JP2010537647A - 癌患者における化学療法に対する応答を測定するために腫瘍のrna完全性を用いる方法 - Google Patents
癌患者における化学療法に対する応答を測定するために腫瘍のrna完全性を用いる方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2010537647A JP2010537647A JP2010523246A JP2010523246A JP2010537647A JP 2010537647 A JP2010537647 A JP 2010537647A JP 2010523246 A JP2010523246 A JP 2010523246A JP 2010523246 A JP2010523246 A JP 2010523246A JP 2010537647 A JP2010537647 A JP 2010537647A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- tumor
- rna
- rin
- chemotherapy
- patient
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 title claims abstract description 215
- 230000004044 response Effects 0.000 title claims abstract description 42
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 35
- 238000002512 chemotherapy Methods 0.000 title abstract description 61
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 title description 17
- 239000002246 antineoplastic agent Substances 0.000 claims abstract description 60
- 229940127089 cytotoxic agent Drugs 0.000 claims abstract description 59
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 claims abstract description 46
- 230000004043 responsiveness Effects 0.000 claims abstract description 24
- 238000005251 capillar electrophoresis Methods 0.000 claims abstract description 13
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 claims description 33
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 claims description 27
- ZDZOTLJHXYCWBA-VCVYQWHSSA-N N-debenzoyl-N-(tert-butoxycarbonyl)-10-deacetyltaxol Chemical compound O([C@H]1[C@H]2[C@@](C([C@H](O)C3=C(C)[C@@H](OC(=O)[C@H](O)[C@@H](NC(=O)OC(C)(C)C)C=4C=CC=CC=4)C[C@]1(O)C3(C)C)=O)(C)[C@@H](O)C[C@H]1OC[C@]12OC(=O)C)C(=O)C1=CC=CC=C1 ZDZOTLJHXYCWBA-VCVYQWHSSA-N 0.000 claims description 23
- 229960003668 docetaxel Drugs 0.000 claims description 23
- AOJJSUZBOXZQNB-VTZDEGQISA-N 4'-epidoxorubicin Chemical group O([C@H]1C[C@@](O)(CC=2C(O)=C3C(=O)C=4C=CC=C(C=4C(=O)C3=C(O)C=21)OC)C(=O)CO)[C@H]1C[C@H](N)[C@@H](O)[C@H](C)O1 AOJJSUZBOXZQNB-VTZDEGQISA-N 0.000 claims description 22
- HTIJFSOGRVMCQR-UHFFFAOYSA-N Epirubicin Natural products COc1cccc2C(=O)c3c(O)c4CC(O)(CC(OC5CC(N)C(=O)C(C)O5)c4c(O)c3C(=O)c12)C(=O)CO HTIJFSOGRVMCQR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 22
- 229960001904 epirubicin Drugs 0.000 claims description 22
- 230000007423 decrease Effects 0.000 claims description 20
- 230000009467 reduction Effects 0.000 claims description 17
- 239000000463 material Substances 0.000 claims description 16
- 108020004463 18S ribosomal RNA Proteins 0.000 claims description 11
- 229940045799 anthracyclines and related substance Drugs 0.000 claims description 8
- 238000002591 computed tomography Methods 0.000 claims description 8
- 229940123237 Taxane Drugs 0.000 claims description 7
- 238000010186 staining Methods 0.000 claims description 5
- ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N ethidium bromide Chemical compound [Br-].C12=CC(N)=CC=C2C2=CC=C(N)C=C2[N+](CC)=C1C1=CC=CC=C1 ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 229960005542 ethidium bromide Drugs 0.000 claims description 4
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 claims description 4
- 238000002595 magnetic resonance imaging Methods 0.000 claims description 4
- 238000012285 ultrasound imaging Methods 0.000 claims description 4
- DKPFODGZWDEEBT-QFIAKTPHSA-N taxane Chemical class C([C@]1(C)CCC[C@@H](C)[C@H]1C1)C[C@H]2[C@H](C)CC[C@@H]1C2(C)C DKPFODGZWDEEBT-QFIAKTPHSA-N 0.000 claims description 3
- 238000009104 chemotherapy regimen Methods 0.000 abstract description 27
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 abstract description 9
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 abstract description 2
- 229920002477 rna polymer Polymers 0.000 description 145
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 19
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 18
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 17
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 description 12
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 description 12
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 12
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 11
- 238000002203 pretreatment Methods 0.000 description 9
- 206010061309 Neoplasm progression Diseases 0.000 description 8
- 102000007537 Type II DNA Topoisomerases Human genes 0.000 description 8
- 108010046308 Type II DNA Topoisomerases Proteins 0.000 description 8
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 8
- 230000008859 change Effects 0.000 description 8
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 8
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 8
- 238000004393 prognosis Methods 0.000 description 8
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 8
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 8
- 230000005751 tumor progression Effects 0.000 description 8
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 7
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 7
- 102000040650 (ribonucleotides)n+m Human genes 0.000 description 6
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 102000003998 progesterone receptors Human genes 0.000 description 6
- 108090000468 progesterone receptors Proteins 0.000 description 6
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 5
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 5
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 5
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 5
- 238000013275 image-guided biopsy Methods 0.000 description 5
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 description 5
- 230000003902 lesion Effects 0.000 description 5
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 5
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 5
- 206010061819 Disease recurrence Diseases 0.000 description 4
- 206010059866 Drug resistance Diseases 0.000 description 4
- WZUVPPKBWHMQCE-UHFFFAOYSA-N Haematoxylin Chemical compound C12=CC(O)=C(O)C=C2CC2(O)C1C1=CC=C(O)C(O)=C1OC2 WZUVPPKBWHMQCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000013614 RNA sample Substances 0.000 description 4
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 4
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 4
- 102000015694 estrogen receptors Human genes 0.000 description 4
- 108010038795 estrogen receptors Proteins 0.000 description 4
- 238000001000 micrograph Methods 0.000 description 4
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 4
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 3
- 101150029707 ERBB2 gene Proteins 0.000 description 3
- 238000010240 RT-PCR analysis Methods 0.000 description 3
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 3
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 3
- 230000006907 apoptotic process Effects 0.000 description 3
- 238000004422 calculation algorithm Methods 0.000 description 3
- 230000006652 catabolic pathway Effects 0.000 description 3
- 108091092328 cellular RNA Proteins 0.000 description 3
- 230000000973 chemotherapeutic effect Effects 0.000 description 3
- 230000002596 correlated effect Effects 0.000 description 3
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 3
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 3
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 3
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 3
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 3
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 3
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 3
- HQQSBEDKMRHYME-UHFFFAOYSA-N pefloxacin mesylate Chemical compound [H+].CS([O-])(=O)=O.C1=C2N(CC)C=C(C(O)=O)C(=O)C2=CC(F)=C1N1CCN(C)CC1 HQQSBEDKMRHYME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229960001373 pegfilgrastim Drugs 0.000 description 3
- 108010044644 pegfilgrastim Proteins 0.000 description 3
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 3
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 3
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 3
- 238000001356 surgical procedure Methods 0.000 description 3
- 239000000439 tumor marker Substances 0.000 description 3
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 2
- CMSMOCZEIVJLDB-UHFFFAOYSA-N Cyclophosphamide Chemical compound ClCCN(CCCl)P1(=O)NCCCO1 CMSMOCZEIVJLDB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000004543 DNA replication Effects 0.000 description 2
- 206010061818 Disease progression Diseases 0.000 description 2
- AOJJSUZBOXZQNB-TZSSRYMLSA-N Doxorubicin Chemical compound O([C@H]1C[C@@](O)(CC=2C(O)=C3C(=O)C=4C=CC=C(C=4C(=O)C3=C(O)C=21)OC)C(=O)CO)[C@H]1C[C@H](N)[C@H](O)[C@H](C)O1 AOJJSUZBOXZQNB-TZSSRYMLSA-N 0.000 description 2
- GHASVSINZRGABV-UHFFFAOYSA-N Fluorouracil Chemical compound FC1=CNC(=O)NC1=O GHASVSINZRGABV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N Formaldehyde Chemical compound O=C WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000005726 Inflammatory Breast Neoplasms Diseases 0.000 description 2
- 206010021980 Inflammatory carcinoma of the breast Diseases 0.000 description 2
- 206010027476 Metastases Diseases 0.000 description 2
- 229930012538 Paclitaxel Natural products 0.000 description 2
- 238000002123 RNA extraction Methods 0.000 description 2
- 102000006382 Ribonucleases Human genes 0.000 description 2
- 108010083644 Ribonucleases Proteins 0.000 description 2
- IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N Thymidine Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N 0.000 description 2
- 238000009098 adjuvant therapy Methods 0.000 description 2
- 229940100198 alkylating agent Drugs 0.000 description 2
- 239000002168 alkylating agent Substances 0.000 description 2
- 229940041181 antineoplastic drug Drugs 0.000 description 2
- 230000022131 cell cycle Effects 0.000 description 2
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 2
- 230000000875 corresponding effect Effects 0.000 description 2
- 239000002254 cytotoxic agent Substances 0.000 description 2
- 231100000599 cytotoxic agent Toxicity 0.000 description 2
- 238000000326 densiometry Methods 0.000 description 2
- 230000005750 disease progression Effects 0.000 description 2
- YQGOJNYOYNNSMM-UHFFFAOYSA-N eosin Chemical compound [Na+].OC(=O)C1=CC=CC=C1C1=C2C=C(Br)C(=O)C(Br)=C2OC2=C(Br)C(O)=C(Br)C=C21 YQGOJNYOYNNSMM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 2
- 229960002949 fluorouracil Drugs 0.000 description 2
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 2
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 2
- 230000002055 immunohistochemical effect Effects 0.000 description 2
- 201000004653 inflammatory breast carcinoma Diseases 0.000 description 2
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 2
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 2
- 210000005075 mammary gland Anatomy 0.000 description 2
- 230000009401 metastasis Effects 0.000 description 2
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 2
- 239000002777 nucleoside Substances 0.000 description 2
- 150000003833 nucleoside derivatives Chemical class 0.000 description 2
- 229960001592 paclitaxel Drugs 0.000 description 2
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 2
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 2
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 2
- 238000001959 radiotherapy Methods 0.000 description 2
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 2
- RCINICONZNJXQF-MZXODVADSA-N taxol Chemical compound O([C@@H]1[C@@]2(C[C@@H](C(C)=C(C2(C)C)[C@H](C([C@]2(C)[C@@H](O)C[C@H]3OC[C@]3([C@H]21)OC(C)=O)=O)OC(=O)C)OC(=O)[C@H](O)[C@@H](NC(=O)C=1C=CC=CC=1)C=1C=CC=CC=1)O)C(=O)C1=CC=CC=C1 RCINICONZNJXQF-MZXODVADSA-N 0.000 description 2
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 2
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 2
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 2
- 238000012800 visualization Methods 0.000 description 2
- 102100033350 ATP-dependent translocase ABCB1 Human genes 0.000 description 1
- DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N Beta-D-1-Arabinofuranosylthymine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1C(O)C(O)C(CO)O1 DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N Carbon dioxide Chemical compound O=C=O CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010048610 Cardiotoxicity Diseases 0.000 description 1
- 108010078791 Carrier Proteins Proteins 0.000 description 1
- 230000005778 DNA damage Effects 0.000 description 1
- 231100000277 DNA damage Toxicity 0.000 description 1
- 102000003844 DNA helicases Human genes 0.000 description 1
- 108090000133 DNA helicases Proteins 0.000 description 1
- 102000005720 Glutathione transferase Human genes 0.000 description 1
- 108010070675 Glutathione transferase Proteins 0.000 description 1
- 101500025419 Homo sapiens Epidermal growth factor Proteins 0.000 description 1
- 101001012157 Homo sapiens Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Proteins 0.000 description 1
- 206010062016 Immunosuppression Diseases 0.000 description 1
- 108010047230 Member 1 Subfamily B ATP Binding Cassette Transporter Proteins 0.000 description 1
- 102000014842 Multidrug resistance proteins Human genes 0.000 description 1
- 108020004485 Nonsense Codon Proteins 0.000 description 1
- 102100030086 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Human genes 0.000 description 1
- 230000018199 S phase Effects 0.000 description 1
- 108010091105 Subfamily B ATP Binding Cassette Transporter Proteins 0.000 description 1
- 102000004243 Tubulin Human genes 0.000 description 1
- 108090000704 Tubulin Proteins 0.000 description 1
- 206010047700 Vomiting Diseases 0.000 description 1
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- 230000006978 adaptation Effects 0.000 description 1
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000001093 anti-cancer Effects 0.000 description 1
- 238000003782 apoptosis assay Methods 0.000 description 1
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 1
- IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N beta-L-thymidine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1OC(CO)C(O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 210000000481 breast Anatomy 0.000 description 1
- 244000309464 bull Species 0.000 description 1
- 235000011089 carbon dioxide Nutrition 0.000 description 1
- 231100000259 cardiotoxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000030833 cell death Effects 0.000 description 1
- 230000003915 cell function Effects 0.000 description 1
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 1
- 230000003833 cell viability Effects 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 229940044683 chemotherapy drug Drugs 0.000 description 1
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 1
- 230000001268 conjugating effect Effects 0.000 description 1
- 229960004397 cyclophosphamide Drugs 0.000 description 1
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 1
- GYOZYWVXFNDGLU-XLPZGREQSA-N dTMP Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(O)=O)[C@@H](O)C1 GYOZYWVXFNDGLU-XLPZGREQSA-N 0.000 description 1
- 238000013501 data transformation Methods 0.000 description 1
- 230000034994 death Effects 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 239000006185 dispersion Substances 0.000 description 1
- 230000003828 downregulation Effects 0.000 description 1
- 229960004679 doxorubicin Drugs 0.000 description 1
- 238000001647 drug administration Methods 0.000 description 1
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 1
- 230000006870 function Effects 0.000 description 1
- 238000011223 gene expression profiling Methods 0.000 description 1
- 102000034356 gene-regulatory proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091006104 gene-regulatory proteins Proteins 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 238000013537 high throughput screening Methods 0.000 description 1
- 238000000265 homogenisation Methods 0.000 description 1
- 229940116978 human epidermal growth factor Drugs 0.000 description 1
- 238000002991 immunohistochemical analysis Methods 0.000 description 1
- 238000003364 immunohistochemistry Methods 0.000 description 1
- 230000001506 immunosuppresive effect Effects 0.000 description 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 1
- 239000000411 inducer Substances 0.000 description 1
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 1
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 1
- 238000007689 inspection Methods 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 1
- 229940127021 low-dose drug Drugs 0.000 description 1
- 210000002751 lymph Anatomy 0.000 description 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 1
- 231100000682 maximum tolerated dose Toxicity 0.000 description 1
- 208000037819 metastatic cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000011575 metastatic malignant neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 238000002493 microarray Methods 0.000 description 1
- 230000025090 microtubule depolymerization Effects 0.000 description 1
- 230000000394 mitotic effect Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- GVUGOAYIVIDWIO-UFWWTJHBSA-N nepidermin Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC=1NC=NC=1)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC=1NC=NC=1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O)C(C)C)[C@@H](C)CC)C(C)C)C(C)C)C1=CC=C(O)C=C1 GVUGOAYIVIDWIO-UFWWTJHBSA-N 0.000 description 1
- 208000004235 neutropenia Diseases 0.000 description 1
- 210000004882 non-tumor cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000000683 nonmetastatic effect Effects 0.000 description 1
- 238000001543 one-way ANOVA Methods 0.000 description 1
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 1
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 description 1
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 1
- 238000010837 poor prognosis Methods 0.000 description 1
- 230000008569 process Effects 0.000 description 1
- 239000000047 product Substances 0.000 description 1
- 230000005522 programmed cell death Effects 0.000 description 1
- 238000001243 protein synthesis Methods 0.000 description 1
- 238000012372 quality testing Methods 0.000 description 1
- 239000003642 reactive oxygen metabolite Substances 0.000 description 1
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 1
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000008261 resistance mechanism Effects 0.000 description 1
- 238000013515 script Methods 0.000 description 1
- 208000011581 secondary neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 230000002459 sustained effect Effects 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 238000011521 systemic chemotherapy Methods 0.000 description 1
- 230000009885 systemic effect Effects 0.000 description 1
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 1
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 1
- 229940104230 thymidine Drugs 0.000 description 1
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 1
- 230000035899 viability Effects 0.000 description 1
- 230000000007 visual effect Effects 0.000 description 1
- 238000011179 visual inspection Methods 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
- C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N27/00—Investigating or analysing materials by the use of electric, electrochemical, or magnetic means
- G01N27/26—Investigating or analysing materials by the use of electric, electrochemical, or magnetic means by investigating electrochemical variables; by using electrolysis or electrophoresis
- G01N27/416—Systems
- G01N27/447—Systems using electrophoresis
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/33—Heterocyclic compounds
- A61K31/335—Heterocyclic compounds having oxygen as the only ring hetero atom, e.g. fungichromin
- A61K31/337—Heterocyclic compounds having oxygen as the only ring hetero atom, e.g. fungichromin having four-membered rings, e.g. taxol
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
- A61K31/7028—Compounds having saccharide radicals attached to non-saccharide compounds by glycosidic linkages
- A61K31/7034—Compounds having saccharide radicals attached to non-saccharide compounds by glycosidic linkages attached to a carbocyclic compound, e.g. phloridzin
- A61K31/704—Compounds having saccharide radicals attached to non-saccharide compounds by glycosidic linkages attached to a carbocyclic compound, e.g. phloridzin attached to a condensed carbocyclic ring system, e.g. sennosides, thiocolchicosides, escin, daunorubicin
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/52—Predicting or monitoring the response to treatment, e.g. for selection of therapy based on assay results in personalised medicine; Prognosis
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Oncology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Electrochemistry (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
Abstract
Description
本発明は、化学療法の前、間、および後に腫瘍細胞のRNA完全性を比較することによって、化学療法に対する腫瘍の応答を測定する方法に関する。
癌は、細胞の制御されない悪性の成長である。転移と呼ばれるプロセスにおいて、癌性細胞は、リンパおよび/または循環系を通して、その起源部位から体内の遠隔部位に広がることができる。転移は、癌を有する人の第一の死因である(Bockhorn, M. et al., Lancet Oncol. 8 (2007) 444-448)。
(a)患者に1種または複数種の化学療法剤を一定期間投与する段階;
(b)化学療法剤が投与される期間の前、間、および後に該患者の腫瘍からRNAを抽出する段階;
(c)各時点に由来する抽出されたRNAのRNA品質を測定する段階;
を含む、1つまたは複数の癌性腫瘍を有する患者における1種または複数の化学療法剤に対する腫瘍の応答性を測定する方法を提供し、本方法では、該期間においてRNA品質が低下すれば腫瘍が該化学療法剤に対して応答性であることが示される。
リボ核酸(RNA)は、真核細胞内での機能的タンパク質への遺伝情報の翻訳において多数の本質的な役割を果たしている。mRNAは、遺伝子のプロセシングされた転写物であり、これは特異的タンパク質に翻訳されるためにリボソームに結合する。他のRNAは、リボソームの必須の部分を形成するか(rRNA)、またはタンパク質合成におけるアミノ酸の担体(tRNA)として作用する。
(a)乳腺組織コア生検材料からの総RNAの単離
RNAは、QIAGEN(登録商標)RNAeasy(登録商標)ミニキット(Qiagen GmbH, Germany)を用いて患者の腫瘍コア生検材料から単離した。RNA単離プロトコールを、Qiagen GmbHによって公表されたプロトコール(Qiagen GmbH, Germanyから無料で入手可能;同様にhttp://wwwl.qiagen.com/literature/handbooks/literature.aspx?id=l000291でも入手可能)からわずかに改変した。
腫瘍のコア生検材料からの総RNA試料を、RNA 6000 Nano Lapchips(商標)(Agilent Technologies, Inc.)に加えて、Agilent(登録商標)2100バイオアナライザを用いるキャピラリー電気泳動に供した。Agilent(登録商標)2100バイオアナライザ(Agilent Technologies, Inc.)のプロトコール(Agilent(登録商標)2100バイオアナライザユーザーズガイド、2003年11月編、マニュアルパート番号G2946-90000、Agilent Technologies, Inc.、http://www.chem.agilent.com/temp/rad4DEAE/00000725.PDFで入手可能)に従った。
(a)化学療法臨床試験における乳癌患者からの腫瘍生検試料
乳癌患者を化学療法剤で処置することによって、腫瘍RNAの分解が起こるか否かを試験するために、腫瘍の画像誘導によるコア生検材料6個を、局所進行または炎症性乳癌患者50人からエピルビシン/ドセタキセル化学療法による処置前、処置中、および処置後に得た。患者は、National Cancer Institute of Canada Clinical Trials Group(グループ「MA.22」と呼ばれる)が主催する国の臨床試験の患者であり、エピルビシンとドセタキセルの双方の用量レベルを増加させながら処置され、この治療に関連する好中球減少症を低減するためにペグフィルグラスチムの補助療法を受けた。化学療法を標準的な投与レジメン(アームA)において3週間毎に適用した。この試験において用いた用量レベルを表1において示す。このレジメンの最大認容量は、用量レベル6、すなわち105 mg/m2エピルビシンおよび75 mg/m2ドセタキセルであった(表1、スケジュールAを参照されたい)。
表1:National Cancer Institute of Canadaによる臨床試験(MA.22)に関連する3週間毎(スケジュールA)または2週間毎(スケジュールB)のレジメンのいずれかを用いて局所進行/炎症性乳癌患者に投与されたエピルビシン、ドセタキセル、およびペグフィルグラスチムの用量レベル。
患者のコア生検材料から単離されたRNAの平均コアRIN値を、これらの値が、エピルビシン/ドセタキセル化学療法に応答して低下したか否か、および薬物用量レベルとRIN低下の程度の間に関係があるか否かを判定するために評価した。患者の処置前の平均腫瘍RIN値にばらつきがあったが、それらが5.0未満であることはほとんどなく、患者50人全員からのデータを評価した場合、平均値は6.5であった(表2)。RINとベースライン薬物用量との関連を一元配置ANOVAを用いて評価した。
表2−表1において示される用量レベルでのエピルビシン/ドセタキセル化学療法による処置前、処置中、および処置後のMA.22臨床試験の患者に関する腫瘍のRIN値。1 患者数(N)=1である場合、平均値の推定値よりむしろその患者のRINの値を提供する。2 N=2の場合、95%信頼限界の推定値の代わりにRINの値の範囲を提供する。3 上付き文字3は、ゼロでの切り捨てを示す。
図3は、キャピラリー電気泳動後の電気泳動図の視覚的検査によって評価したエピルビシン/ドセタキセル化学療法の間のMA.22患者において観察された腫瘍RNA品質の変化パターンを示す。患者は、RNA品質の変化なし(パターンA)、処置中に限られるRNA品質の一時的な低下(パターンD)、処置後に限られるRNA品質の強い低下(パターンB)、または処置中および処置後でのRNA品質の劇的な低下(パターンC)を示した。少数の患者に関して、腫瘍のRNA品質は、全ての時点で不良であり(パターンE)、その原因は不明であった。これらのパターンはまた、化学療法前、療法中、および療法後の対応する患者のRIN値に反映された(図4)。パターンBおよびCを示す腫瘍を有する患者は、化学療法に対する応答者であると考えられ(患者の〜55%)、パターンAおよびCを示す腫瘍を有する患者は処置に対する非応答者であると考えられた(患者の〜37%)。
免疫組織化学アプローチを用いて、乳癌の予後にとって重要であることが知られている特異的腫瘍マーカータンパク質のベースラインレベルを測定して、発現を公知の標準物質に対する陽性染色の百分率として評価した。免疫組織化学によって評価されるタンパク質には、エストロゲン受容体(ER)、プロゲステロン受容体(PR)、ヒト上皮細胞増殖因子受容体2(Her2)、およびトポイソメラーゼII(「topo II」)が含まれた。特異的腫瘍マーカーの処置前レベルと様々な時点でのRIN値との関連を、対称性を改善してデータの分散を安定化させるためのデータ変換を行ってまたは行わずに、スピアマンおよびピアソンの相関係数を算出することによって評価した。全ての患者に関して、topo IIの高い処置前レベルは、処置前の高い腫瘍RINに有意に関連した(表3;p値は、0.01〜0.03)。高い処置前RIN値と高い処置前topo IIレベルとの関連から、高いtopo II発現を有する細胞が非常に生存率が高く、急速に増殖して、高い品質のRNAを産生することが示唆された。この関連はまた、処置後においても明白であった(表3を参照されたい)。処置後に高いRIN値(すなわち高い品質のRNA)を有する腫瘍は、化学療法に応答しない非常に生存率の高い腫瘍、または腫瘍に浸潤した健康な正常組織を表すと考えられた。Her2、ER、またはPRの処置前レベルと、処置前または処置後のRIN値との間には関連が見られなかった(データは示していない)。
表3−化学療法前(ベースライン)、処置中、および処置後のMA.22患者に関する腫瘍のRNA完全性の数値(RIN)とトポイソメラーゼII発現との関係。%トポイソメラーゼII発現は、トポイソメラーゼIIα特異的抗体によって患者からの腫瘍コア生検材料の固定切片をプローブする免疫組織化学実験を通して、病理学者によって測定された。データは、データの分散に関して制御するために、変換値または未変換値を用いて評価した。ピアソンおよびスピアマンの相関係数を求め、統計学的有意性を示すp値を太字で強調する。
患者における薬物応答の1つの測定は、治療後の病変を含む腫瘍細胞数の減少の大きさを評価する段階を伴う。以下の表4において要約されるように、RIN値の変化は、腫瘍の細胞充実度の値の様々な変化パターンに対応した。全体として、全体的な腫瘍のひろがりまたは細胞充実度が、処置中に90.94%±2.17%から50.69%±5.79%に、および処置後に39.6%±5.78%へと低下したことを考慮すると(表4を参照されたい)、患者は、化学療法に対して有意な応答を示した。以下の応答パターンを示した患者を以下のようにA群からE群に入れた:(A)腫瘍の細胞充実度の変化なし;(B)処置後に限られる腫瘍細胞充実度の強い低下;(C)処置中および処置後の腫瘍細胞充実度の劇的な低下;ならびに(D)処置中に限られる腫瘍細胞充実度の一時的な低下。データが不完全な患者をE群に入れた。患者全員を同時に評価したところ、細胞充実度の統計学的に有意な低下が化学療法中および化学療法後に観察された。
その腫瘍が化学療法に応答している患者(処置後の腫瘍の細胞充実度<10%によって決定される)を、処置後の腫瘍RIN最大値が<3.1であることによって正確に同定できるか否かを知るために、収集されたRIN値を調べた。E群を除く全ての処置前の腫瘍のコア生検材料の平均RIN値の半分を表すことから、RIN値3.1を選択した(先の表4を参照されたい)。表6(以下を参照されたい)において示されるように、処置後の腫瘍RIN値の平均値3.1以下を有する患者は、患者20人中19人において処置後の腫瘍細胞充実度<10%を有した(95%の一致)。その上、処置後の腫瘍RIN値>3.0を有した患者25人中16人は、処置後の腫瘍細胞充実度の値>10%を有する(64%の一致)。このように、特異的なカットオフ値を考慮すると、特に応答者に関して処置後のRIN値と処置後の腫瘍細胞充実度の値の間には良好な相関があった。しかし、腫瘍の細胞充実度レベルが高い(>50%)と観察されかつRIN値がゼロであった4例では、この相関に相違が起こった。乳腺腫瘍は不均一であることが知られていることから、腫瘍のいくつかの領域は高い腫瘍細胞充実度を有するが、他の領域はそうではなく、このように腫瘍RINと腫瘍細胞充実度の間の不一致が起こる可能性がある。または、これは、細胞形態を保持しているが完全に加水分解されたRNAを有する生育不能な腫瘍細胞による可能性がある。ゆえに、腫瘍RIN測定は、腫瘍RINが機能的バイオマーカーとして役立つことから、化学療法剤に対する腫瘍の応答の測定において腫瘍の細胞充実度の測定より優れている可能性がある。
a 処置後のRIN最大値の<3.1への低下は、症例20例中19例において応答者を正確に同定した(一致は95%であった);
b 3.1より上の腫瘍RIN最大値は、症例25例中16例において非応答者を正確に同定した(精度64%);
c RIN最大値と腫瘍細胞充実度との相違。
腫瘍のRNA完全性と疾患に対する実際の臨床応答との関係は、化学療法剤に対する応答のバイオマーカーとして機能するための腫瘍RNA完全性の有用性の重要な尺度であると見なされたことから、該関係を調べた。
実施例1の方法に従って、化学療法レジメンの適用の間の2回以上の異なる時点、化学療法レジメンの適用前、およびレジメンの間および/または終了後に、1つまたは複数の腫瘍を有する癌患者の腫瘍細胞からRNAを抽出する。
Claims (19)
- (a)患者に1種または複数種の化学療法剤を一定期間投与する段階;
(b)化学療法剤を投与する期間の前、間、および後に該患者の腫瘍からRNAを抽出する段階;
(c)各時点に由来する抽出されたRNAのRNA品質を測定する段階
を含む、1つまたは複数の癌性腫瘍を有する患者における1種または複数の化学療法剤に対する腫瘍の応答性を測定する方法であって、該期間にわたってRNA品質が低下すれば腫瘍が該化学療法剤に対して応答性であることが示される、方法。 - RNA品質の低下の大きさが腫瘍の応答性に比例する、請求項1記載の方法。
- RNA品質が28S rRNAおよび18S rRNAの強度値の比として測定され、該比が、抽出されたRNAのゲル電気泳動、該ゲルのエチジウムブロミド染色、および紫外光下で可視化された28S rRNAおよび18S rRNAの強度の比の算出によって得られる、請求項1または2記載の方法。
- RNA品質が、抽出されたRNAのキャピラリー電気泳動によって測定される、請求項1または2記載の方法。
- RNA品質がRNA完全性の値(RIN)として定量される、請求項4記載の方法。
- 3以下の処置後RINを有する患者が化学療法剤に対して応答性であると同定される、請求項5記載の方法。
- 3以上の処置後RINを有する患者が化学療法剤に対して非応答性であると同定される、請求項5記載の方法。
- RNAが腫瘍の1つまたは複数のコア生検材料から抽出される、請求項1〜7のいずれか一項記載の方法。
- 腫瘍の3つ以上のコア生検材料を得る、請求項8記載の方法。
- 1つまたは複数の生検材料が画像誘導手段によって得られる、請求項8または9記載の方法。
- 画像誘導手段が、コンピューター断層撮影法(CT)、x線、超音波、および磁気共鳴画像法(MRI)からなる群より選択される、請求項10記載の方法。
- 化学療法剤がアントラサイクリンおよびタキサンからなる群より選択される、請求項1〜11のいずれか一項記載の方法。
- 複数の化学療法剤が投与される、請求項1〜12のいずれか一項記載の方法。
- 化学療法剤がアントラサイクリンおよびタキサンを含む、請求項13記載の方法。
- 化学療法剤がエピルビシンおよびドセタキセルである、請求項14記載の方法。
- 化学療法剤の投与前に患者から得られた腫瘍細胞のRNA品質を測定する段階、および
1種または複数種の化学療法剤の投与後に測定された腫瘍細胞のRNA品質と比較する段階
を含む、1つまたは複数の癌性腫瘍を有する患者における1つまたは複数の化学療法剤に対する患者の応答性を測定するための腫瘍細胞のRNA品質の使用であって、
1種または複数種の化学療法剤の投与後のRNA品質が低下すれば患者が該化学療法剤に対して応答性であることが示される、使用。 - RNA品質が抽出されたRNAのキャピラリー電気泳動によって測定される、請求項16記載の使用。
- RNA品質が、RNA完全性の数値(RIN)として定量される、請求項17記載の使用。
- RNA品質が、28S rRNAおよび18S rRNAの強度値の比として定量され、該比が、抽出されたRNAのゲル電気泳動、該ゲルのエチジウムブロミド染色、および紫外光下で可視化された28S rRNAおよび18S rRNAの強度の比の算出によって得られる、請求項16記載の使用。
Applications Claiming Priority (5)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US93587407P | 2007-09-05 | 2007-09-05 | |
US60/935,874 | 2007-09-05 | ||
US93590307P | 2007-09-06 | 2007-09-06 | |
US60/935,903 | 2007-09-06 | ||
PCT/CA2008/001561 WO2009030029A1 (en) | 2007-09-05 | 2008-09-05 | Method of using tumour rna integrity to measure response to chemotherapy in cancer patients |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2010537647A true JP2010537647A (ja) | 2010-12-09 |
JP2010537647A5 JP2010537647A5 (ja) | 2011-10-20 |
JP5602018B2 JP5602018B2 (ja) | 2014-10-08 |
Family
ID=40428394
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2010523246A Active JP5602018B2 (ja) | 2007-09-05 | 2008-09-05 | 癌患者における化学療法に対する応答を測定するために腫瘍のrna完全性を用いる方法 |
Country Status (7)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US20100317001A1 (ja) |
EP (1) | EP2198296B1 (ja) |
JP (1) | JP5602018B2 (ja) |
AU (1) | AU2008295394B2 (ja) |
CA (1) | CA2698152C (ja) |
ES (1) | ES2561979T3 (ja) |
WO (1) | WO2009030029A1 (ja) |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2015519887A (ja) * | 2012-04-24 | 2015-07-16 | アールエヌエー、ダイアグノスティックス、インコーポレイテッドRna Diagnostics Inc. | Rna破壊を評価するためのアッセイ、方法および装置 |
JP2016507217A (ja) * | 2012-12-03 | 2016-03-10 | アールエヌエー、ダイアグノスティックス、インコーポレイテッドRna Diagnostics Inc. | 癌における放射線療法に対する応答をモニタリングするための方法およびキット |
Families Citing this family (10)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
SG177677A1 (en) * | 2009-07-16 | 2012-02-28 | Gen Hospital Corp | Nucleic acid analysis |
EP3461912B1 (en) | 2009-09-09 | 2022-07-13 | The General Hospital Corporation | Use of microvesicles in analyzing nucleic acid profiles |
WO2011031892A1 (en) | 2009-09-09 | 2011-03-17 | The General Hospital Corporation | Use of microvesicles in analyzing kras mutations |
WO2012031008A2 (en) | 2010-08-31 | 2012-03-08 | The General Hospital Corporation | Cancer-related biological materials in microvesicles |
US20130295574A1 (en) | 2010-11-10 | 2013-11-07 | Exosome Diagnostics, Inc. | Method for Isolation of Nucleic Acid Containing Particles and Extraction of Nucleic Acids Therefrom |
WO2013020201A1 (en) * | 2011-08-10 | 2013-02-14 | Amadeo Mark Parissenti | Diagnostic methods and kits for monitoring response to chemotherapy in ovarian cancer |
US10731222B2 (en) | 2013-10-04 | 2020-08-04 | Rna Diagnostics Inc. | RNA disruption assay for predicting survival |
WO2015134548A1 (en) * | 2014-03-05 | 2015-09-11 | Sorrento Therapeutics, Inc. | Methods for determining the maximum achievable response for a cancer treatment agent |
EP3310260A4 (en) * | 2015-06-22 | 2019-03-06 | Sunnybrook Research Institute | SYSTEMS AND METHOD FOR PREDICTING THE TUMOR RESPONSE TO CHEMOTHERAPY USING QUANTITATIVE ULTRASOUND PARAMETERS OF PRE-TREATMENT |
US11497476B2 (en) * | 2015-06-22 | 2022-11-15 | Sunnybrook Research Institute | Systems and methods for prediction of tumor treatment response to using texture derivatives computed from quantitative ultrasound parameters |
Family Cites Families (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6251247B1 (en) * | 1998-04-01 | 2001-06-26 | Hitachi Chemical Co., Ltd. | Detection of degradation of RNA using microchannel electrophoresis |
ES2311745T3 (es) * | 2002-12-31 | 2009-02-16 | Pfizer Products Inc. | Bioensayo de arn. |
ATE550440T1 (de) * | 2004-11-05 | 2012-04-15 | Genomic Health Inc | Molekulare indikatoren für brustkrebsprognose und vorhersage des ansprechens auf eine behandlung |
EP1772522A1 (en) * | 2005-10-04 | 2007-04-11 | Nederlandse Organisatie Voor Toegepast-Natuurwetenschappelijk Onderzoek Tno | Control of preservation by biomarkers |
CA2742324A1 (en) * | 2008-10-30 | 2010-06-03 | Caris Life Sciences Luxembourg Holdings, S.A.R.L. | Methods for assessing rna patterns |
-
2008
- 2008-09-05 ES ES08783436.2T patent/ES2561979T3/es active Active
- 2008-09-05 AU AU2008295394A patent/AU2008295394B2/en active Active
- 2008-09-05 EP EP08783436.2A patent/EP2198296B1/en active Active
- 2008-09-05 WO PCT/CA2008/001561 patent/WO2009030029A1/en active Application Filing
- 2008-09-05 JP JP2010523246A patent/JP5602018B2/ja active Active
- 2008-09-05 US US12/676,815 patent/US20100317001A1/en not_active Abandoned
- 2008-09-05 CA CA2698152A patent/CA2698152C/en active Active
-
2015
- 2015-11-24 US US14/951,049 patent/US20160077051A1/en not_active Abandoned
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
JPN6013029708; 'Relationship of tumor RNA integrity to clinicopathologic parameters associated with epirubicin/docet' 2007年、[2012年11月6日検索]、インターネット<URL: http://www.asco.org/ASCOv2/Meetings/A * |
JPN6013029711; J. Exp. Clin. Cancer Res., 2001, 20(1), 63-69 * |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2015519887A (ja) * | 2012-04-24 | 2015-07-16 | アールエヌエー、ダイアグノスティックス、インコーポレイテッドRna Diagnostics Inc. | Rna破壊を評価するためのアッセイ、方法および装置 |
JP2016507217A (ja) * | 2012-12-03 | 2016-03-10 | アールエヌエー、ダイアグノスティックス、インコーポレイテッドRna Diagnostics Inc. | 癌における放射線療法に対する応答をモニタリングするための方法およびキット |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
EP2198296A4 (en) | 2011-04-13 |
US20100317001A1 (en) | 2010-12-16 |
ES2561979T3 (es) | 2016-03-01 |
EP2198296B1 (en) | 2015-11-11 |
US20160077051A1 (en) | 2016-03-17 |
AU2008295394B2 (en) | 2014-04-24 |
CA2698152A1 (en) | 2009-03-12 |
JP5602018B2 (ja) | 2014-10-08 |
EP2198296A1 (en) | 2010-06-23 |
WO2009030029A1 (en) | 2009-03-12 |
CA2698152C (en) | 2018-08-14 |
AU2008295394A1 (en) | 2009-03-12 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP5602018B2 (ja) | 癌患者における化学療法に対する応答を測定するために腫瘍のrna完全性を用いる方法 | |
McNamara et al. | Androgen receptor in triple negative breast cancer | |
Tewes et al. | Molecular profiling and predictive value of circulating tumor cells in patients with metastatic breast cancer: an option for monitoring response to breast cancer related therapies | |
Kim et al. | ERCC1 predicting chemoradiation resistance and poor outcome in oesophageal cancer | |
Rodrigues-Ferreira et al. | Predictive biomarkers for personalized medicine in breast cancer | |
KR102067327B1 (ko) | 최적의 암 치료를 위한 Her2 단백질 정량 | |
Beasley et al. | Future perspectives of uveal melanoma blood based biomarkers | |
Aka et al. | 17beta-hydroxysteroid dehydrogenase type 1 modulates breast cancer protein profile and impacts cell migration | |
JP2011125339A (ja) | 転移のための新規な因子及びその使用 | |
JP2019534321A5 (ja) | ||
EP3186638A1 (en) | Serine proteases as biomarkers for ovarian cancer | |
JP2022025113A (ja) | 抗pd-1抗体若しくは抗pd-l1抗体療法の奏効性を予測する方法、がんの悪性度を評価する方法、及び抗pd-1抗体若しくは抗pd-l1抗体療法の奏効性を上昇させる方法 | |
Liang et al. | A method establishment and comparison of in vivo lung cancer model development platforms for evaluation of tumour metabolism and pharmaceutical efficacy | |
EP3211090A1 (en) | Method for predicting sensitivity to vascular endothelial growth factor receptor inhibitor | |
Salah et al. | Regulation of human protease-activated receptor 1 (hPar1) gene expression in breast cancer by estrogen | |
JP7122016B2 (ja) | グリオーマの予後、遠隔部再発リスク及び浸潤を判定する方法及びキット並びにグリオーマを処置するための医薬組成物 | |
Kanjer et al. | Treatment response to preoperative anthracycline-based chemotherapy in locally advanced breast cancer: the relevance of proliferation and apoptosis rates | |
WO2007058965A9 (en) | P66-shc as predictive marker in cancer treatment | |
Mamoulakis et al. | Prostate cancer biomarkers | |
WO2019067636A1 (en) | ANALYSIS OF PROTEIN EXPRESSION FOR THE PROGNOSIS AND TREATMENT OF BREAST CANCER | |
CN110678203A (zh) | 胃癌治疗效果的预测 | |
Frassoldati et al. | Predictive value of biologic parameters for primary chemotherapy in operable breast cancer | |
Lu et al. | Functional analysis of B7-H3 in colonic carcinoma cells | |
Patel et al. | Association of Breast Cancer Subtypes and Clinicopathological Factors with Axillary Lymph Node Positivity Amongst Women with Breast Cancer in Rajasthan: An Observational Analytical Study | |
Grupińska et al. | The evaluation of the inflammatory status and systemic antioxidant-oxidant balance of women with breast cancer during adjuvant chemotherapy |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20110901 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20110901 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20130619 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20130919 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20130927 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20131218 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20140723 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20140819 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 5602018 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |