JP2018521115A - Ｍ様タンパク質をコードするｍＲＮＡを含む癌ワクチン - Google Patents

Abstract

合成細菌メッセンジャーＲＮＡを用いて、自家免疫、他生または直接核酸癌ワクチンを調製することができる。癌細胞は、免疫原性細菌タンパク質をコードするＤＮＡから得られるｍＲＮＡにより、インビトロまたはインビボのいずれかで導入される。癌に対する免疫応答は、インビボでのｍＲＮＡの直接投与またはインビトロでの癌細胞から調製されたワクチンの投与からなされる。
【選択図】なし

Description

関連出願を相互参照
本出願は、２０１５年５月１９日出願の米国仮出願第６２／１６３，４４６号の優先権を主張するものであり、図面、表、アミノ酸および核酸配列を含む全内容を参照することにより組み込まれる。

本出願の配列リストは「Ｓｅｑ−Ｌｉｓｔ．ｔｘｔ」と名付けられ、２０１６年５月１９日に作成された９ＫＢのものである。配列リストの全内容を参照することにより組み込まれる。

本発明は、概して、ワクチン、特に、癌細胞へのトランスフェクション、あるいは合成細菌メッセンジャーリボ核酸（ｍＲＮＡ）による直接腫瘍内投与により調製された癌ワクチンに関する。

本発明は、癌治療用に有効なｍＲＮＡワクチンの開発および使用に係る。デオキシリボ核酸（ＤＮＡ）ワクチンには、低トランスフェクション効率や時間のかかる分配方法をはじめとするいくつかの欠点があるが、本発明のｍＲＮＡワクチンは、腫瘍細胞に直接投与され、免疫原性タンパク質へ即時に翻訳され、多発性腫瘍−抗原応答を引き起こす。ｍＲＮＡワクチンは、対応のＤＮＡに基づくワクチンよりも有効で、細胞中のＤＮＡよりも早い発現を促し、ＤＮＡとは異なり、宿主細胞染色体に組み込まれない。

癌の治療は、診断される特定の型に基づくものである。一般的な癌として、膀胱癌、乳癌、結腸癌、リンパ腫、黒色腫および前立腺癌が挙げられる。治療計画は、これらに限られるものではないが、病期、病因、患者の年齢や全身の健康状態をはじめとする多数の因子の評価に基づいて、医師が作成する。多くの癌について、治療計画には、手術、化学療法、放射線、骨髄幹細胞移植、抗癌剤または免疫療法あるいはこれらの組み合わせが含まれる。最も一般的な治療には、手術、化学療法、放射線および経口投与が含まれる。これらの治療は有効であるが、多くの副作用を引き起こす場合が多い。特に、化学療法は、癌細胞だけでなく、体の全ての新たな分裂細胞をターゲットにする。

免疫療法には、罹患細胞を標的にし、罹患していない細胞は無傷のままとするという利点がある。癌細胞は、適正成長制御機構の機能停止から生じる。従って、体はこれら細胞の多くをまだ自己とみなす。癌免疫療法は、これら罹患自己細胞の体の耐性に打ち勝ち、体にそれらを異物と認識させる。癌はまた、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）分子等細胞での免疫活性マーカーの発現を減じることにより、体の免疫システムの直接抑制により、免疫検出も免れる。ＭＨＣは、細胞が自己か、異物または罹患しているかを、体が見分けるのを助ける成分である。

固形癌の治療には、一般的に、化学療法および／または手術が含まれる。最近、自己免疫防御を刺激するワクチンの開発に関心が集まっている。特許文献１には、リンパ腫の診断対象から単離された形質転換自家または非自家細胞により、ステージの進んだリンパ腫を治療するためのリンパ腫ワクチンについて詳述されている。この単離細胞は、Streptococcus pyogenes Ｅｍｍ５５遺伝子を含むプラスミドベクターによりトランスフェクトされる。細菌タンパク質は、細胞表面で発現し、トランスフェクトされた細胞は、癌対象に導入されて、リンパ腫細胞に対し免疫応答する。

これまで、ＦＤＡ（米国食品医薬品局）は、前立腺癌の治療には、細胞癌免疫療法ワクチン、プロベンジしか認可してこなかったが、いくつかのワクチンが、臨床検査で現在試験されている。ＢｉｏｖａｘＩｄは、遅発性濾胞性非ホジキンリンパ腫の治療における、フェーズＩＩＩ臨床試験を行っている自家腫瘍由来免疫グロブリンインディオタイプワクチンである。

主に、外因性ＤＮＡまたはＲＮＡは、哺乳類の体でタンパク質を発現できる。同様の免疫活性が、ＤＮＡとｍＲＮＡの両方でなされるかどうかにかかわらず、発現されたタンパク質は、不安定である。これまでの認識によれば、ＤＮＡは、その安定性と使いやすさから、ワクチンの製造および遺伝子治療に優れたものである。プラスミドＤＮＡワクチンの一例としては、Ｍｅｒｉａｌ'ｓ Ｏｎｃｅｐｔが挙げられ、これは、口腔内黒色腫の治療のために開発された。

ｍＲＮＡワクチンへの取り組みが報告されてきた。あるケースでは、有効ｍＲＮＡワクチンは、リポソームを用いてデリバーされた。この特定のワクチンは、インフルエンザウィルスタンパク質をコードするｍＲＮＡのマウスへの投与後、インビボで細胞傷害性Ｔリンパ球を誘発した。ＣｕｒｅＶａｃ ＧＭＨによる研究によれば、ｍＲＮＡワクチンは、経皮デリバリーの際、体液および細胞免疫応答を引き起こすことが示された。このワクチンは、裸形態で投与され、ｍＲＮＡの安定性を高めるタンパク質であるプロタミンと錯形成され、タンパク質発現を改善した。このワクチンは、現在、去勢抵抗性前立腺癌の臨床検査中である。

液性および固形腫瘍にｍＲＮＡを用いた臨床検査が行われている。癌としては、急性骨髄リンパ腫、転移性黒色腫、前立腺癌、腎臓細胞癌／上皮癌、神経芽細胞腫、脳、肺、結腸、腎細胞癌が挙げられる。現在実施されている臨床検査の大半には、ｍＲＮＡの、癌細胞でなく、自家樹状細胞へのトランスフェクションが含まれる。さらに、ｍＲＮＡの腫瘍内投与を用いた臨床試験は試みられていない。図３は、ｍＲＮＡワクチンを用いた、公表された臨床検査の表である。

リポソームやカチオンポリマーといったデリバリービヒクルは、トランスフェクションを改善する見込みがあるように思われる。リポソームまたはポリマー錯体が細胞質に入ると、ｍＲＮＡは、デリバリービヒクルから分離して、抗原翻訳を可能とするものでなければならない。残念ながら、これらビヒクルは、ｍＲＮＡと適切に錯形成しないため、コードされたタンパク質の適切な翻訳がなされない。抗原生成はなされるものの、所望の効果を得るには不十分な量である。

多くの免疫療法は、疾病特異的で、あり、その概念は複雑で、製造に関してはさらに複雑かつ高価なものである。かかる治療が商業的に実行可能であるかも分からない。免疫原性タンパク質へすぐに翻訳され、多発性腫瘍−抗原応答を引き起こす患者の腫瘍へのｍＲＮＡの直接投与は、将来にわたって影響を及ぼす。例えば、単一合成ｍＲＮＡは、多種類の多様なタイプの癌の治療に用いることができる。ｍＲＮＡは、デリバーが簡単で、コスト効率が高く、運搬保管が容易で、投与しやすい。優れた安全性プロフィールと共に、ｍＲＮＡの属性によって、開発途上国も含めた世界中で癌患者を治療することができる。

癌細胞を殺すための免疫システムの誘導は、全ての癌の免疫療法に基づくものである。任意の種類の免疫療法を成功させるには、腫瘍関連抗原の免疫応答を誘発して、増幅可能としなければならない。免疫応答には、抗原提示細胞、好中球、ナチュラルキラー細胞、Ｔヘルパー細胞、Ｔ細胞損傷性細胞およびＢ細胞等を含む数多くの免疫細胞が含まれる。しかしながら、単一の腫瘍抗原に対する免疫応答の誘発および活性化は、人体癌ワクチン検査において、恐らく、免疫逃避変異体のために、有益な臨床有効性へ翻訳するのに適切であることが証明されておらず、外因性アジュバントと混合される全腫瘍細胞または腫瘍細胞溶解物を、多数の関連腫瘍抗原の供給源として用いてもいない。このような理由で、腫瘍抗原が患者の腫瘍細胞で発現されるので、腫瘍抗原に関連して、誘発できることが原則である。これを行う唯一の方法は、コードする核酸を、腫瘍細胞に与えて、細胞機構が、抗原の全てが免疫系の細胞に露出されるようなやり方で、腫瘍抗原と共に誘発抗原を発現し得るようにするものである。かかる露出によって、抗原内エピトープ拡大となり、誘発抗原がなくても、適応免疫応答が、これら抗原を含む全腫瘍細胞について学び、活性化する。

核酸をワクチンとして用いると、多数の他の利点もある。核酸ワクチンは、人体および細胞免疫応答の両方を誘発し、低有効薬量で、扱いやすく、即時試験に役立ち、大規模製造および単離においてコスト効率が高く、再生可能で、高頻度で製造して容易に単離でき、従来のワクチンより温度安定性があり、長貯蔵寿命で、保管運搬が容易で、コールドチェーンを必要としない（非特許文献１）。

米国特許第７，７９５，０２０号明細書

Ｓｈｅｄｌｏｃｋ＆Ｗｅｉｎｅｒ，Ｊ Ｌｅｕｋｏｃｙｔｅ Ｂｉｏｌ．Ｖｏｌ６８，２０００

ＤＮＡは、ワクチンとして成功してきた。ＤＮＡは、有機体のブループリント、すなわち、遺伝的命令として機能する二本鎖分子である。ＤＮＡは、極めて安定で未反応性のため、ワクチンとして用いるのに適しており、長期保存できる。しかしながら、ＤＮＡは、自己複製するため、紫外線により容易に損傷してしまう。

一方、ＲＮＡは、一本鎖で、ＤＮＡの命令を実行する機能を果たす。すなわち、ＲＮＡは遺伝子コードを移して、タンパク質を形成する。ＲＮＡは、ＤＮＡより反応性があり、安定性は低いが、紫外線に対して抵抗力がある。結局、ＲＮＡの品質がワクチンとして用いるのに好適なものとさせている。一般に、ｍＲＮＡは、宿主染色体と一体化する恐れはない。ｍＲＮＡのデリバリーの結果、該当抗原のより早い発現となり、発現のために必要な複製は少なくて済む。ｍＲＮＡ発現は、一過性であるので欠点のようであるが、実際には、安全につながる。ｍＲＮＡは、分裂終了および非分裂細胞におけるタンパク質製造についてはＤＮＡより有効である。というのは、ＤＮＡは、核膜およびプラスミド膜を通した転座を必要とするが、ｍＲＮＡは、プラスミド膜を通した転座を必要とするだけであるからである。ｍＲＮＡは、翻訳の鋳型が必要なだけでなく、Ｔｏｌｌ様受容体のリガンドとしても作用し、ヌクレアーゼ感受性もあるため、水平伝播に関する懸念が少ない。

本発明は、免疫原性細菌タンパク質をコードするリボ核酸メッセージ（ｍＲＮＡ）（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１）の使用に基づく。メッセージは、数多くの技術のいずれかを用いて、細胞質へデリバリーされる。ｍＲＮＡが細胞質に届くと、既に実施されている細胞機構を用いて、コード化タンパク質へトランスレートされる。ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のアミノ酸配列を有するＭ様タンパク質のような細菌タンパク質は、細胞中で発現して、癌細胞に免疫原性を与える。例えば、Ｍ様タンパク質は、細菌源である、Ａ群およびＧ群連鎖球菌（ＧＡＳおよびＧＧＳ）由来であるため、哺乳類の体にとっては異物とみなされる。抗原提示細胞（ＡＰＣ）のような免疫監視細胞は、異種タンパク質に引きつけられれる。ＡＰＣは、全癌細胞を食菌し、Ｍ様タンパク質を含む異種／ミュータントタンパク質を他の免疫細胞に与える。

細胞中での細菌タンパク質の製造は、対応の遺伝コードの挿入によりなされる。Ｍ様タンパク質の遺伝子は、ｅｍｍＬと呼ばれる。ｅｍｍＬメッセージが、細胞のＤＮＡにおける突然変異により製造された異常タンパク質を含む癌細胞へデリバリーされると、Ｍ様タンパク質は細胞中で発現し、免疫細胞を引き付けて取り込み、マスキングしておいた突然変異タンパク質を免疫系に与える。異常タンパク質は、長い時間、存在することになるが、「自己」タンパク質由来であるため、体は必ずしも異物または脅威とみなさない。細菌タンパク質抗原は、免疫系のプライマーまたはトリガーとして作用して、前は、損傷して有害と認識できなかった細胞に対応する。

ｍＲＮＡは、実施例に記載したとおりにして製造される。製造されると、免疫原性メッセージを含むｍＲＮＡは、上述したプライミング効果を必要とする自家または同種細胞へデリバリーされる。ｍＲＮＡはまた、腫瘍内に、またはリンパ腫等の癌の場合には、リンパ節内にも直接デリバリーされる。

ｅｍｍＬ遺伝子によりコードされたＭ様タンパク質は、ＤＮＡを通して細胞へデリバリーされてきたが、細胞中で発現して、免疫学的効果が得られることが示された。染色体への遺伝子挿入の可能性をはじめとするＤＮＡデリバリーに係る懸念から、ＲＮＡを介したメッセージのデリバリーは、宿主ＤＮＡへ挿入されないため、より安全な代替手段である。宿主ＤＮＡへ挿入するというＤＮＡのこの能力は、外因性ＤＮＡ挿入が有害となり得る医療用途に特に関与する。ＤＮＡ発現に比べ、ｍＲＮＡ発現は、細胞内側で、僅か数時間から最大で数日しか続かない。細胞にデリバリーされないｍＲＮＡは、環境に存在するリボヌクレアーゼによりすぐに分解されるため、水平伝播の恐れがない。ｅｍｍＬ ｍＲＮＡが、癌細胞に上手くトランスフェクトされると、癌細胞中およびその表面で免疫原性細菌タンパク質を発現でき、免疫原性応答が誘発される。

Ｍ様タンパク質のｍＲＮＡ製造のために設計された組み換えプラスミドの骨格に用いるプラスミドを示す図である。 図１の直鎖状ベクターへ結合されるｅｍｍＬ遺伝子のための源として用いるプラスミドＤＮＡを示す図である。 固形癌で行われるｍＲＮＡ検査をまとめたものである。 固形癌で行われるｍＲＮＡ検査をまとめたものである。 ｍＲＮＡとＤＮＡ間での細胞製造経路の違いを示す図である。 細菌性抗原をコードするｍＲＮＡを製造する組み換えＤＮＡベクターの作製を示す図である。 抗Ｍ様抗体に対する単離Ｅｍｍ５５のウェスタンブロットである。 ＤＮＡおよびＲＮＡトランスフェクション（導入）からのタンパク質発現結果の比較を示す図である。 フラッシュゲルシステムを用いた合成Ｅｍｍ５５ ｍＲＮＡのアガロースゲルの写真である。 ｅｍｍＬ ｍＲＮＡまたは水（対照）（Ｃ２）のワクチン接種を受けたマウスの１、２、３および４週間後のＥｍｍＬタンパク質に反応する抗体を示すグラフである。 ｅｍｍＬ ｍＲＮＡのワクチン接種前後の、ＥｍｍＬタンパク質と反応する、マウス血液中の抗体の存在を示すウェスタンブロットである。

本発明は、以前用いられていたワクチンよりも少ない費用で効率的に調製できる癌ワクチンを提供するものであり、これは、プラスミドＤＮＡを細胞の核に直接導入することにより調製される。細胞質に挿入されたｅｍｍＬをコードするｍＲＮＡ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１）を用いると、腫瘍細胞に導入するのにより効果的である。

ｍＲＮＡは、癌細胞に、抗原タンパク質メッセージをデリバリーすることができる。ｍＲＮＡは、宿主ＤＮＡに挿入されないことから、より安全な代替手段であるばかりでなく、発現が僅か数時間から最大でも数日に限られている。ｍＲＮＡデリバリーは、また、抗原メッセージを細胞タンパク質製造プロセスにおくため、細胞中における発現がさらに早くなる。ｍＲＮＡは、細胞質にデリバリーしさえすればよいが、ＤＮＡは、最終的に、核を有効なものにしなければならない。ｍＲＮＡは、分裂終了細胞と非分裂細胞の両方においてタンパク質製造を誘発可能であるため、ｍＲＮＡは、タンパク質抗原製造に役立つ。

抗原タンパク質のｍＲＮＡデリバリーは、ＤＮＡデリバリーのより安全な代替手段であるが、ｍＲＮＡの安定性および免疫原性については対処しなければならない。安定性および免疫原性の増大を促す元素の多くは、組み換えベクター鋳型に組み込まれる。適切な元素がベクターに含まれていない場合には、加えることができる。例えば、鋳型ベクターが、ポリアデニル化（ポリＡ）テールコード配列を含んでいない場合には、転写中にテールに加える。

細胞質の安定性を増大するには、ｍＲＮＡは、５'−メチルグアノジンキャップと３'−ポリＡテールの両方を含んでいなければならない（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３）。これらの元素には、ｍＲＮＡをタンパク質に翻訳する役割の細胞機構の成分を引き付けそれに付加する役割がある。これらの成分がないと、分解の前に、ｍＲＮＡをタンパク質の翻訳に利用できる時間が減じてしまう。従って、これらの元素は、実施例に記載したとおり、ｍＲＮＡに組み込んでおく。

効率的な免疫原性は、ウイルスベクター、ナノ粒子、カチオンポリマー、リピドおよびエレクトロポレーションによるデリバリーの増進といった技術を利用することにより増大させることができる。ウイルスベクターは、プラスミドＤＮＡ（ｐＤＮＡ）のデリバリーに広く利用されてきたが、いくつかリスクもあり、コストも増大する。ｍＲＮＡによるエレクトロポレーションは、電気的な設定がそれほど厳しくないため、毒性が低く、ｍＲＮＡのデリバリーには好ましい方法である。ＤＮＡを、外側細胞膜および核膜に通過させるには、ＤＮＡは、より高い電荷を必要とするが、ｍＲＮＡに必要なのは、外側細胞膜のみの通過である。

ワクチン用ｍＲＮＡの製造は、ｐＤＮＡに比べて、経済的かつ製造上の利点がある。ｍＲＮＡは、直鎖状ｐＤＮＡ鋳型からインビトロで合成され、僅かの量のＤＮＡしか必要としない。一方、大量のｐＤＮＡの製造は、労働集約型であり、ワクチン製造に必要な大量のｐＤＮＡを製造するために十分な細菌を成長させるには大きな発酵タンク等の機器を必要とする。大きな培地から単離したｐＤＮＡは純度が高いが、プラスミドの環状の性質のために、最終生成物は、弛緩、直鎖状および超らせん、の３つの構造形態で生じる。各形態は、細胞内部だと抗原タンパク質を製造する能力を持つが、各ＤＮＡ形態は、形質膜を介して細胞に入る能力に関して異なる。ｍＲＮＡの製造では、１つの構造形態しか形成されない。さらに、合成製造方法により、バッチ毎の再現性が高い。

製造の観点から、ｍＲＮＡはＤＮＡから合成され、再現性が高い。大規模成長は必要でないことから、ワクチンとして用いるのにこれは重要なことである。すなわち、時間も材料も少なくて済み、コンタミネーションのリスクも少ない。これらの因子はコストを削減するのに寄与する。さらに、１００個のｍＲＮＡ分子を得るのに１つの直鎖状プラスミドＤＮＡしか使わないため、ｍＲＮＡの合成は、高収率となる。ｍＲＮＡは、インビトロで製造され、単離後大腸菌コンタミネーション（ゲノムＤＮＡまたはエンドトキシン）はない。これにより、精製ステップや品質管理試験が少なくて済む。また、インビトロでの転写の合成の性質により、バッチ毎の再現性とより純粋な生成物が確保される。選択マーカーを含むベクター配列が最終生成物の一部ではないからである。また、ＤＮＡとは対照的に、ｍＲＮＡは、単一分子コンフォメーションを有し、プラスミドＤＮＡは３つである。ｍＲＮＡはまた、プラスミドＤＮＡより容易に導入し、必要な電圧が低いため、エレクトロポレーション中の細胞死が少ない。ＤＮＡ同様、ｍＲＮＡもまた凍結乾燥可能である。規制の観点から、ｍＲＮＡは、複製されず、一過性であるため、より安全である。ｍＲＮＡはまた、容易に分解され、抗生物質耐性がないため、環境問題も最小である。

以下の比較は、癌細胞への抗原ｅｍｍＬメッセージデリバリーについて、ＤＮＡの代わりにｍＲＮＡを用いた利点を示すものである。比較は、上流製造、下流製造、および細胞デリバリーの３つのパートに分かれている。製造コストの減少、製造時間の減少、優れたメッセージデリバリー、および安全性の増大をはじめとする利点の大半が、上流製造と細胞デリバリーで見られる。各セクションで、ＤＮＡとｍＲＮＡプロセス間、そして各プロセスの同様の工程間において、大きな差が示されている。

上流製造：両方の核酸生成物の上流製造は、細胞培養増殖まではほぼ同じである。約１００倍の量のｍＲＮＡを生成するのに、少量のＤＮＡしか必要ない。例えば、インビトロ転写実験では、僅か０．２μｇのＤＮＡから２５μｇのｍＲＮＡが得られた。これは、同量の培養によって生成されたＤＮＡの２５倍のｍＲＮＡである。培養増殖は、非常に費用と時間がかかり、コンタミネーションやＤＮＡの突然変異のリスクも増す。

小さな細菌培養で成長させることの利点は大きい。この培養による少量のＤＮＡの単離は小規模で済む。この小規模化によって、時間と資源を節約し、コンタミネーションのリスクも減じる。最終ｍＲＮＡ生成物の製造には、ＤＮＡ鋳型からのｍＲＮＡの転写の追加の工程を必要とする。これは、インビトロで行われる合成工程である。転写の合成の性質により、バッチ毎の再現性が良好で、その手順も僅か数時間しかかからない。ＤＮＡ含有細菌の培養には数日必要である。

ｍＲＮＡでなくｐＤＮＡを用いる大きな欠点は、最終生成物が、ゲノムＤＮＡ（ｇＤＮＡ）で汚染される可能性があることである。また、単離されたｐＤＮＡは、直鎖状、超らせん、環状の３つの形態を形成し、同じ効率で細胞に導入されない。ｍＲＮＡ最終生成物は、純粋な、単一の立体構造であり、ｇＤＮＡまたはｐＤＮＡにより汚染されない。

チャート１ ＤＮＡとｍＲＮＡ製造に用いる工程の比較

下流製造（自家調製）：
下流製造の大半は、ＤＮＡとｍＲＮＡについて同じである。１つの違いはエレクトロポレーション工程にある。ｍＲＮＡは、核膜は通過せず、形質膜を通過するだけであるため、必要な電圧は低めであるが、ＤＮＡは、これとは異なり、形質膜と核膜の両方を通過しなければならない。エレクトロポレーション中、細胞死が少なくなるため、低めの電圧だと好ましい。ｍＲＮＡ導入細胞の増大した生存能力によって、適切な比率のＭ様タンパク質を発現するワクチン細胞へと容易に翻訳される。

チャート２ 導入された細胞でのワクチン調製により腫瘍組織中でのＤＮＡおよびｍＲＮＡの処理の比較

細胞デリバリー：
ｍＲＮＡデリバリーを用いる大きな利点を、以下の細胞デリバリーフローチャートに示す。表に示す通り、細胞へのｍＲＮＡデリバリーは、抗原Ｍ様タンパク質への即時翻訳にスキップされる。導入されたＤＮＡが、さらに細胞膜を通過しなければならないばかりでなく、ｍＲＮＡワクチンにより開始されるタンパク質合成の出発点であるサイトゾルへ戻るデリバリーのために、ｍＲＮＡへ転写されなければならない。

ｍＲＮＡワクチンは、所望の効果に応じて、適合性免疫学的アジュバントまたはリプレッサーと結合させることができる。免疫賦活分子の混じり合ったＴｒｉＭｉｘのようなアジュバントを、コード化免疫原に対する増大した免疫応答を引き出すｍＲＮＡベースワクチンに追加することができる。免疫原リプレッサーは、十分な免疫応答を得るための身体の能力の妨げとなる他の元素の免疫抑制酵素と対抗するのに有用である。免疫抑制元素は、免疫付与中に同時デリバリーできるサイレンシングＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）を用いてサイレンシングすることができる。ｍＲＮＡベースの癌ワクチンと共に投与できるさらなるタイプの免疫リプレッサーは、チェックポイント阻害剤である。これらは、概して、ブロックされないままだと、免疫抑制を誘発する、腫瘍細胞または免疫活性細胞に存在する受容体に結合する抗ＰＤ１および抗ＣＴＬＡ４等の抗体からなる。このプロセスは、「ブレーキ外し」と呼ばれ、この「ブレーキ」外しによって、ｍＲＮＡ癌ワクチン等の免疫療法がなされて、免疫系の癌細胞の攻撃がさらに後押しされるということである。

ワクチンは、ＲＮＡワクチン投与前または同時に、チェックポイント阻害治療ばかりでなく、化学療法、放射線治療、全細胞ワクチン、他の核酸を用いた治療、ナチュラルキラー細胞治療またはキメラ抗原受容体治療と併用して用いることができる。

他の場合、癌患者は、これらに限られるものではないが、ワクチン投与前または同時に、サイトカイン治療、抗fugetaxis(遊走運動)剤、走化性剤治療および化学物質のメトロノミック投与をはじめとする腫瘍微小環境を変える投薬計画により治療される。

チャート３ 細胞内移行から翻訳までのセル中のＤＮＡとｍＲＮＡ処理の比較

以下の実施例は、本発明を例証するものであって、限定するものではない。

実施例１
犬リンパ腫の自家ｍＲＮＡワクチン
７５ポンドのオス去勢済みローデシアン・リッジバックは、獣医に、腫れた下顎と鼠蹊部リンパ節の診察を受けた。患畜の肥大化した節の１つに微細針吸引が行われた。病理医の所見によれば、低悪性びまん性リンパ腫であった。

患畜の飼い主は、免疫療法は副作用が最小であると報告されているため、化学療法やステロイドではなく免疫療法を行うことを選択した。獣医は、患畜に全身麻酔を行って、右下顎リンパ節を切除した。組織試料を研究所での処理のため翌日発送した。

組織試料を受け取った研究所では次のことを実施した。１）送られた媒質が細菌に汚染されていないか検査した。２）組織寸法を測った。３）無傷のリンパ節を、水媒質ボーラスで繰り返し吸引し、腫瘍細胞を放出させた。４）吸引された細胞を集めて数えた。

適正量の細胞は、ｅｍｍＬをコードするｍＲＮＡによるエレクトロポレーションに利用可能である。ＢｉｏＲａｄ遺伝子パルサーマシーンを用いて、１２０ｘ１０^６個の細胞を８０μｇのｍＲＮＡを導入した。少量の導入された細胞を凍結保存し、残りを、約２４時間培養した。２４時間後、細胞を照射し、１０ｘ１０^６個の細胞ワクチン用量に分け、必要になるまで凍結保存した。

患畜は、計８回分ワクチン用量投与された。各用量を、翌日、予定投与日に届くよう、研究所から獣医クリニックに発送した。獣医は、各用量を注射器により投与した。８ワクチン用量を、４週間は７日（＋／−１日）、４か月間は月１で与えた。1回目の用量の前に血液試料を採取した。５回目のワクチン、８回目のワクチン、最後のワクチンから８週間の前にも血液試料を採取した。血液試料は、末梢血および血漿を処理して、研究所で保管した。抗腫瘍免疫応答の評価のために後に用いた。

治療中、患畜の全体的な生活の質と共にリンパ節サイズを観察した。全体的な疾病の状態は、腫瘍負荷の減少および抗腫瘍免疫応答により評価した。腫瘍負荷は、治療中、各リンパ節に行った測定により評価した。抗腫瘍免疫応答は、抗体レベルを評価する標準酵素結合免疫吸着法（ＥＬＩＳＡ）および細胞障害性Ｔ細胞（ＣＴＬ）応答を評価するフローサイトメトリーを用いて測定した。

治療中、患畜のリンパ節サイズは増加したが、継続により後に減少した。これは、恐らく、免疫細胞の腫瘍部位、このケースでは、リンパ節への湿潤によるものである。ＥＬＩＳＡおよびフローサイトメトリーの結果は、４回目のワクチン後の抗体の生成およびＣＴＬの増加を示し、一連のワクチン完了後も持続する。

実施例２ 馬黒色腫のダイレクトｍＲＮＡワクチン
１５歳アンダルシアンは、獣医に、首、たてがみ、肛門周囲の黒病変の診察を受けた。穿刺吸引の所見によれば、病理医は患畜を黒色腫と診断した。飼い主は、患畜の肛門周囲病変の複雑性から、免疫療法を行うことを選択した。

１００μＬ無菌ヌクレアーゼフリーＨ_２Ｏ中１００μｇのｍＲＮＡを含有する３回分ワクチン用量が投与された。３回分用量および３本無針注射（Ｊ−Ｔｉｐ）が獣医に発送された。治療コースを受ける患畜の３か所の病変のを選択し、時点あたり計３００μｇのｍＲＮＡであった。２週間毎に、前回と同じ３回分用量を獣医クリニックに発送し、各用量を、Ｊ−Ｔｉｐ注射を使って同じ３つの病変に投与した。患畜は、病変につき合計で６ワクチン用量を付与された。

ワクチンシリーズ開始前、５回目のワクチン用量前、シリーズ完了後２週間で、血液試料を集めた。血液試料の末梢血および血漿を処理した。抗腫瘍免疫応答の評価のために後に用いた。

全体的な疾病の状態を、腫瘍負荷の減少および抗腫瘍免疫応答により評価した。腫瘍負荷は、各６回分ワクチン用量を投与する前、病変に行った測定により評価した。抗腫瘍免疫応答は、抗体レベルを評価するＥＬＩＳＡおよびＣＴＬ応答を評価するフローサイトメトリーを用いて測定した。

免疫療法を行っている他の患畜にも見られるとおり、黒色腫病変のサイズは増加したが、継続により後に減少した。ＥＬＩＳＡおよびＦＡＣＳの結果は、２回目のワクチン後の抗体の生成およびＣＴＬの増加を示し、一連のワクチン完了後持続する。

実施例３ ｅｍｍＬ ｍＲＮＡ作製方法の概要
方法概要
ベクターおよびインサートの制限酵素消化
最良のｍＲＮＡ生成のために適切な組み換えプラスミドを作製するために、原核生物と真核生物の二重プロモータ、未３'および５'領域、および選択マーカを含むプラスミド骨格を用いた。この種のベクター、例えば、ｐＳＦＣＭＶＴ７は、Ｅｍｍ５５のような抗原Ｍ様タンパク質をコードするｍＲＮＡの生成および安定化を補助する多くの特徴を有する。ベクターｐＳＦＣＭＶＴ７とプラスミドｐＡｃ／ｅｍｍＬを含有するインサートの両方を、制限酵素ＳａｃＩおよびＥｃｏＲＶを用いて切断した。図１および２のプラスミドマップを参照のこと。

ゲル電気泳動によるＤＮＡ断片分離
制限分解を、適切な酵素により実施したら、ＤＮＡ断片をゲル電気泳動により単離した。参照ＤＮＡラダーを両消化反応でＤＮＡバンド長を評価することによって、当該バンドの識別の補助をする。ＤＮＡを含むバンドをゲルから抽出した。

ゲル抽出／ＤＮＡ単離
当該ＤＮＡを含むゲルスライスを溶解し、ベクターおよびインサートを連結すべくＤＮＡを抽出して、組み換えプラスミドｐＳＦＣＭＶＴ７／ｅｍｍＬを作製した。

ベクターおよびインサート連結
プラスミドを含有するベクターおよびインサートの制限酵素消化中、「粘着性末端」が形成され、後に連結によりつなぎあわさる。「粘着性末端」とは、相補的なヌクレオチドと水素結合可能な対になっていないヌクレオチドのことである。ベクターｐＳＦＣＭＶＴ７およびインサートｅｍｍＬは、同じ制限酵素で切断されるため、Ｔ４ ＤＮＡリガーゼに露出させると結合する相補的な末端を含んでいる。

細菌へのトランスフェクション
ｍＲＮＡ生成プラスミドｐＳＦＣＭＶＴ７／ｅｍｍＬを作製したら、適格な細菌へと形質転換、すなわち、導入し、それによって、単離後、インビトロｍＲＮＡ合成に用いられるだけの十分なＤＮＡを生成する。ＩｎｖｉｔｒｏｇｅｎのＳｔｂｌ３ 大腸菌は、トランスフェクションに用いることのできる細菌の一例である。形質転換は、細菌に熱衝撃を与え、細胞膜中の小さいオリフィスを開いて、プラスミドが細胞に、最終的に原子核に入れることにより、誘発された。

細菌培養の成長と増殖
プラスミドによりトランスフェクトされた細菌を、選択性抗生物質を含有する適切な成長媒質に配置した。ｐＳＦＣＭＶＴ７の場合は、カナマイシンである。細菌がプラスミドにより適正に形質転換されると、カナマイシンの抗菌性を妨害して、耐カナマイシン細菌を媒質で選択的に成長させるタンパク質が生成される。

プラスミド単離と精製
ｐＤＮＡを含有する適切な数の細菌が成長したら、細胞を溶解して、プラスミドを細胞内側から放出させた。ｐＤＮＡを、ろ過およびアニオン交換カラムにより、ｇＤＮＡ、タンパク質およびその他細胞残骸から単離した。

テンプレートＤＮＡの作製：プラスミドＤＮＡ線形化
単離したＤＮＡは、ｍＲＮＡ生成のためのテンプレートＤＮＡを含有している。転写反応を起こすために、プラスミドは線形化しなければならない。線形化は、当該オープンリーディングフレーム遺伝子から下流で生じることが重要である。

ｍＲＮＡ転写反応
テンプレート作製後、メッセージをインビトロ転写反応により作製する。この反応は、細胞中でのｍＲＮＡの転写をシミュレートするものであり、安定化増大のための５'末端のキャッピングおよびポリＡテールの付加が含まれる。

ｍＲＮＡ精製
メッセージがｍＲＮＡに転写されると、残留ＤＮＡ鋳型が分解し、純粋なｍＲＮＡ生成物を用いて、自己細胞、同種細胞または腫瘍内へ導入することができる。細胞内側で、ｍＲＮＡは、免疫活性化のために細胞表面にＭ様タンパク質を生成して示す。

ｍＲＮＡの癌細胞へのトランスフェクション
ｍＲＮＡを癌細胞にデリバーする１つの方法は、エレクトロポレーションの方法による。この方法は、弱い電流を利用して、細胞膜に小さな孔を空けて、ｍＲＮＡが膜を通って動いて、細胞質に入るものである。

実施例４ 制限酵素消化
表１に、ｐＤＮＡの即時消化の手順を示す。

実施例５ ゲル電気泳動によるＤＮＡ断片分離
表２に、ＤＮＡ断片分離のための手順を示す。

実施例６ ゲル抽出／ＤＮＡ単離
表３に、抽出およびＤＮＡ単離の手順を示す。

実施例７ ベクターおよびインサート連結
表４に、ベクターインサートおよび連結の手順を示す。

実施例８ ＤＮＡの大腸菌への形質転換
表５に大腸菌の形質転換のための手順を示す。

実施例９ 細菌培養の成長と増殖
表６に、細菌培養の成長と増殖のための手順を示す。

実施例１０ プラスミド単離と精製
表７に、プラスミド単離と精製のための手順を示す。

実施例１１ テンプレートＤＮＡの作製
表８に、テンプレートＤＮＡの精製とプラスミド線形化についての手順を示す。

実施例１２ ｍＲＮＡ転写
表９にｍＲＮＡ転写の手順を示す。

実施例１３ ｍＲＮＡ精製
表１０にｍＲＮＡの精製についての手順を示す。

実施例１４ ｍＲＮＡの癌細胞へのトランスフェクション

以下の表１１に、ｅｍｍＬ ｍＲＮＡの哺乳類の癌細胞へのトランスフェクションについての手順を示す。

実施例１５ ＤＮＡｐＳＦＣＭＶＴ７／ｅｍｍＬについてのクローニングステップ
図５に、細菌抗原をコードするｍＲＮＡを生成する組み換えＤＮＡベクターの作製についての手順を示す。

実施例１６ 抗体のＭ様タンパク質への直接結合
図６に示すウェスタンブロットは、抗Ｍ様タンパク質の、単離Ｍ様タンパク質、特に、Ｅｍｍ５５に対する特異性を示すものである。

タンパク質は、負荷緩衝液中、１３０ｍＭのβ−ＭＥを用いて、ＳＤＳ−ＰＡＧＥ （１０％）により分離した。試料を３分間１００℃で沸騰させ、１３，０００ｘｇで２分間、室温でスパンした。ブロット（左端）を、一次抗体（α−Ｍ様タンパク質）で、１．５時間、室温で、５％乳中でプローブした。一次抗体希釈度は１：５００であった。二次抗体（ヤギのα−マウスコンジュゲートＨＲＰ）は、１：５０００で希釈した。ゼロブロット（左から２番目）は、二次抗体の非特異性結合を示している。

化学発光法を用いて、ニトロセルロースブロット（露光：１０分）でタンパク質を可視化した。

実施例１７ ＤＮＡに比較して、ｍＲＮＡで見られる発現の増大を示す蛍光顕微鏡画像およびチャート。結果を、ＲＮＡおよびＤＮＡを、哺乳類細胞に導入し、タンパク質発現について分析した実験から比較した。結果によれば、等価の導入量のＲＮＡは、発現量が５倍になったことが分かる（図７参照）。

実施例１８ 合成ｅｍｍＬ ｍＲＮＡ、テール無し、有り
図８に示す変性アガロースゲルを作製するのに用いた手順により、Ｌｏｎｚａ ＦｌａｓｈＧｅｌシステムを用いて、合成ｅｍｍＬ ｍＲＮＡ、特に、Ｅｍｍ５５ ｍＲＮＡの可視化を示す。

２０ｎｇの試料および１００ｎｇのラダーを、全量を２．５μＬの容積に、ＤＥＰＣ処理済み水を用いて希釈することにより調製した。等量のホルムアルデヒド試料緩衝液を各試料に加えた。試料を混合し、６５℃で１５分間培養した後、氷で１分間培養した。試料を１．２％ＲＮＡゲルカセットに充填し、２２５ボルトで８分間実行した。ゲルを室温で１０分間培養し、ＦｌａｓｈＧｅｌカメラを用いて視覚化した。ｍＲＮＡのサイズをＲＮＡ Ｍｉｌｌｅｎｎｉｕｍ Ｍａｒｋｅｒにより求めた。

実施例１９
チャート４は、ＲＮＡ（ｅｍｍＬ ｍＲＮＡ）およびＤＮＡ（ｐＳＦ／ｅｍｍＬ）を哺乳類の細胞に導入し、α−Ｍ様タンパク質により着色し、フローサイトメトリー分析を用いて分析した実験の結果を示すものである。結果によれば、ＲＮＡ導入細胞が、ＤＮＡ導入細胞と同等の信号、すなわち、９％を生成したことが分かる。

実施例２０
ｅｍｍＬ ｍＲＮＡ（処置）または滅菌水（対照）でワクチン接種したマウスの血液試料について、ｅｍｍＬタンパク質と反応する抗体が存在するか試験した。図９に示すように、対照マウス（Ｃ２）の血液試料は、α-Ｍ様タンパク質抗体を含んでいなかったが、処置マウス（Ｔ２）の試料は僅かな上昇を示した。

実施例２１
チャート５は、黒色腫瘍細胞を移植した後、ｅｍｍＬ ｍＲＮＡ（処置）または滅菌水（対照）を注射したマウスの実験結果を示す。注射は腫瘍移植後１０日に始めた。処置か対照のいずれかの注射を３回、７日毎に行った。注射２回目の後、実験した５匹のマウスは全て生存していた。この時、３匹の処置マウスのうち２匹は、対照マウスより腫瘍が小さかった。注射３回目の後、５匹のマウスのうち３匹は生存しており、この時点で残り２匹の処理マウスは、残りの対照マウスの腫瘍より小さかった。

実施例２２
図１０に、ｅｍｍＬ ｍＲＮＡによるワクチン接種前後のマウスの血液試料における、ｅｍｍＬタンパク質と反応する抗体の存在について実験の結果を示す。ウェスタンブロットの画像によれば、ワクチン接種後の血液試料は、ワクチン接種前試料よりも抗体への結合が増大していることが分かる。

Claims (22)

1. ＥｍｍＬのような免疫原性細菌ポリペプチドをコードするリボ核酸の使用であって、
   腫瘍細胞に導入し、前記ポリペプチドを発現させる、
   リボ核酸の使用。
2. ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１またはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３の配列を含む
   リボ核酸。
3. 腫瘍細胞に導入したとき、前記腫瘍細胞において免疫原性ポリペプチドを発現するＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１またはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３の配列を有する核酸を含む、
   薬学的に許容可能に賦形されたワクチン組成物。
4. 癌患者の腫瘍または腫瘍潅流リンパ節に直接導入したとき、免疫原性効果を誘発し、腫瘍細胞をインビボで形質転換させる、
   請求項３に記載のワクチン組成物の使用。
5. 化学療法、放射線治療、チェックポイント阻害剤治療、全細胞ワクチン、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１および／またはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３以外の配列を用いた核酸治療、ナチュラルキラー細胞治療またはキメラ抗原受容体治療を用いることにより、前記ワクチン組成物の投与前または投与と同時に前記癌患者を治療する、
   請求項３に記載のワクチン組成物の使用。
6. サイトカイン治療、抗fugetaxis(遊走運動)剤治療、走化性剤治療および腫瘍微小環境を変える化学物質のメトロノミック投与治療のような、治療における前記ワクチン投与前または同時に、前記癌患者を治療する、
   請求項３〜５のいずれかに記載のワクチン組成物の使用。
7. ＩＬ−２、ＩＬ−１２、ＩＬ−１８およびＭＨＣから選択される免疫性分子を発現する核酸を含むさらなる治療により、前記癌患者を治療する、
   請求項３〜６のいずれかに記載のワクチン組成物の使用。
8. 前記腫瘍が、癌腫、肉腫、骨髄腫、リンパ腫、白血病またはこれらの混在したものである
   請求項３〜７のいずれかに記載の使用。
9. 腫瘍または腫瘍潅流リンパ節への導入が、針または無針注射による
   請求項３〜８のいずれかの使用。
10. 腫瘍細胞において免疫原性ポリペプチドを発現するＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１またはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３の配列を有する核酸でインビトロで形質転換した腫瘍細胞と、を含む、
    薬学的に許容可能に賦形された中のワクチン組成物。
11. 前記腫瘍細胞が、癌腫、肉腫、骨髄腫、リンパ腫、白血病またはこれらの混在したものに限られるものではないが、これらを含む２つ以上の異なる癌からのものである、
    請求項１０に記載のワクチン組成物。
12. 癌患者に直接導入したとき、免疫原性効果を誘発するための、
    請求項１０〜１１のいずれかに記載のワクチン組成物の使用。
13. 前記腫瘍細胞が、癌腫、肉腫、骨髄腫、リンパ腫、白血病またはこれらの混在したものから選択される同じ、または異なる癌細胞株からのものである、
    請求項１０〜１１、１２のいずれかに記載のワクチン組成物。
14. 前記ワクチン組成物により、１種類以上の癌を持つ癌患者を治療するための、
    請求項１０または１３に記載のワクチン組成物の使用。
15. 癌患者を、皮内、皮下、静脈またはリンパ節内投与により治療するための、
    請求項１０〜１４のいずれかに記載のワクチン組成物の使用。
16. 化学療法、放射線治療、チェックポイント阻害剤治療、全細胞ワクチン、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１および／またはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３以外の配列を用いた治療、ナチュラルキラー細胞治療を用いることにより、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１またはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３の配列を有する核酸の投与前または投与と同時に前記癌患者を治療する、
    請求項１０〜１５のいずれかの使用。
17. サイトカイン治療、抗fugetxis剤治療、走化性剤治療および化学物質のメトロノミック投与治療のような、腫瘍微小環境を変える治療により、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１またはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３の配列を有する核酸の投与前または投与と同時に前記癌患者を治療する、請求項１０〜１６のいずれかの使用。
18. 前記腫瘍細胞が、ＩＬ−２、ＩＬ−１２、ＩＬ−１８およびＭＨＣから選択される１つ以上の免疫性分子をコードする核酸によりさらに形質転換される、
    請求項１０〜１１に記載のワクチン組成物の使用。
19. 請求項１０または１１〜１３のいずれかに記載のワクチン組成物を、腫瘍または腫瘍潅流リンパ節に導入するための、
    無針注射の使用。
20. ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のアミノ酸配列を有する
    免疫原性ポリペプチド。
21. 前記ポリペプチドが、腫瘍細胞により発現し、免疫応答を引き起こす、
    請求項２０に記載のポリペプチド。
22. 人間、犬、猫または馬のような哺乳類の患者（患畜）を治療するための、
    請求項１〜２１のいずれかの使用。