JP2016154482A - 除去領域設定方法、除去領域設定装置およびプログラム - Google Patents
除去領域設定方法、除去領域設定装置およびプログラム Download PDFInfo
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Abstract
Description
{π×(良好判別範囲10bの中心から輪郭までの最大距離)2}・・・(式2)
(良好判別範囲10bの輪郭の長さ)2/(4π×良好判別範囲10bの面積)
・・・(式3)
1−(良好判別範囲10bの重心から輪郭までの距離の標準偏差/前記距離の平均)
・・・(式4)
2・・・コンピュータ(除去領域設定手段)
3・・・撮像手段
10a・・・良好判別細胞
10b・・・良好判別範囲
14・・・良好細胞領域
15・・・除去領域
15a・・・仮除去領域(残りの領域)
16・・・培地
SP1・・・画像取込み工程
SP2・・・良否判別工程
SP3・・・第1の除去領域設定工程
SP4・・・第2の除去領域設定工程
SP5,SP5A・・・第3の除去領域設定工程
100・・・除去領域設定装置
Claims (6)
- 複数の細胞からなるコロニーが撮像された撮像画像に基づき、コロニーの少なくとも一部を培地から除去すべき除去領域として設定可能な除去領域設定方法であって、
前記撮像画像を取り込む画像取込み工程と、
前記撮像画像に現れている各細胞の良否をそれぞれ判別し、良好判別細胞を得る良否判別工程と、
コロニーに対して前記良好判別細胞が占める面積の割合を求め、当該割合が閾値未満と判断したコロニー全体を除去領域に設定する第1の除去領域設定工程と、
前記良好判別細胞に基づいて、良好な状態で継続的な培養が可能でないコロニーを判別し、当該コロニー全体を除去領域に設定する処理を少なくとも含む第2の除去領域設定工程と、
第1の除去領域設定工程および第2の除去領域設定工程で除去領域に設定されなかったコロニーの一部分に除去領域を設定可能な第3の除去領域設定工程とを有することを特徴とする除去領域設定方法。 - 前記第2の除去領域設定工程では、複数の良好判別細胞が集まって形成される良好判別範囲の面積が閾値以上か否か判断し、面積が閾値以上と判断された良好判別範囲を1つも有さないコロニーを、良好な状態で継続的な培養が可能でないと判断して、当該コロニー全体を除去領域に設定する一方、面積が閾値以上と判断された良好判別範囲に対して膨張および収縮させるための画像処理を行い、当該画像処理後の良好判別範囲のうち少なくとも一部を良好細胞領域に設定可能とし、
前記第3の除去領域設定工程では、前記良好細胞領域に基づいて除去領域を設定する請求項1記載の除去領域設定方法。 - 前記第2の除去領域設定工程では、前記除去領域の設定に加えて、良好判別範囲内の穴の合計面積、良好判別範囲の凸面度、良好判別範囲の真円度、良好判別範囲の円形度または良好判別範囲の丸み度の少なくとも何れか1つを利用して前記良好判別範囲の形状を算出し、算出した良好判別範囲の形状が所定の条件を満たすか否か判断して、所定の条件を満たす良好判別範囲を良好細胞領域に設定する請求項2記載の除去領域設定方法。
- 前記第3の除去領域設定工程では、前記良好細胞領域を膨張させるための画像処理を行い、良好細胞領域を膨張させたコロニーに対して、当該良好細胞領域をコロニーから除いた残りの領域の少なくとも一部を除去領域に設定し、当該除去領域を膨張させるための画像処理を行う、または、コロニーから前記良好細胞領域を除いた残りの領域の少なくとも一部を除去領域に設定し、当該除去領域を膨張および収縮させるための画像処理を行う請求項2又は3記載の除去領域設定方法。
- 複数の細胞からなるコロニーを撮像する撮像手段と、
請求項1〜4の何れかに記載の除去領域設定方法を実行する除去領域設定手段とを備えることを特徴とする除去領域設定装置。 - コンピュータに呼び込まれることによって、複数の細胞からなるコロニーが撮像された撮像画像に基づき、コロニーの少なくとも一部を培地から除去すべき除去領域として設定するための除去領域設定装置として前記コンピュータを動作させるためのプログラムであって、
前記撮像画像を取り込む画像取込ステップと、
前記撮像画像に現れている各細胞の良否をそれぞれ判別し、良好判別細胞を得る良否判別ステップと、
コロニーに対して前記良好判別細胞が占める面積の割合を求め、当該割合が閾値未満と判断したコロニー全体を除去領域に設定する第1の除去領域設定ステップと、
前記良好判別細胞に基づいて、良好な状態で継続的な培養が可能でないコロニーを判別し、当該コロニー全体を除去領域に設定する処理を少なくとも含む第2の除去領域設定ステップと、
第1の除去領域設定ステップおよび第2の除去領域設定ステップで除去領域に設定されなかったコロニーの一部分に除去領域を設定可能な第3の除去領域設定ステップとをコンピュータに実行させることを特徴とするプログラム。
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