JP2019112429A - 抗i型インターフェロン受容体(ifnar)抗体のための固定用量レジメン - Google Patents
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Abstract
Description
本明細書および添付の特許請求範囲の用法では、単数形「a」、「an」、および「the」は、文脈上例外が明記されていない限り、複数形指示対象を含むことに留意すべきである。「a」(または「an」)という用語、ならびに「1つまたは複数」および「少なくとも1つ」という用語は、本明細書で同義的に使用され得る。
第I相治験(MI−CP180;ClinicalTrials.gov Identifier:NCT00930683)では、MEDI−546による治療が、SSc患者からの末梢血および皮膚生検中において、用量依存的様式でI型IFN GSの完全な中和をもたらした。我々の知る限りでは、これはI型IFNが疾患の病因に関与する、末梢血および疾患組織中における、I型IFN GSの正常化を示す最初の研究である。
本開示は、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗体断片を投与するステップを含んでなり、用量が障害を治療するのに効果的である、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者を治療する方法もまた提供する。いくつかの態様では、抗体は抗IFNAR抗体である。いくつかの特定の態様では、抗体は、例えばMEDI−546などの抗IFNAR1抗体である。
本開示は、I型IFN媒介疾患または障害に罹患している患者を、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片で治療した場合、特異的に抑制され得るI型インターフェロン遺伝子シグネチャ(I型 IFN GS)もまた提供する。
本開示は、固定用量でI型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片による治療法もまた提供し、I型IFN GSを抑制し得て、したがってI型IFN媒介疾患または障害の1つまたは複数の症状の低下がもたらされる。
(a)固定用量投与後に、ベースラインIFN GSスコアと比較して、患者のより初期のIFN GSスコアと比較して、または双方と比較して、患者のI型IFN GSスコアを測定するステップと;
(b)引き続く固定用量投与後に、ベースラインIFN GSスコアと比較して、患者のより初期のI型IFN GSスコアと比較して、または双方と比較して、患者のI型IFN GSスコアを測定するステップと;
(c)固定用量投与後に、ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、患者のより初期のI型IFN GSスコアと比較して、または双方と比較して、患者からのサンプルを患者のI型IFN GSスコアの測定にかけるステップと;
(d)引き続く固定用量投与後に、ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、患者のより初期のI型IFN GSスコアと比較して、または双方と比較して、患者からのサンプルを患者のI型IFN GSスコアの測定にかけるステップと;
(e)上の2つ以上の手順の組み合わせ
をさらに含んでなる。
(a)患者のIFN GSスコアが上昇したままであれば、引き続く固定用量の量または頻度を増大/低下させるステップと;
(b)患者のIFN GSスコアが上昇したままであれば、引き続く固定用量の量または頻度を増大/低下させるステップと;
(c)患者のIFN GSスコアが上昇したままであれば、引き続く固定用量の量または頻度を増大/低下させるステップと;
(d)上の2つ以上の手順の組み合わせ
をさらに含んでなる。
本開示ではまた、発病がI型IFNによって媒介される、2つの疾患に共通のI型IFN遺伝子シグネチャ(IFN GS)を検出するキットも提供される。キットは、本明細書で開示されるPDマーカーをコードする核酸(例えばmRNA)またはその断片とハイブリダイズできる核酸プローブ(例えばオリゴヌクレオチド)が充填された容器を含んでなり得る。具体的には本開示は、患者サンプル中において、差次的に調節される薬力学(PD)マーカー遺伝子を測定できる診断アッセイのセットを含んでなる、例えばSScおよびSLEなどのその発病がI型IFNによって媒介される2つの疾患に共通するI型IFN遺伝子シグネチャ(I型IFN GS)を検出するキットであって、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片の投与によってI型IFN GSが抑制されるキットもまた提供する。
本開示は、コンピュータにより実現される、I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片による最適投薬計画を予測する方法、I型IFN媒介疾患または障害を治療する治療薬候補として、I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片を同定する方法、I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片による治療法の候補として、患者を同定する方法、およびI型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片による、I型IFN媒介疾患または障害を治療するための個別化治療法をデザインする方法もまた提供する。
患者集団および研究デザイン
Declaration of Helsinki(1996)、International Conference on Harmonisation Guidelines for Good Clinical Practice(Topic E6)、Institutional Review Boards(21 CFR Part 56)、およびInvestigational New Drug Application(21 CFR Part 312)に従って、びまん性強皮症(SSc)がある成人患者における非盲検コホート用量漸増第I相試験(ClinicalTrials.gov identifier NCT00930683)を実施して、I型インターフェロン受容体のサブユニット1に対する完全ヒトモノクローナル抗体であるMEDI−546の単回および複数静脈内投与の安全、耐容性、薬物動態(PK)、免疫原性、および薬物動力学(PD)を評価した。プロトコルは、試験開始に先だって、施設内審査委員会または各参加センターの独立した倫理委員会によってレビューされ、認可された。あらゆるプロトコル固有行動の実施または研究参加前に、書面によるインフォームドコンセントが、各参加者から得られた。
メソスケールディスカバリー(MSD)プラットフォーム上の検証済み電気化学発光(ECL)アッセイを使用したMEDI−546濃度の測定のために、投与前と、84日目まで(単回投与コホート)または105日目まで(複数回投与コホート)の所定の時点で、全ての患者から血清PKサンプルを得た。手短に述べると、MEDI−546は、ストレプトアビジン被覆MSDプレートに結合した、ビオチン化可溶性インターフェロンα受容体(sIFNAR1)によって捕捉された。捕捉MEDI−546は、変異して抗体依存性細胞媒介性細胞毒性(ADCC)および補体依存性細胞傷害(CDC)が排除された、MEDI−546のFc領域内の特徴的なアミノ酸を特異的に標的にする、スルホTAG標識モノクローナル抗体によって検出された。ECLシグナルの生成と測定のために、MSD読み取り緩衝液を添加して、MSD Sector(商標)画像装置モデル6000読み取り装置上に載せた。アッセイは、ヒト血清中で、20〜1,280ng/mLのMEDI−546測定範囲を有した。
スクリーニング時および所定のPK来院時に、全血サンプルを全ての患者から採取して、I型IFN誘導遺伝子のmRNAレベルを測定した。皮膚生検もまた、投与前(0日目)および7日目(単回投与)または28日目(複数回投与)に採取した。ヒトゲノムU133 Plus 2.0アレイプラットフォーム(Affymetrix,Santa Clara,CA)を使用して、皮膚生検サンプルを採取した、マッチさせたSSc患者標本からの全血中および病変皮膚中のMEDI−546の効果を評価した。サンプル処理の一般手順およびマイクロアレイ試験のデータ解析については、先に記載されている(Yao et al.,Hum.Genomics Proteomics 2009:374312(2009);Yao et al.,PLoS One 3:e2737(2008))。
個人に存在するI型IFN活性の量を発現するために使用された量である、I型IFN GSスコアは、全血または皮膚中で測定された。I型IFN GSスコアは、各対象毎に、5個の遺伝子(IFI27、IFI44、IFI44L、RSAD2、およびIFI6)の組を使用して計算された。24個の正常対照サンプルの組の中の各遺伝子について、log2スケール上で算術平均を計算し、個々の疾患対象と、正常対照サンプルの平均ベクターの間で、各遺伝子の差を計算した。
IFNAR1の結合時のMEDI−546の内部移行は、生きた細胞の共焦点蛍光性画像診断技術を使用して評価された。MEDI−546およびアイソタイプ対照IgGは、Invitrogen(Life Technologies Corp,Carlsbad,CA)からの染料コンジュゲーションキット(A−20186)を使用して、Alexa647で蛍光標識された。反応混合物は、キットで提供されるサイズ排除ミニカラムを使用して、組み込まれていない蛍光性の分子から精製した。10%FBSを含有するRPMI増殖培地を使用して、IFNAR1を発現するTHP−1細胞を懸濁状態で維持し、実験に先だって一晩、新鮮増殖培地中に2×105細胞/mLで播種した。実験日にはTHP−1細胞を洗浄し、3×106細胞/mLの濃度に再懸濁した。
並列一次およびIFNAR媒介排出経路がある2コンパートメントPKモデルを開発して、SSc患者において観察された、MEDI−546の血清濃度プロファイルを説明した(図4)。一次排出経路は、内在性IgGの場合と同じように、細網内皮系(CLres)によるMEDI−546のクリアランスに相当する。非線形排出経路は、おそらくIFNAR媒介クリアランス(抗原シンク効果)と関連する。Rは標的受容体(IFNAR1)を表し、AbRは抗体−受容体複合体である。
ATissue=末梢組織コンパートメント内のMEDI−546の量;
C=中心コンパートメント内の遊離(非結合MEDI−546)の濃度;
Ctot=中心コンパートメント内の全(遊離および結合)MEDI−546;
RC=薬物−受容体複合体(Ab・R)の濃度;
Rtot=全(遊離および結合)受容体濃度、R+Ab・R;
kel=一次排出定数;
kint=内部移行(複合体排出)速度定数;
kdeg=分解(遊離受容体排出)速度定数;
ksyn=受容体生成速度;
kon=結合速度定数;
koff=解離速度定数;
Ks=定常状態速度定数;
kSerumTissue、kTissueSerum=中心血清コンパートメントと末梢組織コンパートメント間のコンパートメント間移送の速度定数;
入力=静脈内輸液速度;および
V=MEDI−546の中心分布容積。
C(0)=D/V;
ATissue(0)=0
RC(C)=0
R(0)=ksyn/kdeg;および
GS(0)=kin/kout
GS=I型IFN遺伝子シグネチャスコア;
Imax=最大阻害割合;
IC50=効力、GS生成の最大阻害半量に相当するMEDI−546濃度;
kin=内在性GS生成速度;および
kout=GS排出速度定数。
GS(0)=kin/kout
薬物統計学ソフトウェアパッケージNONMEM(バージョン7.1、ICON Development Solutions,Elliott City,Maryland)を使用して、データ解析を実施した。モデル開発は、NONMEM目的関数値(可能性の対数の−2倍)および重み付き残差の偶発性に基づいた。モデル開発のために、相互作用(FOCEI)法による一次条件付き評価を使用した。
Y=F+F*εproportional+εadditive、
式中、YはPKまたはPD観察値であり、Fは対応するモデル予測値であった。
SScのPK−PDモデル開発を引き続いて使用して、複数のMEDI−546投与時のSLE患者におけるI型IFN GSおよび標的調節プロファイルをシミュレートした。皮膚組織を表す追加的なコンパートメントを、PK−PDモデルに追加した。SLE患者におけるMEDI−546のPKは、SSc患者と同一であると仮定された。SSc患者よりも高い基線値を反映して、IFN関連GSスコアの生成速度(kin)は、SLE患者で増大した。先行する抗IFNαmAb臨床試験に登録されたSLE患者の、再サンプリングされた実測ベースラインGSスコアと体重を使用して、確率シミュレーションを実施した(Higgs et al.,Ann.Rheum.Dis.70:2029−2036(2011);Yao et al.,Arthritis Rheum.60:1785−1796(2009);Yao et al.,PLoS One 3:e2737(2008);Yao et al.,Hum.Genomics Proteomics 2009:374312(2009);Yao et al.,Arthritis Res.Ther.12(Suppl 1):S6(2010);Merrill et al.,Ann.Rheum.Dis.70:1905−1913(2011))。皮膚組織GSスコアをシミュレートするために、血清から組織へのMEDI−546の分配は25%と仮定された(Paquet et al.,Exp.Dermatol.15:381−386(2006))。
PDマーカーとしてのI型IFNシグネチャ
SLEおよびSScにより共有される、5個の遺伝子I型IFN GSを使用して、血中および疾患組織(皮膚)中の双方で、複合PD生物マーカーを開発した。5個の遺伝子I型IFN GSは、血液中のI型IFN活性の信頼できるサロゲートであり、ならびにSLEおよびSScのベースライン疾患活動性と相関する。SLEまたはSSc患者からの血液および皮膚標本間のこのGSスコアはまた、強力に一致して(Higgs et al.,Ann.Rheum.Dis.70:2029−2036(2011)、MEDI−546の薬理学的効果を測定するためのPD生物マーカーとして、血中のこのI型IFNシグネチャを使用できるようにする。
(1)健常対照と比較した、SScおよびSLE患者における過剰発現の蔓延および規模;
(2)生体外において健康なドナーからの全血中で、I型IFNによって誘導される能力;および
(3)生体外において健康なドナー末梢血単核細胞中で、SLE血清による刺激後に、MEDI−546によって実質的に抑制される能力(Yao et al.,Hum.Genomics Proteomics 2009:374312(2009))。
MEDI−546はSSc患者中においてI型IFNシグネチャを用量依存的様式で完全に抑制した
SScにおけるMEDI−546のFTIH試験で、上述のI型IFN GSを使用した。投薬依存的PD効果の観察に加えて、この研究は、I型IFNシグナル伝達経路を標的とする抗が、I型IFNが病因において役割を果たしているかもしれない疾患において、血液および疾患組織の双方で、I型IFNシグネチャを正常化する能力を有することを初めて示した。さらに、SLEにおけるのと同レベルのI型IFNシグネチャを有する幾人かのSSc患者では、MEDI−546治療に続いて、I型IFNシグネチャのほぼ完全な抑制が観察された(抑制持続期間は用量の違いに応じて変動した)。
受容体内部移行動態
生きた細胞の共焦点蛍光イメージング技術を使用して、IFNAR1を発現するTHP−1細胞中のMEDI−546内部移行の動態を定量的に評価した(図3)。蛍光標識MEDI−546(MEDI−546−Alexa647)がTHP−1細胞に結合した一方で、MEDI−546のアイソタイプ対照であるIgG−Alexa647の結合は観察されなかった。この結果は、MEDI−546によるTHP−1細胞の特異的結合を実証した(図8)。共焦点蛍光画像装置を使用して、細胞表面から細胞質へのMEDI−546−Alexa647の移行を経時的にモニターした。MEDI−546−Alexa647の内部移行の前と後における、細胞質(CFSE)および抗体(Alexa647)シグナルの蛍光画像の重ね合わせは、それぞれ図3Aおよび3Bに示される。
SSc患者におけるMEDI−546の母集団PK−PDモデル化
SLE中で抗IFN−αmAbを評価する先の臨床試験(Yao et al.,Arthritis Rheum.60:1785−1796(2009); Merrill et al.,Ann.Rheum.Dis.70:1905−1913(2011))からの以前の知識と共に、共焦点画像診断から判定されたPD生物マーカーデータおよび標的受容体内部移行動態を、MEDI−546SScデータの母集団解析と、SLEの確率シミュレーションのためのPK−PDモデルに組み込んだ。
SLE患者の確率シミュレーション
SSc患者におけるFTIH試験から、SLEにおける概念実証(PoC)試験へのプログラム移行をサポートするために、我々は、SLEにおける追加的な第I相試験に代えて橋渡しシミュレーションを使用し、2つの患者集団を橋渡しした。シファリムマブ臨床試験からの、記録されたSLE患者の体重およびベースラインI型IFN GSを、仮想SLE患者における複数MEDI−546投与時のI型IFN GS応答シミュレーションの基準として使用した。
橋渡しシミュレーションを使用して決定された固定投薬計画によるSLE、筋炎、および狼瘡性腎炎患者の治療
橋渡しシミュレーショを使用して、SSc臨床データに基づいて有効投与量を同定し、SLE、筋炎または狼瘡性腎炎患者を治療する投薬計画をデザインする。SScおよびSLE、SScおよび筋炎、またはSScおよび狼瘡性腎炎に共通する、I型IFN GSシグネチャを同定する。上述されたSScデータに基づくPK/PDモデルを作成して、SLE、筋炎、または狼瘡性腎炎に対応するPK/PDデータに基づいて補正する。仮想患者における確率シミュレーションを実施して、SSc/SLE、SSc/筋炎、またはSSc/狼瘡性腎炎PK/PDモデルを補正する。
本発明は、以下を提供する。
[1]I型IFN媒介疾患または障害を有する患者を治療する方法であって、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を前記患者に投与するステップを含んでなり、前記固定用量の抗体またはその断片が前記疾患または障害を効果的に治療する、方法。
[2](a)ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者から採取されたサンプル中のI型インターフェロン遺伝子シグネチャ(IFN GS)スコアを測定するステップと;
(b)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を前記患者に投与するステップと
を含んでなり、前記固定用量の抗体またはその断片が前記疾患または障害を効果的に治療する、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者を治療する方法。
[3](a)I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片をI型IFN媒介疾患または障害を有する患者に投与するステップと;
(b)ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、前記患者のI型IFN GSスコアを測定するステップと;
(c)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、引き続く固定用量の量または頻度を増大させるステップと
を含んでなり、前記患者のI型IFN GSの抑制が治効を示唆する、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者を治療する方法。
[4](a)I型IFN媒介疾患または障害がある患者から採取されたサンプルをI型IFN GSスコアの測定にかけるステップと;
(b)ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、前記患者のI型IFN GSスコアが上昇しているかどうかを測定結果から判定するステップと;
(c)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を前記患者に投与するステップと
を含んでなり、前記固定用量の抗体またはその断片が前記疾患または障害を効果的に治療する、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者を治療する方法。
[5](a)I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片をI型IFN媒介疾患または障害を有する患者に投与するステップと;
(b)前記患者から採取されたサンプルをI型IFN GSスコアの測定にかけるステップと;
(c)ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、前記患者のI型IFN GSスコアが上昇しているかどうかを測定結果から判定するステップと;
(d)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、引き続く固定用量の量または頻度を増大させるステップと
を含んでなり、前記患者のI型IFN GSの抑制が治効を示唆する、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者を治療する方法。
[6](a)I型IFN媒介疾患または障害がある患者から採取されたサンプルをI型IFN GSスコアの測定およびベースラインI型IFN GSスコアとの比較にかけるステップと;
(b)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を前記患者に投与するステップと
を含んでなり、前記固定用量の抗体またはその断片が疾患または障害を効果的に治療する、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者を治療する方法。
[7](a)I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者に投与するステップと;
(b)前記患者から採取されたサンプルをI型IFN GSスコアの測定およびベースラインI型IFN GSスコアとの比較にかけるステップと;
(c)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、引き続く固定用量の量または頻度を増大させるステップと
を含んでなり、前記患者のI型IFN GSの抑制が治効を示唆する、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者を治療する方法。
[8](a)I型IFN媒介疾患または障害を有する患者から採取されたサンプルから、I型IFN GSスコアを測定するステップと;
(b)前記患者のI型IFN GSスコアが、ベースラインIFN GSスコアと比較して上昇しているかどうかを判定するステップと;
(c)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を投与するように、保健医療提供者に指示するステップと
を含んでなり、前記固定用量の抗体またはその断片が前記疾患または障害を効果的に治療する、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者を治療する方法。
[9](a)I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を投与されている、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者からサンプルを得るステップと;
(b)前記サンプルからI型IFN GSスコアを測定するステップと;
(c)ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、前記患者のI型IFN GSスコアが上昇しているかどうかを判定するステップと;
(d)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、引き続く固定用量の量または頻度を増大させるように、保健医療提供者に指示するステップと
を含んでなり、前記患者のI型IFN GSの抑制が治効を示唆する、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者を治療する方法。
[10](a)ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者から採取されたサンプル中のI型IFN GSスコアを測定するステップと;
(b)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を前記患者に投与するステップと
を含んでなり、前記抗体またはその抗原結合断片の投与が前記患者のI型IFN GSを抑制する、患者においてI型IFN GSを抑制する方法。
[11](a)I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者に投与するステップと;
(b)ベースライン型IFN GSスコアと比較して、前記患者のI型IFN GSスコアを測定するステップと;
(c)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、引き続く固定用量の量または頻度を増大させるステップと
を含んでなり、前記抗体またはその抗原結合断片の投与が前記患者の型IFN GSを抑制する、患者においてI型IFN GSを抑制する方法。
[12](a)I型IFN媒介疾患または障害がある患者から採取されたサンプルをIFN GSスコアの測定にかけるステップと;
(b)ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、前記患者のI型IFN GSスコアが上昇しているかどうかを測定結果から判定するステップと;
(c)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を前記患者に投与するステップと
を含んでなり、前記抗体またはその抗原結合断片の投与が前記患者のI型IFN GSを抑制する、患者においてIFN GSを抑制する方法。
[13](a)I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者に投与するステップと;
(b)前記患者から採取されたサンプルをI型IFN GSスコアの測定にかけるステップと;
(c)ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、前記患者のI型IFN GSスコアが上昇しているかどうかを測定結果から判定するステップと;
(d)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、引き続く固定用量の量または頻度を増大させるステップと
を含んでなり、前記抗体またはその抗原結合断片の投与が前記患者のI型IFN GSを抑制する、患者においてIFN GSを抑制する方法。
[14](a)I型IFN媒介疾患または障害がある患者から採取されたサンプルをI型IFN GSスコアの測定およびベースラインI型IFN GSスコアとの比較にかけるステップと;
(b)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を前記患者に投与するステップと
を含んでなり、前記抗体またはその抗原結合断片の投与が前記患者のI型IFN GSを抑制する、患者においてI型IFN GSを抑制する方法。
[15](a)I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者に投与するステップと;
(b)前記患者から採取されたサンプルをI型IFN GSスコアの測定およびベースラインI型IFN GSスコアとの比較にかけるステップと、
(c)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、引き続く固定用量の量または頻度を増大させるステップと
を含んでなり、前記抗体またはその抗原結合断片の投与が前記患者のI型IFN GSを抑制する、患者においてI型IFN GSを抑制する方法。
[16](a)I型IFN媒介疾患または障害を有する患者から採取されたサンプルから、I型IFN GSスコアを測定するステップと;
(b)ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、前記患者のI型IFN GSスコアが上昇しているかどうかを判定するステップと;
(c)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を投与するように、保健医療提供者に指示するステップと
を含んでなり、前記抗体またはその抗原結合断片の投与が前記患者のI型IFN GSを抑制する、患者においてI型IFN GSを抑制する方法。
[17](a)I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を投与されている、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者からサンプルを得るステップと;
(b)前記サンプルからI型IFN GSスコアを測定するステップと;
(c)ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、前記患者のI型IFN GSスコアが上昇しているかどうかを判定するステップと;
(d)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、引き続く固定用量の量または頻度を増大させるように、保健医療提供者に指示するステップと
を含んでなり、前記抗体またはその抗原結合断片の投与が前記患者のI型IFN GSを抑制する、患者においてI型IFN GSを抑制する方法。
[18](a)I型IFN媒介疾患または障害を有する患者から採取されたサンプル中の第1のI型IFN GSスコアを測定するステップと;
(b)I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を前記患者に投与するステップと;
(c)抗体投与に続いて前記患者から採取されたサンプル中の第2のI型IFN GSスコアを測定するステップと;
(d)前記第2のI型IFN GSスコアを前記第1のI型IFN GSスコアと比較するステップと
を含んでなり、前記第1および第2のI型IFN GSスコアの間の低下が効能または優れた予後を示唆する、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者において、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片の治療効果をモニターする方法。
[19](a)I型IFN媒介疾患または障害がある患者から採取されたサンプルを第1のI型IFN GSスコアの測定にかけるステップと;
(b)I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を前記患者に投与するステップと;
(c)I型IFN媒介疾患または障害がある患者から採取されたサンプルを第2のI型IFN GSスコアの測定にかけるステップと;
(d)前記第2のI型IFN GSスコアを前記第1のI型IFN GSスコアと比較するステップと
を含んでなり、前記第1および第2のIFN GSスコアの間の低下が効能または優れた予後を示唆する、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者において、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片の治療効果をモニターする方法。
[20](a)I型IFN媒介疾患または障害を有する患者から採取されたサンプルから第1のI型IFN GSスコアを測定するステップと;
(b)I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を投与するように、保健医療提供者に指示するステップと;
(c)抗体投与に続いて前記患者から採取されたサンプル中の第2のI型IFN GSスコアを測定するステップと;
(d)前記第2のI型IFN GSスコアを前記第1のI型IFN GSスコアと比較するステップと
を含んでなり、前記第1および第2のI型IFN GSスコアの間の低下が効能または優れた予後を示唆する、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者において、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片の治療効果をモニターする方法。
[21]前記固定用量投与後に、ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、前記患者のより初期のI型IFN GSスコアと比較して、または双方と比較して、前記患者のI型IFN GSスコアを測定するステップをさらに含んでなる、上記1、7、9、または16に記載の方法。
[22]前記引き続く固定用量投与後に、ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、前記患者のより初期のI型IFN GSスコアと比較して、または双方と比較して、前記患者のI型IFN GSスコアを測定するステップをさらに含んでなる、上記2、8、10、または17に記載の方法。
[23]前記固定用量投与後に、ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、前記患者のより初期のI型IFN GSスコアと比較して、または双方と比較して、前記患者からのサンプルを患者のI型IFN GSスコアの測定にかけるステップをさらに含んでなる、上記3、5、11、または14に記載の方法。
[24]前記引き続く固定用量投与後に、ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、前記患者のより初期のI型IFN GSスコアと比較して、または双方と比較して、前記患者からのサンプルを前記患者のI型IFN GSスコアの測定にかけるステップをさらに含んでなる、上記4、6、12、または15に記載の方法。
[25]前記患者のI型IFN GSスコアが上昇したままであれば、引き続く固定用量の量または頻度を増大させるステップをさらに含んでなる、上記21に記載の方法。
[26]前記患者のI型IFN GSスコアが上昇したままであれば、引き続く固定用量の量または頻度を増大させるように、保健医療提供者に指示するステップをさらに含んでなる、上記23に記載の方法。
[27]前記患者のI型IFN GSスコアが上昇したままであれば、引き続く固定用量の量または頻度を増大させるステップをさらに含んでなる、上記23に記載の方法。
[28]I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を投与するステップを含んでなり、前記固定用量が前記障害を治療するのに効果的である、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者を治療する方法。
[29]前記I型IFN活性が、IFN−アルファ活性である、上記1〜28のいずれかに記載の方法。
[30]前記I型IFN GSが、IFI6、RSAD2、IFI44、IFI44L、IFI27、MX1、IFIT1、HERC5、ISG15、LAMP3、OAS3、OAS1、EPST1、IFIT3、LY6E、OAS2、PLSCR1、SIGLEC1、USP18、RTP4、およびDNAPTP6からなる群から選択される、少なくとも4つの薬力学(PD)マーカー遺伝子の上方制御された発現または活性を含んでなる、上記1〜29のいずれかに記載の方法。
[31]前記I型IFN GSが、遺伝子IFI27、IFI44、IFI44L、およびRSAD2の上方制御された発現または活性を含んでなる、上記30に記載の方法。
[32]前記I型IFN GSが、遺伝子IFI6の上方制御された発現または活性をさらに含んでなる、上記31に記載の方法。
[33]前記I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片が、IFN受容体に特異的に結合する、上記1〜32のいずれかに記載の方法。
[34]前記IFN受容体が、IFNアルファ受容体である、上記33に記載の方法。
[35]前記IFNアルファ受容体が、IFNAR1である、上記34に記載の方法。
[36]前記抗体またはその抗原結合断片が、IFNAR1のサブユニット1に特異的に結合する、上記35に記載の方法。
[37]前記抗体またはその抗原結合断片が、モノクローナルである、上記1〜36のいずれかに記載の方法。
[38]前記抗体またはその抗原結合断片が、免疫グロブリンIgG Fc領域を含んでなる、上記37に記載の方法。
[39]前記抗体が、MEDI−546またはその抗原結合断片である、上記1〜38のいずれかに記載の方法。
[40]前記固定用量が、約300mg〜約1000mgの範囲である、上記1〜39のいずれかに記載の方法。
[41]前記固定用量が、約300mgよりも低い、上記1〜39のいずれかに記載の方法。
[42]前記固定用量が、約100mgである、上記1〜39のいずれかに記載の方法。
[43]前記固定用量が、約300mg、約400mg、約500mg、約600mg、約700mg、約800、約900mg、および約1000mgからなる群から選択される、上記1〜39のいずれかに記載の方法。
[44]前記抗体またはその抗原結合断片が、疾患組織中のI型IFN GSを抑制する、上記1〜43のいずれかに記載の方法。
[45]前記疾患組織が皮膚である、上記44に記載の方法。
[46]前記抗体またはその抗原結合断片が、末梢血中のI型IFN GSを抑制する、上記1〜44のいずれかに記載の方法。
[47]前記抑制が、完全抑制である、上記1〜46のいずれかに記載の方法。
[48]前記抑制が、部分的抑制である、上記1〜46のいずれかに記載の方法。
[49]前記抗体またはその抗原結合断片が、2つ以上の用量で投与される、上記1〜48のいずれかに記載の方法。
[50]前記抗体またはその抗原結合断片が、毎月投与される、上記1〜49のいずれかに記載の方法。
[51]前記抗体またはその抗原結合断片が、静脈内、筋肉内、皮下、またはそれらの組み合わせで投与される、上記1〜50のいずれかに記載の方法。
[52]前記疾患が、自己免疫疾患である、上記1〜51のいずれかに記載の方法。
[53]前記自己免疫疾患が、全身性エリテマトーデス(SLE)、強皮症(SSc)、筋炎、または狼瘡性腎炎である、上記52に記載の方法。
[54]前記抗体またはその抗原結合断片が、前記固定用量の抗体またはその抗原結合断片の投与に先だつ対象のI型IFN GSと比較して、前記I型IFN GSを少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも30%または少なくとも40%抑制する、上記1〜53のいずれかに記載の方法。
[55]前記抗体またはその抗原結合断片が、母集団中の平均I型IFN GSシグネチャと比較して、前記I型IFN GSを少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも30%または少なくとも40%抑制する、上記1〜54のいずれかに記載の方法。
[56]患者サンプル中において、差次的に調節される薬力学(PD)マーカー遺伝子を測定できる診断アッセイのセットを含んでなる、その発病がI型IFNによって媒介される2つの疾患に共通するI型IFN遺伝子シグネチャ(IFN GS)を検出するキットであって、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片の投与によってI型IFN GSが抑制される、キット。
[57]前記I型IFN GSが、IFI6、RSAD2、IFI44、IFI44L、IFI27、MX1、IFIT1、HERC5、ISG15、LAMP3、OAS3、OAS1、EPST1、IFIT3、LY6E、OAS2、PLSCR1、SIGLEC1、USP18、RTP4、およびDNAPTP6からなる群から選択される、少なくとも4つのPDマーカー遺伝子の上方制御された発現または活性を含んでなる、上記56に記載のキット。
[58]前記I型IFN GSが、少なくとも5個のPDマーカー遺伝子の上方制御された発現または活性を含んでなる、上記57に記載のキット。
[59]前記I型IFN GSが、遺伝子IFI27、IFI44、IFI44L、およびRSAD2の上方制御された発現または活性を含んでなる、上記56〜58のいずれかに記載のキット。
[60]前記I型IFN GSが、遺伝子IFI6の上方制御された発現または活性をさらに含んでなる、上記59に記載のキット。
[61]前記患者サンプルが、血液またはその画分、筋肉、皮膚、またはそれらの組み合わせである、上記56〜60のいずれかに記載のキット。
[62]前記診断アッセイが、前記患者サンプル中のmRNAとハイブリダイズする核酸プローブを含んでなる、上記56〜61のいずれかに記載のキット。
[63](a)第2のI型IFN媒介疾患または障害からのPK/PDデータを、第1のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PDデータに基づく薬物動態−薬力学(PK/PD)確率モデルを含んでなるコンピュータシステムに入力し、前記入力された第2のI型IFN媒介疾患または障害からのPK/PDデータを使用して、前記PK/PD確率モデルを補正するステップと;
(b)前記補正PK/PD確率モデルを前記第2のI型IFN媒介疾患または障害からの入力されたPK/PDデータに適用するステップと;
(c)前記補正PK/PD確率モデルの結果から、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害のために、I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片の最適用量を同定するステップと
を含んでなる、I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片の最適投薬計画を予測する、コンピュータにより実現される方法。
[64](a)第2のI型IFN媒介疾患または障害からのPD/PKデータを、第1のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PD値に基づくPK/PD確率モデルを含んでなるコンピュータシステムに入力し、前記入力された第2のI型IFN媒介疾患または障害からのPD/PKデータを使用して、前記PK/PD確率モデルを補正するステップと;
(b)前記補正PK/PD確率モデルを前記第2のI型IFN媒介疾患または障害からの前記入力されたデータに適用するステップと;
(c)前記補正PK/PD確率モデルの結果から、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害を治療する候補治療薬として、I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片を同定するステップと
を含んでなる、I型IFN媒介疾患または障害を治療する候補治療薬として、I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片を同定する、コンピュータにより実現される方法。
[65](a)第2のI型IFN媒介疾患または障害からのPD/PKデータを、第1のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PDデータに基づくPK/PD確率モデルを含んでなるコンピュータシステムに入力し、前記入力された第2のI型IFN媒介疾患からのPD/PKデータを使用して、前記PK/PD確率モデルを補正するステップと;
(b)前記補正PK/PD確率モデルを前記第2のI型IFN媒介疾患または障害からの前記入力されたPD/PKデータに適用するステップと;
(c)前記補正PK/PD確率モデルの結果から、前記第2のI型IFN媒介疾患について、I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片による治療法の候補として、前記第2の疾患がある患者を同定するステップと
を含んでなる、I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片による治療法の候補として患者を同定する、コンピュータにより実現される方法。
[66](a)第2のI型IFN媒介疾患または障害からのPD/PKデータを、第1のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PDデータに基づくPK/PD確率モデルを含んでなるコンピュータシステムに入力し、前記入力された第2のI型IFN媒介疾患または障害からのデータを使用して、前記PK/PD確率モデルを補正するステップと;
(b)前記補正PK/PD確率モデルを前記第2のI型IFN媒介疾患または障害からの前記入力されたPD/PKデータに適用するステップと;
(c)前記補正PK/PD確率モデルの結果から、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害について、I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片によって、I型IFN媒介疾患または障害を治療する個別化治療法を同定するステップ
を含んでなる、I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片によって、I型IFN媒介疾患または障害を治療する個別化治療法をデザインする、コンピュータにより実現される方法。
[67]前記I型IFN活性が、IFN−α活性である、上記63〜66のいずれかに記載のコンピュータにより実現される方法。
[68]前記第1および第2のI型IFN媒介疾患または障害が、共通のI型IFN GSを共有する、上記63〜66のいずれかに記載のコンピュータにより実現される方法。
[69]前記I型IFN GSが、差次的に調節される、上記68に記載のコンピュータにより実現される方法。
[70]前記I型IFN GSが、IFI6、RSAD2、IFI44、IFI44L、IFI27、MX1、IFIT1、HERC5、ISG15、LAMP3、OAS3、OAS1、EPST1、IFIT3、LY6E、OAS2、PLSCR1、SIGLEC1、USP18、RTP4、およびDNAPTP6からなる群から選択される、少なくとも4つの薬力学(PD)マーカー遺伝子の上方制御された発現または活性を含んでなる、上記68または69に記載のコンピュータにより実現される方法。
[71]前記I型IFN GSが、IFI6、RSAD2、IFI44、IFI44L、IFI27、MX1、IFIT1、HERC5、ISG15、LAMP3、OAS3、OAS1、EPST1、IFIT3、LY6E、OAS2、PLSCR1、SIGLEC1、USP18、RTP4、およびDNAPTP6からなる群から選択される、少なくとも5個のPDマーカー遺伝子の上方制御された発現または活性を含んでなる、上記68または69に記載のコンピュータにより実現される方法。
[72]前記I型IFN GSが、遺伝子IFI27、IFI44、IFI44L、およびRSAD2の上方制御された発現または活性を含んでなる、上記70または71に記載のコンピュータにより実現される方法。
[73]前記I型IFN GSが、遺伝子IFI6の上方制御された発現または活性をさらに含んでなる、上記72に記載のコンピュータにより実現される方法。
[74]前記抗体またはその抗原結合断片が、IFN受容体に特異的に結合する、上記63〜66のいずれかに記載のコンピュータにより実現される方法。
[75]前記IFN受容体が、IFNアルファ受容体である、上記74に記載のコンピュータにより実現される方法。
[76]前記IFNアルファ受容体が、IFNAR1である、上記75に記載のコンピュータにより実現される方法。
[77]前記抗体またはその抗原結合断片が、IFNAR1のサブユニット1に特異的に結合する、上記76に記載のコンピュータにより実現される方法。
[78]前記抗体またはその抗原結合断片が、モノクローナルである、上記73〜77のいずれかに記載のコンピュータにより実現される方法。
[79]前記抗体またはその抗原結合断片が、免疫グロブリンIgG Fc領域を含んでなる、上記78に記載のコンピュータにより実現される方法。
[80]前記抗体が、MEDI−546である、上記63〜66のいずれかに記載のコンピュータにより実現される方法。
[81]前記第1および第2のI型IFN媒介疾患または障害が、自己免疫疾患である、上記63〜66のいずれかに記載のコンピュータにより実現される方法。
[82]前記自己免疫疾患が、リウマチ性疾患である、上記81に記載のコンピュータにより実現される方法。
[83]前記リウマチ性疾患が、全身性エリテマトーデス(SLE)、強皮症(SSc)、筋炎、および狼瘡性腎炎からなる群から選択される、上記82に記載のコンピュータにより実現される方法。
[84]前記第1のI型IFN媒介疾患または障害がSScであり、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害がSLEである、上記63〜66のいずれかに記載のコンピュータにより実現される方法。
[85]前記第1のI型IFN媒介疾患または障害がSScであり、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害が筋炎である、上記63〜66のいずれかに記載のコンピュータにより実現される方法。
[86]前記第1のI型IFN媒介疾患または障害がSScであり、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害が狼瘡性腎炎である、上記63〜66のいずれかに記載のコンピュータにより実現される方法。
[87]前記第1のまたは第2のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PDデータが、結合親和性データを含んでなる、上記63〜66のいずれかに記載のコンピュータにより実現される方法。
[88]前記結合親和性データが、抗体またはその抗原結合断片とIFN受容体の結合に対応する、上記87に記載のコンピュータにより実現される方法。
[89]前記抗体またはその抗原結合断片が、MEDI−546である、上記88に記載のコンピュータにより実現される方法。
[90]前記IFN受容体が、IFNAR1である、上記88に記載のコンピュータにより実現される方法。
[91]前記第1のまたは第2のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PDデータが、動態データを含んでなる、上記63〜66のいずれかに記載のコンピュータにより実現される方法。
[92]前記動態データが、細胞による抗原−抗体複合体の内部移行動態に対応する、上記91に記載のコンピュータにより実現される方法。
[93]前記抗原が、IFNAR1である、上記92に記載のコンピュータにより実現される方法。
[94]前記抗体が、MEDI−546である、上記92に記載のコンピュータにより実現される方法。
[95]前記細胞が、THP−1細胞である、上記92に記載のコンピュータにより実現される方法。
[96]前記第1のまたは第2のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PDデータが、I型IFN GS抑制データを含んでなる、上記63〜66のいずれかに記載のコンピュータにより実現される方法。
[97]前記I型IFN GS抑制が、完全抑制である、上記96に記載のコンピュータにより実現される方法。
[98]前記I型IFN GS抑制が、部分的抑制である、上記96に記載のコンピュータにより実現される方法。
[99]前記I型IFN GSが、遺伝子IFI27、IFI44、IFI44L、RSAD2、およびIFI6の上方制御された発現または活性を含んでなる、上記96〜98のいずれかに記載のコンピュータにより実現される方法。
[100]前記PK/PD確率モデルが、2つのコンパートメントを含んでなる、上記63〜66のいずれかに記載のコンピュータにより実現される方法。
[101]前記2つのコンパートメントが、中心コンパートメントおよび末梢コンパートメントである、上記100に記載のコンピュータにより実現される方法。
[102]皮膚コンパートメントをさらに含んでなる、上記100に記載のコンピュータにより実現される方法。
[103]前記PK/PD確率モデルが、2つの排出経路を含んでなる、上記63〜66のいずれかに記載のコンピュータにより実現される方法。
[104]前記2つの排出経路が、クリアランス経路および標的媒介処理経路である、上記103に記載のコンピュータにより実現される方法。
[105]前記クリアランス経路が、細網内皮系経路である、上記104に記載のコンピュータにより実現される方法。
[106]I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片による最適投薬計画を予測するプログラム命令を含有するコンピュータ可読媒体であって、コンピュータシステムの1つまたは複数のプロセッサによるプログラム命令の実行が、前記1つまたは複数のプロセッサに、
(a)第2のI型IFN媒介疾患または障害からの入力されたPK/PDデータをプロセッシングするステップと;
(b)前記第2のI型IFN媒介疾患または障害からのプロセシングされたPK/PDデータによって、第1のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PDデータに基づくPK/PD確率モデルを補正するステップと;
(c)前記補正PK/PD確率モデルを適用して、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害からの前記入力されたPK/PDデータに対して、確率シミュレーションを実行するステップと
を実行させ、前記シミュレーション結果が、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害においてI型IFN活性を調節する、抗体またはその抗原結合断片の最適用量を同定する、コンピュータ可読媒体。
[107]I型IFN媒介疾患または障害を治療する候補治療薬として、I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片を同定するプログラム命令を含有するコンピュータ可読媒体であって、コンピュータシステムの1つまたは複数のプロセッサによるプログラム命令の実行が、前記1つまたは複数のプロセッサに、
(a)第2のI型IFN媒介疾患または障害からの入力されたPK/PDデータをプロセッシングするステップと;
(b)前記第2のI型IFN媒介疾患または障害からのプロセシングされたPK/PDデータによって、第1のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PDデータに基づくPK/PD確率モデルを補正するステップと;
(c)前記補正PK/PD確率モデルを適用して、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害からの前記入力されたPK/PDデータに対して、確率シミュレーションを実行するステップと
を実行させ、前記シミュレーション結果が、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害を治療する候補治療薬として、I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片を同定する、コンピュータ可読媒体。
[108]I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片による治療法の候補として患者を同定するプログラム命令を含有するコンピュータ可読媒体であって、コンピュータシステムの1つまたは複数のプロセッサによるプログラム命令の実行が、1つまたは複数のプロセッサに、
(a)第2のI型IFN媒介疾患または障害からの入力されたPK/PDデータをプロセッシングするステップと;
(b)前記第2のI型IFN媒介疾患または障害からのプロセシングされたPK/PDデータによって、第1のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PDデータに基づくPK/PD確率モデルを補正するステップと;
(c)前記補正PK/PD確率モデルを適用して、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害からの入力されたPK/PDデータに対して、確率シミュレーションを実行するステップと
を実行させ、前記シミュレーション結果が、I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片による治療法の候補として、前記第2のI型IFN媒介疾患がある患者を同定する、コンピュータ可読媒体。
[109]I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片によってI型IFN媒介疾患または障害を治療する個別化治療法をデザインするプログラム命令を含有するコンピュータ可読媒体であって、コンピュータシステムの1つまたは複数のプロセッサによるプログラム命令実行が、前記1つまたは複数のプロセッサに、
(a)第2のI型IFN媒介疾患または障害からの入力されたPK/PDデータをプロセッシングするステップと;
(b)前記第2のI型IFN媒介疾患または障害からのプロセシングされたPK/PDデータによって、第1のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PDデータに基づくPK/PD確率モデルを補正するステップと;
(c)前記補正PK/PD確率モデルを適用して、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害からの入力されたPK/PDデータに対して、確率シミュレーションを実行するステップと
を実行させ、前記シミュレーション結果が、I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片によって、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害を治療する個別化治療法を同定する、コンピュータ可読媒体。
[110]前記I型IFN活性が、IFN−α活性である、上記106〜109のいずれかに記載のコンピュータ可読媒体。
[111]前記第1および第2のI型IFN媒介疾患または障害が、共通のI型IFN GSを共有する、上記106〜110のいずれかに記載のコンピュータ可読媒体。
[112]前記I型IFN GSが、差次的に調節される、上記111に記載のコンピュータ可読媒体。
[113]前記I型IFN GSが、IFI6、RSAD2、IFI44、IFI44L、IFI27、MX1、IFIT1、HERC5、ISG15、LAMP3、OAS3、OAS1、EPST1、IFIT3、LY6E、OAS2、PLSCR1、SIGLEC1、USP18、RTP4、およびDNAPTP6からなる群から選択される、少なくとも4つの薬力学(PD)マーカー遺伝子の上方制御された発現または活性を含んでなる、上記111または112に記載のコンピュータ可読媒体。
[114]前記I型IFN GSが、IFI6、RSAD2、IFI44、IFI44L、IFI27、MX1、IFIT1、HERC5、ISG15、LAMP3、OAS3、OAS1、EPST1、IFIT3、LY6E、OAS2、PLSCR1、SIGLEC1、USP18、RTP4、およびDNAPTP6からなる群から選択される、少なくとも5個のPDマーカー遺伝子の上方制御された発現または活性を含んでなる、上記111または112に記載のコンピュータ可読媒体。
[115]前記I型IFN GSが、遺伝子IFI27、IFI44、IFI44L、およびRSAD2の上方制御された発現または活性を含んでなる、上記113または114に記載のコンピュータ可読媒体。
[116]前記I型IFN GSが、遺伝子IFI6の上方制御された発現または活性をさらに含んでなる、上記115に記載のコンピュータ可読媒体。
[117]前記抗体またはその抗原結合断片が、IFN受容体に特異的に結合する、上記106〜116のいずれかに記載のコンピュータ可読媒体。
[118]前記IFN受容体が、IFNアルファ受容体である、上記117に記載のコンピュータ可読媒体。
[119]前記IFNアルファ受容体が、IFNAR1である、上記118に記載のコンピュータ可読媒体。
[120]前記抗体またはその抗原結合断片が、IFNAR1のサブユニット1に特異的に結合する、上記119に記載のコンピュータ可読媒体。
[121]前記抗体またはその抗原結合断片が、モノクローナルである、上記106〜120のいずれかに記載のコンピュータ可読媒体。
[122]前記抗体またはその抗原結合断片が、免疫グロブリンIgG Fc領域を含んでなる、上記121に記載のコンピュータ可読媒体。
[123]前記抗体が、MEDI−546である、上記106〜119のいずれかに記載のコンピュータ可読媒体。
[124]前記第1および第2のI型IFN媒介疾患または障害が、自己免疫疾患である、上記106〜109のいずれかに記載のコンピュータ可読媒体。
[125]前記自己免疫疾患が、リウマチ性疾患である、上記124に記載のコンピュータ可読媒体。
[126]前記リウマチ性疾患が、全身性エリテマトーデス(SLE)、強皮症(SSc)、筋炎、および狼瘡性腎炎からなる群から選択される、上記125に記載のコンピュータ可読媒体。
[127]前記第1のI型IFN媒介疾患または障害がSScであり、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害がSLEである、上記106〜109のいずれかに記載のコンピュータ可読媒体。
[128]前記第1のI型IFN媒介疾患または障害がSScであり、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害が筋炎である、上記106〜109のいずれかに記載のコンピュータ可読媒体。
[129]前記第1のI型IFN媒介疾患または障害がSScであり、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害が狼瘡性腎炎である、上記106〜109のいずれかに記載のコンピュータ可読媒体。
[130]前記第1のまたは第2のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PDデータが、結合親和性データを含んでなる、上記106〜109のいずれかに記載のコンピュータ可読媒体。
[131]前記結合親和性データが、抗体またはその抗原結合断片とIFN受容体の結合に対応する、上記130に記載のコンピュータ可読媒体。
[132]前記抗体またはその抗原結合断片が、MEDI−546である、上記131に記載のコンピュータ可読媒体。
[133]前記IFN受容体が、IFNAR1である、上記131に記載のコンピュータ可読媒体。
[134]前記第1のまたは第2のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PDデータが、動態データを含んでなる、上記106〜109のいずれかに記載のコンピュータ可読媒体。
[135]前記動態データが、細胞による抗原−抗体複合体の内部移行動態に対応する、上記134に記載のコンピュータ可読媒体。
[136]前記抗原が、IFNAR1である、上記135に記載のコンピュータ可読媒体。
[137]前記抗体が、MEDI−546である、上記135に記載のコンピュータ可読媒体。
[138]前記細胞が、THP−1細胞である、上記135に記載のコンピュータ可読媒体。
[139]前記第1のまたは第2のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PDデータが、I型IFN GS抑制データを含んでなる、上記106〜109のいずれかに記載のコンピュータ可読媒体。
[140]前記I型IFN GS抑制が、完全抑制である、上記139に記載のコンピュータ可読媒体。
[141]前記I型IFN GS抑制が、部分的抑制である、上記139に記載のコンピュータ可読媒体。
[142]前記I型IFN GSが、遺伝子IFI27、IFI44、IFI44L、RSAD2、およびIFI6の上方制御された発現または活性を含んでなる、上記139〜141のいずれかに記載のコンピュータ可読媒体。
[143]前記PK/PD確率モデルが、2つのコンパートメントを含んでなる、上記106〜109のいずれかに記載のコンピュータ可読媒体。
[144]前記2つのコンパートメントが、中心コンパートメントおよび末梢コンパートメントである、上記143に記載のコンピュータ可読媒体。
[145]皮膚コンパートメントをさらに含んでなる、上記144に記載のコンピュータ可読媒体。
[146]前記PK/PD確率モデルが、2つの排出経路を含んでなる、上記106〜109のいずれかに記載のコンピュータ可読媒体。
[147]前記2つの排出経路が、クリアランス経路および標的媒介処理経路である、上記146に記載のコンピュータ可読媒体。
[148]前記クリアランス経路が、細網内皮系経路である、上記147に記載のコンピュータ可読媒体。
Claims (148)
- I型IFN媒介疾患または障害を有する患者を治療する方法であって、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を前記患者に投与するステップを含んでなり、前記固定用量の抗体またはその断片が前記疾患または障害を効果的に治療する、方法。
- (a)ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者から採取されたサンプル中のI型インターフェロン遺伝子シグネチャ(IFN GS)スコアを測定するステップと;
(b)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を前記患者に投与するステップと
を含んでなり、前記固定用量の抗体またはその断片が前記疾患または障害を効果的に治療する、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者を治療する方法。 - (a)I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片をI型IFN媒介疾患または障害を有する患者に投与するステップと;
(b)ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、前記患者のI型IFN GSスコアを測定するステップと;
(c)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、引き続く固定用量の量または頻度を増大させるステップと
を含んでなり、前記患者のI型IFN GSの抑制が治効を示唆する、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者を治療する方法。 - (a)I型IFN媒介疾患または障害がある患者から採取されたサンプルをI型IFN GSスコアの測定にかけるステップと;
(b)ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、前記患者のI型IFN GSスコアが上昇しているかどうかを測定結果から判定するステップと;
(c)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を前記患者に投与するステップと
を含んでなり、前記固定用量の抗体またはその断片が前記疾患または障害を効果的に治療する、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者を治療する方法。 - (a)I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片をI型IFN媒介疾患または障害を有する患者に投与するステップと;
(b)前記患者から採取されたサンプルをI型IFN GSスコアの測定にかけるステップと;
(c)ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、前記患者のI型IFN GSスコアが上昇しているかどうかを測定結果から判定するステップと;
(d)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、引き続く固定用量の量または頻度を増大させるステップと
を含んでなり、前記患者のI型IFN GSの抑制が治効を示唆する、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者を治療する方法。 - (a)I型IFN媒介疾患または障害がある患者から採取されたサンプルをI型IFN GSスコアの測定およびベースラインI型IFN GSスコアとの比較にかけるステップと;
(b)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を前記患者に投与するステップと
を含んでなり、前記固定用量の抗体またはその断片が疾患または障害を効果的に治療する、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者を治療する方法。 - (a)I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者に投与するステップと;
(b)前記患者から採取されたサンプルをI型IFN GSスコアの測定およびベースラインI型IFN GSスコアとの比較にかけるステップと;
(c)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、引き続く固定用量の量または頻度を増大させるステップと
を含んでなり、前記患者のI型IFN GSの抑制が治効を示唆する、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者を治療する方法。 - (a)I型IFN媒介疾患または障害を有する患者から採取されたサンプルから、I型IFN GSスコアを測定するステップと;
(b)前記患者のI型IFN GSスコアが、ベースラインIFN GSスコアと比較して上昇しているかどうかを判定するステップと;
(c)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を投与するように、保健医療提供者に指示するステップと
を含んでなり、前記固定用量の抗体またはその断片が前記疾患または障害を効果的に治療する、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者を治療する方法。 - (a)I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を投与されている、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者からサンプルを得るステップと;
(b)前記サンプルからI型IFN GSスコアを測定するステップと;
(c)ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、前記患者のI型IFN GSスコアが上昇しているかどうかを判定するステップと;
(d)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、引き続く固定用量の量または頻度を増大させるように、保健医療提供者に指示するステップと
を含んでなり、前記患者のI型IFN GSの抑制が治効を示唆する、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者を治療する方法。 - (a)ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者から採取されたサンプル中のI型IFN GSスコアを測定するステップと;
(b)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を前記患者に投与するステップと
を含んでなり、前記抗体またはその抗原結合断片の投与が前記患者のI型IFN GSを抑制する、患者においてI型IFN GSを抑制する方法。 - (a)I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者に投与するステップと;
(b)ベースライン型IFN GSスコアと比較して、前記患者のI型IFN GSスコアを測定するステップと;
(c)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、引き続く固定用量の量または頻度を増大させるステップと
を含んでなり、前記抗体またはその抗原結合断片の投与が前記患者の型IFN GSを抑制する、患者においてI型IFN GSを抑制する方法。 - (a)I型IFN媒介疾患または障害がある患者から採取されたサンプルをIFN GSスコアの測定にかけるステップと;
(b)ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、前記患者のI型IFN GSスコアが上昇しているかどうかを測定結果から判定するステップと;
(c)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を前記患者に投与するステップと
を含んでなり、前記抗体またはその抗原結合断片の投与が前記患者のI型IFN GSを抑制する、患者においてIFN GSを抑制する方法。 - (a)I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者に投与するステップと;
(b)前記患者から採取されたサンプルをI型IFN GSスコアの測定にかけるステップと;
(c)ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、前記患者のI型IFN GSスコアが上昇しているかどうかを測定結果から判定するステップと;
(d)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、引き続く固定用量の量または頻度を増大させるステップと
を含んでなり、前記抗体またはその抗原結合断片の投与が前記患者のI型IFN GSを抑制する、患者においてIFN GSを抑制する方法。 - (a)I型IFN媒介疾患または障害がある患者から採取されたサンプルをI型IFN GSスコアの測定およびベースラインI型IFN GSスコアとの比較にかけるステップと;
(b)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を前記患者に投与するステップと
を含んでなり、前記抗体またはその抗原結合断片の投与が前記患者のI型IFN GSを抑制する、患者においてI型IFN GSを抑制する方法。 - (a)I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者に投与するステップと;
(b)前記患者から採取されたサンプルをI型IFN GSスコアの測定およびベースラインI型IFN GSスコアとの比較にかけるステップと、
(c)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、引き続く固定用量の量または頻度を増大させるステップと
を含んでなり、前記抗体またはその抗原結合断片の投与が前記患者のI型IFN GSを抑制する、患者においてI型IFN GSを抑制する方法。 - (a)I型IFN媒介疾患または障害を有する患者から採取されたサンプルから、I型IFN GSスコアを測定するステップと;
(b)ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、前記患者のI型IFN GSスコアが上昇しているかどうかを判定するステップと;
(c)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を投与するように、保健医療提供者に指示するステップと
を含んでなり、前記抗体またはその抗原結合断片の投与が前記患者のI型IFN GSを抑制する、患者においてI型IFN GSを抑制する方法。 - (a)I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を投与されている、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者からサンプルを得るステップと;
(b)前記サンプルからI型IFN GSスコアを測定するステップと;
(c)ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、前記患者のI型IFN GSスコアが上昇しているかどうかを判定するステップと;
(d)前記患者のI型IFN GSスコアが上昇していれば、引き続く固定用量の量または頻度を増大させるように、保健医療提供者に指示するステップと
を含んでなり、前記抗体またはその抗原結合断片の投与が前記患者のI型IFN GSを抑制する、患者においてI型IFN GSを抑制する方法。 - (a)I型IFN媒介疾患または障害を有する患者から採取されたサンプル中の第1のI型IFN GSスコアを測定するステップと;
(b)I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を前記患者に投与するステップと;
(c)抗体投与に続いて前記患者から採取されたサンプル中の第2のI型IFN GSスコアを測定するステップと;
(d)前記第2のI型IFN GSスコアを前記第1のI型IFN GSスコアと比較するステップと
を含んでなり、前記第1および第2のI型IFN GSスコアの間の低下が効能または優れた予後を示唆する、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者において、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片の治療効果をモニターする方法。 - (a)I型IFN媒介疾患または障害がある患者から採取されたサンプルを第1のI型IFN GSスコアの測定にかけるステップと;
(b)I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を前記患者に投与するステップと;
(c)I型IFN媒介疾患または障害がある患者から採取されたサンプルを第2のI型IFN GSスコアの測定にかけるステップと;
(d)前記第2のI型IFN GSスコアを前記第1のI型IFN GSスコアと比較するステップと
を含んでなり、前記第1および第2のIFN GSスコアの間の低下が効能または優れた予後を示唆する、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者において、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片の治療効果をモニターする方法。 - (a)I型IFN媒介疾患または障害を有する患者から採取されたサンプルから第1のI型IFN GSスコアを測定するステップと;
(b)I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を投与するように、保健医療提供者に指示するステップと;
(c)抗体投与に続いて前記患者から採取されたサンプル中の第2のI型IFN GSスコアを測定するステップと;
(d)前記第2のI型IFN GSスコアを前記第1のI型IFN GSスコアと比較するステップと
を含んでなり、前記第1および第2のI型IFN GSスコアの間の低下が効能または優れた予後を示唆する、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者において、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片の治療効果をモニターする方法。 - 前記固定用量投与後に、ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、前記患者のより初期のI型IFN GSスコアと比較して、または双方と比較して、前記患者のI型IFN GSスコアを測定するステップをさらに含んでなる、請求項1、7、9、または16に記載の方法。
- 前記引き続く固定用量投与後に、ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、前記患者のより初期のI型IFN GSスコアと比較して、または双方と比較して、前記患者のI型IFN GSスコアを測定するステップをさらに含んでなる、請求項2、8、10、または17に記載の方法。
- 前記固定用量投与後に、ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、前記患者のより初期のI型IFN GSスコアと比較して、または双方と比較して、前記患者からのサンプルを患者のI型IFN GSスコアの測定にかけるステップをさらに含んでなる、請求項3、5、11、または14に記載の方法。
- 前記引き続く固定用量投与後に、ベースラインI型IFN GSスコアと比較して、前記患者のより初期のI型IFN GSスコアと比較して、または双方と比較して、前記患者からのサンプルを前記患者のI型IFN GSスコアの測定にかけるステップをさらに含んでなる、請求項4、6、12、または15に記載の方法。
- 前記患者のI型IFN GSスコアが上昇したままであれば、引き続く固定用量の量または頻度を増大させるステップをさらに含んでなる、請求項21に記載の方法。
- 前記患者のI型IFN GSスコアが上昇したままであれば、引き続く固定用量の量または頻度を増大させるように、保健医療提供者に指示するステップをさらに含んでなる、請求項23に記載の方法。
- 前記患者のI型IFN GSスコアが上昇したままであれば、引き続く固定用量の量または頻度を増大させるステップをさらに含んでなる、請求項23に記載の方法。
- I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片を投与するステップを含んでなり、前記固定用量が前記障害を治療するのに効果的である、I型IFN媒介疾患または障害を有する患者を治療する方法。
- 前記I型IFN活性が、IFN−アルファ活性である、請求項1〜28のいずれか一項に記載の方法。
- 前記I型IFN GSが、IFI6、RSAD2、IFI44、IFI44L、IFI27、MX1、IFIT1、HERC5、ISG15、LAMP3、OAS3、OAS1、EPST1、IFIT3、LY6E、OAS2、PLSCR1、SIGLEC1、USP18、RTP4、およびDNAPTP6からなる群から選択される、少なくとも4つの薬力学(PD)マーカー遺伝子の上方制御された発現または活性を含んでなる、請求項1〜29のいずれか一項に記載の方法。
- 前記I型IFN GSが、遺伝子IFI27、IFI44、IFI44L、およびRSAD2の上方制御された発現または活性を含んでなる、請求項30に記載の方法。
- 前記I型IFN GSが、遺伝子IFI6の上方制御された発現または活性をさらに含んでなる、請求項31に記載の方法。
- 前記I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片が、IFN受容体に特異的に結合する、請求項1〜32のいずれか一項に記載の方法。
- 前記IFN受容体が、IFNアルファ受容体である、請求項33に記載の方法。
- 前記IFNアルファ受容体が、IFNAR1である、請求項34に記載の方法。
- 前記抗体またはその抗原結合断片が、IFNAR1のサブユニット1に特異的に結合する、請求項35に記載の方法。
- 前記抗体またはその抗原結合断片が、モノクローナルである、請求項1〜36のいずれか一項に記載の方法。
- 前記抗体またはその抗原結合断片が、免疫グロブリンIgG Fc領域を含んでなる、請求項37に記載の方法。
- 前記抗体が、MEDI−546またはその抗原結合断片である、請求項1〜38のいずれか一項に記載の方法。
- 前記固定用量が、約300mg〜約1000mgの範囲である、請求項1〜39のいずれか一項に記載の方法。
- 前記固定用量が、約300mgよりも低い、請求項1〜39のいずれか一項に記載の方法。
- 前記固定用量が、約100mgである、請求項1〜39のいずれか一項に記載の方法。
- 前記固定用量が、約300mg、約400mg、約500mg、約600mg、約700mg、約800、約900mg、および約1000mgからなる群から選択される、請求項1〜39のいずれか一項に記載の方法。
- 前記抗体またはその抗原結合断片が、疾患組織中のI型IFN GSを抑制する、請求項1〜43のいずれか一項に記載の方法。
- 前記疾患組織が皮膚である、請求項44に記載の方法。
- 前記抗体またはその抗原結合断片が、末梢血中のI型IFN GSを抑制する、請求項1〜44のいずれか一項に記載の方法。
- 前記抑制が、完全抑制である、請求項1〜46のいずれか一項に記載の方法。
- 前記抑制が、部分的抑制である、請求項1〜46のいずれか一項に記載の方法。
- 前記抗体またはその抗原結合断片が、2つ以上の用量で投与される、請求項1〜48のいずれか一項に記載の方法。
- 前記抗体またはその抗原結合断片が、毎月投与される、請求項1〜49のいずれか一項に記載の方法。
- 前記抗体またはその抗原結合断片が、静脈内、筋肉内、皮下、またはそれらの組み合わせで投与される、請求項1〜50のいずれか一項に記載の方法。
- 前記疾患が、自己免疫疾患である、請求項1〜51のいずれか一項に記載の方法。
- 前記自己免疫疾患が、全身性エリテマトーデス(SLE)、強皮症(SSc)、筋炎、または狼瘡性腎炎である、請求項52に記載の方法。
- 前記抗体またはその抗原結合断片が、前記固定用量の抗体またはその抗原結合断片の投与に先だつ対象のI型IFN GSと比較して、前記I型IFN GSを少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも30%または少なくとも40%抑制する、請求項1〜53のいずれか一項に記載の方法。
- 前記抗体またはその抗原結合断片が、母集団中の平均I型IFN GSシグネチャと比較して、前記I型IFN GSを少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも30%または少なくとも40%抑制する、請求項1〜54のいずれか一項に記載の方法。
- 患者サンプル中において、差次的に調節される薬力学(PD)マーカー遺伝子を測定できる診断アッセイのセットを含んでなる、その発病がI型IFNによって媒介される2つの疾患に共通するI型IFN遺伝子シグネチャ(IFN GS)を検出するキットであって、I型IFN活性を調節する固定用量の抗体またはその抗原結合断片の投与によってI型IFN GSが抑制される、キット。
- 前記I型IFN GSが、IFI6、RSAD2、IFI44、IFI44L、IFI27、MX1、IFIT1、HERC5、ISG15、LAMP3、OAS3、OAS1、EPST1、IFIT3、LY6E、OAS2、PLSCR1、SIGLEC1、USP18、RTP4、およびDNAPTP6からなる群から選択される、少なくとも4つのPDマーカー遺伝子の上方制御された発現または活性を含んでなる、請求項56に記載のキット。
- 前記I型IFN GSが、少なくとも5個のPDマーカー遺伝子の上方制御された発現または活性を含んでなる、請求項57に記載のキット。
- 前記I型IFN GSが、遺伝子IFI27、IFI44、IFI44L、およびRSAD2の上方制御された発現または活性を含んでなる、請求項56〜58のいずれか一項に記載のキット。
- 前記I型IFN GSが、遺伝子IFI6の上方制御された発現または活性をさらに含んでなる、請求項59に記載のキット。
- 前記患者サンプルが、血液またはその画分、筋肉、皮膚、またはそれらの組み合わせである、請求項56〜60のいずれか一項に記載のキット。
- 前記診断アッセイが、前記患者サンプル中のmRNAとハイブリダイズする核酸プローブを含んでなる、請求項56〜61のいずれか一項に記載のキット。
- (a)第2のI型IFN媒介疾患または障害からのPK/PDデータを、第1のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PDデータに基づく薬物動態−薬力学(PK/PD)確率モデルを含んでなるコンピュータシステムに入力し、前記入力された第2のI型IFN媒介疾患または障害からのPK/PDデータを使用して、前記PK/PD確率モデルを補正するステップと;
(b)前記補正PK/PD確率モデルを前記第2のI型IFN媒介疾患または障害からの入力されたPK/PDデータに適用するステップと;
(c)前記補正PK/PD確率モデルの結果から、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害のために、I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片の最適用量を同定するステップと
を含んでなる、I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片の最適投薬計画を予測する、コンピュータにより実現される方法。 - (a)第2のI型IFN媒介疾患または障害からのPD/PKデータを、第1のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PD値に基づくPK/PD確率モデルを含んでなるコンピュータシステムに入力し、前記入力された第2のI型IFN媒介疾患または障害からのPD/PKデータを使用して、前記PK/PD確率モデルを補正するステップと;
(b)前記補正PK/PD確率モデルを前記第2のI型IFN媒介疾患または障害からの前記入力されたデータに適用するステップと;
(c)前記補正PK/PD確率モデルの結果から、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害を治療する候補治療薬として、I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片を同定するステップと
を含んでなる、I型IFN媒介疾患または障害を治療する候補治療薬として、I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片を同定する、コンピュータにより実現される方法。 - (a)第2のI型IFN媒介疾患または障害からのPD/PKデータを、第1のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PDデータに基づくPK/PD確率モデルを含んでなるコンピュータシステムに入力し、前記入力された第2のI型IFN媒介疾患からのPD/PKデータを使用して、前記PK/PD確率モデルを補正するステップと;
(b)前記補正PK/PD確率モデルを前記第2のI型IFN媒介疾患または障害からの前記入力されたPD/PKデータに適用するステップと;
(c)前記補正PK/PD確率モデルの結果から、前記第2のI型IFN媒介疾患について、I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片による治療法の候補として、前記第2の疾患がある患者を同定するステップと
を含んでなる、I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片による治療法の候補として患者を同定する、コンピュータにより実現される方法。 - (a)第2のI型IFN媒介疾患または障害からのPD/PKデータを、第1のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PDデータに基づくPK/PD確率モデルを含んでなるコンピュータシステムに入力し、前記入力された第2のI型IFN媒介疾患または障害からのデータを使用して、前記PK/PD確率モデルを補正するステップと;
(b)前記補正PK/PD確率モデルを前記第2のI型IFN媒介疾患または障害からの前記入力されたPD/PKデータに適用するステップと;
(c)前記補正PK/PD確率モデルの結果から、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害について、I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片によって、I型IFN媒介疾患または障害を治療する個別化治療法を同定するステップ
を含んでなる、I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片によって、I型IFN媒介疾患または障害を治療する個別化治療法をデザインする、コンピュータにより実現される方法。 - 前記I型IFN活性が、IFN−α活性である、請求項63〜66のいずれか一項に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記第1および第2のI型IFN媒介疾患または障害が、共通のI型IFN GSを共有する、請求項63〜66のいずれか一項に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記I型IFN GSが、差次的に調節される、請求項68に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記I型IFN GSが、IFI6、RSAD2、IFI44、IFI44L、IFI27、MX1、IFIT1、HERC5、ISG15、LAMP3、OAS3、OAS1、EPST1、IFIT3、LY6E、OAS2、PLSCR1、SIGLEC1、USP18、RTP4、およびDNAPTP6からなる群から選択される、少なくとも4つの薬力学(PD)マーカー遺伝子の上方制御された発現または活性を含んでなる、請求項68または69に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記I型IFN GSが、IFI6、RSAD2、IFI44、IFI44L、IFI27、MX1、IFIT1、HERC5、ISG15、LAMP3、OAS3、OAS1、EPST1、IFIT3、LY6E、OAS2、PLSCR1、SIGLEC1、USP18、RTP4、およびDNAPTP6からなる群から選択される、少なくとも5個のPDマーカー遺伝子の上方制御された発現または活性を含んでなる、請求項68または69に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記I型IFN GSが、遺伝子IFI27、IFI44、IFI44L、およびRSAD2の上方制御された発現または活性を含んでなる、請求項70または71に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記I型IFN GSが、遺伝子IFI6の上方制御された発現または活性をさらに含んでなる、請求項72に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記抗体またはその抗原結合断片が、IFN受容体に特異的に結合する、請求項63〜66のいずれか一項に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記IFN受容体が、IFNアルファ受容体である、請求項74に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記IFNアルファ受容体が、IFNAR1である、請求項75に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記抗体またはその抗原結合断片が、IFNAR1のサブユニット1に特異的に結合する、請求項76に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記抗体またはその抗原結合断片が、モノクローナルである、請求項73〜77のいずれか一項に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記抗体またはその抗原結合断片が、免疫グロブリンIgG Fc領域を含んでなる、請求項78に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記抗体が、MEDI−546である、請求項63〜66のいずれか一項に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記第1および第2のI型IFN媒介疾患または障害が、自己免疫疾患である、請求項63〜66のいずれか一項に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記自己免疫疾患が、リウマチ性疾患である、請求項81に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記リウマチ性疾患が、全身性エリテマトーデス(SLE)、強皮症(SSc)、筋炎、および狼瘡性腎炎からなる群から選択される、請求項82に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記第1のI型IFN媒介疾患または障害がSScであり、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害がSLEである、請求項63〜66のいずれか一項に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記第1のI型IFN媒介疾患または障害がSScであり、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害が筋炎である、請求項63〜66のいずれか一項に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記第1のI型IFN媒介疾患または障害がSScであり、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害が狼瘡性腎炎である、請求項63〜66のいずれか一項に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記第1のまたは第2のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PDデータが、結合親和性データを含んでなる、請求項63〜66のいずれか一項に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記結合親和性データが、抗体またはその抗原結合断片とIFN受容体の結合に対応する、請求項87に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記抗体またはその抗原結合断片が、MEDI−546である、請求項88に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記IFN受容体が、IFNAR1である、請求項88に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記第1のまたは第2のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PDデータが、動態データを含んでなる、請求項63〜66のいずれか一項に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記動態データが、細胞による抗原−抗体複合体の内部移行動態に対応する、請求項91に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記抗原が、IFNAR1である、請求項92に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記抗体が、MEDI−546である、請求項92に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記細胞が、THP−1細胞である、請求項92に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記第1のまたは第2のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PDデータが、I型IFN GS抑制データを含んでなる、請求項63〜66のいずれか一項に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記I型IFN GS抑制が、完全抑制である、請求項96に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記I型IFN GS抑制が、部分的抑制である、請求項96に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記I型IFN GSが、遺伝子IFI27、IFI44、IFI44L、RSAD2、およびIFI6の上方制御された発現または活性を含んでなる、請求項96〜98のいずれか一項に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記PK/PD確率モデルが、2つのコンパートメントを含んでなる、請求項63〜66のいずれか一項に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記2つのコンパートメントが、中心コンパートメントおよび末梢コンパートメントである、請求項100に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 皮膚コンパートメントをさらに含んでなる、請求項100に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記PK/PD確率モデルが、2つの排出経路を含んでなる、請求項63〜66のいずれか一項に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記2つの排出経路が、クリアランス経路および標的媒介処理経路である、請求項103に記載のコンピュータにより実現される方法。
- 前記クリアランス経路が、細網内皮系経路である、請求項104に記載のコンピュータにより実現される方法。
- I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片による最適投薬計画を予測するプログラム命令を含有するコンピュータ可読媒体であって、コンピュータシステムの1つまたは複数のプロセッサによるプログラム命令の実行が、前記1つまたは複数のプロセッサに、
(a)第2のI型IFN媒介疾患または障害からの入力されたPK/PDデータをプロセッシングするステップと;
(b)前記第2のI型IFN媒介疾患または障害からのプロセシングされたPK/PDデータによって、第1のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PDデータに基づくPK/PD確率モデルを補正するステップと;
(c)前記補正PK/PD確率モデルを適用して、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害からの前記入力されたPK/PDデータに対して、確率シミュレーションを実行するステップと
を実行させ、前記シミュレーション結果が、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害においてI型IFN活性を調節する、抗体またはその抗原結合断片の最適用量を同定する、コンピュータ可読媒体。 - I型IFN媒介疾患または障害を治療する候補治療薬として、I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片を同定するプログラム命令を含有するコンピュータ可読媒体であって、コンピュータシステムの1つまたは複数のプロセッサによるプログラム命令の実行が、前記1つまたは複数のプロセッサに、
(a)第2のI型IFN媒介疾患または障害からの入力されたPK/PDデータをプロセッシングするステップと;
(b)前記第2のI型IFN媒介疾患または障害からのプロセシングされたPK/PDデータによって、第1のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PDデータに基づくPK/PD確率モデルを補正するステップと;
(c)前記補正PK/PD確率モデルを適用して、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害からの前記入力されたPK/PDデータに対して、確率シミュレーションを実行するステップと
を実行させ、前記シミュレーション結果が、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害を治療する候補治療薬として、I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片を同定する、コンピュータ可読媒体。 - I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片による治療法の候補として患者を同定するプログラム命令を含有するコンピュータ可読媒体であって、コンピュータシステムの1つまたは複数のプロセッサによるプログラム命令の実行が、1つまたは複数のプロセッサに、
(a)第2のI型IFN媒介疾患または障害からの入力されたPK/PDデータをプロセッシングするステップと;
(b)前記第2のI型IFN媒介疾患または障害からのプロセシングされたPK/PDデータによって、第1のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PDデータに基づくPK/PD確率モデルを補正するステップと;
(c)前記補正PK/PD確率モデルを適用して、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害からの入力されたPK/PDデータに対して、確率シミュレーションを実行するステップと
を実行させ、前記シミュレーション結果が、I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片による治療法の候補として、前記第2のI型IFN媒介疾患がある患者を同定する、コンピュータ可読媒体。 - I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片によってI型IFN媒介疾患または障害を治療する個別化治療法をデザインするプログラム命令を含有するコンピュータ可読媒体であって、コンピュータシステムの1つまたは複数のプロセッサによるプログラム命令実行が、前記1つまたは複数のプロセッサに、
(a)第2のI型IFN媒介疾患または障害からの入力されたPK/PDデータをプロセッシングするステップと;
(b)前記第2のI型IFN媒介疾患または障害からのプロセシングされたPK/PDデータによって、第1のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PDデータに基づくPK/PD確率モデルを補正するステップと;
(c)前記補正PK/PD確率モデルを適用して、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害からの入力されたPK/PDデータに対して、確率シミュレーションを実行するステップと
を実行させ、前記シミュレーション結果が、I型IFN活性を調節する抗体またはその抗原結合断片によって、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害を治療する個別化治療法を同定する、コンピュータ可読媒体。 - 前記I型IFN活性が、IFN−α活性である、請求項106〜109のいずれか一項に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記第1および第2のI型IFN媒介疾患または障害が、共通のI型IFN GSを共有する、請求項106〜110のいずれか一項に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記I型IFN GSが、差次的に調節される、請求項111に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記I型IFN GSが、IFI6、RSAD2、IFI44、IFI44L、IFI27、MX1、IFIT1、HERC5、ISG15、LAMP3、OAS3、OAS1、EPST1、IFIT3、LY6E、OAS2、PLSCR1、SIGLEC1、USP18、RTP4、およびDNAPTP6からなる群から選択される、少なくとも4つの薬力学(PD)マーカー遺伝子の上方制御された発現または活性を含んでなる、請求項111または112に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記I型IFN GSが、IFI6、RSAD2、IFI44、IFI44L、IFI27、MX1、IFIT1、HERC5、ISG15、LAMP3、OAS3、OAS1、EPST1、IFIT3、LY6E、OAS2、PLSCR1、SIGLEC1、USP18、RTP4、およびDNAPTP6からなる群から選択される、少なくとも5個のPDマーカー遺伝子の上方制御された発現または活性を含んでなる、請求項111または112に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記I型IFN GSが、遺伝子IFI27、IFI44、IFI44L、およびRSAD2の上方制御された発現または活性を含んでなる、請求項113または114に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記I型IFN GSが、遺伝子IFI6の上方制御された発現または活性をさらに含んでなる、請求項115に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記抗体またはその抗原結合断片が、IFN受容体に特異的に結合する、請求項106〜116のいずれか一項に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記IFN受容体が、IFNアルファ受容体である、請求項117に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記IFNアルファ受容体が、IFNAR1である、請求項118に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記抗体またはその抗原結合断片が、IFNAR1のサブユニット1に特異的に結合する、請求項119に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記抗体またはその抗原結合断片が、モノクローナルである、請求項106〜120のいずれか一項に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記抗体またはその抗原結合断片が、免疫グロブリンIgG Fc領域を含んでなる、請求項121に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記抗体が、MEDI−546である、請求項106〜119のいずれか一項に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記第1および第2のI型IFN媒介疾患または障害が、自己免疫疾患である、請求項106〜109のいずれか一項に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記自己免疫疾患が、リウマチ性疾患である、請求項124に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記リウマチ性疾患が、全身性エリテマトーデス(SLE)、強皮症(SSc)、筋炎、および狼瘡性腎炎からなる群から選択される、請求項125に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記第1のI型IFN媒介疾患または障害がSScであり、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害がSLEである、請求項106〜109のいずれか一項に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記第1のI型IFN媒介疾患または障害がSScであり、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害が筋炎である、請求項106〜109のいずれか一項に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記第1のI型IFN媒介疾患または障害がSScであり、前記第2のI型IFN媒介疾患または障害が狼瘡性腎炎である、請求項106〜109のいずれか一項に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記第1のまたは第2のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PDデータが、結合親和性データを含んでなる、請求項106〜109のいずれか一項に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記結合親和性データが、抗体またはその抗原結合断片とIFN受容体の結合に対応する、請求項130に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記抗体またはその抗原結合断片が、MEDI−546である、請求項131に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記IFN受容体が、IFNAR1である、請求項131に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記第1のまたは第2のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PDデータが、動態データを含んでなる、請求項106〜109のいずれか一項に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記動態データが、細胞による抗原−抗体複合体の内部移行動態に対応する、請求項134に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記抗原が、IFNAR1である、請求項135に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記抗体が、MEDI−546である、請求項135に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記細胞が、THP−1細胞である、請求項135に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記第1のまたは第2のI型IFN媒介疾患または障害に対応するPK/PDデータが、I型IFN GS抑制データを含んでなる、請求項106〜109のいずれか一項に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記I型IFN GS抑制が、完全抑制である、請求項139に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記I型IFN GS抑制が、部分的抑制である、請求項139に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記I型IFN GSが、遺伝子IFI27、IFI44、IFI44L、RSAD2、およびIFI6の上方制御された発現または活性を含んでなる、請求項139〜141のいずれか一項に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記PK/PD確率モデルが、2つのコンパートメントを含んでなる、請求項106〜109のいずれか一項に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記2つのコンパートメントが、中心コンパートメントおよび末梢コンパートメントである、請求項143に記載のコンピュータ可読媒体。
- 皮膚コンパートメントをさらに含んでなる、請求項144に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記PK/PD確率モデルが、2つの排出経路を含んでなる、請求項106〜109のいずれか一項に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記2つの排出経路が、クリアランス経路および標的媒介処理経路である、請求項146に記載のコンピュータ可読媒体。
- 前記クリアランス経路が、細網内皮系経路である、請求項147に記載のコンピュータ可読媒体。
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