JP2019500061A5

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Publication number: JP2019500061A5
Application number: JP2018552098A
Authority: JP
Filing date: 2016-12-23
Publication date: 2020-03-12
Anticipated expiration: 2036-12-23

Claims

ソース細胞を標的細胞タイプの少なくとも１つの特徴を有する細胞に転換するのに必要な転写因子を決定する方法であって：
−前記ソース細胞タイプ及び標的細胞タイプ中の遺伝子の差次的発現を決定するステップと；
−前記差次的遺伝子発現に基づいて、少なくとも１つのネットワークに亘って、前記ソース細胞タイプ及び標的細胞タイプの各々における各転写因子（ＴＦ）に関するネットワークスコアを決定するステップであって、前記ネットワークは、遺伝子発現に影響する相互作用の情報を含む、ステップと；
−ネットワークスコアと差次的遺伝子発現との情報の組み合わせに基づいて前記ＴＦをランク付けし、それによりソース細胞から標的細胞タイプの少なくとも１つの特徴を有する細胞への転換のための転写因子のセットを特定するステップと、を含む、方法。
更に、ソース細胞タイプにおいて、標的細胞タイプへのソース細胞タイプの転換に必要であると決定された転写因子の量を増大させることを含む、請求項１に記載の方法。
前記ソース細胞タイプ及び標的細胞タイプ中の各差次的発現遺伝子に関する遺伝子スコアを決定するステップを含む、請求項１に記載の方法。
前記遺伝子スコアが、前記差次的発現のｌｏｇ倍数変化と調整Ｐ値との組み合わせである、請求項１又は３に記載の方法。
前記遺伝子スコアが、好ましくは背景に対する、ツリーベースの方法を使用して計算される、請求項１〜４のいずれか一項に記載の方法。
前記ネットワークが、タンパク質−ＤＮＡ相互作用、タンパク質−ＤＮＡ及び／又はタンパク質−ＲＮＡ相互作用の情報を含む、請求項１〜５のいずれか一項に記載の方法。
前記ネットワークが、遺伝子の転写因子及び調節領域の間の相互作用の情報を含む、請求項６に記載の方法。
前記調節領域が、遺伝子のプロモーター領域である、請求項７に記載の方法。
更に、遺伝子スコアを決定する前に、各遺伝子に関する発現データを収集するステップを含む、請求項１〜８のいずれか一項に記載の方法。
更に、各細胞タイプからの前記ランク付けリストから、転写的に重複性のＴＦを除去するステップを含む、請求項１〜９のいずれか一項に記載の方法。
ソース細胞を標的細胞タイプの少なくとも１つの特徴を有する細胞に転換するのに必要な転写因子を決定する方法であって：
−前記ソース細胞タイプ及び標的細胞タイプ中の各遺伝子に関する発現データを収集するステップと；
−各サンプル中の各遺伝子に関するツリーベースの背景に対する差次的発現を計算した後、前記ｌｏｇ倍数変化及び調整Ｐ値を遺伝子スコアと組み合わせるステップと；
−各ＴＦ上に中心を置く少なくとも１つのサブネットワークに亘って、遺伝子スコアの加重和を実行することにより、各ＴＦに関するネットワークスコアを計算するステップと；
−遺伝子スコアとネットワークスコアとの組み合わせに基づいて前記ＴＦをランク付けするステップと；
−各細胞タイプからのランク付けリストの比較に基づいて、任意の２つの細胞タイプ間の転換のための転写因子のセットを計算するステップと；場合により
−前記リストから転写的に重複性のＴＦを除去するステップと、を含み、
それにより、標的細胞タイプへのソース細胞タイプの転換に必要な前記転写因子を決定する、方法。
ソース細胞をリプログラミングする方法であって、前記ソース細胞における１つ又は転写因子、又はその変異体のタンパク質発現を増大させることを含み、前記ソース細胞は、標的細胞の少なくとも１つの特徴を有するようにリプログラミングされ：
−前記ソース細胞は、皮膚線維芽細胞、上皮角化細胞、胚性幹細胞、単球又は心臓線維芽細胞からなる群から選択され；
−前記標的細胞は、軟骨細胞、毛包、ＣＤ４＋Ｔ細胞、ＣＤ８＋Ｔ細胞、ＮＫ−細胞、造血性（ｈａｅｍｏｐｏｅｉｔｉｃ）幹細胞（ＨＳＣ）、脂肪の間葉系幹細胞（ＭＳＣ）、骨髄の間葉系幹細胞（ＭＳＣ）、オリゴデンドロサイト、オリゴデンドロサイト前駆体、骨格筋細胞、平滑筋細胞及び胎児心筋細胞からなる群から選択され；
−前記転写因子は、表４に列挙したものの１つ以上である、方法。
標的細胞の少なくとも１つの特徴を有する細胞をソース細胞から生成する方法であって：
−ソース細胞において１つ以上の転写因子、又はその変異体の量を増大させることと；
−標的細胞を分化させるのに十分な時間及び条件下で、前記ソース細胞を培養し；それにより標的細胞の少なくとも１つの特徴を有する細胞をソース細胞から生成することと、を含み：
−前記ソース細胞は、皮膚線維芽細胞、上皮角化細胞、胚性幹細胞、単球又は心臓線維芽細胞からなる群から選択され；
−前記標的細胞は、軟骨細胞、毛包、ＣＤ４＋Ｔ細胞、ＣＤ８＋Ｔ細胞、ＮＫ（ナチュラルキラー）−細胞、造血性（ｈａｅｍｏｐｏｅｉｔｉｃ）幹細胞（ＨＳＣ）、脂肪の間葉系幹細胞（ＭＳＣ）、骨髄の間葉系幹細胞（ＭＳＣ）、オリゴデンドロサイト、オリゴデンドロサイト前駆体、骨格筋細胞、平滑筋細胞及び胎児心筋細胞からなる群から選択され；
−前記転写因子は、表４に列挙したものの１つ以上である、方法。
１つ以上の転写因子、又はその変異体の量が、ソース細胞において、前記ソース細胞を前記転写因子の発現を増大させる剤と接触させることにより増大される、請求項１３に記載の方法。
前記剤が：ヌクレオチド配列、タンパク質、アプタマー及び小分子、リボソーム、ＲＮＡｉ剤及びペプチド−核酸（ＰＮＡ）並びにその類似体又は変異体からなる群から選択される、請求項１４に記載の方法。
１つ以上の転写因子の量が、表４に列挙される転写因子タンパク質をコードする少なくとも１つの核酸配列を導入することにより増大される、請求項１３〜１５のいずれか一項に記載の方法。
前記ソース細胞が皮膚線維芽細胞であり、
（ａ）前記標的細胞が軟骨細胞であり、前記転写因子がＢＡＲＸ１、ＰＩＴＸ１、ＳＭＡＤ６、ＦＯＸＣ１、ＳＩＸ２及びＡＨＲの任意の１つ以上であり；
（ｂ）前記標的細胞が毛包であり、前記転写因子がＺＩＣ１、ＰＲＲＸ２、ＲＡＲＢ、ＶＤＲ、ＦＯＸＤ１及びＣＲＥＢ３の任意の１つ以上であり；
（ｃ）前記標的細胞がＣＤ４＋Ｔ細胞であり、前記転写因子がＲＯＲＡ、ＬＥＦ１、ＪＵＮ、ＦＯＳ及びＢＡＣＨ２の任意の１つ以上であり；
（ｄ）前記標的細胞がＣＤ８＋Ｔ細胞であり、前記転写因子がＲＯＲＡ、ＦＯＳ、ＳＭＡＤ７、ＪＵＮ及びＲＵＮＸ３の任意の１つ以上であり；
（ｅ）前記標的細胞がＮＫ細胞であり、前記転写因子がＲＯＲＡ、ＳＭＡＤ７、ＦＯＳ、ＪＵＮ及びＮＦＡＴＣ２の任意の１つ以上であり；
（ｆ）前記標的細胞がＨＳＣであり、前記転写因子がＭＹＢ、ＧＡＴＡ１、ＧＦＩ１及びＧＦＩ１Ｂの任意の１つ以上であり；
（ｇ）前記標的細胞が脂肪のＭＳＣであり、前記転写因子がＮＯＴＣＨ３、ＨＩＣ１、ＩＤ１、ＥＳＲＲＡ、ＩＲ１、ＳＩＸ５、ＳＲＥＢＦ１及びＳＮＡＩ２の任意の１つ以上であり；
（ｈ）前記標的細胞が骨髄のＭＳＣであり、前記転写因子がＳＩＸ１、ＩＤ１、ＨＯＸＡ７、ＦＯＸＣ２、ＨＯＸＡ９、ＭＡＦＢ及びＩＲＸ５の任意の１つ以上であり；
（ｉ）前記標的細胞がオリゴデンドロサイト前駆体であり、前記転写因子がＮＫＸ２−１、ＡＮＫＲＤ１、ＦＯＸＡ２、ＣＤＨ１、ＺＦＰ４２、ＩＧＦ１、ＩＣＡＭ１及びＦＯＳの任意の１つ以上であり；
（ｊ）前記標的細胞が骨格筋細胞であり、前記転写因子がＭＹＯＧ、ＨＩＣ１、ＭＹＯＤ１、ＦＯＸＤ１、ＰＩＴＸ３、ＳＩＸ２、ＨＯＸＡ７及びＪＵＮＢの任意の１つ以上であり；
（ｋ）前記標的細胞が平滑筋細胞であり、前記転写因子がＧＡＴＡ６、ＬＩＦ、ＪＵＮＢ、ＣＲＥＢ３、ＭＥＩＳ１及びＰＢＸ１の任意の１つ以上であり；
（ｌ）前記標的細胞が胎児心筋細胞であり、前記転写因子がＢＭＰ１０、ＧＡＴＡ６、ＴＢＸ５、ＦＨＬ２、ＮＫＸ２−５、ＨＡＮＤ２、ＧＡＴＡ４及びＰＰＡＲＧＣ１Ａの任意の１つ以上であり、
（ｍ）前記標的細胞が星状細胞であり、前記転写因子がＳＯＸ２、ＳＯＸ９、ＡＲＮＴ２、Ｅ２Ｆ５、ＰＢＸ１、ＳＭＡＤ１及びＲＵＮＸ２の任意の１つ以上であり；
（ｎ）前記標的細胞が上皮細胞であり、前記転写因子がＦＯＳ、ＤＢＰ、ＨＥＳ１、ＦＯＸＡ２、ＥＳＲＲＡ、ＣＤＨ１、ＦＯＸＱ１及びＰＡＸ６の任意の１つ以上であり；
（ｏ）前記標的細胞が内皮細胞であり、前記転写因子がＳＯＸ１７、ＳＭＡＤ１、ＴＡＬ１、ＩＲＦ１、ＴＣＦ７Ｌ１、ＭＸＤ４及びＪＵＮＢの任意の１つ以上であり；又は
（ｐ）前記標的細胞が角化細胞であり、前記転写因子がＦＯＸＱ１、ＳＯＸ９、ＭＡＦＢ、ＣＤＨ１、ＦＯＳ及びＲＥＬの任意の１つ以上である、請求項１３〜１６のいずれか一項に記載の方法。
前記ソース細胞が上皮角化細胞であり、
（ａ）前記標的細胞が軟骨細胞であり、前記転写因子がＢＡＲＸ１、ＰＩＴＸ１、ＳＭＡＤ６、ＴＧＦＢ３、ＦＯＸＣ１及びＳＩＸ２の任意の１つ以上であり；
（ｂ）前記標的細胞が毛包であり、前記転写因子がＲＵＮＸ１Ｔ１、ＺＩＣ１、ＰＲＲＸ１、ＭＳＸ１、ＥＢＦ１、ＦＯＸＤ１及びＲＵＮＸ２の任意の１つ以上であり；
（ｃ）前記標的細胞がＣＤ４＋Ｔ細胞であり、前記転写因子がＲＯＲＡ、ＬＥＦ１、ＪＵＮ、ＦＯＳ及びＮＲ３Ｃ１の任意の１つ以上であり；
（ｄ）前記標的細胞がＣＤ８＋Ｔ細胞であり、前記転写因子がＲＯＲＡ、ＦＯＳ、ＳＭＡＤ７、ＪＵＮ及びＲＵＮＸ３の任意の１つ以上であり；
（ｅ）前記標的細胞がＮＫ細胞であり、前記転写因子がＲＯＲＡ、ＳＭＡＤ７、ＦＯＳ、ＪＵＮ、ＮＦＡＴＣ２及びＲＵＮＸ３の任意の１つ以上であり；
（ｆ）前記標的細胞がＨＳＣであり、前記転写因子がＭＹＢ、ＧＡＴＡ１、ＧＦＩ１及びＧＦＩ１Ｂの任意の１つ以上であり；
（ｇ）前記標的細胞が脂肪のＭＳＣであり、前記転写因子がＴＷＩＳＴ１、ＨＩＣ１、ＩＤ１、ＭＳＸ１、ＩＲＦ１、ＨＯＸＢ７、ＳＮＡＩ２及びＥ２Ｆ１の任意の１つ以上であり；
（ｈ）前記標的細胞が骨髄のＭＳＣであり、前記転写因子がＳＩＸ１、ＴＷＳＩＴ１、ＩＤ１、ＨＭＯＸ１、ＦＯＸＣ２及びＨＯＸＡ７の任意の１つ以上であり；
（ｉ）前記標的細胞がオリゴデンドロサイト前駆体細胞であり、前記転写因子がＮＫＸ２−１、ＡＮＫＲＤ１、ＺＦＰ４２、ＦＯＳ、ＩＧＦ１、ＩＣＡＭ１、ＦＯＸＡ２及びＣＤＨ１の任意の１つ以上であり；
（ｊ）前記標的細胞が骨格筋細胞であり、前記転写因子がＭＹＯＧ、ＭＹＯＤ１、ＲＦ１、ＰＩＴＸ３、ＨＯＸＡ７、ＦＯＸＤ１及びＳＯＸ８の任意の１つ以上であり；
（ｋ）前記標的細胞が平滑筋細胞であり、前記転写因子がＩＲＦ１、ＧＡＴＡ６、ＬＩＦ及びＭＥＩＳ１の任意の１つ以上であり；
（ｌ）前記標的細胞が内皮細胞であり、前記転写因子がＳＯＸ１７、ＴＡＬ１、ＳＭＡＤ１、ＩＲＦ１、ＴＣＦ７Ｌ１及びＨＯＸＢ７の任意の１つ以上であり；又は
（ｍ）前記標的細胞が上皮細胞であり、前記転写因子がＮＯＴＣＨ１、ＨＲ、ＤＢＰ、ＯＴＸ１、ＥＳＲＲＡ、ＦＯＸＱ１、ＰＡＸ６及びＩＲＸ５の任意の１つ以上である、請求項１３〜１６のいずれか一項に記載の方法。
前記ソース細胞が胚性幹細胞であり、
（ａ）前記標的細胞が軟骨細胞であり、前記転写因子がＢＡＲＸ１、ＰＩＴＸ１、ＳＭＡＤ６及びＮＦＫＢ１の任意の１つ以上であり；
（ｂ）前記標的細胞が毛包であり、前記転写因子がＴＷＩＳＴ１、ＺＩＣ１、ＮＲ２Ｆ２、ＰＲＲＸ１、ＮＦＫＢ１及びＡＨＲの任意の１つ以上であり；
（ｃ）前記標的細胞がＣＤ４＋Ｔ細胞であり、前記転写因子がＲＯＲＡ、ＬＥＦ１、ＪＵＮ、ＦＯＳ及びＢＡＣＨ２の任意の１つ以上であり；
（ｄ）前記標的細胞がＣＤ８＋Ｔ細胞であり、前記転写因子がＲＯＲＡ、ＦＯＳ、ＳＭＡＤ７及びＪＵＮの任意の１つ以上であり；
（ｅ）前記標的細胞がＮＫ細胞であり、前記転写因子がＲＯＲＡ、ＳＭＡＤ７、ＦＯＳ、ＪＵＮ及びＮＦＡＴＣ２の任意の１つ以上であり；
（ｆ）前記標的細胞がＨＳＣであり、前記転写因子がＭＹＢ、ＩＬ１Ｂ、ＫＬＦ１、ＧＡＴＡ１、ＧＦＩ１、ＧＦＩ１Ｂ及びＮＦＥ２の任意の１つ以上であり；
（ｇ）前記標的細胞が脂肪のＭＳＣであり、前記転写因子がＴＷＩＳＴ１、ＳＮＡＩ２、ＩＲＦ１、ＭＸＤ４、ＮＦＫＢ１、ＭＳＸ１、ＨＯＸＢ７及びＥＳＲＲＡの任意の１つ以上であり；
（ｈ）前記標的細胞が骨髄のＭＳＣであり、前記転写因子がＩＲＦ１、ＲＵＮＸ１、ＣＥＢＰＢ、ＡＨＲ、ＦＯＸＣ２及びＨＯＸＡ９の任意の１つ以上であり；
（ｉ）前記標的細胞がオリゴデンドロサイト前駆体細胞であり、前記転写因子がＮＫＸ２−１、ＡＮＫＲＤ１、ＦＯＸＡ２、ＬＭＯ３、ＦＯＳ、ＩＧＦ１、ＩＣＡＭ１及びＣＤＨ１の任意の１つ以上であり；
（ｊ）前記標的細胞が骨格筋細胞であり、前記転写因子がＭＹＯＧ、ＩＲＦ１、ＭＹＯＤ１、ＦＯＸＤ１、ＮＦＫＢ１、ＪＵＮＢ及びＨＯＸＡ７の任意の１つ以上であり；
（ｋ）前記標的細胞が平滑筋細胞であり、前記転写因子がＩＲＦ１、ＮＦＫＢ１、ＪＵＮＢ、ＦＯＳＬ２、ＧＡＴＡ６及びＭＥＩＳ１の任意の１つ以上であり；
（ｌ）前記標的細胞が星状細胞であり、前記転写因子がＩＲＦ１、ＳＯＸ９、ＡＲＮＴ２、ＰＡＸ６、ＳＮＡＩ２、ＲＵＮＸ２及びＳＯＸ５の任意の１つ以上であり；
（ｍ）前記標的細胞が内皮細胞であり、前記転写因子がＳＯＸ１７、ＳＭＡＤ１、ＴＡＬ１、ＨＯＸＢ７、ＪＵＮＢ、ＮＦＫＢ１及びＩＲＦ１の任意の１つ以上であり；
（ｎ）前記標的細胞が上皮細胞であり、前記転写因子がＭＹＣ、ＩＬ１Ｂ、ＦＯＳ、ＮＦＫＢ１、ＥＳＲＲＡ、ＦＯＸＱ１、ＩＲＦ１及びＰＡＸ６の任意の１つ以上であり；又は
（ｏ）前記標的細胞が角化細胞であり、前記転写因子がＳＯＸ９、ＮＦＫＢ１、ＭＹＣ、ＮＲ２Ｆ２、ＦＯＳＬ２、ＦＯＳＬ１及びＡＨＲである、請求項１３〜１６のいずれか一項に記載の方法。
前記ソース細胞が単球細胞であり、
（ａ）前記標的細胞がＨＳＣであり、前記転写因子がＭＹＢ、ＩＬ１Ｂ、ＧＡＴＡ１、ＧＦＩ１及びＧＦＩ１Ｂの任意の１つ以上である、請求項１３〜１６のいずれか一項に記載の方法。
前記ソース細胞が心臓線維芽細胞であり、前記標的細胞が胎児心筋細胞であり、前記転写因子がＢＭＰ１０、ＧＡＴＡ６、ＴＢＸ５、ＡＮＫＲＤ１、ＨＡＮＤ１、ＰＰＡＲＧＣ１Ａ、ＮＫＸ２−５及びＧＡＴＡ４の任意の１つ以上である、請求項１３〜１６のいずれか一項に記載の方法。
前記ソース細胞が間葉系幹細胞であり、前記標的細胞が星状細胞であり、前記転写因子がＳＯＸ２、ＳＯＸ９、ＡＲＮＴ２、ＭＹＢＬ２、ＰＯＵ３Ｆ２、Ｅ２Ｆ１及びＨＭＧＢ２の任意の１つ以上である、請求項１３〜１６のいずれか一項に記載の方法。
前記ソース細胞が多能性幹細胞であり、
（ａ）前記標的細胞が星状細胞であり、前記転写因子がＰＡＸ６、ＰＯＵ３Ｆ２、ＳＮＡＩ２、ＲＵＮＸ２、ＳＯＸ５、Ｅ２Ｆ５及びＨＭＧＢ２の任意の１つ以上であり；
（ｂ）前記標的細胞が角化細胞であり、前記転写因子がＴＰ６３、ＴＦＡＰ２Ａ、ＭＹＣ、ＮＦＫＢＩＡ、ＳＯＸ９及びＮＦＫＢ１の任意の１つ以上であり；又は
（ｃ）前記標的細胞が内皮細胞であり、前記転写因子がＳＯＸ１７、ＴＡＬ１、ＨＯＸＢ７、ＮＦＫＢ１、ＩＲＦ１、ＳＭＡＤ１及びＪＵＮＢの任意の１つ以上である、請求項１３〜１６のいずれか一項に記載の方法。
前記標的細胞の前記少なくとも１つの特徴が、任意の１つ以上の標的細胞マーカーの上方調節、及び／又は細胞形態における変化である、請求項１３〜２３のいずれか一項に記載の方法。
以下の標的細胞に関する前記マーカーが：
−軟骨細胞：ＣＤ４９、ＣＤ１０、ＣＤ９、ＣＤ９５、インテグリンα１０β１，１０５、及び硫酸化グリコサミノグリカン（ＧＡＧ）の産生；
−毛包：ＣＤ２００、ＰＨＬＤＡ１及びフォリスタチン；
−ＣＤ４＋Ｔ−細胞：ＣＤ３、ＣＤ４；
−ＣＤ８＋Ｔ−細胞：ＣＤ３、ＣＤ８；
−ＮＫ−細胞：ＣＤ５６、ＣＤ２；
−ＨＳＣ：ＣＤ４５、ＣＤ１９／２０、ＣＤ１４／１５、ＣＤ３４、ＣＤ９０；
−脂肪のＭＳＣ：ＣＤ１３、ＣＤ２９、ＣＤ９０、ＣＤ１０５、ＣＤ１０、ＣＤ４５、及びインビトロでの骨芽細胞、脂肪細胞及び軟骨細胞に向かった分化；
−骨髄のＭＳＣ：ＣＤ１３、ＣＤ２９、ＣＤ９０、ＣＤ１０５、ＣＤ１０、及びインビトロでの骨芽細胞、脂肪細胞及び軟骨細胞に向かった分化；
−オリゴデンドロサイト及びオリゴデンドロサイト前駆体；ＮＧ２及びＰＤＧＦＲα Ｏｌｉｇ２及びＮｋｘ２．２に関するＱＰＣＲ；
−骨格筋細胞：ＭｙｏＤ、ミオゲニン及びデスミン；
−平滑筋細胞：ミオカルディン、平滑筋αアクチン及び平滑筋ミオシン重鎖；
−胎児心筋細胞：ＭＥＦ２Ｃ、ＭＹＨ６、ＡＣＴＮ１、ＣＤＨ２及びＧＪＡ１；
−内皮細胞：ＰｅＣＡＭ（ＣＤ３１）、ＶＥ−カドヘリン及びＶＥＧＦＲ２；
−角化細胞：ケラチン１、ケラチン１４、パンケラチン及びインボルクリン；
−星状細胞：ＧＦＡＰ、Ｓ１００Ｂ及びＡＬＤＨ１Ｌ１；並びに
−上皮細胞：サイトケラチン１５（ＣＫ１５）、サイトケラチン３（ＣＫ３）、インボルクリン及びコネキシン４を含む、請求項２４に記載の方法。
標的細胞に分化させるのに十分な時間及び条件下で前記ソース細胞を培養させることが、表９に示される関連する培地中で前記細胞を少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９又は３０日間培養することを含む、請求項１３〜２５のいずれか一項に記載の方法。
更に、前記標的細胞タイプの少なくとも１つの特徴を有する細胞を個人に投与するステップを含む、請求項１３〜２６のいずれか一項に記載の方法。
請求項１３〜２７のいずれか一項に記載の方法により生成された、標的細胞の少なくとも１つの特徴を有する細胞。
細胞の少なくとも５％が前記標的細胞の少なくとも１つの特徴を有し、請求項１３〜２７のいずれか一項に記載の方法により生成される、細胞集団。
前記集団中の前記細胞の少なくとも１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％が、前記標的細胞の少なくとも１つの特徴を有する、請求項２９に記載の細胞集団。
標的細胞の少なくとも１つの特徴を有する細胞を製造するための、請求項１３〜２７のいずれか一項に記載の方法における使用のためのキットであって、本明細書に記載した転写因子又はその変異体をコードする１つ以上の核酸配列を有する１つ以上の核酸を含み、場合により更に、ソース細胞を標的細胞の少なくとも１つの特徴を有する細胞にリプログラミングするための指示書を含む、キット。
前記標的細胞タイプへのソース細胞タイプの転換を促進するのに有用な剤を特定する方法であって：
−本明細書に記載した任意の方法により、標的細胞タイプへのソース細胞タイプの転換に必要な１つ以上の転写因子を決定するステップと；
−標的細胞タイプへのソース細胞タイプの転換に必要な前記１つ以上の転写因子の量を増大させる能力に関して１つ以上の候補剤をスクリーニングするステップと；
を含み、
前記１つ以上の転写因子の前記量を増大させる剤は、前記標的細胞タイプへのソース細胞タイプの前記転換を促進するのに有用な剤である、方法。