JP2008547005A - マススペクトルを用いた化学的に架橋された細胞サンプルの分類方法 - Google Patents
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Abstract
Description
マススペクトルが得られた後、既知のデータのようなデータセットが形成される。データセットには、生物学的サンプルのクラスセットのマススペクトルから得られたデータが含まれる。データセットを形成するマススペクトルは、なまの、未処理のデータであり得る。例えば、マススペクトルからの、同定された質量値におけるなまのシグナル強度値は、データセットを形成するために使用できる。別の例では、マススペクトルからのなまのシグナルパターンがデータセットを形成するために使用できる。
デジタルコンピュータによって執行できるコードによって実施される分類プロセスはデータセットを処理できる。コードはデジタルコンピュータで執行されることができ、分類モデルを生成できる。コードは、あらゆる適切なコンピュータ可読媒体に格納されてよい。コンピュータ可読媒体の例には、磁気の、電子の、または光学の、ディスク、或いはテープ、或いはステイック、或いはチップ、などが挙げられる。またコードは、C、C++などを含む好適なコンピュータプログラミング言語で記述できる。
本発明の幾つかの実施形態は、コンピュータ可読媒体を備えるシステムに関する。コンピュータ可読媒体は、デジタルコンピュータによって執行される予定の命令を格納するために使用できる。
一態様において、サンプルは組織のサンプルである。組織サンプルは化学的に固定されたパラフィン包埋の組織、そして特にホルマリン固定されたパラフィン包埋組織から得ることができる。本発明に従った化学的に固定されたパラフィン包埋組織サンプルは、典型的には、組織および/または細胞に由来する1つ以上の切片を含む。好ましくは各サンプルは、少なくとも1つの既知の生物学的特徴(例えば、組織タイプ、または細胞タイプまたは提供患者等)を有する。
一態様において、本発明に従って分析されるサンプルを使用して、癌特異マーカーまたは癌特異抗原の発現または形成をアッセイする。本明細書で用いられる場合、「癌特異マーカーまたは腫瘍特異抗原」は、癌細胞および腫瘍細胞でそれぞれ優先的に発現し、かつ、癌/腫瘍でない成人個体の細胞中で発現しないかまたはわずかにしか発現しない分析物である。
組織マイクロアレイは、シアトルのLifeSpan Bioscienceから購入した。購入した特殊なアレイは、多数のヒト資源から採取した多発癌アレイであった。
1.抗原回復は、デンマークのDakoCytomationより入手可能なターゲット回収溶液(Target Retrieval Solution)を使用して実行される。それは、pH6.1を有した(特定されていない量のEDTAで変性された)変性クエン酸緩衝液である。
ix.これで、スライドは分析に使用できる。
MADLI装置にはスライドは大き過ぎるので、スライドはハンドカットされ、ミルをかけたへこみ区域を有して一般のMADLIプレートに配置可能にされた。組織学的スライドにトリプシン溶液でスポット付けし、4.5時間消化させた。トリプシン消化の後で、残った表面液体および組織学的処理部位をMADLI−TOFによって分析した。加えて、トリプシン処理のない部位をMADLIを用いて分析した。
消化のポジティブコントロールを、ウマのシトクロムCを使用して実行した。10.0gのシトクロムCを重炭酸アンモニウム緩衝液(ABC)中に溶解含有するサンプルの中に、2.0μgのトリプシン分注液を添加した。このサンプルを37℃で4.5時間消化させた。
1)100mMのNH4CO3、pH8.1(ABC)を用いて0.5μg/μLのトリプシンのストックを調製した。
3)各々のスポットから表面上の液体をピペットで取り出し、続いてMALDIプレート上にスポット付けした。各々の組織位置を3μLのミリ−Q H2O ですすぎ洗いし、続いて対応したMALDIプレートのウェルにスポット付けした。
Paxlt画像分析ソフトウエアを備えたLeica顕微鏡を用いて、H&E染色の切片を試験した。各々の腫瘍に対して100xでとった顕微鏡写真の画像ファイルを作成した。乳癌サンプルA1・A1およびA5・E1の代表的な100x顕微鏡写真を以下に示す。
Claims (40)
- サンプルが有機固体材料に包埋される、化学的に架橋された分析物を含む細胞サンプルを提供するステップと、
前記架橋された分析物の前記化学架橋の少なくとも一部を逆転して、脱架橋された分析物を形成するステップと、
前記脱架橋された分析物を含有する前記サンプルの少なくとも一部のマススペクトルを作成するステップと、
前記マススペクトルをデジタルコンピュータを用いて解析するステップであって、
a)複数の細胞サンプルから得られたマススペクトルデータセットを前記デジタルコンピュータに投入するステップであって、各々のサンプルは2つ以上のクラスより構成されるクラスセットに属するクラスであるか、またはクラスに帰属される予定のものであり、各々のクラスは異なった生物学的状況により特徴付けられ、かつ各々のマススペクトルは飛行時間、質量対電荷比、若しくは飛行時間または質量対電荷比から導出された値、の関数であるシグナル強度を表すデータを含むこと、そして
b)前記クラスセット内のクラス同士の間を識別する分類モデルを形成するステップであって、前記モデルを形成することは、分類処理および回帰ツリー処理である再帰分割処理を含む分類処理を実施するコードを執行することによって前記データセットを解析するステップを含むこと、を含んでなる前記マススペクトルを解析するステップと、を含んでなる、分析物を分析する方法。 - 前記マススペクトルは、MALDIスペクトル、表面増強レーザ脱離/イオン化スペクトル、およびエレクトロスプレイイオン化スペクトルからなる群から選択される、請求項1に記載の方法。
- 前記サンプルは、化学的に架橋されていない分析物を更に含み、かつ前記分析方法は脱架橋された分析物および化学的に架橋されていない分析物の両方を分析するステップを含んでなる、請求項1に記載の方法。
- 前記化学的に架橋されていない分析物は、医薬品、代謝産物、またはビタミンを含んでなる、請求項3に記載の方法。
- 前記細胞サンプルは、化学的に固定された組織切片を含んでなる、請求項1に記載の方法。
- 前記化学的に固定された組織切片は、ホルマリン固定された組織切片である、請求項5に記載の方法。
- 前記有機固体材料は、有機ポリマー材料である、請求項1に記載の方法。
- 前記有機ポリマー材料は、メタクリルメタアクリレート包埋媒質を含んでなる、請求項7に記載の方法。
- 前記有機固体がパラフィンである、請求項1に記載の方法。
- 前記架橋を逆転するステップに先立って、前記細胞サンプルを前記固体有機材料から分離するステップを更に含んでなる、請求項1に記載の方法。
- 前記脱架橋された分析物は、1つ以上の蛋白質、ペプチド、アミノ酸、脂肪酸、核酸、炭水化物、ホルモン、ステロイド、脂質、細菌、およびウイルスからなる群から選択される、請求項1に記載の方法。
- 前記架橋された分析物は、1つ以上の架橋された蛋白質、DNA、RNA、炭水化物、脂質、またはそれらの混合物を含んでなる、請求項1に記載の方法。
- 前記化学架橋の少なくとも一部を逆転するステップは、前記化学的な架橋を開裂し、かつ、架橋に先立つ前記分析物において自然発生的結合またはその他の結合を実質的に開裂しないステップを含んでなる、請求項1に記載の方法。
- 前記化学架橋の少なくとも一部を逆転するステップは、水またはある範囲のpH値の緩衝液の存在下でエネルギーをかけて実施される、請求項13に記載の方法。
- かけられる前記エネルギーは熱である、請求項14に記載の方法。
- かけられる前記エネルギーは放射線である、請求項14に記載の方法。
- 前記脱架橋された分析物中の結合の少なくとも一部を開裂して分析物断片を形成するステップを更に含んでなり、前記脱架橋された分析物のマススペクトルを作成するステップは前記分析物断片のマススペクトルを作成するステップを含んでなる、請求項1に記載の方法。
- 前記脱架橋された分析物中の少なくとも一部を開裂するステップは、前記脱架橋された分析物と酵素または化学試薬とを接触させるステップを含んでなる、請求項17に記載の方法。
- 前記脱架橋された分析物の少なくとも一部を開裂するステップは、前記脱架橋された分析物と酵素とを接触させるステップを含んでなる、請求項18に記載の方法。
- 前記酵素は、トリプシン、ペプシン、プロナーゼ、キモトリプシン、およびそれらの組み合わせから成る群から選択される、請求項19に記載の方法。
- 前記脱架橋された分析物は蛋白質を含んでなり、前記酵素はトリプシンを含んでなり、かつ前記脱架橋された分析物を分析するステップは、蛋白質断片を含んでなる溶出液を分析するステップを含んでなる、請求項20に記載の方法。
- 前記細胞サンプルは植物または動物由来である、請求項1に記載の方法。
- 前記細胞サンプルはヒト由来である、請求項22に記載の方法。
- 前記細胞サンプルは疾患を有する個体由来である、請求項22に記載の方法。
- 前記疾患は進行性疾患であり、前記細胞サンプルは前記疾患の進行の異なる段階を表す複数の組織切片を含んでなる、請求項24に記載の方法。
- 前記細胞サンプルは、疾患モデルである非ヒト動物由来である、請求項22に記載の方法。
- 前記細胞サンプルは、外来性核酸をその中に有する少なくとも1つの細胞を含んでなる、請求項22に記載の方法。
- 前記異なった生物学的状況は、正常状態および病的状態を含んでなる、請求項1に記載の方法。
- 前記異なった生物学的状況は、非疾病、軽度の癌および重度の癌を含んでなる、請求項1に記載の方法。
- 前記データセットは既知のデータセットであり、かつ、各々のサンプルは前記データセットが前記デジタルコンピュータに投入される前に前記クラスの一つに帰属されてなる、請求項1に記載の方法。
- 前記分類モデルを形成するステップは、前記分類モデルを形成するために事前存在のマーカーデータを利用するステップを含んでなる、請求項1に記載の方法。
- 前記データセットを形成するステップは、
各々のマススペクトルは質量対電荷比の関数としてシグナル強度を表すデータを含んでなる、前記複数のマススペクトルのシグナルを検出するステップと、
類似した質量対電荷比を有する前記複数のシグナルをシグナルクラスタにクラスタ化するステップと、
所定値を超えるシグナル強度を有する少なくとも所定数のシグナルを有するシグナルクラスタを選択するステップと、
前記選択されたシグナルクラスタに対応する前記質量対電荷比を同定するステップと、
前記同定された質量対電荷比におけるシグナル強度を使用して前記データセットを形成するステップと、を含んでなる、請求項1に記載の方法。 - 前記分類処理は、2値再帰分割処理である、請求項1に記載の方法。
- 請求項1に記載の方法であって、
c)1つ以上の特徴が前記異なった生物学的状況同士の間を識別するか否かについて決定することを前記分類モデルに問い合わせするステップと、を更に含んでなる、前記方法。 - 請求項1に記載の方法であって、
c)より大きな複数のサンプルを使用してa)およびb)を繰り返すステップと、を更に含んでなる、前記方法。 - 前記各々のマススペクトルは、質量対電荷比の関数として、または質量対電荷比から導出された値の関数として、シグナル強度を表すデータを含んでなる、請求項1に記載の方法。
- デジタルコンピュータを使用して未知のサンプルを生物学的状況によって特徴付けられるクラスに分類する方法であって、
a)前記未知のサンプルのマススペクトルから得られたデータをデジタルコンピュータに投入するステップと、
b)前記請求項1の方法によって形成された前記分類モデルを使用して前記マススペクトルデータを処理し、生物学的状況によって特徴付けられるクラスに前記未知サンプルを分類するステップと、を含んでなる、前記クラス分類方法。 - 前記異なった生物学的状況は、非疾患、軽度の癌および重度の癌を含んでなる、請求項37に記載の方法。
- a)未知サンプルのマススペクトルから得られたデータをデジタルコンピュータに投入するためのコードと、
b)前記請求項1の方法によって形成された前記分類モデルを使用して前記マススペクトルデータを処理し、生物学的状況によって特徴付けられるクラスに前記未知サンプルを分類するためのコードと、を含んでなる、コンピュータ可読媒体。 - 気相イオン分光計と、
前記気相イオン分光計から得られたデータを処理するよう適合されたデジタルコンピュータと、
前記デジタルコンピュータと関連付して作動する、請求項39の前記コンピュータ可読媒体と、を含んでなるシステム。
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Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2012185170A (ja) * | 2005-06-16 | 2012-09-27 | Three M Innovative Properties Co | マススペクトルを用いた化学的に架橋された細胞サンプルの分類方法 |
CN112444479A (zh) * | 2021-02-01 | 2021-03-05 | 宁波大学 | 基于并行处理技术的单细胞质谱分析系统及方法 |
Families Citing this family (10)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US8012693B2 (en) | 2003-12-16 | 2011-09-06 | 3M Innovative Properties Company | Analysis of chemically crosslinked cellular samples |
KR101065571B1 (ko) * | 2006-09-28 | 2011-09-19 | 가부시키가이샤 시마즈세이사쿠쇼 | 파라핀 포매 표본의 탈파라핀법 및 파라핀 포매 표본의 해석법 |
JP2011506971A (ja) * | 2007-12-13 | 2011-03-03 | スリーエム イノベイティブ プロパティズ カンパニー | 創傷試料を解析する方法 |
EP2073011A1 (en) * | 2007-12-20 | 2009-06-24 | Max-Planck-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. | Means and methods of processing biological samples |
EP3832658A1 (en) * | 2011-08-03 | 2021-06-09 | QIAGEN Redwood City, Inc. | Methods and systems for biological data analysis |
ES2861600T3 (es) | 2014-04-04 | 2021-10-06 | Mayo Found Medical Education & Res | Isotipaje de inmunoglobulinas usando masa molecular precisa |
US10690676B2 (en) | 2014-07-29 | 2020-06-23 | Mayo Roundation for Medical Education and Research | Quantifying monoclonal antibody therapeutics by LC-MS/MS |
JP6968058B2 (ja) | 2015-09-24 | 2021-11-17 | メイヨ・ファウンデーション・フォー・メディカル・エデュケーション・アンド・リサーチ | 質量分析法による免疫グロブリン遊離軽鎖の同定 |
AU2017325022B2 (en) | 2016-09-07 | 2022-10-13 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Identification and monitoring of cleaved immunoglobulins by molecular mass |
WO2019055634A1 (en) | 2017-09-13 | 2019-03-21 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | IDENTIFICATION AND MONITORING OF A MACROPHAGE APOPTOSIS INHIBITOR |
Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2004080579A2 (en) * | 2003-03-10 | 2004-09-23 | Expression Pathology, Inc. | Liquid tissue preparation from histopatologically processed biological samples, tissues and cells |
WO2004088325A2 (en) * | 2003-03-26 | 2004-10-14 | President And Fellows Of Harvard College | Determination of proteins and/or other molecules using mass spectroscopy |
JP2004536276A (ja) * | 2000-11-16 | 2004-12-02 | シファーゲン バイオシステムズ, インコーポレイテッド | 質量スペクトルを分析する方法 |
Family Cites Families (42)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4304705A (en) * | 1980-01-02 | 1981-12-08 | Minnesota Mining And Manufacturing Company | Radiation-curable polymers containing pendant unsaturated peptide groups derived from azlactone polymers |
US4507233A (en) * | 1981-04-22 | 1985-03-26 | Oriental Yeast Co., Ltd. | Colored molecular weight marker |
US4545831A (en) * | 1982-09-13 | 1985-10-08 | The Mount Sinai School Of Medicine | Method for transferring a thin tissue section |
US4485236A (en) * | 1982-09-27 | 1984-11-27 | Minnesota Mining And Manufacturing Company | Azlactone-functional compounds |
US5258041A (en) * | 1982-09-29 | 1993-11-02 | Bio-Metric Systems, Inc. | Method of biomolecule attachment to hydrophobic surfaces |
US4451619A (en) * | 1982-09-30 | 1984-05-29 | Minnesota Mining And Manufacturing Company | Method of hydrophilizing or hydrophobizing polymers |
US4820504A (en) * | 1986-02-12 | 1989-04-11 | City Of Hope | Multi-specimen tissue blocks and slides |
US5336742A (en) * | 1987-03-13 | 1994-08-09 | Minnesota Mining And Manufacturing Company | Polymeric supports |
US5204219A (en) * | 1987-07-30 | 1993-04-20 | Minnesota Mining And Manufacturing Company | Photographic element with novel subbing layer |
US5049662A (en) * | 1987-10-13 | 1991-09-17 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Kit for diagnosing cancer metastatic potential |
US5753437A (en) * | 1987-10-13 | 1998-05-19 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health & Human Services | Method of diagnosing cancer susceptibility or metastatic potential |
US4914022A (en) * | 1987-10-21 | 1990-04-03 | Amc Cancer Research Center | Method for preparing multiple tissue samples for microscopic investigation and testing |
US5262484A (en) * | 1989-04-10 | 1993-11-16 | Minnesota Mining And Manufacturing Company | Azlactone graft copolymers |
US5149806A (en) * | 1990-03-28 | 1992-09-22 | Minnesota Mining And Manufacturing Company | Azlactone michael adducts |
US5436147A (en) * | 1991-03-01 | 1995-07-25 | Nucleic Assays Corporation | Heterobifunctional crosslinked agents for immobilizing molecules on plastic substrates |
US5639546A (en) * | 1991-09-03 | 1997-06-17 | Minnesota Mining And Manufacturing Company | Coated article having improved adhesion to organic coatings |
US5500251A (en) * | 1992-05-01 | 1996-03-19 | Air Products And Chemicals, Inc. | Process for coating low energy surfaces |
US5489508A (en) * | 1992-05-13 | 1996-02-06 | University Of Texas System Board Of Regents | Therapy and diagnosis of conditions related to telomere length and/or telomerase activity |
US5344701A (en) * | 1992-06-09 | 1994-09-06 | Minnesota Mining And Manufacturing Company | Porous supports having azlactone-functional surfaces |
US5464900A (en) * | 1993-10-19 | 1995-11-07 | Minnesota Mining And Manufacturing Company | Water soluble organosiloxane compounds |
US5602202A (en) * | 1994-01-14 | 1997-02-11 | Minnesota Mining And Manufacturing Company | Methods of using acrylate-containing polymer blends |
US5843644A (en) * | 1994-03-01 | 1998-12-01 | The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services | Isolation of cellular material under microscopic visualization using an adhesive/extraction reagent tipped probe |
US5843657A (en) * | 1994-03-01 | 1998-12-01 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Isolation of cellular material under microscopic visualization |
US6251467B1 (en) * | 1994-03-01 | 2001-06-26 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Isolation of cellular material under microscopic visualization |
US6251516B1 (en) * | 1994-03-01 | 2001-06-26 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Isolation of cellular material under microscopic visualization |
US5728915A (en) * | 1995-05-08 | 1998-03-17 | Children's Hospital, Inc. | Transgenic mice which express simian SV 40 T-antigen under control of the retinoblastoma gene promoter |
FR2740777B1 (fr) * | 1995-11-02 | 1998-01-02 | Hutchinson | Films d'elastomere contenant au moins une substance chimique active, leur procede de preparation et leurs applications |
US6177266B1 (en) * | 1996-04-29 | 2001-01-23 | The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Army | Rapid identification of bacteria by mass spectrometry |
US6376619B1 (en) * | 1998-04-13 | 2002-04-23 | 3M Innovative Properties Company | High density, miniaturized arrays and methods of manufacturing same |
EP1173878B1 (en) * | 1999-04-27 | 2011-04-06 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Probes for a gas phase ion spectrometer |
US6136592A (en) * | 1999-06-25 | 2000-10-24 | Leighton; Stephen B. | Multiple micro-arrays |
US6395483B1 (en) * | 1999-09-02 | 2002-05-28 | 3M Innovative Properties Company | Arrays with mask layers |
WO2001033190A2 (en) * | 1999-11-04 | 2001-05-10 | Arcturus Engineering, Inc. | Automated laser capture microdissection |
ES2353061T5 (es) * | 2000-04-25 | 2014-04-07 | Osiris Therapeutics, Inc. | Reparación de articulaciones utilizando células madre mesenquimatosas |
EP1305595A2 (en) * | 2000-06-22 | 2003-05-02 | Clinomics Laboratories, Inc. | Frozen tissue microarrays and methods for using the same |
US7671010B2 (en) * | 2002-08-30 | 2010-03-02 | The Board Of Regents Of The University Of Texas System | Compositions and methods of use of targeting peptides for diagnosis and therapy of human cancer |
US6756586B2 (en) * | 2001-10-15 | 2004-06-29 | Vanderbilt University | Methods and apparatus for analyzing biological samples by mass spectrometry |
WO2004044555A2 (en) * | 2002-11-12 | 2004-05-27 | Becton, Dickinson And Company | Diagnosis of sepsis or sirs using biomarker profiles |
US8012693B2 (en) * | 2003-12-16 | 2011-09-06 | 3M Innovative Properties Company | Analysis of chemically crosslinked cellular samples |
EP1907845A4 (en) * | 2005-05-25 | 2009-03-04 | Expression Pathology Inc | DIAGNOSIS OF ILLNESSES AND SUFFERING BY ANALYSIS OF HISTOPATHOLOGICALLY PREPARED BIOLOGICAL SAMPLES USING LIQUID TISSUE PREPARATIONS |
JP5166250B2 (ja) * | 2005-05-25 | 2013-03-21 | エクスプレッション、パソロジー、インコーポレイテッド | 組織病理学的に処理した生物学的試料からのプロテオームの適用範囲を増加させるための、液体組織標品を用いたマルチプレックス方法 |
JP2008547005A (ja) * | 2005-06-16 | 2008-12-25 | スリーエム イノベイティブ プロパティズ カンパニー | マススペクトルを用いた化学的に架橋された細胞サンプルの分類方法 |
-
2006
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Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2004536276A (ja) * | 2000-11-16 | 2004-12-02 | シファーゲン バイオシステムズ, インコーポレイテッド | 質量スペクトルを分析する方法 |
WO2004080579A2 (en) * | 2003-03-10 | 2004-09-23 | Expression Pathology, Inc. | Liquid tissue preparation from histopatologically processed biological samples, tissues and cells |
WO2004088325A2 (en) * | 2003-03-26 | 2004-10-14 | President And Fellows Of Harvard College | Determination of proteins and/or other molecules using mass spectroscopy |
Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2012185170A (ja) * | 2005-06-16 | 2012-09-27 | Three M Innovative Properties Co | マススペクトルを用いた化学的に架橋された細胞サンプルの分類方法 |
CN112444479A (zh) * | 2021-02-01 | 2021-03-05 | 宁波大学 | 基于并行处理技术的单细胞质谱分析系统及方法 |
CN112444479B (zh) * | 2021-02-01 | 2021-05-07 | 宁波大学 | 基于并行处理技术的单细胞质谱分析系统及方法 |
Also Published As
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