JP2012514980A5 - - Google Patents
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Description
別の方法は、直接給餌微生物を調製する方法である。この方法においては、液体栄養ブロス中で、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ株ＰｌＢ ｃ６（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０３）、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ株ｏ２４６ｅ ３３ｗ（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０２）、Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ｏ２４６ｅ ４２（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１７１）、およびＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）から選択される少なくとも１つの株が生育される。液体栄養ブロスから株を分離して直接給餌微生物を形成する。
本発明の好ましい実施形態では、例えば以下が提供される：
（項目１）
乳酸菌の１６Ｓ ｒＲＮＡ遺伝子コード領域の一部分を含むＤＮＡ配列であって、前記ＤＮＡ配列の５’末端は５’ＡＧＡＧＴＴＴＧＡＴＹＭＴＧＧＣＴＣＡＧ３’の配列を含み、前記ＤＮＡ配列の３’末端はＢｆａＩ、ＨａｅＩＩＩおよびＭｓｐＩのうちの１つに対する制限酵素認識部位を含み、
前記制限酵素認識部位がＢｆａＩであるとき、前記ＤＮＡ配列の長さは約９９塩基対から約１０３塩基対、約２６８塩基対から約２７３塩基対、約２６０塩基対から約２６５塩基対、約２７９塩基対から約２８４塩基対、約２７８塩基対から約２８２塩基対、または約２７３塩基対から約２７７塩基対であり、
前記制限酵素認識部位がＨａｅＩＩＩであるとき、前記ＤＮＡ配列の長さは約３２９塩基対から約３３４塩基対、約３５２塩基対から約３５７塩基対、約２７７塩基対から約２８２塩基対、または約３３５塩基対から約３３９塩基対であり、
前記制限酵素認識部位がＭｓｐＩであるとき、前記ＤＮＡ配列の長さは約１８８塩基対から約１９２塩基対である、ＤＮＡ配列。
（項目２）
直接給餌微生物として用いられ得る１つまたは複数の株を同定する方法であって、前記方法は、
動物の胃腸管からの細菌からＤＮＡを単離する工程と、
前記ＤＮＡを増幅する工程と、
前記増幅されたＤＮＡをＴ−ＲＦＬＰによって分析してＴＲＦデータを生成する工程と、
前記ＴＲＦデータを目的の特徴と相関させる工程と、
前記相関から目的の株を同定する工程と、
前記株中の前記ＴＲＦの存在を確認する工程と
を含む、方法。
（項目３）
項目２に記載の方法によって同定された株。
（項目４）
前記株は潜在的プロバイオティクである、項目３に記載の株。
（項目５）
前記株は潜在的病原体である、項目３に記載の株。
（項目６）
項目３に記載の少なくとも１つの株の有効量を動物に投与する工程を含む、方法。
（項目７）
単離されたＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）。
（項目８）
項目７に記載の株と、
単離されたＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ株ｏ２４６ｅ ３３ｗ（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０２）と
を含む、組み合わせ。
（項目９）
単離されたＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ株ＰｌＢ ｃ６（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０３）をさらに含む、項目８に記載の組み合わせ。
（項目１０）
Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ株ＰｌＢ ｃ６（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０３）、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ株ｏ２４６ｅ ３３ｗ（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０２）、Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ｏ２４６ｅ ４２（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１７１）、およびＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）の少なくとも１つから選択された、単離株。
（項目１１）
項目１０に記載の株の１つのすべての判明している特徴を有する、単離株。
（項目１２）
キャリアをさらに含む、項目１０に記載の株。
（項目１３）
Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ株ＰｌＢ ｃ６（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０３）、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ株ｏ２４６ｅ ３３ｗ（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０２）、Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ｏ２４６ｅ ４２（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１７１）、およびＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）から選択される少なくとも１つの株の有効量を動物に投与する工程を含む、方法。
（項目１４）
前記株はＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）である、項目１３に記載の方法。
（項目１５）
前記株はＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）およびＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ株ｏ２４６ｅ ３３ｗ（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０２）である、項目１３に記載の方法。
（項目１６）
前記株はＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ株ｏ２４６ｅ ３３ｗ（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０２）、およびＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ株ＰｌＢ ｃ６（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０３）である、項目１３に記載の方法。
（項目１７）
前記動物はブタである、項目１３に記載の方法。
（項目１８）
約１×１０ ８ 合計ｃｆｕ／ブタ／日から約５×１０ １０ 合計ｃｆｕ／ブタ／日の前記株または前記複数の株が前記ブタに投与される、項目１７に記載の方法。
（項目１９）
前記動物は雌ブタである、項目１３に記載の方法。
（項目２０）
前記雌ブタは授乳中の雌ブタである、項目１９に記載の方法。
（項目２１）
前記株はＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ株ｏ２４６ｅ ３３ｗ（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０２）、およびＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ株ＰｌＢ ｃ６（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０３）であり、
前記雌ブタから生まれた（ｂｏｒｎｅ ｔｏ）子ブタにおける体重および１日平均増体量を、前記株を投与されていない雌ブタから生まれた子ブタにおけるそれよりも改善させる工程をさらに含む、項目１９に記載の方法。
（項目２２）
前記株はＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ株ｏ２４６ｅ ３３ｗ（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０２）、およびＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ株ＰｌＢ ｃ６（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０３）であり、
前記雌ブタから生まれた同腹仔内の子ブタ体重の変動の増加を、前記株を投与されていない雌ブタから生まれた子ブタにおけるそれよりもよく防ぐ工程をさらに含む、項目１９に記載の方法。
（項目２３）
前記株はＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）であり、
前記雌ブタから生まれた同腹仔内の子ブタ体重の変動の増加を、前記株を投与されていない雌ブタから生まれた子ブタにおけるそれよりもよく防ぐ工程をさらに含む、項目１９に記載の方法。
（項目２４）
前記株はＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）であり、
前記雌ブタから生まれた同腹仔内の子ブタ体重の変動を、前記株を投与されていない雌ブタから生まれた子ブタにおけるそれよりも減少させる工程をさらに含む、項目１９に記載の方法。
（項目２５）
前記動物は生産の哺育フェーズにあるブタであり、前記株はＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ｏ２４６ｅ ４２（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１７１）である、項目１３に記載の方法。
（項目２６）
前記株によって前記動物の免疫系を調節する工程をさらに含む、項目１３に記載の方法。
（項目２７）
直接給餌微生物を調製する方法であって、前記方法は、
（ａ）液体栄養ブロス中で、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ株ＰｌＢ ｃ６（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０３）、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ株ｏ２４６ｅ ３３ｗ（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０２）、Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ｏ２４６ｅ ４２（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１７１）、およびＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）から選択される少なくとも１つの株を生育させる工程と、
（ｂ）前記液体栄養ブロスから前記株を分離して前記直接給餌微生物を形成する工程と
を含む、方法。
（項目２８）
前記株はＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３ Ｂ−５０１０１である、項目２７に記載の方法。
本発明の好ましい実施形態では、例えば以下が提供される：
（項目１）
乳酸菌の１６Ｓ ｒＲＮＡ遺伝子コード領域の一部分を含むＤＮＡ配列であって、前記ＤＮＡ配列の５’末端は５’ＡＧＡＧＴＴＴＧＡＴＹＭＴＧＧＣＴＣＡＧ３’の配列を含み、前記ＤＮＡ配列の３’末端はＢｆａＩ、ＨａｅＩＩＩおよびＭｓｐＩのうちの１つに対する制限酵素認識部位を含み、
前記制限酵素認識部位がＢｆａＩであるとき、前記ＤＮＡ配列の長さは約９９塩基対から約１０３塩基対、約２６８塩基対から約２７３塩基対、約２６０塩基対から約２６５塩基対、約２７９塩基対から約２８４塩基対、約２７８塩基対から約２８２塩基対、または約２７３塩基対から約２７７塩基対であり、
前記制限酵素認識部位がＨａｅＩＩＩであるとき、前記ＤＮＡ配列の長さは約３２９塩基対から約３３４塩基対、約３５２塩基対から約３５７塩基対、約２７７塩基対から約２８２塩基対、または約３３５塩基対から約３３９塩基対であり、
前記制限酵素認識部位がＭｓｐＩであるとき、前記ＤＮＡ配列の長さは約１８８塩基対から約１９２塩基対である、ＤＮＡ配列。
（項目２）
直接給餌微生物として用いられ得る１つまたは複数の株を同定する方法であって、前記方法は、
動物の胃腸管からの細菌からＤＮＡを単離する工程と、
前記ＤＮＡを増幅する工程と、
前記増幅されたＤＮＡをＴ−ＲＦＬＰによって分析してＴＲＦデータを生成する工程と、
前記ＴＲＦデータを目的の特徴と相関させる工程と、
前記相関から目的の株を同定する工程と、
前記株中の前記ＴＲＦの存在を確認する工程と
を含む、方法。
（項目３）
項目２に記載の方法によって同定された株。
（項目４）
前記株は潜在的プロバイオティクである、項目３に記載の株。
（項目５）
前記株は潜在的病原体である、項目３に記載の株。
（項目６）
項目３に記載の少なくとも１つの株の有効量を動物に投与する工程を含む、方法。
（項目７）
単離されたＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）。
（項目８）
項目７に記載の株と、
単離されたＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ株ｏ２４６ｅ ３３ｗ（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０２）と
を含む、組み合わせ。
（項目９）
単離されたＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ株ＰｌＢ ｃ６（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０３）をさらに含む、項目８に記載の組み合わせ。
（項目１０）
Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ株ＰｌＢ ｃ６（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０３）、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ株ｏ２４６ｅ ３３ｗ（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０２）、Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ｏ２４６ｅ ４２（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１７１）、およびＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）の少なくとも１つから選択された、単離株。
（項目１１）
項目１０に記載の株の１つのすべての判明している特徴を有する、単離株。
（項目１２）
キャリアをさらに含む、項目１０に記載の株。
（項目１３）
Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ株ＰｌＢ ｃ６（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０３）、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ株ｏ２４６ｅ ３３ｗ（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０２）、Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ｏ２４６ｅ ４２（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１７１）、およびＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）から選択される少なくとも１つの株の有効量を動物に投与する工程を含む、方法。
（項目１４）
前記株はＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）である、項目１３に記載の方法。
（項目１５）
前記株はＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）およびＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ株ｏ２４６ｅ ３３ｗ（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０２）である、項目１３に記載の方法。
（項目１６）
前記株はＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ株ｏ２４６ｅ ３３ｗ（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０２）、およびＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ株ＰｌＢ ｃ６（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０３）である、項目１３に記載の方法。
（項目１７）
前記動物はブタである、項目１３に記載の方法。
（項目１８）
約１×１０ ８ 合計ｃｆｕ／ブタ／日から約５×１０ １０ 合計ｃｆｕ／ブタ／日の前記株または前記複数の株が前記ブタに投与される、項目１７に記載の方法。
（項目１９）
前記動物は雌ブタである、項目１３に記載の方法。
（項目２０）
前記雌ブタは授乳中の雌ブタである、項目１９に記載の方法。
（項目２１）
前記株はＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ株ｏ２４６ｅ ３３ｗ（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０２）、およびＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ株ＰｌＢ ｃ６（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０３）であり、
前記雌ブタから生まれた（ｂｏｒｎｅ ｔｏ）子ブタにおける体重および１日平均増体量を、前記株を投与されていない雌ブタから生まれた子ブタにおけるそれよりも改善させる工程をさらに含む、項目１９に記載の方法。
（項目２２）
前記株はＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ株ｏ２４６ｅ ３３ｗ（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０２）、およびＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ株ＰｌＢ ｃ６（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０３）であり、
前記雌ブタから生まれた同腹仔内の子ブタ体重の変動の増加を、前記株を投与されていない雌ブタから生まれた子ブタにおけるそれよりもよく防ぐ工程をさらに含む、項目１９に記載の方法。
（項目２３）
前記株はＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）であり、
前記雌ブタから生まれた同腹仔内の子ブタ体重の変動の増加を、前記株を投与されていない雌ブタから生まれた子ブタにおけるそれよりもよく防ぐ工程をさらに含む、項目１９に記載の方法。
（項目２４）
前記株はＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）であり、
前記雌ブタから生まれた同腹仔内の子ブタ体重の変動を、前記株を投与されていない雌ブタから生まれた子ブタにおけるそれよりも減少させる工程をさらに含む、項目１９に記載の方法。
（項目２５）
前記動物は生産の哺育フェーズにあるブタであり、前記株はＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ｏ２４６ｅ ４２（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１７１）である、項目１３に記載の方法。
（項目２６）
前記株によって前記動物の免疫系を調節する工程をさらに含む、項目１３に記載の方法。
（項目２７）
直接給餌微生物を調製する方法であって、前記方法は、
（ａ）液体栄養ブロス中で、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ株ＰｌＢ ｃ６（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０３）、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ株ｏ２４６ｅ ３３ｗ（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０２）、Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ｏ２４６ｅ ４２（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１７１）、およびＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）から選択される少なくとも１つの株を生育させる工程と、
（ｂ）前記液体栄養ブロスから前記株を分離して前記直接給餌微生物を形成する工程と
を含む、方法。
（項目２８）
前記株はＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３ Ｂ−５０１０１である、項目２７に記載の方法。
Claims (28)
- 乳酸菌の１６Ｓ ｒＲＮＡ遺伝子コード領域の一部分を含むＤＮＡ配列であって、前記ＤＮＡ配列の５’末端は５’ＡＧＡＧＴＴＴＧＡＴＹＭＴＧＧＣＴＣＡＧ３’の配列を含み、前記ＤＮＡ配列の３’末端はＢｆａＩ、ＨａｅＩＩＩおよびＭｓｐＩのうちの１つに対する制限酵素認識部位を含み、
前記制限酵素認識部位がＢｆａＩであるとき、前記ＤＮＡ配列の長さは約９９塩基対から約１０３塩基対、約２６８塩基対から約２７３塩基対、約２６０塩基対から約２６５塩基対、約２７９塩基対から約２８４塩基対、約２７８塩基対から約２８２塩基対、または約２７３塩基対から約２７７塩基対であり、
前記制限酵素認識部位がＨａｅＩＩＩであるとき、前記ＤＮＡ配列の長さは約３２９塩基対から約３３４塩基対、約３５２塩基対から約３５７塩基対、約２７７塩基対から約２８２塩基対、または約３３５塩基対から約３３９塩基対であり、
前記制限酵素認識部位がＭｓｐＩであるとき、前記ＤＮＡ配列の長さは約１８８塩基対から約１９２塩基対である、ＤＮＡ配列。 - 直接給餌微生物として用いられ得る１つまたは複数の株を同定する方法であって、前記方法は、
非ヒト動物の胃腸管からの細菌からＤＮＡを単離する工程と、
前記ＤＮＡを増幅する工程と、
前記増幅されたＤＮＡをＴ−ＲＦＬＰによって分析してＴＲＦデータを生成する工程と、
前記ＴＲＦデータを目的の特徴と相関させる工程と、
前記相関から目的の株を同定する工程と、
前記株中の前記ＴＲＦの存在を確認する工程と
を含む、方法。 - 請求項２に記載の方法によって同定された株。
- 前記株は潜在的プロバイオティクである、請求項３に記載の株。
- 前記株は潜在的病原体である、請求項３に記載の株。
- 請求項３に記載の少なくとも１つの株の有効量を非ヒト動物に投与する工程を含む、方法。
- 単離されたＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）。
- 請求項７に記載の株と、
単離されたＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ株ｏ２４６ｅ ３３ｗ（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０２）と
を含む、組み合わせ。 - 単離されたＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ株ＰｌＢ ｃ６（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０３）をさらに含む、請求項８に記載の組み合わせ。
- Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ株ＰｌＢ ｃ６（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０３）、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ株ｏ２４６ｅ ３３ｗ（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０２）、Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ｏ２４６ｅ ４２（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１７１）、およびＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）の少なくとも１つから選択された、単離株。
- 請求項１０に記載の株の１つのすべての判明している特徴を有する、単離株。
- キャリアをさらに含む、請求項１０に記載の株。
- Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ株ＰｌＢ ｃ６（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０３）、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ株ｏ２４６ｅ ３３ｗ（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０２）、Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ｏ２４６ｅ ４２（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１７１）、およびＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）から選択される少なくとも１つの株の有効量を非ヒト動物に投与する工程を含む、方法。
- 前記株はＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）である、請求項１３に記載の方法。
- 前記株はＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）およびＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ株ｏ２４６ｅ ３３ｗ（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０２）である、請求項１３に記載の方法。
- 前記株はＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ株ｏ２４６ｅ ３３ｗ（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０２）、およびＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ株ＰｌＢ ｃ６（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０３）である、請求項１３に記載の方法。
- 前記動物はブタである、請求項１３に記載の方法。
- 約１×１０８合計ｃｆｕ／ブタ／日から約５×１０１０合計ｃｆｕ／ブタ／日の前記株または前記複数の株が前記ブタに投与される、請求項１７に記載の方法。
- 前記動物は雌ブタである、請求項１３に記載の方法。
- 前記雌ブタは授乳中の雌ブタである、請求項１９に記載の方法。
- 前記株はＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ株ｏ２４６ｅ ３３ｗ（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０２）、およびＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ株ＰｌＢ ｃ６（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０３）であり、
前記雌ブタから生まれた子ブタにおける体重および１日平均増体量を、前記株を投与されていない雌ブタから生まれた子ブタにおけるそれよりも改善させる工程をさらに含む、請求項１９に記載の方法。 - 前記株はＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ株ｏ２４６ｅ ３３ｗ（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０２）、およびＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ株ＰｌＢ ｃ６（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０３）であり、
前記雌ブタから生まれた同腹仔内の子ブタ体重の変動の増加を、前記株を投与されていない雌ブタから生まれた子ブタにおけるそれよりもよく防ぐ工程をさらに含む、請求項１９に記載の方法。 - 前記株はＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）であり、
前記雌ブタから生まれた同腹仔内の子ブタ体重の変動の増加を、前記株を投与されていない雌ブタから生まれた子ブタにおけるそれよりもよく防ぐ工程をさらに含む、請求項１９に記載の方法。 - 前記株はＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）であり、
前記雌ブタから生まれた同腹仔内の子ブタ体重の変動を、前記株を投与されていない雌ブタから生まれた子ブタにおけるそれよりも減少させる工程をさらに含む、請求項１９に記載の方法。 - 前記動物は生産の哺育フェーズにあるブタであり、前記株はＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ｏ２４６ｅ ４２（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１７１）である、請求項１３に記載の方法。
- 前記株によって前記動物の免疫系を調節する工程をさらに含む、請求項１３に記載の方法。
- 直接給餌微生物を調製する方法であって、前記方法は、
（ａ）液体栄養ブロス中で、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ株ＰｌＢ ｃ６（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０３）、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ株ｏ２４６ｅ ３３ｗ（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０２）、Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ｏ２４６ｅ ４２（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１７１）、およびＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３（ＮＲＲＬ Ｂ−５０１０１）から選択される少なくとも１つの株を生育させる工程と、
（ｂ）前記液体栄養ブロスから前記株を分離して前記直接給餌微生物を形成する工程と
を含む、方法。 - 前記株はＰｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ株ＰｌＪ ｅ３ Ｂ−５０１０１である、請求項２７に記載の方法。
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