JP2018533908A5

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Publication number: JP2018533908A5
Application number: JP2018510399A
Authority: JP
Filing date: 2016-08-24
Publication date: 2019-06-20
Anticipated expiration: 2036-08-24

Claims

ポリペプチド担体をコードするヌクレオチド配列又はそのバリアントを含む核酸分子であって、前記バリアントが、前記ヌクレオチド配列と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は９９％の同一性を有し、又はストリンジェントな条件若しくは高ストリンジェントな条件下で前記ヌクレオチド配列とハイブリダイズする能力があり、前記ポリペプチド担体が、
（１）カグラコウモリＨＢＶ由来コア抗原タンパク質（ＲＢＨＢｃＡｇタンパク質）とは、（ａ）ＲＢＨＢｃＡｇタンパク質のＮ末端における位置７８〜８３のアミノ酸残基の１個若しくは複数のアミノ酸残基、すなわち１個、２個、３個、４個、５個、又は６個のアミノ酸残基が除去され、若しくはリンカーで置換されている点、及び（ｂ）任意で、ＲＢＨＢｃＡｇタンパク質のＣ末端における１〜５個、５〜１０個、１０〜１５個、１５〜２０個、２０〜２５個、２５〜３０個、３０〜３５個、又は３５〜４０個のアミノ酸残基が除去されている点で異なるＲＢＨＢｃＡｇ担体；
（２）テントコウモリＨＢＶ由来コア抗原タンパク質（ＴＢＨＢｃＡｇタンパク質）とは、（ａ）ＴＢＨＢｃＡｇタンパク質のＮ末端における位置８０〜８４のアミノ酸残基の１個若しくは複数のアミノ酸残基、すなわち１個、２個、３個、４個、又は５個のアミノ酸残基が除去され、若しくはリンカーで置換されている点、及び（ｂ）任意で、ＴＢＨＢｃＡｇのＣ末端における１〜５個、５〜１０個、１０〜１５個、１５〜２０個、２０〜２５個、２５〜３０個、又は３０〜３５個のアミノ酸残基）が除去されている点で異なるＴＢＨＢｃＡｇ担体；又は
（３）キクガシラコウモリＨＢＶ由来コア抗原タンパク質（ＨＢＨＢｃＡｇタンパク質）とは、（ａ）ＨＢＨＢｃＡｇタンパク質のＮ末端における位置７８〜８３のアミノ酸残基の１個若しくは複数のアミノ酸残基、すなわち１個、２個、３個、４個、５個、又は６個のアミノ酸残基が除去され、若しくはリンカーで置換されている点、及び（ｂ）任意で、ＨＢＨＢｃＡｇのＣ末端における１〜５個、５〜１０個、１０〜１５個、１５〜２０個、２０〜２５個、２５〜３０個、３０〜３５個、又は３５〜４０個のアミノ酸残基が除去されている点で異なるＨＢＨＢｃＡｇ担体
から選択される、上記核酸分子。
以下の（ｉ）〜（ｘｉ）の１つ又は複数を特徴とする請求項１に記載の核酸分子：
（ｉ）前記ＲＢＨＢｃＡｇタンパク質は配列番号１に示されるアミノ酸配列を有し、
（ｉｉ）前記ＲＢＨＢｃＡｇ担体が、（ａ）ＲＢＨＢｃＡｇタンパク質のＮ末端における位置７８〜８３のアミノ酸残基、位置７８〜８２のアミノ酸残基、位置７８〜８１のアミノ酸残基、又は位置７８〜８０のアミノ酸残基が除去され、若しくはリンカーで置換されている点、及び（ｂ）任意で、ＲＢＨＢｃＡｇタンパク質のＣ末端における１〜５個、５〜１０個、１０〜１５個、１５〜２０個、２０〜２５個、２５〜３０個、３０〜３５個、又は３５〜４０個のアミノ酸残基が除去されている点で、ＲＢＨＢｃＡｇタンパク質と異なり、
（ｉｉｉ）前記ＴＢＨＢｃＡｇタンパク質は配列番号２に示されるアミノ酸配列を有し、
（ｉｖ）前記ＴＢＨＢｃＡｇ担体が、ＴＢＨＢｃＡｇタンパク質のＮ末端における位置８０〜８４のアミノ酸残基、位置８０〜８３のアミノ酸残基、又は位置８０〜８２のアミノ酸残基）が除去され、若しくはリンカーで置換されている点、及び（ｂ）任意で、ＴＢＨＢｃＡｇのＣ末端における１〜５個、５〜１０個、１０〜１５個、１５〜２０個、２０〜２５個、２５〜３０個、又は３０〜３５個のアミノ酸残基が除去されている点で、ＴＢＨＢｃＡｇタンパク質と異なり、
（ｖ）前記ＨＢＨＢｃＡｇタンパク質は配列番号３に示されるアミノ酸配列を有し、
（ｖｉ）前記ＨＢＨＢｃＡｇ担体は、ＨＢＨＢｃＡｇタンパク質のＮ末端における位置７８〜８３のアミノ酸残基、位置７８〜８２のアミノ酸残基、位置７８〜８１のアミノ酸残基、又は位置７８〜８０のアミノ酸残基が除去され、若しくはリンカーで置換されている点、及び（ｂ）任意で、ＨＢＨＢｃＡｇのＣ末端における１〜５個、５〜１０個、１０〜１５個、１５〜２０個、２０〜２５個、２５〜３０個、３０〜３５個、又は３５〜４０個のアミノ酸残基が除去されている点で、ＨＢＨＢｃＡｇタンパク質と異なり、
（ｖｉｉ）前記リンカーは可動性リンカーであり、
（ｖｉｉｉ）制限酵素切断部位が、前記除去される１個又は複数のアミノ酸残基をコードするヌクレオチドの位置に導入され、
（ｉｘ）制限酵素切断部位が、前記リンカーをコードするヌクレオチド配列内に、及び／又はその末端の一方若しくは両方に導入され、
（ｘ）前記核酸分子が、標的ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を挿入するために用いられ；並びに
（ｘｉ）前記核酸分子が、標的ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列をさらに含み、前記標的ポリペプチドが、前記ポリペプチド担体に対して異種性であり、且つ前記標的ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列が、前記除去される１個若しくは複数のアミノ酸残基をコードするヌクレオチドの位置に挿入され、或いは前記リンカーをコードするヌクレオチド配列内に、又はその末端の一方若しくは両方に挿入される。
前記ポリペプチド担体が、配列番号４〜９から選択されるアミノ酸配列を有し、前記核酸分子が、配列番号１２〜１７から選択されるヌクレオチド配列を含む、請求項１に記載の核酸分子。
（１）組換えタンパク質をコードする核酸分子を得るように、標的ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を、請求項１〜３のいずれか一項に記載の核酸分子へ挿入するステップであって、前記標的ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列が、前記除去される１個若しくは複数のアミノ酸残基をコードするヌクレオチドの位置に挿入され、或いは前記リンカーをコードするヌクレオチド配列内に、又はその末端の一方若しくは両方に挿入される、ステップ；及び
（２）ステップ（１）における前記組換えタンパク質をコードする核酸分子を発現させて、前記組換えタンパク質を産生するステップ
を含む、標的ポリペプチドを提示するための方法。
前記標的ポリペプチドが、エピトープペプチドであり、前記エピトープペプチドが、以下の（ｉ）〜（ｉｉｉ）の１つを特徴とする、請求項４に記載の方法：
（ｉ）ヒトＨＢＶ由来のＨＢｓＡｇのエピトープ、ＨＩＶＧＰ１２０タンパク質のエピトープ、又はヒトＰＤ−Ｌ１のエピトープを含み；
（ｉｉ）前記エピトープペプチドはＨＢｓＡｇタンパク質の位置１１３〜１３５のアミノ酸、ＨＩＶＧＰ１２０タンパク質の位置３６１〜３７５のアミノ酸、又はヒトＰＤ−Ｌ１タンパク質の位置１４７〜１６０のアミノ酸を含み；並びに
（ｉｉｉ）前記標的ポリペプチドが、配列番号２０〜２２及び６０〜６２から選択されるアミノ酸配列を有する。
ポリペプチド担体及び標的ポリペプチドを含む組換えタンパク質であって、前記ポリペプチド担体が、請求項１〜３のいずれか一項に定義されている通りであり、前記標的ポリペプチドが、前記除去される１個若しくは複数のアミノ酸残基の位置に挿入され、或いは前記リンカー内に、又はその末端の一方若しくは両方に挿入される、上記組換えタンパク質。
以下の（ｉ）〜（ｉｉｉ）の１つ又は複数を特徴とする、請求項６に記載の組換えタンパク質：
（ｉ）前記ポリペプチド担体が、配列番号４〜９から選択されるアミノ酸配列を有し、
（ｉｉ）前記標的ポリペプチドが、エピトープペプチドであり、任意に前記エピトープペプチドが、ヒトＨＢＶ由来のＨＢｓＡｇのエピトープ、ＨＩＶＧＰ１２０タンパク質のエピトープ若しくはヒトＰＤ−Ｌ１のエピトープを含み、又はＨＢｓＡｇタンパク質の位置１１３〜１３５のアミノ酸、ＧＰ１２０タンパク質の位置３６１〜３７５のアミノ酸、又はヒトＰＤ−Ｌ１タンパク質の位置１４７〜１６０のアミノ酸を含み、或いは配列番号２０〜２２及び６０〜６２から選択されるアミノ酸配列を含み、；並びに
（ｉｉｉ）前記組換えタンパク質が、配列番号２３〜４０及び６９〜７４から選択されるアミノ酸配列を含み、又はそれからなる、請求項６に記載の組換えタンパク質。
請求項６又７に記載の組換えタンパク質を含み、又はそれからなるウイルス様粒子。
請求項６又７に記載の組換えタンパク質、又は請求項８に記載のウイルス様粒子、及び任意で、１つ又は複数の薬学的に許容される媒体又は賦形剤を含む医薬組成物。
前記標的ポリペプチドが、ＨＢＶ由来の抗原性エピトープを含むエピトープペプチドであり、任意に以下の（ｉ）〜（ｖ）の１つ又は複数を特徴とする、ＨＢＶ感染、又はＨＢＶ感染に関連した疾患の予防又は処置における使用のための、請求項６又は７に記載の組換えタンパク質又は請求項８に記載のウイルス様粒子又は請求項９に記載の医薬組成物：
（ｉ）前記ＨＢＶ感染に関連した疾患がＢ型肝炎であり、
（ｉｉ）前記エピトープペプチドが、ヒトＨＢＶ由来のＨＢｓＡｇのエピトープを含み、
（ｉｉｉ）前記エピトープペプチドが、ヒトＨＢＶ由来のＨＢｓＡｇタンパク質の位置１１３〜１３５のアミノ酸を含み
（ｉｖ）前記標的ポリペプチドが、配列番号２２及び６０〜６２から選択されるアミノ酸配列を有し；並びに
（ｖ）前記組換えタンパク質が、配列番号３５〜４０及び６９〜７４から選択されるアミノ酸配列を含み、又はそれからなる。
請求項６又は７に記載の組換えタンパク質をコードするポリヌクレオチド。
請求項１〜３のいずれか一項に記載の核酸分子又は請求項１１に記載のポリヌクレオチドを含む、ベクター。
請求項１〜３のいずれか一項に記載の核酸分子、請求項１１に記載のポリヌクレオチド、又は請求項１２に記載のベクターを含む、宿主細胞。
組み換えタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含む宿主細胞を、前記組換えタンパク質を発現させるのに適した条件下で培養するステップ、及び前記組換えタンパク質を回収するステップを含む、請求項６又は７に記載の組換えタンパク質を調製するための方法。
ＨＩＶ感染、又はＨＩＶ感染に関連した疾患の予防又は処置における使用のための請求項６又は７に記載の組換えタンパク質又は請求項８に記載のウイルス様粒子、又は請求項９に記載の医薬組成物であって、前記標的ポリペプチドが、ＨＩＶ由来の抗原性エピトープを含み、任意に以下の（ｉ）〜（ｖ）の１つ又は複数を特徴とする、上記組換えタンパク質、ウイルス様粒子、又は医薬組成物：
（ｉ）前記ＨＩＶ感染に関連した疾患がＡＩＤＳであり、
（ｉｉ）前記エピトープペプチドが、ＨＩＶＧＰ１２０タンパク質のエピトープを含み、
（ｉｉｉ）前記エピトープペプチドが、ＧＰ１２０タンパク質の位置３６１〜３７５のアミノ酸を含み、
（ｉｖ）前記標的ポリペプチドが、配列番号２０に示されるアミノ酸配列を有し；及び
（ｖ）前記組換えタンパク質が、配列番号２３〜２８から選択されるアミノ酸配列を含み、又はそれからなる。
癌の予防又は処置における使用のための請求項６又は７に記載の組換えタンパク質、請求項８に記載のウイルス様粒子、又は請求項９に記載の医薬組成物であって、前記標的ポリペプチドが、ヒトＰＤ−Ｌ１タンパク質の抗原性エピトープを含み、任意に以下の（ｉ）〜（ｉｖ）の１つ又は複数を特徴とする、上記組換えタンパク質、ウイルス様粒子、又は医薬組成物：
（ｉ）前記癌が非小細胞肺癌であり、
（ｉｉ）前記エピトープペプチドが、ヒトＰＤ−Ｌ１タンパク質の位置１４７〜１６０のアミノ酸を含み、
（ｉｉｉ）前記標的ポリペプチドが、配列番号２１に示されたアミノ酸配列を有し；及び
（ｉｖ）前記組換えタンパク質が、配列番号２９〜３４から選択されるアミノ酸配列を含み、又はそれからなる。