JP2009503498A - 固相緩衝剤を使用した等電点に基づくタンパク質の分離 - Google Patents
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Abstract
Description
細胞、組織、または流体などの所定の生物学的環境内で発現されるひとそろいのタンパク質の分析であるプロテオミクスは、生物医学研究の主要な焦点になっている。150種を超えるゲノムがカタログ化されているが、生体系の疾患および正常動作状態間の違いを真に機能的に理解するには、遺伝子と発現タンパク質との相関が必要である。多くの遺伝子は、例えばいわゆるスプライセオソームによる処理、いわゆるRNA干渉(「RNAi」)による制御、または翻訳後の変性を通じて間接的に制御されるので、遺伝子転写分析はこの相関を解明できない。したがって、遺伝子−生成物関係を明らかにするためには、タンパク質のカタログを最初に導き出さなくてはならない。
したがって、一の態様では、固体緩衝剤およびイオン交換樹脂を含んでなるクロマトグラフィー材料が提供される。いくつかの実施形態では、固体緩衝剤は異なるpKのモノマーから得られた架橋ポリマーを含んでなる。その他の態様では、固体緩衝剤およびイオン交換樹脂は、同一または異なる固体担体に付着できる。一例では、固体担体は粒子である。別の例では、固体緩衝剤のための固体担体は、実質的に表面から内側に延びる複数の腔を有する多孔性粒子を含む。また、固体担体は、膜またはモノリスを含むことができる。その他の実施形態では、固体緩衝剤およびイオン交換樹脂が固体担体に付着していない。
本発明は、操作者により選択されるpHで稼働するイオン交換クロマトグラフィー材料を提供する。クロマトグラフィー材料は、それを入れた溶液のpHを安定化する、イオン交換樹脂と固体緩衝剤との組み合わせを含む。イオン交換材料は、例えばpH3〜pH11の一般にクロマトグラフィーで使用されるpH範囲内で荷電される。
本発明のクロマトグラフィー材料は、イオン交換樹脂と組み合わさった固体緩衝剤を含む。好ましい実施形態では、これらのそれぞれが固相に付着する。特に、本発明は、イオン交換樹脂と混合された固体緩衝剤ビーズまたは粒子を含む組成物を考察する。別の実施形態では、固体緩衝剤およびイオン交換樹脂は、固相に付着していない。別の実施形態では、緩衝およびイオン交換特性は同一粒子内で結びついている。
用語「固体緩衝剤」とは、それぞれが異なるpKを有する、イオン化できるモノマーから得られる両性、架橋、不溶性の高分子を意味する。固体緩衝剤は、希釈電解質の水溶液に所定のpHを与え、それは酸性またはアルカリ性分子が添加されるとpHを維持する。これらの物理化学的特性に加えて、この文献で有用な固体緩衝剤は小孔を含み、材料に例えば5000Daよりも低い低排除限界を与える。
Rは特徴的なpIを提供する基を含む)に従うアクリルアミド誘導体である。例えば、米国特許第4,971,670号明細書を参照されたい。この特性決定は原則として多くの分子を包含するが、アマーシャム(Amersham)は、特に等電位ゲルおよびポリマーを作り出すのに適したイモビライン(IMMOBILINE)(登録商標)の下に市販される分子を製造する。イモビライン(IMMOBILINE)(登録商標)コレクションの分子としては、括弧内に示すpIを有する以下が含まれる。N−アクリロイルグリシン(pK3.6)、4−アクリルアミド酪酸(pK4.6)、2−モルホリノエチル−アクリルアミド(pK6.2)、3−モルホリノプロピルアクリルアミド(pK7.0)、N,N−ジメチルアミノ−エチルアクリルアミド(pK8.5)、およびN,N−ジメチルアミノプロピルアクリルアミド(pK9.3)(ひとまとめにして「イモビライン」)。あらゆるイモビラインをモノマーとして組み合わせることができ、アクリルアミドおよびN,N’−メチレンビスアクリルアミドまたは別の適切な架橋剤と共重合させて、所望のpI特異的ポリマーを生成できる。アクリルアミドは、N−イソプロピルアクリルアミド、メチルアクリルアミド、メチロールアクリルアミドジメチルアクリルアミド、ジエチルアクリルアミド、トリス(ヒドロキシメチル)メチルアクリルアミドなどのその他の非イオン性アクリルアミド誘導体で置換できる。
用語「固体担体」とは、そこにイオン交換ポリマーまたは固体緩衝剤が付着または装入されて、低濃度下でのポリマー崩壊を防止できる固体多孔性材料を意味する。
イオン交換クロマトグラフィーは、それらの正味電荷に基づいて化合物を分離する。負にまたは正に帯電した官能基は、固体担体マトリックスに共有結合して、それぞれカチオンまたはアニオン交換体のどちらかを生じる。荷電した化合物が反対に荷電した交換体に適用されると、それは吸着される一方、中性のまたは同一電荷を有する化合物は、カラムのボイド容量内に溶出する。荷電化合物の結合は可逆的であり、吸着された化合物は一般に、塩またはpH勾配により溶出される。
混合物からタンパク質をそれらのpIに基づいて分離するのに有用なクロマトグラフィー材料は、固体緩衝剤とイオン交換樹脂とを組み合わせて製造できる。一の実施形態では、それぞれ異なる固体担体に付着する固体緩衝剤とイオン交換樹脂とを組み合わせて、混合物を形成する。一の態様では混合物は混合粒子床である。
50mLの水中にpK8.5を有する10mMのN,N−ジメチル−アミノプロピル−アクリルアミドを溶解して(これは1420mgの遊離塩基である)、pH8.5の固相緩衝剤を調製できる。pK3.1のモノマーアクリルアミドグリコール酸(遊離酸)の緩慢な添加によって、溶液をpH8.5に滴定する。次に30gのアクリルアミドおよび2gのメチレン−ビス−アクリルアミドを溶液に添加する。次に、溶液の容積を100mLにする。この最終溶液に、例えば過硫酸アンモニウムおよびTEMEDなどの重合触媒を添加する。次に、溶液を使用して、例えば多孔性粒子を含浸させる。ひとたびヒドロゲルが重合したら材料粒子の孔を洗浄し、副産物および過剰な試薬を除去する。固相緩衝剤は20%エタノールの存在下で保存できる。
1Lの蒸留水に100mMのN−アクリロイルグリシン(pK4.6)を溶解して、pH4.6の固相緩衝剤を調製できる。次に、N,N,N−トリエチルアミノエチルアクリルアミドの濃縮溶液(50%水溶液)を添加して、溶液をpH4.6に滴定する。得られた溶液に200gのアクリルアミドおよび10gのN,N’−メチレン−ビス−アクリルアミドを添加する。混合物を撹拌して完全に可溶化する。N,N,N’,N’−テトラメチルエチレンジアミンおよび過硫酸アンモニウムから構成される触媒作用系を使用直前に溶液に添加する。38mLの最終溶液を100mLの約75μMの多孔性ジルコニアビーズ(100gあたり38mLの孔容量)に添加して混合し、溶液をミネラルビーズの孔容量内に完全に吸収させる。次に窒素導入を交互に繰り返して、含浸ビーズを真空下で3回脱気する。次に、モノマーの重合まで、混合物を室温において窒素存在下で保存する。得られた固体緩衝剤を水、同一pHの緩衝剤(例えばpH4.6の酢酸緩衝剤)、最後に水で徹底的に洗浄する。次に、固体緩衝剤は、イオン交換体の存在下で使用する準備ができる。
1Lの蒸留水に100mMのN,N−ジメチルアミノプロピルアクリルアミド(pK9.3)を溶解して、pH9.3の固体緩衝剤を調製できる。次に、アクリル酸の濃縮溶液(50%水溶液)を添加して、溶液をpH9.3に滴定する。得られた溶液に200gのジメチルアクリルアミドおよび10gのN,N’−メチレン−ビス−アクリルアミドを添加する。得られた混合物を撹拌して完全に可溶化する。N,N,N’,N’−テトラメチルエチレンジアミンおよび過硫酸アンモニウムから構成される触媒作用系を使用直前に添加する。38mLの最終溶液を100mLの約75μMの多孔性ジルコニアビーズ(100gあたり38mLの孔容量)に添加して混合し、溶液をビーズの孔容量内に完全に吸収させる。次に窒素導入を交互に繰り返して、含浸ビーズを真空下で3回脱気する。次にモノマーの重合まで、混合物を室温において窒素存在下で保存する。得られた物質を水で、同一pHの緩衝剤(例えばpH9.のトリス−HCl緩衝剤)で、そして再度水で徹底的に洗浄する。次に固体緩衝剤は、イオン交換体の存在下で使用する準備ができる。
1Lの蒸留水に50mMの3−モルホリノプロピルアクリルアミド(pK7.0)および50mMのN,N−ジメチルアミノエチルアクリルアミド(pK8.5)を溶解して、pH9.3の固体緩衝剤を調製できる。次に、2−アクリルアミド−2−メチルプロパンスルホン酸の濃縮溶液(50%水溶液)を添加して、溶液をpH7.7に滴定する。得られた溶液に200gのアクリルアミドおよび10gのN,N’−メチレン−ビス−アクリルアミドを添加して、得られた混合物を撹拌して完全に可溶化する。N,N,N’,N’−テトラメチルエチレンジアミンおよび過硫酸アンモニウムから構成される触媒作用系を使用直前に添加する。38mLの最終溶液を100mLの約75μMの多孔性ジルコニアビーズ(100gあたり38mLの孔容量)に添加して混合し、溶液をビーズの孔容量内に完全に吸収させる。次に、窒素導入を交互に繰り返して、含浸ビーズを真空下で3回脱気する。次に、モノマーの重合まで、混合物を室温において窒素存在下で保存する。得られた物質を水で、同一pHの緩衝剤(例えばpH7.7のモルホリン−HCl緩衝剤)で、そして再度水で徹底的に洗浄する。次に、固体緩衝剤は、イオン交換体の存在下で使用する準備ができる。
1Lの蒸留水に150mMのN−アクリロイルグリシン(pK4.6)および10mMのN,N’−メチレン−ビス−アクリルアミドを溶解して、pH4.6の固体緩衝剤を調製できる。次にN,N,N−トリエチルアミノエチルアクリルアミドの濃縮溶液(50%水溶液)を添加して、溶液をpH4.6に滴定する。N,N,N’,N’−テトラメチルエチレンジアミンおよび過硫酸アンモニウムから構成される触媒作用系を使用直前に添加する。
1Lの蒸留水に150mMの3−モルホリノプロピルアクリルアミド(pK7.0)を溶解して、pH6.5の固体緩衝剤を調製できる。次に、N−アクリロイルグリシン(pK3.6)の濃縮溶液(50%水溶液)を添加して、溶液をpH6.5に滴定する。得られた溶液に400gのアクリルアミドおよび30gのN,N’−メチレン−ビス−アクリルアミドを添加して、得られた混合物を撹拌して完全に可溶化する。N,N,N’,N’−テトラメチルエチレンジアミンおよび過硫酸アンモニウムから構成される触媒作用系を使用直前に添加する。この溶液100mLを3%のアラセルC(油溶性乳化剤)を含有する500mLのパラフィン油に分散する。懸濁液を撹拌しながら65℃で3時間保持して、モノマーを共重合させる。重合中に形成されたヒドロゲルビーズを濾過して収集し、非極性溶剤で徹底的に洗浄して痕跡量のパラフィン油を排除する。次に、ビーズを水、同一pHの緩衝剤、最後に水で徹底的に洗浄する。次に、固体緩衝剤は、イオン交換体の存在下で使用する準備ができる。
1Lの蒸留水に150mMのN,N,N−トリエチル−アミノエチル−アクリルアミド(pK12)を溶解して、pH6.5の固体緩衝剤を調製できる。次に、アクリルアミドグリコール酸(pK3.1)の濃縮溶液(50%水溶液)を添加して、溶液をpH9.0に滴定する。得られた溶液に300gのジメチル−アクリルアミドおよび20gのN,N’−メチレン−ビス−アクリルアミドを添加して、得られた混合物を撹拌して完全に可溶化する。N,N,N’,N’−テトラメチルエチレンジアミンおよび過硫酸アンモニウムから構成される触媒作用系を使用直前に添加する。次に、溶液を窒素下で65℃の温浴に入れる。5時間後、完全なヒドロゲルブロック下で重合が完結する。ヒドロゲルを小片に切断し、磨砕して約100μmの粒子を得る。次に、微粒子生成物を水、次に同一pHの緩衝剤、最後に水で徹底的に洗浄する。次に、固体緩衝剤は、イオン交換体の存在下で使用する準備ができる。
一連の3つのクロマトグラフィー材料を一連の(前のカラム出口から続くカラム入り口に)相互連接する区分カラムにアセンブルする。各クロマトグラフィー材料は同一アニオン交換体(QハイパーZ吸着剤)を含むが、それぞれ異なるpH、特に5.4、7.7、および9.5の異なる固体緩衝剤を含む。クロマトグラフィーの区分カラムはpHが増大する順に配列され、すなわち第1の区分カラムはpH5.4を有し、最後の吸着材はpH9.5を有する。
一連の3つのクロマトグラフィー材料を一連の(前のカラム出口から続くカラム入り口に)相互連接する区分カラムにアセンブルする。各クロマトグラフィー材料は同一カチオン交換体を含むが、それぞれ異なるpH、具体的には5.4、7.7、および9.5の異なる固体緩衝剤を含む。クロマトグラフィーの区分カラムはpHが減少する順に配列され、すなわち第1の区分カラムはpH9.5を有し、最後の吸着材はpH5.4を有する。
Claims (19)
- (A)固体緩衝剤と、(B)イオン交換樹脂と、を含むクロマトグラフィー材料。
- 前記固体緩衝剤および前記イオン交換樹脂が、異なる固体担体に付着する、請求項1に記載のクロマトグラフィー材料。
- 前記固体緩衝剤および前記イオン交換樹脂が、固体担体に付着していない、請求項1に記載のクロマトグラフィー材料。
- 前記固体緩衝剤および前記イオン交換樹脂が、単一固体担体に付着する、請求項1に記載のクロマトグラフィー材料。
- 前記固体担体が粒子である、請求項2に記載のクロマトグラフィー材料。
- 前記固体緩衝剤が5,000Daよりも低い排除限界を有して、約50μmを超える粒子に付着する、請求項2に記載のクロマトグラフィー材料。
- 前記固体緩衝剤が、3,000Daの排除限界を有して、約150μmの粒子に付着する、請求項2に記載のクロマトグラフィー材料。
- 前記固体担体が、粒子、膜またはモノリスである、請求項2に記載のクロマトグラフィー材料。
- 前記固体緩衝剤が、異なるpKのモノマーから得られた架橋ポリマーを含む、請求項1に記載のクロマトグラフィー材料。
- 前記固相緩衝剤の前記固体担体が、表面から内側に延びる複数の空孔を有する実質的に多孔性の粒子を含む、請求項1に記載のクロマトグラフィー材料。
- 前記イオン交換樹脂がアニオン交換体である、請求項1に記載のクロマトグラフィー材料。
- 前記イオン交換樹脂がカチオン交換体である、請求項1に記載のクロマトグラフィー材料。
- 一連の容器を含み装置であって、系列内の第1の容器が流体入り口を含み、系列内の最後の容器が流体出口を含み、系列内の各容器が系列内の次の容器と流体連通し、系列内の各容器が請求項1に記載の異なるクロマトグラフィー材料を含み、容器がクロマトグラフィー材料のpHに従って増大するか、または低下する順に配列される、装置。
- 前記容器が複数ウェルフロープレートのウェルであり、系列内の各容器が脱着式導管によって連接する、請求項13に記載の装置。
- 前記容器が、積み重ねるとフローカラムを形成する積み重ね可能なカートリッジを含む、請求項13に記載の装置。
- 前記固体緩衝剤がpH約11以下の最高pHを有し、前記固体緩衝剤がpH約3以上の最低pHを有する、請求項13に記載の装置。
- 前記イオン交換樹脂がアニオン交換体であり、前記容器がクロマトグラフィー材料のpHに従って増大する順に配列される、請求項13に記載の装置。
- 延期イオン交換樹脂がカチオン交換体であり、前記容器がクロマトグラフィー材料のpHに従って低下する順に配列される、請求項13に記載の装置。
- (A)2つ以上のタンパク質の混合物を一連のクロマトグラフィー材料に適用するステップであって、各クロマトグラフィー材料が固体緩衝剤およびイオン交換樹脂を含み、クロマトグラフィー材料がクロマトグラフィー材料のpHに従って増大または低下する順に配列され、
(B)系列内の最後のクロマトグラフィー材料から通過物を収集するステップと、次に
(C)各クロマトグラフィー材料からタンパク質を別々に脱離させるステップと、を含む、等電点に基づいてタンパク質を分離する方法。
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