JP2005263784A - コラーゲン様構造を有するポリペプチド - Google Patents
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Abstract
【解決手段】 式:
-(-Gly-X-Y-)-
[式中、XおよびYは任意のアミノ酸残基を表す]
の繰り返し単位を基本構造として有する同一鎖長の3個のペプチドが主鎖方向に互いにずれてアミノ酸側鎖どうしがジスルフィド結合などにより結合されているペプチド3量体が開示される。このペプチド3量体は、コラーゲン様の3本らせん構造を有するポリペプチドを形成することができる。また、本発明のペプチド3量体を製造する方法、ならびに本発明のペプチド3量体ユニットを構成単位とする、3本らせん構造を有するコラーゲン様分子集合体も開示される。
【選択図】図1
Description
-(-Gly-X-Y-)-
[式中、XおよびYは任意のアミノ酸残基を表す]
の繰り返し単位を基本構造として有する同一鎖長の3個のペプチドが、主鎖方向に互いにずれて結合されているペプチド3量体を提供する。好ましくは、前記3個のペプチドは、ジスルフィド結合により互いに結合されている。
1個のCysを有する第1のペプチド、2個のCysを有し、その一方のSH基が保護されている第2のペプチドおよび1個のCysを有する第3のペプチドを用意し、
第1のペプチドと第2のペプチドとをジスルフィド結合により結合させてペプチド2量体を形成し、
第2のペプチドの保護されたSHを保護基変換により活性化し、そして
前記ペプチド2量体と第3のペプチドとをジスルフィド結合により結合させる、
の各工程を含む。
本発明のペプチド3量体ユニットは、式:
-(-Gly-X-Y-)-
[式中、XおよびYは任意のアミノ酸残基を表す]
の繰り返し単位を基本構造として有する。天然のコラーゲンを構成するポリペプチド鎖は、-(-Gly-Pro-Pro-)-または-(-Gly-Pro-Hyp-)-の繰り返し単位をその基本構造として有しており、長い左巻きらせんを形成する。3本のポリペプチド鎖は互いに巻き合って、鎖間の水素結合により長く伸びた右巻きらせん構造を形成することができる。また、-(-Gly-Pro-Pro-)-または-(-Gly-Pro-Hyp-)-の繰り返し単位を有する鎖長15−30程度のペプチドの溶液を放置しておくと、天然のコラーゲンと同様の安定な3本らせん構造をとることが知られている。本明細書においては、このような3本らせん構造を「コラーゲン様構造」と称する。
本発明のペプチド3量体ユニットは、部位特異的ジスルフィド結合形成法(Ottl, J et
al., FEBS Lett, 398, 31-36, 1996; Ottl, J. and Moroder, L. , J. Am. Chem. Soc. 121, 653-661, 1999; Koide, T. et al. Bioorg Med Chem Lett. 14, 125-128, 2004)により鎖間ジスルフィド結合を形成させることにより製造することができる。簡単には、ペプチド3量体を構成する3個のペプチド鎖のうち、2個は1残基のCys残基を、1個は2残基のCys残基を有するように設計し、Cys側鎖をジスルフィド結合によって他の鎖のCysと結合させる。
本発明のコラーゲン様分子集合体(超分子)は、本発明のペプチド3量体ユニットをその構造単位とし、コラーゲンと同様の3本らせん構造を有する線維状の構造を持つ(図1、3)。上述の本発明のペプチド3量体ユニットの溶液を低温で放置すると、3本らせん形成を駆動力とする相補的自己集合がおこる。すなわち、本発明の分子集合体は、上述の本発明のペプチド3量体ユニットを含む溶液を0℃−40℃、好ましくは0℃−10℃で、1時間以上、好ましくは12時間以上、さらに好ましくは48時間以上放置することにより形成することができる。溶液としては水溶液が好ましいが、コラーゲン3本らせん構造には他の多くのタンパク質に存在する疎水的コアが存在しないため、有機溶媒の使用も可能である。
カラム:Cosmosil 5C18-AR
溶媒:A, 0.05%トリフルオロ酢酸/水
B, 0.05%トリフルオロ酢酸/アセトニトリル
温度:42℃
溶出はAからBへの直線グラジエントによりおこなった。また、最終生成物および合成中間体はMALDI-TOF MSにより同定した。
1)ペプチド鎖の構築
N-ペプチド(SH体):H-Gly-Pro-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-Pro-Cys(SH)-OH (配列番号1)
M-ペプチド(Acm, SH体):H-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-Cys(Acm)-Cys(SH)-Gly-Pro-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-Pro-OH(配列番号2)
C-ペプチド(SH体):H-Cys(SH)-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-OH (配列番号3)
それぞれのペプチド-樹脂(約0.1mmol)を、氷冷下、水、m-クレゾール, チオアニソール(各0.25 ml)、1,2-エタンジチオール(0.125 ml)、トリフルオロ酢酸(4.125 ml)と混合し、室温で1時間撹拌した。切り出されたペプチドは、約5倍容のエーテルを加えることにより沈澱した。凍結乾燥したペプチドは、0.05%トリフルオロ酢酸/水に溶解し、高速液体クロマトグラフィー(HPLC)によって精製し、凍結乾燥した。
1)M-ペプチドのピリジンスルフェニル化:M-ペプチド(Acm, SPy体)の合成
M-ペプチド(Acm, SH体)25mg (11.2 μmol)を2 mM EDTAを含む50 mM酢酸ナトリウム(pH 5.4)[バッファー A]に溶解し、2,2'-ジピリジルジスルフィド(49.5 mg, 225 μmol)を溶解した2-プロパノールと窒素雰囲気下、室温で混合し、1時間反応させた。生成した目的物は、HPLCにて精製し、凍結乾燥した。
13.2 mg (5.66 μmol)のM-ペプチド(Acm, SPy体)を0.66 mlのバッファー Aに溶解し、これを14.7 mg (6.79 μmol)のC-ペプチド(SH体)を溶解した0.735 mlのバッファー Aに室温、窒素雰囲気下で滴下した。反応液は遮光し、80分撹拌した。生成した目的物は、HPLCにて精製し、凍結乾燥した。
10.3 mg (2.35 μmol)のM-Cダイマー(Acm, SS体)を0.412 mlのトリフルオロ酢酸/酢酸(1:2, v/v)に溶解する。3-ニトロ-2-ピリジンスルフェニルクロリド(1.1 mg, 5.87 μmol)も同様に0.6 mlのトリフルオロ酢酸/酢酸(1:2, v/v)に溶解し、ペプチド溶液に室温、窒素雰囲気下滴下した。反応液は遮光し、45分間撹拌した。生成した目的物は、HPLCにて精製し、凍結乾燥した。
3.9 mg (1.81 μmol)のN-ペプチド(SH体)を0.39 mlのBuffer Aに溶解し、これを8.1 mg (1.81 μmol)のM-Cダイマー(Npys, SS体)を溶解した0.81 mlのBuffer Aに室温、窒素雰囲気下で滴下した。反応液は遮光し、90分撹拌した。生成した目的物は、HPLC(4.6 id x 250 mm)にて精製し、凍結乾燥した。合成したペプチド3量体ユニットはMALDI-TOF MSにより目的物であることを確認した。実測値(M+H)+ 6458, 理論値(M+H)+ 6458。
ペプチド3量体ユニットを10 mg/mlの濃度で水に溶解し、4℃にて14日間放置した(ストック溶液)。
1)円二色性スペクトル測定による構造解析
上記ストック溶液を、4℃にて水で5倍に希釈し、測定に用いた。
測定条件は以下の通りである:
装置:JASCO J-820装置に PTC-423L 温度制御装置を装着して使用
セル長:0.5 mm
測定波長:210-260 nm
データ取り込み:0.2 nm毎
スキャン速度:50 nm/min
レスポンス:2秒
データ積算:3回
感度:100 mdeg
測定温度、4、30、40、50、60、70℃
超分子ストック溶液あるいは、コントロールとして同様に4℃にて3本らせん形成させた(Pro-Hyp-Gly)8-アミドを4℃にて水で20倍に希釈した。これらをMicrocon YM-100(分子量100,000カット)を用いて4℃にて限外濾過をおこなった。濾液をHPLCで分析し、そのピーク面積より限外濾過膜透過率をもとめた。また、同じ溶液を95℃、5分間処理することにより3本らせんを熱変性させた直後のサンプルについても、同様に透過率を求めた。結果を図5に示す。
じペプチド鎖長とほぼ同様のアミノ酸構成からなる、(Pro-Hyp-Gly)8-アミドはその56%が膜を通過した。また、超分子溶液を熱変性することにより、91%が膜を通過できるようになった。このことから、超分子溶液中では、分子間の相互作用(3本らせん形成)による大きな構造体が生じていると解釈される。
実施例1のペプチド3量体ユニットと同じPro-Hyp-Gly繰り返しを基本配列とする分子デザインであって、ただしジスルフィド架橋の位置が異なるペプチド3量体(スタガー3量体)を合成した。図6にその構造を示す。
H-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-Cys(Acm)-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-Pro-Cys(SH)-Gly-Pro-Hyp-Gly-Pro-OH (配列番号5)
H-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-Cys(SH)-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-Pro-Hyp-Gly-Pro-OH (配列番号6)
Claims (7)
- 式:
-(-Gly-X-Y-)-
[式中、XおよびYは任意のアミノ酸残基を表す]
の繰り返し単位を基本構造として有する同一鎖長の3個のペプチドが、主鎖方向に互いにずれて結合されているペプチド3量体。 - 前記3個のペプチドがジスルフィド結合により互いに結合されている、請求項1記載のペプチド3量体。
- 前記3個のペプチドのうち、2個がそれぞれ1つのCys残基を有し、他の1個が2つのCys残基を有する、請求項1または2に記載のペプチド3量体。
- 前記ペプチド3量体分子全体で、Xの30%以上がProであり、Yの30%以上がProまたはHypである、請求項1−3のいずれかに記載のペプチド3量体。
- 請求項1記載のペプチド3量体を製造する方法であって、
1個のCysを有する第1のペプチド、2個のCysを有し、その一方のSH基が保護されている第2のペプチドおよび1個のCysを有する第3のペプチドを用意し、
第1のペプチドと第2のペプチドとをジスルフィド結合により結合させてペプチド2量体を形成し、
第2のペプチドの保護されているSHを保護基変換により活性化し、そして
前記ペプチド2量体と第3のペプチドとをジスルフィド結合により結合させる、
の各工程を含む方法。 - 請求項1−4のいずれかに記載のペプチド3量体を構成成分とし、3本らせん構造を有する分子集合体。
- 請求項6に記載の分子集合体を製造する方法であって、請求項1−4のいずれかに記載のペプチド3量体の溶液を0℃−40℃の温度で1時間以上放置することを特徴とする方法。
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