JP2016123340A - 膵癌治療感受性の診断方法及び膵癌治療感受性の増強剤 - Google Patents

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浩昭 永野
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正樹 森
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祐一郎 土岐
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雅允 今野
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英利 江口
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Koichi Kawamoto
弘一 川本
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尚弘 西田
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準 小関
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慎一郎 長谷川
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幸蔵 野口
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礎 近藤
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Abstract

【課題】膵癌治療感受性の判定方法の提供。
【解決手段】膵癌治療感受性の判定方法であって、(1)ヒト膵癌の腫瘍組織から採取した癌部及び間質由来の検体それぞれにおける、以下のmiRNAから選択される少なくとも一種のmiRNAの発現量を測定する工程;及び(2)前記工程(1)で測定したmiRNAの全種において、前記工程(1)で得られた、間質由来検体の測定値が、癌部由来検体の測定値と比較してより大きければ、当該腫瘍組織の膵癌治療感受性が低いと判定する工程を含む方法。hsa−miR−4689;hsa−miR−4664−5p;hsa−miR−4731−5p;hsa−miR−187−5p;hsa−miR−4270;hsa−miR−4697−5p;hsa−miR−4723−5p;hsa−miR−6087;hsa−miR−145−5p;及びhsa−miR−125b−5p。
【選択図】なし

Description

本発明は、膵癌治療感受性の診断方法及び膵癌治療感受性の増強剤に関する。
難治性消化器癌の中でも膵癌は特に予後不良であり、診断後の5年生存率は数%に満たない。
この予後不良の原因として、膵癌が治療抵抗性を獲得すること(治療感受性が低下すること)が知られている。
このような膵癌の治療感受性を判定する方法が求められている。
本発明は、膵癌治療感受性の判定方法及び膵癌治療感受性の増強剤を提供することを課題とする。
本発明者らは、膵癌の特徴として、他の腫瘍に比べて間質が豊富であることに着目した。間質は、一見病理的には正常に見えても、分子論的には生物学的悪性度の進展に深く関わっている可能性が示唆されている。本発明者らは、この生物学的悪性度を分子論的に究明するため、レーザーマイクロダイセクションを施行してヒト膵癌の腫瘍組織を癌部と間質部で分けて微細な解析を行った。本発明者らは、その結果、複数の患者で共通して、癌部及び間質のそれぞれで共通して増減している一群のmiRNAを掌握した。本発明者らは、かかる知見に基づき、さらに試行錯誤を重ねることにより本発明を完成するに至った。
すなわち、本発明は、下記の態様を含む。
項1.
膵癌治療感受性の判定方法であって、
(1)ヒト膵癌の腫瘍組織から採取した癌部及び間質由来の検体それぞれにおける、以下のmiRNAからなる群より選択される少なくとも一種のmiRNAの発現量を測定する工程;及び
(2)前記工程(1)で測定したmiRNAの全種において、前記工程(1)で得られた、間質由来検体の測定値が、癌部由来検体の測定値と比較してより大きければ、当該腫瘍組織の膵癌治療感受性が低いと判定する工程
を含む方法:
hsa−miR−4689;
hsa−miR−4664−5p;
hsa−miR−4731−5p;
hsa−miR−187−5p;
hsa−miR−4270;
hsa−miR−4697−5p;
hsa−miR−4723−5p;
hsa−miR−6087;
hsa−miR−145−5p;及び
hsa−miR−125b−5p。
項2.
前記工程(2)において、間質由来検体の測定値が、癌部由来検体の測定値と比較して1.2倍以上であれば、膵癌治療感受性が低いと判定する、項1に記載の方法。
項3.
膵癌治療感受性の判定方法であって、
(1)ヒト膵癌の腫瘍組織から採取した癌部及び間質由来の検体それぞれにおける、以下のmiRNAからなる群より選択される少なくとも一種のmiRNAの発現量を測定する工程;及び
(2)前記工程(1)で測定したmiRNAの全種において、前記工程(1)で得られた、癌部由来検体の測定値が、間質由来検体の測定値と比較してより大きければ、当該腫瘍組織の膵癌治療感受性が低いと判定する工程
を含む方法:
hsa−miR−200c−3p;
hsa−miR−29b−3p;
hsa−miR−30d−5p;
hsa−miR−30b−5p;
hsa−miR−29a−3p;
hsa−miR−107;
hsa−miR−221−3p;
hsa−miR−103a−3p;
hsa−miR−16−5p;
hsa−miR−4284;
hsa−miR−1973;
hsa−miR−26b−5p;
hsa−let−7g−5p;
hsa−let−7f−5p;
hsa−miR−1246;及び
hsa−let−7e−5p。
項4.
前記工程(2)において、癌部由来検体の測定値が、間質由来検体の測定値と比較して2倍以上であれば、膵癌治療感受性が低いと判定する、項3に記載の方法。
項5.
hsa−miR−4689;
hsa−miR−4664−5p;
hsa−miR−4731−5p;
hsa−miR−187−5p;
hsa−miR−4270;
hsa−miR−4697−5p;
hsa−miR−4723−5p;
hsa−miR−6087;
hsa−miR−145−5p;
hsa−miR−125b−5p;
hsa−miR−200c−3p;
hsa−miR−29b−3p;
hsa−miR−30d−5p;
hsa−miR−30b−5p;
hsa−miR−29a−3p;
hsa−miR−107;
hsa−miR−221−3p;
hsa−miR−103a−3p;
hsa−miR−16−5p;
hsa−miR−4284;
hsa−miR−1973;
hsa−miR−26b−5p;
hsa−let−7g−5p;
hsa−let−7f−5p;
hsa−miR−1246;及び
hsa−let−7e−5p
からなる群より選択される少なくとも一種のmiRNAに対するアンチmiRNA、又はそれをコードするポリヌクレオチドを含む遺伝子治療ベクターを含む、膵癌治療感受性の増強剤。
本発明によれば、膵癌治療感受性の判定方法及び膵癌治療感受性の増強剤を提供できる。
1. 膵癌治療感受性の判定方法
本発明の判定方法はヒトを対象とする。
本発明の判定方法においては、成熟miRNAの発現量を測定する。
1.1 第一の態様
本発明の、膵癌治療感受性の判定方法のうち、第一の態様は、
(1)ヒト膵癌の腫瘍組織から採取した癌部及び間質由来の検体それぞれにおける、以下のmiRNAからなる群より選択される少なくとも一種のmiRNAの発現量を測定する工程;及び
(2)前記工程(1)で測定したmiRNAの全種において、前記工程(1)で得られた、間質由来検体の測定値が、癌部由来検体の測定値と比較してより大きければ、当該腫瘍組織の膵癌治療感受性が低いと判定する工程
を含む方法:
hsa−miR−4689;
hsa−miR−4664−5p;
hsa−miR−4731−5p;
hsa−miR−187−5p;
hsa−miR−4270;
hsa−miR−4697−5p;
hsa−miR−4723−5p;
hsa−miR−6087;
hsa−miR−145−5p;及び
hsa−miR−125b−5p
を含む。
上記miRNA群を、便宜上、miRNA群Iという。
間質由来検体の測定値と、癌部由来検体の測定値との比較においては、特に限定されないが、閾値を1.2倍以上とすることができる。
厳密な判定が必要とされる場合には、個々のmiRNA毎に閾値を設定することができる。一例を以下に示す。
hsa−miR−4689:1.2倍以上
hsa−miR−4664−5p:1.2倍以上
hsa−miR−4731−5p:1.2倍以上
hsa−miR−187−5p:1.2倍以上
hsa−miR−4270:1.2倍以上
hsa−miR−4697−5p:1.2倍以上
hsa−miR−4723−5p:1.2倍以上
hsa−miR−6087:1.2倍以上
hsa−miR−145−5p:1.5倍以上
hsa−miR−125b−5p:1.5倍以上
miRNA群Iの全てについて測定を行ってもよいし、一部についてのみ行うこともできる。高い精度が求められる場合には、より多くのmiRNAについて測定を行うことが好ましい。
特に限定されないが、判定精度及び作業効率を考慮して、miRNA群Iのうち、2〜5種類、又は3〜4種類を選別して測定を行うことができる。
1.2 第二の態様
本発明の、膵癌治療感受性の判定方法のうち、第二の態様は、
(1)ヒト膵癌の腫瘍組織から採取した癌部及び間質由来の検体それぞれにおける、以下のmiRNAからなる群より選択される少なくとも一種のmiRNAの発現量を測定する工程;及び
(2)前記工程(1)で測定したmiRNAの全種において、前記工程(1)で得られた、癌部由来検体の測定値が、間質由来検体の測定値と比較してより大きければ、膵癌治療感受性が低いと判定する工程
を含む方法:
hsa−miR−200c−3p;
hsa−miR−29b−3p;
hsa−miR−30d−5p;
hsa−miR−30b−5p;
hsa−miR−29a−3p;
hsa−miR−107;
hsa−miR−221−3p;
hsa−miR−103a−3p;
hsa−miR−16−5p;
hsa−miR−4284;
hsa−miR−1973;
hsa−miR−26b−5p;
hsa−let−7g−5p;
hsa−let−7f−5p;
hsa−miR−1246;及び
hsa−let−7e−5p
を含む。
上記miRNA群を、便宜上、miRNA群IIという。
癌部由来検体の測定値と、間質由来検体の測定値との比較においては、特に限定されないが、閾値を2倍以上とすることができる。
厳密な判定が必要とされる場合には、個々のmiRNA毎に閾値を設定することができる。一例を以下に示す。
hsa−miR−200c−3p:5倍以上
hsa−miR−29b−3p:1.5倍以上
hsa−miR−30d−5p:1.5倍以上
hsa−miR−30b−5p:1.5倍以上
hsa−miR−29a−3p:1.2倍以上
hsa−miR−107:1.2倍以上
hsa−miR−221−3p:1.5倍以上
hsa−miR−103a−3p:1倍以上
hsa−miR−16−5p:1.2倍以上
hsa−miR−4284:2倍以上
hsa−miR−1973:1.2倍以上
hsa−miR−26b−5p:1.2倍以上
hsa−let−7g−5p:1.2倍以上
hsa−let−7f−5p:1.2倍以上
hsa−miR−1246:1.2倍以上
hsa−let−7e−5p:1.2倍以上
miRNA群IIの全てについて測定を行ってもよいし、一部についてのみ行うこともできる。高い精度が求められる場合には、より多くのmiRNAについて測定を行うことが好ましい。
特に限定されないが、判定精度及び作業効率を考慮して、miRNA群Iのうち、2〜5種類、又は3〜4種類を選別して測定を行うことができる。
1.3 共通事項
以下、上記した二つの態様に共通する事項について説明する。
ヒト膵癌の腫瘍組織は、典型的には、膵癌治療感受性の診断を必要とするヒトから採取する。
膵癌の腫瘍組織からの癌部及び間質由来の検体の採取は、特に限定されないが、好ましくはレーザーマイクロダイセクションを施行する。レーザーマイクロダイセクションは公知の方法を利用できるが、ヒト臨床検体から癌部及び間質部を正確に判別し高品質なサンプルを得る上では最も優れた技術である。
発現量の測定方法は、特に限定されないが、リアルタイムPCR、マイクロアレイ及びノーザンハイブリダイゼーション等が挙げられる。検出時間が短い点、及び類似配列を識別できる点において、リアルタイムPCRが特に好ましい。
発現量の比較にあたっては、正当な比較が可能な指標を用いる。例えば、組織の単位質量当たりの発現量を指標として用いることができる。
本発明の判定方法により、検体の採取元である腫瘍組織の予後の良し悪しを判定することもできる。具体的には、上記の基準にしたがって、膵癌治療感受性が高いと判定される腫瘍組織は、予後が良いと判定できる。反対に、上記の基準にしたがって、膵癌治療感受性が低いと判定される腫瘍組織は、予後が悪いと判定できる。
2. 膵癌治療感受性の増強剤
本発明の膵癌治療感受性の増強剤は、
hsa−miR−4689;
hsa−miR−4664−5p;
hsa−miR−4731−5p;
hsa−miR−187−5p;
hsa−miR−4270;
hsa−miR−4697−5p;
hsa−miR−4723−5p;
hsa−miR−6087;
hsa−miR−145−5p;
hsa−miR−125b−5p;
hsa−miR−200c−3p;
hsa−miR−29b−3p;
hsa−miR−30d−5p;
hsa−miR−30b−5p;
hsa−miR−29a−3p;
hsa−miR−107;
hsa−miR−221−3p;
hsa−miR−103a−3p;
hsa−miR−16−5p;
hsa−miR−4284;
hsa−miR−1973;
hsa−miR−26b−5p;
hsa−let−7g−5p;
hsa−let−7f−5p;
hsa−miR−1246;及び
hsa−let−7e−5p
からなる群より選択される少なくとも一種のmiRNAに対するアンチmiRNA、又はそれをコードするポリヌクレオチドを含む遺伝子治療ベクターを含む。
アンチmiRNAは、ターゲットのmiRNAと対になるような塩基配列を有する核酸分子(アンチセンス核酸分子)であり、かつターゲットのmiRNAの機能を阻害する活性を有する核酸分子である。アンチmiRNAは、公知の手法により設計し作成できる。
本発明の膵癌治療感受性の増強剤は、膵癌治療感受性の増強作用を有している限り、上記miRNA群のうち、全てをターゲットとする必要はない。好ましくは、一種又は二種のmiRNAをターゲットとする。
上記遺伝子治療ベクターは、適当なベクターにアンチmiRNAをコードするポリヌクレオチドを挿入することにより、得ることができる。
ベクターは、非ウイルスベクターであってもよいし、ウイルスベクターであってもよい。
本発明の膵癌治療感受性の増強剤は、有効量のアンチmiRNA及び/又は遺伝子治療ベクターを含有し、さらに必要に応じて賦形剤、安定剤、保存剤、緩衝剤、矯味剤、懸濁化剤、乳化剤、着香剤、溶解補助剤、着色剤及び粘稠剤等を含んでいてもよい。
本発明の膵癌治療感受性の増強剤の剤型は特に限定されず、例えば注射剤であってもよい。
以下、本発明を実施例及び比較例により具体的に説明するが、本発明はこれらに何ら限定されるものではない。
ヒト臨床検体(3検体)をホルマリン固定後パラフィン包埋し組織切片の作成を行った。組織切片を顕微鏡で観察し癌部及び間質部を確認した後にレーザーマイクロダイセクション法を用いて癌部及び間質部の組織をそれぞれ採取した。
採取した組織からtotalRNAを抽出しマイクロアレイ法を用いて網羅的にマイクロRNAの発現解析を行った。
発現解析の結果癌部において全てのサンプルで共通して発現の高いマイクロRNA(表1)及び間質において全てのサンプルで共通して発現の高いマイクロRNA(表2)の抽出を行った。表1及び表2のいずれも、癌部における発現量の、間質における発現量に対する比率を示している。検体毎の比率に加えて、3検体における比率の平均値も示してある。
Figure 2016123340
Figure 2016123340

Claims (5)

  1. 膵癌治療感受性の判定方法であって、
    (1)ヒト膵癌の腫瘍組織から採取した癌部及び間質由来の検体それぞれにおける、以下のmiRNAからなる群より選択される少なくとも一種のmiRNAの発現量を測定する工程;及び
    (2)前記工程(1)で測定したmiRNAの全種において、前記工程(1)で得られた、間質由来検体の測定値が、癌部由来検体の測定値と比較してより大きければ、当該腫瘍組織の膵癌治療感受性が低いと判定する工程
    を含む方法:
    hsa−miR−4689;
    hsa−miR−4664−5p;
    hsa−miR−4731−5p;
    hsa−miR−187−5p;
    hsa−miR−4270;
    hsa−miR−4697−5p;
    hsa−miR−4723−5p;
    hsa−miR−6087;
    hsa−miR−145−5p;及び
    hsa−miR−125b−5p。
  2. 前記工程(2)において、間質由来検体の測定値が、癌部由来検体の測定値と比較して1.2倍以上であれば、膵癌治療感受性が低いと判定する、請求項1に記載の方法。
  3. 膵癌治療感受性の判定方法であって、
    (1)ヒト膵癌の腫瘍組織から採取した癌部及び間質由来の検体それぞれにおける、以下のmiRNAからなる群より選択される少なくとも一種のmiRNAの発現量を測定する工程;及び
    (2)前記工程(1)で測定したmiRNAの全種において、前記工程(1)で得られた、癌部由来検体の測定値が、間質由来検体の測定値と比較してより大きければ、当該腫瘍組織の膵癌治療感受性が低いと判定する工程
    を含む方法:
    hsa−miR−200c−3p;
    hsa−miR−29b−3p;
    hsa−miR−30d−5p;
    hsa−miR−30b−5p;
    hsa−miR−29a−3p;
    hsa−miR−107;
    hsa−miR−221−3p;
    hsa−miR−103a−3p;
    hsa−miR−16−5p;
    hsa−miR−4284;
    hsa−miR−1973;
    hsa−miR−26b−5p;
    hsa−let−7g−5p;
    hsa−let−7f−5p;
    hsa−miR−1246;及び
    hsa−let−7e−5p。
  4. 前記工程(2)において、癌部由来検体の測定値が、間質由来検体の測定値と比較して2倍以上であれば、膵癌治療感受性が低いと判定する、請求項3に記載の方法。
  5. hsa−miR−4689;
    hsa−miR−4664−5p;
    hsa−miR−4731−5p;
    hsa−miR−187−5p;
    hsa−miR−4270;
    hsa−miR−4697−5p;
    hsa−miR−4723−5p;
    hsa−miR−6087;
    hsa−miR−145−5p;
    hsa−miR−125b−5p;
    hsa−miR−200c−3p;
    hsa−miR−29b−3p;
    hsa−miR−30d−5p;
    hsa−miR−30b−5p;
    hsa−miR−29a−3p;
    hsa−miR−107;
    hsa−miR−221−3p;
    hsa−miR−103a−3p;
    hsa−miR−16−5p;
    hsa−miR−4284;
    hsa−miR−1973;
    hsa−miR−26b−5p;
    hsa−let−7g−5p;
    hsa−let−7f−5p;
    hsa−miR−1246;及び
    hsa−let−7e−5p
    からなる群より選択される少なくとも一種のmiRNAに対するアンチmiRNA、又はそれをコードするポリヌクレオチドを含む遺伝子治療ベクターを含む、膵癌治療感受性の増強剤。
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