JP2022025081A - 血友病aの治療に有用な操作されたヌクレアーゼ - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、2016年5月3日に出願された、「血友病Aの治療に有用な操作されたヌ
クレアーゼ(ENGINEERED NUCLEASES USEFUL FOR TR
EATMENT OF HEMOPHILIA A)」と題される米国特許仮出願第62
/33 1,335号の優先権を主張し、その開示内容全体が参照により本明細書に組み
込まれる。
I因子遺伝子のイントロン22内、特にint22h-1配列内の認識配列に対する特異
性を有する操作されたヌクレアーゼに関する。このような操作されたヌクレアーゼは、第
VIII因子遺伝子のエクソン1-22の逆位を特徴とする血友病Aの治療方法において
有用である。
本出願には、EFS-Webを介してASCIIフォーマットで提出された配列表が含
まれており、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。2017年5月2日に作成
されたこのASCIIコピーは、182W01_Sequence_Listing_F
inalという名称でサイズは172,847バイトである。
疾患である。この遺伝病は、X染色体上に位置付けられた凝固第VIII因子(F8)遺
伝子内の種々の突然変異から生じ得、この突然変異は、大きな欠失、挿入、逆位、及び点
突然変異を含む。臨床的に、血友病Aは、患者の血漿中の相対的な第VIII因子活性に
基づいて、軽症(5~30%活性、患者の50%)、中等症(2~5%活性、患者の10
%)、又は重症(<1%活性、患者の50%)に分類することができる。現在のところ、
血友病Aの治療法はない。標準療法は組換え第VIII因子の投与を含むが、このアプロ
ーチは費用、頻繁な注射の必要性、及び治療の有効性を低下させる第VIII因子不活性
化抗体が被験体に形成されることによって制限される。従って、血友病Aの代替治療のた
めの明確な必要性が依然として存在する。第VIII因子遺伝子の突然変異を標的とする
遺伝子治療は、治療に対する魅力的だが分かりにくいアプローチにとどまっている。
ンド因子に結合した不活性形態で体内を循環する。傷害に応答して、第VIII因子が活
性化され(第Villa因子)、フォンビレブランド因子から分離し、次に凝固カスケー
ドの一部として第IXa因子と相互作用し、これによりフィルビンの形成及び安定な凝固
が生じる。多くの研究により、第VIII因子は、肝臓の類洞内皮細胞及び肝臓以外の体
中の造血細胞によって産生されることが示唆されている。
26エクソンを含む。野生型第VIII因子遺伝子は2つのタンパク質をコードする。第
1のタンパク質は、エクソン1~26に見出される9030塩基によってコードされ、2
332個のアミノ酸残基を含有する循環型を有する全長第VIII因子タンパク質である
。第VHIb因子と呼ばれる第2のタンパク質は、第VIII因子遺伝子に存在する5つ
のエクソン中の2598塩基によってコードされる。得られるタンパク質は216個のア
ミノ酸を含み、現在知られていない機能を有する。
色体内逆位によって引き起こされる。この逆位は、int22h-1と呼ばれるイントロ
ン22の約9.5kbのセグメントが、X染色体上の第VIII因子遺伝子に対して約4
00kb及び500kbテロメアに位置する2つの反復コピー(それぞれint22h-
2及びint22h-3と呼ばれる)の1つと再結合するときに生じる。組換えの後、因
子VIII遺伝子のエクソン1-22は、エクソン23-26に対してゲノムにおいて逆
位し、エクソン23-26によってコードされるアミノ酸が欠損している切断型の不活性
な第VIII因子タンパク質の発現をもたらす(非特許文献1)。
に向いている。初期の研究は、int22h-2及びint22h-3が両方ともint
22h-1に対して逆向きであり、いずれかの反復配列で再構成が起こることを可能にす
ることを示唆した。これはタイプIの逆位とタイプIIの逆位と呼ばれた。しかしながら
、より最近のエビデンスは、int22h-2とint22h-3がX染色体上で互いに
逆向きで見出され、不完全なパリンドロームの一部であることを示す(図1)。このパリ
ンドローム内の配列の組換えにより、int22h-2とin22h-3はゲノム内の場
所を交換し、結果としてint22h-1に対してそれらの向きを変えることができる。
結果として、int22h-1配列は、異なる状況において、int22h-1に対して
反対向きにあるものに応じて、int22h-2反復又はint22h-3反復と再結合
することができる(非特許文献2)。
関連1)及びF8Bと呼ばれる2つのさらなる遺伝子のための双方向プロモーターとして
作用するCpGアイランドを含有する。CpGアイランド及びイントロンなしのF8A1
遺伝子(配列番号5)は両方ともint22h-1配列内(従って、int22h-2及
びin22h-3内)に含有され、第VIII因子遺伝子とは反対方向に転写される(非
特許文献3)。興味深いことに、本発明者らは、F8A1遺伝子の配列が、イヌゲノムの
第VIII因子遺伝子、特に第VIII因子が欠失し第VIII因子遺伝子のエクソン1
-22の逆位を示すイヌの臨床関連集団と有意な相同性を示す、ヒト第VIII因子遺伝
子の唯一の領域であることを確認した(非特許文献4)。
アに位置する逆向き反復配列(int22h-2又はint22h-3)との組換えを促
進するために、int22h-1配列内のDNA配列を認識するように操作された、部位
特異的な希少切断エンドヌクレアーゼの使用を必要とする。本発明者らは、これらの領域
間のヌクレアーゼ誘導組換えが、第VIII因子遺伝子のエクソン1-22の逆位又は復
帰をもたらすことを見出した。
。例えば、ジンクフィンガーヌクレアーゼ(ZFN)は、ゲノム中の所定の部位を認識し
切断するように操作することができる。ZFNは、FokI制限酵素のヌクレアーゼドメ
インに融合したジンクフィンガーDNA結合ドメインを含むキメラタンパク質である。ジ
ンクフィンガードメインは、長さが約18塩基対の所定のDNA配列に結合するタンパク
質を産生するための合理的又は実験的手段によって再設計することができる。この操作さ
れたタンパク質ドメインをFokIヌクレアーゼに融合することにより、ゲノムレベル特
異性を有するDNA切断を標的とすることが可能である。ZFNは、広範囲の真核生物に
おける遺伝子の付加、除去、及び置換を標的とするために広く使用されている(非特許文
献5に概説されている)。
の特定の部位を切断することができる。ZFNと同様に、TALENは、FokIヌクレ
アーゼドメインに融合した操作された部位特異的DNA結合ドメインを含む(非特許文献
6に概説されている)。しかし、この場合、DNA結合ドメインは、各々が単一のDNA
塩基対を特異的に認識するTALエフェクタードメインのタンデム配列を含む。
造である(非特許文献7)。コンパクトTALENは、I-TevIホーミングエンドヌ
クレアーゼからのヌクレアーゼドメインに融合した、操作された部位特異的TALエフェ
クターDNA結合ドメインを含む。Foklとは異なり、I-TevIは二本鎖DNA切
断を行うために二量体化する必要がないので、コンパクトTALENは単量体として機能
する。
れている(非特許文献8)。CRISPRエンドヌクレアーゼは、2つの成分、即ち(1
)カスパーゼエフェクターヌクレアーゼ、典型的には微生物Cas9と、(2)ヌクレア
ーゼをゲノム内の目的の位置に向ける約20個のヌクレオチド標的配列を含む短い「ガイ
ドRNA」とを含む。異なる標的配列を各々有する同じ細胞内に複数のガイドRNAを発
現させることにより、ゲノム中の複数の部位に同時にDNA切断を標的化することが可能
である。
クレアーゼ(「メガヌクレアーゼ」とも呼ばれる)である。ホーミングエンドヌクレアー
ゼは、植物及び真菌のゲノムに一般的に見られる15~40塩基対切断部位を認識する天
然ヌクレアーゼの群である。それらは、1型自己スプライシングイントロン及びインテイ
ンのような寄生DNA要素と頻繁に関連している。それらは、細胞DNA修復機構を補充
する染色体に二本鎖切断を生じさせることによって、宿主ゲノムの特定の位置で相同組換
え又は遺伝子挿入を自然に促進する(非特許文献9)。ホーミングエンドヌクレアーゼは
、通常、LAGLIDADGファミリー、GIY-YIGファミリー、His-Cysボ
ックスファミリー、及びHNHファミリーの4つのファミリーに分類される。これらのフ
ァミリーは、触媒活性及び認識配列に影響を及ぼす構造モチーフを特徴とする。例えば、
LAGLIDADGファミリーのメンバーは、保存されたLAGLIDADGモチーフの
1つ又は2つのいずれかのコピーを有することによって特徴付けられる(非特許文献10
を参照)。LAGLIDADGモチーフの単一のコピーを有するLAGLIDADGホー
ミングエンドヌクレアーゼはホモダイマーを形成するが、LAGLIDADGモチーフの
2つのコピーを有するメンバーはモノマーとして見出される。
inhardtii)の葉緑体染色体中の22塩基対の認識配列を認識し切断する、ホー
ミングエンドヌクレアーゼのLAGLIDADGファミリーのメンバーである。野生型I
-CreI切断部位の優先性を改変するために、遺伝子選択技術が使用されている(非特
許文献11)。I-CreI及び他のホーミングエンドヌクレアーゼを包括的に再設計し
て、哺乳動物、酵母、植物、細菌、及びウイルスゲノム中の部位を含む広く拡散するDN
A部位を標的とすることができるモノLAGLIDADGホーミングエンドヌクレアーゼ
を合理的に設計する方法が記載された(特許文献1)。
通常は二量体であるが、第1のサブユニットのC末端を第2のサブユニットのN末端に接
合する短いペプチドリンカーを用いて、単一のポリペプチドに融合することができる(非
特許文献12)。従って、機能的な「一本鎖」メガヌクレアーゼは、単一の転写物から発
現され得る。これは、操作されたメガヌクレアーゼで観察される非常に低い頻度のオフタ
ーゲット切断と相まって、それらを本発明にとって好ましいエンドヌクレアーゼにする。
されている。Parkらは、TALENを使用して、HEK 293T細胞中の第VII
I因子遺伝子のエクソン1の逆位を誘導し、多能性幹細胞(iPSC)を誘導することを
記載している(非特許文献13)。エクソン1の逆位は、第VIII因子遺伝子のイント
ロン1のintlh-1配列と第VIII因子遺伝子のテロメアに位置する単一の相同領
域(intlh-2)との間の相同組換えにより起こる血友病Aの発生とも関連している
。この研究のために選択されたTALENは、HEK 293T細胞及びiPSCにおい
てそれぞれ1.9%及び1.4%の効率でこの短い配列の逆位を誘導するために、イント
ロン1相同領域内で切断した。著者らは更に、1.3%の同様の効率でiPSCにおける
エクソン1の復帰を実証した。
おける、第VIII因子遺伝子のエクソン1-22の復帰を誘導するためのCRISPR
/Casシステムの使用を報告した(非特許文献14)。著者らは、エクソン1-22の
逆位はエクソン1の逆位よりも8倍多いことに気付いたが、エクソン1-22の逆位は復
帰させることが技術的により困難であることを強調し、一部の理由として、逆位の実質的
により大きなサイズ(140kbpと比較して600kbp)、及びInt1h-1配列
の2つの相同体のみと比較して、X染色体上のint22h-1配列の3つの相同体の存
在が挙げられる。実際、Parkらは、int22h相同性領域内で切断することによっ
て、逆位600-kbpセグメントの所望の復帰ではなく、Int22h-1、int2
2h-2、及びint22h-3の相同体のいずれか2つに関与する望ましくない欠失や
逆位が誘導される可能性を除外するために、これら3つのint22相同体領域の外側の
認識配列を特異的に標的にしている。このアプローチを用いて、著者らは、iPS細胞に
おいて約3.7%の復帰頻度を観察した。
h相同体領域内の認識配列を標的化することを回避するための当該技術分野の示唆にもか
かわらず、本発明者らは、int22h-1内の標的認識配列を標的化すると、第VII
I因子におけるエクソン1-22の逆位又は復帰を高効率で生成できることを見出した。
更に、int22h-1配列内で標的化されたいくつかの認識配列は、F8A1配列内に
見出され、本発明者らは、これがイヌ第VIII因子遺伝子と高度の相同性を共有する第
VIII因子遺伝子の唯一の領域であることを見出した。従って、本発明の方法は、血友
病Aに罹患しているヒト被験体だけでなく、同様にエクソン1-22の逆位を発現する臨
床関連のイヌ血友病A集団においても有用である。従って、本発明は、重症血友病Aに対
するさらなる遺伝子治療アプローチのための当該分野における必要性を満たす。
療に有用な遺伝子操作されたヌクレアーゼを提供する。本発明の操作されたヌクレアーゼ
は、第VIII因子遺伝子のint22h-1配列内の認識配列を認識し切断することに
より、int22h-1配列と、X染色体上の第VIII因子遺伝子に対してテロメアに
位置する同一の又は高度に相同な逆位反復配列との組換えを促進する。このような組換え
は、エクソン1-22の復帰をもたらし、野生型第VIII因子遺伝子を生成する。本発
明はまた、第VIII因子遺伝子のint22h-1配列内に位置する認識配列に対する
特異性を有する操作されたヌクレアーゼを利用する、血友病Aの治療のための医薬組成物
及び方法を提供する。本発明は更に、第VIII因子遺伝子のエクソン1-22の逆位を
修正するように改変された遺伝子改変細胞、並びにこのような遺伝子改変細胞を含む薬学
的組成物及び血友病Aの治療のためのその使用方法を提供する。
識配列を認識し切断する操作されたメガヌクレアーゼを提供する。操作されたメガヌクレ
アーゼは、第1のサブユニットと第2のサブユニットとを含み、第1のサブユニットは、
認識配列の第1の認識ハーフサイトに結合し、第1の超可変領域(HVR1)を含み、第
2のサブユニットは、認識配列の第2の認識ハーフサイトに結合し、第2の超可変領域(
HVR2)を含む。
とも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、又はそれ以上の
配列同一性を有することができる。このような一実施形態では、int22h-1配列は
、配列番号3又は配列番号4を含み得る。
し得る。このような実施形態では、F8A1コード配列は、配列番号5又は配列番号6に
対して少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、又
はそれ以上の配列同一性を有することができる。別のこのような実施形態では、F8A1
コード配列は、配列番号5又は配列番号6を含み得る。
70又は配列番号20-21のいずれか1つの残基24~79に対応するアミノ酸配列に
対して少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むことができる。
221,223,224,229,231,233,235,237,259,261,
266及び268に対応する残基を含むことができるか、又は配列番号20~21のいず
れか1つの残基24,26,28,30,32,33,38,40,42,44,46,
68,70,75,及び77を含むことができる。
番号20~21のいずれか1つの残基24~79を含むことができる。
、又は配列番号20~21のいずれか1つの残基215~270に対応するアミノ酸配列
に対して少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むことができる。
32,33,38,40,42,44,68,70,75,及び77に対応する残基を含
むことができるか、又は配列番号20~21のいずれか1つの残基215、217,21
9,221,223,224,229,231,233,235,259,261,26
6,及び268に対応する残基を含むことができる。
20~21のいずれか1つの残基215~270を含むことができる。
4又は配列番号20若しくは21の残基7~153に対して少なくとも80%、少なくと
も85%、少なくとも90%、少なくとも95%、若しくはそれ以上の配列同一性を有す
るアミノ酸配列を含むことができ、第2のサブユニットは、配列番号19の残基7~15
3又は配列番号20若しくは21の残基198~344に対して少なくとも80%、少な
くとも85%、少なくとも90%、少なくとも95、若しくはそれ以上の配列同一性を有
するアミノ酸配列を含むことができる。
44又は配列番号20若しくは21の残基7~153を含むことができる。別のそのよう
な実施形態では、第2のサブユニットは、配列番号19の残基7~153又は配列番号2
0若しくは21の残基198~344を含むことができる。
メガヌクレアーゼであってもよく、リンカーは、第1のサブユニット及び第2のサブユニ
ットに共有結合する。
いずれか1つのアミノ酸配列を含むことができる。
1つの残基215~270に対応するアミノ酸配列に対して少なくとも80%の配列同一
性を有するアミノ酸配列を含むことができる。
,217,219,221,223,224,231,233,235,237,261
,266,及び268に対応する残基を含むことができる。
5~270を含むことができる。
1つの残基24~79に対応するアミノ酸配列に対して少なくとも80%の配列同一性を
有するアミノ酸配列を含むことができる。
26,28,30,32,33,38,40,42,44,46,68,70,75,及
び77に対応する残基を含むことができる。
含むことができる。
~79を含むことができる。
つの残基198~344に対して少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90
%、少なくとも95%、又はそれ以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むことがで
き、第2のサブユニットは、配列番号28~31のいずれか1つの残基7~153に対し
て少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、又はそ
れ以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むことができる。
1つの残基198~344を含むことができる。別のそのような実施形態では、第2のサ
ブユニットは、配列番号28~31のいずれか1つの残基7~153を含むことができる
。
メガヌクレアーゼであり、リンカーは、第1のサブユニット及び第2のサブユニットに共
有結合する。
いずれか1つのアミノ酸配列を含むことができる。
又は配列番号41-43のいずれか1つの残基215~270に対応するアミノ酸配列に
対して、少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むことができる。
2,33,38,40,42,44,46,68,70,75,及び77に対応する残基
を含むことができるか、又は配列番号41~43のいずれか1つの残基215,217,
219,221,223,224,229,231,233,235,237,259,
261,266,及び268に対応する残基を含むことができる。
1~43のいずれか1つの残基215~270を含むことができる。
70又は配列番号41-43のいずれか1つの残基24~79に対応するアミノ酸配列に
対して、少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むことができる。
21,223,224,229,231,233,235,237,259,261,2
66,及び268に対応する残基を含むことができるか、又は配列番号41~43のいず
れか1つの残基24,26,28,30,32,33,38,40,42,44,46,
68,70,75,及び77に対応する残基を含むことができる。
号41~43のいずれか1つの残基24~79を含むことができる。
は配列番号41~43のいずれか1つの残基198~344に対して少なくとも80%、
少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、又はそれ以上の配列同一性を
有するアミノ酸配列を含むことができ、第2のサブユニットは、配列番号40の残基19
8~344又は配列番号41~43のいずれか1つの残基7~153に対して少なくとも
80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、又はそれ以上の配列
同一性を有するアミノ酸配列を含むことができる。
又は配列番号41~43のいずれか1つの残基198~344を含むことができる。別の
そのような実施形態では、第2のサブユニットは、配列番号40の残基198~344又
は配列番号41~43のいずれか1つの残基7~153を含むことができる。
メガヌクレアーゼであり、リンカーは、第1のサブユニット及び第2のサブユニットに共
有結合する。
いずれか1つのアミノ酸配列を含むことができる。
1つの残基24~79に対応するアミノ酸配列に対して、少なくとも80%の配列同一性
を有するアミノ酸配列を含むことができる。
26,28,30,32,33,38,40,42,44,68,70,75,及び77
に対応する残基を含むことができる。
~79を含むことができる。
1つの残基215~270に対応するアミノ酸配列に対して、少なくとも80%の配列同
一性を有するアミノ酸配列を含むことができる。
,217,219,221,223,224,229,231,233,235,237
,259,261,266,及び268に対応する残基を含むことができる。
5~270を含むことができる。
つの残基7~153に対して少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、
少なくとも95%、又はそれ以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むことができ、
第2のサブユニットは、配列番号52~55のいずれか1つの残基198~344に対し
て少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、又はそ
れ以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むことができる。
1つの残基7~153を含むことができる。別のそのような実施形態では、第2のサブユ
ニットは、配列番号52~55のいずれか1つの残基198~344を含むことができる
。
メガヌクレアーゼであり、リンカーは、第1のサブユニット及び第2のサブユニットに共
有結合する。
いずれか1つのアミノ酸配列を含むことができる。
又は配列番号65-67のいずれか1つの残基215~270に対応するアミノ酸配列に
対して、少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むことができる。
32,33,40,42,44,46,68,70,75,及び77に対応する残基を含
むことができるか、又は配列番号65~67のいずれか1つの残基215、217,21
9,221,223,224,231,233,235,237,259,261,26
6,及び268に対応する残基を含むことができる。
5~67のいずれか1つの残基215~270を含むことができる。
70又は配列番号65-67のいずれか1つの残基24~79に対応するアミノ酸配列に
対して、少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むことができる。
21,223,224,229,231,233,235,237,259,261,2
66,及び268に対応する残基を含むことができるか、又は配列番号65~67のいず
れか1つの残基24,26,28,30,32,33,38,40,42,44,46,
68,70,75,及び77に対応する残基を含むことができる。
号65~67のいずれか1つの残基24~79を含むことができる。
は配列番号65~67のいずれか1つの残基198~344に対して少なくとも80%、
少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、又はそれ以上の配列同一性を
有するアミノ酸配列を含むことができ、第2のサブユニットは、配列番号64の残基19
8~344又は配列番号65~67のいずれか1つの残基7~153に対して少なくとも
80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、又はそれ以上の配列
同一性を有するアミノ酸配列を含むことができる。
又は配列番号65~67のいずれか1つの残基198~344を含むことができる。別の
そのような実施形態では、第2のサブユニットは、配列番号64の残基198~344又
は配列番号65~67のいずれか1つの残基7~153を含むことができる。
メガヌクレアーゼであり、リンカーは、第1のサブユニット及び第2のサブユニットに共
有結合する。
いずれか1つのアミノ酸配列を含むことができる。
1つの残基215~270に対応するアミノ酸配列に対して少なくとも80%の配列同一
性を有するアミノ酸配列を含むことができる。
,217,219,221,223,224,229,231,233,235,259
,261,266,及び268に対応する残基を含むことができる。
5~270を含むことができる。
1つの残基24~79に対応するアミノ酸配列に対して、少なくとも80%の配列同一性
を有するアミノ酸配列を含むことができる。
26,28,30,32,33,38,40,42,44,46,68,70,75,及
び77に対応する残基を含むことができる。
~79を含むことができる。
つの残基198~344に対して少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90
%、少なくとも95%、又はそれ以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むことがで
き、第2のサブユニットは、配列番号76~79のいずれか1つの残基7~153に対し
て少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、又はそ
れ以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むことができる。
1つの残基198~344を含むことができる。別のそのような実施形態では、第2のサ
ブユニットは、配列番号76~79のいずれか1つの残基7~153を含むことができる
。
メガヌクレアーゼであり、リンカーは、第1のサブユニット及び第2のサブユニットに共
有結合する。
いずれか1つのアミノ酸配列を含むことができる。
酸配列を含む単離されたポリヌクレオチドを提供する。特定の実施形態では、単離された
ポリヌクレオチドはmRNAであり得る。
酸配列を含む組換えDNA構築物を提供する。
な実施形態では、ウイルスベクターは、レトロウイルス、レンチウイルス、アデノウイル
ス、又はアデノ随伴ウイルス(AAV)ベクターであり得る。特定の実施形態では、ウイ
ルスベクターは、組換えAAVベクターであり得る。
酸配列を含むウイルスベクターを提供する。
ルス、又はアデノ随伴ウイルス(AAV)ベクターであり得る。特定の実施形態では、ウ
イルスベクターは、組換えAAVベクターであり得る。
供する。このような態様において、血友病Aは、第VIII因子遺伝子のエクソン1-2
2の逆位によって特徴付けられる。医薬組成物は、薬学的に許容される担体と、(a)操
作されたヌクレアーゼをコードする核酸であって、インビボで標的細胞中に発現する操作
されたヌクレアーゼ又は(b)操作されたヌクレアーゼタンパク質と、を含み、操作され
たヌクレアーゼは、標的細胞中の第VIII因子遺伝子のint22h-1配列内に位置
する第1の認識配列に対する特異性を有する。
とも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、又はそれ以上の
配列同一性を有することができる。このような一実施形態では、int22h-1配列は
、配列番号3又は配列番号4を含み得る。
な実施形態では、F8A1コード配列は、配列番号5又は配列番号6に対して少なくとも
80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、又はそれ以上の配列
同一性を有することができる。別のこのような実施形態では、F8A1コード配列は、配
列番号5又は配列番号6を含み得る。
度の相同性を有する第2の認識配列に対して特異性を有することができ、第2の認識配列
は、X染色体内の第VIII因子遺伝子に対してテロメアの反復配列内に位置する。その
ような実施形態では、反復配列は、反復配列がint22h-1配列に対して反対向きで
あることを除いて、int22h-1配列と同一であるか、又は高度の相同性を有する。
一実施形態では、組換えDNA構築物は自己切断することができる。
実施形態では、ウイルスベクターは、レトロウイルス、レンチウイルス、アデノウイルス
、又はAAVであり得る。特定の実施形態において、ウイルスベクターは、組換えAAV
ベクターであり得る。
EN、ジンクフィンガーヌクレアーゼ、コンパクトTALEN、CRISPR、又はme
gaTALであり得る。特定の実施形態では、操作されたヌクレアーゼは、操作されたメ
ガヌクレアーゼであり得る。
の認識配列は配列番号7を含むことができる。このような一実施形態では、医薬組成物は
、配列番号7を認識し切断する本発明の操作されたメガヌクレアーゼ(又はそれをコード
する核酸)を含むことができる。特定の実施形態では、操作されたメガヌクレアーゼは、
配列番号19~21のいずれか1つのアミノ酸配列を含むことができる。
の認識配列は配列番号9を含むことができる。このような一実施形態では、医薬組成物は
、配列番号9を認識し切断する本発明の操作されたメガヌクレアーゼ(又はそれをコード
する核酸)を含むことができる。特定の実施形態では、操作されたメガヌクレアーゼは、
配列番号28~31のいずれか1つのアミノ酸配列を含むことができる。
の認識配列は配列番号11を含むことができる。このような一実施形態では、医薬組成物
は、配列番号11を認識し切断する本発明の操作されたメガヌクレアーゼ(又はそれをコ
ードする核酸)を含むことができる。特定の実施形態では、操作されたメガヌクレアーゼ
は、配列番号40~43のいずれか1つのアミノ酸配列を含むことができる。
の認識配列は配列番号13を含むことができる。このような一実施形態では、医薬組成物
は、配列番号13を認識し切断する本発明の操作されたメガヌクレアーゼ(又はそれをコ
ードする核酸)を含むことができる。特定の実施形態では、操作されたメガヌクレアーゼ
は、配列番号52~55のいずれか1つのアミノ酸配列を含むことができる。
の認識配列は配列番号15を含むことができる。このような一実施形態では、医薬組成物
は、配列番号15を認識し切断する本発明の操作されたメガヌクレアーゼ(又はそれをコ
ードする核酸)を含むことができる。特定の実施形態では、操作されたメガヌクレアーゼ
は、配列番号64~67のいずれか1つのアミノ酸配列を含むことができる。
の認識配列は配列番号17を含むことができる。そのような一実施形態では、医薬組成物
は、配列番号17を認識し切断する本発明の操作されたメガヌクレアーゼ(又はそれをコ
ードする核酸)を含むことができる。特定の実施形態では、操作されたメガヌクレアーゼ
は、配列番号76~79のいずれか1つのアミノ酸配列を含むことができる。
る。このような態様において、血友病Aは、第VIII因子遺伝子のエクソン1~22の
逆位によって特徴付けられる。この方法は、(a)操作されたヌクレアーゼをコードする
核酸であって、操作されたヌクレアーゼがインビボで標的細胞中に発現する核酸又は(b
)操作されたヌクレアーゼタンパク質を、被験体の標的細胞に送達することを含み、操作
されたヌクレアーゼは、標的細胞の第VIII因子遺伝子のint22h-1配列内に位
置する第1の認識配列に対する特異性を有する、本発明の任意の操作されたヌクレアーゼ
である。
ることを含み、本発明の医薬組成物は、(a)本発明の操作されたヌクレアーゼをコード
する核酸であって、操作されたヌクレアーゼがインビボで標的細胞中に発現する核酸又は
(b)本発明の操作されたヌクレアーゼタンパク質を含む。
コードする核酸を、野生型第VIII因子を発現することができる標的細胞、又は野生型
第VIII因子を発現することができる細胞に分化する前駆細胞に送達することができる
。このような一実施形態では、標的細胞は肝細胞であり得る。特定の実施形態において、
肝細胞は、肝類洞内皮細胞であり得る。別のそのような実施形態では、肝細胞は、肝類洞
内皮細胞に分化する肝幹細胞等の前駆細胞であり得る。別のそのような実施形態では、標
的細胞は、造血内皮細胞であり得る。別のそのような実施形態において、標的細胞は、造
血内皮細胞に分化する前駆細胞であり得る。標的細胞は、エクソン1-22の逆位を有す
る第VIII因子遺伝子を含むことが理解される。
断し、int22h-1配列と反復配列との間の組換えを促進し、エクソン1-22を復
帰させて野生型第VIII因子遺伝子を生成する。
列を更に認識し切断する。
ゼ、TALEN、ジンクフィンガーヌクレアーゼ、コンパクトTALEN、CRISPR
、又はmegaTALであり得る。特定の実施形態では、操作されたヌクレアーゼは、操
作されたメガヌクレアーゼであり得る。
、第1の認識配列は配列番号7を含むことができる。このような一実施形態では、操作さ
れたメガヌクレアーゼは、配列番号7を認識し切断する本発明の任意の操作されたメガヌ
クレアーゼであり得る。特定の実施形態では、操作されたメガヌクレアーゼは、配列番号
19~21のいずれか1つのアミノ酸配列を含むことができる。
、第1の認識配列は配列番号9を含むことができる。このような一実施形態では、操作さ
れたメガヌクレアーゼは、配列番号9を認識し切断する本発明の任意の操作されたメガヌ
クレアーゼであり得る。特定の実施形態では、操作されたメガヌクレアーゼは、配列番号
28~31のいずれか1つのアミノ酸配列を含むことができる。
、第1の認識配列は配列番号11を含むことができる。このような一実施形態では、操作
されたメガヌクレアーゼは、配列番号11を認識し切断する本発明の任意の操作されたメ
ガヌクレアーゼであり得る。特定の実施形態では、操作されたメガヌクレアーゼは、配列
番号40~43のいずれか1つのアミノ酸配列を含むことができる。
、第1の認識配列は配列番号13を含むことができる。このような一実施形態では、操作
されたメガヌクレアーゼは、配列番号13を認識し切断する本発明の任意の操作されたメ
ガヌクレアーゼであり得る。特定の実施形態では、操作されたメガヌクレアーゼは、配列
番号52~55のいずれか1つのアミノ酸配列を含むことができる。
いて、第1の認識配列は配列番号15を含み得る。このような一実施形態では、操作され
たメガヌクレアーゼは、配列番号15を認識し切断する本発明の任意の操作されたメガヌ
クレアーゼであり得る。特定の実施形態では、操作されたメガヌクレアーゼは、配列番号
64~67のいずれか1つのアミノ酸配列を含むことができる。
、第1の認識配列は配列番号17を含むことができる。このような一実施形態では、操作
されたメガヌクレアーゼは、配列番号17を認識し切断する本発明の任意の操作されたメ
ガヌクレアーゼであり得る。特定の実施形態では、操作されたメガヌクレアーゼは、配列
番号76~79のいずれか1つのアミノ酸配列を含むことができる。
、被験体はヒトであり得る。別のこのような実施形態では、被験体はイヌであり得る。
法を提供する。この方法は、(a)エクソン1-22の逆位を有する第VIII因子遺伝
子を含む細胞を得ることと、(b)細胞に、(i)操作されたヌクレアーゼをコードする
核酸配列であって、操作されたヌクレアーゼが細胞内に発現する核酸配列又は(ii)操
作されたヌクレアーゼタンパク質を導入することとを含み、ここで、操作されたヌクレア
ーゼは、第VIII因子遺伝子のint22h-1配列内の第1の認識配列に対する特異
性を有し、操作されたヌクレアーゼは、int22h-1配列内の第1の認識配列を認識
し切断して、int22h-1配列と第VIII因子遺伝子のテロメアに位置する反復配
列との間の組換えを促進し、反復配列がint22h-1配列に対して逆向きであること
を除いて、反復配列はint22h-1配列と同一であるか、又は高度相同性を有し、組
換えはエクソン1-22の復帰及び野生型第VIII因子遺伝子を含む遺伝子改変細胞の
生成を引き起こす。
多能性細胞であり得る。そのような実施形態では、多能性細胞は、誘導多能性幹(iPS
)細胞であり得る。特定の実施形態では、iPS細胞は、ヒトiPS細胞又はイヌiPS
細胞であり得る。
くとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、又はそれ以上
の配列同一性を有することができる。このような一実施形態では、int22h-1配列
は、配列番号3又は配列番号4を含み得る。
に存在し得る。そのような実施形態では、F8A1コード配列は、配列番号3又は配列番
号4に対して少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95
%、又はそれ以上の配列同一性を有することができる。特定の実施形態では、F8A1コ
ード配列は、配列番号3又は配列番号4を含むことができる。
高度の相同性を有する第2の認識配列に対して特異性を有することができ、第2の認識配
列は、X染色体内の第VIII因子遺伝子に対してテロメアの反復配列内に位置する。そ
のような実施形態では、反復配列は、反復配列がint22h-1配列に対して反対向き
であることを除いて、int22h-1配列と同一であるか、又は高度の相同性を有する
。
このような一実施形態では、組換えDNA構築物は自己切断することができる。
のような一実施形態では、ウイルスベクターは、レトロウイルス、レンチウイルス、アデ
ノウイルス、又はAAVであり得る。特定の実施形態において、ウイルスベクターは、組
換えAAVベクターであり得る。
EN、ジンクフィンガーヌクレアーゼ、コンパクトTALEN、CRISPR、又はme
gaTALであり得る。特定の実施形態では、操作されたヌクレアーゼは、操作されたメ
ガヌクレアーゼであり得る。
断する本発明の任意の操作されたメガヌクレアーゼであり得る。このような一実施形態で
は、操作されたメガヌクレアーゼは、配列番号19~21のいずれか1つのアミノ酸配列
を含むことができる。
切断する本発明の任意の操作されたメガヌクレアーゼであり得る。このような一実施形態
では、操作されたメガヌクレアーゼは、配列番号28~31のいずれか1つのアミノ酸配
列を含むことができる。
切断する、本発明の任意の操作されたメガヌクレアーゼであり得る。このような一実施形
態では、操作されたメガヌクレアーゼは、配列番号40~43のいずれか1つのアミノ酸
配列を含むことができる。
切断する本発明の任意の操作されたメガヌクレアーゼであり得る。このような一実施形態
では、操作されたメガヌクレアーゼは、配列番号52~55のいずれか1つのアミノ酸配
列を含むことができる。
切断する本発明の任意の操作されたメガヌクレアーゼであり得る。このような一実施形態
では、操作されたメガヌクレアーゼは、配列番号64~67のいずれか1つのアミノ酸配
列を含むことができる。
切断する本発明の任意の操作されたメガヌクレアーゼであり得る。このような一実施形態
では、操作されたメガヌクレアーゼは、配列番号76~79のいずれか1つのアミノ酸配
列を含むことができる。
型第VIII因子遺伝子を含み、本明細書に記載の本発明の方法に従って産生され、エク
ソン1-22の逆位を有する第VIII因子遺伝子を含む細胞から遺伝子改変細胞が産生
される。
供する。このような態様において、血友病Aは、第VIII因子遺伝子のエクソン1-2
2の逆位によって特徴付けられる。異なる実施形態では、医薬組成物は、薬学的に許容さ
れる担体及び本発明の任意の遺伝子改変細胞並びに/又は本発明の方法に従って産生され
た任意の遺伝子改変細胞を含み、遺伝子改変細胞は、野生型第VIII因子遺伝子を含む
。
このような態様において、血友病Aは、第VIII因子遺伝子のエクソン1~22の逆位
によって特徴付けられる。この方法は、薬学的に許容される担体と本発明の任意の遺伝子
改変細胞とを含む本発明の医薬組成物を、被験体に投与することを含む。そのような遺伝
子改変細胞は、改変後の野生型第VIII因子遺伝子を含む。
ような一実施形態では、標的組織は肝臓であり得る。別のこのような実施形態では、標的
組織は、循環系であり得る。
このような一実施形態では、遺伝子改変iPS細胞は、標的組織に送達されると第VII
I因子を発現する細胞に分化することができる。特定の実施形態では、遺伝子改変iPS
細胞は、第VIII因子を発現する肝類洞内皮細胞に分化することができる。別の特定の
実施形態では、遺伝子改変iPS細胞は、第VIII因子を発現する造血内皮細胞などの
造血細胞に分化することができる。
、被験体はヒトであり得る。別のこのような実施形態では、被験体はイヌであり得る。
ヌクレアーゼ、特に操作されたメガヌクレアーゼを提供する。本発明は更に、第VIII
因子遺伝子のエクソン1-22の逆位を特徴とする、血友病Aの治療用医薬品の製造にお
ける、本明細書に記載の操作されたヌクレアーゼ、特に操作されたメガヌクレアーゼの使
用を提供する。
提供し、単離されたポリヌクレオチドは、本発明の操作されたヌクレアーゼ、特に操作さ
れたメガヌクレアーゼをコードする核酸配列を含む。本発明は、血友病Aの治療用医薬品
の製造における、単離されたポリヌクレオチドの使用を更に提供し、これは第VIII因
子遺伝子のエクソン1-22の逆位によって特徴付けられ、単離されたポリヌクレオチド
は、操作されたヌクレアーゼ、特に操作されたメガヌクレアーゼをコードする核酸配列を
含む。
、組換えAAVベクターは単離されたポリヌクレオチドを含み、単離されたポリヌクレオ
チドは、操作されたヌクレアーゼ、特に操作されたメガヌクレアーゼをコードする核酸配
列を含む。本発明は更に、第VIII因子遺伝子のエクソン1-22の逆位を特徴とする
血友病Aの治療用医薬品の製造における組換えAAVベクターの使用を提供し、組換えA
AVベクターは単離されたポリヌクレオチドを含み、単離されたポリヌクレオチドは、本
発明の操作されたヌクレアーゼ、特に操作されたメガヌクレアーゼをコードする核酸配列
を含む。
し、遺伝子改変細胞は、野生型第VIII因子遺伝子を含むように改変されている。本発
明は更に、第VIII因子遺伝子のエクソン1-22の逆位を特徴とする血友病Aの治療
用医薬品の製造における本発明の遺伝子改変細胞の使用を提供し、遺伝子改変細胞は、野
生型第VIII因子遺伝子を含むように改変されている。
i)由来の野生型I-CreIメガヌクレアーゼのアミノ酸配列を示す。
ノ酸配列を示す。
ノ酸配列を示す。
酸配列を示す。
ノ酸配列を示す。
ノ酸配列を示す。
酸配列を示す。
ノ酸配列を示す。
ノ酸配列を示す。
ノ酸配列を示す。
酸配列を示す。
ノ酸配列を示す。
ノ酸配列を示す。
酸配列を示す。
酸配列を示す。
ミノ酸配列を示す。
ミノ酸配列を示す。
ノ酸配列を示す。
ノ酸配列を示す。
アミノ酸配列を示す。
アミノ酸配列を示す。
ミノ酸配列を示す。
ミノ酸配列を示す。
のアミノ酸配列を示す。
のアミノ酸配列を示す。
のアミノ酸配列を示す。
のアミノ酸配列を示す。
のアミノ酸配列を示す。
のアミノ酸配列を示す。
のアミノ酸配列を示す。
のアミノ酸配列を示す。
のアミノ酸配列を示す。
アミノ酸配列を示す。
アミノ酸配列を示す。
のアミノ酸配列を示す。
のアミノ酸配列を示す。
アミノ酸配列を示す。
アミノ酸配列を示す。
のアミノ酸配列を示す。
アミノ酸配列を示す。
のアミノ酸配列を示す。
アミノ酸配列を示す。
のアミノ酸配列を示す。
のアミノ酸配列を示す。
のアミノ酸配列を示す。
アミノ酸配列を示す。
のアミノ酸配列を示す。
細書に引用されるGenBankデータベース配列を含む、発行された米国特許、許可さ
れた出願、公開された外国出願及び参考文献は、あたかも参照によって各々が具体的かつ
個々に組み込まれるように、参照によって同程度に本明細書に組み込まれる。
ものと解釈すべきではない。むしろ、これらの実施形態は、本開示が完全且つ完全であり
、本発明の範囲を当業者に完全に伝えるように提供される。例えば、一実施形態に関して
図示された特徴は、他の実施形態に組み込むことができ、特定の実施形態に関して図示さ
れた特徴は、その実施形態から削除することができる。更に、本明細書に示唆された実施
形態に対する多くの変形及び追加は、本開示に照らして当業者には明らかであり、それら
は本発明から逸脱しない。
が属する技術分野の当業者によって一般的に理解されるのと同じ意味を有する。本明細書
における本発明の説明に使用される用語は、特定の実施形態のみを説明するためのもので
あり、本発明を限定することを意図しない。
参照により本明細書に組み込まれる。
することができる。例えば、「a」細胞は単一の細胞又は多数の細胞を意味することがで
きる。
」の包括的な意味で使用され、「どちらか/又は」の排他的な意味で使用されるものでは
ない。
は、ポリヌクレオチド鎖内のホスホジエステル結合を切断する天然に存在する又は操作さ
れた酵素を指すために交換可能に使用される。
認識配列で二本鎖DNAに結合するエンドヌクレアーゼを指す。好ましくは、本発明のメ
ガヌクレアーゼの認識配列は22塩基対である。メガヌクレアーゼは、I-CreIに由
来するエンドヌクレアーゼであってもよく、例えばDNA結合特異性、DNA切断活性、
DNA結合親和性、又は二量化特性に関して、天然のI-CreIに対して改変されたI
-CreIの操作された変異体を指す。そのようなI-CreIの改変された変異体を産
生する方法は、当該分野で公知である(例えば、国際公開第2007/047859号)
。本明細書で使用されるメガヌクレアーゼは、ヘテロ二量体として二本鎖DNAに結合す
る。メガヌクレアーゼはまた、一対のDNA結合ドメインがペプチドリンカーを用いて単
一のポリペプチドに接合されている「一本鎖メガヌクレアーゼ」であってもよい。「ホー
ミングエンドヌクレアーゼ」という用語は、「メガヌクレアーゼ」という用語と同義であ
る。本発明のメガヌクレアーゼは、細胞内で発現したときに実質的に非毒性であり、本明
細書に記載の方法を用いて測定すると、細胞生存率に対する有害な影響やメガヌクレアー
ゼ切断活性の有意な低下は観察されない。
って接合された一対のヌクレアーゼサブユニットを含むポリペプチドを指す。一本鎖メガ
ヌクレアーゼは、N末端サブユニット-リンカー-C末端サブユニットの構成を有する。
2つのメガヌクレアーゼサブユニットは、一般に、アミノ酸配列において同一ではなく、
同一ではないDNA配列を認識するであろう。従って、一本鎖メガヌクレアーゼは、典型
的には、偽パリンドローム又は非パリンドローム認識配列を切断する。一本鎖メガヌクレ
アーゼは、実際には二量体ではないが、「一本鎖ヘテロ二量体」又は「一本鎖ヘテロ二量
体メガヌクレアーゼ」と呼ばれ得る。明確にするために、他に特定しない限り、「メガヌ
クレアーゼ」という用語は、二量体又は一本鎖メガヌクレアーゼを指すことができる。
ユニットを単一のポリペプチドに接合するために使用される外因性ペプチド配列を指す。
リンカーは、天然タンパク質に見出される配列を有してもよく、又は天然タンパク質には
見出されない人工配列であってもよい。リンカーは、可撓性であり、二次構造が欠如して
いてもよく、又は生理学的条件下で特定の三次元構造を形成する傾向を有していてもよい
。リンカーは、米国特許第8,445,251号に包含されるものを含むが、これらに限
定されない。いくつかの実施形態では、リンカーは、配列番号19~21,28~31,
40~43,52~55,64~67、又は76~79のいずれか1つの残基154~1
95を含むアミノ酸配列を有し得る。
インの任意の部分に融合した16-22個のTALドメイン反復を含むDNA結合ドメイ
ンを含むエンドヌクレアーゼを指す。
ーミングエンドヌクレアーゼの任意の部分に任意の向きで融合した16-22個のTAL
ドメイン反復を有するDNA結合ドメインを含むエンドヌクレアーゼを指す。
用語は、FokI制限酵素のヌクレアーゼドメインに融合したジンクフィンガーDNA結
合ドメインを含むキメラエンドヌクレアーゼを指す。ジンクフィンガードメインは、合理
的又は実験的手段により再設計されて、長さが約18塩基対であり、2~10塩基対で分
離した一対の9塩基対のハーフサイトを含む所定のDNA配列に結合するタンパク質を産
生する。ジンクフィンガーヌクレアーゼによる切断は、可変長の平滑末端又は5’オーバ
ーハンド(しばしば4つの塩基対)を作成することができる。
と、ゲノムDNA中の認識部位にハイブリダイズすることによってカスパーゼのDNA切
断を指向するガイドRNAとを含む、カスパーゼに基づくエンドヌクレアーゼを指す。
ホーミングエンドヌクレアーゼを有する転写活性化因子様エフェクター(TALE)DN
A結合ドメインを含む一本鎖エンドヌクレアーゼを指す。
う用語は、タンパク質及びタンパク質を発現する細胞又は生物をコードする核酸に遺伝子
工学技術を適用した結果として、変化したアミノ酸配列を有することを意味する。核酸に
関して、「組換え」又は「操作された」という用語は、遺伝子工学技術を適用した結果と
して変化した核酸配列を有することを意味する。遺伝子工学技術には、限定されるもので
はないが、PCR及びDNAクローニング技術、トランスフェクション、形質転換及び他
の遺伝子導入技術、相同組換え、部位特異的突然変異誘発、並びに遺伝子融合が含まれる
。この定義に従って、天然に存在するタンパク質と同一のアミノ酸配列を有するが、異種
宿主におけるクローニング及び発現によって産生されたタンパク質は、組換え体とはみな
さない。
における最も一般的な天然の対立遺伝子(即ち、ポリヌクレオチド配列)を指し、ここで
、野生型対立遺伝子によってコードされるポリペプチドは、その元の機能を有する。「野
生型」という用語は、野生型対立遺伝子によってコードされるポリペプチドも指す。野生
型対立遺伝子(即ち、ポリヌクレオチド)及びポリペプチドは、野生型配列に対して1又
は複数の変異及び/又は置換を含む変異体又は変異体の対立遺伝子及びポリペプチドと区
別される。野生型対立遺伝子又はポリペプチドは、生物に正常な表現型を付与することが
できるが、突然変異体又は変異体の対立遺伝子又はポリペプチドは、場合によっては、変
化した表現型を付与することができる。野生型ヌクレアーゼは、組換え体又は天然に存在
しないヌクレアーゼとは区別される。「野生型」という用語は、特定の遺伝子の野生型対
立遺伝子、あるいは比較目的のために使用される細胞、生物、及び/又は被験体を有する
細胞、生物、及び/又は被験体を指すこともできる。
れらの祖先において、ゲノムDNA配列が組換え技術によって故意に改変されたものを指
す。本明細書で使用される場合、「遺伝子改変」という用語は、「トランスジェニック」
という用語を包含する。
列(例えば、野生型配列又は天然配列)に対する組換え配列中のアミノ酸残基の挿入、欠
失、又は置換を意味する。
結合及び切断されるDNA配列をいう。メガヌクレアーゼの場合、認識配列は、4つの塩
基対によって分離された一対の逆位9塩基対「ハーフサイト」を含む。一本鎖メガヌクレ
アーゼの場合、タンパク質のN末端ドメインは第1のハーフサイトに接触し、タンパク質
のC末端ドメインは第2のハーフサイトに接触する。メガヌクレアーゼによる切断は、4
塩基対の3’「オーバーハング」を生じる。「オーバーハング」又は「粘着末端」は、二
本鎖DNA配列のエンドヌクレアーゼ切断によって産生することができる短い一本鎖DN
Aセグメントである。I-CreIに由来するメガヌクレアーゼ及び一本鎖メガヌクレア
ーゼの場合、オーバーハングは、22塩基対認識配列の塩基10~13を含む。コンパク
トTALENの場合、認識配列は、I-TevIドメインによって認識される第1のCN
NNGN配列を含み、その後に長さが4-16塩基対の非特異的スペーサーを含み、その
後にTALエフェクタードメインによって認識される16-22bpの長さの第2の配列
(この配列は典型的には5’T塩基を有する)を含む。コンパクトTALENによる切断
は、2つの塩基対の3’オーバーハングを生じる。CRISPRの場合、認識配列は、典
型的には16~24塩基対の配列であり、これにガイドRNAが結合してCas9切断を
誘導する。CRISPRによる切断は平滑末端を産生した。ジンクフィンガーの場合、D
NA結合ドメインは、典型的には、2~10塩基対により分離された一対の9塩基対「ハ
ーフサイト」を含む18bp認識配列を認識し、ヌクレアーゼによる切断は、平滑末端又
は可変長の5’オーバーハング(4塩基対であることが多い)を作り出す。
配列を含む細胞の染色体DNAの領域を指す。
メガヌクレアーゼが参照DNA分子(例えば、認識配列又は任意の配列)と非共有に関連
する傾向を意味する。結合親和性は、解離定数Kdによって測定される。本明細書で使用
される場合、参照認識配列に対するヌクレアーゼのKdが参照ヌクレアーゼに対して統計
的に有意な(p<0.05)量だけ増加又は減少する場合、ヌクレアーゼは「変化した」
結合親和性を有する。
対の配列でのみ、又は認識配列の特定のセットにおいてのみ、二本鎖DNA分子を認識及
び切断するメガヌクレアーゼの能力を意味する。一組の認識配列は、特定の保存された位
置又は配列モチーフを共有するが、1つ以上の位置で縮重してもよい。高度に特異的なメ
ガヌクレアーゼは、1つ又は非常に少数の認識配列のみを切断することができる。特異性
は、当該分野で公知の任意の方法によって決定することができる。本明細書で使用される
場合、メガヌクレアーゼは、生理学的条件下で参照メガヌクレアーゼ(例えば野生型)に
結合されず切断されない認識配列に結合しそれを切断する場合、又は認識配列の切断率が
参照メガヌクレアーゼに対して生物学的に有意な量(例えば、少なくとも2倍、又は2倍
~10倍)で増加又は減少する場合には、「変化した」特異性を有する。
切断が相同DNA配列を修復鋳型として用いて修復される、天然の細胞プロセスを指す(
例えば、Cahill et al.(2006)、Front.Biosci.11:
1958-1976)。相同DNA配列は、内因性染色体配列又は細胞に送達された外因
性核酸であり得る。
鎖DNA切断が2つの非相同DNAセグメントの直接接合によって修復される、天然の細
胞プロセスをいう(例えば、Cahill et al.(2006)、Front.B
iosci.11:1958-1976を参照)。非相同末端結合によるDNA修復は誤
りを起こしやすく、修復部位でのDNA配列の付加又は欠失が頻繁に起こる。いくつかの
例では、標的認識配列における切断は、標的認識部位にNHEJを生じる。遺伝子のコー
ド配列中の標的部位のヌクレアーゼ誘導切断に続くNHEJによるDNA修復によって、
フレームシフト突然変異等、コード配列への突然変異を導入することができ、遺伝子機能
を破壊する。このように、操作されたヌクレアーゼは、細胞集団中の遺伝子を効果的にノ
ックアウトするために使用することができる。
、「配列同一性」、「類似性割合」、「配列類似性」等の用語は、整列したアミノ酸残基
又はヌクレオチド間の類似性を最大にする配列のアライメントに基づく、2つの配列の類
似性の程度の尺度を指し、これは配列のアライメントにおける同一又は類似の残基又はヌ
クレオチドの数、全ての残基又はヌクレオチドの数、及びギャップの存在及び長さの関数
である。標準的なパラメータを使用して配列類似性を決定するための様々なアルゴリズム
及びコンピュータプログラムが利用可能である。本明細書で使用される場合、配列類似性
は、アミノ酸配列のBLASTpプログラム及び核酸配列のBLASTnプログラムを用
いて測定され、両方ともNational Center for Biotechno
logy Informationを通じて利用可能であり(www.ncbi.nlm
.nih.gov/)、例えば、Altschul et al.(1990)、J.M
ol.Biol.215:403-410;Gish and States(1993
)、Nature Genet.3:266-272;Madden et al.(1
996)、Meth.Enzymol.266:131-141;Altschul e
t al.(1997)、Nucleic Acids Res.25:33 89-3
402;Zhang et al.(2000)、J.Comput.Biol.7(1
-2):203-14に記載されている。本明細書で使用される場合、2つのアミノ酸配
列の類似性割合は、BLASTpアルゴリズムのパラメータ、即ち、ワードサイズ=3、
ギャップオープニングペナルティ=-11、ギャップ伸長ペナルティ=-1、及びスコア
リングマトリックス=BLOSUM62に基づくスコアである。本明細書で使用される場
合、2つの核酸配列の類似性割合は、BLASTnアルゴリズムのパラメータ、即ち、ワ
ードサイズ=11、ギャップオープニングペナルティ=-5、ギャップ伸長ペナルティ=
-2、マッチ報酬=1、及びミスマッチペナルティ=-3に基づくスコアである。
する」という用語は、第1のタンパク質における特定の改変が第2のタンパク質における
改変と同じアミノ酸残基の置換であり、第1のタンパク質における改変のアミノ酸位置は
、2つのタンパク質が標準的な配列アライメント(例えば、BLASTpプログラムを用
いて)に供される場合に、第2のタンパク質における改変のアミノ酸位置に対応するか、
又は整列することを示すために使用される。従って、配列アライメントにおいて残基X及
び残基Yが互いに対応する場合には、第1のタンパク質におけるアミノ酸「A」に対する
残基「X」の修飾は、第2のタンパク質におけるアミノ酸「A」に対する残基「Y」の修
飾に対応し、残基X及び残基Yは異なる数であってもよい。
単に「ハーフサイト」という用語は、ホモ二量体又はヘテロ二量体メガヌクレアーゼのモ
ノマーによって、又は一本鎖メガヌクレアーゼの1つのサブユニットによって認識される
、二本鎖DNA分子中の核酸配列を意味する。
アミノ酸を含むメガヌクレアーゼモノマー又はサブユニット内の局在配列を指す。超可変
領域は、約50~60個の連続残基、約53~57個の連続残基、又は好ましくは約56
残基を含むことができる。いくつかの実施形態では、超可変領域の残基は、配列番号19
~21,28~31,40~43,52~55,64~67,又は76-79のいずれか
1つの位置24-79又は位置215-270に対応し得る。超可変領域は、認識配列中
のDNA塩基に接触する1以上の残基を含むことができ、単量体又はサブユニットの塩基
選択を変化させるように改変することができる。超可変領域はまた、メガヌクレアーゼが
二本鎖DNA認識配列と関連するときにDNA骨格に結合する1つ以上の残基を含むこと
ができる。そのような残基は、DNA骨格及び標的認識配列に対するメガヌクレアーゼの
結合親和性を変化させるように改変することができる。本発明の異なる実施形態では、超
可変領域は、変動性を示す1~20残基を含み、塩基選択及び/又はDNA結合親和性に
影響を及ぼすように改変することができる。特定の実施形態では、超可変領域は、可変性
を示す約15~18残基を含み、塩基選択及び/又はDNA結合親和性に影響を及ぼすよ
うに改変することができる。いくつかの実施形態では、超可変領域内の可変残基は、配列
番号19~21,28~31,40~43,52~55,64~67、又は76~79の
いずれか1つの位置24,26,28,30,32,33,38,40,42,44,4
6,68,70,72,73,75,及び77の1つ以上に対応する。他の実施形態では
、超可変領域内の可変残基は、配列番号19~21,28~31,40~43,52~5
5,64~67、又は76~79のいずれか1つの位置215,217,219,221
,223,224,229,231,233,235,237,259,261,263
,264,266,及び268の1つ以上に対応する。
凝固第VIII因子タンパク質をコードする、X染色体上に位置付けられた遺伝子を指す
。ヒトでは、遺伝子ID番号2157としてNCBIによって同定された第VIII因子
遺伝子は、X染色体上の塩基対154,835,788から塩基対155,026,93
4に位置付けられる。イヌでは、第VIII因子遺伝子は、NCBI参照配列:NM_0
01003212.1によって同定される遺伝子であり得る。「第VIII因子遺伝子」
という用語は、野生型第VIII因子遺伝子と、機能的な第VIII因子タンパク質の産
生を可能にする天然に存在する多型及び/又は突然変異を含む第VIII因子遺伝子の両
方を含み得ることが理解される。
用語は、約9.5kbのサイズを有する第VIII因子遺伝子のイントロン22内に位置
する配列を指し(Bagnall et al.(2006)Journal of T
hrombosis and Haemostasis 4:591-598)、Gen
Bankにより受託番号AY619999.1として同定されたヒト配列を更に指すこと
ができる。int22h-1配列は、CpGアイランド、H2AFB1ヒストンタンパク
質のコード配列、及び第VIII因子関連タンパク質1(F8A1、イントロン22タン
パク質とも呼ばれる)のコード配列を含むことを特徴とする。int22h-1配列は、
X染色体上の第VIII因子遺伝子のテロメアに位置する少なくとも1つの反復配列と同
一であるか、又はそれと高い相同性を有するとして更に特徴付けられる。ヒトでは、in
t22h-2及びint22h-3と呼ばれる2つの反復配列が、X染色体上の第VII
I因子遺伝子のテロメアに位置している。本発明の特定の実施形態では、ヒトint22
h-1配列は配列番号3を含むことができる。本発明の他の特定の実施形態では、イヌi
nt22h-1配列は、配列番号4を含むことができる。
コード配列」という用語は互換的に使用され、F8A1タンパク質をコードする、int
22h-1配列内に位置する配列を指す。F8A1コード配列にはイントロンが無く、第
VIII因子遺伝子とは反対方向に転写される。一実施形態では、野生型ヒトF8A1コ
ード配列は、配列番号5を含むことができる。別の実施形態では、野生型イヌF8A1コ
ード配列は、配列番号6を含むことができ、ヒトF8A1コード配列と約75%の相同性
を有する。F8A1コード配列への言及は、野生型F8A1配列と、機能的F8A1タン
パク質の産生を可能にする天然に存在する多型及び/又は突然変異を含むF8A1配列と
、を含むことが理解される。
第VIII因子遺伝子のint22h-1配列と、X染色体上の第VIII因子遺伝子の
テロメアに位置する同一又は密接に関連した逆向きの反復配列との間で染色体内相同組換
え事象が起こる、第VIII因子遺伝子の突然変異を指し、エクソン23-26に関して
エクソン1-22の逆位をもたらす。
1-22の逆位を含む、細胞における染色体内相同組換え事象を指し、int22h-1
配列内で二本鎖切断が発生し、X染色体上の第VIII因子遺伝子のテロメアにある反復
配列との組換えを促進する。このような組換えは、エクソン1-22の修正された配向及
び機能的な野生型第VIII因子遺伝子の産生を生じる。
キメラ構築物」、「構築物」、及び「組換えDNA断片」という用語は、本明細書では互
換的に使用され、核酸断片である。組換え構築物は、限定されるものではないが、天然に
は一緒に見出されない調節及びコード配列を含む核酸断片の人工的な組み合わせを含む。
例えば、組換えDNA構築物は、異なる供給源に由来する調節配列及びコード配列、又は
同じ供給源に由来し、天然に見出されるものとは異なる様式で配置された調節配列及びコ
ード配列を含み得る。このような構築物は、単独で使用してもよく、又はベクターと組み
合わせて使用してもよい。
主細胞においてポリペプチドをコードする配列の転写及び翻訳が可能な複製系及び配列を
含む構築物であり得る。ベクターが使用される場合、ベクターの選択は、当業者に周知の
宿主細胞を形質転換するために使用される方法に依存する。ベクターは、制限なく、プラ
スミドベクター及び組換えAAVベクター、又は本発明のメガヌクレアーゼをコードする
遺伝子を標的細胞に送達するのに適した当該分野で公知の任意の他のベクターを含むこと
ができる。当業者は、本発明の単離されたヌクレオチド又は核酸配列のいずれかを含む宿
主細胞を首尾よく形質転換、選択、及び増殖させるために、ベクター上に存在しなければ
ならない遺伝的要素を十分に認識している。
ウイルスベクターには、レトロウイルスベクター、レンチウイルスベクター、アデノウイ
ルスベクター、及びアデノ随伴ウイルスベクター(AAV)が含まれるが、これらに限定
されない。
型における変化を測定するための参照点を提供する細胞を指す。対照細胞は、例えば(a
)野生型細胞、即ち、遺伝子改変細胞を生じる遺伝子変更のための出発物質と同じ遺伝子
型の細胞、(b)遺伝子改変細胞と同じ遺伝子型の細胞であるが、ヌル構築物で形質転換
された(即ち、目的の形質に対して既知の効果を有さない構築物を有する)細胞、又は(
c)遺伝子改変細胞と遺伝的に同一であるが、変化した遺伝子型又は表現型の発現を誘導
する条件又は刺激又は更なる遺伝子改変に曝されていない細胞を含み得る。
のための少なくとも1つのコード配列と、同じエンドヌクレアーゼのための少なくとも1
つの認識配列とを含む、DNA構築物を指す。細胞内で発現すると(即ち、インビボ)、
エンドヌクレアーゼは認識配列を認識して切断し、DNA構築物の線状化をもたらす。
する」という用語は、第1のタンパク質における特定の改変が第2のタンパク質における
改変と同じアミノ酸残基の置換であり、第1のタンパク質における改変のアミノ酸位置は
、2つのタンパク質が標準的な配列アライメント(例えば、BLASTpプログラムを用
いて)に供される場合に、第2のタンパク質における改変のアミノ酸位置に対応するか、
又は整列することを示すために使用される。従って、配列アライメントにおいて残基X及
び残基Yが互いに対応する場合には、第1のタンパク質におけるアミノ酸「A」に対する
残基「X」の修飾は、第2のタンパク質におけるアミノ酸「A」に対する残基「Y」の修
飾に対応し、残基X及び残基Yは異なる数であってもよい。
被験体において第VIII因子を通常発現する細胞中の第VIII因子遺伝子のエクソン
1-22の逆位を修正する目的で、本発明の操作されたヌクレアーゼ又は本発明の操作さ
れたヌクレアーゼをコードする核酸を、血友病Aを有する被験体に投与することを指す。
このような治療は、被験体における第VIII因子の循環レベルを上昇させるのに十分な
多数の細胞における第VIII因子遺伝子の修正、及び被験体における血友病Aの1以上
の症状の部分的又は完全な緩和をもたらす。「治療」又は「被験体を治療する」という用
語は、野生型第VIII因子遺伝子を含む遺伝子改変細胞を本発明の方法に従って被験体
に投与することを更に指し、ここで、遺伝子改変細胞は、標的組織に送達され、被験体に
おける第VIII因子の循環レベルを上昇させるのに十分な量で、第VIII因子を産生
するか、又は第VIII因子を産生する細胞に分化して、血友病Aの1以上の症状の部分
的又は完全な緩和をもたらす。いくつかの態様では、本発明の操作されたヌクレアーゼ、
それをコードする核酸、又は本発明の遺伝子改変細胞は、本発明の医薬組成物の形態で治
療中に投与される。
ずれかに等しい変数で実施され得ることを伝えることを意図する。従って、本質的に離散
的な変数の場合、変数は、範囲の終点を含む数値範囲内の任意の整数値に等しくなり得る
。同様に、本質的に連続する変数の場合、変数は、範囲の終点を含む数値範囲内の任意の
実数値と等しくなり得る。限定ではなく例として、0と2の間の値を有すると記載される
変数は、変数が本質的に離散的である場合には、0、1、又は2の値を取ることができ、
変数が本質的に連続している場合には、0.0、0.1、0.01、0.001、又は≧
0且つ≦2である任意の他の実数値を取ることができる。
-22の逆位を修正することによって血友病Aを治療するために使用され得るという仮説
に基づく。より具体的には、ヌクレアーゼは、第VIII因子遺伝子のint22h-1
配列内に存在する認識配列を認識し切断して、二本鎖切断を生じるように操作することが
できる。次いで、int22h-1配列と、X染色体上の第VIII因子遺伝子のテロメ
アにある反復配列との間で、染色体内相同組換えが起こり、被験体の標的細胞中に、エク
ソン1-22の復帰と、機能的な野生型第VIII因子遺伝子の産生とが生じる。
えば、誘導された多能性幹(iPS)細胞)は、上記の同じメカニズムによって第VII
I因子遺伝子を修正するために得ることができ、本発明の操作されたヌクレアーゼ(又は
それをコードする核酸)に接触させることができるという仮説にも部分的に基づく。次い
で、このような多能性細胞を、血友病Aを有する被験体に投与することができ、ここで、
細胞は標的組織(例えば、肝臓又は循環系)に送達され、被験体において野生型第VII
I因子を発現する細胞に分化する。
し切断する、操作されたヌクレアーゼ、特に操作された組換えメガヌクレアーゼを包含す
る。本発明はまた、遺伝子改変細胞を作製するためにこのような操作されたヌクレアーゼ
を使用する方法、並びに医薬組成物及び血友病Aの治療方法におけるこのような細胞の使
用を包含する。更に、本発明は、操作されたヌクレアーゼタンパク質、操作されたヌクレ
アーゼをコードする核酸、又は本発明の遺伝子改変細胞を含む医薬組成物、及び血友病A
を処置するためのこのような組成物の使用を包含する。
めのヌクレアーゼ
うことが可能であり、このようなDNA切断は、ゲノム内に同一又は高度に相同なDNA
配列を有する切断された標的部位の相同組換えによって、ゲノムの永続的改変を生じさせ
ることができることは公知である。
施に有用である。一実施形態では、本発明は、操作された組換えメガヌクレアーゼを用い
て実施することができる。別の実施形態では、本発明は、CRISPRヌクレアーゼ又は
CRISPRニッカラーゼを用いて実施することができる。所定のDNA部位を認識する
CRISPR及びCRISPRニッカラーゼの作製方法は、当該分野で公知であり、例え
ば、Ran et al.(2013)Nat Protoc.8:2281-308が
挙げられる。別の実施形態では、本発明は、TALEN又はコンパクトTALENを使用
して実施することができる。所定のDNA部位に結合するTALEドメインの作製方法は
、当該分野で公知であり、例えば、Reyon et al.(2012)Nat Bi
otechnol.30:460-5が挙げられる。別の実施形態では、本発明はジンク
フィンガーヌクレアーゼ(ZFN)を用いて実施することができる。更なる実施形態では
、本発明はmegaTALを使用して実施することができる。
ガヌクレアーゼである。一本鎖メガヌクレアーゼは、N末端サブユニットと、リンカーペ
プチドによって接合されたC末端サブユニットと、を含む。2つのドメインの各々は、認
識配列の半分(即ち、認識ハーフサイト)を認識し、DNA切断の部位は、2つのサブユ
ニットの界面付近の認識配列の中央にある。DNA鎖切断は、メガヌクレアーゼによるD
NA切断が4塩基対の3’一本鎖オーバーハングの対を生成するように、4塩基対によっ
て相殺される。
番号7)を認識して切断するように操作されている。F8R1-2認識配列は、int2
2h-1配列及びF8A1配列の両方の中に位置する。このような組換えメガヌクレアー
ゼは、本明細書では集合的に「F8R1-2メガヌクレアーゼ」と呼ばれる。例示的なF
8R1-2メガヌクレアーゼは、配列番号19~22に提供される。
9)を認識して切断するように操作されている。F8R3-4認識配列は、int22h
-1配列及びF8A1配列の両方の中に位置する。このような組換えメガヌクレアーゼは
、本明細書では集合的に「F8R3-4メガヌクレアーゼ」と呼ばれる。例示的なF8R
3-4メガヌクレアーゼは、配列番号28~31に提供される。
号11)を認識して切断するように操作されている。このような組換えメガヌクレアーゼ
は、本明細書では集合的に「F8R9-10メガヌクレアーゼ」と呼ばれる。例示的なF
8R9-10メガヌクレアーゼは、配列番号40~43に提供される。
番号13)を認識して切断するように操作されている。このような組換えメガヌクレアー
ゼは、本明細書では集合的に「F8R11-12メガヌクレアーゼ」と呼ばれる。例示的
なF8R11-12メガヌクレアーゼは、配列番号52~55に提供される。
番号15)を認識して切断するように操作されている。このような組換えメガヌクレアー
ゼは、本明細書では集合的に「F8R13-14メガヌクレアーゼ」と呼ばれる。例示的
なF8R13-14メガヌクレアーゼは、配列番号64~67に提供される。
番号17)を認識し、切断するように操作されている。このような組換えメガヌクレアー
ゼは、本明細書では集合的に「F8R15-16メガヌクレアーゼ」と呼ばれる。例示的
なF8R15-16メガヌクレアーゼは、配列番号76~79に提供される。
サブユニットと、第2の超可変領域(HVR2)を含む第2のサブユニットと、を含む。
更に、第1のサブユニットは、認識配列の第1の認識ハーフサイト(例えば、F8R1、
F8R3、F8R9、F8R11、F8R13、又はF8R15ハーフサイト)に結合し
、第2のサブユニットは、認識配列の第2の認識ハーフサイト(例えば、F8R2、F8
R4、F8R10、F8R12、F8R14、又はF8R16ハーフサイト)に結合する
。組換えメガヌクレアーゼが一本鎖メガヌクレアーゼである実施形態では、HVR1領域
を含み第1のハーフサイトに結合する第1のサブユニットがN末端サブユニットとして位
置し、HVR2領域を含み第2のハーフサイトに結合する第2のサブユニットがC末端サ
ブユニットとして位置するように、第1のサブユニット及び第2のサブユニットを配向さ
せることができる。代替となる実施形態では、HVR1領域を含み第1のハーフサイトに
結合する第1のサブユニットがC末端サブユニットとして位置し、HVR2領域を含み第
2のハーフサイトに結合する第2のサブユニットがN末端サブユニットとして位置するよ
うに、第1のサブユニット及び第2のサブユニットを配向させることができる。本発明の
例示的なF8R1-2メガヌクレアーゼを表1に示す。本発明の例示的なF8R3-4メ
ガヌクレアーゼを表2に示す。本発明の例示的なF8R9-10メガヌクレアーゼを表3
に示す。本発明の例示的なF8R11-12メガヌクレアーゼを表4に示す。本発明の例
示的なF8R13-14メガヌクレアーゼを表5に示す。本発明の例示的なF8R15-
16メガヌクレアーゼを表6に示す。
のF8R1結合及びF8R2結合サブユニット領域と、F8R1-2x.27メガヌクレ
アーゼのそれぞれF8R1結合及びF8R2結合サブユニット領域との間のアミノ酸配列
同一性を表す。
のF8R3結合及びF8R4結合サブユニット領域と、F8R3-4x.43メガヌクレ
アーゼのそれぞれF8R3結合及びF8R4結合サブユニット領域との間のアミノ酸配列
同一性を表す。
ゼのF8R9結合及びF8R10結合サブユニット領域と、F8R9-10x.70メガ
ヌクレアーゼのそれぞれF8R9結合及びF8R10結合サブユニット領域との間のアミ
ノ酸配列同一性を表す。
ーゼのF8R11結合及びF8R12結合サブユニット領域と、F8R11-12x.5
6メガヌクレアーゼのそれぞれF8R11結合及びF8R12結合サブユニット領域との
間のアミノ酸配列同一性を表す。
ーゼのF8R13結合及びF8R14結合サブユニット領域と、F8R13-14x.1
3メガヌクレアーゼのそれぞれF8R13結合及びF8R14結合サブユニット領域との
間のアミノ酸配列同一性を表す。
ーゼのF8R15結合及びF8R16結合サブユニット領域と、F8R15-16x.1
4メガヌクレアーゼのそれぞれF8R15結合及びF8R16結合サブユニット領域との
間のアミノ酸配列同一性を表す。
し切断する操作されたヌクレアーゼを用いて遺伝子改変細胞を産生する方法を提供する。
本発明は更に、薬学的に許容される担体と、本発明の操作されたヌクレアーゼ(又は操作
されたヌクレアーゼをコードする核酸)と、を含む医薬組成物を投与することによって、
被験体における血友病Aを治療する方法を提供する。いずれの場合においても、本発明は
、第VIII因子遺伝子のエクソン1-22の逆位を含み、且つ典型的には第VIII因
子を健康な被験体において発現する適切な細胞(例えば、肝類洞内皮細胞若しくは造血内
皮細胞、又はそれらに分化する前駆細胞)のDNA/RNAに、本発明の操作されたヌク
レアーゼが送達可能及び/又は発現可能であることが必要である。
たヌクレアーゼをコードする核酸として、細胞に送達することができる。このような核酸
は、DNA(例えば、環状若しくは線状プラスミドDNA又はPCR産物)又はRNA(
例えば、mRNA)であり得る。操作されたヌクレアーゼコード配列がDNA形態で送達
される実施形態では、操作されたヌクレアーゼは、ヌクレアーゼ遺伝子の転写を促進する
ためにプロモーターに作動可能に連結されるべきである。本発明に適した哺乳動物プロモ
ーターは、サイトメガロウイルス初期(CMV)プロモーター(Thomsen et
al.(1984)、Proc Natl Acad Sci USA.81(3):6
59-63)又はSV40初期プロモーター(Benoist及びChambon(19
81)、Nature.290(5804):304-10)等の構成型プロモーター、
並びにテトラサイクリン誘導性プロモーター(Dingermann et al.(1
992)、Mol Cell Biol.12(9):4038-45)等の誘導性プロ
モーターを含む。本発明の操作されたヌクレアーゼはまた、合成プロモーターに作動可能
に連結され得る。合成プロモーターには、JeTプロモーター(国際公開第2002/0
12514号)が含まれるが、これに限定されない。
クレアーゼをコードする遺伝子が細胞のゲノムに組み込まれる可能性を低減するため、細
胞に送達される。操作されたヌクレアーゼをコードするこのようなmRNAは、インビト
ロ転写等の当該分野で公知の方法を用いて産生させることができる。いくつかの実施形態
において、mRNAは、7-メチル-グアノシンを用いてキャップされる。いくつかの実
施形態では、mRNAはポリアデニル化されていてもよい。
鎖DNA鋳型を用いて細胞に導入することができる。一本鎖DNAは、操作されたヌクレ
アーゼをコードする配列の上流及び/又は下流に5’及び/又は3’AAV逆位末端反復
(ITR)を更に含むことができる。他の実施形態では、一本鎖DNAは、操作されたヌ
クレアーゼをコードする配列の上流及び/又は下流に5’及び/又は3’相同性アームを
更に含むことができる。
したDNA鋳型を用いて細胞に導入することができる。いくつかの例では、エンドヌクレ
アーゼをコードするプラスミドDNAは、環状プラスミドDNAが細胞に導入される前に
線状化するように、1以上の制限酵素によって消化され得る。
断性組換えDNA構築物上の細胞に導入することができる。このような構築物は、エンド
ヌクレアーゼのための少なくとも1つのコード配列と、同じエンドヌクレアーゼのための
少なくとも1つの認識配列とを含むことができる。細胞内で発現すると(即ち、インビボ
)、エンドヌクレアーゼは認識配列を認識して切断し、DNA構築物の線状化をもたらす
。
当技術分野で公知の種々の異なるメカニズムによってゲノムDNAを切断するために、細
胞に送達することができる。
くは肝類洞内皮細胞、あるいは肝類洞内皮細胞に分化する前駆細胞が含まれるが、これら
に限定されない。標的組織は、循環系の細胞、好ましくは造血内皮細胞、あるいは造血内
皮細胞に分化する前駆細胞も含むことができるが、これらに限定されない。考察したよう
に、本発明のエンドヌクレアーゼは、精製タンパク質として、又はエンドヌクレアーゼを
コードするRNAもしくはDNAとして送達することができる。一実施形態では、エンド
ヌクレアーゼタンパク質、又はmRNA、又はエンドヌクレアーゼをコードするDNAベ
クターは、標的組織に直接的に注射を介して標的細胞(例えば、肝臓の細胞又は循環系の
細胞)に供給される。あるいは、エンドヌクレアーゼタンパク質、mRNA、又はDNA
は、循環系を介して全身的に送達することができる。
コードするDNA/mRNAは、公知の技術に従って、薬学的に許容される担体中に、全
身投与又は標的組織への投与のために製剤化される。例えば、Remington、Th
e Science and Practice of Pharmacy(21st
ed.2005)を参照されたい。本発明による医薬製剤の製造において、タンパク質/
RNA/mRNAは、典型的には、薬学的に許容される担体と混合される。担体はもちろ
ん、製剤中の他の成分と適合性があるという意味で許容されなければならず、患者に有害
であってはならない。担体は、固体若しくは液体、又はその両方であってもよく、単位用
量製剤として化合物と共に製剤化することができる。
コードするDNA/mRNAは、細胞浸透性ペプチド又は標的リガンドに結合され、細胞
取り込みを促進する。当該分野で公知の細胞浸透性ペプチドの例には、ポリアルギニン(
Jearawiriyapaisarn et al.(2008)Mol Ther.
16:1624-9)、HIVウイルス由来のTATペプチド(Hudecz et a
l.(2005)、Med.Res.Rev.25:679-736)、MPG(Sim
eoni、et al.(2003)Nucleic Acids Res.31:27
17-2724)、Pep-1(Deshayes et al.(2004)Bioc
hemistry 43:7698-7706、及びHSV-1 VP-22(Desh
ayes et al.(2005)Cell Mol Life Sci.62:18
39-49)が含まれる。別の実施形態では、エンドヌクレアーゼタンパク質、又はエン
ドヌクレアーゼをコードするDNA/mRNAは、エンドヌクレアーゼタンパク質/DN
A/mRNAが標的細胞に結合し、且つ標的細胞によって内在化されるように、標的細胞
上に発現される特異的細胞表面受容体を認識する抗体に共有結合的又は非共有結合的に結
合される。あるいは、エンドヌクレアーゼタンパク質/DNA/mRNAは、このような
細胞表面受容体の天然リガンド(又は天然リガンドの一部)に共有結合的又は非共有結合
的に結合することができる。(McCall et al.(2014)Tissue
Barriers.2(4):e944449;Dinda et al.(2013)
Curr Pharm Biotechnol.14:1264-74;Kang et
al.(2014)Curr Pharm Biotechnol.15 (3):2
20-30; Qian et al.(2014)Expert Opin Drug
Metab Toxicol.10(11):1491-508)。
コードするDNA/mRNAは、肝臓の所望の領域内に(例えば、肝類洞内皮細胞若しく
は造血内皮細胞、又はそれらに分化する前駆細胞に近接して)注射又は移植するための生
分解性ヒドロゲル内にカプセル化される。ヒドロゲルは、頻繁な注射を必要とせずに、標
的組織の所望の領域に治療ペイロードの持続的且つ調整可能な放出を提供することができ
、刺激応答性材料(例えば温度応答性ヒドロゲル及びpH応答性ヒドロゲル)は、環境的
又は外因的に当てはまる合図に応答してペイロードを放出するように設計することができ
る(Kang Derwent et al.(2008)Trans Am Opht
halmol Soc.106:206-214)。
コードするDNA/mRNAは、当技術分野で公知の方法を用いて、ナノ粒子に共有結合
的に、好ましくは非共有結合的に結合するか、あるいはそのようなナノ粒子内にカプセル
化される(Sharma et al.(2014)Biomed Res Int.2
014)。ナノ粒子は、その長さスケールが<1μm、好ましくは<100nmであるナ
ノスケール送達システムである。このようなナノ粒子は、金属、脂質、ポリマー、又は生
物学的高分子から構成されるコアを用いて設計されてもよく、エンドヌクレアーゼタンパ
ク質、mRNA又はDNAの複数のコピーをナノ粒子コアに結合させるか又はカプセル化
することができる。これは、各細胞に送達されるタンパク質/mRNA/DNAのコピー
数を増加させ、従って、各エンドヌクレアーゼの細胞内発現を増加させて、標的認識配列
が切断される可能性を最大にする。このようなナノ粒子の表面をポリマー又は脂質(例え
ば、キトサン、カチオン性ポリマー、又はカチオン性脂質)で更に修飾して、表面が追加
の官能性を付与するコア-シェルナノ粒子を形成して、細胞送達及びペイロードの取り込
みを増強してもよい(Jian et al.(2012)Biomaterials.
33(30):7621-30)。有利には、ナノ粒子を標的化分子に更に結合させて、
ナノ粒子を適切な細胞型に導き、及び/又は細胞取り込みの可能性を高めてもよい。その
ような標的化分子の例には、細胞表面受容体に特異的な抗体、及び細胞表面受容体の天然
リガンド(又は天然リガンドの一部)が含まれる。
コードするDNA/mRNAは、カチオン性脂質を用いてリポソーム内にカプセル化又は
複合化される(例えば、Lipofectamine(商標)、Life Techno
logies Corp.、Carlsbad、CA; Zuris et al.(2
015)Nat Biotechnol。33:73-80; Mishra et a
l.(2011)J Drug Deliv.2011:863734を参照)。リポソ
ーム及びリポプレックス製剤は、ペイロードを分解から保護し、標的部位での蓄積及び保
持を促進し、標的細胞の細胞膜との融合及び/又は破壊により細胞の取り込み及び送達効
率を促進することができる。
コードするDNA/mRNAは、ポリマー足場(例えば、PLGA)内にカプセル化され
るか、又はカチオン性ポリマー(例えばPEI、PLL)を用いて複合化される(Tam
boli et al.(2011)Ther Deliv.2(4):523-536
)。ポリマー担体は、ポリマー侵食及び薬物拡散の制御によって調整可能な薬物放出速度
を提供するように設計することができ、高効率の薬物カプセル化によって、所望の標的細
胞集団への細胞内送達まで治療有効量の保護を提供することができる。
アーゼをコードするDNA/mRNAは、ミセルに自己集合する両親媒性分子と組み合わ
される(Tong et al.(2007)J Gene Med.9(11):95
6-66)。ポリマーミセルは、親水性ポリマー(例えば、ポリエチレングリコール)で
形成されたミセルシェルを含んでもよく、親水性ポリマーは、凝集を防止し、電荷相互作
用をマスクし、非特異的相互作用を減少させることができる。
コードするDNA/mRNAは、標的細胞への投与及び/又は送達のために、エマルジョ
ン又はナノエマルジョン(即ち、平均粒子直径<1nm)に製剤化される。「エマルジョ
ン」という用語は、限定するものではないが、水中油型、油中水型、水中油中水型、又は
油中水中油型の分散液又は液滴を指し、水不混和相が水相と混合されると、無極性残基(
例えば、長い炭化水素鎖)を水から離れるように移動させ、極性頭部基を水に向かって移
動させる疎水力の結果として形成することができる脂質構造体を含む。これらの他の脂質
構造体には、単層、少重膜(paucilamellar)層、及び多重層脂質小胞体、
ミセル及びラメラ相が含まれるが、これらに限定されない。エマルジョンは、水相及び親
油相(典型的には油及び有機溶媒を含有する)から構成される。エマルジョンはまた、1
種以上の界面活性剤を含有することが多い。ナノエマルジョン製剤は、例えば、米国特許
出願第2002/0045667号及び第2004/0043041号、並びに米国特許
第6,015,832号、第6,506,803号、第6,635,676号、及び第6
,559,189号に記載されているように周知であり、これらの各々は参照によりその
全体が本明細書に組み込まれる。
コードするDNA/mRNAは、多官能性ポリマー結合体、DNAデンドリマー、及びポ
リマーデンドリマーに共有結合しているか、又は非共有結合している(Mastorak
os et al.(2015)Nanoscale.7(9):3845-56、Ch
eng et al.(2008)J Pharm Sci.97(1):123-43
)。デンドリマー生成は、ペイロードの容量及びサイズを制御することができ、高い薬物
ペイロード容量を提供することができる。更に、複数の表面基の提示を利用して、安定性
を改善し、非特異的相互作用を低減し、細胞特異的標的化及び薬物放出を増強することが
できる。
クターを用いて送達される。そのようなベクターは、当技術分野で公知であり、レトロウ
イルスベクター、レンチウイルスベクター、アデノウイルスベクター、及びアデノ随伴ウ
イルス(AAV)ベクターが含まれる(Vannucci et al.(2013 N
ew Microbiol.36:1-22)に概説されている)。いくつかの実施形態
では、ウイルスベクターは、標的組織に直接注射される。別の実施形態では、ウイルスベ
クターは、循環系を介して全身に送達される。当分野では、異なるAAVベクターが異な
る組織に局在する傾向があることが知られている。肝標的組織では、肝細胞の効果的な形
質導入が、例えばAAV血清型2,8,及び9で示されている(Sands(2011)
Methods Mol.Biol.807:141-157)。AAVベクターはまた
、宿主細胞において第2鎖DNA合成を必要としないように自己相補的であり得る(Mc
Carty et al.(2001)Gene Ther.8:1248-54)。
は、自己制限ウイルスベクターである。自己制限ウイルスベクターは、ベクター内の組換
えメガヌクレアーゼの認識配列の存在に起因して、細胞又は生物において持続時間が制限
され得る。従って、自己制限ウイルスベクターを操作して、プロモーター、本明細書に記
載のエンドヌクレアーゼ、及びITR内のエンドヌクレアーゼ認識部位のコードを提供す
ることができる。自己制限ウイルスベクターは、エンドヌクレアーゼ遺伝子を細胞、組織
、又は生物に送達して、エンドヌクレアーゼが発現され、ゲノム内の内因性認識配列で細
胞のゲノムを切断することができるようにする。送達されたエンドヌクレアーゼはまた、
自己制限ウイルスベクター自体の中にその標的部位を見出し、この標的部位でベクターを
切断する。切断されると、ウイルスゲノムの5’及び3’末端は、エキソヌクレアーゼに
よって曝露されて分解され、ウイルスを殺し、エンドヌクレアーゼの産生を停止する。
ター(例えばAAV)を介して送達される場合、それらはプロモーターに作動可能に連結
されなければならない。いくつかの実施形態では、これは、ウイルスベクター(例えば、
レンチウイルスベクターのLTR)又は周知のサイトメガロウイルス初期プロモーター又
はSV40ウイルス初期プロモーター由来の内因性プロモーター等のウイルスプロモータ
ーであり得る。好ましい実施形態では、メガヌクレアーゼ遺伝子は、標的細胞において遺
伝子発現を優先的に駆動するプロモーターに作動可能に連結される。肝臓特異的プロモー
ターの例としては、限定されないが、ヒトα-1抗トリプシンプロモーター及びアポリポ
タンパク質A-IIプロモーターが挙げられる。
細胞の割合の中に機能性野生型遺伝子が生じることが想定される。しかし、復帰の頻度が
低い場合、又は標的細胞の大きな割合を修正する必要がある場合、各患者に複数回の治療
を行う必要があり得る。
クレアーゼ、又は薬学的に許容される担体と本発明の操作されたヌクレアーゼをコードす
る核酸を含む単離されたポリヌクレオチドとを含む、医薬組成物を提供する。他の実施形
態では、本発明は、標的組織に送達することができ、そこで次に細胞が野生型第VIII
因子を発現する細胞に分化することができる、薬学的に許容される担体と、本発明の遺伝
子改変細胞と、を含む医薬組成物を提供する。本発明の医薬組成物は、第VIII因子遺
伝子のエクソン1-22の逆位によって特徴付けられる血友病Aを有する被験体の治療に
有用であり得る。
ington、The Science and Practice of Pharm
acy(21st.ed.2005)を参照されたい。本発明による医薬製剤の製造にお
いて、エンドヌクレアーゼポリペプチド(又はそれをコードするDNA/RNA)は、一
般的には、薬学的に許容される担体と混合され、得られた組成物が被験体に投与される。
担体はもちろん、製剤中の他の成分と適合性があるという意味で許容されなければならず
、被験体に有害であってはならない。いくつかの実施形態では、本発明の医薬組成物は、
被験体における疾患の治療に有用な1以上の追加の薬剤又は生物学的分子を更に含むこと
ができる。同様に、追加の薬剤及び/又は生物学的分子は、別個の組成物として同時投与
することができる。
AVベクターを提供する。組換えAAVベクターは、典型的には、HEK-293等の哺
乳動物細胞株で産生される。ウイルスのcap遺伝子及びrep遺伝子は、その自己複製
によって治療遺伝子(例えば、エンドヌクレアーゼ遺伝子)が送達される余地を作ること
を防ぐためにベクターから除去されるため、パッケージング細胞株においてトランスで供
給する必要がある。更に、複製を支持するために必要な「ヘルパー」(例えば、アデノウ
イルス)成分を提供することが必要である(Cots D、Bosch A、Chill
on M(2013)Curr.Gene Ther.13(5):370-81)。し
ばしば、組換えAAVベクターは、「ヘルパー」成分をコードする第1のプラスミドと、
cap及びrep遺伝子を含む第2のプラスミドと、ウイルスにパッケージングされる介
在DNA配列を含有するウイルス性ITRを含む第3のプラスミドとで細胞株がトランス
フェクトされる、三重トランスフェクションを用いて産生される。キャプシドに包まれた
ゲノム(目的のITR及び関与する介在遺伝子)を含むウイルス粒子は、その後、凍結融
解サイクル、超音波処理、界面活性剤、又は当技術分野で公知の他の手段によって細胞か
ら単離される。次いで、塩化セシウム密度勾配遠心分離又はアフィニティークロマトグラ
フィーを用いて粒子を精製し、続いて細胞、組織、又はヒト患者などの生物の目的の遺伝
子に送達する。
ヌクレアーゼがパッケージング細胞中で発現しないことを確実にするように、本発明を実
施する際に注意を払わなければならない。本発明のウイルスゲノムは、エンドヌクレアー
ゼの認識配列を含むため、パッケージング細胞株で発現する任意のエンドヌクレアーゼは
、ウイルスゲノムがウイルス粒子にパッケージングされる前にウイルスゲノムを切断する
ことができる。このことは、パッケージング効率の低下及び/又は断片化したゲノムのパ
ッケージングを生じる。以下を含むいくつかのアプローチを使用して、パッケージング細
胞におけるエンドヌクレアーゼ発現を防止することができる。
ーターの制御下に置くことができる。例えば、筋肉組織にエンドヌクレアーゼ遺伝子を送
達するためにウイルスベクターを開発する場合、筋特異的プロモーターを使用することが
できる。筋特異的プロモーターの例には、C5-12(Liu et al.(2004
)Hum Gene Ther.15:783-92)、筋特異的クレアチンキナーゼ(
MCK)プロモーター(Yuasa、et al.(2002)Gene Ther.9
:1576-88)、又は平滑筋22(SM22)プロモーター(Haase et a
l.(2013)BMC Biotechnol.13:49-54)が含まれる。CN
S(ニューロン)特異的プロモーターの例には、NSE、シナプシン、及びMeCP2プ
ロモーターが含まれる(Lentz et al.(2012)Neurobiol D
is.48:179-88)。肝特異的プロモーターの例には、アルブミンプロモーター
(Palb等)、ヒトα1-抗トリプシン(Pa1AT等)、及びヘモペキシン(Php
x等)が含まれる(Kramer、MG et al.、(2003)Mol.Ther
apy 7:375-85)。眼特異的プロモーターの例には、オプシン、及び角膜上皮
特異的K12プロモーターが含まれる(Martin KRG、Klein RL、及び
Quigley HA(2002)Methods(28):267-75)(Tong
Y et al.(2007)J Gene Med、9:956-66)。これらの
プロモーター又は当該分野で公知の他の組織特異的プロモーターは、HEK-293細胞
において高度に活性ではなく、従って、本発明のウイルスベクターに組み込まれた場合に
、パッケージング細胞において有意なレベルのエンドヌクレアーゼ遺伝子発現を生じるこ
とは期待されない。同様に、本発明のウイルスベクターは、不適合組織特異的プロモータ
ー(即ち、周知のHeLa細胞株(ヒト上皮細胞)及び肝特異的ヘモペキシンプロモータ
ーを用いる)の使用と共に他の細胞株を使用することを企図している。組織特異的プロモ
ーターの他の例には、滑膜肉腫PDZD4(小脳)、C6(肝臓)、ASB5(筋肉)、
PPP1R12B(心臓)、SLC5A12(腎臓)、コレステロール調節APOM(肝
臓)、ADPRHL1(心臓)、及び一因性奇形シンドロームTP73L(筋肉)が含ま
れる。(Jacox E et al.、(2010)PLoS One v.5(8)
:e12274)。
細胞にパッケージングすることができる。例えば、ウイルス粒子は、非哺乳類パッケージ
ング細胞において活性ではない、周知のサイトメガロウイルス初期プロモーター又はSV
40ウイルス初期プロモーター等の哺乳動物プロモーターを用いて、微生物、昆虫、又は
植物細胞中に産生させることができる。好ましい実施形態では、Gaoらによって記載さ
れているようなバキュロウイルス系を用いてウイルス粒子を昆虫細胞中に産生させる(G
ao、H.、et al.(2007)J.Biotechnol.131(2):13
8-43)。哺乳動物プロモーターの制御下にあるエンドヌクレアーゼは、これらの細胞
中で発現する可能性は低い(Airenne、KJ et al.(2013)Mol.
Ther.21(4):739-49)。更に、昆虫細胞は、哺乳動物細胞とは異なるm
RNAスプライシングモチーフを利用する。従って、ヒト成長ホルモン(HGH)イント
ロン又はSV40ラージT抗原イントロン等の哺乳動物イントロンをエンドヌクレアーゼ
のコード配列に組み込むことが可能である。これらのイントロンは昆虫細胞のプレmRN
A転写物から効率的にスプライシングされないため、昆虫細胞は機能的エンドヌクレアー
ゼを発現せず、全長ゲノムをパッケージングする。対照的に、得られた組換えAAV粒子
が送達される哺乳動物細胞は、プレmRNAを適切にスプライスし、機能的エンドヌクレ
アーゼタンパク質を発現する。Haifeng Chenは、HGH及びSV40ラージ
T抗原イントロンを使用して、昆虫パッケージング細胞中の毒性タンパク質バルナーゼ及
びジフテリア毒素断片Aの発現を減弱させ、これらの毒素遺伝子を担持する組換えAAV
ベクターの産生を可能にすることを報告した(Chen、H(2012)Mol The
r Nucleic Acids.1(11):e57)。
要とされるように、誘導性プロモーターに作動可能に連結され得る。誘導性プロモーター
の例には、Tet-Onシステム(Clontech;Chen H、et al.(2
015)BMC Biotechnol.(j)15(1):4))及びRheoSwi
tchシステム(Intrexon;Sowa G、et al.(2011)Spin
e、36(10):E623-8)が含まれる。両方のシステム及び当該分野で公知の類
似のシステムは、小分子活性化因子(それぞれドキシサイクリン又はエクジソン)に応答
して転写を活性化するリガンド誘導性転写因子(それぞれTetリプレッサー及びエクジ
ソン受容体の変異体)に依存する。このようなリガンド誘導性転写活性化因子を用いて本
発明を実施することは、1)対応する転写因子に応答するプロモーターの制御下にエンド
ヌクレアーゼ遺伝子を配置することであって、エンドヌクレアーゼ遺伝子が転写因子の結
合部位を有することと、2)パッケージングされたウイルスゲノム中の転写因子をコード
する遺伝子を含むことと、を含む。転写活性化因子が同じ細胞にも供給されない場合、組
換えAAV送達後に標的細胞又は組織中にエンドヌクレアーゼが発現しないため、後者の
ステップが必要である。次いで、転写活性化因子は、コグネイト小分子活性化因子で処理
された細胞又は組織中にのみエンドヌクレアーゼ遺伝子発現を誘導する。このアプローチ
は、小分子誘導因子がいつ、そしてどの組織に送達されるかを選択することによって、エ
ンドヌクレアーゼ遺伝子発現を空間-時間的に調節することができるため有利である。し
かしながら、担持能力が著しく制限されたウイルスゲノムに誘導因子を含める必要性は、
このアプローチの欠点を作り出す。
るリプレッサーを発現する哺乳動物細胞株に産生される。転写リプレッサーは当該分野で
公知であり、Tetリプレッサー、Lacリプレッサー、Croリプレッサー、及びLa
mbdaリプレッサーを含む。エクジソン受容体などの多くの核内ホルモン受容体は、そ
れらの同族ホルモンリガンドの非存在下で転写リプレッサーとしても作用する。本発明を
実施するために、パッケージング細胞は、転写リプレッサーをコードするベクターでトラ
ンスフェクト/形質導入され、ウイルスゲノム中のエンドヌクレアーゼ遺伝子(パッケー
ジングベクター)は、プロモーターに作動可能に結合され、このプロモーターは、リプレ
ッサーがプロモーターをサイレンシングするように、リプレッサーのための結合部位を含
むように改変されている。転写リプレッサーをコードする遺伝子は、種々の位置に配置す
ることができる。この遺伝子は、別のベクターにコードすることができ、ITR配列の外
側のパッケージングベクターに組み込むことができ、cap/repベクター又はアデノ
ウイルスヘルパーベクターに組み込むことができ、又は最も好ましくは、構成的に発現さ
れるようにパッケージング細胞のゲノムに安定に組み込むことができる。転写リプレッサ
ー部位を組み込むために一般的な哺乳動物プロモーターを改変する方法は、当技術分野で
公知である。例えば、Chang及びRoninsonは、強力な構成的CMV及びRS
VプロモーターをLacリプレッサーのオペレーターを含むように改変し、改変プロモー
ターからの遺伝子発現がリプレッサーを発現する細胞で大きく減弱したことを示した(C
hang BD及びRoninson IB(1996)Gene 183:137-4
2)。非ヒト転写リプレッサーの使用は、エンドヌクレアーゼ遺伝子の転写が、リプレッ
サーを発現するパッケージング細胞においてのみ抑制され、得られる組換えAAVベクタ
ーで形質導入される標的細胞又は組織においては抑制されないことを確実にする。
する。本発明の更なる実施形態は、本明細書に記載のエンドヌクレアーゼをコードする核
酸配列を含む単離されたポリヌクレオチド及びそのようなポリヌクレオチドの変異体を包
含する。
する。「変異体」ポリペプチドは、天然のタンパク質の1以上の内部部位における1以上
のアミノ酸の欠失若しくは付加、及び/又は天然のポリペプチドの1以上の部位における
1以上のアミノ酸の置換によって、「天然の」ポリペプチドから派生したポリペプチドを
意味することを意図する。本明細書で使用される場合、「天然の」ポリヌクレオチド又は
ポリペプチドは、変異体が由来する親配列を含む。実施形態によって包含される変異体ポ
リペプチドは生物学的に活性である。即ち、それらは天然のタンパク質の所望の生物学的
活性を保持し続けており、即ち、例えば、F8R1-2認識配列(配列番号7)、F8R
3-4認識配列(配列番号9)、F8R9-10認識配列(配列番号11)、F8R11
-12認識配列(配列番号13)、F8R13-14認識配列(配列番号15)、又はF
8R15-16認識配列(配列番号17)を含む、第VIII因子遺伝子のint22h
-1配列に見出される認識配列を認識し切断する能力を保持し続けている。そのような変
異体は、例えばヒトの操作から生じ得る。実施形態の天然のポリペプチドの生物学的に活
性な改変体(例えば、配列番号19~21,28~31,40~43,52~55,64
~67、又は76~79)、又は本明細書に記載されているサブユニットを結合する認識
ハーフサイトの生物学的に活性な変異体は、本明細書の他の箇所に記載されている配列ア
ライメントプログラム及びパラメータによって決定されるように、天然のポリペプチド又
は天然のサブユニットのアミノ酸配列に対して少なくとも約40%、約45%、約50%
、約55%、約60%、約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%
、約91%、約92%、約93%、約94%、約95%、約96%、約97%、約98%
、又は約99%の配列同一性を有する。実施形態のポリペプチド又はサブユニットの生物
学的に活性な変異体は、そのポリペプチド又はサブユニットと、わずか約1-40個のア
ミノ酸残基、わずか約1-20個、わずか約1-10個、約5、わずか4,3,2個、又
は更には1個のアミノ酸残基だけ異なり得る。
で変化させることができる。そのような操作のための方法は、当技術分野において一般的
に知られている。例えば、アミノ酸配列変異体は、DNA中の突然変異によって調製する
ことができる。突然変異誘発及びポリヌクレオチド変更の方法は、当技術分野において周
知である。例えば、Kunkel(1985)Proc.Natl.Acad.Sci.
USA 82:488-492、Kunkel et al.(1987)Method
s in Enzymol.154:367-382、米国特許第4,873,192号
、Walker and Gaastra編(1983)Techniques in
Molecular Biology(MacMillan Publishing C
ompany、New York)及びそこに引用されている参考文献を参照されたい。
目的のタンパク質の生物学的活性に影響を及ぼさない適切なアミノ酸置換に関するガイダ
ンスは、Dayhoff et al.(1978)Atlas of Protein
Sequence and Structure(Natl.Biomed.Res.
Found.、Washington、D.C.)に記載されている。あるアミノ酸を同
様の特性を有する別のアミノ酸と交換するなどの保存的置換が最適であり得る。
ノ酸修飾が以前に同定されており(例えば、米国特許第8,021,867号)、これは
単独で又は組み合わせて、DNA認識配列ハーフサイト内の個々の塩基において特異性が
変更された組換えメガヌクレアーゼを生じ、得られる合理的に設計されたメガヌクレアー
ゼは、野生型酵素とは異なるハーフサイト特異性を有するようになる。表7は、認識ハー
フサイトの各ハーフサイト位置(-1~-9)に存在する塩基に基づいて、特異性を増強
するために組換えメガヌクレアーゼモノマー又はサブユニットにおいてなされ得る、可能
性のある置換を提供する。
印は、残基がアンチセンス鎖上の塩基と接触することを示す。
1以上のヌクレオチドの欠失及び/又は付加を含む。当業者は、実施形態の核酸の変異体
が、オープンリーディングフレームが維持されるように構築されることを認識するであろ
う。ポリヌクレオチドの場合、保存的変異体には、遺伝コードの縮重のために、実施形態
のポリペプチドの1つのアミノ酸配列をコードする配列が含まれる。変異体ポリヌクレオ
チドには、例えば、部位特異的突然変異誘発を用いて生成されるが、実施形態の組換えメ
ガヌクレアーゼを依然としてコードするような、合成由来のポリヌクレオチドが含まれる
。一般に、実施形態の特定のポリヌクレオチドの変異体は、本明細書の他の箇所に記載さ
れている配列アライメントプログラム及びパラメータによって決定されるように、その特
定のポリペプチドに対して少なくとも約40%、約45%、約50%、約55%、約60
%、約65%、約70%、約75%、約80%約85%、約90%、約91%、約92%
、約93%、約94%、約95%、約96%、約97%、約98%、約99%、又はそれ
以上の配列同一性を有する。実施形態の特定のポリヌクレオチドの変異体(即ち、参照ポ
リヌクレオチド)は、変異ポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチドと参照ポ
リヌクレオチドによってコードされるポリペプチドとの間の配列同一性割合を比較するこ
とによって評価することもできる。
において根本的な変化を生じることは期待されない。しかし、置換、欠失、又は挿入の正
確な効果をそれに先立って予測することが困難な場合、当業者は、第VIII因子遺伝子
のint22h-1配列内に見出される認識配列を優先的に認識及び切断する能力につい
てポリペプチドをスクリーニングすることによって、その効果が評価されることを理解す
るであろう。
のと解釈されるべきではない。当業者であれば、日常的な実験を用いて、本明細書に記載
の特定の物質及び手順に対する多数の等価物を認識し、又は確認することができるであろ
う。そのような等価物は、以下の実施例に従う請求項の範囲に包含されることが意図され
る。
F8R認識配列を認識し切断するメガヌクレアーゼの特徴付け
ーゼ(配列番号19~21)は、F8R1-2認識配列(配列番号7)を認識し切断する
ように操作され、F8R1-2認識配列(配列番号7)は、ヒト及びイヌ第VIII因子
遺伝子、具体的にはint22h-1配列内、より具体的にはF8A1配列内に存在する
。各F8R1-2組換えメガヌクレアーゼは、SV40に由来するN末端ヌクレアーゼ局
在化シグナルと、第1のメガヌクレアーゼサブユニットと、リンカー配列と、第2のメガ
ヌクレアーゼサブユニットと、を含む。各F8R1-2メガヌクレアーゼの第1のサブユ
ニットは配列番号7のF8R1認識ハーフサイトに結合し、第2のサブユニットはF8R
2認識ハーフサイトに結合する(図2参照)。
VR2と呼ばれる56塩基対超可変領域を各々含む。F8R1結合サブユニットは、HV
R1領域の外側で高度に保存されている。同様に、F8R2結合サブユニットも、HVR
2領域の外側で高度に保存されている。配列番号19~21のF8R1結合領域は、それ
ぞれ配列番号22~24として提供される。配列番号22~24の各々は、メガヌクレア
ーゼF8R1-2x.27(配列番号19)のF8R1結合領域である配列番号22と少
なくとも90%の配列同一性を共有する。配列番号19~21のF8R2結合領域は、そ
れぞれ配列番号25~27として提供される。配列番号25~27の各々は、メガヌクレ
アーゼF8R1-2x.27(配列番号19)のF8R2結合領域である配列番号25と
少なくとも90%の配列同一性を共有する。
ーゼ(配列番号28~31)は、F8R3-4認識配列(配列番号9)を認識し切断する
ように操作され、F8R3-4認識配列(配列番号9)は、ヒト及びイヌ第VIII因子
遺伝子、具体的にはint22h-1配列内、より具体的にはF8A1配列内に存在する
。各F8R3-4組換えメガヌクレアーゼは、SV40に由来するN末端ヌクレアーゼ局
在化シグナルと、第1のメガヌクレアーゼサブユニットと、リンカー配列と、第2のメガ
ヌクレアーゼサブユニットと、を含む。各F8R3-4メガヌクレアーゼの第1のサブユ
ニットは配列番号9のF8R3認識ハーフサイトに結合し、第2のサブユニットはF8R
4認識ハーフサイトに結合する(図2を参照)。
VR2と呼ばれる56塩基対超可変領域を各々含む。F8R3結合サブユニットは、HV
R1領域の外側で高度に保存されている。同様に、F8R4結合サブユニットも、HVR
2領域の外側で高度に保存されている。配列番号28~31のF8R3結合領域は、それ
ぞれ配列番号32~35として提供される。配列番号32~35の各々は、メガヌクレア
ーゼF8R3-4x.43(配列番号28)のF8R3結合領域である配列番号32と少
なくとも90%の配列同一性を共有する。配列番号28~31のF8R4結合領域は、そ
れぞれ配列番号36~39として提供される。配列番号36~39の各々は、メガヌクレ
アーゼF8R3-4x.43(配列番号28)のF8R4結合領域である配列番号36と
少なくとも90%の配列同一性を共有する。
アーゼ(配列番号40~43)は、ヒト及びイヌ第VIII因子遺伝子、具体的にはin
t22h-1配列内に存在するF8R9-10認識配列(配列番号11)を認識し切断す
るように操作された。各F8R9-10組換えメガヌクレアーゼは、SV40に由来する
N末端ヌクレアーゼ局在化シグナルと、第1のメガヌクレアーゼサブユニットと、リンカ
ー配列と、第2のメガヌクレアーゼサブユニットと、を含む。各F8R9-10メガヌク
レアーゼの第1のサブユニットは配列番号11のF8R9認識ハーフサイトに結合し、第
2のサブユニットはF8R10認識ハーフサイトに結合する(図2を参照)。
HVR2と呼ばれる56塩基対超可変領域を各々含む。F8R9結合サブユニットは、H
VR1領域の外側で高度に保存されている。同様に、F8R10結合サブユニットも、H
VR2領域の外側で高度に保存されている。配列番号40~43のF8R9結合領域は、
それぞれ配列番号44~47として提供される。配列番号44~47の各々は、メガヌク
レアーゼF8R9-10x.70(配列番号40)のF8R9結合領域である配列番号4
4と少なくとも90%の配列同一性を共有する。配列番号40~43のF8R10結合領
域は、それぞれ配列番号48~51として提供される。配列番号48~51の各々は、メ
ガヌクレアーゼF8R9-10x.70(配列番号40)のF8R10結合領域である配
列番号48と少なくとも90%の配列同一性を共有する。
レアーゼ(配列番号52~55)は、ヒト及びイヌ第VIII因子遺伝子、具体的にはi
nt22h-1配列内に存在するF8R11-12認識配列(配列番号13)を認識し切
断するように操作された。各F8R11-12組換えメガヌクレアーゼは、SV40に由
来するN末端ヌクレアーゼ局在化シグナルと、第1のメガヌクレアーゼサブユニットと、
リンカー配列と、第2のメガヌクレアーゼサブユニットと、を含む。各F8R11-12
メガヌクレアーゼの第1のサブユニットは配列番号13のF8R11認識ハーフサイトに
結合し、第2のサブユニットはF8R12認識ハーフサイトに結合する(図2を参照)。
びHVR2と呼ばれる56塩基対超可変領域を各々含む。F8R11結合サブユニットは
、HVR1領域の外部で高度に保存されている。同様に、F8R12結合サブユニットも
、HVR2領域の外側で高度に保存されている。配列番号52~55のF8R11結合領
域は、それぞれ配列番号56~59として提供される。配列番号56~59の各々は、メ
ガヌクレアーゼF8R11-12x.56(配列番号52)のF8R11結合領域である
配列番号56と少なくとも90%の配列同一性を共有する。配列番号52~55のF8R
12結合領域は、それぞれ配列番号60~63として提供される。配列番号60~63の
各々は、メガヌクレアーゼF8R11-12x.56(配列番号52)のF8R12結合
領域である配列番号60と少なくとも90%の配列同一性を共有する。
レアーゼ(配列番号64~67)は、ヒト及びイヌ第VIII因子遺伝子、具体的にはi
nt22h-1配列内に存在するF8R13-14認識配列(配列番号15)を認識し切
断するように操作された。各F8R13-14組換えメガヌクレアーゼは、SV40に由
来するN末端ヌクレアーゼ局在化シグナルと、第1のメガヌクレアーゼサブユニットと、
リンカー配列と、第2のメガヌクレアーゼサブユニットと、を含む。各F8R13-14
メガヌクレアーゼの第1のサブユニットは配列番号15のF8R13認識ハーフサイトに
結合し、第2のサブユニットはF8R14認識ハーフサイトに結合する(図2参照)。
びHVR2と呼ばれる56塩基対超可変領域を各々含む。F8R13結合サブユニットは
、HVR1領域の外側で高度に保存されている。同様に、F8R14結合サブユニットも
、HVR2領域の外側で高度に保存されている。配列番号64~67のF8R13結合領
域は、それぞれ配列番号68~71として提供される。配列番号68~71の各々は、メ
ガヌクレアーゼF8R13~14x.13(配列番号64)のF8R13結合領域である
配列番号68と少なくとも90%の配列同一性を共有する。配列番号64~67のF8R
14結合領域は、それぞれ配列番号72~75として提供される。配列番号72~75の
各々は、メガヌクレアーゼF8R13~14x.13(配列番号64)のF8R14結合
領域である配列番号72と少なくとも90%の配列同一性を共有する。
レアーゼ(配列番号76~79)は、ヒト及びイヌ第VIII因子遺伝子、具体的にはi
nt22h-1配列内に存在するF8R15-16認識配列(配列番号17)を認識し切
断するように操作された。各F8R15-16組換えメガヌクレアーゼは、SV40に由
来するN末端ヌクレアーゼ局在化シグナルと、第1のメガヌクレアーゼサブユニットと、
リンカー配列と、第2のメガヌクレアーゼサブユニットと、を含む。各F8R15-16
メガヌクレアーゼの第1のサブユニットは配列番号17のF8R15認識ハーフサイトに
結合し、第2のサブユニットはF8R16認識ハーフサイトに結合する(図2を参照)。
びHVR2と呼ばれる56塩基対超可変領域を各々含む。F8R15結合サブユニットは
、HVR1領域の外側で高度に保存されている。同様に、F8R16結合サブユニットも
、HVR2領域外で高度に保存されている。配列番号76~79のF8R15結合領域は
、それぞれ配列番号80~83として提供される。配列番号80~83の各々は、メガヌ
クレアーゼF8R15-16x.14(配列番号76)のF8R15結合領域である配列
番号80と少なくとも90%の配列同一性を共有する。配列番号76~79のF8R16
結合領域は、それぞれ配列番号84~87として提供される。配列番号84~87の各々
は、メガヌクレアーゼF8R15-16x.14(配列番号76)のF8R16結合領域
である配列番号84と少なくとも90%の配列同一性を共有する。
、及びF8R15-16メガヌクレアーゼがそれらのそれぞれの認識配列(それぞれ配列
番号7,9、11,13,15,及び17)を認識し切断できるかどうかを決定するため
に、以前に記載されたCHO細胞レポーターアッセイを用いて各組換えメガヌクレアーゼ
を評価した(国際公開第2012/167192号及び図4を参照)。アッセイを実施す
るために、細胞のゲノムに組み込まれた非機能性緑色蛍光タンパク質(GFP)遺伝子発
現カセットを担持するCHO細胞レポーター株を産生させた。各細胞株のGFP遺伝子は
、メガヌクレアーゼによるいずれかの認識配列の細胞内切断が機能的GFP遺伝子をもた
らす相同的組換え事象を刺激するように、一対の認識配列によって中断された。
た1つの認識配列は、F8R1-2認識配列(配列番号7)、F8R3-4認識配列(配
列番号9)、F8R9-10認識配列(配列番号11)、F8R11-12認識配列(配
列番号13)、F8R13-14認識配列(配列番号15)、又はF8R15-16認識
配列(配列番号17)であった。GFP遺伝子に挿入された第2の認識配列は、「CHO
-23/24」と呼ばれる対照メガヌクレアーゼによって認識され切断されるCHO-2
3/24認識配列であった。F8R1-2認識配列とCHO-23/24認識配列とを含
むCHOレポーター細胞を「F8R1-2細胞」と呼ぶ。F8R3-4認識配列とCHO
-23/24認識配列とを含むCHOレポーター細胞を「F8R3-4細胞」と呼ぶ。F
8R9-10認識配列とCHO-23/24認識配列とを含むCHOレポーター細胞を「
F8R9-10細胞」と呼ぶ。F8R11-12認識配列とCHO-23/24認識配列
とを含むCHOレポーター細胞を「F8R11-12細胞」と呼ぶ。F8R13-14認
識配列とCHO-23/24認識配列とを含むCHOレポーター細胞を「F8R13-1
4細胞」と呼ぶ。F8R15-16認識配列とCHO-23/24認識配列とを含むCH
Oレポーター細胞を「F8R15-16細胞」と呼ぶ。
スミドDNAでトランスフェクトするか(例えば、F8R1-2細胞を、F8R1-2メ
ガヌクレアーゼをコードするプラスミドDNAでトランスフェクトした)、又はCHO-
23/34メガヌクレアーゼをコードするプラスミドでトランスフェクトした。各アッセ
イにおいて、4e5 CHOレポーター細胞を、製造者の指示に従ってLipofect
amine(登録商標)2000(ThermoFisher)を用いて96ウェルプレ
ート中の50ngのプラスミドDNAでトランスフェクトした。トランスフェクションの
48時間後、細胞をフローサイトメトリーによって評価して、トランスフェクトされてい
ない陰性対照(F8Rbs)と比較したGFP陽性細胞の割合を決定した。図5A~図5
Gに示すように、全てのF8Rメガヌクレアーゼは、対応する認識配列を含む細胞株にお
いて陰性対照を有意に超える頻度でGFP陽性細胞を産生することが見出された。
目にPCS7-8メガヌクレアーゼの有効性を時間依存的に測定した。この研究では、製
造者の指示に従ってBioRad Gene Pulser Xcell(商標)を使用
して、F8R1-2、F8R3-4、F8R9-10、F8R11-12、F8R13-
14、又はF8R15-16細胞(1.0×106個)に、細胞ごとに対応するメガヌク
レアーゼmRNAの1×106コピーをエレクトロポレーションした。トランスフェクシ
ョン後の指定された時点で、細胞をフローサイトメトリーによって評価し、GFP陽性細
胞の割合を決定した。CHO-23/24メガヌクレアーゼも、陽性対照として各時点で
含めた。
た%GFPは、各研究の時間経過にわたって比較的一貫しており、細胞における持続的な
切断活性及び実質的な毒性の欠如を示している。他のF8Rメガヌクレアーゼは、研究の
時間経過にわたって%GFP発現のいくらかの変動性を示した。
認識配列を効率的に標的とし切断することができることを実証した。
ヒト第VIII因子遺伝子におけるエクソン1-22の逆位
ndel)を引き起こす能力について、メガヌクレアーゼF8R1-2及びF8R3-4
を試験した。HEK293細胞に、各ヌクレアーゼをコードする200ngのmRNAを
トランスフェクトした。トランスフェクションの7日後に細胞を採取し、gDNAを抽出
した。このgDNAを、F8R3-4f.357プライマー及びF8R1-2r.467
プライマーを用いたPCR反応における鋳型として使用した。次いで、得られたPCR産
物をT7エンドヌクレアーゼを用いて分析し、indelの存在を明らかにした(図7)
。図7は、モック処理(レーン1)、又はF8R1-2x.15(レーン2)、F8R1
-2x.27(レーン3)、F8R3-4x.43(レーン4)、F8R3-4x.70
(レーン5)で処理したHEK293細胞からのPCR/T7エンドヌクレアーゼ反応を
搭載したアガロースゲルを示す。レーン4及びレーン5のより低い分子量のバンドは、T
7エンドヌクレアーゼ陽性の結果及び標的認識配列におけるindelの存在を示す。
1-22の逆位を刺激するかどうかを決定するために、まず、F8R1-2又はF8R3
-4メガヌクレアーゼをコードする200ngのmRNAでHEK293細胞をトランス
フェクトし、7日後にgDNAを採取した。プライマーセットH1R/H1Fを用いたP
CRによってgDNAを分析して、正常エクソン1-22の位置を検出し、プライマーセ
ットH1R/H2/3Rを用いて逆位エクソン1-22の位置を検出した(図8)。図8
Aは、モック処理(レーン1)、又はF8R1-2x.15(レーン2)、F8R1-2
x.27(レーン3)、F8R3-4x.43(レーン4)、F8R3-4x.70(レ
ーン5)で処理したHEK293細胞からのH1R/H1FプライムPCR反応を搭載し
たアガロースゲルを示す。レーン6は、未処理のヒト細胞gDNA鋳型を用いた対照PC
Rを含む。レーン7は鋳型なしのPCR陰性対照を含む。図8Bは、モック処理(レーン
1)、又はF8R1-2x.15(レーン2)、F8R1-2x.27(レーン3)、F
8R3-4x.43(レーン4)、F8R3-4x.70(レーン5)で処理したHEK
293細胞からのH1R/H2/3RプライムPCR反応を搭載したアガロースゲルを示
す。レーン6は、未処理のヒト細胞gDNA鋳型を用いた対照PCRを含む。レーン7は
鋳型なしのPCR陰性対照を含む。図8BのPCR断片の存在は、本発明に包含されるF
8Rメガヌクレアーゼを用いたエクソン1-22の逆位の成功を示す。
クレアーゼによるゲノムDNAの切断がエクソン1-22の逆位を刺激するかどうかを決
定するために、まず、各個々のヌクレアーゼをコードする200ngのmRNAでHEK
293細胞をトランスフェクトし、トランスフェクション後2日目及び8日目にgDNA
を採取した。プライマーセットH1R/H1Fを用いたPCRによって、gDNAを分析
して、正常エクソン1-22の位置を検出し、プライマーセットH1R/H2/3Rで逆
位エクソン1-22の位置を検出した(図9)。図9は、モック処理(レーン1)、又は
F8R9-10x.38(レーン2)、F8R9-10x.70(レーン3)、F8R1
1-12x.56(レーン4)、F8R11-12x.69(レーン5)、F8R13-
14x.3(レーン6)、F8R13-14x.13(レーン7)、F8R15-16x
.14(レーン8)、F8R15-16x.85(レーン9)で処理したHEK293細
胞からのH1R/H1FプライムPCR反応(上)及びH1R/H2/3RプライムPC
R反応(下)を搭載したアガロースゲルを示す。レーン10は、未処理のヒト細胞gDN
A鋳型を用いた対照PCRを含む。レーン11は鋳型なしのPCR陰性対照を含む。H1
R/H2/3RプライムPCR反応(図9の下半分)におけるPCR断片の存在は、本発
明に包含されるF8Rメガヌクレアーゼを用いたエクソン1-22の逆位の成功を示して
いる。
293細胞中のF8Rヌクレアーゼによる第VIII因子遺伝子の逆位及び逆デジタルP
CRによる効率の決定
友病A特異的第VIII因子遺伝子の逆位をもたらし得ることを実証した。更に、記載さ
れた方法を用いて、F8Rヌクレアーゼ媒介性第VIII因子遺伝子逆位の効率を決定す
ることができる。
それぞれF8R11-12x.69又はF8R13-14x.13ヌクレアーゼをコード
するmRNA(5μg)を、HEK293細胞(2×106)にトランスフェクトした。
トランスフェクションの2日後に、ゲノムDNAを細胞から単離し、逆デジタルPCRを
実施して第VIII因子ゲノム編集を決定した。トランスフェクトされていない細胞から
単離したゲノムDNAは対照として役立った。
、T4 DNAリガーゼを用いて環状化し、製造者の指示に従ってBio-Rad QX
200 Digital PCR Systemを使用して逆デジタルPCRによって分
析した。正常なヒトゲノムDNAにおいて、Bcll消化物は、第VIII因子遺伝子の
イントロン22中のint22h-1反復を包含する約21kbの断片、及びint22
h-1の約0.5Mb上流に位置付けられたint22h-1反復のほぼ同一の逆向きの
コピーを包含する約16kbの断片を生成する。
隣接するプライマーで増幅する。U1プライマー及びD1プライマーは、第VIII因子
遺伝子のイントロン22におけるint22h-1反復の上流及び下流にそれぞれ結合し
、U3プライマーは、int22h-1の約0.5Mb上流に位置付けられたint22
h-1反復のほぼ同一の逆向きのコピーの上流に結合する。全てのプライマーは、従来の
PCRに対して反対向きでゲノムDNAに結合し、Bcll断片が環状化された場合にの
みアンプリコンを生成する。
D1:[5’-ACATACGGTTTAGTCACAAGT-3’](配列番号89)
U3:[5’-TCCAGTCACTTAGGCTCAG-3’](配列番号90)
qManプローブを用いて検出することができる約0.5kbのアンプリコンを生じるが
、U3/U1プライマーを用いたPCRは、増幅産物を生成しない。
片上に位置付けられているU1プライマー結合部位は、D1及びU3プライマー結合部位
に対して再配向される。U1/D1 PCRはPCR産物の生成に失敗するが、U3/U
1 PCRは約0.5kbのアンプリコンを生じ、これは同じTaqManプローブで検
出することができる。
したHEK293細胞及びHEK293細胞由来のゲノムDNAを、逆デジタルPCRに
よって分析した。未処理のHEK293細胞から単離したゲノムDNAからは、U1/D
1断片のみが増幅され、U3/U1 PCRはシグナルを生成しなかった(図10、モッ
ク)。F8Rヌクレアーゼ処理HEK293細胞からのゲノムDNAを用いると、U1/
D1及びU3/U1の両方のアンプリコンが検出された(図10、F8R11-12x.
69及びF8R13-14x.13)。ヌクレアーゼ処理により、編集されたゲノム及び
編集されていないゲノムの両方の細胞の混合集団が生成されたため、U1/D1断片は、
F8Rヌクレアーゼ処理HEK293細胞のゲノムDNAから依然として増幅された。デ
ジタルPCRは数百から数千の染色体等価物の平行分析を可能にするため、第VIII因
子遺伝子の逆位効率を計算することができる。このアッセイによって検出された第VII
I因子遺伝子の総数のうち4%及び30%は、それぞれヌクレアーゼF8R13-14x
.13及びF8R11-12x.69の活性の結果として逆位を示した。
14x.13で処理したHEK293細胞における第VIII因子遺伝子の逆位が検出さ
れた。更に、逆デジタルPCRを用いて、編集効率を計算することができた。ヌクレアー
ゼ(F8R11-12x.69)に依存して、HEK293細胞中の検出された第VII
I因子遺伝子の30%までが編集された。重要なことに、この研究は、第VIII因子遺
伝子逆位がint22h反復内のDNA二本鎖切断によって誘導され得ることを実証する
。両方のヌクレアーゼは、int22h反復内の認識配列を標的とし、潜在的に染色体あ
たり3つの二本鎖切断を導入する。
初代ヒトT細胞におけるF8Rヌクレアーゼによる第VIII因子遺伝子の逆位及び長距
離PCRによる編集の決定
る血友病A特異的第VIII因子遺伝子の逆位をもたらし得ることを実証した。正常ヒト
T細胞(1×106)を、製造者の指示に従ってLonza 4Dヌクレオフェクターを
用いて、F8R3-4x.43ヌクレアーゼをコードするmRNA(1μg)でトランス
フェクトした。トランスフェクションの3日後に、ゲノムDNAを細胞から単離し、長距
離PCRを実施して第VIII因子ゲノム編集を決定した。トランスフェクトされていな
い正常なヒトT細胞から単離されたゲノムDNAは対照として役立った。
WD1プライマーとの間でそれぞれ増幅した。
TCATTCC-3’](配列番号91)
REV1:[5’-CCCCGGCACTTGAAAGTAGCAGATGCAAGAA
GGGCACA-3’](配列番号92)
FWD3:[5’-ACTATAACCAGCACCTTGAACTTCCCCTCTC
ATA-3’](配列番号93)
2におけるint22h-1反復の上流及び下流にそれぞれ結合し、FWD3プライマー
は、int22h-1の約0.5Mb上流に位置付けられたint22h-1反復のほぼ
同一の逆向きのコピーの上流に結合する。
0kbのアンプリコンを生じ、FWD3/FWD1プライマーを用いたPCRは増幅産物
を生成しない。
片上に位置付けられているFWD1プライマー結合部位は、REV1及びFWD3プライ
マー結合部位に対して再配向される。FWD1/REV1 PCRはPCR産物の生成に
失敗し、FWD3/FWD1 PCRは約9.7kbのアンプリコンを生じる。PCR断
片をアガロースゲル電気泳動で分析し、臭化エチジウムで可視化する。
のゲノムDNAを、長距離PCRによって分析した(図11)。未処理の正常ヒトT細胞
から単離したゲノムDNAから増幅されたのはFWD1/REV1断片のみであった(レ
ーン2及びレーン5)。F8R3-4x.43ヌクレアーゼ処理した正常ヒトT細胞のゲ
ノムDNAをPCR鋳型として使用すると、FWD1/REV1プライマー及びFWD3
/FWD1プライマーの両方の組み合わせが、それぞれサイン約10kb及び約9.7k
bのアンプリコンを生じる(レーン3及びレーン6)。ヌクレアーゼ処理により、編集さ
れたゲノムと編集されていないゲノムとの混合細胞集団が生成されたため、FWD1/R
EV1断片は、F8R3-4x.43処理した正常ヒトT細胞のゲノムDNAから依然と
して増幅することができる。
せることにより、ヒトT細胞における第VIII因子遺伝子の逆位を生成することができ
、この逆位は長距離PCRによって検出することができた。
初代ヒト患者T細胞におけるF8Rヌクレアーゼによる第VIII因子遺伝子の復帰と長
距離PCRによる編集の決定
血友病A特異的第VIII因子遺伝子逆位の復帰を誘導し得ることを実証した。
.43、F8R11-12x.69、又はF8R15-16x.14ヌクレアーゼをそれ
ぞれコードするmRNA(1μg)を血友病A患者T細胞(1×106)にトランスフェ
クトした。トランスフェクションの3日後に、ゲノムDNAを細胞から単離し、長距離P
CRを実施して第VIII因子ゲノム編集を決定した。緑色蛍光タンパク質(GFP)を
コードするmRNAでトランスフェクトした患者T細胞から単離されたゲノムDNAは対
照として役立った。
でそれぞれゲノムDNAを増幅した。
GCTGAC-3’](配列番号94)
HID:[5’-GGCCCTACAACCATTCTGCCTTTCACTTTCAG
TGCAATA-3’](配列番号95)
H3D:[5’-CACAAGGGGGAAGAGTGTGAGGGTGTGGGATA
AGAA-3’](配列番号96)
おけるint22h-1リピートの上流及び下流にそれぞれ結合し、H3Dプライマーは
、int22h-1の約0.5Mb上流に位置付けられたint22h-1反復のほぼ同
一の逆向きのコピーの下流に結合する。
のアンプリコンを生じ、H3D/HIDプライマーを用いたPCRは増幅産物を生成しな
い。逆に、HIU/HIDプライマーを用いた血友病A遺伝子逆位を有する患者細胞から
のゲノムDNAの長距離PCRは、PCR産物を生成することができず、H3D/HID
PCRは約11kbのアンプリコンを生じる。
に、逆位断片上に位置付けられているHIUプライマー結合部位は、H3U及びHIDプ
ライマー結合部位に対して再配向される。HIU/HID PCRは、12kbアンプリ
コンを生じ、第VIII因子遺伝子の野生型配置への復帰を示す。PCR断片をアガロー
スゲル電気泳動で分析し、臭化エチジウムで可視化した。
クレアーゼ(又は対照としてのGFP)をコードするmRNAで処理した血友病A患者T
細胞由来のゲノムDNAを、長距離PCRで分析した(図12)。GFP mRNAで処
理した患者T細胞から単離されたゲノムDNAからは、H3U/HID断片のみが増幅さ
れ得る(レーン1a及びレーン1b)。F8R3-4x.43、F8R11-12x.6
9、又はF8R15-16x.14ヌクレアーゼ処理した患者T細胞のゲノムDNAをP
CR鋳型として使用すると、HIU/HIDプライマー及びH3D/HIDプライマーの
両方の組み合わせが、それぞれサイン野生型(約12kb)及び逆位(約11kb)のア
ンプリコンを生じた(レーン3a及びレーン3b:F8R3-4x.43、レーン4a及
びレーン4b:F8R11-12x.69、レーン5a及びレーン5b:F8R15-1
6x.14)。ヌクレアーゼ処理により、編集されたゲノムと編集されていないゲノムと
の細胞の混合集団が生成されたため、H3U/HID断片は、F8Rヌクレアーゼ処理し
た患者T細胞のゲノムDNAから依然として増幅されていた。
生型配置に戻る逆位第VIII因子遺伝子の復帰を誘導することができ、この復帰は長距
離PCRによって検出することができた。
Claims (46)
- 第VIII因子遺伝子のint22h-1配列内の認識配列を認識し切断する操作され
たメガヌクレアーゼであって、
前記操作されたメガヌクレアーゼは、第1のサブユニットと第2のサブユニットとを含
み、前記第1のサブユニットは、前記認識配列の第1の認識ハーフサイトに結合し、第1
の超可変領域(HVR1)を含み、前記第2のサブユニットは、前記認識配列の第2の認
識ハーフサイトに結合し、第2の超可変領域(HVR2)を含む、操作されたメガヌクレ
アーゼ。 - 前記認識配列が前記第VIII因子遺伝子のF8A1コード配列内にある、請求項1に
記載の操作されたメガヌクレアーゼ。 - 前記F8A1コード配列が、配列番号5又は配列番号6と少なくとも95%の配列同一
性を有する、請求項2に記載の操作されたメガヌクレアーゼ。 - 前記認識配列が配列番号9を含む、請求項1~3のいずれか一項に記載の操作されたメ
ガヌクレアーゼ。 - 前記HVR1領域が、配列番号28~31のいずれか1つの残基215~270に対応
するアミノ酸配列と少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項
4に記載の操作されたメガヌクレアーゼ。 - 前記HVR1領域が、配列番号28~31のいずれか1つの残基215,217,21
9,221,223,224,231,233,235,237,261,266,及び
268に対応する残基を含む、請求項4又は5に記載の操作されたメガヌクレアーゼ。 - 前記HVR1領域が、配列番号28~31のいずれか1つの残基215~270を含む
、請求項4~6のいずれか1項に記載の操作されたメガヌクレアーゼ。 - 前記HVR2領域が、配列番号28~31のいずれか1つの残基24~79に対応する
アミノ酸配列に対して少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求
項4~7のいずれか1項に記載の操作されたメガヌクレアーゼ。 - 前記HVR2領域が、配列番号28~31のいずれか1つの残基24,26,28,3
2,33,38,40,42,44,46,68,70,75,及び77に対応する残基
を含む、請求項4~8のいずれか1項に記載の操作されたメガヌクレアーゼ。 - 前記HVR2領域が、配列番号30の残基73に対応する残基を更に含む、請求項4~
9のいずれか1項に記載の操作されたメガヌクレアーゼ。 - 前記HVR2領域が、配列番号28~31のいずれか1つの残基24~79を含む、請
求項4~10のいずれか1項に記載の操作されたメガヌクレアーゼ。 - 前記第1のサブユニットが、配列番号28~31のいずれか1つの残基198~344
に対して少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、前記第2のサブユ
ニットが、配列番号28~31のいずれか1つの残基7~153に対して少なくとも80
%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項4~11のいずれか1項に記載の操
作されたメガヌクレアーゼ。 - 前記第1のサブユニットが、配列番号28~31のいずれか1つの残基198~344
を含む、請求項4~12のいずれか1項に記載の操作されたメガヌクレアーゼ。 - 前記第2のサブユニットが、配列番号28~31のいずれか1つの残基7~153を含
む、請求項4~13のいずれか1項に記載の操作されたメガヌクレアーゼ。 - 前記操作されたメガヌクレアーゼがリンカーを含む一本鎖メガヌクレアーゼであり、前
記リンカーが前記第1のサブユニットと前記第2のサブユニットとを共有結合する、請求
項4~14のいずれか1項に記載の操作されたメガヌクレアーゼ。 - 前記操作されたメガヌクレアーゼが、配列番号28~31のいずれか1つのアミノ酸配
列を含む、請求項4~15のいずれか1項に記載の操作されたメガヌクレアーゼ。 - 請求項1~16のいずれか1項に記載の前記操作されたメガヌクレアーゼをコードする
核酸配列を含む、単離されたポリヌクレオチド。 - 前記単離されたポリヌクレオチドがmRNAである、請求項17に記載の単離されたポ
リヌクレオチド。 - 請求項1~16のいずれか1項に記載の前記操作されたメガヌクレアーゼをコードする
核酸配列を含む、組換えDNA構築物。 - 前記組換えDNA構築物が、請求項1~16のいずれか1項に記載の前記操作されたメ
ガヌクレアーゼをコードする前記核酸配列を含むウイルスベクターをコードする、請求項
19に記載の組換えDNA構築物。 - 前記ウイルスベクターが、組換えアデノ随伴ウイルス(AAV)ベクターである、請求
項19又は20に記載の組換えDNA構築物。 - 請求項1~16のいずれか1項に記載の前記操作されたメガヌクレアーゼをコードする
核酸配列を含む、ウイルスベクター。 - 前記ウイルスベクターが組換えAAVベクターである、請求項22に記載のウイルスベ
クター。 - 第VIII因子遺伝子のエクソン1-22の逆位を特徴とする血友病Aを有する被験体
を治療するための医薬組成物であって、
前記医薬組成物は、薬学的に許容される担体と、
(a)操作されたヌクレアーゼをコードする核酸であって、前記操作されたヌクレアーゼ
がインビボで発現する、核酸、又は
(b)操作されたヌクレアーゼタンパク質
と、を含み、
前記操作されたヌクレアーゼは、前記第VIII因子遺伝子のint22h-1配列内
に位置する第1の認識配列に対する特異性を有する、医薬組成物。 - 前記第1の認識配列がF8A1コード配列内にある、請求項24に記載の医薬組成物。
- 前記F8A1コード配列が、配列番号5又は配列番号6と少なくとも95%の配列同一
性を有する、請求項25に記載の医薬組成物。 - 前記操作されたヌクレアーゼが、前記第1の認識配列と同一である第2の認識配列に対
して特異性を有し、前記第2の認識配列が、X染色体の前記第VIII因子遺伝子のテロ
メアの反復配列に位置し、前記反復配列は、前記反復配列が前記int22h-1配列に
対して逆向きであることを除いて、前記int22h-1配列と同一である、請求項24
~26のいずれか1項に記載の医薬組成物。 - 前記核酸がmRNAである、請求項24~27のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- 前記医薬組成物が、前記核酸を含む組換えDNA構築物を含む、請求項24~27のい
ずれか1項に記載の医薬組成物。 - 前記医薬組成物が、前記核酸を含むウイルスベクターを含む、請求項24~27のいず
れか1項に記載の医薬組成物。 - 前記ウイルスベクターが組換えAAVベクターである、請求項30に記載の医薬組成物
。 - 前記操作されたヌクレアーゼが、操作されたメガヌクレアーゼ、TALEN、ジンクフ
ィンガーヌクレアーゼ、コンパクトTALEN、CRISPR、又はmegaTALであ
る、請求項24~31のいずれか1項に記載の医薬組成物。 - 前記操作されたヌクレアーゼが操作されたメガヌクレアーゼである、請求項24~32
のいずれか1項に記載の医薬組成物。 - 前記第1の認識配列が配列番号9を含む、請求項33に記載の医薬組成物。
- 前記核酸が、請求項4~16のいずれか1項に記載の前記操作されたメガヌクレアーゼ
をコードする、請求項34に記載の医薬組成物。 - 前記操作されたメガヌクレアーゼが、配列番号28~31のいずれか1つのアミノ酸配
列を含む、請求項35に記載の医薬組成物。 - 第VIII因子遺伝子のエクソン1-22の逆位を特徴とする血友病Aを有する被験体
を治療する方法であって、前記方法が、前記被験体に請求項24~36のいずれか1項に
記載の前記医薬組成物を投与することを含む、方法。 - 前記操作されたヌクレアーゼ又は前記操作されたヌクレアーゼをコードする前記核酸が
、野生型被験体において第VIII因子を発現する細胞又は野生型被験体において第VI
II因子を発現する細胞に分化する前駆細胞に送達される、請求項37に記載の方法。 - 前記細胞が肝類洞内皮細胞である、請求項37又は38に記載の方法。
- 前記細胞が、肝類洞内皮細胞に分化する前駆細胞である、請求項37又は38に記載の
方法。 - 前記操作されたヌクレアーゼが、前記int22h-1配列と前記反復配列との間の組
換えを促進するために前記第1の認識配列を認識し切断し、野生型第VIII因子遺伝子
を生成させるためにエクソン1-22を復帰させる、請求項37~40のいずれか1項に
記載の方法。 - 前記操作されたヌクレアーゼが、前記反復配列中の前記第2の認識配列を更に認識し切
断する、請求項41に記載の方法。 - 前記操作されたヌクレアーゼが操作されたメガヌクレアーゼである、請求項37~42
のいずれか1項に記載の方法。 - 前記医薬組成物が、請求項1~16のいずれか1項に記載の前記操作されたメガヌクレ
アーゼをコードする核酸を含む、請求項43に記載の方法。 - 前記被験体がヒトである、請求項37~44のいずれか1項に記載の方法。
- 前記被験体がイヌである、請求項37~44のいずれか1項に記載の方法。
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WO2019089913A1 (en) * | 2017-11-01 | 2019-05-09 | Precision Biosciences, Inc. | Engineered nucleases that target human and canine factor viii genes as a treatment for hemophilia a |
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US20220119786A1 (en) * | 2019-01-10 | 2022-04-21 | Precision Biosciences, Inc. | Genetically-modified cells comprising a modified transferrin gene |
JP2022531459A (ja) | 2019-05-07 | 2022-07-06 | プレシジョン バイオサイエンシズ,インク. | 認識配列に対する、操作されたメガヌクレアーゼの最適化 |
US20230031465A1 (en) * | 2019-12-06 | 2023-02-02 | Precision Biosciences, Inc. | Optimized engineered meganucleases having specificity for a recognition sequence in the hepatitis b virus genome |
US20230183664A1 (en) | 2020-05-11 | 2023-06-15 | Precision Biosciences, Inc. | Self-limiting viral vectors encoding nucleases |
WO2023070002A2 (en) * | 2021-10-19 | 2023-04-27 | Precision Biosciences, Inc. | Gene editing methods for treating alpha-1 antitrypsin (aat) deficiency |
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2011514144A (ja) * | 2008-01-31 | 2011-05-06 | セレクティス | 新しいI−CreI由来単鎖メガヌクレアーゼ及びその使用 |
Family Cites Families (17)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4873192A (en) | 1987-02-17 | 1989-10-10 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Process for site specific mutagenesis without phenotypic selection |
US6015832A (en) | 1997-12-31 | 2000-01-18 | The Regents Of The University Of Michigan | Methods of inactivating bacteria including bacterial spores |
US7767216B2 (en) | 1999-04-28 | 2010-08-03 | The Regents Of The University Of Michigan | Antimicrobial compositions and methods of use |
US6559189B2 (en) | 1999-04-28 | 2003-05-06 | Regents Of The University Of Michigan | Non-toxic antimicrobial compositions and methods of use |
US6635676B2 (en) | 1999-04-28 | 2003-10-21 | Regents Of The University Of Michigan | Non-toxic antimicrobial compositions and methods of use |
US6506803B1 (en) | 1999-04-28 | 2003-01-14 | Regents Of The University Of Michigan | Methods of preventing and treating microbial infections |
US6555674B2 (en) | 2000-08-09 | 2003-04-29 | Nsgene A/S | JeT promoter |
US20060153826A1 (en) | 2003-01-28 | 2006-07-13 | Sylvain Arnould | Use of meganucleases for inducing homologous recombination ex vivo and in toto in vertebrate somatic tissues and application thereof |
EP3246403B1 (en) | 2005-10-18 | 2020-08-26 | Precision Biosciences | Rationally designed meganucleases with altered sequence specificity and dna-binding affinity |
EP2660317B1 (en) | 2007-10-31 | 2016-04-06 | Precision Biosciences, Inc. | Rationally-designed single-chain meganucleases with non-palindromic recognition sequences |
CA2730921A1 (en) | 2008-07-14 | 2010-01-21 | Precision Biosciences, Inc. | Recognition sequences for i-crei-derived meganucleases and uses thereof |
EP2500434A1 (en) | 2011-03-12 | 2012-09-19 | Association Institut de Myologie | Capsid-free AAV vectors, compositions, and methods for vector production and gene delivery |
DK2714936T3 (en) | 2011-06-01 | 2019-03-25 | Prec Biosciences Inc | METHODS AND PRODUCTS FOR PRODUCING MANIPULATED MAMMAL CELL LINES WITH AMPLIFIED TRANSGENES |
BR112015013311A2 (pt) | 2012-12-07 | 2017-11-14 | Haplomics Inc | indução de tolerancia e reparação de mutação do fator 8 |
US20160045575A1 (en) * | 2012-12-07 | 2016-02-18 | Tom E. HOWARD | FACTOR VIII MUTATION REPAIR AND TOLERANCE INDUCTION AND RELATED cDNAs, COMPOSITIONS, METHODS AND SYSTEMS |
CN108064280B (zh) | 2015-01-06 | 2021-10-29 | 延世大学校产学协力团 | 利用以凝血因子viii基因为靶的核酸内切酶的a型血友病治疗用组合物 |
WO2019089913A1 (en) | 2017-11-01 | 2019-05-09 | Precision Biosciences, Inc. | Engineered nucleases that target human and canine factor viii genes as a treatment for hemophilia a |
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PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES, vol. 111, no. 25, JPN5019003709, 2014, pages 9253 - 9258, ISSN: 0004949566 * |
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