JP2004081196A - New protein and dna of the same - Google Patents

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JP2004081196A
JP2004081196A JP2003057943A JP2003057943A JP2004081196A JP 2004081196 A JP2004081196 A JP 2004081196A JP 2003057943 A JP2003057943 A JP 2003057943A JP 2003057943 A JP2003057943 A JP 2003057943A JP 2004081196 A JP2004081196 A JP 2004081196A
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引地 由紀子
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Abstract

<P>PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a new protein having activity of transporting organic anions, to provide a DNA which encodes the protein, to provide a method for screening a compound which promotes or inhibits the activity of the protein, and to provide the compound obtained by the method for screening the compound. <P>SOLUTION: This protein is useful as a diagnostic marker or the like of, for example, renal diseases, hepatic diseases, pancreatic diseases, immunological diseases associated with thymic disorders, genital diseases, gastrointestinal diseases, splenic diseases, cancers, respiratory diseases, myelitis, diabetes, hypertension, postischemic reperfusion injury, retinitis, central nervous diseases, dermal diseases, and diseases related to thyroid hormone. The compound which promotes or inhibits the activity of the protein is obtained by the method for screening the compound in which the protein is used. Further, the compound is used, for example, as a prophylactic or remedy for the diseases. <P>COPYRIGHT: (C)2004,JPO

Description

【0001】
【発明の属する技術分野】
本発明は、新規な有機アニオントランスポーター(oatp/LST)タンパク質、該タンパク質をコードするDNA、該タンパク質の活性を促進または阻害する化合物のスクリーニング方法、該スクリーニング方法で得られる化合物などを提供する。
【0002】
【従来の技術】
有機アニオントランスポーターであるoatp/LST遺伝子群(SLC21ファミリー)はナトリウム非依存性のトランスポーターであり、生体内において血液脳関門を介した甲状腺ホルモン類の中枢神経系への取り込み、血液からの胆汁酸や薬物の肝臓への移行、プロスタグランジンやロイコトリエンなどの炎症性メディエーターの除去、異物の胆汁や尿中への排出などの生体の恒常性維持に欠かせない役割を果たしている事が知られている。現在までにoatp/LST群はヒトでは13種類(例、SLC21A3、SLC21A6、SLC21A11、SLC21A12(非特許文献1 Biochemical and Biophysical Research Communications、273巻、251頁、2000年)など)、ラットでは10種類(例、Slc21a1、Slc21a5など)の報告があり、発現分布は脳特異的、肝臓特異的、広範囲に発現しているものの3種におおよそ分類される。
【非特許文献1】
Biochemical and Biophysical Research Communications、273巻、251頁、2000年
【0003】
【発明が解決しようとする課題】
有機アニオントランスポーターは、基質として胆汁酸のみならず、甲状腺ホルモンや抱合型ステロイドなどの生理活性物質を輸送する。これらの基質の多くは核内レセプターのリガンドであることから、有機アニオントランスポーターは核内レセプターのリガンドを細胞内に最初に取り込むという重要な役割を果たしていると考えられている。しかしながら、その詳細なメカニズムはよく分かっていない。よって、これらのトランスポーターの役割を解明することが種々の疾患に対する治療薬開発につながると考えられる。
【0004】
【課題を解決するための手段】
本発明者らは、鋭意研究を重ねた結果、新規な有機アニオントランスポータータンパク質を見出した。該タンパク質を抑制する方法としては、例えば、有機アニオンの輸送を阻害したり、該タンパク質の転写を抑制して発現レベルを低下させることが考えられる。該タンパク質を賦活化する方法としては、例えば有機アニオンの輸送を促進したり、該タンパク質のプロモーターを活性化したり、mRNAを安定化することで発現レベルを亢進することが考えられる。
本発明者らは、これらの知見に基づいて、さらに検討を重ねた結果、本発明を完成するに至った。
【0005】
すなわち、本発明は、
(1) 配列番号:1、配列番号:26または配列番号:52で表わされるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質またはその塩、
(2) 配列番号:1で表わされるアミノ酸配列からなるタンパク質またはその塩、
(3) 配列番号:26で表わされるアミノ酸配列からなるタンパク質またはその塩、
(4) 配列番号:52で表わされるアミノ酸配列からなるタンパク質またはその塩、
(5) 配列番号:52で表わされるアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列が、配列番号:54で表わされるアミノ酸配列である上記(1)記載のタンパク質またはその塩、
(6) 配列番号:54で表わされるアミノ酸配列からなるタンパク質またはその塩、
(7) 上記(1)記載のタンパク質の部分ペプチドまたはその塩、
(8) 上記(1)記載のタンパク質または上記(7)記載の部分ペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド、
(9) DNAである上記(8)記載のポリヌクレオチド、
(10) 配列番号:2、配列番号:27、配列番号:53または配列番号:55で表わされる塩基配列からなるポリヌクレオチド、
(11) 上記(8)記載のポリヌクレオチドを含有する組換えベクター、
(12) 上記(11)記載の組換えベクターで形質転換された形質転換体、
(13) 上記(12)記載の形質転換体を培養し、上記(1)記載のタンパク質または上記(7)記載の部分ペプチドを生成、蓄積せしめ、これを採取することを特徴とする上記(1)記載のタンパク質もしくは上記(7)記載の部分ペプチドまたはその塩の製造法、
(14) 上記(1)記載のタンパク質もしくは上記(7)記載の部分ペプチドまたはその塩を含有してなる医薬、
(15) 上記(8)記載のポリヌクレオチドを含有してなる医薬、
(16) 上記(8)記載のポリヌクレオチドを含有してなる診断薬、
(17) 上記(1)記載のタンパク質もしくは上記(7)記載の部分ペプチドまたはその塩に対する抗体、
(18) 上記(17)記載の抗体を含有してなる診断薬、
(19) 上記(17)記載の抗体を含有してなる医薬、
(20) 上記(8)記載のポリヌクレオチドに相補的または実質的に相補的な塩基配列またはその一部を含有するポリヌクレオチド、
(21) 上記(20)記載のポリヌクレオチドを含有してなる診断薬、
(22) 上記(20)記載のポリヌクレオチドを含有してなる医薬、
(23) 上記(1)記載のタンパク質もしくは上記(7)記載の部分ペプチドまたはその塩を用いることを特徴とする、上記(1)記載のタンパク質もしくは上記(7)記載の部分ペプチドまたはその塩の活性を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング方法、
(24) 上記(1)記載のタンパク質もしくは上記(7)記載の部分ペプチドまたはその塩を含有してなる、上記(1)記載のタンパク質もしくは上記(7)記載の部分ペプチドまたはその塩の活性を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング用キット、
(25) 上記(23)記載のスクリーニング方法または上記(24)記載のスクリーニング用キットを用いて得られる、上記(1)記載のタンパク質もしくは上記(7)記載の部分ペプチドまたはその塩の活性を促進または阻害する化合物またはその塩、
(25a) 上記(1)記載のタンパク質もしくは上記(7)記載の部分ペプチドまたはその塩の活性を促進する化合物またはその塩、
(26) 上記(25)記載の化合物またはその塩を含有してなる医薬、
(26a) 上記(25a)記載の化合物またはその塩を含有してなる医薬、
(27) 上記(8)記載のポリヌクレオチドを用いることを特徴とする、上記(1)記載のタンパク質遺伝子の発現を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング方法、
(28) 上記(8)記載のポリヌクレオチドを含有してなる、上記(1)記載のタンパク質遺伝子の発現を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング用キット、
(29) 上記(27)記載のスクリーニング方法または上記(28)記載のスクリーニング用キットを用いて得られる、上記(1)記載のタンパク質遺伝子の発現を促進または阻害する化合物またはその塩、
(29a) 上記(1)記載のタンパク質遺伝子の発現を促進する化合物またはその塩、
(30) 上記(29)記載の化合物またはその塩を含有してなる医薬、
(30a) 上記(29a)記載の化合物またはその塩を含有してなる医薬、
(31) 上記(17)記載の抗体を用いることを特徴とする上記(1)記載のタンパク質の定量方法、
(32) 上記(31)記載の定量方法を用いることを特徴とする上記(1)記載のタンパク質の機能が関連する疾患の診断法、
(33) 上記(17)記載の抗体を用いることを特徴とする、上記(1)記載のタンパク質の発現を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング方法、
(34) 上記(17)記載の抗体を含有してなる、上記(1)記載のタンパク質の発現を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング用キット、
(35) 上記(33)記載のスクリーニング方法または上記(34)記載のスクリーニング用キットを用いて得られる、上記(1)記載のタンパク質の発現を促進または阻害する化合物またはその塩、
(35a) 上記(1)記載のタンパク質の発現を促進する化合物またはその塩、
(36) 上記(35)記載の化合物またはその塩を含有してなる医薬、
(36a) 上記(35a)記載の化合物またはその塩を含有してなる医薬、
(37) 腎疾患の予防・治療剤である上記(14)、(15)、(19)、(22)、(26)、(30)または(36)記載の医薬、
(37a) 腎疾患の予防・治療剤である上記(26a)、(30a)または(36a)記載の医薬、
(37b) 腎疾患が糖尿病性腎症である上記(37)または(37a)記載の医薬、
(37c) 甲状腺ホルモン関連疾患の予防・治療剤である上記(14)、(15)、(19)、(22)、(26)、(30)または(36)記載の医薬、
(37d) 甲状腺ホルモン関連疾患の予防・治療剤である上記(26a)、(30a)または(36a)記載の医薬、
(37e) 甲状腺ホルモン関連疾患が甲状腺ホルモン不応症である上記(37c)または(37d)記載の医薬、
(38) 哺乳動物に対して、上記(25)、(29)または(35)記載の化合物またはその塩の有効量を投与することを特徴とする腎疾患の予防・治療方法、
(39) 腎疾患の予防・治療剤を製造するための上記(25)、(29)または(35)記載の化合物またはその塩の使用などを提供する。
【0006】
【発明の実施の形態】
配列番号:1、配列番号:26または配列番号:52で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質(以下、本発明のタンパク質と称することもある)は、ヒトや温血動物(例えば、モルモット、ラット、マウス、ニワトリ、ウサギ、ブタ、ヒツジ、ウシ、サルなど)の細胞(例えば、肝細胞、脾細胞、神経細胞、グリア細胞、膵臓β細胞、骨髄細胞、メサンギウム細胞、ランゲルハンス細胞、表皮細胞、上皮細胞、杯細胞、内皮細胞、平滑筋細胞、繊維芽細胞、繊維細胞、筋細胞、脂肪細胞、免疫細胞(例、マクロファージ、T細胞、B細胞、ナチュラルキラー細胞、肥満細胞、好中球、好塩基球、好酸球、単球)、巨核球、滑膜細胞、軟骨細胞、骨細胞、骨芽細胞、破骨細胞、乳腺細胞、肝細胞もしくは間質細胞、またはこれら細胞の前駆細胞、幹細胞もしくはガン細胞など)もしくはそれらの細胞が存在するあらゆる組織、例えば、脳、脳の各部位(例、嗅球、扁桃核、大脳基底球、海馬、視床、視床下部、大脳皮質、延髄、小脳)、脊髄、下垂体、胃、膵臓、腎臓、肝臓、生殖腺、甲状腺、胆のう、骨髄、副腎、皮膚、筋肉、肺、消化管(例、大腸、小腸)、血管、心臓、胸腺、脾臓、顎下腺、末梢血、前立腺、睾丸、卵巣、胎盤、子宮、骨、関節、骨格筋などに由来するタンパク質であってもよく、合成タンパク質であってもよい。
【0007】
配列番号:1で表されるアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列としては、配列番号:1で表されるアミノ酸配列と約50%以上、好ましくは約60%以上、好ましくは約70%以上、好ましくは約80%以上、好ましくは約90%以上、より好ましくは約95%以上、特に好ましくは約99%以上の相同性を有するアミノ酸配列などが挙げられる。
配列番号:1で表されるアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質としては、例えば、前記の配列番号:1で表されるアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列を含有し、配列番号:1で表されるアミノ酸配列を有するタンパク質と実質的に同質の活性を有するタンパク質などが好ましい。
配列番号:26で表されるアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列としては、配列番号:26で表されるアミノ酸配列と約50%以上、好ましくは約60%以上、好ましくは約70%以上、好ましくは約80%以上、好ましくは約90%以上、より好ましくは約95%以上、特に好ましくは約99%以上の相同性を有するアミノ酸配列などが挙げられる。
配列番号:26で表されるアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質としては、例えば、前記の配列番号:26で表されるアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列を含有し、配列番号:26で表されるアミノ酸配列を有するタンパク質と実質的に同質の活性を有するタンパク質などが好ましい。
配列番号:52で表されるアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列としては、配列番号:52で表されるアミノ酸配列と約50%以上、好ましくは約60%以上、好ましくは約70%以上、好ましくは約80%以上、好ましくは約90%以上、より好ましくは約95%以上、特に好ましくは約99%以上の相同性を有するアミノ酸配列などが挙げられる。
配列番号:52で表されるアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質としては、例えば、前記の配列番号:52で表されるアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列を含有し、配列番号:52で表されるアミノ酸配列を有するタンパク質と実質的に同質の活性を有するタンパク質などが好ましい。配列番号:52で表されるアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質としては、配列番号:54で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質などが挙げられる。
実質的に同質の活性としては、例えば、有機アニオンの輸送活性などが挙げられる。実質的に同質とは、それらの性質が性質的に(例、生理学的に、または薬理学的に)同質であることを示す。したがって、有機アニオンの輸送活性が同等(例、約0.01〜100倍、好ましくは約0.1〜10倍、より好ましくは0.5〜2倍)であることが好ましいが、これらの活性の程度、タンパク質の分子量などの量的要素は異なっていてもよい。
有機アニオンとしては、例えばグルクロン酸、グルタチオン、コール酸などの胆汁酸、甲状腺ホルモンなどが挙げられる。
有機アニオンの輸送活性などの活性の測定は、公知の方法に準じて行うことができ、例えば、Biochemical and Biophysical Research Communications、第273巻、251頁、2000年に記載の方法またはそれに準じる方法に従って測定することができる。
【0008】
また、本発明のタンパク質としては、例えば、(1)(i)配列番号:1で表されるアミノ酸配列中の1または2個以上(例えば1〜200個程度、好ましくは1〜150個程度、好ましくは1〜100個程度、好ましくは1〜50個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が欠失したアミノ酸配列、(ii)配列番号:1で表されるアミノ酸配列に1または2個以上(例えば1〜200個程度、好ましくは1〜150個程度、好ましくは1〜100個程度、好ましくは1〜50個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が付加したアミノ酸配列、(iii)配列番号:1で表されるアミノ酸配列に1または2個以上(例えば1〜200個程度、好ましくは1〜150個程度、好ましくは1〜100個程度、好ましくは1〜50個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が挿入されたアミノ酸配列、(iv)配列番号:1で表されるアミノ酸配列中の1または2個以上(例えば1〜200個程度、好ましくは1〜150個程度、好ましくは1〜100個程度、好ましくは1〜50個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が他のアミノ酸で置換されたアミノ酸配列、または(v)それらを組み合わせたアミノ酸配列を含有するタンパク質などのいわゆるムテイン、
(2)(i)配列番号:26で表されるアミノ酸配列中の1または2個以上(例えば1〜200個程度、好ましくは1〜150個程度、好ましくは1〜100個程度、好ましくは1〜50個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が欠失したアミノ酸配列、(ii)配列番号:26で表されるアミノ酸配列に1または2個以上(例えば1〜200個程度、好ましくは1〜150個程度、好ましくは1〜100個程度、好ましくは1〜50個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が付加したアミノ酸配列、(iii)配列番号:26で表されるアミノ酸配列に1または2個以上(例えば1〜200個程度、好ましくは1〜150個程度、好ましくは1〜100個程度、好ましくは1〜50個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が挿入されたアミノ酸配列、(iv)配列番号:26で表されるアミノ酸配列中の1または2個以上(例えば1〜200個程度、好ましくは1〜150個程度、好ましくは1〜100個程度、好ましくは1〜50個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が他のアミノ酸で置換されたアミノ酸配列、または(v)それらを組み合わせたアミノ酸配列を含有するタンパク質などのいわゆるムテイン、
(3)(i)配列番号:52で表されるアミノ酸配列中の1または2個以上(例えば1〜200個程度、好ましくは1〜150個程度、好ましくは1〜100個程度、好ましくは1〜50個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が欠失したアミノ酸配列、(ii)配列番号:52で表されるアミノ酸配列に1または2個以上(例えば1〜200個程度、好ましくは1〜150個程度、好ましくは1〜100個程度、好ましくは1〜50個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が付加したアミノ酸配列、(iii)配列番号:52で表されるアミノ酸配列に1または2個以上(例えば1〜200個程度、好ましくは1〜150個程度、好ましくは1〜100個程度、好ましくは1〜50個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が挿入されたアミノ酸配列、(iv)配列番号:52で表されるアミノ酸配列中の1または2個以上(例えば1〜200個程度、好ましくは1〜150個程度、好ましくは1〜100個程度、好ましくは1〜50個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が他のアミノ酸で置換されたアミノ酸配列、または(v)それらを組み合わせたアミノ酸配列を含有するタンパク質などのいわゆるムテインも含まれる。
上記のようにアミノ酸配列が挿入、欠失または置換されている場合、その挿入、欠失または置換の位置は、とくに限定されない。
【0009】
本明細書におけるタンパク質は、ペプチド標記の慣例に従って左端がN末端(アミノ末端)、右端がC末端(カルボキシル末端)である。配列番号:1で表わされるアミノ酸配列を含有するタンパク質をはじめとする、本発明のタンパク質は、C末端がカルボキシル基(−COOH)、カルボキシレート(−COO)、アミド(−CONH)またはエステル(−COOR)のいずれであってもよい。
ここでエステルにおけるRとしては、例えば、メチル、エチル、n−プロピル、イソプロピル、n−ブチルなどのC1−6アルキル基、例えば、シクロペンチル、シクロヘキシルなどのC3−8シクロアルキル基、例えば、フェニル、α−ナフチルなどのC6−12アリール基、例えば、ベンジル、フェネチルなどのフェニル−C1−2アルキル基もしくはα−ナフチルメチルなどのα−ナフチル−C1−2アルキル基などのC7−14アラルキル基、ピバロイルオキシメチル基などが用いられる。本発明のタンパク質がC末端以外にカルボキシル基(またはカルボキシレート)を有している場合、カルボキシル基がアミド化またはエステル化されているものも本発明のタンパク質に含まれる。この場合のエステルとしては、例えば上記したC末端のエステルなどが用いられる。
さらに、本発明のタンパク質には、N末端のアミノ酸残基(例、メチオニン残基)のアミノ基が保護基(例えば、ホルミル基、アセチル基などのC1−6アルカノイルなどのC1−6アシル基など)で保護されているもの、生体内で切断されて生成するN末端のグルタミン残基がピログルタミン酸化したもの、分子内のアミノ酸の側鎖上の置換基(例えば−OH、−SH、アミノ基、イミダゾール基、インドール基、グアニジノ基など)が適当な保護基(例えば、ホルミル基、アセチル基などのC1−6アルカノイル基などのC1−6アシル基など)で保護されているもの、あるいは糖鎖が結合したいわゆる糖タンパク質などの複合タンパク質なども含まれる。
本発明のタンパク質の具体例としては、例えば、配列番号:1で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質、配列番号:26で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質、配列番号:52で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質、配列番号:54で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質などがあげられる。
【0010】
本発明のタンパク質の部分ペプチドとしては、前記した本発明のタンパク質の部分ペプチドであって、好ましくは、前記した本発明のタンパク質と同様の性質を有するものであればいずれのものでもよい。
例えば、本発明のタンパク質の構成アミノ酸配列のうち例えば10個以上、好ましくは20個以上、好ましくは50個以上、好ましくは70個以上、好ましくは100個以上、好ましくは200個以上のアミノ酸配列を有するペプチドなどが用いられる。
また、本発明で用いられる部分ペプチドは、そのアミノ酸配列中の1または2個以上(好ましくは1〜20個程度、より好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が欠失し、または、そのアミノ酸配列に1または2個以上(好ましくは1〜20個程度、より好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が付加し、または、そのアミノ酸配列に1または2個以上(好ましくは1〜20個程度、より好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が挿入され、または、そのアミノ酸配列中の1または2個以上(好ましくは1〜20個程度、より好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が他のアミノ酸で置換されていてもよい。
本発明の部分ペプチドとしては、例えば、配列番号:1で表されるアミノ酸配列において、例えば第340番目〜370番目、第490番目〜520番目のアミノ酸配列、配列番号:26で表されるアミノ酸配列において、例えば第335番目〜365番目、第490番目〜520番目のアミノ酸配列、配列番号:52で表されるアミノ酸配列において、例えば第335番目〜365番目、第490番目〜520番目のアミノ酸配列、配列番号:54で表されるアミノ酸配列において、例えば第335番目〜365番目、第490番目〜520番目のアミノ酸配列などを含有するペプチドなどが好ましい。
【0011】
また、本発明で用いられる部分ペプチドはC末端がカルボキシル基(−COOH)、カルボキシレート(−COO)アミド(−CONH)またはエステル(−COOR)の何れであってもよい。
さらに、本発明で用いられる部分ペプチドには、前記した本発明のタンパク質と同様に、C末端以外にカルボキシル基(またはカルボキシレート)を有しているもの、N末端のアミノ酸残基(例、メチオニン残基)のアミノ基が保護基で保護されているもの、N端側が生体内で切断され生成したグルタミン残基がピログルタミン酸化したもの、分子内のアミノ酸の側鎖上の置換基が適当な保護基で保護されているもの、あるいは糖鎖が結合したいわゆる糖ペプチドなどの複合ペプチドなども含まれる。
本発明で用いられる部分ペプチドは抗体作成のための抗原としても用いることができる。たとえば、後述する本発明の抗体を調製する目的には、例えば、配列番号:1で表されるアミノ酸配列において例えば、第340番目〜370番目、第490番目〜520のアミノ酸配列、配列番号:26で表されるアミノ酸配列において例えば、第335番目〜365番目、第490番目〜520番目のアミノ酸配列、配列番号:52で表されるアミノ酸配列において例えば、第335番目〜365番目、第490番目〜520番目のアミノ酸配列、配列番号:54で表されるアミノ酸配列において例えば、第335番目〜365番目、第490番目〜520番目のアミノ酸配列などを含有するペプチドが好ましい。
【0012】
本発明のタンパク質または部分ペプチドの塩としては、生理学的に許容される酸(例、無機酸、有機酸)や塩基(例、アルカリ金属等)などとの塩が用いられ、とりわけ生理学的に許容される酸付加塩が好ましい。このような塩としては、例えば、無機酸(例えば、塩酸、リン酸、臭化水素酸、硫酸)との塩、あるいは有機酸(例えば、酢酸、ギ酸、プロピオン酸、フマル酸、マレイン酸、コハク酸、酒石酸、クエン酸、リンゴ酸、蓚酸、安息香酸、メタンスルホン酸、ベンゼンスルホン酸)との塩などが用いられる。
本発明のタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩は、前述したヒトや温血動物の細胞または組織から公知のタンパク質の精製方法によって製造することもできるし、タンパク質をコードするDNAを含有する形質転換体を培養することによっても製造することができる。また、後述のペプチド合成法に準じて製造することもできる。
ヒトや哺乳動物の組織または細胞から製造する場合、ヒトや哺乳動物の組織または細胞をホモジナイズした後、酸などで抽出を行ない、該抽出液を逆相クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィーなどのクロマトグラフィーを組み合わせることにより精製単離することができる。
【0013】
本発明のタンパク質もしくは部分ペプチドまたはその塩、またはそのアミド体の合成には、通常市販のタンパク質合成用樹脂を用いることができる。そのような樹脂としては、例えば、クロロメチル樹脂、ヒドロキシメチル樹脂、ベンズヒドリルアミン樹脂、アミノメチル樹脂、4−ベンジルオキシベンジルアルコール樹脂、4−メチルベンズヒドリルアミン樹脂、PAM樹脂、4−ヒドロキシメチルメチルフェニルアセトアミドメチル樹脂、ポリアクリルアミド樹脂、4−(2’,4’−ジメトキシフェニル−ヒドロキシメチル)フェノキシ樹脂、4−(2’,4’−ジメトキシフェニル−Fmocアミノエチル)フェノキシ樹脂などを挙げることができる。このような樹脂を用い、α−アミノ基と側鎖官能基を適当に保護したアミノ酸を、目的とするタンパク質の配列通りに、公知の各種縮合方法に従い、樹脂上で縮合させる。反応の最後に樹脂からタンパク質または部分ペプチドを切り出すと同時に各種保護基を除去し、さらに高希釈溶液中で分子内ジスルフィド結合形成反応を実施し、目的のタンパク質もしくは部分ペプチドまたはそれらのアミド体を取得する。
上記した保護アミノ酸の縮合に関しては、タンパク質合成に使用できる各種活性化試薬を用いることができるが、特に、カルボジイミド類がよい。カルボジイミド類としては、DCC、N,N’−ジイソプロピルカルボジイミド、N−エチル−N’−(3−ジメチルアミノプロリル)カルボジイミドなどが用いられる。これらによる活性化にはラセミ化抑制添加剤(例えば、HOBt,HOOBt)とともに保護アミノ酸を直接樹脂に添加するかまたは、対称酸無水物またはHOBtエステルあるいはHOOBtエステルとしてあらかじめ保護アミノ酸の活性化を行なった後に樹脂に添加することができる。
【0014】
保護アミノ酸の活性化や樹脂との縮合に用いられる溶媒としては、タンパク質縮合反応に使用しうることが知られている溶媒から適宜選択されうる。例えば、N,N−ジメチルホルムアミド,N,N−ジメチルアセトアミド,N−メチルピロリドンなどの酸アミド類、塩化メチレン,クロロホルムなどのハロゲン化炭化水素類、トリフルオロエタノールなどのアルコール類、ジメチルスルホキシドなどのスルホキシド類、ピリジン,ジオキサン,テトラヒドロフランなどのエーテル類、アセトニトリル,プロピオニトリルなどのニトリル類、酢酸メチル,酢酸エチルなどのエステル類あるいはこれらの適宜の混合物などが用いられる。反応温度はタンパク質結合形成反応に使用され得ることが知られている範囲から適宜選択され、通常約−20℃〜50℃の範囲から適宜選択される。活性化されたアミノ酸誘導体は通常1.5〜4倍過剰で用いられる。ニンヒドリン反応を用いたテストの結果、縮合が不十分な場合には保護基の脱離を行なうことなく縮合反応を繰り返すことにより十分な縮合を行なうことができる。反応を繰り返しても十分な縮合が得られないときには、無水酢酸またはアセチルイミダゾールを用いて未反応アミノ酸をアセチル化することによって、後の反応に影響を与えないようにすることができる。
【0015】
原料のアミノ基の保護基としては、例えば、Z、Boc、t−ペンチルオキシカルボニル、イソボルニルオキシカルボニル、4−メトキシベンジルオキシカルボニル、Cl−Z、Br−Z、アダマンチルオキシカルボニル、トリフルオロアセチル、フタロイル、ホルミル、2−ニトロフェニルスルフェニル、ジフェニルホスフィノチオイル、Fmocなどが用いられる。
カルボキシル基は、例えば、アルキルエステル化(例えば、メチル、エチル、プロピル、ブチル、t−ブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、シクロオクチル、2−アダマンチルなどの直鎖状、分枝状もしくは環状アルキルエステル化)、アラルキルエステル化(例えば、ベンジルエステル、4−ニトロベンジルエステル、4−メトキシベンジルエステル、4−クロロベンジルエステル、ベンズヒドリルエステル化)、フェナシルエステル化、ベンジルオキシカルボニルヒドラジド化、t−ブトキシカルボニルヒドラジド化、トリチルヒドラジド化などによって保護することができる。
セリンの水酸基は、例えば、エステル化またはエーテル化によって保護することができる。このエステル化に適する基としては、例えば、アセチル基などの低級(C1−6)アルカノイル基、ベンゾイル基などのアロイル基、ベンジルオキシカルボニル基、エトキシカルボニル基などの炭酸から誘導される基などが用いられる。また、エーテル化に適する基としては、例えば、ベンジル基、テトラヒドロピラニル基、t−ブチル基などである。
チロシンのフェノール性水酸基の保護基としては、例えば、Bzl、Cl−Bzl、2−ニトロベンジル、Br−Z、t−ブチルなどが用いられる。
ヒスチジンのイミダゾールの保護基としては、例えば、Tos、4−メトキシ−2,3,6−トリメチルベンゼンスルホニル、DNP、ベンジルオキシメチル、Bum、Boc、Trt、Fmocなどが用いられる。
【0016】
原料のカルボキシル基の活性化されたものとしては、例えば、対応する酸無水物、アジド、活性エステル〔アルコール(例えば、ペンタクロロフェノール、2,4,5−トリクロロフェノール、2,4−ジニトロフェノール、シアノメチルアルコール、パラニトロフェノール、HONB、N−ヒドロキシスクシミド、N−ヒドロキシフタルイミド、HOBt)とのエステル〕などが用いられる。原料のアミノ基の活性化されたものとしては、例えば、対応するリン酸アミドが用いられる。
保護基の除去(脱離)方法としては、例えば、Pd−黒あるいはPd−炭素などの触媒の存在下での水素気流中での接触還元や、また、無水フッ化水素、メタンスルホン酸、トリフルオロメタンスルホン酸、トリフルオロ酢酸あるいはこれらの混合液などによる酸処理や、ジイソプロピルエチルアミン、トリエチルアミン、ピペリジン、ピペラジンなどによる塩基処理、また液体アンモニア中ナトリウムによる還元なども用いられる。上記酸処理による脱離反応は、一般に約−20℃〜40℃の温度で行なわれるが、酸処理においては、例えば、アニソール、フェノール、チオアニソール、メタクレゾール、パラクレゾール、ジメチルスルフィド、1,4−ブタンジチオール、1−2−エタンジチオールなどのようなリガンド作動性カチオン捕捉剤の添加が有効である。また、ヒスチジンのイミダゾール保護基として用いられる2,4−ジニトロフェニル基はチオフェノール処理により除去され、トリプトファンのインドール保護基として用いられるホルミル基は上記の1−2−エタンジチオール、1,4−ブタンジチオールなどの存在下の酸処理による脱保護以外に、希水酸化ナトリウム溶液、希アンモニアなどによるアルカリ処理によっても除去される。
【0017】
原料の反応に関与すべきでない官能基の保護ならびに保護基、およびその保護基の脱離、反応に関与する官能基の活性化などは公知の基または公知の手段から適宜選択しうる。
タンパク質または部分ペプチドのアミド体を得る別の方法としては、例えば、まず、カルボキシ末端アミノ酸のα−カルボキシル基をアミド化して保護した後、アミノ基側にペプチド(タンパク質)鎖を所望の鎖長まで延ばした後、該ペプチド鎖のN末端のα−アミノ基の保護基のみを除いたタンパク質または部分ペプチドとC末端のカルボキシル基の保護基のみを除去したタンパク質または部分ペプチドとを製造し、これらのタンパク質またはペプチドを上記したような混合溶媒中で縮合させる。縮合反応の詳細については上記と同様である。縮合により得られた保護タンパク質またはペプチドを精製した後、上記方法によりすべての保護基を除去し、所望の粗タンパク質またはペプチドを得ることができる。この粗タンパク質またはペプチドは既知の各種精製手段を駆使して精製し、主要画分を凍結乾燥することで所望のタンパク質またはペプチドのアミド体を得ることができる。
タンパク質またはペプチドのエステル体を得るには、例えば、カルボキシ末端アミノ酸のα−カルボキシル基を所望のアルコール類と縮合しアミノ酸エステルとした後、タンパク質またはペプチドのアミド体と同様にして、所望のタンパク質またはペプチドのエステル体を得ることができる。
【0018】
本発明で用いられる部分ペプチドまたはそれらの塩は、公知のペプチドの合成法に従って、あるいは本発明のタンパク質を適当なペプチダーゼで切断することによって製造することができる。ペプチドの合成法としては、例えば、固相合成法、液相合成法のいずれによっても良い。すなわち、本発明で用いられる部分ペプチドを構成し得る部分ペプチドもしくはアミノ酸と残余部分とを縮合させ、生成物が保護基を有する場合は保護基を脱離することにより目的のペプチドを製造することができる。公知の縮合方法や保護基の脱離としては、例えば、以下の(a)〜(e)に記載された方法が挙げられる。
(a)M. Bodanszky および M.A. Ondetti、ペプチド・シンセシス (Peptide Synthesis), Interscience Publishers, New York (1966年)
(b)SchroederおよびLuebke、ザ・ペプチド(The Peptide), Academic Press, New York (1965年)
(c)泉屋信夫他、ペプチド合成の基礎と実験、 丸善(株) (1975年)
(d)矢島治明 および榊原俊平、生化学実験講座 1、 タンパク質の化学IV、 205、(1977年)
(e)矢島治明監修、続医薬品の開発、第14巻、ペプチド合成、広川書店
また、反応後は通常の精製法、例えば、溶媒抽出・蒸留・カラムクロマトグラフィー・液体クロマトグラフィー・再結晶などを組み合わせて本発明で用いられる部分ペプチドを精製単離することができる。上記方法で得られる部分ペプチドが遊離体である場合は、公知の方法あるいはそれに準じる方法によって適当な塩に変換することができるし、逆に塩で得られた場合は、公知の方法あるいはそれに準じる方法によって遊離体または他の塩に変換することができる。
【0019】
本発明のタンパク質をコードするポリヌクレオチドとしては、前述した本発明のタンパク質をコードする塩基配列を含有するものであればいかなるものであってもよい。好ましくはDNAである。DNAとしては、ゲノムDNA、ゲノムDNAライブラリー、前記した細胞・組織由来のcDNA、前記した細胞・組織由来のcDNAライブラリー、合成DNAのいずれでもよい。
ライブラリーに使用するベクターは、バクテリオファージ、プラスミド、コスミド、ファージミドなどいずれであってもよい。また、前記した細胞・組織よりtotalRNAまたはmRNA画分を調製したものを用いて直接Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction(以下、RT−PCR法と略称する)によって増幅することもできる。
本発明のタンパク質をコードするDNAとしては、例えば(i)配列番号:2で表される塩基配列を含有するDNA、または配列番号:2で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列を有し、配列番号:1で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質と実質的に同質の性質を有するタンパク質をコードするDNA、(ii)配列番号:25で表される塩基配列を含有するDNA、または配列番号:25で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列を有し、配列番号:1で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質と実質的に同質の性質を有するタンパク質をコードするDNA、(iii)配列番号:27で表される塩基配列を含有するDNA、または配列番号:27で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列を有し、配列番号:26で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質と実質的に同質の性質を有するタンパク質をコードするDNA、(iv)配列番号:51で表される塩基配列を含有するDNA、または配列番号:51で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列を有し、配列番号:26で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質と実質的に同質の性質を有するタンパク質をコードするDNA、(v)配列番号:53で表される塩基配列を含有するDNA、または配列番号:53で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列を有し、配列番号:52で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質と実質的に同質の性質を有するタンパク質をコードするDNA、(vi)配列番号:80で表される塩基配列を含有するDNA、または配列番号:80で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列を有し、配列番号:52で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質と実質的に同質の性質を有するタンパク質をコードするDNA、(vii)配列番号:55で表される塩基配列を含有するDNA、または配列番号:55で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列を有し、配列番号:54で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質と実質的に同質の性質を有するタンパク質をコードするDNA、(viii)配列番号:81で表される塩基配列を含有するDNA、または配列番号:81で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列を有し、配列番号:54で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質と実質的に同質の性質を有するタンパク質をコードするDNAであれば何れのものでもよい。
【0020】
配列番号:2または配列番号:25で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズできるDNAとしては、例えば、配列番号:2または配列番号:25で表される塩基配列と約50%以上、好ましくは約60%以上、好ましくは約70%以上、好ましくは約80%以上、好ましくは約90%以上、より好ましくは約95%以上、特に好ましくは約99%以上の相同性を有する塩基配列を含有するDNAなどが用いられる。
配列番号:27または配列番号:51で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズできるDNAとしては、例えば、配列番号:27または配列番号:51で表される塩基配列と約50%以上、好ましくは約60%以上、好ましくは約70%以上、好ましくは約80%以上、好ましくは約90%以上、より好ましくは約95%以上、特に好ましくは約99%以上の相同性を有する塩基配列を含有するDNAなどが用いられる。
配列番号:53または配列番号:80で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズできるDNAとしては、例えば、配列番号:53または配列番号:80で表される塩基配列と約50%以上、好ましくは約60%以上、好ましくは約70%以上、好ましくは約80%以上、好ましくは約90%以上、より好ましくは約95%以上、特に好ましくは約99%以上の相同性を有する塩基配列を含有するDNAなどが用いられる。
配列番号:55または配列番号:81で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズできるDNAとしては、例えば、配列番号:55または配列番号:81で表される塩基配列と約50%以上、好ましくは約60%以上、好ましくは約70%以上、好ましくは約80%以上、好ましくは約90%以上、より好ましくは約95%以上、特に好ましくは約99%以上の相同性を有する塩基配列を含有するDNAなどが用いられる。
ハイブリダイゼーションは、公知の方法あるいはそれに準じる方法、例えば、モレキュラー・クローニング(Molecular Cloning)2nd(J. Sambrook et al.,Cold Spring Harbor Lab. Press, 1989)に記載の方法などに従って行なうことができる。また、市販のライブラリーを使用する場合、添付の使用説明書に記載の方法に従って行なうことができる。より好ましくは、ハイストリンジェントな条件に従って行なうことができる。
ハイストリンジェントな条件とは、例えば、ナトリウム濃度が約19〜40mM、好ましくは約19〜20mMで、温度が約50〜70℃、好ましくは約60〜65℃の条件を示す。特に、ナトリウム濃度が約19mMで温度が約65℃の場合が最も好ましい。
より具体的には、配列番号:1で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質をコードするDNAとしては、配列番号:2で表される塩基配列を含有するDNA、配列番号:25で表される塩基配列を含有するDNAなどが、配列番号:26で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質をコードするDNAとしては、配列番号:27で表される塩基配列を含有するDNA、配列番号:51で表される塩基配列を含有するDNAなどが、配列番号:52で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質をコードするDNAとしては、配列番号:53で表される塩基配列を含有するDNA、配列番号:80で表される塩基配列を含有するDNAなどが、配列番号:54で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質をコードするDNAとしては、配列番号:55で表される塩基配列を含有するDNA、配列番号:81で表される塩基配列を含有するDNAなどが用いられる。
【0021】
本発明で用いられる部分ペプチドをコードするポリヌクレオチド(例、DNA)としては、前述した本発明で用いられる部分ペプチドをコードする塩基配列を含有するものであればいかなるものであってもよい。また、ゲノムDNA、ゲノムDNAライブラリー、前記した細胞・組織由来のcDNA、前記した細胞・組織由来のcDNAライブラリー、合成DNAのいずれでもよい。
本発明で用いられる部分ペプチドをコードするDNAとしては、例えば、(1)配列番号:2または配列番号:25で表される塩基配列を有するDNAの一部分を有するDNA、または配列番号:2または配列番号:25で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列を含有し、本発明のタンパク質と実質的に同質の活性を有するタンパク質をコードするDNAの一部分を含有するDNA、(2)配列番号:27で表される塩基配列を有するDNAの一部分を有するDNA、または配列番号:27で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列を含有し、本発明のタンパク質と実質的に同質の活性を有するタンパク質をコードするDNAの一部分を含有するDNA、(3)配列番号:53で表される塩基配列を有するDNAの一部分を有するDNA、または配列番号:53で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列を含有し、本発明のタンパク質と実質的に同質の活性を有するタンパク質をコードするDNAの一部分を含有するDNA、(4)配列番号:55で表される塩基配列を有するDNAの一部分を有するDNA、または配列番号:55で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列を含有し、本発明のタンパク質と実質的に同質の活性を有するタンパク質をコードするDNAの一部分を含有するDNAなどが用いられる。
配列番号:2、配列番号:25、配列番号:27、配列番号:53または配列番号:55で表される塩基配列とハイブリダイズできるDNAは、前記と同意義を示す。
ハイブリダイゼーションの方法およびハイストリンジェントな条件は前記と同様のものが用いられる。
【0022】
本発明のタンパク質、部分ペプチド(以下、これらをコードするDNAのクローニングおよび発現の説明においては、これらを単に本発明のタンパク質と略記する場合がある)を完全にコードするDNAのクローニングの手段としては、本発明のタンパク質をコードする塩基配列の一部分を有する合成DNAプライマーを用いてPCR法によって増幅するか、または適当なベクターに組み込んだDNAを本発明のタンパク質の一部あるいは全領域をコードするDNA断片もしくは合成DNAを用いて標識したものとのハイブリダイゼーションによって選別することができる。ハイブリダイゼーションの方法は、例えば、モレキュラー・クローニング(Molecular Cloning)2nd(J. Sambrook et al., Cold Spring Harbor Lab. Press, 1989)に記載の方法などに従って行なうことができる。また、市販のライブラリーを使用する場合、添付の使用説明書に記載の方法に従って行なうことができる。
DNAの塩基配列の変換は、PCRや公知のキット、例えば、MutanTM−super Express Km(宝酒造(株))、MutanTM−K(宝酒造(株))等を用いて、ODA−LA PCR法やGapped duplex法やKunkel法等の公知の方法あるいはそれらに準じる方法に従って行なうことができる。
クローン化されたタンパク質をコードするDNAは目的によりそのまま、または所望により制限酵素で消化したり、リンカーを付加したりして使用することができる。該DNAはその5’末端側に翻訳開始コドンとしてのATGを有し、また3’末端側には翻訳終止コドンとしてのTAA、TGAまたはTAGを有していてもよい。これらの翻訳開始コドンや翻訳終止コドンは、適当な合成DNAアダプターを用いて付加することもできる。
本発明のタンパク質の発現ベクターは、例えば、(イ)本発明のタンパク質をコードするDNAから目的とするDNA断片を切り出し、(ロ)該DNA断片を適当な発現ベクター中のプロモーターの下流に連結することにより製造することができる。
【0023】
ベクターとしては、大腸菌由来のプラスミド(例、pBR322,pBR325,pUC12,pUC13)、枯草菌由来のプラスミド(例、pUB110,pTP5,pC194)、酵母由来プラスミド(例、pSH19,pSH15)、λファージなどのバクテリオファージ、レトロウイルス,ワクシニアウイルス,バキュロウイルスなどの動物ウイルスなどの他、pA1−11、pXT1、pRc/CMV、pRc/RSV、pcDNAI/Neoなどが用いられる。
本発明で用いられるプロモーターとしては、遺伝子の発現に用いる宿主に対応して適切なプロモーターであればいかなるものでもよい。例えば、動物細胞を宿主として用いる場合は、SRαプロモーター、SV40プロモーター、LTRプロモーター、CMVプロモーター、HSV−TKプロモーターなどが挙げられる。
これらのうち、CMV(サイトメガロウイルス)プロモーター、SRαプロモーターなどを用いるのが好ましい。宿主がエシェリヒア属菌である場合は、trpプロモーター、lacプロモーター、recAプロモーター、λPLプロモーター、lppプロモーター、T7プロモーターなどが、宿主がバチルス属菌である場合は、SPO1プロモーター、SPO2プロモーター、penPプロモーターなど、宿主が酵母である場合は、PHO5プロモーター、PGKプロモーター、GAPプロモーター、ADHプロモーターなどが好ましい。宿主が昆虫細胞である場合は、ポリヘドリンプロモーター、P10プロモーターなどが好ましい。
【0024】
発現ベクターには、以上の他に、所望によりエンハンサー、スプライシングシグナル、ポリA付加シグナル、選択マーカー、SV40複製オリジン(以下、SV40oriと略称する場合がある)などを含有しているものを用いることができる。選択マーカーとしては、例えば、ジヒドロ葉酸還元酵素(以下、dhfrと略称する場合がある)遺伝子〔メソトレキセート(MTX)耐性〕、アンピシリン耐性遺伝子(以下、Ampと略称する場合がある)、ネオマイシン耐性遺伝子(以下、Neoと略称する場合がある、G418耐性)等が挙げられる。特に、dhfr遺伝子欠損チャイニーズハムスター細胞を用いてdhfr遺伝子を選択マーカーとして使用する場合、目的遺伝子をチミジンを含まない培地によっても選択できる。
また、必要に応じて、宿主に合ったシグナル配列を、本発明のタンパク質のN端末側に付加する。宿主がエシェリヒア属菌である場合は、PhoA・シグナル配列、OmpA・シグナル配列などが、宿主がバチルス属菌である場合は、α−アミラーゼ・シグナル配列、サブチリシン・シグナル配列などが、宿主が酵母である場合は、MFα・シグナル配列、SUC2・シグナル配列など、宿主が動物細胞である場合には、インシュリン・シグナル配列、α−インターフェロン・シグナル配列、抗体分子・シグナル配列などがそれぞれ利用できる。
このようにして構築された本発明のタンパク質をコードするDNAを含有するベクターを用いて、形質転換体を製造することができる。
【0025】
宿主としては、例えば、エシェリヒア属菌、バチルス属菌、酵母、昆虫細胞、昆虫、動物細胞などが用いられる。
エシェリヒア属菌の具体例としては、例えば、エシェリヒア・コリ(Escherichia coli)K12・DH1〔Proc. Natl. Acad. Sci. USA,60巻,160(1968)〕,JM103〔Nucleic Acids Research,9巻,309(1981)〕,JA221〔Journal of Molecular Biology,120巻,517(1978)〕,HB101〔Journal of Molecular Biology,41巻,459(1969)〕,C600〔Genetics,39巻,440(1954)〕などが用いられる。
バチルス属菌としては、例えば、バチルス・サブチルス(Bacillus subtilis)MI114〔Gene,24巻,255(1983)〕,207−21〔Journal of Biochemistry,95巻,87(1984)〕などが用いられる。
酵母としては、例えば、サッカロマイセス セレビシエ(Saccharomyces cerevisiae)AH22,AH22R,NA87−11A,DKD−5D,20B−12、シゾサッカロマイセス ポンベ(Schizosaccharomyces pombe)NCYC1913,NCYC2036、ピキア パストリス(Pichia pastoris)KM71などが用いられる。
【0026】
昆虫細胞としては、例えば、ウイルスがAcNPVの場合は、夜盗蛾の幼虫由来株化細胞(Spodoptera frugiperda cell;Sf細胞)、Trichoplusia niの中腸由来のMG1細胞、Trichoplusia niの卵由来のHigh FiveTM細胞、Mamestra brassicae由来の細胞またはEstigmena acrea由来の細胞などが用いられる。ウイルスがBmNPVの場合は、蚕由来株化細胞(Bombyx mori N 細胞;BmN細胞)などが用いられる。該Sf細胞としては、例えば、Sf9細胞(ATCC CRL1711)、Sf21細胞(以上、Vaughn, J.L.ら、イン・ヴィボ(In Vivo),13, 213−217,(1977))などが用いられる。
昆虫としては、例えば、カイコの幼虫などが用いられる〔前田ら、ネイチャー(Nature),315巻,592(1985)〕。
動物細胞としては、例えば、サル細胞COS−7,Vero,チャイニーズハムスター細胞CHO(以下、CHO細胞と略記),dhfr遺伝子欠損チャイニーズハムスター細胞CHO(以下、CHO(dhfr)細胞と略記),マウスL細胞,マウスAtT−20,マウスミエローマ細胞,ラットGH3,ヒトFL細胞などが用いられる。
エシェリヒア属菌を形質転換するには、例えば、Proc. Natl. Acad. Sci. USA,69巻,2110(1972)やGene,17巻,107(1982)などに記載の方法に従って行なうことができる。
【0027】
バチルス属菌を形質転換するには、例えば、モレキュラー・アンド・ジェネラル・ジェネティックス(Molecular & General Genetics),168巻,111(1979)などに記載の方法に従って行なうことができる。
酵母を形質転換するには、例えば、Methods in Enzymology,194巻,182−187(1991)、Proc. Natl. Acad. Sci. USA,75巻,1929(1978)などに記載の方法に従って行なうことができる。
昆虫細胞または昆虫を形質転換するには、例えば、Bio/Technology,6, 47−55(1988)などに記載の方法に従って行なうことができる。
動物細胞を形質転換するには、例えば、細胞工学別冊8 新細胞工学実験プロトコール.263−267(1995)(秀潤社発行)、Virology,52巻,456(1973)に記載の方法に従って行なうことができる。
このようにして、タンパク質をコードするDNAを含有する発現ベクターで形質転換された形質転換体を得ることができる。
宿主がエシェリヒア属菌、バチルス属菌である形質転換体を培養する際、培養に使用される培地としては液体培地が適当であり、その中には該形質転換体の生育に必要な炭素源、窒素源、無機物その他が含有せしめられる。炭素源としては、例えば、グルコース、デキストリン、可溶性澱粉、ショ糖など、窒素源としては、例えば、アンモニウム塩類、硝酸塩類、コーンスチープ・リカー、ペプトン、カゼイン、肉エキス、大豆粕、バレイショ抽出液などの無機または有機物質、無機物としては、例えば、塩化カルシウム、リン酸二水素ナトリウム、塩化マグネシウムなどが挙げられる。また、酵母エキス、ビタミン類、生長促進因子などを添加してもよい。培地のpHは約5〜8が望ましい。
【0028】
エシェリヒア属菌を培養する際の培地としては、例えば、グルコース、カザミノ酸を含むM9培地〔Journal of Experiments in Molecular Genetics, 431−433, Cold Spring Harbor Laboratory, New York 1972〕が好ましい。ここに必要によりプロモーターを効率よく働かせるために、例えば、3β−インドリルアクリル酸のような薬剤を加えることができる。
宿主がエシェリヒア属菌の場合、培養は通常約15〜43℃で約3〜24時間行ない、必要により、通気や撹拌を加えることもできる。
宿主がバチルス属菌の場合、培養は通常約30〜40℃で約6〜24時間行ない、必要により通気や撹拌を加えることもできる。
宿主が酵母である形質転換体を培養する際、培地としては、例えば、バークホールダー(Burkholder)最小培地〔Bostian, K. L. ら、Proc. Natl. Acad. Sci. USA,77巻,4505(1980)〕や0.5%カザミノ酸を含有するSD培地〔Bitter, G. A. ら、Proc. Natl. Acad. Sci. USA,81巻,5330(1984)〕が挙げられる。培地のpHは約5〜8に調整するのが好ましい。培養は通常約20〜35℃で約24〜72時間行ない、必要に応じて通気や撹拌を加える。
宿主が昆虫細胞または昆虫である形質転換体を培養する際、培地としては、Grace’s Insect Medium(Nature,195,788(1962))に非動化した10%ウシ血清等の添加物を適宜加えたものなどが用いられる。培地のpHは約6.2〜6.4に調整するのが好ましい。培養は通常約27℃で約3〜5日間行ない、必要に応じて通気や撹拌を加える。
宿主が動物細胞である形質転換体を培養する際、培地としては、例えば、約5〜20%の胎児牛血清を含むMEM培地〔Science,122巻,501(1952)〕,DMEM培地〔Virology,8巻,396(1959)〕,RPMI 1640培地〔The Journal ofthe American Medical Association 199巻,519(1967)〕,199培地〔Proceeding of the Society for the Biological Medicine,73巻,1(1950)〕などが用いられる。pHは約6〜8であるのが好ましい。培養は通常約30〜40℃で約15〜60時間行ない、必要に応じて通気や撹拌を加える。
以上のようにして、形質転換体の細胞内、細胞膜または細胞外に本発明のタンパク質を生成せしめることができる。
【0029】
上記培養物から本発明のタンパク質を分離精製するには、例えば、下記の方法により行なうことができる。
本発明のタンパク質を培養菌体あるいは細胞から抽出するに際しては、培養後、公知の方法で菌体あるいは細胞を集め、これを適当な緩衝液に懸濁し、超音波、リゾチームおよび/または凍結融解などによって菌体あるいは細胞を破壊したのち、遠心分離やろ過によりタンパク質の粗抽出液を得る方法などが適宜用いられる。緩衝液の中に尿素や塩酸グアニジンなどの蛋白質変性剤や、トリトンX−100TMなどの界面活性剤が含まれていてもよい。培養液中にタンパク質が分泌される場合には、培養終了後、公知の方法で菌体あるいは細胞と上清とを分離し、上清を集める。
このようにして得られた培養上清、あるいは抽出液中に含まれるタンパク質の精製は、公知の分離・精製法を適切に組み合わせて行なうことができる。これらの公知の分離、精製法としては、塩析や溶媒沈澱法などの溶解度を利用する方法、透析法、限外ろ過法、ゲルろ過法、およびSDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動法などの主として分子量の差を利用する方法、イオン交換クロマトグラフィーなどの荷電の差を利用する方法、アフィニティークロマトグラフィーなどの特異的親和性を利用する方法、逆相高速液体クロマトグラフィーなどの疎水性の差を利用する方法、等電点電気泳動法などの等電点の差を利用する方法などが用いられる。
【0030】
かくして得られるタンパク質が遊離体で得られた場合には、公知の方法あるいはそれに準じる方法によって塩に変換することができ、逆に塩で得られた場合には公知の方法あるいはそれに準じる方法により、遊離体または他の塩に変換することができる。
なお、組換え体が産生するタンパク質を、精製前または精製後に適当な蛋白質修飾酵素を作用させることにより、任意に修飾を加えたり、ポリペプチドを部分的に除去することもできる。蛋白質修飾酵素としては、例えば、トリプシン、キモトリプシン、アルギニルエンドペプチダーゼ、プロテインキナーゼ、グリコシダーゼなどが用いられる。
かくして生成する本発明のタンパク質の存在は、特異抗体を用いたエンザイムイムノアッセイやウエスタンブロッティングなどにより測定することができる。
【0031】
本発明のタンパク質もしくは部分ペプチドまたはその塩に対する抗体は、本発明のタンパク質もしくは部分ペプチドまたはその塩を認識し得る抗体であれば、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体の何れであってもよい。
本発明のタンパク質もしくは部分ペプチドまたはその塩(以下、抗体の説明においては、これらを単に本発明のタンパク質と略記する場合がある)に対する抗体は、本発明のタンパク質を抗原として用い、公知の抗体または抗血清の製造法に従って製造することができる。
〔モノクローナル抗体の作製〕
(a)モノクローナル抗体産生細胞の作製
本発明のタンパク質は、温血動物に対して投与により抗体産生が可能な部位にそれ自体あるいは担体、希釈剤とともに投与される。投与に際して抗体産生能を高めるため、完全フロイントアジュバントや不完全フロイントアジュバントを投与してもよい。投与は通常2〜6週毎に1回ずつ、計2〜10回程度行われる。用いられる温血動物としては、例えば、サル、ウサギ、イヌ、モルモット、マウス、ラット、ヒツジ、ヤギ、ニワトリが挙げられるが、マウスおよびラットが好ましく用いられる。
モノクローナル抗体産生細胞の作製に際しては、抗原で免疫された温血動物、例えばマウスから抗体価の認められた個体を選択し最終免疫の2〜5日後に脾臓またはリンパ節を採取し、それらに含まれる抗体産生細胞を同種または異種動物の骨髄腫細胞と融合させることにより、モノクローナル抗体産生ハイブリドーマを調製することができる。抗血清中の抗体価の測定は、例えば、後記の標識化タンパク質と抗血清とを反応させたのち、抗体に結合した標識剤の活性を測定することにより行なうことができる。融合操作は既知の方法、例えば、ケーラーとミルスタインの方法〔Nature、256、495 (1975)〕に従い実施することができる。融合促進剤としては、例えば、ポリエチレングリコール(PEG)やセンダイウィルスなどが挙げられるが、好ましくはPEGが用いられる。
【0032】
骨髄腫細胞としては、例えば、NS−1、P3U1、SP2/0、AP−1などの温血動物の骨髄腫細胞が挙げられるが、P3U1が好ましく用いられる。用いられる抗体産生細胞(脾臓細胞)数と骨髄腫細胞数との好ましい比率は1:1〜20:1程度であり、PEG(好ましくはPEG1000〜PEG6000)が10〜80%程度の濃度で添加され、20〜40℃、好ましくは30〜37℃で1〜10分間インキュベートすることにより効率よく細胞融合を実施できる。モノクローナル抗体産生ハイブリドーマのスクリーニングには種々の方法が使用できるが、例えば、タンパク質抗原を直接あるいは担体とともに吸着させた固相(例、マイクロプレート)にハイブリドーマ培養上清を添加し、次に放射性物質や酵素などで標識した抗免疫グロブリン抗体(細胞融合に用いられる細胞がマウスの場合、抗マウス免疫グロブリン抗体が用いられる)またはプロテインAを加え、固相に結合したモノクローナル抗体を検出する方法、抗免疫グロブリン抗体またはプロテインAを吸着させた固相にハイブリドーマ培養上清を添加し、放射性物質や酵素などで標識したタンパク質を加え、固相に結合したモノクローナル抗体を検出する方法などが挙げられる。
モノクローナル抗体の選別は、公知あるいはそれに準じる方法に従って行なうことができる。通常HAT(ヒポキサンチン、アミノプテリン、チミジン)を添加した動物細胞用培地で行なうことができる。選別および育種用培地としては、ハイブリドーマが生育できるものならばどのような培地を用いても良い。例えば、1〜20%、好ましくは10〜20%の牛胎児血清を含むRPMI 1640培地、1〜10%の牛胎児血清を含むGIT培地(和光純薬工業(株))あるいはハイブリドーマ培養用無血清培地(SFM−101、日水製薬(株))などを用いることができる。培養温度は、通常20〜40℃、好ましくは約37℃である。培養時間は、通常5日〜3週間、好ましくは1週間〜2週間である。培養は、通常5%炭酸ガス下で行なうことができる。ハイブリドーマ培養上清の抗体価は、上記の抗血清中の抗体価の測定と同様にして測定できる。
【0033】
(b)モノクローナル抗体の精製
モノクローナル抗体の分離精製は、公知の方法、例えば、免疫グロブリンの分離精製法〔例、塩析法、アルコール沈殿法、等電点沈殿法、電気泳動法、イオン交換体(例、DEAE)による吸脱着法、超遠心法、ゲルろ過法、抗原結合固相あるいはプロテインAあるいはプロテインGなどの活性吸着剤により抗体のみを採取し、結合を解離させて抗体を得る特異的精製法〕に従って行なうことができる。
【0034】
〔ポリクローナル抗体の作製〕
本発明のポリクローナル抗体は、公知あるいはそれに準じる方法に従って製造することができる。例えば、免疫抗原(タンパク質抗原)自体、あるいはそれとキャリアー蛋白質との複合体をつくり、上記のモノクローナル抗体の製造法と同様に温血動物に免疫を行ない、該免疫動物から本発明のタンパク質に対する抗体含有物を採取して、抗体の分離精製を行なうことにより製造することができる。温血動物を免疫するために用いられる免疫抗原とキャリアー蛋白質との複合体に関し、キャリアー蛋白質の種類およびキャリアー蛋白質とハプテンとの混合比は、キャリアー蛋白質に架橋させて免疫したハプテンに対して抗体が効率良くできれば、どの様なものをどの様な比率で架橋させてもよいが、例えば、ウシ血清アルブミンやウシサイログロブリン、ヘモシアニン等を重量比でハプテン1に対し、約0.1〜20、好ましくは約1〜5の割合でカプルさせる方法が用いられる。
また、ハプテンとキャリアー蛋白質のカプリングには、種々の縮合剤を用いることができるが、グルタルアルデヒドやカルボジイミド、マレイミド活性エステル、チオール基、ジチオビリジル基を含有する活性エステル試薬等が用いられる。
縮合生成物は、温血動物に対して、抗体産生が可能な部位にそれ自体あるいは担体、希釈剤とともに投与される。投与に際して抗体産生能を高めるため、完全フロイントアジュバントや不完全フロイントアジュバントを投与してもよい。投与は、通常約2〜6週毎に1回ずつ、計約3〜10回程度行なわれる。
ポリクローナル抗体は、上記の方法で免疫された温血動物の血液、腹水など、好ましくは血液から採取することができる。
抗血清中のポリクローナル抗体価の測定は、上記の抗血清中の抗体価の測定と同様にして測定できる。ポリクローナル抗体の分離精製は、上記のモノクローナル抗体の分離精製と同様の免疫グロブリンの分離精製法に従って行なうことができる。
【0035】
本発明のタンパク質または部分ペプチドをコードするDNA(以下、アンチセンスポリヌクレオチドの説明においては、これらのDNAを本発明のDNAと略記する場合がある)の塩基配列に相補的な、または実質的に相補的な塩基配列またはその一部を有するアンチセンスポリヌクレオチドとしては、本発明のDNAの塩基配列に相補的な、または実質的に相補的な塩基配列またはその一部を有し、該DNAの発現を抑制し得る作用を有するものであれば、いずれのアンチセンスポリヌクレオチドであってもよいが、アンチセンスDNAが好ましい。
本発明のDNAに実質的に相補的な塩基配列とは、例えば、本発明のDNAに相補的な塩基配列(すなわち、本発明のDNAの相補鎖)の全塩基配列あるいは部分塩基配列と約70%以上、好ましくは約80%以上、より好ましくは約90%以上、最も好ましくは約95%以上の相同性を有する塩基配列などが挙げられる。特に、本発明のDNAの相補鎖の全塩基配列うち、本発明のタンパク質のN末端部位をコードする部分の塩基配列(例えば、開始コドン付近の塩基配列など)の相補鎖と約70%以上、好ましくは約80%以上、より好ましくは約90%以上、最も好ましくは約95%以上の相同性を有するアンチセンスポリヌクレオチドが好適である。
具体的には、配列番号:2、配列番号:27、配列番号:53または配列番号:55で表わされる塩基配列を有するDNAの塩基配列に相補的な、もしくは実質的に相補的な塩基配列、またはその一部分を有するアンチセンスポリヌクレオチド、好ましくは例えば、配列番号:2、配列番号:27、配列番号:53または配列番号:55で表わされる塩基配列を有するDNAの塩基配列に相補な塩基配列、またはその一部分を有するアンチセンスポリヌクレオチドなどが挙げられる。
アンチセンスポリヌクレオチドは通常、10〜40個程度、好ましくは15〜30個程度の塩基から構成される。
ヌクレアーゼなどの加水分解酵素による分解を防ぐために、アンチセンスDNAを構成する各ヌクレオチドのリン酸残基(ホスフェート)は、例えば、ホスホロチオエート、メチルホスホネート、ホスホロジチオネートなどの化学修飾リン酸残基に置換されていてもよい。これらのアンチセンスポリヌクレオチドは、公知のDNA合成装置などを用いて製造することができる。
【0036】
本発明に従えば、本発明のタンパク質遺伝子の複製または発現を阻害することのできる該遺伝子に対応するアンチセンスポリヌクレオチド(核酸)を、クローン化した、あるいは決定されたタンパク質をコードするDNAの塩基配列情報に基づき設計し、合成しうる。かかるアンチセンスポリヌクレオチドは、本発明のタンパク質遺伝子のRNAとハイブリダイズすることができ、該RNAの合成または機能を阻害することができるか、あるいは本発明のタンパク質関連RNAとの相互作用を介して本発明のタンパク質遺伝子の発現を調節・制御することができる。本発明のタンパク質関連RNAの選択された配列に相補的なポリヌクレオチド、および本発明のタンパク質関連RNAと特異的にハイブリダイズすることができるポリヌクレオチドは、生体内および生体外で本発明のタンパク質遺伝子の発現を調節・制御するのに有用であり、また病気などの治療または診断に有用である。用語「対応する」とは、遺伝子を含めたヌクレオチド、塩基配列または核酸の特定の配列に相同性を有するあるいは相補的であることを意味する。ヌクレオチド、塩基配列または核酸とタンパク質との間で「対応する」とは、ヌクレオチド(核酸)の配列またはその相補体から誘導される(指令にある)タンパク質のアミノ酸を通常指している。タンパク質遺伝子の5’端ヘアピンループ、5’端6−ベースペア・リピート、5’端非翻訳領域、ポリペプチド翻訳開始コドン、タンパク質コード領域、ORF翻訳終止コドン、3’端非翻訳領域、3’端パリンドローム領域または3’端ヘアピンループなどは、好ましい対象領域として選択しうるが、タンパク質遺伝子内の如何なる領域も対象として選択しうる。目的核酸と、対象領域の少なくとも一部に相補的なポリヌクレオチドとの関係については、目的核酸が対象領域とハイブリダイズすることができる場合は、その目的核酸は、当該対象領域のポリヌクレオチドに対して「アンチセンス」であるということができる。アンチセンスポリヌクレオチドは、2−デオキシ−D−リボースを含有しているポリデオキシリボヌクレオチド、D−リボースを含有しているポリリボヌクレオチド、プリンまたはピリミジン塩基のN−グリコシドであるその他のタイプのポリヌクレオチド、非ヌクレオチド骨格を有するその他のポリマー(例えば、市販のタンパク質核酸および合成配列特異的な核酸ポリマー)または特殊な結合を含有するその他のポリマー(但し、該ポリマーはDNAやRNA中に見出されるような塩基のペアリングや塩基の付着を許容する配置をもつヌクレオチドを含有する)などが挙げられる。それらは、2本鎖DNA、1本鎖DNA、2本鎖RNA、1本鎖RNA、DNA:RNAハイブリッドであってもよく、さらに非修飾ポリヌクレオチド(または非修飾オリゴヌクレオチド)、公知の修飾の付加されたもの、例えば当該分野で知られた標識のあるもの、キャップの付いたもの、メチル化されたもの、1個以上の天然のヌクレオチドを類縁物で置換したもの、分子内ヌクレオチド修飾のされたもの、例えば非荷電結合(例えば、メチルホスホネート、ホスホトリエステル、ホスホルアミデート、カルバメートなど)を持つもの、電荷を有する結合または硫黄含有結合(例、ホスホロチオエート、ホスホロジチオエートなど)を持つもの、例えばタンパク質(例、ヌクレアーゼ、ヌクレアーゼ・インヒビター、トキシン、抗体、シグナルペプチド、ポリ−L−リジンなど)や糖(例、モノサッカライドなど)などの側鎖基を有しているもの、インターカレント化合物(例、アクリジン、ソラレンなど)を持つもの、キレート化合物(例えば、金属、放射活性をもつ金属、ホウ素、酸化性の金属など)を含有するもの、アルキル化剤を含有するもの、修飾された結合を持つもの(例えば、αアノマー型の核酸など)であってもよい。ここで「ヌクレオシド」、「ヌクレオチド」および「核酸」とは、プリンおよびピリミジン塩基を含有するのみでなく、修飾されたその他の複素環型塩基をもつようなものを含んでいて良い。このような修飾物は、メチル化されたプリンおよびピリミジン、アシル化されたプリンおよびピリミジン、あるいはその他の複素環を含むものであってよい。修飾されたヌクレオチドおよび修飾されたヌクレオチドはまた糖部分が修飾されていてよく、例えば、1個以上の水酸基がハロゲンとか、脂肪族基などで置換されていたり、またはエーテル、アミンなどの官能基に変換されていてよい。
本発明のアンチセンスポリヌクレオチドは、RNA、DNAまたは修飾された核酸(RNA、DNA)である。修飾された核酸の具体例としては、核酸の硫黄誘導体、チオホスフェート誘導体、ポリヌクレオシドアミドやオリゴヌクレオシドアミドの分解に抵抗性のものなどが挙げられる。本発明のアンチセンスポリヌクレオチドは、例えば、以下のように設計されうる。すなわち、細胞内でのアンチセンスポリヌクレオチドをより安定なものにする、アンチセンスポリヌクレオチドの細胞透過性をより高める、目標とするセンス鎖に対する親和性をより大きなものにする、また、もし毒性があるような場合はアンチセンスポリヌクレオチドの毒性をより小さなものにする。このような修飾は、例えばPharm Tech Japan, 8巻, 247頁または395頁, 1992年、Antisense Research and Applications, CRC Press, 1993年などで数多く報告されている。
本発明のアンチセンスポリヌクレオチドは、変化せしめられたり、修飾された糖、塩基、結合を含有していて良く、リポゾーム、ミクロスフェアのような特殊な形態で供与されたり、遺伝子治療により適用されたり、付加された形態で与えられることができうる。こうして付加形態で用いられるものとしては、リン酸基骨格の電荷を中和するように働くポリリジンのようなポリカチオン体、細胞膜との相互作用を高めたり、核酸の取込みを増大せしめるような脂質(例、ホスホリピド、コレステロールなど)などの疎水性のものが挙げられる。付加するに好ましい脂質としては、コレステロールやその誘導体(例、コレステリルクロロホルメート、コール酸など)が挙げられる。こうしたものは、核酸の3’端または5’端に付着させることができ、塩基、糖、分子内ヌクレオシド結合を介して付着させることができうる。その他の基としては、核酸の3’端または5’端に特異的に配置されたキャップ用の基で、エキソヌクレアーゼ、RNaseなどのヌクレアーゼによる分解を阻止するためのものが挙げられる。こうしたキャップ用の基としては、ポリエチレングリコール、テトラエチレングリコールなどのグリコールをはじめとした当該分野で知られた水酸基の保護基が挙げられるが、それに限定されるものではない。
アンチセンスポリヌクレオチドの阻害活性は、本発明の形質転換体、本発明の生体内や生体外の遺伝子発現系、または本発明のタンパク質の生体内や生体外の翻訳系を用いて調べることができる。
【0037】
以下に、本発明のタンパク質もしくは部分ペプチドまたはその塩(以下、本発明のタンパク質と略記する場合がある)、本発明のタンパク質または部分ペプチドをコードするポリヌクレオチド、例えばDNA(以下、本発明のDNAと略記する場合がある)、本発明のタンパク質もしくは部分ペプチドまたはその塩に対する抗体(以下、本発明の抗体と略記する場合がある)、および本発明のDNAのアンチセンスポリヌクレオチド(以下、本発明のアンチセンスポリヌクレオチドと略記する場合がある)の用途を説明する。
本発明のタンパク質の活性を阻害する化合物もしくはその塩を含有する医薬は、例えば、有機アニオンの輸送活性を抑制することで、例えば、腎疾患(例、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫、間質性腎炎、腎硬化症、尿毒症など)、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、膵臓疾患(例、膵炎など)、胸腺異常に伴う免疫疾患、生殖器疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎、精巣神経症、卵巣嚢腫など)、消化器性疾患(例、過敏性腸症候群、潰瘍性大腸炎、虚血性大腸炎、胃炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌、甲状腺癌、骨髄性白血病など)、呼吸器疾患(例、胸膜炎、肺炎、慢性閉塞性肺疾患、喘息など)、骨髄炎、糖尿病、高血圧、虚血後再灌流障害、網膜炎、中枢神経疾患(例、てんかん、アルツハイマー病、パーキンソン症候群、精神分裂病など)、皮膚疾患(例、アトピー性皮膚炎、脂漏性皮膚炎など)、甲状腺ホルモン関連疾患(例、甲状腺ホルモン不応症、バセドウ病、クレチン病、甲状腺機能亢進症など)などの予防・治療剤として使用することができる。好ましくは腎疾患、甲状腺ホルモン関連疾患などの予防・治療剤として、さらに好ましくは糖尿病性腎症などの予防・治療剤として使用する。一方、本発明のタンパク質の活性を促進する化合物もしくはその塩を含有する医薬は、例えば、有機アニオンの輸送活性を促進することで、例えば、腎疾患(例、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫、間質性腎炎、腎硬化症、尿毒症など)、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、膵臓疾患(例、膵炎など)、胸腺異常に伴う免疫疾患、生殖器疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎、精巣神経症、卵巣嚢腫など)、消化器性疾患(例、過敏性腸症候群、潰瘍性大腸炎、虚血性大腸炎、胃炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌、甲状腺癌、骨髄性白血病など)、呼吸器疾患(例、胸膜炎、肺炎、慢性閉塞性肺疾患、喘息など)、骨髄炎、糖尿病、高血圧、虚血後再灌流障害、網膜炎、中枢神経疾患(例、てんかん、アルツハイマー病、パーキンソン症候群、精神分裂病など)、皮膚疾患(例、アトピー性皮膚炎、脂漏性皮膚炎など)、甲状腺ホルモン関連疾患(例、甲状腺ホルモン不応症、バセドウ病、クレチン病、甲状腺機能亢進症など)などの予防・治療剤として使用することができる。好ましくは腎疾患、甲状腺ホルモン関連疾患などの予防・治療剤として、さらに好ましくは糖尿病性腎症などの予防・治療剤として使用する。
【0038】
〔1〕本発明のタンパク質が関与する各種疾病の予防・治療剤
本発明のタンパク質は、有機アニオンの輸送活性などを有し、生体内において血液脳関門を介した甲状腺ホルモン類の中枢神経系への取り込み、血液から胆汁酸または薬物の肝臓への移行、プリスタグランジンまたはロイコトリエンなどの炎症メディエーターの除去、異物の胆汁または尿中への排出など、生体の恒常性維持に重要な役割を果たしている。
したがって、本発明のタンパク質をコードするDNAに異常があったり、欠損している場合あるいは本発明のタンパク質の発現量が減少している場合には、例えば、腎疾患(例、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫、間質性腎炎、腎硬化症、尿毒症など)、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、膵臓疾患(例、膵炎など)、胸腺異常に伴う免疫疾患、生殖器疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎、精巣神経症、卵巣嚢腫など)、消化器性疾患(例、過敏性腸症候群、潰瘍性大腸炎、虚血性大腸炎、胃炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌、甲状腺癌、骨髄性白血病など)、呼吸器疾患(例、胸膜炎、肺炎、慢性閉塞性肺疾患、喘息など)、骨髄炎、糖尿病、高血圧、虚血後再灌流障害、網膜炎、中枢神経疾患(例、てんかん、アルツハイマー病、パーキンソン症候群、精神分裂病など)、皮膚疾患(例、アトピー性皮膚炎、脂漏性皮膚炎など)、甲状腺ホルモン関連疾患(例、甲状腺ホルモン不応症、バセドウ病、クレチン病、甲状腺機能亢進症など)などの種々の疾患が発症する。
したがって、本発明のタンパク質および本発明のDNAは、例えば、腎疾患(例、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫、間質性腎炎、腎硬化症、尿毒症など)、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、膵臓疾患(例、膵炎など)、胸腺異常に伴う免疫疾患、生殖器疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎、精巣神経症、卵巣嚢腫など)、消化器性疾患(例、過敏性腸症候群、潰瘍性大腸炎、虚血性大腸炎、胃炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌、甲状腺癌、骨髄性白血病など)、呼吸器疾患(例、胸膜炎、肺炎、慢性閉塞性肺疾患、喘息など)、骨髄炎、糖尿病、高血圧、虚血後再灌流障害、網膜炎、中枢神経疾患(例、てんかん、アルツハイマー病、パーキンソン症候群、精神分裂病など)、皮膚疾患(例、アトピー性皮膚炎、脂漏性皮膚炎など)、甲状腺ホルモン関連疾患(例、甲状腺ホルモン不応症、バセドウ病、クレチン病、甲状腺機能亢進症など)などの予防・治療剤などの医薬として使用することができる。好ましくは腎疾患、甲状腺ホルモン関連疾患などの予防・治療剤として、さらに好ましくは糖尿病性腎症などの予防・治療剤として使用する。
例えば、生体内において本発明のタンパク質が減少あるいは欠損しているために、有機アニオンの輸送活性が十分に、あるいは正常に発揮されない患者がいる場合に、(イ)本発明のDNAを該患者に投与し、生体内で本発明のタンパク質を発現させることによって、(ロ)細胞に本発明のDNAを挿入し、本発明のタンパク質を発現させた後に、該細胞を患者に移植することによって、または(ハ)本発明のタンパク質を該患者に投与することなどによって、該患者における本発明のタンパク質の役割を十分に、あるいは正常に発揮させることができる。
本発明のDNAを上記の予防・治療剤として使用する場合は、該DNAを単独あるいはレトロウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノウイルスアソシエーテッドウイルスベクターなどの適当なベクターに挿入した後、常套手段に従って、ヒトまたは温血動物に投与することができる。本発明のDNAは、そのままで、あるいは摂取促進のための補助剤などの生理学的に認められる担体とともに製剤化し、遺伝子銃やハイドロゲルカテーテルのようなカテーテルによって投与できる。
本発明のタンパク質を上記の予防・治療剤として使用する場合は、少なくとも90%、好ましくは95%以上、より好ましくは98%以上、さらに好ましくは99%以上に精製されたものを使用するのが好ましい。
【0039】
本発明のタンパク質は、例えば、必要に応じて糖衣を施した錠剤、カプセル剤、エリキシル剤、マイクロカプセル剤などとして経口的に、あるいは水もしくはそれ以外の薬学的に許容し得る液との無菌性溶液、または懸濁液剤などの注射剤の形で非経口的に使用できる。例えば、本発明のタンパク質等を生理学的に認められる担体、香味剤、賦形剤、ベヒクル、防腐剤、安定剤、結合剤などとともに一般に認められた製剤実施に要求される単位用量形態で混和することによって製造することができる。これら製剤における有効成分量は指示された範囲の適当な用量が得られるようにするものである。
錠剤、カプセル剤などに混和することができる添加剤としては、例えば、ゼラチン、コーンスターチ、トラガント、アラビアゴムのような結合剤、結晶性セルロースのような賦形剤、コーンスターチ、ゼラチン、アルギン酸などのような膨化剤、ステアリン酸マグネシウムのような潤滑剤、ショ糖、乳糖またはサッカリンのような甘味剤、ペパーミント、アカモノ油またはチェリーのような香味剤などが用いられる。調剤単位形態がカプセルである場合には、前記タイプの材料にさらに油脂のような液状担体を含有することができる。注射のための無菌組成物は注射用水のようなベヒクル中の活性物質、胡麻油、椰子油などのような天然産出植物油などを溶解または懸濁させるなどの通常の製剤実施に従って処方することができる。
注射用の水性液としては、例えば、生理食塩水、ブドウ糖やその他の補助薬を含む等張液(例えば、D−ソルビトール、D−マンニトール、塩化ナトリウムなど)などが挙げられ、適当な溶解補助剤、例えば、アルコール(例えば、エタノールなど)、ポリアルコール(例えば、プロピレングリコール、ポリエチレングリコールなど)、非イオン性界面活性剤(例えば、ポリソルベート80TM、HCO−50など)などと併用してもよい。油性液としては、例えば、ゴマ油、大豆油などが挙げられ、溶解補助剤として安息香酸ベンジル、ベンジルアルコールなどと併用してもよい。また、緩衝剤(例えば、リン酸塩緩衝液、酢酸ナトリウム緩衝液など)、無痛化剤(例えば、塩化ベンザルコニウム、塩酸プロカインなど)、安定剤(例えば、ヒト血清アルブミン、ポリエチレングリコールなど)、保存剤(例えば、ベンジルアルコール、フェノールなど)、酸化防止剤などと配合してもよい。調製された注射液は、通常、適当なアンプルに充填される。
本発明のDNAが挿入されたベクターも上記と同様に製剤化され、通常、非経口的に使用される。
【0040】
このようにして得られる製剤は、安全で低毒性であるので、例えば、温血動物(例えば、ヒト、ラット、マウス、モルモット、ウサギ、トリ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ウマ、ネコ、イヌ、サル、チンパンジーなど)に対して投与することができる。
本発明のタンパク質の投与量は、対象疾患、投与対象、投与ルートなどにより差異はあるが、例えば、腎不全の治療目的で本発明のタンパク質等を経口投与する場合、一般的に成人(体重60kgとして)においては、一日につき該タンパク質を約0.1〜100mg、好ましくは約1.0〜50mg、より好ましくは約1.0〜20mg投与する。非経口的に投与する場合は、該タンパク質の1回投与量は投与対象、対象疾患などによっても異なるが、例えば、腎不全の治療目的で本発明のタンパク質を注射剤の形で成人(体重60kgとして)に投与する場合、一日につき該タンパク質を約0.01〜30mg、好ましくは約0.1〜20mg、より好ましくは約0.1〜10mgを患部に注射することにより投与するのが好都合である。他の動物の場合も、体重60kg当たりに換算した量を投与することができる。
【0041】
〔2〕疾病に対する医薬候補化合物のスクリーニング
本発明のタンパク質は、本発明のタンパク質の活性を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニングのための試薬として有用である。
本発明は、(1)本発明のタンパク質を用いることを特徴とする本発明のタンパク質の活性(例えば、有機アニオンの輸送活性など)を促進または阻害する化合物またはその塩(以下、それぞれ促進剤、阻害剤と略記する場合がある)のスクリーニング方法を提供する。より具体的には、例えば、
(2)(i)本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞の有機アニオンの輸送活性と(ii)本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞と試験化合物の混合物の有機アニオンの輸送活性の比較を行なうことを特徴とする促進剤または阻害剤のスクリーニング方法を提供する。
具体的には、上記スクリーニング方法においては、例えば、(i)と(ii)の場合において、有機アニオンの輸送活性を蛍光色素で測定し、有機アニオンの輸送活性の指標として比較することを特徴とするものである。
【0042】
試験化合物としては、例えば、ペプチド、タンパク質、非ペプチド性化合物、合成化合物、発酵生産物、細胞抽出液、植物抽出液、動物組織抽出液などが挙げられ、これら化合物は新規な化合物であってもよいし、公知の化合物であってもよい。
上記のスクリーニング方法を実施するには、本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞をスクリーニングに適したバッファーに浮遊して調製する。バッファーには、pH約4〜10(望ましくは、pH約6〜8)のリン酸バッファー、ほう酸バッファーなどの、本発明のタンパク質の有機アニオンの輸送活性を阻害しないバッファーであればいずれでもよい。
本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞としては、例えば、前述した本発明のタンパク質をコードするDNAを含有するベクターで形質転換された宿主(形質転換体)が用いられる。宿主としては、例えば、CHO細胞などの動物細胞が好ましく用いられる。該スクリーニングには、例えば、前述の方法で培養することによって、本発明のタンパク質を細胞膜上に発現させた形質転換体が好ましく用いられる。
【0043】
本発明のタンパク質の有機アニオンの輸送活性は、公知の方法、例えば、Biochemical and Biophysical Research Communications、第273巻、251頁、2000年に記載の方法あるいはそれに準じる方法に従って測定することができる。
例えば、上記(ii)の場合における有機アニオンの輸送活性を、上記(i)の場合に比べて、約20%以上、好ましくは30%以上、より好ましくは約50%以上促進する試験化合物を本発明のタンパク質の活性を促進する化合物またはその塩として選択することができる。
また、例えば、上記(ii)の場合における有機アニオンの輸送活性を、上記(i)の場合に比べて、約20%以上、好ましくは30%以上、より好ましくは約50%以上阻害(または抑制)する試験化合物を本発明のタンパク質の活性を阻害する化合物またはその塩として選択することができる。
また、本発明のタンパク質遺伝子のプロモーター下流に分泌型アルカリホスファターゼ、ルシフェラーゼなどの遺伝子を挿入し、上記の各種細胞に発現させ、該細胞に上記試験化合物を接触させた場合における酵素活性を賦活化または阻害する化合物またはその塩を探索することによって本発明のタンパク質の発現を促進または抑制(すなわち、本発明のタンパク質の活性を促進または阻害)する化合物またはその塩をスクリーニングすることができる。
【0044】
本発明のタンパク質をコードするポリヌクレオチドは、本発明のタンパク質遺伝子の発現を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニングのための試薬として有用である。
本発明は、(3)本発明のタンパク質をコードするポリヌクレオチドを用いることを特徴とする本発明のタンパク質遺伝子の発現を促進または阻害する化合物またはその塩(以下、それぞれ促進剤、阻害剤と略記する場合がある)のスクリーニング方法を提供し、より具体的には、例えば、
(4)(iii)本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞を培養した場合と(iv)本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞と試験化合物の混合物を培養した場合との比較を行うことを特徴とする促進剤または阻害剤のスクリーニング方法を提供する。
上記スクリーニング方法においては、例えば、(iii)と(iv)の場合における、本発明のタンパク質遺伝子の発現量(具体的には、本発明のタンパク質量または前記タンパク質をコードするmRNA量)を測定して、比較する。
試験化合物としては、例えば、ペプチド、タンパク質、非ペプチド性化合物、合成化合物、発酵生産物、細胞抽出液、植物抽出液、動物組織抽出液などが挙げられ、これら化合物は新規な化合物であってもよいし、公知の化合物であってもよい。
上記のスクリーニング方法を実施するには、本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞をスクリーニングに適したバッファーに浮遊して調製する。バッファーには、pH約4〜10(望ましくは、pH約6〜8)のリン酸バッファー、ほう酸バッファーなどの、本発明のタンパク質の有機アニオンの輸送活性を阻害しないバッファーであればいずれでもよい。
本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞としては、例えば、前述した本発明のタンパク質をコードするDNAを含有するベクターで形質転換された宿主(形質転換体)が用いられる。宿主としては、例えば、CHO細胞などの動物細胞が好ましく用いられる。該スクリーニングには、例えば、前述の方法で培養することによって、本発明のタンパク質を細胞膜上に発現させた形質転換体が好ましく用いられる。
本発明のタンパク質量の測定は、公知の方法、例えば、本発明のタンパク質を認識する抗体を用いて、細胞抽出液中などに存在する前記タンパク質を、ウェスタン解析、ELISA法などの方法またはそれに準じる方法に従い測定することができる。
本発明のタンパク質遺伝子の発現量は、公知の方法、例えば、ノーザンブロッティングやReverse transcription−polymerase chain reaction(RT−PCR)、リアルタイムPCR解析システム(ABI社製、TaqMan polymerase chain reaction)などの方法あるいはそれに準じる方法にしたがって測定することができる。
例えば、上記(iv)の場合における本発明のタンパク質遺伝子の発現を、上記(iii)の場合に比べて、約20%以上、好ましくは30%以上、より好ましくは約50%以上促進する試験化合物を本発明のタンパク質遺伝子の発現を促進する化合物またはその塩として選択することができる。
例えば、上記(iv)の場合における本発明のタンパク質遺伝子の発現を、上記(iii)の場合に比べて、約20%以上、好ましくは30%以上、より好ましくは約50%以上阻害する試験化合物を本発明のタンパク質遺伝子の発現を阻害する化合物またはその塩として選択することができる。
さらに、本発明の抗体は、本発明のタンパク質の発現を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニングのための試薬として有用である。
本発明は、(5)本発明の抗体を用いることを特徴とする本発明のタンパク質の発現(産生)を促進または阻害する化合物またはその塩(以下、それぞれ促進剤、阻害剤と略記する場合がある)のスクリーニング方法を提供し、より具体的には、例えば、
(6)(v)本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞を培養した場合と(vi)本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞と試験化合物の混合物を培養した場合との比較を行うことを特徴とする促進剤または阻害剤のスクリーニング方法を提供する。
上記スクリーニング方法においては、例えば、本発明の抗体を用いて(v)と(vi)の場合における、本発明のタンパク質の発現量(具体的には、本発明のタンパク質量)を測定(例、本発明のタンパク質の発現を検出、本発明のタンパク質の発現量を定量等)して、比較する。
試験化合物としては、例えば、ペプチド、タンパク質、非ペプチド性化合物、合成化合物、発酵生産物、細胞抽出液、植物抽出液、動物組織抽出液などが挙げられ、これら化合物は新規な化合物であってもよいし、公知の化合物であってもよい。
上記のスクリーニング方法を実施するには、本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞をスクリーニングに適したバッファーに浮遊して調製する。バッファーには、pH約4〜10(望ましくは、pH約6〜8)のリン酸バッファー、ほう酸バッファーなどの、本発明のタンパク質の有機アニオンの輸送活性を阻害しないバッファーであればいずれでもよい。
本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞としては、例えば、前述した本発明のタンパク質をコードするDNAを含有するベクターで形質転換された宿主(形質転換体)が用いられる。宿主としては、例えば、CHO細胞などの動物細胞が好ましく用いられる。該スクリーニングには、例えば、前述の方法で培養することによって、本発明のタンパク質を細胞膜上に発現させた形質転換体が好ましく用いられる。
本発明のタンパク質量の測定は、公知の方法、例えば、本発明のタンパク質を認識する抗体を用いて、細胞抽出液中などに存在する前記タンパク質を、ウェスタン解析、ELISA法などの方法またはそれに準じる方法に従い測定することができる。
例えば、上記(vi)の場合における本発明のタンパク質の発現を、上記(v)の場合に比べて、約20%以上、好ましくは30%以上、より好ましくは約50%以上促進する試験化合物を本発明のタンパク質の発現を促進する化合物またはその塩として選択することができる。
例えば、上記(vi)の場合における本発明のタンパク質の発現を、上記(v)の場合に比べて、約20%以上、好ましくは30%以上、より好ましくは約50%以上阻害する試験化合物を本発明のタンパク質の発現を阻害する化合物またはその塩として選択することができる。
【0045】
本発明のスクリーニング用キットは、本発明のタンパク質もしくは部分ペプチドまたはその塩、または本発明のタンパク質もしくは部分ペプチドを産生する能力を有する細胞を含有するものである。
本発明のスクリーニング方法またはスクリーニング用キットを用いて得られる化合物またはその塩は、上記した試験化合物、例えば、ペプチド、タンパク質、非ペプチド性化合物、合成化合物、発酵生産物、細胞抽出液、植物抽出液、動物組織抽出液、血漿などから選ばれた化合物またはその塩であり、本発明のタンパク質の活性(例、有機アニオンの輸送活性など)を促進または阻害する化合物またはその塩である。
該化合物の塩としては、前記した本発明のタンパク質の塩と同様のものが用いられる。
本発明のタンパク質の活性を促進する化合物またはその塩は、例えば、腎疾患(例、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫、間質性腎炎、腎硬化症、尿毒症など)、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、膵臓疾患(例、膵炎など)、胸腺異常に伴う免疫疾患、生殖器疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎、精巣神経症、卵巣嚢腫など)、消化器性疾患(例、過敏性腸症候群、潰瘍性大腸炎、虚血性大腸炎、胃炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌、甲状腺癌、骨髄性白血病など)、呼吸器疾患(例、胸膜炎、肺炎、慢性閉塞性肺疾患、喘息など)、骨髄炎、糖尿病、高血圧、虚血後再灌流障害、網膜炎、中枢神経疾患(例、てんかん、アルツハイマー病、パーキンソン症候群、精神分裂病など)、皮膚疾患(例、アトピー性皮膚炎、脂漏性皮膚炎など)、甲状腺ホルモン関連疾患(例、甲状腺ホルモン不応症、バセドウ病、クレチン病、甲状腺機能亢進症など)などの予防・治療剤などの医薬として有用である。好ましくは腎疾患、甲状腺ホルモン関連疾患などの予防・治療剤として、さらに好ましくは糖尿病性腎症などの予防・治療剤として使用する。
また、本発明のタンパク質の活性を阻害する化合物またはその塩は、例えば、腎疾患(例、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫、間質性腎炎、腎硬化症、尿毒症など)、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、膵臓疾患(例、膵炎など)、胸腺異常に伴う免疫疾患、生殖器疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎、精巣神経症、卵巣嚢腫など)、消化器性疾患(例、過敏性腸症候群、潰瘍性大腸炎、虚血性大腸炎、胃炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌、甲状腺癌、骨髄性白血病など)、呼吸器疾患(例、胸膜炎、肺炎、慢性閉塞性肺疾患、喘息など)、骨髄炎、糖尿病、高血圧、虚血後再灌流障害、網膜炎、中枢神経疾患(例、てんかん、アルツハイマー病、パーキンソン症候群、精神分裂病など)、皮膚疾患(例、アトピー性皮膚炎、脂漏性皮膚炎など)、甲状腺ホルモン関連疾患(例、甲状腺ホルモン不応症、バセドウ病、クレチン病、甲状腺機能亢進症など)などの予防・治療剤などなどの医薬として有用である。好ましくは腎疾患、甲状腺ホルモン関連疾患などの予防・治療剤として、さらに好ましくは糖尿病性腎症などの予防・治療剤として使用する。
本発明のタンパク質遺伝子の発現を促進する化合物またはその塩は、例えば、腎疾患(例、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫、間質性腎炎、腎硬化症、尿毒症など)、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、膵臓疾患(例、膵炎など)、胸腺異常に伴う免疫疾患、生殖器疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎、精巣神経症、卵巣嚢腫など)、消化器性疾患(例、過敏性腸症候群、潰瘍性大腸炎、虚血性大腸炎、胃炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌、甲状腺癌、骨髄性白血病など)、呼吸器疾患(例、胸膜炎、肺炎、慢性閉塞性肺疾患、喘息など)、骨髄炎、糖尿病、高血圧、虚血後再灌流障害、網膜炎、中枢神経疾患(例、てんかん、アルツハイマー病、パーキンソン症候群、精神分裂病など)、皮膚疾患(例、アトピー性皮膚炎、脂漏性皮膚炎など)、甲状腺ホルモン関連疾患(例、甲状腺ホルモン不応症、バセドウ病、クレチン病、甲状腺機能亢進症など)などの予防・治療剤などなどの医薬として有用である。好ましくは腎疾患、甲状腺ホルモン関連疾患などの予防・治療剤として、さらに好ましくは糖尿病性腎症などの予防・治療剤として使用する。
また、本発明のタンパク質遺伝子の発現を阻害する化合物またはその塩は、例えば、腎疾患(例、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫、間質性腎炎、腎硬化症、尿毒症など)、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、膵臓疾患(例、膵炎など)、胸腺異常に伴う免疫疾患、生殖器疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎、精巣神経症、卵巣嚢腫など)、消化器性疾患(例、過敏性腸症候群、潰瘍性大腸炎、虚血性大腸炎、胃炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌、甲状腺癌、骨髄性白血病など)、呼吸器疾患(例、胸膜炎、肺炎、慢性閉塞性肺疾患、喘息など)、骨髄炎、糖尿病、高血圧、虚血後再灌流障害、網膜炎、中枢神経疾患(例、てんかん、アルツハイマー病、パーキンソン症候群、精神分裂病など)、皮膚疾患(例、アトピー性皮膚炎、脂漏性皮膚炎など)、甲状腺ホルモン関連疾患(例、甲状腺ホルモン不応症、バセドウ病、クレチン病、甲状腺機能亢進症など)などの予防・治療剤などなどの医薬として有用である。好ましくは腎疾患、甲状腺ホルモン関連疾患などの予防・治療剤として、さらに好ましくは糖尿病性腎症などの予防・治療剤として使用する。
本発明のタンパク質の発現を促進する化合物またはその塩は、例えば、腎疾患(例、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫、間質性腎炎、腎硬化症、尿毒症など)、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、膵臓疾患(例、膵炎など)、胸腺異常に伴う免疫疾患、生殖器疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎、精巣神経症、卵巣嚢腫など)、消化器性疾患(例、過敏性腸症候群、潰瘍性大腸炎、虚血性大腸炎、胃炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌、甲状腺癌、骨髄性白血病など)、呼吸器疾患(例、胸膜炎、肺炎、慢性閉塞性肺疾患、喘息など)、骨髄炎、糖尿病、高血圧、虚血後再灌流障害、網膜炎、中枢神経疾患(例、てんかん、アルツハイマー病、パーキンソン症候群、精神分裂病など)、皮膚疾患(例、アトピー性皮膚炎、脂漏性皮膚炎など)、甲状腺ホルモン関連疾患(例、甲状腺ホルモン不応症、バセドウ病、クレチン病、甲状腺機能亢進症など)などの予防・治療剤などなどの医薬として有用である。好ましくは腎疾患、甲状腺ホルモン関連疾患などの予防・治療剤として、さらに好ましくは糖尿病性腎症などの予防・治療剤として使用する。
また、本発明のタンパク質の発現を阻害する化合物またはその塩は、例えば、腎疾患(例、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫、間質性腎炎、腎硬化症、尿毒症など)、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、膵臓疾患(例、膵炎など)、胸腺異常に伴う免疫疾患、生殖器疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎、精巣神経症、卵巣嚢腫など)、消化器性疾患(例、過敏性腸症候群、潰瘍性大腸炎、虚血性大腸炎、胃炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌、甲状腺癌、骨髄性白血病など)、呼吸器疾患(例、胸膜炎、肺炎、慢性閉塞性肺疾患、喘息など)、骨髄炎、糖尿病、高血圧、虚血後再灌流障害、網膜炎、中枢神経疾患(例、てんかん、アルツハイマー病、パーキンソン症候群、精神分裂病など)、皮膚疾患(例、アトピー性皮膚炎、脂漏性皮膚炎など)、甲状腺ホルモン関連疾患(例、甲状腺ホルモン不応症、バセドウ病、クレチン病、甲状腺機能亢進症など)などの予防・治療剤などの医薬として有用である。好ましくは腎疾患、甲状腺ホルモン関連疾患などの予防・治療剤として、さらに好ましくは糖尿病性腎症などの予防・治療剤として使用する。
本発明のスクリーニング方法またはスクリーニング用キットを用いて得られる化合物またはその塩としては、本発明のタンパク質の活性を促進する化合物またはその塩、本発明のタンパク質遺伝子の発現を促進する化合物またはその塩、本発明のタンパク質の発現を促進する化合物またはその塩が好ましい。
【0046】
本発明のスクリーニング方法またはスクリーニング用キットを用いて得られる化合物またはその塩を上述の予防・治療剤として使用する場合、常套手段に従って製剤化することができる。例えば、錠剤、カプセル剤、エリキシル剤、マイクロカプセル剤、無菌性溶液、懸濁液剤などとすることができる。
このようにして得られる製剤は安全で低毒性であるので、例えば、ヒトまたは温血動物(例えば、マウス、ラット、ウサギ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ウマ、トリ、ネコ、イヌ、サル、チンパンジーなど)に対して経口的にまたは非経口的に投与することができる。
該化合物またはその塩の投与量は、その作用、対象疾患、投与対象、投与ルートなどにより差異はあるが、例えば、腎不全治療の目的で本発明のタンパク質の活性を促進する化合物またはその塩を経口投与する場合、一般的に成人(体重60kgとして)においては、一日につき該化合物またはその塩を約0.1〜100mg、好ましくは約1.0〜50mg、より好ましくは約1.0〜20mg投与する。非経口的に投与する場合は、該化合物またはその塩の1回投与量は投与対象、対象疾患などによっても異なるが、例えば、腎不全治療の目的で本発明のタンパク質の活性を促進する化合物またはその塩を注射剤の形で通常成人(体重60kgとして)に投与する場合、一日につき該化合物またはその塩を約0.01〜30mg、好ましくは約0.1〜20mg、より好ましくは約0.1〜10mgを静脈注射により投与するのが好都合である。他の動物の場合も、体重60kg当たりに換算した量を投与することができる。
【0047】
〔3〕本発明のタンパク質、その部分ペプチドまたはその塩の定量
本発明の抗体は、本発明のタンパク質を特異的に認識することができるので、被検液中の本発明のタンパク質の定量、特にサンドイッチ免疫測定法による定量などに使用することができる。
すなわち、本発明は、
(i)本発明の抗体と、被検液および標識化された本発明のタンパク質とを競合的に反応させ、該抗体に結合した標識化された本発明のタンパク質の割合を測定することを特徴とする被検液中の本発明のタンパク質の定量法、および
(ii)被検液と担体上に不溶化した本発明の抗体および標識化された本発明の別の抗体とを同時あるいは連続的に反応させたのち、不溶化担体上の標識剤の活性を測定することを特徴とする被検液中の本発明のタンパク質の定量法を提供する。
上記(ii)の定量法においては、一方の抗体が本発明のタンパク質のN端部を認識する抗体で、他方の抗体が本発明のタンパク質のC端部に反応する抗体であることが望ましい。
【0048】
また、本発明のタンパク質に対するモノクローナル抗体(以下、本発明のモノクローナル抗体と称する場合がある)を用いて本発明のタンパク質の定量を行なえるほか、組織染色等による検出を行なうこともできる。これらの目的には、抗体分子そのものを用いてもよく、また、抗体分子のF(ab’) 、Fab’、あるいはFab画分を用いてもよい。
本発明の抗体を用いる本発明のタンパク質の定量法は、特に制限されるべきものではなく、被測定液中の抗原量(例えば、タンパク質量)に対応した抗体、抗原もしくは抗体−抗原複合体の量を化学的または物理的手段により検出し、これを既知量の抗原を含む標準液を用いて作製した標準曲線より算出する測定法であれば、いずれの測定法を用いてもよい。例えば、ネフロメトリー、競合法、イムノメトリック法およびサンドイッチ法が好適に用いられるが、感度、特異性の点で、後述するサンドイッチ法を用いるのが特に好ましい。
標識物質を用いる測定法に用いられる標識剤としては、例えば、放射性同位元素(例、〔125I〕、〔131I〕、〔H〕、〔14C〕、〔32P〕、〔33P〕、〔35S〕など)、蛍光物質〔例、シアニン蛍光色素(例、Cy2、Cy3、Cy5、Cy5.5、Cy7(アマシャムバイオサイエンス社製)など)、フルオレスカミン、フルオレッセンイソチオシアネートなど〕、酵素(例、β−ガラクトシダーゼ、β−グルコシダーゼ、アルカリフォスファターゼ、パーオキシダーゼ、リンゴ酸脱水素酵素など)、発光物質(例、ルミノール、ルミノール誘導体、ルシフェリン、ルシゲニンなど)、ビオチン、ランタニド元素などが用いられる。さらに、抗体あるいは抗原と標識剤との結合にビオチン−アビジン系を用いることもできる。
【0049】
抗原あるいは抗体の不溶化に当っては、物理吸着を用いてもよく、また通常タンパク質あるいは酵素等を不溶化、固定化するのに用いられる化学結合を用いる方法でもよい。担体としては、アガロース、デキストラン、セルロースなどの不溶性多糖類、ポリスチレン、ポリアクリルアミド、シリコン等の合成樹脂、あるいはガラス等が挙げられる。
サンドイッチ法においては不溶化した本発明のモノクローナル抗体に被検液を反応させ(1次反応)、さらに標識化した別の本発明のモノクローナル抗体を反応させ(2次反応)たのち、不溶化担体上の標識剤の活性を測定することにより被検液中の本発明のタンパク質量を定量することができる。1次反応と2次反応は逆の順序に行っても、また、同時に行なってもよいし時間をずらして行なってもよい。標識化剤および不溶化の方法は前記のそれらに準じることができる。また、サンドイッチ法による免疫測定法において、固相用抗体あるいは標識用抗体に用いられる抗体は必ずしも1種類である必要はなく、測定感度を向上させる等の目的で2種類以上の抗体の混合物を用いてもよい。
本発明のサンドイッチ法による本発明のタンパク質の測定法においては、1次反応と2次反応に用いられる本発明のモノクローナル抗体は、本発明のタンパク質の結合する部位が相異なる抗体が好ましく用いられる。すなわち、1次反応および2次反応に用いられる抗体は、例えば、2次反応で用いられる抗体が、本発明のタンパク質のC端部を認識する場合、1次反応で用いられる抗体は、好ましくはC端部以外、例えばN端部を認識する抗体が用いられる。
【0050】
本発明のモノクローナル抗体をサンドイッチ法以外の測定システム、例えば、競合法、イムノメトリック法あるいはネフロメトリーなどに用いることができる。
競合法では、被検液中の抗原と標識抗原とを抗体に対して競合的に反応させたのち、未反応の標識抗原(F)と、抗体と結合した標識抗原(B)とを分離し(B/F分離)、B,Fいずれかの標識量を測定し、被検液中の抗原量を定量する。本反応法には、抗体として可溶性抗体を用い、B/F分離をポリエチレングリコール、前記抗体に対する第2抗体などを用いる液相法、および、第1抗体として固相化抗体を用いるか、あるいは、第1抗体は可溶性のものを用い第2抗体として固相化抗体を用いる固相化法とが用いられる。
イムノメトリック法では、被検液中の抗原と固相化抗原とを一定量の標識化抗体に対して競合反応させた後固相と液相を分離するか、あるいは、被検液中の抗原と過剰量の標識化抗体とを反応させ、次に固相化抗原を加え未反応の標識化抗体を固相に結合させたのち、固相と液相を分離する。次に、いずれかの相の標識量を測定し被検液中の抗原量を定量する。
また、ネフロメトリーでは、ゲル内あるいは溶液中で抗原抗体反応の結果生じた不溶性の沈降物の量を測定する。被検液中の抗原量が僅かであり、少量の沈降物しか得られない場合にもレーザーの散乱を利用するレーザーネフロメトリーなどが好適に用いられる。
【0051】
これら個々の免疫学的測定法を本発明の定量方法に適用するにあたっては、特別の条件、操作等の設定は必要とされない。それぞれの方法における通常の条件、操作法に当業者の通常の技術的配慮を加えて本発明のタンパク質の測定系を構築すればよい。これらの一般的な技術手段の詳細については、総説、成書などを参照することができる。
例えば、入江 寛編「ラジオイムノアッセイ」(講談社、昭和49年発行)、入江 寛編「続ラジオイムノアッセイ」(講談社、昭和54年発行)、石川栄治ら編「酵素免疫測定法」(医学書院、昭和53年発行)、石川栄治ら編「酵素免疫測定法」(第2版)(医学書院、昭和57年発行)、石川栄治ら編「酵素免疫測定法」(第3版)(医学書院、昭和62年発行)、「Methods in ENZYMOLOGY」 Vol. 70(Immunochemical Techniques(Part A))、 同書 Vol. 73(Immunochemical Techniques(Part B))、 同書 Vol. 74(Immunochemical Techniques(Part C))、 同書 Vol. 84(Immunochemical Techniques(Part D:Selected Immunoassays))、 同書 Vol. 92(Immunochemical Techniques(Part E:Monoclonal Antibodies and General Immunoassay Methods))、 同書 Vol. 121(Immunochemical Techniques(Part I:Hybridoma Technology and Monoclonal Antibodies))(以上、アカデミックプレス社発行)などを参照することができる。
以上のようにして、本発明の抗体を用いることによって、本発明のタンパク質を感度良く定量することができる。
さらには、本発明の抗体を用いて本発明のタンパク質の濃度を定量することによって、本発明のタンパク質の濃度の減少が検出された場合、例えば、腎疾患(例、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫、間質性腎炎、腎硬化症、尿毒症など)、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、膵臓疾患(例、膵炎など)、胸腺異常に伴う免疫疾患、生殖器疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎、精巣神経症、卵巣嚢腫など)、消化器性疾患(例、過敏性腸症候群、潰瘍性大腸炎、虚血性大腸炎、胃炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌、甲状腺癌、骨髄性白血病など)、呼吸器疾患(例、胸膜炎、肺炎、慢性閉塞性肺疾患、喘息など)、骨髄炎、糖尿病、高血圧、虚血後再灌流障害、網膜炎、中枢神経疾患(例、てんかん、アルツハイマー病、パーキンソン症候群、精神分裂病など)、皮膚疾患(例、アトピー性皮膚炎、脂漏性皮膚炎など)、甲状腺ホルモン関連疾患(例、甲状腺ホルモン不応症、バセドウ病、クレチン病、甲状腺機能亢進症など)などが発症している可能性が高いと診断することができる。反対に、例えば、本発明のタンパク質の濃度の上昇が検出された場合、例えば、腎疾患(例、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫、間質性腎炎、腎硬化症、尿毒症など)、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、膵臓疾患(例、膵炎など)、胸腺異常に伴う免疫疾患、生殖器疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎、精巣神経症、卵巣嚢腫など)、消化器性疾患(例、過敏性腸症候群、潰瘍性大腸炎、虚血性大腸炎、胃炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌、甲状腺癌、骨髄性白血病など)、呼吸器疾患(例、胸膜炎、肺炎、慢性閉塞性肺疾患、喘息など)、骨髄炎、糖尿病、高血圧、虚血後再灌流障害、網膜炎、中枢神経疾患(例、てんかん、アルツハイマー病、パーキンソン症候群、精神分裂病など)、皮膚疾患(例、アトピー性皮膚炎、脂漏性皮膚炎など)、甲状腺ホルモン関連疾患(例、甲状腺ホルモン不応症、バセドウ病、クレチン病、甲状腺機能亢進症など)などが発症している可能性が高いと診断することが出来る。
また、本発明の抗体は、体液や組織などの被検体中に存在する本発明のタンパク質を検出するために使用することができる。また、本発明のタンパク質を精製するために使用する抗体カラムの作製、精製時の各分画中の本発明のタンパク質の検出、被検細胞内における本発明のタンパク質の挙動の分析などのために使用することができる。
【0052】
〔4〕遺伝子診断薬
本発明のDNAは、例えば、プローブとして使用することにより、ヒトまたは温血動物(例えば、ラット、マウス、モルモット、ウサギ、トリ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ウマ、ネコ、イヌ、サル、チンパンジーなど)における本発明のタンパク質またはその部分ペプチドをコードするDNAまたはmRNAの異常(遺伝子異常)を検出することができるので、例えば、該DNAまたはmRNAの損傷、突然変異あるいは発現低下や、該DNAまたはmRNAの増加あるいは発現過多などの遺伝子診断薬として有用である。
本発明のDNAを用いる上記の遺伝子診断は、例えば、公知のノーザンハイブリダイゼーションやPCR−SSCP法(Genomics,第5巻,874〜879頁(1989)、Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,第86巻,2766〜2770頁(1989))などにより実施することができる。
例えば、ノーザンハイブリダイゼーションにより発現増加が検出された場合、例えば腎疾患(例、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫、間質性腎炎、腎硬化症、尿毒症など)、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、膵臓疾患(例、膵炎など)、胸腺異常に伴う免疫疾患、生殖器疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎、精巣神経症、卵巣嚢腫など)、消化器性疾患(例、過敏性腸症候群、潰瘍性大腸炎、虚血性大腸炎、胃炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌、甲状腺癌、骨髄性白血病など)、呼吸器疾患(例、胸膜炎、肺炎、慢性閉塞性肺疾患、喘息など)、骨髄炎、糖尿病、高血圧、虚血後再灌流障害、網膜炎、中枢神経疾患(例、てんかん、アルツハイマー病、パーキンソン症候群、精神分裂病など)、皮膚疾患(例、アトピー性皮膚炎、脂漏性皮膚炎など)、甲状腺ホルモン関連疾患(例、甲状腺ホルモン不応症、バセドウ病、クレチン病、甲状腺機能亢進症など)などである可能性が高いと診断することが出来る。反対に、発現低下が検出された場合やPCR−SSCP法によりDNAの突然変異が検出された場合は、例えば、腎疾患(例、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫、間質性腎炎、腎硬化症、尿毒症など)、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、膵臓疾患(例、膵炎など)、胸腺異常に伴う免疫疾患、生殖器疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎、精巣神経症、卵巣嚢腫など)、消化器性疾患(例、過敏性腸症候群、潰瘍性大腸炎、虚血性大腸炎、胃炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌、甲状腺癌、骨髄性白血病など)、呼吸器疾患(例、胸膜炎、肺炎、慢性閉塞性肺疾患、喘息など)、骨髄炎、糖尿病、高血圧、虚血後再灌流障害、網膜炎、中枢神経疾患(例、てんかん、アルツハイマー病、パーキンソン症候群、精神分裂病など)、皮膚疾患(例、アトピー性皮膚炎、脂漏性皮膚炎など)、甲状腺ホルモン関連疾患(例、甲状腺ホルモン不応症、バセドウ病、クレチン病、甲状腺機能亢進症など)などである可能性が高いと診断することができる。
【0053】
〔5〕アンチセンスポリヌクレオチドを含有する医薬および診断薬
本発明のDNAに相補的に結合し、該DNAの発現を抑制することができる本発明のアンチセンスポリヌクレオチドは低毒性であり、生体内における本発明のタンパク質または本発明のDNAの機能(例、有機アニオンの輸送活性)を抑制することができるので、例えば、腎疾患(例、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫、間質性腎炎、腎硬化症、尿毒症など)、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、膵臓疾患(例、膵炎など)、胸腺異常に伴う免疫疾患、生殖器疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎、精巣神経症、卵巣嚢腫など)、消化器性疾患(例、過敏性腸症候群、潰瘍性大腸炎、虚血性大腸炎、胃炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌、甲状腺癌、骨髄性白血病など)、呼吸器疾患(例、胸膜炎、肺炎、慢性閉塞性肺疾患、喘息など)、骨髄炎、糖尿病、高血圧、虚血後再灌流障害、網膜炎、中枢神経疾患(例、てんかん、アルツハイマー病、パーキンソン症候群、精神分裂病など)、皮膚疾患(例、アトピー性皮膚炎、脂漏性皮膚炎など)、甲状腺ホルモン関連疾患(例、甲状腺ホルモン不応症、バセドウ病、クレチン病、甲状腺機能亢進症など)などの予防・治療剤などとして使用することができる。好ましくは腎疾患、甲状腺ホルモン関連疾患などの予防・治療剤として、さらに好ましくは糖尿病性腎症などの予防・治療剤として使用する。また、本発明のアンチセンスポリヌクレオチドは、上記疾患の診断にも用いられる。
上記アンチセンスポリヌクレオチドを上記の予防・治療剤として使用する場合、公知の方法に従って製剤化し、投与することができる。
例えば、該アンチセンスポリヌクレオチドを用いる場合、該アンチセンスポリヌクレオチドを単独あるいはレトロウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノウイルスアソシエーテッドウイルスベクターなどの適当なベクターに挿入した後、常套手段に従って、ヒトまたは哺乳動物(例、ラット、ウサギ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ネコ、イヌ、サルなど)に対して経口的または非経口的に投与することができる。該アンチセンスポリヌクレオチドは、そのままで、あるいは摂取促進のために補助剤などの生理学的に認められる担体とともに製剤化し、遺伝子銃やハイドロゲルカテーテルのようなカテーテルによって投与できる。
該アンチセンスポリヌクレオチドの投与量は、対象疾患、投与対象、投与ルートなどにより差異はあるが、例えば、腎不全の治療の目的で本発明のアンチセンスポリヌクレオチドを腎臓に局所投与する場合、一般的に成人(体重60kg)においては、一日につき該アンチセンスポリヌクレオチドを約0.1〜100mg投与する。さらに、該アンチセンスポリヌクレオチドは、組織や細胞における本発明のDNAの存在やその発現状況を調べるための診断用オリゴヌクレオチドプローブとして使用することもできる。
【0054】
さらに、本発明は、
(i)本発明のタンパク質をコードするRNAの一部とそれに相補的なRNAを含有する二重鎖RNA、
(ii)前記二重鎖RNAを含有してなる医薬、
(iii)本発明のタンパク質をコードするRNAの一部を含有するリボザイム、
(iv)前記リボザイムを含有してなる医薬、
(v)前記リボザイムをコードする遺伝子(DNA)を含有する発現ベクターなども提供する。
上記アンチセンスポリヌクレオチドと同様に、二重鎖RNA、リボザイムなども、本発明のDNAから転写されるRNAを破壊またはその機能を抑制することができ、生体内における本発明のタンパク質または本発明で用いられるDNAの機能を抑制することができるので、例えば、腎疾患(例、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫、間質性腎炎、腎硬化症、尿毒症など)、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、膵臓疾患(例、膵炎など)、胸腺異常に伴う免疫疾患、生殖器疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎、精巣神経症、卵巣嚢腫など)、消化器性疾患(例、過敏性腸症候群、潰瘍性大腸炎、虚血性大腸炎、胃炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌、甲状腺癌、骨髄性白血病など)、呼吸器疾患(例、胸膜炎、肺炎、慢性閉塞性肺疾患、喘息など)、骨髄炎、糖尿病、高血圧、虚血後再灌流障害、網膜炎、中枢神経疾患(例、てんかん、アルツハイマー病、パーキンソン症候群、精神分裂病など)、皮膚疾患(例、アトピー性皮膚炎、脂漏性皮膚炎など)、甲状腺ホルモン関連疾患(例、甲状腺ホルモン不応症、バセドウ病、クレチン病、甲状腺機能亢進症など)などの予防・治療剤などとして使用することができる。好ましくは腎疾患、甲状腺ホルモン関連疾患などの予防・治療剤として、さらに好ましくは糖尿病性腎症などの予防・治療剤として使用する。
二重鎖RNAは、公知の方法(例、Nature, 411巻, 494頁, 2001年)に準じて、本発明のポリヌクレオチドの配列を基に設計して製造することができる。
リボザイムは、公知の方法(例、TRENDS in Molecular Medicine, 7巻, 221頁, 2001年)に準じて、本発明のポリヌクレオチドの配列を基に設計して製造することができる。例えば、公知のリボザイムの配列の一部を本発明のタンパク質をコードするRNAの一部に置換することによって製造することができる。本発明のタンパク質をコードするRNAの一部としては、公知のリボザイムによって切断され得るコンセンサス配列NUX(式中、Nはすべての塩基を、XはG以外の塩基を示す)の近傍の配列などが挙げられる。
上記の二重鎖RNAまたはリボザイムを上記予防・治療剤として使用する場合、アンチセンスポリヌクレオチドと同様にして製剤化し、投与することができる。また、前記(v)の発現ベクターは、公知の遺伝子治療法などと同様に用い、上記予防・治療剤として使用する。
【0055】
〔6〕本発明の抗体を含有する医薬
本発明のタンパク質の活性を中和する作用を有する本発明の抗体は、例えば、腎疾患(例、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫、間質性腎炎、腎硬化症、尿毒症など)、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、膵臓疾患(例、膵炎など)、胸腺異常に伴う免疫疾患、生殖器疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎、精巣神経症、卵巣嚢腫など)、消化器性疾患(例、過敏性腸症候群、潰瘍性大腸炎、虚血性大腸炎、胃炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌、甲状腺癌、骨髄性白血病など)、呼吸器疾患(例、胸膜炎、肺炎、慢性閉塞性肺疾患、喘息など)、骨髄炎、糖尿病、高血圧、虚血後再灌流障害、網膜炎、中枢神経疾患(例、てんかん、アルツハイマー病、パーキンソン症候群、精神分裂病など)、皮膚疾患(例、アトピー性皮膚炎、脂漏性皮膚炎など)、甲状腺ホルモン関連疾患(例、甲状腺ホルモン不応症、バセドウ病、クレチン病、甲状腺機能亢進症など)などの予防・治療剤などとして使用することができる。好ましくは腎疾患、甲状腺ホルモン関連疾患などの予防・治療剤として、さらに好ましくは糖尿病性腎症などの予防・治療剤として使用する。
本発明の抗体を含有する上記疾患の予防・治療剤は低毒性であり、そのまま液剤として、または適当な剤型の医薬組成物として、ヒトまたは哺乳動物(例、ラット、ウサギ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ネコ、イヌ、サルなど)に対して経口的または非経口的(例、関節内投与)に投与することができる。投与量は、投与対象、対象疾患、症状、投与ルートなどによっても異なるが、例えば、糖尿病性腎症の治療・予防のために使用する場合には、本発明の抗体を1回量として、通常0.01〜20mg/kg体重程度、好ましくは0.1〜10mg/kg体重程度、さらに好ましくは0.1〜5mg/kg体重程度を、1日1〜5回程度、好ましくは1日1〜3回程度、静脈投与するのが好都合である。他の非経口投与および経口投与の場合もこれに準ずる量を投与することができる。症状が特に重い場合には、その症状に応じて増量してもよい。
本発明の抗体は、それ自体または適当な医薬組成物として投与することができる。上記投与に用いられる医薬組成物は、上記抗体またはその塩と薬理学的に許容され得る担体、希釈剤もしくは賦形剤とを含むものである。かかる組成物は、経口または非経口投与(例、静脈、関節内投与)に適する剤形として提供される。好ましくは吸入剤として提供される。
なお前記した各組成物は、上記抗体との配合により好ましくない相互作用を生じない限り他の活性成分を含有してもよい。
【0056】
〔7〕本発明のDNAを有する動物の作出
本発明は、外来性の本発明のタンパク質をコードするDNA(以下、本発明の外来性DNAと略記する)またはその変異DNA(本発明の外来性変異DNAと略記する場合がある)を有する非ヒト哺乳動物を提供する。
すなわち、本発明は、
(1)本発明の外来性DNAまたはその変異DNAを有する非ヒト哺乳動物、
(2)非ヒト哺乳動物がゲッ歯動物である上記(1)記載の動物、
(3)ゲッ歯動物がマウスまたはラットである上記(2)記載の動物、および
(4)本発明の外来性DNAまたはその変異DNAを含有し、哺乳動物において発現しうる組換えベクターなどを提供する。
本発明の外来性DNAまたはその変異DNAを有する非ヒト哺乳動物(以下、本発明のDNA導入動物と略記する)は、未受精卵、受精卵、精子およびその始原細胞を含む胚芽細胞などに対して、好ましくは、非ヒト哺乳動物の発生における胚発生の段階(さらに好ましくは、単細胞または受精卵細胞の段階でかつ一般に8細胞期以前)に、リン酸カルシウム法、電気パルス法、リポフェクション法、凝集法、マイクロインジェクション法、パーティクルガン法、DEAE−デキストラン法などにより目的とするDNAを導入することによって作出することができる。また、該DNA導入方法により、体細胞、生体の臓器、組織細胞などに目的とする本発明の外来性DNAを導入し、細胞培養、組織培養などに利用することもでき、さらに、これら細胞を上述の胚芽細胞と公知の細胞融合法により融合させることにより本発明のDNA導入動物を作出することもできる。
非ヒト哺乳動物としては、例えば、ウシ、ブタ、ヒツジ、ヤギ、ウサギ、イヌ、ネコ、モルモット、ハムスター、マウス、ラットなどが用いられる。なかでも、病体動物モデル系の作成の面から個体発生および生物サイクルが比較的短く、また、繁殖が容易なゲッ歯動物、とりわけマウス(例えば、純系として、C57BL/6系統,DBA2系統など、交雑系として、B6C3F系統,BDF系統,B6D2F系統,BALB/c系統,ICR系統など)またはラット(例えば、Wistar,SDなど)などが好ましい。
哺乳動物において発現しうる組換えベクターにおける「哺乳動物」としては、上記の非ヒト哺乳動物の他にヒトなどがあげられる。
【0057】
本発明の外来性DNAとは、非ヒト哺乳動物が本来有している本発明のDNAではなく、いったん哺乳動物から単離・抽出された本発明のDNAをいう。
本発明の変異DNAとしては、元の本発明のDNAの塩基配列に変異(例えば、突然変異など)が生じたもの、具体的には、塩基の付加、欠損、他の塩基への置換などが生じたDNAなどが用いられ、また、異常DNAも含まれる。
該異常DNAとしては、異常な本発明のタンパク質を発現させるDNAを意味し、例えば、正常な本発明のタンパク質の機能を抑制するタンパク質を発現させるDNAなどが用いられる。
本発明の外来性DNAは、対象とする動物と同種あるいは異種のどちらの哺乳動物由来のものであってもよい。本発明のDNAを対象動物に導入するにあたっては、該DNAを動物細胞で発現させうるプロモーターの下流に結合したDNAコンストラクトとして用いるのが一般に有利である。例えば、本発明のヒトDNAを導入する場合、これと相同性が高い本発明のDNAを有する各種哺乳動物(例えば、ウサギ、イヌ、ネコ、モルモット、ハムスター、ラット、マウスなど)由来のDNAを発現させうる各種プロモーターの下流に、本発明のヒトDNAを結合したDNAコンストラクト(例、ベクターなど)を対象哺乳動物の受精卵、例えば、マウス受精卵へマイクロインジェクションすることによって本発明のDNAを高発現するDNA導入哺乳動物を作出することができる。
【0058】
本発明のタンパク質の発現ベクターとしては、大腸菌由来のプラスミド、枯草菌由来のプラスミド、酵母由来のプラスミド、λファージなどのバクテリオファージ、モロニー白血病ウィルスなどのレトロウィルス、ワクシニアウィルスまたはバキュロウィルスなどの動物ウイルスなどが用いられる。なかでも、大腸菌由来のプラスミド、枯草菌由来のプラスミドまたは酵母由来のプラスミドなどが好ましく用いられる。
上記のDNA発現調節を行なうプロモーターとしては、例えば、(i)ウイルス(例、シミアンウイルス、サイトメガロウイルス、モロニー白血病ウイルス、JCウイルス、乳癌ウイルス、ポリオウイルスなど)に由来するDNAのプロモーター、(ii)各種哺乳動物(ヒト、ウサギ、イヌ、ネコ、モルモット、ハムスター、ラット、マウスなど)由来のプロモーター、例えば、アルブミン、インスリンII、ウロプラキンII、エラスターゼ、エリスロポエチン、エンドセリン、筋クレアチンキナーゼ、グリア線維性酸性タンパク質、グルタチオンS−トランスフェラーゼ、血小板由来成長因子β、ケラチンK1,K10およびK14、コラーゲンI型およびII型、サイクリックAMP依存タンパク質キナーゼβIサブユニット、ジストロフィン、酒石酸抵抗性アルカリフォスファターゼ、心房ナトリウム利尿性因子、内皮レセプターチロシンキナーゼ(一般にTie2と略される)、ナトリウムカリウムアデノシン3リン酸化酵素(Na,K−ATPase)、ニューロフィラメント軽鎖、メタロチオネインIおよびIIA、メタロプロティナーゼ1組織インヒビター、MHCクラスI抗原(H−2L)、H−ras、レニン、ドーパミンβ−水酸化酵素、甲状腺ペルオキシダーゼ(TPO)、ポリペプチド鎖延長因子1α(EF−1α)、βアクチン、αおよびβミオシン重鎖、ミオシン軽鎖1および2、ミエリン基礎タンパク質、チログロブリン、Thy−1、免疫グロブリン、H鎖可変部(VNP)、血清アミロイドPコンポーネント、ミオグロビン、トロポニンC、平滑筋αアクチン、プレプロエンケファリンA、バソプレシンなどのプロモーターなどが用いられる。なかでも、全身で高発現することが可能なサイトメガロウイルスプロモーター、ヒトポリペプチド鎖延長因子1α(EF−1α)のプロモーター、ヒトおよびニワトリβアクチンプロモーターなどが好適である。
上記ベクターは、DNA導入哺乳動物において目的とするmRNAの転写を終結する配列(一般にターミネターと呼ばれる)を有していることが好ましく、例えば、ウイルス由来および各種哺乳動物由来の各DNAの配列を用いることができ、好ましくは、シミアンウイルスのSV40ターミネターなどが用いられる。
【0059】
その他、目的とする外来性DNAをさらに高発現させる目的で各DNAのスプライシングシグナル、エンハンサー領域、真核DNAのイントロンの一部などをプロモーター領域の5’上流、プロモーター領域と翻訳領域間あるいは翻訳領域の3’下流に連結することも目的により可能である。
正常な本発明のタンパク質の翻訳領域は、ヒトまたは各種哺乳動物(例えば、ウサギ、イヌ、ネコ、モルモット、ハムスター、ラット、マウスなど)由来の肝臓、腎臓、甲状腺細胞、線維芽細胞由来DNAおよび市販の各種ゲノムDNAライブラリーよりゲノムDNAの全てあるいは一部として、または肝臓、腎臓、甲状腺細胞、線維芽細胞由来RNAより公知の方法により調製された相補DNAを原料として取得することが出来る。また、外来性の異常DNAは、上記の細胞または組織より得られた正常なポリペプチドの翻訳領域を点突然変異誘発法により変異した翻訳領域を作製することができる。
該翻訳領域は導入動物において発現しうるDNAコンストラクトとして、前記のプロモーターの下流および所望により転写終結部位の上流に連結させる通常のDNA工学的手法により作製することができる。
受精卵細胞段階における本発明の外来性DNAの導入は、対象哺乳動物の胚芽細胞および体細胞のすべてに存在するように確保される。DNA導入後の作出動物の胚芽細胞において、本発明の外来性DNAが存在することは、作出動物の後代がすべて、その胚芽細胞および体細胞のすべてに本発明の外来性DNAを保持することを意味する。本発明の外来性DNAを受け継いだこの種の動物の子孫はその胚芽細胞および体細胞のすべてに本発明の外来性DNAを有する。
本発明の外来性正常DNAを導入した非ヒト哺乳動物は、交配により外来性DNAを安定に保持することを確認して、該DNA保有動物として通常の飼育環境で継代飼育することが出来る。
受精卵細胞段階における本発明の外来性DNAの導入は、対象哺乳動物の胚芽細胞および体細胞の全てに過剰に存在するように確保される。DNA導入後の作出動物の胚芽細胞において本発明の外来性DNAが過剰に存在することは、作出動物の子孫が全てその胚芽細胞および体細胞の全てに本発明の外来性DNAを過剰に有することを意味する。本発明の外来性DNAを受け継いだこの種の動物の子孫はその胚芽細胞および体細胞の全てに本発明の外来性DNAを過剰に有する。
導入DNAを相同染色体の両方に持つホモザイゴート動物を取得し、この雌雄の動物を交配することによりすべての子孫が該DNAを過剰に有するように繁殖継代することができる。
【0060】
本発明の正常DNAを有する非ヒト哺乳動物は、本発明の正常DNAが高発現させられており、内在性の正常DNAの機能を促進することにより最終的に本発明のタンパク質の機能亢進症を発症することがあり、その病態モデル動物として利用することができる。例えば、本発明の正常DNA導入動物を用いて、本発明のタンパク質の機能亢進症や、本発明のタンパク質が関連する疾患の病態機序の解明およびこれらの疾患の治療方法の検討を行なうことが可能である。
また、本発明の外来性正常DNAを導入した哺乳動物は、遊離した本発明のタンパク質の増加症状を有することから、本発明のタンパク質に関連する疾患に対する治療薬のスクリーニング試験にも利用可能である。
一方、本発明の外来性異常DNAを有する非ヒト哺乳動物は、交配により外来性DNAを安定に保持することを確認して該DNA保有動物として通常の飼育環境で継代飼育することが出来る。さらに、目的とする外来DNAを前述のプラスミドに組み込んで原料として用いることができる。プロモーターとのDNAコンストラク卜は、通常のDNA工学的手法によって作製することができる。受精卵細胞段階における本発明の異常DNAの導入は、対象哺乳動物の胚芽細胞および体細胞の全てに存在するように確保される。DNA転移後の作出動物の胚芽細胞において本発明の異常DNAが存在することは、作出動物の子孫が全てその胚芽細胞および体細胞の全てに本発明の異常DNAを有することを意味する。本発明の外来性DNAを受け継いだこの種の動物の子孫は、その胚芽細胞および体細胞の全てに本発明の異常DNAを有する。導入DNAを相同染色体の両方に持つホモザイゴート動物を取得し、この雌雄の動物を交配することによりすべての子孫が該DNAを有するように繁殖継代することができる。
【0061】
本発明の異常DNAを有する非ヒト哺乳動物は、本発明の異常DNAが高発現させられており、内在性の正常DNAの機能を阻害することにより最終的に本発明のタンパク質の機能不活性型不応症となることがあり、その病態モデル動物として利用することができる。例えば、本発明の異常DNA導入動物を用いて、本発明のタンパク質の機能不活性型不応症の病態機序の解明およびこの疾患を治療方法の検討を行なうことが可能である。
また、具体的な利用可能性としては、本発明の異常DNA高発現動物は、本発明のタンパク質の機能不活性型不応症における本発明の異常タンパク質による正常タンパク質の機能阻害(dominant negative作用)を解明するモデルとなる。また、本発明の外来異常DNAを導入した哺乳動物は、遊離した本発明のタンパク質の増加症状を有することから、本発明のタンパク質またはその機能不活性型不応症に対する治療薬スクリーニング試験にも利用可能である。
また、上記2種類の本発明のDNA導入動物のその他の利用可能性として、例えば、
(i)組織培養のための細胞源としての使用、
(ii)本発明のDNA導入動物の組織中のDNAもしくはRNAを直接分析する、またはDNAにより発現されたポリペプチド組織を分析することによる、本発明のタンパク質により特異的に発現あるいは活性化するタンパク質との関連性についての解析、
(iii)DNAを有する組織の細胞を標準組織培養技術により培養し、これらを使用して、一般に培養困難な組織からの細胞の機能の研究、
(iv)上記(iii)記載の細胞を用いることによる細胞の機能を高めるような薬剤のスクリーニング、および
(v)本発明の変異タンパク質を単離精製およびその抗体作製などが考えられる。
さらに、本発明のDNA導入動物を用いて、本発明のタンパク質の機能不活性型不応症などを含む、本発明のタンパク質に関連する疾患の臨床症状を調べることができ、また、本発明のタンパク質に関連する疾患モデルの各臓器におけるより詳細な病理学的所見が得られ、新しい治療方法の開発、さらには、該疾患による二次的疾患の研究および治療に貢献することができる。
また、本発明のDNA導入動物から各臓器を取り出し、細切後、トリプシンなどのタンパク質分解酵素により、遊離したDNA導入細胞の取得、その培養またはその培養細胞の系統化を行なうことが可能である。さらに、本発明のタンパク質産生細胞の特定化、アポトーシス、分化あるいは増殖との関連性、またはそれらにおけるシグナル伝達機構を調べ、それらの異常を調べることなどができ、本発明のタンパク質およびその作用解明のための有効な研究材料となる。
さらに、本発明のDNA導入動物を用いて、本発明のタンパク質の機能不活性型不応症を含む、本発明のタンパク質に関連する疾患の治療薬の開発を行なうために、上述の検査法および定量法などを用いて、有効で迅速な該疾患治療薬のスクリーニング法を提供することが可能となる。また、本発明のDNA導入動物または本発明の外来性DNA発現ベクターを用いて、本発明のタンパク質が関連する疾患のDNA治療法を検討、開発することが可能である。
【0062】
〔8〕ノックアウト動物
本発明は、本発明のDNAが不活性化された非ヒト哺乳動物胚幹細胞および本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物を提供する。
すなわち、本発明は、
(1)本発明のDNAが不活性化された非ヒト哺乳動物胚幹細胞、
(2)該DNAがレポーター遺伝子(例、大腸菌由来のβ−ガラクトシダーゼ遺伝子)を導入することにより不活性化された上記(1)記載の胚幹細胞、
(3)ネオマイシン耐性である上記(1)記載の胚幹細胞、
(4)非ヒト哺乳動物がゲッ歯動物である上記(1)記載の胚幹細胞、
(5)ゲッ歯動物がマウスである上記(4)記載の胚幹細胞、
(6)本発明のDNAが不活性化された該DNA発現不全非ヒト哺乳動物、
(7)該DNAがレポーター遺伝子(例、大腸菌由来のβ−ガラクトシダーゼ遺伝子)を導入することにより不活性化され、該レポーター遺伝子が本発明のDNAに対するプロモーターの制御下で発現しうる上記(6)記載の非ヒト哺乳動物、
(8)非ヒト哺乳動物がゲッ歯動物である上記(6)記載の非ヒト哺乳動物、
(9)ゲッ歯動物がマウスである上記(8)記載の非ヒト哺乳動物、および
(10)上記(7)記載の動物に、試験化合物を投与し、レポーター遺伝子の発現を検出することを特徴とする本発明のDNAに対するプロモーター活性を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング方法を提供する。
本発明のDNAが不活性化された非ヒト哺乳動物胚幹細胞とは、該非ヒト哺乳動物が有する本発明のDNAに人為的に変異を加えることにより、DNAの発現能を抑制するか、あるいは該DNAがコードしている本発明のタンパク質の活性を実質的に喪失させることにより、DNAが実質的に本発明のタンパク質の発現能を有さない(以下、本発明のノックアウトDNAと称することがある)非ヒト哺乳動物の胚幹細胞(以下、ES細胞と略記する)をいう。
非ヒト哺乳動物としては、前記と同様のものが用いられる。
【0063】
本発明のDNAに人為的に変異を加える方法としては、例えば、遺伝子工学的手法により該DNA配列の一部又は全部の削除、他DNAを挿入または置換させることによって行なうことができる。これらの変異により、例えば、コドンの読み取り枠をずらしたり、プロモーターあるいはエキソンの機能を破壊することにより本発明のノックアウトDNAを作製すればよい。
本発明のDNAが不活性化された非ヒト哺乳動物胚幹細胞(以下、本発明のDNA不活性化ES細胞または本発明のノックアウトES細胞と略記する)の具体例としては、例えば、目的とする非ヒト哺乳動物が有する本発明のDNAを単離し、そのエキソン部分にネオマイシン耐性遺伝子、ハイグロマイシン耐性遺伝子を代表とする薬剤耐性遺伝子、あるいはlacZ(β−ガラクトシダーゼ遺伝子)、cat(クロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ遺伝子)を代表とするレポーター遺伝子等を挿入することによりエキソンの機能を破壊するか、あるいはエキソン間のイントロン部分に遺伝子の転写を終結させるDNA配列(例えば、polyA付加シグナルなど)を挿入し、完全なmRNAを合成できなくすることによって、結果的に遺伝子を破壊するように構築したDNA配列を有するDNA鎖(以下、ターゲッティングベクターと略記する)を、例えば相同組換え法により該動物の染色体に導入し、得られたES細胞について本発明のDNA上あるいはその近傍のDNA配列をプローブとしたサザンハイブリダイゼーション解析あるいはターゲッティングベクター上のDNA配列とターゲッティングベクター作製に使用した本発明のDNA以外の近傍領域のDNA配列をプライマーとしたPCR法により解析し、本発明のノックアウトES細胞を選別することにより得ることができる。
【0064】
また、相同組換え法等により本発明のDNAを不活化させる元のES細胞としては、例えば、前述のような既に樹立されたものを用いてもよく、また公知のEvansとKaufmanの方法に準じて新しく樹立したものでもよい。例えば、マウスのES細胞の場合、現在、一般的には129系のES細胞が使用されているが、免疫学的背景がはっきりしていないので、これに代わる純系で免疫学的に遺伝的背景が明らかなES細胞を取得するなどの目的で例えば、C57BL/6マウスやC57BL/6の採卵数の少なさをDBA/2との交雑により改善したBDFマウス(C57BL/6とDBA/2とのF)を用いて樹立したものなども良好に用いうる。BDFマウスは、採卵数が多く、かつ、卵が丈夫であるという利点に加えて、C57BL/6マウスを背景に持つので、これを用いて得られたES細胞は病態モデルマウスを作出したとき、C57BL/6マウスとバッククロスすることでその遺伝的背景をC57BL/6マウスに代えることが可能である点で有利に用い得る。
また、ES細胞を樹立する場合、一般には受精後3.5日目の胚盤胞を使用するが、これ以外に8細胞期胚を採卵し胚盤胞まで培養して用いることにより効率よく多数の初期胚を取得することができる。
また、雌雄いずれのES細胞を用いてもよいが、通常雄のES細胞の方が生殖系列キメラを作出するのに都合が良い。また、煩雑な培養の手間を削減するためにもできるだけ早く雌雄の判別を行なうことが望ましい。
ES細胞の雌雄の判定方法としては、例えば、PCR法によりY染色体上の性決定領域の遺伝子を増幅、検出する方法が、その1例としてあげることができる。この方法を使用すれば、従来、核型分析をするのに約10個の細胞数を要していたのに対して、1コロニー程度のES細胞数(約50個)で済むので、培養初期におけるES細胞の第一次セレクションを雌雄の判別で行なうことが可能であり、早期に雄細胞の選定を可能にしたことにより培養初期の手間は大幅に削減できる。
【0065】
また、第二次セレクションとしては、例えば、G−バンディング法による染色体数の確認等により行うことができる。得られるES細胞の染色体数は正常数の100%が望ましいが、樹立の際の物理的操作等の関係上困難な場合は、ES細胞の遺伝子をノックアウトした後、正常細胞(例えば、マウスでは染色体数が2n=40である細胞)に再びクローニングすることが望ましい。
このようにして得られた胚幹細胞株は、通常その増殖性は大変良いが、個体発生できる能力を失いやすいので、注意深く継代培養することが必要である。例えば、STO繊維芽細胞のような適当なフィーダー細胞上でLIF(1〜10000U/ml)存在下に炭酸ガス培養器内(好ましくは、5%炭酸ガス、95%空気または5%酸素、5%炭酸ガス、90%空気)で約37℃で培養するなどの方法で培養し、継代時には、例えば、トリプシン/EDTA溶液(通常0.001〜0.5%トリプシン/0.1〜5mM EDTA、好ましくは約0.1%トリプシン/1mM EDTA)処理により単細胞化し、新たに用意したフィーダー細胞上に播種する方法などがとられる。このような継代は、通常1〜3日毎に行なうが、この際に細胞の観察を行い、形態的に異常な細胞が見受けられた場合はその培養細胞は放棄することが望まれる。
ES細胞は、適当な条件により、高密度に至るまで単層培養するか、または細胞集塊を形成するまで浮遊培養することにより、頭頂筋、内臓筋、心筋などの種々のタイプの細胞に分化させることが可能であり〔M. J. Evans及びM. H. Kaufman, ネイチャー(Nature)第292巻、154頁、1981年;G. R. Martin プロシーディングス・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンス・ユーエスエー(Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.)第78巻、7634頁、1981年;T. C. Doetschman ら、ジャーナル・オブ・エンブリオロジー・アンド・エクスペリメンタル・モルフォロジー、第87巻、27頁、1985年〕、本発明のES細胞を分化させて得られる本発明のDNA発現不全細胞は、インビトロにおける本発明のタンパク質の細胞生物学的検討において有用である。
本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物は、該動物のmRNA量を公知方法を用いて測定して間接的にその発現量を比較することにより、正常動物と区別することが可能である。
該非ヒト哺乳動物としては、前記と同様のものが用いられる。
【0066】
本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物は、例えば、前述のようにして作製したターゲッティングベクターをマウス胚幹細胞またはマウス卵細胞に導入し、導入によりターゲッティングベクターの本発明のDNAが不活性化されたDNA配列が遺伝子相同組換えにより、マウス胚幹細胞またはマウス卵細胞の染色体上の本発明のDNAと入れ換わる相同組換えをさせることにより、本発明のDNAをノックアウトさせることができる。
本発明のDNAがノックアウトされた細胞は、本発明のDNA上またはその近傍のDNA配列をプローブとしたサザンハイブリダイゼーション解析またはターゲッティングベクター上のDNA配列と、ターゲッティングベクターに使用したマウス由来の本発明のDNA以外の近傍領域のDNA配列とをプライマーとしたPCR法による解析で判定することができる。非ヒト哺乳動物胚幹細胞を用いた場合は、遺伝子相同組換えにより、本発明のDNAが不活性化された細胞株をクローニングし、その細胞を適当な時期、例えば、8細胞期の非ヒト哺乳動物胚または胚盤胞に注入し、作製したキメラ胚を偽妊娠させた該非ヒト哺乳動物の子宮に移植する。作出された動物は正常な本発明のDNA座をもつ細胞と人為的に変異した本発明のDNA座をもつ細胞との両者から構成されるキメラ動物である。
該キメラ動物の生殖細胞の一部が変異した本発明のDNA座をもつ場合、このようなキメラ個体と正常個体を交配することにより得られた個体群より、全ての組織が人為的に変異を加えた本発明のDNA座をもつ細胞で構成された個体を、例えば、コートカラーの判定等により選別することにより得られる。このようにして得られた個体は、通常、本発明のタンパク質のヘテロ発現不全個体であり、本発明のタンパク質のヘテロ発現不全個体同志を交配し、それらの産仔から本発明のタンパク質のホモ発現不全個体を得ることができる。
卵細胞を使用する場合は、例えば、卵細胞核内にマイクロインジェクション法でDNA溶液を注入することによりターゲッティングベクターを染色体内に導入したトランスジェニック非ヒト哺乳動物を得ることができ、これらのトランスジェニック非ヒト哺乳動物に比べて、遺伝子相同組換えにより本発明のDNA座に変異のあるものを選択することにより得られる。
このようにして本発明のDNAがノックアウトされている個体は、交配により得られた動物個体も該DNAがノックアウトされていることを確認して通常の飼育環境で飼育継代を行なうことができる。
さらに、生殖系列の取得および保持についても常法に従えばよい。すなわち、該不活化DNAの保有する雌雄の動物を交配することにより、該不活化DNAを相同染色体の両方に持つホモザイゴート動物を取得しうる。得られたホモザイゴート動物は、母親動物に対して、正常個体1,ホモザイゴート複数になるような状態で飼育することにより効率的に得ることができる。ヘテロザイゴート動物の雌雄を交配することにより、該不活化DNAを有するホモザイゴートおよびヘテロザイゴート動物を繁殖継代する。
本発明のDNAが不活性化された非ヒト哺乳動物胚幹細胞は、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物を作出する上で、非常に有用である。
また、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物は、本発明のタンパク質により誘導され得る種々の生物活性を欠失するため、本発明のタンパク質の生物活性の不活性化を原因とする疾病のモデルとなり得るので、これらの疾病の原因究明及び治療法の検討に有用である。
【0067】
〔8a〕本発明のDNAの欠損や損傷などに起因する疾病に対して治療・予防効果を有する化合物のスクリーニング方法
本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物は、本発明のDNAの欠損や損傷などに起因する疾病に対して治療・予防効果を有する化合物のスクリーニングに用いることができる。
すなわち、本発明は、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物に試験化合物を投与し、該動物の変化を観察・測定することを特徴とする、本発明のDNAの欠損や損傷などに起因する疾病に対して治療・予防効果を有する化合物またはその塩のスクリーニング方法を提供する。
該スクリーニング方法において用いられる本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物としては、前記と同様のものがあげられる。
試験化合物としては、例えば、ペプチド、タンパク質、非ペプチド性化合物、合成化合物、発酵生産物、細胞抽出液、植物抽出液、動物組織抽出液、血漿などがあげられ、これら化合物は新規な化合物であってもよいし、公知の化合物であってもよい。
具体的には、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物を、試験化合物で処理し、無処理の対照動物と比較し、該動物の各器官、組織、疾病の症状などの変化を指標として試験化合物の治療・予防効果を試験することができる。
試験動物を試験化合物で処理する方法としては、例えば、経口投与、静脈注射などが用いられ、試験動物の症状、試験化合物の性質などにあわせて適宜選択することができる。また、試験化合物の投与量は、投与方法、試験化合物の性質などにあわせて適宜選択することができる。
例えば、腎不全に対して予防・治療効果を有する化合物をスクリーニングする場合、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物に試験化合物を投与し、該動物の血中クレアチニン量や、尿タンパク質量などを経時的に測定する。
該スクリーニング方法を用いて得られる化合物は、上記した試験化合物から選ばれた化合物であり、本発明のタンパク質の欠損や損傷などによって引き起こされる疾患に対して予防・治療効果を有するので、該疾患に対する安全で低毒性な予防・治療剤などの医薬として使用することができる。さらに、上記スクリーニングで得られた化合物から誘導される化合物も同様に用いることができる。
【0068】
該スクリーニング方法で得られた化合物は塩を形成していてもよく、該化合物の塩としては、生理学的に許容される酸(例、無機酸、有機酸など)や塩基(例、アルカリ金属など)などとの塩が用いられ、とりわけ生理学的に許容される酸付加塩が好ましい。このような塩としては、例えば、無機酸(例えば、塩酸、リン酸、臭化水素酸、硫酸など)との塩、あるいは有機酸(例えば、酢酸、ギ酸、プロピオン酸、フマル酸、マレイン酸、コハク酸、酒石酸、クエン酸、リンゴ酸、蓚酸、安息香酸、メタンスルホン酸、ベンゼンスルホン酸など)との塩などが用いられる。
該スクリーニング方法で得られた化合物またはその塩を含有する医薬は、前記した本発明のタンパク質を含有する医薬と同様にして製造することができる。
このようにして得られる製剤は、安全で低毒性であるので、例えば、ヒトまたはその他の哺乳動物(例えば、ラット、マウス、モルモット、ウサギ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ウマ、ネコ、イヌ、サルなど)に対して投与することができる。
該化合物またはその塩の投与量は、対象疾患、投与対象、投与ルートなどにより差異はあるが、例えば、該化合物を経口投与する場合、一般的に成人(体重60kgとして)の腎不全の患者においては、一日につき該化合物を約0.1〜100mg、好ましくは約1.0〜50mg、より好ましくは約1.0〜20mg投与する。非経口的に投与する場合は、該化合物の1回投与量は投与対象、対象疾患などによっても異なるが、例えば、該化合物を注射剤の形で通常成人(体重60kgとして)の腎不全の患者に投与する場合、一日につき該化合物を約0.01〜30mg、好ましくは約0.1〜20mg、より好ましくは約0.1〜10mgを静脈注射により投与するのが好都合である。他の動物の場合も、体重60kg当たりに換算した量を投与することができる。
【0069】
〔8b〕本発明のDNAに対するプロモーターの活性を促進または阻害する化合物のスクリーニング方法
本発明は、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物に、試験化合物を投与し、レポーター遺伝子の発現を検出することを特徴とする本発明のDNAに対するプロモーターの活性を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング方法を提供する。
上記スクリーニング方法において、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物としては、前記した本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物の中でも、本発明のDNAがレポーター遺伝子を導入することにより不活性化され、該レポーター遺伝子が本発明のDNAに対するプロモーターの制御下で発現しうるものが用いられる。
試験化合物としては、前記と同様のものがあげられる。
レポーター遺伝子としては、前記と同様のものが用いられ、β−ガラクトシダーゼ遺伝子(lacZ)、可溶性アルカリフォスファターゼ遺伝子またはルシフェラーゼ遺伝子などが好適である。
【0070】
本発明のDNAをレポーター遺伝子で置換された本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物では、レポーター遺伝子が本発明のDNAに対するプロモーターの支配下に存在するので、レポーター遺伝子がコードする物質の発現をトレースすることにより、プロモーターの活性を検出することができる。
例えば、本発明のタンパク質をコードするDNA領域の一部を大腸菌由来のβ−ガラクトシダーゼ遺伝子(lacZ)で置換している場合、本来、本発明のタンパク質の発現する組織で、本発明のタンパク質の代わりにβ−ガラクトシダーゼが発現する。従って、例えば、5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−ガラクトピラノシド(X−gal)のようなβ−ガラクトシダーゼの基質となる試薬を用いて染色することにより、簡便に本発明のタンパク質の動物生体内における発現状態を観察することができる。具体的には、本発明のタンパク質欠損マウスまたはその組織切片をグルタルアルデヒドなどで固定し、リン酸緩衝生理食塩液(PBS)で洗浄後、X−galを含む染色液で、室温または37℃付近で、約30分ないし1時間反応させた後、組織標本を1mM EDTA/PBS溶液で洗浄することによって、β−ガラクトシダーゼ反応を停止させ、呈色を観察すればよい。また、常法に従い、lacZをコードするmRNAを検出してもよい。
上記スクリーニング方法を用いて得られる化合物またはその塩は、上記した試験化合物から選ばれた化合物であり、本発明のDNAに対するプロモーター活性を促進または阻害する化合物である。
【0071】
該スクリーニング方法で得られた化合物は塩を形成していてもよく、該化合物の塩としては、生理学的に許容される酸(例、無機酸など)や塩基(例、アルカリ金属など)などとの塩が用いられ、とりわけ生理学的に許容される酸付加塩が好ましい。このような塩としては、例えば、無機酸(例えば、塩酸、リン酸、臭化水素酸、硫酸など)との塩、あるいは有機酸(例えば、酢酸、ギ酸、プロピオン酸、フマル酸、マレイン酸、コハク酸、酒石酸、クエン酸、リンゴ酸、蓚酸、安息香酸、メタンスルホン酸、ベンゼンスルホン酸など)との塩などが用いられる。
本発明のDNAに対するプロモーター活性を促進する化合物またはその塩は、本発明のタンパク質の発現を促進し、該タンパク質の機能を促進することができるので、例えば、腎疾患(例、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫、間質性腎炎、腎硬化症、尿毒症など)、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、膵臓疾患(例、膵炎など)、胸腺異常に伴う免疫疾患、生殖器疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎、精巣神経症、卵巣嚢腫など)、消化器性疾患(例、過敏性腸症候群、潰瘍性大腸炎、虚血性大腸炎、胃炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌、甲状腺癌、骨髄性白血病など)、呼吸器疾患(例、胸膜炎、肺炎、慢性閉塞性肺疾患、喘息など)、骨髄炎、糖尿病、高血圧、虚血後再灌流障害、網膜炎、中枢神経疾患(例、てんかん、アルツハイマー病、パーキンソン症候群、精神分裂病など)、皮膚疾患(例、アトピー性皮膚炎、脂漏性皮膚炎など)、甲状腺ホルモン関連疾患(例、甲状腺ホルモン不応症、バセドウ病、クレチン病、甲状腺機能亢進症など)などの予防・治療剤などの医薬として有用である。好ましくは腎疾患、甲状腺ホルモン関連疾患などの予防・治療剤として、さらに好ましくは糖尿病性腎症などの予防・治療剤として使用する。
【0072】
また、本発明のDNAに対するプロモーター活性を阻害する化合物またはその塩は、本発明のタンパク質の発現を阻害し、該タンパク質の機能を阻害することができるので、例えば腎疾患(例、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫、間質性腎炎、腎硬化症、尿毒症など)、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、膵臓疾患(例、膵炎など)、胸腺異常に伴う免疫疾患、生殖器疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎、精巣神経症、卵巣嚢腫など)、消化器性疾患(例、過敏性腸症候群、潰瘍性大腸炎、虚血性大腸炎、胃炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌、甲状腺癌、骨髄性白血病など)、呼吸器疾患(例、胸膜炎、肺炎、慢性閉塞性肺疾患、喘息など)、骨髄炎、糖尿病、高血圧、虚血後再灌流障害、網膜炎、中枢神経疾患(例、てんかん、アルツハイマー病、パーキンソン症候群、精神分裂病など)、皮膚疾患(例、アトピー性皮膚炎、脂漏性皮膚炎など)、甲状腺ホルモン関連疾患(例、甲状腺ホルモン不応症、バセドウ病、クレチン病、甲状腺機能亢進症など)などの予防・治療剤などの医薬として有用である。好ましくは腎疾患、甲状腺ホルモン関連疾患などの予防・治療剤として、さらに好ましくは糖尿病性腎症などの予防・治療剤として使用する。
上記化合物の中で好ましくは、本発明のDNAに対するプロモーター活性を促進する化合物またはその塩である。
さらに、上記スクリーニングで得られた化合物から誘導される化合物も同様に用いることができる。
該スクリーニング方法で得られた化合物またはその塩を含有する医薬は、前記した本発明のタンパク質またはその塩を含有する医薬と同様にして製造することができる。
このようにして得られる製剤は、安全で低毒性であるので、例えば、ヒトまたはその他の哺乳動物(例えば、ラット、マウス、モルモット、ウサギ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ウマ、ネコ、イヌ、サルなど)に対して投与することができる。
該化合物またはその塩の投与量は、対象疾患、投与対象、投与ルートなどにより差異はあるが、例えば、本発明のDNAに対するプロモーター活性を促進する化合物を経口投与する場合、一般的に成人(体重60kgとして)の腎不全患者においては、一日につき該化合物を約0.1〜100mg、好ましくは約1.0〜50mg、より好ましくは約1.0〜20mg投与する。非経口的に投与する場合は、該化合物の1回投与量は投与対象、対象疾患などによっても異なるが、例えば、本発明のDNAに対するプロモーター活性を促進する化合物を注射剤の形で通常成人(体重60kgとして)の腎不全患者に投与する場合、一日につき該化合物を約0.01〜30mg、好ましくは約0.1〜20mg、より好ましくは約0.1〜10mgを静脈注射により投与するのが好都合である。他の動物の場合も、体重60kg当たりに換算した量を投与することができる。
【0073】
一方、例えば、本発明のDNAに対するプロモーター活性を阻害する化合物を経口投与する場合、一般的に成人(体重60kgとして)の腎不全患者においては、一日につき該化合物を約0.1〜100mg、好ましくは約1.0〜50mg、より好ましくは約1.0〜20mg投与する。非経口的に投与する場合は、該化合物の1回投与量は投与対象、対象疾患などによっても異なるが、例えば、本発明のDNAに対するプロモーター活性を阻害する化合物を注射剤の形で通常成人(体重60kgとして)の腎不全患者に投与する場合、一日につき該化合物を約0.01〜30mg、好ましくは約0.1〜20mg、より好ましくは約0.1〜10mgを静脈注射により投与するのが好都合である。他の動物の場合も、体重60kg当たりに換算した量を投与することができる。
このように、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物は、本発明のDNAに対するプロモーターの活性を促進または阻害する化合物またはその塩をスクリーニングする上で極めて有用であり、本発明のDNA発現不全に起因する各種疾患の原因究明または予防・治療薬の開発に大きく貢献することができる。
また、本発明のタンパク質のプロモーター領域を含有するDNAを使って、その下流に種々のタンパク質をコードする遺伝子を連結し、これを動物の卵細胞に注入していわゆるトランスジェニック動物(遺伝子導入動物)を作出すれば、特異的にそのポリペプチドを合成させ、その生体での作用を検討することも可能となる。さらに上記プロモーター部分に適当なレポーター遺伝子を結合させ、これが発現するような細胞株を樹立すれば、本発明のタンパク質そのものの体内での産生能力を特異的に促進もしくは抑制する作用を持つ低分子化合物の探索系として使用できる。
【0074】
本明細書および図面において、塩基やアミノ酸などを略号で表示する場合、IUPAC−IUB Commission on Biochemical Nomenclature による略号あるいは当該分野における慣用略号に基づくものであり、その例を下記する。またアミノ酸に関し光学異性体があり得る場合は、特に明示しなければL体を示すものとする。
DNA     :デオキシリボ核酸
cDNA    :相補的デオキシリボ核酸
A      :アデニン
T      :チミン
G      :グアニン
C      :シトシン
RNA     :リボ核酸
mRNA    :メッセンジャーリボ核酸
dATP    :デオキシアデノシン三リン酸
dTTP    :デオキシチミジン三リン酸
dGTP    :デオキシグアノシン三リン酸
dCTP    :デオキシシチジン三リン酸
ATP     :アデノシン三リン酸
EDTA    :エチレンジアミン四酢酸
SDS     :ドデシル硫酸ナトリウム
Gly  :グリシン
Ala  :アラニン
Val  :バリン
Leu  :ロイシン
Ile  :イソロイシン
Ser  :セリン
Thr :スレオニン
Cys  :システイン
Met  :メチオニン
Glu  :グルタミン酸
Asp  :アスパラギン酸
Lys  :リジン
Arg  :アルギニン
His  :ヒスチジン
Phe  :フェニルアラニン
Tyr  :チロシン
Trp  :トリプトファン
Pro  :プロリン
Asn  :アスパラギン
Gln  :グルタミン
pGlu:ピログルタミン酸
【0075】
また、本明細書中で繁用される置換基、保護基および試薬を下記の記号で表記する。
Me      :メチル基
Et      :エチル基
Bu      :ブチル基
Ph      :フェニル基
TC      :チアゾリジン−4(R)−カルボキサミド基
Tos     :p−トルエンスルフォニル
CHO     :ホルミル
Bzl     :ベンジル
Cl−Bzl     :2,6−ジクロロベンジル
Bom     :ベンジルオキシメチル
Z       :ベンジルオキシカルボニル
Cl−Z    :2−クロロベンジルオキシカルボニル
Br−Z    :2−ブロモベンジルオキシカルボニル
Boc     :t−ブトキシカルボニル
DNP     :ジニトロフェニル
Trt     :トリチル
Bum     :t−ブトキシメチル
Fmoc    :N−9−フルオレニルメトキシカルボニル
HOBt    :1−ヒドロキシベンズトリアゾール
HOOBt   :3,4−ジヒドロ−3−ヒドロキシ−4−オキソ−1−2,3−ベンゾトリアジン
HONB    :1−ヒドロキシ−5−ノルボルネン−2,3−ジカルボキシイミド
DCC     :N,N’−ジシクロヘキシルカルボジイミド
【0076】
本願明細書の配列表の配列番号は、以下の配列を示す。
〔配列番号:1〕
実施例3で取得したヒトTCH229タンパク質のアミノ酸配列を示す。
〔配列番号:2〕
配列番号:1で表されるアミノ酸配列を有するヒトTCH229タンパク質をコードするDNAの塩基配列を示す。
〔配列番号:3〕
実施例1、実施例2、実施例5、実施例6、実施例9および実施例10で用いられたプライマーAP1の塩基配列を示す。
〔配列番号:4〕
実施例1、実施例3および実施例15で用いられたプライマーrr1の塩基配列を示す。
〔配列番号:5〕
実施例1、実施例2、実施例5、実施例6、実施例9および実施例10で用いられたプライマーAP2の塩基配列を示す。
〔配列番号:6〕
実施例1、実施例3および実施例15で用いられたプライマーrr2の塩基配列を示す。
〔配列番号:7〕
実施例1で用いられたプライマーrr3の塩基配列を示す。
〔配列番号:8〕
実施例1で用いられたプライマーrr4の塩基配列を示す。
〔配列番号:9〕
実施例2実施例3および実施例15で用いられたプライマーff1の塩基配列を示す。
〔配列番号:10〕
実施例2、実施例3および実施例15で用いられたプライマーff2の塩基配列を示す。
〔配列番号:11〕
実施例3で用いられたプライマーORFF1の塩基配列を示す。
〔配列番号:12〕
実施例3で用いられたプライマーORFR1の塩基配列を示す。
〔配列番号:13〕
実施例3で用いられたプライマーORFF2の塩基配列を示す。
〔配列番号:14〕
実施例3で用いられたプライマーORFR2の塩基配列を示す。
〔配列番号:15〕
実施例3および実施例7で用いられたプライマーM13Fの塩基配列を示す。
〔配列番号:16〕
実施例3および実施例7で用いられたプライマーM13Rの塩基配列を示す。
〔配列番号:17〕
実施例3および実施例15で用いられたプライマーA1の塩基配列を示す。
〔配列番号:18〕
実施例3および実施例15で用いられたプライマーB2の塩基配列を示す。
〔配列番号:19〕
実施例4、実施例16および実施例17で用いられたプライマーTMFの塩基配列を示す。
〔配列番号:20〕
実施例4、実施例16および実施例17で用いられたプライマーTMRの塩基配列を示す。
〔配列番号:21〕
実施例4、実施例16および実施例17で用いられたTaqManプローブP1の塩基配列を示す。
〔配列番号:22〕
実施例1で得られた塩基配列を示す。
〔配列番号:23〕
実施例1で得られた塩基配列を示す。
〔配列番号:24〕
実施例2で得られた塩基配列を示す。
〔配列番号:25〕
実施例3で得られた塩基配列を示す。
〔配列番号:26〕
実施例7で取得したマウスTCH229タンパク質のアミノ酸配列を示す。
〔配列番号:27〕
配列番号:26で表されるアミノ酸配列を有するマウスTCH229タンパク質をコードするDNAの塩基配列を示す。
〔配列番号:28〕
実施例5および実施例7で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:29〕
実施例5および実施例7で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:30〕
実施例5で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:31〕
実施例5および実施例7で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:32〕
実施例6および実施例7で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:33〕
実施例6および実施例7で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:34〕
実施例7で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:35〕
実施例7で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:36〕
実施例7で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:37〕
実施例7で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:38〕
実施例7で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:39〕
実施例7で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:40〕
実施例7で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:41〕
実施例7で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:42〕
実施例7で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:43〕
実施例7で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:44〕
実施例7で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:45〕
実施例8および実施例13で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:46〕
実施例8および実施例13で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:47〕
実施例8および実施例13で用いられたプローブの塩基配列を示す。
〔配列番号:48〕
実施例5で得られた塩基配列を示す。
〔配列番号:49〕
実施例5で得られた塩基配列を示す。
〔配列番号:50〕
実施例6で得られた塩基配列を示す。
〔配列番号:51〕
実施例7で得られた塩基配列を示す。
〔配列番号:52〕
実施例11で取得したラットTCH229タンパク質No.1のアミノ酸配列を示す。
〔配列番号:53〕
配列番号:52で表されるアミノ酸配列を有するラットTCH229タンパク質No.1をコードするDNAの塩基配列を示す。
〔配列番号:54〕
実施例11で取得したラットTCH229タンパク質No.2のアミノ酸配列を示す。
〔配列番号:55〕
配列番号:54で表されるアミノ酸配列を有するラットTCH229タンパク質No.2をコードするDNAの塩基配列を示す。
〔配列番号:56〕
実施例9で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:57〕
実施例9で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:58〕
実施例9で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:59〕
実施例9で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:60〕
実施例10で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:61〕
実施例10および実施例11で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:62〕
実施例11で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:63〕
実施例11で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:64〕
実施例11で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:65〕
実施例11で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:66〕
実施例11および実施例15で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:67〕
実施例11で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:68〕
実施例11で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:69〕
実施例11、実施例12、実施例14および実施例18で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:70〕
実施例11、実施例12、実施例14および実施例18で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:71〕
実施例11で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:72〕
実施例11で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:73〕
実施例11で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:74〕
実施例11で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:75〕
実施例11で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:76〕
実施例12、実施例14および実施例18で用いられたプローブの塩基配列を示す。
〔配列番号:77〕
実施例9で得られた塩基配列を示す。
〔配列番号:78〕
実施例9で得られた塩基配列を示す。
〔配列番号:79〕
実施例10で得られた塩基配列を示す。
〔配列番号:80〕
実施例11で得られた塩基配列を示す。
〔配列番号:81〕
実施例11で得られた塩基配列を示す。
〔配列番号:82〕
実施例15で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:83〕
実施例15で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
〔配列番号:84〕
実施例15で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
【0077】
後述の実施例3で取得されたエシェリヒア・コリ(Escherichia coli)TOP10/pCR−BluntII−TCH229は、2002年3月27日から、日本国茨城県つくば市東1−1−1 中央第6(郵便番号305−8566)の独立行政法人産業技術総合研究所 特許生物寄託センターに寄託番号FERM BP−7983として、2002年3月12日から、大阪府大阪市淀川区十三本町2−17−85(郵便番号532−8686)の財団法人 発酵研究所(IFO)に受託番号IFO 16767としてそれぞれ寄託されている。
後述の実施例7で取得されたエシェリヒア・コリ(Escherichia coli)TOP10/pCR2.1−mTCH229は、2002年6月13日から、日本国茨城県つくば市東1−1−1 中央第6(郵便番号305−8566)の独立行政法人産業技術総合研究所 特許生物寄託センターに寄託番号FERM BP−8076として、2002年6月4日から、大阪府大阪市淀川区十三本町2−17−85(郵便番号532−8686)の財団法人 発酵研究所(IFO)に受託番号IFO16800として寄託されている。
【実施例】
以下に実施例を示して、本発明をより詳細に説明するが、これらは本発明の範囲を限定するものではない。なお、大腸菌を用いての遺伝子操作法は、モレキュラー・クローニング(Molecular cloning)に記載されている方法に従った。
【0078】
実施例1
ヒトTCH229タンパク質をコードするcDNAの5’上流端のクローニング
5’RACE PCR クローニングによりヒトTCH229タンパク質をコードするcDNAの5’上流塩基配列を明らかにした。
2種のプライマーDNA、プライマーAP1(配列番号:3)およびプライマーrr1(配列番号:4)を用いて、ヒト腎臓Marathon−Ready cDNA(クロンテック社製)に対して、Advantage 2 DNA Polymerase(クロンテック社製)により、以下の条件で一次PCRを行った。
(1)94℃30秒間
(2)94℃10秒間−63℃3分間を35サイクル
さらに、この一次PCRの産物を鋳型として、プライマーAP2(配列番号:5)とプライマーrr2(配列番号:6)を用いて、Advantage 2 DNA Polymerase(クロンテック社製)により以下の条件でnested PCRを行った。
(3)94℃30秒間
(4)94℃10秒間−63℃3分間を30サイクル
上記nested PCR反応液 5μlにPCR Product Pre−Sequencing Kit(ユーエスビ社製)中のExonucleaseIとShrimp Alkaline Posphataseをそれぞれ1μl加え、37℃・15分、85℃・15分の反応を行った。これをプライマーAP2(配列番号:5)、プライマーrr2(配列番号:6)およびBigDye Terminator Cycle Sequencing Kit(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて反応を行い、増幅したDNA断片の塩基配列をDNAシークエンサーABI PRISM 3100 DNAアナライザ(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて決定した。その結果、配列番号:22に示す塩基配列を得た。
配列番号:22に示す塩基配列をもとにプライマーrr3(配列番号:7)およびプライマーrr4(配列番号:8)を設計した。プライマーAP1(配列番号:3)およびプライマーrr3(配列番号:7)を用いて、ヒト腎臓Marathon−Ready cDNA(クロンテック社製)に対して、Advantage 2 DNA Polymerase(クロンテック社製)により、以下の条件で一次PCRを行った。
(5)94℃30秒間
(6)94℃10秒間−63℃2分間を35サイクル
さらに、この一次PCRの産物を鋳型として、プライマーAP2(配列番号:5)とプライマーrr4(配列番号:8)を用いて、Advantage 2 DNA Polymerase(クロンテック社製)により以下の条件でnested PCRを行った。
(7)94℃30秒間
(8)94℃10秒間−63℃2分間を30サイクル
上記nested PCR反応液 5μlにPCR Product Pre−Sequencing Kit(ユーエスビ社製)中のExonucleaseIとShrimp Alkaline Posphataseをそれぞれ1μl加え、37℃・15分、85℃・15分の反応を行った。これをプライマーAP2(配列番号:5)とプライマーrr4(配列番号:8)およびBigDye Terminator Cycle Sequencing Kit(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて反応を行い、増幅したDNA断片の塩基配列をDNAシークエンサーABI PRISM 3100 DNAアナライザ(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて決定した。その結果、配列番号:23に示す塩基配列を得た。
【0079】
実施例2
ヒトTCH229タンパク質をコードするcDNAの3’下流端のクローニング
3’RACE PCR クローニングによりヒトTCH229タンパク質をコードするcDNAの3’下塩基配列を明らかにした。
2種のプライマーDNA、プライマーAP1(配列番号:3)およびプライマーff1(配列番号:9)を用いて、ヒト腎臓Marathon−Ready cDNA(クロンテック社製)に対して、Advantage 2 DNA Polymerase(クロンテック社製)により、以下の条件で一次PCRを行った。
(1)94℃30秒間
(2)94℃10秒間−63℃3分間を35サイクル
さらに、この一次PCRの産物を鋳型として、プライマーAP2(配列番号:5)とプライマーff2(配列番号:10)を用いて、Advantage 2 DNA Polymerase(クロンテック社製)により以下の条件でnested PCRを行った。
(3)94℃30秒間
(4)94℃10秒間−63℃3分間を30サイクル
上記nested PCR反応液 5μlにPCR Product Pre−Sequencing Kit(ユーエスビ社製)中のExonucleaseIとShrimp Alkaline Posphataseをそれぞれ1μl加え、37℃・15分、85℃・15分の反応を行った。これをプライマーAP2(配列番号:5)とプライマーff2(配列番号:10)およびBigDye Terminator Cycle Sequencing Kit(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて反応を行い、増幅したDNA断片の塩基配列をDNAシークエンサーABI PRISM 3100 DNAアナライザ(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて決定した。その結果、配列番号:24に示す塩基配列を得た。
【0080】
実施例3
ヒトTCH229タンパク質をコードするcDNAのクローニング
2種のプライマーDNA、プライマーORFF1(配列番号:11)およびプライマーORFR1(配列番号:12)を用いて、ヒト腎臓Marathon−Ready cDNA(クロンテック社製)に対して、pfu turbo DNA Polymerase(ストラタジーン社製)により、以下の条件(1)〜(3)で一次PCRを行った。
(1)94℃30秒間
(2)94℃10秒間−57℃10秒間−72℃2.5分間を35サイクル
(3)72℃5分間
さらに、この一次PCRの産物を鋳型として、プライマーORFF2(配列番号:13)とプライマーORFR2(配列番号:14)を用いて、pfu turbo DNA Polymerase(ストラタジーン社製)により以下の条件(4)〜(6)でnested PCRを行った。
(4)94℃30秒間
(5)94℃10秒間−56℃10秒間−72℃2.5分間を30サイクル
(6)72℃5分間
上記nested PCR反応液をMin Elute Gel Extraction Kit(キアゲン社製)を用いて精製した。このDNAを、Zero Blunt TOPO PCR Cloning Kit (インビトロジェン社製)のプロトコールに従ってpCR−Blunt II−TOPOベクターへクローニングした。これをエシェリヒア コリ(Escherichia coli)TOP10 competent cell(インビトロジェン社製)に導入して形質転換した後、cDNA挿入断片を持つクローンをカナマイシンを含むLB寒天培地で選択し、形質転換体を得た。個々のクローンをカナマイシンを含むLB培地で一晩培養し、QIAwell 8 Plasmid Kit (キアゲン社製)を用いてプラスミドDNAを調製し、プラスミドクローンpCR−BluntII−TCH229の2クローン#1、#2および#3を得た。これをプライマーDNA〔プライマーM13F(配列番号:15)、プライマーM13R(配列番号:16)、プライマーORFF2(配列番号:13) 、プライマーORFR2(配列番号:14)、プライマーrr2(配列番号:6)、プライマーA1(配列番号:17)、プライマーB2(配列番号:18)、プライマーff2(配列番号:10)、プライマーrr1(配列番号:4)、プライマーff1(配列番号:9)〕およびBigDye Terminator Cycle Sequencing Kit(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて反応を行い、挿入されているcDNA断片の塩基配列をDNAシークエンサーABI PRISM 3100 DNAアナライザ(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて決定した。その結果、取得した3クローンは同一のDNA断片を含んでおり2251個の塩基配列を有していた(配列番号:25)。断片には724個のアミノ酸配列(配列番号:1)がコードされており(配列番号:2)、配列番号:1で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質を、ヒトTCH229タンパク質と命名した。
該cDNA断片を含むプラスミドを有する形質転換体を、エシェリヒア・コリ(Escherichia coli)TOP10/pCR−BluntII−TCH229と命名した。
Blast P(Nucleic Acids Res. 第25巻、3389頁、1997年)を用いて公知のデータベースに対してホモロジー検索を行ったところ、該cDNAは有機アニオントランスポータに属する新規遺伝子であることが判明した(図1および図2)。図中、膜貫通領域をTM1〜12で示した。ヒトで報告されている有機アニオントランスポータであるSLC21A12(Biochemical and Biophysical Research Communications、第273巻、251頁、2000年)とはアミノ酸レベルで41%の相同性を、またOATPRP4(GenBank Accession No. NM 030958)とはアミノ酸レベルで36%の相同性を示し、該タンパク質は12回膜貫通型の構造を有すると推測された。
【0081】
実施例4
ヒトTCH229遺伝子産物の組織分布の解析
ヒトTCH229の配列から設計した2種のプライマーDNA、プライマーTMF(配列番号:19)およびプライマーTMR(配列番号:20)と、TaqManプローブP1(配列番号:21)を用いて、ヒトの各組織のcDNAにおけるヒトTCH229の発現量をTaqMan PCRにより測定した。
反応はTaqMan Universal PCR Master Mix(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて、ABI PRISM 7900 sequence detection system(アプライドバイオシステムズ社製)にて最初50℃2分間、さらに95℃10分間おいた後で、95℃で15秒、60℃で1分を1反応サイクルとして40サイクル繰り返し、同時に検出を行った。
測定に用いたヒトの各組織のcDNAを表1に示す。
結果を図3および図4に示す。
ヒトTCH229遺伝子産物(mRNA)は、Human MTC panel  IおよびMTC panel IIにおいては、腎臓で強い発現が見られ、肺、肝臓、膵臓で弱い発現が見られた。
Human digestive system MTC panelにおいては、肝臓で比較的強い発現が見られたが、胃から直腸まですべての部位では若干の発現しか見られなかった。
【表1】

Figure 2004081196
【0082】
実施例5
マウスTCH229タンパク質をコードするcDNAの5’上流端のクローニング
PCRクローニングおよび5’RACE PCR クローニングによりマウスTCH229タンパク質をコードするcDNAの5’上流塩基配列を明らかにした。
2種のプライマーDNA〔プライマーh243F(配列番号:28)およびプライマーmR1(配列番号:29)〕を用いて、マウス腎臓Marathon−Ready cDNA(クロンテック社製)に対して、Advantage 2 DNA Polymerase(クロンテック社製)により、以下の条件でPCRを行った。
(1)94℃30秒間
(2)94℃10秒間−63℃10秒間−68℃2分間を35サイクル
(3)68℃3分間
上記PCR反応液5μlにPCR Product Pre−Sequencing Kit(ユーエスビ社製)中のExonucleaseIとShrimp Alkaline Posphataseをそれぞれ1μl加え、37℃・15分、85℃・15分の反応を行った。これをプライマーh243F(配列番号:28)、プライマーmR1(配列番号:29)およびBigDye Terminator Cycle Sequencing Kit(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて反応を行い、増幅したDNA断片の塩基配列をDNAシークエンサーABI PRISM 3100 DNAアナライザ(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて決定した。その結果、配列番号:48に示す塩基配列を得た。
配列番号:48を基にプライマーmrr5(配列番号:30)およびプライマーmrr6(配列番号:31)を設計した。2種のプライマーDNA〔プライマーAP1(配列番号:3)およびプライマーmrr6(配列番号:31)〕を用いて、マウス腎臓Marathon−Ready cDNA(クロンテック社製)に対して、Advantage 2 DNA Polymerase(クロンテック社製)により、以下の条件で一次PCRを行った。
(1)94℃30秒間
(2)94℃10秒間−64℃4分間を40サイクル
さらに、この一次PCRの産物を鋳型として、プライマーAP2(配列番号:5)とプライマーmrr5(配列番号:30)を用いて、Advantage 2 DNA Polymerase(クロンテック社製)により以下の条件でnested PCRを行った。
(3)94℃30秒間
(4)94℃10秒間−64℃3分間を35サイクル
上記nested PCR反応液5μlにPCR Product Pre−Sequencing Kit(ユーエスビ社製)中のExonucleaseIとShrimp Alkaline Posphataseをそれぞれ1μl加え、37℃・15分、85℃・15分の反応を行った。これをプライマーmrr5(配列番号:30)およびBigDye Terminator Cycle Sequencing Kit(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて反応を行い、増幅したDNA断片の塩基配列をDNAシークエンサーABI PRISM 3100 DNAアナライザ(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて決定した。その結果、配列番号:49に示す塩基配列を得た。
【0083】
実施例6
マウスTCH229タンパク質をコードするcDNAの3’下流端のクローニング
3’RACE PCR クローニングによりマウスTCH229タンパク質をコードするcDNAの3’上流塩基配列を明らかにした。
2種のプライマーDNA〔プライマーAP1(配列番号:3)およびプライマーmF1(配列番号:32)〕を用いて、マウス腎臓Marathon−Ready cDNA(クロンテック社製)に対して、Advantage 2 DNA Polymerase(クロンテック社製)により、以下の条件で一次PCRを行った。
(1)94℃30秒間
(2)94℃10秒間−61℃4分間を40サイクル
さらに、この一次PCRの産物を鋳型として、プライマーAP2(配列番号:5)とプライマーmff2(配列番号:33)を用いて、Advantage 2 DNA Polymerase(クロンテック社製)により以下の条件でnested PCRを行った。
(3)94℃30秒間
(4)94℃10秒間−61℃3分間を35サイクル
上記nested PCR反応液5μlにPCR Product Pre−Sequencing Kit(ユーエスビ社製)中のExonucleaseIとShrimp Alkaline Posphataseをそれぞれ1μl加え、37℃・15分、85℃・15分の反応を行った。これをプライマーmff2(配列番号:33)およびBigDye Terminator Cycle Sequencing Kit(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて反応を行い、増幅したDNA断片の塩基配列をDNAシークエンサーABI PRISM 3100 DNAアナライザ(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて決定した。その結果、配列番号:50に示す塩基配列を得た。
【0084】
実施例7
マウスTCH229タンパク質をコードするcDNAのクローニング
2種のプライマーDNA〔プライマーmORFF(4)(配列番号:34)およびプライマーmORFR(2195)(配列番号:35)〕を用いて、マウス腎臓Marathon−Ready cDNA(クロンテック社製)に対して、pfu turbo DNA Polymerase(ストラタジーン社製)により、以下の条件(1)〜(3)で一次PCRを行った。
(1)94℃30秒間
(2)94℃10秒間−56℃10秒間−72℃2分間を35サイクル
(3)72℃5分間
さらに、この一次PCRの産物を鋳型として、プライマーmORFF(atg)(配列番号:36)とプライマーmORFR(tga)(配列番号:37)を用いて、pfu turbo DNA Polymerase(ストラタジーン社製)により以下の条件(4)〜(6)でnested PCRを行った。
(4)94℃30秒間
(5)94℃10秒間−56℃10秒間−72℃2分間を30サイクル
(6)72℃5分間
上記nested PCR反応液10μlにAdvantage 2 DNA Polymerase(クロンテック社製)を1.5μl加え、72℃、10分間の反応の後、Min Elute Gel Extraction Kit(キアゲン社製)を用いて精製した。このDNAを、TOPO TA Cloning Kit (インビトロジェン社製)のプロトコールに従ってpCR2.1−TOPOベクターへクローニングした。これをエシェリヒア コリ(Escherichia coli)TOP10 competent cell(インビトロジェン社製)に導入して形質転換した後、cDNA挿入断片を持つクローンをカナマイシンを含むLB寒天培地で選択し、形質転換体を得た。個々のクローンをカナマイシンを含むLB培地で一晩培養し、QIAwell 8 Plasmid Kit (キアゲン社製)を用いてプラスミドDNAを調製し、プラスミドクローンpCR2.1−mTCH229の2クローン#1、#2および#3を得た。これをプライマーDNA〔プライマーM13F(配列番号:15)、プライマーM13R(配列番号:16)、プライマーh243F(配列番号:28) 、プライマーmR1(配列番号:29) 、プライマーh650F(配列番号:38)、プライマーh910F(配列番号:39)、プライマーmrr1(配列番号:40)、プライマーmrr2(配列番号:41)、プライマーmrr3(配列番号:42)、プライマーF(45)(配列番号:43) 、プライマーm521R(配列番号:44)、プライマーmF1(配列番号:32)、プライマーmff2(配列番号:33)、プライマーmrr6(配列番号:31)〕およびBigDye Terminator Cycle Sequencing Kit(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて反応を行い、挿入されているcDNA断片の塩基配列をDNAシークエンサーABI PRISM 3100 DNAアナライザ(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて決定した。その結果、取得した3クローンは同一のDNA断片を含んでおり2169個の塩基配列を有していた(配列番号:51)。断片には722個のアミノ酸配列(配列番号:26)がコードされており(配列番号:27)、配列番号:26で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質を、マウスTCH229タンパク質と命名した。
該cDNA断片を含むプラスミドを有する形質転換体を、エシェリヒア・コリ(Escherichia coli)TOP10/pCR2.1−mTCH229と命名した。
Blast P(Nucleic Acids Res. 第25巻、3389頁、1997年)を用いて公知データベースに対してホモロジー検索を行ったところ、該cDNAはマウスで報告されている有機アニオントランスポータであるマウスSLC21A11(Genbank:NP_076397 )と塩基レベルで43.2%、アミノ酸レベルで37%の相同性を示した。またマウスTCH229は有機アニオントランスポータファミリーに属する新規遺伝子であるヒトTCH229と塩基レベルで83%、アミノ酸レベルで81%の相同性を示したことより、ヒトTCH229のマウスホモログであることが判明した(図5)。図中、膜貫通領域をTM1〜12で、またファミリー間で高く保存されているアミノ酸箇所で*で示した。
【0085】
実施例8
マウスTCH229遺伝子産物の組織分布の解析
マウスTCH229の配列から設計した2種のプライマーDNA、プライマーmTMF(配列番号:45)およびプライマーmTMR(配列番号:46)と、TaqManプローブmP1(配列番号:47)を用いて、マウスの各組織のcDNAにおけるマウスTCH229の発現量をTaqMan PCRにより測定した。
反応はTaqMan Universal PCR Master Mix(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて、ABI PRISM 7900 sequence detection system(アプライドバイオシステムズ社製)にて最初50℃2分間、さらに95℃10分間おいた後で、95℃で15秒、60℃で1分を1反応サイクルとして40サイクル繰り返し、同時に検出を行った。
結果を図6に示す。
マウスTCH229遺伝子産物(mRNA)は、mause MTC panel IおよびMTC panel IIにおいては、前立腺で強い発現が見られ、骨髄、目、肺、腎臓においても比較的高い発現が見られた。
【0086】
実施例9
ラットTCH229タンパク質をコードするcDNAの5’上流クローニングPCRクローニングおよび5’RACE PCR クローニングによりラットTCH229タンパク質をコードするcDNAの5’上流塩基配列を明らかにした。
マウスTCH229の配列(配列番号:51)を基に設計した2種のプライマーDNA、プライマーm163F(配列番号:56)およびプライマーm2087R(配列番号:57)を用いて、ラット腎臓Marathon−Ready cDNA(クロンテック社製)に対して、Advantage 2 DNA Polymerase(クロンテック社製)により、以下の条件でPCRを行った。
(1)94℃30秒間
(2)94℃10秒間−60℃10秒間−68℃2.5分間を35サイクル
(3)68℃5分間
上記PCR反応液 5μlにPCR Product Pre−Sequencing Kit(ユーエスビ社製)中のExonucleaseIとShrimp Alkaline Posphataseをそれぞれ1μl加え、37℃・15分、85℃・15分の反応を行った。これをプライマーm163F(配列番号:56)、プライマーm2087R(配列番号:57)およびBigDye Terminator Cycle SequencingKit(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて反応を行い、増幅したDNA断片の塩基配列をDNAシークエンサーABI PRISM 3100 DNAアナライザ(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて決定した。その結果、配列番号:77に示す塩基配列を得た。
配列番号77を基にプライマーr229−rr1(配列番号:58)およびプライマーr229−rr2(配列番号:59)を設計した。2種のプライマーDNA、プライマーAP1(配列番号:3)およびプライマーr229−rr1(配列番号:58)を用いて、ラット腎臓Marathon−Ready cDNA(クロンテック社製)に対して、Advantage 2 DNA Polymerase(クロンテック社製)により、以下の条件で一次PCRを行った。
(1)94℃30秒間
(2)94℃10秒間−64℃2分間を35サイクル
さらに、この一次PCRの産物を鋳型として、プライマーAP2(配列番号:5)とプライマーr229−rr2(配列番号:59)を用いて、Advantage 2 DNA Polymerase(クロンテック社製)により以下の条件でnested PCRを行った。
(3)94℃30秒間
(4)94℃10秒間−64℃2分間を35サイクル
上記nested PCR反応液 5μlにPCR Product Pre−Sequencing Kit(ユーエスビ社製)中のExonucleaseIとShrimp Alkaline Posphataseをそれぞれ1μl加え、37℃・15分、85℃・15分の反応を行った。これをプライマーr229−rr2(配列番号:59)とBigDye Terminator Cycle Sequencing Kit(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて反応を行い、増幅したDNA断片の塩基配列をDNAシークエンサーABI PRISM 3100 DNAアナライザ(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて決定した。その結果、配列番号:78に示す塩基配列を得た。
【0087】
実施例10
ラットTCH229タンパク質をコードするcDNAの3’下流端のクローニング
3’RACE PCR クローニングによりラットTCH229タンパク質をコードするcDNAの3’下流塩基配列を明らかにした。
2種のプライマーDNA、プライマーAP1(配列番号:3)およびプライマーrff1(配列番号:60)を用いて、ラット腎臓Marathon−Ready cDNA(クロンテック社製)に対して、Advantage 2 DNA Polymerase(クロンテック社製)により、以下の条件で一次PCRを行った。
(1)94℃30秒間
(2)94℃10秒間−64℃2分間を35サイクル
さらに、この一次PCRの産物を鋳型として、プライマーAP2(配列番号:5)とプライマーrff3(配列番号:61)を用いて、Advantage 2 DNA Polymerase(クロンテック社製)により以下の条件でnested PCRを行った。
(3)94℃30秒間
(4)94℃10秒間−64℃2分間を30サイクル
上記nested PCR反応液 5μlにPCR Product Pre−Sequencing Kit(ユーエスビ社製)中のExonucleaseIとShrimp Alkaline Posphataseをそれぞれ1μl加え、37℃・15分、85℃・15分の反応を行った。これをプライマーrff3(配列番号:61)およびBigDye Terminator Cycle Sequencing Kit(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて反応を行い、増幅したDNA断片の塩基配列をDNAシークエンサーABI PRISM 3100 DNAアナライザ(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて決定した。その結果、配列番号:79に示す塩基配列を得た。
【0088】
実施例11
ラットTCH229タンパク質をコードするcDNAのクローニング
2種のプライマーDNA、プライマーrORFF1(配列番号:62)およびプライマーrORFR12(配列番号:63)を用いて、ラット腎臓Marathon−Ready cDNA(クロンテック社製)に対して、pfu turbo DNA Polymerase(ストラタジーン社製)により、以下の条件(1)〜(3)で一次PCRを行った。
(1)94℃30秒間
(2)94℃10秒間−56℃10秒間−72℃2.5分間を35サイクル
(3)72℃5分間
さらに、この一次PCRの産物を鋳型として、プライマーrORFF(atg)(配列番号:64)とプライマーrORFR(tga2)(配列番号:65)を用いて、pfu turbo DNAPolymerase(ストラタジーン社製)により以下の条件(4)〜(6)でnested PCRを行った。
(4)94℃30秒間
(5)94℃10秒間−56℃10秒間−72℃2.5分間を30サイクル
(6)72℃5分間
上記nested PCR反応液10μlにAdvantage 2 DNA Polymerase(クロンテック社製)を1.5μl加え、72℃、10分間の反応の後、Min Elute Gel Extraction Kit(キアゲン社製)を用いて精製した。このDNAを、TOPO TA Cloning Kit (インビトロジェン社製)のプロトコールに従ってpCRII−TOPOベクターへクローニングした。これをエシェリヒア コリ(Escherichia coli)TOP10 competent cell(インビトロジェン社製)に導入して形質転換した後、cDNA挿入断片を持つクローンをカナマイシンを含むLB寒天培地で選択し、形質転換体を得た。個々のクローンをカナマイシンを含むLB培地で一晩培養し、QIAwell 8 Plasmid Kit (キアゲン社製)を用いてプラスミドDNAを調製し、プラスミドクローンpCRII−rTCH229の4クローン#1、#2、#3および#4を得た。これをプライマーDNA〔プライマーT7(配列番号:66)、プライマーSP6(配列番号:67)、プライマーrORFF(atg)(配列番号:64)、プライマーrORFR(tga2)(配列番号:65)、プライマーrF1(配列番号:68)、プライマーrTMR(配列番号:69)、プライマーrTMF(配列番号:70)、プライマーrff3(配列番号:61)、プライマーrff2(配列番号:71)、プライマーrR1(配列番号:72) 、プライマーr972F(配列番号:73)、プライマーr1123F(配列番号:74)、プライマーr1746R(配列番号:75)〕およびBigDye Terminator Cycle Sequencing Kit(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて反応を行い、挿入されているcDNA断片の塩基配列をDNAシークエンサーABI PRISM 3100 DNAアナライザ(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて決定した。その結果、取得した4クローンは2種類のDNA断片(No.1およびNo.2)を含んでいた。No.1は2175個の塩基配列を有しており(配列番号:80)、断片には724個のアミノ酸配列(配列番号:52)がコードされており(配列番号:53)、配列番号:52で表されるアミノ酸配列を含有していた。No.2は2175個の塩基配列を有しており(配列番号:81)、断片には724個のアミノ酸配列(配列番号:54)がコードされており(配列番号:55)、配列番号:55で表されるアミノ酸配列を含有していた。それぞれのタンパク質を、ラットTCH229タンパク質No.1およびラットTCH229タンパク質No.2と命名した。該cDNA断片を含むプラスミドを有する形質転換体をそれぞれ、エシェリヒア・コリ(Escherichia coli)TOP10/pCRII−rTCH229No.1およびエシェリヒア・コリ(Escherichia coli)TOP10/pCRII−rTCH229No.2と命名した。
ラットTCH229タンパク質No.1およびラットTCH229タンパク質No.2には、4箇所(配列番号:53で表される塩基配列の144番目、231番目、1252番目および1539番目)の塩基置換が認められた。4箇所のうちA144T(Glu→Asp)、C231A(Ser→Arg)、A1252T(IIe→Phe)の3箇所は、それぞれ括弧内に示したアミノ酸置換を伴うものであったが、A1539Gはアミノ酸置換は無かった。これらの塩基置換は遺伝子多型(SNPs)に由来する可能性があると考えられる。
Blast P(Nucleic Acids Res. 第25巻、3389頁、1997年)を用いて公知データベースに対してホモロジー検索を行ったところ、ラットTCH229No.1およびNo.2は、ラットで報告されている有機アニオントランスポータであるラットoatp−E(Endocrinology 第142巻(5)、2005頁、2001年)と塩基レベルで約50%、アミノ酸レベルで約41%の相同性を示した。またラットTCH229No.1およびNo.2は有機アニオントランスポータファミリーに属する新規遺伝子であるヒトTCH229と塩基レベルで約81.4%、アミノ酸レベルで約81.6%の相同性を示したことより、ヒトTCH229のラットホモログであることが判明した(図7および図8)。図中、膜貫通領域をTM1〜12で示す。
【0089】
実施例12
ラットTCH229遺伝子産物の組織分布の解析
ラットTCH229の配列から設計した2種のプライマーDNA、プライマーrTMF(配列番号:70)およびプライマーrTMR(配列番号:69)と、TaqManプローブrP1(配列番号:76)を用いて、ラットの各組織(脾臓、胸腺、精巣、小腸、胃、皮膚、心臓、脳、肺、筋肉、腎臓)のcDNAにおけるラットTCH229の発現量をTaqMan PCRにより測定した。
反応はTaqMan Universal PCR Master Mix(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて、ABI PRISM 7900 sequence detection system(アプライドバイオシステムズ社製)にて最初50℃2分間、さらに95℃10分間おいた後で、95℃で15秒、60℃で1分を1反応サイクルとして40サイクル繰り返し、同時に検出を行った。結果を図9に示す。
ラットTCH229遺伝子産物(mRNA)は、Multiple Choice cDNAs ; RatKitIおよびRatKitII(オリジーン社製)においては、肺と腎臓で強い発現が見られ、皮膚、脳においても発現が見られた。
【0090】
実施例13
マウスTCH229遺伝子産物の7週齢BALB/cマウスにおける組織分布の解析
(1)正常マウス各組織のcDNAの調製
7週齢BALB/cマウスの各組織〔大脳、小脳、海馬、延髄、脊髄、坐骨神経、皮膚、骨格筋、眼球、心臓、肺、気管、膵臓、腎臓、肝臓、前胃、後胃、十二指腸、空回腸、盲腸、結腸、直腸、脾臓、胸腺、骨髄、卵巣、子宮、前立腺、精巣 (卵巣および子宮は雌から、それ以外は雄から、各1〜10匹分を採取)〕より、ISOGEN(ニッポンジーン社製)、またはRNeasy Mini Kit(キアゲン社製)を用いてtotal RNAを調製した。調製したtotal RNA に対してTaqMan Reverse Transcription Reagents(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて逆転写反応を行いcDNAを調製した。
(2)マウスTCH229遺伝子産物の組織分布の解析
実施例8で用いた2種のプライマーDNA、プライマーmTMF(配列番号:45)およびプライマーmTMR(配列番号:46)と、TaqManプローブmP1(配列番号:47)を用いて、上記のマウス各組織のcDNAにおけるマウスTCH229の発現量(コピー数)をTaqMan PCRにより測定した。同じcDNAについてTaqMan rodent GAPDH control reagents(アプライドバイオシステムズ社製)を用いてrodent glyceraldehide−3−phosphate dehydrogenase (GAPDH)の発現量(コピー数)も測定した。反応はTaqMan Universal PCR Master Mix(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて、ABI PRISM 7900 sequence detection system(アプライドバイオシステムズ社製)にて最初50℃2分間、さらに95℃10分間おいた後で、95℃で15秒、60℃で1分を1反応サイクルとして40サイクル繰り返し、同時に検出を行った。
結果を図10に示す。
マウスTCH229遺伝子産物(mRNA)は7週齢BALB/cマウスの各組織においては、前立腺、気管、腎臓、骨髄で若干の発現が見られ、肺で高い発現が見られた。
【0091】
実施例14
(1)正常ラット各組織のcDNAの調製
12週齢Wistarラット雄の各組織(大脳、小脳、肝臓、腎臓、前立腺、心臓、肺、十二指腸、空回腸、結腸、皮膚、眼球)より、RNeasy Mini Kit(キアゲン社製)を用いてtotal RNAを調製した。調製したtotal RNA に対してTaqMan Reverse Transcription Reagents(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて逆転写反応を行いcDNAを調製した。
(2)ラットTCH229遺伝子産物の組織分布の解析
実施例12で用いた2種のプライマーDNA、プライマーrTMF(配列番号:70)およびプライマーrTMR(配列番号:69)と、TaqManプローブrP1(配列番号:76)を用いて、上記のラット各組織のcDNAにおけるラットTCH229の発現量(コピー数)をTaqMan PCRにより測定した。同じcDNAについてTaqMan rodent GAPDH control reagents(アプライドバイオシステムズ社製)を用いてrodent glyceraldehide−3−phosphate dehydrogenase (GAPDH)の発現量(コピー数)も測定した。反応はTaqMan Universal PCR Master Mix(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて、ABI PRISM 7900 sequence detection system(アプライドバイオシステムズ社製)にて最初50℃2分間、さらに95℃10分間おいた後で、95℃で15秒、60℃で1分を1反応サイクルとして40サイクル繰り返し、同時に検出を行った。
結果を図11に示す。
ラットTCH229遺伝子産物(mRNA)は12週齢Wistarラットの組織においては、腎臓、肺で高い発現が見られた。
【0092】
実施例15
ヒトTCH229発現ベクターの構築
ヒトTCH229(配列番号:1)発現ベクターを、以下の方法により作成した。
実施例1により得られたプラスミド10ngを鋳型として、プライマー229OF2(配列番号:82)およびプライマー229OR2(配列番号:83)を用いて、pfu turbo DNA Polymerase(ストラタジーン社製)により以下の条件(1)〜(3)でPCRを行った。5’末端側プライマー229OF2および3’末端側プライマー229OR2は、ベクターへのクローニングのために5’末端側にそれぞれEcoRVサイトおよびXhoIサイトを付加するように設計した。
(1)94℃30秒間
(2)94℃10秒間−55℃10秒間−70℃2.5分間を35サイクル
(3)70℃5分間
上記PCR反応液をゲル電気泳動後、主要バンドを精製した。これにより得られたPCR断片を、制限酵素EcoRVおよびXhoIを用いて、37℃で1時間保温することにより消化し、この反応液をゲル電気泳動後、精製した。これを、動物細胞発現ベクターであるpcDNA3.1(+)(インビトロジェン社製)のEcoRVサイトおよびXhoIサイトに、Takara ligation kit ver.2(タカラバイオ社製)を用いてライゲーションした。このライゲーション反応液をエタノール沈殿処理後、コンピーテント細胞である大腸菌(Escherichia coli)TOP10(インビトロジェン社製)に形質転換した。これにより得られた複数のコロニーからプラスミドを調製し、この塩基配列をプライマーDNA〔プライマーBGH RV(配列番号:84)、プライマーT7(配列番号:66)、プライマー229OF2(配列番号:82)、プライマー229OR2(配列番号:83)、プライマーrr2(配列番号:6)、プライマーA1(配列番号:17)、プライマーB2(配列番号:18)、プライマーff2(配列番号:10)、プライマーrr1(配列番号:4)、プライマーff1(配列番号:9)〕〕、およびBigDye Terminator Cycle Sequencing Kit(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて反応を行い、塩基配列をDNAシークエンサーABI PRISM 3100 DNAアナライザ(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて確認した。このプラスミドを有する形質転換体を、Escherichia coli TOP10/pCDNA3.1(+)−TCH229と命名した。
【0093】
実施例16
ヒトTCH229発現CHO細胞株の作製および導入遺伝子発現量の測定
Escherichia coli TOP10/pCDNA3.1(+)−TCH229を培養し、この大腸菌体からEndoFree Plasmid Maxi Kit(キアゲン社製)を用いてプラスミドDNAを調製した。このプラスミドDNAをFuGENE 6 Transfection Reagent(ロシュ社製)を用いて添付のプロトコールに従ってCHO dhfr細胞に導入した。2μgのプラスミドDNAとトランスフェクション試薬との混合液を、24時間前に2×10個のCHO dhfr細胞を播種した直径6 cmシャーレに添加した。10%ウシ胎児血清(JRHバイオサイエンス社製)を含むMEMα培地(インビトロジェン社製)で1日間培養した後培地に1.0mg/mlのジェネティシン(インビトロジェン社製)を添加し、その後さらにTCH229発現細胞を培養した。途中何回か培地交換を行い、約10日間後トリプシン処理により細胞をはがし、回収した細胞を1wellあたり0.5〜1個で96well plateに播種し、その後約10日間1.0mg/mlのジェネティシンを含んだ培地中でTCH229発現細胞を選択した。1wellあたり1コロニーの増殖が見られたwellについて、増殖した細胞からRNeasy Mini KitまたはRNeasy 96 Kit(ともにキアゲン社製)を用いてtotal RNAを調製した。調製したtotal RNA に対してTaqMan Reverse Transcription Reagents(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて逆転写反応を行いcDNAを調製した。これについて、実施例4で用いた2種のプライマーDNA、プライマーTMF(配列番号:19)およびプライマーTMR(配列番号:20)と、TaqManプローブP1(配列番号:21)を用いて、ヒトTCH229の発現量をTaqMan PCRにより測定した。反応はTaqMan Universal PCR Master Mix(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて、ABI PRISM 7900 sequence detection system(アプライドバイオシステムズ社製)にて、最初50℃2分間、さらに95℃10分間おいた後で、95℃で15秒、60℃で1分を1反応サイクルとして40サイクル繰り返し、同時に検出を行った。ヒトTCH229遺伝子高発現細胞株(モノクローナル)として、クローンNo.71を選択した。
【0094】
実施例17
ヒトTCH229遺伝子の市販正常ヒト細胞における発現解析
(1)正常ヒト細胞cDNAの調製
正常ヒト細胞はCambrex BioScience Walkersvill社製品を購入し、製品添付の使用説明書記載の方法に従って培養した。実験に使用した細胞を表2に示す。
【表2】
Figure 2004081196
各細胞を75cm培養フラスコにサブコンフルエントになるよう培養した。表中の*印のついた細胞については、TNF−α、IL−1βおよびIL−6が各々最終濃度が10ng/mlになるように加えた。*印が付されていない細胞については培養開始から16時間後に、*印が付された細胞についてはTNF−α、IL−1βおよびIL−6の混合物を添加してから8時間後に、各細胞を、トリプシン−EDTA処理により回収した。回収した細胞から、ISOGEN(ニッポンジーン社製)、またはRNeasy Mini Kit(キアゲン社製)を用いてtotal RNAを調製した(いずれの場合もDNase処理により混入DNAを除去した)。調製したtotal RNA に対してTaqMan Reverse Transcription Reagents(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて逆転写反応を行いcDNAを調製した。
(2)種々の刺激を加えたヒト正常細胞cDNAの調製
a)腎臓近位尿細管上皮細胞(RPTEC)および腎臓皮質上皮細胞(HRCE)(いずれもCambrex BioScience Walkersvill社製)をコラーゲンIコートした24wellプレートに1×10個ずつ播種し、一晩培養後、トリヨードチロニン(T3)フリーのブレッドキットREGM(BIO WHITTAKER社製)に置換し、更に30分培養した。
b)刺激剤としては、TGF−β1(和光純薬社製)、TNF−α(ジェンザイム社製)、IL−1β(ジェンザイム社製)、IL−6(ジェンザイム社製)およびPMA(和光純薬社製)を用いた。これら5種の刺激剤をそれぞれ、T3フリーのブレッドキットREGM(BIO WHITTAKER社製)で最終濃度が10ng/mlになるよう希釈した溶液を準備した。
c)上記a)のRPTECおよびHRCEの培養上清を除去後、直ちに上記b)で調製した溶液を、1wellあたり500μlずつ添加し、培養を行なった。コントロールとして、上記5種の刺激剤が溶けている溶媒の混合物を、T3フリーのブレッドキットREGM(BIO WHITTAKER社製)で刺激剤と同じ割合で希釈した溶液を準備し、RPTECおよびHRCEに1wellあたり500μlずつ添加し、培養を行なった。
d)刺激剤添加後、0.5、1、2、4、6および8時間後に、それぞれ細胞を回収し、RNeasy Mini Kit(キアゲン社製)を用いてtotal RNAを調製した。調製したtotalRNA に対してTaqMan Reverse Transcription Reagents(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて逆転写反応を行いcDNAを調製した。
(3)ヒトTCH229遺伝子の市販正常ヒト細胞における発現解析
実施例4で用いた2種のプライマーDNA、プライマーTMF(配列番号:19)およびプライマーTMR(配列番号:20)と、TaqManプローブP1(配列番号:21)を用いて、上記の正常ヒト細胞および刺激剤で刺激したPRTECおよびHRCEからそれぞれ調製したcDNAにおいて、ヒトTCH229の発現量(コピー数)をTaqMan PCRにより測定した。上記の正常ヒト細胞および刺激剤で刺激したRPTECおよびHRCEからそれぞれ調製したcDNAについて、Eukaryotic 18S rRNA Pre−Developed TaqMan Assay Reagents(アプライドバイオシステムズ社製)を用いてribosomal RNA(18S)の発現量(コピー数)、またはHuman GAPD(GAPDH)(アプライドバイオシステムズ社製)を用いてhuman glyceraldehide−3−phosphate dehydrogenase (GAPDH)の発現量(コピー数)も測定した。反応は、TaqMan Universal PCR Master Mix(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて、ABI PRISM 7900 sequence detection system(アプライドバイオシステムズ社製)にて最初50℃2分間、さらに95℃10分間おいた後で、95℃で15秒、60℃で1分を1反応サイクルとして40サイクル繰り返し、同時に検出を行った。
ヒト正常細胞におけるヒトTCH229の発現変動を図12に示す。表2において*印が付された細胞についてはTNF−α、IL−1βおよびIL−6(各々10ng/ml)で刺激したが、無刺激の場合と比較して発現変動ははほとんど認められず、かつ発現もほとんど認められなかった。
刺激剤で刺激したRPTECにおけるヒトTCH229の発現変動を図13に、刺激剤で刺激したHRCEにおけるヒトTCH229の発現変動を図14に示す。
ヒトTCH229遺伝子産物(mRNA)は腎臓近位尿細管上皮細胞で特異的な発現が見られ、腎臓皮質上皮細胞で若干の発現が見られた。また、RPTECよびHRCEを、TGF−β1、TNF−α、IL−1βまたはPMAで各々で刺激したときにコントロールと比較して、ヒトTCH229の発現が培養時間依存的に減少することが確認できた。
【0095】
実施例18
腎疾患モデル(Wistar Fatty, SHC, Zucker Fatty)ラット腎臓におけるラットTCH229遺伝子産物の発現解析
疾患モデル動物として、Wistar Fatty ラット(WFラット)、Zucker Fatty ラット(ZFラット)、自然発症高コレステロール血症ラット(SHCラット)の3種類を用い、それぞれに対応する対照として、WFラットに対してはWistar Lean Rat(WLラット)、ZFラットに対してはZucker Lean Rat(ZLラット)、SHCラットに対してはSD Rat(SDラット)を使用した。
Wistar Fattyラット(WFラット)は、腎機能低下症状に加え糖尿病に特徴的は症状を示すことから、糖尿病性腎症モデルとして(Frontiers in diabetes research, lessons from animal diabetes II, 535−541, 1988年)、Zucker Fattyラット(ZFラット)は、WFラットと同様に腎機能低下と糖尿病の症状を合わせて呈することから、糖尿病性腎症モデルとして(Kidney international, 52巻, S218−S220頁, 1997年)、自然発症高コレステロール血症ラット(SHCラット)は、ヒト巣状糸球体硬化症と類似の症状を示すことから、巣状糸球体硬化症モデルとして(日本腎臓学界誌, 37巻, 91−99頁, 1995年)報告されている。
(1)疾患モデル動物と対照動物を同じ条件で飼育し、WFラットおよびWLラットでは生後13週(発症前)、20週(発症後)、42週(進展期)および68週(腎機能低下期)に、SHCラットおよびSDラットでは生後6週(発症前)、12週(発症後)、20週(進展期)および26〜30週(腎機能低下期)に、ZFラットおよびZLラットでは生後8週(発症前)および27週(発症後)に、以下のようにtotal RNAを抽出した。
WFラット群(各週齢n=5)、WLラット群(各週齢n=5)、SHCラット群(各週齢n=5)、SDラット群(各週齢n=5)、ZFラット群(各週齢n=9)、ZLラット群(各週齢n=9)の腎臓を、乳頭部を含む割断面で約100mgになるようにスライスし、ISOGENを用いて、添付のマニュアルに従い、total RNAを抽出した。さらにQIAGEN RNeasy Mini kit(キアゲン社製)およびRNase−Free DNase set(キアゲン社製)を用いて、混入DNAを除去した。調製したtotal RNA に対してTaqMan Reverse Transcription Reagents(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて逆転写反応を行いcDNAを調製した。
【0096】
(2) 腎疾患モデルラット腎臓におけるラットTCH229遺伝子産物の発現解析
実施例12で用いた2種のプライマーDNA、プライマーrTMF(配列番号:70)およびプライマーrTMR(配列番号:69)と、TaqManプローブrP1(配列番号:76)を用いて、上記(1)で調製した腎疾患モデルラット腎臓cDNAにおけるラットTCH229の発現量(コピー数)をTaqMan PCRにより測定した。同じcDNAについてTaqMan rodent GAPDH control reagents(アプライドバイオシステムズ社製)を用いてrodent glyceraldehide−3−phosphate dehydrogenase (GAPDH)の発現量(コピー数)も測定した。反応はTaqMan Universal PCR Master Mix(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて、ABI PRISM 7900 sequence detection system(アプライドバイオシステムズ社製)にて最初50℃2分間、さらに95℃10分間おいた後で、95℃で15秒、60℃で1分を1反応サイクルとして40サイクル繰り返し、同時に検出を行った。WFラット群の結果を図15、SHCラット群の結果を図16に、ZFラット群の結果を図17にそれぞれ示す。
ラットTCH229は3種類すべての腎疾患モデルラット腎臓で、腎障害が発症した後にその発現が各対照群と比べて減少した。このことから、TCH229は腎症などの腎疾患に関与する可能性が考えられる。
【0097】
【発明の効果】
本発明のタンパク質、ポリヌクレオチドおよび抗体などは、例えば腎疾患(例、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫、間質性腎炎、腎硬化症、尿毒症など)、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、膵臓疾患(例、膵炎など)、胸腺異常に伴う免疫疾患、生殖器疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎、精巣神経症、卵巣嚢腫など)、消化器性疾患(例、過敏性腸症候群、潰瘍性大腸炎、虚血性大腸炎、胃炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌、甲状腺癌、骨髄性白血病など)、呼吸器疾患(例、胸膜炎、肺炎、慢性閉塞性肺疾患、喘息など)、骨髄炎、糖尿病、高血圧、虚血後再灌流障害、網膜炎、中枢神経疾患(例、てんかん、アルツハイマー病、パーキンソン症候群、精神分裂病など)、皮膚疾患(例、アトピー性皮膚炎、脂漏性皮膚炎など、甲状腺ホルモン関連疾患(例、甲状腺ホルモン不応症、バセドウ病、クレチン病、甲状腺機能亢進症など))などの診断マーカー等として有用である。該タンパク質、ポリヌクレオチドまたは抗体などを用いるスクリーニング法により得られる該タンパク質の活性を促進または阻害する化合物は、該タンパク質遺伝子の発現を促進または阻害する化合物、該タンパク質の発現を促進または阻害する化合物などは、例えば、腎疾患(例、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫、間質性腎炎、腎硬化症、尿毒症など)、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、膵臓疾患(例、膵炎など)、胸腺異常に伴う免疫疾患、生殖器疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎、精巣神経症、卵巣嚢腫など)、消化器性疾患(例、過敏性腸症候群、潰瘍性大腸炎、虚血性大腸炎、胃炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌、甲状腺癌、骨髄性白血病など)、呼吸器疾患(例、胸膜炎、肺炎、慢性閉塞性肺疾患、喘息など)、骨髄炎、糖尿病、高血圧、虚血後再灌流障害、網膜炎、中枢神経疾患(例、てんかん、アルツハイマー病、パーキンソン症候群、精神分裂病など)、皮膚疾患(例、アトピー性皮膚炎、脂漏性皮膚炎など)、甲状腺ホルモン関連疾患(例、甲状腺ホルモン不応症、バセドウ病、クレチン病、甲状腺機能亢進症など)などの予防・治療剤などとして使用することができる。好ましくは腎疾患、甲状腺ホルモン関連疾患などの予防・治療剤として、さらに好ましくは糖尿病性腎症などの予防・治療剤として使用する。
【0098】
【配列表】
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【図面の簡単な説明】
【図1】ヒトTCH229、ヒトSLC21A12およびヒトOATPRP4のアミノ酸配列の比較を表す図である。図中、TCH229はヒトTCH229のアミノ酸配列を、SLC21A12はヒトSLC21A12のアミノ酸配列を、OATPRP4はヒトOATPRP4のアミノ酸配列を、TM1〜TM12は膜貫通領域を示す。□は、ヒトTCH229に一致するアミノ酸を示す。(図2へつづく)
【図2】ヒトTCH229、ヒトSLC21A12およびヒトOATPRP4のアミノ酸配列の比較を表す図である。図中、TCH229はヒトTCH229のアミノ酸配列を、SLC21A12はヒトSLC21A12のアミノ酸配列を、OATPRP4はヒトOATPRP4のアミノ酸配列を、TM1〜TM12は膜貫通領域を示す。□は、ヒトTCH229に一致するアミノ酸を示す。(図1のつづき)
【図3】ヒトTCH229遺伝子産物の各組織における発現量を表す図である。発現量はcDNA溶液1μl当たりのコピー数で表した。
【図4】ヒトTCH229遺伝子産物の各組織における発現量を表す図である。発現量はcDNA溶液1μl当たりのコピー数で表した。
【図5】ヒトTCH229およびマウスTCH229のアミノ酸配列の比較を表す図である。図中、TCH229はヒトTCH229のアミノ酸配列を、mTCH229はマウスTCH229のアミノ酸配列を、膜貫通領域はTM1〜12、ファミリー間で高く保存されているアミノ酸箇所は*で示した。□は、両者に一致するアミノ酸を示す。
【図6】マウスTCH229遺伝子産物の各組織における発現量を表す図である。発現量はcDNA溶液1μl当たりのコピー数で表した。
【図7】ヒトTCH229とラットTCH229No.1およびNo.2のアミノ酸配列の比較を表す図である。図中、TCH229はヒトTCH229のアミノ酸配列を、rTCH229No.1はラットTCH229No.1のアミノ酸配列を、rTCH229No.2はラットTCH229No.2のアミノ酸配列を示す。TM1〜TM12は膜貫通領域を示す。□は、3者に一致するアミノ酸を示す。(図8へつづく)
【図8】ヒトTCH229とラットTCH229No.1およびNo.2のアミノ酸配列の比較を表す図である。図中、TCH229はヒトTCH229のアミノ酸配列を、rTCH229No.1はラットTCH229No.1のアミノ酸配列を、rTCH229No.2はラットTCH229No.2のアミノ酸配列を示す。TM1〜TM12は膜貫通領域を示す。□は、3者に一致するアミノ酸を示す。(図7のつづき)
【図9】ラットTCH229遺伝子産物の各組織における発現量を表す図である。発現量はcDNA溶液1μl当たりのコピー数で表した。
【図10】マウスTCH229遺伝子産物の各組織における発現量を表す図である。発現量は、cDNA溶液1μl当たりのマウスTCH229のコピー数を、等量の各組織cDNAにおけるrodent GAPDHのコピー数で割った値で表した。
【図11】ラットTCH229遺伝子産物の各組織における発現量を表す図である。発現量は、相対的発現量を100倍した値で表した。
【図12】ヒト正常細胞におけるヒトTCH229の発現変動を表す図である。図中、縦軸は、ヒトTCH229遺伝子発現値のヒト18S発現値に対する相対的発現値を100000倍した値を示す。横軸は細胞名を示す。■はTNF−α、IL−1βおよびIL−6(各々10ng/ml)刺激無し、□はTNF−α、IL−1βおよびIL−6(各々10ng/ml)刺激有りを示す。
【図13】刺激剤で刺激したRPTECにおけるヒトTCH229の発現変動を表す図である。図中、縦軸は、ヒトTCH229遺伝子発現値のヒトGAPDH発現値に対する相対的発現値を100倍した値を示す。横軸は刺激剤での反応時間を示す。−●−はTGF−β1、−■−はPMA、−▲−はTNF−α、−*−はIL−1β、−○−はIL−6、−△−はコントロールを示す。
【図14】刺激剤で刺激したHRCEにおけるヒトTCH229の発現変動を表す図である。図中、縦軸は、ヒトTCH229遺伝子発現値のヒトGAPDH発現値に対する相対的発現値を100倍した値を示す。横軸は刺激剤での反応時間を示す。−●−はTGF−β1、−■−はPMA、−▲−はTNF−α、−*−はIL−1β、−○−はIL−6、−△−はコントロールを示す。
【図15】ラットTCH229遺伝子発現量を表す図である。図中、縦軸はラットTCH229遺伝子発現値のrodent GAPDH発現値に対する相対的発現値を1000倍した値を、横軸は腎臓を採取した週齢を示す。□は実験群(WFラット)、■は対照群(WLラット)の結果である。
【図16】ラットTCH229遺伝子発現量を表す図である。図中、縦軸はラットTCH229遺伝子発現値のrodent GAPDH発現値に対する相対的発現値を1000倍した値を、横軸は腎臓を採取した週齢を示す。□は実験群(SHCラット)、■は対照群(SDラット)の結果である。
【図17】ラットTCH229遺伝子発現量を表す図である。図中、縦軸はラットTCH229遺伝子発現値のrodent GAPDH発現値に対する相対的発現値を1000倍した値を、横軸は腎臓を採取した週齢を示す。□は実験群(ZFラット)、■は対照群(ZLラット)の結果である。[0001]
TECHNICAL FIELD OF THE INVENTION
The present invention provides a novel organic anion transporter (oatp / LST) protein, a DNA encoding the protein, a method for screening a compound that promotes or inhibits the activity of the protein, a compound obtained by the screening method, and the like.
[0002]
[Prior art]
The oatp / LST gene group (SLC21 family), which is an organic anion transporter, is a sodium-independent transporter, and takes up thyroid hormones into the central nervous system via the blood-brain barrier in vivo and bile from blood. It is known to play an essential role in maintaining homeostasis such as transfer of acids and drugs to the liver, removal of inflammatory mediators such as prostaglandins and leukotrienes, and excretion of foreign substances into bile and urine. ing. To date, 13 types of oatp / LST groups have been used in humans (eg, SLC21A3, SLC21A6, SLC21A11, SLC21A12 (Non-Patent Document 1 Biochemical and Biophysical Research Communications, 273, 251 pages, 2000)), and 10 in rats. For example, Slc21a1 and Slc21a5) have been reported, and the expression distribution is roughly classified into three types: those that are brain-specific, those that are liver-specific, and those that are widely expressed.
[Non-patent document 1]
Biochemical and Biophysical Research Communications, 273, 251 (2000)
[0003]
[Problems to be solved by the invention]
Organic anion transporters transport not only bile acids as substrates but also physiologically active substances such as thyroid hormones and conjugated steroids. Since many of these substrates are ligands for nuclear receptors, it is thought that the organic anion transporter plays an important role in first taking up ligands for nuclear receptors into cells. However, the detailed mechanism is not well understood. Therefore, elucidation of the role of these transporters will lead to the development of therapeutic agents for various diseases.
[0004]
[Means for Solving the Problems]
The present inventors have conducted intensive studies and, as a result, have found a novel organic anion transporter protein. As a method for suppressing the protein, for example, it is conceivable to inhibit the transport of an organic anion or to suppress the transcription of the protein to lower the expression level. Examples of a method for activating the protein include enhancing the expression level by promoting transport of organic anions, activating a promoter of the protein, or stabilizing mRNA.
The present inventors have further studied based on these findings, and have completed the present invention.
[0005]
That is, the present invention
(1) a protein containing an amino acid sequence identical or substantially identical to the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 26 or SEQ ID NO: 52, or a salt thereof;
(2) a protein comprising an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 or a salt thereof;
(3) a protein consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 26 or a salt thereof;
(4) a protein consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 52 or a salt thereof;
(5) the protein or salt thereof according to the above (1), wherein the amino acid sequence substantially identical to the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 52 is the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 54;
(6) a protein consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 54 or a salt thereof;
(7) a partial peptide of the protein according to (1) or a salt thereof;
(8) a polynucleotide containing a polynucleotide encoding the protein of (1) or the partial peptide of (7),
(9) the polynucleotide according to the above (8), which is a DNA;
(10) a polynucleotide having a base sequence represented by SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 53, or SEQ ID NO: 55,
(11) a recombinant vector containing the polynucleotide according to (8),
(12) a transformant transformed with the recombinant vector according to (11),
(13) The transformant according to (1), wherein the transformant according to (12) is cultured to produce and accumulate the protein according to (1) or the partial peptide according to (7), and collect the protein. ) A method for producing the protein or the partial peptide according to (7) or a salt thereof,
(14) a medicine comprising the protein of (1) or the partial peptide of (7) or a salt thereof,
(15) a medicine comprising the polynucleotide according to the above (8),
(16) a diagnostic agent comprising the polynucleotide according to the above (8),
(17) an antibody against the protein according to (1) or the partial peptide according to (7) or a salt thereof,
(18) a diagnostic agent comprising the antibody according to (17),
(19) a medicine comprising the antibody according to (17),
(20) a polynucleotide comprising a nucleotide sequence complementary to or substantially complementary to the polynucleotide of (8) or a part thereof;
(21) a diagnostic agent comprising the polynucleotide according to (20),
(22) a medicine comprising the polynucleotide according to the above (20),
(23) The protein according to (1), the partial peptide according to (7), or a salt thereof, wherein the protein according to (1), the partial peptide according to (7), or a salt thereof is used. A method for screening a compound or a salt thereof that promotes or inhibits the activity,
(24) The activity of the protein according to (1) or the partial peptide according to (7) or a salt thereof, comprising the protein according to (1) or the partial peptide according to (7) or a salt thereof. A kit for screening for a compound that promotes or inhibits or a salt thereof,
(25) Promotes the activity of the protein of (1), the partial peptide of (7) or a salt thereof obtained by using the screening method of (23) or the screening kit of (24). Or a compound that inhibits or a salt thereof,
(25a) a compound or salt thereof which promotes the activity of the protein of (1) or the partial peptide of (7) or a salt thereof,
(26) a medicament comprising the compound according to (25) or a salt thereof,
(26a) a medicament comprising the compound of (25a) or a salt thereof,
(27) A method for screening a compound or a salt thereof that promotes or inhibits the expression of the protein gene according to (1), which comprises using the polynucleotide according to (8).
(28) A kit for screening a compound or a salt thereof that promotes or inhibits the expression of the protein gene according to (1), comprising the polynucleotide according to (8),
(29) A compound or a salt thereof that promotes or inhibits the expression of the protein gene according to (1), which is obtained by using the screening method according to (27) or the screening kit according to (28),
(29a) a compound that promotes expression of the protein gene according to (1) or a salt thereof,
(30) a medicament comprising the compound according to (29) or a salt thereof,
(30a) a medicine comprising the compound of the above (29a) or a salt thereof,
(31) The method for quantifying a protein according to (1), comprising using the antibody according to (17);
(32) A method for diagnosing a disease associated with the function of the protein according to (1), characterized by using the quantification method according to (31);
(33) a method for screening a compound or a salt thereof that promotes or inhibits the expression of the protein according to (1), which comprises using the antibody according to (17);
(34) A kit for screening a compound or a salt thereof that promotes or inhibits the expression of the protein according to (1), comprising the antibody according to (17);
(35) A compound or a salt thereof that promotes or inhibits the expression of the protein of (1), obtained by using the screening method of (33) or the screening kit of (34),
(35a) a compound or a salt thereof that promotes expression of the protein according to (1),
(36) a medicament comprising the compound according to (35) or a salt thereof,
(36a) a medicament comprising the compound of (35a) or a salt thereof,
(37) The medicament according to the above (14), (15), (19), (22), (26), (30) or (36), which is a prophylactic / therapeutic agent for kidney disease.
(37a) The medicament according to the above (26a), (30a) or (36a), which is a prophylactic / therapeutic agent for kidney disease.
(37b) the medicament according to the above (37) or (37a), wherein the renal disease is diabetic nephropathy;
(37c) The medicament according to the above (14), (15), (19), (22), (26), (30) or (36), which is a prophylactic / therapeutic agent for a thyroid hormone-related disease.
(37d) The medicament according to the above (26a), (30a) or (36a), which is a preventive / therapeutic agent for a thyroid hormone-related disease.
(37e) the medicament according to the above (37c) or (37d), wherein the thyroid hormone-related disease is thyroid hormone refractory;
(38) a method for preventing or treating renal disease, which comprises administering to a mammal an effective amount of the compound or a salt thereof according to (25), (29) or (35);
(39) Use of the compound according to (25), (29) or (35) or a salt thereof for producing a prophylactic / therapeutic agent for kidney disease is provided.
[0006]
BEST MODE FOR CARRYING OUT THE INVENTION
A protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 26 or SEQ ID NO: 52 (hereinafter sometimes referred to as the protein of the present invention) is a human And cells of warm-blooded animals (eg, guinea pig, rat, mouse, chicken, rabbit, pig, sheep, cow, monkey, etc.) (eg, hepatocytes, spleen cells, nerve cells, glial cells, pancreatic β cells, bone marrow cells, Mesangial cells, Langerhans cells, epidermal cells, epithelial cells, goblet cells, endothelial cells, smooth muscle cells, fibroblasts, fiber cells, muscle cells, adipocytes, immune cells (eg, macrophages, T cells, B cells, natural killers) Cells, mast cells, neutrophils, basophils, eosinophils, monocytes), megakaryocytes, synovial cells, chondrocytes, osteocytes, osteoblasts, osteoclasts, mammary cells, liver cells Or stromal cells, or precursors of these cells, stem cells, or cancer cells) or any tissue in which those cells are present, such as the brain, various parts of the brain (eg, olfactory bulb, amygdala, basal sphere, hippocampus, Thalamus, hypothalamus, cerebral cortex, medulla, cerebellum), spinal cord, pituitary, stomach, pancreas, kidney, liver, gonad, thyroid, gall bladder, bone marrow, adrenal gland, skin, muscle, lung, digestive tract (eg, large intestine, small intestine) ), Proteins derived from blood vessels, heart, thymus, spleen, submandibular gland, peripheral blood, prostate, testis, ovary, placenta, uterus, bones, joints, skeletal muscle, etc., or synthetic proteins Good.
[0007]
The amino acid sequence substantially the same as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 is about 50% or more, preferably about 60% or more, preferably about 70% or more as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1. Preferably, the amino acid sequence has a homology of about 80% or more, preferably about 90% or more, more preferably about 95% or more, and particularly preferably about 99% or more.
Examples of the protein containing an amino acid sequence substantially the same as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 include, for example, a protein containing the same amino acid sequence as the above-mentioned amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1. And a protein having substantially the same activity as the protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1.
As the amino acid sequence substantially identical to the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 26, about 50% or more, preferably about 60% or more, preferably about 70% or more of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 26 Preferably, the amino acid sequence has a homology of about 80% or more, preferably about 90% or more, more preferably about 95% or more, and particularly preferably about 99% or more.
Examples of the protein having an amino acid sequence substantially the same as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 26 include, for example, a protein having the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 26 described above. And a protein having substantially the same activity as the protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 26.
As the amino acid sequence substantially identical to the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 52, about 50% or more, preferably about 60% or more, preferably about 70% or more as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 52 Preferably, the amino acid sequence has a homology of about 80% or more, preferably about 90% or more, more preferably about 95% or more, and particularly preferably about 99% or more.
Examples of the protein having an amino acid sequence substantially the same as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 52 include, for example, a protein having the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 52 described above. And a protein having substantially the same activity as the protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 52. Examples of the protein containing the amino acid sequence substantially the same as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 52 include a protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 54.
Examples of the substantially equivalent activity include, for example, organic anion transport activity. Substantially homogenous indicates that the properties are homogenous (eg, physiologically or pharmacologically). Accordingly, it is preferable that the organic anions have the same transport activity (eg, about 0.01 to 100 times, preferably about 0.1 to 10 times, more preferably 0.5 to 2 times). Quantitative factors, such as the degree of molecular weight and protein molecular weight, may be different.
Examples of the organic anion include bile acids such as glucuronic acid, glutathione, and cholic acid, and thyroid hormone.
The activity such as the transport activity of the organic anion can be measured according to a known method. For example, the activity is measured according to the method described in Biochemical and Biophysical Research Communications, Vol. can do.
[0008]
Examples of the protein of the present invention include (1) (i) one or two or more amino acids in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 (eg, about 1 to 200, preferably about 1 to 150, Preferably about 1 to 100, preferably about 1 to 50, preferably about 1 to 30, preferably about 1 to 10, and more preferably several (1 to 5) amino acids Sequence, (ii) one or two or more (for example, about 1 to 200, preferably about 1 to 150, preferably about 1 to 100, preferably 1 to 50) amino acid sequences represented by SEQ ID NO: 1. Amino acid sequence to which about 1, preferably about 1 to 30, preferably about 1 to 10, and more preferably number (1 to 5) amino acids have been added, (iii) the amino acid represented by SEQ ID NO: 1 Into an array Or two or more (eg, about 1 to 200, preferably about 1 to 150, preferably about 1 to 100, preferably about 1 to 50, preferably about 1 to 30, preferably 1 to 10 Degree, more preferably an amino acid sequence in which a number (1 to 5) of amino acids are inserted, and (iv) one or more (eg, about 1 to 200) in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1. Preferably about 1 to 150 pieces, preferably about 1 to 100 pieces, preferably about 1 to 50 pieces, preferably about 1 to 30 pieces, preferably about 1 to 10 pieces, and more preferably number (1 to 5) pieces. )) An amino acid sequence in which the amino acid is replaced with another amino acid, or (v) a so-called mutein such as a protein containing an amino acid sequence obtained by combining them.
(2) (i) one or more amino acids in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 26 (for example, about 1 to 200, preferably about 1 to 150, preferably about 1 to 100, preferably 1 An amino acid sequence in which about 50 to about 50 amino acids are deleted, preferably about 1 to 30 amino acids, preferably about 1 to 10 amino acids, and more preferably several (1 to 5) amino acids. 1 or 2 or more (for example, about 1 to 200, preferably about 1 to 150, preferably about 1 to 100, preferably about 1 to 50, preferably about 1 to 30, Preferably, about 1 to 10, more preferably number (1 to 5) amino acids are added, and (iii) one or more (for example, 1 to 2) amino acid sequences represented by SEQ ID NO: 26 200 pieces Degree, preferably about 1 to 150 pieces, preferably about 1 to 100 pieces, preferably about 1 to 50 pieces, preferably about 1 to 30 pieces, preferably about 1 to 10 pieces, and more preferably a number (1 to 5 pieces). ) Amino acid sequence, and (iv) one or more (eg, about 1 to 200, preferably about 1 to 150, preferably about 1 to 200 in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 26) About 1 to 100, preferably about 1 to 50, preferably about 1 to 30, preferably about 1 to 10, and more preferably several (1 to 5) amino acids are substituted with another amino acid. A so-called mutein such as a protein containing an amino acid sequence or (v) an amino acid sequence combining them;
(3) (i) 1 or 2 or more (eg, about 1 to 200, preferably about 1 to 150, preferably about 1 to 100, preferably 1) in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 52 An amino acid sequence in which about 50, preferably about 1 to 30, preferably about 1 to 10, and more preferably a number (1 to 5) of amino acids have been deleted; (ii) an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 52 1 or 2 or more (for example, about 1 to 200, preferably about 1 to 150, preferably about 1 to 100, preferably about 1 to 50, preferably about 1 to 30, Preferably about 1 to 10, more preferably number (1 to 5) amino acids are added, and (iii) one or more (for example, 1 to 2) to the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 52 200 pieces Degree, preferably about 1 to 150 pieces, preferably about 1 to 100 pieces, preferably about 1 to 50 pieces, preferably about 1 to 30 pieces, preferably about 1 to 10 pieces, and more preferably a number (1 to 5 pieces). ) Amino acid sequence, and (iv) one or more amino acids in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 52 (for example, about 1 to 200, preferably about 1 to 150, and preferably About 1 to 100, preferably about 1 to 50, preferably about 1 to 30, preferably about 1 to 10, and more preferably several (1 to 5) amino acids are substituted with another amino acid. So-called muteins, such as proteins containing the amino acid sequence or (v) an amino acid sequence combining them, are also included.
When the amino acid sequence is inserted, deleted or substituted as described above, the position of the insertion, deletion or substitution is not particularly limited.
[0009]
In the protein in the present specification, the left end is the N-terminus (amino terminus) and the right end is the C-terminus (carboxyl terminus) according to the convention of peptide labeling. The protein of the present invention including the protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 has a carboxyl group (—COOH), a carboxylate (—COO) ), Amide (-CONH 2 ) Or an ester (—COOR).
Here, as R in the ester, for example, C, such as methyl, ethyl, n-propyl, isopropyl, n-butyl, etc. 1-6 Alkyl groups such as C, cyclopentyl, cyclohexyl, etc. 3-8 Cycloalkyl groups such as phenyl, α-naphthyl and the like; 6-12 Aryl groups, for example phenyl-C such as benzyl, phenethyl, etc. 1-2 An alkyl group or α-naphthyl-C such as α-naphthylmethyl 1-2 C such as an alkyl group 7-14 An aralkyl group, a pivaloyloxymethyl group and the like are used. When the protein of the present invention has a carboxyl group (or carboxylate) other than the C-terminus, the protein of the present invention includes a carboxyl group amidated or esterified. As the ester in this case, for example, the above-mentioned C-terminal ester and the like are used.
Furthermore, in the protein of the present invention, the amino group of the N-terminal amino acid residue (eg, methionine residue) has a protecting group (eg, formyl group, acetyl group, etc.). 1-6 C such as alkanoyl 1-6 Acyl group), N-terminal glutamine residue generated by cleavage in vivo, pyroglutamine oxidation, substituent on the side chain of amino acid in the molecule (eg, -OH, -SH , An amino group, an imidazole group, an indole group, a guanidino group, etc.) are suitable protecting groups (for example, formyl group, acetyl group, etc.). 1-6 C such as alkanoyl group 1-6 (Eg, an acyl group), or a complex protein such as a so-called glycoprotein to which a sugar chain is bound.
Specific examples of the protein of the present invention include, for example, a protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, a protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 26, and a protein containing SEQ ID NO: 52 A protein containing the amino acid sequence; a protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 54;
[0010]
The partial peptide of the protein of the present invention is the partial peptide of the protein of the present invention described above, and preferably any peptide having the same properties as the protein of the present invention described above.
For example, of the constituent amino acid sequences of the protein of the present invention, for example, 10 or more, preferably 20 or more, preferably 50 or more, preferably 70 or more, preferably 100 or more, preferably 200 or more And the like.
The partial peptide used in the present invention has one or two or more (preferably about 1 to 20, more preferably about 1 to 10, and still more preferably about 1 to 5) amino acid sequences in the amino acid sequence. Or 1 or 2 or more (preferably about 1 to 20, more preferably about 1 to 10, and still more preferably, about 1 to 5) amino acids in the amino acid sequence. 1 or 2 or more (preferably about 1 to 20, more preferably about 1 to 10, and still more preferably, about 1 to 5) amino acids are added to the amino acid sequence, or In the amino acid sequence, one or more (preferably about 1 to 20, more preferably about 1 to 10, and still more preferably, about 1 to 5) amino acids are substituted with another amino acid. hand Good.
As the partial peptide of the present invention, for example, in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, for example, the amino acid sequence at positions 340 to 370 and 490 to 520, the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 26 In the amino acid sequence represented by, for example, the 335th to 365th, the 490th to 520th, the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 52, for example, the 335th to 365th, the 490th to 520th amino acid sequences; In the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 54, for example, a peptide containing the 335th to 365th amino acids and the 490th to 520th amino acids is preferable.
[0011]
The partial peptide used in the present invention has a carboxyl group (—COOH) and a carboxylate (—COO) at the C-terminus. ) Amide (-CONH 2 )) Or an ester (—COOR).
Further, the partial peptides used in the present invention include those having a carboxyl group (or carboxylate) other than the C-terminus and N-terminal amino acid residues (eg, methionine), as in the above-mentioned protein of the present invention. Residue), the amino group of which is protected by a protecting group, the N-terminal side is cleaved in vivo, and the generated glutamine residue is pyroglutamine-oxidized, and the substituent on the side chain of the amino acid in the molecule is appropriate. Also included are those protected with a protecting group or complex peptides such as so-called glycopeptides to which sugar chains are bonded.
The partial peptide used in the present invention can also be used as an antigen for preparing an antibody. For example, for the purpose of preparing the antibody of the present invention described below, for example, in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, for example, the amino acid sequence at positions 340 to 370 and 490 to 520, SEQ ID NO: 26 In the amino acid sequence represented by, for example, the 335th to 365th and 490th to 520th amino acid sequences, and in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 52, for example, the 335th to 365th and 490th to In the 520th amino acid sequence and the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 54, for example, a peptide containing the 335th to 365th amino acids, the 490th to 520th amino acids, and the like is preferable.
[0012]
As the salt of the protein or partial peptide of the present invention, a salt with a physiologically acceptable acid (eg, an inorganic acid or an organic acid) or a base (eg, an alkali metal or the like) is used. Preferred acid addition salts are: Such salts include, for example, salts with inorganic acids (eg, hydrochloric acid, phosphoric acid, hydrobromic acid, sulfuric acid) or organic acids (eg, acetic acid, formic acid, propionic acid, fumaric acid, maleic acid, succinic acid) Acids, tartaric acid, citric acid, malic acid, oxalic acid, benzoic acid, methanesulfonic acid, benzenesulfonic acid) and the like are used.
The protein of the present invention, a partial peptide thereof, or a salt thereof can be produced from the above-mentioned method for purifying a protein from human or warm-blooded animal cells or tissues, or a transformant containing a DNA encoding the protein. Can also be produced by culturing. Further, it can be produced according to the peptide synthesis method described later.
When producing from human or mammalian tissues or cells, the homogenized human or mammalian tissues or cells are extracted with an acid or the like, and the extract is subjected to chromatography such as reverse phase chromatography or ion exchange chromatography. Can be purified and isolated.
[0013]
For the synthesis of the protein or partial peptide of the present invention, or a salt thereof, or an amide thereof, a commercially available resin for protein synthesis can be generally used. Examples of such a resin include chloromethyl resin, hydroxymethyl resin, benzhydrylamine resin, aminomethyl resin, 4-benzyloxybenzyl alcohol resin, 4-methylbenzhydrylamine resin, PAM resin, and 4-hydroxymethylmethyl. Phenylacetamidomethyl resin, polyacrylamide resin, 4- (2 ′, 4′-dimethoxyphenyl-hydroxymethyl) phenoxy resin, 4- (2 ′, 4′-dimethoxyphenyl-Fmocaminoethyl) phenoxy resin, and the like. it can. Using such a resin, an amino acid having an α-amino group and a side chain functional group appropriately protected is condensed on the resin in accordance with the sequence of the target protein according to various known condensation methods. At the end of the reaction, the protein or partial peptide is cleaved from the resin, and at the same time, various protecting groups are removed.In addition, an intramolecular disulfide bond formation reaction is performed in a highly diluted solution to obtain the target protein or partial peptide or an amide thereof. I do.
For the condensation of the above protected amino acids, various activating reagents that can be used for protein synthesis can be used, and carbodiimides are particularly preferable. As the carbodiimides, DCC, N, N′-diisopropylcarbodiimide, N-ethyl-N ′-(3-dimethylaminoprolyl) carbodiimide and the like are used. For activation by these, the protected amino acid was directly added to the resin together with a racemization inhibitor additive (for example, HOBt, HOOBt), or the protected amino acid was previously activated as a symmetric acid anhydride or HOBt ester or HOOBt ester. Later it can be added to the resin.
[0014]
The solvent used for activating the protected amino acid or condensing with the resin can be appropriately selected from solvents known to be usable for the protein condensation reaction. For example, acid amides such as N, N-dimethylformamide, N, N-dimethylacetamide, N-methylpyrrolidone, halogenated hydrocarbons such as methylene chloride and chloroform, alcohols such as trifluoroethanol, and dimethyl sulfoxide. Sulfoxides, ethers such as pyridine, dioxane, and tetrahydrofuran, nitriles such as acetonitrile and propionitrile, esters such as methyl acetate and ethyl acetate, and appropriate mixtures thereof are used. The reaction temperature is appropriately selected from a range known to be usable for a protein bond formation reaction, and is usually appropriately selected from a range of about -20 ° C to 50 ° C. The activated amino acid derivative is usually used in a 1.5 to 4-fold excess. As a result of the test using the ninhydrin reaction, when the condensation is insufficient, sufficient condensation can be performed by repeating the condensation reaction without removing the protecting group. When sufficient condensation cannot be obtained even by repeating the reaction, unreacted amino acids can be acetylated using acetic anhydride or acetylimidazole to prevent the subsequent reaction from being affected.
[0015]
Examples of the protecting group for the amino group of the starting material include Z, Boc, t-pentyloxycarbonyl, isobornyloxycarbonyl, 4-methoxybenzyloxycarbonyl, Cl-Z, Br-Z, adamantyloxycarbonyl, trifluoroacetyl , Phthaloyl, formyl, 2-nitrophenylsulfenyl, diphenylphosphinothioyl, Fmoc and the like.
The carboxyl group may be, for example, a linear, branched or cyclic alkyl ester such as an alkyl esterified ester (eg, methyl, ethyl, propyl, butyl, t-butyl, cyclopentyl, cyclohexyl, cycloheptyl, cyclooctyl, 2-adamantyl). ), Aralkyl esterification (eg, benzyl ester, 4-nitrobenzyl ester, 4-methoxybenzyl ester, 4-chlorobenzyl ester, benzhydryl esterification), phenacyl esterification, benzyloxycarbonylhydrazide, t-butoxy It can be protected by carbonyl hydrazide, trityl hydrazide and the like.
The hydroxyl group of serine can be protected, for example, by esterification or etherification. Suitable groups for this esterification include, for example, lower (C 1-6 A) Groups derived from carbonic acid such as an aroyl group such as an alkanoyl group and a benzoyl group, and a benzyloxycarbonyl group and an ethoxycarbonyl group. Examples of the group suitable for etherification include a benzyl group, a tetrahydropyranyl group, and a t-butyl group.
Examples of the protecting group for the phenolic hydroxyl group of tyrosine include Bzl, Cl 2 -Bzl, 2-nitrobenzyl, Br-Z, t-butyl and the like are used.
As the imidazole protecting group for histidine, for example, Tos, 4-methoxy-2,3,6-trimethylbenzenesulfonyl, DNP, benzyloxymethyl, Bum, Boc, Trt, Fmoc and the like are used.
[0016]
Examples of the activated carboxyl group of the raw material include, for example, a corresponding acid anhydride, azide, active ester [alcohol (eg, pentachlorophenol, 2,4,5-trichlorophenol, 2,4-dinitrophenol, Cyanomethyl alcohol, paranitrophenol, HONB, N-hydroxysuccinimide, N-hydroxyphthalimide, and an ester with HOBt). As the activated amino group of the raw material, for example, a corresponding phosphoric amide is used.
As a method for removing (eliminating) the protecting group, for example, catalytic reduction in a hydrogen stream in the presence of a catalyst such as Pd-black or Pd-carbon, or hydrogen fluoride anhydride, methanesulfonic acid, trifluoromethane, etc. Acid treatment with dichloromethane, trifluoroacetic acid or a mixture thereof, base treatment with diisopropylethylamine, triethylamine, piperidine, piperazine, etc., reduction with sodium in liquid ammonia, and the like are also used. The elimination reaction by the above acid treatment is generally performed at a temperature of about -20 ° C to 40 ° C. In the acid treatment, for example, anisole, phenol, thioanisole, metacresol, paracresol, dimethylsulfide, 1,4 -Addition of a ligand-agonizing cation scavenger such as butanedithiol, 1-2-ethanedithiol and the like is effective. Further, the 2,4-dinitrophenyl group used as an imidazole protecting group of histidine is removed by thiophenol treatment, and the formyl group used as an indole protecting group of tryptophan is the above-mentioned 1-2-ethanedithiol, 1,4-butane. In addition to deprotection by acid treatment in the presence of dithiol or the like, it is also removed by alkali treatment with dilute sodium hydroxide solution, dilute ammonia or the like.
[0017]
The protection of the functional group that should not be involved in the reaction of the raw materials, the protective group, the elimination of the protective group, the activation of the functional group involved in the reaction, and the like can be appropriately selected from known groups or known means.
As another method for obtaining an amide form of a protein or a partial peptide, for example, after amidating and protecting the α-carboxyl group of the carboxy terminal amino acid, a peptide (protein) chain is added to the amino group side to a desired chain length. After the elongation, a protein or partial peptide from which only the protecting group for the N-terminal α-amino group of the peptide chain has been removed and a protein or partial peptide from which only the protecting group for the C-terminal carboxyl group has been removed, and these are produced. The protein or peptide is condensed in a mixed solvent as described above. Details of the condensation reaction are the same as described above. After purifying the protected protein or peptide obtained by the condensation, all the protecting groups are removed by the above-mentioned method to obtain a desired crude protein or peptide. This crude protein or peptide is purified by various known purification means, and the main fraction is lyophilized to obtain an amide of the desired protein or peptide.
In order to obtain an ester of a protein or peptide, for example, after condensing the α-carboxyl group of the carboxy terminal amino acid with a desired alcohol to form an amino acid ester, the desired protein or An ester of the peptide can be obtained.
[0018]
The partial peptide or a salt thereof used in the present invention can be produced according to a known peptide synthesis method or by cleaving the protein of the present invention with an appropriate peptidase. As a method for synthesizing a peptide, for example, any of a solid phase synthesis method and a liquid phase synthesis method may be used. That is, the partial peptide or amino acid that can constitute the partial peptide used in the present invention is condensed with the remaining portion, and when the product has a protecting group, the protecting group is eliminated to produce the target peptide. it can. Examples of the known condensation method and elimination of the protecting group include the methods described in the following (a) to (e).
(A) M.I. Bodanszky and M.A. A. Ondetti, Peptide Synthesis, Interscience Publishers, New York (1966)
(B) Schroeder and Luebke, The Peptide, Academic Press, New York (1965)
(C) Nobuo Izumiya et al., Basics and experiments of peptide synthesis, Maruzen Co., Ltd. (1975)
(D) Haruaki Yajima and Shunpei Sakakibara, Biochemistry Laboratory Course 1, Protein Chemistry IV, 205, (1977)
(E) Supervised by Haruaki Yajima, Development of Continuing Drugs, Volume 14, Peptide Synthesis, Hirokawa Shoten
After the reaction, the partial peptide used in the present invention can be purified and isolated by a combination of ordinary purification methods such as solvent extraction, distillation, column chromatography, liquid chromatography, and recrystallization. When the partial peptide obtained by the above method is a free form, it can be converted to an appropriate salt by a known method or a method analogous thereto, and conversely, when the partial peptide is obtained as a salt, a known method or analogous method It can be converted into a free form or another salt by a method.
[0019]
The polynucleotide encoding the protein of the present invention may be any polynucleotide containing the above-described nucleotide sequence encoding the protein of the present invention. Preferably it is DNA. The DNA may be any of genomic DNA, genomic DNA library, cDNA derived from the above-described cells / tissues, cDNA library derived from the aforementioned cells / tissues, and synthetic DNA.
The vector used for the library may be any of bacteriophage, plasmid, cosmid, phagemid and the like. Alternatively, amplification can be performed directly by Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction (hereinafter abbreviated as RT-PCR method) using a total RNA or mRNA fraction prepared from the above-described cells / tissues.
The DNA encoding the protein of the present invention includes, for example, (i) a DNA containing the base sequence represented by SEQ ID NO: 2 or a base sequence represented by SEQ ID NO: 2 hybridized under high stringent conditions. DNA encoding a protein having a soybean base sequence and having substantially the same properties as the protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, (ii) a base sequence represented by SEQ ID NO: 25 Or a protein having a nucleotide sequence that hybridizes under high stringent conditions with the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 25 and substantially containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 DNA encoding a protein having the same properties as described above, (iii) DNA containing the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 27, or SEQ ID NO: : A protein having a nucleotide sequence that hybridizes with the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 27 under highly stringent conditions, and having substantially the same properties as the protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 26. Encoding DNA, (iv) a DNA containing the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 51, or a nucleotide sequence that hybridizes under high stringent conditions to the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 51; DNA encoding a protein having substantially the same properties as the protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 26, (v) DNA containing the base sequence represented by SEQ ID NO: 53, or SEQ ID NO: : 53, which has a base sequence hybridizable with the base sequence represented by SEQ ID NO: 53 under high stringent conditions, and is represented by SEQ ID NO: 52. DNA encoding a protein having substantially the same properties as the protein containing the amino acid sequence, (vi) DNA containing the base sequence represented by SEQ ID NO: 80, or base represented by SEQ ID NO: 80 DNA encoding a protein having a nucleotide sequence that hybridizes under high stringent conditions to a sequence and having substantially the same properties as a protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 52, (vii) A DNA containing the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 55, or a nucleotide sequence that hybridizes with the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 55 under high stringency conditions, and represented by SEQ ID NO: 54 DNA encoding a protein having substantially the same properties as the protein containing the amino acid sequence, (viii) SEQ ID NO: 8 DNA having the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 1 or an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 54 which has a nucleotide sequence hybridizable under high stringent conditions to the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 81 Any DNA may be used as long as it encodes a protein having substantially the same properties as a protein containing.
[0020]
Examples of the DNA that can hybridize with the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 25 under high stringency conditions include, for example, a nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 25 and about 50 % Or more, preferably about 60% or more, preferably about 70% or more, preferably about 80% or more, preferably about 90% or more, more preferably about 95% or more, and particularly preferably about 99% or more. DNA having a base sequence having the same is used.
Examples of the DNA that can hybridize with the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 27 or SEQ ID NO: 51 under high stringency conditions include, for example, a nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 27 or SEQ ID NO: 51 and about 50 % Or more, preferably about 60% or more, preferably about 70% or more, preferably about 80% or more, preferably about 90% or more, more preferably about 95% or more, and particularly preferably about 99% or more. DNA having a base sequence having the same is used.
Examples of the DNA that can hybridize with the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 53 or SEQ ID NO: 80 under high stringency conditions include, for example, a nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 53 or about 50 % Or more, preferably about 60% or more, preferably about 70% or more, preferably about 80% or more, preferably about 90% or more, more preferably about 95% or more, and particularly preferably about 99% or more. DNA having a base sequence having the same is used.
Examples of the DNA that can hybridize with the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 55 or SEQ ID NO: 81 under high stringency conditions include, for example, a nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 55 or about 50 % Or more, preferably about 60% or more, preferably about 70% or more, preferably about 80% or more, preferably about 90% or more, more preferably about 95% or more, and particularly preferably about 99% or more. DNA having a base sequence having the same is used.
Hybridization can be performed according to a known method or a method analogous thereto, for example, a method described in Molecular Cloning 2nd (J. Sambrook et al., Cold Spring Harbor Lab. Press, 1989). When a commercially available library is used, it can be performed according to the method described in the attached instruction manual. More preferably, it can be performed under high stringent conditions.
The high stringent conditions are, for example, conditions in which the sodium concentration is about 19 to 40 mM, preferably about 19 to 20 mM, and the temperature is about 50 to 70 ° C, preferably about 60 to 65 ° C. In particular, the case where the sodium concentration is about 19 mM and the temperature is about 65 ° C. is most preferable.
More specifically, the DNA encoding the protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 is a DNA containing the base sequence represented by SEQ ID NO: 2, and represented by SEQ ID NO: 25 Examples of the DNA encoding the protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 26, such as DNA having the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 27, include DNA having the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 27, and SEQ ID NO: 51. Examples of the DNA encoding the protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 52, such as the DNA containing the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 52, include the DNA containing the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 53, No.:80 as a DNA encoding a protein containing an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 54, and the like. Column Number: DNA containing the base sequence represented by 55, SEQ ID NO: DNA containing the base sequence represented by 81 is used.
[0021]
The polynucleotide (eg, DNA) encoding the partial peptide used in the present invention may be any polynucleotide containing the above-described nucleotide sequence encoding the partial peptide used in the present invention. Further, any of genomic DNA, genomic DNA library, cDNA derived from the above-mentioned cells / tissues, cDNA library derived from the aforementioned cells / tissues, and synthetic DNA may be used.
Examples of the DNA encoding the partial peptide used in the present invention include (1) DNA having a part of the DNA having the base sequence represented by SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 25, or SEQ ID NO: 2 or the sequence DNA containing a base sequence hybridizable with the base sequence represented by No. 25 under high stringent conditions, and containing a part of a DNA encoding a protein having substantially the same activity as the protein of the present invention (2) a DNA having a portion of the DNA having the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 27, or a nucleotide sequence that hybridizes with the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 27 under high stringency conditions; A DNA containing a portion of a DNA encoding a protein having substantially the same activity as the protein of the present invention; 3) a DNA comprising a portion of the DNA having the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 53 or a nucleotide sequence which hybridizes under high stringency conditions with the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 53; DNA containing a part of a DNA encoding a protein having substantially the same activity as the protein of the present invention, (4) DNA having a part of a DNA having a base sequence represented by SEQ ID NO: 55, or SEQ ID NO: DNA containing a part of DNA encoding a protein having a nucleotide sequence that hybridizes under high stringent conditions with the nucleotide sequence represented by 55 and encoding a protein having substantially the same activity as the protein of the present invention; Used.
DNAs capable of hybridizing with the base sequence represented by SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 25, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 53 or SEQ ID NO: 55 have the same significance as described above.
The same hybridization method and high stringency conditions as described above are used.
[0022]
As a means for cloning a DNA that completely encodes the protein or partial peptide of the present invention (hereinafter, in the description of the cloning and expression of DNAs encoding them, these may be simply abbreviated to the protein of the present invention), Amplifying by a PCR method using a synthetic DNA primer having a part of the nucleotide sequence encoding the protein of the present invention, or incorporating a DNA incorporated in an appropriate vector into a DNA encoding a part or the whole region of the protein of the present invention. Selection can be performed by hybridization with fragments or those labeled with synthetic DNA. Hybridization can be performed, for example, according to the method described in Molecular Cloning 2nd (J. Sambrook et al., Cold Spring Harbor Lab. Press, 1989). When a commercially available library is used, it can be performed according to the method described in the attached instruction manual.
Conversion of the base sequence of DNA can be performed by PCR or a known kit, for example, Mutan. TM -Super Express Km (Takara Shuzo Co., Ltd.), Mutan TM Using -K (Takara Shuzo Co., Ltd.) or the like, it can be carried out according to a known method such as the ODA-LA PCR method, the Gapped Duplex method or the Kunkel method, or a method analogous thereto.
The DNA encoding the cloned protein can be used as it is or as desired, after digestion with a restriction enzyme or addition of a linker, if desired. The DNA may have ATG as a translation initiation codon at the 5 'end and TAA, TGA or TAG as a translation termination codon at the 3' end. These translation initiation codon and translation termination codon can also be added using an appropriate synthetic DNA adapter.
The expression vector for the protein of the present invention includes, for example, (a) cutting out a DNA fragment of interest from DNA encoding the protein of the present invention, and (b) ligating the DNA fragment downstream of a promoter in an appropriate expression vector. It can be manufactured by the following.
[0023]
Examples of the vector include plasmids derived from Escherichia coli (eg, pBR322, pBR325, pUC12, pUC13), plasmids derived from Bacillus subtilis (eg, pUB110, pTP5, pC194), plasmids derived from yeast (eg, pSH19, pSH15), λ phage and the like. In addition to animal viruses such as bacteriophage, retrovirus, vaccinia virus, and baculovirus, pA1-11, pXT1, pRc / CMV, pRc / RSV, pcDNAI / Neo, and the like are used.
The promoter used in the present invention may be any promoter as long as it is appropriate for the host used for gene expression. For example, when an animal cell is used as a host, SRα promoter, SV40 promoter, LTR promoter, CMV promoter, HSV-TK promoter and the like can be mentioned.
Of these, it is preferable to use a CMV (cytomegalovirus) promoter, SRα promoter, or the like. When the host is a bacterium belonging to the genus Escherichia, trp promoter, lac promoter, recA promoter, λPL promoter, lpp promoter, T7 promoter, etc., and when the host is a bacterium belonging to the genus Bacillus, SPO1 promoter, SPO2 promoter, penP promoter, etc. When the host is yeast, PHO5 promoter, PGK promoter, GAP promoter, ADH promoter and the like are preferable. When the host is an insect cell, a polyhedrin promoter, a P10 promoter and the like are preferable.
[0024]
In addition to the above, an expression vector containing an enhancer, a splicing signal, a polyA addition signal, a selection marker, an SV40 replication origin (hereinafter sometimes abbreviated as SV40 ori), and the like may be used, if desired. it can. Examples of the selectable marker include a dihydrofolate reductase (hereinafter sometimes abbreviated as dhfr) gene [methotrexate (MTX) resistance] and an ampicillin resistance gene (hereinafter Amp). r Neomycin resistance gene (hereinafter Neo). r G418 resistance). In particular, when the dhfr gene is used as a selection marker using Chinese hamster cells deficient in dhfr gene, the target gene can be selected using a thymidine-free medium.
If necessary, a signal sequence suitable for the host is added to the N-terminal side of the protein of the present invention. When the host is a genus Escherichia, a PhoA signal sequence, an OmpA signal sequence, or the like is used. When the host is a Bacillus genus, an α-amylase signal sequence, a subtilisin signal sequence, or the like is used. In some cases, MFα signal sequence, SUC2 signal sequence, etc., and when the host is an animal cell, insulin signal sequence, α-interferon signal sequence, antibody molecule, signal sequence, etc. can be used.
A transformant can be produced using the vector containing the DNA encoding the protein of the present invention thus constructed.
[0025]
As the host, for example, Escherichia, Bacillus, yeast, insect cells, insects, animal cells and the like are used.
Specific examples of the genus Escherichia include, for example, Escherichia coli K12.DH1 [Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 60, 160 (1968)], JM103 [Nucleic Acids Research, 9, 309 (1981)], JA221 [Journal of Molecular Biology, 120, 517 (1978)], HB101 [Journalolgo olegolando]. Vol., 459 (1969)], C600 [Genetics, 39, 440 (1954)] and the like.
As the Bacillus bacterium, for example, Bacillus subtilis MI114 [Gene, 24, 255 (1983)], 207-21 [Journal of Biochemistry, 95, 87 (1984)] and the like are used.
Examples of yeast include, for example, Saccharomyces cerevisiae AH22, AH22R , NA87-11A, DKD-5D, 20B-12, Schizosaccharomyces pombe NCYC1913, NCYC2036, Pichia pastoris KM71 and the like.
[0026]
When the virus is AcNPV, for example, when the virus is AcNPV, a cell line derived from a larva of night roth moth (Spodoptera frugiperda cell; Sf cell), an MG1 cell derived from the midgut of Trichoplusia ni, and a Figh cell derived from Trichoplusia ni egg. And cells derived from Mamestra brassicae or cells derived from Estigmena acrea. When the virus is BmNPV, a silkworm-derived cell line (Bombyx mori N cell; BmN cell) or the like is used. As the Sf cells, for example, Sf9 cells (ATCC CRL 1711), Sf21 cells (Vaughn, JL, et al., In Vivo, 13, 213-217, (1977)) and the like are used. .
As insects, for example, silkworm larvae are used [Maeda et al., Nature, 315, 592 (1985)].
Examples of animal cells include monkey cells COS-7, Vero, Chinese hamster cells CHO (hereinafter abbreviated as CHO cells), dhfr gene-deficient Chinese hamster cells CHO (hereinafter CHO (dhfr). ) Cells), mouse L cells, mouse AtT-20, mouse myeloma cells, rat GH3, human FL cells, and the like.
For transformation of Escherichia, for example, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 69, 2110 (1972), and Gene, 17, 107 (1982).
[0027]
Transformation of Bacillus spp. Can be performed, for example, according to the method described in Molecular & General Genetics, Vol. 168, 111 (1979).
To transform yeast, see, for example, Methods in Enzymology, Vol. 194, 182-187 (1991), Proc. Natl. Acad. Sci. USA, Vol. 75, 1929 (1978).
Insect cells or insects can be transformed, for example, according to the method described in Bio / Technology, 6, 47-55 (1988).
To transform animal cells, for example, see Cell Engineering Separate Volume 8, New Cell Engineering Experiment Protocol. 263-267 (1995) (published by Shujunsha) and Virology, Vol. 52, 456 (1973).
Thus, a transformant transformed with the expression vector containing the DNA encoding the protein can be obtained.
When culturing a transformant whose host is a genus Escherichia or Bacillus, a liquid medium is suitable as a medium used for the culturing, and a carbon source necessary for growth of the transformant is used therein. Nitrogen sources, inorganic substances, etc. are included. As a carbon source, for example, glucose, dextrin, soluble starch, sucrose, etc., as a nitrogen source, for example, ammonium salts, nitrates, corn steep liquor, peptone, casein, meat extract, soybean meal, potato extract and the like Examples of the inorganic or organic substance and the inorganic substance include calcium chloride, sodium dihydrogen phosphate, and magnesium chloride. In addition, yeast extract, vitamins, growth promoting factors and the like may be added. The pH of the medium is preferably about 5 to 8.
[0028]
As a medium for culturing the genus Escherichia, for example, an M9 medium containing glucose and casamino acid [Journal of Experiments in Molecular Genetics, 431-433, Cold Spring Harbor Laboratory, New York] is preferable. If necessary, an agent such as 3β-indolylacrylic acid can be added in order to make the promoter work efficiently.
When the host is a bacterium belonging to the genus Escherichia, the cultivation is usually performed at about 15 to 43 ° C. for about 3 to 24 hours, and if necessary, aeration and stirring can be added.
When the host is a bacterium belonging to the genus Bacillus, the cultivation is usually carried out at about 30 to 40 ° C. for about 6 to 24 hours, and if necessary, aeration and stirring may be added.
When culturing a transformant in which the host is yeast, for example, Burkholder's minimum medium [Bostian, K. et al. L. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, Vol. 77, 4505 (1980)] or an SD medium containing 0.5% casamino acid [Bitter, G. et al. A. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81, 5330 (1984)]. Preferably, the pH of the medium is adjusted to about 5-8. The cultivation is usually performed at about 20 to 35 ° C. for about 24 to 72 hours, and aeration and / or agitation are added as necessary.
When culturing a transformant in which the host is an insect cell or an insect, as a medium, an additive such as 10% bovine serum immobilized in Grace's Insect Medium (Nature, 195, 788 (1962)) is appropriately used. The added one is used. The pH of the medium is preferably adjusted to about 6.2 to 6.4. The cultivation is usually performed at about 27 ° C. for about 3 to 5 days, and if necessary, aeration or stirring is added.
When culturing a transformant in which the host is an animal cell, examples of the medium include a MEM medium containing about 5 to 20% fetal bovine serum [Science, Vol. 122, 501 (1952)], a DMEM medium [Virology, 8, 396 (1959)], RPMI 1640 medium [The Journal of the American Medical Association, 199, 519 (1967)], 199 medium [Proceeding of the Society for Biotechnology, etc., 1973, etc.]. Used. Preferably, the pH is between about 6 and 8. The cultivation is usually performed at about 30 to 40 ° C. for about 15 to 60 hours, and if necessary, aeration and stirring are added.
As described above, the protein of the present invention can be produced in cells, cell membranes or extracellular cells of the transformant.
[0029]
The protein of the present invention can be separated and purified from the culture by, for example, the following method.
When extracting the protein of the present invention from cultured cells or cells, the cells or cells are collected by a known method after culturing, suspended in an appropriate buffer, and subjected to sonication, lysozyme and / or freeze-thawing. After the cells or cells are destroyed by the method, a method of obtaining a crude extract of the protein by centrifugation or filtration is used as appropriate. In a buffer, a protein denaturant such as urea or guanidine hydrochloride, or Triton X-100 is used. TM And the like. When the protein is secreted into the culture solution, after the culture, the supernatant is separated from the cells or cells by a known method, and the supernatant is collected.
The protein contained in the thus obtained culture supernatant or extract can be purified by appropriately combining known separation and purification methods. These known separation and purification methods include methods utilizing solubility such as salting out and solvent precipitation, dialysis, ultrafiltration, gel filtration, and SDS-polyacrylamide gel electrophoresis, mainly molecular weight. Using differences in charge, methods using charge differences such as ion exchange chromatography, methods using specific affinity such as affinity chromatography, and using differences in hydrophobicity such as reversed-phase high-performance liquid chromatography A method utilizing a difference between isoelectric points, such as an isoelectric focusing method, is used.
[0030]
When the thus obtained protein is obtained in a free form, it can be converted to a salt by a known method or a method analogous thereto, and conversely, when the protein is obtained as a salt, by a known method or a method analogous thereto, It can be converted to a free form or other salts.
The protein produced by the recombinant can be arbitrarily modified or the polypeptide can be partially removed by applying an appropriate protein modifying enzyme before or after purification. As the protein modifying enzyme, for example, trypsin, chymotrypsin, arginyl endopeptidase, protein kinase, glycosidase and the like are used.
The presence of the protein of the present invention thus produced can be measured by an enzyme immunoassay using a specific antibody, Western blotting, or the like.
[0031]
The antibody against the protein or partial peptide of the present invention or a salt thereof may be any of a polyclonal antibody and a monoclonal antibody as long as it can recognize the protein or partial peptide of the present invention or a salt thereof.
An antibody against the protein or partial peptide of the present invention or a salt thereof (hereinafter, these may be simply abbreviated as the protein of the present invention) using the protein of the present invention as an antigen, is a known antibody or It can be produced according to the method for producing antiserum.
[Preparation of monoclonal antibody]
(A) Preparation of monoclonal antibody-producing cells
The protein of the present invention is administered to a warm-blooded animal itself or together with a carrier and a diluent at a site capable of producing an antibody upon administration. Complete Freund's adjuvant or incomplete Freund's adjuvant may be administered in order to enhance the antibody-producing ability upon administration. The administration is usually performed once every 2 to 6 weeks, for a total of about 2 to 10 times. Examples of the warm-blooded animal used include monkeys, rabbits, dogs, guinea pigs, mice, rats, sheep, goats, and chickens, and mice and rats are preferably used.
When preparing monoclonal antibody-producing cells, a warm-blooded animal immunized with an antigen, for example, an individual having an antibody titer is selected from a mouse, and the spleen or lymph node is collected 2 to 5 days after the final immunization and contained in them. By fusing the antibody-producing cells thus obtained with myeloma cells of the same or different species, a monoclonal antibody-producing hybridoma can be prepared. The antibody titer in the antiserum can be measured, for example, by reacting a labeled protein described below with the antiserum, and then measuring the activity of a labeling agent bound to the antibody. The fusion operation can be performed according to a known method, for example, the method of Kohler and Milstein [Nature, 256, 495 (1975)]. Examples of the fusion promoter include polyethylene glycol (PEG) and Sendai virus, but PEG is preferably used.
[0032]
Examples of myeloma cells include myeloma cells of warm-blooded animals such as NS-1, P3U1, SP2 / 0, and AP-1, but P3U1 is preferably used. The preferred ratio between the number of antibody-producing cells (spleen cells) and the number of myeloma cells used is about 1: 1 to 20: 1, and PEG (preferably PEG1000 to PEG6000) is added at a concentration of about 10 to 80%. By incubating at 20 to 40 ° C, preferably 30 to 37 ° C for 1 to 10 minutes, cell fusion can be carried out efficiently. Various methods can be used to screen for monoclonal antibody-producing hybridomas. For example, a hybridoma culture supernatant is added to a solid phase (eg, a microplate) on which a protein antigen is directly or adsorbed together with a carrier, and then radioactive substances or A method for detecting a monoclonal antibody bound to a solid phase by adding an anti-immunoglobulin antibody labeled with an enzyme or the like (an anti-mouse immunoglobulin antibody is used when cells used for cell fusion are mice) or protein A; A method in which a hybridoma culture supernatant is added to a solid phase to which globulin antibodies or protein A is adsorbed, a protein labeled with a radioactive substance, an enzyme, or the like is added, and a monoclonal antibody bound to the solid phase is detected.
The selection of the monoclonal antibody can be performed according to a known method or a method analogous thereto. Usually, it can be performed in a medium for animal cells supplemented with HAT (hypoxanthine, aminopterin, thymidine). As a selection and breeding medium, any medium can be used as long as a hybridoma can grow. For example, RPMI 1640 medium containing 1 to 20%, preferably 10 to 20% fetal bovine serum, GIT medium containing 1 to 10% fetal bovine serum (Wako Pure Chemical Industries, Ltd.) or serum-free for hybridoma culture A medium (SFM-101, Nissui Pharmaceutical Co., Ltd.) or the like can be used. The culturing temperature is usually 20 to 40 ° C, preferably about 37 ° C. The culture time is usually 5 days to 3 weeks, preferably 1 week to 2 weeks. The culture can be usually performed under 5% carbon dioxide gas. The antibody titer of the hybridoma culture supernatant can be measured in the same manner as the measurement of the antibody titer in the antiserum described above.
[0033]
(B) Purification of monoclonal antibody
Monoclonal antibodies can be separated and purified by known methods, for example, immunoglobulin separation and purification methods [eg, salting out method, alcohol precipitation method, isoelectric point precipitation method, electrophoresis method, absorption by ion exchanger (eg, DEAE)]. Desorption method, ultracentrifugation method, gel filtration method, antigen-binding solid phase or specific purification method of collecting only the antibody with an active adsorbent such as protein A or protein G and dissociating the bond to obtain the antibody] it can.
[0034]
(Preparation of polyclonal antibody)
The polyclonal antibody of the present invention can be produced according to a known method or a method analogous thereto. For example, a immunizing antigen (protein antigen) itself or a complex thereof with a carrier protein is formed, and immunization is performed on a warm-blooded animal in the same manner as in the above-described method for producing a monoclonal antibody. It can be produced by collecting a substance and separating and purifying the antibody. Regarding a complex of an immunizing antigen and a carrier protein used to immunize a warm-blooded animal, the type of the carrier protein and the mixing ratio of the carrier protein and the hapten are determined by the antibody against the hapten immunized by crosslinking the carrier protein. Any material may be crosslinked at any ratio as long as it can be efficiently produced.For example, bovine serum albumin, bovine thyroglobulin, hemocyanin, etc. are used in a weight ratio of about 0.1 to 20, preferably 1 to hapten 1 with respect to hapten. A method of coupling at a rate of about 1 to 5 is used.
In addition, various condensing agents can be used for coupling the hapten and the carrier protein, and glutaraldehyde, carbodiimide, maleimide active ester, an active ester reagent containing a thiol group or a dithioviridyl group, or the like is used.
The condensation product is administered to a warm-blooded animal itself or together with a carrier or diluent at a site where antibody production is possible. Complete Freund's adjuvant or incomplete Freund's adjuvant may be administered in order to enhance the antibody-producing ability upon administration. The administration is usually performed once every about 2 to 6 weeks, about 3 to 10 times in total.
The polyclonal antibody can be collected from the blood, ascites, or the like, preferably from the blood of a warm-blooded animal immunized by the above method.
The measurement of the polyclonal antibody titer in the antiserum can be performed in the same manner as the measurement of the antibody titer in the antiserum described above. The separation and purification of the polyclonal antibody can be performed according to the same immunoglobulin separation and purification method as the above-mentioned separation and purification of the monoclonal antibody.
[0035]
Complementary or substantially complementary to the base sequence of DNA encoding the protein or partial peptide of the present invention (hereinafter, these DNAs may be abbreviated as the DNA of the present invention in the description of the antisense polynucleotide). The antisense polynucleotide having a complementary base sequence or a part thereof has a base sequence complementary to or substantially complementary to the base sequence of the DNA of the present invention or a part thereof, and Any antisense polynucleotide may be used as long as it has an action of suppressing expression, but antisense DNA is preferable.
The nucleotide sequence substantially complementary to the DNA of the present invention is, for example, about 70% of the total nucleotide sequence or a partial nucleotide sequence of the nucleotide sequence complementary to the DNA of the present invention (that is, the complementary strand of the DNA of the present invention). % Or more, preferably about 80% or more, more preferably about 90% or more, most preferably about 95% or more. In particular, of the entire base sequence of the complementary strand of the DNA of the present invention, the base sequence of the portion encoding the N-terminal portion of the protein of the present invention (for example, the base sequence near the start codon, etc.) is at least about 70% or more of the complementary strand. Antisense polynucleotides having preferably at least about 80%, more preferably at least about 90%, most preferably at least about 95% homology are suitable.
Specifically, a nucleotide sequence complementary or substantially complementary to the nucleotide sequence of DNA having the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 53 or SEQ ID NO: 55, Or a base sequence complementary to a base sequence of a DNA having a base sequence represented by SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 53 or SEQ ID NO: 55, Or an antisense polynucleotide having a part thereof.
The antisense polynucleotide is usually composed of about 10 to 40, preferably about 15 to 30 bases.
In order to prevent degradation by a hydrolase such as nuclease, a phosphate residue (phosphate) of each nucleotide constituting the antisense DNA may be, for example, a chemically modified phosphate residue such as phosphorothioate, methylphosphonate, or phosphorodithionate. It may be substituted. These antisense polynucleotides can be produced using a known DNA synthesizer or the like.
[0036]
According to the present invention, the antisense polynucleotide (nucleic acid) corresponding to the protein gene of the present invention, which can inhibit the replication or expression of the gene, is cloned or the base of DNA encoding the determined protein is determined. It can be designed and synthesized based on sequence information. Such antisense polynucleotides can hybridize to the RNA of the protein gene of the present invention and inhibit the synthesis or function of the RNA, or through interaction with the protein-related RNA of the present invention. The expression of the protein gene of the present invention can be regulated and controlled. Polynucleotides that are complementary to a selected sequence of the protein-associated RNA of the present invention, and that can specifically hybridize with the protein-associated RNA of the present invention, can be used in vivo and in vitro to produce the protein gene of the present invention. It is useful for regulating and controlling the expression of, and also useful for treating or diagnosing diseases and the like. The term “corresponding” means having homology or being complementary to a specific sequence of nucleotides, base sequences or nucleic acids including genes. The "correspondence" between a nucleotide, base sequence or nucleic acid and a protein usually refers to the amino acid of the protein (as indicated) derived from the nucleotide (nucleic acid) sequence or its complement. 5 'end hairpin loop of protein gene, 5' end 6-base pair repeat, 5 'end untranslated region, polypeptide translation start codon, protein coding region, ORF translation stop codon, 3' end untranslated region, 3 ' Although a terminal palindrome region or a 3′-end hairpin loop can be selected as a preferable target region, any region within a protein gene can be selected as a target. Regarding the relationship between the target nucleic acid and a polynucleotide complementary to at least a part of the target region, if the target nucleic acid can hybridize with the target region, the target nucleic acid is Can be said to be "antisense." Antisense polynucleotides are polydeoxyribonucleotides containing 2-deoxy-D-ribose, polyribonucleotides containing D-ribose, N-glycosides of purine or pyrimidine bases and other types of polynucleotides. , Other polymers with non-nucleotide backbones (eg, commercially available protein nucleic acids and synthetic sequence-specific nucleic acid polymers) or other polymers containing specialized linkages, such as those found in DNA or RNA. Base pairing and nucleotides having a configuration that allows base attachment). They may be double stranded DNA, single stranded DNA, double stranded RNA, single stranded RNA, DNA: RNA hybrids, and may further comprise unmodified polynucleotides (or unmodified oligonucleotides), known modifications. Additions, e.g., those with labels known in the art, capped, methylated, substituted for one or more natural nucleotides with analogs, modified with intramolecular nucleotides Having an uncharged bond (eg, methylphosphonate, phosphotriester, phosphoramidate, carbamate, etc.), having a charged or sulfur-containing bond (eg, phosphorothioate, phosphorodithioate, etc.) Such as proteins (eg, nucleases, nuclease inhibitors, toxins, antibodies, Nal peptides, poly-L-lysine, etc.) or sugars (eg, monosaccharides, etc.) having side chain groups, interactive compounds (eg, acridine, psoralen, etc.), chelating compounds (eg, , Metals, radioactive metals, boron, oxidizable metals, etc.), those containing alkylating agents, those having modified bonds (eg, α-anomeric nucleic acids, etc.) Is also good. Here, "nucleoside", "nucleotide", and "nucleic acid" may include not only those containing purine and pyrimidine bases but also those having other modified heterocyclic bases. Such modifications may include methylated purines and pyrimidines, acylated purines and pyrimidines, or other heterocycles. Modified nucleotides and modified nucleotides may also be modified at the sugar moiety, e.g., where one or more hydroxyl groups have been replaced with halogens, aliphatic groups, or the like, or with functional groups such as ethers, amines, and the like. It may have been converted.
The antisense polynucleotide of the present invention is RNA, DNA or a modified nucleic acid (RNA, DNA). Specific examples of the modified nucleic acid include a sulfur derivative of a nucleic acid, a thiophosphate derivative, a nucleic acid which is resistant to degradation of polynucleoside amide and oligonucleoside amide and the like. The antisense polynucleotide of the present invention can be designed, for example, as follows. That is, the antisense polynucleotide in a cell is made more stable, the cell permeability of the antisense polynucleotide is increased, the affinity for the target sense strand is increased, and if the toxicity is low. In some cases, the toxicity of the antisense polynucleotide is reduced. Many such modifications are reported in, for example, Pharm Tech Japan, 8, 247 or 395, 1992, Antisense Research and Applications, CRC Press, 1993.
The antisense polynucleotides of the present invention may contain altered or modified sugars, bases, bonds, and may be provided in special forms such as liposomes, microspheres, or applied by gene therapy. , Can be provided in an added form. Thus, in the form of addition, polycations such as polylysine which acts to neutralize the charge of the phosphate skeleton, lipids which enhance the interaction with the cell membrane or increase the uptake of nucleic acids ( Hydrophobic substances such as, for example, phospholipids, cholesterol, etc.). Preferred lipids for addition include cholesterol and its derivatives (eg, cholesteryl chloroformate, cholic acid, etc.). These can be attached to the 3 'or 5' end of the nucleic acid and can be attached via a base, sugar, intramolecular nucleoside linkage. Other groups include cap groups specifically arranged at the 3 ′ end or 5 ′ end of a nucleic acid for preventing degradation by nucleases such as exonuclease and RNase. Such capping groups include, but are not limited to, hydroxyl-protecting groups known in the art, including glycols such as polyethylene glycol and tetraethylene glycol.
The inhibitory activity of the antisense polynucleotide can be examined using the transformant of the present invention, the in vivo or in vitro gene expression system of the present invention, or the in vivo or in vitro translation system of the protein of the present invention. .
[0037]
Hereinafter, the protein or partial peptide of the present invention or a salt thereof (hereinafter, may be abbreviated as the protein of the present invention), a polynucleotide encoding the protein or partial peptide of the present invention, for example, DNA (hereinafter, DNA of the present invention) ), An antibody against the protein or partial peptide of the present invention or a salt thereof (hereinafter, may be abbreviated as the antibody of the present invention), and an antisense polynucleotide of the DNA of the present invention (hereinafter, the present invention). May be abbreviated as “antisense polynucleotide”).
Pharmaceuticals containing a compound or a salt thereof that inhibits the activity of the protein of the present invention can be used, for example, by suppressing the transport activity of organic anions to obtain, for example, renal diseases (eg, renal failure, glomerulonephritis, diabetic nephropathy) , Focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, interstitial nephritis, renal sclerosis, uremic disease, etc., liver disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.), pancreatic disease (eg, Pancreatitis), immune disorders associated with thymic abnormalities, genital disorders (eg, benign prostatic hyperplasia, prostatitis, testicular neurosis, ovarian cysts), gastrointestinal disorders (eg, irritable bowel syndrome, ulcerative colitis, illness) Blood colitis, gastritis, etc.), spleen disease (eg, hypersplenia, splenomegaly syndrome, etc.), cancer (eg, lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, gastric cancer, bladder) Cancer, breast cancer, cervical cancer, colon cancer, rectal cancer, pancreas , Thyroid cancer, myeloid leukemia, etc.), respiratory diseases (eg, pleurisy, pneumonia, chronic obstructive pulmonary disease, asthma, etc.), osteomyelitis, diabetes, hypertension, post-ischemic reperfusion injury, retinitis, central nervous disease (E.g., epilepsy, Alzheimer's disease, Parkinson's syndrome, schizophrenia), skin disorders (e.g., atopic dermatitis, seborrheic dermatitis, etc.), thyroid hormone-related disorders (e.g., thyroid hormone refractory disease, Basedow's disease, Cretinism, hyperthyroidism, etc.). It is preferably used as a prophylactic / therapeutic agent for renal diseases and thyroid hormone-related diseases, and more preferably as a prophylactic / therapeutic agent for diabetic nephropathy. On the other hand, a drug containing a compound or a salt thereof that promotes the activity of the protein of the present invention can be used, for example, by promoting the transport activity of an organic anion to obtain, for example, a renal disease (eg, renal failure, glomerulonephritis, diabetic Nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, interstitial nephritis, nephrosclerosis, uremic disease, etc., liver disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.), pancreatic disease ( E.g., pancreatitis), immune disorders associated with thymic abnormalities, genital disorders (e.g., benign prostatic hyperplasia, prostatitis, testicular neurosis, ovarian cysts), gastrointestinal disorders (e.g., irritable bowel syndrome, ulcerative colitis) , Ischemic colitis, gastritis, etc.), spleen disease (eg, hypersplenism, splenomegaly syndrome, etc.), cancer (eg, lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, gastric cancer) , Bladder cancer, breast cancer, cervical cancer, colon cancer, rectal cancer Pancreatic cancer, thyroid cancer, myeloid leukemia, etc.), respiratory diseases (eg, pleurisy, pneumonia, chronic obstructive pulmonary disease, asthma, etc.), osteomyelitis, diabetes, hypertension, post-ischemic reperfusion injury, retinitis, central Neurological diseases (eg, epilepsy, Alzheimer's disease, Parkinson's syndrome, schizophrenia, etc.), skin diseases (eg, atopic dermatitis, seborrheic dermatitis, etc.), thyroid hormone-related diseases (eg, thyroid hormone refractory disease, Basedow) Disease, cretinism, hyperthyroidism, etc.). It is preferably used as a prophylactic / therapeutic agent for renal diseases and thyroid hormone-related diseases, and more preferably as a prophylactic / therapeutic agent for diabetic nephropathy.
[0038]
[1] A preventive / therapeutic agent for various diseases related to the protein of the present invention
The protein of the present invention has an organic anion transport activity and the like, takes up thyroid hormones into the central nervous system through the blood brain barrier in vivo, transfers bile acids or drugs from the blood to the liver, It plays an important role in maintaining homeostasis, such as removing inflammatory mediators such as gin or leukotriene, and excreting foreign substances into bile or urine.
Therefore, when the DNA encoding the protein of the present invention is abnormal or defective, or when the expression level of the protein of the present invention is reduced, for example, renal diseases (eg, renal failure, glomeruli) Nephritis, diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, interstitial nephritis, nephrosclerosis, uremia, etc., liver disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.) , Pancreatic disorders (eg, pancreatitis), immune disorders associated with thymic abnormalities, genital disorders (eg, benign prostatic hyperplasia, prostatitis, testicular neurosis, ovarian cysts), gastrointestinal disorders (eg, irritable bowel syndrome, Ulcerative colitis, ischemic colitis, gastritis, etc.), spleen disease (eg, hypersplenism, splenomegaly syndrome, etc.), cancer (eg, lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, Prostate, gastric, bladder, breast, cervical, Intestinal cancer, rectal cancer, pancreatic cancer, thyroid cancer, myeloid leukemia, etc.), respiratory disease (eg, pleurisy, pneumonia, chronic obstructive pulmonary disease, asthma, etc.), osteomyelitis, diabetes, hypertension, reperfusion after ischemia Disorders, retinitis, central nervous system disorders (eg, epilepsy, Alzheimer's disease, Parkinson's syndrome, schizophrenia, etc.), skin disorders (eg, atopic dermatitis, seborrheic dermatitis, etc.), thyroid hormone related disorders (eg, Various diseases such as thyroid hormone refractory disease, Basedow's disease, cretinism, and hyperthyroidism develop.
Therefore, the protein of the present invention and the DNA of the present invention can be used, for example, in renal diseases (eg, renal failure, glomerulonephritis, diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, interstitial nephritis) , Renal sclerosis, uremic disease, etc.), liver disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.), pancreatic disease (eg, pancreatitis, etc.), immune disease associated with thymic abnormalities, genital disease (eg, prostatic hypertrophy) , Prostatitis, testicular neurosis, ovarian cysts, etc.), digestive disorders (eg, irritable bowel syndrome, ulcerative colitis, ischemic colitis, gastritis, etc.), spleen disorders (eg, hypersplenism, splenomegaly) Sexual syndrome, etc.), cancer (eg, lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, gastric cancer, bladder cancer, breast cancer, cervical cancer, colon cancer, rectal cancer, pancreatic cancer, thyroid gland Cancer, myeloid leukemia, etc.), respiratory diseases (eg, pleurisy, pneumonia, Obstructive pulmonary disease, asthma, etc.), osteomyelitis, diabetes, hypertension, post-ischemic reperfusion injury, retinitis, central nervous system diseases (eg, epilepsy, Alzheimer's disease, Parkinson's syndrome, schizophrenia, etc.), skin diseases (eg, , Atopic dermatitis, seborrheic dermatitis, etc.) and thyroid hormone-related diseases (eg, thyroid hormone refractory disease, Basedow's disease, cretin disease, hyperthyroidism, etc.) be able to. It is preferably used as a prophylactic / therapeutic agent for renal diseases and thyroid hormone-related diseases, and more preferably as a prophylactic / therapeutic agent for diabetic nephropathy.
For example, when the protein of the present invention is reduced or deficient in a living body, and there is a patient who cannot sufficiently or normally exhibit the organic anion transport activity, (a) the DNA of the present invention is added to the patient. By administering and expressing the protein of the present invention in vivo, (ii) by inserting the DNA of the present invention into cells and expressing the protein of the present invention, and then transplanting the cells into a patient; or (C) The role of the protein of the present invention in the patient can be sufficiently or normally exerted by administering the protein of the present invention to the patient.
When the DNA of the present invention is used as the above-mentioned prophylactic / therapeutic agent, after inserting the DNA alone or into an appropriate vector such as a retrovirus vector, adenovirus vector, adenovirus associated virus vector, etc. It can be administered to humans or warm-blooded animals. The DNA of the present invention can be administered as it is or in the form of a formulation together with a physiologically acceptable carrier such as an auxiliary agent for promoting uptake, using a gene gun or a catheter such as a hydrogel catheter.
When the protein of the present invention is used as the above-mentioned prophylactic / therapeutic agent, it is preferable to use a protein purified to at least 90%, preferably 95% or more, more preferably 98% or more, and still more preferably 99% or more. preferable.
[0039]
The protein of the present invention can be used, for example, as a sugar-coated tablet, capsule, elixir, microcapsule, orally, or aseptic with water or other pharmaceutically acceptable liquids. It can be used parenterally in the form of injections, such as solutions or suspensions. For example, the protein or the like of the present invention is mixed with physiologically acceptable carriers, flavors, excipients, vehicles, preservatives, stabilizers, binders, and the like in a unit dosage form generally required for the practice of preparations. Can be manufactured. The amount of the active ingredient in these preparations is such that a proper dosage in the specified range can be obtained.
Examples of additives that can be incorporated into tablets, capsules, and the like include binders such as gelatin, corn starch, tragacanth, and acacia, excipients such as crystalline cellulose, corn starch, gelatin, and alginic acid. Useful bulking agents, lubricants such as magnesium stearate, sweeteners such as sucrose, lactose or saccharin, flavoring agents such as peppermint, reddish oil or cherry and the like are used. When the preparation unit form is a capsule, a liquid carrier such as oil and fat can be further contained in the above-mentioned type of material. Sterile compositions for injection can be formulated according to normal pharmaceutical practice such as dissolving or suspending the active substance in vehicles such as water for injection, and naturally occurring vegetable oils such as sesame oil, coconut oil and the like.
Aqueous liquids for injection include, for example, physiological saline, isotonic solutions containing glucose and other adjuvants (eg, D-sorbitol, D-mannitol, sodium chloride, etc.), and suitable solubilizing agents. For example, alcohols (eg, ethanol, etc.), polyalcohols (eg, propylene glycol, polyethylene glycol, etc.), nonionic surfactants (eg, polysorbate 80) TM , HCO-50, etc.). Examples of the oily liquid include sesame oil and soybean oil, and may be used in combination with solubilizers such as benzyl benzoate and benzyl alcohol. Also, buffers (eg, phosphate buffer, sodium acetate buffer, etc.), soothing agents (eg, benzalkonium chloride, procaine hydrochloride, etc.), stabilizers (eg, human serum albumin, polyethylene glycol, etc.), You may mix | blend with a preservative (for example, benzyl alcohol, phenol etc.), an antioxidant, etc. The prepared injection is usually filled in an appropriate ampoule.
The vector into which the DNA of the present invention has been inserted is also formulated in the same manner as described above, and is usually used parenterally.
[0040]
The preparation obtained in this way is safe and low toxic, and thus, for example, is useful for warm-blooded animals (eg, human, rat, mouse, guinea pig, rabbit, bird, sheep, pig, cow, horse, cat, dog, monkey). , Chimpanzees, etc.).
The dose of the protein of the present invention varies depending on the target disease, the subject of administration, the administration route, and the like. For example, when the protein or the like of the present invention is orally administered for the purpose of treating renal insufficiency, generally the adult (body weight 60 kg) is used. )), The protein is administered in an amount of about 0.1-100 mg, preferably about 1.0-50 mg, more preferably about 1.0-20 mg per day. When administered parenterally, a single dose of the protein may vary depending on the administration subject, target disease, and the like. For example, the protein of the present invention may be administered in the form of an injection to an adult (body weight 60 kg) for the treatment of renal failure. ) Is conveniently administered by injecting about 0.01 to 30 mg, preferably about 0.1 to 20 mg, more preferably about 0.1 to 10 mg of the protein per day into the affected area. It is. In the case of other animals, the amount can be administered in terms of the weight per 60 kg.
[0041]
[2] Screening of drug candidate compounds for disease
The protein of the present invention is useful as a reagent for screening a compound or a salt thereof that promotes or inhibits the activity of the protein of the present invention.
The present invention relates to (1) a compound or a salt thereof which promotes or inhibits the activity of the protein of the present invention (for example, an organic anion transporting activity and the like) characterized by using the protein of the present invention (hereinafter referred to as a promoter, Abbreviated as inhibitor). More specifically, for example,
(2) (i) the organic anion transport activity of a cell capable of producing the protein of the present invention and (ii) the organic anion transport activity of a mixture of a test compound and a cell capable of producing the protein of the present invention. There is provided a method of screening for an accelerator or an inhibitor characterized by performing a comparison.
Specifically, in the above screening method, for example, in the cases of (i) and (ii), the transport activity of an organic anion is measured with a fluorescent dye, and compared as an index of the transport activity of the organic anion. Is what you do.
[0042]
Test compounds include, for example, peptides, proteins, non-peptidic compounds, synthetic compounds, fermentation products, cell extracts, plant extracts, animal tissue extracts, and the like. Or a known compound.
In order to carry out the above-mentioned screening method, cells having the ability to produce the protein of the present invention are prepared by suspending them in a buffer suitable for screening. The buffer may be any buffer such as a phosphate buffer or a borate buffer having a pH of about 4 to 10 (preferably, a pH of about 6 to 8) as long as it does not inhibit the organic anion transport activity of the protein of the present invention.
As a cell having the ability to produce the protein of the present invention, for example, a host (transformant) transformed with a vector containing the DNA encoding the protein of the present invention described above is used. As a host, for example, animal cells such as CHO cells are preferably used. For the screening, for example, a transformant in which the protein of the present invention is expressed on a cell membrane by culturing by the method described above is preferably used.
[0043]
The transport activity of the protein of the present invention for organic anions can be measured according to a known method, for example, the method described in Biochemical and Biophysical Research Communications, vol. 273, p. 251, 2000 or a method analogous thereto.
For example, a test compound which promotes the organic anion transport activity in the case (ii) above by about 20% or more, preferably 30% or more, more preferably about 50% or more as compared with the case (i) is used. It can be selected as a compound or a salt thereof that promotes the activity of the protein of the invention.
In addition, for example, the transport activity of the organic anion in the case (ii) is inhibited (or suppressed) by about 20% or more, preferably 30% or more, more preferably about 50% or more as compared with the case (i). ) Can be selected as a compound that inhibits the activity of the protein of the present invention or a salt thereof.
In addition, a gene such as secretory alkaline phosphatase or luciferase is inserted downstream of the promoter of the protein gene of the present invention, expressed in the above-described various cells, and activated to activate the enzyme activity when the test compound is brought into contact with the cells. By searching for an inhibitory compound or a salt thereof, a compound or a salt thereof that promotes or suppresses the expression of the protein of the present invention (that is, promotes or inhibits the activity of the protein of the present invention) can be screened.
[0044]
The polynucleotide encoding the protein of the present invention is useful as a reagent for screening a compound or a salt thereof that promotes or inhibits the expression of the protein gene of the present invention.
The present invention relates to (3) a compound or a salt thereof which promotes or inhibits the expression of the protein gene of the present invention, which is characterized by using a polynucleotide encoding the protein of the present invention (hereinafter referred to as a promoter and an inhibitor, respectively). May be provided), more specifically, for example,
(4) A comparison is made between (iii) culturing cells capable of producing the protein of the present invention and (iv) culturing a mixture of cells capable of producing the protein of the present invention and a test compound. A method for screening for an accelerator or an inhibitor is provided.
In the above-mentioned screening method, for example, in the cases (iii) and (iv), the expression level of the protein gene of the present invention (specifically, the amount of the protein of the present invention or the amount of mRNA encoding the protein) is measured. And compare.
Test compounds include, for example, peptides, proteins, non-peptidic compounds, synthetic compounds, fermentation products, cell extracts, plant extracts, animal tissue extracts, and the like. Or a known compound.
In order to carry out the above-mentioned screening method, cells having the ability to produce the protein of the present invention are prepared by suspending them in a buffer suitable for screening. The buffer may be any buffer such as a phosphate buffer or a borate buffer having a pH of about 4 to 10 (preferably, a pH of about 6 to 8) as long as it does not inhibit the organic anion transport activity of the protein of the present invention.
As a cell having the ability to produce the protein of the present invention, for example, a host (transformant) transformed with a vector containing the DNA encoding the protein of the present invention described above is used. As a host, for example, animal cells such as CHO cells are preferably used. For the screening, for example, a transformant in which the protein of the present invention is expressed on a cell membrane by culturing by the method described above is preferably used.
The amount of the protein of the present invention can be measured by a known method, for example, using an antibody recognizing the protein of the present invention, and analyzing the protein present in a cell extract or the like by a method such as Western analysis, ELISA, or the like. It can be measured according to the method.
The expression level of the protein gene of the present invention can be determined by a known method, for example, a method such as Northern blotting, Reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR), a real-time PCR analysis system (manufactured by ABI, TaqMan polymerase chain reaction), or the like. It can be measured according to a corresponding method.
For example, a test compound that promotes the expression of the protein gene of the present invention in the case of the above (iv) by about 20% or more, preferably 30% or more, more preferably about 50% or more as compared with the case of the above (iii). Can be selected as a compound or its salt that promotes the expression of the protein gene of the present invention.
For example, a test compound that inhibits the expression of the protein gene of the present invention in the case of the above (iv) by about 20% or more, preferably 30% or more, more preferably about 50% or more as compared with the case of the above (iii). Can be selected as a compound that inhibits the expression of the protein gene of the present invention or a salt thereof.
Furthermore, the antibody of the present invention is useful as a reagent for screening a compound or a salt thereof that promotes or inhibits the expression of the protein of the present invention.
The present invention relates to (5) a compound or a salt thereof which promotes or inhibits the expression (production) of the protein of the present invention, which is characterized by using the antibody of the present invention (hereinafter referred to as a promoter or an inhibitor, respectively). Is provided), more specifically, for example,
(6) A comparison is made between (v) culturing cells capable of producing the protein of the present invention and (vi) culturing a mixture of cells capable of producing the protein of the present invention and a test compound. A method for screening for an accelerator or an inhibitor is provided.
In the above screening method, for example, the expression level of the protein of the present invention (specifically, the protein level of the present invention) in the cases (v) and (vi) is measured using the antibody of the present invention (for example, The expression of the protein of the present invention is detected, the expression level of the protein of the present invention is quantified, and the like, and compared.
Test compounds include, for example, peptides, proteins, non-peptidic compounds, synthetic compounds, fermentation products, cell extracts, plant extracts, animal tissue extracts, and the like. Or a known compound.
In order to carry out the above-mentioned screening method, cells having the ability to produce the protein of the present invention are prepared by suspending them in a buffer suitable for screening. The buffer may be any buffer such as a phosphate buffer or a borate buffer having a pH of about 4 to 10 (preferably, a pH of about 6 to 8) as long as it does not inhibit the organic anion transport activity of the protein of the present invention.
As a cell having the ability to produce the protein of the present invention, for example, a host (transformant) transformed with a vector containing the DNA encoding the protein of the present invention described above is used. As a host, for example, animal cells such as CHO cells are preferably used. For the screening, for example, a transformant in which the protein of the present invention is expressed on a cell membrane by culturing by the method described above is preferably used.
The amount of the protein of the present invention can be measured by a known method, for example, using an antibody recognizing the protein of the present invention, and analyzing the protein present in a cell extract or the like by a method such as Western analysis, ELISA, or the like. It can be measured according to the method.
For example, a test compound that promotes the expression of the protein of the present invention in the case (vi) above by about 20% or more, preferably 30% or more, more preferably about 50% or more as compared with the case (v). It can be selected as a compound or a salt thereof that promotes the expression of the protein of the present invention.
For example, a test compound that inhibits the expression of the protein of the present invention in the case of the above (vi) by about 20% or more, preferably 30% or more, more preferably about 50% or more as compared with the case of the above (v) It can be selected as a compound that inhibits the expression of the protein of the present invention or a salt thereof.
[0045]
The screening kit of the present invention contains the protein or partial peptide of the present invention or a salt thereof, or a cell capable of producing the protein or partial peptide of the present invention.
Compounds or salts thereof obtained by using the screening method or the screening kit of the present invention are test compounds described above, for example, peptides, proteins, non-peptide compounds, synthetic compounds, fermentation products, cell extracts, plant extracts. A compound selected from animal tissue extract, plasma, and the like, or a salt thereof that promotes or inhibits the activity of the protein of the present invention (eg, organic anion transport activity).
As the salt of the compound, those similar to the aforementioned salts of the protein of the present invention are used.
Compounds or salts thereof that promote the activity of the protein of the present invention include, for example, renal diseases (eg, renal failure, glomerulonephritis, diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, interstitium) Hepatic disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.), pancreatic disease (eg, pancreatitis, etc.), immune disease associated with thymic abnormalities, genital disease (eg, prostate gland) Hypertrophy, prostatitis, testicular neurosis, ovarian cysts, etc.), digestive disorders (eg, irritable bowel syndrome, ulcerative colitis, ischemic colitis, gastritis, etc.), spleen disorders (eg, hypersplenism) , Splenomatous syndrome, etc.), cancer (eg, lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, gastric cancer, bladder cancer, breast cancer, cervical cancer, colon cancer, rectum cancer, pancreatic cancer , Thyroid cancer, myeloid leukemia, etc.), respiratory diseases (eg, pleurisy, pneumonia, Obstructive pulmonary disease, asthma, etc.), osteomyelitis, diabetes, hypertension, post-ischemic reperfusion injury, retinitis, central nervous system diseases (eg, epilepsy, Alzheimer's disease, Parkinson's syndrome, schizophrenia, etc.), skin diseases ( For example, useful as prophylactic / therapeutic agents such as atopic dermatitis, seborrheic dermatitis, etc., thyroid hormone-related diseases (eg, thyroid hormone refractory disease, Basedow's disease, cretinism, hyperthyroidism, etc.) It is. It is preferably used as a prophylactic / therapeutic agent for renal diseases and thyroid hormone-related diseases, and more preferably as a prophylactic / therapeutic agent for diabetic nephropathy.
Further, the compound or a salt thereof that inhibits the activity of the protein of the present invention includes, for example, renal diseases (eg, renal failure, glomerulonephritis, diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, Interstitial nephritis, renal sclerosis, uremic disease, etc.), liver disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.), pancreatic disease (eg, pancreatitis, etc.), immune disease associated with thymic abnormalities, genital disease (eg, , Prostatic hyperplasia, prostatitis, testicular neurosis, ovarian cysts), gastrointestinal disorders (eg, irritable bowel syndrome, ulcerative colitis, ischemic colitis, gastritis, etc.), spleen disorders (eg, spleen function) Hypertension, splenomegaly syndrome, etc.), cancer (eg, lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, gastric cancer, bladder cancer, breast cancer, cervical cancer, colon cancer, rectal cancer, Pancreatic cancer, thyroid cancer, myeloid leukemia, etc.), respiratory diseases (eg, pleurisy, Inflammation, chronic obstructive pulmonary disease, asthma, etc.), osteomyelitis, diabetes, hypertension, post-ischemic reperfusion injury, retinitis, central nervous system diseases (eg, epilepsy, Alzheimer's disease, Parkinson's syndrome, schizophrenia, etc.), skin Preventive / therapeutic agents for diseases (eg, atopic dermatitis, seborrheic dermatitis, etc.), thyroid hormone-related diseases (eg, thyroid hormone refractory disease, Basedow's disease, cretinism, hyperthyroidism, etc.) Useful as a medicine. It is preferably used as a prophylactic / therapeutic agent for renal diseases and thyroid hormone-related diseases, and more preferably as a prophylactic / therapeutic agent for diabetic nephropathy.
Compounds or salts thereof that promote the expression of the protein gene of the present invention include, for example, renal diseases (eg, renal failure, glomerulonephritis, diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, Hepatic disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.), pancreatic disease (eg, pancreatitis, etc.), immune diseases associated with thymic abnormalities, genital diseases (eg, Prostatic hyperplasia, prostatitis, testicular neurosis, ovarian cysts, etc., gastrointestinal disorders (eg, irritable bowel syndrome, ulcerative colitis, ischemic colitis, gastritis, etc.), spleen disorders (eg, hypersplenism) Disease, splenomegaly syndrome, etc.), cancer (eg, lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, gastric cancer, bladder cancer, breast cancer, cervical cancer, colon cancer, rectal cancer, pancreas) Cancer, thyroid cancer, myeloid leukemia, etc.), respiratory diseases (eg, pleurisy, Inflammation, chronic obstructive pulmonary disease, asthma, etc.), osteomyelitis, diabetes, hypertension, post-ischemic reperfusion injury, retinitis, central nervous system diseases (eg, epilepsy, Alzheimer's disease, Parkinson's syndrome, schizophrenia, etc.), skin Preventive / therapeutic agents for diseases (eg, atopic dermatitis, seborrheic dermatitis, etc.), thyroid hormone-related diseases (eg, thyroid hormone refractory disease, Basedow's disease, cretinism, hyperthyroidism, etc.) Useful as a medicine. It is preferably used as a prophylactic / therapeutic agent for renal diseases and thyroid hormone-related diseases, and more preferably as a prophylactic / therapeutic agent for diabetic nephropathy.
Further, the compound of the present invention that inhibits the expression of the protein gene or a salt thereof includes, for example, renal diseases (eg, renal failure, glomerulonephritis, diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema) , Interstitial nephritis, renal sclerosis, uremic disease, etc.), liver disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.), pancreatic disease (eg, pancreatitis, etc.), immune diseases associated with thymic abnormalities, genital diseases ( Eg, benign prostatic hyperplasia, prostatitis, testicular neurosis, ovarian cysts), gastrointestinal disorders (eg, irritable bowel syndrome, ulcerative colitis, ischemic colitis, gastritis, etc.), spleen disorders (eg, spleen) Hyperfunction, splenomegaly syndrome, etc.), cancer (eg, lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, gastric cancer, bladder cancer, breast cancer, cervical cancer, colon cancer, rectal cancer) , Pancreatic cancer, thyroid cancer, myeloid leukemia, etc.), respiratory diseases (eg, breast Inflammation, pneumonia, chronic obstructive pulmonary disease, asthma), osteomyelitis, diabetes, hypertension, post-ischemic reperfusion injury, retinitis, central nervous system diseases (eg, epilepsy, Alzheimer's disease, Parkinson's syndrome, schizophrenia, etc.) , Skin diseases (eg, atopic dermatitis, seborrheic dermatitis, etc.), thyroid hormone-related diseases (eg, thyroid hormone refractory disease, Basedow's disease, cretinism, hyperthyroidism, etc.), etc. It is useful as a medicament. It is preferably used as a prophylactic / therapeutic agent for renal diseases and thyroid hormone-related diseases, and more preferably as a prophylactic / therapeutic agent for diabetic nephropathy.
Compounds or salts thereof that promote the expression of the protein of the present invention include, for example, renal diseases (eg, renal failure, glomerulonephritis, diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, interstitial) Hepatic disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.), pancreatic disease (eg, pancreatitis, etc.), immune disease associated with thymic abnormalities, genital disease (eg, prostate gland) Hypertrophy, prostatitis, testicular neurosis, ovarian cysts, etc.), digestive disorders (eg, irritable bowel syndrome, ulcerative colitis, ischemic colitis, gastritis, etc.), spleen disorders (eg, hypersplenism) , Splenomatous syndrome, etc.), cancer (eg, lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, gastric cancer, bladder cancer, breast cancer, cervical cancer, colon cancer, rectum cancer, pancreatic cancer , Thyroid cancer, myeloid leukemia, etc.), respiratory diseases (eg, pleurisy, pneumonia, Obstructive pulmonary disease, asthma, etc.), osteomyelitis, diabetes, hypertension, post-ischemic reperfusion injury, retinitis, central nervous system diseases (eg, epilepsy, Alzheimer's disease, Parkinson's syndrome, schizophrenia, etc.), skin diseases ( For example, drugs for the prevention and treatment of thyroid hormone-related diseases (eg, thyroid hormone refractory disease, Basedow's disease, cretin disease, hyperthyroidism, etc.), atopic dermatitis, seborrheic dermatitis, etc. Useful. It is preferably used as a prophylactic / therapeutic agent for renal diseases and thyroid hormone-related diseases, and more preferably as a prophylactic / therapeutic agent for diabetic nephropathy.
Further, the compound or a salt thereof that inhibits the expression of the protein of the present invention includes, for example, renal diseases (eg, renal failure, glomerulonephritis, diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, Interstitial nephritis, renal sclerosis, uremic disease, etc.), liver disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.), pancreatic disease (eg, pancreatitis, etc.), immune disease associated with thymic abnormalities, genital disease (eg, , Prostatic hyperplasia, prostatitis, testicular neurosis, ovarian cysts), gastrointestinal disorders (eg, irritable bowel syndrome, ulcerative colitis, ischemic colitis, gastritis, etc.), spleen disorders (eg, spleen function) Hypertension, splenomegaly syndrome, etc.), cancer (eg, lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, gastric cancer, bladder cancer, breast cancer, cervical cancer, colon cancer, rectal cancer, Pancreatic cancer, thyroid cancer, myeloid leukemia, etc.), respiratory diseases (eg, pleurisy, Inflammation, chronic obstructive pulmonary disease, asthma, etc.), osteomyelitis, diabetes, hypertension, post-ischemic reperfusion injury, retinitis, central nervous system diseases (eg, epilepsy, Alzheimer's disease, Parkinson's syndrome, schizophrenia, etc.), skin Medications for the prevention and treatment of diseases (eg, atopic dermatitis, seborrheic dermatitis, etc.), thyroid hormone-related diseases (eg, thyroid hormone refractory disease, Basedow's disease, cretinism, hyperthyroidism, etc.) Useful as It is preferably used as a prophylactic / therapeutic agent for renal diseases and thyroid hormone-related diseases, and more preferably as a prophylactic / therapeutic agent for diabetic nephropathy.
Compounds or salts thereof obtained using the screening method or screening kit of the present invention include compounds or salts thereof that promote the activity of the protein of the present invention, compounds or salts thereof that promote the expression of the protein gene of the present invention, Compounds or salts thereof that promote the expression of the protein of the present invention are preferred.
[0046]
When the compound or a salt thereof obtained by using the screening method or the screening kit of the present invention is used as the above-mentioned prophylactic / therapeutic agent, it can be formulated according to a conventional method. For example, tablets, capsules, elixirs, microcapsules, sterile solutions, suspensions and the like can be used.
The preparations obtained in this way are safe and low toxic, for example, human or warm-blooded animals (eg, mouse, rat, rabbit, sheep, pig, cow, horse, bird, cat, dog, monkey, chimpanzee, etc.) ) Can be administered orally or parenterally.
The dose of the compound or a salt thereof varies depending on its action, target disease, administration subject, administration route and the like.For example, a compound or a salt thereof that promotes the activity of the protein of the present invention for the purpose of treating renal failure is used. When administered orally, in general, for an adult (with a body weight of 60 kg), the compound or a salt thereof is used in an amount of about 0.1 to 100 mg, preferably about 1.0 to 50 mg, more preferably about 1.0 to 50 mg per day. Administer 20 mg. When administered parenterally, the single dose of the compound or a salt thereof varies depending on the administration subject, target disease, and the like. For example, a compound or a compound that promotes the activity of the protein of the present invention for the purpose of treating renal failure When the salt is administered to an adult (with a body weight of 60 kg) usually in the form of an injection, the compound or a salt thereof is used in an amount of about 0.01 to 30 mg, preferably about 0.1 to 20 mg, more preferably about 0.1 to 20 mg per day. Advantageously, 1 to 10 mg is administered by intravenous injection. In the case of other animals, the amount can be administered in terms of the weight per 60 kg.
[0047]
[3] Quantification of the protein of the present invention, its partial peptide or its salt
Since the antibody of the present invention can specifically recognize the protein of the present invention, it can be used for quantification of the protein of the present invention in a test solution, particularly for quantification by sandwich immunoassay.
That is, the present invention
(I) reacting the antibody of the present invention with a test solution and a labeled protein of the present invention competitively, and measuring the ratio of the labeled protein of the present invention bound to the antibody; A method for quantifying the protein of the present invention in a test solution, and
(Ii) After reacting a test solution with the antibody of the present invention immobilized on a carrier and another labeled antibody of the present invention simultaneously or continuously, the activity of the labeling agent on the insolubilized carrier is measured. A method for quantifying the protein of the present invention in a test solution is provided.
In the quantitative method (ii), it is desirable that one antibody is an antibody that recognizes the N-terminal of the protein of the present invention and the other antibody is an antibody that reacts with the C-terminal of the protein of the present invention.
[0048]
In addition, the protein of the present invention can be quantified using a monoclonal antibody against the protein of the present invention (hereinafter sometimes referred to as the monoclonal antibody of the present invention), and can also be detected by tissue staining or the like. For these purposes, the antibody molecule itself may be used, and the F (ab ') 2 , Fab ′ or Fab fraction may be used.
The method for quantifying the protein of the present invention using the antibody of the present invention is not particularly limited, and the antibody, antigen, or antibody-antigen complex corresponding to the amount of the antigen (eg, the amount of the protein) in the test solution is measured. Any measurement method may be used as long as the amount is detected by chemical or physical means, and the amount is calculated from a standard curve prepared using a standard solution containing a known amount of antigen. For example, nephelometry, competition method, immunometric method and sandwich method are suitably used, but it is particularly preferable to use the sandwich method described later in terms of sensitivity and specificity.
As a labeling agent used in a measurement method using a labeling substance, for example, a radioisotope (eg, [ 125 I], [ 131 I], [ 3 H], [ 14 C], [ 32 P], [ 33 P], [ 35 S], etc.), fluorescent substances [eg, cyanine fluorescent dyes (eg, Cy2, Cy3, Cy5, Cy5.5, Cy7 (manufactured by Amersham Bioscience)), fluorescamine, fluorescein isothiocyanate, etc.], enzymes ( Examples include β-galactosidase, β-glucosidase, alkaline phosphatase, peroxidase, malate dehydrogenase, etc., luminescent substances (eg, luminol, luminol derivatives, luciferin, lucigenin, etc.), biotin, lanthanide elements and the like. Further, a biotin-avidin system can be used for binding the antibody or antigen to the labeling agent.
[0049]
For the insolubilization of an antigen or an antibody, physical adsorption may be used, or a method using a chemical bond usually used for insolubilizing and immobilizing a protein or an enzyme may be used. Examples of the carrier include insoluble polysaccharides such as agarose, dextran, and cellulose; synthetic resins such as polystyrene, polyacrylamide, and silicon; and glass.
In the sandwich method, the test solution is reacted with the insolubilized monoclonal antibody of the present invention (primary reaction), and further reacted with another labeled monoclonal antibody of the present invention (secondary reaction). By measuring the activity of the labeling agent, the amount of the protein of the present invention in the test solution can be determined. The primary reaction and the secondary reaction may be performed in the reverse order, may be performed simultaneously, or may be performed at staggered times. The labeling agent and the method of insolubilization can be in accordance with those described above. In addition, in the immunoassay by the sandwich method, the antibody used for the solid phase antibody or the labeling antibody is not necessarily one kind, and a mixture of two or more kinds of antibodies is used for the purpose of improving measurement sensitivity and the like. You may.
In the method for measuring the protein of the present invention by the sandwich method of the present invention, as the monoclonal antibody of the present invention used in the primary reaction and the secondary reaction, an antibody having a different site to which the protein of the present invention binds is preferably used. That is, the antibody used in the primary reaction and the secondary reaction is preferably, for example, when the antibody used in the secondary reaction recognizes the C-terminal of the protein of the present invention, the antibody used in the primary reaction is preferably An antibody that recognizes, for example, the N-terminal other than the C-terminal is used.
[0050]
The monoclonal antibody of the present invention can be used in a measurement system other than the sandwich method, for example, a competition method, an immunometric method, a nephrometry, or the like.
In the competition method, after the antigen in the test solution and the labeled antigen are allowed to react competitively with the antibody, the unreacted labeled antigen (F) and the labeled antigen (B) bound to the antibody are separated. (B / F separation), the amount of any of B and F is measured, and the amount of antigen in the test solution is quantified. In this reaction method, a soluble antibody is used as the antibody, B / F separation is performed using polyethylene glycol, a liquid phase method using a second antibody against the antibody, or a solid phase antibody is used as the first antibody. A solid-phase method using a soluble antibody as the first antibody and using a solid-phased antibody as the second antibody is used.
In the immunometric method, the antigen in the test solution and the immobilized antigen are subjected to a competitive reaction with a fixed amount of the labeled antibody, and then the solid phase and the liquid phase are separated. And an excess amount of the labeled antibody, and then immobilized antigen is added to bind unreacted labeled antibody to the solid phase, and then the solid phase and the liquid phase are separated. Next, the amount of label in any phase is measured to determine the amount of antigen in the test solution.
In nephelometry, the amount of insoluble sediment produced as a result of an antigen-antibody reaction in a gel or in a solution is measured. Even when the amount of antigen in the test solution is small and only a small amount of sediment is obtained, laser nephrometry utilizing laser scattering is preferably used.
[0051]
In applying these individual immunological measurement methods to the quantification method of the present invention, no special conditions, operations, and the like need to be set. The protein measurement system of the present invention may be constructed by adding ordinary technical considerations of those skilled in the art to ordinary conditions and operation methods in each method. For details of these general technical means, reference can be made to reviews, books, and the like.
For example, Hiroe Irie, "Radio Immunoassay" (Kodansha, published in 1974), Hiroshi Irie, "Sequence Radioimmunoassay" (Kodansha, published in 1974), Eiji Ishikawa et al., "Enzyme Immunoassay" (Medical Shoin, Showa Ed. Ishikawa et al., "Enzyme Immunoassay" (2nd edition) (Issue Shoin, published in 1982), Eiji Ishikawa et al., "Enzyme Immunoassay" (3rd edition) (Medical Shoin, Showa) 62)), "Methods in ENZYMOLOGY" Vol. 70 (Immunochemical Techniques (Part A)), ibid., Vol. 73 (Immunochemical Technologies (Part B)), ibid., Vol. 74 (Immunochemical Technologies (Part C)), ibid., Vol. 84 (Immunochemical Technologies (Part D: Selected Immunoassays)), ibid., Vol. 92 (Immunochemical Techniques (Part E: Monoclonal Antibodies and General Immunoassay Methods)), ibid., Vol. 121 (Immunochemical Technologies (Part I: Hybridoma Technology and Monoclonal Antibodies)) (all published by Academic Press) can be referred to.
As described above, the protein of the present invention can be quantified with high sensitivity by using the antibody of the present invention.
Furthermore, when a decrease in the concentration of the protein of the present invention is detected by quantifying the concentration of the protein of the present invention using the antibody of the present invention, for example, a renal disease (eg, renal failure, glomerulonephritis, Diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, interstitial nephritis, nephrosclerosis, uremia, etc., liver disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.), pancreas Diseases (eg, pancreatitis), immune disorders associated with thymic abnormalities, genital diseases (eg, prostatic hypertrophy, prostatitis, testicular neurosis, ovarian cysts), gastrointestinal disorders (eg, irritable bowel syndrome, ulcerative) Colitis, ischemic colitis, gastritis, etc., spleen disease (eg, hypersplenism, splenomegaly syndrome, etc.), cancer (eg, lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer) , Gastric cancer, bladder cancer, breast cancer, cervical cancer, colon cancer, rectal cancer Pancreatic cancer, thyroid cancer, myeloid leukemia, etc.), respiratory diseases (eg, pleurisy, pneumonia, chronic obstructive pulmonary disease, asthma, etc.), osteomyelitis, diabetes, hypertension, post-ischemic reperfusion injury, retinitis, central Neurological diseases (eg, epilepsy, Alzheimer's disease, Parkinson's syndrome, schizophrenia, etc.), skin diseases (eg, atopic dermatitis, seborrheic dermatitis, etc.), thyroid hormone-related diseases (eg, thyroid hormone refractory disease, Basedow) Disease, cretinism, hyperthyroidism, etc.) can be diagnosed as having a high possibility. Conversely, for example, when an increase in the concentration of the protein of the present invention is detected, for example, renal diseases (eg, renal failure, glomerulonephritis, diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, nephrotic syndrome) Edema, interstitial nephritis, renal sclerosis, uremia, etc.), liver disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.), pancreatic disease (eg, pancreatitis, etc.), immune disease associated with thymic abnormalities, genital disease (Eg, benign prostatic hyperplasia, prostatitis, testicular neurosis, ovarian cysts), gastrointestinal disorders (eg, irritable bowel syndrome, ulcerative colitis, ischemic colitis, gastritis, etc.), spleen disorders (eg, Hypersplenism, splenomegaly syndrome, etc.), cancer (eg, lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, gastric cancer, bladder cancer, breast cancer, cervical cancer, colon cancer, rectum Cancer, pancreatic cancer, thyroid cancer, myeloid leukemia, etc., respiratory diseases (eg, pleurisy) Pneumonia, chronic obstructive pulmonary disease, asthma), osteomyelitis, diabetes, hypertension, post-ischemic reperfusion injury, retinitis, central nervous system diseases (eg, epilepsy, Alzheimer's disease, Parkinson's syndrome, schizophrenia, etc.), skin Diseases (eg, atopic dermatitis, seborrheic dermatitis, etc.) and thyroid hormone-related diseases (eg, thyroid hormone refractory disease, Graves' disease, cretinism, hyperthyroidism, etc.) It can be diagnosed as high.
Further, the antibody of the present invention can be used for detecting the protein of the present invention present in a subject such as a body fluid or a tissue. Further, for preparation of an antibody column used for purifying the protein of the present invention, detection of the protein of the present invention in each fraction at the time of purification, analysis of the behavior of the protein of the present invention in test cells, etc. Can be used.
[0052]
[4] Gene diagnostics
The DNA of the present invention can be used, for example, as a probe to produce a human or warm-blooded animal (eg, rat, mouse, guinea pig, rabbit, bird, sheep, pig, cow, horse, cat, dog, monkey, chimpanzee, etc.). Can detect an abnormality (genetic abnormality) in DNA or mRNA encoding the protein of the present invention or a partial peptide thereof in, for example, damage, mutation or decrease in expression of the DNA or mRNA, or decrease in the DNA or mRNA. It is useful as a diagnostic agent for a gene such as increase or overexpression.
The above-described genetic diagnosis using the DNA of the present invention can be performed, for example, by the known Northern hybridization or PCR-SSCP method (Genomics, Vol. 5, pp. 874-879 (1989), Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States). of America, Vol. 86, pp. 2766-2770 (1989)) and the like.
For example, when increased expression is detected by Northern hybridization, for example, renal diseases (eg, renal failure, glomerulonephritis, diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, interstitial nephritis) , Renal sclerosis, uremic disease, etc.), liver disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.), pancreatic disease (eg, pancreatitis, etc.), immune disease associated with thymic abnormalities, genital disease (eg, prostatic hypertrophy) , Prostatitis, testicular neurosis, ovarian cysts, etc.), digestive disorders (eg, irritable bowel syndrome, ulcerative colitis, ischemic colitis, gastritis, etc.), spleen disorders (eg, hypersplenism, splenomegaly) Sexual syndrome, etc.), cancer (eg, lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, gastric cancer, bladder cancer, breast cancer, cervical cancer, colon cancer, rectal cancer, pancreatic cancer, thyroid gland Cancer, myeloid leukemia, etc.), respiratory diseases (eg, breast Inflammation, pneumonia, chronic obstructive pulmonary disease, asthma), osteomyelitis, diabetes, hypertension, post-ischemic reperfusion injury, retinitis, central nervous system diseases (eg, epilepsy, Alzheimer's disease, Parkinson's syndrome, schizophrenia, etc.) , Skin diseases (eg, atopic dermatitis, seborrheic dermatitis, etc.), thyroid hormone-related diseases (eg, thyroid hormone refractory disease, Basedow's disease, cretinism, hyperthyroidism, etc.) Can be diagnosed. Conversely, when a decrease in expression is detected or a DNA mutation is detected by the PCR-SSCP method, for example, renal diseases (eg, renal failure, glomerulonephritis, diabetic nephropathy, focal glomeruli) Sclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, interstitial nephritis, renal sclerosis, uremic disease, etc., liver disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.), pancreatic disease (eg, pancreatitis, etc.), thymus Immune diseases associated with abnormalities, genital diseases (eg, prostatic hypertrophy, prostatitis, testicular neurosis, ovarian cysts, etc.), gastrointestinal diseases (eg, irritable bowel syndrome, ulcerative colitis, ischemic colitis, gastritis) Etc.), spleen disease (eg, hypersplenia, splenomegaly syndrome, etc.), cancer (eg, lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, gastric cancer, bladder cancer, breast cancer, uterus Cervical, colon, rectal, pancreatic, thyroid, myeloid leukemia Etc.), respiratory diseases (eg, pleurisy, pneumonia, chronic obstructive pulmonary disease, asthma, etc.), osteomyelitis, diabetes, hypertension, post-ischemic reperfusion injury, retinitis, central nervous system diseases (eg, epilepsy, Alzheimer's disease) , Parkinson's syndrome, schizophrenia, etc.), skin diseases (eg, atopic dermatitis, seborrheic dermatitis, etc.), thyroid hormone-related diseases (eg, thyroid hormone refractory disease, Graves' disease, cretin disease, hyperthyroidism) Etc.) can be diagnosed as having a high possibility.
[0053]
[5] Pharmaceutical and diagnostic agents containing antisense polynucleotide
The antisense polynucleotide of the present invention capable of binding complementarily to the DNA of the present invention and suppressing the expression of the DNA has low toxicity, and the function of the protein of the present invention or the function of the DNA of the present invention in vivo (eg, For example, renal disease (eg, renal failure, glomerulonephritis, diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, interstitial) Hepatic disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.), pancreatic disease (eg, pancreatitis, etc.), immune disease associated with thymic abnormalities, genital disease (eg, prostate gland) Hypertrophy, prostatitis, testicular neurosis, ovarian cysts, etc.), digestive disorders (eg, irritable bowel syndrome, ulcerative colitis, ischemic colitis, gastritis, etc.), spleen disorders (eg, hypersplenism) , Splenomegaly syndrome) Cancer (eg, lung, kidney, liver, non-small cell lung, ovarian, prostate, gastric, bladder, breast, cervical, colon, rectal, pancreatic, thyroid, myeloid leukemia ), Respiratory diseases (eg, pleurisy, pneumonia, chronic obstructive pulmonary disease, asthma, etc.), osteomyelitis, diabetes, hypertension, reperfusion injury after ischemia, retinitis, central nervous system diseases (eg, epilepsy, Alzheimer's disease) , Parkinson's syndrome, schizophrenia, etc.), skin diseases (eg, atopic dermatitis, seborrheic dermatitis, etc.), thyroid hormone-related diseases (eg, thyroid hormone refractory disease, Graves' disease, cretin disease, hyperthyroidism) ) Can be used as a prophylactic / therapeutic agent. It is preferably used as a prophylactic / therapeutic agent for renal diseases and thyroid hormone-related diseases, and more preferably as a prophylactic / therapeutic agent for diabetic nephropathy. Further, the antisense polynucleotide of the present invention is also used for diagnosis of the above-mentioned diseases.
When the above-mentioned antisense polynucleotide is used as the above-mentioned prophylactic / therapeutic agent, it can be formulated and administered according to a known method.
For example, when the antisense polynucleotide is used, the antisense polynucleotide is inserted alone or into a suitable vector such as a retrovirus vector, an adenovirus vector, an adenovirus associated virus vector, or the like, and then inserted into a human or mammal according to a conventional method. It can be administered orally or parenterally to animals (eg, rats, rabbits, sheep, pigs, cows, cats, dogs, monkeys, etc.). The antisense polynucleotide can be administered as it is or in the form of a formulation together with a physiologically acceptable carrier such as an auxiliary agent for promoting uptake, and can be administered using a gene gun or a catheter such as a hydrogel catheter.
The dose of the antisense polynucleotide varies depending on the target disease, the administration subject, the administration route, and the like.For example, when the antisense polynucleotide of the present invention is locally administered to the kidney for the purpose of treating renal failure, it is generally used. For an adult (body weight 60 kg), about 0.1 to 100 mg of the antisense polynucleotide is administered per day. Furthermore, the antisense polynucleotide can also be used as a diagnostic oligonucleotide probe for examining the presence or expression of the DNA of the present invention in tissues or cells.
[0054]
Further, the present invention provides
(I) a double-stranded RNA containing a part of RNA encoding the protein of the present invention and RNA complementary thereto,
(Ii) a medicine comprising the double-stranded RNA,
(Iii) a ribozyme containing a part of RNA encoding the protein of the present invention,
(Iv) a medicine comprising the ribozyme,
(V) Also provided is an expression vector containing the gene (DNA) encoding the ribozyme.
Like the above-mentioned antisense polynucleotide, double-stranded RNA, ribozyme and the like can also destroy RNA transcribed from the DNA of the present invention or suppress the function thereof, and can be used in vivo for the protein of the present invention or the present invention. Since the function of DNA used can be suppressed, for example, renal diseases (eg, renal failure, glomerulonephritis, diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, interstitial nephritis) , Renal sclerosis, uremic disease, etc.), liver disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.), pancreatic disease (eg, pancreatitis, etc.), immune disease associated with thymic abnormalities, genital disease (eg, prostatic hypertrophy) , Prostatitis, testicular neurosis, ovarian cysts, etc.), digestive disorders (eg, irritable bowel syndrome, ulcerative colitis, ischemic colitis, gastritis, etc.), spleen disorders (eg, hypersplenism, splenomegaly) Sexual disorder Group, etc.), cancer (eg, lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, gastric cancer, bladder cancer, breast cancer, cervical cancer, colon cancer, rectal cancer, pancreatic cancer, thyroid cancer , Myeloid leukemia), respiratory disease (eg, pleurisy, pneumonia, chronic obstructive pulmonary disease, asthma, etc.), osteomyelitis, diabetes, hypertension, post-ischemic reperfusion injury, retinitis, central nervous system disease (eg, Epilepsy, Alzheimer's disease, Parkinson's syndrome, schizophrenia, etc.), skin diseases (eg, atopic dermatitis, seborrheic dermatitis), thyroid hormone-related diseases (eg, thyroid hormone refractory disease, Graves' disease, Cretin disease, For example, hyperthyroidism, etc.). It is preferably used as a prophylactic / therapeutic agent for renal diseases and thyroid hormone-related diseases, and more preferably as a prophylactic / therapeutic agent for diabetic nephropathy.
The double-stranded RNA can be produced by designing based on the sequence of the polynucleotide of the present invention according to a known method (eg, Nature, 411, 494, 2001).
A ribozyme can be designed and produced based on the sequence of the polynucleotide of the present invention according to a known method (eg, TRENDS in Molecular Medicine, Vol. 7, pp. 221, 2001). For example, it can be produced by substituting a part of a known ribozyme sequence with a part of RNA encoding the protein of the present invention. As a part of the RNA encoding the protein of the present invention, a sequence in the vicinity of a consensus sequence NUX (where N represents all bases and X represents a base other than G) which can be cleaved by a known ribozyme, and the like are included. No.
When the above-mentioned double-stranded RNA or ribozyme is used as the above-mentioned prophylactic / therapeutic agent, it can be formulated and administered in the same manner as an antisense polynucleotide. The expression vector (v) is used in the same manner as known gene therapy methods and used as the above-mentioned prophylactic / therapeutic agent.
[0055]
[6] A drug containing the antibody of the present invention
The antibody of the present invention, which has the activity of neutralizing the activity of the protein of the present invention, can be used, for example, in renal diseases (eg, renal failure, glomerulonephritis, diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal Edema, interstitial nephritis, renal sclerosis, uremia, etc.), liver disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.), pancreatic disease (eg, pancreatitis, etc.), immune disease associated with thymic abnormalities, genital disease (Eg, benign prostatic hyperplasia, prostatitis, testicular neurosis, ovarian cysts), gastrointestinal disorders (eg, irritable bowel syndrome, ulcerative colitis, ischemic colitis, gastritis, etc.), spleen disorders (eg, Hypersplenism, splenomegaly syndrome, etc.), cancer (eg, lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, gastric cancer, bladder cancer, breast cancer, cervical cancer, colon cancer, rectum Cancer, pancreatic cancer, thyroid cancer, myeloid leukemia, etc.), respiratory diseases (eg, pleurisy, Inflammation, chronic obstructive pulmonary disease, asthma, etc.), osteomyelitis, diabetes, hypertension, post-ischemic reperfusion injury, retinitis, central nervous system diseases (eg, epilepsy, Alzheimer's disease, Parkinson's syndrome, schizophrenia, etc.), skin Used as a preventive / therapeutic agent for diseases (eg, atopic dermatitis, seborrheic dermatitis, etc.) and thyroid hormone-related diseases (eg, thyroid hormone refractory disease, Basedow's disease, cretinism, hyperthyroidism, etc.) can do. It is preferably used as a prophylactic / therapeutic agent for renal diseases and thyroid hormone-related diseases, and more preferably as a prophylactic / therapeutic agent for diabetic nephropathy.
The prophylactic / therapeutic agent for the above-mentioned diseases containing the antibody of the present invention has low toxicity and is used as it is as a liquid or as a pharmaceutical composition of an appropriate dosage form, in humans or mammals (eg, rat, rabbit, sheep, pig, It can be administered orally or parenterally (eg, intra-articular administration) to cattle, cats, dogs, monkeys, and the like. The dose varies depending on the administration subject, target disease, symptoms, administration route, and the like.For example, when used for the treatment or prevention of diabetic nephropathy, the antibody of the present invention is usually used as a single dose. About 0.01 to 20 mg / kg body weight, preferably about 0.1 to 10 mg / kg body weight, more preferably about 0.1 to 5 mg / kg body weight, about 1 to 5 times a day, preferably 1 to 5 times a day It is convenient to administer intravenously about three times. In the case of other parenteral administration and oral administration, an equivalent amount can be administered. If the symptoms are particularly severe, the dose may be increased according to the symptoms.
The antibodies of the present invention can be administered as such or as a suitable pharmaceutical composition. The pharmaceutical composition used for the administration contains the antibody or a salt thereof and a pharmacologically acceptable carrier, diluent or excipient. Such compositions are provided in dosage forms suitable for oral or parenteral administration (eg, intravenous, intra-articular administration). It is preferably provided as an inhalant.
Each of the above-mentioned compositions may contain another active ingredient as long as the composition does not cause an undesirable interaction with the antibody.
[0056]
[7] Creation of an animal having the DNA of the present invention
The present invention relates to a non-protein having a DNA encoding an exogenous protein of the present invention (hereinafter abbreviated as the exogenous DNA of the present invention) or a mutant DNA thereof (sometimes abbreviated as the exogenous mutant DNA of the present invention). A human mammal is provided.
That is, the present invention
(1) a non-human mammal having the exogenous DNA of the present invention or a mutant DNA thereof,
(2) The animal according to (1) above, wherein the non-human mammal is a rodent.
(3) The animal according to (2), wherein the rodent is a mouse or a rat, and
(4) A recombinant vector or the like containing the exogenous DNA of the present invention or its mutant DNA and capable of being expressed in mammals is provided.
Non-human mammals having the exogenous DNA of the present invention or the mutant DNA thereof (hereinafter abbreviated as the DNA-transferred animal of the present invention) can be used for non-fertilized eggs, fertilized eggs, germ cells including spermatozoa and their progenitor cells, and the like. And preferably at the stage of embryonic development in non-human mammal development (more preferably at the stage of single cells or fertilized eggs and generally before the 8-cell stage), the calcium phosphate method, the electric pulse method, the lipofection method, the agglutination method, It can be produced by introducing a target DNA by a microinjection method, a particle gun method, a DEAE-dextran method, or the like. Further, by the DNA introduction method, the exogenous DNA of the present invention can be introduced into somatic cells, organs of living organisms, tissue cells, and the like, and used for cell culture, tissue culture, and the like. The DNA-transfected animal of the present invention can also be produced by fusing the above-mentioned germ cells with a known cell fusion method.
As the non-human mammal, for example, cow, pig, sheep, goat, rabbit, dog, cat, guinea pig, hamster, mouse, rat and the like are used. Among them, rodents, which are relatively short in ontogeny and biological cycle in terms of preparation of disease animal model systems, and are easy to breed, especially mice (for example, hybrids such as C57BL / 6 strain and DBA2 strain as pure strains) B6C3F as a system 1 System, BDF 1 System, B6D2F 1 Strain, BALB / c strain, ICR strain, etc.) or rat (eg, Wistar, SD etc.) is preferred.
"Mammals" in a recombinant vector that can be expressed in mammals include humans in addition to the above-mentioned non-human mammals.
[0057]
The exogenous DNA of the present invention refers to the DNA of the present invention once isolated and extracted from a mammal, not the DNA of the present invention originally possessed by a non-human mammal.
As the mutant DNA of the present invention, those having a mutation (for example, mutation) in the base sequence of the original DNA of the present invention, specifically, base addition, deletion, substitution with another base, etc. The resulting DNA or the like is used, and also includes abnormal DNA.
The abnormal DNA means a DNA that expresses an abnormal protein of the present invention, and for example, a DNA that expresses a protein that suppresses the function of the normal protein of the present invention is used.
The exogenous DNA of the present invention may be derived from a mammal that is the same or different from the animal of interest. When introducing the DNA of the present invention into a target animal, it is generally advantageous to use the DNA as a DNA construct linked downstream of a promoter capable of being expressed in animal cells. For example, when the human DNA of the present invention is introduced, DNAs derived from various mammals (eg, rabbits, dogs, cats, guinea pigs, hamsters, rats, mice, etc.) having the DNA of the present invention having high homology thereto are expressed. Highly expressing the DNA of the present invention by microinjecting a DNA construct (eg, vector, etc.) in which the human DNA of the present invention is bound downstream of various promoters that can be made into a fertilized egg of a target mammal, for example, a mouse fertilized egg. DNA-introduced mammals can be created.
[0058]
Examples of the expression vector of the protein of the present invention include plasmids derived from Escherichia coli, plasmids derived from Bacillus subtilis, plasmids derived from yeast, bacteriophages such as λ phage, retroviruses such as Moloney leukemia virus, animal viruses such as vaccinia virus or baculovirus. Are used. Among them, a plasmid derived from Escherichia coli, a plasmid derived from Bacillus subtilis or a plasmid derived from yeast is preferably used.
Examples of the promoter for controlling the DNA expression include, for example, (i) a promoter of a DNA derived from a virus (eg, simian virus, cytomegalovirus, Moloney leukemia virus, JC virus, breast cancer virus, poliovirus, etc.); ) Promoters derived from various mammals (human, rabbit, dog, cat, guinea pig, hamster, rat, mouse, etc.), for example, albumin, insulin II, uroplakin II, elastase, erythropoietin, endothelin, muscle creatine kinase, glial fibrillary acid Protein, glutathione S-transferase, platelet-derived growth factor β, keratins K1, K10 and K14, collagen types I and II, cyclic AMP-dependent protein kinase βI subunit, dyst Lophine, tartrate-resistant alkaline phosphatase, atrial natriuretic factor, endothelial receptor tyrosine kinase (commonly abbreviated as Tie2), sodium potassium adenosine 3 kinase (Na, K-ATPase), neurofilament light chain, metallothionein I and IIA, metalloproteinase 1 tissue inhibitor, MHC class I antigen (H-2L), H-ras, renin, dopamine β-hydroxylase, thyroid peroxidase (TPO), polypeptide chain elongation factor 1α (EF-1α), β Actin, α and β myosin heavy chains, myosin light chains 1 and 2, myelin basic protein, thyroglobulin, Thy-1, immunoglobulin, heavy chain variable region (VNP), serum amyloid P component, myoglobin, troponin C, blunt α-actin, preproenkephalin A, such as a promoter, such as vasopressin are used. Among them, a cytomegalovirus promoter capable of high expression throughout the body, a promoter of human polypeptide chain elongation factor 1α (EF-1α), human and chicken β-actin promoters, and the like are preferable.
The above vector preferably has a sequence that terminates transcription of the target mRNA in a DNA-transfected mammal (generally called a terminator). For example, a sequence of each DNA derived from a virus and from various mammals is used. Preferably, a simian virus SV40 terminator or the like is used.
[0059]
In addition, a splicing signal of each DNA, an enhancer region, a part of an intron of a eukaryotic DNA, and the like are placed 5 ′ upstream of the promoter region, between the promoter region and the translation region, or between the translation region for the purpose of further expressing the desired foreign DNA. It is also possible to connect 3 ′ downstream of the above depending on the purpose.
The normal translation region of the protein of the present invention can be obtained from liver, kidney, thyroid cells, fibroblast-derived DNA derived from humans or various mammals (eg, rabbits, dogs, cats, guinea pigs, hamsters, rats, mice, etc.) and commercially available DNAs. From a variety of genomic DNA libraries, or as a starting material, a complementary DNA prepared by known methods from RNA derived from liver, kidney, thyroid cells, and fibroblasts. In addition, a translation region obtained by mutating a translation region of a normal polypeptide obtained from the above-mentioned cells or tissues by a point mutagenesis method can be used for the exogenous abnormal DNA.
The translation region can be prepared as a DNA construct that can be expressed in an introduced animal by a usual DNA engineering technique in which the translation region is ligated downstream of the promoter and, if desired, upstream of the transcription termination site.
Introduction of the exogenous DNA of the present invention at the fertilized egg cell stage is ensured to be present in all germ cells and somatic cells of the target mammal. The presence of the exogenous DNA of the present invention in the germinal cells of the produced animal after the introduction of the DNA means that all progeny of the produced animal will retain the exogenous DNA of the present invention in all of the germ cells and somatic cells. means. The offspring of such animals that have inherited the exogenous DNA of the present invention have the exogenous DNA of the present invention in all of their germ cells and somatic cells.
The non-human mammal into which the exogenous normal DNA of the present invention has been introduced can be subcultured in a normal breeding environment as an animal having the DNA after confirming that the exogenous DNA is stably maintained by mating.
Introduction of the exogenous DNA of the present invention at the fertilized egg cell stage is ensured to be present in excess in all germ cells and somatic cells of the target mammal. Excessive presence of the exogenous DNA of the present invention in the germinal cells of the produced animal after DNA introduction means that all the offspring of the produced animal have the exogenous DNA of the present invention in all of their germinal and somatic cells. Means Progeny of such animals that have inherited the exogenous DNA of the present invention have an excess of the exogenous DNA of the present invention in all of their germinal and somatic cells.
By obtaining a homozygous animal having the introduced DNA on both homologous chromosomes and mating the male and female animals, all offspring can be bred to have the DNA in excess.
[0060]
The non-human mammal having the normal DNA of the present invention expresses the normal DNA of the present invention at a high level and promotes the function of the endogenous normal DNA to eventually cause hyperactivity of the protein of the present invention. Occasionally, it can be used as a disease model animal. For example, using the normal DNA-transfected animal of the present invention, it is possible to elucidate the pathological mechanism of the hyperactivity of the protein of the present invention and diseases associated with the protein of the present invention, and to examine a method for treating these diseases. It is possible.
Further, since the mammal into which the exogenous normal DNA of the present invention has been introduced has an increased symptom of the released protein of the present invention, it can be used for a screening test for a therapeutic drug for a disease associated with the protein of the present invention. .
On the other hand, a non-human mammal having the exogenous abnormal DNA of the present invention can be subcultured in an ordinary breeding environment as an animal having the DNA after confirming that the exogenous DNA is stably maintained by mating. Furthermore, the desired foreign DNA can be used as a raw material by incorporating it into the aforementioned plasmid. The DNA construct with the promoter can be prepared by a usual DNA engineering technique. Introduction of the abnormal DNA of the present invention at the fertilized egg cell stage is ensured to be present in all germ cells and somatic cells of the target mammal. The presence of the abnormal DNA of the present invention in the germinal cells of the produced animal after DNA transfer means that all the offspring of the produced animal have the abnormal DNA of the present invention in all of its germ cells and somatic cells. The progeny of such animals that have inherited the exogenous DNA of the present invention have the abnormal DNA of the present invention in all of their germinal and somatic cells. A homozygous animal having the introduced DNA on both homologous chromosomes is obtained, and by crossing these male and female animals, it is possible to breed the cells so that all offspring have the DNA.
[0061]
The non-human mammal having the abnormal DNA of the present invention, in which the abnormal DNA of the present invention is highly expressed, inhibits the function of endogenous normal DNA, and finally, the functionally inactive form of the protein of the present invention. It can be refractory and can be used as a model animal for the disease. For example, by using the abnormal DNA-introduced animal of the present invention, it is possible to elucidate the pathological mechanism of the function-inactive refractory of the protein of the present invention and to examine a method for treating this disease.
Further, as a specific possibility, the abnormal DNA-highly expressing animal of the present invention exhibits a function of inhibiting the normal protein function (dominant negative action) by the abnormal protein of the present invention in the inactive refractory disease of the protein of the present invention. A model to elucidate. In addition, since the mammal into which the foreign abnormal DNA of the present invention has been introduced has an increased symptom of the released protein of the present invention, it can be used for a therapeutic drug screening test for the protein of the present invention or a functionally inactive refractory disease thereof. It is.
In addition, other possible uses of the two kinds of the DNA-introduced animals of the present invention include, for example,
(I) use as a cell source for tissue culture;
(Ii) a protein specifically expressed or activated by the protein of the present invention, by directly analyzing DNA or RNA in the tissue of the DNA-transfected animal of the present invention, or analyzing a polypeptide tissue expressed by the DNA; Analysis of the relationship with
(Iii) culturing cells of DNA-bearing tissue by standard tissue culture techniques and using them to study the function of cells from tissues that are generally difficult to culture;
(Iv) screening for an agent that enhances the function of the cell by using the cell described in (iii) above, and
(V) Isolation and purification of the mutant protein of the present invention and production of its antibody can be considered.
Furthermore, using the DNA-introduced animal of the present invention, it is possible to examine the clinical symptoms of diseases related to the protein of the present invention, including the inactive refractory disease of the protein of the present invention, etc. More detailed pathological findings in each organ of a disease model related to the disease can be obtained, which can contribute to the development of a new treatment method, and further to the research and treatment of a secondary disease caused by the disease.
In addition, it is possible to take out each organ from the DNA-introduced animal of the present invention, cut it into small pieces, and then use a proteolytic enzyme such as trypsin to obtain the released DNA-introduced cells, culture them, or systematize the cultured cells. . Furthermore, it is possible to examine the specificity of the protein-producing cell of the present invention, its relationship with apoptosis, differentiation or proliferation, or its signal transduction mechanism, and its abnormalities. It is an effective research material for
Further, in order to develop a therapeutic agent for a disease associated with the protein of the present invention, including a functionally inactive refractory type of the protein of the present invention, using the DNA-transfected animal of the present invention, It is possible to provide an effective and rapid screening method for a therapeutic agent for the disease by using a method or the like. In addition, using the DNA-introduced animal of the present invention or the exogenous DNA expression vector of the present invention, it is possible to examine and develop a DNA treatment method for a disease associated with the protein of the present invention.
[0062]
[8] Knockout animal
The present invention provides a non-human mammalian embryonic stem cell in which the DNA of the present invention has been inactivated, and a non-human mammal deficient in expression of the DNA of the present invention.
That is, the present invention
(1) a non-human mammalian embryonic stem cell in which the DNA of the present invention has been inactivated,
(2) The embryonic stem cell according to (1), wherein the DNA is inactivated by introducing a reporter gene (eg, a β-galactosidase gene derived from Escherichia coli).
(3) The embryonic stem cell according to (1), which is neomycin-resistant,
(4) the embryonic stem cell according to (1), wherein the non-human mammal is a rodent;
(5) The embryonic stem cell according to (4), wherein the rodent is a mouse,
(6) a non-human mammal deficient in expression of the DNA of the present invention, wherein the DNA is inactivated;
(7) The above (6), wherein the DNA is inactivated by introducing a reporter gene (eg, a β-galactosidase gene derived from Escherichia coli), and the reporter gene can be expressed under the control of a promoter for the DNA of the present invention. The non-human mammal of the description,
(8) the non-human mammal according to the above (6), wherein the non-human mammal is a rodent;
(9) The non-human mammal according to (8), wherein the rodent is a mouse, and
(10) A method for screening a compound or a salt thereof that promotes or inhibits promoter activity on DNA of the present invention, which comprises administering a test compound to the animal according to (7) and detecting the expression of a reporter gene. provide.
A non-human mammalian embryonic stem cell in which the DNA of the present invention has been inactivated is an artificially mutated DNA of the present invention possessed by the non-human mammal, which suppresses the expression ability of the DNA, or By substantially losing the activity of the protein of the present invention encoded by the DNA, the DNA does not substantially have the ability to express the protein of the present invention (hereinafter, may be referred to as the knockout DNA of the present invention). ) Non-human mammalian embryonic stem cells (hereinafter abbreviated as ES cells).
As the non-human mammal, the same one as described above is used.
[0063]
The method of artificially mutating the DNA of the present invention can be performed, for example, by deleting a part or all of the DNA sequence and inserting or substituting another DNA by a genetic engineering technique. With these mutations, the knockout DNA of the present invention may be prepared, for example, by shifting the codon reading frame or disrupting the function of the promoter or exon.
Specific examples of the non-human mammalian embryonic stem cells in which the DNA of the present invention has been inactivated (hereinafter abbreviated as the DNA-inactivated ES cells of the present invention or the knockout ES cells of the present invention) include, for example, The DNA of the present invention possessed by a non-human mammal is isolated, and its exon portion is a drug resistance gene represented by a neomycin resistance gene or a hygromycin resistance gene, or lacZ (β-galactosidase gene), cat (chloramphenicol acetyl). A reporter gene or the like typified by a transferase gene) to disrupt the exon function, or insert a DNA sequence that terminates gene transcription into an intron between exons (for example, a polyA addition signal); By making it impossible to synthesize complete mRNA, A DNA strand having a DNA sequence constructed so as to eventually disrupt the gene (hereinafter abbreviated as a targeting vector) is introduced into the chromosome of the animal by, for example, homologous recombination, and the resulting ES cells are used in the present invention. Analysis by Southern hybridization analysis using a DNA sequence on or in the vicinity of the DNA as a probe, or PCR using a DNA sequence on a targeting vector and a DNA sequence of a neighboring region other than the DNA of the present invention used for the preparation of the targeting vector as primers However, it can be obtained by selecting the knockout ES cells of the present invention.
[0064]
As the original ES cells for inactivating the DNA of the present invention by the homologous recombination method or the like, for example, those already established as described above may be used, or according to the known method of Evans and Kaufman. May be newly established. For example, in the case of mouse ES cells, currently, 129-line ES cells are generally used. For example, for the purpose of obtaining ES cells in which BDF is clearly known, for example, BDF in which the number of eggs collected by C57BL / 6 mice or C57BL / 6 has been improved by hybridization with DBA / 2 1 Mouse (F of C57BL / 6 and DBA / 2) 1 ) Can also be used favorably. BDF 1 In addition to the advantage that the number of eggs collected and the eggs are robust, the mice have C57BL / 6 mice as a background, and thus, the ES cells obtained using the C57BL / 6 mice were used to produce C57BL / 6 mice. / 6 mice can be advantageously used in that the genetic background can be replaced by C57BL / 6 mice by backcrossing.
In addition, when ES cells are established, blastocysts 3.5 days after fertilization are generally used. In addition, a large number of blastocysts can be efficiently obtained by collecting embryos at the 8-cell stage and culturing them until blastocysts are used. Early embryos can be obtained.
Either male or female ES cells may be used, but generally male ES cells are more convenient for producing a germline chimera. It is also desirable to discriminate between males and females as soon as possible in order to reduce cumbersome culture labor.
As a method for determining the sex of ES cells, for example, a method of amplifying and detecting a gene in a sex-determining region on the Y chromosome by a PCR method can be mentioned. If this method is used, it is conventionally necessary to perform about 10 karyotype analyses. 6 Since the number of ES cells is required, the number of ES cells of about 1 colony (approximately 50) is sufficient, so that primary selection of ES cells in the early stage of culture can be performed by discriminating between male and female. In addition, by enabling selection of male cells at an early stage, labor in the initial stage of culture can be significantly reduced.
[0065]
The secondary selection can be performed, for example, by confirming the number of chromosomes by the G-banding method. The number of chromosomes in the obtained ES cells is desirably 100% of the normal number. However, when it is difficult due to physical operations at the time of establishment, after knocking out the gene of the ES cells, the normal cells (for example, chromosomes in mice) are knocked out. It is desirable to clone again into cells (number 2n = 40).
The embryonic stem cell line obtained in this way usually has very good growth properties, but it must be carefully subcultured because it tends to lose its ontogenic ability. For example, on a suitable feeder cell such as STO fibroblast in the presence of LIF (1 to 10,000 U / ml) in a carbon dioxide incubator (preferably 5% carbon dioxide, 95% air or 5% oxygen, 5% The cells are cultured by a method such as culturing at about 37 ° C. in carbon dioxide gas and 90% air. At the time of subculture, for example, trypsin / EDTA solution (usually 0.001 to 0.5% trypsin / 0.1 to 5 mM EDTA, Preferably, a method is used in which cells are made into single cells by treatment with about 0.1% trypsin / 1 mM EDTA and seeded on freshly prepared feeder cells. Such passage is usually carried out every 1 to 3 days. At this time, it is desirable to observe the cells and, if any morphologically abnormal cells are found, discard the cultured cells.
ES cells are differentiated into various types of cells, such as parietal muscle, visceral muscle, and cardiac muscle, by monolayer culture up to high density or suspension culture until cell clumps are formed under appropriate conditions. [M. J. Evans and M.E. H. Kaufman, Nature, 292, 154, 1981; R. Martin Proc. Of National Academy of Sciences USA (Proc. Natl. Acad. Sci. USA) 78, 7634, 1981; C. Doetschman et al., Journal of Embryology and Experimental Morphology, Vol. 87, p. 27, 1985], that the DNA-deficient cell of the present invention obtained by differentiating the ES cell of the present invention is characterized by in vitro Is useful in cell biological studies of the protein of the present invention.
The non-human mammal deficient in DNA expression of the present invention can be distinguished from a normal animal by measuring the mRNA level of the animal using a known method and indirectly comparing the expression level.
As the non-human mammal, those similar to the aforementioned can be used.
[0066]
The non-human mammal deficient in expression of the DNA of the present invention is, for example, a DNA in which the targeting vector prepared as described above is introduced into mouse embryonic stem cells or mouse egg cells, and the DNA of the targeting vector is inactivated by the introduction. The DNA of the present invention can be knocked out by homologous recombination in which the sequence replaces the DNA of the present invention on the chromosome of mouse embryonic stem cells or mouse egg cells by homologous recombination.
Cells in which the DNA of the present invention has been knocked out can be used as a DNA sequence on a Southern hybridization analysis or targeting vector using the DNA sequence on or near the DNA of the present invention as a probe, and the DNA of the present invention derived from the mouse used for the targeting vector. It can be determined by analysis by PCR using a DNA sequence of a nearby region other than DNA as a primer. When non-human mammalian embryonic stem cells are used, a cell line in which the DNA of the present invention has been inactivated by gene homologous recombination is cloned, and the cells are cultured at an appropriate time, for example, at the 8-cell stage of non-human mammalian cells. The chimeric embryo is injected into an animal embryo or blastocyst, and the resulting chimeric embryo is transplanted into the uterus of the pseudopregnant non-human mammal. The produced animal is a chimeric animal comprising both cells having the normal DNA locus of the present invention and cells having the artificially mutated DNA locus of the present invention.
When a part of the germ cells of the chimeric animal has a mutated DNA locus of the present invention, all tissues are artificially mutated from a population obtained by crossing such a chimeric individual with a normal individual. It can be obtained by selecting individuals composed of cells having the added DNA locus of the present invention, for example, by judging coat color or the like. The individual thus obtained is usually an individual with a heterozygous expression of the protein of the present invention, which is crossed with an individual with a heterozygous expression of the protein of the present invention. Defective individuals can be obtained.
In the case of using an egg cell, for example, a transgenic non-human mammal having a targeting vector introduced into a chromosome can be obtained by injecting a DNA solution into a nucleus of an egg by a microinjection method, and these transgenic non-human mammals can be obtained. Compared to mammals, they can be obtained by selecting those having a mutation in the DNA locus of the present invention by homologous recombination.
In this manner, the individual in which the DNA of the present invention is knocked out can be bred in an ordinary breeding environment after confirming that the DNA of the animal obtained by the breeding is also knocked out.
Further, the acquisition and maintenance of the germ line may be performed according to a conventional method. That is, by crossing male and female animals having the inactivated DNA, a homozygous animal having the inactivated DNA on both homologous chromosomes can be obtained. The obtained homozygous animal can be efficiently obtained by rearing the mother animal in such a manner that there are one normal animal and one homozygote. By mating male and female heterozygous animals, homozygous and heterozygous animals having the inactivated DNA are bred and subcultured.
The non-human mammalian embryonic stem cells in which the DNA of the present invention has been inactivated are extremely useful for producing a non-human mammal deficient in expressing the DNA of the present invention.
In addition, since the non-human mammal deficient in expression of the DNA of the present invention lacks various biological activities that can be induced by the protein of the present invention, a model of a disease caused by inactivation of the biological activity of the protein of the present invention. Therefore, it is useful for investigating the causes of these diseases and examining treatment methods.
[0067]
[8a] A method for screening a compound having a therapeutic / preventive effect on diseases caused by DNA deficiency or damage of the present invention
The non-human mammal deficient in expression of the DNA of the present invention can be used for screening for a compound having a therapeutic / preventive effect against diseases caused by deficiency or damage of the DNA of the present invention.
That is, the present invention is characterized by administering a test compound to a non-human mammal deficient in expressing the DNA of the present invention, and observing and measuring a change in the animal. Provided is a method for screening a compound or a salt thereof having a therapeutic / prophylactic effect against a disease.
Examples of the non-human mammal deficient in expressing DNA of the present invention used in the screening method include the same as described above.
Test compounds include, for example, peptides, proteins, non-peptidic compounds, synthetic compounds, fermentation products, cell extracts, plant extracts, animal tissue extracts, plasma, and the like. These compounds are novel compounds. Or a known compound.
Specifically, a non-human mammal deficient in expression of the DNA of the present invention is treated with a test compound, compared with an untreated control animal, and tested using changes in each organ, tissue, disease symptoms, etc. of the animal as an index. The therapeutic / preventive effects of the compounds can be tested.
As a method of treating a test animal with a test compound, for example, oral administration, intravenous injection and the like are used, and it can be appropriately selected according to the symptoms of the test animal, the properties of the test compound, and the like. The dose of the test compound can be appropriately selected according to the administration method, the properties of the test compound, and the like.
For example, when screening for a compound having a prophylactic or therapeutic effect on renal failure, a test compound is administered to a non-human mammal deficient in expressing DNA of the present invention, and the amount of creatinine in blood and the amount of urinary protein in the animal are determined. Measure over time.
The compound obtained by using the screening method is a compound selected from the test compounds described above, and has a prophylactic / therapeutic effect against a disease caused by deficiency or damage of the protein of the present invention. It can be used as a drug for safe and low toxic prophylactic / therapeutic agents. Furthermore, compounds derived from the compounds obtained by the above screening can be used in the same manner.
[0068]
The compound obtained by the screening method may form a salt. Examples of the salt of the compound include physiologically acceptable acids (eg, inorganic acids, organic acids, etc.) and bases (eg, alkali metals, etc.). ) Is used, and a physiologically acceptable acid addition salt is particularly preferable. Such salts include, for example, salts with inorganic acids (eg, hydrochloric acid, phosphoric acid, hydrobromic acid, sulfuric acid, etc.) or organic acids (eg, acetic acid, formic acid, propionic acid, fumaric acid, maleic acid, For example, salts with succinic acid, tartaric acid, citric acid, malic acid, oxalic acid, benzoic acid, methanesulfonic acid, benzenesulfonic acid, and the like are used.
A drug containing the compound or a salt thereof obtained by the screening method can be produced in the same manner as the above-mentioned drug containing the protein of the present invention.
The preparations obtained in this way are safe and low toxic, and thus, for example, human or other mammals (eg, rat, mouse, guinea pig, rabbit, sheep, pig, cow, horse, cat, dog, monkey, etc.) ) Can be administered.
The dose of the compound or a salt thereof varies depending on the target disease, the administration subject, the administration route, and the like. For example, when the compound is orally administered, it is generally used in an adult patient (with a body weight of 60 kg) having renal failure. Administers about 0.1-100 mg, preferably about 1.0-50 mg, more preferably about 1.0-20 mg of the compound per day. When administered parenterally, the single dose of the compound varies depending on the administration subject, target disease, and the like. For example, the compound is usually in the form of an injection in an adult patient (with a body weight of 60 kg) having renal failure. It is convenient to administer about 0.01 to 30 mg, preferably about 0.1 to 20 mg, more preferably about 0.1 to 10 mg of the compound by intravenous injection per day. In the case of other animals, the amount can be administered in terms of the weight per 60 kg.
[0069]
[8b] A method for screening a compound that promotes or inhibits the activity of a promoter for the DNA of the present invention
The present invention provides a compound which promotes or inhibits the activity of a promoter for the DNA of the present invention, which comprises administering a test compound to a non-human mammal deficient in expressing the DNA of the present invention, and detecting the expression of a reporter gene, or a compound thereof. A method for screening a salt is provided.
In the above-mentioned screening method, the non-human mammal deficient in expression of DNA of the present invention may be a non-human mammal deficient in expression of DNA of the present invention in which the DNA of the present invention is inactivated by introducing a reporter gene, A reporter gene that can be expressed under the control of a promoter for the DNA of the present invention is used.
Examples of the test compound include the same compounds as described above.
As the reporter gene, the same one as described above is used, and a β-galactosidase gene (lacZ), a soluble alkaline phosphatase gene, a luciferase gene and the like are preferable.
[0070]
In a non-human mammal deficient in expression of the DNA of the present invention in which the DNA of the present invention is replaced with a reporter gene, since the reporter gene is under the control of the promoter for the DNA of the present invention, the expression of the substance encoded by the reporter gene is traced. By doing so, the activity of the promoter can be detected.
For example, when a part of the DNA region encoding the protein of the present invention is replaced with a β-galactosidase gene (lacZ) derived from Escherichia coli, the tissue that expresses the protein of the present invention originally replaces the protein of the present invention. Β-galactosidase is expressed. Therefore, for example, the present invention can be easily performed by staining with a reagent serving as a substrate for β-galactosidase such as 5-bromo-4-chloro-3-indolyl-β-galactopyranoside (X-gal). Can be observed in the animal body. Specifically, the protein-deficient mouse of the present invention or a tissue section thereof is fixed with glutaraldehyde or the like, washed with phosphate buffered saline (PBS), and then stained with X-gal at room temperature or around 37 ° C. After reacting for about 30 minutes to 1 hour, the β-galactosidase reaction may be stopped by washing the tissue specimen with a 1 mM EDTA / PBS solution, and coloration may be observed. Further, mRNA encoding lacZ may be detected according to a conventional method.
The compound or a salt thereof obtained by using the above-mentioned screening method is a compound selected from the above-mentioned test compounds, and is a compound that promotes or inhibits the promoter activity for the DNA of the present invention.
[0071]
The compound obtained by the screening method may form a salt, and the salt of the compound may include a physiologically acceptable acid (eg, an inorganic acid) and a base (eg, an alkali metal). Are used, and especially preferred are physiologically acceptable acid addition salts. Such salts include, for example, salts with inorganic acids (eg, hydrochloric acid, phosphoric acid, hydrobromic acid, sulfuric acid, etc.) or organic acids (eg, acetic acid, formic acid, propionic acid, fumaric acid, maleic acid, For example, salts with succinic acid, tartaric acid, citric acid, malic acid, oxalic acid, benzoic acid, methanesulfonic acid, benzenesulfonic acid, and the like are used.
Since the compound or its salt that promotes the promoter activity of the DNA of the present invention can promote the expression of the protein of the present invention and promote the function of the protein, it can be used for, for example, renal diseases (eg, renal failure, glomerulus) Nephritis, diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, interstitial nephritis, nephrosclerosis, uremia, etc., liver disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.) , Pancreatic disorders (eg, pancreatitis), immune disorders associated with thymic abnormalities, genital disorders (eg, benign prostatic hyperplasia, prostatitis, testicular neurosis, ovarian cysts), gastrointestinal disorders (eg, irritable bowel syndrome, Ulcerative colitis, ischemic colitis, gastritis, etc.), spleen disease (eg, hypersplenism, splenomegaly syndrome, etc.), cancer (eg, lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, Prostate cancer, stomach cancer, bladder cancer, breast cancer, child Cervical, colon, rectal, pancreatic, thyroid, myeloid leukemia, etc., respiratory diseases (eg, pleurisy, pneumonia, chronic obstructive pulmonary disease, asthma, etc.), osteomyelitis, diabetes, hypertension, illness Post-blood reperfusion injury, retinitis, central nervous system disorders (eg, epilepsy, Alzheimer's disease, Parkinson's syndrome, schizophrenia, etc.), skin disorders (eg, atopic dermatitis, seborrheic dermatitis, etc.), thyroid hormone-related It is useful as a medicament such as a prophylactic or therapeutic agent for diseases (eg, thyroid hormone refractory disease, Basedow's disease, cretin disease, hyperthyroidism, etc.). It is preferably used as a prophylactic / therapeutic agent for renal diseases and thyroid hormone-related diseases, and more preferably as a prophylactic / therapeutic agent for diabetic nephropathy.
[0072]
In addition, the compound of the present invention or a salt thereof that inhibits the promoter activity for the DNA can inhibit the expression of the protein of the present invention and inhibit the function of the protein. Glomerulonephritis, diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, interstitial nephritis, nephrosclerosis, uremia, etc., liver disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.) ), Pancreatic disease (eg, pancreatitis), immune disease associated with thymic abnormalities, genital disease (eg, prostatic hypertrophy, prostatitis, testicular neurosis, ovarian cysts, etc.), gastrointestinal disease (eg, irritable bowel syndrome) , Ulcerative colitis, ischemic colitis, gastritis, etc.), spleen disease (eg, hypersplenism, splenomegaly syndrome, etc.), cancer (eg, lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer) , Prostate cancer, stomach cancer, bladder cancer, breast cancer Cervical, colon, rectal, pancreatic, thyroid, myeloid leukemia, etc., respiratory diseases (eg, pleurisy, pneumonia, chronic obstructive pulmonary disease, asthma, etc.), osteomyelitis, diabetes, hypertension, Post-ischemic reperfusion injury, retinitis, central nervous system disorders (eg, epilepsy, Alzheimer's disease, Parkinson's syndrome, schizophrenia, etc.), skin disorders (eg, atopic dermatitis, seborrheic dermatitis, etc.), thyroid hormone It is useful as a medicament such as an agent for preventing or treating related diseases (eg, thyroid hormone refractory disease, Basedow's disease, cretin disease, hyperthyroidism, etc.). It is preferably used as a prophylactic / therapeutic agent for renal diseases and thyroid hormone-related diseases, and more preferably as a prophylactic / therapeutic agent for diabetic nephropathy.
Among the above compounds, a compound or a salt thereof that promotes the promoter activity of the DNA of the present invention is preferable.
Furthermore, compounds derived from the compounds obtained by the above screening can be used in the same manner.
A drug containing the compound or a salt thereof obtained by the screening method can be produced in the same manner as the above-mentioned drug containing the protein of the present invention or a salt thereof.
The preparations obtained in this way are safe and low toxic, and thus, for example, human or other mammals (eg, rat, mouse, guinea pig, rabbit, sheep, pig, cow, horse, cat, dog, monkey, etc.) ) Can be administered.
The dose of the compound or a salt thereof varies depending on the disease to be treated, the subject of administration, the administration route, and the like. For example, when the compound of the present invention that promotes the promoter activity for DNA is orally administered, generally the adult (body weight) In patients with renal failure (as 60 kg), the compound is administered at about 0.1-100 mg, preferably about 1.0-50 mg, more preferably about 1.0-20 mg per day. When administered parenterally, the single dose of the compound varies depending on the administration subject, target disease, and the like. For example, the compound of the present invention that promotes the promoter activity for DNA is usually administered in the form of an injection to an adult ( When administered to a patient with renal failure (with a body weight of 60 kg), about 0.01 to 30 mg, preferably about 0.1 to 20 mg, more preferably about 0.1 to 10 mg of the compound is administered by intravenous injection per day. It is convenient. In the case of other animals, the amount can be administered in terms of the weight per 60 kg.
[0073]
On the other hand, for example, when a compound of the present invention that inhibits the promoter activity for DNA is orally administered, generally, in an adult (assuming a body weight of 60 kg) renal failure patient, about 0.1 to 100 mg of the compound per day is used. Preferably about 1.0-50 mg, more preferably about 1.0-20 mg is administered. When administered parenterally, the single dose of the compound varies depending on the administration subject, target disease, and the like. For example, the compound of the present invention that inhibits the promoter activity for DNA is usually administered in the form of an injection to an adult ( When administered to a patient with renal failure (with a body weight of 60 kg), about 0.01 to 30 mg, preferably about 0.1 to 20 mg, more preferably about 0.1 to 10 mg of the compound is administered by intravenous injection per day. It is convenient. In the case of other animals, the amount can be administered in terms of the weight per 60 kg.
As described above, the non-human mammal deficient in expression of the DNA of the present invention is extremely useful for screening for a compound or a salt thereof that promotes or inhibits the activity of the promoter for the DNA of the present invention, It can greatly contribute to investigating the cause of various diseases caused by it or to develop preventive and therapeutic drugs.
In addition, using a DNA containing the promoter region of the protein of the present invention, genes encoding various proteins are ligated downstream thereof and injected into egg cells of an animal to produce a so-called transgenic animal (transgenic animal). Once created, it will also be possible to specifically synthesize the polypeptide and study its effects in living organisms. Furthermore, if a suitable reporter gene is bound to the above promoter portion, and a cell line that expresses the reporter gene is established, a low-molecular compound having an action of specifically promoting or suppressing the production ability of the protein itself of the present invention in the body. Can be used as a search system.
[0074]
In the present specification and drawings, bases, amino acids, and the like are indicated by abbreviations based on the abbreviations by IUPAC-IUB Commission on Biochemical Nomenclature or by abbreviations commonly used in the art, and examples thereof are described below. When an amino acid can have an optical isomer, the L-form is indicated unless otherwise specified.
DNA: deoxyribonucleic acid
cDNA: complementary deoxyribonucleic acid
A: Adenine
T: Thymine
G: Guanine
C: Cytosine
RNA: ribonucleic acid
mRNA: messenger ribonucleic acid
dATP: deoxyadenosine triphosphate
dTTP: deoxythymidine triphosphate
dGTP: deoxyguanosine triphosphate
dCTP: deoxycytidine triphosphate
ATP: Adenosine triphosphate
EDTA: Ethylenediaminetetraacetic acid
SDS: Sodium dodecyl sulfate
Gly: glycine
Ala: Alanine
Val: Valine
Leu: Leucine
Ile: Isoleucine
Ser: Serine
Thr: Threonine
Cys: cysteine
Met: methionine
Glu: glutamic acid
Asp: Aspartic acid
Lys: lysine
Arg: Arginine
His: histidine
Phe: phenylalanine
Tyr: Tyrosine
Trp: Tryptophan
Pro: Proline
Asn: Asparagine
Gln: Glutamine
pGlu: pyroglutamic acid
[0075]
Further, substituents, protecting groups and reagents frequently used in the present specification are represented by the following symbols.
Me: methyl group
Et: ethyl group
Bu: butyl group
Ph: phenyl group
TC: thiazolidine-4 (R) -carboxamide group
Tos: p-toluenesulfonyl
CHO: Formyl
Bzl: benzyl
Cl 2 -Bzl: 2,6-dichlorobenzyl
Bom: benzyloxymethyl
Z: benzyloxycarbonyl
Cl-Z: 2-chlorobenzyloxycarbonyl
Br-Z: 2-bromobenzyloxycarbonyl
Boc: t-butoxycarbonyl
DNP: dinitrophenyl
Trt: Trityl
Bum: t-butoxymethyl
Fmoc: N-9-fluorenylmethoxycarbonyl
HOBt: 1-hydroxybenztriazole
HOOBt: 3,4-dihydro-3-hydroxy-4-oxo-1-2,3-benzotriazine
HONB: 1-hydroxy-5-norbornene-2,3-dicarboximide
DCC: N, N'-dicyclohexylcarbodiimide
[0076]
The sequence numbers in the sequence listing in the present specification indicate the following sequences.
[SEQ ID NO: 1]
3 shows the amino acid sequence of human TCH229 protein obtained in Example 3.
[SEQ ID NO: 2]
1 shows the nucleotide sequence of DNA encoding human TCH229 protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1.
[SEQ ID NO: 3]
The base sequence of the primer AP1 used in Example 1, Example 2, Example 5, Example 6, Example 9, and Example 10 is shown.
[SEQ ID NO: 4]
15 shows the base sequence of primer rr1 used in Examples 1, 3 and 15.
[SEQ ID NO: 5]
The base sequence of the primer AP2 used in Example 1, Example 2, Example 5, Example 6, Example 9, and Example 10 is shown.
[SEQ ID NO: 6]
15 shows the base sequence of primer rr2 used in Examples 1, 3 and 15.
[SEQ ID NO: 7]
2 shows the base sequence of primer rr3 used in Example 1.
[SEQ ID NO: 8]
2 shows the base sequence of primer rr4 used in Example 1.
[SEQ ID NO: 9]
Example 2 This shows the base sequence of primer ff1 used in Examples 3 and 15.
[SEQ ID NO: 10]
15 shows the base sequence of primer ff2 used in Examples 2, 3, and 15.
[SEQ ID NO: 11]
4 shows the nucleotide sequence of primer ORFF1 used in Example 3.
[SEQ ID NO: 12]
3 shows the nucleotide sequence of primer ORFR1 used in Example 3.
[SEQ ID NO: 13]
4 shows the nucleotide sequence of primer ORFF2 used in Example 3.
[SEQ ID NO: 14]
3 shows the nucleotide sequence of primer ORFR2 used in Example 3.
[SEQ ID NO: 15]
13 shows the nucleotide sequence of primer M13F used in Examples 3 and 7.
[SEQ ID NO: 16]
13 shows the base sequence of primer M13R used in Examples 3 and 7.
[SEQ ID NO: 17]
14 shows the base sequence of primer A1 used in Examples 3 and 15.
[SEQ ID NO: 18]
14 shows the base sequence of primer B2 used in Examples 3 and 15.
[SEQ ID NO: 19]
17 shows the nucleotide sequence of primer TMF used in Examples 4, 16 and 17.
[SEQ ID NO: 20]
17 shows the nucleotide sequence of primer TMR used in Examples 4, 16 and 17.
[SEQ ID NO: 21]
17 shows the base sequence of TaqMan probe P1 used in Examples 4, 16 and 17.
[SEQ ID NO: 22]
1 shows the base sequence obtained in Example 1.
[SEQ ID NO: 23]
1 shows the base sequence obtained in Example 1.
[SEQ ID NO: 24]
3 shows the base sequence obtained in Example 2.
[SEQ ID NO: 25]
3 shows the base sequence obtained in Example 3.
[SEQ ID NO: 26]
7 shows the amino acid sequence of mouse TCH229 protein obtained in Example 7.
[SEQ ID NO: 27]
This shows the base sequence of DNA encoding the mouse TCH229 protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 26.
[SEQ ID NO: 28]
13 shows the base sequences of primers used in Examples 5 and 7.
[SEQ ID NO: 29]
13 shows the base sequences of primers used in Examples 5 and 7.
[SEQ ID NO: 30]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 5.
[SEQ ID NO: 31]
13 shows the base sequences of primers used in Examples 5 and 7.
[SEQ ID NO: 32]
13 shows the base sequences of primers used in Examples 6 and 7.
[SEQ ID NO: 33]
13 shows the base sequences of primers used in Examples 6 and 7.
[SEQ ID NO: 34]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 7.
[SEQ ID NO: 35]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 7.
[SEQ ID NO: 36]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 7.
[SEQ ID NO: 37]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 7.
[SEQ ID NO: 38]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 7.
[SEQ ID NO: 39]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 7.
[SEQ ID NO: 40]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 7.
[SEQ ID NO: 41]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 7.
[SEQ ID NO: 42]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 7.
[SEQ ID NO: 43]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 7.
[SEQ ID NO: 44]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 7.
[SEQ ID NO: 45]
14 shows the base sequences of primers used in Examples 8 and 13.
[SEQ ID NO: 46]
14 shows the base sequences of primers used in Examples 8 and 13.
[SEQ ID NO: 47]
14 shows the nucleotide sequences of probes used in Examples 8 and 13.
[SEQ ID NO: 48]
7 shows the base sequence obtained in Example 5.
[SEQ ID NO: 49]
7 shows the base sequence obtained in Example 5.
[SEQ ID NO: 50]
7 shows the base sequence obtained in Example 6.
[SEQ ID NO: 51]
7 shows the base sequence obtained in Example 7.
[SEQ ID NO: 52]
Rat TCH229 protein No. obtained in Example 11 1 shows the amino acid sequence of 1.
[SEQ ID NO: 53]
Rat TCH229 protein No. having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 52. 1 shows the nucleotide sequence of DNA encoding 1.
[SEQ ID NO: 54]
Rat TCH229 protein No. obtained in Example 11 2 shows the amino acid sequence of 2.
[SEQ ID NO: 55]
Rat TCH229 protein No. having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 54 2 shows the nucleotide sequence of DNA encoding No. 2.
[SEQ ID NO: 56]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 9.
[SEQ ID NO: 57]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 9.
[SEQ ID NO: 58]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 9.
[SEQ ID NO: 59]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 9.
[SEQ ID NO: 60]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 10.
[SEQ ID NO: 61]
13 shows the base sequences of primers used in Examples 10 and 11.
[SEQ ID NO: 62]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 11.
[SEQ ID NO: 63]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 11.
[SEQ ID NO: 64]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 11.
[SEQ ID NO: 65]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 11.
[SEQ ID NO: 66]
15 shows the base sequences of primers used in Examples 11 and 15.
[SEQ ID NO: 67]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 11.
[SEQ ID NO: 68]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 11.
[SEQ ID NO: 69]
The base sequences of the primers used in Examples 11, 12, 14, and 18 are shown.
[SEQ ID NO: 70]
The base sequences of the primers used in Examples 11, 12, 14, and 18 are shown.
[SEQ ID NO: 71]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 11.
[SEQ ID NO: 72]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 11.
[SEQ ID NO: 73]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 11.
[SEQ ID NO: 74]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 11.
[SEQ ID NO: 75]
14 shows the base sequence of a primer used in Example 11.
[SEQ ID NO: 76]
19 shows the nucleotide sequences of probes used in Examples 12, 14, and 18.
[SEQ ID NO: 77]
13 shows the base sequence obtained in Example 9.
[SEQ ID NO: 78]
13 shows the base sequence obtained in Example 9.
[SEQ ID NO: 79]
13 shows the base sequence obtained in Example 10.
[SEQ ID NO: 80]
13 shows the base sequence obtained in Example 11.
[SEQ ID NO: 81]
13 shows the base sequence obtained in Example 11.
[SEQ ID NO: 82]
14 shows the nucleotide sequence of a primer used in Example 15.
[SEQ ID NO: 83]
14 shows the nucleotide sequence of a primer used in Example 15.
[SEQ ID NO: 84]
14 shows the nucleotide sequence of a primer used in Example 15.
[0077]
Escherichia coli TOP10 / pCR-BluntII-TCH229 obtained in Example 3 to be described later has been used since March 27, 2002, 1-1-1 Higashi 1-1-1 Tsukuba City, Ibaraki Prefecture, Japan, postal code 305-8566) at the National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST) under the deposit number FERM BP-7983 from March 12, 2002, at 2-17-85, Jusanhoncho, Yodogawa-ku, Osaka-shi, Osaka, Japan. No. 532-8686) and deposited at the Fermentation Research Institute (IFO) under the accession number IFO 16767.
Escherichia coli TOP10 / pCR2.1-mTCH229 obtained in Example 7 described below has been used since June 13, 2002, 1-1-1 Higashi, 1-1, Tsukuba, Ibaraki, Japan Central Japan No. 6 (postal code) 305-8566) at the National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Patent Organism Depositary, under the deposit number FERM BP-8076 from June 4, 2002, 2-17-85, Jusanhoncho, Yodogawa-ku, Osaka-shi, Osaka No. 532-8686) and deposited at the Fermentation Research Institute (IFO) under the accession number IFO16800.
【Example】
Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to Examples, but these do not limit the scope of the present invention. In addition, the gene manipulation method using Escherichia coli followed the method described in Molecular cloning (Molecular cloning).
[0078]
Example 1
Cloning of 5 'upstream end of cDNA encoding human TCH229 protein
5 ′ RACE PCR cloning revealed the 5 ′ upstream nucleotide sequence of cDNA encoding human TCH229 protein.
Using two types of primer DNAs, primer AP1 (SEQ ID NO: 3) and primer rr1 (SEQ ID NO: 4), an Advantage 2 DNA Polymerase (Clontech) against human kidney Marathon-Ready cDNA (Clontech) ), Primary PCR was performed under the following conditions.
(1) 94 ° C for 30 seconds
(2) 35 cycles of 94 ° C for 10 seconds and -63 ° C for 3 minutes
Furthermore, using the product of this primary PCR as a template, nested PCR was performed under the following conditions using Advantage 2 DNA Polymerase (manufactured by Clontech) using primer AP2 (SEQ ID NO: 5) and primer rr2 (SEQ ID NO: 6). Was.
(3) 94 ° C for 30 seconds
(4) 30 cycles of 94 ° C for 10 seconds and -63 ° C for 3 minutes
To 5 μl of the above nested PCR reaction solution, 1 μl each of Exonuclease I and Shrimp Alkaline Posphorase in PCR Product Pre-Sequencing Kit (manufactured by Usb) were added, and the reaction was carried out at 37 ° C. for 15 minutes and at 85 ° C. for 15 minutes. This was reacted using primer AP2 (SEQ ID NO: 5), primer rr2 (SEQ ID NO: 6) and BigDye Terminator Cycle Sequencing Kit (manufactured by Applied Biosystems), and the base sequence of the amplified DNA fragment was subjected to DNA sequencer ABI. It was determined using a PRISM 3100 DNA analyzer (manufactured by Applied Biosystems). As a result, the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 22 was obtained.
Based on the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 22, primer rr3 (SEQ ID NO: 7) and primer rr4 (SEQ ID NO: 8) were designed. Using the primer AP1 (SEQ ID NO: 3) and the primer rr3 (SEQ ID NO: 7), the following conditions were applied to the human kidney Marathon-Ready cDNA (Clontech) by Advantage 2 DNA Polymerase (Clontech). The primary PCR was performed.
(5) 94 ° C for 30 seconds
(6) 35 cycles of 94 ° C for 10 seconds and -63 ° C for 2 minutes
Further, nested PCR was performed under the following conditions using Advantage 2 DNA Polymerase (manufactured by Clontech) using the product of this primary PCR as a template, primer AP2 (SEQ ID NO: 5) and primer rr4 (SEQ ID NO: 8), under the following conditions. Was.
(7) 94 ° C for 30 seconds
(8) 30 cycles of 94 ° C for 10 seconds and -63 ° C for 2 minutes
To 5 μl of the above nested PCR reaction solution, 1 μl each of Exonuclease I and Shrimp Alkaline Posphorase in PCR Product Pre-Sequencing Kit (manufactured by Usb) were added, and the reaction was carried out at 37 ° C. for 15 minutes and at 85 ° C. for 15 minutes. This was reacted using primer AP2 (SEQ ID NO: 5), primer rr4 (SEQ ID NO: 8), and BigDye Terminator Cycle Sequencing Kit (manufactured by Applied Biosystems), and the base sequence of the amplified DNA fragment was subjected to DNA sequencer ABI. It was determined using a PRISM 3100 DNA analyzer (manufactured by Applied Biosystems). As a result, the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 23 was obtained.
[0079]
Example 2
Cloning of 3 'downstream end of cDNA encoding human TCH229 protein
3'RACE PCR cloning revealed the base sequence 3 'under the cDNA encoding human TCH229 protein.
Using two types of primer DNAs, primer AP1 (SEQ ID NO: 3) and primer ff1 (SEQ ID NO: 9), an Advantage 2 DNA Polymerase (Clontech) against human kidney Marathon-Ready cDNA (Clontech) ), Primary PCR was performed under the following conditions.
(1) 94 ° C for 30 seconds
(2) 35 cycles of 94 ° C for 10 seconds and -63 ° C for 3 minutes
Further, nested PCR was performed under the following conditions using Advantage 2 DNA Polymerase (manufactured by Clontech) using the product of this primary PCR as a template and primer AP2 (SEQ ID NO: 5) and primer ff2 (SEQ ID NO: 10) under the following conditions. Was.
(3) 94 ° C for 30 seconds
(4) 30 cycles of 94 ° C for 10 seconds and -63 ° C for 3 minutes
To 5 μl of the above nested PCR reaction solution, 1 μl each of Exonuclease I and Shrimp Alkaline Posphorase in PCR Product Pre-Sequencing Kit (manufactured by Usb) were added, and the reaction was carried out at 37 ° C. for 15 minutes and at 85 ° C. for 15 minutes. This was reacted using primer AP2 (SEQ ID NO: 5), primer ff2 (SEQ ID NO: 10), and BigDye Terminator Cycle Sequencing Kit (manufactured by Applied Biosystems), and the base sequence of the amplified DNA fragment was subjected to DNA sequencer ABI. It was determined using a PRISM 3100 DNA analyzer (manufactured by Applied Biosystems). As a result, the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 24 was obtained.
[0080]
Example 3
Cloning of cDNA encoding human TCH229 protein
Using two kinds of primer DNAs, primer ORFF1 (SEQ ID NO: 11) and primer ORFR1 (SEQ ID NO: 12), pfu turbo DNA Polymerase (Stratagene) against human kidney Marathon-Ready cDNA (Clontech) Primary PCR was performed under the following conditions (1) to (3).
(1) 94 ° C for 30 seconds
(2) 35 cycles of 94 ° C for 10 seconds -57 ° C for 10 seconds -72 ° C for 2.5 minutes
(3) 72 ° C for 5 minutes
Further, using the product of this primary PCR as a template and the primer ORFF2 (SEQ ID NO: 13) and the primer ORFR2 (SEQ ID NO: 14), the following conditions (4) to pfu turbo DNA Polymerase (Stratagene) were used. Nested PCR was performed in (6).
(4) 94 ° C for 30 seconds
(5) 30 cycles of 94 ° C. for 10 seconds, −56 ° C. for 10 seconds, and −72 ° C. for 2.5 minutes
(6) 72 ° C for 5 minutes
The nested PCR reaction solution was purified using Min Elute Gel Extraction Kit (Qiagen). This DNA was cloned into the pCR-Blunt II-TOPO vector according to the protocol of Zero Blunt TOPO PCR Cloning Kit (manufactured by Invitrogen). This was introduced into Escherichia coli TOP10 competent cell (manufactured by Invitrogen) for transformation, and a clone having a cDNA insert was selected on an LB agar medium containing kanamycin to obtain a transformant. Each clone was cultured overnight in an LB medium containing kanamycin, and a plasmid DNA was prepared using QIAwell 8 Plasmid Kit (manufactured by Qiagen). Two clones # 1, # 2, and # 2 of the plasmid clone pCR-BluntII-TCH229 were prepared. 3 was obtained. This was combined with primer DNA [primer M13F (SEQ ID NO: 15), primer M13R (SEQ ID NO: 16), primer ORFF2 (SEQ ID NO: 13), primer ORFR2 (SEQ ID NO: 14), primer rr2 (SEQ ID NO: 6), Primer A1 (SEQ ID NO: 17), Primer B2 (SEQ ID NO: 18), Primer ff2 (SEQ ID NO: 10), Primer rr1 (SEQ ID NO: 4), Primer ff1 (SEQ ID NO: 9)], and BigDye Terminator Cycle Sequencing The reaction was carried out using Kit (manufactured by Applied Biosystems), and the base sequence of the inserted cDNA fragment was determined using a DNA sequencer ABI PRISM 3100 DNA Analyzer (manufactured by Applied Biosystems). . As a result, the obtained three clones contained the same DNA fragment and had 2251 base sequences (SEQ ID NO: 25). The fragment encodes 724 amino acid sequences (SEQ ID NO: 1) (SEQ ID NO: 2), and the protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 was named human TCH229 protein.
A transformant having a plasmid containing the cDNA fragment was named Escherichia coli TOP10 / pCR-BluntII-TCH229.
A homology search was performed on a known database using Blast P (Nucleic Acids Res., Vol. 25, p. 3389, 1997), and the cDNA was found to be a novel gene belonging to the organic anion transporter. (FIGS. 1 and 2). In the figure, the transmembrane regions are indicated by TM1 to TM12. It has 41% homology at the amino acid level with SLC21A12 (Biochemical and Biophysical Research Communications, vol. 273, p. 251, 2000), which is an organic anion transporter reported in humans, and OATPRP4 (GenBank Accession No. 030958) showed 36% homology at the amino acid level, suggesting that the protein has a 12-transmembrane structure.
[0081]
Example 4
Analysis of tissue distribution of human TCH229 gene product
Using two kinds of primer DNAs designed from the sequence of human TCH229, primer TMF (SEQ ID NO: 19) and primer TMR (SEQ ID NO: 20), and TaqMan probe P1 (SEQ ID NO: 21), The expression level of human TCH229 in the cDNA was measured by TaqMan PCR.
The reaction was first performed at 50 ° C. for 2 minutes and then at 95 ° C. for 10 minutes using ABI PRISM 7900 sequence detection system (Applied Biosystems) using TaqMan Universal PCR Master Mix (Applied Biosystems), and then 95%. Forty cycles were repeated at 15 ° C. for 15 seconds and 60 ° C. for one minute as one reaction cycle, and detection was performed simultaneously.
Table 1 shows the cDNA of each human tissue used for the measurement.
The results are shown in FIGS.
Human TCH229 gene product (mRNA) showed strong expression in human MTC panel I and MTC panel II in kidney and weak expression in lung, liver and pancreas.
In the human digestive system MTC panel, relatively strong expression was observed in the liver, but only slight expression was observed in all sites from the stomach to the rectum.
[Table 1]
Figure 2004081196
[0082]
Example 5
Cloning of 5 'upstream end of cDNA encoding mouse TCH229 protein
PCR cloning and 5′RACE PCR cloning revealed the 5 ′ upstream nucleotide sequence of the cDNA encoding the mouse TCH229 protein.
Using two types of primer DNAs [primer h243F (SEQ ID NO: 28) and primer mR1 (SEQ ID NO: 29)], mouse 2 Marathon-Ready cDNA (Clontech) and Advantage 2 DNA Polymerase (Clontech) Was performed under the following conditions.
(1) 94 ° C for 30 seconds
(2) 35 cycles of 94 ° C for 10 seconds -63 ° C for 10 seconds -68 ° C for 2 minutes
(3) 68 ° C for 3 minutes
To 5 μl of the above PCR reaction solution, 1 μl of Exonuclease I and Shrimp Alkaline Posthase in a PCR Product Pre-Sequencing Kit (manufactured by Usb) were added, and the reaction was carried out at 37 ° C. for 15 minutes and 85 ° C. for 15 minutes. This was reacted using primer h243F (SEQ ID NO: 28), primer mR1 (SEQ ID NO: 29), and BigDye Terminator Cycle Sequencing Kit (manufactured by Applied Biosystems), and the base sequence of the amplified DNA fragment was subjected to DNA sequencer ABI. It was determined using a PRISM 3100 DNA analyzer (manufactured by Applied Biosystems). As a result, the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 48 was obtained.
Based on SEQ ID NO: 48, primer mrr5 (SEQ ID NO: 30) and primer mrr6 (SEQ ID NO: 31) were designed. Using two types of primer DNAs [Primer AP1 (SEQ ID NO: 3) and primer mrr6 (SEQ ID NO: 31)], an Advantage 2 DNA Polymerase (Clontech) against mouse kidney Marathon-Ready cDNA (Clontech). Primary PCR was performed under the following conditions.
(1) 94 ° C for 30 seconds
(2) 40 cycles of 94 ° C for 10 seconds and -64 ° C for 4 minutes
Further, nested PCR was performed under the following conditions using Advantage 2 DNA Polymerase (manufactured by Clontech) using the product of this primary PCR as a template and primer AP2 (SEQ ID NO: 5) and primer mrr5 (SEQ ID NO: 30) under the following conditions. Was.
(3) 94 ° C for 30 seconds
(4) 35 cycles of 94 ° C for 10 seconds and -64 ° C for 3 minutes
To 5 μl of the nested PCR reaction solution, 1 μl of each of Exonuclease I and Shrimp Alkaline Posphorase in PCR Product Pre-Sequencing Kit (manufactured by Usb) were added, and the reaction was carried out at 37 ° C. for 15 minutes and at 85 ° C. for 15 minutes. This was reacted using primer mrr5 (SEQ ID NO: 30) and BigDye Terminator Cycle Sequencing Kit (manufactured by Applied Biosystems), and the base sequence of the amplified DNA fragment was analyzed using the DNA sequencer ABI PRISM 3100 DNA Analyzer (Applied Biosystems). Was used for the determination. As a result, the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 49 was obtained.
[0083]
Example 6
Cloning of 3 'downstream end of cDNA encoding mouse TCH229 protein
3 ′ RACE PCR cloning revealed the 3 ′ upstream nucleotide sequence of cDNA encoding mouse TCH229 protein.
Using two types of primer DNAs [Primer AP1 (SEQ ID NO: 3) and primer mF1 (SEQ ID NO: 32)], an Advantage 2 DNA Polymerase (Clontech) against mouse kidney Marathon-Ready cDNA (Clontech). Primary PCR was performed under the following conditions.
(1) 94 ° C for 30 seconds
(2) 40 cycles of 94 ° C for 10 seconds and -61 ° C for 4 minutes
Further, nested PCR was performed under the following conditions using Advantage 2 DNA Polymerase (manufactured by Clontech) using the product of the primary PCR as a template and primer AP2 (SEQ ID NO: 5) and primer mff2 (SEQ ID NO: 33) under the following conditions. Was.
(3) 94 ° C for 30 seconds
(4) 35 cycles of 94 ° C for 10 seconds and -61 ° C for 3 minutes
To 5 μl of the nested PCR reaction solution, 1 μl of each of Exonuclease I and Shrimp Alkaline Posphorase in PCR Product Pre-Sequencing Kit (manufactured by Usb) were added, and the reaction was carried out at 37 ° C. for 15 minutes and at 85 ° C. for 15 minutes. This was reacted using primer mff2 (SEQ ID NO: 33) and BigDye Terminator Cycle Sequencing Kit (manufactured by Applied Biosystems), and the base sequence of the amplified DNA fragment was analyzed using the DNA sequencer ABI PRISM 3100 DNA Analyzer (Applied Biosystems). Was used for the determination. As a result, the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 50 was obtained.
[0084]
Example 7
Cloning of cDNA encoding mouse TCH229 protein
Using two types of primer DNAs (primer mORFF (4) (SEQ ID NO: 34) and primer mORFR (2195) (SEQ ID NO: 35)), pfu was obtained for mouse kidney Marathon-Ready cDNA (Clontech). Primary PCR was performed using turbo DNA Polymerase (manufactured by Stratagene) under the following conditions (1) to (3).
(1) 94 ° C for 30 seconds
(2) 35 cycles of 94 ° C for 10 seconds -56 ° C for 10 seconds -72 ° C for 2 minutes
(3) 72 ° C for 5 minutes
Further, using the product of this primary PCR as a template and primer mORFF (atg) (SEQ ID NO: 36) and primer mORFR (tga) (SEQ ID NO: 37), pfu turbo DNA Polymerase (manufactured by Stratagene) Nested PCR was performed under the conditions (4) to (6).
(4) 94 ° C for 30 seconds
(5) 30 cycles of 94 ° C for 10 seconds -56 ° C for 10 seconds -72 ° C for 2 minutes
(6) 72 ° C for 5 minutes
1.5 μl of Advantage 2 DNA Polymerase (Clontech) was added to 10 μl of the nested PCR reaction solution, and the mixture was reacted at 72 ° C. for 10 minutes and purified using Min Elute Gel Extraction Kit (Qiagen). This DNA was cloned into the pCR2.1-TOPO vector according to the protocol of TOPO TA Cloning Kit (Invitrogen). This was introduced into Escherichia coli TOP10 competent cell (manufactured by Invitrogen) for transformation, and a clone having a cDNA insert was selected on an LB agar medium containing kanamycin to obtain a transformant. Each clone was cultured overnight in an LB medium containing kanamycin, and a plasmid DNA was prepared using QIAwell 8 Plasmid Kit (manufactured by Qiagen). Two clones # 1, # 2 and # of plasmid clone pCR2.1-mTCH229 were prepared. 3 was obtained. This was combined with primer DNA [primer M13F (SEQ ID NO: 15), primer M13R (SEQ ID NO: 16), primer h243F (SEQ ID NO: 28), primer mR1 (SEQ ID NO: 29), primer h650F (SEQ ID NO: 38), Primer h910F (SEQ ID NO: 39), primer mrr1 (SEQ ID NO: 40), primer mrr2 (SEQ ID NO: 41), primer mrr3 (SEQ ID NO: 42), primer F (45) (SEQ ID NO: 43), primer m521R (SEQ ID NO: 44), primer mF1 (SEQ ID NO: 32), primer mff2 (SEQ ID NO: 33), primer mrr6 (SEQ ID NO: 31)] and BigDye Terminator Cycle Sequencing Kit (Applied Biosystems) And the base sequence of the inserted cDNA fragment was determined using a DNA sequencer ABI PRISM 3100 DNA Analyzer (manufactured by Applied Biosystems). As a result, the obtained three clones contained the same DNA fragment and had 2169 base sequences (SEQ ID NO: 51). The fragment encodes 722 amino acid sequences (SEQ ID NO: 26) (SEQ ID NO: 27), and a protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 26 was designated as mouse TCH229 protein.
A transformant having a plasmid containing the cDNA fragment was designated as Escherichia coli TOP10 / pCR2.1-mTCH229.
When a homology search was performed on a known database using Blast P (Nucleic Acids Res., Vol. 25, p. 3389, 1997), the cDNA was found to be mouse SLC21A11 (an organic anion transporter reported in mice). Genbank: NP — 076397) and 43.2% homology at the base level and 37% at the amino acid level. Further, mouse TCH229 showed a homology of 83% at the base level and 81% at the amino acid level with human TCH229, a novel gene belonging to the organic anion transporter family, indicating that it is a mouse homolog of human TCH229 ( (Fig. 5). In the figure, transmembrane regions are indicated by TM1 to 12 and amino acids highly conserved among families are indicated by *.
[0085]
Example 8
Analysis of tissue distribution of mouse TCH229 gene product
Using two kinds of primer DNAs designed from the sequence of mouse TCH229, primer mTMF (SEQ ID NO: 45) and primer mTMR (SEQ ID NO: 46), and TaqMan probe mP1 (SEQ ID NO: 47), The expression level of mouse TCH229 in the cDNA was measured by TaqMan PCR.
The reaction was first performed at 50 ° C. for 2 minutes and then at 95 ° C. for 10 minutes using ABI PRISM 7900 sequence detection system (Applied Biosystems) using TaqMan Universal PCR Master Mix (Applied Biosystems), and then 95%. Forty cycles were repeated at 15 ° C. for 15 seconds and 60 ° C. for one minute as one reaction cycle, and detection was performed simultaneously.
FIG. 6 shows the results.
In the mouse MTC panel I and MTC panel II, the mouse TCH229 gene product (mRNA) showed strong expression in the prostate and relatively high expression in the bone marrow, eyes, lungs, and kidneys.
[0086]
Example 9
5 ′ upstream cloning PCR cloning of cDNA encoding rat TCH229 protein and 5 ′ RACE PCR cloning revealed the 5 ′ upstream base sequence of cDNA encoding rat TCH229 protein.
Rat kidney Marathon-Ready cDNA (Clontech) was used using two kinds of primer DNAs designed based on the sequence of mouse TCH229 (SEQ ID NO: 51), primer m163F (SEQ ID NO: 56) and primer m2087R (SEQ ID NO: 57). PCR) was performed using Advantage 2 DNA Polymerase (manufactured by Clontech) under the following conditions.
(1) 94 ° C for 30 seconds
(2) 35 cycles of 94 ° C. for 10 seconds, −60 ° C. for 10 seconds, and −68 ° C. for 2.5 minutes
(3) 68 ° C for 5 minutes
To 5 μl of the PCR reaction solution, 1 μl each of Exonuclease I and Shrimp Alkaline Posphorase in the PCR Product Pre-Sequencing Kit (manufactured by Usb) were added, and the reaction was carried out at 37 ° C. for 15 minutes and 85 ° C. for 15 minutes. This was reacted using primer m163F (SEQ ID NO: 56), primer m2087R (SEQ ID NO: 57) and BigDye Terminator Cycle Sequencing Kit (manufactured by Applied Biosystems), and the base sequence of the amplified DNA fragment was analyzed using a DNA sequencer ABI PRISM. It was determined using a 3100 DNA analyzer (manufactured by Applied Biosystems). As a result, the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 77 was obtained.
Based on SEQ ID NO: 77, primers r229-rr1 (SEQ ID NO: 58) and primer r229-rr2 (SEQ ID NO: 59) were designed. Using two types of primer DNAs, a primer AP1 (SEQ ID NO: 3) and a primer r229-rr1 (SEQ ID NO: 58), an Advantage 2 DNA Polymerase (Clontech) was applied to rat kidney Marathon-Ready cDNA (Clontech). Primary PCR was performed under the following conditions.
(1) 94 ° C for 30 seconds
(2) 35 cycles of 94 ° C for 10 seconds and -64 ° C for 2 minutes
Furthermore, using the product of this primary PCR as a template, primer AP2 (SEQ ID NO: 5) and primer r229-rr2 (SEQ ID NO: 59), Advantage 2 DNA Polymerase (manufactured by Clontech) and nested PCR under the following conditions: Was done.
(3) 94 ° C for 30 seconds
(4) 35 cycles of 94 ° C for 10 seconds and -64 ° C for 2 minutes
To 5 μl of the above nested PCR reaction solution, 1 μl each of Exonuclease I and Shrimp Alkaline Posphorase in PCR Product Pre-Sequencing Kit (manufactured by Usb) were added, and the reaction was carried out at 37 ° C. for 15 minutes and at 85 ° C. for 15 minutes. This was reacted with primers r229-rr2 (SEQ ID NO: 59) and BigDye Terminator Cycle Sequencing Kit (manufactured by Applied Biosystems), and the base sequence of the amplified DNA fragment was analyzed using a DNA sequencer ABI PRISM 3100 DNA Analyzer (Applied Biosystems). (Manufactured by Systems Inc.). As a result, the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 78 was obtained.
[0087]
Example 10
Cloning of 3 'downstream end of cDNA encoding rat TCH229 protein
The 3 ′ downstream nucleotide sequence of the cDNA encoding the rat TCH229 protein was revealed by 3 ′ RACE PCR cloning.
Using two types of primer DNAs, primer AP1 (SEQ ID NO: 3) and primer rff1 (SEQ ID NO: 60), an Advantage 2 DNA Polymerase (Clontech) against rat kidney Marathon-Ready cDNA (Clontech). ), Primary PCR was performed under the following conditions.
(1) 94 ° C for 30 seconds
(2) 35 cycles of 94 ° C for 10 seconds and -64 ° C for 2 minutes
Further, using the product of this primary PCR as a template, nested PCR was performed under the following conditions by Advantage 2 DNA Polymerase (Clontech) using primer AP2 (SEQ ID NO: 5) and primer rff3 (SEQ ID NO: 61). Was.
(3) 94 ° C for 30 seconds
(4) 30 cycles of 94 ° C for 10 seconds and -64 ° C for 2 minutes
To 5 μl of the above nested PCR reaction solution, 1 μl each of Exonuclease I and Shrimp Alkaline Posphorase in PCR Product Pre-Sequencing Kit (manufactured by Usb) were added, and the reaction was carried out at 37 ° C. for 15 minutes and at 85 ° C. for 15 minutes. This was reacted using primer rff3 (SEQ ID NO: 61) and BigDye Terminator Cycle Sequencing Kit (manufactured by Applied Biosystems), and the base sequence of the amplified DNA fragment was analyzed using the DNA sequencer ABI PRISM 3100 DNA Analyzer (Applied Biosystems). Was used for the determination. As a result, the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 79 was obtained.
[0088]
Example 11
Cloning of cDNA encoding rat TCH229 protein
Using two types of primer DNAs, primer rORFF1 (SEQ ID NO: 62) and primer rORFR12 (SEQ ID NO: 63), pfu turbo DNA Polymerase (Stratagene) against rat kidney Marathon-Ready cDNA (Clontech) Primary PCR was performed under the following conditions (1) to (3).
(1) 94 ° C for 30 seconds
(2) 35 cycles of 94 ° C for 10 seconds -56 ° C for 10 seconds -72 ° C for 2.5 minutes
(3) 72 ° C for 5 minutes
Further, using the product of this primary PCR as a template and the primer rORFF (atg) (SEQ ID NO: 64) and the primer rORFR (tga2) (SEQ ID NO: 65), the following reaction was performed by pfu turbo DNA Polymerase (manufactured by Stratagene). Nested PCR was performed under conditions (4) to (6).
(4) 94 ° C for 30 seconds
(5) 30 cycles of 94 ° C. for 10 seconds, −56 ° C. for 10 seconds, and −72 ° C. for 2.5 minutes
(6) 72 ° C for 5 minutes
1.5 μl of Advantage 2 DNA Polymerase (Clontech) was added to 10 μl of the nested PCR reaction solution, and the mixture was reacted at 72 ° C. for 10 minutes and purified using Min Elute Gel Extraction Kit (Qiagen). This DNA was cloned into the pCRII-TOPO vector according to the protocol of TOPO TA Cloning Kit (Invitrogen). This was introduced into Escherichia coli TOP10 competent cell (manufactured by Invitrogen) for transformation, and a clone having a cDNA insert was selected on an LB agar medium containing kanamycin to obtain a transformant. The individual clones were cultured overnight in an LB medium containing kanamycin, and plasmid DNA was prepared using QIAwell 8 Plasmid Kit (manufactured by Qiagen), and 4 clones # 1, # 2, # 3 and 4 of plasmid clone pCRII-rTCH229 were prepared. # 4 was obtained. This was combined with primer DNA [primer T7 (SEQ ID NO: 66), primer SP6 (SEQ ID NO: 67), primer rORFF (atg) (SEQ ID NO: 64), primer rORFR (tga2) (SEQ ID NO: 65), primer rF1 ( SEQ ID NO: 68), primer rTMR (SEQ ID NO: 69), primer rTMF (SEQ ID NO: 70), primer rff3 (SEQ ID NO: 61), primer rff2 (SEQ ID NO: 71), primer rR1 (SEQ ID NO: 72) Primer r972F (SEQ ID NO: 73), primer r1123F (SEQ ID NO: 74), primer r1746R (SEQ ID NO: 75)] and BigDye Terminator Cycle Sequencing Kit (manufactured by Applied Biosystems). Was carried out, the base sequence of the cDNA fragment inserted was determined using DNA sequencer ABI PRISM 3100 DNA Analyzer (Applied Biosystems). As a result, the obtained four clones contained two types of DNA fragments (No. 1 and No. 2). No. 1 has a base sequence of 2175 (SEQ ID NO: 80), and the fragment encodes a 724 amino acid sequence (SEQ ID NO: 52) (SEQ ID NO: 53). It contained the amino acid sequence represented. No. 2 has a base sequence of 2175 (SEQ ID NO: 81), and the fragment encodes 724 amino acid sequences (SEQ ID NO: 54) (SEQ ID NO: 55). It contained the amino acid sequence represented. Each protein was designated as rat TCH229 protein No. 1 and rat TCH229 protein no. No. 2. The transformant having the plasmid containing the cDNA fragment was individually subjected to Escherichia coli TOP10 / pCRII-rTCH229No. 1 and Escherichia coli TOP10 / pCRII-rTCH229No. No. 2.
Rat TCH229 protein no. 1 and rat TCH229 protein no. In No. 2, four base substitutions (144th, 231, 1252, and 1539 in the base sequence represented by SEQ ID NO: 53) were observed. Of the four positions, three of A144T (Glu → Asp), C231A (Ser → Arg), and A1252T (IIe → Phe) each had the amino acid substitution shown in parentheses, but A1539G had no amino acid substitution. There was no. It is thought that these base substitutions may be derived from genetic polymorphisms (SNPs).
When a homology search was performed on a known database using Blast P (Nucleic Acids Res. 25, 3389, 1997), rat TCH229No. 1 and No. 2 has a homology of about 50% at the base level and about 41% at the amino acid level with rat oatp-E (Endocrinology Vol. 142 (5), p. 2005, 2001) which is an organic anion transporter reported in rats. Showed sex. In addition, rat TCH229No. 1 and No. 2 has a homology of about 81.4% at the base level and about 81.6% at the amino acid level with human TCH229, a novel gene belonging to the organic anion transporter family, indicating that it is a rat homolog of human TCH229. (FIGS. 7 and 8). In the drawing, the transmembrane regions are denoted by TM1 to TM12.
[0089]
Example 12
Analysis of tissue distribution of rat TCH229 gene product
Using two kinds of primer DNAs designed from the sequence of rat TCH229, primer rTMF (SEQ ID NO: 70) and primer rTMR (SEQ ID NO: 69), and TaqMan probe rP1 (SEQ ID NO: 76), each rat tissue ( The expression level of rat TCH229 in cDNA of spleen, thymus, testis, small intestine, stomach, skin, heart, brain, lung, muscle, kidney) was measured by TaqMan PCR.
The reaction was first performed at 50 ° C. for 2 minutes and then at 95 ° C. for 10 minutes using ABI PRISM 7900 sequence detection system (Applied Biosystems) using TaqMan Universal PCR Master Mix (Applied Biosystems), and then 95%. Forty cycles were repeated at 15 ° C. for 15 seconds and 60 ° C. for one minute as one reaction cycle, and detection was performed simultaneously. FIG. 9 shows the results.
Rat TCH229 gene product (mRNA) showed strong expression in lung and kidney in Multiple Choice cDNAs; RatKitI and RatKitII (manufactured by Origene), and also expression in skin and brain.
[0090]
Example 13
Analysis of tissue distribution of mouse TCH229 gene product in 7-week-old BALB / c mice
(1) Preparation of cDNA for each tissue of normal mouse
7-week-old BALB / c mouse tissues [cerebrum, cerebellum, hippocampus, medulla oblongata, spinal cord, sciatic nerve, skin, skeletal muscle, eyeball, heart, lung, trachea, pancreas, kidney, liver, forestomach, posterior stomach, duodenum , Jejunum, cecum, colon, rectum, spleen, thymus, bone marrow, ovary, uterus, prostate, testis (1 to 10 ovaries and uterus are collected from females, and the rest are collected from males). (Manufactured by Nippon Gene) or RNeasy Mini Kit (manufactured by Qiagen) was used to prepare total RNA. The prepared total RNA was subjected to a reverse transcription reaction using TaqMan Reverse Transcription Reagents (manufactured by Applied Biosystems) to prepare cDNA.
(2) Analysis of tissue distribution of mouse TCH229 gene product
Using the two types of primer DNA, primer mTMF (SEQ ID NO: 45) and primer mTMR (SEQ ID NO: 46) used in Example 8, and TaqMan probe mP1 (SEQ ID NO: 47), The expression level (copy number) of mouse TCH229 in the cDNA was measured by TaqMan PCR. For the same cDNA, the expression level (copy number) of the rodent glycoderaldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) was also measured using TaqMan rodent GAPDH control reagents (manufactured by Applied Biosystems). The reaction was first performed at 50 ° C. for 2 minutes and then at 95 ° C. for 10 minutes using ABI PRISM 7900 sequence detection system (Applied Biosystems) using TaqMan Universal PCR Master Mix (Applied Biosystems), and then 95%. Forty cycles were repeated at 15 ° C. for 15 seconds and 60 ° C. for one minute as one reaction cycle, and detection was performed simultaneously.
The results are shown in FIG.
The mouse TCH229 gene product (mRNA) was slightly expressed in prostate, trachea, kidney, and bone marrow, and highly expressed in lung in each tissue of BALB / c mice at 7 weeks of age.
[0091]
Example 14
(1) Preparation of cDNA for normal rat tissues
Total RNA from 12-week-old Wistar rat male tissues (cerebrum, cerebellum, liver, kidney, prostate, heart, lung, duodenum, jejunum, colon, skin, eyeball) using RNeasy Mini Kit (Qiagen) Was prepared. The prepared total RNA was subjected to a reverse transcription reaction using TaqMan Reverse Transcription Reagents (manufactured by Applied Biosystems) to prepare cDNA.
(2) Analysis of tissue distribution of rat TCH229 gene product
Using the two types of primer DNA, primer rTMF (SEQ ID NO: 70) and primer rTMR (SEQ ID NO: 69) used in Example 12, and TaqMan probe rP1 (SEQ ID NO: 76), The expression level (copy number) of rat TCH229 in the cDNA was measured by TaqMan PCR. For the same cDNA, the expression level (copy number) of the rodent glycoderaldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) was also measured using TaqMan rodent GAPDH control reagents (manufactured by Applied Biosystems). The reaction was first performed at 50 ° C. for 2 minutes and then at 95 ° C. for 10 minutes using ABI PRISM 7900 sequence detection system (Applied Biosystems) using TaqMan Universal PCR Master Mix (Applied Biosystems), and then 95%. Forty cycles were repeated at 15 ° C. for 15 seconds and 60 ° C. for one minute as one reaction cycle, and detection was performed simultaneously.
The results are shown in FIG.
In the tissues of 12-week-old Wistar rats, high expression of the rat TCH229 gene product (mRNA) was observed in kidney and lung.
[0092]
Example 15
Construction of human TCH229 expression vector
A human TCH229 (SEQ ID NO: 1) expression vector was created by the following method.
Using 10 ng of the plasmid obtained in Example 1 as a template and primers 229OF2 (SEQ ID NO: 82) and 229OR2 (SEQ ID NO: 83), pfu turbo DNA Polymerase (manufactured by Stratagene) under the following conditions (1): ) To (3), PCR was performed. The 5′-end primer 229OF2 and the 3′-end primer 229OR2 were designed to add an EcoRV site and an XhoI site to the 5 ′ end for cloning into a vector, respectively.
(1) 94 ° C for 30 seconds
(2) 35 cycles of 94 ° C for 10 seconds -55 ° C for 10 seconds -70 ° C for 2.5 minutes
(3) 70 ° C for 5 minutes
After gel electrophoresis of the PCR reaction solution, the main band was purified. The PCR fragment thus obtained was digested with the restriction enzymes EcoRV and XhoI by incubating at 37 ° C. for 1 hour, and the reaction solution was purified by gel electrophoresis. This was added to Takara ligation kit ver. At the EcoRV site and XhoI site of pcDNA3.1 (+) (Invitrogen), which is an animal cell expression vector. 2 (manufactured by Takara Bio Inc.). After the ligation reaction mixture was subjected to ethanol precipitation, the ligation reaction mixture was transformed into competent E. coli (Escherichia coli) TOP10 (manufactured by Invitrogen). A plasmid was prepared from a plurality of colonies thus obtained, and this base sequence was used as a primer DNA [primer BGH RV (SEQ ID NO: 84), primer T7 (SEQ ID NO: 66), primer 229OF2 (SEQ ID NO: 82), primer 229OR2 (SEQ ID NO: 83), primer rr2 (SEQ ID NO: 6), primer A1 (SEQ ID NO: 17), primer B2 (SEQ ID NO: 18), primer ff2 (SEQ ID NO: 10), primer rr1 (SEQ ID NO: 4), primer ff1 (SEQ ID NO: 9)]], and a reaction using BigDye Terminator Cycle Sequencing Kit (manufactured by Applied Biosystems), and the base sequence was determined using the DNA sequencer ABI PRISM 3100 DNA Analyzer (App). It was confirmed by using the id Biosystems). A transformant having this plasmid was named Escherichia coli TOP10 / pCDNA3.1 (+)-TCH229.
[0093]
Example 16
Preparation of CHO cell line expressing human TCH229 and measurement of transgene expression level
Escherichia coli TOP10 / pCDNA3.1 (+)-TCH229 was cultured, and a plasmid DNA was prepared from the Escherichia coli body using EndoFree Plasmid Maxi Kit (manufactured by Qiagen). This plasmid DNA was subjected to CHO dhfr using FuGENE 6 Transfection Reagent (manufactured by Roche) according to the attached protocol. The cells were introduced. A mixture of 2 μg of plasmid DNA and transfection reagent was added 2 × 10 4 hours before 5 CHO dhfr Cells were added to a seeded 6 cm diameter petri dish. After culturing in MEMα medium (Invitrogen) containing 10% fetal bovine serum (JRH Bioscience) for 1 day, 1.0 mg / ml Geneticin (Invitrogen) was added to the medium, and then TCH229 expressing cells were further added. Was cultured. The medium was exchanged several times during the process. After about 10 days, the cells were separated by trypsin treatment, and the collected cells were seeded on a 96-well plate at 0.5 to 1 cell per well, and thereafter, 1.0 mg / ml of Geneticin was added for about 10 days. TCH229 expressing cells were selected in a medium containing. For wells in which one colony was grown per well, total RNA was prepared from the grown cells using RNeasy Mini Kit or RNeasy 96 Kit (both manufactured by Qiagen). The prepared total RNA was subjected to a reverse transcription reaction using TaqMan Reverse Transcription Reagents (manufactured by Applied Biosystems) to prepare cDNA. In this regard, human TCH229 was purified using the two types of primer DNA, primer TMF (SEQ ID NO: 19) and primer TMR (SEQ ID NO: 20) used in Example 4, and TaqMan probe P1 (SEQ ID NO: 21). The expression level was measured by TaqMan PCR. The reaction was first performed at 50 ° C. for 2 minutes and then at 95 ° C. for 10 minutes using ABI PRISM 7900 sequence detection system (Applied Biosystems) using TaqMan Universal PCR Master Mix (Applied Biosystems). Forty cycles were repeated at 95 ° C. for 15 seconds and 60 ° C. for 1 minute as one reaction cycle, and detection was performed simultaneously. As a human TCH229 gene high expression cell line (monoclonal), clone No. 71 was selected.
[0094]
Example 17
Expression analysis of human TCH229 gene in commercially available normal human cells
(1) Preparation of normal human cell cDNA
Normal human cells were purchased from Cambrex BioScience Walkersville and cultured according to the instructions provided with the product. Table 2 shows the cells used in the experiment.
[Table 2]
Figure 2004081196
75cm each cell 2 The cells were cultured in a culture flask so as to be subconfluent. For the cells marked with * in the table, TNF-α, IL-1β and IL-6 were added to a final concentration of 10 ng / ml. For the cells not marked with *, 16 hours after the start of culture, and for the cells marked with *, 8 hours after adding the mixture of TNF-α, IL-1β and IL-6, Was recovered by trypsin-EDTA treatment. Total RNA was prepared from the collected cells using ISOGEN (manufactured by Nippon Gene) or RNeasy Mini Kit (manufactured by Qiagen) (contaminated DNA was removed by DNase treatment in each case). The prepared total RNA was subjected to a reverse transcription reaction using TaqMan Reverse Transcription Reagents (manufactured by Applied Biosystems) to prepare cDNA.
(2) Preparation of cDNA for human normal cells subjected to various stimuli
a) Renal proximal tubular epithelial cells (RPTEC) and renal cortical epithelial cells (HRCE) (both manufactured by Cambrex BioScience Walkersville) were 1 × 10 4 in a collagen I-coated 24-well plate. 5 The seeds were inoculated individually, cultured overnight, replaced with a triiodothyronine (T3) -free bread kit REGM (manufactured by BIO WHITTAKER), and further cultured for 30 minutes.
b) As stimulants, TGF-β1 (manufactured by Wako Pure Chemical Industries), TNF-α (manufactured by Genzyme), IL-1β (manufactured by Genzyme), IL-6 (manufactured by Genzyme) and PMA (manufactured by Wako Pure Chemical) (Manufactured by the company). A solution was prepared by diluting each of these five stimulants with a T3-free bread kit REGM (manufactured by BIO WHITTAKER) to a final concentration of 10 ng / ml.
c) Immediately after removing the culture supernatant of RPTEC and HRCE in a) above, 500 μl of the solution prepared in b) was added per well, followed by culturing. As a control, a solution prepared by diluting a mixture of the solvents in which the above five kinds of stimulants are dissolved with a T3-free bread kit REGM (manufactured by BIO WHITTAKE) at the same ratio as the stimulant was prepared, and RPTEC and HRCE were used per well. The culture was performed by adding 500 μl each.
d) 0.5, 1, 2, 4, 6 and 8 hours after the addition of the stimulant, the cells were collected respectively, and total RNA was prepared using RNeasy Mini Kit (manufactured by Qiagen). A reverse transcription reaction was performed on the prepared total RNA using TaqMan Reverse Transcription Reagents (manufactured by Applied Biosystems) to prepare cDNA.
(3) Expression analysis of human TCH229 gene in commercially available normal human cells
Using the two types of primer DNA, primer TMF (SEQ ID NO: 19) and primer TMR (SEQ ID NO: 20) used in Example 4, and the TaqMan probe P1 (SEQ ID NO: 21), The expression level (copy number) of human TCH229 was measured by TaqMan PCR in cDNA prepared from PRTEC and HRCE stimulated with a stimulant, respectively. Expression amounts of ribosomal RNA (18S) of cDNA prepared from normal human cells and RPTEC and HRCE stimulated with a stimulant, respectively, using Eukaryotic 18S rRNA Pre-Developed TaqMan Assay Reagents (manufactured by Applied Biosystems). ) Or Human GAPDH (GAPDH) (manufactured by Applied Biosystems) was also used to measure the expression level (copy number) of human glycodealdehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH). The reaction was first carried out at 50 ° C. for 2 minutes and further at 95 ° C. for 10 minutes using ABI PRISM 7900 sequence detection system (Applied Biosystems) using TaqMan Universal PCR Master Mix (Applied Biosystems). Forty cycles were repeated at 95 ° C. for 15 seconds and 60 ° C. for one minute as one reaction cycle, and detection was performed simultaneously.
FIG. 12 shows changes in the expression of human TCH229 in human normal cells. Cells marked with * in Table 2 were stimulated with TNF-α, IL-1β and IL-6 (each at 10 ng / ml), but little change in expression was observed compared to no stimulation. And almost no expression was observed.
FIG. 13 shows changes in the expression of human TCH229 in RPTEC stimulated with the stimulant, and FIG. 14 shows changes in the expression of human TCH229 in HRCE stimulated with the stimulant.
The human TCH229 gene product (mRNA) was specifically expressed in renal proximal tubular epithelial cells and slightly expressed in renal cortical epithelial cells. In addition, when RPTEC and HRCE were stimulated with TGF-β1, TNF-α, IL-1β or PMA, the expression of human TCH229 was confirmed to be decreased in a culture time-dependent manner as compared with the control. .
[0095]
Example 18
Expression analysis of rat TCH229 gene product in renal disease model (Wistar Fatty, SHC, Zucker Fatty) rat kidney
As disease model animals, three types of Wistar Fatty rats (WF rats), Zucker Fatty rats (ZF rats), and spontaneously hypercholesterolemic rats (SHC rats) were used. As corresponding controls, WF rats were used. Used Wistar Lean Rat (WL rat), Zucker Lean Rat (ZL rat) for ZF rat, and SD Rat (SD rat) for SHC rat.
Wistar Fatty rats (WF rats) show symptoms characteristic of diabetes in addition to renal dysfunction symptoms. Therefore, as a diabetic nephropathy model (Frontiers in diabetes research, lessons from animal diabetes II, 535-541, 1988). ) And Zucker Fatty rats (ZF rats) exhibit renal dysfunction and diabetic symptoms in the same manner as WF rats. Therefore, as a diabetic nephropathy model (Kidney international, 52, S218-S220, 1997). ), Spontaneously hypercholesterolemic rats (SHC rats) show symptoms similar to human focal glomerulosclerosis, and are used as focal glomerulosclerosis model (Japanese Society of Nephrology, Vol. 37, 91). 99 pages, has been 1995 years) reported.
(1) Disease model animals and control animals are bred under the same conditions. For WF rats and WL rats, 13 weeks (before onset), 20 weeks (after onset), 42 weeks (for advanced stage) and 68 weeks (for reduced renal function) Phase), at 6 weeks (pre-onset), 12 weeks (post-onset), 20 weeks (expansion phase) and 26-30 weeks (renal dysfunction phase) in SHC rats and SD rats, and in ZF rats and ZL rats. At 8 weeks (before onset) and 27 weeks (after onset), total RNA was extracted as follows.
WF rat group (each week n = 5), WL rat group (each week n = 5), SHC rat group (each week n = 5), SD rat group (each week n = 5), ZF rat group (each week) n = 9), kidneys of the ZL rat group (each weekly age n = 9) were sliced so as to be about 100 mg in a fractured surface including the nipple, and total RNA was extracted using ISOGEN according to the attached manual. . Further, contaminating DNA was removed using QIAGEN RNeasy Mini kit (manufactured by Qiagen) and RNase-Free DNase set (manufactured by Qiagen). The prepared total RNA was subjected to a reverse transcription reaction using TaqMan Reverse Transcription Reagents (manufactured by Applied Biosystems) to prepare cDNA.
[0096]
(2) Expression analysis of rat TCH229 gene product in renal disease model rat kidney
Prepared in (1) above using the two kinds of primer DNA, primer rTMF (SEQ ID NO: 70) and primer rTMR (SEQ ID NO: 69) used in Example 12, and TaqMan probe rP1 (SEQ ID NO: 76). The expression level (copy number) of rat TCH229 in the renal disease model rat kidney cDNA was measured by TaqMan PCR. For the same cDNA, the expression level (copy number) of the rodent glycoderaldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) was also measured using TaqMan rodent GAPDH control reagents (manufactured by Applied Biosystems). The reaction was first performed at 50 ° C. for 2 minutes and then at 95 ° C. for 10 minutes using ABI PRISM 7900 sequence detection system (Applied Biosystems) using TaqMan Universal PCR Master Mix (Applied Biosystems), and then 95%. Forty cycles were repeated at 15 ° C. for 15 seconds and 60 ° C. for one minute as one reaction cycle, and detection was performed simultaneously. FIG. 15 shows the results of the WF rat group, FIG. 16 shows the results of the SHC rat group, and FIG. 17 shows the results of the ZF rat group.
The expression of rat TCH229 was reduced in all three types of renal disease model rat kidneys after the onset of renal dysfunction as compared to each control group. From this, TCH229 may be involved in renal diseases such as nephropathy.
[0097]
【The invention's effect】
The protein, polynucleotide and antibody of the present invention include, for example, renal diseases (eg, renal failure, glomerulonephritis, diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, interstitial nephritis, renal disease) Sclerosis, uremia, etc.), liver disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.), pancreatic disease (eg, pancreatitis, etc.), immune disease associated with thymic abnormalities, genital disease (eg, prostatic hypertrophy, prostate gland) Inflammation, testicular neurosis, ovarian cysts, etc.), gastrointestinal disorders (eg, irritable bowel syndrome, ulcerative colitis, ischemic colitis, gastritis, etc.), spleen disorders (eg, hypersplenism, splenomegaly syndrome) ), Cancer (eg, lung, kidney, liver, non-small cell lung, ovarian, prostate, stomach, bladder, breast, cervical, colon, rectal, pancreatic, thyroid, Myeloid leukemia, etc.), respiratory diseases (eg, pleurisy, pneumonia, chronic Obstructive lung disease, asthma, etc.), osteomyelitis, diabetes, hypertension, post-ischemic reperfusion injury, retinitis, central nervous system diseases (eg, epilepsy, Alzheimer's disease, Parkinson's syndrome, schizophrenia, etc.), skin diseases (eg, It is useful as a diagnostic marker for thyroid hormone-related diseases such as atopic dermatitis and seborrheic dermatitis (eg, thyroid hormone refractory disease, Basedow's disease, cretin disease, hyperthyroidism, etc.). Compounds that promote or inhibit the activity of the protein obtained by a screening method using the protein, polynucleotide, or antibody include compounds that promote or inhibit the expression of the protein gene, compounds that promote or inhibit the expression of the protein, and the like. For example, renal diseases (eg, renal failure, glomerulonephritis, diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, interstitial nephritis, renal sclerosis, uremic, etc.), liver Diseases (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.), pancreatic diseases (eg, pancreatitis, etc.), immune diseases associated with thymic abnormalities, genital diseases (eg, prostatic hypertrophy, prostatitis, testicular neurosis, ovarian cysts, etc.) ), Gastrointestinal disorders (eg, irritable bowel syndrome, ulcerative colitis, ischemic colitis, gastritis, etc.), spleen disorders (eg, hypersplenism, splenomegaly syndrome, etc.), (Eg, lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, gastric cancer, bladder cancer, breast cancer, cervical cancer, colon cancer, rectal cancer, pancreatic cancer, thyroid cancer, myeloid leukemia, etc. ), Respiratory diseases (eg, pleurisy, pneumonia, chronic obstructive pulmonary disease, asthma, etc.), osteomyelitis, diabetes, hypertension, post-ischemic reperfusion injury, retinitis, central nervous system diseases (eg, epilepsy, Alzheimer's disease, Parkinson's syndrome, schizophrenia, etc., skin diseases (eg, atopic dermatitis, seborrheic dermatitis, etc.), thyroid hormone-related diseases (eg, thyroid hormone refractory disease, Basedow's disease, Cretin's disease, hyperthyroidism, etc.) ) Can be used as a prophylactic / therapeutic agent. It is preferably used as a prophylactic / therapeutic agent for renal diseases and thyroid hormone-related diseases, and more preferably as a prophylactic / therapeutic agent for diabetic nephropathy.
[0098]
[Sequence list]
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[Brief description of the drawings]
FIG. 1 is a diagram showing a comparison of amino acid sequences of human TCH229, human SLC21A12 and human OATPRP4. In the figure, TCH229 indicates the amino acid sequence of human TCH229, SLC21A12 indicates the amino acid sequence of human SLC21A12, OATPRP4 indicates the amino acid sequence of human OATPRP4, and TM1 to TM12 indicate the transmembrane region. □ indicates an amino acid corresponding to human TCH229. (Continued to Fig. 2)
FIG. 2 shows a comparison of amino acid sequences of human TCH229, human SLC21A12 and human OATPRP4. In the figure, TCH229 indicates the amino acid sequence of human TCH229, SLC21A12 indicates the amino acid sequence of human SLC21A12, OATPRP4 indicates the amino acid sequence of human OATPRP4, and TM1 to TM12 indicate the transmembrane region. □ indicates an amino acid corresponding to human TCH229. (Continued from Fig. 1)
FIG. 3 is a diagram showing the expression level of human TCH229 gene product in each tissue. The expression level was represented by the number of copies per μl of the cDNA solution.
FIG. 4 is a diagram showing the expression level of human TCH229 gene product in each tissue. The expression level was represented by the number of copies per μl of the cDNA solution.
FIG. 5 is a diagram showing a comparison of amino acid sequences of human TCH229 and mouse TCH229. In the figure, TCH229 indicates the amino acid sequence of human TCH229, mTCH229 indicates the amino acid sequence of mouse TCH229, the transmembrane region is TM1-12, and the amino acid positions highly conserved between families are indicated by *. □ indicates an amino acid corresponding to both.
FIG. 6 is a diagram showing the expression level of mouse TCH229 gene product in each tissue. The expression level was represented by the number of copies per μl of the cDNA solution.
FIG. 7 shows human TCH229 and rat TCH229No. 1 and No. FIG. 3 is a diagram showing a comparison of amino acid sequences of two amino acids. In the figure, TCH229 is the amino acid sequence of human TCH229, rTCH229No. 1 is rat TCH229No. The amino acid sequence of rTCH229No. 2 is rat TCH229No. 2 shows the amino acid sequence of 2. TM1 to TM12 indicate transmembrane regions. □ indicates an amino acid corresponding to the three. (Continued to Fig. 8)
FIG. 8. Human TCH229 and rat TCH229No. 1 and No. FIG. 3 is a diagram showing a comparison of amino acid sequences of two amino acids. In the figure, TCH229 is the amino acid sequence of human TCH229, rTCH229No. 1 is rat TCH229No. The amino acid sequence of rTCH229No. 2 is rat TCH229No. 2 shows the amino acid sequence of 2. TM1 to TM12 indicate transmembrane regions. □ indicates an amino acid corresponding to the three. (Continued from Fig. 7)
FIG. 9 is a view showing the expression level of rat TCH229 gene product in each tissue. The expression level was represented by the number of copies per μl of the cDNA solution.
FIG. 10 is a diagram showing the expression level of mouse TCH229 gene product in each tissue. The expression level was expressed as a value obtained by dividing the copy number of mouse TCH229 per 1 μl of the cDNA solution by the copy number of rodent GAPDH in an equal amount of each tissue cDNA.
FIG. 11 is a view showing the expression level of rat TCH229 gene product in each tissue. The expression level was expressed as a value obtained by multiplying the relative expression level by 100.
FIG. 12 is a graph showing changes in the expression of human TCH229 in human normal cells. In the figure, the vertical axis indicates a value obtained by multiplying the relative expression value of human TCH229 gene expression value to human 18S expression value by 100,000. The horizontal axis indicates the cell name. ■ indicates no TNF-α, IL-1β and IL-6 (10 ng / ml each) stimulation, and □ indicates TNF-α, IL-1β and IL-6 (10 ng / ml each) stimulation.
FIG. 13 is a graph showing changes in the expression of human TCH229 in RPTEC stimulated with a stimulant. In the figure, the vertical axis indicates a value obtained by multiplying the relative expression value of the human TCH229 gene expression value to the human GAPDH expression value by 100. The horizontal axis shows the reaction time with the stimulant. -●-indicates TGF-β1,-■-indicates PMA,-▲-indicates TNF-α,-*-indicates IL-1β,-○-indicates IL-6, and-△-indicates control.
FIG. 14 is a graph showing changes in the expression of human TCH229 in HRCE stimulated with a stimulant. In the figure, the vertical axis indicates a value obtained by multiplying the relative expression value of the human TCH229 gene expression value to the human GAPDH expression value by 100. The horizontal axis shows the reaction time with the stimulant. -●-indicates TGF-β1,-■-indicates PMA,-▲-indicates TNF-α,-*-indicates IL-1β,-○-indicates IL-6, and-△-indicates control.
FIG. 15 is a graph showing the expression level of rat TCH229 gene. In the figure, the vertical axis represents the value obtained by multiplying the relative expression value of the rat TCH229 gene expression value to that of the parent GAPDH expression value by 1000, and the horizontal axis represents the age at which the kidney was collected. □ indicates the results of the experimental group (WF rats), and ■ indicates the results of the control group (WL rats).
FIG. 16 is a graph showing the expression level of rat TCH229 gene. In the figure, the vertical axis represents the value obtained by multiplying the relative expression value of the rat TCH229 gene expression value to that of the parent GAPDH expression value by 1000, and the horizontal axis represents the age at which the kidney was collected. □ indicates the results of the experimental group (SHC rats), and ■ indicates the results of the control group (SD rats).
FIG. 17 is a diagram showing the expression level of rat TCH229 gene. In the figure, the vertical axis represents the value obtained by multiplying the relative expression value of the rat TCH229 gene expression value to that of the parent GAPDH expression value by 1000, and the horizontal axis represents the age at which the kidney was collected. □ indicates the results of the experimental group (ZF rats), and ■ indicates the results of the control group (ZL rats).

Claims (39)

配列番号:1、配列番号:26または配列番号:52で表わされるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質またはその塩。A protein containing an amino acid sequence identical or substantially identical to the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 26 or SEQ ID NO: 52, or a salt thereof. 配列番号:1で表わされるアミノ酸配列からなるタンパク質またはその塩。A protein comprising an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 or a salt thereof. 配列番号:26で表わされるアミノ酸配列からなるタンパク質またはその塩。A protein comprising an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 26 or a salt thereof. 配列番号:52で表わされるアミノ酸配列からなるタンパク質またはその塩。A protein comprising an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 52 or a salt thereof. 配列番号:52で表わされるアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列が、配列番号:54で表わされるアミノ酸配列である請求項1記載のタンパク質またはその塩。The protein or salt thereof according to claim 1, wherein the amino acid sequence substantially identical to the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 52 is the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 54. 配列番号:54で表わされるアミノ酸配列からなるタンパク質またはその塩。A protein consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 54 or a salt thereof. 請求項1記載のタンパク質の部分ペプチドまたはその塩。A partial peptide of the protein according to claim 1 or a salt thereof. 請求項1記載のタンパク質または請求項7記載の部分ペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド。A polynucleotide comprising a polynucleotide encoding the protein according to claim 1 or the partial peptide according to claim 7. DNAである請求項8記載のポリヌクレオチド。The polynucleotide according to claim 8, which is DNA. 配列番号:2、配列番号:27、配列番号:53または配列番号:55で表わされる塩基配列からなるポリヌクレオチド。A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 53 or SEQ ID NO: 55. 請求項8記載のポリヌクレオチドを含有する組換えベクター。A recombinant vector containing the polynucleotide according to claim 8. 請求項11記載の組換えベクターで形質転換された形質転換体。A transformant transformed with the recombinant vector according to claim 11. 請求項12記載の形質転換体を培養し、請求項1記載のタンパク質または請求項7記載の部分ペプチドを生成、蓄積せしめ、これを採取することを特徴とする請求項1記載のタンパク質もしくは請求項7記載の部分ペプチドまたはその塩の製造法。The protein according to claim 1, wherein the transformant according to claim 12 is cultured to produce and accumulate the protein according to claim 1 or the partial peptide according to claim 7, and collect the protein. 8. The method for producing the partial peptide or a salt thereof according to 7. 請求項1記載のタンパク質もしくは請求項7記載の部分ペプチドまたはその塩を含有してなる医薬。A medicament comprising the protein according to claim 1, the partial peptide according to claim 7, or a salt thereof. 請求項8記載のポリヌクレオチドを含有してなる医薬。A medicament comprising the polynucleotide according to claim 8. 請求項8記載のポリヌクレオチドを含有してなる診断薬。A diagnostic agent comprising the polynucleotide according to claim 8. 請求項1記載のタンパク質もしくは請求項7記載の部分ペプチドまたはその塩に対する抗体。An antibody against the protein according to claim 1, the partial peptide according to claim 7, or a salt thereof. 請求項17記載の抗体を含有してなる診断薬。A diagnostic agent comprising the antibody according to claim 17. 請求項17記載の抗体を含有してなる医薬。A medicament comprising the antibody according to claim 17. 請求項8記載のポリヌクレオチドに相補的または実質的に相補的な塩基配列またはその一部を含有するポリヌクレオチド。A polynucleotide comprising a base sequence complementary to or substantially complementary to the polynucleotide according to claim 8, or a part thereof. 請求項20記載のポリヌクレオチドを含有してなる診断薬。A diagnostic agent comprising the polynucleotide according to claim 20. 請求項20記載のポリヌクレオチドを含有してなる医薬。A medicament comprising the polynucleotide according to claim 20. 請求項1記載のタンパク質もしくは請求項7記載の部分ペプチドまたはその塩を用いることを特徴とする、請求項1記載のタンパク質もしくは請求項7記載の部分ペプチドまたはその塩の活性を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング方法。A compound that promotes or inhibits the activity of the protein according to claim 1, the partial peptide according to claim 7, or a salt thereof, wherein the protein according to claim 1 or the partial peptide according to claim 7 or a salt thereof is used. Or a method of screening for a salt thereof. 請求項1記載のタンパク質もしくは請求項7記載の部分ペプチドまたはその塩を含有してなる、請求項1記載のタンパク質もしくは請求項7記載の部分ペプチドまたはその塩の活性を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング用キット。A compound that promotes or inhibits the activity of the protein according to claim 1, the partial peptide according to claim 7, or a salt thereof, or a compound thereof, comprising the protein according to claim 1, the partial peptide according to claim 7, or a salt thereof. Salt screening kit. 請求項23記載のスクリーニング方法または請求項24記載のスクリーニング用キットを用いて得られる、請求項1記載のタンパク質もしくは請求項7記載の部分ペプチドまたはその塩の活性を促進または阻害する化合物またはその塩。A compound or salt thereof that promotes or inhibits the activity of the protein of claim 1, or the partial peptide of claim 7, or a salt thereof, obtained by using the screening method of claim 23 or the screening kit of claim 24. . 請求項25記載の化合物またはその塩を含有してなる医薬。A medicament comprising the compound according to claim 25 or a salt thereof. 請求項8記載のポリヌクレオチドを用いることを特徴とする、請求項1記載のタンパク質遺伝子の発現を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング方法。A method for screening a compound or a salt thereof that promotes or inhibits expression of the protein gene according to claim 1, characterized by using the polynucleotide according to claim 8. 請求項8記載のポリヌクレオチドを含有してなる、請求項1記載のタンパク質遺伝子の発現を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング用キット。A kit for screening a compound or a salt thereof which promotes or inhibits the expression of the protein gene according to claim 1, comprising the polynucleotide according to claim 8. 請求項27記載のスクリーニング方法または請求項28記載のスクリーニング用キットを用いて得られる、請求項1記載のタンパク質遺伝子の発現を促進または阻害する化合物またはその塩。A compound or a salt thereof that promotes or inhibits expression of the protein gene according to claim 1, which is obtained by using the screening method according to claim 27 or the screening kit according to claim 28. 請求項29記載の化合物またはその塩を含有してなる医薬。A medicament comprising the compound according to claim 29 or a salt thereof. 請求項17記載の抗体を用いることを特徴とする請求項1記載のタンパク質の定量方法。A method for quantifying a protein according to claim 1, wherein the antibody according to claim 17 is used. 請求項31記載の定量方法を用いることを特徴とする請求項1記載のタンパク質の機能が関連する疾患の診断法。A method for diagnosing a disease associated with the function of a protein according to claim 1, wherein the method according to claim 31 is used. 請求項17記載の抗体を用いることを特徴とする、請求項1記載のタンパク質の発現を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング方法。A method for screening a compound or a salt thereof that promotes or inhibits expression of the protein according to claim 1, characterized by using the antibody according to claim 17. 請求項17記載の抗体を含有してなる、請求項1記載のタンパク質の発現を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング用キット。A kit for screening a compound or a salt thereof that promotes or inhibits expression of the protein according to claim 1, comprising the antibody according to claim 17. 請求項33記載のスクリーニング方法または請求項34記載のスクリーニング用キットを用いて得られる、請求項1記載のタンパク質の発現を促進または阻害する化合物またはその塩。34. A compound or a salt thereof, which promotes or inhibits the expression of the protein according to claim 1, obtained by using the screening method according to claim 33 or the screening kit according to claim 34. 請求項35記載の化合物またはその塩を含有してなる医薬。A medicament comprising the compound according to claim 35 or a salt thereof. 腎疾患の予防・治療剤である請求項14、請求項15、請求項19、請求項22、請求項26、請求項30または請求項36記載の医薬。The medicament according to claim 14, claim 15, claim 19, claim 22, claim 26, claim 30, or claim 36, which is a prophylactic / therapeutic agent for kidney disease. 哺乳動物に対して、請求項25、請求項29または請求項35記載の化合物またはその塩の有効量を投与することを特徴とする腎疾患の予防・治療方法。A method for preventing or treating renal disease, comprising administering to a mammal an effective amount of the compound according to claim 25, claim 29 or claim 35 or a salt thereof. 腎疾患の予防・治療剤を製造するための請求項25、請求項29または請求項35記載の化合物またはその塩の使用。Use of the compound according to claim 25, claim 29 or claim 35 or a salt thereof for producing a prophylactic / therapeutic agent for kidney disease.
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