JP2005291759A - 二次元画像による病症診断システム - Google Patents
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Abstract
【解決手段】 2以上の診断用画像の対比による病症診断において、標本1をもとに造影手段によって二次元画像を作製するとともに、該画像に現出するスポットに対し、位置補正および濃淡補正に加え、造影に伴うバックグランドの経時変化の補正を行うことを特徴とする。前記二次元画像を得るために、造影操作および撮像操作を制御された一定時間ごとに交互に繰返し行うことを特徴とする。前記二次元画像が、外部標準を加えた標本1をもとに作製されたものであることを特徴とする。
【選択図】 図1
Description
(1)染色法のような処理を施すと画像自体に経時変化が生じることから、対比する画像が同等視できない。
(2)スポット領域同士が重なりをもった場合においては、その境界が不明確になることから、やはり正確な対比が困難となる。
(3)画像の撮像時におけるゲルの条件あるいはゲルマップや電気泳動パターンと撮像装置との配置関係によって、画像におけるスポット位置のズレが生じることから、正確な対比が困難となる。
以下に、標本採取から二次元画像の作製および画像に基くプロテオーム解析にいたる本発明に係る病症診断システムの操作プロセスを説明する。ここでは、標本として癌細胞およびその周辺の正常細胞、処理手段として二次元電気泳動法、造影手段として銀染色反応を利用し、二次元画像を作製した場合を例に挙げる。
図1(A)に示すように、手術で切除された2つの標本1を準備する。図1(B)のように、癌組織を一方の標本としたときには、他方はその生体部位周辺の正常組織であることが好適である。臓器が異なる場合や臓器と皮膚などのように生体部位が変わると、同一処理による比較が困難であるためである。
各標本を二次元電気泳動法によって処理するための試料溶液を作製する。具体的には、図2に示すように、標本1を高濃度尿素液などの膨潤液2を添加しながら、乳鉢3などですりつぶし混合することによって膨潤処理を行い、細胞たんぱくを溶液に溶解させる。これを、両方の標本について行い、2つの試料溶液を得る。
各試料溶液を二次元電気泳動装置に注入し、各々の電気泳動パターンを作製する。つまり、電気泳動ゲルを用いて、一次処理としてタンパク質を電気的な性質で分ける等電点電気泳動を行い、二次処理としてタンパク質の分子量で分けるSDS電気泳動を行うことによって、図1(C)に示すような二次元の電気泳動パターンを図10と同様のプレートPに作製することができる。
得られた二次元の電気泳動パターンに対し、蛋白質の銀染色反応を利用して造影する。ここで、染色方法としては、例えば、CBB染色法のような簡便な操作で容易に染色できる方法など適用することが可能であるが、検出感度の面では、銀染色反応が好ましい。また、この場合、特殊な装置を用いずに、例えばスキャナやデジタルカメラ等の画像読取装置によって取り込めるように、電気泳動パターンを染色できる方法が好ましい。
上記の二次元画像の作製においては、例えば、図4(A)〜(H)に示すような画像の経時変化が生じることを述べた。これを、同図におけるa〜cのスポットおよびバックグランドgについての濃度の経時変化として捉えると、図5のような、バックグランドの上昇と各スポットの反応に伴う強度変化としての関係が得られる。このとき、各スポットの反応に伴う強度変化は、バックグランドの経時変化を補正すれば、ほぼ相似した曲線となり、近似した関数化が可能である。従って、経時変化の補正方法としては、バックグランドの経時変化量だけでなく、スポットの広がり(面積)の変化についても行うことが可能となる。具体的には、バックグランドの経時変化量を補正した後、各スポットの安定した強度を算定することができる。また、後述する濃淡補正におけるベースおよびスポットの強度の算定に、バックグランドの経時変化量を補正した強度を用いて濃淡補正を行い、次に、各スポットの同一時間での画像領域の設定を行うことで、各スポットの経時変化を補正した画像の作製ができる。さらには、各スポット単位での補正だけでなく、画像全体としての補正を行うことが、さらなる高精度化を図ることとなる。
本発明者の研究によって、二次元画像のスポットの境界近傍の画像の濃淡を調べると、次の傾向があることの知見が得られた。つまり、(a)図6に示すように、ベース領域を始点として、比較的フラットな領域Aから、急激に変化する領域Bを経て、濃度の高い領域Cに移行してスポットが形成されている。(b)各スポットの濃淡の差(最高強度DとD’の差)はあっても、その曲線は非常に相似的なものとなる。
対比する2以上の画像におけるスポットの位置補正は、両画像を重ね合せ、比較的相似形で領域の重なりが大きな任意の2以上のスポットを選定し、両画像の同一スポットの特定を行い、両スポットが重なるように、二次元補正を行う。このとき、選定するスポットは極力大きい方が、重ねたときと補正精度の向上が期待できることから好ましく、また、3以上のスポットを選定し、最も重なりの悪いスポットを選定からはずすことによって、補正精度の向上が期待できる。
上記(5)〜(7)の補正をおこなうことで、対比すべき二次元画像が完成し、プロテオーム解析が可能となる。なお、上記(5)〜(7)の補正は、1度行うことで十分精度の向上を図ることができるが、これを繰り返すことで、さらに精度の高い補正が可能となる。プロテオーム解析に際しては、二次元画像を対比しやすいように、マルチ画面が好ましく、例えば、図7(a)各画像の全体画面、(b)比較する画像の任意の範囲の原画面、(c)比較する画像を重ね合わせた画面、(d)特定部位の拡大原画面、(e)特定部位を拡大し、比較する画像を重ね合わせた画面、のように、いずれか任意の画面を並列的に表示する方法が挙げられる。こうした画面の配列、大きさ、色彩などを任意に組合せることで、非常に使い勝手のよい病症診断システムができる。
二次元画像の対比は、図8(A)に示すように、両画像内の対応するスポット同士の照合によって行われる。具体的には、癌組織標本から得られた二次元画像中のスポットxが、正常組織標本から得られた二次元画像中にはないことが判る。
上記の例によれば、図8(B)のように、二次元画像の比較によって、スポットxに対応する組織あるいはたんぱく質が、発生した癌組織に関連する可能性を示していると判断され、係る部位を取出し、例えば、所定の前処理後にTOF−MASS(時間飛行式質量分析法)によって測定された結果と併せて、病症の判断が行われる。なお、発症の有無の判断については、画像のすべての点をもとに行う必要はなく、数〜数十の特異点をもとに行えば十分である。多くの症例から、病症特有の特異点があることが知られており、上記データベースの蓄積が進めば、自動的に病症を判断することも可能となる。
2 膨潤液2
3 乳鉢
4 現像液
5 振とう駆動手段
6 循環液
7 光源
8 CCDカメラ
P プレート
a〜c、x スポット
g バックグランド
Claims (5)
- 2以上の診断用画像の対比による病症診断において、標本をもとに造影手段によって二次元画像を作製するとともに、該画像に現出するスポットに対し、位置補正および濃淡補正に加え、造影に伴うバックグランドの経時変化の補正を行うことを特徴とする病症診断システム。
- 前記二次元画像を得るために、造影操作および撮像操作を制御された一定時間ごとに交互に繰返し行うことを特徴とする請求項1記載の病症診断システム。
- 前記二次元画像が、外部標準を加えた標本をもとに作製されたものであることを特徴とする請求項1または2に記載の病症診断システム。
- 前記二次元画像が、二次元電気泳動をもとに作製されたものであることを特徴とする請求項1〜3のいずれかに記載の病症診断システム。
- 前記二次元電気泳動をもとに銀染色反応を利用してプロテオーム解析を行うとともに、複数の経時画像を用いて銀染色の経時変化に基くバックグランドの変化を補正することを特徴とする請求項1〜4のいずれかに記載の病症診断システム。
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JP2004103544A JP2005291759A (ja) | 2004-03-31 | 2004-03-31 | 二次元画像による病症診断システム |
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- 2004-03-31 JP JP2004103544A patent/JP2005291759A/ja active Pending
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