JP2021515584A - 産生バイオリアクターにおける細胞生存度を改善するための方法 - Google Patents

産生バイオリアクターにおける細胞生存度を改善するための方法 Download PDF

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Abstract

産生バイオリアクターにおける細胞生存度に対する感作剤の濃度の影響を予測する方法、産生バイオリアクターにおける細胞生存度を改善する方法、産生バイオリアクターにおける細胞生存度を予測する方法、および産生バイオリアクターにおいて細胞を培養するための方法が、本明細書で提供される。【選択図】図11

Description

関連出願に対する相互参照
本出願は、2018年3月16日出願の米国仮特許出願第62/644,339号および2018年3月20日出願の米国仮特許出願第62/645,755号に対する優先権を主張する;これらの出願の各々の全内容は、参照によって本明細書に組み入れられる。
本開示は、産生バイオリアクターにおける細胞生存度を改善する方法ならびにバイオテクノロジーおよび細胞生物学の分野に関する。
プロセス強化は、組換え治療タンパク質の産生に多くの利点を提供する。プロセス強化のための戦略の1つは、組換えタンパク質産生を改善するために高い細胞密度を維持することであるが、これは、高い酸素必要量をさらに要求する。産生バイオリアクターにおける酸素スパージは、産生バイオリアクターにおける発泡をもたらす。発泡は、強化された流加プロセスおよび灌流プロセスの両方においてしばしば生じる。従って、泡消し剤が、これらのプロセスにおいて通常添加される。しかし、消泡剤の添加および蓄積は、細胞を剪断に対して感受性にし、増加した細胞死をもたらし得る。
従って、種々の細胞培養パラメーター、例えば、剪断、培地成分および添加剤、ならびに消泡剤濃度の中で、産生バイオリアクターにおける許容可能な細胞培養条件を特徴付けるためのモデルを開発する必要がある。
本発明は、例えば、試験培養容器(例えば、バッフル付き振盪フラスコ)において取得されたデータを利用する本明細書で特許請求された方法が、産生バイオリアクターにおける細胞生存度に対する感作剤の濃度の影響を正確に予測するため、産生バイオリアクターにおける細胞生存度にとって最適な条件を正確に選択するため、産生バイオリアクターにおける細胞生存度を予測するため、および産生バイオリアクターにおいて細胞を培養するために使用することができる条件のセットを正確に同定するために使用されるという発見に基づく。
一態様では、本開示は、産生バイオリアクターにおける細胞生存度に対する感作剤の濃度の影響を予測する方法に関する。これらの方法は、(a)試験培養容器における複数の試験条件下での細胞生存度を決定する工程であって、複数の試験条件は、パラメーターのセットによって規定される、工程;および(b)試験培養容器における複数の条件下での細胞生存度に基づいて、産生バイオリアクターにおける細胞生存度に対する感作剤の濃度の影響を予測する工程、を含む。
一部の実施形態では、パラメーターのセットは、剪断応力、感作剤の濃度および保護剤の濃度を含む。
一部の実施形態では、複数の試験条件は、完全実施要因スクリーニングおよび/または内接中心複合計画に基づいて選択される。
一部の実施形態では、感作剤は、消泡剤である。
一部の実施形態では、消泡剤は、ポリジメチルシロキサンベースの消泡剤またはシメチコンである。
一部の実施形態では、試験培養容器は、約5mL〜約5Lの容量を有するまたは約10mL〜約500mLの容量を有する。一部の実施形態では、試験培養容器は、バッフル付き振盪フラスコである。
一部の実施形態では、産生バイオリアクターは、約5L〜約20,000Lの容量を有するまたは約50L〜約10,000Lの容量を有する。一部の実施形態では、産生バイオリアクターは、灌流バイオリアクターまたは流加バイオリアクターである。
一部の実施形態では、これらの方法は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、40%/日未満の特異的細胞死亡率を有すると予測される感作剤の濃度を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む。
一部の実施形態では、これらの方法は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、20%/日未満の特異的細胞死亡率を有すると予測される感作剤の濃度を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む。
一部の実施形態では、これらの方法は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、150nU/細胞/日未満の細胞特異的LDH産生を生じると予測される感作剤の濃度を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む。
一部の実施形態では、これらの方法は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、100nU/細胞/日未満の細胞特異的LDH産生を生じると予測される感作剤の濃度を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む。
一部の実施形態では、これらの方法は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、1%/日よりも大きい見かけの成長速度を生じると予測される感作剤の濃度を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む。
一部の実施形態では、これらの方法は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、5%/日よりも大きい見かけの成長速度を生じると予測される感作剤の濃度を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む。
一部の実施形態では、細胞は、組換え治療タンパク質をコードする核酸を含む。
一部の実施形態では、これらの方法は、組換え治療タンパク質を収集する工程をさらに含む。一部の実施形態では、これらの方法は、組換え治療タンパク質を精製する工程をさらに含む。一部の実施形態では、これらの方法は、精製された組換え治療タンパク質を製剤化する工程をさらに含む。
一部の実施形態では、細胞は、細菌、酵母または哺乳動物細胞である。
一部の実施形態では、細胞生存度は、試験培養容器中の乳酸デヒドロゲナーゼ(LDH)の濃度を測定することによって決定される。
一部の実施形態では、試験培養容器は、バッフル付き振盪フラスコであり、複数の試験条件は、
(a)約125RPM〜約400RPMの回転式撹拌;
(b)約0ppm〜約5000ppmの感作剤の濃度;および
(c)約1g/L〜約10g/Lである保護剤の濃度
のうち1つまたはそれ以上を含む。
一部の実施形態では、保護剤は、ポロクサマー、ポロキサミンまたはプルロニックポリオールである。
一部の実施形態では、ポロクサマーは、ポロクサマー−188、ポロクサマー−401、ポロクサマー−402またはポロクサマー−407である。
一部の実施形態では、ポロキサミンは、ポロキサミン−904またはポロキサミン−908である。
別の態様では、本開示は、産生バイオリアクターにおける細胞生存度を改善する方法に関する。これらの方法は、
(a)試験培養容器における複数の試験条件下での細胞生存度を決定する工程であって、複数の条件は、パラメーターのセットによって規定される、工程;
(b)試験培養容器における複数の条件下での細胞生存度に基づいて、産生バイオリアクターにおける細胞生存度にとって最適な条件を選択する工程;および
(c)選択された条件下で、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程
を含む。
一部の実施形態では、パラメーターのセットは、剪断応力、感作剤の濃度および保護剤の濃度を含む。
一部の実施形態では、複数の試験条件は、完全実施要因スクリーニングおよび/または内接中心複合計画に基づいて選択される。
一部の実施形態では、感作剤は、消泡剤である。一部の実施形態では、消泡剤は、ポリジメチルシロキサンベースの消泡剤またはシメチコンである。
一部の実施形態では、試験培養容器は、約5mL〜約5Lの容量を有する。
一部の実施形態では、試験培養容器は、約10mL〜約500mLの容量を有する。一部の実施形態では、試験培養容器は、バッフル付き振盪フラスコである。
一部の実施形態では、産生バイオリアクターは、約5L〜約20,000Lの容量を有する。一部の実施形態では、産生バイオリアクターは、約50L〜約10,000Lの容量を有する。一部の実施形態では、産生バイオリアクターは、灌流バイオリアクターまたは流加バイオリアクターである。
一部の実施形態では、工程(c)は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、40%/日未満の特異的細胞死亡率を生じる。一部の実施形態では、工程(c)は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、20%/日未満の特異的細胞死亡率を生じる。一部の実施形態では、工程(c)は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、150nU/細胞/日未満の細胞特異的LDH産生を生じる。一部の実施形態では、工程(c)は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、100nU/細胞/日未満の細胞特異的LDH産生を生じる。一部の実施形態では、工程(c)は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、1%/日よりも大きい見かけの成長速度を生じる。一部の実施形態では、工程(c)は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、5%/日よりも大きい見かけの成長速度を生じる。
一部の実施形態では、細胞は、組換え治療タンパク質をコードする核酸を含む。
一部の実施形態では、これらの方法は、組換え治療タンパク質を収集する工程をさらに含む。一部の実施形態では、これらの方法は、組換え治療タンパク質を精製する工程をさらに含む。一部の実施形態では、これらの方法は、精製された組換え治療タンパク質を製剤化する工程をさらに含む。
一部の実施形態では、細胞は、細菌、酵母または哺乳動物細胞である。一部の実施形態では、細胞生存度は、試験培養容器中の乳酸デヒドロゲナーゼ(LDH)の濃度を測定することによって決定される。
一部の実施形態では、試験培養容器は、バッフル付き振盪フラスコであり、複数の試験条件は、
(a)約125RPM〜約400RPMの回転式撹拌;
(b)約0ppm〜約5000ppmの感作剤の濃度;および
(c)約1g/L〜約10g/Lである保護剤の濃度
のうち1つまたはそれ以上を含む。
一部の実施形態では、保護剤は、ポロクサマー、ポロキサミンまたはプルロニックポリオールである。一部の実施形態では、ポロクサマーは、ポロクサマー−188、ポロクサマー−401、ポロクサマー−402またはポロクサマー−407である。一部の実施形態では、ポロキサミンは、ポロキサミン−904またはポロキサミン−908である。
別の態様では、本開示は、産生バイオリアクターにおける細胞生存度を予測するための方法に関する。これらの方法は、
(a)少なくとも2つのパラメーターを含むパラメーターのセットを選択する工程;
(b)試験培養容器におけるパラメーターのセットによって規定される複数の試験条件下での細胞生存度を決定する工程;および
(c)試験培養容器における複数の条件下での細胞生存度に基づいて、産生バイオリアクターにおける細胞生存度を予測する工程
を含む。
一部の実施形態では、パラメーターのセットは、剪断応力、感作剤の濃度および保護剤の濃度を含む。
一部の実施形態では、複数の試験条件は、完全実施要因スクリーニングおよび/または内接中心複合計画に基づいて選択される。
一部の実施形態では、感作剤は、消泡剤である。
一部の実施形態では、消泡剤は、ポリジメチルシロキサンベースの消泡剤である。一部の実施形態では、消泡剤は、シメチコンである。
一部の実施形態では、試験培養容器は、約5mL〜約5Lの容量を有する。
一部の実施形態では、試験培養容器は、約10mL〜約500mLの容量を有する。
一部の実施形態では、試験培養容器は、バッフル付き振盪フラスコである。
一部の実施形態では、産生バイオリアクターは、約5L〜約20,000Lの容量を有するまたは約50L〜約10,000Lの容量を有する。
一部の実施形態では、産生バイオリアクターは、灌流バイオリアクターまたは流加バイオリアクターである。
一部の実施形態では、これらの方法は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、40%/日未満の特異的細胞死亡率を生じると予測される条件を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む。
一部の実施形態では、これらの方法は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、20%/日未満の特異的細胞死亡率を生じると予測される条件を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む。
一部の実施形態では、これらの方法は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、150nU/細胞/日未満の細胞特異的LDH産生を生じると予測される条件を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む。
一部の実施形態では、これらの方法は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、100nU/細胞/日未満の細胞特異的LDH産生を生じると予測される条件を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む。
一部の実施形態では、これらの方法は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、1%/日よりも大きい見かけの成長速度を生じると予測される条件を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む。
一部の実施形態では、これらの方法は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、5%/日よりも大きい見かけの成長速度を生じると予測される条件を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む。
一部の実施形態では、細胞は、組換え治療タンパク質をコードする核酸を含む。
一部の実施形態では、これらの方法は、組換え治療タンパク質を収集する工程をさらに含む。一部の実施形態では、これらの方法は、組換え治療タンパク質を精製する工程をさらに含む。一部の実施形態では、これらの方法は、精製された組換え治療タンパク質を製剤化する工程をさらに含む。
一部の実施形態では、細胞は、細菌、酵母または哺乳動物細胞である。
一部の実施形態では、細胞生存度は、試験培養容器中の乳酸デヒドロゲナーゼ(LDH)の濃度を測定することによって決定される。
一部の実施形態では、試験培養容器は、バッフル付き振盪フラスコであり、複数の試験条件は、
(a)約125RPM〜約400RPMの回転式撹拌;
(b)約0ppm〜約5000ppmの感作剤の濃度;および
(c)約1g/L〜約10g/Lである保護剤の濃度
のうち1つまたはそれ以上を含む。
一部の実施形態では、保護剤は、ポロクサマー、ポロキサミンまたはプルロニックポリオールである。一部の実施形態では、ポロクサマーは、ポロクサマー−188、ポロクサマー−401、ポロクサマー−402またはポロクサマー−407である。一部の実施形態では、ポロキサミンは、ポロキサミン−904またはポロキサミン−908である。
別の態様では、本開示は、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養するための方法であって、以下の条件:
a)産生バイオリアクターは、約1.0〜約110.0(例えば、約10.0〜約100.0、約20.0〜約80.0、約40.0〜約60.0、または約6.0)のP/V(W/m)を有する;
b)産生バイオリアクターは、約0.01〜約0.10(例えば、約0.02〜約0.08、約0.04〜約0.06、または約0.06)の空気容量/液体容量/分(VVM)(分−1)を有する;
c)培地は、約0ppm〜約5000ppm(例えば、約50ppm〜約4000ppm、約1000ppm〜約2000ppm、または約100ppm)の濃度を有する感作剤を含む;および
d)液体培養培地は、約1g/L〜約15g/L(例えば、約2g/L〜約10g/L、約3g/L〜約7g/L、約4g/L〜約6g/L、または約5g/L)である濃度を有する保護剤を含む
のうち1つまたはそれ以上の下で、液体培養培地において細胞を培養する工程を含む、方法もまた提供する。
一部の実施形態では、感作剤は、消泡剤である。
一部の実施形態では、消泡剤は、ポリジメチルシロキサンベースの消泡剤である。一部の実施形態では、消泡剤は、シメチコンである。
一部の実施形態では、保護剤は、ポロクサマー、ポロキサミンまたはプルロニックポリオールである。
一部の実施形態では、ポロクサマーは、ポロクサマー−188、ポロクサマー−401、ポロクサマー−402またはポロクサマー−407である。一部の実施形態では、ポロキサミンは、ポロキサミン−904またはポロキサミン−908である。
一部の実施形態では、産生バイオリアクターは、約5L〜約20,000Lの容量を有する。一部の実施形態では、産生バイオリアクターは、約50L〜約10,000Lの容量を有する。一部の実施形態では、産生バイオリアクターは、灌流バイオリアクターまたは流加バイオリアクターである。
一部の実施形態では、これらの方法は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、40%/日未満の特異的細胞死亡率を生じる。一部の実施形態では、これらの方法は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、20%/日未満の特異的細胞死亡率を生じる。一部の実施形態では、これらの方法は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、150nU/細胞/日未満の細胞特異的LDH産生を生じる。一部の実施形態では、これらの方法は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、100nU/細胞/日未満の細胞特異的LDH産生を生じる。一部の実施形態では、これらの方法は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、1%/日よりも大きい見かけの成長速度を生じる。一部の実施形態では、これらの方法は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、5%/日よりも大きい見かけの成長速度を生じる。
一部の実施形態では、細胞は、組換え治療タンパク質をコードする核酸を含む。
一部の実施形態では、これらの方法は、組換え治療タンパク質を収集する工程をさらに含む。一部の実施形態では、これらの方法は、組換え治療タンパク質を精製する工程をさらに含む。一部の実施形態では、これらの方法は、精製された組換え治療タンパク質を製剤化する工程をさらに含む。
一部の実施形態では、細胞は、細菌、酵母または哺乳動物細胞である。一部の実施形態では、細胞生存度は、試験培養容器中の乳酸デヒドロゲナーゼ(LDH)の濃度を測定することによって決定される。
本明細書で使用する場合、名詞の前の「1つの(a)」という単語は、その特定の名詞の1つまたはそれ以上を示す。例えば、語句「1つの(a)細胞」は、「1つまたはそれ以上の細胞」を示す。
用語「保護剤」は、容器(例えば、試験培養容器または産生バイオリアクター)における培養の間に、剪断応力に対する細胞の感受性(例えば、哺乳動物細胞の感受性)を減少させる薬剤を意味する。保護剤の非限定的な例には、例えば、ポロクサマー(例えば、ポロクサマー−188、ポロクサマー−401、ポロクサマー−402およびポロクサマー−407)、ポロキサミン(例えば、ポロキサミン−904またはポロキサミン−908)およびプルロニックポリオールが含まれる。保護剤のさらなる例は、本明細書に記載され、当該分野で公知である。
用語「感作剤」は、容器(例えば、試験培養容器または産生バイオリアクター)における培養の間に、剪断応力に対する細胞の感受性を増加させる、細胞の培養物(例えば、哺乳動物細胞培養物)の液体培養培地に添加されるおよび/またはその中に存在する薬剤を意味する。感作剤の非限定的な例には、消泡剤(例えば、ポリジメチルシロキサンベースの消泡剤またはシメチコン)が含まれる。感作剤のさらなる例は、本明細書に記載され、当該分野で公知である。
用語「哺乳動物細胞」は、任意の哺乳動物(例えば、ヒト、ハムスター、マウス、ミドリザル、ラット、ブタ、ウシまたはウサギ)由来のまたはそれに由来する任意の細胞を意味する。例えば、哺乳動物細胞は、不死化細胞であり得る。一部の実施形態では、哺乳動物細胞は、分化した細胞である。一部の実施形態では、哺乳動物細胞は、未分化細胞である。哺乳動物細胞の非限定的な例は、本明細書に記載される。哺乳動物細胞のさらなる例は、当該分野で公知である。
用語「培養」または「細胞培養」は、制御されたセットの物理的条件の下での、哺乳動物細胞の維持または増殖を意味する。
用語「細胞の培養物」または「細胞培養物」は、制御されたセットの物理的条件の下で維持または増殖される、複数の細胞を含む液体培養培地を意味する。
用語「液体培養培地」は、細胞(例えば、哺乳動物細胞)がin vitroで成長または増殖するのを可能にするのに十分な栄養素を含む流体を意味する。例えば、液体培養培地は、以下のうち1つまたはそれ以上を含むことができる:アミノ酸(例えば、20種のアミノ酸)、プリン(例えば、ヒポキサンチン)、ピリミジン(例えば、チミジン)、コリン、イノシトール、チアミン、葉酸、ビオチン、カルシウム、ナイアシンアミド、ピリドキシン、リボフラビン、チミジン、シアノコバラミン、ピルベート、リポ酸、マグネシウム、グルコース、ナトリウム、カリウム、鉄、銅、亜鉛および重炭酸ナトリウム。一部の実施形態では、液体培養培地は、哺乳動物由来の血清を含むことができる。一部の実施形態では、液体培養培地は、哺乳動物由来の血清も別の抽出物も含まない(規定された液体培養培地)。一部の実施形態では、液体培養培地は、微量金属、哺乳動物成長ホルモンおよび/または哺乳動物増殖因子を含むことができる。液体培養培地の別の例は、最少培地(例えば、無機塩、炭素源および水のみを含む培地)である。液体培養培地の非限定的な例は、本明細書に記載される。液体培養培地のさらなる例は、当該分野で公知であり、市販されている。液体培養培地は、任意の密度の哺乳動物細胞を含むことができる。例えば、本明細書で使用する場合、バイオリアクターから除去される液体培養培地の容量は、哺乳動物細胞を実質的に含まなくてもよい。
用語「動物由来成分なしの液体培養培地」は、哺乳動物に由来するいずれの成分(例えば、タンパク質または血清)も含まない液体培養培地を意味する。
用語「無血清液体培養培地」は、哺乳動物血清を含まない液体培養培地を意味する。
用語「血清含有液体培養培地」は、哺乳動物血清を含む液体培養培地を意味する。
用語「化学的に規定された液体培養培地」は、当該分野の用語であり、化学的成分の全てが既知である液体培養培地を意味する。例えば、化学的に規定された液体培養培地は、胎仔ウシ血清もウシ血清アルブミンもヒト血清アルブミンも含まないが、それは、これらの調製物が、典型的には、アルブミンおよび脂質の複雑な混合物を含むからである。
用語「タンパク質なしの液体培養培地」は、いずれのタンパク質(例えば、いずれの検出可能なタンパク質)も含まない液体培養培地を意味する。
用語「灌流バイオリアクター」は、第1の液体培養培地中に複数の細胞(例えば、哺乳動物細胞)を含むバイオリアクターを意味し、バイオリアクター中に存在する細胞の培養は、第1の液体培養培地の周期的または継続的な除去、およびそれと同時またはその直後の、バイオリアクターへの実質的に同じ容量の第2の液体培養培地の添加を含む。一部の例では、第2の液体培養培地は、第1の液体培養培地と同じであり得る。一部の例では、培養期間の間の増分期間(例えば、約24時間の期間、約1分間と約24時間との間の期間、または24時間よりも長い期間)にわたって除去および添加される第1の液体培養培地の容量において、増分変化(例えば、増加または減少)(例えば、毎日の培養培地再供給速度)が存在する。それぞれの日に除去および置換される培地の割合は、培養されている特定の細胞、初期播種密度および特定の時点における細胞密度に依存して変動し得る。「RV」または「リアクター容量」は、培養プロセスの開始時に存在する培養培地の容量(例えば、播種後に存在する培養培地の総容量)を意味する。
用語「流加バイオリアクター」は、当該分野の用語であり、第1の液体培養培地中に複数の細胞(例えば、哺乳動物細胞)を含むバイオリアクターを意味し、バイオリアクター中に存在する細胞の培養は、細胞培養物からの第1の液体培養培地または第2の液体培養培地の実質的なまたは著しい除去を伴わない、第1の液体培養培地への第2の液体培養培地の周期的または継続的な添加を含む。第2の液体培養培地は、第1の液体培養培地と同じであり得る。流加培養の一部の例では、第2の液体培養培地は、第1の液体培養培地の濃縮形態である。流加培養の一部の例では、第2の液体培養培地は、乾燥粉末として添加される。流加培養の一部の例では、第2の液体培養培地は、第1の液体培養培地と比較して完全に異なる処方である。
用語「濃縮流加バイオリアクター」は、当該分野の用語であり、第1の液体培養培地中に複数の細胞(例えば、哺乳動物細胞)を含むバイオリアクターを意味し、バイオリアクター中に存在する細胞の培養は、バイオリアクターから産物を除去することなしの、細胞培養物からの第1の液体培養培地または第2の液体培養培地の実質的なまたは著しい除去を伴う、第1の液体培養培地への第2の液体培養培地の周期的または継続的な添加を含む。第2の液体培養培地は、第1の液体培養培地と同じであり得る。濃縮流加培養の一部の例では、第2の液体培養培地は、第1の液体培養培地の濃縮形態である。濃縮流加培養の一部の例では、第2の液体培養培地は、乾燥粉末として添加される。濃縮流加培養の一部の例では、第2の液体培養培地は、第1の液体培養培地とは完全に異なる処方である。
「回転式撹拌」は、当該分野で周知の用語であり、例えば、その中に含まれる液体培養培地中の溶存O濃度を増加させるために、概して円形の様式、例えば、時計回りまたは反時計回りでの、振盪フラスコの動きを指す。撹拌は、当該分野で公知の任意の方法、例えば、円形または楕円形の運動で振盪フラスコを動かす機器、例えば、回転式振盪器を使用して実施することができる。回転式撹拌を実施するために使用することができる例示的なデバイスは、本明細書に記載される。かかるデバイスのさらなる例もまた、当該分野で公知であり、市販されている。
用語「振盪フラスコ」は、少なくとも1つの気体透過性表面(例えば、気体透過性要素を有する端部、例えば、滅菌したバリアとしても作用し得るメンブレン)および/または少なくとも1つのベントキャップを有する、液体培養培地の容量を保持できる容器(例えば、滅菌した容器)を意味し、その形状の少なくとも一部分は、およそ円錐台状である。例えば、振盪フラスコは、バッフル付き振盪フラスコもしくはErlenmeyerフラスコ、または当該分野で認識されたその任意の改変バージョンであり得る。
用語「産生バイオリアクター」は、当該分野の用語であり、大規模バイオリアクター(例えば、5L、1,000L、5,000L、10,000L、20,000L、50,000Lまたは100,000Lを超える内部容量を有する)を意味する。例えば、産生バイオリアクターは、灌流バイオリアクターである。
用語「試験培養容器」は、当該分野の用語であり、約2mL〜約500mLの容量を有する小規模バイオリアクター(例えば、産生バイオリアクターと比較して)を意味する。一部の例では、試験培養容器の高さと幅の比は、本明細書に記載される方法における産生バイオリアクターのおよその高さと幅の比に対応する。一部の実施形態では、試験培養容器は、振盪フラスコ(例えば、バッフル付き振盪フラスコ)である。試験培養容器のさらなる例は、本明細書に記載され、当該分野で公知である。
用語「バッチ培養」は、当該分野の用語であり、液体培養培地中に複数の細胞(例えば、哺乳動物細胞)を含む容器(例えば、バイオリアクター)を意味し、容器(例えば、バイオリアクター)中に存在する細胞の培養は、細胞培養物への実質的なまたは著しい量の新鮮な液体培養培地の添加を含まず、培養の間に、細胞培養物からの実質的なまたは著しい量の液体培養培地の除去を含まない。
用語「流加培養」は、当該分野の用語であり、液体培養培地中に複数の細胞(例えば、哺乳動物細胞)を含む容器(例えば、産生バイオリアクター)を意味し、容器(例えば、産生バイオリアクター)中に存在する細胞の培養は、培養の間に、容器からの液体培養培地の実質的なまたは著しい除去を伴わない、容器への新鮮な液体培養培地の周期的または継続的な添加を含む。新鮮な液体培養培地は、培養の開始時に容器中に存在する液体培養培地と同じであり得る。流加培養の一部の例では、新鮮な液体培養培地は、培養の開始時に容器中に存在する液体培養培地の濃縮形態である。流加培養の一部の例では、新鮮な培養培地は、乾燥粉末として添加される。流加培養の一部の例では、新鮮な培養培地は、培養の開始時に容器中に存在する液体培養培地と比較して、完全に異なる処方である。
本明細書に記載される方法は、いくつかの利点を提供する。例えば、この方法は、異なる規模を整列させ、Δパラメーターを予測し、既存の計画空間を最適化することができる。これはまた、規模にわたる成績の予測性/整列を増加させ、より代表的な小規模モデルを生み出し、プロセスのロバスト性を増加させ、プロセス強化のために剪断許容範囲を改善し、異なる剪断プロファイルにわたる感作剤および保護剤添加についてのガイダンスを提供する(図12)。
特に定義しない限り、本明細書で使用される全ての技術用語および科学用語は、本発明が属する分野の当業者が一般に理解するものと同じ意味を有する。方法および材料は、本発明における使用のために本明細書に記載される;当該分野で公知の他の適切な方法および材料もまた使用することができる。材料、方法および例は、例示に過ぎず、限定を意図しない。本明細書で言及される全ての刊行物、特許出願、特許、配列、データベースエントリーおよび他の参考文献は、それらの全体が参照によって組み入れられる。矛盾する場合、定義を含む本明細書が支配する。
本発明の他の構成および利点は、以下の詳細な説明および図面ならびに特許請求の範囲から明らかとなる。
図1は、細胞培養培地中の気泡がどのように細胞死を引き起こし得るかを示す図である。 図2は、消泡剤(例示的な感作剤)の添加が、運転条件を許容可能な運転空間の外側に移動させ得ることを示す図である。 図3は、特異的乳酸デヒドロゲナーゼ(LDH)産生と細胞死亡率との間の関連性を示す図である。 図4は、保護剤、感作剤および回転式撹拌の間の関連性、ならびに細胞培養物における特異的LDH産生に対する保護剤、感作剤および撹拌の影響を示す図である。 図5は、特異的LDH産生が、感作剤濃度、保護剤濃度および回転式撹拌(剪断応力)の結果であることを示す図である。 図6は、3つの選択されたパラメーター:感作剤濃度、保護剤濃度および回転式撹拌(剪断応力)についての完全実施要因計画を示す図である。上のパネルは、完全実施要因計画(2)を示し、ここで、応答は、特異的LDH産生(死亡率)であり、要因は、剪断、保護剤の濃度および感作剤の濃度である。中央のパネルは、失敗が極値を生じ、失敗点とデータの残部との間に大きい幅が存在し、失敗点のモデル化が困難であり、極値が排除される(運転不能な領域)ことを示す。下のパネルは、中心点がうまく予測されないことを示す(曲率の指標、応答は、非線形である可能性が高く、RPMを増加させることは、線形に拡大縮小させない)。 図7は、感作剤濃度、保護剤濃度および回転式撹拌(剪断応力)の選択されたパラメーターについての、内接中心複合計画と組み合わせた完全実施要因計画を示す図である。 図8は、内接中心複合計画と組み合わせた完全実施要因計画の利点を示す図である。 図9は、本明細書に記載される方法が、劣った成績の領域(明るい影)および運転失敗の領域(暗い影)を同定するために使用することができることを示す図である。 図10は、特異的LDH産生を介して規模にわたり剪断応力を標準化する方法およびパラメーター変化(Δパラメーター)の影響を予測する方法を示す図である。 図11は、本明細書に記載されるモデルが産生バイオリアクターの運転条件を最適化するためにどのように使用できるかを示す図である。このデータは、運転条件(白抜きの四角で埋められた矩形)が、現在動作しているが、さらに最適化する(例えば、プロセス中の感作剤許容範囲の濃度範囲を増加させ、容器の発泡に対する回復力を改善する)ことができる(大きい矢印の右側の明るい影の矩形)ことを示している。 図12は、本明細書に記載されるモデルの能力および有用性を列挙する図である。このモデルは、異なる規模を整列させ、パラメーターにおける変化を予測し、既存の計画空間を最適化することができる。このモデルは、規模にわたる成績の予測性/整列の増加もまた提供する(例えば、より代表的な小規模モデルを生み出し、伝統的な方法論に加えて、規模にわたる剪断の理解を増補する)。このモデルは、増加したプロセスロバスト性(例えば、プロセス強化のための改善された剪断許容範囲ならびに異なる剪断プロファイルにわたる感作剤の濃度および保護剤添加の濃度についての改善されたガイダンス)もまた提供する。 図13Aは、予測された特異的LDH産生値に対して、試験したベンチトップ容器における観察された特異的LDH産生値を比較するグラフを示す図である。 図13Bは、実施例2に記載される実験からのデータを示す図である。 図13Cは、予測された値と共に、観察された特異的LDH産生値を列挙する図である。 図14は、特異的LDH産生に対する消泡剤の観察された影響および特異的LDH産生に対する消泡剤の予測された影響を比較する図である。 図15Aは、試験した産生バイオリアクターにおける観察された特異的LDH産生値を、予測された値と比較するグラフを示す図である。 図15Bは、予測された値と共に、試験した産生バイオリアクターにおける観察された特異的LDH産生値を列挙する図である。
詳細な説明
本開示は、タンパク質またはポリペプチドの産生のためにプロセス強化を最適化する方法に関する。一態様では、本開示は、種々の運転パラメーター、例えば、保護剤(例えば、ポロクサマー−188)濃度、感作剤(例えば、消泡剤)、剪断応力(例えば、撹拌速度または酸素スパージ速度)、培地成分および添加剤、pHおよび時間などによって規定される、運転空間を特徴付けることができる小規模試験培養容器(例えば、バッフル付き振盪フラスコ)モデルに関する。特に、本明細書に記載される方法は、産生バイオリアクターにおける細胞培養物の成長および生存度に対するこれらの運転パラメーターの影響を予測するために使用することができる。直交アプローチが、小規模モデルとより大規模なモデルとの間で剪断応力を相関付けるために使用され、予測された運転空間が、ベンチトップ規模および産生規模におけるデータによって検証されている。
従って、産生バイオリアクターにおける細胞生存度に対する感作剤の濃度の影響を予測する方法、産生バイオリアクターにおける細胞生存度を改善する方法、産生バイオリアクターにおける細胞生存度を予測するための方法、および産生バイオリアクターにおいて細胞を培養するための方法が、本明細書で提供される。これらの方法の非限定的な態様は、本明細書に記載され、限定なしに組み合わせることができる。
プロセス強化
プロセス強化は、製造プロセスがより正確かつより効率的になるように既存の運転スキームを最適化することによる、製造および加工における改善を指す。これらの改善は、種々の利点、例えば、バイオマスの増加、容量生産性の改善、施設稼働率の最適化、商品原価の低減、製品品質一貫性の維持もしくは改善、施設設置面積の低減、および/またはユニット運転の低減をもたらすことができる。分子レベルでは、プロセス強化は、混合を増強すること、反応速度論を改善すること、ならびに/または収量および特異性を増加させることも含み得る。
本開示は、タンパク質またはポリペプチド(例えば、組換え治療タンパク質、組換えタンパク質または組換えポリペプチド)の産生のためのプロセス強化に関する。組換え治療タンパク質またはポリペプチドの産生を増加させるための1つの戦略は、細胞密度を増加させることである。高い細胞密度は通常、高い酸素消費を要求し、要求される酸素スパージは、発泡問題(即ち、気泡)をもたらす場合が多い。図1に示されるように、気泡は、例えば、細胞−気泡接触、細胞気泡付着、または気泡破裂からの致死的な力を介して、細胞死をもたらし得る。式1は、細胞死亡率、容量通気および気泡サイズの間の関連性を示す。
Figure 2021515584
従って、泡消し剤が細胞培養物プロセスに添加される場合が多い。しかし、消泡剤の添加および/または蓄積は、細胞培養成績(例えば、哺乳動物細胞培養成績)に対して負の影響を引き起こし得る。一部の場合には、消泡剤の添加および蓄積は、特に産生規模(産生バイオリアクター規模)では、増加した細胞死亡率をもたらし得る。従って、産生規模(産生バイオリアクター規模)における、運転パラメーターまたはこれらの運転パラメーター(例えば、消泡剤または一部の他のパラメーター)における変化の影響を評価することは重要である。
感作剤、撹拌および保護剤
産生規模(産生バイオリアクター規模)における種々の運転パラメーターの影響を試験することはひどく費用がかかるので、パイロット実験が通常、試験培養容器(例えば、振盪フラスコ、実験室発酵槽またはパイロット発酵槽)において最初に実施される。これらの試験培養容器は、小規模における種々のパラメーター、例えば、撹拌、感作剤濃度、保護剤濃度、温度、pH、栄養素組成、バイオマス負荷および供給戦略の影響を試験し、観察された影響を産生規模(産生バイオリアクター規模)における影響と相関付けるために運転される。多くの伝統的な方法では、仕事率/容量(P/V)、物質移動容量係数(kLa)、羽先端速度、混合時間、数値流体力学(CFD)モデル化が、試験培養容器における結果を産生規模(産生バイオリアクター規模)における影響と相関付けるためにしばしば使用される。
これらの種々のパラメーターのうち、感作剤パラメーター(例えば、感作剤の濃度)は、スケールアップが特に困難である。本明細書に記載される方法のいずれかの一部の実施形態では、感作剤は、消泡剤(例えば、シメチコン、シメチコンエマルジョンまたはポリジメチルシロキサン(PDMS)ベースの油)であり得る。消泡剤の説明は、例えば、Brecevicら、「Mechanism of antifoaming action of simethicone」、J.Appl.Toxicol.14(3):207〜211、1994;およびBergeronら、「Polydimethylsiloxane(PDMS)−based antifoams」、Colloids and Surfaces A:Physicochemical and Engineering Aspects 122(1〜3):103〜120、1997において見出すことができる;これらは共に、その全体が参照によって本明細書に組み入れられる。
感作剤のさらなる例には、例えば、有機油ベースの感作剤、シリコーン油ベースの感作剤および混成液体−固体混合物/乳化感作剤(例えば、フュームドシリカ、油配合消泡剤)が含まれる。感作剤は、シリコーン発泡制御剤、例えば、XIAMETER(登録商標)ACP−0100消泡剤化合物、XIAMETER(登録商標)ACP−1500消泡剤化合物、XIAMETER(登録商標)AFE−1510消泡剤エマルジョン、XIAMETER(登録商標)AFE−1520消泡剤エマルジョン、XIAMETER(登録商標)AFE−1530消泡剤エマルジョン、XIAMETER(登録商標)ACP−1400消泡剤化合物、XIAMETER(登録商標)AFE−0700消泡剤エマルジョン、XIAMETER(登録商標)ACP−1920粉末消泡剤およびXIAMETER(登録商標)PMX−200シリコーン流体である。感作剤のさらなる例には、Dow Corning(登録商標)消泡剤Cエマルジョン、消泡剤204(Sigma Aldrich)、消泡剤A(Sigma Aldrich)、消泡剤Bエマルジョン(Sigma Aldrich)、消泡剤Cエマルジョン(Sigma Aldrich)、消泡剤Y−30エマルジョン(Sigma Aldrich)、消泡剤O−30(Sigma Aldrich)および消泡剤SE−15(Sigma Aldrich)が含まれる。有機非シリコーンポリプロピレンベースのポリエーテル感作剤の非限定的な例は、消泡剤204である。シメチコンエマルジョンの非限定的な例は、消泡剤EX−Cellである。混成固体−液体消泡剤の非限定的な例には、Marinovaら、Langmuir 17:2426〜2436、2001に記載される、シリコーン油(PDMS)、コンパウンドA、改変CA(MCA)、エマルジョンA(EA)およびEAのアナログ(AEA)が含まれる。ポリジメチルシロキサン(PMSA)ベースの消泡剤の非限定的な例は、Bergeronら、Colloids and Surfaces A:Physiochemical and Engineering Aspects 122:103〜120、1997に記載されている。
感作剤のさらなる例は、当該分野で公知である。例えば、Rashmikaら、Biotechnol.Prog.34(1):262〜270、2018を参照のこと。
一部の他のパラメーター、例えば、バッフリング、フラスコサイズ、撹拌もまた、剪断に対する細胞の感受性に対して影響を有する。他のパラメーターとの相互作用に起因して、これらの感作剤パラメーター(例えば、消泡剤の濃度)は、スケールアッププロセスにおいて非線形の関係を有する場合が多く、異なる規模にわたって幾何学的に関係がない。従って、伝統的なモデルは通常、産生規模における感作剤パラメーターの影響を予測することに関して無力である。
予測をさらにいっそう困難にしているのは、感作剤パラメーターが産生期間全体において変化し得るということである。例えば、産生プロセス(例えば、産生バイオリアクターにおける細胞の培養)の間に、細胞密度は増加し、より高い酸素スパージが要求される。従って、より多くの消泡剤が要求され、産生バイオリアクターに添加される。消泡剤の増加した濃度は、細胞を剪断応力に対してさらにいっそう感受性にし、運転条件を許容可能な運転空間の外に迅速に移動させる(図2)。
さらに、保護剤は、増加した剪断応力から細胞を保護することができ、液体培養培地にしばしば添加される。増加した保護剤濃度が、感作剤の負の影響を軽減するために必要な場合があるが、保護剤と他のパラメーターとの相互作用により、必要とされる保護剤の正確な量を決定することは困難になる。一部の一般的な保護剤には、例えば、ポロクサマー、ポロキサミンおよび/またはプルロニックポリオールが含まれる。一部の実施形態では、保護剤は、ポロクサマー(例えば、ポロクサマー−188、ポロクサマー−401、ポロクサマー−402またはポロクサマー−407)である。一部の他の実施形態では、保護剤は、ポロキサミン(例えば、ポロキサミン−904またはポロキサミン−908)である。一部のさらなる実施形態では、保護剤は、プルロニックポリオール(例えば、L−61、L−121、P−103、P−123、P−84、P−104、P−65、P−105、L−35、F−127、F−38、F−68またはF−108)またはリバースプルロニックポリオール(例えば、25 R−2、25 R−4、25 R−5、25 R−8、10 R−5または10 R−8)である。例示的な保護剤の詳細な説明は、例えば、Moghimiら、「Poloxamers and poloxamines in nanoparticle engineering and experimental medicine」、Trends in Biotechnology 18(10):412〜420、2000;Murhammerら、「Structural features of nonionic polyglycol polymer molecules responsible for the protective effect in sparged animal cell bioreactors」、Biotechnology Progress 6(2):142〜148、1990;Murhammer、「Pluronic polyols,cell protection」、Encyclopedia of Bioprocess Technology(1999)において見出すことができる;これらは各々、その全体が参照によって本明細書に組み入れられる。
実施要因計画および中心複合計画に基づくモデル化
本開示は、試験培養容器モデルからの結果に基づいて、任意の規模においてリアクターを最適化することを目的とした、種々の運転パラメーター、例えば、保護剤(培地成分/添加剤、例えば、プルロニック)、感作剤(例えば、消泡剤)および剪断応力(撹拌)の影響(例えば、細胞生存度、細胞死亡率、組換え治療タンパク質産生または収量)を捕捉するためのモデル化方法を提供する。
一態様では、本明細書に記載される方法は、産生バイオリアクターにおける細胞生存度を予測するために使用することができる。これらの方法は、少なくとも2つ(例えば、3つ、4つ、5つまたは6つ)のパラメーターを含むパラメーターのセットを選択する工程;試験培養容器(例えば、本明細書に記載される試験培養容器のいずれか)におけるパラメーターのセットによって規定される複数の試験条件下での細胞生存度を決定する工程;および試験培養容器における複数の条件下での細胞生存度に基づいて、産生バイオリアクターにおける細胞生存度を予測する工程、を含む。予測に基づいて、改善された細胞生存度を有する条件を同定することができる。産生バイオリアクターにおける細胞生存度に対する感作剤の濃度の影響を予測する方法もまた、本明細書で提供される。これらの方法は、試験培養容器における複数の試験条件下での細胞生存度を決定する工程であって、複数の試験条件は、パラメーターのセットによって規定される、工程;および試験培養容器における複数の条件下での細胞生存度に基づいて、産生バイオリアクターにおける細胞生存度に対する感作剤の濃度の影響を予測する工程、を含む。
試験培養容器は、スピンチューブ(例えば、バッフル付きスピンチューブ)、フラスコ(例えば、約3Lの容量を有する振盪フラスコ)(例えば、バッフル付き振盪フラスコ)、自動実験室発酵槽(SartoriusのAmbr 15およびAmber 250)、実験室発酵槽またはパイロット発酵槽であり得る。一部の実施形態では、試験培養容器は、5L未満、3L未満、1L未満、500ml未満または100ml未満(例えば、1L未満、または50ml〜500ml)の容量を有し得る。一部の実施形態では、試験培養容器は、約5mL〜約5L(例えば、約10mL〜約500mLまたは約2.5L〜約3.5L)の容量(内部容量)を有する。例えば、試験培養容器は、約5mL〜約5L、約5mL〜約4.5L、約5mL〜約4.0L、約5mL〜約3.5L、約5mL〜約3.0L、約5mL〜約2.5L、約5mL〜約2L、約5mL〜約1.5L、約5mL〜約1L、約5mL〜約900mL、約5mL〜約800mL、約5mL〜約700mL、約5mL〜約600mL、約5mL〜約500mL、約5mL〜約450mL、約5mL〜約400mL、約5mL〜約350mL、約5mL〜約300mL、約5mL〜約250mL、約5mL〜約200mL、約5mL〜約150mL、約5mL〜約100mL、約5mL〜約80mL、約5mL〜約60mL、約5mL〜約50mL、約5mL〜約40mL、約5mL〜約30mL、約5mL〜約25mL、約5mL〜約20mL、約5mL〜約15mL、約5mL〜約10mL、約10mL〜約5L、約10mL〜約4.5L、約10mL〜約4.0L、約10mL〜約3.5L、約10mL〜約3.0L、約10mL〜約2.5L、約10mL〜約2L、約10mL〜約1.5L、約10mL〜約1L、約10mL〜約900mL、約10mL〜約800mL、約10mL〜約700mL、約10mL〜約600mL、約10mL〜約500mL、約10mL〜約450mL、約10mL〜約400mL、約10mL〜約350mL、約10mL〜約300mL、約10mL〜約250mL、約10mL〜約200mL、約10mL〜約150mL、約10mL〜約100mL、約10mL〜約80mL、約10mL〜約60mL、約10mL〜約50mL、約10mL〜約40mL、約10mL〜約30mL、約10mL〜約25mL、約10mL〜約20mL、約10mL〜約15mL、約15mL〜約5L、約15mL〜約4.5L、約15mL〜約4.0L、約15mL〜約3.5L、約15mL〜約3.0L、約15mL〜約2.5L、約15mL〜約2L、約15mL〜約1.5L、約15mL〜約1L、約15mL〜約900mL、約15mL〜約800mL、約15mL〜約700mL、約15mL〜約600mL、約15mL〜約500mL、約15mL〜約450mL、約15mL〜約400mL、約15mL〜約350mL、約15mL〜約300mL、約15mL〜約250mL、約15mL〜約200mL、約15mL〜約150mL、約15mL〜約100mL、約15mL〜約80mL、約15mL〜約60mL、約15mL〜約50mL、約15mL〜約40mL、約15mL〜約30mL、約15mL〜約25mL、約15mL〜約20mL、約20mL〜約5L、約20mL〜約4.5L、約20mL〜約4.0L、約20mL〜約3.5L、約20mL〜約3.0L、約20mL〜約2.5L、約20mL〜約2L、約20mL〜約1.5L、約20mL〜約1L、約20mL〜約900mL、約20mL〜約800mL、約20mL〜約700mL、約20mL〜約600mL、約20mL〜約500mL、約20mL〜約450mL、約20mL〜約400mL、約20mL〜約350mL、約20mL〜約300mL、約20mL〜約250mL、約20mL〜約200mL、約20mL〜約150mL、約20mL〜約100mL、約20mL〜約80mL、約20mL〜約60mL、約20mL〜約50mL、約20mL〜約40mL、約20mL〜約30mL、約20mL〜約25mL、約25mL〜約5L、約25mL〜約4.5L、約25mL〜約4.0L、約25mL〜約3.5L、約25mL〜約3.0L、約25mL〜約2.5L、約25mL〜約2L、約25mL〜約1.5L、約25mL〜約1L、約25mL〜約900mL、約25mL〜約800mL、約25mL〜約700mL、約25mL〜約600mL、約25mL〜約500mL、約25mL〜約450mL、約25mL〜約400mL、約25mL〜約350mL、約25mL〜約300mL、約25mL〜約250mL、約25mL〜約200mL、約25mL〜約150mL、約25mL〜約100mL、約25mL〜約80mL、約25mL〜約60mL、約25mL〜約50mL、約25mL〜約40mL、約25mL〜約30mL、約30mL〜約5L、約30mL〜約4.5L、約30mL〜約4.0L、約30mL〜約3.5L、約30mL〜約3.0L、約30mL〜約2.5L、約30mL〜約2L、約30mL〜約1.5L、約30mL〜約1L、約30mL〜約900mL、約30mL〜約800mL、約30mL〜約700mL、約30mL〜約600mL、約30mL〜約500mL、約30mL〜約450mL、約30mL〜約400mL、約30mL〜約350mL、約30mL〜約300mL、約30mL〜約250mL、約30mL〜約200mL、約30mL〜約150mL、約30mL〜約100mL、約30mL〜約80mL、約30mL〜約60mL、約30mL〜約50mL、約30mL〜約40mL、約40mL〜約5L、約40mL〜約4.5L、約40mL〜約4.0L、約40mL〜約3.5L、約40mL〜約3.0L、約40mL〜約2.5L、約40mL〜約2L、約40mL〜約1.5L、約40mL〜約1L、約40mL〜約900mL、約40mL〜約800mL、約40mL〜約700mL、約40mL〜約600mL、約40mL〜約500mL、約40mL〜約450mL、約40mL〜約400mL、約40mL〜約350mL、約40mL〜約300mL、約40mL〜約250mL、約40mL〜約200mL、約40mL〜約150mL、約40mL〜約100mL、約40mL〜約80mL、約40mL〜約60mL、約40mL〜約50mL、約50mL〜約5L、約50mL〜約4.5L、約50mL〜約4.0L、約50mL〜約3.5L、約50mL〜約3.0L、約50mL〜約2.5L、約50mL〜約2L、約50mL〜約1.5L、約50mL〜約1L、約50mL〜約900mL、約50mL〜約800mL、約50mL〜約700mL、約50mL〜約600mL、約50mL〜約500mL、約50mL〜約450mL、約50mL〜約400mL、約50mL〜約350mL、約50mL〜約300mL、約50mL〜約250mL、約50mL〜約200mL、約50mL〜約150mL、約50mL〜約100mL、約50mL〜約80mL、約50mL〜約60mL、約60mL〜約5L、約60mL〜約4.5L、約60mL〜約4.0L、約60mL〜約3.5L、約60mL〜約3.0L、約60mL〜約2.5L、約60mL〜約2L、約60mL〜約1.5L、約60mL〜約1L、約60mL〜約900mL、約60mL〜約800mL、約60mL〜約700mL、約60mL〜約600mL、約60mL〜約500mL、約60mL〜約450mL、約60mL〜約400mL、約60mL〜約350mL、約60mL〜約300mL、約60mL〜約250mL、約60mL〜約200mL、約60mL〜約150mL、約60mL〜約100mL、約60mL〜約80mL、約80mL〜約5L、約80mL〜約4.5L、約80mL〜約4.0L、約80mL〜約3.5L、約80mL〜約3.0L、約80mL〜約2.5L、約80mL〜約2L、約80mL〜約1.5L、約80mL〜約1L、約80mL〜約900mL、約80mL〜約800mL、約80mL〜約700mL、約80mL〜約600mL、約80mL〜約500mL、約80mL〜約450mL、約80mL〜約400mL、約80mL〜約350mL、約80mL〜約300mL、約80mL〜約250mL、約80mL〜約200mL、約80mL〜約150mL、約80mL〜約100mL、約100mL〜約5L、約100mL〜約4.5L、約100mL〜約4.0L、約100mL〜約3.5L、約100mL〜約3.0L、約100mL〜約2.5L、約100mL〜約2L、約100mL〜約1.5L、約100mL〜約1L、約100mL〜約900mL、約100mL〜約800mL、約100mL〜約700mL、約100mL〜約600mL、約100mL〜約500mL、約100mL〜約450mL、約100mL〜約400mL、約100mL〜約350mL、約100mL〜約300mL、約100mL〜約250mL、約100mL〜約200mL、約100mL〜約150mL、約150mL〜約5L、約150mL〜約4.5L、約150mL〜約4.0L、約150mL〜約3.5L、約150mL〜約3.0L、約150mL〜約2.5L、約150mL〜約2L、約150mL〜約1.5L、約150mL〜約1L、約150mL〜約900mL、約150mL〜約800mL、約150mL〜約700mL、約150mL〜約600mL、約150mL〜約500mL、約150mL〜約450mL、約150mL〜約400mL、約150mL〜約350mL、約150mL〜約300mL、約150mL〜約250mL、約150mL〜約200mL、約200mL〜約5L、約200mL〜約4.5L、約200mL〜約4.0L、約200mL〜約3.5L、約200mL〜約3.0L、約200mL〜約2.5L、約200mL〜約2L、約200mL〜約1.5L、約200mL〜約1L、約200mL〜約900mL、約200mL〜約800mL、約200mL〜約700mL、約200mL〜約600mL、約200mL〜約500mL、約200mL〜約450mL、約200mL〜約400mL、約200mL〜約350mL、約200mL〜約300mL、約200mL〜約250mL、約250mL〜約5L、約250mL〜約4.5L、約250mL〜約4.0L、約250mL〜約3.5L、約250mL〜約3.0L、約250mL〜約2.5L、約250mL〜約2L、約250mL〜約1.5L、約250mL〜約1L、約250mL〜約900mL、約250mL〜約800mL、約250mL〜約700mL、約250mL〜約600mL、約250mL〜約500mL、約250mL〜約450mL、約250mL〜約400mL、約250mL〜約350mL、約250mL〜約300mL、約300mL〜約5L、約300mL〜約4.5L、約300mL〜約4.0L、約300mL〜約3.5L、約300mL〜約3.0L、約300mL〜約2.5L、約300mL〜約2L、約300mL〜約1.5L、約300mL〜約1L、約300mL〜約900mL、約300mL〜約800mL、約300mL〜約700mL、約300mL〜約600mL、約300mL〜約500mL、約300mL〜約450mL、約300mL〜約400mL、約300mL〜約350mL、約350mL〜約5L、約350mL〜約4.5L、約350mL〜約4.0L、約350mL〜約3.5L、約350mL〜約3.0L、約350mL〜約2.5L、約350mL〜約2L、約350mL〜約1.5L、約350mL〜約1L、約350mL〜約900mL、約350mL〜約800mL、約350mL〜約700mL、約350mL〜約600mL、約350mL〜約500mL、約350mL〜約450mL、約350mL〜約400mL、約400mL〜約5L、
約400mL〜約4.5L、約400mL〜約4.0L、約400mL〜約3.5L、約400mL〜約3.0L、約400mL〜約2.5L、約400mL〜約2L、約400mL〜約1.5L、約400mL〜約1L、約400mL〜約900mL、約400mL〜約800mL、約400mL〜約700mL、約400mL〜約600mL、約400mL〜約500mL、約400mL〜約450mL、約450mL〜約5L、約450mL〜約4.5L、約450mL〜約4.0L、約450mL〜約3.5L、約450mL〜約3.0L、約450mL〜約2.5L、約450mL〜約2L、約450mL〜約1.5L、約450mL〜約1L、約450mL〜約900mL、約450mL〜約800mL、約450mL〜約700mL、約450mL〜約600mL、約450mL〜約500mL、約500mL〜約5L、約500mL〜約4.5L、約500mL〜約4.0L、約500mL〜約3.5L、約500mL〜約3.0L、約500mL〜約2.5L、約500mL〜約2L、約500mL〜約1.5L、約500mL〜約1L、約500mL〜約900mL、約500mL〜約800mL、約500mL〜約700mL、約500mL〜約600mL、約600mL〜約5L、約600mL〜約4.5L、約600mL〜約4.0L、約600mL〜約3.5L、約600mL〜約3.0L、約600mL〜約2.5L、約600mL〜約2L、約600mL〜約1.5L、約600mL〜約1L、約600mL〜約900mL、約600mL〜約800mL、約600mL〜約700mL、約700mL〜約5L、約700mL〜約4.5L、約700mL〜約4.0L、約700mL〜約3.5L、約700mL〜約3.0L、約700mL〜約2.5L、約700mL〜約2L、約700mL〜約1.5L、約700mL〜約1L、約700mL〜約900mL、約700mL〜約800mL、約800mL〜約5L、約800mL〜約4.5L、約800mL〜約4.0L、約800mL〜約3.5L、約800mL〜約3.0L、約800mL〜約2.5L、約800mL〜約2L、約800mL〜約1.5L、約800mL〜約1L、約800mL〜約900mL、約900mL〜約5L、約900mL〜約4.5L、約900mL〜約4.0L、約900mL〜約3.5L、約900mL〜約3.0L、約900mL〜約2.5L、約900mL〜約2L、約900mL〜約1.5L、約900mL〜約1L、約1L〜約5L、約1L〜約4.5L、約1L〜約4.0L、約1L〜約3.5L、約1L〜約3.0L、約1L〜約2.5L、約1L〜約2L、約1L〜約1.5L、約1.5L〜約5L、約1.5L〜約4.5L、約1.5L〜約4.0L、約1.5L〜約3.5L、約1.5L〜約3.0L、約1.5L〜約2.5L、約1.5L〜約2L、約2L〜約5L、約2L〜約4.5L、約2L〜約4.0L、約2L〜約3.5L、約2L〜約3.0L、約2L〜約2.5L、約2.5L〜約5L、約2.5L〜約4.5L、約2.5L〜約4.0L、約2.5L〜約3.5L、約2.5L〜約3.0L、約3.0L〜約5L、約3.0L〜約4.5L、約3.0L〜約4.0L、約3.0L〜約3.5L、約3.5L〜約5L、約3.5L〜約4.5L、約3.5L〜約4.0L、約4.0L〜約5L、約4.0L〜約4.5L、または約4.5L〜約5.0Lの容量(内部容量)を有し得る。一部の実施形態では、試験培養容器の高さと幅との比は、産生バイオリアクターの高さと幅との比とおよそ同じである。
一部の実施形態では、試験培養容器中に配置された液体培養培地の容量(培養の間)は、約0.5mL〜約1.5L、約0.5mL〜約1.4L、約0.5mL〜約1.3L、約0.5mL〜約1.2L、約0.5mL〜約1.1L、約0.5mL〜約1.0L、約0.5mL〜約900mL、約0.5mL〜約800mL、約0.5mL〜約700mL、約0.5mL〜約600mL、約0.5mL〜約500mL、約0.5mL〜約400mL、約0.5mL〜約300mL、約0.5mL〜約250mL、約0.5mL〜約200mL、約0.5mL〜約150mL、約0.5mL〜約100mL、約0.5mL〜約80mL、約0.5mL〜約60mL、約0.5mL〜約50mL、約0.5mL〜約40mL、約0.5mL〜約30mL、約0.5mL〜約25mL、約0.5mL〜約20mL、約0.5mL〜約10mL、約0.5mL〜約5mL、約0.5mL〜約2.5mL、約2.5mL〜約1.5L、約2.5mL〜約1.4L、約2.5mL〜約1.3L、約0.5mL〜約1.2L、約0.5mL〜約1.1L、約0.5mL〜約1.0L、約2.5mL〜約900mL、約2.5mL〜約800mL、約2.5mL〜約700mL、約2.5mL〜約600mL、約2.5mL〜約500mL、約2.5mL〜約400mL、約2.5mL〜約300mL、約2.5mL〜約250mL、約2.5mL〜約200mL、約2.5mL〜約150mL、約2.5mL〜約100mL、約2.5mL〜約80mL、約2.5mL〜約60mL、約2.5mL〜約50mL、約2.5mL〜約40mL、約2.5mL〜約30mL、約2.5mL〜約25mL、約2.5mL〜約20mL、約2.5mL〜約10mL、約2.5mL〜約5mL、約5mL〜約1.5L、約5mL〜約1.4L、約5mL〜約1.3L、約5mL〜約1.2L、約5mL〜約1.1L、約5mL〜約1.0L、約5mL〜約900mL、約5mL〜約800mL、約5mL〜約700mL、約5mL〜約600mL、約5mL〜約500mL、約5mL〜約400mL、約5mL〜約300mL、約5mL〜約250mL、約5mL〜約200mL、約5mL〜約150mL、約5mL〜約100mL、約5mL〜約80mL、約5mL〜約60mL、約5mL〜約50mL、約5mL〜約40mL、約5mL〜約30mL、約5mL〜約25mL、約5mL〜約20mL、約5mL〜約10mL、約10mL〜約1.5L、約10mL〜約1.4L、約10mL〜約1.3L、約10mL〜約1.2L、約10mL〜約1.1L、約10mL〜約1.0L、約10mL〜約900mL、約10mL〜約800mL、約10mL〜約700mL、約10mL〜約600mL、約10mL〜約500mL、約10mL〜約400mL、約10mL〜約300mL、約10mL〜約250mL、約10mL〜約200mL、約10mL〜約150mL、約10mL〜約100mL、約10mL〜約80mL、約10mL〜約60mL、約10mL〜約50mL、約10mL〜約40mL、約10mL〜約30mL、約10mL〜約25mL、約10mL〜約20mL、約20mL〜約1.5L、約20mL〜約1.4L、約20mL〜約1.3L、約20mL〜約1.2L、約20mL〜約1.1L、約20mL〜約1.0L、約20mL〜約900mL、約20mL〜約800mL、約20mL〜約700mL、約20mL〜約600mL、約20mL〜約500mL、約20mL〜約400mL、約20mL〜約300mL、約20mL〜約250mL、約20mL〜約200mL、約20mL〜約150mL、約20mL〜約100mL、約20mL〜約80mL、約20mL〜約60mL、約20mL〜約50mL、約20mL〜約40mL、約20mL〜約30mL、約20mL〜約25mL、約25mL〜約1.5L、約25mL〜約1.4L、約25mL〜約1.3L、約25mL〜約1.2L、約25mL〜約1.1L、約25mL〜約1.0L、約25mL〜約900mL、約25mL〜約800mL、約25mL〜約700mL、約25mL〜約600mL、約25mL〜約500mL、約25mL〜約400mL、約25mL〜約300mL、約25mL〜約250mL、約25mL〜約200mL、約25mL〜約150mL、約25mL〜約100mL、約25mL〜約80mL、約25mL〜約60mL、約25mL〜約50mL、約25mL〜約40mL、約25mL〜約30mL、約30mL〜約1.5L、約30mL〜約1.4L、約30mL〜約1.3L、約30mL〜約1.2L、約30mL〜約1.1L、約30mL〜約1.0L、約30mL〜約900mL、約30mL〜約800mL、約30mL〜約700mL、約30mL〜約600mL、約30mL〜約500mL、約30mL〜約400mL、約30mL〜約300mL、約30mL〜約250mL、約30mL〜約200mL、約30mL〜約150mL、約30mL〜約100mL、約30mL〜約80mL、約30mL〜約60mL、約30mL〜約50mL、約30mL〜約40mL、約40mL〜約1.5L、約40mL〜約1.4L、約40mL〜約1.3L、約40mL〜約1.2L、約40mL〜約1.1L、約40mL〜約1.0L、約40mL〜約900mL、約40mL〜約800mL、約40mL〜約700mL、約40mL〜約600mL、約40mL〜約500mL、約40mL〜約400mL、約40mL〜約300mL、約40mL〜約250mL、約40mL〜約200mL、約40mL〜約150mL、約40mL〜約100mL、約40mL〜約80mL、約40mL〜約60mL、約40mL〜約50mL、約50mL〜約1.5L、約50mL〜約1.4L、約50mL〜約1.3L、約50mL〜約1.2L、約50mL〜約1.1L、約50mL〜約1.0L、約50mL〜約900mL、約50mL〜約800mL、約50mL〜約700mL、約50mL〜約600mL、約50mL〜約500mL、約50mL〜約400mL、約50mL〜約300mL、約50mL〜約250mL、約50mL〜約200mL、約50mL〜約150mL、約50mL〜約100mL、約50mL〜約80mL、約50mL〜約60mL、約60mL〜約1.5L、約60mL〜約1.4L、約60mL〜約1.3L、約60mL〜約1.2L、約60mL〜約1.1L、約60mL〜約1.0L、約60mL〜約900mL、約60mL〜約800mL、約60mL〜約700mL、約60mL〜約600mL、約60mL〜約500mL、約60mL〜約400mL、約60mL〜約300mL、約60mL〜約250mL、約60mL〜約200mL、約60mL〜約150mL、約60mL〜約100mL、約60mL〜約80mL、約80mL〜約1.5L、約80mL〜約1.4L、約80mL〜約1.3L、約80mL〜約1.2L、約80mL〜約1.1L、約80mL〜約1.0L、約80mL〜約900mL、約80mL〜約800mL、約80mL〜約700mL、約80mL〜約600mL、約80mL〜約500mL、約80mL〜約400mL、約80mL〜約300mL、約80mL〜約250mL、約80mL〜約200mL、約80mL〜約150mL、約80mL〜約100mL、約100mL〜約1.5L、約100mL〜約1.4L、約100mL〜約1.3L、約100mL〜約1.2L、約100mL〜約1.1L、約100mL〜約1.0L、約100mL〜約900mL、約100mL〜約800mL、約100mL〜約700mL、約100mL〜約600mL、約100mL〜約500mL、約100mL〜約400mL、約100mL〜約300mL、約100mL〜約250mL、約100mL〜約200mL、約100mL〜約150mL、約150mL〜約1.5L、約150mL〜約1.4L、約150mL〜約1.3L、約150mL〜約1.2L、約150mL〜約1.1L、約150mL〜約1.0L、約150mL〜約900mL、約150mL〜約800mL、約150mL〜約700mL、約150mL〜約600mL、約150mL〜約500mL、約150mL〜約400mL、約150mL〜約300mL、約150mL〜約250mL、約150mL〜約200mL、約200mL〜約1.5L、約200mL〜約1.4L、約200mL〜約1.3L、約200mL〜約1.2L、約200mL〜約1.1L、約200mL〜約1.0L、約200mL〜約900mL、約200mL〜約800mL、約200mL〜約700mL、約200mL〜約600mL、約200mL〜約500mL、約200mL〜約400mL、約200mL〜約300mL、約200mL〜約250mL、約250mL〜約1.5L、約250mL〜約1.4L、約250mL〜約1.3L、約250mL〜約1.2L、約250mL〜約1.1L、約250mL〜約1.0L、約250mL〜約900mL、約250mL〜約800mL、約250mL〜約700mL、約250mL〜約600mL、約250mL〜約500mL、約250mL〜約400mL、約250mL〜約300mL、約300mL〜約1.5L、約300mL〜約1.4L、約300mL〜約1.3L、約300mL〜約1.2L、約300mL〜約1.1L、約300mL〜約1.0L、約300mL〜約900mL、約300mL〜約800mL、約300mL〜約700mL、約300mL〜約600mL、約300mL〜約500mL、約300mL〜約400mL、約400mL〜約1.5L、約400mL〜約1.4L、約400mL〜約1.3L、約400mL〜約1.2L、約400mL〜約1.1L、約400mL〜約1.0L、約400mL〜約900mL、約400mL〜約800mL、約400mL〜約700mL、約400mL〜約600mL、約400mL〜約500mL、約500mL〜約1.5L、約500mL〜約1.4L、約500mL〜約1.3L、約500mL〜約1.2L、約500mL〜約1.1L、約500mL〜約1.0L、約500mL〜約900mL、約500mL〜約800mL、約500mL〜約700mL、約500mL〜約600mL、約600mL〜約1.5L、約600mL〜約1.4L、約600mL〜約1.3L、約600mL〜約1.2L、約600mL〜約1.1L、約600mL〜約1.0L、約600mL〜約900mL、約600mL〜約800mL、約600mL〜約700mL、約700mL〜約1.5L、約700mL〜約1.4L、約700mL〜約1.3L、約700mL〜約1.2L、約700mL〜約1.1L、約700mL〜約1.0L、約700mL〜約900mL、約700mL〜約800mL、約800mL〜約1.5L、約800mL〜約1.4L、約800mL〜約1.3L、約800mL〜約1.2L、約800mL〜約1.1L、約800mL〜約1.0L、約800mL〜約900mL、約900mL〜約1.5L、約900mL〜約1.4L、約900mL〜約1.3L、約900mL〜約1.2L、約900mL〜約1.1L、約900mL〜約1.0L、約1.0L〜約1.5L、約1.0L〜約1.4L、約1.0L〜約1.3L、約1.0L〜約1.2L、約1.0L〜約1.1L、約1.1L〜約1.5L、約1.1L〜約1.4L、約1.1L〜約1.3L、約1.1L〜約1.2L、約1.2L〜約1.5L、約1.2L〜約1.4L、約1.2L〜約1.3L、約1.3L〜約1.5L、約1.3L〜約1.4L、または約1.4L〜約1.5Lの範囲であり得る。
一部の実施形態では、試験培養容器は、振盪フラスコ、例えば、バッフル付き振盪フラスコである。振盪フラスコは、例えば、約250mL〜約300mL、約300mL〜約400mLまたは約400mL〜約500mLの容量を有し得る。振盪フラスコは、少なくとも1つの気体透過性表面(例えば、滅菌したバリアとしても作用し得る気体透過性メンブレンを有する少なくとも1つの表面)および/または少なくとも1つのベント型キャップを含むことができる。振盪フラスコは、その外部表面に、振盪フラスコが組織培養インキュベータ(例えば、回転式インキュベータ)中に安定に配置されることを可能にする構造を有していてもよい。
振盪フラスコの内部表面は、少なくとも1つのコーティング(例えば、ゼラチン、コラーゲン、ポリ−L−オルニチン、ポリスチレンおよびラミニンの少なくとも1つのコーティング)を有してもよい。本明細書に記載される方法のいずれかにおいて使用することができる例示的な振盪フラスコは、Corning Inc.(Tewsbury、MA)、Presens(Brondby、Denmark)、Nalge−Nunc International(Rochester、NY)から購入することができる。例示的な振盪フラスコには、バッフル付き振盪フラスコもしくはErlenmeyerフラスコ、または当該分野で認識されたその任意の改変バージョンが含まれる。振盪フラスコ(例えば、異なる形状および寸法の振盪フラスコ)および振盪フラスコの内部表面コーティングのさらなる例は、当該分野で公知であり、本発明の方法において使用することができる。
一部の実施形態では、試験培養容器は、約125RPM〜約400RPM(例えば、約150RPM〜約350RPMまたは約200RPM〜約300RPM)の回転式撹拌を有し得る。例えば、試験培養容器は、約125RPM〜約400RPM、約125RPM〜約380RPM、約125RPM〜約360RPM、約125RPM〜約340RPM、約125RPM〜約320RPM、約125RPM〜約300RPM、約125RPM〜約280RPM、約125RPM〜約260RPM、約125RPM〜約240RPM、約125RPM〜約220RPM、約125RPM〜約200RPM、約125RPM〜約180RPM、約125RPM〜約160RPM、約125RPM〜約140RPM、約140RPM〜約400RPM、約140RPM〜約380RPM、約140RPM〜約360RPM、約140RPM〜約340RPM、約140RPM〜約320RPM、約140RPM〜約300RPM、約140RPM〜約280RPM、約140RPM〜約260RPM、約140RPM〜約240RPM、約140RPM〜約220RPM、約140RPM〜約200RPM、約140RPM〜約180RPM、約140RPM〜約160RPM、約160RPM〜約400RPM、約160RPM〜約380RPM、約160RPM〜約360RPM、約160RPM〜約340RPM、約160RPM〜約320RPM、約160RPM〜約300RPM、約160RPM〜約280RPM、約160RPM〜約260RPM、約160RPM〜約240RPM、約160RPM〜約220RPM、約160RPM〜約200RPM、約160RPM〜約180RPM、約180RPM〜約400RPM、約180RPM〜約380RPM、約180RPM〜約360RPM、約180RPM〜約340RPM、約180RPM〜約320RPM、約180RPM〜約300RPM、約180RPM〜約280RPM、約180RPM〜約260RPM、約180RPM〜約240RPM、約180RPM〜約220RPM、約180RPM〜約200RPM、約200RPM〜約400RPM、約200RPM〜約380RPM、約200RPM〜約360RPM、約200RPM〜約340RPM、約200RPM〜約320RPM、約200RPM〜約300RPM、約200RPM〜約280RPM、約200RPM〜約260RPM、約200RPM〜約240RPM、約200RPM〜約220RPM、約220RPM〜約400RPM、約220RPM〜約380RPM、約220RPM〜約360RPM、約220RPM〜約340RPM、約220RPM〜約320RPM、約220RPM〜約300RPM、約220RPM〜約280RPM、約220RPM〜約260RPM、約220RPM〜約240RPM、約240RPM〜約400RPM、約240RPM〜約380RPM、約240RPM〜約360RPM、約240RPM〜約340RPM、約240RPM〜約320RPM、約240RPM〜約300RPM、約240RPM〜約280RPM、約240RPM〜約260RPM、約260RPM〜約400RPM、約260RPM〜約380RPM、約260RPM〜約360RPM、約260RPM〜約340RPM、約260RPM〜約320RPM、約260RPM〜約300RPM、約260RPM〜約280RPM、約280RPM〜約400RPM、約280RPM〜約380RPM、約280RPM〜約360RPM、約280RPM〜約340RPM、約280RPM〜約320RPM、約280RPM〜約300RPM、約300RPM〜約400RPM、約300RPM〜約380RPM、約300RPM〜約360RPM、約300RPM〜約340RPM、約300RPM〜約320RPM、約320RPM〜約400RPM、約320RPM〜約380RPM、約320RPM〜約360RPM、約320RPM〜約340RPM、約340RPM〜約400RPM、約340RPM〜約380RPM、約340RPM〜約360RPM、約360RPM〜約400RPM、約360RPM〜約380RPM、または約380RPM〜約400RPMの回転式撹拌を有し得る。
一部の実施形態では、試験培養容器の回転式撹拌は、約25mm〜約50mmの間のスロー(軌道)直径を有する回転式インキュベータを使用して実施することができる。一部の実施形態では、試験培養容器は、約0ppm〜約5,000ppm(例えば、約0ppm〜約120ppm、約30ppm〜約120ppmまたは約50ppm〜約100ppm)の感作剤の濃度を有し得る。一部の実施形態では、試験培養容器は、0ppm〜約200ppm、0ppm〜約190ppm、0ppm〜約180ppm、0ppm〜約170ppm、0ppm〜約160ppm、0ppm〜約150ppm、0ppm〜約140ppm、0ppm〜約130ppm、0ppm〜約120ppm、0ppm〜約110ppm、0ppm〜約100ppm、0ppm〜約90ppm、0ppm〜約80ppm、0ppm〜約70ppm、0ppm〜約60ppm、0ppm〜約50ppm、0ppm〜約40ppm、0ppm〜約30ppm、0ppm〜約20ppm、0ppm〜約10ppm、約10ppm〜約200ppm、約10ppm〜約190ppm、約10ppm〜約180ppm、約10ppm〜約170ppm、約10ppm〜約160ppm、約10ppm〜約150ppm、約10ppm〜約140ppm、約10ppm〜約130ppm、約10ppm〜約120ppm、約10ppm〜約110ppm、約10ppm〜約100ppm、約10ppm〜約90ppm、約10ppm〜約80ppm、約10ppm〜約70ppm、約10ppm〜約60ppm、約10ppm〜約50ppm、約10ppm〜約40ppm、約10ppm〜約30ppm、約10ppm〜約20ppm、約20ppm〜約200ppm、約20ppm〜約190ppm、約20ppm〜約180ppm、約20ppm〜約170ppm、約20ppm〜約160ppm、約20ppm〜約150ppm、約20ppm〜約140ppm、約20ppm〜約130ppm、約20ppm〜約120ppm、約20ppm〜約110ppm、約20ppm〜約100ppm、約20ppm〜約90ppm、約20ppm〜約80ppm、約20ppm〜約70ppm、約20ppm〜約60ppm、約20ppm〜約50ppm、約20ppm〜約40ppm、約20ppm〜約30ppm、約30ppm〜約200ppm、約30ppm〜約190ppm、約30ppm〜約180ppm、約30ppm〜約170ppm、約30ppm〜約160ppm、約30ppm〜約150ppm、約30ppm〜約140ppm、約30ppm〜約130ppm、約30ppm〜約120ppm、約30ppm〜約110ppm、約30ppm〜約100ppm、約30ppm〜約90ppm、約30ppm〜約80ppm、約30ppm〜約70ppm、約30ppm〜約60ppm、約30ppm〜約50ppm、約30ppm〜約40ppm、約40ppm〜約200ppm、約40ppm〜約190ppm、約40ppm〜約180ppm、約40ppm〜約170ppm、約40ppm〜約160ppm、約40ppm〜約150ppm、約40ppm〜約140ppm、約40ppm〜約130ppm、約40ppm〜約120ppm、約40ppm〜約110ppm、約40ppm〜約100ppm、約40ppm〜約90ppm、約40ppm〜約80ppm、約40ppm〜約70ppm、約40ppm〜約60ppm、約40ppm〜約50ppm、約50ppm〜約200ppm、約50ppm〜約190ppm、約50ppm〜約180ppm、約50ppm〜約170ppm、約50ppm〜約160ppm、約50ppm〜約150ppm、約50ppm〜約140ppm、約50ppm〜約130ppm、約50ppm〜約120ppm、約50ppm〜約110ppm、約50ppm〜約100ppm、約50ppm〜約90ppm、約50ppm〜約80ppm、約50ppm〜約70ppm、約50ppm〜約60ppm、約60ppm〜約200ppm、約60ppm〜約190ppm、約60ppm〜約180ppm、約60ppm〜約170ppm、約60ppm〜約160ppm、約60ppm〜約150ppm、約60ppm〜約140ppm、約60ppm〜約130ppm、約60ppm〜約120ppm、約60ppm〜約110ppm、約60ppm〜約100ppm、約60ppm〜約90ppm、約60ppm〜約80ppm、約60ppm〜約70ppm、約70ppm〜約200ppm、約70ppm〜約190ppm、約70ppm〜約180ppm、約70ppm〜約170ppm、約70ppm〜約160ppm、約70ppm〜約150ppm、約70ppm〜約140ppm、約70ppm〜約130ppm、約70ppm〜約120ppm、約70ppm〜約110ppm、約70ppm〜約100ppm、約70ppm〜約90ppm、約70ppm〜約80ppm、約80ppm〜約200ppm、約80ppm〜約190ppm、約80ppm〜約180ppm、約80ppm〜約170ppm、約80ppm〜約160ppm、約80ppm〜約150ppm、約80ppm〜約140ppm、約80ppm〜約130ppm、約80ppm〜約120ppm、約80ppm〜約110ppm、約80ppm〜約100ppm、約80ppm〜約90ppm、約90ppm〜約200ppm、約90ppm〜約190ppm、約90ppm〜約180ppm、約90ppm〜約170ppm、約90ppm〜約160ppm、約90ppm〜約150ppm、約90ppm〜約140ppm、約90ppm〜約130ppm、約90ppm〜約120ppm、約90ppm〜約110ppm、約90ppm〜約100ppm、約100ppm〜約200ppm、約100ppm〜約190ppm、約100ppm〜約180ppm、約100ppm〜約170ppm、約100ppm〜約160ppm、約100ppm〜約150ppm、約100ppm〜約140ppm、約100ppm〜約130ppm、約100ppm〜約120ppm、約100ppm〜約110ppm、約110ppm〜約200ppm、約110ppm〜約190ppm、約110ppm〜約180ppm、約110ppm〜約170ppm、約110ppm〜約160ppm、約110ppm〜約150ppm、約110ppm〜約140ppm、約110ppm〜約130ppm、約110ppm〜約120ppm、約120ppm〜約200ppm、約120ppm〜約190ppm、約120ppm〜約180ppm、約120ppm〜約170ppm、約120ppm〜約160ppm、約120ppm〜約150ppm、約120ppm〜約140ppm、約120ppm〜約130ppm、約130ppm〜約200ppm、約130ppm〜約190ppm、約130ppm〜約180ppm、約130ppm〜約170ppm、約130ppm〜約160ppm、約130ppm〜約150ppm、約130ppm〜約140ppm、約140ppm〜約200ppm、約140ppm〜約190ppm、約140ppm〜約180ppm、約140ppm〜約170ppm、約140ppm〜約160ppm、約140ppm〜約150ppm、約150ppm〜約200ppm、約150ppm〜約190ppm、約150ppm〜約180ppm、約150ppm〜約170ppm、約150ppm〜約160ppm、約160ppm〜約200ppm、約160ppm〜約190ppm、約160ppm〜約180ppm、約160ppm〜約170ppm、約170ppm〜約200ppm、約170ppm〜約190ppm、約170ppm〜約180ppm、約180ppm〜約200ppm、約180ppm〜約190ppm、または約190ppm〜約200ppmの感作剤(例えば、消泡剤、例えば、本明細書に記載される消泡剤のいずれか)の濃度を有し得る(感作剤が、例えば、培養の間の期間にわたって、試験培養容器中に配置された液体培養培地中に存在する場合)。
一部の実施形態では、試験培養容器は、0ppm〜約5,000ppm、0ppm〜約4,500ppm、0ppm〜約4,000ppm、0ppm〜約3,500ppm、0ppm〜約3,000ppm、0ppm〜約2,500ppm、0ppm〜約2,000ppm、0ppm〜約1,500ppm、0ppm〜約1,000ppm、0ppm〜約800ppm、0ppm〜約600ppm、0ppm〜約500ppm、0ppm〜約450ppm、0ppm〜約400ppm、0ppm〜約350ppm、0ppm〜約300ppm、0ppm〜約250ppm、0ppm〜約200ppm、0ppm〜約150ppm、0ppm〜約140ppm、0ppm〜約120ppm、0ppm〜約100ppm、0ppm〜約80ppm、0ppm〜約60ppm、0ppm〜約50ppm、0ppm〜約40ppm、0ppm〜約30ppm、0ppm〜約20ppm、0ppm〜約10ppm、約10ppm〜約5,000ppm、約10ppm〜約4,500ppm、約10ppm〜約4,000ppm、約10ppm〜約3,500ppm、約10ppm〜約3,000ppm、約10ppm〜約2,500ppm、約10ppm〜約2,000ppm、約10ppm〜約1,500ppm、約10ppm〜約1,000ppm、約10ppm〜約800ppm、約10ppm〜約600ppm、約10ppm〜約500ppm、約10ppm〜約450ppm、約10ppm〜約400ppm、約10ppm〜約350ppm、約10ppm〜約300ppm、約10ppm〜約250ppm、約10ppm〜約200ppm、約10ppm〜約150ppm、約10ppm〜約140ppm、約10ppm〜約120ppm、約10ppm〜約100ppm、約10ppm〜約80ppm、約10ppm〜約60ppm、約10ppm〜約50ppm、約10ppm〜約40ppm、約10ppm〜約30ppm、約10ppm〜約20ppm、約20ppm〜約5,000ppm、約20ppm〜約4,500ppm、約20ppm〜約4,000ppm、約20ppm〜約3,500ppm、約20ppm〜約3,000ppm、約20ppm〜約2,500ppm、約20ppm〜約2,000ppm、約20ppm〜約1,500ppm、約20ppm〜約1,000ppm、約20ppm〜約800ppm、約20ppm〜約600ppm、約20ppm〜約500ppm、約20ppm〜約450ppm、約20ppm〜約400ppm、約20ppm〜約350ppm、約20ppm〜約300ppm、約20ppm〜約250ppm、約20ppm〜約200ppm、約20ppm〜約150ppm、約20ppm〜約140ppm、約20ppm〜約120ppm、約20ppm〜約100ppm、約20ppm〜約80ppm、約20ppm〜約60ppm、約20ppm〜約50ppm、約20ppm〜約40ppm、約20ppm〜約30ppm、約30ppm〜約5,000ppm、約30ppm〜約4,500ppm、約30ppm〜約4,000ppm、約30ppm〜約3,500ppm、約30ppm〜約3,000ppm、約30ppm〜約2,500ppm、約30ppm〜約2,000ppm、約30ppm〜約1,500ppm、約30ppm〜約1,000ppm、約30ppm〜約800ppm、約30ppm〜約600ppm、約30ppm〜約500ppm、約30ppm〜約450ppm、約30ppm〜約400ppm、約30ppm〜約350ppm、約30ppm〜約300ppm、約30ppm〜約250ppm、約30ppm〜約200ppm、約30ppm〜約150ppm、約30ppm〜約140ppm、約30ppm〜約120ppm、約30ppm〜約100ppm、約30ppm〜約80ppm、約30ppm〜約60ppm、約30ppm〜約50ppm、約30ppm〜約40ppm、約40ppm〜約5,000ppm、約40ppm〜約4,500ppm、約40ppm〜約4,000ppm、約40ppm〜約3,500ppm、約40ppm〜約3,000ppm、約40ppm〜約2,500ppm、約40ppm〜約2,000ppm、約40ppm〜約1,500ppm、約40ppm〜約1,000ppm、約40ppm〜約800ppm、約40ppm〜約600ppm、約40ppm〜約500ppm、約40ppm〜約450ppm、約40ppm〜約400ppm、約40ppm〜約350ppm、約40ppm〜約300ppm、約40ppm〜約250ppm、約40ppm〜約200ppm、約40ppm〜約150ppm、約40ppm〜約140ppm、約40ppm〜約120ppm、約40ppm〜約100ppm、約40ppm〜約80ppm、約40ppm〜約60ppm、約40ppm〜約50ppm、約50ppm〜約5,000ppm、約50ppm〜約4,500ppm、約50ppm〜約4,000ppm、約50ppm〜約3,500ppm、約50ppm〜約3,000ppm、約50ppm〜約2,500ppm、約50ppm〜約2,000ppm、約50ppm〜約1,500ppm、約50ppm〜約1,000ppm、約50ppm〜約800ppm、約50ppm〜約600ppm、約50ppm〜約500ppm、約50ppm〜約450ppm、約50ppm〜約400ppm、約50ppm〜約350ppm、約50ppm〜約300ppm、約50ppm〜約250ppm、約50ppm〜約200ppm、約50ppm〜約150ppm、約50ppm〜約140ppm、約50ppm〜約120ppm、約50ppm〜約100ppm、約50ppm〜約80ppm、約50ppm〜約60ppm、約60ppm〜約5,000ppm、約60ppm〜約4,500ppm、約60ppm〜約4,000ppm、約60ppm〜約3,500ppm、約60ppm〜約3,000ppm、約60ppm〜約2,500ppm、約60ppm〜約2,000ppm、約60ppm〜約1,500ppm、約60ppm〜約1,000ppm、約60ppm〜約800ppm、約60ppm〜約600ppm、約60ppm〜約500ppm、約60ppm〜約450ppm、約60ppm〜約400ppm、約60ppm〜約350ppm、約60ppm〜約300ppm、約60ppm〜約250ppm、約60ppm〜約200ppm、約60ppm〜約150ppm、約60ppm〜約140ppm、約60ppm〜約120ppm、約60ppm〜約100ppm、約60ppm〜約80ppm、約80ppm〜約5,000ppm、約80ppm〜約4,500ppm、約80ppm〜約4,000ppm、約80ppm〜約3,500ppm、約80ppm〜約3,000ppm、約80ppm〜約2,500ppm、約80ppm〜約2,000ppm、約80ppm〜約1,500ppm、約80ppm〜約1,000ppm、約80ppm〜約800ppm、約80ppm〜約600ppm、約80ppm〜約500ppm、約80ppm〜約450ppm、約80ppm〜約400ppm、約80ppm〜約350ppm、約80ppm〜約300ppm、約80ppm〜約250ppm、約80ppm〜約200ppm、約80ppm〜約150ppm、約80ppm〜約140ppm、約80ppm〜約120ppm、約80ppm〜約100ppm、約100ppm〜約5,000ppm、約100ppm〜約4,500ppm、約100ppm〜約4,000ppm、約100ppm〜約3,500ppm、約100ppm〜約3,000ppm、約100ppm〜約2,500ppm、約100ppm〜約2,000ppm、約100ppm〜約1,500ppm、約100ppm〜約1,000ppm、約100ppm〜約800ppm、約100ppm〜約600ppm、約100ppm〜約500ppm、約100ppm〜約450ppm、約100ppm〜約400ppm、約100ppm〜約350ppm、約100ppm〜約300ppm、約100ppm〜約250ppm、約100ppm〜約200ppm、約100ppm〜約150ppm、約100ppm〜約140ppm、約100ppm〜約120ppm、約120ppm〜約5,000ppm、約120ppm〜約4,500ppm、約120ppm〜約4,000ppm、約120ppm〜約3,500ppm、約120ppm〜約3,000ppm、約120ppm〜約2,500ppm、約120ppm〜約2,000ppm、約120ppm〜約1,500ppm、約120ppm〜約1,000ppm、約120ppm〜約800ppm、約120ppm〜約600ppm、約120ppm〜約500ppm、約120ppm〜約450ppm、約120ppm〜約400ppm、約120ppm〜約350ppm、約120ppm〜約300ppm、約120ppm〜約250ppm、約120ppm〜約200ppm、約120ppm〜約150ppm、約120ppm〜約140ppm、約140ppm〜約5,000ppm、約140ppm〜約4,500ppm、約140ppm〜約4,000ppm、約140ppm〜約3,500ppm、約140ppm〜約3,000ppm、約140ppm〜約2,500ppm、約140ppm〜約2,000ppm、約140ppm〜約1,500ppm、約140ppm〜約1,000ppm、約140ppm〜約800ppm、約140ppm〜約600ppm、約140ppm〜約500ppm、約140ppm〜約450ppm、約140ppm〜約400ppm、約140ppm〜約350ppm、約140ppm〜約300ppm、約140ppm〜約250ppm、約140ppm〜約200ppm、約140ppm〜約150ppm、約150ppm〜約5,000ppm、約150ppm〜約4,500ppm、約150ppm〜約4,000ppm、約150ppm〜約3,500ppm、約150ppm〜約3,000ppm、約150ppm〜約2,500ppm、約150ppm〜約2,000ppm、約150ppm〜約1,500ppm、約150ppm〜約1,000ppm、約150ppm〜約800ppm、約150ppm〜約600ppm、約150ppm〜約500ppm、約150ppm〜約450ppm、約150ppm〜約400ppm、約150ppm〜約350ppm、約150ppm〜約300ppm、約150ppm〜約250ppm、約150ppm〜約200ppm、約200ppm〜約5,000ppm、約200ppm〜約4,500ppm、約200ppm〜約4,000ppm、約200ppm〜約3,500ppm、約200ppm〜約3,000ppm、約200ppm〜約2,500ppm、約200ppm〜約2,000ppm、約200ppm〜約1,500ppm、約200ppm〜約1,000ppm、約200ppm〜約800ppm、約200ppm〜約600ppm、約200ppm〜約500ppm、約200ppm〜約450ppm、約200ppm〜約400ppm、約200ppm〜約350ppm、約200ppm〜約300ppm、約200ppm〜約250ppm、約250ppm〜約5,000ppm、約250ppm〜約4,500ppm、約250ppm〜約4,000ppm、約250ppm〜約3,500ppm、約250ppm〜約3,000ppm、約250ppm〜約2,500ppm、約250ppm〜約2,000ppm、約250ppm〜約1,500ppm、約250ppm〜約1,000ppm、約250ppm〜約800ppm、約250ppm〜約600ppm、約250ppm〜約500ppm、約250ppm〜約450ppm、約250ppm〜約400ppm、約250ppm〜約350ppm、約250ppm〜約300ppm、約300ppm〜約5,000ppm、約300ppm〜約4,500ppm、約300ppm〜約4,000ppm、
約300ppm〜約3,500ppm、約300ppm〜約3,000ppm、約300ppm〜約2,500ppm、約300ppm〜約2,000ppm、約300ppm〜約1,500ppm、約300ppm〜約1,000ppm、約300ppm〜約800ppm、約300ppm〜約600ppm、約300ppm〜約500ppm、約300ppm〜約450ppm、約300ppm〜約400ppm、約300ppm〜約350ppm、約350ppm〜約5,000ppm、約350ppm〜約4,500ppm、約350ppm〜約4,000ppm、約350ppm〜約3,500ppm、約350ppm〜約3,000ppm、約350ppm〜約2,500ppm、約350ppm〜約2,000ppm、約350ppm〜約1,500ppm、約350ppm〜約1,000ppm、約350ppm〜約800ppm、約350ppm〜約600ppm、約350ppm〜約500ppm、約350ppm〜約450ppm、約350ppm〜約400ppm、約400ppm〜約5,000ppm、約400ppm〜約4,500ppm、約400ppm〜約4,000ppm、約400ppm〜約3,500ppm、約400ppm〜約3,000ppm、約400ppm〜約2,500ppm、約400ppm〜約2,000ppm、約400ppm〜約1,500ppm、約400ppm〜約1,000ppm、約400ppm〜約800ppm、約400ppm〜約600ppm、約400ppm〜約500ppm、約400ppm〜約450ppm、約450ppm〜約5,000ppm、約450ppm〜約4,500ppm、約450ppm〜約4,000ppm、約450ppm〜約3,500ppm、約450ppm〜約3,000ppm、約450ppm〜約2,500ppm、約450ppm〜約2,000ppm、約450ppm〜約1,500ppm、約450ppm〜約1,000ppm、約450ppm〜約800ppm、約450ppm〜約600ppm、約450ppm〜約500ppm、約500ppm〜約5,000ppm、約500ppm〜約4,500ppm、約500ppm〜約4,000ppm、約500ppm〜約3,500ppm、約500ppm〜約3,000ppm、約500ppm〜約2,500ppm、約500ppm〜約2,000ppm、約500ppm〜約1,500ppm、約500ppm〜約1,000ppm、約500ppm〜約800ppm、約500ppm〜約600ppm、約600ppm〜約5,000ppm、約600ppm〜約4,500ppm、約600ppm〜約4,000ppm、約600ppm〜約3,500ppm、約600ppm〜約3,000ppm、約600ppm〜約2,500ppm、約600ppm〜約2,000ppm、約600ppm〜約1,500ppm、約600ppm〜約1,000ppm、約600ppm〜約800ppm、約800ppm〜約5,000ppm、約800ppm〜約4,500ppm、約800ppm〜約4,000ppm、約800ppm〜約3,500ppm、約800ppm〜約3,000ppm、約800ppm〜約2,500ppm、約800ppm〜約2,000ppm、約800ppm〜約1,500ppm、約800ppm〜約1,000ppm、約1,000ppm〜約5,000ppm、約1,000ppm〜約4,500ppm、約1,000ppm〜約4,000ppm、約1,000ppm〜約3,500ppm、約1,000ppm〜約3,000ppm、約1,000ppm〜約2,500ppm、約1,000ppm〜約2,000ppm、約1,000ppm〜約1,500ppm、約1,500ppm〜約5,000ppm、約1,500ppm〜約4,500ppm、約1,500ppm〜約4,000ppm、約1,500ppm〜約3,500ppm、約1,500ppm〜約3,000ppm、約1,500ppm〜約2,500ppm、約1,500ppm〜約2,000ppm、約2,000ppm〜約5,000ppm、約2,000ppm〜約4,500ppm、約2,000ppm〜約4,000ppm、約2,000ppm〜約3,500ppm、約2,000ppm〜約3,000ppm、約2,000ppm〜約2,500ppm、約2,500ppm〜約5,000ppm、約2,500ppm〜約4,500ppm、約2,500ppm〜約4,000ppm、約2,500ppm〜約3,500ppm、約2,500ppm〜約3,000ppm、約3,000ppm〜約5,000ppm、約3,000ppm〜約4,500ppm、約3,000ppm〜約4,000ppm、約3,000ppm〜約3,500ppm、約3,500ppm〜約5,000ppm、約3,500ppm〜約4,500ppm、約3,500ppm〜約4,000ppm、約4,000ppm〜約5,000ppm、約4,000ppm〜約4,500ppm、または約4,500ppm〜約5,000ppmの感作剤(例えば、消泡剤、例えば、本明細書に記載される消泡剤のいずれか)の濃度を有し得る(感作剤が、例えば、培養の間の期間にわたって、試験培養容器中に配置された液体培養培地中に存在する場合)。
一部の実施形態では、試験培養容器は、約1g/L〜約10g/L(例えば、約2g/L〜約8g/L、約3g/L〜約7g/L、約4g/L〜約6g/L、または約5g/L)である保護剤の濃度を有し得る。一部の実施形態では、試験培養容器は、約1.0g/L〜約10.0g/L、約1.0g/L〜約9.5g/L、約1.0g/L〜約9.0g/L、約1.0g/L〜約8.5g/L、約1.0g/L〜約8.0g/L、約1.0g/L〜約7.5g/L、約1.0g/L〜約7.0g/L、約1.0g/L〜約6.5g/L、約1.0g/L〜約6.0g/L、約1.0g/L〜約5.5g/L、約1.0g/L〜約5.0g/L、約1.0g/L〜約4.5g/L、約1.0g/L〜約4.0g/L、約1.0g/L〜約3.5g/L、約1.0g/L〜約3.0g/L、約1.0g/L〜約2.5g/L、約1.0g/L〜約2.0g/L、約1.0g/L〜約1.5g/L、約1.5g/L〜約10.0g/L、約1.5g/L〜約9.5g/L、約1.5g/L〜約9.0g/L、約1.5g/L〜約8.5g/L、約1.5g/L〜約8.0g/L、約1.5g/L〜約7.5g/L、約1.5g/L〜約7.0g/L、約1.5g/L〜約6.5g/L、約1.5g/L〜約6.0g/L、約1.5g/L〜約5.5g/L、約1.5g/L〜約5.0g/L、約1.5g/L〜約4.5g/L、約1.5g/L〜約4.0g/L、約1.5g/L〜約3.5g/L、約1.5g/L〜約3.0g/L、約1.5g/L〜約2.5g/L、約1.5g/L〜約2.0g/L、約2.0g/L〜約10.0g/L、約2.0g/L〜約9.5g/L、約2.0g/L〜約9.0g/L、約2.0g/L〜約8.5g/L、約2.0g/L〜約8.0g/L、約2.0g/L〜約7.5g/L、約2.0g/L〜約7.0g/L、約2.0g/L〜約6.5g/L、約2.0g/L〜約6.0g/L、約2.0g/L〜約5.5g/L、約2.0g/L〜約5.0g/L、約2.0g/L〜約4.5g/L、約2.0g/L〜約4.0g/L、約2.0g/L〜約3.5g/L、約2.0g/L〜約3.0g/L、約2.0g/L〜約2.5g/L、約2.5g/L〜約10.0g/L、約2.5g/L〜約9.5g/L、約2.5g/L〜約9.0g/L、約2.5g/L〜約8.5g/L、約2.5g/L〜約8.0g/L、約2.5g/L〜約7.5g/L、約2.5g/L〜約7.0g/L、約2.5g/L〜約6.5g/L、約2.5g/L〜約6.0g/L、約2.5g/L〜約5.5g/L、約2.5g/L〜約5.0g/L、約2.5g/L〜約4.5g/L、約2.5g/L〜約4.0g/L、約2.5g/L〜約3.5g/L、約2.5g/L〜約3.0g/L、約3.0g/L〜約10.0g/L、約3.0g/L〜約9.5g/L、約3.0g/L〜約9.0g/L、約3.0g/L〜約8.5g/L、約3.0g/L〜約8.0g/L、約3.0g/L〜約7.5g/L、約3.0g/L〜約7.0g/L、約3.0g/L〜約6.5g/L、約3.0g/L〜約6.0g/L、約3.0g/L〜約5.5g/L、約3.0g/L〜約5.0g/L、約3.0g/L〜約4.5g/L、約3.0g/L〜約4.0g/L、約3.0g/L〜約3.5g/L、約3.5g/L〜約10.0g/L、約3.5g/L〜約9.5g/L、約3.5g/L〜約9.0g/L、約3.5g/L〜約8.5g/L、約3.5g/L〜約8.0g/L、約3.5g/L〜約7.5g/L、約3.5g/L〜約7.0g/L、約3.5g/L〜約6.5g/L、約3.5g/L〜約6.0g/L、約3.5g/L〜約5.5g/L、約3.5g/L〜約5.0g/L、約3.5g/L〜約4.5g/L、約3.5g/L〜約4.0g/L、約4.0g/L〜約10.0g/L、約4.0g/L〜約9.5g/L、約4.0g/L〜約9.0g/L、約4.0g/L〜約8.5g/L、約4.0g/L〜約8.0g/L、約4.0g/L〜約7.5g/L、約4.0g/L〜約7.0g/L、約4.0g/L〜約6.5g/L、約4.0g/L〜約6.0g/L、約4.0g/L〜約5.5g/L、約4.0g/L〜約5.0g/L、約4.0g/L〜約4.5g/L、約4.5g/L〜約10.0g/L、約4.5g/L〜約9.5g/L、約4.5g/L〜約9.0g/L、約4.5g/L〜約8.5g/L、約4.5g/L〜約8.0g/L、約4.5g/L〜約7.5g/L、約4.5g/L〜約7.0g/L、約4.5g/L〜約6.5g/L、約4.5g/L〜約6.0g/L、約4.5g/L〜約5.5g/L、約4.5g/L〜約5.0g/L、約5.0g/L〜約10.0g/L、約5.0g/L〜約9.5g/L、約5.0g/L〜約9.0g/L、約5.0g/L〜約8.5g/L、約5.0g/L〜約8.0g/L、約5.0g/L〜約7.5g/L、約5.0g/L〜約7.0g/L、約5.0g/L〜約6.5g/L、約5.0g/L〜約6.0g/L、約5.0g/L〜約5.5g/L、約5.5g/L〜約10.0g/L、約5.5g/L〜約9.5g/L、約5.5g/L〜約9.0g/L、約5.5g/L〜約8.5g/L、約5.5g/L〜約8.0g/L、約5.5g/L〜約7.5g/L、約5.5g/L〜約7.0g/L、約5.5g/L〜約6.5g/L、約5.5g/L〜約6.0g/L、約6.0g/L〜約10.0g/L、約6.0g/L〜約9.5g/L、約6.0g/L〜約9.0g/L、約6.0g/L〜約8.5g/L、約6.0g/L〜約8.0g/L、約6.0g/L〜約7.5g/L、約6.0g/L〜約7.0g/L、約6.0g/L〜約6.5g/L、約6.5g/L〜約10.0g/L、約6.5g/L〜約9.5g/L、約6.5g/L〜約9.0g/L、約6.5g/L〜約8.5g/L、約6.5g/L〜約8.0g/L、約6.5g/L〜約7.5g/L、約6.5g/L〜約7.0g/L、約7.0g/L〜約10.0g/L、約7.0g/L〜約9.5g/L、約7.0g/L〜約9.0g/L、約7.0g/L〜約8.5g/L、約7.0g/L〜約8.0g/L、約7.0g/L〜約7.5g/L、約7.5g/L〜約10.0g/L、約7.5g/L〜約9.5g/L、約7.5g/L〜約9.0g/L、約7.5g/L〜約8.5g/L、約7.5g/L〜約8.0g/L、約8.0g/L〜約10.0g/L、約8.0g/L〜約9.5g/L、約8.0g/L〜約9.0g/L、約8.0g/L〜約8.5g/L、約8.5g/L〜約10.0g/L、約8.5g/L〜約9.5g/L、約8.5g/L〜約9.0g/L、約9.0g/L〜約10.0g/L、約9.0g/L〜約9.5g/L、または約9.5g/L〜約10.0g/Lの保護剤(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の保護剤のいずれか)の濃度を有し得る(保護剤が、例えば、培養の間の期間にわたって、試験培養容器中に配置された液体培養培地中に存在する場合)。
産生バイオリアクターは、灌流バイオリアクター、流加バイオリアクターまたは濃縮流加バイオリアクターであり得る。一部の実施形態では、産生バイオリアクターは、約5L〜約20,000L(例えば、約50L〜約10,000L)の容量を有し得る。一部の実施形態では、産生バイオリアクターは、5Lよりも大きい、10Lよりも大きい、50Lよりも大きい、100Lよりも大きい、1000Lよりも大きい、2000Lよりも大きい、5000Lよりも大きい、20000Lよりも大きい、100000Lよりも大きいまたは150000Lよりも大きい(例えば、1000Lよりも大きい)容量を有し得る。一部の実施形態では、産生バイオリアクターは、約5L〜約20,000L、約5L〜約18,000L、約5L〜約16,000L、約5L〜約14,000L、約5L〜約12,000L、約5L〜約10,000L、約5L〜約9,500L、約5L〜約9,000L、約5L〜約8,500L、約5L〜約8,000L、約5L〜約7,500L、約5L〜約7,000L、約5L〜約6,500L、約5L〜約6,000L、約5L〜約5,500L、約5L〜約5,000L、約5L〜約4,500L、約5L〜約4,000L、約5L〜約3,500L、約5L〜約3,000L、約5L〜約2,500L、約5L〜約2,000L、約5L〜約1,500L、約5L〜約1,000L、約5L〜約900L、約5L〜約800L、約5L〜約700L、約5L〜約600L、約5L〜約500L、約5L〜約400L、約5L〜約300L、約5L〜約250L、約5L〜約200L、約5L〜約150L、約5L〜約100L、約5L〜約80L、約5L〜約60L、約5L〜約50L、約5L〜約25L、約5L〜約10L、約10L〜約20,000L、約10L〜約18,000L、約10L〜約16,000L、約10L〜約14,000L、約10L〜約12,000L、約10L〜約10,000L、約10L〜約9,500L、約10L〜約9,000L、約10L〜約8,500L、約10L〜約8,000L、約10L〜約7,500L、約10L〜約7,000L、約10L〜約6,500L、約10L〜約6,000L、約10L〜約5,500L、約10L〜約5,000L、約10L〜約4,500L、約10L〜約4,000L、約10L〜約3,500L、約10L〜約3,000L、約10L〜約2,500L、約10L〜約2,000L、約10L〜約1,500L、約10L〜約1,000L、約10L〜約900L、約10L〜約800L、約10L〜約700L、約10L〜約600L、約10L〜約500L、約10L〜約400L、約10L〜約300L、約10L〜約250L、約10L〜約200L、約10L〜約150L、約10L〜約100L、約10L〜約80L、約10L〜約60L、約10L〜約50L、約10L〜約25L、約25L〜約20,000L、約25L〜約18,000L、約25L〜約16,000L、約25L〜約14,000L、約25L〜約12,000L、約25L〜約10,000L、約25L〜約9,500L、約25L〜約9,000L、約25L〜約8,500L、約25L〜約8,000L、約25L〜約7,500L、約25L〜約7,000L、約25L〜約6,500L、約25L〜約6,000L、約25L〜約5,500L、約25L〜約5,000L、約25L〜約4,500L、約25L〜約4,000L、約25L〜約3,500L、約25L〜約3,000L、約25L〜約2,500L、約25L〜約2,000L、約25L〜約1,500L、約25L〜約1,000L、約25L〜約900L、約25L〜約800L、約25L〜約700L、約25L〜約600L、約25L〜約500L、約25L〜約400L、約25L〜約300L、約25L〜約250L、約25L〜約200L、約25L〜約150L、約25L〜約100L、約25L〜約80L、約25L〜約60L、約25L〜約50L、約50L〜約20,000L、約50L〜約18,000L、約50L〜約16,000L、約50L〜約14,000L、約50L〜約12,000L、約50L〜約10,000L、約50L〜約9,500L、約50L〜約9,000L、約50L〜約8,500L、約50L〜約8,000L、約50L〜約7,500L、約50L〜約7,000L、約50L〜約6,500L、約50L〜約6,000L、約50L〜約5,500L、約50L〜約5,000L、約50L〜約4,500L、約50L〜約4,000L、約50L〜約3,500L、約50L〜約3,000L、約50L〜約2,500L、約50L〜約2,000L、約50L〜約1,500L、約50L〜約1,000L、約50L〜約900L、約50L〜約800L、約50L〜約700L、約50L〜約600L、約50L〜約500L、約50L〜約400L、約50L〜約300L、約50L〜約250L、約50L〜約200L、約50L〜約150L、約50L〜約100L、約50L〜約80L、約50L〜約60L、約60L〜約20,000L、約60L〜約18,000L、約60L〜約16,000L、約60L〜約14,000L、約60L〜約12,000L、約60L〜約10,000L、約60L〜約9,500L、約60L〜約9,000L、約60L〜約8,500L、約60L〜約8,000L、約60L〜約7,500L、約60L〜約7,000L、約60L〜約6,500L、約60L〜約6,000L、約60L〜約5,500L、約60L〜約5,000L、約60L〜約4,500L、約60L〜約4,000L、約60L〜約3,500L、約60L〜約3,000L、約60L〜約2,500L、約60L〜約2,000L、約60L〜約1,500L、約60L〜約1,000L、約60L〜約900L、約60L〜約800L、約60L〜約700L、約60L〜約600L、約60L〜約500L、約60L〜約400L、約60L〜約300L、約60L〜約250L、約60L〜約200L、約60L〜約150L、約60L〜約100L、約60L〜約80L、約80L〜約20,000L、約80L〜約18,000L、約80L〜約16,000L、約80L〜約14,000L、約80L〜約12,000L、約80L〜約10,000L、約80L〜約9,500L、約80L〜約9,000L、約80L〜約8,500L、約80L〜約8,000L、約80L〜約7,500L、約80L〜約7,000L、約80L〜約6,500L、約80L〜約6,000L、約80L〜約5,500L、約80L〜約5,000L、約80L〜約4,500L、約80L〜約4,000L、約80L〜約3,500L、約80L〜約3,000L、約80L〜約2,500L、約80L〜約2,000L、約80L〜約1,500L、約80L〜約1,000L、約80L〜約900L、約80L〜約800L、約80L〜約700L、約80L〜約600L、約80L〜約500L、約80L〜約400L、約80L〜約300L、約80L〜約250L、約80L〜約200L、約80L〜約150L、約80L〜約100L、約100L〜約20,000L、約100L〜約18,000L、約100L〜約16,000L、約100L〜約14,000L、約100L〜約12,000L、約100L〜約10,000L、約100L〜約9,500L、約100L〜約9,000L、約100L〜約8,500L、約100L〜約8,000L、約100L〜約7,500L、約100L〜約7,000L、約100L〜約6,500L、約100L〜約6,000L、約100L〜約5,500L、約100L〜約5,000L、約100L〜約4,500L、約100L〜約4,000L、約100L〜約3,500L、約100L〜約3,000L、約100L〜約2,500L、約100L〜約2,000L、約100L〜約1,500L、約100L〜約1,000L、約100L〜約900L、約100L〜約800L、約100L〜約700L、約100L〜約600L、約100L〜約500L、約100L〜約400L、約100L〜約300L、約100L〜約250L、約100L〜約200L、約100L〜約150L、約150L〜約20,000L、約150L〜約18,000L、約150L〜約16,000L、約150L〜約14,000L、約150L〜約12,000L、約150L〜約10,000L、約150L〜約9,500L、約150L〜約9,000L、約150L〜約8,500L、約150L〜約8,000L、約150L〜約7,500L、約150L〜約7,000L、約150L〜約6,500L、約150L〜約6,000L、約150L〜約5,500L、約150L〜約5,000L、約150L〜約4,500L、約150L〜約4,000L、約150L〜約3,500L、約150L〜約3,000L、約150L〜約2,500L、約150L〜約2,000L、約150L〜約1,500L、約150L〜約1,000L、約150L〜約900L、約150L〜約800L、約150L〜約700L、約150L〜約600L、約150L〜約500L、約150L〜約400L、約150L〜約300L、約150L〜約250L、約150L〜約200L、約200L〜約20,000L、約200L〜約18,000L、約200L〜約16,000L、約200L〜約14,000L、約200L〜約12,000L、約200L〜約10,000L、約200L〜約9,500L、約200L〜約9,000L、約200L〜約8,500L、約200L〜約8,000L、約200L〜約7,500L、約200L〜約7,000L、約200L〜約6,500L、約200L〜約6,000L、約200L〜約5,500L、約200L〜約5,000L、約200L〜約4,500L、約200L〜約4,000L、約200L〜約3,500L、約200L〜約3,000L、約200L〜約2,500L、約200L〜約2,000L、約200L〜約1,500L、約200L〜約1,000L、約200L〜約900L、約200L〜約800L、約200L〜約700L、約200L〜約600L、約200L〜約500L、約200L〜約400L、約200L〜約300L、約200L〜約250L、約250L〜約20,000L、約250L〜約18,000L、約250L〜約16,000L、約250L〜約14,000L、約250L〜約12,000L、約250L〜約10,000L、約250L〜約9,500L、約250L〜約9,000L、約250L〜約8,500L、約250L〜約8,000L、約250L〜約7,500L、約250L〜約7,000L、約250L〜約6,500L、約250L〜約6,000L、約250L〜約5,500L、約250L〜約5,000L、約250L〜約4,500L、約250L〜約4,000L、約250L〜約3,500L、約250L〜約3,000L、約250L〜約2,500L、約250L〜約2,000L、約250L〜約1,500L、約250L〜約1,000L、約250L〜約900L、約250L〜約800L、約250L〜約700L、約250L〜約600L、約250L〜約500L、約250L〜約400L、約250L〜約300L、約300L〜約20,000L、約300L〜約18,000L、約300L〜約16,000L、約300L〜約14,000L、約300L〜約12,000L、約300L〜約10,000L、約300L〜約9,500L、約300L〜約9,000L、約300L〜約8,500L、約300L〜約8,000L、約300L〜約7,500L、
約300L〜約7,000L、約300L〜約6,500L、約300L〜約6,000L、約300L〜約5,500L、約300L〜約5,000L、約300L〜約4,500L、約300L〜約4,000L、約300L〜約3,500L、約300L〜約3,000L、約300L〜約2,500L、約300L〜約2,000L、約300L〜約1,500L、約300L〜約1,000L、約300L〜約900L、約300L〜約800L、約300L〜約700L、約300L〜約600L、約300L〜約500L、約300L〜約400L、約400L〜約20,000L、約400L〜約18,000L、約400L〜約16,000L、約400L〜約14,000L、約400L〜約12,000L、約400L〜約10,000L、約400L〜約9,500L、約400L〜約9,000L、約400L〜約8,500L、約400L〜約8,000L、約400L〜約7,500L、約400L〜約7,000L、約400L〜約6,500L、約400L〜約6,000L、約400L〜約5,500L、約400L〜約5,000L、約400L〜約4,500L、約400L〜約4,000L、約400L〜約3,500L、約400L〜約3,000L、約400L〜約2,500L、約400L〜約2,000L、約400L〜約1,500L、約400L〜約1,000L、約400L〜約900L、約400L〜約800L、約400L〜約700L、約400L〜約600L、約400L〜約500L、約500L〜約20,000L、約500L〜約18,000L、約500L〜約16,000L、約500L〜約14,000L、約500L〜約12,000L、約500L〜約10,000L、約500L〜約9,500L、約500L〜約9,000L、約500L〜約8,500L、約500L〜約8,000L、約500L〜約7,500L、約500L〜約7,000L、約500L〜約6,500L、約500L〜約6,000L、約500L〜約5,500L、約500L〜約5,000L、約500L〜約4,500L、約500L〜約4,000L、約500L〜約3,500L、約500L〜約3,000L、約500L〜約2,500L、約500L〜約2,000L、約500L〜約1,500L、約500L〜約1,000L、約500L〜約900L、約500L〜約800L、約500L〜約700L、約500L〜約600L、約600L〜約20,000L、約600L〜約18,000L、約600L〜約16,000L、約600L〜約14,000L、約600L〜約12,000L、約600L〜約10,000L、約600L〜約9,500L、約600L〜約9,000L、約600L〜約8,500L、約600L〜約8,000L、約600L〜約7,500L、約600L〜約7,000L、約600L〜約6,500L、約600L〜約6,000L、約600L〜約5,500L、約600L〜約5,000L、約600L〜約4,500L、約600L〜約4,000L、約600L〜約3,500L、約600L〜約3,000L、約600L〜約2,500L、約600L〜約2,000L、約600L〜約1,500L、約600L〜約1,000L、約600L〜約900L、約600L〜約800L、約600L〜約700L、約700L〜約20,000L、約700L〜約18,000L、約700L〜約16,000L、約700L〜約14,000L、約700L〜約12,000L、約700L〜約10,000L、約700L〜約9,500L、約700L〜約9,000L、約700L〜約8,500L、約700L〜約8,000L、約700L〜約7,500L、約700L〜約7,000L、約700L〜約6,500L、約700L〜約6,000L、約700L〜約5,500L、約700L〜約5,000L、約700L〜約4,500L、約700L〜約4,000L、約700L〜約3,500L、約700L〜約3,000L、約700L〜約2,500L、約700L〜約2,000L、約700L〜約1,500L、約700L〜約1,000L、約700L〜約900L、約700L〜約800L、約800L〜約20,000L、約800L〜約18,000L、約800L〜約16,000L、約800L〜約14,000L、約800L〜約12,000L、約800L〜約10,000L、約800L〜約9,500L、約800L〜約9,000L、約800L〜約8,500L、約800L〜約8,000L、約800L〜約7,500L、約800L〜約7,000L、約800L〜約6,500L、約800L〜約6,000L、約800L〜約5,500L、約800L〜約5,000L、約800L〜約4,500L、約800L〜約4,000L、約800L〜約3,500L、約800L〜約3,000L、約800L〜約2,500L、約800L〜約2,000L、約800L〜約1,500L、約800L〜約1,000L、約800L〜約900L、約900L〜約20,000L、約900L〜約18,000L、約900L〜約16,000L、約900L〜約14,000L、約900L〜約12,000L、約900L〜約10,000L、約900L〜約9,500L、約900L〜約9,000L、約900L〜約8,500L、約900L〜約8,000L、約900L〜約7,500L、約900L〜約7,000L、約900L〜約6,500L、約900L〜約6,000L、約900L〜約5,500L、約900L〜約5,000L、約900L〜約4,500L、約900L〜約4,000L、約900L〜約3,500L、約900L〜約3,000L、約900L〜約2,500L、約900L〜約2,000L、約900L〜約1,500L、約900L〜約1,000L、約1,000L〜約20,000L、約1,000L〜約18,000L、約1,000L〜約16,000L、約1,000L〜約14,000L、約1,000L〜約12,000L、約1,000L〜約10,000L、約1,000L〜約9,500L、約1,000L〜約9,000L、約1,000L〜約8,500L、約1,000L〜約8,000L、約1,000L〜約7,500L、約1,000L〜約7,000L、約1,000L〜約6,500L、約1,000L〜約6,000L、約1,000L〜約5,500L、約1,000L〜約5,000L、約1,000L〜約4,500L、約1,000L〜約4,000L、約1,000L〜約3,500L、約1,000L〜約3,000L、約1,000L〜約2,500L、約1,000L〜約2,000L、約1,000L〜約1,500L、約1,500L〜約20,000L、約1,500L〜約18,000L、約1,500L〜約16,000L、約1,500L〜約14,000L、約1,500L〜約12,000L、約1,500L〜約10,000L、約1,500L〜約9,500L、約1,500L〜約9,000L、約1,500L〜約8,500L、約1,500L〜約8,000L、約1,500L〜約7,500L、約1,500L〜約7,000L、約1,500L〜約6,500L、約1,500L〜約6,000L、約1,500L〜約5,500L、約1,500L〜約5,000L、約1,500L〜約4,500L、約1,500L〜約4,000L、約1,500L〜約3,500L、約1,500L〜約3,000L、約1,500L〜約2,500L、約1,500L〜約2,000L、約2,000L〜約20,000L、約2,000L〜約18,000L、約2,000L〜約16,000L、約2,000L〜約14,000L、約2,000L〜約12,000L、約2,000L〜約10,000L、約2,000L〜約9,500L、約2,000L〜約9,000L、約2,000L〜約8,500L、約2,000L〜約8,000L、約2,000L〜約7,500L、約2,000L〜約7,000L、約2,000L〜約6,500L、約2,000L〜約6,000L、約2,000L〜約5,500L、約2,000L〜約5,000L、約2,000L〜約4,500L、約2,000L〜約4,000L、約2,000L〜約3,500L、約2,000L〜約3,000L、約2,000L〜約2,500L、約2,500L〜約20,000L、約2,500L〜約18,000L、約2,500L〜約16,000L、約2,500L〜約14,000L、約2,500L〜約12,000L、約2,500L〜約10,000L、約2,500L〜約9,500L、約2,500L〜約9,000L、約2,500L〜約8,500L、約2,500L〜約8,000L、約2,500L〜約7,500L、約2,500L〜約7,000L、約2,500L〜約6,500L、約2,500L〜約6,000L、約2,500L〜約5,500L、約2,500L〜約5,000L、約2,500L〜約4,500L、約2,500L〜約4,000L、約2,500L〜約3,500L、約2,500L〜約3,000L、約3,000L〜約20,000L、約3,000L〜約18,000L、約3,000L〜約16,000L、約3,000L〜約14,000L、約3,000L〜約12,000L、約3,000L〜約10,000L、約3,000L〜約9,500L、約3,000L〜約9,000L、約3,000L〜約8,500L、約3,000L〜約8,000L、約3,000L〜約7,500L、約3,000L〜約7,000L、約3,000L〜約6,500L、約3,000L〜約6,000L、約3,000L〜約5,500L、約3,000L〜約5,000L、約3,000L〜約4,500L、約3,000L〜約4,000L、約3,000L〜約3,500L、約3,500L〜約20,000L、約3,500L〜約18,000L、約3,500L〜約16,000L、約3,500L〜約14,000L、約3,500L〜約12,000L、約3,500L〜約10,000L、約3,500L〜約9,500L、約3,500L〜約9,000L、約3,500L〜約8,500L、約3,500L〜約8,000L、約3,500L〜約7,500L、約3,500L〜約7,000L、約3,500L〜約6,500L、約3,500L〜約6,000L、約3,500L〜約5,500L、約3,500L〜約5,000L、約3,500L〜約4,500L、約3,500L〜約4,000L、約4,000L〜約20,000L、約4,000L〜約18,000L、約4,000L〜約16,000L、約4,000L〜約14,000L、約4,000L〜約12,000L、約4,000L〜約10,000L、約4,000L〜約9,500L、約4,000L〜約9,000L、約4,000L〜約8,500L、約4,000L〜約8,000L、約4,000L〜約7,500L、約4,000L〜約7,000L、約4,000L〜約6,500L、約4,000L〜約6,000L、約4,000L〜約5,500L、約4,000L〜約5,000L、約4,000L〜約4,500L、約4,500L〜約20,000L、約4,500L〜約18,000L、約4,500L〜約16,000L、約4,500L〜約14,000L、約4,500L〜約12,000L、約4,500L〜約10,000L、約4,500L〜約9,500L、約4,500L〜約9,000L、約4,500L〜約8,500L、約4,500L〜約8,000L、約4,500L〜約7,500L、約4,500L〜約7,000L、約4,500L〜約6,500L、約4,500L〜約6,000L、約4,500L〜約5,500L、約4,500L〜約5,000L、約5,000L〜約20,000L、約5,000L〜約18,000L、約5,000L〜約16,000L、約5,000L〜約14,000L、約5,000L〜約12,000L、
約5,000L〜約10,000L、約5,000L〜約9,500L、約5,000L〜約9,000L、約5,000L〜約8,500L、約5,000L〜約8,000L、約5,000L〜約7,500L、約5,000L〜約7,000L、約5,000L〜約6,500L、約5,000L〜約6,000L、約5,000L〜約5,500L、約5,500L〜約20,000L、約5,500L〜約18,000L、約5,500L〜約16,000L、約5,500L〜約14,000L、約5,500L〜約12,000L、約5,500L〜約10,000L、約5,500L〜約9,500L、約5,500L〜約9,000L、約5,500L〜約8,500L、約5,500L〜約8,000L、約5,500L〜約7,500L、約5,500L〜約7,000L、約5,500L〜約6,500L、約5,500L〜約6,000L、約6,000L〜約20,000L、約6,000L〜約18,000L、約6,000L〜約16,000L、約6,000L〜約14,000L、約6,000L〜約12,000L、約6,000L〜約10,000L、約6,000L〜約9,500L、約6,000L〜約9,000L、約6,000L〜約8,500L、約6,000L〜約8,000L、約6,000L〜約7,500L、約6,000L〜約7,000L、約6,000L〜約6,500L、約6,500L〜約20,000L、約6,500L〜約18,000L、約6,500L〜約16,000L、約6,500L〜約14,000L、約6,500L〜約12,000L、約6,500L〜約10,000L、約6,500L〜約9,500L、約6,500L〜約9,000L、約6,500L〜約8,500L、約6,500L〜約8,000L、約6,500L〜約7,500L、約6,500L〜約7,000L、約7,000L〜約20,000L、約7,000L〜約18,000L、約7,000L〜約16,000L、約7,000L〜約14,000L、約7,000L〜約12,000L、約7,000L〜約10,000L、約7,000L〜約9,500L、約7,000L〜約9,000L、約7,000L〜約8,500L、約7,000L〜約8,000L、約7,000L〜約7,500L、約7,500L〜約20,000L、約7,500L〜約18,000L、約7,500L〜約16,000L、約7,500L〜約14,000L、約7,500L〜約12,000L、約7,500L〜約10,000L、約7,500L〜約9,500L、約7,500L〜約9,000L、約7,500L〜約8,500L、約7,500L〜約8,000L、約8,000L〜約20,000L、約8,000L〜約18,000L、約8,000L〜約16,000L、約8,000L〜約14,000L、約8,000L〜約12,000L、約8,000L〜約10,000L、約8,000L〜約9,500L、約8,000L〜約9,000L、約8,000L〜約8,500L、約8,500L〜約20,000L、約8,500L〜約18,000L、約8,500L〜約16,000L、約8,500L〜約14,000L、約8,500L〜約12,000L、約8,500L〜約10,000L、約8,500L〜約9,500L、約8,500L〜約9,000L、約9,000L〜約20,000L、約9,000L〜約18,000L、約9,000L〜約16,000L、約9,000L〜約14,000L、約9,000L〜約12,000L、約9,000L〜約10,000L、約9,000L〜約9,500L、約9,500L〜約20,000L、約9,500L〜約18,000L、約9,500L〜約16,000L、約9,500L〜約14,000L、約9,500L〜約12,000L、約9,500L〜約10,000L、約10,000L〜約20,000L、約10,000L〜約18,000L、約10,000L〜約16,000L、約10,000L〜約14,000L、約10,000L〜約12,000L、約12,000L〜約20,000L、約12,000L〜約18,000L、約12,000L〜約16,000L、約12,000L〜約14,000L、約14,000L〜約20,000L、約14,000L〜約18,000L、約14,000L〜約16,000L、約16,000L〜約20,000L、約16,000L〜約18,000L、または約18,000L〜約20,000Lの容量を有し得る。
一部の実施形態では、運転パラメーターは、細胞生存度または細胞死に関する任意のパラメーター(例えば、剪断応力、感作剤の濃度、保護剤の濃度、温度、pH、栄養素組成、バイオマス負荷および供給戦略)であり得る。細胞生存度または細胞死亡率は、乳酸デヒドロゲナーゼ(LDH)を発現できる細胞を使用することによって測定することができる。LDHを発現できる細胞が死ぬと、細胞中のLDHは、液体培養培地中に放出される。従って、細胞生存度または細胞死亡率は、LDHと直交して測定することができ、特異的LDH産生(sLDHp)と比例する(図3)。
図4は、プルロニック(例えば、保護剤)、感作剤および剪断(例えば、撹拌)が、特異的LDH産生にどのように影響し得るかを示す。図4に示されるように、保護剤は、細胞−気泡付着を減少させ、細胞の耐久力を増加させ、従って、高い細胞生存度を維持し、細胞を死から保護することができる。対照的に、感作剤は、細胞−気泡付着を増加させ、細胞の耐久力を減少させ、従って、細胞生存度を減少させことができる。これらのパラメーターは互いに相互関連するので、伝統的なモデルによって感作剤、撹拌および/または保護剤の正確な影響を予測することは、非常に困難な場合が多い。
図5は、小規模モデルにおける特異的LDH産生が、感作剤濃度、保護剤濃度および撹拌の関数であることを示す。これらのパラメーター間の相互作用に起因して、特異的LDH産生は通常、これらのパラメーターのいずれとも、線形の関連性を有さない。特異的LDH産生に対するこれらのパラメーターの影響は、実施要因計画、例えば、完全実施要因計画または一部実施要因計画によって決定することができる。
実施要因計画は、条件のセットの下で実験を実施することを含み、これらの条件は、パラメーター(例えば、運転パラメーター)のセットによって規定される。条件のセットにおいて、各パラメーターは、2つまたはそれ以上のレベルを有し得る。実施要因計画の目的は、異なるパラメーター(例えば、感作剤濃度、保護剤濃度および撹拌)間の主効果および相互作用効果を研究することである。用語「完全実施要因計画」は、全てのパラメーターにわたる異なるレベルの全ての可能な組み合わせを含む実験計画を指す。例えば、各々が2つのレベルをとる3つのパラメーター(即ち、要因)を用いる場合、完全実施要因計画は、合計で8つの組み合わせを有し、通常、2実施要因計画と呼ばれる(図6)。対照的に、用語「一部実施要因計画」は、完全実施要因計画の実験的実行の注意深く選択されたサブセット(一部)からなる実験計画を指す。このサブセットは、実験的実行およびリソースに関する完全実施要因計画の試みの一部を使用しつつ、研究される問題の最も重要な構成についての情報を明らかにするために効果の希薄性の原理を利用するように選択される。実施要因計画を実施することによって、運転不能な領域(例えば、運転を失敗させるパラメーターの値の組み合わせ)を同定することができる。実施要因計画は、当該分野で公知であり、例えば、Box,G.E.;Hunter,W.G.;Hunter,J.S.(2005).Statistics for Experimenters:Design,Innovation,and Discovery(第2版).Wiley.ISBN 0−471−71813−0;Vicente,Gemmaら、「Application of the factorial design of experiments and response surface methodology to optimize biodiesel production」、Industrial crops and products 8.1(1998):29〜35;Vandervoort,JoおよびAnnick Ludwig.「Biocompatible stabilizers in the preparation of PLGA nanoparticles:a factorial design study」、International journal of pharmaceutics 238.1〜2(2002):77〜92に記載される;これらは各々、その全体が参照によって本明細書に組み入れられる。
典型的な実施要因計画では、中心点(例えば、目的の領域)は、うまく予測されない場合が多い。従って、一部の実施形態では、実施要因計画は、中心複合計画(例えば、内接中心複合計画、外接中心複合計画または面心複合計画)と組み合わせて使用することができる(図7)。中心複合計画は、曲率の推定を可能にする一群の軸点で増補される、中心点を有する埋め込み実施要因または一部実施要因計画を含む実験計画である。複合計画は、当該分野で公知であり、中心複合計画に関する詳細な説明は、例えば、Box,G.E.;Hunter,W.G.;Hunter,J.S.(2005).Statistics for Experimenters:Design,Innovation,and Discovery(第2版).Wiley.ISBN 0−471−71813−0;Ahmadi,M.ら、「Application of the central composite design and response surface methodology to the advanced treatment of olive oil processing wastewater using Fenton’s peroxidation」、Journal of Hazardous Materials 123.1〜3(2005):187〜195において見出すことができる;これらは各々、その全体が参照によって本明細書に組み入れられる。
一部の実施形態では、試験条件は、完全実施要因スクリーニングおよび中心複合計画(例えば、内接中心複合計画)に基づいて選択される。完全実施要因スクリーニングおよび中心複合計画を組み合わせることによって、選択された試験条件は、目的の領域を最大化し、潜在的な失敗の領域を最小化することができる(図8および図9)。
試験培養容器におけるこれらの試験条件の実験結果は、選択されたパラメーター間の関連性を示す推定された等高線を提供する。小規模モデルの等高線が決定されると、この小規模モデルは、足りない値を予測するために使用することができる。例えば、消泡剤濃度または剪断応力が分かっているので、運転のためにどのくらいのプルロニックが要求されるかを予測することができる。この関連性は、異なる規模(例えば、小規模、ベンチトップ、産生など)にわたって細胞成長速度および死亡率を相関付けることによって決定される。
一部の実施形態では、小規模モデルの推定された等高線は、異なる規模(例えば、産生規模)において収集されたデータポイントを合致させるために使用することができる。感作剤および保護剤の濃度が既知であるので、等高線から、産生バイオリアクターにおける剪断応力に対応する小規模モデルにおける剪断応力を決定することが可能である(図10)。産生バイオリアクターにおける剪断応力に対応する剪断応力および感作剤の濃度に基づいて、保護剤濃度変化(Δ[保護剤])の影響を、推定された等高線から決定することができる(図11)。例えば、図11に示されるように、左端の点(円)、中央左の点(円)、中央右の点(円)および右端の点(円)は全て、同じ剪断応力および感作剤濃度を有する。影付きの領域は、運転不能な空間である。保護剤濃度を増加させる(中央右の点(円)から右端の点(円)まで、これら2つの点の間に示される矢印)ことによって、感作剤濃度の許容可能な範囲は増加し、感作剤に対するより良い回復力をもたらす。
従って、一部の実施形態では、本明細書に記載されるモデルは、異なるパラメーター間の相互作用的な影響を決定するために使用される。伝統的なモデルは通常、各パラメーターの影響を個々に研究する。本明細書に記載されるモデルは、各パラメーターの影響を個々に研究するのではなく、3つのパラメーターの影響を一度に研究できる。従って、本明細書に記載されるこのモデルは、任意の単一のパラメーターが変化される場合に、期待された細胞培養成績がどこに存在するかを予測することができる。
さらに、伝統的なスケールアップパラメーターは通常、細胞培養成績の予測を提供しない。本明細書に記載されるモデルは、産生規模に展開させた場合に失敗のより低い可能性をもたらすより良いガイダンスを用いて運転範囲を予測でき、他の伝統的なパラメーター(P/V、羽先端速度、混合時間、Ka)が満たされたときにスケールアップする能力を提供する。
一部の他の実施形態では、本明細書に記載されるモデルは、任意の個々のパラメーターまたはパラメーターの組み合わせ(例えば、プルロニック、消泡剤および剪断)を考慮して、任意の規模のリアクターのための運転計画空間を確立するために使用することができる。このモデルは、細胞培養物が所与の剪断条件について失敗の前に許容することができる消泡剤の最大量を決定するために使用することができる。
一部の実施形態では、このモデルは、プルロニック濃度が所与の剪断条件についてその効能を喪失する前に持続させることができる消泡剤の最大量を決定するために使用することができる。
一部の実施形態では、このモデルは、異なるプルロニックに対して異なる型の消泡剤(消泡剤C、オートクレーブされた消泡剤、照射された消泡剤など)を試験するために使用することができる。
一部の実施形態では、このモデルは、細胞密度範囲非依存的であり得、規模にわたって標準化するためにLDHを使用するので、強化された灌流培養のみに適用される必要はない。
一部の実施形態では、このモデルは、独立した添加(開始時に1回のボーラス)または毎日の添加のいずれかによって、消泡剤濃度を試験することもできる。
一部の実施形態では、このモデルは、消泡剤非活性化の後の反応速度論および細胞培養物に対するその影響について試験するために使用することができる。
細胞
本明細書で提供される方法は、種々の異なる細胞(例えば、哺乳動物細胞、細菌細胞および酵母細胞)を培養するために使用することができる。
細菌細胞の非限定的な例には、大腸菌、クロストリジウム・ディフィシル、クロストリジウム・スポロゲネス(Clostridium sporogenes)、クロストリジウム・ベイジェリンキおよびクロストリジウム・アセトブチリカムが含まれる。本明細書に記載される方法のいずれかにおいて使用される例示的な市販の細菌細胞には、BL21(DE3)(Novagen)、BL21(DE3)−pLysS(Novagen)、BL21 Star−pLysS(Invitrogen)、BL21−SI(Invitrogen)、BL21−AI(Invitrogen)、Tuner(Novagen)、Tuner pLysS(Novagen)、Origami(Novagen)、Origami D(Novagen)、Origami B pLysS(Novagen)、Rosetta(Novagen)、Rosetta pLysS(Novagen)、Rosetta−gami−pLysS(Novagen)、BL21 CodonPlus(Stratagene)、AD494(Novagen)、BL21trxB(Novagen)、HMS174(Novagen)、NovaBlue(DE3)(Novagen)、BLR(Novagen)、C41(DE3)(Lucigen)、C43(DE3)(Lucigen)、Lemo21(DE3)(New England BioLabs)、SHuffle T7(New England BioLabs)、ArticExpress(Agilent Technologies)およびArtic Express(DE3)(Agilent Technologies)が含まれる。
酵母細胞の非限定的な例には、以下が含まれる:出芽酵母、S.エクシグウス(S.exiguus)およびピキア・パストリス。本明細書に記載される方法のいずれかにおいて使用される酵母細胞のさらなる例には、サッカロマイセス属、ピキア属、クルイベロマイセス(Kluyveromyces)属、ハンゼヌラ属およびヤロウイア属由来のものが含まれる。本明細書に記載される方法のいずれかにおいて使用される酵母細胞のさらなる例は、Nielsen、Methods in Enzymology 536:133〜147、2014に記載されている。
本明細書に記載される方法のいずれかを使用して培養することができる哺乳動物細胞の非限定的な例には、以下が含まれる:チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞(例えば、CHO DG44細胞、CHO−K1s細胞およびCHO−DXB11細胞)、Sp2.0、骨髄腫細胞(例えば、NS/0)、B細胞、ハイブリドーマ細胞、T細胞、ヒト胎児由来腎臓(HEK)細胞(例えば、HEK 293EおよびHEK 293F)、アフリカミドリザル腎臓上皮細胞(Vero)細胞およびメイディン・ダービー・イヌ(コッカースパニエル)腎臓上皮細胞(MDCK)細胞。本明細書に記載される方法を使用して培養することができるさらなる哺乳動物細胞は、当該分野で公知である。本明細書に記載される方法のいずれかの非限定的な例では、培養の開始時に試験培養容器および/または産生バイオリアクター中に存在する哺乳動物細胞の濃度は、約0.1×10細胞/mL〜約10×10細胞/mL(例えば、約0.1×10細胞/mL〜約9×10細胞/mL、約0.1×10細胞/mL〜約8×10細胞/mL、約0.1×10細胞/mL〜約7×10細胞/mL、約0.1×10細胞/mL〜約6×10細胞/mL、約0.1×10細胞/mL〜約5×10細胞/mL、約0.1×10細胞/mL〜約4×10細胞/mL、約0.1×10細胞/mL〜約3×10細胞/mL、約0.1×10細胞/mL〜約2×10細胞/mL、約0.1×10細胞/mL〜約1.5×10細胞/mL、約0.1×10細胞/mL〜約1.0×10細胞/mL、約0.1×10細胞/mL〜約0.8×10細胞/mL、約0.1×10細胞/mL〜約0.5×10細胞/mL、約0.1×10細胞/mL〜約0.3×10細胞/mL、約0.2×10細胞/mL〜約10×10細胞/mL、約0.2×10細胞/mL〜約9×10細胞/mL、約0.2×10細胞/mL〜約8×10細胞/mL、約0.2×10細胞/mL〜約7×10細胞/mL、約0.2×10細胞/mL〜約6×10細胞/mL、約0.2×10細胞/mL〜約5×10細胞/mL、約0.2×10細胞/mL〜約4×10細胞/mL、約0.2×10細胞/mL〜約3×10細胞/mL、約0.2×10細胞/mL〜約2×10細胞/mL、約0.2×10細胞/mL〜約1.5×10細胞/mL、約0.2×10細胞/mL〜約1.0×10細胞/mL、約0.2×10細胞/mL〜約0.8×10細胞/mL、約0.2×10細胞/mL〜約0.5×10細胞/mL、約0.3×10細胞/mL〜約10×10細胞/mL、約0.3×10細胞/mL〜約9×10細胞/mL、約0.3×10細胞/mL〜約8×10細胞/mL、約0.3×10細胞/mL〜約7×10細胞/mL、約0.3×10細胞/mL〜約6×10細胞/mL、約0.3×10細胞/mL〜約5×10細胞/mL、約0.3×10細胞/mL〜約4×10細胞/mL、約0.3×10細胞/mL〜約3×10細胞/mL、約0.3×10細胞/mL〜約2×10細胞/mL、約0.3×10細胞/mL〜約1.5×10細胞/mL、約0.3×10細胞/mL〜約1.0×10細胞/mL、約0.3×10細胞/mL〜約0.8×10細胞/mL、約0.3×10細胞/mL〜約0.5×10細胞/mL、約0.5×10細胞/mL〜約10×10細胞/mL、約0.5×10細胞/mL〜約9×10細胞/mL、約0.5×10細胞/mL〜約8×10細胞/mL、約0.5×10細胞/mL〜約7×10細胞/mL、約0.5×10細胞/mL〜約6×10細胞/mL、約0.5×10細胞/mL〜約5×10細胞/mL、約0.5×10細胞/mL〜約4×10細胞/mL、約0.5×10細胞/mL〜約3×10細胞/mL、約0.5×10細胞/mL〜約2×10細胞/mL、約0.5×10細胞/mL〜約1.5×10細胞/mL、約0.5×10細胞/mL〜約1.0×10細胞/mL、約0.5×10細胞/mL〜約0.8×10細胞/mL、約0.8×10細胞/mL〜約10×10細胞/mL、約0.8×10細胞/mL〜約9×10細胞/mL、約0.8×10細胞/mL〜約8×10細胞/mL、約0.8×10細胞/mL〜約7×10細胞/mL、約0.8×10細胞/mL〜約6×10細胞/mL、約0.8×10細胞/mL〜約5×10細胞/mL、約0.8×10細胞/mL〜約4×10細胞/mL、約0.8×10細胞/mL〜約3×10細胞/mL、約0.8×10細胞/mL〜約2×10細胞/mL、約0.8×10細胞/mL〜約1.5×10細胞/mL、約0.8×10細胞/mL〜約1.0×10細胞/mL、約1.0×10細胞/mL〜約10×10細胞/mL、約1.0×10細胞/mL〜約9×10細胞/mL、約1.0×10細胞/mL〜約8×10細胞/mL、約1.0×10細胞/mL〜約7×10細胞/mL、約1.0×10細胞/mL〜約6×10細胞/mL、約1.0×10細胞/mL〜約5×10細胞/mL、約1.0×10細胞/mL〜約4×10細胞/mL、約1.0×10細胞/mL〜約3×10細胞/mL、約1.0×10細胞/mL〜約2×10細胞/mL、約1.0×10細胞/mL〜約1.5×10細胞/mL、約1.5×10細胞/mL〜約10×10細胞/mL、約1.5×10細胞/mL〜約9×10細胞/mL、約1.5×10細胞/mL〜約8×10細胞/mL、約1.5×10細胞/mL〜約7×10細胞/mL、約1.5×10細胞/mL〜約6×10細胞/mL、約1.5×10細胞/mL〜約5×10細胞/mL、約1.5×10細胞/mL〜約4×10細胞/mL、約1.5×10細胞/mL〜約3×10細胞/mL、約1.5×10細胞/mL〜約2×10細胞/mL、約2×10細胞/mL〜約10×10細胞/mL、約2×10細胞/mL〜約9×10細胞/mL、約2×10細胞/mL〜約8×10細胞/mL、約2×10細胞/mL〜約7×10細胞/mL、約2×10細胞/mL〜約6×10細胞/mL、約2×10細胞/mL〜約5×10細胞/mL、約2×10細胞/mL〜約4×10細胞/mL、約2×10細胞/mL〜約3×10細胞/mL、約3×10細胞/mL〜約10×10細胞/mL、約3×10細胞/mL〜約9×10細胞/mL、約3×10細胞/mL〜約8×10細胞/mL、約3×10細胞/mL〜約7×10細胞/mL、約3×10細胞/mL〜約6×10細胞/mL、約3×10細胞/mL〜約5×10細胞/mL、約3×10細胞/mL〜約4×10細胞/mL、約4×10細胞/mL〜約10×10細胞/mL、約4×10細胞/mL〜約9×10細胞/mL、約4×10細胞/mL〜約8×10細胞/mL、約4×10細胞/mL〜約7×10細胞/mL、約4×10細胞/mL〜約6×10細胞/mL、約4×10細胞/mL〜約5×10細胞/mL、約5×10細胞/mL〜約10×10細胞/mL、約5×10細胞/mL〜約9×10細胞/mL、約5×10細胞/mL〜約8×10細胞/mL、約5×10細胞/mL〜約7×10細胞/mL、約5×10細胞/mL〜約6×10細胞/mL、約6×10細胞/mL〜約10×10細胞/mL、約6×10細胞/mL〜約9×10細胞/mL、約6×10細胞/mL〜約8×10細胞/mL、約6×10細胞/mL〜約7×10細胞/mL、約7×10細胞/mL〜約10×10細胞/mL、約7×10細胞/mL〜約9×10細胞/mL、約7×10細胞/mL〜約8×10細胞/mL、約8×10細胞/mL〜約10×10細胞/mL、約8×10細胞/mL〜約9×10細胞/mL、または約9×10細胞/mL〜約10×10細胞/mL)である。
細胞(例えば、哺乳動物細胞)は、組換え治療タンパク質(例えば、細胞によって分泌される組換え治療タンパク質)をコードする組換え核酸(例えば、細胞のゲノム中に安定に組み込まれた核酸)を含み得る。組換え治療タンパク質の非限定的な例は、本明細書に記載され、当該分野で公知である。
組換え治療タンパク質
組換え治療タンパク質は、細胞(例えば、哺乳動物細胞)によって細胞培養物の液体培養培地中に放出される分泌されるタンパク質であり得る。例えば、可溶性組換えタンパク質をコードする核酸配列は、組換えタンパク質のN末端またはC末端に分泌シグナルペプチドをコードする配列を含むことができ、この組換えタンパク質は、細胞(例えば、哺乳動物細胞)中に存在する酵素によって切断され、細胞培養物の液体培養培地中に引き続いて放出される。他の例では、組換えタンパク質は、分泌されない可溶性タンパク質であり、組換えタンパク質は、細胞(例えば、哺乳動物細胞)内から回収される。
組換えタンパク質の非限定的な例には、免疫グロブリン(軽鎖および重鎖免疫グロブリンを含む)、抗体もしくは抗体断片(例えば、本明細書に記載される抗体断片のいずれか)、酵素(例えば、ガラクトシダーゼ(例えば、アルファ−ガラクトシダーゼ)、MyozymeまたはCerezyme)、タンパク質(例えば、ヒトエリスロポエチン、腫瘍壊死因子(TNF)またはインターフェロンアルファもしくはベータ)、または免疫原性もしくは抗原性タンパク質もしくはタンパク質断片(例えば、ワクチンにおける使用のためのタンパク質)が含まれる。一部の実施形態では、組換えタンパク質は、少なくとも1つの多機能性組換えタンパク質足場を含む操作された抗原結合ポリペプチドである(例えば、Gebauerら、Current Opin.Chem.Biol.13:245〜255、2009;および米国特許出願公開第2012/0164066号(その全体が参照によって本明細書に組み入れられる)に記載される組換え抗原結合タンパク質を参照のこと)。抗体である組換えタンパク質の非限定的な例には、以下が含まれる:パニツムマブ、オマリズマブ、アバゴボマブ(abagovomab)、アブシキシマブ、アクトクスマブ(actoxumab)、アダリムマブ、アデカツムマブ(adecatumumab)、アフェリモマブ、アフツズマブ、アラシズマブ(alacizumab)、アレムツズマブ、アリロクマブ、アルツモマブ(altumomab)、アマツキシマブ、アナツモマブ(anatumomab)、アポリズマブ、アチムマブ(atinumab)、トシリズマブ、バシリキシマブ、ベクツモマブ(bectumomab)、ベリムマブ、ベバシズマブ、ビシロマブ(biciromab)、カナキヌマブ、セツキシマブ、ダクリズマブ、デノスマブ、エクリズマブ、エドレコロマブ、エファリズマブ、エフングマブ(efungumab)、エルツマキソマブ(ertumaxomab)、エタラシズマブ(etaracizumab)、ゴリムマブ、インフリキシマブ、ナタリズマブ、パリビズマブ、パニツムマブ、ペルツズマブ、ラニビズマブ、リツキシマブ、トシリズマブおよびトラスツズマブ。治療抗体のさらなる例は、当該分野で公知である。組換えタンパク質のさらなる非限定的な例には、以下が含まれる:アルグルコシダーゼアルファ、ラロニダーゼ、アバタセプト、ガルスルファーゼ、ルトロピンアルファ、抗血友病因子、アガルシダーゼベータ、インターフェロンベータ−1a、ダルベポエチンアルファ、テネクテプラーゼ、エタネルセプト、凝固第IX因子、卵胞刺激ホルモン、インターフェロンベータ−1a、イミグルセラーゼ、ドルナーゼアルファ、エポエチンアルファおよびアルテプラーゼ。
分泌された可溶性組換えタンパク質は、液体培養培地から回収することができる。例えば、遠心分離、濾過、ピペッティングおよび/または吸引を含む、細胞(例えば、哺乳動物細胞)から液体培養培地を除去するための種々の異なる方法が、当該分野で公知である。次いで、分泌された組換えタンパク質は、種々の型のクロマトグラフィー(例えば、アフィニティクロマトグラフィー、分子ふるいクロマトグラフィー、カチオン交換クロマトグラフィーまたはアニオン交換クロマトグラフィー)および/または濾過(例えば、分子量カットオフ濾過)を含む種々の生化学的技術を使用して、液体培養培地から回収し、さらに精製することができる。
細胞内組換えタンパク質を回収するために、細胞(例えば、哺乳動物細胞)は溶解される。例えば、超音波処理ならびに/または界面活性剤、酵素的および/もしくは化学的溶解を含む、細胞(例えば、哺乳動物細胞)を溶解させるための広範な種々の方法が、当該分野で公知である。組換えタンパク質は、細胞デブリを除去するための遠心分離の工程で典型的には開始し、1つまたはそれ以上のさらなる工程(例えば、1つまたはそれ以上の型のクロマトグラフィー(例えば、アフィニティクロマトグラフィー、分子ふるいクロマトグラフィー、カチオン交換クロマトグラフィーまたはアニオン交換クロマトグラフィー)および/または濾過(例えば、分子量カットオフ濾過))が後に続く、当該分野で公知の種々の生化学的方法を使用して、細胞溶解物(例えば、哺乳動物細胞溶解物)から精製することができる。
一部の実施形態では、回収された組換えタンパク質は、少なくとも50重量%純粋もしくは約50重量%純粋、例えば、少なくとも55重量%純粋もしくは約55重量%純粋、少なくとも60重量%純粋、少なくとも65重量%純粋、少なくとも70重量%純粋、少なくとも75重量%純粋、少なくとも80重量%純粋、少なくとも85重量%純粋、少なくとも90重量%純粋、少なくとも95重量%純粋、少なくとも96重量%純粋、少なくとも97重量%純粋、少なくとも98重量%純粋、もしくは少なくとも99重量%純粋もしくは約99重量%純粋、または99重量%よりも高く純粋である。
一部の実施形態では、回収された組換えタンパク質は、ヒト中の同じネイティブタンパク質と比較して、1つまたはそれ以上の異なる生物物理学的特性(例えば、グリコシル化の型もしくは量における差異、リン酸化における差異、アシル化における差異、メタル化もしくは金属化学量論における差異および/または補因子結合における差異)を有する組換えヒト治療タンパク質である。
本明細書に記載される方法のいずれかによって産生される組換え治療タンパク質もまた、本明細書で提供される。
液体培養培地
液体培養培地は、当該分野で公知である。液体培養培地には、哺乳動物血清(例えば、胎仔ウシ血清およびウシ血清)および/または成長ホルモンもしくは増殖因子(例えば、インスリン、トランスフェリンおよび上皮増殖因子)を補充することができる。あるいはまたはさらに、液体培養培地は、化学的に規定された液体培養培地、動物由来成分なしの液体培養培地、無血清液体培養培地または血清含有液体培養培地であり得る。化学的に規定された液体培養培地、動物由来成分なしの液体培養培地、無血清液体培養培地および血清含有液体培養培地の非限定的な例は、市販されている。
液体培養培地は、典型的には、エネルギー源(例えば、炭水化物、例えば、グルコース)、必須アミノ酸(例えば、20種のアミノ酸プラスシステインの基本セット)、ビタミンおよび/もしくは低濃度で必要とされる他の有機化合物、遊離脂肪酸ならびに/または微量元素を含む。液体培養培地には、必要に応じて、例えば、哺乳動物ホルモンもしくは増殖因子(例えば、インスリン、トランスフェリンまたは上皮増殖因子)、塩および緩衝剤(例えば、カルシウム、マグネシウムおよびリン酸塩)、ヌクレオシドおよび塩基(例えば、アデノシン、チミジンおよびヒポキサンチン)、タンパク質および組織加水分解物、ならびに/またはこれらもしくは他の添加剤の任意の組み合わせを補充することができる。
本明細書に記載される方法において特に有用な液体培養培地の非限定的な例には、例えば、CD CHO、Opti CHOおよびForti CHO(全て、Life Technologies;Grand Island、NYから入手可能)、Hycell CHO培地(Thermo Fisher Scientific,Inc.;Waltham、MA)、Ex−cell CD CHO Fusion培地(Sigma−Aldrich Co.;St.Louis、MO)およびPowerCHO培地(Lonza Group、Ltd.;Basel、Switzerland)が含まれる。本発明の方法においても有用であり得る培地成分には、化学的に規定された(CD)加水分解物、例えば、CDペプトン、CDポリペプチド(2つまたはそれ以上のアミノ酸)およびCD増殖因子が含まれるがこれらに限定されない。液体組織培養培地および培地成分のさらなる例は、当該分野で公知である。
灌流培養
細胞の培養は、灌流培養を使用して実施することができる。容器における細胞(例えば、哺乳動物細胞)の灌流培養は、第1の容量の第1の液体培養培地(例えば、任意の濃度の哺乳動物細胞を含む、例えば、細胞を実質的に含まない第1の容量の第1の液体培養培地)の容器からの除去、および第1の液体培養培地への第2の容量の第2の液体培養培地の添加を含む。除去および添加は、同時にもしくは順次、またはそれら2つの組み合わせで実施することができる。さらに、除去および添加は、(例えば、任意の所与の期間にわたり(例えば、24時間の期間にわたり、約1時間〜約24時間の増分期間にわたり、または24時間よりも長い増分期間にわたり)、容器の容量または第1の液体培養培地容量の0.1%〜800%の間(例えば、1%と700%との間、1%と600%との間、1%と500%との間、1%と400%との間、1%と350%との間、1%と300%との間、1%と250%との間、1%と100%との間、100%と200%との間、5%と150%との間、10%と50%との間、15%と40%との間、8%と80%との間および4%と30%との間)の容量を除去および置換する速度で)継続的に、もしくは周期的に(例えば、3日に1回、1日おきに一回、1日1回、1日2回、1日3回、1日4回または1日5回)、またはそれらの任意の組み合わせで実施することができる。周期的に実施される場合、(例えば、約24時間の期間以内、約1時間〜約24時間の増分期間以内、または24時間よりも長い増分期間以内に)除去または置換される容量は、例えば、容器の容量または第1の液体培養培地容量の0.1%〜800%の間(例えば、1%と700%との間、1%と600%との間、1%と500%との間、1%と400%との間、1%と300%との間、1%と200%との間、1%と100%との間、100%と200%との間、5%と150%との間、10%と50%との間、15%と40%との間、8%と80%との間および4%と30%との間)であり得る。除去される第1の液体培養培地の第1の容量および添加される第2の液体培養培地の第2の容量は、一部の場合には、培養期間の全体または一部にわたって、各24時間の期間(またはあるいは、約1時間〜約24時間の増分期間もしくは24時間よりも長い増分期間)にわたっておよそ同じに維持することができる。当該分野で公知のように、第1の容量の第1の液体培養培地が除去される速度(容量/時間の単位)および第2の容量の第2の液体培養培地が添加される速度(容量/時間の単位)は、変動させることができる。第1の容量の第1の液体培養培地が除去される速度(容量/時間の単位)および第2の容量の第2の液体培養培地が添加される速度(容量/時間の単位)は、おおよそ同じであり得る、または異なり得る。
あるいは、除去および添加される容量は、培養期間の間に、各24時間の期間(またはあるいは、1時間と約24時間との間の増分期間もしくは24時間よりも長い増分期間)にわたって変化(例えば、徐々に増加)し得る。例えば、培養期間にわたる各24時間の期間(またはあるいは、約1時間と24時間超との間の増分期間もしくは24時間よりも長い増分期間)以内に除去される第1の液体培養培地の容量および添加される第2の液体培養培地の容量は、容器容量または第1の液体培養培地容量の0.5%〜約20%から容器容量または第1の液体培養培地容量の約25%〜約150%までの間の容量から、培養期間にわたって増加(例えば、徐々にまたはずれた増分を介して)させることができる。
当業者は、第1の液体培養培地と第2の液体培養培地とが、同じ型の培地であり得ることを理解する。他の例では、第1の液体培養培地と第2の液体培養培地とは、異なり得る。
第1の容量の第1の液体培養培地は、例えば、容器から第1の容量の第1の液体培養培地を(例えば、バイオリアクターから、細胞を実質的に含まない第1の容量の第1の液体培養培地を)除去できる機械システムによって除去することができる。あるいはまたはさらに、第1の容量の第1の液体培養培地は、細胞(例えば、哺乳動物細胞)を排除する分子量カットオフを有する滅菌したメンブレンを介した第1の容量の第1の液体培養培地の浸出または重力流によって除去することができる。
第2の容量の第2の液体培養培地は、例えば、灌流ポンプによって、自動様式で第1の液体培養培地に添加することができる。
一部の例では、第1の容量の第1の液体培養培地(例えば、哺乳動物細胞を実質的に含まない第1の容量の第1の液体培養培地)を除去し、第1の液体培養培地に第2の容量の第2の液体培養培地を添加することは、容器への細胞(例えば、哺乳動物細胞)の播種の少なくとも1時間以内(例えば、2時間以内、3時間以内、4時間以内、5時間以内、6時間以内、7時間以内、8時間以内、9時間以内、10時間以内、12時間以内、14時間以内、16時間以内、18時間以内、24時間以内、36時間以内、48時間以内、72時間以内、96時間以内、または96時間後)には行われない。
流加培養
細胞(例えば、哺乳動物細胞)の培養は、流加培養を使用して実施することができる。細胞(例えば、哺乳動物細胞)の流加培養は、培養期間の大部分にわたる、第1の液体培養培地への第2の容量の第2の液体培養培地の添加(例えば、周期的または継続的な添加)を含む。第2の液体培養培地の添加は、(例えば、任意の所与の期間にわたり(例えば、24時間の期間にわたり、約1時間〜約24時間の増分期間にわたり、または24時間よりも長い増分期間にわたり)、容器の容量または第1の液体培養培地容量の0.1%〜300%の間(例えば、1%と250%との間、1%と100%との間、100%と200%との間、5%と150%との間、10%と50%との間、15%と40%との間、8%と80%との間および4%と30%との間)の容量を添加する速度で)継続的に、もしくは周期的に(例えば、3日に1回、1日おきに一回、1日1回、1日2回、1日3回、1日4回または1日5回)、またはそれらの任意の組み合わせで実施することができる。周期的に実施される場合、(例えば、約24時間の期間以内、約1時間〜約24時間の増分期間以内、または24時間よりも長い増分期間以内に)添加される容量は、例えば、容器の容量または第1の液体培養培地容量の0.1%〜300%の間(例えば、1%と200%との間、1%と100%との間、100%と200%との間、5%と150%との間、10%と50%との間、15%と40%との間、8%と80%との間および4%と30%との間)であり得る。添加される第2の液体培養培地の第2の容量は、一部の場合には、培養期間の全体または一部にわたって、各24時間の期間(またはあるいは、約1時間〜約24時間の増分期間もしくは24時間よりも長い増分期間)にわたっておよそ同じに維持することができる。当該分野で公知のように、第2の容量の第2の液体培養培地が添加される速度(容量/時間の単位)は、培養期間の全体または一部にわたって変動させることができる。例えば、添加される第2の液体培養培地の容量は、培養期間の間に、各24時間の期間(またはあるいは、1時間と約24時間との間の増分期間もしくは24時間よりも長い増分期間)にわたって変化(例えば、徐々に増加)し得る。例えば、培養期間にわたる各24時間の期間(またはあるいは、約1時間と24時間超との間の増分期間もしくは24時間よりも長い増分期間)以内に添加される第2の液体培養培地の容量は、容器容量または第1の液体培養培地容量の0.5%〜約20%から容器容量または第1の液体培養培地容量の約25%〜約150%までの間の容量から、培養期間にわたって増加(例えば、徐々にまたはずれた増分を介して)させることができる。第2の容量の第2の液体培養培地が添加される速度(容量/時間の単位)は、培養期間の全体または一部にわたって、およそ同じであり得る。
当業者は、第1の液体培養培地と第2の液体培養培地とが、同じ型の培地であり得ることを理解する。他の例では、第1の液体培養培地と第2の液体培養培地とは、異なり得る。第2の液体培養培地の容量は、例えば、灌流ポンプによって、自動様式で第1の液体培養培地に添加することができる。
一部の例では、第1の液体培養培地に第2の容量の第2の液体培養培地を添加することは、容器への細胞(例えば、哺乳動物細胞)の播種の少なくとも1時間以内(例えば、2時間以内、3時間以内、4時間以内、5時間以内、6時間以内、7時間以内、8時間以内、9時間以内、10時間以内、12時間以内、14時間以内、16時間以内、18時間以内、24時間以内、36時間以内、48時間以内、72時間以内、96時間以内、または96時間後)には行われない。流加培養における細胞培養培地は、典型的には、培養期間の終了時に収集され、本明細書に記載されるプロセスのいずれかにおいて使用されるが、流加培養における細胞培養培地は、培養期間の間の1つまたはそれ以上の時点においても収集することができ、本明細書に記載されるプロセスのいずれかにおいて使用することができる。
当業者は、種々の培養パラメーター(例えば、容器、容量、培養容量置換の速度または頻度、撹拌周波数、温度、培地およびCO濃度)のいずれかが、これらの方法を実施するために任意の組み合わせで使用されることを理解する。
温度
培養は、32℃〜約39℃の温度、例えば、約32℃〜約37℃の温度で実施することができる。当業者は、温度を、培養方法における(例えば、第1の期間、第2の期間および第3の期間のうち1つまたはそれ以上の間の)特定の時点(複数可)において、例えば、1時間毎にまたは毎日、変化させることができることを理解する。例えば、温度は、振盪フラスコへの哺乳動物細胞の最初の播種の約1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、14日、15日、16日、17日、18日、19日、もしくは約20日もしくはそれ以上後に、または本明細書に記載される第1、第2および/もしくは第3の期間内の任意の時点において、変化またはシフト(例えば、増加または減少)させることができる。例えば、温度は、上にシフトさせることができる(例えば、最大で0.1、0.2、0.3、0.4、0.5、0.6、0.7、0.8、0.9、1.0、1.5、2.0、2.5、3.0、3.5、4.0、4.5、5.0、5.5、6.0、6.5、7.0、7.5、8.0、8.5、9.0、9.5もしくは10.0℃または約0.1、0.2、0.3、0.4、0.5、0.6、0.7、0.8、0.9、1.0、1.5、2.0、2.5、3.0、3.5、4.0、4.5、5.0、5.5、6.0、6.5、7.0、7.5、8.0、8.5、9.0、9.5もしくは10.0℃の変化)。例えば、温度は、下にシフトさせることができる(例えば、最大で0.1、0.2、0.3、0.4、0.5、0.6、0.7、0.8、0.9、1.0、1.5、2.0、2.5、3.0、3.5、4.0、4.5、5.0、5.5、6.0、6.5、7.0、7.5、8.0、8.5、9.0、9.5もしくは10℃または約0.1、0.2、0.3、0.4、0.5、0.6、0.7、0.8、0.9、1.0、1.5、2.0、2.5、3.0、3.5、4.0、4.5、5.0、5.5、6.0、6.5、7.0、7.5、8.0、8.5、9.0、9.5もしくは10℃の変化)。
CO
培養は、多くてもまたは約1%〜15%のCO(例えば、多くてももしくは約14%のCO、12%のCO、10%のCO、8%のCO、6%のCO、5%のCO、4%のCO、3%のCO、2%のCO、または多くてももしくは約1%のCO)を含む大気中で細胞培養物を培養することを含み得る。培養は、加湿大気(例えば、少なくとももしくは約20%、30%、40%、50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、もしくは少なくとももしくは約95%の湿度、または約100%の湿度)中で細胞培養物をインキュベートすることを含み得る。
細胞生存度測定
細胞培養物(例えば、哺乳動物細胞培養物)の細胞生存度を決定するために使用することができる種々の方法およびアッセイは、当該分野で公知である。例えば、乳酸デヒドロゲナーゼ(LDH)が、細胞培養物の液体培養培地中で検出される。細胞培養物の液体培養培地中のLDHの検出のための市販のキットは、当該分野で公知である。
生存細胞によって排除されるが非生存細胞によって選択的に取り込まれる種々の異なる色素が、細胞生存度を決定するために使用される。これらの色素の非限定的な例には、ヨウ化プロピジウム、トリパンブルーおよび7−アミノアクチノマイシンDが含まれる。細胞の生存度は、色素とのインキュベーション後の細胞の染色を可視化または他の方法で検出することによって決定される。
細胞の培養物の細胞生存度を決定するためのさらなるアッセイには、細胞におけるミトコンドリア活性またはカスパーゼ活性の検出(例えば、レサズリンおよびホルマザン)が含まれる。細胞の培養物における細胞生存度を決定するためのさらなる方法は、当該分野で公知である。
産生バイオリアクターにおける細胞生存度に対する感作剤の濃度の影響を予測する方法
産生バイオリアクターにおける細胞生存度に対する感作剤(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の感作剤のいずれか)の濃度の影響を予測する方法であって、(a)試験培養容器(例えば、本明細書に記載される試験培養容器のいずれか)における複数の試験条件下での細胞生存度を決定する工程であって、複数の試験条件は、パラメーターのセットによって規定される、工程;および(b)試験培養容器における複数の条件下での細胞生存度に基づいて、産生バイオリアクター(例えば、本明細書に記載される産生バイオリアクターのいずれか)における細胞生存度に対する感作剤の濃度の影響を予測する工程、を含む方法が、本明細書で提供される。
一部の実施形態では、パラメーターのセットは、剪断応力、感作剤の濃度および保護剤(例えば、本明細書に記載される保護剤のいずれか)の濃度を含む、それらからなる、またはそれらから本質的になる。これらの方法の一部の実施形態では、複数の試験条件は、完全実施要因スクリーニングおよび/または内接中心複合計画に基づいて選択される。これらの方法のいずれかの一部の実施形態では、感作剤は、消泡剤(例えば、ポリジメチルシロキサンベースの消泡剤、シメチコン、または本明細書に記載されるもしくは当該分野で公知の任意の他の消泡剤)である。
一部の実施形態では、試験培養容器(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の例示的な試験培養容器のいずれか)は、約5mL〜約5L(または本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか)の容量を有する。一部の実施形態では、試験培養容器は、振盪フラスコ、例えば、バッフル付き振盪フラスコである。
一部の実施形態では、産生バイオリアクター(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の例示的な産生バイオリアクターのいずれか)は、約5L〜約20,000L(または本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか)の容量を有する。一部の例では、産生バイオリアクターは、灌流バイオリアクターである。他の例では、産生バイオリアクターは、流加バイオリアクターである。
本明細書に記載される特異的細胞死亡率は、以下の式によって定義される:
特異的細胞死亡率=(特異的LDH産生)/(細胞1つ当たりのLDH含量)。
これらの方法の一部の実施形態は、産生バイオリアクターにおける細胞(例えば、本明細書に記載される細胞のいずれか)の培養の間に、40%/日未満、39%/日未満、38%/日未満、37%/日未満、36%/日未満、35%/日未満、34%/日未満、33%/日未満、32%/日未満、31%/日未満、30%/日未満、29%/日未満、28%/日未満、27%/日未満、26%/日未満、25%/日未満、24%/日未満、23%/日未満、22%/日未満、21%/日未満、20%/日未満、19%/日未満、18%/日未満、17%/日未満、16%/日未満、15%/日未満、14%/日未満、13%/日未満、12%/日未満、11%/日未満、10%/日未満、9%/日未満、8%/日未満、7%/日未満、6%/日未満、5%/日未満、4%/日未満、3%/日未満、2%/日未満または1%/日未満の特異的細胞死亡率を有すると予測される感作剤の濃度を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞(例えば、本明細書に記載される細胞のいずれか)を培養する工程をさらに含む。本明細書に記載される方法のいずれかの一部の実施形態は、産生バイオリアクターにおける細胞(例えば、本明細書に記載される細胞のいずれか)の培養の間に、約0.1%〜約40%/日、約0.1%〜約38%/日、約0.1%〜約36%/日、約0.1%〜約34%/日、約0.1%〜約32%/日、約0.1%〜約30%/日、約0.1%〜約28%/日、約0.1%〜約26%/日、約0.1%〜約24%/日、約0.1%〜約22%/日、約0.1%〜約20%/日、約0.1%〜約18%/日、約0.1%〜約16%/日、約0.1%〜約14%/日、約0.1%〜約12%/日、約0.1%〜約10%/日、約0.1%〜約8%/日、約0.1%〜約6%/日、約0.1%〜約5%/日、約0.1%〜約4.5%/日、約0.1%〜約4.0%/日、約0.1%〜約3.5%/日、約0.1%〜約3.0%/日、約0.1%〜約2.5%/日、約0.1%〜約2.0%/日、約0.1%〜約1.5%/日、約0.1%〜約1.0%/日、約0.1%〜約0.5%/日、約0.5%〜約40%/日、約0.5%〜約38%/日、約0.5%〜約36%/日、約0.5%〜約34%/日、約0.5%〜約32%/日、約0.5%〜約30%/日、約0.5%〜約28%/日、約0.5%〜約26%/日、約0.5%〜約24%/日、約0.5%〜約22%/日、約0.5%〜約20%/日、約0.5%〜約18%/日、約0.5%〜約16%/日、約0.5%〜約14%/日、約0.5%〜約12%/日、約0.5%〜約10%/日、約0.5%〜約8%/日、約0.5%〜約6%/日、約0.5%〜約5%/日、約0.5%〜約4.5%/日、約0.5%〜約4.0%/日、約0.5%〜約3.5%/日、約0.5%〜約3.0%/日、約0.5%〜約2.5%/日、約0.5%〜約2.0%/日、約0.5%〜約1.5%/日、約0.5%〜約1.0%/日、約1.0%〜約40%/日、約1.0%〜約38%/日、約1.0%〜約36%/日、約1.0%〜約34%/日、約1.0%〜約32%/日、約1.0%〜約30%/日、約1.0%〜約28%/日、約1.0%〜約26%/日、約1.0%〜約24%/日、約1.0%〜約22%/日、約1.0%〜約20%/日、約1.0%〜約18%/日、約1.0%〜約16%/日、約1.0%〜約14%/日、約1.0%〜約12%/日、約1.0%〜約10%/日、約1.0%〜約8%/日、約1.0%〜約6%/日、約1.0%〜約5%/日、約1.0%〜約4.5%/日、約1.0%〜約4.0%/日、約1.0%〜約3.5%/日、約1.0%〜約3.0%/日、約1.0%〜約2.5%/日、約1.0%〜約2.0%/日、約1.0%〜約1.5%/日、約1.5%〜約40%/日、約1.5%〜約38%/日、約1.5%〜約36%/日、約1.5%〜約34%/日、約1.5%〜約32%/日、約1.5%〜約30%/日、約1.5%〜約28%/日、約1.5%〜約26%/日、約1.5%〜約24%/日、約1.5%〜約22%/日、約1.5%〜約20%/日、約1.5%〜約18%/日、約1.5%〜約16%/日、約1.5%〜約14%/日、約1.5%〜約12%/日、約1.5%〜約10%/日、約1.5%〜約8%/日、約1.5%〜約6%/日、約1.5%〜約5%/日、約1.5%〜約4.5%/日、約1.5%〜約4.0%/日、約1.5%〜約3.5%/日、約1.5%〜約3.0%/日、約1.5%〜約2.5%/日、約1.5%〜約2.0%/日、約2.0%〜約40%/日、約2.0%〜約38%/日、約2.0%〜約36%/日、約2.0%〜約34%/日、約2.0%〜約32%/日、約2.0%〜約30%/日、約2.0%〜約28%/日、約2.0%〜約26%/日、約2.0%〜約24%/日、約2.0%〜約22%/日、約2.0%〜約20%/日、約2.0%〜約18%/日、約2.0%〜約16%/日、約2.0%〜約14%/日、約2.0%〜約12%/日、約2.0%〜約10%/日、約2.0%〜約8%/日、約2.0%〜約6%/日、約2.0%〜約5%/日、約2.0%〜約4.5%/日、約2.0%〜約4.0%/日、約2.0%〜約3.5%/日、約2.0%〜約3.0%/日、約2.0%〜約2.5%/日、約2.5%〜約40%/日、約2.5%〜約38%/日、約2.5%〜約36%/日、約2.5%〜約34%/日、約2.5%〜約32%/日、約2.5%〜約30%/日、約2.5%〜約28%/日、約2.5%〜約26%/日、約2.5%〜約24%/日、約2.5%〜約22%/日、約2.5%〜約20%/日、約2.5%〜約18%/日、約2.5%〜約16%/日、約2.5%〜約14%/日、約2.5%〜約12%/日、約2.5%〜約10%/日、約2.5%〜約8%/日、約2.5%〜約6%/日、約2.5%〜約5%/日、約2.5%〜約4.5%/日、約2.5%〜約4.0%/日、約2.5%〜約3.5%/日、約2.5%〜約3.0%/日、約3.0%〜約40%/日、約3.0%〜約38%/日、約3.0%〜約36%/日、約3.0%〜約34%/日、約3.0%〜約32%/日、約3.0%〜約30%/日、約3.0%〜約28%/日、約3.0%〜約26%/日、約3.0%〜約24%/日、約3.0%〜約22%/日、約3.0%〜約20%/日、約3.0%〜約18%/日、約3.0%〜約16%/日、約3.0%〜約14%/日、約3.0%〜約12%/日、約3.0%〜約10%/日、約3.0%〜約8%/日、約3.0%〜約6%/日、約3.0%〜約5%/日、約3.0%〜約4.5%/日、約3.0%〜約4.0%/日、約3.0%〜約3.5%/日、約3.5%〜約40%/日、約3.5%〜約38%/日、約3.5%〜約36%/日、約3.5%〜約34%/日、約3.5%〜約32%/日、約3.5%〜約30%/日、約3.5%〜約28%/日、約3.5%〜約26%/日、約3.5%〜約24%/日、約3.5%〜約22%/日、約3.5%〜約20%/日、約3.5%〜約18%/日、約3.5%〜約16%/日、約3.5%〜約14%/日、約3.5%〜約12%/日、約3.5%〜約10%/日、約3.5%〜約8%/日、約3.5%〜約6%/日、約3.5%〜約5%/日、約3.5%〜約4.5%/日、約3.5%〜約4.0%/日、約4.0%〜約40%/日、約4.0%〜約38%/日、約4.0%〜約36%/日、約4.0%〜約34%/日、約4.0%〜約32%/日、約4.0%〜約30%/日、約4.0%〜約28%/日、約4.0%〜約26%/日、約4.0%〜約24%/日、約4.0%〜約22%/日、約4.0%〜約20%/日、約4.0%〜約18%/日、約4.0%〜約16%/日、約4.0%〜約14%/日、約4.0%〜約12%/日、約4.0%〜約10%/日、約4.0%〜約8%/日、約4.0%〜約6%/日、約4.0%〜約5%/日、約4.0%〜約4.5%/日、約4.5%〜約40%/日、約4.5%〜約38%/日、約4.5%〜約36%/日、約4.5%〜約34%/日、約4.5%〜約32%/日、約4.5%〜約30%/日、約4.5%〜約28%/日、約4.5%〜約26%/日、約4.5%〜約24%/日、約4.5%〜約22%/日、約4.5%〜約20%/日、約4.5%〜約18%/日、約4.5%〜約16%/日、約4.5%〜約14%/日、約4.5%〜約12%/日、約4.5%〜約10%/日、約4.5%〜約8%/日、約4.5%〜約6%/日、約4.5%〜約5%/日、約5%〜約40%/日、約5%〜約38%/日、約5%〜約36%/日、約5%〜約34%/日、約5%〜約32%/日、約5%〜約30%/日、約5%〜約28%/日、約5%〜約26%/日、約5%〜約24%/日、約5%〜約22%/日、約5%〜約20%/日、約5%〜約18%/日、約5%〜約16%/日、約5%〜約14%/日、約5%〜約12%/日、約5%〜約10%/日、約5%〜約8%/日、約5%〜約6%/日、約6%〜約40%/日、約6%〜約38%/日、約6%〜約36%/日、約6%〜約34%/日、約6%〜約32%/日、約6%〜約30%/日、約6%〜約28%/日、約6%〜約26%/日、約6%〜約24%/日、約6%〜約22%/日、約6%〜約20%/日、約6%〜約18%/日、約6%〜約16%/日、約6%〜約14%/日、約6%〜約12%/日、約6%〜約10%/日、約6%〜約8%/日、約8%〜約40%/日、約8%〜約38%/日、約8%〜約36%/日、約8%〜約34%/日、約8%〜約32%/日、約8%〜約30%/日、約8%〜約28%/日、約8%〜約26%/日、約8%〜約24%/日、約8%〜約22%/日、約8%〜約20%/日、約8%〜約18%/日、約8%〜約16%/日、約8%〜約14%/日、約8%〜約12%/日、約8%〜約10%/日、約10%〜約40%/日、約10%〜約38%/日、約10%〜約36%/日、約10%〜約34%/日、約10%〜約32%/日、約10%〜約30%/日、約10%〜約28%/日、約10%〜約26%/日、約10%〜約24%/日、約10%〜約22%/日、約10%〜約20%/日、約10%〜約18%/日、約10%〜約16%/日、約10%〜約14%/日、約10%〜約12%/日、約12%〜約40%/日、約12%〜約38%/日、約12%〜約36%/日、約12%〜約34%/日、約12%〜約32%/日、約12%〜約30%/日、約12%〜約28%/日、約12%〜約26%/日、約12%〜約24%/日、約12%〜約22%/日、約12%〜約20%/日、約12%〜約18%/日、約12%〜約16%/日、約12%〜約14%/日、約14%〜約40%/日、約14%〜約38%/日、約14%〜約36%/日、約14%〜約34%/日、約14%〜約32%/日、約14%〜約30%/日、約14%〜約28%/日、約14%〜約26%/日、約14%〜約24%/日、約14%〜約22%/日、約14%〜約20%/日、約14%〜約18%/日、約14%〜約16%/日、約16%〜約40%/日、約16%〜約38%/日、約16%〜約36%/日、約16%〜約34%/日、約16%〜約32%/日、約16%〜約30%/日、約16%〜約28%/日、約16%〜約26%/日、約16%〜約24%/日、約16%〜約22%/日、約16%〜約20%/日、約16%〜約18%/日、約18%〜約40%/日、約18%〜約38%/日、約18%〜約36%/日、約18%〜約34%/日、約18%〜約32%/日、約18%〜約30%/日、約18%〜約28%/日、約18%〜約26%/日、約18%〜約24%/日、約18%〜約22%/日、約18%〜約20%/日、約20%〜約40%/日、約20%〜約38%/日、約20%〜約36%/日、約20%〜約34%/日、約20%〜約32%/日、
約20%〜約30%/日、約20%〜約28%/日、約20%〜約26%/日、約20%〜約24%/日、約20%〜約22%/日、約22%〜約40%/日、約22%〜約38%/日、約22%〜約36%/日、約22%〜約34%/日、約22%〜約32%/日、約22%〜約30%/日、約22%〜約28%/日、約22%〜約26%/日、約22%〜約24%/日、約24%〜約40%/日、約24%〜約38%/日、約24%〜約36%/日、約24%〜約34%/日、約24%〜約32%/日、約24%〜約30%/日、約24%〜約28%/日、約24%〜約26%/日、約26%〜約40%/日、約26%〜約38%/日、約26%〜約36%/日、約26%〜約34%/日、約26%〜約32%/日、約26%〜約30%/日、約26%〜約28%/日、約28%〜約40%/日、約28%〜約38%/日、約28%〜約36%/日、約28%〜約34%/日、約28%〜約32%/日、約28%〜約30%/日、約30%〜約40%/日、約30%〜約38%/日、約30%〜約36%/日、約30%〜約34%/日、約30%〜約32%/日、約32%〜約40%/日、約32%〜約38%/日、約32%〜約36%/日、約32%〜約34%/日、約34%〜約40%/日、約34%〜約38%/日、約34%〜約36%/日、約36%〜約40%/日、約36%〜約38%/日、または約38%〜約40%/日の特異的細胞死亡率を有すると予測される感作剤の濃度を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞(例えば、本明細書に記載される細胞のいずれか)を培養する工程をさらに含む。
これらの方法の一部の実施形態は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、150nU/細胞/日未満、145nU/細胞/日未満、140nU/細胞/日未満、135nU/細胞/日未満、130nU/細胞/日未満、125nU/細胞/日未満、120nU/細胞/日未満、115nU/細胞/日、150nU/細胞/日未満、110nU/細胞/日未満、105nU/細胞/日未満、100nU/細胞/日未満、95nU/細胞/日未満、90nU/細胞/日未満、85nU/細胞/日未満、80nU/細胞/日未満、75nU/細胞/日未満、70nU/細胞/日未満、65nU/細胞/日未満、60nU/細胞/日未満、55nU/細胞/日未満、50nU/細胞/日未満、45nU/細胞/日未満、45nU/細胞/日未満、40nU/細胞/日未満、35nU/細胞/日未満、30nU/細胞/日未満、25nU/細胞/日未満、20nU/細胞/日未満、15nU/細胞/日未満、10nU/細胞/日未満、5nU/細胞/日未満または1nU/細胞/日未満の細胞特異的LDH産生を生じると予測される感作剤の濃度を使用して、産生バイオリアクター(例えば、本明細書に記載される産生バイオリアクターのいずれか)において細胞(例えば、本明細書に記載される細胞のいずれか)を培養する工程をさらに含む。これらの方法の一部の実施形態は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、約0.1nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日、約0.1nU/細胞/日〜約140nU/細胞/日、約0.1nU/細胞/日〜約130nU/細胞/日、約0.1nU/細胞/日〜約120nU/細胞/日、約0.1nU/細胞/日〜約110nU/細胞/日、約0.1nU/細胞/日〜約100nU/細胞/日、約0.1nU/細胞/日〜約95nU/細胞/日、約0.1nU/細胞/日〜約90nU/細胞/日、約0.1nU/細胞/日〜約85nU/細胞/日、約0.1nU/細胞/日〜約80nU/細胞/日、約0.1nU/細胞/日〜約75nU/細胞/日、約0.1nU/細胞/日〜約70nU/細胞/日、約0.1nU/細胞/日〜約65nU/細胞/日、約0.1nU/細胞/日〜約60nU/細胞/日、約0.1nU/細胞/日〜約55nU/細胞/日、約0.1nU/細胞/日〜約50nU/細胞/日、約0.1nU/細胞/日〜約45nU/細胞/日、約0.1nU/細胞/日〜約40nU/細胞/日、約0.1nU/細胞/日〜約35nU/細胞/日、約0.1nU/細胞/日〜約30nU/細胞/日、約0.1nU/細胞/日〜約25nU/細胞/日、約0.1nU/細胞/日〜約20nU/細胞/日、約0.1nU/細胞/日〜約15nU/細胞/日、約0.1nU/細胞/日〜約10nU/細胞/日、約0.1nU/細胞/日〜約5nU/細胞/日、約0.1nU/細胞/日〜約2.5nU/細胞/日、約0.1nU/細胞/日〜約1.0nU/細胞/日、約1.0nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日、約1.0nU/細胞/日〜約140nU/細胞/日、約1.0nU/細胞/日〜約130nU/細胞/日、約1.0nU/細胞/日〜約120nU/細胞/日、約1.0nU/細胞/日〜約110nU/細胞/日、約1.0nU/細胞/日〜約100nU/細胞/日、約1.0nU/細胞/日〜約95nU/細胞/日、約1.0nU/細胞/日〜約90nU/細胞/日、約1.0nU/細胞/日〜約85nU/細胞/日、約1.0nU/細胞/日〜約80nU/細胞/日、約1.0nU/細胞/日〜約75nU/細胞/日、約1.0nU/細胞/日〜約70nU/細胞/日、約1.0nU/細胞/日〜約65nU/細胞/日、約1.0nU/細胞/日〜約60nU/細胞/日、約1.0nU/細胞/日〜約55nU/細胞/日、約1.0nU/細胞/日〜約50nU/細胞/日、約1.0nU/細胞/日〜約45nU/細胞/日、約1.0nU/細胞/日〜約40nU/細胞/日、約1.0nU/細胞/日〜約35nU/細胞/日、約1.0nU/細胞/日〜約30nU/細胞/日、約1.0nU/細胞/日〜約25nU/細胞/日、約1.0nU/細胞/日〜約20nU/細胞/日、約1.0nU/細胞/日〜約15nU/細胞/日、約1.0nU/細胞/日〜約10nU/細胞/日、約1.0nU/細胞/日〜約5nU/細胞/日、約1.0nU/細胞/日〜約2.5nU/細胞/日、約2.5nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日、約2.5nU/細胞/日〜約140nU/細胞/日、約2.5nU/細胞/日〜約130nU/細胞/日、約2.5nU/細胞/日〜約120nU/細胞/日、約2.5nU/細胞/日〜約110nU/細胞/日、約2.5nU/細胞/日〜約100nU/細胞/日、約2.5nU/細胞/日〜約95nU/細胞/日、約2.5nU/細胞/日〜約90nU/細胞/日、約2.5nU/細胞/日〜約85nU/細胞/日、約2.5nU/細胞/日〜約80nU/細胞/日、約2.5nU/細胞/日〜約75nU/細胞/日、約2.5nU/細胞/日〜約70nU/細胞/日、約2.5nU/細胞/日〜約65nU/細胞/日、約2.5nU/細胞/日〜約60nU/細胞/日、約2.5nU/細胞/日〜約55nU/細胞/日、約2.5nU/細胞/日〜約50nU/細胞/日、約2.5nU/細胞/日〜約45nU/細胞/日、約2.5nU/細胞/日〜約40nU/細胞/日、約2.5nU/細胞/日〜約35nU/細胞/日、約2.5nU/細胞/日〜約30nU/細胞/日、約2.5nU/細胞/日〜約25nU/細胞/日、約2.5nU/細胞/日〜約20nU/細胞/日、約2.5nU/細胞/日〜約15nU/細胞/日、約2.5nU/細胞/日〜約10nU/細胞/日、約2.5nU/細胞/日〜約5nU/細胞/日、約5nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日、約5nU/細胞/日〜約140nU/細胞/日、約5nU/細胞/日〜約130nU/細胞/日、約5nU/細胞/日〜約120nU/細胞/日、約5nU/細胞/日〜約110nU/細胞/日、約5nU/細胞/日〜約100nU/細胞/日、約5nU/細胞/日〜約95nU/細胞/日、約5nU/細胞/日〜約90nU/細胞/日、約5nU/細胞/日〜約85nU/細胞/日、約5nU/細胞/日〜約80nU/細胞/日、約5nU/細胞/日〜約75nU/細胞/日、約5nU/細胞/日〜約70nU/細胞/日、約5nU/細胞/日〜約65nU/細胞/日、約5nU/細胞/日〜約60nU/細胞/日、約5nU/細胞/日〜約55nU/細胞/日、約5nU/細胞/日〜約50nU/細胞/日、約5nU/細胞/日〜約45nU/細胞/日、約5nU/細胞/日〜約40nU/細胞/日、約5nU/細胞/日〜約35nU/細胞/日、約5nU/細胞/日〜約30nU/細胞/日、約5nU/細胞/日〜約25nU/細胞/日、約5nU/細胞/日〜約20nU/細胞/日、約5nU/細胞/日〜約15nU/細胞/日、約5nU/細胞/日〜約10nU/細胞/日、約10nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日、約10nU/細胞/日〜約140nU/細胞/日、約10nU/細胞/日〜約130nU/細胞/日、約10nU/細胞/日〜約120nU/細胞/日、約10nU/細胞/日〜約110nU/細胞/日、約10nU/細胞/日〜約100nU/細胞/日、約10nU/細胞/日〜約95nU/細胞/日、約10nU/細胞/日〜約90nU/細胞/日、約10nU/細胞/日〜約85nU/細胞/日、約10nU/細胞/日〜約80nU/細胞/日、約10nU/細胞/日〜約75nU/細胞/日、約10nU/細胞/日〜約70nU/細胞/日、約10nU/細胞/日〜約65nU/細胞/日、約10nU/細胞/日〜約60nU/細胞/日、約10nU/細胞/日〜約55nU/細胞/日、約10nU/細胞/日〜約50nU/細胞/日、約10nU/細胞/日〜約45nU/細胞/日、約10nU/細胞/日〜約40nU/細胞/日、約10nU/細胞/日〜約35nU/細胞/日、約10nU/細胞/日〜約30nU/細胞/日、約10nU/細胞/日〜約25nU/細胞/日、約10nU/細胞/日〜約20nU/細胞/日、約10nU/細胞/日〜約15nU/細胞/日、約15nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日、約15nU/細胞/日〜約140nU/細胞/日、約15nU/細胞/日〜約130nU/細胞/日、約15nU/細胞/日〜約120nU/細胞/日、約15nU/細胞/日〜約110nU/細胞/日、約15nU/細胞/日〜約100nU/細胞/日、約15nU/細胞/日〜約95nU/細胞/日、約15nU/細胞/日〜約90nU/細胞/日、約15nU/細胞/日〜約85nU/細胞/日、約15nU/細胞/日〜約80nU/細胞/日、約15nU/細胞/日〜約75nU/細胞/日、約15nU/細胞/日〜約70nU/細胞/日、約15nU/細胞/日〜約65nU/細胞/日、約15nU/細胞/日〜約60nU/細胞/日、約15nU/細胞/日〜約55nU/細胞/日、約15nU/細胞/日〜約50nU/細胞/日、約15nU/細胞/日〜約45nU/細胞/日、約15nU/細胞/日〜約40nU/細胞/日、約15nU/細胞/日〜約35nU/細胞/日、約15nU/細胞/日〜約30nU/細胞/日、約15nU/細胞/日〜約25nU/細胞/日、約15nU/細胞/日〜約20nU/細胞/日、約20nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日、約20nU/細胞/日〜約140nU/細胞/日、約20nU/細胞/日〜約130nU/細胞/日、約20nU/細胞/日〜約120nU/細胞/日、約20nU/細胞/日〜約110nU/細胞/日、約20nU/細胞/日〜約100nU/細胞/日、約20nU/細胞/日〜約95nU/細胞/日、約20nU/細胞/日〜約90nU/細胞/日、約20nU/細胞/日〜約85nU/細胞/日、約20nU/細胞/日〜約80nU/細胞/日、約20nU/細胞/日〜約75nU/細胞/日、約20nU/細胞/日〜約70nU/細胞/日、約20nU/細胞/日〜約65nU/細胞/日、約20nU/細胞/日〜約60nU/細胞/日、約20nU/細胞/日〜約55nU/細胞/日、約20nU/細胞/日〜約50nU/細胞/日、約20nU/細胞/日〜約45nU/細胞/日、約20nU/細胞/日〜約40nU/細胞/日、約20nU/細胞/日〜約35nU/細胞/日、約20nU/細胞/日〜約30nU/細胞/日、約20nU/細胞/日〜約25nU/細胞/日、約25nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日、約25nU/細胞/日〜約140nU/細胞/日、約25nU/細胞/日〜約130nU/細胞/日、約25nU/細胞/日〜約120nU/細胞/日、約25nU/細胞/日〜約110nU/細胞/日、約25nU/細胞/日〜約100nU/細胞/日、約25nU/細胞/日〜約95nU/細胞/日、約25nU/細胞/日〜約90nU/細胞/日、約25nU/細胞/日〜約85nU/細胞/日、約25nU/細胞/日〜約80nU/細胞/日、約25nU/細胞/日〜約75nU/細胞/日、約25nU/細胞/日〜約70nU/細胞/日、約25nU/細胞/日〜約65nU/細胞/日、約25nU/細胞/日〜約60nU/細胞/日、約25nU/細胞/日〜約55nU/細胞/日、約25nU/細胞/日〜約50nU/細胞/日、約25nU/細胞/日〜約45nU/細胞/日、約25nU/細胞/日〜約40nU/細胞/日、約25nU/細胞/日〜約35nU/細胞/日、約25nU/細胞/日〜約30nU/細胞/日、約30nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日、約30nU/細胞/日〜約140nU/細胞/日、約30nU/細胞/日〜約130nU/細胞/日、約30nU/細胞/日〜約120nU/細胞/日、約30nU/細胞/日〜約110nU/細胞/日、約30nU/細胞/日〜約100nU/細胞/日、
約30nU/細胞/日〜約95nU/細胞/日、約30nU/細胞/日〜約90nU/細胞/日、約30nU/細胞/日〜約85nU/細胞/日、約30nU/細胞/日〜約80nU/細胞/日、約30nU/細胞/日〜約75nU/細胞/日、約30nU/細胞/日〜約70nU/細胞/日、約30nU/細胞/日〜約65nU/細胞/日、約30nU/細胞/日〜約60nU/細胞/日、約30nU/細胞/日〜約55nU/細胞/日、約30nU/細胞/日〜約50nU/細胞/日、約30nU/細胞/日〜約45nU/細胞/日、約30nU/細胞/日〜約40nU/細胞/日、約30nU/細胞/日〜約35nU/細胞/日、約35nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日、約35nU/細胞/日〜約140nU/細胞/日、約35nU/細胞/日〜約130nU/細胞/日、約35nU/細胞/日〜約120nU/細胞/日、約35nU/細胞/日〜約110nU/細胞/日、約35nU/細胞/日〜約100nU/細胞/日、約35nU/細胞/日〜約95nU/細胞/日、約35nU/細胞/日〜約90nU/細胞/日、約35nU/細胞/日〜約85nU/細胞/日、約35nU/細胞/日〜約80nU/細胞/日、約35nU/細胞/日〜約75nU/細胞/日、約35nU/細胞/日〜約70nU/細胞/日、約35nU/細胞/日〜約65nU/細胞/日、約35nU/細胞/日〜約60nU/細胞/日、約35nU/細胞/日〜約55nU/細胞/日、約35nU/細胞/日〜約50nU/細胞/日、約35nU/細胞/日〜約45nU/細胞/日、約35nU/細胞/日〜約40nU/細胞/日、約40nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日、約40nU/細胞/日〜約140nU/細胞/日、約40nU/細胞/日〜約130nU/細胞/日、約40nU/細胞/日〜約120nU/細胞/日、約40nU/細胞/日〜約110nU/細胞/日、約40nU/細胞/日〜約100nU/細胞/日、約40nU/細胞/日〜約95nU/細胞/日、約40nU/細胞/日〜約90nU/細胞/日、約40nU/細胞/日〜約85nU/細胞/日、約40nU/細胞/日〜約80nU/細胞/日、約40nU/細胞/日〜約75nU/細胞/日、約40nU/細胞/日〜約70nU/細胞/日、約40nU/細胞/日〜約65nU/細胞/日、約40nU/細胞/日〜約60nU/細胞/日、約40nU/細胞/日〜約55nU/細胞/日、約40nU/細胞/日〜約50nU/細胞/日、約40nU/細胞/日〜約45nU/細胞/日、約45nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日、約45nU/細胞/日〜約140nU/細胞/日、約45nU/細胞/日〜約130nU/細胞/日、約45nU/細胞/日〜約120nU/細胞/日、約45nU/細胞/日〜約110nU/細胞/日、約45nU/細胞/日〜約100nU/細胞/日、約45nU/細胞/日〜約95nU/細胞/日、約45nU/細胞/日〜約90nU/細胞/日、約45nU/細胞/日〜約85nU/細胞/日、約45nU/細胞/日〜約80nU/細胞/日、約45nU/細胞/日〜約75nU/細胞/日、約45nU/細胞/日〜約70nU/細胞/日、約45nU/細胞/日〜約65nU/細胞/日、約45nU/細胞/日〜約60nU/細胞/日、約45nU/細胞/日〜約55nU/細胞/日、約45nU/細胞/日〜約50nU/細胞/日、約50nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日、約50nU/細胞/日〜約140nU/細胞/日、約50nU/細胞/日〜約130nU/細胞/日、約50nU/細胞/日〜約120nU/細胞/日、約50nU/細胞/日〜約110nU/細胞/日、約50nU/細胞/日〜約100nU/細胞/日、約50nU/細胞/日〜約95nU/細胞/日、約50nU/細胞/日〜約90nU/細胞/日、約50nU/細胞/日〜約85nU/細胞/日、約50nU/細胞/日〜約80nU/細胞/日、約50nU/細胞/日〜約75nU/細胞/日、約50nU/細胞/日〜約70nU/細胞/日、約50nU/細胞/日〜約65nU/細胞/日、約50nU/細胞/日〜約60nU/細胞/日、約50nU/細胞/日〜約55nU/細胞/日、約55nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日、約55nU/細胞/日〜約140nU/細胞/日、約55nU/細胞/日〜約130nU/細胞/日、約55nU/細胞/日〜約120nU/細胞/日、約55nU/細胞/日〜約110nU/細胞/日、約55nU/細胞/日〜約100nU/細胞/日、約55nU/細胞/日〜約95nU/細胞/日、約55nU/細胞/日〜約90nU/細胞/日、約55nU/細胞/日〜約85nU/細胞/日、約55nU/細胞/日〜約80nU/細胞/日、約55nU/細胞/日〜約75nU/細胞/日、約55nU/細胞/日〜約70nU/細胞/日、約55nU/細胞/日〜約65nU/細胞/日、約55nU/細胞/日〜約60nU/細胞/日、約60nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日、約60nU/細胞/日〜約140nU/細胞/日、約60nU/細胞/日〜約130nU/細胞/日、約60nU/細胞/日〜約120nU/細胞/日、約60nU/細胞/日〜約110nU/細胞/日、約60nU/細胞/日〜約100nU/細胞/日、約60nU/細胞/日〜約95nU/細胞/日、約60nU/細胞/日〜約90nU/細胞/日、約60nU/細胞/日〜約85nU/細胞/日、約60nU/細胞/日〜約80nU/細胞/日、約60nU/細胞/日〜約75nU/細胞/日、約60nU/細胞/日〜約70nU/細胞/日、約60nU/細胞/日〜約65nU/細胞/日、約65nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日、約65nU/細胞/日〜約140nU/細胞/日、約65nU/細胞/日〜約130nU/細胞/日、約65nU/細胞/日〜約120nU/細胞/日、約65nU/細胞/日〜約110nU/細胞/日、約65nU/細胞/日〜約100nU/細胞/日、約65nU/細胞/日〜約95nU/細胞/日、約65nU/細胞/日〜約90nU/細胞/日、約65nU/細胞/日〜約85nU/細胞/日、約65nU/細胞/日〜約80nU/細胞/日、約65nU/細胞/日〜約75nU/細胞/日、約65nU/細胞/日〜約70nU/細胞/日、約70nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日、約70nU/細胞/日〜約140nU/細胞/日、約70nU/細胞/日〜約130nU/細胞/日、約70nU/細胞/日〜約120nU/細胞/日、約70nU/細胞/日〜約110nU/細胞/日、約70nU/細胞/日〜約100nU/細胞/日、約70nU/細胞/日〜約95nU/細胞/日、約70nU/細胞/日〜約90nU/細胞/日、約70nU/細胞/日〜約85nU/細胞/日、約70nU/細胞/日〜約80nU/細胞/日、約70nU/細胞/日〜約75nU/細胞/日、約75nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日、約75nU/細胞/日〜約140nU/細胞/日、約75nU/細胞/日〜約130nU/細胞/日、約75nU/細胞/日〜約120nU/細胞/日、約75nU/細胞/日〜約110nU/細胞/日、約75nU/細胞/日〜約100nU/細胞/日、約75nU/細胞/日〜約95nU/細胞/日、約75nU/細胞/日〜約90nU/細胞/日、約75nU/細胞/日〜約85nU/細胞/日、約75nU/細胞/日〜約80nU/細胞/日、約80nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日、約80nU/細胞/日〜約140nU/細胞/日、約80nU/細胞/日〜約130nU/細胞/日、約80nU/細胞/日〜約120nU/細胞/日、約80nU/細胞/日〜約110nU/細胞/日、約80nU/細胞/日〜約100nU/細胞/日、約80nU/細胞/日〜約95nU/細胞/日、約80nU/細胞/日〜約90nU/細胞/日、約80nU/細胞/日〜約85nU/細胞/日、約85nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日、約85nU/細胞/日〜約140nU/細胞/日、約85nU/細胞/日〜約130nU/細胞/日、約85nU/細胞/日〜約120nU/細胞/日、約85nU/細胞/日〜約110nU/細胞/日、約85nU/細胞/日〜約100nU/細胞/日、約85nU/細胞/日〜約95nU/細胞/日、約85nU/細胞/日〜約90nU/細胞/日、約90nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日、約90nU/細胞/日〜約140nU/細胞/日、約90nU/細胞/日〜約130nU/細胞/日、約90nU/細胞/日〜約120nU/細胞/日、約90nU/細胞/日〜約110nU/細胞/日、約90nU/細胞/日〜約100nU/細胞/日、約90nU/細胞/日〜約95nU/細胞/日、約95nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日、約95nU/細胞/日〜約140nU/細胞/日、約95nU/細胞/日〜約130nU/細胞/日、約95nU/細胞/日〜約120nU/細胞/日、約95nU/細胞/日〜約110nU/細胞/日、約95nU/細胞/日〜約100nU/細胞/日、約100nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日、約100nU/細胞/日〜約140nU/細胞/日、約100nU/細胞/日〜約130nU/細胞/日、約100nU/細胞/日〜約120nU/細胞/日、約100nU/細胞/日〜約110nU/細胞/日、約110nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日、約110nU/細胞/日〜約140nU/細胞/日、約110nU/細胞/日〜約130nU/細胞/日、約110nU/細胞/日〜約120nU/細胞/日、約120nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日、約120nU/細胞/日〜約140nU/細胞/日、約120nU/細胞/日〜約130nU/細胞/日、約130nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日、約130nU/細胞/日〜約140nU/細胞/日、または約140nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日の細胞特異的LDH産生を生じると予測される感作剤の濃度を使用して、産生バイオリアクター(例えば、本明細書に記載される産生バイオリアクターのいずれか)において細胞(例えば、本明細書に記載される細胞のいずれか)を培養する工程をさらに含む。
成長速度は、以下の方程式を使用して決定される複合的な成長計算である。
最終細胞密度=初期密度×ekt
式中、kは成長定数であり、tは日数での時間である。
見かけの成長速度は、成長速度に加算された計算された死亡率の合計である。
本明細書に記載される方法のいずれかの一部の実施形態は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、1%/日よりも大きい、1.5%/日よりも大きい、2%/日よりも大きい、2.5%/日よりも大きい、3%/日よりも大きい、3.5%/日よりも大きい、4.0%/日よりも大きい、4.5%/日よりも大きい、5.0%/日よりも大きい、5.5%/日よりも大きい、6.0%/日よりも大きい、6.5%/日よりも大きい、7.0%/日よりも大きい、7.5%/日よりも大きい、8.0%/日よりも大きい、8.5%/日よりも大きい、9.0%/日よりも大きい、9.5%/日よりも大きい、10.0%/日よりも大きい、10.5%/日よりも大きい、11.0%/日よりも大きい、11.5%/日よりも大きい、12.0%/日よりも大きい、12.5%/日よりも大きい、13.0%/日よりも大きい、13.5%/日よりも大きい、14.0%/日よりも大きい、14.5%/日よりも大きい、15.0%/日よりも大きい、16%/日よりも大きい、17%/日よりも大きい、18%/日よりも大きい、19%/日よりも大きい、20%/日よりも大きい、21%/日よりも大きい、22%/日よりも大きい、23%/日よりも大きい、24%/日よりも大きい、25%/日よりも大きい、30%/日よりも大きい、35%/日よりも大きい、40%/日よりも大きい、45%/日よりも大きい、50%/日よりも大きい、55%/日よりも大きい、60%/日よりも大きい、65%/日よりも大きい、70%/日よりも大きい、75%/日よりも大きい、80%/日よりも大きい、85%/日よりも大きい、90%/日よりも大きい、95%/日よりも大きい、100%/日よりも大きい、105%/日よりも大きい、110%/日よりも大きい、115%/日よりも大きい、120%/日よりも大きい、125%/日よりも大きい、130%/日よりも大きい、135%/日よりも大きい、140%/日よりも大きい、145%/日よりも大きい、または150%/日よりも大きい見かけの成長速度を生じると予測される感作剤の濃度を使用して、産生バイオリアクター(例えば、本明細書に記載される産生バイオリアクターのいずれか)において細胞(例えば、本明細書に記載される細胞のいずれか)を培養する工程をさらに含む。本明細書に記載される方法のいずれかの一部の実施形態は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、約0.1%/日〜約150%/日、約0.1%/日〜約140%/日、約0.1%/日〜約135%/日、約0.1%/日〜約130%/日、約0.1%/日〜約125%/日、約0.1%/日〜約120%/日、約0.1%/日〜約115%/日、約0.1%/日〜約110%/日、約0.1%/日〜約105%/日、約0.1%/日〜約100%/日、約0.1%/日〜約95%/日、約0.1%/日〜約90%/日、約0.1%/日〜約85%/日、約0.1%/日〜約80%/日、約0.1%/日〜約75%/日、約0.1%/日〜約70%/日、約0.1%/日〜約65%/日、約0.1%/日〜約60%/日、約0.1%/日〜約55%/日、約0.1%/日〜約50%/日、約0.1%/日〜約45%/日、約0.1%/日〜約40%/日、約0.1%/日〜約35%/日、約0.1%/日〜約30%/日、約0.1%/日〜約25%/日、約0.1%/日〜約20%/日、約0.1%/日〜約18%/日、約0.1%/日〜約16%/日、約0.1%/日〜約14%/日、約0.1%/日〜約12%/日、約0.1%/日〜約10%/日、約0.1%/日〜約9.0%/日、約0.1%/日〜約8.0%/日、約0.1%/日〜約7.0%/日、約0.1%/日〜約6.0%/日、約0.1%/日〜約5.0%/日、約0.1%/日〜約4.5%/日、約0.1%/日〜約4.0%/日、約0.1%/日〜約3.5%/日、約0.1%/日〜約3.0%/日、約0.1%/日〜約2.5%/日、約0.1%/日〜約2.0%/日、約0.1%/日〜約1.5%/日、約0.1%/日〜約1.0%/日、約0.1%/日〜約0.5%/日、約0.5%/日〜約140%/日、約0.5%/日〜約135%/日、約0.5%/日〜約130%/日、約0.5%/日〜約125%/日、約0.5%/日〜約120%/日、約0.5%/日〜約115%/日、約0.5%/日〜約110%/日、約0.5%/日〜約105%/日、約0.5%/日〜約100%/日、約0.5%/日〜約95%/日、約0.5%/日〜約90%/日、約0.5%/日〜約85%/日、約0.5%/日〜約80%/日、約0.5%/日〜約75%/日、約0.5%/日〜約70%/日、約0.5%/日〜約65%/日、約0.5%/日〜約60%/日、約0.5%/日〜約55%/日、約0.5%/日〜約50%/日、約0.5%/日〜約45%/日、約0.5%/日〜約40%/日、約0.5%/日〜約35%/日、約0.5%/日〜約30%/日、約0.5%/日〜約25%/日、約0.5%/日〜約20%/日、約0.5%/日〜約18%/日、約0.5%/日〜約16%/日、約0.5%/日〜約14%/日、約0.5%/日〜約12%/日、約0.5%/日〜約10%/日、約0.5%/日〜約9.0%/日、約0.5%/日〜約8.0%/日、約0.5%/日〜約7.0%/日、約0.5%/日〜約6.0%/日、約0.5%/日〜約5.0%/日、約0.5%/日〜約4.5%/日、約0.5%/日〜約4.0%/日、約0.5%/日〜約3.5%/日、約0.5%/日〜約3.0%/日、約0.5%/日〜約2.5%/日、約0.5%/日〜約2.0%/日、約0.5%/日〜約1.5%/日、約0.5%/日〜約1.0%/日、約1.0%/日〜約140%/日、約1.0%/日〜約135%/日、約1.0%/日〜約130%/日、約1.0%/日〜約125%/日、約1.0%/日〜約120%/日、約1.0%/日〜約115%/日、約1.0%/日〜約110%/日、約1.0%/日〜約105%/日、約1.0%/日〜約100%/日、約1.0%/日〜約95%/日、約1.0%/日〜約90%/日、約1.0%/日〜約85%/日、約1.0%/日〜約80%/日、約1.0%/日〜約75%/日、約1.0%/日〜約70%/日、約1.0%/日〜約65%/日、約1.0%/日〜約60%/日、約1.0%/日〜約55%/日、約1.0%/日〜約50%/日、約1.0%/日〜約45%/日、約1.0%/日〜約40%/日、約1.0%/日〜約35%/日、約1.0%/日〜約30%/日、約1.0%/日〜約25%/日、約1.0%/日〜約20%/日、約1.0%/日〜約18%/日、約1.0%/日〜約16%/日、約1.0%/日〜約14%/日、約1.0%/日〜約12%/日、約1.0%/日〜約10%/日、約1.0%/日〜約9.0%/日、約1.0%/日〜約8.0%/日、約1.0%/日〜約7.0%/日、約1.0%/日〜約6.0%/日、約1.0%/日〜約5.0%/日、約1.0%/日〜約4.5%/日、約1.0%/日〜約4.0%/日、約1.0%/日〜約3.5%/日、約1.0%/日〜約3.0%/日、約1.0%/日〜約2.5%/日、約1.0%/日〜約2.0%/日、約1.0%/日〜約1.5%/日、約1.5%/日〜約140%/日、約1.5%/日〜約135%/日、約1.5%/日〜約130%/日、約1.5%/日〜約125%/日、約1.5%/日〜約120%/日、約1.5%/日〜約115%/日、約1.5%/日〜約110%/日、約1.5%/日〜約105%/日、約1.5%/日〜約100%/日、約1.5%/日〜約95%/日、約1.5%/日〜約90%/日、約1.5%/日〜約85%/日、約1.5%/日〜約80%/日、約1.5%/日〜約75%/日、約1.5%/日〜約70%/日、約1.5%/日〜約65%/日、約1.5%/日〜約60%/日、約1.5%/日〜約55%/日、約1.5%/日〜約50%/日、約1.5%/日〜約45%/日、約1.5%/日〜約40%/日、約1.5%/日〜約35%/日、約1.5%/日〜約30%/日、約1.5%/日〜約25%/日、約1.5%/日〜約20%/日、約1.5%/日〜約18%/日、約1.5%/日〜約16%/日、約1.5%/日〜約14%/日、約1.5%/日〜約12%/日、約1.5%/日〜約10%/日、約1.5%/日〜約9.0%/日、約1.5%/日〜約8.0%/日、約1.5%/日〜約7.0%/日、約1.5%/日〜約6.0%/日、約1.5%/日〜約5.0%/日、約1.5%/日〜約4.5%/日、約1.5%/日〜約4.0%/日、約1.5%/日〜約3.5%/日、約1.5%/日〜約3.0%/日、約1.5%/日〜約2.5%/日、約1.5%/日〜約2.0%/日、約2.0%/日〜約140%/日、約2.0%/日〜約135%/日、約2.0%/日〜約130%/日、約2.0%/日〜約125%/日、約2.0%/日〜約120%/日、約2.0%/日〜約115%/日、約2.0%/日〜約110%/日、約2.0%/日〜約105%/日、約2.0%/日〜約100%/日、約2.0%/日〜約95%/日、約2.0%/日〜約90%/日、約2.0%/日〜約85%/日、約2.0%/日〜約80%/日、約2.0%/日〜約75%/日、約2.0%/日〜約70%/日、約2.0%/日〜約65%/日、約2.0%/日〜約60%/日、約2.0%/日〜約55%/日、約2.0%/日〜約50%/日、約2.0%/日〜約45%/日、約2.0%/日〜約40%/日、約2.0%/日〜約35%/日、約2.0%/日〜約30%/日、約2.0%/日〜約25%/日、約2.0%/日〜約20%/日、約2.0%/日〜約18%/日、約2.0%/日〜約16%/日、約2.0%/日〜約14%/日、約2.0%/日〜約12%/日、約2.0%/日〜約10%/日、約2.0%/日〜約9.0%/日、約2.0%/日〜約8.0%/日、約2.0%/日〜約7.0%/日、約2.0%/日〜約6.0%/日、約2.0%/日〜約5.0%/日、約2.0%/日〜約4.5%/日、約2.0%/日〜約4.0%/日、約2.0%/日〜約3.5%/日、約2.0%/日〜約3.0%/日、約2.0%/日〜約2.5%/日、約2.5%/日〜約140%/日、約2.5%/日〜約135%/日、約2.5%/日〜約130%/日、約2.5%/日〜約125%/日、約2.5%/日〜約120%/日、約2.5%/日〜約115%/日、約2.5%/日〜約110%/日、約2.5%/日〜約105%/日、約2.5%/日〜約100%/日、約2.5%/日〜約95%/日、約2.5%/日〜約90%/日、約2.5%/日〜約85%/日、約2.5%/日〜約80%/日、約2.5%/日〜約75%/日、約2.5%/日〜約70%/日、約2.5%/日〜約65%/日、約2.5%/日〜約60%/日、約2.5%/日〜約55%/日、約2.5%/日〜約50%/日、約2.5%/日〜約45%/日、約2.5%/日〜約40%/日、約2.5%/日〜約35%/日、約2.5%/日〜約30%/日、約2.5%/日〜約25%/日、約2.5%/日〜約20%/日、約2.5%/日〜約18%/日、約2.5%/日〜約16%/日、約2.5%/日〜約14%/日、約2.5%/日〜約12%/日、約2.5%/日〜約10%/日、約2.5%/日〜約9.0%/日、約2.5%/日〜約8.0%/日、約2.5%/日〜約7.0%/日、約2.5%/日〜約6.0%/日、約2.5%/日〜約5.0%/日、約2.5%/日〜約4.5%/日、約2.5%/日〜約4.0%/日、約2.5%/日〜約3.5%/日、約2.5%/日〜約3.0%/日、約3.0%/日〜約140%/日、約3.0%/日〜約135%/日、約3.0%/日〜約130%/日、約3.0%/日〜約125%/日、約3.0%/日〜約120%/日、
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約10%/日〜約16%/日、約10%/日〜約14%/日、約10%/日〜約12%/日、約12%/日〜約140%/日、約12%/日〜約135%/日、
約12%/日〜約130%/日、約12%/日〜約125%/日、約12%/日〜約120%/日、約12%/日〜約115%/日、約12%/日〜約110%/日、約12%/日〜約105%/日、約12%/日〜約100%/日、約12%/日〜約95%/日、約12%/日〜約90%/日、約12%/日〜約85%/日、約12%/日〜約80%/日、約12%/日〜約75%/日、約12%/日〜約70%/日、約12%/日〜約65%/日、約12%/日〜約60%/日、約12%/日〜約55%/日、約12%/日〜約50%/日、約12%/日〜約45%/日、約12%/日〜約40%/日、約12%/日〜約35%/日、約12%/日〜約30%/日、約12%/日〜約25%/日、約12%/日〜約20%/日、約12%/日〜約18%/日、約12%/日〜約16%/日、約12%/日〜約14%/日、約14%/日〜約140%/日、約14%/日〜約135%/日、約14%/日〜約130%/日、約14%/日〜約125%/日、約14%/日〜約120%/日、約14%/日〜約115%/日、約14%/日〜約110%/日、約14%/日〜約105%/日、約14%/日〜約100%/日、約14%/日〜約95%/日、約14%/日〜約90%/日、約14%/日〜約85%/日、約14%/日〜約80%/日、約14%/日〜約75%/日、約14%/日〜約70%/日、約14%/日〜約65%/日、約14%/日〜約60%/日、約14%/日〜約55%/日、約14%/日〜約50%/日、約14%/日〜約45%/日、約14%/日〜約40%/日、約14%/日〜約35%/日、約14%/日〜約30%/日、約14%/日〜約25%/日、約14%/日〜約20%/日、約14%/日〜約18%/日、約14%/日〜約16%/日、約16%/日〜約140%/日、約16%/日〜約135%/日、約16%/日〜約130%/日、約16%/日〜約125%/日、約16%/日〜約120%/日、約16%/日〜約115%/日、約16%/日〜約110%/日、約16%/日〜約105%/日、約16%/日〜約100%/日、約16%/日〜約95%/日、約16%/日〜約90%/日、約16%/日〜約85%/日、約16%/日〜約80%/日、約16%/日〜約75%/日、約16%/日〜約70%/日、約16%/日〜約65%/日、約16%/日〜約60%/日、約16%/日〜約55%/日、約16%/日〜約50%/日、約16%/日〜約45%/日、約16%/日〜約40%/日、約16%/日〜約35%/日、約16%/日〜約30%/日、約16%/日〜約25%/日、約16%/日〜約20%/日、約16%/日〜約18%/日、約18%/日〜約140%/日、約18%/日〜約135%/日、約18%/日〜約130%/日、約18%/日〜約125%/日、約18%/日〜約120%/日、約18%/日〜約115%/日、約18%/日〜約110%/日、約18%/日〜約105%/日、約18%/日〜約100%/日、約18%/日〜約95%/日、約18%/日〜約90%/日、約18%/日〜約85%/日、約18%/日〜約80%/日、約18%/日〜約75%/日、約18%/日〜約70%/日、約18%/日〜約65%/日、約18%/日〜約60%/日、約18%/日〜約55%/日、約18%/日〜約50%/日、約18%/日〜約45%/日、約18%/日〜約40%/日、約18%/日〜約35%/日、約18%/日〜約30%/日、約18%/日〜約25%/日、約18%/日〜約20%/日、約20%/日〜約140%/日、約20%/日〜約135%/日、約20%/日〜約130%/日、約20%/日〜約125%/日、約20%/日〜約120%/日、約20%/日〜約115%/日、約20%/日〜約110%/日、約20%/日〜約105%/日、約20%/日〜約100%/日、約20%/日〜約95%/日、約20%/日〜約90%/日、約20%/日〜約85%/日、約20%/日〜約80%/日、約20%/日〜約75%/日、約20%/日〜約70%/日、約20%/日〜約65%/日、約20%/日〜約60%/日、約20%/日〜約55%/日、約20%/日〜約50%/日、約20%/日〜約45%/日、約20%/日〜約40%/日、約20%/日〜約35%/日、約20%/日〜約30%/日、約20%/日〜約25%/日、約25%/日〜約140%/日、約25%/日〜約135%/日、約25%/日〜約130%/日、約25%/日〜約125%/日、約25%/日〜約120%/日、約25%/日〜約115%/日、約25%/日〜約110%/日、約25%/日〜約105%/日、約25%/日〜約100%/日、約25%/日〜約95%/日、約25%/日〜約90%/日、約25%/日〜約85%/日、約25%/日〜約80%/日、約25%/日〜約75%/日、約25%/日〜約70%/日、約25%/日〜約65%/日、約25%/日〜約60%/日、約25%/日〜約55%/日、約25%/日〜約50%/日、約25%/日〜約45%/日、約25%/日〜約40%/日、約25%/日〜約35%/日、約25%/日〜約30%/日、約30%/日〜約140%/日、約30%/日〜約135%/日、約30%/日〜約130%/日、約30%/日〜約125%/日、約30%/日〜約120%/日、約30%/日〜約115%/日、約30%/日〜約110%/日、約30%/日〜約105%/日、約30%/日〜約100%/日、約30%/日〜約95%/日、約30%/日〜約90%/日、約30%/日〜約85%/日、約30%/日〜約80%/日、約30%/日〜約75%/日、約30%/日〜約70%/日、約30%/日〜約65%/日、約30%/日〜約60%/日、約30%/日〜約55%/日、約30%/日〜約50%/日、約30%/日〜約45%/日、約30%/日〜約40%/日、約30%/日〜約35%/日、約35%/日〜約140%/日、約35%/日〜約135%/日、約35%/日〜約130%/日、約35%/日〜約125%/日、約35%/日〜約120%/日、約35%/日〜約115%/日、約35%/日〜約110%/日、約35%/日〜約105%/日、約35%/日〜約100%/日、約35%/日〜約95%/日、約35%/日〜約90%/日、約35%/日〜約85%/日、約35%/日〜約80%/日、約35%/日〜約75%/日、約35%/日〜約70%/日、約35%/日〜約65%/日、約35%/日〜約60%/日、約35%/日〜約55%/日、約35%/日〜約50%/日、約35%/日〜約45%/日、約35%/日〜約40%/日、約40%/日〜約140%/日、約40%/日〜約135%/日、約40%/日〜約130%/日、約40%/日〜約125%/日、約40%/日〜約120%/日、約40%/日〜約115%/日、約40%/日〜約110%/日、約40%/日〜約105%/日、約40%/日〜約100%/日、約40%/日〜約95%/日、約40%/日〜約90%/日、約40%/日〜約85%/日、約40%/日〜約80%/日、約40%/日〜約75%/日、約40%/日〜約70%/日、約40%/日〜約65%/日、約40%/日〜約60%/日、約40%/日〜約55%/日、約40%/日〜約50%/日、約40%/日〜約45%/日、約45%/日〜約140%/日、約45%/日〜約135%/日、約45%/日〜約130%/日、約45%/日〜約125%/日、約45%/日〜約120%/日、約45%/日〜約115%/日、約45%/日〜約110%/日、約45%/日〜約105%/日、約45%/日〜約100%/日、約45%/日〜約95%/日、約45%/日〜約90%/日、約45%/日〜約85%/日、約45%/日〜約80%/日、約45%/日〜約75%/日、約45%/日〜約70%/日、約45%/日〜約65%/日、約45%/日〜約60%/日、約45%/日〜約55%/日、約45%/日〜約50%/日、約50%/日〜約140%/日、約50%/日〜約135%/日、約50%/日〜約130%/日、約50%/日〜約125%/日、約50%/日〜約120%/日、約50%/日〜約115%/日、約50%/日〜約110%/日、約50%/日〜約105%/日、約50%/日〜約100%/日、約50%/日〜約95%/日、約50%/日〜約90%/日、約50%/日〜約85%/日、約50%/日〜約80%/日、約50%/日〜約75%/日、約50%/日〜約70%/日、約50%/日〜約65%/日、約50%/日〜約60%/日、約50%/日〜約55%/日、約55%/日〜約140%/日、約55%/日〜約135%/日、約55%/日〜約130%/日、約55%/日〜約125%/日、約55%/日〜約120%/日、約55%/日〜約115%/日、約55%/日〜約110%/日、約55%/日〜約105%/日、約55%/日〜約100%/日、約55%/日〜約95%/日、約55%/日〜約90%/日、約55%/日〜約85%/日、約55%/日〜約80%/日、約55%/日〜約75%/日、約55%/日〜約70%/日、約55%/日〜約65%/日、約55%/日〜約60%/日、約60%/日〜約140%/日、約60%/日〜約135%/日、約60%/日〜約130%/日、約60%/日〜約125%/日、約60%/日〜約120%/日、約60%/日〜約115%/日、約650%/日〜約110%/日、約60%/日〜約105%/日、約60%/日〜約100%/日、約60%/日〜約95%/日、約60%/日〜約90%/日、約60%/日〜約85%/日、約60%/日〜約80%/日、約60%/日〜約75%/日、約60%/日〜約70%/日、約60%/日〜約65%/日、約65%/日〜約140%/日、約65%/日〜約135%/日、約65%/日〜約130%/日、約65%/日〜約125%/日、約65%/日〜約120%/日、約65%/日〜約115%/日、約65%/日〜約110%/日、約65%/日〜約105%/日、約65%/日〜約100%/日、約65%/日〜約95%/日、約65%/日〜約90%/日、約65%/日〜約85%/日、約65%/日〜約80%/日、約65%/日〜約75%/日、約65%/日〜約70%/日、約70%/日〜約140%/日、約70%/日〜約135%/日、約70%/日〜約130%/日、約70%/日〜約125%/日、約70%/日〜約120%/日、約70%/日〜約115%/日、約70%/日〜約110%/日、約70%/日〜約105%/日、約70%/日〜約100%/日、約70%/日〜約95%/日、約70%/日〜約90%/日、約70%/日〜約85%/日、約70%/日〜約80%/日、約70%/日〜約75%/日、約75%/日〜約140%/日、約75%/日〜約135%/日、約75%/日〜約130%/日、約75%/日〜約125%/日、約75%/日〜約120%/日、約75%/日〜約115%/日、約75%/日〜約110%/日、約75%/日〜約105%/日、約75%/日〜約100%/日、約75%/日〜約95%/日、約75%/日〜約90%/日、約75%/日〜約85%/日、約75%/日〜約80%/日、約80%/日〜約140%/日、約80%/日〜約135%/日、約80%/日〜約130%/日、約80%/日〜約125%/日、約80%/日〜約120%/日、約80%/日〜約115%/日、約80%/日〜約110%/日、約80%/日〜約105%/日、約80%/日〜約100%/日、約80%/日〜約95%/日、約80%/日〜約90%/日、約80%/日〜約85%/日、約85%/日〜約140%/日、約85%/日〜約135%/日、約85%/日〜約130%/日、約85%/日〜約125%/日、約85%/日〜約120%/日、約85%/日〜約115%/日、
約85%/日〜約110%/日、約85%/日〜約105%/日、約85%/日〜約100%/日、約85%/日〜約95%/日、約85%/日〜約90%/日、約90%/日〜約140%/日、約90%/日〜約135%/日、約90%/日〜約130%/日、約90%/日〜約125%/日、約90%/日〜約120%/日、
約90%/日〜約115%/日、約90%/日〜約110%/日、約90%/日〜約105%/日、約90%/日〜約100%/日、約90%/日〜約95%/日、約95%/日〜約140%/日、約95%/日〜約135%/日、約95%/日〜約130%/日、約95%/日〜約125%/日、約95%/日〜約120%/日、約95%/日〜約115%/日、約95%/日〜約110%/日、約95%/日〜約105%/日、約95%/日〜約100%/日、約100%/日〜約140%/日、約100%/日〜約135%/日、約100%/日〜約130%/日、約100%/日〜約125%/日、約100%/日〜約120%/日、約100%/日〜約115%/日、約100%/日〜約110%/日、約100%/日〜約105%/日、約105%/日〜約140%/日、約105%/日〜約135%/日、約105%/日〜約130%/日、約105%/日〜約125%/日、約105%/日〜約120%/日、約105%/日〜約115%/日、約105%/日〜約110%/日、約110%/日〜約140%/日、約110%/日〜約135%/日、約110%/日〜約130%/日、約110%/日〜約125%/日、約110%/日〜約120%/日、約110%/日〜約115%/日、約115%/日〜約140%/日、約115%/日〜約135%/日、約115%/日〜約130%/日、約115%/日〜約125%/日、約115%/日〜約120%/日、約120%/日〜約140%/日、約120%/日〜約135%/日、約120%/日〜約130%/日、約120%/日〜約125%/日、約125%/日〜約140%/日、約125%/日〜約135%/日、約125%/日〜約130%/日、約130%/日〜約140%/日、約130%/日〜約135%/日、または約135%/日〜約140%/日の見かけの成長速度を生じると予測される感作剤の濃度を使用して、産生バイオリアクター(例えば、本明細書に記載される産生バイオリアクターのいずれか)において細胞(例えば、本明細書に記載される細胞のいずれか)を培養する工程をさらに含む。
これらの方法の一部の実施形態では、細胞は、組換え治療タンパク質をコードする核酸を含む。これらの方法の一部の実施形態は、組換え治療タンパク質を収集または回収する工程をさらに含む。これらの方法の一部の実施形態は、組換え治療タンパク質を精製する工程をさらに含む。これらの方法の一部の実施形態は、精製された組換え治療タンパク質を製剤化する工程をさらに含む。
これらの方法の一部の実施形態では、細胞は、細菌(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の例示的な細菌のいずれか)、酵母(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の例示的な酵母細胞のいずれか)または哺乳動物細胞(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の例示的な哺乳動物細胞のいずれか)である。
これらの方法の一部の実施形態では、細胞生存度は、試験培養容器中の乳酸デヒドロゲナーゼ(LDH)の濃度を測定することによって決定される。
一部の実施形態では、試験培養容器は、バッフル付き振盪フラスコ(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知のバッフル付き振盪フラスコのいずれか)であり、複数の試験条件は、(a)約125RPM〜約400RPM(または本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか)の回転式撹拌;(b)約0ppm〜約120ppm(または本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか)の感作剤(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の感作剤のいずれか)の濃度;および(c)約1g/L〜約10g/L(または本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか)である保護剤(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の保護剤のいずれか)の濃度、のうち1つまたはそれ以上を含む。一部の実施形態では、保護剤は、ポロクサマー(例えば、ポロクサマー−188、ポロクサマー−401、ポロクサマー−402またはポロクサマー−407)、ポロキサミン(例えば、ポロキサミン−904またはポロキサミン−908)またはプルロニックポリオールである。
産生バイオリアクターにおける細胞生存度を改善する方法
産生バイオリアクター(例えば、本明細書に記載される産生バイオリアクターのいずれか)における細胞生存度を改善する方法であって、(a)試験培養容器における複数の試験条件下での細胞生存度を決定する工程であって、複数の条件は、パラメーターのセットによって規定される、工程;(b)試験培養容器における複数の条件下での細胞生存度に基づいて、産生バイオリアクターにおける細胞生存度にとって最適な条件を選択する工程;および(c)選択された条件下で、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程、を含む方法もまた、本明細書で提供される。
これらの方法の一部の実施形態では、パラメーターのセットは、剪断応力、感作剤(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の感作剤のいずれか)の濃度および保護剤(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の保護剤のいずれか)の濃度を含む、それらから本質的になる、またはそれらからなる。これらの方法の一部の実施形態では、複数の試験条件は、完全実施要因スクリーニングおよび/または内接中心複合計画に基づいて選択される。これらの方法の一部の実施形態では、感作剤は、消泡剤(例えば、ポリジメチルシロキサンベースの消泡剤、シメチコン、または本明細書に記載されるもしくは当該分野で公知の任意の他の消泡剤)である。
これらの方法の一部の実施形態では、試験培養容器(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の試験培養容器のいずれか)は、約5mL〜約5L(または本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか)の容量を有する。これらの方法の一部の実施形態では、試験培養容器は、振盪フラスコ、例えば、バッフル付き振盪フラスコ(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知のバッフル付き振盪フラスコのいずれか)である。
これらの方法の一部の実施形態では、産生バイオリアクター(例えば、本明細書に記載される産生バイオリアクターのいずれか)は、約5L〜約20,000L(または本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか)の容量を有する。一部の例では、産生バイオリアクターは、灌流バイオリアクターである。他の例では、産生バイオリアクターは、流加バイオリアクターである。
一部の実施形態では、工程(c)は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、1%/日、2%/日、3%/日、4%/日、5%/日、6%/日、7%/日、8%/日、9%/日、10%/日、11%/日、12%/日、13%/日、14%/日、15%/日、16%/日、17%/日、18%/日、19%/日、20%/日、21%/日、22%/日、23%/日、24%/日、25%/日、26%/日、27%/日、28%/日、29%/日、30%/日、31%/日、32%/日、33%/日、34%/日、35%/日、36%/日、37%/日、38%/日、39%/日または40%/日未満の特異的細胞死亡率を生じる。一部の実施形態では、工程(c)は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、約0.1%/日〜約40%/日(または本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか)の特異的細胞死亡率を生じる。
一部の実施形態では、工程(c)は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、150nU/細胞/日未満、145nU/細胞/日未満、140nU/細胞/日未満、135nU/細胞/日未満、130nU/細胞/日未満、125nU/細胞/日未満、120nU/細胞/日未満、115nU/細胞/日未満、150nU/細胞/日未満、110nU/細胞/日未満、105nU/細胞/日未満、100nU/細胞/日未満、95nU/細胞/日未満、90nU/細胞/日未満、85nU/細胞/日未満、80nU/細胞/日未満、75nU/細胞/日未満、70nU/細胞/日未満、65nU/細胞/日未満、60nU/細胞/日未満、55nU/細胞/日未満、50nU/細胞/日未満、45nU/細胞/日未満、45nU/細胞/日未満、40nU/細胞/日未満、35nU/細胞/日未満、30nU/細胞/日未満、25nU/細胞/日未満、20nU/細胞/日未満、15nU/細胞/日未満、10nU/細胞/日未満、5nU/細胞/日未満または1nU/細胞/日未満の細胞特異的LDH産生を生じる。これらの方法の一部の実施形態では、工程(c)は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、約0.1nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日(または本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか)の細胞特異的LDH産生を生じる。
一部の実施形態では、工程(c)は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、1%/日よりも大きい、1.5%/日よりも大きい、2%/日よりも大きい、2.5%/日よりも大きい、3%/日よりも大きい、3.5%/日よりも大きい、4.0%/日よりも大きい、4.5%/日よりも大きい、5.0%/日よりも大きい、5.5%/日よりも大きい、6.0%/日よりも大きい、6.5%/日よりも大きい、7.0%/日よりも大きい、7.5%/日よりも大きい、8.0%/日よりも大きい、8.5%/日よりも大きい、9.0%/日よりも大きい、9.5%/日よりも大きい、10.0%/日よりも大きい、10.5%/日よりも大きい、11.0%/日よりも大きい、11.5%/日よりも大きい、12.0%/日よりも大きい、12.5%/日よりも大きい、13.0%/日よりも大きい、13.5%/日よりも大きい、14.0%/日よりも大きい、14.5%/日よりも大きい、15.0%/日よりも大きい、16%/日よりも大きい、17%/日よりも大きい、18%/日よりも大きい、19%/日よりも大きい、20%/日よりも大きい、21%/日よりも大きい、22%/日よりも大きい、23%/日よりも大きい、24%/日よりも大きい、25%/日よりも大きい、30%/日よりも大きい、35%/日よりも大きい、40%/日よりも大きい、45%/日よりも大きい、50%/日よりも大きい、55%/日よりも大きい、60%/日よりも大きい、65%/日よりも大きい、70%/日よりも大きい、75%/日よりも大きい、80%/日よりも大きい、85%/日よりも大きい、90%/日よりも大きい、95%/日よりも大きい、100%/日よりも大きい、105%/日よりも大きい、110%/日よりも大きい、115%/日よりも大きい、120%/日よりも大きい、125%/日よりも大きい、130%/日よりも大きい、135%/日よりも大きい、140%/日よりも大きい、145%/日よりも大きい、または150%/日よりも大きい見かけの成長速度を生じる。これらの方法の一部の実施形態では、工程(c)は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、約0.1%/日〜約150%/日(または本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか)の見かけの成長速度を生じる。
これらの方法の一部の実施形態では、細胞(例えば、本明細書に記載される細胞のいずれか)は、組換え治療タンパク質(例えば、本明細書に記載される組換え治療タンパク質のいずれか)をコードする核酸を含む。これらの方法の一部の実施形態は、組換え治療タンパク質を収集または回収する工程をさらに含む。これらの方法の一部の実施形態は、組換え治療タンパク質を精製する工程をさらに含む。これらの方法の一部の実施形態は、精製された組換え治療タンパク質を製剤化する工程をさらに含む。これらの方法の一部の実施形態では、細胞は、細菌(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の例示的な細菌のいずれか)、酵母細胞(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の例示的な酵母細胞のいずれか)または哺乳動物細胞(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の例示的な哺乳動物細胞のいずれか)である。
これらの方法の一部の実施形態では、細胞生存度は、試験培養容器中の乳酸デヒドロゲナーゼ(LDH)の濃度を測定することによって決定される。これらの方法の一部の実施形態では、試験培養容器は、バッフル付き振盪フラスコであり、複数の試験条件は、(a)約125RPM〜約400RPM(または本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか)の回転式撹拌;(b)約0ppm〜約120ppm(または本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか)の感作剤(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の感作剤のいずれか)の濃度;および(c)約1g/L〜約10g/L(または本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか)である保護剤(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の保護剤のいずれか)の濃度、のうち1つまたはそれ以上(例えば、2つまたは3つ)を含む(またはそれからなる)。これらの方法の一部の実施形態では、保護剤は、ポロクサマー(例えば、ポロクサマー−188、ポロクサマー−401、ポロクサマー−402またはポロクサマー−407)、ポロキサミン(例えば、ポロキサミン−904またはポロキサミン−908)またはプルロニックポリオールである。
産生バイオリアクターにおける細胞生存度を予測するための方法
産生バイオリアクター(例えば、本明細書に記載される産生バイオリアクターのいずれか)における細胞生存度を予測する方法であって、(a)少なくとも2つ(例えば、2つ、3つ、4つ、5つまたは6つ)のパラメーターを含むパラメーターのセットを選択する工程;(b)試験培養容器(例えば、本明細書に記載される試験培養容器のいずれか)におけるパラメーターのセットによって規定される複数の試験条件下での細胞生存度を決定する工程;および(c)試験培養容器における複数の条件下での細胞生存度に基づいて、産生バイオリアクターにおける細胞生存度を予測する工程、を含む方法もまた、本明細書で提供される。
これらの方法の一部の実施形態では、パラメーターのセットは、剪断応力、感作剤(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の例示的な感作剤のいずれか)の濃度および保護剤(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の保護剤のいずれか)の濃度を含む、それらから本質的になる、またはそれらからなる。これらの方法の一部の実施形態では、複数の試験条件は、完全実施要因スクリーニングおよび/または内接中心複合計画に基づいて選択される。
これらの方法の一部の実施形態では、感作剤は、消泡剤(例えば、ポリジメチルシロキサンベースの消泡剤、シメチコン、または本明細書に記載されるもしくは当該分野で公知の任意の他の消泡剤)である。
これらの方法の一部の実施形態では、試験培養容器(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の試験培養容器のいずれか)は、約5mL〜約5L(または本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか)の容量を有する。これらの方法の一部の実施形態では、試験培養容器は、振盪フラスコ、例えば、バッフル付き振盪フラスコ(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知のバッフル付き振盪フラスコのいずれか)である。
これらの方法の一部の実施形態では、産生バイオリアクター(例えば、本明細書に記載される産生バイオリアクターのいずれか)は、約5L〜約20,000L(または本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか)の容量を有する。一部の例では、産生バイオリアクターは、灌流バイオリアクターである。他の例では、産生バイオリアクターは、流加バイオリアクターである。
これらの方法の一部の実施形態は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、1%/日、2%/日、3%/日、4%/日、5%/日、6%/日、7%/日、8%/日、9%/日、10%/日、11%/日、12%/日、13%/日、14%/日、15%/日、16%/日、17%/日、18%/日、19%/日、20%/日、21%/日、22%/日、23%/日、24%/日、25%/日、26%/日、27%/日、28%/日、29%/日、30%/日、31%/日、32%/日、33%/日、34%/日、35%/日、36%/日、37%/日、38%/日、39%/日または40%/日未満の特異的細胞死亡率を生じると予測される条件を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む。これらの方法の一部の実施形態は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、約0.1%/日〜約40%/日(または本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか)の特異的細胞死亡率を生じると予測される条件を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む。
これらの方法の一部の実施形態は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、150nU/細胞/日未満、145nU/細胞/日未満、140nU/細胞/日未満、135nU/細胞/日未満、130nU/細胞/日未満、125nU/細胞/日未満、120nU/細胞/日未満、115nU/細胞/日未満、150nU/細胞/日未満、110nU/細胞/日未満、105nU/細胞/日未満、100nU/細胞/日未満、95nU/細胞/日未満、90nU/細胞/日未満、85nU/細胞/日未満、80nU/細胞/日未満、75nU/細胞/日未満、70nU/細胞/日未満、65nU/細胞/日未満、60nU/細胞/日未満、55nU/細胞/日未満、50nU/細胞/日未満、45nU/細胞/日未満、45nU/細胞/日未満、40nU/細胞/日未満、35nU/細胞/日未満、30nU/細胞/日未満、25nU/細胞/日未満、20nU/細胞/日未満、15nU/細胞/日未満、10nU/細胞/日未満、5nU/細胞/日未満、または1nU/細胞/日未満の細胞特異的LDH産生を生じると予測される条件を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む。これらの方法の一部の実施形態は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、約0.1nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日(または本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか)の細胞特異的LDH産生を生じると予測される条件を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む。
これらの方法の一部の実施形態は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、1%/日よりも大きい、1.5%/日よりも大きい、2%/日よりも大きい、2.5%/日よりも大きい、3%/日よりも大きい、3.5%/日よりも大きい、4.0%/日よりも大きい、4.5%/日よりも大きい、5.0%/日よりも大きい、5.5%/日よりも大きい、6.0%/日よりも大きい、6.5%/日よりも大きい、7.0%/日よりも大きい、7.5%/日よりも大きい、8.0%/日よりも大きい、8.5%/日よりも大きい、9.0%/日よりも大きい、9.5%/日よりも大きい、10.0%/日よりも大きい、10.5%/日よりも大きい、11.0%/日よりも大きい、11.5%/日よりも大きい、12.0%/日よりも大きい、12.5%/日よりも大きい、13.0%/日よりも大きい、13.5%/日よりも大きい、14.0%/日よりも大きい、14.5%/日よりも大きい、15.0%/日よりも大きい、16%/日よりも大きい、17%/日よりも大きい、18%/日よりも大きい、19%/日よりも大きい、20%/日よりも大きい、21%/日よりも大きい、22%/日よりも大きい、23%/日よりも大きい、24%/日よりも大きい、25%/日よりも大きい、30%/日よりも大きい、35%/日よりも大きい、40%/日よりも大きい、45%/日よりも大きい、50%/日よりも大きい、55%/日よりも大きい、60%/日よりも大きい、65%/日よりも大きい、70%/日よりも大きい、75%/日よりも大きい、80%/日よりも大きい、85%/日よりも大きい、90%/日よりも大きい、95%/日よりも大きい、100%/日よりも大きい、105%/日よりも大きい、110%/日よりも大きい、115%/日よりも大きい、120%/日よりも大きい、125%/日よりも大きい、130%/日よりも大きい、135%/日よりも大きい、140%/日よりも大きい、145%/日よりも大きい、または150%/日よりも大きい見かけの成長速度を生じると予測される条件を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む。これらの方法の一部の実施形態は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、約0.1%/日〜約150%/日(または本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか)の見かけの成長速度を生じると予測される条件を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む。
これらの方法の一部の実施形態では、細胞(例えば、本明細書に記載される細胞のいずれか)は、組換え治療タンパク質(例えば、本明細書に記載される組換え治療タンパク質のいずれか)をコードする核酸を含む。これらの方法の一部の実施形態は、組換え治療タンパク質を収集または回収する工程をさらに含む。これらの方法の一部の実施形態は、組換え治療タンパク質を精製する工程をさらに含む。これらの方法の一部の実施形態は、精製された組換え治療タンパク質を製剤化する工程をさらに含む。これらの方法の一部の実施形態では、細胞は、細菌(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の例示的な細菌のいずれか)、酵母細胞(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の例示的な酵母細胞のいずれか)または哺乳動物細胞(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の例示的な哺乳動物細胞のいずれか)である。
これらの方法の一部の実施形態では、細胞生存度は、試験培養容器中の乳酸デヒドロゲナーゼ(LDH)の濃度を測定することによって決定される。これらの方法の一部の実施形態では、試験培養容器は、バッフル付き振盪フラスコであり、複数の試験条件は、(a)約125RPM〜約400RPM(または本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか)の回転式撹拌;(b)約0ppm〜約120ppm(または本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか)の感作剤(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の感作剤のいずれか)の濃度;および(c)約1g/L〜約10g/L(または本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか)である保護剤(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の保護剤のいずれか)の濃度、のうち1つまたはそれ以上(例えば、2つまたは3つ)を含む(またはそれからなる)。これらの方法の一部の実施形態では、保護剤は、ポロクサマー(例えば、ポロクサマー−188、ポロクサマー−401、ポロクサマー−402またはポロクサマー−407)、ポロキサミン(例えば、ポロキサミン−904またはポロキサミン−908)またはプルロニックポリオールである。
産生バイオリアクターにおいて細胞を培養するための方法
産生バイオリアクターにおいて細胞(例えば、本明細書に記載される細胞のいずれか)を培養する方法であって、以下の条件:
(a)産生バイオリアクターは、約1.0〜約110(例えば、約3.0〜約7.0、約4.0〜約6.0、約5.0〜約6.0、または約6.0)(例えば、約1.0〜約110、約1.0〜約95、約1.0〜約90、約1.0〜約85、約1.0〜約80、約1.0〜約75、約1.0〜約70、約1.0〜約65、約1.0〜約60、約1.0〜約55、約1.0〜約50、約1.0〜約45、約1.0〜約40、約1.0〜約35、約1.0〜約30、約1.0〜約25、約1.0〜約20、約1.0〜約18、約1.0〜約16、約1.0〜約14、約1.0〜約12、約1.0〜約10、約1.0〜約9.0、約1.0〜約8.0、約1.0〜約7.0、約1.0〜約6.0、約1.0〜約5.0、約1.0〜約4.0、約1.0〜約3.0、約1.0〜約2.0、約2.0〜約110、約2.0〜約95、約2.0〜約90、約2.0〜約85、約2.0〜約80、約2.0〜約75、約2.0〜約70、約2.0〜約65、約2.0〜約60、約2.0〜約55、約2.0〜約50、約2.0〜約45、約2.0〜約40、約2.0〜約35、約2.0〜約30、約2.0〜約25、約2.0〜約20、約2.0〜約18、約2.0〜約16、約2.0〜約14、約2.0〜約12、約2.0〜約10、約2.0〜約9.0、約2.0〜約8.0、約2.0〜約7.0、約2.0〜約6.0、約2.0〜約5.0、約2.0〜約4.0、約2.0〜約3.0、約3.0〜約110、約3.0〜約95、約3.0〜約90、約3.0〜約85、約3.0〜約80、約3.0〜約75、約3.0〜約70、約3.0〜約65、約3.0〜約60、約3.0〜約55、約3.0〜約50、約3.0〜約45、約3.0〜約40、約3.0〜約35、約3.0〜約30、約3.0〜約25、約3.0〜約20、約3.0〜約18、約3.0〜約16、約3.0〜約14、約3.0〜約12、約3.0〜約10、約3.0〜約9.0、約3.0〜約8.0、約3.0〜約7.0、約3.0〜約6.0、約3.0〜約5.0、約3.0〜約4.0、約4.0〜約110、約4.0〜約95、約4.0〜約90、約4.0〜約85、約4.0〜約80、約4.0〜約75、約4.0〜約70、約4.0〜約65、約4.0〜約60、約4.0〜約55、約4.0〜約50、約4.0〜約45、約4.0〜約40、約4.0〜約35、約4.0〜約30、約4.0〜約25、約4.0〜約20、約4.0〜約18、約4.0〜約16、約4.0〜約14、約4.0〜約12、約4.0〜約10、約4.0〜約9.0、約4.0〜約8.0、約4.0〜約7.0、約4.0〜約6.0、約4.0〜約5.0、約5.0〜約110、約5.0〜約95、約5.0〜約90、約5.0〜約85、約5.0〜約80、約5.0〜約75、約5.0〜約70、約5.0〜約65、約5.0〜約60、約5.0〜約55、約5.0〜約50、約5.0〜約45、約5.0〜約40、約5.0〜約35、約5.0〜約30、約5.0〜約25、約5.0〜約20、約5.0〜約18、約5.0〜約16、約5.0〜約14、約5.0〜約12、約5.0〜約10、約5.0〜約9.0、約5.0〜約8.0、約5.0〜約7.0、約5.0〜約6.0、約6.0〜約110、約6.0〜約95、約6.0〜約90、約6.0〜約85、約6.0〜約80、約6.0〜約75、約6.0〜約70、約6.0〜約65、約6.0〜約60、約6.0〜約55、約6.0〜約50、約6.0〜約45、約6.0〜約40、約6.0〜約35、約6.0〜約30、約6.0〜約25、約6.0〜約20、約6.0〜約18、約6.0〜約16、約6.0〜約14、約6.0〜約12、約6.0〜約10、約6.0〜約9.0、約6.0〜約8.0、約6.0〜約7.0、約7.0〜約110、約7.0〜約95、約7.0〜約90、約7.0〜約85、約7.0〜約80、約7.0〜約75、約7.0〜約70、約7.0〜約65、約7.0〜約60、約7.0〜約55、約7.0〜約50、約7.0〜約45、約7.0〜約40、約7.0〜約35、約7.0〜約30、約7.0〜約25、約7.0〜約20、約7.0〜約18、約7.0〜約16、約7.0〜約14、約7.0〜約12、約7.0〜約10、約7.0〜約9.0、約7.0〜約8.0、約8.0〜約110、約8.0〜約95、約8.0〜約90、約8.0〜約85、約8.0〜約80、約8.0〜約75、約8.0〜約70、約8.0〜約65、約8.0〜約60、約8.0〜約55、約8.0〜約50、約8.0〜約45、約8.0〜約40、約8.0〜約35、約8.0〜約30、約8.0〜約25、約8.0〜約20、約8.0〜約18、約8.0〜約16、約8.0〜約14、約8.0〜約12、約8.0〜約10、約8.0〜約9.0、約9.0〜約110、約9.0〜約95、約9.0〜約90、約9.0〜約85、約9.0〜約80、約9.0〜約75、約9.0〜約70、約9.0〜約65、約9.0〜約60、約9.0〜約55、約9.0〜約50、約9.0〜約45、約9.0〜約40、約9.0〜約35、約9.0〜約30、約9.0〜約25、約9.0〜約20、約9.0〜約18、約9.0〜約16、約9.0〜約14、約9.0〜約12、約9.0〜約10、約10〜約110、約10〜約95、約10〜約90、約10〜約85、約10〜約80、約10〜約75、約10〜約70、約10〜約65、約10〜約60、約10〜約55、約10〜約50、約10〜約45、約10〜約40、約10〜約35、約10〜約30、約10〜約25、約10〜約20、約10〜約18、約10〜約16、約10〜約14、約10〜約12、約12〜約110、約12〜約95、約12〜約90、約12〜約85、約12〜約80、約12〜約75、約12〜約70、約12〜約65、約12〜約60、約12〜約55、約12〜約50、約12〜約45、約12〜約40、約12〜約35、約12〜約30、約12〜約25、約12〜約20、約12〜約18、約12〜約16、約12〜約14、約14〜約110、約14〜約95、約14〜約90、約14〜約85、約14〜約80、約14〜約75、約14〜約70、約14〜約65、約14〜約60、約14〜約55、約14〜約50、約14〜約45、約14〜約40、約14〜約35、約14〜約30、約14〜約25、約14〜約20、約14〜約18、約14〜約16、約16〜約110、約16〜約95、約16〜約90、約16〜約85、約16〜約80、約16〜約75、約16〜約70、約16〜約65、約16〜約60、約16〜約55、約16〜約50、約16〜約45、約16〜約40、約16〜約35、約16〜約30、約16〜約25、約16〜約20、約16〜約18、約18〜約110、約18〜約95、約18〜約90、約18〜約85、約18〜約80、約18〜約75、約18〜約70、約18〜約65、約18〜約60、約18〜約55、約18〜約50、約18〜約45、約18〜約40、約18〜約35、約18〜約30、約18〜約25、約18〜約20、約20〜約110、約20〜約95、約20〜約90、約20〜約85、約20〜約80、約20〜約75、約20〜約70、約20〜約65、約20〜約60、約20〜約55、約20〜約50、約20〜約45、約20〜約40、約20〜約35、約20〜約30、約20〜約25、約25〜約110、約25〜約95、約25〜約90、約25〜約85、約25〜約80、約25〜約75、約25〜約70、約25〜約65、約25〜約60、約25〜約55、約25〜約50、約25〜約45、約25〜約40、約25〜約35、約25〜約30、約30〜約110、約30〜約95、約30〜約90、約30〜約85、約30〜約80、約30〜約75、約30〜約70、約30〜約65、約30〜約60、約30〜約55、約30〜約50、約30〜約45、約30〜約40、約30〜約35、約35〜約110、約35〜約95、約35〜約90、約35〜約85、約35〜約80、約35〜約75、約35〜約70、約35〜約65、約35〜約60、約35〜約55、約35〜約50、約35〜約45、約35〜約40、約40〜約110、約40〜約95、約40〜約90、約40〜約85、約40〜約80、約40〜約75、約40〜約70、約40〜約65、約40〜約60、約40〜約55、約40〜約50、約40〜約45、約45〜約110、約45〜約95、約45〜約90、約45〜約85、約45〜約80、約45〜約75、約45〜約70、約45〜約65、約45〜約60、約45〜約55、約45〜約50、約50〜約110、約50〜約95、約50〜約90、約50〜約85、約50〜約80、約50〜約75、約50〜約70、約50〜約65、約50〜約60、約50〜約55、約55〜約110、約55〜約95、約55〜約90、約55〜約85、約55〜約80、約55〜約75、約55〜約70、約55〜約65、約55〜約60、約60〜約110、約60〜約95、約60〜約90、約60〜約85、約60〜約80、約60〜約75、約60〜約70、約60〜約65、約65〜約110、約65〜約95、約65〜約90、約65〜約85、約65〜約80、約65〜約75、約65〜約70、約70〜約110、約70〜約95、約70〜約90、約70〜約85、約70〜約80、約70〜約75、約75〜約110、約75〜約95、約75〜約90、約75〜約85、約75〜約80、約80〜約110、約80〜約95、約80〜約90、約80〜約85、約85〜約110、約85〜約95、約85〜約90、約90〜約110、約90〜約95、約95〜約110、約95〜約105、約95〜約100、約100〜約110、約100〜約105、または約105〜約110)のP/V(W/m)を有する;
(b)産生バイオリアクターは、約0.01〜約0.10(例えば、約0.02〜約0.08、約0.04〜約0.06、または約0.06)(例えば、約0.01〜約0.10、約0.01〜約0.09、約0.01〜約0.08、約0.01〜約0.07、約0.01〜約0.06、約0.01〜約0.05、約0.01〜約0.04、約0.01〜約0.03、約0.01〜約0.02、約0.02〜約0.10、約0.02〜約0.09、約0.02〜約0.08、約0.02〜約0.07、約0.02〜約0.06、約0.02〜約0.05、約0.02〜約0.04、約0.02〜約0.03、約0.03〜約0.10、約0.03〜約0.09、約0.03〜約0.08、約0.03〜約0.07、約0.03〜約0.06、約0.03〜約0.05、約0.03〜約0.04、約0.04〜約0.10、約0.04〜約0.09、約0.04〜約0.08、約0.04〜約0.07、約0.04〜約0.06、約0.04〜約0.05、約0.05〜約0.10、約0.05〜約0.09、約0.05〜約0.08、約0.05〜約0.07、約0.05〜約0.06、約0.06〜約0.10、約0.06〜約0.09、約0.06〜約0.08、約0.06〜約0.07、約0.07〜約0.10、約0.07〜約0.09、約0.07〜約0.08、約0.08〜約0.10、約0.08〜約0.09または約0.09〜約0.10)の空気容量/液体容量/分(VVM)(分−1)を有する;
(c)培地は、約0ppm〜約5,000ppm(または本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか)の濃度を有する感作剤(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の感作剤のいずれか)を含む;および
(d)液体培養培地は、約1g/L〜約15g/L(例えば、本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか、例えば、約1g/L〜約15g/L、約1g/L〜約14g/L、約1g/L〜約13g/L、約1g/L〜約12g/L、約1g/L〜約11g/L、約2g/L〜約15g/L、約2g/L〜約14g/L、約2g/L〜約13g/L、約2g/L〜約12g/L、約2g/L〜約11g/L、約3g/L〜約15g/L、約3g/L〜約14g/L、約3g/L〜約13g/L、約3g/L〜約12g/L、約3g/L〜約11g/L、約4g/L〜約15g/L、約4g/L〜約14g/L、約4g/L〜約13g/L、約4g/L〜約12g/L、約4g/L〜約11g/L、約5g/L〜約15g/L、約5g/L〜約14g/L、約5g/L〜約13g/L、約5g/L〜約12g/L、約5g/L〜約11g/L、約6g/L〜約15g/L、約6g/L〜約14g/L、約6g/L〜約13g/L、約6g/L〜約12g/L、約6g/L〜約11g/L、約7g/L〜約15g/L、約7g/L〜約14g/L、約7g/L〜約13g/L、約7g/L〜約12g/L、約7g/L〜約11g/L、約8g/L〜約15g/L、約8g/L〜約14g/L、約8g/L〜約13g/L、約8g/L〜約12g/L、約8g/L〜約11g/L、約9g/L〜約15g/L、約9g/L〜約14g/L、約9g/L〜約13g/L、約9g/L〜約12g/L、約9g/L〜約11g/L、約10g/L〜約15g/L、約10g/L〜約14g/L、約10g/L〜約13g/L、約10g/L〜約12g/L、約10g/L〜約11g/L、約11g/L〜約15g/L、約11g/L〜約14g/L、約11g/L〜約13g/L、約11g/L〜約12g/L、約12g/L〜約15g/L、約12g/L〜約14g/L、約12g/L〜約13g/L、約13g/L〜約15g/L、約13g/L〜約14g/L、または約14g/L〜約15g/L)である濃度を有する保護剤(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の保護剤のいずれか)を含む
のうち1つまたはそれ以上(例えば、2つ、3つまたは4つ)の下で、液体培養培地において細胞を培養する工程を含む、方法もまた、本明細書で提供される。
最適化された条件下では、特異的細胞死亡率は、1%/日、2%/日、3%/日、4%/日、5%/日、6%/日、7%/日、8%/日、9%/日、10%/日、11%/日、12%/日、13%/日、14%/日、15%/日、16%/日、17%/日、18%/日、19%/日、20%/日、21%/日、22%/日、23%/日、24%/日、25%/日、26%/日、27%/日、28%/日、29%/日、30%/日、31%/日、32%/日、33%/日、34%/日、35%/日、36%/日、37%/日、38%/日、39%/日もしくは40%/日未満であり得る、または1%/日、2%/日、3%/日、4%/日、5%/日、6%/日、7%/日、8%/日、9%/日、10%/日、11%/日、12%/日、13%/日、14%/日、15%/日、16%/日、17%/日、18%/日、19%/日、20%/日、21%/日、22%/日、23%/日、24%/日、25%/日、26%/日、27%/日、28%/日、29%/日、30%/日、31%/日、32%/日、33%/日、34%/日、35%/日、36%/日、37%/日、38%/日、39%/日もしくは40%/日未満であると予測することができる。最適化された条件下では、特異的細胞死亡率は、約0.1%〜約40%(または本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか)であり得る。
一部の実施形態では、細胞生存度は、乳酸デヒドロゲナーゼ(LDH)の濃度を測定することによって決定することができる。細胞特異的LDH産生(nU/細胞/日)は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190もしくは200未満(例えば、150)であり得る、または1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190もしくは200未満(例えば、150)であると予測することができる。一部の実施形態では、LDH産生(nU/細胞/日)は、約0.1〜約200(例えば、本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか、例えば、約0.1〜約200、約0.1〜約190、約0.1〜約180、約0.1〜約170、約0.1〜約160、約0.5〜約200、約0.5〜約190、約0.5〜約180、約0.5〜約170、約0.5〜約160、約1.0〜約200、約1.0〜約190、約1.0〜約180、約1.0〜約170、約1.0〜約160、約2.5〜約200、約2.5〜約190、約2.5〜約180、約2.5〜約170、約2.5〜約160、約5.0〜約200、約5.0〜約190、約5.0〜約180、約5.0〜約170、約5.0〜約160、約10〜約200、約10〜約190、約10〜約180、約10〜約170、約10〜約160、約20〜約200、約20〜約190、約20〜約180、約20〜約170、約20〜約160、約30〜約200、約30〜約190、約30〜約180、約30〜約170、約30〜約160、約40〜約200、約40〜約190、約40〜約180、約40〜約170、約40〜約160、約50〜約200、約50〜約190、約50〜約180、約50〜約170、約50〜約160、約60〜約200、約60〜約190、約60〜約180、約60〜約170、約60〜約160、約70〜約200、約70〜約190、約70〜約180、約70〜約170、約70〜約160、約80〜約200、約80〜約190、約80〜約180、約80〜約170、約80〜約160、約90〜約200、約90〜約190、約90〜約180、約90〜約170、約90〜約160、約100〜約200、約100〜約190、約100〜約180、約100〜約170、約100〜約160、約110〜約200、約110〜約190、約110〜約180、約110〜約170、約110〜約160、約120〜約200、約120〜約190、約120〜約180、約120〜約170、約120〜約160、約130〜約200、約130〜約190、約130〜約180、約130〜約170、約130〜約160、約140〜約200、約140〜約190、約140〜約180、約140〜約170、約140〜約160、約150〜約200、約150〜約190、約150〜約180、約150〜約170、約150〜約160、約160〜約200、約160〜約190、約160〜約180、約160〜約170、約170〜約200、約170〜約190、約170〜約180、約180〜約200、約180〜約190、または約190〜約200)であり得る。
一部の実施形態では、見かけの成長速度は、1%/日よりも大きい、1.5%/日よりも大きい、2%/日よりも大きい、2.5%/日よりも大きい、3%/日よりも大きい、3.5%/日よりも大きい、4.0%/日よりも大きい、4.5%/日よりも大きい、5.0%/日よりも大きい、5.5%/日よりも大きい、6.0%/日よりも大きい、6.5%/日よりも大きい、7.0%/日よりも大きい、7.5%/日よりも大きい、8.0%/日よりも大きい、8.5%/日よりも大きい、9.0%/日よりも大きい、9.5%/日よりも大きい、10.0%/日よりも大きい、10.5%/日よりも大きい、11.0%/日よりも大きい、11.5%/日よりも大きい、12.0%/日よりも大きい、12.5%/日よりも大きい、13.0%/日よりも大きい、13.5%/日よりも大きい、14.0%/日よりも大きい、14.5%/日よりも大きい、15.0%/日よりも大きい、16%/日よりも大きい、17%/日よりも大きい、18%/日よりも大きい、19%/日よりも大きい、20%/日よりも大きい、21%/日よりも大きい、22%/日よりも大きい、23%/日よりも大きい、24%/日よりも大きい、25%/日よりも大きい、30%/日よりも大きい、35%/日よりも大きい、40%/日よりも大きい、45%/日よりも大きい、50%/日よりも大きい、55%/日よりも大きい、60%/日よりも大きい、65%/日よりも大きい、70%/日よりも大きい、75%/日よりも大きい、80%/日よりも大きい、85%/日よりも大きい、90%/日よりも大きい、95%/日よりも大きい、100%/日よりも大きい、105%/日よりも大きい、110%/日よりも大きい、115%/日よりも大きい、120%/日よりも大きい、125%/日よりも大きい、130%/日よりも大きい、135%/日よりも大きい、140%/日よりも大きい、145%/日よりも大きい、もしくは150%/日よりも大きい場合がある、または1%/日よりも大きい、1.5%/日よりも大きい、2%/日よりも大きい、2.5%/日よりも大きい、3%/日よりも大きい、3.5%/日よりも大きい、4.0%/日よりも大きい、4.5%/日よりも大きい、5.0%/日よりも大きい、5.5%/日よりも大きい、6.0%/日よりも大きい、6.5%/日よりも大きい、7.0%/日よりも大きい、7.5%/日よりも大きい、8.0%/日よりも大きい、8.5%/日よりも大きい、9.0%/日よりも大きい、9.5%/日よりも大きい、10.0%/日よりも大きい、10.5%/日よりも大きい、11.0%/日よりも大きい、11.5%/日よりも大きい、12.0%/日よりも大きい、12.5%/日よりも大きい、13.0%/日よりも大きい、13.5%/日よりも大きい、14.0%/日よりも大きい、14.5%/日よりも大きい、15.0%/日よりも大きい、16%/日よりも大きい、17%/日よりも大きい、18%/日よりも大きい、19%/日よりも大きい、20%/日よりも大きい、21%/日よりも大きい、22%/日よりも大きい、23%/日よりも大きい、24%/日よりも大きい、25%/日よりも大きい、30%/日よりも大きい、35%/日よりも大きい、40%/日よりも大きい、45%/日よりも大きい、50%/日よりも大きい、55%/日よりも大きい、60%/日よりも大きい、65%/日よりも大きい、70%/日よりも大きい、75%/日よりも大きい、80%/日よりも大きい、85%/日よりも大きい、90%/日よりも大きい、95%/日よりも大きい、100%/日よりも大きい、105%/日よりも大きい、110%/日よりも大きい、115%/日よりも大きい、120%/日よりも大きい、125%/日よりも大きい、130%/日よりも大きい、135%/日よりも大きい、140%/日よりも大きい、145%/日よりも大きい、もしくは150%/日よりも大きいと予測することができる。一部の実施形態では、見かけの成長速度は、約0.1%/日〜約150%/日(例えば、本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか、例えば、約0.1%〜約48%、約0.1%〜約46%、約0.1%〜約44%、約0.1%〜約42%、約0.5%〜約50%、約0.5%〜約48%、約0.5%〜約46%、約0.5%〜約44%、約0.5%〜約42%、約1.0%〜約50%、約1.0%〜約48%、約1.0%〜約46%、約1.0%〜約44%、約1.0%〜約42%、約2.0%〜約50%、約2.0%〜約48%、約2.0%〜約46%、約2.0%〜約44%、約2.0%〜約42%、約4.0%〜約50%、約4.0%〜約48%、約4.0%〜約46%、約4.0%〜約44%、約4.0%〜約42%、約6.0%〜約50%、約6.0%〜約48%、約6.0%〜約46%、約6.0%〜約44%、約6.0%〜約42%、約8.0%〜約50%、約8.0%〜約48%、約8.0%〜約46%、約8.0%〜約44%、約8.0%〜約42%、約10%〜約50%、約10%〜約48%、約10%〜約46%、約10%〜約44%、約10%〜約42%、約12%〜約50%、約12%〜約48%、約12%〜約46%、約12%〜約44%、約12%〜約42%、約14%〜約50%、約14%〜約48%、約14%〜約46%、約14%〜約44%、約14%〜約42%、約16%〜約50%、約16%〜約48%、約16%〜約46%、約16%〜約44%、約16%〜約42%、約18%〜約50%、約18%〜約48%、約18%〜約46%、約18%〜約44%、約18%〜約42%、約20%〜約50%、約20%〜約48%、約20%〜約46%、約20%〜約44%、約20%〜約42%、約22%〜約50%、約22%〜約48%、約22%〜約46%、約22%〜約44%、約22%〜約42%、約24%〜約50%、約24%〜約48%、約24%〜約46%、約24%〜約44%、約24%〜約42%、約26%〜約50%、約26%〜約48%、約26%〜約46%、約26%〜約44%、約26%〜約42%、約28%〜約50%、約28%〜約48%、約28%〜約46%、約28%〜約44%、約28%〜約42%、約30%〜約50%、約30%〜約48%、約30%〜約46%、約30%〜約44%、約30%〜約42%、約32%〜約50%、約32%〜約48%、約32%〜約46%、約32%〜約44%、約32%〜約42%、約34%〜約50%、約34%〜約48%、約34%〜約46%、約34%〜約44%、約34%〜約42%、約36%〜約50%、約36%〜約48%、約36%〜約46%、約36%〜約44%、約36%〜約42%、約38%〜約50%、約38%〜約48%、約38%〜約46%、約38%〜約44%、約38%〜約42%、約40%〜約50%、約40%〜約48%、約40%〜約46%、約40%〜約44%、約40%〜約42%、約42%〜約50%、約42%〜約48%、約42%〜約46%、約42%〜約44%、約44%〜約50%、約44%〜約48%、約44%〜約46%、約46%〜約50%、約46%〜約48%、または約48%〜約50%)であり得る。
これらの方法の一部の実施形態では、感作剤は、消泡剤(例えば、ポリジメチルシロキサンベースの消泡剤、シメチコン、または本明細書に記載されるもしくは当該分野で公知の他の消泡剤のいずれか)である。一部の実施形態では、保護剤は、ポロクサマー(例えば、ポロクサマー−188、ポロクサマー−401、ポロクサマー−402またはポロクサマー−407)、ポロキサミン(例えば、ポロキサミン−904またはポロキサミン−908)またはプルロニックポリオールである。
これらの方法の一部の実施形態では、産生バイオリアクター(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の例示的な産生バイオリアクターのいずれか)は、約5L〜約20,000L(または本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか)の容量を有する。これらの方法の一部の実施形態では、産生バイオリアクターは、灌流バイオリアクターである。これらの方法の一部の実施形態では、産生バイオリアクターは、流加バイオリアクターである。
一部の実施形態では、この方法は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、1%/日、2%/日、3%/日、4%/日、5%/日、6%/日、7%/日、8%/日、9%/日、10%/日、11%/日、12%/日、13%/日、14%/日、15%/日、16%/日、17%/日、18%/日、19%/日、20%/日、21%/日、22%/日、23%/日、24%/日、25%/日、26%/日、27%/日、28%/日、29%/日、30%/日、31%/日、32%/日、33%/日、34%/日、35%/日、36%/日、37%/日、38%/日、39%/日または40%/日未満の特異的細胞死亡率を生じる。一部の実施形態では、この方法は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、約0.1%/日〜約40%/日(または本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか)の特異的細胞死亡率を生じる。
一部の実施形態では、この方法は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、150nU/細胞/日未満、145nU/細胞/日未満、140nU/細胞/日未満、135nU/細胞/日未満、130nU/細胞/日未満、125nU/細胞/日未満、120nU/細胞/日未満、115nU/細胞/日未満、150nU/細胞/日未満、105nU/細胞/日未満、100nU/細胞/日未満、95nU/細胞/日未満、90nU/細胞/日未満、85nU/細胞/日未満、80nU/細胞/日未満、75nU/細胞/日未満、70nU/細胞/日未満、65nU/細胞/日未満、60nU/細胞/日未満、55nU/細胞/日未満、50nU/細胞/日未満、45nU/細胞/日未満、45nU/細胞/日未満、40nU/細胞/日未満、35nU/細胞/日未満、30nU/細胞/日未満、25nU/細胞/日未満、20nU/細胞/日未満、15nU/細胞/日未満、10nU/細胞/日未満、5nU/細胞/日未満または1nU/細胞/日未満の細胞特異的LDH産生を生じる。これらの方法の一部の実施形態では、この方法は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、約0.1nU/細胞/日〜約150nU/細胞/日(または本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか)の細胞特異的LDH産生を生じる。
一部の実施形態では、この方法は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、1%/日よりも大きい、1.5%/日よりも大きい、2%/日よりも大きい、2.5%/日よりも大きい、3%/日よりも大きい、3.5%/日よりも大きい、4.0%/日よりも大きい、4.5%/日よりも大きい、5.0%/日よりも大きい、5.5%/日よりも大きい、6.0%/日よりも大きい、6.5%/日よりも大きい、7.0%/日よりも大きい、7.5%/日よりも大きい、8.0%/日よりも大きい、8.5%/日よりも大きい、9.0%/日よりも大きい、9.5%/日よりも大きい、10.0%/日よりも大きい、10.5%/日よりも大きい、11.0%/日よりも大きい、11.5%/日よりも大きい、12.0%/日よりも大きい、12.5%/日よりも大きい、13.0%/日よりも大きい、13.5%/日よりも大きい、14.0%/日よりも大きい、14.5%/日よりも大きい、15.0%/日よりも大きい、16%/日よりも大きい、17%/日よりも大きい、18%/日よりも大きい、19%/日よりも大きい、20%/日よりも大きい、21%/日よりも大きい、22%/日よりも大きい、23%/日よりも大きい、24%/日よりも大きい、25%/日よりも大きい、30%/日よりも大きい、35%/日よりも大きい、40%/日よりも大きい、45%/日よりも大きい、50%/日よりも大きい、55%/日よりも大きい、60%/日よりも大きい、65%/日よりも大きい、70%/日よりも大きい、75%/日よりも大きい、80%/日よりも大きい、85%/日よりも大きい、90%/日よりも大きい、95%/日よりも大きい、100%/日よりも大きい、105%/日よりも大きい、110%/日よりも大きい、115%/日よりも大きい、120%/日よりも大きい、125%/日よりも大きい、130%/日よりも大きい、135%/日よりも大きい、140%/日よりも大きい、145%/日よりも大きい、または150%/日よりも大きい見かけの成長速度を生じる。これらの方法の一部の実施形態では、この方法は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、約0.1%/日〜約150%/日(または本明細書に記載されるこの範囲の下位範囲のいずれか)の見かけの成長速度を生じる。
これらの方法の一部の実施形態では、細胞(例えば、本明細書に記載される細胞のいずれか)は、組換え治療タンパク質(例えば、本明細書に記載される組換え治療タンパク質のいずれか)をコードする核酸を含む。これらの方法の一部の実施形態は、組換え治療タンパク質を収集または回収する工程をさらに含む。これらの方法の一部の実施形態は、組換え治療タンパク質を精製する工程をさらに含む。これらの方法の一部の実施形態は、精製された組換え治療タンパク質を製剤化する工程をさらに含む。
これらの方法の一部の実施形態では、細胞は、細菌(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の例示的な細菌のいずれか)、酵母細胞(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の酵母細胞のいずれか)または哺乳動物細胞(例えば、本明細書に記載されるまたは当該分野で公知の哺乳動物細胞のいずれか)である。
これらの方法の一部の実施形態では、細胞生存度は、試験培養容器中の乳酸デヒドロゲナーゼ(LDH)の濃度を測定することによって決定される。
実施例
本発明は、特許請求の範囲に記載される本発明の範囲を限定しない、以下の実施例にさらに記載される。
試験培養容器のための内接中心複合計画と組み合わせた完全実施要因スクリーニング
回転式撹拌(RPM)、感作剤の濃度および保護剤の濃度を、パラメーターとして選択した。内接中心複合計画と組み合わせた完全実施要因計画を使用して、試験条件のセットを決定した(図7)。特異的LDH産生値を、各試験条件において測定した。結果を使用して、選択されたパラメーターの推定された等高線を提供した。劣った成績の領域および運転失敗の領域を同定した(図9)。
ベンチトップ規模での特異的LDH産生値を予測する
概念実証実験をベンチトップ規模で実施して、本明細書に記載される予測方法の精度を決定した。
ベンチトップ規模での保護剤の濃度を、3つの異なるレベルに設定した。各レベルについて、2つのベンチトップ培養バイオリアクターを試験した。灌流プロセスに起因するピーク特異的LDH産生値を測定し、予測された値に対して比較した。
ベンチトップ規模実験からの実際の観察された値は、予測された値と非常に良好に合致した(P<0.0001、R=0.84)(図13Aおよび図13C)。これらの結果は、本明細書に記載される方法が、より大きい規模における種々のパラメーターの影響を予測するために首尾よく使用することができることを実証した。
1日当たり30〜40ppmの消泡剤濃度範囲の消泡剤の添加を維持して実験を実施した。プルロニック濃度を、1.8g/L(破線)、2.8g/L(実線、黒塗り円)、3.8g/L(実線、白抜き円)から調整した。実験を再現して実施した。これは、プルロニック濃度を変化させた場合の特異的LDH産生を予測するモデルの能力を実証している。
消泡剤の濃度を1日当たり30ppmから80ppmまで増加させる実験もまた実施した。予測されたLDH範囲は90.19〜96.38であり、これは、実際の観察されたLDH範囲94.74〜99.36と非常に良好に合致した(図14)。これらの結果は、本明細書に記載される方法が、消泡剤の影響を予測するために首尾よく使用できることを示した。
産生規模での特異的LDH産生値を予測する
実験を産生規模で実施して、本明細書に記載されるモデルの精度を決定した。
3つの50L産生バイオリアクターおよび2つの100L産生バイオリアクターを試験した。これらの実験は、1.8g/L〜5.8g/Lの範囲のポロクサマー−188(プルロニック)濃度を試験した。
特異的LDH産生についての実際の観察された値は、これらの予測された値と良好に合致した(P<0.0001、R=0.84)(図15Aおよび図15B)。これらの結果は、本明細書に記載される方法が、産生規模(産生バイオリアクター規模)における選択されたパラメーターの影響を予測するために首尾よく使用できることを実証した。
他の実施形態
その詳細な説明と併せて本発明を記載してきたが、上述の説明は例示を意図し、添付の特許請求の範囲によって規定される本発明の範囲を限定しない意図であることを理解すべきである。他の態様、利点および改変は、以下の特許請求の範囲の範囲内である。

Claims (110)

  1. 産生バイオリアクターにおける細胞生存度に対する感作剤の濃度の影響を予測する方法であって、
    (a)試験培養容器における複数の試験条件下での細胞生存度を決定する工程であって、複数の試験条件は、パラメーターのセットによって規定される、工程;および
    (b)試験培養容器における複数の条件下での細胞生存度に基づいて、産生バイオリアクターにおける細胞生存度に対する感作剤の濃度の影響を予測する工程
    を含む、前記方法。
  2. パラメーターのセットは、剪断応力、感作剤の濃度および保護剤の濃度を含む、請求項1に記載の方法。
  3. 複数の試験条件は、完全実施要因スクリーニングおよび/または内接中心複合計画に基づいて選択される、請求項1または2に記載の方法。
  4. 感作剤は、消泡剤である、請求項1〜3のいずれか1項に記載の方法。
  5. 消泡剤は、ポリジメチルシロキサンベースの消泡剤である、請求項4に記載の方法。
  6. 消泡剤は、シメチコンである、請求項4に記載の方法。
  7. 試験培養容器は、約5mL〜約5Lの容量を有する、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
  8. 試験培養容器は、約10mL〜約500mLの容量を有する、請求項7に記載の方法。
  9. 試験培養容器は、バッフル付き振盪フラスコである、請求項1〜8のいずれか1項に記載の方法。
  10. 産生バイオリアクターは、約5L〜約20,000Lの容量を有する、請求項1〜9のいずれか1項に記載の方法。
  11. 産生バイオリアクターは、約50L〜約10,000Lの容量を有する、請求項10に記載の方法。
  12. 産生バイオリアクターは、灌流バイオリアクターである、請求項1〜11のいずれか1項に記載の方法。
  13. 産生バイオリアクターは、流加バイオリアクターである、請求項1〜11のいずれか1項に記載の方法。
  14. 産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、40%/日未満の特異的細胞死亡率を有すると予測される感作剤の濃度を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む、請求項1〜13のいずれか1項に記載の方法。
  15. 産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、20%/日未満の特異的細胞死亡率を有すると予測される感作剤の濃度を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む、請求項1〜13のいずれか1項に記載の方法。
  16. 産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、150nU/細胞/日未満の細胞特異的LDH産生を生じると予測される感作剤の濃度を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む、請求項1〜13のいずれか1項に記載の方法。
  17. 産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、100nU/細胞/日未満の細胞特異的LDH産生を生じると予測される感作剤の濃度を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む、請求項1〜13のいずれか1項に記載の方法。
  18. 産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、1%/日よりも大きい見かけの成長速度を生じると予測される感作剤の濃度を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む、請求項1〜13のいずれか1項に記載の方法。
  19. 産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、5%/日よりも大きい見かけの成長速度を生じると予測される感作剤の濃度を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む、請求項1〜13のいずれか1項に記載の方法。
  20. 細胞は、組換え治療タンパク質をコードする核酸を含む、請求項14〜19のいずれか1項に記載の方法。
  21. 組換え治療タンパク質を収集する工程をさらに含む、請求項20に記載の方法。
  22. 組換え治療タンパク質を精製する工程をさらに含む、請求項21に記載の方法。
  23. 精製された組換え治療タンパク質を製剤化する工程をさらに含む、請求項22に記載の方法。
  24. 細胞は、細菌、酵母または哺乳動物細胞である、請求項1〜23のいずれか1項に記載の方法。
  25. 細胞生存度は、試験培養容器中の乳酸デヒドロゲナーゼ(LDH)の濃度を測定することによって決定される、請求項1〜24のいずれか1項に記載の方法。
  26. 試験培養容器は、バッフル付き振盪フラスコであり、複数の試験条件は、
    (a)約125RPM〜約400RPMの回転式撹拌;
    (b)約0ppm〜約120ppmの感作剤の濃度;および
    (c)約1g/L〜約10g/Lである保護剤の濃度
    のうち1つまたはそれ以上を含む、請求項1〜8および10〜25のいずれか1項に記載の方法。
  27. 保護剤は、ポロクサマー、ポロキサミンまたはプルロニックポリオールである、請求項2または26に記載の方法。
  28. ポロクサマーは、ポロクサマー−188、ポロクサマー−401、ポロクサマー−402またはポロクサマー−407である、請求項27に記載の方法。
  29. ポロキサミンは、ポロキサミン−904またはポロキサミン−908である、請求項27に記載の方法。
  30. 産生バイオリアクターにおける細胞生存度を改善する方法であって、
    (a)試験培養容器における複数の試験条件下での細胞生存度を決定する工程であって、複数の条件は、パラメーターのセットによって規定される、工程;
    (b)試験培養容器における複数の条件下での細胞生存度に基づいて、産生バイオリアクターにおける細胞生存度にとって最適な条件を選択する工程;および
    (d)選択された条件下で、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程
    を含む、前記方法。
  31. パラメーターのセットは、剪断応力、感作剤の濃度および保護剤の濃度を含む、請求項30に記載の方法。
  32. 複数の試験条件は、完全実施要因スクリーニングおよび/または内接中心複合計画に基づいて選択される、請求項30または31に記載の方法。
  33. 感作剤は、消泡剤である、請求項31または32に記載の方法。
  34. 消泡剤は、ポリジメチルシロキサンベースの消泡剤である、請求項33に記載の方法。
  35. 消泡剤は、シメチコンである、請求項33に記載の方法。
  36. 試験培養容器は、約5mL〜約5Lの容量を有する、請求項30〜35のいずれか1項に記載の方法。
  37. 試験培養容器は、約10mL〜約500mLの容量を有する、請求項36に記載の方法。
  38. 試験培養容器は、バッフル付き振盪フラスコである、請求項30〜37のいずれか1項に記載の方法。
  39. 産生バイオリアクターは、約5L〜約20,000Lの容量を有する、請求項30〜38のいずれか1項に記載の方法。
  40. 産生バイオリアクターは、約50L〜約10,000Lの容量を有する、請求項39に記載の方法。
  41. 産生バイオリアクターは、灌流バイオリアクターである、請求項30〜40のいずれか1項に記載の方法。
  42. 産生バイオリアクターは、流加バイオリアクターである、請求項30〜40のいずれか1項に記載の方法。
  43. 工程(c)は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、40%/日未満の特異的細胞死亡率を生じる、請求項30〜42のいずれか1項に記載の方法。
  44. 工程(c)は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、20%/日未満の特異的細胞死亡率を生じる、請求項30〜42のいずれか1項に記載の方法。
  45. 工程(c)は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、150nU/細胞/日未満の細胞特異的LDH産生を生じる、請求項30〜42のいずれか1項に記載の方法。
  46. 工程(c)は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、100nU/細胞/日未満の細胞特異的LDH産生を生じる、請求項30〜42のいずれか1項に記載の方法。
  47. 工程(c)は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、1%/日よりも大きい見かけの成長速度を生じる、請求項30〜42のいずれか1項に記載の方法。
  48. 工程(c)は、産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、5%/日よりも大きい見かけの成長速度を生じる、請求項30〜42のいずれか1項に記載の方法。
  49. 細胞は、組換え治療タンパク質をコードする核酸を含む、請求項30〜48のいずれか1項に記載の方法。
  50. 組換え治療タンパク質を収集する工程をさらに含む、請求項49に記載の方法。
  51. 組換え治療タンパク質を精製する工程をさらに含む、請求項50に記載の方法。
  52. 精製された組換え治療タンパク質を製剤化する工程をさらに含む、請求項51に記載の方法。
  53. 細胞は、細菌、酵母または哺乳動物細胞である、請求項30〜52のいずれか1項に記載の方法。
  54. 細胞生存度は、試験培養容器中の乳酸デヒドロゲナーゼ(LDH)の濃度を測定することによって決定される、請求項30〜53のいずれか1項に記載の方法。
  55. 試験培養容器は、バッフル付き振盪フラスコであり、複数の試験条件は、
    (a)約125RPM〜約400RPMの回転式撹拌;
    (b)約0ppm〜約120ppmの感作剤の濃度;および
    (c)約1g/L〜約10g/Lである保護剤の濃度
    のうち1つまたはそれ以上を含む、請求項30〜37および39〜54のいずれか1項に記載の方法。
  56. 保護剤は、ポロクサマー、ポロキサミンまたはプルロニックポリオールである、請求項31または55に記載の方法。
  57. ポロクサマーは、ポロクサマー−188、ポロクサマー−401、ポロクサマー−402またはポロクサマー−407である、請求項56に記載の方法。
  58. ポロキサミンは、ポロキサミン−904またはポロキサミン−908である、請求項56に記載の方法。
  59. 産生バイオリアクターにおける細胞生存度を予測するための方法であって、
    (a)少なくとも2つのパラメーターを含むパラメーターのセットを選択する工程;
    (b)試験培養容器におけるパラメーターのセットによって規定される複数の試験条件下での細胞生存度を決定する工程;および
    (c)試験培養容器における複数の条件下での細胞生存度に基づいて、産生バイオリアクターにおける細胞生存度を予測する工程
    を含む、前記方法。
  60. パラメーターのセットは、剪断応力、感作剤の濃度および保護剤の濃度を含む、請求項59に記載の方法。
  61. 複数の試験条件は、完全実施要因スクリーニングおよび/または内接中心複合計画に基づいて選択される、請求項59または60に記載の方法。
  62. 感作剤は、消泡剤である、請求項60または61に記載の方法。
  63. 消泡剤は、ポリジメチルシロキサンベースの消泡剤である、請求項62に記載の方法。
  64. 消泡剤は、シメチコンである、請求項62に記載の方法。
  65. 試験培養容器は、約5mL〜約5Lの容量を有する、請求項59〜64のいずれか1項に記載の方法。
  66. 試験培養容器は、約10mL〜約500mLの容量を有する、請求項65に記載の方法。
  67. 試験培養容器は、バッフル付き振盪フラスコである、請求項59〜66のいずれか1項に記載の方法。
  68. 産生バイオリアクターは、約5L〜約20,000Lの容量を有する、請求項59〜67のいずれか1項に記載の方法。
  69. 産生バイオリアクターは、約50L〜約10,000Lの容量を有する、請求項68に記載の方法。
  70. 産生バイオリアクターは、灌流バイオリアクターである、請求項59〜69のいずれか1項に記載の方法。
  71. 産生バイオリアクターは、流加バイオリアクターである、請求項59〜69のいずれか1項に記載の方法。
  72. 産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、40%/日未満の特異的細胞死亡率を生じると予測される条件を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む、請求項59〜71のいずれか1項に記載の方法。
  73. 産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、20%/日未満の特異的細胞死亡率を生じると予測される条件を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む、請求項59〜71のいずれか1項に記載の方法。
  74. 産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、150nU/細胞/日未満の細胞特異的LDH産生を生じると予測される条件を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む、請求項59〜71のいずれか1項に記載の方法。
  75. 産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、100nU/細胞/日未満の細胞特異的LDH産生を生じると予測される条件を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む、請求項59〜71のいずれか1項に記載の方法。
  76. 産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、1%/日よりも大きい見かけの成長速度を生じると予測される条件を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む、請求項59〜71のいずれか1項に記載の方法。
  77. 産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、5%/日よりも大きい見かけの成長速度を生じると予測される条件を使用して、産生バイオリアクターにおいて細胞を培養する工程をさらに含む、請求項59〜71のいずれか1項に記載の方法。
  78. 細胞は、組換え治療タンパク質をコードする核酸を含む、請求項72〜77のいずれか1項に記載の方法。
  79. 組換え治療タンパク質を収集する工程をさらに含む、請求項78に記載の方法。
  80. 組換え治療タンパク質を精製する工程をさらに含む、請求項79に記載の方法。
  81. 精製された組換え治療タンパク質を製剤化する工程をさらに含む、請求項80に記載の方法。
  82. 細胞は、細菌、酵母または哺乳動物細胞である、請求項59〜81のいずれか1項に記載の方法。
  83. 細胞生存度は、試験培養容器中の乳酸デヒドロゲナーゼ(LDH)の濃度を測定することによって決定される、請求項59〜82のいずれか1項に記載の方法。
  84. 試験培養容器は、バッフル付き振盪フラスコであり、複数の試験条件は、
    (a)約125RPM〜約400RPMの回転式撹拌;
    (b)約0ppm〜約120ppmの感作剤の濃度;および
    (c)約1g/L〜約10g/Lである保護剤の濃度
    のうち1つまたはそれ以上を含む、請求項59〜66および68〜83のいずれか1項に記載の方法。
  85. 保護剤は、ポロクサマー、ポロキサミンまたはプルロニックポリオールである、請求項60または84に記載の方法。
  86. ポロクサマーは、ポロクサマー−188、ポロクサマー−401、ポロクサマー−402またはポロクサマー−407である、請求項85に記載の方法。
  87. ポロキサミンは、ポロキサミン−904またはポロキサミン−908である、請求項85に記載の方法。
  88. 産生バイオリアクターにおいて細胞を培養するための方法であって、以下の条件:
    e)産生バイオリアクターは、約1.0〜約110(例えば、約3.0〜約8.0、約3.0〜約7.0、約4.0〜約6.0、約5.0〜約6.0、または約6.0)のP/V(kW/m)を有する;
    f)産生バイオリアクターは、約0.01〜約0.10(例えば、約0.02〜約0.08、約0.04〜約0.06、または約0.06)の空気容量/液体容量/分(VVM)(分−1)を有する;
    g)培地は、約0ppm〜約5,000ppm(例えば、約0ppm〜約120ppm、約50ppm〜約110ppm、約80ppm〜約100ppm、または約100ppm)の濃度を有する感作剤を含む;および
    h)液体培養培地は、約1g/L〜約15g/L(例えば、約2g/L〜約10g/L、約3g/L〜約7g/L、約4g/L〜約6g/L、または約5g/L)である濃度を有する保護剤を含む
    のうち1つまたはそれ以上の下で、液体培養培地において細胞を培養する工程を含む、前記方法。
  89. 感作剤は、消泡剤である、請求項88に記載の方法。
  90. 消泡剤は、ポリジメチルシロキサンベースの消泡剤である、請求項89に記載の方法。
  91. 消泡剤は、シメチコンである、請求項89に記載の方法。
  92. 保護剤は、ポロクサマー、ポロキサミンまたはプルロニックポリオールである、請求項88〜91のいずれか1項に記載の方法。
  93. ポロクサマーは、ポロクサマー−188、ポロクサマー−401、ポロクサマー−402またはポロクサマー−407である、請求項92に記載の方法。
  94. ポロキサミンは、ポロキサミン−904またはポロキサミン−908である、請求項92に記載の方法。
  95. 産生バイオリアクターは、約5L〜約20,000Lの容量を有する、請求項88〜94のいずれか1項に記載の方法。
  96. 産生バイオリアクターは、約50L〜約10,000Lの容量を有する、請求項95に記載の方法。
  97. 産生バイオリアクターは、灌流バイオリアクターである、請求項88〜96のいずれか1項に記載の方法。
  98. 産生バイオリアクターは、流加バイオリアクターである、請求項88〜96のいずれか1項に記載の方法。
  99. 産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、40%/日未満の特異的細胞死亡率を生じる、請求項88〜98のいずれか1項に記載の方法。
  100. 産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、20%/日未満の特異的細胞死亡率を生じる、請求項88〜98のいずれか1項に記載の方法。
  101. 産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、150nU/細胞/日未満の細胞特異的LDH産生を生じる、請求項88〜98のいずれか1項に記載の方法。
  102. 産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、100nU/細胞/日未満の細胞特異的LDH産生を生じる、請求項88〜98のいずれか1項に記載の方法。
  103. 産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、1%/日よりも大きい見かけの成長速度を生じる、請求項88〜98のいずれか1項に記載の方法。
  104. 産生バイオリアクターにおける細胞の培養の間に、5%/日よりも大きい見かけの成長速度を生じる、請求項88〜98のいずれか1項に記載の方法。
  105. 細胞は、組換え治療タンパク質をコードする核酸を含む、請求項88〜98のいずれか1項に記載の方法。
  106. 組換え治療タンパク質を収集する工程をさらに含む、請求項105に記載の方法。
  107. 組換え治療タンパク質を精製する工程をさらに含む、請求項106に記載の方法。
  108. 精製された組換え治療タンパク質を製剤化する工程をさらに含む、請求項107に記載の方法。
  109. 細胞は、細菌、酵母または哺乳動物細胞である、請求項88〜108のいずれか1項に記載の方法。
  110. 細胞生存度は、試験培養容器中の乳酸デヒドロゲナーゼ(LDH)の濃度を測定することによって決定される、請求項88〜109のいずれか1項に記載の方法。
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