JP2004504032A - 性的機能不全の処置用の新規なヒト可溶性分泌エンドペプチダーゼ（ｓｅｐ） - Google Patents

性的機能不全の処置用の新規なヒト可溶性分泌エンドペプチダーゼ（ｓｅｐ） Download PDF

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Abstract

配列番号：２の新規なヒト可溶性分泌エンドペプチダーゼ（ＳＥＰ）をエンコードしているポリヌクレオチド配列を記載し、およびポリペプチド配列を記載する。該ポリペプチド配列は、（ａ）配列番号：１または配列番号：５のポリヌクレオチド配列から翻訳される推定のアミノ酸配列を有するポリペプチドおよびその変異体、フラグメント、ホモログ、類似体および誘導体；（ｂ）配列番号：２のポリペプチドおよびその変異体、フラグメント、ホモログ、類似体および誘導体；（ｃ）ＮＣＩＭＢ４１１１０のｃＤＮＡによってエンコードされたポリペプチドおよびその変異体、フラグメント、ホモログ、類似体および誘導体；または（ｄ）ポリペプチドであって、（ｉ）配列番号：１または配列番号：５のポリヌクレオチドによってエンコードされたポリペプチド、（ｉｉ）配列番号：２のポリペプチド、または（ｉｉｉ）ＮＣＩＭＢ４１１１０のｃＤＮＡによってエンコードされたポリペプチドに少なくとも７８％の同一性を有するポリペプチドの内の一つまたはそれを越えるものを含む。このようなポリペプチド配列は、特に、性的機能不全、具体的には、男性勃起機能不全（ＭＥＤ）または女性性的機能不全（ＦＳＤ）、好ましくは、女性性的興奮障害（ＦＡＤ）の予防および／または処置において有用である。

Description

【０００１】
技術分野
本発明は、酵素に関する。本発明は、更に、その酵素をエンコードしているヌクレオチド配列に関する。
【０００２】
詳しくは、本発明は、新規なヒト可溶性分泌エンドペプチダーゼ（ＳＥＰ）をエンコードしている新規な核酸配列に関する。
本発明は、更に、疾患の診断および予防および／または処置における新規な核酸配列およびアミノ酸配列の使用に関する。
【０００３】
本発明は、更に、特に、エンドペプチダーゼ活性をモジュレートしうる、好ましくは、阻害しうる、より好ましくは、選択的に阻害しうる試剤を評価するおよび／またはスクリーニングするための新規な核酸配列およびアミノ酸配列の使用に関する。
【０００４】
本発明は、更に、性的機能不全、例えば、女性性的機能不全（ＦＳＤ）、特に、女性性的興奮障害（ＦＳＡＤ）の予防および／または処置において有用な化合物および医薬組成物に関する。
【０００５】
本発明は、また更に、ＦＳＤ、特に、ＦＳＡＤの予防および／または処置の方法に関する。
本発明は、更に、ＦＳＤ、特に、ＦＳＡＤの予防および／または処置において有用な化合物をスクリーニングする検定に関する。
【０００６】
本発明は、男性性的機能不全、特に、男性勃起機能不全（ＭＥＤ）の予防および／または処置において用いるための化合物および医薬組成物に関する。本明細書中で論及される男性性的機能不全とは、早発射精などの射精障害、無オルガスム症（オルガスムに達し得ない）、または活動低下状態の性的欲求障害（性行為への関心欠如）などの欲求障害、を含む意味である。
【０００７】
本発明は、更に、ＭＥＤの予防および／または処置の方法に関する。
本発明は、更に、男性性的機能不全、特に、ＭＥＤの予防および／または処置において有用な化合物をスクリーニングする検定に関する。
【０００８】
発明の背景
ヒト可溶性分泌エンドペプチダーゼ（ヒトＳＥＰ）
プロテアーゼは、タンパク質およびペプチドを、そのペプチドまたはタンパク質鎖の主鎖を形成するペプチド結合において切断する酵素のラージファミリーを形成している。プロテアーゼは、細菌からヒトまでの全ての生物において見出されている。ヒトの場合、全遺伝子の約１％（４００〜１０００）が、プロテアーゼ酵素をエンコードしていると考えらている。それらは、発生期ポリペプチドの活性化および成熟、誤って折りたたまれた且つ損傷したタンパク質の分解、および細胞の内部および外部両方のペプチドおよびタンパク質の制御された代謝回転に関与している。それらの活性は、消化、正常な成長、内分泌機能、創傷治癒、炎症、血管新生、胚発生期の組織再造形、腫瘍転移、心臓血管疾患、神経学的疾患、および細菌、寄生生物およびウイルスの感染を含めた多数の過程に重要である。
【０００９】
プロテアーゼは、それらの基質を切断する場所に基づいて広く分類することができる。エキソペプチダーゼには、アミノペプチダーゼ、ジペプチジルペプチダーゼ、トリペプチダーゼ、カルボキシペプチダーゼ、ペプチジルジペプチダーゼ、ジペプチダーゼおよびωペプチダーゼが含まれ、これらは、その基質の末端の残基を切断する。セリンプロテアーゼ、システインプロテアーゼおよびメタロエンドペプチダーゼが含まれるエンドペプチダーゼは、そのペプチド内の配列において切断する。
【００１０】
亜鉛メタロプロテアーゼとして知られる重要なエンドペプチダーゼ群は、それらの触媒部位に亜鉛イオンを結合する必要条件を有することによって特徴付けられる。亜鉛メタロプロテアーゼは、クラスに細分することができ（概説については、ＦＥＢＳ Ｌｅｔｔｅｒｓ ３５４ （１９９４） ｐｐ．１−６ を参照されたい）、一つのこのようなクラスは、ネプリリシン（ｎｅｐｒｉｌｙｓｉｎ）（ＮＥＰ）様亜鉛メタロプロテアーゼである（ＦＡＳＥＢ Ｊｏｕｒｎａｌ， Ｖｏｌ １１，１９９７ ｐｐ．３５５−３８４）。このＮＥＰクラスには、構造的に互いに関連している少なくとも７種類の酵素が含まれる（後を参照されたい）。それらは、典型的には、大きいカルボキシ末端細胞外ドメイン、短い膜に広がる領域、およびアミノ末端の短い細胞内ドメインと共になって、膜結合性である。このファミリーの既知のメンバーは、ネプリリシン（ＮＥＰ、ＣＤ１０、ＣＡＬＬＡ、エンケファリナーゼまたはＥＣ３．４．２４．１１とも称される）、エンドセリン変換酵素（ＥＣＥ−１およびＥＣＥ−２）、ＰＥＸ、ＫＥＬＬ、Ｘ変換酵素／損傷誘発神経エンドペプチダーゼ（ＸＣＥ／ＤＩＮＥ）、および齧歯類で同定された可溶性分泌エンドペプチダーゼ／ネプリリシンＩＩと称される酵素（ＳＥＰ／ＮＥＰＩＩ；Ｇｈａｄｄａｒ，Ｇ ｅｔ ａｌ， Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｊｏｕｒｎａｌ， Ｖｏｌ ３４７，２０００，ｐｐ．４１９−４２９； Ｉｋｅｄａ，Ｋ ｅｔ ａｌ， Ｊｏｕｒｎａｌ Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ， Ｖｏｌ ２７４，１９９９，ｐｐ．３２４６９−３２４７７； Ｔａｎｊａ，Ｏ ｅｔ ａｌ， Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｂｉｏｐｈｙｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｃｏｍｍｕｎｉｃａｔｉｏｎ， Ｖｏｌ ２７１，２０００，ｐｐ．５６５−５７０； 国際特許出願ＷＯ９９／５３０７７号）である。このクラスのメンバーの機能は、ペプチド作用性シグナリングに関連していると考えられる。これは、ヒトを含めた大部分の生物で見出される過程であり、ここにおいて、ペプチド分子は、生理学的応答を引き出す“メッセンジャー”として用いられる。典型的には、これは、時々、プロテアーゼによって切断されて活性になる不活性前駆体として、特定の細胞によるペプチドメッセンジャーの生産および放出を伴う。次に、このペプチドの活性型は、それが応答を引き出す別の細胞の表面上の特異的レセプターを結合する。次に、このペプチドは、別のプロテアーゼによる分解によって失活する。
【００１１】
ＮＥＰは、このクラスの発見される最初のメンバーであった。ＮＥＰは、多数の生物ペプチド、例えば、エンケファリン、ブラジキニンおよびサブスタンスＰ、をタンパク質分解し且つ失活させることができるという点で無差別なプロテアーゼである。それは、通常、疎水性残基のアミノ末端側のペプチドを切断する。ＮＥＰは、多数の体組織中で見出されうるが、腎臓において最も量が多い。その生理学的機能は、充分に理解されていないが、ＮＥＰ“ノックアウト”マウスの表現型からの一つの指標は、それが内毒素ショックの防止に関与しているということである。
【００１２】
ＥＣＥ−１は、ＮＥＰに３７％一致するタンパク質である。ＥＣＥ−１は、身体中に広く分布し、不活性な前駆体ペプチドであるビッグエンドセリンをエンドセリンに変換するが、これは、血管緊張を維持するのに重要な強力な血管収縮薬である。ＥＣＥ−２酵素は、ＥＣＥ−１とは別個の遺伝子に由来するが、そのアミノ酸配列は、５９％の全体相同性で類似している。エンドセリン生産へのＥＣＥ−２の生理学的重要性は不明である。ＥＣＥ−２ｍＲＮＡは、ＥＣＥ−１ｍＲＮＡよりはるかに低レベルで存在するが、ＥＣＥ−１とは異なったｐＨ最適条件を有し、中性ｐＨで不活性であり、ｐＨ５．５で最も活性である。
【００１３】
ＫＥＬＬ酵素は、赤芽球組織で見出されるＮＥＰクラスの臨床的に重要なメンバーである。ＫＥＬＬ血液型系の抗原は、輸血への溶血反応を引き起こすことがありうるこのタンパク質に存在する。
【００１４】
ＰＥＸ遺伝子は、低下した腎尿細管リン酸塩再吸収を典型とする優勢な障害である、Ｘ連鎖低リン酸血症性くる病と称される障害に遺伝的に連鎖していると同定された。ＮＥＰファミリーの他のメンバーとのその近い相同性（４９〜６０％）に基づき、それは、膜結合性メタロプロテアーゼであるとも予測されるが、基質はまだ発見されていない。
【００１５】
ＸＣＥ（Ｖａｌｄｅｎａｉｒｅ，Ｏ ｅｔ ａｌ， Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｒａｉｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ， Ｖｏｌ ６４，１９９９，ｐｐ．２１１−２２１）およびそのラット均等物ＤＩＮＥ（Ｋｉｒｙｕ−Ｓｅｏ，Ｓ ｅｔ ａｌ， Ｐｒｏｃｅｅｄｉｎｇｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅ ＵＳＡ， ２０００，ｐｐ．４３４５−４３５０）は、中枢神経系において主に発現される。ＤＩＮＥ発現は、ニューロン損傷後にアップレギュレーションされるが、これは、おそらくは、抗酸化酵素のＤＩＮＥに媒介されるタンパク質分解活性化の結果として、ニューロンアポトーシスを妨げるのを助けると考えられる。ＸＣＥ／ＤＩＮＥの生理学的基質もまだ同定されていないが、それらの配列から、明らかに、それらはプロテアーゼであると考えられ、そしてＤＩＮＥについては、合成ペプチド基質を用いてこれが証明されている。
【００１６】
齧歯類ＳＥＰおよびＮＥＰＩＩは、ごく最近発見された。それらは９１％のアミノ酸同一性を有するので、ＮＥＰＩＩは、マウス酵素であるＳＥＰのラット均等物であると考えられる。それらは、アミノ酸配列がＮＥＰに最も近いこのクラスのメンバーであり、両方とも、ヒトＮＥＰに５４％一致する。両者のｍＲＮＡは、精巣において極めて量が多く、広範囲の他の組織においても低レベルで検出されることがありうる。ラットＮＥＰＩＩの場合、そのｍＲＮＡは、脳および下垂体においても比較的高レベルで見出されている。哺乳動物細胞中で組換えによって生じる場合、マウスＳＥＰおよびラットＮＥＰＩＩは両方とも、増殖培地中で見出されうる。これは、それらが、循環することができ、したがって身体中の他の部位でペプチドを切断することができる分泌プロテアーゼでありうるということを示唆している。マウスＳＥＰおよびラットＮＥＰＩＩは、ＥＣＥ−１のようなこのクラスのいくつかの他のメンバーと同様、スプライス変異を示す。マウスＳＥＰおよびラットＮＥＰＩＩの場合、このスプライス変異は、膜の局在化および分泌に関与する配列の変化を含むイソ型を生じる。これの生理学的有意性は不明であるが、これら酵素の膜結合型、循環型、および細胞内在型が存在しうると考えられる。マウスＳＥＰは、エンケファリン、エンドセリン、ビッグエンドセリン、ブラジキニンおよびサブスタンスＰを含めた一定範囲の重要な生物ペプチドを切断しうることが分かった。したがって、ＮＥＰと同様、それは、かなり広い基質特異性を有するので、別々の組織においていくつかの生理学的機能を有することがありうる。
【００１７】
このＮＥＰクラスの酵素は、他のメタロプロテアーゼ酵素と同様、薬物様低分子（例えば、チオルファン（ｔｈｉｏｒｐｈａｎ）およびホスホラミドン）による阻害に影響を受けやすいことが示されている。これは、ペプチド作用性シグナリングをモジュレートする場合のＮＥＰ様酵素のいくつかのメンバーの生理学的機能の現れている性状と一緒に、それらを薬学的介入のための魅力のある標的にする。ＮＥＰ阻害剤は、心臓血管疾患を含めた適応症のために開発されているが、それらの機能の情報が更に増加するにつれ、ＮＥＰ様酵素の特異的阻害剤は、性的機能不全（特に、男性性的機能不全、例えば、男性勃起機能不全（ＭＥＤ）、および女性性的機能不全（ＦＳＤ）、例えば、女性性的興奮障害（ＦＳＡＤ））、早産、子癇前症、子宮内膜症、生殖障害（特に、男性および女性の不妊症、多嚢胞性卵巣症候群、着床不全）、高血圧症、心不全、アンギナ、腎機能不全、周期性水腫、高アルドステロン症、緑内障、喘息、炎症、白血病、痛み、てんかん、情動障害、痴呆および老年性錯乱、肥満症および胃腸障害（特に、下痢および過敏性腸症候群）、敗血症性ショック、胃酸分泌のモジュレーション、および高レニン血症の処置などの多数の他の適応症の予防および／または処置にある役割を有することがありうると考えられる。
【００１８】
性的機能不全
性的機能不全（ＳＤ）は、男性および女性双方に影響しうる重要な臨床的問題である。ＳＤの原因は、器質的でありうるし、心理学的でもありうる。ＳＤの器質的側面は、典型的には、高血圧症または真性糖尿病に関連した疾患のような潜在する血管疾患によって、処方薬によっておよび／またはうつ病のような精神医学的疾患によって引き起こされる。生理学的因子には、恐怖、行為不安および対人間葛藤が含まれる。ＳＤは、性的行為を損ない、自尊心を傷つけ、そして人間関係を破壊することによって、人格窮迫を引き起こす。臨床において、ＳＤ障害は、女性性的機能不全（ＦＳＤ）障害および男性性的機能不全（ＭＳＤ）障害に分けられている（Ｍｅｌｍａｎ ｅｔ ａｌ １９９９）。ＦＳＤは、女性が性的表現に満足を見出すことが難しいことまたはできないこととして最もよく定義される。男性性的機能不全（ＭＳＤ）は、概して、男性勃起機能不全（ＭＥＤ）としても知られる勃起機能不全に関連している（Ｂｅｎｅｔ ｅｔ ａｌ １９９４）。
【００１９】
本発明の化合物は、男性の場合の性的機能不全（例えば、男性勃起機能不全−ＭＥＤ）および女性の場合の女性性的機能不全（ＦＳＤ）、例えば、女性性的興奮障害（ＦＳＡＤ）の予防および／または処置に特に有益である。
【００２０】
女性性的機能不全（ＦＳＤ）
本発明において、ＦＳＤは、女性が性的表現に満足を見出すのが難しいことまたはできないこととして定義することができる。ＦＳＤは、いくつかの異なった女性性的障害についての集合名である（Ｌｅｉｂｌｕｍ， Ｓ． Ｒ． （１９９８）． Ｄｅｆｉｎｉｔｉｏｎ ａｎｄ ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ ｆｅｍａｌｅ ｓｅｘｕａｌ ｄｉｓｏｒｄｅｒｓ． Ｉｎｔ． Ｊ． Ｉｍｐｏｔｅｎｃｅ Ｒｅｓ．， １０，Ｓ１０４−Ｓ１０６； Ｂｅｒｍａｎ， Ｊ． Ｒ．， Ｂｅｒｍａｎ， Ｌ． ＆ Ｇｏｌｄｓｔｅｉｎ， Ｉ． （１９９９）． Ｆｅｍａｌｅ ｓｅｘｕａｌ ｄｙｓｆｕｎｃｔｉｏｎ： Ｉｎｃｉｄｅｎｃｅ， ｐａｔｈｏｐｈｙｓｉｏｌｏｇｙ， ｅｖａｌｕａｔｉｏｎｓ ａｎｄ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｏｐｔｉｏｎｓ． Ｕｒｏｌｏｇｙ， ５４，３８５−３９１．）。それら女性は、欲求の欠如、性的興奮またはオルガスムの困難、性交痛、またはこれら問題の組合せを有することがありうる。疾患のいくつかのタイプ、投薬、傷害または心理学的問題は、ＦＳＤを引き起こすことがありうる。開発中の処置は、ＦＳＤの特定のサブタイプ、優先的には、欲求および性的興奮の障害を処置することを的にしている。
【００２１】
ＦＳＤのカテゴリーは、正常な女性性的応答の様相、すなわち、欲求、性的興奮およびオルガスムにそれらを対比することによって最もよく定義される（Ｌｅｉｂｌｕｍ， Ｓ． Ｒ． （１９９８）． Ｄｅｆｉｎｉｔｉｏｎ ａｎｄ ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ ｆｅｍａｌｅ ｓｅｘｕａｌ ｄｉｓｏｒｄｅｒｓ．， Ｉｎｔ． Ｊ． Ｉｍｐｏｔｅｎｃｅ Ｒｅｓ．， １０， Ｓ１０４−Ｓ１０６）。欲求または性欲は、性的表現の動因である。その徴候には、しばしば、関心のある相手と一緒の場合かまたは他の性的刺激にさらされた場合の性的思考が含まれる。性的興奮は、性的刺激への血管応答であり、その重要な成分は、性器充血であり、そしてそれには、増加した膣潤滑、膣の伸長および増加した性器感覚／感受性が含まれる。オルガスムは、性的興奮中に絶頂に達した性的緊張の解放である。
【００２２】
したがって、ＦＳＤは、女性がこれら様相のいずれか、通常は、欲求、性的興奮またはオルガスムに不十分なまたは不満足な応答をする場合に起こる。ＦＳＤカテゴリーには、活動低下状態の性的欲求障害、性的興奮障害、オルガスム障害および性的苦痛障害が含まれる。本発明の化合物は、（女性性的興奮障害の場合のように）性的刺激への性器応答を改善するであろうが、その場合、それは、関連した苦痛、性交に関連した窮迫および不快も改善することができ、したがって、他の女性性的障害を処置することができる。
【００２３】
したがって、本発明の好ましい側面により、活動低下状態の性的欲求障害、性的興奮障害、オルガスム障害および性的苦痛障害の処置または予防のための、より好ましくは、性的興奮障害、オルガスム障害および性的苦痛障害の処置または予防のための、そして最も好ましくは、性的興奮障害の処置または予防での薬剤の製造における本発明の化合物の使用を提供する。
【００２４】
活動低下状態の性的欲求障害は、女性が性的である欲求を全くまたはほとんど持たないし、性的思考または空想を全くまたはほとんどしない場合に存在する。このタイプのＦＳＤは、自然閉経かまたは外科的閉経のための低テストステロンレベルによって引き起こされることがありうる。他の原因には、疾病、投薬、疲労、うつ病および不安が含まれる。
【００２５】
女性性的興奮障害（ＦＳＡＤ）は、性的刺激への不十分な性器応答を特徴とする。性器は、正常な性的興奮を特徴付ける充血をしない。膣壁は充分に潤滑されないので、性交は苦痛である。オルガスムは妨げられうる。性的興奮障害は、閉経時または出産後および授乳期の減少したエストロゲンによって、更には、糖尿病およびアテローム性動脈硬化症のような血管成分を伴う疾病によって引き起こされることがありうる。他の原因は、利尿薬、抗ヒスタミン薬、抗うつ薬、例えば、選択的セロトニン再吸収阻害剤（ＳＳＲＩ）または抗高血圧症薬での処置に起因する。
【００２６】
性的苦痛障害（性交疼痛症および膣痙を含む）は、陰茎挿入に起因する痛みを特徴とし、潤滑を減少させる投薬、子宮内膜症、骨盤内炎症性疾患、炎症性腸疾患または尿路の問題によって引き起こされることがありうる。
【００２７】
ＦＳＤの有病率は、その用語が、そのいくつかは測定し難い問題のいくつかのタイプにわたっているので、そしてＦＳＤを処置することへの関心が比較的最近であるので、判定するのが難しい。多数の女性の性的問題は、直接的には、女性の加齢過程かまたは糖尿病および高血圧症のような慢性疾患に関連している。
【００２８】
ＦＳＤは、性的応答周期の別々の様相で症状を発現するいくつかのサブタイプから成るので、単一の療法は存在しない。ＦＳＤの現行の処置は、主に、心理学的または関連性の問題に集中している。ＦＳＤの処置は、より臨床的な且つ基礎的な科学研究がこの医学的問題の研究についてなされるにつれ、徐々に発展している。女性の性的病気は、病態生理学において、特に、女性の性的病気全体の原因となる血管形成機能不全の成分（例えば、ＦＳＡＤ）を有することがありうる個々人について、全て心理学的であるとは限らない。現在のところ、ＦＳＤの処置用に認可された薬物はない。経験的薬物療法には、エストロゲン投与（局所にまたはホルモン置換療法としての）、アンドロゲン、またはブスピロンまたはトラゾドンのような気分改変薬が含まれる。これら処置選択は、しばしば、低い効力または許容し得ない副作用のために、満足するものではない。
【００２９】
ＦＳＤを処置することへの薬理学的関心は比較的最近であるので、療法は、次の、心理学的カウンセリング、一般市販用性的潤滑剤、および他の状態に承認された薬物を含めた治験候補物から成る。これら投薬は、テストステロンかまたは、エストロゲンおよびテストステロンの組合せのホルモン剤、およびより最近では、男性勃起機能不全（ＭＥＤ）に有効であると証明された血管薬から成る。これら試剤で、ＦＳＤを処置するのに有効であると示されたものはまだない。
【００３０】
考察されるように、本発明の化合物は、女性性的興奮障害（ＦＳＡＤ）の予防および／または処置に特に有用である。
Ｔｈｅ Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃ ａｎｄ Ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌ Ｍａｎｕａｌ （ＤＳＭ） ＩＶ ｏｆ ｔｈｅ Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｉｃ Ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ では、女性性的興奮障害（ＦＳＡＤ）を：
“・・・性的興奮状態の性的活性十分な潤滑膨張応答の完了まで到達するまたは維持することが永続的にまたは再発的にできないこと。この障害は、顕著な窮迫または対人間困難を引き起こすに違いない。・・・”と定義している。
【００３１】
この興奮応答は、骨盤内の血管うっ血、膣潤滑、および外性器の拡大および膨張から成る。この障害は、顕著な窮迫および／または対人間困難を引き起こす。カップルの性的機能不全を調査している研究は、女性の７６％までが性的機能不全の病気を持っていること、および米国の女性の３０〜５０％がＦＳＤを経験していることを示している（Ｂｅｒｍａｎ， Ｊ． Ｒ．， Ｂｅｒｍａｎ， Ｌ． Ａ．， Ｗｅｒｂｉｎ， Ｔ． Ｊ． ｅｔ ａｌ． （１９９９）． Ｆｅｍａｌｅ ｓｅｘｕａｌ ｄｙｓｆｕｎｃｔｉｏｎ： Ａｎａｔｏｍｙ， ｐｈｙｓｉｏｌｏｇｙ， ｅｖａｌｕａｔｉｏｎ ａｎｄ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｏｐｔｉｏｎｓ． Ｃｕｒｒ． Ｏｐｉｎ． Ｕｒｏｌｏｇｙ， ９， ５６３−５６８）。
【００３２】
ＦＳＡＤは、閉経前、閉経周辺期および閉経後（±ホルモン置換療法（ＨＲＴ））の女性を襲う極めて一般的な性的障害である。それは、うつ病、心臓血管疾患、糖尿病および泌尿生殖器（ＵＧ）障害のような付随障害に関連している。
【００３３】
ＦＳＡＤの一次結果は、充血／膨張の不足、潤滑の不足、および快い性器感覚の不足である。ＦＳＡＤの二次結果は、減少した性的欲求、性交中の苦痛およびオルガスムに達するのが難しいことである。
【００３４】
最近になって、ＦＳＡＤの症状を有する患者の少なくとも一部分について、血管が根拠であると仮定され（Ｇｏｌｄｓｔｅｉｎ ｅｔ ａｌ．， Ｉｎｔ． Ｊ． Ｉｍｐｏｔ． Ｒｅｓ．， １０， Ｓ８４−Ｓ９０， １９９８）、動物データがこの見解を支持している（Ｐａｒｋ ｅｔ ａｌ．， Ｉｎｔ． Ｊ． Ｉｍｐｏｔ． Ｒｅｓ．， ９， ２７−３７， １９９７）。
【００３５】
ＦＳＡＤを処置するための薬物候補は、効力について調査中であるが、主として、男性性器への循環を促す勃起機能不全療法である。それらは、二つのタイプの製剤、すなわち、経口または舌下用薬剤（アポモルフィン、フェントラミン、ホスホジエステラーゼ５型阻害剤、例えば、シルデナフィル（Ｓｉｌｄｅｎａｆｉｌ））、および注射または男性の場合は経尿道でおよび女性の場合は性器に局所投与されるプロスタグランジン（ＰＧＥ１）から成る。しかしながら、これら療法で、ＦＳＡＤの処置に有効であることが示されたものはまだない。
【００３６】
理論によって拘束されたくはないが、本発明者は、血管作用性腸管ペプチド（ＶＩＰ）のような神経ペプチドが、女性性的興奮応答の制御、特に、性器血流の制御における主要な神経伝達物質候補であると考えている。ＶＩＰおよび他の神経ペプチドは、ＳＥＰによって分解される／代謝される。したがって、ＳＥＰ阻害剤は、興奮中に放出されるＶＩＰの内因性血管弛緩作用を増強するであろう。これは、増進した性器血流およびそれゆえの性器充血などによって、ＦＳＡＤの予防および／または処置をもたらすであろう。本発明者は、ＳＥＰの阻害剤が、骨盤神経に刺激されるおよびＶＩＰに誘発される膣および陰核の血流の増加を促すということを示した。更に、本発明者は、ＳＥＰ阻害剤が、分離された膣壁のＶＩＰおよび神経に媒介される弛緩を促すということを示した。
【００３７】
したがって、本発明は、正常な性的興奮応答、すなわち、膣、陰核および陰唇の充血をもたらす増加した性器血流を回復させる手段を提供するのを助けるので好都合である。これは、血漿浸出による増加した膣潤滑、増加した膣コンプライアンス、および増加した性器感受性をもたらすであろう。
【００３８】
したがって、本発明は、正常な性的興奮応答を回復させるまたは増強する手段を提供する。
本明細書中の女性性器は：“生殖器は、内部および外部の群から成る。内器官は、骨盤内に位置し、卵巣、卵管、子宮および膣から成る。外器官は、泌尿生殖器隔膜の表面および骨盤帯の下である。それらは、恥丘、大陰唇および小陰唇、陰核、前庭、前庭球、および大前庭腺を含む”（Ｇｒａｙ’ｓ Ａｎａｔｏｍｙ，Ｃ．Ｄ．Ｃｌｅｍｅｎｔｅ， １３ｔｈ Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｅｄｉｔｉｏｎ）を意味する。
【００３９】
Ｒ．Ｊ．Ｌｅｖｉｎ は、“・・・男性および女性性器は、発生学的に共通の組織原基から発生しているので、男性および女性性器構造は、互いに相同であると論じられている。したがって、陰核は陰茎相同物であり、陰唇は陰嚢の相同物である。・・・”（Ｌｅｖｉｎ， Ｒ． Ｊ． （１９９１）， Ｅｘｐ． Ｃｌｉｎ． Ｅｎｄｏｃｒｉｎｏｌ．， ９８， ６１−６９）ということを教示している。
【００４０】
男性勃起機能不全（ＭＥＤ）
いくらかの個人は、男性勃起機能不全（ＭＥＤ）に苦しむことがありうるといことが知られている。
【００４１】
男性勃起機能不全（ＭＥＤ）は：
“・・・満足のいく性的行為のために陰茎勃起を達成するおよび／または維持することができないこと（ＮＩＨ Ｃｏｎｓｅｎｓｕｓ Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ Ｐａｎｅｌ ｏｎ Ｉｍｐｏｔｅｎｃｅ， １９９３）・・・”と定義される。
【００４２】
全段階（最低限の、中程度のおよび完全なインポテンス）の勃起機能不全（ＥＤ）の有病率は、４０歳〜７０歳の男性の５２％であり、７０歳を越える男性ではより高い比率であると推定されている（Ｍｅｌｍａｎ ｅｔ ａｌ １９９９）。その状態は、患者およびそのパートナーの生活の質に重大な悪影響を及ぼし、しばしば、うつ病および乏しい自尊心をもたらす増加した不安および緊張を引き起こす。２０年前には、ＭＥＤは主に心理学的障害であると考えられていたが（Ｂｅｎｅｔ ｅｔ ａｌ １９９４）、現在は、患者の大部分について、根本的な器質的原因があるということが知られている。結果として、正常な陰茎勃起の機作およびＭＥＤの病態生理学を明らかにすることについて多くの進展がなされた。
【００４３】
陰茎勃起は、海綿体平滑筋の収縮および弛緩の平衡および陰茎の脈管構造に依存する血行力学的イベントである（Ｌｅｒｎｅｒ ｅｔ ａｌ １９９３）。海綿体平滑筋は、本明細書中において、体平滑筋または複数の意味で海綿体とも称する。海綿体平滑筋の弛緩は、海綿体の小柱腔中への増加した血流をもたらし、それらが周囲の膜に対して拡大し且つ排出静脈を圧迫するようにさせる。これは、極めて大きい血圧上昇を生じ、これが勃起を引き起こす（Ｎａｙｌｏｒ， １９９８）。
【００４４】
勃起過程中に起こる変化は複雑であり、末梢および中枢の神経系および内分泌系を包含する高度の協調された制御を必要とする（Ｎａｙｌｏｒ， １９９８）。体平滑筋収縮は、シナプス後α１アドレノセプターの活性化による交感神経ノルアドレナリン作用性神経支配によってモジュレートされる。ＭＥＤは、海綿体の内因性平滑筋緊張の増加に関連することがありうる。しかしながら、体平滑筋弛緩過程は、非アドレナリン作用性・非コリン作用性（ＮＡＮＣ）神経伝達によって部分的に媒介される。陰茎中で見出される酸化窒素（ＮＯ）以外の他のＮＡＮＣ神経伝達物質は、カルシトニン遺伝子関連ペプチド（ＣＧＲＰ）および血管作用性腸管ペプチド（ＶＩＰ）など多数存在する。この弛緩を媒介する原因となる主な弛緩因子はＮＯであり、これは、一酸化窒素合成酵素（ＮＯＳ）によってＬ−アルギニンから合成される（Ｔａｕｂ ｅｔ ａｌ １９９３； Ｃｈｕａｎｇ ｅｔ ａｌ １９９８）。体平滑筋緊張を低下させることは、ＮＯが海綿体の弛緩を引き起こすのを助けうると考えられている。男性の場合の性的興奮の際、ＮＯはニューロンおよび内皮から放出され、平滑筋細胞および内皮中にある可溶性グアニル酸シクラーゼ（ｓＧＣ）に結合してそれを活性化させて、細胞内サイクリックグアノシン３’，５’−一リン酸（ｃＧＭＰ）レベルの上昇をもたらす。このｃＧＭＰの上昇は、プロテインキナーゼＧ活性化を包含すると考えられる未知の機作によって（おそらくは、Ｃａ２＋ポンプの活性化およびＣａ２＋に活性化されるＫ＋チャンネルによって；Ｃｈｕａｎｇ ｅｔ ａｌ．， １９９８）、細胞内カルシウム濃度（［Ｃａ２＋］ｉ）の減少による海綿体の弛緩をもたらす。
【００４５】
クエン酸シルデナフィル（バイアグラ（ＶｉａｇｒａＴＭ）とも称される）は、最近、Ｐｆｉｚｅｒ によってＭＥＤのための最初の経口薬処置として開発された。シルデナフィルは、ホスホジエステラーゼ５（ＰＤＥ５）を選択的に阻害することによって海綿体中のｃＧＭＰ分解を阻害することによって作用し、それによって、ｃＧＭＰの５’ＧＭＰへの加水分解を制限し（Ｂｏｏｌｅｌ ｅｔ ａｌ．， １９９６； Ｊｅｒｅｍｙ ｅｔ ａｌ．， １９９７）、そしてそれによって、ｃＧＭＰの細胞内濃度を増加させて海綿体平滑筋弛緩を容易にする。
【００４６】
現在、プロスタグランジン基剤化合物、すなわち、尿道内に（Ｖｉｖｕｓ Ｉｎｃ． から ＭｕｓｅＴＭとして入手可能）または小針注射によって（Ｐｈａｒｍａｃｉａ ＆ Ｕｐｊｏｈｎ から ＣａｖｅｒｊｅｃｔＴＭとして入手可能）投与することができるアルプロスタジル（ａｌｐｒｏｓｔａｄｉｌ）での処置のような他の利用可能な市販ＭＥＤ療法は全て、不都合であるかおよび／または侵襲性である。他の処置には、真空狭窄装置、血管作用性薬注射または陰茎プロテーゼ植込み（Ｍｏｎｔａｇｕｅ ｅｔ ａｌ．， １９９６）が含まれる。注射可能な血管作用性薬は高い効力を示すが、陰茎痛、線維症および持続勃起症などの副作用が一般的であるし、注射療法は経口療法ほど好都合ではないので、現在のところ、シルデナフィルが最も好ましい市販療法である。
【００４７】
陰茎または海綿体中のまたは勃起機作／過程におけるＳＥＰの発現または機能的役割について、文書による証拠は従来存在しない。
陰茎または海綿体へのまたは代わりに勃起機作／過程におけるＳＥＰ阻害剤の機能的または生化学的作用についても、文書による証拠は従来存在しない。
【００４８】
膣または陰核海綿体中のまたは女性性的興奮機作／過程におけるＳＥＰの発現または機能的役割について、文書による証拠は従来存在しない。
膣または陰核海綿体中のまたは女性性的興奮機作／過程におけるＳＥＰ阻害剤の機能的または生化学的作用についても、文書による証拠は従来存在しない。
【００４９】
したがって、本発明の将来性のある知見は、性的機能不全、特に、ＭＥＤまたはＦＳＡＤに苦しむ男性または女性を、可溶性分泌エンドペプチダーゼ阻害剤（ＳＥＰｉ）の使用で処置する能力である。驚くべきことに、本出願人は、ＳＥＰｉでのＳＥＰの阻害が、神経に刺激される性的興奮過程を有意に増進するということも見出した。
【００５０】
本発明は、正常な性的興奮応答、すなわち、男性の場合は陰茎の勃起をもたらす増加した陰茎血流、および女性の場合は性器充血をもたらす増加した膣陰核血流を回復させる手段を提供するので、好都合である。したがって、本発明は、正常な性的興奮応答を回復させるまたは増強する手段を提供する。
【００５１】
発明の概要
広範な側面において、本発明は、新規なアミノ酸配列に関する。これに関して、具体的な新規アミノ酸配列が同定されており、本発明がその配列、ならびに、その新規な変異体、フラグメント、誘導体およびホモログを包含するということは理解されるはずである。
【００５２】
もう一つの広範な側面において、本発明は、新規な核酸配列に関する。これに関して、具体的な新規核酸配列が同定されており、本発明がその配列、ならびに、その新規な変異体、フラグメント、誘導体およびホモログを包含するということは理解されるはずである。
【００５３】
したがって、要するに、本発明のいくつかの側面は、次に関する：
１．　新規なアミノ酸。
２．　新規なヌクレオチド配列。
【００５４】
３．　これら新規な配列を用いた検定。
４．　これら検定の使用によって識別される化合物／組成物。
５．　これら新規な配列を含むまたは発現する発現系。
【００５５】
６．　これら新規な配列に基づく予防および／または処置の方法。
７．　これら新規な配列に基づく医薬組成物。
本発明のアミノ酸配列および／または本発明のヌクレオチド配列に関する他の側面には、本発明の配列を含むまたは発現することができる構築物；本発明の配列を含むまたは発現することができるベクター；本発明の配列を含むまたは発現することができるプラスミド；本発明の配列を含むまたは発現することができる組織；本発明の配列を含むまたは発現することができる器官；本発明の配列を含むまたは発現することができる形質転換された宿主；および本発明の配列を含むまたは発現することができる形質転換された生物、が含まれる。本発明は、更に、それらを転移する方法を含めた、微生物中での発現のような、それらを発現する方法を包含する。
【００５６】
次の注釈において、“本発明のヌクレオチド配列”および“本発明のアミノ酸配列”の意味は、それぞれ、本明細書中に示されたまたは論じされたヌクレオチド配列のいずれか一つまたはそれを越えるもの、および本明細書中に示されたまたは論じされたアミノ酸配列のいずれか一つまたはそれを越えるものを意味する。更に、本明細書中に用いられるように、“アミノ酸配列”とは、ペプチドまたはタンパク質の配列を意味し、それらの一部分を意味してよい。更に、“本発明のアミノ酸配列”という用語は、“本発明のポリペプチド配列”という句と同義語である。更に、“本発明のヌクレオチド配列”という用語は、“本発明のポリヌクレオチド配列”という句と同義語である。
【００５７】
発明の詳細な側面
本発明の一つの側面においては、単離されたおよび／または精製されたポリヌクレオチドであって、
（ａ）配列番号：２に示されるポリペプチドをエンコードしているポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号：１または配列番号：５のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド；
（ｃ）ＮＣＩＭＢ４１１１０中に含有されるＤＮＡによって発現されたポリペプチドをエンコードしているポリヌクレオチド；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のいずれか一つのポリヌクレオチドに少なくとも８３％の同一性を有するヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド；
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のいずれか一つのポリヌクレオチドにハイブリッド形成することができるヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか一つのポリヌクレオチドの相補鎖；または
（ｇ）（ａ）〜（ｆ）のいずれか一つのポリヌクレオチドのポリヌクレオチドフラグメント
の内の一つまたはそれを越えるものを含むポリヌクレオチドを提供する。
【００５８】
配列番号：２のポリペプチドについて、それらアミノ酸のいずれか一つまたはそれを越えるものは、それらの類似体でありうる。
本明細書中で用いられる“類似体”という用語は、配列番号：２の配列に類似した配列を有する配列であるが、非有害（すなわち、酵素活性に有害でない）アミノ酸置換または欠失が起こっている配列を意味する。
【００５９】
好ましくは、このポリヌクレオチドは、上の（ａ）〜（ｃ）のいずれか一つのポリヌクレオチドに少なくとも８５％の同一性を有するヌクレオチド配列を含む。より好ましくは、このポリヌクレオチドは、上の（ａ）〜（ｃ）のいずれか一つのポリヌクレオチドに少なくとも８７％の同一性を有するヌクレオチド配列を含む。なお一層好ましくは、このポリヌクレオチドは、上の（ａ）〜（ｃ）のいずれか一つのポリヌクレオチドに少なくとも８９％の同一性を有するヌクレオチド配列を含む。また更に好ましくは、このポリヌクレオチドは、上の（ａ）〜（ｃ）のいずれか一つのポリヌクレオチドに少なくとも９０％の同一性を有するヌクレオチド配列を含む。最も好ましくは、このポリヌクレオチドは、上の（ａ）〜（ｃ）のいずれか一つのポリヌクレオチドに少なくとも９５％の同一性を有するヌクレオチド配列を含む。
【００６０】
好ましくは、上記のポリヌクレオチドは、アミノ酸配列ＭＧＫＳＥＧＰＶＧを含むポリペプチドをエンコードしている。好ましくは、このアミノ酸配列ＭＧＫＳＥＧＰＶＧは、そのポリペプチドのアミノ末端にまたはその付近にある。
【００６１】
好ましくは、上記のポリヌクレオチドは、ヌクレオチド配列ＡＴＧＧＧＧＡＡＧＴＣＣＧＡＡＧＧＣＣＣＣＧＴＧＧＧＧを含む。好ましくは、このヌクレオチド配列ＡＴＧＧＧＧＡＡＧＴＣＣＧＡＡＧＧＣＣＣＣＧＴＧＧＧＧは、そのポリヌクレオチドの５’末端にまたはその付近にある。
【００６２】
上記のポリヌクレオチドは、好ましくは、可溶性分泌エンドペプチダーゼ（ＳＥＰ）、好ましくは、ヒトＳＥＰをエンコードしている。
本発明は、更に、上記のポリヌクレオチドの少なくとも１５個連続したヌクレオチドを含むポリヌクレオチドプローブもしくはプライマー、またはその相補鎖を提供する。好ましくは、このプローブまたはプライマーは、このＳＥＰコーディング配列を他の配列から特異的に区別することができる。
【００６３】
本発明は、また更に、上記のポリヌクレオチドを含むベクターを提供する。
本発明のもう一つの側面により、上記のベクターで形質転換されたまたはトランスフェクションされた宿主細胞を提供する。好ましくは、この宿主細胞は、哺乳動物、細菌または酵母の細胞である。
【００６４】
本発明によって更に提供されるのは、上記のポリヌクレオチドの転写されたＲＮＡ産物である。
本発明によって更に提供されるのは、上記のこのＲＮＡ産物に関してアンチセンスであって、それにハイブリッド形成することができるＲＮＡ分子またはそのフラグメントである。
【００６５】
上記のポリヌクレオチドに結合することができるリボザイムまたはジンクフィンガータンパク質も、本発明によって提供する。
本発明のまた更にもう一つの側面により、ポリペプチドまたはそのフラグメントを製造する方法であって、宿主細胞を上記のベクターで形質転換しまたはトランスフェクションし、そしてその形質転換された／トランスフェクションされた宿主細胞を、培地中においてこのポリペプチドまたはフラグメントの発現に充分な条件下で培養することを含む方法を提供する。好ましくは、このポリペプチドまたはフラグメントを培地中に分泌させる。この方法は、好ましくは、ポリペプチドまたはフラグメントを培地から回収することを更に含む。
【００６６】
本発明は、ポリペプチドまたはそのフラグメントを発現することができる細胞を生じる方法であって、上記のベクターで細胞を形質転換するまたはトランスフェクションすることを含む方法を更に提供する。
【００６７】
本発明のもう一つの態様により、上記の方法によって生じた細胞を提供する。更に、上の方法によって生じる上記のポリペプチドまたはそのフラグメントを提供する。
【００６８】
本発明のもう一つの側面により、ＳＥＰ活性を有するポリペプチドであって、
（ａ）配列番号：１または配列番号：５のポリヌクレオチド配列から翻訳される推定のアミノ酸配列を有するポリペプチドおよびその変異型、フラグメント、ホモログ、類似体および誘導体；
（ｂ）配列番号：２のポリペプチドおよびその変異型、フラグメント、ホモログ、類似体および誘導体；
（ｃ）ＮＣＩＭＢ４１１１０のｃＤＮＡによってエンコードされたポリペプチドおよびその変異型、フラグメント、ホモログ、類似体および誘導体；または
（ｄ）ポリペプチドであって、（ｉ）配列番号：１または配列番号：５のポリヌクレオチドによってエンコードされたポリペプチド、（ｉｉ）配列番号：２のポリペプチド、または（ｉｉｉ）ＮＣＩＭＢ４１１１０のｃＤＮＡによってエンコードされたポリペプチド、と少なくとも７８％の同一性を有するもの
の内の一つまたはそれを越えるものを含むポリペプチドを提供する。
【００６９】
好ましくは、このポリペプチドは、（ｉ）配列番号：１または配列番号：５のポリヌクレオチドによってエンコードされたポリペプチド、（ｉｉ）配列番号：２のポリペプチド、または（ｉｉｉ）ＮＣＩＭＢ４１１１０のｃＤＮＡによってエンコードされたポリペプチド、と少なくとも８５％、好ましくは、少なくとも９０％、より好ましくは、少なくとも９５％、最も好ましくは、少なくとも９８％の同一性を有する。
【００７０】
好ましくは、上記のポリペプチドは、アミノ酸配列ＭＧＫＳＥＧＰＶＧを含む。好ましくは、このアミノ酸配列ＭＧＫＳＥＧＰＶＧは、そのポリペプチドのアミノ末端にまたはその付近にある。
【００７１】
好ましくは、上記のポリペプチドをエンコードしているポリヌクレオチドは、ヌクレオチド配列ＡＴＧＧＧＧＡＡＧＴＣＣＧＡＡＧＧＣＣＣＣＧＴＧＧＧＧを含む。好ましくは、このヌクレオチド配列ＡＴＧＧＧＧＡＡＧＴＣＣＧＡＡＧＧＣＣＣＣＧＴＧＧＧＧは、そのポリヌクレオチドの５’末端にまたはその付近にある。
【００７２】
本発明は更に、上記のポリペプチドに対する抗体を提供する。
本発明は、また更に、上記のポリペプチドをモジュレートする化合物を提供する。好ましくは、この化合物は、そのポリペプチドを阻害するまたは選択的に阻害する。
【００７３】
本発明が更に提供するのは、医薬組成物であって、上記の抗体または化合物および１種類またはそれを越える薬学的に許容しうる担体、希釈剤または賦形剤を含む医薬組成物である。
【００７４】
本発明のもう一つの側面により、上記のポリペプチドに結合するおよび／またはそれをモジュレートする候補モジュレーターを識別する方法であって、このポリペプチドを候補モジュレーターと接触させ、そしてモジュレーションが起こるかどうか確かめることを含む方法を提供する。
【００７５】
好ましくは、この方法は、
（ａ）（ｉ）上記のポリペプチドの基質ペプチドと（ｉｉ）上記のポリペプチドとを、（ｉｉｉ）上記のポリペプチドの候補モジュレーターの存在下で接触させ、ここにおいて、この基質ペプチドは、上記のポリペプチドによるこの基質ペプチドの切断に応答して検出可能なシグナルを与えることができ；そして
（ｂ）上記のポリペプチドによるこの基質ペプチドの切断が、この候補モジュレーターによってモジュレートされたか否かを、この基質ペプチドに関連したこの検出可能なシグナルの存在または不存在を検出することによって確かめる；
ことを含む。
【００７６】
好ましくは、この候補モジュレーターは候補阻害剤である。より好ましくは、この基質ペプチドを、少なくとも１種類の蛍光ドナー色素および少なくとも１種類の蛍光アクセプター色素で標識し、そして上記のポリペプチドの候補阻害剤を検出するのに用いられる検定は、蛍光共鳴エネルギー移動（ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ ｒｅｓｏｎａｎｃｅ ｅｎｅｒｇｙ ｔｒａｎｓｆｅｒ）（ＦＲＥＴ）検定である。最も好ましくは、この標識された基質ペプチドは、ローダミングリーン−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−ｄＰｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｒｇ−Ａｒｇ−Ｖａｌ−Ｃｙｓ（ＱＳＹＴＭ−７）−βＡｌａ−ＮＨ２である。
【００７７】
したがって、本発明の好ましい側面により、上記のポリペプチドに結合するおよび／またはそれを阻害する候補阻害剤を識別する方法であって、
（ａ）（ｉ）上記のポリペプチドの基質ペプチドと（ｉｉ）上記のポリペプチドとを、（ｉｉｉ）上記のポリペプチドの候補阻害剤の存在下で接触させ、ここにおいて、この基質ペプチドは、上記のポリペプチドによるこの基質ペプチドの切断に応答して検出可能なシグナルを与えることができ；そして
（ｂ）上記のポリペプチドによるこの基質ペプチドの切断が、この候補阻害剤によって阻害されたか否かを、この基質ペプチドに関連したこの検出可能なシグナルの存在または不存在を検出することによって確かめる；
ことを含む方法を提供する。
【００７８】
好ましくは、この基質ペプチドを、少なくとも１種類の蛍光ドナー色素および少なくとも１種類の蛍光アクセプター色素で標識し、そして上記のポリペプチドの候補阻害剤を検出するのに用いられる検定は、蛍光共鳴エネルギー移動（ＦＲＥＴ）検定である。最も好ましくは、この標識された基質ペプチドは、ローダミングリーン−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−ｄＰｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｒｇ−Ａｒｇ−Ｖａｌ−Ｃｙｓ（ＱＳＹＴＭ−７）−βＡｌａ−ＮＨ２である。
【００７９】
このＳＥＰ　ＦＲＥＴ検定は、ＮＥＰと一緒の使用について、Ｃａｒｖａｌｈｏ ｅｔ ａｌ によって開発された検定に基づいている（Ｃａｒｖａｌｈｏ ｅｔ ａｌ．， Ａｎｎａｌ． Ｂｉｏｃｈｅｍ． ２３７， ｐｐ．１６７−１７３ （１９９６））。ＳＥＰ　ＦＲＥＴ検定は、類似した分子内消光蛍光原性ペプチド基質（ｓｉｍｉｌａｒ ｉｎｔｒａｍｏｌｅｃｕｌａｒｌｙ ｑｕｅｎｃｈｅｄ ｆｌｕｏｒｏｇｅｎｉｃ ｐｅｐｔｉｄｅ ｓｕｂｓｔｒａｔｅ）を利用するが、蛍光原性ドナー／アクセプター色素の新規な組合せ、具体的には、ローダミングリーン（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｒｏｂｅｓ， Ｉｎｃ．， Ｅｕｇｅｎｅ， ＯＲ， ＵＳＡ）およびＱＳＹＴＭ−７（以下、“ＱＳＹ−７”または“ＱＳＹ７”と記す；Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｒｏｂｅｓ， Ｉｎｃ．）を利用する。
【００８０】
合成標識基質ペプチドローダミングリーン−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−ｄＰｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｒｇ−Ａｒｇ−Ｖａｌ−Ｃｙｓ（ＱＳＹ７）−βＡｌａ−ＮＨ２の製造は、実施例部分（以下）に詳述する。
【００８１】
本発明の別の側面により、上記のポリペプチドに結合するおよび／またはそれをモジュレートする候補モジュレーターを識別する方法であって、このポリペプチドを候補モジュレーターと接触させ、そしてモジュレーションが起こるかどうか確かめることを含み、
（ａ）上記のポリペプチドを分泌する細胞と候補モジュレーターを接触させ、このポリペプチドは、このポリペプチドへの候補モジュレーターの結合に関して検出可能なシグナルを与えることができる第二成分に結合していて；この接触は、このポリペプチドに候補モジュレーターを結合させるのに充分な条件下であり；そして
（ｂ）ポリペプチドを結合することができる候補モジュレーターを、この第二成分によって生じるシグナルを検出することによって識別する；
ことを含む方法を提供する。
【００８２】
更に、この方法は、
（ａ）（ｉ）上記のポリペプチドに結合することが知られている検出可能な第一成分および（ｉｉ）候補モジュレーターを、上記ポリペプチドを分泌する細胞と接触させ、このポリペプチドは、このポリペプチドへの候補モジュレーターの結合に関して検出可能なシグナルを与えることができる第二成分に結合していて；この接触は、このポリペプチドに候補モジュレーターを結合させるのに充分な条件下であり；そして
（ｂ）この第一成分がポリペプチドに結合するかどうかを、このポリペプチドと第一成分の相互作用により生じるシグナルの不存在またはそれ以外の場合を検出することによって確かめる；
ことを含む。
【００８３】
上の方法のいずれかによって識別される候補モジュレーターは、好ましくは、上記のポリペプチドに結合するおよび／またはそれを阻害する、すなわち、好ましくは、候補阻害剤である。
【００８４】
さらなるの側面において、本発明は、女性性的機能不全、特に、ＦＳＡＤ、または男性性的機能不全、特に、ＭＥＤを処置するのに用いることができる試剤（以下、ＳＥＰ阻害剤またはＳＥＰｉと称する）を識別するための検定方法であって、ある試験薬が、内因性性器充血過程または勃起過程を直接的に増進することができるかどうか決定することを含み；ここにおいて、この増進は、本明細書中に定義の試験薬の存在下における性器血流または空洞内血圧（ＩＣＰ）（および／または空洞血流）の増強として定義され；試験薬によるこのような増強は、この試験薬が、女性性的機能不全、特に、ＦＳＡＤ、または男性性的機能不全、特に、ＭＥＤの予防および／または処置において有用でありうるということを示すものであり、そしてここにおいて、この試験薬がＳＥＰｉである検定方法に関する。
【００８５】
例として、本発明は、女性性的機能不全、特に、ＦＳＡＤ、または男性性的機能不全、特に、ＭＥＤを処置するための、内因性性器興奮または勃起過程を直接的に増進することができる試剤を識別するための検定方法であって、ペプチド（好ましくは、ローダミングリーン−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−ｄＰｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｒｇ−Ａｒｇ−Ｖａｌ−Ｃｙｓ（ＱＳＹ７）−βＡｌａ−ＮＨ２のような蛍光標識ペプチド）の代謝分解を阻害することができる部分を有する試験薬を接触させ、このペプチドは、通常はＳＥＰによって代謝され；そして一定時間後に残っているペプチドの活性および／またはレベルを（例えば、蛍光定量分析によって）測定することを含み；ここにおいて、蛍光によって測定されるペプチドレベルの変化は、この試験薬の効力（ＩＣ５０）を示し、且つこの試験薬が、女性性的機能不全、特に、ＦＳＡＤ、または男性性的機能不全、特に、ＭＥＤの予防および／または処置において有用でありうるということを示すものであり；そしてここにおいて、この試剤がＳＥＰｉである検定方法に関する。
【００８６】
さらなるの側面において、本発明は、（ａ）本発明による検定を実施し；（ｂ）内因性性器興奮過程または勃起過程を直接的に増進することができる１種類またはそれを越える試剤を識別し；そして（ｃ）一定量のそれら識別された１種類またはそれを越える試剤を製造する工程を含み；そしてここにおいて、この試剤がＳＥＰｉである方法に関する。
【００８７】
この側面について、工程（ｂ）で識別された試剤は、例えば、活性を最大限にするように修飾されてよく、その後、工程（ａ）を繰り返してよい。これら工程は、所望の活性または薬物動態学的プロフィールが得られるまで繰り返してよい。
【００８８】
したがって、さらなる側面において、本発明は、（ａ１）本発明の検定を実施し；（ｂ１）内因性性器興奮過程または勃起過程を直接的に増進することができる１種類またはそれを越える試剤を識別し；（ｂ２）この識別された１種類またはそれを越える試剤を修飾し；（ａ２）場合により、工程（ａ１）を繰り返し；そして（ｃ）一定量のそれら識別された１種類またはそれを越える試剤（すなわち、修飾されたもの）を製造する工程を含み；そしてここにおいて、この試剤がＳＥＰｉである方法に関する。
【００８９】
上記のいずれかの検定（またはその変法）を用いて識別されるいずれかの候補モジュレーター、候補阻害剤、候補選択的阻害剤、試剤（以下、ＳＥＰ阻害剤またはＳＥＰｉと称する）等も、本発明の側面と考えられるということは理解されるはずである。
【００９０】
したがって、本発明は、上記の方法（検定）のいずれか一つによって識別される候補モジュレーター、候補阻害剤、候補選択的阻害剤または試剤を提供する。
エンドペプチダーゼは、特に、生物活性ペプチド活性を調節すること（例えば、ペプチド作用性シグナリング過程）に関与しているので、エンドペプチダーゼのモジュレーター（例えば、選択的阻害剤を含めた阻害剤）は、このような活性をモジュレートする場合に用いることができる。
【００９１】
ＥＣＥ−１のようないくつかのエンドペプチダーゼは、生物学的に不活性なペプチドのそれらの活性型へのタンパク質分解に関与している。したがって、エンドペプチダーゼのモジュレーター（例えば、選択的阻害剤を含めた阻害剤）は、このような活性をモジュレートする場合に用いることができる。
【００９２】
ヒトＳＥＰは、したがって、生物活性ペプチド活性を調節することおよび／または生物学的に不活性なペプチドのそれらの活性型へのタンパク質分解に関与することがありうる。
【００９３】
したがって、本発明は、医薬として用いるための、上記のポリペプチドをモジュレートする抗体、化合物または組成物を提供する。このポリペプチドの阻害剤または選択的阻害剤として作用することができるこのような抗体、化合物または組成物は、したがって、ペプチド作用性シグナリング過程をモジュレートすることのような生物活性ペプチド活性を調節する側面に関する治療的分野においておよび／または生物学的に不活性なペプチドのそれらの活性型へのタンパク質分解において用いることができる。このような治療的に有用な分野には、性的機能不全（例えば、女性性的機能不全、特に、ＦＳＡＤ、または男性性的機能不全、特に、ＭＥＤ）、妊孕性障害、アルツハイマー病および発作のような神経変性障害、高血圧症のような心臓血管疾患、創傷治癒／組織修復等が含まれるが、これらに制限されるわけではない。
【００９４】
したがって、医薬として用いるための上記の抗体、化合物または組成物も提供する。
更に、上記のポリペプチドをモジュレートする必要がある患者の予防および／または処置での薬剤の製造における上の化合物の使用を提供する。
【００９５】
更に、上記のポリペプチドを阻害するまたは選択的に阻害する必要がある患者の予防および／または処置での薬剤の製造における上の化合物の使用を提供する。好ましくは、上の化合物のこの使用は、性的機能不全の予防および／または処置用の薬剤の製造の場合である。より好ましくは、この性的機能不全は、男性勃起機能不全（ＭＥＤ）または女性性的機能不全（ＦＳＤ）である。最も好ましくは、この女性性的機能不全（ＦＳＤ）は女性性的興奮障害（ＦＳＡＤ）である。
【００９６】
本発明のまた更にもう一つの側面により、上記のポリペプチドをモジュレートする必要がある患者の予防および／または処置の方法であって、この患者に治療的有効量の上記の化合物を投与することを含む方法を提供する。
【００９７】
更に、上記のポリペプチドを阻害するまたは選択的に阻害する必要がある患者の予防および／または処置の方法であって、この患者に治療的有効量の上記の化合物を投与することを含む方法を提供する。
【００９８】
また更に、患者の性的機能不全の予防および／または処置の方法であって、この患者に治療的有効量の上記の化合物を投与することを含む方法を提供する。好ましくは、この性的機能不全は、男性勃起機能不全（ＭＥＤ）または女性性的機能不全（ＦＳＤ）である。より好ましくは、この女性性的機能不全（ＦＳＤ）は女性性的興奮障害（ＦＳＡＤ）である。
【００９９】
好ましくは、この化合物はポリペプチドであり、この化合物の治療的有効量は、この化合物をエンコードしている且つこの化合物を ｉｎ ｖｉｖｏ で発現するＤＮＡを患者に与えることによって投与される。より好ましくは、この化合物はポリペプチド阻害剤であり、モジュレーションは、上記のポリペプチドの阻害または選択的阻害である。
【０１００】
本発明によって更に提供されるのは、上記のポリペプチドをモジュレートする必要がある患者の予防および／または処置用の薬剤の製造における上記の抗体の使用である。好ましくは、このモジュレーションは、上記のポリペプチドの阻害または選択的阻害である。好ましくは、この予防および／または処置は、性的機能不全についてである。より好ましくは、この性的機能不全は、男性勃起機能不全（ＭＥＤ）または女性性的機能不全（ＦＳＤ）である。最も好ましくは、この女性性的機能不全（ＦＳＤ）は女性性的興奮障害（ＦＳＡＤ）である。
【０１０１】
本発明によって更に、上記のポリペプチドをモジュレートする必要がある患者の予防および／または処置の方法であって、この患者に治療的有効量の上記の抗体を投与することを含む方法を提供する。好ましくは、このモジュレーションは、上記のポリペプチドの阻害または選択的阻害である。好ましくは、この予防および／または処置は、性的機能不全についてである。より好ましくは、この性的機能不全は、男性勃起機能不全（ＭＥＤ）または女性性的機能不全（ＦＳＤ）である。最も好ましくは、この女性性的機能不全（ＦＳＤ）は女性性的興奮障害（ＦＳＡＤ）である。
【０１０２】
本発明の好ましい側面は、女性性的機能不全、特に、ＦＳＡＤ、または男性性的機能不全、特に、ＭＥＤの予防および／または処置において用いるための（または用いられている場合の）ＳＥＰｉ化合物およびＳＥＰｉ化合物を含有する医薬組成物に関する。この医薬組成物中において、ＳＥＰｉは、薬学的に許容しうる担体、希釈剤または賦形剤と所望により混合されている。ここで、この組成物は（本明細書中に述べられるいずれかの他の組成物のように）、男性性的機能不全、特に、ＭＥＤ、または女性性的機能不全、特に、ＦＳＡＤの予防および／または処置で引き続き用いるために包装されていてよい。
【０１０３】
もう一つの側面において、本発明は、女性性的機能不全、特に、ＦＳＡＤ、または男性性的機能不全、特に、ＭＥＤの予防および／または処置用の薬剤（医薬組成物のような）の製造における試剤の使用に関する。
【０１０４】
もう一つの側面において、本発明は、女性性的機能不全、特に、ＦＳＡＤを患っている女性、または男性性的機能不全、特に、ＭＥＤを患っている男性を処置する方法であって、陰核および膣での内因性性器興奮／充血応答または海綿体での勃起過程を増進することができるＳＥＰｉをその女性または男性に供給することを含み；ここにおいて、このＳＥＰｉは、本明細書中の前に定義の内因性興奮／勃起過程を増進する量で存在し；このＳＥＰｉは、薬学的に許容しうる担体、希釈剤または賦形剤と所望により混合され；そしてこのＳＥＰｉは本明細書中に定義の通りである方法に関する。
【０１０５】
もう一つの側面において、本発明は、女性性的機能不全、特に、ＦＳＡＤ、または男性性的機能不全、特に、ＭＥＤを処置する方法であって、膣／陰核血流、ＩＣＰまたは空洞血流を測定することによって ｉｎ ｖｉｖｏ において（例えば、ウサギにおいて）神経刺激される内因性性器興奮過程または勃起過程をある試剤で増強することにより；ここにおいて、この試剤は、ｉｎ ｖｉｔｒｏ 検定法において蛍光ペプチド（本明細書中で先述された、および以下に詳述される）の代謝分解を直接的に阻害することができ；この ｉｎ ｖｉｔｒｏ 検定法は、本発明による検定法であり；そしてこの試剤はＳＥＰｉである方法に関する。
【０１０６】
もう一つの側面において、本発明は、女性性的機能不全、特に、ＦＳＡＤ、または男性性的機能不全、特に、ＭＥＤの予防および／または処置用の医薬組成物の製造における試剤の使用であって、ここにおいて、この試剤は、本発明の検定法によって ｉｎ ｖｉｔｒｏ で検定された場合に蛍光ペプチドの代謝分解を直接的に阻害することができ；そしてこの試剤はＳＥＰｉである使用に関する。
【０１０７】
好ましくは、本発明による男性および女性の性的機能不全、特に、ＭＥＤおよびＦＳＡＤの予防および／または処置で用いるためのＳＥＰ阻害剤（ＳＥＰｉ）は、１００ｎＭ未満、より好ましくは、５０ｎＭ未満のＩＣ５０を有する。
【０１０８】
好ましくは、本発明によるＳＥＰ阻害剤は、中性エンドペプチダーゼＮＥＰ　ＥＣ３．４．２４．１１およびアンギオテンシン変換酵素（ＡＣＥ）に対するより３０倍を越える、より好ましくは、５０倍を越えるＳＥＰ選択性を有する。これは、ＳＥＰｉを全身に（例えば、口より）投与した場合の心臓血管イベント（例えば、血圧の降下）の見込みを減少させる。好ましくは、ＳＥＰｉは、更に、エンドセリン変換酵素（ＥＣＥ）に対するより１００倍を越える選択性を有する。
【０１０９】
ＳＥＰｉ化合物は、実験の項（以下）に示される教示にしたがって製造される。それらを試剤として調べ、そしてそれらが内因性勃起過程を増進するのに有用であり、それによってＭＥＤおよびＦＳＡＤの予防および／または処置において有用であることが判明した。
【０１１０】
いずれの特定の理論にも制限されることなく、本明細書中において、ＳＥＰを阻害することにより、性的興奮中に放出される、ニューロンによって放出される他の血管作用薬（おそらくは、血管作用性腸管タンパク質（ＶＩＰ））が増進するということが考えられる。ＳＥＰｉの使用は、性的刺激中に放出される神経ペプチド（おそらくは、ＶＩＰ）の作用を増強し、それゆえ、空洞血流を増加させることによる男性勃起機作を増強し、したがって、性器血流を増加させることによる空洞内血圧および女性の充血を増強すると考えられる。
【０１１１】
更に、本発明の化合物の使用は、非ＮＯ依存性ＮＡＮＣ経路を増進することによって作用して、ＭＥＤおよびＦＳＡＤを処置する、および陰茎および膣／陰核中の硝酸作用性（ｎｉｔｒｅｒｇｉｃ）シグナリングを増強するまたは容易にすると考えられる。
【０１１２】
したがって、本発明の好ましい側面により、男性性的機能不全、特に、ＭＥＤ、または女性性的機能不全、特に、ＦＳＡＤの予防および／または処置用の薬剤の製造における、全身投与による（好ましくは、口による、例えば、嚥下可能錠剤またはカプセル剤、または舌下または口腔用製剤）ＳＥＰｉの使用を提供する。
【０１１３】
本研究において、本発明者は、男性および女性の性的興奮の生理学についての強壮な再現可能モデルを開発した。このモデルは、麻酔されたウサギを用い、レーザー・ドップラー（Ｌａｓｅｒ Ｄｏｐｐｌｅｒ）技法を用いて空洞内血圧および性器血流を監視し、同時に、心臓血管パラメーターを常套的に記録する。本発明者は、試験薬の不存在下および存在下における骨盤神経刺激またはＶＩＰの注入によって引き起こされる陰茎中の空洞内血圧および膣（および陰核さえも）血流の僅かな変化を測定することができる。
【０１１４】
本発明者は、この動物モデルが、臨床データに直接的に反映すると考えている。したがって、このモデルを用いて、空洞内血圧の増加による陰茎勃起の増進および膣または陰核血流増進を測定するなどの、例えば、ＭＥＤおよびＦＳＡＤの予防および／または処置のための候補薬を研究することができる。
【０１１５】
したがって、さらなる側面により、本発明は、女性性的機能不全、特に、ＦＳＡＤ、または男性性的機能不全、特に、ＭＥＤを処置することができる試剤を識別するのに用いられる動物モデルであって、麻酔された雌または雄の動物の骨盤神経の刺激後のその膣／陰核血流、空洞内血圧および／または空洞血流の変化を測定する手段を含めたその動物を含み；そしてここにおいて、その試剤はＳＥＰｉである動物モデルに関する。
【０１１６】
さらなる側面において、本発明は、ＦＳＡＤまたはＭＥＤを処置するために内因性性器興奮過程または勃起過程を直接的に増進することができる試剤を識別する検定方法であって、本発明の動物モデルにある試剤を投与し；そして内因性性器興奮過程または勃起過程の変化を測定することを含み；ここにおいて、この変化は、定義の試験薬の存在下における動物モデルの膣／陰核血流、空洞内血圧（ＩＣＰ）（および／または空洞血流）の増強として定義され；そしてその試剤はＳＥＰｉである検定方法に関する。
【０１１７】
さらなる側面において、本発明は、診断方法であって、女性または男性からの試料を単離し；その試料が、女性性的機能不全、好ましくは、ＦＳＡＤ、または男性性的機能不全、好ましくは、ＭＥＤを引き起こすような量で存在する物質を含有するかどうか決定することを含み；ここにおいて、その物質は、女性の内因性性器興奮過程または男性の海綿体の勃起過程への直接的作用を有し；しかもその物質は、ある試剤の使用によって有益な作用を得るようにモジュレートされることができ；そしてその試剤はＳＥＰｉである診断方法に関する。
【０１１８】
さらなる側面において、本発明は、単離された女性または男性の試料中の物質を検出する手段を含む診断用組成物またはキットであって；ここにおいて、その手段は、その試料が、女性性的機能不全、好ましくは、ＦＳＡＤ、または男性性的機能不全、好ましくは、ＭＥＤを引き起こす物質およびそのような量を含有するか、または性的機能不全、好ましくは、ＦＳＡＤまたはＭＥＤを引き起こすような量であるかどうか決定するのに用いることができ；その物質は、内因性性器興奮過程または勃起過程への直接的作用を有し、しかもその物質は、ある試剤の使用によって有益な作用を得るようにモジュレートされることができ；そしてその試剤はＳＥＰｉである診断用組成物またはキットに関する。
【０１１９】
本発明のいっそうさらなる側面により、本発明のポリペプチドを過剰発現する、過少発現するまたはその標的挿入または欠失を示すように ｅｘ ｖｉｖｏ または ｉｎ ｖｉｖｏ で遺伝子操作された細胞を提供する。好ましくは、これら ｉｎ ｖｉｖｏ で遺伝子操作された細胞は、非ヒト動物中に含まれる。
【０１２０】
本発明は、更に、上記のポリペプチドを生じることができる受託番号ＮＣＩＭＢ４１１１０として寄託された細胞およびそれに由来しうる変異体および突然変異体を提供する。
【０１２１】
本発明によって更に提供されるのは、上記のポリペプチドの三次元構造を解明する方法であって、（ａ）ポリペプチドを精製し；（ｂ）それを結晶化し；そして（ｃ）その構造を、特に、Ｘ線結晶学によって解明する工程を含む方法である。
【０１２２】
さらなる側面において、本発明は、更に、上記のポリペプチドの構造をモデリングする方法であって、（ａ）既知の三次元構造を有するタンパク質、特に、ロドプシンの配列と一緒にその配列をアラインメントさせ；（ｂ）上記のポリペプチドの検出された配列差を既知の構造上にマッピングし、（ｃ）上記のポリペプチドの相同モデルを得る工程を含む方法に関する。
【０１２３】
参照しやすくするために、ここで、本発明のこれらおよび更に別の側面を適当な項目タイトルで論じる。しかしながら、各項目の下での教示は、具体的な項目各々に必ずしも制限されない。
【０１２４】
ヒトＳＥＰ酵素
上に説明したように、本発明は、ヒト可溶性分泌エンドペプチダーゼ（ヒトＳＥＰ）と称された新規なエンドペプチダーゼ酵素、およびそれをエンコードしているヌクレオチド配列に関する。本発明は、更に、疾患の診断および予防および／または処置におけるそれら新規な核酸配列およびアミノ酸配列の使用に関する。本発明は、更に、エンドペプチダーゼ活性をモジュレートする（好ましくは、阻害するまたは選択的に阻害する）ことができる試剤を評価するおよび／またはスクリーニングするための、それら新規な核酸配列およびアミノ酸配列の使用に関する。本発明は、更に、エンドペプチダーゼ活性をモジュレートする（好ましくは、阻害するまたは選択的に阻害する）ことができる試剤を評価するおよび／またはスクリーニングするための、それら新規な核酸配列およびアミノ酸配列を含むまたは発現する遺伝子操作された宿主細胞に関する。
【０１２５】
ヒトＳＥＰは、いろいろな源に存在し、およびそれらから入手可能であると考えられる。
例として、ヒトＳＥＰは、心臓血管系、神経系、内分泌系および精巣のいずれか一つまたはそれを越えるものに見出される。
【０１２６】
本発明者は、更に、ＳＥＰが多数の他の源、例えば、齧歯類動物（ネズミ（Ｉｋｅｄａ ｅｔ ａｌ．， Ｊｏｕｒｎａｌ Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ， Ｖｏｌ ２７４，１９９９，ｐｐ．３２４６９−３２４７７）およびラット（ＮＥＰ　ＩＩ−国際特許出願ＷＯ９９／５３０７７号））、ウシ、ヒツジ、ブタおよびウマなどにも存在すると考えている。
【０１２７】
ヒトＳＥＰは、天然に存在する形と同じであってよいが、この側面について、好ましくは、ヒトＳＥＰは、非天然アミノ酸配列である（すなわち、それは、その自然環境中に存在しない）、またはその変異体、ホモログ、フラグメントまたは誘導体である。更に、または代わりに、ヒトＳＥＰは、単離されたヒトＳＥＰおよび／または精製されたヒトＳＥＰである。ヒトＳＥＰは、天然であろうとなかろうと、いずれか適当な源から入手可能でありうるしまたはそれによって生じうるし、またはそれは、合成、半合成またはリコンビナントであってよい。
【０１２８】
ヒトＳＥＰコーディング配列は、天然に存在する形と同じであってよいが、この側面について、好ましくは、ヒトＳＥＰコーディング配列は、非天然ヌクレオチド配列である（すなわち、それは、その自然環境中に存在しない）、またはその変異体、ホモログ、フラグメントまたは誘導体である。更に、または代わりに、ヒトＳＥＰコーディング配列は、単離されたヒトＳＥＰコーディング配列および／または精製されたヒトＳＥＰコーディング配列である。ヒトＳＥＰコーディング配列は、天然であろうとなかろうと、いずれか適当な源から入手可能でありうるしまたはそれによって生じうるし、またはそれは、合成、半合成またはリコンビナントであってよい。
【０１２９】
ヒトＳＥＰ活性およびスクリーニング
ヒトＳＥＰおよび／またはそのコーディング配列および／またはそれにハイブリッド形成することができる配列は、異なったＳＥＰ間の薬物候補の選択性を調べるのに有用である。
【０１３０】
ヒトＳＥＰは、種々の生物活性ペプチドを加水分解する（タンパク質分解する）ことができると考えられる。
ヒトＳＥＰｍＲＮＡは、他の組織と比較して精巣中で最も量が多いということが（本明細書中で）示されている。これは、マウスＳＥＰについて公表されたデータ（Ｇｈａｄｄａｒ ｅｔ ａｌ．， Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ Ｊｏｕｒｎａｌ， Ｖｏｌ ３４７，２０００，ｐｐ．４１９−４２９）と一致し、この場合のｍＲＮＡは、更に、円形および細長い精子細胞に局在している。
【０１３１】
多様な異なるタンパク質分解活性が、以前に精巣中で識別されたが、ある場合には、それらは、精巣機能に本質的であることが分かっている（例えば、ＡＣＥ活性）。この組織中におけるその豊富さから、ＳＥＰの一つの可能な生理学的役割は、精巣の機能に関連していると考えられる（例えば、妊孕性）。
【０１３２】
ヒトＳＥＰは、精巣の妊孕性または別の機能の側面に関与している精巣中の特定の生理学的に重要な生物ペプチドを加水分解して、そのペプチドを活性化するかまたは失活させることができる。この（予想される）生理学的ペプチドの正確な性状は、まだ確認されていない。しかしながら、ＳＥＰは、ビッグエンドセリン、エンドセリン−１、アンギオテンシン−Ｉ、サブスタンスＰ、ブラジキニン、エンケファリンおよび心房性ナトリウム利尿ペプチド（ＡＮＰ）を含めた多数の生物ペプチドを加水分解することができる。これらのいくつかは、精巣中で機能することが知られている。エンドセリン−１は、例えば、精巣中で見出されるが、そこにおいてそれは、精細管収縮性を促すのに関与している。興味深いことに、エンドセリン−１をビッグエンドセリンから生じると考えられる精巣内で検出されるその酵素活性（ＥＣＥ）は、阻害剤ホスホラミドンおよびチオルファンに感受性である。マウスＳＥＰおよびおそらくはヒトＳＥＰも、これら阻害剤に感受性であるので、この活性は、ＥＣＥよりもむしろＳＥＰに関連しているかもしれない。ヒトＳＥＰ活性を阻害する化合物は、したがって、精巣内エンドセリンレベルを変化（増加または減少）させることがあり、これは、不妊症の予防および／または処置にまたは男性用避妊薬として潜在的に有用でありうる。
【０１３３】
血管作用性腸管ペプチド（ＶＩＰ）は、精巣中で役割を果たすもう一つの潜在的ヒトＳＥＰ基質である。ＶＩＰは、精巣中の血流を増加させ、そして更に、精巣ステロイド合成並びにヒト精子運動性を促すことが分かっている（Ｓｉｏｗ ｅｔ ａｌ， Ａｒｃｈｉｖｅｓ ｏｆ Ａｎｄｒｏｌｏｇｙ， Ｖｏｌ ４３，１９９９，ｐ．６７７１）。ヒトＳＥＰ活性を阻害する薬物は、精巣中のＶＩＰレベルを、したがって、精巣血流、ステロイド合成または精子運動性をモジュレートするのに有用でありうる。
【０１３４】
ヒトＳＥＰ　ｍＲＮＡは、精巣中で最も量が多いが、それは、逆転写酵素−ポリメラーゼ連鎖反応（ＲＴ−ＰＣＲ）の敏感な方法を用いて、種々の組織中でのより低いレベルを検出することもできる。マウスの場合、ＳＥＰは、心臓、脳、脾臓、肺、腎臓、腸および副腎で検出されている。本明細書中において完全長ヒトＳＥＰ　ｃＤＮＡ配列を単離するのに用いられたｃＤＮＡライブラリースクリーニングアプローチも、ヒトの脳、胎盤、小腸および腎組織に由来するライブラリー中でヒトＳＥＰ　ｃＤＮＡを識別した。
【０１３５】
ヒトＳＥＰ酵素は、細胞から分泌されることもありうる。したがって、ヒトＳＥＰタンパク質は、精巣中で量が多いことに加えて、身体中の広範囲の他の組織中でも中程度のレベルで見出されるであろうと考えられる。これら組織中において、ヒトＳＥＰは、上述の生物ペプチド基質を加水分解するであろうと考えられる。
【０１３６】
したがって、ＳＥＰの酵素活性を阻害する薬物は、種々の異なった組織中での上述の多数のヒトＳＥＰ基質のレベルを変化させるであろうと考えられる。これらヒトＳＥＰ基質は、通常は、ペプチド作用性シグナリング過程にしばしば関連している生物学的に活性な分子またはそれらの前駆体であるので、ヒトＳＥＰ阻害剤は、性的機能不全（例えば、女性性的機能不全、特に、ＦＳＡＤ、または男性性的機能不全、特に、ＭＥＤ）および生殖障害、並びに、神経変性障害（例えば、アルツハイマー病および発作）および高血圧症などの心臓血管疾患等のような他の疾患／障害がおそらく含まれるがこれに制限されるわけではない、ペプチド作用性シグナリングに関連した多数の異なった障害の予防および／または処置に有用でありうると考えられる。
【０１３７】
したがって、ヒトＳＥＰおよび／またはそのコーディング配列および／またはそれにハイブリッド形成することができる配列は、ペプチド作用性シグナリングに関連した疾患の予防および／または処置用の薬物候補をスクリーニングするのに有用でありうる。更に、ヒトＳＥＰおよび／またはそのコーディング配列および／またはそれにハイブリッド形成することができる配列は、上記の記載のような疾患の予防および／または処置用の薬物候補をスクリーニングするのに有用でありうると考えられる。
【０１３８】
ヒトＳＥＰをコードしているヌクレオチド配列またはヒトＳＥＰ酵素自体のどちらかまたは両方を用いて、ＳＥＰ活性に影響を与えることができる試剤についてスクリーニングすることができる。具体的には、ヒトＳＥＰをコードしているヌクレオチド配列自体を用いて、ＳＥＰ活性を阻害することができる試剤についてスクリーニングすることができる。更に、ヒトＳＥＰをコードしているヌクレオチド配列またはヒトＳＥＰ酵素自体を用いて、ＳＥＰ活性を選択的に阻害するようにＳＥＰ活性に選択的に影響を与える試剤についてスクリーニングすることができる。
【０１３９】
ヒトＳＥＰ活性の測定−ヒトＳＥＰ検定
ヒトＳＥＰタンパク質の酵素（タンパク質分解）活性は、例えば、ヒトＳＥＰ酵素の試料と基質ペプチドとを緩衝液（例えば、５０ｍＭ　ＨＥＰＥＳ；ｐＨ７．４）中で混合し、その混合物を、ＳＥＰ活性に適当な温度（典型的には、３０〜３７℃）で、ヒトＳＥＰが作用してペプチド基質の測定可能な部分を生成物に切断するのに充分な一定時間（１〜３時間など）インキュベートすることを含む検定で測定することができる。その後、タンパク質分解の基質および／または生成物を分析して、その基質がＳＥＰ酵素によって切断されたことを示すことができる。
【０１４０】
ヒトＳＥＰの活性を変化させることができるホスホラミドンおよびチオルファンのような、候補ヒトＳＥＰ阻害剤化合物または対照試験化合物の作用は、それらを初期混合物中に、典型的には、０．１ｎＭ〜５０μＭの適当な試験濃度の範囲で含めることによってこのタイプの検定で測定することができる。
【０１４１】
上のタイプの検定で用いるのに適したＳＥＰ酵素の試料は、組換え発現系を用いて生じることができる。これは、典型的には、ヒトＳＥＰ　ｃＤＮＡまたは遺伝子（例えば、ＮＣＩＭＢ４１１１０より入手可能な発現ベクター）を含有する発現プラスミドを宿主生物または細胞中に導入後、そこでヒトＳＥＰタンパク質を発現させることを含むであろう。ＳＥＰタンパク質は、（例えば、哺乳動物細胞中で人為的に発現させる場合）その宿主から増殖培地中に放出される（すなわち、細胞外に分泌される）ことがありうるし、または細胞中に保持されることがありうる（例えば、酵母または昆虫細胞中で人為的に発現させる場合、そこでは、可能性のある不適切な発現は、ヒトＳＥＰを細胞から分泌させないことがあり、したがって、その細胞内部位からの単離を必要とすることがありうる）。典型的には、その宿主は、酵母、昆虫細胞、哺乳動物細胞または細菌でありうる。次に、ＳＥＰ酵素を、タンパク質精製法を用いる必要がありうる培地または宿主細胞から（例えば、細胞を溶解することによって）回収することができる。
【０１４２】
前述の検定のためのヒトＳＥＰ酵素は、（充分な量が入手可能である場合）適当な組織源から精製されてもよい。この組織には、精巣または脳が含まれうる。　ヒトＳＥＰ検定で用いるのに適した基質は、有用な一定時間内に、例えば、５時間以内に測定可能な速度でＳＥＰが切断することができるいずれのペプチドでもありうる。このような基質ペプチドには、エンケファリン、ＶＩＰ、ブラジキニン、サブスタンスＰ、ビッグエンドセリン、エンドセリン、アンギオテンシン−ＩまたはＡＮＰのような生物ペプチドと同様であるまたは類似したペプチドが含まれうるが、これらに制限されるわけではない。このペプチドは、検定前、中または後の基質および／または生成物の測定を容易にするであろう蛍光基、着色基、放射性基または他の化学基を含むように修飾されうる。
【０１４３】
ヒトＳＥＰ検定で用いるのに適した好ましい基質は、少なくとも１種類の蛍光ドナー色素および少なくとも１種類の蛍光アクセプター色素で標識されたＳＥＰ切断可能合成ペプチドであり、このＳＥＰ切断（タンパク質分解）の阻害を検出するのに用いられる検定は、蛍光共鳴エネルギー移動（ＦＲＥＴ）検定である。最も好ましくは、この標識された基質ペプチドは、低分子量蛍光原性ペプチド、好ましくは、ローダミングリーン−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−ｄＰｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｒｇ−Ａｒｇ−Ｖａｌ−Ｃｙｓ（ＱＳＹ７）−βＡｌａ−ＮＨ２である。
【０１４４】
このようなＦＲＥＴに基づくＳＥＰ検定は、ＮＥＰと一緒の使用について、Ｃａｒｖａｌｈｏ ｅｔ ａｌ によって開発された検定に基づいている（Ｃａｒｖａｌｈｏ ｅｔ ａｌ．， Ａｎｎａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ． ２３７，ｐｐ．１６７−１７３（１９９６））。ＳＥＰ　ＦＲＥＴ検定は、類似の分子内消光蛍光原性ペプチド基質を利用するが、蛍光原性ドナー／アクセプター色素の新規な組合せ、具体的には、ローダミングリーン（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｒｏｂｅｓ，Ｉｎｃ．）およびＱＳＹ７（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｒｏｂｅｓ，Ｉｎｃ．）を利用する。
【０１４５】
合成標識基質ペプチドローダミングリーン−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−ｄＰｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｒｇ−Ａｒｇ−Ｖａｌ−Ｃｙｓ（ＱＳＹ７）−βＡｌａ−ＮＨ２の製造を、実施例の項（以下）に詳述する。
【０１４６】
ヒトＳＥＰ検定で用いるのに適した緩衝液は、その中でヒトＳＥＰが活性であることが判明していて、それ以外には、検定の最終結果の妨げにならないもののいずれかでありうる。通常は、これは、中性ｐＨを維持する緩衝液であろう。このような緩衝液の一例は、５０ｍＭトリスＣｌ；ｐＨ７．４である。しかしながら、このような緩衝液は、トリスが、温度変動のためにｐＨを極めて変化させやすいので、ヒトＳＥＰ　ＦＲＥＴ検定で用いるのに好ましくない。したがって、ヒトＳＥＰ　ＦＲＥＴ検定で用いるのに好ましい緩衝液は、５０ｍＭ　ＨＥＰＥＳ；ｐＨ７．４である。
【０１４７】
ヒトＳＥＰ検定での基質および／または生成物の測定方法は、選択されるペプチド基質およびその修飾の性状に依存するであろう。例えば、選択される基質が蛍光基を含有する場合、蛍光計を用いることができる。同様に、基質が放射性標識されている場合、シンチレーション計数計を用いてよい。大部分の基質および生成物は、高速液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）または質量分析法を用いて測定することができ、これらは、その基質が放射性標識または蛍光標識を含むように修飾されなかった場合に選択される方法であると考えられる。
【０１４８】
更に、ヒトＳＥＰをコードしているヌクレオチド配列またはそれに相補的である配列も、検定において、ヒト細胞中のヒトＳＥＰコーディング配列の存在を検出するのに用いることができる。これら検定は、この酵素の組織分布および特定の疾患状態に関するその生物学的妥当性についての情報を提供すると考えられる。
【０１４９】
本発明は、ヒトＳＥＰ（その誘導体、フラグメント、ホモログまたは変異体を含めた）に対する抗体も包含する。ヒトＳＥＰに対する抗体は、検定において、ヒト細胞中のヒトＳＥＰの存在を検出するのに用いることができる。これら検定は、この酵素の組織分布および特定の疾患状態に関するその生物学的妥当性についての情報を提供すると考えられる。
【０１５０】
本発明は、更に、ヒトＳＥＰ配列のスプライス変異体（イソ酵素）を包含する。具体的には、ヒトＳＥＰイソ酵素、それをコードしているヌクレオチド配列、それに相補的であるヌクレオチド配列、およびそれに向けられた抗体のいずれか一つまたはそれを越えるものを検定で用いて、それらイソ酵素の一つに選択的に影響を与える試剤についてスクリーニングすることができる。これら検定は、これらイソ酵素各々の組織分布についての情報を提供し且つ特定の疾患状態に関するこれらイソ酵素各々の生物学的妥当性についての情報を提供すると考えられる。これら検定は、更に、当業者が、特定の組織または特定の疾患状態などにおいて、ヒトＳＥＰの発現または活性に影響を与えるのに有用な試剤について調べ且つそれを識別することを可能にすると考えられる。
【０１５１】
本発明のポリペプチド
“タンパク質”という用語と同じ意味である“ポリペプチド”という用語には、一本鎖ポリペプチド分子、並びに個々の構成ポリペプチドが共有または非共有手段によって連結されている多重ポリペプチド複合体が含まれる。
【０１５２】
好ましくは、本発明のポリペプチドは、一本鎖ポリペプチドである。
本発明のポリペプチドは、実質的に単離された形であってよい。このポリペプチドは、ポリペプチドの予定の目的を妨げることがない担体または希釈剤と混合されてよいし、なお実質的に単離されたとみなされてよいということは理解されるであろう。本発明のポリペプチドは、実質的に精製された形であってもよく、この場合、それは、概して、標品中の９０％を越える、例えば、９５％、９８％または９９％のポリペプチドが本発明のポリペプチドである標品中のポリペプチドを構成するであろう。本発明のポリペプチドは、それらの精製を助けるように、例えば、ヒスチジン残基の付加によって修飾されてよい。
【０１５３】
本発明のポリペプチドは、下記のように、合成手段によって（例えば、Ｇｅｙｓｅｎ ｅｔ ａｌ．， １９９６ によって記載のように）または組換えによって生じることができる。
【０１５４】
好ましい態様において、本発明のアミノ酸配列は、それがその自然環境中にある場合、およびそれが、その自然環境中にもあるその天然のヌクレオチドコーディング配列によって発現されている場合、およびそのヌクレオチド配列が、その自然環境中にもあるその天然のプロモーターの制御下にある場合、それ自体では本発明の天然のヒトＳＥＰを包含しない。参照しやすくするために、本発明者は、この好ましい態様を“非天然アミノ酸配列”と称している。
【０１５５】
本発明の酵素のアミノ酸配列に関する、“変異体”、“ホモログ”、“誘導体”または“フラグメント”という用語には、その配列からのまたはその配列への一つの（またはそれを越える）アミノ酸のいずれかの置換、変異、修飾、交換、欠失または付加が含まれるが、但し、得られた酵素はＳＥＰ活性を有する、好ましくは、添付の配列番号：２に示される酵素と少なくとも同程度に生物学的に活性であるという条件付きである。具体的には、“ホモログ”という用語は、構造および／または機能に関する相同性を包含する。配列相同性に関して、好ましくは、配列番号：２に示される配列に、少なくとも７８％、より好ましくは、少なくとも８５％、より好ましくは、少なくとも９０％の相同性が存在する。より好ましくは、配列番号：２に示される配列に、少なくとも９５％、より好ましくは、少なくとも９８％の相同性が存在する。
【０１５６】
典型的には、本発明の変異体、ホモログ、誘導体またはフラグメントについて、行われうるアミノ酸置換のタイプは、そのアミノ酸配列の疎水性／親水性を維持すべきである。アミノ酸置換は、例えば、１、２または３〜１０、２０または３０の置換が行われてよいが、但し、その修飾された配列は、本発明によるＳＥＰ酵素として作用する能力を保持しているという条件付きである。アミノ酸置換には、例えば、血漿半減期を増加させるための、天然に存在しない類似体の使用が含まれてよい。
【０１５７】
本発明のアミノ酸配列は、適当な発現系におけるそれをコードしているヌクレオチド配列の発現によって生じることができる。
更に、または代わりに、タンパク質自体は、化学的方法を用いて、ヒトＳＥＰアミノ酸配列を全部または一部分合成して生じうると考えられる。例えば、ペプチドは、固相法によって合成し、樹脂から切断し、そして分取用高性能液体クロマトグラフィーによって精製することができる（例えば、Ｃｒｅｉｇｈｔｏｎ （１９８３） Ｐｒｏｔｅｉｎｓ Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓ ａｎｄ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ， ＷＨ Ｆｒｅｅｍａｎ ａｎｄ Ｃｏ．， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ， ＮＹ， ＵＳＡ）。これら合成ペプチドの組成は、アミノ酸配列分析またはシークエンス法（例えば、エドマン分解法）によって確認することができる。
【０１５８】
直接ペプチド合成は、種々の固相法を用いて行うことができ（Ｒｏｂｅｒｇｅ ＪＹ ｅｔ ａｌ， Ｓｃｉｅｎｃｅ， Ｖｏｌ ２６９，１９９５，ｐｐ．２０２−２０４）、自動合成は、例えば、ＡＢＩ４３１Ａ Ｐｅｐｔｉｄｅ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｚｅｒ（Ｐｅｒｋｉｎ Ｅｌｍｅｒ， Ｂｏｓｔｏｎ， ＭＡ， ＵＳＡ）を用いて、製造者によって提供される取扱い説明書にしたがって行ってよい。更に、ヒトＳＥＰのアミノ酸配列またはそのいずれか一部分は、直接合成中に変更されてよいしおよび／または化学的方法を用いて、他のサブユニットからの配列またはそのいずれか一部分と一緒に組み合わされて、変異ポリペプチドを生じてよい。
【０１５９】
本発明のもう一つの態様において、ヒトＳＥＰの天然の、修飾されたまたは組換えの配列は、異種配列に連結されて、融合タンパク質をエンコードすることができる。例えば、ＳＥＰ活性の阻害剤のペプチドライブラリーのスクリーニングについて、それは、市販の抗体によって認識される異種エピトープを発現するキメラＳＥＰタンパク質をエンコードするのが有用でありうる。融合タンパク質は、ＳＥＰ配列とその異種タンパク質配列との間に位置する切断部位を含有するように遺伝子操作することもできるので、そのＳＥＰは、異種部分から切断され且つ精製されることができる。
【０１６０】
ヒトＳＥＰは、タンパク質精製を容易にするように加えられた一つまたはそれを越える追加のポリペプチドドメインを含む組換えタンパク質として発現されてもよい。このような精製を容易にするドメインには、固定化金属上での精製を可能にするヒスチジン−トリプトファンモジュールのような金属キレートペプチド（Ｐｏｒａｔｈ Ｊ， Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｘｐｒ．Ｐｕｒｉｆ．， Ｖｏｌ ３，１９９２，ｐｐ．２６３−２８１）、固定化免疫グロブリン上での精製を可能にするプロテインＡドメイン、およびＦＬＡＧＳ伸長／アフィニティー精製システム中で利用されるドメイン（Ｉｍｍｕｎｅｘ Ｃｏｒｐ， Ｓｅａｔｔｌｅ， ＷＡ， ＵＳＡ）が含まれるが、これらに制限されるわけではない。この精製用ドメインとＳＥＰとの間のＸＡ因子またはエンテロキナーゼ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ， Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ， ＣＡ， ＵＳＡ）のような切断可能リンカー配列の包含は、精製を容易にするのに有用である。
【０１６１】
ヒトＳＥＰの特定のアミノ酸配列を、配列番号：２に示す。しかしながら、本発明は、その特定のアミノ酸配列に少なくとも７８％の同一性（より好ましくは、少なくとも８５％の同一性）を有するアミノ酸配列が含まれると考えられるＳＥＰファミリーからの他のメンバーをエンコードしているアミノ酸配列を包含する。
【０１６２】
本発明のポリペプチドには、本アミノ酸配列のフラグメントおよびそれらの変異体も含まれる。適当なフラグメントは、少なくとも５、例えば、少なくとも１０、１２、１５または２０アミノ酸のサイズであろう。
【０１６３】
本発明のポリペプチドは、保存置換を含めた一つまたはそれを越える（例えば、少なくとも２、３、５または１０の）置換、欠失または挿入を含有するように修飾されてもよい。これら側面を、後の項で考察する。
【０１６４】
本発明のヌクレオチド配列
本明細書中で用いられる“ヌクレオチド配列”という用語は、オリゴヌクレオチド配列またはポリヌクレオチド配列、および（その一部分などの）その変異体、ホモログ、フラグメントおよび誘導体を意味する。このヌクレオチド配列は、センス鎖であれアンチセンス鎖であれ、二本鎖または一本鎖であってよいゲノムまたは合成またはリコンビナント由来であってよいＤＮＡまたはＲＮＡでありうる。
【０１６５】
好ましくは、“ヌクレオチド配列”という用語はＤＮＡを意味する。
より好ましくは、“ヌクレオチド配列”という用語は、組換えＤＮＡ技術の使用によって製造されるＤＮＡ（すなわち、組換えＤＮＡ）を意味する。
【０１６６】
好ましい態様において、本発明のヌクレオチド配列は、それが、その自然環境中にもあるその天然のプロモーターの制御下にある場合、それ自体ではその自然環境中にある本発明の天然のヌクレオチドコーディング配列を包含しない。参照しやすくするために、本発明者は、この好ましい態様を“非天然ヌクレオチド配列”と称している。
【０１６７】
本発明のヌクレオチド配列は、それらの中に、合成または修飾ヌクレオチドを含んでよい。オリゴヌクレオチドへの多数の異なったタイプの修飾が当該技術分野において知られている。これらには、メチルホスホネートおよびホスホロチオエート主鎖、分子の３’および／または５’末端におけるアクリジンまたはポリリシン鎖の付加が含まれる。本発明の目的について、本明細書中に記載のヌクレオチド配列を、当該技術分野において利用可能ないずれの方法によっても修飾することができるということは理解されるはずである。このような修飾は、本発明のヌクレオチド配列の ｉｎ ｖｉｖｏ 活性または寿命を増進させるように行うことができる。
【０１６８】
本発明は、更に、本明細書中に示される配列に相補的であるヌクレオチド配列、またはいずれのそれらの誘導体、フラグメントまたは変異体も包含する。配列がそのフラグメントに相補的である場合、その配列は、他の生物等における類似のコーディング配列を識別するプローブに用いることができる。
【０１６９】
本発明は、更に、本明細書中に示される配列にハイブリッド形成することができるヌクレオチド配列、またはいずれのそれらの誘導体、フラグメントまたは変異体も包含する。
【０１７０】
本発明は、更に、本明細書中に示される配列に相補的である配列にハイブリッド形成することができるヌクレオチド配列、またはいずれのそれらの誘導体、フラグメントまたは変異体も包含する。
【０１７１】
“変異体”という用語は、本明細書中に示されるヌクレオチド配列にハイブリッド形成することができる配列に相補的である配列も包含する。
好ましくは、“変異体”という用語は、本明細書中に示されるヌクレオチド配列に、ストリンジェント条件下（例えば、６５℃および０．１ｘＳＳＣ｛１ｘＳＳＣ＝０．１５Ｍ　ＮａＣｌ，０．０１５クエン酸Ｎａ３　ｐＨ７．０｝）でハイブリッド形成することができる配列に相補的である配列を包含する。
【０１７２】
本発明は、更に、（本明細書中に示される配列の相補的配列を含めた）本発明のヌクレオチド配列にハイブリッド形成することができるヌクレオチド配列に関する。
【０１７３】
本発明は、更に、（本明細書中に示される配列の相補的配列を含めた）本発明のヌクレオチド配列にハイブリッド形成することができる配列に相補的であるヌクレオチド配列に関する。
【０１７４】
本発明の範囲内に更に含まれるのは、本明細書中に示されるヌクレオチド配列に、中間〜最大のストリンジェンシー条件下でハイブリッド形成することができるポリヌクレオチド配列である。
【０１７５】
好ましい側面において、本発明は、本発明のヌクレオチド配列またはその相補鎖に、ストリンジェント条件下（例えば、６５℃および０．１ｘＳＳＣ）でハイブリッド形成することができるヌクレオチド配列を包含する。
【０１７６】
典型的な核酸は、他に、ヒトＳＥＰタンパク質をエンコードし、および配列番号：１または配列番号：５に示されるＤＮＡ配列にハイブリッド形成するヌクレオチド配列として特徴付けることができる。好ましいのは、配列番号：１または配列番号：５に示される配列またはその相補鎖に高ストリンジェンシー条件下でハイブリッド形成するヒトＳＥＰをエンコードしているような配列である。
【０１７７】
好都合には、本発明は、配列番号：１または配列番号：５に示される配列またはその相補鎖のフラグメントにストリンジェント条件下でハイブリッド形成することができる核酸配列を提供する。好ましくは、そのフラグメントは、１５〜５０塩基の長さである。好都合には、それは約２５塩基の長さである。
【０１７８】
本発明の好ましい酵素をコードしているヌクレオチド配列に関して、“変異体”、“ホモログ”、“誘導体”または“フラグメント”という用語には、その配列からのまたはその配列への一つの（またはそれを越える）核酸のいずれかの置換、変異、修飾、交換、欠失または付加が含まれるが、但し、得られたヌクレオチド配列は、ＳＥＰ活性を有する、好ましくは、配列番号：１または配列番号：５に示される配列によってエンコードされた酵素と少なくとも同程度に生物学的に活性である酵素をコードするまたはコードすることができるという条件付きである。具体的には、“ホモログ”という用語は、構造および／または機能に関する相同性を包含するが、但し、得られたヌクレオチド配列は、ＳＥＰ活性を有する酵素をコードするまたはコードすることができるという条件付きである。配列相同性に関して、好ましくは、配列番号：２に示されるアミノ酸配列をコードしているヌクレオチド配列に、少なくとも８３％、より好ましくは、少なくとも８５％、より好ましくは、少なくとも９０％の相同性が存在する。より好ましくは、配列番号：２に示されるアミノ酸配列をコードしているヌクレオチド配列に、少なくとも９５％、より好ましくは、少なくとも９８％の相同性が存在する。配列相同性に関して、好ましくは、配列番号：１または配列番号：５に示される配列に、少なくとも８３％、より好ましくは、少なくとも８７％、より好ましくは、少なくとも９０％の相同性が存在する。より好ましくは、配列番号：１または配列番号：５に示される配列に、少なくとも９５％、より好ましくは、少なくとも９８％の相同性が存在する。
【０１７９】
示されるように、本発明は、ヒトＳＥＰをエンコードしているＤＮＡ配列（好ましくは、ｃＤＮＡ配列）に関する。具体的には、本発明は、ヒトＳＥＰをエンコードしているｃＤＮＡ配列に関する。
【０１８０】
本発明は、更に、配列番号：１または配列番号：５に示されるＤＮＡ配列またはその対立遺伝子変異を含むＤＮＡセグメントに関する。
本発明は、更に、前述のＤＮＡ配列またはそれらの対立遺伝子変異が包含された宿主細胞中での発現によって生じるポリペプチドに関する。
【０１８１】
本発明は、更に、配列番号：１または配列番号：５に示されるＤＮＡ配列またはその対立遺伝子変異を含むＤＮＡに関し、それを提供する。
本発明は、更に、配列番号：１または配列番号：５に示されるＤＮＡ配列またはその対立遺伝子変異を含む非天然ＤＮＡに関する。
【０１８２】
本発明の極めて好ましい側面は、配列番号：１または配列番号：５に示されるＤＮＡ配列またはその対立遺伝子変異を含む組換えＤＮＡに関する。
本発明のポリヌクレオチドには、本発明のポリペプチドをエンコードしている核酸配列が含まれる。一定範囲の異なったポリヌクレオチドが、ある与えられたアミノ酸配列を遺伝コードの縮重の結果としてエンコードするということは理解されるであろう。
【０１８３】
本明細書中に示されるアミノ酸配列の情報により、本発明のポリペプチドをエンコードするｃＤＮＡおよび／またはゲノムクローンなどの部分および完全長の核酸配列を案出することは可能である。例えば、本発明のポリヌクレオチドは、本明細書中に示されるアミノ酸配列をエンコードしている配列に指向するように設計されたプライマーを用いる縮重ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）を用いて得ることができる。これらプライマーは、典型的には、多数の縮重位置を含有するであろう。しかしながら、縮重を最小限にするために、たった一つのトリプレットによってコードされるメチオニンのようなアミノ酸を含有する本明細書中に示されるアミノ酸配列の領域をエンコードする配列が選択されるであろう。更に、配列は、ＰＣＲ法の鋳型ＤＮＡとしてその核酸が用いられる生物中でのコドン使用を考慮するように選択されるであろう。ＰＣＲは、既知の配列に対する単一配列（非縮重）プライマーを含む配列をクローニングするのに用いられるものより低いストリンジェンシー条件で用いられるであろう。
【０１８４】
次に、本発明のポリペプチドフラグメントをエンコードする、ＰＣＲによって得られた核酸配列を用いて、ハイブリダイゼーションライブラリースクリーニング技術を用いてより大きい配列を得ることができる。例えば、ＰＣＲクローンを、放射性原子で標識して、他の種、好ましくは、他の哺乳動物種からのｃＤＮＡまたはゲノムライブラリーをスクリーニングするのに用いることができる。ハイブリダイゼーション条件は、典型的には、中〜高ストリンジェンシー条件（例えば、約５０℃〜約６０℃において０．０３Ｍ塩化ナトリウムおよび０．０３Ｍクエン酸ナトリウム）であろう。
【０１８５】
アミノ酸配列の全部または一部分をエンコードしている縮重核酸プローブは、他の種、好ましくは、他の哺乳動物種からのｃＤＮＡおよび／またはゲノムライブラリーをプローブするのに用いることもできる。しかしながら、ＰＣＲ法を行って、追加のスクリーニング法で用いるための単一配列を最初に得ることが好適である。
【０１８６】
本発明により、ヒトＳＥＰ、ポリペプチドのフラグメント、融合タンパク質またはその機能的均等物をエンコードするポリヌクレオチド配列は、適当な宿主細胞中でのヒトＳＥＰの発現を指示する組換えＤＮＡ分子を生じるのに用いることができる。遺伝コードの固有の縮重のために、実質的に同じまたは機能的に均等なアミノ酸配列をエンコードする他のＤＮＡ配列は、ヒトＳＥＰをクローン化し且つ発現するのに用いることができる。当業者によって理解されるように、天然に存在しないコドンを有する、ヒトＳＥＰをエンコードしているヌクレオチド配列を生じることは好都合でありうる。特定の原核生物または真核生物宿主に好適なコドン（Ｍｕｒｒａｙ Ｅ ｅｔ ａｌ， （１９８９）， Ｎｕｃ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．， １７：４７７−５０８）は、例えば、ヒトＳＥＰ発現の速度を増加させるように、または天然に存在する配列から生じる転写物より長い半減期などの望ましい性状を有する組換えＲＮＡ転写物を生じるように選択することができる。
【０１８７】
上記の技法を用いて得られる本発明のポリヌクレオチド配列は、上記の技法を用いて更に別の相同配列および変異体を得るのに用いることができる。それらは、例えば、それらポリヌクレオチド配列が発現されている特定の宿主細胞についてコドン選択を最適にするように、種々の宿主細胞系において本発明のポリペプチドを発現させる場合に用いるために修飾されてもよい。他の配列変化は、制限酵素認識部位を導入するために、またはそれらポリヌクレオチドによってエンコードされるポリペプチドの性状または機能を変更するために望まれることがありうる。
【０１８８】
本発明によって用いることができる変更されたヒトＳＥＰポリヌクレオチド配列には、同じまたは機能的に均等なＳＥＰをエンコードするポリヌクレオチドを生じる異なるヌクレオチド残基の欠失、挿入または置換が含まれる。そのタンパク質は、サイレント変化を生じ且つ機能的に均等なＳＥＰを生じるアミノ酸残基の欠失、挿入または置換を有してもよい。計画的なアミノ酸置換は、ＳＥＰの生物学的活性が保持される限りにおいて、それら残基の極性、電荷、溶解性、疎水性、親水性および／または両親媒性の性質の類似性に基づいて行われてよい。例えば、陰電荷アミノ酸には、アスパラギン酸およびグルタミン酸が含まれ；陽電荷アミノ酸には、リシンおよびアルギニンが含まれ；そして類似した親水性値を有する非荷電極性頭部基を含むアミノ酸には、ロイシン、イソロイシン、バリン、グリシン、アラニン、アスパラギン、グルタミン、セリン、トレオニン、フェニルアラニンおよびチロシンが含まれる。
【０１８９】
本発明の範囲内に含まれるのは、ヒトＳＥＰの対立遺伝子である。本明細書中で用いられる“対立遺伝子”または“対立遺伝子配列”は、ヒトＳＥＰの別の形である。対立遺伝子は、突然変異、すなわち、核酸配列の変化によって生じ、そして概して、変更されたｍＲＮＡまたはポリペプチドを生じるが、その構造または機能は変更されていてよいしまたはされていなくてよい。いずれの与えられた遺伝子も、対立遺伝子形を有しない、または一つもしくは多数有していてもよい。対立遺伝子を生じる共通の突然変異変化は、概して、アミノ酸の欠失、付加または置換による。これらの変化のタイプの各々は、ある与えられた配列中において単独でまたは他のものとの組合せで１回またはそれを超えて起こりうる。
【０１９０】
本発明のヌクレオチド配列は、遺伝子産物のクローニング、プロセシングおよび／または発現を修飾する変更が含まれるがこれに制限されるわけではない種々の理由でヒトＳＥＰコーディング配列を変更するために遺伝子操作することができる。例えば、突然変異を、当該技術分野において周知である技法、例えば、部位特異的突然変異誘発を用いて導入して、新しい制限部位を挿入する、グリコシル化パターンを変更するまたはコドン選択を変化させることができる。
【０１９１】
本発明のポリヌクレオチドは、プライマー、例えば、ＰＣＲプライマー、代わりの増幅反応のためのプライマー、プローブであって、例えば、放射性または非放射性標識を用いて慣用的な手段によって明らかになる標識で標識されたものを生じるのに用いることができるし、またはそれらポリヌクレオチドは、ベクター中にクローン化することができる。このようなプライマー、プローブおよび他のフラグメントは、少なくとも１５、好ましくは、少なくとも２０、例えば、少なくとも２５、３０または４０ヌクレオチドの長さであろうが、これらも、本明細書中で用いられる本発明のポリヌクレオチドという用語によって包含される。
【０１９２】
本発明のポリヌクレオチドまたはプライマーは、明らかになる標識を有してよい。適当な標識には、３２Ｐまたは３５Ｓのような放射性同位体、酵素標識、またはビオチンのような他のタンパク質標識が含まれる。このような標識は、本発明のポリヌクレオチドまたはプライマーに加えることができるし、当該技術分野において知られている技法によって検出することができる。
【０１９３】
本発明によるＤＮＡポリヌクレオチドのようなポリヌクレオチドおよびプライマーは、組換えによって、合成によって、または当業者に利用可能ないずれの手段によっても製造することができる。それらも、標準的な技法によってクローン化することができる。
【０１９４】
概して、プライマーは、所望の核酸配列の一度に一つのヌクレオチドの段階的製造を含む合成手段によって製造されるであろう。自動化された技法を用いてこれを行う技法は、当該技術分野において容易に利用可能である。
【０１９５】
より長いポリヌクレオチドは、概して、組換え手段を用いて、例えば、ＰＣＲクローニング法を用いて製造されるであろう。これは、クローン化することが望まれるヌクレオチド配列の領域に（例えば、約１５〜３０ヌクレオチドの）１対のプライマーを製造し、それらプライマーを、例えば、真菌、植物または原核細胞から得られるｍＲＮＡまたはｃＤＮＡと接触させ、所望の領域の増幅をもたらす条件下でポリメラーゼ連鎖反応を行い、増幅されたフラグメントを（例えば、反応混合物をアガロースゲル上で精製することによって）単離し、そして増幅されたＤＮＡを回収することを含むであろう。それらプライマーは、適当な制限酵素認識部位を含有するように設計することができるので、増幅されたＤＮＡは、適当なクローニングベクター中にクローン化することができる。
【０１９６】
ＤＮＡ分子は、細胞内安定性および半減期を増加させるように修飾されてよい。可能な修飾には、その分子の５’および／または３’末端のフランキング配列の付加、またはその分子の主鎖中でのホスホジエステラーゼ結合よりむしろホスホロチオエートまたは２’Ｏ−メチルの使用が含まれるが、これらに制限されるわけではない。
【０１９７】
初めの方で述べられたように、本発明は、更に、配列番号：１または配列番号：５に示される配列またはその対立遺伝子変異の全部または一部分にハイブリッド形成することができるヌクレオチド配列に関する。これらヌクレオチド配列は、アンチセンス法において、ヒトＳＥＰ発現を修飾するために用いてもよい。或いは、これら配列（またはそれらの一部分）は、プローブとして用いることができるし、またはＰＣＲプライマーとして用いられる場合のこのような配列の全部または一部分を増幅させるのに用いることができる。
【０１９８】
組換えＤＮＡ配列に加えて、ゲノム配列も、薬物発見の場合に有用である。その翻訳されたタンパク質を阻害するよりもむしろ、特定のイソ型のｍＲＮＡ転写を阻害することが有益でありうる。これは、スプライス変異体が存在し、それら異なったスプライス変異体が異なったプロモーターから転写されうる場合、ヒトＳＥＰについても当てはまりうる。
【０１９９】
本発明のもう一つの有用性は、ＤＮＡ配列が、いったん知られると、イソ酵素またはスプライス変異体を特異的に検出する検定を設計するのに必要とされる情報を与えるということである。イソ酵素特異的ＰＣＲプライマー対は、イソ酵素またはスプライス変異体の特異的ＤＮＡ配列の情報に完全に依存する検定の唯一の例である。このような検定は、特定の疾患状態への各々のイソ酵素の組織分布および生物学的関係を評価するイソ酵素についてのｍＲＮＡの検出を可能にする。それは、唯一のイソ酵素を天然に発現しうる細胞系の同定、すなわち、組換え遺伝子を発現する必要性をなくするかもしれない発見も可能にする。特定のヒトＳＥＰイソ酵素が特定の疾患状態に関連していることが示されるならば、本発明は、イソ酵素ｍＲＮＡの存在を検出する診断用検定の設計において有益であると考えられる。
【０２００】
ヒトＳＥＰ酵素をエンコードしているヌクレオチド配列の生体試料中での異常レベルは、核酸欠失または突然変異のような染色体異常に反映することがありうる。したがって、ヒトＳＥＰ酵素をエンコードしているヌクレオチド配列は、ヒトＳＥＰをエンコードしている遺伝子中の欠失、突然変異または染色体転座のような染色体異常を診断用に検出するのに用いることができるプローブの基準を提供する。ヒトＳＥＰ遺伝子発現は、このような疾患状態において変更されることがありうるし、またはヒトＳＥＰをエンコードしている遺伝子の領域中に存在する染色体異常がありうる。
【０２０１】
本発明の別の態様において、ヒトＳＥＰのコーディング配列は、当該技術分野において周知の化学的方法を用いて全部または一部分合成されうる（Ｃａｒｕｔｈｅｒｓ ＭＨ ｅｔ ａｌ， （１９８０）， Ｎｕｃ． Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ． Ｓｙｍｐ． Ｓｅｒ．， ｐｐ．２１５−２２３； Ｈｏｒｎ Ｔ ｅｔ ａｌ， （１９８０）， Ｎｕｃ． Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ． Ｓｙｍｐ． Ｓｅｒ．， ｐｐ．２２５−２３２ を参照されたい）。
【０２０２】
天然に存在する
本明細書中で用いられる“天然に存在する”は、天然に見出されるアミノ酸配列を含むヒトＳＥＰに関する。
【０２０３】
単離された／精製された
本明細書中で用いられる“単離された”および“精製された”という用語は、核酸配列かまたはアミノ酸配列の分子であって、それらの自然環境から取り出され且つそれらが天然に関連している少なくとも一つの他の成分から単離されまたは分離される分子に関する。
【０２０４】
生物学的に活性な
本明細書中で用いられる“生物学的に活性な”は、天然に存在するヒトＳＥＰの（同程度の必要はないが）類似した構造機能および／または（同程度の必要はないが）類似した調節機能および／または（同程度の必要はないが）類似した生化学的機能および／または（同程度の必要はないが）免疫学的活性を有する、組換えヒトＳＥＰのような本発明によるヒトＳＥＰに関する。具体的には、本発明のヒトＳＥＰは、一定のペプチド基質をタンパク質分解によって切断する能力を有し、これは、本発明のヒトＳＥＰ酵素の特徴的な活性の一つである。
【０２０５】
免疫学的活性
本明細書中で用いられる“免疫学的活性”は、適当な動物または細胞中において特異的免疫応答を引き起こし且つ特異的抗体と結合する、天然の、組換えまたは合成のヒトＳＥＰまたはそのいずれかのオリゴペプチドの能力として定義される。
【０２０６】
誘導体
アミノ酸配列に関して本明細書中で用いられる“誘導体”という用語には、ヒトＳＥＰの化学修飾が含まれる。このような修飾を代表するものは、アルキル基、アシル基またはアミノ基による水素の交換であると考えられる。
【０２０７】
欠失
本明細書中で用いられる“欠失”は、それぞれ一つまたはそれを越えるヌクレオチドまたはアミノ酸の残基を欠いているヌクレオチド配列かまたはアミノ酸配列の変化として定義される。
【０２０８】
挿入／付加
本明細書中で用いられる“挿入”または“付加”は、天然に存在するヒトＳＥＰと比較して、それぞれ一つまたはそれを越えるヌクレオチドまたはアミノ酸の残基の付加を生じているヌクレオチド配列またはアミノ酸配列の変化である。
【０２０９】
置換
本明細書中で用いられる“置換”は、それぞれ異なったヌクレオチドまたはアミノ酸による一つまたはそれを越えるヌクレオチドまたはアミノ酸の交換によって生じる。
【０２１０】
ホモログ
本発明のヌクレオチド配列および本発明のアミノ酸配列に関する“ホモログ”という用語は、それら配列の対立遺伝子変異と同意語でありうる。
【０２１１】
具体的には、本明細書中で用いられる“相同性”という用語は、“同一性”という用語と等しいことがありうる。ここでは、本発明のヌクレオチド配列および本発明のアミノ酸配列に関する配列相同性を、いずれか一つまたはそれを越える配列と別の配列との、その他の配列がヌクレオチド配列への少なくとも８３％の同一性およびアミノ酸配列への少なくとも７８％の同一性を有するかどうか確かめる簡単な“眼球”比較（すなわち、厳密な比較）によって決定することができる。相対配列相同性（すなわち、配列同一性）は、二つまたはそれを越える配列間の相同性百分率（％）を計算することができる市販の計算機プログラムによって決定することもできる。このような計算機プログラムの典型的な例は、ＣＬＵＳＴＡＬおよびＢＬＡＳＴである。
【０２１２】
相同性百分率（％）は、連続した配列、すなわち、一つの配列が他の配列と並んでいる配列にわたって計算することができ、一つの配列中の各アミノ酸と他の配列中の該当するアミノ酸とで、一度に一つの残基を直接的に比較することができる。これを、“ギャップなし（ｕｎｇａｐｐｅｄ）”アラインメントと称する。典型的には、このようなギャップなしアラインメントは、比較的少数の残基（例えば、５０未満の連続したアミノ酸）にわたってのみ行われる。
【０２１３】
これは、極めて簡単な且つ首尾一貫した方法であるが、例えば、それ以外に一致する配列対の場合、一つの挿入または欠失が続くアミノ酸残基をアラインメントからはずれさせ、それによって、全体的なアラインメントが行われる場合に相同性％を大きく減少させる可能性があるということを考慮することができない。したがって、大部分の配列比較法は、全相同性スコアを過度に不利にすることなく、可能な挿入および欠失を考慮する最適アラインメントを生じるように設計される。これは、配列アラインメント中に“ギャップ”を挿入して、局部相同性を最大にすることを試みることによって達せられる。
【０２１４】
しかしながら、これら一層複雑な方法は、アラインメント中にある各々のギャップに“ギャップペナルティー”を振り分けるので、一致するアミノ酸の同数について、可能な限り少ないギャップを含む配列アラインメントは、二つの比較される配列間のより高い関係性に反映し、多数のギャップを含むものより高いスコアに達するであろう。典型的には、ギャップの存在について比較的高いコストおよびギャップ中の次の残基各々についてより小さいペナルティーを課す“アフィンギャップコスト（ａｆｆｉｎｅ ｇａｐ ｃｏｓｔｓ）”を用いる。これは、最も一般的に用いられるギャップ評点システムである。高いギャップペナルティーは、当然ながら、より少ないギャップを含む最適のアラインメントを生じるであろう。大部分のアラインメントプログラムは、ギャップペナルティーを変更させる。しかしながら、配列比較のためにこのようなソフトウェアを用いる場合、デフォルト値を用いることが好適である。例えば、ＧＣＧ Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ Ｂｅｓｔｆｉｔ パッケージ（下を参照されたい）を用いる場合、アミノ酸配列についてのデフォルト値ギャップペナルティーは、ギャップに−１２および伸長毎に−４である。
【０２１５】
したがって、最大相同性％の計算は、最初に、ギャップペナルティーを考慮した最適アラインメントの作成を必要とする。このようなアラインメントを実施するのに適当な計算機プログラムは、ＧＣＧ Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ Ｂｅｓｔｆｉｔ パッケージ（Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ， Ｕ．Ｓ．Ａ．； Ｄｅｖｅｒｅｕｘ ｅｔ ａｌ．， １９８４， Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ １２：３８７）である。配列比較を行うことができる他のソフトウェアの例には、ＢＬＡＳＴパッケージ（Ａｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．， １９９９ ｉｂｉｄ− Ｃｈａｐｔｅｒ １８ を参照されたい）、ＦＡＳＴＡ（Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．， １９９０， Ｊ． Ｍｏｌ． Ｂｉｏｌ．， ４０３−４１０）およびＧＥＮＥＷＯＲＫＳ比較ツールセット（ｓｕｉｔｅ ｏｆ ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎ ｔｏｏｌｓ）が含まれるが、これらに制限されるわけではない。ＢＬＡＳＴおよびＦＡＳＴＡは両方とも、オフラインおよびオンライン検索に利用可能である（Ａｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．， １９９９ ｉｂｉｄ， ｐａｇｅｓ ７−５８ ｔｏ ７−６０ を参照されたい）。しかしながら、若干の応用には、ＧＣＧ Ｂｅｓｔｆｉｔ プログラムを用いるのが好適である。
【０２１６】
最終相同性％は、同一性の点から測定することができるが、いくつかの場合、アラインメント操作自体、典型的には、全か無か（ａｌｌ−ｏｒ−ｎｏｔｈｉｎｇ）の対比較に基づいていない。その代わり、化学的類似性または進化論的距離に基づく各々の対合比較にスコアを振り分ける階級化した（ｓｃａｌｅｄ）類似性スコアマトリックスを用いる。一般的に用いられるこのようなマトリックスの一例は、ＢＬＡＳＴプログラムセットのデフォルト値マトリックスであるＢＬＯＳＵＭ６２マトリックスである。ＧＣＧ Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ プログラムは、概して、パブリックデフォルト値、または供給される場合、カスタム記号比較表を用いる（更に詳細については使用者マニュアルを参照されたい）。ＧＣＧパッケージにパブリックデフォルト値、または他のソフトウェアの場合、ＢＬＯＳＵＭ６２のようなデフォルト値マトリックスを用いるのは好適である。
【０２１７】
ソフトウェアで最適アラインメントが作成されたら、相同性％、好ましくは、配列同一性％を計算することは可能である。そのソフトウェアは、典型的に、これを配列比較の一部分として行い、数値結果を生じる。
【０２１８】
示されるように、いくつかの応用について、配列相同性（または同一性）は、いずれか適当な相同性アルゴリズムを用いて、例えば、デフォルト値パラメーターを用いて決定することができる。配列データベースの類似性検索における基本的な問題点の考察については、Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．， （１９９４） Ｎａｔｕｒｅ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ ６：１１９−１２９ を参照されたい。いくつかの応用について、ＢＬＡＳＴアルゴリズムを、デフォルト値に設定されるパラメーターと一緒に用いる。ＢＬＡＳＴアルゴリズムは、ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／ＢＬＡＳＴ／ｂｌａｓｔ ｈｅｌｐ．ｈｔｍｌ において詳細に記載されている。好都合には、ＢＬＡＳＴによって評価される場合の“実質的な相同性”は、少なくとも約ｅ−７、好ましくは、少なくとも約ｅ−９、そして最も好ましくは、ｅ−１０またはそれより低いＥＸＰＥＣＴ値に合う配列に等しい。ＢＬＡＳＴ検索におけるＥＸＰＥＣＴのデフォルトの閾値は、通常は１０である。
【０２１９】
配列同一性を決定する場合にギャップペナルティーを用いることが可能ならば、好ましくは、次のパラメーターを用いる。
【０２２０】
【表１】
Figure 2004504032
二つの配列間の同一性および類似性を決定する他の計算機プログラム法には、ＧＣＧプログラムパッケージ（Ｄｅｖｅｒｅｕｘ ｅｔ ａｌ．， １９８４， Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ １２：３８７）およびＦＡＳＴＡ（Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．， １９９０， Ｊ． Ｍｏｌｅｃ． Ｂｉｏｌ．， ｐｐ．４０３−４１０）が含まれるが、これらに制限されるわけではない。
【０２２１】
ポリペプチド変異体および誘導体
本発明のアミノ酸配列に関する“変異体”または“誘導体”という用語には、その配列からのまたは配列への一つの（またはそれを越える）アミノ酸のいずれかの置換、変異、修飾、交換、欠失または付加が含まれるが、但し、得られたアミノ酸配列はヒトＳＥＰ活性を有する、好ましくは、配列番号：２に示されるポリペプチドと少なくとも同じ活性を有するという条件付きである。
【０２２２】
本発明の配列は、本発明で用いるために修飾されてよい。典型的には、その配列のヒトＳＥＰ活性を維持する修飾が行われる。アミノ酸置換は、修飾された配列がヒトＳＥＰ活性を保持するという条件で、例えば、１、２または３〜１０、２０または３０の置換を行ってよい。アミノ酸置換には、例えば、治療的に投与されるポリペプチドの血漿半減期を増加させるための天然に存在しない類似体の使用が含まれうる。
【０２２３】
保存的置換は、例えば、下の表にしたがって行われてよい。第二列の同じブロック中、好ましくは、第三列の同じ行中のアミノ酸は、互いに置換されてよい。
【０２２４】
【表２】
Figure 2004504032
上に示されたように、本発明のタンパク質は、典型的に、組換え手段によって、例えば、本明細書中に記載のように、および／または固相合成のような当業者に周知の技法を用いた合成手段を用いることによって製造される。このような配列の変異体および誘導体には、融合タンパク質であって、少なくとも、別のアミノ酸配列に（直接的にまたは間接的に）連結されている本発明のアミノ酸配列を含む融合タンパク質が含まれる。これら他のアミノ酸配列は、時々、融合タンパク質パートナーと称されるが、典型的には、本発明のアミノ酸配列の抽出および精製を助けるような好ましい官能性を与えるであろう。融合タンパク質パートナーの例には、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼ（ＧＳＴ）、６ｘＨｉｓ、ＧＡＬ４（ＤＮＡ結合および／または転写活性化ドメイン）およびβ−ガラクトシダーゼが含まれる。融合タンパク質パートナーと本発明のタンパク質配列との間に、後者の除去を可能にするようにタンパク質分解切断部位を含むことも好都合でありうる。好ましくは、融合タンパク質パートナーは、本発明のタンパク質の機能を妨害しないであろう。
【０２２５】
ポリヌクレオチド変異体および誘導体
本発明のヌクレオチド配列に関する“変異体”または“誘導体”という用語には、その配列からのまたは配列への一つの（またはそれを越える）核酸のいずれかの置換、変異、修飾、交換、欠失または付加が含まれるが、但し、得られたヌクレオチド配列は、ヒトＳＥＰ活性を有する、好ましくは、配列番号：１または配列番号：５に示される配列によってエンコードされるポリペプチドと少なくとも同じ活性を有するポリペプチドをコードするという条件付きである。
【０２２６】
上に示されたように、配列相同性に関して、好ましくは、配列番号：１または配列番号：５に示される配列に少なくとも８３％、より好ましくは、少なくとも８５％、より好ましくは、少なくとも９０％の相同性がある。より好ましくは、少なくとも９５％、より好ましくは、少なくとも９８％の相同性がある。ヌクレオチド相同性比較は、上記のように行うことができる。若干の応用について、好ましい配列比較プログラムは、上記のＧＣＧ Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ Ｂｅｓｔｆｉｔ プログラムである。デフォルトの評点マトリックスは、一致するヌクレオチド各々に１０および各々のミスマッチに−９の対合値を有する。各々のヌクレオチドについて、デフォルトのギャップ生成ペナルティーは−５０であり、デフォルトのギャップ伸長ペナルティーは−３である。
【０２２７】
本明細書中で用いられる“変異体”、“ホモログ”、“フラグメント”および“誘導体”という用語は、それら配列の対立遺伝子変異を包含する。
“変異体”という用語は、本明細書中に示されるヌクレオチド配列にハイブリッド形成することができる配列に相補的である配列も包含する。
【０２２８】
ハイブリダイゼーション
本明細書中で用いられる“ハイブリダイゼーション”という用語には、“核酸の鎖が塩基対合によって相補鎖と接合する過程”（Ｃｏｏｍｂｓ Ｊ （１９９４） Ｄｉｃｔｉｏｎａｒｙ ｏｆ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ， Ｓｔｏｃｋｔｏｎ Ｐｒｅｓｓ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ ＮＹ）、並びに Ｄｉｅｆｆｅｎｂａｃｈ ＣＷ ａｎｄ ＧＳ Ｄｖｅｋｓｌｅｒ（１９９５， ＰＣＲ Ｐｒｉｍｅｒ， ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ， Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｐｒｅｓｓ， Ｐｌａｉｎｖｉｅｗ， ＮＹ， ＵＳＡ）に記載のＰＣＲ技術で行われるような増幅の過程が含まれるであろう。
【０２２９】
ハイブリダイゼーション条件は、Ｂｅｒｇｅｒ ａｎｄ Ｋｉｍｍｅｌ（１９８７， Ｇｕｉｄｅ ｔｏ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ， Ｖｏｌ １５２， Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ， Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ， ＣＡ， ＵＳＡ）に示されるように、核酸結合性複合体の融解温度（Ｔｍ）に基づき、下に説明されるように定義される“ストリンジェンシー”を与える。
【０２３０】
ハイブリダイゼーションのストリンジェンシーは、その下でポリ核酸ハイブリッドが安定である条件を意味する。このような条件は、当業者に明らかである。当業者に知られているように、ハイブリッドの安定性は、配列相同性が１％減少する毎に約１〜１．５℃低下するハイブリッドの融解温度（Ｔｍ）に反映される。概して、ハイブリッドの安定性は、ナトリウムイオン濃度および温度の関数である。典型的には、ハイブリダイゼーション反応を、より高いストリンジェンシーの条件下で行った後、いろいろなストリンジェンシーの洗浄を行う。
【０２３１】
本明細書中で用いられるように、高ストリンジェンシーとは、１Ｍ　Ｎａ＋中において６５〜６８℃で安定なハイブリッドを形成するそれら核酸配列だけのハイブリダイゼーションを可能にする条件を意味する。
【０２３２】
最大ストリンジェンシーは、典型的に、ほぼＴｍ−５℃（プローブのＴｍより５℃低い温度）で生じる。
高ストリンジェンシーは、プローブのＴｍより約５℃〜１０℃低い温度で生じる。高ストリンジェンシー条件は、例えば、６ｘＳＳＣ、５ｘデンハート（Ｄｅｎｈａｒｄｔ’ｓ）、１％ＳＤＳ（ドデシル硫酸ナトリウム）、０．１Ｎａ＋ピロリン酸および非特異的競合物質としての０．１ｍｇ／ｍｌ変性サケ精子ＤＮＡを含有する水溶液中でのハイブリダイゼーションによって提供されうる。ハイブリダイゼーション後、高ストリンジェンシー洗浄は、数段階で、０．２〜０．１ｘＳＳＣ、０．１％ＳＤＳ中におけるそのハイブリダイゼーション温度で（約３０分間）の最終洗浄を含んで行われてよい。
【０２３３】
中程度または中間のストリンジェンシーは、典型的に、プローブのＴｍより約１０℃〜２０℃低い温度で生じる。
低ストリンジェンシーは、典型的に、プローブのＴｍより約２０℃〜２５℃低い温度で生じる。
【０２３４】
当業者に理解されるように、最大ストリンジェンシーハイブリダイゼーションは、同一のポリヌクレオチド配列を識別するまたは検出するのに用いることができるが、中間の（または低）ストリンジェンシーハイブリダイゼーションは、類似したまたは関連したポリヌクレオチド配列を識別するまたは検出するのに用いることができる。
【０２３５】
中程度のストリンジェンシーとは、上記の溶液中であるが約６０〜６２℃でのハイブリダイゼーションに均等な条件を意味する。その場合、最終洗浄は、１ｘＳＳＣ、０．１％ＳＤＳ中においてそのハイブリダイゼーション温度で行われる。
【０２３６】
低ストリンジェンシーとは、上記の溶液中において約５０〜５２℃でのハイブリダイゼーションに均等な条件を意味する。その場合、最終洗浄は、２ｘＳＳＣ、０．１％ＳＤＳ中においてそのハイブリダイゼーション温度で行われる。
【０２３７】
これら条件が、種々の緩衝液、例えば、ホルムアミド基剤緩衝液および温度を用いて適応され、および再現されてもよいということは理解される。デンハート溶液およびＳＳＣは、他の適当なハイブリダイゼーション緩衝液と同様、当業者に周知である（例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ， ｅｔ ａｌ．，ｅｄｓ．（１９８９） Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ： Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ， Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ； または Ａｕｓｕｂｅｌ， ｅｔ ａｌ．，ｅｄｓ．（１９９０） Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ， Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ． を参照されたい）。最適ハイブリダイゼーション条件は、プローブの長さおよびＧＣ含量も役割を果たしているので、経験的に決定されるべきである。
【０２３８】
本明細書中に示されるヌクレオチド配列またはそれらの相補鎖に選択的にハイブリッド形成することができる本発明のポリヌクレオチドは、概して、本明細書中に示される該当するヌクレオチド配列に、少なくとも２０個、好ましくは、少なくとも２５個または３０個、例えば、少なくとも４０個、６０個または１００個またはそれを越える連続したヌクレオチドの領域にわたって、少なくとも８３％、好ましくは、少なくとも８５％または９０％、そしてより好ましくは、少なくとも９５％または９８％相同であろう。
【０２３９】
“選択的にハイブリッド形成できる”という用語は、プローブとして用いられるポリヌクレオチドが、本発明の標的ポリヌクレオチドがそのプローブに、バックグラウンドを有意に上回るレベルでハイブリッド形成することが判っている条件下で用いられるということを意味する。このバックグラウンドハイブリダイゼーションは、例えば、スクリーニングされているｃＤＮＡまたはゲノムＤＮＡライブラリーの他のポリヌクレオチドのために生じることがありうる。この場合、バックグラウンドとは、そのプローブとライブラリーの非特異的ＤＮＡメンバーとの間の相互作用によって生じる、標的ＤＮＡで認められる特異的相互作用の１０倍未満、好ましくは、１００倍未満と同程度の強さであるレベルのシグナルを意味する。この相互作用の強度は、例えば、プローブを、例えば、３２Ｐで放射性標識することによって測定することができる。
【０２４０】
好ましい側面において、本発明は、本発明のいずれか一つまたはそれを越えるヌクレオチド配列に、ストリンジェント条件下（例えば、６５℃および０．１ｘＳＳＣ｛１ｘＳＳＣ＝０．１５Ｍ　ＮａＣｌ，０．０１５クエン酸Ｎａ３　ｐＨ７．０｝）でハイブリッド形成することができるヌクレオチド配列を包含する。
【０２４１】
本発明のポリヌクレオチドが二本鎖である場合、その二重らせんの両鎖は、個々にかまたは組合せで、本発明によって包含される。このポリヌクレオチドが一本鎖である場合、そのポリヌクレオチドの相補的配列も本発明の範囲内に含まれるということは理解されるはずである。
【０２４２】
本発明の配列に１００％相同ではないが、本発明の範囲内であるポリヌクレオチドは、多数の方法によって得ることができる。本明細書中に記載の配列の他の変異体は、例えば、一定範囲の個体、例えば、異なった集団からの個体から作られるＤＮＡライブラリーをプローブすることによって得ることができる。更に、他のウイルス／細菌の、または細胞性のホモログ、特に、哺乳動物細胞（例えば、ウシ、ヒツジ、ブタ、ウマおよび霊長類の細胞）中で見出される細胞性ホモログを得ることができ、このようなホモログおよびそれらのフラグメントは、概して、配列番号：１または配列番号：５に示される配列に選択的にハイブリッド形成することができるであろう。このような配列は、他の動物種から作られるｃＤＮＡライブラリーまたはそれに由来するゲノムＤＮＡライブラリーをプローブし、そしてこのようなライブラリーを、中〜高ストリンジェンシー条件下において、配列番号：１または配列番号：５に示される配列の全部または一部分を含むプローブでプローブすることによって得ることができる。同様の考え方が、本発明のポリペプチド配列またはヌクレオチド配列の種ホモログおよび対立遺伝子変異体を得るのに当てはまる。
【０２４３】
変異体および系統／種ホモログは、本発明の配列中の保存アミノ酸配列をエンコードしている変異体およびホモログ中の配列に指向するように設計されるプライマーを用いるであろう縮重ＰＣＲを用いて得ることもできる。保存配列は、例えば、数種類の変異体／ホモログからのアミノ酸配列を整列することによって予想することができる。配列アラインメントは、当該技術分野において知られている計算機ソフトウェアを用いて行うことができる。例えば、ＧＣＧ Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ ＰｉｌｅＵｐ プログラムが広く用いられている。
【０２４４】
縮重ＰＣＲで用いられるプライマーは、一つまたはそれを越える縮重位置を含有するであろうし、しかも既知の配列に対して単一配列プライマーで配列をクローニングするのに用いられるものより低いストリンジェンシー条件で用いられるであろう。
【０２４５】
或いは、このようなポリヌクレオチドは、特徴的な配列の部位特異的突然変異誘発によって得ることができる。これは、例えば、そのポリヌクレオチド配列が発現されている特定の宿主細胞についてコドン選択を最適にするために配列にサイレントコドン変化が必要とされる場合に有用でありうる。他の配列変化は、制限酵素認識部位を導入するために、またはそれらポリヌクレオチドによってエンコードされるポリペプチドの性状または機能を変更するために望まれることがありうる。
【０２４６】
本発明のポリヌクレオチドは、プライマー、例えば、ＰＣＲプライマー、代わりの増幅反応のためのプライマー、プローブであって、例えば、放射性または非放射性標識を用いて慣用的な手段によって明らかになる標識で標識されたものを生じるのに用いることができるし、またはそれらポリヌクレオチドは、ベクター中にクローン化することができる。このようなプライマー、プローブおよび他のフラグメントは、少なくとも１５、好ましくは、少なくとも２０、例えば、少なくとも２５、３０または４０ヌクレオチドの長さであろうが、これらも、本明細書中で用いられる本発明のポリヌクレオチドという用語によって包含される。
【０２４７】
本発明によるＤＮＡポリヌクレオチドおよびプローブのようなポリヌクレオチドは、組換えによって、合成によって、または当業者に利用可能ないずれの手段によっても製造することができる。それらも、標準的な技法によってクローン化することができる。
【０２４８】
概して、プライマーは、所望の核酸配列の一度に一つのヌクレオチドの段階的製造を含む合成手段によって製造されるであろう。自動化された技法を用いてこれを行う技法は、当該技術分野において容易に利用可能である。
【０２４９】
より長いポリヌクレオチドは、概して、組換え手段を用いて、例えば、ＰＣＲクローニング法を用いて製造されるであろう。これは、クローン化することが望まれる配列の領域に隣接する（例えば、約１５〜３０ヌクレオチドの）１対のプライマーを製造し、それらプライマーを、動物またはヒト細胞から得られるｍＲＮＡまたはｃＤＮＡと接触させ、所望の領域の増幅をもたらす条件下でポリメラーゼ連鎖反応を行い、増幅されたフラグメントを（例えば、反応混合物をアガロースゲル上で精製することによって）単離し、そして増幅されたＤＮＡを回収することを含むであろう。それらプライマーは、適当な制限酵素認識部位を含有するように設計してよく、増幅されたＤＮＡは、適当なクローニングベクター中にクローン化することができる。
【０２５０】
調節配列
好ましくは、本発明のポリヌクレオチドは、選択された宿主細胞によるなどのコーディング配列の発現を提供することができる調節配列に機能可能に連結している。例として、本発明は、このような調節配列に機能可能に連結している本発明のポリヌクレオチドを含むベクターを包含する、すなわち、このベクターは発現ベクターである。
【０２５１】
“機能可能に連結している”という用語は、記載の化合物が、それらを予定の方式で機能させる関係にある並列を意味する。コーディング配列に“機能可能に連結している”調節配列は、そのコーディング配列の発現が、制御配列に適合しうる条件下で達せられるように連結している。
【０２５２】
“調節配列”という用語には、プロモーターおよびエンハンサーおよび他の発現調節シグナルが含まれる。
“プロモーター”という用語は、当該技術分野の通常の意味に、例えば、ＲＮＡポリメラーゼ結合部位に用いられる。
【０２５３】
本発明のポリペプチドをエンコードしているポリヌクレオチドの増進された発現は、異種調節領域、例えば、プロモーター、分泌リーダーおよびターミネーター領域の選択によって達せられてもよく、これは、選択された発現宿主からの目的のタンパク質の発現および所望ならば分泌レベルを増加させるのにおよび／または本発明のポリペプチドの発現の誘導可能な制御を行うのに役立つ。
【０２５４】
好ましくは、本発明のヌクレオチド配列は、少なくともプロモーターに機能可能に連結していてよい。
本発明のポリペプチドをエンコードしている遺伝子本来のプロモーターとは別に、他のプロモーターを用いて、本発明のポリペプチドの発現を支配することができる。そのプロモーターは、所望の発現宿主中での本発明のポリペプチドの発現を支配する場合のその効率について選択されてよい。
【０２５５】
もう一つの態様において、構成性プロモーターが、本発明の所望のポリペプチドの発現を支配するために選択されてよい。このような発現構築物は、それが、誘導性基質を含有する培地上で発現宿主を培養する必要性を回避するので、追加の利点を与えることがありうる。
【０２５６】
真菌発現宿主で用いるのに好適である強力な構成性および／または誘導可能プロモーターの例は、キシラナーゼ（ｘｌｎＡ）、フィターゼ、ＡＴＰシンテターゼ、サブユニット９（ｏｌｉＣ）、トリオースリン酸イソメラーゼ（ｔｐｉ）、アルコールデヒドロゲナーゼ（ＡｄｈＡ）、α−アミラーゼ（ａｍｙ）、アミログルコシダーゼ（ＡＧ−ｇｌａＡ遺伝子より）、アセトアミダーゼ（ａｍｄＳ）およびグリセルアルデヒド−３−リン酸デヒドロゲナーゼ（ｇｐｄ）のプロモーターについて真菌遺伝子から入手可能であるものである。
【０２５７】
強力な酵母プロモーターの例は、アルコールデヒドロゲナーゼ、ラクターゼ、３−ホスホグリセリン酸キナーゼおよびトリオースリン酸イソメラーゼについての遺伝子から入手可能なものである。
【０２５８】
強力な細菌プロモーターの例は、α−アミラーゼおよびＳＰ０２のプロモーター、並びに細胞外プロテアーゼ遺伝子からのプロモーターである。
ハイブリッドプロモーターは、発現構築物の誘導可能な調節を改善するのに用いることもできる。
【０２５９】
プロモーターには、更に、適当な宿主中での発現を確実にするまたは増加させる特徴が含まれうる。例えば、それら特徴は、Ｐｒｉｂｎｏｗ Ｂｏｘ またはＴＡＴＡボックスのような保存領域でありうる。プロモーターは、他の配列も含有して、本発明のヌクレオチド配列の発現レベルに影響を与えること（維持すること、増進すること、減少させることなど）もできる。例えば、適当な他の配列には、Ｓｈ１−イントロンまたはＡＤＨイントロンが含まれる。他の配列には、温度、化学物質、光またはストレス誘導性要素のような誘導性要素が含まれる。更に、転写または翻訳を増進させる適当な要素が存在してよい。後者の要素の一例は、ＴＭＶ５’シグナル配列である（Ｓｌｅａｔ， Ｇｅｎｅ， ２１７，［１９８７］，ｐｐ．２１７−２２５； および Ｄａｗｓｏｎ， Ｐｌａｎｔ Ｍｏｌ． Ｂｉｏｌ．， ２３，［１９９３］，ｐ．９７ を参照されたい）。
【０２６０】
分泌
本発明のヒトＳＥＰは、由来細胞から、例えば、精巣中で天然に分泌される。しかしながら、ヒトＳＥＰをエンコードしているポリヌクレオチド配列の突然変異、またはヒトＳＥＰを発現する細胞中での翻訳後修飾の変更またはその不存在は、ヒトＳＥＰの非細胞外分泌（例えば、細胞内沈着）をもたらすことがありうる。このような場合、本発明のポリペプチドを一層容易に回収することができる培地中に、本発明のポリペプチドを発現宿主から分泌させることが望まれる。本発明により、分泌リーダー配列は、所望の発現宿主に基づいて選択されうる。ハイブリッドシグナル配列は、本発明の場合に用いることもできる。
【０２６１】
異種分泌リーダー配列の典型的な例は、真菌アミログルコシダーゼ（ＡＧ）遺伝子（ｇｌａＡ−例えば、アスペルギルス属（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ）からの１８アミノ酸および２４アミノ酸両方の型）、ａ−因子遺伝子（酵母、例えば、サッカロミセス属（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）およびクルイベロミセス属（Ｋｌｕｙｖｅｒｏｍｙｃｅｓ））またはα−アミラーゼ遺伝子（バチルス属（Ｂａｃｉｌｌｕｓ））に由来するものである。
【０２６２】
構築物
“コンジュゲート”、“カセット”および“ハイブリッド”などの用語と同意語である“構築物”という用語には、プロモーターに直接的にまたは間接的に結合した本発明によるヌクレオチド配列が含まれる。間接的結合の例は、本発明のプロモーターおよびヌクレオチド配列の中間の、Ｓｈ１−イントロンまたはＡＤＨイントロンなどのイントロン配列のような適当なスペーサー基の供給である。直接的または間接的結合が含まれる本発明に関する“融合した”という用語について同じことが当てはまる。各々の場合、それら用語は、野生型遺伝子プロモーターに通常は関連しているタンパク質をコードするヌクレオチド配列の自然の組合せであって、それらが両方ともそれらの自然環境中にある場合を包含しない。
【０２６３】
この構築物は、それが転移されている、例えば、細菌、好ましくは枯草菌（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ）のような Ｂａｃｉｌｌｕｓ 属の細菌、または植物中での遺伝子構築物の選択を考慮するマーカーを含有するまたは発現することもできる。種々のマーカーが存在するが、例えば、マンノース−６−リン酸イソメラーゼをエンコードするもの（特に、植物について）または抗生物質耐性、例えば、Ｇ４１８、ハイグロマイシン、ブレオマイシン、カナマイシンおよびゲンタマイシンへの耐性を与えるマーカーなどを用いることができる。
【０２６４】
好ましくは、本発明の構築物は、少なくとも、プロモーターに機能可能に連結した本発明のヌクレオチド配列を含む。
ベクター
“ベクター”という用語には、発現ベクターおよび形質転換ベクターおよびシャトルベクターが含まれる。
【０２６５】
“発現ベクター”という用語は、ｉｎ ｖｉｖｏ または ｉｎ ｖｉｔｒｏ 発現の可能な構築物を意味する。
“形質転換ベクター”という用語は、一つの物質を別の物質に転移させることができる構築物を意味し、これは、同じ種のものであってよいしまたは異なった種のものであってよい。その構築物が、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）プラスミドから Ｂａｃｉｌｌｕｓ 属のような細菌へのように、一つの種から別の種に転移させることができる場合、この形質転換ベクターは、時々、“シャトルベクター”と称される。それは、Ｅ．ｃｏｌｉ プラスミドからアグロバクテリア菌（Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）へ、植物へと転移させることができる構築物でもありうる。
【０２６６】
本発明のベクターは、下記のような適当な宿主細胞中に形質転換されて、本発明のポリペプチドを発現させることができる。したがって、もう一つの側面において、本発明は、本発明によるポリペプチドを製造する方法であって、上記のような発現ベクターで形質転換されたまたはトランスフェクションされた宿主細胞を、それらポリペプチドをエンコードしているコーディング配列のベクターによって発現させる条件下で培養し、そして発現したポリペプチドを回収することを含む方法を提供する。
【０２６７】
これらベクターは、例えば、複製開始点、場合により、ポリヌクレオチドの発現のためのプロモーターおよび場合により、そのプロモーターの調節因子を備えた、例えば、プラスミド、ウイルスまたはバクテリオファージ（ファージ）のベクターであってよい。
【０２６８】
本発明のベクターは、一つまたはそれを越える選択可能マーカー遺伝子を含有してよい。工業用微生物に最も適当な選択システムは、宿主生物中での突然変異を必要としない選択マーカーの群によって形成されるものである。真菌選択マーカーの例は、アセトアミダーゼ（ａｍｄＳ）、ＡＴＰシンテターゼ、サブユニット９（ｏｌｉＣ）、オロチジン−５’−リン酸デカルボキシラーゼ（ｐｖｒＡ）、フレオマイシンおよびベノミル耐性（ｂｅｎＡ）の遺伝子である。非真菌選択マーカーの例は、細菌Ｇ４１８耐性遺伝子（これは、酵母で用いることもできるが、糸状菌では用いることができない）、アンピシリン耐性遺伝子（Ｅ．ｃｏｌｉ）、ネオマイシン耐性遺伝子（Ｂａｃｉｌｌｕｓ）およびβ−グルクロニダーゼ（ＧＵＳ）をコードしているＥ．ｃｏｌｉ ｕｉｄＡ遺伝子である。
【０２６９】
ベクターは、ｉｎ ｖｉｔｒｏ で、例えば、ＲＮＡの製造に用いることができるし、または宿主細胞をトランスフェクションするのにまたは形質転換するのに用いることができる。
【０２７０】
したがって、本発明のポリヌクレオチドは、組換えベクター（典型的には、複製可能ベクター）、例えば、クローニングベクターまたは発現ベクター中に包含されることができる。このベクターは、適合しうる宿主細胞中で核酸を複製するのに用いることができる。したがって、さらなる態様において、本発明は、本発明のポリヌクレオチドを製造する方法であって、本発明のポリヌクレオチドを複製可能ベクター中に導入し、そのベクターを適合しうる宿主細胞中に導入し、そしてその宿主細胞を、そのベクターの複製をもたらす条件下で成長させることによる方法を提供する。このベクターは、宿主細胞から回収することができる。適当な宿主細胞は、発現ベクターに関連して下に記載される。
【０２７１】
本発明は、更に、ヒトＳＥＰのモジュレーター（例えば、阻害剤）の識別のためのスクリーニング法における、ヒトＳＥＰまたはその変異体、ホモログ、フラグメントまたは誘導体を発現する遺伝子操作された宿主細胞の使用に関する。このような遺伝子操作された宿主細胞は、ヒトＳＥＰ活性をモジュレートすることができるペプチドライブラリーまたは有機分子をスクリーニングするのに用いられうる。抗体、ペプチドまたは有機低分子のようなヒトＳＥＰの阻害剤は、例えば、ヒトＳＥＰに関連した疾患の予防および／または処置用の医薬組成物についての基準を提供するであろう。このような阻害剤は、このような疾患の予防および／または処置のために単独でまたは他の治療薬と組み合わせて投与することができる。
【０２７２】
本発明は、更に、ヒトＳＥＰタンパク質の ｉｎ ｖｉｖｏ または ｉｎ ｖｉｔｒｏ 生産のための、またはヒトＳＥＰ発現または活性に影響を与えうる試剤についてスクリーニングするための、ヒトＳＥＰまたはその変異体、ホモログ、フラグメントまたは誘導体をエンコードしているポリヌクレオチド配列を含む発現ベクターおよび宿主細胞に関する。
【０２７３】
組織
本明細書中で用いられる“組織”という用語には、組織それ自体および器官が含まれる。
【０２７４】
宿主細胞
本発明に関して、“宿主細胞”という用語には、本発明の組換えタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含むことがありうるいずれかの細胞および／またはそれより得られる生成物が含まれるが、ここにおいて、プロモーターは、その宿主細胞中に存在する場合、本発明によるヌクレオチド配列の発現を可能にすることがありうる。
【０２７５】
したがって、本発明のさらなる態様は、本発明のポリヌクレオチドで形質転換されたまたはトランスフェクションされた宿主細胞を提供する。好ましくは、このポリヌクレオチドは、このポリヌクレオチドの複製および発現のためにベクター中で運ばれる。それら細胞は、このベクターと適合しうるように選択されるであろうが、例えば、原核性（例えば、細菌細胞）または真核性（すなわち、哺乳動物、真菌、昆虫、原生動物、酵母または植物の細胞）であってよい。
【０２７６】
グラム陰性細菌Ｅ．ｃｏｌｉ は、異種遺伝子発現のための宿主として広く用いられている。しかしながら、多量の異種タンパク質は、細胞内部に蓄積しがちである。その後のＥ．ｃｏｌｉ 細胞内タンパク質のバルクからの所望のタンパク質の精製は、時々難しいことがありうる。
【０２７７】
Ｅ．ｃｏｌｉ とは対照的に、Ｂａｃｉｌｌｕｓ 属からの細菌は、培地中にタンパク質を分泌するそれらの能力のために、異種宿主として極めて適している。宿主として適した他の細菌は、ストレプトマイセス属（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ）およびシュードモナス属（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）からのものである。
【０２７８】
宿主細胞中へのポリヌクレオチドの導入は、Ｓａｍｂｒｏｏｋ， ｅｔ ａｌ．，ｅｄｓ．（１９８９） Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ： Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ， Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ， ＮＹ， ＵＳＡ に記載の方法によって行うことができる。これらの方法には、リン酸カルシウムトランスフェクション、ＤＥＡＥ−デキストラン媒介トランスフェクション、陽イオン脂質媒介トランスフェクション、エレクトロポレーション、トランスベクション（ｔｒａｎｓｖｅｃｔｉｏｎ）、マイクロインジェクション、形質導入、スクレイプローディング（ｓｃｒａｐｅ ｌｏａｄｉｎｇ）および射出導入（ｂａｌｌｉｓｔｉｃ ｉｎｔｒｏｄｕｃｔｉｏｎ）が含まれるが、これらに制限されるわけではない。
【０２７９】
代表的な宿主の例には、細菌細胞（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉ、Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ）；酵母細胞および Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ のような真菌細胞；ショウジョウバエ属（Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ）Ｓ２およびスポドプテラ（Ｓｐｏｄｏｐｔｅｒａ）ＳＦ９細胞のような昆虫細胞；ＣＨＯ、ＣＯＳ、ＨＥＫ、ＨｅＬａおよび３Ｔ３細胞のような動物細胞が含まれる。適当な宿主の選択は、当業者がなすことの範囲内であると考えられる。
【０２８０】
本発明のポリペプチドをエンコードしているポリヌクレオチドの性状、および／または発現されるタンパク質のさらなるプロセシングへの所望に依存して、酵母または他の真菌のような真核生物宿主が好適でありうる。概して、酵母細胞は、操作するのが一層容易であるので、真菌細胞より好適である。しかしながら、いくつかのタンパク質は、酵母細胞から不十分にしか発現されないかまたは分泌されないし、またはある場合には、適切に処理されない（例えば、酵母中での高グリコシル化）。これらの状況では、別の真菌宿主生物が選択されるべきである。
【０２８１】
本発明の範囲内の適当な発現宿主の例は、Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ 種（ＥＰ−Ａ−０１８４４３８号およびＥＰ−Ａ−０２８４６０３号に記載のものなど）およびトリコデルマ属（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ）種のような真菌；エシェリキア属（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ）種または Ｂａｃｉｌｌｕｓ 種（ＥＰ−Ａ−０１３４０４８号およびＥＰ−Ａ−０２５３４５５号に記載のものなど）、Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ 種および Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ 種のような細菌；Ｋｌｕｙｖｅｒｏｍｙｃｅｓ 種（ＥＰ−Ａ−００９６４３０号およびＥＰ−Ａ−０３０１６７０号に記載のものなど）および Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ 種のような酵母である。例として、典型的な発現宿主は、クロカビ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｎｉｇｅｒ）、アスペルギルス・ニガー変異ツビジェニス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｎｉｇｅｒ ｖａｒ． ｔｕｂｉｇｅｎｉｓ）、アスペルギルス・ニガー変異アワモリ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｎｉｇｅｒ ｖａｒ． ａｗａｍｏｒｉ）、アスペルギルス・アクレアティス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ａｃｕｌｅａｔｉｓ）、アスペルギルス・ニドゥランス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｎｉｄｕｌａｎｓ）、コウジカビ（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｏｒｙｚａｅ）、トリコデルマ・レエセイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｅｉ）、クルイベロマイセス・ラクティス（Ｋｌｕｙｖｅｒｏｍｙｃｅｓ ｌａｃｔｉｓ）、枯草菌（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ）、バチルス・リシェニホルミス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｌｉｃｈｅｎｉｆｏｒｍｉｓ）、バチルス・アミノリクエファシエンス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ａｍｙｌｏｌｉｑｕｅｆａｃｉｅｎｓ）、シゾサッカロマイセス・ポンベ（Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｐｏｍｂｅ）、ピキア・パストリス（Ｐｉｃｈｉａ ｐａｓｔｏｒｉｓ）およびパン酵母（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）より選択されてよい。
【０２８２】
哺乳動物、酵母、昆虫、植物および真菌の宿主細胞などの適当な宿主細胞の使用は、本発明の組換え発現生成物に最適の生物学的活性を与えるのに必要とされることがありうる翻訳後修飾（例えば、ミリストイル化、グリコシル化、先端切断（ｔｒｕｎｃａｔｉｏｎ）、ラピデーション（ｌａｐｉｄａｔｉｏｎ）、およびチロシン、セリンまたはトレオニンリン酸化）に備えることができる。
【０２８３】
生物
本発明に関する“生物”という用語には、本発明による組換えタンパク質をコードするヌクレオチド配列および／またはそれより得られる生成物を含むことがありうる、ヒトを除くいずれかの生物が含まれるが、ここにおいて、プロモーターは、その生物中に存在する場合、本発明によるヌクレオチド配列の発現を可能にすることがありうる。生物の例には、真菌、酵母、植物または原生動物が含まれてよい。
【０２８４】
本発明に関する“トランスジェニック生物”という用語には、本発明によるタンパク質をコードするヌクレオチド配列および／またはそれより得られる生成物を含む、ヒトを除くいずれかの生物が含まれるが、ここにおいて、プロモーターは、その生物中での本発明によるヌクレオチド配列の発現を可能にすることがありうる。好ましくは、このヌクレオチド配列は、その生物のゲノム中に包含される。
【０２８５】
“トランスジェニック生物”という用語は、その自然環境中にもある天然のプロモーターの制御下にある場合のその自然環境中にある本発明による天然のヌクレオチドコーディング配列を包含しない。更に、本発明は、それがその自然環境中にある場合、およびそれが、その自然環境中にもあるその天然のヌクレオチドコーディング配列によって発現されている場合、およびそのヌクレオチド配列が、その自然環境中にもあるその天然のプロモーターの制御下にある場合、本発明による天然のタンパク質を包含しない。
【０２８６】
したがって、本発明のトランスジェニック生物には、本発明によるアミノ酸配列をコードしているヌクレオチド配列のいずれか一つまたは組合せ、本発明による構築物（それらの組合せを含めた）、本発明によるベクター、本発明によるプラスミド、本発明による細胞および本発明による組織またはそれらの生成物、を含む生物が含まれる。形質転換された細胞または生物は、その細胞または生物から容易に回収できると考えられる所望の化合物の許容しうる量を製造しうると考えられる。
【０２８７】
宿主細胞／宿主生物の形質転換
先に示したように、宿主生物は、原核生物または真核生物でありうる。適当な原核生物宿主の例には、Ｅ．ｃｏｌｉ および Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ が含まれる。原核生物宿主の形質転換についての教示は、当該技術分野においてよく文書化されており、例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ， ｅｔ ａｌ．（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ： Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ， ２ｎｄ ｅｄｉｔｉｏｎ， １９８９， Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ， ＮＹ， ＵＳＡ）および Ａｕｓｕｂｅｌ， ｅｔ ａｌ．（Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ （１９９５）， Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．）を参照されたい。
【０２８８】
一つの態様において、形質転換された宿主は、哺乳動物細胞、または例えば、昆虫細胞であり、ここにおいて、これら宿主細胞中へのポリヌクレオチドの導入は、例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ， ｅｔ ａｌ．（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ： Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ， ２ｎｄ ｅｄｉｔｉｏｎ， １９８９， Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ， ＮＹ， ＵＳＡ）に記載の方法によって行うことができる。これら方法には、リン酸カルシウムトランスフェクション、ＤＥＡＥ−デキストラン媒介トランスフェクション、陽イオン脂質媒介トランスフェクション、エレクトロポレーション、トランスベクション、マイクロインジェクション、形質導入、スクレイプローディングおよび射出導入が含まれるが、これらに制限されるわけではない。
【０２８９】
もう一つの態様において、トランスジェニック生物は酵母でありうる。この点で、酵母は、異種遺伝子発現のためのビヒクルとしても広く用いられてきている。Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ 種には、異種遺伝子発現のための使用を含めた長い工業使用の歴史がある。Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ における異種遺伝子の発現は、Ｇｏｏｄｅｙ ｅｔ ａｌ．（１９８７， Ｙｅａｓｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ， Ｄ Ｒ Ｂｅｒｒｙ ｅｔ ａｌ， ｅｄｓ， ｐｐ ４０１−４２９， Ａｌｌｅｎ ａｎｄ Ｕｎｗｉｎ， Ｌｏｎｄｏｎ）によっておよび Ｋｉｎｇ ｅｔ ａｌ．（１９８９， Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ａｎｄ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌｏｇｙ ｏｆ Ｙｅａｓｔｓ， Ｅ Ｆ Ｗａｌｔｏｎ ａｎｄ Ｇ Ｔ Ｙａｒｒｏｎｔｏｎ， ｅｄｓ， ｐｐ １０７−１３３， Ｂｌａｃｋｉｅ， Ｇｌａｓｇｏｗ）によって概説されている。
【０２９０】
いくつかの理由で、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ は、異種遺伝子発現によく適している。第一に、それはヒトに非病原性であり、しかも、一定の内毒素を生産することができない。第二に、それには、何百年にも渡るいろいろな目的の商業的利用に続く安全使用の長い歴史がある。これが、広い社会的受容性をもたらしている。第三に、この生物に専念した広範囲にわたる商業的使用および研究は、遺伝学および生理学並びに Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ に特有の大規模発酵についての豊富な情報をもたらしている。
【０２９１】
Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ における異種遺伝子発現および遺伝子産物の分泌の原理についての概説は、Ｅ Ｈｉｎｃｈｃｌｉｆｆｅ ａｎｄ Ｅ Ｋｅｎｎｙ（“Ｙｅａｓｔ ａｓ ａ ｖｅｈｉｃｌｅ ｆｏｒ ｔｈｅ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｏｆ ｈｅｔｅｒｏｌｏｇｏｕｓ ｇｅｎｅｓ”， １９９３， Ｙｅａｓｔｓ， Ｖｏｌ ５， Ａｎｔｈｏｎｙ Ｈ Ｒｏｓｅ ａｎｄ Ｊ Ｓｔｕａｒｔ Ｈａｒｒｉｓｏｎ， ｅｄｓ， ２ｎｄ ｅｄｉｔｉｏｎ， Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ Ｌｔｄ．）によって与えられている。
【０２９２】
それらの維持のために宿主ゲノムでの組換えを必要とする組込みベクター、および自律複製プラスミドベクターを含めたいくつかのタイプの酵母ベクターが利用可能である。
【０２９３】
トランスジェニック Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ を製造するために、本発明のヌクレオチド配列を、酵母での発現用に設計された構築物中に挿入することによって発現構築物を製造する。異種発現に用いられるいくつかのタイプの構築物が開発されている。これら構築物は、本発明のヌクレオチド配列に融合した酵母中で活性なプロモーターを含有するが、通常は、ＧＡＬ１プロモーターのような酵母起源のプロモーターを用いる。通常は、ＳＵＣ２シグナルペプチドをエンコードしている配列のような酵母起源のシグナル配列を用いる。酵母中で活性なターミネーターが、この発現系の末端となっている。
【０２９４】
酵母の形質転換のために、いくつかの形質転換プロトコールが開発されている。例えば、本発明によるトランスジェニック Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ は、Ｈｉｎｎｅｎ ｅｔ ａｌ．（１９７８， Ｐｒｏｃｅｅｄｉｎｇｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅ ｏｆ ｔｈｅ ＵＳＡ， ７５：１９２９）；Ｂｅｇｇｓ， Ｊ Ｄ（１９７８， Ｎａｔｕｒｅ， Ｌｏｎｄｏｎ， ２７５：１０４）；および Ｉｔｏ， Ｈ ｅｔ ａｌ．（１９８３， Ｊ． Ｂａｃｔｅｒｉｏｌｏｇｙ １５３：１６３−１６８）の教示にしたがうことによって製造することができる。
【０２９５】
形質転換された酵母細胞は、いろいろな選択マーカーを用いて選択される。形質転換に用いられるマーカーの中には、ＬＥＵ２、ＨＩＳ４およびＴＲＰ１のような多数の栄養要求性マーカー、およびアミノグリコシド抗生物質マーカー、例えば、Ｇ４１８のような支配的な抗生物質耐性マーカーがある。
【０２９６】
もう一つの宿主生物は植物である。遺伝子修飾された植物の構築における基本原理は、挿入された遺伝物質の安定な維持が得られるように、植物ゲノム中に遺伝情報を挿入することである。
【０２９７】
遺伝情報を挿入するためのいくつかの技術があるが、その二つの主な原理は、遺伝情報の直接的導入およびベクター系の使用による遺伝情報の導入である。一般的な技術の概説は、Ｐｏｔｒｙｋｕｓ（Ａｎｎｕ Ｒｅｖ Ｐｌａｎｔ Ｐｈｙｓｉｏｌ Ｐｌａｎｔ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ［１９９１］４２：２０５−２２５）および Ｃｈｒｉｓｔｏｕ（Ａｇｒｏ−Ｆｏｏｄ−Ｉｎｄｕｓｔｒｙ Ｈｉ−Ｔｅｃｈ， Ｍａｒｃｈ／Ａｐｒｉｌ １９９４，１７−２７）による論文に見出されうる。植物の形質転換についての更に別の技術は、ＥＰ−Ａ−０４４９３７５号に見出されうる。
【０２９８】
したがって、本発明は、更に、配列番号：１または配列番号：５に示されるヌクレオチド配列またはその誘導体、ホモログ、変異体またはフラグメントで宿主細胞を形質転換する方法を提供する。
【０２９９】
ヒトＳＥＰヌクレオチドコーディング配列で形質転換された宿主細胞は、そのエンコードされたタンパク質の細胞培養物からの発現および回収に適した条件下で培養することができる。組換え細胞によって生産されるタンパク質は、用いられる配列および／またはベクターに依存して、分泌されてよいしまたは細胞内に含有されていてよい。当業者によって理解されるように、ヒトＳＥＰコーディング配列を含有する発現ベクターは、特定の原核生物または真核生物の細胞膜によってヒトＳＥＰコーディング配列の分泌を支配するシグナル配列で設計されることができる（ヒトＳＥＰがこのようなシグナル配列の不存在下で分泌されない場合）。他の組換え構築物は、可溶性タンパク質の精製を容易にするであろうポリペプチドドメインをエンコードしているヌクレオチド配列に、ヒトＳＥＰコーディング配列をつなぐことができる（Ｋｒｏｌｌ ＤＪ ｅｔ ａｌ． （１９９３） ＤＮＡ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ．， Ｖｏｌ １２，ｐｐ．４４１−５３；融合タンパク質を含有するベクターについての上記の考察も参照されたい）。
【０３００】
遺伝子操作されるまたは遺伝子修飾される
“遺伝子修飾され”ている細胞、好ましくは、動物細胞は、遺伝子操作することによってその細胞中にまたは前駆細胞中に導入される修飾についてヘテロ接合性またはホモ接合性である。修飾を導入するのに利用可能である標準的な遺伝子操作法には、相同的組換え、ウイルスベクター遺伝子トラップ法、照射、化学的突然変異誘発、およびアンチセンスＲＮＡをエンコードしているヌクレオチド配列の単独でのまたは触媒リボザイムとの組合せでのトランスジェニック発現が含まれる。遺伝子修飾に好ましい方法は、相同的組換えおよびウイルスベクター遺伝子トラップ法であり、これらは両方とも、内因性遺伝子を、その遺伝子座中に外来の核酸配列を挿入することによって修飾する。その遺伝子にとって外来の核酸配列は、その遺伝子中に天然に存在しない外因性配列である。この外来のＤＮＡの挿入は、ヒトＳＥＰ遺伝子のいずれの領域中でも、例えば、エンハンサー、プロモーター、調節領域、非コーディング領域、コーディング領域、イントロンまたはエクソンで起こりうる。最も好ましい遺伝子操作法は、相同的組換えであるが、ここにおいて、外来の核酸配列は、標的方式において、単独でかまたは内因性遺伝子配列の一部分の欠失と組合せて挿入される。
【０３０１】
機能的に破壊される
“機能的に破壊され”ているヒトＳＥＰ遺伝子とは、破壊された遺伝子によってエンコードされるヒトＳＥＰポリペプチドの細胞活性が、ヒトＳＥＰ遺伝子の野生型を通常発現する細胞中で減少するように遺伝子修飾されているヒトＳＥＰ遺伝子を意味する。遺伝子修飾が、細胞中のヒトＳＥＰ遺伝子の全ての野生型コピーを全て有効に除去する場合（例えば、好ましくは動物細胞である遺伝子修飾された細胞は、ヒトＳＥＰ遺伝子破壊についてホモ接合性である、または最初に存在するヒトＳＥＰ遺伝子の野生型コピーだけがここで破壊される）、この遺伝子修飾は、野生型ヒトＳＥＰ遺伝子を発現する適当な対照細胞と比較して、ヒトＳＥＰポリペプチド活性を減少させる。ヒトＳＥＰポリペプチド活性のこの減少は、減少したヒトＳＥＰ遺伝子発現によって生じる（すなわち、ヒトＳＥＰｍＲＮＡレベルは、有効に減少し、減少したレベルのヒトＳＥＰポリペプチドを生じる）か、および／または破壊されたヒトＳＥＰ遺伝子が、野生型ヒトＳＥＰポリペプチドと比較して低下した機能または安定性を有する突然変異ポリペプチドをエンコードしているためである。好ましくは、遺伝子修飾された細胞中のヒトＳＥＰポリペプチドの活性は、野生型レベルの５０％またはそれ未満まで、より好ましくは、２５％またはそれ未満まで、そしてなお一層好ましくは、野生型レベルの１０％またはそれ未満まで減少する。最も好ましくは、ヒトＳＥＰ遺伝子破壊は、ヌル突然変異を引き起こす。
【０３０２】
遺伝子修飾された動物細胞
機能的に破壊されたヒトＳＥＰ遺伝子を含有する“遺伝子修飾された動物細胞”とは、機能的に破壊されたヒトＳＥＰ遺伝子を含有するように遺伝子操作することによって生じるヒト細胞を含めた動物細胞、並びに破壊されたヒトＳＥＰ遺伝子を遺伝する娘細胞を意味する。これら細胞は、当該技術分野において知られているいずれの標準法によっても、培養物中で遺伝子修飾することができる。培養物中で細胞を遺伝子修飾することに代わるものとして、非ヒト哺乳動物細胞は、ヒトＳＥＰ遺伝子破壊を含有する遺伝子修飾された非ヒト哺乳動物から単離されてもよい。本発明の動物細胞は、一次細胞または組織標品、並びに培養に適応した、腫瘍発生性のまたは形質転換された細胞系から得ることができる。これら細胞および細胞系は、例えば、内皮細胞、上皮細胞、島細胞、ニューロンおよび他の神経組織由来細胞、中皮細胞、骨細胞、リンパ球、軟骨細胞、造血細胞、免疫細胞、主要な腺または器官（例えば、肝、肺、心臓、胃、膵臓、腎臓および皮膚）の細胞、筋細胞（骨格筋、平滑筋および心筋からの細胞を含めた）、外分泌または内分泌細胞、線維芽細胞、および胚性および他の全能性または多能性幹細胞（例えば、胚性幹（ＥＳ）細胞、ＥＳ様細胞、および胚性生殖系列（ＥＧ）細胞、および前駆細胞および組織由来幹細胞のような他の幹細胞）に由来する。好ましい遺伝子修飾された細胞は、ＥＳ細胞、より好ましくは、マウスまたはラットＥＳ細胞、そして最も好ましくは、ヒトＥＳ細胞である。
【０３０３】
ヒトＳＥＰ遺伝子での相同的組換えのためのターゲッティングベクター中で用いられる“相同領域”は、ヒトＳＥＰ遺伝子の一部分に、または当該技術分野において（例えば、Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｈｕｍａｎ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ， ｕｎｉｔ ４．１， Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ， ＮＹ， ２０００ に記載のように）知られている標準的な低ストリンジェンシー条件下において相同領域とヒトＳＥＰ遺伝子配列との間にハイブリダイゼーションを生じさせるのに充分な程度までヒトＳＥＰ遺伝子に隣接している配列に関係がある（すなわち、相補的である）。
【０３０４】
“ＥＳ細胞”または“ＥＳ様細胞”とは、不定の自己再生並びに３種類全部の胚葉を代表するものである細胞タイプへの分化が可能である胚、始原生殖細胞、または奇形癌に由来する多能性幹細胞を意味する。
【０３０５】
“減少する”とは、統計的に有意の減少（すなわち、ｐ＜０．１）を意味する。
本発明のヒト細胞を含めた遺伝子修飾された動物細胞は、ヒトＳＥＰ遺伝子を機能的に破壊する修飾についてヘテロ接合性またはホモ接合性である。これら動物細胞は、培養物中で細胞を遺伝子操作することによって得られてよいし、または非ヒト哺乳物細胞の場合、遺伝子修飾された非ヒト哺乳動物から細胞を単離してよい。
【０３０６】
ヒトＳＥＰ遺伝子座は、化学的突然変異誘発（Ｒｉｎｃｈｉｋ， Ｔｒｅｎｄｓ ｉｎ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ ７：１５−２１，１９９１， Ｒｕｓｓｅｌｌ， Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ ＆ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｍｕｔａｇｅｎｅｓｉｓ ２３ （Ｓｕｐｐｌ．２４） ２３−２９，１９９４）、照射（Ｒｕｓｓｅｌｌ， 上記）、単独でかまたは触媒ＲＮＡリボザイム配列との組合せでのヒトＳＥＰ遺伝子アンチセンスＲＮＡのトランスジェニック発現（Ｌｕｙｃｋｘ ｅｔ ａｌ．， Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ９６：１２１７４−７９，１９９９； Ｓｏｋｏｌ ｅｔ ａｌ．， Ｔｒａｎｓｇｅｎｉｃ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ５：３６３−７１，１９９６； Ｅｆｒａｔ ｅｔ ａｌ．， Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ ９１：２０５１−５５，１９９４； Ｌａｒｓｓｏｎ ｅｔ ａｌ．， Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ２２：２２４２−４８，１９９４）、および下に更に考察される、ヒトＳＥＰ遺伝子座中への外来の核酸配列の挿入によるヒトＳＥＰ遺伝子の破壊を含めた、当該技術分野において知られているいくつかの遺伝子修飾技術の一つによって機能的に破壊される。好ましくは、この外来の配列は、相同的組換えによってまたはウイルスベクターの挿入によって挿入される。最も好ましくは、ヒトＳＥＰ遺伝子破壊の方法は、相同的組換えであり、これには、内因性ヒトＳＥＰ遺伝子配列の一部分の欠失が含まれる。
【０３０７】
外来の配列の組込みは、次の機作の一つまたはそれを越えるものによって、すなわち：ヒトＳＥＰ遺伝子の転写または翻訳過程を妨げることによって（例えば、プロモーター認識を妨げることによって、または転写終結部位または翻訳停止コドンをヒトＳＥＰ遺伝子中に導入することによって）；またはヒトＳＥＰ遺伝子コーディング配列を、それがもはや、通常の酵素機能を有するヒトＳＥＰポリペプチドをエンコードしないように変形させることによって（例えば、外来のコーディング配列をヒトＳＥＰ遺伝子コーディング配列中に挿入することによって、フレームシフト突然変異または一つまたは複数のアミノ酸置換を導入することによって、または二重乗換えイベントの場合、機能的酵素の発現に必要とされるヒトＳＥＰ遺伝子コーディング配列の一部分を欠失することによって）；ヒトＳＥＰ遺伝子を機能的に破壊する。
【０３０８】
細胞のゲノム中のヒトＳＥＰ遺伝子座中に外来の配列を挿入するためには、この外来のＤＮＡ配列を、エレクトロポレーション、リン酸カルシウム沈降、レトロウイルス感染、マイクロインジェクション、ビオリスティクス（ｂｉｏｌｉｓｔｉｃｓ）、リポソームトランスフェクション、ＤＥＡＥ−デキストラントランスフェクションまたはトランスフェリンフェクションのような当該技術分野において知られている標準法によって細胞中に導入する（例えば、Ｎｅｕｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．， ＥＭＢＯ Ｊ． １：８４１−８４５， １９８２； Ｐｏｔｔｅｒ ｅｔ ａｌ．， Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ ＵＳＡ ８１：７１６１−６５， １９８４； Ｃｈｕ ｅｔ ａｌ．， Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ． １５：１３１１−２６， １９８７； Ｔｈｏｍａｓ ａｎｄ Ｃａｐｅｃｃｈｉ， Ｃｅｌｌ ５１：５０３−１２， １９８７； Ｂａｕｍ ｅｔ ａｌ．， Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ １７：１０５８−６２， １９９４； Ｂｉｅｗｅｎｇａ ｅｔ ａｌ．， Ｊ． Ｎｅｕｒｏｓｃｉｅｎｃｅ Ｍｅｔｈｏｄｓ ７１：６７−７５， １９９７； Ｚｈａｎｇ ｅｔ ａｌ．， Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ １５：８６８−７２， １９９３； Ｒａｙ ａｎｄ Ｇａｇｅ， Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ １３：５９８−６０３， １９９２； Ｌｏ， Ｍｏｌ． Ｃｅｌｌ． Ｂｉｏｌ． ３：１８０３−１４， １９８３； Ｎｉｃｋｏｌｏｆｆ ｅｔ ａｌ．， Ｍｏｌ． Ｂｉｏｔｅｃｈ． １０：９３−１０１， １９９８； Ｌｉｎｎｅｙ ｅｔ ａｌ．， Ｄｅｖ． Ｂｉｏｌ． （Ｏｒｌａｎｄｏ） ２１３：２０７−１６， １９９９； Ｚｉｍｍｅｒ ａｎｄ Ｇｒｕｓｓ， Ｎａｔｕｒｅ ３３８：１５０−１５３， １９８９； および Ｒｏｂｅｒｔｓｏｎ ｅｔ ａｌ．， Ｎａｔｕｒｅ ３２３：４４５−４８， １９８６ を参照されたい）。外来のＤＮＡを細胞中に導入する好ましい方法は、エレクトロポレーションである。
【０３０９】
相同的組換え
相同的組換えの方法は、ヒトＳＥＰ遺伝子を含有する細胞中にヒトＳＥＰ遺伝子ターゲッティングベクターを導入することにより、ヒトＳＥＰ遺伝子を破壊の標的とする。ヒトＳＥＰ遺伝子を破壊の標的とするこのベクターの能力は、ヒトＳＥＰ遺伝子に相同であるベクター中のヌクレオチド配列を用いることによって生じる。この相同領域は、このベクターとヒトＳＥＰ遺伝子の内因性配列との間のハイブリダイゼーションを容易にする。ハイブリダイゼーションにより、このターゲッティングベクターとゲノム配列との間の乗換えイベントの確率が大きく増加する。この乗換えイベントは、ヒトＳＥＰ遺伝子座中へのベクター配列の組込みおよびヒトＳＥＰ遺伝子の機能的破壊を引き起こす。
【０３１０】
ターゲッティングに用いられるベクターの構築に関する一般的な原理は、Ｂｒａｄｌｅｙ ｅｔ ａｌ．（Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ． １０：５３４，１９９２）に概説されている。二つの異なった典型的なタイプのベクター、すなわち、挿入ベクターまたは置換ベクターを用いて、相同的組換えによってＤＮＡを挿入することができる。挿入ベクターとは、二本鎖切断部（ｂｒｅａｋ）を含むヒトＳＥＰ遺伝子相同性領域を含有する環状ＤＮＡである。この相同性領域と内因性ヒトＳＥＰ遺伝子との間のハイブリダイゼーション後、二本鎖切断部における単一乗換えイベントは、この乗換え部位の内因性遺伝子中へのベクター配列全体の挿入をもたらす。
【０３１１】
相同的組換えに用いるより好ましいベクターは、置換ベクターであるが、これは、環状よりむしろ共直線性である。ヒトＳＥＰ遺伝子中への置換ベクター組込みは、二重乗換えイベント、すなわち、ターゲッティングベクターとヒトＳＥＰ遺伝子との間の二つのハイブリダイゼーション部位における乗換えを必要とする。この二重乗換えイベントは、二つの乗換え部位の間に挟まれているベクター配列のヒトＳＥＰ遺伝子中への組込み、および本来二つの乗換え部位の間に広がる該当する内因性ヒトＳＥＰ遺伝子配列の欠失をもたらす（例えば、Ｔｈｏｍａｓ ａｎｄ Ｃａｐｅｃｃｈｉ ｅｔ ａｌ．， Ｃｅｌｌ ５１：５０３−１２，１９８７； Ｍａｎｓｏｕｒ ｅｔ ａｌ．， Ｎａｔｕｒｅ ３３６：３４８−５２，１９８８； Ｍａｎｓｏｕｒ ｅｔ ａｌ．， Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８７：７６８８−７６９２，１９９０； および Ｍａｎｓｏｕｒ， ＧＡＴＡ ７：２１９−２２７，１９９０ を参照されたい）。
【０３１２】
ターゲッティングベクター中の相同性領域は、概して、少なくとも１００ヌクレオチドの長さである。最も好ましくは、この相同性領域は、少なくとも１〜５キロベース（Ｋｂ）の長さである。相同性領域に必要な最低限の長さまたは最低限の関係性度は示されていないが、相同的組換えのためのターゲッティング効率は、概して、ターゲッティングベクターとヒトＳＥＰ遺伝子座との間の長さおよび関係性度と対応する。置換ベクターが用いられ、そして内因性ヒトＳＥＰ遺伝子の一部分が相同的組換えで欠失している場合、更に考慮されるべきことは、内因性ヒトＳＥＰ遺伝子の欠失部分のサイズである。内因性ヒトＳＥＰ遺伝子のこの部分が１Ｋｂの長さを越える場合、１Ｋｂより長い相同性領域を含むターゲッティングカセットは、組換えの効率を増進させるために推奨される。相同的組換えに有効な配列の選択および使用に関する更に別の指針は、参考文献に記載されている（例えば、Ｄｅｎｇ ａｎｄ Ｃａｐｅｃｃｈｉ， Ｍｏｌ． Ｃｅｌｌ． Ｂｉｏｌ． １２：３３６５−３３７１， １９９２； Ｂｏｌｌａｇ ｅｔ ａｌ．， Ａｎｎｕ． Ｒｅｖ． Ｇｅｎｅｔ． ２３：１９９−２２５， １９８９； および Ｗａｌｄｍａｎ ａｎｄ Ｌｉｓｋａｙ， Ｍｏｌ． Ｃｅｌｌ． Ｂｉｏｌ． ８：５３５０−５３５７， １９８８ を参照されたい）。
【０３１３】
ヒトＳＥＰ遺伝子ターゲッティングベクターの構築では、ベクター主鎖として、ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ 関連プラスミド（例えば、Ｂｌｕｅｓｃｒｉｐｔ ＫＳ＋１１）、ｐＱＥ７０、ｐＱＥ６０、ｐＱＥ−９、ｐＢＳ、ｐＤ１０、ファージスクリプト、ｐｈｉＸ１７４、ｐＢＫ ファージミド、ｐＮＨ８Ａ、ｐＮＨ１６ａ、ｐＮＨ１８Ｚ、ｐＮＨ４６Ａ、ｐｔｒｃ９９ａ、ｐＫＫ２２３−３、ｐＫＫ２３３−３、ｐＤＲ５４０、およびｐＲＩＴ５　ＰＷＬＮＥＯ、ｐＳＶ２ＣＡＴ、ｐＸＴ１、ｐＳＧ（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ）、ｐＳＶＫ３、ＰＢＰＶ、ＰＭＳＧ、およびｐＳＶＬ、ｐＢＲ３２２およびｐＢＲ３２２に基づくベクター、ｐＢＭ９、ｐＢＲ３２５、ｐＫＨ４７、ｐＢＲ３２８、ｐＨＣ７９、ファージ Ｃｈａｒｏｎ ２８、ｐＫＢ１１、ｐＫＳＶ−１０、ｐＫ１９関連プラスミド、ｐＵＣプラスミド、およびｐＧＥＭ系列プラスミドを含めたいろいろなクローニングベクターを用いることができる。これらベクターは、種々の市販元から入手可能である（例えば、 Ｂｏｅｈｒｉｎｇｅｒ Ｍａｎｎｈｅｉｍ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌｓ， Ｉｎｄｉａｎａｐｏｌｉｓ， ＩＮ； Ｑｉａｇｅｎ， Ｖａｌｅｎｃｉａ， ＣＡ； Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ， Ｌａ Ｊｏｌｌａ， ＣＡ； Ｐｒｏｍｅｇａ， Ｍａｄｉｓｏｎ， ＷＩ； および Ｎｅｗ Ｅｎｇｌａｎｄ Ｂｉｏｌａｂｓ， Ｂｅｖｅｒｌｙ， ＭＡ：全て米国）。しかしながら、いずれの他のベクター、例えば、プラミド、ウイルスまたはその一部分も、それらが複製可能であり且つ所望の宿主中で生存可能である限り用いることができる。ベクターは、ゲノムが修飾される宿主中でそれを複製することができるようにする配列も含んでいてよい。このようなベクターの使用は、組換えが起こりうる相互作用期間を拡大して、ターゲッティングの効率を増加させることができる（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ， ｅｄ． Ａｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ， Ｕｎｉｔ ９．１６， Ｆｉｇ．９．１６．１ を参照されたい）。
【０３１４】
上記のターゲッティングベクターを増殖させるのに用いられる具体的な宿主は、重要ではない。例には、Ｅ．ｃｏｌｉ Ｋ１２ＲＲ１（Ｂｏｌｉｖａｒ ｅｔ ａｌ．， Ｇｅｎｅ ２：９５，１９７７）、Ｅ．ｃｏｌｉ Ｋ１２ＨＢ１０１（ＡＴＣＣ番号３３６９４）、Ｅ．ｃｏｌｉ ＭＭ２１（ＡＴＣＣ番号３３６７８０）、Ｅ．ｃｏｌｉ ＤＨ１（ＡＴＣＣ番号３３８４９）、Ｅ．ｃｏｌｉ 菌株ＤＨ５αおよびＥ．ｃｏｌｉＳＴＢＬ２が含まれる。或いは、Ｃ．ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ のような宿主を用いることができる。上述の宿主は、市販されている（例えば、Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ， Ｌａ Ｊｏｌｌａ， ＣＡ， ＵＳＡ； および Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ， Ｒｏｃｋｖｉｌｌｅ， ＭＤ， ＵＳＡ）。
【０３１５】
ターゲッティングベクターを生じるためには、ヒトＳＥＰ遺伝子ターゲッティング構築物を上記のベクター主鎖に加える。上記のヒトＳＥＰ遺伝子ターゲッティング構築物は、少なくとも一つのヒトＳＥＰ遺伝子相同性領域を有する。このヒトＳＥＰ遺伝子相同性領域を作るためには、ヒトＳＥＰ遺伝子に関係した配列を、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）プライマーを製造するための基準として用いる。これらプライマーは、ヒトＳＥＰ配列の所望の領域を極めて正確なＰＣＲ増幅によって増幅させるために用いる（Ｍａｔｔｉｌａ ｅｔ ａｌ．， Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ． １９：４９６７， １９９１； Ｅｃｋｅｒｔ ａｎｄ Ｋｕｎｋｅｌ １：１７， １９９１； および米国特許第４，６８３，２０２号）。ゲノム配列は、ゲノムクローンライブラリーからまたはゲノムＤＮＡの製造から、好ましくは、ヒトＳＥＰ遺伝子破壊についてターゲッティングが行われる動物種から得られる。
【０３１６】
好ましくは、上記のターゲッティング構築物には、正のマーカータンパク質をエンコードしている外因性ヌクレオチド配列も含まれる。ベクター組込み後の正のマーカーの安定な発現は、細胞生存率に影響することなく、識別可能な特性を細胞に与える。したがって、置換ベクターの場合、マーカー遺伝子は、二重乗換えイベント後にそれがヒトＳＥＰ遺伝子中に組み込まれるように、二つの隣接している相同性領域の間に位置する。
【０３１７】
正のマーカータンパク質は選択可能タンパク質であるのが好適であり、このようなタンパク質の細胞中での安定な発現は、選択可能な表現型特性を与える、すなわち、この特性は、それがなければ致死する条件下における細胞の生存を増進させる。したがって、選択可能な条件を課すことにより、ベクター配列を生存率に基づいて首尾よく組み込んでいない他の細胞から、正の選択可能マーカーを安定して発現する細胞を単離することができる。正の選択可能マーカータンパク質（およびそれらの選択試剤）の例には、Ｎｅｏ（Ｇ４１８またはカノマイシン）、Ｈｙｇ（ハイグロマイシン）、ＨｉｓＤ（ヒスチジノール）、Ｇｐｔ（キサンチン）、Ｂｌｅ（ブレオマイシン）およびＨｐｒｔ（ヒポキサンチン）が含まれる（例えば、Ｃａｐｅｃｃｈｉ ａｎｄ Ｔｈｏｍａｓ， 米国特許第５，４６４，７６４号および Ｃａｐｅｃｃｈｉ， Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４４：１２８８−９２， １９８９ を参照されたい）。選択可能マーカーに代わるものとして用いることもできる他の正のマーカーには、β−ガラクトシダーゼのようなレポータータンパク質、ホタルルシフェラーゼまたはグリーン蛍光タンパク質が含まれる（例えば、Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｃｙｔｏｍｅｔｒｙ， Ｕｎｉｔ ９．５ および Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ， Ｕｎｉｔ ９．６， Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ， ＮＹ， ２０００ を参照されたい）。
【０３１８】
上記の正の選択スキームは、いずれかの染色体位置へのベクター配列のランダムな非相同的組込みに対して、ヒトＳＥＰ遺伝子座に標的相同的組換えによってベクターが組み込まれた細胞間を区別することはない。したがって、相同的組換えに置換ベクターを用いる場合、負の選択可能マーカータンパク質をエンコードしているヌクレオチド配列を含むことも好適である。負の選択可能マーカーの発現は、ある種の試剤にさらされた場合、そのマーカーを発現する細胞の生存率を減少させる（すなわち、そのマーカータンパク質は、特定の選択可能な条件下において細胞にとって致命的になる）。負の選択可能マーカー（およびそれらの致死性試剤）の例には、単純ヘルペスウイルスチミジンキナーゼ（ガンシクロビルまたは１，２−デオキシ−２−フルオロ−α−ｄ−アラビノフラノシル−５−ヨードウラシル）、Ｈｐｒｔ（６−チオグアニンまたは６−チオキサンチン）、およびジフテリア毒素、リシン毒素およびシトシンデアミナーゼ（５−フルオロシトシン）が含まれる。
【０３１９】
負の選択可能マーカーをエンコードしているヌクレオチド配列は、置換ベクターの二つの相同性領域の外側に位置する。この位置にあると、細胞は、ランダムな非相同的組換えによって組込みが生じる場合にのみ、負の選択可能マーカーを単に組込み且つ安定して発現するであろうが、ヒトＳＥＰ遺伝子とターゲッティング構築物中の二つの相同性領域との間の相同的組換えは、負の選択可能マーカーをエンコードしている配列を組込みから除外する。したがって、負の条件を課すことにより、ランダムな非相同的組換えによってターゲッティングベクターが組み込まれた細胞は生存率が減少する。
【０３２０】
正および負の選択可能マーカーの上記組合せは、一連の正および負の選択工程を、相同的組換えによってベクター組込みが行われ、したがって、潜在的に破壊されたヒトＳＥＰ遺伝子を有する細胞だけをより効率よく選択するように設計することができるので、好適である。正・負選択スキーム、選択可能マーカーおよびターゲッティング構築物の更に別の例は、例えば、米国特許第号５，４６４，７６４、ＷＯ９４／０６９０８号および Ｖａｌａｎｃｉｕｓ ａｎｄ Ｓｍｉｔｈｉｅｓ， Ｍｏｌ． Ｃｅｌｌ． Ｂｉｏｌ． １１：１４０２， １９９１ に記載されている。
【０３２１】
ベクター組込みによってマーカータンパク質が安定して発現されるために、マーカーコーディング配列がベクター組込みによって内因性ヒトＳＥＰ遺伝子プロモーターに機能的に連結するように、ターゲッティングベクターを設計することができる。次に、そのマーカーの発現を、通常はヒトＳＥＰ遺伝子を発現する細胞中においてヒトＳＥＰ遺伝子プロモーターによって作動させる。或いは、そのベクターのターゲッティング構築物中の各々のマーカーは、ヒトＳＥＰ遺伝子プロモーターとは無関係の発現を作動するそれ自体のプロモーターを含有してよい。この後者のスキームは、ヒトＳＥＰ遺伝子を典型的に発現しない細胞中においてマーカーの発現を可能にする利点を有する（Ｓｍｉｔｈ ａｎｄ Ｂｅｒｇ， Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｓｙｍｐ． Ｑｕａｎｔ． Ｂｉｏｌ． ４９：１７１， １９８４； Ｓｅｄｉｖｙ ａｎｄ Ｓｈａｒｐ， Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． （ＵＳＡ） ８６：２２７： １９８９； Ｔｈｏｍａｓ ａｎｄ Ｃａｐｅｃｃｈｉ， Ｃｅｌｌ ５１：５０３， １９８７）。
【０３２２】
マーカー遺伝子発現を作動するのに用いることができる外因性プロモーターには、細胞特異的または段階特異的プロモーター、構成性プロモーター、および誘導性または調節可能プロモーターが含まれる。これらプロモーターの制限されない例には、単純ヘルペスチミジンキナーゼプロモーター、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）プロモーター／エンハンサー、ＳＶ４０プロモーター、ＰＧＫプロモーター、ＰＭＣ１−ｎｅｏ、メタロチオネインプロモーター、アデノウイルス後期プロモーター、ワクシニアウイルス７．５Ｋプロモーター、鳥類のトリβグロビンプロモーター、ヒストンプロモーター（例えば、マウスヒストンＨ３−６１４）、βアクチンプロモーター、ニューロン特異的エノラーゼ、筋アクチンプロモーター、およびカリフラワーモザイクウイルス３５Ｓプロモーターが含まれる（概して、Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．， Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ， Ｖｏｌｓ． Ｉ−ＩＩＩ， Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ， Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ， ＮＹ， １９８９， および Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ， Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ， ＮＹ， ２０００； Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ， Ｌａ Ｊｏｌｌａ， ＣＡ， ＵＳＡ を参照されたい）。
【０３２３】
細胞が、ベクター配列を標的ヒトＳＥＰ遺伝子座中に組み込まれたかどうか確かめるためには、所望のベクター組込みイベントに特異的であるプライマーまたはゲノムプローブを、ＰＣＲまたはサザンブロット分析と組み合わせて用いて、ヒトＳＥＰ遺伝子座中への所望のベクター組込みの存在を確認することができる（Ｅｒｌｉｃｈ ｅｔ ａｌ．， Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５２：１６４３−５１，１９９１； Ｚｉｍｍｅｒ ａｎｄ Ｇｒｕｓｓ， Ｎａｔｕｒｅ ３３８：１５０，１９８９； Ｍｏｕｅｌｌｉｃ ｅｔ ａｌ．， Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．（ＵＳＡ） ８７：４７１２，１９９０； および Ｓｈｅｓｅｌｙ ｅｔ ａｌ．， Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．（ＵＳＡ） ８８：４２９４，１９９１）。
【０３２４】
遺伝子トラップ法
ヒトＳＥＰ遺伝子を機能的に破壊するために、外来の核酸配列をヒトＳＥＰ遺伝子座中に挿入するのに利用可能なもう一つの方法は、遺伝子トラップ法である。この方法は、エクソンをｍＲＮＡ中にスプライシングして、遺伝子トラップベクターコーディング配列を遺伝子中にランダム様式で挿入する、全ての哺乳動物細胞に存在する細胞機構を利用する。いったん挿入されると、遺伝子トラップベクターは、トラップされたヒトＳＥＰ遺伝子を機能的に破壊しうる突然変異を生じる。相同的組換えとは対照的に、突然変異誘発のためのこのシステムは、極めてランダムな突然変異を生じる。したがって、機能的に破壊されたヒトＳＥＰ遺伝子を含有する遺伝子修飾された細胞を得るためには、この特定の突然変異を含有する細胞を、種々の遺伝子のランダム突然変異を含有する細胞のプールから識別し且つ選択しなければならない。
【０３２５】
遺伝子トラップ用のシステムおよびベクターは、ネズミ細胞および他の細胞タイプを遺伝子修飾する場合の使用について記載されている（例えば、Ａｌｌｅｎ ｅｔ ａｌ．， Ｎａｔｕｒｅ ３３：８５２−５５， １９８８； Ｂｅｌｌｅｎ ｅｔ ａｌ．， Ｇｅｎｅｓ Ｄｅｖ． ３：１２８８−１３００， １９８９； Ｂｉｅｒ ｅｔ ａｌ．， Ｇｅｎｅｓ Ｄｅｖ． ３：１２７３−１２８７， １９８９； Ｂｏｎｎｅｒｏｔ ｅｔ ａｌ．， Ｊ． Ｖｉｒｏｌ． ６６：４９８２−９１， １９９２； Ｂｒｅｎｎｅｒ ｅｔ ａｌ．， Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ ８６：５５１７−２１， １９８９； Ｃｈａｎｇ ｅｔ ａｌ．， Ｖｉｒｏｌｏｇｙ １９３：７３７−４７， １９９３； Ｆｒｉｅｄｒｉｃｈ ａｎｄ Ｓｏｒｉａｎｏ， Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｅｎｚｙｍｏｌ． ２２５：６８１−７０１， １９９３； Ｆｒｉｅｄｒｉｃｈ ａｎｄ Ｓｏｒｉａｎｏ， Ｇｅｎｅｓ Ｄｅｖ． ５：１５１３−２３， １９９１； Ｇｏｆｆ， Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｅｎｚｙｍｏｌ． １５２：４６９−８１， １９８７； Ｇｏｓｓｌｅｒ ｅｔ ａｌ．， Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４４：４６３−６５， １９８９； Ｈｏｐｅ， Ｄｅｖｅｌｏｐ． １１３：３９９−４０８， １９９１； Ｋｅｒｒ ｅｔ ａｌ．， Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂ． Ｓｙｍｐ． Ｑｕａｎｔ． Ｂｉｏｌ． ２：７６７−７７６， １９８９； Ｒｅｄｄｙ ｅｔ ａｌ．， Ｊ． Ｖｉｒｏｌ． ６５：１５０７−１５１５， １９９１； Ｒｅｄｄｙ ｅｔ ａｌ．， Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． Ｕ．Ｓ．Ａ． ８９：６７２１−２５， １９９２； Ｓｋａｒｎｅｓ ｅｔ ａｌ．， Ｇｅｎｅｓ Ｄｅｖ． ６：９０３−９１８， １９９２； ｖｏｎ Ｍｅｌｃｈｎｅｒ ａｎｄ Ｒｕｌｅｙ， Ｊ． Ｖｉｒｏｌ． ６３：３２２７−３２３３， １９８９； および Ｙｏｓｈｉｄａ ｅｔ ａｌ， Ｔｒａｎｓｇｅｎ． Ｒｅｓ． ４：２７７−８７， １９９５ を参照されたい）。
【０３２６】
プロモータートラップ（５’トラップ）ベクターは、５’〜３’の順で、スプライスアクセプター配列の後にエクソンを含有するが、これは、典型的に、翻訳開始コドンおよび読み取り枠（ＯＲＦ）および／または内部リボソームエントリー部位を特徴とする。概して、これらプロモータートラップベクターは、プロモーターも、機能的に連結したスプライスドナー配列も含有しない。したがって、宿主細胞の細胞性ゲノム中への組込み後、そのプロモータートラップベクター配列は、上流の遺伝子の通常のスプライシングを遮断し、末端エクソンとして作用する。ベクターコーディング配列の発現は、適当な読み枠中の破壊された遺伝子のイントロン中へのベクター組込みに依存する。このような場合、細胞性スプライシング機構は、ベクターコーディング配列の上流のトラップされた遺伝子からエクソンをスプライシングする（Ｚａｍｂｒｏｗｉｃｚ ｅｔ ａｌ．， ＷＯ９９／５０４２６号）。
【０３２７】
上記のプロモータートラップベクターと類似の作用を生じる別の方法は、プロモータートラップベクターのスプライスアクセプターと翻訳開始コドンまたはポリアデニル化配列との間の領域中に存在するまたはそれ以外の場合、その領域中に遺伝子操作される停止コドンの ｎｅｓｔｅｄ セットを包含するベクターである。コーディング配列は、独立リボソームエントリー部位（ＩＲＥＳ）を含有するように遺伝子操作することもできるので、そのコーディング配列は、宿主細胞ゲノム中の組込み部位とはほとんど無関係に発現されるであろう。典型的には、必然的ではなく、ＩＲＥＳは、停止コドンの ｎｅｓｔｅｄ セットと連結して用いられる。
【０３２８】
別のタイプの遺伝子トラップスキームは、３’遺伝子トラップベクターを用いる。このタイプのベクターは、操作上の組合せで、プロモーター領域を含有するが、これは、隣接するコーディング配列、そのコーディング配列、およびコーディング配列エクソンの３’末端を規定するスプライスドナー配列の発現を媒介する。宿主細胞ゲノム中への組込み後、ベクタープロモーターによって発現される転写物は、組み込まれた遺伝子トラップベクター配列の下流に位置するトラップされた遺伝子からスプライスアクセプター配列へとスプライシングされる。したがって、ベクターの組込みは、３’遺伝子トラップカセットのコーディング配列、および末端エクソンおよびそのポリアデニル化シグナルを含めたいずれかの下流細胞性エクソンを含む融合転写物の発現を引き起こす。このようなベクターが遺伝子中に組み込まれる場合、細胞性スプライシング機構は、トラップされた遺伝子の３’エクソンの上流のベクターコーディング配列をスプライシングする。このようなベクターの一つの利点は、３’遺伝子トラップベクターの発現が、遺伝子トラップカセット中のプロモーターによって作動されるので、宿主細胞中で通常発現される遺伝子中への組込みを必要としないということである（Ｚａｍｂｒｏｗｉｃｚ ｅｔ ａｌ．， ＷＯ９９／５０４２６号）。３’遺伝子トラップベクター中に包含されてよい転写プロモーターおよびエンハンサーの例には、ターゲッティングベクターに関して上に論及されたものが含まれる。
【０３２９】
プロモーターまたは３’遺伝子トラップベクターの構造成分として用いられるウイルスベクター主鎖は、標的細胞のゲノム中に挿入されうる広範囲のベクターより選択されてよい。適当な主鎖ベクターには、単純ヘルペスウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノ関連ウイルスベクター、レトロウイルスベクター、レンチウイルスベクター、仮性狂犬病ウイルス、α−ヘルペスウイルスベクター等が含まれるが、これらに制限されるわけではない。ウイルスベクター、特に、非複製性細胞を修飾するのに適したウイルスベクター、および外因性ポリヌクレオチド配列の発現と連結したこのようなベクターの使用方法についての詳細な概説は、Ｖｉｒａｌ Ｖｅｃｔｏｒｓ： Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒａｐｙ ａｎｄ Ｎｅｕｒｏｓｃｉｅｎｃｅ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ， Ｅｄｓ． Ｃａｐｌｉｔｔ ａｎｄ Ｌｏｅｗｙ， Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ， Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ， １９９５ に見出されうる。
【０３３０】
おそらくは、遺伝子トラップ法にはレトロウイルスベクターが用いられる。これらベクターは、米国特許第５，４４９，６１４号に記載されたようなレトロウイルスパッケージング細胞系と連結して用いることができる。非ネズミ哺乳動物細胞を遺伝子修飾の標的細胞として用いる場合、両種性または汎親和性のパッケージング細胞系を用いて、適当なベクターをパッケージすることができる（Ｏｒｙ ｅｔ ａｌ．， Ｐｒｏ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ．， ＵＳＡ ９３：１１４００−１１４０６，１９９６）。現在記載されている３’遺伝子トラップベクターを生じるのに適応させうる代表的なレトロウイルスベクターは、例えば、米国特許第５，５２１，０７６号に記載されている。
【０３３１】
遺伝子トラップ用ベクターは、相同的組換えに用いられるターゲッティングベクターに関して上に論及された正のマーカー遺伝子の一つまたはそれを越えるものを含有してよい。ターゲッティングベクターでのそれらの使用と同様に、これら正のマーカーは、遺伝子トラップ用ベクター中において、細胞ゲノム中にベクターを組み込まれた細胞を識別し且つ選択するのに用いられる。このマーカー遺伝子は、独立リボソームエントリー部位（ＩＲＥＳ）を含有するように遺伝子操作されてよいので、そのマーカーは、標的細胞ゲノム中にベクターが組み込まれた位置とはほとんど無関係に発現されるであろう。
【０３３２】
遺伝子トラップベクターが、感染した宿主細胞のゲノム中にかなりランダムに組み込まれると仮定すると、破壊されたヒトＳＥＰ遺伝子を有する遺伝子修飾された細胞は、ランダムなベクター組込みが行われた細胞の集団から識別されなければならない。好ましくは、その細胞集団における遺伝子修飾は、その集団が、それら細胞のゲノム中で見出される本質的にあらゆる遺伝子中で突然変異を示して、破壊されたヒトＳＥＰ遺伝子を含む細胞がその集団から識別されることを可能にするように充分なランダムさおよび頻度を有する（Ｚａｍｂｒｏｗｉｃｚ ｅｔ ａｌ．， ＷＯ９９／５０４２６号； Ｓａｎｄｓ ｅｔ ａｌ．， ＷＯ９８／１４６１４号を参照されたい）。
【０３３３】
破壊されたヒトＳＥＰ遺伝子を含有する個々の突然変異細胞系は、突然変異した細胞集団において、例えば、ヒトＳＥＰ遺伝子配列中の突然変異を確認するのに逆転写およびＰＣＲ（ＲＴ−ＰＣＲ）を用いて識別される。この方法は、クローンをプールすることによって能率的にすることができる。例えば、破壊されたヒトＳＥＰ遺伝子を含有する個々のクローンを見出すには、遺伝子トラップベクター中に固定された一つのプライマーおよびヒトＳＥＰ遺伝子配列中に位置する別のプライマーを用いてＲＴ−ＰＣＲを行う。正のＲＴ−ＰＣＲ結果は、そのベクター配列がヒトＳＥＰ遺伝子転写物中にエンコードされていることを示し、ヒトＳＥＰ遺伝子が遺伝子トラップ組込みイベントによって破壊されたことが示される（例えば、Ｓａｎｄｓ ｅｔ ａｌ．， ＷＯ９８／１４６１４号を参照されたい）。
【０３３４】
時間的、空間的および誘導性の遺伝子破壊
内因性ヒトＳＥＰ遺伝子の機能的破壊は、特定の発生段階または細胞周期段階で（時間的破壊）または特定の細胞タイプで（空間的破壊）生じることがありうる。ヒトＳＥＰ遺伝子破壊は、ある種の条件が存在する場合、誘導性でもありうる。Ｃｒｅ−Ｌｏｘ系のようなリコンビナーゼ切除系は、特定の発生段階で、特定の組織または細胞タイプで、または特定の環境条件下でヒトＳＥＰ遺伝子を活性化させるまたは失活させるのに用いることができる。概して、Ｃｒｅ−Ｌｏｘ技法を利用する方法は、Ｔｏｒｒｅｓ ａｎｄ Ｋｕｈｎ， Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｆｏｒ Ｃｏｎｄｉｔｉｏｎａｌ Ｇｅｎｅ Ｔａｒｇｅｔｉｎｇ， Ｏｘｆｏｒｄ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓ， １９９７ によって記載のように行われる。Ｃｒｅ−Ｌｏｘ系について記載されたのと類似した方法も、ＦＬＰ−ＦＲＴ系を利用して用いることができる。相同的組換えまたはウイルス挿入によって条件付きで遺伝子を破壊するリコンビナーゼ切除系の使用に関する更に別の指針は、例えば、米国特許第５，６２６，１５９号、米国特許第５，５２７，６９５号、米国特許第５，４３４，０６６号、ＷＯ９８／２９５３３号、Ｏｒｂａｎ ｅｔ ａｌ．， Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ ８９：６８６１−６５， １９９２； Ｏ’Ｇｏｒｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．， Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５１：１３５１−５５， １９９１； Ｓａｕｅｒ ｅｔ ａｌ．， Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ １７：１４７−６１， １９８９； Ｂａｒｉｎａｇａ， Ｓｃｉｅｎｃｅ ２６５：２６−２８， １９９４； および Ａｋａｇｉ ｅｔ ａｌ．， Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ． ２５：１７６６−７３， １９９７ に与えられる。一つより多いリコンビナーゼ系を、動物細胞を遺伝子修飾に用いることができる。
【０３３５】
Ｃｒｅ−Ｌｏｘ系のようなリコンビナーゼ系を用いて、時間的、空間的または誘導性の様式でヒトＳＥＰ遺伝子を破壊するのに相同的組換えを用いる場合、ヒトＳＥＰ遺伝子コーディング領域の一部分を、ｌｏｘＰ部位に隣接したヒトＳＥＰ遺伝子コーディング領域を含むターゲッティング構築物によって置き換える。この遺伝子修飾を有する動物細胞は、機能的なｌｏｘＰに隣接したヒトＳＥＰ遺伝子を含有する。ヒトＳＥＰ遺伝子破壊の時間的、空間的または誘導性の側面は、所望の空間的に調節された、時間的に調節された、または誘導性のプロモーターそれぞれの制御下において動物細胞中で発現される、追加の導入遺伝子、すなわち、Ｃｒｅリコンビナーゼ導入遺伝子の発現パターンによってもたらされる。Ｃｒｅリコンビナーゼは、組換えのためのｌｏｘＰ部位を標的とする。したがって、Ｃｒｅ発現が活性化されると、ｌｏｘＰ部位で組換えが行われて、挟まれたヒトＳＥＰ遺伝子コーディング配列が切除され、ヒトＳＥＰ遺伝子の機能的破壊が生じる（Ｒａｊｅｗｓｋｉ ｅｔ ａｌ．， Ｊ． Ｃｌｉｎ． Ｉｎｖｅｓｔ． ９８：６００−０３， １９９６； Ｓｔ．−Ｏｎｇｅ ｅｔ ａｌ．， Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ． ２４：３８７５−７７， １９９６； Ａｇａｈ ｅｔ ａｌ．， Ｊ． Ｃｌｉｎ． Ｉｎｖｅｓｔ． １００：１６９−７９， １９９７； Ｂｒｏｃａｒｄ ｅｔ ａｌ．， Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ ９４：１４５５９−６３， １９９７； Ｆｅｉｌ ｅｔ ａｌ．， Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ ９３：１０８８７−９０， １９９６； および Ｋｕｅｈｎ ｅｔ ａｌ．， Ｓｃｉｅｎｃｅ ２６９：１４２７−２９， １９９５）。
【０３３６】
Ｃｒｅリコンビナーゼ導入遺伝子およびｌｏｘＰに隣接したヒトＳＥＰ遺伝子を両方とも含有する細胞は、標準的なトランスジェニック技術によって生じることができる。ヒトＳＥＰ遺伝子を時間的、空間的または条件付きで破壊するためのリコンビナーゼ系特異的プロモーターの使用に関する更に別の指針は、例えば、Ｓａｕｅｒ， Ｍｅｔｈ． Ｅｎｚ． ２２５：８９０−９００， １９９３， Ｇｕ ｅｔ ａｌ．， Ｓｃｉｅｎｃｅ ２６５：１０３−０６， １９９４， Ａｒａｋｉ ｅｔ ａｌ．， Ｊ． Ｂｉｏｃｈｅｍ． １２２：９７７−８２， １９９７， Ｄｙｍｅｃｋｉ， Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ９３：６１９１−９６， １９９６、および Ｍｅｙｅｒｓ ｅｔ ａｌ．， Ｎａｔｕｒｅ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ １８：１３６−４１， １９９８ に見出される。
【０３３７】
ヒトＳＥＰ遺伝子の誘導性破壊は、テトラサイクリン応答性バイナリー系を用いることによって達成することもできる（Ｇｏｓｓｅｎ ａｎｄ Ｂｕｊａｒｄ， Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ ８９：５５４７−５１， １９９２）。この系は、内因性ヒトＳＥＰ遺伝子調節要素、およびテトラサイクリンで制御可能なリプレッサー（ＴｅｔＲ）を発現する導入遺伝子中に、Ｔｅｔプロモーターを導入するように細胞を遺伝子修飾することを含む。このような細胞では、テトラサイクリンの投与は、ＴｅｔＲを活性化させ、順次、これがヒトＳＥＰ遺伝子発現を阻害し、したがって、ヒトＳＥＰ遺伝子を機能的に破壊する（Ｓｔ．−Ｏｎｇｅ ｅｔ ａｌ．， Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ． ２４：３８７５−７７，１９９６，米国特許第５，９２２，９２７号）。
【０３３８】
ヒトＳＥＰ遺伝子の時間的、空間的および誘導性の破壊のための上記の系は、例えば、ＷＯ９８／２９５３３号に記載のように遺伝子修飾の方法として遺伝子トラップ法を用いる場合に用いることもできる。
【０３３９】
遺伝子修飾された動物細胞を生じること
遺伝子修飾のための上記の方法は、実質的には動物に由来する体細胞または幹細胞のいずれのタイプでも、ヒトＳＥＰ遺伝子を機能的に破壊するのに用いることができる。本発明の遺伝子修飾された動物細胞には、ヒト細胞を含めた哺乳動物細胞、および鳥類細胞が含まれるが、これらに制限されるわけではない。これら細胞は、培養に適応された、腫瘍発生性のまたは形質転換された細胞系のようないずれかの動物細胞系を遺伝子修飾することに由来してよいし、またはそれらは、所望のヒトＳＥＰ遺伝子修飾を有する遺伝子修飾された非ヒト動物から単離されてよい。
【０３４０】
これら細胞は、破壊されたヒトＳＥＰ遺伝子についてヘテロ接合性であってよいしまたはホモ接合性であってよい。ヒトＳＥＰ遺伝子破壊についてホモ接合性である細胞（ヒトＳＥＰ−／−）を得るために、両方の対立遺伝子の直接的な逐次的ターゲッティングを行うことができる。この方法は、正の選択可能マーカーを再循環することによって容易にすることができる。このスキームにより、正の選択可能マーカーをエンコードしているヌクレオチド配列は、Ｃｒｅ−ＬｏｘＰ系を用いた一つの対立遺伝子の破壊後に除去される。したがって、同様のベクターは、次の回のターゲッティングにおいて、第二のヒトＳＥＰ遺伝子対立遺伝子を破壊するのに用いることができる（Ａｂｕｉｎ ａｎｄ Ｂｒａｄｌｅｙ， Ｍｏｌ． Ｃｅｌｌ． Ｂｉｏｌ． １６：１８５１−５６， １９９６； Ｓｅｄｉｖｙ ｅｔ ａｌ．， Ｔ． Ｉ． Ｇ． １５：８８−９０， １９９９； Ｃｒｕｚ ｅｔ ａｌ．， Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． （ＵＳＡ） ８８：７１７０−７４， １９９１； Ｍｏｒｔｅｎｓｅｎ ｅｔ ａｌ．， Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． （ＵＳＡ） ８８：７０３６−４０， １９９１； ｔｅ Ｒｉｅｌｅ ｅｔ ａｌ．， Ｎａｔｕｒｅ （Ｌｏｎｄｏｎ） ３４８：６４９−６５１， １９９０）。
【０３４１】
ヒトＳＥＰ−／−であるＥＳ細胞を得るための別の戦略は、ヒトＳＥＰ遺伝子破壊にヘテロ接合性である細胞（ヒトＳＥＰ＋／−）の集団からの細胞のホモジナイゼーションである。この方法は、選択可能薬物耐性マーカーを発現するヒトＳＥＰ＋／−標的クローンを、極めて高い薬物濃度に対して選択するスキームを用いるが、この選択は、薬物耐性マーカーをエンコードしている配列の二つのコピーを発現する、したがって、ヒトＳＥＰ遺伝子破壊にホモ接合性である細胞に有利である（Ｍｏｒｔｅｎｓｅｎ ｅｔ ａｌ．， Ｍｏｌ． Ｃｅｌｌ． Ｂｉｏｌ． １２：２３９１−９５， １９９２）。
【０３４２】
所望の細胞または細胞系の遺伝子修飾後、ヒトＳＥＰ遺伝子座は、標準的なＰＣＲによるＰＣＲ分析または当該技術分野において知られているサザンブロッティング法によって修飾部位として確かめることができる（例えば、米国特許第４，６８３，２０２号；および Ｅｒｌｉｃｈ ｅｔ ａｌ．， Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５２：１６４３，１９９１ を参照されたい）。ヒトＳＥＰ遺伝子の機能的破壊の更に別の立証は、ヒトＳＥＰ遺伝子メッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）レベルおよび／またはヒトＳＥＰポリペプチドレベルが、正常にヒトＳＥＰ遺伝子を発現する細胞中で減少するかどうかで行うこともできる。ヒトＳＥＰ遺伝子ｍＲＮＡレベルの尺度は、逆転写酵素に媒介されるポリメラーゼ連鎖反応（ＲＴ−ＰＣＲ）、ノーザンブロット分析または ｉｎ ｓｉｔｕ ハイブリダイゼーションを用いることによって得ることができる。細胞によって生産されるヒトＳＥＰポリペプチドの定量化は、例えば、当該技術分野において知られている標準的な免疫検定法によって行うことができる。このような免疫検定には、ラジオイムノアッセイ、ＥＬＩＳＡ（酵素結合イムノソルベント検定）、“サンドイッチ”免疫検定、イムノラジオメトリックアッセイ、ゲル拡散沈降反応、免疫拡散検定、ｉｎ ｓｉｔｕ 免疫検定（例えば、金コロイド、酵素または放射性同位体の標識を用いた）、ウェスタンブロット、２次元ゲル分析、沈降反応、免疫蛍光検定、プロテインＡ検定、および免疫電気泳動検定のような技術を用いた競合的および非競合的検定システムが含まれるが、これらに制限されるわけではない。
【０３４３】
好ましい遺伝子修飾された動物細胞は、胚性幹（ＥＳ）細胞およびＥＳ様細胞である。これら細胞は、マウス（Ｅｖａｎｓ ｅｔ ａｌ．， Ｎａｔｕｒｅ １２９：１５４−１５６， １９８１； Ｍａｒｔｉｎ， Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ， ７８：７６３４−７６３８， １９８１）、ブタおよびヒツジ（Ｎｏｔａｎｉａｎｎｉ ｅｔ ａｌ．， Ｊ． Ｒｅｐｒｏｄ． Ｆｅｒｔ． Ｓｕｐｐｌ．， ４３：２５５−２６０， １９９１； Ｃａｍｐｂｅｌｌ ｅｔ ａｌ．， Ｎａｔｕｒｅ ３８０：６４−６８， １９９６）、およびヒトを含めた霊長類（Ｔｈｏｍｓｏｎ ｅｔ ａｌ．， 米国特許第５，８４３，７８０号，Ｔｈｏｍｓｏｎ ｅｔ ａｌ．， Ｓｃｉｅｎｃｅ ２８２：１１４５−１１４７， １９９５； および Ｔｈｏｍｓｏｎ ｅｔ ａｌ．， Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ ９２：７８４４−７８４８， １９９５）などのいろいろな種の着床前の胚および胚盤胞に由来する。
【０３４４】
これらのタイプの細胞は、多能性である。すなわち、適当な条件下において、それらは、３種類全ての胚葉、すなわち、外胚葉、中胚葉および内胚葉に由来するいろいろな細胞タイプに分化する。培養条件に依り、ＥＳ細胞の試料は、幹細胞として無制限に培養されて、単一試料内でいろいろ異なった細胞タイプに分化させることができるし、またはマクロファージ様細胞、ニューロン細胞、心筋細胞、脂肪細胞、平滑筋細胞、内皮細胞、骨格筋細胞、角化細胞、および好酸球、マスト細胞、赤芽球前駆細胞または巨核球などの造血細胞のような特定の細胞タイプに分化するように支配されることができる。支配された分化は、例えば、Ｋｅｌｌｅｒ ｅｔ ａｌ．， Ｃｕｒｒ． Ｏｐｉｎ． Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ． ７：８６２−６９， １９９５， Ｌｉ ｅｔ ａｌ．， Ｃｕｒｒ． Ｂｉｏｌ． ８：９７１， １９９８， Ｋｌｕｇ ｅｔ ａｌ．， Ｊ． Ｃｌｉｎ． Ｉｎｖｅｓｔ． ９８：２１６−２４，１ ９９６， Ｌｉｅｓｃｈｋｅ ｅｔ ａｌ．， Ｅｘｐ． Ｈｅｍａｔｏｌ． ２３：３２８−３４， １９９５， Ｙａｍａｎｅ ｅｔ ａｌ．， Ｂｌｏｏｄ ９０：３５１６−２３， １９９７， および Ｈｉｒａｓｈｉｍａ ｅｔ ａｌ．， Ｂｌｏｏｄ ９３：１２５３−６３， １９９９ に更に記載されるように、その培養条件において特異的増殖因子またはマトリックス成分を含むことによって達せられる。
【０３４５】
遺伝子修飾に用いられる具体的な胚性幹細胞系は重要ではないが、典型的なネズミＥＳ細胞系には、ＡＢ−１（ＭｃＭａｈｏｎ ａｎｄ Ｂｒａｄｌｅｙ， Ｃｅｌｌ ６２：１０７３−８５， １９９０）、Ｅ１４（Ｈｏｏｐｅｒ ｅｔ ａｌ．， Ｎａｔｕｒｅ ３２６：２９２−９５， １９８７）、Ｄ３（Ｄｏｅｔｓｃｈｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．， Ｊ． Ｅｍｂｒｙｏｌ． Ｅｘｐ． Ｍｏｒｐｈ． ８７：２７−４５， １９８５）、ＣＣＥ（Ｒｏｂｅｒｔｓｏｎ ｅｔ ａｌ．， Ｎａｔｕｒｅ ３２３：４４５−４８， １９８６）、ＲＷ４（Ｇｅｎｏｍｅ Ｓｙｓｔｅｍｓ， Ｓｔ． Ｌｏｕｉｓ， ＭＯ）およびＤＢＡ／１１ａｃＪ（Ｒｏａｃｈ ｅｔ ａｌ．， Ｅｘｐ． Ｃｅｌｌ Ｒｅｓ． ２２１：５２０−２５， １９９５）が含まれる。
【０３４６】
ポリペプチドの製造
本発明によれば、本発明のポリペプチドの製造は、例えば、本発明の一つまたはそれを越えるポリヌクレオチドで形質転換された微生物発現宿主を慣用的な栄養発酵培地中で培養することによって行うことができる。適当な培地の選択は、発現宿主の選択に基づいておよび／または発現構築物の調節必要条件に基づいてよい。このような培地は、当業者に周知である。所望ならば、この培地は、潜在的に混入している他の微生物よりも形質転換された発現宿主に有利な追加の成分を含有してよい。
【０３４７】
したがって、本発明は、更に、ヒトＳＥＰ活性を有するポリペプチドを製造する方法であって、（ａ）配列番号：１または配列番号：５に示されるヌクレオチド配列またはその誘導体、ホモログ、変異体またはフラグメントで宿主細胞を形質転換し；そして（ｂ）その形質転換された宿主細胞を、このポリペプチドの発現に適した条件下で培養する工程を含む方法を提供する。
【０３４８】
本発明は、更に、ヒトＳＥＰ活性を有するポリペプチドを製造する方法であって、（ａ）配列番号：１または配列番号：５に示されるヌクレオチド配列またはその誘導体、ホモログ、変異体またはフラグメントで形質転換された宿主細胞を、このポリペプチドの発現に適した条件下で培養し；そして（ｂ）このポリペプチドを宿主細胞培養物から回収する工程を含む方法に関する。
【０３４９】
本発明は、更に、ヒトＳＥＰ活性を有するポリペプチドを製造する方法であって、（ａ）配列番号：１または配列番号：５に示されるヌクレオチド配列またはその誘導体、ホモログ、変異体またはフラグメントで宿主細胞を形質転換し；（ｂ）この形質転換された宿主細胞を、このポリペプチドの発現に適した条件下で培養し；そして（ｃ）このポリペプチドを宿主細胞培養物から回収する工程を含む方法に関する。
【０３５０】
リボザイム
リボザイムは、ＲＮＡの特異的切断を触媒することができる酵素的ＲＮＡ分子である。リボザイム作用機作は、相補的な標的ＲＮＡへのリボザイム分子の配列特異的ハイブリダイゼーションに続く内ヌクレオチド結合分解性の切断（ｅｎｄｏｎｕｃｌｅｏｌｙｔｉｃ ｃｌｅａｖａｇｅ）を含む。本発明の範囲内にあるのは、ヒトＳＥＰ　ＲＮＡ配列の内ヌクレオチド結合分解性の切断を特異的に且つ効率よく触媒するよう設計されたハンマーヘッドモチーフリボザイム分子である。
【０３５１】
いずれか可能なＲＮＡ標的中の特異的リボザイム切断部位は、次の配列、ＧＵＡ、ＧＵＵおよびＧＵＣが含まれるリボザイム切断部位について標的分子を走査することによって最初に識別される。いったん識別されると、この切断部位を含有する標的遺伝子の領域に該当する１５〜２０リボヌクレオチドの短いＲＮＡ配列を、オリゴヌクレオチド配列を機能不能にすることがありうる二次構造特徴について評価することができる。候補標的の適合性も、リボヌクレアーゼ保護検定を用いて、相補的オリゴヌクレオチドとのハイブリダイゼーションについての接近容易性を調べることによって評価することができる。
【０３５２】
本発明のアンチセンスＲＮＡおよびＤＮＡ両方の分子およびリボザイムは、ＲＮＡ分子の合成について当該技術分野において知られているいずれかの方法によって製造することができる。これらには、固相ホスホルアミダイト化学合成のような、オリゴヌクレオチドを化学合成する技法が含まれる。或いは、ＲＮＡ分子は、アンチセンスＲＮＡ分子をエンコードしているＤＮＡ配列の ｉｎ ｖｉｔｒｏ または ｉｎ ｖｉｖｏ 転写によって生じることができる。このようなＤＮＡ配列は、Ｔ７またはＳＰ６のような適当なＲＮＡポリメラーゼプロモーターと一緒にいろいろなベクター中に包含させることができる。或いは、アンチセンスＲＮＡを構成的にまたは誘導的に合成するアンチセンスｃＤＮＡを、細胞系、細胞または組織中に導入することができる。
【０３５３】
検出
ヒトＳＥＰポリヌクレオチドコーディング配列の存在は、配列番号：１または配列番号：５に示される配列のプローブ、一部分またはフラグメントを用いたＤＮＡ−ＤＮＡまたはＤＮＡ−ＲＮＡハイブリダイゼーションまたは増幅によって検出することができる。核酸増幅に基づく検定は、ヒトＳＥＰ　ＤＮＡまたはＲＮＡを含有する形質転換体を検出するための、ヒトＳＥＰコーディング配列に基づくオリゴヌクレオチドまたはオリゴマーの使用を含む。本明細書中で用いられる“オリゴヌクレオチド”または“オリゴマー”は、少なくとも約１０ヌクレオチドおよび約６０ヌクレオチド程度の、好ましくは、好ましくは、約１５〜３０ヌクレオチド、そしてより好ましくは、プローブまたはアンプリマー（ａｍｐｌｉｍｅｒ）として用いることができる約２０〜２５ヌクレオチドの核酸配列を意味してよい。好ましくは、オリゴヌクレオチドは、配列番号：１または配列番号：５に示されるヌクレオチド配列の３’領域に由来する。
【０３５４】
タンパク質に特異的な多クローン性抗体かまたは単クローン性抗体を用いることによるような、ヒトＳＥＰポリペプチドの発現を検出するおよび測定する種々のプロトコールは、当該技術分野において知られている。例には、酵素結合イムノソルベント検定（ＥＬＩＳＡ）、ラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）および蛍光活性化セルソーティング（ＦＡＣＳ）が含まれる。ヒトＳＥＰポリペプチド上の二つの非干渉性エピトープに反応性の単クローン性抗体を用いる単クローン性二部位免疫検定（ｔｗｏ−ｓｉｔｅ， ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ−ｂａｓｅｄ ｉｍｍｕｎｏａｓｓａｙ）が好適であるが、競合的結合検定を用いてよい。これらおよび他の検定は、特に、Ｈａｍｐｔｏｎ Ｒ ｅｔ ａｌ．（１９９０， Ｓｅｒｏｌｏｇｉｃａｌ Ｍｅｔｈｏｄｓ， Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ， ＡＰＳ Ｐｒｅｓｓ， Ｓｔ Ｐａｕｌ， ＭＮ， ＵＳＡ）および Ｍａｄｄｏｘ ＤＥ ｅｔ ａｌ．（１９８３， Ｊ． Ｅｘｐ． Ｍｅｄ．， １５８：１２１１）に記載されている。
【０３５５】
いろいろな標識および接合技術は、当業者に知られており、種々の核酸およびアミノ酸検定で用いることができる。ヒトＳＥＰポリヌクレオチド配列を検出するための標識ハイブリダイゼーションまたはＰＣＲプローブを生じる手段には、標識ヌクレオチドを用いるオリゴラベリング、ニックトランスレーション、エンドラベリングまたはＰＣＲ増幅が含まれる。或いは、ヒトＳＥＰコーディング配列またはそのいずれか一部分を、ｍＲＮＡプローブの製造のためのベクター中にクローン化してよい。このようなベクターは、当該技術分野において知られているし、市販されており、そしてＴ７、Ｔ３またはＳＰ６のような適当なＲＮＡポリメラーゼおよび標識ヌクレオチドの付加によって ｉｎ ｖｉｔｒｏ でＲＮＡプローブを合成するのに用いることができる。
【０３５６】
Ｐｈａｒｍａｃｉａ Ｂｉｏｔｅｃｈ（Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ， ＮＪ， ＵＳＡ）、Ｐｒｏｍｅｇａ（Ｍａｄｉｓｏｎ， ＷＩ， ＵＳＡ）および ＵＳ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ（Ｃｌｅａｖｅｌａｎｄ， ＯＨ， ＵＳＡ）のような多数の会社は、これら手順のための市販のキットおよびプロトコールを供給している。適当なレポーター分子または標識には、放射性核種、酵素、蛍光剤、化学発光剤または発色剤、並びに基質、補助因子、阻害剤、磁性粒子等が含まれる。このような標識の使用を教示する特許には、ＵＳ−Ａ−３８１７８３７号；ＵＳ−Ａ−３８５０７５２号；ＵＳ−Ａ−３９３９３５０号；ＵＳ−Ａ−３９９６３４５号；ＵＳ−Ａ−４２７７４３７号；ＵＳ−Ａ−４２７５１４９号；およびＵＳ−Ａ−４３６６２４１号が含まれる。更に、組換え免疫グロブリンを、ＵＳ−Ａ−４８１６５６７号に示されるように生じることができる。
【０３５７】
特定の分子の発現を定量する更に別の方法には、ヌクレオチドを放射性標識すること（Ｍｅｌｂｙ ＰＣ ｅｔ ａｌ．， １９９３， Ｊ． Ｉｍｍｕｎｏｌ． Ｍｅｔｈｏｄｓ， Ｖｏｌ １５９，ｐｐ．２３５−２４４）またはビオチニル化すること（Ｄｕｐｌａａ Ｃ ｅｔ ａｌ．， １９９３， Ａｎｎａｌ Ｂｉｏｃｈｅｍ．， Ｖｏｌ ２２９， ｐ．３６）、対照核酸の共増幅、および実験結果を補間する標準曲線が含まれる。多重試料の定量化は、ＥＬＩＳＡフォーマットで検定を実施することによって迅速化することができるが、この場合、目的のオリゴマーは、いろいろな希釈度で与えられ、分光測光または熱量測定応答が迅速な定量化を生じる。
【０３５８】
マーカー遺伝子発現の存在／不存在は、目的の遺伝子も存在するということを示唆するが、その存在および発現は、確かめられるべきである。例えば、ヒトＳＥＰコーディング配列をマーカー遺伝子配列内に挿入する場合、ヒトＳＥＰコーディング領域を含有する組換え細胞は、マーカー遺伝子機能の不存在によって識別することができる。或いは、マーカー遺伝子は、単一プロモーターの制御下にあるヒトＳＥＰコーディング配列と一緒にタンデムに置かれることができる。誘導または選択に応答したマーカー遺伝子の発現は、通常、ヒトＳＥＰの発現も示す。
【０３５９】
或いは、ヒトＳＥＰのコーディング配列を含有し且つヒトＳＥＰコーディング領域を発現する宿主細胞は、当業者に知られている種々の手順によって識別することができる。これら手順には、核酸またはタンパク質の検出および／または定量化のためのメンブラン、溶液またはチップを基剤とする技術を含めた、ＤＮＡ−ＤＮＡまたはＤＮＡ−ＲＮＡハイブリダイゼーションおよびタンパク質バイオアッセイまたは免疫検定技術が含まれるが、これらに制限されるわけではない。
【０３６０】
抗体
本発明のアミノ酸配列は、標準的な技法の使用によるように、そのアミノ酸配列に対する抗体を生じるのに用いることもできる。
【０３６１】
当該技術分野において周知の手順は、ヒトＳＥＰポリペプチドへの抗体の産生に用いることができる。このような抗体には、多クローン性、単クローン性、キメラ、単鎖、ＦａｂフラグメントおよびＦａｂ発現ライブラリーによって生じるフラグメントが含まれるが、これらに制限されるわけではない。中和抗体、すなわち、ヒトＳＥＰポリペプチドの生物学的活性を阻害する抗体は、診断薬および治療薬に特に好適である。
【０３６２】
抗体の産生には、ヤギ、ウサギ、ラット、マウス等を含めた種々の宿主を、免疫原性を保持する阻害剤またはそのいずれか一部分、変異体、ホモログ、フラグメントまたは誘導体またはオリゴペプチドの注射によって免疫感作することができる。宿主の種に依り、種々のアジュバントを用いて免疫学的応答を増加させることができる。このようなアジュバントには、フロイント、水酸化アルミニウムのようなミネラルゲル、およびリゾレシチン、プルロニックポリオール、ポリアニオン、ペプチド、オイルエマルジョン、キーホールリンペットヘモシアニンおよびジニトロフェノールのような界面活性物質が含まれるが、これらに制限されるわけではない。ＢＣＧ（カルメット・ゲラン桿菌（Ｂａｃｉｌｌｉ Ｃａｌｍｅｔｔｅ−Ｇｕｅｒｉｎ））およびコリネバクテリウム・パルヴム（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｐａｒｖｕｍ）は、用いることができる潜在的に有用なヒトアジュバントである。
【０３６３】
アミノ酸配列への単クローン性抗体は、培養中の連続的継代細胞系によって抗体分子を産生させるいずれかの技術を用いて製造することもできる。これらには、Ｋｏｅｈｌｅｒ ａｎｄ Ｍｉｌｓｔｅｉｎ によって最初に記載されたハイブリドーマ技術（１９７５， Ｎａｔｕｒｅ， Ｖｏｌ ２５６，ｐｐ．４９５−４９７）、ヒトＢ細胞ハイブリドーマ技術（Ｋｏｓｂｏｒ ｅｔ ａｌ．，（１９８３）， Ｉｍｍｕｎｏｌ． Ｔｏｄａｙ， Ｖｏｌ ４，ｐ．７２； Ｃｏｔｅ ｅｔ ａｌ．，（１９８３）， Ｐｒｏｃｅｅｄｉｎｇｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ （ＵＳＡ）， Ｖｏｌ ８０，ｐｐ．２０２６−２０３０）およびＥＢＶハイブリドーマ技術（Ｃｏｌｅ ｅｔ ａｌ．，（１９８５）， Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ ａｎｄ Ｃａｎｃｅｒ Ｔｈｅｒａｐｙ， Ａｌａｎ Ｒ Ｌｉｓｓ Ｉｎｃ．， ｐｐ．７７−９６）が含まれるが、これらに制限されるわけではない。更に、“キメラ抗体”の産生のために開発された技術である、適当な抗原特異性および生物学的活性を有する分子を得るためのヒト抗体遺伝子へのマウス抗体遺伝子のスプライシングを用いることができる（Ｍｏｒｒｉｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，（１９８４）， Ｐｒｏｃｅｅｄｉｎｇｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ （ＵＳＡ）， Ｖｏｌ ８１， ｐｐ．６８５１−６８５５； Ｎｅｕｂｅｒｇｅｒ ｅｔ ａｌ．，（１９８４）， Ｎａｔｕｒｅ， Ｖｏｌ ３１２， ｐｐ．６０４−６０８； Ｔａｋｅｄａ ｅｔ ａｌ．， （１９８５）， Ｎａｔｕｒｅ， Ｖｏｌ ３１４， ｐｐ．４５２−４５４）。或いは、単鎖抗体の産生について記載された技術（ＵＳ−Ａ−４９４６７７９号）は、阻害剤特異的単鎖抗体を生じるのに適応することができる。
【０３６４】
抗体は、リンパ球集団において ｉｎ ｖｉｖｏ 産生を引き起こすことによって、または Ｏｒｌａｎｄｉ ｅｔ ａｌ．（１９８９， Ｐｒｏｃｅｅｄｉｎｇｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ （ＵＳＡ）， Ｖｏｌ ８６， ｐｐ．３８３３−３８３７）および Ｗｉｎｔｅｒ Ｇ ａｎｄ Ｍｉｌｓｔｅｉｎ Ｃ（１９９１； Ｎａｔｕｒｅ， Ｖｏｌ ３４９， ｐｐ．２９３−２９９）に開示されたように、極めて特異的な結合性試薬の組換え免疫グロブリンライブラリーまたはパネルをスクリーニングすることによって生じることもできる。
【０３６５】
ヒトＳＥＰへの特異的結合部位を含有する抗体フラグメントを生じることもできる。例えば、このようなフラグメントには、抗体分子のペプシン消化によって生じることができるＦ（ａｂ’）２フラグメント、およびこのＦ（ａｂ’）２フラグメントのジスルフィド架橋を還元させることによって生じることができるＦａｂフラグメントが含まれるが、これらに制限されるわけではない。或いは、Ｆａｂ発現ライブラリーを、所望の特異性での単クローン性Ｆａｂフラグメントの迅速且つ容易な識別を可能にするように構築することができる（Ｈｕｓｅ ＷＤ ｅｔ ａｌ．，（１９８９）， Ｓｃｉｅｎｃｅ， Ｖｏｌ ２５６， ｐｐ．１２７５−１２８１）。
【０３６６】
別の技術は、例えば、ファージが、そのコート表面上でｓｃＦｖフラグメントをいろいろな相補性決定領域（ＣＤＲ）とともに発現する場合のファージディスプレイライブラリーをスクリーニングすることを含む。この技術は、当該技術分野において周知である。
【０３６７】
ヒトＳＥＰ特異的抗体は、ヒトＳＥＰポリペプチドの発現に関連した状態および疾患の診断に有用である。確定された特異性を有する多クローン性抗体かまたは単クローン性抗体を用いる競合的結合検定またはイムノラジオメトリックアッセイの種々のプロトコールは、当該技術分野において周知である。このような免疫検定は、典型的に、ヒトＳＥＰポリペプチドとその特異的抗体（または類似したヒトＳＥＰ結合性分子）との間の複合体の形成、および複合体形成の測定を含む。特異的ヒトＳＥＰタンパク質上の二つの非干渉性エピトープに反応性の単クローン性抗体を用いる単クローン性二部位免疫検定は好適であるが、競合的結合検定を用いてもよい。これら検定は、Ｍａｄｄｏｘ ＤＥ ｅｔ ａｌ．（１９８３， Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ， Ｖｏｌ １５８， ｐ．１２１１）に記載されている。
【０３６８】
抗ヒトＳＥＰ抗体は、異常なペプチドシグナリングを伴う障害、またはヒトＳＥＰの異常な発現を特徴とする他の障害または疾患の診断に有用である。ヒトＳＥＰの診断検定には、ヒト体液、細胞、組織、またはこのような組織の切片または抽出物中でヒトＳＥＰポリペプチドを検出するために抗体および標識を利用する方法が含まれる。本発明のポリペプチドおよび抗体は、修飾してまたは修飾することなく用いることができる。しばしば、これらポリペプチドおよび抗体は、レポーター分子とそれらを共有結合によってかまたは非共有結合によって連結することにより標識されるであろう。いろいろなレポーター分子が当業者に知られている。
【０３６９】
抗体は、生物試料中に存在する本発明のポリペプチドを、（ａ）本発明の抗体を提供し；（ｂ）生物試料をこの抗体と一緒に、抗体−抗原複合体を形成させる条件下でインキュベートし；そして（ｃ）この抗体を含む抗体−抗原複合体が形成されるかどうか確認することを含む方法によって検出する方法で用いることができる。
【０３７０】
これら状況に依って、適当な試料には、精巣または脳のような摘出組織、またはこのような組織に由来する腫瘍性新生物が含まれうる。
本発明の抗体は、固体支持体に結合されてよいし、および／または適当な試薬、対照、取扱い説明書等と一緒に、適当な容器中のキットにパッケージされていてよい。
【０３７１】
検定／識別方法
本発明は、更に、（ヒト細胞のような）細胞中のヒトＳＥＰの存在を検出する検定方法であって、（ａ）このような細胞からの（全ＲＮＡのような）ＲＮＡについて、配列番号：１または配列番号：５に示されるＤＮＡ配列またはその対立遺伝子変異から決定されるようなヒトＳＥＰに特異的である１対のＰＣＲプライマーを用いて逆転写酵素−ポリメラーゼ連鎖反応（ＲＴ−ＰＣＲ）を行い；そして（ｂ）適当なサイズのＰＣＲフラグメントの出現を、アガロースゲル電気泳動などによって検定することを含む方法に関する。
【０３７２】
本発明は、更に、ヒトＳＥＰの活性および／またはその発現に（阻害するまたはそれ以外には修飾するなどの）影響を与える試剤（化合物、それを含む他の物質または組成物など）を識別する方法であって、ヒトＳＥＰまたはそれをコードするヌクレオチド配列をその試剤と接触させた後、ヒトＳＥＰの活性および／またはその発現を測定することを含む方法に関する。
【０３７３】
本発明は、更に、ヒトＳＥＰの活性および／またはその発現に（選択的に阻害するまたはそれ以外には選択的に修飾するなどの）選択的に影響を与える試剤（化合物、それを含む他の物質または組成物など）を識別する方法であって、ヒトＳＥＰまたはそれをコードするヌクレオチド配列をその試剤と接触させた後、ヒトＳＥＰの活性および／またはその発現を測定することを含む方法に関する。
【０３７４】
本発明は、更に、ヒトＳＥＰの活性および／またはその発現に（阻害するまたはそれ以外には修飾するなどの）影響を与える試剤（化合物、それを含む他の物質または組成物など）を識別する方法であって、ヒトＳＥＰの活性および／またはその発現を、（ａ）配列番号：１または配列番号：５に示されるＤＮＡ配列またはその対立遺伝子変異を含む組換えＤＮＡを包含している細胞系、または（ｂ）ヒトＳＥＰを天然に選択的に発現する細胞集団または細胞系中において、その試剤の存在下でまたはその試剤を添加後に測定することを含む方法に関する。好ましくは、ヒトＳＥＰの活性は、上記の検定方法によって決定される。
【０３７５】
本発明は、更に、ヒトＳＥＰの活性および／またはその発現に（選択的に阻害するまたはそれ以外には選択的に修飾するなどの）選択的に影響を与える試剤（化合物、それを含む他の物質または組成物など）を識別する方法であって、ヒトＳＥＰの活性および／またはその発現を、（ａ）配列番号：１または配列番号：５に示されるＤＮＡ配列またはその対立遺伝子変異を含む組換えＤＮＡを包含している細胞系、または（ｂ）ヒトＳＥＰを天然に選択的に発現する細胞集団または細胞系中において、その試剤の存在下でまたはその試剤を添加後に測定することを含む方法に関する。好ましくは、ヒトＳＥＰの活性は、上記の検定方法によって決定される。
【０３７６】
本発明は、更に、ヒトＳＥＰ（またはその誘導体、ホモログ、変異体またはフラグメント）活性またはそれ（その誘導体、ホモログ、変異体またはフラグメントを含めた）をコードするヌクレオチド配列の発現のモジュレーション（好ましくは、特異的モジュレーション）について試剤をスクリーニングする方法であって、（ａ）候補試剤を提供し；（ｂ）ヒトＳＥＰ（またはその誘導体、ホモログ、変異体またはフラグメント）またはそれ（またはその誘導体、ホモログ、変異体またはフラグメント）をコードするヌクレオチド配列とその候補試剤とを、適当な条件下でモジュレーションさせるのに充分な時間混合し；そして（ｃ）その候補試剤がヒトＳＥＰ（またはその誘導体、ホモログ、変異体またはフラグメント）活性またはそれ（またはその誘導体、ホモログ、変異体またはフラグメント）をコードするヌクレオチド配列の発現をモジュレートするかどうか確かめるために、その候補試剤によるヒトＳＥＰ（またはその誘導体、ホモログ、変異体またはフラグメント）またはそれ（またはその誘導体、ホモログ、変異体またはフラグメント）をコードするヌクレオチド配列のモジュレーションを検出する工程を含む方法に関する。
【０３７７】
本発明は、更に、ヒトＳＥＰ（またはその誘導体、ホモログ、変異体またはフラグメント）またはそれ（その誘導体、ホモログ、変異体またはフラグメントを含めた）をコードするヌクレオチド配列との特異的結合親和性について試剤をスクリーニングする方法であって、（ａ）候補試剤を提供し；（ｂ）ヒトＳＥＰ（またはその誘導体、ホモログ、変異体またはフラグメント）またはそれ（またはその誘導体、ホモログ、変異体またはフラグメント）をコードするヌクレオチド配列とその候補試剤とを、適当な条件下で結合させるのに充分な時間混合し；そして（ｃ）その候補試剤がヒトＳＥＰ（またはその誘導体、ホモログ、変異体またはフラグメント）またはそれ（またはその誘導体、ホモログ、変異体またはフラグメント）をコードするヌクレオチド配列に結合するかどうか確かめるために、ヒトＳＥＰ（またはその誘導体、ホモログ、変異体またはフラグメント）またはそれ（またはその誘導体、ホモログ、変異体またはフラグメント）をコードするヌクレオチド配列への候補試剤の結合を検出する工程を含む方法に関する。
【０３７８】
本発明は、更に、ヒトＳＥＰをモジュレートすることができる試剤を識別する方法であって、（ａ）その試剤を、ヒトＳＥＰ（またはその誘導体、ホモログ、変異体またはフラグメント）またはそれ（またはその誘導体、ホモログ、変異体またはフラグメント）をコードするヌクレオチド配列と接触させ；（ｂ）工程（ａ）の混合物を生物活性ペプチドと一緒に、その生物活性ペプチドのタンパク質分解に適した条件下でインキュベートし；（ｃ）生物活性ペプチドタンパク質分解の量を測定し；そして（ｄ）工程（ｃ）の生物活性ペプチドタンパク質分解の量と、その試剤を含むことなくインキュベートされたヒトＳＥＰ（またはその誘導体、ホモログ、変異体またはフラグメント）またはそれ（またはその誘導体、ホモログ、変異体またはフラグメント）をコードするヌクレオチド配列について得られる生物活性ペプチドタンパク質分解の量とを比較し、それによって、その試剤が生物活性ペプチドタンパク質分解に（阻害するまたは選択的に阻害するなどの）影響を与えるかどうか確認する工程を含む方法に関する。
【０３７９】
したがって、本発明の一定の態様において、ヒトＳＥＰまたはその変異体、ホモログ、フラグメントまたは誘導体、および／またはヒトＳＥＰまたはその変異体、ホモログ、フラグメントまたは誘導体を発現する細胞系は、エンドペプチダーゼ活性のモジュレーターとして作用する抗体、ペプチド、または有機または無機分子のような他の試剤について、またはそれらの発現についてスクリーニングし、それによって、生物活性ペプチドレベルをモジュレートすることができる治療薬を識別するのに用いることができる。例えば、ヒトＳＥＰの活性を中和することができる抗ヒトＳＥＰ抗体は、生物活性ペプチドのヒトＳＥＰタンパク質分解を阻害し、それによって、それらのレベルを増加させるのに用いることができる。或いは、組換え発現されたヒトＳＥＰまたはその変異体、ホモログ、フラグメントまたは誘導体、またはヒトＳＥＰまたはその変異体、ホモログ、フラグメントまたは誘導体を発現する細胞系を用いる組合せ化学によって作られるペプチドライブラリーまたは有機ライブラリーのスクリーニングは、生物活性ペプチドのヒトＳＥＰによるタンパク質分解をモジュレートすること（例えば、阻害することまたは選択的に阻害すること）によって機能する治療薬の識別に有用でありうる。合成化合物、天然物、および他の潜在的に生物学的に活性な物質源は、当業者にとって常套的であると考えられる多数の方法でスクリーニングすることができる。例えば、ヒトＳＥＰのＮ末端領域をエンコードしているヌクレオチド配列は、細胞系中で発現させることができるが、これは、ヒトＳＥＰ活性のアゴニストかまたはアンタゴニストであるアロステリックモジュレーターをスクリーニングするのに用いることができる。或いは、ヒトＳＥＰの保存触媒ドメインをエンコードしているヌクレオチド配列を、細胞系中で発現させて、生物活性ペプチドタンパク質分解の阻害剤または選択的阻害剤についてスクリーニングするのに用いることができる。
【０３８０】
ヒトＳＥＰ活性または生物活性ペプチドタンパク質分解を妨げる試験薬の能力は、ヒトＳＥＰレベルまたは生物活性ペプチドレベルを測定することによって決定することができる。
【０３８１】
したがって、本発明は、ヒトＳＥＰまたはその変異体、ホモログ、フラグメントまたは誘導体の生物活性ペプチドタンパク質分解活性をモジュレートすることができる化合物を識別する方法であって、（ａ）その化合物を、ヒトＳＥＰまたはその変異体、ホモログ、フラグメントまたは誘導体と接触させ；（ｂ）工程（ａ）の混合物を生物活性ペプチドと一緒に、その生物活性ペプチドのタンパク質分解に適した条件下でインキュベートし；（ｃ）生物活性ペプチドタンパク質分解の量を測定し；そして（ｄ）工程（ｃ）の生物活性ペプチドタンパク質分解の量と、その化合物を含むことなくインキュベートされたヒトＳＥＰまたはその変異体、ホモログ、フラグメントまたは誘導体について得られる生物活性ペプチドタンパク質分解の量とを比較し、それによって、その化合物が生物活性ペプチドタンパク質分解を刺激するまたは阻害するかどうか決定する工程を含む方法に関する。この方法の一つの態様において、フラグメントは、ヒトＳＥＰのＮ末端領域からであってよく、ヒトＳＥＰのアロステリックモジュレーターを識別する方法を提供する。本発明のもう一つの態様において、このフラグメントは、ヒトＳＥＰのカルボキシ末端領域からであってよく、生物活性ペプチドタンパク質分解の阻害剤または選択阻害剤を識別する方法を提供する。
【０３８２】
これら生物活性ペプチドは、完全長であってよいしまたはそのフラグメントであってよく、組換えによって、または好ましくは、合成によって生じることができる。好ましくは、これら生物活性ペプチドは、ヒトＳＥＰによってモジュレートされる（好ましくは、タンパク質分解／加水分解によって切断される）ことができる低分子量合成ペプチドである。より好ましくは、これら合成ペプチドを標識する（好ましくは、蛍光標識、より好ましくは、本明細書中に記載のＦＲＥＴ検定で用いることができるような分子内消光性蛍光原性色素で蛍光標識する）。
【０３８３】
ヒトＳＥＰは、生物活性ペプチド活性を調節することおよび／または生物学的に不活性なペプチドのそれらの活性型へのタンパク質分解に関与しうるので、上記の“生物活性ペプチド（類）”（および同種のもの）への言及は、これら言及が必要な変更を加えて解釈するためにある場合について、適宜、“生物学的に不活性なペプチド（類）”（および同種のもの）への言及を意味するとみなすこともできる。例えば、ヒトＳＥＰ活性の阻害が、増加したレベルの生物活性ペプチド（類）をもたらすかもしれない場合、このような阻害は、更に、または代わりに、増加したレベルの生物学的に不活性なペプチド（類）をもたらし、それによって、それらの“活性型”のペプチド（類）の減少したレベルをもたらすかもしれない。
【０３８４】
ヒトＳＥＰポリペプチド、その免疫原性フラグメントまたはそのオリゴペプチドは、種々の薬物スクリーニング技術のいずれにおいても治療的化合物をスクリーニングするのに用いることができる。このような試験で用いられるポリペプチドは、溶液中でフリーであってよいし、固体支持体に固着されていてよいし、細胞表面上にあってもよいし、または細胞内に位置していてよい。活性の消滅またはヒトＳＥＰポリペプチドと試験される試剤との間の結合性複合体の形成は、測定することができる。
【０３８５】
したがって、本発明は、ヒトＳＥＰまたはその発現、またはその一部分またはその変異体、ホモログ、フラグメントまたは誘導体のモジュレーション（好ましくは、特異的結合親和性または阻害のような特異的モジュレーション）について一つまたは複数の化合物をスクリーニングする方法であって、一つまたは複数の化合物を提供し；ヒトＳＥＰまたはそれをコードするヌクレオチド配列またはその一部分またはその変異体、ホモログ、フラグメントまたは誘導体と、一つまたは複数の化合物各々とを、適当な条件下でモジュレーションさせるのに充分な時間混合し；そして例えば、（ｉ）複数の化合物各々へのヒトＳＥＰ、またはその一部分またはその変異体、ホモログ、フラグメントまたは誘導体の結合を検出し、それによって、ヒトＳＥＰまたはそれをコードするヌクレオチド配列をモジュレートする一つまたは複数の化合物を識別すること；または（ｉｉ）複数の化合物各々によるヒトＳＥＰ、またはその一部分またはその変異体、ホモログ、フラグメントまたは誘導体の阻害を検出し、それによって、ヒトＳＥＰまたはそれをコードするヌクレオチド配列をモジュレートする（阻害する）一つまたは複数の化合物を識別することを含む方法に関する。このような検定において、これら複数の化合物は、当業者に知られている組合せ化学技術によって生じることができる。
【０３８６】
薬物スクリーニングのためのもう一つの技法は、ヒトＳＥＰポリペプチドへの適当な結合親和性を有する化合物の高処理スクリーニング（ＨＴＳ）に提供され、１９８４年９月１３日公開の Ｇｅｙｓｅｎ， ＷＯ８４／０３５６４号に詳細に記載された方法に基づいている。要約すると、多数の異なる低分子量ペプチド試験化合物を、プラスチックピンまたは何か他の表面のような固体支持体上で合成する。これらペプチド試験化合物を、ヒトＳＥＰフラグメントと反応させ、洗浄する。次に、結合したヒトＳＥＰを、当該技術分野において周知の方法を適当に適応することなどによって検出する。精製されたヒトＳＥＰは、上述の薬物スクリーニング技術で用いるためにプレート上に直接的にコーティングすることもできる。或いは、非中和抗体を、そのペプチドを捕捉し且つそれを固体支持体上に固定するために用いることができる。
【０３８７】
本発明は、更に、ヒトＳＥＰを結合することができる中和抗体が、ヒトＳＥＰを結合することについて試験化合物と特異的に競合する競合的薬物スクリーニング検定の使用を包含する。この方式では、これら抗体は、一つまたはそれを越える抗原決定基をヒトＳＥＰと共有するいずれかのペプチドの存在を検出するのに用いることができる。
【０３８８】
本発明の検定方法は、高処理スクリーニング（ＨＴＳ）であってよい。この点で、ＷＯ８４／０３５６４号の教示は、本発明のヒトＳＥＰに適応することができる。
【０３８９】
ＵＳ−Ａ−５７３８９８５号の教示は、本発明の検定方法に適応することができる。
試剤
本発明は、更に、本発明の検定方法および識別方法によって識別される一つまたはそれを越える試剤を提供する。
【０３９０】
本発明の試剤は、例えば、有機化合物または無機化合物でありうる。この試剤は、例えば、配列番号：１または配列番号：５に示される配列の全部または一部分についてアンチセンスであるヌクレオチド配列でありうる。好ましくは、この試剤は、ＳＥＰ活性のモジュレーター、より好ましくは、ＳＥＰ阻害剤（ＳＥＰｉ）または選択的ＳＥＰｉであろう。
【０３９１】
ＳＥＰｉは、ＳＥＰの酵素活性を阻害する、すなわち、それが基質ペプチド、ポリペプチドまたはタンパク質を（タンパク質分解によって）切断するのを妨げる化合物である。
【０３９２】
本発明は、更に、薬剤として用いるための本発明の試剤（またはその薬学的に許容しうる塩またはその薬学的に許容しうる溶媒和化合物さえも）または前述のいずれかを含有する医薬組成物を提供する。
【０３９３】
本発明は、更に、泌尿生殖器系、心臓血管系、神経系および内分泌系のいずれか一つまたはそれを越えるものにおける、ヒトＳＥＰ活性に（阻害する、選択的に阻害する、モジュレートするまたは拮抗するなどの）影響を与える試剤の使用に関する。
【０３９４】
診断薬
本発明は、更に、ヒトＳＥＰポリヌクレオチド配列の検出のための診断用組成物を提供する。この診断用組成物は、配列番号：１または配列番号：５に示される配列またはその変異体、ホモログ、フラグメントまたは誘導体、または配列番号：１または配列番号：５に示されるヌクレオチド配列またはその対立遺伝子変異の全部または一部分にハイブリッド形成することができる配列を含んでいてよい。
【０３９５】
疾患の診断のための基準を提供するには、ヒトＳＥＰポリペプチド発現からの正常値または標準値を決定すべきである。これは、動物かまたはヒトである正常対象から得られる体液または細胞抽出物（例えば、精巣から）と、ヒトＳＥＰポリペプチドへの抗体とを、当該技術分野において周知である複合体形成に適した条件下で混合することによって達せされる。標準的な複合体形成の量は、既知量の抗体が既知濃度の精製ヒトＳＥＰポリペプチドと混合されている陽性対照の希釈列にそれを比較することによって定量することができる。次に、正常な試料から得られる標準値を、ヒトＳＥＰポリペプチド発現に関係がある障害または疾患に潜在的に罹患している対象からの試料により得られる値と比較することができる。標準値と対象値との間の偏差は、その疾患状態の存在を確定する。
【０３９６】
ヒトＳＥＰポリヌクレオチドまたはそのいずれか一部分は、診断用化合物および／または治療的化合物の基準を提供することができる。診断目的には、ヒトＳＥＰポリヌクレオチド配列を用いて、ヒトＳＥＰ活性が関連していることがありうる状態、障害または疾患における遺伝子発現を検出し且つ定量することができる。
【０３９７】
ヒトＳＥＰをエンコードしているポリヌクレオチド配列は、ヒトＳＥＰの発現に起因する疾患の診断に用いることができる。例えば、ヒトＳＥＰをエンコードしているポリヌクレオチド配列は、ヒトＳＥＰ発現の異常を検出するために、血清、滑液または腫瘍生検のような、生検または剖検からの組織または体液のハイブリダイゼーション検定またはＰＣＲ検定で用いることができる。このような定性的または定量的方法の形態には、サザンまたはノーザン分析、ドットブロットまたは他のメンブランを基剤とする技術；ＰＣＲ技術；ディップスティック、ピンまたはチップ技術；およびＥＬＩＳＡまたは他の多重試料フォーマット技術が含まれうる。これら技術は全て、当該技術分野において周知であり、実際上、多数の市販の診断用キットの基準である。
【０３９８】
このような検定は、具体的な治療処置計画の効力を評価するために調整されてよいし、動物実験、臨床試験、または個々の患者の処置を監視する場合に用いることができる。疾患の診断用の基準を提供するためには、ヒトＳＥＰ発現についての正常または標準のプロフィールを決定すべきである。これは、動物かまたはヒトである正常対象から得られる体液または細胞抽出物と、ヒトＳＥＰまたはその一部分とを、ハイブリダイゼーションまたは増幅に適した条件下で混合することによって達せされる。標準的なハイブリダイゼーションは、正常対象について得られる値と、既知量の精製ヒトＳＥＰが用いられている同様の実験で行われる陽性対照の希釈列とを比較することによって定量することができる。正常な試料から得られる標準値は、ヒトＳＥＰコーディング配列の発現に関係がある障害または疾患に潜在的に罹患している対象からの試料により得られる値と比較することができる。標準値と対象値との間の偏差は、その疾患状態の存在を確定する。疾患が確定された場合、既存の治療薬を投与し、そして処置プロフィールまたは値を生じることができる。最終的には、その検定を一定の基準で繰り返して、それら値が正常または標準のパターンに向かって進行するまたは復帰するかどうか評価することができる。成功した処置プロフィールは、数日間または数ヶ月間にわたる処置の効力を示すのに用いることができる。
【０３９９】
本発明は、更に、例えば、疾患状態におけるヒトＳＥＰレベルを診断用に検出し且つ定量するのに用いることができる抗ヒトＳＥＰ抗体を生じるための、ヒトＳＥＰポリペプチド、またはその変異体、ホモログ、フラグメントまたは誘導体の使用に関する。
【０４００】
本発明は、更に、正対照として用いることができる精製されたヒトＳＥＰおよび抗ヒトＳＥＰ抗体を含む、細胞および組織中のヒトＳＥＰの検出のための診断用検定およびキットに関する。このような抗体は、ヒトＳＥＰタンパク質の発現、またはその欠失体、変異体、ホモログ、フラグメントまたは誘導体の発現に関係があるいずれかの疾患状態または状態を検出するための、溶液、メンブランまたは組織を基剤とする技術で用いることができる。
【０４０１】
プローブ
本発明のもう一つの側面は、ヒトＳＥＰコーディング領域または対立遺伝子などの密接に関係した分子をエンコードしている、ゲノム配列を含めたポリヌクレオチド配列を検出することができる核酸ハイブリダイゼーションまたはＰＣＲプローブの規定である。プローブの特異性、すなわち、それが高度に保存された、保存されたまたは非保存の領域またはドメインに由来するかどうか、およびハイブリダイゼーションまたは増幅の（高、中または低）ストリンジェンシーは、そのプローブが、天然に存在するヒトＳＥＰコーディング配列または関係のある配列だけを識別するかどうか決定するであろう。関係のある核酸配列の検出のためのプローブは、３’領域のようなヒトＳＥＰファミリーメンバーの保存されたまたは高度に保存されたヌクレオチド領域から選択され、しかもこのようなプローブは、縮重プローブのプールで用いることができる。同一ヌクレオチド配列、または最大の特異性が望まれる場所の検出ために、核酸プローブは、非保存ヌクレオチド領域またはヒトＳＥＰポリヌクレオチドの独特の領域から選択される。本明細書中で用いられる“非保存ヌクレオチド領域”という用語は、本明細書中に開示されるヒトＳＥＰコーディング配列に独特であり、既知のＳＥＰのような関係のあるファミリーメンバーに存在しないヌクレオチド領域を意味する。
【０４０２】
ＰＣＲは、ＵＳ−Ａ−４６８３１９５号、ＵＳ−Ａ−４８００１９５号およびＵＳ−Ａ−４９６５１８８号に記載のように、ヒトＳＥＰ配列に基づくオリゴヌクレオチドについて更に別の使用を提供する。このようなオリゴマーは、概して、化学合成されるが、それらは、酵素的に生じてよいしまたは組換え体源から製造されてよい。オリゴマーは、概して、二つのヌクレオチド配列、すなわち、特定の遺伝子または状態の識別に最適にされた条件下で用いられるセンス配向（５’→３’）のものおよびアンチセンス配向（３’←５’）のものを含む。同じ二つのオリゴマー、すなわち、ｎｅｓｔｅｄ セットのオリゴマー、またはオリゴマーの縮重プールさえも、密接に関係したＤＮＡまたはＲＮＡ配列の検出および／または定量化のために、低いストリンジェント条件下で用いることができる。
【０４０３】
ヒトＳＥＰの核酸配列は、内因性ゲノム配列をマッピングするために、前に記載されたようなハイブリダイゼーションプローブを生じるのに用いることもできる。この配列は、周知の技法を用いて、特定の染色体にまたはその染色体の特異的領域にマッピングすることができる。これらには、染色体拡大（ｃｈｒｏｍｏｓｏｍａｌ ｓｐｒｅａｄ）への ｉｎ ｓｉｔｕ ハイブリダイゼーション（Ｖｅｒｍａ ｅｔ ａｌ．（１９８８） Ｈｕｍａｎ Ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｓ： Ａ Ｍａｎｕａｌ ｏｆ Ｂａｓｉｃ Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ， Ｐｅｒｇａｍｏｎ Ｐｒｅｓｓ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ Ｃｉｔｙ， ＵＳＡ）、フローソーティド染色体調製（ｆｌｏｗ−ｓｏｒｔｅｄ ｃｈｒｏｍｏｓｏｍａｌ ｐｒｅｐａｒａｔｉｏｎｓ）、または酵母人工染色体（ＹＡＣｓ）、細菌人工染色体（ＢＡＣｓ）、細菌ＰＩ構築または単一染色体ｃＤＮＡライブラリーのような人工染色体構築が含まれる。
【０４０４】
染色体標品の ｉｎ ｓｉｔｕ ハイブリダイゼーション、および確定された染色体マーカーを用いる連鎖分析のような物理的マッピング技術は、遺伝子地図を拡張する場合に非常に貴重である。遺伝子地図の例は、Ｓｃｉｅｎｃｅ（１９９５； ２７０：４１０ｆ および １９９４； ２６５：１９８１ｆ）に見出されうる。しばしば、特定のヒト染色体の数またはアームが知られていないとしても、別の哺乳動物種の染色体上の遺伝子の配置が、関連したマーカーを示すことがありうる。新しい配列は、物理的マッピングによって、染色体アームまたはその一部分に割り当てることができる。これは、ポジショナルクローニングまたは他の遺伝子発見技術を用いて疾患遺伝子について探索している研究者に貴重な情報を提供する。毛細管拡張性運動失調（ＡＴ）などの疾患または症候群が、特定のゲノム領域への遺伝子連鎖によって大まかに位置決定されると、例えばＡＴが１１ｑ２２−２３（Ｇａｔｔｉ ｅｔ ａｌ，（１９８８）， Ｎａｔｕｒｅ， ３３６：５７７−５８０）、その領域へのいずれかの配列マッピングは、更なる研究のための関連遺伝子または調節遺伝子を呈するだろう。本発明のヌクレオチド配列は、正常個体、保持個体または罹患した個体の間で、転座、逆位等による染色体位置の相違を検出するのに用いることもできる。
【０４０５】
医薬
本発明は、更に、ヒトＳＥＰ活性のための処置を必要としている個体を処置するための医薬組成物であって、この活性に（阻害するまたは選択的に阻害するなどの）影響を与える試剤の治療的有効量および薬学的に許容しうる担体、希釈剤または賦形剤を含む組成物を提供する。
【０４０６】
したがって、本発明は、更に、本発明の試剤（本発明のヌクレオチド配列の発現パターンまたはその発現産物の活性をモジュレートすることができる試剤および／または本発明による検定によって識別される試剤）を含む医薬組成物を包含する。この点で、具体的にはヒト療法について、本発明の試剤は単独で投与することができるにもかかわらず、それらは、概して、予定の投与経路および標準的な医薬慣例に関して選択される医薬担体、賦形剤または希釈剤との混合物で投与されるであろう。
【０４０７】
例として、本発明の医薬組成物中では、本発明の試剤を、いずれか適当な１種類または複数の結合剤、１種類または複数の滑沢剤、１種類または複数の懸濁化剤、１種類または複数のコーティング剤、または１種類または複数の可溶化剤と混合してよい。
【０４０８】
概して、本発明の試剤の治療的に有効な１日の経口または静脈内用量は、０．０１〜５０ｍｇ／ｋｇ（処置される対象の体重）、好ましくは、０．０１〜２０ｍｇ／ｋｇ、より好ましくは、０．１〜２０ｍｇ／ｋｇの範囲であると考えられる。本発明の試剤は、静脈内注入によって、０．００１〜１０ｍｇ／ｋｇ／時の範囲であると考えられる用量で投与されてもよい。
【０４０９】
したがって、本発明は、ヒトＳＥＰ活性のための処置を必要としている個体を処置する方法であって、この個体に有効量の本発明の医薬組成物を投与することを含む方法を提供する。
【０４１０】
典型的には、医師が、個々の患者に最も適している実際用量を決定するであろうが、それは、具体的な患者の年齢、体重、性別および応答により異なるであろう。上の投薬量は、平均的な場合を代表するものである。当然ながら、より高いまたはより低い投薬量範囲が望ましい個々の場合がありうるし、そのようなものは本発明の範囲内である。
【０４１１】
適当な場合、これら医薬組成物は、吸入によって；坐剤または膣坐剤の形で；局所には、ローション剤、液剤、クリーム剤、軟膏剤または散布剤の形で；皮膚パッチの使用によって；経口には、デンプンまたはラクトースのような賦形剤を含有する錠剤の形で；または単独でかまたは賦形剤との混合物でのカプセル剤または小卵剤で；または着香剤または着色剤を含有するエリキシル剤、液剤または懸濁剤の形で投与することができるし、またはそれらは、非経口によって、例えば、空洞内、静脈内、筋肉内または皮下に注射することができる。非経口投与には、これら組成物は、他の物質、例えば、その溶液を血液と等張にさせる充分な塩類または単糖類を含有してよい滅菌水性液剤の形で最もよく用いることができる。口腔または舌下投与には、これら組成物は、慣用法で製剤化することができる錠剤または口中錠の形で投与してよい。
【０４１２】
対象（患者など）への経口、非経口、口腔および舌下投与について、本発明の試剤の１日投薬レベルは、典型的には、１０〜５００ｍｇ（１回または分割用量で）であってよい。したがって、および例として、錠剤またはカプセル剤は、適宜、単回で、または一度に２個またはそれを越えて投与するのに、５〜１００ｍｇの活性成分を含有してよい。本発明の試剤を徐放性製剤中で投与することも可能である。
【０４１３】
ある用途には、概して、ヒトの場合、本発明の試剤の経口投与が好ましい経路であり、最も好都合であり、いくつかの場合には、空洞内（ｉ．ｃ．）投与に関連するような他の投与経路に関連した欠点を回避することができる。レシピエントが、嚥下障害または経口投与後の薬物吸収の欠陥を患っている状況では、薬物を非経口投与してよい。
【０４１４】
獣医学的使用について、本発明の試剤は、典型的に、通常の獣医学慣例にしたがって適当に許容しうる製剤として投与され、そして獣医外科医が、具体的な動物に最も適当である投薬計画および投与経路を決定するであろう。しかしながら、ヒト処置の場合と同様、獣医学的処置のために試剤を単独で投与することは可能でありうる。
【０４１５】
典型的に、これら医薬組成物は、ヒトまたは動物使用のためであってよく、いずれか１種類またはそれを越える薬学的に許容しうる希釈剤、担体または賦形剤を含むであろう。医薬担体、賦形剤または希釈剤の選択肢は、予定の投与経路および標準的な医薬慣例に関して選択することができる。上に示されたように、これら医薬組成物は、担体、賦形剤または希釈剤として、またはそれに加えて、いずれか適当な１種類または複数の結合剤、１種類または複数の滑沢剤、１種類または複数の懸濁化剤、１種類または複数のコーティング剤、または１種類または複数の可溶化剤を含んでよい。
【０４１６】
本発明のいくつかの態様において、これら医薬組成物は、本発明の検定によってスクリーニングされた試剤；配列表または図に示される配列であって、その誘導体、フラグメント、ホモログまたは変異体を含めたもの、または配列番号：１または配列番号：５に示されるヌクレオチド配列にハイブリッド形成することができる配列のいずれか一つと相互作用することができる試剤の内の一つまたはそれを越えるものを含むであろう。
【０４１７】
本発明の範囲内に含まれるのは、ヒトＳＥＰ　ｍＲＮＡを不安定にするように機能するまたはヒトＳＥＰの翻訳を阻害するオリゴヌクレオチド配列、アンチセンスＲＮＡおよびＤＮＡ分子、およびリボザイムである。このようなヌクレオチド配列は、生物活性ペプチドのレベルを増加させることが好ましいと考えられる状態で用いることができる。
【０４１８】
ヒトＳＥＰアンチセンス分子は、例えば、増加したヒトＳＥＰ活性に関係した種々の異常な状態の予防および／または処置のための基準を提供することができる。
【０４１９】
ヒトＳＥＰ核酸アンチセンス分子は、生物活性ペプチドレベルを上昇させることが好ましいと考えられる状態においてヒトＳＥＰの活性を阻止するのに用いることができる。
【０４２０】
レトロウイルス、アデノウイルス、ヘルペスまたはワクシニアウイルスに由来するまたは種々の細菌プラスミドに由来する発現ベクターは、標的細胞集団への組換えヒトＳＥＰセンスまたはアンチセンス分子の送達に用いることができる。当業者に周知である方法を用いて、ヒトＳＥＰを含有する組換えベクターを構築することができる。或いは、組換えヒトＳＥＰを、リポソームで標的細胞に送達することができる。
【０４２１】
完全長ｃＤＮＡ配列および／またはその調節成分は、研究者が遺伝子機能のセンス（Ｙｏｕｓｓｏｕｆｉａｎ Ｈ ａｎｄ Ｈ Ｆ Ｌｏｄｉｓｈ，（１９９３）， Ｍｏｌ． Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ．， １３：９８−１０４）またはアンチセンス（Ｅｇｕｃｈｉ ｅｔ ａｌ，（１９９１）， Ａｎｎｕａｌ Ｒｅｖ． Ｂｉｏｃｈｅｍ．， ６０：６３１−６５２）研究においてヒトＳＥＰを手段として用いることを可能にする。ゲノムＤＮＡから得られるｃＤＮＡまたは制御配列から設計されるオリゴヌクレオチドは、ｉｎ ｖｉｔｒｏ または ｉｎ ｖｉｖｏ で発現を阻害するのに用いることができる。このような技法は、現在、当該技術分野において周知であり、センスまたはアンチセンスオリゴヌクレオチドまたはより大きいフラグメントを、コーディング領域または制御領域に沿ったいろいろな位置から設計することができる。適当なオリゴヌクレオチドは、２０ヌクレオチドの長さでありうるが、これを用いて、ヒトＳＥＰ配列または密接に関係した分子をヒトライブラリーから単離することができる。
【０４２２】
更に、ヒトＳＥＰ発現は、エンドペプチダーゼ活性を阻止することによって生物活性ペプチドレベルを増加させることが好ましいと考えられる状態において、高レベルのヒトＳＥＰフラグメントを発現する発現ベクターで細胞または組織をトランスフェクションすることによってモジュレートすることができる。このような構築物は、翻訳できないセンスまたはアンチセンス配列を含む細胞を溢れさせることがありうる。ＤＮＡ中への組込みが不存在の場合でも、このようなベクターは、そのベクターの全コピーが内因性ヌクレアーゼによって無能力にされるまで、ＲＮＡ分子を転写し続けることがありうる。このような一過性発現は、非複製性ベクターについては１ヶ月またはそれを越える間、および適当な複製要素がそのベクター系の一部分である場合はなお一層長い間持続することがありうる。
【０４２３】
ヒトＳＥＰは、生物活性ペプチド活性を調節することおよび／または生物学的に不活性なペプチドのそれらの活性型へのタンパク質分解に関与しうるので、上記の“生物活性ペプチド（類）”（および同種のもの）への言及は、これら言及が必要な変更を加えて解釈するためにある場合について、適宜、“生物学的に不活性なペプチド（類）”（および同種のもの）への言及を意味するとみなすこともできる。例えば、ヒトＳＥＰ活性の阻害が、増加したレベルの生物活性ペプチド（類）をもたらすかもしれない場合、このような阻害は、更に、または代わりに、増加したレベルの生物学的に不活性なペプチド（類）をもたらし、それによって、それらの“活性型”のペプチド（類）の減少したレベルをもたらすかもしれない。
【０４２４】
遺伝子発現の修飾は、プロモーター、エンハンサーおよびイントロンのような、ヒトＳＥＰ遺伝子の制御領域へのアンチセンス配列を設計することによって得ることができる。
【０４２５】
転写開始部位、例えば、リーダー配列の−１０〜＋１０の領域に由来するオリゴヌクレオチドが好適である。アンチセンスＲＮＡおよびＤＮＡ分子は、転写物がリボソームに結合するのを妨げることによってｍＲＮＡの翻訳を阻止するように設計することもできる。同様に、阻害は、“三重らせん”塩基対合としても知られる Ｈｏｇｅｂｏｏｍ 塩基対合法を用いて行うことができる。三重らせん対合は、ポリメラーゼ、転写因子または調節分子の結合のために充分に開く二重らせんの能力に影響する。
【０４２６】
したがって、本発明は、本発明の試剤（またはその薬学的に許容しうる塩またはその薬学的に許容しうる溶媒和化合物さえも）を薬学的に許容しうる希釈剤、賦形剤または担体と一緒に含む医薬組成物を提供する。
【０４２７】
この医薬組成物は、獣医学的（すなわち、動物）使用またはヒト使用のためでありうる。
したがって、本発明は、更に、ヒトＳＥＰタンパク質（アンチセンス核酸配列を含めた）の阻害剤またはアンタゴニストの有効量を、薬学的に許容しうる希釈剤、担体または賦形剤（それらの組合せを含めた）との混合物で含む医薬組成物に関する。
【０４２８】
本発明は、また更に、医薬組成物であって、ヒトＳＥＰポリヌクレオチド配列、ヒトＳＥＰアンチセンス分子、ヒトＳＥＰポリペプチド、タンパク質、ペプチド、または阻害剤、選択的阻害剤、アンタゴニスト（抗体を含めた）またはアゴニストのようなヒトＳＥＰ活性の有機モジュレーターの全部または一部分を単独で、または安定化用化合物のような少なくとも１種類の他の試剤との組合せで含んでよく、しかも生理食塩水、緩衝化生理食塩水、デキストロースおよび水が含まれるがこれに制限されないいずれかの滅菌の生体適合性医薬担体中で投与されてよい医薬組成物に関する。
【０４２９】
医薬組合せ
本発明の医薬組成物は、サイクリックＧＭＰの増強剤またはエンハンサー（ホスホジエステラーゼ５型阻害剤、例えば、Ｓｉｌｄｅｎａｆｉｌ、または酸化窒素ドナー、または酸化窒素前駆体、例えば、Ｌ−アルギニナーゼなど）および／または中枢作用性製剤（例えば、アポモルフィンまたはメラノタンＩＩ（ｍｅｌａｎｏｔａｎ ＩＩ）のようなドーパミンレセプターアゴニストまたはメラノコルチン（ｍｅｌａｎｏｃｏｒｔｉｎ）レセプターアゴニスト）などの１種類またはそれを越える他の薬学的活性剤と組み合わせて用いてよい。アポモルフィンの製剤としての使用についての教示は、ＵＳ−Ａ−５９４５１１７号に見出されうる。その具体的な文書において、アポモルフィンは舌下に送達される。
【０４３０】
更に、または代わりに、本発明の医薬組成物は、１種類またはそれを越える中性エンドペプチダーゼ（ＮＥＰ）阻害剤（ＮＥＰｉ）、１種類またはそれを越えるＰＤＥ５阻害剤（ＰＤＥ５ｉ）（例えば、シルデナフィル（ｓｉｌｄｅｎａｆｉｌ）（Ｐｆｉｚｅｒ）、バルデナフィル（ｖａｒｄｅｎａｆｉｌ）（Ｂａｙｅｒ ＢＡ３８−９４５６）およびＩＣ３５１（Ｃｉａｌｉｓ， Ｉｃｏｓ Ｌｉｌｌｙ））、１種類またはそれを越えるＮＰＹレセプターアンタゴニスト、１種類またはそれを越えるＰＤＥ２型阻害剤、１種類またはそれを越える酸化窒素（ＮＯ）ドナー（例えば、ＮＭＩ−９２１）、１種類またはそれを越えるドーパミンレセプターアゴニスト（例えば、アポモルフィン、Ｕｐｒｉｍａ、Ｉｘｓｅｎｅ）、１種類またはそれを越えるメラノコルチンレセプターアゴニスト（例えば、Ｍｅｌａｎｏｔａｎ ＩＩまたはＰＴ１４）、１種類またはそれを越えるカリウムチャンネルオープナー（例えば、ＫＡＴＰチャンネルオープナー（例えば、ミノキシジル、ニコランジル（ｎｉｃｏｒａｎｄｉｌ））および／またはカルシウム活性化カリウムチャンネルオープナー（例えば、ＢＭＳ−２０４３５２））、１種類またはそれを越えるα１−アドレノセプターアンタゴニスト（例えば、フェントラミン、Ｖａｓｏｆｅｍ、Ｖａｓｏｍａｘ）、１種類またはそれを越えるＶＩＰレセプターアゴニストまたはＶＩＰ類似体（例えば、Ｒｏ−１２５−１５３３）またはＶＩＰフラグメント、１種類またはそれを越えるα−アドレノセプターアンタゴニストとＶＩＰの組合せ（例えば、Ｉｎｖｉｃｏｒｐ、Ａｖｉｐｔａｄｉｌ）、１種類またはそれを越えるα２−アドレノセプターアンタゴニスト（例えば、ヨヒンビン）、１種類またはそれを越えるエストロゲン、エストロゲンおよびメドロキシプロゲステロンまたは酢酸メドロキシプロゲステロン（ＭＰＡ）、またはエストロゲンおよびメチルテストステロンホルモン置換療法薬（例えば、ＨＲＴ、特に、Ｐｒｅｍａｒｉｎ、Ｃｅｎｅｓｔｉｎ、Ｏｅｓｔｒｏｆｅｍｉｎａｌ、Ｅｑｕｉｎ、Ｅｓｔｒａｃｅ、Ｅｓｔｒｏｆｅｍ、Ｅｌｌｅｓｔｅ、Ｓｏｌｏ、Ｅｓｔｒｉｎｇ、Ｅａｓｔｒａｄｅｒｍ、Ｅａｓｔｒａｄｅｒｍ ＴＴＳ、Ｅａｓｔｒａｄｅｒｍ Ｍａｔｒｉｘ、Ｄｅｒｍｅｓｔｒｉｌ、Ｐｒｅｍｐｈａｓｅ、Ｐｒｅｍｐｒｏ、Ｐｒｅｍｐａｋ、Ｐｒｅｍｉｑｕｅ、Ｅｓｔｒａｔｅｓｔ、Ｅｓｔｒａｔｅｓｔ ＨＳ、Ｔｉｂｏｌｏｎｅ）、１種類またはそれを越えるテストステロン置換薬（ＤＨＥＡ（デヒドロアンドロステンジオン）、テストステロン（Ｔｏｓｔｒｅｌｌｅ）またはテストステロンインプラント（Ｏｒｇａｎｏｎ）を含めた）、１種類またはそれを越えるテストステロン／エストラジオール薬、１種類またはそれを越えるエストロゲンアゴニスト（例えば、Ｌａｓｏｆｏｘｉｆｅｎｅ）、１種類またはそれを越えるセロトニンレセプターアゴニストまたはアンタゴニスト（例えば、５ＨＴ１Ａ、５ＨＴ２Ｃ、５ＨＴ２Ａおよび５ＨＴ３レセプターアゴニストおよびアンタゴニスト；ＷＯ００／２８９９３号に記載の）、１種類またはそれを越えるプロスタノイドレセプターアゴニスト（例えば、Ｍｕｓｅ、アルプロスタジル、ミソプロストール）、１種類またはそれを越えるプリン作動性レセプターアゴニスト（特に、Ｐ２Ｙ２およびＰ２Ｙ４）、または１種類またはそれを越える抗うつ薬（例えば、ビュープロピオン（Ｗｅｌｌｂｕｔｒｉｎ）、ミラタザピン（ｍｉｒｒａｔａｚａｐｉｎｅ）、ネファゾドン（ｎｅｆａｚｏｄｏｎｅ））と組み合わせて用いてよい。
【０４３１】
好ましくは、上記のこのような組合せで用いられる本発明のこの医薬組成物は、ＳＥＰｉである。本発明の好ましい組合せは、ＳＥＰｉ＋ＮＥＰｉおよびＳＥＰｉ＋ＰＤＥ５ｉ、具体的には、ＳＥＰｉ＋ Ｓｉｌｄｅｎａｆｉｌ である。
【０４３２】
一般的な方法の参照
概して、本明細書中に述べられる技術は、当該技術分野において周知であるが、具体的には、Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．， Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ， Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ （１９８９） および Ａｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．， Ｓｈｏｒｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ （１９９０） ４ｔｈ Ｅｄ， Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ， Ｉｎｃ． を参照してよい。ＰＣＲは、ＵＳ−Ａ−４６８３１９５号、ＵＳ−Ａ−４８００１９５号およびＵＳ−Ａ−４９６５１８８号に記載されている。
【０４３３】
寄託
次の試料は、ブダペスト条約にしたがって、承認された受託者 Ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎｓ ｏｆ Ｉｎｄｕｓｔｒｉａｌ， Ｆｏｏｄ ａｎｄ Ｍａｒｉｎｅ Ｂａｃｔｅｒｉａ（ＮＣＩＭＢ）ａｔ ２３ Ｓｔ．Ｍａｃｈａｒ Ｄｒｉｖｅ， Ａｂｅｒｄｅｅｎ， Ｓｃｏｔｌａｎｄ， ＡＢ２４ ３ＲＹ， Ｕｎｉｔｅｄ Ｋｉｎｇｄｏｍ に、２００１年６月２９日に寄託された。
【０４３４】
ＮＣＩＭＢ番号ＮＣＩＭＢ４１１１０は、Ｅ．ｃｏｌｉ ＭＳＳＥ８２である。
寄託者は、Ｐｆｉｚｅｒ Ｌｉｍｉｔｅｄ， Ｒａｍｓｇａｔｅ Ｒｏａｄ， Ｓａｎｄｗｉｃｈ， Ｋｅｎｔ， ＣＴ１３ ９ＮＪ， Ｕｎｉｔｅｄ Ｋｉｎｇｄｏｍ であった。
【０４３５】
当業者は、上述のＥ．ｃｏｌｉ クローン（ＮＣＩＭＢ４１１１０）を、アンピシリンを含有する Ｌｕｒｉａ Ｂｒｏｔｈ 中で容易に成長させ、そのクローンのプラスミドＤＮＡを、Ｓａｍｂｒｏｏｋ， ｅｔ ａｌ．，ｅｄｓ．（１９８９） Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ： Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ， Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ， ＮＹ， ＵＳＡ に記載のアルカリ溶解法を用いて単離しうる。次に、Ｓａｎｇｅｒ ｅｔ ａｌ．（Ｐｒｏｃｅｅｄｉｎｇｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅ （ＵＳＡ）， （Ｄｅｃ． １９７７）， ７４（１２）：５４６３−５４６７）によって記載され且つ蛍光検出について Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ， Ｆｏｓｔｅｒ Ｃｉｔｙ， ＣＡ， ＵＳＡ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ 製造者の参考文献を参照されたい）によって変更されたようなジデオキシターミネーション法を用いて、そのＤＮＡを配列決定し且つヒトＳＥＰを識別しうる。
【０４３６】
受託番号ＮＣＩＭＢ４１１１０として寄託された上述の寄託生物物質を言及する場合に本明細書中で用いられる一つまたは複数の“細胞”という用語は、一つまたは複数の“微生物”または“細菌”という均等な用語と同じ意味である。
【０４３７】
本発明は、更に、その寄託物から誘導可能なおよび／または発現可能な配列およびそれを含む態様を包含する。本発明は、更に、その寄託物から誘導可能なおよび／または発現可能な部分配列およびそれを含む態様を包含するが、ここにおいて、それら部分配列は、活性ポリペプチド（活性酵素部位）をコードする。本発明は、更に、その寄託物から誘導可能なおよび／または発現可能な配列を含むタンパク質およびそれを含む態様を包含する。本発明は、更に、その寄託物から誘導可能なおよび／または発現可能な部分配列を含むタンパク質およびそれを含む態様を包含するが、ここにおいて、それら部分配列は、活性ポリペプチド（活性酵素部位）をコードする。
【０４３８】
実施例部分、図面および配列表への序論
本発明を、ここで、単に例として、添付の図面および配列表に関して記載する。
【０４３９】
【実施例】
実施例部分
実施例１−ヒトＳＥＰの同定
データベースマイニング
ヒトＳＥＰの新規な遺伝子は、プローブとしてネプリリシンタンパク質およびＢＬＡＳＴアルゴリズムを用いてヒト発現配列タグ（ＥＳＴｓ）のデータベースをマイニングすることによって発見した。次に、ＥＳＴヒット（データベース＝Ｉｎｃｙｔｅ ＧｏｌｄＴＭ；遺伝子ｉｄ．＝２４１１６１）を集合させて、コーディング配列の大きいフラグメントが予想される隣接した配列にした。これは、ネプリリシンタンパク質配列との相同性（６０％同一性）によって触媒ドメインに該当する。ＰＣＲクローニングのためのプローブは、新規な遺伝子について予想されるコーディング配列のこの領域を用いて設計した。次に、ヒトゲノムデータベースからの未完成の配列を更にマイニングすることで、５個の予想されるエクソンを識別し、これらは、欠けているＮ末端領域中の同じ新規な遺伝子に属すると仮定された。これは、後に、ヒト精巣ライブラリーから得られる完全長クローンの配列決定後に確認した（下を参照されたい）。
【０４４０】
新規なヒトＳＥＰ配列には、３’ＵＴＲ、および二つの活性触媒部位の一つを含有するヒトＳＥＰの高度に保存されたＣ末端領域中のコーディング配列の一部分が含まれる。この新規なヒトＳＥＰは、３７アミノ酸のインサートを含有すると考えられる。
【０４４１】
完全長ヒトＳＥＰ　ｃＤＮＡの単離
オリゴヌクレオチド（５’−ｃｔｇｔｃｔｔｇａｔｇｇａｔｔｇｇａｔｇ−３’）は、５’−ＲＡＣＥ（５’ｃＤＮＡ末端の迅速増幅）ＰＣＲを用いて、ｃＤＮＡライブラリーからより長いヒトＳＥＰ　ｃＤＮＡを増幅させることができるように隣接した発現配列タグ（ＥＳＴｓ）の上述の集合からの部分ヒトＳＥＰ　ｃＤＮＡ配列を用いて設計した。
【０４４２】
次に、１２アレイの９６ウェルフォーマットヒト Ｒａｐｉｄ−ＳｃｒｅｅｎＴＭｃＤＮＡライブラリーのパネルを、５’−ＲＡＣＥ　ＰＣＲによってスクリーニングした。ヒトＳＥＰに該当するｃＤＮＡを、脳、肝、胎盤、小腸および精巣に由来するライブラリー中で識別した。
【０４４３】
これらｃＤＮＡには、完全長であるものがなかったので、精巣からのそれより長いが部分長のｃＤＮＡの内の一つの配列から設計されたプライマー（５’−ｇｔｃｃｔｔｇｇｃａｇｔｃｇａａｔｔｃｔｃｃ−３’）を用いてライブラリーのパネルについて更に５’−ＲＡＣＥを行った。これは、単離され且つ両末端から配列決定された精巣ライブラリー中のより長い（約３．０ｋｂ）推定上の完全長ｃＤＮＡクローンを識別した。この完全長ヒトＳＥＰクローンをＭＳＳＥ８２と称し（そしてＮＣＩＭＢに受託番号ＮＣＩＭＢ４１１１０として寄託し）、この完全長クローンを、Ｇｅｎｂａｎｋ 受託番号＃ＡＦ０６７１９６を有するｐＣＭＶ６−ＸＬ４ベクター中にクローン化した。
【０４４４】
実施例２−ヒトＳＥＰ　ｍＲＮＡの組織分布
多重組織メッセンジャーＲＮＡブロットを、ヒトＳＥＰについてプローブした。ＳＥＰ　ｍＲＮＡは、精巣試料中で検出されたが、他の組織では検出されなかった。
【０４４５】
完全なヒトＳＥＰコーディング配列に該当するＤＮＡのフラグメントを、ＰＣＲにより、ＳＥＰクローンＭＳＳＥ８２を鋳型として用いて増幅させた。そのフラグメントを、メガプライムキット（Ａｍｅｒｓｈａｍ ＰＬＣ， ＵＫ）を用いて３２Ｐ　ｄＣＴＰで放射性標識した。その放射性標識されたフラグメントをハイブリダイゼーションプローブとして、いろいろなヒト組織および細胞系の選択（７６）から、ｍＲＮＡを含有する多重組織ｍＲＮＡアレイ（ドットブロット）（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ， ＵＳＡ より）をスクリーニングするのに用いた。ハイブリダイゼーションおよび洗浄後、そのブロットにオートラジオグラフィーを施した。精巣からはシグナルを検出したが、他の組織からは検出されなかった。
【０４４６】
実施例３−組換えＳＥＰ酵素の製造
チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞の培養物を、リポフェクタミン（ｌｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ）試薬プロトコール（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ Ｌｔｄ， Ｐａｉｓｌｅｙ， ＵＫ）に記載のリポフェクタミン法を用いて、プラスミドＭＳＳＥ８２でトランスフェクションする。トランスフェクション後２４時間または４８時間に、細胞培地を採取し、そして３０００ｇで５分間の遠心分離によって細胞破片を除去する。次に、その培地を、５０ｍＭ　ＨＥＰＥＳ　ｐＨ７．４／１０％グリセロールに対して、“スライド・ア・ライサー（ｓｌｉｄｅ ａ ｌｙｓｅｒ）”（Ｐｉｅｒｃｅ ａｎｄ Ｗａｒｎｅｒ， Ｃｈｅｓｔｅｒ ＵＫ より）を用いて４℃で一晩透析する。次に、透析された試料をアリコートで凍結させ、液体窒素下で貯蔵する。
【０４４７】
実施例４−ＳＥＰペプチダーゼ活性の検定
ＳＥＰ検定
背景
ＳＥＰ検定は、ＮＥＰと一緒の使用について、Ｃａｒｖａｌｈｏ ｅｔ ａｌ． によって開発されたＦＲＥＴ検定に基づく（Ｃａｒｖａｌｈｏ ｅｔ ａｌ．， Ａｎｎａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ． ２３７，ｐｐ．１６７−１７３（１９９６））。このＳＥＰ　ＦＲＥＴ検定は、蛍光原性ドナー／アクセプター色素の新規な組合せ、具体的には、ローダミングリーン（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｒｏｂｅｓ，Ｉｎｃ．）およびＱＳＹ７（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｒｏｂｅｓ，Ｉｎｃ．）を代用することを除いて、同一ではないが類似した分子内消光蛍光原性ペプチド基質を利用する。
【０４４８】
ＳＥＰのエンドペプチダーゼ活性は、合成ペプチド基質ローダミングリーン−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−ｄＰｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｒｇ−Ａｒｇ−Ｖａｌ−Ｃｙｓ（ＱＳＹ７）−βＡｌａ−ＮＨ２をタンパク質分解するその能力をモニターすることによって測定する。
【０４４９】
この検定に選択される二つの発蛍光団（蛍光原性色素）は、オーバーラップする発光および吸収スペクトルを有し、したがって、エネルギー移動に適している。ローダミングリーンは、ドナーとして作用し、４８５ｎｍで励起した場合、５３５ｎｍで発光（蛍光）を生じ、順次、ＱＳＹ７を励起する（ＦＲＥＴが起こっている）。そのＱＳＹ７は蛍光的に不活性しているので、５３５ｎｍより上で発光を生じないし、したがって、シグナルは認められない（ローダミングリーン発光が消光している）。
【０４５０】
このペプチド基質のＡｒｇ−Ｖａｌペプチド結合におけるＳＥＰによる切断（選択的加水分解）時に、ローダミングリーンおよびＱＳＹ７部分は別々に移動するので、４８５ｎｍでの励起では、エネルギー移動はもはや生じることができない。結果として、蛍光の増加は、ローダミングリーンについて５３５ｎｍで認められる。
【０４５１】
合成ペプチド基質ローダミングリーン−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−ｄＰｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｒｇ−Ａｒｇ−Ｖａｌ−Ｃｙｓ（ＱＳＹ７）−βＡｌａ−ＮＨ ２ の製造
実験：
ペプチド組み立てを、０．２５ｍｍｏｌ　ＦＭＯＣ−ＰＡＬ−ＰＥＧ−ＰＳ樹脂上で、固相ペプチド合成プロトコールにより、製造者に供給された（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ， Ｆｏｓｔｅｒ Ｃｉｔｙ， ＣＡ， ＵＳＡ）９−フルオレニルメトキシカルボニル（ＦＭＯＣ）基剤合成サイクルへの変更を用いて完成した。本発明者が変更したサイクルは、２０％ピペリジン／Ｎ−メチルピロリジノン（ＮＭＰ）での２ｘ５分間処理でアミノ末端を脱保護し；その効率を、３０１ｎｍでのＵＶ吸光度により、ＵＶ吸光度検出器を介する小アリコートの脱保護溶液の通過によって監視する。別々のカートリッジ中で、入ってくるアミノ酸を、Ｎ，Ｎ−ジメチルホルムアミド（ＤＭＦ）中に溶解した各０．９当量の２−（１Ｈ−ベンゾトリアゾール−１−イル）−１，１，３，３テトラメチルウロニウムヘキサフルオロリン酸（ＨＢＴＵ）／１−ヒドロキシベンゾトリアゾール（ＨＯＢｔ）で活性化する。２当量のジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＥＡ）を加える。同時に、樹脂を続いてＮＭＰで洗浄して、脱保護副生成物を除去する。洗浄液を樹脂から排液させ、そして活性化したアミノ酸エステルを樹脂に移し、アミノ末端にカップリングさせるように２０分間撹拌する。残留するカップリング溶液を排液し、樹脂を再度ＮＭＰで洗浄する。ペプチド均一性を確実にするために、ＮＭＰ中の０．４Ｍ無水酢酸／０．０４Ｍ　ＨＯＢｔ溶液および１２ｍｍｏｌ　ＤＩＥＡを樹脂に加えて、いずれの潜在的な未反応部位もアセチル化する。最後に、樹脂をＮＭＰで洗浄し、排液した後、１：１のジクロロメタン／２，２，２−トリフルオロエタノール混合物で洗浄し、排液する。これは、ペプチド合成の一つのサイクルの典型である。完成した合成用樹脂を、Ｒｅａｇｅｎｔ Ｋ（Ｋｉｎｇ，Ｄ．Ｓ． ｅｔ ａｌ．， （１９９０）， Ｉｎｔ．Ｊ．Ｐｅｐ．Ｐｒｏｔ．Ｒｅｓ．， ３２，ｐｐ．２５５−６６）を用いて切断し且つ脱保護して、２５１ｍｇ（１００％）の粗製ペプチドＣＰ１、エレクトロスプレー質量分析（ＥＲＭＳ）（ｍ／ｚ計算値（ｃａｌｃ．）＝９７７．２１（ＭＨ＋　平均），ｏｂｓ．＝９７７．４７）を与える。
【０４５２】
ＱＳＹ−７のシステインへの連結：
５０ｍｇ（５１μｍｏｌ）の粗製ＣＰ１を、４５ｍｇ（５２．４μｍｏｌ）のＱＳＹ−７マレイミドを含有する１０％ＤＩＥＡ／ＤＭＦの溶液中に溶解させた。１０分後、その反応を、ＨＰＬＣ−ＭＳ分析によって不完全であると判定し、更に３０ｍｇ（３０．７μｍｏｌ）の粗製ペプチドを加えた。更に３０分後、ＨＰＬＣ−ＭＳにより、その反応は完了していると判定し、出発試薬は全て消費した。生成物を、Ｃ１８分取用ＨＰＬＣクロマトグラフィーによって単離し、マトリックス支援レーザー脱離イオン化質量分析法（ＭＡＬＤＩ−ＭＳ）によって所望の生成物分子量を示す画分をプールし、凍結乾燥させて、７３．７ｍｇ（５０％）の紫色粉末、ＣＰ２、ＥＳＭＳ（ｍ／ｚ　ｃａｌｃ．＝１７９７．８６（ＭＨ＋　一同位体），ｏｂｓ．＝１７９７．８６）とした。
【０４５３】
ビス（トリフルオロアセチル）ローダミングリーンのアミノ末端への連結：
７３．７ｍｇ（４１μｍｏｌ）のＣＰ２を、３５ｍｇ（５２．８μｍｏｌ）のローダミングリーンカルボン酸，トリフルオロアセトアミド，スクシンイミジルエステル（５（６）−ＣＲ　１１０ＴＦＡ，ＳＥ）＊混合異性体＊を含有する２％ＤＩＥＡ／ＤＭＦ溶液中に溶解させた。２時間後、ＨＰＬＣ−ＭＳ分析により、その反応は完了していると判定した。生成物を、Ｃ４分取用ＨＰＬＣクロマトグラフィーによって単離し、所望の生成物分子量（ＭＡＬＤＩ−ＭＳ）を示す画分をプールし、凍結乾燥させて、７１．４ｍｇ（７４％）の紫色粉末ＣＰ３、ＥＳＭＳ（ｍ／ｚ　ｃａｌｃ．＝２３４５．９２（ＭＨ＋　一同位体），ｏｂｓ．＝２３４５．４７）とした。
【０４５４】
ローダミングリーンからのトリフルオロアセチル保護基の除去：
７１．４ｍｇ（３０．４μｍｏｌ）のＣＰ３を、１０ｍｌの４：１のＣＨ３ＣＮ／Ｈ２Ｏ中に溶解させた。これに、２００ｍｇ（１８８６μｍｏｌ）のＮａ２ＣＯ３を加えた。１６時間ボルテックスした後、上澄みを不溶性物質からデカントした。反応容器を１ｍｌのＤＭＳＯですすぎ洗浄し；これを上澄みと一緒にし、そして生成物を、Ｃ４分取用ＨＰＬＣクロマトグラフィーによって単離した。生成物分子量（ＭＡＬＤＩ−ＭＳ）を示す画分を一緒にし、凍結乾燥させて、６４ｍｇ（９８％）の紫色粉末ＣＰ４、ＥＳＭＳ（ｍ／ｚ　ｃａｌｃ．＝２１５５．５４（ＭＨ＋　平均），ｏｂｓ．＝２１５５．２７）とした。ＣＰ４は、所望の合成ペプチド基質ローダミングリーン−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−ｄＰｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｒｇ−Ａｒｇ−Ｖａｌ−Ｃｙｓ（ＱＳＹ７）−βＡｌａ−ＮＨ２である。
【０４５５】
物質：
試薬は全て、入手可能な最高の商用純度のものを購入し、そして更に精製することなく用いた。ペプチド合成のための試薬は全て、次のものを除いて、Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ， Ｆｏｓｔｅｒ Ｃｉｔｙ， ＣＡ， ＵＳＡ から購入した。ＱＳＹＴＭ−７マレイミド（カタログ番号Ｑ−１０２５７）およびローダミングリーンカルボン酸，トリフルオロアセトアミド，スクシンイミジルエステル（５（６）−ＣＲ　１１０ＴＦＡ，ＳＥ）＊混合異性体＊（カタログ番号Ｒ−６１１２）は、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｒｏｂｅｓ，Ｉｎｃ．， ＯＲ， ＵＳＡ から購入した；ＦＭＯＣ−ＰＡＬ−ＰＥＧ−ＰＳは、Ｐｅｒｓｅｐｔｉｖｅ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ， ＭＡ， ＵＳＡ（カタログ番号ＧＥＮ９１３３８４）から購入した；ＦＭＯＣ−Ｂ−アラニンおよびＦＭＯＣ−ｄ−フェニルアラニンは、Ｎｏｖａｂｉｏｃｈｅｍ， ＣＡ， ＵＳＡ から購入した；ＦＭＯＣ−Ａｒｇ（Ｐｂｆ）−ＯＨは、ＡｎａＳｐｅｃ，Ｉｎｃ．， ＣＡ， ＵＳＡ から購入した；２，２，２−トリフルオロエタノールは、Ａｌｄｒｉｃｈ， ＷＩ，ＵＳＡ から購入した。炭酸ナトリウムは、Ｆｉｓｈｅｒ， ＰＡ， ＵＳＡ から購入した。
【０４５６】
分取用ＨＰＬＣクロマトグラフィーは、Ｖｙｄａｃ（ＣＡ， ＵＳＡ）Ｃ１８（カタログ番号２１８ＴＰ１０２２）またはＣ４（カタログ番号２１４ＴＰ１０２２）カラム上において、１０ｍｌ／分の流速で、０％〜８０％の直線勾配（Ａ＝５％ＣＨ３ＣＮ／０．１％ＴＦＡ／９４．９％Ｈ２Ｏ，Ｂ＝１００％ＣＨ３ＣＮ）で３０分間にわたって溶離して行って、３０秒の時間画分を集めた。分析用ＨＰＬＣ−ＭＳは、Ｗａｔｅｒｓ（ＭＡ， ＵＳＡ）２６９０　ＨＰＬＣインレットおよび Ｗａｔｅｒｓ ９９６フォトダイオードアレイ検出器と連結された Ｍｉｃｒｏｍａｓｓ（Ｍａｎｃｈｅｓｔｅｒ， ＵＫ）ＬＣＴ質量分析計（外部校正される標準に基づく質量）を用いて、Ｖｙｄａｃ Ｃ４（カタログ番号２１４ＴＰ５４１５）カラム上における０％〜８０％の直線勾配（Ａ＝５％ＣＨ３ＣＮ／０．１％ＴＦＡ／９４．９％Ｈ２Ｏ，Ｂ＝１００％ＣＨ３ＣＮ）で１ｍｌ／分の流速で３０分間にわたるクロマトグラフィーを行って実施した。デコンボリューション分子量は、多重荷電実測イオンから、Ｍｉｃｒｏｍａｓｓ 変換ソフトウェアを用いて計算した。ＭＡＬＤＩ−ＭＳは、Ｐｅｒｓｅｐｔｉｖｅ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ Ｖｏｙａｇｅｒ−ＤＥリニア型質量分析計において、αシアノ４−ヒドロキシケイヒ酸マトリックス（Ｈｅｗｌｅｔｔ Ｐａｃｋａｒｄ， ＣＡ， ＵＳＡ）を用いて得て、報告した質量は外部校正に基づく。
【０４５７】
操作（化学構造を含む）：
ＣＰ４（＝合成ペプチド基質ローダミングリーン−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−ｄＰｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｒｇ−Ａｒｇ−Ｖａｌ−Ｃｙｓ（ＱＳＹＴＭ−７）−βＡｌａ−ＮＨ２）を、鍵中間体ＣＰ３を固相ペプチド合成スキーム中に包含させることによって合成する。
【０４５８】
スキーム１：
【０４５９】
【化１】
Figure 2004504032
要約すると、ＦＭＯＣ−ＰＡＬ−ＰＥＧ樹脂を、収率および時間の効率について最適化される固相ペプチド合成プロトコールを用いて作り上げる。これらサイクル（上記に充分な詳細）は、２回のＦＭＯＣ脱保護、洗浄、ＨＢＴＵで活性化したアミノ酸の１回のカップリング、洗浄、キャッピング、そして最後に、初めはＮＭＰで、次に１：１のトリフルオロエタノール／ジクロロメタンでの洗浄を包含する。これら洗浄は、樹脂二次構造を弛緩させるのを助けて、次のサイクル中に次の入ってくるアミノ酸の完全な脱保護および有効なカップリングを可能にする。
【０４６０】
ＣＰ２を、スキーム２にしたがって合成する（上記に充分な詳細）：
【０４６１】
【化２】
Figure 2004504032
このＱＳＹ−７タグの包含後、スキーム３にしたがって、二番目の発蛍光団であるローダミングリーンを、ビストリフルオロアセチル保護された色素として加える：
【０４６２】
【化３】
Figure 2004504032
最後に、トリフルオロアセチル基を、Ｎａ２ＣＯ３での処理によって除去して、所望の基質ＣＰ４を与える：
【０４６３】
【化４】
Figure 2004504032
検定
検定用の試薬は、最初に、次のように調製する：
基質溶液は、基質ローダミングリーン−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−ｄＰｈｅ−Ｌｅｕ−Ａｒｇ−Ａｒｇ−Ｖａｌ−Ｃｙｓ（ＱＳＹ７）−βＡｌａ−ＮＨ２を５０ｍＭ　ＨＥＰＥＳ緩衝液ｐＨ７．４（Ｓｉｇｍａ， ＵＫ）中に２μＭの濃度で再懸濁させた後、２５ｍｌにつき１個のＥＤＴＡ不含プロテアーゼ阻害剤混合物錠剤（Ｒｏｃｈｅ Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｓ， ＵＫ）を加えることによって調製する。
【０４６４】
上記のＳＥＰ酵素のアリコートを融解させた後、５０ｍＭ　ＨＥＰＥＳ、ｐＨ７．４中に、その５０μｌが、検定中に約３０％の基質を生成物に変換するのに充分な酵素を含有するように、各々の酵素バッチに特異的な所定の因子によって希釈させる。
【０４６５】
４ｍｌのＤＭＳＯ＋９６ｍｌの５０ｍＭ　ＨＥＰＥＳ　ｐＨ７．４を含んで成る４％ＤＭＳＯを調製する。
生成物溶液は、５００μｌの基質溶液を、２５０μｌの酵素溶液＋２５０μｌの４％ＤＭＳＯ溶液に加え、そして３７℃で１６時間インキュベートすることによって調製する。
【０４６６】
検定を次のように設定する：
黒色９６ウェル微量滴定プレート中において、１００μｌの基質溶液を５０μｌの４％ＤＭＳＯ溶液に加える。同様の非特異的バックグラウンドブランクも設定するが、ここにおいて、この５０μｌの４％ＤＭＳＯ溶液は、更に、４０μＭホスホルアミドンを含有する。５０μｌの酵素溶液をその検定およびブランクに加え、その９６ウェルプレートをＢＭＧギャラクシー蛍光リーダー中に入れて、Ｂｉｏｌｉｓｅ ソフトウェアパッケージで操作する（ＢＭＧ Ｌａｂ ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ， Ｏｆｆｅｎｂｅｒｇ， Ｇｅｒｍａｎｙ）。
【０４６７】
そのプレートを、蛍光リーダー中において３７℃で１時間インキュベートし、蛍光測定値を３分毎に得る（励起（Ｅｘ）４８５ｎｍ／発光（Ｅｍ）５３５ｎｍ）。ＳＥＰのタンパク質分解活性は、試料の蛍光の増加速度から非特異的バックグラウンドブランクの蛍光単位の増加速度を差し引いたものに相当する。４回の成功した示数についてそのソフトウェアによって計算される最大速度測定値（ＭａｘＶ）を、この計算に用いる。
【０４６８】
同一微量滴定プレート上のウェル中の２００μｌの生成物から得られる蛍光測定値を用いる。必要ならば、この値を、ＳＥＰ検定の６０分の時点から測定された蛍光単位と一緒に用いて、１時間のインキュベーション時間中にタンパク質分解される基質の百分率（％）を計算する、または測定された蛍光増加速度を、タンパク質分解された基質ｎｇ／分／ｍｌ（酵素）のような他の有用な単位に変換する。
【０４６９】
この検定を用いて、Ｂｕｔｔｅｒｗｏｒｔｈｓ によって公表された Ａｔｈｅｌ Ｃｏｒｎｉｓｈ Ｂｏｗｄｅｎ， １９７９ による Ｆｕｎｄａｍｅｎｔａｌｓ ｏｆ Ｅｎｚｙｍｅ Ｋｉｎｅｔｉｃｓ に記載の標準的な原理にしたがって、ＶｍａｘおよびＫｍのような酵素反応速度論パラメーターを計算する。
【０４７０】
ＳＥＰ阻害剤の阻害パラメーターを決定するためのＳＥＰ検定の使用
ＳＥＰ阻害剤（例えば、ホスホルアミドン）ののＩＣ５０を決定するために、多重ＳＥＰ検定を、上記のように、５０μｌのＤＭＳＯ溶液（阻害剤の１０ｍＭ１００％ＤＭＳＯ原液の４％ＤＭＳＯ／５０ｍＭ　ＨＥＰＥＳ　ｐＨ７．４を用いる適当な希釈によって作られる）中に含まれる一定範囲の試験濃度の阻害剤で行う。適当な標準グラフフィッティング計算機プログラムを用いて、Ｓ字形用量反応曲線を、対数阻害剤濃度に対するＭａｘＶ（または阻害％または活性％）のプロットに適合させる。ＩＣ５０は、５０％の最大阻害を引き起こす阻害剤濃度として計算する。典型的には、ある与えられたＩＣ５０決定値について、半対数単位増加量が異なる一定用量範囲の少なくとも１０種類の阻害剤濃度を用いる。
【０４７１】
この検定を用いて、例えば、Ｂｕｔｔｅｒｗｏｒｔｈｓ によって公表された Ａｔｈｅｌ Ｃｏｒｎｉｓｈ Ｂｏｗｄｅｎ， １９７９ による Ｆｕｎｄａｍｅｎｔａｌｓ ｏｆ Ｅｎｚｙｍｅ Ｋｉｎｅｔｉｃｓ に記載の標準的な酵素学原理にしたがって、阻害のＫｉおよびモード（すなわち、この阻害が競合的、混合、非競合的であるかどうか等）を決定する。
【０４７２】
実施例５−性的興奮の動物モデル
本研究において、本発明者は、男性および女性の性的興奮の生理学についての強壮な再現可能モデルを開発した。このモデルは、麻酔されたウサギを用い、Ｌａｓｅｒ Ｄｏｐｐｌｅｒ 技法を用いて空洞内血圧および性器血流を監視し、同時に、心臓血管パラメーターを常套的に記録する。本発明者は、試験薬の不存在下および存在下における骨盤神経刺激またはＶＩＰの注入によって引き起こされる陰茎中の空洞内血圧および膣（および陰核さえも）血流の僅かな変化を測定することができる。
【０４７３】
本発明者は、この動物モデルが、臨床データに直接的に反映すると考えている。したがって、このモデルを用いて、空洞内血圧の増加による陰茎勃起の増進および膣または陰核血流増進を測定するなどの、ＭＥＤおよびＦＳＡＤの予防および／または処置のための候補薬を研究することができる。
【０４７４】
男性および女性の性的興奮に関与する潜在的物質としてＶＩＰおよび他の神経ペプチドを識別すること
血管作用性腸管ペプチド（ＶＩＰ）として知られる前性的（ｐｒｏ−ｓｅｘｕａｌ）神経ペプチドを分解するＳＥＰの能力を、例えば、ラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）であって、Ｐｅｎｉｎｓｕｌａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ， ＣＡ， ＵＳＡ から商業的に入手できるＶＩＰ　ＲＩＡなどを利用することによって測定する。
【０４７５】
ＳＥＰ酵素試料、典型的には、５〜１００μｌの組換えＳＥＰ（上記の方法によって製造される）を、ＶＩＰペプチド試料、典型的には、１〜１０ｎｇと一緒に、５０ｍＭ　ＨＥＰＥＳ，ｐＨ７．４のような緩衝液中において３７℃で５時間インキュベートする。これと同一であるが１０μＭホスホルアミドンも含有する負の対照を設定し、同一に処理する。インキュベーション時間後、試料および負の対照双方に残っているＶＩＰの量を、製造者の取扱説明書によりＲＩＡを用いて決定する。負の対照に対する試料中のＶＩＰ量の減少は、ＳＥＰのＶＩＰタンパク質分解活性の尺度である。この検定を用いて、例えば、Ｂｕｔｔｅｒｗｏｒｔｈｓ によって公表された Ａｔｈｅｌ Ｃｏｒｎｉｓｈ Ｂｏｗｄｅｎ， １９７９ による Ｆｕｎｄａｍｅｎｔａｌｓ ｏｆ Ｅｎｚｙｍｅ Ｋｉｎｅｔｉｃｓ に記載の標準的な原理にしたがって、ＶｍａｘおよびＫｍのような酵素反応速度論パラメーターを決定する。
【０４７６】
実施例６−ＳＥＰ阻害剤についての動物試験法
女性性的機能不全動物モデル
麻酔プロトコール
雌ニュージーランドウサギ（〜２．５ｋｇ）に、Ｍｅｄｅｔｏｍｉｄｉｎｅ（Ｄｏｍｉｔｏｒ（登録商標））０．５ｍｌ／ｋｇ　筋肉内（ｉ．ｍ．）および Ｋｅｔａｍｉｎｅ（Ｖｅｔａｌａｒ（登録商標））０．２５ｍｌ／ｋｇ　筋肉内（ｉ．ｍ．）の組合せを前投与し、同時に、フェイスマスクによる吸入酸素を維持する。これらウサギを、ベンチレーターに連結された ＰｏｒｔｅｘＴＭカフなし気管内チューブ３ＩＤを用いて気管切開し、そして３０〜４０呼吸／分の換気速度において、１８〜２０ｍｌのおよその一回呼吸量および１０ｃｍＨ２Ｏの最大気道圧で維持する。次に、麻酔薬を Ｉｓｏｆｌｕｒａｎｅ に切り替え、２ｌ／分でのＯ２で換気を続ける。右耳辺縁静脈に、２３Ｇまたは２４Ｇカテーテルを用いてカニューレ挿入し、乳酸加リンガー液を０．５ｍｌ／分で灌流させる。このウサギを、侵襲性手術中は３％ Ｉｓｏｆｌｕｒａｎｅ で維持し、維持麻酔には２％に降下させる。
【０４７７】
血管のカニューレ挿入
ウサギの左鼠けい部を剃毛し、垂直切開を大腿に沿って約５ｃｍの長さで行う。大腿静脈を露出させ、分離後、薬物および化合物の注入用にＰＶＣカーテル（１７Ｇ；Ｐｏｒｔｅｘ Ｌｉｍｉｔｅｄ， Ｈｙｔｈｅ， Ｋｅｎｔ， ＵＫ）をカニューレ挿入する。カニューレ挿入を大腿動脈について繰り返し、カテーテルを１０ｃｍの深さまで挿入して、カテーテルが腹大動脈に確実に達するようにする。この動脈カテーテルを Ｇｏｕｌｄ システムに連結して、血圧を記録する。血液ガス分析のための試料も、この動脈カテーテルによって採取する。収縮期および拡張期血圧を測定し、そして式［（拡張期ｘ２＋収縮期）÷３］を用いて平均動脈血圧を計算する。心拍数は、脈波型酸素飽和度計および Ｐｏ−ｎｅ−ｍａｈ データ捕捉ソフトウェアシステム（Ｐｏｎｅｍａｈ Ｐｈｙｓｉｏｌｏｇｙ Ｐｌａｔｆｏｒｍ， Ｇｏｕｌｄ Ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔ Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｉｎｃ．， ＯＨ， ＵＳＡ）を用いて測定する。
【０４７８】
骨盤神経の刺激
腹部正中切開を腹腔中に行う。この切開は、恥骨直上約５ｃｍの長さである。脂肪および筋肉を大まかに切除して、体腔の下に走る下腹神経を露出させる。恥骨の上にある大腿静脈および動脈を損傷させないために、恥骨壁の側弯曲に近い状態を保つことが不可欠である。坐骨神経および骨盤神経は、より深部にあり、ウサギの背側に更に切開後に見出される。坐骨神経がいったん識別されると、骨盤神経は容易に見出される。骨盤神経という用語は、大まかに用いられており；これについての解剖学書では、これら神経を充分に詳細に定義することができない。しかしながら、この神経の刺激は、膣および陰核の血流の増加および骨盤領域の神経支配を引き起こす。この骨盤神経を周囲組織から分離し、Ｈａｒｖａｒｄ 双極刺激電極をその神経のまわりに置く。この神経を、ある程度の引っ張りを与えるように僅かに持ち上げた後、電極を適所に確保する。約１ｍｌの軽パラフィン油をその神経および電極のまわりに置く。これは、神経への保護潤滑剤として作用し且つ電極の血液混入を防止する。電極を Ｇｒａｓｓ Ｓ８８ Ｓｔｉｍｕｌａｔｏｒ につなぐ。骨盤神経を、次のパラメーター、すなわち、５Ｖ、０．５ｍｓパルス幅、１０秒の刺激持続および２〜１６Ｈｚの周波数範囲、を用いて刺激する。再現性応答は、神経を１５〜２０分毎に刺激した場合に得られる。
【０４７９】
周波数応答曲線を、亜最大下応答として用いる最適周波数を決定するために、各実験の開始時に決定し、通常は４Ｈｚである。試験される１種類または複数の化合物を、大腿静脈により、Ｈａｒｖａｒｄ ２２注入ポンプを用いて注入して、連続１５分刺激サイクルを可能にする。
【０４８０】
Ｌａｓｅｒ Ｄｏｐｐｌｅｒ 探針の配置
腹部正中切開を骨盤の尾側末端に行って、骨盤部位を露出させる。結合組織を除去して、陰核膜を露出させ、その壁が小血管から確実に離れているようにする。外部膣壁も、結合組織を全て除去することによって露出させる。一つの Ｌａｓｅｒ Ｄｏｐｐｌｅｒ フロー探針を膣内に３ｃｍ挿入するので、探針シャフトの半分はまだ見えている。第二探針は、外部陰核壁直上にあるように配置する。次に、これら探針の位置を、シグナルが得られるまで調整する。第二探針を外部膣壁上の血管表面直上に置く。両方の探針を適所にクランプで固定する。
【０４８１】
膣および陰核の血流を、Ｐｏ−ｎｅ−ｍａｈ データ捕捉ソフトウェア（Ｐｏｎｅｍａｈ Ｐｈｙｓｉｏｌｏｇｙ Ｐｌａｔｆｏｒｍ， Ｇｏｕｌｄ Ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔ Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｉｎｃ．）を用いて Ｆｌｏｗｍｅｔｅｒ から直接的に数値としてか、または Ｇｏｕｌｄ チャートレコーダートレースから間接的に記録する。校正は実験開始時に設定する（０〜１２５ｍｌ／分／１００ｇ組織）。
【０４８２】
血管作用性腸管ペプチド（ＶＩＰ）の注入
注入されるＶＩＰ（Ｂａｃｈｅｍ， Ｈ−３７７５）の用量は、２．０、６．０、２０．０、６０．０μｇ／ｋｇ　静脈内（ｉ．ｖ．）であり、０．５ｍｌ容量の生理食塩水中で注入する。ＶＩＰは、三方タップによって大腿静脈中に５００μｌ／分で注入する Ｈａｒｖａｒｄ ２２ポンプを用いて注入する。ＶＩＰ注入後、カテーテルをヘパリン加生理食塩水（Ｈｅｐｓａｌｉｎｅ）で洗浄するので、カテーテル中にはＶＩＰが残っていない。
【０４８３】
ＶＩＰ注入を用いた実験には、再現性応答を得られるように最初の感作性用量反応曲線（２〜６０μｇ／ｋｇ）のが必要である。Ｈｅｐｓａｌｉｎｅ（５０ＵＩ／ｍｌ）の最初の注入は、負の対照として作用するように注入する。
【０４８４】
阻害剤の注入
ＳＥＰ阻害剤およびビヒクル対照は、ＶＩＰと同速度で注入する。ＳＥＰ阻害剤は、ＶＩＰ用量反応曲線の前の３０分間放置し、骨盤神経刺激の前の１５分間放置する。
【０４８５】
データは、平均性器（膣／陰核）血流±平均の標準誤差（ｓ．ｅ．ｍ．）として表す。有意の変化は、スチューデントｔ検定を用いて確認する。
男性性的機能不全動物モデル
ウサギ麻酔法
雄ニュージーランドウサギ（〜２．５ｋｇ）に、Ｍｅｄｅｔｏｍｉｄｉｎｅ（Ｄｏｍｉｔｏｒ（登録商標））０．５ｍｌ／ｋｇ　筋肉内（ｉ．ｍ．）および Ｋｅｔａｍｉｎｅ（Ｖｅｔａｌａｒ（登録商標））０．２５ｍｌ／ｋｇ　筋肉内（ｉ．ｍ．）の組合せを前投与し、同時に、フェイスマスクによる吸入酸素を維持する。これらウサギを、ベンチレーターに連結された ＰｏｒｔｅｘＴＭカフなし気管内チューブ３ＩＤを用いて気管切開し、そして３０〜４０呼吸／分の換気速度において、１８〜２０ｍｌのおよその一回呼吸量および１０ｃｍＨ２Ｏの最大気道圧で維持する。次に、麻酔薬を Ｉｓｏｆｌｕｒａｎｅ に切り替え、２ｌ／分でのＯ２で換気を続ける。右耳辺縁静脈に、２３Ｇまたは２４Ｇカテーテルを用いてカニューレ挿入し、乳酸加リンガー液を０．５ｍｌ／分で灌流させる。このウサギを、侵襲性手術中は３％ Ｉｓｏｆｌｕｒａｎｅ で維持し、維持麻酔には２％に降下させる。
【０４８６】
血管のカニューレ挿入
ウサギの左鼠けい部を剃毛し、垂直切開を大腿に沿って約５ｃｍの長さで行う。大腿静脈を露出させ、分離後、薬物および化合物の注入用にＰＶＣカーテル（１７Ｇ；Ｐｏｒｔｅｘ Ｌｉｍｉｔｅｄ）をカニューレ挿入する。或いは、または更に、左頸静脈を露出させ、分離後、薬物および化合物の注入用にＰＶＣカーテル（１７Ｇ；Ｐｏｒｔｅｘ Ｌｉｍｉｔｅｄ）をカニューレ挿入する。カニューレ挿入を大腿動脈について繰り返し、カテーテルを１０ｃｍの深さまで挿入して、カテーテルが腹大動脈に確実に達するようにする。この動脈カテーテルを Ｇｏｕｌｄ システムに連結して、血圧を記録する。血液ガス分析のための試料も、この動脈カテーテルによって採取する。収縮期および拡張期血圧を測定し、そして式［（拡張期ｘ２＋収縮期）÷３］を用いて平均動脈血圧を計算する。心拍数は、脈波型酸素飽和度計および Ｐｏ−ｎｅ−ｍａｈ データ捕捉ソフトウェアシステム（Ｐｏｎｅｍａｈ Ｐｈｙｓｉｏｌｏｇｙ Ｐｌａｔｆｏｒｍ， Ｇｏｕｌｄ Ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔ Ｓｙｓｔｅｍｓ， Ｉｎｃ．）を用いて測定する。
【０４８７】
骨盤神経の刺激
腹部正中切開を腹腔中に行う。この切開は、恥骨直上約５ｃｍの長さである。脂肪および筋肉を大まかに切除して、体腔の下に走る下腹神経を露出させる。恥骨の上にある大腿静脈および動脈を損傷させないために、恥骨壁の側弯曲に近い状態を保つことが不可欠である。坐骨神経および骨盤神経は、より深部にあり、ウサギの背側に更に切開後に見出される。坐骨神経がいったん識別されると、骨盤神経は容易に見出される。骨盤神経という用語は、大まかに用いられており；これについての解剖学書では、これら神経を充分に詳細に定義することができない。しかしながら、この神経の刺激は、空洞内血圧および空洞血流の増加および骨盤領域の神経支配を引き起こす。この骨盤神経を周囲組織から分離し、Ｈａｒｖａｒｄ 双極刺激電極をその神経のまわりに置く。この神経を、ある程度の引っ張りを与えるように僅かに持ち上げた後、電極を適所に確保する。約１ｍｌの軽パラフィン油をその神経および電極のまわりに置く。これは、神経への保護潤滑剤として作用し且つ電極の血液混入を防止する。電極を Ｇｒａｓｓ Ｓ８８ Ｓｔｉｍｕｌａｔｏｒ につなぐ。骨盤神経を、次のパラメーター、すなわち、５Ｖ、０．５ｍｓパルス幅、１６Ｈｚの周波数で２０秒の刺激持続を用いて刺激する。再現性応答は、神経を１５〜２０分毎に刺激した場合に得られる。
【０４８８】
上のパラメーターを用いた数回の刺激を行って、平均対照応答を決定する。試験される１種類または複数の化合物を、頸静脈により、Ｈａｒｖａｒｄ ２２注入ポンプを用いて注入して、連続１５分刺激サイクルを可能にする。陰茎のまわりの皮膚および結合組織を除去して、陰茎を露出させる。カテーテルセット（Ｉｎｓｙｔｅ−Ｗ，Ｂｅｃｔｏｎ−Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ２０ Ｇａｕｇｅ １．１ｘ４８ｍｍ，Ｂｅｃｔｏｎ−Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ）を、白膜を介して左海綿体腔中に挿入し、針を除去して、軟質カテーテルを残す。このカテーテルを、圧力変換器（Ｏｈｍｅｄａ ５２９９−０４）によって Ｇｏｕｌｄ システムに連結して、空洞内血圧を記録する。空洞内血圧がいったん決定されたら、そのカテーテルを、Ｖｅｔｂｏｎｄ（組織用接着剤，３Ｍ）を用いて適所で密封する。心拍数は、脈波型酸素飽和度計および Ｐｏ−ｎｅ−ｍａｈ データ捕捉ソフトウェアシステム（Ｐｏｎｅｍａｈ Ｐｈｙｓｉｏｌｏｇｙ Ｐｌａｔｆｏｒｍ， Ｇｏｕｌｄ Ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔ Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｉｎｃ．）を用いて測定する。
【０４８９】
空洞内血流は、Ｐｏ−ｎｅ−ｍａｈ データ捕捉ソフトウェア（Ｐｏｎｅｍａｈ Ｐｈｙｓｉｏｌｏｇｙ Ｐｌａｔｆｏｒｍ， Ｇｏｕｌｄ Ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔ Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｉｎｃ．）を用いて Ｆｌｏｗｍｅｔｅｒ から直接的に数値としてかまたは Ｇｏｕｌｄ チャートレコーダートレースから間接的に記録する。校正は実験開始時に設定する（０〜１２５ｍｌ／分／１００ｇ組織）。
【０４９０】
阻害剤の注入
ＳＥＰ阻害剤およびビヒクル対照は、０．１ｍｌ／秒の速度で注入する。ＳＥＰ阻害剤は、骨盤神経刺激の前の１５分間放置する。
【０４９１】
データは、平均空洞内血圧±ｓ．ｅ．ｍ．として表す。有意の変化は、スチューデントｔ検定を用いて確認する。
【０４９２】
【配列表】
【０４９３】
【表３】
Figure 2004504032
【０４９４】
【表４】
Figure 2004504032
【０４９５】
【表５】
Figure 2004504032
配列番号：１は、ヒトＳＥＰをコードしているヌクレオチド配列（ｃＤＮＡ）を示す。
【０４９６】
配列番号：２は、＋１読み取り枠中のｃＤＮＡ配列の翻訳から予想されるヒトＳＥＰタンパク質を示す。
配列番号：３および４は、ヒトＳＥＰをコードしているヌクレオチド配列（ｃＤＮＡ）の同定で用いられるオリゴヌクレオチドプライマー配列を示す。
【０４９７】
配列番号：５は、５’および３’部分ベクター配列（強調されている）を含めた、ヒトＳＥＰをコードしているヌクレオチド配列（ｃＤＮＡ）を示す。
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【図面の簡単な説明】
【図１】
図１は、ヒトＳＥＰ　ｃＤＮＡ配列の読み取り枠（ＯＲＦ）の分析を示す。
【図２】
図２は、ｂｌａｓｔｐアルゴリズムからのペアワイズアラインメントによるヒトＳＥＰの最も密接に関係したヒトタンパク質に対しての比較を示す。
【図３】
図３は、ｂｌａｓｔｐ（タンパク質）およびｆａｓｔａ（コーディングヌクレオチド）アルゴリズムからのペアワイズアラインメントによるＳＥＰについてのヒト、ラットおよびマウス配列の比較を示す。
【図４】
図４は、触媒ドメインを示すヒトＳＥＰおよび関係したヒトタンパク質の多重アラインメントを示す。
【図５】
図５は、触媒ドメインを示すヒト、ラットおよびマウスＳＥＰタンパク質の多重アラインメントを示す。
【図６】
図６は、触媒ドメインを示すヒト、ラットおよびマウスＳＥＰコーディング配列の多重アラインメントを示す。
【図７】
図７は、全ＳＥＰ様タンパク質の多重アラインメントに由来する放射状樹として表される、Ｎｅｉｇｈｂｏｕｒ−Ｊｏｉｎｉｎｇ Ｄｉｓｔａｎｃｅ 法による系統分析を示す。
【図８】
図８は、多重アラインメントの触媒ドメイン領域に由来する放射状樹として表される、Ｎｅｉｇｈｂｏｕｒ−Ｊｏｉｎｉｎｇ Ｄｉｓｔａｎｃｅ 法による系統分析を示す。

Claims (15)

  1. 単離されたおよび／または精製されたポリヌクレオチドであって、
    （ａ）配列番号：２に示されるポリペプチドをエンコードしているポリヌクレオチド；
    （ｂ）配列番号：１または配列番号：５のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド；
    （ｃ）ＮＣＩＭＢ４１１１０中に含有されるＤＮＡによって発現されたポリペプチドをエンコードしているポリヌクレオチド；
    （ｄ）（ａ）〜（ｃ）のいずれか一つのポリヌクレオチドに少なくとも８３％の同一性を有するヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド；
    （ｅ）（ａ）〜（ｄ）のいずれか一つのポリヌクレオチドにハイブリッド形成することができるヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド；
    （ｆ）（ａ）〜（ｅ）のいずれか一つのポリヌクレオチドの相補鎖；または
    （ｇ）（ａ）〜（ｆ）のいずれか一つのポリヌクレオチドのポリヌクレオチドフラグメント
    の内の一つまたはそれを越えるものを含む上記ポリヌクレオチド。
  2. ヒト可溶性分泌エンドペプチダーゼ（ヒトＳＥＰ）をエンコードする請求項１に記載のポリヌクレオチド。
  3. ポリペプチドまたはそのフラグメントを製造する方法であって、請求項１または請求項２に記載のポリヌクレオチドを含むベクターで形質転換されたまたはトランスフェクションされた宿主細胞を、該ポリペプチドまたはそのフラグメントの発現に充分な条件下の培地中で培養することを含む上記方法。
  4. ＳＥＰ活性を有するポリペプチドであって、
    （ａ）配列番号：１または配列番号：５のポリヌクレオチド配列から翻訳される推定のアミノ酸配列を有するポリペプチドおよびその変異体、フラグメント、ホモログ、類似体および誘導体；
    （ｂ）配列番号：２のポリペプチドおよびその変異体、フラグメント、ホモログ、類似体および誘導体；
    （ｃ）ＮＣＩＭＢ４１１１０のｃＤＮＡによってエンコードされたポリペプチドおよびその変異体、フラグメント、ホモログ、類似体および誘導体；または
    （ｄ）ポリペプチドであって、（ｉ）配列番号：１または配列番号：５のポリヌクレオチドによってエンコードされたポリペプチド、（ｉｉ）配列番号：２のポリペプチド、または（ｉｉｉ）ＮＣＩＭＢ４１１１０のｃＤＮＡによってエンコードされたポリペプチドに少なくとも７８％の同一性を有するもの
    の内の一つまたはそれを越えるものを含む上記ポリペプチド。
  5. 請求項４に記載のポリペプチドに対する抗体。
  6. 請求項４に記載のポリペプチドを阻害するまたは選択的に阻害する化合物。
  7. 医薬組成物であって、請求項５に記載の抗体または請求項６に記載の化合物および１種類またはそれを越える薬学的に許容しうる担体、希釈剤または賦形剤を含む上記医薬組成物。
  8. 製剤として用いるための請求項５に記載の抗体、請求項６に記載の化合物または請求項７に記載の組成物。
  9. 性的機能不全、特に、男性勃起機能不全（ＭＥＤ）または女性性的機能不全（ＦＳＤ）の予防および／または処置のための薬剤の製造における請求項５に記載の抗体または請求項６に記載の化合物の使用。
  10. 前記女性性的機能不全（ＦＳＤ）が女性性的興奮障害（ＦＳＡＤ）である請求項９に記載の使用。
  11. 患者の性的機能不全、特に、男性勃起機能不全（ＭＥＤ）または女性性的機能不全（ＦＳＤ）の予防および／または処置の方法であって、該患者に治療的有効量の請求項５に記載の抗体または請求項６に記載の化合物を投与することを含む上記方法。
  12. 前記女性性的機能不全（ＦＳＤ）が女性性的興奮障害（ＦＳＡＤ）である請求項１１に記載の方法。
  13. 請求項４に記載のポリペプチドを過剰発現する、過少発現するまたはその標的挿入または欠失を示すように ｅｘ ｖｉｖｏ または ｉｎ ｖｉｖｏ で遺伝子操作された細胞。
  14. 請求項１３に記載の細胞を含む非ヒト動物。
  15. 請求項４に記載のポリペプチドを生じることができる受託番号ＮＣＩＭＢ４１１１０として寄託された細胞およびそれに由来しうる変異体および突然変異体。
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