JP2021517814A - 免疫チェックポイント遮断を発現する癌免疫療法のための腫瘍溶解性ワクシニアウイルス - Google Patents
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Abstract
Description
(技術分野)
本開示は概して腫瘍学、ウイルス学及び免疫療法の分野に関する。特に、本技術は、ポックスウイルス(操作された弱毒ワクシニアウイルス(VACV)株を含む)の使用に関し、前記ウイルスは、E3L遺伝子のN-末端DNA結合ドメインの破壊(E3LΔ83N)を、チミジンキナーゼの削除(E3LΔ83N-TK-)とともに含み、操作されて、腫瘍崩壊性免疫療法組成物として細胞傷害性Tリンパ球抗原4を特異的に標的とする抗体を発現する(E3LΔ83N-TK--抗CTLA-4)。いくつかの実施態様では、本開示の技術はE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4ウイルスの使用に関し、前記ウイルスはさらに操作されて、腫瘍崩壊性免疫療法組成物としてヒトFms様チロシンキナーゼ3リガンド(hFlt3L)を発現する(E3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4)。いくつかの実施態様では、操作E3LΔ83Nウイルスは、その必要がある対象動物に単独で又は免疫チェックポイント遮断剤若しくは免疫刺激剤と併用して投与される。
悪性腫瘍(例えばメラノーマ)は、本来は通常療法に耐性であり、重大な治療的難問を提示する。免疫療法は進化する研究領域であり、ある種のタイプの癌の治療では更なる選択肢である。免疫療法アプローチは、免疫系が刺激され腫瘍細胞を識別し、それら腫瘍細胞を破壊の標的とし得るという理論的根拠に基づく。癌細胞による抗原の提示及び腫瘍細胞に対して潜在的に反応できる免疫細胞の存在にもかかわらず、多くの事例で、免疫系は活性化されないか又は積極的に抑制される。この現象のカギは、免疫系の細胞を脅かして当該免疫系の他の細胞を抑制することによって腫瘍自体を免疫応答から保護する腫瘍の能力である。腫瘍は多くの免疫調節メカニズムを発達させて、抗腫瘍免疫応答を回避する。したがって、免疫療法アプローチの改善は、宿主の抗腫瘍免疫を増強し腫瘍細胞を破壊の標的とするために必要である。
いくつかの実施態様では、当該操作ウイルス感染マウスは、ベクターコントロール(E3LΔ83N-TK-)感染マウス又は抗CTLA-4を共投与されるE3LΔ83N-TK-感染マウスと比較して、感染後寿命の延長を有する。
いくつかの実施態様では、免疫原性組成物はさらに医薬的に許容できる担体を含む。いくつかの実施態様では、免疫原性組成物はさらに医薬的に許容できるアジュバントを含む。
ある特徴では、本開示はその必要がある対象動物において固形腫瘍を治療する方法を提供し、前記方法は、有効量の操作されたE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4ワクシニアウイルスを含む組成物を腫瘍にデリバリーする工程を含み、前記ワクシニアウイルスは、チミジンキナーゼ(TK)遺伝子のコード配列中への異種ヌクレオチド配列の挿入を含み、ここで、当該異種ヌクレオチド配列は、抗細胞傷害性Tリンパ球関連抗原(CTLA-4)抗体重鎖(HC)及び抗CTLA-4抗体軽鎖(LC)をコードするオープンリーディングフレームを含む発現カセットを含み、当該HC及びLCは、5’から3’方向にプロテアーゼ切断部位及び2Aペプチド(Pep2A)配列をコードするヌクレオチド配列によって分離される。
いくつかの実施態様では、当該方法はさらに、同時に又は逐次的に1つ以上の免疫チェックポイント遮断剤又は免疫刺激剤を対象動物にデリバリーする工程を含み、ここで、1つ以上の免疫チェックポイント遮断剤は、腫瘍内に、静脈内に、又は前記の任意の組合せで対象動物に投与される。いくつかの実施態様では、1つ以上の免疫チェックポイント遮断剤又は免疫刺激剤は、抗PD-1抗体、抗PD-L1抗体、抗PD-L2抗体、抗CTLA-4抗体、イピリムマブ、ニボルマブ、ピジリズマブ、ランブロリズマブ、ペムブロリズマブ、アテゾリズマブ、アベルマブ、デュルバルマブ、MPDL3280A、BMS-936559、MEDI-4736、MSB 00107180、抗GITR抗体、LAG-3、TIM3、B7-H3、B7-H4、TIGIT、AMP-224、MDX-1105、アレルマブ、トレメリムマブ、IMP321、MGA271、BMS-986016、リリルマブ、ウレルマブ、PF-05082566、IPH2101、MEDI-6469、CP-870、893、モガムリズマブ、バルリルマブ、ガリキシマブ、AMP-514、AUNP 12、インドキシモド、NLG-919、INCB024360、CD80、CD86、ICOS、DLBCL阻害剤、BTLA、及び前記の任意の組合せから成る群から選択される。
ある特徴では、本開示はその必要がある対象動物において固形腫瘍を治療する方法を提供し、前記方法は、有効量の操作されたE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4ワクシニアウイルスを含む組成物を腫瘍にデリバリーする工程を含み、前記ワクシニアウイルスは、チミジンキナーゼ(TK)遺伝子のコード配列中への異種ヌクレオチド配列の挿入を含み、ここで、当該異種ヌクレオチド配列は、ヒトFms様チロシンキナーゼ3リガンド(hFlt3L)、抗細胞傷害性Tリンパ球関連抗原(CTLA-4)抗体重鎖(HC)及び抗CTLA-4抗体軽鎖(LC)をコードするオープンリーディングフレームを含む発現カセットを含み、当該hFlt3L及びHCヌクレオチド配列は、5’から3’方向にプロテアーゼ切断部位及び2Aペプチド(Pep2A)配列をコードするヌクレオチド配列によって分離され、さらに当該HC及びLCは、5’から3’方向にプロテアーゼ切断部位及びPep2A配列をコードするヌクレオチド配列によって分離される。
いくつかの実施態様では、当該方法はさらに、同時に又は逐次的に1つ以上の免疫チェックポイント遮断剤又は免疫刺激剤を対象動物にデリバリーする工程を含み、ここで、前記1つ以上の免疫チェックポイント遮断剤は、腫瘍内に、静脈内に、又は前記の任意の組合せで対象動物に投与される。いくつかの実施態様では、1つ以上の免疫チェックポイント遮断剤又は免疫刺激剤は、抗PD-1抗体、抗PD-L1抗体、抗PD-L2抗体、抗CTLA-4抗体、イピリムマブ、ニボルマブ、ピジリズマブ、ランブロリズマブ、ペムブロリズマブ、アテゾリズマブ、アベルマブ、デュルバルマブ、MPDL3280A、BMS-936559、MEDI-4736、MSB 00107180、抗GITR抗体、LAG-3、TIM3、B7-H3、B7-H4、TIGIT、AMP-224、MDX-1105、アレルマブ、トレメリムマブ、IMP321、MGA271、BMS-986016、リリルマブ、ウレルマブ、PF-05082566、IPH2101、MEDI-6469、CP-870、893、モガムリズマブ、バルリルマブ、ガリキシマブ、AMP-514、AUNP 12、インドキシモド、NLG-919、INCB024360、CD80、CD86、ICOS、DLBCL阻害剤、BTLA、及び前記の任意の組合せから成る群から選択される。
ある特徴では、本開示は組換えE3LΔ83N-TK-hFlt3L-抗CTLA-4ワクシニアウイルス核酸配列を提供し、ここで、配列番号:7に示される対応する野生型ワクシニアゲノムの80,962と81,032位との間の核酸配列は異種核酸配列で取り替えられ、前記異種核酸配列は、ヒトFms様チロシンキナーゼ3リガンド(hFlt3L)、抗細胞傷害性Tリンパ球関連抗原(CTLA-4)抗体重鎖(HC)及び抗CTLA-4抗体軽鎖(LC)をコードするオープンリーディングフレームを含む発現カセットを含み、当該hFlt3L及びHCヌクレオチド配列は、5’から3’方向にプロテアーゼ切断部位及び2Aペプチド(Pep2A)配列をコードするヌクレオチド配列によって分離され、さらに当該HC及びLCは、5’から3’方向にプロテアーゼ切断部位及びPep2A配列をコードするヌクレオチド配列によって分離される。
定義
本明細書で用いられる一定の用語の定義は下記に提供される。特段の規定がなければ、本明細書で一般的に用いられる全ての技術用語及び学術用語は、本技術が属する分野の業者の誰もが一般的に理解する意味と同じ意味を有する。
本明細書及び添付の特許請求の範囲で用いられるように、単数形“a”、“an”及び“the”は、文脈が明らかにそうではないことを示していないかぎり複数の対応語を含む。例えば、“a cell(細胞)”と言えば2つ以上の細胞の組合せなどを含む。
本明細書で用いられるように、数に関して“約”という用語は、特段の指示がないかぎりまたは文脈からそうでないことが明白でないかぎり、どちらの方向においても(多い方でも少ない方でも)、1%−10%の範囲内に入る数を含むと考えられる(ただし、そのような数が、有り得る値の0%未満又は100%を超える場合を除く)。
上記実施態様のいずれにおいても、抗体はさらに任意のアイソタイプのFcドメインを含み、例えばIgG(IgG1、IgG2、IgG3、及びIgG4を含む)、IgA(IgA1及びIgA2を含む)、IgD、IgE、又はIgM、及びIgYであるが、ただしこれらに限定されない。抗体は、例えばIgG Fcドメイン(例えばIgG1、IgG2、IgG3、及びIgG4)を含むことができる。定常領域配列の非限定的な例には以下が含まれる。
APTKAPDVFPIISGCRHPKDNSPVVLACLITGYHPTSVTVTWYMGTQSQPQRTFPEIQRRDSYYMTSSQLSTPLQQWRQGEYKCVVQHTASKSKKEIFRWPESPKAQASSVPTAQPQAEGSLAKATTAPATTRNTGRGGEEKKKEKEKEEQEERETKTPECPSHTQPLGVYLLTPAVQDLWLRDKATFTCFVVGSDLKDAHLTWEVAGKVPTGGVEEGLLERHSNGSQSQHSRLTLPRSLWNAGTSVTCTLNHPSLPPQRLMALREPAAQAPVKLSLNLLASSDPPEAASWLLCEVSGFSPPNILLMWLEDQREVNTSGFAPARPPPQPGSTTFWAWSVLRVPAPPSPQPATYTCVVSHEDSRTLLNASRSLEVSYVTDHGPMK
ヒトIgG1定常領域、Uniprot:P01857(配列番号:15)、前記はC-末端リジンアミノ酸を含むことも含まないこともある:
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
ヒトIgG2定常領域、Uniprot:P01859(配列番号:16)、前記はC-末端リジンアミノ酸を含むことも含まないこともある:
ASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSNFGTQTYTCNVDHKPSNTKVDKTVERKCCVECPPCPAPPVAGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTFRVVSVLTVVHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPAPIEKTISKTKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDISVEWESNGQPENNYKTTPPMLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
ヒトIgG3定常領域、Uniprot:P01860(配列番号:17)、前記はC-末端リジンアミノ酸を含むことも含まないこともある:
ASTKGPSVFPLAPCSRSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYTCNVNHKPSNTKVDKRVELKTPLGDTTHTCPRCPEPKSCDTPPPCPRCPEPKSCDTPPPCPRCPEPKSCDTPPPCPRCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVQFKWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTFRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKTKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESSGQPENNYNTTPPMLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNIFSCSVMHEALHNRFTQKSLSLSPGK
GSASAPTLFPLVSCENSPSDTSSVAVGCLAQDFLPDSITLSWKYKNNSDISSTRGFPSVLRGGKYAATSQVLLPSKDVMQGTDEHVVCKVQHPNGNKEKNVPLPVIAELPPKVSVFVPPRDGFFGNPRKSKLICQATGFSPRQIQVSWLREGKQVGSGVTTDQVQAEAKESGPTTYKVTSTLTIKESDWLGQSMFTCRVDHRGLTFQQNASSMCVPDQDTAIRVFAIPPSFASIFLTKSTKLTCLVTDLTTYDSVTISWTRQNGEAVKTHTNISESHPNATFSAVGEASICEDDWNSGERFTCTVTHTDLPSPLKQTISRPKGVALHRPDVYLLPPAREQLNLRESATITCLVTGFSPADVFVQWMQRGQPLSPEKYVTSAPMPEPQAPGRYFAHSILTVSEEEWNTGETYTCVAHEALPNRVTERTVDKSTGKPTLYNVSLVMSDTAGTCY
ヒトIgG4定常領域、Uniprot:P01861(配列番号:19)、前記はC-末端リジンアミノ酸を含むことも含まないこともある:
ASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPSCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK
ヒトIgA1定常領域、Uniprot:P01876(配列番号:20):
ASPTSPKVFPLSLCSTQPDGNVVIACLVQGFFPQEPLSVTWSESGQGVTARNFPPSQDASGDLYTTSSQLTLPATQCLAGKSVTCHVKHYTNPSQDVTVPCPVPSTPPTPSPSTPPTPSPSCCHPRLSLHRPALEDLLLGSEANLTCTLTGLRDASGVTFTWTPSSGKSAVQGPPERDLCGCYSVSSVLPGCAEPWNHGKTFTCTAAYPESKTPLTATLSKSGNTFRPEVHLLPPPSEELALNELVTLTCLARGFSPKDVLVRWLQGSQELPREKYLTWASRQEPSQGTTTFAVTSILRVAAEDWKKGDTFSCMVGHEALPLAFTQKTIDRLAGKPTHVNVSVVMAEVDGTCY
ヒトIgA2定常領域、Uniprot:P01877(配列番号:21):
ASPTSPKVFPLSLDSTPQDGNVVVACLVQGFFPQEPLSVTWSESGQNVTARNFPPSQDASGDLYTTSSQLTLPATQCPDGKSVTCHVKHYTNPSQDVTVPCPVPPPPPCCHPRLSLHRPALEDLLLGSEANLTCTLTGLRDASGATFTWTPSSGKSAVQGPPERDLCGCYSVSSVLPGCAQPWNHGETFTCTAAHPELKTPLTANITKSGNTFRPEVHLLPPPSEELALNELVTLTCLARGFSPKDVLVRWLQGSQELPREKYLTWASRQEPSQGTTTFAVTSILRVAAEDWKKGDTFSCMVGHEALPLAFTQKTIDRMAGKPTHVNVSVVMAEVDGTCY
ヒトIgカッパ定常領域、Uniprot:P01834(配列番号:22):
TVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
本明細書で用いられるように、“合同投与”又は“共投与”は、本技術の操作されたワクシニアウイルス、例えばE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4と併用される第二の治療薬適用の実行を指す。例えば、免疫チェックポイント遮断剤又は免疫刺激剤を、E3LΔ83N-TK--抗CTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4と時間的に近接して投与することができる。例えば、PD-1/PDL-1阻害剤(より具体的な実施態様では、抗体)を、E3LΔ83N-TK--抗CTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4と同時に(上記で述べたようにE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4を腫瘍内又は全身的に投与するときは、静脈内又は腫瘍内注射によって)、或いはE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4若しくはE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4の投与の前に又は後で投与することができる。いくつかの実施態様では、E3LΔ83N-TK--抗CTLA-4若しくはE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4の処置と免疫チェックポイント遮断剤若しくは免疫刺激剤が1−7日離れて、或いは3週間すら離れて投与されても、なおここでいう“時間的に近接する”と言えよう。したがって、そのような投与は“合同”として条件を満たすであろう。
“コントロール”という用語は、コントロールIgG、抗ジニトロフェノール(DNP)抗体を発現するように操作されたE3LΔ83N-TK--ウイルス(E3LΔ83N-TK--抗DNP)、又はコントロールIgG(例えばDNP)抗体を発現するように操作されたVACVΔC7Lウイルス(VACVΔC7L-抗DNP)を指すために本明細書で用いられる。
“破壊”及び“変異”という用語は本明細書では互換的に用いられ、遺伝物質の検出可能で遺伝可能な変化を指す。変異には挿入、欠失、置換、置換(例えばトランジション、トランスバージョン)、転位、逆位、ノックアウト及び前記の組合せが含まれ得る。変異は、一ヌクレオチドのみ(例えば点変異又は単一ヌクレオチド多形性)又は複数のヌクレオチドを含むことができる。いくつかの実施態様では、変異はサイレントである(すなわち、変異に関する表現型の影響が検出されない)。他の実施態様では、変異は表現型の変化を引起す。例えば、コードされる生成物の発現レベルが変化するか、又はコードされる生成物それ自体が変化する。いくつかの実施態様では、破壊又は変異は、野生型株と比較して、遺伝子生成物(例えばタンパク質又はRNA)の発現レベルの低下を示す破壊遺伝子を生じ得る。他の実施態様では、破壊又は変異は、野生型株の発現タンパク質の活性と比較して、活性が低い発現タンパク質を生じ得る。
免疫刺激剤(例えばアゴニスト抗体)もまた癌の免疫療法として開発されてきた。例えば、抗ICOS抗体はICOSの細胞外ドメインと結合し、ICOSシグナリングの活性化及びT細胞活性化をもたらす。抗OX40抗体はOX40と結合してT細胞受容体シグナリングを増強し、T細胞活性化、増殖及び生存をもたらすことができる。他の例には4-BB(CD137)に対する抗体、GITRが含まれる。
免疫刺激アゴニスト抗体を全身的に、本技術の操作されたワクシニアウイルス(例えばE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4)の腫瘍内注射と一緒に用いることができる。また別には、免疫刺激アゴニスト抗体を、本技術の操作されたワクシニアウイルス(例えばE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4)と合同的に腫瘍内デリバリーにより同時に又は逐次的に用いることができる。
“発現カセット”又は“遺伝子カセット”という用語は、関心のある1つ以上の特定の遺伝子(例えば抗muCTLA-4 muIgG2a、hFlt3L)、及び/又はDNA配列の1つ以上の選択制限部位の間に挿入され得る選別可能マーカー(例えばgpt)をコードし発現できるDNA配列を指すために本明細書では用いられる。いくつかの実施態様では、遺伝子カセットの挿入は、遺伝子破壊(例えばワクシニアウイルスチミジンキナーゼ遺伝子破壊)をもたらす。いくつかの実施態様では、遺伝子の破壊は、当該遺伝子の少なくとも一部分の遺伝子カセットによる入れ替え又はカセットの挿入を必要とし、前記カセットは、作動できるように連結される下記の配列の1つ以上をコードするオープンリーディングフレームを含むヌクレオチド配列を含む:関心のある特定の遺伝子(例えば抗muCTLA-4 muIgG2a重鎖(HC)及び軽鎖(LC)、抗PD-L1抗体重鎖(HC)及び軽鎖(LC)、hFtl3L)、1つ以上のプロモーター(例えばPsE/L)、適切なリーダー配列、プロテアーゼ切断部位(例えばフーリン切断部位)、2Aペプチド(Pep2A)、及び選別可能マーカー。いくつかの実施態様では、2Aペプチドは下記の1つを含む:アミノ酸配列(GSG) E G R G S L L T C G D V E E N P G P(配列番号:23)を有するT2A;アミノ酸配列(GSG) A T N F S L L K Q A G D V E E N P G P(配列番号:24)を有するP2A;アミノ酸配列(GSG) Q C T N Y A L L K L A G D V E S N P G P(配列番号:25)を有するE2A;又はアミノ酸配列(GSG) V K Q T L N F D L L K L A G D V E S N P G P(配列番号:26)を有するF2A、ここで各2AペプチドのN-末端(GSG)は任意である。
いくつかの実施態様では、本技術の抗体は、活性化及び/又は阻害性受容体に対する親和性が改変されて、1つ以上のアミノ酸改変を含む変種Fc領域を有し、ここで、前記1つ以上のアミノ酸改変は、アラニンによるN297置換又はアラニンによるK322置換である。
“グリコシル化改変”。いくつかの実施態様では、本技術の抗体は、親Fc領域と比較して変種グリコシル化を含むFc領域を有する。いくつかの実施態様では、変種グリコシル化にはフコース欠落が含まれる。いくつかの実施態様では、変種グリコシル化はGnT1欠損CHO細胞での発現から生じる。
オリゴ糖側鎖は典型的にはN-又はO-結合により抗体のバックボーンと連結される。N-結合グリコシル化は、オリゴ糖部分とアスパラギン残基の側鎖との結合を指す。O-結合グリコシル化は、オリゴ糖部分とヒドロキシアミノ酸(例えばセリン、スレオニン)との結合を指す。例えば、ある種のオリゴ糖(フコースを含む)及び末端N-アセチルグルコサミンを欠くFc-糖化型は特定のCHO細胞で生成され、増強されたADCCエフェクター機能を示すことができる。
いくつかの実施態様では、本明細書で開示される免疫グロブリン関連組成物の炭水化物含有量は、グリコシル化部位の付加又は欠失によって改変される。抗体の炭水化物含有量の改変方法は当業界で周知であり、本技術内に含まれる。例えば以下を参照されたい:米国特許6,218,149号、EP 0359096B1、米国特許公報No. US 2002/0028486、国際特許公開公報WO 03/035835、米国特許公報No. 2003/0115614、米国特許6,218,149号、米国特許6,472,511号(いずれも参照によってその全体が本明細書に含まれる)。いくつかの実施態様では、抗体(又はその関連部分若しくは成分)の炭水化物含有量は、抗体の1つ以上の内因性炭水化物部分を欠失させることによって改変される。いくつかの実施態様では、本技術は、297位をアスパラギンからアラニンに改変することによって、抗体のFc領域のグリコシル化部位を欠失させる工程を含む。
本明細書で用いられるように、“完全な抗体”又は“完全な免疫グロブリン”という用語は、ジスルフィド結合によって接続される少なくとも2つの重(H)鎖ポリペプチド及び2つの軽(L)鎖を有する抗体を意味する。各重鎖は、重鎖可変領域(本明細書ではHCVR又はVHと省略される)及び重鎖定常領域で構成される。重鎖定常領域は3つのドメイン(CH1、CH2及びCH3)で構成される。各軽鎖は、軽鎖可変領域(本明細書ではLCVR又はVLと省略される)及び軽鎖定常領域で構成される。軽鎖定常領域は、1つのドメイン(CL)で構成される。VH及びVL領域はさらに、超可変性(相補性決定領域(CDR)と称される)という領域に細分割され、前記領域にはフレームワーク領域(FR)と称されるより保存された領域が点在する。各VH及びVLは3つのCDR及び4つのFRで構成され、これらはアミノ末端からカルボキシ末端に向けて以下の順序で配列されている:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。重鎖及び軽鎖の可変領域は、抗原と相互作用する結合ドメインを含む。抗体の定常領域は、免疫グロブリンと宿主組織又は複数の因子(免疫系の多様な細胞(例えばエフェクター細胞)及び古典的補体系の第一成分(C1q)を含む)との結合を媒介することができる。
本明細書で用いられるように、“腫瘍溶解ウイルス”は、もっぱら癌細胞に感染してそのような細胞で複製し、その複製過程により当該癌細胞の溶解を誘発するウイルスを指す。天然に存在する腫瘍溶解ウイルスの非限定的な例には、水疱性口内炎ウイルス、レトロウイルスとともに、操作されて腫瘍選択性となるウイルス(例えばアデノウイルス、ニューカッスル病ウイルス及び単純ヘルペスウイルス)が含まれる(例えば以下を参照されたい:Nemunaitis, J. Invest New Drugs. 17(4):375-86, 1999;Kirn, DH et al. Nat Rev Cancer. 9(1):64-71, 2009;Kirn et al. Nat. Med. 7:781, 2001;Coffey et al. Science 282:1332, 1998)。ワクシニアウイルスは多くのタイプの細胞に感染するが、優先的に腫瘍細胞で複製する。なぜならば、腫瘍細胞は、複製に有利な代謝を有し、複製にもまた有利なある種の経路の活性化を示し、さらに先天性免疫系を回避する環境(ウイルスの複製にもまた有利である)を作り出すからである。
本明細書で用いられるように、“医薬的に許容できる担体及び/又は希釈剤”又は“医薬的に許容できる賦形剤”には、任意のかつ全ての溶媒、分散媒体、コーティング、抗菌抗真菌剤、等張吸収遅延剤などが含まれるが、ただし前記に限定されない。生物学的に活性な物質のためのそのような媒体及び薬剤の使用は当業界で周知である。賦形剤の更なる詳細は下記で提供される。補充的活性成分、例えば抗微生物剤(例えば抗真菌剤)もまた組成物に取り込まれ得る。
本明細書で用いられるように、“医薬的に許容できる賦形剤”は、動物又は人間に投与されたとき、有害でアレルギー性又は他の不都合な反応を生じない物質及び組成物を指す。本明細書で用いられるように、当該用語には、全ての不活性で非毒性の液体若しくは固体充填剤(ただしそれらが本技術の治療用物質と不適切な負の態様で反応しないことを条件とする)、溶媒、分散媒体、コーティング、抗菌抗真菌剤、等張吸収遅延剤、保存料なが含まれ、例えば液体の医薬担体、例えば滅菌水、食塩水、ショ糖溶液、トリス緩衝液、エタノール及び/又はある種の油である。
本明細書で用いられるように、疾患又は症状を“予防(する)(prevention, prevent, preventing)”は、統計学的サンプルで、無処理コントロールサンプルと対比して当該疾患又は症状の出現を低下させ、又は無処理コントロールサンプルと対比して当該疾患又は症状の1つ以上の徴候の開始を遅らせる1つ以上の化合物を指す。
本明細書で用いられるように、“相乗的治療効果”は、累積治療効果よりも大きい治療効果を指し、前記治療効果は、少なくとも2つ以上の薬剤の組合せによって生じ、かつ当該薬剤の個々の投与により生じる効果を超える。例えば、1つ以上の薬剤のより低い用量を用いて疾患又は症状を治療し、治療有効性の増強及び副作用の減少を得ることができる。
本明細書で用いられる“治療(treating, treat, treatment)”は、対象動物(例えば人間)における本明細書に記載の疾患又は異常の治療をカバーし、以下を含む:(i)疾患又は異常を抑制する、すなわちその発達の停止;(ii)疾患又は異常の緩和、すなわち異常の沈静を引起す;(iii)異常の進行を遅らせる;及び/又は(iv)疾患又は異常の1つ以上の徴候の抑制、緩和又は進行速度の低下。いくつかの実施態様では、治療は、疾患に関連する徴候が、例えば緩和され、軽減され、治癒され、又は寛解状態に置かれることを意味する。いくつかの実施態様では、“抑制”は、腫瘍の増殖の低下又はその進行速度の低下を意味する。いくつかの実施態様では、腫瘍増殖の抑制は、例えば5%以上、10%以上、20%以上、30%以上、40%以上、50%以上、60%以上、70%以上、80%以上、又は90%以上であり得る。
記載の治療を要する疾患及び症状の治療又は予防の多様な態様が“実質的”を意味することを意図していることもまた理解されるべきである。“実質的”は完全な治療又は予防を含むが、完全に満たない治療又は予防もまた含まれ、この場合には、生物学的又は医療的に関連する結果が達成される。
本明細書で用いられるように、“T細胞”は、多様な細胞媒介適応免疫反応に加わる胸腺由来リンパ球を指す。
本明細書で用いられるように、“ヘルパーT細胞”はCD4+ T細胞を指し、ヘルパーT細胞はMHCクラスII分子と結合した抗原を認識する。少なくとも2つのタイプのヘルパーT細胞(Th1及びTh2)があり、それらは異なるサイトカインを生成する。
本明細書で用いられるように、“細胞傷害性T細胞”は、通常その表面にCD8分子マーカーを保持し(CD8+)、特異的な抗原分子をその表面に有する標的細胞を破壊することによって細胞媒介免疫で機能を果たすT細胞を指す。細胞傷害性T細胞はまたグランザイムを放出する(グランザイムは、パーフォリン形成孔を介して標的細胞に侵入してアポトーシス(細胞死)を誘発するセリンプロテアーゼである)。グランザイムは細胞傷害性表現型のマーカーとして機能する。細胞傷害性T細胞の他の名称にはCTL、細胞溶解性T細胞、細胞溶解性Tリンパ球、キラーT細胞、又はキラーリンパ球が含まれる。細胞傷害性T細胞の標的には、ウイルス感染細胞、細菌性若しくは原生動物性寄生体感染細胞、又は癌細胞が含まれ得る。大半の細胞傷害性T細胞はそれらの細胞表面に存在するタンパク質CD8を有する。CD8はクラスI MHC分子の一部に引きつけられる。典型的には、細胞傷害性T細胞はCD8+細胞である。
本明細書で用いられるように、“ベクター”には任意の遺伝的エレメント、例えばプラスミド、ファージ、トランスポゾン、コスミド、染色体、人工染色体、ウイルス、ビリオンなどが含まれ、適切な制御エレメントと結合されるとき複製することができ、さらに遺伝子配列を細胞間で伝達することができる。したがって、当該用語には、クローニングビヒクル及び発現ビヒクルがウイルスベクターと同様に含まれる。いくつかの実施態様では、有用なベクターは、転写されるべき核酸セグメントがプロモーターの転写制御下に配置されるベクターであると考えられる。“プロモーター”は、細胞の合成機構に認識され又は合成機構に導入される、遺伝子の特異的な転写に必要なDNA配列を指す。“作動できるように配置される”、“作動できるように連結される”、“制御下にある”又は“転写制御下にある”という語句は、プロモーターが、RNAポリメラーゼの開始及び遺伝子の発現の制御のために、当該核酸との関係で正しい位置及び向きで存在することを意味する。“発現ベクター”又は“発現構築物”という用語は、核酸を含む任意のタイプの遺伝的構築物を意味し、前記構築物では核酸コード配列の部分又は全部が転写され得る。いくつかの実施態様では、発現は、核酸の転写を含み、例えば、生物学的に活性なポリペプチド生成物又はタンパク質前駆体が転写された遺伝子から生成される。
本明細書で用いられる“病毒性”という用語は、疾患を引き起こす病原体の相対的能力を指す。“弱毒化病原性”又は“病原性低下”という用語は、病原体の疾患を引き起こす相対的能力の低下を指すために本明細書では用いられる。
悪性腫瘍はもともと通常療法に耐性であり、著しい治療上の困難を提示する。免疫療法は、研究及びある種の癌タイプの治療の新たな選択肢の発展する分野となっている。免疫療法アプローチは、免疫系を刺激して腫瘍細胞を識別しそれらを破壊の標的とすることができるという理論的根拠に基づく。
多数の研究が、癌の進行における免疫系成分の弁別的存在の重要性を支持している(Jochems et al., Exp Biol Med, 236(5): 567-579, 2011)。臨床データは、高密度の腫瘍浸潤リンパ球は臨床成果の改善と連関していることを示唆している(Mlecnik et al., Cancer Metastasis Rev.; 30: 5-12, 2011)。激しいリンパ球浸潤と患者の生存との間の相関性が、多様なタイプの癌(メラノーマ、卵巣癌、頭頸部癌、乳癌、尿路癌、結腸直腸癌、肺癌、肝細胞癌、胆嚢癌、及び食道癌を含む)で報告されている(Angell et al., Current Opinion in Immunology, 25:1-7, 2013)。腫瘍の免疫浸潤物は、マクロファージ、樹状細胞(DC)、単球、好中球、ナチュラルキラー(NK)細胞、ナイーブ及びメモリーリンパ球、B細胞並びにエフェクターT細胞(Tリンパ球)(腫瘍細胞によって発現される抗原の認識とその後の細胞傷害性T細胞による腫瘍細胞の破壊に本質的に必要である)を含む。
免疫チェックポイントは抗腫瘍免疫の腫瘍媒介ダウンレギュレーションに関与し、治療標的として用いられている。T細胞機能不全は、阻害性受容体CTLA-4及びプログラム細胞死1ポリペプチド(PD-1)(受容体CD28ファミリーメンバー)の発現誘発と同時に生じることが示されている。PD-1は、CD28ファミリー受容体(PD-1に加えて、CD28、CTLA-4、ICOS及びBTLAを含む)の阻害性メンバーである。しかしながら、メラノーマ治療の免疫療法としてのその使用に関する有望性が臨床使用並びに抗CTLA-4(イピリムマブ)及びPD-1医薬(例えばペムブロリズマブ及びニボルマブ)の規制庁の承認によって強調されているにもかかわらず、これら免疫療法に対する患者の応答は限定的である。T細胞におけるこれら阻害性シグナルの遮断に焦点を当てた臨床試験(例えばCTLA-4、PD-1及びPD-1のリガンド、PD-L1)は、T細胞抑制の逆転は免疫療法の成功に必須であることを示している(Sharma et al., Science 348(6230), 56-61, 2015;Topalian et al., Curr Opin Immunol. 24(2), 202-217, 2012)。これらの観察は、癌に対抗して免疫系を誘導する新規な治療アプローチの開発の必要性を強調する。
ポックスウイルス(例えば操作されたワクシニアウイルス)は、転移性癌のための腫瘍細胞崩壊療法の最先端にある(Kirn et al., Nature Review Cancer 9, 64-71, 2009)。ワクシニアウイルスは大きなDNAウイルスであり、迅速な生活環及び遠位組織への効率的な血行性拡散を有する(Moss, In Fields Virology (Lippincott Williams & Wilkins, 2007), pp.2905-2946)。ポックスウイルスは、複数のトランスジーンを癌細胞で発現するのによく適しており、したがって治療効率を増強するためにベクターとして適切である(Breitbach et al., Current pharmaceutical biotechnology 13, 1768-1772, 2012)。前臨床試験及び臨床試験は、通常療法難治性の進行癌の治療に腫瘍溶解性ワクシニアウイルス及び他のポックスウイルスを使用することが有効であることを示した(Park et al., Lacent Oncol 9, 533-542, 2008;Kirn et al., PLoS Med 4, e353, 2007;Thorne et al., J Clin Invest 117, 3350-3358, 2007)。ポックスウイルスベースの腫瘍崩壊療法は、細胞溶解、アポトーシス、及び壊死の組合せを介して癌細胞を殺滅する利点を有する。前記療法はまた、免疫細胞の腫瘍への動員及び抗腫瘍適用免疫応答の発達を促進する先天性免疫感知経路を始動させる。臨床試験(例えばJX-594)の従来の腫瘍溶解ワクシニア株は複製株である。それらは、腫瘍選択性を増強するためにチミジンキナーゼの欠失を有し、免疫応答を刺激するためにトランスジーン(例えば顆粒球マクロファージコロニー刺激因子(GM-CSF))を発現する野生型ワクシニアを使用する(Breitbach et al., Curr Pharm Biotechnol 13, 1768-1772, 2012)。しかしながら、多くの研究が、野生型ワクシニアは抗原提示細胞(APC)に対して免疫抑制作用を有し(Engelmayer et al., J Immunol 163, 6762-6768, 1999;Jenne et al., Gene therapy 7, 1575-1583, 2000;P. Li et al., J Immunol 175, 6481-6488, 2005;Deng et al., J Virol 80, 9977-9987, 2006)、したがって、腫瘍自体に免疫抑制及び免疫回避作用を与えることを示した。
ポックスウイルスは、多数の先天性免疫シグナリング経路の細胞外及び細胞内成分を停止させるタンパク質をコードすることによって、これらの経路の回避及び拮抗に極めて熟練している(Seet et al. Annu. Rev. Immunol. 21377-423, 2003)。細胞内先天性免疫シグナリングのポックスウイルスアンタゴニストで最高のものは、ワクシニアウイルス二重Z-DNA及びdsRNA-結合タンパク質E3であり、ワクシニアウイルス感染によって本来活性化され得るPKR及びNF-κB経路を阻害することができる(Cheng et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 894825-4829, 1992;Deng et al. J. Virol. 809977-9987, 2006)。E3L遺伝子を欠く変異ワクシニアウイルス(ΔE4L)は宿主範囲の制限を示し、IFNに高度に感受性で、致死性ポックス感染動物モデルで病毒性の大きな低下を示す(Beattie et al. Virus Genes. 1289-94, 1996;Brandt et al. Virology 333263-270, 2004)。最近の研究によれば、ΔE3Lウイルスによる培養細胞株の感染は、野生型ワクシニアウイルスによる感染時には遮蔽される炎症促進性応答を引き出すことが示された(Deng et al. J. Virol. 809977-9987, 2006;Langland et al. J. Virol. 8010083-10095)。マウス表皮樹状細胞株の野生型ワクシニアウイルスによる感染は、TLRアゴニスト(リポ多糖類(LPS)及びポリ(I:C))に対する炎症促進性応答を減弱させた(E3Lの欠失により低下した作用)。さらに、ΔE3Lウイルスによる樹状細胞の感染は、外因性アゴニストの非存在下でNF-κB活性化を始動させた(Deng et al. J. Virol. 809977-9987, 2006)。マウスケラチノサイトの野生型ワクシニアウイルス感染は炎症促進性サイトカイン及びケモカインの生成を誘発しないが、ΔE3Lウイルスによる感染は、マウスケラチノサイトによるIFN-β、IL-6、CCL4及びCCL5の生成を確かに誘発し、この誘発は、ミトコンドリア抗ウイルスシグナリングタンパク質(MAVS;細胞質ゾルRNAセンサーRIG-I及びMDA5のためのアダプター)及び転写因子IRF3によって媒介される細胞質ゾルdsRNA-感知経路に依存する(Deng et al., J Virol. 2008 Nov; 82(21): 10735-10746)。
E3Lの欠失は、許容RK13細胞におけるワクシニアウイルス複製をIFN阻害に対して感受性にして宿主域表現型を生じ、それによってΔE3LはHela又はBSC40細胞で複製できない(Chang et al., 1995)。E3のC-末端dsRNA結合ドメインは宿主域効果に必要であるが、一方、N-末端Z-DNA結合ドメインの欠失を有するE3LΔ83Nウイルスは、Hela及びBSC40細胞で複製コンピテントである(Brandt et al., 2001)。
チミジンキナーゼ欠失を有するワクシニアウイルス(Western Reserve株(WR))は、非分裂細胞において高度に弱毒化されるが、形質転換した細胞では複製する(Buller et al., 1988)。TK-欠失ワクシニアウイルスは腫瘍細胞においてin vivoで選択的に複製する(Puhlmann et al., 2000)。Thorneらは、WR株は、正常細胞と対比して腫瘍細胞株で他のワクシニア株と比較して最高のバースト比を有することを示した(Thorne et al., 2007)。この株の派生株、ワクシニアE3LΔ83N WR株を本開示で更なる改変のために選択した。
ヒトFlt3L(Fms様チロシンキナーゼ3リガンド)は、骨髄細胞の増殖を刺激するI型トランスメンブレンタンパク質である。hFlt3Lの使用は、多様な前臨床及び臨床的背景で開発されてきた(前記背景には、骨髄移植用調製物における幹細胞動員、癌免疫療法(例えば樹状細胞の拡張)とともにワクチンアジュバントが含まれる)。組換えヒトFlt3L(rhuFlt3L)は500人を超えるヒト対象で試験され、生物活性を有し安全で十分に寛容される(Fong et al., 1998;Maraskovsky et al., 2000;Shackleton et al., 2004;He et al., 2014;Anandasabapathy et al., 2015)。
本技術の開示は、組換えワクシニアE3LΔ83N-TK-ウイルス又は前記ウイルスを含むワクチンに関し、前記ウイルスは、腫瘍崩壊療法として使用するために、関心のある1つ以上の特定の遺伝子(SG)(例えば抗CTLA-4抗体又はhFlt3L)を発現するように操作される。いくつかの実施態様では、E3LΔ83Nウイルスのチミジンキナーゼ(TK)遺伝子は、相同組換えを介して操作されて1つ以上の発現カセットを含む異種核酸配列を含む破壊を含み、TK遺伝子が発現されないか、作用を示さないほど低レベルで発現されるか、又は発現タンパク質が非機能性(例えばヌル変異)であるようなTK遺伝子ノックアウトを生じる。得られたE3LΔ83N-TK-ウイルスはさらに操作されて1つ以上の発現カセットを含み、前記カセットはTK遺伝子の部分配列に各々の側で(TK-L及びTK-R)フランキングされる(図2)。いくつかの実施態様では、発現カセットは単一オープンリーディングフレームを含み、前記オープンリーディングフレームは、関心のある特定の遺伝子(SG)(例えば抗muCTLA-4(“9D9”)又は抗huCTLA-4)をワクシニアウイルス合成初期及び後期プロモーター(PsE/L)を用いてコードし、E3LΔ83N-TK--抗CTLA-4、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4、又はE3LΔ83N-TK--抗huCTLA-4を生じる。
いくつかの実施態様では、オープンリーディングフレームは抗huCTLA-4抗体をコードする。いくつかの実施態様では、オープンリーディングフレームは、抗huCTLA-4の重鎖CDR領域及び/又は抗huCTLA-4、例えばイピリムマブの軽鎖CDR領域をコードする。いくつかの実施態様では、オープンリーディングフレームは、抗huCTLA-4、例えばイピリムマブの重鎖及び/又は軽鎖可変領域をコードする。いくつかの実施態様では、オープンリーディングフレームは、抗huCTLA-4、例えばイピリムマブの重鎖及び/又は軽鎖をコードする。
いくつかの実施態様では、9D9の重鎖(muIgG2a)及び軽鎖のコード配列は、フーリン切断部位とその後に続くPep2A配列を含むカセットによって分離され、これによりリボソームスキップ及び軽鎖タンパク質合成の開始を可能にする。いくつかの実施態様では、Pep2Aは以下の1つを含む:アミノ酸配列(GSG) E G R G S L L T C G D V E E N P G P(配列番号:23)を有するT2A;アミノ酸配列(GSG) A T N F S L L K Q A G D V E E N P G P(配列番号:24)を有するP2A;アミノ酸配列(GSG) Q C T N Y A L L K L A G D V E S N P G P(配列番号:25)を有するE2A;又はアミノ酸配列(GSG) V K Q T L N F D L L K L A G D V E S N P G P(配列番号:26)を有するF2A、ここで各2AペプチドのN-末端(GSG)は任意的である。ヒトIgGカッパ軽鎖リーダー配列を、9D9の重鎖及び軽鎖の両方のシグナルペプチドとして用いる。この構築物は単一転写物の生成を可能にし、前記転写物は2つのタンパク質前駆体へ翻訳され得る。リンカーペプチドはフーリンによって切断され、成熟重鎖の生成をもたらし、前記重鎖は続いて軽鎖とペアを形成して完全に構築されたIgGとして分泌される(図1)。
いくつかの実施態様では、本技術の開示は、上記に記載の組換えE3LΔ83N-TK-ウイルスに関し、ここで、関心のある特定の遺伝子(SG)は抗プログラム死リガンド1(PD-L1)抗体であり、それによって以下のウイルスがもたらされる:E3LΔ83N-TK--抗PD-L1又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗PD-L1。
いくつかの実施態様では、異種ヌクレオチド配列はさらに、選別可能マーカーをコードするオープンリーディングフレームを含む追加の発現カセットを含み、前記選別可能マーカーは、当該マーカーの発現を指令できるプロモーターに作動できるように連結される(図2)。いくつかの実施態様では、選別可能マーカーは、キサンチン-グアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ(gpt)遺伝子である。
本技術の9D9抗体発現構築物のオープンリーディングフレームの非限定的な例は配列番号:1に示される(表1)。本技術のhFlt3L-9D9抗体発現構築物の非限定的な例は配列番号:5に示される(表1)。
いくつかの実施態様では、本技術の開示は上記に記載の組換えVACVΔC7Lウイルスに関し、ここで、関心のある特定の遺伝子(SG)は抗プログラム死リガンド1(PD-L1)であり、それによって以下のウイルスを生じる:VACVΔC7L-抗PD-L1又はVACVΔC7L-hFlt3L-抗PD-L1。
いくつかの実施態様では、異種ヌクレオチド配列はさらに、選別可能マーカーをコードするオープンリーディングフレームを含む追加の発現カセットを含み、前記選別可能マーカーは、当該マーカーの発現を指令できるプロモーターに作動できるように連結される。いくつかの実施態様では、選別可能マーカーは、キサンチン-グアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ(gpt)遺伝子である。
いくつかの実施態様では、本技術の開示は、上記に記載のE3LΔ83N-TK-及びΔC7L改変を含む組換えワクシニアウイルスに関し、前記ウイルスは、関心のある特定の遺伝子(SG)(例えば抗CTLA-4抗体、抗PD-L1抗体、hFlt3L又は前記の任意の組合せ)を発現するように操作される。
本技術のワクシニアウイルス構築物のオープンリーディングフレームの例示的なヌクレオチド及びアミノ酸配列は表1に提供される。抗muCTLA4-muIgG2aヌクレオチド配列(配列番号:1)、抗muCTLA4-muIgG2aアミノ酸配列(配列番号:2)、抗DNPmuIgG2aヌクレオチド配列(配列番号:3)、抗DNPmuIgG2aアミノ酸配列(配列番号:4)、hFltL3_PEP2A_抗CTLA-4HC_PEP2A_抗CTLA-4LCヌクレオチド配列(配列番号:5)、及びhFltL3_PEP2A_抗CTLA-4HC_PEP2A_抗CTLA-4LCアミノ酸配列(配列番号:6)。
メラノーマ(致死的癌の1つ)は、米国及び全世界でもっとも速く増殖する癌である。ほとんどの症例で、進行したメラノーマは通常療法(化学療法及び放射線照射)に耐性である。結果として、転移メラノーマを有する人々の予後は極めて悪く、余命はわずか6から10ヶ月である。メラノーマの約50%はBRAF(重要な腫瘍促進遺伝子)に変異を有するという発見は、この疾患の標的誘導療法の扉を開いた。BRAF阻害剤に関する初期臨床試験は、BRAF変異を有するメラノーマ患者で目覚ましい応答を示したが、当該応答は残念なことに持続的ではなかった。したがって、BRAF変異の無い他のメラノーマ患者と同様に、前記患者に対するまた別の治療戦略が至急に必要である。
人間の病理学的データは、メラノーマ病巣内のT細胞浸潤の存在は患者の長期生存と正の相関性を有することを示している(Oble et al. Cancer Immun. 9, 3, 2009)。メラノーマの防御における免疫系の重要性は、免疫療法、例えば免疫アクチベーターIFN-α2b及びIL-2の部分的成功(Lacy et al. Expert Rev Dermatol 7(1):51-68, 2012)とともに、免疫チェックポイント療法(単独又は併用抗CTLA-4及び抗PD-1/PD-L1療法を含む)に対する転移メラノーマ患者の先例のない臨床応答によってさらに支持される(Sharma and Allison, Science 348(6230), 56-61, 2015;Hodi et al., NEJM 363(8), 711-723, 2010;Wolchok et al., Lancet Oncol. 11(6), 155-164, 2010;Topalian et al., NEJM 366(26), 2443-2454, 2012;Wolchok et al., NEJM 369(2), 122-133, 2013;Hamid et al., NEJM 369(2), 134-144, 2013;Tumeh et al., Nature 515(7528), 568-571, 2014)。しかしながら、多くの患者は免疫チェックポイント遮断単独療法には応答しない。
本明細書で開示されるものは、本技術の操作されたワクシニアウイルス、例えばE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4を含む組成物であり、前記組成物は担体又は希釈剤を含むことができる。前記担体又は希釈剤は溶媒又は分散媒体であり得る。これらは、例えば水、食塩水、トリス緩衝剤、ポリオール(例えばグリセロール、プロピレングリコール、及び流動ポリエチレングリコールなど)、前記の適切な混合物、及び植物油を含む。適切な流動性は、例えばコーティング(例えばレシチン)の使用によって、分散物の場合には必要な粒子サイズの維持によって、及び界面活性剤の使用によって維持され得る。微生物の作用の防止は、多様な抗菌抗真菌剤(例えばパラベン、クロロブタノール、フェノール、ソルビン酸、チメロサールなど)によって達成され得る。いくつかの実施態様では、等張剤(例えば糖類又は塩化ナトリウム)及び緩衝剤が含まれる。注射可能組成物の長期吸収は、吸収遅延剤(例えばモノステアリン酸アルミニウム及びゼラチン)又は担体分子の組成物における使用によってもたらされ得る。他の賦形剤には湿潤剤又は乳化剤が含まれ得る。一般的には、当業者には明白であるように、注射可能調製物に適切である賦形剤が含まれ得る。
当業者に認められる多くのタイプの処方物が可能である。選択される具体的なタイプは当業者によく知られた選択投与ルートに左右される。例えば、全身用処方物は、一般的には注射(例えば静脈内)による投与のために設計されるが、その他に腫瘍内デリバリーのために設計される。いくつかの実施態様では、全身用又は腫瘍内処方物は無菌的である。
無菌注射可能溶液は、本技術の操作されたワクシニアウイルス、例えばE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4を、必要な量の適切な溶媒に必要に応じて本明細書列挙の多様な他の成分とともに取り込み、続いて適切な滅菌手段を実施して調製される。一般的には、多様な滅菌活性成分を無菌ビヒクルに取り込むことによって分散物が調製され、前記ビヒクルは基本的な分散媒体及び上記に列挙されたものに由来する必要な他の成分を含む。無菌注射可能溶液を調製するための無菌散剤の場合には、好ましい調製方法は真空乾燥及び凍結乾燥技術であり、ウイルス散剤プラス任意の追加的所望成分(あらかじめろ過滅菌された溶液に由来する)を生じる。
本開示の生物学的組成物又は医薬組成物を対象動物に投与したときに、当該ウイルスが利用されて腫瘍細胞の感染を可能にするように当該組成物を処方することができる。投与後の血清、腫瘍、及び所望の場合は他の組織内のウイルスのレベルは、十分に確立された多様な技術、例えば抗体系アッセイ(例えばELISA、免疫組織化学など)によってモニターできる。
治療のためには、凍結乾燥物を水性溶液(例えば生理学的食塩水又はトリス緩衝液)中で溶解し、全身的に又は腫瘍内に投与できる。投与様式、用量、及び投与回数は当業者によって最適化され得る。
本開示の医薬組成物は追加のアジュバントを含むことができる。本明細で用いられるように、“アジュバント”は、腫瘍抗原に対する宿主の免疫応答を強化、増強又は促進する物質を指す。典型的なアジュバントは、アルミニウム塩(例えば水酸化アルミニウム又はリン酸アルミニウム)、Quil A、細菌細胞壁ペプチドグリカン、ウイルス様粒子、多糖類、トル様受容体、ナノビーズなどであり得る(Aguilar et al. (2007), Vaccine 25: 3752-3762)。
本開示は、本技術の1つ以上の組換えワクシニアウイルス、例えばE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4、を含む1つ以上の組成物を含むキットを提供する。本キットは、組換えE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4の1つ若しくは複数の容器若しくはバイアルを、当該組換えE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4を治療される対象動物に投与するための指示書と併せて含むことができる。当該指示書は、組成物又は下記に提供される組成物を投与するための投薬レジメンを指示することができる。
いくつかの実施態様では、キットはまた追加の組成物を含むことができ、前記組成物は、組換えE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4組成物と合同投与されるチェックポイント阻害剤を含む。
概して、対象動物は、約106から約1010プラーク形成単位(pfu)の範囲の投薬量で、本技術の操作されたワクシニアウイルス、例えばE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4を投与されるが、ただしそれより低い又は高い用量もまた投与され得る。いくつかの実施態様では、投薬量は約102から約1010pfuの範囲である。いくつかの実施態様では、投薬量は約103から約1010pfuの範囲である。いくつかの実施態様では、投薬量は約104から約1010pfuの範囲である。いくつかの実施態様では、投薬量は約105から約1010pfuの範囲である。いくつかの実施態様では、投薬量は約106から約1010pfuの範囲である。いくつかの実施態様では、投薬量は約107から約1010pfuの範囲である。いくつかの実施態様では、投薬量は約108から約1010pfuの範囲である。いくつかの実施態様では、投薬量は約109から約1010pfuの範囲である。いくつかの実施態様では、投薬量は約107から約109pfuの範囲である。ウイルス粒子に対して等価のpfuは、用いられる個々のpfu滴定方法に応じて相違し得る。概ね、1 pfuは約5から100ウイルス粒子に等しく、0.69 PFUは約1 TCID50である。治療的に有効な量のE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4を、1回以上の分割用量で処方された期間、処方された投与頻度で投与できる。
例えば、当業者には明白なように、本開示のE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4の治療的に有効な量は、複数の要件、例えば病期、対象動物の年齢、性別、体重、及び一般的健康状態、並びに個別の対象動物で所望の免疫学的応答(治療に対する対象動物の応答)を引き出すE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4の能力にしたがって変動し得る。対象動物へのE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4のデリバリーに際して、投薬量はまた、複数の要件、例えば一般的健康状態、以前の治療歴、疾患のタイプ及び進行、腫瘍負荷、腫瘍内の浸潤免疫細胞の有無などに応じて変動し得る。
いくつかの実施態様では、投与の容易さ及び投薬量の均一性のために、本開示の組成物を用量単位製剤形で処方することは有益であり得る。本明細書で用いられる“用量単位製剤形”は、治療される対象哺乳動物のために用量単位製剤として適切な物理的に別個の単位を指し、各単位は、必要な医薬的又は獣医的に許容できる担体と一緒に所望の治療効果を生じるように計算された予め決定された量の活性物質を含む。
医薬組成物は、典型的にはその意図する投与ルートに適合するように処方される。本技術の操作されたワクシニアウイルス、例えばE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4の投与は、2つ以上のルートを用いて達成できる。投与ルートの例には、非経口(例えば静脈内、筋肉内、腹腔内、皮内、皮下)、腫瘍内、髄腔内、鼻内、全身性、経皮、イオン泳動、皮内、又は外用投与が含まれるが、ただしこれらに限定されない。ある実施態様では、E3LΔ83N-TK--抗CTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4は、腫瘍内に直接、例えば腫瘍内注射によって投与され、この場合には直接的な局所反応を所望できる。加えて、E3LΔ83N-TK--抗CTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4の投与ルートは、例えば腫瘍内注射による1回目の投与及び静脈内注射による以降の投与、又は前記の任意の組合せと変動させ得る。治療的に有効な量のE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4の注射を、処方された期間及び処方された投与頻度で実施できる。ある種の実施態様では、E3LΔ83N-TK--抗CTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4は、他の治療方法と合同で用いることができる。例えば、E3LΔ83N-TK--抗CTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4は、大きな原発腫瘍を有する対象動物のために、ネオアジュバント(術前)又はアジュバント(術後)環境で投与され得る。そのような最適化治療レジメンは腫瘍に対して免疫応答を誘発し、一次療法(例えば外科手術)の前後の対象動物で腫瘍負荷を減少させると予想される。さらに、E3LΔ83N-TK--抗CTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4は、他の治療方法(例えば化学療法又は放射線照射)と接近して投与され得る。
ある種の実施態様では、E3LΔ83N-TK--抗CTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4ウイルスは、毎週又は毎月少なくとも1回投与されるが、必要ならばさらに頻繁に、例えば週に2回数週間、数ヶ月、数年又は利益が持続する限り無期限に投与され得る。より頻繁な投与は、耐性が生じる場合及び投与が持続的又は増強的利益をもたらす場合に意図される。本方法の利益には以下が含まれる:癌細胞の数の減少、腫瘍サイズの減少、腫瘍の根絶、周辺器官への癌細胞浸潤の阻害、転移性増殖の阻害、安定化又は根絶、腫瘍増殖の阻害又は安定化、及び生活の質の安定化又は改善(ただしこれらに限定されない)。さらに、当該利益には、腫瘍に対する免疫応答の誘発、エフェクターCD4+ T細胞の活性化、エフェクターCD8+ T細胞の増加、又は制御性CD4+ 細胞の減少が含まれ得る。例えば、メラノーマの場合、利益は、最初のメラノーマ診断から1、2、3、4、5年以内又は5年を超えて転移再発が発生しないことであり得る。同様な評価が結腸癌及び他の固形腫瘍で生じ得る。
ある種の他の実施態様では、腫瘍塊又は腫瘍細胞は、E3LΔ83N-TK--抗CTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4でin vivo、ex vivo又はin vitroで処置される。
いくつかの実施態様では、pCBプラスミド系ベクターを用い、関心のある特定の遺伝子(SG)、例えばマウスCTLA-4(muCTLA-4)又はヒトFlt3L(hFlt3L)をワクシニア合成初期及び後期プロモーター(PsE/L)の制御下に挿入する。当該ベクターを構築する方法論は記載されている(以下を参照されたい:M. Puhlmann, C. K. Brown, M. Gnant, J. Huang, S. K. Libutti, H. R. Alexander, D. L. Bartlett, Vaccinia as a vector for tumor-directed gene therapy: Biodistribution of a thymidine kinase-deleted mutant. Cancer Gene Therapy, 7(1), 66-73, 2000)。いくつかの実施態様では、CTLA-4重鎖(HC)及び軽鎖(LC)配列は、フーリン切断部位及びPep2Aを含むカセットによって分離される。ヒトIgGカッパ軽鎖リーダー配列が、CTLA-4の重鎖及び軽鎖の両方のためのシグナルペプチドとして用いられる。いくつかの実施態様では、CTLA-4重鎖は、フーリン切断部位及びPep2Aを含む別のカセットによってhFlt3Lをコードする上流のヌクレオチド配列から分離される。ワクシニアP7.5プロモーターの制御下にあるキサンチン-グアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ(gpt)遺伝子が、選別可能マーカーとして用いられる。いくつかの実施態様では、TK又はC7L遺伝子はこれらの発現カセットの各側にフランキングする。プラスミドDNAのTK遺伝子座及びE3LΔ83NゲノムDNAで生じる相同組換えは、SG及びgpt発現カセットのE3LΔ83NゲノムDNA TK遺伝子座への挿入をもたらして、例えばE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4を生じる。いくつかの実施態様では、野生型ワクシニアWRゲノム配列(配列番号:7)の80,962から81,032位の塩基対に対応するE3LΔ83N-TK-塩基対の位置が異種核酸配列で取り替えられ、前記異種核酸配列は、関心のある遺伝子(SG)及び選別可能マーカー(例えばgpt)をコードする1つ以上のオープンリーディングフレームを含む。
E3LΔ83Nゲノムへの挿入に適切な他の任意の発現ベクターを、また別のプロモーター、調節エレメント、選別可能マーカー、切断部位、リーダー配列及びE3LΔ83Nの非必須挿入領域とともに用い得ることは理解されよう。
本技術を以下の例によってさらに詳述する。それらの例は決して限定と解釈されてはならない。
一般的材料と方法
ウイルス及び細胞株:E3LΔ83Nウイルスは、B. L. Jacobs氏(Arizona State University, Tempe, AZ)の好意で提供された。前記ウイルスをBSC40細胞で増殖させ、ウイルス力価はBSC40細胞を用いプラークアッセイにより決定した。また別に、E3LΔ83Nは、TK遺伝子座での相同組換えについて下記に記載する戦略と同様なものを用いて、E3L-Z-DNA結合ドメイン遺伝子座での相同組換えによって作製できる。E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4及びE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4ウイルスは、チミジンキナーゼ(TK)遺伝子座での相同組換えにより作製した(実施例1参照)。これらの組換えウイルスをgpt選別培地での培養により濃縮し、選別培地の存在下で3ラウンドを超えるプラーク精製を実施した。純粋な組換えクローンを選別培地の非存在下で増幅させた。検証後、ウイルスを36%シュクロースクッションで精製した。BSC40細胞は、5%ウシ胎児血清(FBS)、100単位/mLペニシリン及び100μg/mLストレプトマイシンを補充したダルベッコ改変イーグル培地(Dulbecco’s modified Eagle’s medium)(DMEM)で培養した。マウスメラノーマ細胞株B16-F10は最初、I. Fidler氏(MD Anderson Cancer Center, Houston, TX)から入手した。B16-F10細胞は、完全RPMI1640培養液(RPMIに10%FBS、100単位/mLペニシリン、100μg/mLストレプトマイシン、0.1mM非必須アミノ酸(NEAA)、2mM L-グルタミン、1mMピルビン酸ナトリウムを添加し、10mM HEPES緩衝剤を含む)で維持した。ヒトメラノーマSK-MEL-28は完全RPMI1640培養液で培養した。全ての細胞を5%CO2インキュベーターで37℃で増殖させた。
細胞培養での多段増殖:ウイルス(E3LΔ83N-TK+、E3LΔ83N-TK-、E3LΔ83N-TK--DNP及びE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4を含む)を0.1のMOI(感染多重度)で感染させる前に、マウスB16-F10並びにヒトSK-MEL-28及びSK-MEL-146メラノーマ細胞を一晩培養した。60分後に接種物を除去し、細胞をPBSで2回洗浄し、続いて培養液を重層した。最初の感染から1、24、48、及び72時間後に細胞を掻きとって採集しさらに全培養液を収集した。凍結融解を3回繰返した後、サンプルを音波処理し、連続希釈及びBSC40細胞単層の感染によってウイルス力価を決定した。プラークは、20%エタノール中の0.1%クリスタルバイオレットで染色することにより可視化させた。
ウェスタンブロット分析:マウスB16-F10メラノーマ細胞又はヒトメラノーマ細胞SK-MEL-28(1x106)にE3LΔ83N-TK+、E3LΔ83N-TK-、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4ウイルスをMOI 10で感染させた。感染後の種々の時点で、上清及び細胞溶解物を収集した。細胞溶解物について、等量のタンパク質を10%ドデシル硫酸-ポリアクリルアミドゲル電気泳動(SDS-PAGE)ゲルにローディングしてポリペプチドを分離し、ニトロセルロース膜に転写した。抗muCTLA-4及びhFlt3L発現レベルを、HRP結合抗マウスIgG(Cell Signaling Technology, Danvers, MA)及び抗hFlt3L(R&D Systems Inc., Minneapolis, MN)抗体を用いウェスタンブロット分析によって決定した。ローディングコントロールとしてのGAPDHのレベルの検出のために、抗グリセルアルデヒド-3-ホスフェートデヒドロゲナーゼ(GADPH)抗体(Cell Signaling Technology, Danvers, MA)を用いた。分泌された抗muCTLA-4抗体の検出のために、等量の上清を8%非変性(ネイティブ)PAGEゲルにローディングした。ポリペプチドを分離し、ニトロセルロース膜に移した。分泌抗muCTLA-4抗体発現レベルを、HRP結合抗マウスIgGを用いてウェスタンブロット分析によって決定した。
腫瘍浸潤細胞のフローサイトメトリー分析:C57BL/6Jマウスの右脇腹及び左脇腹の皮内にB16-F10メラノーマ細胞を移植した(それぞれ右脇腹に5x105細胞及び左わき腹に1x105細胞)。腫瘍移植から7日後の右脇腹の腫瘍内にPBS、E3LΔ83N-TK-、又はE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4を注射した。3日後に注射を1回繰返した。2回目の注射後3日して、鉗子と外科用ハサミを用いて腫瘍を採集し、重量を測定した。続いて腫瘍を細切してから、リベラーゼ(1.67 Wunsch U/mL)及びDNase(0.2mg/mL)とともに無血清RPMI培養液中で37℃、30分間インキュベートした。70μmのナイロンフィルターを通して潰すことによって細胞懸濁物を作製し、続いて完全RPMI培養液で洗浄した。抗CD3、CD45、CD4及びCD8抗体による表面標識のために細胞を処理した。固定可能染料eFluor506(eBioscience, Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA)を用いることによって、死細胞から生細胞を区別する。透過化キット(eBioscience, Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA)を用いて、生細胞をさらに透過性にしてグランザイムBで染色した。LSRIIフローサイトメーター(Becton-Dickinson Biosciences, Franklin Lakes, NJ)を用いてデータを入手した。FlowJoソフトウェア(FlowJo, Becton-Dickinson, Franklin Lakes, NJ)を用いて、データを分析した。
試薬:試薬の市場供給源は以下のとおりであった:抗hFlt3L抗体はR & D Systems Inc.(Minneapolis, MN)から購入した。治療用抗CTLA4(クローン9D9)抗体はBioXcell(West Lebanon, NH)から購入した。HRP結合抗マウスIgG及び抗GADPH抗体は、Cell Signaling Technology(Danvers, MA)から購入した。抗CD3、CD45、CD8、及びGranzyme B抗体は、eBioscience(Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA)から購入した。CD8αマイクロビーズは、Miltenyi Biotechnology(Somerville, MA)から購入した。ELISPOTアッセイキットは、Becton-Dickinson Biosciences(Franklin Lakes, NJ)から購入した。
統計:両側独立スチューデントt検定を2つの試験グループの比較に用いた。生存データをログランク(Mantel-Cox)検定によって分析した。有意とみなされるp値は以下の数字で示される:*、P<0.05;**、P<0.01;***、P<0.001;****、P<0.0001。
本実施例は、細胞傷害性Tリンパ球抗原4を特異的に標的とするマウス抗体(抗muCTLA-4(9D9))を発現又は発現しない、TK欠失を含む組換えワクシニアE3LΔ83Nウイルスの作製を述べる。図1は、ワクシニアウイルス合成初期及び後期プロモーター(PsE/L)を用いて抗体の重鎖及び軽鎖を発現するように設計された単一発現カセットの模式図を示す。9D9の重鎖(muIgG2a)及び軽鎖のコード配列は、フーリン切断部位に続く2Aペプチド(Pep2A)配列を含むカセット(リボソームスキップを可能にする)によって分離された。ワクシニアPsE/Lの制御下の関心のある特定の遺伝子(SG)とともにワクシニアP7.5の制御下の大腸菌キサンチン-グアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ遺伝子(gpt)(チミジンキナーゼ(TK)遺伝子が各々の側にフランキングする)を含むプラスミドが、pCBプラスミドDNAとウイルスゲノムDNAとの間でTK遺伝子座における相同組換えによる標準的な組換えウイルス技術を用いて構築された(図2)。BSC40細胞を組換えワクシニアウイルスに0.05の感染多重度(MOI)で1時間感染させ、続いて上記に記載のプラスミドDNAをトランスフェクトした。感染細胞を48時間で収集した。MPA、キサンチン及びヒポキサンチンを含むgpt選別培地でさらに培養して組換えウイルスを選別し、さらにプラーク精製を実施した。PCR分析を実施して、TK遺伝子の一部の欠失を有しかつ抗muCTLA-4を持つ組換えウイルス及び持たない組換えウイルスを同定した(図3A)。TK遺伝子座で生じた相同組換えは、ウイルスゲノムへのSG及びgpt発現カセットの挿入又はgptのみの挿入をもたらし、E3LΔ83N-TK--DNP、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4、E3LΔ83N-TK--ベクター、及びE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4を生じる(構築物は図9に記載される)。図3Bは、TK遺伝子の欠失を検証し、親ウイルス(E3LΔ83N)の夾雑が無いこと確認するためのウイルスゲノムDNAのPCR分析を示す。
E3LΔ83N-TK+、E3LΔ83N-TK--ベクター、E3LΔ83N-TK--DNP、及びE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4の複製能力を、マウスB16-F10メラノーマ細胞に0.1のMOIでそれら細胞を感染させることによって決定した。感染後の種々の時点で細胞を収集し、BSC40細胞で滴定することによってウイルス収量(log pfu)を決定した。図4Aは、感染後の時間に対してプロットしたウイルス収量のグラフを示す。E3LΔ83N-TK+はB16-F10細胞で効率的に複製し、感染72時間後にはウイルス力価は20,000倍に増加した。TK遺伝子の欠失は、B16-F10細胞においてはウイルス複製についてE3LΔ83N-TK+と比較して3倍の低下を生じる。1時間後のウイルス収量に対する72時間後の収量の倍率変化を計算した(図4B)。同様に、E3LΔ83N-TK--ベクター、E3LΔ83N-TK--DNP、及びE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4の複製能力を、ヒトメラノーマ細胞株SK-MEL-146及びSK-MEL-28でそれらウイルスをMOI 0.1で感染させることによって決定した。細胞を感染後の種々の時点で収集し、BSC40細胞で滴定することによってウイルス収量(log pfu)を決定した。図4C−4Fは、感染後の時間に対してプロットしたウイルス収量の一連のグラフを示す。全てのVACV株、E3LΔ83N-TK--ベクター、E3LΔ83N-TK--DNP、及びE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4は、ヒトメラノーマ細胞株SK-MEL-146及びSK-MEL-28で効率的に複製した。
E3LΔ83N-TK-組換えウイルスが所望の抗体を発現することができるか否かを決定するために、B16-F10マウスメラノーマ細胞にE3LΔ83N-TK-、E3LΔ83N-TK--DNP、及びE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4をMOI 10で感染させ、抗DNP及び抗muCTLA-4の発現を測定した。細胞溶解物及び上清を感染後の種々の時点(8、24、36及び48時間)で収集した。ウェスタンブロット分析を実施して、抗体発現レベルを決定した。図5A−Bに示すように、ウェスタンブロット分析は、両抗体(抗DNP及び抗muCTLA-4)の豊富なレベルを細胞溶解物及び上清の両方で明示する。したがって、これらの結果は、本技術の組換えウイルスは感染細胞で関心のある特定の遺伝子を発現する能力を有すること、及び所望の抗体を細胞にデリバリーする方法において有用であることを示す。
組換えE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4ウイルス感染が抗CTLA-4抗体の生成をもたらすか否かを決定するために、ヒトSK-MEL-28メラノーマ細胞及びマウスB16-F10細胞にE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4をMOI 10で感染させた。細胞溶解物を感染後6、24及び48時間に収集し、ポリペプチドを10%SDS-PAGEを用いて分離した。HRP結合抗マウスIgG(重鎖及び軽鎖)抗体を用いて、抗muCTLA-4抗体の完全長(FL)、重鎖(HC)、及び軽鎖(LC)を検出した。GAPDHをローディングコントロールとして用いた。図6に示すように、ウェスタンブロット分析は、B16-F10及びSK-MEL-28メラノーマ細胞の両方で抗muCTLA-4抗体の完全長(FL)、重鎖(HC)、及び軽鎖(LC)の発現を示し、抗muCTLA-4は細胞溶解物及び上清の両方に存在することを示す。したがって、これらの結果は、本技術の組換えウイルスは感染細胞で抗muCTLA-4を発現する能力を有すること、及び抗体を細胞にデリバリーする方法において有用であることを示す。
組換えウイルス及びベクターコントロールのin vivo腫瘍殺滅活性を試験するために、両側性腫瘍移植モデルを用いた。B16-F10メラノーマ細胞をC57BL/6Jマウスの右(5x105細胞)及び左(1x105細胞)の脇腹の毛剃りした皮膚の皮内に移植した。移植から7又は8日後に、右のより大きな腫瘍(直径約3mm以上)の腫瘍に週に2回PBS注射、E3LΔ83N-TK-注射、E3LΔ83N-TK- プラス抗muCTLA-4抗体(100μg/マウス)腹腔内(IP)注射、E3LΔ83N-TK- プラス抗muCTLA-4抗体(10μg/マウス)腫瘍内(IT)注射、又はE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4注射をマウスが麻酔下にあるときに実施した。マウスの生存をモニターし、さらに週に2回腫瘍サイズを測定した。図7Aに実験模式図を示す。腫瘍体積を測定しマウスの生存をモニターした。図7Bは実験のカプラン-マイヤー生存曲線を示す。データは、PBS模擬処理マウスで腫瘍は非常に迅速に増殖し、14日という生存期間中央値で死ぬことを示す。腫瘍内へのE3LΔ83N-TK-注射は中央値生存期間を18日に延長した。E3LΔ83N-TK-プラス抗muCTLA-4抗体(100μg/マウス)の腹腔内(IP)共同注射は中央値生存期間を23日に延長した。E3LΔ83N-TK-プラス抗muCTLA-4抗体(10μg/マウス)の腫瘍内(IT)共同注射は中央値生存期間を28日に延長した。E3LΔ83N-TK-プラス抗muCTLA-4抗体の腫瘍内注射は中央値生存期間を57.5日に延長した。図7C−Dは、注射実施腫瘍及び注射非実施腫瘍の時間経過における腫瘍体積測定を示す。これらの結果は、操作されたE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4抗体による抗muCTLA-4の発現は、注射実施及び注射非実施腫瘍の両方で腫瘍体積を低下させかつ腫瘍増殖の速度を低下させることができ、したがって遠達効果を示すことを表している。加えて、これらの結果は、抗muCTLA-4抗体を発現する組換えE3LΔ83N-TK-ウイルスの使用は、E3LΔ83N-TK-プラス抗muCTLA-4のIT又はIP共同注射よりも有効であることを示す。
B16-F10メラノーマにおいてE3LΔ83N-TK-又はE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4の腫瘍内注射がCD8+及びCD4+ T細胞の活性化及び増殖をもたらすか否かを評価するために、B16-F10メラノーマ細胞をC57BL/6Jマウスの右及び左の脇腹の皮内に移植した(右脇腹に5x105細胞及び左脇腹に2.5x105細胞)。移植から7日後に、右脇腹の腫瘍にPBS、E3LΔ83N-TK-、又はE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4を注射した。3日後に注射を繰返した。2回目の注射から3日後に、腫瘍を採集し、抗CD3、CD45、CD4及びCD8抗体による表面標識のために、さらに細胞内グランザイムB染色のために細胞を処理した。注射非実施腫瘍内の生免疫細胞浸潤物をFACSによって分析した。注射実施腫瘍でグランザイムB発現CD8+ T細胞の劇的な増加(PBS処理マウスの腫瘍における37%からE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4処理マウスの腫瘍において62%まで)があったが、一方、グランザイムB+ CD8+ T細胞のパーセンテージはE3LΔ83N-TK-処理マウスの腫瘍で22%に低下した(図8A−B)。これらの結果は、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4の腫瘍内注射は注射非実施腫瘍で活性化CD8+ T細胞のレベルを有意に増加させたことを示す。同様な変化が注射実施腫瘍でグランザイムB発現CD4+ T細胞について観察された。注射非実施腫瘍でグランザイムB発現CD4+ T細胞の劇的な増加があった(PBS処理マウスの腫瘍の3.7%からE3LΔ83N-TK-処理マウスの腫瘍の10%、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4処理マウスの腫瘍の46%)(図8C−D)。これらの結果は、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4の腫瘍内注射は対象動物で免疫応答を誘発することができ、前記応答は、注射非実施腫瘍内の細胞傷害性CD8+ T細胞及び/又はCD4+ T細胞の増加を含むことを示す。
ヒトFms様チロシンキナーゼ3リガンド(hFlt3L)及び細胞傷害性Tリンパ球抗原4を特異的に標的とする抗体(抗muCTLA-4(9D9))を発現する又は発現しない、TK欠失を含む組換えワクシニアウイルスを作製した。図9は単一発現カセットの模式図を示し、前記カセットは、hFlt3L並びに抗muCTLA-4の重鎖及び軽鎖をワクシニアウイルス合成初期及び後期プロモーター(PsE/L)を用いて発現するように設計されている。hFlt3L及び重鎖(muIgG2a)のコード配列は、フーリン切断部位とその後に続く2Aペプチド(Pep2A)配列によって分離された(リボソームスキップを可能にする)。9D9の重鎖(muIgG2a)及び軽鎖も、フーリン切断部位とその後に続くPep2A配列によって分離された。
E3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4組換えウイルスのhFlt3L及び抗muCTLA-4の発現を試験するために、B16-F10メラノーマ細胞にE3LΔ83N-TK-又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4をMOI 10で感染若しくは模擬感染させた。細胞溶解物及び上清を感染後種々の時点(6、20及び36時間)で収集した。ウェスタンブロット分析を実施して、当該タンパク質及び抗体発現のレベルを決定した。図10に示すように、ウェスタンブロット分析は、細胞溶解物における豊富なレベルのhFlt3L及び抗muCTLA-4(完全長(FL)、重鎖(HC)、及び軽鎖(LC))の両方の発現を示す。したがって、これらの結果は、本技術のE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4組換えウイルスは、感染細胞でhFlt3L及び抗muCTLA-4抗体を発現できること及び腫瘍細胞でこれらのタンパク質を発現する方法で有用であることを示す。
マウスをPBS、E3LΔ83N-TK-、E3LΔ83N-TK--hFlt3L、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4の腫瘍内注射により処置した後、そのマウスが、マウスB16-F10メラノーマ癌に対して抗腫瘍メモリーT細胞免疫を獲得したか否かを評価するために、酵素結合イムノスポット(ELISpot)を用いた。B16-F10メラノーマ細胞(それぞれ5x105及び2.5x105細胞)をC57BL/6Jマウスの右及び左の脇腹の毛剃りした皮膚の皮内に移植した。腫瘍移植から7日後に、右脇腹の腫瘍(直径約3mm)にPBS、E3LΔ83N-TK-、E3LΔ83N-TK--hFlt3L-、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4を注射した。3日後に注射を繰返し、2回目の注射から3日後に安楽死させた。ELISpotを実施して、組換えウイルスで処置したマウスの脾臓における抗腫瘍特異的CD8+ T細胞の生成を評価した。略記すれば、CD8+ T細胞を脾臓細胞から単離し、2.5x105細胞を抗IFNγ被覆BD ELISpotプレートマイクロウェルで放射線照射B16-F10細胞とともに一晩37℃で培養した。CD8+ T細胞をγ線照射装置で照射したB16-F10細胞で刺激しIFNγ分泌を抗IFNγ抗体で検出した。図11Aは、PBS、E3LΔ83N-TK-、E3LΔ83N-TK--hFlt3L-、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4のいずれかで処置した個々のマウスの250,000個のCD8+ T細胞当たりのIFNγ+スポット数を示す。図11Bは、PBS、E3LΔ83N-TK-、E3LΔ83N-TK--hFlt3L-、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4のいずれかで処置した各グループのマウスからプールした250,000個のCD8+ T細胞当たりのIFNγ+スポット数を示す。これらの結果は、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4の腫瘍内注射は、処置マウスにおいて抗腫瘍CD8+ T細胞を増加させることを示す。加えて、これらの結果は、マウスB16-F10メラノーマ両側性移植モデルの処置マウスでは、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4の腫瘍内注射は、抗腫瘍CD8+ T細胞の生成でE3LΔ83N-TK-又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-よりも有効であることを示す。したがって、これらの結果は、本技術のE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4ウイルスは、対象動物の免疫応答の増強若しくは促進、及び対象動物の細胞傷害性CD8+ T細胞の増加において有効であることを示す。
本実施例は、固形腫瘍(例えばメラノーマ)における、PD1/PD-L1療法と組み合わせた本技術の組換えウイルス(例えばE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4)の使用を示す。
方法
試薬:マウス抗PD-L1(クローン10F.9G2)抗体はBioXcellから購入した。
腫瘍移植及びウイルスの腫瘍内注射:両側性腫瘍移植モデルを用いた。B16-F10メラノーマ細胞をC57BL/6Jマウスの右(5x105細胞)及び左(1x105細胞)の脇腹の毛剃りした皮膚の皮内に移植した。腫瘍移植から8日後に、右脇腹のより大きな腫瘍(直径約3mm以上)にPBS、E3LΔ83N-TK-、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4、E3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4注射、又はマウスを麻酔下に置いてE3LΔ83N-TK- プラス抗muPD-L1抗体(250μg/マウス)の腹腔内(IP)注射、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4プラス抗muPD-L1抗体(250μg/マウス)のIP注射、E3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4プラス抗muPD-L1抗体(250μg/マウス)のIP注射を実施した。マウスを生存についてモニターし、さらに腫瘍サイズを週に2回測定した。
結果
図12A−12Bに示すように、併用療法は、ウイルスのみの腫瘍内注射と比較したとき、マウスの注射非実施側で腫瘍増殖を遅らせた。さらに、抗muCTLA-4を発現する組換えウイルスとの併用療法は、コントロールウイルス併用療法と比較したとき腫瘍増殖を遅らせた。したがって、これらの結果は、本技術の組成物は固形腫瘍を治療する方法において有用であることを示す。
本実施例は、本技術の組換えウイルス(例えばE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4)の固形腫瘍(例えばメラノーマ)の治療における使用を示す。
方法
固形腫瘍(例えばメラノーマ)を有すると診断された対象動物は、4x106−4x108 pfuのE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4の投与を2週間から3週間毎に受ける。組換えウイルスは、当業界で公知の方法にしたがって腫瘍内に投与される。対象動物は腫瘍体積の測定について2から3週間毎に評価される。治療は、腫瘍体積が低下するか若しくは腫瘍が根絶されるときまで、又は固形腫瘍の指標の1つ以上の徴候若しくは症候が寛解又は除去されるときまで維持される。
固形腫瘍(例えばメラノーマ)を有すると診断され、本技術の組換えウイルス(例えばE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4)の治療的に有効な量を投与された対象動物は、腫瘍体積の減少若しくは腫瘍根絶、及び/又は重篤度の低下又は固形腫瘍の指標の1つ以上の徴候若しくは症候の消失を示すであろうと期待される。
結果
これらの結果は、本技術の組換えウイルス(例えばE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4)は、固形腫瘍(例えばメラノーマ)の治療で有用であることを示すであろう。
E3LΔ83N-TK--ベクター、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4及びE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4の複製能力を、マウスB16-F10メラノーマ細胞及びヒトSK-MEL-28及びSK-MEL-146メラノーマ細胞にMOI 0.1でこれらを感染させることによって決定した。感染後の種々の時点(例えば1、24、48及び72時間)で細胞を収集し、BSC40細胞で滴定することによってウイルス収量(log pfu)を決定した。図14Aは、感染後の時間に対してプロットしたウイルス収量のグラフを示す。E3LΔ83N-TK--ベクターはB16-F10細胞で効率的に複製し、感染72時間後にはウイルス力価は50,000倍に増加した。E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4及びE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4ウイルスもまたB16-F10細胞内で複製したが、ただしE3LΔ83N-TK--ベクターと比較して効率は低下した。感染1時間後のウイルス収量に対するE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4の72時間における収量の倍率変化は、それぞれ約2700及び11500倍であった。同様に、E3LΔ83N-TK--ベクター、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4及びE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4の複製能力を、ヒトSK-MEL-28(図14B)及びSK-MEL-146(図14C)メラノーマ細胞において、MOI 0.1でこれらを感染させることによって決定した。感染後の種々の時点(例えば1、24、48及び72時間)で細胞を収集し、BSC40細胞で滴定することによってウイルス収量(log pfu)を決定した。図14B及び4Cは、感染後の時間に対してプロットしたウイルス収量のグラフを示す。全ての組換えウイルス、E3LΔ83N-TK--ベクター、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4及びE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4は、ヒトメラノーマ細胞SK-MEL-28及びSK-MEL-146で効率的に複製した。
E3LΔ83N-TK-組換えウイルスが所望の抗体を発現することができるか否かを決定するために、B16-F10メラノーマ細胞又はMC38結腸癌細胞にE3LΔ83N-TK-、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4をMOI 10で感染させ、抗muCTLA-4抗体の発現を測定した。細胞溶解物を感染後の種々の時点(例えば8、24及び32時間)に収集した。ウェスタンブロット分析を実施して抗体の発現レベルを決定した。図15A−15Bに示すように、ウェスタンブロット分析は、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4ウイルス感染B16-F10及びMC38細胞の両細胞における豊富な抗muCTLA-4抗体発現レベルを示す。したがって、これらの結果は、本技術の組換えウイルスは、感染細胞で関心のある特定の遺伝子を発現させる能力を有すること、及び所望の抗体を細胞にデリバリーする方法において有用であることを示す。
組換えE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4ウイルス感染が抗CTLA-4抗体の生成をもたらすか否かを決定するために、ヒトSK-MEL-28メラノーマ細胞にE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4をMOI 10で感染させた。細胞溶解物を感染後の種々の時点(例えば24及び32時間)に収集し、ポリペプチドを10%SDS-PAGEを用いて分離した。HRP結合抗マウスIgG(重鎖及び軽鎖)抗体を用いて、抗muCTLA-4抗体の完全長(FL)、重鎖(HC)、及び軽鎖(LC)を検出した。抗ワクシニア-D12抗体を用いてウイルスタンパク質の発現をチェックし、GAPDHをローディングコントロールとして用いた。図16に示すように、ウェスタンブロット分析は、SK-MEL-28メラノーマ細胞株における抗muCTLA-4抗体の完全長(FL)、重鎖(HC)、及び軽鎖(LC)の発現を示す。したがって、これらの結果は、本技術の組換えウイルスは、感染細胞で抗CTLA-4抗体を発現する能力を有すること、及び抗体を細胞にデリバリーする方法において有用であることを示す。
E3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4によるhFlt3Lの発現を試験するために、マウスB16-F10又はヒトSK-MEL-28メラノーマ細胞にE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4をMOI 10で感染又は模擬感染させた。細胞溶解物を感染後の種々の時点(例えば24及び32時間)に収集した。ウェスタンブロット分析を実施してhFlt3Lタンパク質の発現レベルを決定した。図17に示すように、ウェスタンブロット分析は細胞溶解物中のhFlt3Lタンパク質の豊富なレベルを示す。したがって、これらの結果は、本技術のE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4組換えウイルスは、感染細胞でhFlt3Lタンパク質を発現する能力を有すること、及びこれらのタンパク質を腫瘍細胞で発現させる方法において有用であることを示す。
組換えE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4ウイルス感染が抗CTLA-4抗体の分泌をもたらすか否かを決定するために、マウスB16-F10メラノーマ細胞又はヒトSK-MEL-28メラノーマ細胞にE3LΔ83N-TK-、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4をMOI 10で感染させた。細胞上清を感染後の種々の時点(例えば8、24及び32時間)に収集した。ウェスタンブロット分析を実施して、培養上清中の分泌抗muCTLA-4のレベルを決定した。図18A−18Bに示すように、ウェスタンブロット分析は、組換えE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4ウイルス感染マウスB16-F10及びヒトSK-MEL-28メラノーマ細胞の細胞培養上清中で抗muCTLA-4抗体の分泌増加を示す。したがって、これらの結果は、本技術のE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4及びE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4組換えウイルスは、感染細胞で抗CTLA-4抗体を発現及び分泌する能力を有すること、並びに所望の抗体の細胞へのデリバリー及び分泌のための方法において有用であることを示す。
ウイルス感染細胞から分泌された抗体がその意図した標的と結合できるか否かを決定するために、マウスB16-F10メラノーマ細胞又はヒトSK-MEL-28メラノーマ細胞にE3LΔ83N-TK-、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4をMOI 10で感染させた。細胞培養上清を感染後24時間で収集した。上清を組換えマウスCTLA-4タンパク質を含む膜片とともにインキュベートし、抗muCTLA-4抗体の結合を調べた。図19に示されるように、組換えE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4ウイルス感染マウスB16-F10及びヒトSK-MEL-28メラノーマ細胞の上清中の分泌された抗muCTLA-4抗体は、膜片の標的CTLA-4タンパク質と結合できる。したがって、これらのデータは、本技術の組換えE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4ウイルスに感染させたマウスB16-F10又はヒトSK-MEL-28メラノーマ細胞から分泌された抗muCTLA-4抗体は、それらの意図した標的と結合する能力を有すること、及び機能性抗体を生成する方法において有用であることを示す。
E3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4のB16-F10メラノーマ腫瘍内注射がin vivo移植腫瘍における複製及び特定遺伝子の発現をもたらすか否かを評価するために、片側腫瘍移植モデルを用いた。簡単に記せば、C57BL/6Jマウスの右脇腹の毛剃りした皮膚の皮内にB16-F10メラノーマ細胞(5x105細胞)を移植した。移植7日後に、腫瘍(直径約3mm)にE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4を注射した。ウイルス注射後種々の時点(例えば24及び48時間)で腫瘍サンプルを収集した。腫瘍中のE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4ウイルスのウイルス収量をBSC40細胞で滴定することによって決定し、さらに抗muCTLA-4抗体の発現をウェスタンブロットによって調べた。図20A及び20Bに示されるように、ウイルス注射48時間後の腫瘍には中程度のウイルス複製が起こった。注射されたウイルスはまた腫瘍において抗muCTLA-4抗体を発現した。したがって、これらの結果は、本技術の組換えE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4ウイルスは、対象動物で複製コンピテントであること、及び対象動物内で所望の特定遺伝子を発現する能力を有することを示す。
マウスが、PBS、E3LΔ83N-TK-、E3LΔ83N-TK--hFlt3L-、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4の腫瘍内注射による処置後にマウスB16-F10メラノーマ細胞に対して抗腫瘍メモリーT細胞免疫を獲得したか否かを評価するために、酵素結合イムノスポット(ELISpot)を用いた。B16-F10細胞(それぞれ5x105及び2.5x105細胞)をC57BL/6Jマウスの右及び左の脇腹の毛剃りした皮膚の皮内に移植した。腫瘍移植の7日後に、右側の腫瘍(直径約3mm)にPBS、E3LΔ83N-TK-、E3LΔ83N-TK--hFlt3L-、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4を注射した。3日後に注射を繰返し、2回目の注射から3日後に安楽死させた。ELISpotを実施して、組換えウイルスで処置したマウスの脾臓における抗腫瘍特異的CD8+ T細胞の生成を評価した。略記すれば、CD8+ T細胞を脾臓細胞から単離し、2.5x105細胞を抗IFNγ被覆BD ELISpotプレートマイクロウェルで放射線照射B16-F10細胞とともに一晩37℃で培養した。CD8+ T細胞をγ線照射装置で照射したB16-F10細胞で刺激しIFNγ分泌を抗IFNγ抗体で検出した。図21Aは、PBS、E3LΔ83N-TK-、E3LΔ83N-TK--hFlt3L-、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4のいずれかで処置した個々のマウスの250,000個のCD8+ T細胞当たりのIFNγ+スポット数を示す。図21Bは、PBS、E3LΔ83N-TK-、E3LΔ83N-TK--hFlt3L-、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4のいずれかで処置した各グループのマウスからプールした250,000個のCD8+ T細胞当たりのIFNγ+スポット数を示す。これらの結果は、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4の腫瘍内注射は、処置マウスで抗腫瘍CD8+ T細胞を増加させることを示す。加えて、これらの結果は、マウスB16-F10メラノーマ両側性移植モデルの処置マウスにおいて、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4の腫瘍内注射は、抗腫瘍CD8+ T細胞の生成についてE3LΔ83N-TK-又はE3LΔ83N-TK--hFlt3Lよりも有効であることを示す。したがって、これらの結果は、本技術の組換えE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4及びE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4ウイルスは、対象動物の免疫応答の増強若しくは促進において及び対象動物での細胞傷害性CD8+ T細胞の増加において有効であることを示す。
本実施例は、本技術の組換えウイルス(例えばE3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4又はE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4)の固形腫瘍(例えばメラノーマ)の治療における使用を示す。
方法
腫瘍移植及びウイルスの腫瘍内注射:両側腫瘍移植モデルを用いた。C57BL/6Jマウスの右脇腹(5x105細胞)及び左脇腹(1x105細胞)の毛剃りした皮膚の皮内にB16-F10メラノーマ細胞を移植した。移植8日後に、マウスが麻酔下にあるとき、右脇腹のより大きな腫瘍(直径約3mm以上)に週に2回PBS、E3LΔ83N-TK-、E3LΔ83N-TK--抗muCTLA-4、E3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗muCTLA-4を注射した。生存についてマウスをモニターし、さらに腫瘍サイズを週に2回測定した。
結果
図22A−22Dに示されるように、ウイルス療法は、PBSコントロールと比較したときマウスの注射非実施側で腫瘍増殖を遅らせた。さらに、抗muCTLA-4及びヒトFlt3Lを発現するウイルスは、コントロールウイルスと比較したとき腫瘍増殖を遅らせた。したがって、これらの結果は本技術の組成物は固形腫瘍を治療する方法において有用であることを示す。
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本技術は、本出願に記載した個別の実施態様に関して限定されるべきではなく、それら実施態様は、本技術の個々の特徴の1つの例示として意図される。当業者には明白であろうが、本技術の多くの改変及び変型は本技術の趣旨及び範囲を外れることなく実施され得る。本明細書に列挙された装置及び方法に加えて、本技術の範囲内で機能的に等価な方法及び装置は前述の記載から当業者には明白であろう。そのような改変及び変型は添付の特許請求の範囲内に含まれるものである。本技術は、添付の特許請求の範囲によって権利が与えられる全範囲の等価物とともに、当該添付の特許請求の範囲に関してのみ制限されるべきである。本技術は、個別の方法、試薬、化合物、組成物、又は生物学的な系に制限されず、それらは当然変動し得ることは理解されるべきである。本明細書で用いられる用語論は個別の実施態様を説明することを目的とし、制限を意図しないこともまた理解されるべきである。
加えて、本開示の特色又は特徴がマーカッシュグループで記載される場合、当該開示はまた、それによってマーカッシュグループの個々の任意のメンバー又はサブグループのメンバーに関して記載されていることは当業者には理解されよう。
当業者には理解されるように、任意の目的及び全ての目的のために、特に書面での説明を提供する場合には、本明細書に開示される全ての範囲はまた、任意のかつ全ての可能な部分範囲及びその部分範囲の組合せを包含する。列挙されたいずれの範囲も、十二分に記載され、かつ同じ範囲を少なくとも均等な半分、1/3、1/4、1/5、1/10などに分解することが可能であることは容易に理解されよう。非限定的な例として、本明細書で考察される各範囲は、下方の3/1、真ん中の1/3、上方の1/3などに容易に分解することができる。当業者にはまた理解されるところであるが、例えば、“まで”、“少なくとも”、“を超える”、“未満”などの言葉はいずれも列挙された数を含み、さらに上記で考察したように続いて部分範囲に分解することができる範囲を指す。最後に、当業者には理解されるところであるが、範囲は個々の各メンバーを含む。したがって、例えば1−3つの細胞を有するグループは、1、2又は3つの細胞を有するグループを指す。同様に、1−5つの細胞を有するグループは、1、2、3、4又は5つの細胞を有するグループを指し、以下同様である。
本明細書で参照又は引用された全ての特許、特許出願、仮特許出願、及び公開物は、参照によってその全体(全ての図及び表を含む)が本明細書に、本出願の明快な教示と一致する範囲で含まれる。
Claims (41)
- チミジンキナーゼ(TK)遺伝子のコード配列中への異種ヌクレオチド配列の挿入を含む、操作されたE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4ワクシニアウイルスであって、前記異種ヌクレオチド配列が、抗細胞傷害性Tリンパ球関連抗原(CTLA-4)抗体重鎖(HC)及び抗CTLA-4抗体軽鎖(LC)をコードするオープンリーディングフレームを含む発現カセットを含み、前記HC及びLCが、5’から3’方向にプロテアーゼ切断部位及び2Aペプチド(Pep2A)配列をコードするヌクレオチド配列によって分離されている、前記操作されたE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4ワクシニアウイルス。
- プロテアーゼ切断部位がフーリン切断部位である、請求項1に記載の操作されたE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4ワクシニアウイルス。
- 発現カセットがさらに、オープンリーディングフレームの発現を指令することができるプロモーターを含む、請求項1又は請求項2に記載の操作されたE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4ワクシニアウイルス。
- 異種核酸配列がさらに、発現を指令することができるプロモーターに作動できるように連結されている選別可能マーカーをコードするオープンリーディングフレームを含む追加の発現カセットを含む、請求項1−3のいずれか1項に記載の操作されたE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4ワクシニアウイルス。
- 選別可能マーカーが、キサンチン-グアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ(gpt)遺伝子、生物発光タンパク質、蛍光タンパク質、化学発光タンパク質、又は前記の任意の組合せである、請求項4に記載の操作されたE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4ワクシニアウイルス。
- ウイルスが完全長のチミジンキナーゼ(TK)遺伝子生成物を生成しない、請求項1−5のいずれか1項に記載の操作されたE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4ワクシニアウイルス。
- オープンリーディングフレームが配列番号:1に示されるヌクレオチド配列を含む、請求項1−6のいずれか1項に記載の操作されたE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4ワクシニアウイルス。
- オープンリーディングフレームが、抗CTLA-4抗体又は重鎖免疫グロブリン可変ドメイン(VH)及び軽鎖免疫グロブリン可変ドメイン(VL)を含む前記抗体の抗原結合フラグメントをコードし、ここで、
(a)VHが、GYTFTDY(配列番号:27)のVH-CDR1配列、PYNG(配列番号:28)のVH-CDR2配列、及びYGSWFA(配列番号:29)のVH-CDR3配列を含み、さらに
(b)VLが、SQSIVHSNGNTY(配列番号:30)のVL-CDR1配列、KVS(配列番号:31)のVL-CDR2配列、及びGSHVPY(配列番号:32)のVL-CDR3配列を含み、さらに
当該オープンリーディングフレームが配列番号:1に示されるヌクレオチド配列と少なくとも95%同一である、請求項1−6のいずれか1項に記載の操作されたE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4ワクシニアウイルス。 - オープンリーディングフレームが、(a)抗ヒトCTLA-4抗体(抗huCTLA-4)の重鎖CDR領域及び抗huCTLA-4の軽鎖CDR領域をコードするか、又は(b)抗ヒトCTLA-4抗体(抗huCTLA-4)の重鎖可変領域及び抗huCTLA-4の軽鎖可変領域をコードし、前記抗huCTLA-4が場合によってイピリムマブである、請求項1−6のいずれか1項に記載の操作されたE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4ワクシニアウイルス。
- 操作されたウイルス感染マウスが、ベクターコントロール(E3LΔ83N-TK-)感染マウス又は抗CTLA-4を共投与されたE3LΔ83N-TK-感染(E3LΔ83N-TK-+抗CTLA-4)マウスと比較して、感染後寿命の延長を有する、請求項1−9のいずれか1項に記載の操作されたE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4ワクシニアウイルス。
- 請求項1−10のいずれか1項に記載の操作されたE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4ワクシニアウイルスを含む免疫原性組成物。
- さらに医薬的に許容できる担体を含む、請求項11に記載の免疫原性組成物。
- さらに医薬的に許容できるアジュバントを含む、請求項11又は請求項12に記載の免疫原性組成物。
- その必要がある対象動物の固形腫瘍を治療する方法であって、請求項1−10のいずれか1項に記載の操作されたE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4ワクシニアウイルスの有効量を含む組成物、又は請求項11−13のいずれか1項に記載の免疫原性組成物を腫瘍にデリバリーすることを含む、前記方法。
- 治療が以下の1つ以上を含む、請求項14に記載の方法:腫瘍に対する免疫応答の対象動物における誘発、又は対象動物において腫瘍に対する進行中の免疫応答の増強若しくは促進、腫瘍内の細胞傷害CD8+ T細胞及び/又はCD4+ Tエフェクター細胞の増加の誘発;脾臓内の細胞傷害CD8+ T細胞の増加の誘発;腫瘍体積の減少、腫瘍の根絶、腫瘍増殖の阻害、腫瘍の転移性増殖の阻害、腫瘍細胞のアポトーシスの誘発、又は無処理コントロール対象動物と比較した対象動物の延命。
- 腫瘍が、E3LΔ83N-TK--抗CTLA-4ワクシニアウイルスのデリバリー部位に存在する腫瘍細胞を含む、又は当該デリバリー部位及び対象動物の身体の別の場所の両方に存在する腫瘍細胞を含む、請求項14又は請求項15に記載の方法。
- 組成物が、腫瘍内に、静脈内に、又は前記の任意の組合せで対象動物に投与される、請求項14−16のいずれか1項に記載の方法。
- 腫瘍がメラノーマ、結腸癌、乳癌、又は前立腺癌である、請求項14−16のいずれか1項に記載の方法。
- さらに、同時に又は逐次的に1つ以上の免疫チェックポイント遮断剤又は免疫刺激剤を対象動物にデリバリーする工程を含み、当該1つ以上の免疫チェックポイント遮断剤が、腫瘍内に、静脈内に、又は前記の任意の組合せで対象動物に投与される、請求項14−18のいずれか1項に記載の方法。
- 1つ以上の免疫チェックポイント遮断剤又は免疫刺激剤が、抗PD-1抗体、抗PD-L1抗体、抗PD-L2抗体、抗CTLA-4抗体、イピリムマブ、ニボルマブ、ピジリズマブ、ランブロリズマブ、ペムブロリズマブ、アテゾリズマブ、アベルマブ、デュルバルマブ、MPDL3280A、BMS-936559、MEDI-4736、MSB 00107180、抗GITR抗体、LAG-3、TIM3、B7-H3、B7-H4、TIGIT、AMP-224、MDX-1105、アレルマブ、トレメリムマブ、IMP321、MGA271、BMS-986016、リリルマブ、ウレルマブ、PF-05082566、IPH2101、MEDI-6469、CP-870、893、モガムリズマブ、バルリルマブ、ガリキシマブ、AMP-514、AUNP 12、インドキシモド、NLG-919、INCB024360、CD80、CD86、ICOS、DLBCL阻害剤、BTLA、及び前記の任意の組合せから成る群から選択される、請求項19に記載の方法。
- チミジンキナーゼ(TK)遺伝子のコード配列中への異種ヌクレオチド配列の挿入を含む、操作されたE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4ワクシニアウイルスであって、当該異種ヌクレオチド配列が、ヒトFms様チロシンキナーゼ3リガンド(hFlt3L)、抗細胞傷害性Tリンパ球関連抗原(CTLA-4)抗体重鎖(HC)及び抗CTLA-4抗体軽鎖(LC)をコードするオープンリーディングフレームを含む発現カセットを含み、当該hFlt3L及びHCヌクレオチド配列が、5’から3’方向にプロテアーゼ切断部位及び2Aペプチド(Pep2A)配列をコードするヌクレオチド配列によって分離され、さらに当該HC及びLCが、5’から3’方向にプロテアーゼ切断部位及びPep2A配列をコードするヌクレオチド配列によって分離されている、前記操作されたE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4ワクシニアウイルス。
- プロテアーゼ切断部位がフーリン切断部位である、請求項21に記載の操作されたE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4ワクシニアウイルス。
- 発現カセットがさらに、オープンリーディングフレームの発現を指令することができるプロモーターを含む、請求項21又は請求項22に記載の操作されたE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4ワクシニアウイルス。
- 異種核酸配列がさらに、選別可能マーカーをコードするオープンリーディングフレームを含む追加の発現カセットを含み、前記マーカーがその発現を指令することができるプロモーターに作動できるように連結されている、請求項21−23のいずれか1項に記載の操作されたE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4ワクシニアウイルス。
- 選別可能マーカーが、キサンチン-グアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ(gpt)遺伝子、生物発光タンパク質、蛍光タンパク質、化学発光タンパク質、又は前記の任意の組合せである、請求項24に記載の操作されたE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4ワクシニアウイルス。
- ウイルスが完全長のチミジンキナーゼ(TK)遺伝子生成物を生成しない、請求項21−15のいずれか1項に記載の操作されたE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4ワクシニアウイルス。
- オープンリーディングフレームが配列番号:5に示されるヌクレオチド配列を含む、請求項21−26のいずれか1項に記載の操作されたE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4ワクシニアウイルス。
- オープンリーディングフレームが、抗CTLA-4抗体又は重鎖免疫グロブリン可変ドメイン(VH)及び軽鎖免疫グロブリン可変ドメイン(VL)を含む前記抗体の抗原結合フラグメントをコードし、ここで、
(a)VHが、GYTFTDY(配列番号:27)のVH-CDR1配列、PYNG(配列番号:28)のVH-CDR2配列、及びYGSWFA(配列番号:29)のVH-CDR3配列を含み、さらに
(b)VLが、SQSIVHSNGNTY(配列番号:30)のVL-CDR1配列、KVS(配列番号:31)のVL-CDR2配列、及びGSHVPY(配列番号:32)のVL-CDR3配列を含み、さらに
当該オープンリーディングフレームが、配列番号:5に示されるヌクレオチド配列と少なくとも95%同一である、請求項21−26のいずれか1項に記載の操作されたE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4ワクシニアウイルス。 - オープンリーディングフレームが、(a)抗ヒトCTLA-4抗体(抗huCTLA-4)の重鎖CDR領域及び抗huCTLA-4の軽鎖CDR領域をコードするか、又は(b)抗ヒトCTLA-4抗体(抗huCTLA-4)の重鎖可変領域及び抗huCTLA-4の軽鎖可変領域をコードし、当該抗huCTLA-4が場合によってイピリムマブである、請求項21−26のいずれか1項に記載の操作されたE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4ワクシニアウイルス。
- 請求項21−29のいずれか1項に記載の操作されたE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4ワクシニアウイルスを含む免疫原性組成物。
- さらに医薬的に許容できる担体を含む、請求項30に記載の免疫原性組成物。
- さらに医薬的に許容できるアジュバントを含む、請求項30又は請求項31に記載の免疫原性組成物。
- その必要がある対象動物において固形腫瘍を治療する方法であって、請求項21−29のいずれか1項に記載の操作されたE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4ワクシニアウイルスの有効量を含む組成物又は請求項30−32のいずれか1項に記載の免疫原性組成物を腫瘍にデリバリーする工程を含む、前記方法。
- 治療が以下の1つ以上を含む、請求項33に記載の方法:腫瘍に対する免疫応答の対象動物における誘発、又は対象動物における腫瘍に対する進行中の免疫応答の増強若しくは促進、腫瘍内の細胞傷害CD8+ T細胞及び/又はCD4+ Tエフェクター細胞の増加の誘発;脾臓内の細胞傷害CD8+ T細胞の増加の誘発;腫瘍体積の減少、腫瘍の根絶、腫瘍増殖の阻害、腫瘍の転移性増殖の阻害、腫瘍細胞のアポトーシスの誘発、又は無処理コントロール対象動物と比較した対象動物の延命。
- 腫瘍が、E3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4ワクシニアウイルスのデリバリー部位に存在する腫瘍細胞を含む、又はデリバリー部位及び対象動物の身体の別の場所の両方に存在する腫瘍細胞を含む、請求項33又は請求項34に記載の方法。
- 組成物が腫瘍内に、静脈内に、又は前記の任意の組合せで対象動物に投与される、請求項33−35のいずれか1項に記載の方法。
- 腫瘍がメラノーマ、結腸癌、乳癌、又は前立腺癌である、請求項33−37のいずれか1項に記載の方法。
- さらに、同時に又は逐次的に1つ以上の免疫チェックポイント遮断剤又は免疫刺激剤を対象動物にデリバリーする工程を含み、当該1つ以上の免疫チェックポイント遮断剤又は免疫刺激剤が、腫瘍内に、静脈内に、又は前記の任意の組合せで対象動物に投与される、請求項33−37のいずれか1項に記載の方法。
- 1つ以上の免疫チェックポイント遮断剤又は免疫刺激剤が、抗PD-1抗体、抗PD-L1抗体、抗PD-L2抗体、抗CTLA-4抗体、イピリムマブ、ニボルマブ、ピジリズマブ、ランブロリズマブ、ペムブロリズマブ、アテゾリズマブ、アベルマブ、デュルバルマブ、MPDL3280A、BMS-936559、MEDI-4736、MSB 00107180、抗GITR抗体、LAG-3、TIM3、B7-H3、B7-H4、TIGIT、AMP-224、MDX-1105、アレルマブ、トレメリムマブ、IMP321、MGA271、BMS-986016、リリルマブ、ウレルマブ、PF-05082566、IPH2101、MEDI-6469、CP-870、893、モガムリズマブ、バルリルマブ、ガリキシマブ、AMP-514、AUNP 12、インドキシモド、NLG-919、INCB024360、CD80、CD86、ICOS、DLBCL阻害剤、BTLA、及び前記の任意の組合せから成る群から選択される、請求項38に記載の方法。
- 組換えE3LΔ83N-TK--抗CTLA-4ウイルス核酸配列であって、配列番号:7に示される対応する野生型ワクシニアゲノムの80,962と81,032位との間の核酸配列が、請求項1、4、5、6、7、8又は9のいずれか1項に記載の異種核酸配列で取り替えられる、前記組換え核酸配列。
- 組換えE3LΔ83N-TK--hFlt3L-抗CTLA-4ワクシニアウイルス核酸配列であって、配列番号:7に示される対応する野生型ワクシニアゲノムの80,962と81,032位との間の核酸配列が、請求項21、24、25、26、27、28又は29のいずれか1項に記載の異種核酸配列で取り替えられる、前記組換え核酸配列。
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