JP2019514374A5 - - Google Patents

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  1. マントル細胞リンパ腫 (MCL)を有するヒト対象の生存予測スコアを決定する方法であって、該方法が以下:
    (a) 対象由来のホルマリン固定及びパラフィン包埋 (FFPE)の生検試料を提供すること;
    (b) 該生検試料からRNAの遺伝子発現産物を単離すること;
    (c) 該RNAの遺伝子発現産物から遺伝子発現データを取得すること(該遺伝子発現データは、以下の表:

    中に列記された各遺伝子についての発現レベルを表すシグナル値を含む);並びに
    (d) 該遺伝子発現データから生存予測スコアを決定すること(該生存予測スコア
    は、
    (c)の表中に列記された各遺伝子についての乗算の積を計算すること(該乗算の積
    は遺伝子のシグナル値の対数変換と該遺伝子についての係数値との数学的積であり、遺伝子についての該係数値は(c)の表中に列記されている)及び
    該乗算の積を合計すること
    によって決定される)
    を含む、方法。
  2. 前記RNAの遺伝子発現データがNanoString Technologies(登録商標)nCounter(登録商標)アッセイを使用して取得される、請求項1に記載の方法。
  3. マントル細胞リンパ腫 (MCL)を有するヒト対象の生存転帰予測を補助する方法であって、以下:
    (a) 請求項1又は2により対象の生存予測スコアを決定すること;並びに
    (b) 該対象を、生存予測スコアに基づいて、以下の群:(i)良好な予後(生存予測スコアが-143未満として計算される)、(ii)中間の予後(生存予測スコアが-143〜-28の
    間として計算される)、及び(iii)不良な予後(生存予測スコアが-28超として計算される)の一つに属するとして分類すること
    を含む、方法。
  4. マントル細胞リンパ腫 (MCL)を有するヒト対象の治療選択を補助する方法であって、以下:
    (a) 請求項3により対象を分類すること;及び
    (b) 対象の分類に基づいて対象の治療を選択すること
    を含む、方法。
  5. 前記治療が、R-CHOP (リツキシマブ、シクロフォスファミド、ヒドロキシダウノルビシン、ビンクリスチン及びプレドニゾン)の投与を含む、請求項4に記載の方法。
  6. マントル細胞リンパ腫 (MCL)を有するヒト対象の生存予測スコアを決定する方法であって、該方法が以下:
    (a) 対象由来のホルマリン固定及びパラフィン包埋 (FFPE)の生検試料を提供すること;
    (b) 該生検試料からRNAの遺伝子発現産物を単離すること;
    (c) 該RNAの遺伝子発現産物から遺伝子発現データを取得すること(該遺伝子発現データは、以下の表:

    中に列記された各遺伝子についての発現レベルを表すシグナル値を含む);並びに
    (d) 該遺伝子発現データから生存予測スコアを決定すること(該生存予測スコア
    は、
    (c)の表中に列記された各遺伝子についての乗算の積を計算すること(該乗算の積
    は遺伝子のシグナル値と該遺伝子についての係数値との数学的積であり、遺伝子についての該係数値は(c)の表中に列記されている)及び
    該乗算の積を合計すること
    によって決定される)
    を含む、方法。
  7. 前記RNAの遺伝子発現データがNanoString Technologies(登録商標)nCounter(登録商標)アッセイを使用して取得される、請求項6に記載の方法。
  8. マントル細胞リンパ腫 (MCL)を有するヒト対象の生存転帰予測を補助する方法であって、以下:
    (a) 請求項6又は7により対象の生存予測スコアを決定すること;並びに
    (b) 該対象を、生存予測スコアに基づいて、以下の群:(i)良好な予後(生存予測スコアが約-100000未満として計算される)、(ii)中間の予後(生存予測スコアが約-100000〜約-32000の間として計算される)及び(iii)不良な予後(生存予測スコアが約-32000
    超として計算される)の一つに属するとして分類すること
    を含む、方法。
  9. マントル細胞リンパ腫 (MCL)を有するヒト対象の治療の選択を補助する方法であって、以下:
    (a) 請求項8により対象を分類すること;及び
    (b) 対象の分類に基づいて対象の治療を選択すること
    を含む、方法。
  10. 前記治療がR-CHOP (リツキシマブ、シクロフォスファミド、ヒドロキシダウノルビシン、ビンクリスチン及びプレドニゾン)の投与を含む、請求項9に記載の方法。
  11. マントル細胞リンパ腫 (MCL)を有するヒト対象の生存転帰予測を補助する方法であって、以下:
    (a) 対象由来のホルマリン固定及びパラフィン包埋 (FFPE)の生検試料を提供すること;
    (b) 該生検試料からRNAの遺伝子発現産物を単離すること;
    (c) 該RNAの遺伝子発現産物から遺伝子発現データを取得すること(該遺伝子発現データは以下の表:

    中に列記された各遺伝子iについての発現レベルを表すシグナル値を含む);並びに
    (d) 該遺伝子発現データから生存予測スコアを決定すること(生存予測スコアは
    以下の式:


    (前記式中:yは生存予測スコアであり、ci(c)の表中に列記された遺伝子iの係数値で
    あり、xiは遺伝子iのシグナル値である)
    によって決定される)
    を含む、方法。
  12. マントル細胞リンパ腫 (MCL)を有するヒト対象の生存予測スコアを決定するためのキットであって、以下の表:

    中に列記された各遺伝子の特定のmRNA種の存在量を測定するためのプローブのセットを含む、キット。
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