JP2020503031A - 糖タンパク質−薬物コンジュゲートを調製する方法 - Google Patents

糖タンパク質−薬物コンジュゲートを調製する方法 Download PDF

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Abstract

糖タンパク質を修飾する方法を提供する。さらに本発明は、糖タンパク質−ペイロードコンジュゲートを生成する方法、及びそれによって生じるコンジュゲートを提供する。【選択図】なし

Description

関連出願の相互参照
[0001]本出願は、その全容が参照により本明細書に組み込まれている、2016年12月29日に出願された米国特許仮出願第62/440,075号の利益を主張するものである。
発明の分野
[0002]本発明は、糖タンパク質が1つ又は複数のトリ−マンノシルコアを含むように糖タンパク質を修飾する方法に関する。さらに本発明は、本発明の糖タンパク質と目的のペイロードを含む糖タンパク質−ペイロードコンジュゲートに関する。
発明の背景
[0003]治療用タンパク質薬物は臨床分野で広く使用されており、高価値、高特異性及び低毒性というそれらの利点によって、世界中の大手製薬会社の幾つかは、臨床試験用にこのカテゴリーの薬物の開発に傾注している。これらの治療用タンパク質の大部分はモノクローナル抗体である。その臨床結果に満足している患者もある程度存在するが、臨床試験データは、これらの抗体の幾つかの治療効果は、特にがん治療において、依然として向上させる必要があることを示唆する。この欠点を解決するため、科学者達は、これらの臨床用抗体を幾つかの技術により修飾して、がん療法におけるそれらの有効性を向上させることに焦点を合わせ始めている。これらの技術の中では、抗体−薬物コンジュゲート(ADC)が、それらの化学、製造及び品質管理(CMC)フレンドリ性、ユーザフレンドリ性、及び少ない副作用のため一層注目されている。これまで、マイロターグ(Mylotarg)(登録商標)、アドセトリス(Adcetris)(登録商標)、ベスポンサ(Besponsa)(登録商標)及びカドサイラ(Kadcyla)(登録商標)を含めた4個の治療用抗体−薬物コンジュゲートが市場で入手可能であり、多くの他の抗体−薬物コンジュゲートは開発中である(Kubizek F1、Eggenreich B1、Spadiut O1.Protein Pept Lett.2017年、24(8):686〜695頁;Fischer E.、Roger Schibli R.Antibodies 2015年、4、197〜224頁;Sapra、P.、Hooper、A.、O’Donnell、C.and Gerber、H.−P.Expert Opin.Investig.Drugs 2011年、20、1131〜1180頁;Flygare、J.、Pillow、T.and Aristoff、P.、Chem.Biol.Drug Des.2013年、81、113〜121頁;Panowski、S.;Bhakta、S.;Raab、H.;Polakis、P.andJunutula、J.R.Site−specific antibody drug conjugates for cancer therapy.MAbs 2013年、6、34〜45頁)。
[0004]これらの臨床用ADCの中で、カドサイラ(登録商標)とマイロターグ(登録商標)は、リシン残基のアミン基にペイロード又はリンカーをランダムにコンジュゲートすることによって形成されるが、しかしながらアドセトリス(登録商標)、ブレンツキシマブベドチン(cAC10−vcMMAE、SGN−35)は、ネズミ抗CD30抗体AC10の可変重鎖及び軽鎖領域が融合したキメラ抗CD30モノクローナル抗体である。平均4個の(2−8)MMAE分子がSGN−30足場にコンジュゲートする。MMAEのコンジュゲート地点は、鎖間ジスルフィド結合の軽度還元によって生じるシステイン残基のランダムな−SH基である。リンカーはチオール反応性マレイミドカプロイルスペーサー、ジペプチドバリン−シトルリンリンカー、及びPABCスペーサーからなる(Francisco JA、Cerveny CG、Meyer DL、Mixan BJ、Klussman K、Chace DF、Rejniak SXら、cAC10−vcMMAE.Blood 2003年、4、1458〜65頁)。このような技術は抗体にペイロード又はリンカーを容易にコンジュゲートするが、抗体中の多数のリシン配列及びシステイン残基の最適還元反応の問題のため、コンジュゲートの薬物と抗体の比(DAR)を制御することは、これら2つの技術には難しい。これらの現象は抗体製品の不均質性を常にもたらし、CMCの問題を誘発する。幾つかの文献は、このタイプの第一世代非部位特異的ADCには、PK及び免疫原性の欠点があることをさらに示す。
[0005]第一世代ADCのこれらの欠点を解決するため、スマート−タグ(SMART−Tag)、非天然アミノ酸、任意のチロシン、治療用ソルターゼ、チオ−ブリッジ(Thio−Bridge)などを含む部位特異的ADCプラットホームが開発される。本発明者らの予想通り、これらの技術は、親抗体中の数箇所の特異的部位又はドメインを操作することにより均質なADC製品を生成することができる。例えばチオ−ブリッジ技術は、抗体の部分的に還元状態のジスルフィド結合にリンカー及びペイロードを結合させる。スマート−タグは、細菌オキシダーゼの基質配列として抗体の隣接配列を突然変異させることによる技術である。ホルムアルデヒドを含む得られた産物は、リンカー及びペイロードの結合部位として使用される。予想通り、これらの第二世代ADC技術は、独特なDARと高い均質性があるADC製品を生成することができる。しかしながら、天然抗体の突然変異のため、これらのADC製品はPK及び免疫原性の問題を有し得る。現在、糖操作した抗体の開発が成功したため、N−グリコシル化を介した抗体とペイロードのコンジュゲーションが非常に注目されている。
[0006]全ての天然IgG及び組換え抗体は、N−グリコシル化部位である重鎖CH2定常領域のそれぞれの中の位置297にアミノ酸アスパラギン(Asn297)を有する。哺乳動物細胞におけるグリコシル化及び翻訳後修飾によって、2つの2アンテナ形状グリカン部分がIgG上でのN−グリコシル化を介して形成され、2アンテナ形状グリカン部分のそれぞれは以下の式を有する少なくとも7つの糖部分によって基本的に構築される:

上式で第1のGlcNAc(GlcNAc)、及び第2のGlcNAc(GlcNAc)、及び任意選択でフコース糖(Fuc)は抗体のAsn297にそれぞれ結合し、GlcNAcは第1のマンノース(Man)にさらに結合し、第2及び第3のマンノース(Man及びMan)はManのα−1,3及びα−1,6位置にそれぞれ結合し、2つのさらなるGlcNAc糖(GlcNAc及びGlcNAc)はMan及びManのβ−1,2位置にそれぞれ結合する。このようなグリカン部分及びG0Fとして表されるフコースを有する抗体は、しかしながら、フコース部分が存在しないとき、この抗体はG0である(T.Shantha RajuMAbs.2012年5月1日;4(3):385〜391頁)。GlcNAc又はGlcNAcの一方が他のガラサイトース糖(galacytose sugar)と結合するとき、抗体はG1F/G1抗体として表される。抗体のグリカン部分中の末端GlcNAc糖の両方が2つの他のガラサイトース糖にそれぞれ結合するとき、抗体はG2F/G2抗体として表される。哺乳動物細胞によって産生される抗体は、G0F(約40%超)、G1F(約30%〜40%)及びG2F(1%未満)、及びシアル酸と結合した非常に少量のG1F/G1とG2F/G2を一般に含み得る。
[0007]N297グリカン中の各分岐部位の操作は構造を完全な状態に保ち、幾つかの機能多様性、例えば抗体のADCC、半減期及びCDCをもたらすので、幾つかのN297糖操作ADCプラットホームが開発されており、幾つかの製品は臨床試験段階にある。WO2014/164534A2、WO2014/065661A1、WO2015/032899A1、WO2015/057064A1、WO2015/157446A1、US8716033B2、US7416858B2、EP2753752B3、及び論評記事(Bioconjug Chem.;2015年11月18日;26(11):2070〜5頁)は、抗体薬物コンジュゲーション用の多くの修飾グリカン部分を開示している。しかしながら、抗体−薬物コンジュゲーションにおける薬物と抗体の比(DAR)は充分に制御することはできず、且つこれらの技術においてペイロードの多様化を実施できず、したがって、薬物と抗体の比を制御しADCのペイロード多様性を増大することが当技術分野において必要とされる。本発明はその必要性を満たし、他の利点を提供する。
[0008]本発明の一態様は、式(1)の構造を含む糖タンパク質−ペイロードコンジュゲートを生成する方法を提供する:
[0009]本発明の別の態様は、式(5)の構造を含む糖タンパク質−ペイロードコンジュゲートを生成する方法を提供する:
[00010]本発明の別の態様は、式(7)の構造を含む糖タンパク質−ペイロードA/Bコンジュゲートを生成する方法を提供する:
[00011]本発明の別の態様は、本発明の方法によって入手可能な糖タンパク質−ペイロードコンジュゲートを提供する。
トリ−マンノシル抗体薬物コンジュゲートを生成する1ステップ方針と逐次的方針を示す図である。 実施例1の換算質量クロマトグラフィー分析の結果を示す図である。結果は、β1,4ガラクトシダーゼ及びノイラミニダーゼの処理によってG0F/G0型ハーセプチンが生じたことを示す。 実施例2の換算質量クロマトグラフィー分析の結果を示す図である。結果は、N−アセチルグルコサミニダーゼSにより、G0/G0F型ハーセプチンがトリ−マンノシルコア抗体に転換されたことを示す。 実施例3の換算質量クロマトグラフィー分析の結果を示す図である。結果は、MGAT−1により、GlcNACがトリ−マンノシルハーセプチンの各部位上の末端マンノースの1アームにコンジュゲートしたことを示す。 実施例4の換算質量クロマトグラフィー分析の結果を示す図である。結果は、MGAT−2及びMGAT−1により、トリ−マンノシルハーセプチンがG0F/G0型ハーセプチンに転換されたことを示す。 実施例6の換算質量クロマトグラフィー分析の結果を示す図である。結果は、MGAT−1がUDP−GlcNAzをトリ−マンノシルハーセプチンの各部位上の末端マンノースの1アームにコンジュゲートさせたことを示す。 実施例7の換算質量クロマトグラフィー分析の結果を示す図である。図7Bは、実施例7のインタクト質量クロマトグラフィー分析の結果を示す。結果は、MGAT−1及びMGAT−2がUDP−GlcNAzをトリ−マンノシルハーセプチンにコンジュゲートさせて、末端N−アセチルグルコサミン中に4アジド基を有するG0F/G0型ハーセプチンが生じたことを示す。 実施例7のインタクト質量クロマトグラフィー分析の結果を示す図である。結果は、MGAT−1及びMGAT−2がUDP−GlcNAzをトリ−マンノシルハーセプチンにコンジュゲートさせて、末端N−アセチルグルコサミン中に4アジド基を有するG0F/G0型ハーセプチンが生じたことを示す。 実施例8の換算質量クロマトグラフィー分析の結果を示す図である。結果は、トリ−マンノシルハーセプチンがGlcNAzのコンジュゲートに関してMGAT−2の基質ではないことを証明する。 図9Aは実施例9の換算質量クロマトグラフィー分析の結果を示す図である。図9Bは、実施例9のインタクト質量クロマトグラフィー分析の結果を示す。これらの図の結果は、DBCO−(PEG)−DM1がクリックケミストリー反応によりトリ−マンノシルハーセプチン−4GlcNAzにコンジュゲートして、DAR4を有するハーセプチンADCが生成したことを示す。 実施例10の換算質量クロマトグラフィー分析の結果を示す図である。この図の結果は、MGAT−1及びDBCO−(PEG)−DM1により、第1のペイロードがトリ−マンノシル−2GlcNAzハーセプチン抗体の重鎖の各アームにコンジュゲートしたことを示す。 実施例11の換算質量クロマトグラフィー分析の結果を示す図である。この図の結果は、MGAT−2により、第2のGlcNAzがα−6マンノース、トリ−マンノシルハーセプチン−2(GlcNAz−トリアゾール−DBCO−(PEG)4−DM1)ADCの重鎖の各アームにコンジュゲートしたことを示す。これは、MGAT−2が非常に柔軟性のある基質酵素であり、UDP−GlcNAzをトリ−マンノシルハーセプチン−2(GlcNAz−トリアゾール−DBCO−(PEG)4−DM1)などの大型官能基抗体に転換して、デュアルペイロードADC産物の中間体を生成することを示唆する。 実施例12のインタクト質量クロマトグラフィー分析の結果を示す図である。この図の結果は、実施例11の産物から生じた中間体トリ−マンノシルハーセプチン−2−GlcNAz−2(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)4−DM1)にDBCO−(PEG)12−MMAEを加えることにより、抗体の各アーム上に1個のMMAEと1個のDM1を有するDAR4ADCハーセプチン産物が生じたことを示す。 実施例13のインタクト質量クロマトグラフィー分析の結果を示す図である。結果は、実施例11の産物から生じた中間体トリ−マンノシルハーセプチン−2−GlcNAz−2(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)4−DM1)にDBCO−MMAFを加えることにより、抗体の各アーム上に1個のMMAFと1個のDM1を有するDAR4ADCハーセプチン産物が生じたことを示す。 カドサイラと実施例14中に記載したトリ−マンノシルハーセプチン−4(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)4−DM1)の結合ELISAを示す図である。結果は、カドサイラとトリ−マンノシルハーセプチン−4(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)4−DM1)産物の間に有意なKd差はなかったことを示す。 実施例16のトリ−マンノシルコアトラスツズマブ抗体の換算質量クロマトグラフィー分析の結果を示す図である。結果は、哺乳動物細胞株によりトリ−マンノシルトラスツズマブとトリマンノシル抗TMCC3が生成されたことを示す。 実施例17の換算質量クロマトグラフィー分析及びインタクト質量クロマトグラフィー分析の結果を示す図である。これらの図の結果は、トリ−マンノシルトラスツズマブ−4(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)4−DM1)が、トリ−マンノシルトラスツズマブ産生哺乳動物細胞から生じたことを示す。
発明の詳細な説明
[00029]他に定義しない限り、本明細書で使用する全ての技術及び科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者によって一般に理解されているものと同じ意味を有する。本明細書で記載したものと同様又は同等の任意の方法及び材料を、本発明を実施又は試験する際に使用することはできるが、好ましい方法及び材料をここで記載する。本明細書で具体的に言及する全ての刊行物及び特許は、本発明に関して使用することができる刊行物中で報告された化学物質、細胞株、ベクター、動物、装置、統計分析及び方法の記載及び開示を含めたあらゆる目的で参照により本明細書に組み込まれている。本明細書中に引用した全ての参照文献は、当技術分野における技術のレベルを示すものとして考えるべきである。
[00030]略語
ADC 抗体−薬物コンジュゲート
DAR 薬物と抗体の比
Asn アスパラギン
GlcNAc N−アセチルグルコサミン
GlcNAz N−アジドアセチルグルコサミン
Fuc フコース
Man マンノース
MGAT−1;GnT−1 マンノシル(□(四角)−1,3−)−糖タンパク質□(四角)−1,2−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼ
MGAT−2;GnT−2 マンノシル(□(四角)−1,6−)−
糖タンパク質□(四角)−1,2−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼ
UDP ウリジン二リン酸
DBCO ジベンゾシクロオクチン基
DM1 メルタンシン
PEG ポリエチレングリコール
MES 4−モルホリンエタンスルホン酸
MMAE モノメチルアウリスタチンE
MMAF モノメチルアウリスタチンF
TMCC3 膜貫通及びコイルドコイルドメインファミリー3
[00031]本明細書及び添付の特許請求の範囲中で使用する単数形「a」、「an」及び「the」は、文脈が他の事を明らかに示さない限り複数表示を含むことを記さなければならない。同様に、用語「a」(又は「an」)、「1つ又は複数」及び「少なくとも1つ」は本明細書では同義で使用することができる。用語「comprising」、「including」及び「having」を同義で使用することができることも記さなければならない。
[00032]しばしば、「およそ」1つの特定値から及び/又は「およそ」別の特定値までとして、本明細書中で範囲を表す。このような範囲を表すとき、一実施形態は1つの特定値から及び/又は他の特定値までを含む。同様に、語句「およそ」の使用により値を近似値として表すとき、特定値が別の実施形態を形成することは理解される。範囲のそれぞれの終点は、他の終点に対して、それとは無関係にいずれも有意であることがさらに理解される。本明細書で使用する用語「およそ」は、±20%、±15%、±10%、±9%、±8%、±7%、±6%、±5%、±4%、±3%、±2%、±1%、±0.5%、又は±0.25%を指す。
[00033]製剤成分を言及するとき、使用する用語、例えば「作用物質」は指定分子体だけでなく、塩、エステル、アミド、プロドラッグ、コンジュゲート、活性代謝産物、及び他のこのような誘導体、アナログ、及び関連化合物を非制限的に含めた、その薬学的に許容されるアナログも包含するものとする。
[00034]本明細書で使用する一般用語「糖」は、単糖、例えばグルコース(Glc)、ガラクト−ス(Gal)、マンノース(Man)及びフコース(Fuc)、並びに単糖の誘導体、アミノ糖及び糖酸など、例えばグルコサミン(GlcN)、ガラクトースアミン(Galn)、N−アセチルグルコサミン(GlcNAc)、N−アジドアセチルグルコサミン(GlcNAZ)、N−アセチルガラクトースアミン(GalNAc)、N−アセチルノイラミン酸(NeuNAc)、N−アセチルムラミン酸(MurNAc)、グルクロン酸(GlcA)、及びイズロン酸(IdoA)を示す。
[00035]本明細書で使用する用語「タンパク質」は、天然アミノ酸配列を有するポリペプチド、並びにそれらの起源又は調製形式に関わらず変異体及び修飾型を含み得る。天然アミノ酸配列を有するタンパク質は、自然界から得たものと同じアミノ酸配列を有するタンパク質である。このような天然配列タンパク質は自然界から単離することができ、又は標準的組換え及び/又は合成法を使用して調製することができる。天然配列タンパク質は、自然界に存在する切断型又は可溶型、自然界に存在する変異体型(例えば、選択的スプライシング型)、自然界に存在する対立遺伝子変異体、及び翻訳後修飾を含む型を具体的に包含する。天然配列タンパク質は、グリコシル化、又はリン酸化などの翻訳後修飾、又は数個のアミノ酸残基の他の修飾後のタンパク質を含む。
[00036]本明細書で使用する用語「糖タンパク質」は、そのタンパク質と共有結合した1つ又は複数の単糖又はオリゴ糖鎖を含むタンパク質を指す。グリカンは、タンパク質のヒドロキシル基(O−結合−グリコシル)、例えばセリン、スレオニン、チロシン、ヒドロキシリシン又はヒドロキシプロリンのヒドロキシル基、又はタンパク質上のアミド(N−糖タンパク質)、例えばアスパラギン又はアルギニン、又はタンパク質上の炭素(C−糖タンパク質)、例えばトリプトファンに結合し得る。糖タンパク質は2つ以上のグリカンを含む可能性があり、1つ又は複数の単糖と1つ又は複数のオリゴ糖グリカンの組合せを含む可能性があり、N−結合、O−結合及びC−結合グリカンの組合せを含む可能性がある。糖タンパク質の例には、細胞の表面抗原に特異的なリガンド、前立腺特異的膜抗原、カンジダアンタルクティカ(candida antarctica)リパーゼ、gp41、gp120、エリスロポエチン(EPO)、不凍タンパク質及び抗体がある。
[00037]抗体は、特異的抗原を認識しそれに結合することができる、免疫系によって産生されるタンパク質である。本明細書中の用語抗体はその広い意味で使用し、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、ジマー、マルチマー、多重特異性抗体(例えば、二重特異性抗体)、抗体断片、並びに二本鎖及び一本鎖抗体を具体的に含む。用語「抗体」は、本明細書ではヒト抗体、ヒト化抗体、キメラ抗体、及びがん抗原に特異的に結合する抗体を含むことも意味する。用語「抗体」は、完全抗体、ただし抗体の断片、例えば切断抗体由来の抗体Fab断片、F(ab’)2、Fv断片若しくはFc断片、scFv−Fc断片、ミニボディ、ダイアボディ又はscFvも含むことを意味する。さらに、この用語は抗体の遺伝子操作型誘導体を含む。抗体、抗体の断片、及び遺伝子操作型抗体は、当技術分野で知られている方法によって得ることができる。適切な市販の抗体には、アブシキシマブ、リツキシマブ、バシリキシマブ、パリビズマブ、インフリキシマブ、トラスツズマブ、アレムツズマブ、アダリムマブ、トシツモマブ−1131、セツキシマブ、イブリツモマブチウキセタン、オマリズマブ、ベバシズマブ、ナタリズマブ、ラニビズマブ、パニツムマブ、エクリズマブ、セルトリズマブペゴル、ゴリムマブ、カナキヌマブ、カツマキソマブ、ウステキヌマブ、トシリズマブ、オファツムマブ、デノスマブ、ベリムマブ、イピリムマブ及びブレンツキシマブがあるが、これらだけには限られない。
[00038]原核生物及び真核生物発現系を含めた任意の数の発現系を使用して、抗体を産生することができる。幾つかの実施形態では、発現系は、(ハイブリドーマ、又はCHO細胞発現系などの哺乳動物細胞発現系である。多くのこのような系は、民間の供給業者から広範囲で入手可能である。抗体がV領域とV領域の両方を含む実施形態では、V領域とV領域を、シングルベクター、例えばジシストロニック発現ユニットを使用して、又は異なるプロモータの制御下において発現させることが可能である。他の実施形態では、別個のベクターを使用してV領域とV領域を発現させることが可能である。本明細書で記載するV領域又はV領域は、N末端にメチオニンを任意選択で含むことができる。
[00039]目的の抗体の重鎖と軽鎖をコードする遺伝子は細胞からクローニングすることができ、例えば、モノクローナル抗体をコードする遺伝子をハイブリドーマからクローニングし、それらを使用して組換えモノクローナル抗体を産生することができる。モノクローナル抗体の重鎖と軽鎖をコードする遺伝子ライブラリも、ハイブリドーマ又は形質細胞から作製することができる。重鎖及び軽鎖遺伝子産物のランダムな組合せによって、異なる抗原特異性を有する大群の抗体が生じる。
[00040]一本鎖抗体又は組換え抗体を産生するための技法(米国特許第4,946,778号、米国特許第4,816,567号)を適合させて、本発明のポリペプチドに対する抗体を産生することが可能である。さらに、トランスジェニックマウス、又は他の哺乳動物などの他の生物を使用してヒト化又はヒト抗体を発現させることが可能である(例えば米国特許第5,545,807号、米国特許第5,545,806号、米国特許第5,569,825号、米国特許第5,625,126号、米国特許第5,633,425号、米国特許第5,661,016号、Marksら、Bio/Technology10:779〜783頁(1992年);Lonbergら、Nature368:856〜859頁(1994年);Morrison、Nature368:812〜13頁(1994年);Fishwildら、Nature Biotechnology14:845〜51頁(1996年);Neuberger、Nature Biotechnology14:826(1996年);及びLonberg and Huszar、Intern.Rev.Immunol.13:65〜93頁(1995年)を参照)。
[00041]本明細書で使用する「GlcNAc」、「GlcNAc」、「GlcNAc」、及び「GlcNAc」は、アンテナ状グリカン部分の異なる位置におけるGlcNAc糖をそれぞれ表す。
[00042]本明細書で使用する

は3つのマンノースを含むトリ−マンノシル構造を表し、上式で第1のマンノース(Man)はGlcNAc糖に結合し、第2及び第3のマンノース(Man及びMan)はα−1,3及びα−1,6グリコシド結合を介してManにそれぞれ結合する。
[00043]本明細書で使用する「−(Fuc)0−1」は、フコース糖が任意選択で存在し、存在する場合、1つのフコース糖のみが存在することを表す。
[00044]本明細書で使用する「−(CH0−8−」は、−CH−が存在するか又は存在しない可能性があり、存在する場合、それは独立して1、2、3、4、5、6、7又は8個の−CH−基であり得ることを表す。
[00045]本発明の一態様は、式(1)の構造を含む糖タンパク質−ペイロードコンジュゲートを生成する方法であって、

(i)式(2)

を有するグリカンを含む糖タンパク質とβ−N−アセチルグルコサミニダーゼを反応させて、式(3)

のトリ−マンノシルコアを含む修飾糖タンパク質を生成するステップ、
(ii)式(3)のトリ−マンノシルコアを含む修飾糖タンパク質と、Rがアジド、ケトン基又はアルデヒドであるUDP−GlcNAc−(CH0−8−Rを、マンノシル(α−1,3−)−糖タンパク質β−1,2−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼ及びマンノシル(α−1,6−)−糖タンパク質β−1,2−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼの存在下で反応させ、Man及びManそれぞれのβ−1,2位置に2つのUDP−GlcNAc−(CH0−8−R糖をそれぞれ結合させ、それによって式(4)

のグリカン部分が形成されるステップ、及び
(iii)2つのコンジュゲータ−リンカー−ペイロードのペイロードが同じであるか又は異なる2つのコンジュゲータ−リンカー−ペイロードを式(4)のグリカン部分と反応させて、式(1)の構造を含む糖タンパク質−ペイロードコンジュゲートを生成するステップを含む方法を提供する。
[00046]幾つかの実施形態では、2つのペイロードは異なり、ペイロードはランダムな形式で、糖タンパク質中の4つのMan−GlcNAc構造のいずれかに結合することができる。
[00047]本発明の別の態様は、
式(5)の構造を含む糖タンパク質−ペイロードコンジュゲートを生成する方法であって、

(i)前に定義した式(3)のトリ−マンノシルコアを含む修飾糖タンパク質と、Rがアジド、ケトン基又はアルデヒドであるUDP−GlcNAc−(CH0−8−Rを、マンノシル(α−1,3−)−糖タンパク質β−1,2−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼの存在下で反応させ、Manのβ−1,2位置にGlcNAc−(CH0−8−R糖を結合させ、それによって式(6)

のグリカン部分を含む糖タンパク質が形成されるステップ、及び
(ii)式(6)のグリカン部分を含む糖タンパク質とコンジュゲータ−リンカー−ペイロードを反応させて、式(5)の構造を含む糖タンパク質−ペイロードコンジュゲートを生成するステップを含む方法を提供する。
[00048]幾つかの実施形態では、結合ペイロードの位置を正確に制御するため、式(7)

の構造を含む糖タンパク質−ペイロードA/Bコンジュゲートを、以下のステップ:
(i)前に定義した式(3)のトリ−マンノシルコアを含む修飾糖タンパク質と、Rがアジド、ケトン基又はアルデヒドであるUDP−GlcNAc−(CH0−8−Rを、マンノシル(α−1,3−)−糖タンパク質β−1,2−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼの存在下で反応させ、Manのβ−1,2位置にGlcNAc−(CH0−8−R糖を結合させ、それによって前に定義した式(6)のグリカン部分を含む糖タンパク質が形成されるステップ、
(ii)式(6)のグリカン部分を含む糖タンパク質とコンジュゲータ−リンカー−ペイロードAを反応させて、式(8)の構造を含む糖タンパク質−ペイロードAコンジュゲートを生成するステップ、

(iii)式(8)の構造を含む糖タンパク質−ペイロードAコンジュゲートと、Rがアジド、ケトン基又はアルデヒドであるUDP−GlcNAc−(CH0−8−Rを、マンノシル(α−1,6−)−糖タンパク質β−1,2−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼの存在下で反応させ、Manのβ−1,2位置にGlcNAc−(CH0−8−R糖を結合させ、それによって式(9)

を有しグリカン−ペイロードA部分を含む糖タンパク質が形成されるステップ、及び
(iv)式(9)を有しグリカン−ペイロードA部分を含む糖タンパク質とコンジュゲータ−リンカー−ペイロードBを反応させて、式(7)の構造を含む糖タンパク質−ペイロードA/Bコンジュゲートを生成するステップであって、
上式でペイロードAとペイロードBが同じであるか又は異なる方法によって生成することができる。
[00049]本明細書で使用する糖タンパク質は、例えば固相ペプチド合成(例えば、Merrifieldの固相合成)又は組換え生成によって得ることができる。組換え生成用に、糖タンパク質をコードする1つ又は複数のポリヌクレオチドを単離し、宿主細胞中でのさらなるクローニング及び/又は発現用にベクター内に挿入する。このようなポリヌクレオチドは容易に単離することができ、従来手順を使用して塩基配列決定することができる。当業者によく知られる方法を使用して、糖タンパク質のコード配列を含有する発現ベクターを構築することができる。これらの方法は、in vitro組換えDNA技法、合成技法、及びin vivo組換え/遺伝子組換えを含む。例えば、Maniatisら、MOLECULAR CLONING:A LABORATORY MANUAL、Cold Spring Harbor Laboratory、N.Y.(1989年)、及びAusubelら、CURRENT PROTOCOLS IN MOLECULAR BIOLOGY、Greene Publishing Associates and Wiley Interscience、N.Y.(1989年)中に記載された技法を参照。
[00050]本明細書で使用するβ−N−エチルグルコサミニダーゼは、オリゴ糖からのβ−N−アセチルグルコサミン残基の加水分解を触媒するグルコシダーゼファミリーを表す。多くのβ−N−アセチル−グルコサミニダーゼは、多タイプのβ−グリコシド結合を触媒する際に広範囲の加水分解能力を有することが分かっている。好ましい実施形態では、β−N−アセチルグルコサミニダーゼは、末端アセチルグルコサミン残基と糖タンパク質のN−グリカンの間に位置するβ1−2結合を触媒することができるエキソグリコシダーゼであり得る。エクソ−β−N−アセチルグルコサミニダーゼ変異体は、ストレプトコッカス種(Streptococcus spp.)及びカナバリアエンシフォルミス(Canavalia ensiformis)などの異なる供給源から得ることができる。
[00051]本発明によれば、マンノシル(α−1,3−)−糖タンパク質β−1,2−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼ(MGAT−1;GnT−I;EC:2.4.1.101)は、UDP−GlcNAcからα1−3グリコシド結合を介して別の糖部分又はグリカンと結合した末端マンノースにN−アセチル−D−グルコサミンを移動させる。GlcNAcとMGAT1により移動したα3マンノースの結合はβ1−2グリコシド結合である。MGAT1は真核生物において共通して発現されることが分かっている。それは、ゴルジにおけるハイブリッド及び複雑なN−グリカン生合成に不可欠な酵素であるからである。
[00052]本発明によれば、マンノシル(α−1,6−)−糖タンパク質β−1,2−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼ(MGAT−2;GnT−II;EC:2.4.1.143)は、UDP−GlcNAcからα1,6グリコシド結合を介して別の糖部分又はグリカンと結合した末端マンノースにN−アセチル−D−グルコサミンを移動させる。GlcNAcとMGATIIにより移動したα6マンノースの結合はβ1−2グリコシド結合である。MGAT2は真核生物において共通して発現されることが分かっている。それは、ゴルジにおける複雑なN−グリカン生合成に不可欠な酵素であるからである。
[00053]幾つかの実施形態では、式(2)を有するグリカンを含む糖タンパク質とβ−N−アセチルグルコサミニダーゼの間の反応を哺乳動物細胞培養において実施する。哺乳動物細胞培養では、式(2)を有するグリカンを含む糖タンパク質をコードする第1のポリヌクレオチド、及びβ−N−アセチルグルコサミニダーゼをコードする第2のポリヌクレオチドを含む哺乳動物細胞株を、糖タンパク質とβ−N−アセチルグルコサミニダーゼの発現に適した条件において一培地中でインキュベートする。哺乳動物宿主細胞株の例には、SV40によって形質転換されたサル腎CV1細胞株(COS−7)、ヒト胎児腎細胞株(293又は293T細胞)、ベビーハムスター腎細胞(BHK)、マウスセルトリ細胞(TM4細胞)、サル腎細胞(CV1)、アフリカミドリザル腎細胞(VERO−76)、ヒト子宮頸癌細胞(HELA)、イヌ科腎細胞(MDCK)、バッファローラット肝細胞(BRL3A)、ヒト肺細胞(W138)、ヒト肝細胞(HepG2)、マウス乳房腫瘍細胞(MMT060562)、TRI細胞、MRC5細胞、FS4細胞、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞、並びにYO、NS0、P3X63及びSp2/0などのミエローマ細胞株がある。
[00054]本発明の幾つかの実施形態では、糖タンパク質は抗体又はその断片である。抗体又はその断片は、抗体Fab断片、F(ab’)2、切断抗体由来のFv断片若しくはFc断片、scFv−Fc断片、ミニボディ、ダイアボディ又はscFvであり得る。好ましい実施形態では、抗体はハーセプチン、トラスツズマブ又は抗TMCC3抗体である。
[00055]本発明の一実施形態では、Rがアジドであり(これは正式名称なのか?)、コンジュゲータがアルキニルであるとき、コンジュゲータ−リンカー−ペイロードは、クリック反応により−GlcNAc−(CH0−8−R基と反応して、−GlcNAc−(CH0−8−リンカー−ペイロードを形成する(Angewandte Chemie International Edition.40(11):2004〜2021頁、及びAustralian Journal of Chemistry.60(6):384〜395頁)。別の実施形態では、Rがケトン基又はアルデヒドであり、コンジュゲータがアミノであるとき、コンジュゲータ−リンカー−ペイロードは、還元的アミノ化により−GlcNAc−(CH0−8−R基と反応して、−GlcNAc−(CH0−8−リンカー−ペイロードを形成する(J.Org.Chem、2010年、75、5470〜5477頁;and Synthesis、2011年、490〜496頁)。さらなる実施形態では、Rがケトン基又はアルデヒドであり、コンジュゲータがβ−アリールエチルアミノであるとき、コンジュゲータ−リンカー−ペイロードは、ピクテ−スペングラー反応により−GlcNAc−(CH0−8−R基と反応して、−GlcNAc−(CH0−8−リンカー−ペイロードを形成する(Bioconjugate Chem.、2013年、24(6)、846〜851頁)。
[00056]幾つかの実施形態では、糖タンパク質−ペイロードコンジュゲートを対象における疾患の治療に使用するとき、ペイロードは治療剤であってよい。治療剤は、細胞増殖抑制薬又は細胞毒性薬、又は対応する放射性同位元素を含むアイソトープ−キレート剤であってよい。細胞増殖抑制薬又は細胞毒性薬の例には、非制限的に、代謝拮抗薬(例えばフルオロウラシル(5−FU)、フロクスリジン(5−FUdR)、メトトレキサート、ロイコボリン、ヒドロキシウレア、チオグアニン(6−TG)、メルカプトプリン(6−MP)、シタラビン、ペントスタチン、フルダラビンリン酸、クラドリビン(2−CDA)、アスパラギナーゼ、ゲムシタビン、カペシチビン、アザチオプリン、シトシンメトトレキサート、トリメトプリム、ピリメタミン、又はペメトレキセド)、アルキル化剤(例えばメルファラン、クロラムブシル、ブスルファン、チオテパ、イホスファミド、カルムスチン、ロムスチン、セムスチン、ストレプトゾシン、ダカルバジン、マイトマイシンC、シクロホスファミド、メクロレタミン、ウラムスチン、ジブロモマンニトール、テトラニトレート、プロカルバジン、アルトレタミン、マイトゾロマミド、又はテモゾロミド)、アルキル化剤様作用物質(例えばシスプラチン、カルボプラチン、ネダプラチン、オキサリプラチン、サトラプラチン、又はトリプラチン)、DNA小溝アルキル化剤(例えばCC−1065などのデュオカルマイシン、及びその任意のアナログ若しくは誘導体、ピロロベンゾジアザペン、又はその任意のアナログ若しくは誘導体)、アントラサイクリン(例えばダウノルビシン、ドキソルビシン、エピルビシン、イダルビシン、又はバルルビシン)、抗生物質(例えばダクチノマイシン、ベロマイシン、ミトラマイシン、アントラマイシン、ストレプトゾトシン、グラミシジンD、マイトマイシン(例えばマイトマイシンC)、カリケアマイシン、抗有糸分裂薬(例えば、メイタンシノイド(DM1、DM3、及びDM4など)、アウリスタチン(例えば、モノメチルアウリスタチンE(MMAE)及びモノメチルアウリスタチンF(MMAF)含む)、ドラスタチン、クリプトフィシン、ビンカアルカロイド(例えば、ビンクリスチン、ビンブラスチン、ビンデシン、ビノレルビン)、タキサン(例えば、パクリタキセル、ドセタキセル、又は新規のタキサン)、ツブリシン、及びコルヒチン)含む)、トポイソメラーゼ阻害剤(例えばイリノテカン、トポテカン、カンプトテシン、エトポシド、テニポシド、アムサクリン、又はミトキサントロン)、HDAC阻害剤(例えばボリノスタット、ロミデプシン、チダミド、パノビノスタット、又はベリノスタット)、プロテアソーム阻害剤(例えばペプチジルホウ酸)、並びにAt211、I131、I125、Y90、Re186、Re188、Sm153、Bi212又は213、P32などの放射性同位元素及びLu177を含めたLuの放射性同位体がある。アイソトープ−キレート剤の例は、エチレンジアミン四酢酸(EDTA)、ジエチレントリアミン−N,N,N’,N’’,N’’−五酢酸(DTPA)、1,4,7,10−テトラアザシクロドデカン−N,N’,N’’,N’’’−四酢酸(DOTA)、1,4,7,10−テトラキス(2−ヒドロキシプロピル)−1,4,7,10−テトラアザシクロドデカン(THP)、トリエチレンテトラアミン−N,N,N’,N’’,N’’’,N’’’−六酢酸(TTHA)、1,4,7,10−テトラアザシクロドデカン−N,N’,N’’,N’’’−テトラキス(メチレンホスホン酸)(DOTP)、及びメルカプトアセチルトリグリシン(MAG3)を非制限的に含む。
[00057]幾つかの実施形態では、糖タンパク質−ペイロードコンジュゲートを検出に使用するとき、ペイロードは標識であってよい。これらの標識には、直接検出される標識又は成分(蛍光、発色団、高電子密度、化学発光、及び放射性標識など)、及び例えば酵素反応若しくは分子間相互作用によって間接的に検出される酵素又はリガンドなどの成分があるが、これらだけには限られない。例示的標識には、放射性同位元素P32、C14、I125、H、及びI131、レアアースキレート剤又はフルオレセイン及びその誘導体などのフルオロフォア、ローダミン及びその誘導体、ダンシル、ウンベリフェロン、ルシフェラーゼ、例えばホタルルシフェラーゼ及び細菌ルシフェラーゼ、ルシフェリン、2,3−ジヒドロフタラジンジオン、ホースラディッシュペルオキシダーゼ(HRP)、アルカリホスファターゼ、β−ガラクトシダーゼ、グルコアミラーゼ、リゾチーム、サッカリドオキシダーゼ、例えばグルコースオキシダーゼ、ガラクトースオキシダーゼ、及びグルコース−6−リン酸デヒドロゲナーゼ、酵素と結合し過酸化水素を利用してHRPなどの色素前駆体を酸化する、ウリカーゼ及びキサンチンオキシダーゼなどの複素環式化合物オキシダーゼ、ラクトペルオキシダーゼ、又はマイクロペルオキシダーゼ、ビオチン/アビジン、スピン標識、バクテリオファージ標識、安定的フリーラジカルなどがあるが、これらだけには限られない。別の実施形態では、標識はポジトロンエミッタである。ポジトロンエミッタには、Ga68、F18、Cu64、Y86、Br76、Zr89、及びI124があるが、これらだけには限られない。
[00058]幾つかの実施形態では、リンカーは糖タンパク質上に存在する電子求引基と反応することができる官能基を有する。このような電子求引基の例には、アルデヒド及びケトンカルボニル基があるが、これらだけには限られない。幾つかの実施形態では、リンカーの反応性官能基のヘテロ原子は糖タンパク質上の電子求引基と反応することができ、糖タンパク質ユニットと共有結合を形成することができる。このような反応性官能基の非制限的な例には、ヒドラジド、オキシム、アミノ、ヒドラジン、チオセミカルバゾン、ヒドラジンカルボキシレート、及びアリールヒドラジドがあるが、これらだけには限られない。
[00059]幾つかの実施形態では、コンジュゲータは糖タンパク質上に存在する電子求引基と反応することができる官能基を有する。このような電子求引基の例には、アジド、アルデヒド及びケトン基があるが、これらだけには限られない。幾つかの実施形態では、コンジュゲータの反応性官能基のヘテロ原子は糖タンパク質上の電子求引基と反応することができ、糖タンパク質ユニットと共有結合を形成することができる。このような反応性官能基の非制限的な例には、アルキン、ジベンゾシクロシチン、ヒドラジド、オキシム、アミノ、ヒドラジン、チオセミカルバゾン、ヒドラジンカルボキシレート、及びアリールヒドラジドがあるが、これらだけには限られない。
[00060]幾つかの実施形態では、リンカーはコンジュゲータ及びペイロードに結合することができる官能基を有する。このようなリンカーの例には、非切断性リンカー及び切断性リンカーがあるが、これらだけには限られない。幾つかの実施形態では、非切断性リンカーには、直鎖状又は分岐状の、2〜20個の炭素原子を有する、アルキル、シクロアルキル、アルケニル、シクロアルケニル、アルキニル、アリール、ヘテロアリール、アルコキシ、アシル、アルキルアミン、又はアリールアミン基があるが、これらだけには限られない。幾つかの実施形態では、切断性リンカーには、ジスルフィド含有リンカー、酸不安定性リンカー、光不安定性リンカー、ペプチダーゼ不安定性リンカー、及びエステラーゼ不安定性リンカーがあるが、これらだけには限られない。
[00061]以下の実施例は本発明の特定の実施形態を例証するために表し、本発明の範囲を限定するものとして解釈すべきではない。本発明の範囲は、図1中に示したような、トリ−マンノシルコア抗体由来の1種又は2種のペイロードを有する均質ADCを生成するための1ステップ又は逐次的プロセスを含む。
実施例1.β1,4−ガラクトシダーゼ及びノイラミニダーゼの使用によるハーセプチン抗体の調製
[00062]ハーセプチン抗体(Roche Inc)からN−グリカンのガラクトースとシアル酸部分を除去するため、10mgのハーセプチン抗体を、24時間37℃で、20μlのβ1,4−ガラクトシダーゼ(NEB、P0745L、8単位/μl)及び5μlのα2−3,6,8ノイラミニダーゼ(NEB、P0720L、50単位/μl)、1×Glycoバッファー1(NEB、全体積1ml)中を用いて処理した。10μlのβ1,4−ガラクトシダーゼ(NEB、P0745L、8単位/μl)を反応物にさらに加え、反応は37℃でさらに24時間実施させG0F/G0抗体試料を得た。この抗体試料は、rProtein A Sepharose Fast Flow(GE Healthcare、17−1279−02)を使用することによって精製した。精製後、抗体試料は換算質量クロマトグラフィー分析に施した。図2中に示した結果は、試料中の多量の抗体が(50,600Daの分子量である重鎖を有する)G0Fであり、ごく少量が(フコース糖を含まず、50,451Daの分子量である重鎖を有する)G0であることを明らかにする。
実施例2.トリ−マンノシルコア抗体へのハーセプチンの転換
[00063]実施例1からの10mgのG0F/G0ハーセプチン抗体を、24時間37℃で、20μlのβ−N−アセチルグルコサミニダーゼS(NEB、P0744L、4単位/μl)、1×Glycoバッファー1(NEB、全体積1ml)中を用いて処理した。10μlのβ−N−アセチルグルコサミニダーゼS(NEB、P0744L、4単位/μl)を反応物に加え、反応は37℃でさらに24時間進行させ消化抗体試料を得た。この消化抗体試料は、rProtein A Sepharose Fast Flow(GE Healthcare、17−1279−02)を使用することによって精製した。精製後、抗体試料は換算質量クロマトグラフィー分析に施した。図3中に示した結果は、50,194Daの分子量である重鎖を有するトリ−マンノシルコアハーセプチン抗体を得たこと、及びG0F及びG0ハーセプチン抗体のほぼ全てがトリ−マンノシルコア抗体に転換されたことを明らかにする。それは、β−N−アセチルグルコサミニダーゼSが、高効率でG0F及びG0抗体をトリ−マンノシルコアを有する抗体に転換することができることを示唆する。
実施例3.マンノシル(α−1,3−)−糖タンパク質β−1,2−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼ(MGAT−1;GnT−1)による、トリ−マンノシルコアハーセプチン抗体の各重鎖の1アームにおけるα−3マンノースとGlcNAcのコンジュゲーション
[00064]実施例2からのトリ−マンノシルコアハーセプチン抗体(40μg)及びUDP−GlcNAc(2.5mMの最終濃度)(Sigma、U4375)、1×バッファーSP(25mMのMES(4−モルホリンエタンスルホン酸)、10mMのMnCl、pH6.5))80μl中を、MGAT−1(0.15μg;R and D、8334−GT)の存在下において16時間37℃でインキュベートした。産物は換算質量クロマトグラフィー分析に施した。図4中に示した結果として、50,195Daの分子量である重鎖を有するトリ−マンノシルコアハーセプチン抗体と比較して、その重鎖がもう1つのGlcNAc(203Daの分子量)を含有し50,398Daの分子量を有する抗体産物を得た。それは、MGAT−1が1つのN−アセチルグルコサミンのみをその基質タンパク質に転換することをサポートする。
実施例4.MGAT−1及びマンノシル(α−1,6−)−糖タンパク質β−1,2−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼ(MGAT−2;GnT−2)による、G0F/G0ハーセプチンへのトリ−マンノシルコアハーセプチン抗体の転換
[00065]実施例2からのトリ−マンノシルコアハーセプチン抗体(40μg)及びUDP−GlcNAc(2.5mMの最終濃度)(Sigma、U4375)、1×バッファーSP(25mMのMES、10mMのMnCl、pH6.5))80μl中を、MGAT−1(0.15μg)及びMGAT−2(0.1μg)の存在下において16時間37℃でインキュベートした。インキュベーション後、反応産物は換算質量クロマトグラフィー分析に施した。図5中に示した結果として、50,194Daの分子量である重鎖を有するトリ−マンノシルコアハーセプチン抗体と比較して、その重鎖がさらに2つのGlcNAc(203Daの分子量×2)を含有し50,600Daの分子量を有する、少量のG0を含むG0F抗体産物を得た。これらの結果は、MGAT−1、MGAT−2及びN−アセチルグルコサミンを組合わせることによって、トリ−マンノシルコア抗体をG0/G0F抗体に転換することができることを示す。
実施例5.トリ−マンノシルコアハーセプチン抗体はMGAT−2の基質ではない
[00066]MGAT−2は、トリ−マンノシルコアがα(1,3)マンノースと結合したGlcNAc糖を既に有するときのみ、UDP−GlcNAc由来のGlcNAc糖をトリ−マンノシルコアのα(1,6)マンノースに転換する。言い換えると、GlcNAc糖がトリ−マンノシルコアのα(1,3)マンノースと結合していない場合、MGAT−2はGlcNAc糖をα(1,3)マンノース又はα(1,6)マンノースのいずれかに転換することはできない。前述の観察結果を確認するため、実施例2からのトリ−マンノシルコアハーセプチン抗体(40μg)及びUDP−GlcNAc(2.5mM)、1×バッファーSP(25mMのMES、10mMのMnCl、pH6.5)80μl中を、MGAT−2(0.1μg)の存在下において16時間37℃でインキュベートした。産物は換算質量クロマトグラフィー分析に施した。質量スペクトルにおいてトリ−マンノシルコア抗体の分子量に有意な差はない(データ示さず)。この結果は、トリ−マンノシルコアがMGAT−2の基質ではないこと、及びG0F/G0型抗体を生成するのにMGAT−2がMGAT−1の転換産物を必要とすることを示唆する。
実施例6.MGAT−1によるトリ−マンノシルコアハーセプチン抗体の各重鎖の1アームの末端α−3マンノースとGlcNAzのコンジュゲーション
実施例2からのトリ−マンノシルコアハーセプチン抗体(40μg)及びUDP−GlcNAz(1mM)(R and D、ES104−100)、1×バッファー(20mMのトリス、10mMのMnCl、pH6.5)80μl中を、MGAT−1(0.25μg;R and D、8334−GT)の存在下において16時間37℃でインキュベートした。産物は換算質量クロマトグラフィー分析に施した。図6中に示した結果として、50,195Daの分子量である重鎖を有するトリ−マンノシルコアハーセプチン抗体と比較して、その重鎖がもう1つのGlcNAz(244Daの分子量)を含有し50,438Daの分子量を有する抗体産物を得た。この結果は、UDP−GlcNAzがMGAT−1の基質の1つであること、及びMGAT−1を介して、GlcNAzはトリ−マンノシルコアハーセプチン抗体の各重鎖のアーム中のα−3マンノースに結合し、トリ−マンノシルハーセプチン−2GlcNAz抗体を形成することができることを示唆する。
実施例7.MGAT−1及びUDP−MGAT2によりトリ−マンノシルハーセプチン−4GlcNAzを生成するためのトリ−マンノシルコアハーセプチン抗体とGlcNAzのコンジュゲーション
[00067]実施例2からのトリ−マンノシルコアハーセプチン抗体(2mg)及びUDP−GlcNAz(1mM)、1×バッファーSP(25mMのMES、10mMのMnCl、pH6.5)800μl中を、ウサギMGAT−1(25μg)及びラットMGAT−2(10μg)の存在下において16時間37℃でインキュベートした。インキュベーション後、反応産物は換算質量クロマトグラフィー分析、及びインタクト質量クロマトグラフィー分析にそれぞれ施した。図7A中に示した換算質量クロマトグラフィー分析の結果として、50,194Daの分子量である重鎖を有するトリ−マンノシルコアハーセプチン抗体と比較して、その重鎖が2つのGlcNAz分子(244Da×2=488Daの分子量)を含有し各重鎖が50,680Daの分子量を有する、トリ−マンノシルハーセプチン−4GlcNAz抗体産物を得た。この結果は、MGAT−1及びMGAT−2を介して、GlcNAzがトリ−マンノシルコアハーセプチン抗体の各重鎖のα−3マンノースとα−6マンノースにコンジュゲートすることを示唆する。この結果は、インタクト質量クロマトグラフィー分析によってさらに確認される。図7B中に示した結果として、147,237Daの分子量を有する完全トリ−マンノシルコアハーセプチン抗体と比較して、4つのGlcNAz分子(244Da×4=976Daの分子量)を含有し148,213Daの分子量を有するG0Fトリ−マンノシルハーセプチン−4GlcNAz抗体産物を得た。本発明者らの結果は、UDP−GlcNAzがMGAT−1及びMGAT−2の基質の1つであることをさらにサポートし、本発明者らは、本発明者らの1ステッププロセスの仮説において中間体テトラ−アジド抗体を首尾よく合成することができる。
実施例8.トリ−マンノシルコアハーセプチン抗体はGlcNAzとコンジュゲートするMGAT−2の基質ではない
[00068]実施例2からのトリ−マンノシルコアハーセプチン抗体(40μg)及びUDP−GlcNAz(1mM)(R and D ES104−100)、1×バッファーSP(25mMのMES、10mMのMnCl、pH6.5)80μl中を、ラットMGAT−2(0.25μg)の存在下において16時間37℃でインキュベートした。産物は換算質量クロマトグラフィー分析に施した。図8は、質量スペクトルにおいてトリ−マンノシルコア抗体の分子量に有意な差はないことを示し、実施例5の結果としてトリ−マンノシルコア抗体がMGAT−2の基質ではないことを示唆する。
実施例9.DAR4を有するハーセプチンADCを生成するための、DBCO−(PEG)−DM1とトリ−マンノシルハーセプチン−4GlcNAz抗体のコンジュゲーション
[00069]実施例7中で、4つのGlcNAzそれぞれが4つの末端マンノースに結合したトリ−マンノシル抗体を生成した。本発明の1ステッププロセスの仮説を実施するため、DBCO−(PEG)−DM1を使用し毒性ペイロードとトリ−マンノシルハーセプチン−4GlcNAzをカップリングさせ、DAR4を有するADCを生成した。5μLのDBCO−(PEG)−DM1(DMSO中10mM)を、実施例7から得た5mg/mLのトリ−マンノシル−4GlcNAzハーセプチン抗体を含有する50μLのバッファー(25mMのMES、pH6.5)にゆっくり加え、25℃で一晩クリックケミストリー反応を実施した。反応後、Amicon Ultra−15遠心分離用フィルタデバイスにより抗体産物を精製して、トリ−マンノシルハーセプチン−4(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)ADCを得た。産物は換算質量クロマトグラフィー分析に施した。図9A中の結果は、4GlcNAzを含むその親トリ−マンノシル抗体との比較によって、反応産物、トリ−マンノシルハーセプチン−4(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)の重鎖は53,509Daの分子量を有することを明らかにし、それは2つのDBCO−(PEG)−DM1分子(1,413Da×2=2,826Daの分子量)が抗体のそれぞれの重鎖にコンジュゲートしたことを意味する。この結果はインタクト質量クロマトグラフィー分析によってさらに確認される。図9B中の結果は、約148,224Daの分子量を有するトリ−マンノシルハーセプチン−4GlcNAz抗体と比較して、4つのDBCO−(PEG)−DM1分子(1,413Da×4=5,652Daの分子量)を含有し、153,876Daの分子量を有する、トリ−マンノシルハーセプチン−4(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)ADC産物を得たことを明らかにする。実施例7及び9からの結果は、MGAT−1、MGAT−2及びGlcNAz反応及びDBCO−(PEG)−DM1クリックケミストリー反応を直接組合わせることにより、トリ−マンノシル抗体からADC−4DM1産物が生成されることを示す。したがって、本発明者らは、本発明中のADC生成に関する本発明者らの1ステッププロセスの仮説を首尾よく合理化する。
実施例10.DBCO−(PEG)−DM1による、トリ−マンノシルハーセプチン−2GlcNAzの重鎖の各アームにおける末端GlcNAzと第1のペイロードのコンジュゲーション。
実施例4〜9は、本発明中のADC生成に関する1ステッププロセスの実行をサポートして、4の均質DARを有する部位特異的ADCを生成する。これらの成功結果によって、図1中に示した逐次的方法を証明するための試験を実施した。第1の中間体産物を合成するため、DBCO−(PEG)−DM1を使用し反応抗体の重鎖の各末端GlcNAzにペイロードをカップリングさせた。14μLのDBCO−(PEG)−DM1(DMSO中10mM)を、実施例6から得た2mg/mLのトリ−マンノシルハーセプチン−2GlcNAz抗体を含有する350μLのバッファー(25mMのMES、pH6.5)にゆっくり加えた。反応混合物はアルゴン下において25℃で一晩攪拌し、クリックケミストリー反応を実施した。反応後、Amicon Ultra−15遠心分離用フィルタデバイスにより抗体産物を濾過して、トリ−マンノシルハーセプチン−2(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)中間体を得た。産物は換算質量クロマトグラフィー分析に施した。図10中に示した結果として、トリ−マンノシルハーセプチン−2GlcNAc抗体と比較して、51,852Daの分子量を有するトリ−マンノシルハーセプチン−2(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)中間体の重鎖の1アームは、1414Daの分子量を有する1つの他のDBCO−(PEG)−DM1分子を含有する。
実施例11.MGAT−2によるトリ−マンノシルハーセプチン−2(GlcNAz−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)ADCの重鎖の各アームにおける末端α−6マンノースと第2のGlcNAzのコンジュゲーション。
[00070]実施例10から得たトリ−マンノシルハーセプチン−2GlcNAz−2(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)及びUDP−GlcNAz(1mM)(R and D ES104−100)、1×バッファー(25mMのMES、10mMのMnCl、pH6.5)500μl中を、ラットMGAT−2(15μg)の存在下において16時間37℃でインキュベートした。反応後、Amicon Ultra−15遠心分離用フィルタデバイスにより抗体産物を濾過して、トリ−マンノシルハーセプチン−2GlcNAz−2(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)を得た。産物は換算質量クロマトグラフィー分析に施した。図11中に示した結果として、親トリ−マンノシルハーセプチン−2(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)と比較して、トリ−マンノシルハーセプチン−2GlcNAz−2(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)の各重鎖は、52,097Daの分子量を有する1つの他のGlcNAz分子を含有する(MW=244)。この結果は、MGAT−2が非常に柔軟性のある基質酵素であり、UDP−GlcNAzをトリ−マンノシルハーセプチン−2(GlcNAz−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)などの大型官能基抗体に転換して、デュアルペイロードADC産物の中間体を生成することを示す。
実施例12.抗体の各アーム上に1つのMMAEと1つのDM1を有するDAR4ADCハーセプチン産物の構築
[00071]実施例11中で、トリ−マンノシルハーセプチン−2GlcNAz−2(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)中間体を生成した。図1中に示した本発明の逐次的プロセスを実施するため、DBCO−(PEG)12−MMAEを使用し毒性ペイロードとトリ−マンノシルハーセプチン−2GlcNAz−2(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)をカップリングさせ、DAR4を有するADC及び2種のペイロードを生成した。
[00072]3.8μLのDBCO−(PEG)12−MMAE(DMSO中10mM)を、実施例11から得た2.5mg/mLのトリ−マンノシルハーセプチン−2GlcNAz−2(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)ADCを含有する76μLの1×バッファー(25mMのMES、pH6.5)にゆっくり加えた。反応混合物はアルゴン下において25℃で一晩攪拌し、クリックケミストリー反応を実施した。反応後、Amicon Ultra−15遠心分離用フィルタデバイスにより抗体産物を濾過して、トリ−マンノシルハーセプチン−2(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)−2(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)12−MMAE)ADCを得た。精製後、次いで産物はインタクト質量クロマトグラフィー分析に施した。図12中に示した結果として、151,050Daの分子量を有する親トリ−マンノシルハーセプチン−2GlcNAz−2(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)と比較して、得られたトリ−マンノシルハーセプチン−2(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)−2(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)12−MMAE)ADCは2つの他のDBCO−(PEG)12−MMAE分子(分子量=1648×2=3,296)を含有し、154,345Daの分子量を有する。この結果は、本発明の方法が、トリ−マンノシルハーセプチンと2つの異なるペイロード(例えば、DBCO−(PEG)−DM1及びDBCO−(PEG)12−MMAE)のコンジュゲーションを正確に制御することができることを示唆する。
実施例13.抗体の各アーム上に1つのMMAFと1つのDM1を有するDAR4ADCハーセプチン産物の構築
[00073]3.8μLのDBCO−MMAF(DMSO中10mM)を、実施例11から得た2.5mg/mLのトリ−マンノシルハーセプチン−2GlcNAz−2(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)ADCを含有する76μLの1×バッファー(25mMのMES、pH6.5)にゆっくり加えた。反応混合物はアルゴン下において25℃で一晩攪拌し、クリックケミストリー反応を実施した。反応後、Amicon Ultra−15遠心分離用フィルタデバイスにより抗体産物を濾過して、トリ−マンノシルハーセプチン−2(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)−2(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−MMAF)ADCを得た。産物はインタクト質量クロマトグラフィー分析に施した。図13中に示した結果として、親トリ−マンノシルハーセプチン−2GlcNAz−2(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)ADC(分子量=151,050Da)と比較して、得られたトリ−マンノシルハーセプチン−2(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)−2(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−MMAF)ADCは、2,038Daの分子量である2つの他のDBCO−MMAF分子を含有し、153,082Daの分子量を有する。この結果は、本発明の方法が、トリ−マンノシルハーセプチンと様々な種のペイロード(例えば、DBCO−(PEG)−DM1、DBCO−(PEG)12−MMAE及びDBCO−MMAF)のコンジュゲーションを正確に制御することができることを示唆する。
[00074]要約すると、MGAT−1、MGAT−2及びGlcNAz酵素反応及びDBCO−ペイロードケミストリー反応を組合わせることにより、本発明者らは本発明の本発明者らの仮説を合理化する。本発明者らは、本発明者らの1ステッププロセスにより、DAR4又はDAR2を有する均質な部位特異的ADC産物を生成することができる。他方で、本発明をさらに適用して、逐次的プロセスにより2種のペイロードを有する均質な部位特異的ADC産物を合成する。
実施例14.トリ−マンノシルハーセプチン−4(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)の結合アフィニティー分析
[00075]トリ−マンノシルハーセプチン−4(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)ADCを前に記載した方法によって構築した。Her2/Neu分子に対するカドサイラは(Roche Inc.)から購入した。ERBB2−ECD(ebioscience BMS362)(100ng/ウエル)をNUNC Maxisorpプレートの各ウエルに加え、プレートは一晩4℃で別の場所に置いた。プレートは1×PBS−T(0.1%)で洗浄し非コーティング試薬を除去した。3%スキムミルクをプレートのウエルに加え、プレートは室温で2時間別の場所に置いた。プレートは1×PBS−T(0.1%)で3回洗浄し、乾燥させ、次いでさらなる使用のため−20℃で保存した。個々の抗体の1×10−6g/mL〜1×10−12g/mLの連続希釈液をプレートに加え、プレートは37℃で1時間インキュベートした。ホースラディッシュペルオキシダーゼ(HRP)とコンジュゲートしたヤギ抗ヒトIgGを1時間のインキュベーションで加え、次いで3,3’,5,5’−テトラメチルベンジジン(TMB)を加えた。OD405を読み取り活性を計算した。各試験は3回繰り返し、データは平均±SDとして表した。ODを読み取り値と抗体の濃度を使用して、Prismソフトウエアを使用し多重スキャッタープロットを作製した。図14中に示した結果は、トリ−マンノシルハーセプチン−4(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)ADCの曲線は、陽性対照カドサイラ及びトリ−マンノシルハーセプチン−4GlcNAzの曲線とほぼ同じであったことを明らかにする。陰性対照アンチメソテリン(anti−mesothelien)はHer2/Neu分子に対する結合アフィニティーを示さない。この結果は、Her2/Neu分子に対するトリ−マンノシルハーセプチン−4(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)ADCの結合アフィニティーは、施す修飾によって影響を受けないことを示唆する。
実施例15.トリ−マンノシルハーセプチン−4(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)ADCの細胞毒性効果
[00076]Her2/Neu高度発現細胞株SK−BR−3、Her2/Neu中程度発現細胞株HCC−1954及びHer2/Neu低度発現細胞株MDA−MB−231を10細胞/mlに希釈した。100μLの希釈細胞培養物を96ウエルプレートのウエルに加えた後、細胞を37℃で24時間インキュベートした。80μlの完全培地を各ウエルに加え、20μlのトリ−マンノシルハーセプチン−4(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)ADCを、次いで異なるウエルに異なる用量で加えた。プレートを37℃で48時間インキュベートした後、100μlのCellTiter−Glo(登録商標)試薬を各ウエルに加えた。室温で10分間さらにインキュベートした後、ウエルの発光(光)をルミノメータによって測定した。Her2/Neu高度発現細胞株SK−BR−3、及びHer2/Neu中程度発現細胞株HCC−1954に対するトリ−マンノシルハーセプチン−4(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)ADCのIC50値は、それぞれ4.7nM及び14nMであった。これらのIC50値は、試験した全ての抗体には、Her2/Neu低度発現細胞株MDA−MB−231に対する抗増殖効果がなかったことも示す。この結果は、カドサイラ、トリ−マンノシルハーセプチン−4(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)ADCは、Her2/Neu高度発現細胞だけでなくHer2/Neu中程度発現細胞に対しても細胞毒性があり、トリ−マンノシルADCプラットホームによる抗体の修飾はその生物活性に影響を与えないことを示唆する。
実施例16.F293細胞によるトリ−マンノシルコアトラスツズマブ抗体及びトリ−マンノシルコア抗TMC33抗体の産生
[00077]β−N−アセチルグルコサミニダーゼSをコードするcDNAを含有するプラスミドpTCAE8.3−exo−Galを構築し、2つのF293細胞株にコトランスフェクトして、トリ−マンノシルトラスツズマブ(抗Her2抗体)及びトリ−マンノシル抗TMC33(膜貫通及びコイルドコイルドメインファミリー3)抗体をそれぞれ発現させた。インキュベーション後、2つの細胞培養物の上清を回収し、そこに含有されていた抗体は、rProtein A Sepharose Fast Flow(GE Healthcare、17−1279−02)を使用することによってそれぞれ精製した。精製後、精製した抗体試料は換算質量クロマトグラフィー分析に施した。図15A中に示した結果は、トラスツズマブ遺伝子のみをトランスフェクトしたF293細胞から単離した抗体と比較して、トラスツズマブ遺伝子とさらにβ−N−アセチルグルコサミニダーゼSをトランスフェクトした同じ細胞から得たトラスツズマブ抗体の重鎖は50,195Daの分子量でピークを示し、それは得られたトラスツズマブ抗体がトリ−マンノシルコア抗体であったことを示すことを明らかにする。同様の結果が、抗TMCC3抗体遺伝子をトランスフェクトした同じ細胞において見られる(図15B)。この結果は、トリ−マンノシル抗体は市販の細胞株から大量生産することが可能であり、工業的CMC増幅に施用されることを示唆する。
実施例17.MGAT−1及びMGAT−2によりトリ−マンノシルハーセプチン−4(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)ADCを生成するための細胞発現トリ−マンノシルコアトラスツズマブ抗体とUDP−GlcNAzのコンジュゲーション
[00078]実施例7中に記載した方法に従い、(哺乳動物細胞によって産生され)実施例16から得た2mgのトリ−マンノシルコアトラスツズマブ抗体及びUDP−GlcNAz(1mM)、1×バッファーSP(25mMのMES、10mMのMnCl、pH6.5)800μl中を、ウサギMGAT−1(25μg)及びラットMGAT−2(10μg)の存在下において16時間37℃でインキュベートした。インキュベーション後、反応産物は換算質量クロマトグラフィー分析、及びインタクト質量クロマトグラフィー分析に施した。図16A中に示した換算質量クロマトグラフィー分析の結果として、50,194Daの分子量である重鎖を有するトリ−マンノシルコアトラスツズマブ抗体と比較して、その重鎖が約244Da×2=488の分子量である2つの他のGlcNAz分子を含有し各重鎖が約50,680Daの分子量を有する、トリ−マンノシルトラスツズマブ−4GlcNAz抗体産物を得た。この結果は、MGAT−1及びMGAT−2を介して、GlcNAzが哺乳動物細胞によって産生されたトリ−マンノシルコアトラスツズマブ抗体の各重鎖のα−3マンノースとα−6マンノースにコンジュゲートし得ることを示唆する。
[00079]実施例9中に記載した方法に従い、DBCO−(PEG)−DM1を、前に得たトリ−マンノシルトラスツズマブ−4GlcNAz抗体を含有するトリスバッファー(pH7.0)にゆっくり加え、25℃で16時間クリックケミストリー反応を実施した。反応及び精製後、産物は換算質量クロマトグラフィー分析、及びインタクト質量クロマトグラフィー分析に施した。図16B中の換算質量クロマトグラフィー分析の結果は、産物の重鎖が53,509Daの分子量を有することを明らかにし、それは2つのDBCO−(PEG)−DM1分子(1,413Da×2=2,826Daの分子量)がトリ−マンノシルトラスツズマブ−4GlcNAz抗体の重鎖にコンジュゲートしたことを示唆する。この結果は、図16C中のインタクト質量クロマトグラフィー分析の結果によってさらに確認される。この結果は、4つのDBCO−(PEG)−DM1分子(1,413Da×4=5,652Daの分子量)を含有し約153,868Daの分子量を有する、トリ−マンノシル−4(GlcNAc−トリアゾール−DBCO−(PEG)−DM1)ADC産物を得たことを明らかにする。
[00080]当業者は、本発明が主題を実行し、前述の目的及び利点、並びにそれらの本質を得るように充分構成されていることを容易に理解する。本発明の代表的な好ましい実施形態として本明細書に記載した方法及び組成物は例示的なものであり、本発明の範囲を限定するものとして考えるべきではない。本発明の変形及び他の使用は当業者には思い浮かび、それらは本発明の精神内に包含され、特許請求の範囲によって定義される。

Claims (32)

  1. 式(1)の構造を含む糖タンパク質−ペイロードコンジュゲートを調製する方法であって、

    (i)式(2)を有するグリカンを含む糖タンパク質とβ−N−アセチルグルコサミニダーゼを反応させて、

    式(3)のトリ−マンノシルコアを含む修飾糖タンパク質を生成するステップ、

    (ii)式(3)の前記トリ−マンノシルコアを含む前記修飾糖タンパク質を、Rがアジド、ケトン基又はアルデヒドであるUDP−GlcNAc−(CH0−8−Rと、マンノシル(α−1,3−)−糖タンパク質β−1,2−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼ及びマンノシル(α−1,6−)−糖タンパク質β−1,2−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼの存在下で反応させ、2つのGlcNAc−(CH0−8−R糖をそれぞれMan及びManそれぞれのβ−1,2位置に結合させ、それによって式(4)のグリカン部分が形成されるステップ、及び

    (iii)2つのコンジュゲータ−リンカー−ペイロードの前記ペイロードが同じであるか又は異なる2つのコンジュゲータ−リンカー−ペイロードを式(4)の前記グリカン部分と反応させて、式(1)の構造を含む糖タンパク質−ペイロードコンジュゲートを生成するステップを含む方法。
  2. ステップ(i)中の式(2)を有するグリカンを含む前記糖タンパク質及び前記β−N−アセチルグルコサミニダーゼが哺乳動物細胞株によって生成される、請求項1に記載の方法。
  3. 前記哺乳動物細胞株がSV40によって形質転換されたサル腎CV1細胞株(COS−7)、ヒト胎児腎細胞株(293又は293T細胞)、ベビーハムスター腎細胞(BHK)、マウスセルトリ細胞(TM4細胞)、サル腎細胞(CV1)、アフリカミドリザル腎細胞(VERO−76)、ヒト子宮頸癌細胞(HELA)、イヌ科腎細胞(MDCK)、バッファローラット肝細胞(BRL3A)、ヒト肺細胞(W138)、ヒト肝細胞(HepG2)、マウス乳房腫瘍細胞(MMT060562)、TRI細胞、MRC5細胞、FS4細胞、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞、又はミエローマ細胞株である、請求項2に記載の方法。
  4. 前記糖タンパク質が、抗体又はその断片、例えば切断抗体由来の抗体Fab断片、F(ab’)2、Fv断片若しくはFc断片、scFv−Fc断片、ミニボディ、ダイアボディ又はscFvである、請求項1に記載の方法。
  5. Rがアジドであり、前記コンジュゲータがアルキニルであり、ステップ(iii)中で実施する前記反応がクリック反応である、請求項1に記載の方法。
  6. Rがケトン基又はアルデヒドであり、前記コンジュゲータがアミノであり、ステップ(iii)中で実施する前記反応が還元的アミノ化である、請求項1に記載の方法。
  7. Rがケトン基又はアルデヒドであり、前記コンジュゲータがβ−アリールエチルアミノであり、ステップ(iii)中で実施する前記反応がピクテ−スペングラー反応である、請求項1に記載の方法。
  8. 前記リンカーが、直鎖状又は分岐状の、2〜20個の炭素原子を有する、アルキル、シクロアルキル、アルケニル、シクロアルケニル、アルキニル、アリール、ヘテロアリール、アルコキシ、アシル、アルキルアミン、又はアリールアミン基、ジスルフィド含有リンカー、酸不安定性リンカー、光不安定性リンカー、ペプチダーゼ不安定性リンカー、及びエステラーゼ不安定性リンカーから選択される、請求項1に記載の方法。
  9. 前記ペイロードが治療剤及び標識から独立して選択される、請求項1に記載の方法。
  10. 前記治療剤が、代謝拮抗薬、アルキル化剤、アルキル化剤様作用物質、DNA小溝アルキル化剤、アントラサイクリン、抗生物質、カリケアマイシン、抗有糸分裂薬、トポイソメラーゼ阻害剤、プロテアソーム阻害剤、及び放射性同位元素から選択される、請求項9に記載の方法。
  11. 前記標識が、蛍光標識、発色団標識、高電子密度標識、化学発光標識、放射性標識、酵素標識、又はポジトロンエミッタである、請求項9に記載の方法。
  12. 請求項1で定義した式(1)の構造を含む糖タンパク質−ペイロードコンジュゲート。
  13. 式(5)の構造を含む糖タンパク質−ペイロードコンジュゲートを生成する方法であって、

    (i)請求項1で定義した式(3)の前記トリ−マンノシルコアを含む前記修飾糖タンパク質を、Rがアジド、ケトン基又はアルデヒドであるUDP−GlcNAc−(CH0−8−Rと、マンノシル(α−1,3−)−糖タンパク質β−1,2−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼの存在下で反応させ、GlcNAc−(CH0−8−R糖をManのβ−1,2位置に結合させ、それによって式(6)のグリカン部分を含む糖タンパク質が形成されるステップ、及び

    (ii)コンジュゲータ−リンカー−ペイロードを、式(6)のグリカン部分を含む前記糖タンパク質と反応させて、式(5)の構造を含む糖タンパク質−ペイロードコンジュゲートを生成するステップを含む方法。
  14. 前記糖タンパク質が、抗体又はその断片、例えば切断抗体由来の抗体Fab断片、F(ab’)2、Fv断片若しくはFc断片、scFv−Fc断片、ミニボディ、ダイアボディ又はscFvである、請求項13に記載の方法。
  15. Rがアジドであり、前記コンジュゲータがアルキニルであり、ステップ(ii)中で実施する前記反応がクリック反応である、請求項13に記載の方法。
  16. Rがケトン基又はアルデヒドであり、前記コンジュゲータがアミノであり、ステップ(ii)中で実施する前記反応が還元的アミノ化である、請求項13に記載の方法。
  17. Rがケトン基又はアルデヒドであり、前記コンジュゲータがβ−アリールエチルアミノであり、ステップ(ii)中で実施する前記反応がピクテ−スペングラー反応である、請求項13に記載の方法。
  18. 前記リンカーが直鎖状又は分岐状の、2〜20個の炭素原子を有する、アルキル、シクロアルキル、アルケニル、シクロアルケニル、アルキニル、アリール、ヘテロアリール、アルコキシ、アシル、アルキルアミン、又はアリールアミン基、ジスルフィド含有リンカー、酸不安定性リンカー、光不安定性リンカー、ペプチダーゼ不安定性リンカー、及びエステラーゼ不安定性リンカーから選択される、請求項13に記載の方法。
  19. 前記ペイロードが治療剤又は標識である、請求項13に記載の方法。
  20. 前記治療剤が、代謝拮抗薬、アルキル化剤、アルキル化剤様作用物質、DNA小溝アルキル化剤、アントラサイクリン、抗生物質、カリケアマイシン、抗有糸分裂薬、トポイソメラーゼ阻害剤、プロテアソーム阻害剤、及び放射性同位元素から選択される、請求項19に記載の方法。
  21. 前記標識が、蛍光標識、発色団標識、高電子密度標識、化学発光標識、放射性標識、酵素標識、又はポジトロンエミッタである、請求項19に記載の方法。
  22. 請求項13で定義した式(5)の構造を含む糖タンパク質−ペイロードコンジュゲート。
  23. 式(7)の構造を含む糖タンパク質−ペイロードA/Bコンジュゲートを生成する方法であって、

    (i)請求項1で定義した式(3)の前記トリ−マンノシルコアを含む前記修飾糖タンパク質を、Rがアジド、ケトン基又はアルデヒドであるUDP−GlcNAc−(CH0−8−Rと、マンノシル(α−1,3−)−糖タンパク質β−1,2−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼの存在下で反応させ、GlcNAc−(CH0−8−R糖をManのβ−1,2位置に結合させ、それによって式(6)のグリカン部分を含む糖タンパク質が形成されるステップ、

    (ii)コンジュゲータ−リンカー−ペイロードAを、式(6)のグリカン部分を含む前記糖タンパク質と反応させて、式(8)の構造を含む糖タンパク質−ペイロードAコンジュゲートを生成するステップ、

    (iii)式(8)の構造を含む前記糖タンパク質−ペイロードAコンジュゲートを、Rがアジド、ケトン基又はアルデヒドであるUDP−GlcNAc−(CH0−8−Rと、マンノシル(α−1,6−)−糖タンパク質β−1,2−N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼの存在下で反応させ、GlcNAc−(CH0−8−R糖をManのβ−1,2位置に結合させ、それによって式(9)を有しグリカン−ペイロードA部分を含む糖タンパク質が形成されるステップ、及び

    (iv)コンジュゲータ−リンカー−ペイロードBを、式(9)を有し前記グリカン−ペイロードA部分を含む前記糖タンパク質と反応させて、式(7)の構造を含む糖タンパク質−ペイロードA/Bコンジュゲートを生成するステップを含み、
    前記ペイロードAと前記ペイロードBとが同じであるか又は異なる方法。
  24. 前記糖タンパク質が、抗体又はその断片、例えば切断抗体由来の抗体Fab断片、F(ab’)2、Fv断片若しくはFc断片、scFv−Fc断片、ミニボディ、ダイアボディ又はscFvである、請求項23に記載の方法。
  25. Rがアジドであり、前記コンジュゲータがアルキニルであり、ステップ(ii)/(iv)中で実施する前記反応がクリック反応である、請求項23に記載の方法。
  26. Rがケトン基又はアルデヒドであり、前記コンジュゲータがアミノであり、ステップ(ii)/(iv)中で実施する前記反応が還元的アミノ化である、請求項23に記載の方法。
  27. Rがケトン基又はアルデヒドであり、前記コンジュゲータがβ−アリールエチルアミノであり、ステップ(ii)/(iv)中で実施する前記反応がピクテ−スペングラー反応である、請求項23に記載の方法。
  28. 前記リンカーが、直鎖状又は分岐状の、2〜20個の炭素原子を有する、アルキル、シクロアルキル、アルケニル、シクロアルケニル、アルキニル、アリール、ヘテロアリール、アルコキシ、アシル、アルキルアミン、又はアリールアミン基、ジスルフィド含有リンカー、酸不安定性リンカー、光不安定性リンカー、ペプチダーゼ不安定性リンカー、及びエステラーゼ不安定性リンカーから選択される、請求項23に記載の方法。
  29. 前記ペイロードA及び前記ペイロードBが治療剤及び標識から独立して選択される、請求項23に記載の方法。
  30. 前記治療剤が、代謝拮抗薬、アルキル化剤、アルキル化剤様作用物質、DNA小溝アルキル化剤、アントラサイクリン、抗生物質、カリケアマイシン、抗有糸分裂薬、トポイソメラーゼ阻害剤、プロテアソーム阻害剤、及び放射性同位元素から選択される、請求項29に記載の方法。
  31. 前記標識が、蛍光標識、発色団標識、高電子密度標識、化学発光標識、放射性標識、酵素標識、又はポジトロンエミッタである、請求項29に記載の方法。
  32. 請求項23で定義した式(7)の構造を含む糖タンパク質−ペイロードA/Bコンジュゲート。
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