PL238939B1 - Peptyd immunosupresyjny i jego zastosowania - Google Patents
Peptyd immunosupresyjny i jego zastosowania Download PDFInfo
- Publication number
- PL238939B1 PL238939B1 PL419327A PL41932716A PL238939B1 PL 238939 B1 PL238939 B1 PL 238939B1 PL 419327 A PL419327 A PL 419327A PL 41932716 A PL41932716 A PL 41932716A PL 238939 B1 PL238939 B1 PL 238939B1
- Authority
- PL
- Poland
- Prior art keywords
- cells
- peptide
- peptides
- sequence
- sequences
- Prior art date
Links
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 title claims description 107
- 230000001506 immunosuppresive effect Effects 0.000 title claims description 27
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 65
- 210000003289 regulatory T cell Anatomy 0.000 claims description 18
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 16
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 claims description 14
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims description 10
- 210000000612 antigen-presenting cell Anatomy 0.000 claims description 9
- 230000006870 function Effects 0.000 claims description 9
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 claims description 8
- 208000023275 Autoimmune disease Diseases 0.000 claims description 7
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims description 6
- 206010020751 Hypersensitivity Diseases 0.000 claims description 5
- 208000026935 allergic disease Diseases 0.000 claims description 5
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims description 5
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 claims description 5
- 230000002265 prevention Effects 0.000 claims description 5
- 208000035143 Bacterial infection Diseases 0.000 claims description 3
- 206010017533 Fungal infection Diseases 0.000 claims description 3
- 208000031888 Mycoses Diseases 0.000 claims description 3
- 208000030852 Parasitic disease Diseases 0.000 claims description 3
- 208000036142 Viral infection Diseases 0.000 claims description 3
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 claims description 3
- 230000007815 allergy Effects 0.000 claims description 3
- 230000009088 enzymatic function Effects 0.000 claims description 3
- 208000000509 infertility Diseases 0.000 claims description 3
- 230000036512 infertility Effects 0.000 claims description 3
- 231100000535 infertility Toxicity 0.000 claims description 3
- 230000001613 neoplastic effect Effects 0.000 claims description 3
- 230000009385 viral infection Effects 0.000 claims description 3
- 206010062016 Immunosuppression Diseases 0.000 claims description 2
- 229940030225 antihemorrhagics Drugs 0.000 claims description 2
- 230000000025 haemostatic effect Effects 0.000 claims description 2
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 claims description 2
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 3
- 208000026278 immune system disease Diseases 0.000 claims 1
- 230000003071 parasitic effect Effects 0.000 claims 1
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 49
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 20
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 19
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 19
- 101001057504 Homo sapiens Interferon-stimulated gene 20 kDa protein Proteins 0.000 description 16
- 101001055144 Homo sapiens Interleukin-2 receptor subunit alpha Proteins 0.000 description 16
- 102100027268 Interferon-stimulated gene 20 kDa protein Human genes 0.000 description 16
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 16
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 15
- 102100036011 T-cell surface glycoprotein CD4 Human genes 0.000 description 15
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 11
- 230000003614 tolerogenic effect Effects 0.000 description 10
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 9
- 230000008823 permeabilization Effects 0.000 description 9
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 9
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 8
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 8
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 102100022297 Integrin alpha-X Human genes 0.000 description 7
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 description 7
- 235000013351 cheese Nutrition 0.000 description 7
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 7
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 7
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 7
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 210000004443 dendritic cell Anatomy 0.000 description 6
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 6
- 238000001943 fluorescence-activated cell sorting Methods 0.000 description 6
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 6
- 101710114676 E1B 55 kDa protein Proteins 0.000 description 5
- 101001046686 Homo sapiens Integrin alpha-M Proteins 0.000 description 5
- 102100022338 Integrin alpha-M Human genes 0.000 description 5
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 5
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 5
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 5
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 5
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 5
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 5
- 210000004988 splenocyte Anatomy 0.000 description 5
- 238000002198 surface plasmon resonance spectroscopy Methods 0.000 description 5
- PFPUFNLHBXKPHY-HTFCKZLJSA-N Ile-Ile-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N PFPUFNLHBXKPHY-HTFCKZLJSA-N 0.000 description 4
- NWIBSHFKIJFRCO-WUDYKRTCSA-N Mytomycin Chemical compound C1N2C(C(C(C)=C(N)C3=O)=O)=C3[C@@H](COC(N)=O)[C@@]2(OC)[C@@H]2[C@H]1N2 NWIBSHFKIJFRCO-WUDYKRTCSA-N 0.000 description 4
- 108010004729 Phycoerythrin Proteins 0.000 description 4
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 4
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 4
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 4
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 4
- 238000010494 dissociation reaction Methods 0.000 description 4
- 230000005593 dissociations Effects 0.000 description 4
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 4
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 4
- 230000004044 response Effects 0.000 description 4
- 108010071207 serylmethionine Proteins 0.000 description 4
- 210000000130 stem cell Anatomy 0.000 description 4
- UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N streptomycin Chemical compound CN[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@](C=O)(O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@H]1O UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 0.000 description 4
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 4
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 description 4
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102000000588 Interleukin-2 Human genes 0.000 description 3
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 description 3
- CZCSUZMIRKFFFA-CIUDSAMLSA-N Leu-Ala-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O CZCSUZMIRKFFFA-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- HUKLXYYPZWPXCC-KZVJFYERSA-N Met-Ala-Thr Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O HUKLXYYPZWPXCC-KZVJFYERSA-N 0.000 description 3
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 3
- KXUZHWXENMYOHC-QEJZJMRPSA-N Phe-Leu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O KXUZHWXENMYOHC-QEJZJMRPSA-N 0.000 description 3
- 239000012980 RPMI-1640 medium Substances 0.000 description 3
- VTVVYQOXJCZVEB-WDCWCFNPSA-N Thr-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VTVVYQOXJCZVEB-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 3
- SPIFGZFZMVLPHN-UNQGMJICSA-N Thr-Val-Phe Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O SPIFGZFZMVLPHN-UNQGMJICSA-N 0.000 description 3
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 3
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 3
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 3
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 3
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 3
- 206010012601 diabetes mellitus Diseases 0.000 description 3
- 239000005090 green fluorescent protein Substances 0.000 description 3
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 3
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 3
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 description 3
- 230000010534 mechanism of action Effects 0.000 description 3
- 244000045947 parasite Species 0.000 description 3
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 3
- 230000008569 process Effects 0.000 description 3
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 3
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 3
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 3
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 3
- 230000001629 suppression Effects 0.000 description 3
- 201000000596 systemic lupus erythematosus Diseases 0.000 description 3
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 2-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]ethanesulfonic acid Chemical compound OCC[NH+]1CCN(CCS([O-])(=O)=O)CC1 JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- GORKKVHIBWAQHM-GCJQMDKQSA-N Ala-Asn-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O GORKKVHIBWAQHM-GCJQMDKQSA-N 0.000 description 2
- IOFVWPYSRSCWHI-JXUBOQSCSA-N Ala-Thr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](C)N IOFVWPYSRSCWHI-JXUBOQSCSA-N 0.000 description 2
- NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N Ammonia chloride Chemical compound [NH4+].[Cl-] NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 2
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 2
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 2
- 102000009109 Fc receptors Human genes 0.000 description 2
- 108010087819 Fc receptors Proteins 0.000 description 2
- WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N Formaldehyde Chemical compound O=C WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 2
- CUVBTVWFVIIDOC-YEPSODPASA-N Gly-Thr-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)CN CUVBTVWFVIIDOC-YEPSODPASA-N 0.000 description 2
- 239000007995 HEPES buffer Substances 0.000 description 2
- 108010058683 Immobilized Proteins Proteins 0.000 description 2
- OTXBNHIUIHNGAO-UWVGGRQHSA-N Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN OTXBNHIUIHNGAO-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 2
- BPCLGWHVPVTTFM-QWRGUYRKSA-N Phe-Ser-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O BPCLGWHVPVTTFM-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- 239000012979 RPMI medium Substances 0.000 description 2
- SKHPKKYKDYULDH-HJGDQZAQSA-N Thr-Asn-Leu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O SKHPKKYKDYULDH-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 2
- 102000004887 Transforming Growth Factor beta Human genes 0.000 description 2
- 108090001012 Transforming Growth Factor beta Proteins 0.000 description 2
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 2
- 230000009471 action Effects 0.000 description 2
- 108010004469 allophycocyanin Proteins 0.000 description 2
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 2
- 208000022362 bacterial infectious disease Diseases 0.000 description 2
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 2
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 2
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 2
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 2
- VXXZQHUWZSRPAM-CDJUQFLLSA-N edratide Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(O)=O)[C@@H](C)CC)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)CN)C1=CC=C(O)C=C1 VXXZQHUWZSRPAM-CDJUQFLLSA-N 0.000 description 2
- 229950003490 edratide Drugs 0.000 description 2
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 description 2
- 108010089804 glycyl-threonine Proteins 0.000 description 2
- 230000009610 hypersensitivity Effects 0.000 description 2
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 2
- 230000000899 immune system response Effects 0.000 description 2
- 230000036039 immunity Effects 0.000 description 2
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 2
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 2
- 239000003018 immunosuppressive agent Substances 0.000 description 2
- 229940125721 immunosuppressive agent Drugs 0.000 description 2
- 238000000126 in silico method Methods 0.000 description 2
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 2
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 2
- 206010025135 lupus erythematosus Diseases 0.000 description 2
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 2
- 238000013178 mathematical model Methods 0.000 description 2
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 2
- 229960004857 mitomycin Drugs 0.000 description 2
- 201000006417 multiple sclerosis Diseases 0.000 description 2
- 210000002501 natural regulatory T cell Anatomy 0.000 description 2
- NQDJXKOVJZTUJA-UHFFFAOYSA-N nevirapine Chemical compound C12=NC=CC=C2C(=O)NC=2C(C)=CC=NC=2N1C1CC1 NQDJXKOVJZTUJA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 2
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 2
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 2
- 108010073101 phenylalanylleucine Proteins 0.000 description 2
- 230000009711 regulatory function Effects 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 229960005322 streptomycin Drugs 0.000 description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 2
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 2
- ZRKFYGHZFMAOKI-QMGMOQQFSA-N tgfbeta Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CCSC)C(C)C)[C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 ZRKFYGHZFMAOKI-QMGMOQQFSA-N 0.000 description 2
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 2
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 2
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- UHTQHHLSGVOGQR-UHFFFAOYSA-N 2-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-4-ium-1-yl]ethanesulfonate Chemical compound OCCN1CCN(CCS(O)(=O)=O)CC1.OCC[NH+]1CCN(CCS([O-])(=O)=O)CC1 UHTQHHLSGVOGQR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000030507 AIDS Diseases 0.000 description 1
- VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N Ammonium hydroxide Chemical compound [NH4+].[OH-] VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BZWRLDPIWKOVKB-ZPFDUUQYSA-N Asn-Leu-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O BZWRLDPIWKOVKB-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- QYRMBFWDSFGSFC-OLHMAJIHSA-N Asn-Thr-Asn Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N)O QYRMBFWDSFGSFC-OLHMAJIHSA-N 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 102000008203 CTLA-4 Antigen Human genes 0.000 description 1
- 108010021064 CTLA-4 Antigen Proteins 0.000 description 1
- 229940045513 CTLA4 antagonist Drugs 0.000 description 1
- PHEDXBVPIONUQT-UHFFFAOYSA-N Cocarcinogen A1 Natural products CCCCCCCCCCCCCC(=O)OC1C(C)C2(O)C3C=C(C)C(=O)C3(O)CC(CO)=CC2C2C1(OC(C)=O)C2(C)C PHEDXBVPIONUQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101150075174 E1B gene Proteins 0.000 description 1
- VNCNWQPIQYAMAK-ACZMJKKPSA-N Glu-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O VNCNWQPIQYAMAK-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- 108010043121 Green Fluorescent Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000004144 Green Fluorescent Proteins Human genes 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- 108090000144 Human Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000003839 Human Proteins Human genes 0.000 description 1
- 241000620147 Human mastadenovirus C Species 0.000 description 1
- BCVIOZZGJNOEQS-XKNYDFJKSA-N Ile-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)[C@@H](C)CC BCVIOZZGJNOEQS-XKNYDFJKSA-N 0.000 description 1
- DBXXASNNDTXOLU-MXAVVETBSA-N Ile-Leu-His Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N DBXXASNNDTXOLU-MXAVVETBSA-N 0.000 description 1
- QQVXERGIFIRCGW-NAKRPEOUSA-N Ile-Ser-Met Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)N QQVXERGIFIRCGW-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 1
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 description 1
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 description 1
- 208000022559 Inflammatory bowel disease Diseases 0.000 description 1
- WQWSMEOYXJTFRU-GUBZILKMSA-N Leu-Glu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WQWSMEOYXJTFRU-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- 102000043131 MHC class II family Human genes 0.000 description 1
- 108091054438 MHC class II family Proteins 0.000 description 1
- 108700018351 Major Histocompatibility Complex Proteins 0.000 description 1
- 241000736262 Microbiota Species 0.000 description 1
- 241001529936 Murinae Species 0.000 description 1
- 241000699660 Mus musculus Species 0.000 description 1
- 101100179561 Mus musculus Il2ra gene Proteins 0.000 description 1
- 101100341513 Mus musculus Itgam gene Proteins 0.000 description 1
- 101100019396 Mus musculus Itgax gene Proteins 0.000 description 1
- 241000242726 Opisthorchis viverrini Species 0.000 description 1
- 101150037263 PIP2 gene Proteins 0.000 description 1
- 229930182555 Penicillin Natural products 0.000 description 1
- JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N Penicillin G Chemical compound N([C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C(=O)CC1=CC=CC=C1 JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N 0.000 description 1
- 108010071384 Peptide T Proteins 0.000 description 1
- 102000004245 Proteasome Endopeptidase Complex Human genes 0.000 description 1
- 108090000708 Proteasome Endopeptidase Complex Proteins 0.000 description 1
- 201000004681 Psoriasis Diseases 0.000 description 1
- 241000219061 Rheum Species 0.000 description 1
- 241000220010 Rhode Species 0.000 description 1
- 239000006146 Roswell Park Memorial Institute medium Substances 0.000 description 1
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 1
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 1
- UGGWCAFQPKANMW-FXQIFTODSA-N Ser-Met-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O UGGWCAFQPKANMW-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- 241000700584 Simplexvirus Species 0.000 description 1
- 230000005867 T cell response Effects 0.000 description 1
- 108091023040 Transcription factor Proteins 0.000 description 1
- 102000040945 Transcription factor Human genes 0.000 description 1
- LYMVXFSTACVOLP-ZFWWWQNUSA-N Trp-Leu Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C([O-])=O)=CNC2=C1 LYMVXFSTACVOLP-ZFWWWQNUSA-N 0.000 description 1
- RWAYYYOZMHMEGD-XIRDDKMYSA-N Trp-Leu-Ser Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O)=CNC2=C1 RWAYYYOZMHMEGD-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- 206010067584 Type 1 diabetes mellitus Diseases 0.000 description 1
- HJSLDXZAZGFPDK-ULQDDVLXSA-N Val-Phe-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)NC(=O)[C@H](C(C)C)N HJSLDXZAZGFPDK-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- VREFGVBLTWBCJP-UHFFFAOYSA-N alprazolam Chemical compound C12=CC(Cl)=CC=C2N2C(C)=NN=C2CN=C1C1=CC=CC=C1 VREFGVBLTWBCJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000019270 ammonium chloride Nutrition 0.000 description 1
- 239000000908 ammonium hydroxide Substances 0.000 description 1
- 239000012491 analyte Substances 0.000 description 1
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 1
- 230000003172 anti-dna Effects 0.000 description 1
- 206010003246 arthritis Diseases 0.000 description 1
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 1
- FCPVYOBCFFNJFS-LQDWTQKMSA-M benzylpenicillin sodium Chemical compound [Na+].N([C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C([O-])=O)(C)C)C(=O)CC1=CC=CC=C1 FCPVYOBCFFNJFS-LQDWTQKMSA-M 0.000 description 1
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 1
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 1
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 1
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 1
- KQNZDYYTLMIZCT-KQPMLPITSA-N brefeldin A Chemical compound O[C@@H]1\C=C\C(=O)O[C@@H](C)CCC\C=C\[C@@H]2C[C@H](O)C[C@H]21 KQNZDYYTLMIZCT-KQPMLPITSA-N 0.000 description 1
- JUMGSHROWPPKFX-UHFFFAOYSA-N brefeldin-A Natural products CC1CCCC=CC2(C)CC(O)CC2(C)C(O)C=CC(=O)O1 JUMGSHROWPPKFX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 210000004970 cd4 cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 1
- 230000024245 cell differentiation Effects 0.000 description 1
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 239000012141 concentrate Substances 0.000 description 1
- 210000004292 cytoskeleton Anatomy 0.000 description 1
- 210000001151 cytotoxic T lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000003013 cytotoxicity Effects 0.000 description 1
- 231100000135 cytotoxicity Toxicity 0.000 description 1
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 1
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 1
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 description 1
- AGDZIJFMSISITG-UHFFFAOYSA-L disodium 2-oxopropanoate Chemical compound [Na+].[Na+].CC(=O)C([O-])=O.CC(=O)C([O-])=O AGDZIJFMSISITG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 238000004090 dissolution Methods 0.000 description 1
- 238000001647 drug administration Methods 0.000 description 1
- 230000004064 dysfunction Effects 0.000 description 1
- 229960001484 edetic acid Drugs 0.000 description 1
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 1
- 210000003162 effector t lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 210000003743 erythrocyte Anatomy 0.000 description 1
- 239000012894 fetal calf serum Substances 0.000 description 1
- 239000012737 fresh medium Substances 0.000 description 1
- 210000002288 golgi apparatus Anatomy 0.000 description 1
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 1
- 244000005709 gut microbiome Species 0.000 description 1
- 230000012447 hatching Effects 0.000 description 1
- 230000023597 hemostasis Effects 0.000 description 1
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 1
- 229940072221 immunoglobulins Drugs 0.000 description 1
- 239000002955 immunomodulating agent Substances 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 210000002602 induced regulatory T cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 230000008611 intercellular interaction Effects 0.000 description 1
- 230000031261 interleukin-10 production Effects 0.000 description 1
- 230000009878 intermolecular interaction Effects 0.000 description 1
- 210000000936 intestine Anatomy 0.000 description 1
- 238000010212 intracellular staining Methods 0.000 description 1
- PGHMRUGBZOYCAA-UHFFFAOYSA-N ionomycin Natural products O1C(CC(O)C(C)C(O)C(C)C=CCC(C)CC(C)C(O)=CC(=O)C(C)CC(C)CC(CCC(O)=O)C)CCC1(C)C1OC(C)(C(C)O)CC1 PGHMRUGBZOYCAA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PGHMRUGBZOYCAA-ADZNBVRBSA-N ionomycin Chemical compound O1[C@H](C[C@H](O)[C@H](C)[C@H](O)[C@H](C)/C=C/C[C@@H](C)C[C@@H](C)C(/O)=C/C(=O)[C@@H](C)C[C@@H](C)C[C@@H](CCC(O)=O)C)CC[C@@]1(C)[C@@H]1O[C@](C)([C@@H](C)O)CC1 PGHMRUGBZOYCAA-ADZNBVRBSA-N 0.000 description 1
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 1
- 239000002122 magnetic nanoparticle Substances 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 230000002036 metaphylactic effect Effects 0.000 description 1
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 1
- 210000005087 mononuclear cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000010172 mouse model Methods 0.000 description 1
- 210000002200 mouth mucosa Anatomy 0.000 description 1
- 229960000689 nevirapine Drugs 0.000 description 1
- 235000016709 nutrition Nutrition 0.000 description 1
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 1
- 210000003463 organelle Anatomy 0.000 description 1
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 1
- 230000008506 pathogenesis Effects 0.000 description 1
- 229940049954 penicillin Drugs 0.000 description 1
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 description 1
- 210000002824 peroxisome Anatomy 0.000 description 1
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 description 1
- 238000009521 phase II clinical trial Methods 0.000 description 1
- PHEDXBVPIONUQT-RGYGYFBISA-N phorbol 13-acetate 12-myristate Chemical compound C([C@]1(O)C(=O)C(C)=C[C@H]1[C@@]1(O)[C@H](C)[C@H]2OC(=O)CCCCCCCCCCCCC)C(CO)=C[C@H]1[C@H]1[C@]2(OC(C)=O)C1(C)C PHEDXBVPIONUQT-RGYGYFBISA-N 0.000 description 1
- 230000037452 priming Effects 0.000 description 1
- 239000000047 product Substances 0.000 description 1
- 230000000069 prophylactic effect Effects 0.000 description 1
- 230000001681 protective effect Effects 0.000 description 1
- 230000017854 proteolysis Effects 0.000 description 1
- 238000012483 real time interaction analysis Methods 0.000 description 1
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 1
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 1
- 238000004064 recycling Methods 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 210000002345 respiratory system Anatomy 0.000 description 1
- 206010039073 rheumatoid arthritis Diseases 0.000 description 1
- 239000012488 sample solution Substances 0.000 description 1
- 238000005070 sampling Methods 0.000 description 1
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 230000011664 signaling Effects 0.000 description 1
- PXIPVTKHYLBLMZ-UHFFFAOYSA-N sodium azide Substances [Na+].[N-]=[N+]=[N-] PXIPVTKHYLBLMZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 1
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 1
- 239000011550 stock solution Substances 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 238000010998 test method Methods 0.000 description 1
- WROMPOXWARCANT-UHFFFAOYSA-N tfa trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F.OC(=O)C(F)(F)F WROMPOXWARCANT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 1
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 1
- 230000024664 tolerance induction Effects 0.000 description 1
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 1
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 1
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 1
- 108010080629 tryptophan-leucine Proteins 0.000 description 1
- 108700026220 vif Genes Proteins 0.000 description 1
- 239000011534 wash buffer Substances 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K7/00—Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
- C07K7/04—Linear peptides containing only normal peptide links
- C07K7/08—Linear peptides containing only normal peptide links having 12 to 20 amino acids
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N5/00—Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
- C12N5/06—Animal cells or tissues; Human cells or tissues
- C12N5/0602—Vertebrate cells
- C12N5/0634—Cells from the blood or the immune system
- C12N5/0636—T lymphocytes
- C12N5/0637—Immunosuppressive T lymphocytes, e.g. regulatory T cells or Treg
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Public Health (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Hematology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Oncology (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Description
Opis wynalazku
Wynalazek dotyczy nowego peptydu tolerogennego o istotnym wpływie na wzrost liczby limfocytów Treg, który to peptyd przeznaczony jest do stosowania w farmacji, zwłaszcza jako środek immunosupresyjny, w szczególności do stosowania w leczeniu i zapobieganiu chorobom autoimmunologicznym.
Jednym z elementów utrzymywania prawidłowej funkcji układu immunologicznego jest prawidłowa sygnalizacja zachodząca pomiędzy jego strukturami. Znanym sposobem komunikowania się struktur układu immunologicznego jest rozpoznawanie przez komórki immunokompetentne sekwencji określanych mianem tregitopów. Są to sekwencje, które prezentowane przez komórki prezentujące antygen (APC) stymulują wzrost liczby limfocytów T regulatorowych (Treg). Sekwencje takie nazywane są również sekwencjami tolerogennymi. Sekwencje tolerogenne znajdują się w białkach wytwarzanych przez człowieka, zwierzęta, wirusy, bakterie, a także grzyby. Jednym z pierwszych typów białek w jakich rozpoznano sekwencje tolerogenne były immunoglobuliny G [1].
Tregitopy obecne w ludzkich białkach mają istotny udział w regulacji prawidłowej funkcji układu immunologicznego. Obecnie przyjmuje się, że mają znaczącą rolę w rozwoju wielu chorób autoimmunologicznych [2].
Wiadomo, iż zlokalizowane w części Fc IgG tregitopy, ulegają internalizacji i rozpadowi między innymi w proteasomie. Produkty rozpadu przeciwciał mogą osiągać różne kompartmenty komórki takie jak: błona komórkowa, białka cytoszkieletu, organelle komórkowe, aparat Golgiego. Proteoliza pozwala na uwolnienie fragmentów przeciwciał - tregitopów, które mogą być prezentowane przez układ zgodności tkankowej (MHC) i pełnić funkcję regulatorowe. Obecnie bada się możliwość stosowania tregitopów w terapii wielu chorób o podłożu autoimmunologicznym takich jak stwardnienie rozsiane, cukrzyca, układowy toczeń rumieniowy, reumatoidalne zapalenie stawów, łuszczyca, cukrzyca, nieswoiste zapalenia jelit [3-6].
Tregitopy obecne w sekwencjach leków biologicznych i biotechnologicznych mają istotny wpływ na odpowiedź generowaną na podanie leku. Wiadomo, że leki biotechnologiczne zawierające w swojej strukturze tregitopy są mniej immunogenne od tych, które takich sekwencji nie zawierają.
T regitopy obecne w sekwencjach białek obecnych w szczepionkach mogą w istotny sposób ograniczać odpowiedź generowaną przez organizm na podanie szczepionki [7]. Obecnie poszukiwania sekwencji tolerogennych w białkach obecnych w szczepionkach jest jednym z ważniejszych kierunków optymalizacyjnych tej klasy leków.
Zarówno bakterie jak i wirusy, grzyby lub pasożyty również stanowią źródło tregitopów oraz wielu różnych sekwencji o działaniu tolerogennym [8-11]. Jest to jeden z czynników jakim patogeny modulują funkcję układu immunologicznego gospodarza. Celem modulowania odpowiedzi układu immunologicznego gospodarza jest supresja odpowiedzi immunologicznej, która w przypadku sprawnego mechanizmu mogłaby doprowadzić do eliminacji patogenu.
Tregitopom obecnym w białkach bakterii - komensali przypisuje się istotną rolę w utrzymywaniu prawidłowej funkcji układu immunologicznego w obrębie jelit, śluzówki jamy ustnej układu oddechowego [12].
Tregitopom obecnym w białkach chorobotwórczych bakterii przypisuje się istotną rolę w hamowaniu odpowiedzi układu immunologicznego gospodarza na ich obecność.
Działanie tregitopów jest ściśle połączone z wiązaniem z MHC, co wskazuje na to, że ostatecznym „receptorem” dla tregitopów zawartych w IgG jest cząsteczka MHC [13]. Wiadomo, że również w odniesieniu do MHC-I, tregitopy bardzo silnie modulują indukowaną poprzez MHC-I odpowiedź limfocytów T. Obecnie wiadomo, że cytotoksyczność limfocytów T jest ograniczana przez układy MHC-I oraz MHC-II [14]. Obydwa układy, MHC-I oraz MHC-II, są odpowiedzialne za mechanizmy nadwrażliwości na niektóre leki [15]. Wykazano, że układ MHC-I jest również odpowiedzialny za prezentowanie białek o charakterze immunogennym [16].
Celem wynalazku było zidentyfikowanie nowych peptydów tolerogennych o istotnym wpływie na wzrost liczby limfocytów Treg, które to peptydy nadawałyby się do stosowania w farmacji, zwłaszcza jako środki immunosupresyjne, w szczególności do stosowania w leczeniu i zapobieganiu chorobom autoimmunologicznym.
Nieoczekiwanie stwierdzono, że peptyd według wynalazku w istotny sposób indukuje proliferację komórek T regulatorowych w wyniku mechanizmu pośredniego (produkcja IL-10) lub bezpośredniego (interakcja międzykomórkowa z APC). Dodatkowo indukuje on rozwój fenotypu tolerogennego APC.
PL 238 939 B1
Wynalazek ujawnia nowy peptyd immunosupresyjny, który stymuluje różnicowanie limfocytów w kierunku populacji limfocytów Treg.
Istota wynalazku
Przedmiotem wynalazku jest peptyd posiadający sekwencję aminokwasową nr 1.
Kolejnym przedmiotem wynalazku jest peptyd posiadający sekwencję aminokwasową nr 1 do stosowania w farmacji.
Kolejnym przedmiotem wynalazku jest peptyd posiadający sekwencję aminokwasową nr 1 do stosowania w immunosupresji, zwłaszcza do indukowania funkcji lub liczby limfocytów T regulatorowych.
Korzystnie, peptyd do stosowania według wynalazku jest przeznaczony do leczenia lub zapobiegania choroby wybranej z spośród: zaburzenia hemostazy, zaburzenia funkcji układu immunologicznego, alergii, choroby autoimmunologicznej, zaburzenia związanego z przeszczepem, choroby nowotworowej, bezpłodności, braku lub nieprawidłowej funkcji enzymu, infekcji wirusowej, infekcji bakteryjnej, infekcji pasożytniczej lub infekcji grzybiczej.
Kolejnym przedmiotem wynalazku jest sposób zwiększania ilości limfocytów Treg charakteryzujący się tym, że z próbki biologicznej tkanki ssaka izoluje się ex-vivo limfocyty Treg lub komórki prezentujące antygen (APC), a uzyskane komórki poddaje się in-vitro działaniu peptydu zawierającego sekwencję o numerze 1 w celu zwiększenia liczby limfocytów Treg.
Szczegółowy opis wynalazku
Ujawniono peptydy posiadające sekwencję aminokwasową wybraną z grupy obejmującej sekwencje peptydów przedstawione jako sekwencje nr 1 lub 2 albo ich fragmentów przedstawionych odpowiednio jako sekwencje nr 3-11 (stanowiące fragmenty peptydu nr 1) oraz sekwencje 12-20 (stanowiące fragmenty peptydu nr 2).
Nieoczekiwanie ustalono, że peptydy o sekwencji nr 1 lub 2 w istotny sposób zwiększają liczbę funkcjonalnych Treg w badaniach in vitro.
Ponadto ustalono, że fragmentami peptydu nr 1 kluczowymi z punktu widzenia mechanizmu jego działania są peptydy o sekwencjach 3-11.
Jednocześnie ustalono, że fragmentami peptydu nr 2 kluczowymi z punktu widzenia mechanizmu jego działania są peptydy o sekwencjach 12-20.
Ujawniony peptyd stanowi nowy peptydowy epitop limfocytów T, zdolny do wpływania na różnicowanie się limfocytów T.
Ujawniono białkowy epitop limfocytów T o działaniu immunosupresyjnym posiadający sekwencję aminokwasową zawierającą co najmniej jedną spośród sekwencji o nr od 1 do 20.
W szczególności, ujawniony peptyd przeznaczony jest do hamowania odpowiedzi efektorowych limfocytów T, limfocytów T pomocniczych lub limfocytów B.
Ujawnione peptydy przeznaczone są do stosowania w sposobie tłumienia odpowiedzi immunologicznej zależnej od specyficznego antygenu poprzez podanie jednej lub większej liczby peptydów zawierających sekwencję wybraną spośród sekwencji o numerze od 1 do 20 w celu wyhamowania odpowiedzi układu immunologicznego na ten antygen. W szczególności oznacza to, że efekt immunosupresji osiągany jest poprzez wpływ na indukowane limfocyty Treg, naturalne Treg, supresję limfocytów T efektorowych, supresję limfocytów T pomocniczych lub supresję limfocytów B.
Ujawniono metody leczenia lub zapobiegania „stanom medycznym”, w których efekt terapeutyczny, metafilaktyczny lub profilaktyczny zależny jest między innymi od istotnego wzrostu ilości lub funkcji limfocytów Treg. Przy czym, wzrost liczby limfocytów lub zmiana ich funkcji spowodowana jest zastosowaniem co najmniej jednego spośród ujawnionych peptydów.
Ujawniono również zestaw lub preparat farmaceutyczny zawierający peptyd według wynalazku przeznaczony do stosowania w zapobieganiu lub leczeniu stanów medycznych.
Zgodnie z niniejszym opisem „stan medyczny” definiowany jest jako: zaburzenie hemostazy, zaburzenie funkcji układu immunologicznego, alergia, choroba autoimmunologiczna, zaburzenie związane z przeszczepem, choroba nowotworowa, bezpłodność, brak lub nieprawidłowa funkcja enzymu, infekcja wirusowa, infekcja bakteryjna, infekcja pasożytnicza lub infekcja grzybicza.
Rozważa się również zmianę struktury białek poprzez usunięcie z ich struktury sekwencji aminokwasowej wybranej spośród sekwencji 1-20 w celu zwiększenia ich immunogenności. Obejmuje to także zmianę struktury białek polegającą na usunięciu z ich struktury jednej lub więcej
PL 238 939 B1 sekwencji aminokwasowej wybranej spośród sekwencji 1-20 w celu zwiększenia ich antygenowości i immunogenności.
Peptyd według wynalazku może być stosowany w sposobie, który prowadzi do istotnego wzrostu ilości limfocytów Treg. Dotyczy to w szczególności sposobu, w którym próbka biologiczna pobierana jest z organizmu ssaka (pacjent, zwierzę), a następnie z próbki izolowane są komórki Treg lub komórki prezentujące antygen. Następnie komórki te poddawane są działaniu peptydu według wynalazku w celu zwiększenia liczby limfocytów Treg in vivo, ex vivo lub in vitro.
W celu lepszego wyjaśnienia istoty wynalazku został on przedstawiony w opisanych poniżej przykładach wykonania.
W etapie pierwszym prac, które doprowadziły do uzyskania wynalazku podjęto próbę opracowania modelu zależności między budową chemiczną tregitopów a siłą wiązania z MHC-I oraz MHC-II służącego do selekcji nowych tregitopów. W drugim etapie wykonano poszukiwania publikacji naukowych, które ujawniałyby wpływ określonego białka zawierającego potencjalne tregitopy na aktywność Treg. W etapie trzecim prowadzono selekcję wąskiej grupy potencjalnych tregitopów przeznaczonych do weryfikacji in vitro w oparciu o grupę z etapu drugiego.
W pracach eksperymentalnych wykorzystano metodę in vitro pozwalającą na weryfikację aktywności wybranych polipeptydów na modelu zwierzęcym (myszy szczepu C57BL6 Foxp3GFP). Pierwszy etap polegał na optymalizacji izolacji splenocytów oraz sortowaniu z nich odpowiednich grup komórek takich jak komórki prezentujące antygen (komórki dendrytyczne i makrofagi) oraz komórki CD4+CD25-.
W trakcie prac eksperymentalnych przeprowadzono analizę wpływu testowanych peptydów na ilość komórek CD4+CD25-, CD4+CD25+Foxp3+ i CD4+CD25+Foxp3+IL-10+ występujących w hodowli komórek CD11c i CD11b (komórki prezentujące antygen) oraz komórek CD4+25-. Pozwoliło to na określenie zdolności wytypowanych sekwencji polipeptydowych do wywoływania proliferacji limfocytów Treg.
P r z y k ł a d 1. Projektowanie i synteza peptydów
Sekwencje peptydów 1 i 2 ustalono metodami in silico. Peptyd o sekwencji 1 został wyodrębniony z białka o sekwencji 21 natomiast peptyd o sekwencji 2 został wyodrębniony z białka o sekwencji 22.
Sekw. 1 jest sekwencją występującą w białku UniProtKB - P03244 (E1B55_ADE02), (UniProtKB, 2016) opisywanym jako E1B-55K (ang.: E1B 55 kDa protein, nomenklatura UniProtKB). Nazwy alternatywne: E1B protein, large T-antigen, E1B-495R. Białko to produkowane jest między innymi przez: ludzkiego adenowirusa C serotypu 2 (HAdV-2) i kodowane przez gen E1B. Sekwencję białka E1B-55K przedstawiono jako sekwencję nr 21.
Sekwencja nr 2 jest sekwencją występującą w białku UniProtKB - P52960 (PIP2_YEAST), (UniProtKB, 2016) opisywanym jako regulator transkrypcji proliferacji peroksysomów. Białko to produkowane jest między innymi przez: Saccharomyces cerevisiae (ATCC 204508 / S288c) i kodowane przez gen PIP2. Sekwencję białka przedstawiono jako sekwencję nr 22.
Pozostałe peptydy wytypowano jako fragmenty peptydów o sekwencjach 1 i 2.
Syntezę peptydów prowadzono znaną techniką syntezy chemicznej peptydów w GeneCust Europe Laboratoire de Biotechnologie du Luxembourg S. A. Poglądowy proces syntezy peptydów został zaprezentowany na Rycinie 1.
P r z y k ł a d 2. Badania eksperymentalne
W doświadczeniu wykorzystano 30 samic myszy domowej Mus musculus, szczepu C57BL6 Foxp3GFP, w wieku 6-8 tygodni. Myszy użyte w tym doświadczeniu są szczepem transgenicznym, który pod promotorem genu Foxp3, czyli czynnika transkrypcyjnego charakteryzującego komórki T regulatorowe, ma wprowadzone białko zielonej fluorescencji. Jest on szczepem z wyboru, w badaniach nad indukcją limfocytów T regulatorowych. Zwierzęta były utrzymywane w optymalnych warunkach sanitarnych i żywieniowych.
2.1. Skład buforów wykorzystywanych w procedurach badawczych
Na każdym etapie badania wykorzystywano samodzielnie sporządzane bufory. Ich skład przedstawiono w Tabeli 1.
PL 238 939 Β1
Tabela 1. Skład buforów
| Medium RPMI | Medium RPMI | Bufor FACS | Bufor |
| podstawowe | rozs zerzone | do | |
| sortowania | |||
| Medium RPMI 1640 | Medium RPMI 1640 | FBS | FBS |
| FBS | FBS | EDTA | EDTA |
| β - merkaptoetanol | β — merkaptoetanol | PBS | PBS |
| penicylina | penicylina | azydek sodu | |
| streptomycyna | streptomycyna | ||
| pirogronian sodu | pirogronian sodu | ||
| HEPES | HEPES | ||
| MEM NEA | MEM NEA | ||
| IL - 2 | |||
| TGF - beta |
RPMI 1640 - medium hodowlane; bufor FACS - bufor do cytometru przepływowego; FBS - surowica płodowa cieląt; HEPES kwas 4-(2-hydroksyetylo)-1-piperazynoetanosulfonowy; IL-2 - interleukina 2; TGFp - transformujący czynnik wzrostu beta; EDTA - kwas wersenowy; PBS - bufor soli fizjologicznej; MEM NEA - podłoże MEM NEA.
2.2. Peptydy - charakterystyka i proces ich rozpuszczania
W doświadczeniu wykorzystano 10 peptydów, z których osiem sekwencji powstało na podstawie stworzonego w pierwszej części badania modelu matematycznego in silico, sekwencja EEQYNSTYRWSVLTVLHQDW (kontrola pozytywna) oraz sekwencja GYYWSWIRQPPGKGEEWIG (kontrola negatywna) oraz dodatkowo komórki niestymulowane żadnym peptydem (dodatkowa kontrola negatywna). Kontrolą pozytywną jest tregitop o potwierdzonej funkcji regulatorowej [17], a kontrolą negatywną tolerogenny peptyd o nazwie Edratide [18], który nie przeszedł II fazy badań klinicznych. Dlatego też peptyd ten został uznany w modelu matematycznym za kontrolę negatywną.
Każdy z testowanych peptydów cechował się różnym wypadkowym ładunkiem cząsteczki. Na podstawie różnic w ładunku wyodrębniono więc 3 grupy peptydów o wypadkowym ładunku: ujemnym, zerowym lub dodatnim (Tabela 2). Podstawowe roztwory peptydów o wypadkowym ładunku ujemnym (peptydy o numerze 1, 2, 3 z tabeli 2) rozpuszczono w wodzie lub z dodatkiem wodorotlenku amonu (NhUOH). Neutralnie naładowane peptydy (peptydy o numerze 4, 5, 6, 7 z tabeli 2) rozpuszczono w organicznym rozpuszczalniku acetonitrylu. W przypadku jednego trudno rozpuszczającego się peptydu (peptyd o numerze 6 z tabeli 2) użyto dimetylosulfotlenek (DMSO) oraz mocznik w ilości optymalnej dla komórek przeznaczonych do założenia hodowli. Peptydy z przewagą grup aminowych (peptydy o numerze 8, 9, 10 z tabeli 2) rozpuszczono w wodzie, kwasie octowym, a także w kwasie trifluorooctowym (TFA) (słabo rozpuszczalne peptydy).
PL 238 939 Β1
Tabela 2. Peptydy o różnym ładunku
| Lp. | Wypadkowy ładunek cząsteczkowy peptydu | Sekwencja peptydu | Rozpuszczalnik |
| 1. | ładunek ujemny | E EQYN S T YRWS VL T VLH Q DW | Woda |
| 2 . | LKDFALEGTLAADKT | Woda | |
| 3 . | DELLECLSPATSRTF | Woda | |
| 4 . | ładunek zerowy | GYYWSWIRQPPGKGEEWIG | Acetonitryl |
| 5. | WLSIISMATLESSLK | acetonitryl, DMSO | |
| 6. | LMKLYSFLLNDSPLN | acetonitryl, DMSO, mocznik | |
| 7 . | LNVLRIΙΝΕΡΤΑΑΆΙ | Acetonitryl | |
| 8 . | ładunek dodatni | SLRSAHLVGQTILSG | Woda |
| 9. | FSGTVFLANrNLILH | woda, kwas octowy, TFA | |
| 10. | N H HNMLL 3 L S T S GVL | Woda |
2.3. Pobieranie próbek materiału oraz badanie przesiewowe myszy weryfikujące fluorescencję czynnika Foxp3.
Samice myszy poddawano procedurze eutanazji. Samicom, post mortem pobierano próbkę krwi w celu sprawdzenia fluorescencji czynnika Foxp3 oraz śledzionę do dalszego badania.
Każda z samic została poddana procedurze weryfikacji fluorescencji czynnika Foxp3. Niektóre osobniki ze względu na negatywny wynik badania przesiewowego nie zostały włączone do dalszego etapu badania.
Badanie przesiewowe rozpoczynało się pobraniem krwi ze splotu żylnego ocznego. Pozyskaną krew wirowano w temperaturze 4°C przy 700xg przez 8 minut w celu odwirowania osocza. Następnie, warstwę erytrocytów zmieszano z 150 pL chlorku amonu (ACK) i inkubowano przez 3 minuty w temperaturze 21 °C, po czym odwirowano w warunkach jak wyżej. Po wypłukaniu ACK, komórki przepłukano dwukrotnie 200 pL buforu do sortowania, a następnie zawieszono w buforze FACS i przeniesiono do probówek typu FACS. Tak przygotowane próby zbadano metodą cytometrii przepływowej (BD Bioscience FACSCalibur™).
Równolegle do powyższej procedury, pobrano od badanych osobników śledzionę.
2.4. Izolacja komórek
Wyizolowaną śledzionę przetarto sterylnie przez sitko 40 pm do 2 mL roztworu ACK. Następnie, zawiesinę komórek przeniesiono do sterylnej probówki. Jej zawartość uzupełniono do 10 mL roztworem ACK i wirowano w temperaturze 4°C przy 400xg przez 10 minut.
Ostrożnie zebrano supernatant znad komórek. Uzyskany osad zawieszono w roztworze do sortowania, uzupełniono do 10 mL i wirowano w temperaturze 4°C przy 400xg przez 9 minut. Etap płukania w roztworze do sortowania powtórzono jednokrotnie, zmieniając nieznacznie parametry - w temperaturze 4°C przy 350xg przez 10 minut. Po ostatnim płukaniu, zlano supernatant znad osadu komórek, który zawieszono w 1000 pL. Wyizolowane komórki poddawano sortowaniu w celu wyodrębnienia odpowiednich populacji komórek układu immunologicznego.
2.5. Określenie liczby splenocytów w pobranych narządach
Przed przystąpieniem do kolejnego etapu, za każdym razem określano liczbę splenocytów w pobranych organach. W tym celu pobierano ze wcześniej sporządzonej zawiesiny komórek 5 pL roztworu i dodawano 245 pL płynu Turka (rozcieńczenie 50-krotne). Tak rozcieńczoną zawiesinę w ilości 10 pL przenoszono na komorę Burkera i obliczano splenocyty (N = liczba splenocytów/mL) za pomocą następującego wzoru:
stwierdzona liczba komórek x rozcieńczenie objętość komory
X 1000
PL 238 939 B1
2.6. Sortowanie komórek
Wyizolowane w poprzednim etapie komórki poddawano sortowaniu. Celem było wysortowanie komórek APC czyli makrofagów i komórek dendrytycznych oraz komórek CD4+ i komórek CD25+. Komórki CD25+ nie zostały włączone do eksperymentu, lecz ich oddzielenie było konieczne w celu wyizolowania komórek CD25-.
Jako pierwsze zostały wyizolowane komórki dendrytyczne z markerem CD11c. W tym celu wykorzystano zestaw EasySep™ Mouse CD11c Positive Selection Kit postępując zgodnie z instrukcją producenta (STEMCELL Technologies Inc.). Wyizolowane komórki CD11c zawieszono w 1 mL medium i policzono. Uzyskane komórki dendrytyczne umieszczono ostatecznie w 96-dołkowej płytce w ilości 50 000 komórek/dołek.
Kolejną, izolowaną z supernatantu zlanego z poprzedniego procesu sortowania, populacją komórek były makrofagi ekspresjonujące marker CD11b. Izolowanie prowadzono za pomocą EasySep™ Mouse CD11 Positive Selection Kit oraz MagniSort Mouse CD11b Biotin postępując każdorazowo zgodnie z instrukcjami producentów (STEMCELL Technologies Inc.). Wyizolowane i policzone komórki umieszczono w 96-dołkowej płytce w ilości 50 000 komórek/dołek razem z komórkami CD11c. Kolejną izolowaną populacją były komórki CD25+, które nie wchodziły do dalszej części eksperymentu. Izolowano je za pomocą EasySep™ Mouse CD25 Regulatory T Cell Positive Selection Kit postępując zgodnie z instrukcją producenta (STEMCELL Technologies Inc.). Usunięcie komórek CD25+ było konieczne w celu pozyskania populacji komórek CD4+CD25-.
Po usunięciu komórek CD25+, z pozostałej zawiesiny komórkowej izolowano komórki CD4+CD25 stosując zestaw zawierający: CD4 PE Labeling Reagent, EasySep® PE Selection Cocktail oraz EasySep® Magnetic Nanoparticles postępując zgodnie z instrukcją producenta (STEMCELL Technologies Inc.). Wyizolowane i policzone komórki umieszczono w 96-dołkowej płytce w ilości 100 000 komórek/dołek razem z komórkami CD11c i CD11b po inkubacji z mitomycyną C i wielokrotnym płukaniu.
2.7. Hodowle izolowanych populacji limfocytów w obecności analizowanych peptydów
Pozyskane komórki CD11, CD11 b i CD4+CD25- zawieszono w końcowym stężeniu 1 min komórek na 1 mL w medium podstawowym RPMI (Roswelł Park Memoriał Institute). Komórki CD11c i CD11b rozdzielono do dołków na płytce w ilości 50 000 komórek na dołek i pozostawiano w cieplarce na okres 1-2 godzin w celu zapewnienia prawidłowego przylegania komórek do płytki. Po tym czasie, medium odprowadzono i dodano medium podstawowe z mitomycyną C w ilości 50 μg/mL na 15 minut. Tak sporządzony roztwór dodano do komórek APC w ilości 200 μL/dołek i inkubowano 15 minut w temperaturze 37°C. Wszystkie czynności wykonywano używając medium o temperaturze 21°C, tak aby zwiększyć przeżywalność komórek APC. Następnie przepłukano komórki 4-krotnie medium o temperaturze 21°C. Do komórek CD11c i CD11b dodano peptydy w stężeniu 100 μg/mL i komórki CD4+CD25- w ilości 100 000 komórek/dołek zawieszone w medium rozszerzonym. Następnie prowadzono hodowlę przez 6 dni, co drugi dzień dodając świeże medium w temperaturze 21°C z dodatkiem cytokin: interleukiny 2 oraz transformującego czynnika wzrostu beta (medium rozszerzone).
2.8. Barwienie wewnątrzkomórkowe - analiza wyników hodowli
Po sześciu dniach na ostatnie 6 godzin dodano do hodowli następujące odczynniki: brefeldynę A, jonomycynę, PMA oraz monezynę A.
Po 6 godzinach stymulacji komórki zdjęto z płytki i przeniesiono do probówek typu FACS i odwirowano w temperaturze 21°C przy 300xg przez 5 minut. Osad komórek zawieszono w 50 μL buforu FACS i dodano 0,3 μL przeciwciała CD4 sprzężonego z fikoerytryną (PE) i inkubowano przez 30 minut w 4°C. Następnie, komórki odwirowano i zawieszono w 500μL roztworu FACS. Komórki odwirowano w temperaturze 21°C przy 300xg przez 5 minut, energicznie zlano supernatant, a osad komórek zawieszono w 500 μL buforu Fixation/Permeabilisation Buffer (roztwór Fixation/Permeabilisation Concentrate i Fixation/Permeabilisation Diluent w stosunku objętości 1:3 odpowiednio; BD Bioscience) i inkubowano w temperaturze 4°C w czasie około 18 godzin. Po tym czasie, komórki odwirowano w temperaturze 4°C przy 300xg przez 5 minut, energicznie zlano supernatant, a osad komórek zawieszono w 500 μL buforu do permeabilizacji (BD Bioscience) i zwirowano w temperaturze 4°C przy 300xg przez 5 minut. W następnej kolejności supernatant zlano, a osad komórek zawieszono w 50 μL wyżej wymienionego buforu do permeabilizacji z dodatkiem odczynnika blokującego receptor Fc, wykorzystywanego do blokowania niepożądanego wiązania się przeciwciał do mysiego receptora Fc w ilości 1 μL odczynnika na 100 μL buforu do permeabilizacji i inkubowano przez 15 minut w temperaturze 4°C. Po 15 minutach, do zawiesiny dodano oddzielnie mieszaninę przeciwciał 0,3 μL/próbę IL - 10 sprzężonej z allofikocyjaniną
PL 238 939 B1 i 0,3 μL/próbę kontroli izotypowej IL-10 sprzężonej również z allofikocyjaniną z 25 μL buforu do permeabilizacji i inkubowano przez 60 minut w temperaturze 4°C. Następnie komórki odwirowano w temperaturze 4°C przy 300xg przez 5 minut, supernatant zlano i zawieszono w 500 μL buforu do permeabilizacji. Proces płukania w buforze do permeabilizacji powtórzono jednokrotnie. Po ostatnim płukaniu komórki zawieszono w 200 μL roztworu 1% formaliny i zliczano metodą cytometrii przepływowej.
Wyniki badań wpływu analizowanych peptydów na populację komórek CD4+CD25+Foxp3+ i CD4+CD25+Foxp3+IL-10+ przedstawiono na Fig. 1 i Fig. 2.
Na Fig. 1 przedstawiono wpływ badanych polipeptydów na liczebność limfocytów Treg CD4+CD25+Foxp3+ in vitro.
Natomiast na Fig. 2 przedstawiono wpływ badanych polipeptydów na indukcję komórek wydzielających IL-10.
Na obydwu wykresach zastosowano takie same oznaczenia: kolor czarny - kontrola negatywna (peptyd GYY; komórki niestymulowane); kreskowanie ukośne - kontrola pozytywna; kolor biały - nowe, pozytywnie zweryfikowane tregitopy; niestymulowane - wynik analizy hodowli komórkowej bez żadnego peptydu (komórki niestymulowane); GYY - polipeptyd GyYWSWIRQPPGKGEEWIG (kontrola negatywna); NHH - polipeptyd NHHNMLLSLSTSGVL; LKD - polipeptyd LKDFALEGTLAADKT; LMK - polipeptyd LMKLYSFLLNDSPLN; LNV - polipeptyd LNVLRIINEPTAAAI; DEL - polipeptyd DELLECLSPATSRTF; SLR - polipeptyd SLRSAHLVGQTILSG; WLS - polipeptyd WLSIISMATLESSLK; EEQ - polipeptyd EEQYNSTYRVVSVLTVLHQDW (kontrola pozytywna); FSG - polipeptyd FSGTVFLANTNLILH.
2.9. Analiza interakcji w czasie rzeczywistym metodą SPR (surface plasmon resonance).
Technika SPR czyli pomiar rezonansu plazmonów powierzchniowych pozwala na badanie oddziaływań międzycząsteczkowych w czasie rzeczywistym pomiędzy analitem z roztworu badanej próbki, a immobilizowaną biocząsteczką.
Wiązanie wybranych sekwencji do kompleksu MHC-II immobilizowanego do nośnika NTA (GE Healthcare) analizowano metodą SPR za pomocą urządzenia BIAcore T200 (GE Healthcare). Wszystkie pomiary były prowadzone w temperaturze 25°C przy prędkości przepływu 30 μL/min. W celu weryfikacji powinowactwa kontroli negatywnej i pozytywnej do immobilizowanego białka (MHC-II), 150 μL roztworu każdego badanego peptydu w różnych stężeniach (50, 100, 200, 400 nM) oraz bufor kontrolny zostało przepuszczone nad powierzchnią płytki NTA ze zimmobilizowanym MHC-II (faza asocjacji/wiązania), przez 240 sekund. Następną fazą analizy był etap dysocjacji, polegający na przepuszczaniu nad w/w powierzchnią buforu do płukania przez 720 sekund. Te same próby każdego badanego peptydu w czterech różnych stężeniach zostały przepuszczone nad powierzchnią kontrolną, bez zimmobilizowanego MHC-II. Eksperyment był powtarzany trzykrotnie dla każdego z badanych peptydów. Uzyskane sensogramy otrzymano najpierw w wyniku odjęcia wartości ślepej próby buforowej z krzywych zarejestrowanych dla oddziaływań peptydów z unieruchomionym białkiem. Następnie krzywe odczytane po pasażu peptydów przez pustą powierzchnię odjęto od wcześniej uzyskanych sensogramów. Szybkość asocjacji, stałe szybkości dysocjacji oraz stałe równowagi wyznaczono stosując oprogramowanie BIAevaluation (wersja I, Biacore).
Wyniki przedstawiono w tabeli 3.
PL 238 939 Β1
Tabela 3. Szybkość asocjacji (ka), stała szybkości dysocjacji (kd) oraz stała równowagi (Kd) dla wybranych polipeptydów
| Polipeptyd | KD | ka | kd |
| EEQYNSTYRWSVLTVLHQD W | 7, 65*10~8 | 3,38*104 | 2,59*10-3 |
| 8, 69*10~8 | 2,78*104 | 2,39*10-3 | |
| 7, 98*10~8 | 3,15*104 | 2,51*10-3 | |
| SLRSAHLVGQTILSG | 2,15*10~8 | 4,91*105 | l,06*10-2 |
| 3,59*10~8 | 3,05*105 | 1,10*10-2 | |
| 1, 19*10~8 | 9,72*105 | 1, 15*10-2 | |
| NHHNMLLSLSTSGYL | 3,59*10~8 | 9,44*106 | 3,39*10-2 |
| 6, 86*10-9 | 7, 97*106 | 5,40*10-2 | |
| 5, 78*10-9 | 8,63*106 | 4,99*10-2 | |
| DELLECLSPATSRTF | 2,02*10-9 | 1,68*105 | 3,39*10-4 |
| 2,09*10-9 | 1,59*105 | 3,34*10-4 | |
| 1, 97*10-9 | 1,80*105 | 3,55*10-4 |
ka - szybkość asocjacji; kd - stała szybkości dysocjacji; Kd - stała równowagi.
Podsumowanie i wnioski
Przeprowadzono prace badawcze pozwoliły na zidentyfikowanie sekwencji o działaniu immunosupresyjnym, które wpływają na populację limfocytów T regulatorowych (Treg). Zweryfikowane pozytywnie sekwencje to:
Sekwencja nr 1: FSGTVFLANTNLILH
Sekwencja nr 2: WLSIISMATLESSLK
Sekwencja nr 1 oraz sekwencja nr 2 w istotny sposób zwiększają liczbę funkcjonalnych Treg w badaniach in vitro. Kluczowe z punktu widzenia mechanizmu działania sekwencji nr 1 fragmenty wymieniono poniżej (sekwencje nr 3-11):
Sekw. nr 3: FSGTVFL
Sekw. nr 4: SGTVFLA
Sekw. nr 5: GTVFLAN
Sekw. nr 6: TVFLANT
Sekw. nr 7: VFLANTN
Sekw. nr 8: FLANTNL
Sekw. nr 9: LANTNLI
Sekw. nr 10: LANTNLIL
Sekw. nr 11: ANTNLILH
Kluczowe z punktu widzenia mechanizmu działania sekwencji nr 2 fragmenty wymieniono poniżej (sekwencje nr 12-20):
| Sekw. nr 12: WLSIISM |
| Sekw. nr 13: LSIISMA |
| Sekw. nr 14: SIISMAT |
| Sekw. nr 15: IISMATL |
| Sekw. nr 16: ISMATLE |
| Sekw. nr 17: SMATLES |
| Sekw. nr 18: MATLESS |
| Sekw. nr 19: ATLESSL |
| Sekw. nr 20: TLESSLK |
PL 238 939 B1
Piśmiennictwo:
1. de Groot AS, Moise L, McMurry JA, Wambre E, Van Overvelt L, Moingeon P, Scott W, Martin W. Activation of natural regulatory T cells by IgG Fc - derived peptide Tregitopes. Blood. 2008; 112:3303.
2. de Groot AS. Do Tregitopes have the potential to impact the current tre atment landscape of autoimmune diseases? Expert Review of Clinical Immunology. 2013; 9(12):1155-1157.
3. Elyaman W, Khoury SJ, Scott DW, de Groot AS. Potential application of tregitopes as immunomodulating agents in multiple sclerosis. Neurol Res Int. 2011; 2011:256460, doi:10.1155/2011/256460.
4. Hahn BH, Anderson M, Le E, la Cava A. Anti - DNA Ig peptides promote Treg cell activity in systemic lupus erythematosus patients. Arthritis Rheum. 2008; 58:2488-2497.
5. Cousens LP, Su Y, McClaine E, Li X, Terry F, Smith R, Lee J, Martin W, Scott DW, de Groot AS. Application of IgG - derived natural Treg epitopes (IgG Tregitopes) to antigen - specific tolerance induction in a murine model of type 1 diabetes. J Diabetes Res. 2013; 2013:621-693.
6. de Groot AS. Do Tregitopes have the potential to impact the current treatment landscape of autoimmune diseases? Expert Review of Clinical Immunology. 2013; 9(12):1155-1157.
7. Aguirre D. Deletion of antibody encoded tolerogenic signals to improve a dendritic cell targeted vaccine delivery platform system. University Of Rhode Island, 2014.
8. Taylor MD, Harris A, Babayan SA, Bain O, Culshaw A, Allen JE, Maizels RM. CTLA-4 and CD4+CD25+ regulatory T cells inhibit protective immunity to filarial parasites in vivo. J Immunol. 2007; 179(7):4626-34.
9. Donkor ON, Ravikumar M, Proudfoot O, Day SL, Apostolopoulos V, Paukovics G, Vasiljevic T, Nutt SL, Gill H. Cytokine profile and induction of T helper type 17 and regulatory T cells by human peripheral mononuclear cells after microbial exposure. Clin Exp Immunol. 2012; 167 (2):282-95.
10. Hooper LV, Littman DR, Macpherson AJ. Interactions between the microbiota and the immune system. Science. 2012; 336(6086):1268-73.
11. Kaewraemruaen C, Sermswan RW, Wongratanacheewin S. Induction of regulatory T cells by Opisthorchis viverrini. Parasite Immunol. 2016. doi:10.1111/pim.12358.
12. Maynard CL, Elson CO, Hatton RD, Weaver CT. Reciprocal interactions of the intestinal microbiota and immune system. Nature. 2012; 489(7415):231-41.
13. Bergtold A, Desai DD, Gavhane A, Clynes R. Cell Surface recycling of internalized antigen permits dendritic cell priming of B cells. Immunity. 2005; 23(5):503-14.
14. Kolaitis G, Doymaz M, Rouse BT. Demonstration of MHC class II -restricted cytotoxic T lymphocytes in mice against herpes simplex virus. Immunology. 1990; 71: 101-106.
15. Keane NM, Pavlos RK, McKinnon E, Lucas A, Rive C, Blyth CC, Dunn D, Lucas M, Mallal S, Phillips E. HLA Class I restricted CD8+ and Class II restricted CD4+ T cells are implicated in the pathogenesis of nevirapine hypersensitivity. AIDS. 2014; 28:1891-1901.
16. Calis JJA, Maybeno M, Greenbaum JA, Weiskopf D, De Silva AD, Sette A, Kemir K, Peters B. Properties of MHC Class I Presented Peptides That Enhance Immunogenicity. PLoS Comput Biol. 2013; doi: 10.1371/j ournal.pcbi.1003266
17. Epivax, Inc. Regulatory T cell epitopes, compositions and uses thereof US 20090018067 A1, CA2677073A1. US patent, 2007.
18. Urowitz MB, Isenberg DA, Wallace DJ. Safety and efficacy of hCDR1 (Edratide) in patients with active systemic lupus erythematosus: results of phase II study. Lupus Science & Medicine. 2015; 2(1) : e000104. doi: 10.1136/lupus - 2015 -000104.
PL 238 939 Β1
SEQUENCE LISTING <110> Przedsiębiorstwo Farmaceutyczne Okoniewscy „Vetos-Farma sp. z o. o.
| <120> Peptydy immunosupresyjne | i ich zastosowania |
| < 130> PK/4062/RW < 160> 20 < 170> Patentln version 3.5 < 210> 1 < 211> 15 < 212> PRT < 213> artificial <220> < 223> peptyd immunosupresyjny < 400> 1 Phe Ser Gly Thr Val Phe Leu Ala | Asn Thr Asn Leu Ile Leu His |
| 1 5 < 210> 2 < 211> 15 < 212> PRT < 213> artificial <220> < 223> peptyd immunosupresyjny < 400> 2 Trp Leu Ser Ile Ile Ser Met Ala | 10 15 Thr Leu Glu Ser Ser Leu Lys |
| 1 5 | 10 15 |
<210>
<211>
<212>
<213>
PRT artificial <220>
<223> peptyd immunosupresyjny <400> 3
Phe Ser Gly Thr Val Phe Leu <210> 4 <211> 7 <212> PRT
PL 238 939 Β1
| <213> | artificial |
| <220> <223> | peptyd immunosupresyjny |
| <400> | 4 |
Ser Gly Thr Val Phe Leu Ala
5 < 210> 5 < 211> 7 < 212> PRT < 213> artificial <220>
< 223> peptyd immunosupresyjny < 400> 5
Gly Thr Val Phe Leu Ala Asn < 210> 6 < 211> 7 < 212> PRT < 213> artificial <220>
< 223> peptyd immunosupresyjny < 400> 6
Thr Val Phe Leu Ala Asn Thr < 210> 7 < 211> 7 < 212> PRT < 213> artificial <220>
< 223> peptyd immunosupresyjny < 400> 7
Val Phe Leu Ala Asn Thr Asn < 210> 8 < 211> 7 < 212> PRT < 213> artificial
PL 238 939 Β1
| <220> <223> | peptyd inununosupresyjny |
| <400> | 8 |
Phe Leu Ala Asn Thr Asn Leu
| <210> <211> <212> <213> | 9 7 PRT artificial |
| <220> <223> | peptyd immunosupresyjny |
| <400> | 9 |
Leu Ala Asn Thr Asn Leu Ile
| <210> <211> <212> <213> | 10 8 PRT artificial |
| <220> <223> | peptyd immunosupresyjny |
| <400> | 10 |
Leu Ala Asn Thr Asn Leu Ile Leu
| <210> <211> <212> <213> | 11 8 PRT artificial |
| <220> <223> | peptyd immunosupresyjny |
| <400> | 11 |
Ala Asn Thr Asn Leu Ile Leu His
| <210> <211> <212> <213> | 12 7 PRT artificial |
| <220> <223> | peptyd immunosupresyjny |
PL 238 939 Β1 <400> 12
Trp Leu Ser Ile Ile Ser Met <210> 13 <211> 7 < 212> PRT < 213> artificial <220>
< 223> peptyd immunosupresyjny <400> 13
Leu Ser Ile Ile Ser Met Ala
5 < 210> 14 < 211> 7 < 212> PRT < 213> artificial <220>
<223> peptyd immunosupresyjny <400> 14
Ser Ile Ile Ser Met Ala Thr <210>
<211>
<212>
<213>
PRT artificial <220>
<223> peptyd immunosupresyjny <400> 15
Ile Ile Ser Met Ala Thr Leu
5 <210> 16 <211> 7 < 212> PRT < 213> artificial <220>
< 223> peptyd immunosupresyjny <400> 16
PL 238 939 Β1
Ile Ser Met Ala Thr Leu Glu <210> 17 < 211> 7 < 212> PRT < 213> artificial <220>
< 223> peptyd immunosupresyjny < 400> 17
Ser Met Ala Thr Leu Glu Ser <210>
<211>
<212>
<213>
PRT artificial <220>
< 223> peptyd immunosupresyjny <400> 18
Met Ala Thr Leu Glu Ser Ser < 210> 19 < 211> 7 < 212> PRT < 213> artificial <220>
< 223> peptyd immunosupresyjny < 400> 19
Ala Thr Leu Glu Ser Ser Leu <210>
<211>
<212>
<213>
<220>
<223>
<400>
PRT artificial peptyd immunosupresyjny
Thr Leu Glu Ser Ser Leu Lys
Claims (5)
- Zastrzeżenia patentowe1. Peptyd posiadający sekwencję aminokwasową nr 1.
- 2. Peptyd posiadający sekwencję aminokwasową nr 1 do stosowania w farmacji.
- 3. Peptyd posiadający sekwencję aminokwasową nr 1 do stosowania w immunosupresji, zwłaszcza do indukowania funkcji lub liczby limfocytów T regulatorowych.
- 4. Peptyd do stosowania według zastrz. 3, znamienny tym, że jest przeznaczony do leczenia lub zapobiegania choroby wybranej z spośród: zaburzenia hemostazy, zaburzenia funkcji układu immunologicznego, alergii, choroby autoimmunologicznej, zaburzenia związanego z przeszczepem, choroby nowotworowej, bezpłodności, braku lub nieprawidłowej funkcji enzymu, infekcji wirusowej, infekcji bakteryjnej, infekcji pasożytniczej lub infekcji grzybiczej.
- 5. Sposób zwiększania ilości limfocytów Treg, znamienny tym, że z próbki biologicznej tkanki ssaka izoluje się ex-vivo limfocyty Treg lub komórki prezentujące antygen (APC), a uzyskane komórki poddaje się in-vitro działaniu peptydu zawierającego sekwencję o numerze 1 w celu zwiększenia liczby limfocytów Treg.
Priority Applications (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| PL419327A PL238939B1 (pl) | 2016-11-02 | 2016-11-02 | Peptyd immunosupresyjny i jego zastosowania |
| PCT/PL2017/050054 WO2018084731A1 (en) | 2016-11-02 | 2017-11-02 | Immunosuppressive peptides and uses thereof |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| PL419327A PL238939B1 (pl) | 2016-11-02 | 2016-11-02 | Peptyd immunosupresyjny i jego zastosowania |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| PL419327A1 PL419327A1 (pl) | 2018-05-07 |
| PL238939B1 true PL238939B1 (pl) | 2021-10-18 |
Family
ID=62062393
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| PL419327A PL238939B1 (pl) | 2016-11-02 | 2016-11-02 | Peptyd immunosupresyjny i jego zastosowania |
Country Status (2)
| Country | Link |
|---|---|
| PL (1) | PL238939B1 (pl) |
| WO (1) | WO2018084731A1 (pl) |
Families Citing this family (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN114512179B (zh) * | 2022-02-02 | 2024-09-24 | 上海图灵智算量子科技有限公司 | 基于量子互学习机制的结合能预测方法 |
Family Cites Families (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| KR101722305B1 (ko) * | 2007-01-30 | 2017-03-31 | 에피백스, 인크. | 조절 ｔ 세포 에피토프, 그의 조성물 및 용도 |
| WO2016030888A1 (en) * | 2014-08-26 | 2016-03-03 | Compugen Ltd. | Polypeptides and uses thereof as a drug for treatment of autoimmune disorders |
| EP3126374B1 (en) * | 2014-04-01 | 2018-11-07 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | An isolated donor mhc-derived peptide and uses thereof |
-
2016
- 2016-11-02 PL PL419327A patent/PL238939B1/pl unknown
-
2017
- 2017-11-02 WO PCT/PL2017/050054 patent/WO2018084731A1/en not_active Ceased
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| WO2018084731A1 (en) | 2018-05-11 |
| PL419327A1 (pl) | 2018-05-07 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| US20240034759A1 (en) | Immunogenic peptides and their use in immune disorders | |
| JP7001575B2 (ja) | Ｂ細胞の増加及び評価方法並びに疾患治療のための増加ｂ細胞の使用方法 | |
| Frandji et al. | Antigen-dependent stimulation by bone marrow-derived mast cells of MHC class II-restricted T cell hybridoma. | |
| RU2709711C2 (ru) | Новые иммуногенные пептиды | |
| Segovia et al. | Autologous dendritic cells prolong allograft survival through Tmem176b-dependent antigen cross-presentation | |
| Romao et al. | Checking the garbage bin for problems in the house, or how autophagy assists in antigen presentation to the immune system | |
| KR20240015731A (ko) | 신규 면역원성 CD1d 결합 펩티드 | |
| US20120321665A1 (en) | Compositions and methods for treating airway inflammatory diseases | |
| ITRM20070437A1 (it) | Metodo per la generazione ed espansione di cellule t gamma/delta regolatorie cellule cosi' ottenute e loro impieghi | |
| JP2016539635A (ja) | 抗原特異的調節性ｔ細胞の誘導方法 | |
| WO2011078990A1 (en) | Hydrogels comprising hyaluronan and at least one t cell induction agent | |
| Yang et al. | Engineering an “infectious” Treg biomimetic through chemoselective tethering of TGF-β1 to PEG brush surfaces | |
| Soria et al. | Mite allergoids coupled to nonoxidized mannan from Saccharomyces cerevisae efficiently target canine dendritic cells for novel allergy immunotherapy in veterinary medicine | |
| US7595052B2 (en) | Composition and method for the prevention and/or the treatment of allergy | |
| Vicente-Gil et al. | Immunomodulatory properties of Bacillus subtilis extracellular vesicles on rainbow trout intestinal cells and splenic leukocytes | |
| Wang et al. | Induction of immunotolerance via mPEG grafting to allogeneic leukocytes | |
| Sahu et al. | Encapsulation of recombinant MOMP in extended-releasing PLGA 85: 15 nanoparticles confer protective immunity against a Chlamydia muridarum genital challenge and re-challenge | |
| JP2021516052A (ja) | 胸腺組織に由来する制御性ｔ細胞を入手する方法および免疫系障害における細胞免疫療法としての前記細胞の使用 | |
| RU2733886C2 (ru) | КОМПОЗИЦИЯ ДЛЯ СТИМУЛИРОВАНИЯ СОЗРЕВАНИЯ ДЕНДРИТНЫХ КЛЕТОК, СОДЕРЖАЩАЯ ГИБРИДНЫЙ БЕЛОК Rv2299c/ESAT-6 | |
| US20130004528A1 (en) | Direct analysis of antigen-specific immune response | |
| JP2014501726A (ja) | Ｎｋｔ細胞によって認識されるエピトープの添加による、抗原免疫原性の調節 | |
| Wirsdörfer et al. | Dendritic cell-like cells accumulate in regenerating murine skeletal muscle after injury and boost adaptive immune responses only upon a microbial challenge | |
| PL238939B1 (pl) | Peptyd immunosupresyjny i jego zastosowania | |
| Okoniewska et al. | New tregitopes inducing adaptive regulatory T cells in mice | |
| CN101580539A (zh) | 一种诱导cd4+cd25+调节性t细胞的多肽及应用 |