JP2006522602A - 環境モニタリングおよび生物資源調査を行うための方法および装置 - Google Patents
環境モニタリングおよび生物資源調査を行うための方法および装置 Download PDFInfo
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Abstract
Description
本出願は、以下の米国仮特許出願:2003年3月10日に出願された第60/453,411号;2003年4月16日に出願された第60/463,394号;2003年7月8日に出願された第60/485,475号;2003年12月9日に出願された第60/528,256号および2004年2月4日に出願された第60/541,781号の利益を主張し;全てのこれらの出願はRolf U.Haldenによって出願され、The Johns Hopkins Universityに譲渡されたものである。
本発明は、環境的および生物学的現象の測定およびテストに関する。さらに詳しくは、本発明は、環境モニタリングおよび生物資源調査のための方法および装置に関する。
本発明の少なくとも1つの実施形態を詳細に説明する前に、本発明は、その適用において、以下の記載に記載された、または図面で説明された構成の詳細、および構成要素の配置に制限されないことが理解されるべきである。本発明は他の実施形態が可能であり、種々の方法で実行し、行うことができる。また、本明細書中で用いたフレーズおよび用語は記載目的のためであり、限定的であると見なされるべきではないことが理解されるべきである。
(a)以下のツール/アプローチを組み合せ:固相サンプリング技術、イン・サイチュ豊富化および生化学スクリーニング、電子ドナー/アクセプター対の使用、同位体標識、および自動化分析との大量平行スクリーニング、
(b)培養−非依存性微生物群分析と組み合わせてイン・サイチュ微小生態系アレイを利用して、微生物群の包括的な実態を獲得し、
(c)数百または数千の仮定的環境シナリオのためのデータを提供することができ、それにより、これらの摂動によって誘導された環境変化の起こりうる速度を迅速かつ自動様式で決定するのを可能とし、
(d)コンピュータ援助減算プロファイリング技術によって特異的微生物を観察された反応にリンクさせるのに適しており、
(e)現存のロボットシステムを十分に適合し、それにより、化学、物理学、生物学、ゲノムおよびプロテオミック分析技術を用いる迅速かつ十分な自動分析を可能とし、
(f)物理、生物学および/または化学ストレッサーに直面する場合に、どのようにして非自然微生物が自然環境に対処するかの判断を可能とし、
(g)専らイン・サイチュ適用、エクス・サイチュ適用、またはその2つの組合せにつき最適化でき、および
(h)迅速かつ十分な自動化分析でプロテオミックアプローチが用いられるのを可能とする(例えば、マトリックス援助レーザー脱着/イオン化飛行質量分光測定(MALDI−TOF MS)およびタンデム質量分光測定(MS/MS)を用いる酵素消化物の蛋白質配列決定)。
1) モニタリングウェルについてのサンプリング用のダウンウェルツール、
2) マイクロタイタープレートテストおよび十分に自動化された分析、
3) 微生物栄養素の連続的放出のための徐放化合物、
4) 栄養素の送達のための膜テクノロジー、
5) ミクロフルイディック、
6) 微生物により誘導された腐食のレーザー検出、
7) 自動DNA抽出、
8) 微生物の同位体標識、
9) 高密度標識DNAの分離用の密度勾配分析、
10) マイクロアレイおよびバイオインフォーマティックスを用いる微生物群分析、
11) 関連微生物の同定のための減算群プロファイリング、
12) 個々のテスト区画における流体の化学的組成を測定するのに分析することができる収着剤材料;
を含む。
1. 情報的微生物群データは、慣用的地下水試料および生物改善微小生態系の分析を用い、非培養依存性ツールで得ることができる。
2. 微小生態系における電子アクセプターおよびドナーのスクリーニングは微生物群プロファイリングについての区別/予測パワーを加える。
3. 安定な同位体標識電子ドナー化合物の微小生態系設計への取込は、代謝的に活性な微生物の同定を助ける。
4. 微生物特異的蛋白質の質量分光測定分析の適合を用いて、時間および労働が度が過ぎる分離技術の必要性なくして、環境混合培養において微生物を直接的に同定することができる。
5. 現存の蛋白質同定データベースソフトウェアに含まれた微生物同定アルゴリズムの適合は、混合培養の分析を可能とする。
Claims (44)
- テストデバイス(1)を環境中に位置させ、
ここに、該デバイスは流体流入口(12)および流出口(14)を有する容器(10)、該容器内に位置した複数の毛細管微小生態系(16)を含み、該容器は進入、現場での使用および該環境からの脱出用に配置され、該毛細管の各々は該毛細管(16)を通っての流体の流動を可能とするように配置された毛細管流入口(18)および流出口(20)を有し、該毛細管の各々は、さらに、該毛細管の流入口(18)および流出口(18)を被覆して、該毛細管を通っての流動を妨げるための手段を有し、
周囲の環境からの流体が該毛細管を通る場合、該周囲の環境に固有の微生物の収集を促進するための手段を該毛細管の少なくとも1つに入れ、
該毛細管被覆手段を開けて、該周囲の環境からの流体を該容器および毛細管に流動させ、
該毛細管微小生態系(16)内で起こる現象を調べるのに十分な一時的な間、該デバイス(1)を該環境中に残し、
該テストデバイス(1)を回収し、次いで、
該毛細管微小生態系(16)内で起こる現象を分析する;
工程を含むことを特徴とする、特定の環境内の微生物についての環境モニタリングおよび生物資源方法。 - 該デバイス(1)が、さらに、該容器に連結されたポンプ(20)、該ポンプは、該周囲の環境からの流体の該毛細管を通っての該容器流入口(18)への流動を引き起こすように配置され、該毛細管を通って流動する該流体を収集するための手段、および該流体の該容器(10)への逆流を防止するための、該容器の下流に連結されたチェックバルブ(44)を含む請求項1記載の方法。
- 該複数の毛細管(16)が、商業的に入手可能なロボットを用いての該毛細管の自動分析を可能とするように配置された請求項1記載の方法。
- 該複数の毛細管(16)が、商業的に入手可能なロボットを用いての該毛細管(16)の自動分析を可能とするように配置された請求項2記載の方法。
- 該複数の毛細管(16)が迅速に交換可能なマイクロタイタープレートの形態で配置される請求項1記載の方法。
- 該複数の毛細管(16)が迅速に交換可能なマイクロタイタープレートの形態で配置される請求項2記載の方法。
- 該マイクロタイタープレートの内容物が凍結乾燥され、真空シールされる請求項5記載の方法。
- 該マイクロタイタープレートの内容物が凍結乾燥され、真空シールされる請求項6記載の方法。
- さらに該デバイス(1)を位置させる前に、該毛細管を通って流動する流体へ拡散することができる特定のテスト物質を含有する手段を該毛細管(16)の少なくとも1つに入れる工程を含む請求項1記載の方法。
- さらに該デバイス(1)を位置させる前に、該毛細管を通って流動する流体へ拡散することができる特定のテスト物質を含有する手段を該毛細管(16)の少なくとも1つに入れる工程を含む請求項2記載の方法。
- さらに該デバイス(1)を位置させる前に、該毛細管を通って流動する流体へ拡散することができる特定のテスト物質を含有する手段を該毛細管(16)の少なくとも1つに入れる工程を含む請求項1記載の方法。
- さらに該デバイス(1)を位置させる前に、該毛細管を通って流動する流体へ拡散することができる特定のテスト物質を含有する手段を該毛細管(16)の少なくとも1つに入れる工程を含む請求項4記載の方法。
- さらに、該デバイス(1)を位置させる前に、
系統発生に対する該環境で起こる微生物機能の同定および関連付け、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、SIPと一緒に用いることができる同位体標識テスト化合物を有し、
系統発生に対する該環境でおこる微生物機能の同定および関連付け、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、質量分析と一緒に用いることができる同位体標識テスト化合物を有し、
特定の微生物の該環境における生存、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、該特定の微生物を有し、
特定の遺伝子工学的に作成された微生物の該環境における運命、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは該遺伝子工学的に作成された微生物を含むように配置され、
特定の病原体の該環境における運命、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは該病原体を含むように配置され、
該環境における特定のプロセスにつき、該プロセスを加速するその能力についての特定の変化させるテスト物質の有効性、ここに、該テスト物質は該毛細管(16)に添加されており、
該環境における所望の生物改善プロセスを担う該環境に固有の微生物の同定、
該環境についての該変化する生物改善戦略の有効性、ここに、該微小生態系(16)は該変化する生物改善戦略に代表的なように配置され、
該環境についての該変化する生物増加の有効性、ここに、該微小生態系(16)は該変化する生物増加戦略に代表的なように配置され、
該環境についての該変化する化学的処理戦略の有効性、ここに、該微小生態系(16)は該変化する化学的処理戦略を代表するように配置され、
該環境が特定の汚染物で汚染された場合における、該環境での固有の形質転換速度、
該環境が特定の汚染物で汚染された場合に、該環境での増強された形質転換速度、ここに、特定の栄養素が該毛細管微小生態系(16)に添加されており、
該環境に固有の微生物群の分析、
該環境に固有の微生物群のプロテオミック分析、
潜在的社会的価値の新規な微生物の該環境内での発見、
潜在的社会的価値の新規な生化学プロセスの該環境内での発見、
潜在的社会的価値の新規な自然産物の該環境内での発見、
該テストが行われる時および場所の間の差についての該デバイス(1)で達成されるテスト結果の正規化、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、該結果がそれに対して正規化することができる内部標準として働くように配置されており、
特定の微生物の質量分光分析におけるシグナル対ノイズ比率を増加させる手段、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、他の特定されていない微生物の増殖および生存を制限しつつ、該微生物の増殖を促進するよう配置され、
化学的危険評価の目的での該環境における特定の化合物の運命の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該化合物を有し、
化学的危険評価の目的での該環境の微生物群に対する特定の化合物の効果の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該化合物を有し、
生物学的危険評価の目的での特定の微生物の運命の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該微生物を有し、
生物学的危険評価の目的での該環境の微生物群に対する特定の微生物の効果の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に該特定の微生物を有し、
該環境における特定の剤の効果の、環境モニタリング目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該剤は該微小生態系から回収可能なように入れられ、
該環境における特定の剤の効果の、危険評価目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該剤は該微小生態系から回収可能なように入れられ、
該環境における特定の剤の効果の、環境処理目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該剤は該微小生態系から回収可能なように入れられ、
該環境における特定の剤の効果の、環境モニタリング目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該デバイスは、該微小生態系における該剤と接触する周囲の環境からの該流体が回収可能なように配置され、
該環境における特定の剤の効果の、危険評価目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該デバイスは、該微小生態系における該剤と接触する周囲の環境からの該流体が回収可能なように配置され、
該環境における特定の剤の効果の、環境処理目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該デバイスは、該微小生態系における該剤と接触する周囲の環境からの該流体が回収可能なように配置され、
該環境における特定の生化学プロセスの効果の、環境モニタリング目的での決定、ここに、該微小生態系(16)被覆手段は、該微小生態系における該プロセスの持続が制御できるように配置されており、
該環境における特定の生化学プロセスの効果の、危険評価目的での決定、ここに、該微小生態系(16)被覆手段は、該微小生態系における該プロセスの持続が制御可能なように配置されており、
該環境における特定の生化学プロセスの効果の、環境処理目的での決定、ここに、該微小生態系(16)被覆手段は、該微小生態系における該プロセスの持続が制御可能なように配置されており、
特定の微生物のイン・サイチュ代謝活性の解明、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、該微生物の軽い(標識されていない)および重い(標識された)バイオマーカーの比率につき分析すべき同位体標識テスト化合物を有し、または
該環境における特定の微生物の検出、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、その中に入れられた、イン・サイチュバイオマーカー増幅に続く質量分光分析の間に該微生物の特徴的なバイオマーカーのシグナル対ノイズ比率を増加させるのに適したテスト化合物を有し;
よりなる群から選択される研究興味に取組むのを助けるように毛細管微小生態系を配置する工程を含む請求項1記載の方法。 - さらに、該デバイス(1)を位置させる前に、
系統発生に対する該環境で起こる微生物機能の同定および関連付け、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、SIPと一緒に用いることができる同位体標識テスト化合物を有し、
系統発生に対する該環境で起こる微生物機能の同定および関連付け、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、質量分析と一緒に用いることができる同位体標識テスト化合物を有し、
特定の微生物の該環境のおける生存、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、該特定の微生物を有し、
特定の遺伝子工学的に作成された微生物の該環境における運命、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは該遺伝子工学的に作成された微生物を含むように配置され、
特定の病原体の該環境における運命、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは該病原体を含むように配置され、
該環境における特定のプロセスにつき、該プロセスを加速するその能力についての特定の変化させるテスト物質の有効性、ここに、該テスト物質は該毛細管(16)に添加されており、
該環境における所望の生物改善プロセスを担う該環境に固有の微生物の同定、
該環境についての該変化する生物改善戦略の有効性、ここに、該微小生態系(16)は該変化する生物改善戦略に代表的なように配置され、
該環境についての該変化する生物増加の有効性、ここに、該微小生態系(16)は該変化する生物増加戦略に代表的なように配置され、
該環境についての該変化する化学的処理戦略の有効性、ここに、該微小生態系(16)は該変化する化学的処理戦略を代表するように配置され、
該環境が特定の汚染物で汚染された場合における、該環境での固有の形質転換速度、
該環境が特定の汚染物で汚染された場合に、該環境での増強された形質転換速度、ここに、特定の栄養素が該毛細管微小生態系(16)に添加されており、
該環境に固有の微生物群の分析、
該環境に固有の微生物群のプロテオミック分析、
潜在的商業的価値の新規な微生物の該環境内での発見、
潜在的商業的価値の新規な生化学プロセスの該環境内での発見、
潜在的商業的価値の新規な自然産物の該環境内での発見、
該テストが行われる時および場所の間の差についての該デバイス(1)で達成されるテスト結果の正規化、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、該結果がそれに対して正規化することができる内部標準として働くように配置されており、
特定の微生物の質量分光分析におけるシグナル対ノイズ比率を増加させる手段、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、他の特定されていない微生物の増殖および生存を制限しつつ、該微生物の増殖を促進するよう配置され、
化学的危険評価の目的での該環境における特定の化合物の運命の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該化合物を有し、
化学的危険評価の目的での該環境の微生物群に対する特定の化合物の効果の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該化合物を有し、
生物学的危険評価の目的での特定の微生物の運命の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該微生物を有し、
生物学的危険評価の目的での該環境の微生物群に対する特定の微生物の効果の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に該特定の微生物を有し、
該環境における特定の剤の効果の、環境モニタリング目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該剤は該微小生態系から回収可能なように入れられ、
該環境における特定の剤の効果の、危険評価目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該剤は該微小生態系から回収可能なように入れられ、
該環境における特定の剤の効果の、環境処理目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該剤は該微小生態系から回収可能なように入れられ、
該環境における特定の剤の効果の、環境モニタリング目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該デバイスは、該微小生態系における該剤と接触する周囲の環境からの該流体が回収可能なように配置され、
該環境における特定の剤の効果の、危険評価目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該デバイスは、該微小生態系における該剤と接触する周囲の環境からの該流体が回収可能なように配置され、
該環境における特定の剤の効果の、環境処理目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該デバイスは、該微小生態系における該剤と接触する周囲の環境からの該流体が回収可能なように配置され、
該環境における特定の生化学プロセスの効果の、環境モニタリング目的での決定、ここに、該微小生態系(16)被覆手段は、該微小生態系における該プロセスの持続が制御できるように配置されており、
該環境における特定の生化学プロセスの効果の、危険評価目的での決定、ここに、該微小生態系(16)被覆手段は、該微小生態系における該プロセスの持続が制御可能なように配置されており、
該環境における特定の生化学プロセスの効果の、環境処理目的での決定、ここに、該微小生態系(16)被覆手段は、該微小生態系における該プロセスの持続が制御可能なように配置されており、
特定の微生物のイン・サイチュ代謝活性の解明、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、該微生物の軽い(標識されていない)および重い(標識された)バイオマーカーの比率につき分析すべき同位体標識テスト化合物を有し、または
該環境における特定の微生物の検出、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、その中に入れられた、イン・サイチュバイオマーカー増幅に続く質量分光分析の間に該微生物の特徴的なバイオマーカーのシグナル対ノイズ比率を増加させるのに適したテスト化合物を有し;
よりなる群から選択される研究興味に取組むのを助けるように毛細管微小生態系を配置する工程を含む請求項2記載の方法。 - さらに、該デバイス(1)を位置させる前に、
系統発生に対する該環境で起こる微生物機能の同定および関連付け、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、SIPと一緒に用いることができる同位体標識テスト化合物を有し、
系統発生に対する該環境でおこる微生物機能の同定および関連付け、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、質量分析と一緒に用いることができる同位体標識テスト化合物を有し、
特定の微生物の該環境のおける生存、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、該特定の微生物を有し、
特定の遺伝子工学的に作成された微生物の該環境における運命、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは該遺伝子工学的に作成された微生物を含むように配置され、
特定の病原体の該環境における運命、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは該病原体を含むように配置され、
該環境における特定のプロセスにつき、該プロセスを加速するその能力についての特定の変化させるテスト物質の有効性、ここに、該テスト物質は該毛細管(16)に添加されており、
該環境における所望の生物改善プロセスを担う該環境に固有の微生物の同定、
該環境についての該変化する生物改善戦略の有効性、ここに、該微小生態系(16)は該変化する生物改善戦略に代表的なように配置され、
該環境についての該変化する生物増加の有効性、ここに、該微小生態系(16)は該変化する生物増加戦略に代表的なように配置され、
該環境についての該変化する化学的処理戦略の有効性、ここに、該微小生態系(16)は該変化する化学的処理戦略を代表するように配置され、
該環境が特定の汚染物で汚染された場合における、該環境での固有の形質転換速度、
該環境が特定の汚染物で汚染された場合に、該環境での増強された形質転換速度、ここに、特定の栄養素が該毛細管微小生態系(16)に添加されており、
該環境に固有の微生物群の分析、
該環境に固有の微生物群のプロテオミック分析、
潜在的商業的価値の新規な微生物の該環境内での発見、
潜在的商業的価値の新規な生化学プロセスの該環境内での発見、
潜在的商業的価値の新規な自然産物の該環境内での発見、
該テストが行われる時および場所の間の差についての該デバイス(1)で達成されるテスト結果の正規化、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、該結果がそれに対して正規化することができる内部標準として働くように配置されており、
特定の微生物の質量分光分析におけるシグナル対ノイズ比率を増加させる手段、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、他の特定されていない微生物の増殖および生存を制限しつつ、該微生物の増殖を促進するよう配置され、
化学的危険評価の目的での該環境における特定の化合物の運命の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該化合物を有し、
化学的危険評価の目的での該環境の微生物群に対する特定の化合物の効果の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該化合物を有し、
生物学的危険評価の目的での特定の微生物の運命の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該微生物を有し、
生物学的危険評価の目的での該環境の微生物群に対する特定の微生物の効果の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に該特定の微生物を有し、
該環境における特定の剤の効果の、環境モニタリング目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該剤は該微小生態系から回収可能なように入れられ、
該環境における特定の剤の効果の、危険評価目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該剤は該微小生態系から回収可能なように入れられ、
該環境における特定の剤の効果の、環境処理目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該剤は該微小生態系から回収可能なように入れられ、
該環境における特定の剤の効果の、環境モニタリング目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該デバイスは、該微小生態系における該剤と接触する周囲の環境からの該流体が回収可能なように配置され、
該環境における特定の剤の効果の、危険評価目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該デバイスは、該微小生態系における該剤と接触する周囲の環境からの該流体が回収可能なように配置され、
該環境における特定の剤の効果の、環境処理目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該デバイスは、該微小生態系における該剤と接触する周囲の環境からの該流体が回収可能なように配置され、
該環境における特定の生化学プロセスの効果の、環境モニタリング目的での決定、ここに、該微小生態系(16)被覆手段は、該微小生態系における該プロセスの持続が制御できるように配置されており、
該環境における特定の生化学プロセスの効果の、危険評価目的での決定、ここに、該微小生態系(16)被覆手段は、該微小生態系における該プロセスの持続が制御可能なように配置されており、
該環境における特定の生化学プロセスの効果の、環境処理目的での決定、ここに、該微小生態系(16)被覆手段は、該微小生態系における該プロセスの持続が制御可能なように配置されており、
特定の微生物のイン・サイチュ代謝活性の解明、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、該微生物の軽い(標識されていない)および重い(標識された)バイオマーカーの比率につき分析すべき同位体標識テスト化合物を有し、または
該環境における特定の微生物の検出、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、その中に入れられた、イン・サイチュバイオマーカー増幅に続く質量分光分析の間に該微生物の特徴的なバイオマーカーのシグナル対ノイズ比率を増加させるのに適したテスト化合物を有し;
よりなる群から選択される研究興味に取組むのを助けるように毛細管微小生態系を配置する工程を含む請求項3記載の方法。 - さらに、該デバイス(1)を位置させる前に、
系統発生に対する該環境で起こる微生物機能の同定および関連付け、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、SIPと一緒に用いることができる同位体標識テスト化合物を有し、
系統発生に対する該環境でおこる微生物機能の同定および関連付け、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、質量分析と一緒に用いることができる同位体標識テスト化合物を有し、
特定の微生物の該環境のおける生存、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、該特定の微生物を有し、
特定の遺伝子工学的に作成された微生物の該環境における運命、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは該遺伝子工学的に作成された微生物を含むように配置され、
特定の病原体の該環境における運命、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは該病原体を含むように配置され、
該環境における特定のプロセスにつき、該プロセスを加速するその能力についての特定の変化させるテスト物質の有効性、ここに、該テスト物質は該毛細管(16)に添加されており、
該環境における所望の生物改善プロセスを担う該環境に固有の微生物の同定、
該環境についての該変化する生物改善戦略の有効性、ここに、該微小生態系(16)は該変化する生物改善戦略に代表的なように配置され、
該環境についての該変化する生物増加の有効性、ここに、該微小生態系(16)は該変化する生物増加戦略に代表的なように配置され、
該環境についての該変化する化学的処理戦略の有効性、ここに、該微小生態系(16)は該変化する化学的処理戦略を代表するように配置され、
該環境が特定の汚染物で汚染された場合における、該環境での固有の形質転換速度、
該環境が特定の汚染物で汚染された場合に、該環境での増強された形質転換速度、ここに、特定の栄養素が該毛細管微小生態系(16)に添加されており、
該環境に固有の微生物群の分析、
該環境に固有の微生物群のプロテオミック分析、
潜在的商業的価値の新規な微生物の該環境内での発見、
潜在的商業的価値の新規な生化学プロセスの該環境内での発見、
潜在的商業的価値の新規な自然産物の該環境内での発見、
該テストが行われる時および場所の間の差についての該デバイス(1)で達成されるテスト結果の正規化、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、該結果がそれに対して正規化することができる内部標準として働くように配置されており、特定の微生物の質量分光分析におけるシグナル対ノイズ比率を増加させる手段、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、他の特定されていない微生物の増殖および生存を制限しつつ、該微生物の増殖を促進するよう配置され、
化学的危険評価の目的での該環境における特定の化合物の運命の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該化合物を有し、
化学的危険評価の目的での該環境の微生物群に対する特定の化合物の効果の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該化合物を有し、
生物学的危険評価の目的での特定の微生物の運命の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該微生物を有し、
生物学的危険評価の目的での該環境の微生物群に対する特定の微生物の効果の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に該特定の微生物を有し、
該環境における特定の剤の効果の、環境モニタリング目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該剤は該微小生態系から回収可能なように入れられ、
該環境における特定の剤の効果の、危険評価目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該剤は該微小生態系から回収可能なように入れられ、
該環境における特定の剤の効果の、環境処理目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該剤は該微小生態系から回収可能なように入れられ、
該環境における特定の剤の効果の、環境モニタリング目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該デバイスは、該微小生態系における該剤と接触する周囲の環境からの該流体が回収可能なように配置され、
該環境における特定の剤の効果の、危険評価目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該デバイスは、該微小生態系における該剤と接触する周囲の環境からの該流体が回収可能なように配置され、
該環境における特定の剤の効果の、環境処理目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該デバイスは、該微小生態系における該剤と接触する周囲の環境からの該流体が回収可能なように配置され、
該環境における特定の生化学プロセスの効果の、環境モニタリング目的での決定、ここに、該微小生態系(16)被覆手段は、該微小生態系における該プロセスの持続が制御できるように配置されており、
該環境における特定の生化学プロセスの効果の、危険評価目的での決定、ここに、該微小生態系(16)被覆手段は、該微小生態系における該プロセスの持続が制御可能なように配置されており、
該環境における特定の生化学プロセスの効果の、環境処理目的での決定、ここに、該微小生態系(16)被覆手段は、該微小生態系における該プロセスの持続が制御可能なように配置されており、
特定の微生物のイン・サイチュ代謝活性の解明、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、該微生物の軽い(標識されていない)および重い(標識された)バイオマーカーの比率につき分析すべき同位体標識テスト化合物を有し、または
該環境における特定の微生物の検出、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、その中に入れられた、イン・サイチュバイオマーカー増幅に続く質量分光分析の間に該微生物の特徴的なバイオマーカーのシグナル対ノイズ比率を増加させるのに適したテスト化合物を有し;
よりなる群から選択される研究興味に取組むのを助けるように毛細管微小生態系を配置する工程を含む請求項4記載の方法。 - 複数の物理的に分離されたテスト小宇宙(16)を通っての流体の流動を可能とするように配置された該微小生態系を供するための手段、
環境に該テスト小宇宙(16)が置かれる間にそれらを含み、保護するための手段、該手段は、さらに、該微小生態系(16)に入り、それを通るように該周囲の環境からの流体の流動を可能とし、および
該微小生態系(16)を通っての該流体流動経路を被覆して、該微小生態系を通っての流動を調節するための手段;
を含むことを特徴とする、特定の環境内での微生物につき環境モニタリングおよび生物資源調査をするためのテストデバイス(1)。 - 該複数の微小生態系(16)が、商業的に入手可能なロボットを用いての該微小生態系の自動分析を可能とするように配置された請求項17記載のテストデバイス(1)。
- さらに、該周囲の環境からの、該微小生態系(16)を通っての流体流動を引き起こすための手段、
該微小生態系(16)を通っての該流体流動を収集し、保持するための手段、および
該流体の該微小生態系(16)への逆流を妨げるための該微小生態系から下流にある手段;
を含む請求項17記載のテストデバイス。 - さらに、該周囲の環境からの、該微小生態系(16)を通っての流体流動を引き起こすための手段、
該微小生態系(16)を通っての該流体流動を収集し、保持するための手段、および
該流体の該微小生態系(16)への逆流を妨げるための該微小生態系から下流にある手段;
を含む請求項18記載のテストデバイス。 - さらに、該微小生態系に入る該微生物の収集を促進するように配置された手段を該微小生態系(16)の少なくとも1つに含む請求項17記載のテストデバイス。
- さらに、該微小生態系に入る該微生物の収集を促進するように配置された手段を該微小生態系(16)の少なくとも1つに含む請求項18記載のテストデバイス。
- さらに、該微小生態系に入る該微生物の収集を促進するように配置された手段を該微小生態系(16)の少なくとも1つに含む請求項19記載のテストデバイス。
- さらに、該微小生態系に入る該微生物の収集を促進するように配置された手段を該微小生態系(16)の少なくとも1つに含む請求項20記載のテストデバイス。
- 該微小生態系(16)の少なくとも1つは、該微小生態系を通って流動する流体に拡散できる特定のテスト物質を含有するための手段を有する請求項17記載のテストデバイス(1)。
- 該微小生態系(16)の少なくとも1つは、該微小生態系を通って流動する流体に拡散できる特定のテスト物質を含有するための手段を有する請求項18記載のテストデバイス(1)。
- 該微小生態系(16)の少なくとも1つは、該微小生態系を通って流動する流体に拡散できる特定のテスト物質を含有するための手段を有する請求項19記載のテストデバイス(1)。
- 該微小生態系(16)の少なくとも1つは、該微小生態系を通って流動する流体に拡散できる特定のテスト物質を含有するための手段を有する請求項20記載のテストデバイス(1)。
- 該複数のテスト微小生態系(16)が迅速に交換可能なマイクロタイタープレートの形態で配置された請求項17記載のテストデバイス(1)。
- 該複数のテスト微小生態系(16)が迅速に交換可能なマイクロタイタープレートの形態で配置された請求項18記載のテストデバイス(1)。
- 該複数のテスト微小生態系(16)が迅速に交換可能なマイクロタイタープレートの形態で配置された請求項19記載のテストデバイス(1)。
- 該複数のテスト微小生態系(16)が迅速に交換可能なマイクロタイタープレートの形態で配置された請求項20記載のテストデバイス(1)。
- 該マイクロタイタープレートの内容物が凍結乾燥され、真空シールされる請求項29記載のテストデバイス(1)。
- 該マイクロタイタープレートの内容物が凍結乾燥され、真空シールされる請求項30記載のテストデバイス(1)。
- 該マイクロタイタープレートの内容物が凍結乾燥され、真空シールされる請求項31記載のテストデバイス(1)。
- 該マイクロタイタープレートの内容物が凍結乾燥され、真空シールされる請求項32記載のテストデバイス(1)。
- テスト微小生態系が:
系統発生に対する該環境で起こる微生物機能の同定および関連付け、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、SIPと一緒に用いることができる同位体標識テスト化合物を有し、
系統発生に対する該環境で起こる微生物機能の同定および関連付け、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、質量分析と一緒に用いることができる同位体標識テスト化合物を有し、
特定の微生物の該環境のおける生存、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、該特定の微生物を有し、
特定の遺伝子工学的に作成された微生物の該環境における運命、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは該遺伝子工学的に作成された微生物を含むように配置され、
特定の病原体の該環境における運命、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは該病原体を含むように配置され、
該環境における特定のプロセスにつき、該プロセスを加速するその能力についての特定の変化させるテスト物質の有効性、ここに、該テスト物質は該毛細管(16)に添加されており、
該環境における所望の生物改善プロセスを担う該環境に固有の微生物の同定、
該環境についての該変化する生物改善戦略の有効性、ここに、該微小生態系(16)は該変化する生物改善戦略に代表的なように配置され、
該環境についての該変化する生物増加の有効性、ここに、該微小生態系(16)は該変化する生物増加戦略に代表的なように配置され、
該環境についての該変化する化学的処理戦略の有効性、ここに、該微小生態系(16)は該変化する化学的処理戦略を代表するように配置され、
該環境が特定の汚染物で汚染された場合における、該環境での固有の形質転換速度、
該環境が特定の汚染物で汚染された場合に、該環境での増強された形質転換速度、ここに、特定の栄養素が該毛細管微小生態系(16)に添加されており、
該環境に固有の微生物群の分析、
該環境に固有の微生物群のプロテオミック分析、
潜在的商業的価値の新規な微生物の該環境内での発見、
潜在的商業的価値の新規な生化学プロセスの該環境内での発見、
潜在的商業的価値の新規な自然産物の該環境内での発見、
該テストが行われる時および場所の間の差についての該デバイス(1)で達成されるテスト結果の正規化、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、該結果がそれに対して正規化することができる内部標準として働くように配置されており、
特定の微生物の質量分光分析におけるシグナル対ノイズ比率を増加させる手段、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、他の特定されていない微生物の増殖および生存を制限しつつ、該微生物の増殖を促進するよう配置され、
化学的危険評価の目的での該環境における特定の化合物の運命の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該化合物を有し、
化学的危険評価の目的での該環境の微生物群に対する特定の化合物の効果の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該化合物を有し、
生物学的危険評価の目的での特定の微生物の運命の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該微生物を有し、
生物学的危険評価の目的での該環境の微生物群に対する特定の微生物の効果の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に該特定の微生物を有し、
該環境における特定の剤の効果の、環境モニタリング目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該剤は該微小生態系から回収可能なように入れられ、
該環境における特定の剤の効果の、危険評価目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該剤は該微小生態系から回収可能なように入れられ、
該環境における特定の剤の効果の、環境処理目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該剤は該微小生態系から回収可能なように入れられ、
該環境における特定の剤の効果の、環境モニタリング目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該デバイスは、該微小生態系における該剤と接触する周囲の環境からの該流体が回収可能なように配置され、
該環境における特定の剤の効果の、危険評価目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該デバイスは、該微小生態系における該剤と接触する周囲の環境からの該流体が回収可能なように配置され、
該環境における特定の剤の効果の、環境処理目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該デバイスは、該微小生態系における該剤と接触する周囲の環境からの該流体が回収可能なように配置され、
該環境における特定の生化学プロセスの効果の、環境モニタリング目的での決定、ここに、該微小生態系(16)被覆手段は、該微小生態系における該プロセスの持続が制御できるように配置されており、
該環境における特定の生化学プロセスの効果の、危険評価目的での決定、ここに、該微小生態系(16)被覆手段は、該微小生態系における該プロセスの持続が制御可能なように配置されており、
該環境における特定の生化学プロセスの効果の、環境処理目的での決定、ここに、該微小生態系(16)被覆手段は、該微小生態系における該プロセスの持続が制御可能なように配置されており、
特定の微生物のイン・サイチュ代謝活性の解明、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、該微生物の軽い(標識されていない)および重い(標識された)バイオマーカーの比率につき分析すべき同位体標識テスト化合物を有し、または
該環境における特定の微生物の検出、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、その中に入れられた、イン・サイチュバイオマーカー増幅に続く質量分光分析の間に該微生物の特徴的なバイオマーカーのシグナル対ノイズ比率を増加させるのに適したテスト化合物を有し;
よりなる群から選択される研究興味に取組むのを助けるように配置された請求項17記載のテストデバイス(1)。 - テスト微小生態系が:
系統発生に対する該環境で起こる微生物機能の同定および関連付け、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、SIPと一緒に用いることができる同位体標識テスト化合物を有し、
系統発生に対する該環境で起こる微生物機能の同定および関連付け、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、質量分析と一緒に用いることができる同位体標識テスト化合物を有し、
特定の微生物の該環境のおける生存、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、該特定の微生物を有し、
特定の遺伝子工学的に作成された微生物の該環境における運命、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは該遺伝子工学的に作成された微生物を含むように配置され、
特定の病原体の該環境における運命、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは該病原体を含むように配置され、
該環境における特定のプロセスにつき、該プロセスを加速するその能力についての特定の変化させるテスト物質の有効性、ここに、該テスト物質は該毛細管(16)に添加されており、
該環境における所望の生物改善プロセスを担う該環境に固有の微生物の同定、
該環境についての該変化する生物改善戦略の有効性、ここに、該微小生態系(16)は該変化する生物改善戦略に代表的なように配置され、
該環境についての該変化する生物増加の有効性、ここに、該微小生態系(16)は該変化する生物増加戦略に代表的なように配置され、
該環境についての該変化する化学的処理戦略の有効性、ここに、該微小生態系(16)は該変化する化学的処理戦略を代表するように配置され、
該環境が特定の汚染物で汚染された場合における、該環境での固有の形質転換速度、
該環境が特定の汚染物で汚染された場合に、該環境での増強された形質転換速度、ここに、特定の栄養素が該毛細管微小生態系(16)に添加されており、
該環境に固有の微生物群の分析、
該環境に固有の微生物群のプロテオミック分析、
潜在的商業的価値の新規な微生物の該環境内での発見、
潜在的商業的価値の新規な生化学プロセスの該環境内での発見、
潜在的商業的価値の新規な自然産物の該環境内での発見、
該テストが行われる時および場所の間の差についての該デバイス(1)で達成されるテスト結果の正規化、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、該結果がそれに対して正規化することができる内部標準として働くように配置されており、
特定の微生物の質量分光分析におけるシグナル対ノイズ比率を増加させる手段、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、他の特定されていない微生物の増殖および生存を制限しつつ、該微生物の増殖を促進するよう配置され、
化学的危険評価の目的での該環境における特定の化合物の運命の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該化合物を有し、
化学的危険評価の目的での該環境の微生物群に対する特定の化合物の効果の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該化合物を有し、
生物学的危険評価の目的での特定の微生物の運命の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該微生物を有し、
生物学的危険評価の目的での該環境の微生物群に対する特定の微生物の効果の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に該特定の微生物を有し、
該環境における特定の剤の効果の、環境モニタリング目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該剤は該微小生態系から回収可能なように入れられ、
該環境における特定の剤の効果の、危険評価目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該剤は該微小生態系から回収可能なように入れられ、
該環境における特定の剤の効果の、環境処理目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該剤は該微小生態系から回収可能なように入れられ、
該環境における特定の剤の効果の、環境モニタリング目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該デバイスは、該微小生態系における該剤と接触する周囲の環境からの該流体が回収可能なように配置され、
該環境における特定の剤の効果の、危険評価目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該デバイスは、該微小生態系における該剤と接触する周囲の環境からの該流体が回収可能なように配置され、
該環境における特定の剤の効果の、環境処理目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該デバイスは、該微小生態系における該剤と接触する周囲の環境からの該流体が回収可能なように配置され、
該環境における特定の生化学プロセスの効果の、環境モニタリング目的での決定、ここに、該微小生態系(16)被覆手段は、該微小生態系における該プロセスの持続が制御できるように配置されており、
該環境における特定の生化学プロセスの効果の、危険評価目的での決定、ここに、該微小生態系(16)被覆手段は、該微小生態系における該プロセスの持続が制御可能なように配置されており、
該環境における特定の生化学プロセスの効果の、環境処理目的での決定、ここに、該微小生態系(16)被覆手段は、該微小生態系における該プロセスの持続が制御可能なように配置されており、
特定の微生物のイン・サイチュ代謝活性の解明、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、該微生物の軽い(標識されていない)および重い(標識された)バイオマーカーの比率につき分析すべき同位体標識テスト化合物を有し、または
該環境における特定の微生物の検出、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、その中に入れられた、イン・サイチュバイオマーカー増幅に続く質量分光分析の間に該微生物の特徴的なバイオマーカーのシグナル対ノイズ比率を増加させるのに適したテスト化合物を有し;
よりなる群から選択される研究興味に取組むのを助けるように配置された請求項18記載のテストデバイス(1)。 - テスト微小生態系が:
系統発生に対する該環境で起こる微生物機能の同定および関連付け、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、SIPと一緒に用いることができる同位体標識テスト化合物を有し、
系統発生に対する該環境で起こる微生物機能の同定および関連付け、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、質量分析と一緒に用いることができる同位体標識テスト化合物を有し、
特定の微生物の該環境のおける生存、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、該特定の微生物を有し、
特定の遺伝子工学的に作成された微生物の該環境における運命、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは該遺伝子工学的に作成された微生物を含むように配置され、
特定の病原体の該環境における運命、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは該病原体を含むように配置され、
該環境における特定のプロセスにつき、該プロセスを加速するその能力についての特定の変化させるテスト物質の有効性、ここに、該テスト物質は該毛細管(16)に添加されており、
該環境における所望の生物改善プロセスを担う該環境に固有の微生物の同定、
該環境についての該変化する生物改善戦略の有効性、ここに、該微小生態系(16)は該変化する生物改善戦略に代表的なように配置され、
該環境についての該変化する生物増加の有効性、ここに、該微小生態系(16)は該変化する生物増加戦略に代表的なように配置され、
該環境についての該変化する化学的処理戦略の有効性、ここに、該微小生態系(16)は該変化する化学的処理戦略を代表するように配置され、
該環境が特定の汚染物で汚染された場合における、該環境での固有の形質転換速度、
該環境が特定の汚染物で汚染された場合に、該環境での増強された形質転換速度、ここに、特定の栄養素が該毛細管微小生態系(16)に添加されており、
該環境に固有の微生物群の分析、
該環境に固有の微生物群のプロテオミック分析、
潜在的商業的価値の新規な微生物の該環境内での発見、
潜在的商業的価値の新規な生化学プロセスの該環境内での発見、
潜在的商業的価値の新規な自然産物の該環境内での発見、
該テストが行われる時および場所の間の差についての該デバイス(1)で達成されるテスト結果の正規化、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、該結果がそれに対して正規化することができる内部標準として働くように配置されており、
特定の微生物の質量分光分析におけるシグナル対ノイズ比率を増加させる手段、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、他の特定されていない微生物の増殖および生存を制限しつつ、該微生物の増殖を促進するよう配置され、
化学的危険評価の目的での該環境における特定の化合物の運命の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該化合物を有し、
化学的危険評価の目的での該環境の微生物群に対する特定の化合物の効果の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該化合物を有し、
生物学的危険評価の目的での特定の微生物の運命の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該微生物を有し、
生物学的危険評価の目的での該環境の微生物群に対する特定の微生物の効果の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に該特定の微生物を有し、
該環境における特定の剤の効果の、環境モニタリング目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該剤は該微小生態系から回収可能なように入れられ、
該環境における特定の剤の効果の、危険評価目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該剤は該微小生態系から回収可能なように入れられ、
該環境における特定の剤の効果の、環境処理目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該剤は該微小生態系から回収可能なように入れられ、
該環境における特定の剤の効果の、環境モニタリング目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該デバイスは、該微小生態系における該剤と接触する周囲の環境からの該流体が回収可能なように配置され、
該環境における特定の剤の効果の、危険評価目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該デバイスは、該微小生態系における該剤と接触する周囲の環境からの該流体が回収可能なように配置され、
該環境における特定の剤の効果の、環境処理目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該デバイスは、該微小生態系における該剤と接触する周囲の環境からの該流体が回収可能なように配置され、
該環境における特定の生化学プロセスの効果の、環境モニタリング目的での決定、ここに、該微小生態系(16)被覆手段は、該微小生態系における該プロセスの持続が制御できるように配置されており、
該環境における特定の生化学プロセスの効果の、危険評価目的での決定、ここに、該微小生態系(16)被覆手段は、該微小生態系における該プロセスの持続が制御可能なように配置されており、
該環境における特定の生化学プロセスの効果の、環境処理目的での決定、ここに、該微小生態系(16)被覆手段は、該微小生態系における該プロセスの持続が制御可能なように配置されており、
特定の微生物のイン・サイチュ代謝活性の解明、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、該微生物の軽い(標識されていない)および重い(標識された)バイオマーカーの比率につき分析すべき同位体標識テスト化合物を有し、または
該環境における特定の微生物の検出、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、その中に入れられた、イン・サイチュバイオマーカー増幅に続く質量分光分析の間に該微生物の特徴的なバイオマーカーのシグナル対ノイズ比率を増加させるのに適したテスト化合物を有し;
よりなる群から選択される研究興味に取組むのを助けるように配置された請求項19記載のテストデバイス(1)。 - テスト微小生態系が:
系統発生に対する該環境で起こる微生物機能の同定および関連付け、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、SIPと一緒に用いることができる同位体標識テスト化合物を有し、
系統発生に対する該環境で起こる微生物機能の同定および関連付け、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、質量分析と一緒に用いることができる同位体標識テスト化合物を有し、
特定の微生物の該環境のおける生存、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、該特定の微生物を有し、
特定の遺伝子工学的に作成された微生物の該環境における運命、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは該遺伝子工学的に作成された微生物を含むように配置され、
特定の病原体の該環境における運命、ここに、該毛細管(16)の少なくとも1つは該病原体を含むように配置され、
該環境における特定のプロセスにつき、該プロセスを加速するその能力についての特定の変化させるテスト物質の有効性、ここに、該テスト物質は該毛細管(16)に添加されており、
該環境における所望の生物改善プロセスを担う該環境に固有の微生物の同定、
該環境についての該変化する生物改善戦略の有効性、ここに、該微小生態系(16)は該変化する生物改善戦略に代表的なように配置され、
該環境についての該変化する生物増加の有効性、ここに、該微小生態系(16)は該変化する生物増加戦略に代表的なように配置され、
該環境についての該変化する化学的処理戦略の有効性、ここに、該微小生態系(16)は該変化する化学的処理戦略を代表するように配置され、
該環境が特定の汚染物で汚染された場合における、該環境での固有の形質転換速度、
該環境が特定の汚染物で汚染された場合に、該環境での増強された形質転換速度、ここに、特定の栄養素が該毛細管微小生態系(16)に添加されており、
該環境に固有の微生物群の分析、
該環境に固有の微生物群のプロテオミック分析、
潜在的商業的価値の新規な微生物の該環境内での発見、
潜在的商業的価値の新規な生化学プロセスの該環境内での発見、
潜在的商業的価値の新規な自然産物の該環境内での発見、
該テストが行われる時および場所の間の差についての該デバイス(1)で達成されるテスト結果の正規化、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、該結果がそれに対して正規化することができる内部標準として働くように配置されており、
特定の微生物の質量分光分析におけるシグナル対ノイズ比率を増加させる手段、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、他の特定されていない微生物の増殖および生存を制限しつつ、該微生物の増殖を促進するよう配置され、
化学的危険評価の目的での該環境における特定の化合物の運命の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該化合物を有し、
化学的危険評価の目的での該環境の微生物群に対する特定の化合物の効果の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該化合物を有し、
生物学的危険評価の目的での特定の微生物の運命の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該微生物を有し、
生物学的危険評価の目的での該環境の微生物群に対する特定の微生物の効果の決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に該特定の微生物を有し、
該環境における特定の剤の効果の、環境モニタリング目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該剤は該微小生態系から回収可能なように入れられ、
該環境における特定の剤の効果の、危険評価目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該剤は該微小生態系から回収可能なように入れられ、
該環境における特定の剤の効果の、環境処理目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該剤は該微小生態系から回収可能なように入れられ、
該環境における特定の剤の効果の、環境モニタリング目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該デバイスは、該微小生態系における該剤と接触する周囲の環境からの該流体が回収可能なように配置され、
該環境における特定の剤の効果の、危険評価目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該デバイスは、該微小生態系における該剤と接触する周囲の環境からの該流体が回収可能なように配置され、
該環境における特定の剤の効果の、環境処理目的での決定、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つはその中に入れられた該剤を有し、該デバイスは、該微小生態系における該剤と接触する周囲の環境からの該流体が回収可能なように配置され、
該環境における特定の生化学プロセスの効果の、環境モニタリング目的での決定、ここに、該微小生態系(16)被覆手段は、該微小生態系における該プロセスの持続が制御できるように配置されており、
該環境における特定の生化学プロセスの効果の、危険評価目的での決定、ここに、該微小生態系(16)被覆手段は、該微小生態系における該プロセスの持続が制御可能なように配置されており、
該環境における特定の生化学プロセスの効果の、環境処理目的での決定、ここに、該微小生態系(16)被覆手段は、該微小生態系における該プロセスの持続が制御可能なように配置されており、
特定の微生物のイン・サイチュ代謝活性の解明、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、その中に置かれた、該微生物の軽い(標識されていない)および重い(標識された)バイオマーカーの比率につき分析すべき同位体標識テスト化合物を有し、または
該環境における特定の微生物の検出、ここに、該微小生態系(16)の少なくとも1つは、その中に入れられた、イン・サイチュバイオマーカー増幅に続く質量分光分析の間に該微生物の特徴的なバイオマーカーのシグナル対ノイズ比率を増加させるのに適したテスト化合物を有し;
よりなる群から選択される研究興味に取組むのを助けるように配置された請求項20記載のテストデバイス(1)。 - さらに、該微小生態系流体流動経路を被覆するための該手段の操作を遠隔操作するための手段を含む請求項17記載のテストデバイス。
- さらに、該微小生態系流体流動経路を被覆するための該手段、および該微小生態系(16)を通っての流体流動を引き起こすための該手段の操作を遠隔制御するための手段を含む請求項18記載のテストデバイス。
- さらに、該微小生態系流体流動経路を被覆するための該手段の操作を遠隔操作するための手段を含む請求項19記載のテストデバイス。
- さらに、該微小生態系流体流動経路を被覆するための該手段、および該微小生態系(16)を通っての流体流動を引き起こすための該手段の操作を遠隔制御するための手段を含む請求項20記載のテストデバイス。
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