JP2017516752A - 単離されたドナーmhc由来ペプチド及びその使用 - Google Patents
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Abstract
Description
a)本発明の単離されたペプチド、又は
b)本発明のペプチドをコードする核酸、又は
c)このような核酸を含むベクター、又は
d)このような発現ベクターを含むホスト細胞、又は
e)本発明のMHC/ペプチド多量体、又は
f)複合体MHC分子及び本発明のペプチドを含む抗原提示細胞、又は
g)本発明のペプチドを特異的に認識するTリンパ球と、
薬学的に許容し得る担体とを含む、医薬組成物に関する。
本発明の第1の態様は、アミノ酸配列:SDVGEYR(配列番号:1)又はその機能保存変異体を含むMHCクラスII分子由来の、11〜16個のアミノ酸の範囲の長さの単離されたペプチドに関する。
を除く、その機能保存変異体を含むMHCクラスII分子由来の、11〜16個のアミノ酸の範囲の長さの単離されたペプチドである。
からなる群より選択される。
あるいは、本発明のペプチド(例えば、配列番号:2で示されたペプチド)をコードする核酸、このような核酸を含むベクター、又はこのような発現ベクターを含むホスト細胞も、本発明の文脈内で対象となるものである。
本発明の別の態様は、アミノ酸配列:SDVGEYR(配列番号:1)又は上記されたその機能保存変異体を含むMHCクラスII分子由来の、11〜16個のアミノ酸の範囲の長さの単離されたペプチドを含む、MHC/ペプチド多量体である。
からなる群より選択される。
本発明の別の態様は、上記された本発明のMHC/ペプチド多量体を含むペプチド提示細胞である。
からなる群より選択される。
本発明の別の態様は、アミノ酸配列:SDVGEYR(配列番号:1)又は本発明の機能保存変異体を含むMHCクラスII分子由来の、11〜16個のアミノ酸の範囲の長さの単離されたペプチドを特異的に認識するTリンパ球である。
からなる群より選択される。
別の態様では、本発明は、アミノ酸配列:SDVGEYR(配列番号:1)又は本発明のその機能保存変異体を含むMHCクラスII分子由来の、11〜16個のアミノ酸の範囲の長さの単離されたペプチドを含む培養培地により、樹状細胞集団の存在下において、Treg集団を培養する工程を含む、Treg集団を生成するためのin vitro又はex vivo方法に関する。
からなる群より選択される。
本発明の別の態様は、
a)アミノ酸配列:SDVGEYR(配列番号:1)もしくはその機能保存変異体を含むMHCクラスII分子由来の、11〜16個のアミノ酸の範囲の長さの単離されたペプチド、又は
b)本発明のペプチドをコードする核酸、又は
c)このような核酸を含むベクター、又は
d)このような発現ベクターを含むホスト細胞、又は
e)本発明のMHC/ペプチド多量体、又は
f)複合体MHC分子及び本発明のペプチドを含む抗原提示細胞、又は
g)本発明のペプチドを特異的に認識するTリンパ球と、
薬学的に許容し得る担体とを含む、医薬組成物に関する。
からなる群より選択される、単離されたペプチドを含む。
本発明は、免疫寛容の誘導を必要とする患者において免疫寛容を誘導するのに使用するための、方法及び組成物(例えば、医薬組成物)を提供する。
からなる群より選択される。
からなる群より選択される。
からなる群より選択される。
a)本発明のペプチドをコードする核酸、又は
b)このような核酸を含むベクター、又は
c)このような発現ベクターを含むホスト細胞、又は
d)本発明のMHC/ペプチド多量体、又は
e)複合体MHC分子及び本発明のペプチドを含む抗原提示細胞、又は
f)本発明のペプチドを特異的に認識するTリンパ球に関する。
a)本発明のペプチドをコードする核酸、又は
b)このような核酸を含むベクター、又は
c)このような発現ベクターを含むホスト細胞、又は
d)本発明のMHC/ペプチド多量体、又は
e)複合体MHC分子及び本発明のペプチドを含む抗原提示細胞、又は
f)本発明のペプチドを特異的に認識するTリンパ球に関する。
更なる態様では、本発明は、移植患者(レシピエント)が寛容であるかを判定するためのin vitro方法であって、前記移植患者から得られた生体サンプル中のCD8+CD45RClow Tregの存在を判定する工程を含み、CD8+CD45RClow Tregの存在が寛容を示す、方法に関する。
からなる群より選択されるペプチドを含むMHC/ペプチド四量体である。
材料及び方法
動物及び心臓移植モデル
心臓のアロ移植を、以前に説明されたように(1)、全体としてMHC不一致の、LEW.1W(ドナーとしてのRT1.Au)及びLEW.1A(レシピエントとしてのRT1.Aa)のメスラット間で行った。
ヒトIgG1の定常ドメインに融合したマウスCD40の細胞外部分をコードするAd(AdCD40Ig)及びリコンビナント非コードアデノウイルス(Ad)Addl324と、移植組織内送達の手法とは、以前に記載されている(1)。簡潔に、アデノウイルス粒子(2.1010個の感染性粒子)を、心室壁内の3点にゆっくり注入した。
4aaのラギングを有する16mer オーバーラップペプチドライブラリを、以前に公開されたように(4〜6)、MHC−I RT1.Au(アルファ1、2、及び3ドメイン)、MHC−II RT1.Bu(全ドメイン)、及びMHC−II RT1.Du(アルファ2及びベータ1ドメイン)の多型配列全体をカバーするように設計し、GL Biochem Ltd.により調製した。凍結乾燥させたペプチドを、0.4% 無菌DMSO/滅菌水中に溶解させ、−80℃で保存した。対照ペプチドとして、in vitroにおいて、種々の同種非活性化ペプチド#7、26、及び39を使用した。
T細胞を、以前に記載されたように(2)精製した。簡潔に、トータル脾細胞を、抗−γδ T細胞(V65)、抗−CD45RA細胞(OX33)、抗−CD161 NK細胞(3.2.3)、及び抗−CD11b/c単球(OX42)のカクテルにより、磁性ビーズ(Dynal)を使用して枯渇させた。濃縮されたT細胞を、抗−CD45RC−ビオチン(OX22)及びストレプトアビジン−PE−Cy7、抗−CD8α−PE(OX8)、抗−TCRαβ−Alexa 647(R73)、ならびに抗−CD25−FITC(OX39) mAbsによりラベルした。CD8+CD45RClow T細胞及びCD4+CD25− T細胞を、FACSAria(BD Biosciences)によるTCRαβ+細胞のゲーティング後に分取した。分取した集団の純度は、99%超であった。
MLR共培養アッセイ法のために、LEW.1AナイーブラットからのpDC(1.25×104個)、同系CD8+CD40Ig Treg(5×104個)、及び120μg/mL 同種ペプチドを、丸底96ウェルプレート中の完全RPMI−1640培地 200μL中に、トリプリケートで、37℃、5% CO2で6日間蒔いた。pDCを、0.5μM CpG ODN 1826で成熟させた。
細胞外染色のために、細胞を、下記mAb:抗−TCRαβ(R73、Alexa Fluor 647−コンジュート)、抗−CD8α(OX8、PE−Cy7−コンジュート、Ebiosciences)、抗−CD4(W3.25、PE−Cy7−コンジュート)、抗−CD45RC(OX22、FITC−コンジュート)、抗−CD28(JJ319、ビオチンラベル)、抗−CD71(OX26、ビオチンラベル)、抗−CD25(OX39、ビオチンラベル)、及び抗−MHC−II(OX6、ビオチンラベル)で染色した。
IFNγ、IL−10を、共培養上清中において、BD BiosciencesからのELISAであるOptEIAを使用して測定し、IL−12及びTGFβをそれぞれ、Invitrogen及びR&D SystemからのELISAを使用して測定した。
ペプチド活性化試験のために、ノンパラメトリックなウィルコクソンの符号順位検定を、1.0の仮定値に対するカラムメジアンと比較して行った。活性化された細胞の表現型、サイトカイン発現、及び増殖アッセイ法についての統計学的有意性を、両側マン・ホイットニーt検定により評価した。移植片生存を、カプランマイヤー・ログランク検定により分析した。分析を、GraphPad Prism 5.04ソフトウェア(GraphPad)により行った。
全ての動物実験は、動物管理及び利用についてのPays de la Loire地方フランス倫理委員会により承認された。
簡潔に、重鎖RT1−Aa及びβ2ミクログロブリン(b2m)を、pET24中にクローニングし、Escherichia coli BL21-DE3中で産生した。リコンビナントタンパク質を、封入体として産生し、8M 尿素中に溶解させ、ヒトHLA−A2/ペプチド複合体について以前に記載されたように(15)、in vitroでリフォールディングさせた。RT1−Aa、b2m、及びペプチドBu31−10を、0.4M L−アルギニン、0.1M Tris pH8、2mM EDTA、5mM 還元型グルタチオン、及び0.5mM 酸化型グルタチオン中において、4℃で5日間リフォールディングさせた。ついで、この溶液を濃縮し、アミコンメンブラン10Kd(Millipore, Bedford, MA)上でバッファー交換した。フォールディングされたMHC/ペプチド複合体を、BirA酵素(Avidity, Denvers CO)により、30℃で5時間ビオチン化し、Hiprep 26/10脱塩カラム(GE Healthcare)で脱塩した。ついで、MHC/ペプチド複合体を、アニオン交換Q-Sepharoseクロマトグラフィーにより精製した。ビオチン化を、4:1のモル比でのストレプトアビジン(Sigma Aldrich)との四量体化により試験した。
RT1.Aa/Bu31−10の四量体化を、4:1のモル比での、ストレプトアビジン−PE(Jackson ImmunoResearch)又はストレプトアビジン−APC(BD Biosciences)を、15分間隔で加えた4等分アリコートにおいて加えることにより室温で行った。同様に、対照四量体RT1.Aa/MTF−E(ILFPSSERLISNR)(配列番号:22)を、ストレプトアビジン−BV421(Biolegend)にコンジュゲートさせ、Bu31−10−特異的細胞の中でも、1.6+/−0.7% 非特異的染色を表わした。これら3つの試薬を混合し、蒔いた細胞に10μg/mLで4℃において1時間加えた。さらに、細胞を、CD8及びCD45RCで染色した。蛍光を、FACSCanto IIサイトメーター(BD Biosciences, Mountain View, CA)で分析した。まず、細胞を、その形態によりゲーティングし、死んだ細胞を、DAPI陰性細胞を選択することにより除外した。
16mer ペプチドを、注入前に0.4% DMSO/PBS中に溶解させた。1回目のプロトコールについて、単回投与のペプチド(500μg/注入)を、移植前後の種々の時点である、−6、−3、0、+3、及び+7日目に、移植したLEW.1Aレシピエント内にi.v注入した。2回目のプロトコールについて、ミニ浸透圧ポンプ(ALZET, Cupertino, CA, USA)を、レシピエントの腹腔内(i.p)に埋め込み、20.83又は41.66μg/時間のいずれかで、16mer ペプチドを連続的に14日間送達させた。1回目のポンプを、移植前−7日に埋め込み、+7日目に2回目のポンプに置き換えた。このポンプは、28日間連続で動物当たりに14又は28mg ペプチドの送達が可能である。枯渇性抗−CD8α mAb(OX8、IgG1、3mg/kg)を、−7日目から拒絶までに週2回、i.p注入した。移植臓器を、触診により毎日モニターした。移植臓器拒絶を、触知できる心拍の完全な停止として定義した。
移植片の上1/3を、パラホルムアルデヒド中で固定し、パラフィン中に包埋した。5μm 冠状切片を、ヘマトキシリン−エオシン−サフランで染色した。組織を、群に対して盲検の病理医により分析した。慢性拒絶を、以前に記載されたように(16)評価した。
アロ抗体を、他の箇所で記載されたように(14)、サイトフルオロメーターにより分析した。簡潔に、コラゲナーゼDによる消化及び赤血球溶解後に、同種の脾細胞を、希釈(1/8)した熱不活性化血清と共にインキュベートし、ついで、FITC−コンジュゲート ヤギ抗−ラットIgG抗体(H+L鎖特異的)(Jackson Laboratories)、マウス抗−ラットIgG1 MAb(MCA 194、Serotec)、又はIgG2b(MCA 195、Serotec)と共にインキュベートした。抗体が結合したことを、FITC−結合F(ab)’2 ヤギ抗−マウスIgG(Jackson Laboratories)を使用して証明した。細胞を、FACS Canto IIサイトフルオロメーター(BD Biosciences, Mountain View, CA)を使用して分析した。結果を、各血清についての平均チャネル蛍光として表わした。
in vitroにおけるCD8+CD40Ig Treg活性化
CD8+CD40Ig Tregによる同種MHC/ペプチド複合体のTCR認識、及び、その機能のその後の活性化を特定するために、抗原性刺激に対する曝露に従って、フローサイトメトリーによる分析を可能にする活性化の特異的マーカーを選択する必要があった。したがって、ポリクローナル抗−CD3及び抗−CD28抗体による刺激に基づいて、CD8+CD40Ig Tregにより、種々の時点で発現された分子をスクリーニングした。新鮮に単離されたCD8+CD40Ig Tregにおける分子の発現は、Q RT−PCRにより以前に評価されており(1)、これらの分子の中でも、CD25及びIFNγが、他の細胞集団から、CD8+CD40Ig Tregを区別するマーカーであったことが証明された。CD71、CD25、及びIFNγの発現を、0、1、2、3、及び6日目において、フローサイトメトリーにより分析した。
ラットのMHCミスマッチ心臓移植臓器モデルにおいて、ドナー(RT1u)とレシピエント(RT1a)とは、全てのMHC分子についてミスマッチである。したがって、ドナーとレシピエントとのMHCI及びIIアミノ酸(aa)配列をアライメントし、ドナーMHCI及びII分子の多型ドメインとマッチした82個のオーバーラップした16merペプチドを設計した(4〜6)。まず、ペプチドを、6〜8個のペプチド(30μg/mL 各ペプチド)のプールに分類し、未成熟又は成熟した同系のレシピエント形質細胞様樹状細胞(pDC)とCD40Ig処置した長期移植臓器保有レシピエントから分取したCD8+CD40Ig Tregを3又は6日間共培養したin vitroアッセイ法で試験した。未成熟pDCに関して、CD8+CD40Ig Tregの有意な活性化は、ペプチドの同種プールのいずれについても、3日目又は6日目において観察されなかった。成熟pDC及び同種ペプチドプールによる刺激後、3日目に、CD8+CD40Ig Tregの小集団におけるCD25発現のわずかなアップレギュレーションが観察され、6日目に、同種刺激により、CD25発現の有意なアップレギュレーションが観察された。これらの結果から、一部の同種ペプチドは、CD8+CD40Ig Tregにより効率的に認識され、この認識により、CD25発現の増大がもたらされることが示唆された。また、pDCは、当該アッセイ法おいて成熟している必要があることも証明された。
抗原特異的CD8+CD40Ig Tregにより認識される天然のサブドミナントなドナーペプチド配列を決定するために、変性ペプチドのライブラリを使用した。この変性ペプチドは、1つのaaラギングを有する9mer ペプチド〜サブドミナントな16mer Bu31及びペプチド32由来の2つ以上のaaラギングを有する15mer ペプチド(#31−1〜#31−15でラベル)の範囲とした(図1B及び表1)。このライブラリ設計は、以前の結果に基づいており、レポートで報告されており(7〜10)、上記されたin vitroアッセイ法と同様に試験した。興味深いことに、ランダムペプチドライブラリから、ラットMHCクラスI RT1−Aa分子が、C末端にアルギニン(R)を有する9〜15mer ペプチドに対する強力な優位性を示したことが確立されている(10)。
Bu31活性化CD8+CD40Ig Tregの表現型を、刺激後6日で分析した(図2A及び2B)。CD8+CD40Ig Tregが、高レベルのIFNγの分泌を介して働き、次に、DC及び移植片ECによりIDO発現を誘導し、この反応が、in vivoでの寛容誘導に必須であったことが、以前証明されている(1)。これらの結果に基づいて、pDCの存在下におけるペプチドによるCD8+ Tregの刺激が、大方活性化されたCD8+CD40Ig Tregにより、IFNγの有意に増大した発現をもたらすことが観察された(図2A)。同じ培養上清中において、CD8+CD40Ig Treg及びpDCの両方により産生することができるIL−12、TGFβ、及びIL−10発現の改変は観察されなかった。また、CD71、CD28、及びMHCクラスIIのアップレギュレーションも観察されたが、ペプチド刺激の6日後のFoxp3発現の改変は観察されなかった(図2B)。
CD8+CD45RClow Tregのin vivoでの生成及び移植臓器の生存において特定されたサブドミナントなペプチドの活性を更に決定するために、単剤治療として、動物をペプチドで処置した。小さなペプチド自体は、レシピエントの体内から急速に排出された。ミニ浸透圧ポンプの使用により、移植前−7日で開始する28日間の0.5mg/日の一定の腹腔内送達が可能となった。この用量は、移植臓器の生存を長くするのを誘導するのに十分ではなかった。興味深いことに、2倍高い用量のペプチド、すなわち、1mg/日は、80%のレシピエントにおいて、明確でない移植臓器生存を誘導した(0.5mg/日及び未処置と比較して、**p<0.01)(図4)。
フィコエリスリン(PE)及びアロフィコシアニン(APC)でラベルした、MHCクラスI四量体であるRT1.Aa/Bu31−10を生成し、脾臓及び移植片中において特定の集団を染色した。まず、細胞を、PEコンジュゲート、及びAPCコンジュゲートしたRT1.Aa/Bu31−10四量体の混合物により、以前に記載されたBV421でラベルされた対照四量体であるRT1.Aa/MTF−Eと共に染色した。細胞を、CD8−PeCy7及びCD45RC−FITCにより二次染色して、CD8+CD45RClow Tregを特定した。このような戦略について、脾臓において0.281%、移植片において1.11%のBu31特異的細胞を、CD8+CD40Ig Tregの中から特定することができた。ナイーブな脾臓のCD8+CD45RClow Treg集団において、前駆体頻度を0.187%と評価した。このことは、移植及びCD40Ig処置後120日でも、この頻度は、脾臓において2倍近くに増大し、移植片においてかなり濃縮され、ナイーブな動物において、ドナー特異的Tregのプールを特定することができたことを証明している。
CD8+CD45RClow Tregのin vivoでの増強及び移植臓器生存において特定されたサブドミナントなペプチドの活性を更に決定するために、1日当たりに0.5又は1.0mg ペプチドの一定の腹腔内送達するためのミニ浸透圧ポンプで、移植前−7日から開始して28日間、動物を処置した。興味深いことに、このプロトコールは、対照ペプチドと比較して、1mg/日 Bu31ペプチドを使用して、80%の明確でない移植臓器生存を伴って、移植臓器生存の有意な延長を可能にした(対照ペプチド及び未処置と比較して、p<0.01)(図5)。ペプチド注入により誘導された寛容が、CD8+ T細胞とは依存していたことを証明するために、以前説明されたように(1)、レシピエントを、ペプチド注入及び枯渇性抗−CD8 mAb(OX8)により同時処置した。抗−CD8抗体の投与により、移植臓器生存が完全に消滅した。このことは、CD8+ T細胞によるMHCクラスI/抗原の認識が、ペプチド注入により得られた寛容の確立に必要であったことを示している。
本願全体を通して、種々の参考文献が、本発明が属する技術分野の状態を説明している。これらの参考文献の開示は、参照により本開示に組み入れられる。
Claims (15)
- アミノ酸配列:SDVGEYR(配列番号:1)又は下記ペプチド:
を除く、その機能保存変異体を含む、MHCクラスII分子由来の、11〜16個のアミノ酸の範囲の長さの、単離されたペプチド。 - ペプチドが、アミノ酸配列:DSDVGEYR(配列番号:21)又はその機能保存変異体を含む、請求項1記載のペプチド。
- ペプチドが、
からなる群より選択されるアミノ酸配列からなる、請求項1又は2記載のペプチド。 - アミノ酸配列:SDVGEYR(配列番号:1)もしくはその機能保存変異体を含む、MHCクラスII分子由来の、11〜16個のアミノ酸の範囲の長さのペプチドをコードする核酸配列、又は、この核酸配列を含む発現ベクター、又は、この発現ベクターを含むホスト細胞。
- アミノ酸配列:SDVGEYR(配列番号:1)又はその機能保存変異体を含む、MHCクラスII分子由来の、11〜16個のアミノ酸の範囲の長さの単離されたペプチドを含む、MHC/ペプチド多量体。
- ペプチドが、YLRYDSDVGEYR(配列番号:13)である、請求項5記載のMHC/ペプチド多量体。
- アミノ酸配列:SDVGEYR(配列番号:1)又はその機能保存変異体を含む、MHCクラスII分子由来の、11〜16個のアミノ酸の範囲の長さの単離されたペプチドを特異的に認識する、Tリンパ球。
- アミノ酸配列:SDVGEYR(配列番号:1)又はその機能保存変異体を含む、MHCクラスII分子由来の、11〜16個のアミノ酸の範囲の長さの単離されたペプチドを含む培養培地により、形質細胞様樹状細胞集団の存在下において、CD8+ Treg集団を培養する工程を含む、CD8+CD45RClow Treg集団を生成するためのin vitro又はex vivo方法。
- 請求項5又は6記載のMHC/ペプチド多量体を含む培養培地により、CD8+Treg集団を培養する工程を含む、CD8+CD45RClow Treg集団を生成するためのin vitro又はex vivo方法。
- 薬剤として使用するための、アミノ酸配列:SDVGEYR(配列番号:1)又はその機能保存変異体を含む、MHCクラスII分子由来の、11〜16個のアミノ酸の範囲の長さの単離されたペプチド。
- 寛容の誘導を必要とする患者において寛容を誘導するのに使用するための、アミノ酸配列:SDVGEYR(配列番号:1)又はその機能保存変異体を含む、MHCクラスII分子由来の、11〜16個のアミノ酸の範囲の長さの単離されたペプチド。
- 移植拒絶の予防又は減少を必要とする患者において移植拒絶を予防又は減少させるのに使用するための、アミノ酸配列:SDVGEYR(配列番号:1)又はその機能保存変異体を含む、MHCクラスII分子由来の、11〜16個のアミノ酸の範囲の長さの単離されたペプチド。
- ペプチドが、
からなる群より選択されるアミノ酸配列からなる、請求項10〜12のいずれか一項記載の使用のための単離されたペプチド。 - a)アミノ酸配列:SDVGEYR(配列番号:1)もしくはその機能保存変異体を含む、MHCクラスII分子由来の、11〜16個のアミノ酸の範囲の長さの単離されたペプチド、又は
b)このペプチドをコードする核酸、又は
c)この核酸を含むベクター、又は
d)この発現ベクターを含むホスト細胞、又は
e)請求項5又は6記載のMHC/ペプチド多量体、又は
f)複合体MHC分子及びアミノ酸配列:SDVGEYR(配列番号:1)もしくはその機能保存変異体を含む、MHCクラスII分子由来の、11〜16個のアミノ酸の範囲の長さのペプチドを含む抗原提示細胞、又は
g)請求項6記載のペプチドを特異的に認識するTリンパ球と、
薬学的に許容し得る担体とを含む、
医薬組成物。 - 前記移植患者から得られた生体サンプル中のCD8+CD45RClow Tregの存在を判定する工程を含む、移植患者が寛容であるかを判定するためのin vitro方法であって、CD8+CD45RClow Tregの存在が寛容を示す、
方法。
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