JP2005516201A - 自動化された貯蔵および回収装置および方法 - Google Patents

自動化された貯蔵および回収装置および方法 Download PDF

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Abstract

対象物を保持するトレイ(901a)の自動化された貯蔵および回収用装置および方法。複数のトレイ(901a)はアクセス装置に挿入される。コンピュータシステムはアクセス装置、貯蔵棚とワークセルガントリとの間で前記トレイ(901a)を動かすために貯蔵ガントリを制御するようにプログラムされている。

Description

本発明は、微視的結晶を連続して検査するための検査装置に関連して使用する自動化された貯蔵および回収装置および方法、かつ、とくに微視的結晶を連続して検査するための検査装置に関連して使用される装置および方法に関する。
物質の三次元原子構造の測定は純粋なおよび応用研究の最も重要な分野の1つである。物質の三次元原子構造を測定することができる1つの方法はX線クリスタログラフィを通じてである。X線クリスタログラフィは結晶中の原子の精密な配列を測定するために結晶からのX線の回折を利用している。その結果は金属合金、デオキシリボ核酸(DNA)、またはタンパク質の構造のごとき物質の原子構造を明らかにすることができる。
タンパク質結晶の正確な分子構造を知ることには非常に重要な利益がある。例えば、いったん分子構造が知られると、薬品デザイナは有効な治療剤および薬品をより有効に開発することができる。しかしながら、その保証にも拘らず、X線クリスタログラフィは上首尾な結晶を成長させるのが非常に難しいという事実によって制限される。
結晶を成長させる従来技術の方法
タンパク質結晶は微小窪みプレート(ミクロウェルプレート)の窪み内で一般に成長させられる。微小窪みプレートは、また、微小滴定量プレート(ミクロ滴定量プレート)または微小板(ミクロプレート)として知られている。微小窪みプレートは、代表的には、24,48,96,384または1536個の窪みが付いている。96個の窪みの微小窪みプレートが図2に詳細に示されている。タンパク質結晶が成長され得る多数の方法がある。5個の一般的な方法が以下で要約される。
ハンギングドロップ方法
ハンギングドロップ(垂れ下がっている液滴)または蒸気拡散方法として知られる、結晶を成長させるのに利用し得る主要な技術の1つは、タンパク質を含んでいる溶液の1滴がガラスカバースリップに塗布されかつ条件がタンパク質滴内の超飽和およびタンパク質結晶の沈殿の開始に至る蒸気拡散室のごとき装置に逆さまに配置される方法である。
シッティングドロップ方法
他の方法は、液滴がその上方に垂れ下がるのに代えて成長溶液に隣接して小さい窪み内に位置しているシッティングドロップ方法である。この方法はより安定したドロップ(液滴)および位置を設ける。
油中の水性ドロップ方法
他の方法は、油中の水性ドロップ方法である。ドロップは微小窪み中に置かれそして油を基礎にした溶液で被覆される。ドロップは結晶が成長するとき窪みの底に留まる。
透析方法
透析方法(また、ミクロバッチ結晶化と呼ばれる)として言及される他の方法において、タンパク質溶液は半透過サイズの排除膜内に収容されかつ固定のpHおよび沈殿剤濃度の溶液中に置かれる。沈殿剤は膜を通ってタンパク質隔室内に拡散するので、タンパク質の可溶性は減少されかつ結晶ができ得る。
ゲル結晶成長方法
この方法は小径のガラス毛細管の端部へのゲルの配置を伴う。溶液がゲルになった後、タンパク質溶液は毛細管の一端(頂部)に置かれそして他端は沈殿剤の溶液中に沈められる。条件が適切に選択されるならば、結晶成長はタンパク質および沈殿剤が、溶液が拡散によりゆっくり混合するとき、適切な濃度に達するゲル中の或る点において発生する。これは拡散制限方法であるので、それはしたがって延長された時間周期後のみ発生する。しかしながら、この方法によって成長させられた結晶はしばしばより大きくかつより高い品質からなる。
選ばれた方法に関係なく、タンパク質結晶成長は非常に繊細でかつ時間の掛かる方法である。十分な大きさおよび品質の結晶が成長させられかつX線クリスタログラフィに用意される前に数日ないし数ヶ月を要するかもしれない。代表的に述べられる現在の最小の大きさは少なくとも厚さ50ミクロン×長さ100ミクロンの結晶である。タンパク質結晶成長環境条件は、化学から、周囲空気湿度および温度、汚染を阻止するような清潔、およびムラの無い照明条件に厳密に維持される必要がある。未知のタンパク質グループに取り組むタンパク質クリスタログラファは適切な大きさの品質の結晶を成長させるのにおよそ5%の成功だけかもしれない。この成功率によれば、例えば、96個の窪みの微小窪みプレートは良好な結晶がその中に成長している5個の窪みを有するのみかもしれない。
従来技術の結晶成長の検査
現在、研究所の技術者またはオペレータは、顕微鏡および研究ノートを用いて、微小窪みプレート中に成長された結晶を手で検査している。微小窪みプレートを検査するために、研究所の技術者はクリーンルームガウンスーツを着用しそして結晶がその中で成長している冷蔵室に入る。技術者は次いで顕微鏡の下に微小窪みプレートを置きそして微小窪みプレート内の窪みのすべてが検査されるまで微小窪みプレート内の各窪みを検査する。技術者は次いで彼が結晶をどのように分類(また、「スコア」として知られる)するかを観念的に判断する。例えば、技術者は、彼が「粒状の沈殿物」または「酷い沈殿物」を示すイメージを観察していると感じるかもしれない。もしくは彼は、イメージが「結晶成長なし」を示すことを感じるかもしれない。技術者は次いで研究ノートへ分類を記録する。
上記のシステムは人間のエラーの機会でいっぱいである。オペレータは、96個の窪みの微小窪みプレートを手で検査するのに、オペレータの熟練および関心の或る特徴、微小結晶または結晶を包含する窪みの数に依存しておよそ5ないし20分を要する。オペレータは肉体的疲労を余儀なくされ、眼精疲労を被り、そして制御された温度および一般に高い湿度の室内で不快に冷やされるかもしれない。オペレータは疲れかつ混乱しそしてノートにデータを手で記録するのにエラーし易い。例えば、オペレータは窪みH5(図2)で結晶成長を観察するかもしれないが、結晶成長が窪みH6であったようにノートに間違って記録するかもしれない。追加的な転写エラーが、データがコンピュータデータベースに伝達されるとき発生するかもしれない。
研究努力は上記課題を解決しようとするために行なわれるが、それらは工業の受容には不適切である。かかる1つの努力は、IBMシステムジャーナル、第40巻、第2号、2001年の「タンパク質結晶成長に関する理にかなった決定支持」にジュリシカ等によって記載されている。かかる他の努力はウェブサイトwww.dsitech.comに記載されている。
微小窪みプレート貯蔵および回収手順による現行の課題
代表的には、技術者が結晶成長に関して微小窪みプレートを検査した後、微小窪みプレートは、それが再びそれを検査するときまで蓄えられる。微小窪みプレート中のタンパク質結晶の成長および上首尾の結晶成長に関する微小窪みプレートの付随する検査は実験室において大量に同時に代表的に実施される手順である。例えば、あらゆる付与されたときに代表的な実験はタンパク質結晶がその中で成長しようとしている文字通り数千の微小窪みプレートを有することができる。タンパク質結晶の成長サイクルはおよそ6ヶ月にすることができる。6ヶ月の時間周期の間中、微小窪みプレートはおよそ12回まで検査されることができる。検査を必要とする数千の微小窪みプレートがあるならば、微小窪みプレートをその貯蔵位置から手で動かし、それを顕微鏡の下に置き、結果を記録し、かつ次いでそれをその適切な貯蔵位置に戻すのは非常に時間の掛かる作業であるかもしれない。そのうえ、特定の微小窪みプレートが属する場所を技術者が忘れるようなものすごく大きな機会がある。もしくは、かかる大量の微小窪みプレートを取り扱っている技術者は彼が取り扱っている微小窪みプレートを容易に落とすかあるいは微小窪みプレートを損傷するかもしれない。
必要とされるのは、微小窪みプレートを包含しているトレイを補完および回収するための良好な装置および方法である。
本発明は、対象物を保持するトレイを自動的に貯蔵および回収する装置および方法を提供する。複数のトレイがアクセス装置に挿入される。コンピュータシステムは、貯蔵ガントリを制御してアクセス装置、貯蔵棚および作業室ガントリ間でトレイを動かすようにプログラムされる。コンピュータシステムは、また、作業室ガントリを制御して自動受容機械に向離して対象物を動かすようにプログラムされる。好適な実施の形態において、トレイ中の対象物は微視的結晶がその中に成長しているかもしれない複数の微小窪みプレートでありかつ自動受容機械は微視的結晶を検査しかつ分類するように形作られている。検査および分類装置はカメラのカメラ視界中に微視的結晶を連続して配置するための割り出し装置を有しそして制御コンピュータは割り出し装置を制御しかつ微視的結晶の画像をカメラに撮らせかつ次いで画像が分類される分類プロセッサに画像を転送させるようにプログラムされる。好適な実施の形態において、微視的結晶は微小窪みプレートの窪み中に成長されたタンパク質結晶である。
本発明の好適な実施の形態について図面を参照して詳細に説明する。
(第一の実施の形態)
図1は本発明の好適な実施の形態を示している。微小窪みプレート125A〜125Fは固定プレート129上に置かれる。好適な実施の形態において、各微小窪みプレートは96個の窪みを有している。各窪みは微視的タンパク質結晶がその中に成長しているかもしれない液滴を有している。コンピュータ105はリニヤアクチュエータ115,150および160を自動的に制御する。リニヤアクチュエータ115はx軸線に沿って固定プレート129を動かす。リニヤアクチュエータ150はy軸線に沿って可動ベース154を動かし、そしてリニヤアクチュエータ160はz軸線に沿って可動プレート162を動かす。コンピュータは各微小窪みプレート125A〜125Fの各窪みの上方にカメラ155および135を連続して適切に位置決めするようにニヤアクチュエータの運動をうまく調整する。好ましくは、カメラ155および135は、1,300の水平画素×1,030の垂直画素を有する、高解像度の2/3インチCCDカメラである。各画素は、好ましくは、8.7mm×6.9mmの感知面積を有する6.7平方ミクロンである。カメラ155および135は各窪みの画像を撮りかつ画像が各ピクセルの強度(0から255)を表しているグレイレベルの8ビットによりおよそ1,296水平画素×1,000垂直画素の画像データアレイにデジタル化されるコンピュータ105に画像を伝送する。これらのデジタル化された画像はコンピュータ105のデータベースに自動的に記録されかつモニタ620を介してオペレータによって分析されかつ採点されることができる。デジタル化された画像はさらに処理され、分析され、そして個々の窪みの内容が画像データアレイについての計算を実行するためにプログラム指示を実施するコンピュータ105によって採点され得る。好適な実施の形態において、コンピュータ105は通信/制御ラインを介してコンピュータネットワークに接続される。この方法において、本発明は遠隔コンピュータから制御されることができる。同様に、画像およびデータは遠隔コンピュータに伝送されることができる。
好適な実施の形態の作動シーケンス
システム上に負荷された微小窪みプレート
図1に示されるように、6枚の96個の窪みの微小窪みプレート125A〜125Fが固定プレート129上に(オペレータによってまたは外部の積載ロボットによって)置かれている。96個の窪みの微小窪みプレート125Aは図2に示されている。微小窪みプレート125AはA1ないしH12が付された窪みおよびバーコードラベル220を有している。微小窪みプレート125Aは、ニューヨーク、ロチェスターに合衆国事務所を有する、ナルゲ―ナンク・インターナショナル(Nalge−Nunc International)から入手可能である。固定プレート129は微小窪みプレートの外側幅および長さが当該業界において事実上標準であるので24、48、96、384または1536個の窪みの微小窪みプレートを保持する。96個の窪みの微小窪みプレートが本発明を例示するのに使用される。
図3は微小窪みプレート125A〜125Fを積載する直前の固定プレート129の上面図を示している。固定プレート129は微小窪みプレート125A〜125Fより事実上僅かに小さい長さおよび幅の6個の切り欠き部分131を有している。
図4は微小窪みプレート125A〜125Fが固定プレート129上に置かれた直後の微小窪みプレート125A〜125Fの上面図を示している。
オペレータが図4に示されるように固定プレート129上に微小窪みプレート125A〜125Fを配置した後、彼は戻り止め510および520(図5)を広げるためにコンピュータ105(図1および図6)にコマンドを入力する。戻り止め510および520の拡張はプレートストッパ530に対して微小窪みプレート125A〜125Fをしっかり固定する。
微小窪みプレートに関するバーコード情報を記録
コンピュータ105(図1)はオペレータから入力を受信するようにプログラムされている。図7はモニタ620のスクリーン上に微小窪みプレート125A〜125Fを表示しているディスプレイを示している。図7において、オペレータはバー622A〜622Fをグリーンに向けさせたバー622A〜622F上でクリックされるマウスを有している。バー622A〜622F上でクリックすることによって、オペレータは対応する微小窪みプレート125A〜125Fを「実行」に選択した。オペレータは実行バー623をクリックすることにより選択された微小窪みプレートを実行するコマンドを送信する。
図8において、オペレータは選択された微小窪みプレートを実行するコマンドを付与した。微小窪みプレート125Aはカメラ155および135の下の位置に動かされた。プレートセンサ送信機/受信機186および反射器188の利用によって、微小窪みプレート125Aがカメラの下の位置にあることを報告している情報はコンピュータ105に送られる。プレートセンサ送信機/受信機186は支持体189に固定されかつ微小窪みプレートが送信機/受信機186によって放出されかつ反射器188によって反射された光のビームを遮断するたびに感知するように配列される。反射器188はリニヤアクチュエータ115の反対側で支持体191に取り付けられる。プレートセンサ送信機/受信機186および反射器188は、好ましくは、カリフォルニア州、サンタ・アナのウエスタン・スイッチ・コントロールズから入手できるモデル#E3T−SR13である。
バーコードリーダ175はまた支持体189に取り付けられかつカメラ155および135の下に位置決めされるとき微小窪みプレート125Aに取着されるバーコード識別ラベル220(図2)を調べるように位置決めされる。バーコードリーダ175は、好ましくは、ニュージャージー州、ニューワークのアメリカのキーエンス・コーポレイションから入手できるモデル#BL601である。バーコードリーダ175は通信ラインを介してコンピュータ105と通信する。ラベル220に符号化された情報は、好ましくは、プレートシリアルナンバー、プレート型式(すなわち、24個の窪み、48個の窪み、96個の窪み、384個の窪み、または1536個の窪みの微小窪みプレート)、および窪みの型式(すなわち、正方形、または丸くされた、垂れ下がり液滴、置かれている液滴、抑制されて置かれている液滴)を含んでいる。
プレートセンサ送信機/受信機186およびバーコードリーダ175からの情報はコンピュータ105に送信されかつカメラ検査および情報獲得段階の間中、後での使用のために記憶される。
図9において、リニヤアクチュエータ115は微小窪みプレート125Bがカメラ155および135の下にあるように固定プレート129を動かした。微小窪みプレート125Aに関連して上述した方法と同様な方法において、情報はレートセンサ送信機/受信機186およびバーコードリーダ175からコンピュータ105に送信されかつカメラ検査および情報獲得段階の間中、後での使用のために記憶される。
上述したシーケンスはすべての微小窪みプレート125A〜125Fがプレートセンサ送信機/受信機186およびバーコードリーダ175によって感知されかつ記録されるまで継続する。
次いで、図10に示されるように、リニヤアクチュエータ115はカメラ165および155の下にあるように微小窪みプレート125Aを動かす。リニヤアクチュエータ160のモータ130は窪みA1の上方に垂れ下がっている液滴上にレンズ165を適切に焦点合わせする必要があるので上方に向かっておよび/または下方に向かって可動プレート162を動かす。好ましくは、レンズ165は予め定めたズームに設定される。
結晶の検査
各窪み内の液滴の位置の測定
各垂れ下がっている液滴を測定するために各窪みを検査するための作動は微小窪みプレート125Aが図10に示される位置に動かされた後微小窪みプレート125A上で実施される。
図11は微小窪みプレート125Aの窪みA1〜E1の断面側面図を示している。好適な実施の形態において、微小窪みプレート125Aの窪みの各々に垂れ下がっている液滴中にタンパク質結晶を成長させることが試みられた。図11は垂れ下がっている液滴α1、β1、χ1、δ1、およびε1を示している。
タンパク質結晶成長のための好適な方法は垂れ下がっている液滴(ハンギングドロップ)方法である。垂れ下がっている液滴方法(また蒸気拡散として知られる)は多分、タンパク質結晶成長の最も普通の方法である。背景部分において説明されたように、タンパク質溶液の液滴は緩衝剤および沈殿剤を収容している容器の上面に垂れ下がる。水が液滴から最適な結晶成長条件により液滴を出ている溶液に拡散する。
図10において、カメラ155のレンズ165は微小窪みプレート125Aの窪みA1の上方にある(図2、図11、および図13)。図13は固定プレート129上に位置決めされた微小窪みプレート125Aの上面図を示している。
図14は固定プレート129上に位置決めされた微小窪みプレート125Aの側面図を示している。埋め込まれた光源194を備えた支持体191は固定プレート129の側部に位置決めされる。光ガイド195からの光は切り欠き131(同様に図3に示される)を通って上方に向けられる。光ガイド195は固定プレート129とプレート127との間に位置決めされこのようにすると両方のプレートは干渉なしに光ガイド195の周りに動くことができる。上述されたように、固定プレート129は微小窪みプレート125より小さくかつ各窪みプレートの下に配置される切り欠き131(図3)を有し、そのようにすると光ガイド195からの光は窪みプレートが検査のために位置決めされるとき窪みプレートを通して投射されることができる。好適な実施の形態において、光源194は、カリフォルニア州、カールスバッドのイージス・エレクトロニクスから入手できるモデル#A08925ファイバオプティックバックライトである。
カメラ155(図10)は窪みA1を検査しかつデジタル化のためにコンピュータ105に画像を送信する。上述したように、カメラ155は好ましくは(図10)、各6.7ミクロンの正方形のピクセルが、レンズ165によって発生される幾らか小さい歪みを許容している、測定されている物体上およそ6.7ミクロンの正方形を表すように1X倍率で窪みA1を検査する。コンピュータ105はカメラ画像をデジタル化するようにプログラムされかつ次いでビジョンソフトウエアを利用することによりグリースシール361から垂れ下がっている液滴に関して窪みA1内の位置を測定する。液滴の位置は後で使用するためにコンピュータ105のハードドライブ上にかつコンピュータ内のメモリ位置に記録される。
好適な実施の形態において、液滴の位置を測定するのに使用されるビジョンソフトウエアは、MVツールズ(MVTools)と呼ばれる画像処理機器の収集からmvt_blob_findと呼ばれるソフトウエアルーチンアルゴリズムを使用する。MVツールズはコレコ・イメージング(Coreco Imaging)のマサチューセッツ州(MA)、ベドフォードにあるアメリカ事務所から入手できる。
窪みA1内にグリースシール361から垂れ下がっている液滴の位置を記録した後、リニヤアクチュエータ115はレンズ165が窪みB1(図13)上にあるように左方に僅かに固定プレートを動かす。窪みA1に関して記載された方法と同様な方法において、窪みB1内にグリースシール361から垂れ下がっている液滴の位置はコンピュータ105のハードドライブ上にかつコンピュータメモリ内に記録される。例えば、図15に示されるように、コンピュータ105は液滴α1が窪みA1の上方左方象限に向かっていることを記録する。同様に、液滴β1の位置は窪みB1の下方右方象限にあるようにコンピュータ105のデータベース上に記録される。
この方法において、液滴の位置はセルA1−H12に関して記録される。図18において、リニヤアクチュエータ115は窪みH1がレンズ165の下にあるように固定プレート129を動かした。
図19において、リニヤアクチュエータ115は固定プレート129を左方に動かしそしてリニヤアクチュエータ150はレンズ165が微小窪みプレート125A(図13)の窪みA2の上方にあるように可動ベース154を僅かに後方に動かした。
上述した方法と同じ方法において、液滴の位置はセルA2−H12(図2、図13)に関して記録される。図20において、リニヤアクチュエータ115は固定プレート129を左方に動かしそしてリニヤアクチュエータ150は窪みH12がレンズ165の下にあるように可動ベース154を後方に動かした。
液滴の位置が微小窪みプレート125AのセルA1−H12に関して記録された後、リニヤアクチュエータ115は固定プレート129を動かしそしてリニヤアクチュエータ150は微小窪みプレート125BのセルA1がレンズ165の下にあるように可動ベース154を後方に動かす(図21)。
上述した方法と同じ方法において、液滴の位置は各微小窪みプレート125A〜125FのセルA1−H12に関して記録される。図22において、リニヤアクチュエータ115は固定プレート129を動かしそしてリニヤアクチュエータ150は微小窪みプレート125Fの窪みH12がレンズ165の下にあるように可動ベース154を動かす。
各窪み内の液滴の画像を記録
各垂れ下がっている液滴を検査するための作動は、2.68ミクロン正方形(2.5Xにおいて)から0.67ミクロン正方形(10Xにおいて)を表しているデジタル化されたピクセルにほぼ対応している2.5Xから10Xの倍率が可能なそのズームレンズ145を有するカメラ135を使用してより高い倍率で実施される。この検査はタンパク質結晶が成長したかどうかを判断するためになされる。ズームモータ192はズームレンズ145のズーム度を制御する。検査窪みシーケンスの間に得られた各窪み内の液滴の位置を表示しているデータを使用して、コンピュータ105(図1)は各窪み内の液滴の上方にレンズ145を直接位置決めするためにリニヤアクチュエータ115および150に信号を自動的に送信する。例えば、図23において、レンズ145は微小窪みプレート125Aの窪みA1の頂部の上に位置決めされる。以前に得られた位置決めデータを使用して、レンズ145はそれが液滴α1(図13)の頂部上でズームすることができるように精密に位置決めされる。図16は液滴α1の拡大図を示している。図23において、リニヤアクチュエータ160のモータ130は液滴α1上にレンズ165を適切に焦点合わせするのに必要であるように上方に向けておよび/または下方に向けて可動プレート162を動かした。ズームモータ192は所望のズーム度を得るようにレンズ165を操作した。カメラ135は窪みA1を検査しかつ垂れ下がっている液滴の拡大画像を表示している信号をコンピュータ105に送信する。画像は即座の分析のためにコンピュータ105のメモリ内に一時的にかつ後での分析のためにハードディスクに記憶される。
同様な方法において、リニヤアクチュエータ115,150および160およびズームモータ192は画像データ記憶のための所望の焦点合わせおよび倍率を得るために各垂れ下がっている液滴の上方にズームレンズ145を適切に位置決めしかつ拡大するように作動する。例えば、図17は垂れ下がっている液滴β1の拡大図を示している。
検査窪みシーケンスの間中上述された方法と同じ方法において、液滴の拡大画像(図16および図17に示された拡大画像と同様な)は微小窪みプレート125A(図2、図13)のセルA1−H12に関して記録される。図24において、リニヤアクチュエータ115は固定プレート129を動かしそしてリニヤアクチュエータ150は微小窪みプレート125Aの窪みH12がレンズ165の下にあるように可動ベース154を動かした。
次いで、シーケンスは垂れ下がっている液滴の拡大画像が微小窪みプレート125B〜125Fの各セルA1−H12に関して記録されるように微小窪みプレート125B〜125Fに関して繰り返される。図25において、シーケンスは微小窪みプレート125A〜125Fに関して終了した。リニヤアクチュエータ115は固定プレート129を動かしそしてリニヤアクチュエータ150は微小窪みプレート125Fの窪みH12がレンズ145の下にあるように可動ベース154を動かした。
各窪み内の液滴の手動スコアリング
微小窪みプレート125A〜125Fが実行された後、モニタ620は図26に示されるように現れる。図26において、微小窪みプレート125A〜125Fを表示している6個の画像がスクリーン上に現れている。各画像の上には垂れ下がっている液滴の画像データがコンピュータ105に移されたことを指示しているメッセージ″実行完了″がある。各画像の下には″S″がマークされたボタン710〜715がある。いずれかのボタン710〜715上でマウスをクリックすることにより、オペレータは各垂れ下がっている液滴の各々拡大された画像を上首尾の結晶形成のために手動でスコアすることができる。
例えば、図26において、オペレータは微小窪みプレート125Aをスコアするためにボタン710上でマウスをクリックすることができる。
図27において、オペレータは微小窪みプレート125Aの窪みA1を表示している円上でマウスをクリックした。これはスクリーン部分716に液滴α1について表示されるような拡大された画像を発生した。オペレータは液滴α1中に結晶がなしであると判断しかつそれゆえ、″NO CRYSTAL(結晶なし)″に関してボタン717上でマウスをクリックした。表示スクリーン上で、これは微小窪みプレート125Aの窪みA1を表示している円を赤の表示に変化させた。
図28において、オペレータは微小窪みプレート125Aの窪みB1を表示している円上でマウスをクリックした。これはスクリーン部分716に液滴β1について表示されるような拡大された画像を発生した。オペレータは液滴β1中に結晶があると判断しかつそれゆえ、″CRYSTAL(結晶)″に関してボタン718上でマウスをクリックした。表示スクリーン上で、これは微小窪みプレート125Aの窪みB1を表示している円を緑の表示に変化させた。
同様な方法において、上記スコアリング手順は微小窪みプレート125A〜125Fのすべての窪みA1〜H12が赤(結晶なし)または緑(結晶)のいずれかとしてスコアされた。
データ利用
いったん微小窪みプレート125A〜125Fがすべてスコアされると、オペレータは彼の容易な処理において結晶形成が微小窪みプレート内の各窪みに関して発生したかどうかを要約しているスコアに沿って検査された各微小窪みプレートの識別を包含するデータベースを有している。オペレータが獲得することができる自動化されたかつ効率の良い方法は顕微鏡による各窪みを実験的に検査しかつ結果をノートに手書きする従来技術の方法と対比している。
例えば、6枚の96個の窪みの微小窪みプレートをスコアするために本発明を利用することはおよそ10から15分より多くは掛からない。
それに反して、6枚の96個の窪みの微小窪みプレートを顕微鏡により検査およびその結果をノートに手書きする従来の方法はコンピュータデータベースに結果を書き写すのに必要とされる時間に加えて背景部分において議論された条件に依存しておよそ30から100分掛かる。加えて、背景部分において以前に説明されたように、手動の検査およびスコアリングは比較的高い人間のエラーの危険に依存する。
(第2の実施の形態)
第2の好適な実施の形態において、カメラ135の被写界深度はおよそ50から100マイクロメータである。液滴中の結晶は被写界深度より大きいかも知れずまたは図29に示されるように、垂れ下がっている液滴内で種々のレベルで成長している結晶であるかもしれない。それゆえ、第2の好適な実施の形態において、レンズ145は多数の異なるレベル721−724で焦点合わせされかつ1組の画像が、結晶全体が分析され得るように種々のレベルで記録される。
(第3の実施の形態)
本発明の第3の好適な実施の形態は見本(スペシメン)オートフォーカスサブルーチン300(図31)を利用する。サブルーチン300は微小窪み中の見本が画像レンズ145の所望のズーム(倍率比)で焦点が合っていることを保証する。オートフォーカスの特徴を利用すると、本発明は多数のZスライスによって定義される多数の画像をカメラ135に撮らせる。代表的には、Zステップサイズによって互いからZ軸において分離された5と10の間にある。代表的なステップサイズは0.05mmから0.25mmである。スライスは、好ましくは、代表的には、微小窪みプレート上のカバースリップの底部にある、スタートZ値によって定義されるZ軸位置でスタートする。見本オートフォーカス初期化302の間中、入力データ304が受信される。画像内の関心の窓の区域はさらにX窓中心およびY窓中心プラスX幅およびY幅によって入力データ304において定義される。ルーチン300の初期設定306はカウンタNの開始値、ベストフォーカス、ベストZ、およびフォーカスエラーである。検査装置はスタートZ位置に等しいZ位置(N)を設定しかつステップ308においてそこにカメラ135を動かす。画像はカメラ135により獲得されかつ前述されたようにデジタル化されそしてステップ310において画像(N)として記憶される。第2のサブルーチン312は画像(N)用のフォーカ値F(N)を引き出しかつさらに図32の議論用の部分に記載される。試験はステップ316においてF(N)とベストフォーカスの間で行なわれ、そのようにするとF(N)がベストフォーカスより大きいならば、その場合にベストフォーカスはF(N)に設定されかつベストZはステップ320に示されるようにNに設定されそしてプログラムフローはステップ322に進み、試験条件がステップ316において合わないならばその場合にプログラムフローはステップ320にスキップしかつステップ322に進む。ステップ322において、試験はスライスのすべてが、NがZスライスの数に対して試験されるように取られるのに関して判断するようになされる。NがZスライスの数に等しいならばその場合にプログラムフローはステップ324に進む。より多くのスライス画像が必要とされるならば、その場合フローはステップ318に進む。ステップ318において、Z位置(N+1)がZ位置(N)+Zステップサイズに設定されかつZ軸はZ位置(N+1)に動かされそしてプログラムフローはNが1だけ増分されるステップ314に進む。プログラムフローはステップ310に戻りそしてすべての画像スライスが取られるまでステップ310から322のループを完了しかつ次いでステップ324上に動く。ステップ324において、ベストZがその初期値に対して試験され、そしてそれがその初期値(焦点がフォーカス値サブルーチン312に認められないことを意味する)に等しいならば、その場合に2で割られるZスライスの数のデフォールト値に設定されそしてフォーカスエラーはステップ326において1に設定されかつプログラムフローはステップ328に進む。ステップ324において、ベストZがその初期値以外の値を有するならばその場合にプログラムフローはステップ324からテップ328に進む。ステップ328において、ベストイメージ画像がイメージ(ベストZ)に等しいベストイメージを設定することによってベストフォーカスで画像スライスに設定される。また、ベストイメージZ値がZ位置(ベストZ)に等しく設定されかつフローはサブルーチンのリターン部であるステップ330に進みそしてプログラムフローはメインソフトウエアフローに戻る。
図32に示されるように、画像(N)焦点F(N)サブルーチン312は、ステップスタート401から出発して、さらに詳述される。画像(N)へのポインタ404はステップ402に設けられる。ステップ402において、画像(N)は、そのさい画像内の水平縁部が強調されるイメージ(N)Hを発生するように標準3×3ゾーベル水平フィルタ416により畳み込まれる。ステップ410において、画像(N)は、そのさい画像内の垂直縁部が強調されるイメージ(N)Vを発生するように標準3×3ゾーベル垂直フィルタ418により畳み込まれる。ステップ414において、水平縁部強調画像イメージ(N)Hおよび垂直縁部強調画像イメージ(N)Vの両方が、あらゆる結果として生じる負のピクセル値がゼロに設定されかつ255より大きいあらゆる結果として生じるピクセル値が、画像イメージ(N)フォーカスを発生するように、255に設定される合計処理の間中、ピクセルごとに合計される。ステップ420において、簡単な分散F(N)が、X窓センタ、Y窓センタ、X幅、およびY高さによって422において定義された関心の窓内のピクセルに関して計算される。結果として生じる分散の値はステップ424においてF(N)として呼び出しプログラムに戻される。ゾーベル処理および分散計算はMVツールズ内の画像処理ソフトウエア機器の集合によって実施される。MVツールズはコレコ・イメージング(Coreco Imaging)のマサチューセッツ州(MA)、ベドフォードにあるアメリカ事務所から入手できる。
(第4の実施の形態)
第1の好適な実施の形態において、オペレータが「結晶」または「非結晶」として液滴をどのようにスコアするかが開示された。第4の好適な実施の形態において、オペレータは各液滴をどのようにスコアするかについて決定するのにより多くのオプションが付与される。表1は、数、テキスト記述、および対応するカラーコードを含んでいる、オペレータのスコアリングオプションのリストを示している。いったん微小窪み液滴が9でスコアされると、オペレータは表2に示されるスコアリングにおいて結晶をさらに分類することができる。
Figure 2005516201
Figure 2005516201
(第5の実施の形態)
第4の好適な実施の形態において、オペレータが対応するカラーコードにより10個のカテゴリの1つに各液滴を手動でどのようにスコアすることができるかがおよびオペレータが9.0から9.9のさらに他の副カテゴリにカテゴリ9をどのようにスコアすることができるかが開示された。第5の好適な実施の形態において、検査装置は、図36に示されるプログラムフローの制御により図33、図34a、図34b、図34c、図34d、および図35aおよび35bに示されるようなコンピュータソフトウエアサブルーチンを実行することによって各液滴見本を自動的にスコアしかつ分類する。自動分類は3つの細部のレベルで発生することができ、第1のレベル、分類の型=1は、クリヤかまたはクリヤでない(未知)液滴間を簡単に識別し、第2のレベル、分類の型=2は、上記の表1に記載されたようなクラス0から9に液滴をスコアしかつ分類し、そして第3のレベル、分類の型=3は、第2のレベルスコアリングおよび分類を実施し、加えて、上記の表2に詳述されたような、クラス9、結晶分類に追加の10個の副カテゴリを加える。
自動スコアリングおよび分類
図36はステップ842で出発しているメインプログラムフロー840を示している。ソフトウエアはパラメータ、検査リスト、ステップ486において詳述された分類の型により初期化される。フローは、システムが選択されたカメラの下に選択された微小窪みプレート内の関心のある微小窪みを動かすステップ844に続く。ステップ851において、液滴が置かれることが必要ならば、フローは、画像がカメラによって獲得されかつソフトウエアが画像について作動しかつ液滴の位置を測定するステップ849に続く。次いで試験はプレート中の最後の微小窪みが映されたかどうか判断するようにされ、そうでないならばその場合にフローはステップ844にループしかつ続く。ステップ853でプレート中の最後の微小窪みが映されたならばその場合にフローは、システムが高解像度のカメラの下に微小窪みプレート内の微小窪み内の液滴に動かすステップ856に続く。またステップ851において液滴が以前に位置されたならば、その場合にフローは液滴を再び位置する必要なしにステップ856に直接ステップ844から続く。ステップ856から、フローは液滴の高解像度の画像が得られるステップ857に続く。その場合にフローはステップ850に続く。ステップ850において、コールが必要とされる分類の型に依存する液滴を自動的にスコアしかつ分類するサブルーチンになされる。サブルーチンは図33に詳述されかつ図33においてステップ440でスタートする。液滴が分類された後サブルーチンは結果が記憶されかつ報告されるステップ852に戻る。プログラムフローは試験が選択されたプレート中の最後の液滴が処理されたかどうかを判断するようになされるステップ858に続き、もしそうならばその場合にフローは試験が選択されたプレート中の最後の液滴が処理されたかどうかを判断するようになされるステップ848に進む。そうでないならば、フローはステップ856に戻りかつ継続する。最後のプレートが処理されたならば、フローはステップ854に進みかつプログラムがなされる。
図33はステップ440でスタートしている微小窪み見本オートスコアおよび分類サブルーチン438を示している。ベストイメージへのポインタ442はベストフォーカスであると認められる画像へのアクセスを許容する初期化ステップ444に情報を供給する。加えて、分類の型がルーチンに通される。代替的に、ポインタ442はシステムの焦点であるように知られるz高さ値で撮られた画像に向けることができる。初期化444後、サブルーチン438は、ステップ448において、ステップ446に示されるパラメータによって定義される第1の矩形の窓(X背景センタ、Y背景センタ、X背景幅、およびY背景高さ)を使用することによって、かつ窓446によって定義されたピクセルの灰(グレー)スケール値のすべてを合計しかつその窓内のピクセルの数によって割ることによって種々のプレートタイプから存在する変化を許容するように標準化された平均の灰背景値を計算する。平均の灰背景は、またステップ446に認められかつ検査中の種々の微小窪みプレートの型を測定しかつ96個の窪みの標準の微小窪みプレートに標準化することによって一般に測定される微小窪み平均値によって計算された値を乗算することによって窪みの型の差異に関して標準化される。この平均の灰背景448は液滴の区域の外側、しかし一般には窪み内または抑制している窪み壁内にある画像の窓区域において計算される。
ステップ450において、平均の灰分類窓値はステップ452に示されるパラメータによって定義される第2の矩形窓(すなわち、X分類センタ、Y分類センタ、X分類幅、およびY分類高さ)を使用して上述したと同様な方法(微小窪み型に関して標準化されないことを除いて)において計算される。この平均の灰分類窓値450は液滴の区域の内側でかつサブルーチンmvt小滴ファインドを利用している小滴から外部の抑制している矩形ボックスの幅および高さの0.98と0.5(好ましくされた0.8により)の間の部分であることによって定義される画像の矩形の窓区域において取られる。サブルーチンmvt小滴ファインドは部分「各窪み内の液滴の位置を測定」において以前に議論されたように液滴の範囲を定義する。
ステップ454において、対角線の差画像が、分類窓内の(x,y)および(x+Diff_Sep,y+Diff_Sep)によって定義される、2つのピクセルの位置からピクセル値を段階的に減算することによって計算される。ピクセル値はステップ452からの値Diff_Sepによって幅および高さにおいて分離される。これは、X分類センタ、Y分類センタ、X分類幅、およびY分類高さを使用するステップ452によって定義される分類窓内のすべてのピクセルにわたって繰り返される。計算された各値に関して絶対値が減算結果について取られかつステップ452において定義されるしきい値フラグThreshに比較される。計算された値がフラグThresh452より大きいならばその場合にピクセルはステップ452においてSetlによって定義された値に等しいx,yにおける第1の位置に設定され、計算された値がフラグThresh452に等しいかまたはそれ以下であるならば、その場合にピクセル値はゼロに設定される。これはDiffイメージ1を計算することにおいてステップ454に記載された数式およびフローによって理解される。Diff_Sep用の代表的な値は7が好ましいが1と20ピクセルの間である。Setlの代表的な値は128が好ましいが1と511の間である。フラグThresh用の代表的な値は25が好ましいが5と50の間である。
ステップ456において、ステップ454において実施された計算と同様な計算が、計算を受けている2つのピクセル間の分離が、Diffイメージ2を発生するようにステップ456における数学的計算に示されるように、(x+Diff_Sep,y)および(x,y+Diff_Sep)によって定義されることを除いて分類窓で実施される。この計算はステップ452において示される定義付けを使用する。Set2用の代表的な値は200が好ましいが1と511の間である。
ステップ458において、ステップ454と456において発生された画像の組み合わせである分類イメージ(Classify_Image)がステップ452において示される定義付けを使用してステップ458に示される数式によって示されるように計算される。Diffイメージ1またはDiffイメージ2(それぞれ、ステップ454およびステップ456)におけるx,yピクセル値がSet1 452に等しい値を有するならば、その場合にピクセル値はSet2 452に等しい分類イメージにおいて(x,y)で設定される。他の方法では、値はステップ458において数式に示されるようにゼロに等しい。計算は452において定義された窓内のすべてのピクセルに関して繰り返される。分類イメージは基本的にはそのさいオリジナルベストイメージ内に存在する縁部が検出される分類イメージ窓の画像である。
ステップ460において、ピクセルSet2の数値はステップ458におけるSet2 452に等しく設定されるピクセルの合計数に等しく設定される。また、または窓の合計ピクセルの値はステップ458における分類窓の合計ピクセル数に設定される。
ステップ462において、スコア−グレイ(Score−Gray)はステップ448において見出された平均灰背景(Average−Gray−Background)によってステップ450において測定された平均灰分類窓(Average−Gray−Classify−Window)を除算することによって計算される。スコア−フラグ(Score−Flag)はまたステップ460からの窓中の合計ピクセルによりピクセル数Set2(Number−Pixels−Set2)を除算することによって計算される。スコア−グレイおよびスコア−フラグはこの状態において標準化される。
ステップ464において、スコア−グレイ、スコア−フラグ、および分類の型の値が分類サブルーチンに通されそして分類は窓内のタンパク質結晶を有効に分類する、分類画像に戻される。分類サブルーチン464の詳細は図34a、図34b、図34c、図34d、加えて図35aおよび35bに設けられる。
図34aは分類サブルーチン464を示している。分類サブルーチンのスタートは初期化470に追随されるステップ468に示されそれによって初期の分類クラス(Class)値は、「未知」を表している、5に設定されそしてフローはステップ480に進む。
ステップ480は、液滴がクリヤでありかつ以下の式によりステップ482(クリヤ−フラグLTおよびクリヤ−グレイGT)において定義されたしきい値を使用するステップ480に詳述された試験によってクラス=0かどうかを計算し:スコア−フラグがクリヤグレイLTより小さくかつスコア−グレイがクリヤ−グレイGTより大きいならばその場合にクラス=0を設定する。ステップ481で、試験は分類の型が1に等しいことを理解するようになされ、第1の分類の型はそのさい液滴が以前に議論されたように単にクリヤ(0)または未知(5)として分類される。分類の型が1に等しいならばその場合にフローはステップ483に進みかつ次いで結果により図33のステップ466に戻る。分類の型が1に等しくないならばその場合にフローはさらに他の分類のためステップ476に進む。
ステップ478に示されるしきい値パラメータ(Lgt−Precip−フラグ−LT,Lgt−Precip−フラグ−GT,Lgt−Precip−グレイ−GT)を利用しているステップ476は軽い沈殿が分類イメージに存在することを示しているクラスに1の値を割り当てる。ステップ476は、スコア−フラグがLgt−Precip−フラグ−LTより小さくかつスコア−フラグがLgt−Precip−フラグ−GTより大きくそしてスコア−グレイがLgt−Precip−グレイ−GTより大きいならばその場合にクラスを値1に設定することを述べる数式を利用する。
ステップ484は以下の等式によりステップ486に詳述されたしきい値(重い−Precip−フラグ−LT、重い−Precip−フラグ−GT、重い−Precip−グレイ−LT)を使用することによって重い沈殿を計算し:スコア−フラグが重い−Precip−フラグ−LTより小さくかつスコア−フラグが重い−Precip−フラグ−GTより大きくそしてスコア−グレイが重い−Precip−グレイ−LTより小さいならばその場合にクラス=2を設定する。
ステップ488は以下の等式によりステップ490に詳述されたしきい値、酷い−Precip−フラグ−LT、酷い−Precip−フラグ−GT、酷い−Precip−グレイ−LTを使用することによって酷い沈殿を計算し:スコア−フラグが酷い−Precip−フラグ−LTより小さくかつスコア−フラグが酷い−Precip−フラグ−GTより大きくそしてスコア−グレイが酷い−Precip−グレイ−LTより大きいならばその場合にクラス=3を設定する。
ステップ492は図34bの分類過程に続いている。
図34bにおいて、分類過程700の続きがステップ702に続いていることが示される。ステップ704は以下の等式によりステップ703に詳述されたしきい値(ミクロ−Cry−フラグ−GTおよびミクロ−Cry−グレイ−LT)を使用することによりミクロ−結晶を計算し:スコア−フラグがミクロ−Cry−フラグ−GTより大きくかつスコアグレイがミクロ−Cry−グレイ−LTより小さいならば、その場合にクラス=8を設定する。
ステップ704は以下の等式によりステップ705に詳述されたしきい値(結晶−フラグ−LT、結晶−フラグ−GTおよび結晶−グレイ−GT)を使用することにより結晶を計算し:スコア−フラグが結晶−フラグ−LTより小さくかつスコア−グレイが結晶−グレイ−GTより大きいならば、その場合にクラス=9を設定する。
ステップ706は以下の等式によりステップ707に詳述されたしきい値(粒状−フラグ−GT、および粒状−グレイ−GT)を使用することにより粒状沈殿を計算し:クラス=8およびスコア−フラグが粒状−フラグ−GTより大きくかつスコア−グレイが粒状−グレイ−GTより大きいならば、その場合にクラス=7を設定する。
ステップ708は725として図34c上の分類過程に続いている。
ステップ726は図34bのステップ708から続いている。
図34cにおいて、ステップ727は計算しかつ入力726として取っている分類におけるさらに他の使用のための1組の追加の画像特徴(X分類センタ、Y分類センタ、X分類幅、およびY分類高さ、画像分類に対するポインタ、およびmvt−小滴分析パラメータ)を発生する。ステップ727において、分類イメージの窓へのポインタによるMVT-ツールズ−小滴分析が呼び出される。ステップ727は小滴の認められた数(num−found)を得そして見出された各小滴に関して、ステップ727はその区域(m)、高さ(m)、幅(m)、および位置X(m)および位置Y(m)のような各々の位置を得る。これらの値は記録される。これらの計算は、ステップ458として図33において形成された画像である、分類イメージと呼ばれる画像上で実施される。
ステップ728において、見出された数(num−found)がゼロより大きくないならばその場合にサブルーチンはステップ738に進む。しかしながら、あらゆる小滴が見出されるならばその場合にさらに他の分析がm=1,num−スヘロライト=0、およびスヘロライト(m)=0を設定することによってステップ729においてスタートされる。ステップ730において、以下の小滴比が計算される:円状−HW(m)=高さ(m)/幅(m)および円状−AHW(m)=区域(m)/(高さ(m)*幅(m))。円形である小滴に関して、円状−HWはおよそ1の値である。小滴が細長いならばその場合に値は1以外である。円形の小滴の円状−AHWはおよそ0.785の値を有する。正方形状の小滴に関して、値は1により近い。プログラムフローはステップ732に進む。
ステップ732は、734に見出されるパラメータ(円状−HW−下方、円状−HW−上方、円状−AHW−下方、および円状−AHW−上方)を使用することによりスヘロライトを有しているような液滴を分類するかどうかを判断する。以下の等式が利用される:
クラス=8または9および円状−HW(m)が円状−HW−上方より小さくかつ円状−HW(m)が円状−HW−下方より大きく、そして円状−AHW(m)が円状−AHW−上方より小さくそして円状−AHW(m)が円状−AHW−下方より大きいならば、その場合にnum−スヘロライト=num−スヘロライト+1。増分が、m=m+1を計算しかつ1がmで見出されたことを示すようにスヘロライト(m)=1を設定することによってなされる。
ステップ736は見出したすべての小滴が見出された数(num−found)に対してmを試験することによって分類されたかどうかを試験しそして等しいならば、サブルーチンはステップ738に進む。そうでないならばプログラムはステップ730にループしかつ上述したように流れる。
ステップ738は740のような分類サブルーチンに図34dで進む。
図34dは742で図34cから続きかつ第2組の追加の特徴が計算される744に進む。これらの特徴はベストフォーカスの画像としてステップ328(図31)において発生された最初のベストイメージにより発生される。これらの追加の特徴に関して、結果は分類画像について図34cにおいて実施された小滴分析から使用される。見出された数(num−found)、区域(m)、高さ(m)、幅(m)、周囲(m)、位置X(m)、位置Y(m)、スヘロライト数(num−spherolite)、およびスヘロライト(m)のようなパラメータ746に示されるようなかかる特徴。加えて、それは図33のステップ448からの平均グレイ背景および図31のステップ328におけるベストイメージへのポインタを使用する。ステップ744において、″m″およびnum−phase−sepはゼロに等しく設定される。
ステップ748において、以前に見出されたスヘロライト数(num−spherolite)がゼロ(0)より大きくないならば、その場合にフローはステップ756に進みかつ図34dに示される残りのステップはバイパスされる。しかしスヘロライト数がゼロ(0)より大きいならば、その場合にフローはステップ749に進み、そのさいmが1だけ増分される。次いでフローは″m″を見出された数(num−found)に比較することに依存してステップ756またはステップ753に進むかどうかを試験するためにステップ751に進む。ステップ753において、図34cのステップ732に見出されたスヘロライト(m)の値が、いずれかがスヘロライトとして分類されたかどうかを見るように試験される。そうでないならば、その場合にフローはステップ749に戻ってループする。スヘロライト(m)が1(1)に等しいならば、その場合にステップ750が実行される。
ステップ750において、情報位置X(m)、位置Y(m)、高さ(m)の半分および幅(m)の半分が各スヘロライト内部のこの減少された画像内の平均グレイ(灰)値を計算するのに使用される。以前の小滴分析から得られたベストイメージピクセルデータが利用されかつphase−sep−Gray(m)はこの値に等しい。phase−sep−Gray(m)は次いでAverage−Gray−Backgroundにより分割されることで正規化される。プログラムフロ−は、ステップ752に進む。phase−sep−Gray(m)はそれがパラメータ入力ステップ754からパラメータphase−sep−Gray−GTより大きいかどうかを見るために試験される。本当ならば、その場合にクラス(CLASS)は4(4)に等しく設定されかつプログラムはステップ749までループする。
ステップ751において、自動プログラムが微小液滴を、表1において以前に詳述された、10個の主要なクラス、0ないし9の1つに分類した。次いで、試験が分類の型が2に等しいかどうかを見るためになされる。そうならば、その場合にフローはステップ755に進み、そのさいフローは図33に戻される。ステップ466において、全体の分類が完了する。副カテゴリへのさらに他の分類が要求されるならば、その場合にフローはステップ758に進む。
ステップ758において、プログラムフローは図35aのステップ760に進む。
図35aにおいて、結晶分類サブルーチン762は、表2で以前に議論されたように、あらゆるクラス9の結晶画像を追加のサブクラス、9.2、9.4、9.6、9.8または9.9にさらに分類する。サブルーチンはステップ760で始まりそしてステップ764に進む。
ステップ764において、小滴カウンタmはゼロに設定される。試験はクラスが9に等しいかどうか見るために導かれそしてそうでないならば、フローはステップ778に進みかつ図33のステップ466に戻る。ステップ764は、以前に説明されたような、ステップ766に示されるような入力値(平均グレイ背景、ベストイメージへのポインタ、見出された数(num−found)、区域(m)、高さ(m)、幅(m)、周囲(m)、位置X(m)、位置Y(m)、スヘロライト数(num−spherolite)、およびスヘロライト(m))を使用する。クラスが9に等しいならば、他の試験が1またはそれ以上の小滴が以前に見出されたかどうかを見るために行なわれる。1のみの小滴が以前に見出されたならば、その場合にフローはステップ768に進む。1以上が見出されたならば、フローは図35bのステップ769に進む。ステップ768において、高さ対幅比が計算されかつステップ770においては針状の特性を示しているしきい値に比較される。試験条件が合致されるならば、その場合にクラスは9.2に設定される。そうでないならば、フローはステップ771に進む。ステップ771において、高さ対幅比はステップ772において板状の特性を示しているしきい値に比較される。試験条件が合致されるならば、クラスは9.4に変化されかつフローはステップ773に進む。そうでないならば、さらに他の分類は実施されずかつフローはステップ778に進みそしてサブルーチンは図33のステップ466に戻る。ステップ773において、小滴内の、標準化された平均グレイ値、チャンク−グレイ(m)(Chunk−gray(m))が計算されかつフローはステップ774に進む。ステップ774において、チャンク−グレイ(m)がしきい値チャンク−グレイ−LT(ステップ775から)より小さいならば、その場合にクラスは9.6に設定されかつフローはステップ776に進む。ステップ776において、チャンク−グレイ(m)がしきい値チャンク−50−GT(ステップ777から)より大きいならば、その場合にクラスは9.8に設定されかつフローはステップ780に進む。ステップ780において、区域(m)がしきい値ゴージャス(gorgeous)−GT(ステップ779から)より大きいならば、その場合にクラス=9.9そしてフローはステップ778に進む。次いでサブルーチンはず33のステップ466に戻る。
図35bは、表2で以前に議論されたような、追加のサブクラス9.1、9.3、9.5、または9.7に画像内に多数の小滴を有するクラス9のさらに他の分類を示しているフローチャート781を示す。サブルーチンは図35aのステップ769からのステップ786で始まりかつステップ782に進む。ステップ782において、ループは、以前に記載されたように、ステップ784からの入力値(平均グレイ背景、ベストイメージへのポインタ、見出された数(num−found)、区域(m)、高さ(m)、幅(m)、周囲(m)、位置X(m)、位置Y(m)、スヘロライト数(num−spherolite)、およびスヘロライト(m))を使用する各小滴mに関してゼロに等しいmで始まる。フローはmが増分されるステップ788に進みかつ高さ対幅が計算されかつステップ790において針状特性を示しているしきい値に比較される。試験条件が合致されるならば、その場合にクラスは9.1に設定される。そうでないならば、フローはステップ794に進む。ステップ794において、高さ対幅がステップ796において板状特性を示しているしきい値に比較される。試験の条件が合致されるならば、クラスは9.3に変化される。そうでないならば、さらに他の分類は実施されずかつフローはすベての小滴が試験されたかどうかを判断するためにステップ812に進む。ステップ798において、小滴内の標準化された平均グレイ値(前述されたようなチャンク−グレイ(m))が計算されかつフローはステップ802に進む。ステップ802において、チャンク−グレイ(m)がしきい値チャンク−グレイ−LT(ステップ804から)より小さいならば、その場合にクラスは9.5に設定されかつフローはステップ806に進む。ステップ806において、チャンク−グレイ(m)がしきい値チャンク−50−GT(ステップ808から)より大きいならば、その場合にクラスは9.7に設定されかつフローはステップ812に進む。ステップ812において、すベての小滴が試験されたならば、フローはステップ810に進みそしてサブルーチンは図33のステップ466に戻る。すべてが試験されないならば、その場合にフローは次の小滴のためにステップ788に戻ってループしかつプロセスは完了するまでループする。
図33、図34a、図34b、図34c、図34d、および図35aおよび図35bにおける分類に使用するための代表的なパラメータおよびしきい値は好適な値に沿って表3に付与される。これらの値はガイドとしてのみ役立ち、そして他の値は環境が正当と認めるとき使用され得る。例えば、異なる照明条件、微小窪みプレートの透明性の変化、タンパク質成長媒体および液滴の公式化の変化、値が同様に使用され得る。当該技術に熟練した者はそれらの構成に特別な分類結果に合わせるためにパラメータおよびしきい値を調整することができる。
Figure 2005516201
プロトタイプ
出願人は本発明の作業プロトタイプを設計、作成そして試験した。
図30は本出願人のプロトタイプの主要構成要素を示している。プロテオミック(タンパク質)結晶確認および検査システム100リニヤ運動の3軸を有している。リニヤアクチュエータ115は、好ましくは、封入された0.5mmピッチのボールスクリュによって駆動される600mmの走行を有する、カリフォルニア(CA)州、アービンのダイナミック・ソリューションズから入手できるリニヤアクチュエータモデル#802−0763Dである。リニヤアクチュエータ115は、38oz−inの利用可能なトルクを有する、カリフォルニア(CA)州、サンタ・クララのアニメティクス・コープから入手できる知的な内蔵サーボモータ110モデル#SM2320SQによって駆動される。サーボモータ110は中央制御ユニット190により送られるシリアル接続を介してウインドーズを基礎にしたコンピュータ105と連通する。
リニヤアクチュエータ115はグラナイト(granite)テーブルトップ170に固着されている。モータ110はx軸線に沿って可動部117を動かす。グラナイトトップ170はフレーム180によって支持されている。フレーム180はキャスタおよび調整可能な脚部を有している。プレート127は可動部117に取着されている。プレート127の各端部で、スペーサブロック128が固定プレート129をプレート127から離間している。固定プレート129は多数の微小窪みプレート125A−125Fの取り付け、除去および位置決めのために設けている。好ましくは、微小窪みプレート125A−125Fは細菌培養基(agar)プレート、96、384、1536個の窪みの微小タイタ窪みプレート、または他のサンプルプレートである。
支持体191は固定プレート129に隣接して位置決めされかつ光源を含んでいる。好適な実施の形態において、光源は、カリフォルニア(CA)州、カールスバッドのイージス・エレクトロニクスから入手できるモデル#A08925ファイバオプティックバックライトである。
好適な実施の形態において、リニヤアクチュエータ150は、封入された0.5mmピッチのボールスクリュによって駆動される350mmの走行を有する、カリフォルニア(CA)州、アービンのダイナミック・ソリューションズから入手できるリニヤアクチュエータモデル#802−1384Aである。リニヤアクチュエータ150はリニヤアクチュエータ115の上方に水平にブリッジされかつ支柱152によって支持されている。可動ベース154はリニヤアクチュエータ160の構成要素用の取り付けベースを提供する。好適な実施の形態において、リニヤアクチュエータ150はモータ110と同一の知的な内蔵サーボモータ120によって駆動される。サーボモータ120は中央制御ユニット190により送られるシリアル接続を介してウインドーズを基礎にしたコンピュータ105と連通する。
好適な実施の形態において、リニヤアクチュエータ160は、封入された0.5mmピッチのボールスクリュによって駆動される100mmの走行を有する、カリフォルニア(CA)州、アービンのダイナミック・ソリューションズから入手できるリニヤアクチュエータモデル#802−0756Dである。リニヤアクチュエータ160はリニヤアクチュエータ150の可動ベース154に対して垂直に取り付けられかつそれに固定される固定部161を有している。リニヤアクチュエータ160は知的な内蔵サーボモータ130によって駆動される。サーボモータ130は好ましくはモータ110と同一である。サーボモータ130は中央制御ユニット190により送られるシリアル接続を介してウインドーズを基礎にしたコンピュータ105と連通する。
可動プレート162はカメラ155用の取り付けベースを提供する。好適な実施の形態において、カメラ155は、カリフォルニア(CA)州、ラグナ・ヒルのJAI・アメリカ・INC.からの高解像度モノクロメガピクセルCCDカメラモデル#CVM1である。カメラ155はレンズ165を有している。好ましくは、レンズ165は、0.75xないし3xズーム可能性を有しかつニュージャージー(NJ)州、バーリントンのエドムンド・インダストリアル・オプティカルから入手できるモデル#NT52−571である。可動プレート162はまた、カメラ135用の取り付けベースを提供する。好ましくは、カメラ135は、カリフォルニア(CA)州、ラグナ・ヒルのJAI・アメリカ・INC.からの高解像度モノクロメガピクセルCCDカメラモデル#CVM1である。カメラ135はレンズ145を有している。好ましくは、レンズ145は、2.5xないし10xズーム可能性を有しかつニュージャージー(NJ)州、バーリントンのエドムンド・インダストリアル・オプティカルから入手できるモデル#NT54−396である。
可動プレート162はまたズームレンズモータ192、20oz−inの利用可能なトルクを有する、カリフォルニア(CA)州、サンタ・クララのアニメティクス・コープから入手できる知的な内蔵サーボモータモデル#SM2315D、用の取り付けベースを提供する。サーボモータは中央制御ユニット190により送られるシリアル接続を介してウインドーズを基礎にしたコンピュータ105と連通する。ズームレンズモータは通常のベルト駆動装置を介してズームレンズ145を作動する。
バーコードリーダ175はリニヤアクチュエータ115に隣接して取り付けられかつグラナイトトップ170に固着された支持体172に取着される。バーコードリーダ175は微小窪みプレートがリニヤアクチュエータ150の下に位置決めされるとき微小窪みプレートに取着されたバーコード識別ラベルを観察するために位置決めされる。好ましくは、バーコードリーダ175は、ニュージャージー(NJ)州、ニューワークのキーエンス・コーポレイション・オブ・アメリカから入手できるモデル#BL601である。
プレートセンサ送信機/受信機186は、また、支持体172に固着されかつ微小窪みプレート125が送信機/受信機186によって放出されかつ反射器188によって反射される光ビームを遮断するたびに感知するように整列される。反射器188はリニヤアクチュエータ115の反対側の支持体191に取り付けられる。プレートセンサ送信機/受信機186および反射器188は、好ましくは、カリフォルニア(CA)州、サンタ・アナのウエスタン・スイッチ・コントロールズから入手できるモデル#E3T−SR13である。
プロトタイプの接続性を示しているブロック図
図6は本出願人のプロトタイプの接続性を示しているブロック図である。リニヤアクチュエータモータ110、120および130、およびズームモータ192は電気的接続を介して48ボルトDC電源からDC電力を受給する。リニヤアクチュエータモータ110、120および130、およびズームモータ192は共通シリアルライン633を介してウインドーズを基礎にしたコンピュータ105と連通している。バーコードリーダ175は通信ラインを介してコンピュータ105と連通しそしてプレートセンサ186は通信ラインを介してコンピュータ105と連通している。モニタ620はコンピュータ105から送信されたオペレータへの情報を表示する。カメラ135および155は通信ラインを介してフレームグラバ630と連通している。フレームグラバ630はコンピュータ105内に設けられかつ好ましくはマサチューセッツ(MA)州、ベドフォードのコレコ・イメージング・USオフイスからのPCビジョンである。フレームグラバ630はコンピュータ105内にデジタル化した画像データアレイを形成するためにカメラからの画像をデジタル化する。4ポートイーサーネットハブ640はコンピュータ105、中央制御ユニット190、および外部イーサーネット670間の接続性を提供する。イーサーネットへの接続性を設けることにより、コンピュータネットワーク通信が可能である。中央制御ユニット190はアナログ制御ラインを介して光源194を制御する。中央制御ユニット190は24ボルトDC電源660から24ボルトDC電力を受給する。緊急停止ボタンおよびスイッチ(e−ストップ)650が中央制御ユニット190に接続される。
実験結果
53枚の試験画像がシステムから得られかつシステムによって自動的に分類されかつ4人の科学者によって手動の、両方で分類された。表4は種々の科学者とシステムによって設けられた自動分類との間の相関百分率を示している。
Figure 2005516201
カラーの利用
他の好適な実施の形態において、本発明はカラー画像を記録するように形作られる。タンパク質結晶化過程における幾らかの沈殿生成物が特有の色を有しかつクリスタロメタグラファまたは自動化された画像分析アルゴリズムが質結晶化結果を識別するのを助けるようにカラー情報を使用することができるのでカラー画像を分析することができるのが望ましい。
実際のカラー画像
図37は固定プレート129上に位置決めされた微小窪みプレート125Aの側面図を示している。埋め込まれた光源194を備えた支持体191は固定プレート129の側部に位置決めされる。光ガイド195からの光は切り欠き131を通って上方に向けられる。光ガイド195は両方のプレートが干渉なしに光ガイド195のまわりに動くことができるように固定プレート129とプレート127との間に位置決めされる。
リニヤ分極化フィルタ352は光ガイド195からの光が、それが微小窪みプレート125Aを通って通過する前にプログラム可能な角度でリニヤ的に分極化されることができるように光ガイド195の上方に回転可能に取り付けられる。ポーラライザ駆動ベルト356(図38に示される上面図)は垂直軸線のまわりに分極化フィルタ352を回転させる。分極化駆動ベルト356はモータ358によって駆動される。モータ358はCCU190(図40)によって制御される。第2のフィルタ354(図39に示される上面図)は微小窪みプレート125Aを通って通過する光が、それがカメラズームレンズ145に進む前に第2のフィルタ354を通過するように微小窪みプレート125Aの上方に位置決めされる。第2のフィルタ354はフィルタ回転盤装置355に取り付けられる。フィルタ回転盤装置355はズームレンズ145の下の所定位置においてオペレータ選択の第2のフィルタ354を回転させる。選択された第2のフィルタ354は、好ましくは、赤、緑および青の2色性のフィルタである。好ましくは、赤、緑および青の第2のフィルタによって取られた個々の画像は実際のカラー画像を形成するように組み合わされる。
偽のカラー画像
赤、緑および青のフィルタ354を使用して形成され得る実際のカラー画像に加えて、偽のカラー(また擬似カラーと呼ばれる)画像が第2のフィルタに関連して3つの異なる分極角度でリニヤ分極化フィルタ352を使用して3つの個々の画像を取ることによって形成されることができる。この好適な実施の形態において、リニヤ分極化フィルタは上記で議論された2色性の第2のフィルタと交換される。例えば、分極化軸線は互いに90度に、かつ互いにプラスおよびマイナス45度にすることができる。3つの画像はその場合に赤、緑および青と呼ばれそして偽のカラー画像が発生される。結晶が分極化回転効果を呈するならば、その場合に非常に色彩に富んだ画像が結果として生じる。この擬似カラー画像は画像背景材料からの非常に小さいかつ繊細な結晶を検出するのに使用する。他の分極化角度も同様に選択されることができる。
好適な実施の形態において、光ガイド195は、カリフォルニア(CA)州、カールスバッドのイージス・エレクトロニクスから入手できるモデル#A08925ファイバオプティックバックライトである。光源194は、ニュージャージー(NJ)州、バーリントンのエドムンド・インダストリアル・オプティカルから入手できるドーラン−ジェナーモデル−PL−900である。第1の分極化フィルタ352、第2のフィルタ354(リニヤ分極化フィルタ、および2色性の赤、緑および青フィルタを含んでいる)はニュージャージー(NJ)州、バーリントンのエドムンド・インダストリアル・オプティカルから入手できる。フィルタ回転盤355は、カリフォルニア(CA)州、サンタ・バーバラのインテグレーテッド・サイエンティフィック・イメージング・システムズ社から入手できるモデルFW1である。
自動化されたトレイ貯蔵および回収システムと結合
他の好適な実施の形態において、タンパク質結晶確認および検査システム100(図30)は、図41Aおよび図41Bに示されるような、自動化された貯蔵および回収システム900と関連して作動される。図41A正面図を示しかつ図41Bは本出願人が製作しかつ試験したプロトタイプの自動化された貯蔵および回収システム900の背面図を示している。また、表示は2つのタンパク質結晶確認および検査システム100である。好適な実施の形態において、オペレータは微小窪みプレート保持トレイ901a(図42)をアクセスドロワ902(図41A)に負荷する。好ましくは、微小窪みプレート保持トレイ901a(図42)はタンパク質結晶がその中で成長している溶液を収容する6枚の微小窪みプレートを保持する。貯蔵ガントリ903(図41B)はトレイ901aをアクセスドロワ902から除去する。図41Aおよび図41Bに示されるように、自動化された貯蔵および回収システム900は多数の貯蔵スロットを有している。トレイ901aを除去した後、貯蔵ガントリ903はトレイ901aを貯蔵スロットの1つに転送する。好ましくは、この過程は複数の微小窪みプレート保持トレイが複数の貯蔵スロットに貯蔵されるまで繰り返される。次いで、定義された時間間隔において、貯蔵ガントリ903は貯蔵スロットからワークセル区域904へ微小窪みプレート保持トレイを連続して転送する。ワークセル区域904を示している拡大斜視図が図43に示されている。いったん微小窪みプレート保持トレイがワークセル区域904に置かれると、ワークセルガントリ905はトレイから微小窪みプレートを連続して除去しそしてそれらを2つのタンパク質結晶確認および検査システム100の一方に配置する。微小窪みプレート中の各窪みはその場合に上記の好適な実施の形態に記載された方法と同じ方法において検査される。微小窪みプレートが検査された後、ワークセルガントリ905は微小窪みプレートをそれらの微小窪みプレート保持トレイに戻して置く。次いで、貯蔵ガントリ903は微小窪みプレート保持トレイをそれらの貯蔵スロットに戻す。
作動シーケンス
微小窪みプレートを貯蔵
図45は図41Aに示された斜視図と同様な正面図を示している。アクセスドロワ902は閉じられている。
図46はアクセスドロワ902の上面図である。図46において、オペレータはアクセスドロワ902を開いている。
図47において、オペレータはトレイ901aおよび901bをアクセスドロワ902上に置いている。トレイ901aおよび901bは各々6枚の96個の窪みの微小窪みプレートを収容している。各微小窪みプレートの各窪み内にはオペレータがタンパク質結晶をその中に成長させるように試みている溶液がある。
図48において、オペレータはアクセスドロワ902を閉じている。センサ922aおよび922bはドロワ902に隣接して配置され、アクセスドロワ902上のトレイの存在を感知するように向けられている。好適な実施の形態において、センサ922aおよび922bはカリフォルニア(CA)州、フリーモントにオフイスを有する、サイエンティフィック・テクノロジーズ社によって製造されたMC−Sシリーズの安全インターロックスイッチ、制御ユニットおよびセンサである。トレイ901aおよび901bの存在を感知するとき、センサ922aおよび922bはCPU921(図44)に信号を送る。CPU921は自動化された貯蔵および回収システム900を作動するようにプログラムされたウインドーズを基礎にしたコンピュータである。
図49は図41Bに示した斜視図と同様な自動化された貯蔵および回収システム900の背面図である。図49において、トレイ901aおよび901bはアクセスドロワ上に載置している。
図50において、CPU921(センサ922aおよび922bからの信号を受信した後)はリニヤアクチュエータモータ923a(図44)に信号を送った。リニヤアクチュエータモータ923aはリニヤアクチュエータ923bに直接かつアクチュエータ駆動軸923dを介してリニヤアクチュエータ923cに接続される。好適な実施の形態において、リニヤアクチュエータ923bおよび923cは、ペンシルベニア(PA)州、アーウィンにオフイスを有する、パーカー・オートメイション・ディーダル・ディビジョンによって製造される、ベルト駆動リニヤアクチュエータ、シリーズHLEである。図50において、リニヤアクチュエータ923bおよび923cはトレイ901aの上方の左方に貯蔵ガントリ903を動かした。
図51において、CPU921はリニヤアクチュエータモータ924aに信号を送った。リニヤアクチュエータモータ924aはベルト駆動のリニヤアクチュエータモータ924bに直接接続される。好適な実施の形態において、リニヤアクチュエータ924bはペンシルベニア(PA)州、アーウィンにオフイスを有する、パーカー・オートメイション・ディーダル・ディビジョンによって製造される、シリーズHLEである。リニヤアクチュエータ924bはプラットホーム925の垂直の動きを制御する。プラットホーム925はまた支持ベアリング924cによって支持されている。図51において、リニヤアクチュエータ924bはトレイ901aに近接するようにプラットホーム925を下降した。留意すべきは、プラットホーム925が下降するとき、釣り合い重りシリンダ926が上昇するということである。釣り合い重り926はベアリング927上に乗りかつケーブル928によってプラットホーム925に接続される。ケーブル928はプーリ929aおよび929bを通って走行する。好適な実施の形態において、プラットホーム925はおよそ70lbs(完全に負荷された)の重さがありそして釣り合い重り926はおよそ50lbsの重さがある。釣り合い重り926をプラットホーム925に接続することによって、リニヤアクチュエータ924bはプラットホーム925を動かすのにより少ない作業をなさねばならない。それゆえ、プラットホーム925の垂直運動はより滑らかである。
図52は図51のプラットホーム925の上面図を示している。リニヤアクチュエータモータ930aはリニヤアクチュエータモータ930bに直接接続される。リニヤアクチュエータモータ930aおよびリニヤアクチュエータモータ930bは両方ともプラットホーム925によって支持されている。好適な実施の形態において、リニヤアクチュエータ930bは、ペンシルベニア(PA)州、アーウィンにオフイスを有する、パーカー・オートメイション・ディーダル・ディビジョンによって製造される、ER Ball−ネジシリーズ、ギヤ駆動のリニヤアクチュエータである。リニヤアクチュエータ930bはロボットグリッパモータ931aおよびロボットグリッパ931bの水平運動を制御する。ロボットグリッパモータ931aはロボットグリッパ931bを制御する。
図53において、CPU921(図44)は、トレイ901aに近接してロボットグリッパ931bを動かすようなリニヤアクチュエータ930bを生じる、リニヤアクチュエータモータ930aに信号を送っている。ロボットグリッパはトレイ901aを把持した。
図54において、ロボットグリッパ931bはプラットホーム925上に軌道933に沿ってトレイ901aを引っ張った。バーコードリーダ934aはプラットホーム925の側部に取着されそしてそれが通り過ぎるとき各微小窪みプレートのバーコードを読み取ることができるように方向付けられる。バーコード情報はそれがコンピュータデータベース(図44)に記憶されるCPU921に送信される。
図55において、貯蔵ガントリ903はトレイ901aを貯蔵棚932のその貯蔵スロットに移動した。一方、図55に示される位置において、リニヤアクチュエータモータ930aはトレイ901aがその貯蔵スロット内部に貯蔵されるように貯蔵棚932に向かってロボットグリッパ931b(図52)を動かす。
図56において、その貯蔵スロットにトレイ901aを入れた後、貯蔵ガントリ903は901bに隣接して移動した。
図57において、貯蔵ガントリ903は、図44ないし図56に関連して上述された方法と同じ方法において貯蔵棚932のそれらに割り当てられた貯蔵スロットにトレイ901a−901aabを移動した。図57はちょうど貯蔵棚932内に実際に54個のトレイを示しているけれども、好適な実施の形態において、貯蔵棚932は合計1692のトレイを保持することができる。また、好適な実施の形態において、各トレイは6枚の微小窪みプレートを保持することができる。それゆえ、好適な実施の形態において、貯蔵棚932は合計10,152枚の微小窪みプレートを保持することができる。そのうえ、図54に関連して以前に留意されたように、CPU921はそれがプラットホーム925上に負荷されているとき各微小窪みプレートのバーコードを記録する。また、好適な実施の形態において、CPU921は各微小窪みプレートがその中に配置される貯蔵スロットの位置を記録する。それゆえ、例えば、オペレータはCPU921のデータベースを参照することにより特定の微小窪みプレートの位置を即座に確認することができる。
ワークセル区域への微小窪みプレートの移動
好適な実施の形態において、キーボード934b(図44)を介してCPU921にコマンドを書き込むことによって、オペレータはあらゆる時点で付与された微小窪みプレートを検査することができる。もしくは、CPU921は特定の指定された時間または指定された時間間隔でタンパク質結晶確認および検査システム100に指定された微小窪みプレートを転送するような自動化された貯蔵および回収システム900(図58)を自動的に生じるようにプログラムされることができる。例えば、好適な実施の形態において、CPU921はどのようなオペレータの介在もなしにタンパク質結晶成長に関して2週間ごとに検査されるようなトレイ901a−901d上に貯蔵された微小窪みプレートを生じるようにプログラムされる。
図58において、貯蔵ガントリ903はトレイ901a−901aabを収容しているトレイスタックの頂部に移動した。一方、この位置において、微小窪みプレート901aは上述された方法と同じ方法においてプラットホーム925上に負荷される。
図59において、貯蔵ガントリ903は微小窪みプレート901aを収容しているプラットホーム925をワークセル区域904の前方に移動した。
図60はワークセル区域904の前方のプラットホーム925の上面図を示している。ワークセル区域904はプラットホーム936を収容している。プラットホーム936の端部にはロボットグリッパモータ937aを有するロボットグリッパ937bがある。ロボットグリッパモータ937aはCPU921(図44)によって制御される。プラットホーム936に隣接してタンパク質結晶確認および検査システム100の固定プレート129がある。タンパク質結晶確認および検査システム100は上記で議論されかつ図30により詳細に示されている。ワークセルガントリ905はワークセル区域904を取り囲んでいる。
図61において、リニヤアクチュエータ930bはプラットホーム936上にトレイ901aを移動した。ロボットグリッパ937bはトレイ901aの前方を把持した。
図62において、ロボットグリッパ924bはトレイ901aがプラットホーム936上の所定位置に残されるようにトレイ901aの後方端を解放した。
図63において、トレイ901b,901cおよび901dはトレイ901aに関連して記載された方法と同じ方法においてプラットホーム936上に貯蔵された。
図64において、ワークセルガントリ905のリニヤアクチュエータ938bはリニヤアクチュエータ939bを位置決めした。リニヤアクチュエータモータ938aはリニヤアクチュエータ938bに直接かつアクチュエータ駆動軸938cを介してリニヤアクチュエータ938dに接続される。好適な実施の形態において、リニヤアクチュエータ938bおよび938dは、ペンシルベニア(PA)州、アーウィンにオフイスを有する、パーカー・オートメイション・ディーダル・ディビジョンによって製造される、モデルナンバーシリーズHLE、ベルト駆動リニヤアクチュエータである。
図65において、リニヤアクチュエータ939bはトレイ901aに貯蔵された微小窪みプレートの上方に把持装置941を移動した。リニヤアクチュエータ939bはリニヤアクチュエータモータ939aによって制御される。好適な実施の形態において、リニヤアクチュエータ939bは、ペンシルベニア(PA)州、アーウィンにオフイスを有する、パーカー・オートメイション・ディーダル・ディビジョンによって製造される、ER Ball−ネジシリーズ、ギヤ駆動のリニヤアクチュエータである。
図66は図65に示したワークセル区域904の位置の側面図である。把持装置941はトレイ901aに貯蔵された微小窪みプレートの上方に位置決めされている。把持装置941はリニヤアクチュエータ942aによって制御されるリニヤアクチュエータ942bを有している。好適な実施の形態において、リニヤアクチュエータ942bは、ペンシルベニア(PA)州、アーウィンにオフイスを有する、パーカー・オートメイション・ディーダル・ディビジョンによって製造される、ET Ball−ネジシリーズ、ギヤ駆動のリニヤアクチュエータである。リニヤアクチュエータ942bはロボットグリッパ943bの垂直運動を制御している。ロボットグリッパ943bの把持運動はロボットグリッパモータ943aによって制御される。
図67において、リニヤアクチュエータ942bはロボットグリッパ943bをトレイ901aに向かって下降した。グリッパ943bはトレイ901a上の微小窪みプレートを把持した。
図68において、グリッパ943bは微小窪みプレートをトレイ901aから除去した。
図69において、リニヤアクチュエータ939bは微小窪みプレートが固定プレート129の上方に位置決めされるようにロボット把持装置941を移動した。
図70において、グリッパ943bは微小窪みプレートを固定プレート129上に下降した。
図71において、グリッパリニヤアクチュエータ942bは、固定プレート129上の微小窪みプレートを後ろに残して、グリッパ943bを上昇させた。
図72は図71に描かれた位置の上面図を示している。ロボット把持装置941は固定プレート129上に位置決めされている。
図73において、トレイ901a上に貯蔵されたすべての微小窪みプレートが固定プレート129上に位置決めされた。
図74において、固定プレート129はタンパク質結晶確認および検査システム100のレンズ944の下に微小窪みプレートを動かしている。固定プレート129およびタンパク質結晶確認および検査システム100の作動は図1から図40において関連して上記で詳細に記載されている。ロボット把持装置941は、それが第2の固定プレート129上にトレイ901d上に貯蔵された微小窪みプレートを置いているように移動した。
図75において、第1の固定プレート129はレンズ944の下に微小窪みプレートを連続して移動し続けた。ロボット把持装置941は第2の固定プレート129上に微小窪みプレートを置いている過程にある。
図76において、第2の固定プレート129レンズ944の下に微小窪みプレートを連続して移動している。ロボット把持装置941は第1の固定プレート129から微小窪みプレートを除去しかつそれらをトレイ901a上に戻している過程にある。
図77において、トレイ901aないしトレイ901d上のすべての微小窪みプレートは上述された方法においてタンパク質結晶確認および検査システム100によって検査された。すべての微小窪みプレートは今やトレイ901aないしトレイ901d上に戻っている。貯蔵ガントリ903(図41Bおよび図49)はそれらがCPU921(図44)へのプログラムしている入力に応じて再び検査されるように予定されるまで貯蔵棚932(図57)内のそれらの最初の位置にトレイ901aないしトレイ901dに戻って移動する。
貯蔵されたトレイのオペレータ回収
好適な実施の形態において、オペレータは貯蔵棚932(図55)に貯蔵された微小窪みプレートを個人的に検査または処理するオプションを有している。オペレータはまずキーボード934b(図44)を介してCPU921に微小窪みプレート識別バーコードを入力する。CPUは貯蔵ガントリ903(図41B、図59)に信号を送りそして要求された微小窪みプレートを収容している適切なトレイが貯蔵棚932から除去される。貯蔵ガントリ903は次いでアクセスドロワ902(図41A、図46)に要求された微小窪みプレートを収容しているトレイを供給する。トレイはアクセスドロワ902上に負荷される。いったんトレイがアクセスドロワ902上にあると、オペレータは、図46に示されるように、ドロワを開放することによってトレイを個人的に回収することができる。彼がトレイを終了した後、オペレータはトレイをアクセスドロワ902上に戻すことによってトレイを戻す。トレイセンサ922aおよび922b(図48)はトレイの存在を感知しそしてCPUはトレイを把持するように貯蔵ガントリ903に信号を送る。バーコードリーダ934a(図54、図44)はトレイ上の微小窪みプレートのバーコードを読み取りそして貯蔵ガントリ903は貯蔵棚932のその適切な貯蔵スロットにトレイを戻す。
トレイ901aに関する多数の設計が本発明に関連して機能するけれども、好適な微小窪みプレート保持トレイ901aは図78ないし図82に関連して理解されることができる。図78は左方レール906a、頂部レール906b、右方レール906cおよび底部レール906dを有する好適な微小窪みプレート保持トレイ901aの斜視図である。好適な実施の形態において、トレイ901aの矩形寸法はおよそ58mm×148mmである。レールは代表的な微小窪みプレートの高さにまたはそれ以下であるように好ましくは設計される。好適な実施の形態において、それらはおよそ高さ14mmである。また、好適な実施の形態において、トレイ901aは6枚の微小窪みプレートを貯蔵することができる。貯蔵トレイは熱可塑性樹脂の1部片にモールドされかつ透明にまたは着色されることができる。トレイのカラーコードはサンプル識別用の目視フィードバックを付加する。6個の矩形ポケット907a−907f(各々標準の微小窪みプレートを保持するように設計される)は、レール906a−906d内方レール908a−908dの間で、トレイ901aに形成される。頂部レール906bに心出しされたカットダウン区域909はロボットグリッパ用のアクセスを提供する。例えば、ロボットグリッパはカットダウン区域909で頂部レール906bを把持しかつ自動化された貯蔵および回収システム900(図41Aおよび図41B)に示した貯蔵スロットの1つからそれを引っ張りまたはそれを押すことができる。熱可塑性トレイ901aはその底部側で滑らかでありかつそれゆえ微小窪みプレートの窪み内に収容されたサンプルが逆の振動または逆の加速を受けないように支持面上で効率的に摺動することができる。頂部左側隅部平坦部910はトレイ901a用の方向付け基準を提供する。丸みが付けられた右側隅部912はトレイ901aの底部レール906d上の他の2つの隅部と同じである。4つの第2のカットダウン区域911a−911dはトレイの非積み重ねおよび積み重ねを許容するようなロボットアクセスを提供する。
図79は、頂部レール906b、内方レール908a、左方レール906aと右方レール906cとの間に形成されかつ底部支持体913を有するポケット907aを示しているトレイ901aの拡大部分斜視正面側面図である。取り囲んでいるレール間のポケットの好適な内方寸法はおよそ90mm×142mmである。平らな底部支持体913は底部プレート棚914を形成する矩形凹所を有している。開口915は成形過程において901aの構造的な平坦さを提供する。4つのロボットアクセス切り欠き916a−916dは、底部プレート棚914の水平面に延びかつポケット907a内の微小窪みプレートを掴むようなロボットグリッパを許容する。例えば、ワークセルガントリ905上のロボットグリッパはトレイ901a内の微小窪みプレートを掴みかつそれを、図43に示される、2つのタンパク質結晶確認および検査システム100のいずれかの上に配置することができる。8本のテーパ付き案内支柱917a−917hは微小窪みプレートがトレイ内に置かれるとき901a内に微小窪みプレートを心出ししかつ案内するために設ける。テーパ付き案内支柱917a−917hは、平らな底部支持体913に対して垂直から離れて好ましくは5度で傾斜が付けられたポケットの内部に面しているそれらの側部を有し、そのようにすると微小窪みプレートがポケット内に置かれるとき、テーパは、微小窪みプレートが凹所を備えた底部プレート棚914上に設定されるように微小窪みプレートを心出しするのを助ける。支柱917a−917hの案内の特徴は、微小窪みプレートが製造するような製造業者から僅かに異なる寸法を有するかもしれないとしても、プレートの容易なロボット的貯蔵および回収を許容するようにアクセス切り欠き916a−916dとともに作用する。
図80は底部プレート棚914を形成しているその矩形の凹所を有する平らな底部支持体913示している図79の断面A−Aの拡大断面図を示している。第2の棚918bはトレイのレールの縁部に形成され、そのようにするとトレイ901aの背部側に形成された溝918aは2つまたはそれ以上のトレイが、一方が他方の上に、ともにスタックされるとき第2のトレイの第2の棚918bに配置しかつ適切に重ね合わせる。
図81は6個の開口区域、隅部平坦部910、丸みを付けた隅部912、ロボットアクセス切り欠き916a−916x、およびトレイの重ね合わせのための溝918aを示しているトレイ901aの底面図を示している。
図82は96個の窪みの微小窪みプレート919を保持しかつプレート用のバーコード識別子用のバーコード220の可視性を示すように位置決めされたトレイ901aの拡大部分斜視図である。適切に位置決めされた外部のバーコードリーダは微小窪みプレートのバーコードを読み取ることができる一方プレートはトレイのポケット内に収容される。トレイの頂部レールのカットダウン区域909はロボットトレイグリッパ用のアクセスを提供する。頂部左側隅部平坦部910はトレイ用の方向付け基準を提供する。丸みを付けた頂部右側隅部912はトレイの底側の他の2つの隅部と同じである。
上記の好適な実施の形態は特殊性により説明されたけれども、この技術に熟練した者は上記で開示された特別な実施の形態に対する多数の変化が本発明の精神から逸脱することなくなされ得ることを認める。例えば、上記の好適な実施の形態において自動化された貯蔵および回収システム900はタンパク質結晶確認および検査システム100として識別される自動化された受容機械に関連して使用されているように示されたけれども、自動化された貯蔵および回収システム900はタンパク質結晶確認および検査以外の多数の目的に関して多数の対象物を貯蔵かつ回収するのに使用されることができる。例えば、他の好適な実施の形態において、2つのタンパク質結晶確認および検査システム100は2つの他の自動化された受容機械と置き換えられることができる。1つの好適な実施の形態において、2つのタンパク質結晶確認および検査システム100は本出願人のアメリカ合衆国特許出願シリアル番号09/702,164に開示された機械と同様な2つの自動化された微小窪みプレート充填機械と置き換えられる。この好適な実施の形態において、貯蔵ガントリ903は空の微小窪みプレートを収容しているトレイを貯蔵棚932から除去しかつトレイをワークセルガントリ905に供給する。ワークセルガントリ905はタンパク質結晶確認および検査システム100へのトレイの搬送に関連して上述された方法と同じ方法において自動化された微小窪みプレート充填機械へトレイを連続して搬送する。微小窪みプレートが充填された後、貯蔵ガントリ903は貯蔵用の貯蔵棚932へトレイを供給する。また、アクセスドロワ902が上記の好適な実施の形態において詳細に議論されたけれども、また、トレイを配置および除去するために記載されたアクセスドロワ以外の他の型のアクセス装置を利用することも可能である。例えば、上記発明は、オペレータが平らなテーブル上にそれらを置くことによって自動化された貯蔵および回収システム900にトレイを挿入することができるように形作られている。貯蔵ガントリ903はその場合にそれらを平らなテーブル除去しかつトレイを貯蔵棚932に貯蔵する。また、上記の好適な実施の形態は2つのタンパク質結晶確認および検査システム100の利用を議論したけれども、また、2つのタンパク質結晶確認および検査システム100の一方だけを利用することも可能である。また、上記の好適な実施の形態は自動化された貯蔵および回収システム900とともに利用されている好適なトレイ901aを示したけれども、ロボットグリッパを有する種々の他の自動化された機械とともに使用されることができる。また、上記の好適な実施の形態は微小窪みプレートを動かしているワークセルガントリ905を議論したけれども、ワークセルガントリ905は、また、微小窪みプレート以外のトレイ内に貯蔵された他の型の対象物を動かすことができる。例えば、ワークセルガントリ905は、また、製薬、カテーテルおよび注射器のごとき使い捨てヘルスケア製品、および微小窪みプレート内のまたは貯蔵トレイ内の個々の壜内の生物学的化合物を動かすことができ、またはトレイ自体がガントリによって直接取り扱われる個々の微小窪みプレートであってもよい。加えて、本発明はトレイへの6枚の微小窪みプレートに関して説明されているけれども、あらゆる数の微小窪みプレートが1枚ないし24枚またはそれ以上の適切に寸法付けられたトレイにより取り扱われることができる。また、タンパク質結晶確認および検査システムに関して、上記の好適な実施の形態はその中でリニヤアクチュエータ115,150、および160がカメラ155および135の下にタンパク質結晶を連続して位置決めすることに関連して作動する割り出し装置をとくに記載しているけれども、また同一の目的に利用され得る種々の他の型のロボット割り出し装置がある。例えば、割り出し装置は組み立てられることができ、そのさい複数の微小窪みプレートが固定の位置に保持される。カメラレンズは、好ましくは水平面における抑制されない運動が可能である割り出し装置に取着される。カメラレンズは水平面内で微小窪みから微小窪みへ連続して動かされる。いったん微小窪み上の所定位置にあると、レンズは適切なズームおよびフォーカスを達成するように垂直方向に上昇または下降されることができる。他の実施の形態において、割り出し装置は組み立てられることができそのさいカメラ155および135が水平運動に関連して固定して保持される。この実施の形態において、複数の微小窪みプレートは、好ましくは、水平面における抑制されない運動が可能である位置決めプラットホーム上に置かれる。この方法において、位置決めプラットホームは各微小窪みが適切なカメラの下に連続して位置決めされるように動かされることができる。以前の実施の形態によるように、いったん微小窪み上の所定位置にあると、レンズは適切なズームおよびフォーカスを達成するように垂直方向に上昇または下降されることができる。また、第1の好適な実施の形態がハンギング液滴方法によって成長させられる結晶を検査することを議論したけれども、他の方法を利用している成長させられた他の結晶は同等な効率により検査されることができる。例えば、図12は油中の水性液滴タンパク質結晶化の結果としてのタンパク質結晶成長を示している。カメラ135および155は液滴362中の結晶に焦点を合わせる。また、上記の好適な実施の形態は本発明が液滴内のタンパク質結晶を検査するためにどのように利用されるかを詳細に検討したけれども、本発明は他の型の顕微鏡見本を検査するのに利用されることができる。例えば、本発明は代表的な微小窪みの微小タイタープレート反応を検査するのに利用されることができそのさい反応の品質は、適切な光源、フィルタ、および蛍光検出に代表的であるような感知カメラを備えたシステムを形作ることによって判断されることができる。また、上記の好適な実施の形態は2つのカメラ135および155の利用を議論したけれども、また、窪み全体上に焦点を合わせるようにズームアウトしかつ結晶を含んでいる液滴上に焦点を合わせるようにズームインすることができる1つだけのカメラを有することも可能である。加えて、区域CCDカメラが示されるけれども、微小窪みプレートの動きと組み合わされたリニヤCCDカメラがまた本発明において作動する。また、他の好適な実施の形態において、戻り止め510および520は簡単にばね負荷されかつコンピュータ105によって制御されることはできない。また、本発明は光パネル光源、およびまたは管、同様にLED光源および本発明により同様にしようされ得るレーザ光源により教示される。システムは微小窪みプレートを1軸においてかつカメラを他の2軸において端において動かすことが示されているけれども、本発明は同様に2つの直交軸(XおよびYのような)において動いている微小窪みにより実施されることができる一方カメラはZ軸においてのみ動くかまたは3軸すべての動きがカメラシステムによりなされ、そのさい微小窪みプレートは固定でありかつシステムはそれらの上方に動く。システム設計のこれらの他の変化はまた光源または多数の光源の再配置を要求するかもしれない。また、他のフィルタ型が第2のフィルタ354と置き換えられるかもしれない。例えば、直線的に分極化されたフィルタは非常に有効である。また、上記の好適な実施の形態は特別な型のカメラ135および155を開示したけれども、他のCCDカメラがより少ない解像度によりまたはより大きい解像度により本発明において使用されることができかつさらに本発明を実施する。例えば、2,000×2,000ピクセルかつ同様に4,000×4000ピクセルのカメラが幾つかの売り手から市場で入手できる。これらの代替のカメラをデジタル化するとき、デジタル化された画像は対応するカメラの解像度を有する。また、カメラがより大きなビット深さを支持するならば、例えばカメラが画像ノイズを減少するために冷却されるならば、この発明を実施しかつ8ビットより大きいグレイスケール精度および利得利点にデジタル化することができる。それゆえ、添付された請求項およびそれらの法的同等物が本発明の範囲を決定すべきである。
本発明の好適な実施の形態を示す図である。 微小窪みプレートを示す図である。 固定プレートを示す上面図である。 固定プレート上の微小窪みプレートを示す上面図である。 固定プレート上の微小窪みプレートを示す上面図である。 本発明の好適な実施の形態を示すブロック図である。 好適なモニタを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスのステップを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスのステップを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスのステップを示す図である。 微小窪みプレート中の垂れ下がっている液滴を示す図である。 油中の水性液滴タンパク質結晶化の例を示す図である。 固定プレート上の微小窪みプレートを示す上面図である。 微小窪みプレート上で上方に向かって輝いている光源を示す側面図である。 各窪みが液滴を有している、微小窪みプレートの2つの窪みを示す拡大図である。 図15に示した液滴のを示す詳細図である。 図15に示した液滴のを示す詳細図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスのステップを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスのステップを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスのステップを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスのステップを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスのステップを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスのステップを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスのステップを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスのステップを示す図である。 実行が完了された後の好適なモニタスクリーンを示す図である。 他の好適なモニタスクリーンを示す図である。 他の好適なモニタスクリーンを示す図である。 結晶成長による垂れ下がっている液滴を示す図である。 本発明の好適な実施の形態を示す図である。 本発明の自動焦点合わせサブルーチンを示すフローチャートである。 焦点合わせ値サブルーチンを示すフローチャートである。 自動スコアおよび分類サブルーチンを示すフローチャートである。 分類サブルーチンを示すフローチャートである。 分類サブルーチンを示すフローチャートである。 分類サブルーチンを示すフローチャートである。 分類サブルーチンを示すフローチャートである。 結晶クラスのサブ分類を示す図である。 結晶クラスのサブ分類を示す図である。 メインプログラムフローを示す図である。 光路中の二重のフィルタを示す側面図である。 回転可能なリニヤ分極化フィルタ用の駆動機構を示す上面図である。 第2のフィルタ回転盤を示す上面図である。 他の好適な実施の形態の接続性を示す図である。 本発明の他の好適な実施の形態を示す図である。 本発明の他の好適な実施の形態を示す図である。 好適なトレイを示す上面図である。 好適なワークセル区域を示す図である。 本発明の好適な実施の形態を示すブロック図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 本発明の好適な実施の形態の作動シーケンスを示す図である。 好適なトレイを示す斜視図である。 図78のトレイを示す他の図である。 図78のトレイを示す他の図である。 図78のトレイを示す他の図である。 図78のトレイを示す他の図である。

Claims (34)

  1. 対象物を保持するトレイ用の自動化された貯蔵および回収装置において、
    A)複数のトレイの挿入および除去用のアクセス装置、
    B)前記複数のトレイを貯蔵するための貯蔵棚、
    C)少なくとも1つの自動化された受容機械、
    D)前記少なくとも1つの自動化された受容機械に向離して前記対象物を動かすための、ワークセルガントリ、および
    E)前記アクセス装置、前記貯蔵棚と前記ワークセルガントリ間で前記複数のトレイを動かすための貯蔵ガントリ、
    F)前記貯蔵ガントリおよびワークセルガントリを制御するようにプログラムされた少なくとも1つのコンピュータシステムを含んでいることを特徴とする自動化された貯蔵および回収装置。
  2. 前記アクセス装置がアクセスドロワであることを特徴とする請求項1に記載の自動化された貯蔵および回収装置。
  3. 前記少なくとも1つの自動化された受容機械が複数の微視的結晶を検査しかつ分類するための装置であることを特徴とする請求項1に記載の自動化された貯蔵および回収装置。
  4. 前記少なくとも1つの自動化された受容機械が、
    A)少なくとも1つのカメラ、
    B)前記少なくとも1つのカメラのカメラ視界に前記微視的結晶を連続して配置するための割り出し装置、および
    C)前記割り出し装置および前記少なくとも1つのカメラを制御するためにプログラムされた少なくとも1つの制御コンピュータを含み、そのさい前記少なくとも1つの制御コンピュータが前記少なくとも1つのカメラから前記複数の微視的結晶の画像を受信するようにプログラムされ、前記少なくとも1つの制御コンピュータが前記複数の微視的結晶を分類するようにプログラムされることを特徴とする請求項1に記載の自動化された貯蔵および回収装置。
  5. 前記少なくとも1つの制御コンピュータが前記画像像を受信した後前記複数の微視的結晶を自動的に分類することを特徴とする請求項4に記載の自動化された貯蔵および回収装置。
  6. 前記少なくとも1つの自動化された受容機械が自動化された微小窪みプレート充填機械であることを特徴とする請求項1に記載の自動化された貯蔵および回収装置。
  7. 前記少なくとも1つの自動化された受容機械が、
    A)1.割り出し装置、および
    2.メディア源と連通しかつ空の微小窪みプレートに前記メディアの部分を挿入するように位置決めされる充填機構を含んでいる微小窪みプレート充填構体、および
    B)前記割り出し装置が前記充填機構に隣接して空の微小窪みプレート動かし、かつ前記充填機構がメディアを前記メディア源から前記微小窪みプレートの窪みに注入するようにプログラムされた自動制御ユニットを含んでいることを特徴とする請求項1に記載の自動化された貯蔵および回収装置。
  8. 前記対象物が少なくとも1つの微小窪みプレートであることを特徴とする請求項1に記載の自動化された貯蔵および回収装置。
  9. 前記少なくとも1つの微小窪みプレートがバーコードを含み、そのさい前記自動化記憶および検索装置が、さらに、前記少なくとも1つのコンピュータと連通して少なくとも1つのバーコードリーダを含んでいることを特徴とする請求項8に記載の自動化された貯蔵および回収装置。
  10. 前記複数のトレイが少なくとも1つの微小窪みプレートを保持し、そのさい前記貯蔵ガントリおよび前記ワークセルガントリが各々少なくとも1つのロボット的なグリッパを含み、そのさい前記複数のトレイが、
    A)前記少なくとも1つのロボット的なグリッパ用の少なくとも1つのカットダウンアクセス区域、
    B)トレイ方向付け用の墨部平坦部、および
    C)前記少なくとも1つの微小窪みプレートを前記複数のトレイに案内するための複数のテーパ付きガイド支柱を含むことを特徴とする請求項1に記載の自動化された貯蔵および回収装置。
  11. トレイが少なくとも1つのロボット的なグリッパによって処理され、そのさい前記複数のトレイが、
    A)前記少なくとも1つのロボット的なグリッパ用の少なくとも1つのカットダウンアクセス区域、
    B)トレイ方向付け用のコーナーフラット、および
    C)前記少なくとも1つの微小窪みプレートを前記複数のトレイに案内するための複数のテーパ付きガイド支柱を含むことを特徴とする少なくとも1つの微小窪みプレートを保持するためのトレイ。
  12. 複数のトレイを自動的に貯蔵および回収するための複数のトレイの自動貯蔵および回収方法において、そのさい前記複数のトレイが少なくとも1つの微小窪みプレートを保持し、以下の工程、すなわち、
    A)前記複数のトレイをアクセス装置上に挿入し、
    B)貯蔵ガントリを介して前記複数のトレイを貯蔵棚へ移動し、
    G)前記貯蔵ガントリを介して前記複数のトレイをワークセルガントリに移動し、
    H)前記ワークセルガントリを介して前記少なくとも1つの微小窪みプレートを前記複数のトレイから少なくとも1つの自動化された受容機械に移動し、
    I)前記ワークセルガントリを介して前記少なくとも1つの微小窪みプレートを前記少なくとも1つの自動化された受容機械から前記複数のトレイへ移動し、
    J)前記貯蔵ガントリを介して前記複数のトレイを前記アクセス装置に移動し、
    K)前記複数のトレイを前記アクセス装置から除去し、そして
    L)前記貯蔵ガントリおよび前記ワークセルガントリの運動を少なくとも1つのプログラムされたコンピュータシステムを介して制御する工程を含むことを特徴とする複数のトレイの自動貯蔵および回収方法。
  13. 前記アクセス装置がアクセスドロワであることを特徴とする請求項12に記載の複数のトレイの自動貯蔵および回収方法。
  14. 前記少なくとも1つの自動化された受容機械が複数の微視的結晶を検査しかつ分類するための装置であることを特徴とする請求項12に記載の複数のトレイの自動貯蔵および回収方法。
  15. 前記少なくとも1つの自動化された受容機械が、
    A)少なくとも1つのカメラ、
    B)前記少なくとも1つのカメラのカメラ視界に前記微視的結晶を連続して配置するための割り出し装置、および
    C)前記割り出し装置および前記少なくとも1つのカメラを制御するためにプログラムされた少なくとも1つの制御コンピュータを含み、そのさい前記少なくとも1つの制御コンピュータが前記少なくとも1つのカメラから前記複数の微視的結晶の画像を受信するようにプログラムされ、そのさい前記少なくとも1つの制御コンピュータが前記複数の微視的結晶を分類するようにプログラムされることを特徴とする請求項12に記載の複数のトレイの自動貯蔵および回収方法。
  16. 前記少なくとも1つの制御コンピュータが前記画像像を受信した後前記複数の微視的結晶を自動的に分類することを特徴とする請求項15に記載の複数のトレイの自動貯蔵および回収方法。
  17. 前記少なくとも1つの自動化された受容機械が自動化された微小窪みプレート充填機械であることを特徴とする請求項12に記載の複数のトレイの自動貯蔵および回収方法。
  18. 前記少なくとも1つの自動化された受容機械が、
    A)1.割り出し装置、および
    2.メディア源と連通しかつ空の微小窪みプレートに前記メディアの部分を挿入するように位置決めされる充填機構を含んでいる微小窪みプレート充填構体、および
    B)前記割り出し装置が前記充填機構に隣接して空の微小窪みプレートを動かし、かつ前記充填機構がメディアを前記メディア源から前記微小窪みプレートの窪みに注入するようにプログラムされた自動制御ユニットを含んでいることを特徴とする請求項12に記載の複数のトレイの自動貯蔵および回収方法。
  19. 前記複数のトレイが少なくとも1つの微小窪みプレートを保持することを特徴とする請求項12に記載の複数のトレイの自動貯蔵および回収方法。
  20. 前記少なくとも1つの微小窪みプレートがバーコードを含み、そのさい前記自動化された貯蔵および回収装置が、さらに、前記少なくとも1つのコンピュータシステムと連通して少なくとも1つのバーコードリーダを含んでいることを特徴とする請求項19に記載の複数のトレイの自動貯蔵および回収方法。
  21. 前記複数のトレイが少なくとも1つの微小窪みプレートを保持し、そのさい前記貯蔵ガントリおよび前記ワークセルガントリが各々少なくとも1つのロボット的なグリッパを含み、そのさい前記複数のトレイが、
    A)前記少なくとも1つのロボット的なグリッパ用の少なくとも1つのカットダウンアクセス区域、
    B)トレイ方向付け用のコーナーフラット、および
    C)前記少なくとも1つの微小窪みプレートを前記複数のトレイに案内するための複数のテーパ付きガイド支柱を含むことを特徴とする請求項12に記載の複数のトレイの自動貯蔵および回収方法。
  22. 対象物を保持するための自動化された貯蔵および回収装置において、
    A)複数のトレイの挿入および除去用のアクセス手段、
    B)前記複数のトレイを貯蔵するための貯蔵棚手段、
    C)少なくとも1つの自動化された受容機械手段、
    D)前記対象物を前記少なくとも1つの自動化された受容機械手段に向離して動かすためのワークセルガントリ手段、
    E)前記アクセス装置、前記貯蔵棚と前記ワークセルガントリ間で前記複数のトレイを動かすための貯蔵ガントリ手段、および
    F)前記貯蔵ガントリ手段および前記ワークセルガントリを制御するようにプログラムされた少なくとも1つのコンピュータシステム手段を含んでいることを特徴とする自動化された貯蔵および回収装置。
  23. 前記アクセス手段がアクセスドロワであることを特徴とする請求項22に記載の自動化された貯蔵および回収装置。
  24. 前記少なくとも1つの自動化された受容機械手段が複数の微視的結晶を検査しかつ分類するための装置であることを特徴とする請求項22に記載の自動化された貯蔵および回収装置。
  25. 前記少なくとも1つの自動化された受容機械手段が、
    A)少なくとも1つのカメラ、
    B)前記少なくとも1つのカメラのカメラ視界に前記微視的結晶を連続して配置するための割り出し装置、および
    C)前記割り出し装置および前記少なくとも1つのカメラを制御するためにプログラムされた少なくとも1つの制御コンピュータを含み、そのさい前記少なくとも1つの制御コンピュータが前記少なくとも1つのカメラから前記複数の微視的結晶の画像を受信するようにプログラムされ、そのさい前記少なくとも1つの制御コンピュータが前記複数の微視的結晶を分類するようにプログラムされることを特徴とする請求項22に記載の自動化された貯蔵および回収装置。
  26. 前記少なくとも1つの制御コンピュータが前記画像像を受信した後前記複数の微視的結晶を自動的に分類することを特徴とする請求項25に記載の自動化された貯蔵および回収装置。
  27. 前記少なくとも1つの自動化された受容機械手段が自動化された微小窪みプレート充填機械であることを特徴とする請求項22に記載の自動化された貯蔵および回収装置。
  28. 前記少なくとも1つの自動化された受容機械手段が、
    A)1.割り出し装置、および
    2.メディア源と連通しかつ空の微小窪みプレートに前記メディアの部分を挿入するように位置決めされる充填機構を含んでいる微小窪みプレート充填構体、および
    B)前記割り出し装置が前記充填機構に隣接して空の微小窪みプレートを動かし、かつ前記充填機構がメディアを前記メディア源から前記微小窪みプレートの窪みに注入するようにプログラムされた自動制御ユニットを含んでいることを特徴とする請求項22に記載の自動化された貯蔵および回収装置。
  29. 前記対象物が少なくとも1つの微小窪みプレートであることを特徴とする請求項22に記載の自動化された貯蔵および回収装置。
  30. 前記少なくとも1つの微小窪みプレートがバーコードを含み、そのさい前記自動化された貯蔵および回収装置が、さらに、前記少なくとも1つのコンピュータシステム手段と連通して少なくとも1つのバーコードリーダを含んでいることを特徴とする請求項29に記載の自動化された貯蔵および回収装置。
  31. 前記複数のトレイが少なくとも1つの微小窪みプレートを保持し、そのさい前記貯蔵ガントリ手段および前記ワークセルガントリ手段が各々少なくとも1つのロボット的なグリッパを含み、そのさい前記複数のトレイが、
    A)前記少なくとも1つのロボット的なグリッパ用の少なくとも1つのカットダウンアクセス区域、
    B)トレイ方向付け用の隅部平坦部、および
    C)前記少なくとも1つの微小窪みプレートを前記複数のトレイに案内するための複数のテーパ付きガイド支柱を含むことを特徴とする請求項22に記載の自動化された貯蔵および回収装置。
  32. 少なくとも1つの微小窪みプレートを保持するためのトレイにおいて、そのさい前記トレイが少なくとも1つのロボット的なグリッパによって処理され、そのさい前記複数のトレイが、
    A)前記少なくとも1つのロボット的なグリッパ用の少なくとも1つのカットダウンアクセス区域手段、
    B)トレイ方向付け用のコーナーフラット手段、および
    C)前記少なくとも1つの微小窪みプレートを前記複数のトレイに案内するための複数のテーパ付きガイド支柱手段を含むことを特徴とする微小窪みプレート保持トレイ。
  33. タンパク質結晶を成長させるためのタンパク質結晶成長方法において、
    以下の工程、すなわち、
    A)複数の微小窪みプレートにタンパク質溶液の液滴を挿入し、
    B)前記複数の微小窪みプレートを複数のトレイ上に配置し、貯蔵ガントリを介して前記複数のトレイを貯蔵棚へ移動し、
    C)前記複数のトレイをアクセス装置上に挿入し、
    D)前記貯蔵ガントリを介して前記複数のトレイを貯蔵棚に移動し、
    E)前記貯蔵ガントリを介して前記複数のトレイをワークセルガントリに移動し、
    F)前記ワークセルガントリを介して前記少なくとも1つの微小窪みプレートを前記複数のトレイから複数の微視的結晶を検査しかつ分類するための自動化された機械に移動し、
    G)前記自動化された機械を介して前記タンパク質溶液の液滴を分析し、
    H)前記ワークセルガントリを介して前記複数の微小窪みプレートを前記少なくとも1つの自動化された受容機械から前記複数のトレイへ移動し、
    I)前記貯蔵ガントリを介して前記複数のトレイを前記アクセス装置に移動し、
    J)前記複数のトレイを前記アクセス装置から除去し、そして
    K)前記貯蔵ガントリおよび前記ワークセルガントリの運動を少なくとも1つのプログラムされたコンピュータシステムを介して制御する工程を含むことを特徴とするタンパク質結晶成長方法。
  34. 以下の工程、すなわち、
    A)複数の微小窪みプレートにタンパク質溶液の液滴を挿入し、
    B)前記複数の微小窪みプレートを複数のトレイ上に配置し、貯蔵ガントリを介して前記複数のトレイを貯蔵棚へ移動し、
    C)前記複数のトレイをアクセス装置上に挿入し、
    D)前記貯蔵ガントリを介して前記複数のトレイを貯蔵棚に移動し、
    E)前記貯蔵ガントリを介して前記複数のトレイをワークセルガントリに移動し、
    F)前記ワークセルガントリを介して前記複数の微小窪みプレートを前記複数のトレイから複数の微視的結晶を検査しかつ分類するための自動化された機械に移動し、
    G)前記自動化された機械を介して前記タンパク質溶液の液滴を分析し、
    H)前記ワークセルガントリを介して前記複数の微小窪みプレートを前記少なくとも1つの自動化された受容機械から前記複数のトレイへ移動し、
    I)前記貯蔵ガントリを介して前記複数のトレイを前記アクセス装置に移動し、
    J)前記複数のトレイを前記アクセス装置から除去し、そして
    K)前記貯蔵ガントリおよび前記ワークセルガントリの運動を少なくとも1つのプログラムされたコンピュータシステムを介して制御する工程を含んでいる方法によって成長させられることを特徴とするタンパク質結晶。
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