JP2018116197A - 顕微鏡システム、貼り合わせ画像生成プログラム、及び貼り合わせ画像生成方法 - Google Patents

Abstract

【課題】広画角画像（貼り合わせ画像）の生成や更新の際に観察条件が切り替えられる場合であっても画像を適切に貼り合わせて広画角画像の生成や更新を適切に行うことができるようにする。【解決手段】顕微鏡システムは、観察条件が切り替えられた時に、当該観察条件の切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正情報に基づいて、標本が載置されたステージを移動させる。また、標本の画像を取得し、当該画像取得時の画角情報及びステージの座標を取得し、当該座標を補正情報に基づいて補正し、当該補正後の座標を貼り合わせ画像座標系の座標に変換し、取得した画像を取得した画角情報に基づいてリサイズすると共に変換後の座標に基づいて貼り合わせ画像座標系に配置して貼り合わせ画像を生成する。【選択図】図３

Description

本発明は、標本の画像を貼り合わせて貼り合わせ画像を生成する顕微鏡システム、貼り合わせ画像生成プログラム、及び貼り合わせ画像生成方法に関する。

従来、顕微鏡システムが備える機能として、例えばマップ機能がある。
マップ機能は、標本の観察領域（ミクロ領域）と共に標本のマクロ領域を表示し、表示されたマクロ領域上の対応する位置に観察領域を示す枠（例えば矩形枠）を表示することで、観察者が標本の何れの位置を観察しているのかを確認できるようにした機能である。

このようなマップ機能では、ステージに載置された標本を低倍率で撮影して得た広画角画像、又は、その標本の異なる位置を複数回撮影して得た複数の画像を貼り合わせて生成した広画角画像を表示することにより標本のマクロ領域を表示すると共に、ステージの座標及び観察領域の画角情報に基づいて、その広画角画像上の対応する位置に観察領域を示す対応するサイズの枠を表示するようにしている。また、ステージの移動により観察領域を示す枠が広画角画像上から外れてしまう場合には、その時の観察領域の画像を取得し、その画像を広画角画像に貼り合わせて、広画角画像を更新するようにしている。なお、このようにして生成、更新される広画角画像をマップ画像ともいう。

ところで、観察者は、標本の観察中に観察条件を切り替える場合がある。例えば、対物レンズの倍率、光学ズーム機構のズーム倍率、２次元走査機構の走査幅、使用する光学系等といった観察条件を切り替える場合がある。ここで、対物レンズの倍率の切り替えは、倍率が異なる複数の対物レンズを備えたレボルバを回転させて光路上に配置される対物レンズを切り替えることにより行われる。２次元走査機構は、標本に対してレーザ光源から発せられたレーザ光を２次元方向に走査させるものである。光学系の切り替えは、例えば、カラー観察光学系及び共焦点レーザスキャニング光学系の一方から他方への切り替えである。光学系が切り替えられた場合には、それに伴って使用される光源や撮像部（観察画像を取得する撮像部）等も切り替えられる。

このような観察条件の切り替えが行われた場合は、ステージが移動していないにも関わらず、観察中心位置（観察領域の中心位置）がずれる場合がある。例えば、対物レンズの倍率や光学ズーム機構のズーム倍率が切り替えられた場合には、対物レンズ、レボルバ、光学ズーム機構の夫々の製造誤差等の影響により光学系の芯ずれが発生し、これにより観察中心位置がずれる場合がある。また、２次元走査機構の走査幅が切り替えられた場合には、２次元走査機構の製造誤差等の影響により、観察中心位置がずれる場合がある。また、光学系が切り替えられた場合には、切り替え前に使用されていた撮像部（例えばＣＣＤカメラ）と切り替え後に使用される撮像部（例えば光検出器）の夫々の取付誤差等の影響により、観察中心位置がずれる場合がある。このときの取付誤差は、例えば、撮像面（受光面）に垂直な軸を回転軸とした回転方向の取付誤差等である。

そのため、マップ機能では、観察条件の切り替えが行われると、それに伴う観察中心位置のずれにより、実際の観察領域の位置と広画角画像上に表示されている観察領域を示す枠の位置とが一致しなくなる虞がある。また、広画角画像の生成や更新の際に観察条件の切り替えが行われてしまうと、画像がずれて貼り合わされてしまうために広画角画像の生成や更新を適切に行うことができない虞もある。

なお、マップ機能を備えた顕微鏡システムとして、例えば、次のような顕微鏡装置が知られている。その顕微鏡装置は、表示装置に表示された低倍観察像の所定領域が指定されると、該所定領域の高倍観察像を表示するものであって、予め低倍対物レンズ及び所定ズーム倍率の条件で取得された第１の座標誤差及び第１の倍率誤差と、各高倍対物レンズ及び各ズーム倍率の組み合わせに基づく第２の座標誤差及び第２の倍率誤差とを格納しておき、ユーザが低倍観察像の所定領域を指定すると、その指定領域の中心座標を取得して第１の座標誤差で補正すると共に、拡大する倍率を算出し倍率の誤差を第１の倍率誤差で補正した後、対物レンズの倍率及びズーム倍率の組み合わせにより得られる実倍率のうち前記補正した倍率に最も近い実倍率となる組み合わせを特定し、前記補正した中心座標を第２の座標誤差により補正し、この補正内容に基づいて、対物レンズ、ズーム倍率、ステージ位置を調整する（特許文献１参照）。

特開２００８−２９９０２７号公報

上述のように、観察条件が切り替えられたときのマップ機能の課題として、実際の観察領域の位置と広画角画像上に表示されている観察領域を示す枠の位置とが一致しなくなるという課題、及び、画像がずれて貼り合わされてしまうために広画角画像の生成や更新を適切に行うことができないという課題がある。前者の課題については、特許文献１に記載の技術を適用することにより解決が可能である。しかしながら、後者の課題については、特許文献１では考慮されておらず、依然として未解決のままである。

本発明は、上記実状に鑑み、広画角画像（貼り合わせ画像）の生成や更新の際に観察条件が切り替えられる場合であっても画像を適切に貼り合わせて広画角画像の生成や更新を適切に行うことができる顕微鏡システム、貼り合わせ画像生成プログラム、及び貼り合わせ画像生成方法を提供することを目的とする。

本発明の第１の態様は、標本の画像を貼り合わせて貼り合わせ画像を生成する顕微鏡システムであって、前記標本が載置されるステージと、前記ステージを移動させるステージ駆動部と、前記ステージの座標を取得するステージ座標取得部と、前記標本の画像を取得する第１の撮像部と、観察条件の切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正情報を記憶する記憶部と、前記観察条件が切り替えられた時に前記補正情報に基づいて前記ステージ駆動部に前記ステージを移動させるステージ位置補正部と、前記第１の撮像部により前記標本の画像が取得された時の画角情報を取得する画角情報取得部と、前記第１の撮像部により前記標本の画像が取得された時に前記ステージ座標取得部により取得された前記ステージの座標を、前記補正情報に基づいて補正するステージ座標補正部と、前記ステージ座標補正部により補正された前記ステージの座標を、貼り合わせ画像座標系の座標に変換する座標変換部と、前記第１の撮像部により取得された画像を前記画角情報取得部により取得された画角情報に基づいてリサイズすると共に前記座標変換部により変換された座標に基づいて前記貼り合わせ画像座標系に配置して貼り合わせ画像を生成する貼り合わせ画像生成部と、を備える顕微鏡システムを提供する。

本発明の第２の態様は、第１の態様において、前記観察条件の切り替えは、観察倍率の切り替えであり、前記補正情報は、前記観察倍率の切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正量に関する情報を含む、顕微鏡システムを提供する。

本発明の第３の態様は、第２の態様において、前記補正情報は、複数の異なる観察倍率において、基準とする観察倍率から各観察倍率への切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正量に関する情報を含む、顕微鏡システムを提供する。

本発明の第４の態様は、第２又は第３の態様において、前記観察倍率は、対物レンズの倍率である、顕微鏡システムを提供する。
本発明の第５の態様は、第２又は第３の態様において、前記観察倍率は、光学ズーム機構のズーム倍率である、顕微鏡システムを提供する。

本発明の第６の態様は、第２又は第３の態様において、前記観察倍率は、前記標本に対して光源から発せられた光を２次元方向に走査させる２次元走査機構の走査幅である、顕微鏡システムを提供する。

本発明の第７の態様は、第１の態様において、前記標本の画像を取得する第２の撮像部を更に備え、前記観察条件の切り替えは、観察に使用する撮像部を、前記第１の撮像部及び前記第２の撮像部の一方から他方へ切り替えることであり、前記補正情報は、前記第１の撮像部及び第２の撮像部の一方から他方への切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正量に関する情報を含む、顕微鏡システムを提供する。

本発明の第８の態様は、第１の態様において、前記貼り合わせ画像生成部は、前記撮像部により取得された画像をリサイズして前記貼り合わせ画像座標系に配置するか否かを、前記撮像部により取得された画像のコントラスト値に基づいて決定する、又は、前記撮像部により取得された画像と前記貼り合わせ画像座標系に既に配置されている画像との間でのコントラスト値の比較結果に基づいて決定する、顕微鏡システムを提供する。

本発明の第９の態様は、第１の態様において、前記貼り合わせ画像生成部は、前記ステージ位置補正部が前記ステージ駆動部に前記ステージを移動させている間に前記撮像部により取得された画像に対する前記リサイズ及び前記貼り合わせ画像座標系への配置を行わない、顕微鏡システムを提供する。

本発明の第１０の態様は、顕微鏡システムのコンピュータに、観察条件が切り替えられた時に、前記観察条件の切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正情報に基づいて、標本が載置されたステージを移動させ、前記標本の画像を取得し、当該画像取得時の画角情報及び前記ステージの座標を取得し、当該座標を前記補正情報に基づいて補正し、当該補正後の座標を貼り合わせ画像座標系の座標に変換し、前記画像を前記画角情報に基づいてリサイズすると共に前記変換後の座標に基づいて前記貼り合わせ画像座標系に配置して貼り合わせ画像を生成する、という処理を実行させる貼り合わせ画像生成プログラムを提供する。

本発明の第１１の態様は、顕微鏡システムの貼り合わせ画像生成方法であって、観察条件が切り替えられた時に、前記観察条件の切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正情報に基づいて、標本が載置されたステージを移動させ、前記標本の画像を取得し、当該画像取得時の画角情報及び前記ステージの座標を取得し、当該座標を前記補正情報に基づいて補正し、当該補正後の座標を貼り合わせ画像座標系の座標に変換し、前記画像を前記画角情報に基づいてリサイズすると共に前記変換後の座標に基づいて前記貼り合わせ画像座標系に配置して貼り合わせ画像を生成する、貼り合わせ画像生成方法を提供する。

本発明によれば、広画角画像（貼り合わせ画像）の生成や更新の際に観察条件が切り替えられる場合であっても画像を適切に貼り合わせて広画角画像の生成や更新を適切に行うことができる、という効果を奏する。

一実施の形態に係る顕微鏡システムの構成例を示す図である。 制御装置の構成例を示す図である。 制御装置の機能構成例を示す図である。 対物レンズの倍率の切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正情報の一例を示す図である。 光学ズーム機構のズーム倍率の切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正情報の一例を示す図である。 スキャナ倍率の切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正情報の一例を示す図である。 使用される光学系の切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正情報の一例を示す図である。 表示媒体の表示画面例を示す図である。 対物レンズの倍率が切り替えられた場合に実行される貼り合わせ画像生成処理の一例を示すフローチャートである。 生成された貼り合わせ画像の一例を示す図である。 光学系が切り替えられた場合に実行される貼り合わせ画像生成処理の一例を示すフローチャートである。 図９のＳ１３及びＳ１４（又は図１１のＳ２３及びＳ２４）の処理過程の一部を模式的に示す図である。

以下、図面を参照しながら、本発明の実施の形態について説明する。
図１は、本発明の一実施の形態に係る顕微鏡システムの構成例を示す図である。
図１に示したように、顕微鏡システム１は、カラー観察光学系１０、共焦点レーザスキャニング光学系２０、レボルバ３０、ステージ４０、駆動モータ５０、駆動モータ６０、ステージ位置検知機構７０、及び制御装置８０を備える。

カラー観察光学系１０は、白色光源１１、カラーカメラ１２、光学ズーム機構１３、駆動モータ１４、及びハーフミラー１５を備える。光学ズーム機構１３は、ズームレンズ１３１を備えると共に、駆動モータ１４に接続されている。駆動モータ１４は、制御装置８０の制御によって作動し、光学ズーム機構１３が備えるズームレンズ１３１を、光路上に配置される対物レンズ３１の光軸方向（Ｚ方向）に移動させる。これにより、光学ズーム機構１３のズーム倍率が切り替えられる。

カラー観察光学系１０を用いて観察を行う場合には、白色光源１１から射出される照明光を、ハーフミラー１５で反射させ、光路上に配置される対物レンズ３１を介して標本Ｓに照射する。標本Ｓでの反射光が照明光と同じ光路を辿り、光学ズーム機構１３を介してカラーカメラ１２で検出されることで、カラーの明視野観察画像が取得される。

カラーカメラ１２は、標本Ｓからの反射光を検出し、標本Ｓの観察画像を取得する。カラーカメラ１２としては、ＣＣＤイメージセンサを備えたカメラ（所謂ＣＣＤカメラ）やＣＭＯＳイメージセンサを備えたカメラ等が用いられる。

共焦点レーザスキャニング光学系２０は、レーザ光源２１、ハーフミラー２２、２次元スキャナ２３、ダイクロイックミラー２４、ピンホール２５、及び光検出器２６を備える。ダイクロイックミラー２４は、レーザ光源２１からの照明光を反射し、白色光源１１からの照明光を透過する。ピンホール２５は、光路上に配置される対物レンズ３１の焦点面と略共役な面に配置され、その対物レンズ３１の焦点面上から生じる光のみを通過させる。２次元スキャナ２３は、共焦点レーザスキャニング光学系２０の光路上で照明光の光線の角度を変更することで、標本ＳのＸＹ平面上で照明光を走査する。２次元スキャナ２３は、２次元走査機構の一例であり、例えばガルバノスキャナ等が用いられる。なお、ＸＹ平面は、光路上に配置される対物レンズ３１の光軸に垂直は平面でもある。

共焦点レーザスキャニング光学系２０を用いて観察を行う場合には、レーザ光源２１から射出される照明光をハーフミラー２２、ダイクロイックミラー２４で反射させ、２次元スキャナ２３及び光路上に配置される対物レンズ３１を介して標本Ｓに照射する。２次元スキャナ２３によりその照明光を走査しつつ、照明光と同じ光路を辿ってハーフミラー２２を透過してピンホール２５へ到達する標本Ｓからの反射光のうち、ピンホール２５を通過した光のみが光検出器２６で検出される。従って、共焦点レーザスキャニング光学系２０を用いて観察を行う場合には、白黒の共焦点画像が得られる。

光検出器２６は、標本Ｓからの反射光を検出し、標本Ｓの観察画像を取得する。光検出器２６としては、ＰＭＴ等が用いられる。
なお、カラーカメラ１２及び光検出器２６の一方は第１の撮像部の一例であり、他方は第２の撮像部の一例である。

レボルバ３０は、倍率が異なる複数の対物レンズ３１を備えると共に、駆動モータ５０に接続されている。駆動モータ５０は、制御装置８０の制御によって作動し、レボルバ３０を回転させることで光路上に配置される対物レンズ３１を切り替える（即ち、対物レンズ３１の倍率を切り替える）。また、駆動モータ５０は、光路上に配置される対物レンズ３１の光軸方向（Ｚ方向）へレボルバ３０を移動させる。

ステージ４０は、標本Ｓを載置する。ステージ４０は、駆動モータ６０とステージ位置検知機構７０とに接続されている。駆動モータ６０は、ステージ４０をＸ、Ｙ方向に移動させることで、照明光の照射位置をＸ、Ｙ方向に変更する。Ｘ、Ｙ方向は、光路上に配置される対物レンズ３１の光軸に垂直な方向でもある。ステージ位置検知機構７０は、ステージ４０の位置を検知する。ステージ位置検知機構７０は例えばステージ４０に付属するスケールの値を読み取り、制御装置８０へその値を位置情報として出力する。この位置情報は、ステージ座標系（ＸＹ座標系）における、ステージ４０の座標を表す情報でもある。なお、駆動モータ６０は、ステージ駆動部の一例であり、ステージ位置検知機構７０は、ステージ座標取得部の一例である。

制御装置８０は、顕微鏡システム１の各構成を制御するコンピュータである。
図２は、制御装置８０の構成例を示す図である。
図２に示したように、制御装置８０は、入力インタフェース（入力ＩＦ）８１、出力インタフェース（出力ＩＦ）８２、記憶装置８３、メモリ８４、ＣＰＵ８５、及び可搬記録媒体駆動装置８６を備えていて、それらはバス８７により互いに接続されている。

ＣＰＵ８５は、メモリ８４を利用してプログラムを読み込み、そのプログラムに従って各種処理を実行する。これにより、制御装置８０は、顕微鏡システム１の各構成を制御する。ＣＰＵ８５が実行する各種処理は、貼り合わせ画像生成処理を含む。この貼り合わせ画像生成処理は、観察条件が切り替えられた時に、補正情報に基づいて、標本Ｓが載置されたステージ４０を移動させる処理や、標本Ｓの画像を取得し、当該画像取得時の画角情報及びステージ４０の座標を取得し、当該座標を補正情報に基づいて補正し、当該補正後の座標を貼り合わせ画像座標系（ＵＶ座標系）の座標に変換し、取得した画像を取得した画角情報に基づいてリサイズすると共に変換後の座標に基づいて貼り合わせ画像座標系に配置して貼り合わせ画像を生成する処理を含む。貼りあわせ画像生成処理の具体例については図９及び図１１を用いて後述する。補正情報は、観察条件の切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための情報である。補正情報の具体例については図４乃至図７を用いて後述する。観察条件の切り替えは、例えば、対物レンズ３１の倍率、光学ズーム機構１３のズーム倍率、２次元スキャナの走査幅といった観察倍率の切り替えや、使用する光学系の切り替え（カラー観察光学系１０及び共焦点レーザスキャニング光学系２０の一方から他方への切り替え）等である。

メモリ８４は、例えば、Read Only Memory（ＲＯＭ）、Random Access Memory（ＲＡＭ）などの半導体メモリである。記憶装置８３は、例えば磁気ディスク装置であり、ハードディスクドライブであってもよい。なお、記憶装置８３は、テープ装置であってもよく、フラッシュメモリなどの半導体メモリであってもよい。記憶装置８３は、プログラム、補正情報、観察画像データ、貼り合わせ画像データ等を格納する。記憶装置８３に格納されたプログラム、補正情報、観察画像データ、貼り合わせ画像データは、メモリ８４にロードして使用される。

可搬記録媒体駆動装置８６は、可搬記録媒体８８を駆動する装置であり、可搬記録媒体８８の記録内容にアクセスする。可搬記録媒体８８は、例えば、半導体デバイス（ＵＳＢメモリ等）、磁気的作用により情報が入出力される媒体（磁気ディスク等）、光学的作用により情報が入出力される媒体（ＣＤ−ＲＯＭ、ＤＶＤ等）などである。可搬記録媒体８８は、プログラム、補正情報、観察画像データ、貼り合わせ画像データ等を格納してもよい。可搬記録媒体８８に格納されたプログラム、補正情報、観察画像データ、貼り合わせ画像データが、メモリ８４にロードされ、使用されてもよい。

なお、記憶装置８３、可搬記録媒体８８は、記憶部の一例である。
出力ＩＦ８２は、観察画像データ、貼り合わせ画像データ等を不図示のモニタ等の表示媒体へ画像信号として出力するインタフェースである。入力ＩＦ８１は、例えば、不図示の入力装置（キーボードやマウスなど）からデータを受信するインタフェースであり、観察者からの入力を受け付ける。

図３は、制御装置８０の機能構成例を示す図である。
図３に示したように、制御装置８０は、光源制御部８０１、露光制御部８０２、画像入出力部８０３、走査制御部８０４、変倍制御部８０５、レボルバ制御部８０６、ステージ制御部８０７、画角情報取得部８０８、ステージ座標補正部８０９、座標変換部８１０、及び貼り合わせ画像生成部８１１を備える。なお、これらの各部は、ＣＰＵ８５がプログラムを実行することにより実現されるものである。

光源制御部８０１は、白色光源１１、レーザ光源２１のＯＮ、ＯＦＦを制御する。また、白色光源１１、レーザ光源２１に使用する光源の波長の切り替え等を制御してもよい。
露光制御部８０２は、カラーカメラ１２、光検出器２６の露光を制御する。

光源制御部８０１と露光制御部８０２の制御により、カラー観察光学系１０と共焦点レーザスキャニング光学系２０のいずれかを用いて標本Ｓの撮像を行うかを選択する。用いる光学系の選択は、観察者からの光学系指示入力を検知することで実行される。これにより、使用する光学系の切り替えが行われる。

画像入出力部８０３は、カラーカメラ１２、光検出器２６からの画像信号（標本Ｓの観察画像データ）を受信する。また、画像入出力部８０３は、表示媒体に画像データを出力する。画像入出力部８０３が出力する画像データは、観察画像や貼り合わせ画像生成部８１１により生成された貼り合わせ画像等の画像データである。

走査制御部８０４は、２次元スキャナ２３が標本Ｓを走査する際の走査幅を制御する。なお、この走査幅は、観察倍率に対応することからスキャナ倍率ともいう。走査制御部８０４は、例えば、観察者からのスキャナ倍率指示入力が検知されると、その指示に応じたスキャナ倍率へ切り替わるように２次元スキャナ２３の走査幅を制御する。

変倍制御部８０５は、駆動モータ１４を制御して光学ズーム機構１３のズームレンズ１３１をＺ方向に移動させることにより、光学ズーム機構１３のズーム倍率を制御する。例えば、変倍制御部８０５は、観察者からのズーム倍率指示入力が検知されると、その指示に応じたズーム倍率へ切り替わるように駆動モータ１４を制御する。

レボルバ制御部８０６は、駆動モータ５０の制御によりレボルバ３０を制御して、光路上に配置される対物レンズ３１の切り替えや、レボルバ３０（光路上に配置されている対物レンズ３１）のＺ方向への移動を制御する。例えば、レボルバ制御部８０６は、観察者からの対物レンズ倍率指示入力が検知されると、その指示に応じた倍率の対物レンズ３１が光路上に配置されるように駆動モータ５０を制御する。

ステージ制御部８０７は、駆動モータ６０を制御してステージ４０の移動を制御する。
例えば、ステージ制御部８０７は、観察者からのステージ移動指示入力が検知されると、その指示に応じたステージ移動が行われるように駆動モータ５０を制御する。また、ステージ制御部８０７は、観察条件が切り替えられた時に、補正情報に基づいて駆動モータ６０を制御してステージ４０を移動させる。なお、ステージ制御部８０７は、ステージ位置補正部の一例である。

画角情報取得部８０８は、カラーカメラ１２又は光検出器２６により観察画像が取得された時（その観察画像の画像信号を画像入出力部８０３が受信した時）に、当該観察画像の画角情報を取得する。画角情報は、使用される光学系がカラー観察光学系１０である場合には、光路上に配置される対物レンズ３１の倍率及び光学ズーム機構１３のズーム倍率に基づいて取得され、使用される光学系が共焦点レーザスキャニング光学系２０である場合には、光路上に配置される対物レンズ３１の倍率及びスキャナ倍率に基づいて取得される。

ステージ座標補正部８０９は、カラーカメラ１２又は光検出器２６により観察画像が取得された時にステージ位置検知機構により取得された位置情報が示す座標（ステージ４０の座標）を、補正情報に基づいて補正する。

座標変換部８１０は、ステージ座標補正部８０９により補正された座標を、貼り合わせ画像座標系の座標に変換する。なお、貼り合わせ画像座標系は、貼り合わせ画像生成部８１１が貼り合わせ画像を生成する際に使用される仮想的な座標系である。

貼り合わせ画像生成部８１１は、カラーカメラ１２又は光検出器２６により取得された観察画像（画像入出力部８０３が受信した観察画像）を、画角情報取得部により取得された画角情報に基づいてリサイズすると共に座標変換部８１０により変換された座標に基づいて貼り合わせ画像座標系に配置して貼り合わせ画像を生成する。

図４乃至図７は、補正情報の一例を示す図である。
図４は、対物レンズ３１の倍率の切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正情報の一例を示す図である。図５は、光学ズーム機構１３のズーム倍率の切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正情報の一例を示す図である。図６は、スキャナ倍率の切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正情報の一例を示す図である。図７は、使用される光学系の切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正情報の一例を示す図である。

図４に示した補正情報は、レボルバ３０が備える複数の異なる対物レンズ３１の倍率（５ｘ、１０ｘ、２０ｘ、５０ｘ、１００ｘ）において、基準とする対物レンズ３１の倍率（１０ｘ）から各対物レンズ３１の倍率への切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正量に関する情報である。各補正量は、Ｘ方向及びＹ方向の補正量（Δｘ、Δｙ）として表される。なお、この補正量は、対物レンズ３１の倍率が切り替えられた場合に切り替え前後の各対物レンズ３１の製造誤差等の影響により生じる光学系の芯ずれによる観察中心位置のずれを補正するものである。

図４に示した補正情報によれば、例えば、光路上に配置される対物レンズ３１の倍率が、１０ｘから２０ｘへ切り替えられた場合の補正量は、Ｘ方向の補正量が８μｍ、Ｙ方向の補正量が７μｍになることを示している。また、この補正量は、対物レンズ３１の倍率が１０ｘから２０ｘに切り替えられた場合に、観察中心位置がＸ方向に−８μｍずれ、Ｙ方向に−７μｍずれることを示すものでもある。

なお、対物レンズ３１の倍率の切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正情報は、図４に示した補正情報の他、基準とする対物レンズ３１の倍率を１０ｘ以外の各倍率としたときの、当該倍率から各対物レンズ３１の倍率への切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正量に関する情報も有する。

図５に示した補正情報は、光学ズーム機構１３における複数の異なるズーム倍率（１．０ｘ、１．１ｘ、１．２ｘ・・・８．０ｘ）において、基準とするズーム倍率（１．０ｘ）から各ズーム倍率への切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正量に関する情報である。各補正量は、Ｘ方向及びＹ方向の補正量（Δｘ、Δｙ）として表される。なお、この補正量は、光学ズーム機構１３におけるズーム倍率が切り替えられた場合に光学ズーム機構１３の製造誤差等の影響により生じる光学系の芯ずれによる観察中心位置のずれを補正するものである。

図５に示した補正情報によれば、例えば、ズーム倍率が１．０ｘから２．０ｘへ切り替えられた場合の補正量は、Ｘ方向の補正量が５μｍ、Ｙ方向の補正量が９μｍになることを示している。また、この補正量は、ズーム倍率が１．０ｘから２．０ｘへ切り替えられた場合に、観察中心位置がＸ方向に−５μｍずれ、Ｙ方向に−９μｍずれることを示すものでもある。

なお、光学ズーム機構１３のズーム倍率の切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正情報は、図５に示した補正情報の他、基準とするズーム倍率を１．０ｘ以外の各ズーム倍率としたときの、当該ズーム倍率から各ズーム倍率への切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正量に関する情報も有する。

図６に示した補正情報は、２次元スキャナ２３における複数の異なるスキャナ倍率（１．０ｘ、１．１ｘ、１．２ｘ・・・８．０ｘ）において、基準とするスキャナ倍率（１．０ｘ）から各スキャナ倍率への切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正量に関する情報である。各補正量は、Ｘ方向及びＹ方向の補正量（Δｘ、Δｙ）として表される。なお、この補正量は、スキャナ倍率が切り替えられた場合に、２次元スキャナ２３の製造誤差等の影響による観察中心位置のずれを補正するものである。

図６に示した補正情報によれば、例えば、スキャナ倍率が、１．０ｘから３．０ｘへ切り替えられた場合の補正量は、Ｘ方向の補正量が４μｍ、Ｙ方向の補正量が−６μｍになることを示している。また、この補正量は、スキャナ倍率が、１．０ｘから３．０ｘへ切り替えられた場合に、観察中心位置がＸ方向に−４μｍずれ、Ｙ方向に６μｍずれることを示すものでもある。

なお、スキャナ倍率の切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正情報は、図６に示した補正情報の他、基準とするスキャナ倍率を１．０ｘ以外の各スキャナ倍率としたときの、当該スキャナ倍率から各スキャナ倍率への切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正量に関する情報も有する。

図７に示した補正情報は、カラー観察光学系１０及び共焦点レーザスキャニング光学系２０において、基準とする光学系（カラー観察光学系１０）から各光学系への切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正量に関する情報である。各補正量は、Ｘ方向及びＹ方向の補正量（Δｘ、Δｙ）として表される。なお、この補正量は、光学系が切り替えられた場合に、切り替え前に使用されていたカラーカメラ１２と切り替え後に使用される光検出器２６の取付誤差（撮像面（受光面）に垂直な軸を回転軸とした回転方向の取付誤差等）等の影響による観察中心位置のずれを補正するものである。

図７に示した補正情報によれば、カラー観察光学系１０から共焦点レーザスキャニング光学系２０へ切り替えられた場合の補正量は、Ｘ方向の補正量が８μｍ、Ｙ方向の補正量が７μｍになることを示している。また、この補正量は、カラー観察光学系１０から共焦点レーザスキャニング光学系２０へ切り替えられた場合に、観察中心位置がＸ方向に−８μｍずれ、Ｙ方向に−７μｍずれることを示すものでもある。

なお、使用される光学系の切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正情報は、図７に示した補正情報の他、基準とする光学系を共焦点レーザスキャニング光学系２０としたときの、当該共焦点レーザスキャニング光学系２０から各光学系への切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正量に関する情報も有する。

以上のように構成された顕微鏡システム１は、マップ機能を備えており、表示媒体に標本Ｓの観察領域（ミクロ領域）と共に標本Ｓのマクロ領域を表示し、表示されたマクロ領域上の対応する位置に観察領域を示す矩形枠を表示することより、観察者が標本Ｓの何れの位置を観察しているのかを確認できるようにしている。ここで、標本Ｓの観察領域の表示は、標本Ｓの観察画像（ライブ画像）を取得し、その観察画像の表示により行われる。標本Ｓのマクロ領域の表示は、標本Ｓの画像を複数取得し、その複数の画像を貼り合わせて生成した貼り合わせ画像の表示により行われる。あるいは、標本Ｓの低倍率画像を取得し、その低倍率画像の表示により行われてもよい。表示されたマクロ領域上の矩形枠の表示は、観察領域の画角情報等に基づいて、表示された貼り合わせ画像上の対応する位置に対応するサイズの矩形枠を表示することにより行われる。

図８は、このときの表示媒体の表示画面例を示す図である。
図８に示したように、表示画面９０には、標本Ｓの観察領域（観察画像９１）が表示されると共に標本Ｓのマクロ領域（貼り合わせ画像９２）が表示され、表示されたマクロ領域上の対応する位置に対応するサイズで観察領域を示す矩形枠９３が表示される。

また、顕微鏡システム１は、観察領域の移動により、表示されているマクロ領域上から矩形枠が外れてしまう場合には、その時の観察領域の画像を取得して、その画像を更に貼り合わせて貼り合わせ画像の更新を行う。

また、顕微鏡システム１は、貼り合わせ画像の生成や更新の際に観察条件の切り替えが行われた場合であっても画像を適切に貼り合わせて貼り合わせ画像の生成や更新が適切に行われるように、観察条件の切り替えが行われた場合には次のような貼り合わせ画像生成処理を実行する。

図９は、対物レンズ３１の倍率が切り替えられた場合に実行される貼り合わせ画像生成処理の一例を示すフローチャートである。
図９において、Ｓ１１では、観察者からの対物レンズ倍率指示入力に応じて、レボルバ制御部８０６が、駆動モータ５０を制御してレボルバ３０を回転させ、その指示に応じた倍率の対物レンズ３１を光路上に配置させる。ここでは、これにより光路上に配置される対物レンズ３１の倍率が１０ｘから２０ｘへ切り替えられたとする。また、このときは、光学系としてカラー観察光学系１０が使用されていて、光学ズーム機構１３のズーム倍率が１．０ｘであったとする。

Ｓ１２では、ステージ制御部８０７が、補正情報に基づいて駆動モータ６０を制御し、ステージ４０を移動させる。より詳しくは、Ｓ１１での対物レンズ３１の倍率の切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するように、補正情報に基づいて駆動モータ６０を制御してステージ４０を移動させる。この場合は、対物レンズ３１の倍率が１０ｘから２０ｘへ切り替えられた場合であるので、図４に示した補正情報に基づいて、ステージ４０をＸ方向へ−８μｍ、Ｙ方向へ−７μｍ移動させる。すなわち、対物レンズ３１の倍率の切り替えに伴う観察中心位置のずれに追従するように、ステージ４０を移動させる。

Ｓ１３では、Ｓ１２でのステージ４０の移動が終了した後にカラーカメラ１２により取得された観察画像を画像入出力部８０３が受信する。また、画角情報取得部８０８は、この時の画角情報を取得する。ステージ座標補正部８０９は、この時にステージ位置検知機構７０により検知されたステージ４０の位置情報が示す座標（ｘ，ｙ）を、図４に示した補正情報に基づいて補正する。この補正では、次式（１）、（２）を用いて、補正後の座標（ｘ´，ｙ´）を算出する。
ｘ´＝ｘ＋Δｘ 式（１）
ｙ´＝ｙ＋Δｙ 式（２）

この場合は、対物レンズ３１の倍率が１０ｘから２０ｘへ切り替えられた場合であるので、図４に示した補正情報に基づいて、Δｘが８μｍ、Δｙが７μｍとして、補正後の座標（ｘ´，ｙ´）が算出される。

Ｓ１４では、座標変換部８１０が、Ｓ１３で算出された補正後の座標（ｘ´，ｙ´）を、貼り合わせ画像座標系の座標（ｕ，ｖ）に変換する。この変換では、次式（３）、（４）を用いて、変換後の座標（ｕ，ｖ）を算出する。
ｕ＝Ｍａｐ＿ｕ×（ｘ´／マップ表示画角＿ｘ） （３）
ｖ＝Ｍａｐ＿ｖ×（ｙ´／マップ表示画角＿ｙ） （４）

ここで、Ｍａｐ＿ｕは、表示媒体の表示画面における貼り合わせ画像が表示され得る表示領域に対応する貼り合わせ画像座標系の領域（以下、「マップ領域」という）のＵ方向の範囲を示し、Ｍａｐ＿ｖは、そのマップ領域のＶ方向の範囲を示す。また、マップ表示画角＿ｘは、表示媒体の表示画面における貼り合わせ画像が表示され得る表示領域に対応する範囲の画角のＸ方向範囲を示し、マップ表示画角＿ｙは、その表示領域に対応する範囲の画角のＹ方向範囲を示す。

また、貼り合わせ画像生成部８１１は、Ｓ１３で画像入出力部８０３が受信した観察画像を、Ｓ１３で画角情報取得部８０８が取得した画角情報に基づいてリサイズする。このリサイズでは、次式（５）、（６）を用いて、リサイズ後の観察画像のＵ方向範囲（観察範囲＿ｕ）及びＶ方向範囲（観察範囲＿ｖ）を算出し、その両方の範囲で規定されるサイズにリサイズする。

観察範囲＿ｕ＝Ｍａｐ＿ｕ×（観察画像画角＿ｘ／マップ表示画角＿ｘ） （５）
観察範囲＿ｖ＝Ｍａｐ＿ｖ×（観察画像画角＿ｙ／マップ表示画角＿ｙ） （６）
ここで、観察画像画角＿ｘは、観察画像の画角のＸ方向範囲を示し、観察画像画角＿ｙは、観察画像の画角のＹ方向範囲を示す。

そして、貼り合わせ画像生成部８１１は、リサイズした観察画像を、貼り合わせ画像座標系における上記の変換後の座標（ｕ，ｖ）に配置し、このときにマップ領域に配置されている画像を貼り合わせて貼り合わせ画像を生成（更新）する。なお、生成された貼り合わせ画像は、画像入出力部８０３により表示媒体へ出力され、表示媒体により表示される。また、このときには、表示された貼り合わせ画像上において、リサイズ後の観察画像が配置された領域に対応する画像領域が矩形枠として表示される。

その後、例えば、観察者からのステージ４０の移動指示が入力された場合には、ステージ制御部８０７が、その移動指示に応じて駆動モータ６０を制御してステージ４０を移動させると共に、上述のＳ１３及びＳ１４の処理が行われる。

このような処理により、貼り合わせ画像の生成や更新の際に対物レンズ３１の倍率が切り替えられた場合であっても、その切り替えに伴う観察中心位置のずれにより画像がずれて貼り合わされることは無く、貼り合わせ画像の生成や更新を適切に行うことができる。

図１０は、このようにして生成された貼り合わせ画像の一例を示す図である。
図１０に示した貼り合わせ画像は、対物レンズ３１の切り替え前（即ち対物レンズの倍率が１０ｘのとき）に取得、リサイズされた標本Ｓの複数の観察画像９１１と、対物レンズ３１の切り替え後（即ち対物レンズの倍率が２０ｘのとき）に取得、リサイズされた標本Ｓの複数の観察画像９１２と、を貼り合わせて生成された貼り合わせ画像である。

図１１は、光学系が切り替えられた場合に実行される貼り合わせ画像生成処理の一例を示すフローチャートである。
図１１において、Ｓ２１では、観察者からの光学系指示入力に応じて、光源制御部８０１は制御対象を白色光源１１又はレーザ光源２１へ切り替え、露光制御部８０２は制御対象をカラーカメラ１２又は光検出器２６へ切り替える。ここでは、カラー観察光学系１０が使用されているときに共焦点レーザスキャニング光学系２０が指示され、光源制御部８０１が制御対象を白色光源１１からレーザ光源２１へ切り替え、露光制御部８０２が制御対象をカラーカメラ１２から光検出器２６へ切り替えたとする。また、このときは、対物レンズ３１の倍率が１０ｘ、スキャナ倍率が１．０ｘであったとする。

Ｓ２２では、ステージ制御部８０７が、補正情報に基づいて駆動モータ６０を制御し、ステージ４０を移動させる。より詳しくは、Ｓ２１での光学系の切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するように、補正情報に基づいて駆動モータ６０を制御してステージ４０を移動させる。この場合は、カラー観察光学系１０から共焦点レーザスキャニング光学系２０への切り替え（カラーカメラ１２から光検出器２６への切り替え）であるので、図７に示した補正情報に基づいて、ステージ４０をＸ方向へ−８μｍ、Ｙ方向へ−７μｍ移動させる。すなわち、光学系の切り替えに伴う観察中心位置のずれに追従するように、ステージ４０を移動させる。

Ｓ２３では、Ｓ２２でのステージ４０の移動が終了した後に光検出器２６により取得された観察画像を画像入出力部８０３が受信する。また、画角情報取得部８０８は、この時の画角情報を取得する。ステージ座標補正部８０９は、この時にステージ位置検知機構７０により検知されたステージ４０の位置情報が示す座標（ｘ，ｙ）を、図７に示した補正情報に基づいて補正する。この補正では、上述の式（１）、（２）を用いて、補正後の座標（ｘ´，ｙ´）を算出する。この場合は、カラー観察光学系１０から共焦点レーザスキャニング光学系２０への切り替えであるので、図７に示した補正情報に基づいて、Δｘが８μｍ、Δｙが７μｍとして、補正後の座標（ｘ´，ｙ´）が算出される。

Ｓ２４では、座標変換部８１０が、Ｓ２３で算出された補正後の座標（ｘ´，ｙ´）を、貼り合わせ画像座標系の座標（ｕ，ｖ）に変換する。この変換では、上述の式（３）、（４）を用いて、変換後の座標（ｕ，ｖ）を算出する。

また、貼り合わせ画像生成部８１１は、Ｓ２３で画像入出力部８０３が受信した観察画像を、Ｓ２３で画角情報取得部８０８が取得した画角情報に基づいてリサイズする。このリサイズでは、上述の式（５）、（６）を用いて、リサイズ後の観察画像のＵ方向範囲及びＶ方向範囲を算出し、その両方の範囲で規定されるサイズにリサイズする。

そして、貼り合わせ画像生成部８１１は、リサイズした観察画像を、貼り合わせ画像座標系における上記の変換後の座標（ｕ，ｖ）に配置し、このときにマップ領域に配置されている画像を貼り合わせて貼り合わせ画像を生成（更新）する。生成された貼り合わせ画像は、画像入出力部８０３により表示媒体へ出力され、表示媒体により表示される。また、このときには、表示された貼り合わせ画像上において、リサイズ後の観察画像が配置された領域に対応する画像領域が矩形枠として表示される。

その後、例えば、観察者からのステージ４０の移動指示が入力された場合には、ステージ制御部８０７が、その移動指示に応じて駆動モータ６０を制御してステージ４０を移動させると共に、上述のＳ２３及びＳ２４の処理が行われる。

このような処理により、貼り合わせ画像の生成や更新の際に光学系が切り替えられた場合であっても、その切り替えに伴う観察中心位置のずれにより画像がずれて貼り合わされることは無く、貼り合わせ画像の生成や更新を適切に行うことができる。

なお、図示はしないが、光学ズーム機構１３のズーム倍率が切り替えられた場合には、例えば図５に示した補正情報に基づいて同様にして貼り合わせ画像生成処理が実行される。また、２次元スキャナ２３のスキャナ倍率が切り替えられた場合には、例えば図６に示した補正情報に基づいて同様にして貼り合わせ画像生成処理が実行される。

また、このような貼り合わせ画像生成処理では、観察条件が切り替えられた時に行われるステージ４０の移動中（例えば図９のＳ１２や図１１のＳ２２でのステージの移動中）において取得された観察画像のリサイズ及び貼り合わせ画像座標系への配置は行われない。これは、ステージ４０の位置が補正されていない状態で取得された観察画像並びにその時の画角情報及びステージ４０の座標に基づいてリサイズ及び貼り合わせ画像座標系への配置が行われてしまうと、貼り合わせ画像の生成が適切に行われないからである。

図１２は、図９のＳ１３及びＳ１４（又は図１１のＳ２３及びＳ２４）の処理過程の一部を模式的に示す図である。
図１２に示したように、Ｓ１３及びＳ１４（又はＳ２３及びＳ２４）の処理では、現在の観察中心位置であるステージ４０の座標（ｘ，ｙ）が、補正情報（Δｘ，Δｙ）に基づいて補正されて補正後の座標（ｘ´，ｙ´）が得られ、更に貼り合わせ画像座標系の座標に変換されて変換後の座標（ｕ，ｖ）が得られる。また、リサイズ後の観察画像のサイズを規定する観察範囲＿ｕ、観察範囲＿ｖが求められ、その両方で規定されるサイズにリサイズされた観察画像が、貼り合わせ画像座標系における変換後の座標（ｕ，ｖ）に配置される。

以上のように、本実施形態に係る顕微鏡システム１によれば、貼り合わせ画像の生成や更新の際に観察条件が切り替えられた場合であっても、画像を適切に貼り合わせて貼り合わせ画像の生成や更新を適切に行うことができる。

なお、本実施形態に係る顕微鏡システム１では、次のような変形が可能である。
例えば、貼り合わせ画像生成部８１１は、カラーカメラ１２又は光検出器２６により取得された観察画像をリサイズして貼り合わせ画像座標系に配置するか否かを、その観察画像のコントラスト値に基づいて決定するようにしてもよい。この場合は、例えば、そのコントラスト値が所定値未満である場合には、リサイズ及び貼り合わせ画像座標系への配置を行わないようにしてもよい。このようにする理由は、例えば、観察倍率が高倍率へ切り替えられた場合（高倍率の対物レンズ３１へ切り替えられた場合等）に、取得される観察画像においてボケが生じたり焦点位置がずれたりしてコントラストが低下する虞があり、このような画像が貼り合わされてしまうと、貼り合わせ画像の画質が劣化するからである。

あるいは、貼り合わせ画像生成部８１１は、カラーカメラ１２又は光検出器２６により取得された観察画像をリサイズして貼り合わせ画像座標系に配置するか否かを、その観察画像と貼り合わせ画像座標系に既に配置されている画像との間でのコントラスト値の比較結果に基づいて決定するようにしてもよい。この場合は、例えば、観察画像のコントラスト値が貼り合わせ画像座標系に既に配置されている画像のコントラスト値よりも低く且つ所定値以上の差がある場合には、リサイズ及び貼り合わせ画像座標系への配置を行わないようにしてもよい。これも、生成される貼り合わせ画像の画質劣化を防止するために行われる。

また、例えば、顕微鏡システム１は、光学ズーム機構１３及び駆動モータ１４を備えない構成としてもよいし、カラー観察光学系１０を備えない構成としてもよいし、共焦点レーザスキャニング光学系２０を備えない構成としてもよい。

以上、上述した実施形態は、発明の理解を容易にするために本発明の具体例を示したものであり、本発明は上述の実施形態に限定されるものではない。本発明は、特許請求の範囲に規定された本発明の思想を逸脱しない範囲において、さまざまな変形、変更が可能である。

１ 顕微鏡システム
１０ カラー観察光学系
１１ 白色光源
１２ カラーカメラ
１３ 光学ズーム機構
１４ 駆動モータ
１５ ハーフミラー
２０ 共焦点レーザスキャニング光学系
２１ レーザ光源
２２ ハーフミラー
２３ ２次元スキャナ
２４ ダイクロイックミラー
２５ ピンホール
２６ 光検出器
３０ レボルバ
３１ 対物レンズ
４０ ステージ
５０、６０ 駆動モータ
７０ ステージ位置検知機構
８０ 制御装置
８１ 入力インタフェース（入力ＩＦ）
８２ 出力インタフェース（出力ＩＦ）
８３ 記憶装置
８４ メモリ
８５ ＣＰＵ
８６ 可搬記録媒体駆動装置
８７ バス
８８ 可搬記録媒体
９０ 表示画面
９１ 観察画像
９２ 貼り合わせ画像
９３ 矩形枠
１３１ ズームレンズ
８０１ 光源制御部
８０２ 露光制御部
８０３ 画像入出力部
８０４ 走査制御部
８０５ 変倍制御部
８０６ レボルバ制御部
８０７ ステージ制御部
８０８ 画角情報取得部
８０９ ステージ座標補正部
８１０ 座標変換部
８１１ 貼り合わせ画像生成部
９１１、９１２ 観察画像
Ｓ 標本

Claims (11)

1. 標本の画像を貼り合わせて貼り合わせ画像を生成する顕微鏡システムであって、
   前記標本が載置されるステージと、
   前記ステージを移動させるステージ駆動部と、
   前記ステージの座標を取得するステージ座標取得部と、
   前記標本の画像を取得する第１の撮像部と、
   観察条件の切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正情報を記憶する記憶部と、
   前記観察条件が切り替えられた時に前記補正情報に基づいて前記ステージ駆動部に前記ステージを移動させるステージ位置補正部と、
   前記第１の撮像部により前記標本の画像が取得された時の画角情報を取得する画角情報取得部と、
   前記第１の撮像部により前記標本の画像が取得された時に前記ステージ座標取得部により取得された前記ステージの座標を、前記補正情報に基づいて補正するステージ座標補正部と、
   前記ステージ座標補正部により補正された前記ステージの座標を、貼り合わせ画像座標系の座標に変換する座標変換部と、
   前記第１の撮像部により取得された画像を前記画角情報取得部により取得された画角情報に基づいてリサイズすると共に前記座標変換部により変換された座標に基づいて前記貼り合わせ画像座標系に配置して貼り合わせ画像を生成する貼り合わせ画像生成部と、
   を備えることを特徴とする顕微鏡システム。
2. 前記観察条件の切り替えは、観察倍率の切り替えであり、
   前記補正情報は、前記観察倍率の切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正量に関する情報を含む、
   ことを特徴とする請求項１記載の顕微鏡システム。
3. 前記補正情報は、複数の異なる観察倍率において、基準とする観察倍率から各観察倍率への切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正量に関する情報を含む、
   ことを特徴とする請求項２記載の顕微鏡システム。
4. 前記観察倍率は、対物レンズの倍率である、
   ことを特徴とする請求項２又は３記載の顕微鏡システム。
5. 前記観察倍率は、光学ズーム機構のズーム倍率である、
   ことを特徴とする請求項２又は３記載の顕微鏡システム。
6. 前記観察倍率は、前記標本に対して光源から発せられた光を２次元方向に走査させる２次元走査機構の走査幅である、
   ことを特徴とする請求項２又は３記載の顕微鏡システム。
7. 前記標本の画像を取得する第２の撮像部を更に備え、
   前記観察条件の切り替えは、観察に使用する撮像部を、前記第１の撮像部及び前記第２の撮像部の一方から他方へ切り替えることであり、
   前記補正情報は、前記第１の撮像部及び第２の撮像部の一方から他方への切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正量に関する情報を含む、
   ことを特徴とする請求項１記載の顕微鏡システム。
8. 前記貼り合わせ画像生成部は、前記撮像部により取得された画像をリサイズして前記貼り合わせ画像座標系に配置するか否かを、前記撮像部により取得された画像のコントラスト値に基づいて決定する、又は、前記撮像部により取得された画像と前記貼り合わせ画像座標系に既に配置されている画像との間でのコントラスト値の比較結果に基づいて決定する、
   ことを特徴とする請求項１記載の顕微鏡システム。
9. 前記貼り合わせ画像生成部は、前記ステージ位置補正部が前記ステージ駆動部に前記ステージを移動させている間に前記撮像部により取得された画像に対する前記リサイズ及び前記貼り合わせ画像座標系への配置を行わない、
   ことを特徴とする請求項１記載の顕微鏡システム。
10. 顕微鏡システムのコンピュータに、
    観察条件が切り替えられた時に、前記観察条件の切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正情報に基づいて、標本が載置されたステージを移動させ、
    前記標本の画像を取得し、当該画像取得時の画角情報及び前記ステージの座標を取得し、当該座標を前記補正情報に基づいて補正し、当該補正後の座標を貼り合わせ画像座標系の座標に変換し、前記画像を前記画角情報に基づいてリサイズすると共に前記変換後の座標に基づいて前記貼り合わせ画像座標系に配置して貼り合わせ画像を生成する、
    という処理を実行させることを特徴とする貼り合わせ画像生成プログラム。
11. 顕微鏡システムの貼り合わせ画像生成方法であって、
    観察条件が切り替えられた時に、前記観察条件の切り替えに伴う観察中心位置のずれを補正するための補正情報に基づいて、標本が載置されたステージを移動させ、
    前記標本の画像を取得し、当該画像取得時の画角情報及び前記ステージの座標を取得し、当該座標を前記補正情報に基づいて補正し、当該補正後の座標を貼り合わせ画像座標系の座標に変換し、前記画像を前記画角情報に基づいてリサイズすると共に前記変換後の座標に基づいて前記貼り合わせ画像座標系に配置して貼り合わせ画像を生成する、
    ことを特徴とする貼り合わせ画像生成方法。