JP2002504488A - 分泌蛋白およびそれらをコードするポリヌクレオチド - Google Patents

分泌蛋白およびそれらをコードするポリヌクレオチド

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JP2002504488A JP2000532422A JP2000532422A JP2002504488A JP 2002504488 A JP2002504488 A JP 2002504488A JP 2000532422 A JP2000532422 A JP 2000532422A JP 2000532422 A JP2000532422 A JP 2000532422A JP 2002504488 A JP2002504488 A JP 2002504488A
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ケネス・ジェイコブズ
ジョン・エム・マッコイ
エドワード・アール・ラバリー
リサ・エイ・コリンズ−レイシー
デイビッド・マーバーグ
モーリス・トレーシー
マイケル・ジェイ・アゴスティノ
ロバート・ジェイ・スタイニンガー・ザ・セカンド
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ジェネティックス・インスチチュート・インコーポレーテッド
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    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides

Abstract

(57)【要約】 新規ポリヌクレオチドおよびそれらによりコードされる蛋白を開示する。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】発明の分野 本発明は新規なポリヌクレオチドおよびかかるポリヌクレオチドによりコード
される蛋白、ならびにこれらのポリヌクレオチドおよび蛋白に関する治療的、診
断的および研究的有用性を提供する。
【0002】発明の背景 蛋白性因子(例えば、リンホカイン、インターフェロン、CSFsおよびイン
ターロイキンのごときサイトカインを含む)の発見を目的とした方法はこの10
年間に急速に成熟した。現在では常套的なハイブリダイゼーションクローニング
および発現クローニング法は、発見された蛋白に直接関連した情報(すなわち、
ハイブリダイゼーションクローニングの場合には蛋白の部分DNA/アミノ酸配
列;発現クローニングの場合には蛋白の活性)に依存するという意味において、
新規ポリペプチドを「直接的に」クローン化する。シグナル配列クローニング(
現在よく認識されている分泌リーダー配列モチーフの存在に基づいてDNA配列
を単離する)、ならびに種々のPCRによるあるいは低い厳密性によるハイブリ
ダイゼーションクローニング法のごとき、より最近の「間接的」クローニング法
は、リーダー配列のクローニングの場合には分泌されるという性質により、ある
いはPCRによる方法の場合には細胞または組織源により、生物学的活性を有す
ることが知られている蛋白に関する多数のDNA/アミノ酸配列を使用可能にす
ることによって現状を進歩させてきた。本発明はこれらの蛋白およびそれらをコ
ードするポリヌクレオチドに指向されるものである。
【0003】発明の概要 1の具体例において、本発明は、下記のものからなる群より選択される単離ポ
リヌクレオチドを含む組成物を提供する: (a)配列番号:1のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (b)配列番号:1のヌクレオチド185からヌクレオチド1678までのヌ
クレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (c)配列番号:1のヌクレオチド482からヌクレオチド1678までのヌ
クレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (d)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンco821 3
1の全長蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (e)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンco821 3
1のcDNAインサートによりコードされる全長蛋白をコードしているポリヌク
レオチド; (f)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンco821 3
1の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (g)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンco821 3
1のcDNAインサートによりコードされる成熟蛋白をコードしているポリヌク
レオチド; (h)配列番号:2のアミノ酸配列を含む蛋白をコードしているポリヌクレオ
チド; (i)生物学的活性を有する配列番号:2のアミノ酸配列のフラグメントを含
む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:2の8
個の連続したアミノ酸を含む); (j)上記(a)〜(g)のポリヌクレオチドの対立遺伝子変種であるポリヌ
クレオチド; (k)上記(h)または(i)の蛋白の種相同体をコードしているポリヌクレ
オチド; (l)厳密な条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれか1つ
にハイブリダイゼーションするポリヌクレオチド;および (m)厳密な条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれか1つ
にハイブリダイゼーションし、配列番号:1の長さの少なくとも25%の長さを
有するポリヌクレオチド。 好ましくは、かかるポリヌクレオチドは、配列番号:1のヌクレオチド185
からヌクレオチド1678までのヌクレオチド配列;配列番号:1のヌクレオチ
ド482からヌクレオチド1678までのヌクレオチド配列;受託番号ATCC
98663として寄託されたクローンco821 31の全長蛋白コーディング
配列のヌクレオチド配列;または受託番号ATCC98663として寄託された
クローンco821 31の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含
む。他の好ましい具体例において、ポリヌクレオチドは、受託番号ATCC98
663として寄託されたクローンco821 31のcDNAインサートにより
コードされる全長または成熟蛋白をコードする。さらなる好ましい具体例におい
て、本発明は、生物学的活性を有する配列番号:2のアミノ酸配列のフラグメン
トを含む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:
2の、好ましくは8個、より好ましくは20個、最も好ましくは30個の連続し
たアミノ酸を含む)、あるいは生物学的活性を有する配列番号:2のアミノ酸配
列のフラグメントを含む蛋白をコードするポリヌクレオチド(該フラグメントは
配列番号:2のアミノ酸244からアミノ酸253までのアミノ酸配列を含む)
を提供する。 他の具体例は配列番号:1のcDNA配列に対応する遺伝子を提供する。 本発明のさらなる具体例は、単離ポリヌクレオチドの製造方法を提供し、該方
法は以下の方法からなる群から選択される: (a)下記工程を含む方法: (i)6X SSC中、65℃にて下記のものからなる群より選択されるヌ クレオチド配列にハイブリダイゼーションする1またはそれ以上のポリヌクレオ
チドプローブを調製すること; (aa)配列番号:1(配列番号:1の3’末端のポリ(A)テイルを除
く);および (ab)ATCC98663として寄託されたクローンco821 31
のcDNAインサートのヌクレオチド配列 (ii)少なくとも4XSSC、50℃の厳密さの条件下でヒトゲノムDN
Aに該プローブ(複数も可)をハイブリダイゼーションさせること;次いで (iii)該プローブ(複数も可)で検出されたDNAポリヌクレオチドを
単離すること; ならびに (b)下記工程を含む方法: (i)6X SSC中、65℃にて下記のものからなる群より選択されるヌ クレオチド配列にハイブリダイゼーションする1またはそれ以上のポリヌクレオ
チドプライマーを調製すること; (ba)配列番号:1(配列番号:1の3’末端のポリ(A)テイルを除
く);および (bb)ATCC98663として寄託されたクローンco821 31
のcDNAインサートのヌクレオチド配列 (ii)少なくとも4XSSC、50℃の厳密さの条件下でヒトゲノムDN
Aに該プライマー(複数も可)をハイブリダイゼーションさせること; (iii)ヒトDNA配列を増幅すること;次いで (iv)工程(b)(iii)のポリヌクレオチド生成物を単離すること。 好ましくは、この方法により単離されるポリヌクレオチドのヌクレオチド配列
は配列番号:1のcDNA配列に対応するものであり、配列番号:1の5’末端
に対応するヌクレオチド配列から配列番号:1の3’末端に対応するヌクレオチ
ド配列までの連続したものであるが、配列番号:1の3’末端のポリ(A)テイ
ルは除かれる。また好ましくは、、上記方法により単離されたポリヌクレオチド
のヌクレオチド配列は配列番号:1のcDNA配列のヌクレオチド185からヌ
クレオチド1678までに対応するものであり、配列番号:1のヌクレオチド1
85からヌクレオチド1678までの該配列の5’末端に対応するヌクレオチド
配列から、配列番号:1のヌクレオチド185からヌクレオチド1678までの
該配列の3’末端に対応するヌクレオチド配列までの連続したものである。また
好ましくは、上記方法により単離されたポリヌクレオチドのヌクレオチド配列は
配列番号:1のヌクレオチド482からヌクレオチド1678までのcDNA配
列に対応するものであり、配列番号:1のヌクレオチド482からヌクレオチド
1678までの該配列の5’末端に対応するヌクレオチド配列から、配列番号:
1のヌクレオチド482からヌクレオチド1678までの該配列の3’末端に対
応するヌクレオチド配列までの連続したものである。 他の具体例において、本発明は、蛋白を含む組成物であって、該蛋白が、 (a)配列番号:2のアミノ酸配列; (b)配列番号:2のアミノ酸配列のフラグメント(各フラグメントは配列番
号:2の8個の連続したアミノ酸を含む);および (c)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンco821 3
1のcDNAインサートによりコードされるアミノ酸配列 からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むものであり、他の哺乳動物蛋白を
実質的に含まないものである組成物を提供する。さらなる好ましい具体例におい
て、本発明は、生物学的活性を有する配列番号:2のアミノ酸配列のフラグメン
トを含む蛋白(該フラグメントは配列番号:2の、好ましくは8個、より好まし
くは20個、最も好ましくは30個の連続したアミノ酸を含む)、あるいは生物
学的活性を有する配列番号:2のアミノ酸配列のフラグメントを含む蛋白(該フ
ラグメントは配列番号:2のアミノ酸244からアミノ酸253までのアミノ酸
配列を含む)を提供する。
【0004】 1の具体例において、本発明は、下記のものからなる群より選択される単離ポ
リヌクレオチドを含む組成物を提供する: (a)配列番号:3のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (b)配列番号:3のヌクレオチド176からヌクレオチド754までのヌク
レオチド配列を含むポリヌクレオチド; (c)配列番号:3のヌクレオチド425からヌクレオチド754までのヌク
レオチド配列を含むポリヌクレオチド; (d)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンdk329 1
の全長蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (e)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンdk329 1
のcDNAインサートによりコードされる全長蛋白をコードしているポリヌクレ
オチド; (f)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンdk329 1
の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (g)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンdk329 1
のcDNAインサートによりコードされる成熟蛋白をコードしているポリヌクレ
オチド; (h)配列番号:4のアミノ酸配列を含む蛋白をコードしているポリヌクレオ
チド; (i)生物学的活性を有する配列番号:4のアミノ酸配列のフラグメントを含
む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:4の8
個の連続したアミノ酸を含む); (j)上記(a)〜(g)のポリヌクレオチドの対立遺伝子変種であるポリヌ
クレオチド; (k)上記(h)または(i)の蛋白の種相同体をコードしているポリヌクレ
オチド; (l)厳密な条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれか1つ
にハイブリダイゼーションするポリヌクレオチド;および (m)厳密な条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれか1つ
にハイブリダイゼーションし、配列番号:3の長さの少なくとも25%の長さを
有するポリヌクレオチド。 好ましくは、かかるポリヌクレオチドは、配列番号:3のヌクレオチド176
からヌクレオチド754までのヌクレオチド配列;配列番号:3のヌクレオチド
425からヌクレオチド754までのヌクレオチド配列;受託番号ATCC98
663として寄託されたクローンdk329 1の全長蛋白コーディング配列の
ヌクレオチド配列;または受託番号ATCC98663として寄託されたクロー
ンdk329 1の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含む。他の
好ましい具体例において、ポリヌクレオチドは、受託番号ATCC98663と
して寄託されたクローンdk329 1のcDNAインサートによりコードされ
る全長または成熟蛋白をコードする。さらなる好ましい具体例において、本発明
は、生物学的活性を有する配列番号:4のアミノ酸配列のフラグメントを含む蛋
白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:4の、好ま
しくは8個、より好ましくは20個、最も好ましくは30個の連続したアミノ酸
を含む)、あるいは生物学的活性を有する配列番号:4のアミノ酸配列のフラグ
メントを含む蛋白をコードするポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:
4のアミノ酸91からアミノ酸100までのアミノ酸配列を含む)を提供する。 他の具体例は配列番号:3のcDNA配列に対応する遺伝子を提供する。 本発明のさらなる具体例は、単離ポリヌクレオチドの製造方法を提供し、該方
法は以下の方法からなる群から選択される: (a)下記工程を含む方法: (i)6X SSC中、65℃にて下記のものからなる群より選択されるヌ クレオチド配列にハイブリダイゼーションする1またはそれ以上のポリヌクレオ
チドプローブを調製すること; (aa)配列番号:3(配列番号:3の3’末端のポリ(A)テイルを除
く);および (ab)ATCC98663として寄託されたクローンdk329 1の
cDNAインサートのヌクレオチド配列 (ii)少なくとも4XSSC、50℃の厳密さの条件下でヒトゲノムDN
Aに該プローブ(複数も可)をハイブリダイゼーションさせること;次いで (iii)該プローブ(複数も可)で検出されたDNAポリヌクレオチドを
単離すること; ならびに (b)下記工程を含む方法: (i)6X SSC中、65℃にて下記のものからなる群より選択されるヌ クレオチド配列にハイブリダイゼーションする1またはそれ以上のポリヌクレオ
チドプライマーを調製すること; (ba)配列番号:3(配列番号:3の3’末端のポリ(A)テイルを除
く);および (bb)ATCC98663として寄託されたクローンdk329 1の
cDNAインサートのヌクレオチド配列 (ii)少なくとも4XSSC、50℃の厳密さの条件下でヒトゲノムDN
Aに該プライマー(複数も可)をハイブリダイゼーションさせること; (iii)ヒトDNA配列を増幅すること;次いで (iv)工程(b)(iii)のポリヌクレオチド生成物を単離すること。 好ましくは、この方法により単離されるポリヌクレオチドのヌクレオチド配列
は配列番号:3のcDNA配列に対応するものであり、配列番号:3の5’末端
に対応するヌクレオチド配列から配列番号:3の3’末端に対応するヌクレオチ
ド配列までの連続したものであるが、配列番号:3の3’末端のポリ(A)テイ
ルは除かれる。また好ましくは、上記方法により単離されたポリヌクレオチドの
ヌクレオチド配列は配列番号:3のcDNA配列のヌクレオチド176からヌク
レオチド754までに対応するものであり、配列番号:3のヌクレオチド176
からヌクレオチド754までの該配列の5’末端に対応するヌクレオチド配列か
ら、配列番号:3のヌクレオチド176からヌクレオチド754までの該配列の
3’末端に対応するヌクレオチド配列までの連続したものである。また好ましく
は、上記方法により単離されたポリヌクレオチドのヌクレオチド配列は配列番号
:3のcDNA配列のヌクレオチド425からヌクレオチド754までに対応す
るものであり、配列番号:3のヌクレオチド425からヌクレオチド754まで
の該配列の5’末端に対応するヌクレオチド配列から、配列番号:3のヌクレオ
チド425からヌクレオチド754までの該配列の3’末端に対応するヌクレオ
チド配列までの連続したものである。 他の具体例において、本発明は、蛋白を含む組成物であって、該蛋白が、 (a)配列番号:4のアミノ酸配列; (b)配列番号:4のアミノ酸配列のフラグメント(各フラグメントは配列番
号:4の8個の連続したアミノ酸を含む);および (c)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンdk329 1
のcDNAインサートによりコードされるアミノ酸配列 からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むものであり、他の哺乳動物蛋白を
実質的に含まないものである組成物を提供する。好ましくは、かかる蛋白は配列
番号:4のアミノ酸配列を含む。さらなる好ましい具体例において、本発明は、
生物学的活性を有する配列番号:4のアミノ酸配列のフラグメントを含む蛋白(
該フラグメントは配列番号:4の、好ましくは8個、より好ましくは20個、最
も好ましくは30個の連続したアミノ酸を含む)、あるいは生物学的活性を有す
る配列番号:4のアミノ酸配列のフラグメントを含む蛋白(該フラグメントは配
列番号:4のアミノ酸91からアミノ酸100までのアミノ酸配列を含む)を提
供する。
【0005】 1の具体例において、本発明は、下記のものからなる群より選択される単離ポ
リヌクレオチドを含む組成物を提供する: (a)配列番号:5のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (b)配列番号:5のヌクレオチド190からヌクレオチド1449までのヌ
クレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (c)配列番号:5のヌクレオチド913からヌクレオチド1449までのヌ
クレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (d)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンfx317 1
1の全長蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (e)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンfx317 1
1のcDNAインサートによりコードされる全長蛋白をコードしているポリヌク
レオチド; (f)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンfx317 1
1の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (g)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンfx317 1
1のcDNAインサートによりコードされる成熟蛋白をコードしているポリヌク
レオチド; (h)配列番号:6のアミノ酸配列を含む蛋白をコードしているポリヌクレオ
チド; (i)生物学的活性を有する配列番号:6のアミノ酸配列のフラグメントを含
む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:6の8
個の連続したアミノ酸を含む); (j)上記(a)〜(g)のポリヌクレオチドの対立遺伝子変種であるポリヌ
クレオチド; (k)上記(h)または(i)の蛋白の種相同体をコードしているポリヌクレ
オチド; (l)厳密な条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれか1つ
にハイブリダイゼーションするポリヌクレオチド;および (m)厳密な条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれか1つ
にハイブリダイゼーションし、配列番号:5の長さの少なくとも25%の長さを
有するポリヌクレオチド。 好ましくは、かかるポリヌクレオチドは、配列番号:5のヌクレオチド190
からヌクレオチド1449までのヌクレオチド配列;配列番号:5のヌクレオチ
ド913からヌクレオチド1449までのヌクレオチド配列;受託番号ATCC
98663として寄託されたクローンfx317 11の全長蛋白コーディング
配列のヌクレオチド配列;または受託番号ATCC98663として寄託された
クローンfx317 11の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含
む。他の好ましい具体例において、ポリヌクレオチドは、受託番号ATCC98
663として寄託されたクローンfx317 11のcDNAインサートにより
コードされる全長または成熟蛋白をコードする。さらなる好ましい具体例におい
て、本発明は、生物学的活性を有する配列番号:6のアミノ酸配列のフラグメン
トを含む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:
6の、好ましくは8個、より好ましくは20個、最も好ましくは30個の連続し
たアミノ酸を含む)、あるいは生物学的活性を有する配列番号:6のアミノ酸配
列のフラグメントを含む蛋白をコードするポリヌクレオチド(該フラグメントは
配列番号:6のアミノ酸205からアミノ酸214までのアミノ酸配列を含む)
を提供する。 他の具体例は配列番号:5のcDNA配列に対応する遺伝子を提供する。 本発明のさらなる具体例は、単離ポリヌクレオチドの製造方法を提供し、該方
法は以下の方法からなる群から選択される: (a)下記工程を含む方法: (i)6X SSC中、65℃にて下記のものからなる群より選択されるヌ クレオチド配列にハイブリダイゼーションする1またはそれ以上のポリヌクレオ
チドプローブを調製すること; (aa)配列番号:5(配列番号:5の3’末端のポリ(A)テイルを除
く);および (ab)ATCC98663として寄託されたクローンfx317 11
のcDNAインサートのヌクレオチド配列 (ii)少なくとも4XSSC、50℃の厳密さの条件下でヒトゲノムDN
Aに該プローブ(複数も可)をハイブリダイゼーションさせること;次いで (iii)該プローブ(複数も可)で検出されたDNAポリヌクレオチドを
単離すること; ならびに (b)下記工程を含む方法: (i)6X SSC中、65℃にて下記のものからなる群より選択されるヌ クレオチド配列にハイブリダイゼーションする1またはそれ以上のポリヌクレオ
チドプライマーを調製すること; (ba)配列番号:5(配列番号:5の3’末端のポリ(A)テイルを除
く);および (bb)ATCC98663として寄託されたクローンfx317 11
のcDNAインサートのヌクレオチド配列 (ii)少なくとも4XSSC、50℃の厳密さの条件下でヒトゲノムDN
Aに該プライマー(複数も可)をハイブリダイゼーションさせること; (iii)ヒトDNA配列を増幅すること;次いで (iv)工程(b)(iii)のポリヌクレオチド生成物を単離すること。 好ましくは、この方法により単離されるポリヌクレオチドのヌクレオチド配列
は配列番号:5のcDNA配列に対応するものであり、配列番号:5の5’末端
に対応するヌクレオチド配列から配列番号:5の3’末端に対応するヌクレオチ
ド配列までの連続したものであるが、配列番号:5の3’末端のポリ(A)テイ
ルは除かれる。また好ましくは、上記方法により単離されたポリヌクレオチドの
ヌクレオチド配列は配列番号:5のcDNA配列のヌクレオチド190からヌク
レオチド1449までに対応するものであり、配列番号:5のヌクレオチド19
0からヌクレオチド1449までの該配列の5’末端に対応するヌクレオチド配
列から、配列番号:5のヌクレオチド190からヌクレオチド1449までの該
配列の3’末端に対応するヌクレオチド配列までの連続したものである。また好
ましくは、上記方法により単離されたポリヌクレオチドのヌクレオチド配列は配
列番号:5のcDNA配列のヌクレオチド913からヌクレオチド1449まで
に対応するものであり、配列番号:5のヌクレオチド913からヌクレオチド1
449までの該配列の5’末端に対応するヌクレオチド配列から、配列番号:5
のヌクレオチド913からヌクレオチド1449までの該配列の3’末端に対応
するヌクレオチド配列までの連続したものである。 他の具体例において、本発明は、蛋白を含む組成物であって、該蛋白が、 (a)配列番号:6のアミノ酸配列; (b)配列番号:6のアミノ酸配列のフラグメント(各フラグメントは配列番
号:6の8個の連続したアミノ酸を含む);および (c)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンfx317 1
1のcDNAインサートによりコードされるアミノ酸配列 からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むものであり、他の哺乳動物蛋白を
実質的に含まないものである組成物を提供する。好ましくは、かかる蛋白は配列
番号:6のアミノ酸配列を含む。さらなる好ましい具体例において、本発明は、
生物学的活性を有する配列番号:6のアミノ酸配列のフラグメントを含む蛋白(
該フラグメントは配列番号:6の、好ましくは8個、より好ましくは20個、最
も好ましくは30個の連続したアミノ酸を含む)、あるいは生物学的活性を有す
る配列番号:6のアミノ酸配列のフラグメントを含む蛋白(該フラグメントは配
列番号:6のアミノ酸205からアミノ酸214までのアミノ酸配列を含む)を
提供する。
【0006】 1の具体例において、本発明は、下記のものからなる群より選択される単離ポ
リヌクレオチドを含む組成物を提供する: (a)配列番号:7のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (b)配列番号:7のヌクレオチド51からヌクレオチド1202までのヌク
レオチド配列を含むポリヌクレオチド; (c)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンlp547 4
の全長蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (d)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンlp547 4
のcDNAインサートによりコードされる全長蛋白をコードしているポリヌクレ
オチド; (e)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンlp547 4
の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (f)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンlp547 4
のcDNAインサートによりコードされる成熟蛋白をコードしているポリヌクレ
オチド; (g)配列番号:8のアミノ酸配列を含む蛋白をコードしているポリヌクレオ
チド; (h)生物学的活性を有する配列番号:8のアミノ酸配列のフラグメントを含
む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:8の8
個の連続したアミノ酸を含む); (i)上記(a)〜(f)のポリヌクレオチドの対立遺伝子変種であるポリヌ
クレオチド; (j)上記(g)または(h)の蛋白の種相同体をコードしているポリヌクレ
オチド; (k)厳密な条件下で(a)〜(h)に示すポリヌクレオチドのいずれか1つ
にハイブリダイゼーションするポリヌクレオチド;および (l)厳密な条件下で(a)〜(h)に示すポリヌクレオチドのいずれか1つ
にハイブリダイゼーションし、配列番号:7の長さの少なくとも25%の長さを
有するポリヌクレオチド。 好ましくは、かかるポリヌクレオチドは、配列番号:7のヌクレオチド51か
らヌクレオチド1202までのヌクレオチド配列;受託番号ATCC98663
として寄託されたクローンlp547 4の全長蛋白コーディング配列のヌクレ
オチド配列;または受託番号ATCC98663として寄託されたクローンlp
547 4の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含む。他の好まし
い具体例において、ポリヌクレオチドは、受託番号ATCC98663として寄
託されたクローンlp547 4のcDNAインサートによりコードされる全長
または成熟蛋白をコードする。さらなる好ましい具体例において、本発明は、生
物学的活性を有する配列番号:8のアミノ酸配列のフラグメントを含む蛋白をコ
ードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:8の、好ましくは
8個、より好ましくは20個、最も好ましくは30個の連続したアミノ酸を含む
)、あるいは生物学的活性を有する配列番号:8のアミノ酸配列のフラグメント
を含む蛋白をコードするポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:8のア
ミノ酸187からアミノ酸196までのアミノ酸配列を含む)を提供する。 他の具体例は配列番号:7のcDNA配列に対応する遺伝子を提供する。 本発明のさらなる具体例は、単離ポリヌクレオチドの製造方法を提供し、該方
法は以下の方法からなる群から選択される: (a)下記工程を含む方法: (i)6X SSC中、65℃にて下記のものからなる群より選択されるヌ クレオチド配列にハイブリダイゼーションする1またはそれ以上のポリヌクレオ
チドプローブを調製すること; (aa)配列番号:7(配列番号:7の3’末端のポリ(A)テイルを除
く);および (ab)ATCC98663として寄託されたクローンlp547 4の
cDNAインサートのヌクレオチド配列 (ii)少なくとも4XSSC、50℃の厳密さの条件下でヒトゲノムDN
Aに該プローブ(複数も可)をハイブリダイゼーションさせること;次いで (iii)該プローブ(複数も可)で検出されたDNAポリヌクレオチドを
単離すること; ならびに (b)下記工程を含む方法: (i)6X SSC中、65℃にて下記のものからなる群より選択されるヌ クレオチド配列にハイブリダイゼーションする1またはそれ以上のポリヌクレオ
チドプライマーを調製すること; (ba)配列番号:7(配列番号:7の3’末端のポリ(A)テイルを除
く);および (bb)ATCC98663として寄託されたクローンlp547 4の
cDNAインサートのヌクレオチド配列 (ii)少なくとも4XSSC、50℃の厳密さの条件下でヒトゲノムDN
Aに該プライマー(複数も可)をハイブリダイゼーションさせること; (iii)ヒトDNA配列を増幅すること;次いで (iv)工程(b)(iii)のポリヌクレオチド生成物を単離すること。 好ましくは、この方法により単離されるポリヌクレオチドのヌクレオチド配列
は配列番号:7のcDNA配列に対応するものであり、配列番号:7の5’末端
に対応するヌクレオチド配列から配列番号:7の3’末端に対応するヌクレオチ
ド配列までの連続したものであるが、配列番号:7の3’末端のポリ(A)テイ
ルは除かれる。また好ましくは、上記方法により単離されたポリヌクレオチドの
ヌクレオチド配列は配列番号:7のcDNA配列のヌクレオチド51からヌクレ
オチド1202までに対応するものであり、配列番号:7のヌクレオチド51か
らヌクレオチド1202までの該配列の5’末端に対応するヌクレオチド配列か
ら、配列番号:7のヌクレオチド51からヌクレオチド1202までの該配列の
3’末端に対応するヌクレオチド配列までの連続したものである。 他の具体例において、本発明は、蛋白を含む組成物であって、該蛋白が、 (a)配列番号:8のアミノ酸配列; (b)配列番号:8のアミノ酸配列のフラグメント(各フラグメントは配列番
号:8の8個の連続したアミノ酸を含む);および (c)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンlp547 4
のcDNAインサートによりコードされるアミノ酸配列 からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むものであり、他の哺乳動物蛋白を
実質的に含まないものである組成物を提供する。好ましくは、かかる蛋白は配列
番号:8のアミノ酸配列を含む。さらなる好ましい具体例において、本発明は、
生物学的活性を有する配列番号:8のアミノ酸配列のフラグメントを含む蛋白(
該フラグメントは配列番号:8の、好ましくは8個、より好ましくは20個、最
も好ましくは30個の連続したアミノ酸を含む)、あるいは生物学的活性を有す
る配列番号:8のアミノ酸配列のフラグメントを含む蛋白(該フラグメントは配
列番号:8のアミノ酸187からアミノ酸196までのアミノ酸配列を含む)を
提供する。
【0007】 1の具体例において、本発明は、下記のものからなる群より選択される単離ポ
リヌクレオチドを含む組成物を提供する: (a)配列番号:9のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (b)配列番号:9のヌクレオチド61からヌクレオチド2559までのヌク
レオチド配列を含むポリヌクレオチド; (c)配列番号:9のヌクレオチド904からヌクレオチド2559までのヌ
クレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (d)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンlv310 7
の全長蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (e)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンlv310 7
のcDNAインサートによりコードされる全長蛋白をコードしているポリヌクレ
オチド; (f)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンlv310 7
の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (g)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンlv310 7
のcDNAインサートによりコードされる成熟蛋白をコードしているポリヌクレ
オチド; (h)配列番号:10のアミノ酸配列を含む蛋白をコードしているポリヌクレ
オチド; (i)生物学的活性を有する配列番号:10のアミノ酸配列のフラグメントを
含む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:10
の8個の連続したアミノ酸を含む); (j)上記(a)〜(g)のポリヌクレオチドの対立遺伝子変種であるポリヌ
クレオチド; (k)上記(h)または(i)の蛋白の種相同体をコードしているポリヌクレ
オチド; (l)厳密な条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれか1つ
にハイブリダイゼーションするポリヌクレオチド;および (m)厳密な条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれか1つ
にハイブリダイゼーションし、配列番号:9の長さの少なくとも25%の長さを
有するポリヌクレオチド。 好ましくは、かかるポリヌクレオチドは、配列番号:9のヌクレオチド61か
らヌクレオチド2559までのヌクレオチド配列;配列番号:9のヌクレオチド
904からヌクレオチド2559までのヌクレオチド配列;受託番号ATCC9
8663として寄託されたクローンlv310 7の全長蛋白コーディング配列
のヌクレオチド配列;または受託番号ATCC98663として寄託されたクロ
ーンlv310 7の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含む。他
の好ましい具体例において、ポリヌクレオチドは、受託番号ATCC98663
として寄託されたクローンlv310 7のcDNAインサートによりコードさ
れる全長または成熟蛋白をコードする。さらなる好ましい具体例において、本発
明は、生物学的活性を有する配列番号:10のアミノ酸配列のフラグメントを含
む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:10の
、好ましくは8個、より好ましくは20個、最も好ましくは30個の連続したア
ミノ酸を含む)、あるいは生物学的活性を有する配列番号:10のアミノ酸配列
のフラグメントを含む蛋白をコードするポリヌクレオチド(該フラグメントは配
列番号:10のアミノ酸411からアミノ酸420までのアミノ酸配列を含む)
を提供する。 他の具体例は配列番号:9のcDNA配列に対応する遺伝子を提供する。 本発明のさらなる具体例は、単離ポリヌクレオチドの製造方法を提供し、該方
法は以下の方法からなる群から選択される: (a)下記工程を含む方法: (i)6X SSC中、65℃にて下記のものからなる群より選択されるヌ クレオチド配列にハイブリダイゼーションする1またはそれ以上のポリヌクレオ
チドプローブを調製すること; (aa)配列番号:9(配列番号:9の3’末端のポリ(A)テイルを除
く);および (ab)ATCC98663として寄託されたクローンlv310 7の
cDNAインサートのヌクレオチド配列 (ii)少なくとも4XSSC、50℃の厳密さの条件下でヒトゲノムDN
Aに該プローブ(複数も可)をハイブリダイゼーションさせること;次いで (iii)該プローブ(複数も可)で検出されたDNAポリヌクレオチドを
単離すること; ならびに (b)下記工程を含む方法: (i)6X SSC中、65℃にて下記のものからなる群より選択されるヌ クレオチド配列にハイブリダイゼーションする1またはそれ以上のポリヌクレオ
チドプライマーを調製すること; (ba)配列番号:9(配列番号:9の3’末端のポリ(A)テイルを除
く);および (bb)ATCC98663として寄託されたクローンlv310 7の
cDNAインサートのヌクレオチド配列 (ii)少なくとも4XSSC、50℃の厳密さの条件下でヒトゲノムDN
Aに該プライマー(複数も可)をハイブリダイゼーションさせること; (iii)ヒトDNA配列を増幅すること;次いで (iv)工程(b)(iii)のポリヌクレオチド生成物を単離すること。 好ましくは、この方法により単離されるポリヌクレオチドのヌクレオチド配列
は配列番号:9のcDNA配列に対応するものであり、配列番号:9の5’末端
に対応するヌクレオチド配列から配列番号:9の3’末端に対応するヌクレオチ
ド配列までの連続したものであるが、配列番号:9の3’末端のポリ(A)テイ
ルは除かれる。また好ましくは、上記方法により単離されたポリヌクレオチドの
ヌクレオチド配列は配列番号:9のcDNA配列のヌクレオチド61からヌクレ
オチド2559までに対応するものであり、配列番号:9のヌクレオチド61か
らヌクレオチド2559までの該配列の5’末端に対応するヌクレオチド配列か
ら、配列番号:9のヌクレオチド61からヌクレオチド2559までの該配列の
3’末端に対応するヌクレオチド配列までの連続したものである。また好ましく
は、上記方法により単離されたポリヌクレオチドのヌクレオチド配列は配列番号
:9のcDNA配列のヌクレオチド904からヌクレオチド2559までに対応
するものであり、配列番号:9のヌクレオチド904からヌクレオチド2559
までの該配列の5’末端に対応するヌクレオチド配列から、配列番号:9のヌク
レオチド904からヌクレオチド2559までの該配列の3’末端に対応するヌ
クレオチド配列までの連続したものである。 他の具体例において、本発明は、蛋白を含む組成物であって、該蛋白が、 (a)配列番号:10のアミノ酸配列; (b)配列番号:10のアミノ酸配列のフラグメント(各フラグメントは配列
番号:10の8個の連続したアミノ酸を含む);および (c)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンlv310 7
のcDNAインサートによりコードされるアミノ酸配列 からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むものであり、他の哺乳動物蛋白を
実質的に含まないものである組成物を提供する。さらなる好ましい具体例におい
て、本発明は、生物学的活性を有する配列番号:10のアミノ酸配列のフラグメ
ントを含む蛋白(該フラグメントは配列番号:10の、好ましくは8個、より好
ましくは20個、最も好ましくは30個の連続したアミノ酸を含む)、あるいは
生物学的活性を有する配列番号:10のアミノ酸配列のフラグメントを含む蛋白
(該フラグメントは配列番号:10のアミノ酸411からアミノ酸420までの
アミノ酸配列を含む)を提供する。
【0008】 1の具体例において、本発明は、下記のものからなる群より選択される単離ポ
リヌクレオチドを含む組成物を提供する: (a)配列番号:11のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (b)配列番号:11のヌクレオチド389からヌクレオチド1330までの
ヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (c)配列番号:11のヌクレオチド1286からヌクレオチド1330まで
のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (d)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンnq34 12
の全長蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (e)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンnq34 12
のcDNAインサートによりコードされる全長蛋白をコードしているポリヌクレ
オチド; (f)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンnq34 12
の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (g)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンnq34 12
のcDNAインサートによりコードされる成熟蛋白をコードしているポリヌクレ
オチド; (h)配列番号:12のアミノ酸配列を含む蛋白をコードしているポリヌクレ
オチド; (i)生物学的活性を有する配列番号:12のアミノ酸配列のフラグメントを
含む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:12
の8個の連続したアミノ酸を含む); (j)上記(a)〜(g)のポリヌクレオチドの対立遺伝子変種であるポリヌ
クレオチド; (k)上記(h)または(i)の蛋白の種相同体をコードしているポリヌクレ
オチド; (l)厳密な条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれか1つ
にハイブリダイゼーションするポリヌクレオチド;および (m)厳密な条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれか1つ
にハイブリダイゼーションし、配列番号:11の長さの少なくとも25%の長さ
を有するポリヌクレオチド。 好ましくは、かかるポリヌクレオチドは、配列番号:11のヌクレオチド38
9からヌクレオチド1330までのヌクレオチド配列;配列番号:11のヌクレ
オチド1286からヌクレオチド1330までのヌクレオチド配列;受託番号A
TCC98663として寄託されたクローンnq34 12の全長蛋白コーディ
ング配列のヌクレオチド配列;または受託番号ATCC98663として寄託さ
れたクローンnq34 12の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を
含む。他の好ましい具体例において、ポリヌクレオチドは、受託番号ATCC9
8663として寄託されたクローンnq34 12のcDNAインサートにより
コードされる全長または成熟蛋白をコードする。さらなる好ましい具体例におい
て、本発明は、生物学的活性を有する配列番号:12のアミノ酸配列のフラグメ
ントを含む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号
:12の、好ましくは8個、より好ましくは20個、最も好ましくは30個の連
続したアミノ酸を含む)、あるいは生物学的活性を有する配列番号:12のアミ
ノ酸配列のフラグメントを含む蛋白をコードするポリヌクレオチド(該フラグメ
ントは配列番号:12のアミノ酸152からアミノ酸161までのアミノ酸配列
を含む)を提供する。 他の具体例は配列番号:11のcDNA配列に対応する遺伝子を提供する。 本発明のさらなる具体例は、単離ポリヌクレオチドの製造方法を提供し、該方
法は以下の方法からなる群から選択される: (a)下記工程を含む方法: (i)6X SSC中、65℃にて下記のものからなる群より選択されるヌ クレオチド配列にハイブリダイゼーションする1またはそれ以上のポリヌクレオ
チドプローブを調製すること; (aa)配列番号:11(配列番号:11の3’末端のポリ(A)テイル
を除く);および (ab)ATCC98663として寄託されたクローンnq34 12の
cDNAインサートのヌクレオチド配列 (ii)少なくとも4XSSC、50℃の厳密さの条件下でヒトゲノムDN
Aに該プローブ(複数も可)をハイブリダイゼーションさせること;次いで (iii)該プローブ(複数も可)で検出されたDNAポリヌクレオチドを
単離すること; ならびに (b)下記工程を含む方法: (i)6X SSC中、65℃にて下記のものからなる群より選択されるヌ クレオチド配列にハイブリダイゼーションする1またはそれ以上のポリヌクレオ
チドプライマーを調製すること; (ba)配列番号:11(配列番号:11の3’末端のポリ(A)テイル
を除く);および (bb)ATCC98663として寄託されたクローンnq34 12の
cDNAインサートのヌクレオチド配列 (ii)少なくとも4XSSC、50℃の厳密さの条件下でヒトゲノムDN
Aに該プライマー(複数も可)をハイブリダイゼーションさせること; (iii)ヒトDNA配列を増幅すること;次いで (iv)工程(b)(iii)のポリヌクレオチド生成物を単離すること。 好ましくは、この方法により単離されるポリヌクレオチドのヌクレオチド配列
は配列番号:11のcDNA配列に対応するものであり、配列番号:11の5’
末端に対応するヌクレオチド配列から配列番号:11の3’末端に対応するヌク
レオチド配列までの連続したものであるが、配列番号:11の3’末端のポリ(
A)テイルは除かれる。また好ましくは、上記方法により単離されたポリヌクレ
オチドのヌクレオチド配列は配列番号:11のcDNA配列のヌクレオチド38
9からヌクレオチド1330までに対応するものであり、配列番号:11のヌク
レオチド389からヌクレオチド1330までの該配列の5’末端に対応するヌ
クレオチド配列から、配列番号:11のヌクレオチド389からヌクレオチド1
330までの該配列の3’末端に対応するヌクレオチド配列までの連続したもの
である。さらなる好ましい具体例において、該単離されたポリヌクレオチドのヌ
クレオチド配列は配列番号:11のヌクレオチド1286からヌクレオチド13
30までのcDNA配列に対応するものであり、配列番号:11のヌクレオチド
1286からヌクレオチド1330までの該配列の5’末端に対応するヌクレオ
チド配列から、配列番号:11のヌクレオチド1286からヌクレオチド133
0までの該配列の3’末端に対応するヌクレオチド配列までの連続したものであ
る。 他の具体例において、本発明は、蛋白を含む組成物であって、該蛋白が、 (a)配列番号:12のアミノ酸配列; (b)配列番号:12のアミノ酸配列のフラグメント(各フラグメントは配列
番号:12の8個の連続したアミノ酸を含む);および (c)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンnq34 12
のcDNAインサートによりコードされるアミノ酸配列 からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むものであり、他の哺乳動物蛋白を
実質的に含まないものである組成物を提供する。好ましくは、かかる蛋白は配列
番号:12のアミノ酸配列を含む。さらなる好ましい具体例において、本発明は
、生物学的活性を有する配列番号:12のアミノ酸配列のフラグメントを含む蛋
白(該フラグメントは配列番号:12の、好ましくは8個、より好ましくは20
個、最も好ましくは30個の連続したアミノ酸を含む)、あるいは生物学的活性
を有する配列番号:12のアミノ酸配列のフラグメントを含む蛋白(該フラグメ
ントは配列番号:12のアミノ酸152からアミノ酸161までのアミノ酸配列
を含む)を提供する。
【0009】 1の具体例において、本発明は、下記のものからなる群より選択される単離ポ
リヌクレオチドを含む組成物を提供する: (a)配列番号:13のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (b)配列番号:13のヌクレオチド1026からヌクレオチド1226まで
のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (c)配列番号:13のヌクレオチド1101からヌクレオチド1226まで
のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (d)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpj154 1
の全長蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (e)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpj154 1
のcDNAインサートによりコードされる全長蛋白をコードしているポリヌクレ
オチド; (f)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpj154 1
の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (g)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpj154 1
のcDNAインサートによりコードされる成熟蛋白をコードしているポリヌクレ
オチド; (h)配列番号:14のアミノ酸配列を含む蛋白をコードしているポリヌクレ
オチド; (i)生物学的活性を有する配列番号:14のアミノ酸配列のフラグメントを
含む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:14
の8個の連続したアミノ酸を含む); (j)上記(a)〜(g)のポリヌクレオチドの対立遺伝子変種であるポリヌ
クレオチド; (k)上記(h)または(i)の蛋白の種相同体をコードしているポリヌクレ
オチド; (l)厳密な条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれか1つ
にハイブリダイゼーションするポリヌクレオチド;および (m)厳密な条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれか1つ
にハイブリダイゼーションし、配列番号:13の長さの少なくとも25%の長さ
を有するポリヌクレオチド。 好ましくは、かかるポリヌクレオチドは、配列番号:13のヌクレオチド10
26からヌクレオチド1226までのヌクレオチド配列;配列番号:13のヌク
レオチド1101からヌクレオチド1226までのヌクレオチド配列;受託番号
ATCC98663として寄託されたクローンpj154 1の全長蛋白コーデ
ィング配列のヌクレオチド配列;または受託番号ATCC98663として寄託
されたクローンpj154 1の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列
を含む。他の好ましい具体例において、ポリヌクレオチドは、受託番号ATCC
98663として寄託されたクローンpj154 1のcDNAインサートによ
りコードされる全長または成熟蛋白をコードする。さらなる好ましい具体例にお
いて、本発明は、生物学的活性を有する配列番号:14のアミノ酸配列のフラグ
メントを含む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番
号:14の、好ましくは8個、より好ましくは20個、最も好ましくは30個の
連続したアミノ酸を含む)、あるいは生物学的活性を有する配列番号:14のア
ミノ酸配列のフラグメントを含む蛋白をコードするポリヌクレオチド(該フラグ
メントは配列番号:14のアミノ酸28からアミノ酸37までのアミノ酸配列を
含む)を提供する。 他の具体例は配列番号:13のcDNA配列に対応する遺伝子を提供する。 本発明のさらなる具体例は、単離ポリヌクレオチドの製造方法を提供し、該方
法は以下の方法からなる群から選択される: (a)下記工程を含む方法: (i)6X SSC中、65℃にて下記のものからなる群より選択されるヌ クレオチド配列にハイブリダイゼーションする1またはそれ以上のポリヌクレオ
チドプローブを調製すること; (aa)配列番号:13(配列番号:13の3’末端のポリ(A)テイル
を除く);および (ab)ATCC98663として寄託されたクローンpj154 1の
cDNAインサートのヌクレオチド配列 (ii)少なくとも4XSSC、50℃の厳密さの条件下でヒトゲノムDN
Aに該プローブ(複数も可)をハイブリダイゼーションさせること;次いで (iii)該プローブ(複数も可)で検出されたDNAポリヌクレオチドを
単離すること; ならびに (b)下記工程を含む方法: (i)6X SSC中、65℃にて下記のものからなる群より選択されるヌ クレオチド配列にハイブリダイゼーションする1またはそれ以上のポリヌクレオ
チドプライマーを調製すること; (ba)配列番号:13(配列番号:13の3’末端のポリ(A)テイル
を除く);および (bb)ATCC98663として寄託されたクローンpj154 1の
cDNAインサートのヌクレオチド配列 (ii)少なくとも4XSSC、50℃の厳密さの条件下でヒトゲノムDN
Aに該プライマー(複数も可)をハイブリダイゼーションさせること; (iii)ヒトDNA配列を増幅すること;次いで (iv)工程(b)(iii)のポリヌクレオチド生成物を単離すること。 好ましくは、この方法により単離されるポリヌクレオチドのヌクレオチド配列
は配列番号:13のcDNA配列に対応するものであり、配列番号:13の5’
末端に対応するヌクレオチド配列から配列番号:13の3’末端に対応するヌク
レオチド配列までの連続したものであるが、配列番号:13の3’末端のポリ(
A)テイルは除かれる。また好ましくは、上記方法により単離されたポリヌクレ
オチドのヌクレオチド配列は配列番号:13のcDNA配列のヌクレオチド10
26からヌクレオチド1226までに対応するものであり、配列番号:13のヌ
クレオチド1026からヌクレオチド1226までの該配列の5’末端に対応す
るヌクレオチド配列から、配列番号:13のヌクレオチド1026からヌクレオ
チド1226までの該配列の3’末端に対応するヌクレオチド配列までの連続し
たものである。また好ましくは、上記方法により単離されたポリヌクレオチドの
ヌクレオチド配列は配列番号:13のcDNA配列のヌクレオチド1101から
ヌクレオチド1226までに対応するものであり、配列番号:13のヌクレオチ
ド1101からヌクレオチド1226までの該配列の5’末端に対応するヌクレ
オチド配列から、配列番号:13のヌクレオチド1101からヌクレオチド12
26までの該配列の3’末端に対応するヌクレオチド配列までの連続したもので
ある。 他の具体例において、本発明は、蛋白を含む組成物であって、該蛋白が、 (a)配列番号:14のアミノ酸配列; (b)配列番号:14のアミノ酸配列のフラグメント(各フラグメントは配列
番号:14の8個の連続したアミノ酸を含む);および (c)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpj154 1
のcDNAインサートによりコードされるアミノ酸配列 からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むものであり、他の哺乳動物蛋白を
実質的に含まないものである組成物を提供する。好ましくは、かかる蛋白は配列
番号:14のアミノ酸配列を含む。さらなる好ましい具体例において、本発明は
、生物学的活性を有する配列番号:14のアミノ酸配列のフラグメントを含む蛋
白(該フラグメントは配列番号:14の、好ましくは8個、より好ましくは20
個、最も好ましくは30個の連続したアミノ酸を含む)、あるいは生物学的活性
を有する配列番号:14のアミノ酸配列のフラグメントを含む蛋白(該フラグメ
ントは配列番号:14のアミノ酸28からアミノ酸37までのアミノ酸配列を含
む)を提供する。
【0010】 1の具体例において、本発明は、下記のものからなる群より選択される単離ポ
リヌクレオチドを含む組成物を提供する: (a)配列番号:15のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (b)配列番号:15のヌクレオチド478からヌクレオチド651までのヌ
クレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (c)配列番号:15のヌクレオチド562からヌクレオチド651までのヌ
クレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (d)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpk147 1
の全長蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (e)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpk147 1
のcDNAインサートによりコードされる全長蛋白をコードしているポリヌクレ
オチド; (f)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpk147 1
の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (g)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpk147 1
のcDNAインサートによりコードされる成熟蛋白をコードしているポリヌクレ
オチド; (h)配列番号:16のアミノ酸配列を含む蛋白をコードしているポリヌクレ
オチド; (i)生物学的活性を有する配列番号:16のアミノ酸配列のフラグメントを
含む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:16
の8個の連続したアミノ酸を含む); (j)上記(a)〜(g)のポリヌクレオチドの対立遺伝子変種であるポリヌ
クレオチド; (k)上記(h)または(i)の蛋白の種相同体をコードしているポリヌクレ
オチド; (l)厳密な条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれか1つ
にハイブリダイゼーションするポリヌクレオチド;および (m)厳密な条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれか1つ
にハイブリダイゼーションし、配列番号:15の長さの少なくとも25%の長さ
を有するポリヌクレオチド。 好ましくは、かかるポリヌクレオチドは、配列番号:15のヌクレオチド47
8からヌクレオチド651までのヌクレオチド配列;配列番号:15のヌクレオ
チド562からヌクレオチド651までのヌクレオチド配列;受託番号ATCC
98663として寄託されたクローンpk147 1の全長蛋白コーディング配
列のヌクレオチド配列;または受託番号ATCC98663として寄託されたク
ローンpk147 1の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含む。
他の好ましい具体例において、ポリヌクレオチドは、受託番号ATCC9866
3として寄託されたクローンpk147 1のcDNAインサートによりコード
される全長または成熟蛋白をコードする。さらなる好ましい具体例において、本
発明は、生物学的活性を有する配列番号:16のアミノ酸配列のフラグメントを
含む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:16
の、好ましくは8個、より好ましくは20個、最も好ましくは30個の連続した
アミノ酸を含む)、あるいは生物学的活性を有する配列番号:16のアミノ酸配
列のフラグメントを含む蛋白をコードするポリヌクレオチド(該フラグメントは
配列番号:16のアミノ酸24からアミノ酸33までのアミノ酸配列を含む)を
提供する。 他の具体例は配列番号:15のcDNA配列に対応する遺伝子を提供する。 本発明のさらなる具体例は、単離ポリヌクレオチドの製造方法を提供し、該方
法は以下の方法からなる群から選択される: (a)下記工程を含む方法: (i)6X SSC中、65℃にて下記のものからなる群より選択されるヌ クレオチド配列にハイブリダイゼーションする1またはそれ以上のポリヌクレオ
チドプローブを調製すること; (aa)配列番号:15(配列番号:15の3’末端のポリ(A)テイル
を除く);および (ab)ATCC98663として寄託されたクローンpk147 1の
cDNAインサートのヌクレオチド配列 (ii)少なくとも4XSSC、50℃の厳密さの条件下でヒトゲノムDN
Aに該プローブ(複数も可)をハイブリダイゼーションさせること;次いで (iii)該プローブ(複数も可)で検出されたDNAポリヌクレオチドを
単離すること; ならびに (b)下記工程を含む方法: (i)6X SSC中、65℃にて下記のものからなる群より選択されるヌ クレオチド配列にハイブリダイゼーションする1またはそれ以上のポリヌクレオ
チドプライマーを調製すること; (ba)配列番号:15(配列番号:15の3’末端のポリ(A)テイル
を除く);および (bb)ATCC98663として寄託されたクローンpk147 1の
cDNAインサートのヌクレオチド配列 (ii)少なくとも4XSSC、50℃の厳密さの条件下でヒトゲノムDN
Aに該プライマー(複数も可)をハイブリダイゼーションさせること; (iii)ヒトDNA配列を増幅すること;次いで (iv)工程(b)(iii)のポリヌクレオチド生成物を単離すること。 好ましくは、この方法により単離されるポリヌクレオチドのヌクレオチド配列
は配列番号:15のcDNA配列に対応するものであり、配列番号:15の5’
末端に対応するヌクレオチド配列から配列番号:15の3’末端に対応するヌク
レオチド配列までの連続したものであるが、配列番号:15の3’末端のポリ(
A)テイルは除かれる。また好ましくは、上記方法により単離されたポリヌクレ
オチドのヌクレオチド配列は配列番号:15のcDNA配列のヌクレオチド47
8からヌクレオチド651までに対応するものであり、配列番号:15のヌクレ
オチド478からヌクレオチド651までの該配列の5’末端に対応するヌクレ
オチド配列から、配列番号:15のヌクレオチド478からヌクレオチド651
までの該配列の3’末端に対応するヌクレオチド配列までの連続したものである
。また好ましくは、上記方法により単離されたポリヌクレオチドのヌクレオチド
配列は配列番号:15のcDNA配列のヌクレオチド562からヌクレオチド6
51までに対応するものであり、配列番号:15のヌクレオチド562からヌク
レオチド651までの該配列の5’末端に対応するヌクレオチド配列から、配列
番号:15のヌクレオチド562からヌクレオチド651までの該配列の3’末
端に対応するヌクレオチド配列までの連続したものである。 他の具体例において、本発明は、蛋白を含む組成物であって、該蛋白が、 (a)配列番号:16のアミノ酸配列; (b)配列番号:16のアミノ酸配列のフラグメント(各フラグメントは配列
番号:16の8個の連続したアミノ酸を含む);および (c)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpk147 1
のcDNAインサートによりコードされるアミノ酸配列 からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むものであり、他の哺乳動物蛋白を
実質的に含まないものである組成物を提供する。好ましくは、かかる蛋白は配列
番号:16のアミノ酸配列を含む。さらなる好ましい具体例において、本発明は
、生物学的活性を有する配列番号:16のアミノ酸配列のフラグメントを含む蛋
白(該フラグメントは配列番号:16の、好ましくは8個、より好ましくは20
個、最も好ましくは30個の連続したアミノ酸を含む)、あるいは生物学的活性
を有する配列番号:16のアミノ酸配列のフラグメントを含む蛋白(該フラグメ
ントは配列番号:16のアミノ酸24からアミノ酸33までのアミノ酸配列を含
む)を提供する。
【0011】 1の具体例において、本発明は、下記のものからなる群より選択される単離ポ
リヌクレオチドを含む組成物を提供する: (a)配列番号:17のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (b)配列番号:17のヌクレオチド1129からヌクレオチド1896まで
のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (c)配列番号:17のヌクレオチド1189からヌクレオチド1896まで
のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (d)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpt127 1
の全長蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (e)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpt127 1
のcDNAインサートによりコードされる全長蛋白をコードしているポリヌクレ
オチド; (f)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpt127 1
の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (g)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpt127 1
のcDNAインサートによりコードされる成熟蛋白をコードしているポリヌクレ
オチド; (h)配列番号:18のアミノ酸配列を含む蛋白をコードしているポリヌクレ
オチド; (i)生物学的活性を有する配列番号:18のアミノ酸配列のフラグメントを
含む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:18
の8個の連続したアミノ酸を含む); (j)上記(a)〜(g)のポリヌクレオチドの対立遺伝子変種であるポリヌ
クレオチド; (k)上記(h)または(i)の蛋白の種相同体をコードしているポリヌクレ
オチド; (l)厳密な条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれか1つ
にハイブリダイゼーションするポリヌクレオチド:および (m)厳密な条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれか1つ
にハイブリダイゼーションし、配列番号:17の長さの少なくとも25%の長さ
を有するポリヌクレオチド。 好ましくは、かかるポリヌクレオチドは、配列番号:17のヌクレオチド11
29からヌクレオチド1896までのヌクレオチド配列;配列番号:17のヌク
レオチド1189からヌクレオチド1896までのヌクレオチド配列;受託番号
ATCC98663として寄託されたクローンpt127 1の全長蛋白コーデ
ィング配列のヌクレオチド配列;または受託番号ATCC98663として寄託
されたクローンpt127 1の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列
を含む。他の好ましい具体例において、ポリヌクレオチドは、受託番号ATCC
98663として寄託されたクローンpt127 1のcDNAインサートによ
りコードされる全長または成熟蛋白をコードする。さらなる好ましい具体例にお
いて、本発明は、生物学的活性を有する配列番号:18のアミノ酸配列のフラグ
メントを含む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番
号:18の、好ましくは8個、より好ましくは20個、最も好ましくは30個の
連続したアミノ酸を含む)、あるいは生物学的活性を有する配列番号:18のア
ミノ酸配列のフラグメントを含む蛋白をコードするポリヌクレオチド(該フラグ
メントは配列番号:18のアミノ酸123からアミノ酸132までのアミノ酸配
列を含む)を提供する。 他の具体例は配列番号:17のcDNA配列に対応する遺伝子を提供する。 本発明のさらなる具体例は、単離ポリヌクレオチドの製造方法を提供し、該方
法は以下の方法からなる群から選択される: (a)下記工程を含む方法: (i)6X SSC中、65℃にて下記のものからなる群より選択されるヌ クレオチド配列にハイブリダイゼーションする1またはそれ以上のポリヌクレオ
チドプローブを調製すること; (aa)配列番号:17(配列番号:17の3’末端のポリ(A)テイル
を除く);および (ab)ATCC98663として寄託されたクローンpt127 1の
cDNAインサートのヌクレオチド配列 (ii)少なくとも4XSSC、50℃の厳密さの条件下でヒトゲノムDN
Aに該プローブ(複数も可)をハイブリダイゼーションさせること;次いで (iii)該プローブ(複数も可)で検出されたDNAポリヌクレオチドを
単離すること; ならびに (b)下記工程を含む方法: (i)6X SSC中、65℃にて下記のものからなる群より選択されるヌ クレオチド配列にハイブリダイゼーションする1またはそれ以上のポリヌクレオ
チドプライマーを調製すること; (ba)配列番号:17(配列番号:17の3’末端のポリ(A)テイル
を除く);および (bb)ATCC98663として寄託されたクローンpt127 1の
cDNAインサートのヌクレオチド配列 (ii)少なくとも4XSSC、50℃の厳密さの条件下でヒトゲノムDN
Aに該プライマー(複数も可)をハイブリダイゼーションさせること; (iii)ヒトDNA配列を増幅すること;次いで (iv)工程(b)(iii)のポリヌクレオチド生成物を単離すること。 好ましくは、この方法により単離されるポリヌクレオチドのヌクレオチド配列
は配列番号:17のcDNA配列に対応するものであり、配列番号:17の5’
末端に対応するヌクレオチド配列から配列番号:17の3’末端に対応するヌク
レオチド配列までの連続したものであるが、配列番号:17の3’末端のポリ(
A)テイルは除かれる。また好ましくは、上記方法により単離されたポリヌクレ
オチドのヌクレオチド配列は配列番号:17のcDNA配列のヌクレオチド11
29からヌクレオチド1896までに対応するものであり、配列番号:17のヌ
クレオチド1129からヌクレオチド1896までの該配列の5’末端に対応す
るヌクレオチド配列から、配列番号:17のヌクレオチド1129からヌクレオ
チド1896までの該配列の3’末端に対応するヌクレオチド配列までの連続し
たものである。また好ましくは、上記方法により単離されたポリヌクレオチドの
ヌクレオチド配列は配列番号:17のcDNA配列のヌクレオチド1189から
ヌクレオチド1896までに対応するものであり、配列番号:17のヌクレオチ
ド1189からヌクレオチド1896までの該配列の5’末端に対応するヌクレ
オチド配列から、配列番号:17のヌクレオチド1189からヌクレオチド18
96までの該配列の3’末端に対応するヌクレオチド配列までの連続したもので
ある。 他の具体例において、本発明は、蛋白を含む組成物であって、該蛋白が、 (a)配列番号:18のアミノ酸配列; (b)配列番号:18のアミノ酸配列のフラグメント(各フラグメントは配列
番号:18の8個の連続したアミノ酸を含む);および (c)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpt127 1
のcDNAインサートによりコードされるアミノ酸配列 からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むものであり、他の哺乳動物蛋白を
実質的に含まないものである組成物を提供する。好ましくは、かかる蛋白は配列
番号:18のアミノ酸配列を含む。さらなる好ましい具体例において、本発明は
、生物学的活性を有する配列番号:18のアミノ酸配列のフラグメントを含む蛋
白(該フラグメントは配列番号:18の、好ましくは8個、より好ましくは20
個、最も好ましくは30個の連続したアミノ酸を含む)、あるいは生物学的活性
を有する配列番号:18のアミノ酸配列のフラグメントを含む蛋白(該フラグメ
ントは配列番号:18のアミノ酸123からアミノ酸132までのアミノ酸配列
を含む)を提供する。
【0012】 1の具体例において、本発明は、下記のものからなる群より選択される単離ポ
リヌクレオチドを含む組成物を提供する: (a)配列番号:19のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (b)配列番号:19のヌクレオチド172からヌクレオチド1041までの
ヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (c)配列番号:19のヌクレオチド295からヌクレオチド1041までの
ヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (d)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンqo115 1
3の全長蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (e)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンqo115 1
3のcDNAインサートによりコードされる全長蛋白をコードしているポリヌク
レオチド; (f)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンqo115 1
3の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (g)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンqo115 1
3のcDNAインサートによりコードされる成熟蛋白をコードしているポリヌク
レオチド; (h)配列番号:20のアミノ酸配列を含む蛋白をコードしているポリヌクレ
オチド; (i)生物学的活性を有する配列番号:20のアミノ酸配列のフラグメントを
含む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:20
の8個の連続したアミノ酸を含む); (j)上記(a)〜(g)のポリヌクレオチドの対立遺伝子変種であるポリヌ
クレオチド; (k)上記(h)または(i)の蛋白の種相同体をコードしているポリヌクレ
オチド; (l)厳密な条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれか1つ
にハイブリダイゼーションするポリヌクレオチド;および (m)厳密な条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれか1つ
にハイブリダイゼーションし、配列番号:19の長さの少なくとも25%の長さ
を有するポリヌクレオチド。 好ましくは、かかるポリヌクレオチドは、配列番号:19のヌクレオチド17
2からヌクレオチド1041までのヌクレオチド配列;配列番号:19のヌクレ
オチド295からヌクレオチド1041までのヌクレオチド配列;受託番号AT
CC98663として寄託されたクローンqo115 13の全長蛋白コーディ
ング配列のヌクレオチド配列;または受託番号ATCC98663として寄託さ
れたクローンqo115 13の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列
を含む。他の好ましい具体例において、ポリヌクレオチドは、受託番号ATCC
98663として寄託されたクローンqo115 13のcDNAインサートに
よりコードされる全長または成熟蛋白をコードする。さらなる好ましい具体例に
おいて、本発明は、生物学的活性を有する配列番号:20のアミノ酸配列のフラ
グメントを含む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列
番号:20の、好ましくは8個、より好ましくは20個、最も好ましくは30個
の連続したアミノ酸を含む)、あるいは生物学的活性を有する配列番号:20の
アミノ酸配列のフラグメントを含む蛋白をコードするポリヌクレオチド(該フラ
グメントは配列番号:20のアミノ酸140からアミノ酸149までのアミノ酸
配列を含む)を提供する。 他の具体例は配列番号:19のcDNA配列に対応する遺伝子を提供する。 本発明のさらなる具体例は、単離ポリヌクレオチドの製造方法を提供し、該方
法は以下の方法からなる群から選択される: (a)下記工程を含む方法: (i)6X SSC中、65℃にて下記のものからなる群より選択されるヌ クレオチド配列にハイブリダイゼーションする1またはそれ以上のポリヌクレオ
チドプローブを調製すること; (aa)配列番号:19(配列番号:19の3’末端のポリ(A)テイル
を除く);および (ab)ATCC98663として寄託されたクローンqo115 13
のcDNAインサートのヌクレオチド配列 (ii)少なくとも4XSSC、50℃の厳密さの条件下でヒトゲノムDN
Aに該プローブ(複数も可)をハイブリダイゼーションさせること;次いで (iii)該プローブ(複数も可)で検出されたDNAポリヌクレオチドを
単離すること; ならびに (b)下記工程を含む方法: (i)6X SSC中、65℃にて下記のものからなる群より選択されるヌ クレオチド配列にハイブリダイゼーションする1またはそれ以上のポリヌクレオ
チドプライマーを調製すること; (ba)配列番号:19(配列番号:19の3’末端のポリ(A)テイル
を除く);および (bb)ATCC98663として寄託されたクローンqo115 13
のcDNAインサートのヌクレオチド配列 (ii)少なくとも4XSSC、50℃の厳密さの条件下でヒトゲノムDN
Aに該プライマー(複数も可)をハイブリダイゼーションさせること; (iii)ヒトDNA配列を増幅すること;次いで (iv)工程(b)(iii)のポリヌクレオチド生成物を単離すること。 好ましくは、この方法により単離されるポリヌクレオチドのヌクレオチド配列
は配列番号:19のcDNA配列に対応するものであり、配列番号:19の5’
末端に対応するヌクレオチド配列から配列番号:19の3’末端に対応するヌク
レオチド配列までの連続したものであるが、配列番号:19の3’末端のポリ(
A)テイルは除かれる。また好ましくは、上記方法により単離されたポリヌクレ
オチドのヌクレオチド配列は配列番号:19のcDNA配列のヌクレオチド17
2からヌクレオチド1041までに対応するものであり、配列番号:19のヌク
レオチド172からヌクレオチド1041までの該配列の5’末端に対応するヌ
クレオチド配列から、配列番号:19のヌクレオチド172からヌクレオチド1
041までの該配列の3’末端に対応するヌクレオチド配列までの連続したもの
である。また好ましくは、上記方法により単離されたポリヌクレオチドのヌクレ
オチド配列は配列番号:19のcDNA配列のヌクレオチド295からヌクレオ
チド1041までに対応するものであり、配列番号:19のヌクレオチド295
からヌクレオチド1041までの該配列の5’末端に対応するヌクレオチド配列
から、配列番号:19のヌクレオチド295からヌクレオチド1041までの該
配列の3’末端に対応するヌクレオチド配列までの連続したものである。 他の具体例において、本発明は、蛋白を含む組成物であって、該蛋白が、 (a)配列番号:20のアミノ酸配列; (b)配列番号:20のアミノ酸配列のフラグメント(各フラグメントは配列
番号:20の8個の連続したアミノ酸を含む);および (c)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンqo115 1
3のcDNAインサートによりコードされるアミノ酸配列 からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むものであり、他の哺乳動物蛋白を
実質的に含まないものである組成物を提供する。好ましくは、かかる蛋白は配列
番号:20のアミノ酸配列を含む。さらなる好ましい具体例において、本発明は
、生物学的活性を有する配列番号:20のアミノ酸配列のフラグメントを含む蛋
白(該フラグメントは配列番号:20の、好ましくは8個、より好ましくは20
個、最も好ましくは30個の連続したアミノ酸を含む)、あるいは生物学的活性
を有する配列番号:20のアミノ酸配列のフラグメントを含む蛋白(該フラグメ
ントは配列番号:20のアミノ酸140からアミノ酸149までのアミノ酸配列
を含む)を提供する。
【0013】 ある種の好ましい具体例において、ポリヌクレオチドは発現調節配列に作動可
能に連結される。本発明はまた、かかるポリヌクレオチド組成物で形質転換され
た、細菌、酵母、昆虫および哺乳動物細胞を包含する宿主細胞を提供する。また
、本明細書開示のポリヌクレオチド配列に対応する遺伝子の、促進、低下、また
は修飾された発現を有する生物が本発明により提供される。 さらに、蛋白の製造方法であって、 (a)かかるポリヌクレオチド組成物で形質転換された宿主細胞の培養物を適
当な培地にて増殖させ;ついで (b)該培養物から蛋白を精製する ことからなる方法も提供される。かかる方法により産生される蛋白もまた、本発
明により提供されるものである。好ましい具体例として、かかる方法により製造
される蛋白が成熟形態の蛋白であるものが挙げられる。 本発明の蛋白組成物は、さらに医薬上許容される担体を含んでいてもよい。か
かる蛋白と特異的に反応する抗体を含む組成物も、本発明により提供される。 本発明の蛋白および医薬上許容される担体を含む治療上有効量の組成物を哺乳
動物対象に投与することを含む、医学的状態の予防、治療または改善のための方
法も提供される。
【0014】詳細な説明 単離蛋白およびポリヌクレオチド 本願において開示されているクローンおよび蛋白の各々についてのヌクレオチ
ドおよびアミノ酸配列を以下に報告する。既知方法により寄託クローンの配列決
定を行うことにより各クローンの実際のヌクレオチド配列を容易に決定すること
ができる。次いで、推定アミノ酸配列(全長ならびに成熟の両方)をかかるヌク
レオチド配列から決定することができる。適当な宿主細胞中でクローンを発現さ
せ、蛋白を集め、次いで、その配列を決定することにより、個々のクローンによ
りコードされる蛋白のアミノ酸配列も決定することができる。開示されている各
蛋白について、出願人は、出願時に利用可能な配列の情報を用いて最もよく同定
できるリーディングフレームであると決定されたものを同定した。 本明細書の用語「分泌」蛋白は、適当な宿主細胞において発現された場合、膜
を通過して輸送されるものをいい、そのアミノ酸配列中のシグナル配列の結果と
しての輸送も含まれる。「分泌」蛋白は、発現される細胞から全体的に分泌され
る蛋白(例えば、可溶性蛋白)または部分的に分泌される蛋白(例えば、受容体
)を包含するが、これらに限らない。また「分泌」蛋白は、小胞体の膜を通過し
て輸送されるものを包含するが、これに限らない。
【0015】クローン「co821 31」 本発明ポリヌクレオチドはクローンco821 31として同定されている。
co821 31は、分泌蛋白をコードしているcDNAに選択的な方法(米国
特許第5536637号参照)を用いて成人脳cDNAライブラリーから単離さ
れ、あるいはコードされる蛋白のアミノ酸配列のコンピューター分析に基づいて
、分泌蛋白または膜貫通蛋白をコードするものと同定された。co821 31
は全長クローンであり、分泌蛋白(本明細書で「co821 31蛋白」とも称
する)の全コーディング配列を含んでいる。 今回決定されたco821 31のヌクレオチド配列を配列番号:1に示し、
これはポリ(A)テイルを含んでいる。今回出願人が、上記ヌクレオチド配列に
対応したco821 31蛋白の正しいリーディングフレームおよび推定アミノ
酸配列であると考えるものを配列番号:2に示す。配列番号:2のアミノ酸87
から99までは推定リーダー/シグナル配列であり、推定成熟アミノ酸配列はア
ミノ酸100から開始する。推定リーダー/シグナル配列が疎水性であるため、
それは膜貫通ドメインとして作用するはずであり、該推定リーダー/シグナル配
列はco821 31蛋白の残りの部分から分離されないであろう。 クローンco821 31を含む寄託物から得ることのできるEcoRI/N
otI制限フラグメントは約2400bpの長さのはずである。 本明細書に開示されたco821 31のヌクレオチド配列を、BLASTN/BLAST
XおよびFASTA検索プロトコールを用いてGenBankおよびGenSeqヌクレオチド配列 データベースに対して検索した。co821 31は、AA488906 (aa55a02.r1 N
CI_CGAP_GCB1 Homo sapiens cDNA clone IMAGE:824810 5' similar to TR:G6070
03 G607003 BETA TRANSDUCIN-LIKE PROTEIN), L26690 (Mus musculus expressed
sequence tag EST F101), N30002 (yx82e02.s1 Homo sapiens cDNA clone 2682
50 3'), R82926 (EST23j22 Clontech adult human fat cell library HL1108A H
omo sapiens cDNA clone 23j22), T20673 (Human gene signature HUMGS01889),
および W44749 (zb98b11.s1 Soares parathyroid tumor NbHPA Homo sapiens c
DNA clone 320829 3')として同定された配列に対して少なくともある程度の類 似性を示した。co821 31蛋白に関する本明細書開示の推定アミノ酸配列
をBLASTX検索プロトコールを用いてGenPeptおよびGeneSeqアミノ酸配列データベ
ースに対して検索した。推定co821 31蛋白は、U51030 (Ydr267cp [Sacc
haromyces cerevisiae])として同定された配列に対して少なくともある程度の類
似性を示した。推定co821 31蛋白は、U92792 (general transcriptiona
l repressor Tup1 [Schizosaccharomyces pombe]), L28125 (beta transducin-l
ike protein (het-e1) [Podospora anserina])およびWD−40モチーフを含む
他の蛋白に対しても少なくともある程度の類似性を示した。配列類似性に基づけ
ば、co821 31蛋白および各類似蛋白またはペプチドは少なくともある程
度活性を共有している可能性がある。
【0016】クローン「dk329 1」 本発明ポリヌクレオチドはクローンdk329 1として同定されている。d
k329 1は、分泌蛋白をコードしているcDNAに選択的な方法(米国特許
第5536637号参照)を用いてヒト胎児腎臓cDNAライブラリーから単離
され、あるいはコードされる蛋白のアミノ酸配列のコンピューター分析に基づい
て、分泌蛋白または膜貫通蛋白をコードするものと同定された。dk329 1
は全長クローンであり、分泌蛋白(本明細書で「dk329 1蛋白」とも称す
る)の全コーディング配列を含んでいる。 今回決定されたdk329 1のヌクレオチド配列を配列番号:3に示し、こ
れはポリ(A)テイルを含む。今回出願人が、上記ヌクレオチド配列に対応する
dk329 1蛋白の正しいリーディングフレームおよび推定アミノ酸配列と考
えるものを配列番号:4に示す。配列番号:4のアミノ酸71から83までは推
定リーダー/シグナル配列であり、推定成熟アミノ酸配列はアミノ酸84から開
始する。推定リーダー/シグナル配列が疎水性であるため、それは膜貫通ドメイ
ンとして作用するはずであり、推定リーダー/シグナル配列はdk329 1蛋
白の残りの部分から分離されないであろう。 クローンdk329 1を含む寄託物から得ることのできるEcoRI/No
tI制限フラグメントは約1300bpの長さのはずである。 本明細書に開示したdk329 1のヌクレオチド配列を、BLASTA/BLASTXお よびFASTAサーチプロトコールを用いてGenBankおよびGeneSeqデータベースに対 して検索した。dk329 1は、AA147429 (zo39g07.r1 Stratagene endothel
ial cell 937223 Homo sapiens cDNA clone 589308 5' similar to WP T14G10.6
CE06452 LEUCOCYTE SURFACE ANTIGEN CD53 LINE), AA190572 (zp42h08.r1 Stra
tagene muscle 937209 Homo sapiens cDNA clone 612159 5' similar to WP T14
G10.6 CE06452 LEUCOCYTE SURFACE ANTIGEN CD53 LINE), AA234042 (zr51a05.s1
Soares NhHMPu S1 Homo sapiens cDNA clone 666896 3' similar to WP:T14G10
.6 CE06452 LEUCOCYTE SURFACE ANTIGEN CD53 LINE), AA236262 (zr51a05.r1 So
ares NhHMPu S1 Homo sapiens cDNA clone 666896 5' similar to WP:T14G10.6
CE06452 LEUCOCYTE SURFACE ANTIGEN CD53 LINE), N72328 (yv31f12.r1 Homo sa
piens cDNA clone 244367 5' similar to SW A15_HUMAN P41732 CELL SURFACE G
LYCOPROTEIN A15), および W50192 (mb08d07.r1 Life Tech mouse brain Mus mu
sculus cDNA clone 319597 5' similar to SW:CD53_HUMAN P19397 LEUKOCYTE SU
RFACE ANTIGEN CD53)として同定された配列に対して少なくともある程度の類似 性を示した。dk329 1蛋白に関する本明細書開示の推定アミノ酸配列をBL
ASTX検索プロトコールを用いてGenPeptおよびGeneSeqアミノ酸配列データベース
に対して検索した。推定dk329 1蛋白は、Z68880 (T14G10.6 [Caenorhabd
itis elegans])として同定された配列および免疫機能に関与する種々の膜蛋白に
対して少なくともある程度の類似性を示した。配列類似性に基づけば、dk32
9 1蛋白および各類似蛋白またはペプチドは少なくともある程度活性を共有し
ている可能性がある。TopPredIIコンピュータープログラムによれば、配列番号 :4のアミノ酸31、71および103付近をそれぞれ中心とした3個の潜在的
な撒く貫通ドメインが予想される。 dk329 1蛋白はCOS細胞発現系において発現され、SDSポリアクリ
ルアミドゲル電気泳動を用いて約18kDaの発現蛋白バンドが膜フラクション
中に検出された。
【0017】クローン「fx317 11」 本発明ポリヌクレオチドはクローンfx317 11として同定されている。
fx317 11は、分泌蛋白をコードしているcDNAに選択的な方法(米国
特許第5536637号参照)を用いてヒト胎児脳cDNAライブラリーから単
離され、あるいはコードされる蛋白のアミノ酸配列のコンピューター分析に基づ
いて、分泌蛋白または膜貫通蛋白をコードするものと同定された。fx317
11は全長クローンであり、分泌蛋白(本明細書で「fx317 11蛋白」と
も称する)の全コーディング配列を含んでいる。 今回決定されたfx317 11のヌクレオチド配列を配列番号:5に示し、
これはポリ(A)テイルを含む。今回出願人が、上記ヌクレオチド配列に対応す
るfx317 11蛋白の正しいリーディングフレームおよび推定アミノ酸配列
と考えるものを配列番号:6に示す。配列番号:6のアミノ酸229から241
までは推定リーダー/シグナル配列であり、推定成熟アミノ酸配列はアミノ酸2
42から開始する。推定リーダー/シグナル配列が疎水性であるため、それは膜
貫通ドメインとして作用するはずであり、推定リーダー/シグナル配列はfx3
17 11蛋白の残りの部分から分離されないであろう。 クローンfx317 11を含む寄託物から得ることのできるEcoRI/N
otI制限フラグメントは約1900bpの長さのはずである。 本明細書に開示したfx317 11のヌクレオチド配列を、BLASTA/BLASTX およびFASTAサーチプロトコールを用いてGenBankおよびGeneSeqデータベースに 対して検索した。fx317 11は、AA505600 (nh93h11.s1 NCI_CGAP_Br2 Ho
mo sapiens cDNA cloneIMAGE:966117), N47450 (yy89c09.r1 Homo sapiens cDNA
clone 280720 5' similar to contains element PTR5 repetitive element), T
64549 (Human activated platelet protein-2 APP-2 cDNA), および W52611 (zc
49e02.r1 Soares senescent fibroblasts NbHSF Homo sapiens cDNA clone 3256
58 5')として同定された配列に対して少なくともある程度の類似性を示した。f
x317 11蛋白に関する本明細書開示の推定アミノ酸配列をBLASTX検索プロ
トコールを用いてGenPeptおよびGeneSeqアミノ酸配列データベースに対して検索
した。推定fx317 11蛋白は、W15413 (Human activated platelet prote
in-2 APP-2) および W15414 (Human activated platelet protein-2 APP-2 alte
rnatively spliced variant)として同定された配列に対して少なくともある程度
の類似性を示した。APP−2蛋白はヒトの活性化された血小板上に発現される
。配列類似性に基づけば、fx317 11蛋白および各類似蛋白またはペプチ
ドは少なくともある程度活性を共有している可能性がある。
【0018】クローン「lp547 4」 本発明ポリヌクレオチドはクローンlp547 4として同定されている。l
p547 4は、分泌蛋白をコードしているcDNAに選択的な方法(米国特許
第5536637号参照)を用いて成人血液(インビボにおいて顆粒球刺激因子
で処理された末梢血単核細胞)cDNAライブラリーから単離され、あるいはコ
ードされる蛋白のアミノ酸配列のコンピューター分析に基づいて、分泌蛋白また
は膜貫通蛋白をコードするものと同定された。lp547 4は全長クローンで
あり、分泌蛋白(本明細書において「lp547 4蛋白」とも称す)の全コー
ディング配列を含む。 今回決定されたlp547 4のヌクレオチド配列を配列番号:7に示し、こ
れはポリ(A)テイルを含む。上記ヌクレオチド配列に対応するlp547 4
蛋白の正しいリーディングフレームおよび推定アミノ酸配列であると出願人が考
えるものを配列番号:8に示す。 クローンlp547 4を含む寄託物から得ることのできるEcoRI/No
tI制限フラグメントは約1800bpの長さのはずである。 本明細書に開示したlp547 4のヌクレオチド配列を、BLASTA/BLASTXお よびFASTAサーチプロトコールを用いてGenBankおよびGeneSeqデータベースに対 して検索した。lp547 4は、AA442560 (zv75g07.r1 Soares total fetus
Nb2HF8 9w Homo sapiens cDNA clone 759516 5' similar to TR:G436941 G43694
1 PHORBOLIN I)として同定された配列に対して少なくともある程度の類似性を示
した。lp547 4蛋白に関する本明細書開示の推定アミノ酸配列をBLASTX検
索プロトコールを用いてGenPeptおよびGeneSeqアミノ酸配列データベースに対し
て検索した。推定lp547 4蛋白は、R58704 (Apo-B RNA editing protein)
, U03891 (phorbolin I [Homo sapiens]), および U21951 (apolipoprotein B m
RNA-editing component 1 [Mus musculus])として同定された配列に対して少な くともある程度の類似性を示した。U03891蛋白(ホルボリンI)は乾癬性ケラチ
ノサイトにおいてアップレギュレーアホンされる。また推定lp547 4蛋白
はシチジンおよびデオキシシチジンデアミナーゼの亜鉛結合領域シグナチャーを
含んでいる。配列類似性に基づけば、lp547 4蛋白および類似性を有する
各蛋白またはペプチドは少なくともある程度活性を共有している可能性がある。
TopPredIIコンピュータープグラムによれば、lp547 4蛋白配列中、配列 番号:8のアミノ酸290付近を中心とした潜在的な膜貫通ドメインが予想され
る。またアミノ酸278から290まではリーダー/シグナル配列の可能性があ
り、推定成熟アミノ酸配列はアミノ酸291から開始する。 lp547 4蛋白はCOS細胞発現系において発現され、SDSポリアクリ
ルアミドゲル電気泳動を用いて約41kDaの発現蛋白バンドがならし培地およ
び膜フラクション中に検出された。
【0019】クローン「lv310 7」 本発明ポリヌクレオチドはクローンlv310 7として同定されている。l
v310 7は、分泌蛋白をコードしているcDNAに選択的な方法(米国特許
第5536637号参照)を用いて成人甲状腺cDNAライブラリーから単離さ
れ、あるいはコードされる蛋白のアミノ酸配列のコンピューター分析に基づいて
、分泌蛋白または膜貫通蛋白をコードするものと同定された。次いで、これらの
cDNA由来のプローブを用いて成人脳cDNAライブラリーからlv310
7を単離した。lv310 7は全長クローンであり、分泌蛋白(本明細書で「
lv310 7蛋白」とも称する)の全コーディング配列を含んでいる。 今回決定されたlv310 7のヌクレオチド配列を配列番号:9に示し、こ
れはポリ(A)テイルを含む。今回出願人が、上記ヌクレオチド配列に対応する
lv310 7蛋白の正しいリーディングフレームおよび推定アミノ酸配列と考
えるものを配列番号:10に示す。配列番号:10のアミノ酸269から281
までは推定リーダー/シグナル配列であり、推定成熟アミノ酸配列はアミノ酸2
82から開始する。推定リーダー/シグナル配列が疎水性であるため、それは膜
貫通ドメインとして作用するはずであり、推定リーダー/シグナル配列はlv3
10 7蛋白の残りの部分から分離されないであろう。 配列番号:9の塩基対1619から2188までによりコードされるもう1つ
の可能性のあるlv310 7のリーディングフレームおよび推定アミノ酸配列
を配列番号:31に示す。 クローンlv310 7を含む寄託物から得ることのできるEcoRI/No
tI制限フラグメントは約3650bpの長さのはずである。 本明細書に開示したlv310 7のヌクレオチド配列を、BLASTA/BLASTXお よびFASTAサーチプロトコールを用いてGenBankおよびGeneSeqデータベースに対 して検索した。lv310 7は、N37001 (yy40a01.s1 Homo sapiens cDNA clo
ne 273672 3'), R56228 (yg90d01.s1 Homo sapiens cDNA clone 40958 3'), お よび R56310 (yg90d01.r1 Homo sapiens cDNA clone 40958 5')として同定され た配列に対して少なくともある程度の類似性を示した。lv310 7蛋白に関
する本明細書開示の推定アミノ酸配列をBLASTX検索プロトコールを用いてGenPep
tおよびGeneSeqアミノ酸配列データベースに対して検索した。推定lv310
7蛋白は、U24223 (alpha-CP1 [Homo sapiens])として同定された配列に対して 少なくともある程度の類似性を示した。配列類似性に基づけば、lv310 7
蛋白および各類似蛋白またはペプチドは少なくともある程度活性を共有している
可能性がある。TopPredIIコンピュータープログラムによれば、lv310 7 蛋白配列中、配列番号:10のアミノ酸100、130、160、210、28
0、490、520、600、690および750付近をそれぞれ中心とした1
0個の潜在的な膜貫通ドメインが予想される。
【0020】クローン「nq34 12」 本発明ポリヌクレオチドはクローンnq34 12として同定されている。n
q34 12は、分泌蛋白をコードしているcDNAに選択的な方法(米国特許
第5536637号参照)を用いて成人血液(赤白血病TF−1)cDNAライ
ブラリーから単離され、あるいはコードされる蛋白のアミノ酸配列のコンピュー
ター分析に基づいて、分泌蛋白または膜貫通蛋白をコードするものと同定された
。nq34 12は全長クローンであり、分泌蛋白(本明細書で「nq34 1
2蛋白」とも称する)の全コーディング配列を含んでいる。 今回決定されたnq34 12のヌクレオチド配列を配列番号:11に示し、
これはポリ(A)テイルを含む。今回出願人が、上記ヌクレオチド配列に対応す
るnq34 12蛋白の正しいリーディングフレームおよび推定アミノ酸配列と
考えるものを配列番号:12に示す。配列番号:12のアミノ酸287から29
9までは推定リーダー/シグナル配列であり、推定成熟アミノ酸配列はアミノ酸
300から開始する。推定リーダー/シグナル配列が疎水性であるため、それは
膜貫通ドメインとして作用するはずであり、推定リーダー/シグナル配列はnq
34 12蛋白の残りの部分から分離されないであろう。 クローンnq34 12を含む寄託物から得ることのできるEcoRI/No
tI制限フラグメントは約1700bpの長さのはずである。 本明細書に開示したnq34 12のヌクレオチド配列を、BLASTA/BLASTXお よびFASTAサーチプロトコールを用いてGenBankおよびGeneSeqデータベースに対 して検索した。nq34 12は、AA126375 (zl86c06.r1 Stratagene colon (#
937204) Homo sapiens cDNA clone 511498 5'), AA446675 (zw84a08.r1 Soares
total fetus Nb2HF8 9w Homo sapiens cDNA clone 783638 5'), AA448974 (zx07
d05.r1 Soares total fetus Nb2HF8 9w Homo sapiens cDNA clone 785769 5' si
milar to SW YND0_YEAST P40344 HYPOTHETICAL 35.9 KD PROTEIN IN RPC34-CSE2
INTERGENIC REGION), R57902 (F6699 Fetal heart Homo sapiens cDNA clone F
6699 5' end), および X07453 (Plasmodium falciparum 11-1 gene part 1)とし
て同定された配列に対して少なくともある程度の類似性を示した。nq34 1
2蛋白に関する本明細書開示の推定アミノ酸配列をBLASTX検索プロトコールを用
いてGenPeptおよびGeneSeqアミノ酸配列データベースに対して検索した。推定n
q34 12蛋白は、X77395 (N2040 gene product [Saccharomyces cerevisiae
])として同定された配列に対して少なくともある程度の類似性を示した。配列類
似性に基づけば、nq34 12蛋白および類似性を有する各蛋白またはペプチ
ドは少なくともある程度活性を共有している可能性がある。 nq34 12蛋白をCOS細胞発現系において発現させ、SDSポリアクリ
ルアミドゲル電気泳動を用いて約34kDaの発現蛋白バンドを膜フラクション
中に検出した。
【0021】クローン「pj154 1」 本発明ポリヌクレオチドはクローンpj154 1として同定されている。p
j154 1は、分泌蛋白をコードしているcDNAに選択的な方法(米国特許
第5536637号参照)を用いてヒト胎児癌腫(レチノイン酸で23日間処理
されたNTD2細胞)cDNAライブラリーから単離され、あるいはコードされ
る蛋白のアミノ酸配列のコンピューター分析に基づいて、分泌蛋白または膜貫通
蛋白をコードするものと同定された。pj154 1は全長クローンであり、分
泌蛋白(本明細書で「pj154 1蛋白」とも称する)の全コーディング配列
を含んでいる。 今回決定されたpj154 1のヌクレオチド配列を配列番号:13に示し、
これはポリ(A)テイルを含む。今回出願人が、上記ヌクレオチド配列に対応す
るpj154 1蛋白の正しいリーディングフレームおよび推定アミノ酸配列と
考えるものを配列番号:14に示す。配列番号:14のアミノ酸13から25ま
では推定リーダー/シグナル配列であり、推定成熟アミノ酸配列はアミノ酸26
から開始する。推定リーダー/シグナル配列が疎水性であるため、それは膜貫通
ドメインとして作用するはずであり、推定リーダー/シグナル配列はpj154
1蛋白の残りの部分から分離されないであろう。 クローンpj154 1を含む寄託物から得ることのできるEcoRI/No
tI制限フラグメントは約2300bpの長さのはずである。 本明細書に開示したpj154 1のヌクレオチド配列を、BLASTA/BLASTXお よびFASTAサーチプロトコールを用いてGenBankおよびGeneSeqデータベースに対 して検索した。pj154 1は、AA223153 (zr07g12.r1 Stratagene NT2 neur
onal precursor 937230 Homo sapiens cDNA clone 650854 5'), AA223170 (zr07
g12.s1 Stratagene NT2 neuronal precursor 937230 Homo sapiens cDNA clone
650854 3' similar to contains Alu repetitive element), H16627 (ym26d04.r
1 Homo sapiens cDNA clone 49469 5'), および Z44660 (H. sapiens partial c
DNA sequence; clone c-26d11)として同定された配列に対して少なくともある程
度の類似性を示した。配列類似性に基づけば、pj154 1蛋白および類似性
を有する各蛋白またはペプチドは少なくともある程度活性を共有している可能性
がある。pj154 1のヌクレオチド配列は、それがAlu反復エレメントを
含む可能性を示す。
【0022】クローン「pk147 1」 本発明ポリヌクレオチドはクローンpk147 1として同定されている。p
k147 1は、分泌蛋白をコードしているcDNAに選択的な方法(米国特許
第5536637号参照)を用いてヒト胎児腎臓(293細胞系)cDNAライ
ブラリーから単離され、あるいはコードされる蛋白のアミノ酸配列のコンピュー
ター分析に基づいて、分泌蛋白または膜貫通蛋白をコードするものと同定された
。pk147 1は全長クローンであり、分泌蛋白(本明細書で「pk147
1蛋白」とも称する)の全コーディング配列を含んでいる。 今回決定されたpk147 1のヌクレオチド配列を配列番号:15に示し、
これはポリ(A)テイルを含む。今回出願人が、上記ヌクレオチド配列に対応す
るpk147 1蛋白の正しいリーディングフレームおよび推定アミノ酸配列を
配列番号:16に示す。配列番号:16のアミノ酸16から28までは推定リー
ダー/シグナル配列であり、推定成熟アミノ酸配列はアミノ酸29から開始する
。推定リーダー/シグナル配列が疎水性であるため、それは膜貫通ドメインとし
て作用するはずであり、推定リーダー/シグナル配列はpk147 1蛋白の残
りの部分から分離されないであろう。 クローンpk147 1を含む寄託物から得ることのできるEcoRI/No
tI制限フラグメントは約1600bpの長さのはずである。 本明細書に開示したpk147 1のヌクレオチド配列を、BLASTA/BLASTXお よびFASTAサーチプロトコールを用いてGenBankおよびGeneSeqデータベースに対 して検索した。pk147 1は、AA126920 (zl23h01.s1 Soares pregnant ute
rus NbHPU Homo sapiens cDNA clone 502801 3'), AA406448 (zv12f07.r1 Soare
s NhHMPu S1 Homo sapiens cDNA clone 753445 5'), および R51886 (yg78c03.
s1 Homo sapiens cDNA clone 39574 3')として同定された配列に対して少なくと
もある程度の類似性を示した。配列類似性に基づけば、pk147 1蛋白およ
び類似性を有する各蛋白またはペプチドは少なくともある程度活性を共有してい
る可能性がある。TopPredIIコンピュータープログラムによれば、pk147 1蛋白中、配列番号:16のアミノ酸37付近を中心とした1個の潜在的な膜貫
通ドメインが推定される。
【0023】クローン「pt127 1」 本発明ポリヌクレオチドはクローンpt127 1として同定されている。p
t127 1は、分泌蛋白をコードしているcDNAに選択的な方法(米国特許
第5536637号参照)を用いて成人血液(リンパ芽球性白血病MOLT−4
)cDNAライブラリーから単離され、あるいはコードされる蛋白のアミノ酸配
列のコンピューター分析に基づいて、分泌蛋白または膜貫通蛋白をコードするも
のと同定された。pt127 1は全長クローンであり、分泌蛋白(本明細書で
「pt127 1蛋白」とも称する)の全コーディング配列を含んでいる。 今回決定されたpt127 1のヌクレオチド配列を配列番号:17に示し、
これはポリ(A)テイルを含む。今回出願人が、上記ヌクレオチド配列に対応す
るpt127 1蛋白の正しいリーディングフレームおよび推定アミノ酸配列で
あると考えるものを配列番号:18に示す。配列番号:18のアミノ酸8から2
0までは推定リーダー/シグナル配列であり、推定成熟アミノ酸配列はアミノ酸
21から開始する。推定リーダー/シグナル配列が疎水性であるため、それは膜
貫通ドメインとして作用するはずであり、推定リーダー/シグナル配列はpt1
27 1蛋白の残りの部分から分離されないであろう。 クローンpt127 1を含む寄託物から得ることのできるEcoRI/No
tI制限フラグメントは約2600bpの長さのはずである。 本明細書に開示したpt127 1のヌクレオチド配列を、BLASTN/BLASTXお よびFASTA検索プロトコールを用いてGenBankおよびGeneSeqヌクレオチド配列デ ータベースに対して検索した。pt127 1は、AA081843 (zn19g10.r1 Strat
agene neuroepithelium NT2RAMI 937234 Homo sapiens cDNA clone 547938 5')
および R39258 (yc91h08.s1 Homo sapiens cDNA clone 23514 3')として同定さ れた配列に対して少なくともある程度の類似性を示した。配列類似性に基づけば
、pt127 1蛋白および類似性を有する各蛋白またはペプチドは少なくとも
ある程度活性を共有している可能性がある。TopPredIIコンピュータープログラ ムによれば、pt127 1蛋白配列中に2個の潜在的な膜貫通ドメインが予想
され、1個は配列番号:18のアミノ酸60、100、130、190および2
40付近をそれぞれ中心とした5個の潜在的な膜貫通ドメインが予想される。
【0024】クローン「qo115 13」 本発明ポリヌクレオチドはクローンqo115 13として同定されている。
qo115 13は、分泌蛋白をコードしているcDNAに選択的な方法(米国
特許第5536637号参照)を用いて成人脳(脳梁)cDNAライブラリーか
ら単離され、あるいはコードされる蛋白のアミノ酸配列のコンピューター分析に
基づいて、分泌蛋白または膜貫通蛋白をコードするものと同定された。qo11
5 13は全長クローンであり、分泌蛋白(本明細書で「qo115 13蛋白
」とも称する)の全コーディング配列を含んでいる。 今回決定されたqo115 13のヌクレオチド配列を配列番号:19に示し
、これはポリ(A)テイルを含む。今回出願人が、上記ヌクレオチド配列に対応
するqo115 13蛋白の正しいリーディングフレームおよび推定アミノ酸配
列を配列番号:20に示す。配列番号:20のアミノ酸29から41までは推定
リーダー/シグナル配列であり、推定アミノ酸配列はアミノ酸42から開始する
。推定リーダー/シグナル配列が疎水性であるため、それは膜貫通ドメインとし
て作用するはずであり、推定リーダー/シグナル配列はqo115 13蛋白の
残りの部分から分離されないであろう。 クローンqo115 13を含む寄託物から得ることのできるEcoRI/N
otI制限フラグメントは約1200bpの長さのはずである。 本明細書に開示したqo115 13のヌクレオチド配列を、BLASTA/BLASTX およびFASTAサーチプロトコールを用いてGenBankおよびGeneSeqデータベースに 対して検索した。データベース中には有意なヒットはなかった。qo115 1
3のヌクレオチド配列は、それが反復エレメントを含む可能性を示す。
【0025】 クローンの寄託 クローンco821 31、dk329 1、fx317 11、lp547
4、lv310 7、nq34 12、pj154 1、pk147 1、p
t127 1およびqo115 13は、ブダペスト条約に基づいて1998年
2月18日にAmerican Type Culture Collection(10801 University Boulevard
, Manassas, Virginia 20110-2209 U.S.A.)に原寄託物として寄託され、受託番
号ATCC98663が付与され、そこから個々のポリヌクレオチドを含む各ク
ローンが入手可能である。寄託材料の公衆の利用に対するすべての制限は、37
C.F.R.§1.808(b)の規定を除き、特許付与により解除されるであ
ろうし、寄託期間は37C.F.R.§1.806に従うであろう。 各クローンはこの複合体寄託物として別々の細菌細胞(E. coli)中にトラン スフェクションされた。EcoRI/NotI消化(5’部位、EcoRI;3
’部位、NotI)を行い、かかるクローンについて適当な大きさのフラグメン
トを得ることにより各クローンを寄託されているベクターから取ることができる
。各クローンを、図1Aおよび1Bにそれぞれ示すpED6またはpNOTsベ
クターのいずれかに入れて寄託した。cDNAクローニングを容易にする新たな
ポリリンカーを挿入することによりpED6dpc2ベクター(pED6)をp
ED6dpc1から誘導した(Kaufman et al. (1991). NAR 19: 4485-4490)。
DHFRを欠失させ、新たなポリリンカーを挿入し、M13複製開始点をCla
I部位に挿入することによりpNOTsベクターをpMT2(Kaufman et al. 1
989. Mol. Cell. Biol. 9: 1741-1750)から誘導した。いくつかの場合、寄託ク
ローンは寄託単離物中で「フリップ」した(すなわち、逆方向となった)。この
ような場合であってもやはり、EcoRIおよびNotI消化によりcDNAイ
ンサートを単離できる。しかしながら、その場合、適当なベクター中での発現の
ために正しい方向でcDNAを配置するために、NotIは5’部位を生成し、
EcoRIは3’部位を生成するであろう。cDNAが寄託されているベクター
からcDNAを発現させてもよい。 個々のクローンを含む細菌細胞を、複合体寄託物から次のようにして得ること
ができる: 個々のクローンに関して知られた配列に対するものになるよう、オリゴヌクレ
オチドプローブまたはプローブを設計すべきである。この配列は本明細書中の配
列、またはそれらの配列の組み合わせから誘導することができる。各全長クロー
ンを単離するために使用されたオリゴヌクレオチドプローブ配列を以下に示すが
、それらは目的クローンの単離において最も信頼できるはずである。
【0026】クローン プローブ配列 co821 31 配列番号:21 dk329 1 配列番号:22 fx317 11 配列番号:23 lp547 4 配列番号:24 lv310 7 配列番号:25 nq34 12 配列番号:26 pj154 1 配列番号:27 pk147 1 配列番号:28 pt127 1 配列番号:29 qo115 13 配列番号:30 上に挙げた配列は位置2においてNを含み、その位置は好ましいプローブ/プ
ライマーにおいてヌクレオチドというよりはむしろビオチン化ホスホラミダイト
残基(例えば、ビオチンホスホラミダイト(1−ジメトキシトリチルオキシ−2
−(N−ビオチニル−4−アミノブチル)−プロピル−3−O−(2−シアノエ
チル)−(N,N’−ジイソプロピル)−ホスホラミダイト(Glen Researchカ タログ番号10-1953))の使用により得られる)により占められる。 好ましくは、オリゴヌクレオチドプローブの設計はこれらのパラメーターに従
うべきである: (a)もしあったとしても、不明確な塩基(N)が最少である配列の領域とな
るように設計すべきである; (b)Tmが約80℃(AまたはTについては2℃、GまたはCについては4
℃と仮定)となるように設計すべきである。 好ましくは、オリゴヌクレオチド標識に広く用いられる方法を用い、T4ポリ
ヌクレオチドキナーゼを用いてオリゴヌクレオチドをγ−32P−ATP(比活性
6000Ci/mmole)で標識すべきである。他の標識方法を用いることも
できる。好ましくは、取り込まれなかった標識をゲル濾過または他の確立されて
いる方法により除去すべきである。プローブ中に取り込まれた放射活性量をシン
チレーションカウンターで測定することにより定量すべきである。好ましくは、
得られたプローブの比活性は約4e+6 dpm/pmoleとなるべきである 。 好ましくは、全長クローンのプールを含む細菌培養物を融解し、100μlの
ストックを100μg/mlのアンピシリンを含有する25mlの滅菌Lブロス
を入れた滅菌培養フラスコへの接種に用いるべきである。好ましくは、培養物を
37℃で増殖させて飽和状態とすべきであり、好ましくは、飽和培養物を新鮮L
ブロスで希釈すべきである。好ましくは、これらの希釈物の一部をプレーティン
グして、150mmのペトリ皿中の100μg/mlのアンピシリンおよび1.
5%の寒天を含有するLブロスを含む固体細菌用培地上で37℃で一晩増殖させ
た場合5000個の明確な、しかもよく分離したコロニーが生じる希釈率および
体積を決定すべきである。明確な、しかもよく分離したコロニーを得るための他
の既知方法を用いることもできる。 次いで、標準的なコロニーハイブリダイゼーション法を用いてコロニーをニト
ロセルロースフィルタ−に移し、溶解、変性、次いで、焼き付けを行うべきであ
る。 次いで、好ましくは、0.5% SDS、100μg/mlの酵母RNA、お よび10mM EDTAを含有する6X SSC(20Xストックは175.3g
NaCl/リットル、88.2g クエン酸ナトリウム、NaOHでpH7.0
とする)(150mmフィルター1枚あたり約10ml)中で穏やかに撹拌しな
がら65℃で1時間インキュベーションする。次いで、好ましくはプローブをハ
イブリダイゼーションミックスに添加して濃度が1e+6 dpm/mlより大 またはこれと等しくなるようにする。次いで、好ましくはフィルターを室温にお
いて撹拌せずに500mlの2X SSC/0.5% SDSで洗浄し、好ましく
はその後、室温においておだやかに振盪しながら500mlの2X SSC/0 .1% SDSで洗浄する。65℃、30分ないし1時間、0.1X SSC/0
.5% SDSでの3回目の洗浄が最適である。次いで、好ましくはフィルター を乾燥し、十分時間オートラジオグラフィーに供してX線フィルム上に陽性物を
可視化させる。他の既知ハイブリダイゼーション方法を用いることもできる。 陽性コロニーを拾い、培地中で増殖させ、次いで、標準的手順を用いてプラス
ミドDNAを単離する。次いで、制限分析、ハイブリダイゼーション分析または
DNA配列決定によりクローンを証明することができる。
【0027】 生物学的活性を示すことのできる本発明蛋白のフラグメントも本発明に含まれ
る。蛋白のフラグメントは直鎖状であってもよく、あるいは例えばH.U.Saragovi
, et al., Bio/Technology 10, 773-778 (1992)およびR.S.McDowell, et al., J
. Amer. Chem. Soc. 114, 9245-9253 (1992)(参照により両文献を本明細書に記
載されているものとみなす)に記載されたような既知方法を用いて環化させても
よい。多くの目的(蛋白結合部位の結合手を増加させることを包含)のために、
かかるフラグメントを免疫グロブリンのごとキャリヤ分子に融合させてもよい。
例えば、蛋白のフラグメントを「リンカー」を介して免疫グロブリンのFc部分
に融合させてもよい。2価形態の蛋白については、かかる融合をIgG分子のF
c部分に対して行うことができる。他の免疫グロブリンイソタイプを用いてかか
る融合物を得てもよい。例えば、蛋白−IgM融合物は、10価形態の本発明蛋
白を生じるであろう。 また本発明は全長および成熟形態の開示蛋白を提供する。かかる蛋白の全長形
態は、開示クローンのヌクレオチド配列の翻訳により配列表において同定されて
いる。かかる蛋白の成熟形態を、適当な哺乳動物細胞または他の宿主細胞におい
て開示の全長ポリヌクレオチド(好ましくは、ATCCに寄託されたもの)を発
現させることにより得てもよい。蛋白の成熟形態の配列を全長形態のアミノ酸配
列から決定してもよい。
【0028】 また本発明は、本明細書開示のcDNA配列に対応する遺伝子を提供する。「
対応する遺伝子」は、転写されてmRNAを生じるゲノムの領域であり、そのm
RNAからcDNAが誘導され、かかる遺伝子の調節された発現に必要なゲノム
の隣接領域(コーディング配列、5’および3’非翻訳領域を含む)、あるいは
スプライシングされたエキソン、イントロン、プロモーター、エンハンサー、な
らびにサイレンサーまたはサプレッサーエレメントも包含する。本明細書開示の
配列の情報を用いて対応遺伝子を単離することができる。本明細書開示の配列の
情報を用いて対応遺伝子を単離することができる。かかる方法は、開示された配
列の情報からプローブまたはプライマーを調製して適当なゲノムライブラリーま
たは他のゲノム材料源中の遺伝子の同定および/または増幅を行うことを包含す
る。「単離遺伝子」とは、その遺伝子が単離された生物のゲノム中に存在する隣
接コーディング配列(存在する場合には)から分離された遺伝子である。 本明細書開示のポリヌクレオチド配列に対応する染色体位置を、例えば、適当
に標識された本発明ポリヌクレオチドをin situにて染色体にハイブリダイゼー ションさせることにより決定してもよい。すでに特定染色体位置にマッピングさ
れている発現配列タグ(ESTs)のごとき公のデータベース中の有意に類似し
たヌクレオチド配列を同定することにより、開示ポリヌクレオチドの対応染色体
位置を決定してもよい。本明細書に開示した少なくともいくつかのポリヌクレオ
チド配列に関して、本発明ポリヌクレオチドに対して少なくともある程度の類似
性を有する公のデータベース配列はデータベース受託番号によりリストされてい
る。重複配列のUniGene clustersを同定するための、これらの公のデータベース
配列のGenBank受託番号を用いる検索は、National Center for Biotechnology I
nformationにより提供されるインターネットサイトにおいて行うことができ、そ
のアドレスはhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/UniGene/である。そのようにして同
定される多くのUniGene clustersは、すでに特定染色体位置にマッピングされて
いる。
【0029】 本明細書開示のポリヌクレオチド配列に対応する遺伝子の増強、低下、あるい
は改変された発現を有する生物が提供される。アンチセンスポリヌクレオチドを
用いることにより、あるいは遺伝子から転写されたmRNAを結合および/また
は開裂させるリボザイムを用いることにより、遺伝子発現の望ましい変化が成し
遂げられる(Albert and Morris, 1994, Trends Pharmacol. Sci. 15(7): 250-2
54; Lavarosky et al., 1997, Biochem. Mol. Med. 62(1): 11-22; and Hampel,
1998, Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol. 58: 1-39;これらすべてを参照に
より本明細書に記載されているものとみなす)。本明細書開示のポリヌクレオチ
ドに対応する多コピー遺伝子を有するトランスジェニック動物、好ましくは形質
転換細胞およびそれらの子孫中で安定に維持される遺伝学的構築物を用いて細胞
を形質転換することにより得られるトランスジェニック動物が提供される。遺伝
子発現レベルを上昇または低下させる、あるいは遺伝子発現の時間的または空間
的パターンを変化させる改変された遺伝学的制御領域を有するトランスジェニッ
ク動物も提供される(European Patent No. 0 649 464 B1参照;これらすべてを
参照により本明細書に記載されているものとみなす)。さらに、外部配列の挿入
により、あるいは対応遺伝子の全部または一部の欠失により、本明細書開示のポ
リヌクレオチド配列に対応する遺伝子が不完全または完全に不活性化された生物
が提供される。挿入により、好ましくは、転置可能エレメントの不正確な切除後
の挿入により(Plasterk, 1992, Bioessays 14(9): 629-633; Zwaal et al., 19
93, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90(16): 7431-7435; Clark et al., 1994, Pr
oc. Natl. Acad. Sci. USA 91(2): 719-722; これらすべてを参照により本明細 書に記載されているものとみなす)、あるいは相同組み換えにより、好ましくは
陽性/陰性遺伝学的選択法により検出される相同組み換えにより(Mansour et a
l., 1988, Nature 336: 348-352; U.S. Patent Nos. 5,464,764; 5,487,992; 5,
627,059; 5,631,153; 5,614, 396; 5,616,491; and 5,679,523; これらすべてを
参照により本明細書に記載されているものとみなす)、不完全または完全な遺伝
子不活性化を行うことができる。変化した遺伝子発現を有するこれらの生物は、
好ましくは真核生物であり、より好ましくは哺乳動物である。かかる生物は、対
応遺伝子に関連した疾患の研究のための非ヒトモデルの開発に、さらには対応遺
伝子からの蛋白産物と相互作用する分子の同定のためのアッセイ系の開発に有用
である。 本発明蛋白が膜結合(例えば、受容体)である場合、本発明はかかる蛋白の可
溶性形態も提供する。かかる形態において、蛋白の細胞内および膜貫通ドメイン
の一部または全体を取り外して、蛋白が発現された宿主から十分に分泌されるよ
うにする。本発明蛋白の細胞内および膜貫通ドメインを、配列の情報からかかる
ドメインを決定するための既知手法により同定することができる。例えば、TopP
redIIコンピュータープログラムを用いてアミノ酸配列中の膜貫通ドメインの位 置を予想でき、それらのドメインは膜貫通ドメインの中心位置により記載され、
記載された中心残基の両側の少なくとも10個の膜貫通アミノ酸を伴う。 本発明蛋白および蛋白フラグメントは、開示蛋白のアミノ酸配列の少なくとも
25%(より好ましくは少なくとも50%、最も好ましくは少なくとも75%)
の長さのアミノ酸配列を有し、開示蛋白に対して少なくとも60%の配列同一性
(より好ましくは少なくとも75%の同一性、最も好ましくは少なくとも90%
または95%の同一性)を有する蛋白を包含する。配列同一性は、配列のギャッ
プを最小にしつつ、重複および同一性を最大にするように配列を並置した場合に
蛋白のアミノ酸配列を比較することにより決定される。いずれの開示蛋白のセグ
メントに対しても少なくとも75%の配列同一性(より好ましくは、少なくとも
85%の同一性、最も好ましくは少なくとも95%の同一性)を有する、好まし
くは8個またはそれ以上(より好ましくは20個またはそれ以上、最も好ましく
は30個またはそれ以上)の連続したアミノ酸を含むセグメントを含有する蛋白
または蛋白フラグメントも本発明に包含される。
【0030】 詳細には、WU−BLAST(Washington University BLAST)バージョン2 .0ソフトウェアを用いて配列同一性を決定してもよく、該ソフトウェアは、公
に制限なく使用できるNCBI−BLASTバージョン1.4を基礎としたWU
−BLASTに基づいて構築されている(Altschul and Gish, 1996, Local ali
gnment statistics, Doolittle ed., Methods in Enzymology 266: 460-480; Al
tschul et al., 1990, Basic local alignment search tool, Journal of Molec
ular Biology 215: 403-410; Gish and States, 1993, Identification of prot
ein coding regions by database similarity search, Nature Genetics 3: 266
-272; Karlin and Altschul, 1993, Applications and statistics for multipl
e high-scoring segments in molecular sequences, Proc. Natl. Acad. Sci. U
SA 90: 5873-5877(参照によりこれらすべての文献を本明細書に記載されている
ものとみなす))。いくつかのUNIXプラットフォーム用のWU−BLAST
バージョン2.0実行可能プログラムをftp://blast.wustl.edu/blast/executab
lesからダウンロードすることができる。いくつかのサポートプログラムのほか に、検索プログラムの完全な組(BLASTP、BLASTN、BLASTX、
TBLASTNおよびTBLASTX)がこのサイトにおいて提供される。WU
−BLAST 2.0には著作権が設定されており、著者の許諾なしにいかなる 形態であっても販売または再頒布してはならないが、業としての使用でない場合
、あるいは研究用途の場合は自由に使用できる。組(BLASTP、BLAST
N、BLASTX、TBLASTNおよびTBLASTX)に属するすべての検
索プログラムにおいて、ギャップドアラインメントルーチン(gapped alignment
routines)がデータベースサーチ自体に統合されており、そのため、高感度か つ高選択性であり、解釈容易な結果が得られる。最適には、これらすべてのプロ
グラムにおいてギャッピングをオフにすることができる。長さのギャップに関す
るデフォールトペナルティー(default penalty)(Q)は、BLASTPにつ いてはQ=9であり、BLASTNについてはQ=10であるが、ゼロを含めて
、1ないし8、9、10、11、12ないし20、21ないし50、51ないし
100等のいずれの整数値に変更してもよい。ギャップを拡張するための残基1
個あたりのデフォールトペナルティー(R)は、蛋白およびBLASTPについ
てはR=2であり、BLASTNについてはR=10であるが、0、1、2、3
、4、5、6、7、8、9、10、11、12ないし20、21ないし50、5
1ないし100等の整数値に変更してもよい。配列を並置比較して重複および同
一性を最大とし、配列のギャップを最小とするために、QおよびRのいずれの組
み合わせを使用してもよい。デフォールトアミノ酸比較マトリックスはBLOS
UM62であるが、PAMのごとき他のアミノ酸比較マトリックスを使用するこ
ともできる。
【0031】 開示ポリヌクレオチドおよび蛋白の種相同体も、本発明により提供される。本
明細書の用語「種相同体」は、蛋白またはポリヌクレオチドの起源とは異なる種
に関する蛋白またはポリヌクレオチドであるが、当業者により決定された場合、
有意な配列類似性を有するものをいう。好ましくは、ポリヌクレオチド種相同体
は、特定のポリヌクレオチドに対して少なくとも60%(より好ましくは少なく
とも75%、最も好ましくは少なくとも90%)の配列同一性を有し、蛋白種相
同体は、特定の蛋白に対して少なくとも30%(より好ましくは少なくとも45
%、最も好ましくは少なくとも60%)の配列同一性を有する。ここに配列同一
性は、重複および同一性が最大となり、配列のギャップが最小となるように並置
されたポリヌクレオチドのヌクレオチド配列または蛋白のアミノ酸配列を比較す
ることにより決定される。本明細書に示す配列から適当なプローブまたはプライ
マーを作成し、次いで、所望種由来の適当な核酸源をスクリーニングすることに
より種相同体を単離し同定してもよい。好ましくは、種相同体は哺乳動物種から
単離されたものである。最も好ましくは、種相同体は、例えば、Pan troglodyte
s、Gorilla gorilla、Pongo pygmaeus、Hylobates concolor、Macaca mulatta、
Papio papio、Papio hamadryas、Cercopithecus aethiops、Cebus capucinus、A
otus trivirgatus、Sanguinus oedipus、Microcebus murinus、Mus musculus、R
attus norvegicus、Cricetulus griseus、Felis catus、Mustela vison、Canis
familiaris、Oryctolagus cuniculus、Bos taurus、Ovis aries、Sus scrofaお よびEquus caballusのごとき特定の哺乳動物から単離されたものであって、その
遺伝学的地図が作成されていて、1の種における遺伝子のゲノム組織化と別の種
における関連遺伝子のゲノム組織化との間の遺伝子配列順序の関連性の同定が可
能なものである(O'Brien and Seuanez, 1988, Ann. Rev. Genet. 22: 323-351;
O'Brien et al., 1993, Nature Genetics 3: 103-112; Johansson et al., 199
5, Genomics 25: 682-690; Lyons et al., 1997, Nature Genetics 15: 47-56;
O'Brien et al., 1997, Trends in Genetics 13(10): 393-399; Carver and Stu
bbs, 1997, Genome Research 7: 1123-1137(これらすべてを参照により本明細 書に記載されているものとみなす))。
【0032】 また本発明は、開示ポリヌクレオチドの対立遺伝子変種、すなわち、開示ポリ
ヌクレオチドによりコードされている蛋白と同一、相同的またはこれに関連した
蛋白をコードする単離ポリヌクレオチドの自然発生的別形態を包含する。好まし
くは、対立遺伝子変種は、特定のポリヌクレオチドに対して少なくとも60%(
より好ましくは少なくとも75%、最も好ましくは少なくとも90%)の同一性
を有し、ここに配列同一性は、重複および同一性が最大となり、配列のギャップ
が最小となるように並置されたポリヌクレオチドのヌクレオチド配列を比較する
ことにより決定される。本明細書記載の配列から適当なプローブまたはプライマ
ーを作成し、適当な種の個体から得られる適当な核酸源をスクリーニングするこ
とにより対立遺伝子変種を単離し、同定してもよい。 また本発明は、本明細書開示ポリヌクレオチドの配列に相捕的な配列を有する
ポリヌクレオチドも包含する。
【0033】 また本発明は、厳密さを減じた条件下で、より好ましくは厳密な条件下で、最
も好ましくは非常に厳密な条件下で、本明細書記載のポリヌクレオチドにハイブ
リダイゼーションしうるポリヌクレオチドも包含する。厳密さの条件の例を下表
に示す。非常に厳密な条件は、例えば、少なくとも条件A〜Fと同程度に厳密で
あり、厳密な条件は、例えば、少なくとも条件G〜Lと同程度に厳密であり、厳
密さを減じた条件は、例えば、少なくとも条件M〜Rと同程度に厳密である。
【表1】 a) :ハイブリッド長さは、ハイブリダイゼーションしているポリヌクレオチ ドのハイブリッドしている領域(複数も可)に関して予想される長さである。ポ
リヌクレオチドを未知配列の標的ポリヌクレオチドにハイブリダイゼーションさ
せる場合、ハイブリッド長さは、ハイブリダイゼーションするポリヌクレオチド
の長さと仮定する。既知配列のポリヌクレオチドがハイブリダイゼーションする
場合、ポリヌクレオチド配列を並置し、最適な配列相補性の領域(複数も可)を
同定することによりハイブリッド長さを決定することができる。 b) :ハイブリダイゼーションおよび洗浄バッファーにおいてSSPE(1X SSPEは0.15M NaCl、10mM NaH2PO4、および1.25mM EDTA,pH7.4である)をSSC(1XSSCは0.15M NaClおよ び15mMクエン酸ナトリウムである)に置き換えることができる。ハイブリダ
イゼーション完了後、洗浄を15分間行う。 *TB−TR:長さ50塩基対よりも短いと予想されるハイブリッドについてのハ イブリダイゼーション温度は、ハイブリッドの融解温度(Tm)よりも5〜10 ℃低くすべきである。下記等式によりTmが決定される。長さ18塩基対未満の ハイブリッドについては、Tm(℃) = 2(A + T塩基の数) + 4(G + C塩基の数)。長
さ18ないし49塩基対のハイブリッドについては、 Tm(℃) = 81.5 + 16.6(log10[Na+]) + 0.41(%G+C) - (600/N)であり、Nはハイ ブリッドの塩基数であり、ハイブリダイゼーションバッファー中のナトリウムイ
オン濃度である(1XSSCについての[Na+]=0.165M)。 ポリヌクレオチドハイブリダイゼーションのための厳密さの条件のさらなる例
はSambrook, J., E.F. Fritsch, and T. Maniatis, 1989, Molecular Cloning:
A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Ha
rbor, NY, chapters 9 and 11, and Current Protocols in Molecular Biology,
1995, F.M. Ausubel et al., eds., John Wiley & Sons, Inc., sections 2.10
and 6.3-6.4に記載されており、参照により本明細書に記載されているものとみ
なす。 好ましくは、かかるハイブリダイゼーションするポリヌクレオチドのそれぞれ
が、ハイブリダイゼーションすべき本発明ポリヌクレオチドの少なくとも25%
(より好ましくは、少なくとも50%、最も好ましくは、少なくとも75%)の
長さを有し、ハイブリダイゼーションすべき本発明ポリヌクレオチドに対して少
なくとも60%の配列同一性(より好ましくは、少なくとも75%の同一性、最
も好ましくは、少なくとも90%または95%の同一性)を有する。配列同一性
は、配列のギャップを最小にしつつ、重複および同一性を最大にするように配列
を並置した場合に蛋白のアミノ酸配列を比較することにより決定される。
【0034】 本発明蛋白をコードしている単離ポリヌクレオチドを、Kaufman et al., Nucl
eic Acids Res. 19, 4485-4490 (1991)に開示のpMT2またはpED発現ベク ターのごとき発現制御配列に作動可能に連結して、蛋白を組み換え的に製造して
もよい。多くの適当な発現制御配列が当該分野において知られている。多くの適
当な発現制御配列が当該分野において知られている。組み換え蛋白発現のための
一般的方法も知られており、R. Kaufman, Methods in Enzymology 185, 537-566
(1990)が典型例である。ここで定義する「作動可能に連結」とは、本発明単離 ポリヌクレオチドおよび発現制御配列がベクターまたは細胞中に置かれ、連結さ
れたポリヌクレオチド/発現制御配列で形質転換(トランスフェクション)され
た宿主細胞により発現されるようになっていることを意味する。 多くのタイプの細胞は本発明蛋白の発現に適した宿主細胞として作用しうる。
哺乳動物細胞は、例えば、サルCOS細胞、チャイニーズハムスター卵巣 (CHO)細胞、ヒト腎臓293細胞、ヒト表皮A431細胞、ヒトColo2
05細胞、3T3細胞、CV−1細胞、他の形質転換された霊長類細胞系、正常
2倍体細胞、一次組織のインビトロ培養から得られる細胞株、一次エクスプラン
ト、HeLa細胞、マウス細胞、BHK、HL−60、U937HaKまたはJu
rkat細胞を包含する。 別法として、酵母のごとき下等真核細胞または細菌のごとき原核細胞において
蛋白を製造することが可能である。潜在的に適当な酵母株は、Saccharomyces ce
revisiae、Schizosaccharomyces pombe、Kluyveromyces株、Candida、または異 種蛋白を発現可能な酵母株を包含する。潜在的に適当な細菌株は、Escherichia
coli、Bacillus subtilis、Salmonella typhimurium、または異種蛋白を発現可 能な細菌株を包含する。蛋白が酵母または細菌において生成される場合、その中
で生成された蛋白を、例えば適当部位のリン酸化またはグリコシレーションによ
り修飾して機能的蛋白を得る必要があるかもしれない。既知化学的または酵素的
方法を用いてかかる共有結合を行ってもよい。 本発明単離ポリヌクレオチドを1種またはそれ以上の昆虫発現ベクター中の適
当な制御配列に作動可能に連結し、昆虫発現系を用いることにより蛋白を得ても
よい。バキュロウイルス/昆虫細胞発現系のための材料および方法は、例えばIn
vitrogen, San Diego, California, USAからのキット形態(MaxBacRキット)で 市販されており、かかる方法は当該分野においてよく知られており、Summersお よびSmith, Texas Agricultural Experiment Station Bulletin No. 1555 (1987
)(参照により本明細書に記載されているものとみなす)に記載のようなものが ある。本明細書で用いるように、本発明ポリヌクレオチドを発現可能な昆虫細胞
は「形質転換」されている。 組み換え蛋白の発現に適した培養条件下で形質転換宿主細胞を培養することに
より本発明蛋白を製造してもよい。次いで、得られた発現蛋白を、ゲル濾過およ
びイオン交換クロマトグラフィーのごとき既知精製プロセスを用いてかかる培養
物(すなわち、培地または細胞抽出物)から精製してもよい。また、蛋白の精製
は、蛋白に結合するであろう作用剤を含有するアフィニティーカラム;コンカナ
バリンA−アガロース、ヘパリン−トヨパールRまたはCibacrom blue 3GAセファ
ロースRのごときアフィニティーカラムによる1またはそれ以上のカラム工程; フェニルエーテル、ブチルエーテル、またはプロピルエーテルのごとき樹脂を用
いる疎水性相互作用クロマトグラフィーを用いる1またはそれ以上の工程;ある
いは免疫アフィニティークロマトグラフィーを包含する。 別法として、本発明蛋白を精製容易形態として発現させてもよい。例えば、マ
ルトース結合蛋白(MBP)、グルタチオン−S−トンスフェラーゼ(GST)
またはチオレドキシン(TRX)との融合蛋白のごとき融合蛋白として発現させ
てもよい。かかる融合蛋白の発現および精製のためのキットは、それぞれNew En
glan BioLab (Beverly, MA)、Pharmacia (Piscataway, NJ)およびInVitrogenか ら市販されている。蛋白にエピトープでタグを付し、次いで、かかるエピトープ
に指向された特異的抗体を用いることにより精製することもできる。1のかかる
エピトープ(「フラッグ」)はKodak (New Haeven, CT)から市販されている。 最後に、疎水性RP−HPLC媒体、例えば懸垂メチルまたは他の脂肪族基を
有するシリカゲルを用いる1またはそれ以上の逆相高品質液体クロマトグラフィ
ー(RP−PLC)工程を用いてさらに蛋白を精製することができる。いくつか
またはすべての上記精製工程を種々組み合わせて用いて実質的に均一な単離組み
換え蛋白を得ることもできる。かくして精製された蛋白は他の哺乳動物蛋白を実
質的に含まず、本発明において「単離蛋白」と定義される。 本発明蛋白をトランスジェニック動物の生産物として、例えば、蛋白をコード
しているヌクレオチド配列を含む体細胞または生殖細胞により特徴づけられるト
ランスジェニックウシ、ヤギ、ブタ、またはヒツジの乳の成分として発現させて
もよい。 既知の慣用的化学合成により蛋白を製造してもよい。合成的手段による本発明
蛋白の構築方法は当業者に知られている。合成的に構築された蛋白配列は、一次
、二次または三次構造および/またはコンホーメーション特性を共有することに
よって、蛋白活性をはじめとする共通の生物学的特性を有する可能性がある。よ
って、それらを、治療化合物のスクリーニングおよび抗体の生成のための免疫学
的プロセスにおいて、天然の精製蛋白の生物学的活性または免疫学的置換物とし
て使用してもよい。
【0035】 本明細書に示す蛋白は、精製蛋白のアミノ酸配列に類似したアミノ酸配列によ
り特徴づけられるが、その中に自然にあるいは誘導体化によって修飾されていて
もよい。例えば、ペプチドまたはDNA配列の修飾は既知方法を用いて当業者に
より行われうる。蛋白配列中の目的とされる修飾は、コーディング配列中の選択
アミノ酸残基の変化、置換、交換、挿入または欠失を包含する。例えば、1個ま
たはそれ以上のシステイン残基を欠失させ、あるいは別のアミノ酸と交換して分
子のコンホーメーションを変化させてもよい。かかる変化、置換、交換、挿入ま
たは欠失のための方法は当業者によく知られている(例えば、米国特許第415
8584号参照)。好ましくは、かかる変化、置換、交換、挿入または欠失は蛋
白の所望活性を保持するものである。 全体的または部分的に蛋白活性を保持すると期待され、かくしてスクリーニン
グまたは他の免疫学的方法に有用でありうる蛋白配列の他のフラグメントおよび
誘導体も、本明細書の開示から当業者により作成されうる。かかる修飾は本発明
により包含されると確信される。
【0036】用途および生物学的活性 本発明ポリヌクレオチドおよび蛋白は、下記の1またはそれ以上の用途または
生物学的活性(本明細書に引用されたアッセイに関連するものも含む)を示すと
考えられる。本発明蛋白に関して説明された用途または活性は、かかる蛋白の投
与または使用により、あるいはかかる蛋白をコードしているポリヌクレオチドの
投与または使用(例えば、遺伝子治療またはDNA導入に適したベクターのごと
き)により提供されうる。
【0037】研究用途および有用性 本発明により提供されるポリヌクレオチドは、研究集団によって種々の目的に
使用されうる。分析用に、特徴づけまたは治療用途に、対応蛋白が優先的に発現
される(構成的に、または組織分化もしくは発達の特定段階において、または疾
病状態において発現される)組織のマーカーとして、さらにはサザンゲルの分子
量マーカーとして、染色体の同定または関連遺伝子位置のマッピングのための染
色体マーカーまたはタグとして(標識された場合)、患者の内在性DNAと比較
して潜在的な遺伝病の同定を行うために、ハイブリダイゼーションするプローブ
として用いて新規な関連DNA配列を発見するために、遺伝学的フィンガープリ
ンティングのためのPCRプライマーを得るための情報源として、他の新規ポリ
ヌクレオチドを発見するプロセスにおいて既知配列を差し引くためのプローブと
して、「遺伝子チップ」または他の支持体に結合させるためにオリゴマーを選択
し作成するために、発現パターンの試験のために、DNA免疫法を用いて抗蛋白
抗体を生成させるために、ならびに抗DNA抗体を生成させ、あるいはさらなる
免疫応答を誘導するための抗原として、ポリヌクレオチドを使用することができ
る。別の蛋白に結合または潜在的に結合(例えば、受容体−リガンド相互作用に
おけるように)する蛋白をコードしている場合、結合する他の蛋白を同定し、あ
るいは、または結合相互作用の阻害剤を同定するための相互作用トラップアッセ
イ(例えば、Gyuris et al., Cell 75: 791-803 (1993)に記載されたような)に
おいてポリヌクレオチドを使用することができる。 本発明により提供される蛋白は、高処理量スクリーニングのための一群の多数
の蛋白を含む、生物学的活性を決定するためのアッセイに;抗体の生成または他
の免疫応答を誘導するために;生物学的液体中の蛋白(またはその受容体)のレ
ベルを定量的に決定するために設計されたアッセイにおける試薬(標識試薬を包
含)として;対応蛋白が優先的に発現される(構成的に、または組織分化もしく
は発達の特定段階において、または疾病状態において発現される)組織のマーカ
ーとして;ならびに、もちろん関連受容体またはリガンドを単離するために用い
てもよい。蛋白がもう1つの蛋白に結合または潜在的に結合する場合、結合する
他の蛋白を同定し、あるいは、または結合相互作用の阻害剤を同定するために蛋
白を使用することができる。これらの結合相互作用に関与する蛋白を用いて、結
合相互作用に関するペプチドまたは小型分子状阻害剤またはアゴニストのスクリ
ーニングを行うこともできる。 これらの研究用途のいずれかまたはすべては、研究用製品として商品化するた
めに試薬グレードまたはキットのフォーマットへと発展させることができる。 上記使用を実行するための方法は当業者によく知られている。かかる方法を開
示する文献は、"Molecular Cloning: A Laboratory Manual", 2nd ed., Cold Sp
ring Harbor Laboratory Press, Sambrook, J., E.F. Fritsch and T. Maniatis
eds., 1989,および"Methods in Enzymology: Guide to Molecular Cloning Tec
hniques", Academic Press, Berger, S.L. and A.R. Kimmel eds., 1987を包含 するが、これらに限らない。
【0038】 栄養としての用途 本発明ポリヌクレオチドおよび蛋白を栄養源または添加物として使用すること
ができる。かかる用途は、蛋白またはアミノ酸添加物としての用途、炭素源とし
ての用途、窒素源としての用途および炭水化物源としての用途を包含するが、こ
れらに限らない。かかる場合、本発明蛋白またはポリヌクレオチドを特定の生物
のエサとして添加してもよく、あるいは粉末、ピル、溶液、懸濁液またはカプセ
ルの形態のごとき別個の固体液体調合物として投与することもできる。微生物の
場合、微生物が培養される培地に本発明蛋白またはポリヌクレオチドを添加する
ことができる。
【0039】 サイトカインおよび細胞増殖/分化活性 本発明蛋白はサイトカイン活性、細胞増殖活性(誘導もしくは阻害)または細
胞分化活性(誘導もしくは阻害)を示しうるか、またはある種の細胞集団におい
て他のサイトカインの産生を誘導しうる。今日まで見いだされてきた多くの蛋白
性因子(すべての既知サイトカインを包含)は、1またはそれ以上の因子依存的
細胞増殖アッセイにおいて活性を示しており、よって、アッセイはサイトカイン
活性の便利な確認法として役立つ。本発明蛋白の活性は、細胞系(32D、DA
2、DA1G、T10、B9、B9/11、BaF3、MC9/G、M+(pr
eB M+)、2E8、RB5、DA1、123、T1165、HT2、CTL L2、TF−1、Mo7eおよびCMKを包含するが、これらに限らない)のた
めの多くの常套的な因子依存的細胞増殖アッセイのいずれかにより確認される。 本発明蛋白の活性を、とりわけ、下記方法により測定してもよい: T細胞または胸腺細胞の増殖についてのアッセイは、Current Protocols in I
mmunology, Ed by J. E. Coligan, A.M. Kruisbeek, D.H. Margulies, E.M. She
vach, W Strober, Pub. Greene Publishing Associates and Wiley-Interscienc
e (Chapter 3, In Vitro assays for Mouse Lymphocyte Function 3.1-3.19; Ch
apter 7, Immunologic studies in Humans); Takai et al., J. Immunol. 137:3
494-3500, 1986; Bertagnolli et al., J. Immunol. 145:1706-1712, 1990; Ber
tagnolli et al., Cellular Immunology 133:327-341, 1991; Bertagnolli, et
al., J. Immunol. 149:3778-3783, 1992; Bowman et al., J. Immunol. 152: 17
56-1761, 1994 に記載されたものを包含するが、これらに限らない。 脾臓細胞、リンパ節細胞または胸腺細胞のサイトカイン生成および/または増
殖に関するアッセイは、Polyclonal T cell stimulation, Kruisbeek, A.M. an
d Shevach, E.M. In Current Protocols in Immunology. J.E.e.a. Coligan eds
. Vol 1 pp. 3.12.1-3.12.14, John Wiley and Sons, Toronto. 1994; and Meas
urement of mouse and human Interferon g, Schreiber, R.D. In Current Pro
tocols in Immunology. J.E.e.a. Coligan eds. Vol 1 pp. 6.8.1-6.8.8, John
Wiley and Sons, Toronto. 1994に記載されたものを包含するが、これらに限ら ない。 造血およびリンパ生成細胞の増殖および分化についてのアッセイは、 Measurement of Human and Murine Interleukin 2 and Interleukin 4, Bottoml
y, K., Davis, L.S. and Lipsky, P.E. In Current Protocols in Immunology.
J.E.e.a. Coligan eds. Vol 1 pp. 6.3.1-6.3.12, John Wiley and Sons, Toron
to. 1991; deVries et al., J. Exp. Med. 173:1205-1211, 1991; Moreau et al
., Nature 336:690-692, 1988; Greenberger et al., Proc. Natl. Acad. Sci.
U.S.A. 80:2931-2938, 1983; Measurement of mouse and human interleukin 6
- Nordan, R. In Current Protocols in Immunology. J.E.e.a. Coligan eds. V
ol 1 pp. 6.6.1-6.6.5, John Wiley and Sons, Toronto. 1991; Smith et al.,
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83:1857-1861, 1986; Measurement of human I
nterleukin 11 - Bennett, F., Giannotti, J., Clark, S.C. and Turner, K. J
. In Current Protocols in Immunology. J.E.e.a. Coligan eds. Vol 1 pp.
6.15.1 John Wiley and Sons, Toronto. 1991; Measurement of mouse and hum
an Interleukin 9 - Ciarletta, A., Giannotti, J., Clark, S.C. and Turner,
K.J. In Current Protocols in Immunology. J.E.e.a. Coligan eds. Vol 1 p
p. 6.13.1, John Wiley and Sons, Toronto. 1991に記載されたものを包含する が、これらに限らない。 抗原に対するT細胞クローンの応答についてのアッセイ(特に、増殖およびサ
イトカイン産生を測定することによりAPC−T細胞相互作用ならびに直接的な
T細胞の効果を同定する)は、Current Protocols in Immunology, Ed by J. E.
Coligan, A.M. Kruisbeek, D.H. Margulies, E.M. Shevach, W Strober, Pub.
Greene Publishing Associates and Wiley-Interscience (Chapter 3, In Vitro
assays for Mouse Lymphocyte Function; Chapter 6, Cytokines and their ce
llular receptors; Chapter 7, Immunologic studies in Humans); Weinberger
et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77:6091-6095, 1980; Weinberger et al.
, Eur. J. Immun. 11:405-411, 1981; Takai et al., J. Immunol. 137:3494-35
00, 1986; Takai et al., J. Immunol. 140:508-512, 1988に記載されたものを 包含するが、これらに限らない。
【0040】 免疫刺激または抑制活性 また本発明蛋白は、本明細書記載のアッセイにおける活性(これらに限らない
)を包含する免疫刺激または免疫抑制活性を示すものであってもよい。蛋白は、
種々の欠乏症および障害(重症の免疫欠乏合併症(SCID)を包含)において
有用である可能性があり、例えば、Tおよび/またはBリンパ球の増殖をアップ
レギュレーションまたはダウンレギュレーションすることにおいて、ならびにN
K細胞および他の細胞集団の細胞溶解活性を有効ならしめることにおいて有用で
ありうる。これらの免疫欠乏症は遺伝的なものであってもよく、またウイルス(
例えば、HIV)ならびに細菌または真菌感染により引き起こされるものであっ
てもよく、あるいは自己免疫疾患により引き起こされるものであってもよい。よ
り詳細には、ウイルス、細菌、真菌または他の感染物質により引き起こされる感
染性疾患、例えば、HIV、肝炎ウイルス、ヘルペスウイルス、ミコバクテリア
、レシュマニア、マラリアおよびカンジダ種のごとき種々の真菌感染症を、本発
明蛋白を用いて治療可能である。もちろん、この点において、免疫系に対するブ
ーストが必要な場合、すなわち、癌の治療において、本発明蛋白を用いてよい。 本発明蛋白を用いて治療してもよい自己免疫疾患は、例えば、多発性硬化症、
全身性の深在性エリトマーデス、リューマチ性関節炎、自己免疫性肺炎、 Guillain-Barre症候群、自己免疫性甲状腺炎、インスリン依存性糖尿病、重症筋
無力症、対宿主移植片疾患および自己免疫性の炎症性の目の疾患を包含する。本
発明のかかる蛋白を、喘息または他の呼吸器系の疾患のごときアレルギー性反応
および症状の治療に用いてもよい。免疫抑制が望まれる他の症状(例えば、喘息
(特にアレルギー性喘息)および関連呼吸器系の問題を包含)を本発明蛋白を用
いて治療してもよい。免疫抑制が望まれる他の状態(例えば、器官移植を包含)
を、本発明蛋白を用いて治療してもよい。 本発明蛋白を用いて、多くのやり方で免疫応答を可能にすることもできる。ダ
ウンレギュレーションは、すでに進行中の免疫応答を阻害またはブロックする形
態のものであってもよく、あるいは免疫応答の誘導を妨害することを含むもので
あってもよい。T細胞応答を抑制することにより、あるいはT細胞中に特異的な
耐性を誘導することにより、あるいはその両方により活性化T細胞の機能を阻害
してもよい。一般的には、T細胞応答の免疫抑制は活性のある、非抗原特異的な
プロセスであり、T細胞を抑制剤に連続的に曝露することを必要とする。耐性と
は、T細胞における非応答性またはアネルギーを意味し、一般的には抗原特異的
であり耐性化剤への曝露を止めた後も持続するという点で免疫抑制とは異なる。
操作上は、耐性化剤の不存在下で特異的抗原に曝露した際のT細胞応答の欠如に
より耐性が示されうる。 1またはそれ以上の抗原機能(Bリンパ球抗原機能(例えばB7のごとき)を
包含するが、これに限らない)をダウンレギュレーションすることまたは妨害す
ること、例えば、活性化T細胞による高レベルのリンホカイン合成の妨害は、組
織、皮膚および器官の移植および対宿主移植片疾患(GVHD)において有用で
あろう。例えば、T細胞機能のブロックは組織移植における組織破壊を減少させ
るはずである。典型的には、組織移植において、移植片の拒絶反応は、組織片が
T細胞により外来のものと認識されることにより開始され、次いで、移植片を破
壊する免疫反応が起こる。免疫細胞上でのB7リンパ球抗原とその本来的なリガ
ンドとの相互作用を阻害またはブロックする分子(別のBリンパ球抗原(例えば
、B7−1、B7−3)の活性を有するモノマー形態のペプチドと混合された、
あるいは単独の、B7−2活性を有する可溶性でモノマー形態のペプチド)の移
植前の投与は、応答的な同時刺激シグナルを伝達することなく免疫細胞上の本来
のリガンドへの分子の結合を誘導する可能性がある。この点においてBリンパ球
抗原機能をブロックすることは、T細胞のごとき免疫細胞によるサイトカイン合
成を妨害し、かくして、免疫抑制剤として作用する。そのうえ、同時刺激の欠如
はT細胞の反応を失わせるのに十分でありうる。Bリンパ球抗原ブロッキング試
薬による長期の耐性の誘導により、これらのブロッキング試薬の繰り返し投与の
必要性が回避されうる。対象において十分な免疫抑制または耐性を達成するため
には、Bリンパ球抗原の組み合わせの機能をブロックすることも必要かもしれな
い。 器官移植拒絶反応またはGVHDを妨害することにおける個々のブロッキング
試薬の有効性を、ヒトにおける有効性を推定しうる動物モデルを用いて評価する
ことができる。使用可能な適当な系の例は、ラットにおける同種心臓移植片およ
びマウスにおける異種膵臓島細胞移植片を包含し、それらは両方ともインビボで
のCTLA4Ig融合蛋白の免疫抑制効果を試験するために使用された(Lensch
ow et al., Science 257:789-792 (1992)およびTurka et al., Proc Natl. Acad
. Sci. USA, 89:11102-11105 (1992)に記載されている)。さらに、GVHDの ネズミモデル(Paul ed., Fundamental Immunology, Ravan Press, New York, 1
989, pp.846-847参照)を用いて、インビボでの当該疾患の進行に対するBリン パ球抗原機能のブロッキング効果を決定することができる。 また、抗原機能をブロックすることは自己免疫疾患の治療にとり治療的に有用
でありうる。多くの自己免疫疾患は、自己組織に対して反応性があり、疾病の病
理に関与するサイトカインおよび自己抗体の産生を促進するT細胞の不適当な活
性化の結果である。自己反応性T細胞の活性化を妨害することは疾病の徴候を減
少または除去しうる。Bリンパ球抗原の受容体:リガンド相互作用を破壊するこ
とによりT細胞の同時刺激をブロックする試薬の投与を用いてT細胞活性化を阻
害し、疾病プロセスに関与しうる自己抗体またはT細胞由来のサイトカインの産
生を妨害することができる。さらに、ブロッキング試薬は、疾病の長期の寛解を
導く可能性のある自己反応性T細胞の抗原特異的耐性を誘導しうる。自己免疫疾
患の予防または改善におけるブロッキング試薬の有効性を、ヒトの自己免疫疾患
についての十分に特徴づけられた多くの動物モデルを用いて決定することができ
る。例は、ネズミの実験的自己免疫脳炎、MRLlpr/lprマウスまたはN
ZBハイブリッドマウスにおける全身性深在性エリトマトーデス、ネズミ自己免
疫コラーゲン関節炎、NODマウスおよびBBラットにおける糖尿病、およびネ
ズミの実験的重症筋無力症(Paul ed., Fundamental Immunology, Raven Press,
New York, 1989, pp.840-856)を包含する。 免疫応答をアップレギュレーションするための手段としての抗原機能(好まし
くは、Bリンパ球抗原機能)のアップレギュレーションは治療に有用でもある。
免疫応答のアップレギュレーションは存在している免疫応答を促進する形態また
は最初の免疫応答を除去する形態であってよい。例えば、Bリンパ球抗原機能を
刺激することによる免疫応答の促進は、ウイルス感染の場合に有用でありうる。
さらに、インフルエンザ、通常のかぜ、および脳炎のごとき全身的なウイルス性
疾患を、刺激性形態のBリンパ球抗原を全身投与することにより改善してもよい
。 別法として、T細胞を患者から取り、本発明ペプチドを発現するACPsを付
加したウイルス抗原とともにインビトロにおいてT細胞を同時刺激するか、また
は刺激性形態の本発明可溶性ペプチドと一緒にし、次いで、インビトロで活性化
されたT細胞を患者体内に再導入することにより、感染患者における抗ウイルス
免疫応答を促進してもよい。抗ウイルス免疫応答を促進するもう1つの方法は、
感染細胞を患者から取り、本明細書記載の本発明蛋白をコードする核酸をそれら
にトランスフェクションして細胞がその表面に蛋白全体または一部を発現するよ
うにし、次いで、トランスフェクション細胞を患者体内に再導入することであろ
う。すると、感染細胞はインビボにおいて同時刺激シグナルをT細胞に伝えるこ
とができ、そのことによりT細胞を活性化することができよう。 もう1つの適用例において、抗原機能(好ましくは、Bリンパ球抗原機能)の
アップレギュレーションまたは促進は腫瘍免疫性の誘導において有用でありうる
。本発明の少なくとも1種のペプチドをコードする核酸でトランスフェクション
された腫瘍細胞(例えば、肉腫、黒色腫、リンパ腫、白血病、神経芽細胞腫、癌
腫)を対象に投与して対象中の腫瘍特異的耐性を克服することができる。所望な
らば、腫瘍細胞をトランスフェクションしてペプチドの組み合わせを発現させる
ことができる。例えば、患者から得た腫瘍細胞を、B7−2様活性を有するペプ
チドのみ、またはB7−1様活性および/またはB7−3様活性を有するペプチ
ドと組み合わせて発現することを指令する発現ベクターで、エクスビボにおいて
トランスフェクションすることができる。トランスフェクションされた腫瘍細胞
を患者に戻して、トランスフェクションされた細胞の表面上にペプチドを発現さ
せる。別法として、遺伝子治療法を用いてインビボでのトランスフェクションの
ために腫瘍細胞を標的化することができる。 腫瘍細胞表面上におけるBリンパ球抗原の活性を有する本発明ペプチドの存在
は、T細胞に必要な同時刺激シグナルを提供して、T細胞により媒介されるトラ
ンスフェクションされた腫瘍細胞に対する免疫応答を誘導する。さらに、MHC
クラスIまたはMHCクラスII分子を欠く腫瘍細胞、あるいは十分量のMHC
クラスIまたはMHCクラスII分子を再発現できない腫瘍細胞を、MHCクラ
スIα鎖蛋白およびβ2マイクログロブリン蛋白またはMHCクラスIIα鎖お よびMHCクラスIIβ鎖蛋白の全体または一部(例えば、末端切断蛋白の細胞
質ドメイン)をコードしている核酸でトランスフェクションして、そのことによ
りクラスIまたはクラスIIMHC蛋白を細胞表面上に発現させることができる
。Bリンパ球抗原(例えば、B7−1、B7−2、B7−3)の活性を有するペ
プチドと組み合わせた適当なクラスIまたはクラスII HMCの発現は、T細 胞により媒介されるトランスフェクションされた腫瘍細胞に対する免疫応答を誘
導する。所望により、不変鎖のごとき、MHCクラスII結合蛋白の発現をブロ
ックするアンチセンス構築物をコードしている遺伝子を、Bリンパ球抗原の活性
を有するペプチドをコードしているDNAとともに同時トランスフェクションし
て腫瘍関連抗原の提示を促進し、腫瘍特異的免疫性を誘導こともできる。よって
、ヒト対象におけるT細胞により媒介される免疫応答の誘導は、対象における腫
瘍特異的耐性を克服するに十分でありうる。
【0041】 本発明蛋白の活性を、特に、下記方法により測定してもよい: 胸腺細胞または脾臓細胞の細胞毒性に適したアッセイは、Current Protocols
in Immunology, Ed by J. E. Coligan, A.M. Kruisbeek, D.H. Margulies, E.M.
Shevach, W Strober, Pub. Greene Publishing Associates and Wiley-Intersc
ience (Chapter 3, In Vitro assays for Mouse Lymphocyte Function 3.1-3.19
; Chapter 7, Immunologic studies in Humans); Herrmann et al., Proc. Natl
. Acad. Sci. USA 78: 2488-2492, 1981; Herrmann et al., J. Immunol. 128:
1968-1974, 1982; Handa et al., J. Immunol. 135: 1564-1572, 1985; Takai e
t al., J. Immunol. 137: 3494-3500, 1986; Takai et al., J. Immunol. 140:
508-512, 1988; Herrmann et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 78: 2488-2492
, 1981; Herrmann et al., J. Immunol. 128: 1968-1974, 1982; Handa et al.,
J. Immunol. 135: 1564-1572, 1985; Takai et al., J. Immunol. 137: 3494-3
500, 1986; Bowmanet al., J. Virology 61: 1992-1998; Takai et al., J. Imm
unol. 140: 508-512, 1988; Bertagnolli et al., Cellular Immunology 133: 3
27-341, 1991; Brown et al., J. Immunol. 153: 3079-3092, 1994に記載された
アッセイを包含するが、これらに限らない。 T細胞依存性免疫グロブリン応答およびイソタイプスイッチングのためのアッ
セイ(特に、T細胞依存性抗体応答を転調させ、Th1/Th2プロフィールに
影響する蛋白を同定する)は、Maliazewski,J.Immunol.144:3028-3033,1990に記
載されているアッセイを包含するが、これに限らず、さらにB細胞の機能のアッ
セイは、In vitro antibody production,Mond,J.J.and Brunswick,M.In Current
Protocols in Immunology J.E.Coligan eds.Val 1 pp.3.8.1-3.8.16,John Wile
y and Sons,Tronto 1994に記載のアッセイを包含する。 混合リンパ球反応(MLR)アッセイ(特に、主としてTh1およひCTL応
答を発生させる蛋白を同定する)は、Current Protocols in Immunology, Ed by
J. E. Coligan, A.M. Kruisbeek, D.H. Margulies, E.M. Shevach, W Strober,
Pub. Greene Publishing Associates and Wiley-Interscience (Chapter 3, In
Vitro assays for Mouse Lymphocyte Function 3.1-3.19; Chapter 7, Immunol
ogic studies in Humans); Takai et al., J. Immunol. 137: 3494-3500, 1986;
Takai et al., J. Immunol. 140: 508-512, 1988; Bertagnolli et al., J. Im
munol. 149: 3778-3783, 1992に記載されたアッセイを包含するが、これらに限 らない。 樹枝状細胞依存的アッセイ(特に、無処理のT細胞を活性化する樹枝状細胞に
より発現される蛋白を同定する)は、Guery et al., J. Immunol. 134: 536-544
, 1995; Inaba et al., Journal of Experimental Medicine 173: 549-559, 199
1; Macatonia et al., Journal of Immunology 154: 5071-5079, 1995; Porgado
r et al., Journal of Experimental Medicine 182: 255-260, 1995; Nair et a
l., Journal of Virology 67: 4062-4069, 1993; Huang et al., Science 264:
961-965, 1994; Macatonia et al., Journal of Experimental Medicine 169:
1255-1264, 1989; Bhardwaj et al., Journal of Clinical Investigation 94:
797-807, 1994; and Inaba et al., Journal of Experimental Medicine 172:
631-640, 1990 に記載されたアッセイを包含するが、これらに限らない。 リンパ球生存/アポトーシスのアッセイ(特に、超抗体誘導後のアポトーシス
を防止する蛋白、ならびにリンパ球のホメオスタシスを調節する蛋白を同定する
)は、Darzynkiewicz et al., Cytometry 13: 795-808, 1992; Gorczyca et al.
, Leukemia 7: 659-670, 1993; Gorczyca et al., Cancer Research 53: 1945-1
951, 1993; Itoh et al., Cell 66: 233-243, 1991; Zacharchuk, Journal of I
mmunology 145: 4037-4045, 1990; Zamai et al., Cytometry 14: 891-897, 199
3; Gorczyca et al., International Journal of Oncology 1: 639-648, 1992に
記載のアッセイを包含するが、これらに限らない。 初期段階のT細胞のコミットメント(commitment)および発達のアッセイは、
Antica et al.,Blood 84: 111-117,1994; Fine et al.,Cellular Immunology 15
5: 111-122, 1994; Galy et al.,Blood 85: 2770-2778, 1995; Toki et al., Pr
oc. Natl. Acad. Sci. USA 88: 7548-7551, 1991に記載のアッセイを包含するが
、これらに限らない。
【0042】 造血調節活性 本発明蛋白は、造血の調節において有用であり、それゆえ、骨髄およびリンパ
球欠乏症の治療において有用である。コロニー形成細胞または因子依存性細胞系
を支持する最低限の生物学的活性でさえも、造血の調節への関与を示している。
例えば、赤血球系前駆細胞のみの増殖を支持すること、あるいは他のサイトカイ
ンと組み合わされて、例えば種々の貧血の治療に有用性を示すこと、あるいは放
射線療法/化学療法と組み合わされて赤芽前駆細胞および/または赤芽細胞の産
生を刺激すること;顆粒球のごとき骨髄細胞および単球/マクロファージの増殖
を支持すること(すなわち、伝統的なCSF活性)、例えば、化学療法と組み合
わされて、引き続き起こる骨髄抑制を防止することに有用であり;巨核細胞の増
殖、次いで、血小板の増殖を支持すること、またそれにより血小板減少症のごと
き種々の血小板疾患を予防または治療することに有用であり、また一般的には血
小板輸液の代わりにあるいはそれと相補的に使用され;さらに/あるいは造血幹
細胞(成熟して上記のすべての造血細胞となり、それゆえ、種々の幹細胞疾患(
通常には、移植により治療される疾患であり、例えば、再生不良性貧血および発
作性の夜間ヘモグロビン尿症)において有用性がわかる)の増殖を支持すること
に有用であり、さらにはインビボまたはエクスビボでの放射線/化学療法後(す
なわち、骨髄移植と組み合わされる)、あるいは遺伝子治療のために遺伝子操作
された後の幹細胞コンパートメントの正常細胞としての再増殖においても有用で
ある。 本発明蛋白の活性を、特に、下記方法測定してもよい。 種々の造血細胞系の増殖および分化に適したアッセイはすでに引用されている
。 胚の幹細胞の分化のアッセイ(特に、胚の分化造血に影響する蛋白を同定する
)は、Johansson et al. Cellular Biology 15: 141-151, 1995; Keller et al.
, Molecular and Cellular Biology 13: 473-486, 1993; McClanahan et al., B
lood 81: 2903-2915, 1993に記載のアッセイを包含するが、これらに限らない。 幹細胞生存および分化のアッセイ(特に、リンパ−造血を調節する蛋白を同定
する)は、Methylcellulose colony forming assays, Freshney, M.G. In Cultu
re of Hematopoietic Cells. R.I. Freshney, et al. eds. Vol pp. 265-268,
Wiley-Liss, Inc., New York, NY. 1994; Hirayama et al., Proc. Natl. Acad.
Sci. USA 89: 5907-5911, 1992; Primitive hematopoietic colony forming ce
lls with high proliferative potential, McNiece, I.K. and Briddell, R.A.
In Culture of Hematopoietic Cells. R.I. Freshney, et al. eds. Vol pp. 2
3-39, Wiley-Liss, Inc., New York, NY. 1994; Neben et al., Experimental H
ematology 22: 353-359, 1994; Cobblestone area forming cell assay, Ploema
cher, R.E. In Culture of Hematopoietic Cells. R.I. Freshney, et al. eds.
Vol pp. 1-21, Wiley-Liss, Inc.., New York, NY. 1994; Long term bone ma
rrow cultures in the presence of stromal cells, Spooncer, E., Dexter, M.
and Allen, T. In Culture of Hematopoietic Cells. R.I. Freshney, et al.
eds. Vol pp. 163-179, Wiley-Liss, Inc., New York, NY. 1994; Long term c
ulture initiating cell assay, Sutherland, H.J. In Culture of Hematopoiet
ic Cells. R.I. Freshney, et al. eds. Vol pp. 139-162, Wiley-Liss, Inc.,
New York, NY. 1994に記載されたアッセイを包含するが、これらに限らない。
【0043】 組織増殖活性 本発明蛋白は、骨、軟骨、鍵、靭帯および/または神経組織の成長または再生
、ならびに傷の治癒および組織修復に用いる組成物において、さらに熱傷、裂傷
および潰瘍の治療において有用性を有する。 骨が正常に形成されない環境において軟骨および/または骨の成長誘導する本
発明蛋白は、ヒトおよび他の動物における骨折および軟骨損傷または欠損の治癒
における用途がある。本発明蛋白を用いるかかる調合物は、閉鎖性骨折ならびに
解放性骨折の軽減に有用であり、また人工関節の固定の改善にも有用である。骨
形成剤により誘導されるデノボ骨形成は、先天性の、外傷による、あるいは腫瘍
学的切除により誘発される脳顔面頭蓋の欠損の修復に貢献し、さらに美容整形外
科手術においても有用である。 本発明蛋白を歯周病の治療および他の歯の修復プロセスに用いてもよい。かか
る作用剤は、骨形成細胞を誘引する環境を提供し、骨形成細胞の増殖を刺激し、
あるいは骨形成細胞前駆体の分化を誘導しうる。本発明蛋白は、例えば、骨およ
び/または軟骨修復の刺激により、あるいは炎症または炎症プロセスにより媒介
される組織破壊のプロセス(コラゲナーゼ活性、破骨細胞活性等)をブロックす
ることにより、骨粗鬆症または骨関節炎の治療においても有用でありうる。 本発明蛋白によるものとしてもよい組織発生活性のもう1つのカテゴリーは鍵
/靭帯の形成である。鍵/靭帯様組織または他の組織が正常に形成されない環境
におけるかかる組織の形成を誘導する本発明蛋白は、ヒトおよび他の動物におけ
る鍵または靭帯の裂傷、変形および他の鍵または靭帯の欠損の治癒、に適用され
る。鍵/靭帯様組織誘導蛋白を用いるかかる調合物は、鍵または靭帯組織に対す
るダメージの予防ならびに鍵または靭帯の骨または他の組織への固定の改善に用
いてもよい。本発明組成物により誘導されるデノボ鍵/靭帯様組織形成は、先天
性の、外傷による、あるいは腫瘍学的切除により誘発される脳顔面頭蓋の欠損の
修復に貢献し、さらに鍵または靭帯の付着または修復のための美容整形外科手術
においても有用である。本発明組成物は、鍵−または靭帯−形成細胞を誘引する
ための環境を提供し、鍵−または靭帯−形成細胞の増殖を刺激し、鍵−または靭
帯−形成細胞の前駆体の分化を誘導し、あるいはインビボに戻した場合に組織修
復を行うようにエクスビボでの鍵/靭帯細胞または前駆体の増殖を誘導しうる。
本発明組成物は、鍵炎、手根骨トンネル症候群および他の鍵または靭帯の欠損に
も有用である。本発明組成物は、適当なマトリックスおよび/または当該分野で
よく知られた担体のごとき隔離剤を含んでいてもよい。 本発明蛋白は、神経細胞の増殖ならびに神経および脳組織の再生に、すなわち
、中枢および末梢神経系疾患およびニューロパシーならびに機械的疾患および外
傷性疾患(神経細胞または神経組織に対する変性、死もしくは外傷を包含)の治
療にも有用でありうる。より詳細には、末梢神経傷害、末梢ニューロパシーおよ
び局在化ニューロパシーのごとき末梢神経系の疾病、ならびにアルツハイマー病
、パーキンソン病、ハンチントン病、筋委縮性外側脊髄硬化症およびShy-Drager
症候群のごとき中枢神経系の疾病の治療に蛋白を使用してもよい。本発明により
治療してもよいさらなる症状は、脊髄疾患のごとき機械的疾患および外傷性疾患
、頭部外傷ならびに卒中のごとき脳血管系の疾患を包含する。化学療法または他
の医学的療法により引き起こされる末梢ニューロパシーは、本発明蛋白を用いて
治療可能である。 また本発明蛋白は、圧迫性潰瘍、血管機能不全に関連した潰瘍、外科的および
外傷による創傷等(これらに限らない)を包含する非治癒性創傷のより好ましく
迅速な閉口の促進にも有用でありうる。 また本発明蛋白は、器官(例えば、膵臓、肝臓、腸、腎臓、皮膚、内皮を包含
)、筋肉(平滑筋、骨格筋または心筋)、および血管(血管内皮を包含)組織の
ごとき他の組織の発生、あるいはかかる組織を構成している細胞の増殖促進のた
めの活性を示しうる。望ましい効果の一部は、線維症性瘢痕を抑制することによ
る正常組織の再生であってもよい。本発明蛋白は脈管形成活性も示しうる。 本発明蛋白は、腸の保護または再生、および肺または肝臓の線維症、種々の組
織の再灌流傷害、および全身的なサイトカインのダメージにより生じる症状の治
療にも有用でありうる。 本発明蛋白は、前駆体組織または細胞からの上記組織の分化促進または抑制;
あるいは上記組織の増殖抑制にも有用でありうる。 本発明蛋白の活性は、とりわけ、以下の方法により測定してもよい: 組織再生活性のアッセイは、国際公開WO95/16035(骨、軟骨、鍵)
;国際公開WO95/05846(神経、ニューロン);国際公開WO91/0
7491(皮膚、内皮)に記載されたアッセイを包含するが、これらに限らない
。 創傷治癒活性のアッセイは、Winter, Epidermal Wound Healing, pps. 71-112
(Maibach, HI and Rovee, DT, eds.), Year Book Medical Publishers, Inc.,
Chicago(Eaglstein and Mertz, J. Invest. Dermatol 71: 382-384 (1978)によ
り修飾されている)に記載されたものを包含するが、これらに限らない。
【0044】 アクチビン/インヒビン活性 また、本発明蛋白はアクチビン−またはインヒビン−関連活性を示しうる。イ
ンヒビン類は、卵胞刺激ホルモン(FSH)の放出抑制能により特徴づけられ、
アクチビン類は、卵胞刺激ホルモン(FSH)の放出刺激能により特徴づけられ
る。よって、本発明蛋白は、単独であるいはインヒビンαファミリーのメンバー
とのヘテロダイマーの形態で、メスの哺乳動物の繁殖力を減少させ、オスの哺乳
動物の精子形成減少させるインヒビンの能力に基づく不妊薬として有用でありう
る。十分な量の他のインヒビンの投与により、これらの哺乳動物において不妊を
誘導することができる。別法として、本発明蛋白は、ホモダイマーとしてあるい
はインヒビン−βグループの他の蛋白のサブユニットとのヘテロダイマーとして
、下垂体前葉細胞からのFSH放出の刺激におけるアクチビン分子の能力に基づ
いて、繁殖力を誘導する治療薬として有用でありうる。例えば、米国特許第47
98885号参照。また本発明蛋白は、性的に未成熟な哺乳動物における繁殖の
向上に有用である可能性があり、その結果、ウシ、ヒツジおよびブタのごとき家
畜の生存期間中の繁殖力が増大する。 本発明蛋白の活性は、とりわけ、下記方法により測定してもよい: アクチビン/インヒビン活性のアッセイは、Vale et al., Endocrinology 91:
562-572, 1972; Ling et al., Nature 321: 779-782, 1986; Vale et al., Nat
ure 321: 776-779, 1986; Mason et al., Nature 318: 659-663,1985; Forage e
t al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83: 3091-3095,1986に記載のアッセイを包
含するが、これらに限らない。
【0045】 化学走性/ケモキネシス活性 本発明蛋白は、哺乳動物細胞、例えば単球、好中球、T細胞、肥満細胞、好酸
球および/または内皮細胞の化学走性またはケモキネシス活性(例えば、ケモカ
インとして作用)を有する可能性がある。化学走性およびケモキネシス蛋白を用
いて所望細胞集団を所望作用部位に動員または誘引することができる。化学走性
またはケモキネシス蛋白は、組織に対する傷害および他の外傷の治療ならびに局
所的な感染の治療に特に有利である。例えば、リンパ球、単球または好中球の腫
瘍または感染部位への誘引は、腫瘍または感染因子に対する免疫応答を改善しう
る。 特定の蛋白またはペプチドは特定の細胞集団に対して化学走性活性を有してお
り、刺激可能な場合には、直接的または間接的にかかる細胞集団の方向または運
動を指令する。好ましくは、蛋白またはペプチドは、細胞の方向づけられた運動
を直接的に刺激する能力を有する。特定の蛋白が細胞集団に対する化学走性活性
を有するかどうかを、かかる蛋白またはペプチドを細胞化学走性の既知アッセイ
に用いることにより容易に決定することができる。 本発明蛋白の活性は、とりわけ、下記方法により測定してもよい: 化学走性活性のアッセイ(化学走性を誘導または妨害する蛋白を同定するアッ
セイ)は、細胞の膜を越えた移動を誘導する蛋白の能力ならびに1の細胞集団の
他の細胞集団への付着を誘導する蛋白の能力を測定するアッセイを含む。移動お
よび付着に適したアッセイは、Current Protocols in Immunology, Ed by J.E.
Coligan, A.M. Kruisbeek, D.H. Margulies, E.M. Shevach, W.Strober, Pub. G
reene Publishing Associates and Wiley-Interscience (Chapter 6.12, Measur
ement of alpha and beta Chemokines 6.12.1-6.12.28; Taub et al. J. Clin.
Invest. 95: 1370-1376, 1995; Lind et al. APMIS 103: 140-146, 1995; Mulle
r et al Eur. J. Immunol. 25: 1744-1748; Gruber et al. J. of Immunol. 152
: 5860-5867, 1994; Johnston et al. J. of Immunol. 153: 1762-1768, 1994に
記載のアッセイを包含するが、これらに限らない。
【0046】 止血および血栓溶解活性 また、本発明蛋白は、止血または血栓溶解活性を示す可能性がある。結果とし
て、かかる蛋白は、種々の凝血疾患(血友病のごとき遺伝性疾患を包含)の治療
に有用であり、あるいは外傷、手術または他の原因により生じた傷害の治療にお
ける凝血および他の止血を促進しうる。本発明蛋白は、血栓の溶解または血栓形
成阻害ならびにそれらにより生じる症状(例えば、心筋梗塞および中枢神経系血
管の梗塞(例えば、卒中)のごとき)の治療および予防に有用でありうる。 本発明蛋白の活性を、とりわけ、下記方法により測定してもよい: 止血および血栓溶解活性のアッセイは、Linet et al., J. Clin. Pharmacol.
26: 131-140,1986; Burdick et al., Thrombosis Res. 45: 413-419, 1987; Hum
phrey et al., Fibrinolysis 5: 71-79 (1991); Schaub, Prostaglandins 35: 4
67-474, 1988に記載のアッセイを包含するが、これらに限らない。
【0047】 受容体/リガンド活性 また、本発明蛋白は、受容体、受容体リガンドまたは受容体/リガンド相互作
用の阻害剤もしくはアゴニストとしての活性を示しうる。かかる受容体およびリ
ガンドの例は、サイトカイン受容体およびそれらのリガンド、受容体キナーゼお
よびそれらのリガンド、受容体ホスファターゼおよびそれらのリガンド、細胞−
細胞相互作用に関与する受容体およびそれらのリガンド(細胞付着分子(セレク
チン、インテグリンおよびそれらのリガンドのごとき)ならびに抗原提示、抗原
認識、細胞性および体液性免疫応答の発生に関与する受容体/リガンド対などを
包含)を包含するがこれらに限らない。受容体およびリガンドは、関連する受容
体/リガンド相互作用に対する潜在的なペプチドまたは小型分子阻害剤のスクリ
ーニングにも有用である。本発明蛋白(受容体およびリガンドのフラグメントを
包含するが、これらに限らない)は、それ自体、受容体/リガンド相互作用の阻
害剤として有用でありうる。 本発明蛋白の活性を、とりわけ、下記方法により測定してもよい: 受容体−リガンド活性の適当なアッセイは、Current Protocols in Immunolog
y, Ed by J. E. Coligan, A. M. Kruisbeek, D. H. Margulies, E. M. Shevach,
W. Strober, Pub. Greene Publishing Associates and Wiley-Interscience (C
hapter 7.28, Measurement of Cellular Adhesion under static conditions 7.
28.1-7.28.22), Takai et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84: 6864-6868, 1
987; Bierer et al., J. Exp. Med. 168: 1145-1156, 1988; Rosenstein et al.
, J. Exp. Med. 169: 149-160 1989; Stoltenborg et al., J. Immunol. Metho
ds 175: 59-68, 1994; Stitt et al., Cell 80: 661-670, 1995に記載のアッセ イを包含するが、これらに限らない。
【0048】 抗炎症活性 本発明蛋白は抗炎症活性を示しうる。抗炎症活性は、刺激応答に関与している
細胞に刺激を与えることにより、細胞−細胞相互作用(例えば、付着のごとき)
を阻害または促進することにより、炎症プロセスに関与している細胞の化学走性
を阻害または促進することにより、細胞溢出を阻害または促進することにより、
あるいは炎症応答をより直接的に阻害または促進する他の因子の産生を刺激また
は抑制することにより発揮される。かかる活性を示す蛋白を用いて炎症の症状(
慢性もしくは急性症状を包含、感染に関連した炎症(敗血性ショック、敗血症も
しくは全身性炎症応答症候群(SIRS)のごとき)、虚血−再潅流傷害、エン
ドトキシンによる致命的傷害、関節炎、補体により媒介される超急性拒否反応、
腎炎、サイトカインもしくはケモカインにより誘導される肺の傷害、炎症性腸疾
患、クローン病またはTNFもしくはIL−1のごときサイトカインの過剰産生
から生じる疾病を包含するがこれらに限らない)を治療することができる。本発
明蛋白は、アナフィラキシーおよび抗原性物質もしくは材料に対する過敏症の治
療にも有用でありうる。
【0049】 カドヘリン/腫瘍侵入抑制活性 カドヘリン(cadherin)はカルシウム依存性付着分子であり、発達中において
、詳細には特定の細胞タイプを決定することにおいて主要な役割を果たしている
と思われる。正常なカドヘリン発現の損失または変化は、腫瘍増殖および転移に
関連した細胞付着特性への変化を誘導しうる。カドヘリンの機能失調は、尋常性
天疱瘡および落葉状天疱瘡(自己免疫性の皮膚水泡疾患)、クローン病、および
いくつかの発達異常のごときヒトの他の疾病にも関与している。 カドヘリンスーパーファミリーは40余りのメンバーを包含し、それぞれが異
なる発現パターンを有している。当該スーパーファミリーのすべてのメンバーは
、共通の保存された細胞外リピート(カドヘリンドメイン)を有するが、分子の
他の部分において構造の相違が見られる。カドヘリンドメインはカルシウムに結
合してそれらの三次構造を形成するので、カルシウムはそれらの付着に必要であ
る。第1のカドヘリンドメインにおける少数のアミノ酸は同種親和性付着のため
の基礎を提供するので、この認識部位の修飾はカドヘリンの特異性を変化させる
可能性があり、その結果、自分自身だけを認識するのではなく、変異分子も異な
るカドヘリンに結合できるようになる。さらに、いくつかのカドヘリンは他のカ
ドヘリンとの異種親和性付着にも関与している。 カドヘリンスーパーファミリーのメンバーの1つであるE−カドヘリンは上皮
細胞タイプにおいて発現される。病理学的には、E−カドヘリン発現が腫瘍にお
いて失われる場合、悪性細胞は侵入性となり、癌が転移する。E−カドヘドリン
を発現するポリヌクレオチドを癌細胞系にトランスフェクションすることは、変
化した細胞形態を元に戻し、細胞相互および他の基質への付着性を回復させ、細
胞増殖速度を低下させ、足場依存性細胞の増殖を劇的に減少させることにより、
癌に関連した変化を回復させた。よって、E−カドヘドリン発現を再導入するこ
とは、癌腫をより進行していない段階に戻す。他のカドヘドリンも、他の組織タ
イプ由来の癌腫において同じ侵入抑制的役割を有している可能性がある。それゆ
え、カドヘドリン活性を有する本発明蛋白、およびかかる蛋白をコードする本発
明ポリヌクレオチドを用いて癌を治療することができる。かかる蛋白またはポリ
ヌクレオチドを癌細胞に導入することは、正常なカドヘドリン発現を提供するこ
とにより、これらの細胞において観察される癌性の変化を減少または除去しうる
。 癌細胞は、本来のものとは異なる組織タイプのカドヘリンを発現することも知
られており、それゆえこれらの癌細胞は異なる組織に侵入でき、転移できる。カ
ドヘリン活性を有する本発明蛋白、およびかかる蛋白をコードする本発明ポリヌ
クレオチドは、これらの細胞において不適切に発現されたカドヘドリンと置換し
、正常な細胞付着特性を回復させ、細胞の転移傾向を減少させ、あるいは除去し
うる。 さらに、カドヘリン活性を有する本発明蛋白、およびかかる蛋白をコードする
本発明ポリヌクレオチドを用いてカドヘリンを認識しこれに結合するする抗体を
得ることもできる。かかる抗体を用いて不適切に発現された腫瘍細胞カドヘドリ
ンの付着をブロックし、細胞が他の場所で腫瘍を形成しないようにすることもで
きる。かかる抗−カドヘドリン抗体を、癌の等級、病理学的タイプ、および予後
のためのマーカーとして使用できる。すなわち、癌が進行すると、カドヘドリン
発現は低下し、カドヘドリン結合抗体を用いることによりこのカドヘドリン発現
の低下を検出することができる。 カドヘドリン活性を有する本発明蛋白のフラグメント、好ましくはカドヘドリ
ン認識部位のデカペプチド、およびかかる蛋白フラグメントをコードする本発明
ポリヌクレオチドを用いて、カドヘリンに結合させ、望ましくない効果を生じる
カドヘリンの結合を妨げることにより、カドヘリン機能をブロックすることもで
きる。さらに、カドヘリン活性を有する本発明蛋白のフラグメント、好ましくは
癌患者の循環系において安定であることがわかっている末端切断された可溶性カ
ドヘドリンフラグメント、およびかかる蛋白フラグメントをコードするポリヌク
レオチドを用いて正しい細胞−細胞付着を混乱させることもできる。 カドヘドリンの付着および侵入抑制活性のアッセイは、Hortsch et al. J Bio
l Chem 270 (32): 18809-18817, 1995; Miyaki et al. Oncogene 11: 2547-2552
, 1995; Ozawa et al. Cell 63: 1033-1038, 1990.に記載されたものを包含する
が、これらに限らない。
【0050】 腫瘍阻害活性 腫瘍の免疫学的治療または予防に関する上記活性のほかに、本発明蛋白は他の
抗腫瘍活性を示しうる。ある蛋白は腫瘍増殖を直接的または間接的に(例えば、
ADCCを介して)阻害しうる。ある蛋白は、腫瘍組織または腫瘍前駆体組織に
作用して、腫瘍増殖を支持するに必要な組織の形成を阻害し(例えば、脈管形成
を阻害することにより)、腫瘍増殖を阻害する他の因子、作用剤または細胞タイ
プの産生を引き起こすことにより、あるいは腫瘍増殖を促進する因子、作用剤ま
たは細胞タイプを除去または阻害することにより腫瘍阻害活性を示しうる。
【0051】 他の活性 本発明蛋白は、下記のさらなる活性または効果の1つまたはそれ以上を示しう
る:細菌、ウイルス、真菌および他の寄生虫(これらに限らず)を包含する感染
性因子の殺傷;身長、体重、体毛の色、目の色、皮膚または他の組織の色素沈着
、または器官または身体部分のサイズまたは形態(例えば、豊胸またはその逆)
を包含する身体特性への影響(抑制または促進);摂食した脂肪、蛋白または炭
水化物の消化への影響;食欲、性欲、ストレス、認識(認識の疾患を包含)、鬱
(鬱病性疾患を包含)および暴力的行為(これらに限らず)を包含する行動特性
への影響;鎮痛効果または他の痛み軽減効果の提供;造血系以外の系統における
胚の幹細胞の分化および増殖の促進;ホルモンまたは内分泌活性;酵素の場合、
酵素欠乏の修正および関連疾患の治療;過剰増殖性疾患(例えば、乾癬のごとき
)の治療;免疫グロブリン様活性(例えば、抗体または補体に結合する能力);
ならびにワクチン組成物において抗原として作用してかかる蛋白またはかかる蛋
白と交差反応する他の物質もしくは存在に対する免疫応答を生じさせる能力。
【0052】投与および用量 本発明蛋白(どのような源からであってもよく、組み換え法および非組み換え
法によるものを包含するが、これらに限らない)を、医薬上許容される担体と混
合して医薬組成物中に用いてもよい。かかる組成物は(蛋白および担体のほかに
)、希釈剤、充填剤、塩類、バッファー、安定化剤、可溶化剤、および当該分野
でよく知られた他の物質を含有していてもよい。用語「医薬上許容される」は、
有効成分の生物学的活性の有効性を妨害しない無毒の物質を意味する。担体の特
性は投与経路に依存する。本発明医薬組成物は、M−CSF、GM−CSF、T
NF、IL−1、IL−2、IL−3、IL−4、IL−5、IL−6、IL−
7、IL−8、IL−9、IL−10、IL−11、IL−12、IL−13、
IL−14、IL−15、IFN、TNF0、TNF1、TNF2、G−CSF
、Meg−CSF、スロンボポイエチン、幹細胞因子、およびエリスロポイエチ
ンのごときサイトカイン、リンホカイン、または他の造血因子を含有していても
よい。医薬組成物はさらに、蛋白活性を増強し、あるいは治療においてその活性
または有用性を補う他の作用剤を含有していてもよい。かかるさらなる因子およ
び/または作用剤を医薬組成物に含有させて、本発明蛋白との相乗効果を発揮さ
せ、あるいは副作用を最小化してもよい。逆に、特定のサイトカイン、リンホカ
イン、他の造血因子、血栓溶解因子または抗血栓因子、または抗炎症剤の処方に
本発明蛋白を含有させて、サイトカイン、リンホカイン、他の造血因子、血栓溶
解因子または抗血栓因子、または抗炎症剤の副作用を最小化してもよい。 本発明蛋白は、多量体(例えば、ヘテロダイマーまたはホモダイマー)または
それ自体もしくは他の蛋白との複合体となって活性でありうる。結果的に、本発
明医薬組成物は、かかる多量体または複合体形態の本発明蛋白を含むものであっ
てもよい。 本発明医薬組成物は、本発明蛋白と蛋白もしくはペプチド抗原との複合体の形
態であってもよい。蛋白および/またはペプチド抗原は、Bリンパ球ならびにT
リンパ球に対して刺激シグナルを送達するであろう。Bリンパ球はその表面免疫
グロブリン受容体を通して抗原に応答するであろう。Tリンパ球は、MHC蛋白
による抗原提示後、T細胞受容体(TCR)を通して抗原に応答するであろう。
MHCならびに宿主細胞のクラスIおよびクラスIIのMHC遺伝子によりコー
ドされたものを包含する構造上関連した蛋白は、Tリンパ球に対するペプチド抗
原の提示に役立つであろう。抗原成分は、精製MHC−ペプチド複合体のみとし
て、または直接T細胞にシグナルを送ることのできる同時刺激分子とともに供給
されうる。あるいはまた、B細胞上の表面免疫グロブリンならびにT細胞上のT
CRおよび他の分子に結合しうる抗体を、本発明医薬組成物と混合することもで
きる。 本発明医薬組成物はリポソーム形態であってもよく、その中で本発明蛋白はさ
らに他の医薬上許容される担体、脂質のごとき両親媒性作用剤(水溶液中でミセ
ルのような凝集体形態、不溶性単層、液状結晶またはラメラ層として存在)と混
合されている。リポソーム処方に適する脂質は、モノグリセリド、ジグリセリド
、スルファチジド、リゾレシチン、リン脂質、サポニン、胆汁酸等を包含するが
、これらに限らない。かかるリポソーム処方の製造は当業者のレベルの範囲内で
あり、例えば、米国特許第4235871、4501728、4837028、
および4737323号(参照によりそれらすべてを本明細書に記載されている
ものとみなす)に記載されたようなものである。
【0053】 本明細書の用語「治療上有効量」とは、有意な患者の利益、例えば、かかる症
状の徴候の改善、治癒、治癒速度の増大を示すに十分な医薬組成物または方法の
各有効成分の合計量を意味する。単独で投与される個々の有効成分について用い
る場合、該用語は当該成分のみをいう。有効成分の組み合わせに用いる場合、逐
次投与あるいは同時投与にかかわらず治療効果を生じる有効成分量の合計量をい
う。 本発明の治療方法の実施において、治療上有効量の本発明蛋白を治療すべき症
状を有する哺乳動物に投与する。本発明方法に従って、単独またはサイトカイン
、リンホカインもしくは他の造血因子のごとき他の治療薬とともに本発明蛋白を
投与してもよい。1種またはそれ以上のサイトカイン、リンホカインまたは他の
造血因子と共投与する場合、本発明蛋白をサイトカイン、リンホカイン、他の造
血因子、血栓溶解因子もしくは抗血栓因子と同時または逐次投与してもよい。逐
次投与する場合、担当医師は、サイトカイン、リンホカイン、他の造血因子、血
栓溶解因子もしくは抗血栓因子と本発明蛋白との組み合わせにおける適切な投与
順序を決定するであろう。 本発明医薬組成物中または本発明の実施に用いる本発明蛋白の投与を種々の慣
用的方法、例えば、経口的摂食、吸入、または皮内、皮下、または静脈注射で行
うことができる。患者への静脈注射が好ましい。 治療上有効量の本発明蛋白を経口投与する場合、本発明蛋白は錠剤、カプセル
、粉末、溶液またはエリキシルの形態であろう。錠剤形態で投与する場合、本発
明医薬組成物はゼラチンのごとき固体担体またはアジュバントをさらに含有して
いてもよい。錠剤、カプセル、および粉末は、約5ないし95%の本発明蛋白、
好ましくは約25ないし90%の本発明蛋白を含有する。液体形態で投与する場
合、水、ペトロレウム、動物または植物起源の油脂、例えばピーナッツ油、鉱油
、大豆油、またはゴマ油、または合成油脂を添加してもよい。液体形態の医薬組
成物は、生理食塩溶液、デキストロースまたは他の糖類溶液、またはグリコール
類(例えばエチレングリコール、プロピレングリコールもしくはポリエチレング
リコール)をさらに含有していてもよい。液体形態で投与する場合、医薬組成物
は、約0.5ないし90重量%の本発明蛋白、好ましくは約1ないし50%の本
発明蛋白を含有する。 治療上有効量の本発明蛋白を静脈、皮内または皮下注射により投与する場合、
本発明蛋白はパイロジェン不含で、非経口的に許容される水溶液の形態であろう
。適切なpH、等張性、安定性を有するかかる非経口的に許容される蛋白溶液の
調製は、当業者の範囲内である。静脈、皮内、または皮下注射用の好ましい医薬
組成物は、本発明蛋白のほかに、注射用塩化ナトリウム、リンゲル溶液、注射用
デキストロース、注射用デキストロースおよび塩化ナトリウム溶液、注射用乳酸
含有リンゲル溶液、または当該分野で知られている他の担体を含有すべきである
。本発明医薬組成物は、安定化剤、保存料、バッファー、抗酸化剤、または当業
者に知られた他の添加物を含んでいてもよい。 本発明医薬組成物中の本発明蛋白の量は、治療すべき症状の性質および重さ、
ならびに患者がすでに受けていた治療の性質による。最終的には、担当医師が、
各患者を治療すべき本発明蛋白量を決定するであろう。まず、担当医師は、低用
量の本発明蛋白を投与し、患者の応答を観察する。最適治療効果が得られるまで
、より高用量の本発明蛋白を投与してもよく、最適治療効果が得られた時点で用
量をさらに増加させない。本発明方法を実施するための種々の医薬組成物は、体
重1kgあたり約0.01μgないし約100mgの本発明蛋白(好ましくは、
体重1kgあたり約0.1μgないし約10mg、より好ましくは体重1kgあ
たり0.1μgないし約1mgの本発明蛋白を含有すべきである。 本発明組成物を用いる静脈投与による治療の期間は、治療すべき疾病の重さな
らびに各患者の状態および応答により変化させられるであろう。本発明蛋白の各
適用期間は、連続静脈投与の場合12ないし24時間の範囲であると考えられる
。最終的には、担当医師が、本発明医薬組成物を用いる静脈投与による治療の期
間を決定するであろう。
【0054】 本発明蛋白を用いて動物を免役して、本発明蛋白と特異的に反応するポリクロ
ーナルおよびモノクローナル抗体を得てもよい。蛋白全体またはそのフラグメン
トを免疫原として用いてかかる抗体を得てもよい。ペプチド免疫源はカルボキシ
末端にシステイン残基をさらに含んでいてもよく、キーホールリムペット・ヘモ
シアニン(KLH)のごときハプテンに結合する。かかるペプチドを合成する方
法は当該分野において知られており、例えば、R. P. Merrifield, J. Amer. Che
m. Soc. 85, 2149-2154 (1963);J. L. Krstenansky, et. al., FEBS Lett. 211
, 10 (1987)に記載のごときものがある。本発明蛋白に結合するモノクローナル 抗体は、本発明蛋白の免疫検出用の有用な診断薬でありうる。本発明蛋白に結合
する中和抗体は、本発明蛋白に関連した症状の治療薬として有用でありうるし、
さらに本発明蛋白の異常発現が関与しているいくつかの形態の癌の治療における
ある種の腫瘍の治療において有用でありうる。癌細胞または白血球細胞の場合、
本発明蛋白に対する中和モノクローナル抗体は、本発明蛋白により媒介されうる
癌細胞の転移蔓延の検出および予防に有用でありうる。 骨、軟骨、腱または靭帯の再生に有用な本発明組成物に関して、治療方法は、
組成物を局所的、全身的、またはインプラントもしくはデバイスのごとく局部的
に投与することを包含する。投与する場合、本発明に使用する治療組成物は、も
ちろん、パイロジェン不含の生理学的に許容される形態である。さらに、望まし
くは、組成物をカプセル封入するかまたは粘性形態として注射して骨、軟骨また
は組織ダメージ部位に送達してもよい。局所投与は傷の治癒および組織修復に適
する。上記組成物中に含有されていてもよい本発明蛋白以外の治療上有用な作用
剤を、代替的または付加的に、本発明方法における組成物と同時または逐次投与
してもよい。好ましくは、骨および/または軟骨形成のためには、組成物は、蛋
白含有組成物を骨および/または軟骨ダメージ部位に送達し、骨および軟骨の発
生のための構造を提供し、さらに最適には体内に吸収されうるマトリックスを含
有するであろう。かかるマトリックスは、他の移植される医学的器具に現在使用
されている材料からできていてもよい。 マトリックス材料の選択は、生体適合性、生分解性、機械的特性、美容上の外
観および界面特性に基づく。組成物の特別な適用により適当な処方が決定されよ
う。組成物用として可能なマトリックスは生分解性で、化学的に知られた硫酸カ
ルシウム、リン酸三カルシウム、ヒドロキシアパタイト、ポリ乳酸、ポリグリコ
ール酸およびポリ無水物であってもよい。他の使用可能な材料は生分解性で、生
物学的によく知られたもの、例えば、骨または皮膚のコラーゲンである。さらに
マトリックスは純粋な蛋白または細胞外マトリックス成分を含んでいてもよい。
他の可能なマトリックスは、焼結ヒドロキシアパタイト、バイオガラス、アルミ
ネート、または他のセラミックスのごとき生分解性でなく、化学的に知られたも
のである。マトリックスは上記タイプの材料の組み合わせ、例えばポリ乳酸およ
びヒドロキシアパタイトあるいはコラーゲンおよびリン酸三カルシウムを含んで
いてもよい。バイオセラミックスを、組成物中、例えばカルシウム−アルミネー
ト−ホスフェート中において変更してもよく、加工して孔サイズ、粒子サイズ、
粒子形状および生分解性を変化させてもよい。 150ないし800ミクロンの範囲の直径を有する多孔性粒子形態の乳酸およ
びグリコール酸の50:50(モル重量)のコポリマーが現在のところ好ましい
。いくつかの適用例においては、カルボキシメチルセルロースまたは自己由来の
血餅のごとき隔離剤を用いてマトリックスからの蛋白組成物の解離を防止するこ
とが有用であろう。 隔離剤の好ましいファミリーは、メチルセルロース、エチルセルロース、ヒド
ロキシエチルセルロース、ヒドロキシプロピルセルロース、ヒドロキシプロピル
メチルセルロース、およびカルボキシメチルセルロースを包含するアルキルセル
ロース(ヒドロキシアルキルセルロースを包含)のごときセルロース性材料であ
り、カルボキシメチルセルロース(CMC)のカチオン性の塩が最も好ましい。
他の好ましい隔離剤は、ヒアルロン酸、アルギン酸ナトリウム、ポリ(エチレン
グリコール)、ポリオキシエチレンオキシド、カルボキシビニルポリマーおよび
ポリ(ビニルアルコール)を包含する。本発明に有用な隔離剤の量は、全処方重
量に対して0.5〜20重量%、好ましくは1〜10重量%であり、この量は、
ポリマーマトリックスからの蛋白の脱離を防止し、組成物の適切な取り扱いを可
能にする量であるが、前駆細胞がマトリックスから浸潤し、そのことにより前駆
細胞の骨形成活性を促進する機会を蛋白に付与するようにするには、あまり多く
ないようにする。
【0055】 さらなる組成物において、本発明蛋白が骨および/または軟骨の欠損、傷、ま
たは組織の治療に有益な他の作用剤と混合されていてもよい。これらの作用剤は
、上皮増殖因子(EGF)、血小板由来増殖因子(PDGF)、形質転換増殖因
子(TGF−αおよびTGF−β)、およびインスリン様増殖因子(IGF)を
包含する。 また、目下のところ、治療組成物は獣医学的用途にも価値がある。詳細には、
ヒトのほかに、家畜およびサラブレッドのウマが本発明蛋白を用いるかかる治療
に望ましい患者である。 組織の再生に使用される蛋白含有医薬組成物の投与規則は、蛋白の作用を変化
させる種々の要因、例えば形成が望まれる組織重量、ダメージ部位、ダメージを
受けた組織の状態、傷のサイズ、必要な組織のタイプ(例えば、骨)、患者の年
齢、性別、および食事、感染の重さ、投与期間、ならびに他の臨床的要因を考慮
して医師が決定するであろう。用量は、復元に使用するマトリックスのタイプお
よび医薬組成物中の他の蛋白の含有に応じて変更されてもよい。例えば、IGF
I(インスリン様増殖因子I)のごとき他の既知増殖因子の最終組成物への添 加も用量に影響しうる。組織/骨の増殖および/または修復を、例えばX線、組
織形態学的調査およびテトラサイクリン標識により定期的に評価することにより
経過をモニターすることができる。 本発明ポリヌクレオチドを遺伝子治療に用いることもできる。かかるポリヌク
レオチドをインビボまたはエクスビボで細胞に導入して哺乳動物対象中で発現さ
せることができる。核酸を細胞または生物に導入するための他の知られた方法に
より本発明ポリヌクレオチドを投与してもよい(ウイルスベクターに入れて、あ
るいは裸のDNAの形態として等があるが、これらに限らない)。 本発明蛋白存在下で細胞をエクスビボにおいて培養して増殖させ、あるいはか
かる細胞に対する所望効果を生じさせ、あるいはかかる細胞中に所望活性を生じ
させてもよい。次いで、処理された細胞を、治療目的で、インビボにおいて導入
することができる。 本明細書に引用した特許および文献を、参照により全体が本明細書に記載され
ているものとみなす。
【0056】
【配列表】
【図面の簡単な説明】
【図1Aおよび1B】 本明細書開示のクローンの寄託に使用した、pED
6およびpNOTsベクターをそれぞれ図式的に示したものである。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) C12N 1/21 C12P 21/02 C 4H045 5/10 C12Q 1/68 A 15/09 ZNA A61K 37/02 C12P 21/02 C12N 5/00 A C12Q 1/68 15/00 ZNAA (81)指定国 EP(AT,BE,CH,CY, DE,DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,I T,LU,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ ,CF,CG,CI,CM,GA,GN,GW,ML, MR,NE,SN,TD,TG),AP(GH,GM,K E,LS,MW,SD,SZ,UG,ZW),EA(AM ,AZ,BY,KG,KZ,MD,RU,TJ,TM) ,AL,AM,AT,AU,AZ,BA,BB,BG, BR,BY,CA,CH,CN,CU,CZ,DE,D K,EE,ES,FI,GB,GE,GH,GM,HR ,HU,ID,IL,IS,JP,KE,KG,KP, KR,KZ,LC,LK,LR,LS,LT,LU,L V,MD,MG,MK,MN,MW,MX,NO,NZ ,PL,PT,RO,RU,SD,SE,SG,SI, SK,SL,TJ,TM,TR,TT,UA,UG,U Z,VN,YU,ZW (72)発明者 ジョン・エム・マッコイ アメリカ合衆国01867マサチューセッツ州 リーディング、ハワード・ストリート56番 (72)発明者 エドワード・アール・ラバリー アメリカ合衆国01451マサチューセッツ州 ハーバード、アン・リー・ロード133番 (72)発明者 リサ・エイ・コリンズ−レイシー アメリカ合衆国01720マサチューセッツ州 アクトン、スクール・ストリート124番 (72)発明者 デイビッド・マーバーグ アメリカ合衆国01720マサチューセッツ州 アクトン、オーチャード・ドライブ2番 (72)発明者 モーリス・トレーシー アメリカ合衆国02167マサチューセッツ州 チェスナット・ヒル、ウォルコット・ロー ド93番 (72)発明者 マイケル・ジェイ・アゴスティノ アメリカ合衆国01810マサチューセッツ州 アンドーバー、ウォルコット・アベニュー 26番 (72)発明者 ロバート・ジェイ・スタイニンガー・ザ・ セカンド アメリカ合衆国02140マサチューセッツ州 ケンブリッジ、リード・ストリート100番 Fターム(参考) 4B024 AA01 BA80 CA04 DA02 DA06 EA04 FA18 GA11 HA14 HA17 4B063 QA01 QA07 QA18 QA19 QQ02 QQ42 QQ60 QR32 QR56 QS03 QS34 QX07 4B064 AG01 CA02 CA19 CC24 DA01 DA13 4B065 AA26X AA90X AA93Y AB01 BA02 CA24 CA44 4C084 AA02 AA06 AA07 BA01 BA08 BA22 BA23 CA25 CA26 CA27 CA28 CA53 CA56 DA01 NA14 ZA012 ZA222 ZA332 ZA592 ZA962 ZB072 ZB082 ZB112 ZB152 ZB212 ZB262 ZB322 ZB332 ZB352 ZC352 ZC552 4H045 AA10 AA20 BA10 BA20 CA40 CA41 CA42 CA45

Claims (29)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 (a)配列番号:1のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオ
    チド; (b)配列番号:1のヌクレオチド185からヌクレオチド1678までのヌ
    クレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (c)配列番号:1のヌクレオチド482からヌクレオチド1678までのヌ
    クレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (d)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンco821 3
    1の全長蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (e)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンco821 3
    1のcDNAインサートによりコードされる全長蛋白をコードしているポリヌク
    レオチド; (f)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンco821 3
    1の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (g)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンco821 3
    1のcDNAインサートによりコードされる成熟蛋白をコードしているポリヌク
    レオチド; (h)配列番号:2のアミノ酸配列を含む蛋白をコードしているポリヌクレオ
    チド; (i)生物学的活性を有する配列番号:2のアミノ酸配列のフラグメントを含
    む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:2の8
    個の連続したアミノ酸を含む); (j)少なくとも4X SSC、65℃または4X SSC、42℃、50%ホ
    ルムアミドの厳密さの条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれ
    か1つとハイブリダイゼーションするポリヌクレオチド;および (k)少なくとも4X SSC、50℃または6X SSC、40℃、50%ホ
    ルムアミドの厳密さの条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれ
    か1つとハイブリダイゼーションし、配列番号:1の長さの少なくとも25%の
    長さを有するポリヌクレオチド からなる群より選択される単離ポリヌクレオチド。
  2. 【請求項2】 少なくとも1つの発現制御配列に作動可能に連結されている
    請求項1のポリヌクレオチド。
  3. 【請求項3】 請求項2のポリヌクレオチドで形質転換された宿主細胞。
  4. 【請求項4】 哺乳動物細胞である請求項3の宿主細胞。
  5. 【請求項5】 (a)請求項3の宿主細胞の培養物を適当な培地中で増殖さ
    せ;ついで (b)培養物から蛋白を精製する ことを含む、請求項2のポリヌクレオチドによりコードされる蛋白の製造方法。
  6. 【請求項6】 請求項5の方法により製造される蛋白。
  7. 【請求項7】 請求項6の蛋白をコードする単離ポリヌクレオチド。
  8. 【請求項8】 ATCC98663として寄託されたクローンco821
    31のcDNAインサートを含む、請求項7のポリヌクレオチド。
  9. 【請求項9】 (a)配列番号:2のアミノ酸配列; (b)配列番号:2のアミノ酸配列のフラグメント(各フラグメントは配列番
    号:2の8個の連続したアミノ酸を含む);および (c)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンco821 3
    1のcDNAインサートによりコードされるアミノ酸配列 からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む蛋白であって、他の哺乳動物蛋白
    を実質的に含まない蛋白。
  10. 【請求項10】 該蛋白が配列番号:2のアミノ酸配列を含む請求項9の蛋
    白。
  11. 【請求項11】 請求項9の蛋白および医薬上許容される担体を含有する組
    成物。
  12. 【請求項12】 (a)配列番号:3のヌクレオチド配列を含むポリヌクレ
    オチド; (b)配列番号:3のヌクレオチド176からヌクレオチド754までのヌク
    レオチド配列を含むポリヌクレオチド; (c)配列番号:3のヌクレオチド425からヌクレオチド754までのヌク
    レオチド配列を含むポリヌクレオチド; (d)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンdk329 1
    の全長蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (e)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンdk329 1
    のcDNAインサートによりコードされる全長蛋白をコードしているポリヌクレ
    オチド; (f)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンdk329 1
    の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (g)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンdk329 1
    のcDNAインサートによりコードされる成熟蛋白をコードしているポリヌクレ
    オチド; (h)配列番号:4のアミノ酸配列を含む蛋白をコードしているポリヌクレオ
    チド; (i)生物学的活性を有する配列番号:4のアミノ酸配列のフラグメントを含
    む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:4の8
    個の連続したアミノ酸を含む); (j)少なくとも4X SSC、65℃または4X SSC、42℃、50%ホ
    ルムアミドの厳密さの条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれ
    か1つとハイブリダイゼーションするポリヌクレオチド;および (k)少なくとも4X SSC、50℃または6X SSC、40℃、50%ホ
    ルムアミドの厳密さの条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれ
    か1つとハイブリダイゼーションし、配列番号:3の長さの少なくとも25%の
    長さを有するポリヌクレオチド からなる群より選択される単離ポリヌクレオチド。
  13. 【請求項13】 (a)配列番号:4のアミノ酸配列; (b)配列番号:4のアミノ酸配列のフラグメント(各フラグメントは配列番
    号:4の8個の連続したアミノ酸を含む);および (c)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンdk329 1
    のcDNAインサートによりコードされるアミノ酸配列 からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む蛋白であって、他の哺乳動物蛋白
    を実質的に含まない蛋白。
  14. 【請求項14】 (a)配列番号:5のヌクレオチド配列を含むポリヌクレ
    オチド; (b)配列番号:5のヌクレオチド190からヌクレオチド1449までのヌ
    クレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (c)配列番号:5のヌクレオチド913からヌクレオチド1449までのヌ
    クレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (d)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンfx317 1
    1の全長蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (e)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンfx317 1
    1のcDNAインサートによりコードされる全長蛋白をコードしているポリヌク
    レオチド; (f)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンfx317 1
    1の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (g)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンfx317 1
    1のcDNAインサートによりコードされる成熟蛋白をコードしているポリヌク
    レオチド; (h)配列番号:6のアミノ酸配列を含む蛋白をコードしているポリヌクレオ
    チド; (i)生物学的活性を有する配列番号:6のアミノ酸配列のフラグメントを含
    む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:6の8
    個の連続したアミノ酸を含む); (j)少なくとも4X SSC、65℃または4X SSC、42℃、50%ホ
    ルムアミドの厳密さの条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれ
    か1つとハイブリダイゼーションするポリヌクレオチド;および (k)少なくとも4X SSC、50℃または6X SSC、40℃、50%ホ
    ルムアミドの厳密さの条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれ
    か1つとハイブリダイゼーションし、配列番号:5の長さの少なくとも25%の
    長さを有するポリヌクレオチド からなる群より選択される単離ポリヌクレオチド。
  15. 【請求項15】 (a)配列番号:6のアミノ酸配列; (b)配列番号:6のアミノ酸配列のフラグメント(各フラグメントは配列番
    号:6の8個の連続したアミノ酸を含む);および (c)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンfx317 1
    1のcDNAインサートによりコードされるアミノ酸配列 からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む蛋白であって、他の哺乳動物蛋白
    を実質的に含まない蛋白。
  16. 【請求項16】 (a)配列番号:7のヌクレオチド配列を含むポリヌクレ
    オチド; (b)配列番号:7のヌクレオチド51からヌクレオチド1202までのヌク
    レオチド配列を含むポリヌクレオチド; (c)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンlp547 4
    の全長蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (d)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンlp547 4
    のcDNAインサートによりコードされる全長蛋白をコードしているポリヌクレ
    オチド; (e)配列番号:8のアミノ酸配列を含む蛋白をコードしているポリヌクレオ
    チド; (f)生物学的活性を有する配列番号:8のアミノ酸配列のフラグメントを含
    む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:8の8
    個の連続したアミノ酸を含む); (g)少なくとも4X SSC、65℃または4X SSC、42℃、50%ホ
    ルムアミドの厳密さの条件下で(a)〜(f)に示すポリヌクレオチドのいずれ
    か1つとハイブリダイゼーションするポリヌクレオチド;および (h)少なくとも4X SSC、50℃または6X SSC、40℃、50%ホ
    ルムアミドの厳密さの条件下で(a)〜(f)に示すポリヌクレオチドのいずれ
    か1つとハイブリダイゼーションし、配列番号:7の長さの少なくとも25%の
    長さを有するポリヌクレオチド からなる群より選択される単離ポリヌクレオチド。
  17. 【請求項17】 (a)配列番号:8のアミノ酸配列; (b)配列番号:8のアミノ酸配列のフラグメント(各フラグメントは配列番
    号:8の8個の連続したアミノ酸を含む);および (c)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンlp547 4
    のcDNAインサートによりコードされるアミノ酸配列 からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む蛋白であって、他の哺乳動物蛋白
    を実質的に含まない蛋白。
  18. 【請求項18】 (a)配列番号:9のヌクレオチド配列を含むポリヌクレ
    オチド; (b)配列番号:9のヌクレオチド61からヌクレオチド2559までのヌク
    レオチド配列を含むポリヌクレオチド; (c)配列番号:9のヌクレオチド904からヌクレオチド2559までのヌ
    クレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (d)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンlv310 7
    の全長蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (e)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンlv310 7
    のcDNAインサートによりコードされる全長蛋白をコードしているポリヌクレ
    オチド; (f)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンlv310 7
    の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (g)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンlv310 7
    のcDNAインサートによりコードされる成熟蛋白をコードしているポリヌクレ
    オチド; (h)配列番号:10のアミノ酸配列を含む蛋白をコードしているポリヌクレ
    オチド; (i)生物学的活性を有する配列番号:10のアミノ酸配列のフラグメントを
    含む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:10
    の8個の連続したアミノ酸を含む); (j)少なくとも4X SSC、65℃または4X SSC、42℃、50%ホ
    ルムアミドの厳密さの条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれ
    か1つとハイブリダイゼーションするポリヌクレオチド;および (k)少なくとも4X SSC、50℃または6X SSC、40℃、50%ホ
    ルムアミドの厳密さの条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれ
    か1つとハイブリダイゼーションし、配列番号:9の長さの少なくとも25%の
    長さを有するポリヌクレオチド からなる群より選択される単離ポリヌクレオチド。
  19. 【請求項19】 (a)配列番号:10のアミノ酸配列; (b)配列番号:10のアミノ酸配列のフラグメント(各フラグメントは配列
    番号:10の8個の連続したアミノ酸を含む);および (c)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンlv310 7
    のcDNAインサートによりコードされるアミノ酸配列 からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む蛋白であって、他の哺乳動物蛋白
    を実質的に含まない蛋白。
  20. 【請求項20】 (a)配列番号:11のヌクレオチド配列を含むポリヌク
    レオチド; (b)配列番号:11のヌクレオチド389からヌクレオチド1330までの
    ヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (c)配列番号:11のヌクレオチド1286からヌクレオチド1330まで
    のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (d)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンnq34 12
    の全長蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (e)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンnq34 12
    のcDNAインサートによりコードされる全長蛋白をコードしているポリヌクレ
    オチド; (f)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンnq34 12
    の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (g)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンnq34 12
    のcDNAインサートによりコードされる成熟蛋白をコードしているポリヌクレ
    オチド; (h)配列番号:12のアミノ酸配列を含む蛋白をコードしているポリヌクレ
    オチド; (i)生物学的活性を有する配列番号:12のアミノ酸配列のフラグメントを
    含む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:12
    の8個の連続したアミノ酸を含む); (j)少なくとも4X SSC、65℃または4X SSC、42℃、50%ホ
    ルムアミドの厳密さの条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれ
    か1つとハイブリダイゼーションするポリヌクレオチド;および (k)少なくとも4X SSC、50℃または6X SSC、40℃、50%ホ
    ルムアミドの厳密さの条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれ
    か1つとハイブリダイゼーションし、配列番号:11の長さの少なくとも25%
    のさを有するポリヌクレオチド からなる群より選択される単離ポリヌクレオチド。
  21. 【請求項21】 (a)配列番号:12のアミノ酸配列; (b)配列番号:12のアミノ酸配列のフラグメント(各フラグメントは配列
    番号:12の8個の連続したアミノ酸を含む);および (c)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンnq34 12
    のcDNAインサートによりコードされるアミノ酸配列 からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む蛋白であって、他の哺乳動物蛋白
    を実質的に含まない蛋白。
  22. 【請求項22】 (a)配列番号:13のヌクレオチド配列を含むポリヌク
    レオチド; (b)配列番号:13のヌクレオチド1026からヌクレオチド1226まで
    のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (c)配列番号:13のヌクレオチド1101からヌクレオチド1226まで
    のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (d)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpj154 1
    の全長蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (e)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpj154 1
    のcDNAインサートによりコードされる全長蛋白をコードしているポリヌクレ
    オチド; (f)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpj154 1
    の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (g)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpj154 1
    のcDNAインサートによりコードされる成熟蛋白をコードしているポリヌクレ
    オチド; (h)配列番号:14のアミノ酸配列を含む蛋白をコードしているポリヌクレ
    オチド; (i)生物学的活性を有する配列番号:14のアミノ酸配列のフラグメントを
    含む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:14
    の8個の連続したアミノ酸を含む); (j)少なくとも4X SSC、65℃または4X SSC、42℃、50%ホ
    ルムアミドの厳密さの条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれ
    か1つとハイブリダイゼーションするポリヌクレオチド;および (k)少なくとも4X SSC、50℃または6X SSC、40℃、50%ホ
    ルムアミドの厳密さの条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれ
    か1つとハイブリダイゼーションし、配列番号:13の長さの少なくとも25%
    のさを有するポリヌクレオチド からなる群より選択される単離ポリヌクレオチド。
  23. 【請求項23】 (a)配列番号:14のアミノ酸配列; (b)配列番号:14のアミノ酸配列のフラグメント(各フラグメントは配列
    番号:14の8個の連続したアミノ酸を含む);および (c)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpj154 1
    のcDNAインサートによりコードされるアミノ酸配列 からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む蛋白であって、他の哺乳動物蛋白
    を実質的に含まない蛋白。
  24. 【請求項24】 (a)配列番号:15のヌクレオチド配列を含むポリヌク
    レオチド; (b)配列番号:15のヌクレオチド478からヌクレオチド651までのヌ
    クレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (c)配列番号:15のヌクレオチド562からヌクレオチド651までのヌ
    クレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (d)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpk147 1
    の全長蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (e)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpk147 1
    のcDNAインサートによりコードされる全長蛋白をコードしているポリヌクレ
    オチド; (f)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpk147 1
    の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (g)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpk147 1
    のcDNAインサートによりコードされる成熟蛋白をコードしているポリヌクレ
    オチド; (h)配列番号:16のアミノ酸配列を含む蛋白をコードしているポリヌクレ
    オチド; (i)生物学的活性を有する配列番号:16のアミノ酸配列のフラグメントを
    含む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:16
    の8個の連続したアミノ酸を含む); (j)少なくとも4X SSC、65℃または4X SSC、42℃、50%ホ
    ルムアミドの厳密さの条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれ
    か1つとハイブリダイゼーションするポリヌクレオチド;および (k)少なくとも4X SSC、50℃または6X SSC、40℃、50%ホ
    ルムアミドの厳密さの条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれ
    か1つとハイブリダイゼーションし、配列番号:15の長さの少なくとも25%
    のさを有するポリヌクレオチド からなる群より選択される単離ポリヌクレオチド。
  25. 【請求項25】 (a)配列番号:16のアミノ酸配列; (b)配列番号:16のアミノ酸配列のフラグメント(各フラグメントは配列
    番号:16の8個の連続したアミノ酸を含む);および (c)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpk147 1
    のcDNAインサートによりコードされるアミノ酸配列 からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む蛋白であって、他の哺乳動物蛋白
    を実質的に含まない蛋白。
  26. 【請求項26】 (a)配列番号:17のヌクレオチド配列を含むポリヌク
    レオチド; (b)配列番号:17のヌクレオチド1129からヌクレオチド1896まで
    のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (c)配列番号:17のヌクレオチド1189からヌクレオチド1896まで
    のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (d)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpt127 1
    の全長蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (e)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpt127 1
    のcDNAインサートによりコードされる全長蛋白をコードしているポリヌクレ
    オチド; (f)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpt127 1
    の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (g)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpt127 1
    のcDNAインサートによりコードされる成熟蛋白をコードしているポリヌクレ
    オチド; (h)配列番号:18のアミノ酸配列を含む蛋白をコードしているポリヌクレ
    オチド; (i)生物学的活性を有する配列番号:18のアミノ酸配列のフラグメントを
    含む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:18
    の8個の連続したアミノ酸を含む); (j)少なくとも4X SSC、65℃または4X SSC、42℃、50%ホ
    ルムアミドの厳密さの条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれ
    か1つとハイブリダイゼーションするポリヌクレオチド;および (k)少なくとも4X SSC、50℃または6X SSC、40℃、50%ホ
    ルムアミドの厳密さの条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれ
    か1つとハイブリダイゼーションし、配列番号:17の長さの少なくとも25%
    のさを有するポリヌクレオチド からなる群より選択される単離ポリヌクレオチド。
  27. 【請求項27】 (a)配列番号:18のアミノ酸配列; (b)配列番号:18のアミノ酸配列のフラグメント(各フラグメントは配列
    番号:18の8個の連続したアミノ酸を含む);および (c)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンpt127 1
    のcDNAインサートによりコードされるアミノ酸配列 からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む蛋白であって、他の哺乳動物蛋白
    を実質的に含まない蛋白。
  28. 【請求項28】 (a)配列番号:19のヌクレオチド配列を含むポリヌク
    レオチド; (b)配列番号:19のヌクレオチド172からヌクレオチド1041までの
    ヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (c)配列番号:19のヌクレオチド295からヌクレオチド1041までの
    ヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (d)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンqo115 1
    3の全長蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (e)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンqo115 1
    3のcDNAインサートによりコードされる全長蛋白をコードしているポリヌク
    レオチド; (f)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンqo115 1
    3の成熟蛋白コーディング配列のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド; (g)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンqo115 1
    3のcDNAインサートによりコードされる成熟蛋白をコードしているポリヌク
    レオチド; (h)配列番号:20のアミノ酸配列を含む蛋白をコードしているポリヌクレ
    オチド; (i)生物学的活性を有する配列番号:20のアミノ酸配列のフラグメントを
    含む蛋白をコードしているポリヌクレオチド(該フラグメントは配列番号:20
    の8個の連続したアミノ酸を含む); (j)少なくとも4X SSC、65℃または4X SSC、42℃、50%ホ
    ルムアミドの厳密さの条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれ
    か1つとハイブリダイゼーションするポリヌクレオチド;および (k)少なくとも4X SSC、50℃または6X SSC、40℃、50%ホ
    ルムアミドの厳密さの条件下で(a)〜(i)に示すポリヌクレオチドのいずれ
    か1つとハイブリダイゼーションし、配列番号:19の長さの少なくとも25%
    のさを有するポリヌクレオチド からなる群より選択される単離ポリヌクレオチド。
  29. 【請求項29】 (a)配列番号:20のアミノ酸配列; (b)配列番号:20のアミノ酸配列のフラグメント(各フラグメントは配列
    番号:20の8個の連続したアミノ酸を含む);および (c)受託番号ATCC98663として寄託されたクローンqo115 1
    3のcDNAインサートによりコードされるアミノ酸配列 からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む蛋白であって、他の哺乳動物蛋白
    を実質的に含まない蛋白。
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