JP2007312750A - 改良された化学物質の検出方法 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】化学物質に応答してプロモーター活性が変化するモニタリング用プロモーター遺伝子の下流に酸化還元酵素をコードするポリヌクレオチドを作動可能に連結することによって形質転換した組換え細胞を用いる。
【選択図】なし
Description
よって、化学物質について人体や生態系に与える影響を評価する要請がある。
マーカータンパク質の例としてはGFP(Green Fluorescence Protein)(Heim, R., Cubitt, A. B. and Tsien, R. Y.(1995) Nature 373, 663-664;Heim, R., Prasher DC. and Tsien, R. Y.(1994) Proc. Natl. Acad. Sci., 91, 12501-12504;Warg, S. and Hazerigg, T.(1994)Nature 639, 400-403;Youvan, D.C. and Michel-Beyerle, M.E.(1996)Nature Biotechnology 14 1219-1220;Chalfie, M., Tu, Y., Euskirchen, G., Ward, W. W. and Prasher, D.C.(1994)Science 263, 802-805)、β-ガラクトシダーゼ(Canestro C, Albalat R, Escriva H, Gonzalez-Duarte R. Endogenous beta-galactosidase activity in amphioxus: a useful histochemical marker for the digestive system.Dev Genes Evol 2001 Mar 211(3):154-6)、ルシフェラーゼ(Arch Toxicol 2002 Jun;76(5-6):257-61、Estrogenic activity of UV filters determined by an in vitro reporter gene assay and an in vivo transgenic zebrafish assay.Schreurs R, Lanser P, Seinen W, Van Der Burg B.)、及びアセチルトランスフェラーゼ(J Recept Signal Transduct Res 2001 Feb;21(1):71-84, A simplified method for large scale quantification of ranscriptional activity and its use in studies of steroids and steroid receptors. Zhang S, Lu J, Iyama K, Lo SC, Danielsen M.)を挙げることができる。
プロモーター活性の変化は、例えば、GFPなどの蛍光タンパク質の場合、蛍光測定によりモニターされ、ルシフェラーゼの場合、酵素−基質反応による発光によりモニターされる。
したがって、蛍光法を用いずに、より簡便に環境中の化学物質の存在または存在量を検出できるシステムが求められている。
例えば、ホタルルシフェラーゼとD−ホタルルシフェリンによる酵素−基質反応は下式で示される。
例えば、グルコースオキシダーゼとグルコースによる酵素−基質反応は下式で示される。
例えば、特開2001−252066号公報には、細菌数測定対象食品を溶液中に分散させてサンプル溶液を調製し、サンプル溶液の溶存酸素を検出することによって、サンプル溶液中の細菌数を測定する方法が開示されている。
また、特開2001−258592号公報には、酸素電極を用いて溶液の溶存酸素量を検出することによって、短時間で正確に測定対象微生物の薬剤感受性を測定する方法が開示されている。この方法によれば、測定対象微生物および薬剤を含む第1の溶液および薬剤を含まない第2の溶液について、酸素電極からの測定電流値を各々時系列的に保持し、それぞれ時系列的に保持されている測定電流値から移動平均値を算出し、それぞれ算出された移動平均値の対から最小二乗近似で時間微分値を算出するので、非常に簡便かつ正確に測定対象微生物と薬剤との反応を検出することができる。
産生された酸化還元酵素の存在量の増大は、化学物質応答性の遺伝子プロモーターが化学物質の存在により活性化されたことに起因するため、酸素消費量の増大が、化学物質の存在または存在量を示すこととなる。
本発明において、基礎代謝による酸素消費量よりも、酵素−基質反応による酸素消費量が圧倒的に多い場合、予め、基礎代謝による酸素消費量を算出し、これを測定値から差し引くことによって、酵素−基質反応による酸素消費量を検出することができる。
また、本発明において、基礎代謝による酸素消費の影響を排除するため、形質転換細胞を破砕し、酵素−基質反応のみを観察することができる。
さらに、破砕による細胞の内容物からの影響を回避するために、マーカータンパク質として、細胞膜を透過する酸化還元酵素を選択し、形質転換細胞を破砕することなく、溶液中から形質転換細胞を回収することによって、酵素−基質反応による酸素消費量を検出することができる。
本法は酵母細胞の遺伝子を基にしていること、また酵母の生育は塩濃度その他の環境試料において変動する条件に左右されないことから、好ましい細胞は酵母細胞である。
細胞を形質転換する方法はよく知られている(例えば、Kaiser C, Michaelis S, Mitchell A: Lithium acetate yeast transformation, Methods in Yeast Genetics, A Cold Spring Harbor Laboratory Course Manual 1994 edition (Cold Spring Harbor Laboratory Press) pp.133-134,1994を参照)。
また、ベクターを用いなくとも当該酵母遺伝子のコード領域をマーカータンパク質をコードするポリヌクレオチド配列で置換することによっても目的は達せられる。上記ポリヌクレオチド構築物を細胞に直接導入することも可能であり、その方法も周知である。
84C、YFL059W、YFR042W、YFR046C、YFR049W、YGL026C、YGL058W、YGL185C、YGL227W、YGL252C、YGL254W、YGR089W、YGR112W、YGR134W、YGR276C、YHL019C、YHR012W、YHR017W、YHR028C、YHR106W、YHR109W、YHR156C、YIL036W、YIL046W、YIL143C、YIL152W、YIL159W、YIL164C、YJL071W、YJL094C、YJL154C、YJR056C、YJR072C、YJR110W、YJR139C、YKL025C、YKL034W、YKL064W、YKL171W、YKL196C、YKR012C、YKR068C、YKR069W、YLL001W、YLL057C、YLL061W、YLR064W、YLR070C、YLR099C、YLR144C、YLR157C、YLR160C、YLR164W、YLR364W、YLR421C、YML032C、YML042W、YML112W、YML118W、YMR114C、YMR115W、YMR258C、YNL181W、YNL191W、YNL212W、YNL213C、YNL250W、YNL265C、YNL312W、YNR032W、YOL038W、YOL049W、YOL064C、YOR088W、YOR155C、YOR257W、YOR265W、YOR377W、YOR386W、YPL031C、YPL113C、YPL124W、YPL151C、YPL249C、YPL260W、YPL274W、YPR048W、YPR061C、YPR093C、YPR125W、YPR158W、YPR168W、YPR169W、YPR174C、YPR180W、YPR193C、YPR200C、YAL014C、YAL017W、YAL049C、YBL019W、YBL058W、YBR001C、YBR013C、YBR018C、YBR037C、YBR045C、YBR051W、YBR063C、YBR128C、YBR129C、YBR204C、YBR241C、YBR255W、YBR281C、YCL044C、YCL055W、YCR014C、YCR019W、YCR024C、YCR105W、YDL065C、YDL089W、YDL143W、YDL173W、YDL193W、YDL197C、YDL206W、YDL230W、YDL233W、YDR040C、YDR071C、YDR078C、YDR109C、YDR140W、YDR194C、YDR212W、YDR221W、YDR257C、YDR271C、YDR287W、YDR294C、YDR316W、YDR329C、YDR338C、YDR369C、YDR421W、YDR425W、YDR485C、YDR488C、YDR504C、YDR505C、YDR506C、YDR515W、YEL005C、YEL037C、YEL044W、YER017C、YER048C、YER052C、YER078C、YER089C、YER092W、YER100W、YER162C、YER182W、YFL021W、YFL042C、YFR045W、YFR051C、YFR056C、YGL040C、YGL041C、YGL045W、YGL057C、YGL093W、YGL105W、YGL125W、YGL166W、YGL181W、YGL183C、YGL215W、YGL216W、YGL221C、YGL223C、YGR007W、YGR029W、YGR155W、YGR156W、YGR186W、YGR198W、YGR210C、YGR211W、YGR237C、YGR250C、YGR258C、YGR266W、YGR270W、YGR274C、YGR277C、YHL021C、YHL037C、YHL038C、YHR082C、YHR083W、YHR134W、YHR160C、YHR171W、YHR180W、YHR205W、YIL062C、YIL072W、YIL075C、YIL099W、YIL108W、YIL165C、YIL170W、YIR009W、YIR018W、YIR031C、YIR032C、YJL032W、YJL049W、YJL128C、YJL165C、YJR044C、YJR052W、YJR090C、YJR091C、YJR103W、YJR104C、YJR153W、YKL059C、YKL079W、YKL090W、YKL094W、YKL192C、YKL209C、YKR052C、YKR102W、YKR106W、YLL054C、YLR025W、YLR097C、YLR200W、YLR226W、YLR248W、YLR266C、YLR392C、YLR427W、YML013W、YML029W、YML041C、YML051W、YML078W、YML079W、YML088W、YML099C、YMR056C、YMR068W、YMR091C、YMR110C、YMR160W、YMR186W、YMR255W、YNL005C、YNL026W、YNL039W、YNL063W、YNL064C、YNL077W、YNL083W、YNL147W、YNL176C、YNL194C、YNL253W、YNL257C、YNL261W、YNL264C、YNL276C、YNR006W、YNR034W、YNR047W、YNR051C、YNR071C、YOL065C、YOL067C、YOR005C、YOR008C、YOR022C、YOR023C、YOR058C、YOR069W、YOR087W、YOR138C、YOR229W、YOR256C、YOR267C、YPL005W、YPL020C、YPL022W、YPL105C、YPL147W、YPL150W、YPL152W、YPL164C、YPL168W、YPL180W、YPL188W、YPL194W、YPR025C、YPR047W、YPR049C、YPR066W、YPR081C、YPR134W、YPR140W、YPR148C、YPR155C、YPR172W、YPR185W、YAL018C、YAR064W、YBR012C、YBR076W、YBR287W、YDR043C、YDR250C、YDR373W、YFR014C、YGL191W、YGR180C、YHR136C、YJL026W、YJL037W、YLR038C、YNL058C、YOR031W、YGR087C、YIL166C、YHR008C、YIL129C、YGL256W、YJR030C、YMR077C、YBR264C、YPL177C、YKR040C、YGL056C、YDR128W、YGR139W、YBL101W-A、YOR253W、YOL026C、YDR278C、YHR095W、YCL042W、YNL200C、YPL221W、YLR415C、YMR058W、YPR037C、YER072W、YML028W、YOR325W、YAL039C、YMR112C、YJR107W、YGL088W、YJR058C、YNL142W、YDR090C、YMR071C、YBL093C、YGR293C、YML055W、YDL017W、YDL210W、YGL055W、YCL025C、YDR080W、YDL181W、YNR030W、YJL017W、YIL127C、YDR281C、YDR366C、YFR026C、YJL212C、YPL215W、YEL019C、YBR132C、YHL018W、YNL196C、YPL038W、YAR047C、YPL262W、YHL006C、YPL225W、YBR124W、YOR148C、YKR053C、YBL044W、YER029C、YLR360W、YCL056C、YCR007C、YGR239C、YNL256W、YPR146C、YLR377C、YKL097C、YBR066C、YLR338W、YDL229W、YBR253W、YJR027W、YKL198C、YBL030C、YBR031W、YBR118W、YBR162C、YBR221C、YCR024C-A、YCR106W、YDL046W、YDR012W、YDR133C、YDR134C、YDR276C、YDR342C、YDR343C、YEL027W、YEL034W、YGR038W、YGR243W、YGR279C、YHR094C、YHR105W、YHR175W、YHR181W、YIL056W、YIL162W、YJL059W、YJL097W、YJL158C、YJR105W、YKL051W、YKL056C、YKL097W-A、YKL100C、YKL141W、YKR066C、YLR134W、YLR258W、YLR339C、YML058W、YMR083W、YMR203W、YNL209W、YNL307C、YOL030W、YOR178C、YPL028W、YPR028W、YPR113W、YPR149W、YPR150W、YPR183W、YAL016W、YBL099W、YBL100C、YBR011C、YBR096W、YBR100W、YBR127C、YBR283C、YBR286W、YCL008C、YCL058C、YCR030C、YCR034W、YCR069W、YDL015C、YDL023C、YDL061C、YDL086W、YDR038C、YDR039C、YDR050C、YDR151C、YDR178W、YDR233C、YDR284C、YDR298C、YDR345C、YDR359C、YDR382W、YDR385W、YDR400W、YDR407C、YDR538W、YEL024W、YEL033W、YEL063C、YER057C、YER081W、YER120W、YFL011W、YGL012W、YGL206C、YGR022C、YGR026W、YGR082W、YGR107W、YGR172C、YGR191W、YGR204W、YGR260W、YHL005C、YHL046C、YHR025W、YHR026W、YHR123W、YHR126C、YHR143W、YIL011W、YIL015W、YIL018W、YIL157C、YIR041W、YJL016W、YJL121C、YJL133W、YJL138C、YJL191W、YJR018W、YJR047C、YJR077C、YJR119C、YJR121W、YJR123W、YJR143C、YJR145C、YKL060C、YKL147C、YKL148C、YKL157W、YKL164C、YKL169C、YKR033C、YLL041C、YLL064C、YLR041W、YLR044C、YLR056W、YLR058C、YLR081W、YLR089C、YLR110C、YLR177W、YLR264W、YLR284C、YLR304C、YLR340W、YLR354C、YLR372W、YLR388W、YML022W、YMR007W、YMR011W、YMR015C、YMR092C、YMR101C、YMR156C、YMR205C、YMR215W、YMR261C、YMR323W、YNL069C、YNL135C、YNL195C、YNR076W、YOL039W、YOL073C、YOL086C、YOL120C、YOL156W、YOL161C、YOR002W、YOR009W、YOR010C、YOR085W、YOR108W、YOR128C、YOR129C、YOR142W、YOR161C、YOR176W、YOR230W、YOR298W、YPL004C、YPL036W、YPL048W、YPL057C、YPL059W、YPL061W、YPL135W、YPL179W、YPL218W、YPL220W、YPL246C、YPL272C、YPR063C、YPR080W、YPR181C、YBR290W、YCR010C、YCR091W、YDL107W、YDL129W、YDR066C、YDR529C、YFL026W、YGL018C、YGL059W、YNL144C、YOR003W、YAL037W、YAR023C、YBR003W、YBR020W、YBR044C、YBR091C、YBR185C、YBR282W、YCR015C、YCR038C、YCR043C、YDL119C、YDL146W、YDL220C、YDR057W、YDR123C、YDR125C、YDR222W、YDR225W、YDR277C、YDR286C、YDR347W、YDR408C、YDR438W、YDR479C、YDR483W、YEL039C、YEL057C、YEL073C、YER066W、YER076C、YER084W、YER121W、YER189W、YFL017C、YFL046W、YFR006W、YFR008W、YGL115W、YGL208W、YGL214W、YGL218W、YGR021W、YGR023W、YGR024C、YGR064W、YGR076C、YGR096W、YGR108W、YGR174C、YGR182C、YGR236C、YGR288W、YHL042W、YHR195W、YHR210C、YIL006W、YIL012W、YIL028W、YIL050W、YIL057C、YIL089W、YIL102C、YIL113W、YIL122W、YJL100W、YJL169W、YJL199C、YJR039W、YJR050W、YJR101W、YKL003C、YKL016C、YKL061W、YKL093W、YKL121W、YKL160W、YKL170W、YKL194C、YKR034W、YKR067W、YLR006C、YLR016C、YLR030W、YLR036C、YLR112W、YLR125W、YLR128W、YLR204W、YLR211C、YLR233C、YLR257W、YLR288C、YLR326W、YLR334C、YLR395C、YLR408C、YLR414C、YLR444C、YML050W、YML107C、YML120C、YMR031C、YMR053C、YMR073C、YMR162C、YMR204C、YMR206W、YMR284W、YNL010W、YNL025C、YNL127W、YNL139C、YNL217W、YOL116W、YOL118C、YOR053W、YOR100C、YOR103C、YOR122C、YOR150W、YOR187W、YOR251C、YOR312C、YOR327C、YOR348C、YOR352W、YOR388C、YOR394W、YPL001W、YPL033C、YPL066W、YPL148C、YPL230W、YPL275W、YPL276W、YPR005C、YPR014C、YPR192W、YPR194C、YBR005W、YER025W、YFL027C、YGL080W、YGL205W、YHL028W、YHR185C、YIL076W、YJL166W、YLR046C、YMR035W、YMR238W、YMR252C、YNL192W、YNL202W、YOL108C、YOR385W、YPR165W、YAR033W、YBL038W、YBR009C、YBR010W、YBR151W、YCL067C、YCR096C、YDL137W、YDL192W、YDR073W、YDR086C、YDR224C、YDR377W、YDR378C、YER015W、YGL187C、YHR162W、YJL167W、YJL216C、YKR009C、YLR165C、YMR197C、YNL157W、YOL002C、YOL109W、YOR180C、YPL010W、YPL233W、YBR036C、YDR297W、YGR149W、YGR224W、YNL043C、YPL067C、YPL170W、YCR046C、YDR387C、YFL050C、YGL051W、YHR132C、YIL112W、YJL141C、YKR098C、YLR052W、YLR206W、YML129C、YNL203C、YNR014W、YOL043C、YOL096C、YPR184W、YAL028W、YAL055W、YAR062W、YBL095W、YBL102W、YBR122C、YBR157C、YBR161W、YBR251W、YBR298C、YCR039C、YCR083W、YDL018C、YDL067C、YDL078C、YDL091C、YDL215C、YDL216C、YDR022C、YDR067C、YDR079W、YDR181C、YDR186C、YDR196C、YDR262W、YDR306C、YDR319C、YER188W、YGL004C、YGL035C、YGR036C、YGR062C、YGR120C、YGR131W、YGR141W、YGR167W、YGR287C、YHL024W、YHR080C、YHR097C、YIL077C、YJL046W、YJL070C、YJL096W、YJL113W、YJL146W、YJL180C、YJR019C、YJR049C、YKR058W、YLL005C、YLR078C、YLR151C、YLR271W、YLR295C、YLR351C、YLR375W、YMR023C、YMR025W、YMR135C、YMR210W、YMR267W、YMR278W、YMR293C、YNL073W、YNR037C、YNR040W、YNR072W、YOR028C、YOR316C、YOR328W、YOR363C、YPL039W、YPL040C、YPL099C、YPL107W、YPL134C、YPL138C、YPL140C。
また、ゲノム配列のよく知られた酵母の遺伝子のうち、オキシゲナーゼ関連遺伝子として、YBL098w、YDR402c、YGL055w、YGR175c、YGR255c、YHR007c、YHR176w、YJR025c、YJR069c、YJR078w、YJR149w、YLL057c、YLR205c、YMR015cが挙げられる。
これらの酵母遺伝子の塩基配列は、公共のデータベース(例えば、ドイツのMIPS:Munich Information Center for Protein Sequence、米国のSGD:Saccharomyces Genome Database)に開示されており、インターネットを介して知ることができる。また、プロモーター配列についても公共のデータベース(SCPD:The Promoter Database of Saccharomyces cerevisiae)に開示されている。
本発明において、上記オキシダーゼ関連遺伝子またはオキシゲナーゼ関連遺伝子に相同性を有する他種由来の遺伝子を用いることもできる。
この測定装置は、化学物質の存在または存在量を調べようとする被検試料、形質転換細胞およびその形質転換細胞に導入されたポリヌクレオチドにコードされる酸化還元酵素に対する基質を添加してなる第1溶液を収容する第1セル1と、被検試料を添加せず、形質転換細胞を添加してなる第2溶液を収容する第2セル2と、第1セル1に装着されて第1溶液の溶存酸素量を検出し、測定電流値を出力する第1酸素センサ1aと、第2セル2に装着されて第2溶液の溶存酸素量を検出し、測定電流値を出力する第2酸素センサ2aと、第1酸素センサ1aから出力される測定電流値を時系列的に保持する第1保持部3と、第2酸素センサ2aから出力される測定電流値を時系列的に保持する第2保持部4と、第1保持部3に時系列的に保持されている測定電流値から移動平均値を算出し、時系列的に保持する第1移動平均値算出保持部5と、第2保持部4に時系列的に保持されている測定電流値から移動平均値を算出し、時系列的に保持する第2移動平均値算出保持部6と、第1移動平均値算出保持部5に時系列的に保持されている移動平均値から第1の時間微分値を算出する第1時間微分値算出部7と、第2移動平均値算出保持部6に時系列的に保持されている移動平均値から第2の時間微分値を算出する第2時間微分値算出部8と、第1の時間微分値と第2の時間微分値とに基づいて化学物質の存在または存在量を測定する化学物質測定部9とを有している。
溶液中で作用極21において、O2+4H+→2H2Oの反応が生じて4e−の電子の授受が行われ、これに対応する電流が流れる。この反応は溶存酸素濃度に依存するため、流れる電流量を溶存酸素濃度に依存する。
したがって、第1溶液および第2溶液の電流値をそれぞれ測定し、第1溶液の電流値が第2溶液の電流値よりも小さい、すなわち、溶存酸素量が少ないとき、酵素−基質反応が促進されていると判断することができる。酵素−基質反応の促進は、化学物質に応答して化学物質応答性プロモーターが活性化して、上昇した濃度の酵素が発現されたことを意味する。
かくして、溶存酸素量の測定により、被検体中の化学物質の存在または存在量を検出することができる。
ここで、第1の所定時間とは、測定開始から、所定の電流値を下回るまで、もしくはプラトーに達するまで、もしくは所定の時間が経過するまでの時間をいう。
毒性物質の検出のためいかなる酵母遺伝子が有用であるかを調べるため以下の実験を行った。
YPD培地(酵母エキス1%、ポリペプトン2%、ブドウ糖2%)に酵母(Saccharomyces cerevisiae S288C(α SUC2mal mel gap2 CUP1))を25℃で培養した。対数増殖期に以下の細胞に対して毒性を有する化学物質の1つを添加して更に2時間培養した。これと同条件で化学物質を添加せずに培養して対照区とした。化学物質の濃度は酵母の生育を阻害するが死滅には至らないような濃度を選択した。
以下の実施例にはそのようなベクターの調製、該ベクターを用いる酵母細胞の形質転換、形質転換した細胞による毒性物質の検出を示す。
このため、プロモーターアッセイにおける酵母遺伝子の選択にあたっては、強度(コントロール細胞における遺伝子の発現量/全遺伝子の発現量の平均値)が、好ましくは1.5以下、より好ましくは1以下、さらに好ましくは0.5以下であり、発現倍率(化学物質存在下の発現mRNA/化学物質不存在下の発現mRNA)が好ましくは3以上、より好ましくは10以上、さらに好ましくは20以上であるものを選択する。
酵母遺伝子YKL071wのプロモーター配列を含むポリヌクレオチドをPCRにより増幅するためのプライマーを作成した。プライマーはプライマー設計用のソフトウェアであるOligo4.0-S, SequencherIマッキントッシュ版を用いて設計し、アッパープライマーの塩基配列は、
cgcaataatactggaaacatcaa (配列番号2)
であり、ロウワープライマーの塩基配列は、
atcgactttgtttgcttagaat (配列番号3)
とした。PCRはテンプレートとして酵母の染色体(Saccharomyces cerevisiae S288C, Cat.40802,Reserch Genetics, Inc.)を用い試薬は市販のキット(KOD DNA Polymerase;コードKOD-101、Toyobo)を使用する。
使用するベクターは大腸菌と酵母の両方で複製されるYEp型シャトルベクターであるpYES2(pYES2, Cat no:V825-20, Invirtogen Corporation, USA)(R.W.オールド、S.B.プリムローズ 遺伝子操作の原理 原書第5版, 培風館, pp.234-263, 2000))を用いる。また、マーカータンパク質であるリン酸ピリドキサミンオキシダーゼをコードするポリヌクレオチド(配列番号4)は、酵母の染色体DNAをテンプレートとして遺伝子YBR035cの部分をPCRで増幅したものを用いる。
1)酵母細胞Saccharomyces cerevisiae W303を200mLのSD培地でOD660が0.5になるまで振とう培養する。
2)集菌して5mLのTE-bufferにけん濁する。
3)2.5Mのリチウムアセテイト250μLを添加する。
4)300μLずつ分注し10μlの上記プラスミドベクターを添加し、30℃30分培養する。
5)700μLの50%PEG4000を付加し、30℃60分振とう培養する。
6)ヒートショック(42℃、5分)後、急冷する。
7)1Mソルビト−ルで2回洗浄する。
8)最小栄養培地で作成した寒天プレートに播種する。
実施例2にて作成した組換え酵母を、SD培地(アデニン、ヒスチジン、トリプトファン、ロイシン)において、25℃にて振とう培養することにより定常状態になるように増殖させる。
定常状態の酵母をSD培地で500倍希釈して、25℃にて15時間振とう培養を行い、対数増殖期として、600nmの吸光度が0.2から0.5にあることを確認した後、異なる濃度の化学物質TPNを負荷した。最終濃度が0.0053ppm、0.053ppm、0.53ppmの溶液をそれぞれ溶液A、B、Cとする。
また、対照溶液として、TPNを含まない溶液を標準溶液Sとする。
測定用溶液A、BまたはCおよび標準溶液Sにリン酸ピリドキサミンを添加して、測定を開始する。
測定用溶液A、B、Cおよび標準溶液Sの溶存酸素測定における電流値の時間変化を図4に示す。
2・・・第2セル、2a・・・第2酸素センサ、
3・・・第1保持部、4・・・第2保持部、
5・・・第1移動平均値算出保持部、6・・・第2移動平均値算出保持部、
7・・・第1時間微分値算出部、8・・・第2時間微分値算出部、
9・・・化学物質測定部、
21・・・作用電極、
22・・・参照電極、
23・・・対電極、
24・・・測定機器、
25・・・溶液。
マーカータンパク質の例としてはGFP(Green Fluorescence Protein)(Heim, R., Cubitt, A. B. and Tsien, R. Y.(1995) Nature 373, 663-664;Heim, R., Prasher DC. and Tsien, R. Y.(1994) Proc. Natl. Acad. Sci., 91, 12501-12504;Warg, S. and Hazerigg, T.(1994)Nature 639, 400-403;Youvan, D.C. and Michel-Beyerle, M.E.(1996)Nature Biotechnology 14 1219-1220;Chalfie, M., Tu, Y., Euskirchen, G., Ward, W. W. and Prasher, D.C.(1994)Science 263, 802-805)、β-ガラクトシダーゼ(Canestro C, Albalat R, Escriva H, Gonzalez-Duarte R. Endogenous beta-galactosidase activity in amphioxus: a useful histochemical marker for the digestive system.Dev Genes Evol 2001 Mar 211(3):154-6)、ルシフェラーゼ(Arch Toxicol 2002 Jun;76(5-6):257-61、Estrogenic activity of UV filters determined by an in vitro reporter gene assay and an in vivo transgenic zebrafish assay.Schreurs R, Lanser P, Seinen W, Van Der Burg B.)、及びアセチルトランスフェラーゼ(J Recept Signal Transduct Res 2001 Feb;21(1):71-84, A simplified method for large scale quantification of ranscriptional activity and its use in studies of steroids and steroid receptors. Zhang S, Lu J, Iyama K, Lo SC, Danielsen M.)を挙げることができる。
プロモーター活性の変化は、例えば、GFPなどの蛍光タンパク質の場合、蛍光測定によりモニターされ、ルシフェラーゼの場合、酵素−基質反応による発光によりモニターされる。
本法は酵母細胞の遺伝子を基にしていること、また酵母の生育は塩濃度その他の環境試料において変動する条件に左右されないことから、好ましい細胞は酵母細胞である。
細胞を形質転換する方法はよく知られている(例えば、Kaiser C, Michaelis S, Mitchell A: Lithium acetate yeast transformation, Methods in Yeast Genetics, A Cold Spring Harbor Laboratory Course Manual 1994 edition (Cold Spring Harbor Laboratory Press) pp.133-134,1994を参照)。
また、ベクターを用いなくとも当該酵母遺伝子のコード領域をマーカータンパク質をコードするポリヌクレオチド配列で置換することによっても目的は達せられる。上記ポリヌクレオチド構築物を細胞に直接導入することも可能であり、その方法も周知である。
このため、プロモーターアッセイ法における酵母遺伝子の選択にあたっては、強度(コントロール細胞における遺伝子の発現量/全遺伝子の発現量の平均値)が、好ましくは1.5以下、より好ましくは1以下、さらに好ましくは0.5以下であり、発現倍率(化学物質存在下の発現mRNA/化学物質不存在下の発現mRNA)が好ましくは3以上、より好ましくは10以上、さらに好ましくは20以上であるものを選択する。
Claims (8)
- 化学物質の存在下において上昇したプロモーター活性を発現する遺伝子のプロモーターを含む塩基配列の下流に、酵素反応において酸素を電子受容体として基質を酸化する酵素をコードするポリヌクレオチドまたは酵素反応において酸素を電子受容体として基質を酸化する酵素をコードするポリヌクレオチドが作動可能に連結されているポリヌクレオチドを含むベクターで形質転換されていることを特徴とする組換え細胞。
- 酵素反応において酸素を電子受容体として基質を酸化する酵素が、ルシフェラーゼ、オキシダーゼおよびオキシゲナーゼよりなる群から選択される酵素であることを特徴とする請求項1に記載の組換え細胞。
- 酵素反応において酸素を電子受容体として基質を酸化する酵素をコードするポリヌクレオチドが、酵母のゲノム配列のうち、オキシダーゼ関連遺伝子の塩基配列またはオキシゲナーゼ関連遺伝子の塩基配列を含むことを特徴とする請求項1に記載の組換え細胞。
- オキシダーゼ関連遺伝子が、酵母遺伝子のQ0045、Q0250、Q0275、YBL064c、YBR035c、YBR244w、YDL067c、YDR044w、YDR079w、YDR231c、YDR453c、YDR506c、YEL045c、YER014w、YER021w、YER058w、YER141w、YER145c、YER153c、YER154w、YFL041w、YGL187c、YGL191w、YGL205w、YGR029w、YGR060w、YGR062c、YGR112w、YGR234w、YHR051w、YHR116w、YIL111w、YIR037w、YJL003w、YJR034w、YKL026c、YKR066c、YLL009c、YLL018c-a、YLR038c、YLR142w、YLR205c、YLR395c、YML086c、YML129c、YMR020w、YMR058w、YMR256c、YNL052w、YOR350c、YPL132w、YPR037c、およびこれらの遺伝子に相同性を有する多種由来の遺伝子の塩基配列よりなる群から選択される遺伝子の塩基配列であることを特徴とする請求項3に記載の組換え細胞。
- オキシゲナーゼ関連遺伝子が、酵母遺伝子のYBL098w、YDR402c、YGL055w、YGR175c、YGR255c、YHR007c、YHR176w、YJR025c、YJR069c、YJR078w、YJR149w、YLL057c、YLR205c、YMR015c、およびこれらの遺伝子に相同性を有する多種由来の遺伝子の塩基配列よりなる群から選択される遺伝子の塩基配列であることを特徴とする請求項3に記載の組換え細胞。
- 組換え酵母であることを特徴とする請求項1〜5いずれか1に記載の組換え細胞。
- 被検試料と、酵素反応において酸素を電子受容体として基質を酸化する酵素をコードするポリヌクレオチドまたは酵素反応において酸素を電子受容体として基質を酸化する酵素をコードするポリヌクレオチドが作動可能に連結されているポリヌクレオチドを含むベクターで形質転換されていることを特徴とする組換え細胞と、前記酵素反応において酸素を電子受容体として基質を酸化する酵素に対する基質と、を含む溶液中の溶存酸素量を、酸素電極を用いて検出し、酸素電極からの出力信号を、第1の所定時間の間、第2の時間間隔で収集し、出力信号の変化から、溶存酸素量の変化を算出することによって、被検試料中の化学物質の存在または存在量を検出することを特徴とする化学物質測定方法。
- 1種類の溶液を収容すべく、内面所定位置に酸素電極面を有する測定用セルと、複数個の測定用セルをセット可能な測定装置本体とを有し、測定装置本体は、各測定用セルの酸素電極からの出力信号に基づいて、前記溶液中に存在する化学物質の存在または存在量を示す信号を出力する信号出力手段を含んでいることを特徴とする化学物質測定装置。
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