JP2019523000A - 抗原をカップリングさせたハイブリダイゼーション試薬 - Google Patents
抗原をカップリングさせたハイブリダイゼーション試薬 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2019523000A JP2019523000A JP2019502168A JP2019502168A JP2019523000A JP 2019523000 A JP2019523000 A JP 2019523000A JP 2019502168 A JP2019502168 A JP 2019502168A JP 2019502168 A JP2019502168 A JP 2019502168A JP 2019523000 A JP2019523000 A JP 2019523000A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- hybridization reagent
- hybridization
- detectable
- cross
- reagent
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 title claims abstract description 335
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 title claims abstract description 295
- 239000000427 antigen Substances 0.000 title claims abstract description 195
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 title claims abstract description 194
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 title claims abstract description 194
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims abstract description 121
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims abstract description 121
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims abstract description 121
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 116
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims abstract description 81
- 108020005187 Oligonucleotide Probes Proteins 0.000 claims abstract description 77
- 239000002751 oligonucleotide probe Substances 0.000 claims abstract description 77
- 238000003556 assay Methods 0.000 claims abstract description 54
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims abstract description 28
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims description 95
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 claims description 72
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 claims description 56
- -1 amyloid P Proteins 0.000 claims description 55
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 44
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 41
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 claims description 36
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 31
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 claims description 26
- 102000013415 peroxidase activity proteins Human genes 0.000 claims description 23
- 108040007629 peroxidase activity proteins Proteins 0.000 claims description 23
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 23
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims description 21
- 101000946843 Homo sapiens T-cell surface glycoprotein CD8 alpha chain Proteins 0.000 claims description 19
- 102100034922 T-cell surface glycoprotein CD8 alpha chain Human genes 0.000 claims description 19
- 238000010494 dissociation reaction Methods 0.000 claims description 19
- 230000005593 dissociations Effects 0.000 claims description 19
- 101000716102 Homo sapiens T-cell surface glycoprotein CD4 Proteins 0.000 claims description 18
- 102100036011 T-cell surface glycoprotein CD4 Human genes 0.000 claims description 18
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims description 18
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims description 17
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims description 17
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 claims description 17
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims description 13
- 102100022005 B-lymphocyte antigen CD20 Human genes 0.000 claims description 12
- 108010074708 B7-H1 Antigen Proteins 0.000 claims description 12
- 101000897405 Homo sapiens B-lymphocyte antigen CD20 Proteins 0.000 claims description 12
- 101000934372 Homo sapiens Macrosialin Proteins 0.000 claims description 12
- 102100025136 Macrosialin Human genes 0.000 claims description 12
- 102100024216 Programmed cell death 1 ligand 1 Human genes 0.000 claims description 12
- 108010001336 Horseradish Peroxidase Proteins 0.000 claims description 9
- 239000002771 cell marker Substances 0.000 claims description 9
- 102000017420 CD3 protein, epsilon/gamma/delta subunit Human genes 0.000 claims description 8
- 108050005493 CD3 protein, epsilon/gamma/delta subunit Proteins 0.000 claims description 8
- 101001133056 Homo sapiens Mucin-1 Proteins 0.000 claims description 8
- 102100034256 Mucin-1 Human genes 0.000 claims description 8
- 101710089372 Programmed cell death protein 1 Proteins 0.000 claims description 8
- 150000004753 Schiff bases Chemical class 0.000 claims description 8
- 238000012650 click reaction Methods 0.000 claims description 8
- 102000052116 epidermal growth factor receptor activity proteins Human genes 0.000 claims description 8
- 108700015053 epidermal growth factor receptor activity proteins Proteins 0.000 claims description 8
- YOHYSYJDKVYCJI-UHFFFAOYSA-N n-[3-[[6-[3-(trifluoromethyl)anilino]pyrimidin-4-yl]amino]phenyl]cyclopropanecarboxamide Chemical compound FC(F)(F)C1=CC=CC(NC=2N=CN=C(NC=3C=C(NC(=O)C4CC4)C=CC=3)C=2)=C1 YOHYSYJDKVYCJI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- 239000002105 nanoparticle Substances 0.000 claims description 8
- 102100023990 60S ribosomal protein L17 Human genes 0.000 claims description 7
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 claims description 7
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 claims description 7
- 108060005986 Granzyme Proteins 0.000 claims description 7
- 102000001398 Granzyme Human genes 0.000 claims description 7
- 102100031573 Hematopoietic progenitor cell antigen CD34 Human genes 0.000 claims description 7
- 101000777663 Homo sapiens Hematopoietic progenitor cell antigen CD34 Proteins 0.000 claims description 7
- 239000002262 Schiff base Substances 0.000 claims description 7
- 102100031658 C-X-C chemokine receptor type 5 Human genes 0.000 claims description 6
- 108010009992 CD163 antigen Proteins 0.000 claims description 6
- 108010015776 Glucose oxidase Proteins 0.000 claims description 6
- 239000004366 Glucose oxidase Substances 0.000 claims description 6
- 102100034458 Hepatitis A virus cellular receptor 2 Human genes 0.000 claims description 6
- 101000922405 Homo sapiens C-X-C chemokine receptor type 5 Proteins 0.000 claims description 6
- 101001068133 Homo sapiens Hepatitis A virus cellular receptor 2 Proteins 0.000 claims description 6
- 101000998146 Homo sapiens Interleukin-17A Proteins 0.000 claims description 6
- 101000664703 Homo sapiens Transcription factor SOX-10 Proteins 0.000 claims description 6
- 102100033461 Interleukin-17A Human genes 0.000 claims description 6
- 102000004388 Interleukin-4 Human genes 0.000 claims description 6
- 108090000978 Interleukin-4 Proteins 0.000 claims description 6
- 102000017578 LAG3 Human genes 0.000 claims description 6
- 101150030213 Lag3 gene Proteins 0.000 claims description 6
- 108010042215 OX40 Ligand Proteins 0.000 claims description 6
- 102000004473 OX40 Ligand Human genes 0.000 claims description 6
- 102100025831 Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130 Human genes 0.000 claims description 6
- 102100038808 Transcription factor SOX-10 Human genes 0.000 claims description 6
- 102100022153 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4 Human genes 0.000 claims description 6
- 101710165473 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4 Proteins 0.000 claims description 6
- 238000012412 chemical coupling Methods 0.000 claims description 6
- 229940116332 glucose oxidase Drugs 0.000 claims description 6
- 235000019420 glucose oxidase Nutrition 0.000 claims description 6
- 150000002923 oximes Chemical class 0.000 claims description 6
- 239000002096 quantum dot Substances 0.000 claims description 6
- 102000004266 Collagen Type IV Human genes 0.000 claims description 5
- 108010042086 Collagen Type IV Proteins 0.000 claims description 5
- 108010078010 Complement C3c Proteins 0.000 claims description 5
- 101000851370 Homo sapiens Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9 Proteins 0.000 claims description 5
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 claims description 5
- 238000001917 fluorescence detection Methods 0.000 claims description 5
- BJHCYTJNPVGSBZ-YXSASFKJSA-N 1-[4-[6-amino-5-[(Z)-methoxyiminomethyl]pyrimidin-4-yl]oxy-2-chlorophenyl]-3-ethylurea Chemical compound CCNC(=O)Nc1ccc(Oc2ncnc(N)c2\C=N/OC)cc1Cl BJHCYTJNPVGSBZ-YXSASFKJSA-N 0.000 claims description 4
- 102100031585 ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1 Human genes 0.000 claims description 4
- 102100035248 Alpha-(1,3)-fucosyltransferase 4 Human genes 0.000 claims description 4
- 102100032187 Androgen receptor Human genes 0.000 claims description 4
- 102000004145 Annexin A1 Human genes 0.000 claims description 4
- 108090000663 Annexin A1 Proteins 0.000 claims description 4
- 102000006410 Apoproteins Human genes 0.000 claims description 4
- 108010083590 Apoproteins Proteins 0.000 claims description 4
- 102100021569 Apoptosis regulator Bcl-2 Human genes 0.000 claims description 4
- 102100021631 B-cell lymphoma 6 protein Human genes 0.000 claims description 4
- 102100038080 B-cell receptor CD22 Human genes 0.000 claims description 4
- 102100024222 B-lymphocyte antigen CD19 Human genes 0.000 claims description 4
- 102000015735 Beta-catenin Human genes 0.000 claims description 4
- 108060000903 Beta-catenin Proteins 0.000 claims description 4
- 102000024905 CD99 Human genes 0.000 claims description 4
- 108060001253 CD99 Proteins 0.000 claims description 4
- 108010083123 CDX2 Transcription Factor Proteins 0.000 claims description 4
- 102000006277 CDX2 Transcription Factor Human genes 0.000 claims description 4
- 102000000905 Cadherin Human genes 0.000 claims description 4
- 108050007957 Cadherin Proteins 0.000 claims description 4
- 108010028326 Calbindin 2 Proteins 0.000 claims description 4
- 102000016843 Calbindin 2 Human genes 0.000 claims description 4
- 102000055006 Calcitonin Human genes 0.000 claims description 4
- 108060001064 Calcitonin Proteins 0.000 claims description 4
- 102100033620 Calponin-1 Human genes 0.000 claims description 4
- 101710092112 Calponin-1 Proteins 0.000 claims description 4
- 102100025475 Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5 Human genes 0.000 claims description 4
- 101710118321 Casein kinase I isoform alpha Proteins 0.000 claims description 4
- 102100034356 Casein kinase I isoform alpha-like Human genes 0.000 claims description 4
- 102000010792 Chromogranin A Human genes 0.000 claims description 4
- 108010038447 Chromogranin A Proteins 0.000 claims description 4
- 102100032768 Complement receptor type 2 Human genes 0.000 claims description 4
- 102100024458 Cyclin-dependent kinase inhibitor 2A Human genes 0.000 claims description 4
- 102100032620 Cytotoxic granule associated RNA binding protein TIA1 Human genes 0.000 claims description 4
- 101710086368 Cytotoxic granule associated RNA binding protein TIA1 Proteins 0.000 claims description 4
- 102100035186 DNA excision repair protein ERCC-1 Human genes 0.000 claims description 4
- 102100034157 DNA mismatch repair protein Msh2 Human genes 0.000 claims description 4
- 102100021147 DNA mismatch repair protein Msh6 Human genes 0.000 claims description 4
- 102100033215 DNA nucleotidylexotransferase Human genes 0.000 claims description 4
- 102100036912 Desmin Human genes 0.000 claims description 4
- 108010044052 Desmin Proteins 0.000 claims description 4
- 102100031940 Epithelial cell adhesion molecule Human genes 0.000 claims description 4
- 101000962643 Escherichia coli (strain K12) Malate synthase A Proteins 0.000 claims description 4
- 101150097844 F2r gene Proteins 0.000 claims description 4
- 102000004204 Fascin Human genes 0.000 claims description 4
- 108090000786 Fascin Proteins 0.000 claims description 4
- 102100024165 G1/S-specific cyclin-D1 Human genes 0.000 claims description 4
- 102100021260 Galactosylgalactosylxylosylprotein 3-beta-glucuronosyltransferase 1 Human genes 0.000 claims description 4
- 108010001517 Galectin 3 Proteins 0.000 claims description 4
- 102100028652 Gamma-enolase Human genes 0.000 claims description 4
- 101710191797 Gamma-enolase Proteins 0.000 claims description 4
- 102100039289 Glial fibrillary acidic protein Human genes 0.000 claims description 4
- 101710193519 Glial fibrillary acidic protein Proteins 0.000 claims description 4
- 102100035716 Glycophorin-A Human genes 0.000 claims description 4
- 108091005250 Glycophorins Proteins 0.000 claims description 4
- 102000010956 Glypican Human genes 0.000 claims description 4
- 108050001154 Glypican Proteins 0.000 claims description 4
- 108050007237 Glypican-3 Proteins 0.000 claims description 4
- 241000590002 Helicobacter pylori Species 0.000 claims description 4
- 102000007513 Hemoglobin A Human genes 0.000 claims description 4
- 108010085682 Hemoglobin A Proteins 0.000 claims description 4
- 101000777636 Homo sapiens ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1 Proteins 0.000 claims description 4
- 101001022185 Homo sapiens Alpha-(1,3)-fucosyltransferase 4 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000971171 Homo sapiens Apoptosis regulator Bcl-2 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000971234 Homo sapiens B-cell lymphoma 6 protein Proteins 0.000 claims description 4
- 101000884305 Homo sapiens B-cell receptor CD22 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000980825 Homo sapiens B-lymphocyte antigen CD19 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000914324 Homo sapiens Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000914321 Homo sapiens Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 7 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000941929 Homo sapiens Complement receptor type 2 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000876529 Homo sapiens DNA excision repair protein ERCC-1 Proteins 0.000 claims description 4
- 101001134036 Homo sapiens DNA mismatch repair protein Msh2 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000968658 Homo sapiens DNA mismatch repair protein Msh6 Proteins 0.000 claims description 4
- 101001010541 Homo sapiens Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial Proteins 0.000 claims description 4
- 101000920667 Homo sapiens Epithelial cell adhesion molecule Proteins 0.000 claims description 4
- 101000980756 Homo sapiens G1/S-specific cyclin-D1 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000894906 Homo sapiens Galactosylgalactosylxylosylprotein 3-beta-glucuronosyltransferase 1 Proteins 0.000 claims description 4
- 101001015004 Homo sapiens Integrin beta-3 Proteins 0.000 claims description 4
- 101001011441 Homo sapiens Interferon regulatory factor 4 Proteins 0.000 claims description 4
- 101001057504 Homo sapiens Interferon-stimulated gene 20 kDa protein Proteins 0.000 claims description 4
- 101001055144 Homo sapiens Interleukin-2 receptor subunit alpha Proteins 0.000 claims description 4
- 101000998011 Homo sapiens Keratin, type I cytoskeletal 19 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000994460 Homo sapiens Keratin, type I cytoskeletal 20 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000608935 Homo sapiens Leukosialin Proteins 0.000 claims description 4
- 101000878605 Homo sapiens Low affinity immunoglobulin epsilon Fc receptor Proteins 0.000 claims description 4
- 101001008874 Homo sapiens Mast/stem cell growth factor receptor Kit Proteins 0.000 claims description 4
- 101000620359 Homo sapiens Melanocyte protein PMEL Proteins 0.000 claims description 4
- 101000578784 Homo sapiens Melanoma antigen recognized by T-cells 1 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000623901 Homo sapiens Mucin-16 Proteins 0.000 claims description 4
- 101001133081 Homo sapiens Mucin-2 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000934338 Homo sapiens Myeloid cell surface antigen CD33 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000581981 Homo sapiens Neural cell adhesion molecule 1 Proteins 0.000 claims description 4
- 101001024605 Homo sapiens Next to BRCA1 gene 1 protein Proteins 0.000 claims description 4
- 101001131670 Homo sapiens PWWP domain-containing DNA repair factor 3A Proteins 0.000 claims description 4
- 101000601724 Homo sapiens Paired box protein Pax-5 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000601664 Homo sapiens Paired box protein Pax-8 Proteins 0.000 claims description 4
- 101001070790 Homo sapiens Platelet glycoprotein Ib alpha chain Proteins 0.000 claims description 4
- 101000617725 Homo sapiens Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 2 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000583175 Homo sapiens Prolactin-inducible protein Proteins 0.000 claims description 4
- 101000738771 Homo sapiens Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C Proteins 0.000 claims description 4
- 101000701876 Homo sapiens Serpin A9 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000914496 Homo sapiens T-cell antigen CD7 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000934346 Homo sapiens T-cell surface antigen CD2 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000934341 Homo sapiens T-cell surface glycoprotein CD5 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000825086 Homo sapiens Transcription factor SOX-11 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000851376 Homo sapiens Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000621309 Homo sapiens Wilms tumor protein Proteins 0.000 claims description 4
- 241001502974 Human gammaherpesvirus 8 Species 0.000 claims description 4
- 101710123134 Ice-binding protein Proteins 0.000 claims description 4
- 101710082837 Ice-structuring protein Proteins 0.000 claims description 4
- 108010004250 Inhibins Proteins 0.000 claims description 4
- 102000002746 Inhibins Human genes 0.000 claims description 4
- 102100032999 Integrin beta-3 Human genes 0.000 claims description 4
- 102100030126 Interferon regulatory factor 4 Human genes 0.000 claims description 4
- 102100027268 Interferon-stimulated gene 20 kDa protein Human genes 0.000 claims description 4
- 102100033420 Keratin, type I cytoskeletal 19 Human genes 0.000 claims description 4
- 102100032700 Keratin, type I cytoskeletal 20 Human genes 0.000 claims description 4
- 102100039564 Leukosialin Human genes 0.000 claims description 4
- 102100038007 Low affinity immunoglobulin epsilon Fc receptor Human genes 0.000 claims description 4
- 229910015837 MSH2 Inorganic materials 0.000 claims description 4
- 102000005727 Mammaglobin A Human genes 0.000 claims description 4
- 108010031030 Mammaglobin A Proteins 0.000 claims description 4
- 102100027754 Mast/stem cell growth factor receptor Kit Human genes 0.000 claims description 4
- 102100022430 Melanocyte protein PMEL Human genes 0.000 claims description 4
- 102100028389 Melanoma antigen recognized by T-cells 1 Human genes 0.000 claims description 4
- 102000008071 Mismatch Repair Endonuclease PMS2 Human genes 0.000 claims description 4
- 108010074346 Mismatch Repair Endonuclease PMS2 Proteins 0.000 claims description 4
- 102100023123 Mucin-16 Human genes 0.000 claims description 4
- 102100034263 Mucin-2 Human genes 0.000 claims description 4
- 102000016943 Muramidase Human genes 0.000 claims description 4
- 108010014251 Muramidase Proteins 0.000 claims description 4
- 101100490437 Mus musculus Acvrl1 gene Proteins 0.000 claims description 4
- 101001096236 Mus musculus Prolactin-inducible protein homolog Proteins 0.000 claims description 4
- 101000866339 Mus musculus Transcription factor E2F6 Proteins 0.000 claims description 4
- 102100025243 Myeloid cell surface antigen CD33 Human genes 0.000 claims description 4
- 102100032970 Myogenin Human genes 0.000 claims description 4
- 108010056785 Myogenin Proteins 0.000 claims description 4
- 102100030856 Myoglobin Human genes 0.000 claims description 4
- 108010062374 Myoglobin Proteins 0.000 claims description 4
- 108010062010 N-Acetylmuramoyl-L-alanine Amidase Proteins 0.000 claims description 4
- 102000003729 Neprilysin Human genes 0.000 claims description 4
- 108090000028 Neprilysin Proteins 0.000 claims description 4
- 102000008730 Nestin Human genes 0.000 claims description 4
- 108010088225 Nestin Proteins 0.000 claims description 4
- 102100027347 Neural cell adhesion molecule 1 Human genes 0.000 claims description 4
- 102100029438 Nitric oxide synthase, inducible Human genes 0.000 claims description 4
- 101710089543 Nitric oxide synthase, inducible Proteins 0.000 claims description 4
- 102100030476 POU domain class 2-associating factor 1 Human genes 0.000 claims description 4
- 101710114665 POU domain class 2-associating factor 1 Proteins 0.000 claims description 4
- 102100035591 POU domain, class 2, transcription factor 2 Human genes 0.000 claims description 4
- 101710084411 POU domain, class 2, transcription factor 2 Proteins 0.000 claims description 4
- 102100037504 Paired box protein Pax-5 Human genes 0.000 claims description 4
- 102100037502 Paired box protein Pax-8 Human genes 0.000 claims description 4
- 102100024616 Platelet endothelial cell adhesion molecule Human genes 0.000 claims description 4
- 102100034173 Platelet glycoprotein Ib alpha chain Human genes 0.000 claims description 4
- 241000142787 Pneumocystis jirovecii Species 0.000 claims description 4
- 102100030350 Prolactin-inducible protein Human genes 0.000 claims description 4
- 102100038280 Prostaglandin G/H synthase 2 Human genes 0.000 claims description 4
- 108050003267 Prostaglandin G/H synthase 2 Proteins 0.000 claims description 4
- 102100028588 Protein ZNRD2 Human genes 0.000 claims description 4
- 108010014608 Proto-Oncogene Proteins c-kit Proteins 0.000 claims description 4
- 102000016971 Proto-Oncogene Proteins c-kit Human genes 0.000 claims description 4
- 108010007100 Pulmonary Surfactant-Associated Protein A Proteins 0.000 claims description 4
- 102100027773 Pulmonary surfactant-associated protein A2 Human genes 0.000 claims description 4
- 101001076287 Rattus norvegicus Insulin-like growth factor II Proteins 0.000 claims description 4
- 102100037422 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C Human genes 0.000 claims description 4
- 102100030420 Serpin A9 Human genes 0.000 claims description 4
- 102000054727 Serum Amyloid A Human genes 0.000 claims description 4
- 108700028909 Serum Amyloid A Proteins 0.000 claims description 4
- 102000004874 Synaptophysin Human genes 0.000 claims description 4
- 108090001076 Synaptophysin Proteins 0.000 claims description 4
- 102100027208 T-cell antigen CD7 Human genes 0.000 claims description 4
- 102100025237 T-cell surface antigen CD2 Human genes 0.000 claims description 4
- 102100025244 T-cell surface glycoprotein CD5 Human genes 0.000 claims description 4
- 108010032050 Tartrate-Resistant Acid Phosphatase Proteins 0.000 claims description 4
- 102000007591 Tartrate-Resistant Acid Phosphatase Human genes 0.000 claims description 4
- 108010079274 Thrombomodulin Proteins 0.000 claims description 4
- 102100026966 Thrombomodulin Human genes 0.000 claims description 4
- 102100033504 Thyroglobulin Human genes 0.000 claims description 4
- 108010034949 Thyroglobulin Proteins 0.000 claims description 4
- 102100040250 Transcription elongation factor A protein-like 1 Human genes 0.000 claims description 4
- 102100022415 Transcription factor SOX-11 Human genes 0.000 claims description 4
- 102100036857 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8 Human genes 0.000 claims description 4
- 101710107540 Type-2 ice-structuring protein Proteins 0.000 claims description 4
- 102100039094 Tyrosinase Human genes 0.000 claims description 4
- 108060008724 Tyrosinase Proteins 0.000 claims description 4
- 108010061861 Uroplakins Proteins 0.000 claims description 4
- 102000012349 Uroplakins Human genes 0.000 claims description 4
- 108010053099 Vascular Endothelial Growth Factor Receptor-2 Proteins 0.000 claims description 4
- 102100033177 Vascular endothelial growth factor receptor 2 Human genes 0.000 claims description 4
- 102100035071 Vimentin Human genes 0.000 claims description 4
- 108010065472 Vimentin Proteins 0.000 claims description 4
- 108010080146 androgen receptors Proteins 0.000 claims description 4
- 150000001576 beta-amino acids Chemical class 0.000 claims description 4
- BBBFJLBPOGFECG-VJVYQDLKSA-N calcitonin Chemical compound N([C@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(N)=O)C(C)C)C(=O)[C@@H]1CSSC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1 BBBFJLBPOGFECG-VJVYQDLKSA-N 0.000 claims description 4
- 229960004015 calcitonin Drugs 0.000 claims description 4
- 102000028861 calmodulin binding Human genes 0.000 claims description 4
- 108091000084 calmodulin binding Proteins 0.000 claims description 4
- 210000005045 desmin Anatomy 0.000 claims description 4
- 101150007302 dntt gene Proteins 0.000 claims description 4
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims description 4
- 210000005046 glial fibrillary acidic protein Anatomy 0.000 claims description 4
- 229940037467 helicobacter pylori Drugs 0.000 claims description 4
- 239000000893 inhibin Substances 0.000 claims description 4
- ZPNFWUPYTFPOJU-LPYSRVMUSA-N iniprol Chemical compound C([C@H]1C(=O)NCC(=O)NCC(=O)N[C@H]2CSSC[C@H]3C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@H](C(N[C@H](C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=4C=CC(O)=CC=4)C(=O)N[C@@H](CC=4C=CC=CC=4)C(=O)N[C@@H](CC=4C=CC(O)=CC=4)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CSSC[C@H](NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC=4C=CC=CC=4)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC2=O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CSSC[C@H](NC(=O)[C@H](CC=2C=CC=CC=2)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H]2N(CCC2)C(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N2[C@@H](CCC2)C(=O)N2[C@@H](CCC2)C(=O)N[C@@H](CC=2C=CC(O)=CC=2)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N2[C@@H](CCC2)C(=O)N3)C(=O)NCC(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC=2C=CC=CC=2)C(=O)N[C@H](C(=O)N1)C(C)C)[C@@H](C)O)[C@@H](C)CC)=O)[C@@H](C)CC)C1=CC=C(O)C=C1 ZPNFWUPYTFPOJU-LPYSRVMUSA-N 0.000 claims description 4
- 229960000274 lysozyme Drugs 0.000 claims description 4
- 235000010335 lysozyme Nutrition 0.000 claims description 4
- 239000004325 lysozyme Substances 0.000 claims description 4
- 210000005055 nestin Anatomy 0.000 claims description 4
- BLFWHYXWBKKRHI-JYBILGDPSA-N plap Chemical compound N([C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O)C(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O BLFWHYXWBKKRHI-JYBILGDPSA-N 0.000 claims description 4
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 claims description 4
- 101150047061 tag-72 gene Proteins 0.000 claims description 4
- 229960002175 thyroglobulin Drugs 0.000 claims description 4
- 108090000195 villin Proteins 0.000 claims description 4
- 210000005048 vimentin Anatomy 0.000 claims description 4
- 108010047303 von Willebrand Factor Proteins 0.000 claims description 4
- 102100036537 von Willebrand factor Human genes 0.000 claims description 4
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 claims description 3
- 210000000805 cytoplasm Anatomy 0.000 claims description 3
- 230000007017 scission Effects 0.000 claims description 3
- 102100022749 Aminopeptidase N Human genes 0.000 claims 3
- 108010071289 Factor XIII Proteins 0.000 claims 3
- 102000000802 Galectin 3 Human genes 0.000 claims 3
- 101001066288 Gallus gallus GATA-binding factor 3 Proteins 0.000 claims 3
- 244000068988 Glycine max Species 0.000 claims 3
- 235000010469 Glycine max Nutrition 0.000 claims 3
- 101000757160 Homo sapiens Aminopeptidase N Proteins 0.000 claims 3
- 101000666634 Homo sapiens Rho-related GTP-binding protein RhoH Proteins 0.000 claims 3
- 108010010995 MART-1 Antigen Proteins 0.000 claims 3
- 102000016200 MART-1 Antigen Human genes 0.000 claims 3
- 102000013609 MutL Protein Homolog 1 Human genes 0.000 claims 3
- 108010026664 MutL Protein Homolog 1 Proteins 0.000 claims 3
- 102100038338 Rho-related GTP-binding protein RhoH Human genes 0.000 claims 3
- 102000001400 Tryptase Human genes 0.000 claims 3
- 108060005989 Tryptase Proteins 0.000 claims 3
- 229940012444 factor xiii Drugs 0.000 claims 3
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 claims 2
- 125000005597 hydrazone group Chemical group 0.000 claims 2
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 15
- 238000007901 in situ hybridization Methods 0.000 description 15
- 125000002915 carbonyl group Chemical group [*:2]C([*:1])=O 0.000 description 14
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 13
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 12
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 12
- OAKJQQAXSVQMHS-UHFFFAOYSA-N hydrazine group Chemical group NN OAKJQQAXSVQMHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 10
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 10
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 9
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 8
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 8
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 8
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 8
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 8
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 7
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 7
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 7
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 7
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 description 7
- 125000000717 hydrazino group Chemical group [H]N([*])N([H])[H] 0.000 description 7
- 150000007857 hydrazones Chemical class 0.000 description 7
- 125000005647 linker group Chemical group 0.000 description 7
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 7
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 6
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 6
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 6
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 6
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 6
- 229920002477 rna polymer Polymers 0.000 description 6
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 description 6
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 6
- 125000003396 thiol group Chemical class [H]S* 0.000 description 6
- 102100039498 Cytotoxic T-lymphocyte protein 4 Human genes 0.000 description 5
- 101001012157 Homo sapiens Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Proteins 0.000 description 5
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 5
- 102100030086 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Human genes 0.000 description 5
- 239000004005 microsphere Substances 0.000 description 5
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 5
- 230000008569 process Effects 0.000 description 5
- 238000002818 protein evolution Methods 0.000 description 5
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 5
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 5
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 4
- 101150013568 US16 gene Proteins 0.000 description 4
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 4
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 4
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 4
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 4
- 238000002952 image-based readout Methods 0.000 description 4
- 238000003365 immunocytochemistry Methods 0.000 description 4
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 4
- 238000011160 research Methods 0.000 description 4
- 241000894007 species Species 0.000 description 4
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 description 4
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 description 3
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 description 3
- 108010021064 CTLA-4 Antigen Proteins 0.000 description 3
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 3
- 108060001084 Luciferase Proteins 0.000 description 3
- 239000005089 Luciferase Substances 0.000 description 3
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 3
- 150000003934 aromatic aldehydes Chemical class 0.000 description 3
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 description 3
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 3
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 3
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 3
- 150000002429 hydrazines Chemical class 0.000 description 3
- 230000002055 immunohistochemical effect Effects 0.000 description 3
- 238000011532 immunohistochemical staining Methods 0.000 description 3
- 150000002576 ketones Chemical class 0.000 description 3
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 3
- 239000003068 molecular probe Substances 0.000 description 3
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 3
- 239000000376 reactant Substances 0.000 description 3
- 108010054624 red fluorescent protein Proteins 0.000 description 3
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 3
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 3
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 3
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 description 3
- PAYRUJLWNCNPSJ-UHFFFAOYSA-N Aniline Chemical compound NC1=CC=CC=C1 PAYRUJLWNCNPSJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N Ascorbic acid Chemical compound OC[C@H](O)[C@H]1OC(=O)C(O)=C1O CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N 0.000 description 2
- 229940045513 CTLA4 antagonist Drugs 0.000 description 2
- 235000014653 Carica parviflora Nutrition 0.000 description 2
- 241000243321 Cnidaria Species 0.000 description 2
- 238000009007 Diagnostic Kit Methods 0.000 description 2
- 238000005698 Diels-Alder reaction Methods 0.000 description 2
- SHIBSTMRCDJXLN-UHFFFAOYSA-N Digoxigenin Natural products C1CC(C2C(C3(C)CCC(O)CC3CC2)CC2O)(O)C2(C)C1C1=CC(=O)OC1 SHIBSTMRCDJXLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- AOJJSUZBOXZQNB-TZSSRYMLSA-N Doxorubicin Chemical compound O([C@H]1C[C@@](O)(CC=2C(O)=C3C(=O)C=4C=CC=C(C=4C(=O)C3=C(O)C=21)OC)C(=O)CO)[C@H]1C[C@H](N)[C@H](O)[C@H](C)O1 AOJJSUZBOXZQNB-TZSSRYMLSA-N 0.000 description 2
- 101000889276 Homo sapiens Cytotoxic T-lymphocyte protein 4 Proteins 0.000 description 2
- 102100037850 Interferon gamma Human genes 0.000 description 2
- 108010074328 Interferon-gamma Proteins 0.000 description 2
- UFWIBTONFRDIAS-UHFFFAOYSA-N Naphthalene Chemical compound C1=CC=CC2=CC=CC=C21 UFWIBTONFRDIAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DPOPAJRDYZGTIR-UHFFFAOYSA-N Tetrazine Chemical group C1=CN=NN=N1 DPOPAJRDYZGTIR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- LJTFFORYSFGNCT-UHFFFAOYSA-N Thiocarbohydrazide Chemical group NNC(=S)NN LJTFFORYSFGNCT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 150000001299 aldehydes Chemical class 0.000 description 2
- 125000001931 aliphatic group Chemical group 0.000 description 2
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 2
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 2
- SHOTZAAGWLBZQV-UHFFFAOYSA-N aminoazanium;carbonate Chemical group NN.NN.OC(O)=O SHOTZAAGWLBZQV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- MWPLVEDNUUSJAV-UHFFFAOYSA-N anthracene Chemical compound C1=CC=CC2=CC3=CC=CC=C3C=C21 MWPLVEDNUUSJAV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000002246 antineoplastic agent Substances 0.000 description 2
- 230000001588 bifunctional effect Effects 0.000 description 2
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 2
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 2
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 2
- XEVRDFDBXJMZFG-UHFFFAOYSA-N carbonyl dihydrazine Chemical group NNC(=O)NN XEVRDFDBXJMZFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 2
- 239000010949 copper Substances 0.000 description 2
- ZYGHJZDHTFUPRJ-UHFFFAOYSA-N coumarin Chemical compound C1=CC=C2OC(=O)C=CC2=C1 ZYGHJZDHTFUPRJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000003431 cross linking reagent Substances 0.000 description 2
- 108010082025 cyan fluorescent protein Proteins 0.000 description 2
- 238000004163 cytometry Methods 0.000 description 2
- QONQRTHLHBTMGP-UHFFFAOYSA-N digitoxigenin Natural products CC12CCC(C3(CCC(O)CC3CC3)C)C3C11OC1CC2C1=CC(=O)OC1 QONQRTHLHBTMGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SHIBSTMRCDJXLN-KCZCNTNESA-N digoxigenin Chemical compound C1([C@@H]2[C@@]3([C@@](CC2)(O)[C@H]2[C@@H]([C@@]4(C)CC[C@H](O)C[C@H]4CC2)C[C@H]3O)C)=CC(=O)OC1 SHIBSTMRCDJXLN-KCZCNTNESA-N 0.000 description 2
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 2
- 239000005090 green fluorescent protein Substances 0.000 description 2
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 2
- 125000001072 heteroaryl group Chemical group 0.000 description 2
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 2
- 210000002865 immune cell Anatomy 0.000 description 2
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 2
- 238000012296 in situ hybridization assay Methods 0.000 description 2
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 2
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 2
- 150000002527 isonitriles Chemical group 0.000 description 2
- 239000007791 liquid phase Substances 0.000 description 2
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 description 2
- 238000012083 mass cytometry Methods 0.000 description 2
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 2
- 201000001441 melanoma Diseases 0.000 description 2
- 238000002493 microarray Methods 0.000 description 2
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- 125000006501 nitrophenyl group Chemical group 0.000 description 2
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 2
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 2
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 2
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 description 2
- BBEAQIROQSPTKN-UHFFFAOYSA-N pyrene Chemical compound C1=CC=C2C=CC3=CC=CC4=CC=C1C2=C43 BBEAQIROQSPTKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DUIOPKIIICUYRZ-UHFFFAOYSA-N semicarbazide group Chemical group NNC(=O)N DUIOPKIIICUYRZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000001899 southwestern blot Methods 0.000 description 2
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 2
- BRWIZMBXBAOCCF-UHFFFAOYSA-N thiosemicarbazide group Chemical group NNC(=S)N BRWIZMBXBAOCCF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000011269 treatment regimen Methods 0.000 description 2
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 2
- OXBLVCZKDOZZOJ-UHFFFAOYSA-N 2,3-Dihydrothiophene Chemical compound C1CC=CS1 OXBLVCZKDOZZOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001894 2,4,6-trinitrophenyl group Chemical group [H]C1=C(C(*)=C(C([H])=C1[N+]([O-])=O)[N+]([O-])=O)[N+]([O-])=O 0.000 description 1
- FBTSQILOGYXGMD-LURJTMIESA-N 3-nitro-L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C([N+]([O-])=O)=C1 FBTSQILOGYXGMD-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- WOVKYSAHUYNSMH-RRKCRQDMSA-N 5-bromodeoxyuridine Chemical compound C1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)C(Br)=C1 WOVKYSAHUYNSMH-RRKCRQDMSA-N 0.000 description 1
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M Acetate Chemical compound CC([O-])=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 241000059559 Agriotes sordidus Species 0.000 description 1
- 108010011170 Ala-Trp-Arg-His-Pro-Gln-Phe-Gly-Gly Proteins 0.000 description 1
- 102100026882 Alpha-synuclein Human genes 0.000 description 1
- 208000023275 Autoimmune disease Diseases 0.000 description 1
- MLDQJTXFUGDVEO-UHFFFAOYSA-N BAY-43-9006 Chemical compound C1=NC(C(=O)NC)=CC(OC=2C=CC(NC(=O)NC=3C=C(C(Cl)=CC=3)C(F)(F)F)=CC=2)=C1 MLDQJTXFUGDVEO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WOVKYSAHUYNSMH-UHFFFAOYSA-N BROMODEOXYURIDINE Natural products C1C(O)C(CO)OC1N1C(=O)NC(=O)C(Br)=C1 WOVKYSAHUYNSMH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-M Butyrate Chemical compound CCCC([O-])=O FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-N Butyric acid Natural products CCCC(O)=O FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010008886 CAM 5.2 antigen Proteins 0.000 description 1
- GAGWJHPBXLXJQN-UHFFFAOYSA-N Capecitabine Natural products C1=C(F)C(NC(=O)OCCCCC)=NC(=O)N1C1C(O)C(O)C(C)O1 GAGWJHPBXLXJQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GAGWJHPBXLXJQN-UORFTKCHSA-N Capecitabine Chemical compound C1=C(F)C(NC(=O)OCCCCC)=NC(=O)N1[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](C)O1 GAGWJHPBXLXJQN-UORFTKCHSA-N 0.000 description 1
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K Citrate Chemical compound [O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N Copper Chemical compound [Cu] RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004971 Cross linker Substances 0.000 description 1
- XFXPMWWXUTWYJX-UHFFFAOYSA-N Cyanide Chemical compound N#[C-] XFXPMWWXUTWYJX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000008574 D-amino acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000004544 DNA amplification Effects 0.000 description 1
- 239000004593 Epoxy Substances 0.000 description 1
- HKVAMNSJSFKALM-GKUWKFKPSA-N Everolimus Chemical compound C1C[C@@H](OCCO)[C@H](OC)C[C@@H]1C[C@@H](C)[C@H]1OC(=O)[C@@H]2CCCCN2C(=O)C(=O)[C@](O)(O2)[C@H](C)CC[C@H]2C[C@H](OC)/C(C)=C/C=C/C=C/[C@@H](C)C[C@@H](C)C(=O)[C@H](OC)[C@H](O)/C(C)=C/[C@@H](C)C(=O)C1 HKVAMNSJSFKALM-GKUWKFKPSA-N 0.000 description 1
- 108010000196 Factor XIIIa Proteins 0.000 description 1
- 108090000331 Firefly luciferases Proteins 0.000 description 1
- 102100039558 Galectin-3 Human genes 0.000 description 1
- 208000034951 Genetic Translocation Diseases 0.000 description 1
- 108010043121 Green Fluorescent Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000004144 Green Fluorescent Proteins Human genes 0.000 description 1
- HVLSXIKZNLPZJJ-TXZCQADKSA-N HA peptide Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@@H](N)CC=1C=CC(O)=CC=1)C1=CC=C(O)C=C1 HVLSXIKZNLPZJJ-TXZCQADKSA-N 0.000 description 1
- 102100027893 Homeobox protein Nkx-2.1 Human genes 0.000 description 1
- 101710114425 Homeobox protein Nkx-2.1 Proteins 0.000 description 1
- 101000834898 Homo sapiens Alpha-synuclein Proteins 0.000 description 1
- 101000611936 Homo sapiens Programmed cell death protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000652359 Homo sapiens Spermatogenesis-associated protein 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000874179 Homo sapiens Syndecan-1 Proteins 0.000 description 1
- 238000006736 Huisgen cycloaddition reaction Methods 0.000 description 1
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101150106931 IFNG gene Proteins 0.000 description 1
- 102000011782 Keratins Human genes 0.000 description 1
- 108010076876 Keratins Proteins 0.000 description 1
- FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-L L-tartrate(2-) Chemical compound [O-]C(=O)[C@H](O)[C@@H](O)C([O-])=O FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-L 0.000 description 1
- 239000005517 L01XE01 - Imatinib Substances 0.000 description 1
- 239000005551 L01XE03 - Erlotinib Substances 0.000 description 1
- 239000002147 L01XE04 - Sunitinib Substances 0.000 description 1
- 239000005511 L01XE05 - Sorafenib Substances 0.000 description 1
- 239000005536 L01XE08 - Nilotinib Substances 0.000 description 1
- 239000002177 L01XE27 - Ibrutinib Substances 0.000 description 1
- JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-M Lactate Chemical compound CC(O)C([O-])=O JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 108010000817 Leuprolide Proteins 0.000 description 1
- 206010025323 Lymphomas Diseases 0.000 description 1
- 210000004322 M2 macrophage Anatomy 0.000 description 1
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 1
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 1
- 101100013967 Mus musculus Gata3 gene Proteins 0.000 description 1
- 108020004711 Nucleic Acid Probes Proteins 0.000 description 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 1
- 206010061902 Pancreatic neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 108010004729 Phycoerythrin Proteins 0.000 description 1
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 1
- 108091007744 Programmed cell death receptors Proteins 0.000 description 1
- 229940096437 Protein S Drugs 0.000 description 1
- 238000001069 Raman spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 108010052090 Renilla Luciferases Proteins 0.000 description 1
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 description 1
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 1
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L Sulfate Chemical compound [O-]S([O-])(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 102100035721 Syndecan-1 Human genes 0.000 description 1
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 101710088547 Thyroid transcription factor 1 Proteins 0.000 description 1
- 101710159262 Transcription termination factor 1 Proteins 0.000 description 1
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000005789 Vascular Endothelial Growth Factors Human genes 0.000 description 1
- 108010019530 Vascular Endothelial Growth Factors Proteins 0.000 description 1
- UYRDHEJRPVSJFM-VSWVFQEASA-N [(1s,3r)-3-hydroxy-4-[(3e,5e,7e,9e,11z)-11-[4-[(e)-2-[(1r,3s,6s)-3-hydroxy-1,5,5-trimethyl-7-oxabicyclo[4.1.0]heptan-6-yl]ethenyl]-5-oxofuran-2-ylidene]-3,10-dimethylundeca-1,3,5,7,9-pentaenylidene]-3,5,5-trimethylcyclohexyl] acetate Chemical compound C[C@@]1(O)C[C@@H](OC(=O)C)CC(C)(C)C1=C=C\C(C)=C\C=C\C=C\C=C(/C)\C=C/1C=C(\C=C\[C@]23[C@@](O2)(C)C[C@@H](O)CC3(C)C)C(=O)O\1 UYRDHEJRPVSJFM-VSWVFQEASA-N 0.000 description 1
- 238000010958 [3+2] cycloaddition reaction Methods 0.000 description 1
- 229960004103 abiraterone acetate Drugs 0.000 description 1
- UVIQSJCZCSLXRZ-UBUQANBQSA-N abiraterone acetate Chemical compound C([C@@H]1[C@]2(C)CC[C@@H]3[C@@]4(C)CC[C@@H](CC4=CC[C@H]31)OC(=O)C)C=C2C1=CC=CN=C1 UVIQSJCZCSLXRZ-UBUQANBQSA-N 0.000 description 1
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 1
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 1
- 238000007259 addition reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 1
- 230000000996 additive effect Effects 0.000 description 1
- 229940009456 adriamycin Drugs 0.000 description 1
- 125000002009 alkene group Chemical group 0.000 description 1
- 150000001345 alkine derivatives Chemical group 0.000 description 1
- 108010004469 allophycocyanin Proteins 0.000 description 1
- 238000011091 antibody purification Methods 0.000 description 1
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 1
- 229940072107 ascorbate Drugs 0.000 description 1
- 235000010323 ascorbic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000011668 ascorbic acid Substances 0.000 description 1
- 150000001540 azides Chemical group 0.000 description 1
- 150000001541 aziridines Chemical class 0.000 description 1
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 229960000397 bevacizumab Drugs 0.000 description 1
- 238000012575 bio-layer interferometry Methods 0.000 description 1
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 description 1
- 108091005948 blue fluorescent proteins Proteins 0.000 description 1
- 210000000988 bone and bone Anatomy 0.000 description 1
- 210000001185 bone marrow Anatomy 0.000 description 1
- GXJABQQUPOEUTA-RDJZCZTQSA-N bortezomib Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)B(O)O)NC(=O)C=1N=CC=NC=1)C1=CC=CC=C1 GXJABQQUPOEUTA-RDJZCZTQSA-N 0.000 description 1
- 229960001467 bortezomib Drugs 0.000 description 1
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 description 1
- 210000000481 breast Anatomy 0.000 description 1
- 238000000339 bright-field microscopy Methods 0.000 description 1
- 229950004398 broxuridine Drugs 0.000 description 1
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 1
- 229960004117 capecitabine Drugs 0.000 description 1
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 1
- 239000011203 carbon fibre reinforced carbon Substances 0.000 description 1
- 239000003054 catalyst Substances 0.000 description 1
- 238000006555 catalytic reaction Methods 0.000 description 1
- 238000000423 cell based assay Methods 0.000 description 1
- 210000003855 cell nucleus Anatomy 0.000 description 1
- 210000004671 cell-free system Anatomy 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 229960005395 cetuximab Drugs 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 238000002038 chemiluminescence detection Methods 0.000 description 1
- 229930002875 chlorophyll Natural products 0.000 description 1
- 235000019804 chlorophyll Nutrition 0.000 description 1
- ATNHDLDRLWWWCB-AENOIHSZSA-M chlorophyll a Chemical compound C1([C@@H](C(=O)OC)C(=O)C2=C3C)=C2N2C3=CC(C(CC)=C3C)=[N+]4C3=CC3=C(C=C)C(C)=C5N3[Mg-2]42[N+]2=C1[C@@H](CCC(=O)OC\C=C(/C)CCC[C@H](C)CCC[C@H](C)CCCC(C)C)[C@H](C)C2=C5 ATNHDLDRLWWWCB-AENOIHSZSA-M 0.000 description 1
- 229940001468 citrate Drugs 0.000 description 1
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 1
- 230000008045 co-localization Effects 0.000 description 1
- 210000001072 colon Anatomy 0.000 description 1
- 210000002808 connective tissue Anatomy 0.000 description 1
- 229910052802 copper Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000001671 coumarin Nutrition 0.000 description 1
- 229960000956 coumarin Drugs 0.000 description 1
- 239000007822 coupling agent Substances 0.000 description 1
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 1
- 238000006352 cycloaddition reaction Methods 0.000 description 1
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 1
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 1
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 1
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 1
- 239000000412 dendrimer Substances 0.000 description 1
- 229920000736 dendritic polymer Polymers 0.000 description 1
- 229960001251 denosumab Drugs 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 1
- 210000000981 epithelium Anatomy 0.000 description 1
- AAKJLRGGTJKAMG-UHFFFAOYSA-N erlotinib Chemical compound C=12C=C(OCCOC)C(OCCOC)=CC2=NC=NC=1NC1=CC=CC(C#C)=C1 AAKJLRGGTJKAMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960001433 erlotinib Drugs 0.000 description 1
- 229960005167 everolimus Drugs 0.000 description 1
- GVEPBJHOBDJJJI-UHFFFAOYSA-N fluoranthrene Natural products C1=CC(C2=CC=CC=C22)=C3C2=CC=CC3=C1 GVEPBJHOBDJJJI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N fluorescein Chemical class O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000000799 fluorescence microscopy Methods 0.000 description 1
- 238000001943 fluorescence-activated cell sorting Methods 0.000 description 1
- GNNILMDCYQGMRH-UHFFFAOYSA-N formyl benzoate Chemical group O=COC(=O)C1=CC=CC=C1 GNNILMDCYQGMRH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VZCYOOQTPOCHFL-OWOJBTEDSA-L fumarate(2-) Chemical compound [O-]C(=O)\C=C\C([O-])=O VZCYOOQTPOCHFL-OWOJBTEDSA-L 0.000 description 1
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 1
- 238000012224 gene deletion Methods 0.000 description 1
- 238000007429 general method Methods 0.000 description 1
- 210000002216 heart Anatomy 0.000 description 1
- 238000013537 high throughput screening Methods 0.000 description 1
- 210000003630 histaminocyte Anatomy 0.000 description 1
- 229940042795 hydrazides for tuberculosis treatment Drugs 0.000 description 1
- 229960001507 ibrutinib Drugs 0.000 description 1
- XYFPWWZEPKGCCK-GOSISDBHSA-N ibrutinib Chemical compound C1=2C(N)=NC=NC=2N([C@H]2CN(CCC2)C(=O)C=C)N=C1C(C=C1)=CC=C1OC1=CC=CC=C1 XYFPWWZEPKGCCK-GOSISDBHSA-N 0.000 description 1
- 229960002411 imatinib Drugs 0.000 description 1
- KTUFNOKKBVMGRW-UHFFFAOYSA-N imatinib Chemical compound C1CN(C)CCN1CC1=CC=C(C(=O)NC=2C=C(NC=3N=C(C=CN=3)C=3C=NC=CC=3)C(C)=CC=2)C=C1 KTUFNOKKBVMGRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 1
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 1
- 229940127121 immunoconjugate Drugs 0.000 description 1
- 238000009169 immunotherapy Methods 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- 238000011221 initial treatment Methods 0.000 description 1
- 229910052500 inorganic mineral Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000002452 interceptive effect Effects 0.000 description 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 1
- 229960005386 ipilimumab Drugs 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 1
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 1
- 150000002605 large molecules Chemical class 0.000 description 1
- GOTYRUGSSMKFNF-UHFFFAOYSA-N lenalidomide Chemical compound C1C=2C(N)=CC=CC=2C(=O)N1C1CCC(=O)NC1=O GOTYRUGSSMKFNF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960004942 lenalidomide Drugs 0.000 description 1
- GFIJNRVAKGFPGQ-LIJARHBVSA-N leuprolide Chemical compound CCNC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)NC(=O)[C@H](CC=1N=CNC=1)NC(=O)[C@H]1NC(=O)CC1)CC1=CC=C(O)C=C1 GFIJNRVAKGFPGQ-LIJARHBVSA-N 0.000 description 1
- 229960004338 leuprorelin Drugs 0.000 description 1
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 1
- 230000004807 localization Effects 0.000 description 1
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 1
- 210000004324 lymphatic system Anatomy 0.000 description 1
- 229920002521 macromolecule Polymers 0.000 description 1
- 239000006249 magnetic particle Substances 0.000 description 1
- 229940049920 malate Drugs 0.000 description 1
- BJEPYKJPYRNKOW-UHFFFAOYSA-L malate(2-) Chemical compound [O-]C(=O)C(O)CC([O-])=O BJEPYKJPYRNKOW-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 1
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 1
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 1
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 1
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002923 metal particle Substances 0.000 description 1
- 150000002739 metals Chemical class 0.000 description 1
- 230000031864 metaphase Effects 0.000 description 1
- MYWUZJCMWCOHBA-VIFPVBQESA-N methamphetamine Chemical compound CN[C@@H](C)CC1=CC=CC=C1 MYWUZJCMWCOHBA-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- 239000011707 mineral Substances 0.000 description 1
- 210000003470 mitochondria Anatomy 0.000 description 1
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 1
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 1
- 238000011512 multiplexed immunoassay Methods 0.000 description 1
- 210000003205 muscle Anatomy 0.000 description 1
- OWIUPIRUAQMTTK-UHFFFAOYSA-M n-aminocarbamate Chemical compound NNC([O-])=O OWIUPIRUAQMTTK-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229930014626 natural product Natural products 0.000 description 1
- 208000025440 neoplasm of neck Diseases 0.000 description 1
- 229960001346 nilotinib Drugs 0.000 description 1
- HHZIURLSWUIHRB-UHFFFAOYSA-N nilotinib Chemical compound C1=NC(C)=CN1C1=CC(NC(=O)C=2C=C(NC=3N=C(C=CN=3)C=3C=NC=CC=3)C(C)=CC=2)=CC(C(F)(F)F)=C1 HHZIURLSWUIHRB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960003301 nivolumab Drugs 0.000 description 1
- 239000002853 nucleic acid probe Substances 0.000 description 1
- 238000010534 nucleophilic substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 238000002515 oligonucleotide synthesis Methods 0.000 description 1
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 1
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 1
- 210000003463 organelle Anatomy 0.000 description 1
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 1
- 235000005985 organic acids Nutrition 0.000 description 1
- 210000002997 osteoclast Anatomy 0.000 description 1
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 description 1
- WCPAKWJPBJAGKN-UHFFFAOYSA-N oxadiazole Chemical compound C1=CON=N1 WCPAKWJPBJAGKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000000496 pancreas Anatomy 0.000 description 1
- 201000002528 pancreatic cancer Diseases 0.000 description 1
- 230000008506 pathogenesis Effects 0.000 description 1
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 1
- 229960002621 pembrolizumab Drugs 0.000 description 1
- QOFFJEBXNKRSPX-ZDUSSCGKSA-N pemetrexed Chemical compound C1=N[C]2NC(N)=NC(=O)C2=C1CCC1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 QOFFJEBXNKRSPX-ZDUSSCGKSA-N 0.000 description 1
- 229960005079 pemetrexed Drugs 0.000 description 1
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- UTIQDNPUHSAVDN-UHFFFAOYSA-N peridinin Natural products CC(=O)OC1CC(C)(C)C(=C=CC(=CC=CC=CC=C2/OC(=O)C(=C2)C=CC34OC3(C)CC(O)CC4(C)C)C)C(C)(O)C1 UTIQDNPUHSAVDN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000035790 physiological processes and functions Effects 0.000 description 1
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 1
- 238000006116 polymerization reaction Methods 0.000 description 1
- 210000002307 prostate Anatomy 0.000 description 1
- 238000000159 protein binding assay Methods 0.000 description 1
- 230000009145 protein modification Effects 0.000 description 1
- 230000005855 radiation Effects 0.000 description 1
- ZAHRKKWIAAJSAO-UHFFFAOYSA-N rapamycin Natural products COCC(O)C(=C/C(C)C(=O)CC(OC(=O)C1CCCCN1C(=O)C(=O)C2(O)OC(CC(OC)C(=CC=CC=CC(C)CC(C)C(=O)C)C)CCC2C)C(C)CC3CCC(O)C(C3)OC)C ZAHRKKWIAAJSAO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000003289 regulatory T cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N rhodamine B Chemical class [Cl-].C=12C=CC(=[N+](CC)CC)C=C2OC2=CC(N(CC)CC)=CC=C2C=1C1=CC=CC=C1C(O)=O PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960004641 rituximab Drugs 0.000 description 1
- QSHGUCSTWRSQAF-FJSLEGQWSA-N s-peptide Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(OS(O)(=O)=O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCSC)C(C)C)[C@@H](C)CC)C1=CC=C(OS(O)(=O)=O)C=C1 QSHGUCSTWRSQAF-FJSLEGQWSA-N 0.000 description 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 1
- 238000007086 side reaction Methods 0.000 description 1
- QFJCIRLUMZQUOT-HPLJOQBZSA-N sirolimus Chemical compound C1C[C@@H](O)[C@H](OC)C[C@@H]1C[C@@H](C)[C@H]1OC(=O)[C@@H]2CCCCN2C(=O)C(=O)[C@](O)(O2)[C@H](C)CC[C@H]2C[C@H](OC)/C(C)=C/C=C/C=C/[C@@H](C)C[C@@H](C)C(=O)[C@H](OC)[C@H](O)/C(C)=C/[C@@H](C)C(=O)C1 QFJCIRLUMZQUOT-HPLJOQBZSA-N 0.000 description 1
- 229960002930 sirolimus Drugs 0.000 description 1
- 210000003491 skin Anatomy 0.000 description 1
- 229940126586 small molecule drug Drugs 0.000 description 1
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 1
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 1
- 238000010532 solid phase synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 1
- 229960003787 sorafenib Drugs 0.000 description 1
- 238000012306 spectroscopic technique Methods 0.000 description 1
- 210000002784 stomach Anatomy 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 229940086735 succinate Drugs 0.000 description 1
- KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-L succinate(2-) Chemical compound [O-]C(=O)CCC([O-])=O KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 229960001796 sunitinib Drugs 0.000 description 1
- WINHZLLDWRZWRT-ATVHPVEESA-N sunitinib Chemical compound CCN(CC)CCNC(=O)C1=C(C)NC(\C=C/2C3=CC(F)=CC=C3NC\2=O)=C1C WINHZLLDWRZWRT-ATVHPVEESA-N 0.000 description 1
- 238000004416 surface enhanced Raman spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 238000002198 surface plasmon resonance spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 229940095064 tartrate Drugs 0.000 description 1
- 230000002123 temporal effect Effects 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- 150000003573 thiols Chemical class 0.000 description 1
- ANRHNWWPFJCPAZ-UHFFFAOYSA-M thionine Chemical compound [Cl-].C1=CC(N)=CC2=[S+]C3=CC(N)=CC=C3N=C21 ANRHNWWPFJCPAZ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 150000003583 thiosemicarbazides Chemical class 0.000 description 1
- VZCYOOQTPOCHFL-UHFFFAOYSA-N trans-butenedioic acid Natural products OC(=O)C=CC(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960000575 trastuzumab Drugs 0.000 description 1
- 150000003852 triazoles Chemical class 0.000 description 1
- 229940070710 valerate Drugs 0.000 description 1
- NQPDZGIKBAWPEJ-UHFFFAOYSA-N valeric acid Chemical compound CCCCC(O)=O NQPDZGIKBAWPEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000012800 visualization Methods 0.000 description 1
- 239000001018 xanthene dye Chemical class 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6804—Nucleic acid analysis using immunogens
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/26—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving oxidoreductase
- C12Q1/28—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving oxidoreductase involving peroxidase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/34—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving hydrolase
- C12Q1/42—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving hydrolase involving phosphatase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6816—Hybridisation assays characterised by the detection means
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6841—In situ hybridisation
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/90—Immunoglobulins specific features characterized by (pharmaco)kinetic aspects or by stability of the immunoglobulin
- C07K2317/92—Affinity (KD), association rate (Ka), dissociation rate (Kd) or EC50 value
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2543/00—Reactions characterised by the reaction site, e.g. cell or chromosome
- C12Q2543/10—Reactions characterised by the reaction site, e.g. cell or chromosome the purpose being "in situ" analysis
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2563/00—Nucleic acid detection characterized by the use of physical, structural and functional properties
- C12Q2563/131—Nucleic acid detection characterized by the use of physical, structural and functional properties the label being a member of a cognate binding pair, i.e. extends to antibodies, haptens, avidin
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y101/00—Oxidoreductases acting on the CH-OH group of donors (1.1)
- C12Y101/03—Oxidoreductases acting on the CH-OH group of donors (1.1) with a oxygen as acceptor (1.1.3)
- C12Y101/03004—Glucose oxidase (1.1.3.4)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y111/00—Oxidoreductases acting on a peroxide as acceptor (1.11)
- C12Y111/01—Peroxidases (1.11.1)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y301/00—Hydrolases acting on ester bonds (3.1)
- C12Y301/03—Phosphoric monoester hydrolases (3.1.3)
- C12Y301/03004—Phosphatidate phosphatase (3.1.3.4)
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Pathology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
Abstract
Description
本願は、2016年7月18日に出願された米国仮特許出願第62/363,825号に対する利益を主張し、この米国仮特許出願の開示内容は、その全体が参照により本明細書において援用される。
架橋抗原とカップリングしたオリゴヌクレオチドプローブ;および
検出可能な抗体
を含み、該検出可能な抗体が該架橋抗原に対して高親和性で特異的である。
第1の標的核酸を含む第1の試料を供給するステップ;
該第1の標的核酸を第1のハイブリダイゼーション試薬と反応させるステップであって、該第1のハイブリダイゼーション試薬が、該第1の標的核酸に相補的な上記ハイブリダイゼーション試薬のいずれかである、ステップ;
該第1のハイブリダイゼーション試薬を第1の検出可能な抗体と反応させるステップであって、該第1の検出可能な抗体が、該第1のハイブリダイゼーション試薬の架橋抗原に対して、高親和性で特異的である、ステップ;および
該第1のハイブリダイゼーション試薬の該架橋抗原と会合している該第1の検出可能な抗体を検出するステップ
を含む、ハイブリダイゼーションアッセイのための方法を提供する。
前記第1の試料における第2の標的核酸を第2のハイブリダイゼーション試薬と反応させるステップであって、該第2のハイブリダイゼーション試薬が、該第2の標的核酸に相補的な上記ハイブリダイゼーション試薬のいずれかである、ステップ;
該第2のハイブリダイゼーション試薬を第2の検出可能な抗体と反応させるステップであって、該第2の検出可能な抗体が、該第2のハイブリダイゼーション試薬の架橋抗原に対して、高親和性で特異的である、ステップ;および
該第2のハイブリダイゼーション試薬の該架橋抗原と会合している該第2の検出可能な抗体を検出するステップ
をさらに含む。
該第2のハイブリダイゼーション試薬を第2の検出可能な抗体と反応させるステップであって、該第2の検出可能な抗体が、該第2のハイブリダイゼーション試薬の架橋抗原に対して、高親和性で特異的である、ステップ;および
該第2のハイブリダイゼーション試薬の該架橋抗原と会合している該第2の検出可能な抗体を検出するステップ
をさらに含み、前記第1の試料および該第2の試料が、組織試料の連続切片である。
該第1の標的核酸を第1のハイブリダイゼーション試薬と反応させるステップであって、該第1のハイブリダイゼーション試薬が、該第1の標的核酸に相補的な上記ハイブリダイゼーション試薬のいずれかである、ステップ;
該第1のハイブリダイゼーション試薬を第1の反応性抗体と反応させるステップであって、該第1の反応性抗体が、該第1のハイブリダイゼーション試薬の架橋抗原と高親和性で結合する、ステップ;および
該第1の反応性抗体を第1の検出可能な試薬と反応させるステップであって、該第1の検出可能な試薬が、該第1の標的核酸の近くで該試料と結合している、ステップ
を含む。
該第2のハイブリダイゼーション試薬を第2の反応性抗体と反応させるステップであって、該第2の反応性抗体が、該第2のハイブリダイゼーション試薬の架橋抗原と高親和性で結合する、ステップ;および
該第2の反応性抗体を第2の検出可能な試薬と反応させるステップであって、該第2の検出可能な試薬が、該第2の標的核酸の近くで該試料に結合している、ステップ
をなおさらに含む。
本開示は、一態様では、オリゴヌクレオチドプローブおよび架橋抗原を含む高性能のハイブリダイゼーション試薬であって、オリゴヌクレオチドプローブおよび架橋抗原がカップリングされており、架橋抗原が、高親和性の検出可能な抗体により認識可能である、ハイブリダイゼーション試薬を提供する。
Interactions: Methods and Applications(2008年)McMahon編、Humana;Molecular Probes(登録商標)Handbook、4章(2010年)参照)、抗体−ハプテン結合ペア(一般的には、Molecular Probes(登録商標)Handbook、4章(2010年)参照)、S−ペプチドタグ−S−タンパク質結合ペア(KimおよびRaines(1993年)Protein Sci. 2巻:348〜56頁)、または任意の他の高親和性ペプチド−ペプチドもしくはペプチド−タンパク質結合ペアである。そのような高親和性非共有結合性コンジュゲーション部分は、当技術分野において周知である。それぞれのコンジュゲートペアの反応性バージョン、例えば、チオール反応性バージョンまたはアミノ反応性バージョンもまた、当技術分野において周知である。これらのコンジュゲート試薬は、それぞれのオリゴヌクレオチドプローブおよび架橋抗原を修飾するために使用され得る。修飾されたオリゴヌクレオチドプローブおよび架橋抗原は、その後、相補的形体、例えば、オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションペアまたはタンパク質−リガンド結合ペアが、お互いに会合し、非共有結合性高効率コンジュゲーション部分を形成することを可能にするために、混合され得る。上記の共有結合性および非共有結合性連結基は高効率の会合反応を行うことができ、したがって、本ハイブリダイゼーション試薬の作製に使用するのによく適している。
検出可能な抗体
ハイブリダイゼーション試薬組成物ペア
多重化ハイブリダイゼーション試薬ペア
ハイブリダイゼーション試薬パネル
AE1/AE3、D2−40、デスミン、DOG−1、E−カドヘリン、EGFR、EMA、ER、ERCC1、第VIII因子関連抗原、活性化第XIII因子、ファスシン、FoxP1、FoxP3、ガレクチン−3、GATA−3、GCDFP−15、GCET1、GFAP、グリコホリンA、グリピカン3、グランザイムB、HBME−1、Helicobacter Pylori、ヘモグロビンA、Hep Par1、HER−2、HHV−8、HMB−45、HSV l/ll、ICOS、IFNガンマ、IgA、IgD、IgG、IgM、IL17、IL4、インヒビン、iNOS、カッパIg軽鎖、Ki−67、LAG−3、ラムダIg軽鎖、リゾチーム、マンマグロビンA、MART−1/メランA、マスト細胞トリプターゼ、MLH1、MOC−31、MPO、MSA、MSH2、MSH6、MUC1、MUC2、MUM1、MyoD1、ミオゲニン、ミオグロビン、ナプシンA、ネスチン、NSE、Oct−2、OX40、OX40L、p16、p21、p27、p40、p53、p63、p504s、PAX−5、PAX−8、PD−1、PD−L1、PHH3、PIN−4、PLAP、PMS2、Pneumocystis
jiroveci(carinii)、PgR、PSA、PSAP、RCC、S−100、SMA、SMM、スムーセリン、SOX10、SOX11、サーファクタントアポプロテインA、シナプトフィジン、TAG72、TdT、トロンボモジュリン、チログロブリン、TIA−1、TIM3、TRAcP、TTF−1、チロシナーゼ、ウロプラキン、VEGFR−2、ビリン、ビメンチン、およびWT−1など。
CD4、CD8、CD68、およびPD−L1;
CD4、CD8、FoxP3、およびCD68(任意の固形腫瘍について);
CD8、CD68、PD−L1、加えて、腫瘍関連マーカー(頭頚部腫瘍および膵腫瘍について);
SOX10、CD8、PD−1、およびPD−L1(メラノーマについて);
CD4、CD8、CD20、およびサイトケラチン(乳がんTILについて);
CD8、CD34、FoxP3、およびPD−L1(メラノーマ免疫学について);
CD8、CD34、PD−L1、およびFoxP1(がん免疫学について);
CD3、PD1、LAG−3、およびTIM3(T細胞疲弊について);
CD4およびFoxP3(Tregについて);
CD4およびIL17(Th17について);
CD8およびグランザイムB(活性化CD8について);
CD4およびCXCR5(TFhについて);
CD4およびIL4(Th2について);
CD4およびIFNg(Th1について);
CD4、CD8、CD3、およびCD20(一般的なリンパ球について);
CD4、CD8、CD68、およびCD20(リンパ球およびマクロファージについて);
CD4、FoxP3、CD8、およびCD20(Tregおよびリンパ球について);
CD4、FoxP3、CD8、およびグランザイムB(TregおよびAct CTLについて);
CD68(マクロファージについて);
CD68およびCD163(M2マクロファージについて);
CD20(B細胞について);ならびに
OX40、OX40L、ICOS、および41BB(目的の他の分子について)。
インサイチュハイブリダイゼーションの方法
Press、2007年に提供されている。定量的多重化免疫学的アッセイ、特に、定量的フローサイトメトリアッセイにおけるヒドラゾン連結抗体−オリゴヌクレオチドコンジュゲートの使用は、PCT国際公開第WO2013/188756号およびFlorら(2013年)Chembiochem. 15巻:267〜75頁に記載されている。
調製の方法
アミノ反応性オキシアミノコンジュゲート試薬(AOA)は、スキーム2に示されているように調製され得る:
診断キット
Claims (117)
- 架橋抗原とカップリングしたオリゴヌクレオチドプローブ;および
検出可能な抗体
を含むハイブリダイゼーション試薬組成物であって、該検出可能な抗体が該架橋抗原に対して高親和性で特異的である、ハイブリダイゼーション試薬組成物。 - 前記架橋抗原がペプチドである、請求項1に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 前記架橋抗原が複数の抗原決定基を含む、請求項1に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 前記複数の抗原決定基における各抗原決定基が同じである、請求項3に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 前記複数の抗原決定基が線状反復構造を含む、請求項3に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 前記線状反復構造が線状反復ペプチド構造である、請求項5に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 前記複数の抗原決定基が少なくとも3個の抗原決定基を含む、請求項3に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 前記架橋抗原が分岐型構造を含む、請求項3に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 前記架橋抗原が、非天然残基を含むペプチドである、請求項1に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 前記非天然残基が非天然立体異性体である、請求項9に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 前記非天然残基がβ−アミノ酸である、請求項9に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 前記オリゴヌクレオチドプローブおよび前記架橋抗原が、コンジュゲーション部分を介して化学的カップリング反応によりカップリングしている、請求項1に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 前記オリゴヌクレオチドプローブおよび前記架橋抗原が高効率コンジュゲーション部分を介してカップリングしている、請求項12に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 前記高効率コンジュゲーション部分がシッフ塩基である、請求項13に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 前記シッフ塩基がヒドラゾンまたはオキシムである、請求項14に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 前記高効率コンジュゲーション部分がクリック反応によって形成される、請求項13に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 前記コンジュゲーション部分が切断可能なリンカーを含む、請求項12に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 前記オリゴヌクレオチドプローブが、細胞マーカーをコードする遺伝子または前記遺伝子によって発現されるRNAの少なくとも断片に相補的である、請求項1に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 前記細胞マーカーが、4−1BB、AFP、ALK1、アミロイドA、アミロイドP、アンドロゲン受容体、アネキシンA1、ASMA、BCA225、BCL−1、BCL−2、BCL−6、BerEP4、ベータ−カテニン、ベータ−HCG、BG−8、BOB−1、CA19−9、CA125、カルシトニン、カルデスモン、カルポニン−1、カルレチニン、CAM5.2、CD1a、CD2、CD3、CD4、CD5、CD7、CD8、CD10、CD15、CD19、CD20、CD21、CD22、CD23、CD25、CD30、CD31、CD33、CD34、CD38、CD42b、CD43、CD45 LCA、CD45RO、CD56、CD57、CD61、CD68、CD79a、CD99、CD117、CD138、CD163、CDX2、CEA、クロモグラニンA、CMV、c−kit、c−MET、c−MYC、IV型コラーゲン、補体3c(C3c)、COX−2、CXCR5、CK1、CK5、CK6、CK7、CK8、CK14、CK18、CK17、CK19、CK20、CK903、CK AE1、CK AE1/AE3、D2−40、デスミン、DOG−1、E−カドヘリン、EGFR、EMA、ER、ERCC1、第VIII因子関連抗原、活性化第XIII因子、ファスシン、FoxP1、FoxP3、ガレクチン−3、GATA−3、GCDFP−15、GCET1、GFAP、グリコホリンA、グリピカン3、グランザイムB、HBME−1、Helicobacter Pylori、ヘモグロビンA、Hep Par1、HER2、HHV−8、HMB−45、HSV l/ll、ICOS、IFNガンマ、IgA、IgD、IgG、IgM、IL17、IL4、インヒビン、iNOS、カッパIg軽鎖、Ki67、LAG−3、ラムダIg軽鎖、リゾチーム、マンマグロビンA、MART−1/メランA、マスト細胞トリプターゼ、MLH1、MOC−31、MPO、MSA、MSH2、MSH6、MUC1、MUC2、MUM1、MyoD1、ミオゲニン、ミオグロビン、ナプシンA、ネスチン、NSE、Oct−2、OX40、OX40L、p16、p21、p27、p40、p53、p63、p504s、PAX−5、PAX−8、PD−1、PD−L1、PHH3、PIN−4、PLAP、PMS2、Pneumocystis jiroveci(carinii)、PR、PSA、PSAP、RCC、S−100、SMA、SMM、スムーセリン、SOX10、SOX11、サーファクタントアポプロテインA、シナプトフィジン、TAG72、TdT、トロンボモジュリン、チログロブリン、TIA−1、TIM3、TRAcP、TTF−1、チロシナーゼ、ウロプラキン、VEGFR−2、ビリン、ビメンチン、およびWT−1からなる群から選択される、請求項18に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 前記検出可能な抗体が検出可能な標識を含む、請求項1に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 前記検出可能な標識が、フルオロフォア、酵素、アップコンバージョンナノ粒子、量子ドット、または検出可能なハプテンである、請求項20に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 前記検出可能な標識がフルオロフォアである、請求項21に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 前記酵素が、ペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、またはグルコースオキシダーゼである、請求項21に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 前記ペルオキシダーゼが西洋ワサビペルオキシダーゼまたはダイズペルオキシダーゼである、請求項23に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 前記架橋抗原が検出可能な標識を含む、請求項1に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 前記架橋抗原の前記検出可能な標識がフルオロフォアである、請求項25に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 前記検出可能な抗体が検出可能な標識を含む、請求項25に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 前記架橋抗原の前記検出可能な標識および前記二次抗体の前記検出可能な標識がどちらも、同じ波長の蛍光によって検出可能である、請求項27に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 前記検出可能な抗体が、前記架橋抗原に対して特異的であり、最大で100nM、最大で30nM、最大で10nM、最大で3nM、最大で1nM、最大で0.3nM、最大で0.1nM、最大で0.03nM、最大で0.01nM、または最大で0.003nMの解離定数を有する、請求項1に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 複数の、請求項1〜29のいずれか一項に記載のハイブリダイゼーション試薬組成物を含む、多重化ハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 少なくとも3個のハイブリダイゼーション試薬組成物を含む、請求項30に記載の多重化ハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 少なくとも5個のハイブリダイゼーション試薬組成物を含む、請求項30に記載の多重化ハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 少なくとも10個のハイブリダイゼーション試薬組成物を含む、請求項30に記載の多重化ハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 架橋抗原とカップリングしたオリゴヌクレオチドプローブを含むハイブリダイゼーション試薬。
- 前記架橋抗原がペプチドである、請求項34に記載のハイブリダイゼーション試薬。
- 前記架橋抗原が複数の抗原決定基を含む、請求項34に記載のハイブリダイゼーション試薬。
- 前記複数の抗原決定基における各抗原決定基が同じである、請求項36に記載のハイブリダイゼーション試薬。
- 前記複数の抗原決定基が線状反復構造を含む、請求項36に記載のハイブリダイゼーション試薬。
- 前記線状反復構造が線状反復ペプチド構造である、請求項38に記載のハイブリダイゼーション試薬。
- 前記複数の抗原決定基が少なくとも3個の抗原決定基を含む、請求項36に記載のハイブリダイゼーション試薬。
- 前記架橋抗原が分岐型構造を含む、請求項36に記載のハイブリダイゼーション試薬。
- 前記架橋抗原が、非天然残基を含むペプチドである、請求項34に記載のハイブリダイゼーション試薬。
- 前記非天然残基が非天然立体異性体である、請求項42に記載のハイブリダイゼーション試薬。
- 前記非天然残基がβ−アミノ酸である、請求項42に記載のハイブリダイゼーション試薬。
- 前記オリゴヌクレオチドプローブおよび前記架橋抗原が、コンジュゲーション部分を介して化学的カップリング反応によりカップリングしている、請求項34に記載のハイブリダイゼーション試薬。
- 前記オリゴヌクレオチドプローブおよび前記架橋抗原が高効率コンジュゲーション部分を介してカップリングしている、請求項45に記載のハイブリダイゼーション試薬。
- 前記高効率コンジュゲーション部分がシッフ塩基である、請求項46に記載のハイブリダイゼーション試薬。
- 前記シッフ塩基がヒドラゾンまたはオキシムである、請求項47に記載のハイブリダイゼーション試薬。
- 前記高効率コンジュゲーション部分がクリック反応によって形成される、請求項46に記載のハイブリダイゼーション試薬。
- 前記コンジュゲーション部分が切断可能なリンカーを含む、請求項45に記載のハイブリダイゼーション試薬。
- 前記オリゴヌクレオチドプローブが、細胞マーカーをコードする遺伝子または該遺伝子によって発現されるRNAの少なくとも断片に相補的である、請求項34に記載のハイブリダイゼーション試薬。
- 前記細胞マーカーが、4−1BB、AFP、ALK1、アミロイドA、アミロイドP、アンドロゲン受容体、アネキシンA1、ASMA、BCA225、BCL−1、BCL−2、BCL−6、BerEP4、ベータ−カテニン、ベータ−HCG、BG−8、BOB−1、CA19−9、CA125、カルシトニン、カルデスモン、カルポニン−1、カルレチニン、CAM5.2、CD1a、CD2、CD3、CD4、CD5、CD7、CD8、CD10、CD15、CD19、CD20、CD21、CD22、CD23、CD25、CD30、CD31、CD33、CD34、CD38、CD42b、CD43、CD45 LCA、CD45RO、CD56、CD57、CD61、CD68、CD79a、CD99、CD117、CD138、CD163、CDX2、CEA、クロモグラニンA、CMV、c−kit、c−MET、c−MYC、IV型コラーゲン、補体3c(C3c)、COX−2、CXCR5、CK1、CK5、CK6、CK7、CK8、CK14、CK18、CK17、CK19、CK20、CK903、CK AE1、CK AE1/AE3、D2−40、デスミン、DOG−1、E−カドヘリン、EGFR、EMA、ER、ERCC1、第VIII因子関連抗原、活性化第XIII因子、ファスシン、FoxP1、FoxP3、ガレクチン−3、GATA−3、GCDFP−15、GCET1、GFAP、グリコホリンA、グリピカン3、グランザイムB、HBME−1、Helicobacter Pylori、ヘモグロビンA、Hep Par1、HER2、HHV−8、HMB−45、HSV l/ll、ICOS、IFNガンマ、IgA、IgD、IgG、IgM、IL17、IL4、インヒビン、iNOS、カッパIg軽鎖、Ki67、LAG−3、ラムダIg軽鎖、リゾチーム、マンマグロビンA、MART−1/メランA、マスト細胞トリプターゼ、MLH1、MOC−31、MPO、MSA、MSH2、MSH6、MUC1、MUC2、MUM1、MyoD1、ミオゲニン、ミオグロビン、ナプシンA、ネスチン、NSE、Oct−2、OX40、OX40L、p16、p21、p27、p40、p53、p63、p504s、PAX−5、PAX−8、PD−1、PD−L1、PHH3、PIN−4、PLAP、PMS2、Pneumocystis jiroveci(carinii)、PR、PSA、PSAP、RCC、S−100、SMA、SMM、スムーセリン、SOX10、SOX11、サーファクタントアポプロテインA、シナプトフィジン、TAG72、TdT、トロンボモジュリン、チログロブリン、TIA−1、TIM3、TRAcP、TTF−1、チロシナーゼ、ウロプラキン、VEGFR−2、ビリン、ビメンチン、およびWT−1からなる群から選択される、請求項51に記載のハイブリダイゼーション試薬。
- 前記架橋抗原が検出可能な標識を含む、請求項34に記載のハイブリダイゼーション試薬。
- 前記検出可能な標識が、フルオロフォアである、請求項53に記載のハイブリダイゼーション試薬。
- 複数の、請求項34〜54のいずれか一項に記載のハイブリダイゼーション試薬を含む、多重化ハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 少なくとも3個のハイブリダイゼーション試薬を含む、請求項55に記載の多重化ハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 少なくとも5個のハイブリダイゼーション試薬を含む、請求項55に記載の多重化ハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 少なくとも10個のハイブリダイゼーション試薬を含む、請求項55に記載の多重化ハイブリダイゼーション試薬組成物。
- 第1の標的核酸を含む第1の試料を供給するステップ;
該第1の標的核酸を第1のハイブリダイゼーション試薬と反応させるステップであって、該第1のハイブリダイゼーション試薬が、該第1の標的核酸に相補的な、請求項34〜54のいずれか一項に記載のハイブリダイゼーション試薬である、ステップ;
該第1のハイブリダイゼーション試薬を第1の検出可能な抗体と反応させるステップであって、該第1の検出可能な抗体が、該第1のハイブリダイゼーション試薬の架橋抗原に対して、高親和性で特異的である、ステップ;および
該第1のハイブリダイゼーション試薬の該架橋抗原と会合している該第1の検出可能な抗体を検出するステップ
を含む、ハイブリダイゼーションアッセイのための方法。 - 前記第1のハイブリダイゼーション試薬の前記オリゴヌクレオチドプローブが、細胞マーカーをコードする遺伝子または該遺伝子によって発現されるRNAの少なくとも断片に相補的である、請求項59に記載の方法。
- 前記細胞マーカーが、4−1BB、AFP、ALK1、アミロイドA、アミロイドP、アンドロゲン受容体、アネキシンA1、ASMA、BCA225、BCL−1、BCL−2、BCL−6、BerEP4、ベータ−カテニン、ベータ−HCG、BG−8、BOB−1、CA19−9、CA125、カルシトニン、カルデスモン、カルポニン−1、カルレチニン、CAM5.2、CD1a、CD2、CD3、CD4、CD5、CD7、CD8、CD10、CD15、CD19、CD20、CD21、CD22、CD23、CD25、CD30、CD31、CD33、CD34、CD38、CD42b、CD43、CD45 LCA、CD45RO、CD56、CD57、CD61、CD68、CD79a、CD99、CD117、CD138、CD163、CDX2、CEA、クロモグラニンA、CMV、c−kit、c−MET、c−MYC、IV型コラーゲン、補体3c(C3c)、COX−2、CXCR5、CK1、CK5、CK6、CK7、CK8、CK14、CK18、CK17、CK19、CK20、CK903、CK AE1、CK AE1/AE3、D2−40、デスミン、DOG−1、E−カドヘリン、EGFR、EMA、ER、ERCC1、第VIII因子関連抗原、活性化第XIII因子、ファスシン、FoxP1、FoxP3、ガレクチン−3、GATA−3、GCDFP−15、GCET1、GFAP、グリコホリンA、グリピカン3、グランザイムB、HBME−1、Helicobacter Pylori、ヘモグロビンA、Hep Par1、HER2、HHV−8、HMB−45、HSV l/ll、ICOS、IFNガンマ、IgA、IgD、IgG、IgM、IL17、IL4、インヒビン、iNOS、カッパIg軽鎖、Ki67、LAG−3、ラムダIg軽鎖、リゾチーム、マンマグロビンA、MART−1/メランA、マスト細胞トリプターゼ、MLH1、MOC−31、MPO、MSA、MSH2、MSH6、MUC1、MUC2、MUM1、MyoD1、ミオゲニン、ミオグロビン、ナプシンA、ネスチン、NSE、Oct−2、OX40、OX40L、p16、p21、p27、p40、p53、p63、p504s、PAX−5、PAX−8、PD−1、PD−L1、PHH3、PIN−4、PLAP、PMS2、Pneumocystis jiroveci(carinii)、PR、PSA、PSAP、RCC、S−100、SMA、SMM、スムーセリン、SOX10、SOX11、サーファクタントアポプロテインA、シナプトフィジン、TAG72、TdT、トロンボモジュリン、チログロブリン、TIA−1、TIM3、TRAcP、TTF−1、チロシナーゼ、ウロプラキン、VEGFR−2、ビリン、ビメンチン、およびWT−1からなる群から選択される、請求項60に記載の方法。
- 前記第1の検出可能な抗体が検出可能な標識を含む、請求項59に記載の方法。
- 前記検出可能な標識が、フルオロフォア、酵素、アップコンバージョンナノ粒子、量子ドット、または検出可能なハプテンである、請求項62に記載の方法。
- 前記検出可能な標識がフルオロフォアである、請求項63に記載の方法。
- 前記酵素が、ペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、またはグルコースオキシダーゼである、請求項63に記載の方法。
- 前記ペルオキシダーゼが西洋ワサビペルオキシダーゼまたはダイズペルオキシダーゼである、請求項65に記載の方法。
- 前記第1の検出可能な抗体が、前記第1のハイブリダイゼーション試薬の前記架橋抗原に対して特異的であり、最大で100nM、最大で30nM、最大で10nM、最大で3nM、最大で1nM、最大で0.3nM、最大で0.1nM、最大で0.03nM、最大で0.01nM、または最大で0.003nMの解離定数を有する、請求項59に記載の方法。
- 前記第1の標的核酸が組織切片内にある、請求項59に記載の方法。
- 前記検出するステップが蛍光検出ステップである、請求項68に記載の方法。
- 前記検出するステップが酵素的検出ステップである、請求項68に記載の方法。
- 前記第1の標的核酸が細胞内または細胞上にある、請求項59に記載の方法。
- 前記第1の標的核酸が前記細胞の細胞質内にある、請求項71に記載の方法。
- 前記第1の標的核酸が前記細胞の核内にある、請求項71に記載の方法。
- 前記検出するステップが蛍光検出ステップである、請求項71に記載の方法。
- 前記第1の検出可能な抗体に結合している細胞を選別するステップをさらに含む、請求項74に記載の方法。
- 前記第1の試料における第2の標的核酸を第2のハイブリダイゼーション試薬と反応させるステップであって、該第2のハイブリダイゼーション試薬が、該第2の標的核酸に相補的な、請求項34〜54のいずれか一項に記載のハイブリダイゼーション試薬である、ステップ;
該第2のハイブリダイゼーション試薬を第2の検出可能な抗体と反応させるステップであって、該第2の検出可能な抗体が、該第2のハイブリダイゼーション試薬の架橋抗原に対して、高親和性で特異的である、ステップ;および
該第2のハイブリダイゼーション試薬の該架橋抗原と会合している該第2の検出可能な抗体を検出するステップ
をさらに含む、請求項59に記載の方法。 - 前記試料において少なくとも3個の標的核酸を検出するステップをさらに含む、請求項76に記載の方法。
- 前記試料において少なくとも5個の標的核酸を検出するステップをさらに含む、請求項76に記載の方法。
- 前記試料において少なくとも10個の標的核酸を検出するステップをさらに含む、請求項76に記載の方法。
- 第2の試料における第2の標的核酸を第2のハイブリダイゼーション試薬と反応させるステップであって、該第2のハイブリダイゼーション試薬が、該第2の標的核酸に相補的な、請求項35〜56のいずれか一項に記載のハイブリダイゼーション試薬である、ステップ;
該第2のハイブリダイゼーション試薬を第2の検出可能な抗体と反応させるステップであって、該第2の検出可能な抗体が、該第2のハイブリダイゼーション試薬の架橋抗原に対して、高親和性で特異的である、ステップ;および
該第2のハイブリダイゼーション試薬の該架橋抗原と会合している該第2の検出可能な抗体を検出するステップ
をさらに含み、前記第1の試料および該第2の試料が、組織試料の連続切片である、請求項59に記載の方法。 - 前記第1の試料において複数の標的核酸が検出され、前記第2の試料において複数の標的核酸が検出される、請求項80に記載の方法。
- 前記第1の試料において少なくとも3個の標的核酸が検出され、前記第2の試料において少なくとも3個の標的核酸が検出される、請求項81に記載の方法。
- 少なくとも3個の試料において、少なくとも3個の標的核酸が検出され、該少なくとも3個の試料が組織試料の連続切片である、請求項80に記載の方法。
- 前記少なくとも3個の試料のそれぞれにおいて、複数の標的核酸が検出される、請求項83に記載の方法。
- 前記少なくとも3個の試料のそれぞれにおいて、少なくとも3個の標的核酸が検出される、請求項84に記載の方法。
- 第1の標的核酸を含む試料を供給するステップ;
該第1の標的核酸を第1のハイブリダイゼーション試薬と反応させるステップであって、該第1のハイブリダイゼーション試薬が、該第1の標的核酸に相補的な、請求項34〜54のいずれか一項に記載のハイブリダイゼーション試薬である、ステップ;
該第1のハイブリダイゼーション試薬を第1の反応性抗体と反応させるステップであって、該第1の反応性抗体が、該第1のハイブリダイゼーション試薬の架橋抗原と高親和性で結合する、ステップ;および該第1の反応性抗体を第1の検出可能な試薬と反応させるステップであって、該第1の検出可能な試薬が、該第1の標的核酸の近くで該試料と結合している、ステップ
を含む、ハイブリダイゼーションアッセイのための方法。 - 前記第1の反応性抗体が酵素活性を含む、請求項86に記載の方法。
- 前記酵素活性がペルオキシダーゼ活性である、請求項87に記載の方法。
- 前記ペルオキシダーゼ活性が西洋ワサビペルオキシダーゼ活性である、請求項88に記載の方法。
- 前記第1の検出可能な試薬がチラミドを含む、請求項86に記載の方法。
- 前記第1の検出可能な試薬がフルオロフォアまたは発色団を含む、請求項86に記載の方法。
- 前記第1の反応性抗体を前記試料から解離させるステップをさらに含む、請求項86に記載の方法。
- 前記第1の反応性抗体が選択的処理により前記試料から解離する、請求項92に記載の方法。
- 前記選択的処理が可溶性架橋抗原での処理を含む、請求項93に記載の方法。
- 前記選択的処理が切断可能なリンカーの切断を含む、請求項93に記載の方法。
- 前記第1の反応性抗体が熱処理により前記試料から解離する、請求項92に記載の方法。
- 前記試料における第2の標的核酸を第2のハイブリダイゼーション試薬と反応させるステップであって、該第2のハイブリダイゼーション試薬が、該第2の標的核酸に相補的な、請求項34〜54のいずれか一項に記載のハイブリダイゼーション試薬である、ステップ;
該第2のハイブリダイゼーション試薬を第2の反応性抗体と反応させるステップであって、該第2の反応性抗体が、該第2のハイブリダイゼーション試薬の架橋抗原と高親和性で結合する、ステップ;および
該第2の反応性抗体を第2の検出可能な試薬と反応させるステップであって、該第2の検出可能な試薬が、該第2の標的核酸の近くで該試料に結合している、ステップ
をさらに含む、請求項92に記載の方法。 - 前記第2の反応性抗体が酵素活性を含む、請求項97に記載の方法。
- 前記酵素活性がペルオキシダーゼ活性である、請求項98に記載の方法。
- 前記ペルオキシダーゼ活性が西洋ワサビペルオキシダーゼ活性である、請求項99に記載の方法。
- 前記第2の検出可能な試薬がチラミドを含む、請求項97に記載の方法。
- 前記第2の検出可能な試薬がフルオロフォアまたは発色団を含む、請求項97に記載の方法。
- 前記第1の反応性抗体が選択的処理により前記試料から解離する、請求項97に記載の方法。
- 前記選択的処理が可溶性架橋抗原での処理を含む、請求項103に記載の方法。
- 前記選択的処理が切断可能なリンカーの切断を含む、請求項103に記載の方法。
- 前記第1の反応性抗体が熱処理により前記試料から解離する、請求項97に記載の方法。
- 前記試料において前記第1の検出可能な試薬および前記第2の検出可能な試薬を検出するステップをさらに含む、請求項97に記載の方法。
- 請求項34〜54のいずれか一項に記載のハイブリダイゼーション試薬、
前記架橋抗原に対して、高親和性で特異的な検出可能な抗体、および
キットを使用するための指示
を含む、ハイブリダイゼーションアッセイのためのキット。 - 前記検出可能な抗体が検出可能な標識を含む、請求項108に記載のキット。
- 前記検出可能な標識が、フルオロフォア、酵素、アップコンバージョンナノ粒子、量子ドット、または検出可能なハプテンである、請求項109に記載のキット。
- 前記検出可能な標識がフルオロフォアである、請求項110に記載のキット。
- 前記酵素が、ペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、またはグルコースオキシダーゼである、請求項111に記載のキット。
- 前記ペルオキシダーゼが西洋ワサビペルオキシダーゼまたはダイズペルオキシダーゼである、請求項112に記載のキット。
- 前記検出可能な抗体が、前記架橋抗原に対して特異的であり、最大で100nM、最大で30nM、最大で10nM、最大で3nM、最大で1nM、最大で0.3nM、最大で0.1nM、最大で0.03nM、最大で0.01nM、または最大で0.003nMの解離定数を有する、請求項108に記載のキット。
- 請求項108に記載のキットであって、
請求項34〜54のいずれか一項に記載の少なくとも3個のハイブリダイゼーション試薬、
前記架橋抗原に対して、高親和性で特異的な、少なくとも3個の検出可能な抗体、および
該キットを使用するための指示
を含む、キット。 - 請求項108に記載のキットであって、
請求項34〜54のいずれか一項に記載の少なくとも5個のハイブリダイゼーション試薬、
前記架橋抗原に対して、高親和性で特異的な、少なくとも5個の検出可能な抗体、および
該キットを使用するための指示
を含む、キット。 - 請求項108に記載のキットであって、
請求項34〜54のいずれか一項に記載の少なくとも10個のハイブリダイゼーション試薬、
前記架橋抗原に対して、高親和性で特異的な、少なくとも10個の検出可能な抗体、および
該キットを使用するための指示
を含む、キット。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2022142054A JP2022168081A (ja) | 2016-07-18 | 2022-09-07 | 抗原をカップリングさせたハイブリダイゼーション試薬 |
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201662363825P | 2016-07-18 | 2016-07-18 | |
US62/363,825 | 2016-07-18 | ||
PCT/US2017/042659 WO2018017606A1 (en) | 2016-07-18 | 2017-07-18 | Antigen-coupled hybridization reagents |
Related Child Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2022142054A Division JP2022168081A (ja) | 2016-07-18 | 2022-09-07 | 抗原をカップリングさせたハイブリダイゼーション試薬 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2019523000A true JP2019523000A (ja) | 2019-08-22 |
Family
ID=60992572
Family Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2019502168A Pending JP2019523000A (ja) | 2016-07-18 | 2017-07-18 | 抗原をカップリングさせたハイブリダイゼーション試薬 |
JP2022142054A Pending JP2022168081A (ja) | 2016-07-18 | 2022-09-07 | 抗原をカップリングさせたハイブリダイゼーション試薬 |
Family Applications After (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2022142054A Pending JP2022168081A (ja) | 2016-07-18 | 2022-09-07 | 抗原をカップリングさせたハイブリダイゼーション試薬 |
Country Status (7)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20190233876A1 (ja) |
EP (1) | EP3485275A4 (ja) |
JP (2) | JP2019523000A (ja) |
CN (2) | CN116515950A (ja) |
AU (1) | AU2017298299A1 (ja) |
CA (1) | CA3031442A1 (ja) |
WO (1) | WO2018017606A1 (ja) |
Families Citing this family (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US11867696B2 (en) | 2015-02-06 | 2024-01-09 | Cell Idx, Inc. | Antigen-coupled immunoreagents |
CN115586335B (zh) * | 2021-11-04 | 2023-10-13 | 贵州美鑫达医疗科技有限公司 | 用于黑素瘤术中快速免疫组化的多聚酶-抗体组合 |
Citations (10)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO1999004042A1 (en) * | 1997-07-16 | 1999-01-28 | Burden David W | Synthetic oligonucleotide-peptide conjugates and methods of use |
JP2003535569A (ja) * | 1999-03-19 | 2003-12-02 | ヴァリジェン(ユーエス),インコーポレーテッド | ペプチド標識オリゴヌクレオチドと抗体アレイを用いた核酸多型の検出方法 |
JP2010508532A (ja) * | 2006-11-01 | 2010-03-18 | ベンタナ・メデイカル・システムズ・インコーポレーテツド | ハプテン、ハプテンコンジュゲート、その組成物ならびにそれらの製造および使用の方法 |
JP2011514322A (ja) * | 2008-02-08 | 2011-05-06 | ザ スクリプス リサーチ インスティチュート | 遺伝的にコードされる非天然アミノ酸による免疫寛容解除 |
US20120121613A1 (en) * | 2009-01-19 | 2012-05-17 | Bayer Healthcare Llc | Protein conjugate having an endopeptidase- cleavable bioprotective moiety |
JP2013524812A (ja) * | 2010-04-20 | 2013-06-20 | ヴェンタナ メディカル システムズ, インク. | 2色発色性インサイツハイブリダイゼーション |
JP2014509516A (ja) * | 2011-03-14 | 2014-04-21 | ヴェンタナ メディカル システムズ, インク. | 染色体転座を解析する方法及びそのシステム |
WO2014139979A1 (en) * | 2013-03-12 | 2014-09-18 | Ventana Medical Systems, Inc. | Quantum dot in situ hybridization |
JP2015514214A (ja) * | 2012-03-27 | 2015-05-18 | ヴェンタナ メディカル システムズ, インク. | シグナリングコンジュゲート及び使用法 |
WO2016073833A1 (en) * | 2014-11-06 | 2016-05-12 | Cell Idx, Inc. | High-affinity immunopolymers |
Family Cites Families (17)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CA2250723C (en) * | 1996-05-24 | 2012-07-17 | Chiron Corporation | Multiple epitope fusion protein |
US7704962B1 (en) * | 1997-10-03 | 2010-04-27 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Small oligonucleotides with anti-tumor activity |
US6927068B2 (en) * | 2002-01-30 | 2005-08-09 | The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Navy | Rapid and non-invasive method to evaluate immunization status of a patient |
US20040175737A1 (en) * | 2002-12-23 | 2004-09-09 | Wyeth | Assay for RNase H activity |
EP1668157A4 (en) * | 2003-07-07 | 2007-10-24 | One Cell Systems Inc | HAIRPIN MARKED PROBES AND METHOD OF USE |
US20080214408A1 (en) * | 2006-10-18 | 2008-09-04 | Government Of The Uinted States Of America, Represented By The Secretary Dept. | In situ assembly of protein microarrays |
EP3521311A1 (en) * | 2008-04-11 | 2019-08-07 | Chugai Seiyaku Kabushiki Kaisha | Antigen-binding molecule capable of binding to two or more antigen molecules repeatedly |
GB0811574D0 (en) * | 2008-06-24 | 2008-07-30 | Trillion Genomics Ltd | Characterising planar samples by mass spectrometry |
KR101029343B1 (ko) * | 2009-07-30 | 2011-04-13 | 한국과학기술연구원 | 면역분석 기반의 항원 검출용 키트 및 항원 검출 방법 |
CN101935697B (zh) * | 2010-04-16 | 2015-11-25 | 中生方政生物技术有限公司 | 用于核酸序列检测的方法和试剂盒 |
GB201012603D0 (en) * | 2010-07-27 | 2010-09-08 | Ucb Pharma Sa | Protein purification |
CN104203272A (zh) * | 2012-01-26 | 2014-12-10 | 长角牛疫苗和诊断有限责任公司 | 复合抗原序列及疫苗 |
WO2013177046A1 (en) * | 2012-05-21 | 2013-11-28 | Solulink, Inc. | Methods and/or use of oligonucleotide conjugates for suppressing background due to cross-hybridization |
CA2877729C (en) * | 2012-06-29 | 2020-11-17 | Htg Molecular Diagnostics, Inc. | Nuclease protection methods for detection of nucleotide variants |
US20140024024A1 (en) * | 2012-07-17 | 2014-01-23 | General Electric Company | Methods of detecting dna, rna and protein in biological samples |
EP2893041A4 (en) * | 2012-09-05 | 2016-07-06 | Bio Rad Laboratories | CHIMERIC ANTI-DSDNA / CHROMATIN ANTIBODY |
US10195313B2 (en) * | 2014-04-10 | 2019-02-05 | Wisconsin Alumni Research Foundation | Method for forming hydrogel arrays using surfaces with differential wettability |
-
2017
- 2017-07-18 WO PCT/US2017/042659 patent/WO2018017606A1/en unknown
- 2017-07-18 EP EP17831716.0A patent/EP3485275A4/en active Pending
- 2017-07-18 CA CA3031442A patent/CA3031442A1/en active Pending
- 2017-07-18 CN CN202310504007.6A patent/CN116515950A/zh active Pending
- 2017-07-18 JP JP2019502168A patent/JP2019523000A/ja active Pending
- 2017-07-18 AU AU2017298299A patent/AU2017298299A1/en active Pending
- 2017-07-18 US US16/318,801 patent/US20190233876A1/en active Pending
- 2017-07-18 CN CN201780057308.1A patent/CN109716130B/zh active Active
-
2022
- 2022-09-07 JP JP2022142054A patent/JP2022168081A/ja active Pending
Patent Citations (10)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO1999004042A1 (en) * | 1997-07-16 | 1999-01-28 | Burden David W | Synthetic oligonucleotide-peptide conjugates and methods of use |
JP2003535569A (ja) * | 1999-03-19 | 2003-12-02 | ヴァリジェン(ユーエス),インコーポレーテッド | ペプチド標識オリゴヌクレオチドと抗体アレイを用いた核酸多型の検出方法 |
JP2010508532A (ja) * | 2006-11-01 | 2010-03-18 | ベンタナ・メデイカル・システムズ・インコーポレーテツド | ハプテン、ハプテンコンジュゲート、その組成物ならびにそれらの製造および使用の方法 |
JP2011514322A (ja) * | 2008-02-08 | 2011-05-06 | ザ スクリプス リサーチ インスティチュート | 遺伝的にコードされる非天然アミノ酸による免疫寛容解除 |
US20120121613A1 (en) * | 2009-01-19 | 2012-05-17 | Bayer Healthcare Llc | Protein conjugate having an endopeptidase- cleavable bioprotective moiety |
JP2013524812A (ja) * | 2010-04-20 | 2013-06-20 | ヴェンタナ メディカル システムズ, インク. | 2色発色性インサイツハイブリダイゼーション |
JP2014509516A (ja) * | 2011-03-14 | 2014-04-21 | ヴェンタナ メディカル システムズ, インク. | 染色体転座を解析する方法及びそのシステム |
JP2015514214A (ja) * | 2012-03-27 | 2015-05-18 | ヴェンタナ メディカル システムズ, インク. | シグナリングコンジュゲート及び使用法 |
WO2014139979A1 (en) * | 2013-03-12 | 2014-09-18 | Ventana Medical Systems, Inc. | Quantum dot in situ hybridization |
WO2016073833A1 (en) * | 2014-11-06 | 2016-05-12 | Cell Idx, Inc. | High-affinity immunopolymers |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
WO2018017606A1 (en) | 2018-01-25 |
EP3485275A1 (en) | 2019-05-22 |
CA3031442A1 (en) | 2018-01-25 |
EP3485275A4 (en) | 2020-06-17 |
CN109716130A (zh) | 2019-05-03 |
JP2022168081A (ja) | 2022-11-04 |
US20190233876A1 (en) | 2019-08-01 |
CN109716130B (zh) | 2023-05-23 |
CN116515950A (zh) | 2023-08-01 |
AU2017298299A1 (en) | 2019-02-28 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US20210132067A1 (en) | Antigen-coupled immunoreagents | |
US20190265235A1 (en) | Reagent compounds, compositions, kits, and methods for amplified assays | |
US20240035068A1 (en) | On-slide staining by primer extension | |
JP6691092B2 (ja) | ハプテン、ハプテンコンジュゲート、その組成物ならびにそれらの製造および使用の方法 | |
Chu et al. | Labeling tumor cells with fluorescent nanocrystal–aptamer bioconjugates | |
JP2022168081A (ja) | 抗原をカップリングさせたハイブリダイゼーション試薬 | |
TW205094B (ja) | ||
JP6473381B2 (ja) | 免疫組織化学およびinsituハイブリダーゼーションのためのポリマー担体 | |
Byers et al. | Quantum dots brighten biological imaging | |
CA2777421A1 (en) | Detection of plurality of targets in biological samples | |
JP6909156B2 (ja) | 化学ライゲーション及びハプテン移行を用いた近接アッセイ | |
Xu et al. | Quantum dot-based, quantitative, and multiplexed assay for tissue staining | |
WO2016073833A1 (en) | High-affinity immunopolymers | |
EP3746473A1 (en) | Sequential staining for multiplex analyses of tissues and cells | |
Leder | Site-specific protein labeling in the pharmaceutical industry: experiences from novartis drug discovery | |
WO2021226516A2 (en) | Oligonucleotide-tyramide conjugate and use of the same in tyramide-signal amplification (tsa)-based detection methods |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20200717 |
|
A977 | Report on retrieval |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 Effective date: 20210521 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20210524 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20210823 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20211022 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20211124 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20220307 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20220606 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20220805 |
|
A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20221207 |