JP2018518991A5 - - Google Patents
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Description
また、多くの異なるペプチドを合成してペプチドライブラリを構成することもできる。どのペプチドが好ましい候補医薬になるかを予測する良い方法はないから、アミノ酸の全てのあり得る組み合わせを含む完全なペプチドライブラリを構成するように希望し、ペプチドの選別期間において好ましい候補医薬を見出す可能性が高い。天然に存在するアミノ酸は２０個あるため、完全なトリペプチドライブラリを構成するためには８，０００個のトリペプチドを合成する必要がある。同様に、完全なテトラペプチドライブラリを構成するために１６０，０００個のテトラペプチドを合成する必要があり、完全なペンタペプチドライブラリを構成するために３，２００，０００個のペンタペプチドを合成する必要があり、完全なヘキサペプチドライブラリを構成するために６４，０００，０００個のヘキサペプチドを合成する必要がある。また、多くのペプチドを合成する高コストと低スループットのため、完全なヘプタペプチド又はヘキサペプチドライブラリはもとより、１６０，０００個のテトラペプチドを含むべきである完全なテトラペプチドライブラリも今、市場には取得できない。
本発明のもう一つの目的は、単一の発現されたペプチドから多くのペプチドを表示するための方法、ライブラリの容量を顕著に増加する方法を提供することにある。例えば、合理的な設計によって、５０個のアミノ酸が発現されるペプチドは実際に、４７個の異なる連続のテトラペプチド、４６個の異なる連続のペンタペプチド、４５個の異なる連続のヘキサペプチド、４４個の異なる連続のヘプタペプチド、…、３個の異なる連続の４８−ｍｅｒペプチド、２個の異なる連続の４９−ｍｅｒペプチド、及び１個の５０−ｍｅｒペプチドを含み、サイズ範囲が４〜５０個のアミノ酸である４０８個のペプチドを構成することができる。
本発明のもう一つの目的は、完全なペンタペプチドライブラリを構成するための方法を提供することにある。合理的な設計によって、５０個アミノ酸が発現されたペプチドは実際に、４６個の異なる連続のペンタペプチドを含むことができ、このタンパク質表示方法によって、完全なペンタペプチドライブラリを構成するように、３，２００，０００個の合成ペンタペプチドの代わりに６９，５６６個の発現された５０−ｍｅｒペプチドだけが必要である。
図２に示す実施形態によると、５０個のアミノ酸が発現されたペプチドは実際に、４７個の異なる連続のテトラペプチド、４６個の異なる連続のペンタペプチド、４５個の異なる連続のヘキサペプチド、４４個の異なる連続のヘプタペプチド、・・・、３個の異なる連続の４８−ｍｅｒペプチド、２個の異なる連続の４９−ｍｅｒペプチド、及び１個の５０−ｍｅｒペプチドを含み、サイズ範囲が４〜５０個のアミノ酸である４０８個のペプチドを構成することができる。
前記実施形態において、業者にとって明らかになるのは、３，２００，０００個のペンタペプチドの化学的合成の代わりに、６９，６６５個の発現された５０−ｍｅｒペプチドは、完全なペンタペプチドライブラリを構成できる。
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