JP2007505641A5

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Publication number: JP2007505641A5
Application number: JP2006527568A
Authority: JP
Filing date: 2004-09-20
Publication date: 2007-10-18
Anticipated expiration: 2024-09-20

Claims

遺伝子座コピー数の変化を特定する方法であって、前記方法は、前記遺伝子座内における少なくとも１つの遺伝子のメチル化状態を明らかにすることを含み、前記少なくとも１つの遺伝子の所定のメチル化状態とは異なるメチル化状態により、前記遺伝子座コピー数の変化が示される方法。
対象における遺伝子座コピー数の変化を特定する方法であって、前記方法は、前記対象の染色体ＤＮＡの前記遺伝子座における少なくとも１つの遺伝子のメチル化状態を明らかにすることを含み、前記少なくとも１つの遺伝子の所定のメチル化状態とは異なるメチル化状態により、前記遺伝子座のコピー数の変化が示され、それにより、対象における前記遺伝子座コピー数の変化が特定される方法。
遺伝子座コピー数の変化を出生前に特定する方法であって、前記方法は、前記遺伝子座を含む出生前の染色体ＤＮＡにおける少なくとも１つの遺伝子のメチル化状態を明らかにすることを含み、前記少なくとも１つの遺伝子の所定のメチル化状態とは異なるメチル化状態により、前記遺伝子座コピー数の変化が示され、それにより、前記遺伝子座コピー数の変化が出生前に特定される方法。
ダウン症候群を出生前に診断する方法であって、前記方法は、出生前の第２１染色体における少なくとも１つの遺伝子のメチル化状態を明らかにすることを含み、ダウン症候群において増幅されていない前記少なくとも１つの遺伝子が選択され、一方、所定のメチル化状態とは異なる前記メチル化状態により、前記少なくとも１つの遺伝子の増幅が示され、それにより、ダウン症候群が出生前に診断される方法。
包装材と、前記包装材に含有されている、遺伝子座コピー数の変化を検出するのに特定された試薬とを含む製造物であって、前記試薬は、前記遺伝子座における少なくとも１つの遺伝子のメチル化状態を明らかにすることができ、一方、前記少なくとも１つの遺伝子の所定のメチル化状態とは異なるメチル化状態により、前記遺伝子座コピー数の前記変化が示される製造物。
ダウン症候群を検査するためのキットであって、前記キットは、第２１染色体の遺伝子座における少なくとも１つの遺伝子のメチル化状態を明らかにするための試薬を含み、前記少なくとも１つの遺伝子の所定のメチル化状態とは異なるメチル化状態により、ダウン症候群が示されるキット。
遺伝子座コピー数の変化は、異倍数性および多倍数性からなる群から選択される染色体異常に由来する請求項１，２または３に記載の方法。
前記少なくとも１つの遺伝子のメチル化状態を明らかにすることは、（ｉ）制限酵素消化によるメチル化検出；（ｉｉ）重硫酸塩に基づくメチル化検出；（ｉｉｉ）質量分析法による分析；（ｉｖ）配列分析；および／または（ｖ）マイクロアレイ分析によって行われる請求項１，２，３または４に記載の方法。
遺伝子座は、第１染色体、第２染色体、第３染色体、第４染色体、第５染色体、第６染色体、第７染色体、第８染色体、第９染色体、第１０染色体、第１１染色体、第１２染色体、第１３染色体、第１４染色体、第１５染色体、第１６染色体、第１７染色体、第１８染色体、第１９染色体、第２０染色体、第２１染色体、第２２染色体、Ｘ染色体、及びＹ染色体からなる群から選択される染色体上に位置する請求項１，２または３に記載の方法。
出生前の染色体ＤＮＡは、（ｉ）羊水穿刺；（ｉｉ）胎児生検；（ｉｉｉ）絨毛生検；（ｉｖ）母体生検；（ｖ）血液サンプル採取；（ｖｉ）子宮頸サンプル採取；および／または（ｖｉｉ）尿サンプル採取によって得られる請求項３または４に記載の方法。
前記少なくとも１つの遺伝子が、ＡＰＰ、シスタチオニン−β−シンターゼ、アミロイドβ（Ａ４）前駆体タンパク質（プロテアーゼネキシン−ＩＩ、アルツハイマー病）、ＡＴＰ結合カセット、サブファミリーＧ（ＷＨＩＴＥ）、メンバー１、自己免疫調節因子（自己免疫性多内分泌腺症、カンジダ症、外胚葉ジストロフィー）、ＢＴＢおよびＣＮＣの相同性１、塩基性ロイシンジッパー転写因子１、ＢＴＧファミリー、メンバー３、カルボニルレダクターゼ１、カルボニルレダクターゼ３、クロマチンアセンブリー因子１、サブユニットＢ（ｐ６０）、第２１染色体オープンリーディングフレーム１８、第２１染色体オープンリーディングフレーム１８、第２１染色体オープンリーディングフレーム２、コラーゲン、ＶＩ型、α１、コラーゲン、ＶＩ型、α２、コラーゲン、ＸＶＩＩＩ型、α１、コクサッキーウイルスおよびアデノウイルスの受容体、シスタチンＢ（ステフィンＢ）、第２１染色体上のＤＮＡセグメント（特有の）２０５６発現配列、ダウン症候群細胞接着分子、ダウン症候群重要領域遺伝子１、ダウン症候群重要領域遺伝子３、ｆ−ｂｏｘ・ＷＤ−４０ドメインタンパク質１Ｂ、グルタミン酸受容体、向イオン性、カイニン酸Ｉ、ＨＭＴ１（ｈｎＲＮＰメチルトランスフェラーゼ、Ｓ．ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）様１、ホロカルボキシラーゼシンセターゼ（ビオチン−［プロピオニル補酵素Ａ−カルボキシラーゼ（ＡＴＰ加水分解性）］リガーゼ）、インテグリン、β２（抗原ＣＤ１８（ｐ９５）、リンパ球機能関連抗原１；マクロファージ抗原１（ｍａｃ−１）βサブユニット）、インターフェロン（α、βおよびω）受容体１、インターフェロン（α、βおよびω）受容体２、インターフェロンγ受容体２（インターフェロンγトランスジューサーＩ）、インターフェロンγ受容体２（インターフェロンγトランスジューサーＩ）、インターロイキン１０受容体、β、インターセクチン１（ＳＨ３ドメインタンパク質）、ＫＩＡＡ０６５３タンパク質、ミニ染色体維持欠損（Ｓ．ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）３関連タンパク質、ミクソウイルス（インフルエンザ）耐性１、マウスのホモログ（インターフェロン誘導タンパク質ｐ７８）、ミクソウイルス（インフルエンザ）耐性２、マウスのホモログ、神経細胞接着分子２、核受容体相互作用タンパク質１、ＰＢＸ／ｋｎｏｔｔｅｄ１ホメオボックス１、ペリセントリン、ホスホフルクトキナーゼ、肝臓、ホスホリボシルグリシンアミドホルミルトランスフェラーゼ、ホスホリボシルグリシンアミドシンセターゼ、ホスホリボシルアミノイミダゾールシンセターゼ、下垂体腫瘍トランスフォーミング１相互作用タンパク質、カリウム内向き整流チャネル、サブファミリーＪ、メンバー１５、プロテアーゼ、セリン、７（エンテロキナーゼ）、ＰＷＰ２（周期的トリプトファンタンパク質、酵母）ホモログ、ピリドキサール（ピリドキシン、ビタミンＢ６）キナーゼ、ｒｕｎｔ関連転写因子１（急性骨髄性白血病１；ａｍｌ１ガン遺伝子）、Ｓ１００カルシウム結合タンパク質、β（神経性）、ＳＨ３ドメイン結合性グルタミン酸リッチタンパク質、ｓｉｎｇｌｅ−ｍｉｎｄｅｄ（ショウジョウバエ）ホモログ２、ＳＭＴ３（ｍｉｆｔｗｏ３のサプレッサー、酵母）ホモログ１、ＳＯＮＤＮＡ結合タンパク質、スーパーオキシドディスムターゼ１、可溶性（筋萎縮性側索硬化症１（成人））、シナプトジャニン１、テトラトリコペプチド反復ドメイン３、一過性の受容体潜在的チャネル７、膜貫通プロテアーゼ、セリン２、膜貫通タンパク質１、トリプトファンリッチ塩基性タンパク質、ユビキチンコンジュゲート化酵素Ｅ２Ｇ２（酵母ＵＢＣ７に対して相同的）、ｖ−ｅｔｓトリ赤芽球症ウイルスＥ２６ガン遺伝子ホモログ２からなる群から選択される請求項４に記載の方法。
前記少なくとも１つの遺伝子は、ＡＰＰおよびシスタチオニン−β−シンターゼからなる群から選択される請求項４に記載の方法。