JP2012503597A - 細胞接着を予防するペプチド及び組成物、並びにこれを使用する方法 - Google Patents
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Abstract
Description
LFSVPYDYNWYSNWW(配列番号24) EqT−IV
FSVPYDYNLYSNWW(配列番号25) アクチノポリン Or−A
MFSVPFDYNFYSNWW(配列番号26) センジュイソギンチャク(Heteractis magnifica)由来のHMg III
MFSVPFDYNLYSNWW(配列番号27) Avt−I RTX−A
MFSVPFDYNLYTNWW(配列番号28) Pstx20
MWSVPFDYNLYSNWW(配列番号29) フィスコミトレラ・パテンス
MFSVPWDYNLYKNWF(配列番号30) ダニオ・レリオ
MFSVPFDYNLYKNWL(配列番号31) ミドリフグ(Tetraodon nigroviridis)
MSRLIIVFIVVTMICSATALPSKKIIDEDEEDEKRSADVAGAVIDGASLSFDILKTVLEALGNVKRKIAVGVDNESGKTWTALNTYFRSGTSDIVLPHKVPHGKALLYNGQKDRGPVATGAVGVLAYLMSDGNTLAVLFSVPYDYNWYSNWWNVRIYKGKRRADQRMYEELYYNLSPFRGDNGWHTRNLGYGLKSRGFMNSSGHAILEIHVSKA(配列番号33)
>gi|48428895|sp|P61914.1|ACTP2_ACTEQ イクイナトキシン−2前駆体(イクイナトキシンII)(EqT II)(EqTII)ウメボシイソギンチャクを有し、214アミノ酸長である。この配列は任意で、本発明による例示的な配列でもある。この配列の38位〜213位は注釈ドメインpfam06369、Anemone_cytotox、イソギンチャク細胞毒性タンパク質をヒットし、そのため上記配列のこの部分は任意で本発明による例示的な配列でもある。
1a.カリブイソギンチャク(Stichodactyla helianthus)
>gi|2815496|sp|P07845.2|ACTP2_STOHE スチコリシン−2(スチコリシンII)(StnII)(細胞溶解素StII)(細胞溶解素III)(細胞毒素)
ALAGTIIAGASLTFQVLDKVLEELGKVSRKIAVGIDNESGGTWTALNAYFRSGTTDVILPEFVPNTKALLYSGRKDTGPVATGAVAAFAYYMSSGNTLGVMFSVPFDYNWYSNWWDVKIYSGKRRADQGMYEDLYYGNPY
RGDNGWHEKNLGYGLRMKGIMTSAGEAKMQIKISR(配列番号34)
アラインメント:
>sp|P07845.2|ACTP2_STOHE スチコリシン−2(スチコリシンII)(StnII)(細胞溶解素StII)(細胞溶解素III)(細胞毒素)
長さ=175
スコア=253ビット(646)、期待値=8e−66、方法:組成物ベースの統計。
同一性=118/176(67%)、陽性=144/176(81%)、ギャップ=1/176(0%)
2a.ダニオ・レリオ
>gi|125821212|ref|XP_001342650.1|予測:仮想タンパク質[ダニオ・レリオ]
MTESAEAVAANVSSRRHATVEITNLTNNYCFLNPKVYLENGETSNPPQPTVRPLKTEVCTFSKSAAHATGSVGVLTYDLFERRRNDYTETLAIMFSVPWDYNLYKNWFAVGIYPKGKECDQALYKEMYYQKNQHGFVREEANGSGINFEGKNLDIRATMCPMGRAIVKVEVWDKLLSPMAQMDC(配列番号36)
アラインメント:
>ref|XP_001342650.1|UniGene infoGene info 予測:仮想タンパク質[ダニオ・レリオ]
長さ=184
遺伝子番号:100002992apnl|アクチノポリン様タンパク質[ダニオ・レリオ]
スコア=199ビット(505)、期待値=1e−49、方法:組成物ベースの統計。
同一性=49/167(29%)、陽性=73/167(43%)、ギャップ=12/167(7%)
>gi|47218822|emb|CAG02807.1|無名タンパク質産物[ミドリフグ]
MESAEAVAADVSRSRSVTIEISNLTKNYCLINPRVYLESGETYNPPQPTVRPLMTEVCTFSKSSGIPTGSVGVLTYELLERRSTMLPETLAIMFSVPYDYSFYNNWFAVGIYETGTKCNEGLYKQMYNEKKQAEHGFVREKANGSGINYVGGNLDIRATMNPLGKAIMKVEVWDAFFPFSE(配列番号39)
アラインメント:
>emb|CAG02807.1|無名タンパク質産物[ミドリフグ]
長さ=181
スコア=192ビット(489)、期待値=1e−47、方法:組成物ベースの統計。
同一性=46/170(27%)、陽性=76/170(44%)、ギャップ=14/170(8%)
3a.フィスコミトレラ・パテンス
>gi|168060237|ref|XP_001782104.1|予測タンパク質[ヒメツリガネゴケ]
MVVHLIAMGLRYSETIMKTARMAEAIIPAAELSIKTLQNIVEGITGVDRKIAIGFKNLTDYTLENLGVYFNSGSSDRSIAYKINAQEALLFSARKSDHTARGTVGTFSYYIQDEDKTVHVMWSVPFDYNLYSNWWNIAVVDGRQPPDSNVHDNLYNGSGGMPYPNKPDQYINNEQKGFHLFGSMTNNGQATIEVELKKA(配列番号42)
>ref|XP_001782104.1|Gene info 予測タンパク質[ヒメツリガネゴケ]
gb|EDQ53098.1|Gene info 予測タンパク質[ヒメツリガネゴケ]
長さ=199
遺伝子番号:5945292 PHYPADRAFT_61094|仮想タンパク質[ヒメツリガネゴケ]
スコア=230ビット(586)、期待値=7e−59、方法:組成物ベースの統計。
同一性=63/183(34%)、陽性=101/183(55%)、ギャップ=4/183(2%)
4a.ニワトリ(Gallus gallus)
>gi|118129726|ref|XP_001231839.1|予測:仮想タンパク質アイソフォーム1[ニワトリ]
MPPKEKKENDKPCNDNCQPKPQGKGVESLMKNIDVCRSVGLEIINRTRTVTLTDFRSYCFSGKIVTTLPFEIGPDSKGICIFAKTPYSLRGSVGTVVCKADTFFLAITFSNPYDYILYKIEFALEIFTEPNHLGNLGDVFSKMMKSKPYCGSSLFQRAVLESEHETLEVSKGSIRVQAKMSNNRKAILKVQVEDMDPPPYSKGM(配列番号45)
>ref|XP_001231839.1|UniGene infoGene info 予測:仮想タンパク質アイソフォーム1[ニワトリ]
長さ=204
遺伝子番号:769729 LOC769729|仮想タンパク質LOC769729[ニワトリ]
スコア=150ビット(378)、期待値=9e−35、方法:組成物ベースの統計。
同一性=33/172(19%)、陽性=63/172(36%)、ギャップ=22/172(12%)
5a.カモノハシ(Ornithorhynchus anatinus)
>gi|149491241|ref|XP_001516906.1|予測:仮想タンパク質[カモノハシ]
MAQTIEHLVHEVEAGRCVGIEITNTTNMTFRSPRTFCFSGHTLTPPTPIIHPNNAGFCIFVKRKFSLRGSVGLLVYEIEDQTLAIMFSNPFDYNFFKVEFAVALSGYKEETQDLKAFFELLYHEKQKGWLKMAKEKLCECQCPVSLENNGIRVTATMSNNAKAIIKLSSPDAKPPEGDVADVQPTTVRRPNPPPFPSPRPRIGSDLTGDQLATLDFESGK(配列番号47)
>ref|XP_001516906.1|Gene info 予測:仮想タンパク質[カモノハシ]
長さ=220
遺伝子番号:100086848 LOC100086848|仮想タンパク質LOC 100086848[カモノハシ]
スコア=168ビット(426)、期待値=2e−40、方法:組成物ベースの統計。
同一性=36/167(21%)、陽性=69/167(41%)、ギャップ=12/167(7%)
アイプタシア・プルチェラの粗抽出物(全生物)をSephadex G−10カラムで分離し、接着防止/バイオフィルム形成防止活性を共に示す2画分が得られた(図13)。
動物組織由来のゲノムDNAの単離に関する製造業者のプロトコルに従ってウィザードゲノムDNA精製キット(Promega、USDA)を使用して、25mgのアイプタシア・プルチェラ及びアネモニア・ビリダンス(Anemonia viridans)から精製鋳型DNAを調製した。Reddy Mix PCRマスターミックス(ABgene, UK)を使用して以下のプロトコルによってアイプタシア・プルチェラ及びアネモニア・ビリダンス由来の500ngの精製鋳型DNAでPCRを行った:95℃−5分(95℃ 30秒、52℃ 30秒及び72℃ 1分)×35、72℃ 10分。
CRQRVGMHLGKAKYILLLWY*GIKCLPLKLENKKALLYGPRKTTGPVATGAVGVLTYKMLCTNETNTLAVLFSVPFDYNLYSNWWKCQ(配列番号53及び62)
固相方法を用いて以下で挙げられたペプチドを合成し、Peptron Inc.(Taejeon, Korea)により90%尺度まで精製を行った。
CMFSVPFDYNWYSNWWC(配列番号32) AbacZ−17C
Ac−MFSVPFDYNWYSNWW−NH2(配列番号54) AbacZ−15
CFSVPFDYNWYSNWWC(配列番号55) AbacZ−16C
FDYNWY(配列番号5) AbacZ−6
CFDYNWYC(配列番号56) AbacZ−8C
本発明による最も活性のある環状ペプチドを同定するために、ペプチド精製器を備えた手動のParallel Peptide合成装置を用いて、互いに長さ及び環化戦略が異なるペプチドを生成する。マイクロプレート及びフローセルアッセイにおいて接着防止活性に関してそれぞれのペプチドをスクリーニングし、高活性ペプチドの選択を行う。幾つかのバージョンのペプチドのコンピュータモデリングを用いて、活性化合物の選択を最適化する。
任意で好ましくは、水及び/又は液体培地、又はこれらを含有する、例えば逆浸透フィルター及び/又は濾過装置若しくは濾過システムが挙げられるがこれらに限定されないシステム若しくは装置を処理するのに上記のペプチド及び/又は組成物及び/又は生物を使用してもよい。
脱塩条件下での逆浸透生物汚損に対するイソギンチャク目抽出物の効果を決定する。
Claims (76)
- YDYNWY(配列番号1)、YDYNLY(配列番号2)、FDYNFY(配列番号3)、FDYNLY(配列番号4)、WDYNLY(配列番号8)、FDYNWY(配列番号5)、YDWNLY(配列番号6)及びYDWHLY(配列番号7)からなる群から選択される配列を有することを特徴とするペプチド。
- 布、繊維、発泡体、フィルム、コンクリート、レンガ、ガラス、金属及びプラスチックからなる群から選択される表面に単細胞生物が接着するのを予防する方法であって、該方法は該単細胞生物を細胞毒性又は細胞増殖抑制性の活性を欠き、かつYDYNWY(配列番号1)、YDYNLY(配列番号2)、FDYNFY(配列番号3)、FDYNLY(配列番号4)、WDYNLY(配列番号8)、FDYNWY、YDWNLY及びYDWHLYからなる群から選択される配列を含むペプチドを含む組成物に接触させることを含み、該組成物が前記表面への前記単細胞生物の接着を予防又は低減することを特徴とする方法。
- 請求項2に記載の方法において、前記配列YDYNWY(配列番号1)が配列LFSVPYDYNWYSNWW(配列番号9)又は配列LFSVPYDYNLYSNWW(配列番号57)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする方法。
- 請求項2に記載の方法において、前記配列YDYNLY(配列番号2)が配列MFSVPYDYNLYSNWV(配列番号58)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする方法。
- 請求項2に記載の方法において、前記配列FDYNFY(配列番号3)が配列MFSVPFDYNFYSNWW(配列番号11)又は配列LFSVPFDYNFYSNWW(配列番号59)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする方法。
- 請求項2に記載の方法において、前記配列FDYNLY(配列番号4)がLFSVPFDYNLYSNWW(配列番号18)、LFSIPFDYNLYSNWW(配列番号60)、MFSVPFDYNLYSNWW(配列番号12)、MFSVPFDYNLYTNWW(配列番号13)、MWSVPFDYNLYSNWW(配列番号14)及びMFSVPFDYNLYKNWL(配列番号16)からなる群から選択される配列のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする方法。
- 請求項2に記載の方法において、前記配列WDYNLY(配列番号8)が配列MFSVPFDYNLYKNWL(配列番号31)又は配列MFSVPFDYNLYKNWF(配列番号61)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする方法。
- 請求項2に記載の方法において、前記配列FDYNWY(配列番号5)が配列MFSVPFDYNWYSNWW(配列番号54)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする方法。
- 請求項2に記載の方法において、前記配列YDWNLY(配列番号6)が配列MASIPYDWNLYQSWA(配列番号19)又は配列MASIPYDWNLYSAWA(配列番号20)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする方法。
- 請求項2に記載の方法において、前記配列YDWHLY(配列番号7)が配列MASIPYDWHLYNAWA(配列番号21)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする方法。
- 請求項2に記載の方法において、前記ペプチドを水生生物から単離することを特徴とする方法。
- 請求項11に記載の方法において、前記水生生物が魚類及び固着生物からなる群から選択されることを特徴とする方法。
- 請求項12に記載の方法において、前記固着生物がアイプタシア・プルチェラ及びアネモニア・ビリダンスからなる群から選択されるイソギンチャクであることを特徴とする方法。
- 請求項2に記載の方法において、前記ペプチドをコケから単離することを特徴とする方法。
- 請求項14に記載の方法において、前記コケがフィスコミトレラ・パテンス、ヒョウタンゴケ(真核生物界;緑色植物亜界;ストレプト植物門;有胚植物類;コケ植物類;コケ上綱V;蘚類綱;ヒョウタンゴケ亜綱;ヒョウタンゴケ目;ヒョウタンゴケ科;及びニセツリガネゴケ属)からなる群から選択されることを特徴とする方法。
- 請求項2に記載の方法において、前記組成物が凍結乾燥に耐性があることを特徴とする方法。
- 請求項2に記載の方法において、前記組成物が細胞の凝集を阻害することを特徴とする方法。
- 請求項2に記載の方法において、前記単細胞生物がバイオフィルム中に含まれていることを特徴とする方法。
- 請求項2に記載の方法において、前記単細胞生物が細菌、真菌、原生動物及び古細菌からなる群から選択されることを特徴とする方法。
- 請求項19に記載の方法において、前記真菌が酵母を含むことを特徴とする方法。
- 前記組成物が霧状、ゲル及び塗料からなる群から選択される形態にある、請求項2に記載の方法。
- 細胞毒性又は細胞増殖抑制性の活性を欠き、かつYDYNWY(配列番号1)、YDYNLY(配列番号2)、FDYNFY(配列番号3)、FDYNLY(配列番号4)、WDYNLY(配列番号8)、FDYNWY(配列番号5)、YDWNLY(配列番号6)及びYDWHLY(配列番号7)からなる群から選択される配列を含む単離ペプチドを含む組成物を含む医療装置であって、該組成物が該装置の表面上にコーティングされているか、又は該医療装置のポリマーマトリクスに組み込まれており、該医療装置が体内型装置又は体外型装置であることを特徴とする医療装置。
- 請求項22に記載の医療装置において、前記装置が埋め込み型医療装置又は医療機器であることを特徴とする医療装置。
- 請求項22に記載の医療装置において、前記配列YDYNWY(配列番号1)が配列LFSVPYDYNWYSNWW(配列番号9)又は配列LFSVPYDYNLYSNWW(配列番号57)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする医療装置。
- 請求項22に記載の医療装置において、前記配列YDYNLY(配列番号2)が配列MFSVPYDYNLYSNWV(配列番号58)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする医療装置。
- 請求項22に記載の医療装置において、前記配列FDYNFY(配列番号3)が配列MFSVPFDYNFYSNWW(配列番号11)又は配列LFSVPFDYNFYSNWW(配列番号59)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする医療装置。
- 請求項22に記載の医療装置において、前記配列FDYNLY(配列番号4)がLFSVPFDYNLYSNWW(配列番号18)、LFSIPFDYNLYSNWW(配列番号60)、MFSVPFDYNLYSNWW(配列番号12)、MFSVPFDYNLYTNWW(配列番号13)、MWSVPFDYNLYSNWW(配列番号14)及びMFSVPFDYNLYKNWL(配列番号16)からなる群から選択される配列のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする医療装置。
- 請求項22に記載の医療装置において、前記配列WDYNLY(配列番号8)が配列MFSVPFDYNLYKNWL(配列番号31)又は配列MFSVPFDYNLYKNWF(配列番号61)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする医療装置。
- 請求項22に記載の医療装置において、前記配列FDYNWY(配列番号5)
が配列MFSVPFDYNWYSNWW(配列番号54)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする医療装置。 - 請求項22に記載の医療装置において、前記配列YDWNLY(配列番号6)が配列MASIPYDWNLYQSWA(配列番号19)又は配列MASIPYDWNLYSAWA(配列番号20)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする医療装置。
- 請求項22に記載の医療装置において、前記配列YDWHLY(配列番号7)
が配列MASIPYDWHLYNAWA(配列番号21)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする医療装置。 - 前記ペプチドを水生生物から単離する、請求項22に記載の医療装置。
- 請求項32に記載の医療装置において、前記水生生物が魚類及び固着生物からなる群から選択されることを特徴とする医療装置。
- 請求項33に記載の医療装置において、前記固着生物がアイプタシア・プルチェラ及びアネモニア・ビリダンスからなる群から選択されるイソギンチャクであることを特徴とする医療装置。
- 請求項22に記載の医療装置において、前記ペプチドをコケから単離することを特徴とする医療装置。
- 請求項35に記載の医療装置において、前記コケがフィスコミトレラ・パテンス、ヒョウタンゴケ(真核生物界;緑色植物亜界;ストレプト植物門;有胚植物類;コケ植物類;コケ上綱V;蘚類綱;ヒョウタンゴケ亜綱;ヒョウタンゴケ目;ヒョウタンゴケ科;及びニセツリガネゴケ属)からなる群から選択されることを特徴とする医療装置。
- 請求項22に記載の医療装置において、前記組成物が凍結乾燥に耐性があることを特徴とする医療装置。
- 請求項22に記載の医療装置において、前記組成物が細胞の凝集を阻害することを特徴とする医療装置。
- 水を処理して、バイオフィルムの形成又はフィルターの汚損を予防又は低減する方法であって、細胞毒性又は細胞増殖抑制性の活性を欠き、かつYDYNWY(配列番号1)、YDYNLY(配列番号2)、FDYNFY(配列番号3)、FDYNLY(配列番号4)、WDYNLY(配列番号8)、FDYNWY(配列番号5)、YDWNLY(配列番号6)及びYDWHLY(配列番号7)からなる群から選択される配列を含む単離ペプチドを含む組成物で前記水を処理することを含むことを特徴とする方法。
- 請求項39に記載の方法において、前記配列YDYNWY(配列番号1)が配列LFSVPYDYNWYSNWW(配列番号9)又は配列LFSVPYDYNLYSNWW(配列番号57)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする方法。
- 請求項39に記載の方法において、前記配列YDYNLY(配列番号2)が配列MFSVPYDYNLYSNWV(配列番号58)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする方法。
- 請求項39に記載の方法において、前記配列FDYNFY(配列番号3)が配列MFSVPFDYNFYSNWW(配列番号11)又は配列LFSVPFDYNFYSNWW(配列番号59)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする方法。
- 請求項39に記載の方法において、前記配列FDYNLY(配列番号4)がLFSVPFDYNLYSNWW(配列番号18)、LFSIPFDYNLYSNWW(配列番号60)、MFSVPFDYNLYSNWW(配列番号12)、MFSVPFDYNLYTNWW(配列番号13)、MWSVPFDYNLYSNWW(配列番号14)及びMFSVPFDYNLYKNWL(配列番号16)からなる群から選択される配列のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする方法。
- 請求項39に記載の方法において、前記配列WDYNLY(配列番号8)が配列MFSVPFDYNLYKNWL(配列番号31)又は配列MFSVPFDYNLYKNWF(配列番号61)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする方法。
- 請求項39に記載の方法において、前記配列FDYNWY(配列番号5)が配列MFSVPFDYNWYSNWW(配列番号54)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする方法。
- 請求項39に記載の方法において、前記配列YDWNLY(配列番号6)が配列MASIPYDWNLYQSWA(配列番号19)又は配列MASIPYDWNLYSAWA(配列番号20)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする方法。
- 請求項39に記載の方法において、前記配列YDWHLY(配列番号7)が配列MASIPYDWHLYNAWA(配列番号21)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする方法。
- 請求項39に記載の方法において、前記ペプチドを水生生物から単離することを特徴とする方法。
- 請求項48に記載の方法において、前記水生生物が魚類及び固着生物からなる群から選択されることを特徴とする方法。
- 請求項49に記載の方法において、前記固着生物がアイプタシア・プルチェラ及びアネモニア・ビリダンスからなる群から選択されるイソギンチャクであることを特徴とする方法。
- 前記ペプチドをコケから単離する、請求項39に記載の方法。
- 請求項51に記載の方法において、前記コケがフィスコミトレラ・パテンス、ヒョウタンゴケ(真核生物界;緑色植物亜界;ストレプト植物門;有胚植物類;コケ植物類;コケ上綱V;蘚類綱;ヒョウタンゴケ亜綱;ヒョウタンゴケ目;ヒョウタンゴケ科;及びニセツリガネゴケ属)からなる群から選択されることを特徴とする方法。
- 請求項39に記載の方法において、前記組成物が凍結乾燥に耐性があることを特徴とする方法。
- 請求項39に記載の方法において、前記組成物が細胞の凝集を阻害することを特徴とする方法。
- 請求項39に記載の方法において、処理した前記水を逆浸透フィルターにかけることを特徴とする方法。
- 請求項39に記載の方法において、前記バイオフィルムが細菌、真菌、原生動物及び古細菌からなる群から選択される単細胞生物により形成されることを特徴とする方法。
- 請求項56に記載の方法において、前記真菌が酵母を含むことを特徴とする方法。
- 動物の身体を基としない外部流体中でのバイオフィルムの形成を予防又は低減する方法であって、細胞毒性又は細胞増殖抑制性の活性を欠き、かつYDYNWY(配列番号1)、YDYNLY(配列番号2)、FDYNFY(配列番号3)、FDYNLY(配列番号4)、WDYNLY(配列番号8)、FDYNWY(配列番号5)、YDWNLY(配列番号6)及びYDWHLY(配列番号7)からなる群から選択される配列を含む単離ペプチドを含む組成物で前記流体を処理することを含むことを特徴とする方法。
- 請求項58に記載の方法において、前記配列YDYNWY(配列番号1)が配列LFSVPYDYNWYSNWW(配列番号9)又は配列LFSVPYDYNLYSNWW(配列番号57)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする方法。
- 請求項58に記載の方法において、前記配列YDYNLY(配列番号2)が配列MFSVPYDYNLYSNWV(配列番号58)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする方法。
- 請求項58に記載の方法において、前記配列FDYNFY(配列番号3)が配列MFSVPFDYNFYSNWW(配列番号11)又は配列LFSVPFDYNFYSNWW(配列番号59)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする方法。
- 請求項58に記載の方法において、前記配列FDYNLY(配列番号4)がLFSVPFDYNLYSNWW(配列番号18)、LFSIPFDYNLYSNWW(配列番号60)、MFSVPFDYNLYSNWW(配列番号12)、MFSVPFDYNLYTNWW(配列番号13)、MWSVPFDYNLYSNWW(配列番号14)及びMFSVPFDYNLYKNWL(配列番号16)からなる群から選択される配列のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする方法。
- 請求項58に記載の方法において、前記配列WDYNLY(配列番号8)が配列MFSVPFDYNLYKNWL(配列番号31)又は配列MFSVPFDYNLYKNWF(配列番号61)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする方法。
- 請求項58に記載の方法において、前記配列FDYNWY(配列番号5)が配列MFSVPFDYNWYSNWW(配列番号54)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする方法。
- 請求項58に記載の方法において、前記配列YDWNLY(配列番号6)が配列MASIPYDWNLYQSWA(配列番号19)又は配列MASIPYDWNLYSAWA(配列番号20)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする方法。
- 請求項58に記載の方法において、前記配列YDWHLY(配列番号7)が配列MASIPYDWHLYNAWA(配列番号21)のタンパク質の中に含まれていることを特徴とする方法。
- 請求項58に記載の方法において、前記ペプチドを水生生物から単離することを特徴とする方法。
- 請求項67に記載の方法において、前記水生生物が魚類及び固着生物からなる群から選択されることを特徴とする方法。
- 請求項68に記載の方法において、前記固着生物がアイプタシア・プルチェラ及びアネモニア・ビリダンスからなる群から選択されるイソギンチャクであることを特徴とする方法。
- 請求項58に記載の方法において、前記ペプチドをコケから単離することを特徴とする方法。
- 請求項70に記載の方法において、前記コケがフィスコミトレラ・パテンス、ヒョウタンゴケ(真核生物界;緑色植物亜界;ストレプト植物門;有胚植物類;コケ植物類;コケ上綱V;蘚類綱;ヒョウタンゴケ亜綱;ヒョウタンゴケ目;ヒョウタンゴケ科;及びニセツリガネゴケ属)からなる群から選択されることを特徴とする方法。
- 請求項58に記載の方法において、前記組成物が凍結乾燥に耐性があることを特徴とする方法。
- 請求項58に記載の方法において、前記組成物が細胞の凝集を阻害することを特徴とする方法。
- 請求項58に記載の方法において、前記流体を逆浸透フィルターにかけることを特徴とする方法。
- 請求項58に記載の方法において、前記バイオフィルムが細菌、真菌、原生動物及び古細菌からなる群から選択される単細胞生物により形成されることを特徴とする方法。
- 請求項75に記載の方法において、前記真菌が酵母を含むことを特徴とする方法。
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