JP2016507105A - 複合系のための入力パラメータの最適化された組み合わせの高速識別 - Google Patents
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Abstract
Description
本願は、2013年1月17日出願の米国仮出願第61/753,842号の利益を主張し、その開示全体は、参照により本明細書に組み込まれる。
本発明は、全米科学財団によって与えられた助成金番号0751621の下、政府の支援で行われた。政府は、本発明のある特定の権利を有する。
本開示の実施形態は、複合系のための入力パラメータの最適化された組み合わせを識別することに関する。有利に、本開示の実施形態は、労働量、費用、リスク、信頼性、有効性、副作用、及び毒性に関連するものなど、複合系の最適化において直面するいくつかの主要な技術障害を回避する。本開示のいくつかの実施形態の最適化の目的は、とりわけ、労働量を低減すること、費用を低減すること、リスクを低減すること、信頼性を増加させること、有効性を増加させること、副作用を低減すること、及び毒性を低減することなどのうちの1つまたは任意の組み合わせであってもよい。いくつかの実施形態では、最適化された薬物組み合わせ(または組み合わせ薬物)及び個々の用量を用いた生物系の疾病の治療の特定の実施例が、本開示のある特定の態様を例示するために使用される。生物系は、例えば、個々の細胞、細胞培養もしくは細胞株などの細胞の集合体、器官、組織、または動物、個々のヒト患者、もしくはヒト患者群などの多細胞生物を含むことができる。生物系はまた、例えば、神経系、免疫系、または心臓血管系などの多組織系を含むことができる。
刺激は、患者を治療するために薬物を適用するなど、複合系を望ましい状態に向けるために印加され得る。これらの刺激を印加する種類及び大きさ(例えば、用量)は、その系を望ましい状態にするにおいて効率性に影響を及ぼす可能性がある入力パラメータの一部である。しかしながら、各薬物に対してM用量でのN個の種類の異なる薬物は、MN個の考えられる薬物用量組み合わせをもたらす。全ての可能な組み合わせに対する複数の試験によって、最適化された、またはさらに近く最適化された組み合わせを識別することは、実際には法外に高い。例えば、薬物の数及び用量が増加するにつれて、有効な薬物用量組み合わせを見つけるための動物及び臨床試験において全ての可能な薬物用量組み合わせを実施するのは実用的ではない。
E=E0+a1C1+a11C1C1
であり、合計で3つの定数E0、a1、及びa11を有する。
E=E0+a1C1+a2C2+a12C1C2+a11C1C1+a22C2C2
であり、合計で6つの定数E0、a1、a2、a12、a11、及びa22を有する。
図6は、本開示の一実施形態に従って実装される、処理ユニット600を示す。特定の用途に応じて、処理ユニット600は、例えば、携帯用電子機器、クライアントコンピュータ、またはサーバコンピュータとして実装され得る。図6を参照すると、処理ユニット600は、バス606に接続される中央処理装置(「CPU」)602を含む。入力/出力(「I/O」)装置604もまた、バス606に接続され、キーボード、マウス、ディスプレイなどを含むことができる。上記の節に記載されるある特定の手順のためのソフトウェアモジュールのセットを含む、実行可能なプログラムは、同様にバス606に接続されるメモリ608に記憶される。メモリ608はまた、視覚的表現を生成するために、ユーザインターフェースモジュールも記憶することができる。
Claims (21)
- 入力パラメータのプールからの入力パラメータの様々な組み合わせを適用することによって、複合系の複数の試験を実施することと、
多次元フィッティングを使用して、前記試験の結果を前記複合系のモデルにフィッティングすることと、
前記複合系の前記モデルを使用して、前記複合系の望ましい応答を得るために、入力パラメータの少なくとも1つの最適化された組み合わせを識別することと、
を含む、方法。 - 前記複合系は、生物系、化学系、及び物理系のうちの少なくとも1つである、請求項1に記載の方法。
- 前記入力パラメータのプールは、薬物のプールに対応し、前記入力パラメータの少なくとも1つの最適化された組み合わせを識別することは、前記薬物のプールからの薬物の用量の少なくとも1つの最適化された組み合わせを識別することを含む、請求項2に記載の方法。
- 前記複合系の前記モデルは、低次モデルである、請求項1に記載の方法。
- 前記複合系の前記モデルは、m定数を含み、前記試験の前記結果をフィッティングすることは、前記m定数の値を導くことを含む、請求項1に記載の方法。
- 前記複合系の前記複数の試験を実施することは、n≧mで、前記複合系のn個の試験を実施することを含む、請求項5に記載の方法。
- 前記試験の前記結果をフィッティングすることは、前記結果を前記複合系の多次元応答曲面にフィッティングすることを含み、前記入力パラメータの少なくとも1つの最適化された組み合わせは、前記応答曲面における少なくとも1つの極値を識別することを含む、請求項1に記載の方法。
- 薬物のプールからの薬物用量の様々な組み合わせを適用することによって、複数のインビボまたはインビトロ試験を実施することと、
前記試験の結果を薬物有効性の多次元応答曲面にフィッティングすることと、
前記応答曲面を使用して、望ましい薬物有効性を得るために、薬物用量の少なくとも1つの最適化された組み合わせを識別することと、
を含む、方法。 - 前記応答曲面は、薬物用量の二次関数である、請求項8に記載の方法。
- 前記応答曲面は、m定数によって表され、前記試験の前記結果をフィッティングすることは、前記m定数の値を導くことを含む、請求項8に記載の方法。
- 前記薬物のプールは、N個の全薬物を含み、m=1+2N+(N(N−1))/2である、請求項10に記載の方法。
- 前記薬物のプールは、N個の全薬物を含み、前記薬物のプールからの1つの薬物用量は、一定に保たれ、N>1に対して、m=1+2(N−1)+((N−1)(N−2))/2である、請求項10に記載の方法。
- 前記複数の試験を実施することは、n≧mで、n個の試験を実施することを含む、請求項10に記載の方法。
- n=mである、請求項13に記載の方法。
- 前記薬物用量の少なくとも1つの最適化された組み合わせを識別することは、前記応答曲面における少なくとも1つの最大値を識別することを含む、請求項8に記載の方法。
- 複合系のモデルを提供することであって、前記モデルは、前記複合系の応答をN個の入力パラメータの低次関数として表す、前記複合系のモデルを提供することと、
前記複合系の前記モデルを使用して、前記複合系の望ましい応答を得る前記N個の入力パラメータの複数の最適化された部分的組み合わせを識別することと、
を含む、方法。 - 前記複合系は、生物系であり、前記N個の入力パラメータのそれぞれは、N個の薬物のプールからの個々の薬物の用量である、請求項16に記載の方法。
- 前記低次関数は、前記N個の入力パラメータの二次関数である、請求項16に記載の方法。
- 前記低次関数は、mフィッティング定数を含み、m=1+2N+(N(N−1))/2である、請求項16に記載の方法。
- 前記低次関数は、mフィッティング定数を含み、N>1に対して、m=1+2(N−1)+((N−1)(N−2))/2である、請求項16に記載の方法。
- 前記複数の最適化された部分的組み合わせを識別することは、前記低次関数における複数の極値を識別することを含む、請求項16に記載の方法。
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