JP2021083408A - 検査方法および検査装置 - Google Patents

Abstract

【課題】焦点を合わせるのに要する時間を短縮することである。【解決手段】検査装置は、撮像条件が保存されていなければ（最初に観察点を撮像するとき）、オートフォーカス処理を実行して、顕微鏡カメラの焦点が観察点に合う合焦位置を取得し、得られた合焦位置を記憶装置に保存する。一方、検査装置は、撮像条件が保存されていれば（二回目以降に観察点を撮像するとき）、合焦位置を記憶装置から読み出し、読み出した合焦位置に顕微鏡カメラの焦点を設定して観察点を撮像する。【選択図】図５

Description

本開示は、検査方法および検査装置に関する。

特開２０１９−０８８３３９号公報（特許文献１）には、細菌同定培養や薬剤感受性検査のための培養プレートの各々のウェル中の細菌の形状や数を顕微鏡観察し、細菌の分裂の様子をモニタすることで細菌同定検査や薬剤感受性検査を行う検査装置が開示されている。

特開２０１９−０８８３３９号公報

細菌や薬剤などの観察対象を置くプレートは、たとえば成型精度により、個々に僅かな差異が生じる。顕微鏡の被写界深度は狭いため、プレートごとに都度、顕微鏡カメラの焦点を合わせる必要があった。

また、細菌等の生物学的因子の動態をモニタする場合、一の観察点を複数回撮像する。この場合に、撮像する度に焦点を合わせると、一回の撮像にかかる時間が長くなる。また、観察点が複数ある場合であって、観察対象の状態が経時的に変化するような場合、一のプレート内に含まれる各観察点を可能な限り同じタイミングで撮像することが望まれる。しかし、顕微鏡カメラを用いる場合、観察点ごとに焦点を合わせる必要があるため、撮像のタイミングにずれが生じ、観察点が増えることに比例してずれも大きくなり、一のプレートに対する撮像が完了するのに要する時間が長くなるという問題があった。

本開示の目的は、かかる問題を解決するためになされたものであり、生物学的因子の動態を短時間で検査することが可能な検査方法、および検査装置を提供することである。

本開示の検査方法は、生物学的因子が配置されるプレート上の少なくとも一の観察点を顕微鏡カメラで撮像することにより、生物学的因子の動態を検査する検査方法である。検査方法は、観察点を第１撮像するときに、顕微鏡カメラを観察点に合焦して合焦位置を得るステップと、得られた合焦位置を記憶装置に保存するステップと、第１撮像した後、観察点を第２撮像するときに、合焦位置を記憶装置から読み出し、読み出した合焦位置に顕微鏡カメラの焦点を設定して観察点を撮像するステップとを含む。

本開示の検査装置は、生物学的因子が配置されるプレート上の少なくとも一の観察点を撮像することにより、生物学的因子の動態を検査する検査装置である。検査装置は、観察点を撮像する顕微鏡カメラと、顕微鏡カメラの焦点を変更する焦点変更部と、観察点を第１撮像するときに、顕微鏡カメラを観察点に合焦して合焦位置を得る取得部と、得られた合焦位置を記憶装置に保存する保存部と、顕微鏡カメラおよび焦点変更部を制御して、観察点を撮像させる撮像制御部とを含む。撮像制御部は、第１撮像した後、観察点を第２撮像するときに、合焦位置を記憶装置から読み出し、読み出された合焦位置に顕微鏡カメラの焦点を設定させて観察点を撮像させる。

上記の検査方法および検査装置においては、第１撮像した後、観察点を第２撮像するときに、第１撮像したときに得た合焦位置に顕微鏡カメラの焦点が設定される。すなわち、観察点を第２撮像するときは、顕微鏡カメラの焦点を観察点に合わせる必要がない。その結果、焦点を合わせるのに要する時間を短縮することができ、生物学的因子の動態検査を短時間で行うことができる。

本実施の形態にかかる検査装置の概略構成を示す図である。 培養プレートの平面図である。 制御装置のハードウェア構成の一例を示す概略図である。 制御装置の機能構成の一例を示すブロック図である。 制御装置が実行する撮像処理のフローチャートである。 第１の変形例にかかる制御装置が実行する撮像処理のフローチャートである。 第２の変形例にかかる制御装置が実行する撮像処理のフローチャートである。 第２の変形例にかかる制御装置が実行する補正処理のフローチャートである。

以下、本開示の実施の形態について、図面を参照しながら詳細に説明する。なお、図中同一又は相当部分には同一符号を付してその説明は繰り返さない。

［検査装置の構成］
図１は、本実施の形態にかかる検査装置の概略構成を示す図である。本実施の形態にかかる検査装置は、一例として、薬剤感受性試験に用いられる。

検査装置１００は、培養プレート１０上に設けられている複数の観察点の各々を撮像する。複数の観察点の各々には、生物学的因子である菌を含む試験液と薬剤とを接触させて得られる観察対象が置かれている。

検査装置１００は、制御装置１２０と顕微鏡カメラ１４０とステージ１６０と読取部１８０とを含む。制御装置１２０は、顕微鏡カメラ１４０、ステージ１６０および読取部１８０と電気的に接続されている。なお、電気的に接続された各装置は、一部または全部が一体で構成されていてもよい。

制御装置１２０は、培養プレート１０上の各観察点１６撮像するために、読取部１８０が読み取った情報に基づいて、顕微鏡カメラ１４０およびステージ１６０の各々を制御する。

顕微鏡カメラ１４０は、対物レンズ１４２と、焦点変更機構１４４と、イメージセンサ１４６とを含む。

対物レンズ１４２は、ステージ１６０上に設置された培養プレート１０の一部を拡大する。対物レンズ１４２は、観察対象に応じて任意に選択される。

焦点変更機構１４４は、顕微鏡カメラ１４０の焦点を変更する。焦点変更機構１４４は、一例として、対物レンズ１４２の位置を対物レンズ１４２の光軸方向に変更することで、顕微鏡カメラ１４０の焦点を変更する。

イメージセンサ１４６は、対物レンズ１４２により拡大された観察対象の像を撮像するための検出器であって、たとえば、ＣＣＤ（Charge Coupled Device）イメージセンサやＣＭＯＳ（Complementary Metal Oxide Semiconductor）イメージセンサなどである。

ステージ１６０は、撮像視野変更機構１６２と、照明装置１６４とを含む。ステージ１６０上には培養プレート１０が設置される。照明装置１６４は、透過照明であって、ステージ１６０に対して観察用の光を照射する。

撮像視野変更機構１６２は、顕微鏡カメラ１４０の撮像視野を変更する。撮像視野変更機構１６２は、Ｘ軸移動機構１６２Ｘと、Ｙ軸移動機構１６２Ｙとを含む。Ｘ軸移動機構１６２Ｘは、ステージ１６０上に設置された培養プレート１０を図１のＸ軸方向に動かす。Ｙ軸移動機構１６２Ｙは、ステージ１６０上に設置された培養プレート１０を図１のＹ軸方向に動かす。なお、図１において、培養プレート１０が置かれるステージ１６０の平面をＸ−Ｙ平面として、当該ＸＹ平面に対して垂直な軸をＺ軸とする。

読取部１８０は、培養プレート１０の識別情報を読み取る。読取部１８０は、たとえば、バーコードリーダ、ＱＲコード（登録商標）リーダ、またはＲＦ（Radio Frequency）タグ対応のリーダであって、培養プレート１０に付された識別コードの種類に応じて選択される。読取部１８０は、読み取った識別情報を制御装置１２０に送信する。

制御装置１２０は、読取部１８０からの識別情報に基づいて、当該識別情報に対応する撮像条件を読み出し、読み出した撮像条件に基づいて顕微鏡カメラ１４０およびステージ１６０を制御し、各観察点を撮像する。

具体的には、制御装置１２０は、撮像視野変更機構１６２に対して、撮像対象とする観察点の位置を示す観察点情報を出力する。撮像視野変更機構１６２は、出力された観察点情報に従って、培養プレート１０を動かし、撮像対象の観察点を、顕微鏡カメラ１４０の撮像視野内に位置させる。

また、制御装置１２０は、撮像条件にしたがって焦点変更機構１４４に対して焦点の変更指示を出す。このとき、制御装置１２０は、撮像対象の観察点に顕微鏡カメラ１４０の焦点が合う合焦位置を焦点変更機構１４４に出力する。焦点変更機構１４４は、出力された合焦位置に顕微鏡カメラ１４０の焦点を設定する。

制御装置１２０は、顕微鏡カメラ１４０の撮像視野と焦点とが設定された場合に、イメージセンサ１４６に撮像指示を出し、画像データを得る。制御装置１２０は、画像データから観察結果として菌の数、菌の形状等を得る。

［培養プレートの構成］
図２は、培養プレートの平面図である。培養プレート１０は、板状部材１２と、流路構造とを備える。流路構造は、開口部１３、開口１４、マイクロ流路１５、観察点１６、および開口１７を備える。

開口１４は、開口部１３内に設けられ、開口部１３とマイクロ流路１５とを連通させる部分である。つまり、開口１４は、マイクロ流路１５の一方の端部に接続される。開口１４からは、流体圧を用いて菌を含む試験液がマイクロ流路１５に圧入される。図２に示した培養プレート１０上には、４本のマイクロ流路１５が、開口１４を中心として放射状に配置されている。

マイクロ流路１５は、試験液が流動可能に構成される。開口１４から延びたマイクロ流路１５は、複数のマイクロ流路１５に分岐する。開口１４から流入した試験液は、分岐したマイクロ流路１５に流動する。この実施形態では、１本のマイクロ流路１５から、１４本のマイクロ流路１５に分岐している。

分岐後のマイクロ流路１５の途中には観察点１６が設けられている。マイクロ流路１５は、開口１４から流入した試験液を観察点１６に流動させる。

観察点１６は、薬剤が配置され、マイクロ流路１５と接続されてマイクロ流路１５から流入した試験液を貯留する。観察点１６において、試験液は薬剤と反応する。薬剤は、例えば、抗菌薬である。薬剤は、固体であってもよいし、液体であってもよい。薬剤は、観察点１６に、予め載置される。すなわち、観察点１６に試験液が流入する前に、薬剤は観察点１６に載置される。観察点１６は、直方体状に形成される。観察点１６の一辺の長さは、例えば１０μｍ〜１０ｍｍである。

図２では、板状部材１２に５６個（＝１４個×４）の観察点１６が形成されている。すなわち、本実施の形態においては、一の培養プレート１０を観察する場合に、検査装置１００を用いて５６個の観察点１６を観察する。５６個の観察点１６に貯留される試験液の容量は互いに同一である。一方、５６個の観察点１６に載置される薬剤の種類及び薬剤の量は、互いに同一であってもよいし、互いに相違してもよい。

板状部材１２は、ポリメタクリル酸メチル樹脂のようなアクリル樹脂である。板状部材１２の厚みは、特に限定されないが、例えば、１ｍｍ〜６ｍｍに設定される。また、板状部材１２には、培養プレート１０を個別に識別するための識別コード１８が付されている。

識別コード１８は、一次元のバーコードまたは二次元のＱＲコード（登録商標）といった光学的に読み取り可能なものに限らず、ＲＦタグのような無線通信によって読み取り可能なものであってもよい。識別コード１８が示す識別情報は、培養プレート１０に個別に付される製造番号に限られず、培養プレート１０に付されるロット番号であってもよい。

培養プレート１０の主な材料は、アクリル樹脂である。そのため、培養プレート１０は、製造時の条件、保管条件、使用条件等の違いにより、わずかな個体差が生じる。被写界深度が広いカメラを利用する場合、わずかな個体差があったとしても、一の培養プレート１０を撮像したときに合わせた焦点の位置と同じ位置に焦点を合わせて他の培養プレート１０も撮像すれば、ある程度ピントの合った画像が得られる。しかし、本実施の形態にかかる検査においては、被写界深度が狭い顕微鏡カメラ１４０が用いられるため、一の培養プレート１０を撮像したときに合わせた焦点の位置と同じ位置に焦点を合わせて他の培養プレート１０を撮像しても、ピントの合った画像は得られない。

そこで、被写界深度が狭い顕微鏡カメラを利用する本実施の形態にかかる検査においては、撮像条件として各観察点１６にピントを合わせるための情報が、培養プレート１０ごとに付された個別の識別コード１８が示す識別情報によって管理される。

［検査の概要］
図１を参照して、検査の概要について説明する。本実施の形態において、検査装置１００は、菌と薬剤とを接触させてからの菌の様子を観察するために利用される。試験液の圧入された培養プレート１０は、菌の培養に適した温度（たとえば、３７℃）に設定されたインキュベータ２０内に格納され、観察するタイミングでインキュベータ２０から取り出される。

培養プレート１０は、たとえば、菌と薬剤とを接触させてから３時間の間、インキュベータ２０内に格納される。そして、菌と薬剤とを接触させたときを０分とし、０分、６０分、９０分、１２０分、１５０分、１８０分の各々における菌の様子が観察される。これにより、菌と薬剤とを接触させたときの、菌の変化が経時的に観察され、菌の動態検査の結果が得られる。

培養プレート１０上には、５６個の観察点１６が設けられている。本実施の形態における検査では、培養プレート１０をインキュベータ２０から取り出し、検査装置１００により当該培養プレート１０上の５６個の観察点１６の各々の撮像を行い、再度、培養プレート１０をインキュベータ２０に戻すという作業が繰り返される。

複数の培養プレート１０を同時並行で観察してもよい。この場合、各培養プレート１０に対して、上記、インキュベータ２０から取り出し、５６個の観察点１６の各々の撮像を行い、再度インキュベータ２０に戻すという作業の繰り返しが行われる。

［制御装置のハードウェア構成］
図３は、制御装置のハードウェア構成の一例を示す概略図である。制御装置１２０は、一例として、汎用的なコンピュータアーキテクチャに従って構成される。

制御装置１２０は、主な構成要素として、プロセッサ１２２と、メモリ１２４と、入出力インターフェイス（Ｉ／Ｆ）１２６とを有する。これらの各部は、バス１２８を介して互いに通信可能に接続される。

プロセッサ１２２は、典型的には、ＣＰＵ（Central Processing Unit）またはＭＰＵ（Multi Processing Unit）などの演算処理部である。プロセッサ１２２は、メモリ１２４に記憶されたプログラムを読み出して実行することで、検査装置１００の各部の動作を制御する。具体的には、プロセッサ１２２は、当該プログラムを実行することによって、後述する検査装置１００の処理の各々を実現する。なお、図３の例では、プロセッサが単数である構成を例示しているが、制御装置１２０は複数のプロセッサを有する構成としてもよい。

メモリ１２４は、ＲＡＭ（Random Access Memory）、ＲＯＭ（Read Only Memory）およびフラッシュメモリなどの不揮発性メモリ、磁気ディスク等の記憶装置によって実現される。メモリ１２４は、プロセッサ１２２によって実行されるプログラム、またはプロセッサ１２２によって用いられるデータなどを記憶する。具体的には、メモリ１２４は、各培養プレート１０上の各観察点１６を撮像するための撮像条件を記憶する。

入出力Ｉ／Ｆ１２６は、焦点変更機構１４４、イメージセンサ１４６、撮像視野変更機構１６２、および読取部１８０との間で各種データをやり取りするためのインターフェイスである。

［制御装置の機能構成］
図４は、制御装置の機能構成の一例を示すブロック図である。制御装置１２０、取得部２２２と、保存部２２４と、読出部２２６と、撮像制御部２２８と、解析部２３０とを備える。これらの各機能は、プロセッサ１２２がメモリ１２４に格納されたプログラムを実行することで実現する。

取得部２２２は、顕微鏡カメラ１４０の焦点が観察点１６に合う合焦位置４２４を取得する。取得部２２２は、既存のオートフォーカス技術を利用し、焦点変更機構１４４と協同して顕微鏡カメラ１４０を観察点１６に合焦して合焦位置４２４を取得する。

合焦位置４２４は、たとえば、顕微鏡カメラ１４０の焦点が観察点１６に合ったときの対物レンズ１４２の位置であって、ステージ１６０の表面から対物レンズ１４２までのＺ軸方向の距離である。

なお、合焦位置４２４を得る方法は、既存のオートフォーカス技術を利用した方法に限られない。たとえば、レーザ式の変位センサを利用して、予め定められた位置から観察点１６までの距離を測定することで、ステージ１６０のＸＹ平面から観察点１６までの距離を算出し、算出した距離に顕微鏡カメラ１４０の焦点距離を加えることで合焦位置を求めてもよい。

保存部２２４は、識別情報４４とカメラ情報４２とを対応付けて撮像条件２４０としてメモリ１２４に保存する。カメラ情報４２は、観察点情報４２２と合焦位置４２４とを含む。保存部２２４は、観察点情報４２２と、観察点情報４２２が示す観察点１６に顕微鏡カメラ１４０のピントを合わせるための合焦位置４２４とを対応付けてカメラ情報４２としてメモリ１２４に保存する。

観察点情報４２２は、一の観察点１６について、培養プレート１０上における当該観察点１６の位置を示す情報である。本実施の形態において、観察点情報４２２は、培養プレート１０上に５６個設けられた各々を示す観察点１６の番号である。

読出部２２６は、読取部１８０が読み取った識別情報４４に基づいて撮像条件２４０をメモリ１２４から読み出す。読出部２２６は、読み出した結果を撮像制御部２２８に送る。識別情報４４に対応する撮像条件２４０が格納されていない場合、読出部２２６は、撮像条件２４０が格納されていないことを撮像制御部２２８に対して出力する。識別情報４４に対応する撮像条件２４０が格納されている場合、読出部２２６は、当該撮像条件２４０を撮像制御部２２８に対して出力する。

撮像制御部２２８は、顕微鏡カメラ１４０および撮像視野変更機構１６２を制御して、各観察点１６の画像データを取得する。

撮像制御部２２８は、読出部２２６から撮像条件２４０が格納されていない旨の通知を受けた場合、撮像条件２４０を作成しつつ、画像データを得る。具体的には、撮像制御部２２８は、撮像視野変更機構１６２に観察点情報４２２である観察点１６の番号を出力する。なお、培養プレート１０上の観察点１６の位置を示す観察点情報４２２は、メモリ１２４に予め保存されている。

撮像視野変更機構１６２は、撮像制御部２２８からの観察点情報４２２に従って培養プレート１０を動かし、顕微鏡カメラ１４０の撮像視野内に指定した番号（位置）の観察点１６を位置させる。

また、撮像制御部２２８は、取得部２２２に対して、合焦位置４２４の取得を指示する。取得部２２２は、焦点変更機構１４４と協同して、顕微鏡カメラ１４０の撮像視野内に位置する観察点１６に、顕微鏡カメラ１４０を合焦させて合焦位置４２４を取得する。このとき、焦点変更機構１４４は、顕微鏡カメラ１４０の焦点を顕微鏡カメラ１４０の撮像視野内に位置する観察点１６に合わせる。

撮像制御部２２８は、焦点の調整が完了したことに従い、イメージセンサ１４６に撮像指示することで観察点１６の画像データを取得する。

撮像制御部２２８は、撮像が完了すると、観察点１６の番号を変更して、撮像視野変更機構１６２への指示、取得部２２２への指示、イメージセンサ１４６への撮像指示を繰り返す。撮像制御部２２８がこれらの指示を繰り返すことで、観察点１６ごとの合焦位置４２４が得られ、撮像条件２４０が生成されるとともに、画像データが得られる。

解析部２３０は、撮像制御部２２８が取得した画像データを解析し、観察結果２４２を得る。解析部２３０は、得られた観察結果２４２をメモリ１２４に保存する。観察結果２４２は、たとえば、画像データを二値化したデータ、画像データを解析して得られる菌の数、菌の形状を示すデータ、撮像したときの時間、撮像した位置を示す観察点情報４２２などを含み得る。

撮像制御部２２８は、撮像条件２４０が読出部２２６から出力された場合、出力された、すなわち、読み出された撮像条件２４０に従って顕微鏡カメラ１４０および撮像視野変更機構１６２を制御して、各観察点１６の画像データを取得する。解析部２３０は、得られた画像データを解析して得られる観察結果２４２をメモリ１２４に出力する。

具体的には、撮像制御部２２８は、観察点の番号を撮像視野変更機構１６２に出力するとともに、当該観察点の番号に対応する合焦位置を顕微鏡カメラ１４０の焦点変更機構１４４に対して出力し、顕微鏡カメラ１４０のイメージセンサ１４６に撮像指示を出す。

これにより、顕微鏡カメラ１４０の撮像視野内に指定した番号の観察点１６が位置するとともに、当該観察点１６に顕微鏡カメラ１４０の焦点が合い、ピントの合った画像データが得られる。このとき、焦点変更機構１４４は、指示された合焦位置に対物レンズ１４２の位置を設定するだけであり、焦点を合わせるように対物レンズ１４２の位置を調整する必要がないため、顕微鏡カメラ１４０の焦点を観察点１６に合わせるのに要する時間を短縮することができる。

以上のように、本実施の形態にかかる検査装置１００は、培養プレート１０上の各観察点１６を初めて撮像するときは、観察点１６に顕微鏡カメラ１４０の焦点が合うように対物レンズ１４２の位置を調整する一方、２回目以降の撮像では、１回目で撮像したときの調整結果を利用する。これにより、２回目以降の各回における撮像に要する時間を短縮することができる。その結果、菌の動態検査の結果を得るのに要する時間を短縮することができる。

なお、試験液を培養プレート１０に圧入する前に培養プレート１０上の観察点１６ごとの合焦位置４２４を取得し、その後、培養プレート１０に試験液を圧入して、検査を開始してもよい。すなわち、１回目の撮像のときに、観察結果を得ることなく、すなわち、実際に撮像することなく、観察点１６に顕微鏡カメラ１４０を合焦させて合焦位置４２４だけを取得するようにしてもよい。

上述したように、培養プレート１０上には、５６個の観察点１６が設けられているため、一つの観察点１６の撮像を完了するまでの時間が長くなると、一つ目の観察点１６を撮像したときの時間と、最後の５６個目の観察点１６を撮像したときの時間とのずれが大きくなる。

また、複数の培養プレート１０を同時並行で観察する場合に、一つの観察点１６の撮像を完了するまでの時間が長くなると、一の培養プレート１０の観察を完了するまでに要する時間は長くなる。たとえば、３０分間隔で観察する場合、遅くとも、３０分の間にすべての培養プレート１０の観察を終える必要がある。そのため、一の培養プレート１０の観察を完了するまでに要する時間が長くなると、同時並行で処理可能な培養プレート１０の数は少なくなる。

本実施の形態にかかる検査装置１００は、一の観察点１６を複数回観察する場合に、培養プレート１０に付された識別コード１８を読み取り、読み取った識別コード１８が示す識別情報４４に対応する合焦位置４２４を用いて顕微鏡カメラ１４０の焦点を設定する。そのため、検査装置１００を用いて一の観察点１６を複数回観察するときに、培養プレート１０上の観察点１６を観察するたびに顕微鏡カメラ１４０の焦点を観察点１６に合わせるように調節する場合に比べて、一つの観察点１６の撮像を完了するまでの時間を短くすることができる。その結果、最初の観察点１６を撮像したときの時間と最後の観察点１６を撮像したときの時間のずれを小さくすることができ、また、同時並行で処理可能な培養プレート１０の数も増やすことができる。

なお、図４には、プロセッサ１２２がプログラムを実行することで必要な機能が提供される構成例を示したが、これらの提供される機能の一部または全部を、専用のハードウェア回路（例えば、ＡＳＩＣ（Application Specific Integrated Circuit）またはＦＰＧＡ（Field-Programmable Gate Array）など）を用いて実装してもよい。

［フローチャート］
図５は、制御装置が実行する撮像処理のフローチャートである。撮像処理は、ステージ１６０上に培養プレート１０がセットされたときに開始される。なお、以下では、ステップを単に「Ｓ」と記載する。

Ｓ１０２において、制御装置１２０は、識別情報４４を取得する。Ｓ１０４において、制御装置１２０は、取得した識別情報４４に対応する撮像条件２４０がメモリ１２４に保存されているか否かを判断する。

制御装置１２０は、撮像条件２４０がメモリ１２４に保存されていないと判断した場合（Ｓ１０４においてＮＯ）、Ｓ１０６〜Ｓ１２０の処理を実行して、撮像処理を終了する。

Ｓ１０６において、制御装置１２０は、観察点１６の番号を１に設定する。Ｓ１０８において、制御装置１２０は、設定した番号の観察点１６を撮像視野内に位置させる。

Ｓ１１０において、制御装置１２０は、オートフォーカス処理を実行する。オートフォーカス処理は、既存のオートフォーカス技術を利用し、顕微鏡カメラ１４０の焦点を、顕微鏡カメラ１４０の撮像視野内に位置する観察点１６に合わせる処理である。これにより合焦位置４２４が得られる。

Ｓ１１２において、制御装置１２０は、顕微鏡カメラ１４０のイメージセンサ１４６に撮像を開始させる。Ｓ１１４において、制御装置１２０は、顕微鏡カメラ１４０が撮像した画像データから観察結果を得る。得られた観察結果はメモリ１２４に保存される。制御装置１２０は、たとえば、撮像した時間と、当該撮像したときに設定されている観察点１６の番号と画像データを解析して得られる情報とを観察結果としてメモリ１２４に保存する。

Ｓ１１６において、制御装置１２０は、Ｓ１１０のオートフォーカス処理で得られた合焦位置４２４を、設定した番号の観察点１６の合焦位置４２４として、Ｓ１０２の処理で得られた識別情報４４と対応付けて保存する。このとき、制御装置１２０は、合焦位置４２４と設定した番号を示す観察点情報４２２とを対応付けて保存する。

Ｓ１１８において、制御装置１２０は、観察点１６の番号を１加算する。Ｓ１２０において、制御装置１２０は、観察点１６の番号が５６を超えているか否かを判定する。制御装置１２０は、観察点１６の番号が５６を超えるまでＳ１０８〜Ｓ１２０の処理を繰り返し、撮像処理を終了する。

制御装置１２０は、撮像条件２４０がメモリ１２４に保存されていると判断した場合（Ｓ１０４においてＹＥＳ）、Ｓ１２２〜Ｓ１３６の処理を実行して、撮像処理を終了する。

Ｓ１２２において、制御装置１２０は、メモリ１２４からＳ１０２で取得した識別情報４４に対応する合焦位置４２４（カメラ情報４２）を取得する。

Ｓ１２４において、制御装置１２０は、観察点１６の番号を１に設定する。Ｓ１２６において、制御装置１２０は、設定した番号の観察点１６を撮像視野内に位置させる。

Ｓ１２８において、制御装置１２０は、顕微鏡カメラ１４０の焦点が設定した番号（観察点情報４２２）に対応する合焦位置４２４となるように、顕微鏡カメラ１４０の焦点を変更する。

Ｓ１３０において、制御装置１２０は、顕微鏡カメラ１４０のイメージセンサ１４６に撮像を開始させる。Ｓ１３２において、制御装置１２０は、顕微鏡カメラ１４０が撮像した画像データから観察結果を得る。得られた観測結果はメモリ１２４に保存される。制御装置１２０は、たとえば、撮像した時間と、当該撮像したときに設定されている観察点１６の番号と画像データを解析して得られる情報とを観察結果としてメモリ１２４に保存する。

Ｓ１３４において、制御装置１２０は、観察点１６の番号を１加算する。Ｓ１３６において、制御装置１２０は、観察点１６の番号が５６を超えているか否かを判定する。制御装置１２０は、観察点１６の番号が５６を超えるまでＳ１２６〜Ｓ１３６の処理を繰り返し、撮像処理を終了する。

Ｓ１０６〜Ｓ１２０の処理は、培養プレート１０に対して初めて撮像処理が実行されるときに行われる処理であって、撮像条件２４０の生成と各観察点１６の撮像とを同時並行で行う処理である。一方、Ｓ１２２〜Ｓ１３６の処理は、培養プレート１０に対してすでに撮像処理が実行されているときに行われる処理であって、２回目以降、観察点１６を撮像する場合に行われる処理である。Ｓ１２２〜Ｓ１３６の処理では、Ｓ１０６〜Ｓ１２０の実行で生成された撮像条件２４０を利用して各観察点１６の撮像が行われる。

［第１の変形例］
培養プレート１０は、インキュベータ２０内に格納され、予め定められたタイミングで取り出されてステージ１６０上に置かれる。培養プレート１０は、樹脂で出来ているため、インキュベータ２０内に格納されることで変形することが予想される。そこで、２回目以降の撮像で、初めて撮像したときに生成した撮像条件２４０を補正して利用するようにしてもよい。第１の変形例にかかる制御装置１２０は、２回目以降の撮像で、撮像条件２４０（合焦位置４２４）を補正する処理を実行する。

図６は、第１の変形例にかかる制御装置が実行する撮像処理のフローチャートである。第１の変形例にかかる制御装置１２０が実行する撮像処理は、Ｓ１２３の処理を実行する点で、上記実施の形態にかかる制御装置１２０が実行する撮像処理と異なる。

Ｓ１２３において、第１の変形例にかかる制御装置１２０は、培養条件に基づいて合焦位置４２４を補正する。培養条件は、培養プレート１０を変形させる因子であって、培養プレート１０が設置されている環境の温度および湿度、ならびに、培養プレート１０をインキュベータ２０に格納した時間などを含む。

たとえば、培養プレート１０を検査するときと同等の環境下での培養プレート１０の変形度合いを計測し、得られた変形度合いに基づいて合焦位置４２４が補正されてもよい。また、合焦位置４２４は、培養条件をパラメータとする補正式に従って、補正されてもよい。

なお、Ｓ１２３にかかる処理は、撮像処理とは別の処理として実行されてもよい。Ｓ１２３にかかる処理は、撮像条件２４０が生成された以降であれば、いずれのタイミングで実行されてもよい。

［第２の変形例］
第２の変形例にかかる制御装置１２０は、撮像条件２４０を補正する点で第１の変形例にかかる制御装置１２０と共通するものの、補正方法が異なる。以下、図７および図８を参照して、第２の変形例にかかる制御装置１２０が実行する処理について説明する。

図７は、第２の変形例にかかる制御装置が実行する撮像処理のフローチャートである。なお、図７においては、上記実施の形態にかかる制御装置が実行する撮像処理と共通する一部の処理（Ｓ１０２〜Ｓ１２０の処理）を省略している。

第２の変形例にかかる制御装置１２０が実行する撮像処理は、Ｓ１３２の代わりにＳ１３２’を実行し、Ｓ１３１−１〜Ｓ１３１−７の処理を実行する点で、上記実施の形態にかかる制御装置１２０が実行する撮像処理と異なる。以下、上記実施の形態と異なる処理を中心に説明する。

Ｓ１３０に続いて、第２の変形例にかかる制御装置１２０は、Ｓ１３１−１において、画像データを合焦位置と併せて保存する。

Ｓ１３１−２において、第２の変形例にかかる制御装置１２０は、顕微鏡カメラ１４０の焦点を垂直方向（図１中のＺ軸方向）上に所定距離α移動させる。具体的には、撮像条件２４０として保存されている合焦位置４２４から、予め定められた距離α分、ステージ１６０（培養プレート１０）から離す方向に焦点を移動させる。移動させる距離は、顕微鏡カメラ１４０の被写界深度に応じて設定されてもよく、また、培養プレート１０の設置環境に応じて設定されてもよい。

Ｓ１３１−３において、第２の変形例にかかる制御装置１２０は、顕微鏡カメラ１４０のイメージセンサ１４６に撮像を開始させる。

Ｓ１３１−４において、第２の変形例にかかる制御装置１２０は、画像データを合焦位置と併せて保存する。すなわち、第２の変形例にかかる制御装置１２０は、画像データと、当該画像データを撮像したときの顕微鏡カメラ１４０の焦点の位置とを対応付けて保存する。

Ｓ１３１−５において、第２の変形例にかかる制御装置１２０は、顕微鏡カメラ１４０の焦点を垂直方向（図１中のＺ軸方向）下に所定距離α移動させる。具体的には、撮像条件２４０として保存されている合焦位置４２４から、予め定められた距離α分、ステージ１６０（培養プレート１０）に近づく方向に焦点を移動させる。移動させる距離は、Ｓ１３１−２において移動させる距離と必ずしも同じである必要はない。

Ｓ１３１−６において、第２の変形例にかかる制御装置１２０は、第２の変形例にかかる制御装置１２０は、顕微鏡カメラ１４０のイメージセンサ１４６に撮像を開始させる。

Ｓ１３１−７において、第２の変形例にかかる制御装置１２０は、画像データを合焦位置と併せて保存する。

Ｓ１３２’において、第２の変形例にかかる制御装置１２０は、Ｓ１３１−１、Ｓ１３１−４、およびＳ１３１−７の各々で取得した画像データのうち、最もピントの合っている画像データから観察結果を得る。たとえば、第２の変形例にかかる制御装置１２０は、各画像データからピントに関連する特徴量を抽出する。なお、ピントに関連する特徴量は、既存の画像処理技術を利用して算出できる。第２の変形例にかかる制御装置１２０は、抽出した特徴量に基づいて最もピントの合っている画像データを特定する。このとき、第２の変形例にかかる制御装置１２０は、得られた観察結果と、最もピントの合っている画像データを撮像したときの合焦位置とを対応付けて保存する。

Ｓ１２８〜Ｓ１３１−７を実行することで、撮像条件２４０として保存されている合焦位置で撮像した画像に加えて、当該位置を中心に、顕微鏡カメラ１４０の焦点を垂直方向（図１中のＺ軸方向）に上下に所定距離ずらした位置で撮像した画像が得られる。

また、Ｓ１３２’を実行することで、撮像条件２４０として保存されている合焦位置で撮像した画像と、当該位置を中心に、顕微鏡カメラ１４０の焦点を垂直方向（図１中のＺ軸方向）に上下に所定距離ずらした位置で撮像した画像とのうち、最も焦点が合っている画像が特定される。

なお、Ｓ１３１−１，Ｓ１３１−４，およびＳ１３１−７において保存された画像データと合焦位置とから構成された情報は、Ｓ１３２’の処理で最もピントの合っている画像データを特定した後、削除されてもよい。

図８は、第２の変形例にかかる制御装置が実行する補正処理のフローチャートである。補正処理は、合焦位置で撮像した画像および、合焦位置を中心に上下に所定距離ずらした位置で撮像した画像に基づいて、撮像条件２４０を補正する。

具体的には、Ｓ２０２において、第２の変形例にかかる制御装置１２０は、観察点１６の番号を１に設定する。

Ｓ２０４において、第２の変形例にかかる制御装置１２０は、設定した番号の観察点１６の観察結果２４２に対応する合焦位置を取得する。ここで、上述したように、図７のＳ１３２’の処理が実行されることで、撮像条件２４０として保存されている合焦位置で撮像した画像と、当該位置を中心に、顕微鏡カメラ１４０の焦点を垂直方向（図１中のＺ軸方向）に上下に所定距離ずらした位置で撮像した画像とのうち、最も焦点が合っている画像から得られた観察結果２４２が、当該画像を撮像したときの合焦位置に対応付けてメモリ１２４に保存される。

すなわち、Ｓ２０４を実行することで、撮像条件２４０として保存されている合焦位置で撮像した画像と、当該位置を中心に、顕微鏡カメラ１４０の焦点を垂直方向（図１中のＺ軸方向）に上下に所定距離ずらした位置で撮像した画像とのうち、最も焦点が合っている画像を撮像したときの焦点の位置を示す合焦位置が取得される。

Ｓ２０６において、第２の変形例にかかる制御装置１２０は、撮像条件２４０として保存されている合焦位置を、Ｓ２０４で取得した合焦位置に補正する。

Ｓ２０８において、第２の変形例にかかる制御装置１２０は、観察点１６の番号を１加算する。Ｓ２１０において、第２の変形例にかかる制御装置１２０は、観察点１６の番号が５６を超えているか否かを判定する。第２の変形例にかかる制御装置１２０は、観察点１６の番号が５６を超えるまでＳ２０４〜Ｓ２１０の処理を繰り返し、補正処理を終了する。

培養プレート１０が、培養環境の下で変形している場合、顕微鏡カメラ１４０の焦点を顕微鏡カメラ１４０の垂直方向に沿って上下に所定距離ずらした位置で撮像した画像の方が、撮像条件２４０として保存されている合焦位置で撮像した画像に比べてピントが合っていることがある。

そこで、図８に示すような補正処理を実行することで、撮像条件２４０として保存されている合焦位置をピントが合っている画像を撮像したときの顕微鏡カメラ１４０の焦点の位置を示す合焦位置に補正することができる。

補正処理は、ｎ回目の撮像が行われてから、ｎ＋１回目の撮像が行われるまでの間のいずれのタイミングで実行されてもよい。また、補正処理は、インキュベータ２０に格納された時間が所定時間以上となった等、予め設定した条件が成立したことに応じて実行されるようにしてもよい。補正処理を実行する条件は、たとえば、培養プレート１０の変形する条件に基づいて設定される。

補正処理は、所定回数撮像を行う度に実行するようにしてもよい。培養プレート１０は、培養時間が進むにつれて徐々に変形する。そのため、観察点１６に焦点が合う顕微鏡カメラ１４０の焦点位置は、培養時間が進むにつれて徐々に変わる。所定回数撮像を行う度に補正処理を実行することで、培養時間が進むにつれて徐々に変わる焦点位置に合わせて撮像条件２４０を補正することができる。

なお、第２の変形例にかかる制御装置１２０は、撮像処理において焦点位置を変えた３点で撮像するものとしたが、２点以上であればよく、３点に限られない。

なお、第２の変形例にかかる制御装置１２０は、Ｓ１３２’の処理を撮像処理とは別のタイミングで実行してもよい。たとえば、Ｓ１３２’の処理を図８に示した補正処理の一部に組み込んでもよい。また、補正処理は、撮像処理中に実行されてもよい。具体的には、Ｓ２０６の処理をＳ１３２’の後に実行してもよい。

［その他変形例］
制御装置１２０は、撮像条件２４０を、当該制御装置１２０が有するメモリ１２４に保存するものとしたが、撮像条件２４０を保存する先はこれに限られない。たとえば、撮像条件２４０は、制御装置１２０と通信可能に接続された記憶装置に保存されてもよい。また、識別コード１８が書き込み可能なＲＦタグである場合に、ＲＦタグに撮像条件２４０を格納してもよい。

上記実施の形態において、観察点１６は、培養プレート１０上に複数設けられているものとしたが、これに限られない。培養プレート１０上に設けられた観察点１６の数は、１個であってもよく、また、２個以上であってもよく、また、５７個以上であってもよい。また、培養プレート１０上に設けられた観察点１６が一つである場合、撮像条件２４０に観察点１６の位置を示す情報を含めなくとも良く、また、撮像視野変更機構１６２を備えなくともよい。

上記実施の形態において、観察点１６の位置を示す情報は、観察点１６の番号としたが、これに限られない。たとえば、観察点１６の位置を示す情報は、ステージ１６０のうち、培養プレート１０を設置する平面（Ｘ−Ｙ平面）上の座標であってもよい。

また、観察点情報４２２は、予めメモリ１２４に保存されているものとしたが、識別コード１８を読み取ったときに、当該観察点情報４２２も読み取れるようにしてもよい。

上記実施の形態において、撮像視野変更機構１６２は、ステージ１６０を動かすことで顕微鏡カメラ１４０の撮像視野を変更するものとしたが、これに限られない。たとえば、撮像視野変更機構１６２は、顕微鏡カメラ１４０を動かすことで顕微鏡カメラ１４０の撮像視野を変更するものであってもよい。

上記実施の形態においては、解析部２３０が画像データを解析した結果を観察結果２４２として保存する例を示した。これに限られず、制御装置１２０は、解析部２３０を有することなく、画像データを観察結果２４２として保存してもよい。また、制御装置１２０は、画像データを別の情報処理装置に送信し、当該情報処理装置に解析部の機能をもたせてもよい。また、観察結果２４２をメモリ１２４に保存するとしたが、観察結果２４２をモニタ等の表示部に表示し、ユーザが確認した旨を入力したことに応じて当該観察結果２４２を削除するようにしてもよい。

上記実施の形態において、焦点変更機構１４４は、顕微鏡カメラ１４０が有するものとしたが、これに限られない。たとえば、焦点変更機構１４４は、培養プレート１０に対する顕微鏡カメラ１４０の焦点の位置を変更できるものであればよく、たとえば、ステージ１６０をＺ軸方向に移動させるものであってもよい。

上記実施の形態においては、各観察点１６にピントを合わせるための撮像条件が、培養プレート１０ごとに付された個別の識別コード１８が示す識別情報によって管理されるものとした。なお、培養プレート１０ごとの撮像条件を管理する方法は、識別情報を用いる方法に限られない。たとえば、培養プレート１０が保管されている位置情報（保管位置）を用いて、培養プレート１０ごとの撮像条件を管理してもよい。この場合、培養プレート１０に識別コード１８を設ける必要はなく、また、検査装置１００に読取部１８０を設ける必要はない。

たとえば、読出部２２６は、保管位置の入力が受け付けられたことに基づき、保管位置に対応する撮像条件を読み出してもよい。この場合、新たに検査を行うタイミング、または検査が終了したタイミングで、撮像条件を削除するようにしてもよい。保管位置は、たとえば、インキュベータ内の位置などである。保管位置は、ユーザが所定の入力部を操作することで出力されてもよく、あるいは、インキュベータから培養プレート１０を出し入れする作業が機械によって行われる場合、当該機械を管理するコントローラから出力されてもよい。

また、保管位置ではなく、培養プレート１０観察する際の設置位置を、培養プレート１０ごとに予め定めておき、設置位置を用いて培養プレート１０ごとの撮像条件を管理してもよい。

また、一度に検査する培養プレート１０が一枚である場合、撮像条件を識別情報で管理する必要はない。

［態様］
上述した実施の形態およびその変形例は、以下の態様の具体例であることが当業者により理解される。

（第１項）一態様に係る検査方法は、生物学的因子が配置されるプレート上の少なくとも一の観察点を顕微鏡カメラで撮像することにより、生物学的因子の動態を検査する検査方法である。検査方法は、観察点を第１撮像するときに、顕微鏡カメラを観察点に合焦して合焦位置を得るステップと、得られた合焦位置を記憶装置に保存するステップと、第１撮像した後、観察点を第２撮像するときに、合焦位置を記憶装置から読み出し、読み出した合焦位置に顕微鏡カメラの焦点を設定して観察点を撮像するステップとを含む。

このような構成によれば、第１撮像した後、観察点を第２撮像するときに、第１撮像したときに得た合焦位置に顕微鏡カメラの焦点が設定される。すなわち、観察点を第２撮像するときは、顕微鏡カメラの焦点を観察点に合わせる必要がない。その結果、焦点を合わせるのに要する時間を短縮することができ、生物学的因子の動態検査を短時間で行うことができる。

（第２項）第１項に記載の検査方法は、プレートに付された識別情報を読み取るステップをさらに含む。この場合に、合焦位置を保存するステップにおいて、合焦位置と識別情報とを対応付けて保存する。また、観察点を撮像するステップにおいて、読み取られた識別情報に対応する合焦位置を読み出す。

このような構成によれば、各合焦位置がプレートに付された識別情報と対応付けて記憶装置に保存されるため、個体差のあるプレートごとに顕微鏡カメラの焦点が観察点に合う合焦位置を管理することができる。これにより、同時に複数枚のプレートの観察を行う際の検査を簡単にできる。

（第３項）第１項または第２項に記載の検査方法において、プレートは、複数の観察点を有していてもよい。この場合に、合焦位置を保存するステップにおいて、顕微鏡カメラと観察点との相対的な位置関係を示す観察点情報を合焦位置に対応付けて保存する。また、観察点を撮像するステップにおいて、読み出した合焦位置に対応する観察点情報に従って顕微鏡カメラの撮像視野を設定する。

このような構成によれば、観察点ごとに焦点を合わせるのに要する時間を短縮できるため、複数の観察点を同時に観察することが可能であり、各観察点を撮像するタイミングのずれを少なくすることができる。

（第４項）第１項〜第３項のうちいずれか１項に記載の検査方法において、生物学的因子は菌である。この場合に、観察点には、菌を含む検体と抗菌剤とを接触させることで得られる観察対象が置かれる。

（第５項）第４項に記載の検査方法において、プレートを予め定められた時間、インキュベータに格納するステップと、メモリに保存された合焦位置を、培養条件に応じて補正するステップとをさらに含んでもよい。

このような構成によれば、インキュベータに格納することでプレートの変形が起こることが予想されるが、合焦位置を培養条件に応じて補正するため、焦点が観察点にあった画像を取得し続けることができる。

（第６項）第４項に記載の検査方法において、プレートを予め定められた時間、インキュベータに格納するステップと、顕微鏡カメラの焦点を、合焦位置からプレートに対して垂直方向に所定距離ずらした位置で観察点を撮像するステップと、合焦位置で撮像して得られた画像と、垂直方向に所定距離ずらした位置で撮像して得られた画像とのうち、焦点が合っている画像を用いて観察結果を得るステップとをさらに含んでもよい。

このような構成によれば、インキュベータに格納することでプレートの変形が起こることが予想されるが、合焦位置での撮像と、垂直方向に所定距離ずらした位置での撮像とを行うため、プレートの変形が起こっていても、焦点が観察点にあった画像を用いた観測結果を得られる。

（第７項）第４項に記載の検査方法において、プレートを予め定められた時間、インキュベータに格納するステップと、顕微鏡カメラの焦点を、合焦位置からプレートに対して垂直方向に所定距離ずらした位置で観察点を撮像するステップと、記憶装置に保存された合焦位置を、合焦位置で撮像して得られた画像と、垂直方向に所定距離ずらした位置で撮像して得られた画像とのうち、焦点が合っている画像を撮像したときにおける顕微鏡カメラの焦点の位置に補正するステップをさらに含んでもよい。

このような構成によれば、インキュベータに格納することでプレートの変形が起こることが予想されるが、合焦位置で撮像した画像と、垂直方向に所定距離ずらした位置で撮像した画像とのうち、焦点が合っている画像を撮像したときにおける顕微鏡カメラの焦点の位置に合焦位置が補正されるため、焦点の合った画像を取得し続けることができる。

（第８項）一態様に係る検査装置は、生物学的因子が配置されるプレート上の少なくとも一の観察点を撮像することにより、生物学的因子の動態を検査する検査装置である。検査装置は、観察点を撮像する顕微鏡カメラと、顕微鏡カメラの焦点を変更する焦点変更部と、観察点を第１撮像するときに、顕微鏡カメラを観察点に合焦して合焦位置を得る取得部と、得られた合焦位置を記憶装置に保存する保存部と、顕微鏡カメラおよび焦点変更部を制御して、観察点を撮像させる撮像制御部とを含む。撮像制御部は、第１撮像した後、観察点を第２撮像するときに、合焦位置を記憶装置から読み出し、読み出された合焦位置に顕微鏡カメラの焦点を設定させて観察点を撮像させる。

このような構成によれば、第１撮像した後、観察点を第２撮像するときに、第１撮像したときに得た合焦位置に顕微鏡カメラの焦点が設定される。すなわち、観察点を第２撮像するときは、顕微鏡カメラの焦点を観察点に合わせる必要がない。その結果、焦点を合わせるのに要する時間を短縮することができ、生物学的因子の動態検査を短時間で行うことができる。

（第９項）第８項に記載の検査装置は、プレートに付された識別情報を読み取る読取部をさらに含んでいてもよい。この場合、保存部は、合焦位置と識別情報とを対応付けて記憶装置に保存する。また、撮像制御部は、第２撮像するときに、読取部が読み取った識別情報に対応する合焦位置を記憶装置から読み出す。

このような構成によれば、各合焦位置がプレートに付された識別情報と対応付けて記憶装置に保存されるため、個体差のあるプレートごとに顕微鏡カメラの焦点が観察点に合う合焦位置を管理することができる。これにより、同時に複数枚のプレートの観察を行う際の検査を簡単にできる。

（第１０項）第８項または第９項に記載の検査装置は、顕微鏡カメラの撮像視野を変更する撮像視野変更部をさらに含んでいてもよい。プレートは、複数の観察点を有していてもよい。この場合、保存部は、顕微鏡カメラと観察点との相対的な位置関係を示す観察点情報を合焦位置に対応付けて保存する。撮像制御部は、読み出した合焦位置に対応する観察点情報に従って、撮像視野変更部を制御して、顕微鏡カメラの撮像視野を設定させる。

このような構成によれば、観察点ごとに焦点を合わせるのに要する時間を短縮できるため、複数の観察点を同時に観察することが可能であり、各観察点を撮像するタイミングのずれを少なくすることができる。

（第１１項）第８項〜第１０項のうちいずれか１項に記載の検査装置において、撮像制御部は、インキュベータから取り出したプレートの観察点を撮像する場合、記憶装置に保存された合焦位置を、観察点に置かれた観察対象の培養条件に応じて補正してもよい。

このような構成によれば、インキュベータに格納することでプレートの変形が起こることが予想されるが、合焦位置を培養条件に応じて補正するため、焦点が観察点にあった画像を取得し続けることができる。

（第１２項）第８項〜第１０項のうちいずれか１項に記載の検査装置において、撮像制御部は、インキュベータから取り出したプレートの観察点を撮像するときに、合焦位置で撮像させた第１画像と、合焦位置からプレートに対して垂直方向に所定距離ずらした位置で撮像させた第２画像とを取得し、第１画像と第２画像とのうち、焦点が合っている画像を用いて観察結果を得てもよい。

このような構成によれば、インキュベータに格納することでプレートの変形が起こることが予想されるが、合焦位置での撮像と、垂直方向に所定距離ずらした位置での撮像とを行うため、プレートの変形が起こっていても、焦点が観察点にあった画像を用いた観測結果を得られる。

（第１３項）第８項〜第１０項のうちいずれか１項に記載の検査装置において、撮像制御部は、インキュベータから取り出したプレートの観察点を撮像するときに、合焦位置で撮像させた第１画像と、合焦位置からプレートに対して垂直方向に所定距離ずらした位置で撮像させた第２画像とを取得し、記憶装置に保存された合焦位置を、第１画像と第２画像とのうち、焦点が合っている画像を撮像したときにおける顕微鏡カメラの焦点の位置に補正してもよい。

このような構成によれば、インキュベータに格納することでプレートの変形が起こることが予想されるが、合焦位置で撮像した画像と、垂直方向に所定距離ずらした位置で撮像した画像とのうち、焦点が合っている画像を撮像したときにおける顕微鏡カメラの焦点の位置に合焦位置が補正されるため、焦点の合った画像を取得し続けることができる。

今回開示された実施の形態は、全ての点で例示であって制限的なものではないと考えられるべきである。本発明の範囲は、上記した実施の形態の説明ではなくて特許請求の範囲によって示され、特許請求の範囲と均等の意味および範囲内での全ての変更が含まれることが意図される。

１０ 培養プレート、１２ 板状部材、１３ 開口部、１４，１７ 開口、１５ マイクロ流路、１６ 観察点、１８ 識別コード、２０ インキュベータ、４２ カメラ情報、４４ 識別情報、１００ 検査装置、１２０ 制御装置、１２２ プロセッサ、１２４ メモリ、１２６ 入出力Ｉ／Ｆ、１２８ バス、１４０ 顕微鏡カメラ、１４２ 対物レンズ、１４４ 焦点変更機構、１４６ イメージセンサ、１６０ ステージ、１６２ 撮像視野変更機構、１６２Ｘ Ｘ軸移動機構、１６２Ｙ Ｙ軸移動機構、１６４ 照明装置、１８０ 読取部、２２２ 取得部、２２４ 保存部、２２６ 読出部、２２８ 撮像制御部、２３０ 解析部、２４０ 撮像条件、２４２ 観察結果、４２２ 観察点情報、４２４ 合焦位置。

Claims (13)

1. 生物学的因子が配置されるプレート上の少なくとも一の観察点を顕微鏡カメラで撮像することにより、前記生物学的因子の動態を検査する検査方法であって、
   前記観察点を第１撮像するときに、前記顕微鏡カメラを前記観察点に合焦して合焦位置を得るステップと、
   得られた前記合焦位置を記憶装置に保存するステップと、
   前記第１撮像した後、前記観察点を第２撮像するときに、前記合焦位置を前記記憶装置から読み出し、読み出した前記合焦位置に前記顕微鏡カメラの焦点を設定して前記観察点を撮像するステップとを備える、検査方法。
2. 前記プレートに付された識別情報を読み取るステップをさらに備え、
   前記合焦位置を保存するステップにおいて、前記合焦位置と前記識別情報とを対応付けて保存し、
   前記観察点を撮像するステップにおいて、読み取られた前記識別情報に対応する前記合焦位置を読み出す、請求項１に記載の検査方法。
3. 前記プレートは、複数の前記観察点を有し、
   前記合焦位置を保存するステップにおいて、前記顕微鏡カメラと前記観察点との相対的な位置関係を示す観察点情報を前記合焦位置に対応付けて保存し、
   前記観察点を撮像するステップにおいて、読み出した前記合焦位置に対応する前記観察点情報に従って前記顕微鏡カメラの撮像視野を設定する、請求項１または請求項２に記載の検査方法。
4. 前記生物学的因子は菌であり、
   前記観察点には、前記菌を含む検体と抗菌剤とを接触させることで得られる観察対象が置かれる、請求項１〜請求項３のうちいずれか１項に記載の検査方法。
5. 前記プレートを予め定められた時間、インキュベータに格納するステップと、
   前記記憶装置に保存された前記合焦位置を、培養条件に応じて補正するステップとをさらに備える、請求項４に記載の検査方法。
6. 前記プレートを予め定められた時間、インキュベータに格納するステップと、
   前記顕微鏡カメラの焦点を、前記合焦位置から前記プレートに対して垂直方向に所定距離ずらした位置で前記観察点を撮像するステップと、
   前記合焦位置で撮像して得られた画像と、前記垂直方向に所定距離ずらした位置で撮像して得られた画像とのうち、焦点が合っている画像を用いて観察結果を得るステップとをさらに備える、請求項４に記載の検査方法。
7. 前記プレートを予め定められた時間、インキュベータに格納するステップと、
   前記顕微鏡カメラの焦点を、前記合焦位置から前記プレートに対して垂直方向に所定距離ずらした位置で前記観察点を撮像するステップと、
   前記記憶装置に保存された前記合焦位置を、前記合焦位置で撮像して得られた画像と、前記垂直方向に所定距離ずらした位置で撮像して得られた画像とのうち、焦点が合っている画像を撮像したときにおける前記顕微鏡カメラの焦点の位置に補正するステップをさらに備える、請求項４に記載の検査方法。
8. 生物学的因子が配置されるプレート上の少なくとも一の観察点を撮像することにより、前記生物学的因子の動態を検査する検査装置であって、
   前記観察点を撮像する顕微鏡カメラと、
   前記顕微鏡カメラの焦点を変更する焦点変更部と、
   前記観察点を第１撮像するときに、前記顕微鏡カメラを前記観察点に合焦して合焦位置を得る取得部と、
   得られた前記合焦位置を記憶装置に保存する保存部と、
   前記顕微鏡カメラおよび前記焦点変更部を制御して、前記観察点を撮像させる撮像制御部とを備え、
   前記撮像制御部は、前記第１撮像した後、前記観察点を第２撮像するときに、前記合焦位置を前記記憶装置から読み出し、読み出された前記合焦位置に前記顕微鏡カメラの焦点を設定させて前記観察点を撮像させる、検査装置。
9. 前記プレートに付された識別情報を読み取る読取部をさらに備え、
   前記保存部は、前記合焦位置と前記識別情報とを対応付けて前記記憶装置に保存し、
   前記撮像制御部は、前記第２撮像するときに、前記読取部が読み取った前記識別情報に対応する前記合焦位置を前記記憶装置から読み出す、請求項８に記載の検査装置。
10. 前記顕微鏡カメラの撮像視野を変更する撮像視野変更部をさらに備え、
    前記プレートは、複数の前記観察点を有し、
    前記保存部は、前記顕微鏡カメラと前記観察点との相対的な位置関係を示す観察点情報を前記合焦位置に対応付けて保存し、
    前記撮像制御部は、読み出した前記合焦位置に対応する前記観察点情報に従って、前記撮像視野変更部を制御して、前記顕微鏡カメラの撮像視野を設定させる、請求項８または請求項９に記載の検査装置。
11. 前記撮像制御部は、インキュベータから取り出した前記プレートの前記観察点を撮像する場合、前記記憶装置に保存された前記合焦位置を、前記観察点に置かれた観察対象の培養条件に応じて補正する、請求項８〜請求項１０のうちいずれか１項に記載の検査装置。
12. 前記撮像制御部は、
    インキュベータから取り出した前記プレートの前記観察点を撮像するときに、前記合焦位置で撮像させた第１画像と、前記合焦位置から前記プレートに対して垂直方向に所定距離ずらした位置で撮像させた第２画像とを取得し、
    前記第１画像と前記第２画像とのうち、焦点が合っている画像を用いて観察結果を得る、請求項８〜請求項１０のうちいずれか１項に記載の検査装置。
13. 前記撮像制御部は、
    インキュベータから取り出した前記プレートの前記観察点を撮像するときに、前記合焦位置で撮像させた第１画像と、前記合焦位置から前記プレートに対して垂直方向に所定距離ずらした位置で撮像させた第２画像とを取得し、
    前記記憶装置に保存された前記合焦位置を、前記第１画像と前記第２画像とのうち、焦点が合っている画像を撮像したときにおける前記顕微鏡カメラの焦点の位置に補正する、請求項８〜請求項１０のうちいずれか１項に記載の検査装置。
    

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