JP2017521070A - 改変フォンウィルブランド因子 - Google Patents
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Abstract
Description
本明細書で使用する場合、用語「フォンウィルブランド因子」又は「VWF」は、野生型VWFの生物学的活性、特に、第VIII因子に結合する能力を有する任意のポリペプチドを指す。野生型VWFをコードする遺伝子は、9kbのmRNAに転写され、これは、310,000Daの推定分子量を有する2813アミノ酸のプレプロポリペプチドに翻訳される。このプレプロポリペプチドは、22アミノ酸のシグナルペプチド、741アミノ酸のプロポリペプチド及び成熟サブユニットを含む。741アミノ酸のプロポリペプチドのN末端からの切断は、2050アミノ酸からなる成熟VWFをもたらす。VWFプレプロポリペプチドのアミノ酸配列を配列番号2に示す。別段指示がない限り、VWF分子が配列番号2のすべての残基を含む必要がない場合であっても、本出願におけるVWF残基のアミノ酸の番号づけは配列番号2を参照する。成熟VWFのアミノ酸配列を配列番号4に示す。本明細書で使用する場合、用語「VWF」は、別段指示がない限り、VWFの成熟形態を指す。
D1−D2−D’−D3−A1−A2−A3−D4−B1−B2−B3−C1−C2−CK
用語「血液凝固第VIII因子」、「第VIII因子」及び「FVIII」は、本明細書で互換的に使用される。「血液凝固第VIII因子」は、野生型血液凝固FVIII及び野生型血液凝固FVIIIの凝血原活性を有する野生型血液凝固FVIII誘導体を含む。誘導体は、野生型FVIIIのアミノ酸配列と比較して、欠失、挿入及び/又は付加を有し得る。用語FVIIIは、重鎖及び軽鎖を含む、FVIIIのタンパク質分解的にプロセシングを受けた形態、例えば、活性化前の形態を含む。
本発明の改変VWFは、野生型VWFのものと異なるアミノ酸配列を有する。本発明によれば、改変VWFは、配列番号3で示す野生型VWFのD’ドメインのアミノ酸配列と比較して、そのD’ドメイン内に少なくとも1つのアミノ酸置換を有する。
N−VWF−C−L1−H[式1]
(式中、
NはVWFのN末端部分であり、
L1は化学結合又はリンカー配列であり、
HはHLEPであり、
CはVWFのC末端部分である)。
本発明によれば、ペプチドリンカーによって、治療用ポリペプチド部分をHLEP部分に結合させることができる。リンカーは、非免疫原性であるべきであり、切断不可能なリンカーでもよいし、切断可能なリンカーでもよい。
(a)リンカーが、治療用ポリペプチドの活性化の間にタンパク質分解的に切断されるタンパク質分解的切断部位を含む場合、投与される治療用ポリペプチド自体
(b)治療用ポリペプチドの関与によって活性化若しくは形成されるプロテアーゼによって切断される基質ポリペプチド、又は
(c)凝固若しくは線維素溶解に関与するポリペプチド
に由来する配列を好ましくは含む。
本明細書で使用する場合、「半減期増強ポリペプチド」は、アルブミン、アルブミンファミリーのメンバー、免疫グロブリンGの定常領域及びその断片、生理的条件下でアルブミン、アルブミンファミリーのメンバー及び免疫グロブリン定常領域部分に結合することができる領域及びポリペプチドからなる群から選択される。これは、本明細書に記載の全長の半減期増強タンパク質(例えば、アルブミン、アルブミンファミリーのメンバー若しくは免疫グロブリンGの定常領域)又は凝固因子の治療活性若しくは生物学的活性を安定化する若しくは延長することができる、それらのうちの1つ又は複数の断片でもよい。そのような断片は、HLEP断片が、野生型VWFと比較して少なくとも25%の機能的半減期の延長をもたらす限り、10個以上のアミノ酸の長さのものでもよく、又はHLEP配列由来の少なくとも約15、少なくとも約20、少なくとも約25、少なくとも約30、少なくとも約50、少なくとも約100個若しくはそれ超の連続的なアミノ酸を含んでいてもよく、又はそれぞれのHLEPの特定のドメインの一部若しくはすべてを含んでいてもよい。
用語、「ヒト血清アルブミン」(HSA)及び「ヒトアルブミン」(HA)及び「アルブミン」(ALB)は、本出願において互換的に使用される。用語「アルブミン」及び「血清アルブミン」はより広範であり、ヒト血清アルブミン(並びにその断片及び変異体)並びに他の種由来のアルブミン(並びにその断片及び変異体)を包含する。
N−mVWF−C−L1−A
(式中、NはVWFのN末端部分であり、mVWFは上記の改変VWFであり、CはVWFのC末端部分であり、L1は化学結合又はリンカー配列であり、
Aは上記で定義されるアルブミンである)。
免疫グロブリンG(IgG)定常領域(Fc)は、治療用タンパク質の半減期を増大することが当技術分野で既知である(Dumont JAら2006.BioDrugs 20:151〜160)。重鎖のIgG定常領域は、3つのドメイン(CH1〜CH3)及びヒンジ領域からなる。免疫グロブリン配列は、任意の哺乳動物に由来してもよいし、それぞれサブクラスのIgG1、IgG2、IgG3又はIgG4に由来してもよい。IgG及び抗原結合ドメインを有さないIgG断片もHLEPとして使用することもできる。治療用ポリペプチド部分は、好ましくは、切断可能でさえあり得る抗体のヒンジ領域又はペプチドリンカーを介して、IgG又はIgG断片に結合される。いくつかの特許及び特許出願は、治療用タンパク質のインビボ半減期を増強するための、免疫グロブリン定常領域への治療用タンパク質の融合を記載している。US2004/0087778及びWO2005/001025は、免疫グロブリン定常領域のFcドメイン又は少なくとも一部と、ペプチドの半減期を増大させ、そうでなければインビボで急速に除去されるであろう生物学的に活性なペプチドとの融合タンパク質を記載している。生物学的活性の増強、循環半減期の延長及びより大きな溶解度を達成したFc−IFN−β融合タンパク質が記載された(WO2006/000448)。血清半減期が延長し、インビボでの効力が増大したFc−EPOタンパク質が開示され(WO2005/063808)、並びにG−CSF(WO2003/076567)、グルカゴン様ペプチド−1(WO2005/000892)、凝固因子(WO2004/101740)及びインターロイキン−10(US6,403,077)とのFc融合体が開示され、すべて半減期増強特性を有する。
本発明は、本出願に記載されているように、改変VWF又は前記改変VWFを含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドにさらに関する。用語「ポリヌクレオチド(単数又は複数)」は、一般に、非改変RNA又はDNAでもよいし、改変RNA又はDNAでもよい、任意のポリリボヌクレオチド又はポリデオキシリボヌクレオチドを指す。ポリヌクレオチドは、一本鎖又は二本鎖DNA、一本鎖又は二本鎖RNAであり得る。本明細書で使用する場合、用語「ポリヌクレオチド(単数又は複数)」は、1つ又は複数の改変塩基及び/又は通常とは異なる塩基、例えばイノシンを含むDNA又はRNAも含む。当業者に既知の多くの有用な目的に役立つ様々な改変をDNA及びRNAに行うことができることが理解されよう。本明細書で用いられる場合、用語「ポリヌクレオチド(単数又は複数)」は、そのような化学的に、酵素的に又は代謝的に改変された形態のポリヌクレオチド、並びにウイルス、及び例えば、単純型細胞及び複雑型細胞を含めた細胞に特徴的なDNA及びRNAの化学形態を包含する。
(a)所望の改変タンパク質が発現するような条件下で本発明の宿主細胞を培養すること;及び
(b)場合により、宿主細胞から又は培養培地から所望の改変タンパク質を回収すること。
適切な宿主細胞における組換え突然変異体タンパク質の高レベルでの生成は、当業者に既知の方法に従って、様々な発現系で増殖することができる組換え発現ベクターにおいて、適切な調節エレメントとともに上記の改変cDNAを有効な転写単位へアセンブリーすることを必要とする。有効な転写調節エレメントは、天然の宿主として動物細胞を有するウイルスに由来し得るか、動物細胞の染色体DNAに由来し得る。好ましくは、シミアンウイルス40、アデノウイルス、BKポリオーマウイルス、ヒトサイトメガロウイルス若しくはラウス肉腫ウイルスのロングターミナルリピートに由来するプロモーター−エンハンサーの組合せ、又はβ−アクチン若しくはGRP78のような、動物細胞において構成的に強く転写される遺伝子を含むプロモーター−エンハンサーの組合せを使用することができる。cDNAから転写される安定的な高レベルのmRNAを得るために、転写単位は、その3’近傍部に、転写終結−ポリアデニル化配列をコードするDNA領域を含むべきである。好ましくは、この配列は、シミアンウイルス40初期転写領域、ウサギβ−グロビン遺伝子又はヒト組織プラスミノーゲンアクチベーター遺伝子に由来する。
上記のタイプの分泌細胞の培地中に蓄積する組換え改変VWFタンパク質は、細胞培養培地中の所望のタンパク質と他の物質の間のサイズ、電荷、疎水性、溶解度、特異的親和性などの違いを利用する方法を含めた、様々な生化学的及びクロマトグラフィー的方法によって、濃縮及び精製することができる。
FVIIIへの結合が向上したvWF点突然変異体
背景
上述したように、循環FVIIIの大部分はVWFとの複合体になっている。ヒトでは、FVIIIは、VWFの非存在下及び存在下で、それぞれ、およそ2時間及び16時間のt1/2で血液から排除される。VWFはFVIII半減期の増大を与えるが、これはまた、それ自体の半減期によって決まる、t1/2の上限も定める。US8,575,104は、VWF−アルブミン融合タンパク質を開示している。この融合タンパク質は、げっ歯類モデルにおいて、野生型VWFよりも5倍長い半減期を有する。この融合タンパク質とFVIIIの間の安定な複合体は、FVIIIに対してさらなる半減期の利益を与えることができる。FVIII/vWF相互作用の平衡結合定数は高いが、結合キネティクスは速く、VWF−アルブミン融合タンパク質と複合体になっているいかなるFVIIIも、注入の際に内在性のvWFと急速に交換される。したがって、VWF−アルブミン融合体とのFVIIIのオフ速度が天然のVWFとのFVIIIのオフ速度と実質的に等しいのであれば、VWF−アルブミン融合体の使用は、FVIIIの半減期のいかなる実質的な増大も提供しないであろう。
ヒトフォンウィルブランド因子のD’及びD3ドメイン(vWF;アミノ酸(aa)764〜1270;GenBank受託番号NP_000543及びZhouら2012 Blood 120:449〜458によって解明されたドメイン境界部位に基づく)をコードする、コドン最適化合成cDNAは、GeneART AG(Regensberg、Germany)から得た。これを、それ自体のシグナルペプチド(aa1〜22)をコードするように5’末端で、及びC末端の8×Hisタグをコードするように3’末端で改変した。このコンストラクト(Hu−vWF[764〜1270]−8His)を、開始メチオニン上流のKozakコンセンサス配列(GCCACC)及びオープンリーディングフレームの3’末端の二重終止コドン(TGA)を有するpcDNA3.1哺乳類発現ベクター(Invitrogen、USA)に定方向クローニングし、自動シークエンシングによってプラスミド配列を確認した。次いで、この発現プラスミドを鋳型として使用して、標準的なPCR法を使用して、Ser764、Leu765、Ser766又はLys773において一重、二重又は三重の残基変化を起こし、上記のように、コンストラクトをpcDNA3.1にクローニングし、シークエンシングした。C末端のFLAGタグ(DYKDDDDK)とともにHu−vWFのD1及びD2ドメイン(aa1〜762)をコードする、第2のコドン最適化cDNAも合成し、GeneArtから得た。これを、pcDNA3.1に上記のようにクローニングし、シークエンシングした。
プロリンへのセリン764の突然変異誘発は、オフ速度がおよそ3.5倍低下し、親和性が4.4倍増大したvWF変異体を生成した。位置765の変異は、野生型vWFと比較して、いかなるより優れた結合体ももたらさなかった。位置766の多数の変異は、オフ速度特性が向上し、親和性が野生型vWFより高い変異体vWF分子を生成した(His、Arg、Val、Tyr、Trp、Thr、Phe、Ile、Gln、Gly&Asn)。位置764のプロリンがオフ速度に有意な増強を与え、一方で、位置766の多数の変異が結合に明確に強い影響を与えたことを受けて、S764Pと位置766のシステインを除くすべての他の遺伝子コードされるアミノ酸とからなる、一連の突然変異体が生成された。S764Pと位置765のシステインを除くすべての他の遺伝子コードされるアミノ酸とを含む、類似した変異が生成された。いくつかのこれらの二重突然変異体は、野生型vWFと比較して、有意に遅いオフ速度及び高い親和性を有する。特に、S766Iと組み合わせたS764Pは、オフ速度が22倍低下し、親和性が30倍増加したvWF変異体を生成する。
点突然変異体を有するヒト血清アルブミンvWF融合体及びFVIII結合
標準的なNHS/EDCカップリング化学反応を使用して、マウス抗HSA抗体をCM5チップ上に固定化した。典型的には、固定化レベルは10,000から12,000RUの間であった。vWF−HSA(モノマー及び二量体)の各バッチを、0.1〜1μg/mlの範囲の様々な濃度で、各フローセルの単一スポット上に2分間捕獲した。捕獲レベルは、40〜150RUの範囲にわたった。抗vWFが固定化されているが、vWF−HSAが捕獲されていない隣接するスポットを参照として使用した。捕獲は、FVIII結合分析前のすべてのサイクルで実施した。
Claims (45)
- 第VIII因子に結合する改変ポリペプチドにおいて、配列番号3に示される配列であって、位置1又は3に少なくとも1つの改変を含む配列を含み、その結果、非改変の配列番号3を含む参照ポリペプチドより少なくとも5倍低いオフ速度で第VIII因子に結合する、改変ポリペプチド。
- 前記参照ポリペプチドより少なくとも10倍低いオフ速度で第VIII因子に結合する、請求項1に記載の改変ポリペプチド。
- 前記参照ポリペプチドより少なくとも5倍低いKDで第VIII因子に結合する、請求項1に記載の改変ポリペプチド。
- 前記参照ポリペプチドより少なくとも10倍低いオフ速度で第VIII因子に結合する、請求項3に記載の改変ポリペプチド。
- 少なくとも2つの改変を含み、該改変が配列番号3の少なくとも位置1及び3にある、請求項1から4までのいずれか一項に記載の改変ポリペプチド。
- 第VIII因子に結合する改変ポリペプチドにおいて、配列番号3に示される配列であって、少なくとも位置3に改変を含む配列を含み、その結果、非改変の配列番号3を含む参照ポリペプチドより低いオフ速度で第VIII因子に結合する、改変ポリペプチド。
- 少なくとも2つの改変を含み、該改変が配列番号3の位置1及び3にある、請求項6に記載の改変ポリペプチド。
- 配列番号3が、位置3の残基がY、I、M及びWからなる群から選択されるように改変される、請求項1から7までのいずれか一項に記載の改変ポリペプチド。
- 配列番号3が、位置1の残基がG、P、V、E、Y、A及びLからなる群から選択されるように改変される、請求項1から8までのいずれか一項に記載の改変ポリペプチド。
- 第VIII因子に結合する改変ポリペプチドにおいて、配列番号3に示される配列であって、少なくとも位置1に改変を含む配列を含み、その結果、非改変の配列番号3を含む参照ポリペプチドより低いオフ速度で第VIII因子に結合し、位置1の残基が、G、P、E、Y、A及びLからなる群から選択される、改変ポリペプチド。
- 配列番号3が、位置3の残基がY、I、M、V、F、H、R及びWからなる群から選択されるように改変される、請求項10に記載の改変ポリペプチド。
- 配列番号5(S764G/S766Y)を含む、請求項1から11までのいずれか一項に記載の改変ポリペプチド。
- 配列番号6(S764P/S766I)を含む、請求項1から11までのいずれか一項に記載の改変ポリペプチド。
- 配列番号7(S764P/S766M)を含む、請求項1から11までのいずれか一項に記載の改変ポリペプチド。
- 配列番号8(S764V/S766Y)を含む、請求項1から11までのいずれか一項に記載の改変ポリペプチド。
- 配列番号9(S764E/S766Y)を含む、請求項1から11までのいずれか一項に記載の改変ポリペプチド。
- 配列番号10(S764Y/S766Y)を含む、請求項1から11までのいずれか一項に記載の改変ポリペプチド。
- 配列番号11(S764L/S766Y)を含む、請求項1から11までのいずれか一項に記載の改変ポリペプチド。
- 配列番号12(S764P/S766W)を含む、請求項1から11までのいずれか一項に記載の改変ポリペプチド。
- 配列番号13(S766W/S806A)を含む、請求項1から11までのいずれか一項に記載の改変ポリペプチド。
- 配列番号14(S766Y/P769K)を含む、請求項1から11までのいずれか一項に記載の改変ポリペプチド。
- 配列番号15(S766Y/P769N)を含む、請求項1から11までのいずれか一項に記載の改変ポリペプチド。
- 配列番号16(S766Y/P769R)を含む、請求項1から11までのいずれか一項に記載の改変ポリペプチド。
- 配列番号17(S764P/S766L)を含む、請求項1から11までのいずれか一項に記載の改変ポリペプチド。
- 改変フォンウィルブランド因子(VWF)である、請求項1から24までのいずれか一項に記載の改変ポリペプチド。
- 半減期増強タンパク質(HLEP)をさらに含む、請求項1から25までのいずれか一項に記載の改変ポリペプチド。
- 前記HLEPがアルブミンである、請求項26に記載の改変ポリペプチド。
- 前記アルブミンのN末端が、直接的に又スペーサーを介して前記改変ポリペプチド配列のC末端に融合している、請求項27に記載の改変ポリペプチド。
- 前記改変ポリペプチドの天然のC末端の1〜5個のアミノ酸が欠失した、請求項28に記載の改変ポリペプチド。
- 第VIII因子分子と請求項1から29までのいずれか一項に記載の改変ポリペプチドとを含む複合体。
- 出血障害の治療又は予防処置に使用するための、請求項1から29までのいずれか一項に記載の改変ポリペプチド又は請求項30に記載の複合体。
- 前記出血障害が、フォンウィルブランド病(VWD)又は血友病Aである、請求項31に記載の使用のための改変ポリペプチド又は複合体。
- 請求項1から29までのいずれか一項に記載の改変ポリペプチド又は請求項30に記載の複合体を含む医薬組成物。
- 医薬的に有効量の、請求項1から29までのいずれか一項に記載の改変ポリペプチド又は請求項30に記載の複合体を、それを必要とする患者に投与することを含む、出血障害を治療する方法。
- 前記出血障害がフォンウィルブランド病(VWD)又は血友病Aである、請求項34に記載の方法。
- 出血障害の前記治療のための医薬の調製における、請求項1から29までのいずれか一項に記載の改変ポリペプチド又は請求項30に記載の複合体の使用。
- 前記出血障害がフォンウィルブランド病(VWD)又は血友病Aである、請求項36に記載の使用。
- 請求項1から29までのいずれか一項に記載の改変ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
- 請求項38に記載のポリヌクレオチドを含む、プラスミド又はベクター。
- 前記プラスミド又はベクターが発現ベクターである、請求項39に記載のプラスミド又はベクター。
- 請求項38に記載のポリヌクレオチド又は請求項39若しくは40に記載のプラスミドを含む、宿主細胞。
- 改変VWFを含むポリペプチドを生成する方法であって、
(i)該改変VWFを含むポリペプチドが発現するような条件下で、請求項41に記載の宿主細胞を培養すること;及び
(ii)場合により、該宿主細胞から又は培養培地から該改変VWFを含むポリペプチドを回収すること
を含む方法。 - VWFの第VIII因子への結合親和性を増大させる方法であって、配列番号3の位置1及び3、又は位置3及び9、又は位置3及び43の残基が変わるように、該VWFのアミノ酸配列のD’ドメインに少なくとも2つの変異を導入することを含む方法。
- 変異後のD’ドメインの配列が、配列番号5〜17からなる群から選択される、請求項43に記載の方法。
- 第VIII因子の半減期を増大させる方法であって、該第VIII因子を請求項1から29までのいずれか一項に記載の改変ポリペプチドと混合することを含む方法。
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