JP2004000117A - New protein and its dna - Google Patents

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Abstract

<P>PROBLEM TO BE SOLVED: To obtain a new protein having dicarboxylic acid transportation activity and a DNA encoding the protein, to provide a method for screening a compound for promoting or inhibiting the activity of the protein and to obtain a compound prepared by the screening method. <P>SOLUTION: The protein is useful as a diagnostic marker for liver diseases, prostatic diseases, splenic diseases, renal diseases, metabolic diseases, cardiovascular diseases or cancers. The compound for promoting or inhibiting the activity of the protein obtained by the screening method using the protein is used, for example, as a prophylactic/a therapeutic agent for the above-mentioned diseases. <P>COPYRIGHT: (C)2004,JPO

Description

【0001】
【発明の属する技術分野】
本発明は、新規なナトリウム依存性ジカルボン酸トランスポータ(NaDC)タンパク質、該タンパク質をコードするDNA、該タンパク質の活性を促進または阻害する化合物のスクリーニング方法、該スクリーニング方法で得られる化合物などを提供する。
【0002】
【従来の技術】
コハク酸やクエン酸などのジまたはトリカルボン酸は、TCA回路において中間体として中心的な役割を果たしている。これら酸の細胞内外の輸送をつかさどっているのがナトリウム依存性ジカルボン酸トランスポータ(NaDC)であり、ヒトでは、現在までに2種類のNaDCが報告されている。この中で、NaDC1は基質に対する親和性が低く、腎臓や小腸で発現しているが、肝臓での発現は見られない。これに対し、NaDC3は基質に対する親和性が高く、腎の近位尿細管や肝細胞、脳などで発現している。これらNaDCは、腎臓におけるクエン酸の運搬において主要な役割を果たしていると考えられ、尿路結石形成との関連が示唆されている。
【0003】
【特許文献1】
US 2002/0019028号公報
【非特許文献1】
American Journal of Physiology,270巻,F642頁,1996年
【非特許文献2】
American Journal of Physiology,279巻,F482頁,2000年
【0004】
【発明が解決しようとする課題】
NaDCはジカルボン酸またはトリカルボン酸の代謝において重要な役割を果たしていると考えられているが、その詳細なメカニズムや疾患との関連についてはよく分かっていない。NaDCの詳細な基質特異性や代謝反応における役割を解明することが、ジカルボン酸またはトリカルボン酸の代謝に関係する疾患の治療薬開発につながる。
また、NaDC1は、ハエの老化に関与する遺伝子Indy(Science、290巻、2137−2140頁、2000年)と最も相同性の高いヒト遺伝子であり、Indyがジカルボン酸またはトリカルボン酸を輸送する(Biochem. J. Intedmediate Publication. Published on 19 Aug 2002 as manuscript BJ20021132)ことから、NaDCファミリーの機能と老化との関連を解明することにより、老化の進行をくい止める医薬品の開発につながる。
【0005】
【課題を解決するための手段】
本発明者らは、上記の課題を解決するために鋭意研究を重ねた結果、新規ナトリウム依存性ジカルボン酸トランスポータ(NaDC)タンパク質を見出した。該タンパク質はアミノ酸レベルで、ヒトNaDC1と56%の相同性を示し、ナトリウム依存性ジカルボン酸トランスポータとして機能し得るものである。
該タンパク質の機能や活性を抑制する方法としては、例えば、ジまたはトリカルボン酸の輸送を阻害したり、該タンパク質の転写を抑制して発現レベルを低下させることが、賦活化する方法としては、例えばジまたはトリカルボン酸の輸送を促進したり、該タンパク質のプロモーターを活性化したり、mRNAを安定化することで発現レベルを亢進することが考えられる。
本発明者らは、これらの知見に基づいて、さらに検討を重ねた結果、本発明を完成するに至った。
すなわち、本発明は、
(1) 配列番号:1または配列番号:23で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質またはその塩、
(2) 配列番号:1で表されるアミノ酸配列からなるタンパク質またはその塩、
(3) 配列番号:23で表されるアミノ酸配列からなるタンパク質またはその塩、
(4) 前記(1)記載のタンパク質の部分ペプチドまたはその塩、
(5) 前記(1)記載のタンパク質または前記(4)記載の部分ペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド、
(6) DNAである前記(5)記載のポリヌクレオチド、
(7) 配列番号:2または配列番号:22で表される塩基配列からなるポリヌクレオチド、
(8) 配列番号:24または配列番号:36で表される塩基配列からなるポリヌクレオチド、
(9) 前記(5)記載のポリヌクレオチドを含有する組換えベクター、
(10) 前記(9)記載の組換えベクターで形質転換された形質転換体、
(11) 前記(10)記載の形質転換体を培養し、前記(1)記載のタンパク質または前記(4)記載の部分ペプチドを生成、蓄積せしめ、これを採取することを特徴とする前記(1)記載のタンパク質もしくは前記(4)記載の部分ペプチドまたはその塩の製造法、
(12) 前記(1)記載のタンパク質もしくは前記(4)記載の部分ペプチドまたはその塩を含有してなる医薬、
(13) 前記(5)記載のポリヌクレオチドを含有してなる医薬、
(14) 前記(5)記載のポリヌクレオチドを含有してなる診断薬、
(15) 前記(1)記載のタンパク質もしくは前記(4)記載の部分ペプチドまたはその塩に対する抗体、
(16) 前記(15)記載の抗体を含有してなる医薬、
(17) 前記(15)記載の抗体を含有してなる診断薬、
(18) 前記(5)記載のポリヌクレオチドに相補的または実質的に相補的な塩基配列またはその一部を含有するポリヌクレオチド、
(19) 前記(18)記載のポリヌクレオチドを含有してなる医薬、
(20) 前記(1)記載のタンパク質もしくは前記(4)記載の部分ペプチドまたはその塩を用いることを特徴とする、前記(1)記載のタンパク質もしくは前記(4)記載の部分ペプチドまたはその塩の活性を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング方法、
(21) 前記(1)記載のタンパク質もしくは前記(4)記載の部分ペプチドまたはその塩を含有してなる、前記(1)記載のタンパク質もしくは前記(4)記載の部分ペプチドまたはその塩の活性を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング用キット、
(22) 前記(20)記載のスクリーニング方法または前記(21)記載のスクリーニング用キットを用いて得られる、前記(1)記載のタンパク質もしくは前記(4)記載の部分ペプチドまたはその塩の活性を促進または阻害する化合物またはその塩、
(23) 前記(22)記載の化合物またはその塩を含有してなる医薬、
(24) 前記(5)記載のポリヌクレオチドを用いることを特徴とする、前記(1)記載のタンパク質遺伝子の発現を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング方法、
(25) 前記(5)記載のポリヌクレオチドを含有してなる、前記(1)記載のタンパク質遺伝子の発現を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング用キット、
(26) 前記(24)記載のスクリーニング方法または前記(25)記載のスクリーニング用キットを用いて得られる、前記(1)記載のタンパク質遺伝子の発現を促進または阻害する化合物またはその塩、
(27) 前記(26)記載の化合物またはその塩を含有してなる医薬、
(28) 前記(15)記載の抗体を用いることを特徴とする前記(1)記載のタンパク質の定量方法、
(29) 前記(28)記載の定量方法を用いることを特徴とする前記(1)記載のタンパク質の機能が関連する疾患の診断法、
(30) 前記(15)記載の抗体を用いることを特徴とする、前記(1)記載のタンパク質の発現を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング方法、
(31) 前記(15)記載の抗体を含有してなる、前記(1)記載のタンパク質の発現を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング用キット、(32) 前記(30)記載のスクリーニング方法または前記(31)記載のスクリーニング用キットを用いて得られる、前記(1)記載のタンパク質の発現を促進または阻害する化合物またはその塩、
(33) 前記(32)記載の化合物またはその塩を含有してなる医薬、
(34) 肝臓疾患、前立腺疾患、脾臓疾患、腎臓疾患、代謝疾患、循環器疾患もしくは癌の予防・治療剤または老化の予防・抑制剤である前記(13)、(16)、(19)、(23)、(27)または(33)記載の医薬、
(35) 肝臓疾患、前立腺疾患、脾臓疾患、腎臓疾患、代謝疾患、循環器疾患または癌の診断薬である前記(14)または前記(17)記載の診断薬、
(36) 哺乳動物に対して、前記(22)、(26)または(32)記載の化合物またはその塩の有効量を投与することを特徴とする肝臓疾患、前立腺疾患、脾臓疾患、腎臓疾患、代謝疾患、循環器疾患もしくは癌の予防・治療方法または老化の予防・抑制方法、
(37) 肝臓疾患、前立腺疾患、脾臓疾患、腎臓疾患、代謝疾患、循環器疾患もしくは癌の予防・治療剤または老化の予防・抑制剤を製造するための前記(22)、(26)または(32)記載の化合物またはその塩の使用などを提供する。
【0006】
【発明の実施の形態】
配列番号:1または配列番号:23で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質(以下、本発明のタンパク質または本発明で用いられるタンパク質と称することもある)は、ヒトやその他の温血動物(例えば、モルモット、ラット、マウス、ニワトリ、ウサギ、ブタ、ヒツジ、ウシ、サルなど)の細胞(例えば、肝細胞、脾細胞、神経細胞、グリア細胞、膵臓β細胞、骨髄細胞、メサンギウム細胞、ランゲルハンス細胞、表皮細胞、上皮細胞、杯細胞、内皮細胞、平滑筋細胞、繊維芽細胞、繊維細胞、筋細胞、脂肪細胞、免疫細胞(例、マクロファージ、T細胞、B細胞、ナチュラルキラー細胞、肥満細胞、好中球、好塩基球、好酸球、単球など)、巨核球、滑膜細胞、軟骨細胞、骨細胞、骨芽細胞、破骨細胞、乳腺細胞、肝細胞もしくは間質細胞、またはこれら細胞の前駆細胞、幹細胞もしくはガン細胞など)もしくはそれらの細胞が存在するあらゆる組織、例えば、脳、脳の各部位(例、嗅球、扁桃核、大脳基底球、海馬、視床、視床下部、大脳皮質、延髄、小脳)、脊髄、下垂体、胃、膵臓、腎臓、肝臓、生殖腺、甲状腺、胆のう、骨髄、副腎、皮膚、筋肉、肺、消化管(例、大腸、小腸)、血管、心臓、胸腺、脾臓、顎下腺、末梢血、前立腺、睾丸、卵巣、胎盤、子宮、骨、関節、骨格筋などに由来するタンパク質であってもよく、合成タンパク質であってもよい。
【0007】
配列番号:1で表されるアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列としては、配列番号:1で表されるアミノ酸配列と約60%以上、好ましくは約70%以上、より好ましくは約80%以上、特に好ましくは約90%以上、最も好ましくは約95%以上の相同性を有するアミノ酸配列などが挙げられる。
配列番号:1で表されるアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質としては、例えば、前記の配列番号:1で表されるアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列を含有し、配列番号:1で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質と実質的に同質の活性を有するタンパク質などが好ましい。
配列番号:23で表されるアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列としては、配列番号:23で表されるアミノ酸配列と約50%以上、好ましくは約60%以上、好ましくは約70%以上、より好ましくは約80%以上、特に好ましくは約90%以上、最も好ましくは約95%以上の相同性を有するアミノ酸配列などが挙げられる。
配列番号:23で表されるアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質としては、例えば、前記の配列番号:23で表されるアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列を含有し、配列番号:23で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質と実質的に同質の活性を有するタンパク質などが好ましい。
実質的に同質の活性としては、例えば、ジまたはトリカルボン酸の輸送などが挙げられる。実質的に同質とは、それらの性質が性質的に(例、生理学的に、または薬理学的に)同質であることを示す。したがって、ジまたはトリカルボン酸の輸送が同等(例、約0.01〜100倍、好ましくは約0.1〜10倍、より好ましくは0.5〜2倍)であることが好ましいが、これらの活性の程度、タンパク質の分子量などの量的要素は異なっていてもよい。
ジまたはトリカルボン酸の輸送などの活性の測定は、公知の方法に準じて行うことが出来、例えば、Am. J. Physiol. Cell. Physiol.、278巻、C1019−C1030頁、2000年に記載の方法またはそれに準じる方法に従って測定することができる。
【0008】
また、本発明のタンパク質としては、例えば、(1)(i)配列番号:1で表されるアミノ酸配列中の1または2個以上(例えば1〜200個程度、好ましくは1〜100個程度、好ましくは1〜50個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が欠失したアミノ酸配列、(ii)配列番号:1で表されるアミノ酸配列に1または2個以上(例えば1〜200個程度、好ましくは1〜100個程度、好ましくは1〜50個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が付加したアミノ酸配列、(iii)配列番号:1で表されるアミノ酸配列に1または2個以上(例えば1〜200個程度、好ましくは1〜100個程度、好ましくは1〜50個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が挿入されたアミノ酸配列、(iv)配列番号:1で表されるアミノ酸配列中の1または2個以上(例えば1〜200個程度、好ましくは1〜100個程度、好ましくは1〜50個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が他のアミノ酸で置換されたアミノ酸配列、または(v)それらを組み合わせたアミノ酸配列を含有するタンパク質などのいわゆるムテイン、(2)(i)配列番号:23で表されるアミノ酸配列中の1または2個以上(例えば1〜200個程度、好ましくは1〜100個程度、好ましくは1〜50個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が欠失したアミノ酸配列、(ii)配列番号:23で表されるアミノ酸配列に1または2個以上(例えば1〜200個程度、好ましくは1〜100個程度、好ましくは1〜50個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が付加したアミノ酸配列、(iii)配列番号:23で表されるアミノ酸配列に1または2個以上(例えば1〜200個程度、好ましくは1〜100個程度、好ましくは1〜50個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が挿入されたアミノ酸配列、(iv)配列番号:23で表されるアミノ酸配列中の1または2個以上(例えば1〜200個程度、好ましくは1〜100個程度、好ましくは1〜50個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が他のアミノ酸で置換されたアミノ酸配列、または(v)それらを組み合わせたアミノ酸配列を含有するタンパク質などのいわゆるムテインなども含まれる。
上記のようにアミノ酸配列が挿入、欠失または置換されている場合、その挿入、欠失または置換の位置は、とくに限定されない。
【0009】
本明細書におけるタンパク質は、ペプチド表記の慣例に従って左端がN末端(アミノ末端)、右端がC末端(カルボキシル末端)である。配列番号:1で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質をはじめとする、本発明のタンパク質は、C末端がカルボキシル基(−COOH)、カルボキシレート(−COO)、アミド(−CONH)またはエステル(−COOR)の何れであってもよい。
ここでエステルにおけるRとしては、例えば、メチル、エチル、n−プロピル、イソプロピル、n−ブチルなどのC1−6アルキル基、例えば、シクロペンチル、シクロヘキシルなどのC3−8シクロアルキル基、例えば、フェニル、α−ナフチルなどのC6−12アリール基、例えば、ベンジル、フェネチルなどのフェニル−C1−2アルキル基もしくはα−ナフチルメチルなどのα−ナフチル−C1−2アルキル基などのC7−14アラルキル基、ピバロイルオキシメチル基などが用いられる。
本発明で用いられるタンパク質がC末端以外にカルボキシル基(またはカルボキシレート)を有している場合、カルボキシル基がアミド化またはエステル化されているものも本発明で用いられるタンパク質に含まれる。この場合のエステルとしては、例えば上記したC末端のエステルなどが用いられる。
さらに、本発明のタンパク質には、N末端のアミノ酸残基(例、メチオニン残基)のアミノ基が保護基(例えば、ホルミル基、アセチル基などのC1−6アルカノイルなどのC1−6アシル基など)で保護されているもの、生体内で切断されて生成するN末端のグルタミン残基がピログルタミン酸化したもの、分子内のアミノ酸の側鎖上の置換基(例えば−OH、−SH、アミノ基、イミダゾール基、インドール基、グアニジノ基など)が適当な保護基(例えば、ホルミル基、アセチル基などのC1−6アルカノイル基などのC1−6アシル基など)で保護されているもの、あるいは糖鎖が結合したいわゆる糖タンパク質などの複合タンパク質なども含まれる。
本発明のタンパク質の具体例としては、例えば、配列番号:1で表されるアミノ酸配列を含有するヒト肝臓由来のタンパク質、配列番号:23で表されるアミノ酸配列を含有するマウス由来のタンパク質などがあげられる。
【0010】
本発明のタンパク質の部分ペプチドとしては、前記した本発明のタンパク質の部分ペプチドであって、好ましくは、前記した本発明のタンパク質と同様の性質を有するものであればいずれのものでもよい。
例えば、本発明のタンパク質の構成アミノ酸配列のうち少なくとも20個以上、好ましくは50個以上、さらに好ましくは70個以上、より好ましくは100個以上、最も好ましくは200個以上のアミノ酸配列を含有するペプチドなどが用いられる。
また、上記本発明の部分ペプチドは、そのアミノ酸配列中の1または2個以上(好ましくは、1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が欠失し、または、そのアミノ酸配列に1または2個以上(好ましくは、1〜20個程度、より好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が付加し、または、そのアミノ酸配列に1または2個以上(好ましくは、1〜20個程度、より好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が挿入され、または、そのアミノ酸配列中の1または2個以上(好ましくは、1〜10個程度、より好ましくは数個、さらに好ましくは1〜5個程度)のアミノ酸が他のアミノ酸で置換されていてもよい。
【0011】
また、本発明の部分ペプチドはC末端がカルボキシル基(−COOH)、カルボキシレート(−COO)、アミド(−CONH)またはエステル(−COOR)の何れであってもよい。
さらに、本発明の部分ペプチドには、前記した本発明のタンパク質と同様に、C末端以外にカルボキシル基(またはカルボキシレート)を有しているもの、N末端のアミノ酸残基(例、メチオニン残基)のアミノ基が保護基で保護されているもの、N端側が生体内で切断され生成したグルタミン残基がピログルタミン酸化したもの、分子内のアミノ酸の側鎖上の置換基が適当な保護基で保護されているもの、あるいは糖鎖が結合したいわゆる糖ペプチドなどの複合ペプチドなども含まれる。
本発明の部分ペプチドは抗体作成のための抗原としても用いることができる。本発明の抗体を調製する目的としては、例えば配列番号:1で表されるアミノ酸配列において第136〜204番目、第228〜252、第276〜309番目のアミノ酸配列を含有するペプチド、配列番号:23で表されるアミノ酸配列において第136〜207番目、第231〜255、第279〜313番目のアミノ酸配列を含有するペプチドなどがあげられる。
【0012】
本発明のタンパク質またはその部分ペプチドの塩としては、生理学的に許容される酸(例、無機酸、有機酸)や塩基(例、アルカリ金属塩)などとの塩が用いられ、とりわけ生理学的に許容される酸付加塩が好ましい。この様な塩としては、例えば、無機酸(例えば、塩酸、リン酸、臭化水素酸、硫酸)との塩、あるいは有機酸(例えば、酢酸、ギ酸、プロピオン酸、フマル酸、マレイン酸、コハク酸、酒石酸、クエン酸、リンゴ酸、蓚酸、安息香酸、メタンスルホン酸、ベンゼンスルホン酸)との塩などが用いられる。
本発明のタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩は、前述したヒトやその他の温血動物の細胞または組織から公知のタンパク質の精製方法によって製造することもできるし、タンパク質をコードするDNAを含有する形質転換体を培養することによっても製造することができる。また、後述のペプチド合成法に準じて製造することもできる。
ヒトやその他の哺乳動物の組織または細胞から製造する場合、ヒトやその他の哺乳動物の組織または細胞をホモジナイズした後、酸などで抽出を行ない、該抽出液を逆相クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィーなどのクロマトグラフィーを組み合わせることにより精製単離することができる。
【0013】
本発明のタンパク質もしくは部分ペプチドまたはその塩、またはそれらのアミド体の合成には、通常市販のタンパク質合成用樹脂を用いることができる。そのような樹脂としては、例えば、クロロメチル樹脂、ヒドロキシメチル樹脂、ベンズヒドリルアミン樹脂、アミノメチル樹脂、4−ベンジルオキシベンジルアルコール樹脂、4−メチルベンズヒドリルアミン樹脂、PAM樹脂、4−ヒドロキシメチルメチルフェニルアセトアミドメチル樹脂、ポリアクリルアミド樹脂、4−(2’,4’−ジメトキシフェニル−ヒドロキシメチル)フェノキシ樹脂、4−(2’,4’−ジメトキシフェニル−Fmocアミノエチル)フェノキシ樹脂などを挙げることができる。このような樹脂を用い、α−アミノ基と側鎖官能基を適当に保護したアミノ酸を、目的とするタンパク質の配列通りに、公知の各種縮合方法に従い、樹脂上で縮合させる。反応の最後に樹脂からタンパク質または部分ペプチドを切り出すと同時に各種保護基を除去し、さらに高希釈溶液中で分子内ジスルフィド結合形成反応を実施し、目的のタンパク質もしくは部分ペプチドまたはそれらのアミド体を取得する。
上記した保護アミノ酸の縮合に関しては、タンパク質合成に使用できる各種活性化試薬を用いることができるが、特に、カルボジイミド類がよい。カルボジイミド類としては、DCC、N,N’−ジイソプロピルカルボジイミド、N−エチル−N’−(3−ジメチルアミノプロリル)カルボジイミドなどが用いられる。これらによる活性化にはラセミ化抑制添加剤(例えば、HOBt、HOOBt)とともに保護アミノ酸を直接樹脂に添加するかまたは、対応する酸無水物またはHOBtエステルあるいはHOOBtエステルとしてあらかじめ保護アミノ酸の活性化を行なった後に樹脂に添加することができる。
【0014】
保護アミノ酸の活性化や樹脂との縮合に用いられる溶媒としては、タンパク質縮合反応に使用しうることが知られている溶媒から適宜選択されうる。例えば、N,N−ジメチルホルムアミド、N,N−ジメチルアセトアミド、N−メチルピロリドンなどの酸アミド類、塩化メチレン、クロロホルムなどのハロゲン化炭化水素類、トリフルオロエタノールなどのアルコール類、ジメチルスルホキシドなどのスルホキシド類、ピリジン、ジオキサン、テトラヒドロフランなどのエーテル類、アセトニトリル、プロピオニトリルなどのニトリル類、酢酸メチル、酢酸エチルなどのエステル類あるいはこれらの適宜の混合物などが用いられる。反応温度はタンパク質結合形成反応に使用され得ることが知られている範囲から適宜選択され、通常約−20℃〜50℃の範囲から適宜選択される。活性化されたアミノ酸誘導体は通常1.5〜4倍過剰で用いられる。ニンヒドリン反応を用いたテストの結果、縮合が不十分な場合には保護基の脱離を行うことなく縮合反応を繰り返すことにより十分な縮合を行うことができる。反応を繰り返しても十分な縮合が得られないときには、無水酢酸またはアセチルイミダゾールを用いて未反応アミノ酸をアセチル化することによって、後の反応に影響を与えないようにすることができる。
【0015】
原料のアミノ基の保護基としては、例えば、Z、Boc、t−ペンチルオキシカルボニル、イソボルニルオキシカルボニル、4−メトキシベンジルオキシカルボニル、Cl−Z、Br−Z、アダマンチルオキシカルボニル、トリフルオロアセチル、フタロイル、ホルミル、2−ニトロフェニルスルフェニル、ジフェニルホスフィノチオイル、Fmocなどが用いられる。
カルボキシル基は、例えば、アルキルエステル化(例えば、メチル、エチル、プロピル、ブチル、t−ブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、シクロオクチル、2−アダマンチルなどの直鎖状、分枝状もしくは環状アルキルエステル化)、アラルキルエステル化(例えば、ベンジルエステル、4−ニトロベンジルエステル、4−メトキシベンジルエステル、4−クロロベンジルエステル、ベンズヒドリルエステル化)、フェナシルエステル化、ベンジルオキシカルボニルヒドラジド化、t−ブトキシカルボニルヒドラジド化、トリチルヒドラジド化などによって保護することができる。
セリンの水酸基は、例えば、エステル化またはエーテル化によって保護することができる。このエステル化に適する基としては、例えば、アセチル基などの低級(C1−6)アルカノイル基、ベンゾイル基などのアロイル基、ベンジルオキシカルボニル基、エトキシカルボニル基などの炭酸から誘導される基などが用いられる。また、エーテル化に適する基としては、例えば、ベンジル基、テトラヒドロピラニル基、t−ブチル基などである。
チロシンのフェノール性水酸基の保護基としては、例えば、Bzl、Cl−Bzl、2−ニトロベンジル、Br−Z、t−ブチルなどが用いられる。
ヒスチジンのイミダゾールの保護基としては、例えば、Tos、4−メトキシ−2,3,6−トリメチルベンゼンスルホニル、DNP、ベンジルオキシメチル、Bum、Boc、Trt、Fmocなどが用いられる。
【0016】
原料のカルボキシル基の活性化されたものとしては、例えば、対応する酸無水物、アジド、活性エステル〔アルコール(例えば、ペンタクロロフェノール、2,4,5−トリクロロフェノール、2,4−ジニトロフェノール、シアノメチルアルコール、パラニトロフェノール、HONB、N−ヒドロキシスクシミド、N−ヒドロキシフタルイミド、HOBt)とのエステル〕などが用いられる。原料のアミノ基の活性化されたものとしては、例えば、対応するリン酸アミドが用いられる。
保護基の除去(脱離)方法としては、例えば、Pd−黒あるいはPd−炭素などの触媒の存在下での水素気流中での接触還元や、また、無水フッ化水素、メタンスルホン酸、トリフルオロメタンスルホン酸、トリフルオロ酢酸あるいはこれらの混合液などによる酸処理や、ジイソプロピルエチルアミン、トリエチルアミン、ピペリジン、ピペラジンなどによる塩基処理、また液体アンモニア中ナトリウムによる還元なども用いられる。上記酸処理による脱離反応は、一般に約−20℃〜40℃の温度で行なわれるが、酸処理においては、例えば、アニソール、フェノール、チオアニソール、メタクレゾール、パラクレゾール、ジメチルスルフィド、1,4−ブタンジチオール、1,2−エタンジチオールなどのようなカチオン捕捉剤の添加が有効である。また、ヒスチジンのイミダゾール保護基として用いられる2,4−ジニトロフェニル基はチオフェノール処理により除去され、トリプトファンのインドール保護基として用いられるホルミル基は上記の1,2−エタンジチオール、1,4−ブタンジチオールなどの存在下の酸処理による脱保護以外に、希水酸化ナトリウム溶液、希アンモニアなどによるアルカリ処理によっても除去される。
【0017】
原料の反応に関与すべきでない官能基の保護、保護基の脱離および反応に関与する官能基の活性化などは公知の手段から、また用いられる保護基は公知の基からそれぞれ適宜選択、適用される。
タンパク質または部分ペプチドのアミド体を得る別の方法としては、例えば、まず、カルボキシ末端アミノ酸のα−カルボキシル基をアミド化して保護した後、アミノ基側にペプチド(タンパク質)鎖を所望の鎖長まで延ばした後、該ペプチド鎖のN末端のα−アミノ基の保護基のみを除いたタンパク質または部分ペプチドとC末端のカルボキシル基の保護基のみを除去したタンパク質または部分ペプチドとを製造し、これらのタンパク質またはペプチドを上記したような混合溶媒中で縮合させる。縮合反応の詳細については上記と同様である。縮合により得られた保護タンパク質またはペプチドを精製した後、上記方法によりすべての保護基を除去し、所望の粗タンパク質またはペプチドを得ることができる。この粗タンパク質またはペプチドは既知の各種精製手段を駆使して精製し、主要画分を凍結乾燥することで所望のタンパク質またはペプチドのアミド体を得ることができる。
タンパク質またはペプチドのエステル体を得るには、例えば、カルボキシ末端アミノ酸のα−カルボキシル基を所望のアルコール類と縮合しアミノ酸エステルとした後、タンパク質またはペプチドのアミド体と同様にして、所望のタンパク質またはペプチドのエステル体を得ることができる。
【0018】
本発明で用いられる部分ペプチドまたはその塩は、公知のペプチドの合成法に従って、あるいは本発明で用いられるタンパク質を適当なペプチダーゼで切断することによって製造することができる。ペプチドの合成法としては、例えば、固相合成法、液相合成法のいずれによっても良い。すなわち、本発明で用いられる部分ペプチドを構成し得る部分ペプチドもしくはアミノ酸と残余部分とを縮合させ、生成物が保護基を有する場合は保護基を脱離することにより目的のペプチドを製造することができる。公知の縮合方法や保護基の脱離としては、例えば、以下の(i)〜(v)に記載された方法が挙げられる。
(i)M. Bodanszky および M.A. Ondetti、ペプチド・シンセシス (Peptide Synthesis), Interscience Publishers, New York (1966年)
(ii)SchroederおよびLuebke、ザ・ペプチド(The Peptide), Academic Press, New York (1965年)
(iii)泉屋信夫他、ペプチド合成の基礎と実験、 丸善(株) (1975年)
(iv)矢島治明 および榊原俊平、生化学実験講座 1、 タンパク質の化学IV、
205、(1977年)
(v)矢島治明監修、続医薬品の開発、第14巻、ペプチド合成、広川書店
また、反応後は通常の精製法、例えば、溶媒抽出・蒸留・カラムクロマトグラフィー・液体クロマトグラフィー・再結晶などを組み合わせて本発明で用いられる部分ペプチドを精製単離することができる。上記方法で得られる部分ペプチドが遊離体である場合は、公知の方法あるいはそれに準じる方法によって適当な塩に変換することができるし、逆に塩で得られた場合は、公知の方法あるいはそれに準じる方法によって遊離体または他の塩に変換することができる。
【0019】
本発明で用いられるタンパク質をコードするポリヌクレオチドとしては、前述した本発明で用いられるタンパク質をコードする塩基配列を含有するものであればいかなるものであってもよい。好ましくはDNAである。DNAとしては、ゲノムDNA、ゲノムDNAライブラリー、前記した細胞・組織由来のcDNA、前記した細胞・組織由来のcDNAライブラリー、合成DNAのいずれでもよい。
ライブラリーに使用するベクターは、バクテリオファージ、プラスミド、コスミド、ファージミドなどいずれであってもよい。また、前記した細胞・組織よりtotalRNAまたはmRNA画分を調製したものを用いて直接Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction(以下、RT−PCR法と略称する)によって増幅することもできる。
本発明で用いられるタンパク質をコードするDNAとしては、例えば、(i)配列番号:2で表される塩基配列を含有するDNA、または配列番号:2で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列を含有し、配列番号:1で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質と実質的に同質の性質を有するタンパク質をコードするDNA、(ii)配列番号:22で表される塩基配列を含有するDNA、または配列番号:22で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列を含有し、配列番号:1で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質と実質的に同質の性質を有するタンパク質をコードするDNA、(iii)配列番号:24で表される塩基配列を含有するDNA、または配列番号:24で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列を含有し、配列番号:23で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質と実質的に同質の性質を有するタンパク質をコードするDNA、(iv)配列番号:36で表される塩基配列を含有するDNA、または配列番号:36で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列を含有し、配列番号:23で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質と実質的に同質の性質を有するタンパク質をコードするDNAであれば何れのものでもよい。
【0020】
配列番号:2または配列番号:22で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズできるDNAとしては、例えば、配列番号:2または配列番号:22で表される塩基配列と約60%以上、好ましくは約70%以上、好ましくは約80%以上、最も好ましくは約95%以上の相同性を有する塩基配列を含有するDNAなどが用いられる。
配列番号:24または配列番号:36で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズできるDNAとしては、例えば、配列番号:24または配列番号:36で表される塩基配列と約50%以上、好ましくは約60%以上、好ましくは約70%以上、好ましくは約80%以上、最も好ましくは約95%以上の相同性を有する塩基配列を含有するDNAなどが用いられる。
ハイブリダイゼーションは、公知の方法あるいはそれに準じる方法、例えば、モレキュラー・クローニング(Molecular Cloning)2nd(J. Sambrook et al.,Cold Spring Harbor Lab. Press, 1989)に記載の方法などに従って行うことができる。また、市販のライブラリーを使用する場合、添付の使用説明書に記載の方法に従って行うことができる。より好ましくは、ハイストリンジェントな条件に従って行うことができる。
ハイストリンジェントな条件とは、例えば、ナトリウム濃度が約19〜40mM、好ましくは約19〜20mMで、温度が約50〜70℃、好ましくは約60〜65℃の条件を示す。特に、ナトリウム濃度が約19mMで温度が約65℃の場合が最も好ましい。
【0021】
本発明の部分ペプチドをコードするポリヌクレオチドとしては、前述した本発明の部分ペプチドをコードする塩基配列を含有するものであればいかなるものであってもよい。好ましくはDNAである。DNAとしては、ゲノムDNA、ゲノムDNAライブラリー、前記した細胞・組織由来のcDNA、前記した細胞・組織由来のcDNAライブラリー、合成DNAのいずれでもよい。
本発明の部分ペプチドをコードするポリヌクレオチドとしては、例えば、(1)配列番号:2または配列番号:22で表される塩基配列を含有するポリヌクレオチドの一部分を含有するポリヌクレオチド、(2)配列番号:2または配列番号:22で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列を含有し、配列番号:1で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質と実質的に同質の活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドの一部分を含有するポリヌクレオチド、(3)配列番号:24または配列番号:36で表される塩基配列を含有するポリヌクレオチドの一部分を含有するポリヌクレオチド、または(4)配列番号:24または配列番号:36で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列を含有し、配列番号:23で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質と実質的に同質の活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドの一部分を含有するポリヌクレオチドなどが用いられる。
配列番号:2または配列番号:22で表される塩基配列とハイブリダイズできるポリヌクレオチド、および配列番号:24または配列番号:36で表される塩基配列とハイブリダイズできるポリヌクレオチドは前記と同意義を示す。
ハイブリダイゼーションの方法およびハイストリンジェントな条件は前記と同様のものが用いられる。
【0022】
本発明のタンパク質、部分ペプチド(以下、これらをコードするDNAのクローニングおよび発現の説明においては、これらを単に本発明のタンパク質と略記する場合がある)を完全にコードするDNAのクローニングの手段としては、本発明のタンパク質をコードする塩基配列の一部分を含有する合成DNAプライマーを用いたPCR法による増幅、または適当なベクターに組み込んだDNAを本発明のタンパク質の一部あるいは全領域をコードするDNA断片もしくは合成DNAを用いて標識したものとのハイブリダイゼーションによる選別があげられる。ハイブリダイゼーションの方法は、例えば、モレキュラー・クローニング(Molecular Cloning)2nd(J. Sambrook et al., Cold Spring Harbor Lab. Press, 1989)に記載の方法などに従って行うことができる。また、市販のライブラリーを使用する場合、添付の使用説明書に記載の方法に従って行うことができる。
DNAの塩基配列の置換は、PCRや公知のキット、例えば、MutanTM−super Express Km(宝酒造)、MutanTM−K(宝酒造)等を用いて、ODA−LA PCR法、Gapped duplex法、Kunkel法等の公知の方法あるいはそれらに準じる方法に従って行うことができる。
本発明のタンパク質をコードする、クローン化されたDNAは目的によりそのまま、または所望により制限酵素で消化したり、リンカーを付加したりして使用することができる。該DNAはその5’末端側に翻訳開始コドンとしてのATGを有し、また3’末端側には翻訳終止コドンとしてのTAA、TGAまたはTAGを有していてもよい。これらの翻訳開始コドンや翻訳終止コドンは、適当な合成DNAアダプターを用いて付加することもできる。
本発明のタンパク質の発現ベクターは、例えば、(イ)本発明のタンパク質をコードするDNAを含有する、例えばcDNAから目的とするDNA断片を切り出し、(ロ)該DNA断片を適当な発現ベクター中のプロモーターの下流に連結することにより製造することができる。
【0023】
ベクターとしては、大腸菌由来のプラスミド(例、pBR322,pBR325,pUC12,pUC13)、枯草菌由来のプラスミド(例、pUB110,pTP5,pC194)、酵母由来プラスミド(例、pSH19,pSH15)、λファージなどのバクテリオファージ、レトロウイルス,ワクシニアウイルス,バキュロウイルスなどの動物ウイルスなどの他、pA1−11、pXT1、pRc/CMV、pRc/RSV、pcDNAI/Neoなどが用いられる。
本発明で用いられるプロモーターとしては、遺伝子の発現に用いる宿主に対応して適切なプロモーターであればいかなるものでもよい。例えば、動物細胞を宿主として用いる場合は、SRαプロモーター、SV40プロモーター、LTRプロモーター、CMVプロモーター、HSV−TKプロモーターなどが挙げられる。
これらのうち、CMV(サイトメガロウイルス)プロモーター、SRαプロモーターなどを用いるのが好ましい。宿主がエシェリヒア属菌である場合は、trpプロモーター、lacプロモーター、recAプロモーター、λPプロモーター、lppプロモーター、T7プロモーターなどが、宿主がバチルス属菌である場合は、SPO1プロモーター、SPO2プロモーター、penPプロモーターなど、宿主が酵母である場合は、PHO5プロモーター、PGKプロモーター、GAPプロモーター、ADHプロモーターなどが好ましい。宿主が昆虫細胞である場合は、ポリヘドリンプロモーター、P10プロモーターなどが好ましい。
【0024】
発現ベクターには、以上の他に、所望によりエンハンサー、スプライシングシグナル、ポリA付加シグナル、選択マーカー、SV40複製オリジン(以下、SV40oriと略称する場合がある)などを含有しているものを用いることができる。選択マーカーとしては、例えば、ジヒドロ葉酸還元酵素(以下、dhfrと略称する場合がある)遺伝子〔メソトレキセート(MTX)耐性〕、アンピシリン耐性遺伝子(以下、Ampと略称する場合がある)、ネオマイシン耐性遺伝子(以下、Neoと略称する場合がある、G418耐性)等が挙げられる。特に、dhfr遺伝子欠損チャイニーズハムスター細胞を用いてdhfr遺伝子を選択マーカーとして使用する場合、目的遺伝子をチミジンを含まない培地によっても選択できる。
また、必要に応じて、宿主に合ったシグナル配列を、本発明のタンパク質のN端末側に付加する。宿主がエシェリヒア属菌である場合は、PhoAシグナル配列、OmpAシグナル配列などが、宿主がバチルス属菌である場合は、α−アミラーゼシグナル配列、サブチリシンシグナル配列などが、宿主が酵母である場合は、MFαシグナル配列、SUC2シグナル配列など、宿主が動物細胞である場合には、インシュリンシグナル配列、α−インターフェロンシグナル配列、抗体分子シグナル配列などがそれぞれ利用できる。
このようにして構築された本発明のタンパク質をコードするDNAを含有するベクターを用いて、形質転換体を製造することができる。
【0025】
宿主としては、例えば、エシェリヒア属菌、バチルス属菌、酵母、昆虫細胞、昆虫、動物細胞などが用いられる。
エシェリヒア属菌の具体例としては、例えば、エシェリヒア・コリ(Escherichia coli)K12・DH1〔プロシージングズ・オブ・ザ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンシイズ・オブ・ザ・ユーエスエー(Proc. Natl. Acad. Sci. USA),60巻,160 (1968)〕,JM103〔ヌクイレック・アシッズ・リサーチ,(Nucleic Acids Research),9巻,309 (1981)〕,JA221〔ジャーナル・オブ・モレキュラー・バイオロジー(Journal of Molecular Biology),120巻,517 (1978)〕,HB101〔ジャーナル・オブ・モレキュラー・バイオロジー,41巻,459 (1969)〕,C600〔ジェネティックス(Genetics),39巻,440 (1954)〕などが用いられる。
バチルス属菌としては、例えば、バチルス・サブチルス(Bacillus subtilis)MI114〔ジーン,24巻,255 (1983)〕,207−21〔ジャーナル・オブ・バイオケミストリー(Journal of Biochemistry),95巻,87 (1984)〕などが用いられる。
酵母としては、例えば、サッカロマイセス・セレビシエ(Saccharomyces cerevisiae)AH22,AH22R,NA87−11A,DKD−5D,20B−12、シゾサッカロマイセス・ポンベ(Schizosaccharomyces pombe)NCYC1913,NCYC2036、ピキア・パストリス(Pichia pastoris)KM71などが用いられる。
【0026】
昆虫細胞としては、例えば、ウイルスがAcNPVの場合は、夜盗蛾の幼虫由来株化細胞(Spodoptera frugiperda cell;Sf細胞)、Trichoplusia niの中腸由来のMG1細胞、Trichoplusia niの卵由来のHigh FiveTM細胞、Mamestra brassicae由来の細胞またはEstigmena acrea由来の細胞などが用いられる。ウイルスがBmNPVの場合は、蚕由来株化細胞(Bombyx mori N 細胞;BmN細胞)などが用いられる。該Sf細胞としては、例えば、Sf9細胞(ATCC CRL1711)、Sf21細胞(以上、Vaughn, J.L.ら、イン・ヴィボ(In Vivo),13, 213−217,(1977))などが用いられる。
昆虫としては、例えば、カイコの幼虫などが用いられる〔前田ら、ネイチャー(Nature),315巻,592 (1985)〕。
動物細胞としては、例えば、サル細胞COS−7、Vero、チャイニーズハムスター細胞CHO(以下、CHO細胞と略記)、dhfr遺伝子欠損チャイニーズハムスター細胞CHO(以下、CHO(dhfr)細胞と略記)、マウスL細胞、マウスAtT−20、マウスミエローマ細胞、ラットGH3、ヒトFL細胞などが用いられる。
エシェリヒア属菌を形質転換するには、例えば、プロシージングズ・オブ・ザ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンジイズ・オブ・ザ・ユーエスエー(Proc. Natl. Acad. Sci. USA)、69巻、2110 (1972)やジーン(Gene)、17巻、107 (1982)などに記載の方法に従って行うことができる。
【0027】
バチルス属菌を形質転換するには、例えば、モレキュラー・アンド・ジェネラル・ジェネティックス(Molecular & General Genetics)、168巻、111 (1979)などに記載の方法に従って行うことができる。
酵母を形質転換するには、例えば、メソッズ・イン・エンザイモロジー(Methods in Enzymology)、194巻、182−187(1991)、プロシージングズ・オブ・ザ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンシイズ・オブ・ザ・ユーエスエー(Proc. Natl. Acad. Sci. USA)、75巻、1929 (1978)などに記載の方法に従って行うことができる。
昆虫細胞または昆虫を形質転換するには、例えば、バイオ/テクノロジー(Bio/Technology、6、47−55(1988))などに記載の方法に従って行うことができる。
動物細胞を形質転換するには、例えば、細胞工学別冊8 新細胞工学実験プロトコール.263−267(1995)(秀潤社発行)、ヴィロロジー(Virology)、52巻、456 (1973)に記載の方法に従って行うことができる。
このようにして、タンパク質をコードするDNAを含有する発現ベクターで形質転換された形質転換体を得ることができる。
宿主がエシェリヒア属菌、バチルス属菌である形質転換体を培養する際、培養に使用される培地としては液体培地が適当であり、その中には該形質転換体の生育に必要な炭素源、窒素源、無機物その他が含有せしめられる。炭素源としては、例えば、グルコース、デキストリン、可溶性澱粉、ショ糖など、窒素源としては、例えば、アンモニウム塩類、硝酸塩類、コーンスチープ・リカー、ペプトン、カゼイン、肉エキス、大豆粕、バレイショ抽出液などの無機または有機物質、無機物としては、例えば、塩化カルシウム、リン酸二水素ナトリウム、塩化マグネシウムなどが挙げられる。また、酵母エキス、ビタミン類、生長促進因子などを添加してもよい。培地のpHは約5〜8が望ましい。
【0028】
エシェリヒア属菌を培養する際の培地としては、例えば、グルコース、カザミノ酸を含むM9培地〔ミラー(Miller),ジャーナル・オブ・エクスペリメンツ・イン・モレキュラー・ジェネティックス(Journal of Experiments in Molecular Genetics),431−433,Cold Spring Harbor Laboratory, New York 1972〕が好ましい。ここに必要によりプロモーターを効率よく働かせるために、例えば、3β−インドリルアクリル酸のような薬剤を加えることができる。
宿主がエシェリヒア属菌の場合、培養は通常約15〜43℃で約3〜24時間行ない、必要により、通気や撹拌を加えることもできる。
宿主がバチルス属菌の場合、培養は通常約30〜40℃で約6〜24時間行ない、必要により通気や撹拌を加えることもできる。
宿主が酵母である形質転換体を培養する際、培地としては、例えば、バークホールダー(Burkholder)最小培地〔Bostian, K. L. ら、プロシージングズ・オブ・ザ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンシイズ・オブ・ザ・ユーエスエー(Proc. Natl. Acad. Sci. USA),77巻,4505 (1980)〕や0.5%カザミノ酸を含有するSD培地〔Bitter, G. A. ら、プロシージングズ・オブ・ザ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンシイズ・オブ・ザ・ユーエスエー(Proc. Natl. Acad. Sci. USA),81巻,5330(1984)〕が挙げられる。培地のpHは約5〜8に調整するのが好ましい。培養は通常約20℃〜35℃で約24〜72時間行ない、必要に応じて通気や撹拌を加える。
宿主が昆虫細胞または昆虫である形質転換体を培養する際、培地としては、Grace’s Insect Medium(Grace, T.C.C.,ネイチャー(Nature),195,788(1962))に非動化した10%ウシ血清等の添加物を適宜加えたものなどが用いられる。培地のpHは約6.2〜6.4に調整するのが好ましい。培養は通常約27℃で約3〜5日間行ない、必要に応じて通気や撹拌を加える。
宿主が動物細胞である形質転換体を培養する際、培地としては、例えば、約5〜20%の胎児牛血清を含むMEM培地〔サイエンス(Science),122巻,501 (1952)〕,DMEM培地〔ヴィロロジー(Virology),8巻,396 (1959)〕,RPMI 1640培地〔ジャーナル・オブ・ザ・アメリカン・メディカル・アソシエーション(The Journal of the American Medical Association)199巻,519 (1967)〕,199培地〔プロシージング・オブ・ザ・ソサイエティ・フォー・ザ・バイオロジカル・メディスン(Proceeding of the Society for the Biological Medicine),73巻,1(1950)〕などが用いられる。pHは約6〜8であるのが好ましい。培養は通常約30℃〜40℃で約15〜60時間行ない、必要に応じて通気や撹拌を加える。
以上のようにして、形質転換体の細胞内、細胞膜または細胞外に本発明のタンパク質を生成せしめることができる。
【0029】
上記培養物から本発明のタンパク質を分離精製するには、例えば、下記の方法により行うことができる。
本発明のタンパク質を培養菌体あるいは細胞から抽出するに際しては、培養後、公知の方法で菌体あるいは細胞を集め、これを適当な緩衝液に懸濁し、超音波、リゾチームおよび/または凍結融解などによって菌体あるいは細胞を破壊したのち、遠心分離やろ過によりタンパク質の粗抽出液を得る方法などが適宜用いられる。緩衝液の中に尿素や塩酸グアニジンなどのタンパク質変性剤や、トリトンX−100TMなどの界面活性剤が含まれていてもよい。培養液中にタンパク質が分泌される場合には、培養終了後、公知の方法で菌体あるいは細胞と上清とを分離し、上清を集める。
このようにして得られた培養上清、あるいは抽出液中に含まれるタンパク質の精製は、公知の分離・精製法を適切に組み合わせて行うことができる。これらの公知の分離、精製法としては、塩析や溶媒沈澱法などの溶解度を利用する方法、透析法、限外ろ過法、ゲルろ過法、およびSDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動法などの主として分子量の差を利用する方法、イオン交換クロマトグラフィーなどの荷電の差を利用する方法、アフィニティークロマトグラフィーなどの特異的親和性を利用する方法、逆相高速液体クロマトグラフィーなどの疎水性の差を利用する方法、等電点電気泳動法などの等電点の差を利用する方法などが用いられる。
【0030】
このようにして得られるタンパク質が遊離体で得られた場合には、公知の方法あるいはそれに準じる方法によって塩に変換することができ、逆に塩で得られた場合には公知の方法あるいはそれに準じる方法により、遊離体または他の塩に変換することができる。
なお、組換え体が産生するタンパク質を、精製前または精製後に適当なタンパク質修飾酵素を作用させることにより、任意に修飾を加えたり、ポリペプチドを部分的に除去することもできる。タンパク質修飾酵素としては、例えば、トリプシン、キモトリプシン、アルギニルエンドペプチダーゼ、プロテインキナーゼ、グリコシダーゼなどが用いられる。
このようにして生成する本発明のタンパク質の存在は、特異抗体を用いたエンザイムイムノアッセイやウエスタンブロッティングなどにより測定することができる。
【0031】
本発明のタンパク質もしくは部分ペプチドまたはその塩に対する抗体は、本発明のタンパク質もしくは部分ペプチドまたはその塩を認識し得る抗体であれば、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体の何れであってもよい。
本発明のタンパク質もしくは部分ペプチドまたはその塩(以下、抗体の説明においては、これらを単に本発明のタンパク質と略記する場合がある)に対する抗体は、本発明のタンパク質を抗原として用い、公知の抗体または抗血清の製造法に従って製造することができる。
〔モノクローナル抗体の作製〕
(a)モノクローナル抗体産生細胞の作製
本発明のタンパク質は、温血動物に対して投与により抗体産生が可能な部位にそれ自体あるいは担体、希釈剤とともに投与される。投与に際して抗体産生能を高めるため、完全フロイントアジュバントや不完全フロイントアジュバントを投与してもよい。投与は通常2〜6週毎に1回ずつ、計2〜10回程度行われる。用いられる温血動物としては、例えば、サル、ウサギ、イヌ、モルモット、マウス、ラット、ヒツジ、ヤギ、ニワトリが挙げられるが、マウスおよびラットが好ましく用いられる。
モノクローナル抗体産生細胞の作製に際しては、抗原で免疫された温血動物、例えばマウスから抗体価の認められた個体を選択し最終免疫の2〜5日後に脾臓またはリンパ節を採取し、それらに含まれる抗体産生細胞を同種または異種動物の骨髄腫細胞と融合させることにより、モノクローナル抗体産生ハイブリドーマを調製することができる。抗血清中の抗体価の測定は、例えば、後記の標識化タンパク質と抗血清とを反応させたのち、抗体に結合した標識剤の活性を測定することにより行うことができる。融合操作は既知の方法、例えば、ケーラーとミルスタインの方法〔ネイチャー(Nature)、256、495 (1975)〕に従い実施することができる。融合促進剤としては、例えば、ポリエチレングリコール(PEG)やセンダイウィルスなどが挙げられるが、好ましくはPEGが用いられる。
【0032】
骨髄腫細胞としては、例えば、NS−1、P3U1、SP2/0、AP−1などの温血動物の骨髄腫細胞が挙げられるが、P3U1が好ましく用いられる。用いられる抗体産生細胞(脾臓細胞)数と骨髄腫細胞数との好ましい比率は1:1〜20:1程度であり、PEG(好ましくはPEG1000〜PEG6000)が10〜80%程度の濃度で添加され、20〜40℃、好ましくは30〜37℃で1〜10分間インキュベートすることにより効率よく細胞融合を実施できる。
モノクローナル抗体産生ハイブリドーマのスクリーニングには種々の方法が使用できるが、例えば、タンパク質抗原を直接あるいは担体とともに吸着させた固相(例、マイクロプレート)にハイブリドーマ培養上清を添加し、次に放射性物質や酵素などで標識した抗免疫グロブリン抗体(細胞融合に用いられる細胞がマウスの場合、抗マウス免疫グロブリン抗体が用いられる)またはプロテインAを加え、固相に結合したモノクローナル抗体を検出する方法、抗免疫グロブリン抗体またはプロテインAを吸着させた固相にハイブリドーマ培養上清を添加し、放射性物質や酵素などで標識したタンパク質を加え、固相に結合したモノクローナル抗体を検出する方法などが挙げられる。
モノクローナル抗体の選別は、公知あるいはそれに準じる方法に従って行うことができる。通常HAT(ヒポキサンチン、アミノプテリン、チミジン)を添加した動物細胞用培地で行うことができる。選別および育種用培地としては、ハイブリドーマが生育できるものならばどのような培地を用いても良い。例えば、1〜20%、好ましくは10〜20%の牛胎児血清を含むRPMI 1640培地、1〜10%の牛胎児血清を含むGIT培地(和光純薬工業(株))あるいはハイブリドーマ培養用無血清培地(SFM−101、日水製薬(株))などを用いることができる。培養温度は、通常20〜40℃、好ましくは約37℃である。培養時間は、通常5日〜3週間、好ましくは1週間〜2週間である。培養は、通常5%炭酸ガス下で行うことができる。ハイブリドーマ培養上清の抗体価は、上記の抗血清中の抗体価の測定と同様にして測定できる。
【0033】
(b)モノクローナル抗体の精製
モノクローナル抗体の分離精製は、公知の方法、例えば、免疫グロブリンの分離精製法〔例、塩析法、アルコール沈殿法、等電点沈殿法、電気泳動法、イオン交換体(例、DEAE)による吸脱着法、超遠心法、ゲルろ過法、抗原結合固相あるいはプロテインAあるいはプロテインGなどの活性吸着剤により抗体のみを採取し、結合を解離させて抗体を得る特異的精製法〕に従って行うことができる。
【0034】
〔ポリクローナル抗体の作製〕
本発明のポリクローナル抗体は、公知あるいはそれに準じる方法に従って製造することができる。例えば、免疫抗原(タンパク質抗原)自体、あるいはそれとキャリアータンパク質との複合体をつくり、上記のモノクローナル抗体の製造法と同様に温血動物に免疫を行ない、該免疫動物から本発明のタンパク質に対する抗体含有物を採取して、抗体の分離精製を行うことにより製造することができる。
温血動物を免疫するために用いられる免疫抗原とキャリアータンパク質との複合体に関し、キャリアータンパク質の種類およびキャリアーとハプテンとの混合比は、キャリアーに架橋させて免疫したハプテンに対して抗体が効率良くできれば、どの様なものをどの様な比率で架橋させてもよいが、例えば、ウシ血清アルブミンやウシサイログロブリン、ヘモシアニン等を重量比でハプテン1に対し、約0.1〜20、好ましくは約1〜5の割合でカプルさせる方法が用いられる。また、ハプテンとキャリアーのカプリングには、種々の縮合剤を用いることができるが、グルタルアルデヒドやカルボジイミド、マレイミド活性エステル、チオール基、ジチオビリジル基を含有する活性エステル試薬等が用いられる。
縮合生成物は、温血動物に対して、抗体産生が可能な部位にそれ自体あるいは担体、希釈剤とともに投与される。投与に際して抗体産生能を高めるため、完全フロイントアジュバントや不完全フロイントアジュバントを投与してもよい。投与は、通常約2〜6週毎に1回ずつ、計約3〜10回程度行なわれる。
ポリクローナル抗体は、上記の方法で免疫された温血動物の血液、腹水など、好ましくは血液から採取することができる。
抗血清中のポリクローナル抗体価の測定は、上記の抗血清中の抗体価の測定と同様にして測定できる。ポリクローナル抗体の分離精製は、上記のモノクローナル抗体の分離精製と同様の免疫グロブリンの分離精製法に従って行うことができる。
【0035】
本発明で用いられるタンパク質または部分ペプチドをコードするDNA(以下、アンチセンスポリヌクレオチドの説明においては、これらのDNAを本発明のDNAと略記する場合がある)の塩基配列に相補的な、または実質的に相補的な塩基配列またはその一部を含有するアンチセンスポリヌクレオチドとしては、本発明のDNAの塩基配列に相補的な、または実質的に相補的な塩基配列またはその一部を含有し、該DNAの発現を抑制し得る作用を有するものであれば、いずれのアンチセンスポリヌクレオチドであってもよい。アンチセンスDNAが好ましい。
本発明のDNAに実質的に相補的な塩基配列とは、例えば、本発明のDNAに相補的な塩基配列(すなわち、本発明のDNAの相補鎖)の全塩基配列あるいは部分塩基配列と約70%以上、好ましくは約80%以上、より好ましくは約90%以上、最も好ましくは約95%以上の相同性を有する塩基配列などが挙げられる。特に、本発明のDNAの相補鎖の全塩基配列のうち、本発明のタンパク質のN末端部位をコードする部分の塩基配列(例えば、開始コドン付近の塩基配列など)の相補鎖と約70%以上、好ましくは約80%以上、より好ましくは約90%以上、最も好ましくは約95%以上の相同性を有するアンチセンスポリヌクレオチドが好適である。
具体的には、配列番号:2または配列番号:24で表される塩基配列を含有するDNAの塩基配列に相補的な、もしくは実質的に相補的な塩基配列、またはその一部分を含有するアンチセンスポリヌクレオチド、好ましくは例えば、配列番号:2または配列番号:24で表される塩基配列を含有するDNAの塩基配列に相補的な塩基配列、またはその一部分を含有するアンチセンスポリヌクレオチドなどが挙げられる。
アンチセンスポリヌクレオチドは通常、10〜40個程度、好ましくは15〜30個程度の塩基から構成される。
ヌクレアーゼなどの加水分解酵素による分解を防ぐために、アンチセンスDNAを構成する各ヌクレオチドのリン酸残基(ホスフェート)は、例えば、ホスホロチオエート、メチルホスホネート、ホスホロジチオネートなどの化学修飾リン酸残基に置換されていてもよい。これらのアンチセンスポリヌクレオチドは、公知のDNA合成装置などを用いて製造することができる。
【0036】
本発明に従えば、本発明のタンパク質遺伝子の複製または発現を阻害することのできる、本発明のタンパク質遺伝子に対応するアンチセンスポリヌクレオチド(核酸)を、クローン化した、あるいは決定されたタンパク質をコードするDNAの塩基配列情報に基づき設計し、合成しうる。かかるポリヌクレオチド(核酸)は、本発明のタンパク質遺伝子のRNAとハイブリダイズすることができ、該RNAの合成または機能を阻害することができるか、あるいは本発明のタンパク質関連RNAとの相互作用を介して本発明のタンパク質遺伝子の発現を調節・制御することができる。本発明のタンパク質関連RNAの選択された配列に相補的なポリヌクレオチド、および本発明のタンパク質関連RNAと特異的にハイブリダイズすることができるポリヌクレオチドは、生体内および生体外で本発明のタンパク質遺伝子の発現を調節・制御するのに有用であり、また病気などの治療または診断に有用である。用語「対応する」とは、遺伝子を含めたヌクレオチド、塩基配列または核酸の特定の配列に相同性を有するあるいは相補的であることを意味する。ヌクレオチド、塩基配列または核酸とペプチド(タンパク質)との間で「対応する」とは、ヌクレオチド(核酸)の配列またはその相補体から誘導される指令にあるペプチド(タンパク質)のアミノ酸を通常指している。タンパク質遺伝子の5’端ヘアピンループ、5’端6−ベースペア・リピート、5’端非翻訳領域、ポリペプチド翻訳終止コドン、タンパク質コード領域、ORF翻訳終止コドン、3’端非翻訳領域、3’端パリンドローム領域、および3’端ヘアピンループは好ましい対象領域として選択しうるが、タンパク質遺伝子内の如何なる領域も対象として選択しうる。
目的核酸と、対象領域の少なくとも一部に相補的なポリヌクレオチドとの関係については、目的核酸が対象領域とハイブリダイズすることができる場合は、その目的核酸は、当該対象領域のポリヌクレオチドに対して「アンチセンス」であるということができる。アンチセンスポリヌクレオチドは、2−デオキシ−D−リボースを含有しているポリヌクレオチド、D−リボースを含有しているポリヌクレオチド、プリンまたはピリミジン塩基のN−グリコシドであるその他のタイプのポリヌクレオチド、あるいは非ヌクレオチド骨格を有するその他のポリマー(例えば、市販のタンパク質核酸および合成配列特異的な核酸ポリマー)または特殊な結合を含有するその他のポリマー(但し、該ポリマーはDNAやRNA中に見出されるような塩基のペアリングや塩基の付着を許容する配置をもつヌクレオチドを含有する)などが挙げられる。それらは、二本鎖DNA、一本鎖DNA、二本鎖RNA、一本鎖RNA、さらにDNA:RNAハイブリッドであることができ、さらに非修飾ポリヌクレオチド(または非修飾オリゴヌクレオチド)、さらには公知の修飾の付加されたもの、例えば当該分野で知られた標識のあるもの、キャップの付いたもの、メチル化されたもの、1個以上の天然のヌクレオチドを類縁物で置換したもの、分子内ヌクレオチド修飾のされたもの、例えば非荷電結合(例えば、メチルホスホネート、ホスホトリエステル、ホスホルアミデート、カルバメートなど)を持つもの、電荷を有する結合または硫黄含有結合(例えば、ホスホロチオエート、ホスホロジチオエートなど)を持つもの、例えばタンパク質(ヌクレアーゼ、ヌクレアーゼ・インヒビター、トキシン、抗体、シグナルペプチド、ポリ−L−リジンなど)や糖(例えば、モノサッカライドなど)などの側鎖基を有しているもの、インターカレート化合物(例えば、アクリジン、ソラレンなど)を持つもの、キレート化合物(例えば、金属、放射活性をもつ金属、ホウ素、酸化性の金属など)を含有するもの、アルキル化剤を含有するもの、修飾された結合を持つもの(例えば、αアノマー型の核酸など)であってもよい。ここで「ヌクレオシド」、「ヌクレオチド」および「核酸」とは、プリンおよびピリミジン塩基を含有するのみでなく、修飾されたその他の複素環型塩基をもつようなものを含んでいて良い。こうした修飾物は、メチル化されたプリンおよびピリミジン、アシル化されたプリンおよびピリミジン、あるいはその他の複素環を含むものであってよい。修飾されたヌクレオチドおよび修飾されたヌクレオチドはまた糖部分が修飾されていてよく、例えば、1個以上の水酸基がハロゲンとか、脂肪族基などで置換されていたり、あるいはエーテル、アミンなどの官能基に変換されていてよい。
本発明のアンチセンスポリヌクレオチド(核酸)は、RNA、DNA、あるいは修飾された核酸(RNA、DNA)である。修飾された核酸の具体例としては核酸の硫黄誘導体やチオホスフェート誘導体、そしてポリヌクレオシドアミドやオリゴヌクレオシドアミドの分解に抵抗性のものが挙げられるが、それに限定されるものではない。本発明のアンチセンス核酸は次のような方針で好ましく設計されうる。すなわち、細胞内でのアンチセンス核酸をより安定なものにする、アンチセンス核酸の細胞透過性をより高める、目標とするセンス鎖に対する親和性をより大きなものにする、そしてもし毒性があるならアンチセンス核酸の毒性をより小さなものにする。
こうした修飾は当該分野で数多く知られており、例えば J. Kawakami et al.,Pharm Tech Japan, Vol. 8, pp.247, 1992; Vol. 8, pp.395, 1992; S. T. Crooke et al. ed., Antisense Research and Applications, CRC Press, 1993 などに開示がある。
本発明のアンチセンス核酸は、変化せしめられたり、修飾された糖、塩基、結合を含有していて良く、リポゾーム、ミクロスフェアのような特殊な形態で供与されたり、遺伝子治療により適用されたり、付加された形態で与えられることができうる。こうして付加形態で用いられるものとしては、リン酸基骨格の電荷を中和するように働くポリリジンのようなポリカチオン体、細胞膜との相互作用を高めたり、核酸の取込みを増大せしめるような脂質(例えば、ホスホリピド、コレステロールなど)といった疎水性のものが挙げられる。付加するに好ましい脂質としては、コレステロールやその誘導体(例えば、コレステリルクロロホルメート、コール酸など)が挙げられる。こうしたものは、核酸の3’端あるいは5’端に付着させることができ、塩基、糖、分子内ヌクレオシド結合を介して付着させることができうる。その他の基としては、核酸の3’端あるいは5’端に特異的に配置されたキャップ用の基で、エキソヌクレアーゼ、RNaseなどのヌクレアーゼによる分解を阻止するためのものが挙げられる。こうしたキャップ用の基としては、ポリエチレングリコール、テトラエチレングリコールなどのグリコールをはじめとした当該分野で知られた水酸基の保護基が挙げられるが、それに限定されるものではない。
アンチセンス核酸の阻害活性は、本発明の形質転換体、本発明の生体内や生体外の遺伝子発現系、あるいは本発明のタンパク質の生体内や生体外の翻訳系を用いて調べることができる。該核酸は公知の各種の方法で細胞に適用できる。
【0037】
以下に、本発明のタンパク質もしくは部分ペプチドまたはそれらの塩(以下、本発明のタンパク質と略記する場合がある)、本発明のタンパク質または部分ペプチドをコードするDNA(以下、本発明のDNAと略記する場合がある)、本発明のタンパク質もしくは部分ペプチドまたはそれらの塩に対する抗体(以下、本発明の抗体と略記する場合がある)、および本発明のDNAのアンチセンスポリヌクレオチド(以下、本発明のアンチセンスポリヌクレオチドと略記する場合がある)などの用途を説明する。
本発明のタンパク質の活性を阻害する化合物もしくはその塩を含有する医薬は、ジまたはトリカルボン酸輸送活性を抑制することができるので、例えば、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、前立腺疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、腎臓疾患(例、腎炎、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫など)、代謝疾患(例、糖尿病、高脂血症など)、循環器疾患(例、動脈硬化など)または癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌など)などの予防・治療剤、または老化の予防・抑制剤として使用することができる。
一方、本発明のタンパク質の活性を促進する化合物もしくはその塩を含有する医薬は、例えばジまたはトリカルボン酸輸送活性を促進することができるので、例えば、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、前立腺疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、腎臓疾患(例、腎炎、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫など)、代謝疾患(例、糖尿病、高脂血症など)、循環器疾患(例、動脈硬化など)または癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌など)などの予防・治療剤、または老化の予防・抑制剤として使用することができる。
【0038】
〔1〕本発明のタンパク質が関与する各種疾病の予防・治療剤
本発明のタンパク質は、ジまたはトリカルボン酸輸送活性を有し、コハク酸、クエン酸、リンゴ酸、フマル酸またはαケトグルタル酸などの輸送に寄与するとともに、細胞の代謝反応に重要な役割を果たしている。
したがって、本発明のタンパク質をコードするDNAに異常があったり、欠損している場合あるいは本発明のタンパク質の発現量が減少している場合には、例えば、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、前立腺疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、腎臓疾患(例、腎炎、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫など)、代謝疾患(例、糖尿病、高脂血症など)、循環器疾患(例、動脈硬化など)または癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌など)などの種々の疾患が発症したり、老化が進行する。
したがって、本発明のタンパク質および本発明のDNAは、例えば、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、前立腺疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、腎臓疾患(例、腎炎、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫など)、代謝疾患(例、糖尿病、高脂血症など)、循環器疾患(例、動脈硬化など)または癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌など)などの予防・治療剤、老化の予防・抑制剤として使用することができる。
例えば、生体内において本発明のタンパク質が減少あるいは欠損しているために、ジまたはトリカルボン酸の輸送が十分に、あるいは正常に発揮されない患者がいる場合に、(イ)本発明のDNAをその患者に投与し、生体内で本発明のタンパク質を発現させることによって、(ロ)細胞に本発明のDNAを挿入し、本発明のタンパク質を発現させた後に、その細胞を患者に移植することによって、または(ハ)本発明のタンパク質をその患者に投与することなどによって、その患者における本発明のタンパク質の役割を十分に、あるいは正常に発揮させることができる。
本発明のDNAを上記の予防・治療剤として使用する場合は、本発明のDNAを単独あるいはレトロウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノウイルスアソシエーテッドウイルスベクターなどの適当なベクターに挿入した後、常套手段に従って、ヒトまたはその他の温血動物に投与することができる。本発明のDNAは、そのままで、あるいは摂取促進のための補助剤などの生理学的に認められる担体とともに製剤化し、遺伝子銃やハイドロゲルカテーテルのようなカテーテルによって投与できる。
本発明のタンパク質を上記の予防・治療剤として使用する場合は、少なくとも90%、好ましくは95%以上、より好ましくは98%以上、さらに好ましくは99%以上に精製されたものを使用するのが好ましい。
【0039】
本発明のタンパク質は、例えば、必要に応じて糖衣を施した錠剤、カプセル剤、エリキシル剤、マイクロカプセル剤などとして経口的に、あるいは水もしくはそれ以外の薬学的に許容し得る液との無菌性溶液、または懸濁液剤などの注射剤の形で非経口的に使用できる。例えば、本発明のタンパク質を生理学的に認められる担体、香味剤、賦形剤、ベヒクル、防腐剤、安定剤、結合剤などとともに一般に認められた製剤実施に要求される単位用量形態で混和することによって製造することができる。これら製剤における有効成分量は指示された範囲の適当な用量が得られるようにするものである。
錠剤、カプセル剤などに混和することができる添加剤としては、例えば、ゼラチン、コーンスターチ、トラガント、アラビアゴムのような結合剤、結晶性セルロースのような賦形剤、コーンスターチ、ゼラチン、アルギン酸などのような膨化剤、ステアリン酸マグネシウムのような潤滑剤、ショ糖、乳糖またはサッカリンのような甘味剤、ペパーミント、アカモノ油またはチェリーのような香味剤などが用いられる。調剤単位形態がカプセルである場合には、前記タイプの材料にさらに油脂のような液状担体を含有することができる。注射のための無菌組成物は注射用水のようなベヒクル中の活性物質、胡麻油、椰子油などのような天然産出植物油などを溶解または懸濁させるなどの通常の製剤実施に従って処方することができる。
注射用の水性液としては、例えば、生理食塩水、ブドウ糖やその他の補助薬を含む等張液(例えば、D−ソルビトール、D−マンニトール、塩化ナトリウムなど)などが挙げられ、適当な溶解補助剤、例えば、アルコール(例えば、エタノールなど)、ポリアルコール(例えば、プロピレングリコール、ポリエチレングリコールなど)、非イオン性界面活性剤(例えば、ポリソルベート80TM、HCO−50など)などと併用してもよい。油性液としては、例えば、ゴマ油、大豆油などが挙げられ、溶解補助剤として安息香酸ベンジル、ベンジルアルコールなどと併用してもよい。また、緩衝剤(例えば、リン酸塩緩衝液、酢酸ナトリウム緩衝液など)、無痛化剤(例えば、塩化ベンザルコニウム、塩酸プロカインなど)、安定剤(例えば、ヒト血清アルブミン、ポリエチレングリコールなど)、保存剤(例えば、ベンジルアルコール、フェノールなど)、酸化防止剤などと配合してもよい。調製された注射液は、通常、適当なアンプルに充填される。
本発明のDNAが挿入されたベクターも上記と同様に製剤化され、通常、非経口的に使用される。
【0040】
このようにして得られる製剤は、安全で低毒性であるので、例えば、温血動物(例えば、ヒト、ラット、マウス、モルモット、ウサギ、トリ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ウマ、ネコ、イヌ、サル、チンパンジーなど)に対して投与することができる。
本発明のタンパク質の投与量は、対象疾患、投与対象、投与ルートなどにより差異はあるが、例えば、肝臓疾患の治療目的で本発明のタンパク質を経口投与する場合、一般的に成人(60kgとして)においては、一日につき該タンパク質等を約0.1mg〜100mg、好ましくは約1.0〜50mg、より好ましくは約1.0〜20mg投与する。非経口的に投与する場合は、該タンパク質等の1回投与量は投与対象、対象疾患などによっても異なるが、例えば、肝臓疾患の治療目的で本発明のタンパク質を注射剤の形で成人(体重60kgとして)に投与する場合、一日につき該タンパク質等を約0.01〜30mg程度、好ましくは約0.1〜20mg程度、より好ましくは約0.1〜10mg程度を患部に注射することにより投与するのが好都合である。他の動物の場合も、60kg当たりに換算した量を投与することができる。
【0041】
〔2〕疾病に対する医薬候補化合物のスクリーニング
本発明のタンパク質は、本発明のタンパク質の活性を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニングのための試薬として有用である。
本発明は、(1)本発明のタンパク質を用いることを特徴とする本発明のタンパク質の活性(例えば、ジまたはトリカルボン酸の輸送など)を促進または阻害する化合物またはその塩(以下、それぞれ促進剤、阻害剤と略記する場合がある)のスクリーニング方法を提供する。より具体的には、例えば、
(2)(i)本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞のジまたはトリカルボン酸の輸送と(ii)本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞と試験化合物の混合物のジまたはトリカルボン酸の輸送の比較を行うことを特徴とする促進剤または阻害剤のスクリーニング方法を提供する。
具体的には、上記スクリーニング方法においては、例えば、(i)と(ii)の場合において、ジまたはトリカルボン酸の輸送を、標識した基質(例、蛍光標識または放射標識した基質)を用いて測定し、ジまたはトリカルボン酸の輸送の指標として比較することを特徴とするものである。
【0042】
試験化合物としては、例えば、ペプチド、タンパク質、非ペプチド性化合物、合成化合物、発酵生産物、細胞抽出液、植物抽出液、動物組織抽出液などが挙げられ、これら化合物は新規な化合物であってもよいし、公知の化合物であってもよい。
上記のスクリーニング方法を実施するには、本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞をスクリーニングに適したバッファーに浮遊して調製する。バッファーには、pH約4〜10(望ましくは、pH約6〜8)のリン酸バッファー、ほう酸バッファーなどの、本発明のタンパク質のジまたはトリカルボン酸の輸送を阻害しないバッファーであればいずれでもよい。
本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞としては、例えば、前述した本発明のタンパク質をコードするDNAを含有するベクターで形質転換された宿主(形質転換体)が用いられる。宿主としては、例えば、CHO細胞などの動物細胞が好ましく用いられる。該スクリーニングには、例えば、前述の方法で培養することによって、本発明のタンパク質を細胞膜上に発現させた形質転換体が好ましく用いられる。
【0043】
ジまたはトリカルボン酸の輸送などの活性の測定は、公知の方法に準じて行うことが出来るが、例えば、Am. J. Physiol. Cell. Physiol. 278巻, C1019−C1030頁, 2000年に記載の方法またはそれに準じる方法に従って測定することができる。
例えば、上記(ii)の場合におけるジまたはトリカルボン酸の輸送を、上記(i)の場合に比べて、約20%以上、好ましくは30%以上、より好ましくは約50%以上促進する試験化合物を本発明のタンパク質の活性を促進する化合物またはその塩として選択することができる。
また、例えば、上記(ii)の場合におけるジまたはトリカルボン酸の輸送を、上記(i)の場合に比べて、約20%以上、好ましくは30%以上、より好ましくは約50%以上阻害(または抑制)する試験化合物を本発明のタンパク質の活性を阻害する化合物またはその塩として選択することができる。
また、本発明のタンパク質の遺伝子のプロモーター下流に分泌型アルカリホスファターゼ、ルシフェラーゼなどの遺伝子を挿入し、上記の各種細胞に発現させ、該細胞に上記試験化合物を接触させた場合における酵素活性を賦活化または阻害する化合物またはその塩を探索することによって本発明のタンパク質の発現を促進または抑制(すなわち、本発明のタンパク質の活性を促進または阻害)する化合物またはその塩をスクリーニングすることができる。
【0044】
本発明のタンパク質をコードするポリヌクレオチドは、本発明のタンパク質遺伝子の発現を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニングのための試薬として有用である。
本発明は、(3)本発明のタンパク質をコードするポリヌクレオチドを用いることを特徴とする本発明のタンパク質遺伝子の発現を促進または阻害する化合物またはその塩(以下、それぞれ促進剤、阻害剤と略記する場合がある)のスクリーニング方法を提供し、より具体的には、例えば、
(4)(iii)本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞を培養した場合と(iv)本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞と試験化合物の混合物を培養した場合との比較を行うことを特徴とする促進剤または阻害剤のスクリーニング方法を提供する。
上記スクリーニング方法においては、例えば、(iii)と(iv)の場合における、本発明のタンパク質遺伝子の発現量(具体的には、本発明のタンパク質量または前記タンパク質をコードするmRNA量)を測定して、比較する。
試験化合物としては、例えば、ペプチド、タンパク質、非ペプチド性化合物、合成化合物、発酵生産物、細胞抽出液、植物抽出液、動物組織抽出液などが挙げられ、これら化合物は新規な化合物であってもよいし、公知の化合物であってもよい。
上記のスクリーニング方法を実施するには、本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞をスクリーニングに適したバッファーに浮遊して調製する。バッファーには、pH約4〜10(望ましくは、pH約6〜8)のリン酸バッファー、ほう酸バッファーなどの、本発明のタンパク質の有機アニオンの輸送活性を阻害しないバッファーであればいずれでもよい。
本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞としては、例えば、前述した本発明のタンパク質をコードするDNAを含有するベクターで形質転換された宿主(形質転換体)が用いられる。宿主としては、例えば、CHO細胞などの動物細胞が好ましく用いられる。該スクリーニングには、例えば、前述の方法で培養することによって、本発明のタンパク質を細胞膜上に発現させた形質転換体が好ましく用いられる。
本発明のタンパク質量の測定は、公知の方法、例えば、本発明のタンパク質を認識する抗体を用いて、細胞抽出液中などに存在する前記タンパク質を、ウェスタン解析、ELISA法などの方法またはそれに準じる方法に従い測定することができる。
本発明のタンパク質遺伝子の発現量は、公知の方法、例えば、ノーザンブロッティングやReverse transcription−polymerase chain reaction(RT−PCR)、リアルタイムPCR解析システム(ABI社製、TaqMan polymerase chain reaction)などの方法あるいはそれに準じる方法にしたがって測定することができる。
例えば、上記(iv)の場合における本発明のタンパク質遺伝子の発現量を、上記(iii)の場合に比べて、約20%以上、好ましくは30%以上、より好ましくは約50%以上促進する試験化合物を本発明のタンパク質遺伝子の発現を促進する化合物またはその塩として選択することができる。
例えば、上記(iv)の場合における本発明のタンパク質遺伝子の発現量を、上記(iii)の場合に比べて、約20%以上、好ましくは30%以上、より好ましくは約50%以上阻害する試験化合物を本発明のタンパク質遺伝子の発現を阻害する化合物またはその塩として選択することができる。
さらに、本発明の抗体は、本発明のタンパク質の発現を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニングのための試薬として有用である。
本発明は、(5)本発明の抗体を用いることを特徴とする本発明のタンパク質の発現を促進または阻害する化合物またはその塩(以下、それぞれ促進剤、阻害剤と略記する場合がある)のスクリーニング方法を提供し、より具体的には、例えば、
(6)(v)本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞を培養した場合と(vi)本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞と試験化合物の混合物を培養した場合との比較を行うことを特徴とする促進剤または阻害剤のスクリーニング方法を提供する。
上記スクリーニング方法においては、例えば、本発明の抗体を用いて(v)と(vi)の場合における、本発明のタンパク質の発現量(具体的には、本発明のタンパク質量)を測定(例、本発明の蛋白質の発現を検出、本発明の蛋白質の発現量を定量等)して、比較する。
試験化合物としては、例えば、ペプチド、タンパク質、非ペプチド性化合物、合成化合物、発酵生産物、細胞抽出液、植物抽出液、動物組織抽出液などが挙げられ、これら化合物は新規な化合物であってもよいし、公知の化合物であってもよい。
上記のスクリーニング方法を実施するには、本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞をスクリーニングに適したバッファーに浮遊して調製する。バッファーには、pH約4〜10(望ましくは、pH約6〜8)のリン酸バッファー、ほう酸バッファーなどの、本発明のタンパク質の有機アニオンの輸送活性を阻害しないバッファーであればいずれでもよい。
本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞としては、例えば、前述した本発明のタンパク質をコードするDNAを含有するベクターで形質転換された宿主(形質転換体)が用いられる。宿主としては、例えば、CHO細胞などの動物細胞が好ましく用いられる。該スクリーニングには、例えば、前述の方法で培養することによって、本発明のタンパク質を細胞膜上に発現させた形質転換体が好ましく用いられる。
本発明のタンパク質量の測定は、公知の方法、例えば、本発明のタンパク質を認識する抗体を用いて、細胞抽出液中などに存在する前記タンパク質を、ウェスタン解析、ELISA法などの方法またはそれに準じる方法に従い測定することができる。
例えば、上記(vi)の場合における本発明のタンパク質の発現量を、上記(v)の場合に比べて、約20%以上、好ましくは30%以上、より好ましくは約50%以上促進する試験化合物を本発明のタンパク質の発現を促進する化合物またはその塩として選択することができる。
例えば、上記(vi)の場合における本発明のタンパク質の発現量を、上記(v)の場合に比べて、約20%以上、好ましくは30%以上、より好ましくは約50%以上阻害する試験化合物を本発明のタンパク質の発現を阻害する化合物またはその塩として選択することができる。
【0045】
本発明のスクリーニング用キットは、本発明のタンパク質もしくは部分ペプチドまたはその塩、または本発明で用いられるタンパク質もしくは部分ペプチドを産生する能力を有する細胞を含有するものである。
本発明のスクリーニング方法またはスクリーニング用キットを用いて得られる化合物またはその塩は、上記した試験化合物、例えば、ペプチド、タンパク、非ペプチド性化合物、合成化合物、発酵生産物、細胞抽出液、植物抽出液、動物組織抽出液、血漿などから選ばれた化合物またはその塩であり、本発明のタンパク質の活性(例、ジまたはトリカルボン酸の輸送など)を促進または阻害する化合物またはその塩である。
該化合物の塩としては、前記した本発明のタンパク質の塩と同様のものが用いられる。
本発明のタンパク質の活性を促進する化合物またはその塩、本発明のタンパク質遺伝子の発現を促進する化合物またはその塩、または本発明のタンパク質の発現を促進する化合物またはその塩は、例えば、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、前立腺疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、腎臓疾患(例、腎炎、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫など)、代謝疾患(例、糖尿病、高脂血症など)、循環器疾患(例、動脈硬化など)または癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌など)などの予防・治療剤、または老化の予防・抑制剤として有用である。
また、本発明のタンパク質の活性を阻害する化合物またはその塩、本発明のタンパク質遺伝子の発現を阻害する化合物またはその塩、または本発明のタンパク質の発現を阻害する化合物またはその塩は、例えば、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、前立腺疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、腎臓疾患(例、腎炎、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫など)、代謝疾患(例、糖尿病、高脂血症など)、循環器疾患(例、動脈硬化など)または癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌など)などの予防・治療剤、または老化の予防・抑制剤として有用である。
【0046】
本発明のスクリーニング方法またはスクリーニング用キットを用いて得られる化合物またはその塩を上述の予防・治療剤や予防・抑制剤として使用する場合、常套手段に従って製剤化することができる。例えば、錠剤、カプセル剤、エリキシル剤、マイクロカプセル剤、無菌性溶液、懸濁液剤などとすることができる。このようにして得られる製剤は安全で低毒性であるので、例えば、ヒトまたは温血動物(例えば、マウス、ラット、ウサギ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ウマ、トリ、ネコ、イヌ、サル、チンパンジーなど)に対して経口的にまたは非経口的に投与することができる。
該化合物またはその塩の投与量は、その作用、対象疾患、投与対象、投与ルートなどにより差異はあるが、例えば、肝臓疾患治療の目的で本発明のタンパク質の活性を促進する化合物またはその塩を経口投与する場合、一般的に成人(体重60kgとして)においては、一日につき該化合物またはその塩を約0.1〜100mg、好ましくは約1.0〜50mg、より好ましくは約1.0〜20mg投与する。非経口的に投与する場合は、該化合物またはその塩の1回投与量は投与対象、対象疾患などによっても異なるが、例えば、肝臓疾患治療の目的で本発明のタンパク質の活性を促進する化合物またはその塩を注射剤の形で通常成人(体重60kgとして)に投与する場合、一日につき該化合物またはその塩を約0.01〜30mg程度、好ましくは約0.1〜20mg程度、より好ましくは約0.1〜10mg程度を静脈注射により投与するのが好都合である。他の動物の場合も、体重60kg当たりに換算した量を投与することができる。
【0047】
〔3〕本発明のタンパク質、その部分ペプチドまたはその塩の定量
本発明のタンパク質に対する抗体(以下、本発明の抗体と略記する場合がある)は、本発明のタンパク質を特異的に認識することができるので、被検液中の本発明のタンパク質の定量、特にサンドイッチ免疫測定法による定量などに使用することができる。
すなわち、本発明は、
(i)本発明の抗体と、被検液および標識化された本発明のタンパク質とを競合的に反応させ、該抗体に結合した標識化された本発明のタンパク質の割合を測定することを特徴とする被検液中の本発明のタンパク質の定量法、および
(ii)被検液と担体上に不溶化した本発明の抗体および標識化された本発明の別の抗体とを同時あるいは連続的に反応させたのち、不溶化担体上の標識剤の活性を測定することを特徴とする被検液中の本発明のタンパク質の定量法を提供する。
上記(ii)の定量法においては、一方の抗体が本発明のタンパク質のN端部を認識する抗体で、他方の抗体が本発明のタンパク質のC端部に反応する抗体であることが望ましい。
【0048】
また、本発明のタンパク質に対するモノクローナル抗体(以下、本発明のモノクローナル抗体と称する場合がある)を用いて本発明のタンパク質の定量を行なえるほか、組織染色等による本発明のタンパク質の検出を行うこともできる。これらの目的には、抗体分子そのものを用いてもよく、また、抗体分子のF(ab’) 、Fab’、あるいはFab画分を用いてもよい。
本発明の抗体を用いる本発明のタンパク質の定量法は、特に制限されるべきものではなく、被測定液中の抗原量(例えば、タンパク質量)に対応した抗体、抗原もしくは抗体−抗原複合体の量を化学的または物理的手段により検出し、これを既知量の抗原を含む標準液を用いて作製した標準曲線より算出する測定法であれば、いずれの測定法を用いてもよい。例えば、ネフロメトリー、競合法、イムノメトリック法およびサンドイッチ法が好適に用いられるが、感度、特異性の点で、後述するサンドイッチ法を用いるのが特に好ましい。
標識物質を用いる測定法に用いられる標識剤としては、例えば、放射性同位元素、酵素、蛍光物質、発光物質などが用いられる。放射性同位元素としては、例えば、〔125I〕、〔131I〕、〔H〕、〔14C〕などが用いられる。上記酵素としては、安定で比活性の大きなものが好ましく、例えば、β−ガラクトシダーゼ、β−グルコシダーゼ、アルカリフォスファターゼ、パーオキシダーゼ、リンゴ酸脱水素酵素などが用いられる。蛍光物質としては、例えば、フルオレスカミン、フルオレッセンイソチオシアネートなどが用いられる。発光物質としては、例えば、ルミノール、ルミノール誘導体、ルシフェリン、ルシゲニンなどが用いられる。さらに、抗体あるいは抗原と標識剤との結合にビオチン−アビジン系を用いることもできる。
【0049】
抗原あるいは抗体の不溶化に当っては、物理吸着を用いてもよく、また通常タンパク質あるいは酵素等を不溶化、固定化するのに用いられる化学結合を用いる方法でもよい。担体としては、アガロース、デキストラン、セルロースなどの不溶性多糖類、ポリスチレン、ポリアクリルアミド、シリコン等の合成樹脂、あるいはガラス等が挙げられる。
サンドイッチ法においては不溶化した本発明のモノクローナル抗体に被検液を反応させ(1次反応)、さらに標識化した別の本発明のモノクローナル抗体を反応させ(2次反応)たのち、不溶化担体上の標識剤の活性を測定することにより被検液中の本発明のタンパク質量を定量することができる。1次反応と2次反応は逆の順序に行っても、また、同時に行なってもよいし時間をずらして行なってもよい。標識化剤および不溶化の方法は前記のそれらに準じることができる。また、サンドイッチ法による免疫測定法において、固相用抗体あるいは標識用抗体に用いられる抗体は必ずしも1種類である必要はなく、測定感度を向上させる等の目的で2種類以上の抗体の混合物を用いてもよい。
本発明のサンドイッチ法による本発明のタンパク質の測定法においては、1次反応と2次反応に用いられる本発明のモノクローナル抗体は、本発明のタンパク質の結合する部位が相異なる抗体が好ましく用いられる。すなわち、1次反応および2次反応に用いられる抗体は、例えば、2次反応で用いられる抗体が、本発明のタンパク質のC端部を認識する場合、1次反応で用いられる抗体は、好ましくはC端部以外、例えばN端部を認識する抗体が用いられる。
【0050】
本発明のモノクローナル抗体をサンドイッチ法以外の測定システム、例えば、競合法、イムノメトリック法あるいはネフロメトリーなどに用いることができる。
競合法では、被検液中の抗原と標識抗原とを抗体に対して競合的に反応させたのち、未反応の標識抗原(F)と、抗体と結合した標識抗原(B)とを分離し(B/F分離)、B,Fいずれかの標識量を測定し、被検液中の抗原量を定量する。本反応法には、抗体として可溶性抗体を用い、B/F分離をポリエチレングリコール、前記抗体に対する第2抗体などを用いる液相法、および、第1抗体として固相化抗体を用いるか、あるいは、第1抗体は可溶性のものを用い第2抗体として固相化抗体を用いる固相化法とが用いられる。
イムノメトリック法では、被検液中の抗原と固相化抗原とを一定量の標識化抗体に対して競合反応させた後固相と液相を分離するか、あるいは、被検液中の抗原と過剰量の標識化抗体とを反応させ、次に固相化抗原を加え未反応の標識化抗体を固相に結合させたのち、固相と液相を分離する。次に、いずれかの相の標識量を測定し被検液中の抗原量を定量する。
また、ネフロメトリーでは、ゲル内あるいは溶液中で抗原抗体反応の結果生じた不溶性の沈降物の量を測定する。被検液中の抗原量が僅かであり、少量の沈降物しか得られない場合にもレーザーの散乱を利用するレーザーネフロメトリーなどが好適に用いられる。
【0051】
これら個々の免疫学的測定法を本発明の定量方法に適用するにあたっては、特別の条件、操作等の設定は必要とされない。それぞれの方法における通常の条件、操作法に当業者の通常の技術的配慮を加えて本発明のタンパク質の測定系を構築すればよい。これらの一般的な技術手段の詳細については、総説、成書などを参照することができる。
例えば、入江 寛編「ラジオイムノアッセイ」(講談社、昭和49年発行)、入江 寛編「続ラジオイムノアッセイ」(講談社、昭和54年発行)、石川栄治ら編「酵素免疫測定法」(医学書院、昭和53年発行)、石川栄治ら編「酵素免疫測定法」(第2版)(医学書院、昭和57年発行)、石川栄治ら編「酵素免疫測定法」(第3版)(医学書院、昭和62年発行)、「Methods in ENZYMOLOGY」 Vol. 70(Immunochemical Techniques(Part A))、 同書 Vol. 73(Immunochemical Techniques(Part B))、 同書 Vol. 74(Immunochemical Techniques(Part C))、 同書 Vol. 84(Immunochemical Techniques(Part D:Selected Immunoassays))、 同書 Vol. 92(Immunochemical Techniques(Part E:Monoclonal Antibodies and General Immunoassay Methods))、 同書 Vol. 121(Immunochemical Techniques(Part I:Hybridoma Technology and Monoclonal Antibodies))(以上、アカデミックプレス社発行)などを参照することができる。
以上のようにして、本発明の抗体を用いることによって、本発明のタンパク質を感度良く定量することができる。
さらには、本発明の抗体を用いて本発明のタンパク質の濃度を定量することによって、本発明のタンパク質の濃度の減少が検出された場合、例えば、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、前立腺疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、腎臓疾患(例、腎炎、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫など)、代謝疾患(例、糖尿病、高脂血症など)、循環器疾患(例、動脈硬化など)または癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌など)などの可能性が高い、または老化の進行が早いと診断することができる。また、本発明のタンパク質の濃度の上昇が検出された場合、例えば、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、前立腺疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、腎臓疾患(例、腎炎、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫など)、代謝疾患(例、糖尿病、高脂血症など)、循環器疾患(例、動脈硬化など)または癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌など)の可能性が高い、または老化の進行が早いと診断することが出来る。
また、本発明の抗体は、体液や組織などの被検体中に存在する本発明のタンパク質を検出するために使用することができる。また、本発明のタンパク質を精製するために使用する抗体カラムの作製、精製時の各分画中の本発明のタンパク質の検出、被検細胞内における本発明のタンパク質の挙動の分析などのために使用することができる。
【0052】
〔4〕遺伝子診断剤
本発明のDNAは、例えば、プローブとして使用することにより、ヒトまたはその他の温血動物(例えば、ラット、マウス、モルモット、ウサギ、トリ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ウマ、ネコ、イヌ、サル、チンパンジーなど)における本発明のタンパク質またはその部分ペプチドをコードするDNAまたはmRNAの異常(遺伝子異常)を検出することができるので、例えば、該DNAまたはmRNAの損傷、突然変異あるいは発現低下や、該DNAまたはmRNAの増加あるいは発現過多などの遺伝子診断剤として有用である。
本発明のDNAを用いる上記の遺伝子診断は、例えば、公知のノーザンハイブリダイゼーションやPCR−SSCP法(ゲノミックス(Genomics),第5巻,874〜879頁(1989年)、プロシージングズ・オブ・ザ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンシイズ・オブ・ユーエスエー(Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America),第86巻,2766〜2770頁(1989年))などにより実施することができる。
例えば、ノーザンハイブリダイゼーションにより発現増加が検出された場合、例えば、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、前立腺疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、腎臓疾患(例、腎炎、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫など)、代謝疾患(例、糖尿病、高脂血症など)、循環器疾患(例、動脈硬化など)または癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌など)などの可能性が高い、または老化の進行が早いと診断することが出来る。また、発現低下が検出された場合やPCR−SSCP法によりDNAの突然変異が検出された場合は、例えば、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、前立腺疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、腎臓疾患(例、腎炎、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫など)、代謝疾患(例、糖尿病、高脂血症など)、循環器疾患(例、動脈硬化など)または癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌など)などである可能性が高い、または老化の進行が早いと診断することができる。
【0053】
〔5〕アンチセンスポリヌクレオチドを含有する医薬
本発明のDNAに相補的に結合し、該DNAの発現を抑制することができる本発明のアンチセンスポリヌクレオチドは低毒性であり、生体内における本発明のタンパク質または本発明のDNAの機能や活性(例、ジまたはトリカルボン酸の輸送など)を抑制することができるので、例えば、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、前立腺疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、腎臓疾患(例、腎炎、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫など)、代謝疾患(例、糖尿病、高脂血症など)、循環器疾患(例、動脈硬化など)または癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌など)などの予防・治療剤、または老化の予防・抑制剤として使用することができる。
上記アンチセンスポリヌクレオチドを上記の予防・治療剤として使用する場合、公知の方法に従って製剤化し、投与することができる。
例えば、該アンチセンスポリヌクレオチドを用いる場合、該アンチセンスポリヌクレオチドを単独あるいはレトロウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノウイルスアソシエーテッドウイルスベクターなどの適当なベクターに挿入した後、常套手段に従って、ヒトまたはその他の哺乳動物(例、ラット、ウサギ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ネコ、イヌ、サルなど)に対して経口的または非経口的に投与することができる。該アンチセンスポリヌクレオチドは、そのままで、あるいは摂取促進のために補助剤などの生理学的に認められる担体とともに製剤化し、遺伝子銃やハイドロゲルカテーテルのようなカテーテルによって投与できる。
該アンチセンスポリヌクレオチドの投与量は、対象疾患、投与対象、投与ルートなどにより差異はあるが、例えば、肝臓疾患の治療の目的で本発明のアンチセンスポリヌクレオチドを肝臓に局所投与する場合、一般的に成人(体重60kg)においては、一日につき該アンチセンスポリヌクレオチドを約0.1〜100mg投与する。
さらに、該アンチセンスポリヌクレオチドは、組織や細胞における本発明のDNAの存在やその発現状況を調べるための診断用オリゴヌクレオチドプローブとして使用することもできる。
【0054】
さらに、本発明は、
▲1▼本発明のタンパク質をコードするRNAの一部とそれに相補的なRNAを含有する二重鎖RNA、
▲2▼前記二重鎖RNAを含有してなる医薬、
▲3▼本発明のタンパク質をコードするRNAの一部を含有するリボザイム、
▲4▼前記リボザイムを含有してなる医薬、
▲5▼前記リボザイムをコードする遺伝子(DNA)を含有する発現ベクターなども提供する。
上記アンチセンスポリヌクレオチドと同様に、二重鎖RNA、リボザイムなども、本発明のDNAから転写されるRNAを破壊またはその機能を抑制することができ、生体内における本発明で用いられるタンパク質または本発明で用いられるDNAの機能を抑制することができるので、例えば、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、前立腺疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、腎臓疾患(例、腎炎、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫など)、代謝疾患(例、糖尿病、高脂血症など)、循環器疾患(例、動脈硬化など)または癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌など)などの予防・治療剤として使用することができる。
二重鎖RNAは、公知の方法(例、Nature, 411巻, 494頁, 2001年)に準じて、本発明のポリヌクレオチドの配列を基に設計して製造することができる。
リボザイムは、公知の方法(例、TRENDS in Molecular Medicine, 7巻, 221頁, 2001年)に準じて、本発明のポリヌクレオチドの配列を基に設計して製造することができる。例えば、公知のリボザイムの配列の一部を本発明のタンパク質をコードするRNAの一部に置換することによって製造することができる。本発明のタンパク質をコードするRNAの一部としては、公知のリボザイムによって切断され得るコンセンサス配列NUX(式中、Nはすべての塩基を、XはG以外の塩基を示す)の近傍の配列などが挙げられる。
上記の二重鎖RNAまたはリボザイムを上記予防・治療剤として使用する場合、アンチセンスポリヌクレオチドと同様にして製剤化し、投与することができる。また、前記▲5▼の発現ベクターは、公知の遺伝子治療法などと同様に用い、上記予防・治療剤として使用する。
【0055】
〔6〕本発明のDNAを有する動物の作出
本発明は、外来性の本発明のタンパク質をコードするDNA(以下、本発明の外来性DNAと略記する)またはその変異DNA(本発明の外来性変異DNAと略記する場合がある)を有する非ヒト哺乳動物を提供する。
すなわち、本発明は、
(1)本発明の外来性DNAまたはその変異DNAを有する非ヒト哺乳動物、
(2)非ヒト哺乳動物がゲッ歯動物である上記(1)記載の動物、
(3)ゲッ歯動物がマウスまたはラットである上記(2)記載の動物、および
(4)本発明の外来性DNAまたはその変異DNAを含有し、哺乳動物において発現しうる組換えベクターなどを提供する。
本発明の外来性DNAまたはその変異DNAを有する非ヒト哺乳動物(以下、本発明のDNA導入動物と略記する)は、未受精卵、受精卵、精子およびその始原細胞を含む胚芽細胞などに対して、好ましくは、非ヒト哺乳動物の発生における胚発生の段階(さらに好ましくは、単細胞または受精卵細胞の段階でかつ一般に8細胞期以前)に、リン酸カルシウム法、電気パルス法、リポフェクション法、凝集法、マイクロインジェクション法、パーティクルガン法、DEAE−デキストラン法などにより目的とするDNAを導入することによって作出することができる。また、該DNA導入方法により、体細胞、生体の臓器、組織細胞などに目的とする本発明の外来性DNAを導入し、細胞培養、組織培養などに利用することもでき、さらに、これら細胞を上述の胚芽細胞と公知の細胞融合法により融合させることにより本発明のDNA導入動物を作出することもできる。
非ヒト哺乳動物としては、例えば、ウシ、ブタ、ヒツジ、ヤギ、ウサギ、イヌ、ネコ、モルモット、ハムスター、マウス、ラットなどが用いられる。なかでも、病体動物モデル系の作成の面から個体発生および生物サイクルが比較的短く、また、繁殖が容易なゲッ歯動物、とりわけマウス(例えば、純系として、C57BL/6系統,DBA2系統など、交雑系として、B6C3F系統,BDF系統,B6D2F系統,BALB/c系統,ICR系統など)またはラット(例えば、Wistar,SDなど)などが好ましい。
哺乳動物において発現しうる組換えベクターにおける「哺乳動物」としては、上記の非ヒト哺乳動物の他にヒトなどがあげられる。
【0056】
本発明の外来性DNAとは、非ヒト哺乳動物が本来有している本発明のDNAではなく、いったん哺乳動物から単離・抽出された本発明のDNAをいう。
本発明の変異DNAとしては、元の本発明のDNAの塩基配列に変異(例えば、突然変異など)が生じたもの、具体的には、塩基の付加、欠損、他の塩基への置換などが生じたDNAなどが用いられ、また、異常DNAも含まれる。
該異常DNAとしては、異常な本発明のタンパク質を発現させるDNAを意味し、例えば、正常な本発明のタンパク質の機能を抑制するタンパク質を発現させるDNAなどが用いられる。
本発明の外来性DNAは、対象とする動物と同種あるいは異種のどちらの哺乳動物由来のものであってもよい。本発明のDNAを対象動物に導入するにあたっては、該DNAを動物細胞で発現させうるプロモーターの下流に結合したDNAコンストラクトとして用いるのが一般に有利である。例えば、本発明のヒトDNAを導入する場合、これと相同性が高い本発明のDNAを有する各種哺乳動物(例えば、ウサギ、イヌ、ネコ、モルモット、ハムスター、ラット、マウスなど)由来のDNAを発現させうる各種プロモーターの下流に、本発明のヒトDNAを結合したDNAコンストラクト(例、ベクターなど)を対象哺乳動物の受精卵、例えば、マウス受精卵へマイクロインジェクションすることによって本発明のDNAを高発現するDNA導入哺乳動物を作出することができる。
【0057】
本発明のタンパク質の発現ベクターとしては、大腸菌由来のプラスミド、枯草菌由来のプラスミド、酵母由来のプラスミド、λファージなどのバクテリオファージ、モロニー白血病ウィルスなどのレトロウィルス、ワクシニアウィルスまたはバキュロウィルスなどの動物ウイルスなどが用いられる。なかでも、大腸菌由来のプラスミド、枯草菌由来のプラスミドまたは酵母由来のプラスミドなどが好ましく用いられる。
上記のDNA発現調節を行なうプロモーターとしては、例えば、(i)ウイルス(例、シミアンウイルス、サイトメガロウイルス、モロニー白血病ウイルス、JCウイルス、乳癌ウイルス、ポリオウイルスなど)に由来するDNAのプロモーター、(ii)各種哺乳動物(ヒト、ウサギ、イヌ、ネコ、モルモット、ハムスター、ラット、マウスなど)由来のプロモーター、例えば、アルブミン、インスリンII、ウロプラキンII、エラスターゼ、エリスロポエチン、エンドセリン、筋クレアチンキナーゼ、グリア線維性酸性タンパク質、グルタチオンS−トランスフェラーゼ、血小板由来成長因子β、ケラチンK1,K10およびK14、コラーゲンI型およびII型、サイクリックAMP依存タンパク質キナーゼβIサブユニット、ジストロフィン、酒石酸抵抗性アルカリフォスファターゼ、心房ナトリウム利尿性因子、内皮レセプターチロシンキナーゼ(一般にTie2と略される)、ナトリウムカリウムアデノシン3リン酸化酵素(Na,K−ATPase)、ニューロフィラメント軽鎖、メタロチオネインIおよびIIA、メタロプロティナーゼ1組織インヒビター、MHCクラスI抗原(H−2L)、H−ras、レニン、ドーパミンβ−水酸化酵素、甲状腺ペルオキシダーゼ(TPO)、ポリペプチド鎖延長因子1α(EF−1α)、βアクチン、αおよびβミオシン重鎖、ミオシン軽鎖1および2、ミエリン基礎タンパク質、チログロブリン、Thy−1、免疫グロブリン、H鎖可変部(VNP)、血清アミロイドPコンポーネント、ミオグロビン、トロポニンC、平滑筋αアクチン、プレプロエンケファリンA、バソプレシンなどのプロモーターなどが用いられる。なかでも、全身で高発現することが可能なサイトメガロウイルスプロモーター、ヒトポリペプチド鎖延長因子1α(EF−1α)のプロモーター、ヒトおよびニワトリβアクチンプロモーターなどが好適である。
上記ベクターは、DNA導入哺乳動物において目的とするmRNAの転写を終結する配列(一般にターミネターと呼ばれる)を有していることが好ましく、例えば、ウイルス由来および各種哺乳動物由来の各DNAの配列を用いることができ、好ましくは、シミアンウイルスのSV40ターミネターなどが用いられる。
【0058】
その他、目的とする外来性DNAをさらに高発現させる目的で各DNAのスプライシングシグナル、エンハンサー領域、真核DNAのイントロンの一部などをプロモーター領域の5’上流、プロモーター領域と翻訳領域間あるいは翻訳領域の3’下流 に連結することも目的により可能である。
正常な本発明のタンパク質の翻訳領域は、ヒトまたは各種哺乳動物(例えば、ウサギ、イヌ、ネコ、モルモット、ハムスター、ラット、マウスなど)由来の肝臓、腎臓、甲状腺細胞、線維芽細胞由来DNAおよび市販の各種ゲノムDNAライブラリーよりゲノムDNAの全てあるいは一部として、または肝臓、腎臓、甲状腺細胞、線維芽細胞由来RNAより公知の方法により調製された相補DNAを原料として取得することが出来る。また、外来性の異常DNAは、上記の細胞または組織より得られた正常なポリペプチドの翻訳領域を点突然変異誘発法により変異した翻訳領域を作製することができる。
該翻訳領域は導入動物において発現しうるDNAコンストラクトとして、前記のプロモーターの下流および所望により転写終結部位の上流に連結させる通常のDNA工学的手法により作製することができる。
受精卵細胞段階における本発明の外来性DNAの導入は、対象哺乳動物の胚芽細胞および体細胞のすべてに存在するように確保される。DNA導入後の作出動物の胚芽細胞において、本発明の外来性DNAが存在することは、作出動物の後代がすべて、その胚芽細胞および体細胞のすべてに本発明の外来性DNAを保持することを意味する。本発明の外来性DNAを受け継いだこの種の動物の子孫はその胚芽細胞および体細胞のすべてに本発明の外来性DNAを有する。
本発明の外来性正常DNAを導入した非ヒト哺乳動物は、交配により外来性DNAを安定に保持することを確認して、該DNA保有動物として通常の飼育環境で継代飼育することが出来る。
受精卵細胞段階における本発明の外来性DNAの導入は、対象哺乳動物の胚芽細胞および体細胞の全てに過剰に存在するように確保される。DNA導入後の作出動物の胚芽細胞において本発明の外来性DNAが過剰に存在することは、作出動物の子孫が全てその胚芽細胞および体細胞の全てに本発明の外来性DNAを過剰に有することを意味する。本発明の外来性DNAを受け継いだこの種の動物の子孫はその胚芽細胞および体細胞の全てに本発明の外来性DNAを過剰に有する。
導入DNAを相同染色体の両方に持つホモザイゴート動物を取得し、この雌雄の動物を交配することによりすべての子孫が該DNAを過剰に有するように繁殖継代することができる。
【0059】
本発明の正常DNAを有する非ヒト哺乳動物は、本発明の正常DNAが高発現させられており、内在性の正常DNAの機能を促進することにより最終的に本発明のタンパク質の機能亢進症を発症することがあり、その病態モデル動物として利用することができる。例えば、本発明の正常DNA導入動物を用いて、本発明のタンパク質の機能亢進症や、本発明のタンパク質が関連する疾患の病態機序の解明およびこれらの疾患の治療方法の検討を行なうことが可能である。
また、本発明の外来性正常DNAを導入した哺乳動物は、遊離した本発明のタンパク質の増加症状を有することから、本発明のタンパク質に関連する疾患に対する治療薬のスクリーニング試験にも利用可能である。
一方、本発明の外来性異常DNAを有する非ヒト哺乳動物は、交配により外来性DNAを安定に保持することを確認して該DNA保有動物として通常の飼育環境で継代飼育することが出来る。さらに、目的とする外来DNAを前述のプラスミドに組み込んで原科として用いることができる。プロモーターとのDNAコンストラク卜は、通常のDNA工学的手法によって作製することができる。受精卵細胞段階における本発明の異常DNAの導入は、対象哺乳動物の胚芽細胞および体細胞の全てに存在するように確保される。DNA転移後の作出動物の胚芽細胞において本発明の異常DNAが存在することは、作出動物の子孫が全てその胚芽細胞および体細胞の全てに本発明の異常DNAを有することを意味する。本発明の外来性DNAを受け継いだこの種の動物の子孫は、その胚芽細胞および体細胞の全てに本発明の異常DNAを有する。導入DNAを相同染色体の両方に持つホモザイゴート動物を取得し、この雌雄の動物を交配することによりすべての子孫が該DNAを有するように繁殖継代することができる。
【0060】
本発明の異常DNAを有する非ヒト哺乳動物は、本発明の異常DNAが高発現させられており、内在性の正常DNAの機能を阻害することにより最終的に本発明のタンパク質の機能不活性型不応症となることがあり、その病態モデル動物として利用することができる。例えば、本発明の異常DNA導入動物を用いて、本発明のタンパク質の機能不活性型不応症の病態機序の解明およびこの疾患を治療方法の検討を行なうことが可能である。
また、具体的な利用可能性としては、本発明の異常DNA高発現動物は、本発明のタンパク質の機能不活性型不応症における本発明の異常タンパク質による正常タンパク質の機能阻害(dominant negative作用)を解明するモデルとなる。
また、本発明の外来異常DNAを導入した哺乳動物は、遊離した本発明のタンパク質の増加症状を有することから、本発明のタンパク質またはその機能不活性型不応症に対する治療薬スクリーニング試験にも利用可能である。
また、上記2種類の本発明のDNA導入動物のその他の利用可能性として、例えば、
(i)組織培養のための細胞源としての使用、
(ii)本発明のDNA導入動物の組織中のDNAもしくはRNAを直接分析する、またはDNAにより発現されたポリペプチド組織を分析することによる、本発明のタンパク質により特異的に発現あるいは活性化するタンパク質との関連性についての解析、
(iii)DNAを有する組織の細胞を標準組織培養技術により培養し、これらを使用して、一般に培養困難な組織からの細胞の機能の研究、
(iv)上記(iii)記載の細胞を用いることによる細胞の機能を高めるような薬剤のスクリーニング、および
(v)本発明の変異タンパク質を単離精製およびその抗体作製などが考えられる。
さらに、本発明のDNA導入動物を用いて、本発明のタンパク質の機能不活性型不応症などを含む、本発明のタンパク質に関連する疾患の臨床症状を調べることができ、また、本発明のタンパク質に関連する疾患モデルの各臓器におけるより詳細な病理学的所見が得られ、新しい治療方法の開発、さらには、該疾患による二次的疾患の研究および治療に貢献することができる。
また、本発明のDNA導入動物から各臓器を取り出し、細切後、トリプシンなどのタンパク質分解酵素により、遊離したDNA導入細胞の取得、その培養またはその培養細胞の系統化を行なうことが可能である。さらに、本発明のタンパク質産生細胞の特定化、アポトーシス、分化あるいは増殖との関連性、またはそれらにおけるシグナル伝達機構を調べ、それらの異常を調べることなどができ、本発明のタンパク質およびその作用解明のための有効な研究材料となる。
さらに、本発明のDNA導入動物を用いて、本発明のタンパク質の機能不活性型不応症を含む、本発明のタンパク質に関連する疾患の治療薬の開発を行なうために、上述の検査法および定量法などを用いて、有効で迅速な該疾患治療薬のスクリーニング法を提供することが可能となる。また、本発明のDNA導入動物または本発明の外来性DNA発現ベクターを用いて、本発明のタンパク質が関連する疾患のDNA治療法を検討、開発することが可能である。
【0061】
〔7〕ノックアウト動物
本発明は、本発明のDNAが不活性化された非ヒト哺乳動物胚幹細胞および本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物を提供する。
すなわち、本発明は、
(1)本発明のDNAが不活性化された非ヒト哺乳動物胚幹細胞、
(2)該DNAがレポーター遺伝子(例、大腸菌由来のβ−ガラクトシダーゼ遺伝子)を導入することにより不活性化された上記(1)記載の胚幹細胞、
(3)ネオマイシン耐性である上記(1)記載の胚幹細胞、
(4)非ヒト哺乳動物がゲッ歯動物である上記(1)記載の胚幹細胞、
(5)ゲッ歯動物がマウスである上記(4)記載の胚幹細胞、
(6)本発明のDNAが不活性化された該DNA発現不全非ヒト哺乳動物、
(7)該DNAがレポーター遺伝子(例、大腸菌由来のβ−ガラクトシダーゼ遺伝子)を導入することにより不活性化され、該レポーター遺伝子が本発明のDNAに対するプロモーターの制御下で発現しうる上記(6)記載の非ヒト哺乳動物、
(8)非ヒト哺乳動物がゲッ歯動物である上記(6)記載の非ヒト哺乳動物、
(9)ゲッ歯動物がマウスである上記(8)記載の非ヒト哺乳動物、および
(10)上記(7)記載の動物に、試験化合物を投与し、レポーター遺伝子の発現を検出することを特徴とする本発明のDNAに対するプロモーター活性を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング方法を提供する。
本発明のDNAが不活性化された非ヒト哺乳動物胚幹細胞とは、該非ヒト哺乳動物が有する本発明のDNAに人為的に変異を加えることにより、DNAの発現能を抑制するか、あるいは該DNAがコードしている本発明のタンパク質の活性を実質的に喪失させることにより、DNAが実質的に本発明のタンパク質の発現能を有さない(以下、本発明のノックアウトDNAと称することがある)非ヒト哺乳動物の胚幹細胞(以下、ES細胞と略記する)をいう。
非ヒト哺乳動物としては、前記と同様のものが用いられる。
【0062】
本発明のDNAに人為的に変異を加える方法としては、例えば、遺伝子工学的手法により該DNA配列の一部又は全部の削除、他DNAを挿入または置換させることによって行なうことができる。これらの変異により、例えば、コドンの読み取り枠をずらしたり、プロモーターあるいはエキソンの機能を破壊することにより本発明のノックアウトDNAを作製すればよい。
本発明のDNAが不活性化された非ヒト哺乳動物胚幹細胞(以下、本発明のDNA不活性化ES細胞または本発明のノックアウトES細胞と略記する)の具体例としては、例えば、目的とする非ヒト哺乳動物が有する本発明のDNAを単離し、そのエキソン部分にネオマイシン耐性遺伝子、ハイグロマイシン耐性遺伝子を代表とする薬剤耐性遺伝子、あるいはlacZ(β−ガラクトシダーゼ遺伝子)、cat(クロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ遺伝子)を代表とするレポーター遺伝子等を挿入することによりエキソンの機能を破壊するか、あるいはエキソン間のイントロン部分に遺伝子の転写を終結させるDNA配列(例えば、polyA付加シグナルなど)を挿入し、完全なmRNAを合成できなくすることによって、結果的に遺伝子を破壊するように構築したDNA配列を有するDNA鎖(以下、ターゲッティングベクターと略記する)を、例えば相同組換え法により該動物の染色体に導入し、得られたES細胞について本発明のDNA上あるいはその近傍のDNA配列をプローブとしたサザンハイブリダイゼーション解析あるいはターゲッティングベクター上のDNA配列とターゲッティングベクター作製に使用した本発明のDNA以外の近傍領域のDNA配列をプライマーとしたPCR法により解析し、本発明のノックアウトES細胞を選別することにより得ることができる。
【0063】
また、相同組換え法等により本発明のDNAを不活化させる元のES細胞としては、例えば、前述のような既に樹立されたものを用いてもよく、また公知のEvansとKaufmanの方法に準じて新しく樹立したものでもよい。例えば、マウスのES細胞の場合、現在、一般的には129系のES細胞が使用されているが、免疫学的背景がはっきりしていないので、これに代わる純系で免疫学的に遺伝的背景が明らかなES細胞を取得するなどの目的で例えば、C57BL/6マウスやC57BL/6の採卵数の少なさをDBA/2との交雑により改善したBDFマウス(C57BL/6とDBA/2とのF)を用いて樹立したものなども良好に用いうる。BDFマウスは、採卵数が多く、かつ、卵が丈夫であるという利点に加えて、C57BL/6マウスを背景に持つので、これを用いて得られたES細胞は病態モデルマウスを作出したとき、C57BL/6マウスとバッククロスすることでその遺伝的背景をC57BL/6マウスに代えることが可能である点で有利に用い得る。
また、ES細胞を樹立する場合、一般には受精後3.5日目の胚盤胞を使用するが、これ以外に8細胞期胚を採卵し胚盤胞まで培養して用いることにより効率よく多数の初期胚を取得することができる。
また、雌雄いずれのES細胞を用いてもよいが、通常雄のES細胞の方が生殖系列キメラを作出するのに都合が良い。また、煩雑な培養の手間を削減するためにもできるだけ早く雌雄の判別を行なうことが望ましい。
ES細胞の雌雄の判定方法としては、例えば、PCR法によりY染色体上の性決定領域の遺伝子を増幅、検出する方法が、その1例としてあげることができる。この方法を使用すれば、従来、核型分析をするのに約10個の細胞数を要していたのに対して、1コロニー程度のES細胞数(約50個)で済むので、培養初期におけるES細胞の第一次セレクションを雌雄の判別で行なうことが可能であり、早期に雄細胞の選定を可能にしたことにより培養初期の手間は大幅に削減できる。
【0064】
また、第二次セレクションとしては、例えば、G−バンディング法による染色体数の確認等により行うことができる。得られるES細胞の染色体数は正常数の100%が望ましいが、樹立の際の物理的操作等の関係上困難な場合は、ES細胞の遺伝子をノックアウトした後、正常細胞(例えば、マウスでは染色体数が2n=40である細胞)に再びクローニングすることが望ましい。
このようにして得られた胚幹細胞株は、通常その増殖性は大変良いが、個体発生できる能力を失いやすいので、注意深く継代培養することが必要である。例えば、STO繊維芽細胞のような適当なフィーダー細胞上でLIF(1−10000U/ml)存在下に炭酸ガス培養器内(好ましくは、5%炭酸ガス、95%空気または5%酸素、5%炭酸ガス、90%空気)で約37℃で培養するなどの方法で培養し、継代時には、例えば、トリプシン/EDTA溶液(通常0.001−0.5%トリプシン/0.1−5mM EDTA、好ましくは約0.1%トリプシン/1mM EDTA)処理により単細胞化し、新たに用意したフィーダー細胞上に播種する方法などがとられる。このような継代は、通常1−3日毎に行なうが、この際に細胞の観察を行い、形態的に異常な細胞が見受けられた場合はその培養細胞は放棄することが望まれる。
ES細胞は、適当な条件により、高密度に至るまで単層培養するか、または細胞集塊を形成するまで浮遊培養することにより、頭頂筋、内臓筋、心筋などの種々のタイプの細胞に分化させることが可能であり〔M. J. Evans及びM. H. Kaufman, ネイチャー(Nature)第292巻、154頁、1981年;G. R. Martin プロシーディングス・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンス・ユーエスエー(Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.)第78巻、7634頁、1981年;T. C. Doetschman ら、ジャーナル・オブ・エンブリオロジー・アンド・エクスペリメンタル・モルフォロジー、第87巻、27頁、1985年〕、本発明のES細胞を分化させて得られる本発明のDNA発現不全細胞は、インビトロにおける本発明のタンパク質の細胞生物学的検討において有用である。
本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物は、該動物のmRNA量を公知方法を用いて測定して間接的にその発現量を比較することにより、正常動物と区別することが可能である。
該非ヒト哺乳動物としては、前記と同様のものが用いられる。
【0065】
本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物は、例えば、前述のようにして作製したターゲッティングベクターをマウス胚幹細胞またはマウス卵細胞に導入し、導入によりターゲッティングベクターの本発明のDNAが不活性化されたDNA配列が遺伝子相同組換えにより、マウス胚幹細胞またはマウス卵細胞の染色体上の本発明のDNAと入れ換わる相同組換えをさせることにより、本発明のDNAをノックアウトさせることができる。
本発明のDNAがノックアウトされた細胞は、本発明のDNA上またはその近傍のDNA配列をプローブとしたサザンハイブリダイゼーション解析またはターゲッティングベクター上のDNA配列と、ターゲッティングベクターに使用したマウス由来の本発明のDNA以外の近傍領域のDNA配列とをプライマーとしたPCR法による解析で判定することができる。非ヒト哺乳動物胚幹細胞を用いた場合は、遺伝子相同組換えにより、本発明のDNAが不活性化された細胞株をクローニングし、その細胞を適当な時期、例えば、8細胞期の非ヒト哺乳動物胚または胚盤胞に注入し、作製したキメラ胚を偽妊娠させた該非ヒト哺乳動物の子宮に移植する。作出された動物は正常な本発明のDNA座をもつ細胞と人為的に変異した本発明のDNA座をもつ細胞との両者から構成されるキメラ動物である。
該キメラ動物の生殖細胞の一部が変異した本発明のDNA座をもつ場合、このようなキメラ個体と正常個体を交配することにより得られた個体群より、全ての組織が人為的に変異を加えた本発明のDNA座をもつ細胞で構成された個体を、例えば、コートカラーの判定等により選別することにより得られる。このようにして得られた個体は、通常、本発明のタンパク質のヘテロ発現不全個体であり、本発明のタンパク質のヘテロ発現不全個体同志を交配し、それらの産仔から本発明のタンパク質のホモ発現不全個体を得ることができる。
卵細胞を使用する場合は、例えば、卵細胞核内にマイクロインジェクション法でDNA溶液を注入することによりターゲッティングベクターを染色体内に導入したトランスジェニック非ヒト哺乳動物を得ることができ、これらのトランスジェニック非ヒト哺乳動物に比べて、遺伝子相同組換えにより本発明のDNA座に変異のあるものを選択することにより得られる。
このようにして本発明のDNAがノックアウトされている個体は、交配により得られた動物個体も該DNAがノックアウトされていることを確認して通常の飼育環境で飼育継代を行なうことができる。
さらに、生殖系列の取得および保持についても常法に従えばよい。すなわち、該不活化DNAの保有する雌雄の動物を交配することにより、該不活化DNAを相同染色体の両方に持つホモザイゴート動物を取得しうる。得られたホモザイゴート動物は、母親動物に対して、正常個体1,ホモザイゴート複数になるような状態で飼育することにより効率的に得ることができる。ヘテロザイゴート動物の雌雄を交配することにより、該不活化DNAを有するホモザイゴートおよびヘテロザイゴート動物を繁殖継代する。
本発明のDNAが不活性化された非ヒト哺乳動物胚幹細胞は、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物を作出する上で、非常に有用である。
また、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物は、本発明のタンパク質により誘導され得る種々の生物活性を欠失するため、本発明のタンパク質の生物活性の不活性化を原因とする疾病のモデルとなり得るので、これらの疾病の原因究明及び治療法の検討に有用である。
【0066】
〔7a〕本発明のDNAの欠損や損傷などに起因する疾病に対して治療・予防効果を有する化合物のスクリーニング方法
本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物は、本発明のDNAの欠損や損傷などに起因する疾病に対して治療・予防効果を有する化合物のスクリーニングに用いることができる。
すなわち、本発明は、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物に試験化合物を投与し、該動物の変化を観察・測定することを特徴とする、本発明のDNAの欠損や損傷などに起因する疾病に対して治療・予防効果を有する化合物またはその塩のスクリーニング方法を提供する。
該スクリーニング方法において用いられる本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物としては、前記と同様のものがあげられる。
試験化合物としては、例えば、ペプチド、タンパク質、非ペプチド性化合物、合成化合物、発酵生産物、細胞抽出液、植物抽出液、動物組織抽出液、血漿などがあげられ、これら化合物は新規な化合物であってもよいし、公知の化合物であってもよい。
具体的には、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物を、試験化合物で処理し、無処理の対照動物と比較し、該動物の各器官、組織、疾病の症状などの変化を指標として試験化合物の治療・予防効果を試験することができる。
試験動物を試験化合物で処理する方法としては、例えば、経口投与、静脈注射などが用いられ、試験動物の症状、試験化合物の性質などにあわせて適宜選択することができる。また、試験化合物の投与量は、投与方法、試験化合物の性質などにあわせて適宜選択することができる。
【0067】
例えば、糖尿病に対して治療効果を有する化合物のスクリーニングをする場合、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物に糖負荷処置を行ない、糖負荷処置前または処置後に試験化合物を投与し、該動物の血糖値、尿量、尿糖および体重変化などを経時的に測定する。
該スクリーニング方法を用いて得られる化合物は、上記した試験化合物から選ばれた化合物であり、本発明のタンパク質の欠損や損傷などによって引き起こされる疾患に対して予防・治療効果を有するので、該疾患に対する安全で低毒性な予防・治療剤などの医薬として使用することができる。さらに、上記スクリーニングで得られた化合物から誘導される化合物も同様に用いることができる。
【0068】
該スクリーニング方法で得られた化合物は塩を形成していてもよく、該化合物の塩としては、生理学的に許容される酸(例、無機酸、有機酸など)や塩基(例、アルカリ金属など)などとの塩が用いられ、とりわけ生理学的に許容される酸付加塩が好ましい。この様な塩としては、例えば、無機酸(例えば、塩酸、リン酸、臭化水素酸、硫酸など)との塩、あるいは有機酸(例えば、酢酸、ギ酸、プロピオン酸、フマル酸、マレイン酸、コハク酸、酒石酸、クエン酸、リンゴ酸、蓚酸、安息香酸、メタンスルホン酸、ベンゼンスルホン酸など)との塩などが用いられる。
該スクリーニング方法で得られた化合物またはその塩を含有する医薬は、前記した本発明のタンパク質を含有する医薬と同様にして製造することができる。
このようにして得られる製剤は、安全で低毒性であるので、例えば、ヒトまたはその他の哺乳動物(例えば、ラット、マウス、モルモット、ウサギ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ウマ、ネコ、イヌ、サルなど)に対して投与することができる。
該化合物またはその塩の投与量は、対象疾患、投与対象、投与ルートなどにより差異はあるが、例えば、該化合物を経口投与する場合、一般的に成人(体重60kgとして)の糖尿病の患者においては、一日につき該化合物を約0.1〜100mg、好ましくは約1.0〜50mg、より好ましくは約1.0〜20mg投与する。非経口的に投与する場合は、該化合物の1回投与量は投与対象、対象疾患などによっても異なるが、例えば、該化合物を注射剤の形で通常成人(60kgとして)の糖尿病の患者に投与する場合、一日につき該化合物を約0.01〜30mg程度、好ましくは約0.1〜20mg程度、より好ましくは約0.1〜10mg程度を静脈注射により投与するのが好都合である。他の動物の場合も、60kg当たりに換算した量を投与することができる。
【0069】
〔7b〕本発明のDNAに対するプロモーターの活性を促進または阻害する化合物のスクリーニング方法
本発明は、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物に、試験化合物を投与し、レポーター遺伝子の発現を検出することを特徴とする本発明のDNAに対するプロモーターの活性を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング方法を提供する。
上記スクリーニング方法において、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物としては、前記した本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物の中でも、本発明のDNAがレポーター遺伝子を導入することにより不活性化され、該レポーター遺伝子が本発明のDNAに対するプロモーターの制御下で発現しうるものが用いられる。
試験化合物としては、前記と同様のものがあげられる。
レポーター遺伝子としては、前記と同様のものが用いられ、β−ガラクトシダーゼ遺伝子(lacZ)、可溶性アルカリフォスファターゼ遺伝子またはルシフェラーゼ遺伝子などが好適である。
【0070】
本発明のDNAをレポーター遺伝子で置換された本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物では、レポーター遺伝子が本発明のDNAに対するプロモーターの支配下に存在するので、レポーター遺伝子がコードする物質の発現をトレースすることにより、プロモーターの活性を検出することができる。
例えば、本発明のタンパク質をコードするDNA領域の一部を大腸菌由来のβ−ガラクトシダーゼ遺伝子(lacZ)で置換している場合、本来、本発明のタンパク質の発現する組織で、本発明のタンパク質の代わりにβ−ガラクトシダーゼが発現する。従って、例えば、5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−ガラクトピラノシド(X−gal)のようなβ−ガラクトシダーゼの基質となる試薬を用いて染色することにより、簡便に本発明のタンパク質の動物生体内における発現状態を観察することができる。具体的には、本発明のタンパク質欠損マウスまたはその組織切片をグルタルアルデヒドなどで固定し、リン酸緩衝生理食塩液(PBS)で洗浄後、X−galを含む染色液で、室温または37℃付近で、約30分ないし1時間反応させた後、組織標本を1mM EDTA/PBS溶液で洗浄することによって、β−ガラクトシダーゼ反応を停止させ、呈色を観察すればよい。また、常法に従い、lacZをコードするmRNAを検出してもよい。
上記スクリーニング方法を用いて得られる化合物またはその塩は、上記した試験化合物から選ばれた化合物であり、本発明のDNAに対するプロモーター活性を促進または阻害する化合物である。
【0071】
該スクリーニング方法で得られた化合物は塩を形成していてもよく、該化合物の塩としては、生理学的に許容される酸(例、無機酸など)や塩基(例、有機酸など)などとの塩が用いられ、とりわけ生理学的に許容される酸付加塩が好ましい。この様な塩としては、例えば、無機酸(例えば、塩酸、リン酸、臭化水素酸、硫酸など)との塩、あるいは有機酸(例えば、酢酸、ギ酸、プロピオン酸、フマル酸、マレイン酸、コハク酸、酒石酸、クエン酸、リンゴ酸、蓚酸、安息香酸、メタンスルホン酸、ベンゼンスルホン酸など)との塩などが用いられる。
本発明のDNAに対するプロモーター活性を促進する化合物またはその塩は、本発明のタンパク質の発現を促進し、該タンパク質の機能を促進することができるので、例えば、肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、前立腺疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、腎臓疾患(例、腎炎、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫など)、代謝疾患(例、糖尿病、高脂血症など)、循環器疾患(例、動脈硬化など)または癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌など)などの予防・治療剤、または老化の予防・抑制剤などの医薬として有用である。
【0072】
また、本発明のDNAに対するプロモーター活性を阻害する化合物またはその塩は、本発明のタンパク質の発現を阻害し、該タンパク質の機能を阻害することができるので、例えば肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、前立腺疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、腎臓疾患(例、腎炎、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫など)、代謝疾患(例、糖尿病、高脂血症など)、循環器疾患(例、動脈硬化など)または癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌など)などの予防・治療剤、または老化の予防・抑制剤などの医薬として有用である。
さらに、上記スクリーニングで得られた化合物から誘導される化合物も同様に用いることができる。
該スクリーニング方法で得られた化合物またはその塩を含有する医薬は、前記した本発明のタンパク質またはその塩を含有する医薬と同様にして製造することができる。
このようにして得られる製剤は、安全で低毒性であるので、例えば、ヒトまたはその他の哺乳動物(例えば、ラット、マウス、モルモット、ウサギ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ウマ、ネコ、イヌ、サルなど)に対して投与することができる。
該化合物またはその塩の投与量は、対象疾患、投与対象、投与ルートなどにより差異はあるが、例えば、本発明のDNAに対するプロモーター活性を促進する化合物を経口投与する場合、一般的に成人(体重60kgとして)の糖尿病患者においては、一日につき該化合物を約0.1〜100mg、好ましくは約1.0〜50mg、より好ましくは約1.0〜20mg投与する。非経口的に投与する場合は、該化合物の1回投与量は投与対象、対象疾患などによっても異なるが、例えば、本発明のDNAに対するプロモーター活性を促進する化合物を注射剤の形で通常成人(60kgとして)の糖尿病患者に投与する場合、一日につき該化合物を約0.01〜30mg程度、好ましくは約0.1〜20mg程度、より好ましくは約0.1〜10mg程度を静脈注射により投与するのが好都合である。他の動物の場合も、60kg当たりに換算した量を投与することができる。
【0073】
一方、例えば、本発明のDNAに対するプロモーター活性を阻害する化合物を経口投与する場合、一般的に成人(体重60kgとして)の糖尿病患者においては、一日につき該化合物を約0.1〜100mg、好ましくは約1.0〜50mg、より好ましくは約1.0〜20mg投与する。非経口的に投与する場合は、該化合物の1回投与量は投与対象、対象疾患などによっても異なるが、例えば、本発明のDNAに対するプロモーター活性を阻害する化合物を注射剤の形で通常成人(60kgとして)の糖尿病患者に投与する場合、一日につき該化合物を約0.01〜30mg程度、好ましくは約0.1〜20mg程度、より好ましくは約0.1〜10mg程度を静脈注射により投与するのが好都合である。他の動物の場合も、60kg当たりに換算した量を投与することができる。
このように、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物は、本発明のDNAに対するプロモーターの活性を促進または阻害する化合物またはその塩をスクリーニングする上で極めて有用であり、本発明のDNA発現不全に起因する各種疾患の原因究明または予防・治療薬の開発に大きく貢献することができる。
また、本発明のタンパク質のプロモーター領域を含有するDNAを使って、その下流に種々のタンパクをコードする遺伝子を連結し、これを動物の卵細胞に注入していわゆるトランスジェニック動物(遺伝子導入動物)を作出すれば、特異的にそのポリペプチドを合成させ、その生体での作用を検討することも可能となる。さらに上記プロモーター部分に適当なレポーター遺伝子を結合させ、これが発現するような細胞株を樹立すれば、本発明のタンパク質そのものの体内での産生能力を特異的に促進もしくは抑制する作用を持つ低分子化合物の探索系として使用できる。
【0074】
本明細書および図面において、塩基やアミノ酸などを略号で表示する場合、IUPAC−IUB Commission on Biochemical Nomenclature による略号あるいは当該分野における慣用略号に基づくものであり、その例を下記する。またアミノ酸に関し光学異性体があり得る場合は、特に明示しなければL体を示すものとする。
DNA     :デオキシリボ核酸
cDNA    :相補的デオキシリボ核酸
A      :アデニン
T      :チミン
G      :グアニン
C      :シトシン
RNA     :リボ核酸
mRNA    :メッセンジャーリボ核酸
dATP    :デオキシアデノシン三リン酸
dTTP    :デオキシチミジン三リン酸
dGTP    :デオキシグアノシン三リン酸
dCTP    :デオキシシチジン三リン酸
ATP     :アデノシン三リン酸
EDTA    :エチレンジアミン四酢酸
SDS     :ドデシル硫酸ナトリウム
Gly :グリシン
Ala   :アラニン
Val    :バリン
Leu   :ロイシン
Ile :イソロイシン
Ser :セリン
Thr  :スレオニン
Cys :システイン
Met :メチオニン
Glu :グルタミン酸
Asp :アスパラギン酸
Lys :リジン
Arg :アルギニン
His :ヒスチジン
Phe :フェニルアラニン
Tyr :チロシン
Trp :トリプトファン
Pro :プロリン
Asn :アスパラギン
Gln :グルタミン
pGlu    :ピログルタミン酸
【0075】
また、本明細書中で繁用される置換基、保護基および試薬を下記の記号で表記する。
Me      :メチル基
Et      :エチル基
Bu      :ブチル基
Ph      :フェニル基
TC      :チアゾリジン−4(R)−カルボキサミド基
Tos     :p−トルエンスルフォニル
CHO     :ホルミル
Bzl     :ベンジル
Cl−Bzl :2,6−ジクロロベンジル
Bom     :ベンジルオキシメチル
Z       :ベンジルオキシカルボニル
Cl−Z    :2−クロロベンジルオキシカルボニル
Br−Z    :2−ブロモベンジルオキシカルボニル
Boc     :t−ブトキシカルボニル
DNP     :ジニトロフェニル
Trt     :トリチル
Bum     :t−ブトキシメチル
Fmoc    :N−9−フルオレニルメトキシカルボニル
HOBt    :1−ヒドロキシベンズトリアゾール
HOOBt   :3,4−ジヒドロ−3−ヒドロキシ−4−オキソ−
1,2,3−ベンゾトリアジン
HONB    :1−ヒドロキシ−5−ノルボルネン−2,3−ジカルボキシイミド
DCC     :N,N’−ジシクロヘキシルカルボジイミド
【0076】
本願明細書の配列表の配列番号は、以下の配列を示す。
〔配列番号:1〕
実施例1で取得した568アミノ酸のヒトTCH169タンパク質のアミノ酸配列を示す。
〔配列番号:2〕
配列番号:1で表されるアミノ酸配列を有するヒトTCH169タンパク質をコードするDNAの塩基配列を示す。
〔配列番号:3〕
実施例2で用いられたプライマーA10の塩基配列を示す。
〔配列番号:4〕
実施例2で用いられたプライマーB9の塩基配列を示す。
〔配列番号:5〕
実施例2で用いられたTaqManプローブT1の塩基配列を示す。
〔配列番号:6〕
実施例1で用いられたプライマーA7の塩基配列を示す。
〔配列番号:7〕
実施例1で用いられたプライマーB6の塩基配列を示す。
〔配列番号:8〕
実施例1および実施例4で用いられたプライマーSP6の塩基配列を示す。
〔配列番号:9〕
実施例1および実施例4で用いられたプライマーT7の塩基配列を示す。
〔配列番号:10〕
実施例1で用いられたプライマーA1の塩基配列を示す。
〔配列番号:11〕
実施例1で用いられたプライマーA2の塩基配列を示す。
〔配列番号:12〕
実施例1で用いられたプライマーF1の塩基配列を示す。
〔配列番号:13〕
実施例1で用いられたプライマーF2の塩基配列を示す。
〔配列番号:14〕
実施例1で用いられたプライマーF3の塩基配列を示す。
〔配列番号:15〕
実施例1で用いられたプライマーB1の塩基配列を示す。
〔配列番号:16〕
実施例1で用いられたプライマーB2の塩基配列を示す。
〔配列番号:17〕
実施例1で用いられたプライマーB8の塩基配列を示す。
〔配列番号:18〕
実施例1で用いられたプライマーR1の塩基配列を示す。
〔配列番号:19〕
実施例1で用いられたプライマーR2の塩基配列を示す。
〔配列番号:20〕
実施例1で用いられたプライマーR3の塩基配列を示す。
〔配列番号:21〕
実施例1で用いられたプライマーR4の塩基配列を示す。
〔配列番号:22〕
実施例1で取得したヒトTCH169全長遺伝子を含むcDNAの塩基配列を示す。
〔配列番号:23〕
実施例4で取得した572アミノ酸のマウスTCH169タンパク質のアミノ酸配列を示す。
〔配列番号:24〕
配列番号:23で表されるアミノ酸配列を有するマウスTCH169タンパク質をコードするDNAの塩基配列を示す。
〔配列番号:25〕
実施例3で用いられたプライマーAP1の塩基配列を示す。
〔配列番号:26〕
実施例3で用いられたプライマーmB5の塩基配列を示す。
〔配列番号:27〕
実施例3で用いられたプライマーAP2の塩基配列を示す。
〔配列番号:28〕
実施例3で用いられたプライマーmB3の塩基配列を示す。
〔配列番号:29〕
実施例4で用いられたプライマーmA4の塩基配列を示す。
〔配列番号:30〕
実施例4で用いられたプライマーmB6の塩基配列を示す。
〔配列番号:31〕
実施例4で用いられたプライマーmA1の塩基配列を示す。
〔配列番号:32〕
実施例4で用いられたプライマーmA2の塩基配列を示す。
〔配列番号:33〕
実施例4で用いられたプライマーmB2の塩基配列を示す。
〔配列番号:34〕
実施例4で用いられたプライマーmR1の塩基配列を示す。
〔配列番号:35〕
実施例3で取得したマウスTCH169の5’上流cDNAの塩基配列を示す。
〔配列番号:36〕
実施例4で取得したマウスTCH169全長遺伝子を含むcDNAの塩基配列を示す。
〔配列番号:37〕
実施例5で用いられたプライマーmTFの塩基配列を示す。
〔配列番号:38〕
実施例5で用いられたプライマーmTRの塩基配列を示す。
〔配列番号:39〕
実施例5で用いられたTaqManプローブmT1の塩基配列を示す。
〔配列番号:40〕
実施例6で用いられたプライマーOFの塩基配列を示す。
〔配列番号:41〕
実施例6で用いられたプライマーORの塩基配列を示す。
〔配列番号:42〕
実施例6で用いられたプライマーBGH RVの塩基配列を示す。
【0077】
後述の実施例1で得られた形質転換体 大腸菌(Escherichia coli)TOP10/pCR−BluntII−TCH169は、2001年9月13日から茨城県つくば市東1丁目1番地1 中央第6の独立行政法人産業技術総合研究所 特許生物寄託センターに受託番号FERM BP−7734として、2001年8月29日から大阪府大阪市淀川区十三本町2−17−85の財団法人・発酵研究所(IFO)に受託番号IFO 16690として寄託されている。
後述の実施例4で得られた形質転換体 大腸菌(Escherichia coli)TOP10/pCR−BluntII−mTCH169は、2002年4月10日から茨城県つくば市東1丁目1番地1 中央第6の独立行政法人産業技術総合研究所 特許生物寄託センターに受託番号FERM BP−8010として、2002年4月2日から大阪府大阪市淀川区十三本町2−17−85の財団法人・発酵研究所(IFO)に受託番号IFO 16785として寄託されている。
【実施例】
以下に実施例を示して、本発明をより詳細に説明するが、これらは本発明の範囲を限定するものではない。なお、大腸菌を用いての遺伝子操作法は、モレキュラー・クローニング(Molecular cloning)に記載されている方法に従った。
【0078】
実施例1
ヒトTCH169遺伝子cDNAのクローニング
2種のプライマーDNA、プライマーA7(配列番号:6)およびプライマーB6(配列番号:7)を用いて、ヒト肝臓cDNA library(宝酒造社製)に対してPyrobest DNA Polymerase(宝酒造社製)によりPCRを行い、プラスミドクローンpCR−BluntII−TCH169の2クローンである#1、および#2を得た。これをプライマーDNA〔プライマーSP6(配列番号:8)、プライマーT7(配列番号:9)、プライマーA1(配列番号:10)、プライマーA2(配列番号:11)、プライマーF1(配列番号:12)、プライマーF2(配列番号:13)、プライマーF3(配列番号:14) 、プライマーB1(配列番号:15)、プライマーB2(配列番号:16)、プライマーB8(配列番号:17)、プライマーR1(配列番号:18)、プライマーR2(配列番号:19)、プライマーR3(配列番号:20)、プライマーR4(配列番号:21)〕およびBigDye Terminator CycleSequencing Kit(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて反応を行い、挿入されているcDNA断片の塩基配列をDNAシークエンサーABI PRISM 3100 DNAアナライザ(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて決定した。その結果、取得した2クローンは同一のDNA断片を含んでおり2320個の塩基配列を有していた(配列番号:22)。該cDNA断片には568個のアミノ酸配列(配列番号:1)がコードされており(配列番号:2)、該アミノ酸配列を有するタンパク質を、ヒトTCH169タンパク質と命名した。
該cDNA断片を含むプラスミドを有する形質転換体を、エシェリヒア・コリ(Escherichia coli)TOP10/pCR−BluntII−TCH169と命名した。
Blast P[ヌクレイック アシッド リサーチ(Nucleic Acids Res.)第25巻、3389頁(1997年)]を用いてowlに対してホモロジー検索を行ったところ、該cDNAはジカルボン酸トランスポータに属する新規遺伝子であることが判明した(図1および図2)。ヒトで報告されているナトリウム依存性ジカルボン酸トランスポータであるNaDC1[Am J Physiol.、第270巻、F642頁(1996)]とは塩基レベルで65%、アミノ酸レベルで56%の相同性を示した。
【0079】
実施例2
ヒトTCH169遺伝子産物の組織分布の解析
THC169の配列から設計した、2種のプライマーDNA、プライマーA10(配列番号:3)およびプライマーB9(配列番号:4)と、TaqManプローブT1(配列番号:5)を用いて、ヒトの各組織(心臓、脳、胎盤、肺、肝臓、骨格筋、腎臓、膵臓、脾臓、胸腺、前立腺、精巣、卵巣、小腸、大腸、末梢血白血球)のcDNA(Human MTC panel I、およびHuman MTC panel II:クロンテック社製)におけるTCH169の発現量をTaqMan PCRにより測定した。反応はTaqMan Universal PCR Master Mix(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて、ABI PRISM 7900 sequence detection system(アプライドバイオシステムズ社製)にて、最初50℃2分間、さらに95℃10分間おいた後で、95℃で15秒、60℃で1分を1反応サイクルとして40サイクル繰り返し、同時に検出を行った。
結果を図3に示す。ヒトTCH169遺伝子産物(mRNA)は脳、腎臓、精巣、卵巣で僅かに、また前立腺、脾臓、小腸でも若干の発現が見られ、肝臓で最も強い発現を示した。
【0080】
実施例3
マウスTCH169タンパク質をコードするcDNAの5’上流端のクローニング
5’RACE法によりマウスTCH169タンパク質をコードするcDNAの5’上流塩基配列を明らかにした。
2種のプライマーDNA、プライマーAP1(配列番号:25)およびプライマーmB5(配列番号:26)を用いて、マウス脳Marathon−Ready cDNA(クロンテック社製)に対して、Advantage 2 DNA Polymerase(クロンテック社製)により、以下の条件(1)〜(4)で一次PCRを行った。
(1)94℃30秒間
(2)94℃5秒間−72℃4分間を5サイクル
(3)94℃5秒間−70℃4分間を5サイクル
(4)94℃5秒間−68℃4分間を25サイクル
さらに、この一次PCRの産物を鋳型として、プライマーAP2(配列番号:27)およびプライマーmB3(配列番号:28)を用いて、Advantage 2 DNA Polymerase(クロンテック社製)により以下の条件(5)〜(7)でnestedPCRを行った。
(5)94℃30秒間
(6)94℃5秒間−70℃4分間を5サイクル
(7)94℃5秒間−68℃4分間を30サイクル
上記nested PCR反応液をゲル電気泳動後、主要バンドを精製した。これをプライマーmB3(配列番号:28)およびBigDye Terminator Cycle Sequencing Kit(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて反応を行い、増幅したDNA断片の塩基配列をDNAシークエンサーABI PRISM 3100DNAアナライザ(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて決定した。その結果、配列番号:35に示す塩基配列を得た。
【0081】
実施例4
マウスTCH169タンパク質をコードするcDNAのクローニング
2種のプライマーDNA、プライマーmA4(配列番号:29)およびプライマーmB6(配列番号:30)を用いて、マウス脳Marathon−Ready cDNA(クロンテック社製)に対して、Pyrobest DNA Polymerase(宝酒造社製)により、以下の条件(1)〜(3)でPCRを行った。
(1)94℃2分間
(2)98℃10秒間−68℃30秒間−72℃3.5分間を30サイクル
(3)72℃10分間
得られた増幅産物をZero Blunt TOPO Cloning kit(インビトロジェン社製)を用いてクローニングし、プラスミドpCR−BluntII−mTCH169を得た。
これをプライマーDNA〔プライマーSP6(配列番号:8)、プライマーT7(配列番号:9)、プライマーmA1(配列番号:31)、プライマーmA2(配列番号:32)、プライマーmB2(配列番号:33)、プライマーmR1(配列番号:34)〕およびBigDye Terminator CycleSequencing Kit(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて反応を行い、挿入されているcDNA断片の塩基配列をDNAシークエンサーABI PRISM 3100 DNAアナライザ(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて決定した。その結果、クローンは1826個の塩基配列を有していた(配列番号:36)。該cDNA断片には572個のアミノ酸配列(配列番号:23)がコードされており(配列番号:24)、該アミノ酸配列を有するタンパク質を、マウスTCH169タンパク質と命名した。
該cDNA断片を含むプラスミドを有する形質転換体を、エシェリヒア コリ(Escherichia coli)TOP10/pCR−BluntII−mTCH169と命名した。
Blast P[ヌクレイック アシッド リサーチ(Nucleic Acids Res.)第25巻、3389頁、1997年]を用いてowlに対してホモロジー検索を行ったところ、該cDNAはナトリウム依存性ジカルボン酸トランスポータファミリーに属する新規遺伝子であるヒトTCH169のマウスオルソログであることが判明した(図4)。マウスTCH169はヒトTCH169と塩基レベルで77%、アミノ酸レベルで74%の相同性を示した。また、マウスで報告されているナトリウム依存性ジカルボン酸トランスポータであるマウスNaDC1[Am. J. Physiol.、第279巻、F482頁、2000年 ]とは塩基レベル50%、アミノ酸レベルで48%の相同性を示した。
【0082】
実施例5
マウスTCH169遺伝子産物の組織分布の解析
マウスTCH169の配列から設計した、2種のプライマーDNA、プライマーmTF(配列番号:37)およびプライマーmTR(配列番号:38)と、TaqManプローブmT1(配列番号:39)を用いて、マウスの各組織(骨髄、目、リンパ節、平滑筋、前立腺、胸腺、胃、子宮、心臓、脳、脾臓、肺、肝臓、骨格筋、腎臓、精巣、胚(7日)、胚(11日)、胚(15日)、胚(17日))のcDNA(Mouse MTC panel IおよびMouse MTC panel II:クロンテック社製)におけるマウスTCH169の発現量を、TaqMan PCRにより測定した。反応はTaqMan Universal PCR Master Mix(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて、ABI PRISM 7900 sequence detection system(アプライドバイオシステムズ社製)にて、最初50℃2分間、さらに95℃10分間おいた後で、95℃で15秒、60℃で1分を1反応サイクルとして40サイクル繰り返し、同時に検出を行った。
結果を図5に示す。マウスTCH169遺伝子産物(mRNA)は、Mouse MTC panel IおよびMTC panel IIにおいては、胸腺、胃、子宮、肝臓、腎臓、胚(11日)でわずかな発現が見られ、目、胚(17日)で若干の発現が見られ、骨髄、脳、胚(15日)で強い発現が見られ、精巣で最も強い発現が見られた。
【0083】
実施例6
ヒトTCH169発現ベクターの構築
ヒトTCH169(配列番号:1)発現ベクターを、以下の方法により作成した。実施例1により得られたプラスミド10ngを鋳型として、プライマーOF(配列番号:40)およびプライマーOR(配列番号:41)を用いて、Pyrobest DNA Polymerase(宝酒造社製)により以下の条件(1)〜(3)でPCRを行った。5’末端側プライマーOFおよび3’末端側プライマーORは、ベクターへのクローニングのために5’末端側にそれぞれHind IIIサイトおよびXba Iサイトを付加するように設計した。
(1)94℃2分間
(2)98℃10秒間−65℃30秒間−72℃3.5分間を30サイクル
(3)72℃10分間
上記PCR反応液をゲル電気泳動後、主要バンドを精製した。これにより得られたPCR断片を、制限酵素Hind IIIおよびXba Iを用いて、37℃で1時間保温することにより消化し、この反応液をゲル電気泳動後、精製した。これを、動物細胞発現ベクターであるpcDNA3.1(+)(インビトロジェン社製)のHind IIIサイトおよびXba Iサイトに、Takara ligation kit ver.2(宝酒造社製)を用いてライゲーションした。このライゲーション反応液をエタノール沈殿処理後、コンピーテント細胞である大腸菌(Escherichia coli)TOP10(インビトロジェン社製)に形質転換した。これにより得られた複数のコロニーからプラスミドを調製し、この塩基配列をプライマーDNA〔プライマーBGH  RV(配列番号:42)、プライマーT7(配列番号:9)、プライマーA2(配列番号:11)、プライマーF1(配列番号:12)、プライマーF2(配列番号:13)、プライマーB1(配列番号:15)、プライマーB2(配列番号:16)、プライマーR1(配列番号:18)、プライマーR2(配列番号:19)〕、およびBigDye Terminator Cycle Sequencing Kit(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて反応を行い、塩基配列をDNAシークエンサーABI PRISM 3100 DNAアナライザ(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて確認した。このプラスミドを有する形質転換体を、Escherichia coli TOP10/pCDNA3.1(+)−TCH169と命名した。
【0084】
実施例7
TCH169発現CHO細胞株の作製および導入遺伝子発現量の測定
Escherichia coli TOP10/pCDNA3.1(+)−TCH169を培養し、この大腸菌体からEndoFree Plasmid Maxi Kit(キアゲン社製)を用いてプラスミドDNAを調製した。このプラスミドDNAをFuGENE 6 Transfection Reagent(ロシュ社製)を用いて添付のプロトコールに従ってCHO dhfr細胞に導入した。2μgのプラスミドDNAとトランスフェクション試薬との混合液を、24時間前に3 x 10個のCHO dhfr細胞を播種した直径6 cmシャーレに添加した。10%ウシ胎児血清を含むMEMα培地で1日間培養した後、トリプシン処理により細胞をはがし、回収した細胞を1 wellあたり10−50個で96 well plateに播種した。さらに24時間後、培地に0.5mg/mlのG418を添加し、その後7日間0.5−1.0mg/mlのG418を含んだ培地中でTCH169発現細胞を選択した。1 wellあたり1−3コロニーの増殖が見られた10 wellについて、6 well plateに培養し、増殖した細胞からRNeasy Mini KitまたはRNeasy 96 Kit(ともにキアゲン社製)を用いてtotal RNAを調製した。調製したtotal RNA に対してTaqMan Revease Transcription Reagents(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて逆転写反応を行いcDNAを調製した。これについて、実施例2で用いたプライマーA10(配列番号:3)およびプライマーB9(配列番号:4)と、TaqManプローブT1(配列番号:5)とを用いて、TCH169の発現量をTaqMan PCRにより測定した。反応はTaqMan Universal PCR Master Mix(アプライドバイオシステムズ社製)を用いて、ABI PRISM 7900 sequence detection system(アプライドバイオシステムズ社製)にて、最初50℃2分間、さらに95℃10分間おいた後で、95℃で15秒、60℃で1分を1反応サイクルとして40サイクル繰り返し、同時に検出を行った。ヒトTCH169遺伝子高発現細胞株(ポリクローナル)として、クローンNo.2およびNo.13を選択した。これらを1 wellあたり0.5個で96 well plateに播種し、G418含有培地中で7−10日間培養し、モノクローナルなクローンを得た。これについて、total RNAを調製し、ヒトTCH169遺伝子の発現量をTaqMan PCRにより測定した。ヒトTCH169遺伝子高発現細胞株(モノクローナル)として、クローンNo.2−11を選択した。
【0085】
実施例8
ヒトTCH169発現CHO細胞株における[1,5−14C] Citric acid取り込みの測定
実施例7で取得したTCH169発現CHO細胞株クローンNo.2−11を用いて、[1,5−14C] Citric acid取り込みを測定した。TCH169発現CHO細胞株クローンNo.2−11を、96 well plateに1 wellあたり4×10個播種し、37℃で24時間培養した。培地を除き、150μL  NMDGバッファー(140mM  N−メチル−D(−)−グルカミン、25mM Hepes/Tris、5.4mM  KCl、1.8mM  CaCl、0.8mM  MgSO、5mM  Glucose、pH 7.4−7.6)で3回洗い、150μL  NMDGバッファーを入れ37℃で1時間培養した。90μL  NaClバッファー(140mM  NaCl、25mM Hepes/Tris、5.4mM  KCl、1.8mM  CaCl、0.8mM  MgSO、5mM  Glucose、pH7.4−7.6)または90μL  NMDGバッファーに置換したのち、223μM  [1,5−14C] Citric acid(アマシャム・ファルマシア・バイオテク社製)を10μL加え、37℃で15分、30分、1時間培養したのち、200μL PBS(宝酒造社製)で3回洗った。100μL  Opitiphase ’SuperMix’ (パーキンエルマー・ライフサイエンス社製)を加え、攪拌したのち、細胞に取り込まれた[1,5−14C] Citric acid量を放射活性により測定した。測定は、1450 MICROBETA PLUSLIQUID SCINTILLATION COUNTER(パーキンエルマー・ライフサイエンス社製)により行った。同様の操作を、CHO dhfr細胞にベクターpcDNA3.1(+)を導入した細胞(Mock)においても行い、同様に放射活性を測定した。
結果を図6、図7に示す。これより、ヒトTCH169発現CHO細胞は、140mM  NaCl存在下で[1,5−14C] Citric acidを取り込むことが明らかである。
【0086】
【発明の効果】
本発明のタンパク質は、例えば肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、前立腺疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、腎臓疾患(例、腎炎、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫など)、代謝疾患(例、糖尿病、高脂血症など)、循環器疾患(例、動脈硬化など)または癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌など)、あるいは老化などの診断マーカー等として有用であり、該タンパク質を用いるスクリーニング法により得られる該タンパク質の活性を促進または阻害する化合物は、例えば肝臓疾患(例、肝硬変、肝炎、アルコール性肝臓疾患など)、前立腺疾患(例、前立腺肥大症、前立腺炎など)、脾臓疾患(例、脾機能亢進症、脾腫性症候群など)、腎臓疾患(例、腎炎、腎不全、糸球体腎炎、糖尿病性腎症、巣状糸球体硬化症、ネフローゼ症候群、腎性浮腫など)、代謝疾患(例、糖尿病、高脂血症など)、循環器疾患(例、動脈硬化など)または癌(例、肺癌、腎臓癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、前立腺癌、胃癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸部癌、結腸癌、直腸癌、膵臓癌など)などの予防・治療剤、または老化の予防・抑制剤として使用することができる。
【0087】
【配列表】

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【図面の簡単な説明】
【図1】ナトリウム依存性ジカルボン酸トランスポータNaDC1とヒトTCH169とのアミノ酸配列の比較を表す図である(図2へ続く)。
【図2】ナトリウム依存性ジカルボン酸トランスポータNaDC1とヒトTCH169とのアミノ酸配列の比較を表す図である(図1の続き)。
【図3】ヒトTCH169遺伝子産物の各組織における発現量を表す図である。
【図4】マウスTCH169とヒトTCH169とのアミノ酸配列の比較を表す図である。
【図5】マウスTCH169遺伝子産物の各組織における発現量を表す図である。
【図6】ヒトTCH169発現CHO細胞株における[1,5−14C] Citric acidの取り込みを測定した結果を表す図である。取り込み量は、[1,5−14C] Citric acidを1時間取り込ませた際の、1分間あたりのカウント(cpm)で表した。独立した4wellのカウントの平均値および標準偏差により示した。図中、ベクターpcDNA3.1(+)を導入した細胞をMock、ヒトTCH169発現CHO細胞をTCH169で表し、NaClバッファーで[1,5−14C] Citric acidを取り込ませたものをそれぞれ、Mock/NaCl、TCH169/NaClで、NMDGバッファーで[1,5−14C] Citric acidを取り込ませたものをそれぞれ、Mock/NMDG、TCH169/NMDGで表した。
【図7】ヒトTCH169発現CHO細胞株における[1,5−14C] Citric acidの経時的な取り込みを測定した結果を表す図である。取り込み量は、[1,5−14C] Citric acidを15分間、30分間、1時間取り込ませた際の、1分間あたりのカウント(cpm)で表した。独立した4wellのカウントの平均値および標準偏差により示した。図中、ベクターpcDNA3.1(+)を導入した細胞をMock、ヒトTCH169発現CHO細胞をTCH169で表し、NaClバッファーで[1,5−14C] Citric acidを取り込ませたものをそれぞれ、Mock/NaCl、TCH169/NaClで、NMDGバッファーで[1,5−14C] Citric acidを取り込ませたものをそれぞれ、Mock/NMDG、TCH169/NMDGで表した。[0001]
TECHNICAL FIELD OF THE INVENTION
The present invention provides a novel sodium-dependent dicarboxylic acid transporter (NaDC) protein, a DNA encoding the protein, a method for screening a compound that promotes or inhibits the activity of the protein, a compound obtained by the screening method, and the like. .
[0002]
[Prior art]
Di- or tricarboxylic acids such as succinic and citric acids play a central role as intermediates in the TCA cycle. Sodium-dependent dicarboxylic acid transporter (NaDC) is responsible for the transport of these acids into and out of cells, and two types of NaDC have been reported to date in humans. Among these, NaDC1 has low affinity for the substrate and is expressed in the kidney and small intestine, but is not observed in the liver. In contrast, NaDC3 has a high affinity for the substrate and is expressed in the proximal tubule of the kidney, hepatocytes, brain and the like. These NaDCs are thought to play a major role in the transport of citrate in the kidney, suggesting an association with urolith formation.
[0003]
[Patent Document 1]
US 2002/0019028
[Non-patent document 1]
American Journal of Physiology, 270, F642, 1996.
[Non-patent document 2]
American Journal of Physiology, 279, F482, 2000
[0004]
[Problems to be solved by the invention]
Although NaDC is thought to play an important role in the metabolism of dicarboxylic or tricarboxylic acids, its detailed mechanism and its relation to diseases are not well understood. Elucidating the detailed substrate specificity and role of NaDC in metabolic reactions will lead to the development of therapeutics for diseases related to dicarboxylic or tricarboxylic acid metabolism.
NaDC1 is a human gene having the highest homology to Indy (Science, Vol. 290, pp. 2137-2140, 2000), a gene involved in fly aging, and Indy transports dicarboxylic acid or tricarboxylic acid (Biochem). J. Intemediate Publication, Published on 19 Aug 2002 as manuscript BJ20021132), the elucidation of the relationship between the function of the NaDC family and aging leads to the development of a drug that stops the progress of aging.
[0005]
[Means for Solving the Problems]
The present inventors have conducted intensive studies to solve the above problems, and as a result, have found a novel sodium-dependent dicarboxylic acid transporter (NaDC) protein. The protein shows 56% homology at the amino acid level with human NaDC1 and can function as a sodium-dependent dicarboxylic acid transporter.
Examples of a method for suppressing the function or activity of the protein include, for example, inhibiting transport of di- or tricarboxylic acid, and suppressing the transcription of the protein to reduce the expression level. It is considered that the expression level is enhanced by promoting the transport of di- or tricarboxylic acid, activating the promoter of the protein, or stabilizing mRNA.
The present inventors have further studied based on these findings, and have completed the present invention.
That is, the present invention
(1) a protein containing an amino acid sequence identical or substantially identical to the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 23, or a salt thereof;
(2) a protein consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 or a salt thereof;
(3) a protein comprising an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 23 or a salt thereof;
(4) a partial peptide of the protein according to (1) or a salt thereof;
(5) a polynucleotide containing a polynucleotide encoding the protein of (1) or the partial peptide of (4),
(6) the polynucleotide according to (5), which is a DNA;
(7) a polynucleotide having a base sequence represented by SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 22,
(8) a polynucleotide having a base sequence represented by SEQ ID NO: 24 or SEQ ID NO: 36,
(9) a recombinant vector containing the polynucleotide according to (5),
(10) a transformant transformed with the recombinant vector according to (9),
(11) The method according to (1), wherein the transformant according to (10) is cultured to produce and accumulate the protein according to (1) or the partial peptide according to (4), and collect this. )) A method for producing the protein or the partial peptide according to (4) or a salt thereof,
(12) a medicine comprising the protein according to (1) or the partial peptide according to (4) or a salt thereof;
(13) a medicine comprising the polynucleotide according to (5),
(14) a diagnostic agent comprising the polynucleotide according to (5),
(15) an antibody against the protein according to (1) or the partial peptide according to (4) or a salt thereof;
(16) a medicine comprising the antibody according to (15),
(17) a diagnostic agent comprising the antibody according to (15),
(18) a polynucleotide comprising a nucleotide sequence complementary to or substantially complementary to the polynucleotide according to (5) or a part thereof;
(19) a medicine comprising the polynucleotide according to (18),
(20) The protein according to (1), the partial peptide according to (4), or a salt thereof, wherein the protein according to (1), the partial peptide according to (4), or a salt thereof is used. A method for screening a compound or a salt thereof that promotes or inhibits the activity,
(21) The activity of the protein according to (1), the partial peptide according to (4), or a salt thereof, comprising the protein according to (1), the partial peptide according to (4), or a salt thereof. A kit for screening for a compound that promotes or inhibits or a salt thereof,
(22) Promotes the activity of the protein of (1), the partial peptide of (4) or a salt thereof obtained by using the screening method of (20) or the screening kit of (21). Or a compound that inhibits or a salt thereof,
(23) a medicament comprising the compound according to (22) or a salt thereof,
(24) A method for screening a compound or a salt thereof that promotes or inhibits the expression of the protein gene according to (1), comprising using the polynucleotide according to (5);
(25) A kit for screening a compound or a salt thereof that promotes or inhibits the expression of the protein gene according to (1), comprising the polynucleotide according to (5),
(26) a compound or a salt thereof that promotes or inhibits the expression of the protein gene according to (1), obtained by using the screening method according to (24) or the screening kit according to (25);
(27) a medicament comprising the compound according to (26) or a salt thereof,
(28) The method for quantifying a protein according to (1), comprising using the antibody according to (15),
(29) a method for diagnosing a disease associated with the function of the protein according to (1), wherein the method according to (28) is used;
(30) A method for screening a compound or a salt thereof that promotes or inhibits the expression of the protein according to (1), which comprises using the antibody according to (15).
(31) A kit for screening a compound or a salt thereof that promotes or inhibits the expression of the protein according to (1), comprising the antibody according to (15), (32) a screening method according to (30). Or a compound or a salt thereof that promotes or inhibits expression of the protein of (1), obtained by using the screening kit of (31);
(33) a medicament comprising the compound of (32) or a salt thereof;
(34) The above-mentioned (13), (16), (19), which is an agent for preventing or treating liver disease, prostate disease, spleen disease, kidney disease, metabolic disease, cardiovascular disease or cancer, or an agent for preventing or suppressing aging. (23) The medicament according to (27) or (33),
(35) The diagnostic agent according to (14) or (17), which is a diagnostic agent for liver disease, prostate disease, spleen disease, kidney disease, metabolic disease, cardiovascular disease, or cancer.
(36) liver disease, prostate disease, spleen disease, kidney disease, which comprises administering to a mammal an effective amount of the compound according to (22), (26) or (32) or a salt thereof. Metabolic disease, cardiovascular disease or cancer prevention or treatment method or aging prevention and suppression method,
(37) The above (22), (26) or (26) for producing an agent for preventing or treating liver disease, prostate disease, spleen disease, kidney disease, metabolic disease, cardiovascular disease or cancer or preventing or suppressing aging. 32) Use of the compound or a salt thereof described above.
[0006]
BEST MODE FOR CARRYING OUT THE INVENTION
A protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 23 (hereinafter, sometimes referred to as the protein of the present invention or the protein used in the present invention) Cells of humans and other warm-blooded animals (eg, guinea pigs, rats, mice, chickens, rabbits, pigs, sheep, cows, monkeys, etc.) (eg, hepatocytes, spleen cells, nerve cells, glial cells, pancreatic β cells , Bone marrow cells, mesangial cells, Langerhans cells, epidermal cells, epithelial cells, goblet cells, endothelial cells, smooth muscle cells, fibroblasts, fiber cells, muscle cells, adipocytes, immune cells (eg, macrophages, T cells, B cells) Cells, natural killer cells, mast cells, neutrophils, basophils, eosinophils, monocytes, etc.), megakaryocytes, synovial cells, chondrocytes, osteocytes, osteoblasts Vesicles, osteoclasts, mammary cells, hepatocytes or stromal cells, or precursors of these cells, stem cells or cancer cells) or any tissue in which those cells are present, for example, the brain, various parts of the brain (eg, Olfactory bulb, amygdala, basal ganglia, hippocampus, thalamus, hypothalamus, cerebral cortex, medulla, cerebellum), spinal cord, pituitary, stomach, pancreas, kidney, liver, gonads, thyroid, gallbladder, bone marrow, adrenal gland, skin, muscle Proteins from the lungs, gastrointestinal tract (eg, large and small intestines), blood vessels, heart, thymus, spleen, submandibular gland, peripheral blood, prostate, testis, ovaries, placenta, uterus, bones, joints, skeletal muscle, etc. Or a synthetic protein.
[0007]
As the amino acid sequence substantially identical to the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, about 60% or more, preferably about 70% or more, more preferably about 80% Above, particularly preferred are amino acid sequences having about 90% or more, most preferably about 95% or more homology.
Examples of the protein containing an amino acid sequence substantially the same as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 include, for example, a protein containing the same amino acid sequence as the above-mentioned amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1. And proteins having substantially the same activity as the protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1.
The amino acid sequence substantially the same as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 23 is about 50% or more, preferably about 60% or more, preferably about 70% or more as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 23 And more preferably about 80% or more, particularly preferably about 90% or more, and most preferably about 95% or more homology.
Examples of the protein having an amino acid sequence substantially the same as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 23 include, for example, a protein having the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 23 described above. And a protein having substantially the same activity as the protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 23.
Substantially the same activity includes, for example, transport of di- or tricarboxylic acids. Substantially homogenous indicates that the properties are homogenous (eg, physiologically or pharmacologically). Therefore, it is preferable that the transport of di- or tricarboxylic acid is equivalent (eg, about 0.01 to 100 times, preferably about 0.1 to 10 times, more preferably 0.5 to 2 times). Quantitative factors such as the degree of activity and the molecular weight of the protein may vary.
The activity such as transport of di- or tricarboxylic acid can be measured according to a known method. J. Physiol. Cell. Physiol. 278, pages C1019-C1030, 2000 or a method analogous thereto.
[0008]
Examples of the protein of the present invention include (1) (i) one or two or more amino acids in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 (eg, about 1 to 200, preferably about 1 to 100, An amino acid sequence in which preferably about 1 to 50, preferably about 1 to 30, preferably about 1 to 10, and more preferably a number (1 to 5) of amino acids have been deleted, (ii) SEQ ID NO: 1 or 2 or more (for example, about 1 to 200, preferably about 1 to 100, preferably about 1 to 50, preferably about 1 to 30, preferably 1 to 10 Amino acid sequence, more preferably about (1-5) amino acids, and (iii) one or more amino acids (eg, about 1-200, preferably Is 1 An amino acid sequence into which about 00, preferably about 1 to 50, preferably about 1 to 30, preferably about 1 to 10, and more preferably several (1 to 5) amino acids have been inserted, (iv 1) in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 or 2 or more (for example, about 1 to 200, preferably about 1 to 100, preferably about 1 to 50, preferably about 1 to 30, A so-called mutein such as a protein containing an amino acid sequence in which preferably about 1 to 10, more preferably a number (1 to 5) amino acids are substituted with another amino acid, or (v) an amino acid sequence obtained by combining them. , (2) (i) 1 or 2 or more (for example, about 1 to 200, preferably about 1 to 100, and preferably 1 to 50) in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 23. (Preferably about 1 to 30, preferably about 1 to 10, more preferably about 1 to 5) amino acids, and (ii) an amino acid represented by SEQ ID NO: 23. One or two or more (for example, about 1 to 200, preferably about 1 to 100, preferably about 1 to 50, preferably about 1 to 30, more preferably about 1 to 10, more preferably about 1 to 10 (Iii) one or two or more amino acids (for example, about 1 to 200, preferably about 1 to 100) in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 23; An amino acid sequence having preferably 1 to 50, preferably 1 to 30, preferably 1 to 10, and more preferably (1 to 5) amino acids inserted therein, (iv) SEQ ID NO: : 2 1 or 2 or more in the amino acid sequence represented by 3 (for example, about 1 to 200, preferably about 1 to 100, preferably about 1 to 50, preferably about 1 to 30, preferably 1 to 30). Also included are so-called muteins, such as proteins containing an amino acid sequence in which about 10 amino acids are substituted, more preferably about (1 to 5) amino acids, or (v) an amino acid sequence combining them. .
When the amino acid sequence is inserted, deleted or substituted as described above, the position of the insertion, deletion or substitution is not particularly limited.
[0009]
In the protein in the present specification, the left end is the N-terminal (amino terminal) and the right end is the C-terminal (carboxyl terminal) according to the convention of peptide notation. The protein of the present invention, including the protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, has a carboxyl group (—COOH), a carboxylate (—COO) ), Amide (-CONH 2 )) Or an ester (—COOR).
Here, as R in the ester, for example, C, such as methyl, ethyl, n-propyl, isopropyl, n-butyl, etc. 1-6 Alkyl groups such as C, cyclopentyl, cyclohexyl, etc. 3-8 Cycloalkyl groups such as phenyl, α-naphthyl and the like; 6-12 Aryl groups, for example phenyl-C such as benzyl, phenethyl, etc. 1-2 An alkyl group or α-naphthyl-C such as α-naphthylmethyl 1-2 C such as an alkyl group 7-14 An aralkyl group, a pivaloyloxymethyl group and the like are used.
When the protein used in the present invention has a carboxyl group (or carboxylate) other than the C-terminus, the protein used in the present invention includes those in which the carboxyl group is amidated or esterified. As the ester in this case, for example, the above-mentioned C-terminal ester and the like are used.
Furthermore, in the protein of the present invention, the amino group of the N-terminal amino acid residue (eg, methionine residue) has a protecting group (eg, formyl group, acetyl group, etc.). 1-6 C such as alkanoyl 1-6 Acyl group), N-terminal glutamine residue generated by cleavage in vivo, pyroglutamine oxidation, substituent on the side chain of amino acid in the molecule (eg, -OH, -SH , An amino group, an imidazole group, an indole group, a guanidino group, etc.) are suitable protecting groups (for example, formyl group, acetyl group, etc.). 1-6 C such as alkanoyl group 1-6 (Eg, an acyl group), or a complex protein such as a so-called glycoprotein to which a sugar chain is bound.
Specific examples of the protein of the present invention include, for example, a human liver-derived protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, a mouse-derived protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 23, and the like. can give.
[0010]
The partial peptide of the protein of the present invention is the partial peptide of the protein of the present invention described above, and preferably any peptide having the same properties as the protein of the present invention described above.
For example, a peptide containing at least 20 or more, preferably 50 or more, more preferably 70 or more, more preferably 100 or more, and most preferably 200 or more amino acid sequences among the constituent amino acid sequences of the protein of the present invention. Are used.
In the partial peptide of the present invention, one or more (preferably about 1 to 10, more preferably a number (1 to 5)) amino acids in the amino acid sequence are deleted, or One or two or more (preferably about 1 to 20, more preferably about 1 to 10, and still more preferably, about 1 to 5) amino acids are added to the amino acid sequence, or the amino acid sequence 1 or 2 or more (preferably about 1 to 20, more preferably about 1 to 10, and still more preferably a number (1 to 5) amino acids), or 1 amino acid in the amino acid sequence. Alternatively, two or more (preferably about 1 to 10, more preferably several, and still more preferably about 1 to 5) amino acids may be substituted with another amino acid.
[0011]
The partial peptide of the present invention has a carboxyl group (—COOH) and a carboxylate (—COO) ), Amide (-CONH 2 )) Or an ester (—COOR).
Furthermore, the partial peptide of the present invention has a carboxyl group (or carboxylate) other than the C-terminus, an N-terminal amino acid residue (eg, a methionine residue), similarly to the above-described protein of the present invention. ) Wherein the amino group is protected with a protecting group, glutamine residues generated by cleavage of the N-terminal side in vivo are pyroglutamine-oxidized, and the substituent on the side chain of the amino acid in the molecule is an appropriate protecting group. Or a complex peptide such as a so-called glycopeptide to which a sugar chain is bound.
The partial peptide of the present invention can also be used as an antigen for producing an antibody. For the purpose of preparing the antibody of the present invention, for example, a peptide containing the amino acid sequence at positions 136 to 204, 228 to 252, and 276 to 309 in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: Peptides containing the amino acid sequence at positions 136 to 207, 231 to 255, and 279 to 313 in the amino acid sequence represented by No. 23.
[0012]
As the salt of the protein of the present invention or a partial peptide thereof, salts with physiologically acceptable acids (eg, inorganic acids, organic acids) and bases (eg, alkali metal salts) are used. Acceptable acid addition salts are preferred. Such salts include, for example, salts with inorganic acids (eg, hydrochloric acid, phosphoric acid, hydrobromic acid, sulfuric acid) or organic acids (eg, acetic acid, formic acid, propionic acid, fumaric acid, maleic acid, succinic acid) Acids, tartaric acid, citric acid, malic acid, oxalic acid, benzoic acid, methanesulfonic acid, benzenesulfonic acid) and the like are used.
The protein of the present invention, a partial peptide thereof, or a salt thereof can be produced by the above-mentioned method for purifying a protein from human or other warm-blooded animal cells or tissues, or a protein containing a DNA encoding the protein. It can also be produced by culturing the transformant. Further, it can be produced according to the peptide synthesis method described later.
When producing from human or other mammalian tissues or cells, after homogenizing human or other mammalian tissues or cells, extraction is performed with an acid or the like, and the extract is subjected to reverse phase chromatography or ion exchange chromatography. Purification and isolation can be performed by combining chromatography such as described above.
[0013]
For the synthesis of the protein or partial peptide of the present invention, a salt thereof, or an amide thereof, a commercially available resin for protein synthesis can be used. Examples of such a resin include chloromethyl resin, hydroxymethyl resin, benzhydrylamine resin, aminomethyl resin, 4-benzyloxybenzyl alcohol resin, 4-methylbenzhydrylamine resin, PAM resin, and 4-hydroxymethylmethyl. Phenylacetamidomethyl resin, polyacrylamide resin, 4- (2 ′, 4′-dimethoxyphenyl-hydroxymethyl) phenoxy resin, 4- (2 ′, 4′-dimethoxyphenyl-Fmocaminoethyl) phenoxy resin, and the like. it can. Using such a resin, an amino acid having an α-amino group and a side chain functional group appropriately protected is condensed on the resin in accordance with the sequence of the target protein according to various known condensation methods. At the end of the reaction, the protein or partial peptide is cleaved from the resin, and at the same time, various protecting groups are removed.In addition, an intramolecular disulfide bond formation reaction is performed in a highly diluted solution to obtain the target protein or partial peptide or an amide thereof. I do.
For the condensation of the above protected amino acids, various activating reagents that can be used for protein synthesis can be used, and carbodiimides are particularly preferable. As the carbodiimides, DCC, N, N′-diisopropylcarbodiimide, N-ethyl-N ′-(3-dimethylaminoprolyl) carbodiimide and the like are used. For activation by these, the protected amino acid is directly added to the resin together with a racemization inhibitor (eg, HOBt, HOOBt), or the protected amino acid is previously activated as a corresponding acid anhydride or HOBt ester or HOOBt ester. After that, it can be added to the resin.
[0014]
The solvent used for activating the protected amino acid or condensing with the resin can be appropriately selected from solvents known to be usable for the protein condensation reaction. For example, acid amides such as N, N-dimethylformamide, N, N-dimethylacetamide, N-methylpyrrolidone, halogenated hydrocarbons such as methylene chloride and chloroform, alcohols such as trifluoroethanol, dimethyl sulfoxide and the like. Sulfoxides, ethers such as pyridine, dioxane, and tetrahydrofuran, nitriles such as acetonitrile and propionitrile, esters such as methyl acetate and ethyl acetate, and appropriate mixtures thereof are used. The reaction temperature is appropriately selected from a range known to be usable for a protein bond formation reaction, and is usually appropriately selected from a range of about -20 ° C to 50 ° C. The activated amino acid derivative is usually used in a 1.5 to 4-fold excess. As a result of the test using the ninhydrin reaction, when the condensation is insufficient, sufficient condensation can be performed by repeating the condensation reaction without removing the protecting group. When sufficient condensation cannot be obtained even by repeating the reaction, unreacted amino acids can be acetylated using acetic anhydride or acetylimidazole to prevent the subsequent reaction from being affected.
[0015]
Examples of the protecting group for the amino group of the starting material include Z, Boc, t-pentyloxycarbonyl, isobornyloxycarbonyl, 4-methoxybenzyloxycarbonyl, Cl-Z, Br-Z, adamantyloxycarbonyl, trifluoroacetyl , Phthaloyl, formyl, 2-nitrophenylsulfenyl, diphenylphosphinothioyl, Fmoc and the like.
The carboxyl group may be, for example, a linear, branched or cyclic alkyl ester such as an alkyl esterified ester (eg, methyl, ethyl, propyl, butyl, t-butyl, cyclopentyl, cyclohexyl, cycloheptyl, cyclooctyl, 2-adamantyl). ), Aralkyl esterification (eg, benzyl ester, 4-nitrobenzyl ester, 4-methoxybenzyl ester, 4-chlorobenzyl ester, benzhydryl esterification), phenacyl esterification, benzyloxycarbonylhydrazide, t-butoxy It can be protected by carbonyl hydrazide, trityl hydrazide and the like.
The hydroxyl group of serine can be protected, for example, by esterification or etherification. Suitable groups for this esterification include, for example, lower (C 1-6 A) Groups derived from carbonic acid such as an aroyl group such as an alkanoyl group and a benzoyl group, and a benzyloxycarbonyl group and an ethoxycarbonyl group. Examples of the group suitable for etherification include a benzyl group, a tetrahydropyranyl group, and a t-butyl group.
Examples of the protecting group for the phenolic hydroxyl group of tyrosine include Bzl, Cl 2 -Bzl, 2-nitrobenzyl, Br-Z, t-butyl and the like are used.
As the imidazole protecting group for histidine, for example, Tos, 4-methoxy-2,3,6-trimethylbenzenesulfonyl, DNP, benzyloxymethyl, Bum, Boc, Trt, Fmoc and the like are used.
[0016]
Examples of the activated carboxyl group of the raw material include, for example, a corresponding acid anhydride, azide, active ester [alcohol (eg, pentachlorophenol, 2,4,5-trichlorophenol, 2,4-dinitrophenol, Cyanomethyl alcohol, paranitrophenol, HONB, N-hydroxysuccinimide, N-hydroxyphthalimide, and an ester with HOBt). As the activated amino group of the raw material, for example, a corresponding phosphoric amide is used.
As a method for removing (eliminating) the protecting group, for example, catalytic reduction in a hydrogen stream in the presence of a catalyst such as Pd-black or Pd-carbon, or hydrogen fluoride anhydride, methanesulfonic acid, trifluoromethane, etc. Acid treatment with dichloromethane, trifluoroacetic acid or a mixture thereof, base treatment with diisopropylethylamine, triethylamine, piperidine, piperazine, etc., reduction with sodium in liquid ammonia, and the like are also used. The elimination reaction by the above acid treatment is generally performed at a temperature of about -20 ° C to 40 ° C. In the acid treatment, for example, anisole, phenol, thioanisole, metacresol, paracresol, dimethylsulfide, 1,4 -Addition of a cation scavenger such as butanedithiol, 1,2-ethanedithiol and the like is effective. Further, the 2,4-dinitrophenyl group used as an imidazole protecting group of histidine is removed by thiophenol treatment, and the formyl group used as an indole protecting group of tryptophan is the above 1,2-ethanedithiol, 1,4-butane. In addition to deprotection by acid treatment in the presence of dithiol or the like, it is also removed by alkali treatment with dilute sodium hydroxide solution, dilute ammonia or the like.
[0017]
The protection of functional groups that should not be involved in the reaction of the raw materials, the elimination of the protective groups and the activation of the functional groups involved in the reaction are performed by known means, and the protective groups used are appropriately selected and applied from known groups. Is done.
As another method for obtaining an amide form of a protein or a partial peptide, for example, after amidating and protecting the α-carboxyl group of the carboxy terminal amino acid, a peptide (protein) chain is added to the amino group side to a desired chain length. After the elongation, a protein or partial peptide from which only the protecting group for the N-terminal α-amino group of the peptide chain has been removed and a protein or partial peptide from which only the protecting group for the C-terminal carboxyl group has been removed, and these are produced. The protein or peptide is condensed in a mixed solvent as described above. Details of the condensation reaction are the same as described above. After purifying the protected protein or peptide obtained by the condensation, all the protecting groups are removed by the above-mentioned method to obtain a desired crude protein or peptide. This crude protein or peptide is purified by various known purification means, and the main fraction is lyophilized to obtain an amide of the desired protein or peptide.
In order to obtain an ester of a protein or peptide, for example, after condensing the α-carboxyl group of the carboxy terminal amino acid with a desired alcohol to form an amino acid ester, the desired protein or An ester of the peptide can be obtained.
[0018]
The partial peptide or a salt thereof used in the present invention can be produced according to a known peptide synthesis method or by cleaving a protein used in the present invention with an appropriate peptidase. As a method for synthesizing a peptide, for example, any of a solid phase synthesis method and a liquid phase synthesis method may be used. That is, the partial peptide or amino acid that can constitute the partial peptide used in the present invention is condensed with the remaining portion, and when the product has a protecting group, the protecting group is eliminated to produce the target peptide. it can. Known condensation methods and elimination of protecting groups include, for example, the methods described in the following (i) to (v).
(I) M.I. Bodanszky and M.A. A. Ondetti, Peptide Synthesis, Interscience Publishers, New York (1966)
(Ii) Schroeder and Luebke, The Peptide, Academic Press, New York (1965)
(Iii) Nobuo Izumiya et al., Basics and Experiments of Peptide Synthesis, Maruzen Co., Ltd. (1975)
(Iv) Haruaki Yajima and Shunpei Sakakibara, Biochemistry Laboratory Course 1, Protein Chemistry IV,
205, (1977)
(V) Supervisor of Haruaki Yajima, Development of Continuing Drugs, Volume 14, Peptide Synthesis, Hirokawa Shoten
After the reaction, the partial peptide used in the present invention can be purified and isolated by a combination of ordinary purification methods such as solvent extraction, distillation, column chromatography, liquid chromatography, and recrystallization. When the partial peptide obtained by the above method is a free form, it can be converted to an appropriate salt by a known method or a method analogous thereto, and conversely, when the partial peptide is obtained as a salt, a known method or analogous method It can be converted into a free form or another salt by a method.
[0019]
The polynucleotide encoding the protein used in the present invention may be any polynucleotide as long as it contains the above-described nucleotide sequence encoding the protein used in the present invention. Preferably it is DNA. The DNA may be any of genomic DNA, genomic DNA library, cDNA derived from the above-described cells / tissues, cDNA library derived from the aforementioned cells / tissues, and synthetic DNA.
The vector used for the library may be any of bacteriophage, plasmid, cosmid, phagemid and the like. Alternatively, amplification can be performed directly by Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction (hereinafter abbreviated as RT-PCR method) using a total RNA or mRNA fraction prepared from the above-described cells / tissues.
The DNA encoding the protein used in the present invention includes, for example, (i) a DNA containing the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 2 or a condition that is highly stringent with the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 2 A DNA encoding a protein containing a base sequence that hybridizes below and having substantially the same properties as a protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, (ii) represented by SEQ ID NO: 22 Or a protein containing a nucleotide sequence that hybridizes under high stringent conditions to the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 22, and comprising the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 DNA encoding a protein having substantially the same properties as (iii) DN containing a base sequence represented by SEQ ID NO: 24 Or a nucleotide sequence that hybridizes with the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 24 under high stringency conditions, and is substantially the same as a protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 23. (Iv) a DNA containing the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 36, or a nucleotide sequence hybridizing under high stringent conditions to the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 36 And any DNA that encodes a protein having substantially the same properties as the protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 23.
[0020]
Examples of the DNA that can hybridize with the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 22 under high stringency conditions include, for example, a nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 22 and about 60 nucleotides. % Or more, preferably about 70% or more, preferably about 80% or more, and most preferably about 95% or more.
Examples of the DNA that can hybridize with the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 24 or SEQ ID NO: 36 under high stringency conditions include, for example, the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 24 or SEQ ID NO: 36 and % Or more, preferably about 60% or more, preferably about 70% or more, preferably about 80% or more, and most preferably about 95% or more.
Hybridization can be performed according to a known method or a method analogous thereto, for example, the method described in Molecular Cloning 2nd (J. Sambrook et al., Cold Spring Harbor Lab. Press, 1989). When a commercially available library is used, it can be performed according to the method described in the attached instruction manual. More preferably, it can be performed under high stringent conditions.
The high stringent conditions are, for example, conditions in which the sodium concentration is about 19 to 40 mM, preferably about 19 to 20 mM, and the temperature is about 50 to 70 ° C, preferably about 60 to 65 ° C. In particular, the case where the sodium concentration is about 19 mM and the temperature is about 65 ° C. is most preferable.
[0021]
The polynucleotide encoding the partial peptide of the present invention may be any polynucleotide as long as it contains the above-described nucleotide sequence encoding the partial peptide of the present invention. Preferably it is DNA. The DNA may be any of genomic DNA, genomic DNA library, cDNA derived from the above-described cells / tissues, cDNA library derived from the aforementioned cells / tissues, and synthetic DNA.
Examples of the polynucleotide encoding the partial peptide of the present invention include: (1) a polynucleotide containing a part of the polynucleotide containing the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 22, (2) a sequence Contains a nucleotide sequence that hybridizes with the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 22 under high stringency conditions, and is substantially the same as a protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 (3) a polynucleotide containing a part of a polynucleotide containing a nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 24 or SEQ ID NO: 36, or (4) the base sequence represented by SEQ ID NO: 24 or SEQ ID NO: 36 and high stringency Containing a portion of a polynucleotide encoding a protein having a nucleotide sequence that hybridizes under simple conditions and having substantially the same activity as a protein having an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 23 Are used.
The polynucleotide capable of hybridizing with the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 22, and the polynucleotide capable of hybridizing with the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 24 or SEQ ID NO: 36 are as defined above. Show.
The same hybridization method and high stringency conditions as described above are used.
[0022]
As a means for cloning a DNA that completely encodes the protein or partial peptide of the present invention (hereinafter, in the description of the cloning and expression of DNAs encoding them, these may be simply abbreviated to the protein of the present invention), Amplification by the PCR method using a synthetic DNA primer containing a part of the nucleotide sequence encoding the protein of the present invention, or a DNA fragment encoding a part or the whole region of the protein of the present invention by incorporating DNA incorporated in an appropriate vector Alternatively, selection by hybridization with a substance labeled with a synthetic DNA can be mentioned. Hybridization can be performed, for example, according to the method described in Molecular Cloning 2nd (J. Sambrook et al., Cold Spring Harbor Lab. Press, 1989). When a commercially available library is used, it can be performed according to the method described in the attached instruction manual.
Substitution of a DNA base sequence can be performed by PCR or a known kit, for example, Mutan. TM -Super Express Km (Takara Shuzo), Mutan TM Using -K (Takara Shuzo) or the like, it can be carried out according to a known method such as the ODA-LA PCR method, the Gapped Duplex method, the Kunkel method, or a method analogous thereto.
The cloned DNA encoding the protein of the present invention can be used as it is depending on the purpose, or may be used after digesting with a restriction enzyme or adding a linker, if desired. The DNA may have ATG as a translation initiation codon at the 5 'end and TAA, TGA or TAG as a translation termination codon at the 3' end. These translation initiation codon and translation termination codon can also be added using an appropriate synthetic DNA adapter.
The expression vector for the protein of the present invention is, for example, (a) cutting out a target DNA fragment from, for example, cDNA containing a DNA encoding the protein of the present invention, and (b) converting the DNA fragment into an appropriate expression vector. It can be produced by ligating downstream of the promoter.
[0023]
Examples of the vector include plasmids derived from Escherichia coli (eg, pBR322, pBR325, pUC12, pUC13), plasmids derived from Bacillus subtilis (eg, pUB110, pTP5, pC194), plasmids derived from yeast (eg, pSH19, pSH15), λ phage and the like. In addition to animal viruses such as bacteriophage, retrovirus, vaccinia virus, and baculovirus, pA1-11, pXT1, pRc / CMV, pRc / RSV, pcDNAI / Neo, and the like are used.
The promoter used in the present invention may be any promoter as long as it is appropriate for the host used for gene expression. For example, when an animal cell is used as a host, SRα promoter, SV40 promoter, LTR promoter, CMV promoter, HSV-TK promoter and the like can be mentioned.
Of these, it is preferable to use a CMV (cytomegalovirus) promoter, SRα promoter, or the like. When the host is Escherichia, trp promoter, lac promoter, recA promoter, λP L Promoter, lpp promoter, T7 promoter, etc., when the host is Bacillus, SPO1 promoter, SPO2 promoter, penP promoter, etc., and when the host is yeast, PHO5 promoter, PGK promoter, GAP promoter, ADH promoter, etc. Is preferred. When the host is an insect cell, a polyhedrin promoter, a P10 promoter and the like are preferable.
[0024]
In addition to the above, an expression vector containing an enhancer, a splicing signal, a polyA addition signal, a selection marker, an SV40 replication origin (hereinafter sometimes abbreviated as SV40 ori), and the like may be used, if desired. it can. Examples of the selectable marker include a dihydrofolate reductase (hereinafter sometimes abbreviated as dhfr) gene [methotrexate (MTX) resistance] and an ampicillin resistance gene (hereinafter Amp). r Neomycin resistance gene (hereinafter Neo). r G418 resistance). In particular, when the dhfr gene is used as a selection marker using Chinese hamster cells deficient in dhfr gene, the target gene can be selected using a thymidine-free medium.
If necessary, a signal sequence suitable for the host is added to the N-terminal side of the protein of the present invention. When the host is Escherichia, the PhoA signal sequence, OmpA signal sequence, etc., when the host is Bacillus, α-amylase signal sequence, subtilisin signal sequence, etc., and when the host is yeast, When the host is an animal cell, an insulin signal sequence, an α-interferon signal sequence, an antibody molecule signal sequence, etc. can be used, respectively.
A transformant can be produced using the vector containing the DNA encoding the protein of the present invention thus constructed.
[0025]
As the host, for example, Escherichia, Bacillus, yeast, insect cells, insects, animal cells and the like are used.
Specific examples of the genus Escherichia include, for example, Escherichia coli K12.DH1 [Procedures of the National Academy of Sciences of the USA (Proc. Natl. Acad. Sci. USA), 60, 160 (1968)], JM103 [Nucleic Acids Research, 9, 309 (1981)], JA221 [Journal of Molecular Biology (Journal of Molecular Biology)]. Molecular Biology, 120, 517 (1978)], HB101 [Journal of Molecular Biology, 41, 459 (1969)], C600 [Genete Box (Genetics), 39 vol., 440 (1954)], etc..
Examples of Bacillus bacteria include, for example, Bacillus subtilis MI114 [Gene, 24, 255 (1983)], 207-21 [Journal of Biochemistry, 95, 87 (1984)]. )] Is used.
Examples of yeast include, for example, Saccharomyces cerevisiae AH22, AH22R , NA87-11A, DKD-5D, 20B-12, Schizosaccharomyces pombe NCYC1913, NCYC2036, Pichia pastoris KM71 and the like.
[0026]
When the virus is AcNPV, for example, when the virus is AcNPV, a cell line derived from a larva of night roth moth (Spodoptera frugiperda cell; Sf cell), MG1 cell derived from the midgut of Trichoplusia ni, and Hig derived from Trichoplusia ni egg. TM Cells, cells derived from Mamestra brassicae, cells derived from Estigmena acrea, and the like are used. When the virus is BmNPV, a silkworm-derived cell line (Bombyx mori N cell; BmN cell) or the like is used. As the Sf cells, for example, Sf9 cells (ATCC CRL 1711), Sf21 cells (Vaughn, JL, et al., In Vivo, 13, 213-217, (1977)) and the like are used. .
As insects, for example, silkworm larvae and the like are used [Maeda et al., Nature, 315, 592 (1985)].
Examples of animal cells include monkey cells COS-7, Vero, Chinese hamster cells CHO (hereinafter abbreviated as CHO cells), and dhfr gene-deficient Chinese hamster cells CHO (hereinafter CHO (dhfr). ) Cells), mouse L cells, mouse AtT-20, mouse myeloma cells, rat GH3, human FL cells, and the like.
In order to transform Escherichia sp., For example, Procesings of the National Academy of Sciences of the USA (Proc. Natl. Acad. Sci. USA), Vol. 69, 2110 ( 1972) and Gene, Vol. 17, 107 (1982).
[0027]
Transformation of Bacillus spp. Can be performed, for example, according to the method described in Molecular & General Genetics, Vol. 168, 111 (1979).
In order to transform yeast, for example, Methods in Enzymology, 194, 182-187 (1991), Processings of the National Academy of Sciences of Science -The USA (Proc. Natl. Acad. Sci. USA), Vol. 75, 1929 (1978).
Insect cells or insects can be transformed, for example, according to the method described in Bio / Technology (Bio / Technology, 6, 47-55 (1988)).
To transform animal cells, for example, see Cell Engineering Separate Volume 8, New Cell Engineering Experiment Protocol. 263-267 (1995) (published by Shujunsha), Virology, Vol. 52, 456 (1973).
Thus, a transformant transformed with the expression vector containing the DNA encoding the protein can be obtained.
When culturing a transformant whose host is a genus Escherichia or Bacillus, a liquid medium is suitable as a medium used for the culturing, and a carbon source necessary for growth of the transformant is used therein. Nitrogen sources, inorganic substances, etc. are included. As a carbon source, for example, glucose, dextrin, soluble starch, sucrose, etc., as a nitrogen source, for example, ammonium salts, nitrates, corn steep liquor, peptone, casein, meat extract, soybean meal, potato extract and the like Examples of the inorganic or organic substance and the inorganic substance include calcium chloride, sodium dihydrogen phosphate, and magnesium chloride. In addition, yeast extract, vitamins, growth promoting factors and the like may be added. The pH of the medium is preferably about 5 to 8.
[0028]
Examples of a medium for culturing Escherichia include, for example, an M9 medium containing glucose and casamino acid [Miller, Journal of Experiments in Molecular Genetics]. , 431-433, Cold Spring Harbor Laboratory, New York 1972]. If necessary, an agent such as 3β-indolylacrylic acid can be added in order to make the promoter work efficiently.
When the host is a bacterium belonging to the genus Escherichia, the cultivation is usually performed at about 15 to 43 ° C. for about 3 to 24 hours, and if necessary, aeration and stirring can be added.
When the host is a bacterium belonging to the genus Bacillus, the cultivation is usually carried out at about 30 to 40 ° C. for about 6 to 24 hours, and if necessary, aeration and stirring may be added.
When culturing a transformant in which the host is yeast, for example, Burkholder's minimum medium [Bostian, K. et al. L. Procurings of the National Academy of Sciences of the USA (Proc. Natl. Acad. Sci. USA), 77, 4505 (1980)] and 0.5% casamino acid. SD medium containing [Bitter, G .; A. Processing of the National Academy of Sciences of the USA (Proc. Natl. Acad. Sci. USA), 81, 5330 (1984)]. Preferably, the pH of the medium is adjusted to about 5-8. The cultivation is usually performed at about 20 ° C. to 35 ° C. for about 24 to 72 hours, and if necessary, aeration and stirring are added.
When culturing an insect cell or a transformant whose host is an insect, the culture medium is immobilized on Grace's Insect Medium (Grace, TCC, Nature, 195, 788 (1962)). For example, those to which an additive such as 10% bovine serum or the like is appropriately added are used. The pH of the medium is preferably adjusted to about 6.2 to 6.4. The cultivation is usually performed at about 27 ° C. for about 3 to 5 days, and if necessary, aeration or stirring is added.
When culturing a transformant in which the host is an animal cell, examples of the medium include a MEM medium containing about 5 to 20% fetal bovine serum [Science, Vol. 122, 501 (1952)], a DMEM medium. [Virology, 8, 396 (1959)], RPMI 1640 medium [The Journal of the American Medical Association], 199, 519 (1967), 199 medium. [Proceding of the Society for the Biological Medicine, Vol. 73, 1 (195) [Proceding of the Society for the Biological Medicine] )] And the like can be used. Preferably, the pH is between about 6 and 8. The cultivation is usually performed at about 30 ° C. to 40 ° C. for about 15 to 60 hours, and if necessary, aeration and stirring are added.
As described above, the protein of the present invention can be produced in cells, cell membranes or extracellular cells of the transformant.
[0029]
The protein of the present invention can be separated and purified from the culture by, for example, the following method.
When extracting the protein of the present invention from cultured cells or cells, the cells or cells are collected by a known method after culturing, suspended in an appropriate buffer, and subjected to sonication, lysozyme and / or freeze-thawing. After the cells or cells are destroyed by the method, a method of obtaining a crude extract of the protein by centrifugation or filtration is used as appropriate. In a buffer, a protein denaturant such as urea or guanidine hydrochloride, or Triton X-100 is used. TM And the like. When the protein is secreted into the culture solution, after the culture, the supernatant is separated from the cells or cells by a known method, and the supernatant is collected.
The protein contained in the thus obtained culture supernatant or extract can be purified by appropriately combining known separation and purification methods. These known separation and purification methods include methods utilizing solubility such as salting out and solvent precipitation, dialysis, ultrafiltration, gel filtration, and SDS-polyacrylamide gel electrophoresis, mainly molecular weight. Using differences in charge, methods using charge differences such as ion exchange chromatography, methods using specific affinity such as affinity chromatography, and using differences in hydrophobicity such as reversed-phase high-performance liquid chromatography A method utilizing a difference between isoelectric points, such as an isoelectric focusing method, is used.
[0030]
When the protein thus obtained is obtained in a free form, it can be converted to a salt by a known method or a method analogous thereto, and conversely, when the protein is obtained in the form of a salt, the known method or analogous method Depending on the method, it can be converted into a free form or another salt.
The protein produced by the recombinant can be arbitrarily modified or the polypeptide can be partially removed by applying an appropriate protein modifying enzyme before or after purification. As the protein modifying enzyme, for example, trypsin, chymotrypsin, arginyl endopeptidase, protein kinase, glycosidase and the like are used.
The presence of the protein of the present invention thus produced can be measured by an enzyme immunoassay using a specific antibody, Western blotting, or the like.
[0031]
The antibody against the protein or partial peptide of the present invention or a salt thereof may be any of a polyclonal antibody and a monoclonal antibody as long as it can recognize the protein or partial peptide of the present invention or a salt thereof.
An antibody against the protein or partial peptide of the present invention or a salt thereof (hereinafter, these may be simply abbreviated as the protein of the present invention) using the protein of the present invention as an antigen, is a known antibody or It can be produced according to the method for producing antiserum.
[Preparation of monoclonal antibody]
(A) Preparation of monoclonal antibody-producing cells
The protein of the present invention is administered to a warm-blooded animal itself or together with a carrier and a diluent at a site capable of producing an antibody upon administration. Complete Freund's adjuvant or incomplete Freund's adjuvant may be administered in order to enhance the antibody-producing ability upon administration. The administration is usually performed once every 2 to 6 weeks, for a total of about 2 to 10 times. Examples of the warm-blooded animal used include monkeys, rabbits, dogs, guinea pigs, mice, rats, sheep, goats, and chickens, and mice and rats are preferably used.
When preparing monoclonal antibody-producing cells, a warm-blooded animal immunized with an antigen, for example, an individual having an antibody titer is selected from a mouse, and the spleen or lymph node is collected 2 to 5 days after the final immunization and contained in them. By fusing the antibody-producing cells thus obtained with myeloma cells of the same or different species, a monoclonal antibody-producing hybridoma can be prepared. The antibody titer in the antiserum can be measured, for example, by reacting a labeled protein described below with the antiserum, and then measuring the activity of a labeling agent bound to the antibody. The fusion operation can be performed according to a known method, for example, the method of Koehler and Milstein [Nature, 256, 495 (1975)]. Examples of the fusion promoter include polyethylene glycol (PEG) and Sendai virus, but PEG is preferably used.
[0032]
Examples of myeloma cells include myeloma cells of warm-blooded animals such as NS-1, P3U1, SP2 / 0, and AP-1, but P3U1 is preferably used. The preferred ratio between the number of antibody-producing cells (spleen cells) and the number of myeloma cells used is about 1: 1 to 20: 1, and PEG (preferably PEG1000 to PEG6000) is added at a concentration of about 10 to 80%. By incubating at 20 to 40 ° C, preferably 30 to 37 ° C for 1 to 10 minutes, cell fusion can be carried out efficiently.
Various methods can be used to screen for monoclonal antibody-producing hybridomas. For example, a hybridoma culture supernatant is added to a solid phase (eg, a microplate) on which a protein antigen is directly or adsorbed together with a carrier, and then radioactive substances or A method for detecting a monoclonal antibody bound to a solid phase by adding an anti-immunoglobulin antibody labeled with an enzyme or the like (an anti-mouse immunoglobulin antibody is used when cells used for cell fusion are mice) or protein A; A method in which a hybridoma culture supernatant is added to a solid phase to which globulin antibodies or protein A is adsorbed, a protein labeled with a radioactive substance, an enzyme, or the like is added, and a monoclonal antibody bound to the solid phase is detected.
The selection of monoclonal antibodies can be performed according to a known method or a method analogous thereto. Usually, it can be performed in a medium for animal cells to which HAT (hypoxanthine, aminopterin, thymidine) is added. As a selection and breeding medium, any medium can be used as long as a hybridoma can grow. For example, RPMI 1640 medium containing 1 to 20%, preferably 10 to 20% fetal bovine serum, GIT medium containing 1 to 10% fetal bovine serum (Wako Pure Chemical Industries, Ltd.) or serum-free for hybridoma culture A medium (SFM-101, Nissui Pharmaceutical Co., Ltd.) or the like can be used. The culturing temperature is usually 20 to 40 ° C, preferably about 37 ° C. The culture time is usually 5 days to 3 weeks, preferably 1 week to 2 weeks. The culture can be usually performed under 5% carbon dioxide gas. The antibody titer of the hybridoma culture supernatant can be measured in the same manner as the measurement of the antibody titer in the antiserum described above.
[0033]
(B) Purification of monoclonal antibody
Monoclonal antibodies can be separated and purified by known methods, for example, immunoglobulin separation and purification methods [eg, salting out method, alcohol precipitation method, isoelectric point precipitation method, electrophoresis method, absorption by ion exchanger (eg, DEAE)]. Desorption method, ultracentrifugation method, gel filtration method, antigen-binding solid phase or specific purification method in which only antibody is collected using an active adsorbent such as protein A or protein G and the bond is dissociated to obtain the antibody]. it can.
[0034]
(Preparation of polyclonal antibody)
The polyclonal antibody of the present invention can be produced according to a known method or a method analogous thereto. For example, a immunizing antigen (protein antigen) itself or a complex thereof with a carrier protein is formed, and a warm-blooded animal is immunized in the same manner as in the above-described method for producing a monoclonal antibody. It can be produced by collecting a substance and separating and purifying the antibody.
Regarding a complex of an immunizing antigen and a carrier protein used to immunize a warm-blooded animal, the type of carrier protein and the mixing ratio of the carrier and the hapten are such that the antibody is efficiently cross-linked to the hapten immunized by cross-linking with the carrier. If possible, any material may be cross-linked at any ratio. For example, bovine serum albumin, bovine thyroglobulin, hemocyanin and the like are used in a weight ratio of about 0.1 to 20, preferably about 1 to 20, relative to hapten 1. A method of coupling at a rate of ~ 5 is used. Various coupling agents can be used for coupling the hapten and the carrier, and glutaraldehyde, carbodiimide, a maleimide active ester, an active ester reagent containing a thiol group or a dithioviridyl group, or the like is used.
The condensation product is administered to a warm-blooded animal itself or together with a carrier or diluent at a site where antibody production is possible. Complete Freund's adjuvant or incomplete Freund's adjuvant may be administered in order to enhance the antibody-producing ability upon administration. The administration is usually performed once every about 2 to 6 weeks, about 3 to 10 times in total.
The polyclonal antibody can be collected from the blood, ascites, or the like, preferably from the blood of a warm-blooded animal immunized by the above method.
The measurement of the polyclonal antibody titer in the antiserum can be performed in the same manner as the measurement of the antibody titer in the antiserum described above. The polyclonal antibody can be separated and purified according to the same method for separating and purifying immunoglobulins as in the above-described method for separating and purifying a monoclonal antibody.
[0035]
It is complementary to or substantially complementary to the base sequence of DNA encoding the protein or partial peptide used in the present invention (hereinafter, these DNAs may be abbreviated as the DNA of the present invention in the description of antisense polynucleotide). As an antisense polynucleotide containing a base sequence or a part thereof that is complementary to the base sequence of the DNA of the present invention, a base sequence that is complementary to or substantially complementary to a base sequence or a part thereof, Any antisense polynucleotide may be used as long as it has an effect of suppressing the expression of the DNA. Antisense DNA is preferred.
The nucleotide sequence substantially complementary to the DNA of the present invention is, for example, about 70% of the total nucleotide sequence or a partial nucleotide sequence of the nucleotide sequence complementary to the DNA of the present invention (that is, the complementary strand of the DNA of the present invention). % Or more, preferably about 80% or more, more preferably about 90% or more, most preferably about 95% or more. In particular, of the entire base sequence of the complementary strand of the DNA of the present invention, about 70% or more of the complementary sequence of the base sequence of the portion encoding the N-terminal site of the protein of the present invention (for example, the base sequence near the start codon). Antisense polynucleotides having a homology of preferably about 80% or more, more preferably about 90% or more, and most preferably about 95% or more are suitable.
Specifically, an antisense comprising a nucleotide sequence complementary to or substantially complementary to the nucleotide sequence of the DNA containing the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 24, or a part thereof A polynucleotide, preferably, for example, an antisense polynucleotide containing a base sequence complementary to the base sequence of DNA containing the base sequence represented by SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 24, or a part thereof, and the like. .
The antisense polynucleotide is usually composed of about 10 to 40, preferably about 15 to 30 bases.
In order to prevent degradation by a hydrolase such as nuclease, a phosphate residue (phosphate) of each nucleotide constituting the antisense DNA may be, for example, a chemically modified phosphate residue such as phosphorothioate, methylphosphonate, or phosphorodithionate. It may be substituted. These antisense polynucleotides can be produced using a known DNA synthesizer or the like.
[0036]
According to the present invention, an antisense polynucleotide (nucleic acid) corresponding to the protein gene of the present invention, which can inhibit the replication or expression of the protein gene of the present invention, is cloned or encoded. It can be designed and synthesized based on the base sequence information of the DNA to be synthesized. Such a polynucleotide (nucleic acid) can hybridize with the RNA of the protein gene of the present invention and inhibit the synthesis or function of the RNA, or through the interaction with the protein-related RNA of the present invention. Thus, the expression of the protein gene of the present invention can be regulated and controlled. Polynucleotides that are complementary to a selected sequence of the protein-associated RNA of the present invention, and that can specifically hybridize with the protein-associated RNA of the present invention, can be used in vivo and in vitro to produce the protein gene of the present invention. It is useful for regulating and controlling the expression of, and also useful for treating or diagnosing diseases and the like. The term “corresponding” means having homology or being complementary to a specific sequence of nucleotides, base sequences or nucleic acids including genes. "Corresponding" between a nucleotide, base sequence or nucleic acid and a peptide (protein) usually refers to the amino acid of the peptide (protein) as directed by the nucleotide (nucleic acid) sequence or its complement. . 5 'end hairpin loop of protein gene, 5' end 6-base pair repeat, 5 'end untranslated region, polypeptide translation stop codon, protein coding region, ORF translation stop codon, 3' end untranslated region, 3 ' The terminal palindrome region and the 3'-end hairpin loop may be selected as preferred regions of interest, but any region within the protein gene may be selected as a target.
Regarding the relationship between the target nucleic acid and a polynucleotide complementary to at least a part of the target region, if the target nucleic acid can hybridize with the target region, the target nucleic acid is Can be said to be "antisense." Antisense polynucleotides include polynucleotides containing 2-deoxy-D-ribose, polynucleotides containing D-ribose, other types of polynucleotides that are N-glycosides of purine or pyrimidine bases, or Other polymers with non-nucleotide backbones (eg, commercially available protein nucleic acids and synthetic sequence-specific nucleic acid polymers) or other polymers containing special bonds, provided that the polymer is a base such as found in DNA or RNA And nucleotides having a configuration that allows base attachment). They can be double-stranded DNA, single-stranded DNA, double-stranded RNA, single-stranded RNA, and also DNA: RNA hybrids, and can also be unmodified polynucleotides (or unmodified oligonucleotides), or even known. Such as labeled, capped, methylated, one or more naturally-occurring nucleotides replaced by analogs, intramolecular nucleotides Modified, such as those having uncharged bonds (eg, methylphosphonates, phosphotriesters, phosphoramidates, carbamates, etc.), charged or sulfur-containing bonds (eg, phosphorothioates, phosphorodithioates, etc.) ), Such as proteins (nucleases, nuclease inhibitors, Those having side chain groups such as syn, antibody, signal peptide, poly-L-lysine, etc. and sugars (eg, monosaccharide), those having intercalating compounds (eg, acridine, psoralen) Containing chelating compounds (eg, metals, radioactive metals, boron, oxidizing metals, etc.), those containing alkylating agents, those having modified bonds (eg, α-anomeric nucleic acids) Etc.). Here, "nucleoside", "nucleotide", and "nucleic acid" may include not only those containing purine and pyrimidine bases but also those having other modified heterocyclic bases. Such modifications may include methylated purines and pyrimidines, acylated purines and pyrimidines, or other heterocycles. Modified nucleotides and modified nucleotides may also be modified at the sugar moiety, e.g., where one or more hydroxyl groups have been replaced by halogens, aliphatic groups, etc., or by functional groups such as ethers, amines, etc. It may have been converted.
The antisense polynucleotide (nucleic acid) of the present invention is RNA, DNA, or a modified nucleic acid (RNA, DNA). Specific examples of the modified nucleic acid include, but are not limited to, sulfur derivatives and thiophosphate derivatives of nucleic acids, and those that are resistant to degradation of polynucleoside amides and oligonucleoside amides. The antisense nucleic acid of the present invention can be preferably designed according to the following policy. That is, to make the antisense nucleic acid more stable in the cell, to make the antisense nucleic acid more cell permeable, to have a greater affinity for the target sense strand, and to be more toxic if it is toxic. Minimize the toxicity of sense nucleic acids.
A number of such modifications are known in the art, and Kawakami et al. , Pharm Tech Japan, Vol. 8, pp. 247, 1992; Vol. 8, pp. 395, 1992; T. Crooke et al. ed. , Antisense Research and Applications, CRC Press, 1993.
The antisense nucleic acid of the present invention may contain altered or modified sugars, bases or bonds, may be provided in a special form such as liposomes or microspheres, may be applied by gene therapy, It could be provided in an added form. Thus, in the form of addition, polycations such as polylysine which acts to neutralize the charge of the phosphate skeleton, lipids which enhance the interaction with the cell membrane or increase the uptake of nucleic acids ( For example, hydrophobic substances such as phospholipid and cholesterol can be mentioned. Preferred lipids for addition include cholesterol and its derivatives (eg, cholesteryl chloroformate, cholic acid, etc.). These can be attached to the 3 'end or 5' end of the nucleic acid, and can be attached via a base, sugar, or intramolecular nucleoside bond. Other groups include cap groups specifically arranged at the 3 ′ end or 5 ′ end of a nucleic acid for preventing degradation by nucleases such as exonuclease and RNase. Such capping groups include, but are not limited to, hydroxyl-protecting groups known in the art, including glycols such as polyethylene glycol and tetraethylene glycol.
The inhibitory activity of the antisense nucleic acid can be examined using the transformant of the present invention, the in vivo or in vitro gene expression system of the present invention, or the in vivo or in vitro translation system of the protein of the present invention. The nucleic acid can be applied to cells by various known methods.
[0037]
Hereinafter, a protein or partial peptide of the present invention or a salt thereof (hereinafter, sometimes abbreviated as the protein of the present invention), a DNA encoding the protein or partial peptide of the present invention (hereinafter abbreviated as a DNA of the present invention) In some cases), an antibody against the protein or partial peptide of the present invention or a salt thereof (hereinafter, may be abbreviated as the antibody of the present invention), and an antisense polynucleotide of the DNA of the present invention (hereinafter referred to as the antisense polynucleotide of the present invention). (Sometimes abbreviated as sense polynucleotide).
Since a drug containing a compound or a salt thereof that inhibits the activity of the protein of the present invention can suppress di- or tricarboxylic acid transport activity, for example, liver disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.) , Prostate disease (eg, prostatic hyperplasia, prostatitis, etc.), spleen disease (eg, hypersplenia, splenomegaly syndrome, etc.), kidney disease (eg, nephritis, renal failure, glomerulonephritis, diabetic nephropathy, Focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, etc.), metabolic disorders (eg, diabetes, hyperlipidemia, etc.), cardiovascular diseases (eg, arteriosclerosis, etc.) or cancers (eg, lung cancer, kidney cancer, Prophylactic / therapeutic agents such as liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, gastric cancer, bladder cancer, breast cancer, cervical cancer, colon cancer, rectal cancer, pancreatic cancer, etc., or preventive / suppressive agents for aging Can be used as
On the other hand, a medicament containing a compound or a salt thereof that promotes the activity of the protein of the present invention can promote di- or tricarboxylic acid transport activity, for example, a liver disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver). Disease), prostate disease (eg, benign prostatic hyperplasia, prostatitis, etc.), spleen disease (eg, hypersplenia, splenomegaly syndrome, etc.), kidney disease (eg, nephritis, renal failure, glomerulonephritis, diabetic Nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, etc.), metabolic disorders (eg, diabetes, hyperlipidemia, etc.), cardiovascular diseases (eg, arteriosclerosis, etc.) or cancers (eg, lung cancer, Prophylactic / therapeutic agents such as kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, stomach cancer, bladder cancer, breast cancer, cervical cancer, colon cancer, rectal cancer, pancreatic cancer, etc.), or prevention of aging・ Can be used as an inhibitor Kill.
[0038]
[1] A preventive / therapeutic agent for various diseases related to the protein of the present invention
The protein of the present invention has di- or tricarboxylic acid transport activity, contributes to transport of succinic acid, citric acid, malic acid, fumaric acid, α-ketoglutarate, and the like, and plays an important role in the metabolic reaction of cells. .
Therefore, when the DNA encoding the protein of the present invention is abnormal or deficient, or when the expression level of the protein of the present invention is reduced, for example, liver diseases (eg, cirrhosis, hepatitis, alcohol) Liver disease), prostate disease (eg, benign prostatic hyperplasia, prostatitis, etc.), spleen disease (eg, hypersplenia, splenomegaly syndrome, etc.), kidney disease (eg, nephritis, renal failure, glomerulonephritis, Diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, etc.), metabolic disorders (eg, diabetes, hyperlipidemia, etc.), cardiovascular diseases (eg, arteriosclerosis, etc.) or cancer (eg, Various diseases such as lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, gastric cancer, bladder cancer, breast cancer, cervical cancer, colon cancer, rectal cancer, pancreatic cancer, etc. Aging progresses.
Therefore, the protein of the present invention and the DNA of the present invention can be used, for example, for liver disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.), prostate disease (eg, prostatic hypertrophy, prostatitis, etc.), spleen disease (eg, Hypersplenism, splenomegaly syndrome, etc.), kidney disease (eg, nephritis, renal failure, glomerulonephritis, diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, etc.), metabolic disease (eg, , Diabetes, hyperlipidemia, etc.), cardiovascular diseases (eg, arteriosclerosis) or cancers (eg, lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, gastric cancer, bladder cancer, breast cancer) , Cervical cancer, colon cancer, rectal cancer, pancreatic cancer, etc.) and aging.
For example, when there is a patient in which the transport of di- or tricarboxylic acid is not sufficiently or normally exerted because the protein of the present invention is reduced or deleted in a living body, (a) the DNA of the present invention is transferred to the patient. By expressing the protein of the present invention in vivo, (ii) inserting the DNA of the present invention into cells, expressing the protein of the present invention, and then transplanting the cells into a patient. Alternatively, (c) the role of the protein of the present invention in the patient can be sufficiently or normally exerted by administering the protein of the present invention to the patient.
When the DNA of the present invention is used as the above-mentioned prophylactic / therapeutic agent, the DNA of the present invention is used alone or after being inserted into an appropriate vector such as a retrovirus vector, an adenovirus vector, an adenovirus associated virus vector, etc. Can be administered to humans or other warm-blooded animals according to The DNA of the present invention can be administered as it is or in the form of a formulation together with a physiologically acceptable carrier such as an auxiliary agent for promoting uptake, using a gene gun or a catheter such as a hydrogel catheter.
When the protein of the present invention is used as the above-mentioned prophylactic / therapeutic agent, it is preferable to use a protein purified to at least 90%, preferably 95% or more, more preferably 98% or more, and still more preferably 99% or more. preferable.
[0039]
The protein of the present invention can be used, for example, as a sugar-coated tablet, capsule, elixir, microcapsule, orally, or aseptic with water or other pharmaceutically acceptable liquids. It can be used parenterally in the form of injections, such as solutions or suspensions. For example, the protein of the present invention may be mixed with physiologically acceptable carriers, flavors, excipients, vehicles, preservatives, stabilizers, binders, and the like in the unit dosage form generally required for the practice of formulations. Can be manufactured by The amount of the active ingredient in these preparations is such that a proper dosage in the specified range can be obtained.
Examples of additives that can be incorporated into tablets, capsules, and the like include binders such as gelatin, corn starch, tragacanth, and acacia, excipients such as crystalline cellulose, corn starch, gelatin, and alginic acid. Useful bulking agents, lubricants such as magnesium stearate, sweeteners such as sucrose, lactose or saccharin, flavoring agents such as peppermint, reddish oil or cherry and the like are used. When the preparation unit form is a capsule, a liquid carrier such as oil and fat can be further contained in the above-mentioned type of material. Sterile compositions for injection can be formulated according to normal pharmaceutical practice such as dissolving or suspending the active substance in vehicles such as water for injection, and naturally occurring vegetable oils such as sesame oil, coconut oil and the like.
Aqueous liquids for injection include, for example, physiological saline, isotonic solutions containing glucose and other adjuvants (eg, D-sorbitol, D-mannitol, sodium chloride, etc.), and suitable solubilizing agents. For example, alcohols (eg, ethanol, etc.), polyalcohols (eg, propylene glycol, polyethylene glycol, etc.), nonionic surfactants (eg, polysorbate 80) TM , HCO-50, etc.). Examples of the oily liquid include sesame oil and soybean oil, and may be used in combination with solubilizers such as benzyl benzoate and benzyl alcohol. Also, buffers (eg, phosphate buffer, sodium acetate buffer, etc.), soothing agents (eg, benzalkonium chloride, procaine hydrochloride, etc.), stabilizers (eg, human serum albumin, polyethylene glycol, etc.), You may mix | blend with a preservative (for example, benzyl alcohol, phenol etc.), an antioxidant, etc. The prepared injection is usually filled in an appropriate ampoule.
The vector into which the DNA of the present invention has been inserted is also formulated in the same manner as described above, and is usually used parenterally.
[0040]
The preparation obtained in this way is safe and low toxic, and thus, for example, is useful for warm-blooded animals (eg, human, rat, mouse, guinea pig, rabbit, bird, sheep, pig, cow, horse, cat, dog, monkey). , Chimpanzees, etc.).
The dosage of the protein of the present invention varies depending on the target disease, the administration subject, the administration route, and the like. For example, when the protein of the present invention is orally administered for the treatment of liver disease, it is generally adult (60 kg). In this case, about 0.1 to 100 mg, preferably about 1.0 to 50 mg, more preferably about 1.0 to 20 mg of the protein or the like is administered per day. When administered parenterally, the single dose of the protein or the like varies depending on the administration subject, target disease, and the like. For example, the protein of the present invention is injected into an adult (body weight) for the treatment of liver disease. (As 60 kg), by injecting about 0.01 to 30 mg, preferably about 0.1 to 20 mg, more preferably about 0.1 to 10 mg of the protein or the like into the affected area per day. It is convenient to administer. In the case of other animals, the amount can be administered in terms of 60 kg.
[0041]
[2] Screening of drug candidate compounds for disease
The protein of the present invention is useful as a reagent for screening a compound or a salt thereof that promotes or inhibits the activity of the protein of the present invention.
The present invention relates to (1) a compound or a salt thereof which promotes or inhibits the activity (for example, transport of di- or tricarboxylic acid) of the protein of the present invention characterized by using the protein of the present invention (hereinafter referred to as an accelerator, respectively) , May be abbreviated as inhibitor). More specifically, for example,
(2) (i) transport of di- or tricarboxylic acid of a cell capable of producing the protein of the present invention and (ii) conversion of di- or tricarboxylic acid of a mixture of a cell capable of producing the protein of the present invention and a test compound. There is provided a method for screening for an enhancer or an inhibitor, which comprises comparing transport.
Specifically, in the above screening method, for example, in the cases (i) and (ii), the transport of di- or tricarboxylic acid is measured using a labeled substrate (eg, a fluorescently labeled or radiolabeled substrate). And a comparison is made as an index of transport of di- or tricarboxylic acid.
[0042]
Test compounds include, for example, peptides, proteins, non-peptidic compounds, synthetic compounds, fermentation products, cell extracts, plant extracts, animal tissue extracts, and the like. Or a known compound.
In order to carry out the above-mentioned screening method, cells having the ability to produce the protein of the present invention are prepared by suspending them in a buffer suitable for screening. The buffer may be any buffer that does not inhibit the transport of the di- or tricarboxylic acid of the protein of the present invention, such as a phosphate buffer or a borate buffer having a pH of about 4 to 10 (preferably, a pH of about 6 to 8). .
As a cell having the ability to produce the protein of the present invention, for example, a host (transformant) transformed with a vector containing the DNA encoding the protein of the present invention described above is used. As the host, for example, animal cells such as CHO cells are preferably used. For the screening, for example, a transformant in which the protein of the present invention is expressed on a cell membrane by culturing by the method described above is preferably used.
[0043]
The activity such as transport of di- or tricarboxylic acid can be measured according to a known method. J. Physiol. Cell. Physiol. 278, pages C1019-C1030, 2000 or a method analogous thereto.
For example, a test compound which promotes the transport of di- or tricarboxylic acid in the case (ii) above by about 20% or more, preferably 30% or more, more preferably about 50% or more as compared with the case (i). It can be selected as a compound or a salt thereof that promotes the activity of the protein of the present invention.
In addition, for example, the transport of di- or tricarboxylic acid in the case of (ii) is inhibited by about 20% or more, preferably 30% or more, more preferably about 50% or more, as compared with the case of (i). The test compound to be inhibited) can be selected as a compound that inhibits the activity of the protein of the present invention or a salt thereof.
Further, a gene such as secretory alkaline phosphatase or luciferase is inserted downstream of the promoter of the gene of the protein gene of the present invention, expressed in the above-mentioned various cells, and activates the enzyme activity when the test compound is brought into contact with the cells. Alternatively, a compound or a salt thereof that promotes or suppresses the expression of the protein of the present invention (that is, promotes or inhibits the activity of the protein of the present invention) can be screened by searching for a compound or a salt thereof that inhibits.
[0044]
The polynucleotide encoding the protein of the present invention is useful as a reagent for screening a compound or a salt thereof that promotes or inhibits the expression of the protein gene of the present invention.
The present invention relates to (3) a compound or a salt thereof which promotes or inhibits the expression of the protein gene of the present invention, which is characterized by using a polynucleotide encoding the protein of the present invention (hereinafter referred to as a promoter and an inhibitor, respectively). May be provided), more specifically, for example,
(4) A comparison is made between (iii) culturing cells capable of producing the protein of the present invention and (iv) culturing a mixture of cells capable of producing the protein of the present invention and a test compound. A method for screening for an accelerator or an inhibitor is provided.
In the above-mentioned screening method, for example, in the cases (iii) and (iv), the expression level of the protein gene of the present invention (specifically, the amount of the protein of the present invention or the amount of mRNA encoding the protein) is measured. And compare.
Test compounds include, for example, peptides, proteins, non-peptidic compounds, synthetic compounds, fermentation products, cell extracts, plant extracts, animal tissue extracts, and the like. Or a known compound.
In order to carry out the above-mentioned screening method, cells having the ability to produce the protein of the present invention are prepared by suspending them in a buffer suitable for screening. The buffer may be any buffer such as a phosphate buffer or a borate buffer having a pH of about 4 to 10 (preferably, a pH of about 6 to 8) as long as it does not inhibit the organic anion transport activity of the protein of the present invention.
As a cell having the ability to produce the protein of the present invention, for example, a host (transformant) transformed with a vector containing the DNA encoding the protein of the present invention described above is used. As the host, for example, animal cells such as CHO cells are preferably used. For the screening, for example, a transformant in which the protein of the present invention is expressed on a cell membrane by culturing by the method described above is preferably used.
The amount of the protein of the present invention can be measured by a known method, for example, using an antibody recognizing the protein of the present invention, and analyzing the protein present in a cell extract or the like by a method such as Western analysis, ELISA, or the like. It can be measured according to the method.
The expression level of the protein gene of the present invention can be determined by a known method, for example, a method such as Northern blotting, Reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR), a real-time PCR analysis system (manufactured by ABI, TaqMan polymerase chain reaction), or the like. It can be measured according to a corresponding method.
For example, a test in which the expression level of the protein gene of the present invention in the case of the above (iv) is promoted by about 20% or more, preferably 30% or more, more preferably about 50% or more as compared with the case of the above (iii). The compound can be selected as a compound that promotes the expression of the protein gene of the present invention or a salt thereof.
For example, a test that inhibits the expression level of the protein gene of the present invention in the case of the above (iv) by about 20% or more, preferably 30% or more, more preferably about 50% or more as compared with the case of the above (iii). The compound can be selected as a compound that inhibits the expression of the protein gene of the present invention or a salt thereof.
Furthermore, the antibody of the present invention is useful as a reagent for screening a compound or a salt thereof that promotes or inhibits the expression of the protein of the present invention.
The present invention relates to (5) a compound or a salt thereof which promotes or inhibits the expression of the protein of the present invention, which is characterized by using the antibody of the present invention (hereinafter sometimes abbreviated as a promoter or an inhibitor, respectively). Provide a screening method, more specifically, for example,
(6) A comparison is made between (v) culturing cells capable of producing the protein of the present invention and (vi) culturing a mixture of cells capable of producing the protein of the present invention and a test compound. A method for screening for an accelerator or an inhibitor is provided.
In the above screening method, for example, the expression level of the protein of the present invention (specifically, the protein level of the present invention) in the cases (v) and (vi) is measured using the antibody of the present invention (for example, The expression of the protein of the present invention is detected, the expression level of the protein of the present invention is quantified, and the like, and compared.
Test compounds include, for example, peptides, proteins, non-peptidic compounds, synthetic compounds, fermentation products, cell extracts, plant extracts, animal tissue extracts, and the like. Or a known compound.
In order to carry out the above-mentioned screening method, cells having the ability to produce the protein of the present invention are prepared by suspending them in a buffer suitable for screening. The buffer may be any buffer such as a phosphate buffer or a borate buffer having a pH of about 4 to 10 (preferably, a pH of about 6 to 8) as long as it does not inhibit the organic anion transport activity of the protein of the present invention.
As a cell having the ability to produce the protein of the present invention, for example, a host (transformant) transformed with a vector containing the DNA encoding the protein of the present invention described above is used. As the host, for example, animal cells such as CHO cells are preferably used. For the screening, for example, a transformant in which the protein of the present invention is expressed on a cell membrane by culturing by the method described above is preferably used.
The amount of the protein of the present invention can be measured by a known method, for example, using an antibody recognizing the protein of the present invention, and analyzing the protein present in a cell extract or the like by a method such as Western analysis, ELISA, or the like. It can be measured according to the method.
For example, a test compound that promotes the expression level of the protein of the present invention in the case of the above (vi) by about 20% or more, preferably 30% or more, more preferably about 50% or more as compared with the case of the above (v). Can be selected as a compound or its salt that promotes the expression of the protein of the present invention.
For example, a test compound that inhibits the expression level of the protein of the present invention in the case of the above (vi) by about 20% or more, preferably 30% or more, more preferably about 50% or more as compared with the above case (v). Can be selected as a compound that inhibits the expression of the protein of the present invention or a salt thereof.
[0045]
The screening kit of the present invention contains the protein or partial peptide of the present invention or a salt thereof, or a cell capable of producing the protein or partial peptide used in the present invention.
Compounds or salts thereof obtained by using the screening method or the screening kit of the present invention are test compounds described above, for example, peptides, proteins, non-peptide compounds, synthetic compounds, fermentation products, cell extracts, plant extracts. A compound selected from animal tissue extract, plasma, and the like, and a compound or a salt thereof that promotes or inhibits the activity (eg, transport of di- or tricarboxylic acid, etc.) of the protein of the present invention.
As the salt of the compound, those similar to the aforementioned salts of the protein of the present invention are used.
A compound or a salt thereof that promotes the activity of the protein of the present invention, a compound or a salt thereof that promotes the expression of the protein gene of the present invention, or a compound or a salt thereof that promotes the expression of the protein of the present invention may be, for example, a liver disease ( E.g., cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease), prostate disease (e.g., benign prostatic hyperplasia, prostatitis), spleen disease (e.g., hypersplenism, splenomegaly syndrome, etc.), kidney disease (e.g., nephritis, Renal failure, glomerulonephritis, diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, etc., metabolic diseases (eg, diabetes, hyperlipidemia, etc.), cardiovascular diseases (eg, arteriosclerosis) Or cancer (eg, lung, kidney, liver, non-small cell lung, ovarian, prostate, gastric, bladder, breast, cervical, colon, rectal, pancreatic, etc.) Prevention / treatment, or aging It is useful as a prophylactic or inhibitor.
Further, a compound or a salt thereof that inhibits the activity of the protein of the present invention, a compound or a salt thereof that inhibits the expression of the protein gene of the present invention, or a compound or a salt thereof that inhibits the expression of the protein of the present invention may be, for example, a liver. Disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.), prostate disease (eg, prostatic hyperplasia, prostatitis, etc.), spleen disease (eg, hypersplenism, splenomegaly syndrome, etc.), kidney disease (eg, Nephritis, renal failure, glomerulonephritis, diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, etc., metabolic diseases (eg, diabetes, hyperlipidemia, etc.), cardiovascular diseases (eg, Or atherosclerosis) or cancer (eg, lung, kidney, liver, non-small cell lung, ovarian, prostate, gastric, bladder, breast, cervical, colon, rectal, pancreatic, etc.) Prophylactic and therapeutic agents, It is useful as a prophylactic or inhibitor of aging.
[0046]
When the compound or its salt obtained by using the screening method or the screening kit of the present invention is used as the above-mentioned prophylactic / therapeutic agent or prophylactic / suppressive agent, it can be formulated according to a conventional method. For example, tablets, capsules, elixirs, microcapsules, sterile solutions, suspensions and the like can be used. The preparations obtained in this way are safe and low toxic, for example, human or warm-blooded animals (eg, mouse, rat, rabbit, sheep, pig, cow, horse, bird, cat, dog, monkey, chimpanzee, etc.) ) Can be administered orally or parenterally.
The dose of the compound or a salt thereof varies depending on its action, a target disease, an administration subject, an administration route, and the like.For example, a compound or a salt thereof that promotes the activity of the protein of the present invention for the treatment of liver disease is used. When administered orally, in general, for an adult (with a body weight of 60 kg), the compound or a salt thereof is used in an amount of about 0.1 to 100 mg, preferably about 1.0 to 50 mg, more preferably about 1.0 to 50 mg per day. Administer 20 mg. When administered parenterally, the single dose of the compound or a salt thereof varies depending on the administration subject, the target disease, and the like. For example, a compound or a compound that promotes the activity of the protein of the present invention for the purpose of treating liver disease or When the salt is generally administered to an adult (with a body weight of 60 kg) in the form of an injection, the compound or a salt thereof is about 0.01 to 30 mg, preferably about 0.1 to 20 mg, more preferably about 0.1 to 20 mg per day. It is convenient to administer about 0.1 to 10 mg by intravenous injection. In the case of other animals, the amount can be administered in terms of the weight per 60 kg.
[0047]
[3] Quantification of the protein of the present invention, its partial peptide or its salt
An antibody against the protein of the present invention (hereinafter sometimes abbreviated as the antibody of the present invention) can specifically recognize the protein of the present invention. It can be used for quantification by sandwich immunoassay and the like.
That is, the present invention
(I) reacting the antibody of the present invention with a test solution and a labeled protein of the present invention competitively, and measuring the ratio of the labeled protein of the present invention bound to the antibody; A method for quantifying the protein of the present invention in a test solution, and
(Ii) After reacting a test solution with the antibody of the present invention immobilized on a carrier and another labeled antibody of the present invention simultaneously or continuously, the activity of the labeling agent on the insolubilized carrier is measured. A method for quantifying the protein of the present invention in a test solution is provided.
In the quantitative method (ii), it is desirable that one antibody is an antibody that recognizes the N-terminal of the protein of the present invention and the other antibody is an antibody that reacts with the C-terminal of the protein of the present invention.
[0048]
Further, in addition to performing quantification of the protein of the present invention using a monoclonal antibody against the protein of the present invention (hereinafter sometimes referred to as the monoclonal antibody of the present invention), detection of the protein of the present invention by tissue staining or the like can be performed. You can also. For these purposes, the antibody molecule itself may be used, and the F (ab ') 2 , Fab ′ or Fab fraction may be used.
The method for quantifying the protein of the present invention using the antibody of the present invention is not particularly limited, and the antibody, antigen, or antibody-antigen complex corresponding to the amount of the antigen (eg, the amount of the protein) in the test solution is measured. Any measurement method may be used as long as the amount is detected by chemical or physical means, and the amount is calculated from a standard curve prepared using a standard solution containing a known amount of antigen. For example, nephelometry, competition method, immunometric method and sandwich method are suitably used, but it is particularly preferable to use the sandwich method described later in terms of sensitivity and specificity.
As a labeling agent used in a measuring method using a labeling substance, for example, a radioisotope, an enzyme, a fluorescent substance, a luminescent substance and the like are used. As the radioisotope, for example, [ 125 I], [ 131 I], [ 3 H], [ 14 C] is used. As the above-mentioned enzyme, a stable enzyme having a large specific activity is preferable. For example, β-galactosidase, β-glucosidase, alkaline phosphatase, peroxidase, malate dehydrogenase and the like are used. As the fluorescent substance, for example, fluorescamine, fluorescein isothiocyanate and the like are used. As the luminescent substance, for example, luminol, a luminol derivative, luciferin, lucigenin and the like are used. Further, a biotin-avidin system can be used for binding the antibody or antigen to the labeling agent.
[0049]
For the insolubilization of an antigen or an antibody, physical adsorption may be used, or a method using a chemical bond usually used for insolubilizing and immobilizing a protein or an enzyme may be used. Examples of the carrier include insoluble polysaccharides such as agarose, dextran, and cellulose; synthetic resins such as polystyrene, polyacrylamide, and silicon; and glass.
In the sandwich method, the test solution is reacted with the insolubilized monoclonal antibody of the present invention (primary reaction), and further reacted with another labeled monoclonal antibody of the present invention (secondary reaction). By measuring the activity of the labeling agent, the amount of the protein of the present invention in the test solution can be determined. The primary reaction and the secondary reaction may be performed in the reverse order, may be performed simultaneously, or may be performed at staggered times. The labeling agent and the method of insolubilization can be in accordance with those described above. In addition, in the immunoassay by the sandwich method, the antibody used for the solid phase antibody or the labeling antibody is not necessarily one kind, and a mixture of two or more kinds of antibodies is used for the purpose of improving measurement sensitivity and the like. You may.
In the method for measuring the protein of the present invention by the sandwich method of the present invention, as the monoclonal antibody of the present invention used in the primary reaction and the secondary reaction, an antibody having a different site to which the protein of the present invention binds is preferably used. That is, the antibody used in the primary reaction and the secondary reaction is preferably, for example, when the antibody used in the secondary reaction recognizes the C-terminal of the protein of the present invention, the antibody used in the primary reaction is preferably An antibody that recognizes, for example, the N-terminal other than the C-terminal is used.
[0050]
The monoclonal antibody of the present invention can be used in a measurement system other than the sandwich method, for example, a competition method, an immunometric method, a nephrometry, or the like.
In the competition method, after the antigen in the test solution and the labeled antigen are allowed to react competitively with the antibody, the unreacted labeled antigen (F) and the labeled antigen (B) bound to the antibody are separated. (B / F separation), the amount of any of B and F is measured, and the amount of antigen in the test solution is quantified. In this reaction method, a soluble antibody is used as the antibody, B / F separation is performed using polyethylene glycol, a liquid phase method using a second antibody against the antibody, or a solid phase antibody is used as the first antibody. A solid-phase method using a soluble antibody as the first antibody and using a solid-phased antibody as the second antibody is used.
In the immunometric method, the antigen in the test solution and the immobilized antigen are subjected to a competitive reaction with a fixed amount of the labeled antibody, and then the solid phase and the liquid phase are separated. And an excess amount of the labeled antibody, and then immobilized antigen is added to bind unreacted labeled antibody to the solid phase, and then the solid phase and the liquid phase are separated. Next, the amount of label in any phase is measured to determine the amount of antigen in the test solution.
In nephelometry, the amount of insoluble sediment produced as a result of an antigen-antibody reaction in a gel or in a solution is measured. Even when the amount of antigen in the test solution is small and only a small amount of sediment is obtained, laser nephrometry utilizing laser scattering is preferably used.
[0051]
In applying these individual immunological measurement methods to the quantification method of the present invention, no special conditions, operations, and the like need to be set. The protein measurement system of the present invention may be constructed by adding ordinary technical considerations of those skilled in the art to ordinary conditions and operation methods in each method. For details of these general technical means, reference can be made to reviews, books, and the like.
For example, Hiroe Irie, "Radio Immunoassay" (Kodansha, published in 1974), Hiroshi Irie, "Sequence Radioimmunoassay" (Kodansha, published in 1974), Eiji Ishikawa et al., "Enzyme Immunoassay" (Medical Shoin, Showa Ed. Ishikawa et al., "Enzyme Immunoassay" (2nd edition) (Issue Shoin, published in 1982), Eiji Ishikawa et al., "Enzyme Immunoassay" (3rd edition) (Medical Shoin, Showa) 62)), "Methods in ENZYMOLOGY" Vol. 70 (Immunochemical Techniques (Part A)), ibid., Vol. 73 (Immunochemical Technologies (Part B)), ibid., Vol. 74 (Immunochemical Technologies (Part C)), ibid., Vol. 84 (Immunochemical Technologies (Part D: Selected Immunoassays)), ibid., Vol. 92 (Immunochemical Techniques (Part E: Monoclonal Antibodies and General Immunoassay Methods)), ibid., Vol. 121 (Immunochemical Technologies (Part I: Hybridoma Technology and Monoclonal Antibodies)) (all published by Academic Press) can be referred to.
As described above, the protein of the present invention can be quantified with high sensitivity by using the antibody of the present invention.
Furthermore, when a decrease in the concentration of the protein of the present invention is detected by quantifying the concentration of the protein of the present invention using the antibody of the present invention, for example, liver disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver) Disease), prostate disease (eg, prostatic hypertrophy, prostatitis, etc.), spleen disease (eg, hypersplenia, splenomegaly syndrome, etc.), kidney disease (eg, nephritis, renal failure, glomerulonephritis, diabetic Nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, etc.), metabolic disorders (eg, diabetes, hyperlipidemia, etc.), cardiovascular diseases (eg, arteriosclerosis, etc.) or cancer (eg, lung cancer, Kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, stomach cancer, bladder cancer, breast cancer, cervical cancer, colon cancer, rectal cancer, pancreatic cancer, etc.), or advanced aging Can be diagnosed as early. When an increase in the concentration of the protein of the present invention is detected, for example, liver disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.), prostate disease (eg, benign prostatic hyperplasia, prostatitis, etc.), spleen disease (Eg, hypersplenism, splenomegaly syndrome, etc.), kidney disease (eg, nephritis, renal failure, glomerulonephritis, diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, etc.), metabolism Disease (eg, diabetes, hyperlipidemia, etc.), cardiovascular disease (eg, arteriosclerosis, etc.) or cancer (eg, lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, gastric cancer, bladder Cancer, breast cancer, cervical cancer, colon cancer, rectal cancer, pancreatic cancer, etc.), or it can be diagnosed that aging progresses rapidly.
Further, the antibody of the present invention can be used for detecting the protein of the present invention present in a subject such as a body fluid or a tissue. Further, for preparation of an antibody column used for purifying the protein of the present invention, detection of the protein of the present invention in each fraction at the time of purification, analysis of the behavior of the protein of the present invention in test cells, etc. Can be used.
[0052]
[4] Gene diagnostic agent
The DNA of the present invention can be used, for example, as a probe to produce a human or other warm-blooded animal (eg, rat, mouse, guinea pig, rabbit, bird, sheep, pig, cow, horse, cat, dog, monkey, chimpanzee). And the like) can be detected in DNA or mRNA encoding the protein of the present invention or a partial peptide thereof (gene abnormality), for example, damage, mutation or reduced expression of the DNA or mRNA, It is useful as a diagnostic agent for a gene such as increase in mRNA or overexpression.
The above-described genetic diagnosis using the DNA of the present invention can be carried out, for example, by the known Northern hybridization or PCR-SSCP method (Genomics, Vol. 5, pp. 874-879 (1989), Processings of the Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, Vol. 86, pp. 2766-2770 (1989), and the like, which can be performed by the National Academy of Sciences of USA (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America).
For example, when increased expression is detected by Northern hybridization, for example, liver disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.), prostate disease (eg, benign prostatic hyperplasia, prostatitis, etc.), spleen disease (eg, , Hypersplenism, splenomegaly syndrome, etc.), kidney disease (eg, nephritis, renal failure, glomerulonephritis, diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, etc.), metabolic disease ( E.g., diabetes, hyperlipidemia), cardiovascular disease (e.g., atherosclerosis) or cancer (e.g., lung, kidney, liver, non-small cell lung, ovarian, prostate, gastric, bladder, Breast cancer, cervical cancer, colon cancer, rectal cancer, pancreatic cancer, etc.), or it can be diagnosed that aging progresses quickly. In addition, when a decrease in expression is detected or a DNA mutation is detected by the PCR-SSCP method, for example, liver disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.), prostate disease (eg, prostate Hyperplasia, prostatitis, etc.), spleen disease (eg, hypersplenism, splenomegaly syndrome, etc.), kidney disease (eg, nephritis, renal failure, glomerulonephritis, diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, Nephrotic syndrome, renal edema, etc.), metabolic diseases (eg, diabetes, hyperlipidemia, etc.), cardiovascular diseases (eg, arteriosclerosis, etc.) or cancers (eg, lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer) , Ovarian cancer, prostate cancer, gastric cancer, bladder cancer, breast cancer, cervical cancer, colon cancer, rectal cancer, pancreatic cancer, etc.), or aging progresses rapidly.
[0053]
[5] A drug containing an antisense polynucleotide
The antisense polynucleotide of the present invention, which can complementarily bind to the DNA of the present invention and suppress the expression of the DNA, has low toxicity, and functions and activities of the protein of the present invention or the DNA of the present invention in vivo. (Eg, transport of di- or tricarboxylic acids, etc.), for example, liver disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.), prostate disease (eg, benign prostatic hyperplasia, prostatitis, etc.) , Spleen disease (eg, hypersplenism, splenomegaly syndrome, etc.), kidney disease (eg, nephritis, renal failure, glomerulonephritis, diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, etc.) ), Metabolic diseases (eg, diabetes, hyperlipidemia, etc.), cardiovascular diseases (eg, arteriosclerosis, etc.) or cancers (eg, lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, Gastric cancer, bladder cancer, It can be used cancer, cervical cancer, colon cancer, colorectal cancer, pancreatic cancer) agent for the prophylaxis or treatment of such, or as a prophylactic or inhibitor of aging.
When the above-mentioned antisense polynucleotide is used as the above-mentioned prophylactic / therapeutic agent, it can be formulated and administered according to a known method.
For example, when the antisense polynucleotide is used, the antisense polynucleotide is used alone or after insertion into an appropriate vector such as a retrovirus vector, an adenovirus vector, an adenovirus associated virus vector, and the like. (Eg, rats, rabbits, sheep, pigs, cows, cats, dogs, monkeys, etc.) can be administered orally or parenterally. The antisense polynucleotide can be administered as it is or in the form of a formulation together with a physiologically acceptable carrier such as an auxiliary agent for promoting uptake, and can be administered using a gene gun or a catheter such as a hydrogel catheter.
The dose of the antisense polynucleotide varies depending on the target disease, the administration subject, the administration route, and the like.For example, when the antisense polynucleotide of the present invention is locally administered to the liver for the purpose of treating a liver disease, it is generally used. For an adult (body weight 60 kg), about 0.1 to 100 mg of the antisense polynucleotide is administered per day.
Furthermore, the antisense polynucleotide can also be used as a diagnostic oligonucleotide probe for examining the presence or expression of the DNA of the present invention in tissues or cells.
[0054]
Further, the present invention provides
(1) a double-stranded RNA containing a part of the RNA encoding the protein of the present invention and its complementary RNA,
(2) a medicine comprising the double-stranded RNA,
(3) a ribozyme containing a part of RNA encoding the protein of the present invention,
(4) a medicine comprising the ribozyme,
(5) Also provided is an expression vector containing a gene (DNA) encoding the ribozyme.
Like the above-mentioned antisense polynucleotide, double-stranded RNA, ribozyme and the like can also destroy RNA transcribed from the DNA of the present invention or suppress the function thereof, and can be used in vivo for a protein or ribozyme used in the present invention. Since the function of the DNA used in the present invention can be suppressed, for example, liver disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.), prostate disease (eg, prostatic hyperplasia, prostatitis, etc.), spleen disease ( Eg, hypersplenism, splenomegaly syndrome), kidney disease (eg, nephritis, renal failure, glomerulonephritis, diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema), metabolic disease (Eg, diabetes, hyperlipidemia, etc.), cardiovascular disease (eg, arteriosclerosis, etc.) or cancer (eg, lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, gastric cancer, bladder , It can be used breast, cervical cancer, colon cancer, as an agent for preventing or treating such rectal cancer, pancreatic cancer, etc.).
The double-stranded RNA can be produced by designing based on the sequence of the polynucleotide of the present invention according to a known method (eg, Nature, 411, 494, 2001).
A ribozyme can be designed and produced based on the sequence of the polynucleotide of the present invention according to a known method (eg, TRENDS in Molecular Medicine, Vol. 7, pp. 221, 2001). For example, it can be produced by substituting a part of a known ribozyme sequence with a part of RNA encoding the protein of the present invention. As a part of the RNA encoding the protein of the present invention, a sequence in the vicinity of a consensus sequence NUX (where N represents all bases and X represents a base other than G) which can be cleaved by a known ribozyme, and the like are included. No.
When the above-mentioned double-stranded RNA or ribozyme is used as the above-mentioned prophylactic / therapeutic agent, it can be formulated and administered in the same manner as an antisense polynucleotide. The expression vector of (5) is used in the same manner as known gene therapy methods and the like, and used as the prophylactic / therapeutic agent.
[0055]
[6] Production of animals having the DNA of the present invention
The present invention relates to a non-protein having a DNA encoding an exogenous protein of the present invention (hereinafter abbreviated as the exogenous DNA of the present invention) or a mutant DNA thereof (sometimes abbreviated as the exogenous mutant DNA of the present invention). A human mammal is provided.
That is, the present invention
(1) a non-human mammal having the exogenous DNA of the present invention or a mutant DNA thereof,
(2) The animal according to (1) above, wherein the non-human mammal is a rodent.
(3) The animal according to (2), wherein the rodent is a mouse or a rat, and
(4) A recombinant vector or the like containing the exogenous DNA of the present invention or its mutant DNA and capable of being expressed in mammals is provided.
Non-human mammals having the exogenous DNA of the present invention or the mutant DNA thereof (hereinafter abbreviated as the DNA-transferred animal of the present invention) can be used for non-fertilized eggs, fertilized eggs, germ cells including spermatozoa and their progenitor cells, and the like. And preferably at the stage of embryonic development in non-human mammal development (more preferably at the stage of single cells or fertilized eggs and generally before the 8-cell stage), the calcium phosphate method, the electric pulse method, the lipofection method, the agglutination method, It can be produced by introducing a target DNA by a microinjection method, a particle gun method, a DEAE-dextran method, or the like. Further, by the DNA introduction method, the exogenous DNA of the present invention can be introduced into somatic cells, organs of living organisms, tissue cells, and the like, and used for cell culture, tissue culture, and the like. The DNA-transfected animal of the present invention can also be produced by fusing the above-mentioned germ cells with a known cell fusion method.
As the non-human mammal, for example, cow, pig, sheep, goat, rabbit, dog, cat, guinea pig, hamster, mouse, rat and the like are used. Among them, rodents, which are relatively short in ontogeny and biological cycle in terms of preparation of disease animal model systems, and are easy to breed, especially mice (for example, hybrids such as C57BL / 6 strain and DBA2 strain as pure strains) B6C3F as a system 1 System, BDF 1 System, B6D2F 1 Strain, BALB / c strain, ICR strain, etc.) or rat (eg, Wistar, SD etc.) is preferred.
"Mammals" in a recombinant vector that can be expressed in mammals include humans in addition to the above-mentioned non-human mammals.
[0056]
The exogenous DNA of the present invention refers to the DNA of the present invention once isolated and extracted from a mammal, not the DNA of the present invention originally possessed by a non-human mammal.
As the mutant DNA of the present invention, those having a mutation (for example, mutation) in the base sequence of the original DNA of the present invention, specifically, base addition, deletion, substitution with another base, etc. The resulting DNA or the like is used, and also includes abnormal DNA.
The abnormal DNA means a DNA that expresses an abnormal protein of the present invention, and for example, a DNA that expresses a protein that suppresses the function of the normal protein of the present invention is used.
The exogenous DNA of the present invention may be derived from a mammal that is the same or different from the animal of interest. When introducing the DNA of the present invention into a target animal, it is generally advantageous to use the DNA as a DNA construct linked downstream of a promoter capable of being expressed in animal cells. For example, when the human DNA of the present invention is introduced, DNAs derived from various mammals (eg, rabbits, dogs, cats, guinea pigs, hamsters, rats, mice, etc.) having the DNA of the present invention having high homology thereto are expressed. Highly expressing the DNA of the present invention by microinjecting a DNA construct (eg, vector, etc.) in which the human DNA of the present invention is bound downstream of various promoters that can be made into a fertilized egg of a target mammal, for example, a mouse fertilized egg. DNA-introduced mammals can be created.
[0057]
Examples of the expression vector of the protein of the present invention include plasmids derived from Escherichia coli, plasmids derived from Bacillus subtilis, plasmids derived from yeast, bacteriophages such as λ phage, retroviruses such as Moloney leukemia virus, animal viruses such as vaccinia virus or baculovirus. Are used. Among them, a plasmid derived from Escherichia coli, a plasmid derived from Bacillus subtilis or a plasmid derived from yeast is preferably used.
Examples of the promoter for controlling the DNA expression include, for example, (i) a promoter of a DNA derived from a virus (eg, simian virus, cytomegalovirus, Moloney leukemia virus, JC virus, breast cancer virus, poliovirus, etc.); ) Promoters derived from various mammals (human, rabbit, dog, cat, guinea pig, hamster, rat, mouse, etc.), for example, albumin, insulin II, uroplakin II, elastase, erythropoietin, endothelin, muscle creatine kinase, glial fibrillary acid Protein, glutathione S-transferase, platelet-derived growth factor β, keratins K1, K10 and K14, collagen types I and II, cyclic AMP-dependent protein kinase βI subunit, dyst Lophine, tartrate-resistant alkaline phosphatase, atrial natriuretic factor, endothelial receptor tyrosine kinase (commonly abbreviated as Tie2), sodium potassium adenosine 3 kinase (Na, K-ATPase), neurofilament light chain, metallothionein I and IIA, metalloproteinase 1 tissue inhibitor, MHC class I antigen (H-2L), H-ras, renin, dopamine β-hydroxylase, thyroid peroxidase (TPO), polypeptide chain elongation factor 1α (EF-1α), β Actin, α and β myosin heavy chains, myosin light chains 1 and 2, myelin basic protein, thyroglobulin, Thy-1, immunoglobulin, heavy chain variable region (VNP), serum amyloid P component, myoglobin, troponin C, blunt α-actin, preproenkephalin A, such as a promoter, such as vasopressin are used. Among them, a cytomegalovirus promoter capable of high expression throughout the body, a promoter of human polypeptide chain elongation factor 1α (EF-1α), human and chicken β-actin promoters, and the like are preferable.
The above vector preferably has a sequence that terminates transcription of the target mRNA in a DNA-transfected mammal (generally called a terminator). For example, a sequence of each DNA derived from a virus and from various mammals is used. Preferably, a simian virus SV40 terminator or the like is used.
[0058]
In addition, a splicing signal of each DNA, an enhancer region, a part of an intron of a eukaryotic DNA, and the like are placed 5 ′ upstream of the promoter region, between the promoter region and the translation region, or between the translation region for the purpose of further expressing the desired foreign DNA. It is also possible to connect 3 ′ downstream of the above depending on the purpose.
The normal translation region of the protein of the present invention can be obtained from liver, kidney, thyroid cells, fibroblast-derived DNA derived from humans or various mammals (eg, rabbits, dogs, cats, guinea pigs, hamsters, rats, mice, etc.) and commercially available DNAs. From a variety of genomic DNA libraries, or as a starting material, a complementary DNA prepared by known methods from RNA derived from liver, kidney, thyroid cells, and fibroblasts. In addition, a translation region obtained by mutating a translation region of a normal polypeptide obtained from the above-mentioned cells or tissues by a point mutagenesis method can be used for the exogenous abnormal DNA.
The translation region can be prepared as a DNA construct that can be expressed in an introduced animal by a usual DNA engineering technique in which the translation region is ligated downstream of the promoter and, if desired, upstream of the transcription termination site.
Introduction of the exogenous DNA of the present invention at the fertilized egg cell stage is ensured to be present in all germ cells and somatic cells of the target mammal. The presence of the exogenous DNA of the present invention in the germinal cells of the produced animal after the introduction of the DNA means that all progeny of the produced animal will retain the exogenous DNA of the present invention in all of the germ cells and somatic cells. means. The offspring of such animals that have inherited the exogenous DNA of the present invention have the exogenous DNA of the present invention in all of their germ cells and somatic cells.
The non-human mammal into which the exogenous normal DNA of the present invention has been introduced can be subcultured in a normal breeding environment as an animal having the DNA after confirming that the exogenous DNA is stably maintained by mating.
Introduction of the exogenous DNA of the present invention at the fertilized egg cell stage is ensured to be present in excess in all germ cells and somatic cells of the target mammal. Excessive presence of the exogenous DNA of the present invention in the germinal cells of the produced animal after DNA introduction means that all the offspring of the produced animal have the exogenous DNA of the present invention in all of their germinal and somatic cells. Means Progeny of such animals that have inherited the exogenous DNA of the present invention have an excess of the exogenous DNA of the present invention in all of their germinal and somatic cells.
By obtaining a homozygous animal having the introduced DNA on both homologous chromosomes and mating the male and female animals, all offspring can be bred to have the DNA in excess.
[0059]
The non-human mammal having the normal DNA of the present invention expresses the normal DNA of the present invention at a high level and promotes the function of the endogenous normal DNA to eventually cause hyperactivity of the protein of the present invention. Occasionally, it can be used as a disease model animal. For example, using the normal DNA-transfected animal of the present invention, it is possible to elucidate the pathological mechanism of the hyperactivity of the protein of the present invention and diseases associated with the protein of the present invention, and to examine a method for treating these diseases. It is possible.
Further, since the mammal into which the exogenous normal DNA of the present invention has been introduced has an increased symptom of the released protein of the present invention, it can be used for a screening test for a therapeutic drug for a disease associated with the protein of the present invention. .
On the other hand, a non-human mammal having the exogenous abnormal DNA of the present invention can be subcultured in an ordinary breeding environment as an animal having the DNA after confirming that the exogenous DNA is stably maintained by mating. Furthermore, the desired foreign DNA can be incorporated into the above-described plasmid and used as a source material. The DNA construct with the promoter can be prepared by a usual DNA engineering technique. Introduction of the abnormal DNA of the present invention at the fertilized egg cell stage is ensured to be present in all germ cells and somatic cells of the target mammal. The presence of the abnormal DNA of the present invention in the germinal cells of the produced animal after DNA transfer means that all the offspring of the produced animal have the abnormal DNA of the present invention in all of its germ cells and somatic cells. The progeny of such animals that have inherited the exogenous DNA of the present invention have the abnormal DNA of the present invention in all of their germinal and somatic cells. A homozygous animal having the introduced DNA on both homologous chromosomes is obtained, and by crossing these male and female animals, it is possible to breed the cells so that all offspring have the DNA.
[0060]
The non-human mammal having the abnormal DNA of the present invention, in which the abnormal DNA of the present invention is highly expressed, inhibits the function of endogenous normal DNA, and finally, the functionally inactive form of the protein of the present invention. It can be refractory and can be used as a model animal for the disease. For example, by using the abnormal DNA-introduced animal of the present invention, it is possible to elucidate the pathological mechanism of the function-inactive refractory of the protein of the present invention and to examine a method for treating this disease.
Further, as a specific possibility, the abnormal DNA-highly expressing animal of the present invention exhibits a function of inhibiting the normal protein function (dominant negative action) by the abnormal protein of the present invention in the inactive refractory disease of the protein of the present invention. A model to elucidate.
In addition, since the mammal into which the foreign abnormal DNA of the present invention has been introduced has an increased symptom of the released protein of the present invention, it can be used for a therapeutic drug screening test for the protein of the present invention or a functionally inactive refractory disease thereof. It is.
In addition, other possible uses of the two kinds of the DNA-introduced animals of the present invention include, for example,
(I) use as a cell source for tissue culture;
(Ii) a protein specifically expressed or activated by the protein of the present invention, by directly analyzing DNA or RNA in the tissue of the DNA-transfected animal of the present invention, or analyzing a polypeptide tissue expressed by the DNA; Analysis of the relationship with
(Iii) culturing cells of DNA-bearing tissue by standard tissue culture techniques and using them to study the function of cells from tissues that are generally difficult to culture;
(Iv) screening for an agent that enhances the function of the cell by using the cell described in (iii) above, and
(V) Isolation and purification of the mutant protein of the present invention and production of its antibody can be considered.
Furthermore, using the DNA-introduced animal of the present invention, it is possible to examine the clinical symptoms of diseases related to the protein of the present invention, including the inactive refractory disease of the protein of the present invention, etc. More detailed pathological findings in each organ of a disease model related to the disease can be obtained, which can contribute to the development of a new treatment method, and further to the research and treatment of a secondary disease caused by the disease.
In addition, it is possible to take out each organ from the DNA-introduced animal of the present invention, cut it into small pieces, and then use a proteolytic enzyme such as trypsin to obtain the released DNA-introduced cells, culture them, or systematize the cultured cells. . Furthermore, it is possible to examine the specificity of the protein-producing cell of the present invention, its relationship with apoptosis, differentiation or proliferation, or its signal transduction mechanism, and its abnormalities. It is an effective research material for
Further, in order to develop a therapeutic agent for a disease associated with the protein of the present invention, including a functionally inactive refractory type of the protein of the present invention, using the DNA-transfected animal of the present invention, It is possible to provide an effective and rapid screening method for a therapeutic agent for the disease by using a method or the like. In addition, using the DNA-introduced animal of the present invention or the exogenous DNA expression vector of the present invention, it is possible to examine and develop a DNA treatment method for a disease associated with the protein of the present invention.
[0061]
[7] Knockout animal
The present invention provides a non-human mammalian embryonic stem cell in which the DNA of the present invention has been inactivated, and a non-human mammal deficient in expression of the DNA of the present invention.
That is, the present invention
(1) a non-human mammalian embryonic stem cell in which the DNA of the present invention has been inactivated,
(2) The embryonic stem cell according to (1), wherein the DNA is inactivated by introducing a reporter gene (eg, a β-galactosidase gene derived from Escherichia coli).
(3) The embryonic stem cell according to (1), which is neomycin-resistant,
(4) the embryonic stem cell according to (1), wherein the non-human mammal is a rodent;
(5) The embryonic stem cell according to (4), wherein the rodent is a mouse,
(6) a non-human mammal deficient in expression of the DNA of the present invention, wherein the DNA is inactivated;
(7) The above (6), wherein the DNA is inactivated by introducing a reporter gene (eg, a β-galactosidase gene derived from Escherichia coli), and the reporter gene can be expressed under the control of a promoter for the DNA of the present invention. The non-human mammal of the description,
(8) the non-human mammal according to the above (6), wherein the non-human mammal is a rodent;
(9) The non-human mammal according to (8), wherein the rodent is a mouse, and
(10) A method for screening a compound or a salt thereof that promotes or inhibits promoter activity on DNA of the present invention, which comprises administering a test compound to the animal according to (7) and detecting the expression of a reporter gene. provide.
A non-human mammalian embryonic stem cell in which the DNA of the present invention has been inactivated is an artificially mutated DNA of the present invention possessed by the non-human mammal, which suppresses the expression ability of the DNA, or By substantially losing the activity of the protein of the present invention encoded by the DNA, the DNA does not substantially have the ability to express the protein of the present invention (hereinafter, may be referred to as the knockout DNA of the present invention). ) Non-human mammalian embryonic stem cells (hereinafter abbreviated as ES cells).
As the non-human mammal, the same one as described above is used.
[0062]
The method of artificially mutating the DNA of the present invention can be performed, for example, by deleting a part or all of the DNA sequence and inserting or substituting another DNA by a genetic engineering technique. With these mutations, the knockout DNA of the present invention may be prepared, for example, by shifting the codon reading frame or disrupting the function of the promoter or exon.
Specific examples of the non-human mammalian embryonic stem cells in which the DNA of the present invention has been inactivated (hereinafter abbreviated as the DNA-inactivated ES cells of the present invention or the knockout ES cells of the present invention) include, for example, The DNA of the present invention possessed by a non-human mammal is isolated, and its exon portion is a drug resistance gene represented by a neomycin resistance gene or a hygromycin resistance gene, or lacZ (β-galactosidase gene), cat (chloramphenicol acetyl). A reporter gene or the like typified by a transferase gene) to disrupt the exon function, or insert a DNA sequence that terminates gene transcription into an intron between exons (for example, a polyA addition signal); By making it impossible to synthesize complete mRNA, A DNA strand having a DNA sequence constructed so as to eventually disrupt the gene (hereinafter abbreviated as a targeting vector) is introduced into the chromosome of the animal by, for example, homologous recombination, and the resulting ES cells are used in the present invention. Analysis by Southern hybridization analysis using a DNA sequence on or in the vicinity of the DNA as a probe, or PCR using a DNA sequence on a targeting vector and a DNA sequence of a neighboring region other than the DNA of the present invention used for the preparation of the targeting vector as primers However, it can be obtained by selecting the knockout ES cells of the present invention.
[0063]
As the original ES cells for inactivating the DNA of the present invention by the homologous recombination method or the like, for example, those already established as described above may be used, or according to the known method of Evans and Kaufman. May be newly established. For example, in the case of mouse ES cells, currently, 129-line ES cells are generally used. For example, for the purpose of obtaining ES cells in which BDF is clearly known, for example, BDF in which the number of eggs collected by C57BL / 6 mice or C57BL / 6 has been improved by hybridization with DBA / 2 1 Mouse (F of C57BL / 6 and DBA / 2) 1 ) Can also be used favorably. BDF 1 In addition to the advantage that the number of eggs collected and the eggs are robust, the mice have C57BL / 6 mice as a background, and thus, the ES cells obtained using the C57BL / 6 mice were used to produce C57BL / 6 mice. / 6 mice can be advantageously used in that the genetic background can be replaced by C57BL / 6 mice by backcrossing.
In addition, when ES cells are established, blastocysts 3.5 days after fertilization are generally used. In addition, a large number of blastocysts can be efficiently obtained by collecting embryos at the 8-cell stage and culturing them until blastocysts are used. Early embryos can be obtained.
Either male or female ES cells may be used, but generally male ES cells are more convenient for producing a germline chimera. It is also desirable to discriminate between males and females as soon as possible in order to reduce cumbersome culture labor.
As a method for determining the sex of ES cells, for example, a method of amplifying and detecting a gene in a sex-determining region on the Y chromosome by a PCR method can be mentioned. If this method is used, it is conventionally necessary to perform about 10 karyotype analyses. 6 Since the number of ES cells is required, the number of ES cells of about 1 colony (approximately 50) is sufficient, so that primary selection of ES cells in the early stage of culture can be performed by discriminating between male and female. In addition, by enabling selection of male cells at an early stage, labor in the initial stage of culture can be significantly reduced.
[0064]
The secondary selection can be performed, for example, by confirming the number of chromosomes by the G-banding method. The number of chromosomes in the obtained ES cells is desirably 100% of the normal number. However, when it is difficult due to physical operations at the time of establishment, after knocking out the gene of the ES cells, the normal cells (for example, chromosomes in mice) are knocked out. It is desirable to clone again into cells (number 2n = 40).
The embryonic stem cell line obtained in this way usually has very good growth properties, but it must be carefully subcultured because it tends to lose its ontogenic ability. For example, on a suitable feeder cell such as STO fibroblast, in the presence of LIF (1-10000 U / ml) in a carbon dioxide incubator (preferably, 5% carbon dioxide, 95% air or 5% oxygen, 5% The cells are cultured by a method such as culturing at about 37 ° C. in carbon dioxide gas and 90% air. At the time of subculture, for example, a trypsin / EDTA solution (usually 0.001-0.5% trypsin / 0.1-5 mM EDTA, Preferably, a method is used in which cells are converted into single cells by treatment with about 0.1% trypsin / 1 mM EDTA and seeded on newly prepared feeder cells. Such subculture is usually performed every 1 to 3 days. At this time, it is desirable to observe the cells and, if any morphologically abnormal cells are found, discard the cultured cells.
ES cells are differentiated into various types of cells, such as parietal muscle, visceral muscle, and cardiac muscle, by monolayer culture up to high density or suspension culture until cell clumps are formed under appropriate conditions. [M. J. Evans and M.E. H. Kaufman, Nature, 292, 154, 1981; R. Martin Proc. Of National Academy of Sciences USA (Proc. Natl. Acad. Sci. USA) 78, 7634, 1981; C. Doetschman et al., Journal of Embryology and Experimental Morphology, Vol. 87, p. 27, 1985], that the DNA-deficient cell of the present invention obtained by differentiating the ES cell of the present invention is characterized by in vitro Is useful in cell biological studies of the protein of the present invention.
The non-human mammal deficient in DNA expression of the present invention can be distinguished from a normal animal by measuring the mRNA level of the animal using a known method and indirectly comparing the expression level.
As the non-human mammal, those similar to the aforementioned can be used.
[0065]
The non-human mammal deficient in expression of the DNA of the present invention is, for example, a DNA in which the targeting vector prepared as described above is introduced into mouse embryonic stem cells or mouse egg cells, and the DNA of the targeting vector is inactivated by the introduction. The DNA of the present invention can be knocked out by homologous recombination in which the sequence replaces the DNA of the present invention on the chromosome of mouse embryonic stem cells or mouse egg cells by homologous recombination.
Cells in which the DNA of the present invention has been knocked out can be used as a DNA sequence on a Southern hybridization analysis or targeting vector using the DNA sequence on or near the DNA of the present invention as a probe, and the DNA of the present invention derived from the mouse used for the targeting vector. It can be determined by analysis by PCR using a DNA sequence of a nearby region other than DNA as a primer. When non-human mammalian embryonic stem cells are used, a cell line in which the DNA of the present invention has been inactivated by gene homologous recombination is cloned, and the cells are cultured at an appropriate time, for example, at the 8-cell stage of non-human mammalian cells. The chimeric embryo is injected into an animal embryo or blastocyst, and the resulting chimeric embryo is transplanted into the uterus of the pseudopregnant non-human mammal. The produced animal is a chimeric animal comprising both cells having the normal DNA locus of the present invention and cells having the artificially mutated DNA locus of the present invention.
When a part of the germ cells of the chimeric animal has a mutated DNA locus of the present invention, all tissues are artificially mutated from a population obtained by crossing such a chimeric individual with a normal individual. It can be obtained by selecting individuals composed of cells having the added DNA locus of the present invention, for example, by judging coat color or the like. The individual thus obtained is usually an individual with a heterozygous expression of the protein of the present invention, which is crossed with an individual with a heterozygous expression of the protein of the present invention. Defective individuals can be obtained.
In the case of using an egg cell, for example, a transgenic non-human mammal having a targeting vector introduced into a chromosome can be obtained by injecting a DNA solution into a nucleus of an egg by a microinjection method, and these transgenic non-human mammals can be obtained. Compared to mammals, they can be obtained by selecting those having a mutation in the DNA locus of the present invention by homologous recombination.
In this manner, the individual in which the DNA of the present invention is knocked out can be bred in an ordinary breeding environment after confirming that the DNA of the animal obtained by the breeding is also knocked out.
Further, the acquisition and maintenance of the germ line may be performed according to a conventional method. That is, by crossing male and female animals having the inactivated DNA, a homozygous animal having the inactivated DNA on both homologous chromosomes can be obtained. The obtained homozygous animal can be efficiently obtained by rearing the mother animal in such a manner that there are one normal animal and one homozygote. By mating male and female heterozygous animals, homozygous and heterozygous animals having the inactivated DNA are bred and subcultured.
The non-human mammalian embryonic stem cells in which the DNA of the present invention has been inactivated are extremely useful for producing a non-human mammal deficient in expressing the DNA of the present invention.
In addition, since the non-human mammal deficient in expression of the DNA of the present invention lacks various biological activities that can be induced by the protein of the present invention, a model of a disease caused by inactivation of the biological activity of the protein of the present invention. Therefore, it is useful for investigating the causes of these diseases and examining treatment methods.
[0066]
[7a] A method for screening a compound having a therapeutic / preventive effect against diseases caused by DNA deficiency or damage of the present invention
The non-human mammal deficient in expression of the DNA of the present invention can be used for screening for a compound having a therapeutic / preventive effect against diseases caused by deficiency or damage of the DNA of the present invention.
That is, the present invention is characterized by administering a test compound to a non-human mammal deficient in expressing the DNA of the present invention, and observing and measuring a change in the animal. Provided is a method for screening a compound or a salt thereof having a therapeutic / prophylactic effect against a disease.
Examples of the non-human mammal deficient in expressing DNA of the present invention used in the screening method include the same as described above.
Test compounds include, for example, peptides, proteins, non-peptidic compounds, synthetic compounds, fermentation products, cell extracts, plant extracts, animal tissue extracts, plasma, and the like. These compounds are novel compounds. Or a known compound.
Specifically, a non-human mammal deficient in expression of the DNA of the present invention is treated with a test compound, compared with an untreated control animal, and tested using changes in each organ, tissue, disease symptoms, etc. of the animal as an index. The therapeutic / preventive effects of the compounds can be tested.
As a method of treating a test animal with a test compound, for example, oral administration, intravenous injection and the like are used, and it can be appropriately selected according to the symptoms of the test animal, the properties of the test compound, and the like. The dose of the test compound can be appropriately selected according to the administration method, the properties of the test compound, and the like.
[0067]
For example, when screening for a compound having a therapeutic effect on diabetes, a non-human mammal deficient in expressing the DNA of the present invention is subjected to glucose tolerance treatment, and a test compound is administered before or after glucose tolerance treatment, and Blood glucose, urine volume, urinary sugar, weight change, etc. are measured over time.
The compound obtained by using the screening method is a compound selected from the test compounds described above, and has a prophylactic / therapeutic effect against a disease caused by deficiency or damage of the protein of the present invention. It can be used as a drug for safe and low toxic prophylactic / therapeutic agents. Furthermore, compounds derived from the compounds obtained by the above screening can be used in the same manner.
[0068]
The compound obtained by the screening method may form a salt. Examples of the salt of the compound include physiologically acceptable acids (eg, inorganic acids, organic acids, etc.) and bases (eg, alkali metals, etc.). ) Is used, and a physiologically acceptable acid addition salt is particularly preferable. Such salts include, for example, salts with inorganic acids (eg, hydrochloric acid, phosphoric acid, hydrobromic acid, sulfuric acid, etc.) or organic acids (eg, acetic acid, formic acid, propionic acid, fumaric acid, maleic acid, For example, salts with succinic acid, tartaric acid, citric acid, malic acid, oxalic acid, benzoic acid, methanesulfonic acid, benzenesulfonic acid, and the like are used.
A drug containing the compound or a salt thereof obtained by the screening method can be produced in the same manner as the above-mentioned drug containing the protein of the present invention.
The preparations obtained in this way are safe and low toxic, and thus, for example, human or other mammals (eg, rat, mouse, guinea pig, rabbit, sheep, pig, cow, horse, cat, dog, monkey, etc.) ) Can be administered.
The dose of the compound or a salt thereof varies depending on the target disease, the administration subject, the administration route, and the like. For example, when the compound is orally administered, it is generally required for an adult (assuming a body weight of 60 kg) diabetic patient. About 0.1-100 mg, preferably about 1.0-50 mg, more preferably about 1.0-20 mg of the compound per day. When administered parenterally, the single dose of the compound varies depending on the administration subject, target disease, and the like. For example, the compound is usually administered in the form of an injection to an adult (60 kg) diabetic patient. In such a case, it is convenient to administer about 0.01 to 30 mg, preferably about 0.1 to 20 mg, more preferably about 0.1 to 10 mg of the compound by intravenous injection per day. In the case of other animals, the amount can be administered in terms of 60 kg.
[0069]
[7b] A method for screening a compound that promotes or inhibits the activity of a promoter for the DNA of the present invention
The present invention provides a compound which promotes or inhibits the activity of a promoter for the DNA of the present invention, which comprises administering a test compound to a non-human mammal deficient in expressing the DNA of the present invention, and detecting the expression of a reporter gene, or a compound thereof. A method for screening a salt is provided.
In the above-mentioned screening method, the non-human mammal deficient in expression of DNA of the present invention may be a non-human mammal deficient in expression of DNA of the present invention in which the DNA of the present invention is inactivated by introducing a reporter gene, A reporter gene that can be expressed under the control of a promoter for the DNA of the present invention is used.
Examples of the test compound include the same compounds as described above.
As the reporter gene, the same one as described above is used, and a β-galactosidase gene (lacZ), a soluble alkaline phosphatase gene, a luciferase gene and the like are preferable.
[0070]
In a non-human mammal deficient in expression of the DNA of the present invention in which the DNA of the present invention is replaced with a reporter gene, since the reporter gene is under the control of the promoter for the DNA of the present invention, the expression of the substance encoded by the reporter gene is traced. By doing so, the activity of the promoter can be detected.
For example, when a part of the DNA region encoding the protein of the present invention is replaced with a β-galactosidase gene (lacZ) derived from Escherichia coli, the tissue that expresses the protein of the present invention originally replaces the protein of the present invention. Β-galactosidase is expressed. Therefore, for example, the present invention can be easily performed by staining with a reagent serving as a substrate for β-galactosidase such as 5-bromo-4-chloro-3-indolyl-β-galactopyranoside (X-gal). Can be observed in the animal body. Specifically, the protein-deficient mouse of the present invention or a tissue section thereof is fixed with glutaraldehyde or the like, washed with phosphate buffered saline (PBS), and then stained with X-gal at room temperature or around 37 ° C. After reacting for about 30 minutes to 1 hour, the β-galactosidase reaction may be stopped by washing the tissue specimen with a 1 mM EDTA / PBS solution, and coloration may be observed. Further, mRNA encoding lacZ may be detected according to a conventional method.
The compound or a salt thereof obtained by using the above-mentioned screening method is a compound selected from the above-mentioned test compounds, and is a compound that promotes or inhibits the promoter activity for the DNA of the present invention.
[0071]
The compound obtained by the screening method may form a salt, and the salt of the compound may include a physiologically acceptable acid (eg, an inorganic acid) and a base (eg, an organic acid). And particularly preferably a physiologically acceptable acid addition salt. Such salts include, for example, salts with inorganic acids (eg, hydrochloric acid, phosphoric acid, hydrobromic acid, sulfuric acid, etc.) or organic acids (eg, acetic acid, formic acid, propionic acid, fumaric acid, maleic acid, For example, salts with succinic acid, tartaric acid, citric acid, malic acid, oxalic acid, benzoic acid, methanesulfonic acid, benzenesulfonic acid, and the like are used.
Since the compound or its salt that promotes the promoter activity for the DNA of the present invention can promote the expression of the protein of the present invention and promote the function of the protein, for example, liver disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcohol) Liver disease), prostate disease (eg, benign prostatic hyperplasia, prostatitis, etc.), spleen disease (eg, hypersplenia, splenomegaly syndrome, etc.), kidney disease (eg, nephritis, renal failure, glomerulonephritis, Diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, etc.), metabolic diseases (eg, diabetes, hyperlipidemia, etc.), cardiovascular diseases (eg, arteriosclerosis, etc.) or cancer (eg, Prophylactic / therapeutic agents such as lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, gastric cancer, bladder cancer, breast cancer, cervical cancer, colon cancer, rectal cancer, pancreatic cancer, etc.), or aging Medicines such as preventive / suppressive agents Te is useful.
[0072]
Further, the compound of the present invention or a salt thereof that inhibits the promoter activity for DNA can inhibit the expression of the protein of the present invention and inhibit the function of the protein, and thus can be used, for example, for liver diseases (eg, cirrhosis, hepatitis, Alcoholic liver disease, etc., prostate disease (eg, benign prostatic hyperplasia, prostatitis, etc.), spleen disease (eg, hypersplenia, splenomegaly syndrome, etc.), kidney disease (eg, nephritis, renal failure, glomerulonephritis) , Diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, etc.), metabolic diseases (eg, diabetes, hyperlipidemia, etc.), cardiovascular diseases (eg, arteriosclerosis, etc.) or cancer (eg, , Lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, stomach cancer, bladder cancer, breast cancer, cervical cancer, colon cancer, rectal cancer, pancreatic cancer, etc.), or Doctors such as aging prevention / suppression agents As useful.
Furthermore, compounds derived from the compounds obtained by the above screening can be used in the same manner.
A drug containing the compound or a salt thereof obtained by the screening method can be produced in the same manner as the above-mentioned drug containing the protein of the present invention or a salt thereof.
The preparations obtained in this way are safe and low toxic, and thus, for example, human or other mammals (eg, rat, mouse, guinea pig, rabbit, sheep, pig, cow, horse, cat, dog, monkey, etc.) ) Can be administered.
The dose of the compound or a salt thereof varies depending on the disease to be treated, the subject of administration, the administration route, and the like. For example, when the compound of the present invention that promotes the promoter activity for DNA is orally administered, generally the adult (body weight) is used. For diabetic patients (as 60 kg), about 0.1-100 mg, preferably about 1.0-50 mg, more preferably about 1.0-20 mg of the compound is administered per day. When administered parenterally, the single dose of the compound varies depending on the administration subject, target disease, and the like. For example, the compound of the present invention that promotes the promoter activity for DNA is usually administered in the form of an injection to an adult ( When administered to a diabetic patient (about 60 kg), about 0.01 to 30 mg, preferably about 0.1 to 20 mg, more preferably about 0.1 to 10 mg of the compound is administered by intravenous injection per day. It is convenient to do so. In the case of other animals, the amount can be administered in terms of 60 kg.
[0073]
On the other hand, for example, when a compound of the present invention that inhibits the promoter activity for DNA is orally administered, generally in an adult (assuming a body weight of 60 kg) diabetic patient, the compound is preferably about 0.1 to 100 mg per day, preferably Is administered in an amount of about 1.0 to 50 mg, more preferably about 1.0 to 20 mg. When administered parenterally, the single dose of the compound varies depending on the administration subject, target disease, and the like. For example, the compound of the present invention that inhibits the promoter activity for DNA is usually administered in the form of an injection to an adult ( When administered to a diabetic patient (about 60 kg), about 0.01 to 30 mg, preferably about 0.1 to 20 mg, more preferably about 0.1 to 10 mg of the compound is administered by intravenous injection per day. It is convenient to do so. In the case of other animals, the amount can be administered in terms of 60 kg.
As described above, the non-human mammal deficient in expression of the DNA of the present invention is extremely useful for screening for a compound or a salt thereof that promotes or inhibits the activity of the promoter for the DNA of the present invention, It can greatly contribute to investigating the cause of various diseases caused by it or to develop preventive and therapeutic drugs.
Further, using a DNA containing the promoter region of the protein of the present invention, genes encoding various proteins are ligated downstream thereof and injected into egg cells of an animal to produce a so-called transgenic animal (transgenic animal). Once created, it will also be possible to specifically synthesize the polypeptide and study its effects in living organisms. Furthermore, if a suitable reporter gene is bound to the above promoter portion, and a cell line that expresses the reporter gene is established, a low-molecular compound having an action of specifically promoting or suppressing the production ability of the protein itself of the present invention in the body. Can be used as a search system.
[0074]
In the present specification and drawings, bases, amino acids, and the like are indicated by abbreviations based on the abbreviations by IUPAC-IUB Commission on Biochemical Nomenclature or by abbreviations commonly used in the art, and examples thereof are described below. When an amino acid can have an optical isomer, the L-form is indicated unless otherwise specified.
DNA: deoxyribonucleic acid
cDNA: complementary deoxyribonucleic acid
A: Adenine
T: Thymine
G: Guanine
C: Cytosine
RNA: ribonucleic acid
mRNA: messenger ribonucleic acid
dATP: deoxyadenosine triphosphate
dTTP: deoxythymidine triphosphate
dGTP: deoxyguanosine triphosphate
dCTP: deoxycytidine triphosphate
ATP: Adenosine triphosphate
EDTA: Ethylenediaminetetraacetic acid
SDS: Sodium dodecyl sulfate
Gly: glycine
Ala: Alanine
Val: Valine
Leu: Leucine
Ile: Isoleucine
Ser: Serine
Thr: Threonine
Cys: cysteine
Met: methionine
Glu: glutamic acid
Asp: Aspartic acid
Lys: lysine
Arg: Arginine
His: histidine
Phe: phenylalanine
Tyr: Tyrosine
Trp: Tryptophan
Pro: Proline
Asn: Asparagine
Gln: Glutamine
pGlu: pyroglutamic acid
[0075]
Further, substituents, protecting groups and reagents frequently used in the present specification are represented by the following symbols.
Me: methyl group
Et: ethyl group
Bu: butyl group
Ph: phenyl group
TC: thiazolidine-4 (R) -carboxamide group
Tos: p-toluenesulfonyl
CHO: Formyl
Bzl: benzyl
Cl 2 -Bzl: 2,6-dichlorobenzyl
Bom: benzyloxymethyl
Z: benzyloxycarbonyl
Cl-Z: 2-chlorobenzyloxycarbonyl
Br-Z: 2-bromobenzyloxycarbonyl
Boc: t-butoxycarbonyl
DNP: dinitrophenyl
Trt: Trityl
Bum: t-butoxymethyl
Fmoc: N-9-fluorenylmethoxycarbonyl
HOBt: 1-hydroxybenztriazole
HOOBt: 3,4-dihydro-3-hydroxy-4-oxo-
1,2,3-benzotriazine
HONB: 1-hydroxy-5-norbornene-2,3-dicarboximide
DCC: N, N'-dicyclohexylcarbodiimide
[0076]
The sequence numbers in the sequence listing in the present specification indicate the following sequences.
[SEQ ID NO: 1]
1 shows the amino acid sequence of 568 amino acids of human TCH169 protein obtained in Example 1.
[SEQ ID NO: 2]
1 shows the nucleotide sequence of DNA encoding human TCH169 protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1.
[SEQ ID NO: 3]
3 shows the base sequence of primer A10 used in Example 2.
[SEQ ID NO: 4]
3 shows the base sequence of primer B9 used in Example 2.
[SEQ ID NO: 5]
4 shows the base sequence of TaqMan probe T1 used in Example 2.
[SEQ ID NO: 6]
2 shows the base sequence of primer A7 used in Example 1.
[SEQ ID NO: 7]
2 shows the base sequence of primer B6 used in Example 1.
[SEQ ID NO: 8]
3 shows the base sequence of primer SP6 used in Examples 1 and 4.
[SEQ ID NO: 9]
3 shows the nucleotide sequence of primer T7 used in Examples 1 and 4.
[SEQ ID NO: 10]
2 shows the base sequence of primer A1 used in Example 1.
[SEQ ID NO: 11]
2 shows the base sequence of primer A2 used in Example 1.
[SEQ ID NO: 12]
2 shows the nucleotide sequence of primer F1 used in Example 1.
[SEQ ID NO: 13]
2 shows the base sequence of primer F2 used in Example 1.
[SEQ ID NO: 14]
2 shows the base sequence of primer F3 used in Example 1.
[SEQ ID NO: 15]
2 shows the base sequence of primer B1 used in Example 1.
[SEQ ID NO: 16]
2 shows the base sequence of primer B2 used in Example 1.
[SEQ ID NO: 17]
2 shows the base sequence of primer B8 used in Example 1.
[SEQ ID NO: 18]
2 shows the base sequence of primer R1 used in Example 1.
[SEQ ID NO: 19]
3 shows the base sequence of primer R2 used in Example 1.
[SEQ ID NO: 20]
2 shows the base sequence of primer R3 used in Example 1.
[SEQ ID NO: 21]
3 shows the base sequence of primer R4 used in Example 1.
[SEQ ID NO: 22]
1 shows the nucleotide sequence of cDNA containing the full-length human TCH169 gene obtained in Example 1.
[SEQ ID NO: 23]
5 shows the amino acid sequence of a 572 amino acid mouse TCH169 protein obtained in Example 4.
[SEQ ID NO: 24]
This shows the base sequence of DNA encoding mouse TCH169 protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 23.
[SEQ ID NO: 25]
3 shows the base sequence of primer AP1 used in Example 3.
[SEQ ID NO: 26]
3 shows the base sequence of primer mB5 used in Example 3.
[SEQ ID NO: 27]
3 shows the base sequence of primer AP2 used in Example 3.
[SEQ ID NO: 28]
3 shows the nucleotide sequence of primer mB3 used in Example 3.
[SEQ ID NO: 29]
7 shows the base sequence of primer mA4 used in Example 4.
[SEQ ID NO: 30]
14 shows the base sequence of primer mB6 used in Example 4.
[SEQ ID NO: 31]
7 shows the base sequence of primer mA1 used in Example 4.
[SEQ ID NO: 32]
7 shows the nucleotide sequence of primer mA2 used in Example 4.
[SEQ ID NO: 33]
14 shows the base sequence of primer mB2 used in Example 4.
[SEQ ID NO: 34]
13 shows the base sequence of primer mR1 used in Example 4.
[SEQ ID NO: 35]
5 shows the nucleotide sequence of the 5 ′ upstream cDNA of mouse TCH169 obtained in Example 3.
[SEQ ID NO: 36]
5 shows the nucleotide sequence of cDNA containing the full-length mouse TCH169 gene obtained in Example 4.
[SEQ ID NO: 37]
14 shows the base sequence of primer mTF used in Example 5.
[SEQ ID NO: 38]
14 shows the nucleotide sequence of primer mTR used in Example 5.
[SEQ ID NO: 39]
14 shows the base sequence of TaqMan probe mT1 used in Example 5.
[SEQ ID NO: 40]
14 shows the base sequence of primer OF used in Example 6.
[SEQ ID NO: 41]
14 shows the base sequence of primer OR used in Example 6.
[SEQ ID NO: 42]
14 shows the base sequence of primer BGH RV used in Example 6.
[0077]
The transformant Escherichia coli TOP10 / pCR-BluntII-TCH169 obtained in Example 1 described below has been used since September 13, 2001, 1-1-1, Higashi, Tsukuba-shi, Ibaraki Prefecture since September 13, 2001. Commissioned by the National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Patent Organism Depositary, under the accession number FERM BP-7834, from August 29, 2001 to the Fermentation Research Institute (IFO) of 2-17-85 Jusanhoncho, Yodogawa-ku, Osaka-shi, Osaka Deposited under the number IFO 16690.
The transformant Escherichia coli TOP10 / pCR-BluntII-mTCH169 obtained in Example 4 described below has been used since April 10, 2002, 1-1-1 Higashi, Tsukuba City, Ibaraki Pref. Commissioned by the National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Patent Organism Depositary, under the accession number FERM BP-8010, from April 2, 2002 to the Institute of Fermentation (IFO), 2-17-85, Jusanhoncho, Yodogawa-ku, Osaka-shi, Osaka Deposited under the number IFO 16785.
【Example】
Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to Examples, but these do not limit the scope of the present invention. In addition, the gene manipulation method using Escherichia coli followed the method described in Molecular cloning (Molecular cloning).
[0078]
Example 1
Cloning of human TCH169 gene cDNA
Using two types of primer DNA, primer A7 (SEQ ID NO: 6) and primer B6 (SEQ ID NO: 7), PCR was performed on human liver cDNA library (Takara Shuzo) by Pyrobest DNA Polymerase (Takara Shuzo). As a result, two clones # 1 and # 2 of the plasmid clone pCR-BluntII-TCH169 were obtained. This was used as a primer DNA [primer SP6 (SEQ ID NO: 8), primer T7 (SEQ ID NO: 9), primer A1 (SEQ ID NO: 10), primer A2 (SEQ ID NO: 11), primer F1 (SEQ ID NO: 12), Primer F2 (SEQ ID NO: 13), Primer F3 (SEQ ID NO: 14), Primer B1 (SEQ ID NO: 15), Primer B2 (SEQ ID NO: 16), Primer B8 (SEQ ID NO: 17), Primer R1 (SEQ ID NO: 17) : 18), primer R2 (SEQ ID NO: 19), primer R3 (SEQ ID NO: 20), primer R4 (SEQ ID NO: 21)] and BigDye Terminator Cycle Sequencing Kit (Applied Biosystems). The base sequence of the inserted cDNA fragment It was determined using a DNA sequencer ABI PRISM 3100 DNA Analyzer (manufactured by Applied Biosystems). As a result, the obtained two clones contained the same DNA fragment and had a base sequence of 2320 (SEQ ID NO: 22). The cDNA fragment encodes a 568 amino acid sequence (SEQ ID NO: 1) (SEQ ID NO: 2), and the protein having the amino acid sequence was designated as human TCH169 protein.
A transformant having a plasmid containing the cDNA fragment was named Escherichia coli TOP10 / pCR-BluntII-TCH169.
A homology search was performed on owl using Blast P [Nucleic Acids Res., Vol. 25, p. 3389 (1997)], and the cDNA was a novel gene belonging to the dicarboxylic acid transporter. (FIGS. 1 and 2). NaDC1, a sodium-dependent dicarboxylic acid transporter reported in humans [Am J Physiol. 270, F642 (1996)], showing 65% homology at the base level and 56% at the amino acid level.
[0079]
Example 2
Analysis of tissue distribution of human TCH169 gene product
Using two kinds of primer DNAs designed from the sequence of THC169, primer A10 (SEQ ID NO: 3) and primer B9 (SEQ ID NO: 4) and TaqMan probe T1 (SEQ ID NO: 5), each human tissue ( Heart (brain, placenta, lung, liver, skeletal muscle, kidney, pancreas, spleen, thymus, prostate, testis, ovary, small intestine, large intestine, peripheral blood leukocytes) cDNA (Human MTC panel I, and Human MTC panel II: Clontech) The expression level of TCH169 was measured by TaqMan PCR. The reaction was first performed at 50 ° C. for 2 minutes and then at 95 ° C. for 10 minutes using an ABI PRISM 7900 sequence detection system (manufactured by Applied Biosystems) using TaqMan Universal PCR Master Mix (manufactured by Applied Biosystems). Forty cycles were repeated at 95 ° C. for 15 seconds and 60 ° C. for 1 minute as one reaction cycle, and detection was performed simultaneously.
The results are shown in FIG. The human TCH169 gene product (mRNA) was slightly expressed in brain, kidney, testis, and ovary, and slightly expressed in prostate, spleen, and small intestine, and showed the strongest expression in liver.
[0080]
Example 3
Cloning of 5 'upstream end of cDNA encoding mouse TCH169 protein
The 5 'upstream nucleotide sequence of the cDNA encoding the mouse TCH169 protein was revealed by the 5' RACE method.
Using two types of primer DNAs, primer AP1 (SEQ ID NO: 25) and primer mB5 (SEQ ID NO: 26), mouse 2 Marathon-Ready cDNA (Clontech) and Advantage 2 DNA Polymerase (Clontech) ), Primary PCR was performed under the following conditions (1) to (4).
(1) 94 ° C for 30 seconds
(2) 5 cycles of 94 ° C for 5 seconds and -72 ° C for 4 minutes
(3) 5 cycles of 94 ° C for 5 seconds and -70 ° C for 4 minutes
(4) 25 cycles of 94 ° C for 5 seconds and -68 ° C for 4 minutes
Furthermore, using the product of this primary PCR as a template, and using primer AP2 (SEQ ID NO: 27) and primer mB3 (SEQ ID NO: 28), Advantage 2 DNA Polymerase (Clontech) and the following conditions (5) to ( The nested PCR was performed in 7).
(5) 94 ° C for 30 seconds
(6) 5 cycles of 94 ° C for 5 seconds and -70 ° C for 4 minutes
(7) 30 cycles of 94 ° C for 5 seconds and -68 ° C for 4 minutes
After the nested PCR reaction solution was subjected to gel electrophoresis, the main band was purified. This was reacted using primer mB3 (SEQ ID NO: 28) and BigDye Terminator Cycle Sequencing Kit (manufactured by Applied Biosystems), and the base sequence of the amplified DNA fragment was analyzed using a DNA sequencer ABI PRISM 3100 DNA analyzer (manufactured by Applied Biosystems). ). As a result, the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 35 was obtained.
[0081]
Example 4
Cloning of cDNA encoding mouse TCH169 protein
Using two types of primer DNAs, primer mA4 (SEQ ID NO: 29) and primer mB6 (SEQ ID NO: 30), Pyrobest DNA Polymerase (manufactured by Takara Shuzo) against mouse brain Marathon-Ready cDNA (manufactured by Clontech) Was performed under the following conditions (1) to (3).
(1) 94 ° C for 2 minutes
(2) 30 cycles of 98 ° C for 10 seconds -68 ° C for 30 seconds -72 ° C for 3.5 minutes
(3) 10 minutes at 72 ° C
The obtained amplification product was cloned using a Zero Blunt TOPO Cloning kit (manufactured by Invitrogen) to obtain a plasmid pCR-BluntII-mTCH169.
This was used as a primer DNA [primer SP6 (SEQ ID NO: 8), primer T7 (SEQ ID NO: 9), primer mA1 (SEQ ID NO: 31), primer mA2 (SEQ ID NO: 32), primer mB2 (SEQ ID NO: 33), The primer mR1 (SEQ ID NO: 34)] and a BigDye Terminator Cycle Sequencing Kit (manufactured by Applied Biosystems) are used to carry out the reaction, and the base sequence of the inserted cDNA fragment is analyzed by a DNA sequencer ABI PRISM 3100 DNA Analyzer (Applied Biosystems). Was used for the determination. As a result, the clone had 1,826 base sequences (SEQ ID NO: 36). The cDNA fragment encoded a 572 amino acid sequence (SEQ ID NO: 23) (SEQ ID NO: 24), and the protein having the amino acid sequence was designated as mouse TCH169 protein.
A transformant having the plasmid containing the cDNA fragment was named Escherichia coli TOP10 / pCR-BluntII-mTCH169.
A homology search was performed on owl using Blast P [Nucleic Acids Res., Vol. 25, p. 3389, 1997]. The cDNA was found to be a novel member of the sodium-dependent dicarboxylic acid transporter family. It was found to be a mouse ortholog of the gene, human TCH169 (FIG. 4). Mouse TCH169 showed 77% homology at the base level and 74% amino acid level with human TCH169. In addition, mouse NaDC1 [Am., A sodium-dependent dicarboxylic acid transporter reported in mice]. J. Physiol. 279, F482, 2000]], showing 50% homology at the base level and 48% at the amino acid level.
[0082]
Example 5
Analysis of tissue distribution of mouse TCH169 gene product
Using two kinds of primer DNA, primer mTF (SEQ ID NO: 37) and primer mTR (SEQ ID NO: 38) designed from the sequence of mouse TCH169, and TaqMan probe mT1 (SEQ ID NO: 39), each tissue of mouse (Bone marrow, eyes, lymph nodes, smooth muscle, prostate, thymus, stomach, uterus, heart, brain, spleen, lung, liver, skeletal muscle, kidney, testis, embryo (7 days), embryo (11 days), embryo ( The expression level of mouse TCH169 in cDNA (Mouse MTC panel I and Mouse MTC panel II: manufactured by Clontech) of embryo (15th) and embryo (17th) was measured by TaqMan PCR. The reaction was first performed at 50 ° C. for 2 minutes and then at 95 ° C. for 10 minutes using an ABI PRISM 7900 sequence detection system (manufactured by Applied Biosystems) using TaqMan Universal PCR Master Mix (manufactured by Applied Biosystems). Forty cycles were repeated at 95 ° C. for 15 seconds and 60 ° C. for one minute as one reaction cycle, and detection was performed simultaneously.
FIG. 5 shows the results. The mouse TCH169 gene product (mRNA) is slightly expressed in Mouse MTC panel I and MTC panel II in thymus, stomach, uterus, liver, kidney, embryo (day 11), and eyes and embryo (day 17). , Some expression was observed, and strong expression was observed in bone marrow, brain and embryo (15 days), and the strongest expression was observed in testis.
[0083]
Example 6
Construction of human TCH169 expression vector
A human TCH169 (SEQ ID NO: 1) expression vector was created by the following method. Using 10 ng of the plasmid obtained in Example 1 as a template and Pyrobest DNA Polymerase (manufactured by Takara Shuzo) using primer OF (SEQ ID NO: 40) and primer OR (SEQ ID NO: 41), the following conditions (1) to PCR was performed in (3). The 5′-end primer OF and the 3′-end primer OR were designed to add a Hind III site and an Xba I site, respectively, to the 5 ′ end for cloning into a vector.
(1) 94 ° C for 2 minutes
(2) 30 cycles of 98 ° C. for 10 seconds, −65 ° C. for 30 seconds, and −72 ° C. for 3.5 minutes
(3) 10 minutes at 72 ° C
After gel electrophoresis of the PCR reaction solution, the main band was purified. The resulting PCR fragment was digested with the restriction enzymes Hind III and Xba I by incubating at 37 ° C. for 1 hour, and the reaction solution was purified by gel electrophoresis. This was added to Takara ligation kit ver. In Hind III site and Xba I site of pcDNA3.1 (+) (Invitrogen), which is an animal cell expression vector. 2 (Takara Shuzo). After the ligation reaction mixture was subjected to ethanol precipitation, the ligation reaction mixture was transformed into competent E. coli (Escherichia coli) TOP10 (manufactured by Invitrogen). A plasmid was prepared from a plurality of colonies thus obtained, and this base sequence was used as a primer DNA [primer BGH RV (SEQ ID NO: 42), primer T7 (SEQ ID NO: 9), primer A2 (SEQ ID NO: 11), primer F1 (SEQ ID NO: 12), primer F2 (SEQ ID NO: 13), primer B1 (SEQ ID NO: 15), primer B2 (SEQ ID NO: 16), primer R1 (SEQ ID NO: 18), primer R2 (SEQ ID NO: 19)], and a reaction was performed using a BigDye Terminator Cycle Sequencing Kit (manufactured by Applied Biosystems), and the nucleotide sequence was confirmed using a DNA sequencer ABI PRISM 3100 DNA Analyzer (manufactured by Applied Biosystems). A transformant having this plasmid was named Escherichia coli TOP10 / pCDNA3.1 (+)-TCH169.
[0084]
Example 7
Preparation of TCH169 expressing CHO cell line and measurement of transgene expression level
Escherichia coli TOP10 / pCDNA3.1 (+)-TCH169 was cultured, and a plasmid DNA was prepared from the Escherichia coli body using EndoFree Plasmid Maxi Kit (manufactured by Qiagen). This plasmid DNA was subjected to CHO dhfr using FuGENE 6 Transfection Reagent (manufactured by Roche) according to the attached protocol. The cells were introduced. A mixture of 2 μg of plasmid DNA and transfection reagent was added 3 × 10 4 hours before 6 CHO dhfr Cells were added to a seeded 6 cm diameter petri dish. After culturing for 1 day in a MEMα medium containing 10% fetal bovine serum, the cells were detached by trypsin treatment, and the recovered cells were seeded at 10-50 cells per well in a 96-well plate. Twenty-four hours later, 0.5 mg / ml G418 was added to the medium, and TCH169-expressing cells were selected in the medium containing 0.5-1.0 mg / ml G418 for 7 days. For 10 wells in which growth of 1-3 colonies was observed per well, 6 well plates were cultured, and total RNA was prepared from the grown cells using RNeasy Mini Kit or RNeasy 96 Kit (both manufactured by Qiagen). The prepared total RNA was subjected to a reverse transcription reaction using TaqMan Revise Transcription Reagents (manufactured by Applied Biosystems) to prepare cDNA. In this regard, the expression amount of TCH169 was determined by TaqMan PCR using primer A10 (SEQ ID NO: 3) and primer B9 (SEQ ID NO: 4) used in Example 2 and TaqMan probe T1 (SEQ ID NO: 5). It was measured. The reaction was first performed at 50 ° C. for 2 minutes and then at 95 ° C. for 10 minutes using ABI PRISM 7900 sequence detection system (Applied Biosystems) using TaqMan Universal PCR Master Mix (Applied Biosystems). Forty cycles were repeated at 95 ° C. for 15 seconds and 60 ° C. for 1 minute as one reaction cycle, and detection was performed simultaneously. As a human TCH169 gene high expression cell line (polyclonal), clone No. 2 and No. 13 was selected. These cells were inoculated on a 96-well plate at 0.5 cells per well and cultured in a G418-containing medium for 7-10 days to obtain a monoclonal clone. For this, total RNA was prepared, and the expression level of the human TCH169 gene was measured by TaqMan PCR. As a human TCH169 gene high expression cell line (monoclonal), clone No. 2-11 was selected.
[0085]
Example 8
[1,5- in human TCH169 expressing CHO cell line 14 C] Measurement of citric acid uptake
TCH169-expressing CHO cell line clone No. obtained in Example 7. By using 2-11, [1,5- 14 C] Citric acid uptake was measured. TCH169 expressing CHO cell line clone no. 2-11 was added to a 96-well plate at 4 × 10 4 per well. 4 The cells were seeded and cultured at 37 ° C. for 24 hours. The medium was removed and 150 μL NMDG buffer (140 mM N-methyl-D (−)-glucamine, 25 mM Hepes / Tris, 5.4 mM KCl, 1.8 mM CaCl 2 2 , 0.8 mM MgSO 4 , 5 mM Glucose, pH 7.4-7.6) three times, and 150 µL of NMDG buffer was added thereto, followed by culturing at 37 ° C for 1 hour. 90 μL NaCl buffer (140 mM NaCl, 25 mM Hepes / Tris, 5.4 mM KCl, 1.8 mM CaCl 2 , 0.8 mM MgSO 4 , 5 mM Glucose, pH 7.4-7.6) or 90 μL NMDG buffer, followed by 223 μM [1,5- 14 C] 10 μL of Citric acid (manufactured by Amersham Pharmacia Biotech) was added, and the mixture was cultured at 37 ° C. for 15 minutes, 30 minutes and 1 hour, and then washed three times with 200 μL PBS (manufactured by Takara Shuzo). 100 μL Optiphase 'SuperMix' (manufactured by PerkinElmer Life Science) was added, and the mixture was stirred and taken up into cells [1,5- 14 C] The amount of Citric acid was measured by radioactivity. The measurement was performed by 1450 MICROBETA PLUSLIQUID SCINTILLATION COUNTER (manufactured by PerkinElmer Life Sciences). A similar operation is performed using CHO dhfr This was also performed on cells (Mock) into which the vector pcDNA3.1 (+) had been introduced, and the radioactivity was measured in the same manner.
The results are shown in FIGS. Thus, human TCH169-expressing CHO cells were expressed in the presence of 140 mM NaCl [1,5- 14 C] It is evident that it incorporates Citric acid.
[0086]
【The invention's effect】
The protein of the present invention can be used for, for example, liver disease (eg, cirrhosis, hepatitis, alcoholic liver disease, etc.), prostate disease (eg, benign prostatic hyperplasia, prostatitis, etc.), spleen disease (eg, hyperspleenism, splenomegaly syndrome) ), Kidney diseases (eg, nephritis, renal failure, glomerulonephritis, diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, etc.), metabolic diseases (eg, diabetes, hyperlipidemia, etc.) ), Cardiovascular disease (eg, arteriosclerosis, etc.) or cancer (eg, lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, gastric cancer, bladder cancer, breast cancer, cervical cancer, colon cancer) , Rectal cancer, pancreatic cancer, etc.) or a compound that promotes or inhibits the activity of the protein obtained by a screening method using the protein, such as liver disease (eg, cirrhosis, cirrhosis, Hepatitis, a Cholestatic liver disease, etc.), prostate disease (eg, benign prostatic hyperplasia, prostatitis, etc.), spleen disease (eg, hypersplenia, splenomegaly syndrome, etc.), kidney disease (eg, nephritis, renal failure, glomerulonephritis) , Diabetic nephropathy, focal glomerulosclerosis, nephrotic syndrome, renal edema, etc.), metabolic diseases (eg, diabetes, hyperlipidemia, etc.), cardiovascular diseases (eg, arteriosclerosis, etc.) or cancer (eg, , Lung cancer, kidney cancer, liver cancer, non-small cell lung cancer, ovarian cancer, prostate cancer, stomach cancer, bladder cancer, breast cancer, cervical cancer, colon cancer, rectal cancer, pancreatic cancer, etc.), or It can be used as an agent for preventing and suppressing aging.
[0087]
[Sequence list]
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[Brief description of the drawings]
1 shows a comparison of the amino acid sequences of the sodium-dependent dicarboxylic acid transporter NaDC1 and human TCH169 (continued from FIG. 2).
FIG. 2 shows a comparison of the amino acid sequences of sodium-dependent dicarboxylic acid transporter NaDC1 and human TCH169 (continuation of FIG. 1).
FIG. 3 is a diagram showing the expression level of human TCH169 gene product in each tissue.
FIG. 4 is a diagram showing a comparison of amino acid sequences between mouse TCH169 and human TCH169.
FIG. 5 is a diagram showing the expression level of mouse TCH169 gene product in each tissue.
FIG. 6. [1,5- 14 C] It is a figure showing the result of having measured the uptake of Citric acid. The uptake amount is [1,5- 14 C] It was expressed in counts per minute (cpm) when the citric acid was taken in for 1 hour. The results are shown by the mean value and standard deviation of the counts of 4 wells independently. In the figure, cells into which vector pcDNA3.1 (+) has been introduced are represented by Mock, human CHO cells expressing TCH169 are represented by TCH169, and [1,5- 14 C] The citric acid was taken in, and Mock / NaCl, TCH169 / NaCl, and [1,5- 14 C] What incorporated the citric acid was represented by Mock / NMDG and TCH169 / NMDG, respectively.
[FIG. 7] [1,5- 14 C] It is a figure showing the result of having measured the time-dependent incorporation of Citric acid. The uptake amount is [1,5- 14 C] It was expressed in counts per minute (cpm) when the citric acid was taken in for 15 minutes, 30 minutes, and 1 hour. The results are shown by the mean value and standard deviation of the counts of 4 wells independently. In the figure, cells into which vector pcDNA3.1 (+) has been introduced are represented by Mock, human CHO cells expressing TCH169 are represented by TCH169, and [1,5- 14 C] The citric acid was taken in, and Mock / NaCl, TCH169 / NaCl, and [1,5- 14 C] What incorporated the citric acid was represented by Mock / NMDG and TCH169 / NMDG, respectively.

Claims (37)

配列番号:1または配列番号:23で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質またはその塩。A protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 23, or a salt thereof. 配列番号:1で表されるアミノ酸配列からなるタンパク質またはその塩。A protein comprising an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 or a salt thereof. 配列番号:23で表されるアミノ酸配列からなるタンパク質またはその塩。A protein consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 23 or a salt thereof. 請求項1記載のタンパク質の部分ペプチドまたはその塩。A partial peptide of the protein according to claim 1 or a salt thereof. 請求項1記載のタンパク質または請求項4記載の部分ペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド。A polynucleotide comprising a polynucleotide encoding the protein according to claim 1 or the partial peptide according to claim 4. DNAである請求項5記載のポリヌクレオチド。The polynucleotide according to claim 5, which is DNA. 配列番号:2または配列番号:22で表される塩基配列からなるポリヌクレオチド。A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 22. 配列番号:24または配列番号:36で表される塩基配列からなるポリヌクレオチド。A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 24 or SEQ ID NO: 36. 請求項5記載のポリヌクレオチドを含有する組換えベクター。A recombinant vector containing the polynucleotide according to claim 5. 請求項9記載の組換えベクターで形質転換された形質転換体。A transformant transformed with the recombinant vector according to claim 9. 請求項10記載の形質転換体を培養し、請求項1記載のタンパク質または請求項4記載の部分ペプチドを生成、蓄積せしめ、これを採取することを特徴とする請求項1記載のタンパク質もしくは請求項4記載の部分ペプチドまたはその塩の製造法。The protein according to claim 1, wherein the transformant according to claim 10 is cultured to produce and accumulate the protein according to claim 1 or the partial peptide according to claim 4, and collect the protein. 4. The method for producing the partial peptide or a salt thereof according to 4. 請求項1記載のタンパク質もしくは請求項4記載の部分ペプチドまたはその塩を含有してなる医薬。A medicament comprising the protein according to claim 1, the partial peptide according to claim 4, or a salt thereof. 請求項5記載のポリヌクレオチドを含有してなる医薬。A pharmaceutical comprising the polynucleotide according to claim 5. 請求項5記載のポリヌクレオチドを含有してなる診断薬。A diagnostic agent comprising the polynucleotide according to claim 5. 請求項1記載のタンパク質もしくは請求項4記載の部分ペプチドまたはその塩に対する抗体。An antibody against the protein according to claim 1, the partial peptide according to claim 4, or a salt thereof. 請求項15記載の抗体を含有してなる医薬。A medicament comprising the antibody according to claim 15. 請求項15記載の抗体を含有してなる診断薬。A diagnostic agent comprising the antibody according to claim 15. 請求項5記載のポリヌクレオチドに相補的または実質的に相補的な塩基配列またはその一部を含有するポリヌクレオチド。A polynucleotide comprising a nucleotide sequence complementary or substantially complementary to the polynucleotide according to claim 5, or a part thereof. 請求項18記載のポリヌクレオチドを含有してなる医薬。A medicament comprising the polynucleotide according to claim 18. 請求項1記載のタンパク質もしくは請求項4記載の部分ペプチドまたはその塩を用いることを特徴とする、請求項1記載のタンパク質もしくは請求項4記載の部分ペプチドまたはその塩の活性を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング方法。A compound that promotes or inhibits the activity of the protein according to claim 1, the partial peptide according to claim 4, or a salt thereof, wherein the protein according to claim 1 or the partial peptide according to claim 4 or a salt thereof is used. Or a method of screening for a salt thereof. 請求項1記載のタンパク質もしくは請求項4記載の部分ペプチドまたはその塩を含有してなる、請求項1記載のタンパク質もしくは請求項4記載の部分ペプチドまたはその塩の活性を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング用キット。A compound that promotes or inhibits the activity of the protein according to claim 1, the partial peptide according to claim 4, or a salt thereof, or a compound thereof, comprising the protein according to claim 1, the partial peptide according to claim 4, or a salt thereof. Salt screening kit. 請求項20記載のスクリーニング方法または請求項21記載のスクリーニング用キットを用いて得られる、請求項1記載のタンパク質もしくは請求項4記載の部分ペプチドまたはその塩の活性を促進または阻害する化合物またはその塩。A compound or salt thereof that promotes or inhibits the activity of the protein of claim 1 or the partial peptide of claim 4 or a salt thereof, obtained by using the screening method according to claim 20 or the screening kit according to claim 21. . 請求項22記載の化合物またはその塩を含有してなる医薬。A medicament comprising the compound according to claim 22 or a salt thereof. 請求項5記載のポリヌクレオチドを用いることを特徴とする、請求項1記載のタンパク質遺伝子の発現を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング方法。A method for screening a compound or a salt thereof, which promotes or inhibits expression of the protein gene according to claim 1, wherein the polynucleotide according to claim 5 is used. 請求項5記載のポリヌクレオチドを含有してなる、請求項1記載のタンパク質遺伝子の発現を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング用キット。A kit for screening a compound or a salt thereof which promotes or inhibits the expression of the protein gene according to claim 1, comprising the polynucleotide according to claim 5. 請求項24記載のスクリーニング方法または請求項25記載のスクリーニング用キットを用いて得られる、請求項1記載のタンパク質遺伝子の発現を促進または阻害する化合物またはその塩。A compound or a salt thereof, which promotes or inhibits expression of the protein gene according to claim 1, obtained by using the screening method according to claim 24 or the screening kit according to claim 25. 請求項26記載の化合物またはその塩を含有してなる医薬。A medicament comprising the compound according to claim 26 or a salt thereof. 請求項15記載の抗体を用いることを特徴とする請求項1記載のタンパク質の定量方法。A method for quantifying a protein according to claim 1, wherein the antibody according to claim 15 is used. 請求項28記載の定量方法を用いることを特徴とする請求項1記載のタンパク質の機能が関連する疾患の診断法。A method for diagnosing a disease associated with the function of a protein according to claim 1, wherein the method according to claim 28 is used. 請求項15記載の抗体を用いることを特徴とする、請求項1記載のタンパク質の発現を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング方法。A method for screening a compound or a salt thereof, which promotes or inhibits expression of the protein according to claim 1, wherein the antibody according to claim 15 is used. 請求項15記載の抗体を含有してなる、請求項1記載のタンパク質の発現を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング用キット。A kit for screening a compound or a salt thereof that promotes or inhibits the expression of the protein according to claim 1, comprising the antibody according to claim 15. 請求項30記載のスクリーニング方法または請求項31記載のスクリーニング用キットを用いて得られる、請求項1記載のタンパク質の発現を促進または阻害する化合物またはその塩。A compound or a salt thereof that promotes or inhibits the expression of the protein according to claim 1, which is obtained by using the screening method according to claim 30 or the screening kit according to claim 31. 請求項32記載の化合物またはその塩を含有してなる医薬。A medicament comprising the compound according to claim 32 or a salt thereof. 肝臓疾患、前立腺疾患、脾臓疾患、腎臓疾患、代謝疾患、循環器疾患もしくは癌の予防・治療剤または老化の予防・抑制剤である請求項13、請求項16、請求項19、請求項23、請求項27または請求項33記載の医薬。A preventive / therapeutic agent for liver disease, prostate disease, spleen disease, renal disease, metabolic disease, cardiovascular disease or cancer or a preventive / suppressive agent for aging, claim 13, claim 19, claim 23, A medicament according to claim 27 or claim 33. 肝臓疾患、前立腺疾患、脾臓疾患、腎臓疾患、代謝疾患、循環器疾患または癌の診断薬である請求項14または請求項17記載の診断薬。The diagnostic agent according to claim 14 or 17, which is a diagnostic agent for liver disease, prostate disease, spleen disease, kidney disease, metabolic disease, cardiovascular disease, or cancer. 哺乳動物に対して、請求項22、請求項26または請求項32記載の化合物またはその塩の有効量を投与することを特徴とする肝臓疾患、前立腺疾患、脾臓疾患、腎臓疾患、代謝疾患、循環器疾患もしくは癌の予防・治療方法または老化の予防・抑制方法。Liver disease, prostate disease, spleen disease, kidney disease, metabolic disease, circulatory disease characterized by administering to a mammal an effective amount of the compound according to claim 22, 26 or 32 or a salt thereof. For preventing or treating organ diseases or cancer or for preventing or suppressing aging. 肝臓疾患、前立腺疾患、脾臓疾患、腎臓疾患、代謝疾患、循環器疾患もしくは癌の予防・治療剤または老化の予防・抑制剤を製造するための請求項22、請求項26または請求項32記載の化合物またはその塩の使用。33. The method according to claim 22, claim 26 or claim 32 for producing a preventive / therapeutic agent for hepatic disease, prostate disease, spleen disease, kidney disease, metabolic disease, circulatory disease or cancer or a preventive / suppressive agent for aging. Use of a compound or a salt thereof.
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