JP2019023621A - 表示制御装置、表示制御方法およびプログラム - Google Patents
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Abstract
Description
<全体構成>
図1は、本実施の形態における表示制御装置の構成の一例を示すブロック図である。
本実施の形態における回路110は、まず、電気泳動画像と、対応付けテーブルとを、メモリ190から取得する。そして、回路110は、ディスプレイ911に、第1の表示画面として、その電気泳動画像を表示させる。
まず、表示制御装置の回路110は、電気泳動画像と、少なくとも1つの有効たんぱく質の情報を含む対応付けテーブルとを、メモリ190から取得する。
次に、回路110は、ディスプレイ911に、第1の表示画面D1として、電気泳動画像を表示させる。
次に、回路110は、ディスプレイ911に表示された電気泳動画像における第1の画素の選択を受け付ける。
次に、回路110は、その少なくとも1つの有効たんぱく質の情報を含む対応付けテーブルに基づいて、第1の画素に対応付けられている少なくとも1つの第1の有効たんぱく質と、複数の画素のうち、第1の画素から第1の距離以下に位置する少なくとも1つの第2の画素に対応する、少なくとも1つの第2の有効たんぱく質とを取得する。
そして、回路110は、第2の表示画面D2として、その少なくとも1つの第1の有効たんぱく質と、少なくとも1つの第2の有効たんぱく質と、電気泳動画像とを、ディスプレイ911に表示させる。
本実施の形態における表示制御装置は、実施の形態1の表示制御装置100と同様の機能を有するとともに、血液などから得られた電気泳動画像を有効画像に変換する。有効画像では、疾病の識別に有効なたんぱく質に対応する画素ほど、疾病の識別に有効でないたんぱく質に対応する画素よりも大きい画素値を有する。または、有効画像では、疾病の識別に有効なたんぱく質に対応する画素ほど、疾病の識別に有効でないたんぱく質に対応する画素よりも小さい画素値を有する。
図9は、本実施の形態における表示制御装置の機能的な構成の一例を示すブロック図である。図9に示すように、本実施の形態における表示制御装置200は、メモリ201、識別部202、重み画像生成部203、有効画像生成部204、および表示処理部205を備える。このような表示制御装置200は、実施の形態1の入力デバイス912に相当する選択部913の操作に応じて、ディスプレイ911の表示を制御する。
上述のように、識別部102は、ニューラルネットワークに基づく学習を行う。
重み画像生成部203は、ニューラルネットワーク210の重みWを画像化することによって複数の重み画像からなる重み画像群を生成する。
図16Aおよび図16Bに、表示処理部205によってディスプレイ911に表示される画面の一例を示す。
図17は、本実施の形態における表示制御装置200の全体的な処理動作を示すフローチャートである。
まず、表示制御装置200の識別部202は、電気泳動画像Eiのデータセットをメモリ201から読み込む。
次に、識別部202は、そのデータセットおよびニューラルネットワーク210を用いて、電気泳動画像Eiと疾病との関係を学習し、そのニューラルネットワーク210におけるデータセットに対する疾病の識別率を第1の識別率として算出する。
その後、重み画像生成部203は、ニューラルネットワーク210における入力層211と隠れ層212aとの間の重み群を画像化することによって、少なくとも1つの重み画像からなる重み画像群を生成する。
次に、有効画像生成部204は、重み画像群を平均化することによって有効画像Miを生成する。
そして、表示処理部205は、ステップS104にて生成された有効画像Miと、ステップS102にて算出された第1の識別率とを共にディスプレイ911に表示させる。
実施の形態3における表示制御装置は、実施の形態2の表示制御装置100の機能を有するとともに、選択たんぱく質のスポットを用いた場合の識別率を第2の識別率として表示する。
図18は、本実施の形態における表示制御装置300の機能的な構成の一例を示すブロック図である。なお、図18に示す表示制御装置300の各構成要素のうち、実施の形態2と同一の構成要素には、実施の形態2の符号と同一の符号を付し、詳細な説明を省略する。
図19に、除去画像生成部301によって生成される除去画像の一例を示す。
図20に、表示処理部205によってディスプレイ911に表示される画面の一例を示す。
図21は、本実施の形態における表示制御装置300の全体的な処理動作を示すフローチャートである。この図21のフローチャートによって示される処理動作では、選択たんぱく質を用いた場合の識別率である第2の識別率が表示される。
表示制御装置300は、実施の形態2と同様、図17に示すステップS101〜S105の処理を行うことによって、有効画像Miをディスプレイ911に表示させる。
次に、表示制御装置300の表示処理部205は、ユーザによる選択部913の操作に応じて、有効画像Miに現れている各スポットから1つのスポットを選択する。これにより、その1つのスポットに対応する有効たんぱく質が、選択たんぱく質として選択される。つまり、表示処理部205は、選択されたスポットの位置と、上述の対応付けテーブルとを参照することによって、そのスポットに対応するたんぱく質を、選択たんぱく質として選択する。
次に、除去画像生成部301は、メモリ201のデータセットに含まれる複数の電気泳動画像Eiのそれぞれから、選択たんぱく質以外のたんぱく質のスポットを除去することによって、複数の除去画像からなるデータセットを生成する。即ち、除去画像生成部301は、図19に示すように、電気泳動画像Ei1からスポットSp11以外のスポットを除去することによって除去画像Ex1を生成する。同様に、除去画像生成部301は、電気泳動画像Ei2から除去画像Ex2を生成し、電気泳動画像Ei3から除去画像Ex3し、電気泳動画像Ei4から除去画像Ex4を生成する。
次に、識別部202は、生成された除去画像のデータセットをニューラルネットワーク210に入力する。この際、最急降下法などを用いてニューラルネットワーク210の再学習を行ってもよい。
識別部202は、ステップS203の入力によって、そのニューラルネットワーク210における除去画像のデータセットに対する識別率を、第2の識別率として算出する。
表示処理部205は、ステップS100で算出された第1の識別率と、ステップS204で算出された第2の識別率とを併せて表示する。
上記実施の形態では、選択たんぱく質を利用した場合の識別率を第2の識別率として表示するために、除去画像を生成したが、除去画像を生成することなく、その第2の識別率を表示してもよい。例えば、識別部202が、ニューラルネットワーク210の複数の重みのうち、選択たんぱく質以外のたんぱく質に対応付けられている重みを0にしてもよい。
実施の形態4における表示制御装置は、第2の識別率よりも高い識別率を得るためのたんぱく質の組み合わせを表示する。この組み合わせは、選択たんぱく質と、その選択たんぱく質以外のたんぱく質との組み合わせである。
図22は、本実施の形態における表示制御装置400の機能的な構成の一例を示すブロック図である。なお、図22に示す表示制御装置400の各構成要素のうち、実施の形態2または3と同一の構成要素には、実施の形態2または3と同一の符号を付し、詳細な説明を省略する。
図23に、組み合わせたんぱく質を抽出する処理の一例を示す。
除去画像生成部301は、複数の電気泳動画像Eiからなるデータセットをメモリ201から読み出す。また、除去画像生成部301は、選択たんぱく質の情報(例えば名称)と、N個の組み合わせたんぱく質の情報とを、組み合わせ計算部401から取得する。次に、除去画像生成部301は、これらの情報と上述の対応付けテーブルとに基づいて、特定の複数のスポットを除く各スポットを、複数の電気泳動画像Eiのそれぞれから除去する。その特定の複数のスポットは、選択たんぱく質に対応するスポットと、N個の組み合わせたんぱく質のそれぞれに対応するスポットである。これにより、選択たんぱく質のスポットと、出現回数の多い順で上位にあるN個のスポットが残された除去画像のデータセットが生成される。
図24に、表示処理部205によってディスプレイ911に表示される画面の一例を示す。
図25は、本実施の形態における表示制御装置400の全体的な処理動作を示すフローチャートである。この図25のフローチャートによって示される処理動作では、たんぱく質の組み合わせと、その組み合わせを用いた場合の識別率である第3の識別率が表示される。
表示制御装置400は、実施の形態2と同様、図17に示すステップS101〜S105の処理を行うことによって、有効画像Miをディスプレイ911に表示させる。
次に、表示制御装置400の表示処理部205は、実施の形態3と同様、ユーザによる選択部913の操作に応じて、有効画像Miに現れている各スポットから1つのスポットを選択する。これにより、その1つのスポットに対応する有効たんぱく質が、選択たんぱく質として選択される。
次に、組み合わせ計算部401は、重み画像群に含まれる各重み画像から、選択たんぱく質に対応するスポットを選択する。このスポットは、閾値Th以上の重みに相当する画素値を有する複数の画素からなる画像である。
そして、組み合わせ計算部401は、選択たんぱく質以外の複数の非選択たんぱく質のそれぞれについて、選択たんぱく質のスポットと共にその非選択たんぱく質のスポットを含む重み画像の枚数を、その重み画像群からカウントする。このようにカウントされる重み画像の枚数は、その非選択たんぱく質のスポットの出現回数である。
次に、組み合わせ計算部401は、出現回数の多い順で上位にあるN個のスポットを選択する。
その後、除去画像生成部301は、その選択たんぱく質のスポットと、N個の組み合わせたんぱく質のそれぞれのスポットとを除く、各スポットを複数の電気泳動画像Eiのそれぞれから除去する。これにより、選択有効たんぱく質のスポットと、出現回数の多い順で上位にあるN個のスポットが残された除去画像のデータセットが生成される。
次に、識別部202は、実施の形態3と同様、生成された除去画像のデータセットをニューラルネットワーク210に入力する。
識別部202は、実施の形態3と同様、ステップS203の入力によって、そのニューラルネットワーク210における除去画像のデータセットに対する識別率を、第3の識別率として算出する。
表示処理部205は、ステップS100で算出された第1の識別率と、ステップS204で算出された第3の識別率とを併せて表示する。
以上、本開示の表示制御装置について、上記各実施の形態を用いて説明したが、本開示はこれら実施の形態に限定されるものではない。
110 回路
190,201 メモリ
202 識別部
203 重み画像生成部
204 有効画像生成部
205 表示処理部
301 除去画像生成部
401 組み合わせ計算部
911 ディスプレイ
912 入力デバイス
913 選択部
Ei,Ei1〜Ei4 電気泳動画像
Ex1〜Ex4 除去画像
L1 有効たんぱく質リスト
Mi 有効画像
Mx 除去有効画像
Mz 組み合わせ有効画像
Wi1〜Wi4 重み画像
Claims (17)
- メモリと、回路とを備え、
前記メモリは、複数の画素を有する電気泳動画像と、前記複数の画素のそれぞれが複数の有効たんぱく質に含まれる少なくとも1つの有効タンパク質に対応付けられた有効たんぱく質の情報とを記録し、
前記回路は、
(a1)前記電気泳動画像と、前記有効たんぱく質の情報とを、前記メモリから取得し、
(a2)ディスプレイに、第1の表示画面として、前記電気泳動画像を表示させ、
(a3)前記ディスプレイに表示された前記電気泳動画像における前記複数の画素から第1の画素の選択を受け付け、
(a4)前記有効たんぱく質の情報に基づいて、前記第1の画素に対応付けられている少なくとも1つの第1の有効たんぱく質と、前記複数の画素のうち、前記第1の画素から第1の距離以下に位置する少なくとも1つの第2の画素に対応する、少なくとも1つの第2の有効たんぱく質とを取得し、
(a5)第2の表示画面として、前記少なくとも1つの第1の有効たんぱく質と、前記少なくとも1つの第2の有効たんぱく質と、前記電気泳動画像とを、前記ディスプレイに表示させる、
表示制御装置。 - 前記回路は、
前記(a4)において、前記少なくとも1つの第1の有効たんぱく質が、第3の有効たんぱく質及び第4の有効たんぱく質を含む場合、前記第2の表示画面における前記電気泳動画像に、前記第3の有効たんぱく質と対応付けられた少なくとも1つ第3の画素と、前記第4の有効たんぱく質と対応付けられた少なくとも1つ第4の画素とを強調して表示させる、
請求項1に記載の表示制御装置。 - 前記回路は、
(a6)前記第2の表示画面が表示されているとき、前記少なくとも1つの第1の有効たんぱく質、または前記少なくとも1つの第2の有効たんぱく質のいずれかの選択を受け付け、
(a7)前記ディスプレイの前記第2の表示画面における前記電気泳動画像に、前記選択を受け付けた有効たんぱく質に対応付けられた少なくとも1つの第5の画素を強調して表示させる、
請求項1に記載の表示制御装置。 - 前記回路は、
前記(a2)及び前記(a3)の間において、
(a8)前記第1の表示画面において、前記複数の画素の少なくとも1つの画素を中心とした、前記電気泳動画像の拡大動作または前記電気泳動画像の縮小動作を受け付け、
(a9)受け付けた前記拡大動作または前記縮小動作に基づいて、前記第1の表示画面における前記電気泳動画像の拡大率を変更し、拡大率が変更された前記電気泳動画像を前記ディスプレイに表示させ、
前記(a3)において、前記第1の画素の選択を受け付けた後、少なくとも前記(a4)及び前記(a5)において、前記拡大動作または前記縮小動作に基づく前記電気泳動画像の拡大率を変更しない、
請求項1に記載の表示制御装置。 - メモリと、回路とを備え、
前記メモリは、複数の電気泳動画像からなるデータセットを有し、
前記回路は、
(b1)前記データセットおよびニューラルネットワークを用いて、電気泳動画像と疾病との関係を学習し、
(b2)前記関係の学習結果から得られた前記ニューラルネットワークの複数の重みを画像化することによって、少なくとも1つの重み画像からなる重み画像群を生成し、
(b3)前記ニューラルネットワークにおける前記データセットに対する疾病の識別率を第1の識別率として算出し、
(b4)前記重み画像群を用いて有効画像を生成し、
(b5)前記有効画像と前記第1の識別率とを共にディスプレイに表示させ、
前記有効画像は複数の画素を含み、
前記複数の画素は、画素値iを有し有効たんぱく質iに対応する画素i、画素値jを有する有効たんぱく質jに対応する画素j、画素値kを有する有効たんぱく質kに対応する画素kを含み、
前記有効たんぱく質i、前記有効たんぱく質j、前記有効たんぱく質kのうち、前記有効たんぱく質iが前記疾病の識別に最も有効で、前記有効たんぱく質kが前記疾病の識別に最も有効でない場合、前記画素値i>前記画素値j>前記画素値k、または、前記画素値i<前記画素値j<前記画素値kである、
表示制御装置。 - 前記(b4)では、
前記重み画像群に含まれる前記少なくとも1つの重み画像のそれぞれの同一位置にある画素の画素値を平均化することによって、前記有効画像を生成する、
請求項5に記載の表示制御装置。 - 前記回路は、さらに、
(b6)前記有効画像に現れている各スポットに対応付けられたたんぱく質の情報を、リスト化することによって、有効たんぱく質リストを生成し、
前記(b5)では、
前記有効画像と共に前記有効たんぱく質リストを前記ディスプレイに表示させる、
請求項5または6に記載の表示制御装置。 - 前記回路は、さらに、
(b7)前記有効画像に現れている少なくとも1つのスポットから、何れか1つのスポットを選択することによって、または、前記有効たんぱく質リストから、何れかの1つの情報を選択することによって、選択された前記スポットまたは前記情報に対応する1つのたんぱく質を、選択たんぱく質として選択する、
請求項7に記載の表示制御装置。 - 前記回路は、さらに、
(b8)前記ニューラルネットワークの複数の重みのうち、前記選択たんぱく質に対応していない少なくとも1つの重みのそれぞれを0に設定することによって、前記ニューラルネットワークを変更し、
(b9)前記データセットに含まれる前記複数の電気泳動画像を、変更された前記ニューラルネットワークに入力することによって、変更された前記ニューラルネットワークにおける前記データセットに対する識別率を、第2の識別率として算出し、
(b10)前記第2の識別率を前記ディスプレイに表示させる、
請求項8に記載の表示制御装置。 - 前記回路は、さらに、
(b11)前記データセットに含まれる前記複数の電気泳動画像のそれぞれから、前記選択たんぱく質に対応していないスポットを除去することによって、除去画像を生成し、
(b12)複数の前記除去画像を前記ニューラルネットワークに入力することによって、前記ニューラルネットワークにおける複数の前記除去画像に対する識別率を、第2の識別率として算出し、
(b13)前記第2の識別率を前記ディスプレイに表示させる、
請求項8に記載の表示制御装置。 - 前記回路は、さらに、
(b14)前記選択たんぱく質以外のたんぱく質である複数の非選択たんぱく質のそれぞれについて、前記選択たんぱく質のスポットと共に当該非選択たんぱく質のスポットを含む重み画像の枚数を、前記重み画像群から特定し、
(b15)前記重み画像の枚数が多い順で第1番目の非選択たんぱく質から第N(Nは1以上の整数)番目の非選択たんぱく質までのN個の非選択たんぱく質を、前記複数の非選択たんぱく質から抽出し、
(b16)抽出された前記N個の非選択たんぱく質のそれぞれの情報を前記ディスプレイに表示させる、
請求項9または10に記載の表示制御装置。 - メモリと回路とを用いてディスプレイの表示を制御する表示制御方法であって、
前記メモリは、複数の画素を有する電気泳動画像と、前記複数の画素のそれぞれが複数の有効たんぱく質に含まれる少なくとも1つの有効タンパク質に対応付けられた有効たんぱく質の情報とを記録し、
前記回路は、
(a1)前記電気泳動画像と、前記有効たんぱく質の情報とを、前記メモリから取得し、
(a2)ディスプレイに、第1の表示画面として、前記電気泳動画像を表示させ、
(a3)前記ディスプレイに表示された前記電気泳動画像における前記複数の画素から第1の画素の選択を受け付け、
(a4)前記有効たんぱく質の情報に基づいて、前記第1の画素に対応付けられている少なくとも1つの第1の有効たんぱく質と、前記複数の画素のうち、前記第1の画素から第1の距離以下に位置する少なくとも1つの第2の画素に対応する、少なくとも1つの第2の有効たんぱく質とを取得し、
(a5)第2の表示画面として、前記少なくとも1つの第1の有効たんぱく質と、前記少なくとも1つの第2の有効たんぱく質と、前記電気泳動画像とを、前記ディスプレイに表示させる、
表示制御方法。 - 前記回路は、
前記(a4)において、前記少なくとも1つの第1の有効たんぱく質が、第3の有効たんぱく質及び第4の有効たんぱく質を含む場合、前記第2の表示画面における前記電気泳動画像に、前記第3の有効たんぱく質と対応付けられた少なくとも1つ第3の画素と、前記第4の有効たんぱく質と対応付けられた少なくとも1つ第4の画素とを強調して表示させる、
請求項12に記載の表示制御方法。 - 前記回路は、
(a6)前記第2の表示画面が表示されているとき、前記少なくとも1つの第1の有効たんぱく質、または前記少なくとも1つの第2の有効たんぱく質のいずれかの選択を受け付け、
(a7)前記ディスプレイの前記第2の表示画面における前記電気泳動画像に、前記選択を受け付けた有効たんぱく質に対応付けられた少なくとも1つの第5の画素を強調して表示させる、
請求項12に記載の表示制御方法。 - 前記回路は、
前記(a2)及び前記(a3)の間において、
(a8)前記第1の表示画面において、前記複数の画素の少なくとも1つの画素を中心とした、前記電気泳動画像の拡大動作または前記電気泳動画像の縮小動作を受け付け、
(a9)受け付けた前記拡大動作または前記縮小動作に基づいて、前記第1の表示画面における前記電気泳動画像の拡大率を変更し、拡大率が変更された前記電気泳動画像を前記ディスプレイに表示させ、
前記(a3)において、前記第1の画素の選択を受け付けた後、少なくとも前記(a4)及び前記(a5)において、前記拡大動作または前記縮小動作に基づく前記電気泳動画像の拡大率を変更しない、
請求項12に記載の表示制御方法。 - メモリと回路とを用いてディスプレイの表示を制御する表示制御方法であって、
前記メモリは、複数の電気泳動画像からなるデータセットを有し、
前記回路は、
(b1)前記データセットおよびニューラルネットワークを用いて、電気泳動画像と疾病との関係を学習し、
(b2)前記関係の学習結果から得られた前記ニューラルネットワークの複数の重みを画像化することによって、少なくとも1つの重み画像からなる重み画像群を生成し、
(b3)前記ニューラルネットワークにおける前記データセットに対する疾病の識別率を第1の識別率として算出し、
(b4)前記重み画像群を用いて有効画像を生成し、
(b5)前記有効画像と前記第1の識別率とを共にディスプレイに表示させ、
前記有効画像は、複数の画素を含み、
前記複数の画素は、画素値iを有し有効たんぱく質iに対応する画素i、画素値jを有する有効たんぱく質jに対応する画素j、画素値kを有する有効たんぱく質kに対応する画素kを含み、
前記有効たんぱく質i、前記有効たんぱく質j、前記有効たんぱく質kのうち、前記有効たんぱく質iが前記疾病の識別に最も有効で、前記有効たんぱく質kが前記疾病の識別に最も有効でない場合、前記画素値i>前記画素値j>前記画素値k、または、前記画素値i<前記画素値j<前記画素値kである
表示制御方法。 - 請求項12〜16の何れか1項に記載の表示制御方法における、前記回路によって行われる処理を、前記回路であるコンピュータに実行させるためのプログラム。
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