JP2021528148A - 生体物理信号における非同期ノイズを定量化し、かつ除去するための方法およびシステム - Google Patents
生体物理信号における非同期ノイズを定量化し、かつ除去するための方法およびシステム Download PDFInfo
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Abstract
【選択図】図1B
Description
本国際PCT出願は、2018年6月18日に出願され、「METHODS AND SYSTEMS TO QUANTIFY AND REMOVE ASYNCHRONOUS NOISE IN BIOPHYSICAL SIGNALS」と題された米国仮特許出願第62/686,245号の優先権および利益を主張し、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
図1Aは、例示的な実施形態による、骨格筋関連アーチファクトノイズ汚染などの非同期ノイズを定量化し、かつ除去し、そのような定量化を使用して、準周期的なシステムにおける複雑な非線形変動性をより正確に評価するように構成された例示的なシステム100の図である。本明細書で使用される場合、「除去(remove)」という用語は、その後の分析を改善するか、または有益にするノイズ汚染の全体的または部分的な任意の有意な低減を指す。
図2は、例示的な実施形態による、取得された生体物理信号から非同期ノイズを除去する例示的な方法118を示す。図2に示されるように、方法118は、プロセッサによって、対象106の生体物理信号データセット(例えば、データセット108)を受信するステップ(ステップ202)を含む。上述のように、除去演算118は、測定システム102および/または評価システム110によって実行することができる。心臓信号については、手持ちデバイスまたは他のデバイスを使用して、X、Y、およびZチャネルに対応する3つの直交軸に沿って配置された6つのプローブまたは電極(例えば、プローブ114a〜114f)のセットから、患者の安静時の胸部生理学的信号を収集することができる。非侵襲的測定システム102の一部としての電極は、電離放射線、造影剤、運動、または薬理学的ストレスを使用することなく、位相勾配生体物理信号データセット108を取得することができる。非侵襲的測定システム102は、いくつかの実施形態において、約30〜約1400秒間、好ましくは約210秒間、約8kHzでサンプリングする。取得されたデータ点は、データセット108の一部として評価システム110に転送され、機械学習アルゴリズム/予測器を使用してその中の分析エンジンによって評価される。
上述のように、図4は、準周期信号パターンの代表的なサイクル(例えば、心臓拍動パターンの代表的なサイクル)のテンプレート信号ベクトルデータセットを判定する方法400の図である。方法400は、生体物理信号(例えば、心臓信号、脳信号など)における骨格筋関連アーチファクトおよびノイズ汚染の評価または定量化の一部であり得る。
図5は、例示的な実施形態による、取得された生体物理信号における骨格筋関連アーチファクトノイズ汚染をプロセッサによって定量化する例示的な方法500の図である。
上述のように、骨格筋関連アーチファクトなどの非同期ノイズ汚染、および生体物理信号(心臓信号など)におけるノイズ汚染の定量化は、複雑であり得る。骨格筋関連アーチファクトおよびノイズは、例えば、生体物理信号に関してバンド内ノイズとして現れ得る。すなわち、それは、生体物理信号の支配的な成分と同じ周波数範囲で、典型的には、心臓信号については約0.5Hz〜80Hz、脳信号については約0.1〜50Hzで生じ得る。さらに、EMGは、典型的な心臓または脳波形と同じ振幅を有し得る。
別の態様において、本明細書に記載される非同期汚染除去演算は、例えば、機械学習ベースの疾患関連のためにそのようなプラットフォームから取得されたデータを対象とする前に、複数の異なる取得プラットフォームから取得された心臓信号を正規化するために使用され得る。正規化は、少なくとも部分的に、ディープラーニングからの理論的トポロジーの違いと洞察の知識によって推進される。デバイス正規化プロセスは、例えば、機械学習訓練プロセスを改善することができる信号の群間の類似性(機械学習および電気工学理論の両方によって誘導されるように)を増大させるために、2つ以上の異なる世代からである複数の取得デバイスから取得されたデータに適用され得る。
冠動脈疾患学習アルゴリズム開発(CADLAD)研究は、機械学習アルゴリズムの開発および試験をサポートするための2つの異なる段階を伴って実施された。ステージ1では、対の臨床データを使用して、前処理、特徴抽出、および機械学習ステップの設計および開発を誘導した。すなわち、収集された臨床試験データは、3つのコホートに分割される:トレーニング(50%)、妥当性確認(25%)、検証(25%)。分析のために患者からの信号を処理するための上述のステップと同様に、各信号は、データをクリーニングし、かつ正規化するために最初に前処理される。これらのプロセスに続いて、特徴のセットが、特徴の各セットが真の状態の表現(例えば、有意なCADの有無のバイナリ分類)と対になる信号から抽出される。このステージの最終出力は、測定システム内で具現化された固定アルゴリズムである。CADLAD試験のステージ2では、機械学習アルゴリズムを使用して、以前に試験されていない臨床データのプールに対する有意なCADの判定を提供する。疾患の基準は、American College of Cardiology(ACC)臨床ガイドラインで定義されているように、具体的には血管造影による70%超の狭窄またはフローワイヤによる0.80%未満の狭窄として確立されている。
3次元位相空間体積物体または計算された位相空間断層撮影画像は、訓練された神経ネットワーク分類子によって直接評価されて、肺動脈高血圧の存在または非存在を判定することができる。いくつかの実装態様において、ニューラルネットワーク分類子は、肺動脈高血圧の存在および非存在について評価された冠動脈血管造影結果と対になるグレースケール断層撮影画像のセット上で訓練されたニューラルネットワークであってもよい。いくつかの実装態様において、ニューラルネットワークベースの非線形分類子が使用される。いくつかの実装態様において、ニューラルネットワークベースの非線形分類子は、生成された断層撮影画像からの個々の画素をバイナリ疾患状態予測(すなわち、状態が存在するかまたは存在しない)または推定された生理学的特徴にマッピングするように構成される。いくつかの実装態様において、このマッピングを制御するニューラルネットワークの重みは、勾配降下技術を使用して最適化される。
Claims (32)
- 取得された生体物理信号データセットから非同期ノイズをフィルタリングする方法であって、
プロセッサによって、対象の生体物理信号データセットを受信することと、
前記プロセッサによって、前記受信された生体物理信号データセットにおいて検出された複数の検出された準周期サイクルから、前記対象の代表的な準周期信号パターンに特徴的な少なくとも1つのテンプレート信号ベクトルデータセットを判定することと、
前記プロセッサによって、前記少なくとも1つの判定されたテンプレート信号ベクトルデータセットを1つ以上のノイズ除去ベクトルデータセットに適用することであって、前記1つ以上のノイズ除去ベクトルデータセットが、フィルタリングされる前記受信された生体物理信号データセットの一部分のベクトル長に対応するベクトル長を集合的に有し、前記少なくとも1つの判定されたテンプレート信号ベクトルデータセットが、i)フィルタリングされる受信された心臓信号データセットの前記一部分に存在すると判定された前記検出されたサイクルの各々に適用され、ii)フィルタリングされる前記受信された生体物理信号データセットの前記一部分の対応する検出されたサイクルの前記ベクトル長に一致するように長さが変化する、ことと、
フィルタリングされる前記受信された生体物理信号データセットの前記一部分、および前記1つ以上の生成されたノイズ除去ベクトルデータセットをマージすることによって、前記生体物理信号データセットまたはその一部分のフィルタリングされた生体物理信号データセットを生成することと、を含む、方法。 - 前記プロセッサによって、各々が前記生体物理信号データセットとともに前記対象から同時に取得される1つ以上の追加の生体物理信号データセットを受信することと、
前記プロセッサによって、前記受信された1つ以上の追加の生体物理信号データセットの各々において検出された複数の検出された心臓拍動サイクルから、前記対象の代表的な準周期信号パターンに特徴的な少なくとも1つのテンプレート信号ベクトルデータセットを判定することと、
前記プロセッサによって、前記受信された1つ以上の追加の生体物理信号データセットの各々について、複数の判定されたテンプレート信号ベクトルデータセットを、反復様態で1つ以上のノイズ除去ベクトルデータセットに適用することであって、前記1つ以上のノイズ除去ベクトルデータセットが、フィルタリングされる前記受信された追加の生体物理信号データセットの一部分のベクトル長に対応するベクトル長を集合的に有し、前記複数の判定されたテンプレート信号ベクトルデータセットの各々が、i)フィルタリングされる受信された追加の生体物理信号データセットの前記一部分に存在すると判定された前記検出されたサイクルの各々に適用され、ii)フィルタリングされる前記受信された追加の生体物理信号データセットの前記一部分の対応する検出されたサイクルの前記ベクトル長に一致するように長さが変化する、ことと、
フィルタリングされる前記受信された生体物理信号データセットの前記一部分、および前記1つ以上の生成されたノイズ除去ベクトルデータセットをマージすることによって、前記生体物理信号データセットまたはその一部分のフィルタリングされた生体物理信号データセットを生成することと、をさらに含む、請求項1に記載の方法。 - 前記代表的な準周期信号パターンに特徴的な前記少なくとも1つのテンプレート信号ベクトルデータセットを判定するステップが、
前記プロセッサによって、前記受信された生体物理信号データセットまたはその一部分において特徴的に異なる複数の信号特徴を判定することと、
前記プロセッサによって、前記複数の判定された信号特徴の各々の間の複数のサイクル領域を判定することと、
前記プロセッサによって、前記複数のサイクル領域の各々を、前記複数の信号特徴の同じ態様または前記サイクル領域の各々に位置する信号特徴の別のセットに対して互いに整合させることと、
前記プロセッサによって、前記複数のサイクル領域のうちの点の各セットに対して実行された平均演算またはメディアン演算を使用して、前記少なくとも1つのテンプレート信号ベクトルデータセットの各点を判定することと、を含む、請求項1または2に記載の方法。 - 前記受信された生体物理信号データセットが、心臓信号データセットを含み、前記複数の信号特徴が、前記受信された心臓信号データセットもしくはその一部分におけるRピーク、前記受信された心臓信号データセットもしくはその一部分におけるSピーク、前記受信された心臓信号データセットもしくはその一部分におけるTピーク、前記受信された心臓信号データセットもしくはその一部分におけるQピーク、および前記受信された心臓信号データセットもしくはその一部分におけるPピーク、からなる群から選択される、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。
- 前記受信された生体物理信号データセットが、心臓信号データセットを含み、前記複数の信号特徴が、前記受信された心臓信号データセットまたはその一部分におけるRピークに対応する、請求項1〜4のいずれか一項に記載の方法。
- 前記代表的な準周期パターンに特徴的な前記少なくとも1つのテンプレート信号ベクトルデータセットを判定する前記ステップが、
前記プロセッサによって、前記複数のサイクル領域の各々から導出される正規化パラメータを判定することをさらに含む、請求項1〜5のいずれか一項に記載の方法。 - 前記代表的な準周期信号パターンに特徴的な前記少なくとも1つのテンプレート信号ベクトルデータセットを判定する前記ステップが、
前記プロセッサによって、前記複数のサイクル領域の各々の値、またはそれから導出されるパラメータを、事前に定義されたスケールに正規化することをさらに含む、請求項1〜6のいずれか一項に記載の方法。 - 前記代表的な準周期信号パターンに特徴的な前記少なくとも1つのテンプレート信号ベクトルデータセットを判定する前記ステップが、
前記プロセッサによって、2つ以上の支配的なサイクル形態の存在を判定するために、前記複数のサイクル領域のクラスタリングベースの分析を実行することであって、テンプレート信号ベクトルが、判定された支配的なサイクル形態ごとに判定される、ことをさらに含む、請求項1〜7のいずれか一項に記載の方法。 - 前記複数のサイクル領域が、互いに隣接するサイクルを含む、請求項1〜8のいずれか一項に記載の方法。
- 互いに隣接する前記サイクルが、互いに部分的に重複する、請求項9に記載の方法。
- 互いに隣接する前記サイクルが、互いに重複しない、請求項9に記載の方法。
- 前記フィルタリングされた生体物理信号データセットが、前記複数のサイクル領域の2つ以上のサイクル群から2つ以上のテンプレート信号ベクトルデータセットを使用することによって生成され、前記複数のサイクル領域の前記2つ以上のサイクル群が、互いに隣接する、請求項9〜11のいずれか一項に記載の方法。
- 前記フィルタリングされた生体物理信号データセットが、前記生体物理信号が取得される際に、ほぼリアルタイムで生成される、請求項1〜12のいずれか一項に記載の方法。
- 前記フィルタリングされた生体物理信号データセットが、前記生体物理信号の取得完了後に生成される、請求項1〜13のいずれか一項に記載の方法。
- 前記1つ以上のノイズ除去ベクトルデータセットが、1次元ベクトルとして配置される、請求項1〜14のいずれか一項に記載の方法。
- 前記1つ以上のノイズ除去ベクトルデータセットが、N次元ベクトルとして配置され、Nが、フィルタリングされる受信された生体物理信号データセットの前記一部分に存在すると判定された検出されたサイクルの数に対応する、請求項1〜15のいずれか一項に記載の方法。
- 前記複数の前記判定されたテンプレート信号ベクトルデータセットを1つ以上のノイズ除去ベクトルデータセットに適用する前記ステップが、
前記プロセッサによって、前記1つ以上のノイズ除去ベクトルデータセットを、フィルタリングされる受信された生体物理信号の前記一部分の長さに対応する長さを有する1次元ベクトルとして初期化することと、
前記プロセッサによって、少なくとも前記判定されたテンプレート信号ベクトルのピークと関連付けられたデータ点を、フィルタリングされる前記受信された生体物理信号において判定された各ピークに整合させるように、前記1次元ベクトル内の前記判定されたテンプレート信号ベクトルを複製することと、を含む、請求項1〜16のいずれか一項に記載の方法。 - 前記複製ステップの間に、現在複製しているテンプレート信号ベクトルデータセットの競合部分が、前記現在複製しているテンプレート信号ベクトルデータセットが競合を有する以前に複製されたテンプレート信号ベクトルデータセットの対応する部分に関して割り当てられた平均値である、請求項17に記載の方法。
- 前記複製ステップの間に、現在複製しているテンプレート信号ベクトルデータセットと以前に複製されたテンプレート信号ベクトルデータセットとの間の前記1次元ベクトル内の空の領域が、最後の埋められた値と前記空の領域の周りの次の埋められた値との間に補間された値とともに記憶される、請求項17または18に記載の方法。
- 請求項1〜19のいずれか一項に記載の方法であって、前記ウィンドウベースの演算が、
前記プロセッサによって、事前に定義されたウィンドウ長を有する複数のウィンドウ関数でフィルタリングされる前記受信された生体物理信号データセットの前記一部分をスケーリングして、修正された生体物理信号データセットを生成することと、
前記プロセッサによって、前記1つ以上の生成されたノイズ除去ベクトルデータセットを前記複数のウィンドウ関数でスケーリングして、修正されたノイズ除去ベクトルデータセットを生成することと、
前記プロセッサによって、前記修正されたノイズ除去ベクトルデータセットのエンベロープを判定することと、
前記プロセッサによって、FFT演算を介して、前記修正されたノイズ除去ベクトルデータセットおよび前記周波数領域にフィルタリングされる前記受信された生体物理信号データセットの前記一部分の前記エンベロープを変換することと、
前記プロセッサによって、前記修正されたノイズ除去ベクトルデータセットおよび前記修正された生体物理信号データセットの前記FFTエンベロープの加重平均演算を、静的補間係数または動的補間係数セットを使用して実行して、結果として生じるデータセットを生成することと、
前記プロセッサによって、逆FFT演算を介して、前記結果として生じるデータセットを、前記生体物理信号の前記フィルタリングされた生体物理信号データセットとして時系列データセットに変換することと、を含む、方法。 - 第1の測定機器のセットで取得されたデータセットの第1のセット、および第2の測定機器のセットで取得されたデータセットの第2のセットを正規化する方法であって、それにより、前記データセットの第1のセットが、機械学習演算において前記データセットの第2のセットで分析可能であり、前記方法が、
プロセッサによって、第1の測定機器のセットで取得された対象の生体物理信号データセットのセットを受信することと、
前記プロセッサによって、前記受信された生体物理信号データセットにおいて検出された複数の検出された準周期信号サイクルから、前記対象の代表的な準周期信号パターンに特徴的な少なくとも1つのテンプレート信号ベクトルデータセットを判定することと、
前記プロセッサによって、複数の前記判定されたテンプレート信号ベクトルデータセット、またはその群から選択されたベクトルを1つ以上のノイズ除去ベクトルデータセットに適用することであって、前記1つ以上のノイズ除去ベクトルデータセットが、フィルタリングされる前記受信された生体物理信号データセットの一部分のベクトル長に対応するベクトル長を集合的に有し、前記各適用されたテンプレート信号ベクトルデータセットが、i)フィルタリングされる受信された生体信号データセットの前記一部分に存在すると判定された前記検出されたサイクルの各々に適用され、ii)フィルタリングされる前記受信された生体物理信号データセットの前記一部分の対応する検出されたサイクルの前記ベクトル長に一致するように長さが変化する、ことと、
前記生体物理信号データセットまたはその一部分と関連付けられたフィルタリングされた生体物理信号データセットを、前記生体物理信号の正規化されたデータセットとして生成することであって、フィルタリングされる前記受信された生体物理信号の前記一部分、および前記1つ以上の生成されたノイズ除去ベクトルをマージすることによって、前記フィルタリングされた生体物理信号が生成される、ことと、を含み、
前記第1の計測機器で取得された前記生体物理信号に関連付けられた前記正規化されたデータセットが、第2の計測機器で取得された第2のデータセットとともに機械学習訓練データセットとして分析可能である、方法。 - 前記受信された生体物理信号のデータセットが、12リード面電位感知電極システム、心臓内電位図、ホルター心電図、6リード差動面電位感知電極システム、3リード直交面電位感知電極システム、および単一リード電位感知電極システムからなる群から選択されたセンサから捕捉されたデータを含む、請求項1〜21のいずれか一項に記載の方法。
- 前記受信された生体物理信号のデータセットが、心臓に近接した体の表面に配置された複数の表面電極から同時に捕捉された生体電位信号から導出された広帯域心相勾配心臓信号データを含む、請求項1〜22のいずれか一項に記載の方法。
- 取得された生体物理信号を拒否する方法であって、
プロセッサによって、対象の生体物理信号データセットを受信することと、
前記プロセッサによって、前記受信された生体物理信号データセットを、前記生体物理信号データセット内の代表的な準周期パターンに特徴的な少なくとも1つのテンプレート信号ベクトルデータセットと比較することと、
前記比較に基づいて、前記プロセッサによって、前記受信された生体物理信号データセットを拒否することと、を含む、方法。 - 前記代表的な準周期パターンに特徴的な前記少なくとも1つのテンプレート信号ベクトルデータセットを判定する前記ステップが、
前記プロセッサによって、前記受信された生体物理信号データセットまたはその一部分において特徴的に異なる複数の信号特徴を判定することと、
前記プロセッサによって、前記複数の判定された信号特徴の各々の間の複数のサイクル領域を判定することと、
前記プロセッサによって、前記複数のサイクル領域の各々を、前記複数の信号特徴の同じ態様または前記サイクル領域の各々に位置する信号特徴の別のセットに対して互いに整合させることと、
前記プロセッサによって、前記複数のサイクル領域のうちの点の各セットに対して実行された平均演算またはメディアン演算を使用して、前記少なくとも1つのテンプレート信号ベクトルデータセットの各点を判定することと、を含む、請求項24に記載の方法。 - 前記代表的な準周期パターンに特徴的な前記少なくとも1つのテンプレート信号ベクトルデータセットを判定する前記ステップが、
前記プロセッサによって、2つ以上の支配的なサイクル形態の存在を判定するために、前記複数のサイクル領域のクラスタリングベースの分析を実行することであって、テンプレート信号ベクトルが、判定された支配的なサイクル形態ごとに判定される、ことをさらに含む、請求項25に記載の方法。 - 請求項1〜26のいずれか一項に記載の方法であって、
前記プロセッサによって、生体物理信号データセットの失敗した取得の通知を生成することであって、前記通知が、実行される前記生体物理信号データセットの後続の取得を促す、ことをさらに含む、方法。 - 請求項1〜27のいずれか一項に記載の方法であって、
前記プロセッサによって、ネットワークを介して外部分析システムに前記受信された生体物理信号データセットを送信させることであって、前記分析システムが、病理学的または臨床状態の存在または程度について前記受信された生体物理信号データを分析するように構成されている、ことをさらに含む、方法。 - 前記比較が、
事前に定義された閾値を超える値またはエネルギーを有する、前記取得された生体物理信号データセットに存在する非同期ノイズの存在を判定することを含む、請求項1〜28のいずれか一項に記載の方法。 - 取得された生体物理信号の非同期ノイズを定量化する方法であって、
プロセッサによって、対象の生体物理信号データセットを受信することと、
前記プロセッサによって、前記受信された生体物理信号データセットまたはその一部分において特徴的に異なる複数の信号特徴を判定することと、
前記プロセッサによって、前記複数の判定された信号特徴の各々の間の複数のサイクル領域を判定することと、
前記プロセッサによって、前記複数のサイクル領域の各々を、前記複数の信号特徴の同じ態様または前記サイクル領域の各々に位置する信号特徴の別のセットに対して互いに整合させることと、
前記プロセッサによって、前記複数のサイクル領域のうちの点の各セットに対して実行された平均演算またはメディアン演算を使用して、前記少なくとも1つのテンプレート信号ベクトルデータセットの各点を判定することと、
前記プロセッサによって、2つ以上の支配的なサイクル形態の存在を判定するために、前記複数のサイクル領域のクラスタリングベースの分析を実行することであって、テンプレート信号ベクトルが、判定された支配的なサイクル形態ごとに判定される、ことと、を含む、方法。 - システムであって、
1つ以上のプロセッサと、
その上に記憶された命令を有するメモリであって、前記1つ以上のプロセッサによる前記命令の実行が、前記1つ以上のプロセッサに請求項1〜30に記載の方法のいずれか1つを実行させる、メモリと、を備える、システム。 - 1つ以上のプロセッサによる前記命令の実行により、前記1つ以上のプロセッサに請求項1〜30に記載の方法のいずれか1つを実行させる、非一時的コンピュータ可読媒体。
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