JP2003038200A - Method for testing sensitivity of tumor cell to anticancer agent - Google Patents

Method for testing sensitivity of tumor cell to anticancer agent

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JP2003038200A
JP2003038200A JP2001359805A JP2001359805A JP2003038200A JP 2003038200 A JP2003038200 A JP 2003038200A JP 2001359805 A JP2001359805 A JP 2001359805A JP 2001359805 A JP2001359805 A JP 2001359805A JP 2003038200 A JP2003038200 A JP 2003038200A
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隆志 大和
Akira Yokoi
晃 横井
Junro Kuromitsu
淳郎 黒光
Takatoshi Kawai
隆利 河合
Hiroyuki Kato
弘之 加藤
Takeshi Nagasu
毅志 長洲
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Abstract

PROBLEM TO BE SOLVED: To provide acting markers for antitumor effect of E7070 and its related compound when E7070 or the related compound is allowed to act on tumor cells. SOLUTION: The sensitivity of tumor cells to an anticancer agent (E7070 or its related compound) is carried out as follows: tumor cells are taken out from a cancer patient to whom the anticancer agent has been administered, and the expression levels of genes described in Table 3 and Table 4 are determined; or the anticancer agent is allowed to act on the tumor cells taken out from a cancer patient, and the expression levels of the genes described in Table 3 and Table 4 are determined; and in the case where the expression level of the gene described in Table 3 is increased, or that of the gene described in Table 4 is decreased, it is judged that the tumor cells are sensitive to the anticancer agent.

Description

【発明の詳細な説明】Detailed Description of the Invention

【0001】[0001]

【発明の属する技術分野】本発明は、抗癌剤に対し腫瘍
細胞が感受性か否かを検定する方法に関する。
TECHNICAL FIELD The present invention relates to a method for assaying whether tumor cells are sensitive to an anticancer drug.

【0002】[0002]

【従来の技術】従来の抗癌剤の臨床治験においては、ま
ず、第一相試験で毒性のプロフィールと最大推奨用量が
決められ、次いで第二相試験で腫瘍縮小率を効果判定基
準とするレスポンスレート(response rate)により薬剤
としての評価が成されてきた。一方、近年の癌生物学の
進展に伴い、細胞内情報伝達系や血管新生などを阻害す
る新しい作用機序の薬剤が、活発な研究開発の途にあ
る。これら新規抗癌剤においては必ずしも毒性用量に近
い最大推奨用量が投与される必要性がない可能性が考え
られる。さらに、腫瘍の縮小よりもむしろ腫瘍の増殖抑
制に伴うQOL(Quality of Life)の改善や延命を指標に
した方が薬剤の効果を適正に判定できるものと推測され
る。この場合、より論理的かつ具体的に薬剤の効果を確
かめるためには、腫瘍の増殖抑制メカニズムに密接に関
連する生物学的マーカーの変化を、代理(surrogate)
マーカーとして利用することが望まれる。
2. Description of the Related Art In conventional clinical trials of anti-cancer agents, first, a toxicity profile and maximum recommended dose are determined in a phase I trial, and then a response rate using the tumor shrinkage rate as a criterion for efficacy in a phase II trial ( Response rate has been evaluated as a drug. On the other hand, with the recent progress in cancer biology, drugs with a new action mechanism that inhibits intracellular signal transduction system and angiogenesis are under active research and development. It is conceivable that it is not always necessary to administer the maximum recommended dose close to the toxic dose for these novel anticancer agents. Furthermore, it is presumed that the effect of the drug can be judged more appropriately by using, as an index, improvement of QOL (Quality of Life) associated with suppression of tumor growth or prolongation of life rather than tumor shrinkage. In this case, in order to confirm the effect of the drug more logically and specifically, the changes in biological markers closely related to the tumor growth suppression mechanism were surrogateed.
It is desired to use it as a marker.

【0003】一般的に、抗癌療法において、抗癌剤を投
与した際の生体の反応性は、薬剤の標的となる腫瘍細胞
の、その薬剤に対する感受性に大きく依存する。この腫
瘍細胞の薬剤に対する感受性は、腫瘍細胞毎に大きく異
なるものである。このような感受性の差は、その薬剤の
標的分子もしくはそれに関連する因子の量的もしくは質
的な差異、あるいは薬剤耐性の獲得等に起因する。この
ような背景を踏まえると、標的となる腫瘍細胞が、薬剤
に対して感受性を示す際に特異的に引き起こされる腫瘍
細胞の変化を、バイオプシ等により取得した腫瘍組織等
を用いて測定することができれば、これを代理マーカー
として、早期に薬剤の効果判定、治療法の確立、新たな
治療法の選択等が可能となり、非常に有益である。ま
た、治療に先立ってバイオプシ等により取得した腫瘍組
織より、常法に従い腫瘍細胞を分離した後薬剤処理を行
い、この腫瘍細胞が薬剤感受性であるか否かを上記代理
マーカーの変化により測定すれば、予めその薬剤による
治療が奏効するか否かを予測することが可能となり、臨
床上極めて有用である。この代理マーカーは、その変化
が抗腫瘍効果に特異的であることが重要であり、かつ高
感度に測定可能であればよい。具体的には、薬剤の抗腫
瘍効果に特異的な遺伝子発現変動の定量、それら遺伝子
発現の変化に伴うタンパク質の量的変動の解析、さらに
はその変化に伴う機能変化の解析等何れもこの代理マー
カーと成り得る。
Generally, in anticancer therapy, the reactivity of an organism upon administration of an anticancer drug largely depends on the sensitivity of the tumor cells targeted by the drug to the drug. The susceptibility of tumor cells to drugs varies greatly depending on the tumor cells. Such a difference in sensitivity is due to a quantitative or qualitative difference in the target molecule of the drug or a factor related thereto or the acquisition of drug resistance. Based on such a background, it is possible to measure the change of tumor cells specifically caused when the target tumor cells show sensitivity to a drug, using a tumor tissue obtained by biopsy or the like. If possible, this can be used as a surrogate marker for early determination of drug effects, establishment of treatment methods, selection of new treatment methods, and the like, which is extremely useful. Further, from the tumor tissue obtained by biopsy or the like prior to the treatment, drug treatment is performed after separating the tumor cells according to a conventional method, and whether or not the tumor cells are drug-sensitive is measured by the change of the surrogate marker. Therefore, it becomes possible to predict in advance whether or not the treatment with the drug will be effective, which is extremely useful clinically. It is important that the change of the surrogate marker is specific to the antitumor effect, and that it can be measured with high sensitivity. Specifically, quantification of gene expression fluctuations specific to the antitumor effect of drugs, analysis of protein quantitative fluctuations due to changes in those gene expressions, and further analysis of functional changes accompanying such changes, etc. Can be a marker.

【0004】E7070(N-(3-chloro-7-indolyl)-1,4-benz
enedisulfonamide)は細胞周期のG1期をターゲットとし
た抗腫瘍効果を有する化合物であり、現在臨床開発中で
ある(Takashi Owa, Hiroshi Yoshino, Tatsuo Okauch
i, Kentaro Yoshimatsu, Yoichi Ozawa, Naoko Hata Su
gi, Takeshi Nagasu, Nozomu Koyanagi and KyosukeKi
toh, J. Med. Chem, 1999, 42, 3789-3799)。
E7070 (N- (3-chloro-7-indolyl) -1,4-benz
enedisulfonamide) is a compound with an antitumor effect that targets the G1 phase of the cell cycle and is currently in clinical development (Takashi Owa, Hiroshi Yoshino, Tatsuo Okauch).
i, Kentaro Yoshimatsu, Yoichi Ozawa, Naoko Hata Su
gi, Takeshi Nagasu, Nozomu Koyanagi and KyosukeKi
toh, J. Med. Chem, 1999, 42, 3789-3799).

【0005】この化合物の種々の腫瘍細胞に対する細胞
増殖抑制作用の強さのスペクトルは、既存の抗癌剤の何
れとも異なり、新たな作用機序を有する抗癌剤としてそ
の効果が期待される。この薬剤の臨床開発を速やかに進
行させ臨床治療法を早期に確立するために、さらには確
立された治療法に基づき効率よく治療を進め、患者のQO
L向上に貢献するために、本薬剤投与時に特異的に使用
できる代理マーカーを発見し、応用することが望まれ
る。
The spectrum of the cytostatic activity of this compound on various tumor cells is different from any of the existing anticancer agents, and its effect is expected as an anticancer agent having a new mechanism of action. In order to rapidly advance the clinical development of this drug and establish a clinical treatment method at an early stage, the treatment is efficiently advanced based on the established treatment method, and the patient's QO
In order to contribute to the improvement of L, it is desirable to discover and apply a surrogate marker that can be used specifically during the administration of this drug.

【0006】近年、種々のDNAマイクロアレイを用い、
多数の遺伝子の発現量を同時に検出する方法が確立さ
れ、幅広い目的に応用されている(Schena M, Shalon
D, Davis RW, Brown PO, Science 1995, 270, 467-70,
Lockhart, D.J., Dong, H., Byrne, M.C., Folletti
e, M.T., Gallo, M.V., Chee, M.S., Mittmann, M., Wa
ngC., Kobayashi, M., Horton, H. Brown, E.L., Natur
e Biotechnology, 1996,14, 1675-1680 )。
In recent years, various DNA microarrays have been used,
A method for simultaneously detecting the expression level of many genes has been established and applied to a wide range of purposes (Schena M, Shalon
D, Davis RW, Brown PO, Science 1995, 270, 467-70,
Lockhart, DJ, Dong, H., Byrne, MC, Folletti
e, MT, Gallo, MV, Chee, MS, Mittmann, M., Wa
ngC., Kobayashi, M., Horton, H. Brown, EL, Natur
e Biotechnology, 1996,14, 1675-1680).

【0007】癌研究の分野においてもこのDNAマイクロ
アレイを用いた研究は盛んに行われている。例えばDNA
マイクロアレイを用いた発現解析によりびまん性大B細
胞リンパ腫(diffuse large B-cell lymphoma; DLBCL)を
解析した研究においては、DLBCLが遺伝子発現プロファ
イルの違いにより2つの異なるタイプに分類され、この
分類が予後の予測にも繋がることが示された(Alizadeh
AA, Eisen MB, DavisRE, Ma C, Lossos IS, Rosenwald
A, Boldrick JC, Sabet H, Tran T, Yu X, Powell JI,
Yang L, Marti GE, Moore T, Hudson J Jr, Lu L, Lew
is DB, Tibshirani R, Sherlock G, Chan WC, Greiner
TC, Weisenburger DD, Armitage JO, Warnke R, Staudt
LM, et al, Nature, 2000, 403, 503-11 )。また米国
National Cancer Instituteの60種類の癌細胞株パネル
について遺伝子発現プロファイルを解析することによ
り、これら細胞株を再分類し、その特性を検討した報告
(Ross DT, Scherf U, Eisen MB, Perou CM, Rees C, S
pellman P, Iyer V, JeffreySS, Van de Rijn M, Walth
am M, Pergamenschikov A, Lee JC, Lashkari D, Shalo
n D, Myers TG, Weinstein JN, Botstein D, Brown PO,
Nat Genet, 2000, 24, 227-35 )、さらにこの60種類
の癌細胞株パネルの遺伝子発現プロファイルと、各細胞
株の各種抗癌剤に対する感受性との間の関連について考
察した報告(Scherf U, Ross DT, Waltham M, Smith L
H, Lee JK, Tanabe L, Kohn KW, Reinhold WC, Myers T
G, Andrews DT, Scudiero DA, Eisen MB, Sausville E
A, PommierY, Botstein D, Brown PO, Weinstein JN, N
at Genet, 2000, 24, 236-44 )等がなされている。
In the field of cancer research as well, research using this DNA microarray has been actively conducted. DNA for example
In a study that analyzed diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) by expression analysis using a microarray, DLBCL was classified into two different types according to the difference in gene expression profile, and this classification was prognostic. Has been shown to be linked to the prediction of (Alizadeh
AA, Eisen MB, DavisRE, Ma C, Lossos IS, Rosenwald
A, Boldrick JC, Sabet H, Tran T, Yu X, Powell JI,
Yang L, Marti GE, Moore T, Hudson J Jr, Lu L, Lew
is DB, Tibshirani R, Sherlock G, Chan WC, Greiner
TC, Weisenburger DD, Armitage JO, Warnke R, Staudt
LM, et al, Nature, 2000, 403, 503-11). Also the United States
Report on the reclassification and characterization of these cell lines by analyzing gene expression profiles for a panel of 60 cancer cell lines from the National Cancer Institute (Ross DT, Scherf U, Eisen MB, Perou CM, Rees C , S
pellman P, Iyer V, JeffreySS, Van de Rijn M, Walth
am M, Pergamenschikov A, Lee JC, Lashkari D, Shalo
n D, Myers TG, Weinstein JN, Botstein D, Brown PO,
Nat Genet, 2000, 24, 227-35), and a report discussing the relationship between the gene expression profiles of these 60 cancer cell line panels and the susceptibility of each cell line to various anticancer agents (Scherf U, Ross DT , Waltham M, Smith L
H, Lee JK, Tanabe L, Kohn KW, Reinhold WC, Myers T
G, Andrews DT, Scudiero DA, Eisen MB, Sausville E
A, PommierY, Botstein D, Brown PO, Weinstein JN, N
at Genet, 2000, 24, 236-44).

【0008】また、同様にDNAマイクロアレイ(一部メ
ンブランフィルターを用いたマクロアレイ)を用いて、
腫瘍細胞に抗癌剤を作用させた際に起こる遺伝子発現変
化を検討した報告もいくつか成されている(Rhee CH, R
uan S, Chen S, Chenchik A,Levin VA, Yung AW, Fulle
r GN, Zhang W , Oncol Rep, 1999, 6, 393-401. Zimm
ermann J, Erdmann D, Lalande I, Grossenbacher R, N
oorani M, Furst P,Oncogene, 2000, 19, 2913-20. Ku
doh K, Ramanna M, Ravatn R, Elkahloun AG, Bittner
ML, Meltzer PS, Trent JM, Dalton WS, Chin KV, Canc
er Res, 2000, 4161-6 )。これらの報告は、遺伝子発
現の変動解析が、複数の細胞集団の特性比較や、薬剤の
処理等により細胞に引き起こされる生物学的な変化を、
分子レベルで包括的に研究する目的で極めて有用である
ことを示している。
Similarly, using a DNA microarray (macro array using a part of a membrane filter),
There have been some reports on changes in gene expression that occur when tumor cells are treated with anti-cancer drugs (Rhee CH, R
uan S, Chen S, Chenchik A, Levin VA, Yung AW, Fulle
r GN, Zhang W, Oncol Rep, 1999, 6, 393-401. Zimm
ermann J, Erdmann D, Lalande I, Grossenbacher R, N
oorani M, Furst P, Oncogene, 2000, 19, 2913-20. Ku
doh K, Ramanna M, Ravatn R, Elkahloun AG, Bittner
ML, Meltzer PS, Trent JM, Dalton WS, Chin KV, Canc
er Res, 2000, 4161-6). These reports show that analysis of gene expression fluctuations reveals biological changes caused by comparison of characteristics of multiple cell populations, drug treatment, etc.
It is extremely useful for the purpose of comprehensive research at the molecular level.

【0009】[0009]

【発明が解決しようとする課題】本発明の課題は、腫瘍
細胞に、E7070及びその関連化合物を作用させた際の、
該化合物の抗腫瘍効果の代理マーカーを提供することに
ある。
The object of the present invention is to treat tumor cells with E7070 and its related compounds,
It is to provide a surrogate marker for the antitumor effect of the compound.

【0010】[0010]

【課題を解決するための手段】本発明者らは、E7070及
びその関連化合物を、これら抗癌剤に対し感受性である
腫瘍細胞に作用させた際に引き起こされる遺伝子発現の
変化を、DNAマイクロアレイ法により解析し、これら抗
癌剤により共通に現れる、遺伝子発現の変化を見出し
た。
[Means for Solving the Problems] The present inventors analyzed by DNA microarray method the changes in gene expression caused by the action of E7070 and its related compounds on tumor cells sensitive to these anticancer agents. However, the inventors have found changes in gene expression that commonly appear with these anticancer agents.

【0011】更に、それら遺伝子の中には3癌種に共通
した発現の変化を示すものがあることを見出し、これら
の遺伝子の発現変化が、E7070及びその関連化合物の抗
腫瘍効果の代理マーカーとして使用できることを見出し
て、本発明を完成させた。すなわち本発明は、以下のも
のを提供する。
Furthermore, it was found that some of these genes show changes in expression common to the three cancer types, and the changes in expression of these genes serve as surrogate markers for the antitumor effect of E7070 and its related compounds. The present invention has been completed by finding that it can be used. That is, the present invention provides the following.

【0012】1. 1).下記一般式(I)で表される抗
癌剤を投与した癌患者より取り出された腫瘍細胞の、第
3表及び第4表に記載の遺伝子からなる群から選択され
る1個または複数の遺伝子の発現量を測定し、 2).該癌患者から抗癌剤投与前に取り出された腫瘍細胞
と比較して、第3表に記載の遺伝子の発現量が増加し、
または第4表に記載の遺伝子の発現量が減少する場合
に、該腫瘍細胞が該抗癌剤に対して感受性であると判定
する、工程を含んで成る、該腫瘍細胞の該抗癌剤に対す
る感受性を検定する方法。
1. 1). One or more tumor cells extracted from a cancer patient administered with an anticancer agent represented by the following general formula (I), selected from the group consisting of the genes shown in Tables 3 and 4 The expression level of the gene was measured, and 2). The expression level of the gene shown in Table 3 was increased as compared with tumor cells taken out from the cancer patient before administration of the anticancer drug,
Or assaying the susceptibility of the tumor cells to the anti-cancer drug, which comprises the step of determining that the tumor cells are susceptible to the anti-cancer drug when the expression level of the gene shown in Table 4 decreases. Method.

【0013】[0013]

【化3】 [Chemical 3]

【0014】(式中、A環は、置換基を有していてもよ
い、単環式または二環式芳香環を、B環は、置換基を有
していてもよい、6員環式不飽和炭化水素またはヘテロ
原子として窒素原子を1個含む不飽和6員ヘテロ環を、
C環は、置換基を有していてもよい、窒素原子を1また
は2個含む5員ヘテロ環を、Wは単結合または−CH=
CH−を、Xは−N(R1)−または酸素原子を、Yは
炭素原子または窒素原子を、Zは−N(R2)−または
窒素原子を、R1およびR2は同一または異なって水素原
子または低級アルキル基を、意味する。)
(In the formula, A ring is a monocyclic or bicyclic aromatic ring which may have a substituent, and B ring is a 6-membered ring which may have a substituent. Unsaturated hydrocarbon or an unsaturated 6-membered heterocycle containing one nitrogen atom as a heteroatom,
Ring C is a 5-membered heterocyclic ring which may have a substituent and contains 1 or 2 nitrogen atoms, W is a single bond or -CH =
The CH-, X is -N (R 1) - or an oxygen atom, Y is a carbon atom or a nitrogen atom, Z is -N (R 2) - or a nitrogen atom, R 1 and R 2 are the same or different Means a hydrogen atom or a lower alkyl group. )

【0015】2. 1).癌患者より取り出された腫瘍細
胞に、下記一般式(I)で表される抗癌剤を作用させ、 2).該腫瘍細胞の、第3表及び第4表に記載の遺伝子か
らなる群から選択される1個または複数の遺伝子の発現
量を測定し、 3).無処理の腫瘍細胞と比較して、第3表に記載の遺伝
子の発現量が増加し、または第4表に記載の遺伝子の発
現量が減少する場合に、該腫瘍細胞が該抗癌剤に対して
感受性であると判定する、工程を含んで成る、該腫瘍細
胞の該抗癌剤に対する感受性を検定する方法。
2. 1). A tumor cell taken out from a cancer patient is treated with an anticancer agent represented by the following general formula (I), and 2). A group of the tumor cell containing the genes shown in Tables 3 and 4 The expression level of one or more genes selected from 3). The expression level of the genes listed in Table 3 is increased, or the expression levels of the genes listed in Table 3 are increased as compared to untreated tumor cells. The method for assaying the sensitivity of the tumor cells to the anticancer drug, which comprises the step of determining that the tumor cells are susceptible to the anticancer drug when the expression level of the gene is decreased.

【0016】[0016]

【化4】 [Chemical 4]

【0017】(式中、A環は、置換基を有していてもよ
い、単環式または二環式芳香環を、B環は、置換基を有
していてもよい、6員環式不飽和炭化水素またはヘテロ
原子として窒素原子を1個含む不飽和6員ヘテロ環を、
C環は、置換基を有していてもよい、窒素原子を1また
は2個含む5員ヘテロ環を、Wは単結合または−CH=
CH−を、Xは−N(R1)−または酸素原子を、Yは
炭素原子または窒素原子を、Zは−N(R2)−または
窒素原子を、R1およびR2は同一または異なって水素原
子または低級アルキル基を、意味する。)
(In the formula, A ring is a monocyclic or bicyclic aromatic ring which may have a substituent, and B ring is a 6-membered cyclic group which may have a substituent. Unsaturated hydrocarbon or an unsaturated 6-membered heterocycle containing one nitrogen atom as a heteroatom,
Ring C is a 5-membered heterocyclic ring which may have a substituent and contains 1 or 2 nitrogen atoms, W is a single bond or -CH =
The CH-, X is -N (R 1) - or an oxygen atom, Y is a carbon atom or a nitrogen atom, Z is -N (R 2) - or a nitrogen atom, R 1 and R 2 are the same or different Means a hydrogen atom or a lower alkyl group. )

【0018】3. 遺伝子の発現量の測定を、該遺伝子
の転写産物であるRNAをDNAマイクロアレイにより定量す
ることにより行う、1または2に記載の方法。
3. The method according to 1 or 2, wherein the expression level of the gene is measured by quantifying RNA, which is a transcription product of the gene, by a DNA microarray.

【0019】4. 遺伝子の発現量の測定を、該遺伝子
の転写産物であるRNAを定量的PCRにより定量することに
より行う、1または2に記載の方法。
4. 3. The method according to 1 or 2, wherein the expression level of the gene is measured by quantifying RNA, which is a transcription product of the gene, by quantitative PCR.

【0020】5. 4に記載の方法において使用するた
めの、該RNAに相補的なオリゴヌクレオチドを構成要素
として含む、RNAの定量試薬。
5. A RNA quantification reagent for use in the method according to 4, which comprises an oligonucleotide complementary to the RNA as a component.

【0021】6. 遺伝子の発現量の測定を、該遺伝子
の遺伝子産物である蛋白質を免疫化学的方法により定量
することにより行う、1または2に記載の方法。
6. The method according to 1 or 2, wherein the expression level of the gene is measured by quantifying a protein, which is a gene product of the gene, by an immunochemical method.

【0022】7. 遺伝子の発現量の測定を、該遺伝子
の遺伝子産物である蛋白質をELISAにより定量すること
により行う、6に記載の方法。
7. 7. The method according to 6, wherein the expression level of the gene is measured by quantifying the protein, which is the gene product of the gene, by ELISA.

【0023】8. 遺伝子の発現量の測定を、該遺伝子
の遺伝子産物である蛋白質をウエスタンブロットにより
定量することにより行う、6に記載の方法。
8. 7. The method according to 6, wherein the expression level of the gene is measured by quantifying the protein, which is the gene product of the gene, by Western blotting.

【0024】9. 6に記載の方法において使用するた
めの、該蛋白質に対する抗体を構成要素として含む免疫
測定試薬。
9. An immunoassay reagent for use in the method according to 6, which comprises an antibody against the protein as a constituent element.

【0025】10. A環が置換基を有していてもよ
い、ベンゼンまたはピリジンであり、B環が置換基を有
していてもよいベンゼンであり、C環が置換基を有して
いてもよいピロールであり、Wが単結合であり、かつX
およびZがいずれも−NH−である、1または2に記載
の方法。
10. A ring is benzene or pyridine which may have a substituent, B ring is benzene which may have a substituent, and C ring is a pyrrole which may have a substituent. , W is a single bond, and X is
The method according to 1 or 2, wherein both and Z are -NH-.

【0026】[0026]

【発明の実施の形態】以下に本発明の実施の形態につい
て、詳細に説明する。
BEST MODE FOR CARRYING OUT THE INVENTION Embodiments of the present invention will be described in detail below.

【0027】本発明の検定方法は、腫瘍細胞がin vivo
またはin vitroで抗癌剤に暴露されたときの、腫瘍細胞
における特定の遺伝子の発現量の変化を、腫瘍細胞の抗
癌剤に対する感受性の指標とする点に特徴を有する。
In the assay method of the present invention, tumor cells are in vivo
Alternatively, it is characterized in that a change in the expression level of a specific gene in a tumor cell when exposed to an anticancer agent in vitro is used as an index of the sensitivity of the tumor cell to the anticancer agent.

【0028】従って、本発明の第1の態様の検定方法
は、1).下記一般式(I)で表される抗癌剤を投与した
癌患者より取り出された腫瘍細胞の、第3表及び第4表
に記載の遺伝子からなる群から選択される1個または複
数の遺伝子の発現量を測定し、2).該癌患者から抗癌剤
投与前に取り出された腫瘍細胞と比較して、第3表に記
載の遺伝子の発現量が増加し、または第4表に記載の遺
伝子の発現量が減少する場合に、該腫瘍細胞が該抗癌剤
に対して感受性であると判定する、工程を含んで成る。
Therefore, the assay method according to the first aspect of the present invention is 1). Tables 3 and 4 of tumor cells taken out from a cancer patient administered with an anticancer agent represented by the following general formula (I): The expression level of one or more genes selected from the group consisting of the genes listed in the table was measured, and 2). Compared with tumor cells taken out from the cancer patient before administration of the anticancer drug, the results are shown in Table 3. The method comprises the step of determining that the tumor cell is sensitive to the anti-cancer agent when the expression level of the described gene increases or the expression level of the gene described in Table 4 decreases.

【0029】また、本発明の第2の態様の検定方法は、
1).癌患者より取り出された腫瘍細胞に、下記一般式
(I)で表される抗癌剤を作用させ、 2).該腫瘍細胞の、第3表及び第4表に記載の遺伝子か
らなる群から選択される1個または複数の遺伝子の発現
量を測定し、 3).無処理の腫瘍細胞と比較して、第3表に記載の遺伝
子の発現量が増加し、または第4表に記載の遺伝子の発
現量が減少する場合に、該腫瘍細胞が該抗癌剤に対して
感受性であると判定する、工程を含んで成る。
The assay method according to the second aspect of the present invention is
1). A tumor cell taken out from a cancer patient is treated with an anticancer agent represented by the following general formula (I), and 2). A group of the tumor cell containing the genes shown in Tables 3 and 4 The expression level of one or more genes selected from 3). The expression level of the genes listed in Table 3 is increased, or the expression levels of the genes listed in Table 3 are increased as compared to untreated tumor cells. Determining that the tumor cell is susceptible to the anti-cancer agent when the expression level of the gene is decreased.

【0030】本発明における抗癌剤は、上記一般式
(I)で表されるスルホンアミド誘導体及びスルホン酸
エステル誘導体である。
The anticancer agent in the present invention is a sulfonamide derivative or a sulfonate derivative represented by the above general formula (I).

【0031】上記一般式(I)において、A環の意味す
る「置換基を有していてもよい、単環式または二環式芳
香環」とは、芳香族炭化水素、または窒素原子、酸素原
子および硫黄原子のうち少なくとも1個を含む芳香族ヘ
テロ環であり、当該環上には置換基1〜3個があっても
よいものを示す。A環に含まれる主な芳香環を例示する
と、ピロール、ピラゾール、イミダゾール、チオフェ
ン、フラン、チアゾール、オキサゾール、ベンゼン、ピ
リジン、ピリミジン、ピラジン、ピリダジン、ナフタレ
ン、キノリン、イソキノリン、フタラジン、ナフチリジ
ン、キノキサリン、キナゾリン、シンノリン、インドー
ル、イソインドール、インドリジン、インダゾール、ベ
ンゾフラン、ベンゾチオフェン、ベンズオキサゾール、
ベンズイミダゾール、ベンゾピラゾール、ベンゾチアゾ
ールなどがある。上記芳香環は置換基1〜3個を有して
いてもよく、置換基が複数個ある場合には、同一または
異なっていてもよい。置換基としては、例えば、低級ア
ルキル基または低級シクロアルキル基で置換されていて
もよいアミノ基、低級アルキル基、低級アルコキシ基、
水酸基、ニトロ基、メルカプト基、シアノ基、低級アル
キルチオ基、ハロゲン基、式−a−b[式中、aは単結
合、−(CH2)k−、−O−(CH2k−、−S−
(CH2k−または−N(R3)−(CH2k−を、k
は1〜5の整数を、R3は水素原子または低級アルキル
基を、bは−CH2−d(式中、dは低級アルキル基で
置換されていてもよいアミノ基、ハロゲン基、水酸基、
低級アルキルチオ基、シアノ基または低級アルコキシ基
を意味する)を意味する]で示される基、式−a−e−
f[式中、aは前記と同じ意味を、eは−S(O)−ま
たは−S(O)2−を、fは低級アルキル基または低級
アルコキシ基で置換されていてもよいアミノ基、低級ア
ルキル基、トリフルオロメチル基、−(CH2m−bま
たは−N(R4)−(CH2m−b(式中、bは前記と
同じ意味を示し、R4は水素原子または低級アルキル基
を、mは1〜5の整数を意味する)を意味する]で示さ
れる基、式−a−g−h[式中、aは前記と同じ意味を
示し、gは−C(O)−または−C(S)−を、hは低
級アルキル基で置換されていてもよいアミノ基、水酸
基、低級アルキル基、低級アルコキシ基、−(CH2n
−bまたは−N(R5)−(CH2n−b(式中、bは
前記と同じ意味を示し、R5は水素原子または低級アル
キル基を、nは1〜5の整数を意味する)を意味する]
で示される基、式−a−N(R6)−g−i[式中、a
およびgは前記と同じ意味を示し、R6は水素原子また
は低級アルキル基を、iは水素原子、低級アルコキシ基
またはf(fは前記と同じ意味を示す)を意味する]で
示される基、式−a−N(R 7)−e−f(式中、a、
eおよびfは前記と同じ意味を示し、R7は水素原子ま
たは低級アルキル基を意味する)で示される基、または
式−(CH2p−j−(CH2q−b(式中、jは酸素
原子または硫黄原子を意味し、bは前記と同じ意味を示
し、pおよびqは同一または異なって1〜5の整数を意
味する)で示される基などを挙げることができる。
In the above general formula (I), the meaning of ring A is
“A monocyclic or bicyclic aromatic group which may have a substituent
"Aromatic ring" means an aromatic hydrocarbon, or a nitrogen atom, an oxygen source.
Aromatics containing at least one of a child and a sulfur atom
It is a terror ring, and even if there are 1 to 3 substituents on the ring.
Show good things. Illustrates the main aromatic rings contained in ring A
And pyrrole, pyrazole, imidazole, thiophe
Amine, furan, thiazole, oxazole, benzene,
Lysine, pyrimidine, pyrazine, pyridazine, naphthale
Quinoline, isoquinoline, phthalazine, naphthyridine
, Quinoxaline, quinazoline, cinnoline, indo
Le, isoindole, indolizine, indazole,
Nzofuran, benzothiophene, benzoxazole,
Benzimidazole, benzopyrazole, benzothiazo
Etc. The aromatic ring has 1 to 3 substituents
If there are a plurality of substituents, the same or
It may be different. As the substituent, for example, a lower group
Substituted with an alkyl group or a lower cycloalkyl group
Good amino group, lower alkyl group, lower alkoxy group,
Hydroxyl group, nitro group, mercapto group, cyano group, lower alcohol
Kirthio group, halogen group, formula -ab [where a is a single bond
-(CH2) K-, -O- (CH2)k-, -S-
(CH2)k-Or-N (R3)-(CH2)k-Is k
Is an integer of 1 to 5, R3Is a hydrogen atom or lower alkyl
Group, b is -CH2-D (wherein d is a lower alkyl group)
Optionally substituted amino group, halogen group, hydroxyl group,
Lower alkylthio group, cyano group or lower alkoxy group
A group represented by the formula -a-e-
f [wherein a has the same meaning as described above, and e is -S (O)-or
Or-S (O)2-, F is a lower alkyl group or lower
An amino group which may be substituted with an alkoxy group, a lower group
Alkyl group, trifluoromethyl group,-(CH2)m-B
Or -N (RFour)-(CH2)m-B (where b is the same as above)
Has the same meaning, RFourIs a hydrogen atom or a lower alkyl group
, M means an integer of 1 to 5)].
A group represented by formula -a-g-h [wherein a has the same meaning as described above]
, G is -C (O)-or -C (S)-, and h is low.
Amino group optionally substituted with a primary alkyl group, hydroxy
Group, lower alkyl group, lower alkoxy group,-(CH2)n
-B or -N (RFive)-(CH2)n-B (where b is
Has the same meaning as above, RFiveIs a hydrogen atom or lower alkyl
Kill group, n means an integer of 1 to 5]]
A group represented by formula -a-N (R6) -G-i [in the formula, a
And g have the same meanings as above, R6Is a hydrogen atom
Is a lower alkyl group, i is a hydrogen atom, a lower alkoxy group
Or f (where f has the same meaning as above)]
The group shown, formula -a-N (R 7) -E-f (in the formula, a,
e and f have the same meanings as described above, and R7Is a hydrogen atom
Or a lower alkyl group), or
Formula- (CH2)p-J- (CH2)q-B (where j is oxygen
Means an atom or a sulfur atom, and b has the same meaning as above.
However, p and q are the same or different and are integers of 1 to 5.
A group represented by (taste).

【0032】上記置換基例において、アミノ基が2個の
アルキル基で置換されている場合には、これらのアルキ
ル基が結合して5または6員環を形成していてもよい。
また、A環が水酸基またはメルカプト基を有する含窒素
ヘテロ環である場合には、これらの基が共鳴構造をとる
ことにより、オキソ基またはチオキソ基の形になってい
てもよい。
In the above substituent examples, when the amino group is substituted with two alkyl groups, these alkyl groups may be bonded to each other to form a 5- or 6-membered ring.
When ring A is a nitrogen-containing heterocycle having a hydroxyl group or a mercapto group, these groups may have a resonance structure to form an oxo group or a thioxo group.

【0033】B環の意味する「置換基を有していてもよ
い、6員環式不飽和炭化水素またはヘテロ原子として窒
素原子を1個含む不飽和6員ヘテロ環」とは、一部が水
素化されていてもよい、ベンゼンまたはピリジンであ
り、当該環上に置換基1または2個を有していてもよ
く、置換基が2個ある場合には同一または異なっていて
もよいものを示す。
The "6-membered unsaturated hydrocarbon optionally having a substituent or an unsaturated 6-membered heterocycle containing one nitrogen atom as a heteroatom", which means the ring B, is partially Benzene or pyridine, which may be hydrogenated, may have 1 or 2 substituents on the ring, and if there are 2 substituents, may be the same or different. Show.

【0034】C環の意味する「置換基を有していてもよ
い、窒素原子を1または2個含む5員ヘテロ環」とは、
一部が水素化されていてもよい、ピロール、ピラゾー
ル、イミダゾールであり、当該環上に置換基1または2
個を有していてもよく、置換基が2個ある場合には同一
または異なっていてもよいものを示す。
The "5-membered heterocycle containing 1 or 2 nitrogen atoms, which may have a substituent (s)", which means ring C, means
Pyrrole, pyrazole, imidazole, which may be partially hydrogenated, and the substituent 1 or 2 on the ring.
And the number of substituents is the same or different.

【0035】B環およびC環が有していてもよい置換基
としては、例えば、ハロゲン基、シアノ基、低級アルキ
ル基、低級アルコキシ基、水酸基、オキソ基、式−C
(O)−r(式中、rは水素原子、低級アルキル基で置
換されていてもよいアミノ基、低級アルキル基、低級ア
ルコキシ基または水酸基を意味する)、低級アルキル基
で置換されていてもよいアミノ基、トリフルオロメチル
基などを挙げることができる。
Examples of the substituent which ring B and ring C may have include, for example, halogen group, cyano group, lower alkyl group, lower alkoxy group, hydroxyl group, oxo group, and formula -C.
(O) -r (in the formula, r represents a hydrogen atom, an amino group which may be substituted with a lower alkyl group, a lower alkyl group, a lower alkoxy group or a hydroxyl group), or a lower alkyl group Good amino group, trifluoromethyl group and the like can be mentioned.

【0036】上記一般式(I)において、R1、R2なら
びにA環、B環およびC環が有していてもよい置換基の
定義中の低級アルキル基は、炭素数1〜6の直鎖もしく
は分枝状のアルキル基、例えばメチル基、エチル基、n
−プロピル基、イソプロピル基、n−ブチル基、イソブ
チル基、sec−ブチル基、tert−ブチル基、n−ペンチ
ル基(アミル基)、イソペンチル基、ネオペンチル基、
tert−ペンチル基、1−メチルブチル基、2−メチルブ
チル基、1,2−ジメチルプロピル基、n−ヘキシル
基、イソヘキシル基、1−メチルペンチル基、2−メチ
ルペンチル基、3−メチルペンチル基、1,1−ジメチ
ルブチル基、1,2−ジメチルブチル基、2,2−ジメ
チルブチル基、1,3−ジメチルブチル基、2,3−ジ
メチルブチル基、3,3−ジメチルブチル基、1−エチ
ルブチル基、2−エチルブチル基、1,1,2−トリメ
チルプロピル基、1,2,2−トリメチルプロピル基、
1−エチル−1−メチルプロピル基、1−エチル−2−
メチルプロピル基などを意味する。これらのうち好まし
い基としては、メチル基、エチル基、n−プロピル基、
イソプロピル基、n−ブチル基、イソブチル基などを挙
げることができ、これらのうち、最も好ましい基として
はメチル基、エチル基、n−プロピル基、イソプロピル
基を挙げることができる。
In the above general formula (I), R 1 and R 2 and the lower alkyl group in the definition of the substituent which ring A, ring B and ring C may have are a straight-chain alkyl group having 1 to 6 carbon atoms. Chain or branched alkyl groups such as methyl, ethyl, n
-Propyl group, isopropyl group, n-butyl group, isobutyl group, sec-butyl group, tert-butyl group, n-pentyl group (amyl group), isopentyl group, neopentyl group,
tert-pentyl group, 1-methylbutyl group, 2-methylbutyl group, 1,2-dimethylpropyl group, n-hexyl group, isohexyl group, 1-methylpentyl group, 2-methylpentyl group, 3-methylpentyl group, 1 , 1-dimethylbutyl group, 1,2-dimethylbutyl group, 2,2-dimethylbutyl group, 1,3-dimethylbutyl group, 2,3-dimethylbutyl group, 3,3-dimethylbutyl group, 1-ethylbutyl Group, 2-ethylbutyl group, 1,1,2-trimethylpropyl group, 1,2,2-trimethylpropyl group,
1-ethyl-1-methylpropyl group, 1-ethyl-2-
It means a methylpropyl group or the like. Of these, preferred groups include a methyl group, an ethyl group, an n-propyl group,
An isopropyl group, an n-butyl group, an isobutyl group and the like can be mentioned, and among these, a methyl group, an ethyl group, an n-propyl group and an isopropyl group can be mentioned as the most preferable group.

【0037】A環が有していてもよい置換基の定義中の
低級シクロアルキル基は、炭素数3〜8のシクロアルキ
ル基を意味し、例えばシクロプロピル基、シクロペンチ
ル基、シクロヘキシル基などを挙げることができる。
The lower cycloalkyl group in the definition of the substituent which the ring A may have means a cycloalkyl group having 3 to 8 carbon atoms, and examples thereof include a cyclopropyl group, a cyclopentyl group and a cyclohexyl group. be able to.

【0038】A環、B環およびC環が有していてもよい
置換基の定義中の低級アルコキシ基とは、メトキシ基、
エトキシ基、n−プロポキシ基、イソプロポキシ基、n
−ブトキシ基、イソブトキシ基、tert−ブトキシ基など
上記の低級アルキル基から誘導されるアルコキシ基を意
味するが、これらのうち最も好ましい基としてはメトキ
シ基、エトキシ基を挙げることができる。低級アルキル
チオ基は、上記の低級アルキル基から誘導されるアルキ
ルチオ基を意味する。またハロゲン原子としてはフッ素
原子、塩素原子、臭素原子などが挙げられる。
The lower alkoxy group in the definition of the substituent which ring A, ring B and ring C may have is a methoxy group,
Ethoxy group, n-propoxy group, isopropoxy group, n
It means an alkoxy group derived from the above lower alkyl group such as -butoxy group, isobutoxy group and tert-butoxy group, and the most preferable group among these is methoxy group and ethoxy group. The lower alkylthio group means an alkylthio group derived from the above lower alkyl group. Further, examples of the halogen atom include a fluorine atom, a chlorine atom and a bromine atom.

【0039】上記一般式(I)で示されるスルホンアミ
ド誘導体またはスルホン酸エステル誘導体は酸または塩
基と塩を形成する場合もある。本発明における抗癌剤は
一般式(I)で示される化合物の塩をも包含する。酸と
の塩としては、たとえば塩酸塩、臭化水素酸塩、硫酸塩
等の無機酸塩や酢酸、乳酸、コハク酸、フマル酸、マレ
イン酸、クエン酸、安息香酸、メタンスルホン酸、p−
トルエンスルホン酸などの有機酸との塩を挙げることが
できる。また、塩基との塩としては、ナトリウム塩、カ
リウム塩、カルシウム塩などの無機塩、トリエチルアミ
ン、アルギニン、リジン等の有機塩基との塩を挙げるこ
とができる。
The sulfonamide derivative or sulfonate derivative represented by the general formula (I) may form a salt with an acid or a base. The anticancer agent in the present invention also includes a salt of the compound represented by the general formula (I). Examples of the salt with an acid include inorganic acid salts such as hydrochloride, hydrobromide and sulfate, acetic acid, lactic acid, succinic acid, fumaric acid, maleic acid, citric acid, benzoic acid, methanesulfonic acid, p-
Mention may be made of salts with organic acids such as toluenesulfonic acid. Examples of the salt with a base include inorganic salts such as sodium salt, potassium salt and calcium salt, and salts with organic base such as triethylamine, arginine and lysine.

【0040】また、これら化合物の水和物はもちろんの
こと光学異性体が存在する場合はそれらすべてが含まれ
ることはいうまでもない。また、本発明における抗癌剤
は強い抗腫瘍活性を示すが、生体内で酸化、還元、加水
分解、抱合などの代謝を受けて抗腫瘍活性を示す化合物
をも包含する。またさらに、本発明における抗癌剤は生
体内で酸化、還元、加水分解などの代謝を受けて一般式
(I)で示される化合物を生成する化合物をも包含す
る。
It goes without saying that not only hydrates of these compounds but also all optical isomers are included when they exist. Further, the anticancer agent of the present invention includes a compound that exhibits a strong antitumor activity, but exhibits an antitumor activity by being metabolized in vivo by metabolism such as oxidation, reduction, hydrolysis and conjugation. Furthermore, the anticancer agent in the present invention also includes a compound which undergoes metabolism such as oxidation, reduction and hydrolysis in vivo to produce the compound represented by the general formula (I).

【0041】感受性を検定する腫瘍細胞は、一般式
(I)で表される抗癌剤に対して感受性を示すものであ
れば、特に限定されない。例えば、大腸癌、肺癌、乳
癌、白血病、膵臓癌、腎臓癌、メラノーマ、悪性リンパ
腫、頭頸部癌、胃癌などに由来する腫瘍細胞が挙げられ
る。
The tumor cells to be tested for sensitivity are not particularly limited as long as they show sensitivity to the anticancer drug represented by the general formula (I). Examples thereof include tumor cells derived from colon cancer, lung cancer, breast cancer, leukemia, pancreatic cancer, kidney cancer, melanoma, malignant lymphoma, head and neck cancer, gastric cancer and the like.

【0042】癌患者から取り出された腫瘍細胞は、癌患
者から摘出された癌組織に含まれる腫瘍細胞も包含され
る。
The tumor cells taken out from the cancer patient also include the tumor cells contained in the cancer tissue extracted from the cancer patient.

【0043】第1の態様の検定方法の場合には、癌患者
が取り出された腫瘍細胞は、一般式(I)で表される抗
癌剤が、腫瘍細胞の感受性が測定可能となる量投与され
ている癌患者から取り出された腫瘍細胞であればよく、
通常には100〜1500 mgの用量で1〜14日間投与された
癌患者から取り出された腫瘍細胞である。
In the case of the assay method of the first aspect, the tumor cells taken out from a cancer patient are administered with an anticancer agent represented by the general formula (I) in an amount such that the sensitivity of the tumor cells can be measured. Tumor cells taken from a living cancer patient,
Tumor cells removed from a cancer patient, usually administered at a dose of 100-1500 mg for 1-14 days.

【0044】第2の態様の検定方法の場合には、癌患者
から取り出された腫瘍細胞に、一般式(I)で表される
抗癌剤を作用させる条件は、腫瘍細胞の感受性が測定可
能となるものであればよく、通常には、培地中0.01〜10
μMの抗癌剤濃度で、6〜72時間の培養という条件が
挙げられる。
In the case of the assay method of the second aspect, the sensitivity of tumor cells can be measured under the condition that the anticancer agent represented by the general formula (I) is allowed to act on the tumor cells taken out from the cancer patient. Anything can be used, usually 0.01 to 10 in the medium.
A condition of culturing for 6 to 72 hours at an anticancer agent concentration of μM can be mentioned.

【0045】遺伝子の発現量の測定は、遺伝子の転写産
物であるRNAまたは遺伝子産物である蛋白質を定量する
ことにより行うことができる。RNAまたは蛋白質の定量
は、通常には、腫瘍細胞からRNAまたは蛋白質を抽出
し、抽出物中のRNAまたは蛋白質を定量することによっ
て行うことができる。以下、1.RNAまたは蛋白質の抽
出、2.RNAの定量、3.蛋白質の定量の順に、それら
の例を詳細に説明する。
The expression level of a gene can be measured by quantifying RNA, which is a transcription product of a gene, or protein, which is a gene product. Quantification of RNA or protein can usually be performed by extracting RNA or protein from tumor cells and quantifying RNA or protein in the extract. Below, 1. RNA or protein extraction, 2. RNA quantification, 3. These examples will be described in detail in the order of protein quantification.

【0046】1.RNAの抽出 1).一般式(I)で表される抗癌剤を投与された患者の
癌組織からの、RNAまたは蛋白質の抽出 一般式(I)で表される抗癌剤を投与された患者より、
バイオプシ等で摘出された癌組織から以下に述べる方法
で、RNAまたは蛋白質を抽出する。
1. Extraction of RNA 1). Extraction of RNA or Protein from Cancer Tissue of Patients Receiving Anticancer Agent Represented by General Formula (I) From patients administered anticancer agent represented by General Formula (I),
RNA or protein is extracted from the cancer tissue extracted by biopsy or the like by the method described below.

【0047】RNAの抽出は、一般的なRNA抽出法に従って
行えばよい。例えばTRIZOL試薬(ライフテックオリエン
タル)等を用いて、添付の操作法に従って行えばよい。
具体的には以下のとおりである。癌組織50〜100 mgに対
して1 mlのTRIZOL試薬を加え、テフロン(登録商標)ホ
モジェナイザーを用いて均一化する。これを遠心し(1
2,000 x g、10分間、4℃)、得られた上清を室温で5分
間放置後、使用したTRIZOL試薬1 mlに対して0.2 mlの割
合でクロロフォルムを添加する。この溶液を15秒間激し
く振盪、攪拌し室温で2〜3分間放置後遠心を行う(12,0
00 x g、15分間、4℃)。遠心後、水層を新しいチュー
ブに移し、使用したTRIZOL試薬1 mlに対して0.5 mlの割
合でイソプロピルアルコールを加え、室温で10分間放置
後、遠心を行う(12,000 x g、10分間、4℃)。得られ
た沈殿を75%エタノールにて洗浄した後、風乾し、全RNA
として以降の操作に供する。
RNA may be extracted according to a general RNA extraction method. For example, TRIZOL reagent (Lifetech Oriental) or the like may be used according to the attached operation method.
Specifically, it is as follows. 50 ml of cancer tissue is added with 1 ml of TRIZOL reagent and homogenized using a Teflon (registered trademark) homogenizer. Centrifuge this (1
(2,000 xg, 10 minutes, 4 ° C), and leave the obtained supernatant at room temperature for 5 minutes, and then add chloroform at a ratio of 0.2 ml to 1 ml of the TRIZOL reagent used. This solution is shaken vigorously for 15 seconds, stirred, left at room temperature for 2-3 minutes, and then centrifuged (12,0
00 xg, 15 minutes, 4 ° C). After centrifugation, transfer the aqueous layer to a new tube, add 0.5 ml of isopropyl alcohol to 1 ml of TRIZOL reagent used, leave it at room temperature for 10 minutes, and then centrifuge (12,000 xg, 10 minutes, 4 ° C). . The obtained precipitate was washed with 75% ethanol and then air-dried to obtain total RNA.
To be used for the subsequent operations.

【0048】癌組織からの蛋白質の抽出は、Bollag, D.
M., Rozycki M. D., Edelstein S.J., Protein Method
s, 1996, Wiley-Liss, Inc., New York, U.S.A. Walke
r,J. M., The protein handbook, 1996, Humana Press,
New Jersey, U.S.A.等に記載の方法に従って行えばよ
い。
Extraction of proteins from cancer tissue is described by Bollag, D.
M., Rozycki MD, Edelstein SJ, Protein Method
s, 1996, Wiley-Liss, Inc., New York, USA Walke
r, JM, The protein handbook, 1996, Humana Press,
It may be performed according to the method described in New Jersey, USA and the like.

【0049】2).一般式(I)で表される抗癌剤の存在
下で培養した癌細胞からの、RNAまたは蛋白質の抽出 患者よりバイオプシ等で得られた癌組織から、定法に従
い癌細胞(腫瘍細胞)を分離する。例えばHamburgerら
(Hamburger A., Salmon S. E., Kim M. B., Trent J.
M., Soehnlen B. J., Alberts D. S., and Schmidt H.
t., Cancer Res., 38, 3438-3443, 1978)に従い、得ら
れた組織を無菌的に細切し、その後ステンレスメッシ
ュ、注射針、さらにはナイロンメッシュ等を用いて細胞
の懸濁液を調製する。こうして得られた細胞を適当な培
地(例えば、10〜15%FCSを含むRPMI-1640、MEM、McCoy
培地等)に培養する。得られた癌細胞を一般式(I)で
表される抗癌剤の存在下に適当な期間、好ましくは3時
間・6時間・12時間あるいは24時間、更に好ましくは12
時間5%CO2条件下37℃にて培養し、以下に述べる方法
で、RNAまたは蛋白質を抽出する。なお、使用するバイ
オプシ等で得られた組織中から軟寒天培養法(Hamburge
r A., and Salmon S. E., Science, 197, 461-463,197
7、Hamburger A., and Salmon S. E., J. Clin. Inves
t., 60, 846-854, 1977、Von Hoff D. D., and Johnso
n, G. E., Proc. Am. Assoc. Cancer Res., 20, 51, 19
79)を用いて、癌細胞のみを特異的に分離して用いるこ
とも可能である。
2). Extraction of RNA or protein from cancer cells cultivated in the presence of the anticancer agent represented by the general formula (I) From a cancer tissue obtained by biopsy from a patient, cancer cells (tumor Cells). For example, Hamburger et al. (Hamburger A., Salmon SE, Kim MB, Trent J.
M., Soehnlen BJ, Alberts DS, and Schmidt H.
T., Cancer Res., 38, 3438-3443, 1978), aseptically cut the obtained tissue, and then use a stainless mesh, an injection needle, a nylon mesh, etc. to suspend the cell suspension. Prepare. The cells thus obtained were mixed with an appropriate medium (for example, RPMI-1640 containing 10 to 15% FCS, MEM, McCoy
Culture the medium). The obtained cancer cells are treated in the presence of the anticancer agent represented by the general formula (I) for a suitable period of time, preferably 3 hours, 6 hours, 12 hours or 24 hours, more preferably 12 hours.
After culturing at 37 ° C. under 5% CO 2 for an hour, RNA or protein is extracted by the method described below. In addition, the soft agar culture method (Hamburge
r A., and Salmon SE, Science, 197, 461-463,197
7, Hamburger A., and Salmon SE, J. Clin. Inves
t., 60, 846-854, 1977, Von Hoff DD, and Johnso
n, GE, Proc. Am. Assoc. Cancer Res., 20, 51, 19
It is also possible to specifically separate and use only cancer cells by using 79).

【0050】癌細胞からのRNAの抽出は、癌組織からのR
NAの抽出と同様、一般的なRNA抽出法に従って行えばよ
い。例えばTRIZOL試薬(ライフテックオリエンタル)を
用いた場合、添付の操作法に従って行えばよい。具体的
には癌細胞5〜10x106に対して1 mlのTRIZOL試薬を加
え、以下癌組織からのRNAの抽出と同様の操作を行えば
よい。
Extraction of RNA from cancer cells can be performed by extracting R from cancer tissue.
Similar to the extraction of NA, it may be performed according to a general RNA extraction method. For example, when TRIZOL reagent (Lifetech Oriental) is used, it may be performed according to the attached operation method. Specifically, 1 ml of TRIZOL reagent is added to 5 to 10 × 10 6 cancer cells, and then the same operation as RNA extraction from cancer tissue may be performed.

【0051】癌細胞からの蛋白質の抽出についても、癌
組織からの抽出と同様、成書に記載の方法に従えばよ
い。
The extraction of proteins from cancer cells may be performed according to the method described in the textbook, as in the case of extraction from cancer tissues.

【0052】2.RNAの定量 RNAはノーザンブロット解析・DNAマイクロアレイ・RT-P
CR・定量的PCR等の技術により定量できる。好ましくはD
NAマイクロアレイ・定量的PCRであることが好ましい。
以下にそれぞれについて説明するが、本発明はこれによ
り限定されない。
2. Quantification of RNA RNA is analyzed by Northern blot analysis, DNA microarray, RT-P
It can be quantified by techniques such as CR and quantitative PCR. Preferably D
NA microarray / quantitative PCR is preferable.
Each will be described below, but the present invention is not limited thereto.

【0053】DNAマイクロアレイによる定量は次のよう
に行う。最初に得られたRNAを鋳型としてSuperScript C
hoice System(ライフテックオリエンタル)及びT7-d
(T)24プライマーを用いて2本鎖のcDNAを合成し、続いて
そのcDNAを鋳型としてビオチン化したcRNAを合成する。
Quantitation by DNA microarray is performed as follows. SuperScript C using the first RNA obtained as a template
hoice System (Life Tech Oriental) and T7-d
(T) 24 primer is used to synthesize double-stranded cDNA, and then biotinylated cRNA is synthesized using the cDNA as a template.

【0054】具体的には、先ず得られたRNAよりT7-d(T)
24プライマーを用いて1本鎖のDNAを合成し、次いでdNT
P・DNAリガーゼ・DNAポリメラーゼI・RNase Hを添加し
て反応後、更にT4 DNAポリメラーゼIを添加して2本鎖cD
NAを合成する。得られたcDNAを精製後、RNA Transcript
Labeling Kit(Enzo Diagnostics)を用い、ビオチン
化UTPならびにCTPを加えてラベル化反応を行う。反応生
成物を精製後、200 mMトリス酢酸 pH8.1、150 mM 酢酸
マグネシウム、50 mM 酢酸カリウム中で94℃にて35分間
加熱して、断片化したcRNAを得る。
Specifically, first, from the RNA obtained, T7-d (T)
Synthesize single-stranded DNA using 24 primers, then dNT
Double-stranded cD by adding P ・ DNA ligase ・ DNA polymerase I ・ RNase H and then adding T4 DNA polymerase I
Synthesize NA. After purifying the obtained cDNA, RNA Transcript
Using the Labeling Kit (Enzo Diagnostics), the labeling reaction is performed by adding biotinylated UTP and CTP. After purification of the reaction product, it is heated in 200 mM Tris-acetate pH8.1, 150 mM magnesium acetate, 50 mM potassium acetate at 94 ° C for 35 minutes to obtain fragmented cRNA.

【0055】断片化したcRNAを、例えば100 mM MES、1
M ナトリウム塩、20 mM EDTA、0.01% Tween 20中、45℃
にて16時間、GeneChip(Affymetrix)Hu6800あるいは同
等の製品にハイブリダイズさせる。ハイブリダイズ後、
GeneChipはAffymetrix fluidics stationに添付のプロ
トコールEukGE-WS2に従い洗浄・染色する。染色にはス
トレプトアビジン-フィコエリトリンとビオチン化抗ス
トレプトアビジン山羊抗体を用いる。染色後のGeneChip
をHP アルゴンイオンレーザー共焦点顕微鏡(Hewlett P
ackard)を用いてスキャンし、蛍光強度を測定する。こ
の蛍光色素の場合、測定は488 nmの励起光を用い570 nm
の蛍光を測定する。
Fragmented cRNA was isolated, for example, from 100 mM MES, 1
M sodium salt, 20 mM EDTA, 0.01% Tween 20, 45 ° C
Hybridize for 16 hours with GeneChip (Affymetrix) Hu6800 or equivalent product. After hybridizing,
GeneChip is washed and stained according to the protocol EukGE-WS2 attached to the Affymetrix fluidics station. For staining, streptavidin-phycoerythrin and biotinylated anti-streptavidin goat antibody are used. GeneChip after staining
HP Argon Ion Laser Confocal Microscope (Hewlett P
ackard) to measure fluorescence intensity. In the case of this fluorescent dye, the measurement was performed using excitation light of 488 nm and 570 nm.
To measure the fluorescence of.

【0056】定量的データ解析を、好ましくはGeneChip
software(Affymetrix)を用いて行う。RNAの定量を行
うために、それぞれのプローブファミリー毎に「差
([完全マッチハイブリダイゼーションシグナル(perfec
t match hybridization signal)] −[ミスマッチシグナ
ル(mismatch signal)])」の平均(average differenc
e)を求め、この値が50以上であり、かつ2つの条件間
でRNAの定量値が乖離している場合、好ましくは1.8倍以
上解離している場合につき、その遺伝子の発現が有意に
「増加」あるいは「減少」したと判断する。
Quantitative data analysis, preferably GeneChip
This is done using software (Affymetrix). In order to perform RNA quantification, the difference ([perfect match hybridization signal (perfec
t match hybridization signal)]-[mismatch signal]) "
e) is obtained, and when this value is 50 or more and the quantitative value of RNA deviates between the two conditions, preferably when dissociating 1.8 times or more, the expression of the gene is significantly " It is judged to have increased or decreased.

【0057】第3表に記載の1個または複数の遺伝子の
RNA量が増加し、または第4表に記載の1個または複数
の遺伝子のRNA量が減少する場合に、該腫瘍細胞が該抗
癌剤に対して感受性であると判定する。
One or more of the genes listed in Table 3
When the amount of RNA increases or the amount of RNA of one or more genes listed in Table 4 decreases, the tumor cell is determined to be sensitive to the anticancer drug.

【0058】また、定量的PCRはSYBR GreenとABI Prism
7700 Sequence Detection System(Perkin-Elmer Appl
ied Biosystems)を用い、次のように行う。
Quantitative PCR was performed using SYBR Green and ABI Prism.
7700 Sequence Detection System (Perkin-Elmer Appl
ied Biosystems) as follows.

【0059】操作は逆転写反応及びPCR反応の2段階で行
う。最初の段階である逆転写反応は、得られたRNAにdNT
P・oligo d(T)16プライマー・Rnaseインヒビター・Mult
iscribe Reverse Transcriptase(Perkin-Elmer Applie
d Biosystems)を加え、25℃にて10分間保温後、48℃に
て30分間加熱することにより行う。反応を95℃ 5分間加
熱することにより停止させる。
The operation is performed in two steps of reverse transcription reaction and PCR reaction. The first step, reverse transcription, involves dNT
P ・ oligo d (T) 16 primer ・ Rnase inhibitor ・ Mult
iscribe Reverse Transcriptase (Perkin-Elmer Applie
d Biosystems) is added, the mixture is kept at 25 ° C for 10 minutes, and then heated at 48 ° C for 30 minutes. The reaction is stopped by heating at 95 ° C for 5 minutes.

【0060】得られたcDNAを第2段階のPCR反応に供す
る。PCR反応は、例えば4 ng cDNA、1xSYBR PCR バッフ
ァー、3 mM MgCl2、各200μM dATP, dCTP, dGTP、400μ
M dUTP、200 nM プライマー対、0.01 U/μl AmpErase U
NG、0.025 U/μl AmpliTaq Gold DNA Polymerase(Perk
in-Elmer Applied Biosystems)の反応系で行う。反応
条件は、例えば50℃ 2分間、95℃ 10分間に次いで95℃
20秒間・55℃ 20秒間・72℃ 30秒間を40サイクルで行
う。プライマーとプローブは、例えばPrimer Expressio
n(Perkin-Elmer Applied Biosystems)を用いて設計す
る。複数検体の比較は、定量値を各検体の転写量に変動
の少ないハウスキーピング(house keeping)遺伝子、好
ましくはGAPDHのmRNAレベルにより補正して行う。
The obtained cDNA is subjected to the PCR reaction of the second stage. For PCR reaction, for example, 4 ng cDNA, 1xSYBR PCR buffer, 3 mM MgCl 2 , 200 μM each dATP, dCTP, dGTP, 400 μM
M dUTP, 200 nM primer pair, 0.01 U / μl AmpErase U
NG, 0.025 U / μl AmpliTaq Gold DNA Polymerase (Perk
in-Elmer Applied Biosystems). The reaction conditions are, for example, 50 ° C for 2 minutes, 95 ° C for 10 minutes, and then 95 ° C.
Perform 40 cycles of 20 seconds, 55 ° C, 20 seconds, 72 ° C, 30 seconds. Primers and probes are, for example, Primer Expressio
Design using n (Perkin-Elmer Applied Biosystems). The comparison of a plurality of samples is performed by correcting the quantitative value with a house keeping gene, preferably GAPDH mRNA level, in which the transcription amount of each sample has little variation.

【0061】第3表に記載の1個または複数の遺伝子の
RNA量が増加し、または第4表に記載の1個または複数
の遺伝子のRNA量が減少する場合に、該腫瘍細胞が該抗
癌剤に対して感受性であると判定する。
Of one or more of the genes listed in Table 3
When the amount of RNA increases or the amount of RNA of one or more genes listed in Table 4 decreases, the tumor cell is determined to be sensitive to the anticancer drug.

【0062】本発明は、本発明の検定方法において使用
するための、発現量を測定する対称の遺伝子の転写産物
であるRNAに相補的なオリゴヌクレオチドを構成要素と
して含む、RNAの定量試薬も提供する。構成成分となる
オリゴヌクレオチドは、定量的PCRに使用されるプライ
マー及び/またはプローブであり、上述のようにして設
計することができる。本発明のRNAの定量試薬は、上記
オリゴヌクレオチドに加えて、一般の定量試薬において
慣用的な成分を含んでいてもよい。
The present invention also provides a RNA quantification reagent for use in the assay method of the present invention, comprising as a constituent an oligonucleotide complementary to RNA which is a transcription product of a symmetrical gene whose expression level is to be measured. To do. The constituent oligonucleotides are primers and / or probes used in quantitative PCR and can be designed as described above. The RNA quantification reagent of the present invention may contain, in addition to the above-mentioned oligonucleotide, components commonly used in general quantification reagents.

【0063】3.蛋白質の定量 蛋白質は、その活性あるいは抗原性を基に定量するが、
好ましくは蛋白質一般に適用しやすい抗原性を基にした
定量、即ち免疫化学的定量が好ましい。
3. Quantification of protein Protein is quantified based on its activity or antigenicity.
It is preferable to use a quantitative assay based on an antigenic property that is generally applicable to proteins, that is, an immunochemical assay.

【0064】蛋白質に対する抗体は、そのアミノ酸配列
よりParkerらの報告(Parker J. M.R., Guo D., Hodges
R. S., Biochemistry, 25,5425, 1986)あるいはKarpl
usらの報告(Karplus P. A., Schulz G. E., Naturwiss
enschaften, 72, 212, 1985)に基づいて抗原決定基を
予測し、ペプチドを合成し、あるいは融合蛋白例えばグ
ルタチオン合成酵素(GST)との融合蛋白を発現させて
グルタチオンカラムで精製して、抗原を作製し、得られ
た抗原を家兎・マウス等に免疫してポリクローナル、好
ましくはモノクローナル抗体(Harlow E., Lane D., An
tibodies: ALaboratory Manual, 1988, Cold Spring Ha
rbor Laboratory Press, New York)を作製することが
できる。また、市販の抗体が利用可能な場合は、特異性
を確かめた上で使うことも許される。
The antibody against the protein was reported by Parker et al. From its amino acid sequence (Parker JMR, Guo D., Hodges.
RS, Biochemistry, 25,5425, 1986) or Karpl
Report from us et al. (Karplus PA, Schulz GE, Naturwiss
Enschaften, 72, 212, 1985) to predict an antigenic determinant, synthesize a peptide, or express a fusion protein such as a fusion protein with glutathione synthase (GST) and purify it with a glutathione column to purify the antigen. Rabbits, mice, etc. are immunized with the obtained antigens, and polyclonal, preferably monoclonal antibodies (Harlow E., Lane D., An
tibodies: ALaboratory Manual, 1988, Cold Spring Ha
rbor Laboratory Press, New York) can be produced. In addition, if a commercially available antibody is available, it can be used after confirming its specificity.

【0065】得られた抗体を用い、例えば酵素免疫測定
法(石川栄治他、医学書院、1982)またはEnzyme Immun
oassay(Ishikawa E., Kawai T., Miyai, K., Igaku-Sh
oin,Tokyo New York, 1981)に記載の方法によりELISA
あるいはRIAを行い蛋白質を定量する。蛋白質が腫瘍細
胞外に分泌されるものである場合には、腫瘍細胞から蛋
白質を抽出をすることなく培地中の蛋白質を定量するこ
とが可能である。
Using the obtained antibody, for example, an enzyme immunoassay (Eiji Ishikawa et al., Ikusho Shoin, 1982) or Enzyme Immun
oassay (Ishikawa E., Kawai T., Miyai, K., Igaku-Sh
ELISA, by the method described in Oin, Tokyo New York, 1981).
Alternatively, RIA is performed to quantify the protein. When the protein is secreted outside the tumor cells, it is possible to quantify the protein in the medium without extracting the protein from the tumor cells.

【0066】第3表に記載の1個または複数の遺伝子の
蛋白質量が増加し、あるいは第4表に記載の1個または
複数の遺伝子の蛋白質量が減少する場合に、該腫瘍細胞
が該抗癌剤に対して感受性であると判定する。
When the protein amount of one or more genes shown in Table 3 is increased or the protein amount of one or more genes shown in Table 4 is decreased, the tumor cells are treated with the anticancer agent. To be sensitive to.

【0067】本発明は、本発明の検定方法において使用
するための、該蛋白質に対する抗体を構成要素として含
む免疫測定試薬も提供する。構成成分となる抗体は、上
述のようにして得ることができる。本発明の免疫測定試
薬は、上記抗体に加えて、一般の免疫測定試薬において
慣用的な成分を含んでいてもよい。
The present invention also provides an immunoassay reagent containing an antibody against the protein as a constituent for use in the assay method of the present invention. The antibody as a component can be obtained as described above. The immunoassay reagent of the present invention may contain components commonly used in general immunoassay reagents, in addition to the above-mentioned antibody.

【0068】[0068]

【実施例】以下に、具体的な例をもって本発明を示す
が、本発明はこれに限られるものではない。
EXAMPLES The present invention will be described below with reference to specific examples, but the present invention is not limited thereto.

【0069】[0069]

【実施例1】 E7070感受性株及び耐性株の培養とRNAの
抽出 全ての細胞は10%の胎児牛血清、100 units/mlのペニシ
リン、100 mg/mlのストレプトマイシンを添加したRPMI-
1640培地を用いて5%CO2条件下37℃にて培養した。
Example 1 Culture of E7070-sensitive strain and resistant strain and extraction of RNA All cells were RPMI-supplemented with 10% fetal bovine serum, 100 units / ml penicillin, and 100 mg / ml streptomycin.
The cells were cultured in 1640 medium at 37 ° C. under 5% CO 2 .

【0070】E7070 または下記に構造式を示すER-35748
もしくはER-68487をE7070感受性株HCT116-C9及びE7070
耐性株HCT116-C9-C1の培地に8μMの濃度で添加して培養
し、0, 3, 6, 12時間後の細胞を回収した。また、薬剤
を加えずに12時間培養した細胞も同様に回収した。
E7070 or ER-35748 whose structural formula is shown below
Alternatively, ER-68487 is used as an E7070 sensitive strain HCT116-C9 and E7070
The cells were added at a concentration of 8 μM to the medium of the resistant strain HCT116-C9-C1 and cultured, and the cells after 0, 3, 6, 12 hours were collected. Similarly, cells cultured for 12 hours without adding a drug were also collected.

【0071】[0071]

【化5】 [Chemical 5]

【0072】これらの細胞より全RNAを抽出しその後の
解析に供した。薬剤添加12時間後の細胞から抽出したRN
Aならびに薬剤を添加せずに12時間培養した細胞から抽
出したRNAを実施例2に示すDNAマイクロアレイによる遺
伝子発現解析に用いた。なお、HCT116-C9はヒト大腸癌
由来HCT116(American Type Culture Collection, Mana
ssas, VA, U.S.A.)から分離した亜株であり、このHCT1
16-C9をE7070存在下培養、E7070濃度を漸次的に上昇さ
せることにより得たE7070耐性亜株がHCT116-C9-C1であ
る。
Total RNA was extracted from these cells and subjected to the subsequent analysis. RN extracted from cells 12 hours after drug addition
RNA extracted from cells cultured for 12 hours without addition of A and a drug was used for gene expression analysis by the DNA microarray described in Example 2. HCT116-C9 is human colon cancer-derived HCT116 (American Type Culture Collection, Mana
ssas, VA, USA)
HCT116-C9-C1 is an E7070-resistant substrain obtained by culturing 16-C9 in the presence of E7070 and gradually increasing the E7070 concentration.

【0073】同様にE7070をE7070感受性株LX-1及びE707
0耐性株LX-1-E2の培地に8μMの濃度で添加して培養し、
0, 3, 6, 12時間後の細胞を回収した。これらの細胞よ
り全RNAを抽出しその後の解析に供した。なお、LX-1(C
ancer Chemotherapy Center,Japan Foundation for Can
cer Research, Tokyo, Japan)はヒト小細胞性肺癌由来
の細胞株であり、このLX-1をE7070存在下培養、E7070濃
度を漸次的に上昇させることにより得たE7070耐性亜株
がLX-1-E2である。
Similarly, E7070 was replaced with E7070 sensitive strains LX-1 and E707.
Add to the culture medium of 0-resistant strain LX-1-E2 at a concentration of 8 μM and culture,
The cells after 0, 3, 6 and 12 hours were collected. Total RNA was extracted from these cells and subjected to subsequent analysis. LX-1 (C
ancer Chemotherapy Center, Japan Foundation for Can
cer Research, Tokyo, Japan) is a cell line derived from human small cell lung cancer. E7070 resistant substrain obtained by culturing this LX-1 in the presence of E7070 and gradually increasing the E7070 concentration was LX-1. -It's E2.

【0074】使用した細胞株HCT116-C9、HCT116-C9-C
1、LX-1、LX-1-E2にE7070を添加し72時間培養し、MTT法
(Mosmann T., J. Immunol. Methods, 65, 55, 1983)
により測定した細胞増殖抑制曲線を図1に示す。実際の
操作はCellTiter 96 Non-Radioactive Cell Proliferat
ion Assay(Promega, Madison, WI)を用いて、添付の
操作法に従って行った。
Cell lines used HCT116-C9, HCT116-C9-C
1, LX-1, LX-1-E2 with E7070 added and cultured for 72 hours, MTT method (Mosmann T., J. Immunol. Methods, 65, 55, 1983)
The cell growth inhibition curve measured by the method is shown in FIG. Actual operation is CellTiter 96 Non-Radioactive Cell Proliferat
Ion Assay (Promega, Madison, WI) was used according to the attached procedure.

【0075】回収した細胞からの全RNAの抽出は、TRIZO
L試薬(ライフテックオリエンタル)を用いて添付の操
作法に従って行った。
Extraction of total RNA from the recovered cells was performed using TRIZO
The procedure was carried out using L reagent (Lifetech Oriental) according to the attached procedure.

【0076】[0076]

【実施例2】 DNAマイクロアレイによる遺伝子発現解
析 1).cDNA合成とビオチン標識 実施例1で得られたRNAを100μlのジエチルピロカーボ
ネート(DEPC)処理をした滅菌水に溶解し、さらにRNea
syカラム(QIAGEN)を用いて精製し、SuperScript Choi
ce System(ライフテックオリエンタル)及びT7-d(T)24
プライマーを用いて2本鎖のcDNAを合成した。
[Example 2] Gene expression analysis by DNA microarray 1). CDNA synthesis and biotin labeling The RNA obtained in Example 1 was dissolved in 100 μl of sterile water treated with diethylpyrocarbonate (DEPC), and further RNea
Purified using sy column (QIAGEN), SuperScript Choi
ce System (Life Tech Oriental) and T7-d (T) 24
Double-stranded cDNA was synthesized using the primers.

【0077】まず10μgのRNAに5μMのT7-d(T)24プライ
マー、1x First strand buffer、10mM DTT、500μMのdN
TP mix、20 units/μlのSuperScript II Reverse Trans
criptaseを加え、42℃にて1時間反応させ1本鎖DNAを合
成した。続いて1x Second strand buffer、200μMのdNT
P mix、67 U/ml DNA ligase、270 U/ml DNAポリメラー
ゼI、13 U/ml RNase Hを添加して16℃にて2時間反応さ
せ2本鎖cDNAを合成した。さらに67 U/ml T4 DNAポリメ
ラーゼIを添加して16℃にて5分間反応させたのち、10μ
lの0.5 M EDTAを加え反応を停止した。
First, 10 μg of RNA was added to 5 μM of T7-d (T) 24 primer, 1x First strand buffer, 10 mM DTT, and 500 μM of dN.
TP mix, 20 units / μl SuperScript II Reverse Trans
Criptase was added and reacted at 42 ° C for 1 hour to synthesize single-stranded DNA. Then 1x Second strand buffer, 200 μM dNT
P mix, 67 U / ml DNA ligase, 270 U / ml DNA polymerase I and 13 U / ml RNase H were added and reacted at 16 ° C for 2 hours to synthesize double-stranded cDNA. Further, 67 U / ml T4 DNA polymerase I was added and reacted at 16 ° C for 5 minutes.
The reaction was stopped by adding l of 0.5 M EDTA.

【0078】得られたcDNAをフェノール/クロロフォル
ムにて精製し、RNA Transcript Labeling Kit(Enzo Di
agnostics)を用い、添付の操作法に従って、ビオチン
化UTPならびにCTPによるラベル化反応を行った。反応生
成物をRneasyカラムにて精製後、200 mM トリス酢酸 pH
8.1、150 mM 酢酸マグネシウム、50 mM 酢酸カリウム中
で94℃にて35分間加熱してcRNAを断片化した。
The obtained cDNA was purified with phenol / chloroform, and RNA Transcript Labeling Kit (Enzo Di
agnostics) and a labeling reaction with biotinylated UTP and CTP was performed according to the attached procedure. After purifying the reaction product with Rneasy column, 200 mM Tris-acetate pH
The cRNA was fragmented by heating in 8.1, 150 mM magnesium acetate, 50 mM potassium acetate at 94 ° C. for 35 minutes.

【0079】2).DNAマイクロアレイ(GeneChip)へのハ
イブリダイズと測定 断片化したcRNAを、100 mM MES、1 M ナトリウム塩、20
mM EDTA、0.01% Tween 20中、45℃にて16時間、GeneCh
ip(Affymetrix)Hu6800にハイブリダイズさせた。ハイ
ブリダイズ後、GeneChipはAffymetrix fluidics statio
nに添付のプロトコールEukGE-WS2に従い洗浄・染色し
た。染色にはストレプトアビジン-フィコエリトリンと
ビオチン化抗ストレプトアビジン山羊抗体を用いた。染
色後のGeneChipをHP アルゴンイオンレーザー共焦点顕
微鏡(Hewlett Packard)を用いてスキャンし、蛍光強
度を測定した。測定は、488 nmの励起光を用い570 nmの
蛍光で行った。
2). Hybridization to DNA microarray (GeneChip) and measurement Fragmented cRNA was treated with 100 mM MES, 1 M sodium salt, 20 mM.
16 hours at 45 ° C in mM EDTA, 0.01% Tween 20, GeneCh
Hybridized to ip (Affymetrix) Hu6800. After hybridization, GeneChip will be Affymetrix fluidics statio
The cells were washed and stained according to the protocol EukGE-WS2 attached to n. For staining, streptavidin-phycoerythrin and biotinylated anti-streptavidin goat antibody were used. The stained GeneChip was scanned using an HP argon ion laser confocal microscope (Hewlett Packard), and the fluorescence intensity was measured. The measurement was performed with excitation light of 488 nm and fluorescence of 570 nm.

【0080】定量的データ解析は全てGeneChip softwar
e(Affymetrix)を用いて行った。RNAの定量を行うため
に、それぞれのプローブファミリー毎に「差([完全マ
ッチハイブリダイゼーションシグナル(perfect match h
ybridization signal)] −[ミスマッチシグナル(mismat
ch signal)])」の平均(average difference)を求
め、この値が50以上であり、かつ2つの条件間でRNAの
定量値が乖離している場合、好ましくは1.8倍以上解離
している場合につき、その遺伝子の発現が有意に「増
加」あるいは「減少」したと判断した。
GeneChip softwar is used for all quantitative data analysis.
e (Affymetrix). To perform RNA quantification, the difference ([perfect match hybridization signal (perfect match h
ybridization signal)]-[Mismatch signal (mismat
ch signal)]) ”, the average (average difference) is calculated, and when this value is 50 or more and the quantitative value of RNA deviates between two conditions, preferably 1.8 times or more dissociation Therefore, it was judged that the expression of the gene was significantly “increased” or “decreased”.

【0081】E7070 またはER-35748、ER-68487をHCT116
-C9の培地に8μMの濃度で添加して培養し、12時間後に
細胞から抽出したRNAのGeneChipによる解析結果を、薬
剤を加えないで同様の操作により得たHCT116-C9細胞のR
NA解析結果と比較した。この結果、E7070 、ER-35748、
ER-68487の3種の薬剤の処理により、共通してその発現
が上昇した遺伝子のリスト(GenBankの登録番号もあわ
せて示す(以下の表において同じ))を第1表に、同様に
3種の薬剤の処理により共通してその発現が減少した遺
伝子のリストを第2表に示す。
E7070 or ER-35748, ER-68487 to HCT116
-C9 medium was added at a concentration of 8 μM and cultured, and 12 hours later, the results of analysis by GeneChip of RNA extracted from the cells were obtained by the same procedure without adding a drug, and the RCT of HCT116-C9 cells was obtained.
It was compared with the NA analysis results. As a result, E7070, ER-35748,
Table 1 shows a list of genes whose expression was commonly increased by the treatment of 3 agents of ER-68487 (also showing the GenBank accession numbers (same in the table below)). Table 2 shows a list of genes whose expression was commonly reduced by the treatment with the drug.

【0082】[0082]

【表1】 [Table 1]

【0083】[0083]

【表2】 [Table 2]

【0084】[0084]

【表3】 [Table 3]

【0085】[0085]

【表4】 [Table 4]

【0086】[0086]

【表5】 [Table 5]

【0087】[0087]

【表6】 [Table 6]

【0088】第1表及び第2表に示した遺伝子に関し、
E7070耐性株2株(C9-C1及びC9-C1と同様の方法により
得られた別の耐性株(C9-C4))を用い、上記と同様に、8
μMのE7070で12時間処理した後に、遺伝子の変動をGen
eChipにより解析した。この結果、1.8倍以上発現が
増加または減少する遺伝子は両株において認められなか
った。
Regarding the genes shown in Tables 1 and 2,
Using two E7070 resistant strains (C9-C1 and another resistant strain (C9-C4) obtained by the same method as C9-C1),
After 12 h treatment with μM E7070
It was analyzed by eChip. As a result, a gene whose expression was increased or decreased 1.8 times or more was not observed in both strains.

【0089】以上の結果から、これら3種の抗癌剤の処
理により共通に変動する遺伝子は、単独または組み合わ
せでその変化を測定することによりE7070及びその関連
化合物の抗腫瘍効果の代理マーカーとして使用できるこ
とが明らかである。
From the above results, it is possible to use, as a surrogate marker for the antitumor effect of E7070 and its related compounds, by measuring the changes in the genes that commonly change due to the treatment with these three anticancer agents, alone or in combination. it is obvious.

【0090】[0090]

【実施例3】 定量的PCRによる遺伝子発現解析 実施例2で得られた遺伝子の発現変動が、腫瘍細胞のE7
070に対する感受性を反映したものであることを確認す
る目的で、実施例1に示したRNAを用いて、E7070感受性
細胞と耐性細胞におけるこれら遺伝子発現の変化をSYBR
GreenとABI Prism 7700 Sequence Detection System
(Perkin-Elmer Applied Biosystems)を用いた定量的P
CRにより検討した。
Example 3 Analysis of Gene Expression by Quantitative PCR The expression variation of the gene obtained in Example 2 was due to the fact that E7 of tumor cells was
For the purpose of confirming that it reflects the sensitivity to 070, the RNA shown in Example 1 was used to detect changes in the expression of these genes in E7070-sensitive cells and resistant cells.
Green and ABI Prism 7700 Sequence Detection System
(Perkin-Elmer Applied Biosystems)
It was examined by CR.

【0091】操作は逆転写反応及びPCR反応の2段階で行
った。最初の段階である逆転写反応は、1μgの全RNAに1
x TaqMan RT buffer、5.5 mM MgCl2、500μMのdNTP mi
x、2.5 μM oligo d(T)16プライマー、0.4 U/μl RNase
Inhibitor、1.25 U/μl Multiscribe Reverse Transcr
iptase(Perkin-Elmer Applied Biosystems)を加え、2
5℃にて10分間保温後、48℃にて30分間加熱することに
より行った。反応を95℃5分間加熱することにより停止
させた。
The operation was performed in two steps of reverse transcription reaction and PCR reaction. The first step, the reverse transcription reaction, required 1 μg of total RNA for 1
x TaqMan RT buffer, 5.5 mM MgCl 2 , 500 μM dNTP mi
x, 2.5 μM oligo d (T) 16 primer, 0.4 U / μl RNase
Inhibitor, 1.25 U / μl Multiscribe Reverse Transcr
Add iptase (Perkin-Elmer Applied Biosystems) and add 2
After keeping the temperature at 5 ° C for 10 minutes, heating was performed at 48 ° C for 30 minutes. The reaction was stopped by heating at 95 ° C for 5 minutes.

【0092】得られたcDNAを第2段階のPCR反応に供し
た。PCR反応は4 ng cDNA、1xSYBR PCRバッファー、3 mM
MgCl2、各200μM dATP, dCTP, dGTP、400μM dUTP、20
0 nMプライマー対、0.01 U/μl AmpErase UNG、0.025 U
/μl AmpliTaq Gold DNA Polymerase(Perkin-Elmer Ap
plied Biosystems)の反応系で行った。反応条件は50℃
2分間、95℃ 10分間に次いで95℃ 20秒間・55℃ 20秒
間・72℃ 30秒間を40サイクルで行った。プライマーはG
APDHは配列番号1及び2、S80343は配列番号3及び4、
U07919は配列番号5及び6、U11791は配列番号7及び
8、M95809は配列番号9及び10、U18291は配列番号1
1及び12、U63743は配列番号13及び14、M61764は
配列番号15及び16に示す塩基配列を有するオリゴヌ
クレオチドを用いた。
The obtained cDNA was subjected to the second stage PCR reaction. PCR reaction is 4 ng cDNA, 1xSYBR PCR buffer, 3 mM
MgCl 2 , 200 μM dATP, dCTP, dGTP, 400 μM dUTP, 20 each
0 nM primer pair, 0.01 U / μl AmpErase UNG, 0.025 U
/ μl AmpliTaq Gold DNA Polymerase (Perkin-Elmer Ap
plied Biosystems). Reaction conditions are 50 ℃
Two cycles of 95 ° C for 10 minutes, 95 ° C for 20 seconds, 55 ° C for 20 seconds, and 72 ° C for 30 seconds were performed for 40 cycles. The primer is G
APDH is SEQ ID NOS: 1 and 2, S80343 is SEQ ID NOS: 3 and 4,
U07919 is SEQ ID NO: 5 and 6, U11791 is SEQ ID NO: 7 and 8, M95809 is SEQ ID NO: 9 and 10, U18291 is SEQ ID NO: 1.
1 and 12, U63743 used the sequence number 13 and 14, and M61764 used the oligonucleotide which has the base sequence shown in sequence number 15 and 16.

【0093】各検体中のmRNA量は蛍光強度を測定するこ
とにより定量した。なお、複数検体の比較においては、
定量値を各検体のGAPDHのmRNA量により補正して行っ
た。薬剤処理0時間における定量値をコントロール(100
%)として、薬剤処理時間と各mRNA量の関係を示したも
のが図2〜図5である。各遺伝子は感受性が最も高いHC
T116-C9で最大の発現変動を示し(図2)、感受性株LX-
1ではHCT116-C9よりは変動の幅は小さいものの、S80343
を除く全ての遺伝子で発現変動を示した(図3)。これ
に対し耐性株HCT116-C9-C1では、全く発現変動が認めら
れず(図4)、実験に用いた8μMの薬剤濃度で多少の増
殖抑制の効果が認められる耐性株LX-1-E2では、U11791
が発現変動を示しM95809およびU18291に僅かな発現変動
が認められた(図5)。
The amount of mRNA in each sample was quantified by measuring the fluorescence intensity. In addition, in the comparison of multiple samples,
The quantitative value was corrected with the amount of GAPDH mRNA of each sample. Control the quantitative value at 0 hours of drug treatment (100
%), The relationship between the drug treatment time and the amount of each mRNA is shown in FIGS. Each gene has the most sensitive HC
T116-C9 showed the largest expression fluctuation (Fig. 2), and the sensitive strain LX-
1 has a smaller fluctuation range than HCT116-C9, but S80343
Expression variation was shown in all genes except (Fig. 3). On the other hand, in the resistant strain HCT116-C9-C1, no change in expression was observed (Fig. 4), and in the resistant strain LX-1-E2, which had some effect of suppressing the growth at the drug concentration of 8 µM used in the experiment. , U11791
Shows the expression variation, and a slight expression variation was observed in M95809 and U18291 (Fig. 5).

【0094】実施例2で示された遺伝子の発現変動はE7
070に対する感受性と相関しており、実施例2で示され
た遺伝子は、単独または組み合わせでその変化を測定す
ることによりE7070及びその関連化合物の抗腫瘍効果の
代理マーカーとして使用できることが確認された。
The expression variation of the gene shown in Example 2 was E7.
It was confirmed that the gene shown in Example 2, which is correlated with the sensitivity to 070, can be used as a surrogate marker for the antitumor effect of E7070 and its related compounds by measuring the change alone or in combination.

【0095】[0095]

【実施例4】 ELISAによる解析 実施例2の第2表に示した遺伝子のうち、細胞外に分泌
されることが報告されているX51956(Human ENO2 gene
for neuron specific (gamma) enolase)について既に
報告されているELISA法(Duncan M. E., McAleese S.
M., Booth N. A., Melvin W. T., and Fothergill J.
E., J. of Immunol. Methods, 151, 227-236, 1992、Ya
maguchi K., Aoyagi K., Urakami K., Fukutani T., Ma
ki N., Yamamoto S., Otsubo K., Miyake Y., and Koda
ma T., Jpn. J. Cancer Res., 86,698-705, 1995)によ
りその発現レベルを検討した。実際の測定には栄研化学
(東京)のNSE ELISA kitを用い、操作は添付の資料に
従った。
[Example 4] Analysis by ELISA Among the genes shown in Table 2 of Example 2, X51956 (Human ENO2 gene), which is reported to be secreted extracellularly
ELISA method already reported for for neuron specific (gamma) enolase (Duncan ME, McAleese S.
M., Booth NA, Melvin WT, and Fothergill J.
E., J. of Immunol. Methods, 151, 227-236, 1992, Ya
maguchi K., Aoyagi K., Urakami K., Fukutani T., Ma
ki N., Yamamoto S., Otsubo K., Miyake Y., and Koda
ma T., Jpn. J. Cancer Res., 86, 698-705, 1995) to examine the expression level. The NSE ELISA kit from Eiken Kagaku (Tokyo) was used for the actual measurement, and the operation was according to the attached data.

【0096】[0096]

【実施例5】 3癌種における遺伝子発現解析 HCT116-C9(ヒト大腸癌細胞株)、MDA-MB-435(ヒト乳
癌細胞株)及びMOLT-4(ヒトTリンパ芽球系白血病細胞
株)の三癌種について、実施例2と同様にして、E7070
(8 μMで12 h処理)による遺伝子発現変化をGene Chip
を用いて調べた。
Example 5 Gene Expression Analysis in Three Cancer Types HCT116-C9 (human colon cancer cell line), MDA-MB-435 (human breast cancer cell line) and MOLT-4 (human T lymphoblastic leukemia cell line) For the three types of cancer, E7070 in the same manner as in Example 2.
Gene Chip changes caused by (8 μM treatment for 12 h)
It investigated using.

【0097】三癌種で共通して1.8培以上発現が亢進さ
れる遺伝子のリストを第3表に示す。また、三癌種で共
通して1.8培以上発現が抑制される遺伝子のリストを第
4表に示す。遺伝的背景の全く異なる癌患者から樹立さ
れたこれら三癌種で共通して発現が変動(亢進または減
少)する遺伝子は、腫瘍細胞に共通するE7070の抗腫瘍
作用メカニズムにより深く関係している可能性が高いの
で、腫瘍細胞のE7070及びその関連化合物に対する感受
性を検定する際に有効なマーカーになり得ると考えられ
る。
Table 3 shows a list of genes whose expression is increased by 1.8 cultures or more in the three cancer types. In addition, Table 4 shows a list of genes whose expression is suppressed in all three cancer types by 1.8 times or more. Genes whose expression is commonly changed (enhanced or decreased) in these three cancer types established from cancer patients with completely different genetic backgrounds may be deeply related to the antitumor action mechanism of E7070 common to tumor cells. Therefore, it is considered that it can be an effective marker when assaying the sensitivity of tumor cells to E7070 and its related compounds.

【0098】[0098]

【表7】 [Table 7]

【0099】[0099]

【表8】 [Table 8]

【0100】[0100]

【表9】 [Table 9]

【0101】[0101]

【表10】 [Table 10]

【0102】[0102]

【発明の効果】本発明により、一般式(I)で表される
抗癌剤を投与した癌患者より取り出された腫瘍細胞の、
第3表及び第4表に記載の遺伝子の発現量を測定するこ
とにより、あるいは癌患者より取り出された腫瘍細胞に
一般式(I)で表される抗癌剤を作用させ、第3表及び
第4表に記載の遺伝子の発現量を測定することにより、
該腫瘍細胞の該抗癌剤に対する感受性を調べることが可
能となる。
INDUSTRIAL APPLICABILITY According to the present invention, tumor cells taken out from a cancer patient to which an anticancer agent represented by the general formula (I) is administered,
By measuring the expression levels of the genes shown in Tables 3 and 4, or by allowing the anti-cancer agent represented by the general formula (I) to act on the tumor cells taken out from the cancer patient, By measuring the expression levels of the genes listed in the table,
It becomes possible to examine the sensitivity of the tumor cells to the anticancer drug.

【0103】[0103]

【配列表】 <110> エーザイ株式会社(Eisai Co., Ltd.) <120> 腫瘍細胞の抗癌剤に対する感受性を検定する方法 <130> P-9401 <150> JP 2000-357398 <151> 2000-11-24 <160> 16 <210> 1 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 1 gaaggtgaag gtcggagtc 19 <210> 2 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 2 gaagatggtg atgggatttc 20 <210> 3 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 3 gcattttacg gttccctgag at 22 <210> 4 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 4 gatacgccac atgttcacct tc 22 <210> 5 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 5 cagaatcaat agcccagaga gctt 24 <210> 6 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 6 gttgtggcgt tagaagattg gatc 24 <210> 7 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 7 gtcattctgc tgagcttgca ctta 24 <210> 8 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 8 gagagattct accaggtcgt catca 25 <210> 9 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 9 ccaagttacg aagctctgtc cat 23 <210> 10 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 10 tgtaggctgt ctggagcatc tct 23 <210> 11 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 11 tgttgattcc tcagaacgca tc 22 <210> 12 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 12 tgtatcatct cgcctaagac caag 24 <210> 13 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 13 atctcaccag gcataagctc ct 22 <210> 14 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 14 acagttcctc ctcttccttg gat 23 <210> 15 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 15 ctcaagaggc tgacgcagaa t 21 <210> 16 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 16 ctggctgaca tgatggtaga cac 23[Sequence list] <110> Eisai Co., Ltd. <120> Method for assaying sensitivity of tumor cells to anticancer drug <130> P-9401 <150> JP 2000-357398 <151> 2000-11-24 <160> 16 <210> 1 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 1 gaaggtgaag gtcggagtc 19 <210> 2 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 2 gaagatggtg atgggatttc 20 <210> 3 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 3 gcattttacg gttccctgag at 22 <210> 4 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 4 gatacgccac atgttcacct tc 22 <210> 5 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 5 cagaatcaat agcccagaga gctt 24 <210> 6 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 6 gttgtggcgt tagaagattg gatc 24 <210> 7 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 7 gtcattctgc tgagcttgca ctta 24 <210> 8 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 8 gagagattct accaggtcgt catca 25 <210> 9 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 9 ccaagttacg aagctctgtc cat 23 <210> 10 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 10 tgtaggctgt ctggagcatc tct 23 <210> 11 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 11 tgttgattcc tcagaacgca tc 22 <210> 12 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 12 tgtatcatct cgcctaagac caag 24 <210> 13 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 13 atctcaccag gcataagctc ct 22 <210> 14 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 14 acagttcctc ctcttccttg gat 23 <210> 15 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 15 ctcaagaggc tgacgcagaa t 21 <210> 16 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 16 ctggctgaca tgatggtaga cac 23

【図面の簡単な説明】[Brief description of drawings]

【図1】 細胞株HCT116-C9、HCT116-C9-C1、LX-1、LX-
1-E2のE7070による細胞増殖抑制曲線を示す。
FIG. 1 Cell lines HCT116-C9, HCT116-C9-C1, LX-1, LX-
The cell growth suppression curve by E7070 of 1-E2 is shown.

【図2】 E7070感受性株HCT116-C9における遺伝子発現
変動の定量的PCRによる解析の結果を示す。
FIG. 2 shows the results of quantitative PCR analysis of gene expression fluctuations in the E7070-sensitive strain HCT116-C9.

【図3】 E7070感受性株LX-1における遺伝子発現変動
の定量的PCRによる解析の結果を示す。
FIG. 3 shows the results of quantitative PCR analysis of gene expression fluctuations in the E7070-sensitive strain LX-1.

【図4】 E7070耐性株HCT116-C9-C1における遺伝子発
現変動の定量的PCRによる解析の結果を示す。
FIG. 4 shows the results of quantitative PCR analysis of gene expression fluctuations in the E7070 resistant strain HCT116-C9-C1.

【図5】 E7070耐性株LX-1-E2における遺伝子発現変動
の定量的PCRによる解析の結果を示す。
FIG. 5 shows the results of quantitative PCR analysis of gene expression changes in the E7070 resistant strain LX-1-E2.

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) G01N 37/00 102 C12N 15/00 A (72)発明者 河合 隆利 茨城県つくば市東2−11−33 (72)発明者 加藤 弘之 茨城県北相馬郡守谷町御所ヶ丘5−25−41 (72)発明者 長洲 毅志 茨城県土浦市永国852−13 Fターム(参考) 4B024 AA12 CA09 HA14 4B063 QA07 QA19 QQ08 QQ43 QQ52 QR32 QR35 QR55 QR62 QR77 QR84 QS25 QS34 QX02 ─────────────────────────────────────────────────── ─── Continuation of front page (51) Int.Cl. 7 Identification code FI theme code (reference) G01N 37/00 102 C12N 15/00 A (72) Inventor Takatoshi Kawai 2-11-33 East, Tsukuba, Ibaraki ( 72) Inventor Hiroyuki Kato 5-25-41 Goshogaoka, Moriya-machi, Kitasoma-gun, Ibaraki Prefecture (72) Takeshi Nagasu 85-23, Nagakuni, Tsuchiura-shi, Ibaraki F-term (reference) 4B024 AA12 CA09 HA14 4B063 QA07 QA19 QQ08 QQ43 QQ52 QR32 QR35 QR55 QR62 QR77 QR84 QS25 QS34 QX02

Claims (10)

【特許請求の範囲】[Claims] 【請求項1】 1).下記一般式(I)で表される抗癌剤
を投与した癌患者より取り出された腫瘍細胞の、第3表
及び第4表に記載の遺伝子からなる群から選択される1
個または複数の遺伝子の発現量を測定し、 2).該癌患者から抗癌剤投与前に取り出された腫瘍細胞
と比較して、第3表に記載の遺伝子の発現量が増加し、
または第4表に記載の遺伝子の発現量が減少する場合
に、該腫瘍細胞が該抗癌剤に対して感受性であると判定
する、工程を含んで成る、該腫瘍細胞の該抗癌剤に対す
る感受性を検定する方法。 【化1】 (式中、A環は、置換基を有していてもよい、単環式ま
たは二環式芳香環を、B環は、置換基を有していてもよ
い、6員環式不飽和炭化水素またはヘテロ原子として窒
素原子を1個含む不飽和6員ヘテロ環を、C環は、置換
基を有していてもよい、窒素原子を1または2個含む5
員ヘテロ環を、Wは単結合または−CH=CH−を、X
は−N(R1)−または酸素原子を、Yは炭素原子また
は窒素原子を、Zは−N(R2)−または窒素原子を、
1およびR2は同一または異なって水素原子または低級
アルキル基を、意味する。)
1. A tumor cell extracted from a cancer patient administered with an anticancer agent represented by the following general formula (I), selected from the group consisting of the genes shown in Tables 3 and 4. 1
2). The expression level of the gene shown in Table 3 is increased as compared with the tumor cells taken out from the cancer patient before administration of the anticancer drug,
Or assaying the susceptibility of the tumor cells to the anti-cancer drug, which comprises the step of determining that the tumor cells are susceptible to the anti-cancer drug when the expression level of the gene shown in Table 4 decreases. Method. [Chemical 1] (In the formula, ring A is a monocyclic or bicyclic aromatic ring which may have a substituent, and ring B is a 6-membered unsaturated carbon ring which may have a substituent. An unsaturated 6-membered heterocycle containing one nitrogen atom as hydrogen or a heteroatom, and C ring containing one or two nitrogen atoms which may have a substituent 5
Membered heterocycle, W is a single bond or -CH = CH-, X
It is -N (R 1) - or an oxygen atom, Y is a carbon atom or a nitrogen atom, Z is -N (R 2) - or a nitrogen atom,
R 1 and R 2 are the same or different and each represents a hydrogen atom or a lower alkyl group. )
【請求項2】 1).癌患者より取り出された腫瘍細胞
に、下記一般式(I)で表される抗癌剤を作用させ、 2).該腫瘍細胞の、第3表及び第4表に記載の遺伝子か
らなる群から選択される1個または複数の遺伝子の発現
量を測定し、 3).無処理の腫瘍細胞と比較して、第3表に記載の遺伝
子の発現量が増加し、または第4表に記載の遺伝子の発
現量が減少する場合に、該腫瘍細胞が該抗癌剤に対して
感受性であると判定する、工程を含んで成る、該腫瘍細
胞の該抗癌剤に対する感受性を検定する方法。 【化2】 (式中、A環は、置換基を有していてもよい、単環式ま
たは二環式芳香環を、B環は、置換基を有していてもよ
い、6員環式不飽和炭化水素またはヘテロ原子として窒
素原子を1個含む不飽和6員ヘテロ環を、C環は、置換
基を有していてもよい、窒素原子を1または2個含む5
員ヘテロ環を、Wは単結合または−CH=CH−を、X
は−N(R1)−または酸素原子を、Yは炭素原子また
は窒素原子を、Zは−N(R2)−または窒素原子を、
1およびR2は同一または異なって水素原子または低級
アルキル基を、意味する。)
2. A tumor cell taken out from a cancer patient is treated with an anticancer agent represented by the following general formula (I), and 2). The tumor cell is shown in Tables 3 and 4. The expression level of one or more genes selected from the group consisting of 3) genes is measured, and 3). The expression level of the genes listed in Table 3 is increased as compared to untreated tumor cells, or A method for assaying the susceptibility of the tumor cell to the anticancer drug, comprising the step of determining that the tumor cell is susceptible to the anticancer drug when the expression level of the gene shown in Table 4 decreases. . [Chemical 2] (In the formula, ring A is a monocyclic or bicyclic aromatic ring which may have a substituent, and ring B is a 6-membered unsaturated carbon ring which may have a substituent. An unsaturated 6-membered heterocycle containing one nitrogen atom as hydrogen or a heteroatom, and C ring containing one or two nitrogen atoms which may have a substituent 5
Membered heterocycle, W is a single bond or -CH = CH-, X
It is -N (R 1) - or an oxygen atom, Y is a carbon atom or a nitrogen atom, Z is -N (R 2) - or a nitrogen atom,
R 1 and R 2 are the same or different and each represents a hydrogen atom or a lower alkyl group. )
【請求項3】 遺伝子の発現量の測定を、該遺伝子の転
写産物であるRNAをDNAマイクロアレイにより定量するこ
とにより行う、請求項1または請求項2に記載の方法。
3. The method according to claim 1, wherein the expression level of the gene is measured by quantifying RNA, which is a transcription product of the gene, by a DNA microarray.
【請求項4】 遺伝子の発現量の測定を、該遺伝子の転
写産物であるRNAを定量的PCRにより定量することにより
行う、請求項1または請求項2に記載の方法。
4. The method according to claim 1, wherein the expression level of the gene is measured by quantifying RNA, which is a transcription product of the gene, by quantitative PCR.
【請求項5】 請求項4に記載の方法において使用する
ための、該RNAに相補的なオリゴヌクレオチドを構成要
素として含む、RNAの定量試薬。
5. An RNA quantification reagent, which comprises an oligonucleotide complementary to said RNA as a constituent, for use in the method according to claim 4.
【請求項6】 遺伝子の発現量の測定を、該遺伝子の遺
伝子産物である蛋白質を免疫化学的方法により定量する
ことにより行う、請求項1または請求項2に記載の方
法。
6. The method according to claim 1, wherein the expression level of the gene is measured by quantifying a protein, which is a gene product of the gene, by an immunochemical method.
【請求項7】 遺伝子の発現量の測定を、該遺伝子の遺
伝子産物である蛋白質をELISAにより定量することによ
り行う、請求項6に記載の方法。
7. The method according to claim 6, wherein the expression level of the gene is measured by quantifying the protein, which is the gene product of the gene, by ELISA.
【請求項8】 遺伝子の発現量の測定を、該遺伝子の遺
伝子産物である蛋白質をウエスタンブロットにより定量
することにより行う、請求項6に記載の方法。
8. The method according to claim 6, wherein the expression level of the gene is measured by quantifying the protein, which is the gene product of the gene, by Western blotting.
【請求項9】 請求項6に記載の方法において使用する
ための、該蛋白質に対する抗体を構成要素として含む免
疫測定試薬。
9. An immunoassay reagent for use in the method according to claim 6, which comprises an antibody against the protein as a constituent element.
【請求項10】 A環が置換基を有していてもよい、ベ
ンゼンまたはピリジンであり、B環が置換基を有してい
てもよいベンゼンであり、C環が置換基を有していても
よいピロールであり、Wが単結合であり、かつXおよび
Zがいずれも−NH−である、請求項1または請求項2
に記載の方法。
10. A ring A is optionally substituted benzene or pyridine, a ring B is optionally substituted benzene, and a ring C is optionally substituted. Or pyrrole, W is a single bond, and both X and Z are -NH-.
The method described in.
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JP2005034150A (en) * 2003-07-03 2005-02-10 Kitakyushu Foundation For The Advancement Of Industry Science & Technology Method for determination of susceptibility of anticancer agent
JP2007097574A (en) * 2005-09-06 2007-04-19 Dna Chip Research Inc QUANTITATIVE METHOD FOR mRNA OF OBJECTIVE GENE
JP5548695B2 (en) * 2009-10-30 2014-07-16 学校法人慶應義塾 Anticancer drug sensitivity determination marker

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