求項1から4までのいずれかに記載のシステム。
  6. 前記処理溶液のバイオバーデンを決定するように構成されたコントローラを更に備える、請求項1及び3から5までのいずれかに記載のシステム。
  7. 希釈液サプライを備え、
    前記バイオプロセス容器からの前記濃縮処理溶液、及び前記希釈液サプライからの水及び緩衝剤のうちの少なくとも1つがインライン処理溶液希釈システムの入口に加えられ、それにより希釈された処理溶液が得られる、請求項1から6までのいずれかに記載のシステム。
  8. 処理溶液を送達するための方法であって、
    バイオプロセス容器の中に濃縮処理溶液を提供するステップであって、第1のサイトで前記濃縮処理溶液が製造される、ステップと、
    前記濃縮処理溶液と、前記第1のサイトとは異なる第2のサイトのバイオリアクタ内で製造された生体高分子含有溶液とを結合するステップと
    を含み、前記処理溶液が緩衝剤及び培地のうちの少なくとも1つである、方法。
  9. 前記濃縮処理溶液が、前記濃縮処理溶液が必要であることが決定され、且つ、前記決定が前記第2のサイトから前記第1のサイトへ通信されることに基づいて提供される、請求項8に記載の方法。
  10. 前記生体高分子含有溶液との結合に先立って前記濃縮処理溶液を希釈するステップを更に含む、請求項8又は請求項9に記載の方法。
  11. 前記処理溶液が、トリス、トリス塩基、トリシン、HEPES、MOPS、PIPES、TAPS、ビシン、BES、TES、カコジラート、MES、アセテート、MKP、ADA、ACES、グリシンアミド、アセトアミドグリシン、酢酸、クエン酸、グリシン、グリシングリシナート、リン酸ナトリウム、エタノール、塩酸、水酸化ナトリウム、塩化グアニジニウム、塩酸グアニジン、塩化ナトリウム及びこれらの任意の組合せのうちの1つである、請求項8から10までのいずれかに記載の方法。
  12. 前記バイオプロセス容器が、産物接触のための内部層、及び前記内部層を支持するように構成された外部層を備える、請求項8から11までのいずれかに記載の方法。
  13. 前記処理溶液のバイオバーデンを決定するステップを更に含む、請求項8から12までのいずれかに記載の方法。
  14. 前記処理溶液を含む前記バイオプロセス容器を前記第1のサイトから前記第2のサイトへ輸送するステップを更に含む、請求項8から13までのいずれかに記載の方法。
  15. 薬剤製造施設であって、
    濃縮処理溶液を含むように構成された少なくとも1つのバイオプロセス容器を受け取ることができる緩衝剤貯蔵エリアと、
    少なくとも1つの処理ユニットを有する処理エリアと、
    前記緩衝剤貯蔵エリアを前記処理エリアから分離する壁と、
    前記緩衝剤貯蔵エリア内に第1の端部を有し、また、前記処理エリア内に第2の端部を有する少なくとも1つのパイプであって、前記第1の端部が、前記少なくとも1つのバイオプロセス容器のうちの少なくとも1つのバイオプロセス容器に接続するように構成され、また、前記第2の端部が、前記少なくとも1つの処理ユニットのうちの少なくとも1つの処理ユニットに接続するように構成されるパイプと
    を備える薬剤製造施設。
  16. 前記少なくとも1つのパイプがバルブを有する、請求項15に記載の薬剤製造施設。
  17. 前記少なくとも1つのバイオプロセス容器が、前記処理溶液を接触させるための内部層、及び前記内部層を支持するように構成された外部層を含む、請求項15又は請求項16に記載の薬剤製造施設。
  18. 前記緩衝剤貯蔵エリア内のプラットホームを更に備え、前記プラットホームが、前記少なくとも1つのバイオプロセス容器を支持するように構成され、
    前記少なくとも1つのバイオプロセス容器が複数のバイオプロセス容器を含み、
    前記プラットホームが、前記複数のバイオプロセス容器のうちの少なくとも1つのバイオプロセス容器を支持するように構成された第1のレベル、及び前記複数のバイオプロセス容器のうちの少なくとも1つのバイオプロセス容器を支持するように構成された第2のレベルを有し、
    前記プラットホームが、ユーザによる、フォークリフトを使用した前記プラットホーム上への前記複数のバイオプロセス容器のうちの1つのバイオプロセス容器の据付けを許容するように構成され、また、前記プラットホームが、ユーザによる、前記フォークリフトを使用した前記プラットホームからのそれぞれの前記バイオプロセス容器の除去を許容するように構成される、請求項15から17までのいずれかに記載の薬剤製造施設。
  19. 前記プラットホームに沿って間隔を隔てた複数の入口を更に備え、個々の入口が前記少なくとも1つのパイプに接続され、また、個々の入口が、前記複数のバイオプロセス容器のうちの1つのバイオプロセス容器の出口に接続されるように構成される、請求項18に記載の薬剤製造施設。
  20. 前記処理エリアがクリーンルーム環境として構成される、請求項15から19までのいずれかに記載の薬剤製造施設。
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