JP2012094149A - 協業基盤の塩基配列データの管理、表示およびアップデート方法 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】協業基盤の塩基配列データの管理方法は塩基配列の少なくとも1つのベースに対応するアンカー(anchor)に対する注釈データを入力受けるステップおよび前記サービスサーバが注釈データに対する1つ以上のカラム(column)を含む注釈データテーブルに、前記受信した注釈データを格納するステップを含む。
【選択図】図6
Description
Claims (17)
- サービスサーバが塩基配列の少なくとも1つのベースに対応するアンカー(anchor)に対して入力された注釈データを受信するステップ、および
サービスサーバが、注釈データに対する1つ以上のカラム(column)を含む注釈データテーブルに前記受信された注釈データを格納するステップを含む協業基盤の塩基配列データの管理方法。 - 前記注釈データに対するカラムは予め定められた注釈タイプのうち1つが格納される注釈タイプのカラムが含む塩基配列データに結合された請求項1に記載の協業基盤の塩基配列データの管理方法。
- 前記注釈データに対するカラムは注釈の作成者以外の評価に基づいて計算する評価値が格納される注釈評価値カラムを含む請求項1に記載の協業基盤の塩基配列データの管理方法。
- 前記注釈データに対するカラムには注釈内容である文字列を格納するコンテンツコンテンツカラムおよび前記文字列をキーワード辞書と比較し、前記文字列から抽出したキーワードに対する情報が格納されるキーワードコンテンツカラムが含まれる請求項1に記載の協業基盤の塩基配列データの管理方法。
- クライアントが塩基配列の少なくとも1つのベースに対応するアンカー(anchor)の前記塩基配列内の位置データをサーバから受信するステップ、および
前記クライアントが前記受信した位置データに基づきアンカーの位置を塩基配列マップに表示するステップを含む協業基盤の塩基配列データの表示方法。 - 前記クライアントが前記アンカーに対する注釈データをさらに受信するステップと、
前記クライアントが少なくとも1つのアンカーの選択を受けるステップ、および
前記クライアントが前記選択されたアンカーに対する注釈データに含まれている注釈コンテンツを表示するステップをさらに含む請求項5に記載の協業基盤の塩基配列データの表示方法。 - 前記選択されたアンカーに対する注釈データに含まれている注釈コンテンツを表示するステップは、
前記クライアントが前記選択されたアンカーに対する注釈が2つ以上存在する場合、現在のユーザの職業と前記注釈データに含まれている作成者の職業の類似性、現在のユーザの関心分野と前記注釈データに含まれている作成者の関心分野の類似性および前記注釈データの評価値を考慮して計算した点数を基準に注釈を配列して表示するステップを含む請求項6に記載の協業基盤の塩基配列データの表示方法。 - 前記クライアントが前記アンカーに対する注釈データをさらに受信するステップ、および
前記クライアントが前記注釈データに含まれた注釈コンテンツのキーワードに基づき前記アンカーをグループ化し、グループ化情報を前記塩基配列マップに表示するステップをさらに含む請求項5に記載の協業基盤の塩基配列データの表示方法。 - 前記クライアントが前記アンカーに対する注釈データをさらに受信し、前記注釈データは作成者情報、注釈タイプ情報、評価値情報および注釈コンテンツを含むステップ、および
前記クライアントが前記作成者情報、前記注釈タイプ情報、前記評価値情報および前記注釈コンテンツから抽出したキーワードのうち少なくとも1つに基づき前記注釈データをフィルタリングして表示するステップをさらに含む請求項5に記載の協業基盤の塩基配列データの表示方法。 - 前記注釈データをフィルタリングして表示するステップは、
前記クライアントが現在のユーザの職業と前記注釈データに含まれている作成者の職業の類似性、現在のユーザの関心分野と前記注釈データに含まれている作成者の関心分野の類似性を考慮して計算した数値に基づき前記注釈データをフィルタリングして表示するステップを含む請求項9に記載の協業基盤の塩基配列データの表示方法。 - クライアントが塩基配列マップ上の注釈入力位置の選択を受けるステップと、
前記クライアントが注釈入力のための編集領域を含む注釈入力インターフェースを表示するステップ、および
前記クライアントが前記編集領域を介して入力された注釈コンテンツおよび前記注釈入力位置を含む注釈データを塩基配列データ格納装置に送信するステップを含む協業基盤の塩基配列データのアップデート方法。 - 前記注釈入力インターフェースを表示するステップは、前記クライアントが注釈タイプの選択領域をさらに含む注釈入力インターフェースを表示するステップを含み、
前記塩基配列データ格納装置に送信するステップは、前記クライアントが前記注釈タイプ選択領域を介して選択した注釈タイプ情報をさらに含む注釈データを前記塩基配列データ格納装置に送信するステップを含む請求項11に記載の協業基盤の塩基配列データのアップデート方法。 - 前記塩基配列マップ上の注釈入力位置を選択するステップは塩基配列マップ上のアンカーのうち1つを選択するステップであり、
前記注釈入力インターフェースを表示するステップは、前記選択された注釈タイプが既存の注釈に対するリプライタイプである場合、前記クライアントが前記既存の注釈評価を選択する評価選択領域をさらに含む注釈入力インターフェースを表示するステップを含み、
前記塩基配列データ格納装置に送信するステップは、前記クライアントが前記評価選択領域を介して選択された前記既存の注釈に対する評価情報をさらに前記塩基配列データ格納装置に送信するステップを含む請求項12に記載の協業基盤の塩基配列データのアップデート方法。 - 前記クライアントが前記注釈データを公開可否の入力を受けるステップをさらに含む請求項11に記載の協業基盤の塩基配列データのアップデート方法。
- 塩基配列の少なくとも1つのベースに対応するアンカー(anchor)に対する注釈データおよび塩基配列データを格納するDBサーバ、および
クライアントの要請領域に対応する前記注釈データおよび塩基配列データを前記クライアントに送信し、前記クライアントから前記アンカーの位置情報を含む前記注釈データを受信し、前記DBサーバに格納された前記注釈データのフォーマットに合わせて変換した後、前記DBサーバに格納するサービスサーバを含む協業基盤の塩基配列データ管理システム。 - 前記サービスサーバから前記注釈データおよび前記塩基配列データを受信し、前記注釈データに含まれているアンカー位置が表示された塩基配列マップを表示し、ユーザからアンカーの位置情報および注釈コンテンツの入力を受け、前記サービスサーバに送信する前記クライアントをさらに含む請求項15に記載の協業基盤の塩基配列データ管理システム。
- 前記クライアントは、
前記注釈データに含まれた注釈コンテンツのキーワードに基づき前記アンカーをグループ化して、グループ化情報を前記塩基配列マップ上に表示する請求項16に記載の協業基盤の塩基配列データ管理システム。
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