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  1. GlycAを測定する方法であって、
    被験者のバイオサンプルのフィッティング領域の合成NMRスペクトルを電子的に取得するステップと、
    高密度リポタンパク質(HDL)成分、低密度リポタンパク質(LDL)成分、VLDL(超低密度リポタンパク質)/カイロミクロン成分、および少なくともGlycAピーク領域に関連する複数のカーブフィット関数を用いた、定義されたデコンボリューションモデルを用いて前記合成NMRスペクトルを電子的にデコンボリューションするステップと、ならびに
    前記カーブフィット関数を用いてGlycAの測定値を電子的に生成するステップと
    を含む方法。
  2. 請求項1に記載の方法であって、μmol/Lで前記測定値を提供するために、GlycAの前記測定値に換算係数を適用するステップをさらに含む方法。
  3. 請求項1に記載の方法であって、前記カーブフィット関数が、オーバーラッピングローレンツ関数であり、およびGlycAの前記測定値が、定義された数のローレンツ関数を積算することによって生成される方法。
  4. 請求項1に記載の方法であって、前記デコンボリューションモデルが、1.21g/Lを超える密度を有するタンパク質のタンパク質信号成分をさらに含む方法。
  5. 請求項2に記載の方法であって、前記デコンボリューションモデルが、1.21g/Lを超える密度を有するタンパク質のタンパク質信号成分をさらに含み、および前記方法が、数式
    HDL−P/LDL−P*GlycA
    (式中、HDL−Pは、HDL粒子数のNMR測定値であり、およびLDL−Pは、LDL粒子数のNMR測定値であり、および前記式中のGlycAは、前記GlycA測定値であり、全て単位はμmol/Lである。)
    を用いてリスク予測因子を生成するステップをさらに含む方法。
  6. 請求項1に記載の方法であって、バリンの信号の四重線に関連する前記サンプルの前記NMRスペクトルの別の部分をデコンボリューションするステップ、およびバリンのNMR測定値を生成するステップをさらに含む方法。
  7. 請求項5に記載の方法であって、試験レポート内に前記バリンおよびGlycA測定値を提供するステップをさらに含む方法。
  8. 請求項1に記載の方法であって、前記複数のカーブフィット関数がオーバーラッピングローレンツ関数であり、および前記デコンボリューションモデルが、前記ローレンツ関数を、化学シフトスペクトルの前記GlycAピーク領域の右側からGlycBピーク領域の左側に延びる前記フィッティング領域のサブセットに適用する方法。
  9. 請求項1に記載の方法であって、前記バイオサンプルが、血漿または血清を含み、前記電子的に取得するステップは、前記バイオサンプルがNMR分光計のNMRフロープローブ内で47℃±0.2℃である間に、前記バイオサンプルのNMR信号を取得するステップを含み、および前記フィッティング領域は、1.845ppmから2.080ppmまで延び、および前記GlycAピーク領域は、2.00ppmを中心とし、および前記方法は、GlycBの測定値を生成するために、定義された数の異なる組のカーブフィッティング関数を積算するステップをさらに含む方法。
  10. 請求項1に記載の方法であって、前記複数のカーブフィット関数が、前記GlycAピーク領域を含み、および約40から50の間のカーブフィット関数を伴うGlycBピーク領域まで延びるフィッティング領域に適用され、GlycAの前記測定値の前記生成ステップが、前記カーブフィット関数の定義された第1のサブセットの値を積算することによって実施され、前記方法が、前記複数のカーブフィット関数の第2のさらに小さいサブセットを用いてGlycBの測定値を生成するステップをさらに含む方法。
  11. 請求項1に記載の方法であって、前記定義されたデコンボリューションモデルが、代謝産物A成分を含む方法。
  12. 患者の冠動脈性心疾患(CHD)リスクを決定する方法であって、
    GlycAのレベルを求めるために、バイオサンプルのGlycAに関連するプロトンNMRスペクトルの定義されたピーク領域内のNMR信号を電子的に評価するステップ、および
    GlycAの前記レベルに少なくとも部分的に基づいて患者のCHDのリスクを決定するステップ
    を含む方法。
  13. インビトロの患者バイオサンプルを評価するためのコンピュータプログラムであって、
    (i)高密度リポタンパク質(HDL)成分、(ii)低密度リポタンパク質(LDL)成分、(iii)VLDL(超低密度リポタンパク質)/カイロミクロン成分、(iv)別の定義されたタンパク質信号成分、および(v)少なくともGlycAピーク領域に適用されるカーブフィッティング関数を用いる定義されたデコンボリューションモデルを用いて、前記合成NMRスペクトルをデコンボリューションし、被験者の血漿サンプルのフィッティング領域の合成NMRスペクトルをデコンボリューションするコンピュータ可読プログラムコードを含み、非一時的なコンピュータ可読記憶媒体内で具体化されるコンピュータ可読プログラムコードを有する前記コンピュータ可読記憶媒体、ならびに
    GlycAの測定値を生成するために、定義された数の前記関数を積算するコンピュータ可読プログラムコード
    を含むコンピュータプログラム。
  14. インビトロバイオサンプルの少なくとも1つのNMRスペクトルを取得するためのNMR分光計、および前記少なくとも1つのNMRスペクトルを用いてGlycAのNMR測定値を取得するように構成された、前記NMR分光計と通信している少なくとも1つのプロセッサを含むシステム。
  15. μmol/Lおよび/または任意の単位でのGlycAの定量的な測定値を含む、複数のリポタンパク質測定値を含む患者レポート。
  16. NMR分析装置であって、
    NMR分光計、
    前記分光計と通信しているフロープローブ、ならびに
    前記フロープローブ内の流体の検体のGlycAに関連するNMRスペクトルの定義された単一のピーク領域のNMR信号を得て、およびGlycAレベルを提供する患者レポートを生成するように構成された前記分光計と通信している少なくとも1つのプロセッサ
    を含むNMR分析装置。
  17. ある人の全死因死亡リスクを評価または予測する方法であって、
    GlycAに対するバリン、GlycAに対するHDL−P、または(バリン*HDL−P)/GlycAのうちの少なくとも1つの測定値の比を電子的に計算するステップ、および、
    ある人が定義された集団と比べて上昇した全死因死亡のリスクを有するかを評価するステップ
    を含み、前記計算された比が、前記集団の第1三分位、第1四分位または第1五分位にあるとき、それぞれの人が、前記定義された集団と比べて、上昇したリスクを有する方法。
  18. バイオサンプル中の代謝産物Aのレベルを定量化する方法であって、リポタンパク質に関連する信号を有するプロトンNMRスペクトルの定義された代謝産物Aのピーク領域、および代謝産物Aに関連する単一のピークをデコンボリューションするステップ、複数のカーブフィッティング関数を前記代謝産物Aのピーク領域に適用するステップ、ならびに前記適用されたカーブフィッティング関数を用いて代謝産物Aのレベルを測定するステップを含む方法。
  19. バイオサンプル中のバリンを定量化する方法であって、
    リポタンパク質およびタンパク質の成分のデコンボリューションモデルを用いてNMRスペクトルをデコンボリューションするステップ、
    0.90から1.01ppmの間の領域内の多重線信号を識別するステップ、ならびに
    前記バイオサンプル中のバリンのレベルを計算するステップ
    を含む方法。
  20. GlycBを測定する方法であって、
    被験者のバイオサンプルのフィッティング領域の合成NMRスペクトルを電子的に取得するステップ、
    高密度リポタンパク質(HDL)成分、低密度リポタンパク質(LDL)成分、VLDL(超低密度リポタンパク質)/カイロミクロン成分、および少なくともGlycBのピーク領域に関連する複数のカーブフィット関数を用いた定義されたデコンボリューションモデルを用いて前記合成NMRスペクトルを電子的にデコンボリューションするステップ、ならびに
    前記カーブフィット関数を用いてGlycBの測定値を電子的に生成するステップ
    を含む方法。
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Families Citing this family (20)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US9076342B2 (en) 2008-02-19 2015-07-07 Architecture Technology Corporation Automated execution and evaluation of network-based training exercises
US9928345B2 (en) * 2012-06-08 2018-03-27 Liposciences, Inc. Multiple-marker risk parameters predictive of conversion to diabetes
US9361429B2 (en) 2012-06-08 2016-06-07 Liposcience, Inc. Multi-parameter diabetes risk evaluations
US20140358451A1 (en) * 2013-06-04 2014-12-04 Arizona Board Of Regents On Behalf Of Arizona State University Fractional Abundance Estimation from Electrospray Ionization Time-of-Flight Mass Spectrum
WO2015079000A1 (en) * 2013-11-27 2015-06-04 Institut D'investigació Sanitària Pere Virgili Method for the characterization of lipoproteins
CA2931648C (en) * 2014-01-06 2022-11-29 Liposcience, Inc. Multiple-marker risk parameters predictive of conversion to diabetes
US9952232B2 (en) * 2014-09-11 2018-04-24 Liposcience, Inc. Cardiovascular risk evaluations using a risk parameter that includes an HDL and inflammatory biomarker interaction parameter
KR101926665B1 (ko) 2014-10-31 2018-12-07 후아웨이 테크놀러지 컴퍼니 리미티드 커브피팅 회로, 아날로그 전치보상기 및 무선 주파수 신호 송신기
US10803766B1 (en) 2015-07-28 2020-10-13 Architecture Technology Corporation Modular training of network-based training exercises
US10083624B2 (en) 2015-07-28 2018-09-25 Architecture Technology Corporation Real-time monitoring of network-based training exercises
EP3258285B1 (en) * 2016-06-14 2020-10-21 Bruker BioSpin GmbH Method for predicting chemical shift values of nmr spin systems in a sample of a fluid class, in particular in a sample of a biofluid
DE102016224691A1 (de) * 2016-12-12 2018-06-14 Numares Ag Verfahren zur Analyse eines NMR-Spektrums einer lipoproteinhaltigen Probe
FI20177098A1 (fi) * 2017-08-29 2019-03-01 Leppaeluoto Juhani Menetelmiä ja laitejärjestelyitä diabeteksen, sydän- ja verisuonisairauksien, tulehdusten, dementian ja kuolleisuuden riskejä vähän liikkuvilla henkilöillä vähentävän liikunnan kynnysarvojen määrittämiseen
CN111448458A (zh) * 2017-09-07 2020-07-24 力保科学公司 多参数代谢脆弱性指数评估
CN107796946B (zh) * 2017-10-20 2019-10-25 中国医学科学院基础医学研究所 尿液中冠心病的蛋白标志物及其用途
WO2019143801A1 (en) * 2018-01-18 2019-07-25 New York University System and method for blood glucose monitoring using magnetic resonance spectroscopy
CN109805898B (zh) * 2019-03-22 2024-04-05 中国科学院重庆绿色智能技术研究院 基于注意力机制时序卷积网络算法的危重症死亡预测方法
US11887505B1 (en) 2019-04-24 2024-01-30 Architecture Technology Corporation System for deploying and monitoring network-based training exercises
US20240044826A1 (en) 2022-08-05 2024-02-08 Liposcience, Inc. Metabolic vulnerability analyzed by nmr
DE102023110285B3 (de) 2023-04-21 2024-05-08 Universität zu Lübeck, Körperschaft des öffentlichen Rechts Nmr-messung von glykoproteinen

Family Cites Families (33)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4529710A (en) 1981-06-12 1985-07-16 The United States Of America As Represented By The United States Department Of Energy Method of using a nuclear magnetic resonance spectroscopy standard
JPH0698036B2 (ja) 1986-10-20 1994-12-07 小野薬品工業株式会社 アミノ酸の選択的定量法
US4933844A (en) 1988-09-26 1990-06-12 Otvos James D Measurement of blood lipoprotein constituents by analysis of data acquired from an NMR spectrometer
US6653140B2 (en) * 1999-02-26 2003-11-25 Liposcience, Inc. Methods for providing personalized lipoprotein-based risk assessments
AU2054000A (en) 1999-02-26 2000-09-14 Lipomed, Inc. Methods, systems, and computer program products for analyzing and presenting risk assessment results based on nmr lipoprotein analysis of blood
CA2367820C (en) 1999-04-22 2009-12-22 James D. Otvos Nmr-method for determining the risk of developing type 2 diabetes
CA2331116A1 (en) 2001-01-15 2002-07-15 Chenomx, Inc. Compound identification and quantitation in liquid mixtures -- method and process using an automated nuclear magnetic resonance measurement system
WO2003012416A1 (en) 2001-08-01 2003-02-13 Liposcience, Inc. Method of determining presence and concentration of lipoprotein x in blood plasma and serum
EP1540560B1 (en) 2002-06-14 2011-03-16 Pfizer Limited Metabolic phenotyping
US7243030B2 (en) 2002-10-25 2007-07-10 Liposcience, Inc. Methods, systems and computer programs for deconvolving the spectral contribution of chemical constituents with overlapping signals
WO2004085996A2 (en) 2003-03-20 2004-10-07 Albert Einstein College Of Medicine Of Yeshiva University Biomarkers for longevity and disease and uses thereof
CA2542107A1 (en) 2003-10-23 2005-05-12 Liposcience, Inc. Methods, systems and computer programs for assessing chd risk using mathematical models that consider in vivo concentration gradients of ldl particle subclasses of discrete size
EP2189802B1 (en) 2004-04-01 2014-05-14 Liposcience, Inc. NMR clinical analyzers and related methods, systems, modules and computer program products for clinical evaluation biosamples
WO2006057081A1 (en) 2004-11-24 2006-06-01 Mitsuyo Okazaki Method for analyzing lipoproteins
JP5006524B2 (ja) 2005-05-13 2012-08-22 株式会社日立製作所 緩和時間特定のためのnmr装置の信号処理方法
JP4358814B2 (ja) 2005-11-09 2009-11-04 花王株式会社 試料の解析方法
EP2336782B1 (en) 2006-03-24 2014-08-27 Metanomics GmbH Methods for predicting diabetes type II
WO2007133593A2 (en) 2006-05-10 2007-11-22 Liposcience, Inc. Methods, systems and computer programs for assessing chd risk using weighted hdl particle number measurements
WO2008137075A2 (en) 2007-05-02 2008-11-13 President And Fellows Of Harvard College Compositions and methods for the treatment of metabolic disorders and inflammation
US7923257B2 (en) 2007-05-04 2011-04-12 Perkinelmer Health Sciences, Inc. Detecting isomers using differential derivatization mass spectrometry
EP2019311A1 (en) 2007-07-23 2009-01-28 F.Hoffmann-La Roche Ag A method for detecting a target substance by nuclear magnetic resonance
US20110311650A1 (en) 2008-07-07 2011-12-22 Thomas Wang Multiplexed biomarkers of insulin resistance
CA2741034C (en) 2008-10-20 2021-06-22 Liposcience, Inc. Lipoprotein insulin resistance indexes and related methods, systems and computer programs for generating same
US20120122981A1 (en) 2009-03-31 2012-05-17 Yun Fu Hu Biomarkers Related to Insulin Resistance and Methods using the Same
US7935643B2 (en) 2009-08-06 2011-05-03 Applied Materials, Inc. Stress management for tensile films
US8741788B2 (en) 2009-08-06 2014-06-03 Applied Materials, Inc. Formation of silicon oxide using non-carbon flowable CVD processes
US8449942B2 (en) 2009-11-12 2013-05-28 Applied Materials, Inc. Methods of curing non-carbon flowable CVD films
US20110136241A1 (en) 2009-12-08 2011-06-09 Stephen Naylor Type ii diabetes molecular bioprofile and method and system of using the same
SG182336A1 (en) 2010-01-06 2012-08-30 Applied Materials Inc Flowable dielectric using oxide liner
CA2799757C (en) 2010-05-21 2018-12-04 The Governors Of The University Of Alberta Methods for the assessment of colorectal cancer and colorectal polyps by measurement of metabolites in urine
US9361429B2 (en) 2012-06-08 2016-06-07 Liposcience, Inc. Multi-parameter diabetes risk evaluations
US9928345B2 (en) 2012-06-08 2018-03-27 Liposciences, Inc. Multiple-marker risk parameters predictive of conversion to diabetes
CN104823055B (zh) 2012-10-09 2017-12-05 力保科学公司 支链氨基酸的nmr定量

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