JP2021504438A - クレブシエラ ニューモニエ(Klebsiella pneumoniae)に対するワクチン - Google Patents

クレブシエラ ニューモニエ(Klebsiella pneumoniae)に対するワクチン Download PDF

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Abstract

本発明は、クレブシエラ・ニューモニエ(Klebsiella pneumoniae)血清型O3、O3bおよび/またはO5リポ多糖に関連する一般式(I)の合成オリゴ糖、並びに一般式(I)の合成オリゴ糖の複合体に関する。前記合成オリゴ糖、前記複合体、並びに前記合成オリゴ糖を含む医薬組成物および前記複合体を含む医薬組成物は、クレブシエラ・ニューモニエと関連する疾患の予防および/または治療に有用である。さらに、一般式(I)の合成オリゴ糖は、クレブシエラ・ニューモニエ血清型O3、O3bおよび/またはO5細菌に対する抗体の検出のための免疫学的分析のマーカーとして有用である。

Description

発明の詳細な説明
[発明の分野]
本発明は、クレブシエラ ニューモニエ(Klebsiella pneumoniae)血清型O3、O3bおよび/またはO5リポポリオリゴ糖、特にクレブシエラ ニューモニエ血清型O3、O3bおよび/またはO5リポポリオリゴ糖のO−抗原および複合体に関連する一般式(I)の合成オリゴ糖に関する。前記合成オリゴ糖、前記複合体、並びに前記合成オリゴ糖を含む医薬組成物および前記複合体を含む医薬組成物は、クレブシエラ ニューモニエと関連する疾患、より特異的にクレブシエラ ニューモニエ血清型O3、O3bおよび/またはO5と関連する疾患の予防および/または治療に有用である。さらに、一般式(I)の合成オリゴ糖は、クレブシエラ ニューモニエ細菌に対する抗体の検出のための免疫学的分析のマーカーとして有用である。
[発明の背景]
クレブシエラ ニューモニエは、大抵は気道および尿路にコロニー形成し、K.ニューモニエ感染症(KPIs)を引き起こすグラム陰性の、通性嫌気性桿菌である。KPIは、院内感染の主な原因になり、主に免疫障害を持つ患者に影響を及ぼす。過去10年において、K.ニューモニエによって引き起こされる感染症は、ほとんど全ての利用可能な抗菌剤に耐性のある株の出現、およびそれらの世界規模での普及によって医療の場では重要な課題になっている。クレブシエラ ニューモニエによって引き起こされる感染症は、高い罹患率および高い死亡率の原因となる。したがって、K.ニューモニエによって引き起こされる感染症の予防は、高く望まれており、リスク群の予防接種は、最も費用効率が高く、および最も強力な手段である。
K.ニューモニエ細菌は、K.ニューモニエ細菌の細胞表面上に2つの抗原型を一般的に発現する。第一に、O−抗原は、リポポリオリゴ糖(LPS)の成分であり、O−抗原において9つの血清群が存在する。第二は、K抗原であり、80以上の血清型を有する莢膜多糖/オリゴ糖である。O−抗原は、LPSにおける最も可変的な部分であり、血清学的特異性を提供し、K抗原と共に、血清型決定のために使用される。両抗原は、細菌表面上に多糖/オリゴ糖複合体から構成され、高い免疫原性および毒性となる。タンパク質と比較して、炭水化物は進化的により安定である。担体タンパク質に共有結合されると、オリゴ糖抗原は、長期にわたりT細胞依存的保護を引き起こすことができる(Microbiol Rev 1995,591)。炭水化物ワクチンの最近の動向のレビューのために、Chem.&Biol.2014,21,38−50を参照する。自動炭水化物合成および炭水化物に基づくワクチンの開発における当該合成の適用のレビューのために、Carbohydr.Res.2008,343,1889−1896を参照する。
WO2016/156338 A1は、クレブシエラ ニューモニエ(Klebsiella pneumoniae)細菌によって引き起こされる疾患の治療のための、合成カルバペネム耐性クレブシエラ ニューモニエオリゴ糖および合成カルバペネム耐性クレブシエラ ニューモニエオリゴ糖の複合体を開示する。
ワクチン(Vaccine)に関する論文1986,4,15は、K2、K3、K10、K21、K30およびK55血清型に由来する莢膜多糖から構成される6価のクレブシエラワクチンについて報告する。試験されたワクチンは、致命的な実験的クレブシエラK2熱傷創感染に対して高い保護があることが明らかになったため、予防接種後に機能的抗体が引き起こされることを示す。
O−抗原、すなわち、K.ニューモニエのO−多糖の繰り返しユニットが解明された(The Journal of Biological Chemistry,2002,277(28),25070−25081)(図1参照)。
K.ニューモニエ血清型O3のO−多糖の繰り返しユニットは:
→2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1→]
からなる。
K.ニューモニエ血清型O3bのO−多糖の繰り返しユニットは:
→2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1→]
からなる。
K.ニューモニエ血清型O5のO−多糖の繰り返しユニットは:
→3)−β−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1→
からなる。
クレブシエラ ニューモニエ血清型O3、O3bおよびO5リポ多糖に関連し、並びに保護免疫原性O−抗原エピトープ、すなわち、クレブシエラ ニューモニエ血清型O3、O3b、および血清型O5によって引き起こされる疾患に対して保護する抗体を引き起こすO−抗原エピトープを含む、一般式(I)のよく定義された合成オリゴ糖を提供することが、本発明の目的である。前記オリゴ糖は、クレブシエラ ニューモニエ血清型O3、O3bおよび/または血清型O5と関連する疾患の予防および/または治療に有用である複合体および複合体の医薬組成物を提供するために、免疫原性担体に結合することができる。さらに、一般式(I)の合成オリゴ糖は、クレブシエラ ニューモニエ細菌に対する抗体の検出のための免疫学的分析のマーカーとして有用である。
本発明の目的は、独立請求項の教示によって解決される。本発明の更に有利な特徴、態様および詳細は、本出願の従属請求項、明細書、図および例から明らかである。
[発明の説明]
[定義]
本願に使用される用語「リンカー」は、オリゴ糖の還元末端単糖を免疫原性担体または固体支持体と、任意に少なくとも一つの内部連結分子に結合することによって、連結することが可能な分子断片を包含する。したがって、リンカー自体の、または内部連結分子と共にリンカーの機能は、還元末端単糖と免疫原性担体と間に、または還元末端単糖と固体支持体との間に特有の距離を設立する、保持する、および/または橋渡しをすることである。オリゴ糖と免疫原性担体との間に特定の距離を保持することによって、免疫原性担体の構造(例えば、担体タンパク質の二次構造など)による免疫原性オリゴ糖エピトープの遮蔽を防ぐ。さらに、リンカーは、反応基における立体障害を減少させることによってオリゴ糖とのより大きい結合効率を提供する(Methods in Molecular
Medicine 2003,87,153−174)。より具体的に、リンカーの一端は、還元末端単糖のアノマー中心で環外の酸素に連結され、他の末端は、窒素原子を介して内部連結分子と、または免疫原性担体もしくは固体支持体と直接連結される。
当該技術において公知のオリゴ糖複合体(例えば、多糖およびオリゴ糖−担体タンパク質複合体、抗体−薬物複合体など)のための任意のリンカーを、本発明内で使用すること
ができる。使用されるリンカー、すなわち、リンカーの長さおよび結合型は、オリゴ糖複合体の免疫原性に重大な影響を及ぼさないので(PLoS ONE 2017,12(12):e0189100,J.Immun.Meth.1996,191,1−10参照)、多糖およびオリゴ糖担体タンパク質に関する多くの出版物から、当業者は、本願において開示されるオリゴ糖および複合体のための適切なリンカーを容易に想定することができる(Chem Soc Rev.2018での「抗菌性複合糖質ワクチン(Antimicrobial glycoconjugate vaccines:タンパク質修飾のための古典的および近代的取り組みの概要(an overview of classic and modern approaches for protein modification)」,進展論文(Advance Article),DOI:10.1039/C8CS00495A;Acc Chem Res 2017,50,1270−1279参照)。当該適切なリンカーは、無害(すなわち、非毒性)および非免疫原性(すなわち、複合体での免疫付与に対して非保護抗体の形成を導かない)であり、市販の二官能性ポリエチレングリコール(Journal of Controlled
Release 2013,172,382−389,J.Immun.Meth.1996,191,1−10)、グルタル酸誘導体(J.Org.Chem.2005,70(18),7123−7132)、アジピン酸誘導体、スクアリン酸塩誘導体、アルキン、N−ヒドロキシスクシンイミド、例えば、市販のMFCO−NHS(モノフルオロ置換シクロオクチンN−ヒドロキシスクシンイミドエステル)、(Acc Chem Res 2017,50,1270−1279に開示されるような)マレイミド、または親水性のアルキルホスフィン酸塩および(WO2014080251A1に開示されるような)スルホニルを含むが、これらに制限されない。
本願に使用される用語「内部連結分子」は、官能基Xおよび官能基Yを含む二官能性分子に関し、ここで、官能基Xは、リンカーLにおける末端アミノ基と反応することができ、官能基Yは、免疫原性担体に、または固体支持体に存在する官能基と反応することができる。図3は、市販の内部連結分子の例を示すが、本願に示される実施例に対して本発明に従って使用されることができる内部連結分子を制限しない。
本願に使用される用語「アジュバント」は、免疫学的アジュバント、すなわちアジュバントに関連する抗原性を有さず、ワクチンに含まれる所与の抗原に対して免疫応答を高めることによって前記ワクチンの効果を修正するまたは増大させるワクチン組成物において使用される材料に関する。当業者にとって、古典的に認識されるアジュバントの例は:
−カルシウム塩およびアルミニウム塩(またはそれらの混合物)を含む、ミネラル含有組成物。カルシウム塩はリン酸カルシウムを含む。アルミニウム塩は、任意の適切な形態(例えば、ゲル、結晶質、非結晶質など)をとる塩と共に、水酸化物、リン酸塩、硫酸塩などを含む。これらの塩への吸着は好ましい。ミネラル含有組成物は、金属塩の粒子として形成されてもよい。水酸化アルミニウムおよびリン酸アルミニウムとして公知のアジュバントも使用されてもよい。本発明は、一般的にアジュバントとして使用される「水酸化物」または「リン酸塩」のいくつかを使用することができる。「水酸化アルミニウム」として公知のアジュバントは、一般的にオキシ水酸化アルミニウム塩であり、オキシ水酸化アルミニウム塩は、通常少なくとも部分的に結晶質である。「リン酸アルミニウム」として公知のアジュバントは、一般的に水酸化リン酸アルミニウムであり、少量の硫酸塩(すなわち、水酸化リン酸硫酸アルミニウム(aluminium hydroxyphosphate sulfate))を含むことも多い。それらは沈殿によって得られてもよく、沈殿中の反応条件および濃度は、塩においてヒドロキシルへのリン酸塩の置換の程度に影響を与える。水酸化アルミニウムとリン酸アルミニウムとの混合物は、本発明に係る製剤化において用いられることができ;
−サポニン、サポニンは、広範囲の植物種における樹皮、葉、幹、根に、および花にさえ発見されるステロール配糖体およびトリテルペノイド配糖体の異種群である。キラヤ サ
ポナリア(Quillaia saponaria)の樹皮、モリナ(Morina)木からのサポニンは、アジュバントとして広く研究されている。サポニンを、スミラックス
オルナタ(Smilax ornate)(サルサパリラ(sarsaprilla))、ジプソフィラ パニキュラタ(Gypsophilla paniculata)(ブライド ヴェイル( brides veil))、およびサポナリア オフィシナリス(Saponaria oficianalis)(ソープ ルート(soap root))から商業的に得ることもできる。サポニンアジュバント製剤は、QS21のような精製製剤、およびISCOMsのような脂質製剤を含む。サポニン組成物は、HPLCおよびRP−HPLCを用いて精製されている。これらの技術を用いて特定の精製画分は同定されており、QS7、QS17、QS18、QS21、QH−A、QH−BおよびQH−Cを含む。サポニン製剤は、コレステロールのようなステロールを含んでもよい。サポニンおよびコレステロールの組み合わせは、免疫刺激複合体(ISCOMs)と呼ばれる特有の粒子を形成するために使用することができる。ISCOMsは、例えばホスファチジルエタノールアミンまたはホスファチジルコリンのようなリン脂質を一般的に含む。いくつかの公知のサポニンをISCOMsにおいて使用することができる。好ましくは、ISCOMは一つ以上のQuilA、QHA&QHC:
−生分解性および非毒性である材料から形成される微粒子(すなわち、直径100nm〜150pm、より好ましくは、直径200nm〜30pm、または直径500nm〜10pmの粒子)。このような非毒性および生分解性材料は、ポリ(α−ヒドロキシ酸)、ポリヒドロキシ酪酸、ポリオルトエステル、ポリ無水物、ポリカプロラクトンを含むが、これらに制限されない;
−CD1dリガンド、例えば、α−グリコシルセラミド、フィトスフィンゴシン含有α−グリコシルセラミド、OCH、KRN7000[(2S,3S,4R)−1−O−(α−D−ガラクトピラノシル)−2−(N−ヘキサコサノイルアミノ)−1,3,4−オクタデカントリオール]、CRONY−101、3’’−スルホ−ガラクトシル−セラミド;7DW8−5(フナコシ株式会社)など
−免疫刺激性オリゴヌクレオチド、例えば、CpGモチーフ含有オリゴヌクレオチド(リン酸結合によってグアノシン残基に連結される非メチル化シトシン残基を含むジヌクレオチド配列)、またはCpIモチーフ含有オリゴヌクレオチド(イノシンに連結されるシトシンを含有するジヌクレオチド配列)、または二本鎖RNA、または回文配列を含むオリゴヌクレオチド、またはポリ(dG)配列を含むオリゴヌクレオチド、など。免疫刺激性オリゴヌクレオチドは、ホスホロチオエート修飾のようなヌクレオチド修飾体/類似体を含むことができ、二本鎖または(RNAを除いて)一本鎖であることができる;
−リン酸塩含有非環式骨格に連結される脂質含有化合物、例えば、TLR4アンタゴニストE5564など;
−油乳剤(例えば、フロイント(Freund’s)アジュバントなど)、外膜ベシクル(OMVs)、
を含む。
理論的に、免疫学的事象のカスケードにおいて特定の状況を好む、または増幅させることができ、より顕著な免疫学的応答に最終的につながる各分子または物質を、アジュバントとして定義することができる。
原理的には、ワクチン製剤においてアジュバントの使用を介して、
−ワクチンに適切な、または所望の免疫応答を指示する、および最適化することができ;−ワクチンの粘膜伝達、すなわち、ワクチンの、例えば頬部、または胃もしくは肺の上皮のような粘膜面、および関連するリンパ組織との接触をもたらす投与を可能にし;
−細胞媒介免疫応答を促進することができ;
−例えば、高純度抗原または組み換え抗原のような、より弱い免疫原の免疫原性を高めることができ;
−保護免疫を提供するために必要とされる抗原量または免疫付与の頻度を減らすことができ;および
−例えば、新生児、老人、および免疫障害を持つワクチン受容者などのような減少した、または弱い免疫応答を有する個人におけるワクチンの効果を改善することができる。
アジュバントの作用様式については、ほとんど知られていないが、アジュバントは、次の機構:
−抗原の生物学的または免疫学的半減期を増加すること;
−抗原提示細胞(APCs)への抗原伝達を改善すること、並びにAPCsによって、例えば、抗原−アジュバント複合体の摂取後にAPCによって抗原が細胞質へとエンドソーム膜を通過することを可能にすることによって、抗原処理、および抗原提示を改善すること;
−ストレス細胞または損傷細胞からの危険誘導シグナルを模倣すること、そのことは免疫応答を開始するのに役立つ;
−免疫調節サイトカインの産生を誘導すること;
−免疫システムの特定の一部となるように免疫応答にバイアスをかけること;および−抗原チャレンジの急速な分散を遮断すること、
の一つによって免疫応答を増大させることが現在は信じられている。
多糖およびオリゴ糖は、両性イオンでない場合に、TI−2(T細胞非依存的−2)抗原および低い免疫抗原性として当業者に知られている。したがって、多糖に基づくワクチン、オリゴ糖に基づくワクチンを生産するために、前記多糖、、オリゴ糖は、免疫原性担体に結合され複合体を提供し、複合体は、多糖またはオリゴ糖と比較して増加した免疫原性を示す。この文脈において、用語「免疫原性担体」は、構造として定義され、免疫原性担体は、多糖自体、オリゴ糖自体と比較して増加した免疫を示す複合体を形成するために、多糖、オリゴ糖に結合される。したがって、オリゴ糖の免疫原性担体への、好ましくはタンパク質担体への結合は、前記免疫原性担体に対する免疫応答を誘導することなく、前記オリゴ糖に対する免疫応答を刺激する効果を有する。
したがって、本発明は、一般式(I)のオリゴ糖、または一般式(I)のオリゴ糖のジアステレオ異性体もしくは薬学的に許容できる塩に関し、
式中、
mは、0および1から選択される整数であり;
xは、1〜2×m+3から選択される整数であり;
nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から選択される整数であり、
−T−は、結合,−(Ux+4−(Vx+21−m−,−(Ux+4−Ux+3−(Vx+2−Vx+11−m−,−(Ux+4−Ux+3−Ux+2)m−,または−(Ux+4−Ux+3−Ux+2−Ux+1−を表し;
−は、H−,H−(U−(V1−m−,H−(Ux+1−U−(Vx+1−V1−m−,H−(Ux+2−Ux+1−U−,またはH−(Ux+3−Ux+2−Ux+1−U−を表し;
Lは、リンカーを表し;
Eは、−NH,−N,−CN,−O−NH,−CH=CH,−C≡CH,−Br,−Cl,−I,−COR’,−COR’,−CONH−NH,−SH,または−SAcを表し;
R’は、−H,−Me,−Et,4−ニトロフェニル,ペンタフルオロフェニル,−N−ヒドロキシスクシンイミジル,−(3−スルホ−N−ヒドロキシスクシンイミジル),または−(ジベンゾシクロオクチン−スルホ−N−ヒドロキシスクシンイミジル)を表す。
リンカーLは、好ましくは2〜40個の炭素原子(任意の側鎖の炭素原子を含む)、より好ましくは、2〜30個、より好ましくは2〜20個、より好ましくは、2〜14個、より好ましくは、2〜12個、および更により好ましくは2〜10個の炭素原子を含む。
酸素原子(すなわち、−O−L−Eの酸素)とE基との間の最も短い原子鎖は、好ましくは2〜14個の原子、より好ましくは2〜12個の原子、より好ましくは2〜10個の原子、より好ましくは2〜8個の原子からなる。最も短い鎖(最も短い鎖はアノマー中心での酸素とNH基との間の最も短い可能な連結である)が2〜6個原子からなる場合、これらの原子は好ましくは炭素原子である。最も短い鎖が4〜8個の原子からなる場合、鎖は、O、N、およびSから選択される1個または2個のヘテロ原子を含んでもよい。最も短い鎖が9〜14個の原子からなる場合、鎖は、O、N、およびSから選択される1、2、3、または4個のヘテロ原子を含んでもよい。
リンカー−L−または最も短い鎖は、完全に、または部分的にフッ素化されていることも好ましい。リンカー−L−は、3員環、4員環、5員環もしくは6員環の飽和炭素環、または5員環の部分的に不飽和(および非芳香族)炭素環、または4員環、5員環もしくは6員環の飽和酸素ヘテロ環、または4員環、5員環もしくは6員環の飽和窒素ヘテロ環
、または6員環の芳香族炭素環を含んでもよい。
リンカー−L−は、アミド(−NH−CO−、−CO−NH−)および/または尿素(−NH−CO−NH−)残基を含んでもよく、好ましくは一つのみのアミド残基または尿素残基を含んでもよい。リンカーは、置換基を含んでもよく、好ましくは例えば、R10およびR11などのような2つの置換基、または例えば、R10、R11、R15、およびR14などのような4つの置換基を含んでもよく、置換基は、本願に定義される通りの意味を有し、好ましくは:−F,−Cl,−CH,−C,−C,−C,−C13,−OCH,−OC,−CHF,−CHF,−CF,−C(O)−NH,−SCH,−SC,−NHC(O)CH,−N(CH,および−N(C
から選択される。
リンカーLがフッ素化される場合、2つ以上の置換基−Fが好ましい。
好ましくは、リンカーL−は:−CH−,−(CH−,−(CH−,−(CH−,−(CH−,−(CH−,−(CH−,−(CH−,−(CH−,−(CH10−,−CF−,−(CF−,−(CF−,−(CF−,−(CF−,−(CF−,−(CF−,−(CF−,−(CF−,−(CF10−,−(CH−O−(CH−,−CH−O−(CH−,−(CH−O−CH−,−CH−O−(CH−,−(CH−O−CH−,−(CH−O−(CH−,−(CH−O−(CH−,−(CH−O−CH−,−CH−O−(CH−,−L−,−L−L−,−L−L−L−,−L−L−L−L−L−,−L−L−L−から選択され;
ここで、−L−は、−(CH−,−(CF−,−(CH−CH−O)−C−,−(CH−CH−O)−CH−,−(CR1011−,
から選択され;
−L−および−L−は、互いに独立して:−O−,−NH−C(O)−NH−,−NH−C(S)−NH−,−NH−C(O)−,−C(O)−NH−,−NH−C(O)−O−,−NR−,−NR18−,−SO−,−NH−CO−CH−NH−,
から選択され;
−L−は、−(CH−,−(CF−,−(CR1213−,−(CH−CH−O)−C−,−(CH−CH−O)−CH−,
を表し;
−L−は:−(CHp1−,−(CFp1−,−C−(O−CH−CHp1−,−CH−(O−CH−CHp1−,−(CHp1−O−(CHp2−,−(CR1415p1−,−(CR1415p1−O−(CR2122p2−,
から選択され;
およびR18は、互いに独立して:−CH,−C,−Cおよび−C(O)CHから選択され;
10、R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17、R19、R20、R21、およびR22は、互いに独立して:−H,−F,−Cl,−CH,−C,−C,−C,−C13,−OCH,−OC,−CHF,−CHF,−CF,−C(O)−NH,−SCH,−SC,−NHC(O)CH,−N(CHおよび−N(Cから選択され;
o,q,p1およびp2は、互いに独立して1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から選択される整数である。
より好ましくは、−L−は、−L−,−L−L−,−L−L−L−,または−L−L−L−を表し;
−L−は、−(CH−,−(CH−CH−O)−C−,または−(CH−CH−O)−CHを表し;
−L−は、−O−,−NH−CO−NH−,−NH−CO−CH−NH−,−NH−CO−を表し;
−L−は、−(CH−,−(CH(OH))−,−(CF−,−(CH−CH−O)−C−,または−(CH−CH−O)−CH−を表し;
−L−は、−(CHp1−,−(CFp1−,−C−(O−CH−CHp1−,−CH−(O−CH−CHp1−,または−(CHp1−O−(CHp2−を表し;および
o、q、p1およびp2は、互いに独立して、1、2、3、4、5、および6から選択される整数であり;好ましくは1、2、3、および4から選択される整数である。
より好ましくは、一般式(I)のオリゴ糖は:
からなる群から選択される−O−L−E基を有し、
式中、R’は、−H,−Me,−Et,4−ニトロフェニル,ペンタフルオロフェニル,−N−ヒドロキシスクシンイミジル,−(3−スルホ−N−ヒドロキシスクシンイミジル)、または−(ジベンゾシクロオクチン−スルホ−N−ヒドロキシスクシンイミジル)を表し;
Xは、−Br,−Cl,−I,−COH,または−SAcを表す。
したがって、好ましくは一般式(I)のオリゴ糖、または一般式(I)のオリゴ糖のジアステレオ異性体もしくは薬学的に許容できる塩であり
式中、
mは、0および1から選択される整数であり;
xは、1〜2×m+3から選択される整数であり;
nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から選択される整数であり;好ましくは、nは、1、2、3、4、5、6、7、および8から選択される整数であり;より好ましくは、nは、1、2、3、4、5、および6から選択される整数であり;更により好ましくは、nは、1、2、3、および4から選択される整数であり;更により好ましくは、nは、1、2、および3から選択される整数であり;更により好ましくは、nは、1および2から選択される整数であり;
−T−は、結合,−(Ux+4−(Vx+21−m−,−(Ux+4−Ux+3−(Vx+2−Vx+11−m−,−(Ux+4−Ux+3−Ux+2−,または−(Ux+4−Ux+3−Ux+2−Ux+1−を表し;
−は、H−,H−(U−(V1−m−,H−(Ux+1−U−(Vx+1−V1−m−,H−(Ux+2−Ux+1−U−,またはH−(Ux+3−Ux+2−Ux+1−U−を表し;
Lは、−L−,−L−L−,−L−L−L−,または−L−L−L−を表し;
−L−は、−(CH−,−(CH−CH−O)−C−,または−(CH−CH−O)−CHを表し;
−L−は、−O−,−NH−CO−NH−,−NH−CO−CH−NH−,−NH−CO−を表し;
−L−は、−(CH−,−(CH(OH))−,−(CF−,−(CH−CH−O)−C−,または−(CH−CH−O)−CH−を表し;
−L−は、−(CHp1−,−(CFp1−,−C−(O−CH−CHp1−,−CH−(O−CH−CHp1−,または−(CHp1−O−(CHp2−を表し;および
o、q、p1およびp2は、互いに独立して、1、2、3、4、5、および6から選択される整数であり;好ましくは1、2、3、および4から選択される整数である。
Eは、−NH,−N,−CN,−O−NH,−CH=CH,−C≡CH,−Br,−Cl,−I,−COR’,−COR’,−CONH−NH,−SH,または−SAcを表し;
R’は、−H,−Me,−Et,4−ニトロフェニル,ペンタフルオロフェニル,−N−ヒドロキシスクシンイミジル,−(3−スルホ−N−ヒドロキシスクシンイミジル),または−(ジベンゾシクロオクチン−スルホ−N−ヒドロキシスクシンイミジル)を表す。
本発明におけるオリゴ糖のアノマーは、−O−L−E基が結合されるC−1位置でのα/β−アノマーを意味する。グリコシド結合の立体化学は、一般式(I)における糖断片
、U、U、U、U、U、U、U、U、V、V、V、V、およびVのアノマー中心に示される立体化学によって定義されるということは、炭水化物化学の当業者にとって明らかである。
本発明のオリゴ糖は、吸湿性であることができるので、様々なオリゴ糖の水和物を構築することができる。好ましくは、水分子対オリゴ糖のモル比は、1対20、より好ましくは1対10、最も好ましくは1対5〜10の範囲である。
本発明におけるオリゴ糖は、塩基性および/または酸性置換基を有してもよく、有機酸もしくは有機塩基、または無機酸もしくは無機塩基と共に塩を形成してもよい。
このような酸付加塩形成のための適切な酸の例は、塩化水素酸、臭化水素酸、硫酸、リン酸、酢酸、クエン酸、シュウ酸、マロン酸、サリチル酸、p−アミノサリチル酸、リンゴ酸、フマル酸、コハク酸、アスコルビン酸、マレイン酸、スルホン酸、ホスホン酸、過塩素酸、硝酸、ギ酸、プロピオン酸、グルコン酸、乳酸、酒石酸、ヒドロキシマレイン酸、ピルビン酸、フェニル酢酸、安息香酸、p−アミノ安息香酸、p−ヒドロキシ安息香酸、メタンスルホン酸、エタンスルホン酸、亜硝酸、ヒドロキシエタンスルホン酸、エチレンスルホン酸、p−トルエンスルホン酸、ナフチルスルホン酸、スルファニル酸、カンファースルホン酸、キナ酸、マンデル酸、o−メチルマンデル酸、水素−ベンゼンスルホン酸、ピクリン酸、アジピン酸、d−o−トリ酒石酸、タルトロン酸、(o,m,p−)トルエン酸、ナフチルアミンスルホン酸、および当業者によく知られた他の鉱酸、またはカルボン酸である。慣習的な手法で塩を生産するために、塩は、遊離塩基形を、十分な量の所望の酸と結合することによって調製される。
適切な無機塩基または有機塩基の例は、例えば、NaOH、KOH、NHOH、水酸化テトラアルキルアンモニウム、リジンまたはアルギ二ンなどである。塩は、当該技術分野においてよく知られた方法を用いて慣習的な方法で、例えば、一般式(I)の化合物の溶液を、上述の基から選択される塩基の溶液と処理することによって、調製されてもよい。
一般式(I)のオリゴ糖は、−O−O−結合、および、または糖のアノマー炭素またはC−1炭素を介して互いに連結される、または結合される糖断片(U、Ux+1、Ux+2、Ux+3、Ux+4、V、Vx+1、Vx+2)を含まないということは、炭水化物化学の当業者にとって明らかである。
驚くべきことに、一般式(I)のオリゴ糖は、免疫原性保護エピトープを含み、およびヒトおよび/または動物宿主においてK.ニューモニエ血清型O3、O3b、および/またはO5細菌に対して保護免疫応答を誘導することができることを明らかにした。一般式(I)のオリゴ糖は、抗体を引き起こし、抗体は、リポ多糖である天然K.ニューモニエ血清型O3、O3b、および/またはO5のO−抗原と交差反応し、K.ニューモニエ血清型O3、O3b、および/またはO5細菌を特異的に認識し、食細胞によってK.ニューモニエ血清型O3、O3b、および/またはO5細菌を殺すためにオプソニン化するので、K.ニューモニエ血清型O3、O3b、および/またはO5細菌に対する保護を与える。
本発明のオリゴ糖は、生産の純度および容易さに関して、細菌源から生産されるポリ−、オリゴ糖および細菌源から生産されるポリ−、オリゴ糖の複合体と関連する全ての問題を克服する。病原性細菌のリポ多糖のO−抗原からの定義された長さおよび構造の純粋なオリゴ糖の単離および精製は、面倒であり、時々実現可能でない工程であるということはよく知られている。第一に、リポ多糖のO−抗原の生産は、生育条件の最適化を必要とす
る。第二に、構成する単糖の構造的完全性が維持される脱重合条件が明らかにされる必要がある。最後に、定義された長さ、および構造の純粋なポリ−、オリゴ糖の単離を可能にする精製条件が決定される必要がある。通常の不純物、例えば細胞多糖、核酸、脂質およびタンパク質などに加えて、脱重合工程によって得られた所望されないオリゴ糖も、除去されなければならない。したがって、細菌源からの定義された構造および長さの純粋なオリゴ糖の生産は、面倒で、ほとんど不可能な工程である。
好ましくは一般式(II)の合成オリゴ糖であり、
式中、m、n、x、L、E、Ux+1、Ux+2、Ux+3、Ux+4、V、Vx+1、Vx+2、およびTは、本願に定義される意味を有する
好ましくは、一般式(Ia)および(IIa)、または一般式(Ia)および(IIa)のジアステレオ異性体もしくは薬学的に許容できる塩であり、
式中、
xは、1、2または3から選択される整数であり;
nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から選択される整数であり;好ましくは、nは、1、2、3、4、5、6、7、および8から選択される整数であり;より好ましくは、nは、1、2、3、4、5、および6から選択される整数であり;更により好ましくは、nは、1、2、3、および4から選択される整数であり;更により好ましくは、nは、1、2、および3から選択される整数であり;更により好ましくは、nは、1および2から選択される整数であり;
−T−は、結合,−(Ux+4−(Vx+21−m−,−(Ux+4−Ux+3−(Vx+2−Vx+11−m−,−(Ux+4−Ux+3−Ux+2−,または−(Ux+4−Ux+3−Ux+2−Ux+1−を表し;
−は、H−,H−(U−(V1−m−,H−(Ux+1−U−(Vx+1−V1−m−,H−(Ux+2−Ux+1−U−,またはH−(Ux+3−Ux+2−Ux+1−U−を表し;
Lは、−L−,−L−L−,−L−L−L−,または−L−L−L−を表し;
−L−は、−(CH−,−(CH−CH−O)−C−,または−(CH−CH−O)−CHを表し;
−L−は、−O−,−NH−CO−NH−,−NH−CO−CH−NH−,−NH−CO−を表し;
−L−は、−(CH−,−(CH(OH))−,−(CF−,−(CH−CH−O)−C−,または−(CH−CH−O)−CH−を表し;
−L−は、−(CHp1−,−(CFp1−,−C−(O−CH−CHp1−,−CH−(O−CH−CHp1−,または−(CHp1−O−(CHp2−を表し;および
o、q、p1およびp2は、互いに独立して、1、2、3、4、5、および6から選択される整数であり;好ましくは1、2、3、および4から選択される整数である。
Eは、−NH,−N,−CN,−O−NH,−CH=CH,−C≡CH,−Br,−Cl,−I,−COR’,−COR’,−CONH−NH,−SH,または−SAcを表し;
R’は、−H,−Me,−Et,4−ニトロフェニル,ペンタフルオロフェニル,−N−ヒドロキシスクシンイミジル,−(3−スルホ−N−ヒドロキシスクシンイミジル),または−(ジベンゾシクロオクチン−スルホ−N−ヒドロキシスクシンイミジル)を表す。
さらに好ましくは、一般式(Ib)および(IIb)、または一般式(Ib)および(IIb)のジアステレオ異性体もしくは薬学的に許容できる塩であり、
式中、
xは、1、2、3、4または5から選択される整数であり;
nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から選択される整数であり;好ましくは、nは、1、2、3、4、5、6、7、および8から選択される整数であり;より好ましくは、nは、1、2、3、4、5、および6から選択される整数であり;更により好ましくは、nは、1、2、3、および4から選択される整数であり;更により好ましくは、nは、1、2、および3から選択される整数であり;更により好ましくは、nは、1および2から選択される整数であり;
−T−は、結合,−(Ux+4−(Vx+21−m−,−(Ux+4−Ux+3−(Vx+2−Vx+11−m−,−(Ux+4−Ux+3−Ux+2−,または−(Ux+4−Ux+3−Ux+2−Ux+1−を表し;
−は、H−,H−(U−(V1−m−,H−(Ux+1−U−(Vx+1−V1−m−,H−(Ux+2−Ux+1−U−,またはH−(Ux+3−Ux+2−Ux+1−U−を表し;
Lは、−L−,−L−L−,−L−L−L−,または−L−L−L−を表し;
−L−は、−(CH−,−(CH−CH−O)−C−,または−(CH−CH−O)−CHを表し;
−L−は、−O−,−NH−CO−NH−,−NH−CO−CH−NH−,−NH−CO−を表し;
−L−は、−(CH−,−(CH(OH))−,−(CF−,−(C
−CH−O)−C−,または−(CH−CH−O)−CH−を表し;
−L−は、−(CHp1−,−(CFp1−,−C−(O−CH−CHp1−,−CH−(O−CH−CHp1−,または−(CHp1−O−(CHp2−を表し;および
o、q、p1およびp2は、互いに独立して、1、2、3、4、5、および6から選択される整数であり;好ましくは1、2、3、および4から選択される整数である。
Eは、−NH,−N,−CN,−O−NH,−CH=CH,−C≡CH,−Br,−Cl,−I,−COR’,−COR’,−CONH−NH,−SH,または−SAcを表し;
R’は、−H,−Me,−Et,4−ニトロフェニル,ペンタフルオロフェニル,−N−ヒドロキシスクシンイミジル,−(3−スルホ−N−ヒドロキシスクシンイミジル),または−(ジベンゾシクロオクチン−スルホ−N−ヒドロキシスクシンイミジル)を表す。
さらに好ましくは、一般式(Ic)、または一般式(Ic)のジアステレオ異性体もしくは薬学的に許容できる塩であり、
式中、
mは、0および1から選択される整数であり;
xは、1〜2×m+3から選択される整数であり;
nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から選択される整数であり;好ましくは、nは、1、2、3、4、5、6、7、および8から選択される整数であり;より好ましくは、nは、1、2、3、4、5、および6から選択される整数であり;更により好ましくは、nは、1、2、3、および4から選択される整数であり;更により好ましくは、nは、1、2、および3から選択される整数であり;更により好ましくは、nは、1および2から選択される整数であり;
Lは、−L−,−L−L−,−L−L−L−,または−L−L−L−を表し;
−L−は、−(CH−,−(CH−CH−O)−C−,または−(CH−CH−O)−CHを表し;
−L−は、−O−,−NH−CO−NH−,−NH−CO−CH−NH−,−NH−CO−を表し;
−L−は、−(CH−,−(CH(OH))−,−(CF−,−(CH−CH−O)−C−,または−(CH−CH−O)−CH−を表し;
−L−は、−(CHp1−,−(CFp1−,−C−(O−CH−CHp1−,−CH−(O−CH−CHp1−,または−(CHp1−O−(CHp2−を表し;および
o、q、p1およびp2は、互いに独立して、1、2、3、4、5、および6から選択される整数であり;好ましくは1、2、3、および4から選択される整数である。
Eは、−NH,−N,−CN,−O−NH,−CH=CH,−C≡CH,−Br,−Cl,−I,−COR’,−COR’,−CONH−NH,−SH,または−SAcを表し;
R’は、−H,−Me,−Et,4−ニトロフェニル,ペンタフルオロフェニル,−N−ヒドロキシスクシンイミジル,−(3−スルホ−N−ヒドロキシスクシンイミジル),または−(ジベンゾシクロオクチン−スルホ−N−ヒドロキシスクシンイミジル)を表す。
したがって、一般式(II−a)、(II−b)、(II−c)、(II−d)、(II−e)、(II−f)、(II−g)、(II−h)、(II−i)、(II−j)、または(II−k)のオリゴ糖(式中、n、L、EおよびTは、本願に定義される意味を有する)は、特に好ましい。
さらに好ましくは、一般式(III)の合成オリゴ糖であり
式中、m、n、x、L、E、Ux+1、Ux+2、Ux+3、Ux+4、V、Vx+1、Vx+2およびTは、本願に定義される通りの意味を有する。
したがって、一般式(III−a)、(III−b)、(III−c)、(III−d)、(III−e)、(III−f)、(III−g)、(III−h)、(III−i)、(III−j)、および(III−k)のオリゴ糖(式中、n、L、EおよびTは、本願に定義される意味を有する)は、特に好ましい。
式中、n、LおよびEは、本願に定義される通りの意味を有する。
好ましくは、整数xは1を表し、したがって、一般式(I)、(II)、または(III)の化合物(式中、xは1を表す)が特に好ましい。更により好ましくは、一般式(I)、(II)、または(III)の化合物であり、式中xは1を表し、TはH−を表す。一般式(I)、(II)、または(III)の化合物(式中、TはH−を表す)も好ましい。
好ましくは、nは2〜10、好ましくは1〜8、より好ましくは1〜6、更により好ましくは1〜4、更により好ましくは1〜3、更により好ましくは1〜2から選択される整数を表す。したがって、一般式(I)、(II)、(II−a)、(II−b)、(II−c)、(II−d)、(II−e)、(II−f)、(II−g)、(II−h)、(II−i)、(II−j)、(II−k)、(III)、(III−a)、(III−b)、(III−c)、(III−d)、(III−e)、(III−f)、(III−g)、(III−h)、(III−i)、(III−j)、または(II−k)(式中、nは2〜10から選択される整数を表す)が特に好ましい。他の代替的な実施例において、整数は好ましくは1である。したがって、一般式(I)、(II)、(II−a)、(II−b)、(II−c)、(II−d)、(II−e)、(II−f)、(II−g)、(II−h)、(II−i)、(II−j)、(II−k)、(III)、(III−a)、(III−b)、(III−c)、(III−d)、(III−e)、(III−f)、(III−g)、(III−h)、(III−i)、(III−j)、または(III−k)(式中、nは1を表す)も好ましい。
好ましくはリンカー−L−は、−L−,−L−L−,−L−L−L−,または−L−L−L−を表し;
−L−は、−(CH−,−(CH−CH−O)−C−,または−(CH−CH−O)−CHを表し;
−L−は、−O−,−NH−CO−NH−,−NH−CO−CH−NH−,−NH−CO−を表し;
−L−は、−(CH−,−(CH(OH))−,−(CF−,−(CH−CH−O)−C−,または−(CH−CH−O)−CH−を表し;
−L−は、−(CHp1−,−(CFp1−,−C−(O−CH−CHp1−,−CH−(O−CH−CHp1−,または−(CHp1−O−(CHp2−を表し;および
o、q、p1およびp2は、互いに独立して、1、2、3、4、5、および6から選択される整数であり;好ましくは1、2、3、および4から選択される整数である。
したがって、一般式(I)、(II)、(II−a)、(II−b)、(II−c)、(II−d)、(II−e)、(II−f)、(II−g)、(II−h)、(II−i)、(II−j)、(II−k)、(III)、(III−a)、(III−b)、(III−c)、(III−d)、(III−e)、(III−f)、(III−g)、(III−h)、(III−i)、(III−j)、または(III−k)のいずれか一つのオリゴ糖が特に好ましく、式中、
−L−は、−L−,−L−L−,−L−L−L−,または−L−L−L−を表し;
−L−は、−(CH−,−(CH−CH−O)−C−,または−(CH−CH−O)−CHを表し;
−L−は、−O−,−NH−CO−NH−,−NH−CO−CH−NH−,−NH−CO−を表し;
−L−は、−(CH−,−(CH(OH))−,−(CF−,−(CH−CH−O)−C−,または−(CH−CH−O)−CH−を表し;
−L−は、−(CHp1−,−(CFp1−,−C−(O−CH−CHp1−,−CH−(O−CH−CHp1−,または−(CHp1−O−(CHp2−を表し;および
o、q、p1およびp2は、互いに独立して、1、2、3、4、5、および6から選択される整数であり、および好ましくは1、2、3、および4から選択される整数である。
一般式(I)、(II)、(II−a)、(II−b)、(II−c)、(II−d)、(II−e)、(II−f)、(II−g)、(II−h)、(II−i)、(II−j)、(II−k)、(III)、(III−a)、(III−b)、(III−c)、(III−d)、(III−e)、(III−f)、(III−g)、(III−h)、(III−i)、(III−j)、または(III−k)のいずれか一つのオリゴ糖も好ましく、式中、
−L−は:−L−,−L−L−,−L−L−L−,および−L−L−L−から選択され;
−L−は:−(CH−,−(CH−CH−O)−C−,−(CH−CH−O)−CHから選択され;
−L−は、−O−,−NH−CO−NH−,−NH−CO−CH−NH−,−NH−CO−を表し;
−L−は:−(CH−,−(CF−,−(CH−CH−O)−C
−,および−(CH−CH−O)−CH−から選択され;
−L−は:−(CHp1−,−(CFp1−,−C−(O−CH−CHp1−,−CH−(O−CH−CHp1−,および−(CHp1−O−(CHp2−から選択され;
o、q、p1およびp2は、互いに独立して、1、2、3、4、5、および6から選択される整数であり;好ましくは1、2、3、および4から選択される整数であり;およびnは1を表す。
更により好ましくは、一般式(I)、(II)、(II−a)、(II−b)、(II−c)、(II−d)、(II−e)、(II−f)、(II−g)、(II−h)、(II−i)、(II−j)、(II−k)、(III)、(III−a)、(III−b)、(III−c)、(III−d)、(III−e)、(III−f)、(III−g)、(III−h)、(III−i)、(III−j)、または(III−k)のオリゴ糖であり、式中、−L−は−(CHーを表し、およびoは2、3、4、5、および6から選択される整数である。
更に好ましくは、一般式(I)、(II)、(II−a)、(II−b)、(II−c)、(II−d)、(II−e)、(II−f)、(II−g)、(II−h)、(II−i)、(II−j)、(II−k)、(III)、(III−a)、(III−b)、(III−c)、(III−d)、(III−e)、(III−f)、(III−g)、(III−h)、(III−i)、(III−j)、または(III−k)のオリゴ糖であり、式中、−L−は−(CHーを表し、oは2、3、4、5、および6から選択される整数であり、およびnは1を表す。
より好ましい実施形態において、−O−L−Eは:
からなる群から選択され、
式中、R’は、−H,−Me,−Et,4−ニトロフェニル,ペンタフルオロフェニル
,−N−ヒドロキシスクシンイミジル,−(3−スルホ−N−ヒドロキシスクシンイミジル),または−(ジベンゾシクロオクチン−スルホ−N−ヒドロキシスクシンイミジル)を表し;
Xは、−Br,−Cl,−I,−COH,または−SAcを表す。
特に好ましくは、−O−L−Eは:
からなる群から選択される。
特に好ましくは、一般式(II−a)のオリゴ糖であり、式中、Tは−Hを表し、および−O−L−Eは:
からなる群から選択される。
特に好ましくは、一般式(II−f)のオリゴ糖であり、式中、Tは−Hを表し、および−O−L−Eは:
からなる群から選択される。
さらに好ましくは、一般式(I)、(II)、(II−a)、(II−b)、(II−c)、(II−d)、(II−e)、(II−f)、(II−g)、(II−h)、(II−i)、(II−j)、(II−k)、(III)、(III−a)、(III−b)、(III−c)、(III−d)、(III−e)、(III−f)、(III−g)、(III−h)、(III−i)、(III−j)、または(III−k)のオリゴ糖であり、式中、−L−は−(CHーを表し、oは2、3、4、5、および6から選択される整数であり、Eはアミノ基を表す。
更に他の好ましい実施形態において、本発明に係るオリゴ糖は:
からなる群から選択される。
[化学合成]
本発明の他の態様は、一般式(I)のオリゴ糖の合成方法に関し
式中、
mは、1であり;
xは、1〜2×m+3から選択される整数であり;
nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から選択される整数であり、
−T−は、結合を表し;
−は、Hを表し;
Lは、リンカーを表し;
Eは、−NH,−N,−CN,−O−NH,−CH=CH,−C≡CH,−Br,−Cl,−I,−COR’,−COR’,−CONH−NH,−SH,または−SAcを表し;
R’は、−H,−Me,−Et,4−ニトロフェニル,ペンタフルオロフェニル,−N−ヒドロキシスクシンイミジル,−(3−スルホ−N−ヒドロキシスクシンイミジル),または−(ジベンゾシクロオクチン−スルホ−N−ヒドロキシスクシンイミジル)を表し;
次のステップ:
A1)単糖1を提供すること
式中、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EとなるEpを有する−L−Epを表し、ここでEおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
A2)活性化剤の存在において、単糖1を構成要素2と処理すること
式中、P〜Pは、保護基を表し、およびLGは、脱離基を表す;
A3)保護基Pの除去を行うこと;
A4)活性化剤の存在下でステップA3)の生成物を構成要素3と処理すること
式中、P、P、P、およびPは、保護基を表し、およびLGは、脱離基を表す;
A5)保護基Pの除去を行うこと;
A6)中間体化合物4aを得るためにステップA4)およびA5)を2回繰り返すこと;
式中、P、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EとなるEpを有する−L−Epを表し、ここでEおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
A7)式5aの中間体化合物を得るために、A2)→A3)→A2)→A3)→A4)→A5)→A6)の順序でステップA2)〜A6)をn−1回任意に繰り返すこと、
式中、P、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EとなるEpを有する−L−Epを表し、ここでn、EおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
A8)一般式(I)のオリゴ糖を得るために全ての保護基の除去を行うこと、
を含む。
一般式(I)のオリゴ糖の更なる合成方法は、次のステップ:
B1)単糖1を提供すること
式中、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EとなるEpを有する−L−Epを表し、ここでEおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
B2)活性化剤の存在において、単糖1を構成要素3と処理すること
式中、P、P、P、およびPは、保護基を表し、およびLGは、脱離基を表す;
B3)保護基Pの除去を行うこと;
B4)ステップB2)およびB3)を2回繰り返すこと;
B5)活性化剤の存在下でステップB4)の生成物を構成要素2と処理すること
式中、P〜Pは、保護基を表し、およびLGは、脱離基を表す;
B6)中間体化合物4bを得るために保護基Pの除去を行うこと;
式中、P、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EとなるEpを有する−L−Epを表し、ここでEおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
B7)式5bの中間体化合物を得るために、B5)→B6)→B2)→B3)→B4)→B5)→B6)の順序でステップB2)〜B6)をn−1回任意に繰り返すこと、
式中、P、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EとなるEpを有する−L−Epを表し、ここでn、EおよびLは、本願に定義される通りの意味を有し;
B8)一般式(I)のオリゴ糖を得るために全ての保護基の除去を行うこと、
を含む。
一般式(I)のオリゴ糖の更なる合成方法は、次のステップ:
C1)単糖6を提供すること
式中、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EとなるEpを有する−L−Epを表し、ここでEおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
C2)活性化剤の存在において、単糖6を構成要素3と処理すること
式中、P、P、P、およびPは、保護基を表し、およびLGは、脱離基を表す;
C3)保護基Pの除去を行うこと;
C4)活性化剤の存在下でステップC3)の生成物を構成要素2と処理すること
式中、P〜Pは、保護基を表し、およびLGは、脱離基を表す;
C5)保護基Pの除去を行うこと;
C6)ステップC4)およびC5)を繰り返すこと;
C7)中間体化合物4dを得るためにステップC2)およびC3)を繰り返すこと;
式中、P、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EであるEpを有する−L−Epを表し、ここでEおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
C8)式5dの中間体化合物を得るために、C2)→C3)→C2)→C3)→C4)→C5)→C6)→C7)の順序でステップC2)〜C7)をn−1回任意に繰り返すこと、
式中、P、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EであるEpを有する−L−Epを表し、ここでn、EおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
C9)一般式(I)のオリゴ糖を得るために全ての保護基の除去を行うこと、
を含む。
一般式(I)のオリゴ糖の更なる合成方法は、次のステップ:
D1)単糖6を提供すること
式中、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EであるEpを有する−L−Epを表し、ここでEおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
D2)活性化剤の存在において、単糖6を構成要素3と処理すること
式中、P、P、P、およびPは、保護基を表し、およびLGは、脱離基を表す;
D3)保護基Pの除去を行うこと;
D4)ステップD2)およびD3)を繰り返すこと;
D5)活性化剤の存在下でステップD4)の生成物を構成要素2と処理すること
式中、P〜Pは、保護基を表し、およびLGは、脱離基を表す;
D6)保護基Pの除去を行うこと;
D7)中間体化合物4cを得るためにステップD5)およびD6)を繰り返すこと;
式中、P、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EであるEpを有する−L−Ep、を表し、ここでEおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
D8)式5cの中間体化合物を得るために、D2)→D3)→D4)→D4)→D5)→D6)→D7)の順序でステップD2)〜D7)をn−1回任意に繰り返すこと、
式中、P、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EであるEpを有する−L−Epを表し、ここでn、EおよびLは、本明細書に定義される通りの意味を有する;
D9)一般式(I)のオリゴ糖を得るために全ての保護基の除去を行うこと、
を含む。
一般式(I)のオリゴ糖の他の合成方法は、次のステップ:
E1)単糖6を提供すること
式中、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EであるEpを有する−L−Epを表し、ここでEおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
E2)活性化剤の存在において、単糖6を構成要素2と処理すること
式中、P〜Pは、保護基を表し、およびLGは、脱離基を表す;
E3)保護基Pの除去を行うこと;
E4)ステップE2)およびE3)を繰り返すこと;
E5)活性化剤の存在下でステップE4)の生成物を構成要素3と処理すること
式中、P、P、P、およびPは、保護基を表し、およびLGは、脱離基を表す;
E6)保護基Pの除去を行うこと;
E7)中間体化合物4eを得るためにステップE5)およびE6)を繰り返すこと;
式中、P、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EであるEpを有する−L−Epを表し、ここでEおよびLは、本明細書に定義される通りの意味を有する;
E8)式5eの中間体化合物を得るために、E5)→E6)→E2)→E3)→E4)→E5)→E6)の順序でステップE2)〜E6)をn−1回任意に繰り返すこと、
式中、P、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EであるEpを有する−L−Epを表し、ここでn、EおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
E8)一般式(I)のオリゴ糖を得るために全ての保護基の除去を行うこと、
を含む。
一般式(I)のオリゴ糖の他の合成方法は、次のステップ:
F1)単糖7を提供すること
式中、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EであるEpを有する−L−Epを表し、ここでEおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
F2)活性化剤の存在において、単糖7を構成要素8と処理すること
式中、P〜P10は、保護基を表し、およびLGは、脱離基を表す;
F3)保護基P10の除去を行うこと;
F4)活性化剤の存在下でステップF3)の生成物を構成要素9と処理すること
式中、P、P、P11、およびP12は、保護基を表し、およびLGは、脱離基を表す;
F5)中間体化合物4fを得るために保護基P11の除去を行うこと;
式中、P〜PおよびP12は、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EであるEpを有する−L−Ep、表し、ここでEおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
F6)式5fの中間体化合物を得るために、F2)→F3)→F2)→F4)→F5)の
順序でステップF2)〜F5)をn−1回任意に繰り返すこと、
式中、P〜PおよびP12は、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EであるEpを有する−L−Epを表し、ここでn、EおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
F7)一般式(I)のオリゴ糖を得るために全ての保護基の除去を行うこと、
を含む。
一般式(I)のオリゴ糖の他の合成方法は、次のステップ:
G1)単糖7を提供すること
式中、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EであるEpを有する−L−Epを表し、ここでEおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
G2)活性化剤の存在において、単糖7を構成要素9と処理すること
式中、P、P、P11、およびP12は、保護基を表し、およびLGは、脱離基を表す;
G3)保護基P11の除去を行うこと;
G4)活性化剤の存在下でステップG3)の生成物を構成要素8と処理すること
式中、P〜P10は、保護基を表し、およびLGは、脱離基を表す;
G5)中間体化合物4gを得るために保護基P10の除去を行うこと;
式中、P〜PおよびP12は、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EであるEpを有する−L−Epを表し、ここでEおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
G6)式5gの中間体化合物を得るために、G4)→G5)→G2)→G3)→G4)→G5)の順序でステップG2)〜G5)をn−1回任意に繰り返すこと、
式中、P〜PおよびP12は、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EであるEpを有する−L−Epを表し、ここでn、EおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
G7)一般式(I)のオリゴ糖を得るために全ての保護基の除去を行うこと、
を含む。
一般式(I)のオリゴ糖の他の合成方法は、次のステップ:
H1)単糖10を提供すること
式中、P、PおよびP12は、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EであるEpを有する−L−Epを表し、ここでEおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
H2)活性化剤の存在において、単糖10を構成要素8と処理すること
式中、P〜P10は、保護基を表し、およびLGは、脱離基を表す;
H3)保護基P10の除去を行うこと;
H4)中間体化合物4hを得るためにステップH2)およびH3)繰り返すこと;
式中、P〜PおよびP12は、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EであるEpを有する−L−Epを表し、ここでEおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
H5)活性化剤の存在下で化合物4hを構成要素9と任意に処理すること
式中、P、P、P11、およびP12は、保護基を表し、およびLGは、脱離基を表し、保護基P11の除去を行うこと、および式5hの中間体化合物を得るためにステップH2)〜H4)をn−1回行うこと
式中、P〜PおよびP12は、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EであるEpを有する−L−Epを表し、ここでn、EおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
H6)一般式(I)のオリゴ糖を得るために全ての保護基の除去を行うこと、
を含む。
一般式(I)のオリゴ糖の更なる合成方法は、次のステップ:
I1)単糖1を提供すること
式中、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EであるEpを有する−L−Epを表し、ここでEおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
I2)活性化剤の存在において、単糖1を構成要素2と処理すること
式中、P〜Pは、保護基を表し、およびLGは、脱離基を表す;
I3)保護基Pの除去を行うこと;
I4)活性化剤の存在下でステップI3)の生成物を構成要素3と処理すること
式中、P、P、P、およびPは、保護基を表し、およびLGは、脱離基を表し;
I5)中間体化合物4iを得るために保護基Pの除去を行うこと;
式中、P、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EであるEpを有する−L−Ep、を表し、ここでEおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
I6)式5iの中間体化合物を得るために、I2)→I3)→I2)→I3)→I4)→I5)の順序でステップI2)〜I5)をn−1回任意に繰り返すこと、
式中、P、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EであるEpを有する−L−Epを表し、ここでn、EおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
I7)一般式(I)のオリゴ糖を得るために全ての保護基の除去を行うこと、
を含む。
一般式(I)のオリゴ糖の更なる合成方法は、次のステップ:
J1)単糖1を提供すること
式中、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EであるEpを有する−L−Epを表し、ここでEおよびLは、本願に定義される通
りの意味を有する;
J2)活性化剤の存在において、単糖1を構成要素3と処理すること
式中、P、P、P、およびPは、保護基を表し、およびLGは、脱離基を表す;
J3)保護基Pの除去を行うこと;
J4)活性化剤の存在下でステップJ3)の生成物を構成要素2と処理すること
式中、P〜Pは、保護基を表し、およびLGは、脱離基を表す;
J5)中間体化合物4Jを得るために保護基Pの除去を行うこと;
式中、P、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EであるEpを有する−L−Ep、を表し、ここでEおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
J6)式5jの中間体化合物を得るために、J4)→J5)→J2)→J3)→J4)→J5)の順序でステップJ2)〜J5)をn−1回任意に繰り返すこと、
式中、P、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EであるEpを有する−L−Epを表し、ここでn、EおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
J7)一般式(I)のオリゴ糖を得るために全ての保護基の除去を行うこと、
を含む。
一般式(I)のオリゴ糖の更なる合成方法は、次のステップ:
K1)単糖6を提供すること
式中、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EであるEpを有する−L−Epを表し、ここでEおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
K2)活性化剤の存在において、単糖6を構成要素2と処理すること
式中、P〜Pは、保護基を表し、およびLGは、脱離基を表す;
K3)保護基Pの除去を行うこと;
K4)中間体化合物4kを得るためにステップK2)およびK3)を繰り返すこと;
式中、P、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EであるEpを有する−L−Epを表し、ここでEおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
K5)活性化剤の存在下で化合物4kを構成要素3と任意に処理すること
式中、P、P、P、およびPは、保護基を表し、およびLGは、脱離基を表し、保護基Pの除去を行うこと、および式5kの中間体化合物を得るためにステップK2)〜K4)をn−1回繰り返すこと;
式中、P、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EであるEpを有する−L−Epを表し、ここでn、EおよびLは、本願に定義される通りの意味を有する;
K7)一般式(I)のオリゴ糖を得るために全ての保護基の除去を行うこと、
を含む。
Epは固体支持体または保護末端基を表す。Eは、−NH,−N,−CN,−O−NH,−CH=CH,−C≡CH,−Br,−Cl,−I,−COR’,−COR’,−CONH−NH,−SH,または−SAcを表し;および対応する保護末端基Epは、−N(P13)(P14),−N,−CN,−O−N(P13)(P14),−CH=CH,−C≡CH,−Br,−Cl,−I,−COR’,−CONHN(P
)(P14),−SP,または−SAcを表す。
、P、P、P、P、P、P、P、P、P10、P11、P12、P13、およびP14は保護基を表す。本願に使用される用語「保護基」は、有機合成において一般的に使用される基に関し、好ましくは、ヒドロキシル基およびチオールを保護するために使用される。
より好ましくは、P、P、P、P、P、P、P、P、P、P10、P11、およびP12は、ヒドロキシル基のための適切な保護基、より好ましくは、脱保護反応の適切な順序によって次々に続けて除去されることが可能であるヒドロキシル基のための種々の適切な保護基である。ヒドロキシル基のための好ましい保護基は、アセチル、フェニル、ベンジル、イソプロピリデン、ベンジリデン、ベンゾイル、p−メトキシベンジル、p−メトキシベンジリデン、p−メトキシフェニル、p−ブロモベンジリデン、p−ニトロフェニル、アリル、アセチル、イソプロピル、p−ブロモベンジル、ジメトキシトリチル、トリチル、2−ナフチルメチル、ピバロイル、(2−ニトロフェニル)アセチル、トリイソプロピルシリル、tert−ブチルジメチルシリル、tert−ブチルジフェニルシリル、tert−ブチルメトキシフェニルシリル、トリエチルシリル、トリメチルシリル、2−トリメチルシリルエトキシメチル、9−フルオレニルメトキシカルボニル、ベンジルオキシメチル、メチルオキシメチル、tert−ブチルオキシメチル、メトキシエチルオキシメチル、レブリノイルである。
保護基は、永続的な保護基、および一時的な保護基に区別されることができる。永続的な保護基は、全合成中安定であり、合成の後期で効率的に除去されることができる保護基である。この場合において、永続的な保護基は、P、P、P、P、P、P、P、P12、P13、およびP14を含む。P、P、P、P、P、P、P、およびP12は、全合成の間、ヒドロキシル基を隠しており、一方、保護基P13およびP14は、末端基Epに存在する末端アミノ基を隠している。好ましくは、保護基P、P、P、P、P、およびPは、ベンジル基であり、保護基Pは、ベンゾイル基であり、保護基P12は、ベンジル基であり、保護基P13は、ベンジル基であり、および保護基P14は、ベンジルオキシカルボニル基(Cbz)である。
一時的な保護基は、一般的に、異なる置換基の後続の導入のために、合成の様々なレベルでヒドロキシル基を遊離するために選択的に除去されることができる直交保護基であり、モノオリゴ糖、他の保護基、または分子上に存在する他の残基を含む。この場合において、一時的な保護基は、P、P、P10、およびP11を含む。
保護基の独創的な選択は、免疫原性担体または固体支持体へのその後の結合のために末端基を用いて官能基化された一般式(I)、(II)、(II−a)、(II−b)、(II−c)、(II−d)、(II−e)、(II−f)、(II−g)、(II−h)、(II−i)、(II−j)、(II−k)、(III)、(III−a)、(III−b)、(III−c)、(III−d)、(III−e)、(III−f)、(III−g)、(III−h)、(III−i)、(III−j)、または(III−k)のオリゴ糖のライブラリーへの、適切なアクセスを可能にする。さらに、脱離基の選択は、ステップA2)、A4)、B2)、B5)、C2)、C4)、D2)、D5)、E2)、E5)、F2)、F4)、H2)、H5)、J2)、J4)、I2)、I4)、K2)、およびK5)においてグリコシル化反応の立体学的結果に影響を及ぼす。先行技術から、当業者にとって、一般式(I)、(II)、(II−a)、(II−b)、(II−c)、(II−d)、(II−e)、(II−f)、(II−g)、(II−h)、(II−i)、(II−j)、(II−k)、(III)、(III−a)、(III−b)、(III−c)、(III−d)、(III−e)、(III−f)、(III−g)、(I
II−h)、(III−i)、(III−j)、または(III−k)の所望のマンノースオリゴ糖を得るために、保護基および反応条件を選択することは明らかである(J.Chem.Soc.,Perkin Trans.1,2000,1471−1491 およびEur.J.Org.Chem.2009,870−888参照)。
一時的な保護基P、P、P10、およびP11は:アリル、p−メトキシベンジル、2−ナフチルメチル、トリ−イソプロピルシリル、tert−ブチルジメチルシリル、tert−ブチルメトキシフェニルシリル、トリエチルシリル、トリメチルシリル、2−トリメチルシリルエトキシメチル、9−フルオレニルメトキシカルボニル、およびレブリノイルから好ましくは選択されるが、これらに制限されない。好ましくは、保護基P、P、P10、およびP11は、保護基P、P、P、P、P、P、P、P12、P13、およびP14の存在下で選択的に除去されることができる。好ましくは、P、P、P10、およびP11は、9−フルオレニルメトキシカルボニル、またはレブリノイルであり、より好ましくは、PおよびP11は同じであり、並びにPおよびP10は同じである。好ましい実施形態において、保護基PおよびP10は、9−フルオレニルメトキシカルボニルを表し、並びに保護基PおよびP11は、−フルオレニルメトキシカルボニル、またはレブリノイルを表す。
構成要素2、3、8、および9は、グリコシル化剤である。本願に使用されるように、グリコシル化剤の用語は、脱離基を有するアノマー位置で官能基化された単糖に関し、適切な活性化剤を用いて活性化すると、例えばヒドロキシル基などのような求核剤と反応することができるオキソカルベニウム中間体を提供する。したがって、グリコシル化剤2、3、8、および9は、脱離基LG、LG、LG、およびLGを有するアノマー位置で官能基化される。本合成に適切な脱離基の例は、炭水化物化学の当業者によく知られており、ハロゲン化物、チオエーテル、イミダート、酢酸塩、スルホキシド、ペンテニル、およびリン酸塩を含む。
好ましくは、脱離基LG、LG、LG、およびLGは:
からなる脱離基の群から選択される。
すでに述べたように、オキソカルベニウム中間体の提供は、適当な、または適切な活性化剤を用いてグリコシル化剤のアノマー位置で導入された脱離基の活性化に依存する。リン酸塩のための適切な活性化剤(すなわち、リン酸塩活性化剤)、およびイミダートのための適切な活性化剤(すなわち、イミダート活性化剤)は、例えば、シリルトリフラートまたは銀トリフラートなどのようなルイス酸であり、一方、チオエーテルのための適切な活性化剤、すなわち、チオエーテル活性化剤は:NIS/TfOH,NIS/TMSOTf,NIS/BF・EtO,NIS/AgOTf,DMTST/TfO,IDPC,BSP/TfO,PhSO/TfOを含むが、これらに制限されない。シリルトリフラートの例は、トリメチルシリルトリフルオロメタンスルホネート、tert−ブチ
ルジメチルトリフルオロメタンスルホネート、トリイソプロピルトリフルオロメタンスルホネートを含むが、これらに制限されない。
好ましくは、LG、LG、LG、およびLGはチオエーテルであり、更により好ましくはLG、LG、LG、およびLGは:
からなる群から選択される。
ステップA2)、A4)、B2)、B5)、C2)、C4)、D2)、D5)、E2)、E5)、F2)、F4)、G2)、G4)、H2)、H5)、J2)、J4)、I2)、I4)、K2)およびK5)においてオリゴ糖間のカップリング反応は、−78℃〜0℃もしくは−50℃〜0℃、または−10℃〜+10℃の温度で、非極性溶媒および極性非プロトン性溶媒の混合物中で、NIS/TfOHまたはTMSOTfを用いての活性化によって行われると好ましい。更により好ましくは、前記反応は、約0℃の温度でNIS/TfOHを用いた処理によって、非極性溶媒および極性非プロトン性溶媒の混合物中で行われる。
好ましい極性非プロトン性溶媒は、テトラヒドロフラン、ジエチルエーテル、およびジオキサンである。好ましい非極性溶媒は、トルエン、例えば、クロロホルムおよび塩化メチレンなどのようなハロゲン化溶媒である。非極性溶媒および極性非プロトン性溶媒の好ましい混合物は:塩化メチレン/テトラヒドロフラン、塩化メチレン/ジエチルエーテル、トルエン/ジエチルエーテル、トルエン/テトラヒドロフランである。
ステップA8)、B8)、C9)、D9)、E8)、F7)、F4)、G7)、H8)、I7)、J7)およびK7)で行われる保護基P、P、P、P、P、P、P、P12、P13、およびP14の除去は:
−溶媒の混合物中における、任意に過酸化水素の存在下での、塩基と処理することによる塩基不安定な保護基の第一の開裂(好ましくは、塩基はNaOMe、またはLiOHである);および
−溶媒の混合物中における、パラジウム触媒の存在下での、化合物を水素にさらすことによる水素化に敏感である保護基の第二の開裂
を含む。
本発明に係る更なる態様は、一般式(I)、(II)、(II−a)、(II−b)、(II−c)、(II−d)、(II−e)、(II−f)、(II−g)、(II−h)、(II−i)、(II−j)、(II−k)、(III)、(III−a)、(III−b)、(III−c)、(III−d)、(III−e)、(III−f)、(III−g)、(III−h)、(III−i)、(III−j)、または(III−k)のオリゴ糖を調製するための中間体化合物に関し、ここで、中間体化合物は、一般式(I2a)、(I2b)、(I2c)、(I2d)、(I2e)、(I2f)、(I2g)、(I2h)、(I3a)、(I3b)、(I3c)、(I3d)、(I3e)、(I3f)、(I3g)、(I3h)、(I3i)、(I3j)、(I3k)、(I3l)、(I3m)、(I3n)、(I4a)、(I4b)、(I4c)、(I4d)、(I4e)、(
I4f)、(I4g)、(I4h)、(I4i)、(I4j)、(I5a)、(I5b)、(I5c)、(I5d)、(I5e)、(I5f)、(I5g)、(I5h)、(I5i)、または(I5j):
のいずれか一つを有し、
式中、Cは、固体支持体または保護末端基EであるEpを有する−L−Epを表し、P、P、P、P、P、P、P、P、P、P10、P11、およびP12は、保護基を表し、並びにEおよびLは、上記に定義されるのと同じ意味を有する。
式(I2a)、(I2b)、(I2c)、(I2d)、(I2e)、(I2f)、(I2g)、(I2h)、(I3a)、(I3b)、(I3c)、(I3d)、(I3e)、(I3f)、(I3g)、(I3h)、(I3i)、(I3j)、(I3k)、(I3l)、(I3m)、(I3n)、(I4a)、(I4b)、(I4c)、(I4d)、(I4e)、(I4f)、(I4g)、(I4h)、(I4i)、(I4j)、(I5a)、(I5b)、(I5c)、(I5d)、(I5e)、(I5f)、(I5g)、(I5h)、(I5i)、または(I5j)において、好ましくは、リンカー−L−は、−L−,−L−L−,−L−L−L−,または−L−L−L−を表し;
−L−は、−(CH−,−(CH−CH−O)−C−,または−(CH−CH−O)−CHを表し;
−L−は、−O−,−NH−CO−NH−,−NH−CO−CH−NH−,−NH−CO−を表し;
−L−は、−(CH−,−(CH(OH))−,−(CF−,−(CH−CH−O)−C−,または−(CH−CH−O)−CH−を表
し;
−L−は、−(CHp1−,−(CFp1−,−C−(O−CH−CHp1−,−CH−(O−CH−CHp1−,または−(CHp1−O−(CHp2−を表し;および
o、q、p1およびp2は、互いに独立して、1、2、3、4、5、および6から選択される整数であり;好ましくは、1、2、3、および4から選択される整数である。
特に好ましい中間体は、式(I2a)、(I2b)、(I2c)、(I2d)、(I2e)、(I2f)、(I2g)、(I2h)、(I3a)、(I3b)、(I3c)、(I3d)、(I3e)、(I3f)、(I3g)、(I3h)、(I3i)、(I3j)、(I3k)、(I3l)、(I3m)、(I3n)、(I4a)、(I4b)、(I4c)、(I4d)、(I4e)、(I4f)、(I4g)、(I4h)、(I4i)、(I4j)、(I5a)、(I5b)、(I5c)、(I5d)、(I5e)、(I5f)、(I5g)、(I5h)、(I5i)、または(I5j)中間体であり、式中、−L−は、−(CH2)−を表し、およびoは、2、5および6から選択される整数である。
、P、P、P、P、P、P、P、P、P10、P11、およびP12は、ヒドロキシル基のための適切な保護基、より好ましくは、脱保護反応の適切な順序によって次々に続けて除去されることが可能であるヒドロキシル基のための種々の適切な保護基である。ヒドロキシル基のための好ましい保護基は、アセチル、フェニル、ベンジル、イソプロピリデン、ベンジリデン、ベンゾイル、p−メトキシベンジル、p−メトキシベンジリデン、p−メトキシフェニル、p−ブロモベンジリデン、p−ニトロフェニル、アリル、アセチル、イソプロピル、p−ブロモベンジル、ジメトキシトリチル、トリチル、2−ナフチルメチル、ピバロイル、(2−ニトロフェニル)アセチル、トリイソプロピルシリル、tert−ブチルジメチルシリル、tert−ブチルジフェニルシリル、tert−ブチルメトキシフェニルシリル、トリエチルシリル、トリメチルシリル、2−トリメチルシリルエトキシメチル、9−フルオレニルメトキシカルボニル、ベンジルオキシメチル、メチルオキシメチル、tert−ブチルオキシメチル、メトキシエチルオキシメチル、レブリノイルである。
したがって、中間体(I2a)、(I2b)、(I2c)、(I2d)、(I2e)、(I2f)、(I2g)、(I2h)、(I3a)、(I3b)、(I3c)、(I3d)、(I3e)、(I3f)、(I3g)、(I3h)、(I3i)、(I3j)、(I3k)、(I3l)、(I3m)、(I3n)、(I4a)、(I4b)、(I4c)、(I4d)、(I4e)、(I4f)、(I4g)、(I4h)、(I4i)、(I4j)、(I5a)、(I5b)、(I5c)、(I5d)、(I5e)、(I5f)、(I5g)、(I5h)、(I5i)、または(I5j)は、保護基P、P、P、P、P、およびPがベンジル基であり、保護基P、P、P10、およびP11が9−フルオレニルメトキシカルボニル基またはレブリノイル基であり、保護基PおよびP12がベンゾイル基であり、保護基P13がベンジル基であり、および保護基P14が、ベンジルオキシカルボニル基(Cbz)である場合に特に好ましい。
[複合糖質]
本発明の他の態様は、−O−L−E基の末端基Eを介して免疫原性担体に共有結合(covalently bound)または共有結合(covalently linked)している一般式(I)のオリゴ糖を含む複合体に関する。言い換えると、本発明の他の態様は、−O−L−E基の末端基Eを介して免疫原性担体と複合体化される一般式(I)、(II)、(II−a)〜(II−k)、(III)、(III−a)〜(III−j)、または(III−k)のいずれかのオリゴ糖に関する。一般式(I)、(II)、(II−a)〜(II−k)、(III)、(III−a)〜(III−j)、または(
III−k)の合成オリゴ糖を含む複合体は、−O−L−E基の末端基Eを介して免疫原性担体に共有結合(covalently bound)、または共有結合(covalently linked)しており、一般式(I)、(II)、(II−a)〜(II−k)、(III)、(III−a)〜(III−j)、または(III−k)のいずれかのオリゴ糖を免疫原性担体と反応させることによって得られる複合体としても定義される。驚くべきことに、前記複合体は、クレブシエラ ニューモニエ血清型O3、O3b、および/またはO5細菌と関連する疾患に対する免疫付与のためのワクチンとして効果的であることを証明した。
オリゴ糖は、一般的にTI−2(T細胞非依存的−2)抗原および低い免疫抗原性として当業者に知られている。TI−2抗原は、表面露出された免疫グロブリン受容体のクロスリンクを介して成熟B細胞によってのみ認識される抗原である。T細胞の助けなしでは、免疫記憶は生じず、IgMサブクラスから他のIgGサブクラスへのアイソタイプ変換もB細胞親和性成熟も起こらない。さらに、オリゴ糖は、ヒト糖脂質およびヒト糖タンパク質に対する構造的相同性のためにヒトにおいて低い免疫原であると知られている。オリゴ糖の低い免疫原性特性のために、オリゴ糖は、強力なワクチンの生産に必須の特徴である、B細胞による抗体産生、および記憶細胞の形成の両方を生じさせる能力が低いことを示す。
したがって、強力なオリゴ糖に基づくワクチンを生産するために、一般式(I)、(II)、(II−a)〜(II−k)、(III)、(III−a)〜(III−j)、または(III−k)のオリゴ糖は、複合体を提供するために免疫原性担体に結合され、当該複合体は、オリゴ糖と比較して上昇した免疫原性を示す。したがって、本願の範囲下では、オリゴ糖断片
を含む複合体も包含され、
式中、m、n、x、Ux+1、Ux+2、Ux+3、Ux+4、V、Vx+1、Vx+2、TおよびTは、本願に定義される意味を有し、O原子を介して免疫原性担体に共有結合される。
前記複合体は、少なくとも一つの一般式(I)の合成オリゴ糖、および少なくとも一つのオリゴ糖が共有結合される免疫原性担体を含む。
驚くべきことに、免疫原性担体に共有結合している一般式(I)のオリゴ糖を含む複合体を用いての免疫付与は、一般式(I)のオリゴ糖の炭水化物部分に対する特異的な高力価の抗体の生産をもたらすことを明らかにした。前記抗体は、天然のクレブシエラ ニューモニエ血清型O3、O3b、および/またはO5リポポリオリゴ糖と交差反応し、オプソニン化貪食作用および殺菌活性を示すので、クレブシエラ ニューモニエ血清型O3、O3b、および/またはO5細菌に対する保護を与える。
この文脈において用語「免疫原性担体」は、構造として定義され、免疫原性担体は、オリゴ糖自体と比較して増加した免疫原性を示す複合体を形成するためにオリゴ糖に結合される。したがって、一般式(I)、(II)、(II−a)〜(II−k)、(III)、(III−a)〜(III−j)、または(III−k)のオリゴ糖の免疫原性担体への複合は、前記免疫原性担体に対する免疫応答を誘導することなく、一般式(I)のオリゴ糖に対して免疫応答を刺激する効果を有する。
好ましい免疫原性担体は、免疫調節特性を有する担体タンパク質またはグリコスフィンゴ脂質である。当業者にとって、担体タンパク質は、ジフテリアトキソイド、変異ジフテリアトキソイド、修飾ジフテリアトキソイド、変異および修飾ジフテリアトキソイド、破傷風トキソイド、修飾破傷風トキソイド、変異破傷風トキソイド、分類不可能なヘモフィルス インフルエンザ(Haemophilus influenzae)の非脂質付加細胞表面リプロテイン(liporotein)(タンパク質D)、ナイセリア メニンジチディス(Neisseria meningitidis)の外膜タンパク質(OMP)複合体、ウシ血清アルブミン(BSA)、キーホール リンペット ヘモシアニン(keyhole limpet hemocyanine)(KLH))、シュードモナス エルギノーサ(Pseudomonas aeruginosa)外毒素A(γEPA)の組み換え非毒性型、またはコレラトキソイド(CT)、を含む群、または、からなる群から選択されるタンパク質である。本願に使用される用語「トキソイド」は、細菌毒素(一般的に外毒素)に関し、細菌毒素の毒性は、化学的(ホルマリン)または熱処理のいずれかによって不活性化または抑制されており、一方、他の特性、一般的に免疫原性は、維持される。本願に使用される変異トキソイドは、組み換え細菌毒素であり、組み換え細菌毒素は、野生型アミノ酸配列を修正することによって、低い毒性になる、または非毒性にさえもなるように修正されている。このような変異は、一つ以上のアミノ酸の置換であり得る。このような変異トキソイドは、修飾トキソイドを提供するために相互連結分子の官能基Yと反応することができる官能性を当該表面に示す。前記官能性は、当業者に公知であり、還元剤の存在下で活性化エステル、イソシアネート基、またはアルデヒドと反応することができるリジン残基の第一級アミノ官能性、カルボジイミドによって活性化されることができるグルタミン酸塩残基またはアスパラギン酸塩残基のカルボキシレート官能性、またはシステイン残基のチオール官能性を含むが、これらに制限されない。
活性化エステルは、N−(γ−マレイミドブチリルオキシ)スルホスクシンイミドエステル(スルホ−GMBS)、スクシンイミジル(4−ヨードアセチル)アミノベンゾエート(スルホ−SIAB)、スクシンイミジル−3−(ブロモアセトアミド)プロピオネート(SBAP)、ジスクシンイミジルグルタレート(DSG)、ジスクシンイミジルアジペート(DSA)、2−ピリジルジチオール−テトラオキサテトラデカン−N−ヒドロキシスクシンイミド(PEG−4−SPDP)を含む(図2参照)。
担体タンパク質におけるシステイン残基は、担体タンパク質の表面に相互連結分子の官能基Xを有する修飾担体タンパク質を提供するために、適切な相互連結分子と更に反応されることができる、対応するデヒドロアラニンに変換されることができる。
一般式Iのオリゴ糖は、リジン残基の第一級アミノ官能性として示す非毒性変異ジフテリア毒素CRM197に結合されると特に好ましい。
CRM197様野生型ジフテリア毒素は、グリシンへグルタミン酸の一つのアミノ酸置換を有するジスルフィド架橋によって結合される2つのサブユニットからなる535アミノ酸(58kD)の単一ポリペプチド鎖である。プレベナー(Prevnar)のような、疾患のために多くの承認された複合体ワクチンにおける担体タンパク質として利用される。
したがって、本発明の好ましい実施形態において、担体タンパク質は、相互連結分子の前記官能基Xを担体タンパク質の表面に有する修飾担体タンパク質を提供するために、当該表面に相互連結分子の官能基Yと反応することができるリジン残基の第一級アミノ官能性を示し、修飾担体タンパク質は、一般式(I)の化合物におけるリンカーの末端アミノ基と反応することができる。
相互連結分子の前記官能基Xは、マレイミド;α−ヨードアセチル;α−ブロモアセチル;およびN−ヒドロキシ−スクシンイミドエステル(NHS)、アルデヒド、イミドエステル、カルボン酸、スルホン酸アルキル、塩化スルホニル、エポキシド、無水物、炭酸塩を含む、または、からなる群から選択される(図3参照)。
好ましくは、一般式Iのオリゴ糖は、非毒性変異ジフテリア毒素CRM197に結合され、マレイミドによって修飾される。さらに他の好ましい実施形態において、一般式Iのオリゴ糖は、非毒性変異ジフテリア毒素CRM197に結合され、α−ブロモアセトアミドによって修飾される。最も好ましい実施形態において、一般式Iのオリゴ糖は、非毒性変異ジフテリア毒素CRM197に結合され、N−ヒドロキシスクシンイミドアジペートによって修飾される。
好ましくは、一般式(IV)の複合体であり
式中、
cは2〜18を含み;
−E−は、共有結合,−NH−,−O−NH−,−O−,−S−,−CO−,−CH=CH−,−CONH−,−CO−NHNH−,
を表し;
−W−は:
から選択され、
aは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から選択される整数を表し、
bは、1、2、3、および4から選択される整数を表し、
CPは、担体タンパク質であり;および
m、n、x、L、Ux+1、Ux+2、Ux+3、Ux+4、V、Vx+1、Vx+2、TおよびTは、本願に定義される通りの意味を有する。
好ましくは、Eは、共有結合、−NH−,−CH=CH−,−CONH−,
である。
好ましいCPは、CRM197である。したがって、本発明の一つの実施形態において、複合体は一般式(IV)であり、式中、CPは、CRM197であり、およびc、−E−、W、m、n、x、L、Ux+1、Ux+2、Ux+3、Ux+4、V、Vx+1、Vx+2、TおよびTは、本願に定義される通りの意味を有する。
好ましくは、一般式(IV)において、リンカー−L−は:−L−,−L−L−,−L−L−L−,および−L−L−L−から選択され;
−L−は、−(CH−,−(CH−CH−O)−C−,−(CH−CH−O)−CHから選択され;
−L−は、−O−,−NH−CO−NH−,−NH−CO−CH−NH−,−NH−CO−を表し;
−L−は:−(CH−,−(CF−,−(CH−CH−O)−C−,および−(CH−CH−O)−CH−から選択され;
−L−は、−(CHp1−,−(CFp1−,−C−(O−CH−CHp1−,−CH−(O−CH−CHp1−,および−(CHp1−O−(CHp2−から選択され;
および、o、q、p1およびp2は、互いに独立して、1、2、3、4、5、および6から選択される整数であり;好ましくは、1、2、3、および4から選択される整数である。
さらに、一般式(IV)の複合体が好ましく、式中、−W−は、
を表し、およびaは、2、3、4、5、および6から選択される整数である。
一般式(IV)の複合体が特に好ましく、式中、
リンカー−L−は:−L−,−L−L−,−L−L−L−,および−L−L−L−から選択され;
−L−は、−(CH−,−(CH−CH−O)−C−,−(CH−CH−O)−CHから選択され;
−L−は、−O−,−NH−CO−NH−,−NH−CO−CH−NH−,−NH−CO−を表し;
−L−は:−(CH−,−(CF−,−(CH−CH−O)−C
−,および−(CH−CH−O)−CH−から選択され;
−L−は、−(CHp1−,−(CFp1−,−C−(O−CH−CHp1−,−CH−(O−CH−CHp1−,および−(CHp1−O−(CHp2−から選択され;
o、q、p1およびp2は、互いに独立して、1、2、3、4、5、および6から選択される整数であり;好ましくは、1、2、3、および4から選択される整数であり;
−W−は、
を表し、およびaは、2、3、4、5、および6から選択される整数である。
更により好ましくは、一般式(IV)の複合体であり、式中
xは1を表し、
−はH−を表し、
リンカー−L−は:−L−,−L−L−,−L−L−L−,および−L−L−L−から選択され;
−L−は、−(CH−,−(CH−CH−O)−C−,−(CH−CH−O)−CHから選択され;
−L−は、−O−,−NH−CO−NH−,−NH−CO−CH−NH−,−NH−CO−を表し;
−L−は:−(CH−,−(CF−,−(CH−CH−O)−C−,および−(CH−CH−O)−CH−から選択され;
−L−は、−(CHp1−,−(CFp1−,−C−(O−CH−CHp1−,−CH−(O−CH−CHp1−,および−(CHp1−O−(CHp2−から選択され;
o、q、p1およびp2は、互いに独立して、1、2、3、4、5、および6から選択される整数であり;好ましくは、1、2、3、および4から選択される整数であり;
−W−は、
を表し、およびaは、2、3、4、5、および6から選択される整数である。
特に好ましくは、一般式(IV)の複合体であり、式中、リンカー−L−は、−(CH−を表し、
oは、2、3、4、5、および6から選択される整数であり;
−W−は、
を表し、およびaは、2、3、4、5、および6から選択される整数である。
さらに好ましくは、一般式(IV)の複合体であり、式中、xは1を表し、
はH−を表し、
リンカー−L−は、−(CH−を表し、
oは、2、3、4、5、および6から選択される整数であり;
−W−は、
を表し、およびaは、2、3、4、5、および6から選択される整数である。
好ましくは、cは、2〜18、より好ましくは、5〜15、更により好ましくは、8〜12を含む。nは1を表すとさらに好ましい。
好ましくは、一般式(V)の複合体でもあり、
式中、
cは2〜18を含み;
−E−は、共有結合,−NH−,−O−NH−,−O−,−S−,−CO−,−CH=CH−,−CONH−,−CO−NHNH−,
を表し;
−W−は:
から選択され、
aは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から選択される整数を表し、
bは、1、2、3、および4から選択される整数を表し;および
m、n、x、L、Ux+1、Ux+2、Ux+3、Ux+4、V、Vx+1、およびVx+2は、本願に定義される通りの意味を有する。
他の実施形態において、前記免疫原性担体は、好ましくは、免疫調節特性を有するグリコスフィンゴ脂質であり、より好ましくは、(2S,3S,4R)−1−(α−D−ガラクトピラノシル)−2−ヘキサコサノイルアミノオクタデカン−3,4−ジオールである。免疫調節特性を有するグリコスフィンゴ脂質の用語は、本願に使用される通り、標的抗原に対して免疫システム応答を刺激することができるが、上記に定義される通りグリコスフィンゴ脂質自体では免疫性を与えない、適切なグリコスフィンゴ脂質に関する。
本願に使用されるグリコスフィンゴ脂質は、スフィンゴ脂質にα−結合される炭水化物部分を含む化合物である。好ましくは、炭水化物部分は、ヘキソピラノースであり、最も好ましくは、α−D−ガラクトピラノースである。当業者にとって、スフィンゴ脂質は、アミド結合を介して脂肪酸に連結されるC18アミノアルコールを含む脂質のクラスである。C18アミノアルコールは、ヒドロキシル基と好ましくはモノ−、ジ−、またはポリ置換される。特に好ましくは、C18アミノアルコールは、フィトスフィンゴシンである。脂肪酸は、好ましくは、16〜18個の範囲の、およびより好ましくは、18〜26個の範囲の多数の炭素の飽和アルキル鎖を有するモノカルボン酸である。免疫調節特性を有するグリコスフィンゴ脂質は、(2S,3S,4R)−1−(α−D−ガラクトピラノシル)−2−ヘキサコサノイルアミノオクタデカン−3,4−ジオールを含むが、これに制限されず、ナチュラルキラー(NK)活性およびナチュラルキラーT(NKT)細胞によるサイトカイン産生を刺激することができ、インビボにおいて強力な抗腫瘍活性を示す(Proc.Natl Acad.Sci.USA,1998,95,5690)。
免疫調節特性を有するグリコスフィンゴ脂質を有する一般式(I)のオリゴ糖の複合体は、熱安定性があるという利点を有する。複合体が安定であるために、免疫調節特性を有するグリコスフィンゴ脂質において、官能性が導入される。前記官能性は、一般式Iのオリゴ糖の複合体を提供するために一般式Iのオリゴ糖におけるリンカーの末端アミノ基と、または免疫調節特性を有する修飾グリコスフィンゴ脂質を提供するために相互連結分子の官能基Yと、反応する傾向がある。
好ましくは、前記官能性は、免疫調節特性を有するグリコスフィンゴ脂質の炭水化物部分におけるC6に導入される。したがって、免疫調節特性を有するグリコスフィンゴ脂質は、官能性を用いて官能基化され、オリゴ糖の末端アミノ基と、または相互連結分子の官能基Yと、反応する傾向がある。アミノ基と反応する傾向がある官能性は、活性化エステ
ル、イソシアネート基、アルデヒド、エポキシド、イミドエステル、カルボン酸、アルキルスルホネート、および塩化スルホニルを含むが、これらに制限されない。相互連結分子の官能基Xを示す免疫調節特性を有する修飾グリコスフィンゴ脂質を提供するために、相互連結分子の官能基Yと反応する傾向がある官能性は、アミン、アルコール、チオール、活性化エステル、イソシアネート基、アルデヒド、エポキシド、ビニル、イミドエステル、カルボン酸、アルキルスルホネート、塩化スルホニル、ビニル基、アルキニル基、およびアジド基を含むが、これらに制限されない。
好ましくは、免疫調節特性を有するグリコスフィンゴ脂質の炭水化物部分におけるC6に導入される官能性は、アミン、チオール、アルコール、カルボン酸、ビニル、マレイミド、α−ヨードアセチル、α−ブロモアセチル、N−ヒドロキシスクシンイミドエステル(NHS)、2−ピリジルジチオールを含む(comprising)、または含む(containing)群から選択される。
相互連結分子の前記官能基Xは、マレイミド、α−ヨードアセチル、α−ブロモアセチル、N−ヒドロキシスクシンイミドエステル(NHS)、アルデヒド、カルボン酸、エポキシド、アルキルスルホネート、塩化スルホニル、無水物、炭酸塩を含む、または、からなる群から選択される。
本願に使用される用語「相互連結分子」は、官能基Xおよび官能基Yを含む二官能性分子に関し、ここで、官能基Xは、リンカー−L−における末端アミノ基と反応することが可能であり、官能基Yは、免疫原性担体または固体支持体に存在する官能基と反応することが可能である。
本発明の少なくとも一つの複合体を含むワクチンは、クレブシエラ ニューモニエの莢膜ポリ−、オリゴ糖またはクレブシエラ ニューモニエの莢膜ポリ−、オリゴ糖の複合体における非選択的開裂によって得られるオリゴ糖の単離された(および合成されていない)混合物を含むワクチンと比較して、より少ない副作用、および/またはより少ない非保護免疫応答をもたらす。さらに、本発明のワクチンは、非選択的開裂された莢膜ポリ−、オリゴ糖の単離された混合物を含むワクチンより、GMP規則にしたがって、より容易に製造されることができ、より容易に特徴づけられることができ、そのことは、安定性および純度制御を容易にし、並びに不純物の種類および量の検出をする。
より好ましくは一般式(V−1)〜(V−11):
のいずれか一つの複合体であり、
式中、L、E、W、c、およびnは、本願に定義されるのと同じ意味を有する。
より好ましくは、一般式(IV)、(V)、および(V−1)〜(V−11)のいずれか一つの複合体であり、式中、nは2〜10の整数である。
より好ましくは、一般式(IV)、(V)、および(V−1)〜(V−11)のいずれか一つの複合体であり、式中、cは4〜10から選択される。
好ましくは、−W−は、
を表し、およびaは、2、3、4、5、および6から選択される整数である。
したがって、一般式(IV)、(V)、および(V−1)〜(V−11)の複合体は特に好ましく、式中、−W−は
を表し、およびaは2、3、4、5、および6から選択される整数である。
好ましくは、リンカー−L−は、−L−,−L−L−,−L−L−L−,または−L−L−L−を表し;
−L−は、−(CH−,−(CH−CH−O)−C−,または−(CH−CH−O)−CHを表し;
−L−は、−O−,−NH−CO−NH−,−NH−CO−CH−NH−,−NH−CO−を表し;
−L−は、−(CH−,−(CH(OH))−,−(CF−,−(CH−CH−O)−C−,または−(CH−CH−O)−CH−を表し;
−L−は、−(CHp1−,−(CFp1−,−C−(O−CH−CHp1−,−CH−(O−CH−CHp1−,または−(CHp1−O−(CHp2−を表し;および
o、q、p1およびp2は、互いに独立して、1、2、3、4、5、および6から選択される整数であり;好ましくは1、2、3、および4から選択される整数である。
最も好ましい実施形態において、Eは、共有結合,−NH−, −CH=CH−,−CONH−,
である。
一般式(I)、(II)、(II−a)〜(II−k)、(III)、(III−a)〜(III−j)、または(III−k)のいずれか一つのオリゴ糖を含む複合体、および特に、一般式(IV)、(V)、および(V−1)〜(V−11)のいずれか一つの複合体は、ヒトおよび/または動物宿主において保護免疫応答を誘導するので、クレブシエラ ニューモニエ血清型O3、O3b、および/またはO5細菌と関連する疾患の予防および/または治療に有用であるということが明らかになった。したがって、免疫原性担体に結合される一般式(I)のオリゴ糖を含む複合体は、リポ多糖において次のオリゴ糖断片:
−2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1−;
−3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1−;
−3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−;
−2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−;
−2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−;
−3)−β−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−;
−2)−α−D−Man−(1,3)−β−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−;
−2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,3)−β−D−Man−
(1−;
−2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1−;
−3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1−;
−3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−
の一つを含む、クレブシエラ ニューモニエ細菌と関連する疾患の予防および/または治療に有用である。
好ましくは、リポ多糖において、上記のオリゴ糖断片の一つを含む細菌は、クレブシエラ ニューモニエ血清型O3、O3b、および/またはO5である。
好ましい実施形態において、免疫原性担体に結合される一般式(I)のオリゴ糖を含む複合体は、細菌と関連する疾患の、特に、細菌のO−多糖において、次のオリゴ糖断片:−2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1−;−3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1−;−3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−;−2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−;−2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−;−3)−β−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−;−2)−α−D−Man−(1,3)−β−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−;−2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,3)−β−D−Man−(1−;−2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1−;−3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1−;−3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−、の一つを含む細菌と、好ましくはクレブシエラ ニューモニエ血清型O3、O3b、および/またはO5と関連する疾患の、予防および/または治療に有用であり、ここで前記疾患は、肺炎、気管支炎、髄膜炎、尿路感染症、創傷感染症、骨髄炎、菌血症、敗血症、および強直性脊椎炎を含む。
[医薬組成物]
本発明の他の態様は、少なくとも一つの薬学的に許容できるアジュバントおよび/または賦形剤と共に、免疫原性担体に結合される一般式(I)のオリゴ糖、および/または一般式(I)の少なくとも一つのオリゴ糖を含む少なくとも一つの複合体を含む医薬組成物またはワクチンに関する。前記医薬組成物は、ヒトおよび/または動物宿主において保護免疫応答を高めるために使用されることができる。理論的に、医薬組成物はヒトにおける使用のために適切である。
本発明の他の態様において、前記医薬組成物またはワクチンは、クレブシエラ ニューモニエ血清型O1、O2(O2a,O2ac,...)、O4、O7、O8、O12、およびカルバペネム耐性クレブシエラ ニューモニエST258ガラクタン−IIIを含む、または、からなる群から選択されるクレブシエラ ニューモニエ細菌における、少なくとも一つの莢膜多糖、O−多糖、および、/または莢膜多糖断片、O−多糖断片、および/またはそれらのタンパク質複合体を更に含む。
本明細書に使用される用語「アジュバント」は、免疫学的アジュバント、すなわち、ア
ジュバントに関連する抗原性はなく、ワクチンに含まれる所与の抗原への免疫応答を高めることによって、前記ワクチンの効果を修正する、または増加させるワクチン組成物において使用される材料に関する。当業者にとって、古典的に認識される免疫学的アジュバントの例は、油乳剤(例えば、フロイント(Freund’s) アジュバントなど)、サポニン、アルミニウム塩またはカルシウム塩(例えば、アルム(alum)など)、非イオン性ブロック重合体界面活性剤、および他の物を含むが、これらに制限されない。
医薬組成物は、特に投与の時点で、好ましくは、水性形態であるが、非水性液体形態、またはゼラチンカプセルのような乾燥形態、または凍結乾燥品など、で存在することができる。
医薬組成物は、チオメルサールまたは2−フェノキシエタノールなどのような、一つ以上の防腐剤を含んでもよい。水銀を使わない組成物は好ましく、および防腐剤を使わないワクチンを調製することができる。
医薬組成物は、等張性を制御するために、例えばナトリウム塩などのような、生理的塩を含んでもよい。塩化ナトリウム(NaCl)は、一般的であり、1〜20mg/mlで存在してもよい。存在し得る他の塩は、塩化カリウム、リン酸二水素カリウム、無水リン酸二ナトリウム、塩化マグネシウム、塩化カルシウム、などを含む。
医薬組成物は、200mOsm/kg〜400mOsm/kgの浸透圧を有することができる。
医薬組成物は、普通の水(例えば、注射用水(w.f.i))中に化合物(不溶性の金属塩を有する、または有さない)を含んでもよいが、通常一つ以上の緩衝剤を含むであろう。一般的な緩衝剤は:リン酸塩緩衝剤;トリス緩衝剤;ホウ酸塩緩衝剤;コハク酸塩緩衝剤;ヒスチジン緩衝剤(特に、水酸化アルミニウムアジュバントを有する場合);またはクエン酸塩緩衝剤を含んでもよい。緩衝塩は、一般的に、5〜20mMの範囲で含まれるであろう。
医薬組成物は、一般的にpH5.0〜9.5、例えば、pH6.0〜8.0を有する。
医薬組成物は、好ましくは、無菌および無グルテンである。
医薬組成物は、動物(および、特にヒト)患者に投与するために適切であるので、ヒト用および動物用の両方を含む。医薬組成物は、患者における免疫応答を高める方法において使用されてもよく、患者へ組成物を投与するステップを含む。
本発明の医薬組成物は、患者がクレブシエラ ニューモニエ血清型O3、O3b、および/またはO5にさらされる前、並びに/あるいは後に投与されてもよい。
本発明の他の態様において、本発明は、クレブシエラ ニューモニエ血清型O3、O3b、またはO5細菌と関連する疾患の予防および/または治療のための前記医薬組成物もしくは前記ワクチンの製造のための、免疫原性担体に結合される一般式(I)の少なくとも一つのオリゴ糖を含む少なくとも一つの複合体、および/または一般式(I)の少なくとも一つのオリゴ糖の使用に関し、特にクレブシエラ ニューモニエ血清型O3、O3b、またはO5細菌と関連する疾患は、肺炎、気管支炎、髄膜炎、尿路感染症、創傷感染症、骨髄炎、菌血症、敗血症、および強直性脊椎炎を含む、または、からなる群から選択される。
好ましくは、本発明は、前記医薬組成物または前記ワクチンの製造のための、一般式(I)、(II)、(II−a)〜(II−k)、(III)、(III−a)〜(III
−j)または(III−k)のいずれか少なくとも一つのオリゴ糖、および/または一般式(I)、(II)、(II−a)〜(II−k)、(III)、(III−a)〜(III−j)もしくは(III−k)のいずれか少なくとも一つのオリゴ糖を含む少なくとも一つ複合体の使用に関する。
より好ましくは、本発明は、前記医薬組成物または前記ワクチンの製造のために、オリゴ糖I’a−1〜I’a−11、I’a−1〜I’b−11、I’b−1〜I’c−11、I’c−1〜I’c−11、I’d−1〜I’d−11、I’e−1〜I’e−11、およびI’f−1〜I’f−11の少なくとも一つ、並びに/または、オリゴ糖I’a−1〜I’a−11、I’a−1〜I’b−11、I’b−1〜I’c−11、I’c−1〜I’c−11、I’d−1〜I’d−11、I’e−1〜I’e−11およびI’f−1〜I’f−11の少なくとも一つを含む少なくとも一つの複合体の使用に関する。
特に、本発明は、前記医薬組成物または前記ワクチンの製造のために、一般式(IV)、(V)、および(V−1)〜(V−11)のいずれか少なくとも一つの複合体の使用に関する。
医薬組成物は、単位用量形態で調製されてもよい。好ましくは、本発明の複合体の用量は、0.1〜10μg、好ましくは1〜10μg、好ましくは0.2〜9μg、より好ましくは、0.5〜9μg、好ましくは1〜6μg、および最も好ましくは1〜5μgで調製されてもよい。いくつかの実施形態において、単位用量は、0.1〜10mL、例えば、約0.5mLの量を有してもよい。
本発明は、例えば、単位用量を含む本発明の医薬組成物を含む送達装置(例えば、注射器、ネブライザー(nebuliser)、噴霧器(sprayer)、吸入器、皮膚パッチなど)も提供する。この装置は、脊椎動物の対象に組成物を投与するために使用することができる。
本発明は、本発明の医薬組成物を、例えば単位用量含む滅菌容器(例えば、バイアルなど)も提供する。
本発明は、本発明の医薬組成物の単位用量も提供する。
本発明は、本発明の医薬組成物を含む密閉容器も提供する。適切な容器は、例えば、バイアルを含む。
本発明の医薬組成物は、種々の形態で調製されてもよい。例えば、組成物は、液体溶液または懸濁液のいずれかとして、注入物質として調製されてもよい。注射前の液体ビヒクル中の溶液または懸濁液のために適切な固体形態を調製することもできる(例えば、凍結乾燥組成物、またはスプレー凍結乾燥組成物)。組成物は、例えば、軟膏、クリーム、または粉末などの一般的な投与のために調製されてもよい。組成物は、例えば、錠剤またはカプセルとして、スプレーとして、またはシロップとして(任意に風味をつけて)、経口投与のために調製されてもよい。組成物は、例えば、吸入器などによって、微粉またはスプレーを用いて肺投与のために調製されてもよい。組成物は、座薬として調製されてもよい。組成物は、例えば、スプレーまたは点滴剤などとして、経鼻投与、耳投与、または眼投与のために調製されてもよい。筋肉内投与のための注射は一般的である。
医薬組成物は、アジュバントの効果的な量、すなわち、単回投与で、または系列の一部として、個々に投与される場合、同時投与されるクレブシエラ ニューモニエ血清型O3、O3b、および/またはO5抗原への免疫応答を高めるために効果的な量を含んでもよい。
この量は、治療される個々の健康状態および体調、年齢、治療される個々の分類群(例えば、非ヒト霊長類、霊長類など)、抗体を合成するための個々の免疫システムの能力、所望される保護の程度、ワクチンの形成、医学的状況における治療する医師の評価、並びに他の関連する要因に依存して変えることができる。量は、ルーチン試験によって決定されることができる比較的広範囲で低下するであろう。
本発明のワクチンの形成および投与のための技術は、「レミントンの医薬品化学(Remington’s Pharmaceutical Sciences)」マック パブリッシング社(Mack Publishing Co.),イーストン(Easton) ペンシルベニア(PA)において明らかにされ得る。
本発明に係る一つの複合体における、または一般式(I)の一つのオリゴ糖における治療有効量は、疾患に対して少なくとも部分的な免疫付与をもたらす化合物の量に関する。このような化合物の毒性および治療有効性は、細胞培養または実験動物における標準的な薬学的、薬理学的、および毒物学的手順によって決定されることができる。毒性と治療有効性との間の用量比は、治療指数である。投与される組成物の実際量は、治療される患者、患者の体重、疾患の重症度、投与方法、および処方医師における判断に依存するだろう。
本発明の他の態様は、ヒトおよび/または動物宿主においてクレブシエラ ニューモニエ血清型O3、O3b、および/またはO5に対する免疫応答を誘導する方法に関し、前記方法は、前記ヒトおよび/または動物宿主に対して、一般式(I)のオリゴ糖、および/または一般式(I)のオリゴ糖の塩、および/または一般式(I)のオリゴ糖の複合体もしくは一般式(I)のオリゴ糖の医薬組成物を投与することを含む。本発明に係るヒトおよび/または動物宿主において、クレブシエラ ニューモニエ血清型O3、O3b、および/またはO5に起因する疾患を治療または予防する方法は、前記ヒトおよび/または動物宿主に対して、少なくとも一つの一般式(I)のオリゴ糖、および/または一般式(I)のオリゴ糖の塩、および/または一般式(I)のオリゴ糖の複合体もしくは一般式(I)のオリゴ糖の医薬組成物を投与することを含む。
[免疫学的分析]
本発明の更に他の態様は、O−ポリ−、オリゴ糖において次のオリゴ糖断片:
−2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1−;
−3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1−;
−3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−;
−2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−;
−2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−;
−3)−β−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−;
−2)−α−D−Man−(1,3)−β−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−;
−2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,3)−β−D−Man−(1−;
−2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1−;
−3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1−;
−3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−
を含む細菌に対する抗体の検出のための免疫学的分析におけるマーカーとして使用のための一般式(I)のオリゴ糖に関する。
このような分析は、O−ポリ、オリゴ糖断片において、クレブシエラ ニューモニエ血清型O3、O3b、および/またはO5などの上述のオリゴ糖断片の一つを含む細菌に対する抗体の検出のために有用な、例えば、マイクロアレイおよびELISAを含む。
K.ニューモニエ血清型O3、O3b、およびO5におけるO−抗原は、大腸菌(E.coli)O9、およびO8によってそれぞれ共有される。O5−抗原は、バークホルデリア セパシア(Burkholderia ceparcia)O2およびE、並びにセラチア マルセッセンス(Serratia marcescens)O28によって共有される。したがって、上述のオリゴ糖断片におけるO−ポリ−,オリゴ糖の一つは、大腸菌O8およびO9、バークホルデリア セパシアO2およびE、並びにセラチア マルセッセンスO28に対する抗体の検出のために使用されることができる。
本発明のオリゴ糖は、クレブシエラ ニューモニエ血清型O3、O3b、および/またはO5に対する抗体の検出のために免疫学的分析を提供する固体支持体に容易に複合されることができる。前記固体支持体は、修飾固体支持体を提供するために、一般式(I)のオリゴ糖のアミノ基と、または相互連結分子の官能基Yと、反応する傾向がある官能性を、固体支持体表面に示し、一般式(I)のオリゴ糖のアミノ基と更に反応することができる相互連結分子の官能基Xを固体支持体の表面に示す。本発明に係る実施形態において、固体支持体は、マイクロアレイスライドであり、マイクロアレイスライドは、修飾マイクロアレイスライドを提供するために、相互連結分子の官能基Yと反応する傾向がある官能性をマイクロアレイスライド表面に示し、相互連結分子の官能基Xをマイクロアレイスライド表面に示す。このようなマイクロアレイスライドの例は、コーニング(Corning)(登録商標)エポキシド被覆スライド、またはコーニング(Corning)(登録商標)GAPS(商標)II被覆スライドを含むが、これらに制限されない。
好ましい実施形態において、固体支持体は、一般式(I)のオリゴ糖のアミノ基、および好ましくは、N−ヒドロキシスクシンイミド(NHS)活性化エステルと反応する傾向がある官能性を固体支持体の表面上に示すマイクロアレイスライドである。このようなマイクロアレイスライドは、例えば、コードリンク(CodeLink)(登録商標)NHSスライドである。
[図面の説明]
クレブシエラ ニューモニエ血清型O3、O3b、およびO5 LPS O−多糖の繰り返しユニットの化学構造を示す。 本発明に係る相互連結分子の官能基Xの例を示す。 本発明に係る相互連結分子の官能基Xの例を示す。 本発明のCRM197複合体を示す。 21−CRM197の構造を示す。 69−CRM197の構造を示す。 免疫付与実験において使用され、10%ポリアクリルアミドゲルを用いて分析される糖複合体(2.5μg/ウェル)21−CRM197および69−CRM197のSDS−PAGEを示す。 KPC糖複合体21−CRM197および69−CRM197のSECクロマトグラムを示す。 21−CRM197および69−CRM197製剤を用いて免疫性を与えられたマウス(n=6)からの0日および35日のプール血清のELISA力価を示す。21−CRM197および69−CRM197製剤における血清は、対応するO−抗原BSA複合体21−BSAおよび69−BSAに対して試験された。両方の場合において、血清は、1%BSA−PBSを用いて1:100、1:1000および1:10,000に希釈された。希釈された血清(100μL)を、0.5μgの対応するBSA複合体を用いて被覆したマイクロタイタープレートのウェル毎に加えた。1:10000に希釈されたHRP結合ヤギ抗−マウス二次抗体を用いて検出を行い、TMB基質を用いて発色させた。吸光度を450nmで測定し、データをグラフパッドプリズム(GraphPad prism)ソフトウェアを用いてプロットした。 69−CRM197製剤を用いて免疫付与されたマウス(n=6)からの0日および35日のプール血清の交差反応性を示す。69−CRM197製剤における血清は、対応する株、すなわち、LPS(O5)から単離されたLPSに対して試験された。血清は、1%BSA−PBSを用いて1:200に希釈された。希釈された血清(100μL)を、1.0μgの対応するLPSを用いて被覆したマイクロタイタープレートのウェル毎に加えた。1:10000に希釈されたHRP結合ヤギ抗−マウス二次抗体を用いて検出を行い、TMB基質を用いて発色させた。吸光度を450nmで測定し、データをグラフパッドプリズム(GraphPad prism)ソフトウェアを用いてプロットした。 69−CRM197製剤を用いて免疫性を与えられたウサギ(n=4)からの0日、7日、21日、および35日のプール血清のELISA力価を示す。69−CRM197製剤における血清は、対応するO−抗原BSA複合体69−BSAに対して試験された。血清は、1%BSA−PBSを用いて1:1000、および1:10,000に希釈された。希釈された血清(100μL)を、0.5μgの対応する69−BSAを用いて被覆したマイクロタイタープレートのウェル毎に加えた。1:10000に希釈されたHRP結合ヤギ抗−ウサギ二次抗体を用いて検出を行い、TMB基質を用いて発色させた。吸光度を450nmで測定し、データをグラフパッドプリズム(GraphPad prism)ソフトウェアを用いてプロットした。 69−CRM197製剤を用いて免疫付与されたウサギ(n=4)からの0日および35日のプール血清の交差反応性を示す。69−CRM197製剤における血清は、異なるKPC株#1〜#4から単離されたLPSに対して試験された。両方の場合において、血清は、LPS(O1)、商業用LPS(O2a,c)、LPS(O2a)、LPS(O5)、およびLPS(Gal III)に対して試験された。血清は、1%BSA−PBSを用いて1:200に希釈され、および100μLの希釈された血清を、1.0μgの対応するLPSを用いて被覆したマイクロタイタープレートのウェル毎に加えた。1:10000に希釈されたHRP結合ヤギ抗−ウサギ二次抗体を用いて検出を行い、TMB基質を用いて発色させた。吸光度を450nmで測定し、データをグラフパッドプリズム(GraphPad prism)ソフトウェアを用いてプロットした。
[実施例]
[A.化学合成]
一般情報:
商業用等級溶媒を、特に明記しない限り使用した。乾燥溶媒を、水乾燥溶媒システム(Waters Dry Solvent System)から得た。クロマトグラフィーのための溶媒を、使用する前に蒸留した。敏感反応を、熱−乾燥ガラス製品中で、アルゴン雰囲気下で行った。分析的薄層クロマトグラフィー(TLC)を、0.25mm厚のシリカゲルでプレコートされたキエセルゲル(Kieselgel)60 F254ガラス
プレートで行った。スポットを、バニリン溶液(95%EtOH中に、6%(w/v)バニリンおよび10%(v/v)硫酸を有する)またはハネシアン(Hanessian’s)染色(水中に、5%(w/v)モリブデン酸アンモニウム、1%(w/v)硫酸セリウム(II)、および10%(v/v)硫酸を有する)を用いて染色することによって可視化した。シリカカラムクロマトグラフィーをフルカ(Fluka) キエセルゲル60(230〜400メッシュ)で行った。
H、13C、および二次元NMRスペクトルを、296Kでバリアン(Varian)400−MRスペクトロメーターを用いて測定した。化学シフト(d)は、各残留溶媒ピーク(CDClH NMRでd7.26、および13C NMRで77.16;CDOD:H NMRでd3.31、および13C NMRで49.15)に関連して100万分の1(ppm)で報告される。次の略語は、ピーク多重度を示すために使用される:s 一重項;d 二重項;dd 二重項の二重項(doublet of doublets);t 三重項;dt 三重項の二重項(doublet of triplets);q 四重項;m 多重項。カップリング定数(J)は、ヘルツ(Hz)で報告される。旋光度(OR)測定を、シュミット&ヘンシュ(Schmidt&Haensh) ウニポル(UniPol)L1000偏光計を用いてλ=589nmで、括弧に記述される溶媒中でg/100mLで表される濃度(c)で行った。高分解能質量分析(HRMS)は、ベルリン自由大学の質量分析中核施設で、アジレント(Agilent)6210 ESI−TOF質量分析計を用いて行われた。赤外線(IR)スペクトルは、出願人の施設でパーキンエルマー(Perkin Elmer)100 FTIR分光計を用いて測定された。
[略語]
AcOH 酢酸
Alloc アリルオキシカルボニル
aq.水溶液
BH ボラン
BBr 三臭化ホウ素
Boc tert−ブトキシカルボニル
br. ブロード
CAS CAS登録番号(CAS=ケミカル アブストラクツ サービス)
CHCl クロロホルム
cHex シクロヘキサン
d 二重項
dd 二重項の二重項
DCM ジクロロメタン
DEAD ジエチルアゾジカルボキシレート
DIPEA N,N−ジイソプロピル−エチルアミン
DME ジメトキシエタン
DMF ジメチルホルムアミド
DMSO ジメチルスルホキシド
DPPA ジフェニルホスホリルアジド
EDC・HCl N1−((エチルイミノ)メチレン)−N3,N3−ジメチルプロパン−1,3−ジアミンヒドロクロリド
ES 電気スプレー
EtO ジエチルエーテル
EtOAc 酢酸エチル
h 時間
HCl 塩酸
O 水
HOBt.HO 1H−ベンゾ[d][1,2,3]トリアゾール−1−オール水和物KCO 炭酸カリウム
m 多重項
MeCN アセトニトリル
MeOH メタノール
MeI ヨウ化メチル
MgSO 硫酸マグネシウム
min 分
MS 質量分析
NaCO 炭酸ナトリウム
NaCNBH シアノ水素化ホウ素ナトリウム
NaHCO 炭酸水素ナトリウム
NaH 水素化ナトリウム
NaOH 水酸化ナトリウム
NaSO 硫酸ナトリウム
NCS N−クロロスクシンイミド
NIS N−ヨードスクシンイミド
NMR 核磁気共鳴
PBS リン酸緩衝生理食塩水
Pd/C パラジウム/炭素
PPh トリフェニルホスフィン
q 四重項
rt 室温
s 一重項
sat. 飽和
sep 七重項
t 三重項
TFA トリフルオロ酢酸
THF テトラヒドロフラン
TsOH トシル酸
Wt 重量
実施例1:単糖構成要素の合成
化合物1
化合物1を、Carb.Res.,2010,345,10,1316−1323に記述される手順に従って調製した。
化合物2
化合物2を、Chemistry−A European Journal,2010,16(44),13163−13175に記述される手順に従って調製した。
化合物3
化合物3を、Org.Biomol.Chem.,2018,(16)13,2277−2288に記述される手順に従って調製した。
化合物4
化合物4を、J.Org.Chem.,2012,77(1),108−125に記述される手順に従って調製した。
化合物5
化合物4(2g,3.30mmol)を、無水DCM(33ml)に溶解した。臭化ベンジル(1.4g,8.24mmol)およびAgO(7.64g,33mmol)を加え、反応混合物を室温で一晩、激しく攪拌した。反応物はセライトに通してろ過し、減圧下で濃縮し、粗生成物を得た。粗生成物をアイソリュート(isolute)(登録商標)でチャージし、シリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)における自動精製システムを用いて精製し、生成物(1.43g,62%)を得た。HRMS(ESI)C4440SNa[M+Na]の計算値は719.2443、実測値は719.2390であった。
化合物6
化合物6を化合物9から出発してJ.Am.Chem.Soc.,2017,139(2),1011−1018に記述される手順に従って調製した:化合物9(400mg,1.068mmol)を、無水ピリジン(5ml)に溶解した。FmocCl(431mg,1.666mmol)およびDMAP(19.58mg,0.160mmol)を加え、反応混合物を室温で一晩、攪拌した。反応物を、酢酸エチルを用いて希釈し、および飽和NaHCO、およびブライン用いて洗浄した。有機層を、NaSOを用いて乾燥させ、溶媒を蒸発させ、粗生成物を得た。粗生成物をアイソリュート(登録商標)でチャージし、シリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)を用いた自動精製システムを用いて精製し、生成物(360mg,56%)を得た。HRMS(ESI)C3532SNa[M+Na]の計算値は597.1947、実測値は597.1857であった。
化合物7
化合物6(1.7g,2.274mmol)を、BH・THF(27ml,27mmol)に溶解し、TMSOTf(0.41mL,2.274mmol)を加えた。溶液を室温で1.5時間攪拌した。反応物を、メタノールを用いて(氷/水浴を用いて冷却しながら)クエンチし、減圧下で濃縮し、粗生成物を得た。粗生成物をアイソリュート(登録商標)でチャージし、および酢酸エチル/シクロヘキサンを用いた自動精製システムを用いて精製し、生成物(930mg,61%)を得た。HRMS(ESI)C4138SNa[M+Na]の計算値は697.2236、実測値は697.2188であった。
化合物8
化合物7(930mg,1.37mmol)を、無水DCM(14ml)に溶解した。臭化ベンジル(589mg,3.45mmol)およびAgO(3.19g,13.78mmol)を加え、反応混合物を、室温で一晩、激しく攪拌した。反応物を、セライト(登録商標)を通してろ過し、減圧下で濃縮し、粗生成物を得た。粗生成物をアイソリュート(登録商標)でチャージし、およびシリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)を用いた自動精製システムを用いて精製し、生成物8(680mg,65%)を得た。HRMS(ESI)C4844SNa[M+Na]の計算値は787.2705、実測値は787.2653であった。
化合物9
化合物9を、Chem.Eur.J.2014,20,3578−3583に記述される手順に従って調製した。
実施例2:K.ニューモニエ血清型O3オリゴ糖の合成
化合物10
無水DCM(2.9mL)中に化合物5(550mg,0.789mmol)および5−アジドペンタノール(306mg,2.368mmol)を有する溶液に、4Åモレキュラーシーブを加え、混合物を室温で30分間攪拌した。その後、NIS(213mg,0.947mmol)を加え、反応混合物を−20℃に冷却した。TMSOTf(14μL,0.079mmol)を加え、反応混合物を1.5時間0℃で攪拌した。反応混合物を、ろ過し、DCMを用いて洗浄し、ろ液を、飽和Na溶液(15mL)を用いて洗浄し、CHCl(2×25mL)を用いて抽出した。合わせた有機層を飽和NaHCO溶液(15mL)およびブライン(10mL)を用いて洗浄した。無水NaSOで乾燥させ、ろ過し、減圧下で濃縮した。シリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)を用いた自動精製システムによる精製は、溶媒の蒸発後、無色の粘性の高いゲルとして生成物10(51mg,49%)を与えた。HRMS(ESI)C4345Na[M+Na]の計算値は738.3155、実測値は738.3147であった。
化合物11
DCM:PBS(2:1,16.81mL)中に化合物10(361mg,0.504mmol)を有する溶液に、2,3−ジクロロ−5,6−ジシアノ−1,4−ベンゾキノン(229mg,1.01mmol)を0℃で加えた。反応混合物を室温で2.5時間攪拌した。反応をTLC(シクロヘキサン中にEtOAc,2:1)によって観察した。反応を、飽和NaHCO(50ml)を用いてクエンチし、DCM(2×50mL)を用いて抽出した。合わせた有機層を、ブライン(50mL)を用いて洗浄し、NaSO
で乾燥させ、ろ過し、およびろ液を減圧下で濃縮し、粗生成物を得た。粗生成物を、シリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)を用いる自動フラッシュクロマトグラフィーによって精製し、無色のオイル状の化合物11(210mg,72%)を得た。HRMS(ESI)C3237Na[M+Na]の計算値は599.2563、実測値は599.2555であった。
化合物12
無水DCM(8.4mL)中に化合物5(276mg,0.396mmol)および化合物11(190mg,0.330mmol)を有する溶液に、4ÅのMSを加え、混合物を、室温で30分間攪拌した。その後、NIS(89mg,0.396mmol)を加え、反応混合物を−20℃に冷却した。TMSOTf(6μL,0.03mmol)を加え、反応混合物を1時間0℃で攪拌した。反応混合物をろ過し、ろ液を、飽和Na溶液(15mL)を用いて洗浄し、CHCl(2×50mL)を用いて抽出した。合わせた有機層を、飽和NaHCO溶液(15mL)およびブライン(10mL)を用いて洗浄した。無水NaSOで乾燥後、層を減圧下で濃縮した。シリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)を用いた自動精製システムによる精製は、溶媒の蒸発後、濁った粘度が高いゲルとして生成物12(300mg,78%)を与えた。
HRMS(ESI)C707113Na[M+Na]の計算値は1184.4885、実測値は1184.4902であった。
化合物13
DCM:PBS(2:1,8.3mL)中に化合物12(290mg,0.294mmol)を有する溶液に、2,3−ジクロロ−5,6−ジシアノ−1,4−ベンゾキノン(113mg,0.499mmol)を0℃で加えた。反応混合物を室温で2.5時間攪拌し、TLC(シクロヘキサン中にEtOAc,2:1)によって観察した。反応を、飽和NaHCO(40ml)を用いてクエンチし、DCM(2×40mL)を用いて抽出した。合わせた有機層を、ブライン(20mL)を用いて洗浄し、NaSOで乾燥させ、減圧下で濃縮し、粗生成物を得た。粗生成物を、シリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)を用いた自動フラッシュクロマトグラフィーによって精製し、無色のオイルとして化合物13(136mg,53%)を得た。
HRMS(ESI)C596313Na[M+Na]の計算値は1044.4259、実測値は1044.4252であった。
化合物14
無水DCM(3.8mL)中に化合物8(135mg,0.176mmol)および化合物13(150mg,0.147mmol)を有する溶液に、4ÅのMSを加え、混合物を、室温で30分間攪拌した。その後、NIS(40mg,0.176mmol)を加え、反応混合物を−20℃に冷却した。TMSTOf(2.6μL,0.015mmol)を加え、反応混合物を1.5時間0℃で攪拌した。反応混合物をろ過し、飽和Na溶液(15mL)を用いて洗浄し、CHCl(2×50mL)を用いて抽出した。合わせた有機層を、飽和NaHCO溶液(15mL)およびブライン(10mL)を用いて洗浄した。無水NaSOで乾燥後、粗生成物を、シリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)を用いた自動精製システムによって精製し、溶媒の蒸発後、濁った粘度が高いゲルとして生成物14(184mg,75%)を得た。
HRMS(ESI)C10110120Na[M+Na]の計算値は1699.6910、実測値は1699.6886であった。
化合物15
DCM(2mL)中に化合物14(180mg,0.107mmol)を有する溶液に、トリエチルアミン(208μL,1.491mmol)を室温で加え、1時間攪拌した。揮発性物質を減圧下で除去した。シリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)を用いた自動精製システムによる精製は、溶媒の蒸発後、濁った粘度が高いゲルとして生成物15(138mg,88%)を与えた。
HRMS(ESI)C859118Na[M+Na]の計算値は1476.6195、実測値は1476.6198であった。
化合物16
MeOH(0.5M)中にナトリウムメドキシドを有する溶液(0.075mL,0.330mmol)を、MeOH:THF(2:1,1.5mL)の混合液中に化合物15(24mg,0.016mmol)を有する溶液に加えた。反応物を同じ温度で20時間攪拌した。反応物を、HO(2mL)の添加によってクエンチし、ブライン(5mL)を用いて希釈した。反応混合物を、EtOAc(2×10mL)を用いて抽出した。合わせた有機層を、無水NaSOで乾燥させ、および減圧下で濃縮した。シリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)を用いた自動精製システムによる精製は、溶媒の蒸発後、無色の粘度が高いゲルとして生成物(18mg,88%)を与えた。
HRMS(ESI)C999022Na[M+Na]の計算値は1268.5671、実測値は1268.5813であった。
化合物17
化合物16(8.6mg,6.90μmol)を、DCM(1mL)、tert−ブタノール(1mL)、および2滴の水の溶媒混合物中に入れた。Pd/Cを加え、24時間、Hの7バール圧力、室温で水素化した。反応混合物をPTFEフィルターに通してろ過し、残渣をメタノール(6mL)、(50%メタノール−水(6mL))を用いて洗浄した。ろ液を真空下で蒸発させ、粗生成物を得た。粗生成物は1H NMRによると純粋であり、試料を回収し、凍結乾燥させ、白色の結晶性固体として化合物17*(3.8mg,93%)を得た。
HRMS(ESI)C2343NO16[M+H]の計算値は590.2694、実測値は590.2683であった。
H NMR(400MHz,DO)δ5.15(d,J=1.7Hz,1H),5.11(d,J=1.8Hz,1H),4.85(d,J=1.8Hz,1H),4.24(dd,J=3.3,1.8Hz,1H),4.06−4.12(m,2H),4.03(dd,J=9.1,3.3Hz,1H),3.86−3.97(m,5H),3.71−3.86(m,8H),3.61−3.71(m,2H),3.51−3.61(m,1H),3.01(t,J=7.6Hz,2H),1.61−1.78(m,4H),1.39−1.54(m,2H)。
化合物18
無水DCM(1.94mL)中に化合物8(43mg,0.056mmol)および化合物15(65mg,0.045mmol)を有する溶液に、4ÅのMSを加え、混合物を、室温で30分間攪拌した。その後、NIS(12mg,0.054mmol)を加え、反応混合物を−20℃に冷却した。TMSTOf(0.8μL,4.47μmol)を加え、反応混合物を35分間、0℃で攪拌した。出発材料がなくなるまでTLCによって反応を観察した。トリエチルアミン(250μl)を加え、混合物を、1時間にわたって徐々に室温に温めた。反応混合物をろ過し、および飽和Na溶液(15mL)を用いて洗浄し、CHCl(2×50mL)を用いて抽出した。合わせた有機層を、飽和NaHCO溶液(15mL)およびブライン(10mL)を用いて洗浄し、続いて無水NaSOで乾燥させ、減圧下で濃縮した。シリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)を用いた自動精製システムによる精製は、溶媒の蒸発後、濁った粘度が高いゲルとして生成物(46mg,54%)を与えた。
HRMS(ESI)C11311923[M+H]の計算値は1909.8166、実測値は1909.8160であった。
化合物19
無水トルエン(0.9mL)および無水ジオキサン(0.3mL)の混合物中に化合物3(16.8mg,0.026mmol)および化合物18(28mg,0.015mmol)を有する溶液に、4ÅのMSを加え、混合物を、室温で1時間攪拌した。その後、NIS(4mg,0.018mmol)を加え、反応混合物を−20℃に冷却した。TMSTOf(0.27μL,1.484μmol)を加え、反応混合物を2時間攪拌し、室温に温めさせた。反応混合物をろ過し、および飽和Na溶液(15mL)を用いて洗浄し、CHCl(2×25mL)を用いて抽出した。合わせた有機層を、飽和NaHCO溶液(15mL)およびブライン(10mL)を用いて洗浄し、続いて無水NaSOで乾燥させ、減圧下で濃縮した。シリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)を用いた自動精製システムによる精製は、溶媒の蒸発後、濁った粘度が高いゲルとして生成物(32mg,89%)を与えた。
HRMS(ESI)C14715129Na[M+Na]の計算値は2445.0331、実測値は2445.9951であった。
化合物20
MeOH中にナトリウムメトキシドを有する溶液(25%w/w)(0.051mL,0.223mmol)を、MeOH:THF(2:1,1.5mL)の混合物中に五糖19(27mg,0.011mmol)を有する溶液に加えた。反応物を同じ温度で16時間攪拌した。反応物をHO(3mL)の添加によってクエンチし、ブライン(5mL)を用いて希釈した。反応混合物はEtOAc(2×10mL)を用いて抽出した。合わせた有機層を、無水NaSOで乾燥させ、減圧下で濃縮した。シリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)を用いた自動精製システムによる精製は、溶媒の蒸発後、無色粘度が高いゲルとして生成物(17mg,72%)を与えた。
HRMS(ESI)C12613926Na[M+Na]の計算値は2133.9578、実測値は2133.9517であった。
化合物21
化合物20(17mg,8.05μmol)を、DCM(1mL)、tert−ブタノール(1mL)、および2滴の水の溶媒混合物中に入れた。Pd/Cを加え、24時間、Hバルーン下、室温で水素化した。反応混合物をPTFEフィルターに通してろ過し、残渣をメタノール(6mL)、(50%メタノール−水(6mL))を用いて洗浄した。ろ液を真空下で蒸発させ、粗生成物を得た。1H NMR分析は、反応の完結および生成物の存在を示した。したがって、粗生成物を、水(3mL×2,fr1)、20%アセトニトリル−水(3mL×2,fr2)、およびアセトニトリル(3mL,fr3)を用いて、C18セッパック(Sepak)カラムに通して精製した。全ての分画を凍結し、
24時間凍結乾燥させ、化合物21(白色固体,6.4mg,87%)の一つの純粋な分画fr1、および2つの純粋でない分画である白色のフワフワとした固体(fr2,0.4mg)、白色のフワフワとした固体(fr3,0.6mg)を得た。
HRMS(ESI)C3563NO26[M+H]の計算値は914:3717、実測値は914:3725であった。
H NMR(400MHz,DO)δ5.35(d,J=1.7Hz,1H),5.28(d,J=1.8Hz,1H),5.08(d,J=1.8Hz,1H),5.02(d,J=1.8Hz,1H),4.82(d,J=1.8Hz,1H),4.20(dd,J=3.3,1.8Hz,1H),4.02−4.11(m,4H),3.92−4.01(m,3H),3.80−3.92(m,8H),3.50−3.80(m,18H),2.93−3.04(m,2H),1.58−1.76(m,4H),1.37−1.58(m,2H)。
化合物22
化合物22を、化合物5およびアジドエタノールから出発して化合物21と同様に調製した。
化合物23
化合物23を、化合物5およびアジドデカノールから出発して化合物21と同様に調製した。
化合物24
化合物24を、化合物5および2−(2−アジドエトキシ)エタノールから出発して化合物21と同様に調製した。
化合物25
化合物25を、化合物5および3−アジド−2,2−ジフルオロプロパノールから出発して化合物21と同様に調製した。
化合物26
化合物26を、化合物5および対応するアジドアルコールから出発して化合物21と同様に調製した。
化合物27
化合物27を、化合物5および対応するアジドアルコールから出発して化合物21と同様に調製した。
化合物28
化合物28を、化合物5および対応するS−ベンジルチオアルコールから出発して化合物21と同様に調製した。
化合物29
化合物29を、化合物5および5−ヘキサノールから出発して化合物21と同様に調製した。
化合物30
化合物30を、化合物5および11−アジド−3,6,9−トリオキサウンデカノールから出発して化合物21と同様に調製した。
化合物31
化合物31を、化合物5およびアジド−PEG7−アルコールから出発して化合物21と同様に調製した。
化合物32
化合物32を、化合物5および5−ベンジルオキシペンタノールから出発して化合物21と同様に調製した。
化合物33
化合物33を、化合物5および12−ベンジルオキシデカノールから出発して化合物21と同様に調製した。
化合物34
化合物34を、化合物5およびメチル6−ヒドロキシデカン酸から出発して化合物21と同様に調製した。
化合物34a
化合物34aを、化合物5およびメチル6−ヒドロキシデカン酸から出発して化合物21と同様に調製した。
化合物35
化合物35を、化合物5および1,2−ジベンジルグリセロール、または化合物5およびアセトニド保護グリセロールから出発して化合物21と同様に調製した。
化合物36
化合物36を、化合物5および2−(クロロエトキシ)エタノールから出発して化合物21と同様に調製した。
化合物37
化合物37を、化合物5および4−ペンテン−1−オールからから出発して化合物21と同様に調製した。
実施例3:K.ニューモニエ血清型O5三糖類の合成
化合物38
無水トルエン(11.4mL)と無水ジオキサン(3.76mL)との混合物中に化合物3(490mg,0.758mmol)および5−アジドプロパノール(294mg,2.273mmol)を有する溶液に、4ÅのMSを加え、混合物を室温で30分間攪拌した。その後、NIS(205mg,0.909mmol)を加え、反応混合物を0℃に冷却した。TfOH(11.4mg,0.076mmol)を加え、反応混合物を2時間0℃で攪拌した。反応混合物をろ過し、飽和Na溶液(25mL)を用いて洗浄し、CHCl(2×40mL)を用いて抽出した。合わせた有機層を飽和NaHCO溶液(25mL)およびブライン(10mL)を用いて洗浄し、無水NaSOで乾燥させ、減圧下で濃縮した。シリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)を用いた自動精製システムによる精製は、溶媒の蒸発後、無色の粘性の高いゲルとして生成物38(420mg,83%)を与えた。
HRMS(ESI)C3943Na[M+Na]の計算値は688.2999、実測値は688.3009であった。
化合物39
MeOH中にナトリウムメトキシドを有する溶液(25%w/w)(0.41mL,1.802mmol)を、MeOH:THF(2:1,12mL)の混合液中に単糖38
(400mg,0.601mmol)有する溶液に加えた。反応を、20時間同じ温度で攪拌した。反応を、HO(15mL)の添加によってクエンチし、ブライン(20mL)を用いて希釈した。反応混合物を、EtOAc(2×60mL)を用いて抽出した。合わせた有機層を、無水NaSOで乾燥させ、減圧下で濃縮した。シリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)を用いた自動精製システムによる精製は、溶媒の蒸発後、無色粘性の高いゲルとして生成物(300mg,89%)を与えた。
HRMS(ESI)C3239Na[M+Na]の計算値は584.2737、実測値は584.2738であった。
化合物40
無水トルエン(10mL)と無水ジオキサン(3.3mL)との混合物中に化合物3(355mg,0.548mmol)および化合物39(280mg,0.499mmol)を有する溶液に、4ÅのMSを加え、混合物を室温で30分間攪拌した。その後、NIS(135mg,0.598mmol)を加え、反応混合物を0℃に冷却した。TfOH(7.5mg,0.05mmol)を加え、反応混合物を1時間、0℃で攪拌した。反応混合物をろ過し、飽和Na溶液(15mL)を用いて洗浄し、およびCHCl(2×25mL)を用いて抽出した。合わせた有機層を飽和NaHCO溶液(15mL)およびブライン(10mL)を用いて洗浄し、続いて無水NaSOで乾燥させ、減圧下で濃縮した。シリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)を用いた自動精製システムによる精製は、溶媒の蒸発後、濁った粘度の高いゲルとして生成物(350mg,64%)、および出発化合物39(62mg,22%)を与えた。
HRMS(ESI)C6671Na[M+Na]の計算値は1120.4935、実測値は1120.4922であった。
化合物41
MeOH中にナトリウムメトキシドを有する溶液(25%w/w)(0.8mL,3.19mmol)を、MeOH:THF(2:1,7.5mL)の混合物中に化合物40(350mg,0.319mmol)を有する溶液に加えた。反応を、20時間同じ温度で攪拌した。反応を、HO(15mL)の添加によってクエンチし、ブライン(20mL)を用いて希釈した。反応混合物を、EtOAc(2×60mL)を用いて抽出した。合わせた有機層を、無水NaSOで乾燥させ、減圧下で濃縮した。シリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)を用いた自動精製システムによる精製は、溶媒の蒸発後、無色粘性の高いゲルとして生成物(278mg,88%)を与えた。
HRMS(ESI)C596711Na[M+Na]の計算値は1016
.4673、実測値は1016.4686であった。
化合物42
無水DCM(11mL)中に化合物2(180mg,0.304mmol)を有する溶液に、4ÅのMSを加え、混合物を、室温で30分間攪拌させた。その後、1−(フェニルスルフィニル)ピペリジン(69.7mg,0.333mmol)および2,4,6−トリ−tert−ブチルピリミジン(150mg,0.606mmol)を加え、反応混合物を−65℃に冷却し、30分間攪拌した。無水トリフリック(Triflic)(61μL,0.362mmol)を加え、反応混合物を20分間−65℃で攪拌した。反応混合物を、その後−78℃に冷却し、DCM(5mL)中に化合物41(275mg,0.277mmol)を有する溶液を滴下し、6時間、−78℃で攪拌し、その後1時間にわたって0℃に温めた。反応混合物を、ろ過し、飽和NaHCO溶液(25mL)を用いて洗浄し、CHCl(2×35mL)を用いて抽出した。合わせた有機層を、ブライン(10mL)を用いて洗浄し、無水NaSOで乾燥させた。シリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)を用いた自動精製システムによる精製は、溶媒の蒸発後、濁った粘度が高いゲルとして生成物(220mg,54%)を与えた。
HRMS(ESI)C999516Na[M+Na]の計算値は1496.6610、実測値は1496.6623であった。
化合物43
化合物42(8mg,5.99μmol)を、DCM(1mL)、tBuOH(1mL)、および2滴の水の溶媒混合物中に入れた。Pd/Cを加え、Hバルーン下、室温で水素化した。反応混合物をPTFEフィルターに通してろ過し、残渣をメタノール(6mL)、(50%メタノール−水(6mL))を用いて洗浄した。ろ液を真空下で蒸発させ、粗生成物を得た。粗生成物は1H NMRによると純粋であり、試料を回収し、凍結乾燥させ、白色結晶性固体(3.53mg,定量的)を得た。
HRMS(ESI)C2343NO16[M+H]の計算値は590.2660、実測値は590.2814であった。
H NMR(400MHz,DO)δ5.12(d,J=1.8Hz,1H),5.07(d,J=1.7Hz,1H),4.77(s,1H),4.28(dd,J=3.
4,1.8Hz,1H),4.02(d,J=3.2Hz,1H),3.81−4.00(m,6H),3.48−3.81(m,11H),3.36(ddd,J=9.4,6.7,2.3Hz,1H),2.98(t,J=7.6Hz,2H),1.58−1.74(m,4H),1.36−1.51(m,2H)。
化合物44
化合物44を、化合物3およびアジドエタノールから出発して化合物43と同様に調製した。
化合物45
化合物45を、化合物5およびアジドデカノールから出発して化合物43と同様に調製した。
化合物46
化合物46を、化合物5および2−(2−アジドエトキシ)エタノールから出発して化合物43と同様に調製した。
化合物47
化合物47を、化合物5および3−アジド−2,2−ジフルオロプロパノールから出発して化合物43と同様に調製した。
化合物48
化合物48を、化合物5および対応するアジドアルコールから出発して化合物43と同様に調製した。
化合物49
化合物49を、化合物5および対応するアジドアルコールから出発して化合物43と同様に調製した。
化合物50
化合物50を、化合物5および対応するS−ベンジルチオアルコールから出発して化合物43と同様に調製した。
化合物51
化合物51を、化合物5および5−ヘキサノールから出発して化合物43と同様に調製した。
化合物52
化合物52を、化合物5および11−アジド−3,6,9−トリオキサウンデカノールから出発して化合物43と同様に調製した。
化合物53
化合物53を、化合物5およびアジド−PEG7−アルコールから出発して化合物43と同様に調製した。
化合物54
化合物54を、化合物5およ5−ベンジルオキシペンタノールから出発して化合物43と同様に調製した。
化合物55
化合物55を、化合物5および12−ベンジルオキシデカノールから出発して化合物43と同様に調製した。
化合物56
化合物56を、化合物5およびメチル6−ヒドロキシデカン酸から出発して化合物43と同様に調製した。
化合物56a
化合物56aを、化合物5およびメチル6−ヒドロキシデカン酸から出発して化合物43と同様に調製した。
化合物57
化合物57を、化合物5および1,2−ジベンジルグリセロールから出発して化合物43と同様に調製した。
化合物58
化合物58を、化合物5および2−(クロロエトキシ)エタノールから出発して化合物43と同様に調製した。
化合物59
化合物59を、化合物5および4−ペンテン−1−オールから出発して化合物43と同様に調製した。
実施例4:K.ニューモニエ血清型O5六糖類の合成
化合物60
DCM:PBS(2:1,7.4mL)中に化合物42(220mg,0.149mmol)を有する溶液に、2,3−ジクロロ−5,6−ジシアノ−1,4−ベンゾキノン(67.7mg,0.298mmol)を0℃で加えた。反応混合物を室温で4時間攪拌し、TLC(シクロヘキサン中にEtOAc,2:1)によって観察した。飽和NaHCO(50ml)を用いてクエンチし、DCM(2×50mL)を用いて反応を抽出した。合わせた有機層を、ブライン(25mL)を用いて洗浄し、NaSOで乾燥させ、粗生成物を得た。粗生成物を、シリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)を用いた自動フラッシュクロマトグラフィーによって精製し、無色のオイルとして化合物60(125mg,63%)を得た。
HRMS(ESI)C798716Na[M+Na]の計算値は1356
.5984、実測値は1356.5983であった。
化合物61
DCM(3mL)中に化合物8(160mg,0.209mmol)有する溶液に、トリエチルアミン(0.2mL,1.435mmol)を0℃で加えた。反応混合物を、室温で1時間攪拌した。反応混合物を、減圧下で濃縮し、粗生成物を得た。粗生成物を、シリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)を用いた自動フラッシュクロマトグラフィーによって精製し、無色のオイル(96mg,85%)を得た。
HRMS(ESI)C3334SNa[M+Na]の計算値は566.2025、実測値は566.2065であった。
化合物62
DCM(10mL)とHO(1mL)との混合液中に化合物61(1.05g,1.623mmol)を有する溶液に、N−ヨードスクシンイミド(365mg,1.623mmol)およびトリフルオロ酢酸(124μL,1.623mmol)を0℃で加え、2時間攪拌した。反応混合物を、飽和NaHCO(50mL)水溶液およびDCM(50mL)の間で分離した。有機層を、飽和Na溶液(50mL)を用いて洗浄し、NaSOで乾燥させた。粗生成物をEtOAcおよびシクロヘキサンを溶媒として用いてカラムクロマトグラフィーによって精製し、無色のオイルとして所望の生成物(730mg,81%)を得た。
HRMS(ESI)C3434Na[M+Na]の計算値は577.2202、実測値は577.2208であった。
化合物63
CsCO(141mg,0.433mmol)および2,2,2−トリフルオロ−N−フェニル−アセトイミドイルクロリド(135mg,0.649mmol)を、DCM(2.2mL)中にラクトール62(120mg,0.216mmol)を有する溶液に加えた。反応混合物を室温で攪拌し、TLCによって観察した。2時間後、出発材料は消費され、反応物をセライト(登録商標)に通してろ過し、DCM(10mL)を用いて洗浄した。溶媒を蒸発させ、粗生成物(157mg,定量的)を、更なる精製なしで次
のステップにおいて使用した。
化合物64
無水トルエン(4.6mL)およびジオキサン(1.5mL)の混合液中に化合物63(157mg,0.216mmol)および化合物61(117mg,0.216mmol)を有する溶液に、4ÅのMSを加え、混合物を、室温で30分間攪拌した。TMSOTf(3.92μL,0.022mmol)を加え、反応混合物を−10℃で1時間攪拌した。飽和NaHCO溶液(25mL)を用いて反応をクエンチし、DCM(2×20mL)を用いて抽出した。有機層を、NaSOで乾燥させ、粗生成物を得るために蒸発させた。残渣をEtOAcおよびシクロヘキサンを溶媒として用いてカラムクロマトグラフィーによって精製し、無色のオイルとして所望の生成物(193mg,83%)を得た。
HRMS(ESI)C676611SNa[M+Na]の計算値は1101.4224、実測値は1101.4073であった。
化合物65
無水トルエン(4.5mL)および無水ジオキサン(1.5mL)の混合液中に化合物64(116mg,0.108mmol)および化合物60(120mg,0.090mmol)を有する溶液に、4ÅのMSを加え、混合物を、室温で30分間攪拌した。その後、NIS(26.3mg,0.117mmol)を加え、反応混合物を0℃に冷却した。TfOH(1.35mg,8.99μmol)を加え、反応混合物を3時間攪拌し、室温に徐々に温めた。反応混合物をろ過し、飽和Na溶液(15mL)を用いて洗浄し、CHCl(2×25mL)を用いて抽出した。合わせた有機層を、飽和NaHCO溶液(15mL)およびブライン(10mL)を用いて洗浄した。無水NaSOで乾燥させた。シリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)を用いた自動精製システムによる精製は、溶媒の蒸発後、濁った粘度が高いゲルとして生成物(110mg,53%)を与えた。
HRMS(ESI)C14014727Na[M+Na]の計算値は23
26.0153、実測値は2326.0177であった。
化合物66
MeOH中にナトリウムメトキシドを有する溶液(25%w/w)(0.051mL,0.239mmol)を、MeOH:THF(2:1,3mL)の混合液中に五糖類65(110mg,0.048mmol)有する溶液に加えた。反応を、16時間同じ温度で攪拌した。HO(5mL)の添加によって反応をクエンチし、ブライン(10mL)を用いて希釈した。反応混合物を、EtOAc(2×20mL)を用いて抽出した。合わせた有機層を、無水NaSOで乾燥させ、ろ過し、減圧下で濃縮した。シリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)を用いた自動精製システムによる精製は、溶媒の蒸発後、無色で粘性の高いゲルとして生成物66(95mg,90%)を与えた。
HRMS(ESI)C14014727Na[M+Na]の計算値は2221.9891、実測値は2221.9960であった。
化合物67
無水DCM(2mL)中に化合物2(23.16mg,0.039mmol)を有する溶液に、4ÅのMSを加え、混合物を、室温で10分間攪拌した。その後、1−(フェニルスルフィニル)ピペリジン(8.59mg,0.041mmol)および2,4,6−トリ−tert−ブチルピリミジン(18.55mg,0.075mmol)を加えた。反応混合物を−65℃に冷却し、30分間攪拌した。無水トリフリック(Triflic)(7.55μL,0.045mmol)を加え、反応混合物を−65℃で15分間攪
拌した。反応混合物を、その後、−78℃に冷却し、DCM(1.5mL)中に化合物66(75mg,0.034mmol)を有する溶液を滴下し、−78℃で6時間攪拌し、その後、1時間以内で−25℃に温めた。反応混合物をろ過し、飽和NaHCO溶液(15mL)を用いて洗浄し、CHCl(2×25mL)を用いて抽出した。合わせた有機層を、ブライン(10mL)を用いて洗浄し、無水NaSOで乾燥させた。シリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)を用いた自動精製システムによる精製は、溶媒の蒸発後、濁った粘度が高いゲルとして(α/β混合物として)生成物(35mg,38%)を与えた。
HRMS(ESI)C16417131Na[M+Na]の計算値は2702.1828、実測値は2702.1783であった。
化合物68
DCM(2.5mL)中に化合物67(35mg,0.013mmol)を有する溶液に、エタンチオール(9.66μL,0.131mmol)およびp−トルエンスルホン酸一水和物(1.24mg,6.53μmol)を室温で加え、混合物を1.5時間攪拌した。反応混合物を、トリエチルアミン(1mL)を用いてクエンチし、減圧下で濃縮し、残渣を、EtOAcおよびシクロヘキサンを溶媒として用いたカラムクロマトグラフィーによって精製し、無色のオイルの純粋な所望のβ−異性体(16mg,49%)として所望の生成物を得た。
HRMS(ESI)C15016331Na[M+Na]の計算値は2526.1202、実測値は2526.1152であった。
化合物69
化合物68(15mg,5.99μmol)を、DCM(1mL)、tBuOH(1mL)、および2滴の水の溶媒混合物中に入れた。Pd/Cを加え、24時間、Hバルーン下、室温で水素化した。反応混合物をPTFEフィルターに通してろ過し、残渣をメタノール(6mL)、(50%メタノール−水(6mL))を用いて洗浄した。ろ液を真空下で蒸発させ、粗生成物を得た。H NMR分析は、反応の完結および生成物の存在を示した。したがって、粗生成物を、水(3mL×2,fr1)、20%アセトニトリル−水(3mL×2,fr2)、およびアセトニトリル(3mL,fr3)を用いて、C18セッパック(Sepak)カラムに通して精製した。全ての分画を凍結し、24時間凍結乾燥させ、化合物69(白色固体,5.64mg,87%)の一つの純粋な分画fr1、および2つの純粋でない分画である白色のフワフワとした固体(fr2,0.2mg)、白色のフワフワとした固体(fr3,0.2mg)を得た。
HRMS(ESI)C4173NO31[M+H]の計算値は1076.4244、実測値は1076.4245であった。
H NMR(400MHz,重水)δ5.33(d,J=1.8Hz,1H),5.14(d,J=1.8Hz,1H),5.10(d,J=1.7Hz,1H),5.06(d,J=1.7Hz,1H),4.65−4.68(m,2H),4.27(dt,J=3.2,1.4Hz,2H),4.14−4.20(m,1H),4.09(dd,J=3.4,1.7Hz,1H),3.82−4.04(m,12H),3.47−3.82(m,23H),3.32−3.43(m,2H),2.94−3.02(m,2H),1.59−1.73(m,4H),1.35−1.53(m,2H)。
実施例5:K.ニューモニエ血清型O5九糖類の合成
化合物70
無水トルエン(7.3mL)およびジオキサン(2.5mL)の混合液中に化合物63(720mg,0.978mmol)および4−メトキシフェノール(121mg,0.978mmol)を有する溶液に、4ÅのMSを加え、混合物を、室温で30分間攪拌した。TMSOTf(18μL,0.098mmol)を加え、反応混合物を−10℃で1時間攪拌した。反応物を、飽和NaHCO溶液(35mL)を用いてクエンチし、D
CM(2×50mL)を用いて抽出した。有機層を、NaSOで乾燥させ、粗生成物を得るために蒸発させた。残渣をEtOAcおよびシクロヘキサンを溶媒として用いたカラムクロマトグラフィーによって精製し、無色のオイルとして所望の生成物(540mg,84%)を得た。
HRMS(ESI)C4140Na[M+Na]の計算値は683.2621、実測値は683.2643であった。
化合物71
MeOH中にナトリウムメトキシドを有する溶液(25%w/w)(0.52mL,2.406mmol)を、MeOH:THF(4:1,7.5mL)の混合液中にベンゾエート70(530mg,0.802mmol)を有する溶液に加えた。反応を、16時間同じ温度で攪拌した。HO(3mL)の添加によって反応をクエンチし、ブライン(10mL)を用いて希釈した。反応混合物を、EtOAc(2×50mL)を用いて抽出した。合わせた有機層を、無水NaSOで乾燥させ、減圧下で濃縮した。シリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)を用いた自動精製システムによる精製は、溶媒の蒸発後、無色の粘性の高いゲルとして生成物(430mg,96%)を与えた。
HRMS(ESI)C3436Na[M+Na]の計算値は579.2359、実測値は579.2395であった。
化合物72
無水トルエン(2.3mL)および無水ジオキサン(0.8mL)の混合液中に化合物3(100mg,0.155mmol)および化合物71(86mg,0.155mmol)を有する溶液に、4ÅのMSを加え、混合物を、室温で30分間攪拌した。その後、NIS(41.7mg,0.186mmol)を加え、反応混合物を、−10℃に冷却した。TfOH(2.32mg,0.015mmol)を加え、反応混合物を1時間攪拌し、徐々に室温に温めた。反応混合物をろ過し、飽和Na溶液(25mL)を用いて洗浄し、CHCl(2×30mL)を用いて抽出した。合わせた有機層を、飽和NaHCO溶液(15mL)およびブライン(10mL)を用いて洗浄し、無水NaSOで乾燥させ、減圧下で濃縮した。シリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)を用いた自動精製システムによる精製は、溶媒の蒸発後、濁った粘度の高いゲルとして生成物(132mg,78%)を与えた。
HRMS(ESI)C666813Na[M+Na]の計算値は1115.4558、実測値は1115.4595であった。
化合物73
MeOH中にナトリウムメトキシドを有する溶液(25%w/w)(0.074mL,0.343mmol)を、MeOH:THF(4:1,2.3mL)の混合液中にベンゾエート72(125mg,0.114mmol)を有する溶液に加えた。反応を、16時間同じ温度で攪拌した。HO(3mL)の添加によって反応をクエンチし、ブライン(25mL)を用いて希釈した。反応混合物を、EtOAc(2×25mL)を用いて抽出した。合わせた有機層を、無水NaSOで乾燥させ、減圧下で濃縮した。シリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)を用いた自動精製システムによる精製は、溶媒の蒸発後、無色の粘度の高いゲルとして生成物(108mg,95%)を与えた。
HRMS(ESI)C616412Na[M+Na]の計算値は1011.4295、実測値は1011.4326であった。
化合物74
無水DCM(6mL)中に化合物2(197mg,0.334mmol)を有する溶液に、4ÅのMSを加え、混合物を、室温で30分間攪拌した。その後、1−(フェニルスルフィニル)ピペリジン(76mg,0.365mmol)および2,4,6−トリ−tert−ブチルピリミジン(165mg,0.664mmol)を加え、反応混合物を−65℃に冷却し、30分間攪拌した。無水トリフリック(Triflic)(67μL,0.397mmol)を加え、反応混合物を−65℃で20分間攪拌した。反応混合物を、その後、−78℃に冷却し、DCM(4mL)中に化合物73(300mg,0.303mmol)を有する溶液を滴下し、−78℃で6時間攪拌し、その後、1時間以内で0℃に温めた。反応混合物をろ過し、飽和NaHCO溶液(25mL)を用いて洗浄し、CHCl(2×25mL)を用いて抽出した。合わせた有機層を、ブライン(10mL)を用いて洗浄し、無水NaSOで乾燥させ、減圧下で濃縮した。シリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)を用いた自動精製システムによる精製は、溶媒の蒸発後、濁った粘度が高いゲルとして生成物(300mg,67%)を与えた。
HRMS(ESI)C929517Na[M+Na]の計算値は1492.6266、実測値は1492.6232であった。
化合物75
アセトニトリル(8.7mL)およびHO(1.1mL)の混合液中に、三糖類74(289mg,0.197mmol)を有する溶液に、硝酸セリウムアンモニウム(172mg,0.315mmol)を0℃で加え、2時間攪拌した。反応混合物をTLCによって観察し、硝酸セリウムアンモニウムの他の部分(172mg,0.315mmol)を加え、2時間攪拌した。反応混合物を、飽和NaHCO溶液(25mL)とDCM(35mL)との間に分離した。水層を、DCM(25mL)を用いて抽出し、合わせた有機層を、NaSOで乾燥させ、蒸発させ、粗生成物を得た。残渣を、EtOAcおよびシクロヘキサンを溶媒として用いたカラムクロマトグラフィーによって精製し、淡黄色のオイルとして所望の生成物(125mg,46%)を得た。
HRMS(ESI)C858616Na[M+Na]の計算値は1385.5814、実測値は1385.5885であった。
化合物76
CsCO(38.2mg,0.117mmol)および2,2,2−トリフルオロ−N−フェニル−アセトイミドイルクロリド(36.5mg,0.176mmol)を、DCM(8mL)中にラクトール75(80mg,0.059mmol)を有する溶液に加えた。反応混合物を室温で攪拌し、TLCによって観察した。2時間後、全ての出発材料は消費され、反応物をセライトに通してろ過し、DCM(20mL)を用いて洗浄した。溶媒を蒸発させ、粗生成物(90mg,定量的)を、更なる精製なしで次のステップにおいて使用した。
化合物77
無水トルエン(2mL)およびジオキサン(0.66mL)の混合液中に化合物76(80mg,0.052mmol)および化合物60(69.6mg,0.052mmol)を有する溶液に、4ÅのMSを加え、混合物を、室温で30分間攪拌した。TMSOTf(1μL,5.21μmol)を加え、反応混合物を−10℃で1時間攪拌した。飽和NaHCO溶液(20mL)を用いて反応物をクエンチし、DCM(2×25mL)を用いて抽出した。有機層を、NaSOで乾燥させ、蒸発させ、粗生成物を得た。残渣を溶媒としてEtOAcおよびシクロヘキサンを用いたカラムクロマトグラフィーによって精製し、無色のオイルとして所望の生成物(70mg,50%)を得た。
HRMS(ESI)C16417131Na[M+Na]の計算値は2702.1828、実測値は2702.1853であった。
化合物78
DCM:PBS(2:1,5.1mL)中に化合物77(60mg,0.022mmol)を有する溶液に、2,3−ジクロロ−5,6−ジシアノ−1,4−ベンゾキノン(10.2mg,0.045mmol)を0℃で加えた。反応混合物を室温で2時間攪拌し、TLC(シクロヘキサン中にEtOAc,2:1)によって観察した。2,3−ジクロロ−5,6−ジシアノ−1,4−ベンゾキノンの一部(5mg)を再び加え、混合物を室温で2時間攪拌した。飽和NaHCO(25ml)を用いて反応をクエンチし、DCM
(2×25mL)を用いて抽出した。合わせた有機層を、ブライン(15mL)を用いて洗浄し、NaSOで乾燥させ、ろ液を減圧下で濃縮し、粗生成物を得た。粗生成物を、シリカ(酢酸エチル/シクロヘキサン)を用いた自動フラッシュクロマトグラフィーによって精製し、無色のオイル(30mg,63%)を得た。
HRMS(ESI)C15316331Na[M+Na]の計算値は2562.1202、実測値は2562.1219であった。
化合物79
無水トルエン(3mL)およびジオキサン(1mL)の混合液中に化合物76(35mg,0.023mmol)および化合物78(29mg,0.011mmol)を有する溶液に、4ÅのMSを加え、混合物を、室温で30分間攪拌した。TMSOTf(0.2μL,1.142μmol)を加え、反応混合物を−10℃で1時間攪拌した。反応物を、飽和NaHCO溶液(20mL)を用いてクエンチし、DCM(2×25mL)を用いて抽出した。有機層を、NaSOで乾燥させ、蒸発させ、粗生成物を得た。残渣をEtOAcおよびシクロヘキサンを溶媒として用いたカラムクロマトグラフィーによって精製し、黄色のオイルとして所望の生成物(28mg,63%)を得た。
MALDI−TOF:C23824746[M+H]の計算値は3885.722、実測値は3885.105であった。
化合物80
化合物79(6.0mg,1.415μmol)を、DCM(1mL)、tBuOH(1mL)、および2滴の水の溶媒混合物中に入れた。Pd/Cを加え、24時間、Hバルーン下、室温で水素化した。反応混合物をPTFEフィルターに通してろ過し、残渣をメタノール(6mL)、(50%メタノール−水(6mL))を用いて洗浄した。ろ液を真空下で蒸発させ、粗生成物を得た。H NMR分析は、反応の完結および生成物の存在を示した。したがって、粗生成物を、水(3mL×2,fr1)、20%アセトニトリル−水(3mL×2,fr2)、およびアセトニトリル(3mL,fr3)を用いて、C18セッパック(Sepak)カラムに通して精製した。全ての分画を凍結し、24時間凍結乾燥させ、化合物80(白色固体,2.4mg,99%)の一つの純粋な分画fr1、および2つの純粋でない分画である白色のフワフワとした固体(fr2,0.03mg)、白色のフワフワとした固体(fr3,0.4mg)、を得た。
HRMS(ESI)C59103NO46[M+H]の計算値は1562.5829、実測値は1562.5815であった。
実施例5:K.ニューモニエ血清型O3オリゴ糖の自動合成
[一般的な方法および材料]
構成要素を調製するために使用される無水溶媒、並びに活性化剤、TMSOTfおよびキャッピング保存溶液は、溶媒乾燥システム(JC メイヤー溶媒システムズ(Meyer solvent systems))から得た。HPLC等級DCMを洗浄のために使用した。全ての他の洗浄溶媒(DMF、THF、ジオキサン、およびMeOH)は、試薬等級であった。
構成要素は、トルエン(3×)を用いて共蒸発によって乾燥され、約1〜2時間高真空下で乾燥されている。
全ての合成を、光開裂性リンカーを用いて修飾されたメリフィールド(Merrifield)樹脂(負荷(loading)=0.41mmol/g)を用いて、0.0125mmolのスケールで行った。リンカー負荷された樹脂の構造は次の通りである−
[保存溶液]
活性化溶液:DCM:ジオキサン中に150mM NIS/15mM TfOH
酸洗浄溶液:DCM中に62mM TMSOTf
キャッピング溶液:DCM中に10%(v/v)AcO/2%(v/v)MeSOピリジン「プレ洗浄」溶液:DMF中に10%(v/v)ピリジン
Fmoc脱保護溶液:DMF中に20%(v/v)ピぺリジン
[自動化モジュール]
[モジュールA:]最初の樹脂膨張/合成洗浄の開始
DCM、DMFおよびTHF(それぞれ、3×、2mL、25秒)を用いて樹脂を洗浄し、その後、パルスアルゴンバブリング(bubbling)を用いる不定期の混合を用いてDCM(2mL)中で30分間膨張させる。
[モジュールB:]62mM TMSOTfを用いた酸洗浄
DCM(2mL)を反応槽に供給し、温度を−20℃に調節する。DCMを排水し、他の2mLのDCMに交換し、その後TMSOTf溶液(1mL)を滴下する。混合物を、1.5分間、Arバブリング下でインキュベートし、その後2mLのDCMを用いて25秒間、排水洗浄する。
[モジュールC]:チオグリコシド結合
構成要素ストック、およびグリコシル化パラメーター:
グリコシル化サイクル:
DCM(2mL)を樹脂に加え、温度を活性化温度T1−2Kに設定する。冷却しながら、構成要素溶液を反応槽に供給する。設定温度を、T1−2Kで安定化させた後、1mLの活性化剤溶液を加えることによって反応を開始する。混合をT1で5分間維持し、その後、第2の20分間インキュベーションサイクルを、温度を温度T2に上げる間に開始する。インキュベーションサイクルが終了すると、反応混合物を流し出し、樹脂をDCM:ジオキサン 1:1(2mL)およびDCM(2mL)を用いてそれぞれ一度洗浄する。モジュールは、2回の付加的なDCM洗浄(2mL)を行いながら温度を25℃に上げることによって終了する。
[モジュールD]:キャッピング
樹脂を、DMFを用いて洗浄し(2×、25秒)、反応槽の温度を、25℃に設定した。DMF中に10%ピリジンを有する溶液2mLを、反応槽に供給する。1分後、溶液を流し出し、樹脂を、DCMを用いて洗浄し(3×、2mL、25秒)、その後、4mLのキャッピング溶液を反応槽に供給し、20分間、アルゴンバブリング下でインキュベートする。サイクルは、反応混合物を流し出し、樹脂を、DCMを用いて洗浄すること(3×、2mL、25秒)によって終了する。
[モジュールE]:FMOC脱保護
樹脂を、DMFを用いて洗浄し(3×、2mL、25秒)、反応槽の温度を、25℃に調節する。2mLのFMOC脱保護溶液を、反応槽に供給する。5分後、溶液をUV−センサーに通して流し出し、樹脂を、DMF(3×、2mL)およびDCM(それぞれ5×、2mL、60秒)を用いて洗浄する。反応槽の温度を、次のサイクルの調製において、−20℃に下げた。
[自動化後ステップ]
[固体支持体からの開裂]
自動合成後、オリゴ糖を一連のフロー光リアクターを用いて固体支持体から開裂した。試料(標的オリゴ糖を用いて負荷された樹脂)を、20mLのDCM(アミレンを用いて安定化された、LC−MS等級)中に取り上げ、反応装置(波長=300nm)に1.0mL/分の速度で注入する。全ての樹脂が反応装置内にある場合、新鮮なDCM(20mL)を、光開裂樹脂を回収するために注入する。得られたろ液は真空中で濃縮され、更なる分析および精製に供される。
[精製およびHPLC分析]
粗生成物をヘキサン:酢酸エチル1:1中に溶解し、分析的HPLCを用いて分析した(YMC−ジオール(Diol)−300カラム、150×4.6mm、ELSD検出器およびDAAD、280nm).
方法−(停止時間−60分)
得られたオリゴ糖のリスト
[液相合成における自動化ステップからの完全に保護されたオリゴ糖における脱保護のための実験手順]
[ベンゾイルおよびアセテート脱保護:]
MeOH中にナトリウムメトキシドを有する溶液(25%w/w)(30〜45eq.)を、MeOH:THF(2:1)の混合液中にベンゾエート83〜87(1eq.)を有する溶液に加えた。反応を、同じ温度で16時間攪拌した。HO(1mL)の添加によって反応をクエンチし、ブライン(5mL)を用いて希釈した。反応混合物を、EtOAc(2×10mL)を用いて抽出した。合わせた有機層を、無水NaSOで乾燥させ、減圧下で濃縮した。溶媒の蒸発後、粗生成物83a〜87aを、黄色の粘度が高いゲルとして得て、任意の更なる精製無しで次のステップにおいて使用した。
[ベンジル脱保護:]
83a〜87a(1eq.)を、DCM(2mL)、tBuOH(2mL)、および2滴の水の溶媒混合物中に入れた。Pd/Cを加え、24時間、Hバルーン下、室温で水素化した。反応混合物をPTFEフィルターに通してろ過し、残渣をメタノール(6mL)、(50%メタノール−水(6mL))を用いて洗浄した。ろ液を真空下で蒸発させ、粗生成物を得た。H NMR分析は、反応の完結および生成物の存在を示した。したがって、粗生成物を、水(3mL×2,fr1)、50%アセトニトリル−水(3mL×2,fr2)、およびアセトニトリル(3mL,fr2)を用いて、C18セッパック
(Sepak)カラムに通して精製した。全ての分画を凍結し、24時間凍結乾燥させ、化合物83b〜87bの一つの純粋な分画fr1、および純粋でない分画fr2を得た。
したがって、六糖類83b、十糖類84b、十二糖類85b、および十五糖類86bを、上記のプロトコルを用いて得ている。同様のプロトコルの後に、完全に脱保護された二十糖類87bを化合物87aから達成することができる。
[B K.ニューモニエ血清型O3およびO5オリゴ糖の免疫付与研究]
[材料:]
・ELISAプレート(高結合、EIA/RIAプレート、96ウェル、低い蒸発蓋を有する平底、会社:コスター(Costar)(登録商標)3361)
・検出抗体:ヤギ抗ウサギIgGペルオキシダーゼ複合体(シグマ(Sigma)社、#A4914)およびヤギ抗−マウスIgG(H+L)ペルオキシダーゼ複合体(ディアノバ(Dianova)社 コード:115−035−068)
・ブロッキング溶液:PBS中に1%FCS(v/v)
・抗体希釈液:PBS+1%BSA(w/v)
・洗浄緩衝液:PBS+0.1%Tween20(PBS−T)
・現像溶液:1ステップ(Step)(商標)ウルトラ(Ultra)TMB−ELISA現像液(サーモサイエンティフィック(ThermoScientific)社、Cat#:34028)
・停止溶液:2M硫酸(HSO4)
・プレートリーダー:アントス(Anthos)HT2
・ソフトウェア:吸光度測定のためのウィンリード(WinRead)2.36およびデータプロッティングおよび分析のためのグラフパッドプリズム(GraphPad Prism)7
・アルム:水酸化アルミニウムゲルアジュバント(アルヒドロゲル(登録商標)2%)、ブレンタグ(Brenntag)社、バッチ#:5447 使用期限:2020年2月
・不完全フロイントアジュバント(Freund’s Adjuvant)(IFA).インビボジェン(InvivoGen)社;Cat:vac−ifa−10、バッチ#:IFA−39−03;使用期限:2019年9月
・クアンチプロ(QuantiPro)(商標)BCA分析キット(SIGMA)製品:QPBCA−1KT;ロット#:SLBR7451V;Pコード:1002296464・ミニ−プロティアン(Mini−PROTEAN)(登録商標)TGX(商標)ゲル−10%、10ウェル(30μL/ウェル)対照 Nr:64175708、
・プレシジョンプラスデュアルカラー(Precision Plus Dual Color)、Cat:1610374;対照 Nr:641798899
・ゲルコード(GelCode)(商標)ブルーセーフタンパク染料(Blue Safe Protein Stain);サーモサイエンティフィック(ThermoScientific)社;Ref:1860957;ロット#:TA260266
・クレブシエラ ニューモニエLPS.シグマ(SIGMA)−L4268;ロット#:116M 4057V
[方法:]
[1.細菌株およびLPS]
LPS(O−抗原)において異なっており、莢膜を有する/有さない、クレブシエラ ニューモニエ(KPC)株は、対応するLPSを単離および精製するために使用された。精製されたLPSを、酵素結合免疫吸着分析法(ELISA)における被覆抗原として使用した。O2a,cLPSを、シグマ−アルドリッチ社から調達した。
[2.複合糖質の生成および特徴づけ]
KPC合成抗原は、免疫付与実験のための担体タンパク質CRM197に結合される21および69(21−CRM197および69−CRM197)、並びに下記の手順に従ったELISAのための被覆抗原としてのウシ血清アルブミンに結合される21および69(BSA;(21−CRM197および69−CRM197))であった。
[一般的な結合プロトコル]
[ステップ1:PNP−エステル合成]
化合物21または69(1eq)を、DMSOまたはDMSO−HOに、室温で、8mLバイアル中で溶解した。活性化されたビス−(4−ニトロフェニル)アジペート(20eq)を加え、5分間攪拌した。トリエチルアミン(50eq)を加え、反応混合物を室温で3〜5時間攪拌することを可能にした。反応混合物を、液体窒素を用いて凍結し、その後18時間凍結乾燥させ、淡黄色の粗生成物を過剰の試薬と共に得た。粗生成物を、十分な量のCHCl、続いてDCMを用いて完全に洗浄し、過剰の試薬を除去した。固体のパラ−ニトロフェニル(PNP)エステルを乾燥させ、次のステップのために用いた。
[ステップ2:タンパク質への結合]
結合手順:NaPi緩衝液中に0.15MのNaClを有する溶液50μL中にPNPエステル21または69を有する溶液を、緩衝液(〜150μL)中にCRM197またはBSA有する溶液を含む反応バイアルに滴下した。バイアルを、50μLの緩衝液を用いて最後にリンスし、反応バイアルを完全に移した。したがって、バイアル中の反応量は200μL以下となる。反応混合物は、色が黄色になり、反応混合物を室温で24時間攪拌した。複合溶液(21−CRM197、69−CRM197、21−CRM197、または69−CRM197)を、アミコン(登録商標)ウルトラ−0.5mL遠心ろ過機に移し、6分間、2〜8℃で遠心分離した。300μLの緩衝液を反応バイアルに加え、リンスし、フィルターに移し、再び遠心分離した。追加の洗浄を1×PBS溶液を用いて行い、黄色の色が無くなり、複合体が透明溶液になるまで遠心分離した。最後の洗浄後、複合体を1×PBS溶液中で2〜8℃で保存した。
SDS−PAGE、SECクロマトグラフィー、およびMALDI分析によって、複合体を分析した。担体上の糖の負荷は、MALDI分析を用いて複合体化タンパク質と非複合体化タンパク質との間で質量を減算することによって、明確に計算した。タンパク質含有量を、製品のプロトコルにしたがってマイクロBCA方法を用いて推定した。
[2.1 SDS−PAGE分析]
試料を、マイクロチューブ(microfuge tube)中で混合し、サーモサイクラーで、5分間95℃で加熱した。5分間室温に冷却後、試料を約2.5μgで、10%ポリアクリルアミドゲルの各ウェルに、10μLのマーカーと共にロードした。試料の泳動を120Vの定電圧で1時間行った。染色を、製品指示書のとおりにゲルコード(GelCode)(商標)ブルーセーフタンパク染料(Blue Safe Protein Stain)を用いて行った。ゲルを、脱イオン化水を用いて一晩洗浄し、ゲルドキュメンテーションシステム(gel documentation system)を用いてスキャンした。
[2.2 複合糖質のサイズ排除クロマトグラフィー(SEC)]
免疫付与研究のために使用された糖複合体(21−CRM197および69−CRM197)を、複合体化CRMタンパク質と非複合体CRMタンパク質との間の質量の差を観察するためにSECによって分析した。50mM トリス(Tris)、20mM NaCl、pH7.2で試料を希釈し、東ソー TSK G2000カラム(SWxl,
7.8mm×30cm,5μm)および東ソー TSKゲル(登録商標) ガード(Guard)カラム(SWxl,6.0mm×4cm,7μm)を装着したアジレント(Agilent)1100HPLCシステムで分析を行った。流速を1mL/minに維持した。
[3.免疫付与のためのワクチン製剤]
複合糖質を、マウス研究のために水酸化アルミニウム(アルム)アジュバントで、およびウサギにおける免疫付与のために不完全フロイントアジュバント(Freund’s Adjuvant)(IFA)で製剤化した。
[3.1 アルムにおける製剤]
全ての製剤を、無菌条件下で調製した。複合糖質(DS)およびPBSを、50mLファルコン(Falcon)(商標)チューブ中で、必要とされるアルムの量(0.25mg/mL)を除いて、最終製剤量に応じて事前に計算した適切な比率で混合した。これはDS−PBS混合物を形成した。動物当たりの抗原/DS投与量を、5μg/100μL/動物に維持した。DS−PBS混合物を、血清学的ピペットを用いて優しく混合した(5X)。DS−PBS混合物に、対応する量の保存アルム(10mg/mL)を加え、1;40の最終アルム比率、または0.0250mg/mLとした。混合物を、5mLの血清学的ピペットを用いて優しくピペッティングすることによって(20X)、すぐに混合した。ファルコン(商標)チューブに蓋をして、パラフィルム(登録商標)を用いて覆い、振とう機で、250rpmで、2時間、室温(RT)で混合させた。2時間のインキュベーション後、製剤をクリーンベンチ下に置き、等分し、更なる使用まで4℃で更に保存した。
[3.2 IFAにおける製剤]
インビボジェン(InvivoGen)からの不完全フロイントアジュバントを、ウサギ免疫付与研究のためのワクチンを製剤化するために使用した。プロトコルは、製品の通りに行われた。抗原:IFA濃度を1:1に保持した。動物当たりの抗原投与量を、5μg/200μL/動物(100μLの抗原+100μLのIFA)に保持した。所望の算出された量(最終免疫付与用量の50%)でIFAを15mLの滅菌ファルコン(商標)チューブに取った。算出された量(最終免疫付与用量の50%にPBSで調節された量)の希釈抗原溶液を、20Gの針を装着された3mL滅菌シリンジに取った。DS溶液を、IFAを含むファルコン(商標)チューブに加え、すぐに15秒間(5X)ボルテックスした。製剤の色は、ボルテックスをするとすぐに淡黄色から乳白色に変化し、そのことは、安定なエマルションの形成を示す。結果的に生じるワクチン製剤を、軽くボルテックスし、所望の投与量で2mLの滅菌チューブに等分した。免疫付与の前に、ワクチン製剤を含むチューブをボルテックスし、その後、動物に注射した。
[3.3 アルム製剤の特徴付け]
アルムで製剤化された複合糖質を、最終アルム濃度、および製剤のpHを決定するために特徴付けした。
[4.免疫付与スケジュール]
マウスおよびウサギの免疫付与を、特定病原体未感染条件下で行い、食物および水を自由に提供した。マウス(n=6)およびウサギ(n=4)を、100μL/マウス、および200μL/ウサギの注射量でワクチン製剤(表2)を用いて皮下に免疫付与した。マウスのための抗原量は、抗原−7を除いて5μg/動物(抗原1、および−2はそれぞれ2.5μg)に保持した。ウサギのための抗原量は、5μg/動物に保持した。マウスおよびウサギを、0、14、および28日に免疫付与した。抗体力価の決定のために、マウスでは−1、7、および22日に、ウサギでは0、7、および21日に、それぞれ血液を採取した。35日目に、動物を犠牲にし、血液を集めた。
[5.自家抗原被覆プレートを用いた血清の酵素結合免疫吸着分析法(ELISA):]
[抗原によるプレートの被覆:]
複合体21−BSAおよび69−BSA、並びにLPS#1〜#4を、被覆抗原として使用した。LPSを、10/20μg/mLの濃度でイソプロパノールに溶解した。100μLを、各ウェルを被覆するために使用し、結果的に1〜2μg/ウェルの被覆濃度にした。LPS溶液を、ウェルにロードし、滅菌ベンチ内で、室温で一晩、蒸発させた。複合体21−BSAおよび69−BSAのために、各複合体を、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)pH7.4に5μg/mLの濃度で溶解した。100μLを各ウェルに被覆し、4℃で一晩インキュベートし、0.5μg/ウェルの抗原濃度を得た。
[洗浄:]
一晩、抗原の吸着後、プレートを、PBS−T(200μL/ウェル)を用いて1X洗浄し、ウェル毎の過剰な液体を、プレートを反転することによって、およびクリーンドライティッシュタオル上で軽くたたくことによって除去した。
ブロッキング:
プレートを、200μLの商用のブロッキング溶液を用いてブロックし、2時間室温でインキュベートした。
洗浄:
ブロッキング後、プレートを、PBS−T(200μL/ウェル)を用いて3X洗浄し、ウェル毎の過剰な液体を、プレートを反転することによって、およびクリーンドライティッシュタオル上で軽くたたくことによって除去した。
[血清の希釈およびインキュベーション:]
異なる実験群の異なる時点から集められた血清(n=4ウサギ/群、またはn=6マウス/群)を、抗体希釈液(PBS+1%BSA)で、集められた血清の各希釈液へと希釈した。異なる実験群における100μLの希釈血清試料を、対応するウェルへデュプリケートで加え、250rpmに設定された振とう機で2時間、室温でインキュベートした。100μL/ウェルの抗体希釈液(PBS+1%BSA)は実験的ブランクを形成した。血清を用いてインキュベートした後、プレートをPBS−Tを用いて4X洗浄し(200μL/ウェル)、ウェル毎の過剰な液体を、プレートを反転することによって、およびクリーンドライティッシュタオル上で軽くたたくことによって除去した。
[インキュベーション(検出抗体):]
対応する検出抗体、抗−ウサギIgG HRP複合体または抗−マウスIgG HRP複合体を、抗体希釈液(PBS+1%BSA)で1:10,000に希釈し、100μL/ウェルを加え、振とう機で、250rpmで1時間、室温でインキュベートした。検出抗体を用いてインキュベートした後、プレートを、PBS−Tを用いて5X洗浄し(200μL/ウェル)、ウェル毎の過剰な液体を、プレートを反転することによって、および
クリーンドライティッシュタオル上で軽くたたくことによって除去した。
[基質付加:]
各ウェルに、(4℃から室温に標準に戻された)滅菌済みのTMB(3,3,’,5,5’−テトラメチルベンジジン)基質を加え、暗室で15分間インキュベートした。酵素反応における青色を、50μL/ウェルの2MのHSO溶液を加えることによって停止し、結果的に黄色溶液になった。黄色溶液の吸光度を、プレートリーダーを用いて450nmで測定した。
[結果:]
吸光度値を、グラフパッドプリズム(GraphPad prism)ソフトウェアを用いてグラフをプロットすることによって分析した。
[結果]
[複合糖質21−CRM197および69−CRM197の特徴づけ]
免疫付与研究のために使用されるKPC抗原複合糖質21−CRM197および69−CRM197を、結合効率および抗原量のために分析した。複合糖質におけるMALDI分析は、非常によい結合効率を明らかにした。複合体化CRM197タンパク質と非複合体化CRM197タンパク質との間の質量差は、異なる複合糖質のために2〜15抗原/CRM197分子、好ましくは、3〜10抗原/CRM197分子の負荷を生成した。
複合糖質を、10%SDS−PAGEおよびSECによっても分析し、非複合体化CRM197タンパク質と比較して、明確な質量シフトを明らかにした(図5Aおよび図5B)。
[ELISAデータ。]
21−CRM197および69−CRM197を免疫付与されたマウスからの血清は、対応する抗原を認識する(図6参照)。血清は、対応するK.ニューモニエLPSと交差反応もする(図7参照)。21−CRM197および69−CRM197を免疫付与されたウサギからの血清は、関連したBSA複合体21−BSAおよび69−BSAそれぞれにおける対応するO−抗原を認識する(図8参照)。21−CRM197/69−CRM197を免疫付与されたマウスからの血清は、対応するK.ニューモニエLPSを選択的に認識する(図9参照)。
本明細書において提供されたデータは、本発明における複合体を用いて免疫付与後に、本発明のオリゴ糖に対して、並びにK.ニューモニエ血清型O3、O3b、およびO5の天然のO−多糖に対する機能的な抗体を、ウサギおよびマウスにおいて誘発することを示す。抗体は、K.ニューモニエ血清型O3、O3b、およびO5の天然のO−多糖(LPS)と交差反応し、このことは、これらの抗体がK.ニューモニエ細菌に結合する、およびK.ニューモニエ感染症に対する保護を与える可能性を示す。
ELISAデータは、本発明における複合体が免疫原性であり、高い抗体力価を誘導することを更に証明する。したがって、ELISA分析は、本発明の式(I)のオリゴ糖が、ウサギおよびマウスに対して免疫原性であり、交差反応性抗体を生成することを示す。

Claims (15)

  1. 一般式(I)のオリゴ糖、または一般式(I)のオリゴ糖のジアステレオ異性体もしくは薬学的に許容できる塩であって、
    式中、
    mは、0および1から選択される整数であり;
    xは、1〜2×m+3から選択される整数であり;
    nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から選択される整数であり、
    −T−は、結合,−(Ux+4−(Vx+21−m−,−(Ux+4−Ux+3−(Vx+2−Vx+11−m−,−(Ux+4−Ux+3−Ux+2−,または−(Ux+4−Ux+3−Ux+2−Ux+1−を表し;
    −は、H−,H−(U−(V1−m−,H−(Ux+1−U−(Vx+1−V1−m−,H−(Ux+2−Ux+1−U−,またはH−(Ux+3−Ux+2−Ux+1−U−を表し;
    Lは、リンカーを表し、および;
    Eは、−NH,−N,−CN,−O−NH,−CH=CH,−C≡CH,−Br,−Cl,−I,−COR’,−COR’,−CONH−NH,−SH,または−SAcを表し;
    R’は、−H,−Me,−Et,4−ニトロフェニル,ペンタフルオロフェニル,−N−ヒドロキシスクシンイミジル,−(3−スルホ−N−ヒドロキシスクシンイミジル),または−(ジベンゾシクロオクチン−スルホ−N−ヒドロキシスクシンイミジル)を表す;
    一般式(I)のオリゴ糖、または一般式(I)のオリゴ糖のジアステレオ異性体もしくは薬学的に許容できる塩。
  2. 一般式(II)の請求項1に記載のオリゴ糖であって、
    式中、m、n、x、L、E、Ux+1、Ux+2、Ux+3、Ux+4、V、Vx+1、Vx+2、およびTは、請求項1に定義される意味を有する、オリゴ糖。
  3. 請求項1または請求項2に記載のオリゴ糖であって、式中、
    −L−は、−L−,−L−L−,−L−L−L−,または−L−L−L−を表し;
    −L−は、−(CH−,−(CH−CH−O)−C−,または−(CH−CH−O)−CHを表し;
    −L−は、−O−,−NH−CO−NH−,−NH−CO−CH−NH−,−NH−CO−を表し;
    −L−は、−(CH−,−(CH(OH))−,−(CF−,−(CH−CH−O)−C−,または−(CH−CH−O)−CH−を表し;
    −L−は、−(CHp1−,−(CFp1−,−C−(O−CH−CHp1−,−CH−(O−CH−CHp1,−,または−(CHp1−O−(CHp2−を表し;並びに
    o、q、p1およびp2は、互いに独立して、1、2、3、4、5、および6から選択される整数である、オリゴ糖。
  4. 請求項1または請求項2に記載のオリゴ糖であって、式中、−O−L−Eは:
    からなる群から選択され、
    式中、R’は、−H,−Me,−Et,4−ニトロフェニル,ペンタフルオロフェニル,−N−ヒドロキシスクシンイミジル,−(3−スルホ−N−ヒドロキシスクシンイミジ
    ル)、または−(ジベンゾシクロオクチン−スルホ−N−ヒドロキシスクシンイミジル)を表し;
    Xは、−Br,−Cl,−I,−COH,または−SAcを表す、オリゴ糖。
  5. からなる群から選択される請求項1に記載のオリゴ糖。
  6. 前記−O−L−E基の残基Eを介して免疫原性担体に共有結合される、請求項1〜請求項5のいずれか1項に記載のオリゴ糖を含む複合体。
  7. ヒトおよび/または動物宿主における保護免疫応答の上昇において使用するための、請求項1〜請求項5のいずれか1項に記載のオリゴ糖または請求項6に記載の複合体。
  8. 細菌のリポ多糖において、次のオリゴ糖断片:
    −2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1−;
    −3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1−;
    −3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−;
    −2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−;
    −2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−;
    −3)−β−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−;
    −2)−α−D−Man−(1,3)−β−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−;
    −2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,3)−β−D−Man−(1−;
    −2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1−;
    −3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1−;
    −3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−
    の一つを含む前記細菌と関連する疾患の予防および/または治療において使用するための、請求項1〜請求項5のいずれか1項に記載のオリゴ糖または請求項6に記載の複合体。
  9. 細菌と関連する前記疾患は、肺炎、気管支炎、髄膜炎、尿路感染症、傷口感染、骨髄炎、菌血症、敗血症、および強直性脊椎炎を含む、請求項8に記載の使用のためのオリゴ糖または複合体。
  10. 少なくとも一つの薬学的に許容できるアジュバントおよび/または賦形剤と共に請求項6に記載の複合体および/または請求項1〜請求項5のいずれか1項に記載のオリゴ糖を含む医薬組成物。
  11. 細菌のO−多糖において、次のオリゴ糖断片:
    −2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1−;
    −3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1−;
    −3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−;
    −2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−;
    −2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−;
    −3)−β−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−;
    −2)−α−D−Man−(1,3)−β−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−;
    −2)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,3)−β−D−Man−(1−;
    −2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1−;
    −3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1−;
    −3)−α−D−Man−(1,3)−α−D−Man−(1,2)−α−D−Man−(1−
    の一つを含む前記細菌に対する抗体の検出のための免疫学的分析におけるマーカーとして使用するための、請求項1〜請求項5のいずれか1項に記載のオリゴ糖。
  12. 一般式(I)のオリゴ糖の合成方法であって:
    A1)単糖1を提供すること
    式中、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EとなるEpを有する−L−Epを表し、ここでEおよびLは、請求項1に定義される通りの意味を有し;
    A2)活性化剤の存在において、単糖1を構成要素2と処理すること
    式中、P〜Pは、保護基を表し、およびLGは、脱離基を表し;
    A3)保護基Pの除去を行うこと;
    A4)活性化剤の存在下でステップA3)の生成物を構成要素3と処理すること
    式中、P、P、P、およびPは、保護基を表し、およびLGは、脱離基を表し;
    A5)保護基Pの除去を行うこと;
    A6)中間体化合物4aを得るためにステップA4)およびA5)を2回繰り返すこと;
    式中、P、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EとなるEpを有する−L−Epを表し、ここでEおよびLは、請求項1に定義される通りの意味を有し;
    A7)式5aの中間体化合物を得るために、A2)→A3)→A2)→A3)→A4)→A5)→A6)の順序でステップA2)〜A6)をn−1回任意に繰り返すこと、
    式中、P、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EとなるEpを有する−L−Epを表し、ここでn、EおよびLは、請求項1に定義される通りの意味を有し;
    A8)一般式(I)のオリゴ糖を得るために全ての保護基の除去を行うこと、
    を含む、方法、
    もしくは
    一般式(I)のオリゴ糖の合成方法であって:
    F1)単糖7を提供すること
    式中、P、PおよびPは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EとなるEpを有する−L−Epを表し、ここでEおよびLは、請求項1に定義される通りの意味を有し;
    F2)単糖7を活性化剤の存在で構成要素8と処理すること
    式中、P〜P10は保護基を表し、およびLGは脱離基を表し;
    F3)保護基P10の除去を行うこと;
    F4)ステップF3)の生成物を活性化剤の存在下で構成要素9と処理すること
    式中、P、P、P11およびP12は、保護基を表し、およびLGは、脱離基を表し;
    F5)中間体化合物4fを得るために保護基P11の除去を行うこと;
    式中、P〜PおよびP12は、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EとなるEpを有する−L−Epを表し、ここでEおよびLは、請求項1に定義される通りの意味を有し;
    F6)式5fの中間体化合物を得るために、F2)→F3)→F2)→F4)→F5)の順序でステップF2)〜F5)をn−1回任意に繰り返すこと、
    式中、P〜PおよびP12は、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EとなるEpを有する−L−Epを表し、ここでn、EおよびLは、請求項1に定義される通りの意味を有し;
    F7)一般式(I)のオリゴ糖を得るために全ての保護基の除去を行うこと、
    を含む、方法。
  13. 一般式(I)のオリゴ糖を調製するための中間体化合物であって、
    ここで、前記中間体化合物は、一般式(I2a)、(I2b)、(I2c)、(I2d)、(I2e)、(I2f)、(I2g)、(I2h)、(I3a)、(I3b)、(I3c)、(I3d)、(I3e)、(I3f)、(I3g)、(I3h)、(I3i)、(I3j)、(I3k)、(I3l)、(I3m)、(I3n)、(I4a)、(I4b)、(I4c)、(I4d)、(I4e)、(I4f)、(I4g)、(I4h)、(I4i)、(I4j)、(I5a)、(I5b)、(I5c)、(I5d)、(I5e)、(I5f)、(I5g)、(I5h)、(I5i)、または(I5j)のいずれか一つを有し:
    式中、P〜Pは、保護基を表し、およびCは、固体支持体または保護末端基EとなるEpを有する−L−Epを表し、ここでEおよびLは、請求項1に定義される通りの意味を有する、
    中間体化合物。
  14. 一般式(V)の請求項6に記載の複合体であって
    式中、
    cは2〜18を含み;
    −E−は、共有結合,−NH−,−O−NH−,−O−,−S−,−CO−,−CH=CH−,−CONH−,−CO−NHNH−,
    を表し;
    −W−は:
    から選択され、
    aは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から選択される整数を表し、
    bは、1、2、3、および4から選択される整数を表し、並びに
    m、n、x、L、Ux+1、Ux+2、Ux+3、Ux+4、V、Vx+1およびVx+2は、請求項1で定義される通りの意味を有する、
    複合体。
  15. 前記複合体は、次の式(V−1)〜(V−11)
    のいずれか一つを有し、
    式中、L、E、W、c、およびnは、請求項14に定義される通りの意味を有する、請求項14に記載の複合体。
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