JP2018132471A - 非アルコール性脂肪性肝炎検出方法、該肝炎の重篤度判定方法及び該肝炎の治療評価判定方法 - Google Patents
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Abstract
Description
慢性肝疾患では、肝内炎症と肝細胞障害が持続し、それに伴い肝線維化が進展し、終末状態では肝硬変に至る(参照:非特許文献1)。肝硬変では、門脈圧亢進症による食道静脈瘤破裂など様々な重篤な合併症発症、さらに肝不全へ進行する。また、肝硬変は肝細胞癌発生の高危険状態である。これらのため、肝硬変では、生活の質の著しい低下、予後の悪化が大きな問題である。慢性肝疾患には、B型、C型ウイルス肝炎、アルコール性肝障害、非アルコール性脂肪性肝炎、自己免疫性肝炎、原発性胆汁性胆管炎等がある。
非アルコール性脂肪性肝疾患 (NAFLD:non alcoholic fatty liver disease) は、アルコールの飲酒歴がないにも関わらず、アルコール性肝炎類似の大滴性の脂肪沈着を呈する疾患である。該疾患には、肝炎を伴わない単純性脂肪肝(SS:simple steatosis)と、炎症や肝細胞障害を伴い肝硬変へ進展する非アルコール性脂肪性肝炎(NASH:non alcoholic steatohepatitis) が含まれる。肥満・脂質異常症・糖尿病などの生活習慣病がNASHの病態に関与していることが示唆されている。
近年、生活習慣病増加に伴い慢性肝疾患に占めるNASHの割合が増加している。現在のところNASHの発症、病態進展の機序が明らかにされておらず、NASH発症予防、NASHから肝硬変への進展の抑制や、肝発癌を抑制する確立した予防・治療法はない。
以下の先行技術が知られている。
特許文献1では、「被験者の生体試料における、sCD40、HMGB1、sPLA2groupIIA及びsPLA2活性からなる群より選ばれる1以上の因子をマーカーとして測定する工程を含む、非アルコール性脂肪肝炎の検出を補助するための方法」を開示している。しかし、特許文献1に記載の非アルコール性脂肪性肝炎関連マーカーは、本発明で使用するマーカーとは異なり、さらに非アルコール性脂肪性肝炎と単純性脂肪肝ではない健常者との比較により得られたものである。
そこで、本発明者らは、非アルコール性脂肪性肝疾患が肝炎を伴わない単純性脂肪肝ではなく、炎症や肝細胞障害を伴い肝硬変へ進展する非アルコール性脂肪性肝炎であるかどうかを判定する方法、さらには該肝炎に進行するかを予測するための方法を開発することを目的とした。
1.被験者から得られた生体試料中の以下の(1)〜(51)のいずれか1以上から選ばれたマーカーを測定する工程を含む、非アルコール性脂肪性肝炎の検出方法又は検出を補助する方法、
(1)T細胞サブセット分泌シグナルに関与する遺伝子、
(2)Native CD4+ T細胞分化に関与する遺伝子、
(3)G-proteinsignaling_Cross-talk between Ras-family GTPasesに関与する遺伝子、
(4)関節炎におけるサイト/ケモカイン発現におけるPDE4調節に関与する遺伝子、
(5)Th17、Th22及びTh9細胞分化に関与する遺伝子、
(6)酸化的リン酸化に関与する遺伝子、
(7)加齢黄斑変性におけるNALP3インフラマソーム活性に関与する遺伝子、
(8)SLEにおけるB細胞の役割に関与する遺伝子、
(9)IL-10シグナルパスウェイに関与する遺伝子、
(10)COPDにおける細胞間関連に関与する遺伝子、
(11)Tヘルパー細胞の免疫反応ICOSシグナルパスウェイに関与する遺伝子、
(12)アテローム性動脈硬化症に関与する遺伝子の発現の制御におけるZNF202の役割に関与する遺伝子、
(13)上皮間葉転換(EMT)の発生制御に関与する遺伝子、
(14)SLEにおけるNETosisに関与する遺伝子、
(15)IL-1シグナルパスウェイに関与する遺伝子、
(16)ストレス誘導抗ウイルス性細胞反応におけるPKRの役割に関与する遺伝子、
(17)抗原提示細胞(APC)のSLE遺伝マーカー特異的パスウェイに関与する遺伝子、
(18)脂質代謝の制御{脂肪代謝のG-アルファ(q)制御}に関与する遺伝子、
(19)RNAウイルス感染への先天性免疫反応に関与する遺伝子、
(20)CD8+ T細胞の分化及びクローン増殖に関与する遺伝子、
(21)ストレス誘導アポトーシスにおけるPKRのアポトーシス及び生存の役割に関与する遺伝子、
(22)MAPKsを介した炎症誘発性サイトカインのP物質刺激発現に関与する遺伝子、
(23)IL-33シグナルパスウェイに関与する遺伝子、
(24)ユビキノン代謝に関与する遺伝子、
(25)MIF媒介性グルココルチコイド制御に関与する遺伝子、
(26)加齢黄斑変性の病因における脂質輸送異常及び代謝異常に関与する遺伝子、
(27)IL-18シグナル伝達に関与する遺伝子、
(28)HGFシグナルパスウェイに関与する遺伝子、
(29)Th17細胞分化に関与する遺伝子、
(30)肝細胞におけるIL-6誘導性急性期応答に関与する遺伝子、
(31)IL-23シグナルパスウェイに関与する遺伝子、
(32)慢性関節リウマチに関与する遺伝子、
(33)炎症性皮膚疾患における細胞/ケモカイン発現のPDE4制御に関与する遺伝子、
(34)鎌状赤血球症における物質P媒介性炎症及び疼痛に関与する遺伝子、
(35)樹状細胞成熟及び移動におけるHMGB1の役割に関与する遺伝子、
(36)HMGB1/RAGEシグナルパスウェイに関与する遺伝子、
(37)転写サイレンシングにおけるヘテロクロマチンタンパク質1(HP1)ファミリーの役割に関与する遺伝子、
(38)HSP60及びHSP70/TLRシグナルパスウェイに関与する遺伝子、
(39)CF中のTh17細胞に関与する遺伝子、
(40)乾癬IL-23/T17発症軸の役割に関与する遺伝子、
(41)タイプ2免疫におけるIL-4応答性遺伝子に関与する遺伝子、
(42)脂肪細胞分化におけるフタル酸ジエチルヘキシル及びトリブチルスズの役割に関与する遺伝子、
(43)アレルギー性接触皮膚炎のT細胞動員の開始に関与する遺伝子、
(44)結腸直腸癌に関与する遺伝子、
(45)C5a誘導走化性に関与する遺伝子、
(46)緑内障における網膜神経節細胞損傷に関与する遺伝子、
(47)免疫反応におけるPGE2シグナル伝達に関与する遺伝子、
(48)TLR3及びTLR4誘導TICAM1-特異的シグナルパスウェイに関与する遺伝子、
(49)ビスフェノールAによる脂肪細胞分化の刺激の推定経路に関与する遺伝子、
(50)JAK/STAT、p38、JNK及びNF-kBを介したIL-3シグナル伝達に関与する遺伝子、及び
(51)骨粗鬆症関与遺伝子の制御におけるVDRの役割に関与する遺伝子。
2.測定したマーカーの測定値が、単純性脂肪肝の患者から得られた生体試料中の測定値よりも高い、前項1に記載の方法。
3.さらに、CD29、CD45及び/又はCD44を検出することを含む前項1又は2に記載の方法。
4.前記マーカーは、以下のいずれか1以上から選ばれる前項1〜3のいずれか1に記載の方法:
IL-6、IL-10、MIP-1-beta、IL-17F、IL-17、Amphiregulin、IL-1 alpha、IFN-gamma、TNF-beta、TNF-alpha、AHR、ROR-gamma、CD80、c-Maf、CD40(TNFRSF5)、RAP-1A、RalA、p120GAP、M-Ras、PI3K cat class IA、DBS、RhoGAP5、PLD1、IP10、Bcl-6、IL23R、PAK1、BRCC36、Caspase-1、C1q、IL-18R1、CARD5、Fc gamma RII beta、IFN-alpha、OX40(TNFRSF4)、COX-2(PTGS2)、Hemeoxygenase 1、HPGD、I-TAC、CCR2、Cytochrome c、NDUFA7、NDUFS5、NDUFAB1、UQCR11、UQCRB、NDUFB3、NDUFA2、NDUFA13、ATP5H、NDUFA5、NDUFC2、NDUFC1、ATP5I、Beta-adrenergic receptor、ABCA1、PEMT、SDP1、LPL、HDL proteins、HGF、IL-1RI、Endothelin-1、HGF receptor(Met)、NOTCH4、Vimentin、PAI1、PDGF-D、Frizzled、Histone H2、Histone H2A、TLR7、Histone H4、HistoneH1、COX-2 (PTGS2)、TLR3、IFN-beta、TRIF (TICAM1)、MDA-5、LXR-alpha、cPLA2、APOC2、APOC1、CD36、PLC-beta、TANK、CD137ligand(TNFSF9)、ATF-3、eIF4E、PI3K cat class IA (p110-beta)、CCL13、VCAM1、Histone H2B、eNOS、Apaf-1、CXCL16、PLAU(UPA)、Syndecan-1、AGP1 (ORM1)、SAA1、SAA2、MxA、Cyclin A2、HP1 alpha、HP1gamma、HP1、DNMT3A、CD69、HSP70、Eotaxin-2、CCL7、A-FABP、C/EBPalpha、ALPHA-PIX、HSP27、BAD、Factor H、EDNRB、GATA-2、ID1、Calcitonin、VDR、及びRANK(TNFRSF11A)。
5.被験者から得られた生体試料中のCD29、CD45及びCD44のいずれか1から選ばれたマーカーを測定する工程を含む、非アルコール性脂肪性肝炎の重篤度判定測定方法又は重篤度判定測定を補助する方法。
6.非アルコール性脂肪性肝炎治療中の患者から得られた生体試料中のCD29、CD45及びCD44のいずれか1から選ばれたマーカーを測定する工程を含む、非アルコール性脂肪性肝炎の治療評価判定方法又は治療評価判定方法を補助する方法。
7.以下のいずれか1以上に対する抗体又は抗体フラグメントを含む、非アルコール性脂肪性肝炎検出キット:
IL-6、IL-10、MIP-1-beta、IL-17F、IL-17、Amphiregulin、IL-1 alpha、IFN-gamma、TNF-beta、TNF-alpha、AHR、ROR-gamma、CD80、c-Maf、CD40(TNFRSF5)、RAP-1A、RalA、p120GAP、M-Ras、PI3K cat class IA、DBS、RhoGAP5、PLD1、IP10、Bcl-6、IL23R、PAK1、BRCC36、Caspase-1、C1q、IL-18R1、CARD5、Fc gamma RII beta、IFN-alpha、OX40(TNFRSF4)、COX-2(PTGS2)、Heme oxygenase 1、HPGD、I-TAC、CCR2、Cytochrome c、NDUFA7、NDUFS5、NDUFAB1、UQCR11、UQCRB、NDUFB3、NDUFA2、NDUFA13、ATP5H、NDUFA5、NDUFC2、NDUFC1、ATP5I、Beta-adrenergic receptor、ABCA1、PEMT、SDP1、LPL、HDL proteins、HGF、IL-1RI、Endothelin-1、HGF receptor(Met)、NOTCH4、Vimentin、PAI1、PDGF-D、Frizzled、Histone H2、Histone H2A、TLR7、Histone H4、HistoneH1、COX-2 (PTGS2)、TLR3、IFN-beta、TRIF (TICAM1)、MDA-5、LXR-alpha、cPLA2、APOC2、APOC1、CD36、PLC-beta、TANK、CD137ligand(TNFSF9)、ATF-3、eIF4E、PI3K cat class IA (p110-beta)、CCL13、VCAM1、Histone H2B、eNOS、Apaf-1、CXCL16、PLAU(UPA)、Syndecan-1、AGP1 (ORM1)、SAA1、SAA2、MxA、Cyclin A2、HP1 alpha、HP1gamma、HP1、DNMT3A、CD69、HSP70、Eotaxin-2、CCL7、A-FABP、C/EBPalpha、ALPHA-PIX、HSP27、BAD、Factor H、EDNRB、GATA-2、ID1、Calcitonin、VDR、及びRANK(TNFRSF11A)。
8.以下のいずれか1以上に対する抗体又は抗体フラグメントを含む、非アルコール性脂肪性肝炎の重篤度判定キット:
CD29、CD45及びCD44。
9.以下のいずれか1以上に対する抗体又は抗体フラグメントを含む、非アルコール性脂肪性肝炎の治療評価判定キット:
CD29、CD45及びCD44。
本発明は、以下の非アルコール性脂肪性肝炎検出方法、非アルコール性脂肪性肝炎の重篤度判定方法及び非アルコール性脂肪性肝炎の治療評価判定方法を対象とする。
〇非アルコール性脂肪性肝炎検出方法
被験者から得られた生体試料中の以下の(1)〜(10)のいずれか1から選ばれたマーカーを測定する工程を含む、非アルコール性脂肪性肝炎の検出方法又は検出を補助する方法。
(1)免疫反応T細胞サブセット分泌シグナルに関与する遺伝子
(2)免疫反応Native CD4+ T細胞分化に関与する遺伝子
(3)G-proteinsignaling_Cross-talk between Ras-family GTPasesに関与する遺伝子
(4)関節炎におけるサイト/ケモカイン発現におけるPDE4調節に関与する遺伝子
(5)免疫反応Th17、Th22及びTh9細胞分化に関与する遺伝子
(6)酸化的リン酸化に関与する遺伝子
(7)加齢黄斑変性におけるNALP3インフラマソーム活性に関与する遺伝子
(8)SLEにおけるB細胞の役割に関与する遺伝子
(9)免疫反応IL-10シグナルパスウェイに関与する遺伝子
(10)COPDにおける細胞間関連に関与する遺伝子
(11)Tヘルパー細胞の免疫反応ICOSシグナルパスウェイに関与する遺伝子
(12)アテローム性動脈硬化症に関与する遺伝子の発現の制御におけるZNF202の役割に関与する遺伝子
(12)アテローム性動脈硬化症に関与する遺伝子の発現の制御におけるZNF202の役割に関与する遺伝子
(13)上皮間葉転換(EMT)の発生制御に関与する遺伝子
(14)SLEにおけるNETosisに関与する遺伝子
(15)免疫反応IL-1シグナルパスウェイに関与する遺伝子
(16)免疫反応ストレス誘導抗ウイルス性細胞反応におけるPKRの役割に関与する遺伝子
(17)抗原提示細胞(APC)のSLE遺伝マーカー特異的パスウェイに関与する遺伝子
(18)脂質代謝の制御{脂肪代謝のG-アルファ(q)制御}に関与する遺伝子
(19)免疫反応RNAウイルス感染への先天性免疫反応に関与する遺伝子
(20)免疫反応CD8+ T細胞の分化及びクローン増殖に関与する遺伝子
(21)ストレス誘導アポトーシスにおけるPKRのアポトーシス及び生存の役割に関与する遺伝子
(22)免疫反応(MAPKsを介した炎症誘発性サイトカインのP物質刺激発現)に関与する遺伝子
(23)免疫反応IL-33シグナルパスウェイに関与する遺伝子
(24)ユビキノン代謝に関与する遺伝子
(25)免疫反応MIF媒介性グルココルチコイド制御に関与する遺伝子
(26)加齢黄斑変性の病因における脂質輸送異常及び代謝異常に関与する遺伝子
(27)免疫反応IL-18シグナル伝達に関与する遺伝子
(28)発生HGFシグナルパスウェイに関与する遺伝子
(29)免疫反応Th17細胞分化に関与する遺伝子
(30)免疫反応肝細胞におけるIL-6誘導性急性期応答に関与する遺伝子
(31)免疫反応IL-23シグナルパスウェイに関与する遺伝子
(32)慢性関節リウマチに関与する遺伝子
(33)炎症性皮膚疾患における細胞/ケモカイン発現のPDE4制御に関与する遺伝子
(34)鎌状赤血球症における物質P媒介性炎症及び疼痛に関与する遺伝子
(35)免疫反応樹状細胞成熟及び移動におけるHMGB1の役割に関与する遺伝子
(36)免疫反応HMGB1/RAGEシグナルパスウェイに関与する遺伝子
(37)転写{転写サイレンシングにおけるヘテロクロマチンタンパク質1(HP1)ファミリーの役割}に関与する遺伝子
(38)免疫反応HSP60及びHSP70/TLRシグナルパスウェイに関与する遺伝子
(39)CF中のTh17細胞に関与する遺伝子
(40)乾癬IL-23/T17発症軸の役割に関与する遺伝子
(41)免疫反応タイプ2免疫におけるIL-4応答性遺伝子に関与する遺伝子
(42)脂肪細胞分化におけるフタル酸ジエチルヘキシル及びトリブチルスズの役割に関与する遺伝子
(43)スキーマ:アレルギー性接触皮膚炎のT細胞動員の開始に関与する遺伝子
(44)結腸直腸癌に関与する遺伝子
(45)走化性C5a誘導走化性に関与する遺伝子
(46)緑内障における網膜神経節細胞損傷に関与する遺伝子
(47)免疫反応(免疫反応におけるPGE2シグナル伝達)に関与する遺伝子
(48)免疫反応TLR3及びTLR4誘導TICAM1-特異的シグナルパスウェイに関与する遺伝子
(49)ビスフェノールAによる脂肪細胞分化の刺激の推定経路に関与する遺伝子
(50)免疫反応JAK/STAT、p38、JNK及びNF-kBを介したIL-3シグナル伝達に関与する遺伝子
(51)転写骨粗鬆症関与遺伝子の制御におけるVDRの役割に関与する遺伝子
〇非アルコール性脂肪性肝炎の重篤度判定方法
被験者から得られた生体試料中のCD29、CD45及びCD44のいずれか1から選ばれたマーカーを測定する工程を含む、非アルコール性脂肪性肝炎の重篤度判定方法又は重篤度判定を補助する方法。
なお、非アルコール性脂肪性肝炎の重篤度とは、病理学的には、Matteoni分類、NAFLD activity scoreで評価することができる。
〇非アルコール性脂肪性肝炎の治療評価判定方法
非アルコール性脂肪性肝炎治療中の患者から得られた生体試料中のCD29、CD45及びCD44のいずれか1から選ばれたマーカーを測定する工程を含む、非アルコール性脂肪性肝炎の治療評価判定方法又は治療評価判定方法を補助する方法
本発明で使用する非アルコール性脂肪性肝炎の検出用マーカーは以下のいずれか1の群から選択できる。
IL-6(Interleukin-6): インターロイキン-6、IL-10(Interleukin-10): インターロイキン-10、MIP-1-beta(Macrophage inflammatory protein 1-beta):マクロファージ炎症性タンパク質1-ベータ、IL-17F(Interleukin-17Fprecursorを含む): インターロイキン-17F、IL-17(Interleukin-17): インターロイキン-17、Amphiregulin:アンフィレグリン、IL-1 alpha(Interleukin-1 alpha): インターロイキン-1アルファ、IFN-gamma(Interferon-gamma): インターフェロン-ガンマ、TNF-beta(Tumornecrosis factor-beta): 腫瘍壊死因子-ベータ、及びTNF-alpha(Tumor necrosis factor-alpha): 腫瘍壊死因子-アルファ。
AHR(Aryl Hydrocarbon Receptor):芳香族炭化水素受容体、IL-6、IL-10、ROR-gamma(retinoic acid-related orphan receptor-gamma): レチノイン酸受容体関連オーファン受容体-ガンマ、IL-17F、CD80(Cluster of differentiation 80): 表面抗原CD80、c-Maf(MAF bZIPtranscription factor): 小Maf転写因子、IL-17、CD40(TNFRSF5): 表面抗原CD40(腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーメンバー5)、IFN-gamma、及びTNF-alpha。
RAP-1A(Ras-related protein Rap-1A): Ras関連タンパク質RAP-1A、RalA(Ras-relatedprotein Ral-A): Ras関連タンパク質Ral-A、p120GAP(p120 GTPase activating protein): p120グアニンヌクレオチド加水分解酵素活性化タンパク質、M-Ras(Ras-related protein M-Ras): Ras関連タンパク質M-Ras、PI3K cat class IA(Class IA Phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase): クラスIAホスファチジルイノシトール3-キナーゼ、DBS(Guanine nucleotide exchange factor DBS): グアニンヌクレオチド交換因子DBS、RhoGAP5(Rho GTPase activating protein 5): RhoGTPase活性化タンパク質5、及びPLD1(Phospholipase D1): ホスホリパーゼD1。
IL-6、RAP-1A、IL-10、MIP-1-beta、PI3K cat class IA、IL-17、IL-1 alpha、IFN-gamma、IP10(Interferon gamma-induced protein 10): インターフェロンガンマ誘導タンパク質10、及びTNF-alpha。
AHR、IL-6、IL-10、ROR-gamma、IL-17F、CD80、IL-17、CD40(TNFRSF5)、及びTNF-alpha。
Bcl-6(B-cell lymphoma 6 protein): B細胞リンパ腫タンパク質6、IL-10、ROR-gamma、IL-17F、PI3K cat class IA、c-Maf、IL-17、IFN-gamma、IL23R(Interleukin-23 receptor): インターロイキン-23受容体、PAK1(p21 protein (Cdc42/Rac)-activated kinase 1): p21タンパク質(Cdc42/Rac)活性化キナーゼ1、及びTNF-alpha。
BRCC36(BRCA1/BRCA2-containing complex subunit 36): BRCA1/BRCA2含有複合体サブユニット36、IL-6、Caspase-1(interleukin-1 beta converting enzyme): カスパーゼ-1、C1q(ComplementComponent C1q): 補体C1q、IL-18R1(interleukin-18 receptor 1): インターロイキン-18受容体1、CARD5: PYCARD(PYD andCARD domain containing)、IL-1 alpha、及びTNF-alpha。
IL-6、Fc gamma RII beta(typeII receptor for the Fc region of IgG beta): Fcガンマ受容体IIベータ、IFN-alpha(Interferon-alpha): インターフェロン-アルファ、CD80、OX40(TNFRSF4) (Tumor necrosis factorreceptor superfamily member 4): 腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーメンバー4、PI3K cat class IA、CD40(TNFRSF5)、IFN-gamma、TNF-beta、及びTNF-alpha。
COX-2(PTGS2)(Prostaglandin-endoperoxide synthase 2): プロスタグランジン-エンドペルオキシド合成酵素2、IL-6、Heme oxygenase 1: ヘムオキシゲナーゼ1、IL-10、Fc gamma RIIbeta、CD80、HPGD(Hydroxyprostaglandin Dehydrogenase 15-(NAD)): 15-ヒドロキシプロスタグランジンデヒドロゲナーゼ(NAD)、PI3K cat class IA、IL-1 alpha、及びTNF-alpha。
IL-6、I-TAC(Interferon-inducible T-cell alphachemoattractant): インターフェロン誘導T細胞アルファ走化性因子、IL-17、CCR2(C-C chemokine receptor type 2): CCケモカイン受容体2、IFN-gamma、IP10、及びTNF-alpha。
シトクロムc (Cytochrome c)、NDUFA7{NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex subunit 7}、NDUFS5(NADH:Ubiquinone OxidoreductaseSubunit S5)、NDUFAB1(NADH:UbiquinoneOxidoreductase Subunit AB1)、UQCR11(Ubiquinol-Cytochrome C Reductase, Complex III Subunit XI)、UQCRB(Ubiquinol-cytochrome c reductasebinding protein)、NDUFB3{NADHdehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 3}、NDUFA2(NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2)、NDUFA13(NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13)、ATP5H(ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex subunit D)、NDUFA5(NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5)、NDUFC2(NADH:Ubiquinone Oxidoreductase Subunit C2)、NDUFC1(NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1)、及びATP5I(ATP synthase, H+ transporting,mitochondrial Fo complex subunit E)。
Beta-adrenergic receptor、ABCA1(ATP bindingcassette subfamily A member 1)、PEMT(phosphatidylethanolamine N-methyltransferase)、SDP1(Patatin-likephospholipase family protein)、LPL(lipoprotein lipase)、及びHDL proteins(High-density lipoproteins)。
HGF(hepatocyte growth factor)、IL-1RI(interleukin-1 receptor 1)、Endothelin-1、HGF receptor{Met(MET proto-oncogene)}、NOTCH4(Neurogenic locus notch homolog 4)、Vimentin、PAI1(Plasminogen activator inhibitor-1)、PDGF-D(platelet derived growth factor D)、Frizzled、及びTNF-alpha。
C1q、IFN-alpha、Histone H2、Histone H2A、TLR7(tolllike receptor 7)、Histone H4、及びHistoneH1。
COX-2{cyclooxygenase-2; PTGS2(Prostaglandin-endoperoxide synthase 2)}、IL-1RI、Endothelin-1、IL-6、Hemeoxygenase 1、IL-1 alpha、PAI1、及びTNF-alpha。
IL-1RI、IL-6、IL-10、TLR3(toll like receptor 3)、IFN-alpha、IFN-beta(Interferon-beta): インターフェロン-ベータ、IFN-gamma、TRIF {TIR-domain-containingadapter-inducing interferon-beta: TICAM1(toll likereceptor adaptor molecule 1)}、及びTNF-alpha。
IL-1RI、MDA-5(melanoma differentiation associatedgene 5)、IL-10、IFN-alpha、IFN-beta、IL-1 alpha、TLR7、CD40(TNFRSF5)、IFN-gamma、TRIF(TICAM1)、及びTNF-alpha。
COX-2(PTGS2)、LXR-alpha(Liver X receptor alpha)、cPLA2(phospholipase A2)、ABCA1、APOC2(apolipoprotein C2)、APOC1(apolipoprotein C1)、CD36: 表面抗原CD36、LPL、及びPLC-beta(PhospholipaseC-beta)。
MDA-5、TLR3、IFN-alpha、IFN-beta、TANK(TRAF family member associated NFKBactivator)、及びTLR7。
IFN-alpha、CD80、CD137 ligand(表面抗原CD137リガンド; TNFSF9): 腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーメンバー9、OX40(TNFRSF4)、IFN-beta、CD40(TNFRSF5)、及びIFN-gamma。
TLR3、ATF-3(activating transcription factor 3)、IFN-alpha、IFN-beta、IFN-gamma、eIF4E(eukaryotic translation initiation factor 4E)、TRIF (TICAM1)、及びTNF-alpha。
COX-2(PTGS2)、IL-6、PI3K cat class IA{p110-beta(phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate3-kinase catalytic subunit beta)}、MIP-1-beta、CCL13(C-C motif chemokine ligand 13)、TNF-alpha、及びPLC-beta。
IL-6、IL-17F、PI3K cat class IA、Histone H2A、VCAM1(vascularcell adhesion molecule 1)、Histone H2B、eNOS(endothelia NO synthase)、及びTNF-alpha。
NDUFA7、NDUFS5、NDUFAB1、NDUFB3、NDUFA2、NDUFA13、NDUFA5、NDUFC2、及びNDUFC1。
COX-2(PTGS2)、IL-6、VCAM1、IFN-gamma、及びTNF-alpha。
Cytochrome c、C1q、Apaf-1(apoptotic peptidase activating factor 1)、ABCA1、IL-17、IFN-gamma、CD36、及びTNF-alpha。
COX-2(PTGS2)、IL-6、IL-18R1、PI3K cat class IA、IL-1 alpha、CXCL16(C-X-C motif chemokine ligand 16)、VCAM1、及びTNF-alpha。
HGF、COX-2 (PTGS2)、RAP-1A、HGF receptor (Met)、PI3K cat class IA、PLAU{plasminogen activator, urokinase; UPA(urokinase-type plasminogen activator)}、及びSyndecan-1。
IL-1RI、IL-6、ROR-gamma、IL-17F、CD80、及びIL-17。
IL-6、Heme oxygenase 1、PAI1、AGP1{ Alpha-1-acid glycoprotein 1; ORM1(orosomucoid1)}、SAA1(serum amyloid A1)、及びSAA2(serum amyloid A2)。
ROR-gamma、IL-17F、PI3K cat class IA、IL-17、及びIL23R。
IL-6、CD80、IL-17、VCAM1、CD40(TNFRSF5)、IFN-gamma、及びTNF-alpha。
IL-6、IL-10、MxA(myxovirusresistance A)、IL-17、IFN-gamma、IP10、及びTNF-alpha。
IL-1RI、IL-6、VCAM1、IFN-gamma、TNF-alpha、及びPLC-beta。
IL-6、CD80、CD40(TNFRSF5)、IFN-gamma、及びTNF-alpha。
IL-6、MIP-1-beta、PI3K cat class IA、IL-1 alpha、PAI1、VCAM1、及びTNF-alpha。
CyclinA2、HP1 alpha(Heterochromatin Protein 1 alpha)、HP1 gamma(Heterochromatin Protein 1 gamma)、HP1(Heterochromatin Protein 1)、DNMT3A(DNA methyltransferase 3 alpha)、及びHistone H4。
CD69:表面抗原CD69、IL-6、HSP70(heat shock protein 70)、IL-10、CD80、CD40(TNFRSF5)、及びTNF-alpha。
IL-1RI、IL-6、ROR-gamma、IL-17F、CD80、IL-17、及びVCAM1。
IL-1RI、IL-6、ROR-gamma、IL-17F、CD80、IL-17、及びCD40(TNFRSF5)。
COX-2(PTGS2)、IL-10、VCAM1、CD40(TNFRSF5)、CD36、CCL13、Eotaxin-2、及びCCL7(C-C motif chemokine ligand 7)。
A-FABP(AdipocyteCfatty acid-binding protein)、LXR-alpha、CD36、LPL、及びC/EBPalpha(CCAAT/enhancer binding protein alpha)。
VCAM1、IFN-gamma、IP10、及びTNF-alpha。
HGF、IL-6、HGF receptor (Met)、Frizzled、及びTNF-alpha。
RAP-1A、ALPHA-PIX(Rhoguanine nucleotide exchange factor 6)、HSP27(Heat shock protein 27)、PAK1、PLD1、及びPLC-beta。
BAD(BCL2 associated agonist of cell death)、Endothelin-1、C1q、Factor H、EDNRB(endothelin receptor type B)、及びTNF-alpha。
HGF、COX-2 (PTGS2)、IL-10、MIP-1-beta、IFN-gamma、及びTNF-alpha。
TLR3、IFN-alpha、IFN-beta、及びTRIF (TICAM1)。
A-FABP、GATA-2(GATA binding protein 2)、PI3K cat class IA、LPL、及びC/EBPalpha。
BAD、CD69、Cyclin A2、IL-6、Bcl-6、ID1(inhibitor of DNA binding 1, HLH protein)、NOTCH4、PI3K cat class IA、及びCD40(TNFRSF5)。
IL-6、Calcitonin: カルシトニン、VDR(vitamin D receptor)、IL-1 alpha、IFN-gamma、RANK(receptor activator of nuclear factor kappaB; TNFRSF11A): 腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーメンバー11a、及びTNF-alpha。
CD29(Integrin beta-1):表面抗原CD29(インテグリンベータ1)、CD45(ProteinTyrosine Phosphatase Receptor Type C):表面抗原CD45(タンパク質チロシンホスファターゼ受容体C型)、及びCD44(CD44 molecule (Indian blood group)):表面抗原CD44{CD44分子(インド人血液型)}。
本発明の非アルコール性脂肪性肝炎は、アルコールに起因しない肝臓に脂肪が蓄積することで起こる肝炎を対象とするが、単純性脂肪肝とは異なることを意味する。
本発明において、被験者とは、哺乳類全般(ヒト、ネコ、イヌ、ウマを含む)を含み、さらに、健常者、非アルコール性脂肪性肝炎の患者、該肝炎の疑いがある人、該肝炎が将来発生する人、脂肪肝の患者、脂肪肝の疑いがある人、脂肪肝が将来発生する人も含む。
さらに、生体試料は、各マーカーとなる遺伝子及び/又はタンパク質が含まれていれば特に限定されないが、血液、血液成分(血清、血漿、血球など)、唾液、尿、髄液、涙液、汗、毛髪、組織由来の成分、生検試料、iPS細胞、初代培養細胞を含む。
本発明のマーカーが遺伝子(DNA、RNA、cDNA、mRNA、それらの断片)である場合、特に限定されないが、自体公知の遺伝子測定方法を利用することができる。例えば、被験者から得られた生体試料中の標的とする遺伝子(マーカー)を、プライマーを用いてRT-PCRで増幅する。標的とする遺伝子(マーカー)が存在すれば、DNAが増幅されて生体試料中のマーカーの存在が検出される。
具体的には、次の工程からなる。
ア)被験者から得られた生体試料からmRNAを抽出する工程、
イ)得られたRNAを鋳型として逆転写反応によりcDNAを合成する工程、
ウ)プライマーを生体試料中に加えてPCRを行う工程、
エ)増幅されたDNAを検出する工程
ア)〜エ)の各工程は公知の方法により行うことができる。
さらに、初期、中期若しくは末期の非アルコール性脂肪性肝炎の患者、単純性脂肪肝の患者、又は健常者由来の生体試料を対照試料(コントロール)として、その対象試料を同様の工程により処理した後に比較する工程を含むこともできる。
さらに、DNAマイクロアレイ、DNAチップ、又は抗体アレイ等が挙げられる。DNAマイクロアレイ又はDNAチップには該遺伝子のヌクレオチド又はcDNAが少なくとも1つ以上固定化されているものを用いる。なお、ヌクレオチド又はcDNAは、該遺伝子の一部に相当する部分でもよい。
本発明のマーカーがタンパク質である場合、特に限定されないが、自体公知のタンパク質の測定方法(検出、定量、活性)を利用することができる。例えば、タンパク質に特異的に結合する抗体やアプタマー等を用いることができ、抗体としては、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、一本鎖抗体、ヒト化抗体、キメラ抗体、2つのエピトープを同時に認識することができる二機能性抗体等を例示できる。これらの抗体は、慣用のプロトコルを用いて該ポリペプチド又はタンパク質又はそれらの断片を抗原として用いて作製することができる。また、アプタマーとは、タンパク質、アミノ酸等の分子に特異的に結合する核酸分子である。
上記タンパク質に特異的に結合する抗体を用いて、被検試料中に存在する該ポリペプチド又はタンパク質を検出又は定量する場合、免疫沈降法、電気化学発光法、RIA(radioimmunoassay)法、ELISA(Enzyme−LikedImmunosorbent Assay)法、蛍光抗体法等の公知の免疫学的方法を用いることができる。
本発明の「非アルコール性脂肪性肝炎の指標」とは、非アルコール性脂肪性肝炎を有する患者と非アルコール性脂肪性肝炎を有さない人(特に、単純性脂肪肝、健常者等)を区別するための被験者由来生体試料中の各マーカーの数値(基準値、平均値等)を意味する。
例えば、予め設定した「被験者由来生体試料の各マーカーの基準値」以上の場合には、非アルコール性脂肪性肝炎が今後発症する、現在発症している又は進行していること(可能性があること)を判定できる。
特に、予め設定した「被験者由来生体試料の各マーカーの基準値」は、単純性脂肪肝を有する患者由来生体試料中の各マーカーの平均値、非アルコール性脂肪性肝炎を有する患者由来生体試料中の各マーカーの平均値、又は、健常者由来生体試料中の各マーカーの平均値から算出することができる。
Cut off(カットオフ)値の設定方法としては、単純性脂肪肝を有する患者由来生体試料中の各マーカーの平均値、非アルコール性脂肪性肝炎を有する患者由来生体試料中の各マーカーの平均値、又は、健常者由来生体試料中の各マーカーの平均値から算出する。通常、予め決定したcut off値の標準偏差の90%以下、好ましくは80%以下、より好ましくは70%以下、さらに好ましくは60%以下、最も好ましくは50%以下である。
また、別のcut off値の設定方法としては、非アルコール性脂肪性肝炎歴のない被験者において、被験者由来生体試料の各マーカーを測定して得られた値に基づき、市販の統計解析ソフトを使用してROC(Receiver Operating Characteristic)曲線を作成し、最適な感度及び特異度を求める。例えば、一次スクリーニング等の目的では感度が高い方を優先し、精査目的では特異度が高くなるようなカットオフ値を設定することが可能である。
本発明の「非アルコール性脂肪性肝炎の重篤度・治療評価の指標」とは、非アルコール性脂肪性肝炎の進行度又は治療効果を判定するための被験者由来生体試料中の各マーカーの数値(基準値、平均値等)を意味する。
例えば、非アルコール性脂肪性肝炎の重篤度において、予め設定した「被験者由来生体試料の各マーカーの基準値」以下の場合には、非アルコール性脂肪性肝炎がMatteoni分類、NAFLD activity scoreで評価される分類(例えば、初期、中期、末期)、今後発症する、現在発症している又は非常に進行していること(可能性があること)を判定できる。
例えば、非アルコール性脂肪性肝炎の治療評価において、予め設定した「被験者由来生体試料の各マーカーの基準値」以上の場合には、現在行っている治療方法が好ましい(継続する、良好である、効果がある、予後良好)と判定できる。
特に、予め設定した「被験者由来生体試料の各マーカーの基準値」は、初期、中期若しくは末期の非アルコール性脂肪性肝炎を有する患者由来生体試料中の各マーカーの平均値、健常者由来生体試料中の各マーカーの平均値、又は、非アルコール性脂肪性肝炎の患者の治療前又は治療中の患者由来生体試料中の各マーカーの平均値から算出することができる。
Cut off値の設定方法としては、初期、中期若しくは末期の非アルコール性脂肪性肝炎を有する患者由来生体試料中の各マーカーの平均値、健常者由来生体試料中の各マーカーの平均値、又は、非アルコール性脂肪性肝炎の患者の治療前又は治療中の患者由来生体試料中の各マーカーの平均値から算出する。通常、予め決定したcut off値の標準偏差の90%以下、好ましくは80%以下、より好ましくは70%以下、さらに好ましくは60%以下、最も好ましくは50%以下である。
(1)被験者から得られた生体試料中の各マーカーを測定する。
(2)各マーカーの測定値を、非アルコール性脂肪性肝炎の指標と比較する。
(3)各マーカーの測定値が該指標よりも高い場合には、非アルコール性脂肪性肝炎であると判定する。
なお、指標は、単純性脂肪肝を有する患者由来生体試料中の各マーカーの平均値を採用することが好ましい。
加えて、上記工程に、さらに、CD29、CD45及び/又はCD44を測定することにより、非アルコール性脂肪性肝炎だけでなく、さらに該肝炎の重篤度も判定することができる。
(1)被験者から得られた生体試料中の各マーカーであるCD29、CD45及び/又はCD44を測定する。
(2)各マーカーの測定値を、非アルコール性脂肪性肝炎の重篤度の指標と比較する。
(3)各マーカーの測定値が該指標よりも低い場合には、非アルコール性脂肪性肝炎が重篤(進行している)と判定する。
なお、指標は、初期、中期若しくは末期の非アルコール性脂肪性肝炎を有する患者由来生体試料中の各マーカーの平均値を採用することが好ましい。
(1)非アルコール性脂肪性肝炎治療中の患者から得られた生体試料中の各マーカーであるCD29、CD45及び/又はCD44を測定する。
(2)各マーカーの測定値を、非アルコール性脂肪性肝炎の治療評価の指標と比較する。
(3)各マーカーの測定値が該指標よりも高い場合には、治療が良好であると判定する。
なお、指標は、非アルコール性脂肪性肝炎の患者の治療前又は治療中の患者由来生体試料中の各マーカーの値(好ましくは、平均値)を採用することが好ましい。
本発明の非アルコール性脂肪性肝炎検出キットは、以下のいずれか1以上に対する抗体又は抗体フラグメントを含む。
IL-6、IL-10、MIP-1-beta、IL-17F、IL-17、Amphiregulin、IL-1 alpha、IFN-gamma、TNF-beta、TNF-alpha、AHR、ROR-gamma、CD80、c-Maf、CD40(TNFRSF5)、RAP-1A、RalA、p120GAP、M-Ras、PI3K cat class IA、DBS、RhoGAP5、PLD1、IP10、Bcl-6、IL23R、PAK1、BRCC36、Caspase-1、C1q、IL-18R1、CARD5、Fc gamma RII beta、IFN-alpha、OX40(TNFRSF4)、COX-2(PTGS2)、Heme oxygenase 1、HPGD、I-TAC、CCR2、Cytochrome c、NDUFA7、NDUFS5、NDUFAB1、UQCR11、UQCRB、NDUFB3、NDUFA2、NDUFA13、ATP5H、NDUFA5、NDUFC2、NDUFC1、及びATP5I。
本発明の非アルコール性脂肪性肝炎の重篤度判定キットは、以下のいずれか1以上に対する抗体又は抗体フラグメントを含む。
CD29、CD45及びCD44。
本発明の非アルコール性脂肪性肝炎の治療評価判定キットは、以下のいずれか1以上に対する抗体又は抗体フラグメントを含む。
CD29、CD45及びCD44。
また、抗体フラグメントは、抗体の抗原認識機能を実質的に維持することができれば、どのような構造でもよく、例えば抗原認識部位(軽鎖可変領域配列、重鎖可変領域配列)を有することが好ましい。
C57BL/6Jマウス (8週齢、雌) に動脈硬化高脂肪食Atherogenic high-fat (AT+HF、参照:下記表1、参考文献:Hepatology. 2013 Sep;58(3):1133-42. doi: 10.1002/hep.26470. Epub2013 Jul 24.) を給餌し、給餌開始から2、4、8、12週後に肝臓を摘出した。摘出した肝臓はIHC Zinc Fixative (BD) で固定・パラフィン包埋し、HE、Azan染色を行った。
また、GenEluteTM Mammalian Total RNA Miniprep Kit(Sigma-Aldrich) にて肝組織のRNAを抽出した。抽出したRNA100ngをHigh Capacity cDNA Reverse Transcription (ABI)にて、逆転写しcDNAを作製した。該cDNAを用いて、Alb、Col4a1及びTnf{Alb、Col4a1、Tnfprobes (ABI)} の発現をqPCR Master mix Plus (EUROGENTEC) を用い、real-time PCRにて定量した。
C57BL/6Jマウス (9-10週齢、雌) に非アルコール性脂肪性肝炎(NASH)マウス作製のためにAT+HF又は単純性脂肪肝(SS)マウス作製のためにHFD-60(参照:下記表1)を給餌し、給餌開始から4週、12週後に肝組織を採取した。
さらに、肝組織を破砕・酵素処理した後、肝実質細胞と肝内炎症細胞をPercollTMPLUS (GEHealthcare)にて分離した。分離した肝内炎症細胞はMicro RNA isolation kit (AgilentTechnologies) にてRNAを抽出し、DNAマイクロアレイ (Agilent Whole Mouse Genome 4×44K) を行った。
IHC Zinc Fixativeで肝組織を固定・パラフィン包埋し、2μm薄切切片を作製した。脱パラフィン後、Peroxidase Blocking Reagent (Dako)による内因性ペルオキシダーゼブロッキング、Protein Block (Dako) による非特異的タンパクブロッキング後、1%BSA含有PBSで希釈したanti-Gr-1抗体 (BD)、anti-F4/80抗体 (Invitrogen) を4℃で一晩反応させた。二次抗体シンプルステインマウスMAX-PO(Rat) (ニチレイバイオサイエンス) を室温で30分反応させた後、Liquid DAB + Substrate ChromogenSystem (Dako) を用いて発色し、ヘマトキシリンにて対比染色した。
C57BL/6Jマウス (9-10週齢、雌) に非アルコール性脂肪性肝炎マウス作製のためにAT+HFを給餌し、給餌開始から4週又は12週後に脂肪由来幹細胞を採取した。
採取した脂肪由来幹細胞の発現タンパク質発現変異を、各表面抗原に対する抗体を使用してFACS解析(フローサイトメトリー)により行った。
At+HF給餌2、4、8、12週後の肝組織の遺伝子発現、組織所見の検討では、経時的にAlbの低下、Col4a1とTnfの上昇傾向が認められた(図1B)。また組織学的には給餌開始後2週より肝細胞への脂肪沈着がみられ、4週より門脈周囲の炎症細胞浸潤を認めた。12週では脂肪化が著明となり、肝細胞周囲の線維化や肝細胞風船様腫大を認めた(図1A)。
以上により、AT+HF給餌により脂肪性肝炎を惹起することができることを確認した、さらに、非アルコール性脂肪性肝炎マウスが作製できていることを確認した。
AT+HF又はHFD-60を給餌し4、12週における組織所見と肝内炎症細胞の遺伝子発現を評価した。
肝細胞においてはAT+HF給餌NASHマウスモデル、HFD-60給餌SSマウスモデルの4、12週いずれも同程度の脂肪沈着が認められた(図2A)。しかし、AT+HF給餌NASHマウスモデルでは、門脈域を中心にGr-1やF4/80陽性の炎症細胞の集簇がみられ、12週では線維化をきたした(図2A)。これらの組織所見から、AT+HF給餌NASHマウスモデルは非アルコール性脂肪性肝炎類似病態を示す一方、HFD-60給餌SSマウスモデルは単純性脂肪肝に類似した病態を示すことを確認した。
さらに、AT+HF給餌NASHマウスモデルで発現が上昇していた遺伝子について生物学的プロセスを解析したところ、proinflammatory cytokinesであるTnf(TNF)、Il1α(IL-1 alpha)、Il6(IL-6)、ならびにIl17a(IL-17)、Il17f(IL-17F)、Rorc(ROR-gamma)、Il10(IL-10)等の、T細胞(T cell)、リンパ球細胞(lymphocyte cell)に関わる免疫液性因子発現を確認した(図3、4)。
(免疫反応T細胞サブセット分泌シグナル:Immune response T cellsubsets: secreted signals)
IL-6、IL-10、MIP-1-beta、IL-17F、IL-17、Amphiregulin、IL-1 alpha、INF-gamma、TNF-beta、TNF-alpha
(免疫反応Native CD4+ T細胞分化:Immune response NativeCD4+ T cell differentiation )
AHR、IL-6、IL-10、ROR-gamma、IL-17F、CD80、c-Maf、IL-17、CD40(TNFRSF5)、INF-gamma、TNF-alpha
(G-protein signaling_Cross-talk between Ras-familyGTPases)
RAP-1A、RalA、p120GAP、M-Ras、PI3K cat class IA、DBS、RhoGAP5、PLD1
(関節炎におけるサイト/ケモカイン発現におけるPDE4調節:PDE4 regulation of cyto/chemokine expression in arthritis)
IL-6、RAP-1A、IL-10、MIP-1-beta、PI3K cat class IA、IL-17、IL-1 alpha、INF-gamma、IP10、TNF-alpha
(免疫反応Th17、Th22及びTh9細胞分化:Immune response Th17,Th22 and Th9 cell differentiation)
AHR、IL-6、IL-10、ROR-gamma、IL-17R、CD80、IL-17、CD40(TNFRSF5)、TNF-alpha
(酸化的リン酸化:oxidative phosphorylation)
Cytochrome c、NDUFA7、NDUFS5、NDUFAB1、UQCR11、UQCRB、NDUFB3、NDUFA2、NDUFA13、ATP5H、NDUFA5、NDUFC2、NDUFC1、ATP5I
(加齢黄斑変性におけるNALP3インフラマソーム活性:NALP3 inflammasome activation in age-related macular degeneration )
BRCC36、IL-6、Caspase-1、C1q、IL-18R1、CARD5、IL-1 alpha、TNF-alpha
(SLEにおけるB細胞の役割:Role of B cells in SLE)
IL-6、Fc gamma RII beta、INF-alpha、CD80、OX40(TNFRSF4)、PI3K cat class IA、CD40(TNFRSF5)、INF-gamma、TNF-beta、TNF-alpha
(免疫反応IL-10シグナルパスウェイ:Immune response IL-10 signaling pathway)
COX-2(PTGS2)、IL-6、Hemeoxyhenase 1、IL-10、Fc gamma RIIbeta、CD80、HPGD、PI3K cat class IA、IL-1 alpha、TNF-alpha
(COPDにおける細胞間関連:inter-cellular relations in COPD)
IL-6、I-TAC、IL-17、CCR2、INF-gamma、IP10、TNF-alpha
(Tヘルパー細胞の免疫反応ICOSシグナルパスウェイ:Immune response ICOS signaling pathway in T-helper cell)
Bcl-6、IL-10、ROR-gamma、IL-17F、PI3K cat class IA、c-Maf、IL-17、IFN-gamma、IL23R、PAK1、TNF-alpha
(アテローム性動脈硬化症に関与する遺伝子の発現の制御におけるZNF202の役割:Role of ZNF202in regulation of expression of genes involved in atherosclerosis)
Beta-adrenergic receptor、ABCA1(ATP binding cassette subfamily A member 1)、PEMT(phosphatidylethanolamine N-methyltransferase)、SDP1(Patatin-likephospholipase family protein)、LPL(lipoprotein lipase)、HDL proteins(High-density lipoproteins)
{上皮間葉転換(EMT)の発生制御:Development_Regulation ofepithelial-to-mesenchymal transition (EMT)}
HGF(hepatocyte growth factor)、IL-1RI(interleukin-1 receptor 1)、Endothelin-1、HGF receptor{Met(METproto-oncogene)}、NOTCH4(Neurogeniclocus notch homolog 4)、Vimentin、PAI1(Plasminogen activator inhibitor-1)、PDGF-D(platelet derived growth factor D)、Frizzled、TNF-alpha
(SLEにおけるNETosis:NETosisin SLE)
C1q、IFN-alpha、HistoneH2、Histone H2A、TLR7(toll like receptor 7)、Histone H4、Histone H1
(免疫反応IL-1シグナルパスウェイ:Immune response_IL-1 signaling pathway)
COX-2{cyclooxygenase-2; PTGS2(Prostaglandin-endoperoxide synthase 2)}、IL-1RI、Endothelin-1、IL-6、Heme oxygenase 1、IL-1 alpha、PAI1、TNF-alpha
(免疫反応ストレス誘導抗ウイルス性細胞反応におけるPKRの役割:Immune response_Role of PKR instress-induced antiviral cell response)
IL-1RI、IL-6、IL-10、TLR3(toll like receptor 3)、IFN-alpha、IFN-beta(Interferon-beta): インターフェロン-ベータ、IFN-gamma、TRIF {TIR-domain-containing adapter-inducing interferon-beta: TICAM1(toll like receptor adaptor molecule 1)}、TNF-alpha
{抗原提示細胞(APC)のSLE遺伝マーカー特異的パスウェイ:SLE genetic marker-specific pathways in antigen-presenting cells(APC)}
IL-1RI、MDA-5(melanoma differentiation associated gene 5)、IL-10、IFN-alpha、IFN-beta、IL-1 alpha、TLR7、CD40(TNFRSF5)、IFN-gamma、TRIF(TICAM1)、TNF-alpha
[脂質代謝の制御{脂肪代謝のG-アルファ(q)制御}:Regulation of lipid metabolism_G-alpha(q) regulation of lipid metabolism]
COX-2 (PTGS2)、LXR-alpha(Liver X receptor alpha)、cPLA2(phospholipase A2)、ABCA1、APOC2(apolipoprotein C2)、APOC1(apolipoprotein C1)、CD36: 表面抗原CD36、LPL、PLC-beta(PhospholipaseC-beta)
(免疫反応RNAウイルス感染への先天性免疫反応:Immune response_Innateimmune response to RNA viral infection)
MDA-5、TLR3、IFN-alpha、IFN-beta、TANK(TRAFfamily member associated NFKB activator)、TLR7
(免疫反応CD8+ T細胞の分化及びクローン増殖:Immune response_Differentiation and clonal expansion of CD8+ T cells)
IFN-alpha、CD80、CD137ligand(表面抗原CD137リガンド; TNFSF9): 腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーメンバー9、OX40(TNFRSF4)、IFN-beta、CD40(TNFRSF5)、IFN-gamma
(ストレス誘導アポトーシスにおけるPKRのアポトーシス及び生存の役割:Apoptosis andsurvival_Role of PKR in stress-induced apoptosis)
TLR3、ATF-3(activatingtranscription factor 3)、IFN-alpha、IFN-beta、IFN-gamma、eIF4E(eukaryotic translation initiation factor 4E)、TRIF (TICAM1)、TNF-alpha
{免疫反応(MAPKsを介した炎症誘発性サイトカインのP物質刺激発現):Immune response_Substance P-stimulated expression of proinflammatory cytokines via MAPKs}
COX-2 (PTGS2)、IL-6、PI3Kcat class IA{p110-beta(phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate3-kinase catalytic subunit beta)}、MIP-1-beta、CCL13(C-C motif chemokine ligand 13)、TNF-alpha、PLC-beta
(免疫反応IL-33シグナルパスウェイ:Immune response_IL-33signaling pathway)
IL-6、IL-17F、PI3K catclass IA、Histone H2A、VCAM1(vascular cell adhesion molecule 1)、Histone H2B、eNOS(endothelia NO synthase)、TNF-alpha
(ユビキノン代謝:Ubiquinone metabolism)
NDUFA7、NDUFS5、NDUFAB1、NDUFB3、NDUFA2、NDUFA13、NDUFA5、NDUFC2、NDUFC1
(免疫反応MIF媒介性グルココルチコイド制御:Immune response_MIF-mediatedglucocorticoid regulation)
COX-2 (PTGS2)、IL-6、VCAM1、IFN-gamma、TNF-alpha
(加齢黄斑変性の病因における脂質輸送異常及び代謝異常:Aberrantlipid trafficking and metabolism in age-related macular degeneration pathogenesis)
Cytochrome c、C1q、Apaf-1(apoptotic peptidase activating factor 1)、ABCA1、IL-17、IFN-gamma、CD36、TNF-alpha
(免疫反応IL-18シグナル伝達:Immune response_IL-18 signaling)
COX-2 (PTGS2)、IL-6、IL-18R1、PI3K cat class IA、IL-1 alpha、CXCL16(C-X-C motif chemokine ligand 16)、VCAM1、TNF-alpha
(発生HGFシグナルパスウェイ:Development_HGF signaling pathway)
HGF、COX-2 (PTGS2)、RAP-1A、HGF receptor (Met)、PI3K cat class IA、PLAU{plasminogen activator, urokinase; UPA(urokinase-type plasminogen activator)}、Syndecan-1
(免疫反応Th17細胞分化:Immune response_Th17 cell differentiation)
IL-1RI、IL-6、ROR-gamma、IL-17F、CD80、IL-17
(免疫反応肝細胞におけるIL-6誘導性急性期応答:Immune response_IL-6-induced acute-phase response in hepatocytes)
IL-6、Heme oxygenase 1、PAI1、AGP1{ Alpha-1-acid glycoprotein 1; ORM1(orosomucoid 1)}、SAA1(serum amyloid A1)、SAA2(serum amyloid A2)
(免疫反応IL-23シグナルパスウェイ:Immune response_IL-23 signaling pathway)
ROR-gamma、IL-17F、PI3Kcat class IA、IL-17、IL23R
(慢性関節リウマチ:Rheumatoid arthritis)
IL-6、CD80、IL-17、VCAM1、CD40(TNFRSF5)、IFN-gamma、TNF-alpha
(炎症性皮膚疾患における細胞/ケモカイン発現のPDE4制御:PDE4 regulation of cyto/chemokine expression in inflammatory skin diseases)
IL-6、IL-10、MxA(myxovirus resistance A)、IL-17、IFN-gamma、IP10、TNF-alpha
(鎌状赤血球症における物質P媒介性炎症及び疼痛:Substance P-mediated inflammationand pain in Sickle cell disease)
IL-1RI、IL-6、VCAM1、IFN-gamma、TNF-alpha、PLC-beta
(免疫反応樹状細胞成熟及び移動におけるHMGB1の役割:Immune response_Role of HMGB1 in dendritic cell maturation and migration)
IL-6、CD80、CD40(TNFRSF5)、IFN-gamma、TNF-alpha
(免疫反応HMGB1/RAGEシグナルパスウェイ:Immune response_HMGB1/RAGE signaling pathway)
IL-6、MIP-1-beta、PI3Kcat class IA、IL-1 alpha、PAI1、VCAM1、TNF-alpha
[転写{転写サイレンシングにおけるヘテロクロマチンタンパク質1(HP1)ファミリーの役割}:Transcription_Role of heterochromatin protein 1 (HP1) family in transcriptional silencing]
Cyclin A2、HP1 alpha(Heterochromatin Protein 1 alpha)、HP1 gamma(Heterochromatin Protein 1 gamma)、HP1(Heterochromatin Protein 1)、DNMT3A(DNA methyltransferase 3 alpha)、Histone H4
(免疫反応HSP60及びHSP70/TLRシグナルパスウェイ:Immune response_HSP60 and HSP70/ TLR signaling pathway)
CD69: 表面抗原CD69、IL-6、HSP70(heat shock protein 70)、IL-10、CD80、CD40(TNFRSF5)、TNF-alpha
(CF中のTh17細胞:Th17 cells in CF)
IL-1RI、IL-6、ROR-gamma、IL-17F、CD80、IL-17、VCAM1
(乾癬IL-23/T17発症軸の役割:Role of IL-23/ T17 pathogenic axis in psoriasis)
IL-1RI、IL-6、ROR-gamma、IL-17F、CD80、IL-17、及びCD40(TNFRSF5)。
(免疫反応タイプ2免疫におけるIL-4応答性遺伝子:Immune response_IL-4-responsive genes in type 2 immunity)
COX-2 (PTGS2)、IL-10、VCAM1、CD40(TNFRSF5)、CD36、CCL13、Eotaxin-2、CCL7(C-C motif chemokine ligand 7)
(脂肪細胞分化におけるフタル酸ジエチルヘキシル及びトリブチルスズの役割:Role of Diethylhexyl Phthalate and Tributyltin in fat cell differentiation)
A-FABP(Adipocytefatty acid-binding protein)、LXR-alpha、CD36、LPL、C/EBPalpha(CCAAT/enhancer binding protein alpha)
(スキーマ:アレルギー性接触皮膚炎のT細胞動員の開始:Schema: Initiation of T cellrecruitment in allergic contact dermatitis)
VCAM1、IFN-gamma、IP10、TNF-alpha
(結腸直腸癌:Colorectal cancer)
HGF、IL-6、HGF receptor (Met)、Frizzled、TNF-alpha
(走化性C5a誘導走化性:Chemotaxis_C5a-induced chemotaxis)
RAP-1A、ALPHA-PIX(Rho guanine nucleotide exchange factor 6)、HSP27(Heat shock protein 27)、PAK1、PLD1、PLC-beta
(緑内障における網膜神経節細胞損傷:Retinal ganglion cell damage in glaucoma)
BAD(BCL2 associated agonist of cell death)、Endothelin-1、C1q、Factor H、EDNRB(endothelin receptortype B)、TNF-alpha
{免疫反応(免疫反応におけるPGE2シグナル伝達):Immune response_PGE2 signaling in immune response}
HGF、COX-2 (PTGS2)、IL-10、MIP-1-beta、IFN-gamma、TNF-alpha
(免疫反応TLR3及びTLR4誘導TICAM1-特異的シグナルパスウェイ:Immune response_TLR3 and TLR4 induced TICAM1-specific signaling pathway)
TLR3、IFN-alpha、IFN-beta、TRIF (TICAM1)
(ビスフェノールAによる脂肪細胞分化の刺激の推定経路:Putative pathways forstimulation of fat cell differentiation by Bisphenol A)
A-FABP、GATA-2(GATA binding protein 2)、PI3K cat class IA、LPL、C/EBPalpha
(免疫反応JAK/STAT、p38、JNK及びNF-kBを介したIL-3シグナル伝達:Immune response_IL-3 signaling via JAK/STAT, p38, JNK and NF-kB)
BAD、CD69、Cyclin A2、IL-6、Bcl-6、ID1(inhibitor of DNA binding 1, HLH protein)、NOTCH4、PI3K cat class IA、CD40(TNFRSF5)
(転写骨粗鬆症関与遺伝子の制御におけるVDRの役割:Transcription_Role of VDR inregulation of genes involved in osteoporosis)
IL-6、Calcitonin: カルシトニン、VDR(vitamin D receptor)、IL-1 alpha、IFN-gamma、RANK(receptor activator of nuclear factor kappa B; TNFRSF11A): 腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーメンバー11a、TNF-alpha
4週目(非アルコール性脂肪性肝炎発症期)の非アルコール性脂肪性肝炎マウス作製由来の脂肪由来細胞の表面抗原と12週目(非アルコール性脂肪性肝炎が進行している)の非アルコール性脂肪性肝炎マウス作製由来の脂肪由来細胞の表面抗原を比較した(図5)。
CD29、CD45及びCD44は、非アルコール性脂肪性肝炎が進行するにつれて、発現量が減少することを確認した。
以上により、CD29、CD45及びCD44は、非アルコール性脂肪性肝炎の進行度合い(重篤度)のマーカーになることを確認した。
加えて、CD29、CD45及びCD44は、非アルコール性脂肪性肝炎の治療評価判定のマーカーにもなる。より詳しくは、非アルコール性脂肪性肝炎の治療方法が成功していれば、CD29、CD45及びCD44の発現量が減少しない、又は、該治療方法が成功していなければCD29、CD45及びCD44の発現量が減少する。
Claims (9)
- 被験者から得られた生体試料中の以下の(1)〜(51)のいずれか1以上から選ばれたマーカーを測定する工程を含む、非アルコール性脂肪性肝炎の検出方法又は検出を補助する方法、
(1)T細胞サブセット分泌シグナルに関与する遺伝子、
(2)Native CD4+ T細胞分化に関与する遺伝子、
(3)G-proteinsignaling_Cross-talk between Ras-family GTPasesに関与する遺伝子、
(4)関節炎におけるサイト/ケモカイン発現におけるPDE4調節に関与する遺伝子、
(5)Th17、Th22及びTh9細胞分化に関与する遺伝子、
(6)酸化的リン酸化に関与する遺伝子、
(7)加齢黄斑変性におけるNALP3インフラマソーム活性に関与する遺伝子、
(8)SLEにおけるB細胞の役割に関与する遺伝子、
(9)IL-10シグナルパスウェイに関与する遺伝子、
(10)COPDにおける細胞間関連に関与する遺伝子、
(11)Tヘルパー細胞の免疫反応ICOSシグナルパスウェイに関与する遺伝子、
(12)アテローム性動脈硬化症に関与する遺伝子の発現の制御におけるZNF202の役割に関与する遺伝子、
(13)上皮間葉転換(EMT)の発生制御に関与する遺伝子、
(14)SLEにおけるNETosisに関与する遺伝子、
(15)IL-1シグナルパスウェイに関与する遺伝子、
(16)ストレス誘導抗ウイルス性細胞反応におけるPKRの役割に関与する遺伝子、
(17)抗原提示細胞(APC)のSLE遺伝マーカー特異的パスウェイに関与する遺伝子、
(18)脂質代謝の制御{脂肪代謝のG-アルファ(q)制御}に関与する遺伝子、
(19)RNAウイルス感染への先天性免疫反応に関与する遺伝子、
(20)CD8+ T細胞の分化及びクローン増殖に関与する遺伝子、
(21)ストレス誘導アポトーシスにおけるPKRのアポトーシス及び生存の役割に関与する遺伝子、
(22)MAPKsを介した炎症誘発性サイトカインのP物質刺激発現に関与する遺伝子、
(23)IL-33シグナルパスウェイに関与する遺伝子、
(24)ユビキノン代謝に関与する遺伝子、
(25)MIF媒介性グルココルチコイド制御に関与する遺伝子、
(26)加齢黄斑変性の病因における脂質輸送異常及び代謝異常に関与する遺伝子、
(27)IL-18シグナル伝達に関与する遺伝子、
(28)HGFシグナルパスウェイに関与する遺伝子、
(29)Th17細胞分化に関与する遺伝子、
(30)肝細胞におけるIL-6誘導性急性期応答に関与する遺伝子、
(31)IL-23シグナルパスウェイに関与する遺伝子、
(32)慢性関節リウマチに関与する遺伝子、
(33)炎症性皮膚疾患における細胞/ケモカイン発現のPDE4制御に関与する遺伝子、
(34)鎌状赤血球症における物質P媒介性炎症及び疼痛に関与する遺伝子、
(35)樹状細胞成熟及び移動におけるHMGB1の役割に関与する遺伝子、
(36)HMGB1/RAGEシグナルパスウェイに関与する遺伝子、
(37)転写サイレンシングにおけるヘテロクロマチンタンパク質1(HP1)ファミリーの役割に関与する遺伝子、
(38)HSP60及びHSP70/TLRシグナルパスウェイに関与する遺伝子、
(39)CF中のTh17細胞に関与する遺伝子、
(40)乾癬IL-23/T17発症軸の役割に関与する遺伝子、
(41)タイプ2免疫におけるIL-4応答性遺伝子に関与する遺伝子、
(42)脂肪細胞分化におけるフタル酸ジエチルヘキシル及びトリブチルスズの役割に関与する遺伝子、
(43)アレルギー性接触皮膚炎のT細胞動員の開始に関与する遺伝子、
(44)結腸直腸癌に関与する遺伝子、
(45)C5a誘導走化性に関与する遺伝子、
(46)緑内障における網膜神経節細胞損傷に関与する遺伝子、
(47)免疫反応におけるPGE2シグナル伝達に関与する遺伝子、
(48)TLR3及びTLR4誘導TICAM1-特異的シグナルパスウェイに関与する遺伝子、
(49)ビスフェノールAによる脂肪細胞分化の刺激の推定経路に関与する遺伝子、
(50)JAK/STAT、p38、JNK及びNF-kBを介したIL-3シグナル伝達に関与する遺伝子、及び
(51)骨粗鬆症関与遺伝子の制御におけるVDRの役割に関与する遺伝子。
- 測定したマーカーの測定値が、単純性脂肪肝の患者から得られた生体試料中の測定値よりも高い、請求項1に記載の方法。
- さらに、CD29、CD45及び/又はCD44を検出することを含む請求項1又は2に記載の方法。
- 前記マーカーは、以下のいずれか1以上から選ばれる請求項1〜3のいずれか1に記載の方法:
IL-6、IL-10、MIP-1-beta、IL-17F、IL-17、Amphiregulin、IL-1 alpha、IFN-gamma、TNF-beta、TNF-alpha、AHR、ROR-gamma、CD80、c-Maf、CD40(TNFRSF5)、RAP-1A、RalA、p120GAP、M-Ras、PI3K cat class IA、DBS、RhoGAP5、PLD1、IP10、Bcl-6、IL23R、PAK1、BRCC36、Caspase-1、C1q、IL-18R1、CARD5、Fc gamma RII beta、IFN-alpha、OX40(TNFRSF4)、COX-2(PTGS2)、Hemeoxygenase 1、HPGD、I-TAC、CCR2、Cytochrome c、NDUFA7、NDUFS5、NDUFAB1、UQCR11、UQCRB、NDUFB3、NDUFA2、NDUFA13、ATP5H、NDUFA5、NDUFC2、NDUFC1、ATP5I、Beta-adrenergic receptor、ABCA1、PEMT、SDP1、LPL、HDL proteins、HGF、IL-1RI、Endothelin-1、HGF receptor(Met)、NOTCH4、Vimentin、PAI1、PDGF-D、Frizzled、Histone H2、Histone H2A、TLR7、Histone H4、HistoneH1、COX-2 (PTGS2)、TLR3、IFN-beta、TRIF (TICAM1)、MDA-5、LXR-alpha、cPLA2、APOC2、APOC1、CD36、PLC-beta、TANK、CD137ligand(TNFSF9)、ATF-3、eIF4E、PI3K cat class IA (p110-beta)、CCL13、VCAM1、Histone H2B、eNOS、Apaf-1、CXCL16、PLAU(UPA)、Syndecan-1、AGP1 (ORM1)、SAA1、SAA2、MxA、Cyclin A2、HP1 alpha、HP1gamma、HP1、DNMT3A、CD69、HSP70、Eotaxin-2、CCL7、A-FABP、C/EBPalpha、ALPHA-PIX、HSP27、BAD、Factor H、EDNRB、GATA-2、ID1、Calcitonin、VDR、及びRANK(TNFRSF11A)。
- 被験者から得られた生体試料中のCD29、CD45及びCD44のいずれか1から選ばれたマーカーを測定する工程を含む、非アルコール性脂肪性肝炎の重篤度判定測定方法又は重篤度判定測定を補助する方法。
- 非アルコール性脂肪性肝炎治療中の患者から得られた生体試料中のCD29、CD45及びCD44のいずれか1から選ばれたマーカーを測定する工程を含む、非アルコール性脂肪性肝炎の治療評価判定方法又は治療評価判定方法を補助する方法。
- 以下のいずれか1以上に対する抗体又は抗体フラグメントを含む、非アルコール性脂肪性肝炎検出キット:
IL-6、IL-10、MIP-1-beta、IL-17F、IL-17、Amphiregulin、IL-1 alpha、IFN-gamma、TNF-beta、TNF-alpha、AHR、ROR-gamma、CD80、c-Maf、CD40(TNFRSF5)、RAP-1A、RalA、p120GAP、M-Ras、PI3K cat class IA、DBS、RhoGAP5、PLD1、IP10、Bcl-6、IL23R、PAK1、BRCC36、Caspase-1、C1q、IL-18R1、CARD5、Fc gamma RII beta、IFN-alpha、OX40(TNFRSF4)、COX-2(PTGS2)、Heme oxygenase 1、HPGD、I-TAC、CCR2、Cytochrome c、NDUFA7、NDUFS5、NDUFAB1、UQCR11、UQCRB、NDUFB3、NDUFA2、NDUFA13、ATP5H、NDUFA5、NDUFC2、NDUFC1、ATP5I、Beta-adrenergic receptor、ABCA1、PEMT、SDP1、LPL、HDL proteins、HGF、IL-1RI、Endothelin-1、HGF receptor(Met)、NOTCH4、Vimentin、PAI1、PDGF-D、Frizzled、Histone H2、Histone H2A、TLR7、Histone H4、HistoneH1、COX-2 (PTGS2)、TLR3、IFN-beta、TRIF (TICAM1)、MDA-5、LXR-alpha、cPLA2、APOC2、APOC1、CD36、PLC-beta、TANK、CD137ligand(TNFSF9)、ATF-3、eIF4E、PI3K cat class IA (p110-beta)、CCL13、VCAM1、Histone H2B、eNOS、Apaf-1、CXCL16、PLAU(UPA)、Syndecan-1、AGP1 (ORM1)、SAA1、SAA2、MxA、Cyclin A2、HP1 alpha、HP1gamma、HP1、DNMT3A、CD69、HSP70、Eotaxin-2、CCL7、A-FABP、C/EBPalpha、ALPHA-PIX、HSP27、BAD、Factor H、EDNRB、GATA-2、ID1、Calcitonin、VDR、及びRANK(TNFRSF11A)。
- 以下のいずれか1以上に対する抗体又は抗体フラグメントを含む、非アルコール性脂肪性肝炎の重篤度判定キット:
CD29、CD45及びCD44。
- 以下のいずれか1以上に対する抗体又は抗体フラグメントを含む、非アルコール性脂肪性肝炎の治療評価判定キット:
CD29、CD45及びCD44。
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