JP2003527108A - ポリペプチドおよびポリペプチドをコードする核酸 - Google Patents

ポリペプチドおよびポリペプチドをコードする核酸

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protein
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コリーヌ アー． エム． ヴェルネ，
リチャード エイ． シムケッツ，
ルカ ラステリ，
キャサリン イー． バーゲス，
レイモンド ジェイ． ジュニア タウピール，
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キュラジェン コーポレイション
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Abstract

(57)【要約】 本発明は、新規の単離されたＮＯＶＸポリヌクレオチドおよびＮＯＶＸポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチドを提供する。ＮＯＶＸポリペプチドに免疫特異的に結合する抗体、またはＮＯＶＸのポリペプチド、ポリヌクレオチドもしくは抗体の、任意の誘導体、改変体、変異体もしくはフラグメントがまた、提供される。本発明はさらに、ＮＯＶＸのポリペプチド、ポリヌクレオチドおよび抗体が、病理学的状態の広い範囲の検出および処置に利用される方法、ならびに他の使用を提供する。本発明に従う種々のＮＯＶＸ核酸およびポリペプチドは、タンパク質に対するドメインおよび配列の関連性の存在に従って、タンパク質ファミリーの新規なメンバーとして有用である。さらに、ＮＯＶＸ核酸およびＮＯＶＸポリペプチドはまた、ＮＯＶＸポリペプチドが属するファミリーのメンバーであるタンパク質を同定するために使用され得る。

Description

【発明の詳細な説明】
【０００１】 （発明の背景） 本発明は、一般的に、核酸およびそれによってコードされるポリペプチドに関
する。より詳細には、本発明は、細胞質、核、膜結合、および分泌ポリペプチド
をコードする核酸、ならびにこれらの核酸およびポリペプチドを産生するための
ベクター、宿主細胞、抗体および組換え方法に関する。
【０００２】 （発明の要旨） 本発明は、新規なポリペプチドをコードする新規なポリヌクレオチド配列の発
見に一部基づく。
【０００３】 従って、一つの局面において、本発明は、配列番号１、３、５、７、９、１１
もしくは１３の配列、あるいはそれらのフラグメント、ホモログ、アナログまた
は誘導体を含む単離された核酸分子を提供する。この核酸は、例えば、配列番号
２、４、６、８、１０、１２もしくは１４のアミノ酸配列を含むポリペプチドに
少なくとも８５％同一なポリペプチドをコードする核酸配列を含み得る。この核
酸は、例えば、ゲノムＤＮＡフラグメント、またはｃＤＮＡ分子であり得る。
【０００４】 本明細書中に記載される核酸の一つ以上を含むベクター、および本明細書中に
記載されるベクターまたは核酸を含む細胞もまた、本発明に含まれる。
【０００５】 本発明はまた、上記核酸分子のいずれかを含むベクターを用いて形質転換され
た宿主細胞に関する。
【０００６】 別の局面において、本発明は、ＮＯＶＸ核酸および薬学的に受容可能なキャリ
アまたは希釈剤を含む薬学的組成物を含む。
【０００７】 さらなる局面において、本発明は、実質的に精製されたＮＯＶＸポリペプチド
（例えば、ＮＯＶＸ核酸によってコードされるＮＯＶＸポリペプチドのいずれか
、ならびにそのフラグメント、ホモログ、アナログ、および誘導体）を含む。本
発明はまた、ＮＯＶＸポリペプチドおよび薬学的に受容可能なキャリアまたは希
釈剤を含む薬学的組成物を含む。
【０００８】 なおさらなる局面において、本発明は、ＮＯＶＸポリペプチドに特異的に結合
する抗体を提供する。抗体は、例えば、モノクローナル抗体またはポリクローナ
ル抗体、ならびにそれらのフラグメント、ホモログ、アナログ、および誘導体で
あり得る。本発明はまた、ＮＯＶＸ抗体および薬学的に受容可能なキャリアまた
は希釈剤を含む薬学的組成物を含む。本発明はまた、上記核酸分子のいずれかに
よってコードされるポリペプチドのエピトープに結合する単離された抗体に関す
る。
【０００９】 本発明はまた、上記薬学的組成物のいずれかを含むキットを含む。
【００１０】 本発明はさらに、ＮＯＶＸ核酸（例えば、ＮＯＶＸ核酸を含むベクター）を含
む細胞を提供し、そしてこの核酸によってコードされるＮＯＶＸポリペプチドを
発現するのに十分な条件下で細胞を培養することによってＮＯＶＸポリペプチド
を産生するための方法を提供する。次いで、発現されたＮＯＶＸポリペプチドは
、細胞から回収される。好ましくは、この細胞は、ほとんどまたは全く内因性の
ＮＯＶＸポリペプチドを産生しない。この細胞は、例えば、原核生物細胞または
真核生物細胞であり得る。
【００１１】 本発明はまた、サンプルをＮＯＶＸポリペプチドまたはＮＯＶＸ核酸に特異的
に結合する化合物と接触させ、そして存在する場合、複合体形成を検出すること
によって、このサンプル中のＮＯＶＸポリペプチドまたはＮＯＶＸ核酸を同定す
る方法に関する。
【００１２】 本発明はさらに、ＮＯＶＸポリペプチドを化合物と接触させ、ＮＯＶＸポリペ
プチドの活性が改変されるか否かを決定することによって、ＮＯＶＸポリペプチ
ドの活性を調節する化合物を同定する方法を提供する。
【００１３】 本発明はまた、ＮＯＶＸポリペプチドを化合物と接触させ、その化合物が、Ｎ
ＯＶＸポリペプチドの活性を改変するか、ＮＯＶＸポリペプチドに結合するか、
またはＮＯＶＸポリペプチドをコードする核酸分子に結合するか否かを決定する
ことによって同定されるＮＯＶＸポリペプチド活性を調節する化合物に関する。
【００１４】 別の局面において、本発明は、被験体のＮＯＶＸ関連障害の存在またはこの障
害の素因を測定する方法を提供する。この方法は、被験体からサンプルを提供す
る工程、およびこの被験体サンプル中のＮＯＶＸポリペプチドの量を測定する工
程を包含する。次いで、被験体サンプル中のＮＯＶＸポリペプチドの量を、コン
トロールサンプル中のＮＯＶＸポリペプチドの量と比較する。コントロールタン
パク質サンプル中のＮＯＶＸポリペプチドの量に対する被験体のタンパク質サン
プル中のＮＯＶＸポリペプチドの量における変化は、この被験体が、組織増殖関
連状態を有することを示す。コントロールサンプルは、好ましくは、対等の個体
（すなわち、年齢、性別、または他の一般的状態の類似する個体であって、組織
増殖関連状態を有することが疑われていない個体）から採取される。あるいは、
コントロールサンプルは、被験体が組織増殖関連障害を有すると疑われていない
場合、その被験体から採取され得る。いくつかの実施形態において、ＮＯＶＸは
、ＮＯＶＸ抗体を使用して検出される。
【００１５】 さらなる局面において、本発明は、被験体のＮＯＶＸ関連障害の存在またはこ
の障害の素因を決定する方法を提供する。この方法は、核酸サンプル（例えば、
ＲＮＡまたはＤＮＡまたはその両方）を被験体から提供する工程、および被験体
の核酸サンプル中のＮＯＶＸ核酸の量を測定する工程を包含する。次いで、被験
体核酸中のＮＯＶＸ核酸サンプルの量を、コントロールサンプル中のＮＯＶＸ核
酸の量と比較する。コントロールサンプル中のＮＯＶＸの量に対するサンプル中
のＮＯＶＸ核酸の量における変化は、この被験体がＮＯＶＸ関連障害を有するこ
とを示す。
【００１６】 なおさらなる局面において、本発明は、ＮＯＶＸ関連障害を処置または予防ま
たは遅延させる方法を提供する。本方法は、このような処置または予防または遅
延が望ましい被験体に、ＮＯＶＸ核酸、ＮＯＶＸポリペプチド、またはＮＯＶＸ
抗体を、被験体のＮＯＶＸ関連障害を処置、予防、または遅延するのに十分な量
で投与する工程を包含する。
【００１７】 他に規定しない限り、本明細書中で使用される全ての技術的用語および科学的
用語は、本発明が属する技術分野の当業者によって共通して理解されるのと同じ
意味を有する。本明細書中に記載される方法および材料と類似または等価な方法
または材料が、本発明の実施または試験において使用され得るが、適切な方法お
よび材料は以下に記載される。本明細書中で言及されるすべての刊行物、特許出
願、特許、および他の文献は、その全体が参考として援用される。矛盾する場合
には、定義を含む本明細書が優先される（ｃｏｎｔｒｏｌ）。さらに、材料、方
法、および実施例は、例示のみであって限定することを意図しない。
【００１８】 本発明の他の特徴および他の利点は、以下の詳細な説明および特許請求の範囲
から明らかとなる。
【００１９】 （発明の詳細な説明） 本発明は、新規なヌクレオチドおよびそれによってコードされるポリペプチド
を提供する。それらの配列は、集合的に「ＮＯＶＸ核酸」または「ＮＯＶＸポリ
ヌクレオチド」と呼ばれ、そして対応するコードされるポリペプチドは、「ＮＯ
ＶＸポリペプチド」または「ＮＯＶＸタンパク質」と呼ばれる。他に示されない
場合、「ＮＯＶＸ」は、本明細書中に開示された新規な配列のいずれかをいうこ
とを意味する。表１は、種々の開示されるＮＯＶＸ核酸およびそれらのコードさ
れるポリペプチドの要約を提供する。実施例１は、新規な核酸がどのように同定
されたかについての記載を提供する。
【００２０】
【表１】 ＮＯＶＸ核酸およびそれらのコードされるポリペプチドは、種々の用途および
内容において有用である。本発明に従う種々のＮＯＶＸ核酸およびポリペプチド
は、先に記載されたタンパク質に対するドメインおよび配列の関連性の存在に従
って、タンパク質ファミリーの新規なメンバーとして有用である。さらに、ＮＯ
ＶＸ核酸およびＮＯＶＸポリペプチドはまた、ＮＯＶＸポリペプチドが属するフ
ァミリーのメンバーであるタンパク質を同定するために使用され得る。
【００２１】 例えば、ＮＯＶ１およびＮＯＶ２核酸は、胎児の腎臓から単離された。従って
、ＮＯＶ１およびＮＯＶ２核酸、ＮＯＶ１およびＮＯＶ２ポリペプチド、ＮＯＶ
１およびＮＯＶ２抗体ならびに本発明の他の組成物を使用して、腎形成および腎
臓癌における新規の遺伝子、タンパク質およびシグナル伝達経路を同定し得る。
同様に、ＮＯＶ３核酸は下垂体が起源であり、そして従ってＮＯＶ３核酸を使用
して、成長ホルモン調節、血管疾患およびクッシング症候群における新規の遺伝
子、タンパク質およびシグナル伝達経路を同定し得る。
【００２２】 また、ＮＯＶ４核酸は、乳腺から単離され、そして染色体２１ａの領域に局在
する。従って、ＮＯＶ４核酸、ＮＯＶ４ポリペプチド、ＮＯＶ４抗体および本発
明の他の組成物は、染色体２１についてのマーカーとして使用され得、そして産
褥性乳腺炎および乳癌における新規の遺伝子、タンパク質およびシグナル伝達経
路を同定し得る。
【００２３】 また、ＮＯＶ６核酸は、膵臓から単離された。そういうものとして、ＮＯＶ６
核酸、ＮＯＶ６ポリペプチド、ＮＯＶ６抗体および本発明の他の組成物を使用し
て、糖尿病および膵臓癌における新規の遺伝子、タンパク質およびシグナル伝達
経路を同定し得る。
【００２４】 さらに、ＮＯＶ７は、Ｎ−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼファミ
リーの新規のメンバーであり、そしてＮＯＶ７核酸、ＮＯＶ７ポリペプチド、Ｎ
ＯＶ７抗体および本発明の他の組成物をそのように使用して、他のアセチルグル
コサミニルトランスフェラーゼファミリーメンバーを同定し得る。
【００２５】 このＮＯＶＸ核酸およびＮＯＶＸポリペプチドをまた使用して、ＮＯＶＸ活性
またはＮＯＶＸ機能を阻害または増強する分子についてスクリーニングし得る。
詳細には、本発明に従う核酸およびポリペプチドは、例えば、腎形成、細胞分化
、細胞運動、細胞増殖および新脈管形成を調節または阻害する小分子の同定のた
めの標的として使用され得る。
【００２６】 本発明に従うＮＯＶＸ核酸およびＮＯＶＸポリペプチドについてのさらなる有
用性が、本明細書中に開示される。
【００２７】 （ＮＯＶ１） 本発明に従うＮＯＶ１配列は、ヒト胎児腎臓を含む胎児腎臓において見出され
るポリペプチドをコードする核酸配列を含む。表２において示されるこの開示さ
れた核酸（配列番号１）は、５７９ヌクレオチド長であり、そしてヌクレオチド
３０〜３２でのＡＴＧ開始コドンで開始し、ヌクレオチド３１２〜３１４でのＴ
ＡＡ停止コドンで終了するオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）を含む。Ｋ
ｏｚａｋコンセンサス配列は何もこの配列と関係がない。この例示的なＯＲＦは
、９４アミノ酸ポリペプチド（配列番号２）をコードする。ＮＯＶ２ポリペプチ
ドの予想分子量は１０３５４．６ダルトン（Ｄａ）である。このコードされるタ
ンパク質は、推定分泌タンパク質である。なぜならＰＳＯＲＴ分析は、この細胞
の外側に０．５１３５の確実度で見出したからである。このタンパク質は、切断
可能なＮ末端シグナル配列を、部位３６と部位３７との間のもっともありそうな
切断部位で有すると思われる。コード配列の上流および下流の推定非翻訳領域は
、配列番号１において下線を付した。
【００２８】
【表２】 この開示されたＮＯＶ１核酸配列は、高い類似性（１００％の同一性）をヒト
染色体１の領域の部分に有し、これは、表３に示すように染色体１ｑ４２．１３
−４３上のクローンＲＰ４−７０９Ｌ２１（ＥＭＢＬ受託番号０７８６４６．２
９）に含まれる。Ｏｎｌｉｎｅ Ｍｅｎｄｅｌｉａｎ Ｉｎｈｅｒｉｔａｎｃｅ
ｉｎ Ｍａｎ（ＯＭＩＭ）データベースの探査は、この領域は、ヒトレニン遺
伝子（これは本態性高血圧および腎不全に関係がある（ＯＩＭＩデータベースエ
ントリーナンバー１７９８２０））；アンジオテンシンＩ（これもまた高血圧の
発症および進行に関係がある（ＯＭＩＭデータベースエントリーナンバー１０６
１５０））；前立腺癌の素因の遺伝子座（ＯＭＩＭデータベースエントリーナン
バー６０２７５９）；および前立腺癌遺伝子座（ＯＭＩＭデータベースエントリ
ーナンバー１７６８０７）を含むことを示す。
【００２９】
【表３】 染色体１のｑ４２．１３−４３領域は、複数の高血圧関連遺伝子座を含む。Ｎ
ＯＶ１核酸およびＮＯＶ１ポリペプチドを検出する試薬を使用して、腎臓組織を
検出し得、そしてこれは１ｑ４２．１３−４３遺伝子座に含まれる遺伝子の発現
における変化の決定に有用である。ＮＯＶ１は、腎臓および高血圧関連タンパク
質のメンバーの発現における変化に関係のある障害の処置において有用な、新し
い診断組成物または治療組成物を提供する。また、ＮＯＶ１は前立腺癌の診断に
おいても有用である。ＮＯＶ１核酸、ＮＯＶ１ポリペプチド、ＮＯＶ１抗体およ
び本発明の他の組成物は、非限定的な例として、腎不全および肝硬変、発作、心
不全および他の血管疾患を含む種々の疾患および病理学の処置および／または診
断において有用である。
【００３０】 （ＮＯＶ２） 本発明に従うＮＯＶ２核酸は、表４に開示される核酸分子を含む。開示された
ＮＯＶ２核酸の起源の組織は、胎児腎臓である。この開示された配列は、ヒト染
色体１に局在する。この開示された核酸（配列番号３）は、６９２ヌクレオチド
長であり、そしてヌクレオチド２２４〜２２６でのＡＴＧ開始コドンで開始し、
ヌクレオチド５６９〜５７１でのＴＡＡ停止コドンで終了するオープンリーディ
ングフレーム（ＯＲＦ）を含む。この核酸配列は、Ｋｏｚａｋコンセンサス配列
を含む。この例示的なＯＲＦは、１１５アミノ酸ポリペプチド（配列番号４）を
コードする。ＮＯＶ２ポリペプチドの予想分子量は、１３６７１．８Ｄａである
。ＮＯＶ２は、ＰＳＯＲＴ分析によって、マイクロボディ（ペルオキシソーム）
を０．６４００の確実度で分離することが予想される。このタンパク質は、Ｎ末
端シグナル配列を有さないと思われる。コード配列の上流および下流の推定非翻
訳領域は、配列番号３において下線を付した。
【００３１】
【表４】 ＮＯＶ２核酸配列は、表５に示すように、染色体１１（ＣＨＲ１１）（ＥＭＢ
Ｌ受託番号ＡＬ１３３２９５）に対応するヒトゲノムクローンの領域と高い相同
性（９８％の同一性）を有する。染色体１１のｐ１２−１４．２領域は、複数の
糖尿病関連遺伝子座を含む。このクローンは、１１ｐ１２−１４．２の領域に含
まれる。Ｏｎｌｉｎｅ Ｍｅｎｄｅｌｉａｎ Ｉｎｈｅｒｉｔａｎｃｅ ｉｎ
Ｍａｎ（ＯＭＩＭ）データベースの探査は、この領域は、ＬＩＭホメオボックス
遺伝子１（ＯＩＭＩデータベースエントリーナンバー６０１９９９）およびマイ
トジェン活性化プロテインキナーゼ８−相互作用タンパク質（ＭＡＰＫ８ＩＰ１
；ＯＭＩＭデータベースエントリーナンバー６０４６４１）ならびにＩＩ型真性
糖尿病についての遺伝子座（ＯＭＩＭデータベースエントリーナンバー１２５８
５３）およびインスリン遺伝子（ＯＭＩＭデータベースエントリーナンバー１７
６７３０）を含むことを示す。
【００３２】
【表５】 ＮＯＶ２を使用して腎臓組織を検出し、そしてこれは１１ｐ１２−１４．２遺
伝子座に含まれる遺伝子の発現における変化の決定に有用である。ＮＯＶ２は、
腎臓および糖尿病関連タンパク質のメンバーの発現における変化に関係のある障
害の処置において有用な、新しい診断組成物または治療組成物を提供する。また
、ＮＯＶ２は癌の診断においても有用である。ＮＯＶ２核酸、ＮＯＶ２ポリペプ
チド、ＮＯＶ２抗体および本発明の他の組成物は、非限定的な例として、腎不全
および肝硬変、糖尿病、筋退化、網膜症および他の血管疾患を含む種々の疾患お
よび病理学の処置および／または診断において有用である。
【００３３】 （ＮＯＶ３） 本発明に従うＮＯＶ３配列は、表６に開示される核酸分子を含む。開示された
配列は、アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼと関連のあるポリペプチド
をコードする。開示されたＮＯＶ３核酸配列の起源の組織は、下垂体である。開
示されたＮＯＶ３配列と相同な配列は、８個のヒト成体組織および２個のヒト胎
児組織（膵臓、胎盤および腎臓を含む）の混合物において見出される。
【００３４】 この開示された核酸（配列番号５）は、表６で示すように、２，３５１ヌクレ
オチド長であり、そしてヌクレオチド２６０〜２６２でのＡＴＧ開始コドンで開
始し、ヌクレオチド２，１１１〜２，１１３でのＴＧＡ停止コドンで終了するオ
ープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）を含む。このＯＲＦは、６１７アミノ酸
ポリペプチド（配列番号６）をコードする。ＮＯＶ３ポリペプチドの予想分子量
は、７０９２１．７Ｄａである。このＮＯＶ３ポリペプチドは、推定分泌タンパ
ク質であるが、ＰＳＯＲＴに従って確立度０．６０００で、さらに核酸局在化シ
グナルを運ぶ。シグナルＰは、残基１７および残基１８との間に切断部位が存在
し得ることを予想する。コード配列の上流および下流の推定非翻訳領域は、配列
番号５において下線を付した。
【００３５】
【表６】 この開示されたＮＯＶ３核酸配列は、表７に示されるように、染色体Ｙ（ＣＨ
Ｒ Ｙ）（ジーンバンク受託番号ＡＣ００６３６６．３）由来の配列を含むヒト
ＢＡＣゲノムクローンの領域と、高程度の相同性（１００％の同一性）を有する
。また、ＮＯＶ３核酸配列は、表８に示されるように、染色体Ｙ（ＣＨＲ Ｙ）
（ジーンバンク受託番号ＡＣ０１０１５３．３）に対応する別の特徴化されない
ヒトＢＡＣゲノムクローンと、高程度の相同性（１００％の同一性）を有する。
ＮＯＶ３ポリペプチドは、表９に示すように、アセチルグルコサミニルトランス
フェラーゼ様タンパク質（ＧＬＹ Ｔ；受託番号ＰＤ０４２４２３）の領域と相
同性（６８％の同一性、７８％の類似性）を有する。ＮＯＶ３ポリペプチドはま
た、表１０に示すように、特徴化されていないヒトタンパク質ＫＩＡＡ０６０９
（ＫＩＡＡ；受託番号ＡＢ０１１１１８１）と相同性（６８％の同一性、７８％
の類似性）を有する。ＮＯＶ３ポリペプチドのＰｆａｍ探査は、表１１に示すよ
うに、ＮＯＶ３がアセチルグルコサミニルトランスフェラーゼファミリー（グリ
コシルトランスフェラーゼファミリー８）のメンバーであり、ここでＮＯＶ３ポ
リペプチドは公知のアセチルグルコサミニルトランスフェラーゼ（ＧＬＹ Ｔ；
受託番号ＰＦ０１５０１）と整列化することを示す。このグリコシルトランスフ
ェラーゼファミリー８は、糖残基をドナー分子に移動する酵素を含む。このファ
ミリーのメンバーは、リポ多糖類生合成およびグリコーゲン合成に関する。この
ファミリーには、リポ多糖類ガラクトシルトランスフェラーゼ、リポ多糖類グリ
コシルトランスフェラーゼ１およびヒトグルコース生成（ｇｌｙｃｏｇｅｎｉｎ
）グルコシルトランスフェラーゼが挙げられる。
【００３６】
【表７】
【００３７】
【表８】
【００３８】
【表９】
【００３９】
【表１０】
【００４０】
【表１１】 ＮＯＶ３は、アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼファミリーの新しい
メンバーである。ＮＯＶ３を使用して下垂体組織を検出し、そしてこれは生理学
的および病理学的な下垂体活性に関連する遺伝子の発現における変化の決定に有
用である。アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼ活性の欠失は、腫瘍増殖
および腫瘍転移における減少と関連がある（例えば、Ｇｒａｎｓｏｖｓｋｙら、
２０００ Ｎａｔｕｒｅ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ ６（３）：３０６を参照のこと）
。ＮＯＶ３は、癌腫形成および転移の発症および増殖の、診断および測定におい
て有用である。ＮＯＶ３は、下垂体およびアセチルグルコサミニルトランスフェ
ラーゼタンパク質ファミリーのメンバーの発現における改変に関連する障害の処
置において有用である、新しい診断組成物または治療組成物を提供する。ＮＯＶ
３核酸、ＮＯＶ３ポリペプチド、ＮＯＶ３抗体および本発明の他の組成物は、非
限定的な例として、成長遅延および癌を含む種々の疾患および病理学の処置およ
び／または診断において有用である。
【００４１】 （ＮＯＶ４） 本発明に従うＮＯＶ４核酸は、表１２に開示される核酸分子を含む。開示され
たＮＯＶ４核酸の起源の組織は、乳腺組織から単離された。この開示された配列
（配列番号７）は、表１２に示すように、８１２ヌクレオチド長であり、そして
ヌクレオチド２５０〜２５２でのＡＴＧ開始コドンで開始し、ヌクレオチド６４
６〜６４８でのＴＧＡ停止コドンで終了するオープンリーディングフレーム（Ｏ
ＲＦ）を含む。この核酸配列は、Ｋｏｚａｋコンセンサス配列を含む。この例示
的なＯＲＦは、１３２アミノ酸ポリペプチド（配列番号８）をコードする。ＮＯ
Ｖ４ポリペプチドの予想分子量は、１３３４８Ｄａである。ＰＳＯＲＴプログラ
ムは、ミトコンドリアマトリックス間隙において、０．４６３５の中程度の確実
度で局在化を予想する。コード配列の上流および下流の推定非翻訳領域は、配列
番号７において下線を付した。
【００４２】
【表１２】 ＮＯＶ４核酸は、表１３に示すように、ヒト染色体２１ｑＤＮＡ（ＣＨＲ２１
；受託番号ＡＰ００１６９５．１）の部分と相同性を有する。
【００４３】
【表１３】 ＮＯＶ４は、ヒト染色体２１ｑの領域についてのマーカーとして有用である。
また、ＮＯＶ４を使用して乳腺組織を検出し、そしてこれは生理学的および病理
学的な乳腺活性（例えば、乳癌および産褥性乳腺炎）に関連する遺伝子の発現に
おける変化の決定に有用である。ＮＯＶ４は、乳腺関連タンパク質ファミリーの
メンバーの発現における改変に関連する障害の処置において有用である、新しい
診断組成物または治療組成物を提供する。ＮＯＶ４核酸、ＮＯＶ４ポリペプチド
、ＮＯＶ４抗体および本発明の他の組成物は、非限定的な例として、細菌感染お
よび癌を含む種々の疾患および病理学の処置および／または診断において有用で
ある。
【００４４】 （ＮＯＶ５） 本発明に従うＮＯＶ５配列は、表１４に示され核酸を含む。開示される核酸は
、神経膜タンパク質に関連するポリヌクレオチドをコードする。開示されるＮＯ
Ｖ５核酸は、副腎、乳房、前立腺、精巣、子宮、骨髄、黒色腫、松果体、甲状腺
、脾臓、胎盤、骨髄、乳腺、胎児胸腺−ＣＲＬ７０４６、骨形成肉腫細胞株−Ｈ
ＴＢ９６、胎児肺、視床、胎児腎臓およびバーキットリンパ腫（Ｒａｊｉ）に存
在する。発現配列タグ（ＥＳＴ）データは、ＮＯＶ５配列が、大動脈、血液、骨
、脳、胸部、中枢神経系、結腸、包皮、肺細胞、心臓、腎臓、咽頭、肺、リンパ
、筋肉、卵巣、膵臓、上皮小体、胎盤、プール（ｐｏｏｌｅｄ）、前立腺、胃、
精巣、扁桃腺、子宮、全胚、血液、胸部、頸（ｃｃｒｖｉｘ）、結腸、頭および
頸（ｎｅｃｋ）、肺、子宮、ならびに胃に発現することを示唆する。開示される
核酸（配列番号９）は、表１４に示されるように、２，０５９ヌクレオチドの長
さであり、ヌクレオチド６３−６５のＡＴＧ開始コドンで始まり、そしてヌクレ
オチド１，０２２−１，０２４のＴＧＡ終止コドンで終結するオープンリーディ
ングフレーム（ＯＲＦ）を含む。この核酸配列は、Ｋｏｚａｋコンセンサス配列
を含む。代表的なＯＲＦは、３２０アミノ酸ポリヌクレオチドをコードする（配
列番号９）。ＮＯＶ５ポリペプチドの推定分子量は、３５，２０４．３Ｄａであ
る。コード配列の推定非転写領域上流および下流を、配列番号９において下線を
引く。
【００４５】 ＮＯＶ５は、神経膜タンパク質またはプロリン−リッチ膜タンパク質であると
推定される。ＰＳＯＲＴアルゴリズムは、形質膜へのＮＯＶ５ポリペプチドの局
在を０．６０の確実度で推定する。
【００４６】
【表１４】 開示されるＮＯＶ５核酸は、表１５に示されるように、特徴のないヒトＰＰ１
２０１タンパク質をコードする遺伝子（ＰＰ１２０１：ジーンバンク受付番号：
ＮＭ０２２１５２．１）の領域と高い程度の相同性（１００％同一性）を有する
。また、ＮＯＶ５核酸は、表１６に示されるように、染色体２由来のヒトＢＡＣ
ゲノムクローンＲＰ１１−３７８Ａ１３（ジーンバンク受付番号：ＡＣ０２１０
１６．４；ＣＨＲ２）の領域と高い相同性（９９％同一性）を有する。さらに、
ＮＯＶ５核酸は、表１７に示されるように、米国特許第５，４８３，７１６号か
らのポリヌクレオチド配列の一部分（配列番号２；ジーンバンク受付番号：ＡＲ
０６２２７８）と高い相同性（１００％相同性）を有する。さらにまた、ＮＯＶ
５核酸は、表１８に示されるように、ラット神経膜タンパク質３５（ＮＭＰ３５
；受付番号：ＡＡＣ３２４６３１．１）と相同性（７０％類似性、８３％同一性
）を有する。
【００４７】
【表１５】
【００４８】
【表１６】
【００４９】
【表１７】
【００５０】
【表１８】 ここで、＊は、同一性を示し、そして＋は、類似性を示す。
【００５１】 開示されるＮＯＶ５核酸は、マーカーＤ２Ｓ１６４とマーカーＤ２Ｓ１６３と
の間のヒト染色体２に位置する。開示されるＮＯＶ５核酸配列は、２ｑ３３−３
６に位置する。この領域についてのＯｍｌｉｎｅ Ｍｅｎｄｅｌｉａｎ Ｉｎｈ
ｅｒｉｔａｎｃｅ ｉｎ Ｍａｎ（ＯＭＩＭ）エントリーは、以下の疾患が、こ
の遺伝子座に関連することを示す。従って、この遺伝子は、これら疾患（数字は
、障害についてのＯＭＩＭエントリーを示す）；ワールデンブルヒ症候群Ｉ型（
３）；ワールデンブルヒ症候群ＩＩＩ型，１４８８２０（３）；横紋筋肉腫、肺
胞，２６８２２０；心臓、顔−難聴−手症候群，１２２８８０（３）；インスリ
ン依存型糖尿病−１２；筋萎縮側索硬化症−２、若年性退縮；エーレルス‐ダン
ロー症候群、Ｘ型；インスリン依存型糖尿病−１３；白血病／リンパ腫，Ｔ細胞
；ブヨルンスタッド症候群（捻転毛および難聴）；筋障害、デスミンズ関連、心
臓骨格（ｃａｒｄｉｏｓｋｅｌｅｔａｌ）、６０１４１９（３）；心臓筋障害、
拡張性の１Ｉ；脳腱黄色腫症；フィンランド致死性新生児代謝症候群；舞踏病ア
テトーシス、家族性発作（発作性非運動遺伝子ジスキネジー）における治療的ま
たは診断的に使用され得る。
【００５２】 発現パターン、マップ位置およびタンパク質相同性の情報は、ＮＯＶ５が、こ
のマップ位置（上記される）に関連する疾患を含む、イオンチャネルおよびグル
タミン酸レセプターとして機能し得ることを示す。従って、この遺伝子は、これ
らの疾患およびこれらの疾患を含む他の組織における薬剤標的および抗体標的な
らびに診断マーカーとして役に立ち得る。インビトロでの使用は、これらの疾患
由来のこれらの組織および細胞型を含む全ての組織および細胞型に対する組織再
生を含む。
【００５３】 グルタミン酸レセプターは、哺乳動物脳におけるプレドミナント興奮性神経伝
達物質レセプターであり、そして種々の正常神経生理学的プロセスにおいて活性
化される。グルタミン酸レセプターの分類は、異なる薬理学的なアゴニストによ
る活性化に基づく。
【００５４】 ＮＯＶ５は、マーカーＤ２Ｓ１６４とマーカーＤ２Ｓ１６３との間のヒト染色
体２の領域に対するマーカーとして有用である。また、ＮＯＶ５は、神経組織な
らびに副腎、乳房、前立腺、精巣、子宮、骨髄、黒色腫、松果体、甲状腺、脾臓
、胎盤、骨髄、乳腺、胎児胸腺、胎児肺、視床、胎児腎臓およびバーキットリン
パ腫由来の組織を検出するために使用され得る。さらに、ＮＯＶ５核酸またはポ
リペプチドを検出する試薬は、副腎関連タンパク質ファミリーのメンバーの発現
における交代に関連する障害の処置に有用な新しい診断的または治療的組成物を
提供する。ＮＯＶ５核酸、ポリペプチド、抗体、および本発明の他の組成物は、
非限定的な例として、これらに関連する神経学的な障害、異常な細胞、増殖およ
び分化、ならびに癌を含む、種々の疾患および病原体の処置および／または診断
に有用である。
【００５５】 （ＮＯＶ６） 本発明に従うＮＯＶ６配列は、表１９に示される核酸配列を含む。表１９に示
されるものはまた、開示される核酸配列によってコードされるポリペプチドであ
る。このコードされるポリペプチドは、ＬＩＭ−相互作用タンパク質に関連する
。開示されるＮＯＶ６核酸は、膵臓ＲＮＡから単離された。ＮＯＶ６核酸に相同
な配列を発現する他の組織としては、脊髄、胃、胎児肺、ならびに細胞株Ｕ−９
３７およびＣＡＤＭＥＣＬＡが挙げられる。開示される核酸（配列番号１１）は
、表１９に示されるように、８０７ヌクレオチド長であり、そしてヌクレオチド
２０７〜２０９のＡＴＧ開始コドンで始まり、そしてヌクレオチド６１２〜６１
４のＴＡＧ終止コドンで終わるオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）を含む
。Ｋｏｚａｋコンセンサス配列は観察された。代表的なＯＲＦは、１３５アミノ
酸ポリペプチドをコードする（配列番号１２）。ＮＯＶ６ポリペプチドの推定分
子量は、１４，７１２，５Ｄａである。コード配列の推定の非転写領域の上流お
よび下流を、配列番号１１において下線を引く。
【００５６】
【表１９】 開示されるＮＯＶ６核酸の領域は、表２０に示されるように、染色体２由来の
ヒトＢＡＣゲノムクローンＲＰ１１−３７８Ａ１３の領域（ＣＨＲ２；ジーンバ
ンク受付番号：ＡＣ０２１０１６．４）と高い程度の相同性（１００％同一性）
を有する。また、ＮＯＶ６核酸は、表２１に示されるように、神経抵抗性関連マ
クロファージタンパク質−１をコードする、ヒトＳＬＣ１１Ａ１遺伝子の領域（
ＮＲＡＭ１；ジーンバンク受付番号：ＡＦ２２９１６３．１）と高い程度の相同
性（１００％同一性）を有する。さらに、ＮＯＶ６核酸は、表２２に示されるよ
うに、ヒト核ＬＩＭ−イントラクター−相互作用因子の領域（ＬＩＭ；受付番号
：ＸＭ００２５８４．１）と高い程度の相同性（１００％同一性）を有する。
【００５７】
【表２０】
【００５８】
【表２１】
【００５９】
【表２２】 ＮＯＶ６は、ヒト染色体２に対するマーカーとして有用である。また、ＮＯＶ
６は、膵臓、脊髄、胃、および胎児肺由来の組織の検出に使用され得る。ＬＩＭ
−相互作用因子は、種々の転写因子に結合し得、そして多様な転写因子と接触さ
せ、そして上位の活性化複合体形成するかまたはこのような複合体の形成をブロ
ックするエンハンサーとして機能するようである。ＬＩＭ−相互作用因子は、い
くつかの組織、特に骨格系の発達制御に関連する。従って、このタンパク質は、
骨格系における発達制御に関連する。ＮＯＶ６は、膵臓関連相互作用タンパク質
ファミリーのメンバーおよびＬＩＭ−相互作用タンパク質ファミリーのメンバー
の発現における交代に関連する障害の処置に有用である新しい診断的または治療
的組成物を提供することによって当該分野における必要性を満足させる。本発明
のＮＯＶ６核酸、ポリペプチド、抗体および他の組成物は、非限定的な例として
、膵臓の障害（例えば、糖尿病、異常細胞増殖および分化、ならびに癌）を含む
、種々の疾患および病原体の処置および／または診断に有用である。
【００６０】 ＬＩＭドメイン−結合因子をコードする遺伝子は、核タンパク質のＬＩＭドメ
インに生理学的に相互作用するタンパク質に対するスクリーニングにおいて最初
に単離された。これらのタンパク質は、種々の転写因子に結合し得、そして多様
な転写因子と接触させ、そして上位の活性化複合体形成するかまたはこのような
複合体の形成をブロックするエンハンサーとして機能するようである（Ｊｕｒａ
ｔａおよびＧｉｌｌ，１９９７，Ｍｏｌｅｃ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．１７：５６
８８を参照のこと）。ＬＩＭドメイン−結合因子をコードする遺伝子のファミリ
ーは、マウス、Ｃｌｉｍ１（Ｂａｃｈら，１９９７，Ｇｅｎｅｓ Ｄｅｖ．１１
：１３７０を参照のこと）およびＣｌｉｍ２／Ｌｂｄ１／Ｎｌｉ（Ａｇｕｌｎｉ
ｃｋら，１９９６，Ｎａｔｕｒｅ ３８４：２７０；ＪｕｒａｔａおよびＧｉｌ
ｌ，１９９７，Ｍｏｌｅｃ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．１７：５６８８；およびＢａ
ｃｈら，１９９７，Ｇｅｎｅｓ Ｄｅｖ．１１：１３７０を参照のこと）から単
離された２つのメンバーならびにカエル、ニワトリおよびハエから単離されたこ
れらの相同体に関連する。従って、ＬＩＭドメイン−結合因子が、多くの疾患因
子の転写活性の配位に関連するようであるという事実は、複数の不自然な位置に
よって特徴付けられる疾患に関連している。
【００６１】 疎水性プロット分析は、分泌タンパク質または形質膜局在型タンパク質と推定
されるような、ＮＯＶ６ポリペプチドのアミノ末端に疎水性ピークを示す。ＰＳ
ＯＲＴプログラムは、０．７４８０の高い確実度で微小体（ペルオキシソーム）
における局在を推定する。Ｎ−末端シグナル配列は示さない。ＮＯＶ６のＰｒｏ
ｔｅｉｎ ｅｘｔｒａｃｅｌｌｕｌａｒ Ｌｏｃａｔｏｒ Ｐｒｅｄｉｃｔｉｏ
ｎ Ａｎａｌｙｓｉｓは、このタンパク質が、細胞外に分泌されるか、または核
に移行されることを推定する。
【００６２】 （ＮＯＶ７） 本発明に従うＮＯＶ７配列は、表２３に示される核酸配列を含む。コードされ
るポリペプチドは、Ｎ−アセチルグルコサミン転移酵素ＩＩＩ（ＧｌｃＮＡｃ−
ＴＩＩＩ）に関連する。ＮＯＶ７核酸のオリジナルの組織は、膵臓である。この
開示される核酸（配列番号１３）は、表２３に示されるように、２，３５７ヌク
レオチド長であり、そしてヌクレオチド１８〜２０のＡＴＧ開始コドンで始まり
、そしてヌクレオチド２１０３〜２１０５のＴＧＡ終止コドンで終わるオープン
リーディングフレーム（ＯＲＦ）を含む。代表的なＯＲＦは、６９５アミノ酸ポ
リペプチドをコードする（配列番号１４）。コード配列の推定非転写領域の上流
および下流を、配列番号１３において下線を引く。
【００６３】
【表２３】 開示されるＮＯＶ７核酸は、表２４に示されるように、ヒトグリコシル転移酵
素様タンパク質（ＧＬＹ Ｔ；ジーンバンク受付番号：ＮＭ００４７３７．１）
と相同性（８４％同一性）を有する。また、ＮＯＶ７ポリペプチドは、表２５に
示されるように、ヒトＮ−アセチルグルコサミン転移酵素様タンパク質（ＧＬＹ
Ｔ；ＥＭＢＬ 受付番号：０９５４６１）と相同性（７０％同一性、８３％類
似性）を有する。さらに、表２６に示されるように、開示されるＮＯＶ７ポリペ
プチドは、このファミリーの代表である公知のグリコソ転移酵素（ｈｅｌｉｃｏ
ｂａｃｔｅｒ ｐｙｌｏｒｉ由来のＬＰＳ生合成タンパク質（受付番号：７４６
５０８５））を有するＮＯＶ７のグリコソ転移酵素ドメインを含むＰＦＡＭ整列
である、多くのグリコソ転移酵素間に保存された共通領域を含む。
【００６４】 開示されるＮＯＶ７核酸は、染色体１１に位置する。ＮＯＶ７配列は、少なく
とも以下の組織：脳、扁桃腺、結腸、前立腺、肝臓、腎臓、胃、肺、松果体、膵
臓、乳腺／乳房、子宮および骨髄に発現される。さらに、配列は、ヒトアセチル
グルコサミン転移酵素相同体（ジーンバンク受付番号：ＨＳＡ７５８３）の発現
パターンと密接に関連するので、胎児脳において発現することが推定される。
【００６５】 アセチルグルコサミン転移酵素に対するシグナルｌＰ、Ｐｓｏｒｔおよび／ま
たはハイドロパシープロファイルは、この配列が、シグナルペプチドを有し、そ
してリソソーム（ｐ＝０．８６５）または（ファミリーの多くの特徴である）細
胞外（ｐ＝０．８２００）に局在するようであることを推定する。
【００６６】 本明細書中で開示されるアセチルグルコサミン転移酵素様タンパク質および核
酸に対するタンパク質類似性の情報、発現パターンおよび局在位置は、このアセ
チルグルコサミン転移酵素が、アセチルグルコサミン転移酵素ファミリーの特徴
的な構造的および／または生理学的な機能を有し得ることを示唆する。従って、
本発明の核酸および（タンパク質をコードする）アミノ酸は、強力な診断および
治療適用において有用である。これらは、特異的および／または選択的な核酸ま
たはタンパク質診断マーカーおよび／またはタンパク質予測マーカーとして貢献
を含み、ここで核酸またはタンパク質の存在または量は、以下のように強力な診
断適用と同様に、評価される：（ｉ）タンパク質治療薬剤、（ｉｉ）低分子薬剤
標的、（ｉｉｉ）抗体標的（治療的、診断的、薬剤標的／細胞毒性抗体），（ｉ
ｖ）遺伝子治療に有用な核酸（遺伝子送達／遺伝子切断）、および（ｖ）インビ
ボおよびインビトロにおける組織再生を促進する組成物。
【００６７】 本発明の核酸およびタンパク質をコードするアミノ酸は、以下に記載される種
々の疾患および／または障害および／または他の病原体に関連する強力な診断お
よび治療適用に有用である。例えば、本発明の組成物は、ｍｇａｔ２（正常胚発
生の重度の機能障害に関連する）の先天性欠損を患う患者、特に、カルボハイド
レート欠損糖タンパク質症候群ＩＩ（ｃｄｇｓＩＩ型またはｃｄｇ２）を患う患
者の神経系における処置に有効性がある。先天性異常赤血球産生症のＩＩ型貧血
の種々の形成の原因にも関連している。このアセチルグルコサミン転移酵素様遺
伝子はまた、種々の癌および腫瘍抑制に対する診断および治療適用に使用され得
る。さらに、このアセチルグルコサミン転移酵素様遺伝子はまた、子宮内膜症、
受胎能、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、憩室性疾患、糖尿病、膵炎、フォン−ヒッペ
ル−リンダウ（ＶＨＬ）症候群、肝硬変、移植、アルツマイマー病、発作、結節
硬化、高カルシウム血症、パーキンソン病、ハンティングトン病、脳性麻痺、癲
癇、レッシュ−ナイハン症候群、多発性硬化症、毛細血管拡張性運動失調、白質
萎縮症、行動障害、嗜癖、不安、疼痛、神経防御、内分泌機能不全、成長障害お
よび生殖障害、全身性エリテマトーデス、自己免疫疾患、ぜん息、気腫、アレル
ギー、ＡＲＤＳ、自己免疫疾患、腎動脈狭窄、間質性腎炎、糸球体腎炎、多発性
嚢胞腎疾患、全身性エリテマトーデス、尿細管性アシドーシス、ＩｇＡ腎症、高
カルシウム血症、レッシュ−ナイハン症候群、膀胱炎および失調症に対する適用
を有する。
【００６８】
【表２４】
【００６９】
【表２５】 ここで、＊は、同一性を示し、そして＋は、類似性を示す。
【００７０】
【表２６】 ここで、＊は、同一性を示し、そして＋は、類似性を示す。
【００７１】 ＮＯＶ７ポリペプチド配列は、３つの公知のまたは推定アセチルグルコサミン
転移酵素（ＡＧＴ）−様タンパク質、ヒトＡＧＴ−タンパク質（ｈＡＧＴ；ＥＭ
ＢＬ受付：Ｏ０９５４６１）、ヒトタンパク質ＫＩＡＡ０６０９（ＫＩＡＡ；Ｅ
ＭＢＬ受付：Ｏ６０３４８）およびマウスＡＧＴ−様タンパク質（ｍＡＧＴ；Ｅ
ＭＢＬ受付Ｑ９Ｚ１Ｍ７）とのＣＬＵＳＴＡＬＷ整列分析に供した。結果を、表
２７に示す。
【００７２】
【表２７】 ここで、＊は同一性を示す、：は高い類似性を示し、そして．は低い類似性を示
す。
【００７３】 定量的発現分析（実施例２）および遺伝子発現の連続分析（ＳＡＧＥ；実施例
３）は、ＮＯＶ７核酸を使用して実施された。ＮＯＶ７遺伝子は、病気に冒され
ていない組織、特に乳癌、肺癌、結腸癌、肺への結腸転移、卵巣癌および胃癌に
対応する関連する癌のいくつかの型に過剰発現する（図１を参照のこと）。ＮＯ
Ｖ７はまた、卵巣癌細胞株、ＯＶＣＡ４３２−２において過剰発現する（図２を
参照のこと）。
【００７４】 ＮＯＶ７は、アセチルグルコサミン転移酵素ファミリーにおける新しいメンバ
ーである。ＮＯＶ７は、膵臓組織を検出するために使用され得、そして生理学的
および病原体学的な膵臓活性（例えば、糖尿病）に関連する遺伝子の発現におけ
る変化を決定するのに有用である。アセチルグルコサミン転移酵素活性の欠損は
、腫瘍の増殖および転移における減少に関連する（Ｇｒａｎｓｏｖｓｋｙら，２
０００ Ｎａｔｕｒｅ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ ６（３）：３０６を参照のこと）。
ＮＯＶ７は、発癌性発生および進行ならびに転移性発生および進行を診断および
測定に有用である。ＮＯＶ７核酸およびポリペプチドは、膵臓およびアセチルグ
ルコサミン転移酵素タンパク質ファミリーのメンバーの発現における交代に関連
する障害の処置に有用な新しい診断的または治療的組成物を提供する。本発明の
ＮＯＶ７、核酸、ポリペプチド、抗体および他の組成物は、非限定的な例として
、糖尿病および癌に関連する、種々の疾患および病原体の処置および／または診
断に有用である。
【００７５】 アセチルグルコサミン転移酵素ファミリーは、ドナー分子に糖残基を転移する
酵素を含む。このファミリーのメンバーは、リポ多糖生合成およびグリコーゲン
合成に関連する。このファミリーは、リポ多糖グラクトシル転移酵素（ＳＷＩＳ
ＳＰＲＯＴ受付番号：Ｐ２７１２８）、リポ多糖グルコシル転移酵素１（ＳＷＩ
ＳＳＰＲＯＴ受付番号：Ｐ２７１２９）およびグリコゲニングルコシル転移酵素
（ＳＷＩＳＳＰＲＯＴ受付番号：Ｐ４６９７６）を含む。
【００７６】 アセチルグルコサミン転移酵素ファミリーの１つのメンバーは、Ｍｇａｔ３遺
伝子によってコードされ、そしてＮ−グリカンの核に二分したＧｌｃＮＡｃの添
加を触媒する、Ｎ−アセチルグルコサミン転移酵素ＩＩＩ（ＧｌｃＮＡｃ−ＴＩ
ＩＩ）である。ＧｌｃＮＡｃ−ＴＩＩＩを欠いたマウスは、ジエチルニトロサミ
ンによって誘導される肝臓腫瘍の停滞した進行を示す、挿入変異Ｍｇａｔ３ｔｍ
ｌＰｓｔ（Ｍｇａｔ３ｎｅｏと称される）に帰する。
【００７７】 転移性の強力な種々の癌細胞は、ＧｎＴ−Ｖ活性との関連すること、そしてβ
１−６分枝のＮ−アセチルグルコサミンを付随することが示されている。Ｈ−ｒ
ａｓまたはｖ−ｓｉｓ／ＰＤＧＦ−Ｂの過剰発現は、トランスフェクションされ
た細胞において種々の程度に対するＧｎＴ−Ｖの活性を上方制御した。ヒト神経
膠腫Ｕ−３７３ＭＧ細胞へのＧｎＴ−Ｖの安定したトランスフェクションは、イ
ンビトロでの神経膠腫侵襲における細胞形態および病巣の接着ならびに著名な増
加の変化を生じた。アンチセンスＮ−アセチルグルコサミン転移酵素Ｖ ｃＤＮ
Ａを使用してトランスフェクションされたヒト肝臓癌細胞のアポトーシスに対す
る感受性を増加した。
【００７８】 本発明の核酸およびタンパク質は、障害（例えば、膵臓の障害、乳腺の障害、
および腎臓の障害（例えば、糖尿病、高血圧および癌））に関連する強力な治療
適用に有用である。非限定的な例として、本発明の組成物は、腎系および膵臓系
の障害を患う患者の処置に対する効力を有する。新規のタンパク質をコードする
新規の核酸、本発明の新規のタンパク質またはそれらのフラグメントは、腺癌；
リンパ腫；前立腺癌；子宮癌；免疫応答、ＡＩＤＳ、喘息、クローン病、多発性
硬化症の処置、オールブライト遺伝性骨形成異常、疾患の病原体を理解する助け
となる種々のヒト障害の機能分析のための強力なアッセイ系の開発および種々の
障害に対する新しい薬剤標的の開発にさらに有用であり得る。これらはまた、診
断適用に使用され得、ここで核酸またはタンパク質に存在または量が、評価され
る。これらの材料は、治療方法または診断方法における使用のための本発明の新
規の基質に免疫特異的に結合する抗体の産生においてさらに有用である。
【００７９】 （ＮＯＶＸ核酸） 本発明の核酸は、ＮＯＶＸポリペプチドまたはＮＯＶＸタンパク質をコードす
る核酸を含有する。本明細書において使用されるように、用語ポリペプチドおよ
びタンパク質は、交換可能である。
【００８０】 いくつかの実施形態において、ＮＯＶＸ核酸は、成熟ＮＯＶＸポリペプチドを
コードする。本明細書中で使用される場合、本明細書中に記載されるポリペプチ
ドまたはタンパク質の「成熟」形態は、天然に存在するポリペプチドあるいは前
駆体形態またはプロタンパク質の産物に関係する。天然に存在するポリペプチド
、前駆体またはプロタンパク質としては、非制限例として、対応する遺伝子によ
ってコードされる完全長遺伝子産物が挙げられる。あるいは、本明細書中で記載
されるオープンリーディングフレームによってコードされる、ポリペプチド、前
駆体またはプロタンパク質として規定されている。産物「成熟」形態は、さらに
非制限例として、遺伝子産物が産生される細胞中で発生し得る、１以上の天然に
存在するプロセッシング工程の結果として発生する。ポリペプチドまたはタンパ
ク質の「成熟」形態に導くこのようなプロセッシング工程の例としては、オープ
ンリーディングフレームの開始コドンによってコードされる、Ｎ−末端メチオニ
ン残基の切断、またはシグナルペプチドまたはリーダー配列のタンパク分解性切
断が挙げられる。従って、残基１〜Ｎ（ここで、残基１は、Ｎ−末端メチオニン
である）を有する、前駆体ポリペプチドまたはタンパク質から生じる成熟形態は
、Ｎ−末端メチオニンの除去後に残った残基２〜Ｎ末端を有する。あるいは、残
基１〜Ｎを有する前駆体ポリペプチドまたはタンパク質から生じる成熟形態（こ
こで、残基１〜残基ＭのＮ末端シグナル配列が切断される）は、残った残基Ｍ＋
１〜残基Ｎを有する。本明細書中でさらに使用されるように、ポリペプチドまた
はタンパク質の「成熟」形態は、タンパク質分解性切断事象以外の、翻訳後改変
事象の工程から生じ得る。このようなさらなるプロセスとしては、非制限例とし
て、グリコシル化、ミリストイル化、またはリン酸化が挙げられる。一般に、成
熟ポリペプチドまたは成熟タンパク質は、結果として、これらのプロセスの１つ
のみの作用、またはそれらの任意の組み合わせから得られ得る。
【００８１】 ＮＯＶＸ核酸としては、とりわけ、配列番号１、３、５、７、９、１１、もし
くは１３で提供される配列の核酸あるいはそれらのフラグメントである。さらに
、本発明には、配列番号１、３、５、７、９、１１、もしくは１３の変異体核酸
または改変体核酸あるいはそれらのフラグメントが挙げられ、任意のこれらの塩
基は、配列番号１、３、５、７、９、１１、もしくは１３に示される対応する塩
基から変化され得、ＮＯＶＸ様の活性および生理学的機能（すなわち、新脈管形
成の調節、ニューロン発生）の少なくとも１つを維持するタンパク質をさらにコ
ードする。本発明には、配列番号１、３、５、７、９、１１、もしくは１３の核
酸配列の相補体（それらのフラグメント、誘導体、アナログおよびそれらのホモ
ログを含む）がさらに挙げられる。本発明は、その構造が化学的改変を含む、核
酸または核酸フラグメントあるいはそれらの相補体をさらに含む。
【００８２】 本発明の１つの局面は、ＮＯＶＸタンパク質またはそれらの生物学的に活性な
部分をコードする単離された核酸分子に関する。また、ＮＯＶＸをコードする核
酸（例えば、ＮＯＶＸ ｍＲＮＡ）を同定するためにハイブリダイゼーションプ
ローブとして使用するための十分な核酸フラグメントおよびＮＯＶＸ核酸分子の
増幅または変異のためのポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）プライマーとして使用
するためのフラグメントも含まれる。本明細書において使用されるように、用語
「核酸分子」は、ＤＮＡ分子（例えば、ｃＤＮＡまたはゲノムＤＮＡ）、ＲＮＡ
分子（例えば、ｍＲＮＡ）、ヌクレオチドアナログを使用して産生されるＤＮＡ
またはＲＮＡのアナログ、ならびにそれらの誘導体、フラグメントおよびホモロ
グを含むことが意図される。核酸分子は、一本鎖または二本鎖であり得るが、好
ましくは、二本鎖ＤＮＡである。
【００８３】 「プローブ」とは、種々の長さの核酸配列をいい、好ましくは、使用に依存し
て、少なくとも約１０ヌクレオチド（ｎｔ）、１００ｎｔ、または例えば、約６
，０００ｎｔほどの大きさの間である。プローブは、同一、類似または相補的な
核酸配列の検出において使用される。より長いプローブは、通常、天然供給源ま
たは組換え供給源から入手され、非常に特異的であり、そしてオリゴマーよりも
はるかに遅くハイブリダイズする。プローブは、一本鎖または二本鎖であり得、
そしてＰＣＲ、メンブレンベースのハイブリダイゼーション技術またはＥＬＩＳ
Ａのような技術において特異性を有するように設計される。
【００８４】 「単離された」核酸分子は、この核酸の天然の供給源中に存在するその他の核
酸分子から分離されているものである。単離された核酸分子の例としては、ベク
ター中に含まれる組換えＤＮＡ分子、異種宿主細胞中に維持される組換えＤＮＡ
分子、部分的または実質的に精製された核酸分子、および合成ＤＮＡまたはＲＮ
Ａ分子が挙げられるが、これらに限定されない。好ましくは、「単離された」核
酸は、この核酸が由来する生物のゲノムＤＮＡ中でこの核酸に天然に隣接する配
列（すなわち、この核酸の５’末端および３’末端に位置する配列）を含まない
。例えば、種々の実施形態で、単離されたＮＯＶＸ核酸分子は、この核酸が由来
する細胞のゲノムＤＮＡ中でこの核酸に天然で隣接する、約５０ｋｂ、２５ｋｂ
、５ｋｂ、４ｋｂ、３ｋｂ、２ｋｂ、１ｋｂ、０．５ｋｂ、または０．１ｋｂ未
満のヌクレオチド配列を含み得る。さらに、「単離された」核酸分子、例えば、
ｃＤＮＡ分子は、組換え技術により産生される場合、その他の細胞物質または培
養培地を実質的に含まないか、または化学的に合成される場合、化学物質前駆体
もしくはその他の化学物質を実質的に含まないものであり得る。
【００８５】 本発明の核酸分子、例えば、配列番号１、３、５、７、９、１１、もしくは１
３のヌクレオチド配列を有する核酸分子、またはこれらのヌクレオチド配列の任
意の相補体は、標準的な分子生物学的技法および本明細書で提供される配列情報
を用いて単離され得る。ハイブリダイゼーションプローブとして、配列番号１、
３、５、７、９、１１、もしくは１３の核酸の全部または一部を使用して、ＮＯ
ＶＸ核酸配列は、標準的なハイブリダイゼーションおよびクローニング技術（例
えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋら（編）、ＭＯＬＥＣＵＬＡＲ ＣＬＯＮＩＮＧ：Ａ
ＬＡＢＯＲＡＴＯＲＹＹ ＭＡＮＵＡＬ第２版、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａ
ｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａ
ｒｂｏｒ、ＮＹ、１９８９；およびＡｕｓｕｂｅｌら、（編）、ＣＵＲＲＥＮＴ
ＰＲＯＴＯＣＯＬＳ ＩＮ ＭＯＬＥＣＵＬＡＲ ＢＩＯＬＯＧＹ、Ｊｏｈｎ
Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ、Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ、ＮＹ、１９９３）を用いて単離さ
れ得る。
【００８６】 本発明の核酸は、標準的なＰＣＲ増幅技法に従って、テンプレートとしてｃＤ
ＮＡ、ｍＲＮＡあるいはゲノムＤＮＡ、および適切なオリゴヌクレオチドプライ
マーを用いて増幅され得る。このように増幅された核酸は、適切なベクター中に
クローン化され、そしてＤＮＡ配列分析により特徴付けられ得る。さらに、ＮＯ
ＶＸヌクレオチド配列に対応するオリゴヌクレオチドは、標準的な合成技術、例
えば、自動化ＤＮＡ合成機を用いることにより調製され得る。
【００８７】 本明細書で用いられる用語「オリゴヌクレオチド」は、一連の連結されたヌク
レオチド残基をいい、このオリゴヌクレオチドは、ＰＣＲ反応で用いられ得る十
分な数のヌクレオチド塩基を有する。短いオリゴヌクレオチド配列は、ゲノム配
列もしくはｃＤＮＡ配列に基づき得るか、またはそれから設計され得、そして特
定の細胞もしくは組織において、同一、類似もしくは相補的ＤＮＡまたはＲＮＡ
を増幅し、確認し、もしくはその存在を示すために用いられる。オリゴヌクレオ
チドは、約１０ｎｔ、５０ｎｔ、または１００ｎｔの長さ、好ましくは約１５ｎ
ｔ〜３０ｎｔの長さを有する核酸配列の部分を含む。１つの実施形態では、１０
０ｎｔより少ない長さの核酸分子を含むオリゴヌクレオチドは、さらに、配列番
号１、３、５、７、９、１１、もしくは１３の少なくとも６個連続するヌクレオ
チド、またはその相補体を含む。オリゴヌクレオチドは、化学的に合成され得、
そしてプローブとして用いられ得る。
【００８８】 別の実施形態では、本発明の単離された核酸分子は、配列番号１、３、５、７
、９、１１、もしくは１３に示されるヌクレオチド配列またはこのヌクレオチド
配列の一部分の相補体である核酸分子を含む。配列番号１、３、５、７、９、１
１、もしくは１３に示されるヌクレオチド配列に相補的である核酸分子は、配列
番号１、３、５、７、９、１１、もしくは１３に示されるヌクレオチド配列に十
分相補的である核酸分子であり、配列番号１、３、５、７、９、１１、もしくは
１３に示される核酸配列に対しミスマッチがほとんどまたは全くなく水素結合し
得、それによって安定な二本鎖を形成する。
【００８９】 本明細書で用いる用語「相補的」は、核酸分子のヌクレオチド単位間のＷａｔ
ｓｏｎ−ＣｒｉｃｋまたはＨｏｏｇｓｔｅｅｎ塩基対形成をいい、そして用語「
結合」は、２つのポリペプチドまたは化合物または関連ポリペプチドまたは化合
物またはその組合せ間の物理的または化学的相互作用を意味する。結合は、イオ
ン性、非イオン性、ファンデルワールス性、疎水性相互作用などを含む。物理的
相互作用は直接的であるかまたは間接的であり得る。間接的相互作用は、別のポ
リペプチドまたは化合物を介するか、またはその効果に起因し得る。直接的結合
は、別のポリペプチドもしくは化合物を介して、またはその効果に起因して生じ
ない、その他の実質的な化学的中間体がない相互作用をいう。
【００９０】 さらに、本発明の核酸分子は、配列番号１、３、５、７、９、１１、もしくは
１３の核酸配列の一部のみ（例えば、プローブまたはプライマーとして使用され
得るフラグメント、あるいはＮＯＶＸの生物学的に活性な部分をコードするフラ
グメント）を含み得る。本明細書中に提供されるフラグメントは、少なくとも６
個の（連続する）核酸配列または少なくとも４個の（連続する）アミノ酸配列（
それぞれ、核酸の場合には、特異的なハイブリダイゼーションを可能にし、また
はアミノ酸の場合には、エピトープの特異的な認識を可能にするに十分な長さ）
として規定され、そして全長配列未満のせいぜいいくらかの部分である。フラグ
メントは、選択された核酸配列またはアミノ酸配列の任意の連続する部分に由来
し得る。誘導体は、直接的にかまたは改変もしくは部分的置換によってかのいず
れかでネイティブな化合物から形成される核酸配列またはアミノ酸配列である。
アナログは、ネイティブな化合物に類似する構造を有する（しかし、同一ではな
い）が、特定の成分または側鎖に関してそれとは異なる核酸配列またはアミノ酸
配列である。アナログは、合成物であり得るか、または進化的に異なる起源に由
来し得、そして野生型と比較して、類似の代謝活性または反対の代謝活性を有し
得る。
【００９１】 誘導体およびアナログは、以下に記載のように、誘導体またはアナログが、修
飾された核酸またはアミノ酸を含む場合、全長、または全長以外のものであり得
る。本発明の核酸またはタンパク質の誘導体またはアナログは、種々の実施形態
において、本発明の核酸もしくはタンパク質に、同一の大きさの核酸またはアミ
ノ酸配列にわたって、または整列した配列に比較した場合（この整列は、当該分
野で公知であるコンピューター相同性プログラムによって実施される）、少なく
とも約７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％、もしくは９９％もの
同一性（好ましい同一性は、８０〜９９％）で実質的に相同であるか、あるいは
そのコードする核酸がストリンジェントの、中程度にストリンジェントの、また
は低いストリンジェントの条件下で上記のタンパク質をコードする配列の相補体
にハイブリダイズし得る、領域を含む分子を包含するが、これらに限定されない
。例えば、Ａｕｓｕｂｅｌら、ＣＵＲＲＥＮＴ ＰＲＯＴＯＣＯＬＳ ＩＮ Ｍ
ＯＬＥＣＵＬＡＲ ＢＩＯＬＯＧＹ、Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ、Ｎ
ｅｗ Ｙｏｒｋ、ＮＹ、１９９３、および以下を参照のこと。例示のプログラム
は、Ｇａｐプログラム（Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ａｎａｌｙｓ
ｉｓ Ｐａｃｋａｇｅ、Ｖｅｒｓｉｏｎ ８ ｆｏｒ ＵＮＩＸ（登録商標）、
Ｇｅｎｅｔｉｃｓ Ｃｏｍｐｕｔｅｒ Ｇｒｏｕｐ、Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｒ
ｅｓｅａｒｃｈ Ｐａｒｋ、Ｍａｄｉｓｏｎ、ＷＩ）（デフォルト設定を使用、
これは、ＳｍｉｔｈおよびＷａｔｅｒｍａｎのアルゴリズム（Ａｄｖ．Ａｐｐｌ
．Ｍａｔｈ．、１９８１、２：４８２−４８９、これらは、その全体が参考とし
て本明細書中に援用される）を使用する）である。
【００９２】 「相同な核酸配列」もしくは「相同なアミノ酸配列」、またはその改変体とは
、上記で考察したように、ヌクレオチドレベルまたはアミノ酸レベルにおける相
同性によって特徴付けられる配列をいう。相同なヌクレオチド配列は、ＮＯＶＸ
ポリペプチドのアイソフォームをコードする配列をコードする。アイソフォーム
は、例えば、ＲＮＡの選択的スプライシングの結果として、同一の生物の異なる
組織において発現され得る。あるいは、アイソフォームは、異なる遺伝子によっ
てコードされ得る。本発明において、相同なヌクレオチド配列は、ヒト以外の種
（哺乳動物が挙げられるが、これに限定されず、従って、例えば、マウス、ラッ
ト、ウサギ、イヌ、ネコ、ウシ、ウマおよび他の生物が挙げられ得る）のＮＯＶ
Ｘポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む。相同なヌクレオチド配列
はまた、天然に生じる対立遺伝子改変体および本明細書に記載されるヌクレオチ
ド配列の変異体が挙げられるが、これらに限定されない。しかし、相同的ヌクレ
オチド配列は、ヒトＮＯＶＸタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含まな
い。相同核酸配列は、配列番号２、４、６、８、１０、１２、もしくは１４の保
存的アミノ酸置換（以下を参照のこと）、およびＮＯＶＸ活性を有するポリペプ
チドをコードする核酸配列を含む。ＮＯＶＸタンパク質の生物学的活性は以下に
記載されている。相同的アミノ酸配列は、ヒトＮＯＶＸポリペプチドのアミノ酸
配列をコードしない。
【００９３】 ヒトＮＯＶＸ遺伝子のクローニングから決定されたヌクレオチド配列は、他の
細胞型（例えば、他の組織由来）におけるＮＯＶＸホモログ、ならびに他の哺乳
動物由来のＮＯＶＸホモログを同定および／またはクローニングする際の使用の
ために設計されるプローブおよびプライマーの作製を可能にする。このプローブ
／プライマーは、代表的には、実質的に精製されたオリゴヌクレオチドを含む。
このオリゴヌクレオチドは、代表的には、配列番号１、３、５、７、９、１１、
もしくは１３の少なくとも約１２個、約２５個、約５０個、約１００個、約１５
０個、約２００個、約２５０個、約３００個、約３５０個または約４００個以上
の連続するセンス鎖ヌクレオチド配列；または配列番号１、３、５、７、９、１
１、もしくは１３のアンチセンス鎖ヌクレオチド配列；あるいは配列番号１、３
、５、７、９、１１、もしくは１３の天然に存在する変異体の少なくとも約１２
個、約２５個、約５０個、約１００個、約１５０個、約２００個、約２５０個、
約３００個、約３５０個または約４００個以上の連続するセンス鎖ヌクレオチド
配列に、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列の領
域を含む。
【００９４】 ヒトＮＯＶＸヌクレオチド配列に基づくプローブは、同じまたは相同なタンパ
ク質をコードする転写物またはゲノム配列を検出するために使用され得る。種々
の実施形態において、このプローブはさらに、プローブに付着した標識基を含み
、例えば、この標識基は放射性同位体、蛍光化合物、酵素、または酵素補因子で
あり得る。このようなプローブは、ＮＯＶＸタンパク質を誤って発現する細胞ま
たは組織を同定するための診断試験キットの一部として、例えば、被験体由来の
細胞のサンプル中のＮＯＶＸをコードする核酸のレベルを測定すること（例えば
、ＮＯＶＸ ｍＲＮＡレベルを検出すること、またはゲノムＮＯＶＸ遺伝子が変
異しているかまたは欠失しているか否かを決定すること）によって使用され得る
。
【００９５】 「ＮＯＶＸの生物学的に活性な部分を有するポリペプチド」は、本発明のポリ
ペプチドの活性に類似するが必ずしも同一ではない活性を示すポリペプチドをい
い、用量依存性の有無に関わらず、特定の生物学的アッセイにおいて測定される
ような成熟形態を含む。「ＮＯＶＸの生物学的に活性な部分」をコードする核酸
フラグメントは、ＮＯＶＸの生物学的活性（ＮＯＶＸタンパク質の生物学的活性
は、以下に記載される）を有するポリペプチドをコードする、配列番号１、３、
５、７、９、１１、もしくは１３の一部を単離し、ＮＯＶＸタンパク質のコード
された部分を発現させ（例えば、インビトロでの組換え発現によって）、そして
ＮＯＶＸのコードされた部分の活性を評価することによって調製され得る。例え
ば、ＮＯＶＸの生物学的に活性な部分をコードする核酸フラグメントは、必要に
応じて、ＡＴＰ結合ドメインを含み得る。別の実施形態おいて、ＮＯＶＸの生物
学的に活性な部分をコードする核酸フラグメントは、１つ以上の領域を含む。
【００９６】 （ＮＯＶＸの改変体） 本発明はさらに、遺伝コードの縮重に起因して、配列番号１、３、５、７、９
、１１、もしくは１３に示されるヌクレオチド配列とは異なる核酸分子を包含す
る。それにより、これらの核酸は、配列番号１、３、５、７、９、１１、もしく
は１３に示されるヌクレオチド配列によってコードされるタンパク質（例えば、
配列番号２、４、６、８、１０、１２、もしくは１４のポリペプチド）と同じＮ
ＯＶＸタンパク質をコードする。別の実施形態において、本発明の単離された核
酸分子は、配列番号２、４、６、８、１０、１２、もしくは１４に示されるアミ
ノ酸配列を有するタンパク質をコードするヌクレオチド配列を有する。
【００９７】 配列番号１、３、５、７、９、１１、もしくは１３に示されるヒトＮＯＶＸヌ
クレオチド配列に加えて、ＮＯＶＸのアミノ酸配列における変化を導くＤＮＡ配
列多型は、集団（例えば、ヒト集団）内に存在し得ることが、当業者によって理
解される。ＮＯＶＸ遺伝子中のこのような遺伝的多型は、天然の対立遺伝子のバ
リエーションに起因して、集団内の個体間に存在し得る。本明細書中で使用され
る場合、用語「遺伝子」および「組換え遺伝子」は、ＮＯＶＸタンパク質、好ま
しくは哺乳動物のＮＯＶＸタンパク質をコードするオープンリーディングフレー
ムを含む核酸分子をいう。このような天然の対立遺伝子のバリエーションは、代
表的には、ＮＯＶＸ遺伝子のヌクレオチド配列において１〜５％の変動性を生じ
得る。天然の対立遺伝子バリエーションの結果であり、そしてＮＯＶＸの機能的
活性を変化させない、ＮＯＶＸ内の任意および全てのこのようなヌクレオチドの
バリエーションならびに得られるアミノ酸多型は、本発明の範囲内であると意図
される。
【００９８】 さらに、他の種由来のＮＯＶＸタンパク質をコードし、従って、配列番号１、
３、５、７、９、１１、もしくは１３のヒト配列とは異なるヌクレオチド配列を
有する核酸分子は、本発明の範囲内にあることが意図される。本発明のＮＯＶＸ
のｃＤＮＡの天然の対立遺伝子改変体およびホモログに対応する核酸分子は、本
明細書中に開示されるヒトＮＯＶＸ核酸に対するその相同性に基づいて、ストリ
ンジェントハイブリダイゼーション条件下で、標準的なハイブリダイゼーション
技術に従うハイブリダイゼーションプローブとしてヒトｃＤＮＡまたはその一部
を用いて単離され得る。例えば、可溶性ヒトＮＯＶＸ ｃＤＮＡは、ヒトの膜結
合ＮＯＶＸに対するその相同性に基づいて単離され得る。同様に、膜結合ヒトＮ
ＯＶＸ ｃＤＮＡは、可溶性ヒトＮＯＶＸに対するその相同性に基づいて単離さ
れ得る。
【００９９】 従って、別の実施形態では、本発明の単離された核酸分子は、少なくとも６ヌ
クレオチド長であり、そしてストリンジェント条件下で配列番号１、３、５、７
、９、１１、もしくは１３のヌクレオチド配列を含む核酸分子にハイブリダイズ
する。別の実施形態では、この核酸は、少なくとも１０、２５、５０、１００、
２５０、５００または７５０ヌクレオチド長である。別の実施形態では、本発明
の単離された核酸分子は、コード領域にハイブリダイズする。本明細書中で用い
られる場合、用語「ストリンジェント条件下でハイブリダイズする」は、ハイブ
リダイゼーションおよび洗浄に関して、互いに少なくとも６０％相同なヌクレオ
チド配列が代表的には互いにハイブリダイズしたままである条件を記載すること
を意図する。
【０１００】 ホモログ（すなわち、ヒト以外の種由来のＮＯＶＸタンパク質をコードする核
酸）または他の関連配列（例えば、パラログ（ｐａｒａｌｏｇｓ））は、特定の
ヒト配列の全てまたは一部をプローブとし、核酸ハイブリダイゼーションおよび
クローニングに関して当該分野で周知の方法を使用して、低い、中程度の、また
は高いストリンジェンシーのハイブリダイゼーションによって入手され得る。
【０１０１】 本明細書で用いられる場合、語句「ストリンジェントハイブリダイゼーション
条件」は、その条件下で、プローブ、プライマーまたはオリゴヌクレオチドが、
その標的配列にハイブリダイズするが、その他の配列にはハイブリダイズしない
条件をいう。ストリンジェントな条件は配列依存性であり、そして異なる状況で
異なる。より長い配列は、より短い配列より高い温度で特異的にハイブリダイズ
する。一般に、ストリンジェントな条件は、規定されたイオン強度およびｐＨで
、特定の配列の熱融解点（Ｔｍ）より約５℃低いように選択される。このＴｍは
、標的配列に相補的なプローブの５０％が、平衡状態で標的配列にハイブリダイ
ズする（規定されたイオン強度、ｐＨおよび核酸濃度下）温度である。標的配列
は一般に過剰で存在するので、Ｔｍでは、５０％のプローブが平衡状態で占有さ
れている。代表的には、ストリンジェントな条件は、ｐＨ７．０〜８．３で、塩
濃度が約１．０Ｍナトリウムイオンより少なく、代表的には約０．０１〜１．０
Ｍナトリウムイオン（またはその他の塩）、そして温度が短いプローブ、プライ
マーまたはオリゴヌクレオチド（例えば、１０ｎｔ〜５０ｎｔ）について少なく
とも約３０℃、そしてより長いプローブ、プライマーおよびオリゴヌクレオチド
について少なくとも約６０℃であるような条件である。ストリンジェントな条件
はまた、ホルムアミドのような、脱安定化剤の添加で達成され得る。
【０１０２】 ストリンジェント条件は、当業者に公知であり、そしてＣＵＲＲＥＮＴ ＰＲ
ＯＴＯＣＯＬＳ ＩＮ ＭＯＬＥＣＵＬＡＲ ＢＩＯＬＯＧＹ，Ｊｏｈｎ Ｗｉ
ｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｎ．Ｙ．（１９８９），６．３．１−６．３．６に見出
され得る。好ましくは、この条件は、互いに少なくとも約６５％、約７０％、約
７５％、約８５％、約９０％、約９５％、約９８％または約９９％相同な配列が
、代表的には互いにハイブリダイズしたままであるような条件である。ストリン
ジェントハイブリダイゼーション条件の非限定的な例は、６×ＳＳＣ、５０ｍＭ
Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ７．５）、１ｍＭ ＥＤＴＡ、０．０２％ ＰＶＰ、
０．０２％ Ｆｉｃｏｌｌ、０．０２％ ＢＳＡ、および５００ｍｇ／ｍｌ変性
サケ精子ＤＮＡを含む高塩緩衝液中での６５℃でのハイブリダイゼーションであ
る。このハイブリダイゼーションに、０．２×ＳＳＣ、０．０１％ ＢＳＡ中で
の５０℃での１回以上の洗浄が続く。ストリンジェント条件下で配列番号１、３
、５、７、９、１１、もしくは１３の配列にハイブリダイズする、本発明の単離
された核酸分子は、天然に存在する核酸分子に対応する。本明細書中で使用され
る場合、「天然に存在する」核酸分子とは、天然に存在する（例えば、天然のタ
ンパク質をコードする）ヌクレオチド配列を有する、ＲＮＡ分子またはＤＮＡ分
子をいう。
【０１０３】 第２の実施形態では、配列番号１、３、５、７、９、１１、もしくは１３また
はそれらのフラグメント、アナログもしくは誘導体のヌクレオチド配列を含む核
酸分子に、中程度のストリンジェンシー条件下でハイブリダイズし得る核酸配列
が提供される。中程度のストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件の非限
定的な例は、５５℃での６×ＳＳＣ、５×デンハルト溶液、０．５％ ＳＤＳお
よび１００ｍｇ／ｍｌ変性サケ精子ＤＮＡ中でのハイブリダイゼーション、続い
て１×ＳＳＣ、０．１％ ＳＤＳ中での３７℃での１回以上の洗浄である。用い
られ得る中程度のストリンジェンシーの他の条件は、当該分野で周知である。例
えば、Ａｕｓｕｂｅｌら（編），１９９３，ＣＵＲＲＥＮＴ ＰＲＯＴＯＣＯＬ
Ｓ ＩＮ ＭＯＬＥＣＵＬＡＲ ＢＩＯＬＯＧＹ，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆
Ｓｏｎｓ，ＮＹおよびＫｒｉｅｇｌｅｒ，１９９０，ＧＥＮＥ ＴＲＡＮＳＦＥ
Ｒ ＡＮＤ ＥＸＰＲＥＳＳＩＯＮ，Ａ ＬＡＢＯＲＡＴＯＲＹ ＭＡＮＵＡＬ
，Ｓｔｏｃｋｔｏｎ Ｐｒｅｓｓ，ＮＹを参照のこと。
【０１０４】 第３の実施形態では、配列番号１、３、５、７、９、１１、もしくは１３、ま
たはそれらのフラグメント、アナログもしくは誘導体のヌクレオチド配列を含む
核酸分子に、低ストリンジェンシー条件下でハイブリダイズし得る核酸が提供さ
れる。低ストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件の非限定的な例は、３
５％ホルムアミド、５×ＳＳＣ、５０ ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ７．５）
、５ｍＭ ＥＤＴＡ、０．０２％ ＰＶＰ、０．０２％ Ｆｉｃｏｌｌ、０．２
％ ＢＳＡ、１００ｍｇ／ｍｌの変性サケ精子ＤＮＡ、１０％（重量／容量）デ
キストラン硫酸中での４０℃でのハイブリダイゼーション、続いて２×ＳＳＣ、
２５ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ７．４）、５ｍＭ ＥＤＴＡおよび０．１％
ＳＤＳ中での５０℃での１回以上の洗浄である。用いられ得る低ストリンジェ
ンシーの他の条件は、当該分野で周知である（例えば、種交差ハイブリダイゼー
ションについて用いられるように）。例えば、Ａｕｓｕｂｅｌら（編），１９９
３，ＣＵＲＲＥＮＴ ＰＲＯＴＯＣＯＬＳ ＩＮ ＭＯＬＥＣＵＬＡＲ ＢＩＯ
ＬＯＧＹ，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，ＮＹならびにＫｒｉｅｇｌｅ
ｒ，１９９０，ＧＥＮＥ ＴＲＡＮＳＦＥＲ ＡＮＤ ＥＸＰＲＥＳＳＩＯＮ，
Ａ ＬＡＢＯＲＡＴＯＲＹ ＭＡＮＵＡＬ，Ｓｔｏｃｋｔｏｎ Ｐｒｅｓｓ，Ｎ
Ｙ；ＳｈｉｌｏおよびＷｅｉｎｂｅｒｇ，１９８１，Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃ
ａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ７８：６７８９−６７９２を参照のこと。
【０１０５】 （保存的変異） 集団中に存在し得る、ＮＯＶＸ配列の天然に存在する対立遺伝子改変体に加え
て、当業者は、配列番号１、３、５、７、９、１１、もしくは１３のヌクレオチ
ド配列への変異によって変化が導入され得、それによって、ＮＯＶＸタンパク質
の機能的能力を変更することなく、コードされるＮＯＶＸタンパク質のアミノ酸
配列に変化がもたらされることをさらに理解する。例えば、「非必須」アミノ酸
残基にてアミノ酸置換をもたらすヌクレオチド置換は、配列番号１、３、５、７
、９、１１、もしくは１３の配列において行われ得る。「非必須」アミノ酸残基
は、生物学的活性を有意に変更することなく、ＮＯＶＸの野生型配列から、変更
され得る残基であり、一方、「必須」アミノ酸残基は、生物学的活性に必要とさ
れる。例えば、本発明のＮＯＶＸタンパク質の間で保存されているアミノ酸残基
は、特に変更を受け入れ難いと予測される。
【０１０６】 本発明の別の局面は、活性に必須ではないアミノ酸残基における変化を含む、
ＮＯＶＸタンパク質をコードする核酸分子に関する。このようなＮＯＶＸタンパ
ク質は、アミノ酸配列が、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、
１８、２０、２２、もしくは２４とは異なるが、生物学的活性をなお保持する。
１つの実施形態では、単離された核酸分子は、タンパク質をコードするヌクレオ
チド配列を含み、ここで、このタンパク質は、それぞれ、配列番号２、４、６、
８、１０、１２、もしくは１４のアミノ酸配列に少なくとも約７５％の相同性で
あるアミノ酸配列を含む。好ましくは、この核酸分子によってコードされるタン
パク質は、配列番号２、４、６、８、１０、１２、もしくは１４に少なくとも約
８０％相同性であり、より好ましくは配列番号２、４、６、８、１０、１２、１
４、１６、１８、２０、２２、もしくは２４に少なくとも約９０％、約９５％、
約９８％相同性であり、そして最も好ましくは少なくとも約９９％相同性である
。
【０１０７】 タンパク質に相同なＮＯＶＸタンパク質をコードする単離された核酸分子は、
配列番号１、３、５、７、９、１１、もしくは１３のヌクレオチド配列に１以上
のヌクレオチドの置換、付加または欠失を導入することにより作製され得、その
結果、１以上のアミノ酸の置換，付加または欠失が、コードされるタンパク質に
導入される。
【０１０８】 変異は、標準技術（例えば、部位特異的変異誘発およびＰＣＲ媒介変異誘発）
によって配列番号１、３、５、７、９、１１、もしくは１３のヌクレオチド配列
に導入され得る。好ましくは、保存的アミノ酸置換が、１以上の推定非必須アミ
ノ酸残基にて作製される。「保存的アミノ酸置換」は、アミノ酸残基が類似の側
鎖を有するアミノ酸残基で置換される、アミノ酸置換である。類似の側鎖を有す
るアミノ酸残基のファミリーは、当該分野で定義されている。これらのファミリ
ーとしては、以下が挙げられる：塩基性側鎖を有するアミノ酸（例えば、リジン
、アルギニン、ヒスチジン）、酸性側鎖を有するアミノ酸（例えば、アルパラギ
ン酸、グルタミン酸）、非荷電極性側鎖を有するアミノ酸（例えば、グリシン、
アスパラギン、グルタミン、セリン、トレオニン、チロシン、システイン）、非
極性側鎖を有するアミノ酸（例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシ
ン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン）、β分枝側鎖
を有するアミノ酸（例えば、トレオニン、バリン、イソロイシン）および芳香族
側鎖を有するアミノ酸（例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン
、ヒスチジン）。従って、ＮＯＶＸ中の推定された非必須アミノ酸残基は、同じ
側鎖のファミリー由来の別のアミノ酸残基で置換される。あるいは、別の実施形
態では、変異は、ＮＯＶＸコード配列の全てまたは一部に沿って（例えば、飽和
変異誘発（ｓａｔｕｒａｔｉｏｎ ｍｕｔａｇｅｎｅｓｉｓ）によって）ランダ
ムに導入され得、そして得られる変異体は、ＮＯＶＸの生物学的活性についてス
クリーニングされて、活性を維持する変異体を同定し得る。配列番号１、３、５
、７、９、１１、もしくは１３の変異誘発に続いて、コードされるタンパク質は
、当該分野で公知の任意の組換え技術によって発現され得、そしてこのタンパク
質の活性が決定され得る。
【０１０９】 １つの実施形態では、変異ＮＯＶＸタンパク質は、以下についてアッセイされ
得る：（１）他のＮＯＶＸタンパク質、他の細胞表面タンパク質、または生物学
的に活性なそれらの部分と、タンパク質：タンパク質相互作用を形成する能力、
（２）変異ＮＯＶＸタンパク質と、ＮＯＶＸのレセプターとの間の複合体形成；
（３）変異ＮＯＶＸタンパク質が細胞内標的タンパク質またはその生物学的に活
性な部分に結合する能力；（例えば、アビジンタンパク質）；（４）ＮＯＶＸタ
ンパク質に結合する能力；あるいは（５）抗ＮＯＶＸタンパク質抗体に特異的に
結合する能力。
【０１１０】 （アンチセンスＮＯＶＸ核酸） 本発明の別の局面は、配列番号１、３、５、７、９、１１、もしくは１３また
はそのフラグメント、アナログもしくは誘導体のヌクレオチド配列を含む核酸分
子にハイブリダイズし得るかまたは相補的である、単離されたアンチセンス核酸
分子に関する。「アンチセンス」核酸は、タンパク質をコードする「センス」核
酸に相補的である（例えば、二本鎖ｃＤＮＡ分子のコード鎖に相補的であるかま
たはｍＲＮＡ配列に相補的である）ヌクレオチド配列を含む。特定の局面では、
少なくとも約１０、約２５、約５０、約１００、約２５０もしくは約５００ヌク
レオチドまたは全体のＮＯＶＸコード鎖、またはそれらの一部のみに相補的な配
列を含む、アンチセンス核酸分子が提供される。配列番号２、４、６、８、１０
、１２、１４、１６、１８、２０、２２、もしくは２４のＮＯＶＸタンパク質の
フラグメント、ホモログ、誘導体およびアナログをコードする核酸分子、または
配列番号１、３、５、７、９、１１、もしくは１３のＮＯＶＸの核酸配列に相補
的なアンチセンス核酸がさらに提供される。
【０１１１】 １つの実施形態では、アンチセンス核酸分子は、ＮＯＶＸをコードするヌクレ
オチド配列のコード鎖の「コード領域」に対してアンチセンスである。用語「コ
ード領域」とは、アミノ酸残基に翻訳されるコドンを含む、ヌクレオチド配列の
領域をいう（例えば、配列番号２、４、６、８、１０、１２、もしくは１４に対
応する、ヒト（ｈｕｍａ）ＮＯＶＸのタンパク質コード領域）。別の実施形態で
は、このアンチセンス核酸分子は、ＮＯＶＸをコードするヌクレオチド配列のコ
ード鎖の「非コード領域」に対してアンチセンスである。用語「非コード領域」
とは、コード領域に隣接する、アミノ酸に翻訳されない、５’配列および３’配
列をいう（すなわち、５’非翻訳領域および３’非翻訳領域ともいわれる）。
【０１１２】 本明細書中に開示されるＮＯＶＸをコードするコード鎖配列（例えば、配列番
号１、３、５、７、９、１１、もしくは１３）を考慮すれば、本発明のアンチセ
ンス核酸は、ＷａｔｓｏｎおよびＣｒｉｃｋまたはＨｏｏｇｓｔｅｅｎの塩基対
合の規則に従って設計され得る。アンチセンス核酸分子は、ＮＯＶＸ ｍＲＮＡ
のコード領域全体に相補的であり得るが、より好ましくは、ＮＯＶＸ ｍＲＮＡ
のコード領域または非コード領域の一部にのみアンチセンスであるオリゴヌクレ
オチドである。例えば、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、ＮＯＶＸ ｍＲＮ
Ａの翻訳開始部位を取り囲む領域に相補的であり得る。アンチセンスオリゴヌク
レオチドは、例えば、長さが約５、約１０、約１５、約２０、約２５、約３０、
約３５、約４０、約４５または約５０ヌクレオチドであり得る。本発明のアンチ
センス核酸は、当該分野で公知の手順を用いて、化学的合成または酵素連結反応
を用いて構築され得る。例えば、アンチセンス核酸（例えば、アンチセンスオリ
ゴヌクレオチド）は、天然に存在するヌクレオチド、またはこの分子の生物学的
安定性を増大させるように、もしくはアンチセンス核酸とセンス核酸との間で形
成される二重鎖の物理的安定性を増大させるように設計された種々に改変された
ヌクレオチドを用いて化学的に合成され得る（例えば、ホスホロチオエート誘導
体およびアクリジン置換ヌクレオチドが用いられ得る）。
【０１１３】 アンチセンス核酸を作製するために用いられ得る改変されたヌクレオチドの例
としては以下が挙げられる：５−フルオロウラシル、５−ブロモウラシル、５−
クロロウラシル、５−ヨードウラシル、ヒポキサンチン、キサンチン、４−アセ
チルシトシン、５−（カルボキシヒドロキシメチル）ウラシル、５−カルボキシ
メチルアミノメチル２−チオウリジン、５−カルボキシメチルアミノメチルウラ
シル、ジヒドロウラシル、β−Ｄ−ガラクトシルクエオシン（ｇａｌａｃｔｏｓ
ｙｌｑｕｅｏｓｉｎｅ）、イノシン、Ｎ６−イソペンテニルアデニン、１−メチ
ルグアニン、１−メチルイノシン、２，２−ジメチルグアニン、２−メチルアデ
ニン、２−メチルグアニン、３−メチルシトシン、５−メチルシトシン、Ｎ６−
アデニン、７−メチルグアニン、５−メチルアミノメチルウラシル、５−メトキ
シアミノメチル−２−チオウラシル、β−Ｄ−マンノシルクエオシン（ｍａｎｎ
ｏｓｙｌｑｕｅｏｓｉｎｅ）、５’−メトキシカルボキシメチルウラシル、５−
メトキシウラシル、２−メチルチオ−Ｎ６−イソペンテニルアデニン、ウラシル
−５−オキシ酢酸（ｖ）、ワイブトキソシン、シュードウラシル、クエオシン（
ｑｕｅｏｓｉｎｅ）、２−チオシトシン、５−メチル−２−チオウラシル、２−
チオウラシル、４−チオウラシル、５−メチルウラシル、ウラシル−５−オキシ
酢酸メチルエステル、ウラシル−５−オキシ酢酸（ｖ）、５−メチル−２−チオ
ウラシル、３−（３−アミノ−３−Ｎ−２−カルボキシプロピル）ウラシル、（
ａｃｐ３）ｗ、および２，６−ジアミノプリン。あるいは、このアンチセンス核
酸は、核酸がアンチセンス方向でサブクローニングされた発現ベクターを用いて
生物学的に生成され得る（すなわち、挿入された核酸から転写されたＲＮＡは、
以下の小節にさらに記載される、目的の標的核酸に対してアンチセンス方向であ
る）。
【０１１４】 本発明のアンチセンス核酸分子は、代表的には被験体に投与されるか、または
インサイチュで生成され、その結果それらは、ＮＯＶＸタンパク質をコードする
細胞性ｍＲＮＡおよび／またはゲノムＤＮＡとハイブリダイズするか、またはそ
れに結合し、それによってこのタンパク質の発現を、例えば転写および／または
翻訳を阻害することによって阻害する。ハイブリダイゼーションは、安定な二重
鎖を形成する従来のヌクレオチド相補性によってか、または例えばＤＮＡ二重鎖
に結合するアンチセンス核酸分子の場合には、二重らせんのメジャーグルーブ（
ｍａｊｏｒ ｇｒｏｏｖｅ）における特異的相互作用を介してであり得る。本発
明のアンチセンス核酸分子の投与経路の例としては、組織部位での直接的注射が
挙げられる。あるいは、アンチセンス核酸分子は、選択された細胞を標的化する
ように改変され得、次いで全身に投与される。例えば、全身投与のために、アン
チセンス分子は、それらが選択された細胞表面上に発現されたレセプターまたは
抗原に特異的に結合するように改変され得る。これは、例えば、そのアンチセン
ス核酸分子を細胞表面レセプターまたは抗原に結合するペプチドまたは抗体に連
結することによる。このアンチセンス核酸分子はまた、本明細書中に記載される
ベクターを用いて細胞に送達され得る。アンチセンス分子の十分な細胞内濃度を
達成するために、アンチセンス核酸分子が強力なｐｏｌ ＩＩプロモーターまた
はｐｏｌ ＩＩＩプロモーターの制御下に置かれているベクター構築物が、好ま
しい。
【０１１５】 なお別の実施形態において、本発明のアンチセンス核酸分子は、α−アノマー
核酸分子である。α−アノマー核酸分子は、相補的ＲＮＡと特異的な二本鎖ハイ
ブリッドを形成する。ここで、通常のβ−ユニットとは対照的に、鎖は、互いに
平行に走行する（Ｇａｕｌｔｉｅｒら（１９８７）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ
Ｒｅｓ １５：６６２５〜６６４１）。このアンチセンス核酸分子はまた、２
’−ｏ−メチルリボヌクレオチド（Ｉｎｏｕｅら、（１９８７）Ｎｕｃｌｅｉｃ
Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ １５：６１３１〜６１４８）またはキメラＲＮＡ−ＤＮ
Ａアナログ（Ｉｎｏｕｅら（１９８７）ＦＥＢＳ Ｌｅｔｔ ２１５：３２７〜
３３０）を含み得る。
【０１１６】 このような改変としては、非制限的な例として、改変塩基、および糖リン酸バ
ックボーンが改変または誘導体化された核酸が挙げられる。これらの改変は、少
なくとも一部は、改変された核酸の化学的安定性を増強するために実施され、そ
の結果、それらは、例えば、被験体での治療的適用におけるアンチセンス結合核
酸として使用され得る。
【０１１７】 （ＮＯＶＸリボザイムおよびＰＮＡ部分） なお別の実施形態において、本発明のアンチセンス核酸はリボザイムである。
リボザイムは、一本鎖核酸（例えば、ｍＲＮＡ）を切断し得るリボヌクレアーゼ
活性を有する触媒性ＲＮＡ分子であり、これらは、その一本鎖核酸に対して相補
領域を有する。従って、リボザイム（例えば、ハンマーヘッド型リボザイム（Ｈ
ａｓｅｌｈｏｆｆおよびＧｅｒｌａｃｈ（１９８８）Ｎａｔｕｒｅ ３３４：５
８５〜５９１に記載される））を使用して、ＮＯＶＸ ｍＲＮＡ転写物を触媒的
に切断し、それによってＮＯＶＸ ｍＲＮＡの翻訳を阻害し得る。ＮＯＶＸをコ
ードする核酸に特異性を有するリボザイムは、本明細書中に開示されるＮＯＶＸ
ＤＮＡのヌクレオチド配列（すなわち、配列番号１、３、５、７、９、１１、
もしくは１３）に基づいて設計され得る。例えば、活性部位のヌクレオチド配列
が、ＮＯＶＸをコードするｍＲＮＡ内で切断されるヌクレオチド配列に相補的で
ある、テトラヒメナＬ−１９ ＩＶＳ ＲＮＡの誘導体が構築され得る。例えば
、Ｃｅｃｈら、米国特許第４，９８７，０７１号；およびＣｅｃｈら、米国特許
第５，１１６，７４２号を参照のこと。あるいは、ＮＯＶＸ ｍＲＮＡを使用し
て、ＲＮＡ分子のプールから、特異的リボヌクレアーゼ活性を有する触媒性ＲＮ
Ａを選択し得る。例えば、Ｂａｒｔｅｌら（１９９３）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２６１
：１４１１〜１４１８を参照のこと。
【０１１８】 あるいは、ＮＯＶＸ遺伝子発現は、ＮＯＶＸの調節領域（例えば、ＮＯＶＸの
プロモーターおよび／またはエンハンサー）に相補的なヌクレオチド配列を標的
化し、標的細胞中でＮＯＶＸ遺伝子の転写を妨害する三重らせん構造を形成する
ことによって阻害され得る。一般には、Ｈｅｌｅｎｅ．（１９９１）Ａｎｔｉｃ
ａｎｃｅｒ Ｄｒｕｇ Ｄｅｓ．６：５６９〜８４；Ｈｅｌｅｎｅら（１９９２
）Ａｎｎ．Ｎ．Ｙ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．６６０：２７〜３６；およびＭａｈｅｒ
（１９９２）Ｂｉｏａｓｓａｙｓ １４：８０７〜１５を参照のこと。
【０１１９】 種々の実施形態において、ＮＯＶＸの核酸は、塩基部分、糖部分またはリン酸
骨格で改変され、例えば、その分子の安定性、ハイブリダイゼーションまたは可
溶性を改善し得る。例えば、核酸のデオキシリボースリン酸骨格を改変して、ペ
プチド核酸を生成し得る（Ｈｙｒｕｐら（１９９６）Ｂｉｏｏｒｇ Ｍｅｄ Ｃ
ｈｅｍ ４：５〜２３を参照のこと）。本明細書中で使用される場合、用語「ペ
プチド核酸」または「ＰＮＡ」は、デオキシリボースリン酸骨格が偽ペプチド骨
格によって置換され、そして４つの天然の核塩基（ｎｕｃｌｅｏｂａｓｅ）のみ
が保持されている核酸模倣物（例えば、ＤＮＡ模倣物）をいう。ＰＮＡの中性の
骨格は、低いイオン強度の条件下でＤＮＡおよびＲＮＡに対する特異的ハイブリ
ダイゼーションを可能にすることが示されている。ＰＮＡオリゴマーの合成は、
上記のＨｙｒｕｐら（１９９６）；Ｐｅｒｒｙ−Ｏ’Ｋｅｅｆｅら（１９９６）
ＰＮＡＳ ９３：１４６７０〜６７５において記載されるような標準的固相ペプ
チド合成プロトコールを用いて行われ得る。
【０１２０】 ＮＯＶＸのＰＮＡは、治療的適用および診断的適用において使用され得る。例
えば、ＰＮＡは、例えば転写または翻訳の停止を誘導することまたは複製を阻害
することによる、遺伝子発現の配列特異的調節のためのアンチセンスまたは抗遺
伝子剤として使用され得る。ＮＯＶＸのＰＮＡはまた、例えばＰＮＡ指向性ＰＣ
Ｒクランピングによる遺伝子における一塩基対変異の分析において；他の酵素（
例えば、Ｓ１ヌクレアーゼ）と組み合わせて使用される場合の人工制限酵素とし
て（Ｈｙｒｕｐ Ｂ．（１９９６）上記）；またはＤＮＡ配列およびハイブリダ
イゼーションのプローブもしくはプライマーとして（Ｈｙｒｕｐら（１９９６）
上記；Ｐｅｒｒｙ−Ｏ’Ｋｅｅｆｅ（１９９６）、上記）、使用され得る。
【０１２１】 別の実施形態において、ＮＯＶＸのＰＮＡは、例えば、それらの安定性または
細胞性取り込みを増強するために、ＰＮＡに脂溶性基または他のヘルパー基を結
合することによって、ＰＮＡ−ＤＮＡキメラの形成によって、またはリポソーム
もしくは当該分野において公知の薬物送達の他の技術の使用によって改変され得
る。例えば、ＰＮＡおよびＤＮＡの有利な特性を組合せ得る、ＮＯＶＸのＰＮＡ
−ＤＮＡキメラが生成され得る。ＰＮＡ部分が高い結合親和性および特異性を提
供する一方で、そのようなキメラは、ＤＮＡ認識酵素（例えば、ＲＮａｓｅ Ｈ
およびＤＮＡポリメラーゼ）がＤＮＡ部分と相互作用するのを可能にする。ＰＮ
Ａ−ＤＮＡキメラは、塩基のスタッキング、核塩基間の結合数および方向を考慮
して選択される適切な長さのリンカーを使用して連結され得る（Ｈｙｒｕｐ（１
９９６）上記）。ＰＮＡ−ＤＮＡキメラの合成は、Ｈｙｒｕｐ（１９９６）上記
およびＦｉｎｎら（１９９６）Ｎｕｃｌ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ ２４：３３５７
〜６３において記載されるように行われ得る。例えば、ＤＮＡ鎖は、標準的なホ
スホラミダイトカップリング化学を用いて固体支持体上で合成され得、そして改
変されたヌクレオシドアナログ（例えば、５’−（４−メトキシトリチル）アミ
ノ−５’−デオキシ−チミジンホスホルアミダイト）が、ＰＮＡとＤＮＡの５’
末端との間に使用され得る（Ｍａｇら（１９８９）Ｎｕｃｌ Ａｃｉｄ Ｒｅｓ
１７：５９７３〜８８）。次いで、ＰＮＡモノマーが段階様式でカップリング
され、５’ＰＮＡセグメントおよび３’ＤＮＡセグメントを有するキメラ分子を
生成する（Ｆｉｎｎら（１９９６）上記）。あるいは、５’ＤＮＡセグメントお
よび３’ＰＮＡセグメントを用いて、キメラ分子が合成され得る。Ｐｅｔｅｒｓ
ｅｎら（１９７５）Ｂｉｏｏｒｇ Ｍｅｄ Ｃｈｅｍ Ｌｅｔｔ ５：１１１９
〜１１１２４を参照のこと。
【０１２２】 他の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、以下のような他の付属の基を
含み得る：ペプチド（例えば、インビボで宿主細胞レセプターを標的化するため
）、または細胞膜を横切る輸送を容易にする因子（例えば、Ｌｅｔｓｉｎｇｅｒ
ら、１９８９、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．８６：６
５５３〜６５５６；Ｌｅｍａｉｔｒｅら、１９８７、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃ
ａｄ．Ｓｃｉ．８４：６４８〜６５２；ＰＣＴ公開番号ＷＯ８８／０９８１０を
参照のこと）、または血液脳関門（例えば、ＰＣＴ公開番号ＷＯ８９／１０１３
４を参照のこと）。さらに、オリゴヌクレオチドは、ハイブリダイゼーション誘
発切断剤（例えば、Ｋｒｏｌら、１９８８、ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ ６：
９５８〜９７６を参照のこと）、またはインターカレーター剤（例えば、Ｚｏｎ
，１９８８、Ｐｈａｒｍ．Ｒｅｓ．５：５３９〜５４９を参照のこと）で改変さ
れ得る。この目的のために、オリゴヌクレオチドは、別の分子（例えば、ペプチ
ド、ハイブリダイゼーション誘発架橋剤、輸送剤、ハイブリダイゼーション誘発
切断剤など）に結合され得る。
【０１２３】 （ＮＯＶＸポリペプチド） 本発明のＮＯＶＸポリペプチドは、その配列が配列番号２、４、６、８、１０
、１２、もしくは１４に提供されるＮＯＶＸ様タンパク質を含む。本発明はまた
、なおそのＮＯＶＸ活性および生理学的機能を維持するタンパク質、またはその
機能的フラグメントをコードするが、その任意の残基が配列番号２、４、６、８
、１０、１２、もしくは１４に示される対応する残基から変化し得る、変異体ま
たは改変体タンパク質を含む。いくつかの実施形態において、この変異体または
改変体タンパク質において、２０％までまたはそれ以上の残基がそのように変化
され得る。いくつかの実施形態において、本発明に従ったＮＯＶＸポリペプチド
は、成熟ポリペプチドである。
【０１２４】 一般に、ＮＯＶＸ様機能を保持するＮＯＶＸ改変体は、配列中の特定位置の残
基が他のアミノ酸により置換され、そしてさらに、親タンパク質の２つの残基間
にさらなる残基を挿入する可能性、および親配列から１つ以上の残基を欠失する
可能性を含む。任意のアミノ酸置換、挿入または欠失が、本発明に包含される。
好適な状況では、この置換は、上記で規定されるような保存的置換である。
【０１２５】 本発明の１つの局面は、単離されたＮＯＶＸタンパク質、およびその生物学的
に活性な部分、またはその誘導体、フラグメント、アナログもしくはホモログに
関する。抗ＮＯＶＸ抗体を惹起するための免疫原としての使用に適するポリペプ
チドフラグメントもまた提供される。１つの実施形態では、ネイティブなＮＯＶ
Ｘタンパク質が、標準的なタンパク質精製技法を用いる適切な精製スキームによ
り、細胞または組織供給源から単離され得る。別の実施形態では、ＮＯＶＸタン
パク質は、組換えＤＮＡ技法により生産される。組換え発現の代替えとして、Ｎ
ＯＶＸタンパク質またはポリペプチドは、標準的なペプチド合成技法を用いて化
学的に合成され得る。
【０１２６】 「単離された」または「精製された」タンパク質またはその生物学的に活性な
部分は、ＮＯＶＸタンパク質の由来する細胞または組織供給源由来の細胞性物質
または他の夾雑タンパク質を実質的に含まないか、あるいは化学合成される場合
に化学前駆体または他の化学物質を実質的に含まない。用語「細胞性物質を実質
的に含まない」は、ＮＯＶＸタンパク質の調製物を含み、この調製物において、
ＮＯＶＸタンパク質が単離または組換え産生される細胞の細胞性成分から、ＮＯ
ＶＸタンパク質は分離されている。１つの実施形態において、用語「細胞性物質
を実質的に含まない」は、非ＮＯＶＸタンパク質（本明細書中において「夾雑タ
ンパク質」とも呼ばれる）を約３０％未満（乾燥重量にて）、より好ましくは非
ＮＯＶＸタンパク質を約２０％未満、なおより好ましくは非ＮＯＶＸタンパク質
を約１０％未満、そして最も好ましくは非ＮＯＶＸタンパク質を約５％未満有す
る、ＮＯＶＸタンパク質の調製物を含む。ＮＯＶＸタンパク質またはその生物学
的に活性な部分が組換え産生される場合、好ましくは、調製物はまた培養培地を
実質的に含まない。すなわち、培養培地は、そのタンパク質調製物の容量の約２
０％未満、より好ましくは約１０％未満、そして最も好ましくは約５％未満を示
す。
【０１２７】 用語「化学前駆体または他の化学物質を実質的に含まない」は、タンパク質が
、そのタンパク質の合成に関与する化学前駆体または他の化学物質から分離され
ているＮＯＶＸタンパク質の調製物を含む。１つの実施形態において、用語「化
学前駆体または他の化学物質を実質的に含まない」は、化学前駆体または非ＮＯ
ＶＸの化学物質を約３０％未満（乾燥重量にて）、より好ましくは化学前駆体ま
たは非ＮＯＶＸ化学物質を約２０％未満、なおより好ましくは化学前駆体または
非ＮＯＶＸ化学物質を約１０％未満、そして最も好ましくは化学前駆体または非
ＮＯＶＸ化学物質を約５％未満有する、ＮＯＶＸタンパク質の調製物を含む。
【０１２８】 ＮＯＶＸタンパク質の生物学的に活性な部分は、全長ＮＯＶＸタンパク質より
少ないアミノ酸を含み、そしてＮＯＶＸタンパク質の少なくとも１つの活性を示
す、ＮＯＶＸタンパク質のアミノ酸配列（例えば、配列番号２、４、６、８、１
０、１２、もしくは１４に示されるアミノ酸配列）に十分に相同なアミノ酸配列
、またはＮＯＶＸタンパク質のアミノ酸配列に由来するアミノ酸配列を含むペプ
チドを含む。代表的には、生物学的に活性な部分は、ＮＯＶＸタンパク質の少な
くとも１つの活性を有するドメインまたはモチーフを含む。ＮＯＶＸタンパク質
の生物学的に活性な部分は、例えば、長さが１０、２５、５０、１００またはそ
れより多いアミノ酸であるポリペプチドであり得る。
【０１２９】 本発明のＮＯＶＸタンパク質の生物学的に活性な部分は、ＮＯＶＸタンパク質
間に保存される上記の同定されたドメインの少なくとも１つ（例えば、ＴＳＲモ
ジュール）を含み得る。さらに、タンパク質の他の領域が欠失している他の生物
学的に活性な部分は、組換え技術によって調製され得、そしてネイティブなＮＯ
ＶＸタンパク質の機能的活性のうちの１つ以上について評価され得る。
【０１３０】 １つの実施形態において、ＮＯＶＸタンパク質は、配列番号２、４、６、８、
１０、１２、もしくは１４に示されるアミノ酸配列を有する。他の実施形態にお
いて、ＮＯＶＸタンパク質は、配列番号２、４、６、８、１０、に実質的に相同
であり、そして以下に詳細に議論されるように、天然の対立遺伝子改変体または
変異誘発に起因してアミノ酸配列が異なるが、配列番号２、４、６、８、１０、
１２、もしくは１４のタンパク質の機能的活性を保持する。従って、別の実施形
態において、ＮＯＶＸタンパク質は、配列番号２、４、６、８、１０、１２、も
しくは１４のアミノ酸配列に少なくとも約４５％相同なアミノ酸配列を含み、そ
して、配列番号２、４、６、８、１０、１２、もしくは１４のＮＯＶＸタンパク
質の機能的活性を保持するタンパク質である。
【０１３１】 （２つ以上の配列間の相同性の決定） ２つのアミノ酸配列または２つの核酸の相同性の百分率を決定するために、配
列は、至適な比較の目的のために整列される（例えば、ギャップは、配列間の最
適な整列について比較される配列のいずれかに導入され得る）。次いで、対応す
るアミノ酸位置またはヌクレオチド位置でのアミノ酸残基またはヌクレオチドが
比較される。第１の配列中の位置が、第２の配列中の対応する位置と同じアミノ
酸残基またはヌクレオチドで占められる場合、分子はその位置で相同である（す
なわち、本明細書中で使用される場合、アミノ酸または核酸の「相同性」は、ア
ミノ酸または核酸の「同一性」と等価である）。
【０１３２】 核酸配列の相同性は、２つの配列間の同一性の程度として決定され得る。相同
性は、当該分野において公知のコンピュータープログラム（例えば、ＧＣＧプロ
グラムパッケージにおいて提供されるＧＡＰソフトウェア）を用いて決定され得
る。ＮｅｅｄｌｅｍａｎおよびＷｕｎｓｃｈ １９７０ Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ
４８：４４３〜４５３を参照のこと。核酸配列比較のための以下の設定（ＧＡ
Ｐ作製ペナルティー、５．０、およびＧＡＰ伸長ペナルティー、０．３）を用い
てＧＣＧ ＧＡＰソフトウェアを使用すると、上記で言及される類似の核酸配列
のコード領域は、配列番号１、３、５、７、９、１１、もしくは１３に示される
ＤＮＡ配列のＣＤＳ（コード）部分と、好ましくは少なくとも７０％、少なくと
も７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくと
も９５％、少なくとも９８％または少なくとも９９％の同一性の程度を示す。
【０１３３】 用語「配列同一性」は、２つのポリヌクレオチド配列またはポリペプチド配列
が、特定の比較領域にわたって、残基毎を基準として同一である程度をいう。用
語「配列同一性のパーセンテージ」は、以下により算出される：この比較領域に
わたって最適に整列された２つの配列を比較すること、両方の配列において同一
の核酸塩基（例えば、核酸の場合にはＡ、Ｔ、Ｃ、Ｇ、Ｕ、またはＩ）が存在す
る位置の数を決定し、一致した位置の数を導くこと、この一致した位置の数を、
比較領域の内の位置の総数（すなわち、ウインドウサイズ）で除算すること、お
よびその結果を１００で乗算して、配列同一性のパーセンテージを導くこと。用
語「実質的な同一性」は、本明細書中で使用される場合、ポリヌクレオチド配列
の特徴を示し、ここでこのポリヌクレオチドは、比較領域にわたり参照配列と比
較して、少なくとも８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも８５％の配列同
一性、そして頻繁には９０〜９５％の配列同一性、より通常には少なくとも９９
％の配列同一性を有する配列を含む。用語「陽性（ｐｏｓｉｔｉｖｅ）残基の百
分率」は、以下により算出される：その比較領域にわたって最適に整列された２
つの配列を比較すること、同一のアミノ酸および保存的アミノ酸置換が、上記の
ように両方の配列において存在する位置の数を決定し、一致した位置の数を導く
こと、この一致した位置の数を、比較領域中の位置の総数（すなわち、ウインド
ウサイズ）で除算すること、およびその結果を１００で乗算して、陽性残基の百
分率を導くこと。
【０１３４】 （キメラタンパク質および融合タンパク質） 本発明はまた、ＮＯＶＸキメラタンパク質または融合タンパク質を提供する。
本明細書中で使用される場合、ＮＯＶＸ「キメラタンパク質」またはＮＯＶＸ「
融合タンパク質」は、非ＮＯＶＸポリペプチドに作動可能に連結された、ＮＯＶ
Ｘポリペプチドを含む。「ＮＯＶＸポリペプチド」は、ＮＯＶＸに対応するアミ
ノ酸配列を有するポリペプチドをいうが、「非ＮＯＶＸポリペプチド」は、ＮＯ
ＶＸタンパク質に対して実質的に相同ではないタンパク質（例えば、ＮＯＶＸタ
ンパク質とは異なり、かつ同一でかまたは異なる生物体に由来するタンパク質）
に対応するアミノ酸配列を有するポリペプチドをいう。ＮＯＶＸ融合タンパク質
において、このＮＯＶＸポリペプチドは、ＮＯＶＸタンパク質のすべてまたは一
部分に対応し得る。１つの実施形態では、ＮＯＶＸ融合タンパク質は、ＮＯＶＸ
タンパク質の少なくとも１つの生物学的に活性な部分を含む。別の実施形態では
、ＮＯＶＸ融合タンパク質は、ＮＯＶＸタンパク質の少なくとも２つの生物学的
に活性な部分を含む。融合タンパク質において、用語「作動可能に連結された」
は、ＮＯＶＸポリペプチドおよび非ＮＯＶＸポリペプチドが、インフレームで互
いに融合されていることを示すことが意図される。非ＮＯＶＸポリペプチドは、
ＮＯＶＸポリペプチドのＮ末端またはＣ末端に融合され得る。
【０１３５】 例えば、１つの実施形態では、ＮＯＶＸ融合タンパク質は、第２のタンパク質
の細胞外ドメインに連結されたＮＯＶＸポリペプチドを含む。このような融合タ
ンパク質は、ＮＯＶＸ活性を調節する化合物についてのスクリーニングアッセイ
でさらに利用され得る（このようなアッセイは、以下に詳細に記載される）。
【０１３６】 別の実施形態においては、この融合タンパク質は、ＧＳＴ−ＮＯＶＸ融合タン
パク質であり、ここではＮＯＶＸ配列が、ＧＳＴ（すなわち、グルタチオンＳ−
トランスフェラーゼ）配列のＣ末端に融合される。このような融合タンパク質は
、組換えＮＯＶＸの精製を容易にし得る。
【０１３７】 別の実施形態においては、この融合タンパク質は、ＮＯＶＸ−免疫グロブリン
融合タンパク質であり、ここでは１つ以上のドメインを含むＮＯＶＸ配列が、免
疫グロブリンタンパク質ファミリーのメンバーに由来する配列に融合される。本
発明のこのＮＯＶＸ−免疫グロブリン融合タンパク質は、薬学的組成物中に取り
込まれ、そして被験体に投与されて、細胞の表面上でＮＯＶＸリガントとＮＯＶ
Ｘタンパク質との間の相互作用を阻害し、それによってインビボのＮＯＶＸ媒介
信号伝達を抑制し得る。１つの非限定的な例においては、意図される本発明のＮ
ＯＶＸリガンドは、ＮＯＶＸレセプターである。このＮＯＶＸ−免疫グロブリン
融合タンパク質を用い、ＮＯＶＸ同族リガンドの生体利用性に影響を与え得る。
ＮＯＶＸリガンド／ＮＯＶＸ相互作用の阻害は、増殖障害および分化障害（例え
ば、癌）の両方の処置、および細胞生存を調節（例えば、促進または阻害）する
こと、ならびに急性および慢性炎症性障害および過形成創傷治癒（例えば、過形
成性瘢痕およびケロイド）に、治療的に有用であり得る。さらに、本発明のこの
ＮＯＶＸ−免疫グロブリン融合タンパク質は、被験体中で抗ＮＯＶＸ抗体を産生
するための免疫原として用いられ得、ＮＯＶＸリガンドを精製し、そしてＮＯＶ
ＸリガンドとのＮＯＶＸの相互作用を阻害する分子を同定するスクリーニングア
ッセイで用いられ得る。
【０１３８】 本発明のＮＯＶＸキメラまたは融合タンパク質は、標準的な組換えＤＮＡ技法
により産生され得る。例えば、異なるポリペプチド配列をコードするＤＮＡフラ
グメントを、従来の技法に従って、例えば、連結のための平滑末端または粘着（
ｓｔａｇｇｅｒ）末端、適切な末端を提供するための制限酵素消化、必要に応じ
て粘着（ｃｏｈｅｓｉｖｅ）末端のフィルイン、所望しない連結を避けるための
アルカリホスファターゼ処理、および酵素的連結を採用することにより、インフ
レームで一緒に連結する。別の実施形態では、融合遺伝子を、自動化ＤＮＡ合成
機を含む従来技法により合成し得る。あるいは、遺伝子フラグメントのＰＣＲ増
幅を、キメラ遺伝子配列を生成するために次いでアニールおよび再増幅され得る
、２つの連続遺伝子フラグメント間の相補的オーバハングを生じるアンカープラ
イマーを用いて実施し得る（例えば、Ａｕｓｂｅｌら（編）ＣＵＲＲＥＮＴ Ｐ
ＲＯＴＯＣＯＬＳ ＩＮ ＭＯＬＥＣＵＬＡＲ ＢＩＯＬＯＧＹ、Ｊｏｈｎ Ｗ
ｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ、１９９２を参照のこと）。さらに、融合成分（例えば、Ｇ
ＳＴポリペプチド）をすでにコードした多くの発現ベクターが市販されている。
ＮＯＶＸをコードする核酸は、この融合成分がＮＯＶＸタンパク質にインフレー
ム連結されるように、このような発現ベクター中にクローン化され得る。
【０１３９】 （ＮＯＶＸアゴニストおよびアンタゴニスト） 本発明はまた、ＮＯＶＸアゴニスト（模倣物）として、またはＮＯＶＸアンタ
ゴニストとして機能するＮＯＶＸタンパク質の改変体に関する。ＮＯＶＸタンパ
ク質の改変体、例えば、ＮＯＶＸタンパク質の離散した点変異または短縮型が、
変異誘発により生成され得る。ＮＯＶＸタンパク質のアゴニストは、天然に存在
する形態のＮＯＶＸタンパク質と実質的に同じ生物学的活性、またはその生物学
的活性のサブセットを保持し得る。ＮＯＶＸタンパク質のアンタゴニストは、天
然に存在する形態のＮＯＶＸタンパク質の１つ以上の活性を、例えば、ＮＯＶＸ
タンパク質を含む細胞シグナル伝達カスケードの下流または上流メンバーに競合
的に結合することにより阻害し得る。従って、特異的生物学的効果が、限られた
機能の改変体を用いた処理により惹起され得る。１つの実施形態では、このタン
パク質の天然に存在する形態の生物学活性のサブセットを有する改変体を用いた
被験体の処置は、ＮＯＶＸタンパク質の天然に存在する形態を用いた処置に対し
て被験体におけるより少ない副作用を有する。
【０１４０】 ＮＯＶＸアゴニスト（模倣物）として、またはＮＯＶＸアンタゴニストのいず
れかとして機能するＮＯＶＸタンパク質の改変体は、ＮＯＶＸタンパク質アゴニ
ストまたはアンタゴニスト活性のためのＮＯＶＸタンパク質の変異体、例えば短
縮型変異体のコンビナトリアルライブラリーをスクリーニングすることにより同
定され得る。１つの実施形態では、ＮＯＶＸ改変体の多彩なライブラリーは、核
酸レベルのコンビナトリアル変異誘発により生成され、そして多彩な遺伝子ライ
ブラリーによりコードされる。ＮＯＶＸ改変体の多彩なライブラリーは、例えば
、合成オリゴヌクレオチドの混合物を、潜在的なＮＯＶＸ配列の縮重セットが、
個々のポリペプチドとして、あるいは、その中にＮＯＶＸ配列のセットを含む（
例えば、ファージディスプレイのための）より大きな融合タンパク質のセットと
して発現可能であるように、遺伝子配列に酵素的に連結することにより産生され
得る。縮重オリゴヌクレオチド配列から潜在的なＮＯＶＸ改変体のライブラリー
を産生するために用いられ得る種々の方法がある。縮重遺伝子配列の化学的合成
は、自動化ＤＮＡ合成機中で実施され得、次いでこの合成遺伝子は、適切な発現
ベクター中に連結される。遺伝子の縮重セットの使用は、１つの混合物において
、潜在的なＮＯＶＸ配列の所望のセットをコードする配列のすべての供給を可能
にする。縮重オリゴヌクレオチドを合成する方法は当該分野で公知である（例え
ば、Ｎａｒａｎｇ（１９８３）Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ ３９：３；Ｉｔａｋｕ
ｒａら（１９８４）Ａｎｎｕ Ｒｅｖ Ｂｉｏｃｈｅｍ ５３：３２３；Ｉｔａ
ｋｕｒａら（１９８４）Ｓｃｉｅｎｃｅ １９８：１０５６；Ｉｋｅら（１９８
３）Ｎｕｃｌ Ａｃｉｄ Ｒｅｓ １１：４７７を参照のこと）。
【０１４１】 （ポリペプチドライブラリー） さらに、ＮＯＶＸタンパク質コード配列のフラグメントのライブラリーを用い
て、ＮＯＶＸタンパク質の改変体のスクリーニングおよび引き続く選択のための
ＮＯＶＸフラグメントの多彩な集団を生成し得る。１つの実施形態では、コード
配列フラグメントのライブラリーは、ＮＯＶＸコード配列の二本鎖ＰＣＲフラグ
メントを、１分子あたり約１つのみのニックが生じる条件下、ヌクレアーゼで処
理すること、二本鎖ＤＮＡを変性させること、異なるニック産物からのセンス／
アンチセンス対を含み得る二本鎖ＤＮＡを形成するためにこのＤＮＡを再生する
こと、Ｓ１ヌクレアーゼを用いた処理により再形成された二本鎖から一本鎖部分
を除去すること、および得られるフラグメントライブラリーを発現ベクター中に
連結することにより生成し得る。この方法により、ＮＯＶＸタンパク質の種々の
サイズのＮ末端および内部フラグメントをコードする発現ライブラリーが派生し
得る。
【０１４２】 点変異または短縮により作成されたコンビナトリアルライブラリーの遺伝子産
物をスクリーニングするため、選択された性質を有する遺伝子産物のｃＤＮＡラ
イブラリーをスクリーニングするためのいくつかの技法が当該分野で公知である
。このような技法を、ＮＯＶＸタンパク質のコンビナトリアル変異誘発により生
成された遺伝子ライブラリーの迅速スクリーニングに適用可能である。大きな遺
伝子ライブラリーをスクリーニングするための、高スループット分析に適した最
も広く用いられる技法は、代表的には、遺伝子ライブラリーを複製可能な発現ベ
クター中にクローニングすること、得られるベクターのライブラリーで適切な細
胞を形質転換すること、およびこのコンビナトリアル遺伝子を、所望の活性の検
出が、その産物が検出された遺伝子をコードするベクターの単離を容易にする条
件下で発現することを含む。ライブラリー中の機能的変異体の頻度を増大する新
規技法であるリクルーシブエンセブル変異誘発（ＲＥＭ）を、スクリーニングア
ッセイと組み合わせて用い、ＮＯＶＸ改変体を同定し得る（ＡｒｋｉｎおよびＹ
ｏｕｒｖａｎ（１９９２）ＰＮＡＳ ８９：７８１１−７８１５；Ｄｅｌｇｒａ
ｖｅら（１９９３）Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ ６：３２７−３
３１）。
【０１４３】 （ＮＯＶＸ抗体） ＮＯＶＸタンパク質に対する抗体、またはＮＯＶＸタンパク質のフラグメント
もまた、本発明に含まれる。本明細書中で使用される場合、用語「抗体」は、免
疫グロブリン分子、および免疫グロブリン（Ｉｇ）分子の免疫学的に活性な部分
（すなわち、抗原に特異的に結合する（免疫反応する）抗原結合部位を含む分子
）をいう。このような抗体としては、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体
、キメラ抗体、単鎖抗体、Ｆａｂフラグメント、Ｆａｂ’フラグメントおよびＦ （ａｂ’）２ フラグメント、ならびにＦａｂ発現ライブラリーが挙げられるが、
これらに限定されない。一般的に、ヒト由来の抗体分子は、ＩｇＧ、ＩｇＭ、Ｉ
ｇＡ、ＩｇＥおよびＩｇＤの任意のクラスに関連し、これらは分子内に存在する
重鎖の性質によってお互いに異なる。特定のクラスは同様にサブクラス（例えば
、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２など）を有する。さらに、ヒトにおいては、軽鎖はκ鎖ま
たはλ鎖であり得る。本明細書中で抗体に対する参照は、ヒト抗体種のすべての
このようなクラス、サブクラスおよび型に対する参照を含む。
【０１４４】 本発明の単離されたＮＯＶＸ関連タンパク質は、抗原、またはその一部もしく
はフラグメントとして役立つことが意図され得、そしてさらに、免疫原として使
用され、ポリクローナル抗体およびモノクローナル抗体の調製のための標準的な
技術を用いて、抗原に免疫特異的に結合する抗体を生成し得る。全長タンパク質
が使用され得るか、あるいは本発明は、免疫原として使用するための抗原の抗原
性ペプチドフラグメントを提供する。抗原性ペプチドフラグメントは、全長タン
パク質のアミノ酸配列（例えば、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、
１６、１８、もしくは２０において示されるアミノ酸配列）の少なくとも６アミ
ノ酸残基を含み、そしてそれらのエピトープを含み、その結果このペプチドに対
して惹起された抗体は、全長タンパク質またはこのエピトープを含む任意のフラ
グメントと特定の免疫複合体を形成する。好ましくは、抗原性ペプチドは、少な
くとも１０アミノ酸残基、または少なくとも１５アミノ酸残基、または少なくと
も２０アミノ酸残基、または少なくとも３０アミノ酸残基を含む。この抗原性ペ
プチドにより含まれる好ましいエピトープは、そのペプチド表面上に位置するタ
ンパク質の領域であり；通常、これらは親水性領域である。
【０１４５】 本発明の特定の実施形態では、抗原性ペプチドにより包含される少なくとも１
つのエピトープは、ＮＯＶＸタンパク質の表面上に位置するＮＯＶＸ関連タンパ
ク質の領域、例えば、親水性領域である。ヒトＮＯＶＸ関連タンパク質配列の疎
水性分析は、ＮＯＶＸ関連タンパク質のどの領域が特に親水性であるか、そして
それ故、抗体産生を標的にするために有用な表面残基をコードするようであるか
を示す。抗体産生を標的にする手段として、親水性および疎水性の領域を示すヒ
ドロパシープロットを、例えば、フーリエ変換とともにまたはなしの、Ｋｙｔｅ
ＤｏｏｌｉｔｔｌｅまたはＨｏｐｐ Ｗｏｏｄｓ法を含む、当該分野で周知の
任意の方法により生成し得る。例えば、それらの全体が本明細書に参考として援
用される、ＨｏｐｐおよびＷｏｏｄｓ、１９８１、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ．Ａｃａｄ
．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ７８：３８２４−３８２８；ＫｙｔｅおよびＤｏｏｌｉｔｔ
ｌｅ １９８２、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１５７：１０５−１４２を参照のこと
。抗原性タンパク質またはその誘導体、フラグメント、アナログもしくはホモロ
グ内の１つ以上のドメインに対して特異的な抗体はまた、本明細書中で提供され
る。
【０１４６】 本発明のタンパク質、またはその誘導体、フラグメント、アナログ、ホモログ
もしくはオルソログは、これらのタンパク質成分に免疫特異的に結合する抗体の
産生における免疫原として利用され得る。
【０１４７】 当該分野において公知の種々の手順が、本発明のタンパク質、またはその誘導
体、フラグメント、アナログ、ホモログもしくはオルソログに対して指向される
ポリクローナル抗体またはモノクローナル抗体の産生のために使用され得る（例
えば、Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ Ｌａｍｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，Ｈａ
ｒｌｏｗ Ｅ，およびＬａｎｅ Ｄ，１９９８，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａ
ｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａ
ｒｂｏｒ、ＮＹ（本明細書中に参考として援用される）を参照のこと）。これら
の抗体のうちのいくつかは、以下で考察される。
【０１４８】 （ポリクローナル抗体） ポリクローナル抗体の産生のために、種々の適切な宿主動物（例えば、ウサギ
、ヤギ、マウスまたは他の動物）は、ネイティブなタンパク質、その合成改変体
、または前記の誘導体を用いる１以上の注射によって免疫され得る。適切な免疫
原性調製物は、例えば、天然に存在する免疫原性タンパク質、免疫原性タンパク
質を提示する化学的に合成されたポリペプチド、または組換え的に発現される免
疫原性タンパク質を含み得る。さらに、このタンパク質は、免役されている哺乳
動物において免疫原性であることが知られている第２のタンパク質に結合体化さ
れ得る。このような免疫原性タンパク質の例としては、キーホールリンペットヘ
モシアニン、血清アルブミン、ウシサイログロブリン、および大豆トリプシンイ
ンヒビターが挙げられるが、これらに限定されない。この調製物はさらに、アジ
ュバントを含み得る。種々のアジュバントが免疫学的応答を増加させるために使
用され、このようなアジュバントとしては、Ｆｒｅｕｎｄ’ｓ（完全および不完
全）、ミネラルゲル（例えば、水酸化アルミニウム）、界面活性物質（例えば、
リゾレシチン、プルロニック（ｐｌｕｒｏｎｉｃ）ポリオール、ポリアニオン、
ペプチド、油乳濁液、ジニトロフェノールなど）、ヒトにおいて使用可能なアジ
ュバント（例えば、Ｂａｃｉｌｌｅ Ｃａｌｍｅｔｔｅ−ＧｕｅｒｉｎおよびＣ
ｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｐａｒｖｕｍ）または類似の免疫刺激剤が挙げ
られるが、これらに限定されない。使用され得るアジュバントのさらなる例とし
ては、ＭＰＬ−ＴＤＭアジュバント（モノホスホリルリピドＡ、合成トレハロー
スジコリノミコレート）が挙げられる。
【０１４９】 免疫原性タンパク質に対して指向されるポリクローナル抗体分子は、哺乳動物
から（例えば、血液から）単離され得、そして周知の技術（例えば、プロテイン
ＡまたはプロテインＧを用いるアフィニティクロマトグラフィー（これは、主に
免疫血清のＩｇＧ画分を提供する））によってさらに精製され得る。続いて、ま
たは代替的に、求められている免疫グロブリンの標的である特定の抗原またはそ
の抗原のエピトープがカラムに固定され、免疫アフィニティクロマトグラフィー
によって免疫特異的抗体を精製し得る。免疫グロブリンの精製は、例えば、Ｄ．
Ｗｉｌｋｉｎｓｏｎ（Ｔｈｅ Ｓｃｉｅｎｔｉｓｔ（Ｔｈｅ Ｓｃｉｅｎｔｉｓ
ｔ，Ｉｎｃ．，Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ ＰＡより発行）、第１４巻、第８号
（２０００年４月１７日）、２５〜２８頁）によって考察される。
【０１５０】 （モノクローナル抗体） 本明細書で用いられる用語「モノクローナル抗体」（ＭＡｂ）または「モノク
ローナル抗体組成物」は、独特の軽鎖遺伝子産物および独特の重鎖遺伝子産物か
らなる唯一の分子種の抗体分子を含む抗体分子の集団をいう。特に、モノクロー
ナル抗体の相補性決定領域（ＣＤＲ）は、すべての分子の集団に同一である。従
って、ＭＡｂは、抗原への独特の結合親和性によって特徴付けられる抗原の特定
のエピトープと免疫反応可能な抗原結合部位を含む。
【０１５１】 モノクローナル抗体は、ハイブリドーマ方法（例えば、ＫｏｈｌｅｒおよびＭ
ｉｌｓｔｅｉｎ，Ｎａｔｕｒｅ，２５６：４９５（１９７５）に記載されるよう
な方法）を使用して調製され得る。ハイブリドーマ方法において、マウス、ハム
スター、または他の適切な宿主細胞は、免疫因子で代表的に免疫され、免疫因子
に特異的に結合する抗体を産生するか、または産生し得るリンパ球を誘発する。
あるいは、リンパ球は、インビトロで免疫され得る。
【０１５２】 免疫因子としては、代表的に、タンパク質抗原、そのフラグメントまたはその
融合タンパク質が挙げられる。一般的には、以下のいずれかである：ヒト起源の
細胞が望まれる場合は、末梢血リンパ球が使用され、または非ヒト哺乳動物供給
源が望まれる場合は、脾臓細胞またはリンパ節細胞が使用される。次いで、適切
な融合因子（例えば、ポリエチレングリコール）を使用して、リンパ球を不死化
細胞株に融合し、ハイブリドーマ細胞を形成する（Ｇｏｄｉｎｇ，Ｍｏｎｏｃｌ
ｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ ａｎｄ Ｐｒａｃｔ
ｉｃｅ，Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ（１９８６）第５９−１０３頁）。不死
化細胞株は、哺乳動物細胞、特にげっ歯類、ウシおよびヒト起源の骨髄腫細胞に
通常形質転換される。通常ラットまたはマウスの骨髄腫細胞株が使用されるハイ
ブリドーマ細胞は、１以上の物質（融合されていない不死化細胞の増殖も生存も
阻害する）を適切に含む適切な培養培地中で培養され得る。例えば、親の細胞が
酵素、ヒポキサンチングアニンンホスホリボシルトランスフェラーゼ（ＨＧＰＲ
ＴまたはＨＰＲＴ）を欠く場合、ハイブリドーマからの培養培地は、代表的にヒ
ポキサンチン、アミノプテリン、およびチミジンを含み（「ＨＡＴ培地」）、そ
れらの物質はＨＧＰＲＴ欠失細胞の増殖を阻害する。
【０１５３】 好ましい不死化細胞株は、効率的に融合する細胞株であり、それらは選択され
た抗体産生細胞の安定な高レベルの抗体の発現を支持し、そしてＨＡＴ培地のよ
うな培地に敏感である。より好ましい不死化細胞株はマウス骨髄腫細胞株であり
、それらを、例えば、Ｓａｌｋ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ Ｃｅｌｌ Ｄｉｓｔｒｉ
ｂｕｔｉｏｎ Ｃｅｎｔｅｒ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，Ｃａｌｉｆｏｒｎｉａおよ
びＡｍｅｒｉｃａｎ Ｔｙｐｅ Ｃｕｌｔｕｒｅ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ，Ｍａ
ｎａｓｓａｓ，Ｖｉｒｇｉｎｉａから得ることが可能である。ヒト骨髄腫および
マウス−ヒト骨髄腫細胞株はまた、ヒトモノクローナル抗体の産生について記載
される（Ｋｏｚｂｏｒ，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１３３：３００１（１９８４）
；Ｂｒｏｄｅｕｒら、Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｙ Ｐｒｏｄｕｃ
ｔｉｏｎ Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ ａｎｄ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ，Ｍａｒｃ
ｅｌ Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，（１９８７）第５１−６３
頁）。
【０１５４】 次いで、ハイブリドーマ細胞が培養される培養培地は、抗原に対するモノクロ
ーナル抗体の存在についてアッセイされ得る。好ましくは、ハイブリドーマ細胞
によって産生されるモノクローナル抗体の結合特異性は、免疫沈降によって決定
されるか、またはインビトロ結合アッセイ（例えば、ラジオイムノアッセイ（Ｒ
ＩＡ）または酵素結合イムノソルベント検定法（ＥＬＩＳＡ））によって決定さ
れる。このような技術およびアッセイは、当該分野で公知である。モノクローナ
ル抗体の結合親和性は、例えば、ＭｕｎｓｏｎおよびＰｏｌｌａｒｄ，Ａｎａｌ
．Ｂｉｏｃｈｅｍ．，１０７：２２０（１９８０）のスキャッチャード分析によ
って決定され得る。好ましくは、標的抗原に対する高い程度の特異性および高結
合親和性を有する抗体が、単離される。
【０１５５】 所望のハイブリドーマ細胞が同定された後、希釈手順を限定することによって
、クローンをサブクローニングし得、そして標準方法によって増殖し得る。例え
ば、この目的のために適切な培養培地としては、Ｄｕｌｂｅｃｃｏ’ｓ Ｍｏｄ
ｉｆｉｅｄ Ｅａｇｌｅ’ｓ ＭｅｄｉｕｍおよびＲＰＭＩ−１６４０培地が挙
げられる。あるいは、ハイブリドーマ細胞は、哺乳動物内の腹水としてインビボ
で増殖され得る。
【０１５６】 サブクローンによって分泌されたモノクローナル抗体は、従来の免疫グロブリ
ン精製手順（例えば、タンパク質Ａセファロース、ヒドロキシアパタイトクロマ
トグラフィー、ゲル電気泳動、透析、またはアフィニティクロマトグラフィー）
によって、培養培地または腹水から、単離または精製され得る。
【０１５７】 モノクローナル抗体はまた、組換えＤＮＡ方法（例えば、米国特許第４，８１
６，５６７号に記載される方法）によって作製され得る。本発明のモノクローナ
ル抗体をコードするＤＮＡは、従来の手順を使用して（例えば、マウス抗体の重
鎖および軽鎖をコードする遺伝子に特異的に結合し得るオリゴヌクレオチドプロ
ーブを使用することによって）容易に単離され得、そして配列決定され得る。本
発明のハイブリドーマ細胞は、このようなＤＮＡの好ましい供給源として役立つ
。一旦単離されると、ＤＮＡは、発現ベクターに配置され得、次いでそれらは、
宿主細胞（例えば、さもなければ免疫グロブリンタンパク質を産生しないサルＣ
ＯＳ細胞、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞、または骨髄腫細胞）に
トランスフェクトされ、組換え宿主細胞内でのモノクローナル抗体の合成を得る
。ＤＮＡはまた、例えば、相同なマウス配列の代わりにヒト重鎖および軽鎖定常
ドメインをコードする配列の置換（米国特許第４，８１６，５６７号；Ｍｏｒｒ
ｉｓｏｎ，Ｎａｔｕｒｅ ３６８，８１２−１３（１９９４））によってか、ま
たは非免疫グロブリンポリペプチドについてのコード配列のすべてまたは一部の
配列をコードする免疫グロブリンへの共有結合的な連結によって改変され得る。
このような非免疫グロブリンポリペプチドは、本発明の抗体の定常領域に置換さ
れ得るか、または本発明の抗体の１つの抗原結合部位の可変領域に置換され得、
キメラ二価の抗体を作製する。
【０１５８】 （ヒト化抗体） 本発明のタンパク質抗原に対する抗体は、さらにヒト化抗体またはヒト抗体を
含み得る。これらの抗体は、投与された免疫グロブリンに対するヒトの免疫応答
を引き起こさないヒトへの投与に適する。抗体のヒト化形態は、キメラ免疫グロ
ブリン、免疫グロブリン鎖またはそれらのフラグメント（例えば、Ｆｖ、Ｆａｂ
、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２または他の抗体の抗原結合配列）であり、それらは
主にヒト免疫グロブリンの配列から構成され、そして非ヒト免疫グロブリンに由
来する最小の配列を含む。ヒト化は、ヒト抗体の対応する配列についてのげっ歯
類ＣＤＲまたはＣＤＲ配列の置換によって、Ｗｉｎｔｅｒおよび共同研究者の方
法（Ｊｏｎｅｓら、Ｎａｔｕｒｅ，３１：５２２−５２５（１９８６）；Ｒｉｅ
ｃｈｍａｎｎら、Ｎａｔｕｒｅ，３３２：３２３−３２７（１９８８）；Ｖｅｒ
ｈｏｅｙｅｎら、Ｓｃｉｅｎｃｅ，２３９：１５３４−１５３６（１９８８））
の後に達成され得る。（米国特許第５，２２５，５３９号もまた参照のこと。）
いくつかの場合において、ヒト免疫グロブリンのＦｖ骨格（ｆｒａｍｅｗｏｒｋ
）残基は、対応する非ヒト残基によって置換される。ヒト化抗体はまた、患者の
抗体においても、移入されたＣＤＲまたは骨格配列においても見出されない残基
を含み得る。一般に、ヒト化抗体は、すべての少なくとも１つ、および代表的に
は２つの可変領域を実質的に含む。これらの領域内で、すべてのまたは実質的に
すべてのＣＤＲ領域は非ヒト免疫グロブリンの領域に対応し、そしてすべてまた
は実質的にすべての骨格領域はヒト免疫グロブリンコンセンサス配列の領域に対
応する。ヒト化抗体はまた、免疫グロブリン定常領域（Ｆｃ）、代表的には、ヒ
ト免疫グロブリンの少なくとも一部を必要に応じて含む（Ｊｏｎｅｓら、１９８
６；Ｒｉｅｃｈａｍａｎｎら、１９８８；およびＰｒｅｓｔａ、Ｃｕｒｒ．Ｏｐ
．Ｓｔｒｕｃｔ．Ｂｉｏｌ．，２：５９３−５９６（１９９２））。
【０１５９】 （ヒト抗体） ＣＤＲを含む軽鎖および重鎖の両方の全体配列がヒト遺伝子から本質的に生じ
る抗体分子に、ヒト抗体は十分に関連する。このような抗体を、「ヒト抗体」、
または「十分なヒト抗体」と本明細書中で呼ぶ。ヒトモノクローナル抗体は、ト
リオーマ（ｔｒｉｏｍａ）技術によって調製され得る；ヒトＢ細胞ハイブリドー
マ技術（Ｋｏｚｂｏｒら、１９８３ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｔｏｄａｙ ４：７２を
参照のこと）およびヒトモノクローナル抗体を産生するためのＥＢＶハイブリド
ーマ技術（Ｃｏｌｅら、１９８５：ＭＯＮＯＣＬＯＮＡＬ ＡＮＴＩＢＯＤＩＥ
Ｓ ＡＮＤ ＣＡＮＣＥＲ ＴＨＥＲＡＰＹ，Ａｌａｎ Ｒ．Ｌｉｓｓ，Ｉｎｃ
．，第７７−９６頁）。ヒトモノクローナル抗体は、本発明の実行において使用
され得、そしてヒトハイブリドーマの使用によってか（Ｃｏｔｅら、１９８３．
Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ ＵＳＡ ８０：２０２６−２０３０を参照のこ
と）、またはインビトロでのＥｐｓｔｅｉｎ Ｂａｒｒ Ｖｉｒｕｓを用いたヒ
トＢ細胞による形質転換によって（Ｃｏｌｅら、１９８５：ＭＯＮＯＣＬＯＮＡ
Ｌ ＡＮＴＩＢＯＤＩＥＳ ＡＮＤ ＣＡＮＣＥＲ ＴＨＥＲＡＰＹ，Ａｌａｎ
Ｒ．Ｌｉｓｓ，Ｉｎｃ．，第７７−９６頁を参照のこと）産生され得る。
【０１６０】 さらに、ヒト抗体はまた、さらなる技術（ファージディスプレイライブラリー
（ＨｏｏｇｅｎｂｏｏｍおよびＷｉｎｔｅｒ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，２２７
：３８１（１９９１）；Ｍａｒｋｓら、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，２２２：５８
１（１９９１））を含む）を使用して産生され得る。同様に、ヒト免疫グロブリ
ン位置をトランスジェニック動物（例えば、内因性免疫グロブリン遺伝子が、部
分的または完全に不活化されているマウス）に導入することによって、ヒト抗体
は作製され得る。チャレンジの際にヒト抗体産生が観察され、このことはすべて
の点（遺伝子再配列、アセンブリ、および抗体レパートリーを含む）でヒトにお
いて観察されたものに密接に類似する。このアプローチは、例えば、以下に記載
される：米国特許第５，５４５，８０７号；同第５，５４５，８０６号；同第５
，５６９，８２５号；同第５，６２５，１２６号；同第５，６３３，４２５号；
同第５，６１１，０１６号、およびＭａｒｋｓら（Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇ
ｙ １０、７７９−７８３（１９９２））；Ｌｏｎｂｅｒｇら（Ｎａｔｕｒｅ
３６８ ８５６−８５９（１９９４））；Ｍｏｒｒｉｓｏｎ（Ｎａｔｕｒｅ ３
６８、８１２−１３（１９９４））；Ｆｉｓｈｗｉｌｄら（Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉ
ｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １４、８４５−５１（１９９６））；Ｎｅｕｂｅｒｇ
ｅｒ（Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １４、８２６（１９９６）
）；ならびにＬｏｎｂｅｒｇおよびＨｕｓｚａｒ（Ｉｎｔｅｒｎ．Ｒｅｖ．Ｉｍ
ｍｕｎｏｌ．１３ ６５−９３（１９９５））。
【０１６１】 ヒト抗体は、抗原によるチャレンジに応答して動物の内因性抗体よりもヒト抗
体を十分に産生するように改変されたトランスジェニック非ヒト動物を使用して
、さらに産生され得る。（ＰＣＴ刊行物ＷＯ９４／０２６０２を参照のこと。）
非ヒト宿主における重免疫グロブリン鎖および軽免疫グロブリン鎖をコードする
内因性遺伝子は、耐えられなくなっており、そしてヒト重鎖および軽鎖免疫グロ
ブリンをコードする活性な位置は、宿主のゲノムに挿入される。例えば、要求性
ヒトＤＮＡセグメントを含む酵母人工染色体を使用して、ヒト遺伝子は組み込ま
れる。次いで、すべての所望の改変を提供する動物を、完全な改変の相補体より
もより少ない改変の相補体を含む中間トランスジェニック動物を雑種することに
よって子孫として得る。このような非ヒト動物の好ましい実施形態は、マウスで
あり、ＰＣＴ刊行物ＷＯ９６／３３７３５およびＷＯ９６／３４０９６に開示さ
れるようにＸｅｎｏｍｏｕｓＴＭと呼ばれる。この動物は、ヒト免疫グロブリン
を十分に分泌するＢ細胞を産生する。目的の免疫原を有する免疫後の動物から（
例えば、ポリクローナル抗体の調製）、あるいは動物由来の不死化されたＢ細胞
（例えば、モノクローナル抗体を産生するハイブリドーマ）から、抗体を直接得
ることが可能である。さらに、ヒト可変領域を有する免疫グロブリンをコードす
る遺伝子は、抗体を直接得るために回復され、そして発現され得るか、または抗
体のアナログ（例えば、１本鎖Ｆｖ分子）を得るために、さらに改変され得る。
【０１６２】 内因性免疫グロブリン重鎖の発現を欠く非ヒト宿主（マウスとして例証される
）を作製するための方法の例は、米国特許第５，９３９，５９８号に記載される
。それを、以下の工程を包含する方法によって得ることが可能である：位置の再
配列を防ぎ、そして再配列された免疫グロブリン重鎖位置の転写物の形成、およ
び選択マーカーをコードする遺伝子を含む標的ベクターによって影響される欠失
を防ぐために、胚幹細胞における少なくとも１つの内因性重鎖位置由来のＪセグ
メント遺伝子を欠失する工程；およびトランスジェニックマウス（その体細胞お
よび生殖細胞は、選択マーカーをコードする遺伝子を含む）を、胚幹細胞から作
製する工程。
【０１６３】 目的の抗体（例えば、ヒト抗体）を産生する方法は、米国特許第５，９１６，
７７１号に開示される。それは以下の工程を包含する：重鎖をコードするヌクレ
オチド配列を含む発現ベクターを、培養中の１つの哺乳動物宿主細胞に導入する
工程、軽鎖をコードするヌクレオチド配列を含む発現ベクターを、別の哺乳動物
宿主細胞に導入する工程、およびハイブリッド細胞を形成するために２つの細胞
融合する工程。ハイブリッド細胞は、重鎖および軽鎖を含む抗体を発現する。
【０１６４】 この手順のさらなる改善において、免疫原上の臨床的に関連するエピトープを
同定する方法、および関連するエピトープに高い親和性で免疫特異的に結合する
抗体を選択する相関する方法は、ＰＣＴ刊行物ＷＯ９９／５３０４９に開示され
る。
【０１６５】 （Ｆａｂフラグメントおよび１本鎖抗体） 本発明に従って、技術は、本発明の抗原性タンパク質に特異的な１本鎖抗体の
産生に適用され得る（例えば、米国特許第４，９４６，７７８号を参照のこと）
。さらに、方法は、Ｆａｂ発現ライブラリーの構築に適用され得（例えば、Ｈｕ
ｓｅら、１９８９ Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４６：１２７５−１２８１を参照のこと
）、タンパク質またはその誘導体、フラグメント、アナログまたはホモログにつ
いての所望の特異性を有するモノクローナルＦａｂフラグメントの迅速かつ効果
的な同定を可能にする。タンパク質抗原に対するイディオタイプを含む抗体フラ
グメント（（ｉ）抗体分子のペプシン消化によって産生されるＦ（ａｂ’） ２フ
ラグメント；（ｉｉ）Ｆ（ａｂ’）２フラグメントのジスルフィド架橋を還元す
ることによって産生されたＦａｂフラグメント（ｉｉｉ）ペプシンおよび還元剤
を用いた抗体分子の処理によって産生されたＦａｂフラグメント、および（ｉｖ
）Ｆｖフラグメントを含むが、これらに限定ない）は、当該分野で公知の技術に
よって産生され得る。
【０１６６】 （二重特異的抗体） 二重特異的抗体は、モノクローナル抗体（好ましくはヒトモノクローナル抗体
またはヒト化されたモノクローナル抗体）であって、これは少なくとも２つの異
なる抗原に対して結合特異性を有する。この場合において、結合特異性の１つは
、本発明の抗原性タンパク質に対してである。第２の結合標的は、任意の他の抗
原であり、そして有利には細胞表面タンパク質あるいはレセプターまたはレセプ
ターサブユニットである。
【０１６７】 二重特異的抗体を作製する方法は、当該分野で公知である。伝統的に、二重特
異的抗体の組換え生成は、２つの免疫グロブリンの重鎖／軽鎖の対の同時発現に
基づき、ここでこの２つの重鎖は異なる特異性を有する（Ｍｉｌｓｔｅｉｎおよ
びＣｕｅｌｌｏ、Ｎａｔｕｒｅ，３０５：５３７−５３９（１９８３））。免疫
グロブリンの重鎖および軽鎖のランダムな組み合わせのために、これらのハイブ
リドーマ（クアドローマ）は、１０の異なる抗体分子の潜在的混合物を作製し、
このうち１つのみが正確な二重特異的構造を有する。この正確な分子の精製は、
通常アフィニティクロマトグラフィー工程によって達成される。同様の手順は、
１９９３年５月１３日開示のＷＯ９３／０８８２９、およびＴｒａｕｎｅｃｋｅ
ｒら、１９９１ ＥＭＢＯ Ｊ．、１０：３６５５−３６５９において開示され
る。
【０１６８】 所望の結合特異性（抗体−抗原結合部位）を有する抗体可変ドメインは、免疫
グロブリン定常領域配列に融合され得る。この融合は、好ましくは免疫グロブリ
ン重鎖定常ドメインを有し、ヒンジ、ＣＨ２、およびＣＨ３領域の少なくとも部
分を含む。この融合物中の少なくとも１つに存在する軽鎖結合のために必要な部
位を含む第１の重鎖定常領域（ＣＨ１）を有することが好ましい。この免疫グロ
ブリン重鎖融合体、および所望の場合、この免疫グロブリン軽鎖をコードするＤ
ＮＡは、別々の発現ベクターに挿入され、そして適切な宿主生物体に同時トラン
スフェクトされる。二重特異的抗体の作製のさらなる詳細は、例えば、Ｓｕｒｅ
ｓｈら、Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，１２１：２１０（１９
８６）を参照のこと。
【０１６９】 ＷＯ９６／２７０１１に記載される別のアプローチに従って、抗体分子の対の
間の界面は、組換え細胞培養物から回収されるヘテロダイマーのパーセンテージ
を最大化するために操作され得る。好ましい界面は、抗体定常領域のＣＨ３領域
の少なくとも一部を含む。この方法において、第１の抗体分子の界面からの１つ
以上の小さなアミノ酸側鎖は、より大きな側鎖（例えば、チロシンまたはトリプ
トファン）で置換される。大きな側鎖についての同一または同様のサイズの代償
的な「空洞」は、大きなアミノ酸側鎖を小さなアミノ酸側鎖（例えば、アラニン
またはスレオニン）で置換することによって、第２の抗体分子の界面上に生成さ
れる。このことは、ホモダイマーのような他の不必要な最終生成物よりも、ヘテ
ロダイマーの収量を増加するための機構を提供する。
【０１７０】 二重特異的抗体は、全長抗体または抗体フラグメント（例えば、Ｆ（ａｂ’） ２ 二重特異的抗体）として調製され得る。抗体フラグメントから二重特異的抗体
を作製するための技術は、文献において記載される。例えば、二重特異的抗体は
、化学結合を使用して調製され得る。Ｂｒｅｎｎａｎら、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２２
９：８１（１９８５）は、インタクトな抗体がタンパク分解的に切断されてＦ（
ａｂ’）２フラグメントを作製する手順を記載する。これらのフラグメントは、
ビシナルジチオールを安定化し、そして分子間ジスルフィド形成を阻止するため
に、ジチオール錯化剤ナトリウム亜ヒ酸塩の存在下で還元される。次いで、この
作製されたＦａｂ’フラグメントは、チオニトロベンゾエート（ＴＢＮ）誘導体
に変換される。次いで、Ｆａｂ’−ＴＢＮ誘導体の１つは、メルカプトエチルア
ミンでの還元によってＦａｂ’−チオールに再変換され、そしてこれは等モル量
の他のＦａｂ’−ＴＢＮ誘導体と混合されて二重特異的抗体を形成する。生成さ
れた二重特異的抗体は、酵素の選択的固定化のための薬剤として使用され得る。
【０１７１】 さらに、Ｆａｂ’フラグメントは、Ｅ．ｃｏｌｉから直接回収され得、そして
化学的にカップリングされて二重特異的抗体を形成する。Ｓｈａｌａｂｙら、Ｊ
．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１７５：２１７−２２５（１９９２）は、完全にヒト化され
た二重特異的抗体Ｆ（ａｂ’）２分子の生成を記載する。各Ｆａｂ’フラグメン
トは、Ｅ．ｃｏｌｉから別々に分泌され、そしてインビトロの化学的カップリン
グに供され、二重特異的抗体を形成する。従って、形成されたこの二重特異的抗
体は、ＥｒｂＢ２レセプターを過剰発現する細胞および正常なヒトＴ細胞に結合
し得、そしてヒト胸部腫瘍標的に対するヒト細胞傷害性リンパ球の溶解性活性を
誘引し得る。
【０１７２】 組換え細胞培養物から直接二重特異的抗体フラグメントを作製し、そして単離
するための種々の技術が記載されてきた。例えば、二重特異的抗体は、ロイシン
ジッパーを使用して産生される。Ｋｏｓｔｅｌｎｙら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１
４８（５）：１５４７−１５５３（１９９２）。ＦｏｓおよびＪｕｎタンパク質
由来のロイシンジッパーペプチドは、遺伝子融合によって２つの異なる抗体のＦ
ａｂ’部分に結合される。この抗体ホモダイマーは、ヒンジ領域で還元されてモ
ノマーを形成し、次いで再酸化されて抗体ヘテロダイマーを形成する。この方法
はまた、抗体ホモダイマーの産生のために使用され得る。Ｈｏｌｌｉｎｇｅｒら
、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９０：６４４４−６４４８
（１９９３）に記載されるこの「ディアボディー（ｄｉａｂｏｄｙ）」技術は、
二重特異的抗体フラグメントを作製するための代替的な機構を提供した。このフ
ラグメントは、短すぎて同じ鎖上の２つのドメインの間を対にできないリンカー
によって軽鎖可変領域（ＶＬ）に接続された重鎖可変領域（ＶＨ）を含む。従っ
て、１つのフラグメントのＶＨおよびＶＬドメインは、別のフラグメントの相補
的なＶＬおよびＶＨドメインと対になるように強制され、これによって２つの抗
原結合部位が形成する。単鎖Ｆｖ（ｓＦｖ）ダイマーの使用によって二重特異的
抗体フラグメントを作製するための別のストラテジーもまた、報告されてきた。
Ｇｒｕｂｅｒら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１５２：５３６８（１９９４）を参照の
こと。
【０１７３】 ２つ以上の結合価を有する抗体が意図される。例えば、三重特異的抗体が調製
され得る。Ｔｕｔｔら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４７：６０（１９９１）。
【０１７４】 例示的な二重特異的抗体は、２つの異なるエピトープに結合し得、このうち少
なくとも１つは、本発明のタンパク質抗原に起源を有する。あるいは、免疫グロ
ブリン分子の抗抗原性アームは、Ｔ細胞レセプター分子のような白血球（例えば
、ＣＤ２、ＣＤ３、ＣＤ２８、またはＢ７）、あるいはＩｇＧに対するＦｃレセ
プター（Ｆｃ Ｒ）（例えば、Ｆｃ ＲＩ（ＣＤ６４）、Ｆｃ ＲＩＩ（ＣＤ３
２）およびＦｃ ＲＩＩＩ（ＣＤ１６））上の標的化分子に結合するアームに、
特定の抗原を発現する細胞に対する細胞の防御機構に焦点を合わせるように結合
され得る。二重特異的抗体はまた、特定の抗原を発現する細胞に対する細胞傷害
性因子に指向するために使用され得る。これらの抗体は抗原結合アーム、および
細胞傷害性因子または放射性核種キレーター（例えば、ＥＯＴＵＢＥ、ＤＰＴＡ
、ＤＯＴＡ、またはＴＥＴＡ）に結合するアームを保有する。目的の別の二重特
異的抗体は、本明細書中に記載のタンパク質抗原に結合し、そしてさらに組織因
子（ＴＦ）に結合する。
【０１７５】 （ヘテロ接合体抗体） ヘテロ接合体抗体はまた、本発明の範囲内である。ヘテロ接合体抗体は、２つ
の共有結合した抗体からなる。このような抗体は、例えば、免疫系細胞を不必要
な細胞に標的化するために（米国特許第４，６７６，９８０号）、およびＨＩＶ
感染の処置のために（ＷＯ９１／００３６０；ＷＯ９２／２００３７３；ＥＰ０
３０８９）提案されてきた。この抗体（架橋剤を含む抗体を含む）は、インビト
ロで、合成タンパク質化学において公知の方法を使用して調製され得ることが意
図される。例えば、免疫毒素は、ジスルフィド交換反応の使用またはチオエーテ
ル結合の形成によって構築され得る。この目的のための適切な試薬の例としては
、イミノチオレートおよびメチル−４−メルカプトブチルイミデート、ならびに
例えば米国特許第４，６７６，９８０号において開示される試薬が挙げられる。
【０１７６】 （エフェクター機能操作） 本発明の抗体を、エフェクター機能について、例えば癌の処置における抗体の
効力を増大するように改変することが望ましい。例えば、システイン残基は、Ｆ
ｃ領域に導入され得、これによってこの領域における鎖間ジスルフィド結合の形
成を可能にする。従って、作製されるこのホモダイマー抗体は、改良されたイン
ターナリゼーションの可能性および／または増加した補体媒介細胞死滅、ならび
に抗体依存性細胞傷害性（ＡＤＣＣ）を有し得る。Ｃａｒｏｎら、Ｊ．Ｅｘｐ．
Ｍｅｄ．、１７６：１１９１−１１９５（１１９２）およびＳｈｏｐｅｓ、Ｊ．
Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４８：２９１８−２９２２（１９９２）を参照のこと。増大
した抗腫瘍活性を有するホモダイマー抗体はまた、Ｗｏｌｆｆら、Ｃａｎｃｅｒ
Ｒｅｓｅａｒｃｈ、５３：２５６０−２６５６（１９９３）に記載されるヘテ
ロ二官能性架橋剤を使用して調製され得る。あるいは、抗体は操作され得、これ
は二重のＦｃ領域を有し、そしてこれによって増大した補体溶解およびＡＤＣＣ
の可能性を有し得る。Ｓｔｅｖｅｎｓｏｎら、Ａｎｔｉ−Ｃａｎｃｅｒ Ｄｒｕ
ｇ Ｄｅｓｉｇｎ，３：２１９−２３０（１９８９）を参照のこと。
【０１７７】 （免疫接合体） 本発明はまた、細胞傷害性の薬剤（例えば、化学療法剤、毒素（例えば、細菌
、真菌、植物、または動物起源の酵素学的に活性な毒素、あるいはそれらのフラ
グメント）、または放射性同位体（すなわち、放射性接合体））に結合した抗体
を含む免疫接合体に関する。
【０１７８】 このような免疫接合体の作製において有用な化学療法剤は、上記に記載される
。使用され得る酵素学的に活性な毒素およびそれらのフラグメントとしては、ジ
フテリアＡ鎖、ジフテリア毒素の非結合活性フラグメント、外毒素Ａ鎖（Ｐｓｅ
ｕｄｏｍｏｎａｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ由来）、リシンＡ鎖、アブリンＡ鎖、
モデシン（ｍｏｄｅｃｃｉｎ）Ａ鎖、α−サルシン、Ａｌｅｕｒｉｔｅｓ ｆｏ
ｒｄｉｉタンパク質、ジアンチン（ｄｉａｎｔｈｉｎ）タンパク質、Ｐｈｙｔｏ
ｌａｃａ ａｍｅｒｉｃａｎａタンパク質（ＰＡＰＩ、ＰＡＰＩＩ、およびＰＡ
Ｐ−Ｓ）、ｍｏｍｏｒｄｉｃａ ｃｈａｒａｎｔｉａインヒビター、クルシン（
ｃｕｒｃｉｎ）、クロチン（ｃｒｏｔｉｎ）、ｓｅｐａｏｎａｒｉａ ｏｆｆｉ
ｃｉｎａｌｉｓインヒビター、ゲロニン（ｇｅｌｏｎｉｎ）、ミトゲリン（ｍｉ
ｔｏｇｅｌｌｉｎ）、レストリクトシン（ｒｅｓｔｒｉｃｔｏｃｉｎ）、フェノ
マイシン（ｐｈｅｎｏｍｙｃｉｎ）、エノマイシン（ｅｎｏｍｙｃｉｎ）、およ
びトリコテセン（ｔｒｉｃｏｔｈｅｃｅｎ）が挙げられる。種々の放射性核種は
、放射性結合した抗体の作製のために利用可能である。その例としては、２１２ Ｂｉ、１３１Ｉ、１３１Ｉｎ、９０Ｙ、および１８６Ｒｅが挙げられる。
【０１７９】 抗体および細胞傷害性因子の接合体は、種々の二官能性タンパク質結合因子（
例えば、Ｎ−スクシンイミジル−３−（２−ピリジルジチオール）プロピオネー
ト（ＳＰＤＰ）、イミノチオラン（ｉｍｉｎｏｔｈｉｏｌａｎｅ）（ＩＴ）、イ
ミドエステルの二官能性誘導体（例えば、ジメチルアジピミデート ＨＣＬ）、
活性エステル（例えば、ジスクシンイミジルスベレート）、アルデヒド（例えば
、グルタルアルデヒド（ｇｌｕｔａｒｅｌｄｅｈｙｄｅ））、ビスアジド化合物
（例えば、ビス（ｐ−アジドベンゾイル）ヘキサンジアミン）、ビス−ジアゾニ
ウム誘導体（例えば、ビス−（ｐ−ジアゾニウムベンゾイル）−エチレンジアミ
ン）、ジイソシアネート（例えば、トリエン２，６−ジイソシアネート）、およ
びビス−活性フッ素化合物（例えば、１，５−ジフルオロ−２，４−ジニトロベ
ンゼン））を使用して作製される。例えば、リシン免疫毒素は、Ｖｉｔｅｔｔａ
ら、Ｓｃｉｅｎｃｅ，２３８：１０９８（１９８７）に記載されるように調製さ
れ得る。炭素−１４−標識１−イソチオシアナトベンジル−３−メチルジエチレ
ントリアミン五酢酸（ＭＸ−ＤＴＰＡ）は、放射性ヌクレオチドの抗体への結合
のための例示的なキレート剤である。ＷＯ９４／１１０２６を参照のこと。
【０１８０】 別の実施形態において、腫瘍の前標的化における利用のために、この抗体は、
「レセプター」（例えば、ストレプトアビジン）に結合され得、ここで抗体−レ
セプター接合体は患者に投与され、続いて除去剤を使用して結合していない接合
体が循環から除去され、次いで細胞傷害性因子に次々に結合する「リガンド」（
例えば、アビジン）が投与される。
【０１８１】 （ＮＯＶＸ組換え発現ベクターおよび宿主細胞） 本発明の別の局面は、ＮＯＶＸタンパク質、またはそれらの誘導体、フラグメ
ント、アナログ、もしくはホモログをコードする核酸を含むベクター、好ましく
は発現ベクターに関する。本明細書中で使用される場合、用語「ベクター」は、
これが接続された別の核酸を輸送し得る核酸分子をいう。ベクターの１つの型は
「プラスミド」であり、これはさらなるＤＮＡセグメントが連結し得る環状の二
本鎖ＤＮＡループをいう。ベクターの別の型はウイルス性ベクターであり、ここ
でさらなるＤＮＡセグメントはこのウイルス性ゲノムに連結され得る。特定のベ
クターは宿主細胞中で自発的に複製し得、この中に導入される（例えば、細菌の
複製起源を有する細菌ベクターおよびエピソームの哺乳類ベクター）。他のベク
ター（例えば、非エピソーム哺乳類ベクター）は、宿主細胞に導入される際に宿
主細胞のゲノムに組み込まれ、そしてこれによって宿主のゲノムと同調して複製
される。さらに、特定のベクターは、これが作動可能に連結される遺伝子の発現
を指向し得る。このようなベクターは、本明細書中で「発現ベクター」といわれ
る。一般に、組換えＤＮＡ技術において有用な発現ベクターは、しばしばプラス
ミドの形態である。本明細書において、「プラスミド」および「ベクター」は、
このプラスミドはベクターの最も一般的に使用される形態であるため、交換可能
に使用され得る。しかし、本発明は、ウイルス性ベクター（例えば、複製欠損レ
トロウイルス、アデノウイルスおよびアデノ随伴ウイルス）のような発現ベクタ
ーのこのような他の形態を含むことを意図し、これは等価な機能を果たす。
【０１８２】 本発明の組換え発現ベクターは、本発明の核酸を、宿主細胞における核酸の発
現に適切な形態で含み、これはこの組換え発現ベクターが、発現のために使用さ
れる宿主細胞に基づいて選択される１つ以上の調節配列を含むこと意味し、これ
は発現される核酸配列に作動可能に連結される。組換え発現ベクターにおいて、
「作動可能に連結」は、目的のヌクレオチド配列が、ヌクレオチド配列の発現を
可能にする（例えば、このベクターが宿主細胞に導入される場合、インビトロ転
写／翻訳系または宿主細胞において）ような様式で調節配列に連結されることを
意味することを意図する。
【０１８３】 用語「調節配列」は、プロモーター、エンハンサーおよび他の発現制御エレメ
ント（例えば、ポリアデニル化シグナル）を含むことを意図する。このような調
節配列は、例えば、Ｇｏｅｄｄｅｌ、ＧＥＮＥ ＥＸＰＲＥＳＳＩＯＮ ＴＥＣ
ＨＮＯＬＯＧＹ：ＭＥＴＨＯＤＳ ＩＮ ＥＮＺＹＭＯＬＯＧＹ １８５、Ａｃ
ａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ、Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ、Ｃａｌｉｆ．（１９９０）に
記載されている。調節配列は、多くの型の宿主細胞においてヌクレオチド配列の
構成的発現を指向する配列、および特定の宿主細胞のみにおいてヌクレオチド配
列の発現を指向する配列（例えば、組織特異的調節配列）を含む。発現ベクター
の設計が形質転換されるべき宿主細胞の選択、所望のタンパク質の発現のレベル
などのような因子に依存し得ることは当業者に理解される。本発明の発現ベクタ
ーは、宿主細胞に導入され、それにより、本明細書に記載されるような核酸によ
りコードされるタンパク質またはペプチド（融合タンパク質または融合ペプチド
を含む）（例えば、ＮＯＶＸタンパク質、ＮＯＶＸタンパク質の変異形態、融合
タンパク質など）を生成し得る。
【０１８４】 本発明の組換え発現ベクターは、原核生物細胞または真核生物細胞における、
ＮＯＶＸタンパク質の発現のために設計され得る。例えば、ＮＯＶＸタンパク質
は、細菌細胞（例えば、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ．ｃｏｌｉ）、昆虫細胞（バキ
ュロウイルス発現ベクターを用いる）、酵母細胞または哺乳動物細胞において発
現され得る。適切な宿主細胞は、Ｇｏｅｄｄｅｌ、ＧＥＮＥ ＥＸＰＲＥＳＳＩ
ＯＮ ＴＥＣＨＮＯＬＯＧＹ：ＭＥＴＨＯＤＳ ＩＮ ＥＮＺＹＭＯＬＯＧＹ
１８５、Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ、Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ、Ｃａｌｉｆ．（
１９９０）においてさらに考察される。あるいは、組換え発現ベクターは、例え
ば、Ｔ７プロモーター調節配列およびＴ７ポリメラーゼを用いて、インビトロで
転写および翻訳され得る。
【０１８５】 原核生物におけるタンパク質の発現は、最も頻繁には、融合タンパク質または
非融合タンパク質のいずれかの発現を指向する構成的プロモーターまたは誘導性
プロモーターを含むベクターを有するＥｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ．ｃｏｌｉにおい
て実行される。融合ベクターは、そこにコードされるタンパク質に、通常、組換
えタンパク質のアミノ末端に、多数のアミノ酸を付加する。このような融合ベク
ターは、代表的には、以下の３つの目的のために役立つ：（ｉ）組換えタンパク
質の発現を増加させること；（ｉｉ）組換えタンパク質の溶解度を増加させるこ
と；および（ｉｉｉ）親和性精製においてリガンドとして作用することによって
組換えタンパク質の精製の際に補助すること。しばしば、融合発現ベクターにお
いて、タンパク質分解の切断部位が、融合部分の結合部に導入され、そして融合
タンパク質の精製の後に、組換えタンパク質が組換えタンパク質の融合部分から
分離されることを可能にする。このような酵素、およびその同族の認識配列は、
第Ｘａ因子、トロンビン、およびエンテロキナーゼを含む。代表的な融合発現ベ
クターとしては、グルタチオンＳ−トランスフェラーゼ（ＧＳＴ）、マルトース
Ｅ結合タンパク質、またはプロテインＡを、それぞれ、標的の組換えタンパク質
に融合するｐＧＥＸ（Ｐｈａｒｍａｃｉａ Ｂｉｏｔｅｃｈ Ｉｎｃ；Ｓｍｉｔ
ｈ ａｎｄ Ｊｏｈｎｓｏｎ（１９８８）Ｇｅｎｅ ６７：３１−４０）、ｐＭ
ＡＬ（Ｎｅｗ Ｅｎｇｌａｎｄ Ｂｉｏｌａｂｓ，Ｂｅｖｅｒｌｙ，Ｍａｓｓ．
）およびｐＲＩＴ５（Ｐｈａｒｍａｃｉａ，Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ，Ｎ．Ｊ．）
が挙げられる。
【０１８６】 適切な誘導性非融合Ｅ．ｃｏｌｉ発現ベクターの例としては、ｐＴｒｃ（Ａｍ
ｒａｎｎら（１９８８）Ｇｅｎｅ ６９：３０１−３１５）およびｐＥＴ １１
ｄ（Ｓｔｕｄｉｅｒら、ＧＥＮＥ ＥＸＰＲＥＳＳＩＯＮ ＴＥＣＨＮＯＬＯＧ
Ｙ：ＭＥＴＨＯＤＳ ＩＮ ＥＮＺＹＭＯＬＯＧＹ １８５，Ａｃａｄｅｍｉｃ
Ｐｒｅｓｓ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，Ｃａｌｉｆ．（１９９０）６０−８９）が
挙げられる。
【０１８７】 Ｅ．ｃｏｌｉにおける組換えタンパク質発現を最大化するための１つのストラ
テジーは、組換えタンパク質をタンパク質分解的に切断する能力が損なわれた宿
主細菌中でタンパク質を発現させることである。例えば、Ｇｏｔｔｅｓｍａｎ，
ＧＥＮＥ ＥＸＰＲＥＳＳＩＯＮ ＴＥＣＨＮＯＬＯＧＹ：ＭＥＴＨＯＤＳ Ｉ
Ｎ ＥＮＺＹＭＯＬＯＧＹ １８５，Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，Ｓａｎ
Ｄｉｅｇｏ，Ｃａｌｉｆ．（１９９０）１１９−１２８を参照のこと。別のスト
ラテジーは、各アミノ酸についての個々のコドンが、Ｅ．ｃｏｌｉにおいて優先
的に利用されるように、発現ベクターに挿入される核酸の核酸配列を変更するこ
とである（例えば、Ｗａｄａら（１９９２）Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．２
０：２１１１−２１１８を参照のこと）。本発明の核酸配列のこのような変更は
、標準的なＤＮＡ合成技術によって実行され得る。
【０１８８】 別の実施形態において、ＮＯＶＸ発現ベクターは、酵母発現ベクターである。
酵母Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ．ｃｅｒｉｖｉｓａｅにおける発現のためのベ
クターの例には、ｐＹｅｐＳｅｃ１（Ｂａｌｄａｒｉら、（１９８７）ＥＭＢＯ
Ｊ ６：２２９−２３４）、ｐＭＦａ（ＫｕｒｊａｎおよびＨｅｒｓｋｏｗｉ
ｔｚ、（１９８２）Ｃｅｌｌ ３０：９３３−９４３）、ｐＪＲＹ８８（Ｓｃｈ
ｕｌｔｚら、（１９８７）Ｇｅｎｅ ５４：１１３−１２３）、ｐＹＥＳ２（Ｉ
ｎｖｉｔｒｏｇｅｎ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，Ｃａｌｉ
ｆ．）、およびｐｉｃＺ（ＩｎＶｉｔｒｏｇｅｎ Ｃｏｒｐ．，Ｓａｎ Ｄｉｅ
ｇｏ，Ｃａｌｉｆ．）が挙げられる。
【０１８９】 あるいは、ＮＯＶＸは、バキュロウイルス発現ベクターを使用して、昆虫細胞
中で発現され得る。培養された昆虫細胞（例えば、ＳＦ９細胞）中でタンパク質
の発現のために利用可能なバキュロウイルスベクターには、ｐＡｃシリーズ（Ｓ
ｍｉｔｈら（１９８３）Ｍｏｌ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ ３：２１５６−２１６５
）およびｐＶＬシリーズ（ＬｕｃｋｌｏｗおよびＳｕｍｍｅｒｓ（１９８９）Ｖ
ｉｒｏｌｏｇｙ １７０：３１−３９）が挙げられる。
【０１９０】 なお別の実施形態において、本発明の核酸は、哺乳動物発現ベクターを使用し
て、哺乳動物細胞中で発現される。哺乳動物発現ベクターの例には、ｐＣＤＭ８
（Ｓｅｅｄ（１９８７）Ｎａｔｕｒｅ ３２９：８４０）およびｐＭＴ２ＰＣ（
Ｋａｕｆｍａｎら（１９８７）ＥＭＢＯ Ｊ ６：１８７−１９５）が挙げられ
る。哺乳動物細胞中で使用される場合、発現ベクターの制御機能は、しばしば、
ウイルスの調節エレメントによって提供される。例えば、一般に使用されるプロ
モーターは、ポリオーマ、アデノウイルス２、サイトメガロウイルス、およびシ
ミアンウイルス４０に由来する。原核生物細胞および真核生物細胞の両方のため
の他の適切な発現系については、例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋら、ＭＯＬＥＣＵＬ
ＡＲ ＣＬＯＮＩＮＧ：Ａ ＬＡＢＯＲＡＴＯＲＹ ＭＡＮＵＡＬ．第２版、Ｃ
ｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，Ｃｏｌｄ Ｓｐ
ｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐ
ｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，Ｎ．Ｙ．，１９８９の第１６章および第１７章を参照
のこと。
【０１９１】 別の実施形態において、組換え哺乳動物発現ベクターは、特定の細胞型（例え
ば、組織特異的調節エレメントを使用して核酸を発現する）中で優先的に核酸の
発現を指向し得る。組織特異的調節エレメントは、当該分野で公知である。適切
な組織特異的プロモーターの非限定的な例としては、アルブミンプロモーター（
肝臓特異的；Ｐｉｎｋｅｒｔら（１９８７）Ｇｅｎｅｓ Ｄｅｖ １：２６８−
２７７）、リンパ特異的プロモーター（ＣａｌａｍｅおよびＥａｔｏｎ（１９８
８）Ａｄｖ Ｉｍｍｕｎｏｌ ４３：２３５−２７５）、特に、Ｔ細胞レセプタ
ープロモーター（ＷｉｎｏｔｏおよびＢａｌｔｉｍｏｒｅ（１９８９）ＥＭＢＯ
Ｊ ８：７２９−７３３）および免疫グロブリン（Ｂａｎｅｒｊｉら（１９８
３）Ｃｅｌｌ ３３：７２９−７４０；ＱｕｅｅｎおよびＢａｌｔｉｍｏｒｅ（
１９８３）Ｃｅｌｌ ３３：７４１−７４８）のプロモーター、ニューロン特異
的プロモーター（例えば、ニューロフィラメントプロモーター；Ｂｙｒｎｅおよ
びＲｕｄｄｌｅ（１９８９）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ
８６：５４７３−５４７７）、膵臓特異的プロモーター（Ｅｄｌｕｎｄら（１９
８５）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２３０：９１２−９１６）、および乳腺特異的プロモー
ター（例えば、ミルク乳清プロモーター；米国特許第４，８７３，３１６号およ
び欧州出願公開第２６４，１６６号）が挙げられる。発生的に調節されるプロモ
ーターもまた含まれる（例えば、マウスホックス（ｍｕｒｉｎｅ ｈｏｘ）プロ
モーター（ＫｅｓｓｅｌおよびＧｒｕｓｓ（１９９０）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４９
：３７４−３７９）およびα−フェトプロテインプロモーター（Ｃａｍｐｅｓお
よびＴｉｌｇｈｍａｎ（１９８９）Ｇｅｎｅｓ Ｄｅｖ ３：５３７−５４６）
。
【０１９２】 本発明はさらに、アンチセンス方向で発現ベクターにクローニングされた本発
明のＤＮＡ分子を含む組換え発現ベクターを提供する。すなわち、そのＤＮＡ分
子は、ＮＯＶＸ ｍＲＮＡに対してアンチセンスであるＲＮＡ分子の発現（ＤＮ
Ａ分子の転写によって）を可能にする様式で調節配列に作動可能に連結される。
種々の細胞型におけるアンチセンスＲＮＡ分子の連続的な発現を指向する、アン
チセンス方向でクローニングされた核酸に作動可能に連結される調節配列が選択
され得る。例えば、アンチセンスＲＮＡの構成的発現、組織特異的発現、または
細胞型特異的発現を指向する、ウイルスプロモーターおよび／もしくはエンハン
サー、または調節配列が選択され得る。アンチセンス発現ベクターは、組換えプ
ラスミド、ファージミド、または弱毒化されたウイルスの形態であり得、ここで
はアンチセンス核酸は、高効率調節領域の制御下で産生され、その活性は、ベク
ターが導入される細胞型によって決定され得る。アンチセンス遺伝子を使用する
遺伝子発現の調節の議論については、例えば、Ｗｅｉｎｔｒａｕｂら、「Ａｎｔ
ｉｓｅｎｓｅ ＲＮＡ ａｓ ａ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｔｏｏｌ ｆｏｒ ｇ
ｅｎｅｔｉｃ ａｎａｌｙｓｉｓ」、Ｒｅｖｉｅｗｓ−Ｔｒｅｎｄｓ ｉｎ Ｇ
ｅｎｅｔｉｃｓ、第１巻（１）１９８６を参照のこと。
【０１９３】 本発明の別の局面は、本発明の組換え発現ベクターが導入された宿主細胞に関
する。用語「宿主細胞」および「組換え宿主細胞」は、本明細書中で、交換可能
に使用される。このような用語は、特定の対象の細胞をいうのみでなく、そのよ
うな細胞の子孫または潜在的な子孫をいうことが理解される。変異または環境的
影響のいずれかに起因して、特定の改変は次の世代において存在し得るので、こ
のような子孫は、実際、親の細胞と同一でないかもしれないが、なお、本明細書
中で使用されるような用語の範囲内に含まれる。
【０１９４】 宿主細胞は、任意の原核生物細胞または真核生物細胞であり得る。例えば、Ｎ
ＯＶＸタンパク質は、細菌細胞（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉ）、昆虫細胞、酵母また
は哺乳動物細胞（例えば、ヒトチャイニーズハムスター卵巣細胞（ＣＨＯ）また
はＣＯＳ細胞）で発現され得る。他の適切な宿主細胞は、当業者に公知である。
【０１９５】 ベクターＤＮＡは、従来的な形質転換またはトランスフェクション技術を介し
て原核生物細胞または真核生物細胞に導入され得る。本明細書中で使用される場
合、用語「形質転換」および「トランスフェクション」とは、外来性の核酸（例
えば、ＤＮＡ）を宿主細胞中に導入するための当該分野で認識される種々の技術
をいうことを意図し、これらには、リン酸カルシウムまたは塩化カルシウム共沈
殿、ＤＥＡＥデキストラン媒介トランスフェクション、リポフェクション、また
はエレクトロポレーションが含まれる。宿主細胞を形質転換またはトランスフェ
クトするための適切な方法は、Ｓａｍｂｒｏｏｋら（ＭＯＬＥＣＵＬＡＲ ＣＬ
ＯＮＩＮＧ：Ａ ＬＡＢＯＲＡＴＯＲＹ ＭＡＮＵＡＬ．第２版、Ｃｏｌｄ Ｓ
ｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ
Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ
Ｈａｒｂｏｒ，Ｎ．Ｙ．，１９８９）および他の実験室マニュアルに見出され得
る。
【０１９６】 哺乳動物細胞の安定なトランスフェクションについては、使用される発現ベク
ターおよびトランスフェクション技術に依存して、細胞のほんの一部のみが外来
ＤＮＡをそのゲノム中に組み込み得ることが知られている。これらの要素を同定
および選択するために、選択マーカー（例えば、抗生物質に対する耐性）をコー
ドする遺伝子が、一般的には目的の遺伝子とともに宿主細胞に導入される。種々
の選択マーカーには、薬物に対する耐性を付与するマーカー（例えば、Ｇ４１８
、ハイグロマイシン、およびメトトレキセート）が含まれる。選択マーカーをコ
ードする核酸は、ＮＯＶＸをコードするベクターと同じベクター上で宿主細胞に
導入され得るか、あるいは別々のベクター上で導入され得る。導入された核酸と
ともに安定にトランスフェクトされる細胞は、薬物選択によって同定され得る（
例えば、選択マーカー遺伝子を取り込んだ細胞は生存するが、他の細胞は死滅す
る）。
【０１９７】 本発明の宿主細胞（例えば、培養中の原核生物宿主細胞および真核生物宿主細
胞）は、ＮＯＶＸタンパク質を産生（すなわち、発現）するために使用され得る
。従って、本発明はさらに、本発明の宿主細胞を使用して、ＮＯＶＸタンパク質
を産生するための方法を提供する。１つの実施形態において、この方法は、ＮＯ
ＶＸタンパク質が産生されるような適切な培地中で、本発明の宿主細胞（ここに
、ＮＯＶＸタンパク質をコードする組換え発現ベクターが導入されている）を培
養する工程を包含する。別の実施形態において、この方法はさらに、培地または
宿主細胞からＮＯＶＸを単離する工程を包含する。
【０１９８】 （トランスジェニックＮＯＶＸ動物） 本発明の宿主細胞はまた、非ヒトトランスジェニック動物を作製するために使
用され得る。例えば、１つの実施形態において、本発明の宿主細胞は、ＮＯＶＸ
タンパク質コード配列が導入される、受精した卵母細胞または胚性幹細胞である
。次いで、このような宿主細胞は、非ヒトトランスジェニック動物を作製するた
めに使用され得、ここで外因性のＮＯＶＸ配列は、それらのゲノムまたは相同組
換え動物（ここで内因性のＮＯＶＸ配列が変更されている）に導入される。この
ような動物は、ＮＯＶＸタンパク質の機能および／または活性を研究するため、
およびＮＯＶＸタンパク質の活性のモジュレーターを同定および／または評価す
るために有用である。本明細書中で使用される場合、「トランスジェニック動物
」とは、非ヒト動物、好ましくは哺乳動物であり、より好ましくは、ラットまた
はマウスのような齧歯動物であり、ここでこれらの動物の１つ以上の細胞は、導
入遺伝子を含む。トランスジェニック動物の他の例には、非ヒト霊長類、ヒツジ
、イヌ、ウシ、ヤギ、ニワトリ、両生類などを含む。導入遺伝子は、細胞のゲノ
ムに組み込まれ（この細胞からトランスジェニック動物が発生する）、そして成
熟動物のゲノムに残存する外因性のＤＮＡであり、それによって、このトランス
ジェニック動物の１つ以上の細胞型または組織においてコード遺伝子産物の発現
を指向する。本明細書中で使用される場合、「相同組換え動物」とは、非ヒト動
物であり、好ましくは哺乳動物、より好ましくはマウスであり、ここで、内因性
ＮＯＶＸ遺伝子は、この内因性の遺伝子と、動物の発生の前に動物の細胞（例え
ば、動物の胚細胞）に導入された外因性ＤＮＡ分子との間の相同組換えによって
、変更されている。
【０１９９】 本発明のトランスジェニック動物は、ＮＯＶＸをコードする核酸を、（受精し
た卵母細胞の雄性前核に導入することによって例えば、マイクロインジェクショ
ン、レトロウイルス感染によって）、およびこの卵母細胞が偽妊娠雌性フォスタ
ー動物（ｆｏｓｔｅｒ ａｎｉｍａｌ）中で発生することを可能にすることによ
って作製され得る。配列番号１、３、５、７、９、１１、もしくは１３を含む配
列は、非ヒト動物のゲノムに導入遺伝子として導入され得る。あるいは、ヒトＮ
ＯＶＸ遺伝子の非ヒトホモログ（例えば、マウスＮＯＶＸ遺伝子）は、ヒトＮＯ
ＶＸ ｃＤＮＡに対するハイブリダイゼーションに基づいて単離され得（上述に
さらに記載される）、そして導入遺伝子として使用され得る。イントロン配列お
よびポリアデニル化シグナルもまた導入遺伝子中に含まれ、その導入遺伝子の発
現の効率を増大させ得る。組織特異的調節配列（単数または複数）は、特定の細
胞に対して、ＮＯＶＸタンパク質の発現を指向するために、ＮＯＶＸ導入遺伝子
に作動可能に連結される。胚の操作およびマイクロインジェクションを介するト
ランスジェニック動物（特に、マウスのような動物）を生成するための方法は、
当該分野で従来的になっており、そして例えば、米国特許第４，７３６，８６６
号；同第４，８７０，００９号；および同第４，８７３，１９１号；ならびにＨ
ｏｇａｎ １９８６、ＭＡＮＩＰＵＬＡＴＩＮＧ ＴＨＥ ＭＯＵＳＥ ＥＭＢ
ＲＹＯ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒ
ｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，Ｎ．Ｙ．に記載されている。
同様の方法は、他のトランスジェニック動物の作製のために使用される。トラン
スジェニック初代動物は、そのゲノムにおけるＮＯＶＸ導入遺伝子の存在および
／またはその動物の組織または細胞中のＮＯＶＸ ｍＲＮＡの発現に基づいて同
定され得る。次いで、トランスジェニック初代動物は、導入遺伝子を有するさら
なる動物を繁殖させるために使用され得る。さらに、ＮＯＶＸタンパク質をコー
ドする導入遺伝子を有するトランスジェニック動物は、さらに、他の導入遺伝子
を有する他のトランスジェニック動物へと繁殖させ得る。
【０２００】 相同組換え動物を作製するために、欠失、付加、または置換が導入されて、そ
れによってＮＯＶＸ遺伝子が変化（例えば、機能的に破壊）されている、少なく
とも、ＮＯＶＸ遺伝子の一部を含むベクターを調製する。ＮＯＶＸ遺伝子は、ヒ
ト遺伝子（例えば、配列番号１、３、５、７、９、１１、もしくは１３のＤＮＡ
）であり得るが、より好ましくは、ヒトＮＯＶＸ遺伝子の非ヒトホモログである
。例えば、配列番号１、３、５、７、９、１１、もしくは１３のヒトＮＯＶＸ遺
伝子のマウスホモログは、マウスゲノムにおいて内因性ＮＯＶＸ遺伝子を変更す
るのに適切な相同組換えベクターを構築するために使用され得る。１つの実施形
態において、そのベクターは、相同組換えに際して、内因性ＮＯＶＸ遺伝子が、
機能的に破壊される（すなわち、機能的タンパク質をもはやコードしない；「ノ
ックアウト」ベクターともいわれる）ように設計される。
【０２０１】 あるいは、このベクターは、相同組換えの際に、内因性ＮＯＶＸ遺伝子が変異
されるか、あるいはさもなければ、変更されるが、なお機能性タンパク質をコー
ドするように設計される（例えば、上流の調節領域を変更して、それによって内
因性ＮＯＶＸタンパク質の発現を変更し得る）。相同組換えベクターにおいて、
ＮＯＶＸ遺伝子の変更された部分は、ＮＯＶＸ遺伝子のさらなる核酸によって、
その５’末端および３’末端で隣接され、相同組換えが、ベクターによって運ば
れる外因性ＮＯＶＸ遺伝子と胚幹細胞中の内因性ＮＯＶＸ遺伝子との間で起こる
ことを可能にする。さらなる隣接するＮＯＶＸ核酸は、内因性遺伝子との首尾よ
い相同組換えに十分な長さである。代表的に、数キロベースの隣接するＤＮＡ（
５’末端および３’末端の両方）が、ベクターに含まれる。例えば、相同組換え
ベクターの記載について、Ｔｈｏｍａｓら（１９８７）Ｃｅｌｌ ５１：５０３
を参照のこと。このベクターは、胚幹細胞株に導入され（例えば、エレクトロポ
レーションによって）、この導入されたＮＯＶＸ遺伝子が、内因性ＮＯＶＸ遺伝
子と相同組換えされた細胞が、選択される（例えば、Ｌｉら（１９９２）Ｃｅｌ
ｌ ６９：９１５を参照のこと）。
【０２０２】 次いで、この選択された細胞を、動物（例えば、マウス）の胚盤胞へ注入して
、凝集キメラを形成する。例えば、Ｂｒａｄｌｅｙ（１９８７）のＴＥＲＡＴＯ
ＣＡＲＣＩＮＯＭＡＳ ＡＮＤ ＥＭＢＲＹＯＮＩＣ ＳＴＥＭ ＣＥＬＬＳ：
Ａ ＰＲＡＣＴＩＣＡＬ ＡＰＰＲＯＡＣＨ、Ｒｏｂｅｒｔｓｏｎ編、ＩＲＬ、
Ｏｘｆｏｒｄ １１３頁〜１５２頁を参照のこと。次いで、キメラ胚を、適切な
偽妊娠雌性フォスター動物に移植し得、そしてこの胚を、一定期間置く。それら
の胚芽細胞中に相同組換えＤＮＡを保有する子孫を使用して、動物を繁殖し得、
ここで、この動物の全ての細胞は、導入遺伝子の生殖系列伝達によって、この相
同組換えＤＮＡを含む。相同的組換えベクターおよび相同的組換え動物を構築す
るための方法が、さらに以下に記載される；Ｂｒａｄｌｅｙ（１９９１）Ｃｕｒ
ｒ．Ｏｐｉｎ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２：８２３−８２９；ＰＣＴ国際公開番
号：ＷＯ９０／１１３５４；ＷＯ９１／０１１４０；ＷＯ９２／０９６８；およ
びＷＯ９３／０４１６９。
【０２０３】 別の実施形態において、導入遺伝子の調節された発現を可能にする選択された
系を含む、非ヒトトランスジェニック動物が産生され得る。このような系の１つ
の例は、バクテリオファージＰ１のｃｒｅ／ｌｏｘＰリコンビナーゼ系である。
ｃｒｅ／ｌｏｘＰリコンビナーゼ系の記載については、例えば、Ｌａｋｓｏら、
１９９２、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８９：６２３２−
６２３６を参照のこと。リコンビナーゼ系の別の例は、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃ
ｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅのＦＬＰリコンビナーゼ系である（Ｏ’Ｇｏｒｍａ
ｎら、１９９１、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５１：１３５１−１３５５を参照のこと）
。ｃｒｅ／ｌｏｘＰリコンビナーゼ系が導入遺伝子の発現を調節するために使用
される場合、Ｃｒｅリコンビナーゼおよび選択されたタンパク質の両方をコード
する導入遺伝子を含む動物が、必要となる。このような動物は、例えば、２種の
トランスジェニック動物（一方は選択されたタンパク質をコードした導入遺伝子
を含み、他方はリコンビナーゼをコードした導入遺伝子を含む）を交配すること
による、「二重の」トランスジェニック動物の構築によって提供され得る。
【０２０４】 本明細書中に記載されるトランスジェニック非ヒト動物のクローンがまた、Ｗ
ｉｌｍｕｔら、１９９７、Ｎａｔｕｒｅ ３８５：８１０−８１３に記載される
方法に従って、産生され得る。簡単には、トランスジェニック動物由来の細胞（
例えば、体細胞）を、単離および誘導し、増殖サイクルから出し、そしてＧ０期
に入らせ得る。次いで、この静止細胞を、例えば、電気パルスの使用により、静
止細胞が単離される同種動物由来の、摘出された卵母細胞へ融合し得る。次いで
、この再構築された卵母細胞を培養し、これにより、これは桑実胚または未分化
胚芽細胞に発達し、次いで、偽妊娠雌性フォスター動物に移される。この雌性フ
ォスター動物の産生子孫は、この細胞（例えば、体細胞）が単離される動物のク
ローンである。
【０２０５】 （薬学的組成物） 本発明のＮＯＶＸ核酸分子、ＮＯＶＸタンパク質、および抗ＮＯＶＸ抗体（こ
れはまた、本明細書中で「活性化合物」といわれる）、ならびにそれらの誘導体
、フラグメント、アナログ、およびホモログが、投与に適した薬学的組成物に組
み込まれ得る。このような組成物は、代表的に、核酸分子、タンパク質または抗
体、および薬学的に受容可能なキャリアを含む。本明細書中で使用される場合、
「薬学的に受容可能なキャリア」は、薬学的な投与に適合した、任意および全て
の溶媒、分散液、コーティング、抗菌剤および抗真菌剤、等張剤および吸収遅延
剤（ｄｅｌａｙｉｎｇ ａｇｅｎｔ）などを含むことが意図される。適切なキャ
リアは、当該分野における標準的な参考書である、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐ
ｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓの最新版（本明細書中で参考と
して援用される）に記載される。このようなキャリアまたは賦形薬の好ましい例
としては、水、生理食塩水、フィンガー溶液、デキストロース溶液、および５％
ヒト血清アルブミンを含むが、これらに限定されない。リポソームおよび非水性
ビヒクル（例えば、不揮発性油）はまた、使用され得る。薬学的に活性物質であ
る、このような媒体および薬剤の使用は、当該分野で周知である。この活性化合
物と不適合性である任意の従来の媒体または薬剤の範囲を除いて、組成物におけ
るその使用は、意図される。補足的な活性化合物はまた、この組成物に組み込ま
れ得る。
【０２０６】 本明細書中に開示された抗体は、免疫リポソームとして処方され得る。この抗
体を含むリポソームは、当該分野で公知の方法によって調製される（例えば、Ｅ
ｐｓｔｅｉｎら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８２：３６
８８（１９８５）；Ｈｗａｎｇら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ
ＳＡ，７７：４０３０（１９８０）；および米国特許第４，４８５，０４５号お
よび同第４，５４４，５４５号において記載される）。増強された循環時間を有
するリポソームは、米国特許第５，０１３，５５６号に開示される。
【０２０７】 特に、有用であるリポソームは、ホスファチジルコリン、コレステロール、お
よびＰＥＧ誘導体化ホスファチジルエタノールアミン（ＰＥＧ−ＰＥ）を含有す
る脂質組成物との逆層蒸発法によって生成され得る。リポソームは、規定された
孔径のフィルターを通って押し出され、所望の直径を有するリポソームを生じる
。本発明の抗体のＦａｂフラグメントは、Ｍａｒｔｉｎら、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈ
ｅｍ．，２５７：２８６−２８８（１９８２）に記載のようにジスルフィド交換
反応を介してリポソームに結合体化され得る。化学治療剤（例えば、Ｄｏｘｏｒ
ｕｂｉｃｉｎ）は、必要に応じてリポソーム内に含まれ得る。Ｇａｂｉｚｏｎら
、Ｊ．Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃａｎｃｅｒ Ｉｎｓｔ．，８１（１９）：１４８４
（１９８９）を参照のこと。
【０２０８】 本発明の薬学的組成物は、その意図される投与の経路と適合可能に処方される
。投与経路の例としては、非経口（例えば、静脈内、皮内、皮下）、経口（例え
ば、吸入）、経皮的（すなわち、局所的）、粘膜を越えて、および直腸投与が挙
げられる。非経口、皮内、または皮下適用のために使用される溶液または懸濁液
としては、以下の成分が挙げられ得る：滅菌賦形薬（注射のための水、生理食塩
水溶液、不揮発性油、ポリエチレングリコール、グリセリン、プロピレングリコ
ールまたは他の合成溶媒）；抗菌性剤（例えば、ベンジルアルコールまたはメチ
ルパラベン）；抗酸化剤（例えば、アスコルビン酸または重亜硫酸ナトリウム）
；キレート剤（例えば、エチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ））；緩衝液（例え
ば、アセテート、シトラートまたはホスフェート）；および張度の調整のための
薬剤（例えば、塩化ナトリウムまたはデキストロース）。ｐＨは、酸または塩基
（例えば、塩酸または水酸化ナトリウム）を用いて調整され得る。非経口調製物
は、ガラスまたはプラスチック製のアンプル、使い捨てシリンジまたは複数用量
バイアルに封入され得る。
【０２０９】 注射使用に適した薬学的組成物は、滅菌の水溶液（ここで、水溶性）または分
散液および滅菌注射可能な溶液または分散液の即席調製のための滅菌粉末を含む
。静脈内投与について、適切なキャリアには、生理食塩水、静菌性水、Ｃｒｅｍ
ｏｐｈｏｒ ＥＬＴＭ（ＢＡＳＦ、Ｐａｒｓｉｐｐａｎｙ、Ｎ．Ｊ．）またはリ
ン酸塩緩衝化生理食塩水（ＰＢＳ）が挙げられる。全ての場合において、組成物
は、滅菌性であるべきであり、そして容易な注入性（ｓｙｒｉｎｇｅａｂｉｌｉ
ｔｙ）が存在する程度に流動的であるべきである。これは、製造および保存の条
件下で安定でなければならず、そして、細菌および真菌などの微生物の汚染作用
に対して維持されるべきである。このキャリアは、例えば、以下を含む溶媒また
は分散媒体であり得る：例えば、水、エタノール、ポリオール（例えば、グリセ
ロール、プロピレングリコール、および液体ポリエチレングリコールなど）なら
びにそれらの適切な混合物。適切な流動性が、例えば、レシチンなどのコーティ
ングの使用によって、分散に関しては、要求される粒子サイズを維持することに
よって、および界面活性剤を使用することによって維持され得る。微生物の作用
の予防は、種々の抗菌および抗真菌剤（例えば、パラベン、クロロブタノール、
フェノール、アスコルビン酸、チメロサールなど）によって達成され得る。多く
の場合、組成物中に等張剤（例えば、糖、マンニトール（ｍａｎｉｔｏｌ）、ソ
ルビトールなどのポリアルコール、塩化ナトリウム）を含むことが好ましい。注
射可能組成物の長期の吸収は、吸収を遅らせる薬剤（例えば、アルミニウムモノ
ステアレートおよびゼラチン）を組成物に含ませることによってもたらされ得る
。
【０２１０】 滅菌注射可能溶液は、必要量のこの活性化合物（例えば、ＮＯＶＸタンパク質
あるいは抗ＮＯＶＸ抗体）を、適切な溶媒中に、上記で列挙される成分の１つま
たは組み合わせと共に組み込み、必要な場合、続いて濾過滅菌することによって
調製され得る。一般的に、分散液は、活性化合物を、基本分散媒体および上記で
列挙される成分から必要とされる他の成分を含む滅菌ビヒクル中へ組み込むこと
によって調製される。滅菌注射可能溶液の調製のための滅菌粉末の場合において
、調製方法は、真空乾燥および凍結乾燥であり、これにより、活性成分および予
め滅菌濾過されたその溶液からの任意のさらなる所望の成分の粉末を得る。
【０２１１】 経口組成物は、一般的に、不活性希釈剤または食用キャリアを含む。これらは
、ゼラチンカプセルに封入され得るか、または錠剤へ圧縮され得る。経口治療投
与の目的のために、この活性化合物は、賦形剤とともに組み込まれ得、そして錠
剤、トローチ剤、またはカプセル剤の形態で使用され得る。経口組成物はまた、
マウスウォッシュ（ｍｏｕｔｈｗａｓｈ）としての使用のために流体キャリアを
使用して調製され得、ここで、この流体キャリア中のこの化合物は、経口的に適
用され、そして素早く動かされ（スイッシュ）（ｓｗｉｓｈ）、そして吐き出さ
れるか、または飲み込まれる。薬学的に適合性の結合剤、および／またはアジュ
バント材料が、この組成物の一部として含まれ得る。錠剤、丸剤、カプセル剤、
トローチ剤などが、以下のいずれかの成分または同様の性質を有する化合物を含
み得る：結合剤（例えば、微結晶セルロース、ガムトラガントまたはゼラチン）
；賦形剤（例えば、デンプンまたはラクトース）、崩壊剤（例えば、アルギン酸
）、Ｐｒｉｍｏｇｅｌ、またはコーンスターチ；滑沢剤（例えば、ステアリン酸
マグネシウムまたはＳｔｅｒｏｔｅｓ）；グライダント（ｇｌｉｄａｎｔ）（例
えば、コロイド状二酸化ケイ素）；甘味剤（例えば、スクロースまたはサッカリ
ン）；あるいは香味剤（例えば、ペパーミント、サリチル酸メチル、またはオレ
ンジフレーバー）。
【０２１２】 吸入による投与について、この化合物は、適切な噴霧剤（例えば、二酸化炭素
のような気体）を含む圧縮容器またはディスペンサー、あるいは噴霧器から、エ
アロゾルスプレーの形態で送達される。
【０２１３】 全身的投与はまた、経粘膜手段または経皮手段により得る。経粘膜投与または
経皮投与について、浸透されるバリアに対して適切な浸透剤が、処方において使
用される。このような浸透剤は、一般的に、当該分野で公知であり、そして、例
えば、経粘膜投与については、界面活性剤、胆汁酸塩、およびフシジン酸誘導体
が挙げられる。経粘膜投与は、鼻スプレーまたは坐剤によって達成され得る。経
皮投与については、この活性化合物は、当該分野で一般的に公知である軟膏剤、
軟膏、ゲル、またはクリーム剤へ処方される。
【０２１４】 この化合物はまた、直腸送達のための坐剤の使用（例えば、ココアバターおよ
び他のグリセリドのような従来の坐剤ベースと共に）または保持浣腸の形態で調
製され得る。
【０２１５】 １つの実施形態において、この活性化合物は、身体からの迅速な排出に対して
この化合物を保護するキャリアを用いて調製され（例えば、制御放出処方物）、
これには、移植片およびマイクロカプセル化された送達系が挙げられる。酢酸エ
チレンビニル、ポリ無水物、ポリグリコール酸、コラーゲン、ポリオルトエステ
ル、およびポリ乳酸のような、生分解性、生体適合性ポリマーが使用され得る。
このような処方物の調製のための方法は、当該業者には明らかである。これらの
材料はまた、Ａｌｚａ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ ａｎｄ Ｎｏｖａ Ｐｈａｒ
ｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｉｎｃ．から商業的に入手可能である。リポソーム懸
濁液（ウイルス抗原に対するモノクローナル抗体を含む、感染させた細胞へ標的
化されるリポソームを含む）がまた、薬学的に受容可能なキャリアとして使用さ
れ得る。これらは、例えば、米国特許第４，５２２，８１１号に記載されるよう
な、当業者に公知の方法に従って調製され得る。
【０２１６】 投与の容易さおよび投薬量の均一性のために、投薬単位形態で、経口組成物ま
たは非経口組成物を処方することが、特に有益である。本明細書で使用される投
薬単位形態は、処置される被験体のための単位投薬量として適切な、物理的に個
々の単位をいい；各単位は、必要とされる薬学的キャリアと関連して、所望の治
療的効果を生じるように計算された所定量の活性化合物を含む。本発明の投薬単
位形態についての詳細は、この活性化合物の固有の特性、および達成される特定
の治療効果、ならびに個体の処置のためのこのような活性化合物を調合する当該
分野に固有の制限によって決定されるか、あるいはこれらに直接依存する。
【０２１７】 本発明の核酸分子は、ベクターに挿入され得、そして遺伝子治療ベクターとし
て使用され得る。遺伝子治療ベクターは、被験体へ、例えば、静脈内注射、局所
投与（米国特許第５，３２８，４７０号を参照のこと）または定位注射（例えば
、Ｃｈｅｎら（１９９４）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ．９１：３０５
４−３０５７を参照のこと）によって送達され得る。遺伝子治療ベクターの薬学
的調製物には、受容可能な希釈剤中の遺伝子治療ベクターが挙げられ得、または
遺伝子送達ビヒクルが組み込まれる徐放性マトリックスを含み得る。あるいは、
完全な遺伝子送達ベクターが、組換え細胞からインタクトで産生され得（例えば
、レトロウイルスベクター）、この薬学的調製物は、遺伝子送達系を産生する１
以上の細胞を含み得る。
【０２１８】 本発明のタンパク質に特異的に結合する抗体、ならびに本明細書中で開示され
るスクリーニングアッセイによって同定される他の分子は、薬学的組成物の形態
で種々の障害の処置のために投与され得る。このような組成物を調製する際に関
する原理および考慮、ならびに成分の選択の際の手引きは、例えば、Ｒｅｍｉｎ
ｇｔｏｎのＴｈｅ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ Ｏｆ Ｐｈａ
ｒｍａｃｙ 第１９編（Ａｌｆｏｎｓｏ Ｒ．Ｇｅｎｎａｒｏら、編）Ｍａｃｋ
Ｐｕｂ．Ｃｏ．，Ｅａｓｔｏｎ，Ｐａ：１９９５；Ｄｒｕｇ Ａｂｓｏｒｐｔ
ｉｏｎ Ｅｎｈａｎｃｅｍｅｎｔ：Ｃｏｎｃｅｐｔｓ，Ｐｏｓｓｉｂｉｌｉｔｉ
ｅｓ，Ｌｉｍｉｔａｔｉｏｎｓ，Ａｎｄ Ｔｒｅｎｄｓ，Ｈａｒｗｏｏｄ Ａｃ
ａｄｅｍｉｃ Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ，Ｌａｎｇｈｏｒｎｅ，Ｐａ．，１９９４
；およびＰｅｐｔｉｄｅ Ａｎｄ Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒ
ｙ（Ａｄｖａｎｃｅｓ Ｉｎ Ｐａｒｅｎｔｅｒａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｖｏ
ｌ．４）、１９９１、Ｍ．Ｄｅｋｋｅｒ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ．に提供される。抗
原性タンパク質が、細胞内にあり、そして完全な抗体が、インヒビターとして使
用される場合、抗体を内在化することが、好ましい。しかし、リポソームはまた
、抗体または抗体フラグメントを細胞に送達するために使用され得る。抗体フラ
グメントが、使用される場合、標的タンパク質の結合ドメインに特異的に結合す
る最小の抑制フラグメントが、好ましい。例えば、抗体の可変領域配列に基づい
て、標的タンパク質配列に結合する能力を維持するペプチド分子は、設計され得
る。このようなペプチドは、化学的に合成され得、そして／または組み換えＤＮ
Ａ技術によって産生され得る。例えば、Ｍａｒａｓｃｏら、１９９３ Ｐｒｏｃ
．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，９０：７８８９−７８９３を参照のこ
と。本明細書中の処方物はまた、処置される特定の指標について必要な１より多
くの活性化合物を含み得、好ましくは、互いに悪影響を与えない相補的活性を有
する化合物を含み得る。あるいは、またはさらに、この組成物は、その機能を増
強する薬剤（例えば、細胞毒性剤、サイトカイン、化学療法剤または増殖抑制剤
）を含み得る。このような分子は、意図される目的のために有効である量で組み
合わせて適切に存在する。活性成分はまた、例えば、コアセルベーション技術ま
たは界面重合化によって調製されたマイクロカプセル（例えば、それぞれ、ヒド
ロキシメチルセルロースまたはゼラチン−マイクロカプセルおよびポリ−（メタ
クリル酸メチル）マイクロカプセル）で、コロイド状薬物送達系（例えば、リポ
ソーム、アルブミン微粒子、マイクロエマルジョン、ナノ粒子、およびナノカプ
セル）またはマクロエマルジョンにおいてトラップされ得る。
【０２１９】 インビボ投与のために使用される処方物は、滅菌である。これは、滅菌濾過膜
を通す濾過によって容易に達成される。
【０２２０】 徐放性調製物は、調製され得る。徐放性調製物の適切な例としては、抗体を含
有する固体疎水性ポリマーの半透性マトリックスが挙げられ、このマトリックス
は、成形された粒子（例えば、フィルムまたはマイクロカプセル）の形態である
。徐放性マトリックスの例としては、ポリエステル、ヒドロゲル（例えば、ポリ
（２−ヒドロキシエチル−メタクリレート）またはポリ（ビニルアルコール））
、ポリラクチド（米国特許第３，７７３，９１９号）、Ｌ−グルタミン酸のコポ
リマーおよびエチル−Ｌ−グルタメート、非分解性エチレン−ビニルアセテート
、分解性乳酸−グリコール酸コポリマー（例えば、ＬＵＰＲＯＮ ＤＥＰＯＴＴ Ｍ （乳酸−グリコール酸コポリマーおよび酢酸ロイプロリドで構成される注入可
能なミクロスフェア）、ならびにポリ−Ｄ−（−）−３−ヒドロキシ酪酸が挙げ
られる。エチレン−ビニルアセテートおよび乳酸−グリコール酸のようなポリマ
ーは、１００日を超えて分子の放出を可能にする一方で、特定のヒドロゲルは、
より短い期間でタンパク質を放出する。
【０２２１】 薬学的組成物は、投与のための使用説明書をとともに、容器、包装、またはデ
ィスペンサーに含まれ得る。
【０２２２】 （スクリーニング方法および検出方法） 本発明の単離された核酸分子は、ＮＯＶＸタンパク質を発現するために（例え
ば、遺伝子治療適用の際に宿主細胞における組み換え発現ベクターを介して）使
用され、ＮＯＶＸ ｍＲＮＡ（例えば、生物学的サンプルにおける）またはＮＯ
ＶＸ遺伝子における遺伝的病変を検出し得、かつ以下にさらに記載されるような
ＮＯＶＸ活性を調節し得る。さらに、ＮＯＶＸタンパク質は、ＮＯＶＸタンパク
質活性または発現を調節する薬物または化合物をスクリーニングし、ならびにＮ
ＯＶＸタンパク質の不十分かもしくは過剰な産生またはＮＯＶＸタンパク質形態
の産生の減少またはＮＯＶＸ野生型タンパク質と比較して異常な活性によって特
徴づけられる障害を処置するために使用され得る。さらに、本発明の抗ＮＯＶＸ
抗体は、ＮＯＶＸタンパク質を検出および単離し、ならびにＮＯＶＸ活性を調節
するために使用され得る。例えば、ＮＯＶＸ活性は、成長および分化、抗体産生
、および腫瘍増殖を含む。
【０２２３】 本発明は、さらに、本明細書中に記載されるスクリーニングアッセイによって
同定される新規の薬剤および上記される処置のためのそれらの使用に関する。
【０２２４】 （スクリーニングアッセイ） 本発明は、調節因子、すなわち、ＮＯＶＸタンパク質に結合するか、あるいは
例えば、ＮＯＶＸタンパク質発現またはＮＯＶＸタンパク質活性に対して刺激効
果または阻害効果を有する、候補化合物または候補薬剤、あるいは試験化合物ま
たは試験薬剤（例えば、ペプチド、ペプチド模倣物、低分子または他の薬物）を
同定するための方法（本明細書中において「スクリーニングアッセイ」とも称さ
れる）を提供する。本発明はまた、本明細書中で記載されるスクリーニングアッ
セイにおいて同定される化合物を含む。
【０２２５】 １つの実施形態において、本発明は、ＮＯＶＸのタンパク質またはポリペプチ
ド、あるいはその生物学的に活性な部分の膜結合形態に結合するか、またはそれ
ら膜結合形態の活性を調節する、候補化合物もしくは試験化合物をスクリーニン
グするためのアッセイを提供する。本発明の試験化合物は、当該分野において公
知のコンビナトリアルライブラリー法における任意の多数のアプローチを使用し
て得られ得、これらのライブラリーには、以下が挙げられる：生物学的ライブラ
リー；空間的にアクセス可能な平行固相もしくは溶液相ライブラリー；逆重畳を
要する合成ライブラリー法；「１ビーズ１化合物」ライブラリー法；およびアフ
ィニティクロマトグラフィー選択を使用する合成ライブラリー法。生物学的ライ
ブラリーアプローチはペプチドライブラリーに限定されるが、他の４つのアプロ
ーチは、ペプチド、非ペプチドオリゴマーもしくは化合物の低分子ライブラリー
に適用可能である（Ｌａｍ（１９９７）Ａｎｔｉｃａｎｃｅｒ Ｄｒｕｇ Ｄｅ
ｓｉｇｎ １２：１４５）。
【０２２６】 本明細書中で使用される場合、「低分子」とは、約５ｋＤ未満の分子量、最も
好ましくは約４ｋＤ未満の分子量を有する組成物をいうように意味される。低分
子は、例えば、核酸、ペプチド、ポリペプチド、ペプチド模倣体、糖、脂質また
は他の有機分子もしくは無機分子であり得る。化学的および／または生物学的混
合物（例えば、真菌、細菌または藻類抽出物）のライブラリーは、当該分野で公
知であり、そして本発明のアッセイのいずれかを用いてスクリーニングされ得る
。
【０２２７】 分子ライブラリーの合成のための方法の例は、当該分野において、例えば以下
に見出され得る：ＤｅＷｉｔｔら（１９９３）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ
Ｓｃｉ Ｕ．Ｓ．Ａ．９０：６９０９；Ｅｒｂら（１９９４）Ｐｒｏｃ Ｎａｔ
ｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ Ｕ．Ｓ．Ａ．９１：１１４２２；Ｚｕｃｋｅｒｍａｎｎ
ら（１９９４）Ｊ Ｍｅｄ Ｃｈｅｍ ３７：２６７８；Ｃｈｏら（１９９３）
Ｓｃｉｅｎｃｅ ２６１：１３０３；Ｃａｒｒｅｌｌら（１９９４）Ａｎｇｅｗ
Ｃｈｅｍ Ｉｎｔ Ｅｄ Ｅｎｇｌ ３３：２０５９；Ｃａｒｅｌｌら（１９
９４）Ａｎｇｅｗ Ｃｈｅｍ Ｉｎｔ Ｅｄ Ｅｎｇｌ ３３：２０６１；およ
びＧａｌｌｏｐら（１９９４）Ｊ Ｍｅｄ Ｃｈｅｍ ３７：１２３３。
【０２２８】 化合物のライブラリーは、溶液中で（例えば、Ｈｏｕｇｈｔｅｎ（１９９２）
Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ １３：４１２〜４２１）、あるいはビーズ上（Ｌ
ａｍ（１９９１）Ｎａｔｕｒｅ ３５４：８２〜８４）、チップ上（Ｆｏｄｏｒ
（１９９３）Ｎａｔｕｒｅ ３６４：５５５〜５５６）、細菌（Ｌａｄｎｅｒ
米国特許第５，２２３，４０９号）、胞子（Ｌａｄｎｅｒ 米国特許第５，２３
３，４０９号）、プラスミド（Ｃｕｌｌら（１９９２）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａ
ｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ８９：１８６５〜１８６９）またはファージ上（Ｓｃ
ｏｔｔおよびＳｍｉｔｈ（１９９０）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４９：３８６〜３９０
；Ｄｅｖｌｉｎ（１９９０）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４９：４０４〜４０６；Ｃｗｉ
ｒｌａら（１９９０）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ Ｕ．Ｓ．Ａ．８
７：６３７８〜６３８２；Ｆｅｌｉｃｉ（１９９１）Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ２
２２：３０１〜３１０；Ｌａｄｎｅｒ、米国特許第５，２３３，４０９号）にお
いて示され得る。
【０２２９】 １つの実施形態において、アッセイは細胞ベースのアッセイであり、ここで、
膜結合形態のＮＯＶＸタンパク質、またはその生物学的に活性な部分を細胞表面
上に発現する細胞が、試験化合物と接触され、そしてこの試験化合物が、ＮＯＶ
Ｘタンパク質に結合する能力が、決定される。例えば、細胞は、哺乳動物起源ま
たは酵母細胞であり得る。この試験化合物がＮＯＶＸタンパク質に結合する能力
の決定は、例えば、その試験化合物を放射性同位体標識または酵素標識とカップ
リングさせて、その結果、この試験化合物のＮＯＶＸタンパク質またはその生物
学的に活性な部分に対する結合が、複合体におけるその標識化合物を検出するこ
とによって決定され得ることによって達成され得る。例えば、試験化合物は、１ ２５ Ｉ、３５Ｓ、１４Ｃ、または３Ｈで直接的または間接的のいずれかで標識さ
れ得、そしてその放射性同位体が、放射線放射の直接の計数により、またはシン
チレーション計数により、検出され得る。あるいは、試験化合物は、例えば、西
洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、またはルシフェラーゼで
酵素的に標識され得、そしてこの酵素的標識が、適切な基質の生成物への転換を
決定することにより、検出され得る。１つの実施形態において、このアッセイは
、膜結合形態のＮＯＶＸタンパク質、またはその生物学的に活性な部分をその細
胞表面上に発現する細胞を、ＮＯＶＸと結合する公知の化合物と接触させて、ア
ッセイ混合物を形成する工程、このアッセイ混合物に試験化合物を接触させる工
程、ならびにこの試験化合物がＮＯＶＸタンパク質と相互作用する能力を決定す
る工程を包含し、ここで、この試験化合物がＮＯＶＸタンパク質と相互作用する
能力を決定する工程が、この試験化合物が、公知の化合物と比較して、ＮＯＶＸ
またはその生物学的に活性な部分と優先的に結合する能力を決定する工程を包含
する。
【０２３０】 別の実施形態において、アッセイは、細胞ベースのアッセイであり、これは、
膜結合形態のＮＯＶＸタンパク質またはその生物学的に活性な部分を細胞表面上
で発現する細胞を、試験化合物と接触させる工程、ならびにこの試験化合物が、
ＮＯＶＸタンパク質またはその生物学的に活性な部分の活性を調節（例えば、刺
激または阻害）する能力を決定する工程を包含する。この試験化合物が、ＮＯＶ
Ｘまたはその生物学的に活性な部分の活性を調節する能力の決定は、例えば、Ｎ
ＯＶＸタンパク質が、ＮＯＶＸ標的分子に結合またはこれら標的分子と相互作用
する能力を決定することによって、達成され得る。本明細書中において使用する
場合には、「標的分子」とは、ＮＯＶＸタンパク質が自然に結合または相互作用
する分子であり、例えば、ＮＯＶＸタンパク質を発現する細胞表面上の分子、第
二の細胞表面上の分子、細胞外環境中の分子、細胞膜の内部表面と会合する分子
、または細胞質分子である。ＮＯＶＸ標的分子は、非ＮＯＶＸ分子あるいは本発
明のＮＯＶＸタンパク質またはポリペプチドである。１つの実施形態において、
ＮＯＶＸ標的分子は、シグナル伝達経路の構成要素であり、これは、細胞膜を通
って細胞内への細胞外シグナル（例えば、化合物が膜結合ＮＯＶＸ分子に結合す
ることにより発生するシグナル）の伝達を促進する。その標的は、例えば、触媒
活性を有する第二の細胞内タンパク質、または下流シグナル分子のＮＯＶＸとの
会合を容易にするタンパク質であり得る。
【０２３１】 ＮＯＶＸタンパク質がＮＯＶＸ標的分子に結合するかまたはその標的分子と相
互作用する能力の決定は、直接的結合を決定するための上記方法の１つにより、
達成され得る。１つの実施形態において、ＮＯＶＸタンパク質がＮＯＶＸ標的分
子に結合するかまたはその標的分子と相互作用する能力の決定は、その標的分子
の活性を決定することにより、達成され得る。例えば、この標的分子の活性は、
その標的の細胞セカンドメッセンジャー（すなわち、細胞内Ｃａ２＋、ジアシル
グリセロール、ＩＰ３など）の誘導を検出すること、適切な基質への標的の触媒
活性／酵素活性を検出すること、レポーター遺伝子（検出可能なマーカー（例え
ば、ルシフェラーゼ）をコードする核酸に作動的に連結されたＮＯＶＸ応答性調
節エレメントを含む）の誘導を検出すること、または細胞応答（例えば、細胞生
存度、細胞分化、または細胞増殖）を検出することにより、決定され得る。
【０２３２】 なお別の実施形態において、本発明のアッセイは、無細胞アッセイであり、Ｎ
ＯＶＸタンパク質またはその生物学的に活性な部分を試験化合物に接触させる工
程、ならびにその試験化合物がＮＯＶＸタンパク質またはその生物学的に活性な
部分と結合する能力を決定する工程を包含する。この試験化合物の、ＮＯＶＸタ
ンパク質への結合は、上記のように、直接的または間接的にのいずれかで決定さ
れ得る。１つのこのような実施形態において、このアッセイは、ＮＯＶＸタンパ
ク質またはその生物学的に活性な部分を、ＮＯＶＸを結合する公知の化合物に接
触させて、アッセイ混合物を形成する工程、このアッセイ混合物を試験化合物に
接触させる工程、ならびにその試験化合物がＮＯＶＸタンパク質と相互作用する
能力を決定する工程を包含し、ここで、この試験化合物がＮＯＶＸタンパク質と
相互作用する能力を決定する工程は、この試験化合物が、公知の化合物と比較し
て、ＮＯＶＸ、またはその生物学的に活性な部分と優先的に相互作用する能力を
決定する工程を包含する。
【０２３３】 さらに別の実施形態において、アッセイは、無細胞アッセイであり、ＮＯＶＸ
タンパク質またはその生物学的に活性な部分を試験化合物と接触させる工程、な
らびにその試験化合物がＮＯＶＸタンパク質またはその生物学的に活性な部分の
活性を調節（例えば、刺激または阻害）する能力を決定する工程を包含する。こ
の試験化合物がＮＯＶＸの活性を調節する能力の決定は、例えば、ＮＯＶＸタン
パク質が、ＮＯＶＸ標的分子に結合する能力を、直接的結合の決定のための上記
方法の１つによって決定することにより、達成され得る。代替の実施形態におい
て、この試験化合物がＮＯＶＸタンパク質の活性を調節する能力の決定は、ＮＯ
ＶＸタンパク質が、ＮＯＶＸ標的分子をさらに調節する能力を決定することによ
り、達成され得る。例えば、この標的分子の適切な基質に対する触媒活性／酵素
活性は、上記のように決定され得る。
【０２３４】 なお別の実施形態において、無細胞アッセイは、ＮＯＶＸタンパク質またはそ
の生物学的に活性な部分を、ＮＯＶＸタンパク質を結合する公知の化合物に接触
させてアッセイ混合物を形成する工程、このアッセイ混合物を試験化合物と接触
させる工程、ならびにこの試験化合物がＮＯＶＸタンパク質と相互作用する能力
を決定する工程を包含し、ここで、この試験化合物がＮＯＶＸタンパク質と相互
作用する能力の決定は、ＮＯＶＸタンパク質が、ＮＯＶＸ標的分子と優先的に結
合するか、またはその標的分子の活性を優先的に調節する能力を決定する工程を
包含する。
【０２３５】 本発明の無細胞アッセイは、ＮＯＶＸタンパク質の、可溶性の形態または膜結
合形態の両方の使用に受け入れられる。膜結合形態のＮＯＶＸタンパク質を含む
無細胞アッセイの場合には、ＮＯＶＸタンパク質の膜結合形態が溶液中に維持さ
れるように、可溶化剤を利用することが望ましくあり得る。このような可溶化剤
の例には、非イオン性界面活性剤が挙げられ、例えば、ｎ−オクチルグルコシド
、ｎ−ドデシルグルコシド、ｎ−ドデシルマルトシド、オクタノイル−Ｎ−メチ
ルグルカミド、デカノイル−Ｎ−メチルグルカミド、Ｔｒｉｔｏｎ（登録商標）
Ｘ−１００、Ｔｒｉｔｏｎ（登録商標）Ｘ−１１４、Ｔｈｅｓｉｔ（登録商標）
、イソトリデシルポリ（エチレングリコールエーテル）ｎ（Ｉｓｏｔｒｉｄｅｃ
ｙｐｏｌｙ（ｅｔｈｙｌｅｎｅ ｇｌｙｃｏｌ ｅｔｈｅｒ）ｎ、Ｎ−ドデシル
−Ｎ，Ｎ−ジメチル−３−アンモニオ−１−プロパンスルホネート、３−（３−
コラミドプロピル）ジメチルアンモニオ−１−プロパンスルホネート（３−（３
−ｃｈｏｌａｍｉｄｏｐｒｏｐｙｌ）ｄｉｍｅｔｈｙｌａｍｍｉｎｉｏｌ−１−
ｐｒｏｐａｎｅ ｓｕｌｆｏｎａｔｅ）（ＣＨＡＰＳ）、または３−（３−コラ
ミドプロピル）ジメチルアンモニオ−２−ヒドロキシ−１−プロパンスルホネー
ト（３−（３−ｃｈｏｌａｍｉｄｏｐｒｏｐｙｌ）ｄｉｍｅｔｈｙｌａｍｍｉｎ
ｉｏｌ−２−ｈｙｄｒｏｘｙ−１−ｐｒｏｐａｎｅ ｓｕｌｆｏｎａｔｅ）（Ｃ
ＨＡＰＳＯ）である。
【０２３６】 本発明の上記アッセイ方法の１つより多い実施形態において、ＮＯＶＸタンパ
ク質またはその標的分子のいずれかを固定して、そのタンパク質の一方または両
方の非複合形態からの複合形態の分離を促進し、そしてそのアッセイの自動化に
適用させることが、望ましくあり得る。試験化合物の、ＮＯＶＸタンパク質への
結合、または候補化合物の存在下および非存在下での、ＮＯＶＸタンパク質の標
的分子との相互作用は、これらの反応物を収容するために適切な任意の容器内で
、達成され得る。このような容器の例には、マイクロタイタープレート、試験管
、および微小遠心管が挙げられる。１実施形態において、そのタンパク質の一方
または両方がマトリックスに結合することを可能にするドメインを付加する融合
タンパク質が、提供され得る。例えば、ＧＳＴ−ＮＯＶＸ融合タンパク質または
ＧＳＴ標的融合タンパク質は、グルタチオンセファロースビーズ（Ｓｉｇｍａ
Ｃｈｅｍｉｃａｌ、Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ、ＭＯ）またはグルタチオン誘導体化マイ
クロタイタープレート上に吸着され得、次いでこれらは、試験化合物と合わせら
れるか、あるいは試験化合物および吸着されない標的タンパク質、またはＮＯＶ
Ｘタンパク質のいずれかと合わせられ、そしてこの混合物が、複合体形成に貢献
する条件下（例えば、塩およびｐＨに関して生理学的条件）でインキュベートさ
れる。インキュベーションに続いて、ビーズまたはマイクロタイタープレートウ
ェルを洗浄して、結合していないあらゆる成分を除去し、ビーズの場合にはマト
リックスを固定し、例えば上記のように、複合体を直接的または間接的のいずれ
かで決定する。あるいは、複合体がマトリックスから解離され得、そしてＮＯＶ
Ｘタンパク質の結合レベルまたは活性レベルを、標準的な技術を使用して決定し
得る。
【０２３７】 タンパク質をマトリックスに固定するための他の技術がまた、本発明のスクリ
ーニングアッセイにおいて使用され得る。例えば、ＮＯＶＸタンパク質、または
その標的分子のいずれかが、ビオチンとストレプトアビジンとの結合を利用して
、固定され得る。ビオチニル化ＮＯＶＸタンパク質、または標的分子は、当該分
野において周知の技術を使用して、ビオチン−ＮＨＳ（Ｎ−ヒドロキシスクシン
イミド）から調製され得（例えば、ビオチニル化キット、Ｐｉｅｒｃｅ Ｃｈｅ
ｍｉｃａｌｓ、Ｒｏｃｋｆｏｒｄ、Ｉｌｌ．）、そしてストレプトアビジンで被
覆した９６ウェルのプレート（Ｐｉｅｒｃｅ Ｃｈｅｍｉｃａｌ）のウェルに固
定され得る。あるいは、ＮＯＶＸタンパク質、または標的分子と反応性であるが
ＮＯＶＸタンパク質のその標的分子への結合を妨害しない抗体が、そのプレート
のウェルに誘導体化され得、そして結合していない標的またはＮＯＶＸタンパク
質が、抗体の結合によってウェル内にトラップされ得る。このような複合体を検
出するための方法には、ＧＳＴ固定複合体に関しての上記のものに加えて、ＮＯ
ＶＸタンパク質または標的分子と反応性の抗体を使用する、複合体の免疫検出、
ならびにＮＯＶＸタンパク質、または標的分子に関する酵素活性の検出に依存す
る酵素結合アッセイが挙げられる。
【０２３８】 別の実施形態において、ＮＯＶＸタンパク質発現のモジュレーターは、細胞を
候補化合物と接触させ、そして細胞中のＮＯＶＸ ｍＲＮＡまたはタンパク質の
発現を決定する方法において同定される。候補化合物の存在下でのＮＯＶＸ ｍ
ＲＮＡまたはタンパク質の発現レベルは、候補化合物の非存在下でのＮＯＶＸ
ｍＲＮＡまたはタンパク質の発現レベルと比較される。次いで、候補化合物は、
この比較に基づいて、ＮＯＶＸ ｍＲＮＡまたはタンパク質発現のモジュレータ
ーとして同定され得る。例えば、ＮＯＶＸ ｍＲＮＡまたはタンパク質の発現が
候補化合物の非存在下より、その存在下における方が大きい（すなわち、統計的
に有意に大きい）場合、この候補化合物は、ＮＯＶＸ ｍＲＮＡまたはタンパク
質の発現の刺激物質として同定される。あるいは、ＮＯＶＸ ｍＲＮＡまたはタ
ンパク質の発現が候補化合物の非存在下よりその存在下の方が少ない（統計的に
有意に少ない）場合、この候補化合物は、ＮＯＶＸ ｍＲＮＡまたはタンパク質
の発現のインヒビターとして同定される。細胞中のＮＯＶＸ ｍＲＮＡまたはタ
ンパク質の発現レベルは、ＮＯＶＸ ｍＲＮＡまたはタンパク質を検出するため
に本明細書中に記載の方法によって決定され得る。
【０２３９】 本発明のなお別の局面において、ＮＯＶＸタンパク質は、ツーハイブリッドア
ッセイまたはスリーハイブリッドアッセイにおいて「ベイトタンパク質」として
使用されて（例えば、米国特許第５，２８３，３１７号；Ｚｅｒｖｏｓら（１９
９３）Ｃｅｌｌ ７２：２２３−２３２；Ｍａｄｕｒａら、１９９３ Ｊ．Ｂｉ
ｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６８：１２０４６−１２０５４；Ｂａｒｔｅｌら、１９９３
Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ １４：９２０−９２４；Ｉｗａｂｕｃｈｉら、
１９９３ Ｏｎｃｏｇｅｎｅ ８：１６９３−１６９６；およびＢｒｅｎｔ Ｗ
Ｏ９４／１０３００を参照のこと）、ＮＯＶＸ（「ＮＯＶＸ結合タンパク質」ま
たは「ＮＯＶＸ−ｂｐ」）に結合するか、またはこれと相互作用し、そしてＮＯ
ＶＸ活性を調節する他のタンパク質を同定し得る。このようなＮＯＶＸ結合タン
パク質はまた、例えば、ＮＯＶＸ経路の上流または下流エレメントとしてＮＯＶ
Ｘタンパク質によるシグナル伝達に関与するようである。
【０２４０】 ツーハイブリッドシステムは、分離可能なＤＮＡ結合ドメインおよび活性化ド
メインからなる、大部分の転写因子のモジュール的性質に基づく。簡潔には、こ
のアッセイは、２つの異なるＤＮＡ構築物を利用する。一方の構築物においては
、ＮＯＶＸをコードする遺伝子が公知の転写因子（例えば、ＧＡＬ−４）のＤＮ
Ａ結合ドメインをコードする遺伝子に融合される。他方の構築物においては、Ｄ
ＮＡ配列のライブラリー由来の、未同定タンパク質（「プレイ」または「サンプ
ル」）をコードするＤＮＡ配列が、公知の転写因子の活性化ドメインをコードす
る遺伝子に融合される。「ベイト」および「プレイ」タンパク質がインビボで相
互作用して、ＮＯＶＸ依存性複合体を形成し得る場合、この転写因子のＤＮＡ結
合ドメインおよび活性化ドメインは、非常に近くにある。近位にあることにより
、転写因子に応答性の転写調節部位に作動可能に連結されたレポーター遺伝子（
例えば、ＬａｃＺ）の転写を可能にする。レポーター遺伝子の発現が検出され得
、そして機能的転写因子を含む細胞コロニーは、単離され得、そしてＮＯＶＸと
相互作用するタンパク質をコードするクローニングされた遺伝子を得るために使
用され得る。
【０２４１】 本発明はさらに、上記のスクリーニングアッセイにより同定される新規な薬剤
および本明細書中に記載されるような処置のためのこの薬剤の使用に関する。
【０２４２】 （検出アッセイ） 本明細書中で同定されるｃＤＮＡ配列の一部分またはフラグメント（および対
応する完全な遺伝子配列）は、ポリヌクレオチド試薬として多くの方法で使用さ
れ得る。例えば（限定はされない）、これらの配列を使用して、（ｉ）微量の生
物学的サンプルから個体を同定し得る（組織型決定）；および（ｉｉ）生物学的
サンプルの法医学的識別を助け得る。これらの適用のうちのいくつかは、以下の
節において記載される。
【０２４３】 （組織型決定（ｔｉｓｓｕｅ ｔｙｐｉｎｇ）） 本発明のＮＯＶＸ配列は、わずかな生物学的サンプルから個体を識別するため
に使用され得る。この技術において、個体のゲノムＤＮＡは、１つ以上の制限酵
素で消化され、そして同定のために独特のバンドを生成するためにサザンブロッ
ト上でプローブされる。本発明の配列は、ＲＦＬＰ（米国特許第５，２７２，０
５７号に記載の「制限フラグメント長多型」）のためのさらなるＤＮＡマーカー
として有用である。
【０２４４】 さらに、本発明の配列を用いて、個体のゲノムの選択された部分について実際
の塩基ごとにＤＮＡ配列を決定する代替的技術を提供し得る。従って、本明細書
中に記載のＮＯＶＸ配列を用いて、配列の５’末端および３’末端から２つのＰ
ＣＲプライマーを調製し得る。次いで、これらのプライマーを使用して、個体の
ＤＮＡを増幅し得、引き続いて、配列決定し得る。
【０２４５】 このように調製された個体由来の対応するＤＮＡ配列のパネルは、各個体が、
対立遺伝子差異に起因するこのようなＤＮＡ配列の独特のセットを有するので、
唯一の個体識別を提供し得る。本発明の配列は、個体由来および組織由来の配列
のこのような識別を得るために使用され得る。本発明のＮＯＶＸ配列は、ヒトゲ
ノムの部分を独特に表す。対立遺伝子変異は、これらの配列のコード領域におい
てある程度生じ、そして非コード領域においてより大きな程度に生じる。個々の
ヒト間での対立遺伝子変異は、各５００塩基につき約１回の頻度で生じると見積
もられる。対立遺伝子変異の多さは、制限フラグメント長多型（ＲＦＬＰ）を含
む単一ヌクレオチド多型（ＳＮＰ）に起因する。
【０２４６】 本明細書中で記載の配列の各々は、ある程度、標準物質（これに対して個体か
らのＤＮＡが識別の目的で比較され得る）として使用され得る。より多くの多型
が非コード領域で生じるので、個体を区別するために、それほど多くの配列が必
要であるわけではない。非コード配列は、おそらく１０〜１，０００プライマー
のパネルを用いてポジティブな個体識別を不自由なく提供し得る。これらのプラ
イマーは、各々が１００塩基の増幅された非コード配列を生じる。推定コード配
列（例えば、配列番号１、３、５、７、９、１１、もしくは１３における配列）
が使用される場合、ポジティブな個体識別に関するプライマーのより適切な数は
、５００〜２，０００である。
【０２４７】 （予測医療） 本発明はまた、診断アッセイ、予後アッセイ、薬物ゲノム（ｐｈａｒｍａｃｏ
ｇｅｎｏｍｉｃｓ）およびモニタリング臨床試験が、予後（予測）の目的に使用
され、これによって個体を予防的に処置する、予測医療の分野に関する。従って
、本発明の１つの局面は、ＮＯＶＸタンパク質および／または核酸の発現、なら
びにＮＯＶＸの活性を、生物学的サンプル（例えば、血液、血清、細胞、組織）
の関連で決定し、これによって、異常なＮＯＶＸの発現または活性に関連して、
個体が疾患または障害に罹患するかどうか、あるいは障害を発症するリスクがあ
るかどうかを決定する。異常なＮＯＶＸ発現活性に関連した障害としては、例え
ば、腎臓および膵臓の機能不全の障害（例えば、糖尿病、高血圧、肝硬変、およ
び癌）が挙げられる。
【０２４８】 本発明はまた、個体が、ＮＯＶＸのタンパク質、核酸の発現または活性と関連
した障害を発症するリスクがあるかどうかを決定するための予後的（または予測
的）アッセイを提供する。例えば、ＮＯＶＸ遺伝子における変異が、生物学的サ
ンプルにおいてアッセイされ得る。このようなアッセイは、予後的または予測的
な目的に使用され得、これによってＮＯＶＸのタンパク質、核酸の発現または生
物学的活性によって特徴付けられるかまたはそれに関連した障害の発病の前に個
体を予防的に処置する。
【０２４９】 本発明の別の局面は、個体におけるＮＯＶＸタンパク質、核酸の発現または活
性を決定するための方法を提供し、これによって、その個体についての適切な治
療的または予防的因子（本明細書において「薬物ゲノム」とよばれる）を選択す
る。薬物ゲノムは、個体の遺伝型（例えば、特定の因子に対して応答する個体の
能力を決定するために試験された個体の遺伝型）に基づいた、個体の治療的また
は予防的処置のための因子（例えば、薬物）の選択を可能にする。
【０２５０】 本発明のなお別の局面は、臨床試験におけるＮＯＶＸの発現または活性に対す
る因子（例えば、薬剤、化合物）の影響をモニタリングすることに関する。
【０２５１】 これらおよび他の因子は、以下の節でさらに詳細に記載される。
【０２５２】 （診断アッセイ） 生物学的サンプルにおけるＮＯＶＸの存在または非存在を検出するための例示
的な方法は、試験被験体から生物学的サンプルを得る工程、およびその生物学的
サンプルをＮＯＶＸタンパク質またはＮＯＶＸタンパク質をコードする核酸（例
えば、ｍＲＮＡ、ゲノムＤＮＡ）を検出し得る化合物もしくは薬剤とを接触させ
、その結果、ＮＯＶＸの存在が、その生物学的サンプルにおいて検出される、工
程を包含する。ＮＯＶＸのｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡを検出するための薬剤は
、ＮＯＶＸのｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡにハイブリダイズし得る、標識された
核酸プローブである。この核酸プローブは、例えば、全長のＮＯＶＸ核酸（例え
ば、配列番号１、３、５、７、９、１１、もしくは１３またはその部分の核酸（
例えば、少なくとも、１５、３０、５０、１００、２５０もしくは５００ヌクレ
オチド長のオリゴヌクレオチドであり、そしてストリンジェントな条件下でＮＯ
ＶＸのｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡと特異的にハイブリダイズするに十分である
核酸））であり得る。本発明の診断アッセイにおける使用のための他の適切なプ
ローブは本明細書中に記載される。
【０２５３】 ＮＯＶＸタンパク質を検出するための１つの薬剤は、ＮＯＶＸと結合し得る抗
体、好ましくは、検出可能な標識を有する抗体である。本発明のタンパク質に対
する抗体は、タンパク質の局在および／または定量化に関連する、当該分野で公
知の方法において使用され得る（例えば、適切な生理学的サンプル内のタンパク
質のレベルの測定における使用のため、診断方法における使用のため、タンパク
質の画像化における使用のためなど）。所定の実施形態では、タンパク質に対す
る抗体または抗原結合ドメインを含むその誘導体、フラグメント、アナログまた
はホモログは、薬理学的に活性な組成物として使用される。
【０２５４】 本発明のタンパク質に特異的な抗体は、標準技術（例えば、免疫親和性クロマ
トグラフィまたは免疫沈降）によって、タンパク質を単離するために用いられ得
る。このような抗体は、細胞からの天然のタンパク質抗原の精製および宿主細胞
において発現される組換え的に産生された抗原の精製を容易にし得る。さらに、
抗原タンパク質の発現の量およびパターンを評価するために、このような抗体を
用いて（例えば、細胞の溶解液または細胞上清における）抗原タンパク質を検出
し得る。このタンパク質に対する抗体は、例えば、所定の処置レジメンの有効性
を決定するために、臨床試験の手順の一部として組織におけるタンパク質レベル
を診断的にモニターするために用いられ得る。検出は、抗体を検出可能物質にカ
ップリングする（すなわち、物理的に連結する）ことにより容易にされ得る。検
出可能な物質の例としては、種々の酵素、補欠分子団、蛍光物質、発光物質、生
物発光物質および放射性物質が挙げられる。適切な酵素の例としては、西洋ワサ
ビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、β−ガラクトシダーゼまたはア
セチルコリンエステラーゼが挙げられ；適切な補欠分子団複合体の例としては、
ストレプトアビジン／ビオチンおよびアビジン／ビオチンが挙げられ；適切な蛍
光物質の例としては、ウンベリフェロン、フルオレセイン、フルオレセインイソ
チオシアネート、ローダミン、ジクロロトリアジニルアミン（ｄｉｃｈｌｏｒｏ
ｔｒｉａｚｉｎｙｌａｍｉｎｅ）フルオレセイン、ダンシルクロリドまたはフィ
コエリトリンが挙げられ；発光物質の例としては、ルミノールが挙げられ；生物
発光物質の例としては、ルシフェラーゼ、ルシフェリンおよびエクオリンが挙げ
られ、そして、適切な放射性物質の例としては１２５Ｉ、１３１Ｉ、３５Ｓまた
は３Ｈが挙げられる。
【０２５５】 抗体は、ポリクローナルであり得るか、またはより好ましくはモノクローナル
抗体であり得る。インタクトな抗体またはそのフラグメント（例えば、Ｆａｂま
たはＦ（ａｂ’）２）が使用され得る。用語「標識（された）」とは、プローブ
または抗体に関して、検出可能な物質をそのプローブもしくは抗体にカップリン
グさせる（すなわち、物理的に連結する）ことによって、そのプローブまたは抗
体を直接標識すること、ならびに、直接標識される別の試薬との反応性によって
、そのプローブもしくは抗体を間接的に標識することを包含することが意図され
る。間接的な標識の例としては、蛍光標識された二次抗体を用いる一次抗体の検
出、および蛍光標識されたストレプトアビジンを用いて検出され得るようにビオ
チンを用いるＤＮＡプローブの末端標識が挙げられる。用語「生物学的サンプル
」とは、被験体から単離された、組織、細胞および生物学的流体ならびに被験体
に存在する組織、細胞および流体を含むことが意図される。すなわち、本発明の
検出方法を用いて、生物学的サンプル中のＮＯＶＸのｍＲＮＡ、タンパク質また
はゲノムＤＮＡを、インビトロおよびインビボで検出し得る。例えば、ＮＯＶＸ
ｍＲＮＡの検出のためのインビトロ技術としては、ノーザンハイブリダイゼー
ションおよびインサイチュハイブリダイゼーションが挙げられる。ＮＯＶＸタン
パク質の検出のためのインビトロ技術としては、酵素結合免疫吸着アッセイ（Ｅ
ＬＩＳＡ）、ウェスタンブロット、免疫沈降および免疫蛍光が挙げられる。ＮＯ
ＶＸゲノムＤＮＡを検出するためのインビトロ技術としては、サザンハイブリダ
イゼーションが挙げられる。さらに、ＮＯＶＸタンパク質の検出のためのインビ
ボ技術としては、標識された抗ＮＯＶＸ抗体を被験体に導入することが挙げられ
る。例えば、その抗体は、放射性マーカーを用いて標識され得る。この被験体に
おける放射性マーカーの存在および位置は、標準的な画像化技術によって検出さ
れ得る。
【０２５６】 １つの実施形態において、この生物学的サンプルは、その試験被験体からのタ
ンパク質分子を含む。あるいは、その生物学的サンプルは、その試験被験体から
のｍＲＮＡ分子またはその試験被験体からのゲノムＤＮＡ分子を含み得る。好ま
しい生物学的サンプルは、被験体から従来の手段によって単離された末梢血白血
球サンプルである。
【０２５７】 １つの実施形態において、本発明の方法はさらに、コントロール被験体からコ
ントロール生物学的サンプルを得る工程、そのコントロールサンプルを、ＮＯＶ
Ｘのタンパク質、ｍＲＮＡもしくはゲノムを検出し得る化合物または薬剤と接触
させ、その結果、ＮＯＶＸのタンパク質、ｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡの存在が
その生物学的サンプルにおいて検出される、工程、およびそのコントロールサン
プルにおけるＮＯＶＸのタンパク質、ｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡの存在と、そ
の試験サンプルにおけるＮＯＶＸのタンパク質、ｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡの
存在とを比較する工程を包含する。
【０２５８】 本発明はまた、生物学的サンプルにおけるＮＯＶＸの存在を検出するためのキ
ットを包含する。例えば、このキットは、以下を備え得る：生物学的サンプルに
おいてＮＯＶＸのタンパク質またはｍＲＮＡを検出し得る、標識された化合物ま
たは薬剤；そのサンプルにおいてＮＯＶＸの量を決定するための手段；およびそ
のサンプルにおけるＮＯＶＸの量を標準と比較するための手段。この化合物また
は薬剤は、適切な容器内にパッケージングされ得る。このキットは、さらに、Ｎ
ＯＶＸタンパク質または核酸を検出するためにキットを用いるための説明書を備
え得る。
【０２５９】 （予後アッセイ） 本明細書において記載された診断方法をさらに利用して、ＮＯＶＸの異常発現
または異常活性に関連した疾患もしくは障害を有するか、またはその発症の危険
性を有する被験体を同定し得る。例えば、本明細書に記載されるアッセイ（例え
ば、上述の診断アッセイまたは下記のアッセイ）を利用して、ＮＯＶＸのタンパ
ク質、核酸の発現または活性に関連する障害を有するかまたはその発症の危険性
を有する被験体を同定し得る。このような障害としては、腎臓および膵臓の機能
不全の障害（例えば、糖尿病、高血圧、肝硬変、および癌）が挙げられる。
【０２６０】 あるいは、この予後アッセイを利用して、疾患または障害を有するかまたはそ
の発症の危険性を有する被験体を同定し得る。従って、本発明は、ＮＯＶＸの異
常発現または異常活性に関連する疾患もしくは障害を同定するための方法を提供
する。ここで、試験サンプルは、被験体から得られ、そしてＮＯＶＸのタンパク
質または核酸（例えば、ｍＲＮＡ、ゲノムＤＮＡ）が検出され、ここで、ＮＯＶ
Ｘのタンパク質または核酸の存在は、ＮＯＶＸの異常発現または異常活性に関連
する疾患または障害を有するかまたはその発症の危険性を有する被験体について
の診断指標である。本明細書において使用される場合「試験サンプル」とは、目
的の被験体から得られた生物学的サンプルをいう。例えば、試験サンプルは、生
物学的流体（例えば、血清）、細胞サンプル、または組織であり得る。
【０２６１】 さらに、本明細書に記載される予後アッセイを使用して、被験体に薬剤（例え
ば、アゴニスト、アンタゴニスト、ペプチド模倣物、タンパク質、ペプチド、核
酸、低分子、または他の薬物候補）を投与してＮＯＶＸの異常発現または異常活
性に関連する疾患または障害を処置し得るか否かを、決定し得る。例えば、この
ような方法を使用して、被験体が障害のための薬剤で有効に処置され得るか否か
を決定し得る。従って、本発明は、ＮＯＶＸの異常発現または異常活性に関連す
る障害についての薬剤を用いて、被験体が有効に処置され得るか否かを決定する
ための方法を提供する。ここで、試験サンプルが得られ、そしてＮＯＶＸのタン
パク質または核酸が検出される（例えば、ここで、ＮＯＶＸのタンパク質または
核酸の存在は、この薬剤が投与されてＮＯＶＸの異常発現または異常活性に関連
する障害が処置され得る被験体についての、診断指標である）。
【０２６２】 本発明の方法はまた、ＮＯＶＸ遺伝子における遺伝的損傷を検出し、それによ
って、その損傷遺伝子を有する被験体が異常な細胞増殖および／または分化によ
って特徴付けられる障害についての危険性を有するか否かを決定するためにも使
用され得る。種々の実施形態において、この方法は、その被験体からの細胞のサ
ンプルにおいて、ＮＯＶＸタンパク質をコードする遺伝子の統合性に影響を与え
る少なくとも１つの変更によって特徴付けられる遺伝的損傷の存在または非存在
、あるいはＮＯＶＸ遺伝子の誤発現を検出する工程を包含する。例えば、そのよ
うな遺伝的損傷は、以下の少なくとも１つの存在を確認することによって検出さ
れ得る：（ｉ）ＮＯＶＸ遺伝子からの１つ以上のヌクレオチドの欠失；（ｉｉ）
ＮＯＶＸ遺伝子への１つ以上のヌクレオチドの付加；（ｉｉｉ）ＮＯＶＸ遺伝子
の１つ以上のヌクレオチドの置換、（ｉｖ）ＮＯＶＸ遺伝子の染色体再配置；（
ｖ）ＮＯＶＸ遺伝子のメッセンジャーＲＮＡ転写物のレベルにおける変更、（ｖ
ｉ）ＮＯＶＸ遺伝子の異常改変（例えば、ゲノムＤＮＡのメチル化パターンの異
常改変）、（ｖｉｉ）ＮＯＶＸ遺伝子のメッセンジャーＲＮＡ転写物の非野生型
スプライシングパターンの存在、（ｖｉｉｉ）ＮＯＶＸタンパク質の非野生型レ
ベル、（ｉｘ）ＮＯＶＸ遺伝子の対立遺伝子の欠失、ならびに（ｘ）ＮＯＶＸタ
ンパク質の不適切な翻訳後修飾。本明細書において記載されるように、当該分野
において、ＮＯＶＸ遺伝子における損傷を検出するために使用され得る、多数の
公知のアッセイ技術が存在する。好ましい生物学的サンプルは、従来手段によっ
て被験体から単離された末梢血白血球サンプルである。しかし、有核細胞を含む
任意の生物学的サンプルが使用され得、これには、例えば、頬粘膜細胞が挙げら
れる。
【０２６３】 特定の実施形態において、損傷の検出は、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）（
例えば、米国特許第４，６８３，１９５号および同第４，６８３，２０２号を参
照のこと）（例えば、アンカーＰＣＲまたはＲＡＣＥ ＰＣＲ）、あるいは、連
結連鎖反応（ＬＣＲ）（例えば、Ｌａｎｄｅｇｒａｎら（１９８８）Ｓｃｉｅｎ
ｃｅ ２４１：１０７７−１０８０；およびＮａｋａｚａｗａら（１９９４）Ｐ
ｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｉｃ．ＵＳＡ ９１：３６０−３６４を参照の
こと）におけるプローブ／プライマーの使用を包含する。後者は、ＮＯＶＸ遺伝
子における点変異を検出するために特に有用であり得る）（Ａｂｒａｖａｙａら
，１９９５ Ｎｕｃｌ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ ２３：６７５−６８２を参照のこ
と）。この方法は、患者から細胞のサンプルを収集する工程、核酸（例えば、ゲ
ノム、ｍＲＮＡまたはその両方）をそのサンプルの細胞から単離する工程、ＮＯ
ＶＸの遺伝子に特異的にハイブリダイズする１つ以上のプライマーとその核酸サ
ンプルとを、ＮＯＶＸ遺伝子（存在する場合）のハイブリダイゼーションおよび
増幅が生じるような条件下で接触させる工程、ならびに増幅産物の存在もしくは
非存在を検出する工程、またはその増幅産物のサイズを検出する工程およびその
長さをコントロールサンプルと比較する工程を包含し得る。ＰＣＲおよび／また
はＬＣＲは、本明細書中に記載される変異を検出するために使用される技術のい
ずれかとともに予備的増幅工程として使用されることが望ましくあり得ることが
予想される。
【０２６４】 代替的な増幅方法としては、以下が挙げられる：当業者に周知な技術を用いた
、その増幅された分子の検出の前の、自己維持配列複製（Ｇｕａｔｅｌｌｉら、
１９９０、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８７：１８７４−
１８７８を参照のこと）、転写増幅系（Ｋｗｏｈら、１９８９、Ｐｒｏｃ．Ｎａ
ｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８６：１１７３−１１７７を参照のこと）、
Ｑβレプリカーゼ（Ｌｉｚａｒｄｉら、１９８８、ＢｉｏＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ
６：１１９７を参照のこと）、または他の任意の核酸増幅方法。これらの検出
スキームは、核酸分子が非常に極少数で存在する場合に、そのような核酸分子の
検出のために特に有用である。
【０２６５】 代替の実施形態において、サンプル細胞からのＮＯＶＸ遺伝子における変異は
、制限酵素切断パターンにおける変更によって同定され得る。例えば、サンプル
およびコントロールのＤＮＡが単離され、増幅され（必要に応じて）、１つ以上
の制限エンドヌクレアーゼを用いて消化され、そしてフラグメント長の大きさが
ゲル電気泳動によって決定され、そして比較される。サンプルＤＮＡとコントロ
ールＤＮＡとの間のフラグメント長の大きさにおける差異は、そのサンプルＤＮ
Ａにおける変異を示す。さらに、配列特異的なリボザイムの使用（例えば、米国
特許第５，４９３，５３１号を参照のこと）を使用して、リボザイム切断部位の
発生または喪失によって特異的な変異の存在についてスコア付けし得る。
【０２６６】 他の実施形態において、ＮＯＶＸにおける遺伝子変異は、サンプル核酸および
コントロール核酸（例えば、ＤＮＡまたはＲＮＡ）を、数百または数千のオリゴ
ヌクレオチドプローブを含む高密度アレイに対してハイブリダイズさせることに
よって同定され得る（Ｃｒｏｎｉｎら（１９９６）Ｈｕｍａｎ Ｍｕｔａｔｉｏ
ｎ ７：２４４−２５５；Ｋｏｚａｌら（１９９６）Ｎａｔ．Ｍｅｄ．２：７５
３−７５９）。例えば、ＮＯＶＸにおける遺伝子変異は、Ｃｒｏｎｉｎら（前出
）に記載されるように光生成ＤＮＡプローブを含む二次元アレイにおいて同定さ
れ得る。手短には、プローブの第一ハイブリダイゼーションアレイを用いて、サ
ンプルおよびコントロールにおける長いストレッチのＤＮＡにわたって走査し、
連続的に重複するプローブの線形アレイを作成することによって、その配列間の
塩基変化を同定し得る。この工程は、点変異の同定を可能にする。この工程に第
二のハイブリダイゼーションアレイが続き、これは、検出される全ての改変体ま
たは変異体に相補的な、より小さな特化されたプローブアレイを用いることによ
る特定の変異の特徴付けを可能にする。各変異アレイは、一方が野生型遺伝子に
対して相補的であり、そして他方が変異遺伝子に対して相補である並行プローブ
セットから構成される。
【０２６７】 なお別の実施形態において、当該分野で公知の種々の配列決定反応のいずれか
を使用して、ＮＯＶＸ遺伝子を直接配列決定し得、そしてサンプルＮＯＶＸ配列
と対応する野生型（コントロール）配列とを比較することによって、変異を検出
し得る。配列決定反応の例としては、ＭａｘａｍおよびＧｉｌｂｅｒｔ（１９７
７）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｉｃ．ＵＳＡ ７４：５６０またはＳａ
ｎｇｅｒ（１９７７）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｉｃ．ＵＳＡ ７４：
５４６３によって開発された技術に基づくものが挙げられる。診断アッセイを実
施する場合、種々の自動化配列決定手順のいずれかを利用し得ることもまた意図
される（例えば、Ｎａｅｖｅら（１９９５）Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ １９
：４４８を参照のこと）。これらには、質量分析法による配列決定法（例えば、
ＰＣＴ国際公開番号ＷＯ ９４／１６１０１；Ｃｏｈｅｎら（１９９６）Ａｄｖ
Ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒ ３６：１２７−１６２；およびＧｒｉｆｆｉｎら（１
９９３）Ａｐｐｌ Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ ３８．：１４７−
１５９を参照のこと）が含まれる。
【０２６８】 ＮＯＶＸ遺伝子における変異を検出するための他の方法としては、切断剤から
の保護を使用して、ＲＮＡ／ＲＮＡもしくはＲＮＡ／ＤＮＡのヘテロ二重鎖に基
づくミスマッチ塩基を検出する方法が挙げられる（Ｍｙｅｒｓら（１９８５）Ｓ
ｃｉｅｎｃｅ ２３０：１２４２）。一般に、「ミスマッチ切断」の当該分野の
技術は、野生型のＮＯＶＸ配列を含む（標識された）ＲＮＡまたはＤＮＡを、組
織サンプルから得られた潜在的な変異体ＲＮＡまたはＤＮＡとハイブリダイズさ
せることによって形成されるヘテロ二重鎖を提供する工程によって始まる。この
二本鎖の二重鎖を、二重鎖の一本鎖領域（例えば、そのコントロールとサンプル
の鎖との間の塩基対ミスマッチに起因して存在するもの）を切断する薬剤を用い
て処理する。例えば、ＲＮＡ／ＤＮＡ二重鎖を、ＲＮａｓｅを用いて処理し得、
そしてＤＮＡ／ＤＮＡハイブリッドを、そのミスマッチ領域を酵素的に消化する
ことに対して、Ｓ１ヌクレアーゼを用いて処理し得る。他の実施形態において、
ＤＮＡ／ＤＮＡまたはＲＮＡ／ＤＮＡのいずれかの二重鎖を、ミスマッチ領域を
消化するために、ヒドロキシルアミンまたは四酸化オスミウム、およびピペリジ
ンを用いて処理し得る。そのミスマッチ領域の消化後、次いで、得られた物質を
変性ポリアクリルアミドゲル上で、大きさにより分離して、変異の部位を決定す
る。例えば、Ｃｏｔｔｏｎら（１９８８）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃ
ｉ ＵＳＡ ８５：４３９７；Ｓａｌｅｅｂａら（１９９２）Ｍｅｔｈｏｄｓ
Ｅｎｚｙｍｏｌ ２１７：２８６−２９５を参照のこと。１つの実施形態におい
て、コントロールのＤＮＡまたはＲＮＡは、検出のために標識され得る。
【０２６９】 なお別の実施形態において、ミスマッチ切断反応は、二本鎖ＤＮＡにおけるミ
スマッチ塩基対を認識する１つ以上のタンパク質（いわゆる「ＤＮＡミスマッチ
修復」酵素）を、細胞のサンプルから得られたＮＯＶＸ ｃＤＮＡにおける点変
異を検出およびマッピングするために規定された系において使用する。例えば、
Ｅ．ｃｏｌｉのｍｕｔＹ酵素は、Ｇ／ＡミスマッチでＡを切断し、そしてＨｅＬ
ａ細胞からのチミジンＤＮＡグリコシラーゼは、Ｇ／ＴミスマッチでＴを切断す
る（Ｈｓｕら（１９９４）Ｃａｒｃｉｎｏｇｅｎｅｓｉｓ １５：１６５７〜１
６６２）。例示的な実施形態に従って、ＮＯＶＸ配列（例えば、野生型ＮＯＶＸ
配列）に基づくプローブは、試験細胞由来のｃＤＮＡまたは他のＤＮＡ産物にハ
イブリダイズされる。二重鎖は、ＤＮＡミスマッチ修復酵素を用いて処理され、
そしてその切断産物（もしあれば）は、電気泳動プロトコールなどから検出され
得る。例えば、米国特許第５，４５９，０３９号を参照のこと。
【０２７０】 他の実施形態において、電気泳動の移動度における変化は、ＮＯＶＸ遺伝子に
おける変異を同定するために使用される。例えば、一本鎖コンホメーション多型
（ＳＳＣＰ）は、変異体と野生型核酸との間の電気泳動の移動度における差異を
検出するために使用され得る（Ｏｒｉｔａら（１９８９）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ
Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ：８６：２７６６、またＣｏｔｔｏｎ（１９９３）Ｍ
ｕｔａｔ Ｒｅｓ ２８５：１２５〜１４４；Ｈａｙａｓｈｉ（１９９２）Ｇｅ
ｎｅｔ Ａｎａｌ Ｔｅｃｈ Ａｐｐｌ ９：７３〜７９を参照のこと）。サン
プルおよびコントロールＮＯＶＸ核酸の一本鎖ＤＮＡフラグメントは、変性され
、そして再生される。一本鎖核酸の二次構造は、配列に従って変化し、電気泳動
の移動度において得られる変化は、１つの塩基変化の検出さえも可能にする。Ｄ
ＮＡフラグメントは、標識され得るか、または標識されたプローブを用いて検出
され得る。アッセイの感度は、ＤＮＡよりもむしろ、二次構造が配列中の変化に
対してより感受的であるＲＮＡを使用することによって増強され得る。１つの実
施形態において、本発明の方法は、ヘテロ二重鎖分析を利用して、電気泳動の移
動度における変化に基づいて二本鎖のヘテロ二重鎖分子を分離する。例えば、Ｋ
ｅｅｎら（１９９１）Ｔｒｅｎｄｓ Ｇｅｎｅｔ ７：５を参照のこと。
【０２７１】 なお別の実施形態において、一定勾配の変性剤を含有するポリアクリルアミド
ゲルにおける変異体または野生型フラグメントの移動は、変性勾配ゲル電気泳動
（ＤＧＧＥ）を使用してアッセイされる。例えば、Ｍｙｅｒｓら（１９８５）Ｎ
ａｔｕｒｅ ３１３：４９５を参照のこと。ＤＧＧＥが分析の方法として使用さ
れる場合、ＤＮＡは、例えば、ＰＣＲにより約４０ｂｐの高融点ＧＣリッチＤＮ
ＡのＧＣクランプを付加することによって、完全には変性されないことを確実す
るように改変される。さらなる実施形態において、温度勾配は、コントロールお
よびサンプルＤＮＡの移動度における差異を同定するために、変性剤勾配の代わ
りに使用される。例えば、ＲｏｓｅｎｂａｕｍおよびＲｅｉｓｓｎｅｒ（１９８
７）Ｂｉｏｐｈｙｓ Ｃｈｅｍ ２６５：１２７５３を参照のこと。
【０２７２】 点変異を検出するための他の技術の例としては、以下が挙げられるが、これら
に限定されない：選択的オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーション、選択的増
幅、または選択的プライマー伸長。例えば、オリゴヌクレオチドプライマーは、
既知の変異が中心的に配置されるように調製され得、次いで、完全なマッチが見
出される場合にのみハイブリダイゼーションを許容する条件下で標的ＤＮＡにハ
イブリダイズされる。例えば、Ｓａｉｋｉら（１９８６）Ｎａｔｕｒｅ ３２４
：１６３）；Ｓａｉｋｉら（１９８９）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ．Ｓｃｉ
ＵＳＡ ８６：６２３０を参照のこと。このような対立遺伝子特異的オリゴヌ
クレオチドは、このオリゴヌクレオチドがハイブリダイズ膜に付着され、そして
標識された標的ＤＮＡとハイブリダイズされる場合に、ＰＣＲ増幅された標的Ｄ
ＮＡまたは多くの異なる変異にハイブリダイズされる。
【０２７３】 あるいは、選択的ＰＣＲ増幅に依存する対立遺伝子特異的増幅技術は、本発明
と合わせて使用され得る。特異的増幅についてのプライマーとして使用されるオ
リゴヌクレオチドは、分子の中心において（その結果、増幅は、差次的ハイブリ
ダイゼーションに依存する）（Ｇｉｂｂｓら（１９８９）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃ
ｉｄｓ Ｒｅｓ １７：２４３７〜２４４８）か、あるいは適切な条件下でミス
マッチが妨げられ得るかまたはポリメラーゼ伸長を減少し得る、１つのプライマ
ーの３’の最末端で、目的の変異を保有し得る（Ｐｒｏｓｓｎｅｒ（１９９３）
Ｔｉｂｔｅｃｈ １１：２３８）。さらに、切断に基づく検出を行うために、変
異領域に新規な制限部位を導入することは、切断に基づく検出を行うために望ま
しくあり得る。例えば、Ｇａｓｐａｒｉｎｉら（１９９２）Ｍｏｌ Ｃｅｌｌ
Ｐｒｏｂｅｓ ６：１を参照のこと。特定の実施形態において、増幅はまた、増
幅用Ｔａｑリガーゼを使用して実施され得ることが予測される。例えば、Ｂａｒ
ａｎｙ（１９９１）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ８８：１
８９を参照のこと。このような場合において、連結は、５’配列の３’末端に完
全なマッチが存在する場合にのみ生じ、増幅の存在または非存在を探索すること
によって、特定の部位における既知の変異の存在を検出することを可能にする。
【０２７４】 本明細書中に記載される方法は、例えば、本明細書中に記載れる少なくとも１
つのプローブ核酸または抗体試薬を含む、予めパッケージングされた診断キット
を利用することによって実施され得、これは、例えば、ＮＯＶＸ遺伝子を含む疾
患または疾病の症状または家族病歴を示す患者を診断するための臨床的設定にお
いて簡便に使用され得る。
【０２７５】 さらに、ＮＯＶＸが発現される任意の細胞型または組織（好ましくは、末梢血
白血球）は、本明細書中に記載される予後アッセイにおいて利用され得る。しか
し、有核細胞を含む任意の生物学的サンプル（例えば、頬粘膜細胞を含む）が、
使用され得る。
【０２７６】 （薬理ゲノム学（Ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｏｍｉｃｓ）） ＮＯＶＸ活性（例えば、ＮＯＶＸ遺伝子発現）に対する刺激性または阻害性の
影響を有する因子、すなわちモジュレーターは、本明細書中に記載されるスクリ
ーニングアッセイによって同定されるように、障害（例えば、腎臓および膵臓の
機能不全の障害（例えば、糖尿病、高血圧、肝硬変、および癌））を処置（予防
的または治療的に）するために個体に投与され得る。このような処置と合わせて
、個体の薬理ゲノム学（すなわち、個体の遺伝子型と外来化合物または薬物に対
するその個体の応答との間の関係についての研究）が、考慮され得る。治療剤の
代謝における差異は、薬理学的に活性な薬物の用量と血中濃度との間の関係を変
更することによって、重篤な毒性または治療の失敗を導き得る。従って、個体の
薬理ゲノム学は、個体の遺伝子型の考慮に基づく予防的または治療的処置のため
に有効な薬剤（例えば、薬物）の選択を許容する。このような薬理ゲノム学は、
さらに、適切な投薬量および治療剤レジメンを決定するために使用され得る。従
って、ＮＯＶＸタンパク質の活性、ＮＯＶＸ核酸の発現、あるいは個体における
ＮＯＶＸ遺伝子の変異含量が決定されて、それによって個体の治療的または予防
的処置のために適切な薬剤を選択し得る。
【０２７７】 薬理ゲノム学は、罹患された人おける変更された薬物の性質および異常な作用
に起因して、薬物に応答する臨床的に有意な遺伝性変更を扱う。例えば、Ｅｉｃ
ｈｅｌｂａｕｍ、１９９６、Ｃｌｉｎ Ｅｘｐ Ｐｈａｒｍａｃｏｌ Ｐｈｙｓ
ｉｏｌ，２３：９８３〜９８５およびＬｉｎｄｅｒ、１９９７、Ｃｌｉｎ Ｃｈ
ｅｍ，４３：２５４〜２６６を参照のこと。一般に、２つの型の薬理ゲノム学状
態が、区別され得る。薬物が身体に作用する方法を変更する１つの因子として伝
達される遺伝的状態（変更された薬物作用）、または身体が薬物に作用する方法
を変更する１つの因子として伝達される遺伝的状態（変更された薬物代謝）。こ
れらの薬理ゲノム学状態は、稀な欠損としてか、または多型としてのいずれかで
生じ得る。例えば、グルコース−６−リン酸デヒドロゲナーゼ（Ｇ６ＰＤ）欠損
は、一般的な遺伝性酵素病であり、この主な臨床的合併症は、酸化剤薬物（抗マ
ラリア剤、スルホンアミド、鎮痛薬、ニトロフラン）の摂取およびソラマメの消
費後の溶血である。
【０２７８】 例示的な実施形態として、薬物代謝酵素の活性は、薬物作用の強度および持続
期間の両方の主要な決定因子である。薬物代謝酵素（例えば、Ｎ−アセチルトラ
ンスフェラーゼ２（ＮＡＴ２）およびシトクロムＰ４５０酵素ＣＹＰ２Ｄ６およ
びＣＹＰ２Ｃ１９）の遺伝的多型の発見は、幾人かの患者が予期される薬物効果
を得ないか、または標準的かつ安全な用量の薬物を摂取した後に過大な薬物応答
および深刻な毒性を示すことに関しての説明を提供した。これらの多型は、集団
において２つの表現型（高い代謝能を持つ人（ｅｘｔｅｎｓｉｖｅ ｍｅｔａｂ
ｏｌｉｚｅｒ）（ＥＭ）および低い代謝能を持つ人（ｐｏｏｒ ｍｅｔａｂｏｌ
ｉｚｅｒ）（ＰＭ））で表現される。ＰＭの有病率は、異なる集団の間で異なる
。例えば、ＣＹＰ２Ｄ６をコードする遺伝子は高度に多型であり、そしていくら
かの変異がＰＭにおいて同定されており、この全ては機能的ＣＹＰ２Ｄ６の非存
在に至る。ＣＹＰ２Ｄ６およびＣＹＰ２Ｃ１９の低い代謝能を持つ人は、彼らが
標準的な用量を受ける場合に、かなり頻繁に過大な薬物応答および副作用を経験
する。代謝産物が活性な治療的部分である場合、そのＣＹＰ２Ｄ６形成代謝産物
であるモルヒネによって媒介されるコデインの鎮痛効果について実証されるよう
に、ＰＭは治療的応答を示さない。他の極端なものは、標準的な用量に応答しな
い、いわゆる超迅速な代謝能を持つ人である。最近、超迅速な代謝の基準となる
分子は、ＣＹＰ２Ｄ６遺伝子増幅に起因していることが同定されている。
【０２７９】 従って、ＮＯＶＸのタンパク質の活性、ＮＯＶＸの核酸の発現、あるいは個体
におけるＮＯＶＸの遺伝子の変異内容を決定して、それによって、その個体の治
療的または予防的処置のために適切な薬剤を選択し得る。さらに、薬理ゲノム学
の研究を使用して、個体の薬物応答性の表現型の同定に対して薬物代謝酵素をコ
ードする多型対立遺伝子の遺伝子型を適用し得る。この知見は、用量または薬物
選択に適用される場合、有害な反応または治療の失敗を回避し得、従って、被験
体をＮＯＶＸの調節因子（例えば、本明細書中に記載される例示的なスクリーニ
ングアッセイの１つによって同定される調節因子）を用いて処置する場合に治療
的または予防的効率を増強し得る。
【０２８０】 （臨床試験中の効果のモニタリング） ＮＯＶＸの発現または活性（例えば、異常な細胞増殖および／または分化を調
節する能力）に対する薬剤（例えば、薬物、化合物）の影響をモニタリングする
ことは、基本的な薬物スクリーニングおよび臨床試験に適用され得る。例えば、
本明細書中に記載されるようなスクリーニングアッセイによって決定される、Ｎ
ＯＶＸの遺伝子発現、タンパク質レベルを増加するため、またはＮＯＶＸ活性を
アップレギュレートする薬剤の効力は、減少したＮＯＶＸの遺伝子発現、タンパ
ク質レベル、またはダウンレギュレートしたＮＯＶＸの活性を示す被験体の臨床
試験においてモニターされ得る。あるいは、スクリーニングアッセイによって決
定される、ＮＯＶＸの遺伝子発現、タンパク質レベルを減少、またはＮＯＶＸの
活性をダウンレギュレートする薬剤の効力は、増加したＮＯＶＸの遺伝子発現、
タンパク質レベル、またはアップレギュレートしたＮＯＶＸの活性を示す被験体
の臨床試験においてモニターされ得る。このような臨床試験において、ＮＯＶＸ
の発現または活性、および好ましくは、例えば、増殖または神経障害に関与する
ような他の遺伝子が、「リードアウト（読み出し）（ｒｅａｄ ｏｕｔ）」、す
なわち、特定の細胞の応答性のマーカーとして使用され得る。
【０２８１】 例えば、ＮＯＶＸを含む遺伝子（これは、ＮＯＶＸ活性（例えば、本明細書中
に記載されるようなスクリーニングアッセイにおいて同定される）を調節する薬
剤（例えば、化合物、薬物または低分子）を用いる処置によって、細胞内で調節
される）が、同定され得る。従って、細胞性増殖障害に対する薬剤の効果を研究
するために、例えば、臨床試験において、細胞が単離され得、そしてＲＮＡが調
製され得、そしてＮＯＶＸおよびこの障害に関与する他の遺伝子の発現のレベル
について分析され得る。遺伝子発現のレベル（すなわち、遺伝子発現パターン）
は、本明細書中に記載されるように、ノーザンブロット分析もしくはＲＴ−ＰＣ
Ｒによるか、あるいは産生されるタンパク質の量を測定することによるか、本明
細書中に記載されるような方法の１つによるか、あるいはＮＯＶＸまたは他の遺
伝子の活性のレベルを測定することによって、定量され得る。この様式で、この
遺伝子発現パターンは、この薬剤に対する細胞の生理学的応答の指標であるマー
カーとして作用し得る。従って、この応答状態は、この薬剤を用いる個体の処置
の前、および処置の間の種々の時点で、決定され得る。
【０２８２】 １つの実施形態において、本発明は、薬剤（例えば、アゴニスト、アンタゴニ
スト、タンパク質、ペプチド、核酸、ペプチド模倣物、低分子、または本明細書
中に記載されるスクリーニングアッセイによって同定される他の薬物候補物）を
用いる、被験体の処置の効力をモニタリングするための方法を提供し、これは、
以下の工程を包含する：（ｉ）薬剤の投与の前に、被験体から投与前サンプルを
得る工程；（ｉｉ）この投与前サンプルにおいて、ＮＯＶＸのタンパク質、ｍＲ
ＮＡ、またはゲノムＤＮＡの発現のレベルを検出する工程；（ｉｉｉ）この被験
体から１つ以上の投与後サンプルを得る工程；（ｉｖ）この投与後サンプルにお
いて、ＮＯＶＸのタンパク質、ｍＲＮＡ、またはゲノムＤＮＡの発現または活性
のレベルを検出する工程；（ｖ）この投与前サンプルにおけるＮＯＶＸのタンパ
ク質、ｍＲＮＡ、またはゲノムＤＮＡの発現または活性のレベルを、この投与後
サンプルにおけるＮＯＶＸのタンパク質、ｍＲＮＡ、またはゲノムＤＮＡの発現
または活性のレベルと比較する工程；ならびに（ｖｉ）従って、この被験体に対
する薬剤の投与を変更する工程。例えば、この薬剤の増加した投与は、検出され
るよりも高いレベルにＮＯＶＸの発現または活性を増加することが（すなわち、
この薬剤の効力を増加すること）望ましくあり得る。あるいは、この薬剤の減少
した投与は、検出されるよりも低いレベルにＮＯＶＸの発現または活性を減少す
ることが（すなわち、この薬剤の効力を減少すること）望ましくあり得る。
【０２８３】 （処置方法） 本発明は、異常なＮＯＶＸの発現または活性に関連する障害の危険性のある（
または感受性）か、またはこの障害を有する被験体を処置する予防的および治療
的の両方の方法を提供する。異常なＮＯＶＸ発現に関連する障害には、例えば、
腎臓および膵臓の機能不全の障害（例えば、糖尿病、高血圧、肝硬変、および癌
）が挙げられる。これらの治療方法は、以下により詳細に記載される。
【０２８４】 （疾患および障害） （その疾患または障害に罹患していない被験体と比較して）増加したレベルま
たは生物学的活性によって特徴付けられる疾患および障害は、活性を拮抗する（
すなわち、低減または阻害する）治療剤を用いて処置され得る。活性を拮抗する
治療剤は、治療的または予防的な様式で、投与され得る。利用され得る治療剤と
しては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：（ｉ）上記ペプチド、ま
たはそのアナログ、誘導体、フラグメントもしくはホモログ；（ｉｉ）上記ペプ
チドに対する抗体；（ｉｉｉ）上記ペプチドをコードする核酸；（ｉｖ）相同組
換えによって上記ペプチドの内因性機能を「ノックアウトする」ために利用され
る、アンチセンス核酸および「機能不全性」である（すなわち、上記ペプチドに
対するコード配列のコード配列内の異種挿入に起因する）核酸の投与、（例えば
、Ｃａｐｅｃｃｈｉ、１９８９、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４４：１２８８〜１２９２
を参照のこと）；または（ｖ）上記ペプチドとその結合パートナーとの間の相互
作用を変化させる、調節因子（すなわち、インヒビター、アゴニストおよびアン
タゴニスト（本発明のさらなるペプチド模倣物または本発明のペプチドに対して
特異的な抗体を含む））。
【０２８５】 （その疾患または障害に罹患していない被験体と比較して）減少したレベルま
たは生物学的活性によって特徴付けられる疾患および障害は、活性を増加させる
（すなわち、活性に対するアゴニストである）治療剤を用いて処置され得る。活
性をアップレギュレートする治療剤は、治療的または予防的な様式で、投与され
得る。利用され得る治療剤としては、以下が挙げられるが、これらに限定されな
い：上記ペプチド、またはそのアナログ、誘導体、フラグメントもしくはホモロ
グ；あるいはバイオアベイラビリティーを増加させるアゴニスト。
【０２８６】 増加したレベルまたは減少したレベルは、ペプチドおよび／またはＲＮＡを定
量することによって、容易に検出され得る。この定量は、患者の組織サンプルを
（例えば、生検組織から）入手し、そしてそのサンプルを、その発現したペプチ
ド（または上記ペプチドのｍＲＮＡ）のＲＮＡレベルまたはペプチドレベル、構
造および／または活性をインビトロでアッセイすることによる。当該分野におい
て周知の方法としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：イムノア
ッセイ（例えば、ウェスタンブロット分析、ドデシル硫酸ナトリウム（ＳＤＳ）
ポリアクリルアミドゲル電気泳動が後に続く免疫沈降、免疫細胞化学などによる
）および／またはｍＲＮＡの発現を検出するためのハイブリダイゼーションアッ
セイ（例えば、ノーザンアッセイ、ドットブロット、インサイチュハイブリダイ
ゼーションなど）。
【０２８７】 （予防的方法） １つの局面において、本発明は、被験体において異常なＮＯＶＸの発現または
活性と関連する疾患または状態を、ＮＯＶＸの発現または少なくとも１つのＮＯ
ＶＸ活性を調節する薬剤をこの被験体に投与することによって予防するための方
法を提供する。異常なＮＯＶＸの発現または活性によって引き起こされるかまた
はこれらに起因する、疾患にかかる危険がある被験体は、例えば、本明細書中に
記載の診断アッセイまたは予後アッセイのいずれか、またはそれらの組み合わせ
によって、同定され得る。予防薬剤の投与は、疾患または障害が予防されるか、
あるいはその進行を遅らせられるように、このＮＯＶＸ異常の特徴である症状の
発現の前に行い得る。このＮＯＶＸ異常の型に依存して、例えば、ＮＯＶＸアゴ
ニスト薬剤またはＮＯＶＸアンタゴニスト薬剤が、その被験体を処置するために
使用され得る。その適切な薬剤は、本明細書中に記載のスクリーニングアッセイ
に基づいて決定され得る。本発明の予防方法は、以下の小区分において、さらに
議論される。
【０２８８】 （治療方法） 本発明の別の局面は、治療目的のためにＮＯＶＸの発現または活性を調節する
方法に関する。本発明の調節方法は、細胞を、その細胞に関するＮＯＶＸタンパ
ク質活性の活性のうちの１つ以上を調節する薬剤と接触させる工程を包含する。
ＮＯＶＸタンパク質活性を調節する薬剤は、核酸またはタンパク質、ＮＯＶＸタ
ンパク質の天然に存在する同族リガンド、ペプチド、ＮＯＶＸペプチド模倣物、
または他の低分子のような、本明細書中に記載されるような薬剤であり得る。１
つの実施形態において、この薬剤は、ＮＯＶＸタンパク質活性のうちの１つ以上
を刺激する。このような刺激薬剤の例としては、活性なＮＯＶＸタンパク質、お
よびその細胞に導入されたＮＯＶＸをコードする核酸分子が挙げられる。別の実
施形態において、この薬剤は、ＮＯＶＸタンパク質活性のうちの１つ以上を阻害
する。このような阻害薬剤の例としては、アンチセンスＮＯＶＸ核酸分子、およ
び抗ＮＯＶＸ抗体が挙げられる。これらの調節方法は、インビトロで（例えば、
その薬剤とともにその細胞を培養することによって）、あるいはインビボで（例
えば、被験体にその薬剤を投与することによって）実施され得る。このように、
本発明は、ＮＯＶＸのタンパク質または核酸分子の、異常な発現または異常な活
性によって特徴付けられる、疾患または障害に罹患した個体を処置する方法を提
供する。１つの実施形態において、この方法は、ＮＯＶＸの発現または活性を調
節する（例えば、アップレギュレートまたはダウンレギュレートする）薬剤（例
えば、本明細書中に記載のスクリーニングアッセイによって同定される薬剤）あ
るいはそのような薬剤の組み合わせを投与する工程を包含する。別の実施形態に
おいて、この方法は、ＮＯＶＸのタンパク質または核酸分子を、低減したかまた
は異常な、ＮＯＶＸの発現または活性を補償するための治療として、投与する工
程を包含する。
【０２８９】 ＮＯＶＸ活性の刺激は、ＮＯＶＸが異常にダウンレギュレートされている状況
、および／またはＮＯＶＸ活性の増加が有益な効果を有するようである状況にお
いて、望ましい。このような状況の１つの例は、被験体が、異常な細胞増殖およ
び／または細胞分化によって特徴付けられる障害（例えば、癌または免疫関連）
を有する場合である。このような状況の別の例は、被験体が免疫不全疾患（例え
ば、ＡＩＤＳ）を有する場合である。
【０２９０】 本発明の抗体（ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、ヒト化抗体、およ
び完全なヒト抗体を含む）は、治療剤として使用され得る。このような薬剤は、
一般的に、被験体における疾患および病理を処置または予防するために使用され
る。抗体調製物（好ましくは、その標的抗原について高い特異性および高い親和
性を有するもの）は、被験体に対して投与され、そして一般的に、その標的との
結合に起因して効果を有する。このような効果は、所定の抗体分子と問題の標的
抗原との間の相互作用の特異的性質に依存して、２つの種類のうちの１つであり
得る。第１の例では、抗体の投与は、標的とそれが天然に結合する内因性リガン
ドとの結合を抑止または阻害し得る。この場合、抗体は、標的に結合し、そして
天然に存在するリガンドの結合部位をマスクし、ここでそのリガンドは、エフェ
クター分子として働く。従って、レセプターは、シグナル伝達経路を媒介する。
そのリガンドは、シグナル伝達の原因である。
【０２９１】 あるいは、その効果は、標的分子上のエフェクター結合部位への結合によって
、抗体が生理学的結果を誘発するものであり得る。この場合、標的（存在し得な
いかまたは疾患もしくは病理を欠損し得る内因性リガンドを有するレセプター）
が、代理のエフェクターリガンドとして抗体を結合して、レセプターによって、
レセプターに基づくシグナル伝達事象を開始する。
【０２９２】 治療的に有効な量の本発明の抗体は、治療目的を達成するために必要とされる
量を一般的にいう。上記のように、これは、いくつかの場合において標的の機能
を妨害し、そして他の場合において生理学的応答を促進する、抗体とその標的抗
原の間の結合相互作用であり得る。投与されるために必要とされる量は、その特
異的抗原についての抗体の結合親和性にさらに依存し、そしてまた、その量は、
投与される抗体が、その抗体が投与される自由な体積の他の被験体から枯渇され
る速度に依存する。本発明の抗体または抗体フラグメントの治療的有効用量の一
般的な範囲は、非限定的な量として、約０．１ｍｇ／ｋｇ体重〜約５０ｍｇ／ｋ
ｇ体重である。一般的な投薬の頻度は、例えば、毎日２回〜１週間に１回の範囲
であり得る。
【０２９３】 （治療剤の生物学的効果の決定） 本発明の種々の実施形態において、適切なインビトロまたはインビボアッセイ
を行って、特定の治療剤の効果およびその投与が罹患組織の処置を示すか否かを
決定する。
【０２９４】 種々の特定の実施形態において、インビトロアッセイが患者の障害に関与する
代表的な細胞型で行われ、所定の治療剤がこの細胞型に対して所望の効果を発揮
するか否かを決定し得る。治療において使用する化合物は、ヒト被験体において
試験する前に適切な動物モデル系において試験され得る。これらの動物モデル系
としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：ラット、マウス、ニワ
トリ、ウシ、サル、ウサギなど。同様に、インビボ試験については、当該分野で
公知の任意の動物モデル系が、ヒト被験体に対する投与の前に使用され得る。
【０２９５】 本発明はさらに、以下の実施例において記載され、この実施例は、特許請求の
範囲において記載される本発明の範囲を限定しない。
【０２９６】 （実施例） （実施例１．：ＮＯＶ１−７核酸を同定する方法） 本発明のＮＯＶ１−７核酸配列を、本発明のＤＮＡ配列の、全長および／もし
くは部分に及ぶｃＤＮＡフラグメントの実験室でのクローニング、ならびに／ま
たは公開されているヒト配列データベースから、本発明のＤＮＡ配列の全長およ
び／もしくは部分をインシリコ（ｉｎ ｓｉｌｉｃｏ）予測することによって誘
導した。実験室でのクローニングを、以下のような方法によって行った：Ｓｅｑ
ＣａｌｌｉｎｇＴＭ、ＲＡＣＥ、エキソン連結、ＣｕｒａＳｅｌｅｃｔ。これら
の方法を、簡潔にまとめると以下のようになる。
【０２９７】 ＳｅｑＣａｌｌｉｎｇＴＭ：ｃＤＮＡを、種々のヒトサンプルより誘導する。
これらのサンプルは、異なるドナー由来の、複数の組織型、正常状態および疾患
状態、生理的状態、ならびに発生学的状態を表す。サンプルを、組織全体、初代
細胞または組織培養初代細胞または細胞株として得た。細胞および細胞株を、遺
伝子発現を調節する生物学的薬剤または化学的薬剤（例えば、増殖因子、ケモカ
イン、またはステロイド）で処理し得た。次いで、誘導されたｃＤＮＡを、Ｃｕ
ｒａＧｅｎ独自のＳｅｑＣａｌｌｉｎｇ技術を使用して配列決定した。全てのサ
ンプルからのｃＤＮＡ配列を、それらの自体および公開されたＥＳＴを用い、Ｃ
ｕｒａＧｅｎのＳｅｑＣａｌｌｉｎｇアセンブリのヒトＳｅｑＣａｌｌｉｎｇデ
ータベースを生成する為のバイオインフォマティックスプログラムを使用してア
センブルした。各アセンブリは、同一または異なったヒトサンプル由来の、１つ
以上の重複したｃＤＮＡ配列を含む。フラグメントおよびＥＳＴを、アセンブリ
に対する構成要素として含めるとき、別のアセンブリの構成要素とこれらとの重
複している範囲を、５０ｂｐを超えてものにおいて、９５％を最小値とした。各
アセンブリは、遺伝子および／またはこれの改変体（例えば、スプライス形態お
よび／または一塩基多型（ＳＮＰｓ）ならびにこれらの組合せ）を表し得る。
さらに、配列トレース（ｔｒａｃｅｓ）を、手動により評価し、そして適切な場
合は、修正のために編集した。
【０２９８】 ＲＡＣＥ：ｃＤＮＡ端の高速増幅（Ｒａｐｉｄ ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ
ｏｆ ｃＤＮＡ ｅｎｄｓ）（ＲＡＣＥ）のようなポリメラーゼ連鎖反応に基
づいた技術を、本発明のｃＤＮＡの推定配列を単離するか、または完成させるた
めに使用した。通常、複数のクローンを、ＳｅｑＣａｌｌｉｎｇプロセスと同様
にアセンブルされた配列を誘導するためのＳｅｑＣａｌｌｉｎｇの場合のように
、１つ以上のサンプルから配列決定した。さらに、配列トレースを、手動で評価
し、そして適切な場合は、修正のために編集した。
【０２９９】 エキソン連結：本配列をコードするｃＤＮＡを、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣ
Ｒ）により、以下のヒトｃＤＮＡのプールについて、クローニングした：副腎、
骨髄、脳−扁桃、脳−小脳、脳−海馬、脳−黒質、脳−視床、脳全体、胎児の脳
、胎児の腎臓、胎児の肝臓、胎児の肺、心臓、腎臓、リンパ腫（ｌｙｍｐｈｏｍ
ａ）−ラージ（Ｒａｊｉ）、乳腺、膵臓、下垂体、胎盤、前立腺、唾液腺、骨格
筋、小腸、脊髄、脾臓、胃、精巣、胸腺、気管、子宮。プライマーを、本発明の
ＤＮＡ／タンパク質配列の完全長また部分（１つ以上のエキソン）についてのイ
ンシリコ予測に基づいてか、または深く関連するヒト配列もしくは、他の種由来
の配列に対する予測されたエキソンの翻訳された相同性によって、設計した。通
常、複数のクローンを、ＳｅｑＣａｌｌｉｎｇプロセスと同様にアセンブルされ
た配列を誘導するためのＳｅｑＣａｌｌｉｎｇの場合のように、１つ以上のサン
プルから配列決定した。さらに、配列トレーを、手動で評価し、そして適切な場
合は、修正のために編集した。
【０３００】 改変体の配列はまた、本出願に含まれる。改変体の配列は、単一ヌクレオチド
（ＳＮＰ）多型を含み得る。ＳＮＰは、いくつかの例で、ＳＮＰを含むヌクレオ
チド配列が、ｃＤＮＡとして始まるということを意味する「ｃＳＮＰ」として呼
ばれる。ＳＮＰは、いくつかの方法で生じ得る。例えば、ＳＮＰは、多型部位に
おける、１つのヌクレオチドの別のヌクレオチドとの置換に起因する。このよう
な置換は、遷移 またはトランスバージョンのいずれかであり得る。ＳＮＰはま
た、参照対立遺伝子に対する、１ヌクレオチド欠失または１ヌクレオチド挿入に
より生じ得る。従って、この多型部位は、１つの対立遺伝子が別の対立遺伝子中
の特定のヌクレオチドに関してギャップを保持する部位である。遺伝子中に存在
するＳＮＰは、この遺伝子によってコードされているアミノ酸配列の改変を、Ｓ
ＮＰの位置で生じる。遺伝子内ＳＮＰはまた、ＳＮＰを含むコドンが遺伝子コー
ドの冗長性の結果として同一のアミノ酸をコードしている場合には、サイレント
であり得る。遺伝子領域外、または遺伝子内だがイントロン中に存在するＳＮＰ
は、タンパク質のアミノ酸配列のいずれにおいても変化を生じないが、発現パタ
ーンの改変された調節（例えば、一時的な発現、生理学的応答調節、細胞型発現
調節、発現強度、転写メッセージの安定性における改変）を生じ得る。
【０３０１】 例えば、ゲノムクローンＡＣ０６８３８５を、アセチルグルコサミニルトラン
スフェラーゼ（Ａｃｅｔｙｌｇｌｕｃｏｓａｍｉｎｙｌｔｒａｎｓｆｅｒａｓｅ
）および／またはアセチルグルコサミニルトランスフェラーゼファミリーのメン
バーについてのＣｕｒａＧｅｎ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎの配列ファイルを使用
し、ＧｅｎＢａｎｋにより利用可能であるかまたはＨｕｍａｎ Ｇｅｎｏｍｅ
Ｐｒｏｊｅｃｔ Ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ Ｃｅｎｔｅｒｓから得られる、日々作
製されるゲノムファイルに対して実行したＴＢＬＡＳＴＮによって、第１１染色
体上で同定した。これらのゲノムクローンをエキソン予測プログラムＧｅｎｓｃ
ａｎおよびＧｒａｉｌならびに他の分析プログラム（すなわち、ＢＬＡＳＴＮ、
ＴＢＬＡＳＴＮ、ＴＦＡＳＴＮ、ＴＦＡＳＴＡ、ＢＬＡＳＴＸ）によって分析し
、アミノ酸鎖へ翻訳される場合に、目的のオリジナルの、タンパク質またはタン
パク質ファミリーに対する類似性が維持される推定エキソン（すなわち推定コー
ド配列）に対応する領域を同定した。いくつかのさらなるゲノム領域をまた、本
発明に包含されるものとして同定し得た。これは、ＳｅｑＣａｌｌｉｎｇアセン
ブリ（ＳｅｑＣａｌｌｉｎｇは、発現量全体が低い遺伝子の差次的発現を含む差
次的発現されたフラグメントを同定するＣｕｒａＧｅｎ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏ
ｎ’ｓ独自技術である）および／またはこれらの領域にマップされたＥＳＴなら
びにこれらのアセンブリおよび／またはＥＳＴをまた、相同性またエキソン予測
によって定義された領域と重ね合わされたからか、または、このアセンブリおよ
び／またはＥＳＴの配置が、相同性または本発明に含まれるエキソン予測により
定義されたゲノム領域の近傍内に存在するからである。
【０３０２】 このようにして同定された配列を、手動で結び付け、次いでまたＣｕｒａＧｅ
ｎのＳｅｑＣａｌｌｉｎｇを使用し、アセンブリ配列および／または公開され利
用可能であるＥＳＴ配列から取得した１つ以上のさらなる配列を使用することに
より伸長した。ＳｅｑＣａｌｌｉｎｇアセンブリ配列を、予測配列を使用して、
ＣｕｒａＧｅｎのＳｅｑＣａｌｌｉｎｇデータベースに対してＢＬＡＳＴＮサー
チすることにより同定した。この予測配列に対して１００％同一な領域を有して
いたＳｅｑＣａｌｌｉｎｇアセンブリ配列を、さらなる分析のために選択した。
これは、この同一性が、選択されたクローンとして、同一のゲノムの位置由来で
あることを示すからである。ＳｅｑＣａｌｌｉｎｇアセンブリである、ｓ３ａｑ
：１３９７５８４３１；ｓ３ａｑ：１３４０７１４９９およびｓ３ａｑ：１０５
３３１０８６を、適切に有意な類似度を有しているとして同定した。ＳｅｑＣａ
ｌｌｉｎｇアセンブリｓ３ａｑ：１３９７５８４３１は、２３７つの構成要素を
有しており；ｓ３ａｑ：１３４０７１４９９は、１８つの構成要素を有しており
；ｓ３ａｑ：１０５３３１０８６は、３つの構成要素を有している。
【０３０３】 以下の供給源からの配列は、本明細書中で同定された新規配列に到達したもの
として含まれる：ＡＣ０６８３８５、ｓ３ａｑ：１３９７５８４３１、ｓ３ａｑ
：１３４０７１４９９、およびｓ３ａｑ：１０５３３１０８６。
【０３０４】 新規のアセチルグルコサミニルトランスフェラーゼ様遺伝子または、次いで誘
導されたこのスプライス形態のうちの１つについての、ＤＮＡ配列およびタンパ
ク質配列を、本明細書中でＮＯＶ７（ＣｕｒａＧｅｎ登録番号ＳＣ２０６９２３
６９）として示した。
【０３０５】 （実施例２．種々の細胞および組織におけるＮＯＶ７の定量発現分析） 様々なクローンの定量発現分析を、様々な正常細胞および病理学的に誘導され
た細胞、細胞株、ならびに組織由来のＲＮＡサンプルを含むマイクロタイタープ
レートを使用して評価した。これには、リアルタイム定量ＰＣＲ（ＲＴＱ ＰＣ
Ｒ；ＴＡＱＭＡＮ（登録商標））を使用した。ＲＴＱ ＰＣＲを、Ｐｅｒｋｉｎ
−Ｅｌｍｅｒ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ ＡＢＩ ＰＲＩＳＭ（登録商標） ７７
００配列検出システムに基づいて実施した。サンプルの様々な収集物をプレート
上にアセンブルし、そしてこれをパネル１（正常な供給源および癌である供給源
からの細胞および細胞株を含む）およびパネル３（様々な癌である供給源に由来
するサンプルを含む）と呼ぶ。
【０３０６】 第１に、ＲＮＡサンプルをアクチンおよびＧＡＰＤＨのような構成的に発現し
ている遺伝子に対して正規化した。ＲＮＡ（合計約５０ｎｇまたは約１ｎｇポリ
Ａ＋）を、ＴＡＱＭＡＮ（登録商標）Ｒｅｖｅｒｓｅ Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉ
ｏｎ Ｒｅａｇｅｎｔｓ Ｋｉｔ（ＰＥ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ，Ｆｏｓｔｅｒ
Ｃｉｔｙ，ＣＡ；カタログ番号Ｎ８０８−０２３４）および製造者のプロトコ
ールに従ったランダムな６量体を使用してｃＤＮＡに変換した。反応を、２０μ
ｌで実施し、そして３０分間４８℃でインキュベートした。次いで、ｃＤＮＡ（
５μｌ）を、製造業者のプロトコールに従って、βアクチンおよびＧＡＰＤＨ
ＴＡＱＭＡＮ（登録商標）Ａｓｓａｙ Ｒｅａｇｅｎｔｓ（ＰＥ Ｂｉｏｓｙｓ
ｔｅｍｓ；カタログ番号は、それぞれ、４３１０８８１Ｅおよび４３１０８８４
Ｅである）およびＴＡＱＭＡＮ（登録商標）ｕｎｉｖｅｒｓａｌ ＰＣＲ Ｍａ
ｓｔｅｒ Ｍｉｘ（ＰＥ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ；カタログ番号４３０４４４７
）を使用するＴＡＱＭＡＮ（登録商標）反応のために、分離プレートに移した。
反応を、以下のパラメータを使用して２５μｌで実施した：５０℃で２分；９５
℃で１０分；９５℃で１５秒／６０℃で１分（４０サイクル）。結果を、対数ス
ケールを使用するＣＴ値（所与のサンプルが、蛍光の閾値レベル超えるサイクル
）として記録し、所与のサンプルと最も低いＣＴ値を有するサンプルとの間のＲ
ＮＡ濃度の差は、２のΔＣＴ乗として示した。次いで、相対発現パーセントを、
このＲＮＡの差の逆数をとって１００を掛けることにより得る。βアクチンおよ
びＧＡＰＤＨについて得られたＣＴの平均値は、ＲＮＡサンプルを正規化するた
めに使用した。最も高いＣＴ値を生じるＲＮＡサンプルは、さらなる希釈を必要
としないが、他の全てのサンプルは、β−アクチン／ＧＡＰＤＨの平均ＣＴ値に
従ってこのサンプルと比較して希釈した。
【０３０７】 正規化ＲＮＡ（５μｌ）を、ｃＤＮＡに転換し、製造者の指示に従って、Ｏｎ
ｅ Ｓｔｅｐ ＲＴ−ＰＣＲ Ｍａｓｔｅｒ Ｍｉｘ Ｒｅａｇｅｎｔｓ（ＰＥ
Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ；カタログ番号４３０９１６９）および遺伝子特異的プ
ライマーを使用するＴＡＱＭＡＮ（登録商標）によって分析した。プローブおよ
びプライマーを、インプットとして標的配列を使用する、Ｐｅｒｋｉｎ Ｅｌｍ
ｅｒ ＢｉｏｓｙｓｔｅｍのＰｒｉｍｅｒ Ｅｘｐｒｅｓｓ Ｓｏｆｔｗａｒｅ
パッケージ（Ａｐｐｌｅ ＣｏｍｐｕｔｅｒのＭａｃｉｎｔｏｓｈ Ｐｏｗｅｒ
ＰＣ用のヴァージョンＩ）または他のアルゴリズムに従って、各アッセイに対
して設定した。デフォルトの設定を、反応条件に対して使用し、そして以下のパ
ラメータを、プライマーを選択する前に設定した：プライマーの濃度＝２５０ｎ
Ｍ、プライマーの融点（Ｔｍ）範囲＝５８℃〜６０℃、プライマーの最適Ｔｍ＝
５９℃、プライマーの最大差＝２℃、プローブは、５’Ｇを有さず、プローブＴ ｍ は、プライマーＴｍよりも１０℃高くなければならず、アンプリコンサイズは
７５ｂｐ〜１００ｂｐであり。選択されるプローブおよびプライマー（以下を参
照のこと）は、Ｓｙｎｔｈｅｇｅｎ（Ｈｏｕｓｔｏｎ，ＴＸ，ＵＳＡ）によって
合成された。プローブを、未反応の色素を除去するために２回ＨＰＬＣ精製し、
プローブのそれぞれ５’末端および３’末端へのレポーター色素およびクエンチ
ャー色素のカップリングを立証するために、マススペクトルによって評価した。
正方向プライマーおよび逆方向プライマーの最終濃度は、各々９００ｎＭであり
、そしてプローブの濃度は、２００ｎＭであった。
【０３０８】 ＰＣＲ条件：各組織および各細胞株由来の正規化ＲＮＡを、９６ウェルＰＣＲ
プレート（Ｐｅｒｋｉｎ Ｅｌｍｅｒ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）の各ウェルにス
ポットした。２つのプローブ（標的特異的プローブおよび標的プローブで多重化
された別の遺伝子特異的プローブ）を含むＰＣＲカクテルを、ＰＥ Ｂｉｏｓｙ
ｓｔｅｍｓ ７７００の１×ＴａｑＭａｎＴＭＰＣＲ Ｍａｓｔｅｒ Ｍｉｘ（
５ｍＭのＭｇＣｌ２、ｄＮＴＰ（ｄＡ、Ｇ、Ｃ、Ｕ（１：１：１：２の比））、
０．２５Ｕ／ｍｌ ＡｍｐｌｉＴａｑ ＧｏｌｄＴＭ（ＰＥ Ｂｉｏｓｙｓｔｅ
ｍｓ）、および０．４Ｕ／μｌのＲＮａｓｅインヒビター、および０．２５Ｕ／
μｌの逆転写酵素を含む）を用いて設定した。逆転写を、４８℃で３０分間実施
し、次いで以下の増幅／ＰＣＲサイクルを実施した：９５℃で１０分、次いで９
０℃で１５秒間、６０℃で１分間を４０サイクル。
【０３０９】 パネル１の結果について、以下の略記が使用される。
【０３１０】 ｃａ．＝癌、 ＊＝転移から樹立された、 ｍｅｔ＝転移、 ｓ ｃｅｌｌ ｖａｒ＝小細胞変異体、 ｎｏｎ−ｓ＝ｎｏｎ−ｓｍ＝非小、 ｓｑｕａｍ＝扁平上皮（ｓｑｕａｍｏｕｓ）、 ｐｌ．ｅｆｆ＝ｐｌ ｅｆｆｕｓｉｏｎ＝滲出、 ｇｌｉｏ＝グリア細胞、 ａｓｔｒｏ＝星状細胞、および ｎｅｕｒｏ＝中枢神経系。
【０３１１】 クローン２０６９２３６９を研究するために使用したプライマー−プローブセ
ットは、Ａｇ７９５であり、これは表２８に示され、パネル１についてのＴａｑ
Ｍａｎ分析の結果は、表２９に示される。
【０３１２】 表２８．プライマー−プローブセット（Ａｇ７９５）
【０３１３】
【表２８】 表２９．パネル１の細胞におけるクローン２０６９２３６９の実時間発現分析
【０３１４】
【表２９】 表２９の結果は、クローン２０６９２３６９がいくつかの大腸癌サンプルにお
いては高度に発現されるが、正常な結腸直腸においては全く発現されないことを
示している。このクローンはまた、肺の小細胞癌サンプル、肝臓癌サンプルにお
いて差次的に高度に発現され、特定の他の癌サンプルにおいて中度に発現される
。このクローンはまた、これらの癌組織に関連しない特定の正常組織においても
発現される。
【０３１５】 パネル３についての結果を表３０に示す。
【０３１６】 表３０．パネル３の細胞におけるクローン２０６９２３６９の実時間発現分析
【０３１７】
【表３０】 表３０に示す結果は、いくつかの肺癌組織、大腸癌組織および胃癌組織が、ク
ローン２０６９２３６９の高度な発現を示すという表２９からの結果を確証し、
かつ伸展する。
【０３１８】 表２９および表３０の結果は、種々の癌のためのプローブとしてのクローン２
０６９２３６９の使用、および特異的抗体のための潜在的な治療標的としてのそ
の遺伝子産物の使用、このような癌を処置する際の使用を確立する。
【０３１９】 （実施例３．種々の細胞および組織におけるＮＯＶ７の遺伝子発現の連続分析
） 遺伝子発現の連続分析（ＳＡＧＥ）は、ＳＡＧＥタグ、一般に約２０のヌクレ
オチドの下で、メッセンジャーＲＮＡの特定の位置に生じる短いポリヌクレオチ
ド配列、を使用する。ＳＡＧＥタグを使用して、対応する転写物および転写され
た遺伝子を同定し得る。ＳＡＧＥ分析は、腫瘍細胞株由来のライブラリーから相
補的なデオキシリボ核酸（ｃＤＮＡ）を供給することから始まる。ｃＤＮＡをプ
ライマー部位と連結し得る。次いで、例えば、ＤＮＡを増幅するために適切なプ
ライマーを使用して、配列タグを作製する。ｃＤＮＡライブラリー間のこれらの
タグの差異を測定することによって、腫瘍細胞株において異常発現される配列を
同定し得る。図２に示すように、ＳＡＧＥをＮＯＶ７核酸について行った。
【０３２０】 （実施例４．クローン２８８０４２７９．０．７の成熟形態の分子クローニン
グ） オリゴヌクレオチドプライマーを、表６に記載されるタンパク質配列（配列番
号６）の３７〜９４残基からの２８８０４２７９．０．７タンパク質の成熟形態
をコードするＤＮＡセグメントを増幅するために設計した。順方向プライマーは
、インフレームＢａｍＨＩ制限部位を含み、逆方向プライマーはインフレームＸ
ｈｏＩ制限部位を含む。このプライマーの配列は、以下である： ２８８０４２７９．０．７順方向： ＧＧＡＴＣＣＧＡＧＧＡＣＴＣＴＧＧＴＴＧＧＴＧＴＧＧＧＣＣＴＧＴＧＴＧＣ
（配列番号５７）、 ２８８０４２７９．０．７逆方向： ＣＴＣＧＡＧＧＡＣＡＴＣＴＴＧＣＡＡＡＣＣＣＴＧＴＧＣＴＧＴＧＡＴＧＧ（
配列番号５８）。
【０３２１】 ＰＣＲ反応を、５０μｌのサンプル容量で、５ｎｇのヒト胎児腎臓ｃＤＮＡテ
ンプレート、各々１μＭの、２８８０４２７９．０．７順方向プライマーおよび
２８８０４２７９．０．７逆方向プライマー、５μＭのｄＮＴＰ（Ｃｌｏｎｔｅ
ｃｈ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ ＣＡ）ならびに１μｌ
の５０×Ａｄｖａｎｔａｇｅ−ＨＦ ２ポリメラーゼ（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ Ｌａ
ｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ）を使用して、設定した。以下の反応条件を、使用した：
ａ）９６℃ ３分 ｂ）９６℃ ３０秒変性 ｃ）７０℃ ３０秒、プライマーアニーリング。この温度を、徐々に、１℃／サ
イクル単位で減少した。 ｄ）７２℃ １分伸長 ｂ〜ｄを１０回繰り返す ｅ）９６℃ ３０秒変性 ｆ）６０℃ ３０秒アニーリング ｇ）７２℃ １分伸長 ｅ〜ｇを２５回繰り返す ｈ）７２℃ ５分最終伸長 約１６０ｂｐの予測サイズを有する単一増幅産物を、アガロースゲル電気泳動
によって検出した。この産物を、２０μｌの最終容積においてＱｕｉａＸ（ＱＬ
ＡＧＥＮ Ｉｎｃ，Ｖａｌｅｎｃｉａ ＣＡ）によって単離した。
【０３２２】 単離した産物を、ｐＣＲ２．１ベクター（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｃａｒｌｓ
ｂａｄ，ＣＡ）に連結し、そして配列決定した。ヌクレオチド配列を、表６に示
される配列（配列番号６）のクローン２８８０４２７９．０．７の１３８〜２５
７塩基に対応する部分に１００％相同であると決定した。この構築物をｐＣＲ２
．１−２８８０４２７９．０．７−Ｓ３７１−２Ｂと呼ぶ。
【０３２３】 （実施例５．２０６９２３６９＿ＥＸＴの成熟形態の分子クローニング） オリゴヌクレオチドプライマーを、２０６９２３６９＿ＥＸＴ（表２３；配列
番号１４）の細胞外部分をコードするＤＮＡセグメントを増幅するために、設計
した。順方向プライマーは、インフレームＢｇ１Ｉ制限部位を含み、逆方向プラ
イマーは、インフレームＸｈｏＩ制限部位を含む。このプライマーの配列は、以
下である： ２０６９２３６９ ＭＡＴ−ＦＯＲＷ： ＡＧＡＴＣＴＣＧＧＧＡＧＧＣＴＧＣＧＧＡＧＡＧＣＣＧＣＣＧＣＣＣＴＣＧＡ
ＣＧ（配列番号５９）、 ２０６９２３６９ ＲＥＶ： ＣＴＣＧＡＧＧＣＣＴＣＧＧＧＣＡＧＧＧＣＴＣＴＧＧＧＧＣＴＧＣＴＧＣＡＧ
Ｇ（配列番号６０）。
【０３２４】 ＰＣＲ反応を、５０μｌの容量で、３０の成熟組織に対応する５ｎｇのヒトｃ
ＤＮＡテンプレートの混合物、各々１μＭの、２８８０４２７９．０．７ＭＡＴ
−ＦＯＲＷプライマーおよび２８８０４２７９．０．７ＲＥＶプライマー、５μ
ＭのｄＮＴＰ（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，Ｐａｌｏ Ａｌ
ｔｏ ＣＡ）ならびに１μｌの５０×Ａｄｖａｎｔａｇｅ−ＨＦ ２ポリメラー
ゼ（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ）を使用して、設定した。以
下の反応条件を、使用した： ａ）９６℃ ３分 ｂ）９６℃ ３０秒変性 ｃ）７０℃ ３０秒、プライマーアニーリング。この温度を、徐々に、１℃／サ
イクル単位で減少した。 ｄ）７２℃ ３分伸長 ｂ〜ｄを１０回繰り返す ｅ）９６℃ ３０秒変性 ｆ）６０℃ ３０秒アニーリング ｇ）７２℃ ３分伸長 ｅ〜ｇを２５回繰り返す ｈ）７２℃ １０分最終伸長 約２ｋｂｐの予測サイズを有する単一増幅産物を、アガロースゲル電気泳動に
よって検出した。この産物を、２０μｌの最終容積においてＱｕｉａＸ（ＱＬＡ
ＧＥＮ Ｉｎｃ，Ｖａｌｅｎｃｉａ ＣＡ）によって単離した。
【０３２５】 単離した産物を、ｐＣＲ２．１ベクター（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｃａｒｌｓ
ｂａｄ，ＣＡ）に連結して、ｐＣＲ２．１−２０６９２３６９−Ｓ９２９−２Ｃ
と呼ばれる構築物を提供した。これを、以下の配列決定プライマーを用いて、配
列決定した：
【０３２６】
【化１】 得られた配列は、挿入物が、２０６９２３６９＿ＥＸＴの変異体をコードする
ＯＲＦであることを示す。ＤＮＡ挿入物の５’末端は、予測ＤＮＡ配列と異なっ
た（以下を参照のこと）。この理由は、順方向プライマー（２０６９２３６９
ＭＡＴ−ＦＯＲＷ；配列番号５９）がインフレームでないからであった。２０６
９２３６９＿ＥＸＴのクローン化した変異体を発現するのを可能にするために、
インフレームの５’プライマーを設計した。このプライマーの配列を、以下に示
す。
【０３２７】 ２０６９２３６９−Ｓ９２９＿２Ｃ−ＦＯＲＷ：ＡＧＡＴＣＴＡＡＣＣＧＣＴ
ＣＣＧＡＣＴＧＣＧＧＣＣＣＧＣＡＧＣ（配列番号７１）。
【０３２８】 ＰＣＲ反応を、５０μｌの容量で、テンプレートとしてｐＣＲ２．１−２０６
９２３６９−Ｓ９２９−２Ｃ ＤＮＡ、各々１μＭの、２０６９２３６９−Ｓ９
２９＿２Ｃ−ＦＯＲＷプライマー（配列番号７１）および２０６９２３６９ Ｒ
ＥＶプライマー（配列番号６０）、５μＭのｄＮＴＰ（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ Ｌａ
ｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ ＣＡ）ならびに１μｌの５０×Ａ
ｄｖａｎｔａｇｅ−ＨＦ ２ポリメラーゼ（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ Ｌａｂｏｒａｔ
ｏｒｉｅｓ）を使用して、設定した。以下の反応条件を、使用した： ａ）９６℃ ３分 ｂ）９６℃ ３０秒変性 ｃ）６０℃ ３０秒、アニーリング ｄ）７２℃ ３分伸長 （ｂ、ｃおよびｄを１５回繰り返す） ｅ）７２℃ １０分伸長 単離したＰＣＲ産物を、ｐＣＲ２．１ベクターに連結して、ｐＣＲ２．１−２
０６９２３６９＿ＥＸＴ−Ａ９８＿１０Ａと呼ばれる構築物を提供し、そして配
列決定した。得られた配列を、表３１（配列番号７２）に示し、そしてこの配列
は、挿入物が２０６９２３６９＿ＥＸＴの変異体をコードすることを確証する。
【０３２９】 表３１．ｐＣＲ２．１−２０６９２３６９＿ＥＸＴ−Ａ９８＿１０Ａにおける
クローン化された挿入物のＤＮＡ配列
【０３３０】
【表３１】 挿入ｐＣＲ２．１−２０６９２３６９＿ＥＸＴ−Ａ９８＿１０Ａによってコー
ドされるポリペプチドのアミノ酸配列を、表３２に示す（配列番号７３）。
【０３３１】 表３２
【０３３２】
【表３２】 クローン１０３１２９４７．０．４０によってコードされるアセチルグルコサ
ミン転移酵素様タンパク質とＳＣ２０６９２３６９ｅｘｔとｐＣＲ２．１−２０
６９２３６９＿ＥＸＴ−Ａ９８＿１０Ａとの間の関係を、以下に示すＣｌｕｓｔ
ａＩＷアルゴリズムを用いて調製される配列において示す。
【０３３３】
【化２】 ここで、＊は同一性を示し、：は強い類似性を示し、そして．は弱い類似性を示
す。
【０３３４】 （他の実施形態） 本発明は、その詳細な説明とともに記載されてきたが、前述の説明は例示であ
って、本発明の範囲を限定することを意図するのではない。本発明の範囲は、添
付の特許請求の範囲の範囲により規定される。他の局面、利点および改変は、下
記の特許請求の範囲の範囲内にある。
【図面の簡単な説明】
【図１】 図１は、正常組織および細胞系ならびに疾患組織および細胞系におけるＮＯＶ
７核酸を測定する、定量的遺伝子発現分析の結果を示す。
【図２】 図２は、多くの腫瘍細胞系誘導ライブラリーにおけるＮＯＶ７核酸の、遺伝子
発現プロフィール分析を示す。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 ＦＩ テーマコート゛(参考） Ａ６１Ｋ 39/395 Ａ６１Ｐ 1/04 ４Ｂ０６５ 1/16 ４Ｃ０８４ 48/00 1/18 ４Ｃ０８５ Ａ６１Ｐ 1/04 3/00 ４Ｃ０８６ 1/16 3/10 ４Ｈ０４５ 1/18 3/14 3/00 5/00 3/10 9/00 3/14 11/06 5/00 11/16 9/00 13/12 11/06 15/00 11/16 21/00 13/12 25/00 15/00 25/04 21/00 25/08 25/00 25/14 25/04 25/16 25/08 25/18 25/14 25/22 25/16 25/28 25/18 25/30 25/22 27/02 25/28 27/16 25/30 35/00 27/02 35/02 27/16 37/02 35/00 37/06 35/02 37/08 37/02 43/00 １０１ 37/06 Ｃ０７Ｋ 14/47 37/08 16/18 43/00 １０１ 16/40 Ｃ０７Ｋ 14/47 Ｃ１２Ｎ 1/15 16/18 1/19 16/40 1/21 Ｃ１２Ｎ 1/15 9/10 1/19 Ｃ１２Ｑ 1/02 1/21 1/48 5/10 1/68 Ａ 9/10 Ｇ０１Ｎ 33/15 Ｚ Ｃ１２Ｑ 1/02 33/50 Ｚ 1/48 33/53 Ｄ 1/68 Ｍ Ｇ０１Ｎ 33/15 33/566 33/50 33/577 Ｂ 33/53 Ｃ１２Ｐ 21/08 Ｃ１２Ｎ 15/00 ＺＮＡＡ 33/566 5/00 Ａ 33/577 Ａ６１Ｋ 37/02 // Ｃ１２Ｐ 21/08 37/52 (31)優先権主張番号 ６０／２４０，３１６ (32)優先日 平成12年10月13日(2000．10．13) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ０９／７８３，４３６ (32)優先日 平成13年２月14日(2001．2．14) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (81)指定国 ＥＰ(ＡＴ，ＢＥ，ＣＨ，ＣＹ， ＤＥ，ＤＫ，ＥＳ，ＦＩ，ＦＲ，ＧＢ，ＧＲ，ＩＥ，Ｉ Ｔ，ＬＵ，ＭＣ，ＮＬ，ＰＴ，ＳＥ，ＴＲ)，ＯＡ(ＢＦ ，ＢＪ，ＣＦ，ＣＧ，ＣＩ，ＣＭ，ＧＡ，ＧＮ，ＧＷ， ＭＬ，ＭＲ，ＮＥ，ＳＮ，ＴＤ，ＴＧ)，ＡＰ(ＧＨ，Ｇ Ｍ，ＫＥ，ＬＳ，ＭＷ，ＭＺ，ＳＤ，ＳＬ，ＳＺ，ＴＺ ，ＵＧ，ＺＷ)，ＥＡ(ＡＭ，ＡＺ，ＢＹ，ＫＧ，ＫＺ， ＭＤ，ＲＵ，ＴＪ，ＴＭ)，ＡＥ，ＡＧ，ＡＬ，ＡＭ， ＡＴ，ＡＵ，ＡＺ，ＢＡ，ＢＢ，ＢＧ，ＢＲ，ＢＹ，Ｂ Ｚ，ＣＡ，ＣＨ，ＣＮ，ＣＲ，ＣＵ，ＣＺ，ＤＥ，ＤＫ ，ＤＭ，ＤＺ，ＥＥ，ＥＳ，ＦＩ，ＧＢ，ＧＤ，ＧＥ， ＧＨ，ＧＭ，ＨＲ，ＨＵ，ＩＤ，ＩＬ，ＩＮ，ＩＳ，Ｊ Ｐ，ＫＥ，ＫＧ，ＫＰ，ＫＲ，ＫＺ，ＬＣ，ＬＫ，ＬＲ ，ＬＳ，ＬＴ，ＬＵ，ＬＶ，ＭＡ，ＭＤ，ＭＧ，ＭＫ， ＭＮ，ＭＷ，ＭＸ，ＭＺ，ＮＯ，ＮＺ，ＰＬ，ＰＴ，Ｒ Ｏ，ＲＵ，ＳＤ，ＳＥ，ＳＧ，ＳＩ，ＳＫ，ＳＬ，ＴＪ ，ＴＭ，ＴＲ，ＴＴ，ＴＺ，ＵＡ，ＵＧ，ＵＳ，ＵＺ， ＶＮ，ＹＵ，ＺＡ，ＺＷ (72)発明者 シムケッツ， リチャード エイ． アメリカ合衆国 コネチカット 06516， ウエスト ヘイブン， リート ストリ ート 191 (72)発明者 ラステリ， ルカ アメリカ合衆国 コネチカット 06437， グイルフォード， ペッパーブッシュ レーン 52 (72)発明者 バーゲス， キャサリン イー． アメリカ合衆国 コネチカット 06109， ウェザーズフィールド， キャリッジ ヒル ドライブ 90 (72)発明者 タウピール， レイモンド ジェイ． ジ ュニア アメリカ合衆国 コネチカット 06512， イースト ヘイブン， ホルムズ スト リート 47 Ｆターム(参考） 2G045 AA25 AA40 BA13 BB03 BB20 CA25 CA26 CB01 CB17 CB21 DA12 DA13 DA14 DA36 DA77 FB02 FB03 FB04 FB05 FB06 FB07 HA16 4B024 AA01 AA11 BA10 BA31 CA04 CA09 DA02 DA06 EA02 EA04 GA11 GA18 GA19 HA03 HA14 4B050 CC01 CC03 DD11 LL01 LL03 4B063 QA01 QA18 QQ20 QQ42 QR32 QR38 QR55 QR77 QR82 QS25 QS34 QS39 QX01 QX07 4B064 AG27 CA10 CA19 CC24 DA01 4B065 AA26X AA90X AA93Y AB01 AC14 BA01 CA24 CA27 CA44 4C084 AA01 AA02 AA06 AA07 BA01 BA22 CA53 DC25 ZA022 ZA062 ZA082 ZA162 ZA182 ZA222 ZA332 ZA362 ZA592 ZA602 ZA662 ZA752 ZA812 ZA942 ZB072 ZB082 ZB132 ZB262 ZB272 ZC032 ZC212 ZC352 ZC392 4C085 AA13 AA14 BB11 BB22 DD63 DD88 4C086 AA01 AA03 AA04 EA16 MA01 MA04 NA14 ZA02 ZA06 ZA08 ZA16 ZA18 ZA22 ZA33 ZA36 ZA59 ZA60 ZA66 ZA75 ZA81 ZA94 ZB07 ZB08 ZB13 ZB26 ZB27 ZC03 ZC21 ZC35 ZC39 4H045 AA10 AA11 AA30 BA10 CA40 DA75 DA76 DA86 DA89 EA20 FA72 FA74

Claims (43)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項１】 単離されたポリペプチドであって、以下： ａ）配列番号２、４、６、８、１０、１２、もしくは１４からなる群より選択
    されるアミノ酸配列の成熟形態； ｂ）配列番号２、４、６、８、１０、１２、もしくは１４からなる群より選択
    されるアミノ酸配列の成熟形態の改変体であって、ここで、該成熟形態中の任意
    のアミノ酸が異なるアミノ酸に改変され、ただし、該成熟形態の配列中の１５％
    以下のアミノ残基がそのように改変される、改変体； ｃ）配列番号２、４、６、８、１０、１２、もしくは１４からなる群より選択
    されるアミノ酸配列； ｄ）配列番号２、４、６、８、１０、１２、もしくは１４からなる群より選択
    されるアミノ酸配列の改変体であって、ここで該選択された配列中で特定される
    任意のアミノ酸が異なるアミノ酸に改変され、ただし、該配列中の１５％以下の
    アミノ酸残基がそのように改変される、改変体；および ｅ）ａ）〜ｄ）のいずれかのフラグメント からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、ポリペプチド。
  2. 【請求項２】 請求項１に記載のポリペプチドであって、該ポリペプチドが
    、配列番号２、４、６、８、１０、１２、もしくは１４からなる群より選択され
    る配列の天然に存在する対立遺伝子改変体である、ポリペプチド。
  3. 【請求項３】 請求項２に記載のポリペプチドであって、ここで、前記改変
    体が単一ヌクレオチド多型の翻訳である、ポリペプチド。
  4. 【請求項４】 請求項１に記載のポリペプチドであって、該ポリペプチドが
    本明細書中に記載の改変体ポリペプチドであり、ここで、前記選択された配列中
    で特定される任意のアミノ酸が保存的置換を提供するように改変される、ポリペ
    プチド。
  5. 【請求項５】 単離された核酸分子であって、該核酸分子が、以下： ａ）配列番号２、４、６、８、１０、１２、もしくは１４に提供されるアミノ
    酸配列の成熟形態； ｂ）配列番号２、４、６、８、１０、１２、もしくは１４からなる群より選択
    されるアミノ酸配列の成熟形態の改変体であって、ここで、該選択された配列の
    該成熟形態中の任意のアミノ酸が異なるアミノ酸に改変され、ただし、該成熟形
    態の配列中の１５％以下のアミノ残基がそのように改変される、改変体； ｃ）配列番号２、４、６、８、１０、１２、もしくは１４からなる群より選択
    されるアミノ酸配列； ｄ）配列番号２、４、６、８、１０、１２、もしくは１４からなる群より選択
    されるアミノ酸配列の改変体であって、該選択された配列中で特定される任意の
    アミノ酸が異なるアミノ酸に改変され、ただし、該配列中の１５％以下のアミノ
    酸残基がそのように改変される、改変体； ｅ）配列番号２、４、６、８、１０、１２、もしくは１４からなる群より選択
    されるアミノ酸配列を含むポリペプチドまたは該ポリペプチドの任意の改変体の
    、少なくとも一部をコードする核酸フラグメントであって、ここで、該選択され
    た配列の任意のアミノ酸が異なるアミノ酸に改変され、ただし、該配列中の１０
    ％以下のアミノ酸残基がそのように変化される、核酸フラグメント；および ｆ）該核酸分子のいずれかの相補体 からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸配
    列を含む、核酸分子。
  6. 【請求項６】 請求項５に記載の核酸分子であって、ここで、該核酸分子が
    天然に存在する対立遺伝子核酸改変体のヌクレオチド配列を含む、核酸分子。
  7. 【請求項７】 改変体ポリペプチドをコードする請求項５に記載の核酸分子
    であって、ここで、該改変体ポリペプチドが天然に存在するポリペプチド改変体
    のポリペプチド配列を有する、核酸分子。
  8. 【請求項８】 請求項５に記載の核酸分子であって、ここで、該核酸分子が
    前記改変体ポリペプチドをコードする単一ヌクレオチド多型を含む、核酸分子。
  9. 【請求項９】 請求項５に記載の核酸分子であって、ここで、該核酸分子が
    以下： ａ）配列番号１、３、５、７、９、１１、もしくは１３からなる群より選択さ
    れるヌクレオチド配列； ｂ）ヌクレオチド配列であって、ここで、配列番号１、３、５、７、９、１１
    、もしくは１３からなる群より選択されるヌクレオチド配列中の１つ以上のヌク
    レオチドが、該選択された配列からなる群より選択されるヌクレオチドから異な
    るヌクレオチドに改変され、ただし、１５％以下のヌクレオチドがそのように改
    変される、ヌクレオチド配列； ｃ）配列番号１、３、５、７、９、１１、もしくは１３からなる群より選択さ
    れる配列の核酸フラグメント；および ｄ）核酸フラグメントであって、ここで、配列番号１、３、５、７、９、１１
    、もしくは１３からなる群より選択されるヌクレオチド配列中の１つ以上のヌク
    レオチドが、該選択された配列からなる群より選択されるヌクレオチドから異な
    るヌクレオチドに改変され、ただし、１５％以下のヌクレオチドがそのように改
    変される、核酸フラグメント； からなる群より選択されるヌクレオチド配列を含む、核酸分子。
  10. 【請求項１０】 請求項５に記載の核酸分子であって、ここで、該核酸分子
    が、配列番号１、３、５、７、９、１１、もしくは１３からなる群より選択され
    るヌクレオチド配列または該ヌクレオチド配列の相補体にストリンジェントな条
    件下でハイブリダイズする、核酸分子。
  11. 【請求項１１】 請求項５に記載の核酸分子であって、ここで、該核酸分子
    が、以下：前記選択されたヌクレオチド配列のコード配列において特定される任
    意のヌクレオチドが、該選択された配列からなる群より選択されるヌクレオチド
    から異なるヌクレオチドに改変され、ただし、該選択されたコード配列中の１５
    ％以下のヌクレオチドがそのように変化されるヌクレオチド配列、第１のポリヌ
    クレオチドに相補的な単離された第２のポリヌクレオチドまたはそれらの任意の
    フラグメント を含む、核酸分子。
  12. 【請求項１２】 請求項１１に記載の核酸分子を含む、ベクター。
  13. 【請求項１３】 前記核酸分子に作動可能に連結されたプロモーターをさら
    に含む、請求項１２に記載のベクター。
  14. 【請求項１４】 請求項１２に記載のベクターを含む、細胞。
  15. 【請求項１５】 請求項１に記載のポリペプチドに免疫特異的に結合する、
    抗体。
  16. 【請求項１６】 前記抗体がモノクローナル抗体である、請求項１５に記載
    の抗体。
  17. 【請求項１７】 前記抗体がヒト化抗体である、請求項１５に記載の抗体。
  18. 【請求項１８】 サンプル中の請求項１に記載のポリペプチドの存在または
    量を測定するための方法であって、該方法は、以下： （ａ）該サンプルを提供する工程； （ｂ）該サンプルを該ポリペプチドに免疫特異的に結合する抗体に導入する工
    程；および （ｃ）該ポリペプチドに結合する抗体の存在または量を測定する工程であり、 それによって該サンプル中のポリペプチドの存在または量を測定する工程 を包含する、方法。
  19. 【請求項１９】 サンプル中の請求項５に記載の核酸分子の存在または量を
    測定するための方法であって、該方法は、以下： （ａ）該サンプルを提供する工程； （ｂ）該サンプルを該核酸分子に結合するプローブに導入する工程；および （ｃ）該核酸分子に結合する該プローブの存在または量を測定する工程であり
    、 それによって該サンプル中の該核酸分子の存在または量を測定する工程 を包含する、方法。
  20. 【請求項２０】 請求項１に記載のポリペプチドに結合する因子を同定する
    方法であって、該方法は、以下： （ａ）該ポリペプチドを該因子に導入する工程；および （ｂ）該因子が該ポリペプチドに結合するか否かを測定する工程 を包含する、方法。
  21. 【請求項２１】 病態の処置における使用のための潜在的な治療因子を同定
    するための方法であって、ここで、該病態は、請求項１に記載のポリペプチドの
    異常な発現または異常な生理学的相互作用に関連し、該方法が、以下： （ａ）請求項１に記載のポリペプチドを発現しかつ該ポリペプチドに起因する
    特性または機能を有する細胞を提供する工程； （ｂ）該細胞を、候補物質を含有する組成物と接触させる工程；および （ｃ）該物質が該ポリペプチドに起因し得る該性質または該機能を改変するか
    否かを測定する工程であり、 これによって、該物質の存在中に観察された改変が、該細胞を、該物質を欠く
    組成物と接触させた際に観察されない場合、該物質が潜在的な治療因子として同
    定される、工程 を包含する、方法。
  22. 【請求項２２】 請求項１に記載のポリペプチドの活性を調節するための方
    法であって、該方法が、該請求項に記載のポリペプチドを発現する細胞サンプル
    を、該ポリペプチドの活性を調節するに十分な量で該ポリペプチドに結合する化
    合物と共に導入する工程を包含する、方法。
  23. 【請求項２３】 請求項１に記載のポリペプチドと関連する病態を処置また
    は予防する方法であって、該方法が、そのような処置または予防が所望される被
    験体に、該被験体の該病態を処置または予防するに十分な量で請求項１に記載の
    ポリペプチドを投与する工程を包含する、方法。
  24. 【請求項２４】 前記被験体がヒトである、請求項２３に記載の方法。
  25. 【請求項２５】 請求項１に記載のポリペプチドと関連する病態を処置また
    は予防する方法であって、該方法が、そのような処置または予防が所望される被
    験体に、該被験体の該病態を処置または予防するに十分な量でＮＯＶＸ核酸を投
    与する工程を包含する、方法。
  26. 【請求項２６】 前記被験体がヒトである、請求項２５に記載の方法。
  27. 【請求項２７】 請求項１に記載のポリペプチドと関連する病態を処置また
    は予防する方法であって、該方法が、そのような処置または予防が所望される被
    験体に、該被験体の該病態を処置または予防するに十分な量でＮＯＶＸ抗体を投
    与する工程を包含する、方法。
  28. 【請求項２８】 前記被験体がヒトである、請求項２７に記載の方法。
  29. 【請求項２９】 請求項１に記載のポリペプチドおよび薬学的に受容可能な
    キャリアを含有する、薬学的組成物。
  30. 【請求項３０】 請求項５に記載の核酸分子および薬学的に受容可能なキャ
    リアを含有する、薬学的組成物。
  31. 【請求項３１】 請求項１５に記載の抗体および薬学的に受容可能なキャリ
    アを含有する、薬学的組成物。
  32. 【請求項３２】 請求項２９に記載の薬学的組成物を１つ以上の容器に含む
    、キット。
  33. 【請求項３３】 請求項３０に記載の薬学的組成物を１つ以上の容器に含む
    、キット。
  34. 【請求項３４】 請求項３１に記載の薬学的組成物を１つ以上の容器に含む
    、キット。
  35. 【請求項３５】 ヒトの疾患と関連する症候群を処置するための医薬品の製
    造における治療剤の使用であって、該疾患が請求項１に記載のポリペプチドと関
    連する病態から選択され、ここで、該治療剤が請求項１に記載のポリペプチドで
    ある、使用。
  36. 【請求項３６】 ヒトの疾患と関連する症候群を処置するための医薬品の製
    造における治療剤の使用であって、該疾患が請求項１に記載のポリペプチドと関
    連する病態から選択され、ここで、該治療剤がＮＯＶＸ核酸である、使用。
  37. 【請求項３７】 ヒトの疾患と関連する症候群を処置するための医薬品の製
    造における治療剤の使用であって、該疾患が請求項１に記載のポリペプチドと関
    連する病態から選択され、ここで、該治療剤がＮＯＶＸ抗体である、使用。
  38. 【請求項３８】 請求項１に記載のポリペプチドと関連する病態に対する活
    性もしくは潜伏のモジュレーターまたは該病態の性質をスクリーニングするため
    の方法であって、該方法が、以下： ａ）請求項１に記載のポリペプチドと関連する病態に対する増加した危険性の
    ある試験動物に試験化合物を投与する工程であって、ここで、該試験動物は請求
    項１に記載のポリペプチドを組み換え発現する、工程； ｂ）工程（ａ）の該化合物を投与する工程の後に該試験動物中の該ポリペプチ
    ドの活性を測定する工程；および ｃ）該試験動物における該タンパク質の活性を、該ポリペプチドが投与されて
    いないコントロール動物における該ポリペプチドの活性と比較する工程であって
    、ここで、該コントロール動物と比較した該試験動物中の該ポリペプチドの活性
    における変化は、該試験化合物が請求項１に記載のポリペプチドと関連する病態
    の潜伏のモジュレーターまたは該病態の性質であることを示す、工程 を包含する、方法。
  39. 【請求項３９】 請求項３８に記載の方法であって、ここで、前記試験動物
    が、野生型試験動物と比較して増加したレベルで、試験タンパク質導入遺伝子を
    発現するかまたはプロモーターの制御下で該導入遺伝子を発現する、組換え試験
    動物であり、ここで、該プロモーターは、該導入遺伝子のネイティブな遺伝子プ
    ロモーターではない、方法。
  40. 【請求項４０】 第１の哺乳動物被験体における請求項１に記載のポリペプ
    チドの変化したレベルと関連する疾患の存在または該疾患の性質を決定するため
    の方法であって、該方法が、以下： ａ）該第１の哺乳動物被験体由来のサンプル中の該ポリペプチドの発現レベル
    を測定する工程；および ｂ）工程（ａ）の該サンプル中の該ポリペプチドの量を、該疾患を有さないこ
    とが既知であるかまたは該疾患にかかりにくいことが既知の、第２の哺乳動物被
    験体由来のコントロールサンプル中に存在する該ポリペプチドの量と比較する工
    程であって、 ここで、該コントロールサンプルと比較した場合の該第１の被験体における該
    ペプチドの発現レベルにおける変化が、該疾患の存在または該疾患の性質を示す
    、工程 を包含する、方法。
  41. 【請求項４１】 第１の哺乳動物被験体における請求項５に記載の核酸分子
    の変化したレベルと関連する疾患の存在または該疾患の性質を決定するための方
    法であって、該方法が、以下： ａ）該第１の哺乳動物被験体由来のサンプル中の該核酸の量を測定する工程；
    および ｂ）工程（ａ）の該サンプル中の該核酸の量を、該疾患を有さないことが既知
    であるかまたは該疾患にかかりにくいことが既知の、第２の哺乳動物被験体由来
    のコントロールサンプル中に存在する該核酸の量と比較する工程であって、 ここで、該コントロールサンプルと比較した場合の該第１の被験体における該
    核酸のレベルにおける変化が、該疾患の存在または該疾患の性質を示す、工程 を包含する、方法。
  42. 【請求項４２】 哺乳動物において病理学的状態を処置する方法であって、
    該方法が、該病理状態を緩和するに十分な量でポリペプチドを該哺乳動物に投与
    する工程を包含し、ここで、該ポリペプチドが、配列番号２、４、６、８、１０
    、１２、もしくは１４からなる群より選択されるアミノ酸配列またはそれらの生
    物学的に活性なフラグメントを含むポリペプチドに少なくとも９５％同一なアミ
    ノ酸配列を有するポリペプチドである、方法。
  43. 【請求項４３】 哺乳動物の病理学的状態を処置する方法であって、該方法
    が、該病理学的状態を緩和するに十分な量で請求項１５に記載の抗体を該哺乳動
    物に投与する工程を包含する、方法。
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