JP2021517131A - 糞便回収方法及び糞便微生物叢を移植するためのサンプル調製方法 - Google Patents
糞便回収方法及び糞便微生物叢を移植するためのサンプル調製方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2021517131A JP2021517131A JP2020546950A JP2020546950A JP2021517131A JP 2021517131 A JP2021517131 A JP 2021517131A JP 2020546950 A JP2020546950 A JP 2020546950A JP 2020546950 A JP2020546950 A JP 2020546950A JP 2021517131 A JP2021517131 A JP 2021517131A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- sample
- inoculum
- mixture
- fecal
- homogeneous mixture
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 96
- 230000002550 fecal effect Effects 0.000 title claims abstract description 73
- 244000005706 microflora Species 0.000 title claims abstract description 63
- 238000005464 sample preparation method Methods 0.000 title 1
- 239000008240 homogeneous mixture Substances 0.000 claims abstract description 55
- 208000027244 Dysbiosis Diseases 0.000 claims abstract description 13
- 230000007140 dysbiosis Effects 0.000 claims abstract description 13
- 239000002054 inoculum Substances 0.000 claims description 136
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 95
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 claims description 69
- 239000000463 material Substances 0.000 claims description 40
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 claims description 37
- 241000736262 Microbiota Species 0.000 claims description 26
- 241000894007 species Species 0.000 claims description 24
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims description 23
- 239000002504 physiological saline solution Substances 0.000 claims description 22
- 206010012735 Diarrhoea Diseases 0.000 claims description 20
- 208000009329 Graft vs Host Disease Diseases 0.000 claims description 19
- 208000024908 graft versus host disease Diseases 0.000 claims description 19
- 241000700605 Viruses Species 0.000 claims description 17
- 239000000047 product Substances 0.000 claims description 17
- 238000003860 storage Methods 0.000 claims description 17
- 244000045947 parasite Species 0.000 claims description 16
- 238000002054 transplantation Methods 0.000 claims description 15
- 239000004067 bulking agent Substances 0.000 claims description 14
- 238000003908 quality control method Methods 0.000 claims description 14
- GNFTZDOKVXKIBK-UHFFFAOYSA-N 3-(2-methoxyethoxy)benzohydrazide Chemical compound COCCOC1=CC=CC(C(=O)NN)=C1 GNFTZDOKVXKIBK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 13
- 241000186000 Bifidobacterium Species 0.000 claims description 12
- 241000193403 Clostridium Species 0.000 claims description 11
- 239000007798 antifreeze agent Substances 0.000 claims description 11
- 244000005709 gut microbiome Species 0.000 claims description 11
- 238000000265 homogenisation Methods 0.000 claims description 11
- 230000000968 intestinal effect Effects 0.000 claims description 11
- 230000000735 allogeneic effect Effects 0.000 claims description 10
- 238000011084 recovery Methods 0.000 claims description 10
- HDTRYLNUVZCQOY-UHFFFAOYSA-N α-D-glucopyranosyl-α-D-glucopyranoside Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OC1C(O)C(O)C(O)C(CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- 229920002774 Maltodextrin Polymers 0.000 claims description 9
- 239000005913 Maltodextrin Substances 0.000 claims description 9
- HDTRYLNUVZCQOY-WSWWMNSNSA-N Trehalose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-WSWWMNSNSA-N 0.000 claims description 9
- HDTRYLNUVZCQOY-LIZSDCNHSA-N alpha,alpha-trehalose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-LIZSDCNHSA-N 0.000 claims description 9
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 claims description 9
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims description 9
- 238000001914 filtration Methods 0.000 claims description 9
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 claims description 9
- 229940035034 maltodextrin Drugs 0.000 claims description 9
- 230000008569 process Effects 0.000 claims description 9
- 208000037384 Clostridium Infections Diseases 0.000 claims description 8
- 208000022559 Inflammatory bowel disease Diseases 0.000 claims description 8
- 208000008589 Obesity Diseases 0.000 claims description 8
- 230000000688 enterotoxigenic effect Effects 0.000 claims description 8
- 241000193163 Clostridioides difficile Species 0.000 claims description 7
- 206010009657 Clostridium difficile colitis Diseases 0.000 claims description 7
- 206010054236 Clostridium difficile infection Diseases 0.000 claims description 7
- 208000004232 Enteritis Diseases 0.000 claims description 7
- 208000018522 Gastrointestinal disease Diseases 0.000 claims description 7
- 108010059993 Vancomycin Proteins 0.000 claims description 7
- 208000002551 irritable bowel syndrome Diseases 0.000 claims description 7
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims description 7
- 238000003756 stirring Methods 0.000 claims description 7
- 239000003053 toxin Substances 0.000 claims description 7
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 claims description 7
- 229960003165 vancomycin Drugs 0.000 claims description 7
- MYPYJXKWCTUITO-UHFFFAOYSA-N vancomycin Natural products O1C(C(=C2)Cl)=CC=C2C(O)C(C(NC(C2=CC(O)=CC(O)=C2C=2C(O)=CC=C3C=2)C(O)=O)=O)NC(=O)C3NC(=O)C2NC(=O)C(CC(N)=O)NC(=O)C(NC(=O)C(CC(C)C)NC)C(O)C(C=C3Cl)=CC=C3OC3=CC2=CC1=C3OC1OC(CO)C(O)C(O)C1OC1CC(C)(N)C(O)C(C)O1 MYPYJXKWCTUITO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- 241001036151 Aichi virus 1 Species 0.000 claims description 6
- 241000589876 Campylobacter Species 0.000 claims description 6
- 241001464948 Coprococcus Species 0.000 claims description 6
- 241000709661 Enterovirus Species 0.000 claims description 6
- 241000186394 Eubacterium Species 0.000 claims description 6
- 108010015899 Glycopeptides Proteins 0.000 claims description 6
- 102000002068 Glycopeptides Human genes 0.000 claims description 6
- 241001263478 Norovirus Species 0.000 claims description 6
- 241000709664 Picornaviridae Species 0.000 claims description 6
- 241001137860 Rotavirus A Species 0.000 claims description 6
- 241000192031 Ruminococcus Species 0.000 claims description 6
- 241000607142 Salmonella Species 0.000 claims description 6
- 241000369757 Sapovirus Species 0.000 claims description 6
- 241000244177 Strongyloides stercoralis Species 0.000 claims description 6
- 241000607598 Vibrio Species 0.000 claims description 6
- 244000309743 astrovirus Species 0.000 claims description 6
- 229940079593 drug Drugs 0.000 claims description 6
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 6
- 206010014881 enterobiasis Diseases 0.000 claims description 6
- 230000000369 enteropathogenic effect Effects 0.000 claims description 6
- 235000020824 obesity Nutrition 0.000 claims description 6
- 239000000758 substrate Substances 0.000 claims description 6
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 claims description 6
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 claims description 6
- 208000030507 AIDS Diseases 0.000 claims description 5
- 241000726107 Blastocystis hominis Species 0.000 claims description 5
- 241000224467 Giardia intestinalis Species 0.000 claims description 5
- 241000186779 Listeria monocytogenes Species 0.000 claims description 5
- 206010040070 Septic Shock Diseases 0.000 claims description 5
- 102000006635 beta-lactamase Human genes 0.000 claims description 5
- 230000001684 chronic effect Effects 0.000 claims description 5
- 150000002016 disaccharides Chemical class 0.000 claims description 5
- 229940085435 giardia lamblia Drugs 0.000 claims description 5
- 230000000642 iatrogenic effect Effects 0.000 claims description 5
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 claims description 5
- 239000011148 porous material Substances 0.000 claims description 5
- 230000036303 septic shock Effects 0.000 claims description 5
- DQJCDTNMLBYVAY-ZXXIYAEKSA-N (2S,5R,10R,13R)-16-{[(2R,3S,4R,5R)-3-{[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy}-5-(ethylamino)-6-hydroxy-2-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy}-5-(4-aminobutyl)-10-carbamoyl-2,13-dimethyl-4,7,12,15-tetraoxo-3,6,11,14-tetraazaheptadecan-1-oic acid Chemical compound NCCCC[C@H](C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)NC(=O)CC[C@H](C(N)=O)NC(=O)[C@@H](C)NC(=O)C(C)O[C@@H]1[C@@H](NCC)C(O)O[C@H](CO)[C@H]1O[C@H]1[C@H](NC(C)=O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 DQJCDTNMLBYVAY-ZXXIYAEKSA-N 0.000 claims description 4
- 208000004998 Abdominal Pain Diseases 0.000 claims description 4
- 208000022309 Alcoholic Liver disease Diseases 0.000 claims description 4
- 241001227086 Anaerostipes Species 0.000 claims description 4
- 206010003805 Autism Diseases 0.000 claims description 4
- 208000020706 Autistic disease Diseases 0.000 claims description 4
- 206010005940 Bone and joint infections Diseases 0.000 claims description 4
- FGUUSXIOTUKUDN-IBGZPJMESA-N C1(=CC=CC=C1)N1C2=C(NC([C@H](C1)NC=1OC(=NN=1)C1=CC=CC=C1)=O)C=CC=C2 Chemical compound C1(=CC=CC=C1)N1C2=C(NC([C@H](C1)NC=1OC(=NN=1)C1=CC=CC=C1)=O)C=CC=C2 FGUUSXIOTUKUDN-IBGZPJMESA-N 0.000 claims description 4
- 208000011231 Crohn disease Diseases 0.000 claims description 4
- 208000004262 Food Hypersensitivity Diseases 0.000 claims description 4
- 208000012671 Gastrointestinal haemorrhages Diseases 0.000 claims description 4
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims description 4
- 208000018737 Parkinson disease Diseases 0.000 claims description 4
- 206010040047 Sepsis Diseases 0.000 claims description 4
- 108010079723 Shiga Toxin Proteins 0.000 claims description 4
- 206010046914 Vaginal infection Diseases 0.000 claims description 4
- 230000001476 alcoholic effect Effects 0.000 claims description 4
- 230000001093 anti-cancer Effects 0.000 claims description 4
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 claims description 4
- 238000002512 chemotherapy Methods 0.000 claims description 4
- 201000003146 cystitis Diseases 0.000 claims description 4
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims description 4
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims description 4
- 235000020932 food allergy Nutrition 0.000 claims description 4
- 208000030304 gastrointestinal bleeding Diseases 0.000 claims description 4
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 claims description 4
- 208000006454 hepatitis Diseases 0.000 claims description 4
- 231100000283 hepatitis Toxicity 0.000 claims description 4
- 238000009169 immunotherapy Methods 0.000 claims description 4
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 claims description 4
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 claims description 4
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 claims description 4
- 229920005862 polyol Polymers 0.000 claims description 4
- 150000003077 polyols Chemical class 0.000 claims description 4
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 claims description 4
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 claims description 4
- 201000000980 schizophrenia Diseases 0.000 claims description 4
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 claims description 4
- 238000012546 transfer Methods 0.000 claims description 4
- 150000004043 trisaccharides Chemical class 0.000 claims description 4
- 208000001072 type 2 diabetes mellitus Diseases 0.000 claims description 4
- 206010000087 Abdominal pain upper Diseases 0.000 claims description 3
- 208000020925 Bipolar disease Diseases 0.000 claims description 3
- 241001202853 Blautia Species 0.000 claims description 3
- 208000015943 Coeliac disease Diseases 0.000 claims description 3
- 206010010774 Constipation Diseases 0.000 claims description 3
- 241000223936 Cryptosporidium parvum Species 0.000 claims description 3
- 206010020751 Hypersensitivity Diseases 0.000 claims description 3
- 206010023126 Jaundice Diseases 0.000 claims description 3
- 206010028116 Mucosal inflammation Diseases 0.000 claims description 3
- 201000010927 Mucositis Diseases 0.000 claims description 3
- 208000031888 Mycoses Diseases 0.000 claims description 3
- 206010028813 Nausea Diseases 0.000 claims description 3
- 206010037660 Pyrexia Diseases 0.000 claims description 3
- 206010047700 Vomiting Diseases 0.000 claims description 3
- 206010016256 fatigue Diseases 0.000 claims description 3
- 235000012054 meals Nutrition 0.000 claims description 3
- 208000030159 metabolic disease Diseases 0.000 claims description 3
- 201000006417 multiple sclerosis Diseases 0.000 claims description 3
- 230000008693 nausea Effects 0.000 claims description 3
- 201000001119 neuropathy Diseases 0.000 claims description 3
- 230000007823 neuropathy Effects 0.000 claims description 3
- 208000033808 peripheral neuropathy Diseases 0.000 claims description 3
- 239000012466 permeate Substances 0.000 claims description 3
- 230000009329 sexual behaviour Effects 0.000 claims description 3
- 230000008673 vomiting Effects 0.000 claims description 3
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 claims description 2
- 241000243190 Microsporidia Species 0.000 claims description 2
- 238000002483 medication Methods 0.000 claims description 2
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 claims description 2
- 108020004256 Beta-lactamase Proteins 0.000 claims 2
- 241000701474 Alistipes Species 0.000 claims 1
- 241000605902 Butyrivibrio Species 0.000 claims 1
- 241000179198 Cyclospora sp. Species 0.000 claims 1
- 241000157306 Dientamoeba fragilis Species 0.000 claims 1
- 241000224432 Entamoeba histolytica Species 0.000 claims 1
- 241001608234 Faecalibacterium Species 0.000 claims 1
- 241000986152 Holdemanella Species 0.000 claims 1
- 241000955225 Isospora sp. Species 0.000 claims 1
- 241000785902 Odoribacter Species 0.000 claims 1
- 241000843248 Oscillibacter Species 0.000 claims 1
- 241000606999 Plesiomonas shigelloides Species 0.000 claims 1
- 241000605947 Roseburia Species 0.000 claims 1
- 241001136694 Subdoligranulum Species 0.000 claims 1
- 241000607284 Vibrio sp. Species 0.000 claims 1
- 241000607447 Yersinia enterocolitica Species 0.000 claims 1
- 229940007078 entamoeba histolytica Drugs 0.000 claims 1
- 244000000013 helminth Species 0.000 claims 1
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 claims 1
- 231100000033 toxigenic Toxicity 0.000 claims 1
- 230000001551 toxigenic effect Effects 0.000 claims 1
- MYPYJXKWCTUITO-LYRMYLQWSA-N vancomycin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1OC1=C2C=C3C=C1OC1=CC=C(C=C1Cl)[C@@H](O)[C@H](C(N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H]3C(=O)N[C@H]1C(=O)N[C@H](C(N[C@@H](C3=CC(O)=CC(O)=C3C=3C(O)=CC=C1C=3)C(O)=O)=O)[C@H](O)C1=CC=C(C(=C1)Cl)O2)=O)NC(=O)[C@@H](CC(C)C)NC)[C@H]1C[C@](C)(N)[C@H](O)[C@H](C)O1 MYPYJXKWCTUITO-LYRMYLQWSA-N 0.000 claims 1
- 229940098232 yersinia enterocolitica Drugs 0.000 claims 1
- 230000035899 viability Effects 0.000 abstract description 34
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 abstract description 29
- 239000002158 endotoxin Substances 0.000 abstract 1
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 95
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 40
- 210000003608 fece Anatomy 0.000 description 36
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 31
- 230000002528 anti-freeze Effects 0.000 description 17
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 14
- FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-M Butyrate Chemical compound CCCC([O-])=O FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 12
- FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-N Butyric acid Natural products CCCC(O)=O FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 12
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 description 9
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 8
- 241000157305 Dientamoeba Species 0.000 description 7
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 7
- 206010009900 Colitis ulcerative Diseases 0.000 description 6
- LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N Ethylene glycol Chemical compound OCCO LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 241000567229 Isospora Species 0.000 description 6
- DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N Propylene glycol Chemical compound CC(O)CO DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 201000006704 Ulcerative Colitis Diseases 0.000 description 6
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 6
- 239000013074 reference sample Substances 0.000 description 6
- 235000002639 sodium chloride Nutrition 0.000 description 6
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 6
- MYPYJXKWCTUITO-LYRMYLQWSA-O vancomycin(1+) Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1OC1=C2C=C3C=C1OC1=CC=C(C=C1Cl)[C@@H](O)[C@H](C(N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H]3C(=O)N[C@H]1C(=O)N[C@H](C(N[C@@H](C3=CC(O)=CC(O)=C3C=3C(O)=CC=C1C=3)C([O-])=O)=O)[C@H](O)C1=CC=C(C(=C1)Cl)O2)=O)NC(=O)[C@@H](CC(C)C)[NH2+]C)[C@H]1C[C@](C)([NH3+])[C@H](O)[C@H](C)O1 MYPYJXKWCTUITO-LYRMYLQWSA-O 0.000 description 6
- 241001156739 Actinobacteria <phylum> Species 0.000 description 5
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 5
- 241000607768 Shigella Species 0.000 description 5
- YZBQHRLRFGPBSL-RXMQYKEDSA-N carbapenem Chemical compound C1C=CN2C(=O)C[C@H]21 YZBQHRLRFGPBSL-RXMQYKEDSA-N 0.000 description 5
- 238000011134 hematopoietic stem cell transplantation Methods 0.000 description 5
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 description 5
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 5
- 238000012423 maintenance Methods 0.000 description 5
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 5
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 5
- 230000002572 peristaltic effect Effects 0.000 description 5
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 5
- 108020004465 16S ribosomal RNA Proteins 0.000 description 4
- 241000224489 Amoeba Species 0.000 description 4
- CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N Ascorbic acid Chemical compound OC[C@H](O)[C@H]1OC(=O)C(O)=C1O CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N 0.000 description 4
- 206010061802 Cyclosporidium infection Diseases 0.000 description 4
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 4
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 4
- 239000003963 antioxidant agent Substances 0.000 description 4
- 235000006708 antioxidants Nutrition 0.000 description 4
- 229940011597 blastocystis hominis Drugs 0.000 description 4
- 201000002641 cyclosporiasis Diseases 0.000 description 4
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 4
- 235000005911 diet Nutrition 0.000 description 4
- 230000037213 diet Effects 0.000 description 4
- 239000012467 final product Substances 0.000 description 4
- 239000000902 placebo Substances 0.000 description 4
- 229940068196 placebo Drugs 0.000 description 4
- 238000011176 pooling Methods 0.000 description 4
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 4
- 208000024827 Alzheimer disease Diseases 0.000 description 3
- 108090000204 Dipeptidase 1 Proteins 0.000 description 3
- 241000605861 Prevotella Species 0.000 description 3
- 238000000692 Student's t-test Methods 0.000 description 3
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 3
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 3
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 3
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 description 3
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 3
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 3
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 3
- 238000012353 t test Methods 0.000 description 3
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 3
- 238000011179 visual inspection Methods 0.000 description 3
- 241000223935 Cryptosporidium Species 0.000 description 2
- 241000179197 Cyclospora Species 0.000 description 2
- FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N D-Glucitol Natural products OC[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N 0.000 description 2
- FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N D-Mannitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 2
- FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N D-glucitol Chemical compound OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N 0.000 description 2
- 241000510209 Girardia Species 0.000 description 2
- KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N Isopropanol Chemical compound CC(C)O KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241001386813 Kraken Species 0.000 description 2
- TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L Magnesium chloride Chemical compound [Mg+2].[Cl-].[Cl-] TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 229930195725 Mannitol Natural products 0.000 description 2
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 2
- 241000192142 Proteobacteria Species 0.000 description 2
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 2
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 2
- 238000001793 Wilcoxon signed-rank test Methods 0.000 description 2
- 208000030961 allergic reaction Diseases 0.000 description 2
- 230000003110 anti-inflammatory effect Effects 0.000 description 2
- 230000003078 antioxidant effect Effects 0.000 description 2
- 239000012298 atmosphere Substances 0.000 description 2
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 2
- 230000008859 change Effects 0.000 description 2
- 238000004737 colorimetric analysis Methods 0.000 description 2
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 2
- 208000012696 congenital leptin deficiency Diseases 0.000 description 2
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 2
- 230000007812 deficiency Effects 0.000 description 2
- 235000013681 dietary sucrose Nutrition 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 2
- 238000007710 freezing Methods 0.000 description 2
- 230000008014 freezing Effects 0.000 description 2
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 2
- 238000012432 intermediate storage Methods 0.000 description 2
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 2
- 239000000594 mannitol Substances 0.000 description 2
- 235000010355 mannitol Nutrition 0.000 description 2
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 2
- 208000001022 morbid obesity Diseases 0.000 description 2
- 239000000825 pharmaceutical preparation Substances 0.000 description 2
- 229940127557 pharmaceutical product Drugs 0.000 description 2
- NROKBHXJSPEDAR-UHFFFAOYSA-M potassium fluoride Chemical compound [F-].[K+] NROKBHXJSPEDAR-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 2
- 238000005070 sampling Methods 0.000 description 2
- 239000002689 soil Substances 0.000 description 2
- 239000000600 sorbitol Substances 0.000 description 2
- 238000007619 statistical method Methods 0.000 description 2
- 210000000130 stem cell Anatomy 0.000 description 2
- 229960004793 sucrose Drugs 0.000 description 2
- 238000010257 thawing Methods 0.000 description 2
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 2
- 229930003799 tocopherol Natural products 0.000 description 2
- 239000011732 tocopherol Substances 0.000 description 2
- QIJRTFXNRTXDIP-UHFFFAOYSA-N (1-carboxy-2-sulfanylethyl)azanium;chloride;hydrate Chemical compound O.Cl.SCC(N)C(O)=O QIJRTFXNRTXDIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AEQDJSLRWYMAQI-UHFFFAOYSA-N 2,3,9,10-tetramethoxy-6,8,13,13a-tetrahydro-5H-isoquinolino[2,1-b]isoquinoline Chemical compound C1CN2CC(C(=C(OC)C=C3)OC)=C3CC2C2=C1C=C(OC)C(OC)=C2 AEQDJSLRWYMAQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M Acetate Chemical compound CC([O-])=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 241000024192 Aloa Species 0.000 description 1
- 208000004881 Amebiasis Diseases 0.000 description 1
- 206010001980 Amoebiasis Diseases 0.000 description 1
- 241000606125 Bacteroides Species 0.000 description 1
- BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-M Bicarbonate Chemical compound OC([O-])=O BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L Calcium chloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].[Ca+2] UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 241001112695 Clostridiales Species 0.000 description 1
- 241001467496 Coriobacterium Species 0.000 description 1
- RGHNJXZEOKUKBD-SQOUGZDYSA-M D-gluconate Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)C([O-])=O RGHNJXZEOKUKBD-SQOUGZDYSA-M 0.000 description 1
- SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N D-mannomethylose Natural products CC1OC(O)C(O)C(O)C1O SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000007400 DNA extraction Methods 0.000 description 1
- 241001609975 Enterococcaceae Species 0.000 description 1
- 241000194033 Enterococcus Species 0.000 description 1
- 229930091371 Fructose Natural products 0.000 description 1
- RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N Fructose Chemical compound OC[C@H]1O[C@](O)(CO)[C@@H](O)[C@@H]1O RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N 0.000 description 1
- 239000005715 Fructose Substances 0.000 description 1
- PNNNRSAQSRJVSB-SLPGGIOYSA-N Fucose Natural products C[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)C=O PNNNRSAQSRJVSB-SLPGGIOYSA-N 0.000 description 1
- 206010017533 Fungal infection Diseases 0.000 description 1
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- 208000002250 Hematologic Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 102000001554 Hemoglobins Human genes 0.000 description 1
- 108010054147 Hemoglobins Proteins 0.000 description 1
- 206010019799 Hepatitis viral Diseases 0.000 description 1
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N L-Cysteine Chemical compound SC[C@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- SHZGCJCMOBCMKK-DHVFOXMCSA-N L-fucopyranose Chemical compound C[C@@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H]1O SHZGCJCMOBCMKK-DHVFOXMCSA-N 0.000 description 1
- 241001112724 Lactobacillales Species 0.000 description 1
- 241000186781 Listeria Species 0.000 description 1
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 1
- 208000034189 Sclerosis Diseases 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 244000061456 Solanum tuberosum Species 0.000 description 1
- 235000002595 Solanum tuberosum Nutrition 0.000 description 1
- 229920002472 Starch Polymers 0.000 description 1
- 241000244174 Strongyloides Species 0.000 description 1
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 241000209140 Triticum Species 0.000 description 1
- 235000021307 Triticum Nutrition 0.000 description 1
- 206010052428 Wound Diseases 0.000 description 1
- 208000027418 Wounds and injury Diseases 0.000 description 1
- 240000008042 Zea mays Species 0.000 description 1
- 235000005824 Zea mays ssp. parviglumis Nutrition 0.000 description 1
- 235000002017 Zea mays subsp mays Nutrition 0.000 description 1
- KBGAYAKRZNYFFG-BOHATCBPSA-N aceneuramic acid Chemical compound OC(=O)C(=O)C[C@H](O)[C@@H](NC(=O)C)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO KBGAYAKRZNYFFG-BOHATCBPSA-N 0.000 description 1
- 229940022663 acetate Drugs 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- 239000013543 active substance Substances 0.000 description 1
- 208000024340 acute graft versus host disease Diseases 0.000 description 1
- 238000011316 allogeneic transplantation Methods 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N alpha-D-galactose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 235000010323 ascorbic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000011668 ascorbic acid Substances 0.000 description 1
- 229960005070 ascorbic acid Drugs 0.000 description 1
- 230000007147 bacterial dysbiosis Effects 0.000 description 1
- 244000052616 bacterial pathogen Species 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 1
- 238000003766 bioinformatics method Methods 0.000 description 1
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 1
- 239000001110 calcium chloride Substances 0.000 description 1
- 229910001628 calcium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011148 calcium chloride Nutrition 0.000 description 1
- 159000000007 calcium salts Chemical class 0.000 description 1
- 238000002619 cancer immunotherapy Methods 0.000 description 1
- 235000013339 cereals Nutrition 0.000 description 1
- 230000001276 controlling effect Effects 0.000 description 1
- 235000005822 corn Nutrition 0.000 description 1
- 229960002433 cysteine Drugs 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 1
- 229960001305 cysteine hydrochloride Drugs 0.000 description 1
- 238000011393 cytotoxic chemotherapy Methods 0.000 description 1
- GVJHHUAWPYXKBD-UHFFFAOYSA-N d-alpha-tocopherol Natural products OC1=C(C)C(C)=C2OC(CCCC(C)CCCC(C)CCCC(C)C)(C)CCC2=C1C GVJHHUAWPYXKBD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000014670 detection of bacterium Effects 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 1
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 1
- 238000007905 drug manufacturing Methods 0.000 description 1
- 235000013399 edible fruits Nutrition 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 230000007717 exclusion Effects 0.000 description 1
- 230000002349 favourable effect Effects 0.000 description 1
- 229960002089 ferrous chloride Drugs 0.000 description 1
- 239000000835 fiber Substances 0.000 description 1
- 238000011049 filling Methods 0.000 description 1
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 1
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 1
- 208000024386 fungal infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 229930182830 galactose Natural products 0.000 description 1
- 239000007789 gas Substances 0.000 description 1
- 230000002496 gastric effect Effects 0.000 description 1
- 210000005095 gastrointestinal system Anatomy 0.000 description 1
- 210000001035 gastrointestinal tract Anatomy 0.000 description 1
- 108060003196 globin Proteins 0.000 description 1
- 102000018146 globin Human genes 0.000 description 1
- 229940050410 gluconate Drugs 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 230000005484 gravity Effects 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 230000009033 hematopoietic malignancy Effects 0.000 description 1
- 210000003958 hematopoietic stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 208000018706 hematopoietic system disease Diseases 0.000 description 1
- 230000013632 homeostatic process Effects 0.000 description 1
- 150000003840 hydrochlorides Chemical class 0.000 description 1
- 229960003444 immunosuppressant agent Drugs 0.000 description 1
- 239000003018 immunosuppressive agent Substances 0.000 description 1
- 230000002757 inflammatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 1
- 210000000936 intestine Anatomy 0.000 description 1
- NMCUIPGRVMDVDB-UHFFFAOYSA-L iron dichloride Chemical compound Cl[Fe]Cl NMCUIPGRVMDVDB-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 210000002429 large intestine Anatomy 0.000 description 1
- 229910001629 magnesium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011147 magnesium chloride Nutrition 0.000 description 1
- 159000000003 magnesium salts Chemical class 0.000 description 1
- 235000013372 meat Nutrition 0.000 description 1
- 210000004877 mucosa Anatomy 0.000 description 1
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 1
- 230000003472 neutralizing effect Effects 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 description 1
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 1
- XAEFZNCEHLXOMS-UHFFFAOYSA-M potassium benzoate Chemical compound [K+].[O-]C(=O)C1=CC=CC=C1 XAEFZNCEHLXOMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 239000011698 potassium fluoride Substances 0.000 description 1
- 235000003270 potassium fluoride Nutrition 0.000 description 1
- 235000012015 potatoes Nutrition 0.000 description 1
- XJMOSONTPMZWPB-UHFFFAOYSA-M propidium iodide Chemical compound [I-].[I-].C12=CC(N)=CC=C2C2=CC=C(N)C=C2[N+](CCC[N+](C)(CC)CC)=C1C1=CC=CC=C1 XJMOSONTPMZWPB-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 230000008707 rearrangement Effects 0.000 description 1
- 238000007430 reference method Methods 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- 238000013207 serial dilution Methods 0.000 description 1
- 210000000813 small intestine Anatomy 0.000 description 1
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 description 1
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 239000000176 sodium gluconate Substances 0.000 description 1
- 235000012207 sodium gluconate Nutrition 0.000 description 1
- 229940005574 sodium gluconate Drugs 0.000 description 1
- 159000000000 sodium salts Chemical class 0.000 description 1
- 230000007480 spreading Effects 0.000 description 1
- 238000003892 spreading Methods 0.000 description 1
- 230000006641 stabilisation Effects 0.000 description 1
- 238000011105 stabilization Methods 0.000 description 1
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 1
- 239000008107 starch Substances 0.000 description 1
- 235000019698 starch Nutrition 0.000 description 1
- 238000000528 statistical test Methods 0.000 description 1
- 210000002784 stomach Anatomy 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- 230000031068 symbiosis, encompassing mutualism through parasitism Effects 0.000 description 1
- 235000010384 tocopherol Nutrition 0.000 description 1
- 229960001295 tocopherol Drugs 0.000 description 1
- 235000019149 tocopherols Nutrition 0.000 description 1
- 239000013638 trimer Substances 0.000 description 1
- 241001148471 unidentified anaerobic bacterium Species 0.000 description 1
- 210000004291 uterus Anatomy 0.000 description 1
- 235000013311 vegetables Nutrition 0.000 description 1
- 201000001862 viral hepatitis Diseases 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000003442 weekly effect Effects 0.000 description 1
- 239000002023 wood Substances 0.000 description 1
- GVJHHUAWPYXKBD-IEOSBIPESA-N α-tocopherol Chemical compound OC1=C(C)C(C)=C2O[C@@](CCC[C@H](C)CCC[C@H](C)CCCC(C)C)(C)CCC2=C1C GVJHHUAWPYXKBD-IEOSBIPESA-N 0.000 description 1
- QUEDXNHFTDJVIY-UHFFFAOYSA-N γ-tocopherol Chemical class OC1=C(C)C(C)=C2OC(CCCC(C)CCCC(C)CCCC(C)C)(C)CCC2=C1 QUEDXNHFTDJVIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K35/00—Medicinal preparations containing materials or reaction products thereof with undetermined constitution
- A61K35/12—Materials from mammals; Compositions comprising non-specified tissues or cells; Compositions comprising non-embryonic stem cells; Genetically modified cells
- A61K35/37—Digestive system
- A61K35/38—Stomach; Intestine; Goblet cells; Oral mucosa; Saliva
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K35/00—Medicinal preparations containing materials or reaction products thereof with undetermined constitution
- A61K35/66—Microorganisms or materials therefrom
- A61K35/74—Bacteria
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
- A01N—PRESERVATION OF BODIES OF HUMANS OR ANIMALS OR PLANTS OR PARTS THEREOF; BIOCIDES, e.g. AS DISINFECTANTS, AS PESTICIDES OR AS HERBICIDES; PEST REPELLANTS OR ATTRACTANTS; PLANT GROWTH REGULATORS
- A01N1/00—Preservation of bodies of humans or animals, or parts thereof
- A01N1/02—Preservation of living parts
- A01N1/0205—Chemical aspects
- A01N1/021—Preservation or perfusion media, liquids, solids or gases used in the preservation of cells, tissue, organs or bodily fluids
- A01N1/0221—Freeze-process protecting agents, i.e. substances protecting cells from effects of the physical process, e.g. cryoprotectants, osmolarity regulators like oncotic agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P1/00—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P1/00—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
- A61P1/12—Antidiarrhoeals
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
- A61P37/02—Immunomodulators
- A61P37/06—Immunosuppressants, e.g. drugs for graft rejection
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/04—Preserving or maintaining viable microorganisms
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
- C12Q1/689—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for bacteria
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
- C12Q1/6893—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for protozoa
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K35/00—Medicinal preparations containing materials or reaction products thereof with undetermined constitution
- A61K2035/11—Medicinal preparations comprising living procariotic cells
- A61K2035/115—Probiotics
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
- Y02A50/00—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
- Y02A50/30—Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Immunology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Virology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Mycology (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Environmental Sciences (AREA)
- Transplantation (AREA)
- Dentistry (AREA)
- Nutrition Science (AREA)
- Physiology (AREA)
- Developmental Biology & Embryology (AREA)
Abstract
Description
a.そのあらかじめ選択したドナーから糞便微生物叢の少なくとも1つのサンプルを採取する工程と、
b.そのサンプルを採取してから5分以内の期間に、a)で得られたサンプルを、酸素が透過しない回収装置の中に入れる工程と、
c.採取したサンプルの品質を管理し、品質基準に合致しないサンプルを除外する工程と、
d.c)の品質管理工程の後に残ったサンプルのそれぞれに、少なくとも1つの凍結防止剤および/または増量剤を含む生理食塩水性溶液を添加する工程と、
e.工程d)の終了時に得られたサンプルを濾過して一連の接種材料を形成する工程と、
f.それら接種材料を1つにまとめて接種材料の混合物を形成する工程と、
g.工程f)で得られた混合物を、特に手で撹拌することによって、または撹拌装置を用いることによって均一化する工程を含んでいて、
工程b)とd)は嫌気下で実施する。
i.年齢が18歳〜60歳であること、
ii.ボディマス指数(BMI)が18〜30であること、
iii.重い感染性疾患(エイズ、肝炎など)、代謝障害、神経障害、鬱の個人的病歴がないこと、
iv.腸微生物叢の組成を劣化させることのできる薬を最近摂取していないこと、
v.胃腸疾患に関係する症状、例えば発熱、下痢、嘔吐、吐き気、胃痛、黄疸が最近発生しておらず;重い感染性疾患、特にエイズ、肝炎などの病歴がないこと、
vi.熱帯諸国を最近旅行していないこと、
vii.リスクがある性的行動をしていないこと、
viii.最近(典型的には過去3ヶ月以内)の傷、および/またはピアス、および/または入れ墨がないこと、
ix.慢性疲労が最近(典型的には過去3ヶ月以内)はないこと、
x.アレルギー性反応が最近(典型的には過去3ヶ月以内)はないこと
xi.場合によっては多彩な食事をしていること
に従ってなされる。
- サンプルのコンシステンシーがブリストルスケールで1〜6であること、
- サンプル中に血液または尿が存在していないこと
を含んでいる。
- 以下の微生物が存在していないこと、すなわちカンピロバクター、クロストリジウム・ディフィシル(A/B毒素)、サルモネラ属の種、エルシニア・エンテロコリティカ、ビブリオ属の種、志賀毒素を産生する大腸菌(STEC)stx1/stx2、多剤耐性菌(基質特異性拡張型β-ラクタマーゼ(ESBL)産生菌、糖ペプチド/バンコマイシン耐性腸球菌(GRE/VRE))、リステリア・モノサイトゲネス、カルバペネム耐性菌が存在していないこと、
- 以下の寄生虫が存在していないこと、すなわちクリプトスポリジウム・パルバム、サイクロスポラ属の種、赤痢アメーバ、ランブル鞭毛虫、ブラストシスチス・ホミニス、蠕虫類、ストロンギロイデス・ステルコラリス、イソスポーラ属の種、微胞子虫類、二核アメーバが存在していないこと、
- 以下のウイルスが存在していないこと、すなわちアデノウイルスF40/41、アストロウイルス、ノロウイルス、ロタウイルスA、サポウイルス、ピコルナウイルス(アイチウイルスとエンテロウイルス)が存在していないこと、
- 以下の細菌が存在していないこと、すなわち腸管凝集性大腸菌(EAEC)、腸管病原性大腸菌(EPEC)、腸管毒素原性大腸菌(ETEC)It/st、赤痢菌/腸管組織侵襲性大腸菌(EIEC)、プレジオモナス・シゲロイデスが存在していないこと、
を含んでいる。
h.工程g)で得られた均一化された混合物を
i.約-50℃〜-80℃、好ましくは-80℃の温度で保管することを目的として、または約16時間以内に混合物を利用するために約2〜6℃の温度で保管することを目的として、または約4時間以内に混合物を利用するために10〜25℃の温度で保管することを目的として、パウチに移動させるか、
ii.凍結乾燥のため凍結乾燥装置に移動させる工程を含んでいる。
i.年齢が18歳〜60歳であること、
ii.ボディマス指数(BMI)が18〜30であること、
iii.重い感染性疾患(エイズ、ウイルス性肝炎など)、代謝障害、神経障害、鬱の個人的病歴がないこと、
iv.腸微生物叢の組成を劣化させることのできる薬(抗生剤など)を最近(供与する前のほぼ3ヶ月間)摂取していないこと、
v.胃腸疾患に関係する症状、例えば発熱、下痢、嘔吐、吐き気、胃痛、黄疸が最近(供与する前のほぼ3ヶ月間)発生しておらず;重い感染性疾患、特にエイズ、肝炎などの病歴がないこと、
vi.熱帯諸国を最近(供与する前のほぼ3ヶ月間)旅行していないこと、
vii.リスクがある性的行動をしていないこと、
viii.最近(供与する前のほぼ3ヶ月間)、例えば傷、および/またはピアス、および/または入れ墨を通じたヒト血液との接触がないこと、
ix.慢性疲労が最近(供与する前のほぼ3ヶ月間)はないこと、
x.アレルギー性反応が最近(供与する前のほぼ3ヶ月間)はないこと
xi.場合によっては多彩な食事をしていること。
- ドナー対象からの糞便微生物叢のサンプルを受け入れるのに適した内部空間を有する本体と、本体の内部空間にアクセスする開口部を規定する首部を含む容器と、
- 首部のアクセス用開口部を閉じるとともに本体の内部空間を閉じるよう、容器の首部に気密かつ取り外し可能に取り付けるのに適した蓋を含んでいて、
容器の本体は可撓性パウチで構成され、容器と蓋の少なくとも一方に、容器の本体の内部空間に含まれるガスの少なくとも一部を排気するのに適した排気設備が取り付けられているタイプの形態であることが好ましい。
- ドナー対象からの糞便微生物叢のサンプルを受け入れるのに適した内部空間を有する本体と、本体の内部空間にアクセスする開口部を規定する首部を含む容器と、
- 首部のアクセス用開口部を閉じるとともに本体の内部空間を閉じるよう、容器の首部に気密かつ取り外し可能に取り付けるのに適した蓋を含んでいて、
- 容器の本体の内部空間に場合によっては化学装置中和用酸素が含まれるタイプの形態である。
- 目視によってサンプルのコンシステンシーがブリストルスケールで1〜6であること、
- サンプル中に血液または尿が存在していないこと
を含んでいる。
- 以下の微生物が存在していないこと、すなわちカンピロバクター、クロストリジウム・ディフィシル(A/B毒素)、サルモネラ属の種、エルシニア・エンテロコリティカ、ビブリオ属の種、シガ毒素を産生する大腸菌(STEC)stx1/stx2、多剤耐性菌(基質特異性拡張型β-ラクタマーゼ(ESBL)産生菌、糖ペプチド/バンコマイシン耐性腸球菌(GRE/VRE))、リステリア・モノサイトゲネス、カルバペネム耐性菌が存在していないこと、
- 以下の寄生虫が存在していないこと、すなわちクリプトスポリジウム・パルバム、サイクロスポラ属の種、赤痢アメーバ、ランブル鞭毛虫、ブラストシスチス・ホミニス、蠕虫類、ストロンギロイデス・ステルコラリス、イソスポーラ属の種、微胞子虫類、二核アメーバが存在していないこと、
- 以下のウイルスが存在していないこと、すなわちアデノウイルスF40/41、アストロウイルス、ノロウイルス、ロタウイルスA、サポウイルス、ピコルナウイルス(アイチウイルスとエンテロウイルス)が存在していないこと、
- 以下の細菌が存在していないこと、すなわち腸管凝集性大腸菌(EAEC)、腸管病原性大腸菌(EPEC)、腸管毒素原性大腸菌(ETEC)It/st、赤痢菌/腸管組織侵襲性大腸菌(EIEC)、プレジオモナス・シゲロイデスが存在していないこと
も含めることができる。
外観:均一な黄色/茶色の懸濁液。
生存率:20%超、凍結乾燥のためには40%超が好ましい。
(細菌)イベントの数:109細菌/mlよりも多い。
細菌の多様性:逆シンプソン指数が4以上。接種材料の混合物のシンプソン指数は、10以上、好ましくは15超、より好ましくは20超であることが好ましい。
- この混合物を16時間後以降に使用するために約-50℃〜-80℃、好ましくは約-80℃で保管することを目的として、または
- 約16時間以内に使用するために2〜6℃で保管することを目的として、または
- この混合物を次の4時間以内に使用するために10〜25℃で保管することを目的として、
パウチに移される。周囲温度の状態で4時間を超えると、細菌の数が増加し、接種材料の均一性が低下する可能性がある。
- 逆シンプソン指数がはるかに大きいことによって示されるように多様性の維持状態が改善されており、
- 興味あるいくつかの分類群(アクチノバクテリア門などであり、その中には周知のビフィドバクテリウム属が含まれる)の維持状態が有意により大きくなっており、
- サンプル間の均一性のレベルが、Paramsothyらの方法に従って製造されたサンプルのセットで得られた均一性のレベルよりも高い
ことを実証することができる。
- 対照条件:調整後、接種材料をただちに-80℃で保管する、
- 周囲温度で保持する状態:調製後、接種材料を周囲温度で16時間維持し、サンプリングを実施して微生物叢の生存率、微生物叢のイベント/μl、pHとPO2を測定した後、接種材料を-80℃で保管する、
- 4℃で保管する状態:調製後、接種材料を4℃で16時間保管し、サンプリングを実施して微生物叢の生存率、微生物叢のイベント/μl、pHとPO2を測定した後、接種材料を-80℃で保管する。
- 実施例2に記載されている方法と、
- Paramsothyらによる先行技術の方法[Paramsothy S.他(2017年)、「活動性潰瘍性大腸炎のための複数ドナー集中的微生物叢移植:無作為化プラセボ対照試験」、Lancet、3月25日;第389巻(10075):1218〜1228ページ]
を比較することである。図5に、利用したこれら2つの方法が示されている。
- 以下の微生物が存在していないこと、すなわちカンピロバクター、クロストリジウム・ディフィシル(A/B毒素)、サルモネラ属の種、エルシニア・エンテロコリティカ、ビブリオ属の種、志賀毒素を産生する大腸菌(STEC)stx1/stx2、多剤耐性菌、基質特異性拡張型β-ラクタマーゼ(ESBL)産生菌 - 糖ペプチド/バンコマイシン耐性腸球菌(GRE/VRE)、リステリア・モノサイトゲネス、およびカルバペネム耐性菌が存在していないこと、
- 以下の寄生虫が存在していないこと、すなわちクリプトスポリジウム・パルバム、サイクロスポラ属の種、赤痢アメーバ、ランブル鞭毛虫、ブラストシスチス・ホミニス、蠕虫類、ストロンギロイデス・ステルコラリス、イソスポーラ属の種、微胞子虫類、および二核アメーバが存在していないこと、
- 以下のウイルスが存在していないこと、すなわちアデノウイルスF40/41、アストロウイルス、ノロウイルス、ロタウイルスA、サポウイルス、およびピコルナウイルス(アイチウイルスとエンテロウイルス)が存在していないこと、
- 以下の細菌が存在していないこと、すなわち腸管凝集性大腸菌(EAEC)、腸管病原性大腸菌(EPEC)、腸管毒素原性大腸菌(ETEC)It/st、赤痢菌/腸管組織侵襲性大腸菌(EIEC)、およびプレジオモナス・シゲロイデスが存在していないこと、
を含んでいる。
- 以下の微生物が存在していないこと、すなわちカンピロバクター、クロストリジウム・ディフィシル(A/B毒素)、サルモネラ属の種、エルシニア・エンテロコリティカ、ビブリオ属の種、シガ毒素を産生する大腸菌(STEC)stx1/stx2、多剤耐性菌、基質特異性拡張型β-ラクタマーゼ(ESBL)産生菌 - 糖ペプチド/バンコマイシン耐性腸球菌(GRE/VRE)、リステリア・モノサイトゲネス、およびカルバペネム耐性菌が存在していないこと、
- 以下の寄生虫が存在していないこと、すなわちクリプトスポリジウム・パルバム、サイクロスポラ属の種、赤痢アメーバ、ランブル鞭毛虫、ブラストシスチス・ホミニス、蠕虫類、ストロンギロイデス・ステルコラリス、イソスポーラ属の種、微胞子虫類、および二核アメーバが存在していないこと、
- 以下のウイルスが存在していないこと、すなわちアデノウイルスF40/41、アストロウイルス、ノロウイルス、ロタウイルスA、サポウイルス、およびピコルナウイルス(アイチウイルスとエンテロウイルス)が存在していないこと、
- 以下の細菌が存在していないこと、すなわち腸管凝集性大腸菌(EAEC)、腸管病原性大腸菌(EPEC)、腸管毒素原性大腸菌(ETEC)It/st、赤痢菌/腸管組織侵襲性大腸菌(EIEC)、およびプレジオモナス・シゲロイデスが存在していないこと
も含めることができる。
外観:均一な黄色/茶色の懸濁液。
生存率:20%超、凍結乾燥のためには40%超が好ましい。
(細菌)イベントの数:109細菌/mlよりも多い。
細菌の多様性:逆シンプソン指数が4以上。接種材料の混合物の逆シンプソン指数は、10以上、好ましくは15超、より好ましくは20超であることが好ましい。
Claims (18)
- あらかじめ選択した少なくとも2人のドナーに由来する糞便微生物叢の均一な混合物を調製する方法であって、
a.そのあらかじめ選択したドナーから糞便微生物叢の少なくとも1つのサンプルを採取する工程と、
b.そのサンプルを採取してから5分以内の期間に、a)で得られたサンプルを、酸素が透過しない回収装置の中に入れる工程と、
c.採取したサンプルの品質を管理し、品質基準に合致しないサンプルを除外する工程と、
d.c)の品質管理工程の後に残ったサンプルのそれぞれに、少なくとも1つの凍結防止剤および/または増量剤を含む生理食塩水性溶液を添加する工程と、
e.工程d)の終了時に得られたサンプルを濾過して一連の接種材料を形成する工程と、
f.それら接種材料を1つにまとめて接種材料の混合物を形成する工程と、
g.工程f)で得られた混合物を、特に手で撹拌することによって、または撹拌装置を用いることによって均一化する工程を含んでいて、
工程b)とd)を嫌気下で実施する方法。 - 糞便微生物叢の前記均一な混合物が少なくとも4人のドナーに由来することを特徴とする、請求項1に記載の方法。
- 前記ドナーをあらかじめ選択する操作が、以下の事前選択基準、すなわち
i.年齢が18歳〜60歳であること、
ii.ボディマス指数(BMI)が18〜30であること、
iii.重い感染性疾患、代謝障害、神経障害、鬱の個人的病歴がないこと、
iv.腸微生物叢の組成を劣化させることのできる薬を最近摂取していないこと、
v.胃腸疾患に関係する症状、例えば発熱、下痢、嘔吐、吐き気、胃痛、黄疸が最近発生しておらず;重い感染性疾患、特にエイズ、肝炎などの病歴がないこと、
vi.熱帯諸国を最近旅行していないこと、
vii.リスクがある性的行動をしていないこと、
viii.最近の傷、および/またはピアス、および/または入れ墨がないこと、
ix.慢性疲労が最近はないこと、
x.アレルギー性反応が最近はないこと
xi.場合によっては多彩な食事をしていること
に従ってなされることを特徴とする、請求項1または2に記載の方法。 - 工程c)のサンプルの品質基準が、
- サンプルのコンシステンシーがブリストルスケールで1〜6であること、
- サンプル中に血液または尿が存在していないこと
を含むことを特徴とする、請求項1、2または3に記載の方法。 - 工程c)のサンプルの品質基準が、
- 以下の微生物が存在していないこと、すなわちカンピロバクター(Campylobacter)、クロストリジウム・ディフィシル(A/B毒素)(Clostridium difficile (A/B toxin))、サルモネラ属の種(Salmonella)、エルシニア・エンテロコリティカ(Yersinia enterocolitica)、ビブリオ属の種(Vibrio sp.)、シガ毒素を産生する大腸菌(STEC)stx1/stx2(Shiga toxin-producing E.coli (STEC) stx1/stx2)、多剤耐性菌(multi-resistant bacteria)、基質特異性拡張型β-ラクタマーゼ(ESBL)産生菌(extended-spectrum beta-lactamases (ESBL))、糖ペプチド/バンコマイシン耐性腸球菌(GRE/VRE)(glycopeptide/vancomycin resistant Enterococci (GRE/VRE))、リステリア・モノサイトゲネス(Listeria monocytogenes)、カルバペネム耐性菌(carbapenemases-resistant bacteria)が存在していないこと、
- 以下の寄生虫が存在していないこと、すなわちクリプトスポリジウム・パルバム(Cryptosporidium parvum)、サイクロスポラ属の種(Cyclospora sp.)、赤痢アメーバ(Entamoeba histolytica)、ランブル鞭毛虫(Giardia lamblia)、ブラストシスチス・ホミニス(Blastocystis hominis)、蠕虫類(Helminths)、ストロンギロイデス・ステルコラリス(Strongyloides stercoralis)、イソスポーラ属の種(Isospora sp.)、微胞子虫類(Microsporidia)および二核アメーバ(Dientamoeba fragilis)が存在していないこと、
- 以下のウイルスが存在していないこと、すなわちアデノウイルスF40/41(adenovirus F40/41)、アストロウイルス(astrovirus)、ノロウイルス(norovirus)、ロタウイルスA(rotavirus A)、サポウイルス(sapovirus)、ピコルナウイルス(picornavirus)(アイチウイルスとエンテロウイルス(aichi virus およびenterovirus))が存在していないこと、
- 以下の細菌が存在していないこと、すなわち腸管凝集性大腸菌(EAEC)(enteroaggregative E.coli (EAEC))、腸管病原性大腸菌(EPEC)(enteropathogenic E.coli (EPEC))、腸管毒素原性大腸菌(ETEC)It/st(enterotoxigenic E.coli (ETEC) It/st)、赤痢菌/腸管組織侵襲性大腸菌(EIEC)(Shigella/enteroinvasive E.coli (EIEC))、プレジオモナス・シゲロイデス(Plesiomonas shigelloides)が存在していないこと、
を含むことを特徴とする、請求項4に記載の方法。 - 前記少なくとも1つの凍結防止剤および/または増量剤が、ポリオール、二糖、三糖、多糖のいずれか、またはこれらの混合物と、増量剤であることを特徴とする、請求項1〜5のいずれか1項に記載の方法。
- 前記生理食塩水性溶液がマルトデキストリンとトレハロースを含むことを特徴とする、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 工程e)の濾過を、直径が0.5 mm以下、好ましくは265μm以下の孔を含むフィルタを用いて実施することを特徴とする、請求項1〜7のいずれか1項に記載の方法。
- サンプル回収から工程g)終了までの時間が76時間未満であることを特徴とする、請求項1〜8のいずれか1項に記載の方法。
- 均一化の工程g)を、2℃〜25℃、好ましくは2〜6℃、より好ましくは約4℃の温度で実施することを特徴とする、請求項1〜9のいずれか1項に記載の方法。
- 以下の移動工程、すなわち
h.工程g)で得られた均一化された混合物を
i.約-50℃〜-80℃、好ましくは-80℃の温度で保管することを目的として、または約16時間以内に前記混合物を利用するために約2〜6℃の温度で保管することを目的として、または約4時間以内に前記混合物を利用するために10〜25℃の温度で保管することを目的として、接種材料パウチに移動させるか、
ii.凍結乾燥のため凍結乾燥装置に移動させる工程を含むことを特徴とする、請求項1〜10のいずれか1項に記載の方法。 - 糞便微生物叢の前記均一な混合物が、15種類の属の細菌、すなわちブラウティア属(Blautia)、フィーカリバクテリウム属(Faecalibacterium)、アリスティペス属(Alistipes)、ユーバクテリウム属(Eubacterium)、ビフィドバクテリウム属(Bifidobacterium)、ルミノコッカス属(Ruminococcus)、クロストリジウム属(Clostridium)、コプロコッカス属(Coprococcus)、オドリバクター属(Odoribacter)、ロゼブリア属(Roseburia)、ホルデマネラ属(Holdemanella)、アナエロスティペス属(Anaerostipes)、オシリバクター属(Oscillibacter)、サブドリグラヌラム属(Subdoligranulum)およびブチリビブリオ属(Butyrivibrio)を含むことを特徴とする、請求項2〜11のいずれか1項に記載の方法。
- 同種異系糞便微生物叢の移植で使用するための、請求項1〜12のいずれか1項に記載の方法に従って得ることのできる糞便微生物叢の均一な混合物。
- シンプソン指数が15超、好ましくは20超であることを特徴とする、請求項1〜12のいずれか1項に記載の方法に従って得ることのできる糞便微生物叢の均一な混合物。
- 腸内毒素症の治療で使用するための、請求項13または14に記載の糞便微生物叢の均一な混合物。
- 移植片対宿主病(GvHD)の治療で使用するための、請求項13または14に記載の糞便微生物叢の均一な混合物。
- 医原性腸内毒素症、および/またはそれに関係していて、敗血症、敗血症性ショック、胃腸障害(腸炎、下痢、粘膜炎、腹痛、胃腸出血が含まれる)を含む病状と合併症の治療で使用するための、請求項13または14に記載の糞便微生物叢の均一な混合物。
- クロストリジウム・ディフィシル感染症(CDI)とそれに関連する下痢症、炎症性腸疾患(IBD)、過敏性腸症候群(IBS)、特発性便秘、セリアック病、クローン病、肥満と病的肥満、自閉症、多発性硬化症、旅行者下痢症、慢性膣感染症(膀胱炎と真菌症を含む)、骨と関節の感染症、パーキンソン病、II型糖尿病、食物アレルギー、がん、抵抗性白血病、アルツハイマー病、統合失調症と双極性障害、抗がん化学療法または免疫療法に伴う腸内毒素症、アルコール性と非アルコール性の肝疾患の治療で使用するための、請求項13または14に記載の糞便微生物叢の均一な混合物。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
FR1852084A FR3078627B1 (fr) | 2018-03-09 | 2018-03-09 | Procedure de collecte de selles et procede de preparation d'un echantillon pour transplantation de microbiote fecal |
FR1852084 | 2018-03-09 | ||
PCT/FR2019/050522 WO2019171012A1 (fr) | 2018-03-09 | 2019-03-08 | Procédure de collecte de selles et procédé de préparation d'un échantillon pour transplantation de microbiote fécal |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2021517131A true JP2021517131A (ja) | 2021-07-15 |
JP7330998B2 JP7330998B2 (ja) | 2023-08-22 |
Family
ID=62143384
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2020546950A Active JP7330998B2 (ja) | 2018-03-09 | 2019-03-08 | 糞便回収方法及び糞便微生物叢を移植するためのサンプル調製方法 |
Country Status (10)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US11389488B2 (ja) |
EP (1) | EP3762001A1 (ja) |
JP (1) | JP7330998B2 (ja) |
KR (1) | KR102524970B1 (ja) |
CN (1) | CN111836631A (ja) |
AU (1) | AU2019229721B2 (ja) |
CA (1) | CA3091626C (ja) |
FR (1) | FR3078627B1 (ja) |
IL (1) | IL276969B2 (ja) |
WO (1) | WO2019171012A1 (ja) |
Families Citing this family (8)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP6796868B2 (ja) * | 2018-03-15 | 2020-12-09 | 株式会社メタジェン | 糞便の保存方法 |
EP3895716A1 (en) | 2020-04-17 | 2021-10-20 | Maat Pharma | Fmt performance prediction test to guide and optimize therapeutic management of gvhd patients |
NL2025863B1 (en) | 2020-06-19 | 2022-02-17 | Acad Medisch Ct | Fecal matter for treatment of cachexia |
CN111888381A (zh) * | 2020-09-18 | 2020-11-06 | 广西细微生物科技有限责任公司 | 一种肠道微生物移植工艺 |
US20240115623A1 (en) | 2020-12-23 | 2024-04-11 | Maat Pharma | Method of expanding a complex community of microorganisms |
EP4086337A1 (en) | 2021-05-06 | 2022-11-09 | Maat Pharma | Method of predicting and then producing a mix of microbiota samples |
CN115404167A (zh) * | 2022-09-21 | 2022-11-29 | 上海承葛医药科技有限公司 | 一种适用于人体肠道菌群的冻存保护液 |
EP4369344A1 (en) | 2022-11-08 | 2024-05-15 | Maat Pharma | Determination of microbiota samples to produce a target mix product and prediction of mixes |
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2016170285A1 (fr) * | 2015-04-24 | 2016-10-27 | Maat Pharma | Procédé de préparation d'un échantillon de microbiote fécal |
WO2018026913A1 (en) * | 2016-08-03 | 2018-02-08 | Crestovo Llc | Methods for treating ulcerative colitis |
Family Cites Families (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CA2914636C (en) | 2013-06-05 | 2021-04-06 | Rebiotix, Inc. | Microbiota restoration therapy (mrt), compositions and methods of manufacture |
JP6777643B2 (ja) * | 2014-11-25 | 2020-10-28 | メモリアル スローン ケタリング キャンサー センター | 腸内微生物叢及びgvhd |
FR3035317B1 (fr) * | 2015-04-24 | 2019-06-14 | Maat Pharma | Dispositif de prelevement de micro-organismes, kit de prelevement comprenant un tel dispositif et procede de prelevement mettant en œuvre un tel dispositif |
-
2018
- 2018-03-09 FR FR1852084A patent/FR3078627B1/fr active Active
-
2019
- 2019-03-08 US US16/979,077 patent/US11389488B2/en active Active
- 2019-03-08 WO PCT/FR2019/050522 patent/WO2019171012A1/fr active Application Filing
- 2019-03-08 AU AU2019229721A patent/AU2019229721B2/en active Active
- 2019-03-08 EP EP19713110.5A patent/EP3762001A1/fr active Pending
- 2019-03-08 CN CN201980018083.8A patent/CN111836631A/zh active Pending
- 2019-03-08 IL IL276969A patent/IL276969B2/en unknown
- 2019-03-08 CA CA3091626A patent/CA3091626C/fr active Active
- 2019-03-08 JP JP2020546950A patent/JP7330998B2/ja active Active
- 2019-03-08 KR KR1020207028567A patent/KR102524970B1/ko active IP Right Grant
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2016170285A1 (fr) * | 2015-04-24 | 2016-10-27 | Maat Pharma | Procédé de préparation d'un échantillon de microbiote fécal |
WO2018026913A1 (en) * | 2016-08-03 | 2018-02-08 | Crestovo Llc | Methods for treating ulcerative colitis |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
VINITA JACOB ET AL.: ""Single Delivery of High-Diversity Fecal Microbiota Preparation by Colonoscopy Is Safe and Effectiv", INFLAMMATORY BOWEL DISEASES, vol. 23, no. 6, JPN6022055860, June 2017 (2017-06-01), pages 903 - 911, XP002791475, ISSN: 0004959703, DOI: 10.1097/MIB.0000000000001132 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
IL276969B1 (en) | 2024-03-01 |
KR102524970B1 (ko) | 2023-04-21 |
US11389488B2 (en) | 2022-07-19 |
AU2019229721A2 (en) | 2020-10-22 |
AU2019229721A1 (en) | 2020-10-15 |
IL276969B2 (en) | 2024-07-01 |
FR3078627B1 (fr) | 2020-11-13 |
WO2019171012A1 (fr) | 2019-09-12 |
EP3762001A1 (fr) | 2021-01-13 |
US20200405776A1 (en) | 2020-12-31 |
AU2019229721B2 (en) | 2023-07-13 |
KR20200130367A (ko) | 2020-11-18 |
CN111836631A (zh) | 2020-10-27 |
JP7330998B2 (ja) | 2023-08-22 |
CA3091626A1 (fr) | 2019-09-12 |
CA3091626C (fr) | 2023-12-19 |
IL276969A (en) | 2020-10-29 |
FR3078627A1 (fr) | 2019-09-13 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP7330998B2 (ja) | 糞便回収方法及び糞便微生物叢を移植するためのサンプル調製方法 | |
US11554143B2 (en) | Microbiota restoration therapy (MRT), compositions and methods of manufacture | |
US10434124B2 (en) | Microbiota restoration therapy (MRT), compositions and methods of manufacture | |
US20210154239A1 (en) | Method of preparing a faecal microbiota sample | |
US20150238544A1 (en) | Microbiota restoration therapy (mrt), compositions and methods of manufacture | |
JP2023531096A (ja) | 全菌カプセル及びその調製方法と使用 | |
CN108770344A (zh) | 抗癌溶瘤病毒联合治疗和优良反应者选择平台 | |
AU2016202831A1 (en) | Microbiota restoration therapy (MRT), compositions and methods of manufacture |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20201125 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20220307 |
|
A977 | Report on retrieval |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 Effective date: 20221228 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20230110 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20230407 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20230424 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20230711 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20230809 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 7330998 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |