JP2003083967A - Biologically related substance fixed gel and biologically related substance fixed gel chip having the gel held thereto - Google Patents

Biologically related substance fixed gel and biologically related substance fixed gel chip having the gel held thereto

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JP2003083967A
JP2003083967A JP2001275251A JP2001275251A JP2003083967A JP 2003083967 A JP2003083967 A JP 2003083967A JP 2001275251 A JP2001275251 A JP 2001275251A JP 2001275251 A JP2001275251 A JP 2001275251A JP 2003083967 A JP2003083967 A JP 2003083967A
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JP
Japan
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gel
related substance
bio
immobilized
biologically related
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JP2001275251A
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Japanese (ja)
Inventor
Chiaki Nagahama
千秋 長浜
Chiho Ito
千穂 伊藤
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Mitsubishi Rayon Co Ltd
Original Assignee
Mitsubishi Rayon Co Ltd
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Publication date
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Abstract

PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a gel composition accelerating the diffusion speed of a biologically related substance being a specimen without lowering the concentration of a gel and easy to form a hybrid, a biologically related substance fixed gel based on the gel composition and a biologically related substance fixed gel chip having the gel held thereto. SOLUTION: The biologically related substance fixed gel is prepared by fixing the biologically related substance within an aqueous gel containing 3-20 wt.% of an acrylamide type polymer and 0.1-10 wt.% of a polymeric polyhydric alcohol. The biologically related substance fixed gel chip wherein the gel is held to a plurality of sections is also disclosed.

Description

【発明の詳細な説明】Detailed Description of the Invention

【0001】[0001]

【発明の属する技術分野】本発明は、高分子多価アルコ
ールを含む生体関連物質固定化ゲル及びそれを用いた生
体関連物質固定化ゲルチップに関する。該チップは、遺
伝子発現解析等に使用される。
TECHNICAL FIELD The present invention relates to a bio-related substance-immobilized gel containing a high molecular weight polyhydric alcohol and a bio-related substance-immobilized gel chip using the same. The chip is used for gene expression analysis and the like.

【0002】[0002]

【従来の技術】近年、各種生物におけるゲノムプロジェ
クトが進められており、ヒト遺伝子をはじめとして、多
数の遺伝子とその塩基配列が急速に明らかにされつつあ
る。配列の明らかにされた遺伝子の機能については、各
種の方法で調べることができる。その有力な方法の一つ
として、明らかにされた塩基配列情報を利用した遺伝子
発現解析が知られている。例えば、ノーザンハイブリダ
イゼーションに代表されるような、各種の核酸:核酸間
ハイブリダイゼーション反応や各種のPCR反応を利用
した方法が開発され、当該方法により各種遺伝子とその
生体機能発現との関係を調べることができる。これらの
方法では適用し得る遺伝子の数に制限があるが、今日の
ゲノムプロジェクトを通して明らかにされつつあるよう
な、一個体レベルという極めて多数の遺伝子の総合的・
系統的解析を行うために、多数遺伝子の一括発現解析を
可能とするDNAマイクロアレイ法(DNAチップ法)
と呼ばれる新しい分析法、ないし方法論が開発されてき
た。
2. Description of the Related Art In recent years, genome projects in various organisms have been under way, and many genes including human genes and their nucleotide sequences are rapidly being clarified. The function of the gene whose sequence has been elucidated can be examined by various methods. As one of the effective methods, gene expression analysis using the revealed nucleotide sequence information is known. For example, a method utilizing various nucleic acid: nucleic acid hybridization reactions and various PCR reactions represented by Northern hybridization has been developed, and the relationship between various genes and their biological function expression is investigated by the method. You can Although there is a limit to the number of genes that can be applied by these methods, the comprehensive number of genes at the single-individual level, which is being clarified through today's genome projects,
DNA microarray method (DNA chip method) that enables batch expression analysis of multiple genes for systematic analysis
A new analytical method, or methodology, has been developed.

【0003】DNAマイクロアレイとしては、リソグラ
フィー技術を応用して区画化された多数のセル上にDN
A合成を行ったもの(Science 251 767
−773)、基盤上に溝又は穴で区画を形成し、該区画
の内壁にプローブを固定化したもの(特開平11−10
8928号、特開2000−78998号)、チップ上
に固定するプローブ量を多くするために、アクリルアミ
ド等のゲルにプローブを固定したマイクロアレイ(US
P 5,770,721、特開2000−60554
号)等、多数の形状物が知られている。本発明者らの一
部は、先に新規なマイクロアレイ及びその製造法を開発
した(特開2000−270878号、特開2000−
270879号)。該発明は、核酸固定化ゲルを保持す
る核酸固定化ゲル保持繊維配列体を作製し、この配列体
を配列体の繊維軸と交差する方向に切断することにより
薄片を得るものである。この薄片は固定化核酸二次元高
密度配列体、すなわちDNAマイクロアレイとして使用
される。
As a DNA microarray, DN is formed on a large number of compartmentalized cells by applying lithography technology.
A synthesized (Science 251 767
-773), a partition is formed on the base by grooves or holes, and a probe is fixed to the inner wall of the partition (Japanese Patent Laid-Open No. 11-10).
8928, JP-A-2000-78998), in order to increase the amount of probe immobilized on the chip, a microarray in which the probe is immobilized on a gel such as acrylamide (US
P 5,770,721, Japanese Patent Laid-Open No. 2000-60554.
No.) and many other shapes are known. Some of the present inventors previously developed a novel microarray and a method for manufacturing the same (Japanese Patent Laid-Open Nos. 2000-270878 and 2000-
270879). According to the invention, a thin piece is obtained by producing a nucleic acid-immobilized gel-holding fiber array holding a nucleic acid-immobilized gel and cutting the array in a direction intersecting the fiber axis of the array. This thin piece is used as an immobilized nucleic acid two-dimensional high-density array, that is, a DNA microarray.

【0004】[0004]

【発明が解決しようとする課題】アクリルアミド等のゲ
ルにプローブを固定したマイクロアレイは、無孔の基盤
上にプローブを固定化するものに比べ、固定の場が3次
元となるため小面積で多くのプローブが保持できる。し
かし、マイクロアレイに作用させる検体となる生体関連
物質はゲル内に拡散し、ゲル内部でハイブリッドを形成
する必要があり、したがって、検体の検出速度は拡散律
速となり、高分子量の検体ほど拡散速度が遅くなるため
に、検出に時間がかかるという問題があった。
A microarray in which probes are immobilized on a gel such as acrylamide has a three-dimensional immobilization field as compared with an array in which the probes are immobilized on a non-porous substrate, and therefore has a large area in a small area. Can hold the probe. However, the bio-related substance that acts as a sample to act on the microarray needs to diffuse into the gel and form a hybrid inside the gel. Therefore, the detection rate of the sample is diffusion-controlled, and the diffusion rate is slower for higher molecular weight samples. Therefore, there is a problem in that it takes time to detect.

【0005】このため、ゲルを利用した生体関連物質固
定化チップでは、より高分子量の検体のゲル中への拡散
速度を上げ、ハイブリッドの形成速度を速め、検出速度
を上げることが求められていた。この問題を解消する手
段として、ゲル濃度が下げる方法が考えられるが、ゲル
濃度を下げすぎるとゲルが柔らかくなり、アクリルアミ
ド濃度4%以下では、ゲルを形成し難い。一方、電気泳
動ゲルの分野では、生体関連物質、例えば、蛋白質、D
NA等の移動速度を速めるために、特開平8−1522
2号のようにアクリルアミド以外のモノマーが提案され
ているが、ゲル強度、重合速度等からアクリルアミドゲ
ルに匹敵する媒体は開発されていない。
Therefore, in the case of a bio-related substance-immobilized chip using a gel, it has been required to increase the diffusion rate of a higher molecular weight sample into the gel, accelerate the hybrid formation rate, and increase the detection rate. . As a means for solving this problem, a method of lowering the gel concentration can be considered, but if the gel concentration is too low, the gel becomes soft, and if the acrylamide concentration is 4% or less, it is difficult to form a gel. On the other hand, in the field of electrophoresis gel, biological substances such as proteins and D
To increase the moving speed of NA, etc., Japanese Patent Laid-Open No. 8-15222
Although monomers other than acrylamide have been proposed, such as No. 2, a medium comparable to acrylamide gel has not been developed because of its gel strength, polymerization rate, and the like.

【0006】本発明は、ゲル濃度を下げることなく、検
体である生体関連物質が拡散速度を速め、ハイブリッド
を形成しやすいゲル組成、並びにこの組成に基づく生体
関連物質固定化ゲル及び該ゲルが保持された生体関連物
質固定化ゲルチップを提供することを目的とする。
According to the present invention, a gel composition in which a bio-related substance as a sample accelerates the diffusion rate and easily forms a hybrid without lowering the gel concentration, and a bio-related substance-immobilized gel based on this composition and the gel are retained by the gel. An object of the present invention is to provide a biochip-immobilized gel chip.

【0007】[0007]

【課題を解決するための手段】本発明者らは上記課題を
解決するために鋭意検討した結果、特定量のアクリルア
ミド系ポリマー及び高分子多価アルコールを含むゲルに
生体関連物質が保持された生体関連物質固定化ゲルが、
従来のゲルと比較して格段に検体である生体関連物質の
拡散速度を速め、ゲル内でのハイブリッド形成速度を向
上させ得ることを見出し、本発明に至った。
Means for Solving the Problems As a result of intensive studies for solving the above-mentioned problems, the present inventors have found that a biological substance in which a biological substance is held in a gel containing a specific amount of an acrylamide polymer and a high molecular weight polyhydric alcohol. Related substance-immobilized gel
The present inventors have found that the diffusion rate of a biologically-relevant substance as a sample can be markedly increased as compared with a conventional gel, and the hybridization rate in the gel can be improved, and the present invention has been completed.

【0008】すなわち、本発明は、アクリルアミド系ポ
リマー3〜20重量%及び高分子多価アルコール0.1
〜10重量%を含む水性ゲル中に生体関連物質が固定化
された生体関連物質固定化ゲル、である。高分子多価ア
ルコールとしては、下記一般式(1)〜(3)で表され
る化合物からなる群から選ばれる少なくとも1種が挙げ
られる。 一般式(1) OH−[CHCHO−]nH (式中、nは10以上の整数である) 一般式(2) OH−[CH(CH)CH3O−]nH (式中、nは10以上の整数である) 一般式(3) ROCHCHORCHOR (式中、Rは[−CHCHCHO]nHを示し、ここでnは5以上の整数 である) 高分子多価アルコールの分子量は、通常、1,000〜
1,000,000の範囲である。また、生体関連物質
としては、核酸が挙げられる。
That is, the present invention uses 3 to 20% by weight of an acrylamide polymer and 0.1 of a high molecular weight polyhydric alcohol.
A bio-related substance-immobilized gel in which a bio-related substance is immobilized in an aqueous gel containing 10% by weight. Examples of the high molecular weight polyhydric alcohol include at least one selected from the group consisting of compounds represented by the following general formulas (1) to (3). Formula (1) OH- [CH 2 CH 2 O-] nH ( wherein, n is an integer of 10 or more) Formula (2) OH- [CH 2 ( CH) CH 3 O-] nH ( Formula In the formula, n is an integer of 10 or more. General formula (3) ROCH 2 CHORCH 2 OR (In the formula, R represents [-CH 2 CHCH 3 O] nH, and n is an integer of 5 or more) The molecular weight of the high molecular weight polyhydric alcohol is usually 1,000 to
It is in the range of 1,000,000. In addition, examples of the biological substance include nucleic acids.

【0009】さらに、本発明は、上記生体関連物質固定
化ゲルが複数の区画に保持された生体関連物質固定化ゲ
ルチップ、である。複数の区画の、各区画の面積は、通
常、10−6以下である。これら区画は、例えば、
溝又は貫通孔により形成され、貫通孔を形成するものと
しては、中空繊維を挙げることができる。
Further, the present invention is a bio-related substance-immobilized gel chip in which the bio-related substance-immobilized gel is held in a plurality of compartments. The area of each of the plurality of sections is usually 10 −6 m 2 or less. These compartments are, for example,
Hollow fibers can be used as the material for forming the through holes, which are formed by grooves or through holes.

【0010】[0010]

【発明の実施の形態】本発明の生体関連物質固定化用ゲ
ルは、アクリルアミド系ポリマー3〜20重量%、好ま
しくは4〜15重量%及び高分子多価アルコール0.1
〜10重量%、好ましくは1〜10重量%を含む水性ゲ
ルである。
BEST MODE FOR CARRYING OUT THE INVENTION The gel for immobilizing a biological substance of the present invention comprises 3 to 20% by weight, preferably 4 to 15% by weight, of an acrylamide polymer and 0.1% of a polyhydric alcohol.
An aqueous gel containing 10 to 10% by weight, preferably 1 to 10% by weight.

【0011】アクリルアミド系ポリマーは、(メタ)ア
クリルアミド及びN―置換(メタ)アクリルアミドの少
なくとも1種類の単量体と架橋剤からなる共重合体であ
るの。単量体としては、例えば、アクリルアミド、メタ
クリルアミド、N.N―ジメチルアクリルアミド、N―
イソプロピルアクリルアミド、N,N―ジエチルアクリ
ルアミド等が挙げられる。架橋剤は、これら単量体と共
重合可能なものであれば特に限定されない。例えば、電
気泳動ゲルなどで一般的に用いられるメチレンビスアク
リルアミド、ビスアクリルアミドメチルエーテル、(ポ
リ)エチレングリコールジ(メタ)アクリレート等が挙
げられる。架橋剤の使用量は、単量体に対して1〜10
重量%が好ましい。
The acrylamide polymer is a copolymer composed of at least one monomer of (meth) acrylamide and N-substituted (meth) acrylamide and a crosslinking agent. Examples of the monomer include acrylamide, methacrylamide, N.I. N-dimethylacrylamide, N-
Examples include isopropyl acrylamide and N, N-diethyl acrylamide. The crosslinking agent is not particularly limited as long as it is copolymerizable with these monomers. For example, methylene bis acrylamide, bis acrylamide methyl ether, (poly) ethylene glycol di (meth) acrylate and the like which are generally used in electrophoresis gel and the like can be mentioned. The amount of the crosslinking agent used is 1 to 10 with respect to the monomer.
Weight percent is preferred.

【0012】高分子多価アルコールは、前記一般式
(1)〜(3)で表される複数のOH基をもつ化合物で
ある。例えば、ポリエチレングリコール、ポリプロピレ
ングリコール、ポリビニルアルコール、ヒドロキシメチ
ルセルロース等が挙げられる。これら高分子多価アルコ
ールの分子量は1,000〜1,000,000、好ま
しくは、5,000〜100,000である。
The high molecular weight polyhydric alcohol is a compound having a plurality of OH groups represented by the above general formulas (1) to (3). Examples thereof include polyethylene glycol, polypropylene glycol, polyvinyl alcohol, hydroxymethyl cellulose and the like. The molecular weight of these high molecular weight polyhydric alcohols is 1,000 to 1,000,000, preferably 5,000 to 100,000.

【0013】上記ゲルに固定化する対象となる生体関連
物質としては、デオキシリボ核酸(DNA)やリボ核酸
(RNA)が挙げられる。本発明に用いる生体関連物質
は、市販品又は生細胞等から得られた生体関連物質何れ
でもよい。
Examples of the bio-related substance to be immobilized on the gel include deoxyribonucleic acid (DNA) and ribonucleic acid (RNA). The bio-related substance used in the present invention may be either a commercial product or a bio-related substance obtained from living cells or the like.

【0014】例えば、生体関連物質として核酸を用いる
場合には、生細胞からのDNA又はRNAの調製は、公
知の方法、例えばDNAの抽出については、Blinら
の方法(Nucleic Acids Res.3.2
303(1976))等により、また、RNAの抽出に
ついては、Favaloroらの方法(Method
s.Enzymol.65.718(1980))等に
より行うことができる。更には、鎖状若しくは環状のプ
ラスミドDNA又は染色体DNAが用いられる。これら
のDNAは、制限酵素若しくは化学的に切断したDNA
断片、試験管内で酵素等により合成されたDNA、又は
化学合成したオリゴヌクレオチド等を用いることもでき
る。
For example, when a nucleic acid is used as the biological substance, a known method for preparing DNA or RNA from living cells, for example, for the extraction of DNA, the method of Blin et al. (Nucleic Acids Res. 3.2) is used.
303 (1976)) and for the extraction of RNA, the method of Favaroro et al. (Method).
s. Enzymol. 65.718 (1980)) and the like. Furthermore, linear or circular plasmid DNA or chromosomal DNA is used. These DNAs are DNAs cut with restriction enzymes or chemically.
It is also possible to use fragments, DNA synthesized by an enzyme or the like in a test tube, or chemically synthesized oligonucleotides.

【0015】本発明では、生体関連物質をそのままゲル
に固定化してもよく、また、生体関連物質に化学的修飾
を施した誘導体や、必要に応じて変成させた生体関連物
質を固定化してもよい。生体関連物質のゲルへの固定化
には、ゲルに物理的に包括する方法や、ゲル構成成分へ
の直接的な結合を利用してもよく、生体関連物質を一旦
高分子体や無機粒子などの担体に共有結合あるいは非共
有結合により結合させ、その担体をゲルに固定化しても
よい。例えば、生体関連物質の末端基にビニル基を導入
し、アクリルアミド等のゲルの構成成分と共重合させる
ことができる(WO98/39351)。
In the present invention, the bio-related substance may be directly immobilized on the gel, or a derivative obtained by chemically modifying the bio-related substance, or a bio-related substance modified as necessary may be immobilized. Good. For immobilizing the bio-related substance on the gel, a method of physically encapsulating in the gel or a direct binding to the gel component may be used. The carrier may be bound to the carrier by covalent bond or non-covalent bond, and the carrier may be immobilized on the gel. For example, it is possible to introduce a vinyl group into the terminal group of a biological substance and copolymerize it with a gel component such as acrylamide (WO98 / 39351).

【0016】このようにして作成された生体関連物質固
定化ゲルは、例えば、USP 5,770,721、特
開2000−60554号、特開2000−27087
8号、特開2000−270879号等に記載のDNA
マイクロアレイのプローブを保持するゲルとして使用で
きる。
The bio-related substance-immobilized gel thus prepared is, for example, USP 5,770,721, JP 2000-60554 A, JP 2000-27087 A.
No. 8, DNA described in JP 2000-270879 A, etc.
It can be used as a gel for holding microarray probes.

【0017】例えば、生体関連物質固定化ゲルチップに
おいて、該ゲルを保持する基盤としては、平滑面を有す
る基盤、複数の溝を有する基盤、複数の貫通穴を有する
基盤等が使用できる。例えば、複数の溝又は貫通穴を有
する基盤を用いる場合は、溝又は貫通穴によって形成さ
れた区画に、重合前又は重合開始直後の生体関連物質固
定化ゲルモノマー溶液を添加し区画内でゲル化を実施す
ることにより生体関連物質固定化ゲルチップが作成でき
る。複数の貫通穴を有する基盤としては、中空繊維の配
列体を繊維軸と交差する方向にスライスしたものが例示
される(特願平11−93044号)。各区画に保持さ
れる生体関連物質の種類は、各々異なっていてもよい
し、グループ化されていてもよい。また、位置決めの指
標として、生体関連物質の変わりに例えば、色素が保持
されたゲルを区画に保持することも可能である。また、
複数の区画の各区画の面積は、通常10−6以下で
ある。下限は生体関連物質の検出が可能である限り特に
制限されない。
For example, in a gel chip on which a biological substance is immobilized, a substrate having a smooth surface, a substrate having a plurality of grooves, a substrate having a plurality of through holes, etc. can be used as a substrate for holding the gel. For example, when a substrate having a plurality of grooves or through holes is used, the bio-related substance-immobilized gel monomer solution before or immediately after the initiation of polymerization is added to the section formed by the grooves or the through holes to gel within the section. By carrying out the above, a gel chip on which a biological substance is immobilized can be prepared. An example of the substrate having a plurality of through holes is a hollow fiber array body sliced in a direction intersecting the fiber axis (Japanese Patent Application No. 11-93044). The types of bio-related substances retained in each compartment may be different or may be grouped. Further, as a positioning index, for example, a gel in which a dye is retained can be retained in the compartment instead of the biological substance. Also,
The area of each of the plurality of sections is usually 10 −6 m 2 or less. The lower limit is not particularly limited as long as it is possible to detect a biological substance.

【0018】本発明で得られる生体関連物質固定化ゲル
及び該ゲルが多数区画化されたチップは、従来技術で示
したゲルチップと全く同様に固定化された生体関連物質
をプローブとして、検体と反応させてハイブリダイゼー
ションを行うことにより、検体中の特定の塩基配列を有
する生体関連物質の検出に用いることができる。本発明
で言うプローブとは、広義には検体中に存在するするタ
ンパク質や低分子化合物等と特異的に結合することがで
きる生体関連物質を指す。すなわち、本発明の生体関連
物質固定化ゲルを検体と反応させてハイブリダイゼーシ
ョンを行い、プローブと相補的な検体中に存在する生体
関連物質とハイブリッドを形成させ、このハイブリッド
を検出することにより、目的とする検体中の生体関連物
質を検出することができる。
The bio-related substance-immobilized gel obtained in the present invention and a chip in which the gel is divided into a large number of compartments react with a specimen using the immobilized bio-related substance as a probe, just like the gel chip shown in the prior art. By carrying out the hybridization, it can be used for detection of a biological substance having a specific base sequence in a sample. In the broad sense, the term “probe” as used in the present invention refers to a bio-related substance capable of specifically binding to a protein, a low molecular weight compound, or the like present in a sample. That is, the bio-related substance-immobilized gel of the present invention is reacted with a sample to perform hybridization, form a hybrid with a bio-related substance present in a sample complementary to the probe, and detect the hybrid It is possible to detect a biological substance in the sample.

【0019】ハイブリッドの検出には、ハイブリッドを
特異的に認識することができる公知の手段を用いること
ができる。例えば、検体となる生体関連物質に蛍光物質
を導入し、検体とプローブのハイブリダイゼーション反
応量を検体に導入した蛍光強度として検出することが可
能である。
For detecting the hybrid, a known means capable of specifically recognizing the hybrid can be used. For example, it is possible to introduce a fluorescent substance into a biological substance as a sample and detect the hybridization reaction amount between the sample and the probe as the fluorescence intensity introduced into the sample.

【0020】以下、本発明を実施例により更に詳細に説
明する。但し、本発明はこれら実施例によりその技術的
範囲が限定されるものではない。
Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to Examples. However, the technical scope of the present invention is not limited by these examples.

【0021】<参考例1> (a)ビニル基導入オリゴヌクレオチドプローブの調整 以下に示したオリゴヌクレオチド(プローブA、プロー
ブB)を合成した。 プローブA:cgcgttacct tccgcgagat cagtatccac cga (配列番号1) オリゴヌクレオチドの合成はPEバイオシステムズ社の
自動合成機DNA/RNA synthesizer
(model394)を用いて行い、DNA合成の最終
ステップで、アミノリンクII(商標名)(アプライドバ
イオシステム社)を用いてそれぞれのオリゴヌクレオチ
ドの5′未端にNH(CH−を導入しアミノ化
したプローブを調製した。これらは、一般的手法により
脱保護及び精製して使用した。得られたプローブA(1
000nmol/ml)10μl、1000mMの炭酸
ナトリウム水溶液5μl及び20μmol/mlの濃度
でDMSOに溶解したメタクリル酸無水物5μlを混合
し、室温で2時間反応させ、ビニル基が導入されたオリ
ゴヌクレオチドプローブを合成した。
Reference Example 1 (a) Preparation of Vinyl Group-Introduced Oligonucleotide Probes The following oligonucleotides (Probe A and Probe B) were synthesized. Probe A: cgcgttacct tccgcgagat cagtatccac cga (SEQ ID NO: 1) The oligonucleotide was synthesized by PE Biosystems' automatic synthesizer DNA / RNA synthesizer.
(Model 394), and in the final step of DNA synthesis, NH 2 (CH 2 ) 6 − was added to the 5′-end of each oligonucleotide using Aminolink II (trade name) (Applied Biosystems). An introduced and aminated probe was prepared. These were used after being deprotected and purified by a general method. Obtained probe A (1
000 nmol / ml) 10 μl, 1000 mM sodium carbonate aqueous solution 5 μl, and methacrylic anhydride 5 μl dissolved in DMSO at a concentration of 20 μmol / ml were mixed and reacted at room temperature for 2 hours to synthesize a vinyl group-introduced oligonucleotide probe. did.

【0022】(b)末端ビニル基導入オリゴヌクレオチ
ドのPCR反応 (b-1)鋳型(染色体)の調製 ロドコッカス ロドクロウス J−1株を栄養培地(グ
ルコース15g、酵母エキス1g、グルタミン酸ナトリ
ウム10g、KHPO 0.5g、KHPO
0.5g、MgSO4・7H2O 0.5g/L、pH
7.2)100mlで30℃、3日培養し、集菌した。
この菌体から染色体を調製し、PCRの鋳型に用いた。
なお、ロドコッカス ロドクロウスJ−1株はFERM
BP−1478として工業技術院生命工学工業技術研
究所(茨城県つくば市東1丁目1番3号)に寄託されて
いる。
(B) PCR Reaction of Oligonucleotide Introducing Terminal Vinyl Group (b-1) Preparation of Template (Chromosome) Rhodococcus rhodochrous J-1 strain was fed to a nutrient medium (glucose 15 g, yeast extract 1 g, sodium glutamate 10 g, KH 2 PO). 4 0.5g, K 2 HPO 4
0.5 g, MgSO4.7H2O 0.5 g / L, pH
7.2) The cells were cultured in 100 ml at 30 ° C. for 3 days to collect the cells.
A chromosome was prepared from this cell and used as a template for PCR.
In addition, Rhodococcus rhodochrous J-1 strain is FERM
Deposited as BP-1478 at the Institute of Biotechnology, Institute of Industrial Science and Technology (1-3, Higashi 1-3, Tsukuba, Ibaraki).

【0023】(b−2)PCR 参考例で作製した末端ビニル化オリゴヌクレオチド(配
列番号1)を滅菌水で50μM、オリゴヌクレオチド
(配列番号2)を滅菌水で5μMにそれぞれ希釈し、
(1)で調製した鋳型を用い、PCR反応を行った。オ
リゴヌクレオチドはアマシャムファルマシアに合成を依
頼した。PCRは、Ex−Taq(宝酒造)の仕様書に
従い、TaKaRa PCRThermal Cycl
er PERSONALを用いて行った。反応は100
μlで行い、温度条件は93℃ 30秒、65℃ 30
秒、72℃ 1分を35サイクル行った。この反応によ
って623base(配列番号3)の5’末端ビニル化核酸
(プローブC)が増幅された。
(B-2) PCR The terminal vinylated oligonucleotide (SEQ ID NO: 1) prepared in Reference Example was diluted to 50 μM with sterile water, and the oligonucleotide (SEQ ID NO: 2) was diluted to 5 μM with sterile water.
PCR reaction was performed using the template prepared in (1). Oligonucleotides were commissioned to Amersham Pharmacia for synthesis. PCR was performed in accordance with the specifications of Ex-Taq (Takara Shuzo), TaKaRa PCR Thermal Cycle.
er PERSONAL. 100 reactions
μl, temperature conditions are 93 ° C. for 30 seconds, 65 ° C. for 30 seconds
35 cycles of 1 second at 72 ° C. for 1 second. By this reaction, the 623 base (SEQ ID NO: 3) 5'-terminal vinylated nucleic acid (probe C) was amplified.

【0024】(c)試料核酸(検体)の調製 (c−1)オリゴヌクレオチドの合成 以下に示したオリゴヌクレオチド(プローブB、プロー
ブD)を合成した。 プローブA:cgcgttacct tccgcgagatc agtatccac cga(配列番号1) プローブB:cgcgacaatg gcgagcttgt attcaccgag (配列番号2) オリゴヌクレオチドの合成は(a)と同様に行い、オリ
ゴヌクレオチド(プローブB)の5′未端にCy5を導
入した蛍光標識試料核酸のモデルを調製した。これら
は、一般的手法により脱保護及び精製して使用した。
(C) Preparation of sample nucleic acid (sample) (c-1) Synthesis of oligonucleotides The following oligonucleotides (probe B, probe D) were synthesized. Probe A: cgcgttacct tccgcgagatc agtatccac cga (SEQ ID NO: 1) Probe B: cgcgacaatg gcgagcttgt attcaccgag (SEQ ID NO: 2) Oligonucleotide synthesis was performed in the same manner as in (a), and Cy5 was added to the 5'end of the oligonucleotide (probe B). A model of the introduced fluorescence-labeled sample nucleic acid was prepared. These were used after being deprotected and purified by a general method.

【0025】(c−2)PCR 上記記載の5′未端にCy5標識したオリゴヌクレオチ
ド(配列番号2)を滅菌水で50μM、オリゴヌクレオ
チド(配列番号5)を滅菌水で5μMに希釈し、(1)
で調製した鋳型とオリゴヌクレオチド(配列番号2、
5)を用い、PCR反応を行った。PCR反応は、Ex
−Taq(宝酒造)の仕様書に従い、TaKaRa P
CR Thermal Cycler PERSONA
Lを用いて行った。反応は100μlで行い、オリゴヌ
クレヲチド(配列番号2)温度条件は93℃ 30秒、
65℃ 30秒、72℃ 1分を35サイクル行った。
この反応によって623b(配列番号3)の一部(22
8〜623)に相補的な配列である5’末端Cy5標識
した一本鎖核酸(395base)が増幅された。
(C-2) PCR The 5'-end Cy5-labeled oligonucleotide (SEQ ID NO: 2) described above was diluted to 50 μM with sterile water, and the oligonucleotide (SEQ ID NO: 5) was diluted to 5 μM with sterile water, 1)
And the template (SEQ ID NO: 2,
PCR reaction was carried out using 5). PCR reaction is Ex
-TaKaRa P according to the specifications of Taq (Takara Shuzo)
CR Thermal Cycler PERSONA
Performed using L. The reaction was carried out at 100 μl, and the oligonucleotide (SEQ ID NO: 2) temperature condition was 93 ° C. for 30 seconds,
35 cycles of 65 ° C. for 30 seconds and 72 ° C. for 1 minute were performed.
By this reaction, part of 623b (SEQ ID NO: 3) (22
8 to 623), a 5'-terminal Cy5-labeled single-stranded nucleic acid (395 base), which is a complementary sequence, was amplified.

【0026】<実施例1> (1)生体関連物質固定化モデルゲルの作製 (1−1)モノマー溶液の調製 表1に示した組成のモノマー溶液を調製した。<Example 1> (1) Preparation of model gel with bio-related substances immobilized (1-1) Preparation of monomer solution A monomer solution having the composition shown in Table 1 was prepared.

【表1】 [Table 1]

【0027】(1−2)ゲルの調製 表1に示したモノマー溶液を調製後直ちに、長さ2cm
にカットした1mmφのヘマトクリット管に10μl添
加して室温で1時間放置し、参考例(a)で得られた末
端ビニル基核酸が固定化されたアクリルアミドゲルを作
製した。
(1-2) Preparation of gel Immediately after preparation of the monomer solutions shown in Table 1, the length was 2 cm.
10 μl was added to a 1 mmφ hematocrit tube cut into 1 and left at room temperature for 1 hour to prepare an acrylamide gel in which the terminal vinyl group nucleic acid obtained in Reference Example (a) was immobilized.

【0028】(2)ハイブリダイゼーション 表2に示すハイブリダイゼーション溶液を、表3に示す
ように試料核酸(検体)溶液と混合し、1500μl容
量のマイクロチューブに(1−2)で作製したモデルゲ
ルを検体溶液中に添加した。60℃に調節したふらん器
に約20時間放置しハイブリダイゼーションを行った。
(2) Hybridization The hybridization solution shown in Table 2 was mixed with the sample nucleic acid (specimen) solution as shown in Table 3 and the model gel prepared in (1-2) was placed in a 1500 μl capacity microtube. It was added to the sample solution. Hybridization was carried out by leaving it in an incubator adjusted to 60 ° C. for about 20 hours.

【表2】 [Table 2]

【表3】 [Table 3]

【0029】(3)洗浄 ハイブリダイゼーション終了後、マイクロチューブから
ヘマトクリット管を取りだし、あらかじめ保温しておい
た50mlの0.1 × SSC、 0.1%SDS溶
液に移し、振盪しながら45℃、20分間の洗浄を3回
行った。
(3) After washing and hybridization, the hematocrit tube was taken out from the microtube, transferred to 50 ml of 0.1 × SSC, 0.1% SDS solution which had been kept warm, and shaken at 45 ° C. at 20 ° C. Washing for 3 minutes was performed 3 times.

【0030】(4)検出 洗浄終了後のゲルを、蛍光顕微鏡(オリンパス製蛍光顕
微鏡BX60)でcy5用フィルターを用いて観察し、
ゲルの深さ方向(即ちヘマトクリット管の長手方向)で
の蛍光を観察し、冷却CCDカメラ(オリンパス社製C
OOLSnap)で画像取得した。得られた画像につい
て、ヘマトクリット管の長手方向での蛍光強度のライン
プロファイルを画像解析ソフトImage−Pro P
lus(プラネトロン社製)で測定し、ゲル表面からの
蛍光強度の積分値を測定した。 <比較例1>実施例1のモノマー溶液組成のうち、ポリ
エチレングリコール20000を抜いた以外は、同様に
ゲルの調製、ハイブリダイゼーション、検出を行った。
結果を表4に示した。
(4) The gel after completion of the detection washing was observed with a fluorescence microscope (Olympus fluorescence microscope BX60) using a cy5 filter,
The fluorescence in the depth direction of the gel (that is, the longitudinal direction of the hematocrit tube) was observed, and the cooled CCD camera (C by Olympus Co., Ltd.
Images were acquired by OOLSnap). With respect to the obtained image, a line profile of fluorescence intensity in the longitudinal direction of the hematocrit tube was obtained by image analysis software Image-Pro P.
It was measured with lus (manufactured by Planetron), and the integrated value of the fluorescence intensity from the gel surface was measured. Comparative Example 1 Gel preparation, hybridization, and detection were performed in the same manner as in Example 1 except that polyethylene glycol 20000 was omitted.
The results are shown in Table 4.

【0031】[0031]

【表4】 * )蛍光強度の積分値が高いほど、ハイブリッド
を形成した量が多いことを示す。
[Table 4] *) The higher the integrated value of the fluorescence intensity, the more the amount of hybrids formed.

【0032】<参考例2> (a)ビニル基導入オリゴヌクレオチドプローブの調
整,(b)末端ビニル基導入オリゴヌクレオチドのPC
R反応 は参考例1と同様に行った。 (c)試料核酸(検体)の調製 (c−1)オリゴヌクレオチドの合成 以下に示したオリゴヌクレオチド(プローブB、プロー
ブD)を合成した。 プローブA:cgcgttacct tccgcgagat cagtatccac cga(配列番号1) プローブC:gactcggggc tgatcagcga agatgagatc (配列番号4) オリゴヌクレオチドの合成はPEバイオシステムズ社の
自動合成機DNA/RNA synthesizer
(model394)を用いて行った。オリゴヌクレオ
チド(プローブC)については5′未端にCy5を導入
した蛍光標識試料核酸のモデルを調製した。これらは、
一般的手法により脱保護及び精製して使用した。 (c−2)PCR C−1記載の5′未端にCy5標識したオリゴヌクレオ
チド(配列番号2)を滅菌水で50μM、オリゴヌクレ
オチド(配列番号1)を滅菌水で5μMに希釈し、
(1)で調製した鋳型とオリゴヌクレオチド(配列番号
1、2)を用い、PCR反応を行った。PCR反応は、
Ex−Taq(宝酒造)の仕様書に従い、TaKaRa
PCR Thermal Cycler PERSO
NALを用いて行った。反応は100μlで行い、オリ
ゴヌクレオチド(配列番号2)温度条件は93℃ 30
秒、65℃ 30秒、72℃ 1分を35サイクル行っ
た。この反応によって623b(配列番号3)の一部
(420〜623)に相補的な配列である5’末端Cy
5標識した一本鎖核酸(203base)が増幅された。
Reference Example 2 (a) Preparation of vinyl group-introduced oligonucleotide probe, (b) PC of terminal vinyl group-introduced oligonucleotide
The R reaction was performed in the same manner as in Reference Example 1. (C) Preparation of sample nucleic acid (sample) (c-1) Synthesis of oligonucleotide The oligonucleotides (probe B, probe D) shown below were synthesized. Probe A: cgcgttacct tccgcgagat cagtatccac cga (SEQ ID NO: 1) Probe C: gactcggggc tgatcagcga agatgagatc (SEQ ID NO: 4) Oligonucleotides are synthesized by PE Biosystems automated synthesizer DNA / RNA synthesizer.
(Model 394). Regarding the oligonucleotide (probe C), a model of a fluorescence-labeled sample nucleic acid in which Cy5 was introduced at the 5'end was prepared. They are,
It was used after being deprotected and purified by a general method. (C-2) PCR The 5 ′ unterminated Cy5-labeled oligonucleotide (SEQ ID NO: 2) described in C-1 was diluted to 50 μM with sterile water, and the oligonucleotide (SEQ ID NO: 1) was diluted to 5 μM with sterile water,
A PCR reaction was performed using the template prepared in (1) and the oligonucleotides (SEQ ID NOs: 1 and 2). The PCR reaction is
According to the specifications of Ex-Taq (Takara Shuzo), TaKaRa
PCR Thermal Cycler PERSO
This was done using NAL. The reaction was carried out in 100 μl, and the oligonucleotide (SEQ ID NO: 2) temperature condition was 93 ° C. 30
Seconds, 65 ° C. for 30 seconds, 72 ° C. for 1 minute for 35 cycles. By this reaction, the 5'terminal Cy which is a sequence complementary to a part (420 to 623) of 623b (SEQ ID NO: 3).
5-labeled single-stranded nucleic acid (203 base) was amplified.

【0033】<実施例2> (1)繊維配列体の調製 1cm四方に縦横各々5個、合計25個の孔が規則正
しく正方配列された繊維ガイド板2枚を用い、繊維ガイ
ド板の中心部のたて5列,横5列にナイロン製中空繊維
(外径約300μm、長さ約50cm)計25本を通過
させることにより中空繊維配列体を得た。2枚の繊維ガ
イド板の間隔を20cmとし、ポリウレタン樹脂 (日本
ポリウレタン工業(株)コロネー4403,ニッポラン4223)を
流しこみ、硬化させることにより、両端に樹脂で固定化
されない部分を有する中空繊維配列体を得た。
<Example 2> (1) Preparation of fiber array body Two fiber guide plates each having a total of 25 holes arranged vertically and horizontally on a square of 1 cm 2 were used, and two fiber guide plates were regularly arranged. A hollow fiber array was obtained by passing a total of 25 nylon hollow fibers (outer diameter of about 300 μm, length of about 50 cm) in five vertical rows and five horizontal rows. A hollow fiber array having a portion which is not fixed by resin at both ends by pouring a polyurethane resin (Nippon Polyurethane Industry Co., Ltd., Corona 4403, Nipporan 4223) between the two fiber guide plates at a distance of 20 cm and curing it. Got

【0034】(2)中空繊維配列体への生体高分子の導
入及び固定化 参考例2において合成したを含む、以下の組成からなる
モノマー溶液3,4を作製した。
(2) Introduction and Immobilization of Biopolymer into Hollow Fiber Arrangement Monomer solutions 3 and 4 having the following composition, including those synthesized in Reference Example 2, were prepared.

【表5】 [Table 5]

【0035】モノマー溶液3またはモノマー溶液4を、
中空繊維配列体の中空繊維の中空部に注入した後、内部
が水蒸気で飽和された密閉ガラス容器に移し、80℃に
て4時間放置することにより重合反応を行った。その結
果、末端ビニル化核酸が固定化されたゲルを内部に保持
する中空繊維配列体を得た。
The monomer solution 3 or the monomer solution 4 is
After injecting into the hollow part of the hollow fiber of the hollow fiber array, it was transferred to a closed glass container whose inside was saturated with water vapor, and left at 80 ° C. for 4 hours to carry out a polymerization reaction. As a result, a hollow fiber array having a gel having terminal vinylized nucleic acid immobilized therein was obtained.

【0036】(3) 生体高分子配列薄片の作製:
(2)で得られた末端ビニル化核酸固定化中空繊維配列
体、各々の繊維軸に直角方向に、ミクロトームを用いて
約500μmの厚さに薄片を切り出すことにより、末端
ビニル化核酸が規則的に配列された生体高分子配列薄片
得た。
(3) Preparation of biopolymer array thin piece:
The terminal vinylated nucleic acid-immobilized hollow fiber array obtained in (2) is cut out in a direction perpendicular to each fiber axis to a thickness of about 500 μm using a microtome, whereby the terminal vinylated nucleic acid becomes regular. A biopolymer array thin piece was obtained.

【0037】(4)ハイブリダイゼーション ハイブリパック(NIPPON GENETICS CO,LTD製)に表5
に示すハイブリダイゼーション溶液を100μl添加
し、(3)で作製した生体高分子配列薄片をハイブリダ
イゼーション溶液中に添加して、熱シールをした。65
℃に調節したふらん器に約20時間放置し、ハイブリダ
イゼーションを行った。
(4) Hybridization Table 5 is attached to the hybrid pack (manufactured by NIPPON GENETICS CO, LTD).
100 μl of the hybridization solution shown in 1) was added, and the biopolymer array thin piece prepared in (3) was added to the hybridization solution and heat-sealed. 65
Hybridization was carried out by leaving it in a shaker adjusted to 0 ° C. for about 20 hours.

【0038】[0038]

【表6】 (5)洗浄 ハイブリダイゼーション終了後、ハイブリパックから生
体高分子配列薄片をとりだし、以下の洗浄操作を行っ
た。 2×SSC,0.1%SDS 室温 20分 0.2×SSC,0.1%SDS 55℃ 20分 0.2×SSC,0.1%SDS 55℃ 20分 0.02×SSC 室温 5分 0.02×SSC 室温 5分
[Table 6] (5) Washing After completion of the hybridization, the biopolymer array thin piece was taken out from the hybrid pack and the following washing operation was performed. 2 × SSC, 0.1% SDS room temperature 20 minutes 0.2 × SSC, 0.1% SDS 55 ° C. 20 minutes 0.2 × SSC, 0.1% SDS 55 ° C. 20 minutes 0.02 × SSC Room temperature 5 minutes 0.02 × SSC Room temperature 5 minutes

【0039】(6)検出 洗浄終了後の薄片を、蛍光顕微鏡(オリンパス製蛍光顕
微鏡BX60)でcy5用フィルターを用いて観察し、
冷却CCDカメラ(オリンパス社製COOLSnap)
で画像取得した。露光時間は15秒とした。得られた画
像について、末端ビニル化核酸が固定化されているスポ
ット内の蛍光強度の平均値を算出した。画像解析は、画
像解析ソフトImage−ProPlus(プラネトロ
ン社製)で行った。結果を表6に示した。
(6) The thin piece after completion of the detection and washing was observed with a fluorescence microscope (Olympus fluorescence microscope BX60) using a cy5 filter,
Cooled CCD camera (Olympus COOLSnap)
I got the image at. The exposure time was 15 seconds. For the obtained image, the average value of the fluorescence intensity in the spot where the terminal vinylated nucleic acid was immobilized was calculated. The image analysis was performed using image analysis software Image-ProPlus (manufactured by Planetron). The results are shown in Table 6.

【0040】<比較例2>実施例2のモノマー溶液組成
のうち、ポリエチレングリコール20000を抜いてた
以外は、同様に中空繊維配列体への生体高分子の導入及
び固定化,生体高分子配列薄片の作製,ハイブリダイゼ
ーション,洗浄,検出を行った。実施例2,比較例2の
検出結果を表6に示した。
<Comparative Example 2> In the monomer solution composition of Example 2, except that polyethylene glycol 20000 was omitted, the biopolymer was introduced into and immobilized on the hollow fiber array in the same manner as described above. Was prepared, hybridized, washed, and detected. The detection results of Example 2 and Comparative Example 2 are shown in Table 6.

【0041】[0041]

【表7】 [Table 7]

【0042】[0042]

【発明の効果】本発明のゲル組成は、高分子多価アルコ
ールが添加されていないゲルと比較して検体とプローブ
とのハイブリッド形成量が高い。すなわち、ハイブリッ
ドを形成する速度を向上させることが可能である。
EFFECT OF THE INVENTION The gel composition of the present invention has a higher hybrid formation amount between the sample and the probe as compared with the gel to which the high molecular weight polyhydric alcohol is not added. That is, it is possible to improve the speed of forming a hybrid.

【0043】[0043]

【配列表】 <110> Mitsubishi Rayon Co., Ltd. <120> Bio-related material-fixed gel and bio-related material-fixed gel chip holding said gel <130> <210> 1 <211> 33 <212> DNA <213> Artificial Sequence <223> Synthetic DNA <400> 1 cgcgttacct tccgcgagat cagtatccac cga <210> 2 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <223> Synthetic DNA <400> 2 cgcgacaatg gcgagcttgt attcaccgag <210> 3 <211> 623 <212> DNA <213> Rhodococcus rhodochrous <400> 3 gcgataggtg gaggtcaggg tttgggacag cagctccgaa atccgctaca tcgtcatccc 60 ggaacggccg gccggcaccg acggttggtc cgaggaggag ctgacgaagc tggtgagccg 120 ggactcgatg atcggtgtca gtaatgcgct cacaccgcag gaagtgatcg tatgagtgaa 180 gacacactca ctgatcggct cccggcgact gggaccgccg caccgccccg cgacaatggc 240 gagcttgtat tcaccgagcc ttgggaagca acggcattcg gggtcgccat cgcgctttcg 300 gatcagaagt cgtacgaatg ggagttcttc cgacagcgtc tcattcactc catcgctgag 360 gccaacggtt gcgaggcata ctacgagagc tggacaaagg cgctcgaggc cagcgtggtc 420 gactcggggc tgatcagcga agatgagatc cgcgagcgca tggaatcgat ggccatcatc 480 gactgacatc ccctgtgtct ccatctagca gcagtgcggg cgtaccccga cggtgctgag 540 ccgacggggt acgcccgcac ttcatcaatg acggtggttc ctaatttggc tcggtggata 600 ctgatctcgc ggaaggtaac gcg 623 <210> 4 <211> 30 <212> DNA <214> Artificial Sequence <223> Synthetic DNA <400> 4 gactcggggc tgatcagcga agatgagatc [Sequence list] <110> Mitsubishi Rayon Co., Ltd. <120> Bio-related material-fixed gel and bio-related material-fixed gel        chip holding said gel <130> <210> 1 <211> 33 <212> DNA <213> Artificial Sequence <223> Synthetic DNA <400> 1      cgcgttacct tccgcgagat cagtatccac cga <210> 2 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <223> Synthetic DNA <400> 2       cgcgacaatg gcgagcttgt attcaccgag <210> 3 <211> 623 <212> DNA <213> Rhodococcus rhodochrous <400> 3 gcgataggtg gaggtcaggg tttgggacag cagctccgaa atccgctaca tcgtcatccc 60 ggaacggccg gccggcaccg acggttggtc cgaggaggag ctgacgaagc tggtgagccg 120 ggactcgatg atcggtgtca gtaatgcgct cacaccgcag gaagtgatcg tatgagtgaa 180 gacacactca ctgatcggct cccggcgact gggaccgccg caccgccccg cgacaatggc 240 gagcttgtat tcaccgagcc ttgggaagca acggcattcg gggtcgccat cgcgctttcg 300 gatcagaagt cgtacgaatg ggagttcttc cgacagcgtc tcattcactc catcgctgag 360 gccaacggtt gcgaggcata ctacgagagc tggacaaagg cgctcgaggc cagcgtggtc 420 gactcggggc tgatcagcga agatgagatc cgcgagcgca tggaatcgat ggccatcatc 480 gactgacatc ccctgtgtct ccatctagca gcagtgcggg cgtaccccga cggtgctgag 540 ccgacggggt acgcccgcac ttcatcaatg acggtggttc ctaatttggc tcggtggata 600 ctgatctcgc ggaaggtaac gcg 623 <210> 4 <211> 30 <212> DNA <214> Artificial Sequence <223> Synthetic DNA <400> 4       gactcggggc tgatcagcga agatgagatc

【0044】[0044]

【配列表フリーテキスト】[Sequence list free text]

配列番号1:合成DNA 配列番号2:合成DNA 配列番号4:合成DNA SEQ ID NO: 1 synthetic DNA SEQ ID NO: 2: Synthetic DNA SEQ ID NO: 4: Synthetic DNA

Claims (8)

【特許請求の範囲】[Claims] 【請求項1】 アクリルアミド系ポリマー3〜20重量
%及び高分子多価アルコール0.1〜10重量%を含む
水性ゲル中に生体関連物質が固定化された生体関連物質
固定化ゲル。
1. A bio-related substance-immobilized gel in which a bio-related substance is immobilized in an aqueous gel containing 3 to 20% by weight of an acrylamide polymer and 0.1 to 10% by weight of a high molecular weight polyhydric alcohol.
【請求項2】 高分子多価アルコールが一般式(1)〜
(3)で表される化合物からなる群から選ばれる少なく
とも1種である請求項1記載の生体関連物質固定化ゲ
ル。 一般式(1) OH−[CHCHO−]nH (式中、nは10以上の整数である) 一般式(2) OH−[CH(CH)CH3O−]nH (式中、nは10以上の整数である) 一般式(3) ROCHCHORCHOR (式中、Rは[−CHCHCHO]nHを示し、ここでnは5以上の整数 である)
2. The high molecular weight polyhydric alcohol is represented by the general formula (1) to
The bio-related substance-immobilized gel according to claim 1, which is at least one selected from the group consisting of the compounds represented by (3). Formula (1) OH- [CH 2 CH 2 O-] nH ( wherein, n is an integer of 10 or more) Formula (2) OH- [CH 2 ( CH) CH 3 O-] nH ( Formula In the formula, n is an integer of 10 or more. General formula (3) ROCH 2 CHORCH 2 OR (In the formula, R represents [-CH 2 CHCH 3 O] nH, and n is an integer of 5 or more)
【請求項3】 高分子多価アルコールの分子量が1,0
00〜1,000,000である請求項2記載の生体関
連物質固定化ゲル。
3. The high molecular weight polyhydric alcohol has a molecular weight of 1,0.
The bio-related substance-immobilized gel according to claim 2, which is from 0 to 1,000,000.
【請求項4】 生体関連物質が核酸である請求項1〜3
のいずれか1項に記載の生体関連物質固定化ゲル。
4. The biological-related substance is a nucleic acid.
9. The bio-related substance-immobilized gel according to any one of 1.
【請求項5】 請求項1〜4のいずれか1項に記載の生
体関連物質固定化ゲルが複数の区画に保持された生体関
連物質固定化ゲルチップ。
5. A bio-related substance-immobilized gel chip in which the bio-related substance-immobilized gel according to claim 1 is held in a plurality of compartments.
【請求項6】 複数の区画の各区画の面積が10−6
以下である請求項5記載の生体関連物質固定化ゲルチ
ップ。
6. The area of each of the plurality of compartments is 10 −6 m
The biochip-related substance-immobilized gel chip according to claim 5, which is 2 or less.
【請求項7】 区画が溝又は貫通孔により形成されてい
る請求項5又は6記載の生体関連物質固定化ゲルチッ
プ。
7. The biochip-immobilized gel chip according to claim 5, wherein the partition is formed by a groove or a through hole.
【請求項8】 貫通孔が中空繊維により形成されている
請求項7記載の生体関連物質固定化ゲルチップ。
8. The bio-related substance-immobilized gel chip according to claim 7, wherein the through holes are formed of hollow fibers.
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Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
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