JP2022094509A - 電気泳動分析データ処理装置及びデータ処理プログラム - Google Patents
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Abstract
Description
取得されたデータに基いてエレクトロフェログラムを作成し、表示部の画面上に表示する表示処理部と、
前記表示部に表示されているエレクトロフェログラム上で、解析対象として抽出するスメア範囲をユーザーに指定させるとともに、指定されたスメア範囲に対応する前記エレクトロフェログラム上の背景領域を他の背景領域と識別可能な態様で示す解析範囲指定部と、
指定された前記スメア範囲に含まれるデータを用いて所定のスメア解析を実施する解析処理部と、
を備えるものである。
取得されたデータに基いてエレクトロフェログラムを作成し、表示部の画面上に表示する表示処理ステップと、
前記表示部に表示されているエレクトロフェログラム上で、解析対象として抽出するスメア範囲をユーザーに指定させるとともに、指定されたスメア範囲に対応する前記エレクトロフェログラム上の背景領域を他の背景領域とは識別可能な態様で示す解析範囲指定ステップと、
指定された前記スメア範囲に含まれるデータを用いて所定のスメア解析を実施する解析処理ステップと、
を実行させるものである。
本システムは、図1に示すように、測定部1、制御部2、データ処理部3、操作部4、及び表示部5、を備える。
測定部1は、与えられたサンプルについて測定(電気泳動分析)を実行してデータを取得するものであって、サンプル供給部10、電気泳動分離部11、検出部12、アナログデジタル変換器(ADC)13などを含む。
上述した例示的な実施形態は、以下の態様の具体例であることが当業者により理解される。
取得されたデータに基いてエレクトロフェログラムを作成し、表示部の画面上に表示する表示処理部と、
前記表示部に表示されているエレクトロフェログラム上で、解析対象として抽出するスメア範囲をユーザーに指定させるとともに、指定されたスメア範囲に対応する前記エレクトロフェログラム上の背景領域を他の背景領域と識別可能な態様で示す解析範囲指定部と、
指定された前記スメア範囲に含まれるデータを用いて所定のスメア解析を実施する解析処理部と、
を備えるものである。
取得されたデータに基いてエレクトロフェログラムを作成し、表示部の画面上に表示する表示処理ステップと、
前記表示部に表示されているエレクトロフェログラム上で、解析対象として抽出するスメア範囲をユーザーに指定させるとともに、指定されたスメア範囲に対応する前記エレクトロフェログラム上の背景領域を他の背景領域とは識別可能な態様で示す解析範囲指定ステップと、
指定された前記スメア範囲に含まれるデータを用いて所定のスメア解析を実施する解析処理ステップと、
を実行させるものである。
10…サンプル供給部
11…電気泳動分離部
12…検出部
13…AD変換部
2…制御部
3…データ処理部
30…データ格納部
31…エレクトロフェログラム作成部
32…ゲルイメージ作成部
33…表示処理部
34…スメア範囲指定処理部
35…スメア解析処理部
4…操作部
5…表示部
100…スメア解析画面
101…サンプル表示領域
102…ゲルイメージ表示領域
103…エレクトロフェログラム表示領域
104…解析結果表示領域
105…サイズ入力ダイアログ
300A、300B…エレクトロフェログラム
310、320…スメア範囲
311、321…開始位置指示ライン
312、322…終了位置指示ライン
313、323…範囲指示タグ
400…解析結果テーブル
410…開始サイズ表示欄
420…終了サイズ表示欄
430…解析結果表示欄
500…サイズ指定データグリッド
510…開始サイズ入力欄
520…終了サイズ入力欄
Claims (12)
- 電気泳動分析により取得されたデータを処理するデータ処理装置であって、
取得されたデータに基いてエレクトロフェログラムを作成し、表示部の画面上に表示する表示処理部と、
前記表示部に表示されているエレクトロフェログラム上で、解析対象として抽出するスメア範囲をユーザーに指定させるとともに、指定されたスメア範囲に対応する前記エレクトロフェログラム上の背景領域を他の背景領域と識別可能な態様で示す解析範囲指定部と、
指定された前記スメア範囲に含まれるデータを用いて所定のスメア解析を実施する解析処理部と、
を備える電気泳動分析データ処理装置。 - 前記表示処理部は、一つ以上の泳動波形を、少なくとも横軸を揃えて配置したエレクトロフェログラムを作成して表示し、
前記解析範囲指定部は、前記一つ以上の泳動波形が表示されているエレクトロフェログラム上でスメア範囲の指定を受け付ける、請求項1に記載の電気泳動分析データ処理装置。 - 前記解析範囲指定部は、エレクトロフェログラム上に表示されるスメア範囲の両端部をそれぞれドラッグ操作により移動させることで、該スメア範囲の位置及び幅の変更を行う、請求項1又2に記載の電気泳動分析データ処理装置。
- 前記解析範囲指定部は、エレクトロフェログラム上に表示されるスメア範囲にそれぞれ割り当てられたタグをドラッグ操作で移動させることにより、該スメア範囲の幅を保ったまま位置の変更を行う、請求項1~3のいずれか1項に記載の電気泳動分析データ処理装置。
- 前記解析範囲指定部は、解析対象のスメア範囲の開始位置及び終了位置をそれぞれ数値で入力するための入力領域を、エレクトロフェログラムと同じ画面上に表示し、該エレクトロフェログラム上でのスメア範囲に関する指示操作と、前記入力領域における数値での入力操作とを互いに連動させる、請求項1~4のいずれか1項に記載の電気泳動分析データ処理装置。
- 前記解析処理部は、前記解析範囲指定部により指定されるスメア範囲が変更される毎にスメア解析を実行し、前記表示処理部は、前記解析処理部によるスメア解析結果をエレクトロフェログラムと同じ画面上に表示する、請求項1~5のいずれか1項に記載の電気泳動分析データ処理装置。
- 電気泳動分析により取得されたデータを処理するためのデータ処理プログラムであって、コンピューターに、
取得されたデータに基いてエレクトロフェログラムを作成し、表示部の画面上に表示する表示処理ステップと、
前記表示部に表示されているエレクトロフェログラム上で、解析対象として抽出するスメア範囲をユーザーに指定させるとともに、指定されたスメア範囲に対応する前記エレクトロフェログラム上の背景領域を他の背景領域とは識別可能な態様で示す解析範囲指定ステップと、
指定された前記スメア範囲に含まれるデータを用いて所定のスメア解析を実施する解析処理ステップと、
を実行させる電気泳動分析データ処理プログラム。 - 前記表示処理ステップでは、一つ以上の泳動波形を、少なくとも横軸を揃えて配置したエレクトロフェログラムを作成して表示し、
前記解析範囲指定ステップでは、前記一つ以上の泳動波形が表示されているエレクトロフェログラム上でスメア範囲の指定を受け付ける、請求項7に記載の電気泳動分析データ処理プログラム。 - 前記解析範囲指定ステップでは、エレクトロフェログラム上に表示されるスメア範囲の両端部をそれぞれドラッグ操作により移動させることで、該スメア範囲の位置及び幅の変更を行う、請求項7又は8に記載の電気泳動分析データ処理プログラム。
- 前記解析範囲指定ステップでは、エレクトロフェログラム上に表示されるスメア範囲にそれぞれ割り当てられたタグをドラッグ操作で移動させることにより、該スメア範囲の幅を保ったまま位置の変更を行う、請求項7~9のいずれか1項に記載の電気泳動分析データ処理プログラム。
- 前記解析範囲指定ステップでは、解析対象のスメア範囲の開始位置及び終了位置をそれぞれ数値で入力するための入力領域を、エレクトロフェログラムと同じ画面上に表示し、該エレクトロフェログラム上でのスメア範囲に関する指示操作と、前記入力領域における数値での入力操作とを互いに連動させる、請求項7~10のいずれか1項に記載の電気泳動分析データ処理プログラム。
- 前記解析処理ステップでは、前記解析範囲指定ステップにおいて指定されるスメア範囲が変更される毎にスメア解析を実行し、前記表示処理ステップでは、前記解析処理ステップによるスメア解析結果を前記エレクトロフェログラムと同じ画面上に表示する、請求項7~11のいずれか1項に記載の電気泳動分析データ処理プログラム。
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