JP2003533217A - 分裂促進因子および内分泌調節因子としての新規な二重オキシダーゼ - Google Patents

分裂促進因子および内分泌調節因子としての新規な二重オキシダーゼ

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JP2003533217A JP2001585175A JP2001585175A JP2003533217A JP 2003533217 A JP2003533217 A JP 2003533217A JP 2001585175 A JP2001585175 A JP 2001585175A JP 2001585175 A JP2001585175 A JP 2001585175A JP 2003533217 A JP2003533217 A JP 2003533217A
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Abstract

(57)【要約】 本発明は、反応性酸素中間物の生成に関連する、そして細胞分裂、甲状腺のホルモン生合成および組織線維症を含む生物学的機能に影響を及ぼす過酸化的な反応に関連する、新規なタンパク質の生成をコードする新しい遺伝子に関する。本発明はまた、これらの遺伝子を含むベクター、これらのベクターによってトランスフェクトされた細胞、これらの新規なタンパク質に対して惹起された抗体、これらの遺伝子およびタンパク質の検出、局在化および測定のためのキット、ならびに本発明のタンパク質の活性に影響を及ぼす薬物の活性を決定する方法を提供する。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】 米国政府は、特許所有者が合理的条件上の国立衛生研究所補助金HL3820
6の条件によって提供されるように他を認可することを必要とするために限られ
た状況の本発明および右の支払済みの許可を有するHL58000、そして、C
A84138。
【0002】 (発明の技術分野) 本発明は甲状腺のホルモン生合成に対する、そして、線虫表皮生物発生説に対
する特定の分裂促進的な規則において、通常で異常な細胞成長の分野に関する。
本発明は、以下を提供する:甲状腺のホルモン生合成に触媒作用を及ぼして、線
虫において表皮の生物発生説に触媒作用を及ぼす分裂促進的なレギュレータであ
る酵素の生成をコードするヌクレオチド配列;これらの酵素のアミノ酸配列;こ
れらのヌクレオチド配列を含んでいるベクター;これらの酵素を生産するベクタ
ーを有する細胞をトランスフェクションさせる方法;そして、これらの酵素のレ
ベルを検出して、測るために、そして、これらの酵素の細胞外エピトープを所有
している細胞に縛るために役立つこれらの酵素に対する抗体。
【0003】 (発明の背景) 反応性酸素中間物(ROI)は、酸素の部分的な減少製品である:1つの電子
は02を形式過酸化物(2)に下げる、そして、2つの電子は2を形式過酸化水
素(H2O2)に下げる。ROIは、酸素の代謝の副産物として、そして、毒物
的なメカニズムによって発生する。様々な細胞のH2O2へのその転換が、02
−andの管理された酵素の生成の証拠を育ててある。02−to H2O2の
転換は、自発的に起こるが、過酸化物dismutase(SOD)によって、
著しく速められる。ROIの高いレベルは、生体分子(例えばDNA、生体膜お
よびタンパク質)に、損害と関連する。最近の証拠は、通常の細胞条件のROI
および信号を送ることまでの位置の生成および02−and H2O2のための
代謝役割を示す。
【0004】 生物学的いくつかのシステムは、反応性酸素を生成する。好中球のような食細
胞の細胞は、殺菌のメカニズムのそれらのバッテリの一部として大きい多量のR
OIを生成する。バクテリアに対するまたはホルミルMet−Leu−Pheま
たはホルボール・エステルのようなさまざまな可溶な仲裁者に対する好中球の露
出は酸素の大きい消費を活性化する。そして、H2O2、HOC1および水酸基
の第2の生成については、まず最初に過酸化物を生成するために、呼吸の爆発と
呼ばれる。この酸素消費に対して責任がある酵素は、呼吸の爆発オキシダーゼ(
ニコチンアミドアデニンジヌクレオチドリン酸−短縮形(NADPH)オキシダ
ーゼ)である。
【0005】 特に細胞増殖に関する状況において、ROIの生成の証拠は、非食細胞の細胞
によって成長している。加えて、甲状腺のような若干の組織において、ROI生
成は、甲状腺のホルモンの生合成のような代謝転換に関係する。H2O2(O2
−)の重大な世代または、両方とも若干の細胞タイプにおいて有名だった。線維
芽細胞および人間の内皮細胞は、interleukin−1または腫瘍壊死要
因(TNF)のようなサイトカインに応答して、過酸化物の増加する発表を示す
(マイヤーほか(1989の)Biochem J. 263,539−545
.;松原ほか(1986の)J.Immun. 137,3295−3298)
。ラース−変わる線維芽細胞は、制御線維芽細胞と比較して増加する過酸化物リ
リースを示す(イラン人、その他(1997の)サイエンス275,1649−
1652)。脈管の平滑筋細胞が示すネズミは、PDGFに応答してH2O2リ
リースを増加した(Sundaresanその他(1995の)サイエンス27
0,296−299)、そして、アンギオテンシンII(Griendling
その他(1994の)Circ.物件。74,1141−1148; 福井ほか(1997の)Circ.物件。80、45−51;ウシオ−Fuka
iその他(1996)J. Biol. C}le771. 271,2331
7−23321)、そして、これらの細胞のH2O2は、増加する増殖率と関連
する。様々な細胞タイプのROIの出来事は、表1(Burdon、R.(19
95の)FreeRadical Biol. Med. 18、775−79
4から適応した)において要約される。
【0006】 表1 Superoxide Hydrogen Peroxide 人間の線維芽細胞 Balb/3T3細胞 人間の内皮細胞 ネズミ膵臓セル 人間/ネズミ平滑筋細胞 ネズミkeratinocytes 人間の分厚い細胞 ウサギ軟骨細胞 人間骨細胞 人間腫瘍細胞 BHK−21細胞 細胞を太らすと 人間の結腸の上皮細胞。
【0007】 ROIが好中球によって生成した3T3 LI細胞が細胞障害性効果がある。
ROIが通常そうな、ROIがまた、組織損害を誘導することができることを侵
入している微生物で指令する(e。扇動的な状況(例えば関節炎、ショック、肺
病および扇動的な腸病)において、g.)、または、腫瘍開始または、DNAに
対する効果に損害を与えることのために、促進の含むことができる。ネーサン(
Szatrowskiほか(1991の)Canc.Res. 51,794−
798)腫瘍細胞のROIの世代が腫瘍に示すhypermutability
に貢献することができて、したがって、腫瘍異質性、侵入および転移に貢献する
ことができることを提案する。細胞障害性で突然変異誘発性役割に加えて、RO
Iが信号分子として理想的な特性を有すること:1)、それらは上流の信号に応
答して制御方法で発生する;2)、信号はSODおよびカタラーゼによる02−
and H2O2/ペルオキシダーゼの速い代謝によって終了されることができ
る;3)、彼らは目標分子に対する下流の効果を引き出す。eに、g.、NFカ
ッパBおよびAP−1のようなレドックスに敏感な規定するタンパク質(Sch
reckほか(1991の)EMBO J. 10,2247−2258; シュミットほか(1995の)Chemistry及びBiology 2,1
3−22)。02−およびH2O2のようなオキシダントはバクテリアの比較的
かなり定義済みの信号を送っている役割を有する。そして、コピーを管理するた
めにSoxI/II regulonを経て作動する。ROIは、細胞分裂を管
理する際の直接の役割を有するように見えて、成長に関連した病理学の状況の分
裂促進的な信号として機能することができる。これらの状況は、ガンおよび心臓
血管の病気を含む。サイトカインに応答して内皮細胞において発生する02−i
sおよび力は、血管形成で役割を演ずる(松原ほか(1986の)J. Imm
un.137,3295−3298).02−and202は、また、機能as
”life−信号に申し込まれる」。そして、細胞がアポトーシス(松原ほか(
1986の)J. Immun. 137,32953298)を経るのを防止
する。上記のように、多くの細胞は、発育因子に応答する(e。g.、小板引き
出された発育因子(PDGF)、表皮の引き出された発育因子(EGF)、アン
ギオテンシンII、そして、多様なサイトカイン)Oz’/H2O2の増加する
生成および増加する増殖を有する。ROI生成の抑制は、分裂促進的な反応を防
ぐ。exogenouslyな生成された02−and H2O2への露出は、
細胞増殖の増加に結果としてなる。応答する細胞タイプの部分的なリストは、表
2に示される(Burdon(Free Radical Biol.がMed
したR.(1995))から適応した。18,775−794).ハムスター線
維芽細胞マウス表皮の細胞人間平滑筋細胞ネズミ結腸の上皮細胞ネズミ脈管の平
滑筋ネズミ脈管の平滑筋細胞細胞While非変わる細胞がそうすることができ
る。
【0008】 表2 Superoxide Hydrogen過酸化物 人間(ハムスター線維芽細胞マウスosteoblasticな細胞Balb/
3T3細胞Balb/人間のhistiocyticな3T3セル白血病ネズミ
)はROIの生成を有する発育因子およびサイトカインに応答する。
【0009】 そして、腫瘍細胞は抑制できない方法のROIを生産するように見える。 一連の人間の腫瘍細胞は、非腫瘍細胞(Szatrowskiほか(1991の
)Canc. Res. 51,794−798)と比較して、大量の過酸化水
素を生産した。細胞が生成したラース−変わるNIH 3T3は過酸化物の量を
上げた、そして、いくつかのメカニズムによる過酸化物生成の抑制はa”nor
mal”growth発現型への復帰に結果としてなった。02−has黒色腫
を含んでいるガン細胞、胸癌、線維肉腫およびvirallyな変わる腫瘍細胞
の変わる発現型のメンテナンスの関係させる。SOD(MnSOD)のマンガン
種類の減少されたレベルはガン細胞および試験管内の変わる細胞系において測ら
れた。そして、増加する02−レベル(Burdon、R.(1995の)Fr
ee Radical Biol. Med. 18、775−794)を予測
した。頻繁に黒色腫において消失する染色体6q25に、MnSODはコード化
される。黒色腫および他のガン細胞のMnSODのOverexpressio
n(全米科学アカデミー90(3113−3117)教会のほか(1993の)
会報;フェルナンデス−Polほか(1982の)Canc.物件。42,60
9−617;Yanほか(1996の)Cane. Res. 56,2864
−2871)変わる発現型の抑制の結果としてなる。
【0010】 ROIは、血管形成の後、高血圧、アテローム性動脈硬化症およびreste
nosisと関連する脈管の平滑筋の成長に関係する。02−生成は、ウサギ大
動脈の外膜(Paganoほか(1997の)会報全米科学アカデミー94,1
4483−14488)に示す。脈管の内皮細胞は、サイトカイン(松原ほか(
1986の)J:I7n7nzm. 137,3295−3298)への02−
in反応をリリースする。また、細胞肥大を誘発するアンギオテンシンIIによ
って、培養および増加する02−世代の大動脈の平滑筋細胞によって発生する0
2−isは、刺激される。ネズミ・モデル・システムの、アンギオテンシンII
の注入がその後単離された大動脈の組織の02−生成を増加したのと同様に、高
血圧につながること(ウシオ−Fukaiほか(1996の)J. Biol.
化学271,23317−23321.;Yuほか(1997の)J. Bio
l.化学272,27288−27294)。それが脈管構造に局所化するSO
Dの種類または02−廃品回収業者防がれたアンギオテンシンIIの注入の静脈
の注入は、高血圧を誘発して、ROI生成を禁止した(福井ほか(1997の)
Circ.Res. 80,45−51)。好中球NADPHオキシダーゼ(ま
た、食細胞呼吸の爆発オキシダーゼとして公知の)は、方法を専門酵素のROI
−生成システムの研究のために用意する。この広く周到な酵素は、NADPHを
酸化させて、酸素をNADPHオキシダーゼが成る形式2eに直す多数のタンパ
ク質、そして、cytosolicなおよび膜部品の組立てによって管理する。
触媒作用の半分はflavocytochrome b558から成る。そして
、必要不可欠な原形質膜酵素が2つの構成要素から成る:gp91phox(g
pは、グリコプロテインに関連する;phoxはワード食細胞およびオキシダー
ゼの省略形である)、そして、p22phox(pは、タンパク質に関連する)
。gp91phoxは部位を結合しているNADPHと同様に1つのフラビンア
デニンジヌクレチオド(FAD)および2つのヘムを含む。p22phoxはc
ytosolicな規定するタンパク質の結合する場所として役立つC−末端・
プロリンの豊富な配列を有する。2つのシトクロム・サブユニット、gp91p
hoxおよびp22phoxは、いずれのサブユニットもの遺伝する不調の慢性
granulomatousな病気(CGD)がパートナー・サブユニット(Y
uほか(1997の)J. Biol.化学272,2728827294)の
非存在下で起こるように遺伝子の欠如から、お互いを安定させるように見える。
基本的cytosolicなタンパク質は2つのisoforms. p47p
hoxがあるp47phox(p67phoxおよび小さいGTPase Ra
c)を含む、そして、p67phoxは両方とも起動の間、オキシダーゼ部品の
組立てを決定しているタンパク質相互作用に参加するSH3領域およびprol
ine−rich領域を含む。GTP−bindingしているタンパク質Ra
cを活性化するためにグアニン・ヌクレオチド交換によって同程度よく、好中球
酵素は、p47phoxおよびおそらく他の構成要素のリン酸化によって、バク
テリアの食菌作用またはchemotacticな信号に応答して管理される。
非食細胞の組織のROIの起源は証明されていない、しかし、食細胞オキシダー
ゼ構成要素の出来事はimmunochemicalな方法、ノーザンしみおよ
び逆転写酵素−ポリメラーゼ連鎖反応(RT−PCR)によっていくつかのシス
テムで評価された。02−生成ができる細胞タイプがgp91phoxを含んで
いるphox構成要素の全てを含むために示されたRacl. Several
のためのそれが表3の下記を要約されていているように、p22phoxのため
のメッセージは広く表される。これらの細胞タイプは、内皮細胞、大動脈の外膜
およびリンパ球を含む。
【0011】 表3 Tissue g9lphox p22phox p47phox p67ph
ox好中球+1 Z +1 z +1、2 +l、z大動脈の外膜+l +l
+l +lリンパ球+2 +2 +1、2 +1、2内皮細胞+2 +2 +1
、2 +1、2 glomerular mesangialな+1、2 +1
、2 +1、2細胞線維芽細胞−+2 +1、2 +2大動脈のsm. mus
cle−+1(2) 示される1=タンパク質発現。 示される2= mRNA発現。
【0012】 明確に異なるパターンは、glomerular mesangialな細胞
、ネズミ大動脈の平滑筋および線維芽細胞を含む表3に示される他のいくつかの
細胞タイプに示す。これらの細胞において、p22phoxおよび場合によって
はcytosolicなphox構成要素があることを証明されると共に、gp
91phoxの現れは不在である。gp91phoxおよびp22phoxが好
中球のお互いを安定させるので、若干の分子(おそらくgp91phoxに関す
る)がglomerular mesangialな細胞、ネズミ大動脈の平滑
筋および線維芽細胞のROI生成を説明する多くの推測があって、(ウシオ−F
ukaiほか(1996の)J. Biol.Claim. 271,2331
7−23321)。gp91phoxの遺伝子の欠如をもつ患者からの線維芽細
胞の調査は、gp91phoxサブユニットがこれらの細胞(Emmendor
fferほか(1993の)Eur. l. Haeynatol. 51,2
23−227)のROI生成に、関係していないという証明を提供する。アンチ
センスの方法を使用している脈管の平滑筋からのp22phoxの減少は、検出
可能なgp91phox(ウシオ−Fukaiほか(1996の)J. Bio
l.化学271,23317−23321)の欠如にもかかわらず、このサブユ
ニットがこれらの細胞のROI生成に参加することを示した。甲状腺のホルモン
はミトコンドリア一呼吸上のendeffectsによる基礎の代謝率を管理す
る、そして、under−or生産過剰の条件は臨床的に重要である。甲状腺の
ホルモンの生合成を管理する薬の開発は医学的に重要な目的である、そして、こ
の経路の酵素の識別はpharmacologicallyな関連した目標を開
発することの鍵である。甲状腺は独自にヨウ化物に集中する。そして、それはチ
ログロブリン(TG)上のチロシン残留物をiodinateするために用いる
。 TGは67のtyrosyl残留物を含む大きいタンパク質(660kDa
)である。そして、その幾つかはiodinationの優先の場所である。T
GのチロシンのIodinationは、甲状腺のペルオキシダーゼ(TPO)
(原形質膜ヘムタンパク質)によって触媒作用を及ぼされる。Iodinati
onは、H2O2の以前に未確認の酵素の出所を必要とする。第2のステップは
タンパク質提携のチロキシン(T4)を形成する2つのdiiodotyros
ines(DIT)の連結である。そして、それは自由なT4を自由にするため
にその後proteolyticallyにTGから隔離される。必要であるこ
とは、甲状腺のHZOZを生成する、そして、カップリング反応および甲状腺の
ホルモン生合成を調整するためにその組成物を使用する方法に触媒作用を及ぼす
酵素をコード化する遺伝子の組成物である。この種の情報は、甲状腺の機能の変
調のための薬の開発に役立つ。この種の変調は、甲状腺機能亢進の治療に役立つ
かもしれない。最近の証拠は、刺激される発育因子のチロシンの中で酸性にクロ
スリンクすることに関係しているその酵素に線維芽細胞がfibroticな損
害に至ることができることを示唆する。肺線維症は、この状態で苦しめられる個
人に対する特に損傷である。薬が、特に肺において、軽減するかまたはfibr
oticな損害を防ぐように設計されていてもよいために、この種の酸性のクロ
ス連結している反応に関係している酵素をコード化している遺伝子の識別が必要
である。
【0013】 寄生的な病気は、世界的に不健全および死亡率の人間および動物の主な原因で
あって、農業の生産性に対する重大な衝撃も有する。寄生的な病気は、表皮(線
虫のような寄生体の厳しいexoskeletalな構造)の存在のための一部
において、扱うのが困難であると判明した。必要であることは、組成物および、
表皮を有する寄生体によって生じるそれらの寄生的な病気を含むがこれに限らず
、寄生的な病気と戦うために組成物を使用する方法である。
【0014】 したがって、必要であることは、虫をホスト防衛機構および薬物治療に影響さ
れやすくする表皮の形成を中断させる方法である。また、必要であることは、特
に非食細胞の組織および細胞において、ROI生成に関係しているタンパク質の
同一性である。
【0015】 また、必要であることは、これらのタンパク質をコードするヌクレオチド配列
およびタンパク質の主要な配列である。
【0016】 また、これらのタンパク質のためのヌクレオチド符号化を含むように設計され
ているベクターが、必要である。ヌクレオチド配列に由来する調査およびPCR
プライマーはmRNAを含むヌクレオチド配列を検出して、局所化して、測定す
るために必要である。そして、これらのタンパク質の統合に関係している。
【0017】 加えて、必要であることは、これらのベクターを有する細胞をトランスフェク
ションさせる手段である。
【0018】 また、必要であることは、これらの分子の生成の発現システムである。 また、局地化を含んでいる様々な使用、発見および測定値のためのこれらの分子
に向けられる抗体が、必要である、そして、受動免疫。
【0019】 (発明の開示) 本発明はヌクレオチド配列の新しい一系統を提供することによって上記した課
題を解決する、そして、これらのヌクレオチド配列によってコード化されるタン
パク質はduoxをタンパク質と呼んだ。
【0020】 特に、本発明はヌクレオチド配列SEQ ID NOから成る組成物を提供す
る:1およびSEQ ID NO:3、そして、断片、そして、保守的なそれに
ついて置換それ(SEQ ID NOから成るタンパク質の発現のためのコード
化する:2およびSEQ ID NO:それぞれ4、そして、断片、そして、そ
れの保守的な置換。好適なタンパク質断片は、SEQ ID NO.を含むが、
これに限定されるものではない:31およびSEQ ID NO:32。
【0021】 以下の記載によって束縛されたくないと共に、これらのタンパク質がROI生
成に関係していて、過酸化物生成を刺激するかまたは過酸化的な反応を起こすこ
とができると考えられる。
【0022】 本発明もこれらのヌクレオチド配列を含んでいるベクターを提供する。そして
、SEQ ID NOから成るタンパク質を生産するこれらのベクターによって
、細胞がトランスフェクションする:2およびSEQ ID NO:4、そして
、断片、そして、それの保守的な置換およびこれらのタンパク質および断片およ
びそれの保守的な置換に対する抗体。
【0023】 本発明も、方法をSEQ ID NOから成るタンパク質の生成のためにコー
ド化されるベクターを管理することによって細胞増殖を刺激するために提供する
:2およびSEQ ID NO:4、そして、断片、そして、それの保守的な置
換、本発明もSEQ IDから成るタンパク質を管理することによって細胞増殖
を刺激する方法にNOを提供する:2およびSEQ ID NO:4および断片
および保守的な置換それについて。SEQ ID NOから成るタンパク質:2
およびSEQ ID NO:4、そして、断片、そして、それの保守的な置換は
、線虫を含むがこれに限らず外骨格(寄生体の特に表皮)に影響を及ぼすことに
役立つ。
【0024】 本発明のヌクレオチドおよび抗体は、発見、局地化および本発明のタンパク質
の生成のための、更に、発見、局地化および本発明のタンパク質の寸法のための
核酸符号化の測定に役立つ。これらのヌクレオチドおよび抗体は、発見、局地化
および測定値の目的のためのキットの他の試薬と組み合わせられることができる
。 最も特に、本発明は活性を修正することによる細胞分裂または細胞増殖またはS
EQ IDと記述されるduoxタンパク質の発現の調整のための方法を含む:
2およびSEQ ID NO:4または断片、または、それの保守的な置換。 それらの自然に起こっているか表されたフォームにおいて、これらのタンパク質
は、これらの酵素活性の抑制を観察することによる化学のおよび薬ライブラリの
スクリーニングのための実施例のために、薬開発に役立つと思われる。
【0025】 この種の化学製品および薬は、たぶんガン、前立腺の肥大、優しい前立腺の肥
大、高血圧、代謝病気、線維症、アテローム性動脈硬化症および異常な細胞成長
または増殖を含んでいる多くの他の不調の治療として有効である、そして、動物
および収穫の下記のように様々な寄生的な病気。全ての表されたタンパク質は、
これらの分析評価に役立ってもよい。抑制または変更態様の目標であってもよい
分子の部分は、ピリジン・ヌクレオチド(NADPHまたはNADH)、フラビ
ンタンパク質領域(ほぼC−末端265のアミノ酸)および/またはフラビンア
デニンジヌクレチオド(FAD)の結合するか触媒作用の場所の結合する場所を
含むが、これに限定されるものではない。
【0026】 本発明の方法が、薬の開発または以下を含むがこれに限らず異常な成長にかか
わる状況の治療のための他の療法のために使われることができる:ガン、線維症
、肺線維症、代謝アンバランス、甲状腺のアンバランス、hyperthryo
idism、乾癬、前立腺の肥大、優しい前立腺の肥大、心臓血管の病気、血管
およびリンパ管容器、arteriovenousな奇形、目と関連する脈管の
課題、アテローム性動脈硬化症、高血圧および血管形成および寄生的な病気に続
いているrestenosisを含むがこれに限らず、容器の増殖。
【0027】 本発明の酵素は、これらの酵素活性を調整することができる薬およびその他因
子の開発の優れた目標である。それは、活性の変調がそうすることができるため
に、理解されるために強化されて中で結果が減少したということである、または
、酵素活性の欠如。異常な成長、代謝不調および線維症にかかわる状況を含むが
これに限らず、これらの酵素活性の変調は、状況の治療に役立ってもよい。SE
Q ID NO.で表されるduox酵素活性に影響を及ぼす薬:2およびSE
Q ID NO:4または断片、または、それの保守的な置換は、また、特定の
状況の治療の他の治療学と組み合わせられることができる。
【0028】 たとえば、アテローム性動脈硬化症の、そして、ホルモンの作動筋を有する処
理のための薬を下げているコレステロールまたは内分泌の不調(例えば甲状腺の
不調)の治療の敵対者については、高血圧の治療のための抗高血圧剤については
、これらの薬は、ガンの治療の血管形成抑制剤と組み合わせられることができる
。 あることはそれを理解したことは、ある本発明のタンパク質以下から成る制限さ
れない、ために(SEQ ID NO):2およびSEQ ID NO:4また
は断片、または、それの保守的な置換は、他の組成物(例えば抗寄生虫性の組成
物、農薬、除草剤および肥料)と共に管理されることができる。
【0029】 したがって、本発明のタンパク質は人間を扱うための他の組成物または家畜、
他の農場動物および家畜を含む動物と協力してか単独で役立ってもよい。そして
、寄生体(特に土線虫)によってプラントおよび収穫を攻撃から保護するために
、そして、寄生体を破壊するために防ぐかまたは寄生的な病気と得るために戦う
ために、ペットを含む。
【0030】 したがって、本発明の目的はヌクレオチド配列またはそれであるか保守的な断
片にそれの置換、タンパク質の生成のための符号化またはそれであるか保守的な
断片を提供することになっているそれについて置換、ROI生成に関係している
か、過酸化物生成を刺激するかまたは過酸化的な反応を起こす。
【0031】 本発明のもうひとつの目的は、SEQ ID NOにおいて代表されるタンパ
ク質を提供することにある。2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO
:31およびSEQ ID NO:32または断片、または、それの保守的な置
換。
【0032】 本発明のもうひとつの目的は、SEQ ID NOにおいて代表されるタンパ
ク質をコードするヌクレオチド配列を提供することにある。2(SEQ ID
NO.):4(SEQ ID NO):31およびSEQ ID NO:32ま
たは断片、または、保守的なそれについて置換、これらのヌクレオチド配列は、
SEQ ID NOを含む:1(SEQ ID NO):3または断片、または
、それの保守的な置換。
【0033】 本発明の他の目的は、exoskeletalな表皮形成を防いで、外骨格ま
たは表皮を有する有機体を害するように設計されている療法の目標として使われ
ることができるexoskeletalな表皮形成において関係するタンパク質
(それの断片またはそれの保守的な置換)(特に寄生体)を提供することである
【0034】 本発明の他の目的は、甲状腺のホルモンの生合成を禁止するように設計されて
いる療法の目標として使われることができる甲状腺のホルモン生合成において関
係するタンパク質(それの断片またはそれの保守的な置換)を提供することであ
る。
【0035】 本発明のさらに他の目的は、線維症を防ぐように設計されている療法の目標と
して使われることができる組織線維症において関係するタンパク質(それの断片
またはそれの保守的な置換)を提供することである。
【0036】 本発明のもうひとつの目的は、肺線維症を防ぐように設計されている療法の目
標として使われることができる肺線維症に関係しているタンパク質を提供するこ
とにある。
【0037】 本発明のもうひとつの目的は、これらのヌクレオチド配列を含んでいるベクタ
ーまたはそれの断片を提供することにある。 さらに、本発明の別の目的は、これらのベクターによってトランスフェクション
する細胞を提供することになっている。
【0038】 さらに別の本発明の目的は、動物および人間にこれらのベクターによってトラ
ンスフェクションする細胞を管理することになっている。 本発明のもうひとつの目的は、タンパク質またはそれについて断片、ROI生成
に関係しているか、過酸化物生成を刺激するかまたは過酸化的な反応を起こすを
提供することにある。
【0039】 他の本発明の目的がある静寂は単クローンおよび多クローン性抗体を含む抗体
またはそれの断片に提供して、タンパク質またはそれであるか保守的な断片に対
して上げたそれについて置換、ROI生成に関係しているか、過酸化物生成を刺
激するかまたは過酸化的な反応を起こす。 この種の抗体は局地化およびタンパク質またはそれの断片の寸法に役立つ。そし
て、ROI生成に関係している。
【0040】 他の本発明の目的はタンパク質またはそれであるか保守的な断片の生成のため
に、ヌクレオチド配列またはそれの断片を含んでいる遺伝子を管理するためにコ
ード化しているそれについて置換、ROI生成に関係しているか、過酸化物生成
を刺激するかまたは、動物および人間にとって、更に、動物および人間から得ら
れた細胞にとって、過酸化的な反応を起こす。
【0041】 他の本発明の目的はヌクレオチド配列を含んでいる遺伝子またはそれであるか
保守的な断片のアンチセンスの賞賛の配列にそれの置換、タンパク質の生成のた
めの符号化またはそれであるか保守的な断片を施すことになっているそれについ
て置換、ROI生成に関係しているか、過酸化物生成を刺激するかまたは、動物
および人間にとって、更に、動物および人間から得られた細胞にとって、過酸化
的な反応を起こす。
【0042】 ROI生成に関係している、過酸化物生成を刺激する、または、過酸化的な反
応を、動物および人間にとって、起こすさらに、本発明の別の目的は、それにつ
いてヌクレオチド配列または断片を含んでいるベクターを管理することによって
刺激するかまたは細胞増殖を禁ずる方法にタンパク質の生成またはそれの断片の
ための符号化を提供するためにある。
【0043】 本発明のまた、目的は、それについてそれについてヌクレオチド配列または断
片のアンチセンスの賞賛の配列を含んでいるベクターにタンパク質または断片の
生成のための符号化を施すことによって刺激するかまたは細胞増殖を禁ずるため
の方法、ROI生成に関係しているか、過酸化物生成を刺激するかまたは、動物
および人間にとって、過酸化的な反応を起こすを提供することである。 細胞増殖を刺激するこれらの方法は、様々な目的に役立つ、腫瘍形成、化学療法
に続いている血液髄細胞の刺激的な細胞増殖または放射の動物のモデルを開発し
て、を含むがこれに限らず、または、貧血症の場合には。
【0044】 ROI生成に関係している、過酸化物生成を刺激する、または、過酸化的な反
応を起こすさらに、本発明の別の目的は、発見、局地化およびヌクレオチド配列
またはそれの断片の寸法に役立つヌクレオチド調査にタンパク質の生成またはそ
れの断片のための符号化を提供するためにある。
【0045】 本発明のもうひとつの目的は、SEQ ID NOにおいて代表される核酸を
含んでいる核酸の探知に役立つキットを提供することにある。1およびSEQ
ID NO:3またはそれであるか保守的な断片それについて置換、それはタン
パク質またはそれであるか保守的な断片のためにコード化するそれについて置換
、ROI生成に関係しているか、過酸化物生成を刺激するかまたは過酸化的な反
応を起こす。
【0046】 さらに、本発明の別の目的は、発見に役立つキットおよびSEQ ID NO
において代表される核酸を含んでいる核酸の寸法を提供することになっている:
1およびSEQ ID NO:3またはそれについて断片、それはタンパク質ま
たはそれであるか保守的な断片のためにコード化するそれについて置換、ROI
生成に関係しているか、過酸化物生成を刺激するかまたは過酸化的な反応を起こ
す。
【0047】 本発明のもうひとつの目的は、SEQ ID NOにおいて代表されるタンパ
ク質を含むタンパク質の探知に役立つキットを提供することにある。2およびS
EQ ID NO.:4またはそれについて断片、ROI生成に関係しているか
、過酸化物生成を刺激するかまたは過酸化的な反応を起こす。
【0048】 さらに、本発明の別の目的は発見に役立つキットおよびタンパク質の寸法を提
供することになっている。そして、SEQ ID NOにおいて代表されるタン
パク質を含む:2およびSEQ ID NO:4またはそれについて断片、RO
I生成に関係しているか、過酸化物生成を刺激するかまたは過酸化的な反応を起
こす。
【0049】 さらに別の本発明の目的はタンパク質の局地化に役立つキットを提供すること
になっている。そして、SEQ ID NO.で表されるタンパク質を含む: 2およびSEQ ID NO:4またはそれについて断片、ROI生成に関係し
ているか、過酸化物生成を刺激するかまたは過酸化的な反応を起こす。さらに、
本発明の別の目的はあるタンパク質または断片のためのそれについて符号化を発
見、測定値または核酸またはそれの断片の局地化に役立つキットに提供する、R
OI生成に関連した異常な細胞増殖の診断および予想ために、ROI生成に関係
している。
【0050】 他の本発明の目的は、あるそれを発見、測定値またはタンパク質またはそれの
断片の局地化に役立つキットに提供する、ROI生成に関連した異常な細胞増殖
の診断および予想ために、ROI生成の含む。
【0051】 これらの、そしてまた他の、本発明の目的、特徴および利点は開示された実施
態様および添付の図面の以下の詳細な説明の再考の後、明らかになる。
【0052】 (発明の詳細な説明) 本発明はヌクレオチド配列の新しい一系統を提供することによって上記した課題
を解決する、そして、タンパク質(これらのヌクレオチド配列によってコード化
される)はduoxをタンパク質と呼んだ。term”duox”refers
to”dualオキシダーゼ」。特に、本発明はヌクレオチド配列SEQ I
D NOから成る新規な組成物を提供する:1およびSEQ ID NO:3、
そして、それであるか保守的な断片それについて置換、それぞれ、それはSEQ
IDから成るタンパク質の発現のために、NOをコード化する:2およびSE
Q ID NO:4、そして、それであるか保守的な断片それの置換。
【0053】 好適なタンパク質断片は、SEQ ID NOを含むが、これに限定されるも
のではない:31およびSEQ ID NO:32.しかし、本願明細書におい
て記載されているduoxタンパク質は、ROI生成に関係しているgp91p
hoxタンパク質に、duoxタンパク質がタンパク質の新しくてはっきりした
一系統から成る効果がある。
【0054】 本願明細書において記載されているduoxタンパク質は、3つのはっきりし
た領域を有する:ペルオキシダーゼ・タンパク質に対する異体同形を有するアミ
ンの末端の領域、calmodulin(CAM)タンパク質に対する異体同形
を有する内部領域およびmox(また、noxと呼ばれている)タンパク質に対
する異体同形を有するカルボキシ・末端の領域。人間のduox2のアミノ酸配
列は、SEQ ID NOに示される:2.duox2タンパク質をコード化し
ているヌクレオチドは、また、SEQ ID NOに示される:1.人間のdu
oxタンパク質に加えて、捜しているBLASTを使用しているゲノム・データ
ベースを有する人間のDuox1および人間のduox2の配列の比較がC.
elegansのduoxの2つの相同物の識別に結果としてなったこと(Ce
−Duox1 SEQ ID NO:3)、そして、偽遺伝子Ce−duox2
.ショウジョウバエも、少なくとも一つのduox相同物を有するように見える
。このように、遺伝子/タンパク質のduox一系統は、広く多細胞有機体に配
布される。
【0055】 gp9lphoxの高い分子量相同物は、人間(h)およびC. elega
ns(Ce)において識別されて、それらが両方とも有するDuox for”
dual oxidase”becauseと呼ばれるperoxidaseh
omology領域、そして、gp91phox領域。Ce−Duoxは、反応
性酸素を生成するためにcytosolicなNADPHを使用する。それは、
線虫のcuticular細胞外マトリックスの安定化に関係している自由なチ
ロシン・エチル・エステルの中でクロスリンクすることに触媒作用を及ぼす。
【0056】 以下の記載によって束縛されたくないにもかかわらず、duox酵素(たとえ
ばduox2およびCe−Duox1)が二重の酵素の機能を有すると考えられ
る。そして、過酸化物の生成および過酸化的なタイプ反応に触媒作用を及ぼす。
反応の後のクラスは、基板(そして、場合によっては、基板として過酸化物を利
用するために提案された)として、過酸化水素を利用する。
【0057】 過酸化水素が過酸化物の不均化から自発的に発生するので、NAD(P)Hオ
キシダーゼ領域がそれからペルオキシダーゼ領域のための基板として使われるこ
とができる過酸化物および/または水素過酸化物を生成すると考えられる。 この仮説を支持して、細胞外N−末端・ペルオキシダーゼ領域を有するC. e
legansのduox2タンパク質のモデルは開発された。そして、膜内外領
域およびNADPHが原形質膜のcytosolicな表面にある部位を結合し
た。
【0058】 細胞外過酸化物を生成する好中球NADPH−oxidaseから類推して、
それがペルオキシダーゼ領域によって利用されることができる所で、人間のdu
ox2は細胞外で過酸化物およびその副産物過酸化水素を生成するために予測さ
れる。ペルオキシダーゼ領域は、追加の生物学的機能を授けそうである。共同基
板によって、ペルオキシダーゼはハロゲン化(例えばmyeloperoxid
aseによる次亜塩素酸(HOC1)の生成および甲状腺のペルオキシダーゼに
よってチロキシンを形成するチロシンのiodination)を含んでいる様
々な反応に参加することができる。ペルオキシダーゼは、また、不飽和結合の多
い脂肪質の酸の代謝において、そして、コラーゲン(ウニovoperoxid
aseによって)のチロシンの化学的処理において参加するために文書化された
【0059】 この記載によって束縛されたくないにもかかわらず、duox2の予測された
膜内外性質が形成のその機能または細胞外マトリックスまたは基底膜の変更態様
を容易にすると考えられる。細胞外マトリックスが腫瘍細胞成長、侵入および転
移で重要な役割を演ずるので、duoxタイプ酵素がこの種の状況で病原性の役
割を演ずると考えられる。上記したヌクレオチド配列に加えて、本発明もそれに
ついてこれらのヌクレオチド配列およびそれの断片を含んでいるベクターまたは
保守的な置換にSEQ IDから成るタンパク質を生産するこれらのベクターに
よってトランスフェクションする細胞を提供すること:2およびSEQ ID
NO:4、そして、それであるか保守的な断片それの置換、そして、これらのタ
ンパク質およびそれの断片に抗体。
【0060】 本発明も方法をベクターを管理することによる刺激的な細胞増殖またはベクタ
ーを含んでいる細胞のために用意する。そして、SEQ ID NOから成るタ
ンパク質の生成のためにコード化される:2(SEQ ID NO):4および
それの断片。
【0061】 本発明のヌクレオチドおよび抗体は、発見、局地化および本発明のタンパク質
の生成のための、更に、発見、局地化および本発明のタンパク質の寸法のための
核酸符号化の測定に役立つ。これらのヌクレオチドおよび抗体は、発見、局地化
および測定値の目的のためのキットの他の試薬と組み合わせられることができる
。これらのキットは診断に役立つ、そして、細胞増殖を含んでいる状況の予想は
反応性酸素中間物の生成と関連した。
【0062】 本発明は、ヌクレオチド配列SEQから成る組成物にIDいいえを提供するこ
とによって上記した課題を解決する:1およびそれの断片およびそれの保守的な
置換。
【0063】 本発明も、ヌクレオチド配列SEQ ID NOから成る組成物を提供する:
3およびそれの断片およびそれの保守的な置換。
【0064】 本発明は、タンパク質SEQ ID NOから成る組成物を提供する:2、そ
して、断片、そして、保守的な置換は、それについてヌクレオチド配列SEQ
ID NOによって、コード化した:1および断片および保守的な置換それにつ
いて。
【0065】 本発明は、タンパク質SEQ ID NOから成る組成物を提供する:4およ
び断片および保守的な置換は、それについてヌクレオチド配列SEQ IDによ
ってNOをコード化した:3および断片および保守的な置換それについて。好適
なタンパク質断片は、SEQ ID NOを含むが、これに限定されるものでは
ない:31およびSEQ ID NO:32.本発明も、ヌクレオチド配列SE
Q ID NOを含んでいるベクターを提供する:1およびSEQ ID NO
:3またはそれの断片。
【0066】 本発明も、これらのベクターによってトランスフェクションする細胞を提供す
る。加えて、本発明はヌクレオチド配列SEQ ID NOによって、安定して
トランスフェクションする細胞を提供する:1またはそれの断片。
【0067】 本発明も、ヌクレオチド配列SEQ ID NOによって、安定してトランス
フェクションする細胞を提供する:3またはそれの断片。
【0068】 本発明は、ヌクレオチド配列SEQ ID NOによって、安定してトランス
フェクションする細胞を提供する:1または断片、または、保守的なそれについ
て置換、それはタンパク質SEQ ID NOを生産する:2または断片、また
は、それの保守的な置換。
【0069】 加えて、本発明はヌクレオチド配列SEQ ID NOによって、安定してト
ランスフェクションする細胞を提供する:3または断片、または、それの保守的
な置換、それはタンパク質SEQ ID NOを生産する:4または断片、また
は、それの保守的な置換。
【0070】 本発明は、方法をヌクレオチド配列SEQ ID NO.によって、安定して
トランスフェクションする細胞を管理することによって成長を刺激するために提
供する:1または断片、または、それの保守的な置換、それはタンパク質SEQ
ID NOを生産する:2または断片、または、それの保守的な置換。
【0071】 本発明も、方法をヌクレオチド配列SEQ ID NOによって、安定してト
ランスフェクションする細胞を管理することによって成長を刺激するために提供
する:3または断片、または、保守的なそれについて置換、それはタンパク質S
EQ ID NOを生産する:4または断片、または、それの保守的な置換。具
体的には、本発明は方法をヌクレオチド配列SEQ ID NOによって、安定
してトランスフェクションする細胞を管理することによって腫瘍形成を刺激する
ために提供する:1またはそれについて断片、それはタンパク質SEQ ID
NOを生産する:2またはそれの断片。
【0072】 本発明も、方法をヌクレオチド配列SEQ ID NOによって、安定してト
ランスフェクションする細胞を管理することによって腫瘍形成を刺激するために
提供する:3またはそれについて断片、それはタンパク質SEQ ID NOを
生産する:4またはそれの断片。本発明は、また、SEQ ID NOにアンチ
センスのヌクレオチド配列を開発するために用いてもよい:1およびSEQ I
D NO:3またはそれの断片。これらのアンチセンスの分子は、ヌクレオチド
配列(例えばSEQ ID NO)の翻訳のじゃまをするために用いてもよい:
1およびSEQ ID NO:3またはそれについて断片、それはSEQ ID
NOのようなタンパク質のためにコード化する:2(SEQ ID NO):
4またはそれの断片。これらのアンチセンスの分子の内閣または、人間および動
物にとって、反感覚分子のためのベクター符号化は、SEQ ID NOのよう
なタンパク質の生成のじゃまをする:2(SEQ ID NO.):4またはそ
れの断片(ROIおよび禁じている細胞増殖のこのことにより減少している生成
)。
【0073】 これらの方法は、腫瘍の進行、表皮形成および脈管の成長の、そして、生体内
に腫瘍成長、脈管の成長および表皮形成に影響を及ぼすための処理の効力の研究
のための研究ために、動物のモデルを生産することに役立つ。本発明も方法を薬
の高いスループット・スクリーニングおよび本発明または断片の酵素またはそれ
の保守的な置換の増殖的な活性を調整する化学製品のために用意する。そして、
それによって細胞分裂、代謝活性、表皮形成、線維症および酸性の反応を含んで
いる他の生物学的機能に影響を及ぼす。
【0074】 これらの酵素の増殖的な活性または酸性の活性を調整する化学製品のために、
組合せの化学のライブラリは、隠されることができる。薬および化学製品は表さ
れるか内部から発生するタンパク質の酵素活性を調整するそれらの能力に基づい
て評価されることができる。そして、それらの表されたSEQ ID NOを含
む:2およびSEQ ID NO:4または断片、または、それの保守的な置換
。内部から発生するタンパク質は、多くの異なる組織または細胞(例えば結腸細
胞)から得られることができる。
【0075】 薬は、また、SEQ ID NOによって表される表されるか内部から発生す
るタンパク質に縛るそれらの能力に基づいて評価されることができる:2および
SEQ ID NO:4または断片、または、それの保守的な置換。酵素活性は
、NADHに依存する過酸化物世代がholoproteinによって触媒作用
を及ぼしたNADPH−orであってもよい。酵素活性は、また、NADHに依
存するジアホラーゼ活性がholoproteinかフラビンタンパク質領域に
よって触媒作用を及ぼしたNADPH−orであってもよい。フラビンタンパク
質によって、領域はほぼSEQ ID NOに示される酵素のCtermina
l半分を定められる:2およびSEQ ID NO:4または断片、または、そ
れの(ほぼC−末端265のアミノ酸)保守的な置換。gp91phoxのこの
断片は、シトクロムc、nitrobluetetrazoliumおよび他の
染料の方へNADPHに依存する還元酵素活性を有する。
【0076】 表されたタンパク質またはそれの断片が、既存の組合せの化学のライブラリの
ロボットのスクリーンのために使われることができる。以下の記載によって束縛
されたくないと共に、部位を結合している部位およびFADを結合しているNA
DPHまたはNADHがduox酵素または断片に縛る薬および他の組成物の能
力またはそれの保守的な置換を評価することに役立つと考えて、または、それら
の酵素活性を調整すること。holoproteinの使用またはC−末端半分
または端領域は、高いスループット薬スクリーンを開発するために好まれる。そ
の上、duox領域(ペルオキシダーゼ領域)のN−末端3分の1は、また、ペ
ルオキシダーゼ活性を禁止して、高いスループットの更なる開発のために、スク
リーンに薬を混ぜるために薬および他の組成物の能力を評価するために用いても
よい。
【0077】 本発明も、SEQ ID NOのような酸性の酵素の方向を目指す抗体を提供
する:2およびSEQ ID NO:4、そして、断片、または、それの保守的
な置換。好適なタンパク質断片は、SEQ ID NOを含むが、これに限定さ
れるものではない:31およびSEQ ID NO:32.本発明の抗体は、局
地化を含んでいる様々な目的、発見およびタンパク質SEQ ID NOの測定
に役立つ:2およびSEQ ID NO:4、そして、断片、または、それの保
守的な置換。抗体は、これらの目的を達成するためにキットで使用されることが
できる。これらの抗体は、また、細胞の選択された殺害のための細胞障害性薬品
に結合されることができる。項抗体は、抗体(例えばIgG、IgMおよび他の
クラス)のいかなるクラスも含むはずである。Fab断片およびFab + F
c断片を含むがこれに限らず、項抗体も、完全に完全な抗体、更にはそれの断片
を含む。
【0078】 本発明も、ヌクレオチド配列SEQ ID NOを提供する:1およびSEQ
ID NO.:3、そして、断片、または、それの保守的な置換。これらのヌ
クレオチドは、局地化を含んでいる様々な目的、発見およびSEQ ID NO
であると述べられるタンパク質の統合に関係しているメッセンジャRNAの測定
に役立つ:2およびSEQ ID NO:4、そして、断片、または、それの保
守的な置換。これらのヌクレオチドが、また、局地化、発見およびメッセンジャ
RNAのような核酸の寸法のためのラベルをつけられた調査のまたは代わりにS
EQ ID NOに示されるヌクレオチド配列を含んでいるより大きいヌクレオ
チド配列の隔離のための構造において使われることができる:1およびSEQ
ID NO:3または断片、または、それの保守的な置換。これらのヌクレオチ
ド配列は、相応する岸を従来技術において当業者にとって公知の技術を使用して
いる他の種から分離するために用いてもよい。これらのヌクレオチド配列は、ま
た、調査および相補的な岸を作るために用いてもよい。
【0079】 最も特に、本発明はSEQ ID NOであると述べられるタンパク質を修正
することによって成長の変調のための方法を含む:2およびSEQ ID NO
.:4または断片、または、それの保守的な置換。作用するいかなる分子も細胞
分裂に影響を及ぼすと定めるために本願明細書において用いられるterm”m
itogenic regulators”is。男女両方の人間を意味するた
めに本願明細書において用いられるterm”animal”isおよび人間以
外の動物。
【0080】 文脈が不適当でない限り、本願明細書において用いられるterms”a」,
an”and”the”asは一つ以上を意味して、複数を含むために定義さ
れる。
【0081】 「タンパク質」、ペプチド、polypeptides”and「アルファ・
カーボンが1つのアミノ酸のアルファ・カーボンのカルボキシル基およびアミン
のグループの他のアミノ酸のアルファ・カーボン間の凝結反応によって形成され
るペプチド結合で結合されるアミノ酸(概してL−アミノ酸)のoligope
ptides”are連鎖。
【0082】 鎖(i. e.(アミンの末端))の一端の末端のアミノ酸は、自由なアミン
のグループを有する。その一方で、鎖の他端で末端のアミノ酸(i. e.、カ
ルボキシ・末端)自由なカルボキシル基を有する。
【0083】 このように、term”amino終点」(Nterminusを略記した)
は、タンパク質のアミンの末端でまたはタンパク質の範囲内の他のいかなる場所
でものアミノ酸のアルファ−アミノ基(ペプチド結合に参加するときに、imi
noは集まる)にアミノ酸上の自由なアルファ−アミノ基に関連する。
【0084】 同様に、term”carboxy終点」(C−終点を略記した)は、アミノ
酸上の自由なカルボキシル基に関連するカルボキシ・タンパク質のまたはタンパ
ク質の範囲内の他のいかなる場所でものアミノ酸のカルボキシル基に終点。
【0085】 概して、タンパク質をやめているアミノ酸は、命令、アミンの末端の出発およ
び増加すること際に番号をつけられる方向のの方へカルボキシ・タンパク質の末
端。1つのアミノ酸が前記to”follow”anotherであるときに、
そのアミノ酸が閉じるものを配置されて、このようにカルボキシ・タンパク質の
末端前のアミノ酸に。それをアミノ酸(DまたはL)または模倣のアミノ酸に委
託するために本願明細書において用いられるterm”residue”isは
、アミド結合によってタンパク質に組み込まれる。このように、アミノ酸は自然
に起こっているアミノ酸であってもよいかまたは一方、制限されない限り、自然
に起こっているアミノ酸(i. e.(アミノ酸擬似))と同様の方法で機能す
る自然のアミノ酸の周知のアナログを含むことができる。さらに、模倣のアミド
結合は、当業者にとって周知のペプチド・バックボーン変更態様を含む。
【0086】 さらに、上記したように、技術のうちの1つは、それを認識する;個々の置換
、削除またはコード化された配列のアミノ酸(概して5%(より概して1%未満
の)未満の)の単一のアミノ酸または少ないパーセンテージを変えるか、加える
かまたは削除する加算は、変更が化学的に類似したアミノ酸を有するアミノ酸の
置換に結果としてなる保守的に修正されたバリエーションである。機能的に類似
したアミノ酸を提供している保守的な置換テーブルは、公知技術である。
【0087】 以下の6つのグループは、各々お互いのための保守的な置換であるアミノ酸を
含む: 1) アラニン(A)、セリン(S)、トレオニン(T); 2) アスパラギン酸(D)(グルタミン酸(E)); 3) アスパラギン(N)(グルタミン(Q)); 4) アルギニン(R)(リジン(K)); 5) イソロイシン(I)、ロイシン(L)、メチオニン(M)、バリン(V)
; そして、 6)Phenylalanine (F)、Tyrosine(Y)、Tryp
tophan(W)。
【0088】 ペプチドが長さ(i. e.(約50未満のアミノ酸))に比較的不足してい
るときに、それらは標準の化学のペプチド統合技術を使用して、しばしば合成さ
れる。配列のC−末端・アミノ酸が配列の残留するアミノ酸の連続した追加が続
く不溶性のサポートに取り付けられる強力なフェーズ合成は、本願明細書におい
て記載されている抗原性のエピトープの化学の統合のための好適な方法である。
強力なフェーズ合成の技術は、当業者にとって公知である。あるいは、本願明細
書において記載されている抗原性のエピトープは、再結合物核酸方法論を使用し
て合成される。通常、これはペプチドまたはタンパク質をコード化する核酸配列
をつくることを含む。そして、特定のプロモータの管理下の発現カセットの核酸
を配置して、ホストのペプチドまたはタンパク質を表して、表されたペプチドま
たはタンパク質を分離して、必要な場合、ペプチドまたはタンパク質をrena
turingする。この種の手順による技術のうちの1つを導くのに十分な技術
は、文学において見つかる。所望のいくつかのタンパク質断片またはペプチドが
ベクターに組み込まれるヌクレオチド配列においてコード化されるときに、技術
のうちの1つはタンパク質断片またはペプチドが一つ以上のアミノ酸からなる間
隔保持装置分子(例えばペプチド)によって分離されることができると従来技術
において認める。通常、間隔保持装置は所望のタンパク質断片またはペプチドを
結び付けるかまたは最小限のある距離またはそれらとの他の空間の関係を保存す
るより、別の特定の生物学的活性を有しない。しかし、間隔保持装置の組成のア
ミノ酸は、分子(例えば折りたたみ、ネット負担または疎水性)の若干の特性に
影響するのに選ばれることができる。表された再結合物タンパク質の浄化に役立
ってもよい残留物の生成をコードするヌクレオチド配列は、ベクターに組み込ま
れることができる。
【0089】 この種の配列は、従来技術において周知である。たとえば、ボリエステル繊維
ヒスチジン・配列をコードするヌクレオチド配列は、ニッケル・コラム上の表さ
れた再結合物タンパク質の浄化を容易にするためにベクターに加えられることが
できる。一旦表されると、再結合物ペプチド、ポリペプチドおよびタンパク質は
従来技術において当業者にとって公知の標準の手順によって精製されることがで
きる。そして、硫酸アンモニウム沈殿、類似性コラム、コラム・クロマトグラフ
ィ、ゲル電気泳動などを含む。99%の均質性に対する約50の実質的に純粋な
組成物は好まれる、そして、95%またはより大きい均質性に対する80は治療
的な因子としての用途のために最も好適である。技術のうちの1つは、化学の統
合、生物学的発現または浄化の後、所望のタンパク質、それの断片およびペプチ
ドが実質的に異なる形態を所有することができると従来技術において認識するタ
ンパク質、それの断片およびペプチドの自国の形態に。この場合、それはしばし
ばタンパク質を特性を奪って、減らすのに必要でそれからre−foldにタン
パク質が生じるために好適な形態に夢中である。減少して、タンパク質の特性を
奪って、re−foldingすることを誘導する方法は、従来技術において技
術のそれらにとって周知である。
【0090】 本発明の遺伝子の構造物は、それについて異なるタンパク質、断片およびペプ
チドのための符号化配列を含む。遺伝子の構造物も、浄化または表されたタンパ
ク質の探知を許可するように選ばれるエピトープまたは領域を含む。この種のエ
ピトープまたは領域は、グルタチオンS−転移酵素、hexahistidin
e、thioredoxin、赤血球凝集素抗原、タンパク質を結合しているマ
ルトースおよび従来技術において技術のうちの1つにとって共通に公知の他から
領域を結合しているグルタチオンをコード化しているDNA配列を含む。好適な
遺伝子の構造物は、SEQ ID NOのヌクレオチド配列を含む:1およびS
EQ ID NO:3または断片、または、それの保守的な置換。
【0091】 追加であるか他のヌクレオチド配列が以下のためにコード化する命令の遺伝子
の構造物に含まれることができると理解されることになっている:多数のa)は
、それについて所望のタンパク質、断片またはペプチドの中でコピーする;所望
のタンパク質、それについて断片またはペプチドのb)さまざまな組合せ;そし
て、所望のタンパク質、それの断片またはペプチドのc)保守派変更態様、そし
て、それの組合せ。
【0092】 本発明の好適なさらに、別のタンパク質は、人間のduox2である(SEQ
ID NO:2)タンパク質、そして、断片、または、それの保守的な置換S
EQ ID NOによってコード化されるように:1、そして、断片、または、
それの保守的な置換。本発明の好適な他のタンパク質は、Ce Duox 1(
SEQ ID NO:4)タンパク質であるか断片であるか保守的であるそれの
SEQ ID NOによってコード化されるように置換:3、そして、断片、ま
たは、それの保守的な置換。
【0093】 本発明のヌクレオチド配列は、また、たとえば、代わりとして継がれたメッセ
ージの探知を許可する高い厳しさ状況の下で、DNAまたはRNAヌクレオチド
配列のような核酸に雑種を産むために使用されることができる。遺伝子の構造物
は、再結合物タンパク質を生産するためにpcDNA−3本のベクター(Inv
itrogen、Carlsbad、CA)の再結合物配列を使用しているNI
H 3T3細胞において、例えば発現システムで表される。好適な発現システム
はコス−7つの細胞を含むが、これに限定されるものではない。そして、昆虫細
胞が再結合物baculovirusおよびイーストを使用する。従来技術にお
いて技術のうちの1つにとって公知の他の発現システムが本発明の遺伝子の構造
物の現れのために使われることができると理解されることになっている。本発明
の好適なタンパク質は、本願明細書において人間のduox2または断片と称さ
れるかまたは保守的であるそれについて置換、それはSEQ ID NOに記載
されるアミノ酸配列を有する:かなり逆方法の再結合物タンパク質の機能を変え
ない定義において定義したアミノ酸置換を有する2またはアミノ酸配列。本発明
の好適な他のタンパク質は、Ce Duox 1である(SEQ ID NO.
:4)SEQ ID NOによってコード化されるように、断片またはそれの保
守的な置換をまたは:3、そして、断片、または、それの保守的な置換。 Terminology Asが本願明細書において記載されて、SEQに記載
のアミノ酸配列から成るタンパク質に対するterm”human duox2
”refersは、いいえの身元を確認する:2または断片、または、保守的な
それについて置換、そして、SEQ ID NOにて説明したように、ヌクレオ
チド配列によってコード化した:1または断片、または、それの保守的な置換。
Ce duoxは、C. elegansまたは断片からのduoxまたはそれ
の保守的な置換に関連する。Recombi7lant遺伝子の構造 所望の遺伝子は転送ベクター(例えばpcDNA3)に結さつされる、そして
、再結合物はコス−7つの細胞のような宿主細胞を変えるために用いる。共通に
、従来技術において当業者にとって公知であるように、異なる転送ベクター、宿
主細胞およびトランスフェクション方法が使用されることができると理解される
ことになっている。トランスフェクションに用いられる2つの所望の遺伝子は、
SEQ ID NOに示される:1およびSEQ ID NO:3.たとえば、
トランスフェクションをlipofectamine−mediatedして、
活発な相応する組換えにおいて3T3セルDuox1遺伝子をNIHにもたらす
ために用いる。合成遺伝子はクローンをつくられる、そして、duox遺伝子を
含んでいる再結合物構造物が生じて、コス−7つの細胞系の合流する単分子層培
養において発達する。好ましくは類似性クロマトグラフィ技術を使用して、表さ
れた再結合物タンパク質はそれから精製される、そして、その純度および特性は
周知の方法によって決定した。様々な発現システムは、再結合物タンパク質の発
現のために使用されることができる。この種の発現方法は、以下を含むが、これ
に限定されるものではない:それらが大腸菌およびBacillus subt
ilisを利用することを含むバクテリアの発現システム;ウイルス・システム
; イースト発現システム;培養された昆虫および哺乳類の細胞;そして、従来技術
において当業者にとって公知の他の発現システム。
【0094】 細胞のトランスフェクション 本発明のベクターがいかなる所望の細胞もまたは細胞系にトランスフェクション
することができると理解されることになっている。細胞の悪および試験管内のト
ランスフェクションは、本発明の一部として活発に熟慮される。トランスフェク
ションのための好適な細胞は、以下を含むが、これに限定されるものではない:
線維芽細胞(おそらく、高まることは治療するおよび皮膚形成を巻いた)、顆粒
白血球(エイズおよび無形成性貧血に示すように障害を生じる免疫性のシステム
の機能を増やす可能な利点)、筋肉細胞、神経芽細胞、幹細胞、骨髄細胞、骨芽
細胞、Bリンパ球およびTリンパ球。
【0095】 細胞は、従来技術において当業者にとって公知の様々な方法によってトランス
フェクションすることができて、以下を含むが、これに限定されるものではなく
なることができる:electroporation、遺伝子銃、リン酸カルシ
ウム、lipofectamineおよび、アデノウイルス・トランスフェクシ
ョン・システムと同じく、fugene。SEQ ID NOにおいて代表され
る核酸によってトランスフェクションする宿主細胞:1およびSEQ ID N
O.:3または断片、または、それの保守的な置換は、タンパク質SEQ ID
NOを表すために用いる:2およびSEQ ID NO:それぞれ、4または
断片またはそれの保守的な置換。これらの表されたタンパク質は、抗体を上げる
ために用いる。これらの抗体が、表皮形成に影響を及ぼすために、そして、発見
、局地化およびSEQ ID NOに示されるタンパク質の寸法のために、du
oxタンパク質のうちの1つを表しているガンに対して、免疫治療を含むがこれ
に限らず様々なアプリケーションのために使われることができる:2およびSE
Q ID NO:4または断片、または、それの保守的な置換。
【0096】 (表されたタンパク質の浄化および特徴描写) 本発明のタンパク質は、ボリエステル繊維ヒスチジン構成要素を有する融合タ
ンパク質として表されることができるヘキサ・ヒスチジン、そして、ニッケルを
使用している金属類似性コラムまたはコバルト類似性マトリックスに縛ることに
よって浄化する。タンパク質は、また、グルタチオンS−転移酵素を有する融合
タンパク質として表されることができて、グルタチオン・アガロース・マトリッ
クスを使用している類似性クロマトグラフィによって浄化した。タンパク質は、
また、赤血球凝集素抗原を有する実施例のために、融合タンパク質としてそれを
表すことによってimmunoaffinityクロマトグラフィによって精製
されることができる。陰イオンおよび陽イオン交換クロマトグラフィを含む従来
のクロマトグラフィおよび浄化方法によって、表されるか自然に起こっているタ
ンパク質はまた、精製されることができる。そして、ゲル除外クロマトグラフィ
、hydroxylapatiteクロマトグラフィ、クロマトグラフィを結合
している染料、硫酸アンモニウム沈殿、有機溶媒の沈殿または他の技術が従来技
術において共通に技術のうちの1つにとって公知である。
【0097】 (表されたタンパク質の活性を査定する方法) 異なる方法は、SEQ ID NOであると述べられるタンパク質を含むがこ
れに限らず、本発明の表されたタンパク質の活性を査定することに利用できる:
2およびSEQ ID NO:4、それの置換されたアナログ、そして、断片、
または、それの保守的な置換。1. holoproteinの分析評価および
過酸化物生成のためにそれの断片: A.一般的な考慮。 これらの分析評価は、本発明の酵素活性を調整するように設計されている薬の効
力を査定することに役立つ。holoproteinは、3T3セル、COS−
7つの細胞、NIH、昆虫細胞(baculoviralな技術を使用すること
)または従来技術において技術のうちの1つにとって公知の方法を使用している
他の細胞において表されることができる。膜分数または精製されたタンパク質が
、分析評価のために使われる。分析評価は、要求することができるかまたは潜在
的に他の未確認の要因と同様に他の細胞タンパク質(例えばp47phox、p
67phoxおよびRacl)によって増やされることができる(e。g.、キ
ナーゼまたは他の規定するタンパク質)。
【0098】 B. Cytochrome c減少 約100ttMの集中において、NADPHまたはNADHが減少している基
板として使われる。シトクロムcの減少は550ナノメートルで吸光度の増加に
よって分光測光法でモニタされる。そして、絶滅を21のmM’lcm’1の係
数とみなす。分析評価は、不在および約10の水差し過酸化物dismutas
eの存在において実行される。過酸化物に依存する減少は、過酸化物dismu
taseがある場合には、それなしで過酸化物dismutaseの非存在下で
シトクロムc減少として定義される(Uhlingerその他(1991の)J
. Biol. Chenz. 266,20990−20997)。Acet
ylatedされたシトクロムcがまた、使われることができる。これは、次の
ことの故である。acetylatedされたシトクロムcの減少は過酸化物だ
けを経てあると思われる。
【0099】 C. Nitroblueテトラゾリウム減少 nitroblueテトラゾリウム(NBT)減少のために、同じ一般的なプ
ロトコルが使われる。但し、次の場合は除く−NBTがシトクロムcの代わりに
使われる。一般に、酸化するNBTは、青(シグマ、セントルイス、MO)がハ
ンクス・緩衝液において加えられるフィルターをかけられた0.25の% ni
trotetrazoliumのまたは過酸化物dismutase(シグマ)
およびサンプルの約600のUnitsを有する1mLについて、ほぼ37のC
.で培養されてある減少するNBTが青くて不溶性である間、明白である。 不溶性の製品は遠心分離によって集められる、そして、ペレットは約1mLのピ
リジン(シグマ)の中に再懸濁されて、減少するNBTを可溶性にするために1
00Cで約10分間熱くなった。減少するNBTの集中は510ナノメートルで
吸光度を測定することによって決定される。そして、11,000のM’lcm
’1の絶滅係数を使用する。非処理のウェルは、細胞番号を決定するために用い
る。
【0100】 D.発光 過酸化物生成は、また、lucigenin(ビスNmethylacrid
inium硝酸塩、シグマ、セントルイス、MO)を利用している化学ルミネセ
ンス発見システムでモニタされることができる。サンプルは、約150nLハン
クス溶液の量の約100uM NADPH(シグマ、セントルイス、MO)およ
び10juM lucigenin(シグマ、セントルイス、MO)を混ぜ合わ
せられる。発光は、約5分の合計のためのほぼ1分の間隔で、0.5の秒/読み
込みのためのLumiCounter(パッカード、Downersグローヴ、
IL)を使用している96−ウェルプレートにおいてモニタされる;各々のデー
タセットの最も高い安定した価値が、比較のために使われる。上のように、過酸
化物dismutaseは、発光が過酸化物から起こるということを証明するた
めに若干のサンプルに加えられる。空白の緩衝液は、各々の読み込みから減じら
れる(ウシオ−Fukaiその他(1996の)J. Biol.化学271,
23317−23321)。
【0101】 完全な細胞のE. Assays 過酸化物生成のための分析評価は、3T3セル完全な細胞(たとえばduox
−トランスフェクションするNIH)を使用して実行されることができる。 原則として、上記の分析評価のいずれでも、使って3T3セル完全な細胞(たと
えばduox−トランスフェクションするNIH)を使用している過酸化物生成
を評価する。NBT減少は、好適な分析評価方法である。
【0102】 2. 以下の記載によって束縛されたくないと共に、頭を切って短くされたタ
ンパク質の分析評価がほぼC−末端265のアミノ酸残留物から成って、ほぼC
terminalな265のアミノ酸残留物から成る頭を切って短くされたタン
パク質は過酸化物を生成すると思われない、したがって、過酸化物dismut
aseは頭を切って短くされたタンパク質の分析評価において加えられない。基
本的には、類似した分析評価は確立される、そして、NBT、シトクロムc、d
ichlorophenolindophenol、フェリシアン化物またはr
edox−activeな他の染料の過酸化物から独立した減少は調べられる。
【0103】 ヌクレオチドおよび核酸調査 ヌクレオチド配列SEQ ID NO:1およびSEQ ID NO:それぞ
れ、断片またはそれの保守的な置換としてのウェルおよびPCRプライマーとし
てしたがって、3が局地化、発見およびSEQ ID NOに関する核酸の寸法
のために使われることができる:1およびSEQ ID NO:断片またはそれ
の保守的な置換と同じく、3。SEQ ID NO 1は、また、本出願の人間
のduox2をコード化しているヌクレオチド配列として公知である。SEQ
ID NO:3は、また、本出願のCe duox 1をコード化しているヌク
レオチド配列として公知である。ヌクレオチド配列SEQ ID NO:1(S
EQ ID NO):断片またはそれの保守的な置換と同じく、3はヌクレオチ
ド配列SEQ ID NOを含んでいるより大きいヌクレオチド配列を分離する
ために調査をつくるために用いてもよい:1(SEQ ID NO):それぞれ
、3。 ヌクレオチド配列SEQ ID NO:1(SEQ ID NO):断片または
それの保守的な置換と同じく、3はまた、他の種のduoxタンパク質を識別し
て、分離するために調査をつくるために用いてもよい。
【0104】 本願明細書において記載されている核酸は、SEQ ID NOの生成のため
のメッセンジャRNA符号化を含む:2(SEQ ID NO):4およびそれ
の断片。この種の核酸は、cDNA調査を含むが、これに限定されるものではな
い。これらの調査は、従来技術において当業者にとって公知の様々な方法でラベ
ルをつけられることができる。この種の方法は、含むが、これに限定されるもの
ではないアイソトープで非アイソトープのラベルをつけている。これらの調査が
、原位置にSEQ ID NOのためのmRNA符号化のような核酸の局地化の
ための交雑のために使われることができる:2およびSEQ ID NO:4、
そして、断片、または、それの保守的な置換。局地化は、従来技術において当業
者にとって公知の技術を使用している解像度の超構造で軽い微細なレベルで、原
位置に交雑を使用して実行されることができる。これらの調査は、また、溶液交
雑を含むがこれに限らず技術の当業者にとって公知の技術を使用している核酸お
よびmRNAレベルの検出して、量をはかるために使用されることができる。
【0105】 抗体生成 SEQ ID NO.で示されるタンパク質:2(SEQ ID NO):4
つのSEQ ID NO:31およびSEQ ID NO:32または断片、ま
たは、それの保守的な置換は、製薬組成物を生産する薬学的に受け入れられるキ
ャリアまたは車両と組み合わせられて、従来技術において当業者にとって公知の
方法を使用している多クローン性抗体の生成のための動物に貢献した。抗体生成
のための好適な動物は、ウサギおよびマウスである。他の動物は、これらのタン
パク質を有する免疫またはそれの断片のために使用されることができる。この種
の動物は、以下を含むが、これに限定されるものではない;羊、馬、ブタ、ロバ
、牛、猿および齧歯動物(例えばモルモットおよびネズミ)。
【0106】 受け入れられるキャリアまたは薬学的に受け入れられるvehicle”ar
eが水または生理食塩水を含むがこれに限らずいかなる液体も、油、ゲル、塗剤
、溶媒、希釈剤、流体軟膏ベース、リポソーム、ミセル、巨大なミセル、などを
意味するために本願明細書において使用した、逆生理的反応が生じることのない
生きている動物性であるか人間のティッシュと接触して、使用に適している、そ
して、有害な方法の組成物の他の構成要素と、相互に作用しないterms”p
harmaceutically。製薬組成物は、装置投薬形式において便利に
示されることができて、従来の製薬技術によって準備されることができる。この
種の技術は、関連に活性成分および医薬にキャリア(s)または賦形剤(s)を
持ってくるステップを含む。一般に、公式化は一様に備えられて、関連に個人的
に液体キャリアを有する活性成分を持ってきている。非経口の管理に適している
公式化は、酸化防止剤、緩衝液、静菌剤および公式化が意図された受取人の血液
によって等張になる溶質を含むことができる水で非水の不毛な注入溶液を含む;
そして、因子を懸架して、因子を厚くすることを含むことができる水で非水の不
毛なサスペンション。公式化は、装置−服用か複数の服用コンテナ(たとえば密
封されたアンプルおよび小びん)において示されることができて、直ちに使用よ
り重要な不毛な流動運送業者(たとえば注入のための水)に、加算だけを要求し
ているfreezedriedされた(凍結乾燥された)状態に格納されること
ができる。即座の注入溶液およびサスペンションは不毛な粉から準備されること
ができる。そして、微粒およびタブレットが従来技術において共通に当業者によ
って使われる。好適な装置投薬公式化は、服用または装置を含んでいるそれらま
たは、管理された成分の中で、それの適当な一部分である。成分(特に上で言及
される)に加えて本発明の公式化が従来技術において当業者によって共通して使
う他の因子を含むことができると理解されなければならない。鼻で、筋内で、皮
下で、皮内で局所の製薬組成物が、直腸の、非経口の異なるルート(例えば口の
、含んでいるbuccalおよび舌下腺)(エアゾール)によって管理されてあ
ってもよい。溶液、エマルジョンおよびサスペンションを含むがこれに限らず、
本発明の組成物が別に管理されることができる医薬は、ミクロスフェア、分子、
microparticles、nanoparticlesおよびリポソーム
を形成する。約1から7まで投薬が免疫摂生につき必要であることができること
を思われる。最初の注入は、約0から変動することができる。800の水差しに
対する約1つのAgの好適な範囲については、1mgまでzug、そして、より
好適な範囲の500の水差しに対するほぼ25のギャグから。ブースタ注入は、
0から変動することができる。1mgまでzug、好適な範囲を有するのほぼ、
mg 800p. gおよび500のj−tg.に対する約10の水差しのより
好適なシリーズに。管理の体積は、管理のルートおよび受取人の大きさに従い変
化する。たとえば、筋内注射は約0.1mlから1.0mlまで変動することが
できる。 製薬組成物がそうすることができる約4C to−100 C.からも、組成物
が温度で格納されることができる医薬は、室温を含んでいる異なる温度で凍結乾
燥された状態に格納される。製薬組成物は、従来技術において当業者にとって公
知の従来の手段によって殺菌されることができる。この種の手段は、濾過、放射
および熱を含むが、これに限定されるものではない。
【0107】 本発明の製薬組成物は、また、静菌剤代理人(例えば従来技術において当業者
にとって公知のアジュバントのAバラエティが製薬組成物のタンパク質とともに
、施されることができるバクテリアの成長Adjuvantsを禁止するチメロ
サール)と組み合わせられることができる。この種のアジュバントは、以下を含
むが、これに限定されるものではない:ブロック共重合体を含む重合体(pol
yoxyethylene−polyoxypropylene共重合体のよう
な共同重合体);重合体P1005;フロイントの完全なアジュバント(動物の
ための);フロイントの不完全なアジュバント;monooleateなsor
bitan;スクアレン;CRL8300アジュバント;ミョウバン;QS 2
1(muramylジペプチド);トレハロース;ミコバクテリウム抜粋を含む
バクテリアの抜粋;detoxifiedされた内毒素;膜脂質;またはそれの
組合せ。
【0108】 モノクロナール抗体が、当業者にとって周知の方法に従ってハイブリドーマ技
術を使用して生じることができる。抗体が、調査または診断上の試薬として有効
であるかまたは受動免疫のために使われることができる。組成物は、任意にアジ
ュバントを含むことができる。調査または診断上の試薬として有効な多クローン
性および単クローン抗体は、発見およびSEQ ID NO.の寸法のために使
用されることができる:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:3
1およびSEQ ID NO:32、そして、断片、または、それの保守的な置
換。この種の抗体は、サンプル(例えば細胞、細胞抜粋、組織、組織抜粋、生検
、腫瘍および生物学的流体)を含むがこれに限らず、生物学的サンプルにこれら
のタンパク質を認めるために用いてもよい。
【0109】 この種の発見能力は、診断および予想を容易にして、可能な処理選択肢を提案
するためにこれらのタンパク質に関連した病気の発見に役立つ。共通に、従来技
術において当業者にとって公知であるように、発見は免疫細胞化学、ELISA
、標識免疫検定法または他の分析評価の使用で成し遂げられることができる。本
発明または断片のhduox2およびCe−duoxタンパク質を含むduox
タンパク質、または、以下を含むがこれに限らず、それの保守的な置換は、共通
に周知の方法でラベルをつけられることができる:放射性同位元素で識別する(
染料)、磁気分子、ビオチン−アビディン、蛍光性の分子は分子およびシステム
をchemiluminescentする。そして、フェリチン、コロイド金お
よび他の方法がタンパク質にラベルをつける技法の技術のうちの1つにとって公
知である。抗体がSEQ ID NO.として示されるタンパク質に、向けたA
dfninistation ofAfntibodies:2、SEQ ID
NO:4、SEQ ID NO:31(SEQ ID NO):32、または
、断片または保守派にそれの置換がまた、直接受動免疫方法の人間および動物に
与えられることができると指令した。SEQ ID NOの細胞外部分の方向を
目指す抗体:2およびSEQ ID NO:4は、これらの細胞外エピトープに
縛る。これらの抗体に対するラベルの付着は、縛る部位の局地化および視覚化を
容易にする。リシンのような分子またはこれらの抗体に対する他の細胞毒素の付
着は、選択的にSEQ ID NOを表している細胞を損傷を与えるかまたは殺
すのを助ける:2およびSEQ ID NO:4またはそれの断片。
【0110】 本発明が抗体、核酸、核酸調査、ラベルをつけられた抗体、ラベルをつけられ
たタンパク質または発見、局地化および測定値のためにそれの断片によって役立
つキットを含むキットSEQ ID:1(SEQ ID NO):2(SEQ
ID NO):3(SEQ ID NO):4または組合せ、そして、断片また
はそれの保守的な置換。キットが免疫細胞化学のために使われることができる。
そして、交雑、溶液交雑、標識免疫検定法、ELISA、西洋のしみ、量的PC
Rおよび発見、局地化およびこれらの核酸、タンパク質または断片の寸法のため
の他の分析評価がそれについて原位置に従来技術において技術のうちの1つにと
って公知の技術を使用する。SEQ ID NOに示されるヌクレオチド配列:
1およびSEQ ID NO:3または断片が、それについてまた、代わりとし
て検出することはSEQ ID NOに関するメッセージを継いだという高い厳
しさ状況の下で使われることができる:1およびSEQ ID NO:3または
、それぞれ、それの断片。診断上のキットは、本願明細書において記載されてい
るduoxタンパク質の相関的な発現を測定することができるかまたは検出する
ことができる(i. e。人間的なDuox1および/または人間的なduox
2、そして、ce−duox)。SEQ ID NO.の断片:1およびSEQ
ID NO:3(関連した雑種を産んでいる配列がチップ配列の表層の上へ合
成されることができることを含むこと)。RNAサンプル。eに、腫瘍から、ゴ
ールキーパはそれからfluorescentlyにタグを付けられて、発見の
ためのチップの上へ交雑した。この方法は、診断によって腫瘍タイプを特徴づけ
て、処理を合わせておよび/または前兆の情報を提供するために用いてもよい。
この種の前兆の情報は、病気進行および寿命に関する予言の値を有することがで
きて、また、療法の選択に影響を及ぼすことができる。本発明は更に以下の実施
例で例示される。そして、それはいかなる形であれそれの範囲に限界を賦課する
こととして解釈されることになっていない。これに反して、リゾートがそれにつ
いてさまざまな他の実施態様、変更態様および均等物に有されることができると
明らかに理解されることになっている。そして、本願明細書において説明を読ん
だ後に、それは本発明の趣旨から逸脱することなく、それ自身を当業者に提案す
ることができる。表された配列・タグのofcDNAfor人間のDuox 2
つのA 535−ベース部分をCloningしているEXAMPLE 1(E
ST zc92hO3. rl;Genbank継承no. W52750)、
Blast検索の質問として人間のgp91phoxのアミノ酸配列を使用する
ことは、人間の膵臓の小島から識別された。pBluescript SK−ベ
クターのEST配列zc92hO3. rlを含んでいるバクテリアの緊張#5
95758は、ATCC(Rockville(MD))から購入された。DN
Aは、T7およびT3ベクター・プロモータに配列に特有の内部プライマーと同
様にプライマーを使用して配列された。ESTは24.4%の識別をgp91p
hoxに示している440のアミンの酸性の部分的なcDNAをコード化した。
そして、gp91phoxのC−終点に対応する中止コドンを含んだ。5’−a
nd 3」レースは、cDNA端版2.0(Gibco BRL、Gaithe
rsburg、MD)の速い拡大のための5’RACEキットを有する人間の成
人のすい臓mRNA(Clontech、パロアルト、CA)を使用して、実行
された。PCRは、特定のプライマーでされた:5’−RACE:プライマー1
,5’GAAGTGGTGGGAGGCGAAGACATA−3」(SEQ I
D NO:5);プライマー2,5’−CCTGTCATACCTGGGACG
GTCTGG−3」(SEQ ID NO:6);プライマー3,5’−GAG
CACAGTGAGATGCCTGTTCAG−3」(SEQ IDNo:7)
;プライマー4,5’−GGAAGGCAGCAGAGAGCAATGATG−
3」(SEQ ID NO:8);プライマー5(5’−AGGTGGGATG
CGGATGTTGAG−3)」(SEQ ID NO:9)(入れ子にされた
PCRのための);3’−RACE Primer 6,5’ACATCTGC
GAGCGGCACTTCCAGA−3」(SEQ ID NO:10);プラ
イマー7,5’−AGCTCGTCAACAGGCAGGACCGAGC−3」
(SEQ ID NO:11) ;プライマー8,5’−TCTCCATCAG
AATCCACCTTAGGC−3」(SEQ ID NO:12)(入れ子に
されたPCRのための)。配列(5)を完了するために」RACEがプライマー
3およびアダプタプライマーAP1を有する人間の甲状腺のMarathon−
手早いcDNA(Clontech、パロアルト、CA)およびプライマー5を
使用して、実行されたこと、そして、アダプタプライマーAP2.これらの手順
は、追加の3.7kbの5’regionおよび1.5kbの3’region
に結果としてなった。h−Duox2のためのcDNAは、予測されるフレーム
(遺伝子銀行#AF267981)を読み込んで開いた4647の塩基対が15
48のアミノ酸(175kDa)のタンパク質をコード化することを示して、コ
ンセンサスKozak配列を含んだ、GGCATGC(SEQ ID NO.:
13、翻訳スタート・コドンで)。
【0111】 Duox2 cDNA配列は、甲状腺のNADPH−oxidaseと以前に
確認されるgp9lphox相同物のより大きい種類であって、pl38TをX
と呼んだ;後の配列は、含まなかったペルオキシダーゼ異体同形領域(Dupu
yほか(1999))。h−Duox1およびh Duox2は、77%、アミ
ンの酸性のレベルで同一だった。Ce−Duox1および、染色体の端の近くで
両方ともC. elegansのゲノム・配列の人間のgp91phox識別さ
れた2つの推定の相同物(Genbank #s AF043697およびAF
003130)のcDNA配列を使用しているCe−Duox1 A BLAS
T検索のためのcDNAの中でCloningして、Ce−Duox2のための
geraesのEXAMPLE 2 Identification私、そして
、分離された副6 Kb。遺伝子配列に基づいて、PCRプライマーはCe−D
uox1遺伝子の2つの重なり合う部分を拡大するように設計されていた。そし
て、5’endおよび1から伸びているものが3’endから伸びた。プライマ
ーは、5’ATTCGTCGACAAATGCGCTCAAAACATGTGC
TGT−3であった」(SEQ ID NO:14)、そして、5’−AACT
TTGTGGATCAAAGTTAGCG−3」(SEQ ID NO:15)
5’regionおよび5のための」TTGGATTAGCATTTTGCTA
TGGAA−3’and(SEQ ID NO:16) 5’GAGCGGCC
GCGAACGTTTCAAAGCGATGTGCA−3」(SEQ ID N
o:17)3’region.のためのPCRは、以下の状況の下でIACT(
R. Barstead(オクラホマMedical Research Fo
undation)から得られて)のランダムな満たされたC. elegan
s cDNAライブラリを使用して、実行された:30秒の間の95のCでの変
性;30秒の間の59Cでアニール化されること;1分の間の72のCでの拡張
。5’pieceおよび3’pieceは、Dra IIIによって消化されて
、全長Ce−Duox1 cDNAを生産するために結さつされた。全長Ce−
Duox1 cDNAは、pBluescript SK−ベクターに嵌入され
て、T7およびT3てベクターてプライマーて配列特定のプライマーを使用して
配列された。
【0112】 C. elegans.のDuox相同物 質問としてgp9lphoxのタンパク質配列を使用しているC. elega
nsゲノム・データベースのBLAST検索は、cosmids F56C11
およびF53G12に含まれる2つの相応する遺伝子を識別した。19人の近衛
伍長を含んで、1506のアミノ酸のタンパク質をコード化するために、概念上
の反訳記録(遺伝子銀行# AF043697)が予測されるCe−Duox1
は、8197bp前に、継いでいる。Ce−Duox1(遺伝子銀行#AF22
9855)のためのcDNAのクローニングは4491bp(1497のアミノ
酸)のcDNAを明らかにした。そして、それはいくぶん予測されたイントロン
−エクソン接合の不正確のために、遺伝子構造から得られる概念上のcDNAと
異なった。16人の近衛伍長を含んで、1313のアミノ酸タンパク質をコード
化するために、反訳記録(Ce−Duox2(遺伝子銀行#AF043697)
)が予測される第二は、5308bp前に、継いでいる。Duox1の第2で第
3のエクソンに、非常に相応したDuox2の第1の予測されたエクソンでなく
、しかし、Duox1のexonlに相応するDuox2の近衛伍長がそうする
ことができたCe−Duox1てCe−Duox2識別された2人の新任の近衛
伍長5’ofのゲノム・配列の異体同形による配置は、異体同形によって識別さ
れる。Ce−Duox1およびCe−Duox2の予測されたアミノ酸配列は、
h−Duox1およびh−Duox2(図1および2A)を有するほぼ30%の
識別を示す。Ce−Duox1も、h−Duox1/2(下記参照)と同じ領域
を含んで、粗く同じサイズである。しかし、Ce−Duox2はタンパク質の極
端なC−末端部分を除去しなければならない中止コドンを含む。そして、それは
部位を結合しているピリジン・ヌクレオチドの部分を含む。
【0113】 このように、Ce−Duox2が完全なペルオキシダーゼおよびcalmod
ulinのような領域を含まなければならないと共に、機能しているNADPH
−oxidase領域(図1を見る)をコード化することは予測されない。この
Cterminal領域を除いて、Ce−Duox2は、94%、アミンの酸性
のレベルでCe−Duox1と同一である。Ce−Duox1およびCe−Du
ox2は染色体の端の近くに位置する。そして、私は6kbだけ、そして、対向
するオリエンテーションにおいて分かれた。染色体の終わり間近の両方ともの場
所と同様に配列識別の高い程度およびイントロン構造(示されないデータ)の保
持は、最近の遺伝子重複と整合している。
【0114】 主要な構造のEXAMPLE 3つのAnalysis; Domain OrganizationおよびSequence Cornp
arisons Amoyag gp9lphox、h−Duox2、Ce−D
uox1およびCe−Duox2.輸出信号配列は、ニールセンその他によって
予測された、1997。膜内外アルファ螺旋は、Sonnhammerその他に
よって予測された、1998。両方の方法は、Biological Sequ
ence Analysisのためのセンターでインターネットで利用可能であ
る(http://www.cbs. dtu. dk/services/)
。 多数の配列配置系統発生の分析は、Megalignソフトウェア(DNAST
AR)を用いて、clustalな方法を使用して、実行された。gp9lph
ox、h−Duox1、hDuox2、Ce−Duox1およびCe−Duox
2の領域構造および膜内外領域は、図1において図解される。Duox酵素は、
それらのC−終点のgp91phoxに相応する(httpを参照のこと://
www.生化学emory. edu/Lambeth/これらの領域の配置の
ためのgp91〜homology. pdf)。あるより、Noxl(Suh
ほか(1999))(それはgp91phoxと同じサイズである)はgp91
phox(54%同一の)に密接に関連しているhDuox1またはhDuox
2(−26% gp91phoxと同一の)のNADPH−oxidase領域
。 しかし、h−Duox1およびhDuox2は、NADPH−oxidase領
域(−39%同一の)の中で、より密接にCe−Duox1に関する。領域を結
合している推定のFADおよび領域を結合しているNADPHの範囲内で、相同
物はかなりより高い異体同形を共有する。そして、領域に従い、60%から90
%まで変動する。これは、螺旋GXGXXPを結合している標準的なジヌクレオ
チドを含む(SEQ ID NO:18).gp91phox、Noxl、h−
Duox1およびh−Duox2においてこの配列の後にF(それは多くのNA
DPHに特有のフラビンタンパク質に存在する)が続く。その一方で、C. e
legansタンパク質において、Fは保守的にYと取り替えられる。
【0115】 Duoxタンパク質は、gp91phoxに存在しない追加の領域を有する。
中心領域は、図1に示す配列を結合している2つのEF手カルシウムを含む。 カルシウムくくることに関係している標準的な残留物はh−Duox1およびh
−Duox2においてかなり節約されるが、Ce−Duox1およびCe−Du
ox2において不十分に節約される。そして、この地域の機能が線虫において縛
っているカルシウムから離れて展開することができたことを示唆する。 驚くべきことに、Duoxタンパク質のN−末端第3は、myeloperox
idase、好酸球ペルオキシダーゼ、甲状腺のペルオキシダーゼ、lacto
peroxidaseおよびウニovoperoxidases(図2Aおよび
2B)を含むペルオキシダーゼに相応する。全体的に、全ての領域の中のペルオ
キシダーゼを有する識別はほぼ20%である、しかし、小区域はかなりより高い
異体同形を示す。Duox酵素はペルオキシダーゼ族(図2B)の範囲内で、は
っきりしたグループを代表する、そして、phylogeneticallyに
、このグループはわずかにより密接にウニovoperoxidasesに関す
る。 ペルオキシダーゼ異体同形領域の中で、6つの内部鎖二硫化物結合(それは4つ
の相応する哺乳類のペルオキシダーゼにおいて節約される)に関係している12
のシステイン残留物のうちの2つだけは、Duoxタンパク質(図示せず)に存
在する。
【0116】 加えて、MPOで見つけられるアスパラギンにリンクされたグリコシル化部位
は、Ce−Duox1またはCe−Duox2に存在しない。MPOの部位を結
合しているカルシウム(アスパラギン酸塩263、そして、341まで残留物3
35(図2Aの優れた複縦線))、Duox系統において節約されるウェルは、
残留物(三角形を満たした)をligandingしている4つの候補カルシウ
ムのうちの3つを含んで、タンパク質である(ZengおよびFenna(19
92))。Ce−Duox1の極端なN−末端21アミノ酸分泌する信号のペプ
チド・配列(図1)を含むシトソルに経膜的であるコンパートメントにおいて、
Nterminalペルオキシダーゼ領域があることを意味する(e。g.、細
胞外、または、分泌する小嚢の範囲内で)。加えて、水治療法プロット線は、タ
ンパク質がgp91phoxのN−末端第3に対応する非常に疎水性の領域を含
むことを明らかにする。この領域は、図1に示す6つの膜内外アルファ螺旋のク
ラスタとして立体感を与えられることができる。追加の膜内外螺旋形の領域は、
ペルオキシダーゼ異体同形領域およびcalmodulinのような領域の間で
ある。Human Duox(hDuox mRNAのTissue Dist
ribution)のためのmRNAのEXAMPLE 4つのPCR Det
ection。クローンをつくられたh−Duox1およびhDuox2 cD
NA配列に基づいて、我々が特定のプライマーを設計したこと(Duox1:5
’−GCAGGACATCAACCCTGCACTCTC−3」(SEQ ID
NO:19);5’CTGCCATCTACCACACGGATCTGC−3
」(SEQ ID NO:20);Duox2:5’−GCCCTCAACCT
AAGCAGCTCACAACTG−3」(SEQ ID NO:21);5’
−GAGCACAGTGAGATGCCTGTTCAG−3」)(SEQ ID
NO.:22)、それは人間の多数の組織PCRパネルおよび人間の甲状腺マ
ラソン−手早いcDNA(Clontech、パロアルト、CA)を使用してい
るDuox1およびDuox2の組織発現パターンを決定するために用いた。P
CR状況は、以下の通りであった30s、20sのための65のC、30sのた
めの72のC、35のサイクルの間の95 C。胎盤、精巣およびすい臓および
心臓の検出可能な発現を有する前立腺にまた、示す重大な発現を有する肺および
甲状腺の以外最も高い発現については、h−Duox1 mRNAは様々な成人
の組織に配布された。それが肺で豊富だった胎児の組織において、h−Duox
1 mRNAはまた、広く表された。加えて、腎臓、肝臓、肺、すい臓の検出可
能な発現については、我々は様々な胎児の組織の、そして、成人のコロンの重大
な発現を観察した前立腺、そして、精巣。コロンの最も高い発現については、h
−Duox2 mRNAは様々な成人の組織に配布された精巣、すい臓、そして
、甲状腺。それが肺、肝臓、腎臓で豊富で心臓で甲状腺だった胎児の組織におい
て、h−Duox2mRNAはまた、広く表された。我々も、胎児の骨格の筋肉
および胸腺の重大な発現を観察した。簡潔なRNAi Ce−Duox動物To
が洞察に得させるC.のC. elegans PhenotypesのEXA
MPLE 5つのRNA干渉(RNAi)がDuox酵素の生物学的機能に注意
して、我々は逆の遺伝子のツール、RNA干渉(RNAi)、C. elega
ns(火ほか(1998))のto”knock out”Duoxを使用した
。この技術は、C. elegans野生のタイプ両性具有者の性腺に、Ce−
Duox1またはCe−Duox2の部分をコード化している倍の足止めされる
RNA(dsRNA)の注入を含む。注射された動物はそれから卵を敷設するこ
とができた、収穫された卵は発達することができた、そして、後継者は発現型の
ために観察された。この手順は、具体的には、重要な遺伝子の発現を減らすかま
たは除去する。RNAは、いずれのpBluescriptからも写された。D
uox2(pBluescript.)E17Duox1またはpBluesc
ript.E18+19Duox1.pBluescript.のためのDuo
x2、Ce−Duox2のエクソン10は、ゲノムDNAからPCRによって拡
大された前のプライマー5」GCTAGAGCTCTTCAGTTTGCTAT
GGAATTGGC−3」(SEQ ID NO:23)、そして、逆のプライ
マー5’−CATAAAGGATGAGGAGAATTCTGTG−3」(SE
Q ID NO:24)。発生する457bp断片は、SstIおよびEcoR
Iによって消化されて、pBluescriptにsubclonedした。p
Bluescript.のためのE17Duox1、Duox1のエクソン17
は、ゲノムDNAからPCRによって拡大された前のプライマー5’−GCTA
GAGCTCGGCTACTACTACGTTGTTGGACC−3」(SEQ
ID NO:25)、そして、逆のプライマー5」GACTGAAGGACT
TGTGGAACGTCTGAGTGAC−3」(SEQ ID NO:26)
.発生する659bp断片はSstIおよびEcoRIによって消化された、そ
して、サブはpBluescriptにクローンをつくった。pBluescr
ipt.のためのE18+19Duox1、Exons 18およびCe−Du
ox1のうちの19は、前のプライマー5’−GCTAGAGCTCACATT
TGCGAGAAGCACTTCCG−3を使用しているランダムに満たされた
C. elegans cDNAライブラリ(R. Barstead(オクラ
ホマMedical Research Foundation)から得られて
)から、PCRによって拡大された」(SEQ ID NO:27)、そして、
逆のプライマー5’−GTGTGAATTCAGCGATGTGCAAATGA
AGGAGC−3」(SEQ ID NO:28).発生する266bp断片は
、SstIおよびEcoRIによって消化されて、pBluescriptにs
ubclonedした。プラスミドはSstlかEcoRlによって線形にされ
た、そして、コピーは別々の反応のT3およびT7 RNAポリメラーゼ(Pr
omega)を使用して、運び出された。感覚およびアンチセンスのシングルの
要素をもつRNAは同等の集中において結合されて、倍の座礁されたRNA(d
sRNA)を形成するために37のCで30分インキュベーションが続く68の
Cで、10分間卵を抱いた。dsRNAsはInjectedされた動物が回復
することができた以下のパラグラフの詳細にて説明したように、N2両性具有者
C. elegansの性腺に注射されて、注入(個々のプレートへ移されて、
第2の24のh期間の間の卵を敷設することができる)の後、卵for〜20
hを敷設する。敷設している卵のこの第2の期間から生じているF1後継者は、
評価された。発現型は、F1動物の90%、>において観察された。Ce−Du
ox1およびDuox2の3つのはっきりした領域に対応するCe−Duox
aninzals dsRNAが使われたPlzeraotypesof C.
elegans RNAiは、実験を切り離す。第1の二つは、Ce−Duo
x1およびCe−Duox2間の識別の領域と一致して、Duoxの両方の種類
の現れを遮断するために予測される。第3のdsRNAはCe−Duox1の極
端なC−終点と一致する。そして、それはCe−Duox2の対応する物を有し
なくて、したがって、Ce−Duox1の現れだけを遮断する。全ての3枚のd
sRNA書式は、発現型の同じ範囲に結果としてなった。複製実験において、い
かなる与えられた発現型も呈している動物のパーセンテージは、いくぶん変数(
おそらくRNAiの量または注入の部位の違いによる)であった。 しかし、典型的実験において、動物の90%を超えるは、一つ以上の発現型によ
って影響を受けた。典型的実験の、発現型が大きい表面的な水ぶくれの存在を含
んだこと(−50%の動物)、そして、短いor”dumpy”animals
(−35%の動物)、そして、保持された卵または幼虫(図示せず)をもつ動物
。 加えて、野生のタイプ動物が暗い外観を示すと共に、80%以上のRNAi
動物は半透明だった。RNAiの半分のまわりで、動物は不能が通常の蛇行する
方法のプレートの上に移動することを示した:影響を受ける動物は完全に麻痺し
ているかまたは前の領域だけを移動した。そして、頭の近くで局所化された帯か
ら大腸菌を取り除いた。C. elegansの類似した発現型は、以前に記載
されていて、コラーゲンbiosyntheticな経路の変化にかかわる(ほ
か(1993)を徴集する;クレイマー(1997);ジョンストン、2000
)。変化するときに、表皮コラーゲンをコード化するいくつかの遺伝子がBli
(「水ぶくれ)、Dpy(「ずんぐりした」、短い太った虫)、Rol(シヌソ
イドに関する「ローラー」(平面の代わりに螺旋形の運動)は、合図する)また
はSqtに結果としてなって(「しゃがむ」(一般に成人としての幼虫および足
の短い鶏としてのローラー))発現型。この過程の遺伝学は、若干の遺伝子のた
めの同じ遺伝子の異なる変化が異なる発現型を引き起こした時から、複雑で時々
発現型である結合する(e。g.ずんぐりしたローラー」)。線虫、他のタンパ
ク質が表皮の主要構成要素に提供するいくつかと一緒のコラーゲン、外骨格とし
て作用する細胞外マトリックスで。オリゴヌクレオチド配列(丘ほか(2000
))を使用している全てのC. elegans遺伝子の発現の大域的分析にお
いて、Ce−Duox1は、ステージに特有の方法の低レベル(hypoder
malな細胞のその排他的な発現と整合した)で表された。発現は胎児ステージ
の間、そして、36時間にピークに達している周期的パターンで起こった。そし
て、コラーゲン/表皮生合成(col−14、dpy−2、−7、−10および
sqt−3)に関する他の遺伝子(ジョンストン、I. L.、2000)のピ
ークの発現と一致した。collagen/cuticleに関連した遺伝子(
bli−1、−2、col−2、−6、−17、−35、−36、−37、−4
1、dyp−13、sqt−1およびrol−6(−8))の中でもセットされ
る1秒は、36時間にピーク発現を示す。Ce−Duox2の重大な現れは、い
かなるステージでも見られなかった。このように、これらのデータは、表皮生物
発生説のCe−Duox1の機能と整合している。pPD96.62PRODu
ox1BからCe−Duox1発現DNAを研究するトランスジェニックの線虫
のEXAMPLE 6つのGenerationは、myo−3つのGFP D
NA(優しく、A. Fire、EmbryologyのカーネギーInsti
tute、ボルチモア、MDによって提供されて)を混ぜ合わせられて、野生の
タイプまたはrol−6人の(sulO06)ヤングアダルト両性具有者(Me
lloおよびFire(1995))に注射された。Transformant
sは、緑の体壁筋肉のための顕微鏡を解剖している蛍光の下で、F1後継者を審
査することによって識別された。これらの緑の白熱した動物は、汚された−、下
記のように、ガラクトシダーゼ発現。pPD96.62がn−ガラクトシダーゼ
て緑の蛍光性のタンパク質(GFP)発現を駆動したと思われたにもかかわらず
、蛍光は体壁筋肉(目印Myo−3−GFPの現れの部位)の外側に観察されな
かった。pPD96.62PRODuox1Bは、次のように準備された: 3389のbp断片は、前のプライマー5’−AGTCGAAGCTTAGCA
TGTCAAAGTCCGGAGTTCAGT−3を使用しているC. ele
gansゲノムDNAから、長い範囲PCRによって拡大された」(SEQ I
D NO:29)、そして、逆のプライマー5’−CTAGTGGATCCGC
ATTGCTCGTGCGCCTTAGAGTTT−3」(SEQ ID NO
:30).断片は、Ce−Duox1および5’untranslated配列
のスタート・メチオニンを含んだ。断片は、HindIIIおよびBamHIに
よって消化されて、それからpPD96.62にsubclonedした。この
構造物はCe−Duox1プロモータ領域(3389bp)に結果としてなる、
そして、挿入された5’of大腸菌lacZ遺伝子であることは緑の蛍光タンパ
ク質(GFP)に、溶かしたスタート・メチオニンは遺伝子を報告した。/3−
Galactosidase Staining Stainingは、gfp
の現れを検出するために用いた:pPD96.62PRODuox1B.を運ん
でいるトランスジェニックの虫のlacZ融合タンパク質Fire(1993)
によって記載されているように、試薬準備および固定は実行された。N−終点で
核の局地化ペプチドをまた、取り入れられるベクター(3−ガラクトシダーゼ。
これは、細胞を表す核において支配的に汚れることを許して、それらの識別を容
易にする。線虫は8つのウェル顕微鏡スライドwith−15 jjの個々の源
に配置された蒸留水のl、そして、2−3つの最小限度のための真空の下で乾燥
させる。Acetoneは2分の間の乾燥した動物の上へ、連続的にしたたった
。そして、スライドはおおいのない湿気室に置かれるが、乾いておかれた。10
julの)、3−ガラクトシダーゼ汚れ(火(1993))は、アセトンが完全
に蒸発した、そして、湿気室に対するふたが交換されたとすぐに、よい各々の上
へ階層化された。線虫は、それからいくつかの時間室温で、培養されて、いくつ
かの項目をリン酸塩緩衝された生理食塩水で洗って、それから複合顕微鏡で観察
した。C. elegansのCe−Duox1の細胞場所が決定されたCe−
Duox1の移動電話現れは、Ce−Duox1に対する、そして、ミオシンA
(体壁筋肉細胞のための目印)に対する抗体によって汚れることを二倍にする。
【0117】 Ce−Duox1は、筋肉細胞をA−containingしているミオシン
の直ちに上に横たわっている細胞のhypodermalな層の幼虫の動物に示
して、筋肉四分円の上に横たわらなかったhypodermalな細胞において
、かすかに検出可能なだけだった。成人の動物において、Ce−Duox1は、
不十分に検出(図示せず)であった。幼虫の動物に示す強い信号は、Ce−Du
ox1ペプチドによってpreincubatedされた反対のCe Duox
1抗体を使用して除去された。
【0118】 実施例7つの抗体生成および浄化 Ce−Duox1の残留物340−355に対応する16のアミノ酸ペプチドは
、鍵穴カサガイ・ヘモシアニン(KLH)に、Emory Microchem
ical Facilityおよび被結合使用しているgluteraldeh
ydeによって合成された。ラビット抗体は、標準のプロトコルを使用している
Lampire Biological Laboratories(Pipe
rsville(PA))によって、KLH−活用されたペプチドに対して準備
された。ペプチド(30mg)は、1mlの抗体immunopurifica
tionのためのAffi−Gel 10(バイオRad)に連結した;2ml
の血清は、PBSに対して透析されて、PBSによってpreequilibr
atedされるAffi−Gelコラムに積まれた。コラムは、1MのNaCl
を含んでいる10mlのPBSによって洗われた。抗体の0.5mlの派閥は、
0.1Mのグリシン−HCl(pH 2.4)によって抜き取られて、TRIS
(pH 9)によって直ちに中性化された。タンパク質の最も高い濃度を含んで
いる分数が、免疫蛍光検査法実験において使われた。
【0119】 実施例8つの西洋のしみ 線虫は、M9緩衝液によって洗われて、0.5mlの超音波処理緩衝液(10
mMのTris HC1、pH 7.4,1 mM EDTA、1mMのphe
nylmethanesulfonylフッ化物)において停止して、20s、
4つのxを超音波で破壊した。タンパク質は、標準としてウシ血清アルブミンを
使用しているブラッドフォード分析評価によって決定された。10igの全部の
動物性抽出物は、それからイモビロン−P膜(ミリポア)へ移された10%のS
DSpageゲルに積まれた。しみはPBSの脂肪を含まない5%の粉乳および
0.05%のTweenの溶液の1時間遮断された。Ce Duox1に対する
抗体は加えられた1、解釈を妨げることに関する15の最小限度のための3つの
時間は2000の希薄、培養された前夜および膜に流された。しみは、それから
ピアス(Rockford(Il.))からSuperSignalなChem
iluminescentキットを使用して開発された。C. elegans
タンパク質抜粋の西のしみは、分子量of−180(000(示されないデータ
))を有する単一のバンドを示した。
【0120】 実施例9つの間接的なI7n7nunofluorescence.Beni
anその他のC. elegansの中で汚れている免疫蛍光検査法は実行され
た、1996。Myosin Aに対するマウス抗体は、D.ミラー(ミラーほ
か(1983))からの贈り物であった。ヤギ反ウサギは抗体をrhodami
ne−conjugatedした、そして、ヤギ反マウスFITC−活用された
抗体がそれぞれCe−Duox1およびMyosin Aの探知のための第2の
抗体として使われた。Ce−Duox1抗体の非特異性の締め具を決定するため
に、Ce−Duox1ペプチドのモル10倍の過剰は、抗体を中和するために加
えられた。顕微鏡検査は、confocalな顕微鏡を走査しているツァイス5
10のレーザーを使用して、実行された。Abdelrahimその他の標準の
dityrosine標準DityrosineのEXAMPLE 10のPr
eparationは合成されて、浄化された、軽微な変更態様を有する199
7。反応製品は酸性化されたメタノールにおいて溶かされて、濾過されて、直接
CP−11のセルロース・リン酸塩にあてはまった。そして、回転蒸発ステップ
を除去した。dityrosineに特有の吸収特性を有するサンプルは、プー
ルされて、乾燥させて凍る。質量分析のために、dityrosine標準(0
.77のmg/ml)の1つのmlは、1mlのメタノールに加えられた:酢の
0.1%の酸の水(1:1)。dityrosineおよびtrityrosi
ne Nematodesの分析は、M9緩衝液によって洗われて、0.5ml
の超音波処理緩衝液(10mMのTris HC1、pH 7.4,1 mM
EDTA、1mMのphenylmethanesulfonylフッ化物)に
おいて停止して、20s、4つのxを超音波で破壊した。タンパク質は、標準と
してウシ血清アルブミンを使用しているブラッドフォード分析評価によって決定
された。全部の虫抽出物は、凍結乾燥されて、6N HC1の中に再懸濁された
。サンプルは、真空の下の110のCでの24h加水分解されて、真空の下で乾
燥して、Dionex AGP−1つのHPLC計測器を使用しているC18コ
ラム(0.46×26cm、フィッシャー)上の高性能な流動クロマトグラフィ
(HPLC)によって、分析のための移動フェーズの中に再懸濁された。移動フ
ェーズは、1つのml/分の流速で、0.1Mのリン酸を有するpH 3.8に
合う0.1MのKH2PO4から成った。コラム溶離剤は、305395ナノメ
ートルの帯域通過フィルタおよび放出が40ナノメートルの帯域通過を有する4
50ナノメートルで、フィルターをかける刺激を有する蛍光によってモニタされ
た。dityrosineの同一性を検査するために、標準の確実なdityr
osineは若干のサンプルに加えられた、そして、推定のdityrosin
eバンドの強度の増加は観察された(示されないデータ)。di−and tr
ityrosine.の分光器の特性HPLCはdityrosineのサンプ
ルを浄化した、そして、反応をクロスリンクしている両方のC.簡潔な抜粋およ
びペルオキシダーゼ領域からのtrityrosineは凍結乾燥されて、いず
れの0.1のM HC1(3ml)もまたは0.1MのNaOH(3ml)にお
いてresolubilizedした。蛍光刺激および放出スペクトルは、Pe
rkin−エルマーLS−5B Luminescence Spectrom
eterによって得られた。3000台の3倍の四重極質量分析計がturbo
ionsprayソースを備えたPE sciex APIに、質量分析ミサ分
光測定法は、予め形成された。乾燥したdityrosine標準(20mg)
は、200ulのH20において再構成された。これの50ul約数は、MeO
Hおよび酢の1%の酸の5mMのアンモニウム酢酸塩の950ulを有する1m
lの最終的な体積に薄められた。それぞれ、ionsprayが縫う5つの1つ
のmin〜l.の流速で、注がれるこの溶液は、正および負のイオン分析のため
の+550Vのand−4500Vで保たれた。予測されるように、これらの実
験はそれぞれm/z 361.3および359.3である標準の単独でprot
onatedされ(陽イオン・モード)てdeprotonatedされた(否
定のイオン・モード)種を識別した。C. elegafasからの標準で全タ
ンパク質酸加水分解物は、逆のフェーズLC−MS/MSによって分析された。
サンプルの50のgl量は、300のユト最小限度の流速で、15 1 cm×
2.1mmのSupelcoディスカバリーC18コラムの上へ吹き込まれた」
、¥ Solvent Aは、99であった:1つのH20/酢の酸性で溶解力
があるBは、99であった:5mMのアンモニウム酢酸塩を両方とも含んでいる
1つのMeOH/酢の酸。コラムは、直接陽イオン・モードにおいて作動してい
る質量分析計のイオン出所に吹き込まれた。コラムは、予めサンプル注入が続く
6つの最小限度のための100%のAによって釣り合わせた。コラムは、それか
ら4分100%のAによって洗われて、100%のBに対する線形1分勾配によ
って、抜き取って、100%のB. Forを有する4分洗浄によって、続いた
両方ともこれらの実験先駆者イオン(dityrosineのための上記として
;trityrosineのためのinlz 540.4/538.4)、そし
て、構造的に特徴的な故障イオンモニタした。dityrosineのためにモ
ニタされる移行は、両方のカルボキシル基の中立のロス、カルボキシル基および
1つのアミンのグループの中立のロスおよびカルボキシル基および両方のアミン
のグループ(269.4,252.2および235.0だけそれぞれ)の中立の
ロスであった。trityrosineのために、モニタされる移行は、カルボ
キシルのロスが集める中立、カルボキシル基および1つのアミンのグループの中
立のロス、2つのC−終点の中立のロスおよび2つのカルボキシル基および2つ
のアミンのグループ(494.3,477.2,448.2および431.2だ
けそれぞれ)の中立のロスであった。* proteinaceousな構造を
橋渡しをして、安定させるdi−and三チロシン結合で、RIV、コラーゲン
の中でクロスリンクしている4i線虫および線虫の他の表皮タンパク質のtvr
osiyzeクロスlinkitigの欠如は、起こる(Fettererほか
(1993);Fetterer、そして、Rhoads、1990)。ウニo
voperoxidaseおよび人間のmyeloperoxidaseのよう
なペルオキシダーゼがこの反応を実行する、(MalanikおよびLedvi
na(1979);LaBellaほか(1968);Deitsその他、19
84)、我々はCe−Duox1の機能がチロシン・クロスリンクを生成するこ
とになっている、そして、Ce−Duox RNAi動物の不完全な表皮がチロ
シン・クロスリンクを形成することができないことによると仮定した。活性をク
ロスリンクしているチロシンがペルオキシダーゼ抑制剤4−アミンの2,3,4
アミノトリアゾール、phenylhydrazineおよびN−アセチル・チ
ロシン(Fettererほか(1993))を使用して禁じられた研究に基づ
いて、Ascarisにおいてクロスリンクしているチロシンの未知のペルオキ
シダーゼのための役割は、以前に提案された。
【0121】 我々は、したがって、野生のタイプてCe−Duox1 RNAiノックアウ
ト動物にdi−and三チロシン結合がないか調べた。野生のタイプC. el
egansの酸性加水分解物のHPLC側面は確実な標準および大規模なスペク
トルの分析を有する比較に基づいて、dityrosineと確認された第1の
大きいピークを明らかにした、そして、第2のピークはdityrosineお
よび大規模なスペクトルの分析と関連してHPLC上のその移動に基づいてtr
ityrosineと確認される。ピーク域および僭越な等価イオン化に基づい
て、dityrosineおよびチロシンは、1の比率に存在した:成人の野生
のタイプ動物の200。加えて、蛍光刺激/放出最大は、アルカリで酸性のpH
で決定されて、以前に報告された値(ジェイコブ(ほか1996))との良い契
約においてあった。dityrosineもtrityrosineピークも、
Ce−Duox RNAi線虫の加水分解物に認められなかった。Cuticl
e BiogenesisのduoxのEXAMPLE 11のPartici
pation;コラーゲンおよび表皮生合成において不完全な動物の中の発現型
の類似がRNAi Duox動物と比較した超構造Analysisは、Duo
xが表皮生物発生説に参加することを示唆した。この仮説を確かめるために、電
子顕微鏡検査法はwildtypeおよびRNAi動物に実行された。野生のタ
イプまたはRNAi水ぶくれにされた成人のC. elegansは、集められ
て、M9緩衝液によって、そして、それから0.1Mのカコジル酸塩緩衝液(p
H 7.4)によって最初に洗われた。0.8%のglutaraldeyde
の1mlに加えられて、動物は小球をぶつけられた0.7%の四酸化オスミウム
、0.1Mのカコジル酸塩pH 7.4、そして、1.5時間の氷上の卵を抱く
時々の混合。動物は、0.1Mのカコジル酸塩緩衝液によって洗われて、ガラス
製のホールスライドに移って、23本のゲージ針を有する半分に割り込んだ。二
分された動物は、1mlの新しい色留め剤(0.8%のグルタルアルデヒド、0
.7%の四酸化オスミウム、0.1Mのカコジル酸塩pH 7.4)を含んでい
るチューブに変形して、2時間のための氷に卵を抱いた。0.1Mのカコジル酸
塩緩衝液によって洗った後に、二分された動物は、一晩0.1Mのカコジル酸塩
緩衝液の1%の四酸化オスミウムの氷に取り付けられた。動物は、数回0.1M
のカコジル酸塩緩衝液で洗われて、酸化プロピレンによる等級分けされたアルコ
ールを使用して脱水状態になって、浸透して、Embed−812に埋められた
(電子Microscopy Sciences(Ft.)ワシントン、PA)
。動物は、16時間の60Cで重合の前にまつげ調査との平行の取り決めにいじ
められた。断面(0.5mm)はオリエンテーションのために評価された、そし
て、ultrasections(厚さ800A)は200のメッシュ銅格子に
集められて、ウラニル酢酸塩によって汚れて、クエン酸塩を導く、そして、横断
面はフィリップスEM201電子顕微鏡で調べられた。超構造分析で、RNAi
Duox動物の表皮が大いに異常であることが分かった。通常の動物において
、3枚の表皮層は、明らかに見られた:皮質(外側の)で、中央で基礎の(内側
の)層以前に記載されている(コックス、G. N.、ほか、1981)ように
。メジアン層は、これらの層との流体に満ちたすきまについては、皮質で基礎の
層を接続している支柱から成る。RNAi動物は、しばしば分離を示した皮質の
、そして、これらの層にさらに見えた流体空洞および壊れて広げられた支柱の著
しい展開については、基礎の層。これらの分離は、筋繊維の束を通じて主に起こ
って、少しの顕微鏡検査を使用しているのを見られる水ぶくれの形成を説明しそ
うである。このように、表皮構造は、RNAi Duox動物において厳格に影
響を受けた。ポリメラーゼ連鎖反応が使われた実施例12の構造ofDuoxペ
ルオキシダーゼ領域発現プラスミドは、h−Duoxのペルオキシダーゼ領域を
拡大する(アミノ酸残留物1−593(SEQ ID NO.):31)、そし
て、Ce−Duox(アミノ酸残留物1−590(SEQ ID NO):32
)クローンをつくられた全長配列から。プライマーは、私が据え付けるN−末端
BamHおよび私が据え付けるC−末端Notを導くように設計されていた。P
CR製品はBamHによって消化された私、そして、Not私、そして、Nov
ogen(マディソン(WI))からpET−32a(+)ベクターに結さつさ
れる。プラスミドはchloramphenicolresistantなプラ
スミドpT−groE(ヤスカワ、ほか、1995)を含んでいるBL21(D
E3)細胞に変わった。そして、それはT7プロモータからchaperoni
ns groESおよびgroELを表す。BL21(DE3)細胞のpTgr
oE発現ベクターは、博士リー−Hoワング(テキサス大学ヘルス・サイエンス
・センタ、ヒューストン、TX)およびシュンスケ・イシイ博士(Physic
alおよびChemical Research、茨城、日本の学会)からの寛
容な贈り物であった。アンピシリンおよびクロラムフェニコールを含んでいるL
B−寒天プレートは、コロニーを分離するために用いた。
【0122】 h−DuoxまたはCe−Duoxからペルオキシダーゼ領域を有するプラス
ミドを含んでいる細胞のLB夜通しの0.5mlの培養が50ml接種するため
に用いたDuoxペルオキシダーゼ領域Aの現れは、d−aminolevul
inicな0.5mMの酸、100のmgの/mlのアンピシリンおよび250
mlのフラスコの25のmgの/mlのクロラムフェニコールを含んでいるTB
媒体(Sandhuほか(1993))を修正した。細胞密度が600ナノメー
トルで0.7のODを測定するまで、バクテリアは200回転数/分でシェーカ
の37Cで育てられた。イソプロピル−b−D thiogalactopyr
anoside(1mM)は加えられた、そして、培養は150回転数/分で2
4時間の25Cで続けられた。細胞は、4,500のx gで小球をぶつけられ
て、4−(2aminoethyl)benzenesufnylフッ化物(2
mM)、bestatin(130nM)、transepoxysuccin
yl−L leucyl−amido(4−guanidino)ブタン(1.
4nM)、leupeptin(1nM)およびaprotinin(0.3n
M)を含んでいるPBSにおいて再懸濁された。細胞懸濁液は、それから氷に超
音波で破壊された。
【0123】 Ceの表されたペルオキシダーゼ領域の生化学活性 Duox1およびh−Duox1 Ce−Duoxのペルオキシダーゼ領域(残
留物1−590(SEQ ID NO.):32)、そして、h−Duox1(
残留物1−593(SEQ ID NO):31)、上記の通りに、大腸菌の表
した。これらの細胞からの溶解物は、ペルオキシダーゼ活性のために分析された
。結果は、Duoxから人間およびC.簡潔なペルオキシダーゼ−異体同形領域
を表して、大腸菌からの溶解物がTMB(よく特徴づけられたペルオキシダーゼ
基板)の方へ、ペルオキシダーゼ活性を示すことを示した。活性は、ペルオキシ
ダーゼ抑制剤aminobenzolydrazideによって禁止された。 ベクター制御細胞からのそれら以外でない、h−DuoxおよびCe−Duox
ものペルオキシダーゼ領域を表している大腸菌からの溶解物は、チロシン・エチ
ル・エステルをクロスリンクすることに触媒作用を及ぼした。2つの主な蛍光性
の製品は見られた。そして、そのことはまた、表皮タンパク質の加水分解物に示
した;ピーク1はdityrosineとして確実な材料および大規模なスペク
トルの分析を有するcochromatographyによって識別された。そ
の一方で、ピーク2は上記として大規模なスペクトルの分析によって三チロシン
と確認された。EXAMPLE 13のActivityは、3,3を分析する
」、流動基板系(シグマ、セントルイス、MO)が使われた5,5−テトラメチ
ルベンジジン(TMB)はペルオキシダーゼ活性(オランダほか(1974))
を分析する。TMB基板系の細胞からの溶解物タンパク質の100mg 1ml
の約数に表すどちらか、人間のDuox1ペルオキシダーゼ領域、Ce−Duo
x1ペルオキシダーゼ領域またはベクター制御は、加えられた。ペルオキシダー
ゼ反応は三つ組の一つにおいて実行された、そして、活性はBeckman D
U640B分光光度計を有する655ナノメートルでモニタされた。若干のサン
プルは、30mMのアミノ安息香酸ヒドラジド(ペルオキシダーゼ抑制剤(ヤカ
ンその他1995))を含んだ。クロスリンクしているチロシンを分析するため
に、チロシン・エチル・エステル(20mM)は、10mlの3%のH2O2の
80mlで補充されるPBS緩衝液において溶かされた。1mlの約数まで、1
00mgの大腸菌溶解物タンパク質が加えられたこと、サンプルは1時間培養さ
れた、そして、反応は12MのHC1の同等の量を使用して消された。 サンプルは、上記としてdi−and三チロシンのために分析された。
【0124】 NADPHに依存する過酸化物Generatio7l分析評価 本発明の実施例において、細胞が人間のduox2遺伝子(SEQ ID NO
:1)によって、安定してトランスフェクションさせたNIH 3T3は、lu
cigeninを使用している過酸化物生成のために分析される(ビスNmet
hylacridinium発光は、分析する(シグマ、セントルイス、MO、
Liその他(1998の)J;生物学Che7n.273,2015−2023
).細胞は、冷えたHANKS’solutionによって洗われて、Doun
ceホモジェナイザを使用している15%のサッカロースを含んでいるHANK
S’bufferの氷に均質にした。細胞溶解物は、ドライアイス/エタノール
浴槽において直ちに凍る。分析評価のために、30igの細胞溶解物は、200
のFM NADPHおよび500のFM lucigeninを混ぜ合わせられ
る。発光は3つの連続した1つの分間隔で、LumiCounter(パッカー
ド)を使用してモニタされる、そして、最も高い値が比較のために使われる。タ
ンパク質濃度は、ブラッドフォード方法によって決定される。過酸化物生成は、
いくつかの安定してトランスフェクションする細胞系からの溶解物においてモニ
タされて、untransfectedされたNIH 3T3細胞溶解物によっ
て、過酸化物生成と比較された。結果は、トランスフェクションする細胞が過酸
化物生成の最も高い程度に対応する微細な審査によって、形態的な変化の最も高
い程度を所有するショーである。発光の信号は過酸化物dismutaseおよ
び一般的なフラビンタンパク質抑制剤diphenylene iodoniu
mによって禁じられるが、加算再結合物人間のp47phox、p67phox
およびRacl(GTP−yS)に影響を受けない。そして、それは食細胞呼吸
の爆発オキシダーゼのための基本的cytosolicな要因である。
【0125】 本発明の交互の実施態様において、hduox2(YA28)によってまたは
空のベクター(NEF2)によって安定してトランスフェクションする細胞は、
ほぼ80%のconfluencyにDMEM、10%の子牛血清、100単位
/mlペニシリン、100のjug/mlストレプトマイシンおよび1つのug
/mlのピューロマイシンを含んでいる媒体の10cmの組織培養プレートにお
いて発達する。緩衝された生理食塩水(PBS)がそれから5mMのEDTAを
含んでいるPBSを有するプレートから、分離した5mlのリン酸塩によって、
細胞(各セル・タイプの5枚の組織培養プレート)は簡潔に洗われる。細胞は、
1000のx gで簡潔にcentrifugingすることによって小球をぶ
つけられる。細胞をpermeabilizeするために、凍結解凍渙散は、小
さい孔針による細胞材料の通過が続いて、実行される。上澄みは除去される、そ
して、凍られる細胞は15分の間の氷を乾燥させる。細胞が解けたあと、Sig
ma(カタログ# P2714)からプロテアーゼ抑制剤の混合物を含んでいる
200のゲル渙散緩衝液(HANKS’Buffered Salt解決手段H
BBS)は加えられる。氷上の細胞は10回18本のguage針に通される、
そして、200glの34%のサッカロースを含んでいるHBSS緩衝液は17
%のサッカロースの最終的な濃度を生むために加えられた。サッカロースは、倉
庫に安定性を強化するように見える。freeze−thawingする組合せ
および細胞およびこの材料の全ての渙散の本質的に針結果を通る通路はthe”
cell溶解物。細胞溶解物が、BioRadタンパク質分析評価システムを使
用しているタンパク質濃度のために分析されると呼ばれる。
【0126】 細胞溶解物は、HBSS緩衝液を結合することによるNADPHに依存する化
学ルミネセンス、アラキドン酸および分析評価プレート(96枚のかなりプラス
チック・プレート)の0.01−1つのgタンパク質のために分析される。 反応は200、uM NADPHおよび10uM lucigeninの最終的
な集中を与えるために1.5mMのNADPHおよび75uM lucigen
inを分析評価混合に加えることによって始められる、そして、化学ルミネセン
スは直ちにモニタされる。最終的な分析評価量は、最適のアラキドン酸濃度が5
0−100のpMについてである約150のjj. l.である。パッカードL
umicount照度計はプレートが60分連続的にモニタされる37のC.で
、lucigeninおよび過酸化物間の反応の化学ルミネセンスを測定するた
めに用いる、そして、各々のサンプルのための最大限の相対的な発光装置(RL
U)値はプロットされる。結果は、NaClの存在または50−150のpMの
集中範囲の中のKC1が最適の活性にとって重要であることを示す。もっと先の
MgCl2(1−5つのmM)は、2−折り目についてによって活性を強化する
。 duox2 NADPH−oxidase活性のためのこのcellfree分
析評価は、duox2酵素のモジュレータ(抑制剤または刺激器)を隠すことに
役立つ。分析評価は、また、検出するために用いてもよい、そして、一般の、そ
して、酵素のduox一系統のモジュレータ(抑制剤または刺激器)のためのス
クリーンに対するduox NADPH−oxidase活性。NIH 3T3
によって発生する過酸化物によるニトロ悲観的なテトラゾリウム換算。完全なセ
ルのそばのSuperoxide世代がnitroblueテトラゾリウムの過
酸化物dismutase−傷つきやすい減少を使用してモニタされるDuox
2 cDNA(SEQ ID NO:1)によって、細胞はTransfect
edした。NEF2(単独で制御を一定方向に向ける)YA26(duox2(
SEQ ID NO:1)−トランスフェクションさせる)、そして、YA28
(duox2(SEQ ID NO:1)−トランスフェクションさせる)、細
胞はウェルにつき500,000の細胞で6枚のウェルプレートにおいてメッキ
をされる。約24時間後に、媒体は細胞から取り外される、そして、細胞は1m
Lのハンクス溶液(シグマ、セントルイス、MO)を有する一度洗われる。 約1mLの青いテトラゾリウム(NBT(Sigma))がハンクスにおいて加
えられる0.25%のナイトロ・フィルターをかけるまたは過酸化物dismu
tase(シグマ)および細胞の600台の装置を有する5%のC02.がある
場合には、37のCで抱かれる8分以後、細胞はこすられて、10,000g以
上で小球をぶつけられる。ペレットは、1mLのピリジン(シグマ)の中に再懸
濁されて、減少するNBTを可溶性にするために100Cで10分間熱くなった
。減少するNBTの集中は510ナノメートルで吸光度を測定することによって
決定される。そして、11,000のM’lcm’1の絶滅係数を使用する。若
干のウェルは、処理されていなくて、細胞番号を決定したものである。データは
、それを示すduox2(SEQ ID NO:1)(トランスフェクションす
る細胞生成された重大な多量の過酸化物)。過酸化物dismutaseが細胞
を通しそうでないので、過酸化物は細胞外で発生しなければならない。これらの
細胞によって発生する過酸化物の量は、活性化された人間の好中球によって発生
するそれの5−10%についてである。Duox2の細胞内構成要素の実施例1
4の変更態様は、細胞をトランスフェクションさせたduox2によって発生す
る過酸化物がintracellular”targetsに影響を及ぼすこと
ができるかどうか検査するために」、制御およびduoxtransfecte
dされた細胞系のアコニターゼ活性は、Suhほか(1999の)ネイチャー4
01,79−82にて説明したように、方法を使用してモニタされる。
【0127】 アコニターゼが、活性のロスに結果としてなって、過酸化物によって変更態様
に非常に影響されやすい4−ironsulphurクラスタを含んで、細胞内
過酸化物世代のリポータとして使われた。Acotinase活性は、ガードナ
ーほか(1995の)Jにて説明したように、決定される:生物学化学270(
13399−13405)。Acotinase活性は、YA26、YA28お
よびトランスフェクションする制御と比較したYA212と称される全ての3つ
のduox−トランスフェクションする細胞系において、かなり減らされる。差
動の遠心分離に基づいて、これらの細胞のアコニターゼのほぼ50%はミトコン
ドリアである、そして、cytosolicでミトコンドリア形式は両方とも影
響を受ける。鉄の硫黄センターを含まないcytosolicな制御およびミト
コンドリア酵素は、影響を受けない。duox2−トランスフェクションする細
胞において発生する過酸化物は、したがって、細胞内構成要素を化学反応して、
修正することができる。
【0128】 細胞を受けているヌードマウスの15腫瘍代が人間とトランスフェクションさ
せた実施例 duox2 cDNA(SEQ ID NO:1) 約2×106 NIH 3T3細胞(SEQ ID NOを有するいずれのhd
uox2transfectedも:1または細胞は、空のベクターを使用する
ことをトランスフェクションさせた)4−5匹の週旧ヌードマウスの首の横方向
の態様に、subdermallyに注射する。6匹のマウスに対する3は各々
の3つのDuox1−トランスフェクションする細胞系のために吹き込まれる、
そして、3匹のマウスは空のベクター(制御)によってトランスフェクションす
る電池を注射される。3週に対する2の後、マウスは犠牲にされる。腫瘍は、1
0%のホルマリンに取り付けられて、組織学の分析によって特徴づけられる。腫
瘍は、大きさにおいて1.5のx 1×1cmを平均して、肉腫タイプ腫瘍を代
表する組織学を示す。加えて、腫瘍は表面的な毛細管によって非常にvascu
larizedされるように見える。duox2遺伝子トランスフェクションす
る電池を注射される12匹のマウスのうちの11匹は腫瘍を発達させる。その一
方で、3匹の制御動物のどれも腫瘍にならない。
【0129】 他の研究において、15匹のマウスは、3T3セル、duox2transf
ected NIHを注射される。注射される15匹のマウスの中で、14は1
7日の注入の範囲内で大きい腫瘍を示す、そして、腫瘍はDuox1 mRNA
の現れを示す。Histologicallyに、腫瘍は線維肉腫に似ていて、
ラースによって誘発された腫瘍と同様である。このように、ラースおよびduo
x2は、athymicなマウスのNIH 3T3細胞の腫瘍形成性を誘発する
それらの能力において、同様に有力である。非ガンのGrowt1lのDuox
2の役割の実施例16のデモンストレーション。
【0130】 通常の成長の役割は、duox2をネズミにアンチセンスに扱うことによって
ネズミ大動脈の脈管の平滑筋細胞において示される。アンチセンスのDNAを有
するトランスフェクションは、過酸化物生成および血清に依存する成長の減少に
結果としてなる。Duox2は、したがって、この細胞タイプの通常の成長に関
係する。
【0131】 全ての特許、刊行およびアブストラクトは、上記がそれらの全部において本願
明細書に引用したものとするということを引用した。前述のことが本発明の好適
な実施例だけに関すると理解されなければならない、そして、その多数の変更態
様または変更は趣旨および以下の請求項に記載の本発明の範囲から逸脱すること
なく、その中でなされることができる。
【図面の簡単な説明】
【図1】 図1。gp9lphox.の大きい相同物の構造Duoxタンパク質の領域構
造。分泌する信号のペプチド・配列は灰色の三角形によって示される。その一方
で、予測された膜内外アルファ螺旋はハッシュされた長方形によって示される。
白い卵形は、部位を結合しているEF−手カルシウムを有する異体同形を示して
いる領域を示す。
【図2A】 図2。h−Duox、Ce Duox1および周知の若干のペルオキシダーゼ
のペルオキシダーゼ領域の比較。A) 配列配置。省略形は、以下の通りである MPO(myeloperoxidase);TPO(甲状腺のペルオキシダ
ーゼ);欧州特許庁(好酸球ペルオキシダーゼ);LPO、lactopero
xidase、Pxsn. dros、ショウジョウバエperoxidasi
n.全ての7つのタンパク質の中で節約される残留物はブラック・ボックスによ
って示される。その一方で、引き出された共通配列にマッチしているそれらは線
箱に示される。満たされた円は、犬のmyeloperoxidase(Zen
gおよびFenna(1992))の結晶構造に基づいて、接触にヘムを供給す
るために提案される残留物を示す。superscriptedされた複縦線は
領域を結合しているカルシウムから成る残留物を示す、そして、満たされた三角
形はカルシウム・イオンに直接縛るために結晶構造に現れる残留物を示す。
【図2B】 系統発生の関係。追加の配列と同様にAに示される配列は、示される。省略形
は、以下の通りであるOPO(ovoperoxidase);str. pu
rp(Strongyloce7ltrotus purpuratus);l
y.バール(Lytechinus variegatus);hemi. p
ulch;Hemicentrotus pulcherrimus。
【図3】 図3。h Duox1、h−Duox2およびグリセルアルデヒド3−リン酸
塩デヒドロゲナーゼのためのh−Duox. mRNAのためのmRNAの組織
現れは、RT−PCRによって検出された。
【配列表】
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) A61P 5/14 A61P 9/10 101 4C087 9/00 9/12 4H045 9/10 101 11/00 9/12 13/08 11/00 17/06 13/08 29/00 17/06 35/00 29/00 C07K 16/40 35/00 C12N 1/15 C07K 16/40 1/19 C12N 1/15 1/21 1/19 9/02 1/21 C12Q 1/02 5/06 1/28 5/10 1/68 Z 9/02 C12N 15/00 ZNAA C12Q 1/02 5/00 A 1/28 E 1/68 A61K 37/50 (81)指定国 EP(AT,BE,CH,CY, DE,DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,I T,LU,MC,NL,PT,SE,TR),OA(BF ,BJ,CF,CG,CI,CM,GA,GN,GW, ML,MR,NE,SN,TD,TG),AP(GH,G M,KE,LS,MW,MZ,SD,SL,SZ,TZ ,UG,ZW),EA(AM,AZ,BY,KG,KZ, MD,RU,TJ,TM),AE,AG,AL,AM, AT,AU,AZ,BA,BB,BG,BR,BY,B Z,CA,CH,CN,CR,CU,CZ,DE,DK ,DM,DZ,EE,ES,FI,GB,GD,GE, GH,GM,HR,HU,ID,IL,IN,IS,J P,KE,KG,KP,KR,KZ,LC,LK,LR ,LS,LT,LU,LV,MA,MD,MG,MK, MN,MW,MX,MZ,NO,NZ,PL,PT,R O,RU,SD,SE,SG,SI,SK,SL,TJ ,TM,TR,TT,TZ,UA,UG,US,UZ, VN,YU,ZA,ZW (72)発明者 グレンドリング, キャシー ケイ. アメリカ合衆国 ジョージア 30087, ストーン マウンテン, カナワ トレイ ル 1819 (72)発明者 アーノルド, レベッカ エス. アメリカ合衆国 ジョージア 30084, タッカー, ブリドル パス コート 4344 (72)発明者 チェン, グアンギジー アメリカ合衆国 ジョージア 30329, アトランタ, ブライアークリフ ロード 2751, アパートメント 1 (72)発明者 シャーリング, リサ イギリス国 557 3ディーエイチ エセ ックス, サンダースリー, ザ チェイ ス, ライムツリー ビラズ 2 (72)発明者 ベニアン, ガイ アメリカ合衆国 ジョージア 30033, ディカター, ウォーターフォード コー ブ 2396 (72)発明者 エデンス, ウィリアム エイ. アメリカ合衆国 ジョージア 30084, タッカー, ハイドアウェイ ドライブ 4171 Fターム(参考) 4B024 AA01 AA11 BA08 CA04 CA20 DA01 DA02 DA05 DA11 DA12 EA04 GA11 HA11 HA17 4B050 CC01 CC03 CC05 DD11 EE01 LL01 LL03 LL05 4B063 QA01 QA05 QQ21 QQ23 QQ41 QQ61 QQ89 QQ95 QR03 QR57 QR77 QR80 QS36 QX01 QX10 4B065 AA01X AA58X AA72X AA91X AA93Y AB01 AC14 AC20 BA02 BA30 CA28 CA43 CA44 CA46 4C084 AA13 AA16 CA18 CA53 DC23 NA14 ZA022 ZA162 ZA362 ZA422 ZA452 ZA592 ZA892 ZB112 ZB262 4C087 BC83 NA14 ZA02 ZA16 ZA36 ZA42 ZA45 ZA59 ZA89 ZB11 ZB26 4H045 AA11 CA40 DA75 EA20 EA50 FA71

Claims (34)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 過酸化物生成を刺激することができるタンパク質またはタン
    パク質であって、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ
    ID NO:31、またはSEQ ID NO:32のアミノ酸配列から成る生
    成過酸化的な反応、それの断片またはそれの置換、そこにおいて、タンパク質、
    それの断片またはそれの保守的な置換ができる保守派生成反応性酸素中間物また
    は生成過酸化的な反応。
  2. 【請求項2】 過酸化物生成を刺激することができるタンパク質またはタン
    パク質がSEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID N
    O:31、またはSEQ ID NO:32のアミノ酸配列から成る生成過酸化
    的な反応、それの断片またはそれの保守的な置換。
  3. 【請求項3】 過酸化物生成を刺激することができるタンパク質またはタン
    パク質がSEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID N
    O:31、またはSEQ ID NO:32のアミノ酸配列から成る生成過酸化
    的な反応、それの削除またはそれに対してアミノ酸配列またはそれの保守的な置
    換の約5%よりそこにおいて、これ以上の加算でない、保守的な置換は、a)ア
    ラニン、セリンまたは各々のためのトレオニンの置換から成る;各々のためのb
    )アスパラギン酸またはグルタミン酸;各々のためのc)アスパラギンまたはグ
    ルタミン;各々のためのd)アルギニンまたはリジン;e)イソロイシン、ロイ
    シン、メチオニンまたは各々のためのバリン;そして、f)フェニルアラニン、
    チロシンまたは各々のためのトリプトファン。
  4. 【請求項4】 SEQ ID NO.:2、SEQ ID NO.:4、S
    EQ ID NO.:31またはSEQ ID NO.:32のアミノ酸配列か
    ら成るタンパク質。
  5. 【請求項5】 請求項1〜4のいずれか1つに詳述したタンパク質(それの
    断片またはそれの保守的な置換)をコードするヌクレオチド配列。
  6. 【請求項6】 ヌクレオチド配列がSEQ ID NO.:1またはSEQ
    ID NO:3、それの断片またはそれの保守的な置換から成る請求項5のヌ
    クレオチド配列。
  7. 【請求項7】 SEQ ID NO.:1またはSEQ ID NO:3か
    ら成るヌクレオチド配列。
  8. 【請求項8】 ベクターが請求項1〜4のいずれか1つに詳述したタンパク
    質それの断片またはそれの保守的な置換をコードするヌクレオチド配列を含むベ
    クター。
  9. 【請求項9】 ヌクレオチド配列がSEQ ID NO.:1またはSEQ
    ID NO:3、それの断片またはそれの保守的な置換から成る請求項8のベ
    クター。
  10. 【請求項10】 ベクターがSEQ ID NO.:1またはSEQ ID
    NO:3、それの断片またはそれの保守的な置換から成るヌクレオチド配列を
    含むベクター。
  11. 【請求項11】 請求項8のベクターを含んでいる細胞。
  12. 【請求項12】 請求項10のベクターを含んでいる細胞。
  13. 【請求項13】 請求項1〜4のいずれか1つのタンパク質に対して発生す
    る抗体。
  14. 【請求項14】 SEQ ID NO.:2、SEQ ID NO:4、S
    EQ ID NO:31またはSEQ ID NO:32のアミノ酸配列に対し
    て発生する抗体。
  15. 【請求項15】 過酸化物形成を刺激する方法であって、インビトロまたは
    、インビボにおいて、生成過酸化的な反応、または、薬学的に受け入れられるキ
    ャリアの請求項1〜4のいずれか1つのタンパク質から成る組成物の投与から成
    る、方法。
  16. 【請求項16】 過酸化物形成を刺激する方法であって、インビトロまたは
    、インビボにおいて、生成過酸化的な反応、または、薬学的に受け入れられるキ
    ャリアの請求項4のタンパク質から成る組成物の投与から成る、方法。
  17. 【請求項17】 過酸化物形成を刺激する方法であって、インビトロまたは
    、インビボにおいて、生成過酸化的な反応、または、薬学的に受け入れられるキ
    ャリアの請求項8のベクターから成る組成物の投与から成る、方法。
  18. 【請求項18】 過酸化物形成を刺激する方法であって、インビトロまたは
    、インビボにおいて、生成過酸化的な反応、または、薬学的に受け入れられるキ
    ャリアの請求項9のベクターから成る組成物の投与から成る、方法。
  19. 【請求項19】 薬の活性を決定する方法または、過酸化物生成を刺激する
    かまたは薬または化学製品の管理に続いている過酸化的な反応を起こすために、
    請求項1〜4のいずれか1つに詳述したタンパク質(それの断片またはそれの保
    守的な置換)の化学の成っている測定酵素活性。
  20. 【請求項20】 薬の活性を決定する方法または過酸化物生成を刺激するか
    または薬または化学製品の管理に続いている過酸化的な反応を起こすために請求
    項4において詳述されるタンパク質の化学の成っている測定酵素活性。
  21. 【請求項21】 酵素活性がテトラメチルベンジジンにNADPH−依存性
    であるかNADH−依存性の過酸化物世代である請求項19の方法酸化かチロシ
    ン・クロス連結している。
  22. 【請求項22】 酵素活性がテトラメチルベンジジンにNADPH−依存性
    であるかNADH−依存性のジアホラーゼ活性である請求項19の方法酸化かチ
    ロシン・クロス連結している。
  23. 【請求項23】 薬の活性または薬またはタンパク質に化学のものの化学の
    成っている測定締め具を決定する方法、それの断片または、請求項1〜4のいず
    れか1つに詳述したようにも、それの保守的な置換。
  24. 【請求項24】 薬の活性または薬の化学の成っている測定締め具を決定す
    る方法または請求項4において詳述されるタンパク質に化学の。
  25. 【請求項25】 薬の活性または増殖的な活性を調整するために薬または化
    学製品の活性を測ることから成っている化学製品を決定する方法または請求項1
    〜4のいずれか1つに詳述したタンパク質(それの断片またはそれの保守的な置
    換)の過酸化的な活性。
  26. 【請求項26】 薬の活性または増殖的な活性を調整するために薬または化
    学製品の活性を測ることから成っている化学製品を決定する方法または請求項4
    において詳述されるタンパク質の過酸化的な活性。
  27. 【請求項27】 酵素活性が完全な細胞を使用して査定される、それの細胞
    または細胞溶解物をトランスフェクションさせた請求項19の方法。
  28. 【請求項28】 酵素活性が完全な細胞を使用して査定される請求項20の
    方法は、それの細胞または細胞溶解物をトランスフェクションさせた。
  29. 【請求項29】 活性が表皮生物発生説であるduox(それの断片または
    それの保守的な置換)から成るタンパク質の活性に影響を及ぼす組成物の表皮を
    有する有機体の管理から成る表皮生物発生説に影響を及ぼす方法。
  30. 【請求項30】 タンパク質がSEQ ID NO.:2、SEQ ID
    NO:4、SEQ ID NO:31またはSEQ ID NO:32、のアミ
    ノ酸配列それの断片またはそれの保守的な置換から成る請求項29の方法。
  31. 【請求項31】 duoxから成るタンパク質、それの断片または、過酸化
    物生成を刺激するかまたは薬または化学製品の管理に続いている過酸化的な反応
    を起こすために、薬の生物学的活性またはduox、それの断片またはそれの保
    守的な置換の化学の、成っている測定酵素活性を評価するためにそれの保守的な
    置換の使用。
  32. 【請求項32】 duoxタンパク質がSEQ ID NO.:2、SEQ
    ID NO:4、SEQ ID NO:31またはSEQ ID NO:32
    、それの断片またはそれの保守的な置換のアミノ酸配列から成る請求項31の使
    用。
  33. 【請求項33】 生物学的活性が表皮生物発生説、甲状腺のホルモン生合成
    または線維症である請求項31の使用。
  34. 【請求項34】 線維症が肺線維症である請求項33の使用。
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