JP2002142780A - Method for assaying enzyme involved in the first phase reaction of drug metabolism, probe and kit therefor - Google Patents

Method for assaying enzyme involved in the first phase reaction of drug metabolism, probe and kit therefor

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JP2002142780A
JP2002142780A JP2001257338A JP2001257338A JP2002142780A JP 2002142780 A JP2002142780 A JP 2002142780A JP 2001257338 A JP2001257338 A JP 2001257338A JP 2001257338 A JP2001257338 A JP 2001257338A JP 2002142780 A JP2002142780 A JP 2002142780A
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Abstract

PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a new method for assaying an enzyme involved in the first phase reaction of drug metabolism by PCR, especially establishing a real time detection method, and a probe and a primer pair therefor. SOLUTION: The method for assaying the enzyme comprises a probe containing an oligonucleotide hybridizing to a specific region of the enzyme involved in the first phase reaction of drug metabolism, a kit for assaying the enzyme containing combination of the probe and the specific primer pair, performing a polymerase chain reaction using the kit, and measuring presence and absence of hydrolysis reaction of the used probe.

Description

【発明の詳細な説明】DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION

【0001】[0001]

【発明の属する技術分野】本発明は、薬物代謝の第I相
反応に関与する酵素の測定方法およびそのためのプロー
ブおよびキットに関する。
TECHNICAL FIELD The present invention relates to a method for measuring an enzyme involved in a phase I reaction of drug metabolism, and a probe and a kit therefor.

【0002】[0002]

【従来の技術】ヒトにおける薬物代謝反応は、大別する
と、第I相(phase I)の酸化、還元および加水分解反応
および第II相(phase II)の抱合反応からなっている。
この薬物代謝反応に関与する酵素群(drug-metabolizin
g enzymes)に属する酵素は、約1500種に及ぶ既知酵素
の、約1割を占めることが知られている。
2. Description of the Related Art Drug metabolism reactions in humans can be roughly classified into phase I oxidation, reduction and hydrolysis reactions and phase II conjugation reactions.
Enzymes (drug-metabolizin) involved in this drug metabolism reaction
g enzymes) are known to account for about 10% of about 1500 known enzymes.

【0003】特に、上記薬物代謝の第I相反応に関与す
る酵素としては、例えば下記表1に示すような各酵素
(ファミリー)およびそれらの分子種が知られている。
[0003] In particular, as the enzymes involved in the phase I reaction of drug metabolism, for example, each enzyme (family) shown in Table 1 below and their molecular species are known.

【0004】[0004]

【表1】 【table 1】

【0005】新薬を開発する上で、該新薬を投与した際
の薬物代謝の第I相反応に関与する酵素の働き(発現量
の増減)を把握することは、殊に重要である。何故な
ら、この第I相反応に関与する酵素の変動が判らない
と、新薬と併用される併用薬剤の効力や副作用の増減或
いは併用薬剤、他の摂取物による新薬の効力、副作用の
増減などが予測できず、該新薬の安全性を確認すること
ができないからである。
[0005] In developing a new drug, it is particularly important to understand the function (increase / decrease in expression level) of an enzyme involved in the phase I reaction of drug metabolism when the new drug is administered. Because if the fluctuation of the enzymes involved in this phase I reaction is not known, the efficacy and side effect of the concomitant drug used in combination with the new drug or the efficacy of the new drug due to the concomitant drug and other ingestion, the increase and decrease of the side effect, etc. This is because it cannot be predicted and the safety of the new drug cannot be confirmed.

【0006】従って、新薬開発などの分野においては、
かかる薬物代謝の第I相反応に関与する酵素に関する情
報、殊に該酵素およびその各分子種を区別して測定でき
る測定技術の開発が、要望されている。かかる技術が開
発できれば、例えば、新薬の他剤との相互作用、特殊病
態時における影響などが容易に把握でき、該新薬の副作
用に関する有用な情報を得ることができ、かくして新薬
の安全性を確保することができる。
Accordingly, in fields such as new drug development,
There is a need for the development of information relating to enzymes involved in the phase I reaction of drug metabolism, in particular, a measurement technique capable of separately measuring the enzymes and their respective molecular species. If such a technology can be developed, for example, it is possible to easily understand the interaction of the new drug with other drugs, the effects during a special disease state, and obtain useful information on the side effects of the new drug, thus ensuring the safety of the new drug. can do.

【0007】一方、ポリメラーゼチェインリアクション
(PCR)は、核酸の増幅法として広く知られており、例え
ばRT-PCR(Reverse Transcription-PCR)、コンペティ
ティブRT-PCRなどが微量のmRNAの検出、定量に威力を発
揮している。
On the other hand, polymerase chain reaction
(PCR) is widely known as a method for amplifying a nucleic acid, and, for example, RT-PCR (Reverse Transcription-PCR), competitive RT-PCR, and the like are exerting their power in detecting and quantifying a small amount of mRNA.

【0008】近年、PCRを利用したリアルタイム定量検
出法が確立された(Taq Man PCR (Genome Res., 6(10),
986 (1996)), ABI PRISMTM Sequence Detection Syste
m (Applied Biosystems社))。この検出法は、特定の蛍
光標識プローブ(TaqMan probe)を用いて核酸を測定す
る方法であり、その原理は次の通りである。即ち、例え
ば5'末端にリポーター色素および3'末端にクエンチャー
色素を付加して蛍光標識したプローブをターゲットDNA
にアニールさせた状態で、通常のPCR反応を行わせる
と、伸長反応の進行に伴って、DNAポリメラーゼの有す
る5'-3'エキソヌクレアーゼ活性により、上記プローブ
が5'末端から加水分解される。その結果、5'末端のリポ
ーター色素が3'末端のクエンチャー色素から離れ、これ
により、当初一定の空間的距離を保っていたことによる
FRET(Fluoresence Resonance Energy Transfer, 両蛍
光色素の共鳴によるリポーター色素のエネルギー順位の
低下に基づく蛍光強度の低下現象)効果がなくなり、ク
エンチャー色素により制御されていたリポーター色素の
蛍光強度が増加する。該蛍光強度の増加を測定すれば、
ターゲット核酸をリアルタイムに選択的に定量検出でき
る。
In recent years, a real-time quantitative detection method using PCR has been established (Taq Man PCR (Genome Res., 6 (10),
986 (1996)), ABI PRISM TM Sequence Detection Syste
m (Applied Biosystems)). This detection method is a method of measuring a nucleic acid using a specific fluorescently labeled probe (TaqMan probe), and its principle is as follows. That is, for example, a probe labeled with a reporter dye at the 5 ′ end and a quencher dye at the 3 ′ end and fluorescently labeled is used as the target DNA.
When a normal PCR reaction is carried out in the state of annealing, the probe is hydrolyzed from the 5 ′ end by the 5′-3 ′ exonuclease activity of the DNA polymerase as the extension reaction proceeds. As a result, the reporter dye at the 5 'end was separated from the quencher dye at the 3' end, thereby maintaining a certain spatial distance initially.
The FRET (Fluoresence Resonance Energy Transfer, a phenomenon of a decrease in the fluorescence intensity based on a decrease in the energy order of the reporter dye due to the resonance of both fluorescent dyes) disappears, and the fluorescence intensity of the reporter dye controlled by the quencher dye increases. By measuring the increase in the fluorescence intensity,
The target nucleic acid can be selectively quantitatively detected in real time.

【0009】この方法には、PCR反応後に増幅物を例え
ばアガロースゲル電気泳動して、泳動パターンを解析す
るなどの複雑な工程が不要となり、短時間で且つ同時に
多種のサンプルを定量できる利点がある。
[0009] This method has an advantage that a complicated process such as analyzing an electrophoresis pattern after a PCR reaction by, for example, amplifying an agarose gel and analyzing an electrophoresis pattern is not required, and it is possible to quantify various kinds of samples in a short time and simultaneously. .

【0010】一般に、臨床検査センターなどで臨床検査
を行う場合は、非常に多数の検体について限られた時間
内に検査をする必要があり、検査を効率良く行い得る手
法の開発が要望されており、上記リアルタイム検出法
は、この要望に合致するものとして期待できる。
In general, when conducting a clinical test at a clinical test center or the like, it is necessary to test a very large number of samples within a limited time, and there is a demand for the development of a method capable of performing the test efficiently. The real-time detection method described above can be expected to meet this demand.

【0011】本発明者らは、上記PCRによるリアルタイ
ム検出法に着目し、その薬物代謝の第I相反応に関与す
る酵素の検出への応用を着想した。即ち、かかる応用に
よって、同じ装置を用いて同一のPCR条件で多数の検体
を同時に検査でき、しかもこれによって各酵素の分子種
までも区別して測定、検出することが可能となると考え
た。
The present inventors have paid attention to the real-time detection method using PCR, and have conceived its application to the detection of an enzyme involved in the phase I reaction of drug metabolism. In other words, it was thought that such an application would allow simultaneous testing of a large number of specimens under the same PCR conditions using the same apparatus, and that this would allow the measurement and detection of the molecular species of each enzyme as well.

【0012】しかるに、現在知られている薬物代謝の第
I相反応に関与する酵素は、前述したとおり、非常に多
数であり、それぞれのmRNAの配列は、知られているもの
の、これらをターゲット遺伝子として、互いに重複する
配列部分を有さず、しかも同一PCR条件で充分に増幅し
得、更に、該ターゲット遺伝子の特定位置にハイブリダ
イズし得る各プライマー対としてのオリゴヌクレオチド
の検索自体困難であると考えられた。
However, currently known drug metabolism
As described above, the enzymes involved in the phase I reaction are extremely numerous, and although the sequences of the respective mRNAs are known, they have no target sequence and do not have overlapping sequence portions and are identical. It was considered that it was difficult to search for an oligonucleotide as each primer pair that could be sufficiently amplified under PCR conditions and that could hybridize to a specific position of the target gene.

【0013】また、かかるプライマー対に挟まれた特定
領域に、同一PCR条件下にこれらのプライマーよりも早
くハイブリダイズし得、しかも薬物代謝の第I相反応に
関与する各酵素に対して特異的なプローブの構築もま
た、同様に困難であると考えられた。
[0013] In addition, the primer can hybridize to a specific region sandwiched by such a primer pair faster than these primers under the same PCR conditions, and is specific for each enzyme involved in the phase I reaction of drug metabolism. Construction of a suitable probe was also considered difficult.

【0014】特に、ヌクレオチド配列が既知の2つの核
酸のハイブリダイズのし易さは、融点(Tm)の計算により
ある程度推定することはできるものの、この推定によっ
て選択したプライマーとプローブとの組合せが、必ずし
もDNA測定において好結果をもたらすわけではないこと
が知られており、現在知られている薬物代謝の第I相反
応に関与する多種の酵素について、これらを同時に区別
して測定可能な、上記PCRによるリアルタイム検出用の
各プライマー対とプローブとの組合せの選択には、熟練
者の試行錯誤による多大な実験などが必要となると予想
された。
In particular, the ease of hybridization between two nucleic acids whose nucleotide sequences are known can be estimated to some extent by calculating the melting point (Tm), but the combination of the primer and probe selected based on this estimation is It is known that good results are not necessarily obtained in DNA measurement, and it is possible to simultaneously distinguish and measure various enzymes involved in the currently known phase I reaction of drug metabolism by the above-mentioned PCR. It was expected that selection of a combination of each primer pair and probe for real-time detection would require a great deal of experimentation by trial and error of a skilled person.

【0015】[0015]

【発明が解決しようとする課題】本発明の目的は、薬物
代謝の第I相反応に関与する酵素のPCRによる測定法、特
にリアルタイム検出法の確立と、そのためのプローブお
よびプライマー対を提供することにある。
SUMMARY OF THE INVENTION An object of the present invention is to establish a method for measuring enzymes involved in the phase I reaction of drug metabolism by PCR, in particular, to establish a real-time detection method, and to provide a probe and primer pair therefor. It is in.

【0016】[0016]

【課題を解決するための手段】本発明者は、上記目的よ
り薬物代謝の第I相反応に関与する多種の酵素につい
て、多大な実験、研究を繰返し行った結果、上記酵素の
内の39種に対する目的プライマー対およびプローブの組
合せを提供するに成功し、ここに本発明を完成するに至
った。
Means for Solving the Problems The present inventor repeatedly conducted extensive experiments and studies on various enzymes involved in the phase I reaction of drug metabolism for the above purpose, and as a result, 39 of the above enzymes were identified. The present invention succeeded in providing a target primer pair and a probe combination for the present invention, and thereby completed the present invention.

【0017】本発明は、薬物代謝の第I相反応に関与す
る酵素の測定に用いられるプローブであって、下記(1)
〜(53)に示される領域のいずれかにハイブリダイズする
オリゴヌクレオチドからなる群から選ばれるプローブ;
特にリポーター色素とクエンチャー色素とが結合してい
る該プローブ;塩基配列の長さが20-40の範囲にある該
プローブ;配列番号1〜配列番号53に示される配列のい
ずれかを含む該プローブ;並びに配列番号1〜配列番号5
3に示される配列のいずれかである該プローブを提供す
る。 (1)EPHX1遺伝子の222-248領域 (2)EPHX2遺伝子の174-203領域 (3)PIG3遺伝子の767-796領域 (4)NMOR2遺伝子の50-77領域 (5)MAOA遺伝子の853-881領域 (6)MAOB遺伝子の1491-1519領域 (7)PTGS1遺伝子の1088-1115領域 (8)PTGS2遺伝子の830-855領域 (9)DPYD遺伝子の2345-2370領域 (10)AOX1遺伝子の3500-3527領域 (11)XDH遺伝子の3504-3533領域 (12)CEL遺伝子の468-493領域 (13)CES1遺伝子の976-1005領域 (14)CES2遺伝子の328-354領域 (15)AADAC遺伝子の86-113領域 (16)GZMA遺伝子の326-353領域 (17)GZMB遺伝子の276-301領域 (18)IL17遺伝子の99-126領域 (19)LIPA遺伝子の253-282領域 (20)NTE遺伝子の3670-3697領域 (21)UCHL1遺伝子の255-280領域 (22)UCHL3遺伝子の105-134領域 (23)FMO1遺伝子の728-755領域 (24)FMO2遺伝子の727-750領域 (25)FMO2遺伝子の1117-1143領域 (26)FMO3遺伝子の735-763領域 (27)FMO4遺伝子の1326-1351領域 (28)FMO5遺伝子の1111-1138領域 (29)ALDH1遺伝子の381-407領域 (30)ALDH2遺伝子の1204-1228領域 (31)ALDH3遺伝子の461-488領域 (32)ALDH3遺伝子の1094-1121領域 (33)ALDH4遺伝子の823-848領域 (34)ALDH5遺伝子の1212-1236領域 (35)ALDH6遺伝子の1413-1439領域 (36)ALDH7遺伝子の790-816領域 (37)ALDH8遺伝子の95-122領域 (38)ALDH9遺伝子の481-504領域 (39)ALDH10遺伝子の563-588領域 (40)ADH1遺伝子の168-197領域 (41)ADH1遺伝子の298-333領域 (42)ADH2遺伝子の144-173領域 (43)ADH2遺伝子の438-467領域 (44)ADH3遺伝子の102-131領域 (45)ADH3遺伝子の939-966領域 (46)ADH4遺伝子の927-956領域 (47)ADH5遺伝子の322-351領域 (48)ADH5遺伝子の616-641領域 (49)ADH6遺伝子の912-939の領域 (50)ADH7遺伝子の745-772の領域 (51)ESD遺伝子の451-476の領域(ジーンバンク登録番号M
13450の配列に基づく、以下同じ) (52)HADH2遺伝子の483-509の領域 (53)HEP27遺伝子の610-584の領域 また、本発明は、下記(1)〜(53)のいずれかに示される
各領域にハイブリダイズするオリゴヌクレオチドからな
るフォワードプライマー、プローブおよびリバースプラ
イマーの組合せを含む、薬物代謝の第I相反応に関与す
る酵素の測定キット;特にプローブが更にリポーター色
素とクエンチャー色素とを結合させたものである上記測
定キットを提供する。 (1)フォワードプライマー;EPHX1遺伝子の200-220領
域、プローブ;同遺伝子の222-248領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の302-281領域、 (2)フォワードプライマー;EPHX2遺伝子の145-165領
域、プローブ;同遺伝子の174-203領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の237-217領域、 (3)フォワードプライマー;PIG3遺伝子の743-763領域、
プローブ;同遺伝子の767-796領域およびリバースプラ
イマー;同遺伝子の858-838領域、 (4)フォワードプライマー;NMOR2遺伝子の26-46領域、
プローブ;同遺伝子の50-77領域およびリバースプライ
マー;同遺伝子の101-80領域、 (5)フォワードプライマー;MAOA遺伝子の827-849領域、
プローブ;同遺伝子の853-881領域およびリバースプラ
イマー;同遺伝子の919-898領域、 (6)フォワードプライマー;MAOB遺伝子の1440-1461領
域、プローブ;同遺伝子の1491-1519領域およびリバー
スプライマー;同遺伝子の1555-1535領域、 (7)フォワードプライマー;PTGS1遺伝子の1066-1086領
域、プローブ;同遺伝子の1088-1115領域およびリバー
スプライマー;同遺伝子の1187-1167領域、 (8)フォワードプライマー;PTGS2遺伝子の792-813領
域、プローブ;同遺伝子の830-855領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の928-908領域、 (9)フォワードプライマー;DPYD遺伝子の2321-2341領
域、プローブ;同遺伝子の2345-2370領域およびリバー
スプライマー;同遺伝子の2399-2379領域、 (10)フォワードプライマー;AOX1遺伝子の3464-3484領
域、プローブ;同遺伝子の3500-3527領域およびリバー
スプライマー;同遺伝子の3585-3564領域、 (11)フォワードプライマー;XDH遺伝子の3446-3468領
域、プローブ;同遺伝子の3504-3533領域およびリバー
スプライマー;同遺伝子の3562-3540領域、 (12)フォワードプライマー;CEL遺伝子の429-451領域、
プローブ;同遺伝子の468-493領域およびリバースプラ
イマー;同遺伝子の555-533領域、 (13)フォワードプライマー;CES1遺伝子の935-956領
域、プローブ;同遺伝子の976-1005領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の1061-1041領域、 (14)フォワードプライマー;CES2遺伝子の298-319領
域、プローブ;同遺伝子の328-354領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の383-362領域、 (15)フォワードプライマー;AADAC遺伝子の63-83領域、
プローブ;同遺伝子の86-113領域およびリバースプライ
マー;同遺伝子の206-185領域、 (16)フォワードプライマー;GZMA遺伝子の304-324領
域、プローブ;同遺伝子の326-353領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の433-413領域、 (17)フォワードプライマー;GZMB遺伝子の253-274領
域、プローブ;同遺伝子の276-301領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の350-328領域、 (18)フォワードプライマー;IL17遺伝子の68-88領域、
プローブ;同遺伝子の99-126領域およびリバースプライ
マー;同遺伝子の163-142領域、 (19)フォワードプライマー;LIPA遺伝子の226-248領
域、プローブ;同遺伝子の253-282領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の347-327領域、 (20)フォワードプライマー;NTE遺伝子の3634-3655領
域、プローブ;同遺伝子の3670-3697領域およびリバー
スプライマー;同遺伝子の3747-3725領域、 (21)フォワードプライマー;UCHL1遺伝子の233-253領
域、プローブ;同遺伝子の255-280領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の306-285領域、 (22)フォワードプライマー;UCHL3遺伝子の76-97領域、
プローブ;同遺伝子の105-134領域およびリバースプラ
イマー;同遺伝子の164-140領域、 (23)フォワードプライマー;FMO1遺伝子の696-716領
域、プローブ;同遺伝子の728-755領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の790-769領域、 (24)フォワードプライマー;FMO2遺伝子の705-725領
域、プローブ;同遺伝子の727-750領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の826-806領域、 (25)フォワードプライマー;FMO2遺伝子の1077-1097領
域、プローブ;同遺伝子の1117-1143領域およびリバー
スプライマー;同遺伝子の1165-1145領域、 (26)フォワードプライマー;FMO3遺伝子の706-726領
域、プローブ;同遺伝子の735-763領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の844-823領域、 (27)フォワードプライマー;FMO4遺伝子の1297-1317領
域、プローブ;同遺伝子の1326-1351領域およびリバー
スプライマー;同遺伝子の1422-1401領域、 (28)フォワードプライマー;FMO5遺伝子の1063-1084領
域、プローブ;同遺伝子の1111-1138領域およびリバー
スプライマー;同遺伝子の1162-1141領域、 (29)フォワードプライマー;ALDH1遺伝子の359-379領
域、プローブ;同遺伝子の381-407領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の494-472領域、 (30)フォワードプライマー;ALDH2遺伝子の1179-1199領
域、プローブ;同遺伝子の1204-1228領域およびリバー
スプライマー;同遺伝子の1307-1285領域、 (31)フォワードプライマー;ALDH3遺伝子の422-442領
域、プローブ;同遺伝子の461-488領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の549-528領域、 (32)フォワードプライマー;ALDH3遺伝子の1058-1078領
域、プローブ;同遺伝子の1094-1121領域およびリバー
スプライマー;同遺伝子の1194-1174領域、 (33)フォワードプライマー;ALDH4遺伝子の768-788領
域、プローブ;同遺伝子の823-848領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の967-947領域、 (34)フォワードプライマー;ALDH5遺伝子の1183-1206領
域、プローブ;同遺伝子の1212-1236領域およびリバー
スプライマー;同遺伝子の1261-1241領域、 (35)フォワードプライマー;ALDH6遺伝子の1382-1404領
域、プローブ;同遺伝子の1413-1439領域およびリバー
スプライマー;同遺伝子の1466-1445領域、 (36)フォワードプライマー;ALDH7遺伝子の743-764領
域、プローブ;同遺伝子の790-816領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の878-858領域、 (37)フォワードプライマー;ALDH8遺伝子の55-75領域、
プローブ;同遺伝子の95-122領域およびリバースプライ
マー;同遺伝子の182-162領域、 (38)フォワードプライマー;ALDH9遺伝子の459-479領
域、プローブ;同遺伝子の481-504領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の534-513領域、 (39)フォワードプライマー;ALDH10遺伝子の525-546領
域、プローブ;同遺伝子の563-588領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の644-623領域、 (40)フォワードプライマー;ADH1遺伝子の94-115領域、
プローブ;同遺伝子の168-197領域およびリバースプラ
イマー;同遺伝子の365-345領域、 (41)フォワードプライマー;ADH1遺伝子の261-281領
域、プローブ;同遺伝子の298-333領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の365-345領域、 (42)フォワードプライマー;ADH2遺伝子の94-115領域、
プローブ;同遺伝子の144-173領域およびリバースプラ
イマー;同遺伝子の431-411領域、 (43)フォワードプライマー;ADH2遺伝子の411-431領
域、プローブ;同遺伝子の438-467領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の518-496領域、 (44)フォワードプライマー;ADH3遺伝子の72-93領域、
プローブ;同遺伝子の102-131領域およびリバースプラ
イマー;同遺伝子の167-144領域、 (45)フォワードプライマー;ADH3遺伝子の743-763領
域、プローブ;同遺伝子の939-966領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の1113-1091領域、 (46)フォワードプライマー;ADH4遺伝子の903-924領
域、プローブ;同遺伝子の927-956領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の984-964領域、 (47)フォワードプライマー;ADH5遺伝子の289-310領
域、プローブ;同遺伝子の322-351領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の495-474領域、 (48)フォワードプライマー;ADH5遺伝子の564-585領
域、プローブ;同遺伝子の616-641領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の676-656領域。 (49)フォワードプライマー;ADH6遺伝子の889-910領
域、プローブ;同遺伝子の912-939領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の987-967領域。 (50)フォワードプライマー;ADH7遺伝子の722-743領
域、プローブ;同遺伝子の745-772領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の802-781領域。 (51)フォワードプライマー;ESD遺伝子の427-447領域、
プローブ;同遺伝子の451-476領域およびリバースプラ
イマー;同遺伝子の519-497領域(ジーンバンク登録番号
M13450の配列に基づく、以下同じ)。 (52)フォワードプライマー;HADH2遺伝子の451-471領
域、プローブ;同遺伝子の483-509領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の539-519領域。 (53)フォワードプライマー;HEP27遺伝子の505-526領
域、プローブ;同遺伝子の610-584領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の635-615領域。
The present invention relates to a probe used for measuring an enzyme involved in a phase I reaction of drug metabolism.
A probe selected from the group consisting of oligonucleotides that hybridize to any of the regions shown in (53);
In particular, the probe in which a reporter dye and a quencher dye are bound; the probe having a base sequence length in the range of 20 to 40; the probe including any of the sequences shown in SEQ ID NOS: 1 to 53 ; And SEQ ID NOS: 1 to 5
3. The probe is provided which is any of the sequences shown in 3. (1) 222-248 region of EPHX1 gene (2) 174-203 region of EPHX2 gene (3) 767-796 region of PIG3 gene (4) 50-77 region of NMOR2 gene (5) 853-881 region of MAOA gene (6) MAOB gene 1491-1519 region (7) PTGS1 gene 1088-1115 region (8) PTGS2 gene 830-855 region (9) DPYD gene 2345-2370 region (10) AOX1 gene 3500-3527 region (11) XDH gene 3504-3533 region (12) CEL gene 468-493 region (13) CES1 gene 976-1005 region (14) CES2 gene 328-354 region (15) AADAC gene 86-113 region (16) GZMA gene 326-353 region (17) GZMB gene 276-301 region (18) IL17 gene 99-126 region (19) LIPA gene 253-282 region (20) NTE gene 3670-3697 region (21) 255-280 region of UCHL1 gene (22) 105-134 region of UCHL3 gene (23) 728-755 region of FMO1 gene (24) 727-750 region of FMO2 gene (25) 1117-1143 region of FMO2 gene (26) FMO3 gene 735-763 region (27) FMO4 gene 1326-1351 region (28) FMO5 gene 1111-1138 region (29) ALDH1 gene 381-407 region (3 0) ALDH2 gene 1204-1228 region (31) ALDH3 gene 461-488 region (32) ALDH3 gene 1094-1121 region (33) ALDH4 gene 823-848 region (34) ALDH5 gene 1212-1236 region ( (35) ALDH6 gene 1413-1439 region (36) ALDH7 gene 790-816 region (37) ALDH8 gene 95-122 region (38) ALDH9 gene 481-504 region (39) ALDH10 gene 563-588 region ( 40) 168-197 region of ADH1 gene (41) 298-333 region of ADH1 gene (42) 144-173 region of ADH2 gene (43) 438-467 region of ADH2 gene (44) 102-131 region of ADH3 gene ( 45) ADH3 gene 939-966 region (46) ADH4 gene 927-956 region (47) ADH5 gene 322-351 region (48) ADH5 gene 616-641 region (49) ADH6 gene 912-939 region (50) Region 745-772 of the ADH7 gene (51) Region 451-476 of the ESD gene (Genebank accession number M
(52) The region of 483-509 of the HADH2 gene (53) The region of 610-584 of the HEP27 gene Also, the present invention shows any of the following (1) to (53) A kit for measuring an enzyme involved in the phase I reaction of drug metabolism, comprising a combination of a forward primer, a probe and a reverse primer consisting of an oligonucleotide hybridizing to each region to be treated; in particular, the probe further comprises a reporter dye and a quencher dye. The present invention provides the above-mentioned measurement kit which is bound. (1) forward primer; 200-220 region of EPHX1 gene, probe; 222-248 region and reverse primer of the gene; 302-281 region of the gene; (2) forward primer; 145-165 region of EPHX2 gene, probe 174-203 region and reverse primer of the same gene; 237-217 region of the same gene; (3) forward primer; 743-763 region of PIG3 gene;
Probe; 767-796 region and reverse primer of the same gene; 858-838 region of the same gene; (4) forward primer; 26-46 region of the NMOR2 gene;
Probe; 50-77 region and reverse primer of the same gene; 101-80 region of the same gene; (5) forward primer; 827-849 region of the MAOA gene;
Probe; 853-881 region and reverse primer of the same gene; 919-898 region of the same gene; (6) forward primer; 1440-1461 region of the MAOB gene; probe; 1491-1519 region of the same gene and reverse primer; 1555-1535 region of (7) forward primer; 1066-1086 region of PTGS1 gene, probe; 1088-1115 region and reverse primer of the same gene; 1187-1167 region of the same gene; (8) forward primer; PTGS2 gene 792-813 region, probe; 830-855 region and reverse primer of the same gene; 928-908 region of the same gene; (9) forward primer; 2321-2341 region of the DPYD gene, probe; Reverse primer; 2399-2379 region of the same gene; (10) forward primer; AOX1 gene 3464-3484 region; probe; 3500-3527 region of the same gene and reverse Limer; 3585-3564 region of the same gene; (11) forward primer; 3446-3468 region of the XDH gene; probe; 3504-3533 region of the same gene and reverse primer; 3562-3540 region of the same gene; (12) forward primer 429-451 region of the CEL gene;
Probe; 468-493 region and reverse primer of the same gene; 555-533 region of the same gene; (13) forward primer; 935-956 region of the CES1 gene; probe; 976-1005 region of the same gene and reverse primer; the same gene 1061-1041 region of (14) forward primer; 298-319 region of CES2 gene, probe; 328-354 region and reverse primer of the same gene; 383-362 region of the same gene; (15) forward primer; 63-83 region,
Probe; 86-113 region and reverse primer of the same gene; 206-185 region of the same gene; (16) forward primer; 304-324 region of the GZMA gene; probe; 326-353 region and reverse primer of the same gene; 433-413 region of (17) forward primer; 253-274 region of GZMB gene, probe; 276-301 region and reverse primer of the same gene; 350-328 region of the same gene; (18) forward primer; 68-88 area,
Probe; 99-126 region and reverse primer of the same gene; 163-142 region of the same gene; (19) forward primer; 226-248 region of the LIPA gene; probe; 253-282 region of the same gene and reverse primer; 347-327 region of (20) forward primer; 3634-3655 region of NTE gene; probe; 3670-3697 region of gene and reverse primer; 3747-3725 region of same gene; (21) forward primer; of UCHL1 gene 233-253 region, probe; 255-280 region and reverse primer of the same gene; 306-285 region of the same gene; (22) forward primer; 76-97 region of the UCHL3 gene;
Probe; 105-134 region and reverse primer of the same gene; 164-140 region of the same gene; (23) forward primer; 696-716 region of the FMO1 gene; probe; 728-755 region of the same gene and reverse primer; the same gene 790-769 region of (24) forward primer; 705-725 region of FMO2 gene, probe; 727-750 region of reverse gene and reverse primer; 826-806 region of same gene; (25) forward primer; of FMO2 gene 1077-1097 region, probe; 1117-1143 region and reverse primer of the same gene; 1165-1145 region of the same gene; (26) forward primer; 706-726 region of the FMO3 gene, probe; 735-763 region of the same gene and Reverse primer; 844-823 region of the gene; (27) forward primer; 1297-1317 region of FMO4 gene, probe; 1326-1351 region of the gene and reverse ply -; 1422-1401 region of the gene; (28) forward primer; 1063-1084 region of the FMO5 gene, probe; 1111-1138 region and reverse primer of the gene; 1162-1141 region of the gene; (29) forward primer Region 359-379 of the ALDH1 gene, probe; region 381-407 of the gene and a reverse primer; region 494-472 of the gene; (30) forward primer; region 1179-1199 of the ALDH2 gene, probe; 1204 of the gene -1228 region and reverse primer; 1307-1285 region of the same gene; (31) forward primer; 422-442 region of the ALDH3 gene; probe; 461-488 region of the same gene and reverse primer; 549-528 region of the same gene; (32) forward primer; 1058-1078 region of the ALDH3 gene, probe; 1094-1121 region and reverse primer of the gene; 1194-1174 region of the gene; (33) forward primer Primer: 768-788 region of the ALDH4 gene, probe; 823-848 region and reverse primer of the gene; 967-947 region of the gene; (34) forward primer; 1183-1206 region of the ALDH5 gene, probe; 1212-1236 region and reverse primer; 1261-1241 region of the same gene; (35) forward primer; 1382-1404 region of ALDH6 gene; probe; 1413-1439 region of the same gene and reverse primer; 1466-1445 region of the same gene (36) forward primer; 743-764 region of the ALDH7 gene, probe; 790-816 region and reverse primer of the same gene; 878-858 region of the same gene; (37) forward primer; 55-75 region of the ALDH8 gene;
Probe; 95-122 region and reverse primer of the same gene; 182-162 region of the same gene; (38) forward primer; 459-479 region of the ALDH9 gene; probe; 481-504 region and reverse primer of the same gene; 534-513 region, (39) forward primer; 525-546 region of the ALDH10 gene, probe; 563-588 region and reverse primer of the gene; 644-623 region of the gene; (40) forward primer; 94-115 region,
Probe; 168-197 region and reverse primer of the same gene; 365-345 region of the same gene; (41) forward primer; 261-281 region of the ADH1 gene; probe; 298-333 region of the same gene and reverse primer; the same gene 365-345 region of (42) forward primer; 94-115 region of ADH2 gene;
Probe; 144-173 region and reverse primer of the same gene; 431-411 region of the same gene; (43) forward primer; 411-431 region of the ADH2 gene; probe; 438-467 region of the same gene and reverse primer; 518-496 region of (44) forward primer; 72-93 region of ADH3 gene;
Probe; 102-131 region and reverse primer of the same gene; 167-144 region of the same gene; (45) forward primer; 743-763 region of the ADH3 gene; probe; 939-966 region of the same gene and reverse primer; 1113-1091 region of (46) forward primer; 903-924 region of ADH4 gene, probe; 927-956 region of the same gene and reverse primer; 984-964 region of the same gene; (47) forward primer; of ADH5 gene 289-310 region, probe; 322-351 region and reverse primer of the same gene; 495-474 region of the same gene; (48) forward primer; 564-585 region of the ADH5 gene, probe; 616-641 region of the same gene Reverse primer; 676-656 region of the same gene. (49) forward primer; region 889-910 of the ADH6 gene, probe; region 912-939 of the gene and a reverse primer; region 987-967 of the gene. (50) forward primer; 722-743 region of the ADH7 gene, probe; 745-772 region and reverse primer of the gene; 802-781 region of the gene. (51) forward primer; 427-447 region of the ESD gene,
Probe; 451-476 region of the gene and reverse primer; 519-497 region of the gene (Genebank accession number)
Based on the sequence of M13450, the same applies hereinafter). (52) Forward primer; 451-471 region of HADH2 gene, probe; 483-509 region and reverse primer of the gene; 539-519 region of the gene. (53) forward primer; 505-526 region of the HEP27 gene, probe; 610-584 region and reverse primer of the gene; 635-615 region of the gene.

【0018】上記測定キットを構成するフォワードプラ
イマー、プローブおよびリバースプライマーの組合せの
好ましいものとしては、下記(1)〜(53)に記載の各配列
番号で示される配列を含むオリゴヌクレオチドの組合
せ、より好ましくは各配列番号で示される配列のオリゴ
ヌクレオチドの組合せを挙げることができる。 (1)フォワードプライマー;配列番号54、プローブ;配
列番号1およびリバースプライマー;配列番号55、 (2)フォワードプライマー;配列番号56、プローブ;配
列番号2およびリバースプライマー;配列番号57、 (3)フォワードプライマー;配列番号58、プローブ;配
列番号3およびリバースプライマー;配列番号59、 (4)フォワードプライマー;配列番号60、プローブ;配
列番号4およびリバースプライマー;配列番号61、 (5)フォワードプライマー;配列番号62、プローブ;配
列番号5およびリバースプライマー;配列番号63、 (6)フォワードプライマー;配列番号64、プローブ;配
列番号6およびリバースプライマー;配列番号65、 (7)フォワードプライマー;配列番号66、プローブ;配
列番号7およびリバースプライマー;配列番号67、 (8)フォワードプライマー;配列番号68、プローブ;配
列番号8およびリバースプライマー;配列番号69 (9)フォワードプライマー;配列番号70、プローブ;配
列番号9およびリバースプライマー;配列番号71、 (10)フォワードプライマー;配列番号72、プローブ;配
列番号10およびリバースプライマー;配列番号73、 (11)フォワードプライマー;配列番号74、プローブ;配
列番号11およびリバースプライマー;配列番号75、 (12)フォワードプライマー;配列番号76、プローブ;配
列番号12およびリバースプライマー;配列番号77、 (13)フォワードプライマー;配列番号78、プローブ;配
列番号13およびリバースプライマー;配列番号79、 (14)フォワードプライマー;配列番号80、プローブ;配
列番号14およびリバースプライマー;配列番号81、 (15)フォワードプライマー;配列番号82、プローブ;配
列番号15およびリバースプライマー;配列番号83、 (16)フォワードプライマー;配列番号84、プローブ;配
列番号16およびリバースプライマー;配列番号85、 (17)フォワードプライマー;配列番号86、プローブ;配
列番号17およびリバースプライマー;配列番号87、 (18)フォワードプライマー;配列番号88、プローブ;配
列番号18およびリバースプライマー;配列番号89、 (19)フォワードプライマー;配列番号90、プローブ;配
列番号19およびリバースプライマー;配列番号91、 (20)フォワードプライマー;配列番号92、プローブ;配
列番号20およびリバースプライマー;配列番号93、 (21)フォワードプライマー;配列番号94、プローブ;配
列番号21およびリバースプライマー;配列番号95、 (22)フォワードプライマー;配列番号96、プローブ;配
列番号22およびリバースプライマー;配列番号97、 (23)フォワードプライマー;配列番号98、プローブ;配
列番号23およびリバースプライマー;配列番号99、 (24)フォワードプライマー;配列番号100、プローブ;
配列番号24およびリバースプライマー;配列番号101、 (25)フォワードプライマー;配列番号102、プローブ;
配列番号25およびリバースプライマー;配列番号103、 (26)フォワードプライマー;配列番号104、プローブ;
配列番号26およびリバースプライマー;配列番号105、 (27)フォワードプライマー;配列番号106、プローブ;
配列番号27およびリバースプライマー;配列番号107、 (28)フォワードプライマー;配列番号108、プローブ;
配列番号28およびリバースプライマー;配列番号109、 (29)フォワードプライマー;配列番号110、プローブ;
配列番号29およびリバースプライマー;配列番号111、 (30)フォワードプライマー;配列番号112、プローブ;
配列番号30およびリバースプライマー;配列番号113、 (31)フォワードプライマー;配列番号114、プローブ;
配列番号31およびリバースプライマー;配列番号115、 (32)フォワードプライマー;配列番号116、プローブ;
配列番号32およびリバースプライマー;配列番号117、 (33)フォワードプライマー;配列番号118、プローブ;
配列番号33およびリバースプライマー;配列番号119、 (34)フォワードプライマー;配列番号120、プローブ;
配列番号34およびリバースプライマー;配列番号121、 (35)フォワードプライマー;配列番号122、プローブ;
配列番号35およびリバースプライマー;配列番号123、 (36)フォワードプライマー;配列番号124、プローブ;
配列番号36およびリバースプライマー;配列番号125、 (37)フォワードプライマー;配列番号126、プローブ;
配列番号37およびリバースプライマー;配列番号127、 (38)フォワードプライマー;配列番号128、プローブ;
配列番号38およびリバースプライマー;配列番号129、 (39)フォワードプライマー;配列番号130、プローブ;
配列番号39およびリバースプライマー;配列番号131、 (40)フォワードプライマー;配列番号132、プローブ;
配列番号40およびリバースプライマー;配列番号133、 (41)フォワードプライマー;配列番号134、プローブ;
配列番号41およびリバースプライマー;配列番号135、 (42)フォワードプライマー;配列番号136、プローブ;
配列番号42およびリバースプライマー;配列番号137、 (43)フォワードプライマー;配列番号138、プローブ;
配列番号43およびリバースプライマー;配列番号139、 (44)フォワードプライマー;配列番号140、プローブ;
配列番号44およびリバースプライマー;配列番号141、 (45)フォワードプライマー;配列番号142、プローブ;
配列番号45およびリバースプライマー;配列番号143、 (46)フォワードプライマー;配列番号144、プローブ;
配列番号46およびリバースプライマー;配列番号145、 (47)フォワードプライマー;配列番号146、プローブ;
配列番号47およびリバースプライマー;配列番号147、 (48)フォワードプライマー;配列番号148、プローブ;
配列番号48およびリバースプライマー;配列番号149、 (49)フォワードプライマー;配列番号150、プローブ;
配列番号49およびリバースプライマー;配列番号151、 (50)フォワードプライマー;配列番号152、プローブ;
配列番号50およびリバースプライマー;配列番号153、 (51)フォワードプライマー;配列番号154、プローブ;
配列番号51およびリバースプライマー;配列番号155、 (52)フォワードプライマー;配列番号156、プローブ;
配列番号52およびリバースプライマー;配列番号157、 (53)フォワードプライマー;配列番号158、プローブ;
配列番号53およびリバースプライマー;配列番号159。
Preferred combinations of the forward primer, probe and reverse primer constituting the above-described assay kit include combinations of oligonucleotides containing the sequences represented by the respective SEQ ID NOs described in the following (1) to (53). Preferably, a combination of oligonucleotides having the sequence represented by each SEQ ID NO can be mentioned. (1) forward primer; SEQ ID NO: 54, probe; SEQ ID NO: 1 and reverse primer; SEQ ID NO: 55; (2) forward primer; SEQ ID NO: 56, probe; SEQ ID NO: 2 and reverse primer; SEQ ID NO: 57, (3) forward SEQ ID NO: 58, probe; SEQ ID NO: 3 and reverse primer; SEQ ID NO: 59, (4) forward primer; SEQ ID NO: 60, probe; SEQ ID NO: 4 and reverse primer; SEQ ID NO: 61, (5) forward primer; 62, probe; SEQ ID NO: 5 and reverse primer; SEQ ID NO: 63, (6) forward primer; SEQ ID NO: 64, probe; SEQ ID NO: 6 and reverse primer; SEQ ID NO: 65, (7) forward primer; SEQ ID NO: 66, probe; SEQ ID NO: 7 and reverse primer; SEQ ID NO: 67, (8) forward primer SEQ ID NO: 68, probe; SEQ ID NO: 8 and reverse primer; SEQ ID NO: 69 (9) forward primer; SEQ ID NO: 70, probe; SEQ ID NO: 9 and reverse primer; SEQ ID NO: 71, (10) forward primer; SEQ ID NO: 72, probe SEQ ID NO: 10 and reverse primer; SEQ ID NO: 73, (11) forward primer; SEQ ID NO: 74, probe; SEQ ID NO: 11 and reverse primer; SEQ ID NO: 75, (12) forward primer; SEQ ID NO: 76, probe; SEQ ID NO: 12 SEQ ID NO: 77, (13) forward primer; SEQ ID NO: 78, probe; SEQ ID NO: 13 and reverse primer; SEQ ID NO: 79, (14) forward primer; SEQ ID NO: 80, probe; SEQ ID NO: 14 and reverse primer; SEQ ID NO: 81, (15) forward primer; SEQ ID NO: 82, professional SEQ ID NO: 15 and reverse primer; SEQ ID NO: 83, (16) forward primer; SEQ ID NO: 84, probe; SEQ ID NO: 16 and reverse primer; SEQ ID NO: 85, (17) forward primer; SEQ ID NO: 86, probe; SEQ ID NO: SEQ ID NO: 87, (18) Forward primer; SEQ ID NO: 88, probe; SEQ ID NO: 18 and reverse primer; SEQ ID NO: 89, (19) Forward primer; SEQ ID NO: 90, probe; SEQ ID NO: 19 and reverse primer SEQ ID NO: 91, (20) forward primer; SEQ ID NO: 92, probe; SEQ ID NO: 20 and reverse primer; SEQ ID NO: 93, (21) forward primer; SEQ ID NO: 94, probe; SEQ ID NO: 21 and reverse primer; SEQ ID NO: 95 (22) forward primer; SEQ ID NO: 96, probe; SEQ ID NO: SEQ ID NO: 97, (23) forward primer; SEQ ID NO: 98, probe; SEQ ID NO: 23 and reverse primer; SEQ ID NO: 99, (24) forward primer; SEQ ID NO: 100, probe;
SEQ ID NO: 24 and reverse primer; SEQ ID NO: 101; (25) forward primer; SEQ ID NO: 102, probe;
SEQ ID NO: 25 and reverse primer; SEQ ID NO: 103; (26) forward primer; SEQ ID NO: 104, probe;
SEQ ID NO: 26 and reverse primer; SEQ ID NO: 105; (27) forward primer; SEQ ID NO: 106, probe;
SEQ ID NO: 27 and reverse primer; SEQ ID NO: 107, (28) forward primer; SEQ ID NO: 108, probe;
SEQ ID NO: 28 and reverse primer; SEQ ID NO: 109; (29) forward primer; SEQ ID NO: 110, probe;
SEQ ID NO: 29 and reverse primer; SEQ ID NO: 111; (30) forward primer; SEQ ID NO: 112, probe;
SEQ ID NO: 30 and reverse primer; SEQ ID NO: 113, (31) forward primer; SEQ ID NO: 114, probe;
SEQ ID NO: 31 and reverse primer; SEQ ID NO: 115, (32) forward primer; SEQ ID NO: 116, probe;
SEQ ID NO: 32 and reverse primer; SEQ ID NO: 117, (33) forward primer; SEQ ID NO: 118, probe;
SEQ ID NO: 33 and a reverse primer; SEQ ID NO: 119; (34) forward primer; SEQ ID NO: 120, probe;
SEQ ID NO: 34 and reverse primer; SEQ ID NO: 121, (35) forward primer; SEQ ID NO: 122, probe;
SEQ ID NO: 35 and reverse primer; SEQ ID NO: 123, (36) forward primer; SEQ ID NO: 124, probe;
SEQ ID NO: 36 and reverse primer; SEQ ID NO: 125, (37) forward primer; SEQ ID NO: 126, probe;
SEQ ID NO: 37 and reverse primer; SEQ ID NO: 127, (38) forward primer; SEQ ID NO: 128, probe;
SEQ ID NO: 38 and reverse primer; SEQ ID NO: 129, (39) forward primer; SEQ ID NO: 130, probe;
SEQ ID NO: 39 and reverse primer; SEQ ID NO: 131; (40) forward primer; SEQ ID NO: 132, probe;
SEQ ID NO: 40 and reverse primer; SEQ ID NO: 133, (41) forward primer; SEQ ID NO: 134, probe;
SEQ ID NO: 41 and reverse primer; SEQ ID NO: 135; (42) forward primer; SEQ ID NO: 136, probe;
SEQ ID NO: 42 and reverse primer; SEQ ID NO: 137; (43) forward primer; SEQ ID NO: 138, probe;
SEQ ID NO: 43 and reverse primer; SEQ ID NO: 139, (44) forward primer; SEQ ID NO: 140, probe;
SEQ ID NO: 44 and reverse primer; SEQ ID NO: 141, (45) forward primer; SEQ ID NO: 142, probe;
SEQ ID NO: 45 and reverse primer; SEQ ID NO: 143, (46) forward primer; SEQ ID NO: 144, probe;
SEQ ID NO: 46 and reverse primer; SEQ ID NO: 145; (47) forward primer; SEQ ID NO: 146, probe;
SEQ ID NO: 47 and a reverse primer; SEQ ID NO: 147, (48) forward primer; SEQ ID NO: 148, probe;
SEQ ID NO: 48 and reverse primer; SEQ ID NO: 149; (49) forward primer; SEQ ID NO: 150, probe;
SEQ ID NO: 49 and reverse primer; SEQ ID NO: 151, (50) forward primer; SEQ ID NO: 152, probe;
SEQ ID NO: 50 and reverse primer; SEQ ID NO: 153; (51) forward primer; SEQ ID NO: 154, probe;
SEQ ID NO: 51 and reverse primer; SEQ ID NO: 155; (52) forward primer; SEQ ID NO: 156, probe;
SEQ ID NO: 52 and a reverse primer; SEQ ID NO: 157; (53) forward primer; SEQ ID NO: 158, probe;
SEQ ID NO: 53 and reverse primer; SEQ ID NO: 159.

【0019】上記各組合せは、それぞれ以下の薬物代謝
の第I相反応に関与する酵素の測定用である。 (1)の組合せ;EPHX1測定用 (2)の組合せ;EPHX2測定用 (3)の組合せ;PIG3測定用 (4)の組合せ;NMOR2測定用 (5)の組合せ;MAOA測定用 (6)の組合せ;MAOB測定用 (7)の組合せ;PTGS1測定用 (8)の組合せ;PTGS2測定用 (9)の組合せ;DPYD測定用 (10)の組合せ;AOX1測定用 (11)の組合せ;XDH測定用 (12)の組合せ;CEL測定用 (13)の組合せ;CES1測定用 (14)の組合せ;CES2測定用 (15)の組合せ;AADAC測定用 (16)の組合せ;GZMA測定用 (17)の組合せ;GZMB測定用 (18)の組合せ;IL17測定用 (19)の組合せ;LIPA測定用 (20)の組合せ;NTE測定用 (21)の組合せ;UCHL1測定用 (22)の組合せ;UCHL3測定用 (23)の組合せ;FMO1測定用 (24)の組合せ;FMO2測定用 (25)の組合せ;FMO2測定用 (26)の組合せ;FMO3測定用 (27)の組合せ;FMO4測定用 (28)の組合せ;FMO5測定用 (29)の組合せ;ALDH1測定用 (30)の組合せ;ALDH2測定用 (31)の組合せ;ALDH3測定用 (32)の組合せ;ALDH3測定用 (33)の組合せ;ALDH4測定用 (34)の組合せ;ALDH5測定用 (35)の組合せ;ALDH6測定用 (36)の組合せ;ALDH7測定用 (37)の組合せ;ALDH8測定用 (38)の組合せ;ALDH9測定用 (39)の組合せ;ALDH10測定用 (40)の組合せ;ADH1測定用 (41)の組合せ;ADH1測定用 (42)の組合せ;ADH2測定用 (43)の組合せ;ADH2測定用 (44)の組合せ;ADH3測定用 (45)の組合せ;ADH3測定用 (46)の組合せ;ADH4測定用 (47)の組合せ;ADH5測定用 (48)の組合せ;ADH5測定用 (49)の組合せ;ADH6測定用 (50)の組合せ;ADH7測定用 (51)の組合せ;ESD測定用 (52)の組合せ;HADH2測定用 (53)の組合せ;HEP27測定用。
Each of the above combinations is used for measuring an enzyme involved in the following phase I reaction of drug metabolism. Combination of (1); for EPHX1 measurement (2) combination; for EPHX2 measurement (3) combination; for PIG3 measurement (4) combination; for NMOR2 measurement (5) combination; for MAOA measurement (6) combination For MAOB measurement (7) combination; For PTGS1 measurement (8) combination; For PTGS2 measurement (9) combination; For DPYD measurement (10) combination; For AOX1 measurement (11) combination; For XDH measurement ( Combination of 12); CEL measurement (13) combination; CES1 measurement (14) combination; CES2 measurement (15) combination; AADAC measurement (16) combination; GZMA measurement (17) combination; GZMB measurement combination (18) combination; IL17 measurement combination (19) combination; LIPA measurement combination (20) combination; NTE measurement combination (21) combination; UCHL1 measurement combination (22) combination; UCHL3 measurement combination (23 For FMO1 measurement Combination (24); For FMO2 measurement (25) combination; For FMO2 measurement (26) combination; For FMO3 measurement (27) combination; For FMO4 measurement (28) combination; FMO5 For measurement (29) combination; For ALDH1 measurement (30) combination; For ALDH2 measurement (31) combination Combination of (32) for ALDH3 measurement; Combination of (33) for measurement of ALDH3; Combination of (34) for measurement of ALDH4; Combination of (35) for measurement of ALDH5; Combination of (36) for measurement of ALDH6; Combination of (37); Combination of ALDH8 (38); Combination of ALDH9 (39); Combination of ALDH10 (40); Combination of ADH1 (41); Combination of ADH1 (42) For ADH2 measurement (43) combination; for ADH2 measurement (44) combination; for ADH3 measurement (45) combination; for ADH3 measurement (46) combination; for ADH4 measurement (47) combination; for ADH5 measurement ( 48) combination; for ADH5 measurement (49) combination; for ADH6 measurement (50) combination; for ADH7 measurement (51) combination; for ESD measurement (52) combination; for HADH2 measurement (53) combination; For HEP27 measurement.

【0020】本発明は、更に薬物代謝の第I相反応に関
与する酵素の遺伝子を含む検体について、前記いずれか
に記載の本発明測定キットを用いてポリメラーゼ連鎖反
応(PCR)を行い、用いたプローブの加水分解の有無を測
定することを特徴とする薬物代謝の第I相反応に関与す
る酵素の測定方法、特に上記加水分解の有無が、励起光
照射による蛍光の発色の有無によりなされる上記測定方
法を提供する。
In the present invention, a sample containing a gene of an enzyme involved in the phase I reaction of drug metabolism is further subjected to polymerase chain reaction (PCR) using the assay kit of the present invention described above. A method for measuring an enzyme involved in the phase I reaction of drug metabolism, characterized by measuring the presence or absence of hydrolysis of a probe, and in particular, the presence or absence of the hydrolysis is determined by the presence or absence of fluorescence by excitation light irradiation. Provide a measurement method.

【0021】該測定方法は、より好ましくは、フォーワ
ードプライマーおよびリバースプライマーのプライマー
対、並びにレポーター色素およびクエンチャー色素が結
合しており且つ上記両プライマーに挟まれた領域内で鋳
型核酸とハイブリダイズするプローブを用いて、5'-3'
エキソヌクレアーゼ活性を有するDNAポリメラーゼによ
りポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行う、リアルタイム検
出法によって実施される。
[0021] More preferably, the measuring method is such that a primer pair of a forward primer and a reverse primer, and a reporter dye and a quencher dye are bound to each other and hybridized with a template nucleic acid in a region sandwiched between both primers. 5'-3 '
It is performed by a real-time detection method in which a polymerase chain reaction (PCR) is performed by a DNA polymerase having exonuclease activity.

【0022】本発明に係わる上記リアルタイム検出法
は、同一PCR乃至RT-PCR反応条件下にリアルタイムで簡
便且つ迅速に、各種酵素を分別定量できるものであり、
その確立は、臨床分野、医薬品分野において非常に有益
である。
The real-time detection method according to the present invention is capable of separating and quantifying various enzymes easily and quickly in real time under the same PCR or RT-PCR reaction conditions.
Its establishment is very useful in the clinical and pharmaceutical fields.

【0023】即ち、該方法によれば、医薬品開発におけ
る動態試験において重要な位置を占める薬物代謝の第I
相反応に関与する酵素のヒト試料中でのmRNAの発現を容
易に定量することができ、これによって、医薬品などの
化学物質に曝露された場合の該第I相反応に関与する各
酵素の変化を知ることができる。また、該方法によれ
ば、迅速且つ多種の試料を同時に処理でき、また僅かな
組織片から抽出した全RNAを試料とすることもできるた
め、例えば、手術で摘出した組織やバイオプシーにより
摘出した組織中の該第I相反応に関与する酵素のmRNA発
現を検出、定量する方法として好適である。
In other words, according to the method, the I-position of drug metabolism, which is important in kinetic studies in drug development,
The expression of mRNA in a human sample of an enzyme involved in the phase reaction can be easily quantified, and thereby the change of each enzyme involved in the phase I reaction when exposed to a chemical substance such as a pharmaceutical product. You can know. In addition, according to the method, it is possible to process a variety of samples quickly and simultaneously, and it is also possible to use as a sample total RNA extracted from a small amount of tissue pieces, for example, tissues removed by surgery or tissues removed by biopsy This method is suitable as a method for detecting and quantifying the mRNA expression of an enzyme involved in the phase I reaction.

【0024】更に、特定の第I相反応に関与する酵素に
おいては、肝臓、腎臓などでの酵素誘導などによる発現
量の変化が血液中(血液に含まれる核を有する細胞)の
値の変化と相関する可能性が考えられるが、この血液中
の発現量は小さく、測定には多くの血液を必要とする。
しかるに、特定のプライマー対とプローブとを用いる本
発明方法によれば、少ない血液サンプル量で、既存の測
定機器を用いて、該血液中の発現量を容易に測定するこ
とができる。
[0024] Furthermore, in the enzymes involved in specific phase I reactions, changes in the expression level due to enzyme induction in the liver, kidney, etc., are caused by changes in the values in blood (cells having nuclei contained in blood). Although there is a possibility of correlation, the expression level in this blood is small, and a large amount of blood is required for measurement.
However, according to the method of the present invention using a specific primer pair and a probe, the expression level in the blood can be easily measured with a small amount of a blood sample using an existing measuring instrument.

【0025】また、特定の第I相反応に関与する酵素に
おいては、肝臓、腎臓などでの酵素誘導などによる発現
量の変化が唾液中などの分泌液中に含まれる核を有する
細胞の値の変化と相関する可能性も考えられるが、この
唾液中など分泌液中に含まれる核を有する細胞中の発現
量も僅かである。本発明方法は、かかる唾液などの分泌
液をサンプルとして、該分泌液中に含まれる核を有する
細胞中の発現量も、少ないサンプル量で、既存の機器を
用いて容易に測定可能である。
In addition, in the enzymes involved in a specific phase I reaction, changes in the expression level due to enzyme induction in the liver, kidney and the like are caused by changes in the value of cells having nuclei contained in secretions such as saliva. Although it is possible to correlate with the change, the expression level in cells having nuclei contained in secretions such as saliva is also small. According to the method of the present invention, the amount of expression in cells having nuclei contained in the secretion fluid can be easily measured with a small sample amount using existing equipment, using the secretion fluid such as saliva as a sample.

【0026】以下、本発明方法に利用するプローブおよ
びプライマー対につき詳述する。
Hereinafter, the probe and primer pair used in the method of the present invention will be described in detail.

【0027】これら各プローブおよびプライマーは、上
述した通り、薬物代謝の第I相反応に関与する酵素の遺
伝子の特定領域にハイブリダイズするオリゴヌクレオチ
ドから選択される。
As described above, each of these probes and primers is selected from oligonucleotides that hybridize to a specific region of a gene of an enzyme involved in the phase I reaction of drug metabolism.

【0028】ここで「ハイブリダイズする」とは、後述
するPCR(RT-PCR)の条件でハイブリダイズすることをい
う。
Here, "to hybridize" means to hybridize under the conditions of PCR (RT-PCR) described later.

【0029】本発明に係わるプローブおよびプライマー
に共通する要件としては、増幅生成物が約50-400塩基対
の長さであること、プライマーとプローブができる限り
近接していること、配列に含まれるG(グアニン)およ
びC(シトシン)の割合がなるべく50%前後であるこ
と、G(グアニン)が4つ以上連続していないことなどを
挙げることができる。また、他の要件としては、本発明
プローブではTm値が70℃前後であることを、本発明プラ
イマーでは、Tm値が60℃前後であることをそれぞれ挙げ
ることができる。
The common requirements of the probes and primers according to the present invention are that the amplification product is about 50-400 base pairs in length, that the primer and the probe are as close as possible, and that they are included in the sequence. The ratio of G (guanine) and C (cytosine) is about 50% as much as possible, and four or more G (guanine) are not continuous. Other requirements include that the probe of the present invention has a Tm value of about 70 ° C., and the primer of the present invention has a Tm value of about 60 ° C.

【0030】薬物代謝の第I相反応に関与する各酵素のm
RNAの配列は公知であり、それぞれジーンバンク(GenBa
nk)に以下の登録番号で登録されている。 (1)EPHX1遺伝子;NM#000120 (2)EPHX2遺伝子;NM#001979 (3)PIG3遺伝子;NM#004881 (4)NMOR2遺伝子;NM#000904 (5)MAOA遺伝子;NM#000240 (6)MAOB遺伝子;NM#000898 (7)PTGS1遺伝子;M59979 (8)PTGS2遺伝子;NM#000963 (9)DPYD遺伝子;NM#000110 (10)AOX1遺伝子;NM#001159 (11)XDH遺伝子;NM#000379 (12)CEL遺伝子;NM#001807 (13)CES1遺伝子;NM#001266 (14)CES2遺伝子;NM#003869 (15)AADAC遺伝子;NM#001086 (16)GZMA遺伝子;NM#006144 (17)GZMB遺伝子;NM#004131 (18)IL17遺伝子;NM#002190 (19)LIPA遺伝子;NM#000235 (20)NTE遺伝子;NM#006702 (21)UCHL1遺伝子;NM#004181 (22)UCHL3遺伝子;NM#006002 (23)FMO1遺伝子;NM#002021 (24)FMO2遺伝子;NM#001460 (25)FMO2遺伝子;NM#001460 (26)FMO3遺伝子;NM#006894 (27)FMO4遺伝子;NM#002022 (28)FMO5遺伝子;NM#001461 (29)ALDH1遺伝子;AF003341 (30)ALDH2遺伝子;NM#000690 (31)ALDH3遺伝子;NM#000691 (32)ALDH3遺伝子;NM#000691 (33)ALDH4遺伝子;NM#003748 (34)ALDH5遺伝子;NM#000692 (35)ALDH6遺伝子;NM#000693 (36)ALDH7遺伝子;NM#000694 (37)ALDH8遺伝子;NM#000695 (38)ALDH9遺伝子;NM#000696 (39)ALDH10遺伝子;NM#000382 (40)ADH1遺伝子;NM#000667 (41)ADH1遺伝子;NM#000667 (42)ADH2遺伝子;NM#000668 (43)ADH2遺伝子;NM#000668 (44)ADH3遺伝子;NM#000669 (45)ADH3遺伝子;NM#000669 (46)ADH4遺伝子;NM#000670 (47)ADH5遺伝子;NM#000671 (48)ADH5遺伝子;NM#000671 (49)ADH6遺伝子;NM#000672 (50)ADH7遺伝子;NM#000673 (51)ESD遺伝子;M13450 (52)HADH2遺伝子;NM#004493 (53)HEP27遺伝子;NM#005794。
M of each enzyme involved in the phase I reaction of drug metabolism
RNA sequences are known, and each gene bank (GenBank)
nk) with the following registration number. (1) EPHX1 gene; NM # 000120 (2) EPHX2 gene; NM # 001979 (3) PIG3 gene; NM # 004881 (4) NMOR2 gene; NM # 000904 (5) MAOA gene; NM # 000240 (6) MAOB gene NM # 000898 (7) PTGS1 gene; M59979 (8) PTGS2 gene; NM # 000963 (9) DPYD gene; NM # 000110 (10) AOX1 gene; NM # 001159 (11) XDH gene; NM # 000379 (12) CEL gene; NM # 001807 (13) CES1 gene; NM # 001266 (14) CES2 gene; NM # 003869 (15) AADAC gene; NM # 001086 (16) GZMA gene; NM # 006144 (17) GZMB gene; NM # 004131 (18) IL17 gene; NM # 002190 (19) LIPA gene; NM # 000235 (20) NTE gene; NM # 006702 (21) UCHL1 gene; NM # 004181 (22) UCHL3 gene; NM # 006002 (23) FMO1 NM # 002021 (24) FMO2 gene; NM # 001460 (25) FMO2 gene; NM # 001460 (26) FMO3 gene; NM # 006894 (27) FMO4 gene; NM # 002022 (28) FMO5 gene; NM # 001461 (29) ALDH1 gene; AF003341 (30) ALDH2 gene; NM # 000690 (31) ALDH3 gene; NM # 000691 (32) ALDH3 gene; NM # 000691 (33) ALDH4 gene; NM # 003748 (34) ALDH5 NM # 000692 (35) ALDH6 gene; NM # 000693 (36) ALDH7 gene; NM # 000694 (37) ALDH8 gene; NM # 000695 (38) ALDH9 gene; NM # 000696 (39) ALDH10 gene; NM # 000382 (40) ADH1 gene; NM # 000667 (41) ADH1 gene; NM # 000667 (42) ADH2 gene; NM # 000668 (43) ADH2 gene; NM # 000668 (44) ADH3 gene; NM # 000669 (45) ADH3 gene NM # 000669 (46) ADH4 gene; NM # 000670 (47) ADH5 gene; NM # 000671 (48) ADH5 gene; NM # 000671 (49) ADH6 gene; NM # 000672 (50) ADH7 gene; NM # 000673 ( 51) ESD gene; M13450 (52) HADH2 gene; NM # 004493 (53) HEP27 gene; NM # 005794.

【0031】本明細書において、各酵素の特定領域の表
示は、いずれも上記各登録番号で登録された遺伝子の配
列に従うものである。
In the present specification, the designation of the specific region of each enzyme is in accordance with the sequence of the gene registered with each of the above-mentioned registration numbers.

【0032】本発明に係わる各プライマーおよびプロー
ブ用のオリゴヌクレオチドのヌクレオチド数は、少なく
とも15個、通常15-50個、好ましくは20-40個の範囲にあ
るのがよい。これらプライマーおよびプローブのヌクレ
オチド数が上記よりあまりに多くなりすぎると、1本鎖D
NAにハイブリダイズしにくくなり、逆にあまりに小さす
ぎると、ハイブリダイゼーションの特異性が低下する。
The number of nucleotides of the oligonucleotides for each primer and probe according to the present invention is at least 15, usually 15 to 50, and preferably 20 to 40. If the number of nucleotides of these primers and probes becomes too large, the single-stranded D
It is difficult to hybridize to NA, and if too small, the specificity of hybridization is reduced.

【0033】プライマーおよびプローブの特定のヌクレ
オチド配列の好ましい具体的配列の例は、前述したとお
りであり、各分子種に応じてそれぞれ、配列番号1-53
(プローブの場合)並びに配列番号54-159(プライマー
の場合)に示される。
Examples of preferred specific sequences of the specific nucleotide sequences of the primers and the probes are as described above, and according to each molecular species, SEQ ID NOS: 1 to 53 are respectively used.
(For probes) and SEQ ID NOs: 54-159 (for primers).

【0034】尚、例えば20ヌクレオチドからなるプライ
マーまたはプローブは、鋳型鎖との間に少数のミスマッ
チが存在してもハイブリダイズし、PCRのプライマーと
してまたは検出用プローブとして機能し得ることが知ら
れている。従って本発明プライマーおよびプローブもま
た、上記の特定のヌクレオチド配列を有するものに限定
されず、該配列をその一部として含む配列や、この配列
中の例えば2個以下の、特に1個のヌクレオチドの置換、
欠失および/または付加による修飾のなされた配列であ
ることができる。
It is known that a primer or probe consisting of, for example, 20 nucleotides hybridizes even if a small number of mismatches exist with the template strand, and can function as a PCR primer or a detection probe. I have. Accordingly, the primers and probes of the present invention are also not limited to those having the specific nucleotide sequence described above, but include sequences containing the sequence as a part thereof, and, for example, two or less, particularly one nucleotide in this sequence. Replacement,
It may be a sequence modified by deletion and / or addition.

【0035】本発明プローブおよびプライマーとしての
各オリゴヌクレオチドは、常法に従い、自動合成機、例
えばDNAシンセサイザー(パーキンエルマー社)などを
用いて容易に合成することができる。かくして得られる
オリゴヌクレオチドは、更に必要に応じて、市販の精製
用カートリッジなどを用いて精製することもできる。
Each oligonucleotide as the probe and the primer of the present invention can be easily synthesized according to a conventional method using an automatic synthesizer, for example, a DNA synthesizer (Perkin Elmer). The oligonucleotide thus obtained can be further purified, if necessary, using a commercially available purification cartridge or the like.

【0036】本発明のリアルタイム検出用プローブは、
その一端、例えば5'-末端にレポーター色素を結合して
おり、そして他端、例えば3'-末端にクエンチャー色素
を結合している。レポーター色素は、例えば励起光の照
射によって蛍光を発する物質であり、クエンチャーは、
該レポーター色素に距離的に接近して存在する場合にレ
ポーター色素に作用してその蛍光の発生を消去する作用
を有するものであることができる。該レポーター色素の
例としては、例えば6-カルボキシ−フルオレッセイン(F
AM)、テトラクロロ-6-カルボキシフルオレッセイン(TE
T)、2,7-ジメトキシ-4,5-ジクロロ-6-カルボキシフルオ
レッセイン(JOE)、ヘキソクロロ-6-カルボキシフルオレ
ッセイン(HEX)などが挙げられる。クエンチャー色素の
例としては、例えば6-カルボキシ−テトラメチル−ロー
ダミン(TAMRA)などが挙げられる。
The probe for real-time detection of the present invention comprises:
A reporter dye is attached at one end, eg, the 5′-end, and a quencher dye is attached at the other end, eg, the 3′-end. The reporter dye is a substance that emits fluorescence when irradiated with excitation light, for example, and the quencher is
When present in close proximity to the reporter dye, it can act on the reporter dye to eliminate its fluorescence. Examples of such reporter dyes include, for example, 6-carboxy-fluorescein (F
AM), tetrachloro-6-carboxyfluorescein (TE
T), 2,7-dimethoxy-4,5-dichloro-6-carboxyfluorescein (JOE), hexochloro-6-carboxyfluorescein (HEX) and the like. Examples of quencher dyes include, for example, 6-carboxy-tetramethyl-rhodamine (TAMRA).

【0037】本発明プローブは、前記特定配列のプロー
ブ用オリゴヌクレオチドにレポーター色素およびクエン
チャー色素を結合させることにより調製できる。例えば
プローブの5'側には、通常数個のメチレン鎖をリンカー
とし、末端のリン酸基にFAM分子をリン酸エステルの形
で結合させることができる。また、3'側には、下に示す
構造単位を介してアミド結合によりTAMRA分子を結合さ
せ得る。
The probe of the present invention can be prepared by binding a reporter dye and a quencher dye to the probe oligonucleotide having the specific sequence. For example, a few methylene chains are usually used as a linker on the 5 'side of the probe, and a FAM molecule can be bound to a terminal phosphate group in the form of a phosphate ester. Further, a TAMRA molecule can be bound to the 3 ′ side by an amide bond via a structural unit shown below.

【0038】[0038]

【化1】 [Formula 1]

【0039】以下、本発明プライマー対およびプローブ
を利用したPCR検出法およびリアルタイム検出法につき
詳述する。
Hereinafter, a PCR detection method and a real-time detection method using the primer pair and the probe of the present invention will be described in detail.

【0040】本発明方法は、前述した本発明プライマー
対およびプローブを利用することを必須として、他は公
知のPCR法(例えば、Science, 230, 1350 (1985)参
照)、RT-PCR(Genome Res., 6(10), 986 (1996)参照)
など、特にリアルタイム検出法(例えばTaqMan PCR, AB
I PRISMTM 7700 SEQUENCE DETECTION SYSTEM, Applied
Biosystems, Ver1, June 1996参照)に従い実施するこ
とができる。
The method of the present invention requires the use of the above-described primer pair and probe of the present invention. Other methods are well-known PCR methods (see, for example, Science, 230, 1350 (1985)), and RT-PCR (Genome Res. ., 6 (10), 986 (1996))
Especially real-time detection methods (eg, TaqMan PCR, AB
I PRISMTM 7700 SEQUENCE DETECTION SYSTEM, Applied
Biosystems, Ver1, June 1996).

【0041】該方法は、特に本発明が対象とする薬物代
謝の第I相反応に関与する各酵素の発現量の測定方法と
して、mRNAを測定する場合に有用である。この場合、特
定酵素を発現している生体組織を採取し、常法に従って
全RNAを抽出し、次にそれに対して相補性のcDNAを常法
に従って合成した後、本発明プライマー対とプローブと
を用いて、PCRを行えばよい。また、常法に従って全RNA
を抽出後、本発明プライマーとプローブとを用いて、直
接RT-PCRを行なうこともできる。
This method is particularly useful when measuring mRNA as a method for measuring the expression level of each enzyme involved in the phase I reaction of drug metabolism targeted by the present invention. In this case, a living tissue expressing the specific enzyme is collected, total RNA is extracted according to a conventional method, and cDNA complementary thereto is synthesized according to a conventional method. And PCR may be performed. Also, according to the standard method, total RNA
After extraction, RT-PCR can also be directly performed using the primer and the probe of the present invention.

【0042】PCR反応およびRT-PCR反応は、基本的には
公知の方法に従うことができる。それらの反応条件も公
知の方法に準じて適宜決定することができ、特にこれら
の方法と異なるものではない。具体的には、後記実施例
に示す条件を好ましく採用できる。
The PCR reaction and the RT-PCR reaction can basically follow a known method. The reaction conditions can also be appropriately determined according to known methods, and are not particularly different from these methods. Specifically, the conditions described in the following examples can be preferably adopted.

【0043】リアルタイム検出法による検出も、基本的
には常法に従って、例えば、アルゴンレーザ光をPCR反
応液に照射し、放射される蛍光をCCDカメラを用いて検
出することにより行なうことができる。
The detection by the real-time detection method can also be performed basically according to a conventional method, for example, by irradiating the PCR reaction solution with an argon laser beam and detecting the emitted fluorescence using a CCD camera.

【0044】かくして、本発明方法の実施によって、所
期の薬物代謝の第I相反応に関与する各酵素を容易且つ
迅速に、しかも各酵素毎に区別して測定、検出すること
ができる。
Thus, by carrying out the method of the present invention, each enzyme involved in the intended phase I reaction of drug metabolism can be measured and detected easily and quickly, and separately for each enzyme.

【0045】本発明は、上記方法の実施のためのキット
をも提供する。このキットは本発明プライマー対および
プローブを含んでなる。本発明キットは、更に対照とし
て使用することのできる既知の核酸や、該核酸を測定す
るためのプライマー対およびプローブを含むことができ
る。
The present invention also provides a kit for performing the above method. This kit comprises the primer pair of the present invention and a probe. The kit of the present invention can further include a known nucleic acid that can be used as a control, and a primer pair and a probe for measuring the nucleic acid.

【0046】本発明方法によれば、薬物代謝の第I相反
応に関与する各酵素の遺伝子をその酵素毎に分別して測
定、検出できる。また、該酵素の定量を迅速に、精度よ
く行なうことができる。かくして、新薬の他剤との相互
作用や配合禁忌などに関連する基礎データを効率よく得
ることができる。
According to the method of the present invention, the genes of the enzymes involved in the phase I reaction of drug metabolism can be measured and detected separately for each enzyme. In addition, the enzyme can be quantified quickly and accurately. Thus, basic data relating to the interaction of the new drug with other drugs, contraindications, and the like can be efficiently obtained.

【0047】[0047]

【実施例】以下、本発明を更に詳しく説明するため試験
例および実施例を挙げる。
EXAMPLES Hereinafter, Test Examples and Examples will be given to explain the present invention in more detail.

【0048】[0048]

【試験例1】リアルタイム検出法による検量線の作成 (1)試験方法 本試験で採用したリアルタイムワンステップRT-PCR法
は、96ウエルを用いて、最大96の異なった反応を同時に
実施して、一度に最大96の検体を測定できるものであ
る。また、1チューブ内でRT反応とPCR反応とを行うこと
ができる。
[Test Example 1] Preparation of calibration curve by real-time detection method (1) Test method The real-time one-step RT-PCR method adopted in this test was performed simultaneously in a maximum of 96 different reactions using 96 wells. It can measure up to 96 samples at a time. Further, the RT reaction and the PCR reaction can be performed in one tube.

【0049】本定量の原理は、隣接した2種類の蛍光色
素を用いて、一方の色素(リポーター色素)の蛍光波長
と他方の色素(クエンチャー色素)の励起光波長との間
で、波長領域が重なる場合に生じるFRETの現象を利用し
ている。より詳しくはこの原理は次の通り説明できる。
即ち、FRETを生じる2種の蛍光色素を両末端に結合させ
たプローブ(TaqMan probe)は、PCRで増幅した特定の
薬物代謝の第I相反応に関与する酵素種に由来するcDNA
にハイブリダイゼーションし、この状態でPCRの伸長反
応が始まる。この反応系に、Taq DNAポリメラーゼを存
在させると、該ポリメラーゼの有する5'-3'エンドヌク
レアーゼ活性によってTaqManプローブが加水分解され
て、これに結合していたリポーター色素が脱離する。該
色素の脱離によれば、クエンチャー色素との間の物理的
距離が生じ、FRETによって抑制されていたリポーター色
素の蛍光強度が増加する。この蛍光強度の増加は、PCR
の増幅産物の増加量に比例する。該蛍光強度の増加をPC
R反応毎に測定すれば、所望の定量が可能となる。
The principle of this quantification is to use two types of fluorescent dyes adjacent to each other and to determine the wavelength range between the fluorescence wavelength of one dye (reporter dye) and the excitation light wavelength of the other dye (quencher dye). Utilizes the phenomenon of FRET that occurs when overlaps occur. More specifically, this principle can be explained as follows.
That is, a probe (TaqMan probe) in which two types of fluorescent dyes generating FRET are bound to both ends is a cDNA derived from an enzyme species involved in a phase I reaction of a specific drug metabolism amplified by PCR.
And elongation reaction of PCR starts in this state. When Taq DNA polymerase is present in this reaction system, the TaqMan probe is hydrolyzed by the 5'-3 'endonuclease activity of the polymerase, and the reporter dye bound thereto is eliminated. The elimination of the dye causes a physical distance from the quencher dye, and increases the fluorescence intensity of the reporter dye suppressed by FRET. This increase in fluorescence intensity
Is proportional to the amount of increase of the amplification product. Increase the fluorescence intensity to PC
If measurement is performed for each R reaction, desired quantification is possible.

【0050】本試験では、プローブの5'末端側にリポー
ター色素としてFAMを、3'末端側にクエンチャー色素と
してTAMRAを結合させたTaqManプローブを使用した。こ
れら各色素の結合およびこれによるTaqManプローブの作
成は、文献記載の方法(Genome Res., 6(10), 986 (199
6))に従った。
In this test, a TaqMan probe having FAM bound to the 5 'end of the probe as a reporter dye and TAMRA bound to the 3' end as a quencher dye was used. The binding of each of these dyes and the production of a TaqMan probe by this are performed by the method described in the literature (Genome Res., 6 (10), 986 (1992).
6)).

【0051】また、各プライマーおよびプローブとして
のオリゴヌクレオチドは、自動シンセサイザーとしてAB
I社製のDNA/RNA合成機を利用して、基質(dNTP)および
規定の試薬を用いて合成した。
Also, oligonucleotides as primers and probes are used as automatic synthesizers for AB.
Using a DNA / RNA synthesizer manufactured by Company I, synthesis was performed using a substrate (dNTP) and a specified reagent.

【0052】検体RNAとしては、成人の脳、成人の腎
臓、成人の肺、成人の小腸、胎児の肝臓および成人の肝
臓プールよりそれぞれ精製された全RNAを用いた。尚、
これらの全RNAはいずれもクローンテック社(Clontech
Laboratories, Inc.)より購入した。
As the sample RNA, total RNA purified from adult brain, adult kidney, adult lung, adult small intestine, fetal liver and adult liver pool was used. still,
All of these RNAs were obtained from Clontech.
Laboratories, Inc.).

【0053】成人の脳、成人の腎臓、成人の肺、成人の
小腸、胎児の肝臓および成人の肝臓プールより精製され
た全RNAは、RNaseフリーの水で希釈し、20μg/mLに調整
した。その後、これら6種類を等量ずつ混合し、検量線
作成用とした。以後は、50μg/mLのイーストtRNA(Yeas
t tRNA, GIBCO社製)を用いて、5倍公比で希釈した。測
定には5μLを使用した。
Total RNA purified from adult brain, adult kidney, adult lung, adult small intestine, fetal liver and adult liver pool was diluted with RNase-free water and adjusted to 20 μg / mL. Thereafter, these six types were mixed in equal amounts to prepare a calibration curve. Thereafter, 50 μg / mL yeast tRNA (Yeas
(t tRNA, manufactured by GIBCO) at a 5-fold common ratio. 5 μL was used for the measurement.

【0054】RT-PCR反応は、300nMフォーワードプライ
マー、900nMリバースプライマーおよび200nM TaqManプ
ローブを含むキット(TaqMan One-Step RT-PCR Master
Mix Reagents Kit, PE Applied Biosystems)を用い
て、50μL/チューブの系で、配列検出システム(ABI PR
ISMTM 7700 Sequence Detection System, PE Applied B
iosystems)にて行った。
The RT-PCR reaction was performed using a kit (TaqMan One-Step RT-PCR Master) containing 300 nM forward primer, 900 nM reverse primer and 200 nM TaqMan probe.
Using the Mix Reagents Kit, PE Applied Biosystems), the sequence detection system (ABI PR
ISM TM 7700 Sequence Detection System, PE Applied B
iosystems).

【0055】温度条件は、48℃で30分間および95℃で10
分間で保温した後、95℃で15秒間および60℃で1分間の
サイクルを50回行い、各サイクルごとに蛍光強度を測定
した。
The temperature conditions were 48 ° C. for 30 minutes and 95 ° C. for 10 minutes.
After incubating for 1 minute, the cycle of 95 ° C. for 15 seconds and 60 ° C. for 1 minute was performed 50 times, and the fluorescence intensity was measured for each cycle.

【0056】下記表2および表3に示す各酵素に対して各
配列番号に示される配列のプライマー対およびプローブ
を用いて行なった上記試験の結果(検量線)を表4およ
び表5に示す。
Tables 4 and 5 show the results (calibration curves) of the above-mentioned tests performed on each enzyme shown in Tables 2 and 3 below using a primer pair and a probe having the sequence shown in each SEQ ID NO.

【0057】[0057]

【表2】 [Table 2]

【0058】[0058]

【表3】 [Table 3]

【0059】[0059]

【表4】 [Table 4]

【0060】[0060]

【表5】 [Table 5]

【0061】上記表4および5に示す結果より、100000pg
全RNA/50μL反応液量から5倍公比で希釈された検量線を
作成したところ、EPHX1については、6.4pg全RNA/50μL
反応液量まで定量性を有しており、他の酵素についても
0.256pgから4000pg全RNAを定量限界とした検量線の相関
係数(r)は0.99以上であった。但し、IL17は0.93、ALD
H7は0.97であった。
From the results shown in Tables 4 and 5, 100,000 pg
When a calibration curve diluted 5 times the common ratio was prepared from the total RNA / 50 μL reaction volume, for EPHX1, 6.4 pg total RNA / 50 μL
It has quantitative properties up to the volume of the reaction solution,
The correlation coefficient (r) of the calibration curve using 0.256 pg to 4000 pg total RNA as the quantification limit was 0.99 or more. However, IL3 is 0.93, ALD
H7 was 0.97.

【0062】[0062]

【配列表】 SEQUENCE LISTING <110> Ostuka Pharmaceutical Factory Inc. <120> A method of detecting human phase I enzymes of drug-metabolizing and a probe and a kit therefor <130> 2FD01JP <150> JP 2000-267163 <151> 2000-09-04 <160> 159 <170> PatentIn Ver. 2.0 <210> 1 <211> 27 <212> DNA <213> human EPHX1 gene <400> 1 acctttggag gacagctgct tccacta 27 <210> 2 <211> 30 <212> DNA <213> human EPHX2 gene <400> 2 cacactttcc cagtggatac cactcatgga 30 <210> 3 <211> 30 <212> DNA <213> human PIG3 gene <400> 3 ttaagcgagg aagtctgatc accagtttgc 30 <210> 4 <211> 28 <212> DNA <213> human NMOR2 gene <400> 4 ctttcaacgg atccttgaag aatgtggc 28 <210> 5 <211> 29 <212> DNA <213> human MAOA gene <400> 5 ccagagcttc cagcagagag aaaccagtt 29 <210> 6 <211> 29 <212> DNA <213> human MAOB gene <400> 6 attgaccacc atcttttcag caacggctc 29 <210> 7 <211> 28 <212> DNA <213> human PTGS1 gene <400> 7 agctgctgtt cggtgtccag ttccaata 28 <210> 8 <211> 26 <212> DNA <213> human PTGS2 gene <400> 8 tctttggtct ggtgcctggt ctgatg 26 <210> 9 <211> 26 <212> DNA <213> human DPYD gene <400> 9 ctcgtgctct gcctggattt cccatt 26 <210> 10 <211> 28 <212> DNA <213> human AOX1 gene <400> 10 cctgttccga ggttgaaata gactgcct 28 <210> 11 <211> 30 <212> DNA <213> human XDH gene <400> 11 aacaggagat cataagaacc tccgcacaga 30 <210> 12 <211> 26 <212> DNA <213> human CEL gene <400> 12 cggaaacgtc atcgtggtca ccttca 26 <210> 13 <211> 30 <212> DNA <213> human CES1 gene <400> 13 atgctgctgc tgaaaacacc tgaagagctt 30 <210> 14 <211> 27 <212> DNA <213> human CES2 gene <400> 14 ttcaacatga ccttcccttc cgactcc 27 <210> 15 <211> 28 <212> DNA <213> human AADAC gene <400> 15 agccatggag aatgatgtgg ataaacgc 28 <210> 16 <211> 28 <212> DNA <213> human GZMA gene <400> 16 ccacacgcga aggtgacctt aaactttt 28 <210> 17 <211> 26 <212> DNA <213> human GZMB gene <400> 17 aagacccatc ccccatccag cctata 26 <210> 18 <211> 28 <212> DNA <213> human IL17 gene <400> 18 cccaaattct gaggacaaga acttcccc 28 <210> 19 <211> 30 <212> DNA <213> human LIPA gene <400> 19 caacatggct tgctggcaga ttctagtaac 30 <210> 20 <211> 28 <212> DNA <213> human NTE gene <400> 20 tctacagacc ttaatgagag ccgccgtg 28 <210> 21 <211> 26 <212> DNA <213> human UCHL1 gene <400> 21 tcacgcagtg gccaataatc aagaca 26 <210> 22 <211> 30 <212> DNA <213> human UCHL3 gene <400> 22 tggaatggat cctgaactcc ttagcatggt 30 <210> 23 <211> 28 <212> DNA <213> human FMO1 gene <400> 23 tgagaaattc cctcccaacc ccaattgt 28 <210> 24 <211> 24 <212> DNA <213> human FMO2 gene <400> 24 ctccgcaatg tactgccacg aaca 24 <210> 25 <211> 27 <212> DNA <213> human FMO2 gene <400> 25 cagcccctag gttccatttt cccaact 27 <210> 26 <211> 29 <212> DNA <213> human FMO3 gene <400> 26 caatttaccg acagccatct ctgactggt 29 <210> 27 <211> 26 <212> DNA <213> human FMO4 gene <400> 27 cacaaagccc agcatcccac ttctgt 26 <210> 28 <211> 28 <212> DNA <213> human FMO5 gene <400> 28 ttgattcagc ccttaggagc cattatgc 28 <210> 29 <211> 27 <212> DNA <213> human ALDH1 gene <400> 29 caaaacattg cgctactgtg caggttg 27 <210> 30 <211> 25 <212> DNA <213> human ALDH2 gene <400> 30 tttggagatg tgcaggatgg catga 25 <210> 31 <211> 28 <212> DNA <213> human ALDH3 gene <400> 31 tcccccagta cctggacaag gatctgta 28 <210> 32 <211> 28 <212> DNA <213> human ALDH3 gene <400> 32 acatgttctc cagcaacgac aaggtgat 28 <210> 33 <211> 26 <212> DNA <213> human ALDH4 gene <400> 33 agctcagagc acctctgtgg catcaa 26 <210> 34 <211> 25 <212> DNA <213> human ALDH5 gene <400> 34 tggcgtgcag gatgacatga gaatt 25 <210> 35 <211> 27 <212> DNA <213> human ALDH6 gene <400> 35 ctatgcacag gctccatttg gtggctt 27 <210> 36 <211> 27 <212> DNA <213> human ALDH7 gene <400> 36 ctgcagagca ccatcacccg tttctat 27 <210> 37 <211> 28 <212> DNA <213> human ALDH8 gene <400> 37 cctggaacta cccattgaac ctgaccct 28 <210> 38 <211> 24 <212> DNA <213> human ALDH9 gene <400> 38 attgcctctt ggaagtcggc tcca 24 <210> 39 <211> 26 <212> DNA <213> human ALDH10 gene <400> 39 cggttggcaa aattgtcatg gaagct 26 <210> 40 <211> 30 <212> DNA <213> human ADH1 gene <400> 40 taccatggtg accccacttc ctgtgatttt 30 <210> 41 <211> 36 <212> DNA <213> human ADH1 gene <400> 41 aaatgcagaa tttgtaaaaa cccggagagc aactac 36 <210> 42 <211> 30 <212> DNA <213> human ADH2 gene <400> 42 cacagatgac cacgtggtta gtggcaaact 30 <210> 43 <211> 30 <212> DNA <213> human ADH2 gene <400> 43 cttctcccag tacacggtgg tggatgagaa 30 <210> 44 <211> 30 <212> DNA <213> human ADH3 gene <400> 44 tcatgaagtt cgcattaaga tggtggctgc 30 <210> 45 <211> 28 <212> DNA <213> human ADH3 gene <400> 45 cacgtggaaa ggagctattt ttggaggc 28 <210> 46 <211> 30 <212> DNA <213> human ADH4 gene <400> 46 ttttccagag gagctaataa tcggccgtac 30 <210> 47 <211> 30 <212> DNA <213> human ADH5 gene <400> 47 atcccacttt acatcccaca gtgtggagaa 30 <210> 48 <211> 26 <212> DNA <213> human ADH5 gene <400> 48 aagttggagc ctggctctgt ttgtgc 26 <210> 49 <211> 28 <212> DNA <213> human ADH6 gene <400> 49 cagtggccag ttgttcttct caggacgt 28 <210> 50 <211> 28 <212> DNA <213> human ADH7 gene <400> 50 cccatcagtg aggtgctgtc agaaatga 28 <210> 51 <211> 26 <212> DNA <213> human ESD gene <400> 51 tttccagtgg atccccaaag gatgtc 26 <210> 52 <211> 27 <212> DNA <213> human HADH2 gene <400> 52 tcaggttgga caagctgcat actctgc 27 <210> 53 <211> 27 <212> DNA <213> human HEP27 gene <400> 53 ccagctccaa tgccagtgtt ctagtga 27 <210> 54 <211> 21 <212> DNA <213> human EPHX1 gene <400> 54 tcgataagtt ccgtttcacc c 21 <210> 55 <211> 22 <212> DNA <213> human EPHX1 gene <400> 55 aattcattcc gccagtagga ga 22 <210> 56 <211> 21 <212> DNA <213> human EPHX2 gene <400> 56 gccactaccc ggcttatgaa a 21 <210> 57 <211> 21 <212> DNA <213> human EPHX2 gene <400> 57 tttagcggtc tcggagcact t 21 <210> 58 <211> 21 <212> DNA <213> human PIG3 gene <400> 58 ggcccctgtt ttcaaagcta c 21 <210> 59 <211> 21 <212> DNA <213> human PIG3 gene <400> 59 cagaatttgc tccgtgaaag c 21 <210> 60 <211> 21 <212> DNA <213> human NMOR2 gene <400> 60 tctatgcaca ccaggaaccc a 21 <210> 61 <211> 22 <212> DNA <213> human NMOR2 gene <400> 61 ccctgcctgc tcagttcatc ta 22 <210> 62 <211> 23 <212> DNA <213> human MAOA gene <400> 62 ccttgactgc caagattcac ttc 23 <210> 63 <211> 22 <212> DNA <213> human MAOA gene <400> 63 tgcacttaat gacagctccc at 22 <210> 64 <211> 22 <212> DNA <213> human MAOB gene <400> 64 ctttttggag agacatttgc cc 22 <210> 65 <211> 21 <212> DNA <213> human MAOB gene <400> 65 tcacaagtag cccccttttg t 21 <210> 66 <211> 21 <212> DNA <213> human PTGS1 gene <400> 66 ctgcagctga aatttgaccc a 21 <210> 67 <211> 21 <212> DNA <213> human PTGS1 gene <400> 67 accttgaagg agtcaggcat g 21 <210> 68 <211> 22 <212> DNA <213> human PTGS2 gene <400> 68 agtccctgag catctacggt tt 22 <210> 69 <211> 21 <212> DNA <213> human PTGS2 gene <400> 69 cccattcagg atgctcctgt t 21 <210> 70 <211> 21 <212> DNA <213> human DPYD gene <400> 70 ctttgagagc tgtgacctcc a 21 <210> 71 <211> 21 <212> DNA <213> human DPYD gene <400> 71 tcagcagagt caattccacc a 21 <210> 72 <211> 21 <212> DNA <213> human AOX1 gene <400> 72 aaggccagcc cttcgaatac t 21 <210> 73 <211> 22 <212> DNA <213> human AOX1 gene <400> 73 tatactgcag ccaacatcca tg 22 <210> 74 <211> 23 <212> DNA <213> human XDH gene <400> 74 accgcttcca ctacttcagc tat 23 <210> 75 <211> 23 <212> DNA <213> human XDH gene <400> 75 ttagactgga gccaacatcc atg 23 <210> 76 <211> 23 <212> DNA <213> human CEL gene <400> 76 caacaactac ctgtatgacg gcg 23 <210> 77 <211> 23 <212> DNA <213> human CEL gene <400> 77 atagttacct ggcagattgg cgt 23 <210> 78 <211> 22 <212> DNA <213> human CES1 gene <400> 78 ccagagagag tcaacccctt ct 22 <210> 79 <211> 21 <212> DNA <213> human CES1 gene <400> 79 tcctgcttgt taattccgac c 21 <210> 80 <211> 22 <212> DNA <213> human CES2 gene <400> 80 accgcagtgg agtcagagtt tc 22 <210> 81 <211> 22 <212> DNA <213> human CES2 gene <400> 81 atgctgaggt acaggcagtc ct 22 <210> 82 <211> 21 <212> DNA <213> human AADAC gene <400> 82 gcctctccca gataacgttg a 21 <210> 83 <211> 22 <212> DNA <213> human AADAC gene <400> 83 tcaaagctcc cgacaacctt aa 22 <210> 84 <211> 21 <212> DNA <213> human GZMA gene <400> 84 ccctatccat gctatgaccc a 21 <210> 85 <211> 21 <212> DNA <213> human GZMA gene <400> 85 ctggtttcac atcatccccc t 21 <210> 86 <211> 22 <212> DNA <213> human GZMB gene <400> 86 acccagcagt ttatccctgt ga 22 <210> 87 <211> 23 <212> DNA <213> human GZMB gene <400> 87 tttctctcca gctgcagtag cat 23 <210> 88 <211> 21 <212> DNA <213> human IL17 gene <400> 88 caggaatcac aatcccacga a 21 <210> 89 <211> 22 <212> DNA <213> human IL17 gene <400> 89 tccggttatg gatgttcagg tt 22 <210> 90 <211> 23 <212> DNA <213> human LIPA gene <400> 90 aaaggtccca aaccagttgt ctt 23 <210> 91 <211> 21 <212> DNA <213> human LIPA gene <400> 91 cacacgtcaa aaccagcatc a 21 <210> 92 <211> 22 <212> DNA <213> human NTE gene <400> 92 ggcaacgtca ttgagaaaat gc 22 <210> 93 <211> 23 <212> DNA <213> human NTE gene <400> 93 aatctctgcc aagtcagtga agc 23 <210> 94 <211> 21 <212> DNA <213> human UCHL1 gene <400> 94 cctgtggcac aatcggactt a 21 <210> 95 <211> 22 <212> DNA <213> human UCHL1 gene <400> 95 aactgatcca tcctcaaatc cc 22 <210> 96 <211> 22 <212> DNA <213> human UCHL3 gene <400> 96 catcctaact ggcaattcgt tg 22 <210> 97 <211> 25 <212> DNA <213> human UCHL3 gene <400> 97 agaagtaaga ctgcacagac tggtc 25 <210> 98 <211> 21 <212> DNA <213> human FMO1 gene <400> 98 catggtgttc atgacacgct t 21 <210> 99 <211> 22 <212> DNA <213> human FMO1 gene <400> 99 gccagttgtt tatctttcgc tc 22 <210> 100 <211> 21 <212> DNA <213> human FMO2 gene <400> 100 ccacacccgg tttcgttcta t 21 <210> 101 <211> 21 <212> DNA <213> human FMO2 gene <400> 101 tgttttgagg ctcaaggcca t 21 <210> 102 <211> 21 <212> DNA <213> human FMO2 gene <400> 102 tcacctggac aagtcaaccc t 21 <210> 103 <211> 21 <212> DNA <213> human FMO2 gene <400> 103 cccaacgagc ttgaagttca g 21 <210> 104 <211> 21 <212> DNA <213> human FMO3 gene <400> 104 gtcactcgat tcggaacctt c 21 <210> 105 <211> 22 <212> DNA <213> human FMO3 gene <400> 105 gctctttcct caggactcca tt 22 <210> 106 <211> 21 <212> DNA <213> human FMO4 gene <400> 106 tacatggatg atatcgctgc c 21 <210> 107 <211> 22 <212> DNA <213> human FMO4 gene <400> 107 catgaggcgg tactgataag ga 22 <210> 108 <211> 22 <212> DNA <213> human FMO5 gene <400> 108 aaggtcttcc ctcctaacct gg 22 <210> 109 <211> 22 <212> DNA <213> human FMO5 gene <400> 109 agcgtccttg gagctctgaa at 22 <210> 110 <211> 21 <212> DNA <213> human ALDH1 gene <400> 110 tgagtgattt agcaggctgc a 21 <210> 111 <211> 23 <212> DNA <213> human ALDH1 gene <400> 111 tggccacata caccaatagg ttc 23 <210> 112 <211> 21 <212> DNA <213> human ALDH2 gene <400> 112 tggttacttc atccagccca c 21 <210> 113 <211> 23 <212> DNA <213> human ALDH2 gene <400> 113 gctctcccaa caacctcctc tat 23 <210> 114 <211> 21 <212> DNA <213> human ALDH3 gene <400> 114 agctgagtga gaacatggcg a 21 <210> 115 <211> 22 <212> DNA <213> human ALDH3 gene <400> 115 atggtcgaac ctctccttga gc 22 <210> 116 <211> 21 <212> DNA <213> human ALDH3 gene <400> 116 agttcatcaa ccagcgtgag a 21 <210> 117 <211> 21 <212> DNA <213> human ALDH3 gene <400> 117 gtgcaaggtg atgtggacga t 21 <210> 118 <211> 21 <212> DNA <213> human ALDH4 gene <400> 118 caacatcatc cagtttgtgc c 21 <210> 119 <211> 21 <212> DNA <213> human ALDH4 gene <400> 119 cgaagtggaa gttctttccg c 21 <210> 120 <211> 24 <212> DNA <213> human ALDH5 gene <400> 120 ggtttcttca tcaagcctac tgtc 24 <210> 121 <211> 21 <212> DNA <213> human ALDH5 gene <400> 121 caggcccaaa gatctcctct t 21 <210> 122 <211> 23 <212> DNA <213> human ALDH6 gene <400> 122 gaacggtctg gatcaactgc tac 23 <210> 123 <211> 22 <212> DNA <213> human ALDH6 gene <400> 123 agttctctgc catttcctga ca 22 <210> 124 <211> 22 <212> DNA <213> human ALDH7 gene <400> 124 actacgtcct atgcagccct ga 22 <210> 125 <211> 21 <212> DNA <213> human ALDH7 gene <400> 125 cgctggaact gtttctggtt g 21 <210> 126 <211> 21 <212> DNA <213> human ALDH8 gene <400> 126 atctggaagg aaccctttgg c 21 <210> 127 <211> 21 <212> DNA <213> human ALDH8 gene <400> 127 atttctgacg gcttcagcac c 21 <210> 128 <211> 21 <212> DNA <213> human ALDH9 gene <400> 128 agcatggaac tacccctttc a 21 <210> 129 <211> 22 <212> DNA <213> human ALDH9 gene <400> 129 aaagaccatg gcattaccac ag 22 <210> 130 <211> 22 <212> DNA <213> human ALDH10 gene <400> 130 gcagcgattt gaccacattt tc 22 <210> 131 <211> 22 <212> DNA <213> human ALDH10 gene <400> 131 taacatggac ttttccctcc ca 22 <210> 132 <211> 22 <212> DNA <213> human ADH1 gene <400> 132 cctaaggccc atgaagttcg ta 22 <210> 133 <211> 21 <212> DNA <213> human ADH1 gene <400> 133 ccctgaggat tgcttacatc g 21 <210> 134 <211> 21 <212> DNA <213> human ADH1 gene <400> 134 tgataaagtc atcccactcg c 21 <210> 135 <211> 21 <212> DNA <213> human ADH1 gene <400> 135 ccctgaggat tgcttacatc g 21 <210> 136 <211> 22 <212> DNA <213> human ADH2 gene <400> 136 cctaaggctt atgaagttcg ca 22 <210> 137 <211> 21 <212> DNA <213> human ADH2 gene <400> 137 gtgccaagga agtggtgaat g 21 <210> 138 <211> 21 <212> DNA <213> human ADH2 gene <400> 138 cattcaccac ttccttggca c 21 <210> 139 <211> 23 <212> DNA <213> human ADH2 gene <400> 139 atgaggcaga ctttctccag ttt 23 <210> 140 <211> 22 <212> DNA <213> human ADH3 gene <400> 140 tgaggaggta gaggttgcac ct 22 <210> 141 <211> 24 <212> DNA <213> human ADH3 gene <400> 141 ccactaacca catgctcatc tgaa 24 <210> 142 <211> 21 <212> DNA <213> human ADH3 gene <400> 142 agaaacccat tcaggaagtg c 21 <210> 143 <211> 23 <212> DNA <213> human ADH3 gene <400> 143 ggtacggata ctctttccag agc 23 <210> 144 <211> 22 <212> DNA <213> human ADH4 gene <400> 144 tgctggtagc aaaggattga ct 22 <210> 145 <211> 21 <212> DNA <213> human ADH4 gene <400> 145 ccaaccacca aagaatgttc c 21 <210> 146 <211> 22 <212> DNA <213> human ADH5 gene <400> 146 ggagttacta agctgaaggc gg 22 <210> 147 <211> 22 <212> DNA <213> human ADH5 gene <400> 147 agaaaatgtg ctggttccca tg 22 <210> 148 <211> 22 <212> DNA <213> human ADH5 gene <400> 148 ccttctaggt tgtggcattt ca 22 <210> 149 <211> 21 <212> DNA <213> human ADH5 gene <400> 149 taactgccaa tccgactcct c 21 <210> 150 <211> 22 <212> DNA <213> human ADH6 gene <400> 150 cctgccagtg ttcaactcaa aa 22 <210> 151 <211> 21 <212> DNA <213> human ADH6 gene <400> 151 gatgtgctgt ctgctcttcc a 21 <210> 152 <211> 22 <212> DNA <213> human ADH7 gene <400> 152 tcagtcccaa ggactctacc aa 22 <210> 153 <211> 22 <212> DNA <213> human ADH7 gene <400> 153 cttcaaaggt gtatcccacg tt 22 <210> 154 <211> 21 <212> DNA <213> human ESD gene <400> 154 cttccccaac tcataaatgc c 21 <210> 155 <211> 23 <212> DNA <213> human ESD gene <400> 155 acagatcaga gctccatgac ctc 23 <210> 156 <211> 21 <212> DNA <213> human HADH2 gene <400> 156 atcaacactg ccagtgtggc t 21 <210> 157 <211> 21 <212> DNA <213> human HADH2 gene <400> 157 agtgtcatgc ccactattcc c 21 <210> 158 <211> 22 <212> DNA <213> human HEP27 gene <400> 158 ctggtctctt ccattgcagc tt 22 <210> 159 <211> 21 <212> DNA <213> human HEP27 gene <400> 159 cagtttaccc ggatgtcctt g 21[Sequence List] SEQUENCE LISTING <110> Ostuka Pharmaceutical Factory Inc. <120> A method of detecting human phase I enzymes of drug-metabolizing and a probe and a kit therefor <130> 2FD01JP <150> JP 2000-267163 <151> 2000-09-04 <160> 159 <170> PatentIn Ver. 2.0 <210> 1 <211> 27 <212> DNA <213> human EPHX1 gene <400> 1 acctttggag gacagctgct tccacta 27 <210> 2 <211> 30 <212> DNA <213> human EPHX2 gene <400> 2 cacactttcc cagtggatac cactcatgga 30 <210> 3 <211> 30 <212> DNA <213> human PIG3 gene <400> 3 ttaagcgagg aagtctgatc accagtttgc 30 <210> 4 <211 > 28 <212> DNA <213> human NMOR2 gene <400> 4 ctttcaacgg atccttgaag aatgtggc 28 <210> 5 <211> 29 <212> DNA <213> human MAOA gene <400> 5 ccagagcttc cagcagagag aaaccagtt 29 <210> 6 <211> 29 <212> DNA <213> human MAOB gene <400> 6 attgaccacc atcttttcag caacggctc 29 <210> 7 <211> 28 <212> DNA <213> human PTGS1 gene <400> 7 agctgctgtt cggtgtccag ttccaata 28 <210 > 8 <211> 26 <212> DNA <213> human PTGS2 gene <400> 8 tctttggtct ggtgcctggt ctgatg 26 <2 10> 9 <211> 26 <212> DNA <213> human DPYD gene <400> 9 ctcgtgctct gcctggattt cccatt 26 <210> 10 <211> 28 <212> DNA <213> human AOX1 gene <400> 10 cctgttccga ggttgaaata gactgcct 28 <210> 11 <211> 30 <212> DNA <213> human XDH gene <400> 11 aacaggagat cataagaacc tccgcacaga 30 <210> 12 <211> 26 <212> DNA <213> human CEL gene <400> 12 cggaaacgtc atcgtggtca ccttca 26 <210> 13 <211> 30 <212> DNA <213> human CES1 gene <400> 13 atgctgctgc tgaaaacacc 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<400> 24 ctccgcaatg tactgccacg aaca 24 <210> 25 <211> 27 <212> DNA <213> human FMO2 gene <400> 25 cagcccctag gttccatttt cccaact 27 <210> 26 <211> 29 <212> DNA <213> human FMO3 gene <400> 26 caatttaccg acagccatct ctgactggt 29 <210> 27 <211> 26 <212> DNA <213> human FMO4 gene <400> 27 cacaaagccc agcatcccac ttctgt 26 <210> 28 <211> 28 <212> DNA <213> human FMO5 gene <400> 28 ttgattcagc ccttaggagc cattatgc 28 <210> 29 <211> 27 <212> DNA < 213> human ALDH1 gene <400> 29 caaaacattg cgctactgtg caggttg 27 <210> 30 <211> 25 <212> DNA <213> human ALDH2 gene <400> 3 0 tttggagatg tgcaggatgg catga 25 <210> 31 <211> 28 <212> DNA <213> human ALDH3 gene <400> 31 tcccccagta cctggacaag gatctgta 28 <210> 32 <211> 28 <212> DNA <213> human ALDH3 gene < 400> 32 acatgttctc cagcaacgac aaggtgat 28 <210> 33 <211> 26 <212> DNA <213> human ALDH4 gene <400> 33 agctcagagc acctctgtgg catcaa 26 <210> 34 <211> 25 <212> DNA <213> human ALDH5 gene <400> 34 tggcgtgcag gatgacatga gaatt 25 <210> 35 <211> 27 <212> DNA <213> human ALDH6 gene <400> 35 ctatgcacag gctccatttg gtggctt 27 <210> 36 <211> 27 <212> DNA <213> human ALDH7 gene <400> 36 ctgcagagca ccatcacccg tttctat 27 <210> 37 <211> 28 <212> DNA <213> human ALDH8 gene <400> 37 cctggaacta cccattgaac ctgaccct 28 <210> 38 <211> 24 <212> DNA < 213> human ALDH9 gene <400> 38 attgcctctt ggaagtcggc tcca 24 <210> 39 <211> 26 <212> DNA <213> human ALDH10 gene <400> 39 cggttggcaa aattgtcatg gaagct 26 <210> 40 <211> 30 <212> DNA <213> human ADH1 gene <400> 40 taccatggtg accccacttc ctgtgatttt 30 <210> 41 <211> 36 <212> DNA <213> huma n ADH1 gene <400> 41 aaatgcagaa tttgtaaaaa cccggagagc aactac 36 <210> 42 <211> 30 <212> DNA <213> human ADH2 gene <400> 42 cacagatgac cacgtggtta gtggcaaact 30 <210> 43 <211> 30 <212> DNA <213> human ADH2 gene <400> 43 cttctcccag tacacggtgg tggatgagaa 30 <210> 44 <211> 30 <212> DNA <213> human ADH3 gene <400> 44 tcatgaagtt cgcattaaga tggtggctgc 30 <210> 45 <211> 28 <212 > DNA <213> human ADH3 gene <400> 45 cacgtggaaa ggagctattt ttggaggc 28 <210> 46 <211> 30 <212> DNA <213> human ADH4 gene <400> 46 ttttccagag gagctaataa tcggccgtac 30 <210> 47 <211> 30 <212> DNA <213> human ADH5 gene <400> 47 atcccacttt acatcccaca gtgtggagaa 30 <210> 48 <211> 26 <212> DNA <213> human ADH5 gene <400> 48 aagttggagc ctggctctgt ttgtgc 26 <210> 49 <211 > 28 <212> DNA <213> human ADH6 gene <400> 49 cagtggccag ttgttcttct caggacgt 28 <210> 50 <211> 28 <212> DNA <213> human ADH7 gene <400> 50 cccatcagtg aggtgctgtc agaaatga 28 <210> 51 <211> 26 <212> DNA <213> human ESD gene <400> 51 tttccagtgg atccccaaag gatgtc 26 < 210> 52 <211> 27 <212> DNA <213> human HADH2 gene <400> 52 tcaggttgga caagctgcat actctgc 27 <210> 53 <211> 27 <212> DNA <213> human HEP27 gene <400> 53 ccagctccaa tgccagtgtt ctagtga 27 <210> 54 <211> 21 <212> DNA <213> human EPHX1 gene <400> 54 tcgataagtt ccgtttcacc c 21 <210> 55 <211> 22 <212> DNA <213> human EPHX1 gene <400> 55 aattcattcc gccagtagga ga 22 <210> 56 <211> 21 <212> DNA <213> human EPHX2 gene <400> 56 gccactaccc ggcttatgaa a 21 <210> 57 <211> 21 <212> DNA <213> human EPHX2 gene <400> 57 tttagcggtc tcggagcact t 21 <210> 58 <211> 21 <212> DNA <213> human PIG3 gene <400> 58 ggcccctgtt ttcaaagcta c 21 <210> 59 <211> 21 <212> DNA <213> human PIG3 gene < 400> 59 cagaatttgc tccgtgaaag c 21 <210> 60 <211> 21 <212> DNA <213> human NMOR2 gene <400> 60 tctatgcaca ccaggaaccc a 21 <210> 61 <211> 22 <212> DNA <213> human NMOR2 gene <400> 61 ccctgcctgc tcagttcatc ta 22 <210> 62 <211> 23 <212> DNA <213> human MAOA gene <400> 62 ccttgactgc caagattcac ttc 23 <210> 63 <211> 22 <212> DNA <21 3> human MAOA gene <400> 63 tgcacttaat gacagctccc at 22 <210> 64 <211> 22 <212> DNA <213> human MAOB gene <400> 64 ctttttggag agacatttgc cc 22 <210> 65 <211> 21 <212> DNA <213> human MAOB gene <400> 65 tcacaagtag cccccttttg t 21 <210> 66 <211> 21 <212> DNA <213> human PTGS1 gene <400> 66 ctgcagctga aatttgaccc a 21 <210> 67 <211> 21 < 212> DNA <213> human PTGS1 gene <400> 67 accttgaagg agtcaggcat g 21 <210> 68 <211> 22 <212> DNA <213> human PTGS2 gene <400> 68 agtccctgag catctacggt tt 22 <210> 69 <211> 21 <212> DNA <213> human PTGS2 gene <400> 69 cccattcagg atgctcctgt t 21 <210> 70 <211> 21 <212> DNA <213> human DPYD gene <400> 70 ctttgagagc tgtgacctcc a 21 <210> 71 < 211> 21 <212> DNA <213> human DPYD gene <400> 71 tcagcagagt caattccacc a 21 <210> 72 <211> 21 <212> DNA <213> human AOX1 gene <400> 72 aaggccagcc cttcgaatac t 21 <210> 73 <211> 22 <212> DNA <213> human AOX1 gene <400> 73 tatactgcag ccaacatcca tg 22 <210> 74 <211> 23 <212> DNA <213> human XDH gene <400> 74 accgcttcca ctacttca gc tat 23 <210> 75 <211> 23 <212> DNA <213> human XDH gene <400> 75 ttagactgga gccaacatcc atg 23 <210> 76 <211> 23 <212> DNA <213> human CEL gene <400> 76 caacaactac ctgtatgacg gcg 23 <210> 77 <211> 23 <212> DNA <213> human CEL gene <400> 77 atagttacct ggcagattgg cgt 23 <210> 78 <211> 22 <212> DNA <213> human CES1 gene < 400> 78 ccagagagag tcaacccctt ct 22 <210> 79 <211> 21 <212> DNA <213> human CES1 gene <400> 79 tcctgcttgt taattccgac c 21 <210> 80 <211> 22 <212> DNA <213> human CES2 gene <400> 80 accgcagtgg agtcagagtt tc 22 <210> 81 <211> 22 <212> DNA <213> human CES2 gene <400> 81 atgctgaggt acaggcagtc ct 22 <210> 82 <211> 21 <212> DNA <213> human AADAC gene <400> 82 gcctctccca gataacgttg a 21 <210> 83 <211> 22 <212> DNA <213> human AADAC gene <400> 83 tcaaagctcc cgacaacctt aa 22 <210> 84 <211> 21 <212> DNA < 213> human GZMA gene <400> 84 ccctatccat gctatgaccc a 21 <210> 85 <211> 21 <212> DNA <213> human GZMA gene <400> 85 ctggtttcac atcatccccc t 21 <210> 86 <211> 22 <212> DNA <213> h uman GZMB gene <400> 86 acccagcagt ttatccctgt ga 22 <210> 87 <211> 23 <212> DNA <213> human GZMB gene <400> 87 tttctctcca gctgcagtag cat 23 <210> 88 <211> 21 <212> DNA < 213> human IL17 gene <400> 88 caggaatcac aatcccacga a 21 <210> 89 <211> 22 <212> DNA <213> human IL17 gene <400> 89 tccggttatg gatgttcagg tt 22 <210> 90 <211> 23 <212> DNA <213> human LIPA gene <400> 90 aaaggtccca aaccagttgt ctt 23 <210> 91 <211> 21 <212> DNA <213> human LIPA gene <400> 91 cacacgtcaa aaccagcatc a 21 <210> 92 <211> 22 < 212> DNA <213> human NTE gene <400> 92 ggcaacgtca ttgagaaaat gc 22 <210> 93 <211> 23 <212> DNA <213> human NTE gene <400> 93 aatctctgcc aagtcagtga agc 23 <210> 94 <211> 21 <212> DNA <213> human UCHL1 gene <400> 94 cctgtggcac aatcggactt a 21 <210> 95 <211> 22 <212> DNA <213> human UCHL1 gene <400> 95 aactgatcca tcctcaaatc cc 22 <210> 96 < 211> 22 <212> DNA <213> human UCHL3 gene <400> 96 catcctaact ggcaattcgt tg 22 <210> 97 <211> 25 <212> DNA <213> human UCHL3 gene <400> 97 agaagtaaga ctgcac agac tggtc 25 <210> 98 <211> 21 <212> DNA <213> human FMO1 gene <400> 98 catggtgttc atgacacgct t 21 <210> 99 <211> 22 <212> DNA <213> human FMO1 gene <400> 99 gccagttgtt tatctttcgc tc 22 <210> 100 <211> 21 <212> DNA <213> human FMO2 gene <400> 100 ccacacccgg tttcgttcta t 21 <210> 101 <211> 21 <212> DNA <213> human FMO2 gene < 400> 101 tgttttgagg ctcaaggcca t 21 <210> 102 <211> 21 <212> DNA <213> human FMO2 gene <400> 102 tcacctggac aagtcaaccc t 21 <210> 103 <211> 21 <212> DNA <213> human FMO2 gene <400> 103 cccaacgagc ttgaagttca g 21 <210> 104 <211> 21 <212> DNA <213> human FMO3 gene <400> 104 gtcactcgat tcggaacctt c 21 <210> 105 <211> 22 <212> DNA <213> human FMO3 gene <400> 105 gctctttcct caggactcca tt 22 <210> 106 <211> 21 <212> DNA <213> human FMO4 gene <400> 106 tacatggatg atatcgctgc c 21 <210> 107 <211> 22 <212> DNA < 213> human FMO4 gene <400> 107 catgaggcgg tactgataag ga 22 <210> 108 <211> 22 <212> DNA <213> human FMO5 gene <400> 108 aaggtcttcc ctcctaacct gg 22 <210> 109 <211> 22 <212> DNA <213> human FMO5 gene <400> 109 agcgtccttg gagctctgaa at 22 <210> 110 <211> 21 <212> DNA <213> human ALDH1 gene <400> 110 tgagtgattt agcaggctgc a 21 <210> 111 <211 > 23 <212> DNA <213> human ALDH1 gene <400> 111 tggccacata caccaatagg ttc 23 <210> 112 <211> 21 <212> DNA <213> human ALDH2 gene <400> 112 tggttacttc atccagccca c 21 <210> 113 <211> 23 <212> DNA <213> human ALDH2 gene <400> 113 gctctcccaa caacctcctc tat 23 <210> 114 <211> 21 <212> DNA <213> human ALDH3 gene <400> 114 agctgagtga gaacatggcg a 21 <210 > 115 <211> 22 <212> DNA <213> human ALDH3 gene <400> 115 atggtcgaac ctctccttga gc 22 <210> 116 <211> 21 <212> DNA <213> human ALDH3 gene <400> 116 agttcatcaa ccagcgtgag a 21 <210> 117 <211> 21 <212> DNA <213> human ALDH3 gene <400> 117 gtgcaaggtg atgtggacga t 21 <210> 118 <211> 21 <212> DNA <213> human ALDH4 gene <400> 118 caacatcatc cagtttgtgc c 21 <210> 119 <211> 21 <212> DNA <213> human ALDH4 gene <400> 119 cgaagtggaa gttctttccg c 21 <210> 120 <211> 24 <212> DNA <213> human ALDH5 gene <400> 120 ggtttcttca tcaagcctac tgtc 24 <210> 121 <211> 21 <212> DNA <213> human ALDH5 gene <400> 121 caggcccaaa gatctcctct t 21 <210> 122 <211> 23 <212> DNA < 213> human ALDH6 gene <400> 122 gaacggtctg gatcaactgc tac 23 <210> 123 <211> 22 <212> DNA <213> human ALDH6 gene <400> 123 agttctctgc catttcctga ca 22 <210> 124 <211> 22 <212> DNA <213> human ALDH7 gene <400> 124 actacgtcct atgcagccct ga 22 <210> 125 <211> 21 <212> DNA <213> human ALDH7 gene <400> 125 cgctggaact gtttctggtt g 21 <210> 126 <211> 21 < 212> DNA <213> human ALDH8 gene <400> 126 atctggaagg aaccctttgg c 21 <210> 127 <211> 21 <212> DNA <213> human ALDH8 gene <400> 127 atttctgacg gcttcagcac c 21 <210> 128 <211> 21 <212> DNA <213> human ALDH9 gene <400> 128 agcatggaac tacccctttc a 21 <210> 129 <211> 22 <212> DNA <213> human ALDH9 gene <400> 129 aaagaccatg gcattaccac ag 22 <210> 130 < 211> 22 <212> DNA <213> human ALDH10 gene <400> 130 gcagcgattt gaccacattt tc 22 <210> 131 <211> 22 <212> DNA <213> human ALDH 10 gene <400> 131 taacatggac ttttccctcc ca 22 <210> 132 <211> 22 <212> DNA <213> human ADH1 gene <400> 132 cctaaggccc atgaagttcg ta 22 <210> 133 <211> 21 <212> DNA <213 > human ADH1 gene <400> 133 ccctgaggat tgcttacatc g 21 <210> 134 <211> 21 <212> DNA <213> human ADH1 gene <400> 134 tgataaagtc atcccactcg c 21 <210> 135 <211> 21 <212> DNA <213> human ADH1 gene <400> 135 ccctgaggat tgcttacatc g 21 <210> 136 <211> 22 <212> DNA <213> human ADH2 gene <400> 136 cctaaggctt atgaagttcg ca 22 <210> 137 <211> 21 <212 > DNA <213> human ADH2 gene <400> 137 gtgccaagga agtggtgaat g 21 <210> 138 <211> 21 <212> DNA <213> human ADH2 gene <400> 138 cattcaccac ttccttggca c 21 <210> 139 <211> 23 <212> DNA <213> human ADH2 gene <400> 139 atgaggcaga ctttctccag ttt 23 <210> 140 <211> 22 <212> DNA <213> human ADH3 gene <400> 140 tgaggaggta gaggttgcac ct 22 <210> 141 <211 > 24 <212> DNA <213> human ADH3 gene <400> 141 ccactaacca catgctcatc tgaa 24 <210> 142 <211> 21 <212> DNA <213> human ADH3 gene <400> 142 agaaa cccat tcaggaagtg c 21 <210> 143 <211> 23 <212> DNA <213> human ADH3 gene <400> 143 ggtacggata ctctttccag agc 23 <210> 144 <211> 22 <212> DNA <213> human ADH4 gene <400 > 144 tgctggtagc aaaggattga ct 22 <210> 145 <211> 21 <212> DNA <213> human ADH4 gene <400> 145 ccaaccacca aagaatgttc c 21 <210> 146 <211> 22 <212> DNA <213> human ADH5 gene <400> 146 ggagttacta agctgaaggc gg 22 <210> 147 <211> 22 <212> DNA <213> human ADH5 gene <400> 147 agaaaatgtg ctggttccca tg 22 <210> 148 <211> 22 <212> DNA <213> human ADH5 gene <400> 148 ccttctaggt tgtggcattt ca 22 <210> 149 <211> 21 <212> DNA <213> human ADH5 gene <400> 149 taactgccaa tccgactcct c 21 <210> 150 <211> 22 <212> DNA <213 > human ADH6 gene <400> 150 cctgccagtg ttcaactcaa aa 22 <210> 151 <211> 21 <212> DNA <213> human ADH6 gene <400> 151 gatgtgctgt ctgctcttcc a 21 <210> 152 <211> 22 <212> DNA <213> human ADH7 gene <400> 152 tcagtcccaa ggactctacc aa 22 <210> 153 <211> 22 <212> DNA <213> human ADH7 gene <400> 153 cttcaaaggt gtatcccacg tt 22 < 210> 154 <211> 21 <212> DNA <213> human ESD gene <400> 154 cttccccaac tcataaatgc c 21 <210> 155 <211> 23 <212> DNA <213> human ESD gene <400> 155 acagatcaga gctccatgac ctc 23 <210> 156 <211> 21 <212> DNA <213> human HADH2 gene <400> 156 atcaacactg ccagtgtggc t 21 <210> 157 <211> 21 <212> DNA <213> human HADH2 gene <400> 157 agtgtcatgc ccactattcc c 21 <210> 158 <211> 22 <212> DNA <213> human HEP27 gene <400> 158 ctggtctctt ccattgcagc tt 22 <210> 159 <211> 21 <212> DNA <213> human HEP27 gene <400> 159 cagtttaccc ggatgtcctt g 21

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Claims (12)

【特許請求の範囲】[Claims] 【請求項1】薬物代謝の第I相反応に関与する酵素の測定
に用いられるプローブであって、下記(1)〜(53)に示さ
れる領域のいずれかにハイブリダイズするオリゴヌクレ
オチドからなる群から選ばれるプローブ。 (1)EPHX1遺伝子の222-248領域 (2)EPHX2遺伝子の174-203領域 (3)PIG3遺伝子の767-796領域 (4)NMOR2遺伝子の50-77領域 (5)MAOA遺伝子の853-881領域 (6)MAOB遺伝子の1491-1519領域 (7)PTGS1遺伝子の1088-1115領域 (8)PTGS2遺伝子の830-855領域 (9)DPYD遺伝子の2345-2370領域 (10)AOX1遺伝子の3500-3527領域 (11)XDH遺伝子の3504-3533領域 (12)CEL遺伝子の468-493領域 (13)CES1遺伝子の976-1005領域 (14)CES2遺伝子の328-354領域 (15)AADAC遺伝子の86-113領域 (16)GZMA遺伝子の326-353領域 (17)GZMB遺伝子の276-301領域 (18)IL17遺伝子の99-126領域 (19)LIPA遺伝子の253-282領域 (20)NTE遺伝子の3670-3697領域 (21)UCHL1遺伝子の255-280領域 (22)UCHL3遺伝子の105-134領域 (23)FMO1遺伝子の728-755領域 (24)FMO2遺伝子の727-750領域 (25)FMO2遺伝子の1117-1143領域 (26)FMO3遺伝子の735-763領域 (27)FMO4遺伝子の1326-1351領域 (28)FMO5遺伝子の1111-1138領域 (29)ALDH1遺伝子の381-407領域 (30)ALDH2遺伝子の1204-1228領域 (31)ALDH3遺伝子の461-488領域 (32)ALDH3遺伝子の1094-1121領域 (33)ALDH4遺伝子の823-848領域 (34)ALDH5遺伝子の1212-1236領域 (35)ALDH6遺伝子の1413-1439領域 (36)ALDH7遺伝子の790-816領域 (37)ALDH8遺伝子の95-122領域 (38)ALDH9遺伝子の481-504領域 (39)ALDH10遺伝子の563-588領域 (40)ADH1遺伝子の168-197領域 (41)ADH1遺伝子の298-333領域 (42)ADH2遺伝子の144-173領域 (43)ADH2遺伝子の438-467領域 (44)ADH3遺伝子の102-131領域 (45)ADH3遺伝子の939-966領域 (46)ADH4遺伝子の927-956領域 (47)ADH5遺伝子の322-351領域 (48)ADH5遺伝子の616-641領域 (49)ADH6遺伝子の912-939の領域 (50)ADH7遺伝子の745-772の領域 (51)ESD遺伝子の451-476の領域 (52)HADH2遺伝子の483-509の領域 (53)HEP27遺伝子の610-584の領域
Claims: 1. A probe used for measuring an enzyme involved in a phase I reaction of drug metabolism, comprising a group consisting of an oligonucleotide hybridizing to any of the following regions (1) to (53): Probe selected from: (1) 222-248 region of EPHX1 gene (2) 174-203 region of EPHX2 gene (3) 767-796 region of PIG3 gene (4) 50-77 region of NMOR2 gene (5) 853-881 region of MAOA gene (6) MAOB gene 1491-1519 region (7) PTGS1 gene 1088-1115 region (8) PTGS2 gene 830-855 region (9) DPYD gene 2345-2370 region (10) AOX1 gene 3500-3527 region (11) XDH gene 3504-3533 region (12) CEL gene 468-493 region (13) CES1 gene 976-1005 region (14) CES2 gene 328-354 region (15) AADAC gene 86-113 region (16) GZMA gene 326-353 region (17) GZMB gene 276-301 region (18) IL17 gene 99-126 region (19) LIPA gene 253-282 region (20) NTE gene 3670-3697 region (21) 255-280 region of UCHL1 gene (22) 105-134 region of UCHL3 gene (23) 728-755 region of FMO1 gene (24) 727-750 region of FMO2 gene (25) 1117-1143 region of FMO2 gene (26) FMO3 gene 735-763 region (27) FMO4 gene 1326-1351 region (28) FMO5 gene 1111-1138 region (29) ALDH1 gene 381-407 region (3 0) ALDH2 gene 1204-1228 region (31) ALDH3 gene 461-488 region (32) ALDH3 gene 1094-1121 region (33) ALDH4 gene 823-848 region (34) ALDH5 gene 1212-1236 region ( (35) ALDH6 gene 1413-1439 region (36) ALDH7 gene 790-816 region (37) ALDH8 gene 95-122 region (38) ALDH9 gene 481-504 region (39) ALDH10 gene 563-588 region ( 40) 168-197 region of ADH1 gene (41) 298-333 region of ADH1 gene (42) 144-173 region of ADH2 gene (43) 438-467 region of ADH2 gene (44) 102-131 region of ADH3 gene ( 45) ADH3 gene 939-966 region (46) ADH4 gene 927-956 region (47) ADH5 gene 322-351 region (48) ADH5 gene 616-641 region (49) ADH6 gene 912-939 region (50) ADH7 gene 745-772 region (51) ESD gene 451-476 region (52) HADH2 gene 483-509 region (53) HEP27 gene 610-584 region
【請求項2】更にリポーター色素とクエンチャー色素と
を結合させたものである請求項1に記載のプローブ。
2. The probe according to claim 1, further comprising a reporter dye and a quencher dye.
【請求項3】塩基配列の長さが20-40の範囲にある請求項
1に記載のプローブ。
3. The method according to claim 1, wherein the length of the base sequence is in the range of 20-40.
The probe according to 1.
【請求項4】配列番号1〜配列番号53に示される配列のい
ずれかを含む請求項1-3のいずれかに記載のプローブ。
4. The probe according to claim 1, which comprises any one of the sequences shown in SEQ ID NOs: 1 to 53.
【請求項5】配列番号1〜配列番号53に示される配列のい
ずれかである請求項1-3のいずれかに記載のプローブ。
5. The probe according to claim 1, which is any one of the sequences shown in SEQ ID NOs: 1 to 53.
【請求項6】下記(1)〜(53)のいずれかに示される各領域
にハイブリダイズするオリゴヌクレオチドからなるフォ
ワードプライマー、プローブおよびリバースプライマー
の組合せを含む、薬物代謝の第I相反応に関与する酵素
の測定キット。 (1)フォワードプライマー;EPHX1遺伝子の200-220領
域、プローブ;同遺伝子の222-248領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の302-281領域、 (2)フォワードプライマー;EPHX2遺伝子の145-165領
域、プローブ;同遺伝子の174-203領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の237-217領域、 (3)フォワードプライマー;PIG3遺伝子の743-763領域、
プローブ;同遺伝子の767-796領域およびリバースプラ
イマー;同遺伝子の858-838領域、 (4)フォワードプライマー;NMOR2遺伝子の26-46領域、
プローブ;同遺伝子の50-77領域およびリバースプライ
マー;同遺伝子の101-80領域、 (5)フォワードプライマー;MAOA遺伝子の827-849領域、
プローブ;同遺伝子の853-881領域およびリバースプラ
イマー;同遺伝子の919-898領域、 (6)フォワードプライマー;MAOB遺伝子の1440-1461領
域、プローブ;同遺伝子の1491-1519領域およびリバー
スプライマー;同遺伝子の1555-1535領域、 (7)フォワードプライマー;PTGS1遺伝子の1066-1086領
域、プローブ;同遺伝子の1088-1115領域およびリバー
スプライマー;同遺伝子の1187-1167領域、 (8)フォワードプライマー;PTGS2遺伝子の792-813領
域、プローブ;同遺伝子の830-855領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の928-908領域、 (9)フォワードプライマー;DPYD遺伝子の2321-2341領
域、プローブ;同遺伝子の2345-2370領域およびリバー
スプライマー;同遺伝子の2399-2379領域、 (10)フォワードプライマー;AOX1遺伝子の3464-3484領
域、プローブ;同遺伝子の3500-3527領域およびリバー
スプライマー;同遺伝子の3585-3564領域、 (11)フォワードプライマー;XDH遺伝子の3446-3468領
域、プローブ;同遺伝子の3504-3533領域およびリバー
スプライマー;同遺伝子の3562-3540領域、 (12)フォワードプライマー;CEL遺伝子の429-451領域、
プローブ;同遺伝子の468-493領域およびリバースプラ
イマー;同遺伝子の555-533領域、 (13)フォワードプライマー;CES1遺伝子の935-956領
域、プローブ;同遺伝子の976-1005領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の1061-1041領域、 (14)フォワードプライマー;CES2遺伝子の298-319領
域、プローブ;同遺伝子の328-354領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の383-362領域、 (15)フォワードプライマー;AADAC遺伝子の63-83領域、
プローブ;同遺伝子の86-113領域およびリバースプライ
マー;同遺伝子の206-185領域、 (16)フォワードプライマー;GZMA遺伝子の304-324領
域、プローブ;同遺伝子の326-353領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の433-413領域、 (17)フォワードプライマー;GZMB遺伝子の253-274領
域、プローブ;同遺伝子の276-301領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の350-328領域、 (18)フォワードプライマー;IL17遺伝子の68-88領域、
プローブ;同遺伝子の99-126領域およびリバースプライ
マー;同遺伝子の163-142領域、 (19)フォワードプライマー;LIPA遺伝子の226-248領
域、プローブ;同遺伝子の253-282領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の347-327領域、 (20)フォワードプライマー;NTE遺伝子の3634-3655領
域、プローブ;同遺伝子の3670-3697領域およびリバー
スプライマー;同遺伝子の3747-3725領域、 (21)フォワードプライマー;UCHL1遺伝子の233-253領
域、プローブ;同遺伝子の255-280領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の306-285領域、 (22)フォワードプライマー;UCHL3遺伝子の76-97領域、
プローブ;同遺伝子の105-134領域およびリバースプラ
イマー;同遺伝子の164-140領域、 (23)フォワードプライマー;FMO1遺伝子の696-716領
域、プローブ;同遺伝子の728-755領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の790-769領域、 (24)フォワードプライマー;FMO2遺伝子の705-725領
域、プローブ;同遺伝子の727-750領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の826-806領域、 (25)フォワードプライマー;FMO2遺伝子の1077-1097領
域、プローブ;同遺伝子の1117-1143領域およびリバー
スプライマー;同遺伝子の1165-1145領域、 (26)フォワードプライマー;FMO3遺伝子の706-726領
域、プローブ;同遺伝子の735-763領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の844-823領域、 (27)フォワードプライマー;FMO4遺伝子の1297-1317領
域、プローブ;同遺伝子の1326-1351領域およびリバー
スプライマー;同遺伝子の1422-1401領域、 (28)フォワードプライマー;FMO5遺伝子の1063-1084領
域、プローブ;同遺伝子の1111-1138領域およびリバー
スプライマー;同遺伝子の1162-1141領域、 (29)フォワードプライマー;ALDH1遺伝子の359-379領
域、プローブ;同遺伝子の381-407領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の494-472領域、 (30)フォワードプライマー;ALDH2遺伝子の1179-1199領
域、プローブ;同遺伝子の1204-1228領域およびリバー
スプライマー;同遺伝子の1307-1285領域、 (31)フォワードプライマー;ALDH3遺伝子の422-442領
域、プローブ;同遺伝子の461-488領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の549-528領域、 (32)フォワードプライマー;ALDH3遺伝子の1058-1078領
域、プローブ;同遺伝子の1094-1121領域およびリバー
スプライマー;同遺伝子の1194-1174領域、 (33)フォワードプライマー;ALDH4遺伝子の768-788領
域、プローブ;同遺伝子の823-848領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の967-947領域、 (34)フォワードプライマー;ALDH5遺伝子の1183-1206領
域、プローブ;同遺伝子の1212-1236領域およびリバー
スプライマー;同遺伝子の1261-1241領域、 (35)フォワードプライマー;ALDH6遺伝子の1382-1404領
域、プローブ;同遺伝子の1413-1439領域およびリバー
スプライマー;同遺伝子の1466-1445領域、 (36)フォワードプライマー;ALDH7遺伝子の743-764領
域、プローブ;同遺伝子の790-816領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の878-858領域、 (37)フォワードプライマー;ALDH8遺伝子の55-75領域、
プローブ;同遺伝子の95-122領域およびリバースプライ
マー;同遺伝子の182-162領域、 (38)フォワードプライマー;ALDH9遺伝子の459-479領
域、プローブ;同遺伝子の481-504領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の534-513領域、 (39)フォワードプライマー;ALDH10遺伝子の525-546領
域、プローブ;同遺伝子の563-588領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の644-623領域、 (40)フォワードプライマー;ADH1遺伝子の94-115領域、
プローブ;同遺伝子の168-197領域およびリバースプラ
イマー;同遺伝子の365-345領域、 (41)フォワードプライマー;ADH1遺伝子の261-281領
域、プローブ;同遺伝子の298-333領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の365-345領域、 (42)フォワードプライマー;ADH2遺伝子の94-115領域、
プローブ;同遺伝子の144-173領域およびリバースプラ
イマー;同遺伝子の431-411領域、 (43)フォワードプライマー;ADH2遺伝子の411-431領
域、プローブ;同遺伝子の438-467領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の518-496領域、 (44)フォワードプライマー;ADH3遺伝子の72-93領域、
プローブ;同遺伝子の102-131領域およびリバースプラ
イマー;同遺伝子の167-144領域、 (45)フォワードプライマー;ADH3遺伝子の743-763領
域、プローブ;同遺伝子の939-966領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の1113-1091領域、 (46)フォワードプライマー;ADH4遺伝子の903-924領
域、プローブ;同遺伝子の927-956領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の984-964領域、 (47)フォワードプライマー;ADH5遺伝子の289-310領
域、プローブ;同遺伝子の322-351領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の495-474領域、 (48)フォワードプライマー;ADH5遺伝子の564-585領
域、プローブ;同遺伝子の616-641領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の676-656領域。 (49)フォワードプライマー;ADH6遺伝子の889-910領
域、プローブ;同遺伝子の912-939領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の987-967領域。 (50)フォワードプライマー;ADH7遺伝子の722-743領
域、プローブ;同遺伝子の745-772領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の802-781領域。 (51)フォワードプライマー;ESD遺伝子の427-447領域、
プローブ;同遺伝子の451-476領域およびリバースプラ
イマー;同遺伝子の519-497領域。 (52)フォワードプライマー;HADH2遺伝子の451-471領
域、プローブ;同遺伝子の483-509領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の539-519領域。 (53)フォワードプライマー;HEP27遺伝子の505-526領
域、プローブ;同遺伝子の610-584領域およびリバース
プライマー;同遺伝子の635-615領域。
6. It is involved in a phase I reaction of drug metabolism, including a combination of a forward primer, a probe and a reverse primer comprising an oligonucleotide hybridizing to each of the following regions (1) to (53): A kit for measuring enzymes. (1) forward primer; 200-220 region of EPHX1 gene, probe; 222-248 region and reverse primer of the gene; 302-281 region of the gene; (2) forward primer; 145-165 region of EPHX2 gene, probe 174-203 region and reverse primer of the same gene; 237-217 region of the same gene; (3) forward primer; 743-763 region of PIG3 gene;
Probe; 767-796 region and reverse primer of the same gene; 858-838 region of the same gene; (4) forward primer; 26-46 region of the NMOR2 gene;
Probe; 50-77 region and reverse primer of the same gene; 101-80 region of the same gene; (5) forward primer; 827-849 region of the MAOA gene;
Probe; 853-881 region and reverse primer of the same gene; 919-898 region of the same gene; (6) forward primer; 1440-1461 region of the MAOB gene; probe; 1491-1519 region of the same gene and reverse primer; 1555-1535 region of (7) forward primer; 1066-1086 region of PTGS1 gene, probe; 1088-1115 region of the same gene and reverse primer; 1187-1167 region of the same gene; (8) forward primer; PTGS2 gene 792-813 region, probe; 830-855 region and reverse primer of the same gene; 928-908 region of the same gene; (9) forward primer; 2321-2341 region of the DPYD gene, probe; Reverse primer; 2399-2379 region of the same gene; (10) forward primer; AOX1 gene 3464-3484 region; probe; 3500-3527 region of the same gene and reverse Limer; 3585-3564 region of the same gene; (11) forward primer; 3446-3468 region of the XDH gene; probe; 3504-3533 region of the same gene and reverse primer; 3562-3540 region of the same gene; (12) forward primer 429-451 region of the CEL gene;
Probe; 468-493 region and reverse primer of the same gene; 555-533 region of the same gene; (13) forward primer; 935-956 region of the CES1 gene; probe; 976-1005 region of the same gene and reverse primer; the same gene 1061-1041 region of (14) forward primer; 298-319 region of CES2 gene, probe; 328-354 region and reverse primer of the same gene; 383-362 region of the same gene; (15) forward primer; 63-83 region,
Probe; 86-113 region and reverse primer of the same gene; 206-185 region of the same gene; (16) forward primer; 304-324 region of the GZMA gene; probe; 326-353 region and reverse primer of the same gene; 433-413 region of (17) forward primer; 253-274 region of GZMB gene, probe; 276-301 region and reverse primer of the same gene; 350-328 region of the same gene; (18) forward primer; 68-88 area,
Probe; 99-126 region and reverse primer of the same gene; 163-142 region of the same gene; (19) forward primer; 226-248 region of the LIPA gene; probe; 253-282 region of the same gene and reverse primer; 347-327 region of (20) forward primer; 3634-3655 region of NTE gene; probe; 3670-3697 region of gene and reverse primer; 3747-3725 region of same gene; (21) forward primer; of UCHL1 gene 233-253 region, probe; 255-280 region and reverse primer of the same gene; 306-285 region of the same gene; (22) forward primer; 76-97 region of the UCHL3 gene;
Probe; 105-134 region and reverse primer of the same gene; 164-140 region of the same gene; (23) forward primer; 696-716 region of the FMO1 gene; probe; 728-755 region of the same gene and reverse primer; the same gene 790-769 region of (24) forward primer; 705-725 region of FMO2 gene, probe; 727-750 region of reverse gene and reverse primer; 826-806 region of same gene; (25) forward primer; of FMO2 gene 1077-1097 region, probe; 1117-1143 region and reverse primer of the same gene; 1165-1145 region of the same gene; (26) forward primer; 706-726 region of the FMO3 gene, probe; 735-763 region of the same gene and Reverse primer; 844-823 region of the gene; (27) forward primer; 1297-1317 region of FMO4 gene, probe; 1326-1351 region of the gene and reverse ply -; 1422-1401 region of the gene; (28) forward primer; 1063-1084 region of the FMO5 gene, probe; 1111-1138 region and reverse primer of the gene; 1162-1141 region of the gene; (29) forward primer Region 359-379 of the ALDH1 gene, probe; region 381-407 of the gene and a reverse primer; region 494-472 of the gene; (30) forward primer; region 1179-1199 of the ALDH2 gene, probe; 1204 of the gene -1228 region and reverse primer; 1307-1285 region of the same gene; (31) forward primer; 422-442 region of the ALDH3 gene; probe; 461-488 region of the same gene and reverse primer; 549-528 region of the same gene; (32) forward primer; 1058-1078 region of the ALDH3 gene, probe; 1094-1121 region and reverse primer of the gene; 1194-1174 region of the gene; (33) forward primer Primer: 768-788 region of the ALDH4 gene, probe; 823-848 region and reverse primer of the gene; 967-947 region of the gene; (34) forward primer; 1183-1206 region of the ALDH5 gene, probe; 1212-1236 region and reverse primer; 1261-1241 region of the same gene; (35) forward primer; 1382-1404 region of ALDH6 gene; probe; 1413-1439 region of the same gene and reverse primer; 1466-1445 region of the same gene (36) forward primer; 743-764 region of the ALDH7 gene, probe; 790-816 region and reverse primer of the gene; 878-858 region of the gene; (37) forward primer; 55-75 region of the ALDH8 gene;
Probe; 95-122 region and reverse primer of the same gene; 182-162 region of the same gene; (38) forward primer; 459-479 region of the ALDH9 gene; probe; 481-504 region and reverse primer of the same gene; 534-513 region, (39) forward primer; 525-546 region of the ALDH10 gene, probe; 563-588 region and reverse primer of the gene; 644-623 region of the gene; (40) forward primer; 94-115 region,
Probe; 168-197 region and reverse primer of the same gene; 365-345 region of the same gene; (41) forward primer; 261-281 region of the ADH1 gene; probe; 298-333 region of the same gene and reverse primer; the same gene 365-345 region of (42) forward primer; 94-115 region of ADH2 gene;
Probe; 144-173 region and reverse primer of the same gene; 431-411 region of the same gene; (43) forward primer; 411-431 region of the ADH2 gene; probe; 438-467 region of the same gene and reverse primer; 518-496 region of (44) forward primer; 72-93 region of ADH3 gene;
Probe; 102-131 region and reverse primer of the same gene; 167-144 region of the same gene; (45) forward primer; 743-763 region of the ADH3 gene; probe; 939-966 region of the same gene and reverse primer; 1113-1091 region of (46) forward primer; 903-924 region of ADH4 gene, probe; 927-956 region of the same gene and reverse primer; 984-964 region of the same gene; (47) forward primer; of ADH5 gene 289-310 region, probe; 322-351 region and reverse primer of the same gene; 495-474 region of the same gene; (48) forward primer; 564-585 region of the ADH5 gene, probe; 616-641 region of the same gene Reverse primer; 676-656 region of the same gene. (49) forward primer; region 889-910 of the ADH6 gene, probe; region 912-939 of the gene and a reverse primer; region 987-967 of the gene. (50) forward primer; 722-743 region of the ADH7 gene, probe; 745-772 region and reverse primer of the gene; 802-781 region of the gene. (51) forward primer; 427-447 region of the ESD gene,
Probe; 451-476 region of the same gene and reverse primer; 519-497 region of the same gene. (52) Forward primer; 451-471 region of HADH2 gene, probe; 483-509 region and reverse primer of the gene; 539-519 region of the gene. (53) forward primer; 505-526 region of the HEP27 gene, probe; 610-584 region and reverse primer of the gene; 635-615 region of the gene.
【請求項7】プローブが、更にリポーター色素とクエン
チャー色素とを結合させたものである請求項6に記載の
測定キット。
7. The measurement kit according to claim 6, wherein the probe further comprises a reporter dye and a quencher dye.
【請求項8】下記(1)〜(53)のいずれかに記載の各配列番
号で示される配列を含むオリゴヌクレオチドからなる、
フォワードプライマー、プローブおよびリバースプライ
マーの組合せから選ばれる、請求項7に記載の測定キッ
ト。 (1)フォワードプライマー;配列番号54、プローブ;配
列番号1およびリバースプライマー;配列番号55、 (2)フォワードプライマー;配列番号56、プローブ;配
列番号2およびリバースプライマー;配列番号57、 (3)フォワードプライマー;配列番号58、プローブ;配
列番号3およびリバースプライマー;配列番号59、 (4)フォワードプライマー;配列番号60、プローブ;配
列番号4およびリバースプライマー;配列番号61、 (5)フォワードプライマー;配列番号62、プローブ;配
列番号5およびリバースプライマー;配列番号63、 (6)フォワードプライマー;配列番号64、プローブ;配
列番号6およびリバースプライマー;配列番号65、 (7)フォワードプライマー;配列番号66、プローブ;配
列番号7およびリバースプライマー;配列番号67、 (8)フォワードプライマー;配列番号68、プローブ;配
列番号8およびリバースプライマー;配列番号69 (9)フォワードプライマー;配列番号70、プローブ;配
列番号9およびリバースプライマー;配列番号71、 (10)フォワードプライマー;配列番号72、プローブ;配
列番号10およびリバースプライマー;配列番号73、 (11)フォワードプライマー;配列番号74、プローブ;配
列番号11およびリバースプライマー;配列番号75、 (12)フォワードプライマー;配列番号76、プローブ;配
列番号12およびリバースプライマー;配列番号77、 (13)フォワードプライマー;配列番号78、プローブ;配
列番号13およびリバースプライマー;配列番号79、 (14)フォワードプライマー;配列番号80、プローブ;配
列番号14およびリバースプライマー;配列番号81、 (15)フォワードプライマー;配列番号82、プローブ;配
列番号15およびリバースプライマー;配列番号83、 (16)フォワードプライマー;配列番号84、プローブ;配
列番号16およびリバースプライマー;配列番号85、 (17)フォワードプライマー;配列番号86、プローブ;配
列番号17およびリバースプライマー;配列番号87、 (18)フォワードプライマー;配列番号88、プローブ;配
列番号18およびリバースプライマー;配列番号89、 (19)フォワードプライマー;配列番号90、プローブ;配
列番号19およびリバースプライマー;配列番号91、 (20)フォワードプライマー;配列番号92、プローブ;配
列番号20およびリバースプライマー;配列番号93、 (21)フォワードプライマー;配列番号94、プローブ;配
列番号21およびリバースプライマー;配列番号95、 (22)フォワードプライマー;配列番号96、プローブ;配
列番号22およびリバースプライマー;配列番号97、 (23)フォワードプライマー;配列番号98、プローブ;配
列番号23およびリバースプライマー;配列番号99、 (24)フォワードプライマー;配列番号100、プローブ;
配列番号24およびリバースプライマー;配列番号101、 (25)フォワードプライマー;配列番号102、プローブ;
配列番号25およびリバースプライマー;配列番号103、 (26)フォワードプライマー;配列番号104、プローブ;
配列番号26およびリバースプライマー;配列番号105、 (27)フォワードプライマー;配列番号106、プローブ;
配列番号27およびリバースプライマー;配列番号107、 (28)フォワードプライマー;配列番号108、プローブ;
配列番号28およびリバースプライマー;配列番号109、 (29)フォワードプライマー;配列番号110、プローブ;
配列番号29およびリバースプライマー;配列番号111、 (30)フォワードプライマー;配列番号112、プローブ;
配列番号30およびリバースプライマー;配列番号113、 (31)フォワードプライマー;配列番号114、プローブ;
配列番号31およびリバースプライマー;配列番号115、 (32)フォワードプライマー;配列番号116、プローブ;
配列番号32およびリバースプライマー;配列番号117、 (33)フォワードプライマー;配列番号118、プローブ;
配列番号33およびリバースプライマー;配列番号119、 (34)フォワードプライマー;配列番号120、プローブ;
配列番号34およびリバースプライマー;配列番号121、 (35)フォワードプライマー;配列番号122、プローブ;
配列番号35およびリバースプライマー;配列番号123、 (36)フォワードプライマー;配列番号124、プローブ;
配列番号36およびリバースプライマー;配列番号125、 (37)フォワードプライマー;配列番号126、プローブ;
配列番号37およびリバースプライマー;配列番号127、 (38)フォワードプライマー;配列番号128、プローブ;
配列番号38およびリバースプライマー;配列番号129、 (39)フォワードプライマー;配列番号130、プローブ;
配列番号39およびリバースプライマー;配列番号131。 (40)フォワードプライマー;配列番号132、プローブ;
配列番号40およびリバースプライマー;配列番号133、 (41)フォワードプライマー;配列番号134、プローブ;
配列番号41およびリバースプライマー;配列番号135、 (42)フォワードプライマー;配列番号136、プローブ;
配列番号42およびリバースプライマー;配列番号137、 (43)フォワードプライマー;配列番号138、プローブ;
配列番号43およびリバースプライマー;配列番号139、 (44)フォワードプライマー;配列番号140、プローブ;
配列番号44およびリバースプライマー;配列番号141、 (45)フォワードプライマー;配列番号142、プローブ;
配列番号45およびリバースプライマー;配列番号143、 (46)フォワードプライマー;配列番号144、プローブ;
配列番号46およびリバースプライマー;配列番号145、 (47)フォワードプライマー;配列番号146、プローブ;
配列番号47およびリバースプライマー;配列番号147、 (48)フォワードプライマー;配列番号148、プローブ;
配列番号48およびリバースプライマー;配列番号149、 (49)フォワードプライマー;配列番号150、プローブ;
配列番号49およびリバースプライマー;配列番号151。 (50)フォワードプライマー;配列番号152、プローブ;
配列番号50およびリバースプライマー;配列番号153、 (51)フォワードプライマー;配列番号154、プローブ;
配列番号51およびリバースプライマー;配列番号155、 (52)フォワードプライマー;配列番号156、プローブ;
配列番号52およびリバースプライマー;配列番号157、 (53)フォワードプライマー;配列番号158、プローブ;
配列番号53およびリバースプライマー;配列番号159。
An oligonucleotide comprising a sequence represented by each of SEQ ID NOs in any one of the following (1) to (53):
8. The measurement kit according to claim 7, which is selected from a combination of a forward primer, a probe and a reverse primer. (1) forward primer; SEQ ID NO: 54, probe; SEQ ID NO: 1 and reverse primer; SEQ ID NO: 55; (2) forward primer; SEQ ID NO: 56, probe; SEQ ID NO: 2 and reverse primer; SEQ ID NO: 57, (3) forward SEQ ID NO: 58, probe; SEQ ID NO: 3 and reverse primer; SEQ ID NO: 59, (4) forward primer; SEQ ID NO: 60, probe; SEQ ID NO: 4 and reverse primer; SEQ ID NO: 61, (5) forward primer; 62, probe; SEQ ID NO: 5 and reverse primer; SEQ ID NO: 63, (6) forward primer; SEQ ID NO: 64, probe; SEQ ID NO: 6 and reverse primer; SEQ ID NO: 65, (7) forward primer; SEQ ID NO: 66, probe; SEQ ID NO: 7 and reverse primer; SEQ ID NO: 67, (8) forward primer SEQ ID NO: 68, probe; SEQ ID NO: 8 and reverse primer; SEQ ID NO: 69 (9) forward primer; SEQ ID NO: 70, probe; SEQ ID NO: 9 and reverse primer; SEQ ID NO: 71, (10) forward primer; SEQ ID NO: 72, probe SEQ ID NO: 10 and reverse primer; SEQ ID NO: 73, (11) forward primer; SEQ ID NO: 74, probe; SEQ ID NO: 11 and reverse primer; SEQ ID NO: 75, (12) forward primer; SEQ ID NO: 76, probe; SEQ ID NO: 12 SEQ ID NO: 77, (13) forward primer; SEQ ID NO: 78, probe; SEQ ID NO: 13 and reverse primer; SEQ ID NO: 79, (14) forward primer; SEQ ID NO: 80, probe; SEQ ID NO: 14 and reverse primer; SEQ ID NO: 81, (15) forward primer; SEQ ID NO: 82, professional SEQ ID NO: 15 and reverse primer; SEQ ID NO: 83, (16) forward primer; SEQ ID NO: 84, probe; SEQ ID NO: 16 and reverse primer; SEQ ID NO: 85, (17) forward primer; SEQ ID NO: 86, probe; SEQ ID NO: SEQ ID NO: 87, (18) Forward primer; SEQ ID NO: 88, probe; SEQ ID NO: 18 and reverse primer; SEQ ID NO: 89, (19) Forward primer; SEQ ID NO: 90, probe; SEQ ID NO: 19 and reverse primer SEQ ID NO: 91, (20) forward primer; SEQ ID NO: 92, probe; SEQ ID NO: 20 and reverse primer; SEQ ID NO: 93, (21) forward primer; SEQ ID NO: 94, probe; SEQ ID NO: 21 and reverse primer; SEQ ID NO: 95 (22) forward primer; SEQ ID NO: 96, probe; SEQ ID NO: SEQ ID NO: 97, (23) forward primer; SEQ ID NO: 98, probe; SEQ ID NO: 23 and reverse primer; SEQ ID NO: 99, (24) forward primer; SEQ ID NO: 100, probe;
SEQ ID NO: 24 and reverse primer; SEQ ID NO: 101; (25) forward primer; SEQ ID NO: 102, probe;
SEQ ID NO: 25 and reverse primer; SEQ ID NO: 103; (26) forward primer; SEQ ID NO: 104, probe;
SEQ ID NO: 26 and reverse primer; SEQ ID NO: 105; (27) forward primer; SEQ ID NO: 106, probe;
SEQ ID NO: 27 and reverse primer; SEQ ID NO: 107, (28) forward primer; SEQ ID NO: 108, probe;
SEQ ID NO: 28 and reverse primer; SEQ ID NO: 109; (29) forward primer; SEQ ID NO: 110, probe;
SEQ ID NO: 29 and reverse primer; SEQ ID NO: 111; (30) forward primer; SEQ ID NO: 112, probe;
SEQ ID NO: 30 and reverse primer; SEQ ID NO: 113, (31) forward primer; SEQ ID NO: 114, probe;
SEQ ID NO: 31 and reverse primer; SEQ ID NO: 115, (32) forward primer; SEQ ID NO: 116, probe;
SEQ ID NO: 32 and reverse primer; SEQ ID NO: 117, (33) forward primer; SEQ ID NO: 118, probe;
SEQ ID NO: 33 and a reverse primer; SEQ ID NO: 119; (34) forward primer; SEQ ID NO: 120, probe;
SEQ ID NO: 34 and reverse primer; SEQ ID NO: 121, (35) forward primer; SEQ ID NO: 122, probe;
SEQ ID NO: 35 and reverse primer; SEQ ID NO: 123, (36) forward primer; SEQ ID NO: 124, probe;
SEQ ID NO: 36 and reverse primer; SEQ ID NO: 125, (37) forward primer; SEQ ID NO: 126, probe;
SEQ ID NO: 37 and reverse primer; SEQ ID NO: 127, (38) forward primer; SEQ ID NO: 128, probe;
SEQ ID NO: 38 and reverse primer; SEQ ID NO: 129, (39) forward primer; SEQ ID NO: 130, probe;
SEQ ID NO: 39 and reverse primer; SEQ ID NO: 131. (40) forward primer; SEQ ID NO: 132, probe;
SEQ ID NO: 40 and reverse primer; SEQ ID NO: 133, (41) forward primer; SEQ ID NO: 134, probe;
SEQ ID NO: 41 and reverse primer; SEQ ID NO: 135; (42) forward primer; SEQ ID NO: 136, probe;
SEQ ID NO: 42 and reverse primer; SEQ ID NO: 137; (43) forward primer; SEQ ID NO: 138, probe;
SEQ ID NO: 43 and reverse primer; SEQ ID NO: 139, (44) forward primer; SEQ ID NO: 140, probe;
SEQ ID NO: 44 and reverse primer; SEQ ID NO: 141, (45) forward primer; SEQ ID NO: 142, probe;
SEQ ID NO: 45 and reverse primer; SEQ ID NO: 143, (46) forward primer; SEQ ID NO: 144, probe;
SEQ ID NO: 46 and reverse primer; SEQ ID NO: 145; (47) forward primer; SEQ ID NO: 146, probe;
SEQ ID NO: 47 and a reverse primer; SEQ ID NO: 147, (48) forward primer; SEQ ID NO: 148, probe;
SEQ ID NO: 48 and reverse primer; SEQ ID NO: 149; (49) forward primer; SEQ ID NO: 150, probe;
SEQ ID NO: 49 and reverse primer; SEQ ID NO: 151. (50) forward primer; SEQ ID NO: 152, probe;
SEQ ID NO: 50 and reverse primer; SEQ ID NO: 153; (51) forward primer; SEQ ID NO: 154, probe;
SEQ ID NO: 51 and reverse primer; SEQ ID NO: 155; (52) forward primer; SEQ ID NO: 156, probe;
SEQ ID NO: 52 and a reverse primer; SEQ ID NO: 157; (53) forward primer; SEQ ID NO: 158, probe;
SEQ ID NO: 53 and reverse primer; SEQ ID NO: 159.
【請求項9】請求項8に記載の測定キットであって、(1)
の組合せがEPHX1の測定用で、(2)の組合せがEPHX2の測
定用で、(3)の組合せがPIG3の測定用で、(4)の組合せが
NMOR2の測定用で、(5)の組合せがMAOAの測定用で、(6)
の組合せがMAOBの測定用で、(7)の組合せがPTGS1の測定
用で、(8)の組合せがPTGS2の測定用で、(9)の組合せがD
PYDの測定用で、(10)の組合せがAOX1の測定用で、(11)
の組合せがXDHの測定用で、(12)の組合せがCELの測定用
で、(13)の組合せがCES1の測定用で、(14)の組合せがCE
S2の測定用で、(15)の組合せがAADACの測定用で、(16)
の組合せがGZMAの測定用で、(17)の組合せがGZMBの測定
用で、(18)の組合せがIL17の測定用で、(19)の組合せが
LIPAの測定用で、(20)の組合せがNTEの測定用で、(21)
の組合せがUCHL1の測定用で、(22)の組合せがUCHL3の測
定用で、(23)の組合せがFMO1の測定用で、(24)の組合せ
がFMO2の測定用で、(25)の組合せがFMO2の測定用で、(2
6)の組合せがFMO3の測定用で、(27)の組合せがFMO4の測
定用で、(28)の組合せがFMO5の測定用で、(29)の組合せ
がALDH1の測定用で、(30)の組合せがALDH2の測定用で、
(31)の組合せがALDH3の測定用で、(32)の組合せがALDH3
の測定用で、(33)の組合せがALDH4の測定用で、(34)の
組合せがALDH5の測定用で、(35)の組合せがALDH6の測定
用で、(36)の組合せがALDH7の測定用で、(37)の組合せ
がALDH8の測定用で、(38)の組合せがALDH9の測定用で、
(39)の組合せがALDH10の測定用で、(40)の組合せがADH1
の測定用で、(41)の組合せがADH1の測定用で、(42)の組
合せがADH2の測定用で、(43)の組合せがADH2の測定用
で、(44)の組合せがADH3の測定用で、(45)の組合せがAD
H3の測定用で、(46)の組合せがADH4の測定用で、(47)の
組合せがADH5の測定用で、(48)の組合せがADH5の測定用
で、(49)の組合せがADH6の測定用で、(50)の組合せがAD
H7の測定用で、(51)の組合せがESDの測定用で、(52)の
組合せがHADH2の測定用で、(53)の組合せがHEP27の測定
用である測定キット。
9. The measurement kit according to claim 8, wherein (1)
The combination of is for EPHX1 measurement, the combination of (2) is for measurement of EPHX2, the combination of (3) is for measurement of PIG3, and the combination of (4) is
For measurement of NMOR2, combination of (5) is for measurement of MAOA, (6)
The combination of is for MAOB measurement, the combination of (7) is for measurement of PTGS1, the combination of (8) is for measurement of PTGS2, and the combination of (9) is D
For PYD measurement, (10) combination for AOX1 measurement, (11)
The combination of is for XDH measurement, the combination of (12) is for CEL measurement, the combination of (13) is for CES1 measurement, and the combination of (14) is CE
For measurement of S2, combination of (15) is for measurement of AADAC, (16)
The combination of is for GZMA measurement, the combination of (17) is for GZMB measurement, the combination of (18) is for IL17 measurement, and the combination of (19) is
For measurement of LIPA, combination of (20) is for measurement of NTE, (21)
The combination of is for UCHL1 measurement, the combination of (22) is for measurement of UCHL3, the combination of (23) is for measurement of FMO1, the combination of (24) is for measurement of FMO2, and the combination of (25) Is for FMO2 measurement, (2
The combination of (6) is for measurement of FMO3, the combination of (27) is for measurement of FMO4, the combination of (28) is for measurement of FMO5, the combination of (29) is for measurement of ALDH1, and (30) Is for ALDH2 measurement,
The combination of (31) is for ALDH3 measurement, and the combination of (32) is for ALDH3
The combination of (33) is for measurement of ALDH4, the combination of (34) is for measurement of ALDH5, the combination of (35) is for measurement of ALDH6, and the combination of (36) is for measurement of ALDH7 The combination of (37) is for the measurement of ALDH8, the combination of (38) is for the measurement of ALDH9,
The combination of (39) is for ALDH10 measurement and the combination of (40) is ADH1
The combination of (41) is for measuring ADH1, the combination of (42) is for measuring ADH2, the combination of (43) is for measuring ADH2, and the combination of (44) is for measuring ADH3. The combination of (45) is AD
The combination of (46) is for measurement of ADH4, the combination of (47) is for measurement of ADH5, the combination of (48) is for measurement of ADH5, and the combination of (49) is for measurement of ADH6. For measurement, the combination of (50) is AD
A measurement kit for measuring H7, the combination of (51) is for measurement of ESD, the combination of (52) is for measurement of HADH2, and the combination of (53) is for measurement of HEP27.
【請求項10】フォワードプライマー、プローブおよびリ
バースプライマーが、請求項8に記載の(1)〜(53)のいず
れかに記載の各配列番号で示される配列であるオリゴヌ
クレオチドから選ばれる、請求項9に記載の測定キッ
ト。
10. The forward primer, the probe and the reverse primer are selected from oligonucleotides having a sequence represented by each sequence number according to any one of (1) to (53) according to claim 8. 9. The measurement kit according to 9.
【請求項11】薬物代謝の第I相反応に関与する酵素の遺
伝子を含む検体について、請求項6-10のいずれかに記載
の測定キットを用いてポリメラーゼ連鎖反応を行い、用
いたプローブの加水分解の有無を測定することを特徴と
するヒトにおける薬物代謝の第I相反応に関与する酵素
を測定する方法。
A sample containing a gene of an enzyme involved in a phase I reaction of drug metabolism is subjected to a polymerase chain reaction using the measurement kit according to any one of claims 6 to 10, and the probe used is hydrolyzed. A method for measuring an enzyme involved in a phase I reaction of drug metabolism in a human, which comprises determining the presence or absence of decomposition.
【請求項12】加水分解の有無が、励起光照射による蛍光
の発色の有無によりなされる請求項11に記載の測定方
法。
12. The measuring method according to claim 11, wherein the presence or absence of hydrolysis is determined by the presence or absence of the emission of fluorescence by irradiation with excitation light.
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