JP2015510775A - 試料容器内の微生物増殖を検出する方法及びシステム - Google Patents
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Abstract
Description
(a) 前記一連の測定データポイントにおける連続するデータポイントの変動解析、及び
(b) 前記一連の測定データポイントにおけるデータポイントによるセット相互間の増殖曲線下面積変化の変化解析
を同時並行的に実施し、
双方の解析方法(a)及び(b)は、前記測定データポイントから容器内の微生物増殖の陽性状況を決定する処理ステップを含むものとする、該プログラム化コンピュータを備える。
前記試料容器を培養するステップと、
前記試料容器を培養する間に、一連の測定データポイントを取得し、また試料容器内における微生物増殖の増殖曲線を表す、該一連の測定データポイントをマシン可読メモリに格納するステップと、
前記一連の測定データポイントにおける連続するデータポイントにおける変動を判定閾値に対して解析するステップと、
前記連続するデータポイントにおける変動が連続する測定データポイントの所定回数連続して前記判定閾値を超える場合、前記試料容器の微生物増殖が陽性であると報告するステップと
を有する。
(a) 前記試料容器を培養するステップと、
(b) 前記試料容器を培養する間に、一連の測定データポイントを前記試料容器から取得し、また試料容器内における微生物増殖の増殖曲線を表す、該一連の測定データポイントをマシン可読メモリに格納するステップと、
(c) 1対の測定データポイントに対する増殖曲線下面積を計算するステップと、
(d) 第2の対の測定データポイントに対する増殖曲線下面積を計算するステップと、
(e) ステップ(c)及び(d)で計算した増殖曲線下面積の百分率差を計算するステップと、
(f) ステップ(e)で計算した百分率差が判定閾値よりも大きいか否かを決定するステップと、
(g) ステップ(f)が肯定的である場合、測定データポイントの連続する対に対してステップ(c)、(d)、(e)及び(f)を繰返し、ステップ(f)で計算した判定閾値よりも大きい百分率差を有して連続する測定データポイント対の数が所定限界より大きくなるまで繰り返すステップと、
(h) これに応じて前記試料容器の微生物増殖が陽性であると報告するステップと
を有する。
図3は、ポイント・ツー・ポイント変動方法のグラフ300であって、このグラフをどのように使用して微生物増殖を生じていることを示す陽性検査判断を決定するかを示す。図3は、検査曲線200(時間の関数としての図1に示す光検出器からの強度)、入力測定データからそれぞれ決定される上側判定閾値302及び下側判定閾値304、並びに取得した測定値におけるポイント・ツー・ポイント変動のプロット曲線306を示す。ポイント・ツー・ポイント変動のプロット曲線306は、検査測定の規定最小回数にわたり上側閾値302を超え、このことは、培養時間の開始後46.2時間の培養時間で陽性検査(310)として判断される。図4は、図3と同様のデータのポイント・ツー・ポイント変動の第2の例であるが、より詳細にデータのポイント・ツー・ポイント変動を示す。ポイント・ツー・ポイント変動のプロット曲線306は、2つの連続するデータポイントに関して閾値を超え、このことは陽性検査の判断310という結果となり、この例では培養開始後15.7時間である。
上述したように、データのポイント・ツー・ポイント変動方法は、随意的ではあるが好適には、増殖曲線下相対面積(RAUC)及びとくにRAUCに対する変化をモニタリングする第2方法と同時並行的に実施する。図6は、増殖曲線200の例及び2つの培養時間t1及びt2を示す。t1とt2との間における曲線下面積600は台形近似方法を使用して計算する。t1及びt2が互いに十分近接していると仮定すると、曲線200は直線に近似し、また面積A(600)は、以下の公式に従って計算することができる。すなわち、
A=1/2×(I1+I2)×(t2−t1)
ここで、I1は時刻t1における強度測定値、及びI2は時刻t2における強度測定値である。
上述の説明及び図3及び図7を念頭に置いて、本明細書は図9A、9B、10A及び10Bにつき本発明の一実施例を詳細に説明する。図9A及び9Bはデータのポイント・ツー・ポイント変動解析方法を示すフローチャートであり、図10A及び10BはRAUC変動解析方法を示すフローチャートである。上述したように、好適な実施例において、これら方法双方を同時並行的に行う。
本発明の方法は、入力データとして以下の項目のものを使用する。
1. 形式の順序付けられたデータポイント(検査値、時間)。この実施例における「検査値」は任意の単位における強度測定値である。「時間」は培養時間(例えば、10.35時間)である。測定データポイントを記録するシステムはクロックを有し、またタイムスタンプはデータポイントの時間部分をなす各測定値に関連する。
2. データのポイント・ツー・ポイント変動技法(図3,9A〜9B)のための判定閾値302及び304を計算するとき使用する増倍係数(正の実数)。このような係数の使用は、統計的区間に対して信頼水準を設定するのに類似する。
3. RAUC方法(図7,10A〜10B)における変動のための判定閾値702及び704を計算するとき使用する増倍係数(正の実数)。このような係数の使用は、統計的区間に対して信頼水準を設定するのに類似する。
4. 検査曲線の一区間からの曲線下相対面積を検査曲線の先行区間に対して比較するとき使用される検査値の個数(整数)。これは以下の説明におけるパラメータxである。
5. 検査を陽性として判断する前に観測する必要がある判定閾値の上方にある順次のデータポイントの個数に対応する閾値値(整数)。1つの値はポイント・ツー・ポイント変動方法にとって固有であることが必要であり(値「NR2RP」未満)、第2値は曲線下相対面積方法にとって固有であることが必要である(値「NRAUCP」未満)。
6. 検査値を無視するとき、培養の初期段階中における期間(時間数に対応する正の実数)。幾つかの検査に対して、ある期間は検査環境を安定化させるのに必要である。このパラメータは、本明細書でCSP(curve stabilization period)という用語を充てる。
7. 最大培養時間であり、この最大培養時間後に陽性検査結果がポイント・ツー・ポイント変動方法又はRAUC方法のいずれかによって報告されなかった場合、処理を停止する。この最大培養時間が陽性検査結果なしに満了した場合、本発明の方法は陰性検査結果を報告する。
イエスである場合、ステップ914に進む。
ステップ914では、リード・ツー・リード(R2R)標準偏差値を使用して以下のように上側及び下側のポイント・ツー・ポイント判定閾値(図3の302及び304)を計算する。R2R標準偏差の公式は以下のように与えられる。
(式1)R2R標準偏差s=合計(2連続R2R値1〜n間の差の合計)/n
ここで、2連続R2R値間の差は|R2R先行−R2R現時点|であり、また
nは現時点反射率読み値に関連するR2R値である。
(無視すべきRAUC値は1〜nのシーケンスには含めない)
上側及び下側の判定限界の公式は以下のように与えられる。
下側R2R判定限界(図3の304)=ks
上側R2R判定限界(図3の302)=−ks
ここで、kはR2R標準偏差数(入力パラメータ)であり、sは式1につき計算したR2R標準偏差である。
(ステップ904で)ノーである場合、ステップ906に進む。
イエスである、すなわち、差分が上側及び下側判定閾値の範囲内に納まる場合、ステップ908,910,912,914及び916に進む。
ステップ908では上側閾値を超えて連続するデータポイントのカウントをゼロにセットする。
ステップ910では標準偏差(式1におけるs)をアップデートする。
ステップ914では上側及び下側の判定閾値を上述したように計算する。
ステップ916に進む。
ステップ906においてノーである、すなわち、差分が上側及び下側判定閾値の範囲内に納まらない場合、処理は図9Bに示すステップに進む。
上回る場合、ステップ922,924,926及び928に進む。
ステップ922において、判定閾値を超えて連続するデータポイントの個数を1だけインクリメントする。
ステップ924において、RAUC方法が判断できない時間インターバルを規定する(図10A及び10B)。この時点で、検査測定エラーを生じている可能性がある。したがって、ステップ924は、RAUC方法が必ずしも微生物活動に関連しないデータにおける変化に基づいて検査曲線を陽性と判断するのを回避する。
ステップ926において、上側判定閾値を超えて連続するデータポイントの個数を、陽性検査判断を示すのに必要な値である入力パラメータ値(NR2RP)と比較する。
上側判定閾値を超えて連続するデータポイントの個数がNR2RPに等しい場合(ステップ928)、陽性結果をステップ930で報告する。
上側判定閾値を超えて連続するデータポイントの個数がNR2RPに等しくない場合(ステップ928)、ステップ916に進む。
新たに取得した差分測定値がステップ920で下側閾値を下回る場合、ステップ932に進む。
ステップ932において、RAUC方法が判断できない時間インターバルを規定する(図10A及び10B)。上述したように、このことはあり得る偽陽性判断を回避する。
ステップ934において、上側閾値を超えて連続するデータポイントのカウントをゼロにセットする。
ステップ916に進む。
イエス、すなわち、現時点培養時間が最大培養時間に等しい場合、検査を終了し、判断は陰性検査とする。
ノー、すなわち、現時点培養時間が最大培養時間よりも短い場合、ステップ900にループバックする。このプロセスは、陽性検査判断がデータのポイント・ツー・ポイント解析から得られるまで、陽性検査判断がRAUC解析から得られるまで、又はプロセスが最大培養時間に達するまで、持続する。
ステップ1000において、曲線における最後の1番目の検査値からx番目の検査値までで決定される曲線部分に対する曲線下面積、及び最後のx番目から(2x−1)番目の検査値までで決定される曲線部分に対する曲線下面積を計算し、ここでxは入力データで特定される検査値の個数である。
RAUC=100(AUC(2x−1)〜x−AUC1〜x)/AUC1〜x
イエスである場合、ステップ1012に進む。
ステップ1012において、平均RAUC値を計算する。
ステップ1014において、RAUC差分の累積合計を計算する。
ステップ1016において、ステップ1014に基づく平均差分を計算する。
ステップ1018において、次式を用いてRAUCの上側及び下側の判定閾値を計算する。すなわち、
上側判定閾値(702)=(平均RAUC)+(増倍係数)(平均差分)
下側判定閾値(704)=(平均RAUC)−(増倍係数)(平均差分)
[RAUC判定閾値を計算するための増倍係数は入力パラメータとして定義することに留意されたい。]
ステップ1020に進む。
ステップ1006においてノーである、すなわち、1つの差分値より多い差分値が計算されている場合、ステップ1008に進む。
イエスである場合、ステップ1010に進む。
ステップ1010において、上側判定閾値を超えて連続するデータポイントの個数カウントをゼロにセットする。
ステップ1012において、平均RAUC値を計算する。
ステップ1014において、RAUC差分の累積合計を計算する。
ステップ1016において、ステップ1014に基づく平均差分を計算する。
ステップ1018において、上述したように、RAUCの上側及び下側の判定閾値を計算する。
ステップ1020に進む。
ステップ1008においてノーである、すなわち、新たに取得したRAUC値が判定閾値の範囲内に納まらない場合、ステップ1022に進む(図10B参照)。
イエスである場合、ステップ1024に進む。
ステップ1024において、データのポイント・ツー・ポイント解析プロセスから(ステップ922又は930から)の限界が存在するか否かを決定する。
イエスである場合、ステップ1036に進む。
ステップ1036において、上側判定閾値を超えて連続するデータポイントの個数カウントをゼロにセットする。
次に、ステップ1020に進む。このステップに進みこのプロセスのこの時点で測定エラーに起因する曲線の偽陽性判断の可能性を回避する。さらに、データポイントはRAUCの下側及び上側閾値をアップデートするのに使用しない。
したがって、測定エラーからのデータは自然プロセス変動の評価に不適切に反映しない。
ステップ1024でノーである場合、ステップ1026に進む。
ステップ1026において、上側判定閾値を超えて連続するデータポイントのカウントをインクリメントする。
ステップ1028において、閾値を超えて連続するデータポイントの個数を、陽性検査判断を示す値(NRAUCP)と比較する。
入力パラメータに等しい場合(ステップ1030)、ステップ1032で陽性検査結果を報告する。プロセスを終了する(ステップ1034)。
入力パラメータに等しくない場合、ステップ1036に進む。
ステップ1036において、上側判定閾値を超えて連続するデータポイントの個数カウントをゼロにセットし、次にステップ1020に進む。
ノー(ステップ1022から)である、すなわち、新たに取得したRAUC値が上側判定閾値を超えない場合、ステップ1036に進み、次にステップ1020に進む。
イエスである場合、検査を終了し、判断は陰性検査とする。
ノーである場合、次のデータ対を持ってステップ1000にループバックする。このプロセスは、陽性検査判断がデータのポイント・ツー・ポイント解析から得られるまで、陽性検査判断がRAUC解析から得られるまで、又はプロセスが最大培養時間に達するまで、持続する。
上述したように、本発明の他の態様は、試料容器が微生物増殖に関して陽性である、及びひいては微生物因子が存在すると同定する方法論であって、本発明の方法を採用した検出システムに容器を設置する前に通常よりも長い期間にわたり容器を放置した遅延状況における、該同定方法論を企図する。とくに、詳細に上述したポイント・ツー・ポイント方法及び曲線下相対面積方法は、典型的な臨床的使用の下で、すなわち、検査ボトルに試料を接種し、このボトルを培養及び読取りのためのシステム内に即刻装荷(ローディング)する状況下で、容器検出システムからデータ測定値を判断できるものである。しかし、幾つかのラボラトリーは接種したボトルを延長した期間にわたり保持して(必ずしも培養条件下ではない場合もあり得る)から、ボトルを検出システム内に装荷する場合がある。この装荷遅延は不完全な反射率又は増殖曲線を生ずる結果となるおそれがある。不完全さによって、図2の「典型的」な増殖曲線における、遅滞フェーズのすべて、及び指数関数的フェーズのすべて、一部又は大部分が喪失するおそれがあることを意味する。
平均反射率陽性方法は、図13及び14における実施例で示すように、反射率曲線の遅滞フェーズ及び指数関数的フェーズ202のすべてではないが大部分が喪失しているケースに対処する。換言すれば、曲線は大部分が定常フェーズである(図13の203)。平均反射率陽性方法は、直近x番目の反射率値のトリム平均を計算し、xは曲線インターバルパラメータ(上述のように定義した)の値に等しい。図14参照。現時点で観測されたトリム平均反射率値が、反射率値陽性閾値よりも大きい場合、増殖曲線は陽性であるとみなし、試料容器を陽性であるとフラグ立てする。
平均ポイント・ツー・ポイント値陽性方法は、指数関数的フェーズの十分多い部分を解析に利用可能なケースに最もよく適合する。図13のプロット曲線を例とする。この方法では、x番目の直近ポイント・ツー・ポイント値(図13における1300)のトリム平均を計算し、また平均ポイント・ツー・ポイント値陽性閾値と比較する。平均値が平均ポイント・ツー・ポイント値陽性閾値よりも大きい場合、曲線は陽性として分類する。図15の例においては、陽性分類は、図面で「陽性」の付記で示されている1.75時間で行う。
特定値より大きい連続するポイント・ツー・ポイント値の数による方法は、やはり図13のケースのような、反射率曲線の指数関数的フェーズの断片を捉えたケースをターゲットにする。この手法では、各ポイント・ツー・ポイント値を初期ポイント・ツー・ポイント変動スクリーン値と比較する。早期培養ポイント・ツー・ポイント値が一貫してスクリーン値よりも大きい場合、反射率データは曲線の指数関数的部分に対応する。カウンタを使用して、十分な数の連続して増加するP2P値が得られた時を決定する。カウンタは以下の論理を使用して計算する:
現時点P2P値が初期ポイント・ツー・ポイント変動スクリーンの値より大きく、かつ現時点P2P値が先行P2P値の85%より大きい場合、カウンタを1だけ増加する。さもなければカウンタをゼロにリセットする。
5,218個ある検査曲線セットを、本発明の方法に対する入力パラメータの3種類の異なる組合せを使用して評価した。比較目的のため、同一の5,218個の曲線を、機器BacT/ALERTでの現行方法(従来技術)を使用して評価した。5,218個の曲線のうち、1,559個の曲線は有機体増殖の証拠を示さない。残りの3,659個の曲線は有機体増殖の証拠を示す。表1は、入力パラメータを3セット掲げている。表2は、入力パラメータの3セットそれぞれを有する本発明の方法から、及び従来方法からの検査結果の比較を示す。
本発明の方法は、培養ユニット、測定ユニット、及び処理ユニットを組合せたシステムで、例えば、ロビンソン氏らの米国特許出願公開第2011/0124028号(参照によりその内容は本明細書に援用されるものとする)に記載のシステム、本願人ビオメリュー社のBacT/ALERTシステム、上述の背景技術で掲げた特許文献に記載の競合他社によるシステムで実施することができる。このようなシステムは、試料容器を培養する装置(例えば、温風源を有するエンクロージャ)、試料容器内における微生物増殖の増殖曲線を表す、一連の測定データポイントを取得するとともに、試料容器を培養し、またデータポイントをマシン可読メモリに記憶する測定システム(図1又は類似の構成参照)、及び解析方法(a)及び(b)を同時並行的に実施するプログラム化コンピュータにより構成する。解析方法(a)及び(b)は、以下の通りである。
(a) 一連の測定データポイントにおける連続するデータポイントの変動解析(例えば、図3,4及び9A〜9B参照)、及び
(b) 一連の測定データポイントにおけるデータポイントによるセット相互間の増殖曲線下面積変化の変化解析(例えば、図7及び10A〜10B)であり、双方の解析方法(a)及び(b)は、測定データポイントから容器内の微生物増殖の陽性状況を決定する処理ステップを含むものとする。
Claims (42)
- 微生物増殖が試料容器内で生じているか否かを決定する方法であって、
前記試料容器を培養するステップと、
前記試料容器を培養する間に、一連の測定データポイントを前記試料容器から取得し、また試料容器内における微生物増殖の増殖曲線を表す、該一連の測定データポイントをマシン可読メモリに格納するステップと、
プログラム化コンピュータ解析方法(a)及び(b)、すなわち、
(a) 前記一連の測定データポイントにおける連続するデータポイントの変動解析、及び
(b) 前記一連の測定データポイントにおけるデータポイントによるセット相互間の増殖曲線下面積変化の変化解析
を同時並行的に実施するステップと
を有し、
双方の解析方法(a)及び(b)は、前記測定データポイントから容器内の微生物増殖の陽性状況を決定する処理ステップを含むものとする、
方法。 - 請求項1記載の方法において、前記解析方法(a)は、前記解析方法(b)の陽性状況を決定する能力に対して制限を課する、方法。
- 請求項1又は2記載の方法において、前記解析方法(a)は、前記一連の測定データポイントにおける測定エラーの事例を決定する、方法。
- 請求項1〜3のうちいずれか一項記載の方法において、前記解析方法(a)及び(b)は、前記測定データポイントを使用して微生物増殖の陽性判断をするための判定閾値をリアルタイムに計算する、方法。
- 請求項1〜4のうちいずれか一項記載の方法において、さらに、前記解析方法(a)及び(b)と同時並行的に解析方法(c)を実施するステップを有し、該解析方法(c)は、前記試料容器が前記測定データポイントを取得するのに遅延して、前記測定データポイントに関連する増殖曲線における遅滞フェーズが存在しないようなシナリオの下で、前記一連の測定データポイントを解析するステップを含む、方法。
- 請求項5記載の方法において、さらに、前記解析方法(c)は、以下の方法、すなわち、
平均測定データポイント値を計算し、またこのような平均測定データポイント値を閾値と比較する第1方法、
測定データの平均ポイント・ツー・ポイント値を計算し、このような平均を閾値と比較する第2方法、及び
連続して増加する測定データのポイント・ツー・ポイント値の数をカウントして特定閾値と比較する第3方法
のうち少なくとも1つを含むものとする、方法。 - 請求項6記載の方法において、前記解析方法(c)は、前記第1、第2及び第3の方法を同時並行的に実施する、方法。
- 請求項1〜7のうちいずれか一項記載の方法において、前記試料容器はボトルとする、方法。
- 請求項8記載の方法において、前記ボトルは内部比色センサを有する、方法。
- 請求項1〜9のうちいずれか一項記載の方法において、前記試料容器は、人間から採取した生体サンプルを収納する、方法。
- 請求項10記載の方法において、前記生体サンプルは血液又は血液製剤とする、方法。
- 請求項1〜11のうちいずれか一項記載の方法において、さらに、前記解析方法(a)は、図9A及び9Bに示すステップのシーケンスを有する、方法。
- 請求項1〜12のうちいずれか一項記載の方法において、さらに、前記解析方法(b)は、図10A及び10Bに示すステップのシーケンスを有する、方法。
- 微生物増殖が試料容器内で生じているか否かを決定するシステムであって、
前記試料容器を培養する装置と、
前記試料容器を培養する間に、一連の測定データポイントを前記試料容器から取得し、また試料容器内における微生物増殖の増殖曲線を表す、該一連の測定データポイントをマシン可読メモリに格納する測定システムと、
解析方法(a)及び(b)、すなわち、
(a) 前記一連の測定データポイントにおける連続するデータポイントの変動解析、及び
(b) 前記一連の測定データポイントにおけるデータポイントによるセット相互間の増殖曲線下面積変化の変化解析
を同時並行的に実施するプログラム化コンピュータであって、
双方の解析方法(a)及び(b)は、前記測定データポイントから容器内の微生物増殖の陽性状況を決定する処理ステップを含むものとする、該プログラム化コンピュータと
を備える、システム。 - 請求項14記載のシステムにおいて、前記解析方法(a)は、前記解析方法(b)の陽性状況を決定する能力に対して制限を課する、システム。
- 請求項14又は15記載のシステムにおいて、前記解析方法(a)は、前記一連の測定データポイントにおける測定エラーの事例を決定する、システム。
- 請求項14〜16のうちいずれか一項記載のシステムにおいて、前記プログラム化コンピュータは、前記解析方法(a)及び(b)に対して、前記測定データポイントを使用して微生物増殖の陽性判断をするための判定閾値をリアルタイムに計算する、システム。
- 請求項14〜17のうちいずれか一項記載のシステムにおいて、さらに、前記解析方法(a)及び(b)と同時並行的に解析方法(c)を実施し、該解析方法(c)は、前記試料容器が前記測定データポイントを取得するのに遅延して、前記測定データポイントに関連する増殖曲線における遅滞フェーズが存在しないようなシナリオの下で、前記一連の測定データポイントを解析するステップを含む、システム。
- 請求項18記載のシステムにおいて、前記解析方法(c)は、以下の方法、
平均測定データポイント値を計算し、またこのような平均測定データポイント値を閾値と比較する第1方法、
測定データの平均ポイント・ツー・ポイント値を計算し、このような平均を閾値と比較する第2方法、及び
連続して増加する測定データのポイント・ツー・ポイント値の数をカウントして特定閾値と比較する第3方法
のうち少なくとも1つを含むものとする、システム。 - 請求項19記載のシステムにおいて、前記解析方法(c)は、前記第1、第2及び第3の方法を同時並行的に実施する、システム。
- 請求項14記載のシステムにおいて、前記試料容器はボトルとするシステム。
- 請求項21記載のシステムにおいて、前記ボトルは内部比色センサを有する、システム。
- 請求項14〜22のうちいずれか一項記載のシステムにおいて、前記試料容器は、人間から採取した生体サンプルを収納する、システム。
- 請求項23記載のシステムにおいて、前記生体サンプルは血液又は血液製剤とする、システム。
- 請求項14〜24のうちいずれか一項記載のシステムにおいて、前記プログラム化コンピュータは、図9A及び9Bに示すステップのシーケンスを実装する一連の命令を有するようプログラム化する、システム。
- 請求項14〜25のうちいずれか一項記載のシステムにおいて、前記プログラム化コンピュータは、図10A及び10Bに示すステップのシーケンスを実装する一連の命令を有するようプログラム化する、システム。
- 微生物増殖がサンプルを含む試料容器内で生じているか否かを決定する方法であって、
前記試料容器を培養するステップと、
前記試料容器を培養する間に、一連の測定データポイントを取得し、また試料容器内における微生物増殖の増殖曲線を表す、該一連の測定データポイントをマシン可読メモリに格納するステップと、
前記一連の測定データポイントにおける連続するデータポイントにおける変動を判定閾値に対して解析するステップと、
前記連続するデータポイントにおける変動が連続する測定データポイントの所定回数連続して前記判定閾値を超える場合、前記試料容器の微生物増殖が陽性であると報告するステップと
を有する、方法。 - 請求項27記載の方法において、前記一連の測定データポイントは前記試料容器内に収納した比色センサから取得する、方法。
- 請求項27又は28記載の方法において、前記判定閾値は前記測定データポイントからリアルタイムで計算する、方法。
- 請求項27〜29のうちいずれか一項記載の方法において、さらに、前記測定データポイントから前記測定データポイントにおける急峻部を決定し、またこれに応じて前記測定データポイントから前記試料容器内の微生物増殖を決定する第2方法に制約を課すステップを有する、方法。
- 請求項27〜30のうちいずれか一項記載の方法において、前記サンプルは、人間の患者からのサンプルとする、方法。
- 微生物学的検査マシンであって、
複数個の試料容器を培養する培養システムと、
前記培養システムが前記試料容器を培養する間に一連の測定データポイントを前記試料容器から取得する測定システムと、
前記試料容器内における微生物増殖の増殖曲線を表す、該一連の測定データポイントを格納するマシン可読メモリと、
前記容器の微生物増殖が陽性であるか否かを決定するよう動作する処理ユニットであり、前記一連の測定データポイントにおける連続するデータポイントの閾値に対する変動を解析するプログラム命令を実行し、前記連続するデータポイントにおける変動が連続する測定データポイントの所定回数連続して前記判定閾値を超える場合、前記試料容器の微生物増殖が陽性であると報告する、該処理ユニットと
を備える、微生物学的検査マシン。 - 微生物増殖がサンプルを含む試料容器内で生じているか否かを決定する方法であって、
(a) 前記試料容器を培養するステップと、
(b) 前記試料容器を培養する間に、一連の測定データポイントを前記試料容器から取得し、また試料容器内における微生物増殖の増殖曲線を表す、該一連の測定データポイントをマシン可読メモリに格納するステップと、
(c) 1対の測定データポイントに対する増殖曲線下面積を計算するステップと、
(d) 第2の対の測定データポイントに対する増殖曲線下面積を計算するステップと、
(e) ステップ(c)及び(d)で計算した増殖曲線下面積の百分率差を計算するステップと、
(f) ステップ(e)で計算した百分率差が判定閾値よりも大きいか否かを決定するステップと、
(g) 測定データポイントの連続する対に対してステップ(c)、(d)、(e)及び(f)を繰返し、ステップ(f)で計算した判定閾値よりも大きい百分率差を有して連続する測定データポイント対の数が所定限界より大きくなるまで繰り返すステップと、
(h) これに応じて前記試料容器の微生物増殖が陽性であると報告するステップと
を有する、方法。 - 請求項33記載の方法において、前記一連の測定データポイントは前記試料容器内に収納した比色センサから取得する、方法。
- 請求項33又は34記載の方法において、前記判定閾値は前記測定データポイントから計算する、方法。
- 請求項33〜35のうちいずれか一項記載の方法において、前記サンプルは、人間の患者からのサンプルとする、方法。
- 微生物学的検査マシンであって、
複数個の試料容器を培養する培養システムと、
前記培養システムが前記試料容器を培養する間に一連の測定データポイントを前記試料容器から取得する測定システムと、
前記試料容器内における微生物増殖の増殖曲線を表す、該一連の測定データポイントを格納するマシン可読メモリと、
前記容器の微生物増殖が陽性であるか否かを決定するよう動作する処理ユニットと
を備え、前記処理ユニットは、以下のプログラム命令のシーケンス、すなわち、
(1) 1対の測定データポイントに対する増殖曲線下面積を計算するプログラム命令と、
(2) 第2の対の測定データポイントに対する増殖曲線下面積を計算するプログラム命令と、
(3) ステップ(1)及び(2)で計算した増殖曲線下面積の百分率差を計算するプログラム命令と、
(4) ステップ(3)で計算した百分率差が判定閾値よりも大きいか否かを決定するプログラム命令と、
(5) 測定データポイントの連続する対に対してステップ(1)、(2)、(3)及び(4)を繰返し、ステップ(4)で計算した判定閾値よりも大きい百分率差を有して連続する測定データポイント対の数が所定限界より大きくなるまで繰り返すプログラム命令と、
(6) これに応じて前記試料容器の微生物増殖が陽性であると報告するプログラム命令と
のシーケンスを実行する、微生物学的検査マシン。 - 微生物増殖がサンプルを含む試料容器内で生じているか否かを決定する方法であって、
前記試料容器を培養するステップと、
前記試料容器を培養する間に、一連の測定データポイントを前記試料容器から取得し、また試料容器内における微生物増殖の増殖曲線を表す、該一連の測定データポイントをマシン可読メモリに格納するステップと、
前記一連の測定データポイントを解析する解析ステップと
を有し、前記試料容器は前記測定データポイントを取得するのに遅延して、前記増殖曲線における指数関数的増殖フェーズの遅滞フェーズが存在しないものである、方法。 - 請求項38記載の方法において、前記解析ステップは、以下の方法、
平均測定データポイント値を計算し、またこのような平均測定データポイント値を閾値と比較する第1方法、
測定データの平均ポイント・ツー・ポイント値を計算し、このような平均を閾値と比較する第2方法、及び
連続して増加する測定データのポイント・ツー・ポイント値の数をカウントして特定閾値と比較する第3方法
のうち少なくとも1つを含むものとする、方法。 - 請求項39記載の方法において、前記解析ステップは、前記第1、第2及び第3の方法を同時並行的に実施する、方法。
- 微生物学的検査マシンであって、
複数個の試料容器を培養する培養システムと、
前記培養システムが前記試料容器を培養する間に一連の測定データポイントを前記試料容器から取得する測定システムと、
前記試料容器内における微生物増殖の増殖曲線を表す、該一連の測定データポイントを格納するマシン可読メモリと、
前記容器の微生物増殖が陽性であるか否かを決定するよう動作する処理ユニットであって、前記一連の測定データポイントを解析するプログラム命令のシーケンスを実行する、該処理ユニットと
を備え、前記試料容器は前記測定データポイントを取得するのに遅延して、前記増殖曲線における指数関数的増殖フェーズの遅滞フェーズが存在しないものである、微生物学的検査マシン。 - 請求項41記載の微生物学的検査マシンにおいて、前記処理ユニットは、以下の方法、すなわち、
平均測定データポイント値を計算し、またこのような平均測定データポイント値を閾値と比較する第1方法、
測定データの平均ポイント・ツー・ポイント値を計算し、このような平均を閾値と比較する第2方法、及び
連続して増加する測定データのポイント・ツー・ポイント値の数をカウントして特定閾値と比較する第3方法
のうち少なくとも1つに従って、前記測定データポイントを解析する命令を実行する、微生物学的検査マシン。
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